溶蛋白芽孢杆菌在防治依赖群体感应信号分子的致病菌及病
害方面的应用
技术领域
本发明属于生物防治技术领域。更具体地,涉及溶蛋白芽孢杆菌在防治依赖群体感应信号分子的致病菌及病害方面的应用。
背景技术
动态平衡是一个稳定的生态系统所具有的状态,这种状态是变化的,不是一成不变的。当外界环境条件没有发生剧烈变化时,每个生物种群的数量会在某一水平上下波动,形成相对平衡的状态(彭好文,黎起秦,林纬.生物防治研究及其应用概况[J].广西农业生物科学,2004,2:170-174.)。病虫害的爆发就是生态系统的相对平衡状态被打破时的表现,这一现象在农业生态系统最为明显。
每年,病虫害的发生给我国主要粮食作物和经济作物产业带来巨大的经济损失。20世纪初期,有机合成农药开始出现并广泛应用于植物病虫害防控上,并有显著的防治效果。然而,大量使用化学农药进行病害防控不是长远的办法。过度使用化学农药会造成农作物上农药的高残留,这对人类和其他生物的生命健康以及大自然环境造成严重威胁。此外,大量使用抗生素防控病害,会提高细菌的耐药性,甚至是使细菌产生抗药性,从而失去抗生素的效力,加大病害防治的难度。目前国内外针对微生物导致的重大农作物病害进行研究,尝试着寻找新的防治植物病害的方法——生物防治。
生物防治是利用生物种群间或种群内的相互作用,从而诱导植物产生抗性等方式,产生不利于有害动物、植物、微生物种群的影响,达到防治植物病害的目的(王万能,全学军,周跃钢,等.关于植物病害生物防治[J].重庆工学院学报,2004,2:50-52.)。生物防治与抗生素这类化学防治的不同之处在于,化学防治不具有靶向性,有可能会把要保护的种群本身也杀死,而生物防治可以避免这一点。再者,生物防治不会危害人类及其他生物的健康,也不会污染自然环境,是一种人类、环境友好型的防治方法,符合可持续发展理念。
群体感应(Quorum sensing,QS)是细菌通过信号分子分泌、识别,从而调控基因水平转移等群体行为的细胞交流机制。通过干扰信号分子的分泌、识别,可以阻断群体感应,实现群体淬灭(Quorum quenching,QQ)(Bar-Rogovsky Hagit,Hugenmatter Adrian,Tawfik Dan S.The evolutionary origins of detoxifying enzymes:the mammalianserum paraoxonases(PONs)relate to bacterial homoserine lactonases[J].TheJournal of Biological Chemistry,2013,288:23914-23927)。近年研究发现,群体淬灭是一种较有希望的生物防治方法。群体淬灭(Quorum quenching,QQ)是目前一种控制致病性、预防致腐性的重要策略(孙锋,严慧聪,汪美贞.细菌群体感应调控多样性及群体感应淬灭研究进展[J].微生物学报,2019,59:454-467)。群体淬灭可以通过化学抑制剂、改变物理条件或通过相应的降解酶来实现。
群体感应淬灭是通过调控群体感应系统进行来防治病害,所以不会对微生物产生选择压力,理论上细菌不会产生抗药性。群体感应淬灭是一种有效防治植物病害的新途径,具有操作简便、经济实用、环境友好、效率高且周期短等优点。针对不同群体感应信号发展群体淬灭制剂是目前国际范围的研究热点。不断研究丰富的群体感应淬灭菌库,对相关病害的防治意义重大。
发明内容
本发明的目的是提供一种具有淬灭群体感应信号分子能力的淬灭菌的新选择,即溶蛋白芽孢杆菌(Bacillus proteolyticus)。本发明研究发现,溶蛋白芽孢杆菌对群体感应信号分子AHLs、DSF和/或DSF类似物具有显著且快速的降解作用,在防治群体感应信号分子介导的致病菌危害方面有巨大的应用潜力,这为以生物防治替代化学防治且以阻断群体感应为靶标而不引起选择压力的防治策略提供了新的开发途径。
本发明的目的是提供一株高效降解微生物群体感应信号分子的溶蛋白芽孢杆菌(Bacillus proteolyticus)菌株S-5。
本发明另一目的是所述溶蛋白芽孢杆菌在淬灭微生物群体感应信号分子及相关病害的防治中的应用。
本发明上述目的通过以下技术方案实现:
一株可降解微生物群体感应信号分子的溶蛋白芽孢杆菌(Bacillusproteolyticus)菌株S-5,已于2019年9月4日保藏于广东省微生物菌种保藏中心,保藏编号为GDMCC No.60764,保藏地址是广东省广州市先烈中路100号大院59号楼5楼。
该菌株从采集自华南农业大学树木园土壤样本,经分离纯化筛选获得,对该菌株的16S rDNA序列、形态学特征进行分析,菌株S-5被鉴定为溶蛋白芽孢杆菌(Bacillusproteolyticus)。
菌株S-5的菌落形态特征为:在营养琼脂平板上培养24h,菌落呈乳白色,菌落凸起,表面光滑不透明,边缘整齐。
所述菌株S-5对氨苄青霉素的抗性达到50μg·mL-1,对链霉素、卡那霉素、庆大霉素、四环素、羧苄青霉素几乎无抗性。
实验结果表明,该溶蛋白芽孢杆菌菌株S-5对群体感应信号分子AHLs、DSF和/或DSF类似物具有高淬灭活性,能够显著且快速的降解群体感应信号。菌株S-5可在浓度高达0.4mM的以群体感应信号分子为唯一碳源的基础盐培养基中正常生长并在48h内完全降解信号分子。在防治AHLs和/或DSF群体感应信号分子介导的病原菌危害方面有巨大的应用潜力。
因此,溶蛋白芽孢杆菌在淬灭群体感应信号分子中的应用,或在制备降解信号分子的产品中的应用也属于本发明的保护范围。
溶蛋白芽孢杆菌在防治群体感应信号分子AHLs和/或DSF介导致病的植物病害中的应用,或在制备依赖群体感应信号分子AHLs和/或DSF致病的病原菌的防治制剂方面的应用也属于本发明的保护范围。
优选地,上述任一所述的应用中,所述溶蛋白芽孢杆菌为溶蛋白芽孢杆菌菌株S-5。
一种防治依赖AHLs和/或DSF群体感应信号分子致病的致病菌病害的方法,是用溶蛋白芽孢杆菌菌株S-5的菌液对作物进行处理,以预防依赖AHLs和/或DSF致病的病原菌的侵染。
优选地,所述处理的方式为对作物进行接种处理。
优选地,应用时,所述的溶蛋白芽孢杆菌淬灭AHLs的最适pH为6.5,最适温度为30℃。
实验显示,溶蛋白芽孢杆菌菌株S-5对依赖AHLs和/或DSF致病的病原菌引起的病害具有显著的生防作用。
一种含有上述淬灭菌株S-5和/或其菌液的可降解群体感应信号分子AHLs和/或DSF的降解菌剂,以及一种含有菌株S-5和/或其菌液的依赖AHLs和/或DSF致病的病原菌的生防制剂,也都应在本发明的保护范围之内。
本发明同时还提供了在富营养培养基中所述菌株S-5菌液的制备方法:具体是将菌株S-5划线于LB固体培养基平板上,30℃下培养24h,挑取单菌落接种于LB液体培养基中预培养至对数期,得到菌株S-5菌液。菌液的浓度不做严格限制,具体可根据实际病害程度和应用效果进行调整。
优选地,所述LB培养基为:胰蛋白胨10.0g/L,酵母提取物5.0g/L,氯化钠10.0g/L,pH 6.8~7.2,121℃灭菌20min。LB固体培养基配方是在液体培养基中加入1.5%(w/ν)的琼脂。
本发明具有以下有益效果:
本发明研究发现,溶蛋白芽孢杆菌对群体感应信号分子AHLs、DSF和/或DSF类似物具有淬灭活性,能够快速且显著地降解群体感应信号分子,在防治AHLs和/或DSF介导致病的病原菌危害方面有巨大的应用潜力,这为以生物防治替代化学防治且以阻断群体感应为靶标而不引起选择压力的治疗策略提供了新的开发途径。
同时,本发明筛选获得了一株高效降解群体感应信号分子的溶蛋白芽孢杆菌菌株S-5,可在浓度高达0.4mM的AHLs/DSF为唯一碳源的培养基中正常生长,在48h内可完全降解群体感应信号分子,具有显著的生物降解效果。
依据本发明,由于菌株S-5具有稳定高效降解植物病原菌中群体感应信号分子AHLs和/或DSF的特性,因此,菌株S-5可应用于自然环境中AHLs和/或DSF介导致病的植物病原菌的防治,既可以减少农药滥用问题,又给植物病害防治带来了新思维、新途径和新方法。
附图说明
图1为本发明的菌株S-5对AHLs淬灭活性结果图(E.coli为阴性对照,B23为阳性对照)。
图2为本发明的菌株S-5在LB培养基上的正反面菌落形态图。
图3为本发明的菌株S-5的系统进化树分析图。
图4为本发明的菌株S-5在不同抗生素中的生长情况图。
图5为本发明的菌株S-5对AHLs降解的HPLC图(黑线为未接种菌株S-5的对照图,红线和蓝线分别为菌株S-5对AHLs降解24h、48h的高效液相色谱(HPLC)图)。
图6为本发明的菌株S-5、E.coli、B23分别与Z3-3共同接种于白萝卜块茎24h后的发病情况。
具体实施方式
以下结合具体实施例和说明书附图来进一步说明本发明,但实施例并不对本发明做任何形式的限定。除非特别说明,本发明采用的试剂、方法和设备为本技术领域常规试剂、方法和设备。
除非特别说明,本发明所用试剂和材料均为市购。
实施例1芽孢杆菌菌株S-5的获取与鉴定
1、菌株S-5的分离、筛选
将采集的土壤样本以AHLs作为唯一碳源进行富集培养筛选。配置若干瓶50mL的基础盐MSM培养基装入250mL三角瓶中,在121℃灭菌20min,冷却后在无菌条件下加入AHLs母液,使AHLs的最终浓度为2.5μM,称5g土壤样品加入MSM培养基中,在30℃、200rpm摇床培养7d后,按照2%的接种量(1mL)转接到第二批AHLs浓度为5μM的50mlMSM培养基中。相同条件下培养7d后,再按2%的接种量转接到AHLs浓度为10μM的50mLMSM培养基中,继续培养7d。以此类推接种,直到AHLs浓度增加至160μM。
其中,所述基础盐(MSM)培养基的配方为:硫酸铵2g;七水合硫酸镁0.2g;二水合氯化钙0.01g;七水合硫酸亚铁0.001g;十二水合磷酸氢二钠1.5g;磷酸二氢钠1.5g;pH 6.5。
吸取100μL AHLs浓度为160μM的MSM培养基发酵液于2mL离心管中,依次稀释为浓度10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6、10-7、10-8的发酵液,然后各吸取100μL稀释好的各种浓度梯度的发酵液分别均匀地涂布在LB固体平板上,在30℃恒温箱培养1d。培养结束后,观察各浓度梯度平板的菌落生长情况,挑取平板上不同菌落形态的单菌落,在LB固体平板反复划线纯化,直至到分离出单菌落。在适宜稀释浓度的平板上,选取单菌落,分别在LB板上划线,标记培养代数G1和菌株编号,30℃培养1d,从第一代培养的菌株中各自挑取一个单菌落进行继代培养划板,标记培养代数G2和菌株编号,30℃培养1d,以此类推培养至第六代。挑取单菌落分别接种至离心管中并编号,进行培养后用甘油保藏在-80℃冰柜中,待进一步实验确定其对AHLs的降解能力。
将保存在-80℃菌株活化至LB固体平板上,放置在30℃培养箱,培养24h,之后接入液体LB中30℃,200rpm条件下过夜培养,获得菌液。将菌液进行离心(4000rpm,5min),超净工作台中倒掉上清液,加入含有AHLs的MSM液体培养基各1mL,并设置对照组;培养24h后取5μL反应混合物点样至1cm宽的MM琼脂条顶端,然后在下方点一排可以检测AHLs的报告菌株CF11(Agrobacterium tumefaciens NT1)。其中MM琼脂条的pH值为6.5,琼脂条中含有40μg/mL的X-gal。将MM琼脂条放置在28℃培养箱,避光培养24h后观察实验结果。
其中,所述基础(MM)培养基的配方为:硫酸铵2g;七水合硫酸镁0.2g;无水氯化钙0.01g;硫酸亚铁0.005g;氯化锰0.002g;磷酸氢二钾10.5g;磷酸二氢钾4.5g;pH 6.5。
实验相关原理:AHLs信号分子能够沿着MM固体培养基的琼脂条实现扩散,其扩散距离与浓度成正比。报告菌株CF11在监测到环境中存在AHLs信号分子时,CF11则开启转录表达β-半乳糖苷酶的相关基因,随即向环境中释放β-半乳糖苷酶;此时,培养基中的X-gal接触到β-半乳糖苷酶,被催化分解产生5-溴-4-靛蓝。其中,X-gal本身为无色化合物,5-溴-4-靛蓝为深蓝色化合物。以此为原理进行淬灭菌株的初步筛选,最终发现一株具有较强降解能力的菌株,命名为S-5.
随后,对其淬灭活性进行了进一步的确认,实验结果如图1所示,CK与阴性对照E.coli的AHLs的扩散距离基本一致,两者反应的混合物中AHLs含量也相近;而阳性对照B23与实验组S-5的琼脂条上的报告菌株均未变蓝,即两者反应混合物中不含有AHLs,即菌株S-5具有降解AHLs活性的能力。
2、菌株S-5的鉴定及系统进化分析
(1)菌落形态特征(如图2所示):在营养琼脂平板上培养24h,菌落呈乳白色,菌落凸起,表面光滑不透明,边缘整齐。
(2)16S rDNA序列及系统进化分析:菌株S-5的16S rDNA基因序列长度为1423bp,与NCBI数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)进行比对,发现所述菌株S-5与Bacillusproteolyticus同源性最高,其系统进化树如图3所示。
综上所述,通过对菌株S-5的16S rDNA序列、形态学特征进行分析,将菌株S-5鉴定为溶蛋白芽孢杆菌(Bacillus proteolyticus),并于2019年9月4日保藏于广东省微生物菌种保藏中心(GDMCC),保藏编号为GDMCC No.60764,保藏地址是广东省广州市先烈中路100号大院59号楼5楼。
实施例2淬灭菌株S-5的抗生素敏感性分析
为了能够更好地研究实施例1获得的菌株S-5的生防潜力,我们对该菌株的生物学特性进行了深入的研究。实验研究了菌株S-5对不同抗生素的敏感性,方法如下:
将菌株从-80℃冰箱中取出,用固体LB板把淬灭菌活化后,挑取单菌落接种到1mL液体LB中,培养至OD600值在1.0-1.5范围之间,菌液作为接种液。以5mL液体LB培养基作为体系,分别加入卡那霉素、氨苄青霉素、庆大霉素、链霉素、羧苄青霉素、四环素6种抗生素,以检测淬灭菌的抗生素敏感性。每个抗生素除对照组外,还要设置13个浓度,分别为5μg·mL-1、10μg·mL-1、20μg·mL-1、30μg·mL-1、40μg·mL-1、50μg·mL-1、100μg·mL-1、150μg·mL-1、200μg·mL-1、250μg·mL-1、300μg·mL-1、350μg·mL-1、400μg·mL-1。每个浓度设置2个平行,每个平行接种菌液1μL,在30℃、200rpm条件下培养9h后测量OD600值,观察菌株在含有不同抗生素、不同浓度的LB培养基中的生长状况。
菌株S-5抗生素敏感性实验结果如图4所示。菌株S-5对氨苄青霉素的抗性达到50μg·mL-1,对链霉素、卡那霉素、庆大霉素、四环素、羧苄青霉素几乎无抗性。
实施例3淬灭菌株S-5生长和降解AHLs关系曲线的测定
将菌株从-80℃冰柜中取出,用固体LB板把菌株进行活化,挑取单菌落分别加入到5个装有5mL液体LB的50mL离心管中,过夜培养后,取菌液(V=1/OD600)至灭菌的2mL离心管中,10000rpm离心1min,弃上清液。用灭菌的MSM培养基中溶液重悬浮沉淀的菌体后,接种至20mL MSM培养基中,添加AHLs母液(浓度为100mmol/L),使终浓度为0.4mM。在30℃、200rpm条件下培养,采集24h、48h的时间点的样品并测定OD600值表示淬灭菌的生长情况,利用HPLC法测定AHLs的残留量表示淬灭菌对AHL的降解情况。
提取AHLs的方法:在24h、48h取6mL对应的每个样品到15mL离心管中,4000rpm条件下离心5min,取5mL上清液至50mL分液漏斗中,向分液漏斗中加入5-10mL乙酸乙酯,剧烈震荡1min,待静置分层,把下层液体倒回15mL离心管中,上层液体经漏斗中的滤纸过滤到50mL圆底烧瓶中,漏斗上铺有滤纸。按上述方法把下层液体再进行一次萃取,下层液体倒入废液缸,上层清液过滤并入到圆底烧瓶中,把圆底烧瓶放在40℃恒温水浴锅进行蒸悬,待圆底烧瓶内的液体完全蒸干,用色谱乙腈分两次洗涤圆底烧瓶,每次用1mL色谱乙腈洗涤1min,定容到2mL,经0.45μM有机滤膜过滤至进样瓶,使用HPLC法测定残余量。
HPLC测定方法:AHLs的HPLC测定方法的各部分参数如下:①HPLC:Waters2695;②色谱柱:KinetexEVOC18反相色谱柱(250μm×4.6mm×5μm);③流速:0.5mL/min;④柱温:30℃;⑤流动相:乙腈:水=30:70(v:v);检测波长:210nm;进样量:20μL。
HPLC检测结果如图5所示(黑线为未接种菌株S-5的对照图,红线和蓝线分别为菌株S-5对AHLs降解24h、48h的高效液相色谱(HPLC)图),在24h、48h菌株S-5对OHHL降解率分别达到91.8%,100%。实验结果表明,该芽孢杆菌菌株S-5对AHLs群体感应信号分子具有很高的淬灭活性,能够显著且快速的降解AHLs。菌株S-5可在浓度高达0.4mM的以群体感应信号分子AHLs为唯一碳源的基础盐培养基中正常生长并在48h内将AHLs完全降解。在防治AHLs类群体感应信号分子介导的病原菌危害方面有巨大的应用潜力。
实施例4淬灭菌株S-5降解DSF能力的测定
挑取淬灭菌株S-5单菌落接种于LB培养基中预培养至对数期,所得菌液在4000rpm的条件下离心5min后,弃去上清液,菌体用0.9%的无菌生理盐水冲洗并重悬,作为种子悬液,再以1-3%的接种量接种至50mL MSM基础培养基中,并添加DSF母液,使其最终浓度为2mM,在30℃,200rpm条件下培养,定时取样。HPLC测定降解率。
在以DSF为唯一碳源的MSM中,菌株S-5生长没有停滞期,并快速降解DSF,培养至48h,DSF完全降解。对照中48h内DSF的自然降解率不到5%。结果表明,淬灭菌S-5对DSF有显著且快速的降解作用,在防治DSF介导的致病原菌危害方面有巨大的应用潜力。
实施例5菌株S-5对白萝卜软腐病的的生防效果研究
本实施例以引起马铃薯软腐病的病原菌胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种(Pectobacterium carotovorum subsp.carotovora,Pcc)Z3-3(刘春妍,郭松,艾力·吐热克,等.不动杆菌属中aidE基因编码高丝氨酸内酯酶[J].生物工程学报,2017,33:1625-1639)为例,研究菌株S-5对依赖AHLs致病的致病菌的生防效果。
接种试验中,淬灭菌S-5、大肠杆菌E.coli、苏云金芽孢杆菌B23均为安全不致病的菌种。
1、苏云金芽孢杆菌B23、大肠杆菌E.coli、菌株S-5、胡萝卜软腐果胶杆菌Z3-3划线于LB固体平板上,30℃培养。分别挑取平板上的单菌落,接种至液体LB培养基中,以30℃、200rpm的条件过夜培养,得到菌液。把萝卜进行前处理。摘掉萝卜叶子和须,用自来水冲洗表面土壤。把萝卜放入装有巴氏消毒液的盆子里滚动1min,再放进装酒精的水盆里滚动1min,泡洗步骤重复3次,用纯水冲洗刀和砧板,冲洗后喷酒精,将萝卜切成大小、厚度相近1cm的片状,放入大烧杯待用。
用液体LB将B23、E.coli、菌株S-5和致病菌Z3-3的菌液调整至1.0×107cfu/mL。将Z3-3分别与B23、E.coli、S-5和液体LB培养基以一定比例混合,并将5μL混合菌液分别接种至马铃薯上。即分别设置LB+Z3-3、Z3-3+E.coli、Z3-3+B23、Z3-3+S-5,四个实验组。将接种好的马铃薯放置在28℃生化培养箱,24h后观察其发病情况并拍照。
2、如图6所示,PBS与致病菌Z3-3、大肠杆菌与致病菌Z3-3的萝卜块茎发病面积较大,而B23与致病菌Z3-3、淬灭菌S-5与致病菌Z3-3各自混合共同接种时软腐病病害症状明显减轻。实验结果表明,菌株S-5对致病菌Z3-3引起的萝卜软腐病具=具有显著的生物防治效果。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。