CN111100841A - 抗肥胖药物靶点ucp1的基因工程细胞株和高通量药物筛选模型的建立及应用 - Google Patents

抗肥胖药物靶点ucp1的基因工程细胞株和高通量药物筛选模型的建立及应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种构建抗肥胖药物靶点UCP1的基因工程细胞株的方法,同时公开了抗肥胖药物高通量筛选模型的建立及应用。主要涉及利用CRISPR/Cas9系统,设计两条独特的sgRNA,在细胞的UCP1基因N端ATG之后敲入luciferase‑T2A‑tdTomato‑WPRE‑pA,特别是将luciferase和tdTomato敲入永生化棕色脂肪细胞UCP1的基因位点,形成首株在UCP1启动子区域插入luciferase和tdTomato的稳转棕色脂肪细胞株,并将其应用于抗肥胖药物的高通量筛选、抗肥胖药物的评价、机体抗肥胖活性物质的评价以及UCP1检测试剂盒的开发。UCP1是特异性表达于棕色脂肪组织的解偶联蛋白,抵抗肥胖的新靶点,该稳转基因工程细胞株的构建对于应用报告基因和高内涵方法,灵敏、准确、高效地对化合物库进行高通量筛选,获得促进产热、降低体重的抗肥胖药物意义重大。

Description

抗肥胖药物靶点UCP1的基因工程细胞株和高通量药物筛选模 型的建立及应用
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,涉及一种应用CRISPR/Cas9系统在细胞解偶联蛋白(uncoupling protein 1,UCP1)基因位点敲入luciferase-T2A-tdTomato-WPRE-pA,替换exon1和部分intron1,构建稳转细胞株,特别是将luciferase和tdTomato敲入永生化棕色脂肪细胞UCP1的基因位点的基因定向编辑方法与应用,并利用阳性克隆建立抗肥胖药物高通量筛选模型、评价抗肥胖药物、评价机体抗肥胖活性物质以及UCP1检测试剂盒的开发。
背景技术
在过去的二十年里,定点设计核酸酶的创新使得基因组编辑技术取得了巨大地进步,如锌指核酸酶(ZFN)和转录激活样效应因子核酸酶(TALEN)。然而,设计、合成以及对特定基因位点的蛋白质验证的困难限制了这些方法的可行性。基因组编辑技术关键的突破是发现了一种叫做成簇的规律间隔的短回文重复序列(CRISPR)的细菌免疫系统相关RNA分子,它能够指导CRISPR相关的9(Cas9)核酸酶靶向与向导RNA(gRNA)互补的DNA序列。这种gRNA易于编程,并且设计的gRNA与Cas9表达组件的简单转导就可以高度特异性和高效性在DNA中引入双链断裂(DSB)。CRISPR还具有比ZFN和TALEN更小的优势,因此,更容易将其封装到慢病毒结构中,具有较低的脱靶剪切风险,更容易创建,成本更低,并且表现出更高的效率。CRISPR/Cas9系统在许多哺乳动物培养细胞中取得了成功的结果。
随着全球肥胖人群的日益增加,肥胖已成为21世纪最大的公共健康挑战之一,据世界卫生组织(WHO)统计,全球肥胖发病率自1980年至今已增加2倍以上。肥胖是影响很多疾病的重大风险因素,如心血管疾病、糖尿病、高血脂和肿瘤等。鉴于此,美国医学会于2013年认定肥胖是一种疾病。增加锻炼,控制饮食等非药物治疗肥胖的方法往往依从性较差,而减肥药治疗则通过抑制食欲或肠道脂类吸收达到限制能量摄入进而减肥的目的,长期应用会出现抑郁、脂肪泻等副作用,一旦停药则出现明显的体重反弹。因此,寻找安全有效的减肥药是目前治疗肥胖症,进而减少代谢性疾病及其并发症的重中之重。
棕色脂肪活化或促白色脂肪“棕色化”是近年来提出的新概念,通过激活棕色脂肪或促进白色脂肪出现棕色脂肪的特征表现,从而显著促进机体的能量消耗,改善糖脂代谢,增加胰岛素敏感性,因此可能成为针对肥胖症及其相关代谢异常疾病治疗的新靶点。
UCP1是一种特异性表达于棕色脂肪组织的线粒体蛋白,它解偶联细胞呼吸和线粒体ATP合成,以热量的形式耗散能量。由于UCP1被认为是唯一负责棕色脂肪组织产热作用的“热基因”,因此当前研究认为UCP1的主要作用是调节棕色和米色脂肪的功能,UCP1激活具有抗肥胖作用。
发明内容
本发明的目的在于提供一种高效定点将外源基因luciferase和tdTomato敲入细胞UCP1基因位点的方法,特别是敲入永生化棕色脂肪细胞UCP1基因位点的方法。
本发明的另一目的在于应用上述稳转棕色脂肪细胞,提供一种抗肥胖药物高通量筛选模型的构建方法。
本发明的第三个目的在于提供一种抗肥胖药物评价方法。
本发明的第四个目的在于提供一种机体抗肥胖活性物质的评价方法。
本发明的第五个目的在于采用本发明所提及的技术筛选出的药物用于抗代谢性疾病治疗,不限于肥胖,还包括糖尿病、高脂血症、代谢综合症等疾病。
本发明的第六个目的在于提供一种用于检测UCP1的试剂盒。
为了实现上述目的,本发明采用如下技术方案:
本发明提供一种高效定点将外源基因luciferase和tdTomato敲入细胞UCP1基因位点的方法,其特征在于所述方法为:
(1)确定打靶策略,在分析UCP1基因结构编码序列(Coding sequences,CDS)后,设计在N端ATG之后敲入luciferase-T2A-tdTomato-WPRE-pA-loxP-Neo-loxP,替换exon1和部分intron1;
(2)靶序列的测序确认,设计引物,对靶细胞系靶位点序列进行PCR扩增并测序验证,以保证小向导RNA(small guide RNA,sgRNA)识别序列与靶细胞系DNA序列完全一致,靶细胞系靶位点测序引物序列为如SEQ ID NO.1与SEQ ID NO.2所示;
(3)Cas9/sgRNA设计,在5’端和3’端靶位点区域各设计5条sgRNA,sgRNA对应的靶向序列分别如SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7、SEQID NO.8、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示,UCP1-sgRNA1序列如SEQ ID NO.13所示、UCP1-sgRNA2序列如SEQ ID NO.14所示、UCP1-sgRNA3序列如SEQID NO.15所示、UCP1-sgRNA4序列如SEQ ID NO.16所示、UCP1-sgRNA5序列如SEQ ID NO.17所示、UCP1-sgRNA6序列如SEQ ID NO.18所示、UCP1-sgRNA7序列如SEQ ID NO.19所示、UCP1-sgRNA8序列如SEQ ID NO.20所示、UCP1-sgRNA9序列如SEQ ID NO.21所示、UCP1-sgRNA10序列如SEQ ID NO.22所示;
(4)Cas9/sgRNA质粒的构建,按照已设计sgRNA序列合成相应引物,通过GibsonAssembly的方式连入pCS-3G载体,连接产物转化后送样测序验证正确;
(5)Cas9/sgRNA的活性检测,综合考虑活性、特异性因素,选择使用的sgRNA为UCP1-sgRNA1和UCP1-sgRNA6,序列如SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.18所示,pCS-sgRNA1与pCS-sgRNA6核苷酸序列如SEQ ID NO.23与SEQ ID NO.24所示。
(6)重组外源基因载体构建,合成LR-A片段,设计引物克隆RR片段,并将其与载体LScKO-4G连接为重组外源基因载体UCP1-LScKO-4G-Neo-LR-A-RR,经过酶切鉴定和测序,确认重组外源基因载体构建完成,外源基因RR片段的克隆引物序列如SEQ ID NO.25与SEQ IDNO.26所示,重组外源基因载体核苷酸序列如SEQ ID NO.27所示;
(7)阳性克隆筛选,Cas9/sgRNA质粒和重组外源基因载体转染靶细胞系,经过G418药物抗性筛选、细胞富集、再进行PCR筛选,首先筛选混合克隆,再进行连接PCR(JunctionPCR)筛选得到阳性克隆,筛选混合克隆PCR引物UCP1-L-GT-F序列如SEQ ID NO.28所示、WPRE-120R序列如SEQ ID NO.29所示、tdTomato-2371F序列如SEQ ID NO.30所示、UCP1-R-GT-R序列如SEQ ID NO.31所示,Junction PCR引物UCP1-L-GT-F序列如SEQ ID NO.32所示、WPRE-R2序列如SEQ ID NO.33所示、WPRE-F2序列如SEQ ID NO.34所示、UCP1-R-GT-R序列如SEQ ID NO.35所示;
进一步,所述靶细胞系为永生化棕色脂肪细胞系。
进一步,所述外源基因为luciferase-T2A-tdTomato-WPRE-pA基因。
进一步,所述靶标基因为UCP1基因。
本发明还提供一种应用上述稳转棕色脂肪细胞株构建的一种抗肥胖药物高通量筛选模型的构建方法,其特征在于所述方法为:
(1)采用UCP1启动子区域插入luciferase和tdTomato的稳转棕色脂肪细胞株,对其进行诱导分化,加阳性药刺激,优选有效作用浓度和有效作用时间,检测luciferase和tdTomato的活性。
(2)更进一步地,使用CL316,243和异丙肾上腺素(异丙肾上腺素)作为阳性药,CL316,243有效作用浓度为10μmol/L,异丙肾上腺素有效作用浓度为1μmol/L和3μmol/L,有效作用时间为24h或48h。
(3)更进一步地,检测luciferase和tdTomato活性的方法采用报告基因和高内涵方法。
本发明还提供了一种抗肥胖药物以及机体抗肥胖活性物质的评价方法,其特征在于所述方法为:
(1)采用UCP1启动子区域插入luciferase和tdTomato的稳转棕色脂肪细胞株;
(2)采用抗肥胖药物高通量筛选模型构建方法构建的luciferase和tdTomato检测体系。
(3)采用抗肥胖药物高通量筛选模型构建方法确定的CL316,243和异丙肾上腺素作为阳性药,并采用两种阳性药的有效作用浓度和有效作用时间。
本发明还提供了一种用于检测UCP1的试剂盒,其特征在于所述方法为:包括如下组成:
(1)采用UCP1启动子区域插入luciferase和tdTomato的稳转棕色脂肪细胞株;
(2)采用抗肥胖药物高通量筛选模型构建方法构建的luciferase和tdTomato检测体系;
(3)UCP1标准品;
本发明的特点在于:
1、应用CRISPR/Cas9系统定点敲入外源基因
本发明采用CRISPR/Cas9系统将外源基因定点敲入细胞,相较于传统的采用质粒、逆转录病毒、慢病毒等进行瞬时转染/感染或构建稳转细胞株的方法,大大地减少了错配率,具有遗传稳定性。另外,相较于质粒转染后进行抗性筛选获得的稳转细胞株,应用CRISPR/Cas9系统构建的稳转细胞株无需应用抗生素进行抗性维持,不会因为抗生素与筛选药物发生反应影响筛选结果,因此更有利于用于高通量药物筛选工作。同时,棕色脂肪细胞永生化极为困难,极大地阻碍了科研及抗肥胖药物开发,本发明是在前期已建立的永生化棕色脂肪细胞株基础上所构建的稳转棕色脂肪细胞株,为这一问题提供了解决方法。
2、检测灵敏度高
本发明构建了UCP1启动子区域插入luciferase和tdTomato的稳转棕色脂肪细胞株,能够采用报告基因和高内涵的检测方法对化学发光和红色荧光进行双重灵敏、准确、高效的启动子活性检测。相较于传统的构建UCP1基因过表达稳转细胞株的方法,该方法极大地降低了药物筛选的假阳性率,有利于筛选获得棕色脂肪活化或促白色脂肪棕色化的活性化合物,为抗肥胖药物筛选提供高效、可靠的高通量筛选模型。同时,也有利于评价抗肥胖药物和机体抗肥胖活性物质以及开发UCP1检测试剂盒。
本发明的有益效果在于:
本发明提供的将外源基因luciferase和tdTomato定点敲入到靶细胞UCP1基因位点的方法,主要采用CRISPR/Cas9系统将外源基因luciferase-T2A-tdTomato-WPRE-pA敲入靶细胞UCP1启动子区域,使外源基因特异性表达。这是首次利用CRISPR/Cas9系统特异性地将外源基因luciferase-T2A-tdTomato-WPRE-pA定点整合到靶细胞UCP1启动子区域,特别是将luciferase和tdTomato敲入永生化棕色脂肪细胞UCP1基因位点,使luciferase和tdTomato成功在UCP1基因位点特异性表达。应用本发明方法成功构建的永生化棕色脂肪细胞UCP1启动子区域敲入luciferase和tdTomato稳转棕色细胞株,并建立抗肥胖药物高通量筛选模型、抗肥胖药物和机体抗肥胖活性物质评价方法以及UCP1检测试剂盒,采用报告基因和高内涵双重灵敏、准确、高效的检测方法,有利于从化合物、天然产物与中草药中筛选获得棕色脂肪活化或促白色脂肪棕色化的活性化合物,并对其活性强度、选择性与作用机制进行评价,为治疗肥胖症等代谢性疾病的治疗药物研发提供高效的工具。
附图说明
图1为定点整合外源基因luciferase-T2A-tdTomato-WPRE-pA到脂肪细胞UCP1基因启动子区域的的打靶策略。注:Targeting vector:重组外源载体;CDS:编码序列;UTR:非翻译区;5‘-homologous arm:5’-同源臂;3‘-homologous arm:3’-同源臂;Neo:Neomycin·新霉素。
图2为实验中使用的DNA分子量标准(DNA ladder/marker)。
图3为靶标基因UCP1扩增的凝胶电泳图,泳道MSD为靶标基因UCP1的PCR扩增产物,泳道M为DNA Marker。
图4为pCS-3G质粒图谱。
图5为Cas9/sgRNA的活性检测结果图。注:Positive Control:阳性对照;sgRNA:小向导RNA;Relative Cas9/sgRNA activity:相对Cas9/sgRNA活性。
图6为重组外源基因载体UCP1-LScKO-4G-Neo-LR-A-RR构建模式图。
图7为外源基因3’端同源臂片段扩增的凝胶电泳图,泳道RR为3’端同源臂的扩增产物,泳道M为Marker。
图8为限制性内切酶酶切鉴定重组外源基因载体的凝胶电泳图,泳道CK为质粒对照,泳道M为Marker,泳道1代表所用限制性内切酶为ScaI+SmaI,泳道2代表所用限制性内切酶为SalI+EcoRV,泳道3代表所用限制性内切酶为NcoI。
图9为筛选混合克隆引物设计策略,包括野生型等位基因(wild type allele)和靶等位基因(targeted allele)。
图10为应用引物UCP1-L-GT-F/WPRE-120R筛选永生化棕色脂肪细胞混合克隆的凝胶电泳图,泳道M为Marker,泳道mix colonies为混合克隆,泳道WT为野生型基因型,泳道H2O为水。
图11为应用引物tdTomato-2371F/UCP1-R-GT-R筛选永生化棕色脂肪细胞混合克隆的凝胶电泳图,泳道M为Marker,泳道mix colonies为混合克隆,泳道WT为野生型基因型,泳道H2O为水。
图12为Junction PCR引物设计策略,包括wild type allele和targeted allele。
图13、图14为应用引物UCP1-L-GT-F/WPRE-R2进行Junction PCR的凝胶电泳图。
图15为应用引物WPRE-F2/UCP1-R-GT-R进行Junction PCR的凝胶电泳图。
图16、图17为应用引物UCP1-MSD-F2/UCP1-MSD-R2进行Junction PCR的凝胶电泳图。
图18为经过PCR和测序筛选得到的4个永生化棕色脂肪细胞阳性克隆结果图。注:Colony:克隆;KI:敲入;KI allele:敲入等位基因;Non-KI allele:非敲入等位基因;5‘-HR&Seq:5’-同源臂序列;KI element Seq:敲入原件序列;3‘-HR&Seq:3’-同源臂序列;Indel:插入/缺失;WT:野生型;Genotype:基因型;Mut:突变;None:无。
图19为采用报告基因方法检测永生化棕色脂肪细胞阳性克隆1-H6诱导前后Luciferase活性图。
图20为分别采用报告基因和检测荧光值的方法检测阳性药诱导24h后1-H6的Luciferase和tdTomato活性图。
图21为阳性药CL316,243和阳性药异丙肾上腺素有效作用浓度和有效作用时间筛选结果图。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明进行进一步描述,但本发明的保护范围并不仅限于此:
下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径获得。下述实施例中所用方法如无特殊说明均为常规方法。
pCS-3G及LScKO-4G购自北京百奥赛图基因生物技术有限公司。所用引物由上海英骏生物技术有限公司合成。
实施例1、靶向永生化棕色脂肪细胞UCP1基因位点的Cas9/sgRNA设计
1、UCP1序列的测序确认
不同细胞系,UCP1基因序列可能有所差异。为了保证所设计Cas9/sgRNA的效率,首先对永生化棕色脂肪细胞UCP1基因序列进行PCR扩增并测序验证,以保证sgRNA识别序列与永生化棕色脂肪细胞UCP1基因序列完全一致。
实验方法:(1)PCR引物如下所示:
Figure BDA0001841142460000051
(2)PCR反应体系如下所示:
Figure BDA0001841142460000052
Figure BDA0001841142460000061
(3)PCR反应条件如下所示:
Enzyme:KOD-FX
Program:Touchdown PCR
Figure BDA0001841142460000062
实验结果:对永生化棕色脂肪细胞DNA进行PCR及测序,结果证明永生化棕色脂肪细胞UCP1基因序列与Genebank和Ensembl所提供的UCP1基因序列完全一致。
2、体外Cas9/sgRNA质粒构建与制备
实验方法:(1)sgRNA序列如下所示:
UCP1-sgRNA1GGATATCATCACCTTCCCGC(SEQ ID NO.13);
UCP1-sgRNA6GGCTGAAGAACCGCTGTTGAT(SEQ ID NO.18)。
(2)Cas9/sgRNA质粒的构建
按照已设计sgRNA序列合成相应引物,通过Gibson Assembly的方式连入pCS-3G载体,连接产物转化后送样测序。
实验结果:测序结果显示Cas9/sgRNA质粒序列正确,序列如SEQ ID NO.23与SEQID NO.24所示。
实施例2、重组外源基因载体的构建与制备
合成5’端同源臂(5’-homologous arm,LR)以及敲进片段luciferase-T2A-tdTomato-WPRE-pA(A),克隆3’端同源臂(3’-homologous arm,RR)片段,并将LR-A和RR片段与载体LScKO-4G连接为重组外源基因载体UCP1-LScKO-4G-Neo-LR-A-RR,经过酶切鉴定和测序,确认重组外源基因载体构建完成。
1、外源基因克隆
实验方法:(1)UCP1-LR-A采用直接合成的方法进行制备
Figure BDA0001841142460000063
(2)UCP1-RR采用PCR方法进行制备,引物序列如下所示:
Figure BDA0001841142460000064
(3)采用酶切连接方法,将LR-A(EcoRI+XhoI)和RR(NotI+NheI)片段与载体LScKO-4G连接为重组外源基因载体UCP1-LScKO-4G-Neo-LR-A-RR。
实验结果:外源基因RR片段扩增的凝胶电泳图如图7所示。
2、限制性酶切分析
实验方法:(1)限制性酶切策略如下所示:
①Restriction enzyme:ScaI+SmaI
Expected products:6504bp+2541bp+1813bp+790bp
②Restriction enzyme:SalI+EcoRV
Expected products:8123bp+2201bp+1324bp
③Restriction enzyme:NcoI
Expected products:8487bp+1864bp+726bp+571bp
实验结果:(1)重组外源基因载体构建模式图如图6所示。
(2)重组外源基因载体的限制性内切酶酶切鉴定结果如图8所示。经过酶切鉴定和测序,确认重组外源基因载体构建完成。
(3)重组外源基因载体序列如SEQ ID NO.27所示。
实施例3、阳性克隆筛选
1、细胞转染
实验方法:UCP1-sgRNA1、UCP1-sgRNA6和重组外源基因载体电转永生化棕色脂肪细胞,电转方法参见neon转染说明书。
2、药物筛选
实验方法:转染后24h,加600μg/mL G418进行药物筛选,7天后,进行富集,获得混合克隆。
3、PCR筛选混合克隆
实验方法:通过PCR方法筛选混合克隆,具体流程如下:
(1)PCR筛选混合克隆引物设计策略:
详见图9。
(2)PCR筛选引物序列如下所示:
Figure BDA0001841142460000071
(3)PCR反应体系如下所示:
Reaction component Volume(μL) Final concentration
ddH2O 19
2×KOD FX buffer 10
2mM dNTPs 4 0.4mM each
10μM Primer-F 0.6 0.3μM
10μM Primer-R 0.6 0.3μM
DMSO 1 5%
1U/μL KOD FX DNA polymerase 0.4 0.02U/μL
Template DNA 1.5 5-10*ng/μL
(4)PCR反应条件如下所示:
Enzyme:KOD-FX
Program:Touchdown PCR
Figure BDA0001841142460000081
实验结果:(1)应用引物UCP1-L-GT-F/WPRE-120R筛选永生化棕色脂肪细胞混合克隆的结果见图10。
(2)应用引物tdTomato-2371F/UCP1-R-GT-R筛选永生化棕色脂肪细胞混合克隆的结果见图11。
4、PCR筛选阳性克隆
实验方法:通过Junction PCR进行长片段检测,鉴定正确重组。具体流程如下:
(1)Junction PCR引物设计策略:
详见图12。
(2)Junction PCR引物序列如下所示:
Figure BDA0001841142460000082
(3)Junction PCR反应体系如下所示:
Reaction component Volume(μL) Final concentration
ddH2O 19
2×KOD FX buffer 10
2mM dNTPs 4 0.4mM each
10μM Primer-F 0.6 0.3μM
10μM Primer-R 0.6 0.3μM
DMSO 1 5%
1U/μL KOD FX DNA polymerase 0.4 0.02U/μL
Template DNA 1.5 5-10*ng/μL
(4)Junction PCR反应条件如下所示:
Enzyme:KOD-FX
Program:Touchdown PCR
Figure BDA0001841142460000083
实验结果:(1)应用引物UCP1-L-GT-F/WPRE-R2进行Junction PCR的结果如图13、图14所示。
(2)应用引物WPRE-F2/UCP1-R-GT-R进行Junction PCR的结果如图15所示。
(3)应用引物UCP1-MSD-F2/UCP1-MSD-R2进行Junction PCR的结果如图16、图17所示。
(4)经过PCR和测序筛选得到的4个永生化棕色脂肪细胞阳性克隆,如图18所示。
实施例4、抗肥胖药物高通量筛选模型的构建及应用
肥胖是由体内过剩的能量在白色脂肪组织(white adipose tissue,WAT)中过度堆积所引发的慢性代谢性疾病。它是影响很多疾病的重大风险因素,如心血管疾病、糖尿病、高血脂和肿瘤等。增加锻炼,控制饮食等非药物治疗肥胖的方法往往依从性较差,而减肥药治疗则通过抑制食欲或肠道脂类吸收达到限制能量摄入进而减肥的目的,长期应用会出现抑郁、脂肪泻等副作用。因此,寻找安全有效的减肥药是目前治疗肥胖症,进而减少代谢性疾病及其并发症的重中之重。
国外研究表明,有功能的棕色脂肪组织(brown adipose tissue,BAT)在成人中的发现及其产热功能的确认将人们的视线重新转向具有强大燃烧脂肪、抵抗肥胖的棕色脂肪,其产热功能源于富含大量线粒体且特异性高表达线粒体膜蛋白—UCP1。白色脂肪作为储存热量的脂肪,在特定条件下也可向棕色脂肪转化,具有棕色脂肪样的产热功能,即“白色脂肪棕色化(Browning)”,这是近年来肥胖研究中提出的新概念。Kajimura教授认为,只要寻找到增加脂肪组织中UCP1的药物,将会是增加全身产热和能量消耗的安全途径,从而达到减少体内脂肪、抵抗肥胖的目的。鉴于目前尚无商业化的产热激动剂体内外筛选模型,构建产热功能调节靶点激动剂的高通量筛选模型对于寻找肥胖症治疗药物具有非常重要的意义,为肥胖症等代谢性疾病的治疗提供帮助。
1、诱导分化对抗肥胖药物高通量筛选模型的影响
实验方法:将阳性克隆1-H6种于96孔板中,进行诱导分化,Day6时用荧光素酶报告基因试剂盒检测诱导分化的脂肪细胞和未诱导分化的前脂肪细胞Luciferase活性。
实验结果:诱导分化后,1-H6的Luciferase活性明显高于前脂肪细胞,如图19所示。为了提高抗肥胖药物高通量筛选模型的敏感性,确定采用诱导分化后的阳性克隆进行抗肥胖药物高通量筛选工作。
2、Luciferase和tdTomato的活性检测
实验方法:将阳性克隆1-H6种于96孔板中,进行诱导分化,Day6加阳性药CL316,243诱导,24h后分别采用报告基因和高内涵方法检测Luciferase和tdTomato的活性。
实验结果:阳性药CL316,243诱导后,Luciferase和tdTomato的活性与正常对照组相比均有明显升高,如图20所示,证明抗肥胖药物高通量筛选模型建立成功,能够用于产热功能调节靶点激动剂的高通量筛选工作。
3、阳性药有效作用浓度和有效作用时间的确定
实验方法:将阳性克隆1-H6种于96孔板中,进行诱导分化,Day6分别加阳性药CL316,243(β3受体激动剂)以及阳性药异丙肾上腺素(β受体激动剂)进行诱导,分别于24h和48h后检测Luciferase活性。
实验结果:CL316,243有效作用浓度为10μmol/L,有效作用时间为24h和48h。异丙肾上腺素有效作用浓度为1μmol/L和3μmol/L,有效作用时间为24h和48h。如图21所示。CL316,243和异丙肾上腺素均可作为抗肥胖药物高通量筛选模型的阳性药使用。
序列表
<110> 中国医学科学院药物研究所
<120> 抗肥胖药物靶点UCP1的基因工程细胞株和高通量药物筛选模型的建立及应用
<160> 35
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 40
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 1
gcatcaagct tggtaccgat gcaatctggg cttaacgggt 40
<210> 2
<211> 40
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 2
acttaatcgt ggaggatgat cagagcccct aaaagcagga 40
<210> 3
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 3
agatatcatc accttcccgc tgg 23
<210> 4
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 4
ggaaggtgat gatatctgcc agg 23
<210> 5
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 5
cggactttgg cagtgtccag cgg 23
<210> 6
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 6
tgccaggcaa gctgaaactc cgg 23
<210> 7
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 7
agccggagtt tcagcttgcc tgg 23
<210> 8
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 8
gctgaagaac cgctgttgat ggg 23
<210> 9
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 9
aggacaccat tgccttatga agg 23
<210> 10
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 10
cgccaggcct gtaaactctg agg 23
<210> 11
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 11
ccgtgcccca aatcaaagaa agg 23
<210> 12
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 12
caatggtgtc ctgagcatgt ggg 23
<210> 13
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 13
ggatatcatc accttcccgc 20
<210> 14
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 14
ggaaggtgat gatatctgcc 20
<210> 15
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 15
ggcggacttt ggcagtgtcc ag 22
<210> 16
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 16
ggtgccaggc aagctgaaac tc 22
<210> 17
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 17
ggagccggag tttcagcttg cc 22
<210> 18
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 18
ggctgaagaa ccgctgttga t 21
<210> 19
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 19
ggacaccatt gccttatga 19
<210> 20
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 20
ggccaggcct gtaaactctg 20
<210> 21
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 21
ggtgccccaa atcaaagaa 19
<210> 22
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 22
ggcaatggtg tcctgagcat gt 22
<210> 23
<211> 8467
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 23
gagggcctat ttcccatgat tccttcatat ttgcatatac gatacaaggc tgttagagag 60
ataattggaa ttaatttgac tgtaaacaca aagatattag tacaaaatac gtgacgtaga 120
aagtaataat ttcttgggta gtttgcagtt ttaaaattat gttttaaaat ggactatcat 180
atgcttaccg taacttgaaa gtatttcgat ttcttggctt tatatatctt gtggaaagga 240
cgaaacaccg gatatcatca ccttcccgcg ttttagagct agaaatagca agttaaaata 300
aggctagtcc gttatcaact tgaaaaagtg gcaccgagtc ggtgcttttt tgtttttagc 360
gcgtgcgcca attctgcaga caaatggctc tagaggtacc cgttacataa cttacggtaa 420
atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt gacgtcaata gtaacgccaa 480
tagggacttt ccattgacgt caatgggtgg agtatttacg gtaaactgcc cacttggcag 540
tacatcaagt gtatcatatg ccaagtacgc cccctattga cgtcaatgac ggtaaatggc 600
ccgcctggca ttgtgcccag tacatgacct tatgggactt tcctacttgg cagtacatct 660
acgtattagt catcgctatt accatggtcg aggtgagccc cacgttctgc ttcactctcc 720
ccatctcccc cccctcccca cccccaattt tgtatttatt tattttttaa ttattttgtg 780
cagcgatggg ggcggggggg gggggggggc gcgcgccagg cggggcgggg cggggcgagg 840
ggcggggcgg ggcgaggcgg agaggtgcgg cggcagccaa tcagagcggc gcgctccgaa 900
agtttccttt tatggcgagg cggcggcggc ggcggcccta taaaaagcga agcgcgcggc 960
gggcgggagt cgctgcgacg ctgccttcgc cccgtgcccc gctccgccgc cgcctcgcgc 1020
cgcccgcccc ggctctgact gaccgcgtta ctcccacagg tgagcgggcg ggacggccct 1080
tctcctccgg gctgtaatta gctgagcaag aggtaagggt ttaagggatg gttggttggt 1140
ggggtattaa tgtttaatta cctggagcac ctgcctgaaa tcactttttt tcaggttgga 1200
ccggtgccac catggactat aaggaccacg acggagacta caaggatcat gatattgatt 1260
acaaagacga tgacgataag atggccccaa agaagaagcg gaaggtcggt atccacggag 1320
tcccagcagc cgacaagaag tacagcatcg gcctggacat cggcaccaac tctgtgggct 1380
gggccgtgat caccgacgag tacaaggtgc ccagcaagaa attcaaggtg ctgggcaaca 1440
ccgaccggca cagcatcaag aagaacctga tcggagccct gctgttcgac agcggcgaaa 1500
cagccgaggc cacccggctg aagagaaccg ccagaagaag atacaccaga cggaagaacc 1560
ggatctgcta tctgcaagag atcttcagca acgagatggc caaggtggac gacagcttct 1620
tccacagact ggaagagtcc ttcctggtgg aagaggataa gaagcacgag cggcacccca 1680
tcttcggcaa catcgtggac gaggtggcct accacgagaa gtaccccacc atctaccacc 1740
tgagaaagaa actggtggac agcaccgaca aggccgacct gcggctgatc tatctggccc 1800
tggcccacat gatcaagttc cggggccact tcctgatcga gggcgacctg aaccccgaca 1860
acagcgacgt ggacaagctg ttcatccagc tggtgcagac ctacaaccag ctgttcgagg 1920
aaaaccccat caacgccagc ggcgtggacg ccaaggccat cctgtctgcc agactgagca 1980
agagcagacg gctggaaaat ctgatcgccc agctgcccgg cgagaagaag aatggcctgt 2040
tcggaaacct gattgccctg agcctgggcc tgacccccaa cttcaagagc aacttcgacc 2100
tggccgagga tgccaaactg cagctgagca aggacaccta cgacgacgac ctggacaacc 2160
tgctggccca gatcggcgac cagtacgccg acctgtttct ggccgccaag aacctgtccg 2220
acgccatcct gctgagcgac atcctgagag tgaacaccga gatcaccaag gcccccctga 2280
gcgcctctat gatcaagaga tacgacgagc accaccagga cctgaccctg ctgaaagctc 2340
tcgtgcggca gcagctgcct gagaagtaca aagagatttt cttcgaccag agcaagaacg 2400
gctacgccgg ctacattgac ggcggagcca gccaggaaga gttctacaag ttcatcaagc 2460
ccatcctgga aaagatggac ggcaccgagg aactgctcgt gaagctgaac agagaggacc 2520
tgctgcggaa gcagcggacc ttcgacaacg gcagcatccc ccaccagatc cacctgggag 2580
agctgcacgc cattctgcgg cggcaggaag atttttaccc attcctgaag gacaaccggg 2640
aaaagatcga gaagatcctg accttccgca tcccctacta cgtgggccct ctggccaggg 2700
gaaacagcag attcgcctgg atgaccagaa agagcgagga aaccatcacc ccctggaact 2760
tcgaggaagt ggtggacaag ggcgcttccg cccagagctt catcgagcgg atgaccaact 2820
tcgataagaa cctgcccaac gagaaggtgc tgcccaagca cagcctgctg tacgagtact 2880
tcaccgtgta taacgagctg accaaagtga aatacgtgac cgagggaatg agaaagcccg 2940
ccttcctgag cggcgagcag aaaaaggcca tcgtggacct gctgttcaag accaaccgga 3000
aagtgaccgt gaagcagctg aaagaggact acttcaagaa aatcgagtgc ttcgactccg 3060
tggaaatctc cggcgtggaa gatcggttca acgcctccct gggcacatac cacgatctgc 3120
tgaaaattat caaggacaag gacttcctgg acaatgagga aaacgaggac attctggaag 3180
atatcgtgct gaccctgaca ctgtttgagg acagagagat gatcgaggaa cggctgaaaa 3240
cctatgccca cctgttcgac gacaaagtga tgaagcagct gaagcggcgg agatacaccg 3300
gctggggcag gctgagccgg aagctgatca acggcatccg ggacaagcag tccggcaaga 3360
caatcctgga tttcctgaag tccgacggct tcgccaacag aaacttcatg cagctgatcc 3420
acgacgacag cctgaccttt aaagaggaca tccagaaagc ccaggtgtcc ggccagggcg 3480
atagcctgca cgagcacatt gccaatctgg ccggcagccc cgccattaag aagggcatcc 3540
tgcagacagt gaaggtggtg gacgagctcg tgaaagtgat gggccggcac aagcccgaga 3600
acatcgtgat cgaaatggcc agagagaacc agaccaccca gaagggacag aagaacagcc 3660
gcgagagaat gaagcggatc gaagagggca tcaaagagct gggcagccag atcctgaaag 3720
aacaccccgt ggaaaacacc cagctgcaga acgagaagct gtacctgtac tacctgcaga 3780
atgggcggga tatgtacgtg gaccaggaac tggacatcaa ccggctgtcc gactacgatg 3840
tggaccatat cgtgcctcag agctttctga aggacgactc catcgacaac aaggtgctga 3900
ccagaagcga caagaaccgg ggcaagagcg acaacgtgcc ctccgaagag gtcgtgaaga 3960
agatgaagaa ctactggcgg cagctgctga acgccaagct gattacccag agaaagttcg 4020
acaatctgac caaggccgag agaggcggcc tgagcgaact ggataaggcc ggcttcatca 4080
agagacagct ggtggaaacc cggcagatca caaagcacgt ggcacagatc ctggactccc 4140
ggatgaacac taagtacgac gagaatgaca agctgatccg ggaagtgaaa gtgatcaccc 4200
tgaagtccaa gctggtgtcc gatttccgga aggatttcca gttttacaaa gtgcgcgaga 4260
tcaacaacta ccaccacgcc cacgacgcct acctgaacgc cgtcgtggga accgccctga 4320
tcaaaaagta ccctaagctg gaaagcgagt tcgtgtacgg cgactacaag gtgtacgacg 4380
tgcggaagat gatcgccaag agcgagcagg aaatcggcaa ggctaccgcc aagtacttct 4440
tctacagcaa catcatgaac tttttcaaga ccgagattac cctggccaac ggcgagatcc 4500
ggaagcggcc tctgatcgag acaaacggcg aaaccgggga gatcgtgtgg gataagggcc 4560
gggattttgc caccgtgcgg aaagtgctga gcatgcccca agtgaatatc gtgaaaaaga 4620
ccgaggtgca gacaggcggc ttcagcaaag agtctatcct gcccaagagg aacagcgata 4680
agctgatcgc cagaaagaag gactgggacc ctaagaagta cggcggcttc gacagcccca 4740
ccgtggccta ttctgtgctg gtggtggcca aagtggaaaa gggcaagtcc aagaaactga 4800
agagtgtgaa agagctgctg gggatcacca tcatggaaag aagcagcttc gagaagaatc 4860
ccatcgactt tctggaagcc aagggctaca aagaagtgaa aaaggacctg atcatcaagc 4920
tgcctaagta ctccctgttc gagctggaaa acggccggaa gagaatgctg gcctctgccg 4980
gcgaactgca gaagggaaac gaactggccc tgccctccaa atatgtgaac ttcctgtacc 5040
tggccagcca ctatgagaag ctgaagggct cccccgagga taatgagcag aaacagctgt 5100
ttgtggaaca gcacaagcac tacctggacg agatcatcga gcagatcagc gagttctcca 5160
agagagtgat cctggccgac gctaatctgg acaaagtgct gtccgcctac aacaagcacc 5220
gggataagcc catcagagag caggccgaga atatcatcca cctgtttacc ctgaccaatc 5280
tgggagcccc tgccgccttc aagtactttg acaccaccat cgaccggaag aggtacacca 5340
gcaccaaaga ggtgctggac gccaccctga tccaccagag catcaccggc ctgtacgaga 5400
cacggatcga cctgtctcag ctgggaggcg acaaaaggcc ggcggccacg aaaaaggccg 5460
gccaggcaaa aaagaaaaag taagaattcc tagagctcgc tgatcagcct cgactgtgcc 5520
ttctagttgc cagccatctg ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga ccctggaagg 5580
tgccactccc actgtccttt cctaataaaa tgaggaaatt gcatcgcatt gtctgagtag 5640
gtgtcattct attctggggg gtggggtggg gcaggacagc aagggggagg attgggaaga 5700
gaatagcagg catgctgggg agcggccgca ggaaccccta gtgatggagt tggccactcc 5760
ctctctgcgc gctcgctcgc tcactgaggc cgggcgacca aaggtcgccc gacgcccggg 5820
ctttgcccgg gcggcctcag tgagcgagcg agcgcgcagc tgcctgcagg ggcgcctgat 5880
gcggtatttt ctccttacgc atctgtgcgg tatttcacac cgcatacgtc aaagcaacca 5940
tagtacgcgc cctgtagcgg cgcattaagc gcggcgggtg tggtggttac gcgcagcgtg 6000
accgctacac ttgccagcgc cctagcgccc gctcctttcg ctttcttccc ttcctttctc 6060
gccacgttcg ccggctttcc ccgtcaagct ctaaatcggg ggctcccttt agggttccga 6120
tttagtgctt tacggcacct cgaccccaaa aaacttgatt tgggtgatgg ttcacgtagt 6180
gggccatcgc cctgatagac ggtttttcgc cctttgacgt tggagtccac gttctttaat 6240
agtggactct tgttccaaac tggaacaaca ctcaacccta tctcgggcta ttcttttgat 6300
ttataaggga ttttgccgat ttcggcctat tggttaaaaa atgagctgat ttaacaaaaa 6360
tttaacgcga attttaacaa aatattaacg tttacaattt tatggtgcac tctcagtaca 6420
atctgctctg atgccgcata gttaagccag ccccgacacc cgccaacacc cgctgacgcg 6480
ccctgacggg cttgtctgct cccggcatcc gcttacagac aagctgtgac cgtctccggg 6540
agctgcatgt gtcagaggtt ttcaccgtca tcaccgaaac gcgcgagacg aaagggcctc 6600
gtgatacgcc tatttttata ggttaatgtc atgataataa tggtttctta gacgtcaggt 6660
ggcacttttc ggggaaatgt gcgcggaacc cctatttgtt tatttttcta aatacattca 6720
aatatgtatc cgctcatgag acaataaccc tgataaatgc ttcaataata ttgaaaaagg 6780
aagagtatga gtattcaaca tttccgtgtc gcccttattc ccttttttgc ggcattttgc 6840
cttcctgttt ttgctcaccc agaaacgctg gtgaaagtaa aagatgctga agatcagttg 6900
ggtgcacgag tgggttacat cgaactggat ctcaacagcg gtaagatcct tgagagtttt 6960
cgccccgaag aacgttttcc aatgatgagc acttttaaag ttctgctatg tggcgcggta 7020
ttatcccgta ttgacgccgg gcaagagcaa ctcggtcgcc gcatacacta ttctcagaat 7080
gacttggttg agtactcacc agtcacagaa aagcatctta cggatggcat gacagtaaga 7140
gaattatgca gtgctgccat aaccatgagt gataacactg cggccaactt acttctgaca 7200
acgatcggag gaccgaagga gctaaccgct tttttgcaca acatggggga tcatgtaact 7260
cgccttgatc gttgggaacc ggagctgaat gaagccatac caaacgacga gcgtgacacc 7320
acgatgcctg tagcaatggc aacaacgttg cgcaaactat taactggcga actacttact 7380
ctagcttccc ggcaacaatt aatagactgg atggaggcgg ataaagttgc aggaccactt 7440
ctgcgctcgg cccttccggc tggctggttt attgctgata aatctggagc cggtgagcgt 7500
ggaagccgcg gtatcattgc agcactgggg ccagatggta agccctcccg tatcgtagtt 7560
atctacacga cggggagtca ggcaactatg gatgaacgaa atagacagat cgctgagata 7620
ggtgcctcac tgattaagca ttggtaactg tcagaccaag tttactcata tatactttag 7680
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ggggcatggc accggcagca ccggcagcgg cagctccggc accgcctcct ccgaggacaa 4380
caacatggcc gtcatcaaag agttcatgcg cttcaaggtg cgcatggagg gctccatgaa 4440
cggccacgag ttcgagatcg agggcgaggg cgagggccgc ccctacgagg gcacccagac 4500
cgccaagctg aaggtgacca agggcggccc cctgcccttc gcctgggaca tcctgtcccc 4560
ccagttcatg tacggctcca aggcgtacgt gaagcacccc gccgacatcc ccgattacaa 4620
gaagctgtcc ttccccgagg gcttcaagtg ggagcgcgtg atgaacttcg aggacggcgg 4680
tctggtgacc gtgacccagg actcctccct gcaggacggc acgctgatct acaaggtgaa 4740
gatgcgcggc accaacttcc cccccgacgg ccccgtaatg cagaagaaga ccatgggctg 4800
ggaggcctcc accgagcgcc tgtacccccg cgacggcgtg ctgaagggcg agatccacca 4860
ggccctgaag ctgaaggacg gcggccacta cctggtggag ttcaagacca tctacatggc 4920
caagaagccc gtgcaactgc ccggctacta ctacgtggac accaagctgg acatcacctc 4980
ccacaacgag gactacacca tcgtggaaca gtacgagcgc tccgagggcc gccaccacct 5040
gttcctgtac ggcatggacg agctgtacaa gtagaatcaa cctctggatt acaaaatttg 5100
tgaaagattg actggtattc ttaactatgt tgctcctttt acgctatgtg gatacgctgc 5160
tttaatgcct ttgtatcatg ctattgcttc ccgtatggct ttcattttct cctccttgta 5220
taaatcctgg ttgctgtctc tttatgagga gttgtggccc gttgtcaggc aacgtggcgt 5280
ggtgtgcact gtgtttgctg acgcaacccc cactggttgg ggcattgcca ccacctgtca 5340
gctcctttcc gggactttcg ctttccccct ccctattgcc acggcggaac tcatcgccgc 5400
ctgccttgcc cgctgctgga caggggctcg gctgttgggc actgacaatt ccgtggtgtt 5460
gtcggggaaa tcatcgtcct ttccttggct gctcgcctgt gttgccacct ggattctgcg 5520
cgggacgtcc ttctgctacg tcccttcggc cctcaatcca gcggaccttc cttcccgcgg 5580
cctgctgccg gctctgcggc ctcttccgcg tcttcgcctt cgccctcaga cgagtcggat 5640
ctccctttgg gccgcctccc cgcatcgata ccgtcgacct cgactgtgcc ttctagttgc 5700
cagccatctg ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga ccctggaagg tgccactccc 5760
actgtccttt cctaataaaa tgaggaaatt gcatcgcatt gtctgagtag gtgtcattct 5820
attctggggg gtggggtggg gcaggacagc aagggggagg attgggaaga caatagcagg 5880
catgctgggg actcgagagc gctatgcata taacttcgta taatgtatgc tatacgaagt 5940
tatatcgata agcttgcgat cgctcgcgaa gatctgaatt ccgaagttcc tattctctag 6000
aaagtatagg aacttcaggt ctgaagagga gtttacgtcc agccaagcta gcttggctgc 6060
aggtcgtcga aattctaccg ggtaggggag gcgcttttcc caaggcagtc tggagcatgc 6120
gctttagcag ccccgctggg cacttggcgc tacacaagtg gcctctggcc tcgcacacat 6180
tccacatcca ccggtaggcg ccaaccggct ccgttctttg gtggcccctt cgcgccacct 6240
tctactcctc ccctagtcag gaagttcccc cccgccccgc agctcgcgtc gtgcaggacg 6300
tgacaaatgg aagtagcacg tctcactagt ctcgtgcaga tggacagcac cgctgagcaa 6360
tggaagcggg taggcctttg gggcagcggc caatagcagc tttgctcctt cgctttctgg 6420
gctcagaggc tgggaagggg tgggtccggg ggcgggctca ggggcgggct caggggcggg 6480
gcgggcgccc gaaggtcctc cggaggcccg gcattctgca cgcttcaaaa gcgcacgtct 6540
gccgcgctgt tctcctcttc ctcatctccg ggcctttcga cctgcagcct gttgacaatt 6600
aatcatcggc atagtatatc ggcatagtat aatacgacaa ggtgaggaac taaaccatgg 6660
gatcggccat tgaacaagat ggattgcacg caggttctcc ggccgcttgg gtggagaggc 6720
tattcggcta tgactgggca caacagacaa tcggctgctc tgatgccgcc gtgttccggc 6780
tgtcagcgca ggggcgcccg gttctttttg tcaagaccga cctgtccggt gccctgaatg 6840
aactgcagga cgaggcagcg cggctatcgt ggctggccac gacgggcgtt ccttgcgcag 6900
ctgtgctcga cgttgtcact gaagcgggaa gggactggct gctattgggc gaagtgccgg 6960
ggcaggatct cctgtcatct caccttgctc ctgccgagaa agtatccatc atggctgatg 7020
caatgcggcg gctgcatacg cttgatccgg ctacctgccc attcgaccac caagcgaaac 7080
atcgcatcga gcgagcacgt actcggatgg aagccggtct tgtcgatcag gatgatctgg 7140
acgaagagca tcaggggctc gcgccagccg aactgttcgc caggctcaag gcgcgcatgc 7200
ccgacggcga tgatctcgtc gtgacccatg gcgatgcctg cttgccgaat atcatggtgg 7260
aaaatggccg cttttctgga ttcatcgact gtggccggct gggtgtggcg gaccgctatc 7320
aggacatagc gttggctacc cgtgatattg ctgaagagct tggcggcgaa tgggctgacc 7380
gcttcctcgt gctttacggt atcgccgctc ccgattcgca gcgcatcgcc ttctatcgcc 7440
ttcttgacga gttcttctga ggggatcaat tctctagagc tcgctgatca gcctcgactg 7500
tgccttctag ttgccagcca tctgttgttt gcccctcccc cgtgccttcc ttgaccctgg 7560
aaggtgccac tcccactgtc ctttcctaat aaaatgagga aattgcatcg cattgtctga 7620
gtaggtgtca ttctattctg gggggtgggg tggggcagga cagcaagggg gaggattggg 7680
aagacaatag caggcatgct ggggatgcgg tgggctctat ggcttctgag gcggaaagaa 7740
ccagctgggg ctcgactaga gcttgcggaa cccttcgaag ttcctattct ctagaaagta 7800
taggaacttc atcagtcagg tacataatat aacttcgtat aatgtatgct atacgaagtt 7860
attaggtgga tccgtcgacg tatacgcggc cgcgatgggt taaaaatggc ctctgccaaa 7920
tccttcataa ggcaatggtg tcctgagcat gtggggtcta aataataata ataattcaaa 7980
tccctcagag tttacaggcc tggcgctttt acctttcttt gatttggggc acggggtggt 8040
gtactatccc atcctgcttt taggggctct ggagatttcc tgggtacctt gtttaggtgt 8100
ttggagcctg cattgtagca agctccacct ctgagatgga tagatgatag atagattaga 8160
tagaaagaaa gatagataga tagatagata gatagataga tagatagata gatagataga 8220
tagatagaca gagacagagg gagagatgag aatatggggt agtatgcaag agaggtgttg 8280
agaaggggaa attataaaaa agatacttac ctagggtata caccagtttt tttttttttt 8340
ttttagtccc cctgtcaggt gggatccccc cttccttaat ggacagccac ttctctctga 8400
cccacacttt tctgatttcc agatccaagg tgaaggccag gcttccagta ccattaggta 8460
taaaggtgtc ctagggacca tcaccaccct ggcaaaaaca gaaggattgc cgaaactgta 8520
cagcggtctg cctgcgggca ttcagaggca aatcagcttt gcctcactca ggattggcct 8580
ctacgactca gtccaagagt acttctcttc agggagagaa agtaaggaaa tatgcatacc 8640
agttcttcac ctgtttatat ctgtgaaaac caactggcca gtgaggaaag tttgtgtttc 8700
ttcatggaca atgtgggtgg gctataaagc aacgctcaat gtagactttc ccaaacagca 8760
cggtcccaga gaagcttaga gagctttgtg taaagtcaga aagagaccac cacgctccct 8820
gagtctgcgt gggtgtctaa gtaaaacaca tcttcacaga gcaaaggtct gatgttaaag 8880
gttagcaaga gcagataaac ctagagtggc ccatccgggg gactttctgc aaattcttta 8940
atcagtcact ggttatatca ggctccacag taatcagata tattctgtga gtgttcctcg 9000
ttctacattc tgcttcttca gttgatctag taagctttgt tgaacttcct gtgctcggtt 9060
ggccaatgaa agttgccact ctagacagga gcctccagtt cagctgacta cacaaccatg 9120
acatatgctg tgttgcaagc taccacagaa tgggcacagt gaagaggcat gatcattcaa 9180
gactcgtgaa gagttgatat ctgcattgac tcttgagaaa gcagtaggag acttcgaggg 9240
ccaggagcaa agtggtgagg gaagtccttt ctagccaagt gaagactggg tacaaactct 9300
gagtgaggag ctgacattca gggcagacag agaagggcca cattgatgag aagggacaga 9360
tgagtccaga gctagcatcg aagcttccga cgctttagga gtgaatacca gcttggcgta 9420
atcatggtca tagctgtttc ctgtgtgaaa ttgttatccg ctcacaattc cacacaacat 9480
acgagccgga agcataaagt gtaaagcctg gggtgcctaa tgagtgagct aactcacatt 9540
aattgcgttg cgctcactgc ccgctttcca gtcgggaaac ctgtcgtgcc agctgcatta 9600
atgaatcggc caacgcgcgg ggagaggcgg tttgcgtatt gggcgctctt ccgcttcctc 9660
gctcactgac tcgctgcgct cggtcgttcg gctgcggcga gcggtatcag ctcactcaaa 9720
ggcggtaata cggttatcca cagaatcagg ggataacgca ggaaagaaca tgtgagcaaa 9780
aggccagcaa aaggccagga accgtaaaaa ggccgcgttg ctggcgtttt tccataggct 9840
ccgcccccct gacgagcatc acaaaaatcg acgctcaagt cagaggtggc gaaacccgac 9900
aggactataa agataccagg cgtttccccc tggaagctcc ctcgtgcgct ctcctgttcc 9960
gaccctgccg cttaccggat acctgtccgc ctttctccct tcgggaagcg tggcgctttc 10020
tcatagctca cgctgtaggt atctcagttc ggtgtaggtc gttcgctcca agctgggctg 10080
tgtgcacgaa ccccccgttc agcccgaccg ctgcgcctta tccggtaact atcgtcttga 10140
gtccaacccg gtaagacacg acttatcgcc actggcagca gccactggta acaggattag 10200
cagagcgagg tatgtaggcg gtgctacaga gttcttgaag tggtggccta actacggcta 10260
cactagaagg acagtatttg gtatctgcgc tctgctgaag ccagttacct tcggaaaaag 10320
agttggtagc tcttgatccg gcaaacaaac caccgctggt agcggtggtt tttttgtttg 10380
caagcagcag attacgcgca gaaaaaaagg atctcaagaa gatcctttga tcttttctac 10440
ggggtctgac gctcagtgga acgaaaactc acgttaaggg attttggtca tgagattatc 10500
aaaaaggatc ttcacctaga tccttttaaa ttaaaaatga agttttaaat caatctaaag 10560
tatatatgag taaacttggt ctgacagtta ccaatgctta atcagtgagg cacctatctc 10620
agcgatctgt ctatttcgtt catccatagt tgcctgactc cccgtcgtgt agataactac 10680
gatacgggag ggcttaccat ctggccccag tgctgcaatg ataccgcgag acccacgctc 10740
accggctcca gatttatcag caataaacca gccagccgga agggccgagc gcagaagtgg 10800
tcctgcaact ttatccgcct ccatccagtc tattaattgt tgccgggaag ctagagtaag 10860
tagttcgcca gttaatagtt tgcgcaacgt tgttgccatt gctacaggca tcgtggtgtc 10920
acgctcgtcg tttggtatgg cttcattcag ctccggttcc caacgatcaa ggcgagttac 10980
atgatccccc atgttgtgca aaaaagcggt tagctccttc ggtcctccga tcgttgtcag 11040
aagtaagttg gccgcagtgt tatcactcat ggttatggca gcactgcata attctcttac 11100
tgtcatgcca tccgtaagat gcttttctgt gactggtgag tactcaacca agtcattctg 11160
agaatagtgt atgcggcgac cgagttgctc ttgcccggcg tcaatacggg ataataccgc 11220
gccacatagc agaactttaa aagtgctcat cattggaaaa cgttcttcgg ggcgaaaact 11280
ctcaaggatc ttaccgctgt tgagatccag ttcgatgtaa cccactcgtg cacccaactg 11340
atcttcagca tcttttactt tcaccagcgt ttctgggtga gcaaaaacag gaaggcaaaa 11400
tgccgcaaaa aagggaataa gggcgacacg gaaatgttga atactcatac tcttcctttt 11460
tcaatattat tgaagcattt atcagggtta ttgtctcatg agcggataca tatttgaatg 11520
tatttagaaa aataaacaaa taggggttcc gcgcacattt ccccgaaaag tgccacctga 11580
cgtctaagaa accattatta tcatgacatt aacctataaa aataggcgta tcacgaggcc 11640
ctttcgtc 11648
<210> 28
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 28
ctgtttgggg gtttattcta gcctc 25
<210> 29
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 29
acgggaagca atagcatgat ac 22
<210> 30
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 30
ccaccacctg ttcctgtacg 20
<210> 31
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 31
tgaacccaag gccaagtgtt ctac 24
<210> 32
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 32
ctgtttgggg gtttattcta gcctc 25
<210> 33
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 33
atccaggtgg caacacaggc 20
<210> 34
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 34
tgcactgtgt ttgctgacgc 20
<210> 35
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列(Unknown)
<400> 35
tgaacccaag gccaagtgtt ctac 24

Claims (18)

1.一种利用CRISPR-Cas9系统构建UCP1启动子区域敲入荧光素酶luciferase和红色荧光蛋白tdTomato稳转细胞株的方法,其特征在于,所述方法为:(1)确定打靶策略,在分析靶基因UCP1基因结构后,设计在UCP1基因N端ATG之后敲入luciferase-T2A-tdTomato-WPRE-pA-loxP-Neo-loxP,替换exon1和部分intron1;(2)靶序列的测序确认,设计靶位点测序引物,对靶细胞系的靶位点序列进行PCR扩增并测序验证,以保证sgRNA识别序列与靶细胞系DNA序列完全一致;(3)Cas9/sgRNA设计,基于sgRNA的设计原则,在5’端和3’端靶位点区域各设计5条sgRNA;(4)Cas9/sgRNA质粒的构建,按照已设计sgRNA序列合成相应引物,通过Gibson Assembly的方式连入pCS-3G载体,连接产物转化后送样测序验证正确;(5)Cas9/sgRNA的活性检测,综合考虑活性、特异性因素选择UCP1-sgRNA1和UCP1-sgRNA6进行下一步实验;(6)重组外源基因载体构建,合成LR-A片段,设计引物克隆RR片段,并将LR-A片段及RR片段与载体LScKO-4G连接为重组外源基因载体UCP1-LScKO-4G-Neo-LR-A-RR,经过酶切鉴定和测序,确认重组外源基因载体构建完成;(7)阳性克隆筛选,UCP1-sgRNA1、UCP1-sgRNA6和重组外源基因载体转染靶细胞系,经过G418药物抗性筛选、细胞富集、PCR筛选,得到阳性克隆。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述靶细胞系为永生化棕色脂肪细胞系。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述外源基因为luciferase-T2A-tdTomato-WPRE-pA基因。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述靶标基因为UCP1基因。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述靶位点测序引物序列如SEQ ID NO.1与SEQ ID NO.2所示。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,sgRNA对应的靶向序列分别如SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9、SEQID NO.10、SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12所示。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,UCP1-sgRNA1序列如SEQ ID NO.13所示、UCP1-sgRNA2序列如SEQ ID NO.14所示、UCP1-sgRNA3序列如SEQ ID NO.15所示、UCP1-sgRNA4序列如SEQ ID NO.16所示、UCP1-sgRNA5序列如SEQ ID NO.17所示、UCP1-sgRNA6序列如SEQ ID NO.18所示、UCP1-sgRNA7序列如SEQ ID NO.19所示、UCP1-sgRNA8序列如SEQID NO.20所示、UCP1-sgRNA9序列如SEQ ID NO.21所示、UCP1-sgRNA10序列如SEQ ID NO.22所示。
8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,Cas9/sgRNA质粒载体为pCS-3G载体。
9.如权利要求1所述的方法,其特征在于,选择使用的sgRNA为UCP1-sgRNA1和UCP1-sgRNA6,序列如SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.18所示,pCS-sgRNA1与pCS-sgRNA6核苷酸序列如SEQ ID NO.23与SEQ ID NO.24所示。
10.如权利要求1所述的方法,其特征在于,重组外源基因的质粒载体为LScKO-4G。
11.如权利要求1所述的方法,其特征在于,外源基因RR片段的克隆引物序列如SEQ IDNO.25与SEQ ID NO.26所示,重组外源基因载体核苷酸序列如SEQ ID NO.27所示。
12.如权利要求1所述的方法,其特征在于,限制性酶切分析所用的限制性核酸内切酶分别为Scal、Smal、Sall、EcoRV或Ncol。
13.如权利要求1所述的方法,其特征在于,筛选混合克隆PCR引物UCP1-L-GT-F序列如SEQ ID NO.28所示、WPRE-120R序列如SEQ ID NO.29所示、tdTomato-2371F序列如SEQ IDNO.30所示、UCP1-R-GT-R序列如SEQ ID NO.31所示。
14.如权利要求1所述的方法,其特征在于,Junction PCR引物UCP1-L-GT-F序列如SEQID NO.32所示、WPRE-R2序列如SEQ ID NO.33所示、WPRE-F2序列如SEQ ID NO.34所示、UCP1-R-GT-R序列如SEQ ID NO.35所示。
15.一种抗肥胖药物高通量筛选模型的建立及应用方法,其特征在于,所述方法为:采用权利要求1-14所述的构建方法构建的UCP1启动子区域插入luciferase和tdTomato的稳转棕色脂肪细胞株,对其进行诱导分化,加阳性药刺激,确定有效作用浓度和有效作用时间,检测luciferase和tdTomato的活性。
16.如权利要求15所述的方法,其特征在于,使用CL316,243和异丙肾上腺素作为阳性药,CL316,243有效作用浓度为10μmol/L,异丙肾上腺素有效作用浓度为1μmol/L和3μmol/L,有效作用时间为24h或48h。
17.如权利要求15所述的方法,其特征在于,检测luciferase和tdTomato活性的方法采用报告基因和高内涵方法。
18.如权利要求15所述的方法,其特征在于,所构建的抗肥胖药物高通量筛选模型用于促进产热、降低体重的抗肥胖药物的筛选、抗肥胖药物的评价、机体抗肥胖活性物质的评价以及UCP1检测试剂盒的开发。
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