CN111118173A - 一种影响牦牛乳冰点的连锁snp位点及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点及其应用，属于牦牛分子育种技术领域，位点为第650位A和第730位A，第650位A的基因序列如SEQ：ID：NO：1所示，所述第730位A的基因序列如SEQ：ID：NO：2所示。本发明还提供了所述影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点在牦牛早期选种育种中的应用。通过对牦牛血液样本采集，提取DNA，PCR扩增该影响牦牛乳冰点SNP连锁位点所在片段，通过测序分型，再结合乳冰点与乳蛋白、乳糖、非脂乳固体均呈极显著负相关的相关关系，通过该连锁位点基因型的选择，在母牦牛还不能表现泌乳性状的早期，根据育种需要进行有针对性的早期选种、选育，提供理论依据，加快遗传进展。
Description
技术领域
本发明属于牦牛分子育种技术领域，涉及一种影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点及其应用。
背景技术
牦牛乳具有得天独厚的优势，产自于海拔3000米以上无污染天然草场，属有机安全绿色食品，但由于长期粗放的管理及缺乏正确的育种指导，牦牛产乳量非常低，乳脂率过高，牦牛乳产品受众群体很小，乳产量和乳品质不能兼顾。牦牛乳主要受品种遗传、营养、管理条件等多种因素的影响。从遗传角度着手，泌乳性状为重要经济性状及数量性状，有大量基因、数量性状位点、SNP位点共同作用影响性状。本团队在对影响牦牛泌乳性状候选基因SNP与泌乳性状(乳脂肪、乳蛋白、非脂乳固体、密度、冰点、盐、电导率)相关性研究中，发现影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点2个，同时发现冰点与乳蛋白、乳糖、非脂乳固体均呈极显著的负相关。在分子育种工作中，可将该连锁SNP作为遗传手段，筛选SNP不同基因型，有针对性开展选育以提高选种的准确性及通过基因型开展早期选种，加快遗传进展。
SNP(single nucleotide polymorphism,SNP)，即单核苷酸多态性，是属于第三代遗传标记，广泛地分布于染色体上。SNP主要是指由基因组核苷酸水平上的变异引起的DNA序列多态性，而其中最少一种等位基因在群体中的频率不小于1％。包括单碱基的转换、颠换以及单碱基的插入和缺失等，例如，一个SNP可以将一个DNA序列AAGMCTAA变为ATGGCTAA。在基因组内，SNP可以划分为两种形式：一是遍布于基因组的大量单碱基突变；二是基因编码区的功能性突变，由于分布在基因编码区(coding region)，故又称其为cS-NP。cSNP经常引起表达蛋白的多态性变异，有时会影响他们的功能特性。
发明内容
本发明的目的在于提供一种影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点及其应用。
其具体技术方案为：
一种影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点，所述位点为第650位A和第730位A，所述第650位A的基因序列如SEQ：ID：NO：1所示，所述第730位A的基因序列如SEQ：ID：NO：2所示。
本发明所述影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点在牦牛早期选种育种中的应用。
与现有技术相比，本发明的有益效果：
本发明通过对牦牛血液样本采集，提取DNA，PCR扩增该影响牦牛乳冰点SNP连锁位点所在片段，通过测序分型，再结合乳冰点与乳蛋白、乳糖、非脂乳固体均呈极显著负相关的相关关系，通过该连锁位点基因型的选择，在母牦牛还不能表现泌乳性状的早期，根据育种需要进行有针对性的早期选种、选育，提供理论依据，加快遗传进展。填补了牦牛乳在该类研究的空白。
附图说明
图1是第650位A的基因示意图；
图2是第730位A的基因示意图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明的技术方案作进一步详细地说明。
在对影响牦牛泌乳性状候选基因SNP与泌乳性状相关性研究中发现影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点,所测序列产生两个连锁SNP位点,第650位A(AA/AC),第730位A(AA/AG),AA/AA为连锁基因型,AC/AG为连锁基因型,经差异显著性分析结果表明，AA/AA连锁基因型与AC/AG连锁基因型差异显著(P＜0.05),AA/AA型冰点值显著高于AC/AG型。说明第650位A、第730位A为影响牦牛乳冰点值的连锁SNP。
实施例：
1、两个SNP连锁位点
测序所得序列第650位A(AA/AC)，第730位A(AA/AG),AA/AA为连锁基因型,AC/AG为连锁基因型。
如图1所示，第650位A，如图2所示，第730位A。
2、不同基因型间乳成分及差异显著性分析：
牦牛乳样采集时间为7月底纯放牧条件下，采集50ml泌乳牦母牛奶样干冰运往实验室，用超声波乳品分析仪检测乳脂肪、乳蛋白、非脂乳固体、密度、冰点、盐、电导率。每个样品测3个重复，取平均值。AA/AA连锁基因型与AC/AG连锁基因型差异显著(P＜0.05)AA/AA型冰点值显著高于AC/AG型。说明第650位A、第730位A为影响牦牛乳冰点值的连锁SNP。SPSS差异显著性分析见下表：
表1不同基因型间乳成分差异显著性分析
以上所述，仅为本发明较佳的具体实施方式，本发明的保护范围不限于此，任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明披露的技术范围内，可显而易见地得到的技术方案的简单变化或等效替换均落入本发明的保护范围内。
序列表
<110> 青海省畜牧兽医科学院
<120> 一种影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点及其应用
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Claims (2)
1.一种影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点，其特征在于，所述位点为第650位A和第730位A，所述第650位A的基因序列如SEQ：ID：NO：1所示，所述第730位A的基因序列如SEQ：ID：NO：2所示。
2.一种权利要求1所述影响牦牛乳冰点的连锁SNP位点在牦牛早期选种育种中的应用。
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