CN110499269A - 一种指导微生物配伍的“相似相容”原则及其提高外源投加微生物功能与效率的配伍方法 - Google Patents

一种指导微生物配伍的“相似相容”原则及其提高外源投加微生物功能与效率的配伍方法 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种指导微生物的配伍的“相似相容”原则及其微生物的配伍的“相似相容”原则以及提高外源投加微生物功能与效率的配伍方法。本发明提出的“相似相容”配伍方法如下:首先是对目标环境中的群落结构进行解析,筛选出其中的主要优势种群;然后结合生物激活的分析结果,筛选出相对丰度明显增长、即竞争占优势的细菌类群;最后以16SrDNA序列为参照,从菌株资源库中筛选若干同时具有较强功能、又与目标本源优势种群或激活中竞争优势种群系统发育相似的菌株进行配伍,然后将这些微生物培养后混合投加到目标环境中。本发明对于石油污染治理有重要意义。

Description

一种指导微生物配伍的“相似相容”原则及其提高外源投加微 生物功能与效率的配伍方法
技术领域
本发明涉及一种指导微生物配伍的“相似相容”原则及其提高外源投加微生物功能与效率的配伍方法。
背景技术
微生物在自然界中不是以个体,而是以群落的形式存在的。自然环境,包括土壤环境(动物、微生物共存)、水环境(动物、植物、微生物共存)和油藏环境(油层环境本身就很复杂,同时原油本身也是由烷烃、芳香烃、非烃和沥青质组成的混合物)等都具有复杂多样的特点。在这些环境中单一种类的微生物很难适应。同时,由于微生物对碳源的选择有着很强的偏好性,单一微生物难以对于复杂的有机混合污染物进行高效稳定地降解。对外源投加的微生物尤其如此。只有外源微生物在目标环境稳定生存并且与同内源微生物竞争中取得优势才能高效、稳定长久地发挥作用。在外源投加微生物时,通常认为多种微生物的作用要优于投加单一微生物。在选择和投加多种微生物时,需要考虑这些微生物的配伍性:只有很好配伍的微生物才能更好地发挥作用。目前,通常采用的配伍方法是将微生物菌株进行随机组合,对于菌株的筛选和组合完全是一个随机的过程,忽略了外源微生物之间的功能关系以及它们与目标环境中内源微生物可能存在的拮抗作用。
发明内容
本发明的目的是提供一种指导微生物的配伍的“相似相容”原则及其提高外源投加微生物功能与效率的配伍方法。
本发明首先提供了用于降解目标土壤中原油的菌株组合配伍方法,包括如下步骤:
(a1)参照方法A和方法B筛选菌株;
(a2)将1-3种方法A筛选的菌株和1-3种方法B筛选的菌株进行组合,得到用于降解目标土壤中原油的菌株组合;
方法A包括如下步骤:从候选菌株中筛选与目标土壤中优势菌种相似度大于88%的菌株;
方法B包括如下步骤:从候选菌株中筛选与经过生物激活的目标土壤中竞争优势菌种相似度大于88%的菌株;
所述候选菌株为具有原油利用能力的菌株。
在本发明的实施例中,从方法A中选择2种菌株,从方法B中选择3种菌株进行混合。
所述方法A和方法B中,筛选的菌株可为在满足相似度的情况下原油利用能力最强的菌株。
方法A包括如下(b1)-(b3)所述的步骤:
(b1)利用T-RFLP分析目标土壤中微生物菌落结构,筛选丰度最高的n种T-RFs;
(b2)获得步骤(b1)筛选的n种T-RFs代表的细菌16S rDNA作为参照序列;
(b3)在候选菌株中筛选16S rDNA与步骤(a2)中的任一种参照序列相似度大于88%的菌株;
方法B包括如下(c1)-(c3)所示的步骤:
(c1)利用T-RFLP分析经过生物激活的目标土壤中微生物菌落结构,筛选激活前后丰度增长最多的n种T-RFs;
(c2)获得步骤(c1)筛选的n种T-RFs对应的细菌16S rDNA作为参照序列;
(c3)在候选菌株中筛选16S rDNA与步骤(a2)中的任一种参照序列相似度大于88%的菌株;
n为1-10中任意自然数。
所述(b2)或(c2)中,所述T-RFs代表的细菌16S rDNA的获得方式如下:将待测土壤菌落16S rDNA文库导入大肠杆菌并通过蓝白斑筛选阳性克隆,利用T-RFLP对阳性克隆进行分析,将T-RFs与步骤(b1)或(c1)中筛选的T-RFs相同的阳性克隆的16S rDNA片段测序获得所述T-RFs代表的细菌16S rDNA。
所述具有原油利用能力的菌株筛选方法如下:将菌株接种于含有10g/L原油的培养基中,使培养体系初始OD600=0.1,然后30度、150rpm培养7天,在培养结束后检测培养体系OD600,筛选OD600值大于20的菌株。
所述培养基具体可为无机盐培养基。无机盐培养基(1L):NH4NO34 g;KH2PO4,4g;Na2HPO4,5.68g;CaCl2,0.78mg;MgSO4·6H2O,197.18mg;FeSO4,1.112mg;微量元素溶液TES,0.1mL;补充去离子水至1L;调节pH 7.0。
所述生物激活方法如下:向目标土壤中加入氮和磷,在25±1℃温度下运行60天,控制土壤含水率在20±3%;所述氮和磷与土壤中总有机碳的质量比为:10:1:200。
所述氮具体可以通过硝酸钠的形式加入。所述磷具体可以通过磷酸二氢钠的形式加入。
在生物激活过程中,每隔3天对反应器土壤进行翻动充氧并适时喷洒灭菌水控制土壤含水率在20±3%。
所述目标土壤为将原始土壤放入通风橱风干后破碎后过50目金属网筛得到的干土。
所述目标土壤中还加入表面活性剂吐温80(1.5mL/kg干土)和5%土壤质量百分含量的锯屑。
所述生物激活具体可在生物反应器中进行。
本发明还保护以上任一所述方法在降解原油或原油污染治理中的应用。
本发明还保护以上任一所述方法得到的菌株组合。
本发明还保护菌株组合,由如下(A)-(E)的菌株组成;
(A)在中国普通微生物菌种保藏管理中心的菌种编号为1.6444的胜利盐单胞菌Halomonas shengliensis;
(B)在中国普通微生物菌种保藏管理中心的菌种编号为1.6294的孤岛海杆状菌Marinobacter gudaonensis;
(C)在中国普通微生物菌种保藏管理中心的菌种编号为1.10267的浅黄海洋杆菌Pelagibacterium luteolum;
(D)在德国微生物菌种保藏中心的菌种编号为16503的粪产碱菌粪亚种Alcaligenes faecalis subsp.phenolicus;
(E)在中国普通微生物菌种保藏管理中心的菌种编号为1.9108的海神鲁杰氏菌Ruegeria marina。
以上任一所述菌株组合中,每种菌株的菌量可相等。
本发明还保护以上任一所述菌株组合在下述任一中的应用:
1)降解原油;
2)制备降解原产品;
3)消除或降低原油污染;
4)制备消除或降低原油污染产品;
5)消除或降低土壤原油污染;
6)制备消除或降低土壤原油污染产品。
本发明还保护土壤中原油降解方法,包括如下步骤:将以上任一所述的菌株组合加至目标土壤中进行培养,实现土壤中的原油降解。
所述菌株组合中,每种菌株的菌量可相等。
所述培养具体可在25±1℃下进行。培养的时间以满足石油降解为准,在本发明的一个实施例中,培养时间为45天。所述培养可在生物反应器中进行,每隔3天对反应器土壤进行翻动充氧并适时喷洒灭菌水控制土壤含水率在20±3%。
以上任一所述生物反应器具体可采用有机玻璃制成,有效尺寸为70cm(长)×60cm(宽)×25cm(高)。反应器的底部设置多孔板,多孔板上面铺设一层70目的金属网筛,网筛上面再铺设约5cm厚度碎石层。
基因序列或系统分类地位上越相似的菌株间具有越相近的代谢特点和适应环境与参与种间竞争的能力,本发明提出的“相似相容”配伍方法如下:首先是对目标环境中的群落结构进行解析,筛选出其中的主要优势种群;然后结合生物激活的分析结果,筛选出相对丰度明显增长、即竞争占优势的细菌类群;最后以16S rDNA序列为参照,从菌株资源库中筛选若干同时具有较强功能、又与目标本源优势种群或激活中竞争优势种群系统发育相似的菌株进行配伍,然后将这些微生物培养后混合投加到目标环境中。本发明对于石油污染治理有重要意义。
附图说明
图1为参照序列获得方法路线示意图。
图2为生物反应器示意图。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。
LB培养基(1L):氯化钠10g,蛋白胨10g,酵母粉5g,加水至1L,调节PH值为7.4。
无机盐培养基(1L):NH4NO34 g;KH2PO4,4g;Na2HPO4,5.68g;CaCl2,0.78mg;MgSO4·6H2O,197.18mg;FeSO4,1.112mg;微量元素溶液TES,0.1mL;补充去离子水至1L;调节pH 7.0。
微量元素溶液TES(1L):ZnSO4·7H2O,2.32g;MnSO4·4H2O,1.78g;H3BO3,0.56g;CuSO4·5H2O,0.78g;Na2MoO4·2H2O,0.39g;CoCl2·6H2O,0.42g;EDTA,0.10g;NiCl2·6H2O,0.004g;KI,0.66g。
实施例1、“相似相容”配伍方法的建立
一、目标环境中的群落结构分析筛选主要优势种群
分析方法流程如图1所示。
1、选取胜利油田油泥罐中的石油污染的土壤,经过预处理(去除表面杂物然后铲取表层5cm以上的土壤),将土壤装在无菌袋存储于4℃保温箱至实验室,提取土壤基因组DNA。
2、以步骤1得到的土壤基因组DNA为模板,分别进行PCR扩增得到古菌菌落16SrDNA和细菌菌落16S rDNA。古菌16S rDNA的扩增体系和热循环程序见表1。细菌16S rDNA扩增体系和热循环程序见表2。
表1古菌16S rDNA的扩增体系和热循环程序
古菌PCR反应体系(50μl) 古菌热循环程序
10×PCR缓冲液:8μl ①预变性:94℃,5min
dNTPMixture:1μl ②变性:94℃,1min
109F:1μl(10μM) ③退火:50℃,45s
915R:1μl(10μM) ④延伸:72℃,1.5min
Taq酶:0.3μl ⑤回到②,30循环
无菌水:33.7μl ⑥保持4℃
DNA模板:2μl ⑦结束
表2细菌16S rDNA扩增体系和热循环程序
细菌PCR反应体系(50μl) 细菌热循环程序
10×PCR缓冲液:8μl ①预变性:94℃,5min
dNTPMixture:4μl ②变性:94℃,1min
8F-FAM:1μl(10μM) ③退火:51℃,1min
1492R:1μl(10μM) ④延伸:72℃,2min
Taq酶:0.3μl ⑤回到②,30循环
无菌水:33.7μl ⑥保持4℃,保温
DNA模板:2μl ⑦结束
109F:5’-ACKGCTCAGTAACACGT-3’
915R:5’-GTGCTCCCCCGCCAATTCCT-3’
8F-FAM:5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’
1492R:5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’
引物915R和引物-FAM的5’端采用羧基荧光素(6-carboxyfluorescein,FAM)标记。10×PCR缓冲液:宝日医生物技术(北京)有限公司,货号:9151AM。
3、取步骤2得到的古菌菌落PCR扩增产物和细菌菌落PCR扩增产物,采用常规试剂盒纯化、脱盐后进行酶切处理。酶切体系组成如表3所示。古菌菌落于37℃孵育酶切6小时,细菌菌落于65℃孵育酶切6小时。
表3酶切体系组成
10×PCR缓冲液:宝日医生物技术(北京)有限公司,货号:9151AM。
TaqI内切酶:生工生物工程(上海)股份有限公司,货号:B600244-0001Rs。
RsaI内切酶:生工生物工程(上海)股份有限公司,货号:B600224-0200。
4、完成步骤3后,分别将古菌和细菌的酶切产物脱盐干燥后用20μl超纯去离子甲酰胺溶解,4℃放置2小时后,取其中10μl与0.5μl的Liz500内标(国药集团化学试剂北京有限公司货号:ZA4322682)及4.5μl甲酰胺混合均匀,95℃变性5min,迅速转移到冰上冷却3min,然后上样到96孔板进行毛细管电泳和检测。电泳条件:毛细管进样电压为3.0kv;进样持续时间为30sec。峰高检测阈值为50RFU,片段长度检测范围50-900bp,对得到峰面积数据进行标准化处理,获得微生物群落T-RFLP谱图。
5、按照步骤2进行操作(其中,引物不采用荧光基团标记),将扩增产物插入pGEM-Teasy载体(Promega,USA)中并转化大肠杆菌DH5α菌株,经过蓝白斑筛选含有目的基因的白斑转化子;将白斑转化子进行T7/SP6扩增验证和筛选阳性克隆,筛选方法如下:以转化子菌悬液为模板采用采用空载体中两端的两段序列T7(5’-TAATACGACTCACTATAGGG-3’)和SP6(5’-GATTTAGGTGACACTATAG-3’)作为引物进行PCR扩增,若克隆菌中插入目标DNA片段则扩增片段的大小等于目标DNA大小和在两个引物中间的载体的自身大小(126bp),否则扩增片段仅为两个引物中间的载体的自身大小(126bp)。目标片段为细菌16S rRNA基因(1.5kb)时,扩增片段为1.6k左右为阳性克隆。
6、提取步骤5的阳性克隆基因组DNA,按照步骤2-4进行操作(使用细菌的扩增和酶切体系),得到阳性克隆的特征T-RFs。根据阳性克隆的特征T-RFs片段长度将克隆分类,将不同长度特征T-RFs片段对应的阳性克隆进行16S rDNA片段测序。所有阳性克隆分类汇总如表4所示。
表4细菌文库所有阳性克隆分类汇总表
综合步骤4得到的微生物群落T-RFLP分析结果和步骤6得到的阳性克隆特征T-RFs分析结果,选择二者共同含有且丰度最高的8种T-RFs,具体为168bp、463bp、309bp、305bp、315bp、79bp、417bp和468bp,并找出其对应的阳性克隆的16S rDNA片段测序结果,作为土壤内源优势类群参照序列。168bp、463bp、309bp、305bp、315bp、79bp、417bp和468bp对应的参照序列依次如序列表的序列1-8所示。
二、结合生物激活的分析结果,筛选出竞争占优势的细菌类群
生物激活实验在生物反应器中进行。反应器采用有机玻璃制成,有效尺寸为70cm(长)×60cm(宽)×25cm(高),基本结构如图2所示。反应器的底部设置多孔板,多孔板上面铺设一层70目的金属网筛,网筛上面再铺设约5cm厚度碎石层。实际应用中,也可采用其他可进行生物激活实验的生物反应器或装置替代。
实验组:加入来自目标环境的土壤(步骤一种油田油泥罐中的石油污染的土壤)干土(干土是将原始土壤放入通风橱风干后破碎后过50目金属网筛得到的,经检测,干土中总石油烃含量为137.85g/kg)、硝酸钠和磷酸二氢钠(土壤中总有机碳和氮磷质量比为200:10:1)、表面活性剂吐温80(1.5mL/kg干土)和5%土壤质量百分含量的锯屑,混匀。
对照组:只加入与实验组相同的干土。
实验组和对照组反应器运行60天,在此期间温度维持在25±1℃。每隔3天对反应器土壤进行翻动充氧并适时喷洒灭菌水控制土壤含水率在20±3%。分别在实验的第0天、第10天、第20天、第30天、第40天和第60天参照步骤一的方法测定实验组和对照组土壤的微生物群落T-RFLP和阳性克隆特征T-RFs。
综合微生物群落T-RFLP分析结果和阳性克隆特征T-RFs分析结果,选择二者共同含有且60天内丰度增长最多的7种T-RFs,具体为115bp,125bp,309bp,315bp,429bp,468bp,768bp,并找出其对应的阳性克隆的16S rDNA片段测序结果,作为竞争优势类群参照序列。115bp,125bp,309bp,315bp,429bp,468bp和768bp对应的参照序列依次如序列表的序列9-15所示。
表5反应器实验组和对照组中细菌主要类群动态变化的对比
三、筛选优势种群系统发育相似的菌株和配伍
1、从现有的菌种保藏中心中挑选50株可利用原油的菌株,将每一菌株的16S rDNA序列与步骤一和步骤二中确定的参照序列比对相似度。
所述可利用原油的菌株可通过如下方法筛选:(1)将菌株接种于LB液体培养基中培养至对数中期,将培养体系8000rpm离心10min,收集菌体沉淀;用无机盐培养基洗沉淀三次后重悬得到种子液。(2)将步骤1得到的种子液接种于含有10g/L原油的无机盐培养基中(菌液初始OD600=0.1),30度、150rpm培养7天,在培养结束后监测培养液的OD600数值。OD600值越高,菌株对于原油的利用能力越高。选择OD600值大于20的菌株作为候选菌株。
2、实验菌株挑选标准与结果
(1)在与步骤一确定的参照序列进行相似度比对的结果当中,选择与步骤一确定的任一参照序列相似度大于88%且原油利用能力最高的两个菌株(菌株H1和菌株M2)。
菌株H1为胜利盐单胞菌(Halomonas shengliensis),在中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC)的菌种编号为1.6444,菌株H1的16S rDNA序列(序列表的序列16)与79bp对应的参照序列(序列表的序列6)相似度为88.90%。
菌株M2为孤岛海杆状菌(Marinobacter gudaonensis),在中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC)的菌种编号为1.6294,菌株M2的16S rDNA序列(序列表的序列17)与168bp对应的参照序列(序列表的序列1)相似度为96.94%。
(2)在与步骤二确定的参照序列进行相似度比对的结果当中,选择与步骤二确定的任一参照序列相似度大于88%且原油利用能力最高的三个菌株(菌株P1、菌株A2和菌株R1)。
菌株P1为浅黄海洋杆菌(Pelagibacterium luteolum),在中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC)的菌种编号为1.10267,菌株P1的16S rDNA序列(序列表的序列18)与115bp对应的参照序列(序列表的序列9)相似度为95.17%。
菌株A2为粪产碱菌粪亚种(Alcaligenes faecalis subsp.phenolicus),在德国微生物菌种保藏中心(DSMZ)的菌种编号为16503,菌株A2的16S rDNA序列(序列表的序列19)与125bp对应的参照序列(序列表的序列10)相似度为95.35%。
菌株R1为海神鲁杰氏菌(Ruegeria marina),在中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC)的菌种编号为1.9108,菌株R1的16S rDNA序列(序列表的序列20)与768bp对应的参照序列(序列表的序列15)相似度为92.41%。
3、对照菌株挑选标准与结果
(1)在与步骤一确定的参照序列进行相似度比对的结果当中,选择与步骤一确定的所有参照序列相似度都小于88%且原油利用能力最高的两个菌株(菌株F7和菌株BC6)。
菌株F7为施氏微杆菌(Microbacterium schleiferi),在中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC)的菌种编号为1.17096,菌株F7的16S rDNA序列如序列表的序列21所示。
菌株BC6为蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus),在中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC)的菌种编号为1.17094,菌株BC6的16S rDNA序列如序列表的序列22所示。
(2)在与步骤二确定的参照序列进行相似度比对的结果当中,选择与步骤二确定的所有参照序列相似度都小于88%且原油利用能力最高的三个菌株(菌株C1A、菌株BC9和菌株6S2)。
菌株C1A为赤红球菌(Rhodococcus ruber),在中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC)的菌种编号为1.17096,菌株C1A的16S rDNA序列如序列表的序列23所示。
菌株BC9为鲁氏不动杆菌(Acinetobacter lwoffii),中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC)的菌种编号为1.17092,菌株BC9的16S rDNA序列如序列表的序列24所示。
菌株6S2为松嫩假单胞菌(Pseudomonas songnenensis),在中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC)的菌种编号为1.17095,菌株6S2的16S rDNA序列如序列表的序列25所示。
上述菌株的原油利用能力检测结果见表6。
四、外源微生物投加效果检测
1、将菌株分别接种于LB液体培养基中培养至对数中期,将培养体系8000rpm离心10min,收集菌体沉淀;用无机盐培养基洗沉淀三次后重悬得到种子液。
2、将步骤1得到的种子液接种于含有10g/L原油(胜利油田)的无机盐培养基中(菌液初始OD600=0.1),30度、150rpm培养7天,在培养结束后监测培养液的OD600数值(表6)。
表6
编号 OD600值
菌株H1 42.5
菌株M2 37.8
菌株P1 53.2
菌株A2 42.7
菌株R1 30.4
菌株F7 32.7
菌株BC6 42.1
菌株C1A 39.2
菌株BC9 35.6
菌株6S2 32.7
3、实验在生物反应器中进行。反应器采用有机玻璃制成,有效尺寸为70cm(长)×60cm(宽)×25cm(高),基本结构如图2所示。反应器的底部设置多孔板,多孔板上面铺设一层70目的金属网筛,网筛上面再铺设约5cm厚度碎石层。
分为如下四组进行实验(每个反应器中含有实施例1中步骤一预处理后的土壤10公斤)
A组(空白对照组):不添加任何微生物;
B组(实验组):将步骤1得到的菌株H1、菌株M2、菌株P1、菌株A2和菌株R1的种子液离心后用400ml无机盐培养基洗沉淀三次后重悬并调整菌浓度得到菌液(每种菌株的菌悬液初始OD600为0.2),将5种菌悬液等体积混合后加至含有原油污染土壤的生物反应器中;
C组(菌株对照组1):将步骤1得到的菌株F7、菌株BC6、菌株C1A、菌株BC9和菌株6S2的种子液离心后用400ml无机盐培养基洗沉淀三次后重悬并调整菌浓度得到菌液(每种菌株的菌悬液初始OD600为0.2),将5种菌悬液等体积混合后加至含有原油污染土壤的生物反应器中;
D组(菌株对照组2):将步骤1得到的菌株H1、菌株M2、菌株C1A、菌株BC9和菌株6S2的种子液离心后用400ml无机盐培养基洗沉淀三次后重悬并调整菌浓度得到菌液(每种菌株的菌悬液初始OD600为0.2),将5种菌悬液等体积混合后加至含有原油污染土壤的生物反应器中;
E组(菌株对照组3):将步骤1得到的菌株F7、菌株BC6、菌株P1、菌株A2和菌株R1的种子液离心后用400ml无机盐培养基洗沉淀三次后重悬并调整菌浓度得到菌液(每种菌株的菌悬液初始OD600为0.2),将5种菌悬液等体积混合后加至含有原油污染土壤的生物反应器中;
生物反应器置于室温下运行45天,在此期间温度维持在25±1℃。每隔3天对反应器土壤进行翻动充氧并适时喷洒灭菌水控制土壤含水率在20±3%。实验结束后按照中华人民共和国国家环境标准HJ783-2016土壤和沉积物有机物的提取加压流体萃取法对各组土壤的原油含油率进行测定。结果如表7所示。
表7
分组 含油率(%) 降解率(%)
A组(空白对照组) 13.15 4.64
B组(实验组) 5.41 60.76
C组(菌株对照组1) 10.32 25.16
D组(菌株对照组2) 9.75 29.30
E组(菌株对照组3) 11.26 27.75
结果显示,采用本发明的利用“相似相容”配伍方法指导筛选的菌株组合、投加到目标环境石油污染土壤中,具有明显高于其他组合的原油降解率。
序列表
<110> 北京大学
<120> 一种指导微生物配伍的“相似相容”原则及其提高外源投加微生物功能与效率的配伍方法
<160> 25
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1499
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgagc 60
ggtaacaggg gtgcttgcac ccgctgacga gcggcggacg ggtgagtaat gcttaggaaa 120
ctgcccagta gtgggggata gcccggggaa acccggatta ataccgcgta cgcccttagg 180
gggaaagcag gggatcttcg gaccttgcgc tattggatgt gcctaagtcg gattagctag 240
ttggtggggt aaaggcctac caaggcgacg atccgtagct ggtctgagag gatgatcagc 300
cacatcggga ctgagacacg gcccgaactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga 360
caatgggggc aaccctgagg cggccatgcc gcgtgtgtga agaaggcttt cgggttgtag 420
agcactttca gtgaggagga aggcttgaag gttaataccc ttcaggattg acgttactca 480
cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg gtgcaagcgt 540
taatcggaat tactgggcgt aaagcgcgcg taggtggttt gataagcgag atgtgaaagc 600
cccgggctta acctgggaac ggcatttcga actgacaggc tagagtgtgg tagaggggtg 660
tggaatttcc tgtgtagcgg tgtaatgcgt agatatagga aggaacacca gtggcgaarg 720
cggcaccctg gaccaacact gacactgagg tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag 780
ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg tcaactagcc gttgggactc ttgaagtctt 840
agtggcgcag ctaacgcact aagttgaccg cctggggagt acggccgcaa ggttaaaact 900
caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgacgcaacg 960
cgaagaacct tacctggcct tgacatgctg agaatcctgc agagatgcgg gagtgccttc 1020
gggagctcag acacaggtgc tgcatggccg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt 1080
aagtcccgta acgagcgcaa cccctatccc tagttgctag cagttcggct gagaactcta 1140
gggagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaggtca tcatggccct 1200
tacggccagg gctacacacg tgctacaatg gcgcgcacag agggctgcaa acccgcgagg 1260
gggagccaat ctcacaaaac gcgtcgtagt ccggatcgca gtctgcaact cgactgcgtg 1320
aagtcggaat cgctagtaat cgtgaatcag aatgtcacgg tgaatacgtt cccgggcctt 1380
gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg gattgcacca gaagtggtta gtctaacctt 1440
cgggaggacg atcaccacgg tgtggttcat gactggggtg aagtcgtaac aaggtaacc 1499
<210> 2
<211> 1502
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc 60
ggaaacgatc ctagcttgct aggaggcgtc gagcggcgga cgggtgagta acgcgtgaga 120
atctgcccat ttgtggggga taactcgggg aaactcgagc taataccgca taatccctac 180
gggggaaagc aggggacctt cgggccttgt gcagatggat gagctcgcgt cggattagct 240
tgttggtgag gtaaaggctc accaaggcga cgatccgtag ctggtctgag aggatgatca 300
gccacaccgg gactgagaca cggcccggac tcctacggga ggcagcagtg gggaatcttg 360
gacaatgggg gcaaccctga tccagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttcgggttgt 420
aaagcacttt cagtagggag gaaggcttac cgctaataac ggtgagtact tgacgttacc 480
tacagaagaa gcaccggcta atttcgtgcc agcagccgcg gtaatacgaa aggtgcgagc 540
gttaatcgga attactgggc gtaaagcgcg cgtaggcggt ttgttaagtc agatgtgaaa 600
gccccgggct caacctggga attgcatttg aaactggcag gctagagtgc agtagaggga 660
ggtggaattt ccggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatcg gaaggaacac cagtggcgaa 720
rgcggcctcc tggactgaca ctgacgctga ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt 780
agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtctactag tcgttgggaa tcttagtatt 840
cttggtgacg aagttaacgc gataagtaga ccgcctgggg agtacggccg caaggttaaa 900
actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca 960
acgcgaagaa ccttaccagg ccttgacatc cttggaactt tctagagata gattggtgcc 1020
ttcgggagcc aagtgacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1080
gttaagtccc gtaacgagcg caacccttgt ccctagttgc cagcacttcg ggtgggaact 1140
ctagggagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga cgacgtcaag tcatcatggc 1200
ccttacggcc tgggctacac acgtgctaca atgggcagta cagagggccg cgaagtcgcg 1260
aggccaagca gatcccttaa aactgttcgt agtccggatt ggagtctgca actcgactcc 1320
atgaagtcgg aatcgctagt aatcgcgaat cagaatgtcg cggtgaatac gttcccgggc 1380
cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtggattgca ccagaagtag ttagtctaac 1440
cttcgggagg acgattacca cggtgtggtt catgactggg gtgaagtcgt aacaaggtaa 1500
cc 1502
<210> 3
<211> 1484
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ttaacacatg caagtcgagg 60
ggcagcacgt cttcggatgg tggcgaccgg cgcacgggtg cgtaacgcgt atacaatcta 120
ccttttacag gggcatagcc cggggaaacc cggattaata tcccatggta tcatttagtg 180
gcatcacttg aatgattaaa gctttggcgg taaaagatga gtatgcgttc tattagctag 240
atggtaaggt aacggcttac catggctttg atagataggg gtcctgagag ggagatcccc 300
cacactggta ctgagacacg gaccagactc ctacgggagg cagcagtgag gaatattgga 360
caatgggcga gagcctgatc cagccatgcc gcgtgcagga agactgccct atgggttgta 420
aactgctttt atacgggaag aaacacctcc acgtgtggag gtttgacggt accgtacgaa 480
taaggatcgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggaggatcca agcgttatcc 540
ggaatcattg ggtttaaagg gtccgtaggc gggagagtca gtcagtggtg aaagtctgca 600
gctcaactgt agaactgcca ttgatactgc tttccttgag taattatgaa gtggttagaa 660
tatgtagtgt agcggtgaaa tgcatagata ttacatagaa taccgattgc gaaggcagat 720
cactaataat ttactgacgc cgatggacga aagcgtakgt agcgaacagg attagatacc 780
ctggtagtct acgccgtaaa cgatggttac tagctgttcg gctcgattaa gagctgagtg 840
gctaagcgaa agtgataagt aacccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa 900
ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gatacgcgag 960
gaaccttacc agggcttaaa tgtagtctga caggggtgga aacacctcct ccttcgggca 1020
gattacaagg tgctgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgccgt gaggtgtcag gttaagtcct 1080
ataacgagcg caacccctgt ggttagttgc cagcgagtca agtcgggaac tctagccaga 1140
ctgccggtgc aaaccgtgag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcacgg cccttacgtc 1200
ctgggccaca cacgtgctac aatggtaggg acagagagca gccactgggc gaccaggagc 1260
gaatctataa accctatcac agttcggatc ggagtctgca actcgactcc gtgaagctgg 1320
aatcgctagt aatcgcatat cagccatgat gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac 1380
accgcccgtc aagccatgga agctgggggt acctgaagtc ggtcaccgca aggagccgcc 1440
tagggtaaaa ctggtaactg gggctaagtc gtaacaaggt aacc 1484
<210> 4
<211> 1475
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg 60
ggtagaaaga acttgctctt ttgagaccgg cgcacgggtg cgtaacgcgt atacaatctg 120
cctcttactg cgggatagcc cagagaaatt tggattaaca ccgcgtagta taattacttg 180
gcatcaagtt attattaaag gttacggtaa gagatgagta tgcgttctat tagctagatg 240
gagtggtaac ggcacaccat ggcaacgata gataggggcc ctgagagggg gatcccccac 300
actggtactg agacacggac cagactccta cgggaggcag cagcgaggaa tattggacaa 360
tgggggcaac cctgatccag ccatgccgcg tgcaggaaga ctgccctatg ggctgtaaac 420
tgcttttgta cgggaagaaa cactgccacg tgtggcagct tgacggtacc gtaagaataa 480
ggatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga ggatccaagc gttatccgga 540
atcattgggt ttaaagggtc cgtaggtgga caattaagtc agaggtgaaa tcctgcagct 600
caactgtaga attgcctttg atactggttg tcttgaatca atgtgaagtg gttagaatat 660
gtagtgtagc ggtgaaatgc atagatatta catagaatac caattgcgaa ggcagatcac 720
taacattgca ttgacactga tggacgaaag cgtggggagc gaacaggatt agataccctg 780
gtagtccacg ccgtaaacga tggatactag ctgttcgggt ttacctgagt ggctaagcga 840
aagtgataag tatcccacct ggggagtacg ggcgcaagcc tgaaactcaa aggaattgac 900
gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgatacgcga ggaaccttac 960
cagggcttaa atgtaagttg cattagctgg agacagctat ttcttcggac cacttacaag 1020
gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtca ggttaagtcc tataacgagc 1080
gcaacccctg ttgttagttg ccagcgagtc aagtcgggaa ctctagcaag actgccagtg 1140
caaactgtga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcacg gcccttacgt cctgggctac 1200
acacgtgcta caatggtagg gacagagagc agccactggg cgaccaggag cgaatctaca 1260
aaccctatca cagttcggat cggagtctgc aactcgactc cgtgaagctg gaatcgctag 1320
taatcgcata tcagccatga tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt 1380
caagccatgg aagctgggag tgcctgaagt ccgtcaccgc aaggagcggc ctagggtaaa 1440
atcggtaact agggctaagt cgtaacaagg taacc 1475
<210> 5
<211> 1491
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac 60
ggtaacagga attagcttgc taatttgctg acgagtggcg cacgggtgcg taacgcgtat 120
acaatctgcc tttaagcggg gaatagccca tggaaacgtg gattaatacc ccatagtata 180
tagacatctc ctgatgatta tattaaacat ttatggctta aagatgagta tgcgtcctat 240
tagttagttg gtaaggtaac ggcttaccaa gaccgcgata ggtaggggtc ctgagaggga 300
gatcccccac actggtactg agacacggac cagactccta cgggaggcag cagtgaggaa 360
tattggacaa tggaggcaac tctgatccag ccatgccgcg tgcaggaaga cggccctatg 420
ggttgtaaac tgcttttata cgggaagaac cactccgacg tgtcggagct tgacggtacc 480
gtatgaataa ggaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtccaagc 540
gttatccgga atcattgggt ttaaagggtc cgtaggcgga ataataagtc agtggtgaaa 600
gtctgcagct caactgtaga attgccattg atactgttgt tcttgaatta ttatgaagtg 660
gttggaaaga gtagtgtagc ggtgaaatgc atagatatta ctcagaacac ctattgcgaa 720
ggcagatcac taataatata ttgacgctga gggacgaaag cgtaggtagc gaacaggatt 780
agataccctg gtagtctacg ccgtaaacga tggttactag ctgtccggct cgattgagag 840
ctgggtggtt aagcgaaagt gataagtaac ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa 900
actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgat 960
acgcgaggaa ccttaccagg gcttaaatgt agtctgacag gtctggaaac agacccttct 1020
tcggacagat tacaaggtgc tgcatggttg tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcaggtt 1080
aagtcctata acgagcgcaa cccctgtggt tagttgccag cgagtcatgt cgggaactct 1140
aaccagactg ccggtgcaaa ccgcgaggaa ggtggggatg acgtcaaatc atcacggccc 1200
ttacgtcctg ggccacacac gtgctacaat ggtagggaca gagggcagct accccgcgag 1260
gggatgcgaa tcttcaaacc ctatcacagt tcggatcgca gtctgcaact cgactgcgtg 1320
aagctggaat cgctagtaat cgcatatcag ccatgatgcg gtgaatacgt tcccgggcct 1380
tgtacacacc gcccgtcaag ccatggaagc cgggggtacc tgaagtccgt caccgtaagg 1440
agcggcctag ggtagaactg gtaactgggg ctaagtcgta acaaggtaac c 1491
<210> 6
<211> 1495
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc 60
gagaaaggtc ttcggaccga gtacagcggc ggacgggtga gtaacgcgta ggaatttgcc 120
cagtagtggg ggacaactcg gggaaacccg agctaatacc gcatacgccc tacgggggaa 180
agcaggggat cttcggacct tgcgctattg gataagcctg cgtcggatta gctagttggt 240
agggtaaggg cctaccaagg cgacgatccg tagctggtct gagaggatga tcagccacac 300
tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata ttggacaatg 360
ggggaaaccc tgatccagcc atgccgcgtg tgtgaagaag gctctagggt tgtaaagcac 420
tttcagcagg gaggaaaggt taacggttaa tacccgttag ctgtgacgtt acctgcacaa 480
gaagcaccgg caaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttaatc 540
ggaattactg ggcgtaaagc gcgcgtaggc ggtttggtaa gctggatgtg aaatccccgg 600
gctcaacctg ggaactgcat tcagaactgc caggctagag tacagtagag gatagtggaa 660
tttccggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tcggaaggaa catcagtggc gaaggcggct 720
atctggactg atactgacgc tgaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc 780
ctggtagtcc acgctgtaaa cgatgtcaac tagccgttgg ggggcttgtc cccttagtgg 840
cgcagctaac gcgataagtt gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat 900
gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag 960
aaccttacca ggtcttgaca tcctcggaac tttccagaga tggattggtg ccttcgggaa 1020
ccgagtgaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc 1080
ccgtaacgag cgcaaccctt gtccttagtt gccagcacgt aatggtggga actctaagga 1140
gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat ggcccttacg 1200
acctgggcta cacacgtgct acaatggccg gtacaaaggg ttgccaagcc gcgaggtgga 1260
gctaatccca gaaaaccgtt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt 1320
cggaatcgct agtaatcgcg aatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac 1380
acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag tgggtagact aaccctcggg 1440
aggtcgctca ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg taacc 1495
<210> 7
<211> 1422
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgg ataaggcatg caagtcaagg 60
ggtccttcgg gacaccggca aacggggtag taacaggtag gaacataccc agaagtcagg 120
aatagctcat cgaaaggtgg ggtaatactt gatagtctcg taagagtaaa gcttcggcgc 180
ttctggaatg gcctgcttcg tatcagcttg ttggtgaggt aaaagctcac caaggctatg 240
acgcgtaggg gaggtgagag cctgaccccc accattggca ctgagacact ggccaaacac 300
ctacgggtgg ctgcagtcga gaatcttccg caatgcacga gagtgtgacg gagcgacgcc 360
gcgtgatcga tgaagcactt cggtgtgtaa aggtctttta taggggaaga agtttattga 420
cggtacctta tgaataaggg gttcctaaac tcgtgccagc aggagcggta atacgagtgc 480
cccaagcgtt atccggaatt attgggcgta aagggtgcgt aggcggttgt gttagtctct 540
gttaaaatct ttcggcttaa ccgagagtcc ggcagagaaa cggcacgact tgaggatgtg 600
agaggtgtgt ggaactcacg gtgtaggggt gaaatccgtt gatatcgtgg ggaacgccaa 660
aggcgaaggc agcacactgg cacattcctg acgctgaggc acgaaagcca gggtagcgaa 720
gcggattaga tacccgcgta gtcctggccc taaacgttgt ccgctagctt ttgggagtat 780
cgaccctctc agaggcgaag ctaacgcgtt aagcggaccg cctgggtagt acgagcgcaa 840
gcttaaaact caaaggaata gacgggggct cgcacaagcg gtggagcgtg tggtttaatt 900
cgacgctaag cgaagaacct caccaaggct agacatctag acgaactctc tgagaaacca 960
gaggggtctt cggacggcta gacaggtgat gcatggctgt cgtcagttcg tggcttgacc 1020
tgttccctta agtggggtaa cgaacgcaac ccttatcgtg tgttacaagt gtcacacgag 1080
actgctgtct cacgacagag gaaggtgagg atgacgccaa gtcagcatgt cccttgatgc 1140
ctttggctac acacgcgcta caatggtaca tacagtgggt cgcgacgggg taaccctgag 1200
ctaatcctcc aaagtgtgcc tcagttcgga tagaggtctg caactcgacc tcttgaagtt 1260
ggaatcgcta gtaatcgtgg gtcagcacac cacggtgaat acgttctcga gccttgtact 1320
caccgcccgt cacgtcaagg gagttggggg tacccgaagt tcggccctcg ggccggccga 1380
aggtaaattc aatgacaggg acgaagtcgt aacaaggtaa cc 1422
<210> 8
<211> 1481
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaatacatg caagtcgaac 60
ggtaagtagt gtgcttgcac attacacgag tggcgcacgg gtgcgtaacg cgtatgcaac 120
ctacctttaa ctgggggata gcccggagaa attcggatta ataccccata gtatcataga 180
ttcgcatgat gaaatgatta aagatttatt ggttaaagat gggcatgcgt ctgattagtt 240
agtaggtagt gtaacggact acctaggcga tgatcagtag gggttctgag aggattatcc 300
cccacactgg cactgagata cgggccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatattg 360
gtcaatgggc gagagcctga accagccatg ccgcgtgcag gaagacggcc ttctgggttg 420
taaactgctt ttatcaggga acaaaatggc catgcgtggc aaattgcgtg tacctgagga 480
atgagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc aagcgttgtc 540
cggatttatt gggtttaaag ggtgcgtagg tggctaatta agtcagtggt gaaagtctgt 600
agcttaacta tagaattgcc attgatactg gttagcttga gtatagacga ggtaggcgga 660
attcatggtg tagcggtgaa atgcatagat accatgaaga acaccgatag cgaaggcagc 720
ttactaggct ataactgaca ctgaggcacg aaagcgtggg gagcgaacag gattagatac 780
cctggtagtc cacgctgtaa acgatgctca ctcgatgttt gcgatacaca gtatgcgtcc 840
aagcgaaagc gttaagtgag ccacctgggg agtacgctcg caagagtgaa actcaaagga 900
attgacgggg gtccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa 960
ccttacctgg gctagaatgt gagcgcaatc cccagagatg gggagttctt cggacgtgaa 1020
acaaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgttgggtta agtcccgcaa 1080
cgagcgcaac ccctatgttt agttgccagc atgtaatgat ggggactcta aacagactgc 1140
ctgcgcaagc agagaggaag gaggggatga cgtcaagtca tcatggccct tacgcccagg 1200
gctacacacg tgctacaatg gcgtatatag agggtagcta cacggtaacg tgatgccaat 1260
ctcaaaaagt acgtctcagt tcggattgag gtctgcaact cgacctcatg aagtcggaat 1320
cgctagtaat cgcgtatcag caatgacgcg gtgaatacgt tcccggacct tgtacacacc 1380
gcccgtcaag ccatggaagt tgggaggacc tgaagacagt tgccgcaagg cgttgtttag 1440
ggttatacca gtaactaggg ctaagtcgta acaaggtaac c 1481
<210> 9
<211> 1446
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 9
agagtttgat cctggctcag aacgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac 60
gatctcttcg gagatagtgg cagacgggtg agtaacgcgt gggaacctac cttgtagtac 120
ggaatagcct cgggaaactg ggattaatac cgtatacgcc cttaggggga aagatttatc 180
gctataagat gggcccgcgt ttgattagct agttggtggg gtaatggcct accaaggcga 240
cgatcaatag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac 300
tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg 360
ccgcgtgagt gatgaaggcc ctagggttgt aaagctcttt cagcagggat gataatgaca 420
gtacctgcag aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg 480
ctagcgttgt tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggactatt aagtcagagg 540
tgaaatcccg gggctcaact ccggaactgc ctttgatact ggtagtcttg agtccgagag 600
aggcgagtgg aactcctagt gtagaggtgg aattcgtaga tattaggaag aacaccagtg 660
gcgaaggcgg ctcactggct cggtactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 720
ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aactatggaa gctagccgtt gggggattta 780
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catggccctt acgggctggg ctacacacgt gctacaatgg cggtgacaga gggcagccac 1200
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ctaactttta gaggcagccg accacggtag ggtcagcgac tggggtgaag tcgtaacaag 1440
gtaacc 1446
<210> 10
<211> 1502
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 10
agagtttgat cctggctcag attgaacgct agcgggatgc tttacacatg caagtcgaac 60
ggcagcgcga ggtaagcttg cttactttgg cggcgagtgg cgaacgggtg agtaatgtat 120
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attttggaca atgggggcaa ccctgatcca gccatcccgc gtgtgcgatg aaggccttcg 420
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tgctcgcaag agaaccggaa cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga 1080
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cc 1502
<210> 11
<211> 1481
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 11
agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg 60
ggtatagttt agcttgctaa actagagacc ggcgcacggg tgagtaacgc gtatgcaacc 120
taccttttac agagggatag cccggagaaa tccggattaa taccttatag tattaagatt 180
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<210> 12
<211> 1491
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 12
agagtttgat cctggctcag gatgaacgct agcggcaggc ctaacacatg caagtcgagg 60
ggtaacaggg aagagcttgc tctttcgctg acgaccggcg cacgggtgcg taacgcgtat 120
acaacctacc ttttggaggg gaatagccca gggaaacttg gattaatgcc ccatagtatg 180
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tagttagttg gtaaggtaac ggcttaccaa ggcagcgata ggtaggggtc ctgagaggga 300
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tattggacaa tgggcgagag cctgatccag ccatgccgcg tgcaggaaga ctgccctatg 420
ggttgtaaac tgcttttaca gaggaagaac cactcccacg tgtgggagtt tgacggtact 480
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<210> 13
<211> 1422
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 13
agagtttgat cctggctcag ggtgaacgct ggcggcgtgg atgaggcatg caagtcgaat 60
gagtttatac tcatggcaga cgaggtagga acacgtaggt tacgtacccc aaagtcaggg 120
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<210> 14
<211> 1488
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 14
agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgggc ttaacacatg caagtcgcgg 60
gagaaggggt ccttcggggc cctggagacc ggcggatggg tgagtaacgc gtaggtaatc 120
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gtggcgcagc taacgcacta agttgaccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc 900
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agtcccgcaa cgagcgcaac ccctgtggtt agttaccagc acgtaaaggt ggggactcta 1140
gccagactgc ctacgcaagt agtgaggaag gtggggacga cgtcaagtca tcatggccct 1200
tacgtccagg gctgcacacg tgctacaatg gatggtacaa tgggtcgcca cccagcgatg 1260
gggagcaaat ccacaaagcc attctcagtt cggattggag tctgcaactc gactccatga 1320
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gtacacaccg cccgtcaagc gatggaagtc aggagtacct gatgtcgccc cttcaagggg 1440
tgcctagggt aagcctggta actggcgcta agtcgtaaca aggtaacc 1488
<210> 15
<211> 1447
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 15
agagtttgat cctggctcag aacgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc 60
gcgcccttcg gggtgagcgg cggacgggtg agtaacgcgt gggaacgtgc cctcttctgc 120
ggaatagcca ctggaaacgg tgagtaatac cgcatacgcc cttttgggga aagatttatc 180
ggaggaggat cggcccgcgt tggattaggt agttggtggg gtaatggcct accaagccta 240
cgatccatag ctggttttag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac 300
tcctacggga ggcagcagtg gggaatctta gacaatgggc gcaagcctga tctagccatg 360
ccgcgtgagt gacgaaggcc ctagggtcgt aaagctcttt cgcctgtgat gataatgaca 420
gtagcaggta aagaaacccc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggggg 480
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gcaacgcgca gaaccttacc agcgtttgac atccttatcg cggattccag agatggtttc 960
cttcagctcg gctggataag tgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag 1020
atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctatctt tagttgctac catttagttg 1080
ggcactctaa agagaccgcc ggtgataagc cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct 1140
catggccctt acacgctggg ctacacacgt gctacaatgg cggtgacaga gggcagctac 1200
ttggcgacaa gatgctaatc cctaaaagcc gtctcagttc ggattgcact ctgcaactcg 1260
ggtgcatgaa gttggaatcg ctagtaatcg cagatcagca tgctgcggtg aatacgttcc 1320
cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg ttctacccga agccggtgcg 1380
ctaacctttt ggaggcagcc gaccacggta gggtcagcga ctggggtgaa gtcgtaacaa 1440
ggtaacc 1447
<210> 16
<211> 1460
<212> DNA
<213> 胜利盐单胞菌(Halomonas shengliensis)
<400> 16
attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggaaacgatc ctagcttgct 60
aggaggcgtc gagcggcgga cgggtgagta acgcatagga atctgcccgg tagtggggga 120
taacctgggg aaacccaggc taataccgca tacgtcctac gggagaaagc aggggatctt 180
cggaccttgc gctatcggat gagcctatgt cggattagct ggttggtgag gtaatggctc 240
accaaggcga cgatccgtag ctggtctgag aggatgatca gccacatcgg gactgagaca 300
cggcccgaac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gcaagcctga 360
tccagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggcc ttcgggttgt aaagcacttt cagtggggaa 420
gaaatcctcg gggctaatac cctcgaggga ggacatcacc cacagaagaa gcaccggcta 480
actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcgagc gttaatcgga attactgggc 540
gtaaagcgcg cgtaggcggc ctgataagcc ggttgtgaaa gccccgggct caacctggga 600
acggcatccg gaactgtcag gctagagtgc aggagaggaa ggtagaattc ccggtgtagc 660
ggtgaaatgc gtagagatcg ggaggaatac cagtggcgaa ggcggccttc tggactgaca 720
ctgacgctga ggtgcgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg 780
ccgtaaacga tgtcgactag ccgttggggt ccttgagacc tttgtggcgc agttaacgcg 840
ataagtcgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg 900
cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctacc 960
cttgacatcg agagaacttg gcagagatgc cttggtgcct tcgggaactc tcagacaggt 1020
gctgcatggc cgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg taacgagcgc 1080
aatccttgtc cctatttgcc agcgattcgg tcgggaactc tagggagact gccggtgaca 1140
aaccggagga aggtggggac gacgtcaggt catcatggcc cttacgggta gggctacaca 1200
cgtgctacaa tggccggtac aaagggttgc gaagccgcga ggtggagcca atcccgaaaa 1260
gccggtctca gtccggatcg gagtctgcaa ctcgactccg tgaagtcgga atcgctagta 1320
atcgtgaatc agaatgtcac ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac 1380
accatgggag tggactgcac cagaagtggt tagcctaact tcggagggcg atcaccacgg 1440
tgtggttcat gactggggtg 1460
<210> 17
<211> 1501
<212> DNA
<213> 孤岛海杆状菌(Marinobacter gudaonensis)
<400> 17
agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgagc 60
ggtaacaggg ggagcttgct ccctgctgac gagcggcgga cgggtgagta atgcatagga 120
atctgcccag tagtggggga tagcccgggg aaacccggat taataccgca tacgcccttt 180
gggggaaagc aggggatctt cggaccttgc gctattggat gagcctatgt cggattagct 240
agttggtggg gtaaaggccc accaaggcga cgatccgtag ctggtctgag aggatgatca 300
gccacatcgg gactgagaca cggcccgaac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg 360
gacaatgggg gcaaccctga tccagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggct ttcgggttgt 420
aaagcacttt cagtgaggag gaaaaccttc tggttaatac ccaggaggct tgacgttact 480
cacagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc 540
gttaatcgga attactgggc gtaaagcgcg cgtaggtggt ttgataagcg agatgtgaaa 600
gccccgggct taacctggga acggcatttc gaactgtcag gctagagtgt ggtagagggt 660
agtggaattt cctgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatag gaaggaacac cagtggcgaa 720
ggcggctacc tggaccaaca ctgacactga ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt 780
agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcaactag ccgttgggac tcttgaagtc 840
ttagtggcgc agctaacgca ctaagttgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa 900
ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgacgcaa 960
cgcgaagaac cttacctggc cttgacatgt tgggaacttt ccagagatgg attggtgcct 1020
tcgggaaccc aaacacaggt gctgcatggc cgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg 1080
ttaagtcccg taacgagcgc aacccctatc cctagttgct agcagttcgg ctgagaactc 1140
tagggagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaggt catcatggcc 1200
cttacggcca gggctacaca cgtgctacaa tggcgcgcac agagggctgc aaacccgcga 1260
gggggagcca atctcacaaa acgcgtcgta gtccggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg 1320
tgaagtcgga atcgctagta atcgtgaatc agaatgtcac ggtgaatacg ttcccgggcc 1380
ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tggattgcac cagaagtggt tagtctaacc 1440
ttcgggagga cgatcaccac ggtgtggttc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtaac 1500
c 1501
<210> 18
<211> 1408
<212> DNA
<213> 浅黄海洋杆菌(Pelagibacterium luteolum)
<400> 18
aacgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac gcactcttcg gagtgagtgg 60
cagacgggtg agtaacgcgt gggaatctac ccagtccttc ggaatagctc ctggaaacgg 120
gaattaatac cggatacgcc cttttgggga aagatttatc gggattggat gagcccgcgt 180
aagattagct agttggtggg gtaatggcct accaaggcga cgatctttag ctggtctgag 240
aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg 300
gggaatattg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgagt gatgaaggcc 360
ttagggttgt aaagctcttt caccggtgaa gataatgacg gtaaccggag aagaagcccc 420
ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg ctagcgttgt tcggaattac 480
tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggattggt cagttagggg tgaaatcccg gagctcaact 540
ccggaactgc ctttaatact gccagtctag agaccgagag aggtaagtgg aactcctagt 600
gtagaggtgg aattcgtaga tattaggaag aacaccagtg gcgaaggcgg cttactggct 660
cggaactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt 720
ccacgccgta aactatggaa gctagccgtt ggggtgttta cacttcagtg gcgcagctaa 780
cgcattaagc ttcccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg 840
ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc 900
agcccttgac atcccggtcg cgatttccag agatggattt cttcagttcg gctggaccgg 960
tgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca 1020
acgagcgcaa ccctcgcctt tagttgccat catttagttg ggcactctag agggactgcc 1080
ggtgataagc cggaggaagg tggggatgag gtcaagtcat catggccctt acgggctggg 1140
ctacacacgt gctacaatgg cggtgacaga gggcagctac ttggcgacaa gatgctaatc 1200
cctaaaaacc gtctcagttc ggattgcact ctgcaactcg ggtgcatgaa gttggaatcg 1260
ctagtaatcg cagatcagca tgctgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc 1320
cgtcacacca tgggagttgg ttctacccga agccggtgcg ctaacctttt ggaggcagcc 1380
gaccacggta gggtcagcga ctggggtg 1408
<210> 19
<211> 1418
<212> DNA
<213> 粪产碱菌粪亚种(Alcaligenes faecalis subsp. phenolicus)
<400> 19
attgaacgct agcgggatgc tttacacatg caagtcgaac ggcagcgcga gagagcttgc 60
tctcttggcg gcgagtggcg gacgggtgag taatatatcg gaacgtgccc agtagcgggg 120
gataactact cgaaagagtg gctaataccg catacgccct acgggggaaa gggggggatc 180
gcaagacctc tcactattgg agcggccgat atcggattag ctagttggtg gggtaaaggc 240
tcaccaaggc aacgatccgt agctggtttg agaggacgac cagccacact gggactgaga 300
cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaattt tggacaatgg gggaaaccct 360
gatccagcca tcccgcgtgt atgatgaagg ccttcgggtt gtaaagtact tttggcagag 420
aagaaaaggt atctcctaat acgagatact gctgacggta tctgcagaat aagcaccggc 480
taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg 540
gcgtaaagcg tgtgtaggcg gttcggaaag aaagatgtga aatcccaggg ctcaaccttg 600
gaactgcatt tttaactgcc gagctagagt atgtcagagg ggggtagaat tccacgtgta 660
gcagtgaaat gcgtagatat gtggaggaat accgatggcg aaggcagccc cctgggataa 720
tactgacgct cagacacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca 780
cgccctaaac gatgtcaact agctgttggg gccgttaggc cttagtagcg cagctaacgc 840
gtgaagttga ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg 900
acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta attcgatgca acgcgaaaaa ccttacctac 960
ccttgacatg tctggaaagc cgaagagatt tggccgtgct cgcaagagaa ccggaacaca 1020
ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080
cgcaaccctt gtcattagtt gctacgcaag agcactctaa tgagactgcc ggtgacaaac 1140
cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct catggccctt atgggtaggg cttcacacgt 1200
catacaatgg tcgggacaga gggtcgccaa cccgcgaggg ggagccaatc tcagaaaccc 1260
gatcgtagtc cggatcgcag tctgcaactc gactgcgtga agtcggaatc gctagtaatc 1320
gcggatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc ccgtcacacc 1380
atgggagtgg gtttcaccag aagtaggtag cctaaccg 1418
<210> 20
<211> 1386
<212> DNA
<213> 海神鲁杰氏菌(Ruegeria marina)
<400> 20
aacgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc gcgcccttcg gggtgagcgg 60
cggacgggtt agtaacgcgt gggaacgtgc ccttctctac ggaatagtcc cgggaaactg 120
ggggtaatac cgtatacgcc ctttggggga aagatttatc ggagaaggat cggcccgcgt 180
tagattaggt agttggtggg gtaatggcct accaagccta cgatctatag ctggttttag 240
aggatgatca gcaacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg 300
gggaatcttg gacaatgggg gcaaccctga tccagccatg ccgcgtgagt gaagaaggcc 360
ctagggtcgt aaagctcttt cgcctgtgaa gataatgacg gtagcaggta aagaaacccc 420
ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggggg ttagcgttgt tcggaattac 480
tgggcgtaaa gcgcgcgtag gcggattgga aagttggggg tgaaatccca gggctcaacc 540
ctggaactgc ctccaaaact cccagtcttg agttcgagag aggtgagtgg aattccgagt 600
gtagaggtga aattcgtaga tattcggagg aacaccagtg gcgaaggcgg ctcactggct 660
cgatactgac gctgaggtgc gaaagtgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt 720
ccacaccgta aacgatgaat gccagtcgtc gggtagcatg ctgctcggtg acacacctaa 780
cggattaagc attccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa ggaattgacg 840
ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca gaaccttacc 900
aacccttgac atcctcggac cgttccagag atggttcttt cccttcgggg accgagtgac 960
aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tcggttaagt ccggcaacga 1020
gcgcaaccca cacccttagt tgccagcagt tcggctgggc actctagggg aactgcccgt 1080
gataagcggg aggaaggtgt ggatgacgtc aagtcctcat ggcccttacg ggttgggcta 1140
cacacgtgct acaatggtag tgacaatggg ttaatcccaa aaagctatct cagttcggat 1200
tgtcgtctgc aactcgacgg catgaagtcg gaatcgctag taatcgcgta acagcatgac 1260
gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agttgggtct 1320
acccgaagac ggtgcgccaa cctttcgagg aggcagctgg ccacggtagg ctcagcgact 1380
ggggtg 1386
<210> 21
<211> 1387
<212> DNA
<213> 施氏微杆菌(Microbacterium schleiferi)
<400> 21
catgcagtcg aacggtgaag cagagcttgc tctgtggatc agtggcgaac gggtgagtaa 60
cacgtgagca atctgcccct gactctggga taagcgctgg aaacggcgtc taataccgga 120
tacgagctgc gaaggcatct tcagcagctg gaaagaattt cggtcaggga tgagctcgcg 180
gcctatcagc ttgttggtga ggtaacggct caccaaggcg tcgacgggta gccggcctga 240
gagggtgacc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt 300
ggggaatatt gcacaatggg cgaaagcctg atgcagcaac gccgcgtgag ggacgacggc 360
cttcgggttg taaacctctt ttagcaggaa agaagcgaaa gtgacggtac ctgcagaaaa 420
agcgccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggcgcaag cgttatccgg 480
aattattggg cgtaaagagc tcgtaggcgg tctgtcgcgt ctgctgtgaa aacccgaggc 540
tcaacctcgg gcctgcagtg ggtacgggca gactagagtg cggtagggga gattggaatt 600
cctggtgtag cggtggaatg cgcagatatc aggaggaaca ccgatggcga aggcagatct 660
ctgggccgta actgacgctg aggagcgaaa gggtggggag caaacaggct tagataccct 720
ggtagtccac cccgtaaacg ttgggaacta gttgtggggt ccattccacg gattccgtga 780
cgcagctaac gcattaagtt ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag 840
gaattgacgg ggacccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag 900
aaccttacca aggcttgaca tatacgagaa cgggccagaa atggtcaact ctttggacac 960
tcgtaaacag gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc 1020
cgcaacgagc gcaaccctcg ttctatgttg ccagcacgta atggtgggaa ctcatgggat 1080
actgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt 1140
cttgggcttc acgcatgcta caatggccgg tacaaagggc tgcaataccg cgaggtggag 1200
cgaatcccaa aaagccggtc ccagttcgga ttgaggtctg caactcgacc tcatgaagtc 1260
ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac 1320
acaccgcccg tcaagtcatg aaagtcggta acacctgaag ccggtggccc aacccttgtg 1380
gagggag 1387
<210> 22
<211> 1426
<212> DNA
<213> 蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)
<400> 22
aggcggctgg ctccaaaaag gttaccccac cgacttcggg tgttacaaac tctcgtggtg 60
tgacgggcgg tgtgtacaag gcccgggaac gtattcaccg cggcatgctg atccgcgatt 120
actagcgatt ccagcttcat gtaggcgagt tgcagcctac aatccgaact gagaacggtt 180
ttatgagatt agctccacct cgcggtcttg cagctctttg taccgtccat tgtagcacgt 240
gtgtagccca ggtcataagg ggcatgatga tttgacgtca tccccacctt cctccggttt 300
gtcaccggca gtcaccttag agtgcccaac ttaatgatgg caactaagat caagggttgc 360
gctcgttgcg ggacttaacc caacatctca cgacacgagc tgacgacaac catgcaccac 420
ctgtcactct gctcccgaag gagaagccct atctctaggg ttttcagagg atgtcaagac 480
ctggtaaggt tcttcgcgtt gcttcgaatt aaaccacatg ctccaccgct tgtgcgggcc 540
cccgtcaatt cctttgagtt tcagccttgc ggccgtactc cccaggcgga gtgcttaatg 600
cgttaacttc agcactaaag ggcggaaacc ctctaacact tagcactcat cgtttacggc 660
gtggactacc agggtatcta atcctgtttg ctccccacgc tttcgcgcct cagtgtcagt 720
tacagaccag aaagtcgcct tcgccactgg tgttcctcca tatctctacg catttcaccg 780
ctacacatgg aattccactt tcctcttctg cactcaagtc tcccagtttc caatgaccct 840
ccacggttga gccgtgggct ttcacatcag acttaagaaa ccacctgcgc gcgctttacg 900
cccaataatt ccggataacg cttgccacct acgtattacc gcggctgctg gcacgtagtt 960
agccgtggct ttctggttag gtaccgtcaa ggtgccagct tattcaacta gcacttgttc 1020
ttccctaaca acagagtttt acgacccgaa agccttcatc actcacgcgg cgttgctccg 1080
tcagactttc gtccattgcg gaagattccc tactgctgcc tcccgtagga gtctgggccg 1140
tgtctcagtc ccagtgtggc cgatcaccct ctcaggtcgg ctacgcatcg ttgccttggt 1200
gagccgttac ctcaccaact agctaatgcg acgcgggtcc atccataagt gacagccgaa 1260
gccgcctttc aatttcgaac catgcggttc aaaatgttat ccggtattag ccccggtttc 1320
ccggagttat cccagtctta tgggcaggtt acccacgtgt tactcacccg tccgccgcta 1380
acttcataag agcaagctct taatccattc gctcgactgc atgtat 1426
<210> 23
<211> 1392
<212> DNA
<213> 赤红球菌(Rhodococcus ruber)
<400> 23
cggctccctc ccacgagggg ttaggccacc ggcttcgggt gttaccgact ttcatgacgt 60
gacgggcggt gtgtacaagg cccgggaacg tattcaccgc agcgttgctg atctgcgatt 120
actagcgact ccgacttcac ggggtcgagt tgcagacccc gatccgaact gagaccggct 180
ttaagggatt cgctccacct cgcggtatcg cagccctctg taccggccat tgtagcatgt 240
gtgaagccct ggacataagg ggcatgatga cttgacgtcg tccccacctt cctccgagtt 300
gaccccggca gtctcctgcg agtccccacc attacgtgct ggcaacacag gacaagggtt 360
gcgctcgttg cgggacttaa cccaacatct cacgacacga gctgacgaca gccatgcacc 420
acctgtacac cgaccacaag ggaaacccca tctctggggc ggtccggtgt atgtcaaacc 480
caggtaaggt tcttcgcgtt gcatcgaatt aatccacatg ctccgccgct tgtgcgggcc 540
cccgtcaatt cctttgagtt ttagccttgc ggccgtactc cccaggcggg gcgcttaatg 600
cgttagctac ggcacggatc ccgtggaagg aaacccacac ctagcgccca ccgtttacgg 660
cgtggactac cagggtatct aatcctgttc gctacccacg ctttcgctcc tcagcgtcag 720
ttactgccca gagacccgcc ttcgccaccg gtgttcctcc tgatatctgc gcatttcacc 780
gctacaccag gaattccagt ctcccctgca gtactcaagt ctgcccgtat cgcctgcaag 840
cccgcagttg agctgcgggt tttcacagac gacgcgacaa accgcctacg agctctttac 900
gcccagtaat tccggacaac gctcgcaccc tacgtattac cgcggctgct ggcacgtagt 960
tggccggtgc ttcttctgta cctaccgtca cttgcgcttc gtcggtactg aaagaggttt 1020
acaacccgaa ggccgtcatc cctcacgcgg cgtcgctgca tcaggcttgc gcccattgtg 1080
caatattccc cactgctgcc tcccgtagga gtctgggccg tgtctcagtc ccagtgtggc 1140
cggtcgccct ctcaggccgg ctacccgtcg tcgccttggt gggccgttac cccaccaaca 1200
agctgatagg ccgcgggccc atcctgcacc ggaaaacctt tccaccccgg aacatgcatc 1260
ccgaggtcct atccggtatt agacccagtt tcccaggctt atcccgaagt gcagggcaga 1320
tcacccacgt gttactcacc cgttcgccac taatccaccc agcaagctgg gcttcatcgt 1380
tcgactgcat gt 1392
<210> 24
<211> 1405
<212> DNA
<213> 鲁氏不动杆菌(Acinetobacter lwoffii)
<400> 24
acacatgcag tcgagcgggg aagagtagct tgctacttta cctagcggcg gacgggtgag 60
taatgcttag gaatctgcct attagtgggg gacaacatct cgaaagggat gctaataccg 120
catacgtcct acgggagaaa gcaggggacc ttcgggcctt gcgctaatag atgagcctaa 180
gtcggattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatctgt agcgggtctg 240
agaggatgat ccgccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag 300
tggggaatat tggacaatgg ggggaaccct gatccagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg 360
ccttttggtt gtaaagcact ttaagcgagg aggaggctac cgagattaat actcttggat 420
agtggacgtt actcgcagaa taagcaccgg ctaactctgt gccagcagcc gcggtaatac 480
agagggtgca agcgttaatc ggatttactg ggcgtaaagc gcgcgtaggt ggccaattaa 540
gtcaaatgtg aaatccccga gcttaacttg ggaattgcat tcgatactgg ttggctagag 600
tatgggagag gatggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctggaggaa 660
taccgatggc gaaggcagcc atctggccta atactgacac tgaggtgcga aagcatgggg 720
agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa cgatgtctac tagccgttgg 780
ggcctttgag gctttagtgg cgcagctaac gcgataagta gaccgcctgg ggagtacggt 840
cgcaagacta aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt 900
taattcgatg caacgcgaag aaccttacct ggtcttgaca tagtaagaac tttccagaga 960
tggattggtg ccttcgggaa cttacataca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc 1020
gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt ttccttattt gccagcgggt 1080
taagccggga actttaagga tactgccagt gacaaactgg aggaaggcgg ggacgacgtc 1140
aagtcatcat ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggtcg gtacaaaggg 1200
ttgctacctc gcgagaggat gctaatctca aaaagccgat cgtagtccgg attggagtct 1260
gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagaatg ccgcggtgaa 1320
tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtttgtt gcaccagaag 1380
taggtagtct aaccgtaagg aggac 1405
<210> 25
<211> 1409
<212> DNA
<213> 松嫩假单胞菌(Pseudomonas songnenensis)
<400> 25
cacatgcagt cgagcggatg aagagagctt gctctctgat tcagcggcgg acgggtgagt 60
aatgcctagg aatctgcctg gtagtggggg acaacgtttc gaaaggaacg ctaataccgc 120
atacgtccta cgggagaaag caggggacct tcgggccttg cgctatcaga tgagcctagg 180
tcggattagc tagttggtga ggtaaaggct caccaaggcg acgatccgta actggtctga 240
gaggatgatc agtcacactg gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt 300
ggggaatatt ggacaatggg cgaaagcctg atccagccat gccgcgtgtg tgaagaaggt 360
cttcggattg taaagcactt taagttggga ggaagggcag taagctaata ccttgctgtt 420
ttgacgttac cgacagaata agcaccggct aacttcgtgc cagcagccgc ggtaatacga 480
agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcgc gcgtaggtgg ttcgttaagt 540
tggatgtgaa agccccgggc tcaacctggg aactgcatcc aaaactggcg agctagagta 600
tggcagaggg tggtggaatt tcctgtgtag cggtgaaatg cgtagatata ggaaggaaca 660
ccagtggcga aggcgaccac ctgggctaat actgacactg aggtgcgaaa gcgtggggag 720
caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgtcgacta gccgttggga 780
tccttgagat cttagtggcg cagctaacgc attaagtcga ccgcctgggg agtacggccg 840
caaggttaaa actcaaatga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta 900
attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg ccttgacatg cagagaactt tccagagatg 960
gattggtgcc ttcgggaact ctgacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt 1020
gagatgttgg gttaagtccc gtaacgagcg caacccttgt ccttagttac cagcacgtta 1080
aggtgggcac tctaaggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa 1140
gtcatcatgg cccttacggc ctgggctaca cacgtgctac aatggtcggt acaaagggtt 1200
gccaagccgc gaggtggagc taatcccata aaaccgatcg tagtccggat cgcagtctgc 1260
aactcgactg cgtgaagtcg gaatcgctag taatcgtgaa tcagaatgtc acggtgaata 1320
cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc tccagaagta 1380
gctagtctaa ccttcggggg gacggtacc 1409

Claims (10)

1.用于降解目标土壤中原油的菌株组合配伍方法,包括如下步骤:
(a1)参照方法A和方法B筛选菌株;
(a2)将1-3种方法A筛选的菌株和1-3种方法B筛选的菌株进行组合,得到用于降解目标土壤中原油的菌株组合;
方法A包括如下步骤:从候选菌株中筛选与目标土壤中优势菌种相似度大于88%的菌株;
方法B包括如下步骤:从候选菌株中筛选与经过生物激活的目标土壤中竞争优势菌种相似度大于88%的菌株;
所述候选菌株为具有原油利用能力的菌株。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:
方法A包括如下(b1)-(b3)所述的步骤:
(b1)利用T-RFLP分析目标土壤中微生物菌落结构,筛选丰度最高的n种T-RFs;
(b2)获得步骤(b1)筛选的n种T-RFs代表的细菌16S rDNA作为参照序列;
(b3)在候选菌株中筛选16S rDNA与步骤(a2)中的任一种参照序列相似度大于88%的菌株;
方法B包括如下(c1)-(c3)所示的步骤:
(c1)利用T-RFLP分析经过生物激活的目标土壤中微生物菌落结构,筛选激活前后丰度增长最多的n种T-RFs;
(c2)获得步骤(c1)筛选的n种T-RFs对应的细菌16S rDNA作为参照序列;
(c3)在候选菌株中筛选16S rDNA与步骤(a2)中的任一种参照序列相似度大于88%的菌株;
n为1-10中任意自然数。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于:
所述(b2)或(c2)中,所述T-RFs代表的细菌16S rDNA的获得方式如下:将待测土壤菌落16S rDNA文库导入大肠杆菌并通过蓝白斑筛选阳性克隆,利用T-RFLP对阳性克隆进行分析,将T-RFs与步骤(b1)或(c1)中筛选的T-RFs相同的阳性克隆的16S rDNA片段测序获得所述T-RFs代表的细菌16S rDNA。
4.如权利要求1至3任一所述的方法,其特征在于:
所述具有原油利用能力的菌株筛选方法如下:将菌株接种于含有10g/L原油的培养基中,使培养体系初始OD600=0.1,然后30度、150rpm培养7天,在培养结束后检测培养体系OD600,筛选OD600值大于20的菌株。
5.如权利要求1至4任一所述的方法,其特征在于:
所述生物激活方法如下:向目标土壤中加入氮和磷,在25±1℃温度下运行60天,控制土壤含水率在20±3%;所述氮和磷与土壤中总有机碳的质量比为:10:1:200。
6.权利要求1至5任一所述方法在降解原油或原油污染治理中的应用。
7.利用权利要求1-6中任一所述方法得到的菌株组合。
8.菌株组合,由如下(A)-(E)的菌株组成;
(A)在中国普通微生物菌种保藏管理中心的菌种编号为1.6444的胜利盐单胞菌Halomonas shengliensis;
(B)在中国普通微生物菌种保藏管理中心的菌种编号为1.6294的孤岛海杆状菌Marinobactergudaonensis;
(C)在中国普通微生物菌种保藏管理中心的菌种编号为1.10267的浅黄海洋杆菌Pelagibacterium luteolum;
(D)在德国微生物菌种保藏中心的菌种编号为16503的粪产碱菌粪亚种Alcaligenesfaecalis subsp.phenolicus;
(E)在中国普通微生物菌种保藏管理中心的菌种编号为1.9108的海神鲁杰氏菌Ruegeria marina。
9.权利要求7或8所述的菌株组合在下述任一中的应用:
1)降解原油;
2)制备降解原产品;
3)消除或降低原油污染;
4)制备消除或降低原油污染产品;
5)消除或降低土壤原油污染;
6)制备消除或降低土壤原油污染产品。
10.土壤中原油降解方法,包括如下步骤:将以权利要求7或8所述的菌株组合加至目标土壤中进行培养,实现土壤中的原油降解。
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