CN110709081A - 用于治疗细菌感染的化合物及方法 - Google Patents

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Abstract

本文提供一种由式I表示的抗菌化合物或其药学上可接受的盐,其中X、Y、R4、R5及R6如本文中所定义。还提供包括式I化合物的药物组合物。

Description

用于治疗细菌感染的化合物及方法
相关申请
本申请要求于2017年5月8日提交的美国临时申请第62/502,867号的优先权,其全部内容是以引用方式并入本文中。
关于由联邦政府赞助的研究与开发的声明
本发明是在美国卫生福利部的整备及应变助理国务卿办公室授予的第IDSEP160030号计划的政府资助下进行。美国政府享有本发明的某些权益。
背景技术
根据疾病控制与预防中心(CDC)估计,仅在美国每年估计有51,000个与绿脓杆菌(P.aeruginosa)感染相关的医疗照护案例,其中在这些感染案例中有超过6,000例(13%)的感染是衍生自多重抗药性菌株。这已导致平均每年约有400个死亡案例。欧洲疾病控制与预防中心的案例数甚至更高,其中估计2009年约有800,000个额外的住院日及10,000个额外的死亡案例是由抗药性绿脓杆菌菌株所引起的。目前绿脓杆菌的多重抗药率为约20%,且预计到2040年将上升至约30%。
目前对于绿脓杆菌的治疗包含有β-内酰胺抗生素。虽然有一些β-内酰胺抗生素在体外表现出非常好的前景,但大多数(即便不是全部)在临床环境中会受到高度抗药性的困扰。由于持续性的抗药性及预计感染增加,新抗菌剂(特别是目前在临床中观察到尚未或轻微受到抗药性机制的影响的那些新抗菌剂)的开发是一项重要的医疗需求。
发明内容
本文是提供一种在其他用途之中用于治疗细菌感染的抗菌化合物。这类化合物是由式I表示,
Figure BDA0002263941680000011
或其药学上可接受的盐,其中X、Y、R4、R5及R6是如本文中所定义。本文亦提供了包括式I化合物的药物组合物。
本文所公开的化合物用作盘尼西林结合蛋白3(PBP3)抑制剂,且在一些例子中,其也用作为PBP1抑制剂,并显示出抗菌活性。参阅(例如)表6及表7。
所公开的PBP3抑制剂在活体内也具有优于已知PBP2抑制剂的显著改善。参阅(例如)在例示段落中的“对于绿脓杆菌PBP抑制剂的活体内剖析”部分以及图1及2,其中将本申请的实例40与PBP2抑制剂(比较物1)进行比较。实例40与比较物1之间的唯一结构差异在于氨基甲基基团被N-甲基-酰胺肟基团取代。然而,比较物1在嗜中性白血球减少的鼠大腿模型中对于绿脓杆菌临床分离株并不具有活性(在此研究中,即使暴露于超过其MIC 100%倍也未实现停滞),而本申请的实例40则显示出稳健的功效(在暴露于超过其MIC 57%倍时降低超过2Log(CFU/g))。
也已发现到以肟取代羰基提供了对PBP3的生化活性改善,并降低了针对革兰氏阴性病原体的MIC。参见(例如)表5-7中的数据,其是比较了比较物2与本公开的肟的结果。
附图说明
图1是显示PBP2化合物(比较物1)在嗜中性白血球减少的鼠大腿模型中对于绿脓杆菌临床分离株(ARC6347,AmpC+,PoxB+)的活体内功效。
图2是显示本申请的PBP3化合物(实例40)在嗜中性白血球减少的鼠大腿模型中对于绿脓杆菌临床分离株(ARC6347,AmpC+,PoxB+)的活体内功效。
具体实施方式
1.化合物的概述
在某些实施例中,本发明是提供一种式I化合物:
Figure BDA0002263941680000021
或其药学上可接受的盐,其中
X为H、CN、C(O)NR1R2、NR1R2、或可选地经NHC(O)Rg或NHS(O)NH2取代的(C1-C6)烷基;
Y为NOR3;或R3及X连同与其连接的原子一起形成4至6元杂环基或5至6元杂芳基,其每一者可选地经选自(C1-C6)烷基、C=O、C(O)OH及C(O)O(C1-C6)烷基中的一个或多个基团取代,其中所述(C1-C6)烷基可选地经选自OH、(C1-C6)烷氧基、苯基及5至6元杂芳基中的一个或多个基团取代,其中所述5至6元杂芳基可选地经NH2、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2取代;
R1及R2各自独立地为氢、氰基、C(O)NH2、NH2、OH、(C1-C6)烷氧基、或可选地经一个或多个R7取代的(C1-C6)烷基;
R3为氢、C(O)(C1-C6)烷基、C(O)NRdRe、SO2NH2、SO2OH、或可选地经一个或多个R7取代的(C1-C6)烷基;
R4、R5及R6各自独立地为氢、(C1-C6)烷基或C(O)NRaRb,其中R4、R5及R6的所述(C1-C6)烷基可选地经一个或多个R7取代,条件是R4及R5中的至少一者不是氢,且条件是当与R4及R5键合的对应氮原子经由双键而与相邻的环原子连接时R4及R5不存在;
各个R7独立地选自卤代基、OH、ORc、(C1-C6)烷氧基、CN、4至6元杂环基、5至6元杂芳基、苯基、C(=NH)NH2、NHC(=NH)NH2、NRdRe、C(O)OH、C=NO(C1-C6)烷基NH2、NHC(O)(C1-C6)烷基、C(O)NRdRe、SO2Rf及S(O)Rf,其中所述5至6元杂芳基可选地经NH2取代且所述苯基可选地经NH2取代;
Ra、Rb、Rd及Re各自独立地为氢、OH、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷氧基、苯基、OSO2OH、4至6元环烷基、4至6元杂环基或5至6元杂芳基,其中Ra、Rb、Rd及Re的所述(C1-C6)烷基及(C1-C6)烷氧基中的每一者可选地且独立地经选自OH、NH2、C(O)OH、C(O)O(C1-C6)烷基、NHC(O)NH2、NHC(O)NH(C1-C6)烷基、C(O)NH2、NHC(O)N((C1-C6)烷基)2、NHC(O)(C1-C6)烷基、NHC(O)卤代基(C1-C6)烷基、4至6元杂环基、5至6元杂芳基、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代,其中Ra、Rb、Rd及Re的所述苯基、4至6元杂环基、4至6元环烷基及5至6元杂芳基中的每一者,及Ra、Rb、Rd及Re的(C1-C6)烷基及(C1-C6)烷氧基的所述5至6元可选的杂芳基可选地且独立地经选自(C1-C6)烷基、NH2、NH(C1-C6)烷基及–N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代;
Rc为可选地经选自C(=NH)NH2、C(=NH)NH(5至6元杂环基)、C(=NH)NH(C1-C6)烷基、NHC(=NH)NH2、-NRdRe、C(O)NRdRe、SO2Rf及SORf中的一个或多个基团取代的苯基,其中在基团C(=NH)NH(C1-C6)烷基中的所述(C1-C6)烷基可选地经选自NH2、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代;
Rf为氢或(C1-C6)烷基;以及
Rg为可选地经选自C=O及(C1-C6)烷基中的一个或多个基团取代的4至6元杂环基。
2.定义
当在关于描述可能有多个附接点的化学基团中使用时,连字符(-)是指明该基团与所定义的变量的附接点。例如,-NRdRe表示此基团的附接点是在氮原子上。
本文中所使用术语“卤代基”及“卤素”是指一选自氟(氟基,F)、氯(氯基,Cl)、溴(溴基,Br)及碘(碘基,I)的原子。
术语“烷基”(单独使用或作为较大基团的一部分,诸如“烷氧基”、“卤代烷基”等)是指饱和的直链或支链单价烃基。除非另有说明,否则烷基通常具有1至6个碳原子,即(C1-C6)烷基。如本文中所使用,“(C1-C6)烷基”基团是指具有以直链或支链排列的1至6个碳原子的基团。
术语“卤代烷基”包含单卤代烷基、多卤代烷基与全卤代烷基,其中该卤素独立地选自氟、氯、溴及碘。
“烷氧基”指经由氧连接原子附接的烷基基团,由“–O-烷基”表示。例如,“(C1-C4)烷氧基”包含甲氧基、乙氧基、丙氧基及丁氧基。
除非另有说明,否则术语“杂芳基”是指包含选自N、O与S的1至4个杂原子的5至12元芳香族基团。在一些例子中,杂芳基中的氮原子可以被季铵化。术语“杂芳基”可与术语“杂芳基环”、“杂芳基基团”或“杂芳香族”交换使用。杂芳基可为单环或双环。单环杂芳基包含(例如)噻吩基、呋喃基、吡咯基、咪唑基、吡唑基、三唑基、四唑基、恶唑基、异恶唑基、恶二唑基、噻唑基、异噻唑基、噻二唑基、吡啶基、哒嗪基、嘧啶基、吡嗪基等。双环杂芳基包含其中单环杂芳基环与一个或多个芳基或杂芳基环稠合的基团。非限制性的实例包含吲哚基、苯并恶唑基、苯并恶二唑基、吲唑基、苯并咪唑基、苯并噻唑基、喹啉基、喹唑啉基、喹恶啉基、吡咯并吡啶基、吡咯并嘧啶基、吡咯并吡啶基、噻吩并吡啶基、噻吩并嘧啶基、吲哚嗪基(indolizinyl)、嘌呤基、萘啶基及喋啶基。应理解的是,在指定时,杂芳基上的可选的取代基可出现于任何可取代位置,包含(例如)连接该杂芳基的位置。
除非另有说明,术语“杂环基”意指包含独立地选自N、O与S的1至4个杂原子的4元至12元饱和或部分不饱和杂环。本文中术语“杂环”、“杂环基”、“杂环基环”、“杂环状基团”、“杂环状部分基团”与“杂环性基团”可交换使用。杂环基环可在产生稳定结构的任何杂原子或碳原子上附接其侧接基团。杂环基可以是单环或双环。单环的饱和或部分不饱和杂环性基团包含(但不限于)四氢呋喃基、四氢噻吩基、四氢吡喃基、吡咯烷基、吡咯烷酮基、哌啶基、恶唑烷基、哌嗪基、二氧杂环己烷基、二氧杂环戊烷基、吗啉基、二氢呋喃基、二氢吡喃基、二氢吡啶基、四氢吡啶基、二氢嘧啶基、四氢嘧啶基、二氢恶二唑基及二氢异恶唑基。双环杂环基基团包含(例如)与另一个不饱和杂环性基团、环烷基、芳基或杂芳基环融合的不饱和杂环性基团,诸如(例如)苯并二氧杂环戊烯基、二氢苯并二氧杂环己烯基、二氢苯并呋喃基等。应理解,当指明时,杂环基上的可选择的取代基可以存在于任何可取代的位置上,包含(例如)附接该杂环基的位置。
某些所公开的化合物可以多种立体异构形式存在。立体异构体为不同之处仅在于其空间排列的化合物。对映异构体为镜像不可重叠的立体异构体对,最常见的原因为其含有作为手性中心的经非对称取代的碳原子。“对映异构体”意指互为镜像且不可重叠的一对分子中的一个。非对映异构体为含有两个或两个以上经非对称取代的碳原子的立体异构体。结构式中的符号“*”表示存在手性碳中心。“R”及“S”表示一个或多个手性碳原子周围的取代基的构型。因此,“R*”及“S*”表示一个或多个手性碳原子周围的取代基的相对构型。
“外消旋体”或“外消旋混合物”意指等摩尔量的两种对映异构体的化合物,其中该混合物未展现光学活性,亦即其不会旋转偏振光的平面。
“几何异构体”意指在与(例如)碳碳双键、肟、肟醚、环烷基环或桥接双环系统有关的取代基原子的定向方面不同的异构体。位于碳碳双键的每一侧上的原子(除了H以外)可以呈E(取代基位于碳碳双键的相对侧)或Z(取代基定向于同一侧)构型。“R”、“S”“S*”、“R*”、“E”、“Z”、“顺”(syn)、“反”(anti)、“顺式”及“反式”指示与核心分子有关的构型。当所公开的化合物由结构命名或描绘而不指示特定几何异构体形式时,应理解该名称或结构涵盖一种几何异构体而无其他几何异构体、几何异构体混合物或含所有几何异构体的混合物。对于“肟”及“肟醚”,可使用指称“Z”或“E”,以及“顺”或“反”。
当仅通过结构绘示时,在肟的N-O键画为实心键的情况下,其表示所描绘几何异构体相对于全部其他异构体的重量纯度为至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%。相对于全部其他异构体的重量纯度百分比为一个异构体的重量与其他异构体的重量比率。同样地,在肟的N-O键的几何异构体被命名时(即E或Z),其表示所命名的几何异构体相对于全部其他异构体的重量纯度为至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%。就所公开的肟而言,波状键
Figure BDA0002263941680000051
是表明该结构涵盖一种几何异构体而无其他几何异构体、几何异构体混合物或含所有几何异构体的混合物。同样地,在肟的N-O键的几何异构体未被命名时,该化合物涵盖一种几何异构体而无其他几何异构体、几何异构体混合物或所有几何异构体的混合物。
本发明的化合物可通过对映特异性合成来制备成个别对映异构体或自对映异构体富集混合物拆分而得。常用拆分技术包含使用光学活性酸形成对映异构体对的每个异构体的游离碱的盐(随后分步结晶并再生游离碱);使用光学活性胺形成对映异构体对的每个对映异构体的酸形式的盐(随后分步结晶并再生游离酸);使用光学纯酸、胺或醇形成对映异构体对的每个对映异构体的酯或酰胺(随后层析分离并去除手性助剂);或使用多种熟知层析方法拆分起始物质或最终产物的对映异构体混合物。此外,该化合物可通过使用常用手性层析技术分离出外消旋混合物而被制备成单个对映异构体。
当所公开的化合物的立体化学由结构命名或描绘时,所命名或描绘的立体异构体相对于所有其他立体异构体的重量纯度为至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%。相对于所有其他立体异构体的重量纯度百分比是为一种立体异构体的重量相对于其他立体异构体的重量的比率。当单一对映异构体由结构命名或描绘时,所描绘或命名的对映异构体的光学重量纯度为至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%。光学重量纯度百分比为对映异构体的重量相对于对映异构体的重量加上其光学异构体的重量的比率。
当所公开的化合物的立体化学由结构命名或描绘,且所命名或描绘的结构涵盖多于一种立体异构体(例如呈非对映异构体对)时,应理解包括所涵盖的立体异构体中之一或所涵盖的立体异构体的任何混合物。进一步应理解,所命名或描绘的立体异构体的立体异构纯度相对于所有其他立体异构体以重量纯度计为至少60%、70%、80%、90%、99%或99.9%。在此情况下通过将由该名称或结构涵盖的立体异构体的混合物的总重量除以所有立体异构体的混合物的总重量来确定立体异构纯度。
当所公开的化合物由结构命名或描绘而不指明立体化学,且化合物具有一个手性中心时,应理解其名称或结构涵盖化合物中的一种对映异构体而无对应光学异构体、化合物的外消旋混合物或相对于其对应光学异构体富集于一种对映异构体的混合物。
当所公开的化合物由结构命名或描绘而未指明立体化学,且(例如)该化合物具有多于一个的手性中心(例如至少两个手性中心)时,应理解其名称或结构涵盖一种立体异构体而无其他立体异构体、立体异构体混合物、或其中相对于其他立体异构体富集于一个或多个立体异构体的立体异构体混合物。例如,该名称或结构可涵盖一种不含有其他非对映异构体的立体异构体、立体异构体的混合物、或其中相对于其他非对映异构体富集于一个或多个非对映异构体的立体异构体混合物。
除非如Int-29、Int-30、实例40及实例41中的R及S符号后面有星号(*),否则本公开中的全部立体异构体都是相对的(即为反式外消旋的)。例如,实例1中的名称硫酸氢“(4R,8S)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯”意指该化合物是反式外消旋的。相反地,实例40中的名称“硫酸氢(4R*,8S*)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯钠”意指在手性中心处的立体化学是绝对的。
除非在诸如Int-29、Int-30、实例40及实例41中画出化合物时其立体中心是由R及S标示,否则本公开中的全部立体异构体都是相对的(即,反式外消旋的)。例如,
Figure BDA0002263941680000061
意指其立体化学是相对的且该化合物是反式外消旋的,而
Figure BDA0002263941680000062
意指其立体化学是绝对的,如4R*,8S*。
除非另有说明,否则本文所述的该化合物的全部互变异构形式皆落入本发明的范围内。
本文中的该化合物可以药学上可接受的盐形式存在。对于用于药物中而言,本发明的化合物的盐是指无毒性的“药学上可接受的盐”。药学上可接受的盐形式包含药学上可接受的酸性/阴离子性盐或碱性/阳离子性盐。
术语“受试者”及“患者”可互换使用,且意指需要治疗的哺乳动物,例如伴侣动物(例如狗、猫等)、家畜(例如牛、猪、马、绵羊、山羊等)及实验动物(例如大鼠、小鼠、天竺鼠等)。通常,该受试者为需要治疗的人类。
术语“抑制”包含生物活性或过程的基线活性降低。
如本文中所使用,术语“治疗”是指逆转、缓解、推迟如本文所述的疾病或病症或其一种或多种症状的发作,或抑制如本文所述的疾病或病症或其一种或多种症状的进展。在一些实施例中,治疗可在已发展一种或多种症状的后施予,亦即治疗性处理。在其他实施例中,治疗可在无症状的情况下施予。例如,治疗可在症状发作的前(例如鉴于症状史和/或鉴于暴露于特定有机体下,或其他易感性因素)被施予易感个体,亦即预防性处理。治疗亦可在症状已解决后继续进行,例如用于预防或推迟其复发。
术语“有效量”或“治疗有效量”包含将引发受试者的例如以下生物或医学反应的本文中所述的化合物的量:与细菌感染有关的酶或蛋白质活性的降低或抑制、细菌感染症状的改善、或细菌感染病程的减缓或推迟。在一些实施例中,用语“有效量”包含本文中所述的化合物在当被施予受试者时,有效达成以下的量:至少部分缓解、抑制和/或改善细菌感染或抑制PBP3,和/或降低或抑制细菌的生长、复制或细菌于受试者中的细菌载量。
术语“药学上可接受的载体”是指不会破坏与其一起配置的化合物的药理学活性的非毒性载体、佐剂或媒介物。可用于本公开的组合物中的药学上可接受的载体、佐剂或媒介物包括(但不限于)适用于药学应用的有机或无机载体、赋形剂或稀释剂。
3.例示性化合物的描述
在第一实施例中,本公开提供式I化合物
Figure BDA0002263941680000071
或其药学上可接受的盐,其中变量如上文所述。
在第二实施例中,Y在式I化合物中为NOR3,且R3及X连同与其连接的原子一起形成4至6元杂环基,该4至6元杂环基可选地经选自(C1-C6)烷基、C=O或C(O)OH中的一个或多个基团取代,其中该(C1-C6)烷基可选地经OH、苯基或5至6元杂芳基取代,其中该5至6元杂芳基可选地经NH2取代,且其中其余变量如上文关于式I所述。可替选地,Y在式I化合物中为NOR3,且R3及X连同与其连接的原子一起形成4,5-二氢-1,2,4-恶二唑或4,5-二氢异恶唑,其每一者可选地经选自(C1-C4)烷基、C=O或C(O)OH中的一个或多个基团取代,其中该(C1-C4)烷基可选地经OH、苯基或噻唑基取代,其中该噻唑基可选地经NH2取代,其中其余变量如上文关于式I所述。
在第三实施例中,Ra、Rb、Rd及Re的所述4至6元环烷基在式I化合物中为环己基且所述Rg的4至6元杂环基为哌嗪基,其中其余变量如上文关于式I或第二实施例所述。
在第四实施例中,式I化合物为式Ia:
Figure BDA0002263941680000081
或其药学上可接受的盐,其中
X为H、CN、C(O)NR1R2、NR1R2或(C1-C6)烷基;
R1及R2各自独立地为氢、氰基、或可选地经一个或多个R7取代的(C1-C6)烷基;
R3为氢或可选地经一个或多个R7取代的(C1-C6)烷基;
R4、R5及R6各自独立地为氢、(C1-C6)烷基或C(O)NRaRb,其中R4、R5及R6的(C1-C6)烷基可选地经一个或多个R7取代,条件是R4及R5中的至少一者不是氢,且条件是当与R4及R5键合的对应氮原子经由双键而与相邻的环原子连接时R4及R5不存在;
各个R7独立地选自卤代基、OH、ORc、(C1-C6)烷氧基、CN、4至6元杂环基、5至6元杂芳基、苯基、C(=NH)NH2、NHC(=NH)NH2、NRdRe、C(O)NRdRe、SO2Rf及S(O)Rf
Ra、Rb、Rd及Re各自独立地为氢、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷氧基、苯基、4至6元杂环基或5至6元杂芳基,其中Ra、Rb、Rd及Re的所述(C1-C6)烷基及(C1-C6)烷氧基中的每一者可选地且独立地经选自NH2、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代,且其中Ra、Rb、Rd及Re的所述苯基、4至6元杂环基及5至6元杂芳基中的每一者可选地且独立地经选自(C1-C6)烷基、NH2、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代;
Rc为可选地经选自C(=NH)NH2、C(=NH)NH(C1-C6)烷基、NHC(=NH)NH2、NRdRe、C(O)NRdRe、SO2Rf及SORf中的一个或多个基团取代的苯基,其中在基团C(=NH)NH(C1-C6)烷基中的所述(C1-C6)烷基可选地经选自NH2、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代;以及
Rf为氢或(C1-C6)烷基。
在第五实施例中,式I化合物为式II:
Figure BDA0002263941680000082
或其药学上可接受的盐,其中变量如上文关于式I或Ia所述。
在第六实施例中,式I化合物为式III:
Figure BDA0002263941680000091
或其药学上可接受的盐,其中变量如上文关于式I或Ia所述。
在第七实施例中,R3在式I、Ia、II或III的任一者中为氢或可选地经胺基取代的(C1-C6)烷基,其中其余变量如上文关于式I或Ia所述。在可替选实施例中,R3在式I、Ia、II或III的任一者中为氢,其中其余变量如上文关于式I或Ia所述。
在第八实施例中,R1在式I、Ia、II或III的任一者中为氢且R2为(C1-C6)烷基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第七实施例所述。在可替选实施例中,R1在式I、Ia、II或III的任一者中为氢且R2为甲基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第七实施例所述。
在第九实施例中,R1及R2在式I、Ia、II或III的任一者中各为(C1-C6)烷基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第七实施例所述。在可替选实施例中,R1及R2在式I、Ia、II或III的任一者中各为甲基,其中变量如上文关于式I或Ia、或第七实施例所述。
在第十实施例中,式I或Ia化合物为式IV或V:
Figure BDA0002263941680000092
或其药学上可接受的盐,其中变量如上文关于式I或Ia、或第七实施例、第八实施例、第九实施例所述。
在第十一实施例中,R6在式I、Ia、II、III、IV或V的任一者中是为氢、-C(O)NRaRb、或可选地经ORc取代的(C1-C6)烷基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第七实施例、第八实施例或第九实施例所述。
在第十二实施例中,Ra在式I、Ia、II、III、IV或V的任一者中是为氢;Rb为可选地经一个或多个(C1-C6)烷基取代的5至6元杂芳基,或可选地经-ORc取代的(C1-C6)烷基;而Rc为可选地经-C(=NH)NH(C1-C6)烷基NH2取代的苯基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第七实施例、第八实施例、第九实施例或第十一实施例所述。在可替选实施例中,Ra在式I、Ia、II、III、IV或V的任一者中是为氢,且Rb为可选地经一个或多个(C1-C6)烷基取代的吡唑基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第七实施例、第八实施例、第九实施例或第十一实施例所述。
在第十三实施例中,式I或Ia化合物为式VI:
Figure BDA0002263941680000101
或其药学上可接受的盐,其中变量如上文关于式I或Ia、或第八实施例或第九实施例所述。
在第十四实施例中,R4在式I、Ia、II、III、IV、V或VI的任一者中是为C(O)NRaRb或可选地经NH2取代的(C1-C6)烷基;Ra为氢;而Rb为可选地经NH2取代的(C1-C6)烷基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第八实施例或第九实施例所述。在可替选实施例中,R4在式I、Ia、II、III、IV、V或VI的任一者中为(C1-C6)烷基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第八实施例或第九实施例所述。在另一可替选实施例中,R4在式I、Ia、II、III、IV、V或VI的任一者中是为甲基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第八实施例或第九实施例所述。
在第十五实施例中,式I或Ia化合物为式VII:
Figure BDA0002263941680000102
或其药学上可接受的盐,其中变量如上文关于式I或Ia、或第八实施例或第九实施例所述。
在第十六实施例中,R5在式I、Ia、II、III、IV、VI或VII的任一者中是为C(O)NRaRb或可选地经NH2取代的(C1-C6)烷基;Ra为氢;而Rb为可选地经NH2取代的(C1-C6)烷基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第八实施例或第九实施例所述。在可替选实施例中,R5在式I、Ia、II、III、IV、VI或VII的任一者中为(C1-C6)烷基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第八实施例或第九实施例所述。在另一可替选实施例中,R5在式I、Ia、II、III、IV、VI或VII的任一者中为甲基,其中其余变量如上文关于式I或Ia、或第八实施例或第九实施例所述。
化合物的特定实例被提供于范例中。药学上可接受的盐及这些化合物的中性形式包含于本文中。
4.用途、制剂及给药
本文中所述的该化合物可用于治疗由革兰氏阴性或非典型细菌中的一种或多种所引起的细菌感染。革兰氏阴性细菌包含(但不限于)流行性感冒嗜血杆菌(Haemophilusinfluenzae)、鲍氏不动杆菌(Acinetobacter baumannii)、伯克霍尔德氏菌属(Burkholderia spp.)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter spp.)、大肠杆菌(Escherichiacoli)、肠内杆菌属(Enterobacter spp.)、绿脓杆菌(Pseudomonas aeruginosa)、克雷白氏菌属(Klebsiella spp.)、嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonas maltophila)、土拉弗朗西斯菌(Francisella tularensis)、耶尔森氏菌属(Yersinia spp.)、沙门氏菌属(Salmonella spp.)、志贺氏菌属(Shigella spp.)、军团杆菌属(Legionella spp.)及淋病双球菌(Neisseria gonorrhoeae)。非典型细菌包含(但不限于)肺炎支原体(Mycoplasmapneumoniae)、肺炎衣原体(Chlamydophila pneumoniae)、嗜肺军团杆菌(Legionellapneumophila)。
在一些方面,细菌对除本文中所述的该化合物外的一种或多种抗细菌剂具有抗性。用语“抗性”及“抗细菌剂抗性”是指细菌在暴露于一种或多种抗细菌剂的情况下能够存活。在一个方面,本文中所述的该化合物可用于治疗由革兰氏阴性细菌或具抗性的革兰氏阴性细菌所引起的细菌感染。在另一方面,本文中所述的该化合物可用于治疗由诸如大肠杆菌、克雷白氏肺炎菌(K.pneumoniae)及不动杆菌属(Acinetobacter spp.)的肠内杆菌科细菌(Enterobacteriaceae)所引起的细菌感染。在又一方面,本文中所述的该化合物可用于治疗由绿脓杆菌(P.aeruginosa)、鲍氏不动杆菌(A.baumannii)或肠内杆菌科细菌、以及抗细菌剂抗性型细菌所引起的细菌感染。在又一方面,本文中所述的该化合物可用于治疗由绿脓杆菌以及抗细菌剂抗性型细菌所引起的细菌感染。例如,革兰氏阴性细菌中的抗性机制包含(但不限于)超广效性β-内酰胺酶表达、金属β-内酰胺酶表达、碳青霉烯酶表达、DNA旋转酶突变、孔蛋白突变、排出系统过度表达、脂多醣改性、以及16S rRNA甲基化酶表达。
在一个方面,由本发明化合物所治疗的细菌感染是由革兰氏阴性细菌所引起。在另一方面,由本发明化合物所治疗的细菌感染是由绿脓杆菌、鲍氏不动杆菌、大肠杆菌或克雷白氏肺炎菌、以及其他肠内杆菌科细菌所引起。在又一方面,由本发明化合物所治疗的细菌感染是由绿脓杆菌所引起。在另一方面,由本发明化合物所治疗的细菌感染是由抗细菌剂抗性革兰氏阴性细菌所引起。在又一方面,由本发明化合物所治疗的细菌感染是由绿脓杆菌的抗细菌剂抗性菌株所引起。在又一方面,由本发明化合物所治疗的细菌感染是由肠内杆菌科细菌所引起。在又一方面,由本发明化合物所治疗的细菌感染是由大肠杆菌、克雷白氏肺炎菌或不动杆菌属细菌所引起。在又一方面,由本发明化合物所治疗的细菌感染是由选自伯克霍尔德氏菌属、炭疽芽孢杆菌(B.anthracis)、鼠疫耶尔森氏菌(Y.pestis)及土拉弗朗西斯菌的病原菌所引起。
由本发明化合物所治疗的细菌感染包含(但不限于)呼吸道(例如肺炎)感染、血流(例如菌血症)感染、心脏(例如心内膜炎)感染、CNS(例如脑膜炎、脑脓疡)感染、耳朵(例如外耳炎)感染、眼睛(例如细菌性角膜炎,眼内炎)感染、胃肠道(腹泻、肠炎、小肠结肠炎)感染、泌尿道感染、皮肤感染、腹腔内感染、院内感染及伤口/烧伤感染。
在一个方面,本文中所述的该化合物抑制盘尼西林结合蛋白3(PBP3)。因此,在一个方面,本公开提供一种抑制细菌PBP3的方法,包括向一有需要的受试者施予本文中所述的化合物中的一种或多种,或其药学上可接受的盐。
在另一方面,本文中所述的该化合物抑制盘尼西林结合蛋白1(例如PBP1a和/或PBP1b)。因此,在一个方面,本公开提供一种抑制细菌PBP1的方法,包括向一有需要的受试者施予一种或多种本文中所述的化合物,或其药学上可接受的盐。在另一方面,本公开提供一种抑制细菌PBP1(例如PBP1a和/或PBP1b)及细菌PBP3的方法,包括向一有需要的受试者施予本文中所述的化合物中的一种或多种,或其药学上可接受的盐。
又在另一方面,本文中所述的该化合物并非是盘尼西林结合蛋白2(PBP2)的特异性抑制剂。
根据其他方面,本公开提供药学上可接受的组合物,其包括本文中所述的化合物及药学上可接受的载体。这些组合物可用于治疗上述细菌感染中的一种或多种,并抑制PBP3。
本文中所述的组合物可经口给药、非经肠式给药、通过吸入式喷雾给药、局部给药、经直肠给药、经鼻给药、经颊给药、经阴道给药或经由植入式储器给药。本文中所使用术语“非经肠式”包含皮下注射或输注技术、静脉内注射或输注技术、肌肉内注射或输注技术、关节内注射或输注技术、滑膜内注射或输注技术、胸骨内注射或输注技术、鞘内注射或输注技术、肝内注射或输注技术、病灶内注射或输注技术与颅内注射或输注技术。液体剂型、注射用制剂、固体分散型以及用于局部或经皮施予化合物的剂型包含在本文中。
可与载体材料组合而产生单一剂型组合物的所提供的化合物的用量将根据要治疗患者与特定给药模式而改变。
也应理解,用于任何特定患者的特定剂量及治疗方案将取决于各种因素,包含年龄、体重、总体健康、性别、饮食、给药时间、排泄速率、药物组合、治疗医师的判断及所治疗的特定疾病的严重性。该组合物中的所提供的化合物的量也将视该组合物中的特定化合物而定。
范例
如下列实例中所示,在某些例示性实施例中,化合物根据下列一般过程制备。应了解,尽管该一般方法示出了本文中某些化合物的合成,但下列该一般方法及本领域普通技术人员已知的其他方法可应用于所有化合物以及这些化合物中的每一者的子类及种类,如本文中所述。
方案1
Figure BDA0002263941680000131
Int-1
平行进行两批具有相同规模的以下反应。向3,5-二氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(275g,1.29mol)在甲苯(1.95L)中的混合物添加1,1-二甲氧基-N,N-二甲基-甲胺(247.59mL,1.87mol)。将反应混合物在80℃搅拌0.5小时,接着在50℃搅拌3.5小时。将反应混合物经减压浓缩以得到呈黄色油状物的4-((二甲氨基)亚甲基)-3,5-二氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(692g,99%)。MS:269ES+(C13H20N2O4)。其直接用于下一步骤中。
Int-2
平行进行两批具有相同规模的以下反应。向4-((二甲氨基)亚甲基)-3,5-二氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(346g,1.29mol)的乙醇(1.90L)及甲苯(1.90L)溶液添加甲肼(168.1mL,3.21mol)。将反应混合物在25℃搅拌3小时。将反应混合物经减压浓缩以得到一残余物。将该残余物通过柱层析法(SiO2,DCM/乙酸乙酯=1:0至1:1)纯化以得到呈黄色固体的1-甲基-4-氧代-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(540g,83%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ:1.51-1.43(m,9H);3.85(s,3H);4.14(s,2H);4.73(br s,2H);7.88(s,1H)。
Int-3
将1-甲基-4-氧代-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(50g,0.199mmol)溶解于THF(500mL)中并放置在N2环境下。将反应混合物冷却降至-78℃并添加LDA(2M,397.96mL)。在-78℃搅拌反应混合物40分钟。在1小时期间引入过量的二氧化碳,并接着搁置使混合物回到环境温度并搅拌12小时。通过添加10%H2SO4至pH=2.5以使反应混合物淬灭,并用乙酸乙酯(3×500ml)萃取。将饱和碳酸氢钠水溶液加入到合并的有机层中直至pH>7。分离水相并通过添加柠檬酸溶液(10%)而酸化。接着用乙酸乙酯(4×500mL)对其进行萃取。合并该有机萃取物,使其经无水硫酸钠干燥并减压浓缩以得到呈白色固体的6-(叔丁氧基羰基)-1-甲基-4-氧代-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-羧酸(58g,95%)。其直接用于下一步骤中。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ:1.48(s,9H);4.02(s,3H);4.12(m,1H);4.65-4.52(m,1H);6.16(s,1H);7.90(s,1H)。
Int-4
向6-(叔丁氧基羰基)-1-甲基-4-氧代-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-羧酸(58g,196.42mmol)的DMF(300mL)溶液添加硫酸二甲酯(196.42mL,245.52mmol)并在25℃搅拌2小时。添加碳酸钾(10.86g,78.57mmol)及硫酸二甲酯(196.42mL,39.28mmol)并在25℃搅拌12小时。添加额外的碳酸钾(5.43g,39.28mmol)并再搅拌反应混合物1小时。将水(500mL)加入到反应混合物中,并用DCM(3×500mL)萃取。将合并的有机层经以0.1N HCl(300mL)洗涤,随后用水(300mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,以得到呈黄色油状物的1-甲基-4-氧代-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6,7-二甲酸6-(叔丁酯)7-甲酯(50g,82%)。其直接用于下一步骤中。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ:1.49(s,9H);3.03-2.82(m,1H);3.80(s,3H);4.02(s,3H);4.59(d,J=18.4Hz,1H);6.16(s,1H);7.91(s,1H)。
Int-5
向1-甲基-4-氧代-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6,7-二甲酸6-(叔丁酯)7-甲酯(50g,161.64mmol)的DCM(500mL)溶液添加吡啶(25.57g,323.28mmol)及O-苯甲基羟基胺盐酸盐(25.80g,161.64mmol)。在20℃搅拌反应混合物12小时。添加10%酒石酸(200mL)。将有机层分离并用2%酒石酸(200mL)洗涤。用DCM(500mL)洗涤合并的水层。将合并的有机物用盐水(200mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,以得到呈黄色油状物的(Z)-4-((苯甲氧基)亚胺基)-1-甲基-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6,7-二甲酸6-(叔丁酯)7-甲酯(70g,104%)。其未进一步纯化即直接使用于下一步骤中。
Int-6
在0℃向(Z)-4-((苯甲氧基)亚胺基)-1-甲基-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6,7-二甲酸6-(叔丁酯)7-甲酯(60g,144.77mmol)的MeOH(240mL)溶液添加HCl/二恶烷(4N,36.16mL,144.77mmol)。搅拌反应混合物30分钟。在0-2℃添加硼烷吡啶复合物(13.45g,144.77mmol)并搅拌1.5小时,随后添加HCl/二恶烷(4M,180.96mL,723.84mmol)。在25℃搅拌反应混合物12小时。将HCl(31.67g,868.62mmol)气体鼓泡通过反应混合物。添加乙腈(500mL)并搅拌40分钟。将反应混合物过滤,且将滤饼用乙腈(300mL)洗涤,接着用MTBE(300ml)洗涤。将滤饼溶解在乙酸乙酯(500mL)中并添加饱和碳酸氢钠水溶液以调整到pH>7。用乙酸乙酯(3×500mL)萃取水层。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥及浓缩,以得到呈褐色油状物的4-((苯甲氧基)胺基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-甲酸甲酯(37g,81%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ:2.01-1.70(m,1H);2.88(dd,J=2.8,13.6Hz,1H);3.32(d,J=13.4Hz,1H);3.76(s,3H);3.82-3.78(m,3H);3.94(br s,1H);4.56(s,1H);4.70(s,2H);7.38-7.25(m,5H);7.42(s,1H)。
Int-7
平行进行两批具有相同规模的以下反应。在0℃向4-((苯甲氧基)胺基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-甲酸甲酯(18.5g,58.48mmol)及三甲胺(130.4mL,935.68mmol)的THF(360mL)溶液添加三光气(6.94g,23.39mmol)的THF(80mL)溶液。在0℃搅拌该混合物并使其升温至25℃历时12小时。将反应混合物过滤,将滤饼溶解在DCM(200mL)中并用1N HCl溶液调整至pH<7,接着用DCM(3×200mL)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(12.00g)。将反应混合物滤液浓缩且将残余物通过柱层析法(SiO2,石油醚/乙酸乙酯/DCM=5/1/0至1/1/0.5)纯化,以得到呈白色固体的另外的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(13.00g)。合并这两批次(25.00g,62%)并直接使用于下一步骤中。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ:3.23(d,J=11.2Hz,1H);3.43(dd,J=2.9,11.5Hz,1H);3.77(s,3H);3.86(s,3H);3.98(d,J=2.4Hz,1H);4.86(d,J=11.8Hz,1H);5.04-4.95(m,1H);5.21(s,1H);7.48-7.32(m,6H)。
Int-8
在-10℃将氢硼化锂(2N于THF中,146.04mL,292.1mmol)溶液添加至(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(20g,58.42mmol)的甲醇(960mL)及THF(480mL)溶液中。在-5℃搅拌所得混合物1.5小时。接着用饱和氯化铵水溶液使其淬灭。将大部分的溶剂于减压环境下除去。将粗制材料再溶解于DCM(1000mL)中,并添加水(500mL)。将有机层分离,并经无水硫酸钠干燥及浓缩。用乙酸乙酯湿磨所得残余物以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(羟甲基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(12.5g,68%)。其直接用于下一步骤中。MS:315ES+(C17H18N4O4)。
Int-9
在环境温度向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(羟甲基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(12.36g,39.36mmol)的二氯甲烷(500mL)溶液添加戴斯-马丁过碘烷(Dess-Martin periodinane,20.06g,47.23mmol)。搅拌反应混合物1小时。将硫代硫酸钠水溶液(1N,300mL)及饱和碳酸氢钠水溶液(200mL)加入到反应混合物中并搅拌15分钟。将该双相混合物分离并用二氯甲烷(500mL)萃取水层。将合并的有机层经无水硫酸镁干燥,过滤及浓缩,以得到粗产物。以急骤层析法(120g硅胶,0%-100%乙酸乙酯/己烷)得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛(9.72g,79%)。MS:313ES+(C16H16N4O3)。
Int-10
在环境温度向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛(8.62g,27.6mmol)的吡啶(120mL)溶液添加羟基胺盐酸盐(2.11g,30.36mmol)。搅拌反应混合物20分钟。添加氯化铵水溶液(500mL)及乙酸乙酯(500mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥并浓缩,以得到呈白色固体的(E)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛肟(9.03g,99%)。其直接用于下一步骤中。MS:328ES+(C16H17N5O3)。
Int-11
在室温向(E)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛肟(9.03g,27.6mmol)的DMF(300mL)溶液添加N-氯琥珀酰亚胺(4.05g,30.36mmol)。在40℃搅拌反应混合物2小时,接着搁置在环境温度过夜。添加冰水(500mL)及乙酸乙酯(500mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥并浓缩,以得到呈浅黄色固体的(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氯(carbimidoyl chloride)(9.98g,99%)。其直接用于下一步骤中。MS:362ES+(C16H16ClN5O3)。
Int-12
在室温向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氯(9.98g,27.6mmol)的DCM(360mL)溶液添加甲胺(2N于THF中,2.02mL,56.05mmol)。在环境温度搅拌反应混合物30分钟。添加饱和氯化铵水溶液(300mL)及DCM(200mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥并浓缩,以得到粗产物。用DCM与丙酮混合物湿磨所得粗产物并过滤,以得到呈白色固体的(Z)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(7.27g,74%)。其直接用于下一步骤中。MS:357ES+(C17H20N6O3)。
Int-13
在室温向(Z)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(6.88g,19.31mmol)的DCM(500mL)溶液添加三氟甲磺酸叔丁基二甲基硅基酯(4.88mL,21.24mmol)及2,6-二甲基吡啶(2.7mL,23.17mmol)。在30℃搅拌反应混合物2小时。添加DCM(300mL)及饱和氯化铵水溶液(300mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥并浓缩,以得到粗产物。用己烷与乙酸乙酯混合物湿磨粗产物并过滤,以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(9.17g,99%)。MS:471ES+(C23H34N6O3Si)。
Int-14
将(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(1.3g,2.76mmol)的MeOH(60mL)与乙酸乙酯(150mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(294mg,0.28mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌1小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-5-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(1.02g,97%)。MS:381ES+(C16H28N6O3Si)。
Int-15
在环境温度向(4R,8S,Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-5-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(400mg,1.05mmol)的吡啶(pyr)(20mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(SO3.Py)(1338mg,8.41mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着减压浓缩以得到粗产物。将材料在短硅胶垫上纯化,用己烷(100mL)洗脱,随后用乙酸乙酯/己烷(1:1,100mL)、乙酸乙酯(100mL)及丙酮(200mL)洗脱。将含有产物的级分汇集并浓缩,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(400mg,83%)。MS:461ES+(C16H28N6O6SSi)。
Int-16
在室温向硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(130mg,0.28mmol)的乙酸乙酯(15mL)溶液添加HF.吡啶(0.01mL,0.31mmol)。将反应混合物搅拌2小时,接着进行浓缩。将所得固体通过逆相层析法(Sepabeads,100%水)纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯的吡啶盐(71mg,59%)。MS:345ES-(C10H14N6O6S)。
实例1
Figure BDA0002263941680000181
将硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯的吡啶盐(71mg,0.17mmol)溶解于水(2mL)中,并通过
Figure BDA0002263941680000182
50WX8Na+型离子交换树酯滤筒且用水作为洗脱液进行洗脱。将含有产物的级分汇集并冷冻干燥,以得到呈白色固体的硫酸(4R,8S)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯钠(55mg,88%)。MS:345ES-(C10H14N6O6S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.08(s,3H);3.46(m,1H);3.57(m,1H);3.61(s,3H);4.92(m,1H);5.75(s,1H);7.60(s,1H)。
实例2
Figure BDA0002263941680000183
硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-羟基-N,N-二甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯通过按照如实例1所示相似的反应顺序,使用步骤12中的二甲胺的THF溶液而合成。实例2如在步骤16中的游离硫酸酯那样进行纯化及获得。MS:359ES-(C11H16N6O6S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.01(s,6H);3.49(m,2H);3.60(s,3H);4.90(m,1H);5.64(s,1H);7.57(s,1H)。
实例3
Figure BDA0002263941680000184
硫酸(4R,8S)-8-((Z)-N'-羟基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯钠通过按照如实例1所示相似的反应顺序,使用步骤12中的氨的THF溶液合成。MS:331ES-(C9H12N6O6S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.17(m,2H);3.64(s,1H);4.96(m,1H);5.38(s,1H);7.59(s,1H)。
方案2
Figure BDA0002263941680000191
Int-17
在0℃向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-12,15mg,0.042mmol)的DMF(2mL)溶液添加NaH(2.53mg,0.063mmol,60%)。在0℃搅拌反应混合物10分钟后,并添加甲基碘(MeI)(7.17mg,0.050mmol)。接着使其升温至室温并在室温搅拌10分钟。添加乙酸乙酯及饱和氯化铵溶液。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%的丙酮的DCM溶液)将其纯化以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N’-甲氧基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(8mg,产率51.3%)。MS:371ES+(C18H22N6O3)。
Int-18
将(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N’-甲氧基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-17,8mg,0.0216mmol)的MeOH(3mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(4.58mg,0.0043mmol)。将将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛下于室温中搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-5-羟基-N’-甲氧基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(4.5mg,74.3%)。MS:281ES+(C11H16N6O3)。
实例4
Figure BDA0002263941680000192
在室温向(4R,8S,Z)-5-羟基-N’-甲氧基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-18,4.5mg,0.016mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(25.5mg,0.16mmol)。搅拌反应混合物16小时,接着减压浓缩以得到粗产物。用DCM湿磨粗产物并过滤以除去固体。将滤液是通过逆相层析法(Sepabeads,12g,ACN/水0-50%)浓缩及纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N’-甲氧基-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(2.2mg,30.4%)。MS:359ES-(C11H16N6O6S)1H NMR(300MHz,D2O-d2)δ:3.07(s,3H);3.52-3.66(m,2H);3.69(m,6H);4.96(s,1H);5.73(s,1H);7.64(s,1H)。
另外的实例的分析数据
实例6及实例7通过按照如实例4所示相似的合成顺序而合成。表1中的其他实例以与方案1相似的方法,使用本领域技术人员容易知道的相似反应而合成。全部的化合物被分离为反式外消旋的。
表1
Figure BDA0002263941680000201
Figure BDA0002263941680000211
方案3
Figure BDA0002263941680000221
Int-19及Int 20
在室温向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-12,229mg,0.64mmol)的DCE(15mL)溶液添加DIEA(0.11mL,0.64mmol)及(4-硝基苯基)氯甲酸酯(129.52mg,0.64mmol)。在室温搅拌反应混合物2小时,以得到溶液(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N,1-二甲基-N'-(((4-硝基苯氧基)羰基)氧基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int 19)。
在室温向上述Int-19的溶液添加DIEA(0.11mL,0.64mmol)及氨的THF溶液(0.64mL,0.64mmol)。在室温搅拌反应混合物1小时。将溶剂去除以得到粗产物。将粗产物经急骤层析法(20g硅胶,0%-100%乙酸乙酯/己烷)纯化,以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-(氨基甲酰基氧基)-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(87mg,34%)。MS:400ES+(C18H21N7O4)。
Int-21
将(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-(氨基甲酰基氧基)-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-20,87mg,0.22mmol)的丙酮(10mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(23mg,0.022mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的((4R,8S,Z)-N'-(氨基甲酰基氧基)-5-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(66mg,67%)。MS:310ES+(C11H15N7O4)。
实例14
在环境温度向((4R,8S,Z)-N'-(氨基甲酰基氧基)-5-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-21,66mg,0.21mmol)的吡啶(5mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(271mg,1.71mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着减压浓缩以得到粗产物。将该粗产物在短硅胶垫上纯化,用己烷(50mL)洗脱,随后用乙酸乙酯/己烷(1:1,50mL)、乙酸乙酯(50mL)及丙酮(100mL)洗脱,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-(氨基甲酰基氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯吡啶鎓(13mg,14%)。MS:388ES-(C11H15N7O7S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.57–3.63(m,5H);4.90(m,1H);5.72(m,1H);7.58(s,1H);8.01(m,2H);8.58(m,1H);8.74(m,2H)化合物/吡啶比率(1:1)。
另外的实例的分析数据
表2中的全部化合物是根据方案3或使用本领域技术人员容易知道的相似反应而合成。全部的化合物被分离为反式外消旋的。
表2
Figure BDA0002263941680000232
Figure BDA0002263941680000241
Figure BDA0002263941680000251
Figure BDA0002263941680000261
Figure BDA0002263941680000271
Figure BDA0002263941680000281
方案4
Figure BDA0002263941680000282
Int-22
在室温向(E)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛肟(Int-10,88mg,0.27mmol)的氯仿(10mL)溶液添加NCS(52mg,0.30mmol)及吡啶(0.02mL,0.27mmol)。在40℃将其搅拌1小时并冷却至室温。添加丙-2-烯酸叔丁酯(0.04mL,0.30mmol)及DIEA(0.06mL,0.32mmol),并在室温搅拌30分钟。添加DCM(10mL)及饱和氯化铵溶液(10mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥并浓缩以得到粗产物。通过急骤层析法(12g硅胶,0-100%EtOAc的己烷溶液)将其纯化以得到呈白色固体的3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4,5-二氢异恶唑-5-甲酸叔丁酯(51mg,41%)。MS:454ES+(C23H27N5O5)。
Int-23
将3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4,5-二氢异恶唑-5-甲酸叔丁酯(Int-22,41mg,0.094mmol)的丙酮(10mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(1mg,0.001mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的3-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4,5-二氢异恶唑-5-甲酸叔丁酯(32mg,97%)。MS:364ES+(C16H21N5O5)。
Int-24
在环境温度向3-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4,5-二氢异恶唑-5-甲酸叔丁酯(Int-23,32mg,0.088mmol)的吡啶(5mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(112mg,0.70mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着减压浓缩以得到粗产物。通过逆相层析法(Sepabeads,20g,乙腈/水=0/100至1/5)将其纯化,以得到呈白色固体的3-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4,5-二氢异恶唑-5-甲酸叔丁酯(17mg,43%)。MS:442ES-(C16H21N5O8S)。
实例35
Figure BDA0002263941680000291
在0℃向3-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4,5-二氢异恶唑-5-甲酸叔丁酯(Int-24,17mg,0.038mmol)的DCM(1mL)溶液添加TFA(1mL,13.05mmol)。在0℃搅拌反应混合物2小时。将溶剂去除以得到粗产物。将其溶解于水中并通过逆相层析法(Sepabeads,12g,100%水)纯化,以得到呈白色固体的3-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4,5-二氢异恶唑-5-羧酸(12mg,64%)。MS:386ES-(C12H13N5O8S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.26–3.34(m,2H);2.52–3.68(m,5H);4,72(m,1H);4.85–5.02(m,1H);5.55(m,1H);7.53(s,1H)。
另外的实例的分析数据
表3中的全部化合物根据方案4或使用本领域技术人员容易知道的相似反应而合成。全部的化合物被分离为反式外消旋的。
表3
Figure BDA0002263941680000301
方案5
Figure BDA0002263941680000302
Int-25
在-10℃向3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4,5-二氢异恶唑-5-甲酸叔丁酯(Int-22,90mg,0.198mmol)的MeOH(3mL)及THF(6mL)溶液添加LiBH4(5.94mL,5.94mmol)的THF(1N)溶液。在-10℃搅拌反应混合物2小时。添加DCM(50mL)及饱和氯化铵溶液(50mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥并浓缩,以得到粗产物。通过急骤层析法(12g硅胶,0-100%EtOAc的己烷溶液)将其纯化以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(5-(羟甲基)-4,5-二氢异恶唑-3-基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(40mg,52%)。MS:384ES+(C19H21N5O4)。
Int 26
在室温向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(5-(羟甲基)-4,5-二氢异恶唑-3-基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-25,40mg,0.10mmol)的DCM(10mL)溶液添加2,6-二甲基吡啶(0.01mL,0.13mmol)及三氟甲磺酸叔丁基二甲基硅基酯(0.03mL,0.11mmol)。在35℃搅拌反应混合物2小时。添加DCM(10mL)及饱和氯化铵溶液(10mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥并浓缩以得到粗产物。通过急骤层析法(12g硅胶,0-100%EtOAc的己烷溶液)将其纯化以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(5-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)甲基)-4,5-二氢异恶唑-3-基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(50mg,96%)。MS:498ES+(C25H35N5O4Si)。
Int 27
将(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(5-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)甲基)-4,5-二氢异恶唑-3-基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-26,50mg,0.10mmol)的丙酮(10mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(1mg,0.001mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的(4R,8S)-8-(5-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)甲基)-4,5-二氢异恶唑-3-基)-5-羟基-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(40mg,97%)。MS:408ES+(C18H29N5O4Si)。
Int-28
在环境温度向(4R,8S)-8-(5-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)甲基)-4,5-二氢异恶唑-3-基)-5-羟基-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-27,40mg,0.098mmol)的吡啶(5mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(125mg,0.785mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着减压浓缩以得到粗产物。通过急骤层析法(硅胶,4g,0-100%EtOAc的己烷溶液)将其纯化以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-(5-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)甲基)-4,5-二氢异恶唑-3-基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(5mg,10%)。MS:486ES-(C18H29N5O7SiS)。
实例38
在环境温度向硫酸氢(4R,8S)-8-(5-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)甲基)-4,5-二氢异恶唑-3-基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-28,5mg,0.0103mmol)的乙酸乙酯(2mL)及THF(1mL)溶液添加HF.吡啶(0.001mL,0.09mmol)。搅拌反应混合物2小时,接着进行浓缩。将所得固体溶解于水中,并通过逆相层析法(Sepabeads,4g,100%水)纯化以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-(5-(羟甲基)-4,5-二氢异恶唑-3-基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(0.8mg,19%)。MS:372ES-(C12H15N5O7S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:(300MHz,D2O)δ:3.25–3.30(m,3H);3.59–3.65(m,5H);3.62–3.79(m,1H);4.93(m,2H);5.60(m,1H);7.60(s,1H);7.98(m,1H);8.48(m,0.5H);8.72(m,1H)化合物/吡啶比率(2:1)。
实例39
Figure BDA0002263941680000322
硫酸氢(4R,8S)-8-(5-(羟甲基)-4-甲基-4,5-二氢异恶唑-3-基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯吡啶鎓通过按照如实例38所示相似的反应顺序,使用方案4的步骤1中的(E)-丁-2-烯酸甲酯及KF.2H2O而合成。MS:386ES-(C13H17N5O7S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:1.42(d,3H);3.25(m,1H);3.56(m,1H);3.60(m,2H);3.65(s,3H);3.81(m,1H);4.50(m,1H);4.93(m,1H);5.65(m,1H);7.61(s,1H);8.04(m,2H);8.61(m,1H);8.77(m,2H)化合物/吡啶比率(1:1)。
方案6
Figure BDA0002263941680000323
Int-29及Int-30
通过SFC使用Chiralpak AD-H柱(以25%异丙醇为CO2共溶剂,条件为75g/min、系统压力120巴、柱温度为25℃)而分离出反式外消旋的(Z)-5-(苯甲氧基)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-13,8g),以得到以下各物:
Int-29:(4R*,8S*,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(手性,3.06g,34%)。MS:471ES+(C23H34N6O3Si)1H NMR(300MHz,MeOD)δ:0.01(s,6H);0.81(s,9H);3.07(s,3H);3.32(m,1H);3.47(m,1H);3.62(s,3H);4.31(m,1H);4.95(m,2H);5.48(m,1H);7.35-7.44(m,6H).ee>99%。
Int-30:(4S*,8R*,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(手性,2.38g,26%)。MS:471ES+(C23H34N6O3Si)1H NMR(300MHz,MeOD)δ:0.01(s,6H);0.81(s,9H);3.07(s,3H);3.32(m,1H);3.47(m,1H);3.62(s,3H);4.31(m,1H);4.95(m,2H);5.48(m,1H);7.35-7.44(m,6H).ee>99%。
实例40
硫酸氢(4R*,8S*)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯钠(手性)通过按照如实例1所示相似的反应顺序,使用方案1步骤14中的Int-29而合成。MS:345ES-(C10H14N6O6S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.08(s,3H);3.52(m,2H);3.61(s,3H);4.93(m,1H);5.69(s,1H);7.60(s,1H)。绝对立体化学通过结晶学确认。
实例41
Figure BDA0002263941680000332
硫酸氢(4S*,8R*)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯钠(手性)通过按照如实例1所示相似的反应顺序,使用方案1步骤14中的Int-30而合成。MS:345ES-(C10H14N6O6S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.05(s,3H);3.52(m,2H);3.60(s,3H);4.92(m,1H);5.68(s,1H);7.58(s,1H)。
实例42
Figure BDA0002263941680000341
在0℃向硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-(((2-氨基乙基)氨基甲酰基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(实例18,8.3mg,0.0192mmol)的吡啶(0.5mL)溶液添加异氰酸三甲基硅基酯(2.35mg,0.0192mmol)。在0℃搅拌反应混合物2小时。将溶剂去除以得到粗产物。将其溶解于水中并通过逆相层析法(Sepabeads,4g,100%水)纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-甲基-8-((Z)-N-甲基-N'-(((2-脲基乙基)氨基甲酰基)氧基)甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(2mg,19%)。MS:474ES-(C14H21N9O8S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.05(s,3H);3.14(m,4H);3.57(m,2H);3.63(s,3H);4.90(m,1H);5.72(m,1H);7.59(s,1H)。
实例43
Figure BDA0002263941680000342
实例43通过按照如实例42中的相似反应条件而合成。取硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-(((2-氨基乙基)氨基甲酰基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(实例18,8.3mg,0.0192mmol)作为底物,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N-氨基甲酰基-N-甲基-N'-(((2-脲基乙基)氨基甲酰基)氧基)甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(0.7mg,6%)。MS:517ES-(C15H22N10O9S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.05(s,3H);3.24(m,4H);3.56(m,2H);3.62(s,3H);4.90(m,1H);5.71(m,1H);7.58(s,1H)。
实例44
Figure BDA0002263941680000343
实例44通过按照如实例42中的相似反应条件而合成。取硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-(((2-氨基乙基)氨基甲酰基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(实例18,8mg,0.0185mmol)作为底物,且用乙酰氯(0.001mL,0.0185mmol)作为试剂,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-(((2-乙酰胺基乙基)氨基甲酰基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(4mg,41%)。MS:473ES-(C15H22N8O8S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:1.88(s,3H);3.05(2,3H);3.19(m,4H);3.57(m,2H);3.62(s,3H);4.90(m,1H);5.71(m,1H);7.59(s,1H);8.01(m,1H);8.55(m,0.5H);8.72(m,1H)化合物/吡啶比率(2:1)。
实例45
Figure BDA0002263941680000351
在0℃向硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-(((4-氨基丁基)氨基甲酰基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-19,70mg,0.125mmol)的DCM(10mL)溶液添加TFA(0.956mL,12.48mmol)。在0℃搅拌反应混合物2小时。将溶剂去除。将残余物溶解于水中并通过逆相层析法(40g Sepabeads,100%水)纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-甲基-8-((Z)-N-甲基-N'-(((4-(2,2,2-三氟乙酰胺基)丁基)氨基甲酰基)氧基)甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(48mg,59%)。MS:555ES-(C17H23F3N8O8S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:1.47(m,4H);3.05–3.25(m,7H);3.57–3.69(m,5H);4.95(m,1H);5.75(m,1H);7.59(s,1H)。
方案7
Figure BDA0002263941680000352
Int-31
在10分钟的过程内于0℃向叔丁醇(1.9mL,20mmol)的DCM(12mL)搅拌溶液逐滴添加异氰酸氯磺酰酯(1.4mL,15mmol)。在0℃搅拌5分钟的后,使反应混合物升温至室温并搅拌20分钟。将将其真空浓缩至三分之一体积。将烧瓶放回到0℃浴中,使产物从溶液中结晶出来。在50分钟的后,过滤产物并用己烷(20mL)洗涤,以得到呈白色固体的(氯磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(1.41g,40%)。将其立即用于下一步骤中。
Int-32
在0℃向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-12,248mg,0.696mmol)的DCM(30mL)搅拌溶液添加(氯磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(Int-31,225mg,1.044mmol),随后添加DIEA(0.36mL,2.09mmol)。在0℃搅拌反应混合物16小时。将饱和氯化铵水溶液(20mL)及DCM(20mL)添加至反应混合物中。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。将粗产物经急骤层析法(4g,0-100%EtOAc的己烷溶液)纯化,以得到呈白色固体的(((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(88mg,24%)。MS:536ES+(C22H29N7O7S)。
Int-33
将(((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(Int-32,88mg,0.164mmol)的丙酮(20mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(1.7mg,0.0016mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的(((((Z)-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(60mg,82%)。MS:446ES+(C15H23N7O7S)。
Int-34
在环境温度向(((((Z)-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(Int-33,60mg,0.135mmol)的吡啶(10mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(172mg,1.078mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着减压浓缩以得到粗产物。将粗产物经急骤层析法(硅胶,4g,0-100%EtOAc的己烷溶液,接着用丙酮)纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-((N-(叔丁氧基羰基)胺磺酰基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(70mg,99%)。MS:524ES-(C15H23N7O10S2)。
实例46
Figure BDA0002263941680000371
在0℃向硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-((N-(叔丁氧基羰基)胺磺酰基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-34,50mg,0.095mmol)的DCM(0.5mL)搅拌溶液添加TFA(2.7mL,36.3mmol)。在0℃搅拌反应混合物2小时。将溶剂去除以得到粗产物。将其溶解于水中并通过逆相层析法(Sepabeads,12g,100%水)纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-甲基-8-((Z)-N-甲基-N'-(胺磺酰基氧基)甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(8mg,17%)。MS:424ES-(C10H15N7O8S2)1H NMR(300MHz,D2O)δ:(300MHz,D2O)δ:3.14(s,3H);3.65–3.76(m,5H);4.98(m,1H);5.85(m,1H);7.67(s,1H);8.11(m,,4H);8.63(m,2H);8.82(m,4H)化合物/吡啶/TFA比率(1:2:1)。
方案8
Figure BDA0002263941680000372
Int-35
在2000mL圆底烧瓶中装填4-[(二甲氨基)亚甲基]-3,5-二氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(Int-1,170g,633.60mmol)及乙醇(675mL)。添加2-肼基乙-1-醇(48g,630.77mmol)。在室温将所得的反应混合物搅拌过夜。将其真空浓缩。用乙酸乙酯(2000mL)稀释残余物,并用盐水(2×500mL)洗涤。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥,并真空浓缩以得到粗产物。将其施加于硅胶柱上并用乙酸乙酯/石油醚洗脱,以得到呈浅黄色油状物的1-(2-羟乙基)-4-氧代-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(95g,53%)。MS:282ES+(C13H19N3O4)。
Int-36
在0℃于2000-mL圆底烧瓶中装填1-(2-羟乙基)-4-氧代-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(Int-35,95g,337.71mmol)、咪唑(46g,676.47mmol)及DCM(1000mL)。逐滴添加叔丁基(氯)二甲基硅烷(66g,437.89mmol)的DCM(100mL)溶液。在室温将反应混合物搅拌过夜。用盐水(2×500mL)洗涤所得混合物。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加于硅胶柱上并用乙酸乙酯/石油醚洗脱,以得到呈白色固体的1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4-氧代-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(130g,97%)。MS:396ES+(C19H33N3O4Si)。
Int-37
在0℃在2000-mL圆底烧瓶中装填1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4-氧代-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(Int-36,73g,184.54mmol)、MeOH(365mL)及THF(730mL)。添加NaBH4(7g,185mmol)。在0℃将所得的反应混合物搅拌2小时。接着通过添加水(1000mL)以使其淬灭。用EtOAc(3×1000mL)萃取所得溶液。将合并的有机层用盐水(2×500mL)洗涤、分离、经无水硫酸钠干燥并真空浓缩,以得到呈浅黄色油状物的1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4-羟基-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(77.5g,定量产率)。MS:398ES+(C19H35N3O4Si)。
Int-38
在0℃在2000-mL圆底烧瓶中装填1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4-羟基-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(Int-37,51g,128mmol)、N-(苯甲氧基)-2-硝基苯-1-磺胺(59g,191mmol)、PPh3(67g,255mmol)及THF(1000mL)。逐滴添加DIAD(52g,255mmol)的THF(100mL)溶液。在室温将所得的反应混合物搅拌过夜并真空浓缩。将残余物施加于硅胶柱上并用乙酸乙酯/石油醚洗脱,以得到呈浅黄色油状物的4-((N-(苯甲氧基)-4-硝基苯基)磺酰胺基)-1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(68g,77%)。MS:688ES+(C32H45N5O8SSi)。
Int-39
在2000-mL圆底烧瓶中装填4-((N-(苯甲氧基)-4-硝基苯基)磺酰胺基)-1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(Int-38,68g,98.85mmol)、DCM(680mL)及ZnBr2(67g,296.55mmol)。在室温将反应混合物搅拌2天。将固体过滤出。接着通过添加饱和氯化铵水溶液(500mL)以使反应淬灭,并用DCM(3×500mL)萃取。将有机层合并,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施于硅胶柱上并用乙酸乙酯/石油醚洗脱,以得到呈浅黄色油状物的N-(苯甲氧基)-N-(1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-4-基)-4-硝基苯磺胺(55g,94.7%)。MS:588ES+(C27H37N5O6SSi)。
Int-40
在0℃于2000-mL圆底烧瓶中装填N-(苯甲氧基)-N-(1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-4-基)-4-硝基苯磺胺(Int-39,53g,90.17mmol)及DCM(530mL)。添加NCS(15.7g,117.22mmol)。在室温将反应混合物搅拌1.5小时并接着冷却至0℃。添加DBU(20.6g,135.25mmol),使反应混合物升温至室温并另外搅拌3小时。所得溶液未进一步纯化即直接使用于下一步骤中。MS:586ES+(C27H35N5O6SSi)。
Int-41
将TMSCN(35.7g,360.7mmol)添加至N-(苯甲氧基)-N-(1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4,5-二氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-4-基)-4-硝基苯磺胺(Int-40)中。在室温将反应混合物搅拌过夜。用饱和碳酸氢钠水溶液(500mL)将其稀释,并用DCM(2×500mL)萃取。将有机萃取物合并,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施于硅胶柱上并用乙酸乙酯/石油醚洗脱,以得到呈浅褐色油状物的N-(苯甲氧基)-N-(1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-7-氰基-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-4-基)-4-硝基苯磺胺(46g,83%)。MS:613ES+(C28H36N6O6SSi)。
Int-42
在0℃于1000-mL圆底烧瓶中装填N-(苯甲氧基)-N-(1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-7-氰基-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-4-基)-4-硝基苯磺胺(Int-41,44.7g,72.95mmol)及甲醇(450mL)。逐滴添加乙酰氯(148g,1896mmol)。在室温将所得的反应混合物搅拌1小时,接着在55℃搅拌2小时。将其冷却至室温。用饱和碳酸氢钠水溶液将反应混合物的pH值调整到9,并用乙酸乙酯(3×50mL)萃取。将有机萃取物合并,经无水硫酸钠干燥,并真空浓缩以得到呈褐色油状物的4-((N-(苯甲氧基)-4-硝基苯基)磺酰胺基)-1-(2-羟乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-甲酸甲酯(38g,98%)。MS:532ES+(C23H25N5O8S)。
Int-43
在0℃于1000-mL圆底烧瓶中装填4-((N-(苯甲氧基)-4-硝基苯基)磺酰胺基)-1-(2-羟乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-甲酸甲酯(Int-42,38g,71.49mmol)、DCM(380mL)及咪唑(9.7g,142.98mmol)。逐滴添加TBSCl(14g,92.94mmol)的DCM(50mL)溶液。在室温将所得的反应混合物搅拌过夜。将其用盐水(2×500mL)洗涤。将有机萃取物经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施于硅胶柱上并用乙酸乙酯/石油醚洗脱,以得到呈黄色油状物的4-((N-(苯甲氧基)-4-硝基苯基)磺酰胺基)-1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-甲酸甲酯(39g,85%)。MS:646ES+(C29H39N5O8SSi)。
Int-44
于250mL圆底烧瓶中装填4-((N-(苯甲氧基)-4-硝基苯基)磺酰胺基)-1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-甲酸甲酯(Int-43,10g,15.48mmol))、DMF(100mL)、硫代羟基乙酸(3.56g,30.96mmol)及LiOH(1.86g,77.40mmol)。在室温搅拌反应混合物1小时,并用EtOAc(200mL)稀释。将其用盐水(200mL)洗涤。用EtOAc(100mL)萃取水层,并合并有机层。将有机萃取物用盐水(5×100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施于硅胶柱上并用乙酸乙酯/石油醚洗脱,以得到呈黄色油状物的4-((苯甲氧基)氨基)-1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-甲酸甲酯(5.4g,76%)。MS:461ES+(C23H36N4O4Si)。
Int-45
在0℃于2000-mL圆底烧瓶中装填4-((苯甲氧基)氨基)-1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-甲酸甲酯(Int-44,27g,58.61mmol)、乙腈(540mL)及DIEA(30g,234.44mmol)。将三光气(7g,23.44mmol)的乙腈(100mL)溶液逐滴添加至反应混合物中并搅拌2小时,随后添加4-二甲氨基吡啶(1.4g,11.72mmol)。在室温将所得的反应混合物搅拌过夜,并真空浓缩。用EtOAc(500mL)稀释并用盐水洗涤(2×100mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。将粗产物施于硅胶柱上,并用乙酸乙酯/石油醚洗脱,以得到(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(16g,56%)。MS:487ES+(C24H34N4O5Si)。
方案9
Figure BDA0002263941680000401
Int 46
于250-mL圆底烧瓶中装填(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氧基)乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-45,3820mg,7.85mmol)、HF.吡啶(HF.Py)(0.32mL,8.63mmol)及EtOAc(100mL)。在室温搅拌反应混合物3小时。添加饱和氯化铵水溶液(100mL)及EtOAc(100mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。用EtOAc(20mL)将其湿磨。将沉淀物过滤并用EtOAc(5mL)洗涤,以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-羟乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(2724mg,93%)。MS:373ES+(C18H20N4O5)。
Int-47
在0℃于100-mL圆底烧瓶中装填(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-羟乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-46,1910mg,5.13mmol)及DCM(30mL)。添加甲磺酰氯(0.48mL,6.16mmol)的DCM(5mL)溶液,随后添加DIEA(1.34mL,7.69mmol)。在0℃将反应混合物搅拌20分钟。添加水(100mL)。通过添加0.5N HCl溶液而将该混合物的pH调整至约3。用EtOAc(3×100mL)萃取该混合物。将有机萃取物汇集,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到呈白色黏性泡沫的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-((甲基磺酰基)氧基)乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(2070mg,89%)。MS:451ES+(C19H22N4O7S)。
Int-48
于100-mL圆底烧瓶中装填(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-((甲基磺酰基)氧基)乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-47,2070mg,4.6mmol)及DMF(50mL)。添加叠氮化钠(3584mg,55.14mmol),在40℃搅拌反应混合物4小时,接着在室温过夜。将反应混合物分配于水(200mL)及EtOAc(200mL)的间。将有机层分离,用水(100mL)、盐水(100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(40g,用EtOAc/己烷洗脱)将其纯化以得到呈灰白色固体的(4R,8S)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(1810mg,99%)。MS:398ES+(C18H19N7O4)。
Int-49
在-10℃向(4R,8S)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-48,354mg,0.89mmol)的甲醇(60mL)及THF(30mL)溶液添加LiBH4(4.46mL,8.90mmol)的THF溶液。在-10℃搅拌所得混合物2小时。添加DCM(100mL)及饱和氯化铵水溶液(100mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(40g硅胶,用0-100%EtOAc的己烷溶液洗脱,接着用100%丙酮洗脱)将其纯化以得到呈白色固体的(4R,8S)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-8-(羟甲基)-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(310mg,94%)。MS:370ES+(C17H19N7O3)。
Int-50
在室温向(4R,8S)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-8-(羟甲基)-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-49,310mg,0.84mmol)的DCM(60mL)溶液添加戴斯-马丁过碘烷(427mg,1.01mmol)。搅拌反应混合物2小时。添加水(10mL)、饱和碳酸氢钠水溶液(30mL)及2N Na2S2O3溶液(50mL)并搅拌5分钟。将双相混合物分离并用DCM(100mL)萃取水层。将合并的有机层经无水硫酸镁干燥,过滤及浓缩以得到呈无色油状物的(4R,8S)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛(300mg,97%)。MS:368ES+(C17H17N7O3)。
Int-51
Int-51通过按照如关于Int-10(方案1,步骤10)所示的相似反应条件而合成,使用(4R,8S)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛(Int-50,300mg,0.816mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(E)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛肟(283mg,91%)。MS:383ES+(C17H18N8O3)。
Int-52
Int-52通过按照如关于Int-11(方案1,步骤11)所示的相似反应条件而合成,使用(E)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛肟(Int-51,283mg,0.74mmol)作为底物,以得到呈黄色固体的(4R,8S,Z)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-N-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氯(308mg,99%)。MS:417ES+(C17H17ClN8O3)。
Int-53
Int-53通过按照如关于Int-12(方案1,步骤12)所示的相似反应条件而合成,使用(4R,8S,Z)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-N-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氯(Int-52,308mg,0.74mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(247mg,81%)。MS:412ES+(C18H21N9O3)。
Int-54
Int-54通过按照如关于Int-13(方案1,步骤13)所示的相似反应条件而合成,使用(4R,8S,Z)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-53,247mg,0.60mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(308mg,97%)。MS:526ES+(C24H35N9O3Si)。
Int-55
在-10℃向(4R,8S,Z)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-54,308mg,0.586mmol)的甲醇(20mL)及THF(10mL)溶液添加LiBH4(1.46mL,2.93mmol)及CuSO4(93.52mg,0.59mmol)的溶液。在-10℃将其搅拌1小时。添加Boc2O(127.87mg,0.59mmol)及DIEA(0.1mL,0.59mmol)并在0℃搅拌2小时。添加饱和氯化铵溶液(100mL)并搅拌5分钟。去除大部分有机溶剂。加入DCM(100mL)和饱和氯化铵溶液(100mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(20g硅胶,0-50%EtOAc的己烷溶液)将其纯化以得到呈无色油状物的(2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(86mg,24%)。MS:600ES+(C29H45N7O5Si)。
Int-56
Int-56通过按照如关于Int-14(方案1,步骤14)所示的相似反应条件而合成,使用(2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(Int-55,86mg,0.14mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(2-((4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-5-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(68mg,93%)。MS:510ES+(C22H39N7O5Si)。
Int-57
Int-57通过按照如关于Int-15(方案1,步骤15)所示的相似反应条件而合成,使用(2-((4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-5-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(Int-56,68mg,0.13mmol)作为底物,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)乙基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(78mg,99%)。MS:588ES-(C22H39N7O8SSi)。
Int-58
Int-58通过按照如关于Int-16(方案1,步骤16)所示的相似反应条件而合成,使用硫酸氢(4R,8S)-1-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)乙基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-57,78mg,0.13mmol)作为底物,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)乙基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)基酯(31mg,49%)。MS:474ES-(C16H25N7O8S)。
实例47
Figure BDA0002263941680000441
在0℃向硫酸氢(4R,8S)-1-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)乙基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)基酯(Int-58,31mg,0.07mmol)的DCM(10mL)溶液添加TFA(0.25mL,3.28mmol)。在0℃将反应混合物搅拌6小时,并真空浓缩。将粗制材料溶解于水,并通过逆相层析法(sepabeads 12g,100%水)纯化以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-(2-氨基乙基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(7mg,25%)。MS:376ES+(C11H17N7O6S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.05(s,3H);3.42(m,2H);3.57(m,2H);4.17(m,2H);4.91(m,1H);5.71(m,1H);7.70(s,1H)。
方案10
Figure BDA0002263941680000442
Int-59
Int-59通过按照如关于Int-55(方案9,步骤10)所示的相似反应条件而合成,使用(4R,8S,Z)-1-(2-叠氮基乙基)-5-(苯甲氧基)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-54,89mg,0.17mmol)作为底物,且不添加Boc2O,以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-1-(2-氨基乙基)-5-(苯甲氧基)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(84mg,99%)。MS:500ES+(C24H37N7O3Si)。
Int-60
在-10℃向(4R,8S,Z)-1-(2-氨基乙基)-5-(苯甲氧基)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-59,84mg,0.17mmol)的吡啶(5mL)溶液添加乙酸酐(0.01mL,0.17mmol)。在-10℃将其搅拌1小时。添加饱和氯化铵溶液(20mL)及DCM(20mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。将粗产物经急骤层析法(20g硅胶,0-50%EtOAc的己烷溶液)纯化,以得到呈无色黏性油状物的N-(2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙基)乙酰胺(74mg,81%)。MS:542ES+(C26H39N7O4Si)。
Int-61
Int-61通过按照如关于Int-56(方案9,步骤11)所示的相似反应条件而合成,使用N-(2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙基)乙酰胺(Int-60,74mg,0.136mmol)作为底物,以得到呈白色固体的N-(2-((4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-5-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙基)乙酰胺(50mg,81%)。MS:452ES+(C19H33N7O4Si)。
Int-62
Int-62通过按照如关于Int-57(方案9,步骤12)所示的相似反应条件而合成,使用N-(2-((4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-5-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙基)乙酰胺(Int-61,50mg,0.11mmol)作为底物,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-(2-乙酰胺基乙基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(57mg,97%)。MS:530ES-(C19H33N7O7SiS)。
实例48
Figure BDA0002263941680000451
实例48通过按照如关于Int-16(方案1,步骤16)所示的相似反应条件而合成,使用硫酸氢(4R,8S)-1-(2-乙酰胺基乙基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-62,57mg,0.107mmol)作为底物,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-(2-乙酰胺基乙基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(10mg,20%)。MS:416ES-(C13H19N7O7S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:1.93(s,3H);3.08(s,3H);3.55(m,4H);4.01(m,2H);4.94(m,1H);5.45(m,1H);7.68(s,1H);8.02(m,0.5H);8.61(m,0.25H);8.79(0.5H)化合物/吡啶比率(1:0.25)。
方案11
Figure BDA0002263941680000461
Int-63
Int-63通过按照如关于Int-9(方案1,步骤9)所示的相似反应条件而合成,使用(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-羟乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-46,234.3mg,0.63mmol)作为底物,以得到呈浅黄色油状物的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2,2-二羟乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(244.3mg,100%)。MS:389ES+(C18H20N4O6)。
Int-64
在0℃向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2,2-二羟乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-63,244.3mg,0.63mmol)的吡啶(0.5mL)溶液添加(2-(氨基氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(110.84mg,0.63mmol)的吡啶(0.5mL)溶液。使反应混合物升温至室温并搅拌15分钟,接着用乙酸乙酯(50mL)稀释,且用饱和氯化铵溶液(20mL)及盐水(20mL)洗涤。将有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并浓缩。通过硅胶层析法(0%-80%乙酸乙酯/己烷)而得到呈灰白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-((E)-10,10-二甲基-8-氧代-4,9-二氧杂-3,7-二氮杂十一-2-烯-1-基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(241.1mg,73%)。MS:529ES+(C25H32N6O7)。
Int-65
在0℃向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-((E)-10,10-二甲基-8-氧代-4,9-二氧杂-3,7-二氮杂十一-2-烯-1-基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-64,248.5mg,0.47mmol)的THF(4mL)及水(1mL)溶液添加氢氧化锂(0.66mL,0.66mmol)。在0℃搅拌反应混合物15分钟,接着用1N HCl中和。将THF去除并将水溶液冷冻并冻干以得到白色固体。将该固体溶解于水中以得到一混浊溶液。将pH调整到约3至4并用乙酸乙酯(2×100mL)萃取产物。将有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并浓缩以得到呈灰白色泡沫的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-((E)-10,10-二甲基-8-氧代-4,9-二氧杂-3,7-二氮杂十一-2-烯-1-基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-羧酸(236.4mg,98%)。MS:515ES+(C24H30N6O7)。
Int-66
在室温向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-((E)-10,10-二甲基-8-氧代-4,9-二氧杂-3,7-二氮杂十一-2-烯-1-基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-羧酸(Int-65,236.4mg,0.46mmol)的DCM(4mL)悬浮液添加O-(叔丁基二甲基硅基)羟胺(87.98mg,0.59mmol)及EDC(105.63mg,0.55mmol)。在室温搅拌反应混合物约2小时,接着用二氯甲烷稀释,且用1:1的盐水:水洗涤一次。将有机层经硫酸镁干燥,过滤并浓缩。通过硅胶层析法(0%-50%乙酸乙酯/己烷)而得到呈白色泡沫的(2-((((E)-2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)氨基甲酰基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)亚乙基)氨基)氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(148.2mg,50%)。MS:644ES+(C30H45N7O7Si)。
Int-67
在-78℃向(2-((((E)-2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)氨基甲酰基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)亚乙基)氨基)氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(Int-66,141mg,0.22mmol)及三乙胺(0.06mL,0.44mmol)的DCM(3mL)溶液添加三氟甲磺酸酐(0.07mL,0.44mmol)。搅拌反应混合物5分钟。向该溶液逐滴添加甲胺(0.05mL,1.31mmol)。接着使反应混合物升温至室温并搅拌1.5小时。用DCM稀释反应混合物并用饱和氯化铵洗涤一次。将有机层经硫酸镁干燥,过滤并浓缩。通过硅胶层析法(0%-50%乙酸乙酯/己烷)而得到呈白色泡沫的(2-((((E)-2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)亚乙基)氨基)氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(60.6mg,42%)。MS:657ES+(C31H48N8O6Si)。
Int-68
对(2-((((E)-2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)亚乙基)氨基)氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(Int-67,60.6mg,0.09mmol)的乙酸乙酯(3mL)溶液用氮气脱气,并添加Pd/C(9.82mg,0.01mmol)。使混合物再次脱气并置于氢气球形瓶下。搅拌反应混合物2小时。观察到有微量的产物。用氮气冲洗反应混合物,并添加甲醇(1mL)。使反应混合物脱气。添加更多的Pd/C(9.82mg,0.01mmol),并使反应混合物脱气并再置于氢气球形瓶下。搅拌反应混合物约40分钟,接着用氮气冲洗,并过滤,以去除催化剂。将滤液浓缩以得到呈无色油状物的(2-((((E)-2-((4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-5-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)亚乙基)氨基)氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(52.28mg,100%)。MS:567ES+(C24H42N8O6Si)。
Int-69
在室温向(2-((((E)-2-((4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-5-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)亚乙基)氨基)氧基)乙基)氨基甲酸叔丁酯(Int-68,52.2mg,0.09mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶(SO3-pyr)复合物(87.96mg,0.55mmol)。搅拌反应混合物过夜,接着用DCM稀释,并过滤以去除固体。将滤液浓缩及真空干燥。用DCM及丙酮湿磨所得的油状物,并过滤以去除固体。将滤液浓缩以得到呈灰白色泡沫的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-((E)-10,10-二甲基-8-氧代-4,9-二氧杂-3,7-二氮杂十一-2-烯-1-基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(59.57mg,100%)。MS:645ES-(C24H42N8O9SiS)。
Int-70
在室温向硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-1-((E)-10,10-二甲基-8-氧代-4,9-二氧杂-3,7-二氮杂十一-2-烯-1-基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-69,59.57mg,0.09mmol)的乙酸乙酯(2mL)及THF(1mL)溶液添加HF.吡啶(0.0026mL,0.10mmol)。搅拌反应混合物30分钟。添加更多的HF.吡啶(HF.Pyr)(0.0026mL,0.10mmol)。再过30分钟后,添加另外的HF.吡啶(0.0026mL,0.10mmol)。在30分钟后,将反应混合物浓缩以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-((E)-10,10-二甲基-8-氧代-4,9-二氧杂-3,7-二氮杂十一-2-烯-1-基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(49mg,100%)。MS:533ES+(C18H28N8O9S)。
实例49
Figure BDA0002263941680000491
在0℃向硫酸氢(4R,8S)-1-((E)-10,10-二甲基-8-氧代-4,9-二氧杂-3,7-二氮杂十一-2-烯-1-基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-70,49mg,0.09mmol)的DCM(2mL)悬浮液添加三氟乙酸(0.14mL,1.84mmol)。搅拌反应混合物30分钟。添加更多的三氟乙酸(0.14mL,1.84mmol),并使反应混合物升温至室温历时15分钟。用DCM将反应混合物浓缩多次以去除过剩的TFA。将所得的油状物进行真空干燥。通过C18 ISCO(100%水,4分钟,0%-50%ACN/水,3分钟)纯化以得到呈白色固体的硫酸氢1-((E)-2-((2-氨基乙氧基)亚氨基)乙基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(14.8mg,37%),其为E/Z异构体的约3:2的混合物。MS:431ES-(C13H20N8O7S).1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:2.89(m,3H);3.03(m,2H);4.13(m,2H);4.70(m,3H);5.44(d,1H);5.75(m,1H);6.95(m,0.4H);7.35(m,1H);7.51(m,0.6H);7.74(bs,3H);9.45(m,1H)。
方案12
Figure BDA0002263941680000492
Int-71
于1000-mL圆底烧瓶中装填4-[(二甲氨基)亚甲基]-3,5-二氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(Int-1,63g,234.80mmol)、乙醇(600mL)、NH2NH2.H2O(62g,992mmol)。在53℃于油浴中搅拌所得溶液过夜。将所得的混合物进行真空浓缩。添加MTBE(500mL),将所形成的固体经由过滤收集。在减压下于烤箱中将该固体烘干,以得到呈黄色固体的(E)-4-亚肼基(hydrazineylidene)-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(40g,68%)。MS:252ES+(C11H17N5O2)。
Int-72
于2000-mL圆底烧瓶中装填4-亚肼基-2H,4H,5H,6H,7H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(Int-71,80g,318.36mmol)、丙酮(800mL)及氯化氢(1M)(800mL)。在室温搅拌所得溶液2小时。添加水(700mL),并用乙酸乙酯(3×500mL)萃取反应混合物。将有机层合并、用盐水(3×2L)洗涤、经无水硫酸钠干燥并真空浓缩,以得到呈黄色油状物的4-氧代-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-甲酸叔丁酯(75g,99%)。其直接用于下一步骤中。MS:182ES+(C11H15N3O3)。
Int-73
于2000-mL圆底烧瓶中装填4-氧代-1,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-甲酸叔丁酯(Int-72,75g,316.12mmol)、二氯甲烷(750mL)、(氯二苯基甲基)苯(97g,347.95mmol)及三乙胺(38g,375.53mmol)。在室温搅拌所得溶液过夜。接着通过添加水(6000mL)使反应淬灭。用二氯甲烷(2×400mL)萃取反应混合物。将有机萃取物合并,用盐水(3×100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加于使用乙酸乙酯/石油醚(1:10)的硅胶柱上。将收集到的级分合并,并真空浓缩,以得到呈白色固体的4-氧代-2-三苯甲基-2,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(50g,33%)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ7.96(s,1H);7.41–7.30(m,9H);7.20–7.12(m,6H);4.76(s,2H);4.22(s,2H);1.50(s,9H)。
Int-74
用氮气惰性气氛将1000-mL三颈圆底烧瓶吹扫并保持在该环境中。添加4-氧代-2-三苯甲基-2,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(Int-73,46g,95.92mmol)、四氢呋喃(460mL)及甲醇(230mL),随后在10℃于5分钟内以多个批次添加NaBH4(3.65g,96.48mmol)。在10℃于水/冰浴中搅拌所得溶液1小时,并通过添加水(500mL)使其淬灭。用乙酸乙酯(3×500mL)萃取所得溶液,并将有机层合并。将有机萃取物用盐水(3×1000mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加于使用乙酸乙酯/石油醚(1:10-1:0)的硅胶柱上。将收集到的级分合并,并真空浓缩,以得到呈白色固体的4-羟基-2-三苯甲基-2,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(33g,71%)。1H NMR(300MHz,氯仿-d)δ7.41(s,1H);7.37–7.28(m,9H);7.21–7.11(m,6H);4.81(d,J=28.0Hz,2H);4.34(d,J=16.5Hz,1H);3.96(dd,J=13.7,4.3Hz,1H);3.50(dd,J=13.7,3.4Hz,1H);1.49(s,9H)。
Int-75
用氮气惰性气氛将1000-mL三颈圆底烧瓶吹扫并保持在该环境中。添加4-羟基-2-三苯甲基-2,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6-甲酸叔丁酯(Int-74,18g,37.38mmol)及四氢呋喃(360mL),随后在-30℃于5分钟内在搅拌下逐滴添加n-BuLi(22.5mL,56.13mmol)。在-20℃搅拌该溶液20分钟。在-30℃于5分钟内在搅拌下逐滴添加氯三甲基硅烷(4.5g,41.42mmol)。在-20℃搅拌该溶液30分钟。在-50℃于10分钟内在搅拌下向混合物逐滴添加n-BuLi(45mL,112.3mmol)。在-50℃搅拌该溶液2小时。接着在-50℃于20分钟内将CO2吹扫到反应物内。在室温搅拌所得溶液20分钟。接着通过添加水(1000mL)使反应淬灭。用氯化氢(1mol/L)将溶液的pH值调整到3。用乙酸乙酯(3×1000mL)萃取所得溶液,并将有机层合并。将有机萃取物用盐水(2×2000mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。用石油醚(200mL)将残余物湿磨。将固体过滤出并干燥,以得到呈黄色固体的6-(叔丁氧基羰基)-4-羟基-2-三苯甲基-4,5,6,7-四氢-2H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-羧酸(19g,96.7%)。将其直接使用在下一步骤中。
Int-76
于500-mL圆底烧瓶中装填6-(叔丁氧基羰基)-4-羟基-2-三苯甲基-4,5,6,7-四氢-2H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-羧酸(Int-75,19g,36.15mmol)、丙酮(190mL)、碳酸钾(7.5g,54.27mmol)及硫酸二甲酯(4.9g,38.85mmol)。在室温搅拌所得溶液过夜。将固体过滤出,并用EtOAc(500mL)洗涤。将滤液真空浓缩。将残余物施加于使用乙酸乙酯/石油醚(1:10-1:3)的硅胶柱上。将收集到的级分合并,并真空浓缩,以得到呈白色固体的4-羟基-2-三苯甲基-2,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6,7-二甲酸6-叔丁酯7-甲酯(13.24g,68%)。MS:562ES+1+Na(C32H33N3O5)。
Int-77
用氮气惰性气氛将500-mL三颈圆底烧瓶吹扫并保持在该环境中。添加4-羟基-2-三苯甲基-2,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6,7-二甲酸6-叔丁酯7-甲酯(Int-76,8g,14.83mmol)及二氯甲烷(160mL),随后在-60℃于2分钟内在搅拌下逐滴添加三乙胺(3g,29.65mmol)。在-60℃于30分钟内在搅拌下向其逐滴添加甲磺酰基甲磺酸酯(5.2g,29.85mmol)的二氯甲烷(35mL)溶液。在-60℃搅拌该溶液2小时。在-60℃于30分钟内在搅拌下向该混合物逐滴添加O-苯甲基羟基胺(5.5g,44.66mmol)的二氯甲烷(35mL)溶液。在-60℃搅拌该溶液30分钟。在室温搅拌所得溶液过夜,并接着添加水(500mL)使其淬灭。用二氯甲烷(2×500mL)萃取所得溶液,并将有机层合并。将有机萃取物用盐水(3×1000mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加于使用乙酸乙酯/石油醚(1:30-1:10)的硅胶柱上。将收集到的级分合并,并真空浓缩。得到呈白色固体的4-((苯甲氧基)氨基)-2-三苯甲基-2,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6,7-二甲酸6-叔丁酯7-甲酯(5.6g,58.6%)。MS:645ES+(C39H40N4O5)。
Int-78
用氮气惰性气氛将250-mL圆底烧瓶吹扫并保持在该环境中。添加4-((苯甲氧基)氨基)-2-三苯甲基-2,4,5,7-四氢-6H-吡唑并[3,4-c]吡啶-6,7-二甲酸6-叔丁酯7-甲酯(Int-77,7g,10.86mmol)及二恶烷(28mL),随后在0℃于20分钟内在搅拌下逐滴添加氯化氢(4M于二恶烷中)(105mL)。在室温搅拌所得溶液2小时。通过过滤而收集沉淀物。将固体减压干燥以得到呈白色固体的4-((苯甲氧基)氨基)-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-甲酸甲酯(2.81g,85.8%)。MS:303ES+(C15H18N4O3)。
Int-79
用氮气惰性气氛将3000-mL三颈圆底烧瓶吹扫并保持在该环境中。添加4-((苯甲氧基)氨基)-4,5,6,7-四氢-1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-7-甲酸甲酯(Int-78,4.5g,12.03mmol)及乙腈(1350mL)。随后在0℃于5分钟内在搅拌下逐滴添加三乙胺(7.3g,72.14mmol)的乙腈(36mL)溶液。在0℃搅拌该溶液30分钟。在0℃于5小时内在搅拌下向其逐滴添加碳酸二三氯甲酯(1.25g,4.21mmol)的乙腈(125mL)溶液。在室温搅拌所得溶液过夜。将反应混合物真空浓缩,并用EtOAc(1000mL)稀释。将其用盐水(2×1000mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩以得到粗产物。将其从比率为1:10的EtOAc:MTBE中再结晶,以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(1.3g,33%)。MS:329ES+(C16H16N4O4)1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ7.80(s,1H);7.49-7.34(m,5H);5.02(s,1H);4.94-7.88(m,2H);4.57(s,1H);3.75(s,3H);3.44-3.35(m,2H)。
方案13
Figure BDA0002263941680000521
Int-80及Int-81
在室温向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-79,7530mg,22.92mmol)的DMF(210mL)溶液添加溴乙酸叔丁酯(33.89mL,229.34mmol)。在100℃加热反应混合物约3小时。用乙酸乙酯稀释反应混合物并用水洗涤两次。将有机层经硫酸镁干燥,过滤并浓缩。通过硅胶层析法(0%-5%丙酮/DCM)而一起得到两个位置异构体(Int-80及Int-81)。将其在纯化以分离(0%-5%丙酮/DCM)。首先洗脱出:(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-80,2.928g,29%),MS:443ES+(C22H26N4O6)。其次洗脱出:(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-2-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基)-6-氧代-2,5,6,8-四氢-4H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-81,0.47g,5%),MS:443ES+(C22H26N4O6)。
Int-82
在0℃向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-80,2928mg,6.62mmol)的THF(40mL)及水(20mL)溶液添加1M氢氧化锂(6.62mL,6.62mmol)。在室温搅拌反应混合物1小时。在0℃另外添加0.5当量的氢氧化锂。在室温搅拌反应混合物2小时。其仍然只是起始材料。每小时添加0.2当量的氢氧化锂直到再添加1当量。将反应混合物保持在冰箱中过夜。早上仍然只有50%的产物。再加入0.2当量的LiOH,于30分钟后该反应完成约70-80%。在室温继续搅拌1小时。将反应混合物冷却至0℃,用0.5N HCl酸化至约pH 4,并用乙酸乙酯萃取4次。将水层进一步酸化至约pH 2并用乙酸乙酯萃取四次。将有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩以得到呈浅黄色泡沫的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-羧酸(1.953g,69%)。MS:429ES+(C21H24N4O6)。
Int-83
在室温向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-羧酸(Int-82,1453mg,3.39mmol)的DCM(30mL)溶液添加O-(叔丁基二甲基硅基)羟胺(599.42mg,4.07mmol)及EDC(780.15mg,4.07mmol)。在室温搅拌反应混合物1.5小时。再添加0.4当量的NH2OTBS并搅拌3小时。将反应混合物浓缩并通过硅胶层析法(0%-30%乙酸乙酯/己烷)纯化两次,以得到呈白色泡沫的2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)氨基甲酰基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙酸叔丁酯。MS:558ES+(C27H39N5O6Si)。
Int-84
在-78℃向2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)氨基甲酰基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙酸叔丁酯(Int-83,616.4mg,1.11mmol)及三乙胺(0.15mL,1.11mmol)的DCM(12mL)溶液添加三氟甲磺酸酐(0.19mL,1.11mmol)。在-78℃搅拌反应混合物5分钟。向反应混合物添加甲胺(6.63mL,13.26mmol)。使反应混合物升温至室温并搅拌6小时。将其浓缩并通过急骤层析法(20g硅胶,0%-30%乙酸乙酯/己烷)纯化,以得到2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙酸叔丁酯(138.5mg,22%)。MS:571ES+(C28H42N6O5Si)。
Int-85
在0℃向2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙酸叔丁酯(Int-84,138.5mg,0.24mmol)的DCM(2mL)溶液添加TFA(1.02mL,13.35mmol)。使反应混合物升温至室温并搅拌3小时。用DCM将反应混合物浓缩两次,将所得的黄色油状物经真空干燥2小时以得到黄色固体。将其溶解于约2mL的1:1ACN/pH 7磷酸盐缓冲剂中,通过C18 ISCO(100%水,3分钟,接着至50%ACN,4分钟)纯化以得到呈淡黄色固体的2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙酸(67.9mg,70%)。MS:401ES+(C18H20N6O5)。
Int-86
在室温向2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙酸(Int-85,67.9mg,0.17mmol)的DMF(2mL)溶液添加氯化铵(36.29mg,0.68mmol)、HATU(128.96mg,0.34mmol)及DIEA(0.12mL,0.68mmol)。在室温搅拌反应混合物15分钟,接着用乙酸乙酯稀释,并用饱和碳酸氢钠溶液及盐水/水(1:1)洗涤。用乙酸乙酯萃取水层两次。将有机萃取物汇集,经无水硫酸镁干燥,过滤并浓缩。通过硅胶层析法(0%-90%丙酮/DCM)得到2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙酰胺(48.9mg,72%)。MS:400ES+(C18H21N7O4)。
Int-87
在0℃向2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙酰胺(Int-86,48.9mg,0.12mmol)(纯度为~50-60%)的DCM溶液添加三氟甲磺酸叔丁基二甲基硅基酯(0.03mL,0.12mmol)及2,6-二甲基吡啶(0.01mL,0.12mmol)。在室温搅拌反应混合物30分钟。观看到单TBS与双TBS保护的起始材料混合物。添加更多的三氟甲磺酸叔丁基二甲基硅基酯(0.03mL,0.12mmol)及2,6-二甲基吡啶(0.01mL,0.12mmol)。在1小时后,主要产物为双TBS保护的。再添加更多的三氟甲磺酸叔丁基二甲基硅基酯(0.03mL,0.12mmol)及2,6-二甲基吡啶(0.01mL,0.12mmol)。又过一个小时后,用二氯甲烷稀释反应混合物,并用饱和氯化铵溶液洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。通过硅胶层析法(0%-100%乙酸乙酯/己烷)得到2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)-N-(叔丁基二甲基硅基)乙酰胺(23.9mg,31%).MS:628ES+(C30H49N7O4Si2)。
Int-88
将2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)-N-(叔丁基二甲基硅基)乙酰胺(Int-87,31.1mg,0.05mmol)的甲醇(1mL)及乙酸乙酯(1mL)溶液用氮气吹扫。添加钯碳(5.27mg,0.005mmol)且再次吹扫反应混合物并置于氢气球形瓶下,并搅拌1小时45分钟。使反应混合物通过0.45μm过滤器过滤,并浓缩,以得到N-(叔丁基二甲基硅基)-2-((4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-5-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙酰胺(24.5mg,92%)。MS:538ES+(C23H43N7O4Si2)。
Int-89及Int-90
在室温向N-(叔丁基二甲基硅基)-2-((4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-5-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)乙酰胺(Int-88,24.5mg,0.05mmol)的吡啶(1mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(43.5mg,0.27mmol)。在室温搅拌反应混合物3小时,接着浓缩及真空干燥。通过硅胶层析法(0%-100%丙酮/二氯甲烷)而得到以下的1:1混合物:硫酸氢(4R,8S)-1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氨基)-2-氧代乙基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-89),MS:618ES+(C23H43N7O7Si2S);与硫酸氢(4R)-1-(2-氨基-2-氧代乙基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-90)(16.4mg,64%),MS:504ES+(C17H29N7O7SiS)。
实例50
在室温向硫酸氢(4R,8S)-1-(2-((叔丁基二甲基硅基)氨基)-2-氧代乙基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-89)与硫酸氢(4R)-1-(2-氨基-2-氧代乙基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-90)(16.4mg,0.03mmol)的DCM(1mL)溶液添加四丁基铵二氟三苯基硅酸盐(21.49mg,0.04mmol)。在室温搅拌反应混合物35分钟,接着装填到4g硅胶柱上纯化(0%-100%丙酮/DCM)。将产物洗脱于100%丙酮中。将级分合并,并浓缩以得到无色膜。将所得的膜溶解在水/乙腈(1:1)中,冷冻并冻干,以得到呈白色固体的硫酸(4R,8S)-1-(2-氨基-2-氧代乙基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯的TBA盐(11.9mg,70%)。MS:390ES+(C11H15N7O7S)1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:0.85(m,9H);1.23(m,6H);1.47(m,6H);2.82(m,3H);3.09(m,6H);3.30(m,2H);4.41(m,2H);4.61(m,1H);5.47(s,1H);7.17(bs,1H);7.28(s,1H);7.39(bs,1H);9.50(s,1H).化合物:TBA=1:0.75。
方案14
Figure BDA0002263941680000561
Int-91
在-16℃向(2-甲酰基噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(500mg,2.19mmol)的甲醇(100mL)及THF(50mL)悬浮液逐滴添加LiBH4(5.48mL,10.95mmol)的THF溶液。在-16℃搅拌2小时后,用饱和氯化铵溶液(100mL)使反应淬灭。将溶剂去除。将残余物分配于DCM(100mL)及饱和氯化铵溶液(100mL)的间。将有机层收集,用水(50mL)及盐水(50mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并浓缩。用EtOAc湿磨残余物以得到呈白色固体的(2-(羟甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(504mg,99%)。MS:231ES+(C9H14N2O3S)。
Int-92
在0℃向(2-(羟甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(Int-91,500mg,2.18mmol)的DCM(50mL)溶液添加DIEA(0.76mL.4.36mmol),随后添加甲磺酰氯(0.19mL,2.4mmol)。在0℃搅拌反应混合物2小时。添加DCM(50mL)及饱和氯化铵溶液(100mL)。将有机层分离,用水(50mL)、盐水(50mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并浓缩以得到呈白色固体的甲磺酸(4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)甲酯(673mg,99%)。MS:309ES+(C10H16N2O5S2)。
Int-93
在0℃向甲磺酸(4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)甲酯(Int-92,606mg,1.96mmol)的DMF(20mL)溶液添加叠氮化钠(255mg,3.93mmol)。在室温搅拌反应混合物16小时。添加DCM(100mL)及饱和氯化铵溶液(100mL)。将有机层分离,用水(50mL)及盐水(50mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并浓缩以得到粗产物。将其用EtOAc湿磨以得到呈白色固体的(2-(叠氮基甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(501mg,99%)。MS:255ES+(C9H13N5O2S)。
Int-94
Int-94通过按照如Int-14(方案1,步骤14)中的相似反应条件而合成,使用(2-(叠氮基甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(Int-93,501mg,01.96mmol)作为底物,用EtOH作为溶剂,以得到呈白色固体的(2-(氨基甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(380mg,84%)。MS:230ES+(C9H15N3O2S)。
方案15
Int-95
Int-95通过按照如关于Int-14(方案1,步骤14)所示的相似反应条件而合成,使用(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-7,2298mg,6.71mmol)作为底物,以得到(4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(722mg,42%)。MS:253ES+(C10H12N4O4)。
Int-96
向(4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-95,406mg,1.61mmol)的DMF(5mL)悬浮液添加碳酸铯(629.34mg,1.93mmol)及烯丙烯溴(0.14mL,1.61mmol)。在室温搅拌反应混合物3小时。添加水(20mL)及EtOAc(50mL)。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(20g硅胶,0-100%EtOAc的己烷溶液)将其纯化以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(350mg,74%)。MS:293ES+(C13H16N4O4)。
Int-97
Int-97通过按照如关于Int-8(方案1,步骤8)所示的相似反应条件而合成,使用(4R,8S)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-96,350mg,1.19mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(烯丙氧基)-8-(羟甲基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(106mg,33%)。MS:265ES+(C12H16N4O3)。
Int-98
Int-98通过按照如关于Int-9(方案1,步骤9)所示的相似反应条件而合成,使用(4R,8S)-5-(烯丙氧基)-8-(羟甲基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-97,106mg,0.40mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛(105mg,99%)。MS:263ES+(C12H14N4O3)。
Int-99
Int-99通过按照如关于Int-10(方案1,步骤10)所示的相似反应条件而合成,使用(4R,8S)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛(Int-98,647mg,2.467mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(E)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛肟(684mg,99%)。MS:278ES+(C12H15N5O3)。
Int-100
Int-100通过按照如关于Int-11(方案1,步骤11)所示的相似反应条件而合成,使用(E)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛肟(Int-99,614mg,2.21mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-5-(烯丙氧基)-N-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氯(690mg,99%)。MS:312ES+(C12H14ClN5O3)。
Int-101
Int-101通过按照如关于Int-12(方案1,步骤12)所示的相似反应条件而合成,使用(4R,8S,Z)-5-(烯丙氧基)-N-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氯(Int-100,470mg,1.51mmol)及(2-(氨基甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(Int-94,380mg,1.66mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(2-(((4R,8S,Z)-5-(烯丙氧基)-N'-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒)甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(115mg,15%)。MS:505ES+(C21H28N8O5S)。
Int-102
Int-102通过按照如关于Int-13(方案1,步骤13)所示的相似反应条件而合成,使用(2-(((4R,8S,Z)-5-(烯丙氧基)-N'-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒)甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(Int-101,58mg,0.11mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(2-((Z)-3-((4R,8S)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-6,6,7,7-四甲基-5-氧杂-2,4-二氮杂-6-硅杂辛-3-烯-1-基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(65mg,92%)。MS:619ES+(C27H42N8O5SiS)。
Int-103
在室温向(2-((Z)-3-((4R,8S)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-6,6,7,7-四甲基-5-氧杂-2,4-二氮杂-6-硅杂辛-3-烯-1-基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(Int-102,65mg,0.10mmol)的MeOH(5mL)溶液添加1,3-二甲基巴比妥酸(32.8mg,0.21mmol)及四(三苯基膦)钯(0)(121.38mg,0.11mmol)。在室温搅拌反应混合物1小时并浓缩。
在环境温度向上述粗制材料添加吡啶(5mL)及三氧化硫吡啶复合物(132mg,0.83mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着减压浓缩以得到粗产物。将其在短硅胶垫上纯化,用己烷(100mL)洗脱,随后用乙酸乙酯/己烷(1:1,100mL)、乙酸乙酯(100mL)及丙酮(200mL)洗脱,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N-((4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)甲基)-N'-羟基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(54mg,79%)。MS:659ES+(C24H38N8O8SiS2)。
Int-104
Int-104通过按照如关于Int-16(方案1,步骤16)所示的相似反应条件而合成,使用硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N-((4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)甲基)-N'-羟基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-103,54mg,0.082mmol)作为底物,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N-((4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)甲基)-N'-羟基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(38mg,85%)。MS:545ES+(C18H24N8O8S2)。
实例51
在0℃向硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N-((4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)甲基)-N'-羟基甲脒基)-1-甲基-6-代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-104,25mg,0.046mmol)的DCM(2mL)溶液添加TFA(1.2mL,15.6mmol)。在0℃搅拌反应混合物2小时。将溶剂去除。将残余物溶解于水中并通过逆相层析法(12gsepabeads,100%水)纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N-((4-氨基噻唑-2-基)甲基)-N'-羟基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯TBA盐(4mg,15.6%)。MS:445ES+(C13H16N8O6S2)1HNMR(300MHz,D2O)δ:3.39–3.49(m,5H);4.35(m,1H);4.56(m,1H);4.86(m,1H);5.51(m,1H);6.56(s,1H);7.54(s,1H).化合物/TBA=1:1。
方案16
Figure BDA0002263941680000601
Int-105及Int-106
Int-105及Int-106通过按照如关于Int-20(方案3,步骤1及2)所示的相似反应条件而合成,使用(2-(((4R,8S,Z)-5-(烯丙氧基)-N'-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒)甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(Int-101,52.3mg,0.10mmol)作为底物,以得到(Z)-3-((4R,8S)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)-8,8-二甲基-6-氧代-5-氧杂-2,4,7-三氮杂壬-3-烯-9-酸叔丁酯(Int-105,18mg,25%),MS:690ES+(C30H43N9O8S);及(2-((3-((4R,8S)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-5-氧代-1,2,4-恶二唑-4(5H)-基)甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(Int-106,27mg,49%),MS:531ES+(C22H26N8O6S)。
Int-107
Int-107通过按照如关于Int-103(方案15,步骤7)所示的相似反应条件而合成,使用(Z)-3-((4R,8S)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)-8,8-二甲基-6-氧代-5-氧杂-2,4,7-三氮杂壬-3-烯-9-酸叔丁酯(Int-105,18mg,0.03mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(Z)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)-8,8-二甲基-3-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-6-氧代-5-氧杂-2,4,7-三氮杂壬-3-烯-9-酸叔丁酯(15mg,95%)。MS:730ES+(C27H39N9O11S2)。
实例52
Figure BDA0002263941680000611
实例52通过按照如关于实例51(方案15,步骤9)所示的相似反应条件而合成,使用(Z)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)-8,8-二甲基-3-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-6-氧代-5-氧杂-2,4,7-三氮杂壬-3-烯-9-酸叔丁酯(Int-107,15mg,0.02mmol)作为底物,以得到呈白色固体的(Z)-1-(4-氨基噻唑-2-基)-8,8-二甲基-3-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-6-氧代-5-氧杂-2,4,7-三氮杂壬-3-烯-9-酸(1.5mg,10%)。MS:574ES+(C18H23N9O9S2)1HNMR(300MHz,D2O)δ:1.48(s,3H);1.54(s,3H);3.56(m,2H);3.63(s,3H);4.67(m,2H);4.92(m,1H);5.66(m,1H);6.65(s,1H);7.60(s,1H)。
方案17
Figure BDA0002263941680000612
Int-108
Int-108通过按照如关于Int-107(方案16,步骤2)所示的相似反应条件而合成,使用(2-((3-((4R,8S)-5-(烯丙氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-5-氧代-1,2,4-恶二唑-4(5H)-基)甲基)噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(Int-106,27mg,0.05mmol)作为底物,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-(4-((4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)甲基)-5-氧代-4,5-二氢-1,2,4-恶二唑-3-基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(13mg,99%)。MS:571ES+(C19H22N8O9S2)。
实例53
Figure BDA0002263941680000613
实例53通过按照如关于实例52(方案16,步骤3)所示的相似反应条件而合成,使用硫酸氢(4R,8S)-8-(4-((4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻唑-2-基)甲基)-5-氧代-4,5-二氢-1,2,4-恶二唑-3-基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-108,13mg,0.02mmol)作为底物,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-(4-((4-氨基噻唑-2-基)甲基)-5-氧代-4,5-二氢-1,2,4-恶二唑-3-基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(1mg,8.2%)。MS:471ES+(C14H14N8O7S2)1HNMR(300MHz,D2O)δ:3.31(m,1H);3.52(m,1H);3.59(s,3H);4.95(m,3H);5.92(m,1H);6.78(s,1H);7.64(s,1H)。
实例54
Figure BDA0002263941680000621
在0℃向硫酸氢(4R,8S)-1-甲基-8-((Z)-N-甲基-N'-((((1-甲基-1H-吡唑并-4-基)甲基)氨基甲酰基)氧基)甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(实例15,18mg,0.04mmol)的DMF(0.3mL)溶液分批添加四氟硼酸三甲基氧鎓(27mg,0.19mmol)。使反应混合物升温至室温并搅拌15分钟。将大部分的DMF移除以得到粗产物。经由逆相层析法(12g Sepabeads,用0-15%乙腈/水洗脱)将其纯化,以得到呈白色固体的1,2-二甲基-4-((Z)-3-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-6-氧代-5-氧杂-2,4,7-三氮杂辛-3-烯-8-基)-1H-吡唑-2-鎓(5mg,27%)。MS:498ES+(C17H23N9O7S)1HNMR 300MHz,DMSO-d6)δ:2.99(d,3H);3.36(m,2H);3.63(s,3H);4.05(s,6H);4.08(m,2H);4.70(s,1H);5.64(s,1H);4.80(d,1H);7.20(t,1H);7.36(s,1H);8.31(s,2H)。
方案18
Figure BDA0002263941680000631
Int-109
在室温向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氯(Int-11,500mg,1.38mmol)的DCM(8mL)溶液添加三甲基硅基氰化物(0.21mL,1.66mmol)及DIEA(0.36mL,2.07mmol)。在环境温度搅拌反应混合物30分钟。添加饱和氯化铵溶液及DCM。将有机层分离,用水及盐水洗涤,并经无水硫酸钠干燥及浓缩以得到粗产物。通过硅胶层析法(0%-50%乙酸乙酯/己烷)而得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氰(150mg,产率30.8%)。MS:353ES+(C17H16N6O3)。
Int-110
在室温向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氰(Int-109,150mg,0.43mmol)的DCM(50mL)溶液添加三氟甲磺酸叔丁基二甲基硅基酯(0.21mL,0.64mmol)及2,6-二甲基吡啶(0.074mL,0.64mmol)。在室温搅拌反应混合物30分钟。添加DCM及饱和氯化铵溶液。将有机层分离,用水及盐水洗涤,并经无水硫酸钠干燥及浓缩。通过硅胶层析法(0%-50%乙酸乙酯/己烷)而得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氰(120mg,产率60.4%)。MS:467ES+(C23H30N6O3Si)。
Int-111
在0℃向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氰(Int-110,120mg,0.26mmol)及六水合氯化镍(II)(50.0mg,0.39mmol)的MeOH(10mL)溶液添加NaBH4(77.8mg,2.06mmol)。在0℃搅拌反应混合物30分钟。添加饱和氯化铵溶液。接着用乙酸乙酯萃取该混合物。将有机层分离,用水及盐水洗涤,并经无水硫酸钠干燥且浓缩得到呈白色固体的粗产物(4R,8S)-8-((E)-2-氨基-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基-5-(苯甲氧基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(80mg,产率66.1%)。其直接用于下一步骤中。MS:471ES+(C23H34N6O3Si)。
Int-112
向(4R,8S)-8-((E)-2-氨基-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基-5-(苯甲氧基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-111,80mg,0.17mmol)的吡啶(3mL)溶液添加4-乙基-2,3-二氧代-哌嗪-1-羰基氯(41.7mg,0.20mmol)及TEA(34.4mg,0.34mmol)。在室温搅拌反应混合物20分钟。添加饱和氯化铵溶液。接着用乙酸乙酯萃取该混合物。将有机层分离,用水及盐水洗涤,并经无水硫酸钠干燥且浓缩。通过硅胶层析法(0%-100%乙酸乙酯/己烷)而得到呈白色固体的N-((E)-2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基)-4-乙基-2,3-二氧代哌嗪-1-羧酰胺(20mg,产率18.4%)。MS:639ES+(C30H42N8O6Si)。
Int-113
将N-((E)-2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基)-4-乙基-2,3-二氧代哌嗪-1-羧酰胺(Int-112,20mg,0.031mmol)的MeOH(2mL)及乙酸乙酯(4mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(9.02mg,0.0094mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的N-((E)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)-2-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)乙基)-4-乙基-2,3-二氧代哌嗪-1-羧酰胺(15mg,产率87.3%)。MS:549ES+(C23H36N8O6Si)。
Int-114
在环境温度向N-((E)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)-2-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)乙基)-4-乙基-2,3-二氧代哌嗪-1-羧酰胺(Int-113,15mg,0.0273mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(13.0mg,0.082mmol)。搅拌反应混合物3小时,接着减压浓缩。用DCM湿磨该材料并通过过滤将固体去除。将滤液浓缩以得到粗产物。将其溶解于pH约7的缓冲液中并通过逆相层析法(Sepabeads,12g,ACN/水0-50%)纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-1-(4-乙基-2,3-二氧代哌嗪-1-基)-7,7,8,8-四甲基-1-氧代-6-氧杂-2,5-二氮杂-7-硅壬-4-烯-4-基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(10mg,产率58.2%)。MS:627ES-(C23H36N8O9SiS)。
实例55
Figure BDA0002263941680000651
在环境温度向硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-1-(4-乙基-2,3-二氧代哌嗪-1-基)-7,7,8,8-四甲基-1-氧代-6-氧杂-2,5-二氮杂-7-硅壬-4-烯-4-基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-114,8mg,0.0127mmol)的乙酸乙酯(1mL)及THF(0.5mL)溶液添加HF.吡啶(1.27mg,0.0383mmol)。搅拌反应混合物3小时,接着浓缩。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)纯化所得的固体,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-2-(4-乙基-2,3-二氧代哌嗪-1-甲酰胺基)-1-(羟基亚氨基)乙基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯的吡啶鎓盐(4.5mg,61.9%)。MS:513ES-(C17H22N8O9S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:1.20(m,3H);3.26-3.85(m,9H);4.12(m,2H);4.53(m,2H);4.97(m,1H);5.51(s,1H);7.65(s,1H);7.90(m,0.8H);0.41(m,0.4H);8.74(m,0.8H).化合物/吡啶比率(1:0.4)。
方案19
Figure BDA0002263941680000652
Int-115
在0℃向(4R,8S)-8-((E)-2-氨基-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基-5-(苯甲氧基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-111,200mg,0.42mmol)的DCM(10mL)搅拌溶液添加TEA(86.2mg,0.849mmol)及(氯磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(Int-29,109.9mg,0.509mmol)。在室温搅拌反应混合物20分钟。向反应混合物添加饱和氯化铵溶液及DCM。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%EtOAc的己烷溶液)将其纯化,以得到呈白色固体的(N-((E)-2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基)胺磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(50mg,产率18.1%)。MS:648ES-(C28H43N7O7SiS)。
Int-116
将(N-((E)-2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基)胺磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(Int-115,50mg,0.0769mmol)的乙酸乙酯(8mL)及甲醇(4mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(22.2mg,0.023mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的(N-((E)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基-2-(4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-)乙基)胺磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(38mg,88.2%)。MS:560ES+(C21H37N7O7SiS)。
Int-117
在环境温度向(N-((E)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基-2-(4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-)乙基)胺磺酰基)氨基甲酸叔丁酯(Int-116,38mg,0.0679mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(32.4mg,0.204mmol)。在室温搅拌反应混合物3小时,接着减压浓缩。用DCM湿磨该材料并通过过滤将固体去除。将滤液浓缩。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将所得的固体纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-2-((N-(叔丁氧基羰基)胺磺酰基)氨基)-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(30mg,69.1%)。MS:638ES-(C21H37N7O10SiS2)。
Int-118
向硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-2-((N-(叔丁氧基羰基)胺磺酰基)氨基)-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-117,20mg,0.0313mmol)的DCM(2mL)搅拌溶液添加TBAT(20.2mg,0.0375mmol)。在室温搅拌反应混合物3小时。将溶剂去除。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将所得的固体纯化,以得到为四丁基铵盐的硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-2-((N-(叔丁氧基羰基)胺磺酰基)氨基)-1-(羟基亚氨基)乙基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(20mg,83.3%)。MS:524ES-(C15H23N7O10S2)。
实例56
Figure BDA0002263941680000661
向硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-2-((N-(叔丁氧基羰基)胺磺酰基)氨基)-1-(羟基亚氨基)乙基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯四丁基铵盐(Int-118,20mg,0.026mmol)的DCM(2mL)搅拌溶液添加TFA(297mg,2.60mmol)。在室温搅拌反应混合物2小时。将溶剂去除以得到粗产物。将其溶解于pH约7的缓冲液中并通过逆相层析法(Sepabeads,12g,ACN/水0-50%)纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-1-(羟基氨基)-2-(胺磺酰基)氨基)乙基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(4.0mg,28.9%)。MS:424ES-(C10H15N7O8S2)1H NMR(300MHz,D2O)δ:(300MHz,D2O)δ:3.37(m,1H);3.51-3.72(m,4H);4.03(m,1H);4.53(m,1H);4.96(m,1H);5.70(s,1H);7.65(s,1H)。
方案20
Figure BDA0002263941680000671
Int-119
在0℃向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-12,70mg,0.2mmol)的DMF(1mL)溶液添加NaH(11.8mg,0.29mmol,60%)并搅拌10分钟,添加2-溴乙酰胺(32.5mg,0.24mmol)。接着使其升温至室温并搅拌10分钟。添加乙酸乙酯及饱和氯化铵溶液。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%丙酮的DCM溶液)将其纯化以得到呈白色固体的2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酰胺(58mg,产率71%)。MS:414ES+(C19H23N7O4)。
Int-120
将2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酰胺(Int-119,58mg,0.14mmol)的MeOH(5mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(29.9mg,0.03mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于室温搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的2-((((Z)-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酰胺(40mg,88.1%)。MS:324ES+(C12H17N7O4)。
实例57
Figure BDA0002263941680000681
在室温向2-((((Z)-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酰胺(Int-120,40mg,0.12mmol)的吡啶(1mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(59.1mg,0.38mmol)。搅拌反应混合物6小时,接着减压浓缩以得到粗产物。将材料通过逆相层析法(Sepabeads,12g,ACN/水0-50%)纯化以得到呈白色固体的吡啶鎓硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-(2-氨基-2-氧代乙氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(15mg,27%)。MS:402ES-(C12H17N7O7S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.00(s,3H);3.31(m,2H);3.57(s,3H);4.07(m2H);4.67(m,1H);5.50(s,1H);6.48(b,1H);7.25(m,2H);7.31(s,1H);7.90(m,1.4H);8.39(m,0.7H);8.86(m,1.4H)化合物/吡啶比率(1:0.7)。
方案21
Figure BDA0002263941680000682
Int-121及Int-122
在0℃向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-12,150mg,0.42mmol)的DMF(2mL)溶液添加NaH(25.2mg,0.63mmol,60%)。然后在0℃搅拌10分钟,并添加溴乙酸叔丁酯(0.014mL,0.51mmol)。接着使其升温至室温并搅拌10分钟。添加乙酸乙酯及饱和氯化铵溶液。将有机层分离,经无水硫酸镁干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%丙酮的DCM溶液)将其纯化以得到两种产物。
Int-121:呈白色固体的2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸叔丁酯(120mg,产率60%)。MS:471ES+(C23H30N6O5)。
Int-122:呈白色固体的3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4-甲基-4H-1,2,4-恶二嗪-5(6H)-酮(30mg,产率17.9%)。MS:397ES+(C19H20N6O4)。
方案22
Figure BDA0002263941680000691
Int-123及Int-124
2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)-2-甲基丙酸叔丁酯(Int-123)及3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4,6,6-三甲基-4H-1,2,4-恶二嗪-5(6H)-酮(Int-124)通过按照如关于Int-121及Int-122于方案21,步骤1所示的相似反应而合成,使用2-溴-2-甲基-丙酸叔丁酯。
方案23
Figure BDA0002263941680000692
Int-125
向2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸叔丁酯(Int-121,100mg,0.21mmol)的DCM(3mL)溶液添加TFA(0.81mL,10.63mmol)。在室温搅拌反应混合物2小时。将TFA去除以得到呈白色固体的2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸(88mg,产率99%)。MS:415ES+(C19H22N6O5)。
Int-126
向2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸(Int-125,30mg,0.07mmol)的DMF(1.5mL)溶液添加HATU(55.1mg,0.14mmol)、(2-氨基乙基)氨基甲酸叔丁酯(17.4mg,0.11mmol)及胡氏碱(Hunig’s base,0.03mL,0.14mmol)。在室温搅拌反应混合物30分钟。添加乙酸乙酯及饱和氯化铵溶液。将有机层分离,经无水硫酸镁干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%EtOAc/己烷)将其纯化,以得到呈白色固体的((Z)-3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-7-氧代-5-氧杂-2,4,8-三氮杂癸-3-烯-10-基)氨基甲酸叔丁酯(35mg,86.7%)。MS:557ES+(C26H36N8O6)。
Int-127
将((Z)-3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-7-氧代-5-氧杂-2,4,8-三氮杂癸-3-烯-10-基)氨基甲酸叔丁酯(Int-126,35mg,0.06mmol)的MeOH(3mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(13.1mg,0.126mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于室温搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的((Z)-3-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-7-氧代-5-氧杂-2,4,8-三氮杂癸-3-烯-10-基)氨基甲酸叔丁酯(25mg,85%)。MS:467ES+(C19H30N8O6)。
Int-128
在室温向((Z)-3-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-7-氧代-5-氧杂-2,4,8-三氮杂癸-3-烯-10-基)氨基甲酸叔丁酯(Int-127,25mg,0.05mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(25.6mg,0.16mmol)。搅拌反应混合物6小时,接着减压浓缩以得到粗产物。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将该材料纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-(2-((2-((叔丁氧基羰基)氨基)乙基)氨基)-2-氧代乙氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(20mg,68.2%)。MS:545ES-(C19H30N8O9S)。
实例58
Figure BDA0002263941680000701
在室温向硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-(2-((2-((叔丁氧基羰基)氨基)乙基)氨基)-2-氧代乙氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-128,20mg,0.04mmol)的DCM(2mL)搅拌溶液添加TFA(0.14mL,1.83mmol)。在室温搅拌反应混合物30分钟。将溶剂去除以得到粗产物。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将其纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-(2-((2-氨基乙基)氨基)-2-氧代乙氧基)-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(10mg,55.1%)。MS:447ES+(C14H22N8O7S)1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:2.82(m,2H);3.01(m,3H);3.31(m,2H);3.58(s,3H);4.14(m 2H);4.70(m,1H);5.52(s,1H);6.37(m,1H);7.25(m,2H);7.31(s,1H);7.60(m,2H);7.92(m,1H)。
另外的实例的分析数据
表4中的全部化合物根据上文或使用本领域技术人员容易知道的相似反应而合成。全部的化合物被分离为反式外消旋的。
表4
Figure BDA0002263941680000711
方案24
Figure BDA0002263941680000721
Int-129
将2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸叔丁酯(Int-121,30mg,0.0638mmol)的MeOH(3mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(10mg,0.094mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于室温搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的2-((((Z)-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸叔丁酯(23mg,94.8%)。MS:381ES+(C16H24N6O5)。
Int-130
在室温向2-((((Z)-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸叔丁酯(Int-129,23mg,0.0605mmol)的吡啶(1mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(28.87mg,0.181mmol)。搅拌反应混合物16小时,接着减压浓缩以得到粗产物。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将其纯化,以得到呈白色固体的2-((((Z)-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸叔丁酯(18mg,58.2%)。MS:459ES-(C16H24N6O8S)。
实例62
在室温向2-((((Z)-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸叔丁酯(Int-130,14mg,0.030mmol)的DCM(3mL)溶液添加TFA(0.12mL,1.52mmol)。在室温搅拌反应混合物2小时。将溶剂去除以得到粗产物。接着将其溶解于水(2mL)中,并通过
Figure BDA0002263941680000723
50WX8Na+型离子交换树酯滤筒且用水作为洗脱液进行洗脱。将含有产物的级分汇集并冻干,以得到呈灰白色固体。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将该固体纯化,以得到呈白色固体的2-((((Z)-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸的钠盐(2.0mg,13.8%)。MS:405ES+(C12H16N6O8S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.13(s,3H);3.60(m,2H);3.67(s,3H);4.27(m,2H);4.98(m,1H);5.73(s,1H);7.63(s,1H)。
实例63
Figure BDA0002263941680000731
实例63通过按照如关于实例62所示的相似反应条件而合成。使用2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)-2-甲基丙酸叔丁酯(Int-123)作为方案24步骤1中的底物。MS 433(C14H20N6O8S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:1.38(m,6H);3.05(s,3H);3.10(m,5H);4.93(m,1H);5.68(s,1H);7.59(s,1H);8.10(m,0.6H);8.61(m,0.3H);8.80(m,0.6H)化合物/吡啶比率(1:0.3)。
方案25
Figure BDA0002263941680000732
Int-131
将3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4-甲基-4H-1,2,4-恶二嗪-5(6H)-酮(Int-122,30mg,0.0757mmol)的MeOH(3mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(8.05mg,0.0076mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于室温搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的3-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4-甲基-4H-1,2,4-恶二嗪-5(6H)-酮(20mg,86.3%)。MS:307ES+(C12H14N6O4)。
实例64
Figure BDA0002263941680000741
在室温向3-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4-甲基-4H-1,2,4-恶二嗪-5(6H)-酮(Int-131,20mg,0.0653mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(31.18mg,0.196mmol)。搅拌反应混合物3小时,接着减压浓缩以得到粗产物。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将该材料纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢((4R,8S)-1-甲基-8-(4-甲基-5-氧代-5,6-二氢-4H-1,2,4-恶二嗪-3-基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基)酯(15mg,56.5%)。MS:387ES+(C12H14N6O7S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.45-3.57(m,4H);3.61-3.78(m,4H);4.41-4.69(m,2H);4.99(m,1H);6.02(s,1H);7.69(s,1H);8.08(m,1.4H);8.64(m,0.7H);8.79(m,1.4H)化合物/吡啶比率(1:0.7)。
实例65
Figure BDA0002263941680000742
实例65通过按照如关于实例64所示的相似反应条件而合成,使用3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4,6,6-三甲基-4H-1,2,4-恶二嗪-5(6H)-酮(Int-124)作为方案25步骤1中的底物。MS:415(C14H18N6O7S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:δ:1.41(s,3H);1.52(s,3H);3.53(m,4H);3.73(m,4H);5.02(m,1H);6.02(s,1H);7.69(s,1H);8.10(m,2H);8.67(m,1H);8.80(m,2H)化合物/吡啶比率(1:1)。
方案26
Figure BDA0002263941680000743
Int-132
于0℃向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-12,50mg,0.143mmol)的DCM(25mL)搅拌溶液添加胡氏碱(0.029mL,0.168mmol)。逐滴添加三光气(20.8mg,0.701mmol)的DCM(15mL)溶液。添加后,使反应物升温至室温并在室温搅拌30分钟。用DCM稀释该反应物。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸镁干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%EtOAc/己烷)将其纯化,以得到呈白色固体的3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4-甲基-1,2,4-恶二唑-5(4H)-酮(30mg,55.9%)。MS:383ES+(C18H18N6O4)。
Int-133
将3-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4-甲基-1,2,4-恶二唑-5(4H)-酮(Int-132,15mg,0.0392mmol)的甲醇(3mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(4.17mg,0.0039mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的3-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4-甲基-1,2,4-恶二唑-5(4H)-酮(8mg,69.8%)。MS:293ES+(C11H12N6O4)。
实例66
Figure BDA0002263941680000751
向3-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-4-甲基-1,2,4-恶二唑-5(4H)-酮(8mg,0.027mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(43.57mg,0.27mmol)。在室温搅拌反应混合物16小时,接着减压浓缩。用DCM湿磨该材料,并通过过滤将固体去除。将滤液浓缩以得到粗产物。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将其纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢((4R,8S)-1-甲基-8-(4-甲基-5-氧代-4,5-二氢-1,2,4-恶二唑-3-基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(5mg,41.7%)。MS:371ES-(C11H12N6O7S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.41(m,1H);3.51(s,3H);3.67(m,1H);3.72(s,3H);5.01(m,1H);6.15(s,1H);7.71(s,1H);8.09(m,4H);8.66(m,2H);8.79(m,4H)化合物/吡啶比率(1:2)。
方案27
Figure BDA0002263941680000752
Int-134
于0℃向((4-羟基丁基)氨基甲酸叔丁酯(1.4g,7.4mmol)的DCM(50mL)搅拌溶液添加TEA(2.04mL,14.6mmol)。逐滴添加甲磺酰氯(0.69mL,8.88mmol)。添加后,使反应混合物升温至室温并在室温搅拌3小时。添加DCM。将有机层用稀HCl溶液、水及盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到呈黄色油状物的Int-134甲磺酸4-((叔丁氧基羰基)氨基)丁酯(1.8g,产率91%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:1.30(s,9H);1.40-1.50(m,2H);1.60-1.70(m,2H);2.92(m,2H),3.15(s,3H);4.25(m,2H);6.79(m,1H)。
方案28
Figure BDA0002263941680000761
Int-135
甲磺酸2-(叔丁氧基羰基)氨基)乙酯通过按照如关于Int-134所示的相似反应而合成,使用(2-羟乙基)氨基甲酸叔丁酯作为底物。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:1.39(s,9H);3.15(s,3H);3.35(m,2H);4.25(m,2H);7.12(m,1H)。
方案29
Figure BDA0002263941680000762
Int-136
向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氰(Int-110,100mg,0.214mmol)的甲苯(5mL)搅拌溶液添加乙醛肟(101.3mg,1.71mmol)及InCl3(47.4mg,0.214mmol)。在60℃加热反应混合物8小时。使反应混合物冷却至室温。向反应混合物添加饱和氯化铵溶液及乙酸乙酯。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸镁干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%EtOAc的己烷溶液)将其纯化,以得到呈白色固体的(Z)-2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基l)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙酰胺(32mg,产率30.8%)。MS:485ES+(C23H32N6O4Si)。
Int-137
将(Z)-2-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙酰胺(Int-136,32mg,0.066mmol)的乙酸乙酯(5mL)及甲醇(2.5mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(19.02mg,0.0198mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌30分钟。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的(Z)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)-2-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)乙酰胺(25mg,95.9%)。MS:395ES+(C16H26N6O4Si)。
Int-138
向(Z)-2-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)-2-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)乙酰胺(Int-137,25mg,0.063mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(30.3mg,0.19mmol)。在室温搅拌反应混合物3小时,接着减压浓缩。用DCM湿磨该材料,并通过过滤将固体去除。将滤液浓缩以得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%丙酮的DCM溶液)将其纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-2-氨基-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基亚氨基)-2-氧代乙基-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(20mg,66.5%)。MS:473ES-(C16H26N6O7SiS)。
实例67
Figure BDA0002263941680000771
向硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-2-氨基-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基亚氨基)-2-氧代乙基-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-138,20mg,0.042mmol)的DCM(5mL)搅拌溶液添加TBAT(27.3mg,0.051mmol)。在室温搅拌反应混合物30分钟。将溶剂去除。通过急骤层析法(0-100%丙酮的DCM溶液)将所得的固体纯化,以得为四丁基铵盐的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-2-氨基-1-(羟基亚氨基)-2-氧代乙基-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(14mg,71.1%)。MS:359ES-(C10H12N6O7S)1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:0.94(m,10H);1.30(m,7H);1.58(m,7H);3.04-3.40(m,9H);3.56(s,3H);4.70(m,1H);5.47(s,1H);7.36(s,1H);7.79(m,2H);11.86(s,1H)化合物/四丁基铵比率(1:0.9)。
方案30
Figure BDA0002263941680000781
Int-139
向((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-79,700mg,2.13mmol)的DMF(8mL)搅拌溶液添加甲磺酸4-((叔丁氧基羰基)氨基)丁酯(Int-134,1424mg,2.13mmol)及Cs2CO3(4.17g,12.8mmol)。在80℃加热反应混合物20分钟,并冷却至室温。向反应混合物添加乙酸乙酯及水。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%EtOAc的己烷溶液)将其纯化,以得到呈白色固体的((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)丁基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(230mg,产率21.6%)。MS:500ES+(C25H33N5O6)。
Int-140
在0℃向((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)丁基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲酸甲酯(Int-139,230mg,0.46mmol)的THF(5mL)及水(1mL)溶液添加氢氧化锂(0.48mL,0.48mmol)。使反应混合物升温至室温并在室温搅拌1小时。将THF去除。向该水溶液添加1N HCl以调整pH为约3-4,并用乙酸乙酯萃取产物。将有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并浓缩,以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)丁基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-羧酸(200mg,89.5%)。MS:486ES+(C24H31N5O6)。
Int-141
在室温向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)丁基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-羧酸(Int-140,200mg,0.41mmol)的DCM(5mL)溶液添加O-(叔丁基二甲基硅基)羟胺(78.9mg,0.54mmol)及EDC(94.8mg,0.49mmol)。在室温搅拌反应混合物40分钟。将反应混合物直接装填至硅胶上并通过急骤层析法(20g硅胶,0%-50%乙酸乙酯/己烷)纯化,以得到呈白色泡沫的(4-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((((叔丁基二甲基硅基)氧基)氨基甲酰基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)丁基)氨基甲酸叔丁酯(103mg,40.6%)。MS:615ES+(C30H46N6O6Si)。
Int-142
在-78℃向(4-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)氨基甲酰基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)丁基)氨基甲酸叔丁酯(Int-141,100mg,0.16mmol)及三乙胺(0.090mL,0.65mmol)的DCM(2mL)溶液添加三氟甲磺酸酐(0.055mL,0.33mmol)。搅拌反应混合物5分钟。向该溶液逐滴添加甲胺(0.36mL,0.72mmol,2N于THF中)。接着使反应混合物升温至室温并搅拌2小时。用DCM稀释反应混合物并用饱和氯化铵溶液洗涤一次。将有机层经硫酸镁干燥,过滤并浓缩。通过硅胶层析法(0%-50%乙酸乙酯/己烷)而得到呈白色泡沫的(4-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)丁基)氨基甲酸叔丁酯(18mg,17.7%)。MS:628ES+(C31H49N7O5Si)。
Int-143
向(4-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)丁基)氨基甲酸叔丁酯(Int-142,18mg,0.0287mmol)的乙酸乙酯(3mL)溶液用氮气脱气,并添加Pd/C(3.6mg,0.0057mmol)。使该混合物再次脱气并置于氢气球形瓶下。搅拌反应混合物2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈无色油状物的(4-((4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-5-羟基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)丁基)氨基甲酸叔丁酯(14mg,产率90.8%)。MS:538ES+(C24H43N7O5Si)。
Int-144
在室温向(4-((4R,8S)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-5-羟基-6-氧代-4,5,,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-1-基)丁基)氨基甲酸叔丁酯(Int-143,14mg,0.03mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(33.15mg,0.21mmol)。在室温搅拌反应混合物3小时,接着用DCM稀释并过滤以将固体去除。将滤液浓缩。通过急骤层析法(0-100%丙酮的DCM溶液)将残余物纯化,以得到呈无色油状物的硫酸氢(4R,8S)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)丁基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(13mg,80.8%)。MS:616ES-(C24H43N7O8SiS)。
Int-145
在室温向硫酸氢(4R,8S)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)丁基)-8-((Z)-N'-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-144,13mg,0.021mmol)的乙酸乙酯(1mL)及THF(0.5mL)溶液添加HF.吡啶(0.0006mL,0.023mmol)。搅拌反应混合物30分钟。在30分钟后,将反应混合物浓缩以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)丁基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基l)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(11mg,100%)。MS:504ES+(C18H29N7O8S)。
实例68
Figure BDA0002263941680000801
在0℃向硫酸氢(4R,8S)-1-(4-((叔丁氧基羰基)氨基)丁基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基l)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-145,10mg,0.0199mmol)的DCM(1mL)溶液添加三氟乙酸(0.076mL,0.99mmol)。在室温搅拌反应混合物30分钟。用DCM将反应混合物浓缩多次以去除过剩的TFA。将残余物溶解于pH约7的缓冲液中,并通过逆向层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)纯化以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-1-(4-氨基丁基)-8-((Z)-N'-羟基-N-甲基甲脒基)-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(3.5mg,37.1%)。MS:404ES+(C13H21N7O6S)1H NMR(300MHz,D2O)δ:1.42-1.75(m,2H);1.79-2.04(m,2H);2.94(m,2H);3.10(s,3H);3.51-3.72(m,2H);3.88-4.14(m,2H);4.99(m,1H);5.62(s,1H);7.69(s,1H)。
方案31
Figure BDA0002263941680000811
Int-146
向(4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N'-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-12,110mg,0.31mmol)的DCM(10mL)搅拌溶液添加TEA(0.064mL,0.46mmol)及乙酰氯(0.029mL,0.37mmol)。在室温搅拌该反应物30分钟。添加饱和氯化铵溶液使该反应淬灭。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸镁干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%丙酮的DCM溶液)将其纯化以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-N’-乙酰氧基-5-(苯甲氧基)-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(70mg,产率56.9%)。MS:399ES+(C19H22N6O4)。
Int-147
将(4R,8S,Z)-N’-乙酰氧基-5-(苯甲氧基)-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-146,70mg,0.175mmol)的甲醇(5mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(12.9mg,0.012mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌30分钟。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的(4R,8S,Z)-N’-乙酰氧基-5-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(50mg,92.3%)。MS:309ES+(C12H16N6O4)。
实例69
Figure BDA0002263941680000812
向(4R,8S,Z)-N’-乙酰氧基-5-羟基-N,1-二甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲脒(Int-147,50mg,0.16mmol)的吡啶(1mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(77.4mg,0.49mmol)。在室温搅拌反应混合物6小时,接着减压浓缩。用DCM湿磨该材料并通过过滤将固体去除。将滤液浓缩以得到粗产物。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将其纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N’-乙酰氧基-N-甲基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-酯吡啶鎓(35mg,55.6%)。MS:387ES-(C12H16N6O7S)1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:2.03(s,3H);3.00(m,2H);3.36(m,2H);3.65(s,3H);4.71(m,1H);5.62(s,1H);6.84(b,2H);7.31(s,1H);7.90(m,2H);8.39(m,1H);8.86(m,2H)化合物/吡啶比率(1:1)。
实例70
吡啶鎓硫酸氢(4R,8S)-8-((Z)-N'-乙酰氧基甲脒基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯通过按照如关于实例69所示的相似反应而合成,在方案1步骤12中使用氨的THF溶液。MS 373ES-(C11H14N6O7S)1H NMR300MHz,DMSO-d6)δ:2.03(s,3H);3.34(m,2H);3.68(s,3H);4.67(m,1H);5.22(s,1H);6.84(bs,2H);7.31(s,1H);7.90(m,3H);8.39(m,1.5H);8.86(m,3H)化合物/吡啶比率(1:1.5)。
方案32
Figure BDA0002263941680000822
Int-148
在0℃向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-甲醛(Int-9,200mg,0.64mmol)的THF(10mL)搅拌溶液逐滴添加MeMgBr(0.38mL,1.15mmol,3N于Et2O中)。在0℃搅拌该反应物4小时。添加饱和氯化铵溶液使该反应淬灭。添加乙酸乙酯。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸镁干燥,并浓缩得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((R)-1-羟乙基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(100mg,47.6%)。其直接用于下一步骤中。MS:329ES+(C17H20N4O3)。
Int-149
在环境温度向(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-((R)-1-羟乙基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-148,100mg,0.30mmol)的二氯甲烷(10mL)溶液添加戴斯-马丁过碘烷(155mg,0.37mmol)。搅拌反应混合物30分钟。向反应混合物添加硫代硫酸钠水溶液(1N)及饱和碳酸氢钠水溶液并搅拌15分钟。将双相混合物分离并用二氯甲烷淬取水层。将合并的有机层经无水硫酸镁干燥,过滤及浓缩以得到粗产物。通过急骤层析法(0%-100%乙酸乙酯/己烷)而得到呈白色固体的(4R,8S)-8-乙酰基-5-(苯甲氧基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(40mg,40.2%)。MS:327ES+(C17H18N4O3)。
Int-150
在环境温度向(4R,8S)-8-乙酰基-5-(苯甲氧基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-149,40mg,0.12mmol)的吡啶(2mL)溶液添加羟胺盐酸盐(10.2mg,0.15mmol)。搅拌反应混合物30分钟。添加氯化铵水溶液及乙酸乙酯。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并浓缩得到呈白色固体的(4R,8S)-5-苯甲氧基)-8-(E)-1-(羟基亚氨基)乙基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(30mg,71.7%)。其直接用于下一步骤中。MS:342ES+(C17H19N5O3)。
Int-151
在0℃向(4R,8S)-5-苯甲氧基)-8-(E)-1-(羟基亚氨基)乙基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-150,30mg,0.088mmol)的DCM(5mL)溶液添加三氟甲磺酸叔丁基二甲基硅基酯(0.022mL,0.097mmol)及2,6-二甲基吡啶(0.012mL,0.11mmol)。使反应混合物升温至室温并搅拌2小时。添加DCM及饱和氯化铵溶液。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥并浓缩。通过急骤层析法(0-100%EtOAc/己烷)将该残余物纯化,以得到呈白色固体的(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(E)-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(25mg,62.4%)。MS:456ES+(C23H33N5O3Si)。
Int-152
将(4R,8S)-5-(苯甲氧基)-8-(E)-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基)-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-151,25mg,0.055mmol)的MeOH(10mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(5.84mg,0.0055mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌1小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的(4R,8S)-8-((E)-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基)-5-羟基-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(17mg,84.7%)。MS:366ES+(C16H27N5O3Si)。
Int-153
在环境温度向(4R,8S)-8-((E)-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基)-5-羟基-1-甲基-1,4,5,8-四氢-6H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-6-酮(Int-152,17mg,0.047mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(1338mg,8.41mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着减压浓缩以得到粗产物。用DCM湿磨该材料并通过过滤将更多的固体去除。将滤液浓缩。通过急骤层析法(0-100%丙酮/DCM)将残余物纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(18mg,86.9%)。MS:446ES+(C16H27N5O6SSi)。
Int-154及实例71
Figure BDA0002263941680000841
在环境温度向硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-1-(((叔丁基二甲基硅基)氧基)亚氨基)乙基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯(Int-153,18mg,0.040mmol)的THF(2mL)溶液添加TBAF(0.014mL,0.049mmol,1N于THF中)。搅拌反应混合物2小时,接着浓缩。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将残余物纯化,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-1-(羟基亚氨基)乙基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯的四丁基铵盐Int-154。接着将其溶解于水(2mL)中,并通过
Figure BDA0002263941680000842
50WX8Na+型离子交换树酯滤筒且用水作为洗脱液进行洗脱。将含有产物的级分汇集并冷冻干燥,以得到呈白色固体的硫酸氢(4R,8S)-8-((E)-1-(羟基亚氨基)乙基)-1-甲基-6-氧代-4,8-二氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-5(6H)-基酯的钠盐(10mg,67.2%)。MS:332ES+(C10H13N5O6S)1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:3.04(m,1H);3.25(m,1H);3.30(s,3H);3.54(s,3H);4.62(m,1H);5.23(s,1H);7.30(s,1H);11.16(s,1H)。
方案33
Figure BDA0002263941680000851
Int-155
在室温向((4R,8S,Z)-5-(苯甲氧基)-N-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-亚胺甲酰氯(Int-11,80mg,0.221mmol)的DCM(10mL)溶液添加N-(甲氨基)氨基甲酸叔丁酯(48.5mg,0.332mmol)及胡氏碱(85.7mg,0.66mmo)。在环境温度搅拌反应混合物30分钟。添加饱和氯化铵溶液及DCM。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥,并浓缩得到呈白色固体的2–((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(羟基亚氨基)甲基)-2-甲肼-1-甲酸叔丁酯(60mg,57.5%)。其直接用于下一步骤中。MS:357ES+(C22H29N7O5)。
Int-156
在0℃向2–((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(羟基亚氨基)甲基)-2-甲肼-1-甲酸叔丁酯(Int-155,60mg,0.127mmol)的DCM(8mL)溶液添加三氟甲磺酸叔丁基二甲基硅基酯(0.064mL,0.28mmol)及2,6-二甲基吡啶(0.037mL,0.32mmol)。使反应混合物升温至室温并在室温搅拌1小时。添加DCM及饱和氯化铵溶液。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并浓缩。通过硅胶层析法(0-100%乙酸乙酯/己烷)而得到呈白色固体的(Z)-4-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-3,7,7,8,8-五甲基-6-氧杂-2,3,5-三氮杂-7-硅壬-4-烯酸叔丁酯(30mg,产率40.2%)。MS:586ES+(C28H43N7O5Si)。
Int-157及Int-158
将(Z)-4-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-3,7,7,8,8-五甲基-6-氧杂-2,3,5-三氮杂-7-硅壬-4-烯酸叔丁酯(Int-156,28mg,0.0478mmol)的MeOH(2mL)及乙酸乙酯(4mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(10.1mg,0.0096mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于环境温度搅拌1小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体(18mg)的如下的混合物:(Z)-4-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-3,7,7,8,8-五甲基-6-氧杂-2,3,5-三氮杂-7-硅杂壬-4-烯酸叔丁酯(Int-157)(MS:496ES+(C21H37N7O5Si))及呈白色固体的2-((Z)-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(羟基亚氨基)甲基)-2-甲肼-1-甲酸叔丁酯(Int-158)。MS:382ES+(C15H23N7O5)。
Int-159
在环境温度向(Z)-4-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)-3,7,7,8,8-五甲基-6-氧杂-2,3,5-三氮杂-7-硅杂壬-4-烯酸叔丁酯(Int-157)及2-((Z)-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(羟基亚氨基)甲基)-2-甲肼-1-甲酸叔丁酯(18mg)的混合物的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(17.3mg,0.11mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着减压浓缩以得到粗产物。用DCM将其湿磨并通过过滤将固体去除。将滤液浓缩。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将残余物纯化,以得到呈白色固体的((((Z)-(2-(叔丁氧基羰基)-1-甲肼基)((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)亚甲基)氨基)氧基)磺酸(18mg,86.9%)。MS:539ES-(C15H23N7O11S2)。
实例72
在室温向((((Z)-(2-(叔丁氧基羰基)-1-甲肼基)((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)亚甲基)氨基)氧基)磺酸(Int-159,2mg,0.037mmol)的DCM(2mL)溶液添加三氟乙酸(0.0283mL,0.369mmol)。在室温搅拌反应混合物30分钟。用DCM将反应混合物浓缩多次以去除过剩的TFA。将残余物溶解于ACN/水中,并在冷冻干燥机中干燥以得到呈白色固体的((((Z)-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(1-甲肼基)亚甲基)氨基)氧基)磺酸的TFA盐(2.2mg,100%)。442ES+(C10H15N7O9S2)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.23-4.95(m,8H);5.02(m,1H);5.99(m,1H);7.67(s,1H);8.09(m,1.36H);8.66(m,0.68H);8.80(m,1.36H)化合物/吡啶比率(1:0.68)。
方案34
Figure BDA0002263941680000871
Int-160
在0℃向2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酸(Int-125,60mg,0.14mmol)的DMF(3mL)溶液添加HATU(110mg,0.29mmol)、O-(叔丁基二甲基硅基)羟胺(31.9mg,0.22mmol)及胡氏碱(0.050mL,0.299mmol)。使反应混合物升温至室温并在室温搅拌30分钟。添加乙酸乙酯及饱和氯化铵溶液。将有机层分离,用水及盐水洗涤,经无水硫酸镁干燥,并浓缩得到粗产物。通过急骤层析法(0-100%丙酮/DCM)将其纯化,以得到呈白色固体的2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)-N-羟基乙酰胺(30mg,产率48.3%)。MS:430ES+(C19H27N3O5)。
Int-161
将2-((((Z)-((4R,8S)-5-(苯甲氧基)-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)-N-羟基乙酰胺(Int-160,25mg,0.058mmol)的MeOH(3mL)溶液用氮气吹扫3次,并添加10%Pd/C(6.19mg,0.0058mmol)。将反应混合物用氮气吹扫3次,并接着在氢气气氛中于室温搅拌2小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将滤液浓缩以得到呈白色固体的N-羟基-2-((((Z)-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酰胺(16mg,80.9%)。MS:338ES-(C12H17N7O5)。
实例73
Figure BDA0002263941680000872
在室温向N-羟基-2-((((Z)-((4R,8S)-5-羟基-1-甲基-6-氧代-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酰胺(Int-161,16mg,0.047mmol)的吡啶(2mL)溶液添加三氧化硫吡啶复合物(22.5mg,0.14mmol)。在室温搅拌反应混合物6小时,接着减压浓缩以得到粗产物。用DCM湿磨该材料并通过过滤将固体去除。将滤液浓缩以得到粗产物。通过逆相层析法(Sepabeads,ACN/水0-50%)将其纯化两次,以得到呈白色固体的吡啶鎓((2-((((Z)-((4R,8S)-1-甲基-6-氧代-5-(磺酰氧基)-4,5,6,8-四氢-1H-4,7-甲桥吡唑并[3,4-e][1,3]二氮杂卓-8-基)(甲氨基)亚甲基)氨基)氧基)乙酰胺基)氧基)磺酸(6mg,21.6%)。MS:498ES-(C12H17N7O11S2)1H NMR(300MHz,D2O)δ:3.13(s,3H);3.58(m,2H);3.64(s,3H);4.50(m,2H);4.98(m,1H);5.72(s,1H);7.67(s,1H);8.11(m,2H);8.67(m,1H);8.82(m,2H)化合物/吡啶比率(1:1)。
以下的另外的化合物可根据与本文中所述过程相似的过程或于文献中找到的过程而制作。
Figure BDA0002263941680000881
绿脓杆菌PBP1a、PBP2及PBP3的酰化速率常数的测量
来自绿脓杆菌(P.aeruginosa)的PBP1a、PBP2及PBP3的二阶酰化速率常数使用BOCILLIN FL盘尼西林荧光各向异性测定法(Anal.Biochem.463,15-22(2014))测量。在每种情形中BOCILLIN FL(Thermo-Fisher Scientific,Waltham,MA)的浓度为30nM。绿脓杆菌PBP1a及PBP3的PBP浓度为60nM,而绿脓杆菌PBP2的浓度为300nM。测定缓冲液为0.1M磷酸钠及0.01%Triton X-100。除绿脓杆菌PBP2的pH为6.2外,全部PBP的pH皆为7.0。将化合物连续稀释2倍,使绿脓杆菌PBP的浓度范围为328至0.02μM。结果显示于下面表5中。
表5
Figure BDA0002263941680000891
Figure BDA0002263941680000901
Figure BDA0002263941680000911
关于PBP1a的酰化速率,*是表示k(on)<100M-1.s-1,**是表示k(on)为100-10,000M- 1.s-1,而***是表示k(on)>10,000M-1.s-1;关于PBP2的酰化速率,*是表示k(on)<100M-1.s-1,**是表示k(on)为100-5,000M-1.s-1,而***是表示k(on)>5,000M-1.s-1;关于PBP3的酰化速率,*是表示k(on)<100M-1.s-1,**是表示k(on)为100-10,000M-1.s-1,而***是表示k(on)>10,000M-1.s-1。NT:未测试。
对于革兰氏阴性临床分离株的MIC
化合物对于绿脓杆菌的最低抑制浓度(MIC)值使用临床与实验室标准协会准则(CLSI)培养液微量稀释法(CLSI M07-A10)来确定。结果显示于下面表6中。
表6
Figure BDA0002263941680000921
Figure BDA0002263941680000941
*是表示MIC>16mg/L,**是表示MIC为8-16mg/L,而***是表示MIC<8mg/L.
对于大肠杆菌、克雷白氏肺炎菌及鲍氏不动杆菌的最低抑制浓度(MIC)值显示于下面表7中。
表7
Figure BDA0002263941680000961
*是表示MIC>16mg/L,**是表示MIC为8-16mg/L,而***是表示MIC<8mg/L。
对于类鼻疽伯克氏菌、鼻疽伯克氏菌、土伦法兰西氏菌、鼠疫耶尔森氏菌及炭疽芽孢杆菌的MIC
实例40显示出其对于类鼻疽伯克氏菌(B.pseudomallei)、鼻疽伯克氏菌(B.mallei)、土伦法兰西氏菌(F.tularensis)、鼠疫耶尔森氏菌及炭疽芽孢杆菌展现了抑制活性(MIC<4mg/L)。
对于绿脓杆菌PBP抑制物的活体内剖析
在嗜中性白血球减少的鼠大腿模型中评价了比较物1(一种PBP2靶向化合物)及本公开的实例40对于绿脓杆菌临床分离株(ARC6347,AmpC+,PoxB+)的活体内功效。参见图1及2。实例40与比较物1之间的唯一结构差异在于氨基甲基基团被N-甲基-酰胺肟基团取代。然而,该PBP2靶向化合物(比较物1)不具有活性(在此研究中,即使暴露于超过其MIC 100%倍也未实现停滞),而PBP3的抑制化合物(实例40)则显示出稳健的功效(在暴露于超过其MIC57%倍时降低超过2Log(CFU/g))。
在开始研究之前将来自Charles River Laboratories的雌性CD-1小鼠驯养5天。每个笼子安置5只动物并让其自由取用食物及水。为了诱发嗜中性白血球减少症的瞬时状态,使小鼠分别在第4天及第1天以腹腔内给药的方式接受150mg/kg及100mg/kg的两剂环磷酰胺。所有过程均配合动物福利政策以IACUC过程与准则以及OLAW标准执行。绿脓杆菌菌株ARC 6347(AmpC+,PoxB+)从一个隔夜平板培养基制备以供感染用。将一部分的平板重新悬浮于无菌生理食盐水中并调整625nm下的OD为0.1。将调整后的细菌悬浮液进一步稀释以用约5.0×105CFU/鼠的量靶向感染接种物。进行接种物的平板计数以确认接种物浓度。以100uL的制备细菌接种物感染小鼠左右两侧的大腿肌肉。感染2小时后开始给小鼠服用测试品、阳性对照抗生素(左旋氧氟沙星)或载体。接受实例40、或比较物1、或载体的小鼠以10mL/kg经皮下给药,间隔3小时共8剂。接受左旋氧氟沙星的小鼠于感染2小时后以160mg/kg单一口服剂量给药。
每组/浓度中对三只动物给药。在开始治疗(T-Rx)时将一组的三只小鼠安乐死,并判定CFU。感染26小时后将所有剩余的小鼠安乐死。在无菌条件下移除两只大腿、称重、匀浆成一致稠度、连续稀释并在细菌生长培养基上平板培养。过夜温育后计算CFU。
整个本申请中所引用的所有参考文献(包括文献参考、已发布的专利、已公开的专利申请及待审的专利申请)的内容是以全文引用的方式明确并入本文中。除非另有定义,否则本文中使用的所有技术术语及科学术语符合本领域中普通技术人员通常已知的含义。

Claims (30)

1.一种下式化合物:
Figure FDA0002263941670000011
或其药学上可接受的盐,其中
X为H、CN、C(O)NR1R2、NR1R2、或可选地经NHC(O)Rg或S(O)NH2取代的(C1-C6)烷基;
Y为NOR3;或R3及X连同与其连接的原子一起形成4至6元杂环基或5至6元杂芳基,其每一者可选地经选自(C1-C6)烷基、C=O、C(O)OH及C(O)O(C1-C6)烷基中的一个或多个基团取代,其中所述(C1-C6)烷基可选地经选自OH、(C1-C6)烷氧基、苯基及5至6元杂芳基中的一个或多个基团取代,其中所述5至6元杂芳基可选地经NH2、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2取代;
R1及R2各自独立地为氢、氰基、C(O)NH2、NH2、OH、(C1-C6)烷氧基、或可选地经一个或多个R7取代的(C1-C6)烷基;
R3为氢、C(O)(C1-C6)烷基、C(O)NRdRe、SO2NH2、SO2OH、或可选地经一个或多个R7取代的(C1-C6)烷基;
R4、R5及R6各自独立地为氢、(C1-C6)烷基或C(O)NRaRb,其中R4、R5及R6的所述(C1-C6)烷基可选地经一个或多个R7取代,条件是R4及R5中的至少一者不是氢,且条件是当与R4及R5键合的对应氮原子经由双键而与相邻的环原子键合时R4及R5不存在;
各个R7独立地选自卤代基、OH、ORc、(C1-C6)烷氧基、CN、4至6元杂环基、5至6元杂芳基、苯基、C(=NH)NH2、NHC(=NH)NH2、NRdRe、C(O)OH、C=NO(C1-C6)烷基NH2、NHC(O)(C1-C6)烷基、C(O)NRdRe、SO2Rf及S(O)Rf,其中所述5至6元杂芳基可选地经NH2取代且所述苯基可选地经NH2取代;
Ra、Rb、Rd及Re是各自独立地为氢、OH、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷氧基、苯基、OSO2OH、4至6元环烷基、4至6元杂环基或5至6元杂芳基,其中Ra、Rb、Rd及Re的所述(C1-C6)烷基及(C1-C6)烷氧基中的每一者可选地且独立地经选自OH、NH2、C(O)OH、C(O)O(C1-C6)烷基、NHC(O)NH2、NHC(O)NH(C1-C6)烷基、C(O)NH2、NHC(O)N((C1-C6)烷基)2、NHC(O)(C1-C6)烷基、NHC(O)卤代基(C1-C6)烷基、4至6元杂环基、5至6元杂芳基、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代,其中Ra、Rb、Rd及Re的所述苯基、4至6元杂环基、4至6元环烷基及5至6元杂芳基中的每一者,及Ra、Rb、Rd及Re的(C1-C6)烷基及(C1-C6)烷氧基的所述5至6元可选的杂芳基可选地且独立地经选自(C1-C6)烷基、NH2、NH(C1-C6)烷基及–N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代;
Rc为可选地经选自C(=NH)NH2、C(=NH)NH(5至6元杂环基)、C(=NH)NH(C1-C6)烷基、NHC(=NH)NH2、-NRdRe、C(O)NRdRe、SO2Rf及SORf中的一个或多个基团取代的苯基,其中在基团C(=NH)NH(C1-C6)烷基中的所述(C1-C6)烷基可选地经选自NH2、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代;
Rf为氢或(C1-C6)烷基;以及
Rg为可选地经选自C=O及(C1-C6)烷基中的一个或多个基团取代的4至6元杂环基。
2.根据权利要求1所述的化合物,其中所述化合物为下式的化合物:
Figure FDA0002263941670000021
或其药学上可接受的盐,其中
X为H、CN、C(O)NR1R2、NR1R2或(C1-C6)烷基;
R1及R2各自独立地为氢、氰基、或可选地经一个或多个R7取代的(C1-C6)烷基;
R3为氢或可选地经一个或多个R7取代的(C1-C6)烷基;
R4、R5及R6各自独立地为氢、(C1-C6)烷基或C(O)NRaRb,其中R4、R5及R6的所述(C1-C6)烷基可选地经一个或多个R7取代,条件是R4及R5中的至少一者不是氢,且条件是当与R4及R5键合的对应氮原子经由双键而与相邻的环原子连接时R4及R5不存在;
各个R7独立地选自卤代基、OH、ORc、(C1-C6)烷氧基、CN、4至6元杂环基、5至6元杂芳基、苯基、C(=NH)NH2、NHC(=NH)NH2、NRdRe、C(O)NRdRe、SO2Rf及S(O)Rf
Ra、Rb、Rd及Re各自独立地为氢、(C1-C6)烷基、(C1-C6)烷氧基、苯基、4至6元杂环基或5至6元杂芳基,其中Ra、Rb、Rd及Re的所述(C1-C6)烷基及(C1-C6)烷氧基中的每一者可选地且独立地经选自NH2、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代,且其中Ra、Rb、Rd及Re的所述苯基、4至6元杂环基及5至6元杂芳基中的每一者可选地且独立地经选自(C1-C6)烷基、NH2、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代;
Rc为可选地经选自C(=NH)NH2、C(=NH)NH(C1-C6)烷基、NHC(=NH)NH2、NRdRe、C(O)NRdRe、SO2Rf及SORf中的一个或多个基团取代的苯基,其中在基团C(=NH)NH(C1-C6)烷基中的所述(C1-C6)烷基可选地经选自NH2、NH(C1-C6)烷基及N((C1-C6)烷基)2中的一个或多个基团取代;以及
Rf为氢或(C1-C6)烷基。
3.根据权利要求1或2所述的化合物,其中所述化合物为下式的化合物:
Figure FDA0002263941670000031
或其药学上可接受的盐。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的化合物,其中所述化合物为下式的化合物:
Figure FDA0002263941670000032
或其药学上可接受的盐。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的化合物,其中R3为氢或可选地经氨基取代的(C1-C6)烷基。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的化合物,其中R3为氢。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的化合物,其中R1为氢且R2为(C1-C6)烷基。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的化合物,其中R1为氢且R2为甲基。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的化合物,其中所述化合物为下式的化合物:
Figure FDA0002263941670000041
或其药学上可接受的盐。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的化合物,其中R6为氢、C(O)NRaRb、或可选地经ORc取代的(C1-C6)烷基。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的化合物,其中Ra为氢;Rb为可选地经一个或多个(C1-C6)烷基取代的5至6元杂芳基,或可选地经ORc取代的(C1-C6)烷基;且Rc为可选地经C(=NH)NH(C1-C6)烷基NH2取代的苯基。
12.根据权利要求1至11中任一项所述的化合物,其中Ra为氢且Rb为可选地经一个或多个(C1-C6)烷基取代的吡唑基。
13.根据权利要求1至9中任一项所述的化合物,其中所述化合物为下式的化合物:
或其药学上可接受的盐。
14.根据权利要求1至9及13中任一项所述的化合物,其中R4为C(O)NRaRb或可选地经NH2取代的(C1-C6)烷基;Ra为氢;且Rb为可选地经NH2取代的(C1-C6)烷基。
15.根据权利要求1至9、13及14中任一项所述的化合物,其中R4为(C1-C6)烷基。
16.根据权利要求1至9及13至15中任一项所述的化合物,其中R4为甲基。
17.根据权利要求1至9中任一项所述的化合物,其中所述化合物为下式的化合物:
或其药学上可接受的盐。
18.根据权利要求1至9及17中任一项所述的化合物,其中R5为C(O)NRaRb或可选地经NH2取代的(C1-C6)烷基;Ra为氢;且Rb为可选地经NH2取代的(C1-C6)烷基。
19.根据权利要求1至9、17及18中任一项所述的化合物,其中R5为(C1-C6)烷基。
20.根据权利要求1至9及17至19中任一项所述的化合物,其中R5为甲基。
21.根据权利要求1所述的化合物,其中所述化合物是选自下式的化合物:
Figure FDA0002263941670000061
Figure FDA0002263941670000091
Figure FDA0002263941670000101
Figure FDA0002263941670000102
或前述任一者的药学上可接受的盐。
22.根据权利要求1所述的化合物,其中所述化合物为下式的化合物:
或其药学上可接受的盐。
23.一种药物组合物,包括:根据权利要求1至22中任一项所述的化合物,或其药学上可接受的盐;以及药学上可接受的载体。
24.一种治疗有需要的受试者的细菌感染的方法,包括:向所述受试者施予有效量的根据权利要求1至22中任一项所述的化合物,或其药学上可接受的盐,或根据权利要求23所述的组合物。
25.根据权利要求24所述的方法,其中所述细菌感染是由革兰氏阴性细菌所引起。
26.根据权利要求24或25所述的方法,其中所述细菌感染是由绿脓杆菌所引起。
27.根据权利要求24或25所述的方法,其中所述细菌感染是由肠内杆菌科细菌所引起。
28.根据权利要求24或25所述的方法,其中所述细菌感染是由大肠杆菌、克雷白氏肺炎菌或不动杆菌属细菌所引起。
29.根据权利要求24所述的方法,其中所述细菌感染是由选自伯克霍尔德氏菌属、炭疽芽孢杆菌、鼠疫耶尔森氏菌及土拉弗朗西斯菌的病原菌所引起。
30.一种抑制有需要的受试者的细菌盘尼西林结合蛋白3(PBP3)且可选地抑制细菌PBP1a/b的方法,包括向所述受试者施予有效量的根据权利要求1至22中任一项所述的化合物,或其药学上可接受的盐,或根据权利要求23所述的组合物。
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