CN109468351B - 高效酶催化合成血根碱与白屈菜红碱的方法 - Google Patents
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Abstract
一种高效酶催化合成血根碱和白屈菜红碱的方法,其分别从已知的普罗托品‑6‑羟基化酶基因、二氢苯并菲啶氧化酶基因及细胞色素P450还原酶基因中通过异源表达和结果比对分析,筛选出表达效率高的最优基因,然后对选出的最优基因进行密码子优化;再将优化基因序列构建到表达载体上,之后转入酵母工程菌中进行转化获得重组酵母工程菌株;最后用博落回的叶片原料液前体饲喂重组酵母工程菌进行发酵,即得。本发明从基因水平、发酵工艺等多方面上提高血根碱和白屈菜红碱的酶催化效率,利用博落回的非传统药用部位叶片原料液直接与工程菌进行发酵,将叶片中生物碱含量高的原阿片碱和别隐品碱转化成高价值的血根碱和白屈菜红碱,以实现博落回资源的综合利用。
Description
技术领域
本发明涉及血根碱和白屈菜红碱酶催化合成技术领域,具体涉及一种高效酶催化合成血根碱与白屈菜红碱的方法。
技术背景
博落回(Macleaya cordata(Willd.)R.Br.)属于罂粟科博落回属植物,别名又叫号筒杆、落回、山号筒、山梧桐、三钱三等,生长于丘陵、低山、林边、草地、路旁,是一种野生草本植物。博落回主要分布于中国、东亚、北美洲和欧洲。博落回属植物包括博落回和小果博落回(M.microcarpa(Maxim)Fedde)两个种,作为一种传统中草药最早见于《本草拾遗》,在民间作为一种杀蛆青草药而广泛使用。随着研究的不断深入,发现博落回具有抑菌、抗炎、调节畜禽类肠道菌群等多重药理作用,博落回开始作为一种药源植物得到越来越广泛的应用。
博落回中含有的血根碱、白屈菜红碱、原阿片碱和别隐品碱占博落回总生物碱的90%以上。现代药理研究表明原阿片碱、别隐品碱、白屈菜红碱和血根碱具有显著的生物活性,其中血根碱对治疗多种炎症有效,对畜禽类有较好的肠道菌群调节作用,目前已经作为饲用抗生素的替代品在欧洲等地区广泛销售。从2006年1月开始欧盟全面禁止在饲料中添加任何抗生素,导致血根碱的需求逐年增加。目前血根碱的主要来源是从博落回植株中提取,而博落回作为一种野生资源,这种获取方式导致其野生资源的存储量逐年减少。
现有的研究结果发现博落回的这4种主要生物碱在博落回中的分布呈现组织特异性。在成熟果荚中血根碱、白屈菜红碱占总碱的70%左右,原阿片碱和别隐品碱占30%左右;而在叶片中却相反,血根碱、白屈菜红碱占总碱的30%左右,原阿片碱和别隐品碱占70%左右。从生物合成途径上看(附图1),原阿片碱和别隐品碱分别是血根碱和白屈菜红碱的前体物质,原阿片碱在普罗托品-6-羟基化酶(P6H)与辅酶基因CPR一起催化下生成二氢血根碱(DHSAN),然后二氢血根碱(DHSAN)在二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因催化下生成血根碱(SAN);别隐品碱在普罗托品-6-羟基化酶(P6H)与辅酶基因CPR一起催化下生成二氢白屈菜红碱(DHCHE),然后二氢白屈菜红碱(DHCHE)在二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因催化下生成白屈菜红碱(CHE)。
血根碱和白屈菜红碱是博落回提取物中最主要的有效成分,在果荚中含量仅为0.5~2%左右。而叶片中的总生物碱含量大约是果荚中的50%左右,生物学产量是果荚的一倍以上。目前博落回提取物绝大部分来源于野生资源的果荚,来源有限,血根碱含量低,从而造成血根碱价格昂贵,而限制了其产业的发展。另一方面,占总生物碱很大比例的前体类物质未转化完全,在提取过程中被当成废弃物未进行综合高效利用,导致资源的极大浪费。由于每提高0.1%植株中血根碱含量可降低10%的提取成本,而传统的栽培和育种进行改良所需周期长、受环境影响大、效率低、难以大规模种植和提升潜力有限,通过现代分子生物学技术体外构建工程化菌对前体物向终产物的有效转化是获得血根碱的新药源途径。
生物转化(biotransformation)也叫生物催化(biocatalysis),是指利用微生物全细胞或提取酶作为催化剂对外源底物进行结构修饰或定向合成而获得有价值产物的生理生化反应,其本质是生物体系中酶的催化反应。这种特定的酶催化反应具有以下特点:(1)具有高度的立体选择性。(2)反应条件温和,生产安全,不造成环境污染和后处理简单。(3)目标明确,副产物少,成本低。(4)微生物转化可以减少反应步骤。
本发明拟提供一种酵母工程菌高效酶催化合成血根碱和白屈菜红碱的方法。
发明内容
本发明要解决的技术问题是提供一种高效酶催化合成血根碱和白屈菜红碱的方法。
为了解决上述技术问题,本发明采用以下技术方案:
提供一种高效酶催化合成血根碱和白屈菜红碱的方法,具体包括如下步骤:
S1、对参与血根碱和白屈菜红碱生物合成的基因进行密码子优化:首先根据血根碱和白屈菜红碱的生物合成途径,分别从已知的普罗托品-6-羟基化酶(P6H)、二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因及细胞色素P450还原酶(CPR)基因中通过异源表达和结果比对分析,分别筛选出表达效率高的最优基因,然后对筛选出的最优基因进行密码子优化;
S2、将优化后的基因序列构建到表达载体上,然后转入酵母工程菌中进行转化获得重组酵母工程菌株;
S3、将博落回的叶片原料液与步骤S3构建的重组酵母工程菌进行发酵,然后收集培养后的酵母工程菌,裂解菌体、分离纯化,即得血根碱和白屈菜红碱。
进一步地,
步骤S1中的最优基因包括普罗托品-6-羟基化酶(P6H)基因MC11229,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,MC11229进行密码子优化后的序列记为MC11229opt,其核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。
进一步地,
步骤S1中的最优基因还包括二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因MC6408,其核苷酸序列如SEQ ID No.6所示;MC6408进行密码子优化后的序列记为MC6408opt,其核苷酸序列如SEQ ID No.7所示。
进一步地,
步骤S1中的最优基因还包括黄瓜细胞色素P450还原酶基因CuCPR,其核苷酸序列如SEQ ID No.10所示。
进一步地,
步骤S2具体如下:
将博落回普罗托品-6-羟基化酶(P6H)基因优化序列MC11229opt与辅酶基因CuCPR、二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因优化序列MC6408opt一起构建到表达载体上,然后转入酵母工程菌中,并进行转化,获得重组酵母工程菌株。
进一步地,
步骤S2中,所述表达载体的质粒选自PYES2。
进一步地,
步骤S2中,所述酵母工程菌株的宿主菌选自酵母菌株ivf。
进一步地,
步骤S3中博落回叶片原液的制备方法如下:
(1)将博落回叶片放于35~45℃的恒温干燥箱中烘干,并粉碎得叶片粉末备用;
(2)然后将制得的叶片粉末按比例加入一定体积pH=8.0的TE缓冲溶液中,配置呈一定比例的缓冲液;
(3)最后将所述缓冲液先放入高压蒸汽灭菌锅中110~120℃灭菌25~35min或者放入超声波清洗器中超声25~35min,然后4500~5500rpm离心4~6min,上清液过0.2~0.25μm滤膜,即得。
进一步地,步骤S3中的发酵条件具体如下:
将上述方法制得的博落回叶片原液作为底物,前体饲喂步骤S2构建的酵母工程菌;温度30°下,发酵培养24小时。
本发明的有益效果:
本发明将博落回中参与合成血根碱与白屈菜红碱的功能基因MC11229,根据酵母菌偏爱的密码子,进行密码子优化后,然后将得到的优化序列,整合到酿酒酵母中进行异源表达实现血根碱与白屈菜红碱的微生物转化,与未经优化的功能基因相比,能极大提高其酶催化效率,提高催化产物二氢血根碱及血根碱的含量,降低二氢血根碱及血根碱的生产成本。
本发明将博落回中参与合成血根碱与白屈菜红碱的功能基因MC6408,根据酵母菌偏爱的密码子,进行密码子优化后,然后将得到的优化序列MC6408opt,整合到酿酒酵母中进行异源表达实现血根碱与白屈菜红碱的微生物转化,与未经优化的功能基因相比,能极大提高其酶催化效率,提高催化产物二氢血根碱及血根碱的含量,降低血根碱的生产成本。
本发明构建的具有高效转化原阿片碱与别隐品碱生成血根碱和白屈菜红碱的酿酒酵母工程菌,以博落回非传统药用部位叶片的粉末为底物进行生物转化,同时还对工程菌的发酵条件进行了优化,实现博落回资源的综合利用,能为降低血根碱/白屈菜红碱的生产成本和工业化应用奠定基础。
由于,博落回叶片中原阿片碱与别隐品碱的含量大于血根碱与白屈菜红碱,而博落回提取物的主要有效成分是血根碱与白屈菜红碱。将博落回叶片原料液直接进行生物转化,使原料中的原阿片碱与别隐品碱转化成高价值的血根碱与白屈菜红碱,既可以提高血根碱与白屈菜红碱的含量,又可以省去传统提纯原阿片碱与别隐品碱的操作,从而降低血根碱和白屈菜红碱的生产成本,还可以实现博落回资源的综合利用,具有较高的应用价值。
综上,本发明从比较、筛选出参与合成血根碱与白屈菜红碱的最优功能基因,并且对筛选出的最优功能基因进行密码子优化,得到酶催化效率更高的基因优化序列,以期从基因水平上提高血根碱和白屈菜红碱的含量;同时将其构建到酵母工程菌中,并且对酵母工程菌的发酵条件进行了研究和优化,以期建立一个高产血根碱和白屈菜红碱的标准化微生物发酵工艺。最后,为实现博落回资源的综合利用,将博落回的非传统药用部位叶片原料液直接与工程菌进行发酵,将叶片中生物碱含量高的原阿片碱和别隐品碱转化成高价值的血根碱和白屈菜红碱具有较高的实际应用价值。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为博落回中血根碱和白屈菜红碱的合成途径;
图2为不同P6H基因催化产生二氢血根碱的含量结果图;
图3为优化前后的MC 11229基因催化产生二氢血根碱含量测定结果图;
图4为不同DBOX基因催化产生血根碱的含量结果图;
图5为优化前后的MC6408催化产生血根碱含量测定结果图;
图6为不同CPR基因催化产生二氢血根碱含量测定结果图;
图7为不同前体溶液催化效率比较图;
图8为不同底物浓度催化效率比较图;
图9为不同前处理条件下制得的博落回叶片原液与构建的不同重组酵母工程菌发酵培养合成血根碱的催化效率比较图;
图10为不同前处理条件下制得的博落回叶片原液与构建的不同重组酵母工程菌发酵培养合成白屈菜红碱的催化效率比较图。
具体实施方式
为了更好地阐述该发明的内容,下面通过具体实施例对本发明进一步的验证。特在此说明,实施例只是为更直接地描述本发明,它们只是本发明的一部分,不能对本发明构成任何限制。
如附图1的博落回中血根碱和白屈菜红碱的合成途径所示:普罗托品-6-羟基化酶(P6H)参与了血根碱(SAN)和白屈菜红碱(CHE)生物合成的步骤,其能催化别隐品碱(ALL)生成二氢白屈菜红碱(DHCHE)以及催化原阿片碱(PRO)生成二氢血根碱(DHSAN)。由于P6H属于细胞色素P450氧化还原酶,作为一种单加氧酶,需要与细胞色素P450还原酶(CPR)共表达才能发挥蛋白催化作用,CPR在反应中起到传递电子的作用。二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)基因参与了血根碱(SAN)和白屈菜红碱(CHE)生物合成的步骤,其能催化二氢白屈菜红碱(DHCHE)生成白屈菜红碱(CHE)以及催化二氢血根碱(DHSAN)生成血根碱(SAN)。
一、筛选最优基因并对最优基因进行密码子优化
(一)P6H最优基因的筛选与优化
在本申请人之前的研究中,在以罂粟和花菱草的P6H基因序列为参照,在博落回转录组数据中进行同源比对后找到2个同源性较高的基因序列(编号为MC11229和MC11218,参照专利:CN106119265A,博落回中参与血根碱与白屈菜红碱合成的细胞色素P450酶基因),并进行了酵母异源表达验证。
本发明首先通过酵母表达系统比较罂粟、花菱草和博落回中P6H基因的酶催化效率,筛选出最优的P6H基因,具体是分别将三个物种的P6H基因组合模式植物及拟南芥(A.thaliana)中的CPR(AtCPR)基因转入酿酒酵母中构建酵母工程菌。再通过饲喂底物(原阿片碱标准品)的方式,利用UPLC-QQQ MS定量分析比较最终获得的产物量(二氢血根碱)来比较酶催化效率。
1、基因的获得
PsP6H为罂粟(学名:Papaver somniferumL.)的P6H基因,EcP6H为花菱草(学名:Eschscholtzia californica Cham.)的P6H基因,基因PsP6H(GenBank KC154002)、PsCPR(GenBank KF661328)序列信息来源于NCBI,由苏州金唯智生物科技有限公司合成。
MC11229、MC11218为博落回的P6H基因,其核苷酸序列分别如SEQ ID No.1、SEQ IDNo.3所示。按照多糖多酚植物总RNA提取试剂盒提取博落回总RNA,并使用反转录试剂盒将其反转录为cDNA。
2、然后利用正向引物和反向引物进行PCR扩增,引物序列表见下表1-1:
表1-1引物序列表
PCR反应体系以20μl计为:10-20ng/μl模板1μl,10pmol/μl正向、反向引物各1μl,10mmol/LdNTP mix 0.4μl,0.5U/μL高保真Taq DNA聚合酶1μl,10×PCR反应缓冲液2μl,余量为水。PCR反应条件为:94℃5分钟;94℃20秒,55℃20秒,72℃2分30秒,35个循环;72℃10分钟。
3、表达载体构建:用限制性内切酶KpnI-HF、XBaI将载体质粒PYES2-Ura、PYES2-Leu回收产物分别进行双酶切,反应体系如下小表1-2:
表1-2双酶切反应体系
用限制性内切酶KpnI-HF、Sph-HF将载体质粒PYES2-Trp进行双酶切,反应体系如下1-3:
表1-3PYES2-Trp双酶切反应体系
将扩增得到的片段与具有对应氨基酸缺陷的载体(Invitrogen)PYES2连接,测序确认没有突变。
4、利用酵母表达系统验证上述各P6H基因的转化效率
将PYES2-Trp质粒单独转入酵母(ivf)菌株中,获得酵母工程菌株MCY-3060;将重组质粒PYES2-Ura+MC11218,PYES2-Ura+MC11229,PYES2-Ura+PsP6H,PYES2-Ura+EcP6H分别和PYES2-Leu+AtCPR转入酵母(ivf)中,获得重组酵母工程菌株MCY-3061(PYES2+MC11218+AtCPR)、MCY-3062(PYES2+MC11229+AtCPR)、MCY-3063(PYES2+PsP6H+AtCPR)、MCY-3064(PYES2+EcP6H+AtCPR)。然后再分别在色氨酸(Trp)单缺陷以及亮氨酸(Leu)与尿嘧啶(Ura)双缺陷的SD/Dropout选择培养基上培养48h,得到直径约l mm的单菌落。
诱导酵母表达蛋白,然后进行前体饲喂收集酵母,裂解后用甲醇抽提化合物,样品制备好后用UPLC-Q-TOF进行检测,测定结果如下表1-4及图2所示。
MCY-3060是转入空载体的酵母工程菌,作为空白对照。MCY-3060在相同条件下饲喂原阿片碱后未产生二氢血根碱和血根碱,证明酵母本身不会对实验产生影响。MCY-3061、MCY-3062、MCY-3063、MCY-3064均检测到了二氢血根碱,含量结果经SPSS 19.0软件分析,P<0.05,样品之间差异显著,实验结果具有统计学意义。
表1-4二氢血根碱含量测定结果
通过比较PsP6H、EcP6H、MC11229和MC11218基因的酶催化效率,我们发现MC11229+AtCPR工程菌催化产生了最高含量的二氢血根碱91.143±52.096ng﹒mL-1。且博落回的MC11229基因的催化效率是PsP6H基因的9.6倍,是EcP6H基因的5.7倍,同时是MC11218基因的9.6倍。
5、最优P6H基因MC11229的优化
选取MC11229(其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示)作为最优基因,根据酿酒酵母偏爱的密码子,进行密码子优化后,得到基因优化序列MC11229opt,其核苷酸序列如SEQ IDNo.2所示。
(1)制备博落回cDNA,然后利用正向引物和反向引物对基因进行PCR扩增,引物序列表见下表1-5:
表1-5PCR引物序列与产物长度
用限制性内切酶将载体质粒PYES2-Ura、PYES2-Leu、PYES2-His回收产物分别进行双酶切,PYES2-Ura、PYES2-Leu双酶切反应体系同表1-2,PYES2-His的双酶切反应体系见下表1-6:
表1-6PYES2-His双酶切反应体系
将扩增得到的片段与具有对应氨基酸缺陷的载体(Invitrogen)PYES2连接,测序确认没有突变。
将基因序列MC11229opt构建到表达载体上,并以优化前的基因序列MC11229为参照,按照同样的方法构建重组表达载体,获得重组表达载体PYES2-His+MC11229opt、PYES2-Ura+MC11229,同时还构建重组表达载体PYES2-Leu+CuCPR。
将重组表达载体PYES2-Ura+MC11229、PYES2-His+MC11229opt分别与PYES2-Leu+CuCPR转入酵母(ivf,购自Thermo Fisher Scientific公司)中,获得酵母工程菌株MCY-3072(PYES2-Ura+MC11229+CuCPR)MCY-3083(PYES2+MC11229opt+CuCPR),同时还将PYES2-Trp质粒单独转入酵母(ivf)菌株中,获得酵母工程菌株MCY-3060,作为空白对照;然后再分别在组氨酸(His)与Leu双缺陷以及Trp、Leu与Ura三缺陷的SD/Dropout选择培养基上培养48h,得到直径约l mm的单菌落。
以pH=8.0的TE缓冲溶液作为前体溶液,加入10μmol/L~2mmol/L原阿片碱作为底物,前体饲喂酵母工程菌;温度30°下发酵培养24小时。
收集培养后的酵母工程菌,裂解菌体、用甲醇抽提化合物,即得样品。将制备好的样品用UPLC-Q-TOF进行检测,结果如下表1-6和图3所示。
本发明以MCY-3060作为空白对照,在相同条件下饲喂原阿片碱后未产生二氢血根碱和血根碱,证明酵母本身不会对实验产生影响。MCY-3072、MCY-3083均检测到了二氢血根碱,含量结果经SPSS 19.0软件分析,P<0.05,样品之间差异显著,实验结果具有统计学意义。具体结果见表1-7:
表1-7优化前后的MC 11229基因二氢血根碱含量测定结果
上表1-7的结果以及附图3表明,MC11229opt+CuCPR工程菌催化产生的二氢血根碱含量比MC11229+CuCPR的高,优化后的基因MC11229opt相比优化前的基因MC11229使得催化产物的含量得到了提高。具体地,优化后的酵母工程菌MC11229opt+CuCPR使得二氢血根碱的含量从20.096ng﹒mL-1提高到了26.944ng﹒mL-1,提高了34%。
(二)DBOX最优基因的筛选与优化
二氢苯并菲啶氧化酶(DBOX)既可以催化二氢白屈菜红碱(DHCHE)生成白屈菜红碱(CHE)又可以催化二氢血根碱(DHSAN)生成血根碱(SAN)。本发明以PsDBOX、MC6408和MC6407基因为研究目标,分别与PsP6H和AtCPR转入酿酒酵母中构建酵母工程菌。再以原阿片碱为底物,与工程菌共同进行发酵培养后,利用UPLC-QQQ MS定量分析血根碱的含量,比较PsDBOX、MC6408和MC6407基因的酶催化效率。
1、基因的获得
PsDBOX为罂粟(学名:Papaver somniferumL.)的DBOX基因,PsDBOX序列信息来源于NCBI,由苏州金唯智生物科技有限公司合成。
MC6408、MC6407为博落回的P6H基因,其核苷酸序列分别如SEQ ID No.6、SEQ IDNo.8所示。按照多糖多酚植物总RNA提取试剂盒提取博落回总RNA,并使用反转录试剂盒将其反转录为cDNA。
2、然后利用正向引物和反向引物进行PCR扩增,引物序列表见下表2-1:
表2-1PCR引物序列与产物长度
3、参照上述P6H最优基因的筛选与优化构建重组表达载体:
4、将重组质粒PYES2-Trp+PsDBOX,PYES2-Trp+MC6408,PYES2-Trp+MC6407分别和PYES2-Ura+PsP6H与PYES2-Leu+AtCPR转入酵母(ivf)中,获得重组酵母工程菌株MCY-3065(PYES2+PsP6H+AtCPR+MC6407)、MCY-3066(PYES2+PsP6H+AtCPR+MC6408)、MCY-30667(PYES2+PsP6H+AtCPR+PsDBOX)。然后再在Trp、Leu与Ura三个缺陷的SD/Dropout选择培养基上培养48h,得到直径约l mm的单菌落。
诱导酵母表达蛋白,然后进行前体饲喂收集酵母,裂解后用甲醇抽提化合物,样品制备好后用UPLC-Q-TOF进行检测,测定结果如下表2-2及图4所示。
以MCY-3060作为空白对照,MCY-3060在相同条件下饲喂原阿片碱后未产生血根碱,证明酵母本身不会对实验产生影响。MCY-3065和MCY-3066均检测到了血根碱,含量结果经SPSS 19.0软件分析,P<0.05,样品之间差异显著,实验结果具有统计学意义。
表2-2血根碱含量测定结果
上述结果表明:工程菌PsP6H+AtCPR+MC6408催化产生的血根碱含量最高,其计算得出博落回的MC6408基因的酶催化效率最高。
5、最优DBOX基因MC6408的优化
选取MC6408(其核苷酸序列如SEQ ID No.6所示)作为最优基因,根据酿酒酵母偏爱的密码子,进行密码子优化后,得到基因优化序列MC 6408opt,其核苷酸序列如SEQ IDNo.7所示。
(1)制备博落回cDNA,然后利用正向引物和反向引物对基因进行PCR扩增,引物序列表见下表2-3:
表2-3PCR引物序列与产物长度
3、参照上述P6H最优基因的筛选与优化构建重组表达载体。
4、将基因序列MC6408opt构建到表达载体上,并以优化前的基因序列MC6408为参照,按照同样的方法构建重组表达载体,获得重组质粒PYES2-Trp+MC6408、PYES2-Trp+MC6408opt,同时构建重组质粒PYES2-Leu+CuCPR、PYES2-Ura+MC11229;
将重组表达载体PYES2-Ura+MC6408、PYES2-His+MC6408opt分别与PYES2-Leu+CuCPR转入酵母(ivf,购自Thermo Fisher Scientific公司)中,获得酵母工程菌株MCY-3084(PYES2+MC11229+CuCPR+MC6408)、MCY-3085(PYES2+MC11229+CuCPR+MC6408opt),同时还将PYES2-Trp质粒单独转入酵母(ivf)菌株中,获得酵母工程菌株MCY-3060,作为空白对照;然后再分别在组氨酸(His)与Leu双缺陷以及Trp、Leu与Ura三缺陷的SD/Dropout选择培养基上培养48h,得到直径约l mm的单菌落。
以pH=8.0的TE缓冲溶液作为前体溶液,加入10μmol/L~2mmol/L原阿片碱作为底物,前体饲喂酵母工程菌;温度30°下发酵培养24小时。收集培养后的酵母工程菌,裂解菌体、用甲醇抽提化合物,即得样品。
将制备好的样品用UPLC-Q-TOF进行检测,结果如下表2-3和图5所示:
以MCY-3060作为空白对照,在相同条件下饲喂原阿片碱后未产生二氢血根碱和血根碱,证明酵母本身不会对实验产生影响。MCY-3084、MCY-3085均检测到了血根碱,含量结果经SPSS 19.0软件分析,P<0.05,样品之间差异显著,实验结果具有统计学意义。具体结果见表2-3:
表2-3优化前后的MC6408基因血根碱含量测定结果
上表2-3的结果以及附图5表明,工程菌MC11229+CuCPR+MC6408opt催化产生的血根碱含量比MC11229+CuCPR+MC6408高,优化后的基因MC6408opt相比优化前的基因MC6408使得催化产物的含量得到了提高。具体地,优化后的MC11229+CuCPR+MC6408opt酵母工程菌使得血根碱的含量从51.770ng﹒mL-1提高到了56.361ng﹒mL-1,提高了8.9%。
(三)最优CPR基因的筛选
细胞色素P450还原酶(cytochrome P450reductase,CPR)作为P450s电子传递链的重要功能单位,将电子供体NADPH的电子经过黄素腺嘌呤二核苷酸(flavin adenosinedinucleotide,FAD)和黄素单核苷酸(flavin mononucleotide,FMN)2个辅基传递给P450s,在P450s介导的氧化还原反应中起限速作用,是氧化还原反应中的关键酶。找到能在酵母表达系统中高效表达的CPR基因对于提高血根碱的含量具有非常重要的意义。在本申请人之前的研究中在博落回转录组数据中找到2个CPR的基因序列(编号为MC19967和MC13802),并且进行了酵母异源表达验证。
本发明以CuCPR、PsCPR、AtCPR、Mc19967和Mc13802基因为研究目标,与MC11229重新构建酵母工程菌后。再通过饲喂底物的方式,利用UPLC-QQQ MS定量分析比较最终获得的产物量来比较CPR的酶催化效率。
1、基因的获得
CuCPR为黄瓜细胞色素P450还原酶(Cucumis sativus Linn.CPR)(由合作团队中国农业科学院蔬菜花卉研究所黄三文研究团队提供);PsCPR为罂粟细胞色素P450还原酶;AtCPR为拟南芥细胞色素P450还原酶;Mc19967和Mc13802为博落回细胞色素P450还原酶基因。
CuCPR、PsCPR、AtCPR、Mc19967和Mc13802的核苷酸序列分别如SEQ ID No.10–14所示。PsCPR、AtCPR序列信息来源于NCBI,由苏州金唯智生物科技有限公司合成。按照多糖多酚植物总
RNA提取试剂盒提取博落回总RNA,并使用反转录试剂盒将其反转录为cDNA。
2、然后利用正向引物和反向引物进行PCR扩增,引物序列表见下表3-1:
表3-1PCR引物序列与产物长度
3、参照上述P6H最优基因的筛选与优化构建重组表达载体。
将重组质粒PYES2-Leu+CuCPR,PYES2-Leu+PsCPR,PYES2-Leu+Mc19967,PYES2-Leu+Mc13802分别与PYES2-Ura+MC11229转入酵母(ivf)中,获得酵母工程菌株MCY-3072(PYES2+MC11229+CuCPR)、MCY-3073(PYES2+MC11229+PsCPR)、MCY-3074(PYES2+MC11229+Mc19967)、MCY-3075(PYES2+MC11229+Mc13802),然后再在Leu与Ura双缺陷的SD/Dropout选择培养基上培养48h,得到直径约l mm的单菌落。
以pH=8.0的TE缓冲溶液作为前体溶液,加入10μmol/L~2mmol/L原阿片碱作为底物,前体饲喂酵母工程菌;温度30°下发酵培养24小时。收集培养后的酵母工程菌,裂解菌体、用甲醇抽提化合物,即得样品。
将制备好的样品用UPLC-Q-TOF进行检测,结果如下表3-2和图6所示。
MCY-3060作为空白对照,在相同条件下饲喂原阿片碱后未产生二氢血根碱,证明酵母本身不会对实验产生影响。MCY-3062、MCY-3072、MCY-3073、MCY-3074、MCY-3075均检测到了二氢血根碱,含量结果经SPSS 19.0软件分析,P<0.05,样品之间差异显著,实验结果具有统计学意义。
表3-2不同物种CPR催化生成二氢血根碱含量结果
上述结果显示,MCY3072工程菌催化产生的二氢血根碱94.194±24.981ng﹒mL-1是MCY3062的4.3倍,是MCY3074的3.7倍,是MCY3075的1.9倍,是MCY3073的1.7倍。即MC11229+CuCPR工程菌催化产生了最高含量的二氢血根碱,催化效率最好。这表明,在此试验条件下,CuCPR和MC11229在酵母中有高效表达。
(四)以上述(一)、(二)、(三)分别筛选和/或优化后的基因MC11229opt、MC6408opt、CuCPR构建最佳酵母工程菌合成血根碱和白屈菜红碱。
MC11229opt、MC6408opt、CuCPR的引物设计参照上表1-5,2-3.
参照上述P6H最优基因的筛选与优化构建重组表达载体,将重组质粒PYES2-Ura+MC11229opt、PYES2-Leu+CuCPR、PYES2-Trp+MC6408opt转入酵母(ivf)中,获得最佳重组酵母工程菌株MCY-3092(PYES2+MC11229opt+CuCPR+MC6408opt)。
1、配置不同的前体饲喂溶液,筛选最佳发酵条件
培养液5000rpm离心5min,弃上清。
(1)加入2mL含有终浓度分别为10μM、100μM、1mM、2mM原阿片碱、pH=8.0的TE缓冲溶液。每个样品平行重复3份。30℃振荡培养16h。
(2)分别加入2mL含有终浓度为10μM原阿片碱、pH=5.8和pH=8.0的TE缓冲溶液和2mL含有终浓度为10μM原阿片碱、pH=5.8和pH=8.0的SD/Dropout缺陷型半乳糖液体培养基。每个样品平行重复3份。30℃振荡培养16h。
加入上述配置的不同pH的TE缓冲溶液和SD/Dropout缺陷型半乳糖液体培养基的相同浓度原阿片碱后,温度30°下,发酵培养24小时;收集培养后的酵母工程菌,裂解菌体、用甲醇抽提化合物,制得样品;检测到的血根碱具体结果见表4-1和图7。
同上,加入上述不同浓度原阿片碱pH=8.0的TE缓冲溶液后,检测到血根碱的具体结果见表4-2和图8。经SPSS 19.0软件分析,P<0.05,样品之间差异显著,实验结果具有统计学意义。
表4-1不同前体溶液血根碱含量测定结果
表4-2不同底物浓度血根碱含量测定结果
上述结果表明:以pH=5.8和pH=8.0的TE缓冲溶液为前体溶液时,在pH=8.0的TE缓冲溶液中工程菌催化产生的血根碱含量较高;以pH=5.8和pH=8.0的SD/Dropout缺陷型半乳糖液体培养基作为前体溶液时,工程菌在pH=8.0前体溶液中催化产生的血根碱含量较高。而在相同pH不同前体溶液的情况下,工程菌在TE缓冲溶液中催化产生的血根碱含量较高。因此我们可以得出工程菌在pH=8.0的TE缓冲溶液中催化效率最高,是最佳的前体饲喂条件。
2、以博落回叶片原液饲喂上述构建的最佳酵母工程菌合成血根碱与白屈菜红碱。
博落回叶片中原阿片碱与别隐品碱的含量大于血根碱与白屈菜红碱,而博落回提取物的主要有效成分是血根碱与白屈菜红碱。将博落回叶片原料液直接进行生物转化,以使原料中的原阿片碱与别隐品碱转化成高价值的血根碱与白屈菜红碱,一方面提高血根碱与白屈菜红碱的含量,另一方面省去传统提纯原阿片碱与别隐品碱的操作,从而降低血根碱和白屈菜红碱的生产成本,实现博落回资源的综合利用。
2.1博落回叶片原料液的前处理
(1)将博落回叶片放于40℃的恒温干燥箱中烘干,并用干磨机粉碎;
1)秤取0.5g粉末加入100mL pH=8.0的TE缓冲溶液中;放入高压蒸汽灭菌锅中115℃灭菌30min。
2)秤取0.5g粉末加入100mL pH=8.0的TE缓冲溶液中;放入超声波清洗器中超声30min。
(3)5000rpm离心5min,上清过0.22μm滤膜,备用。
2.2制备样品:菌株培养液5000rpm离心5min,弃上清;加入2mL 8.2.2中制备好的过膜上清液。每个样品平行重复3份,30℃振荡培养16h。
在相同条件下加入上述不同处理后的TE缓冲溶液,温度30°下,发酵培养24小时;收集培养后的酵母工程菌,裂解菌体、用甲醇抽提化合物,制得样品。MCY-3060作为空白对照,检测到的血根碱和白屈菜红碱含量可作为加入叶片粉末后的TE缓冲溶液中固有的血根碱和白屈菜红碱含量。加入MCY-3092工程菌后血根碱和白屈菜红碱的具体结果见表4-3、表4-4和图9、图10。经SPSS 19.0软件分析,P<0.05,样品之间差异显著,实验结果具有统计学意义。
表4-3植物组织发酵培养血根碱含量测定结果
编号 | 处理方式 | 血根碱含量(平均值±标准差)/ng·mL<sup>-1</sup> | 转化率/% |
MCY3060 | TE灭菌 | 25.445±2.789 | / |
MCY3060 | TE超声 | 31.205±0.784 | / |
MCY3092 | TE灭菌 | 65.007±10.961 | 4.04 |
MCY3092 | TE超声 | 85.415±11.887 | 6.40 |
表4-4植物组织发酵培养白屈菜红碱含量测定结果
上述结果表明:加入工程菌MCY-3092后,发酵液中血根碱的含量提高了约3倍,白屈菜红碱的含量提高了约2倍。不同叶片原料液前处理方式的结果表明,叶片原料液放入超声波清洗器中超声30min得到的血根碱和白屈菜红碱含量要高于在高压蒸汽灭菌锅中115℃灭菌30min的含量,并且工程菌在超声30min的叶片原料液中的催化效率也要高于高压蒸汽灭菌30min。
综上,本发明从比较、筛选出参与合成血根碱与白屈菜红碱的最优功能基因,并且对筛选出的最优功能基因进行密码子优化,得到酶催化效率更高的基因优化序列,以期从基因水平上提高血根碱和白屈菜红碱的含量;同时将其构建到酵母工程菌中,并且对酵母工程菌的发酵条件进行了研究和优化,以期建立一个高产血根碱和白屈菜红碱的标准化微生物发酵工艺。最后,将博落回的非传统药用部位叶片原料液直接与工程菌进行发酵,将叶片中生物碱含量高的原阿片碱和别隐品碱转化成高价值的血根碱和白屈菜红碱具有较高的实际应用价值,实现了博落回资源的综合利用。
以上所述为本发明的具体实施方式,但不能对本发明构成任何限制,因此需特别指出,凡是以本发明为基础,做得任何修改与改进均落在本发明保护范围之内。
序列说明:
SEQ ID No.1-5分别为MC11229、MC11229opt、MC11218、PsP6H、EcP6H的核苷酸序列;
SEQ ID No.6-9分别为MC6408、MC6408opt、MC6407以及PsDBOX的核苷酸序列;
SEQ ID10-14分别为CuCPR、PsCPR、AtCPR、Mc19967和Mc13802的核苷酸序列;
SEQ ID No.15-44分别为引物PsP6H-Ura-F、PsP6H-Ura-R、EcP6H-Ura-F、EcP6H-Ura-R、MC11229-Ura-F、MC11229-Ura-R、MC11218-Ura-F、MC11218-Ura-R、AtCPR-Leu-F、AtCPR-Leu-R、YES2-Detect-F、YES2-Detect-R、MC11229opt-His-F、MC11229opt-His-R、CuCPR-Leu-F、CuCPR-Leu-R、MC6408-Trp-F、MC6408-Trp-R、MC6407-Trp-F、MC6407-Trp-R、PsDBOX-Trp-F、PsDBOX-Trp-R、MC6408opt-Trp-F、MC6408opt-Trp-R、PsCPR-Leu-F、PsCPR-Leu-R、Mc19967-Leu-F、Mc19967-Leu-R、Mc13802-Leu-F、Mc13802-Leu-R的序列。
SEQUENCE LISTING
<110> 湖南美可达生物资源股份有限公司
<120> 高效酶催化合成血根碱和白屈菜红碱的方法
<130> 20181123
<160> 44
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1617
<212> DNA
<213> MC11229序列
<400> 1
atggctgctc ttcttgcctt ggttttcctc tacaatttca tcatcatctg gagctcatcc 60
ccaagaacca ctatcaacgg taagaaacaa attaggaagg cacccatggc agccggcgca 120
tggccgattc ttggtcacct tcatttgttt ggatccggtg agctgcctca caaaatgctt 180
gcagccatgg ctgaaaagta tggctccgcc ttcatgatga agttcggtaa gcacacaaca 240
ctagttgtga gtgacacccg catagtaaaa gaatgtttca ctactaatga taccctcttt 300
gctaaccgtc cttcgaccac cgcctttgat ctcatgactt atgccaatga ttccgttgct 360
ttcacaccct atggtcctta ttggcgagag cttagaaaga tatccactct caaacttctc 420
tctaaccacc gtctccaggc catcaaggac gttcgagcct ccgaggtgaa cgtatgcttc 480
agggaactat acaatttatg caataagcag aataaaaatg atggagctga tcatgttttg 540
gtggatatga agaaatggtt tgaagaggtc tcaaacaacg tcgtgatgag ggtaatcgtt 600
gggagacaga acttcgggtc taagattgtg cgtggtgagg aggaggccgt caattacaag 660
aaagtcatgg atgaactctt acgacttgct agtctgtcta tgttatctga tttcgctcct 720
ttacttggtt ggttggatat tttccaagga aacatgagcg ccatgaaacg aaatgccaag 780
aaagtcgaca ccatacttga gggctggttg gaagagcata ggaataagaa gaagaagagc 840
tcatcatcat catcatcatc atcatcatca tcatcatcat catcatctgg tgagaatgac 900
caagacttca tggatgttat gttgtcgatt attgaggaga ccaagttgtc tggccgtgat 960
gctgatactg ttattaaagc tacttgcttg gccatgatca tgggtgggac agacaccacg 1020
gcggtgagtc taacatggat cgtctcttta ctgatgaaca atcgtcatgt actgaagaag 1080
gctagagaag aattggacgc gctcgtgggg aaggatagac aagtggaaga ttcagatttg 1140
aagaatttgg tgtacatgaa tgccatcgtc aaggaaacga tgcgattatt cccattgggt 1200
gctcttcttg aacgtgaaac caaggaggac tgtgaggttg gtgggttcca gctccaaggt 1260
ggttcgcgtt tactagtgaa tgtatggaag ttacagcgag accccaacgt gtggtcggat 1320
ccaacagagt ttagaccaga gagatttcta tcggagaatg cggatataga cgtcgggggt 1380
caacatttcg aactactacc atttggggcc ggtagaaggg tgtgcccggg agtgtcgttc 1440
gcgctccaat tcatgcattt ggtactggct cgtctcatcc atggctatga attgggaacc 1500
cagaatgatg aggatgtgga tttaactgag agcacagaag gacatgttaa ccacaaagca 1560
tcccccctcg atctcatcct caccccacgc ctccatccca agctttatga gtattag 1617
<210> 2
<211> 1617
<212> DNA
<213> MC11229opt序列
<400> 2
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ccaagaacta ctattaatgg taaaaagcag attagaaaag ctccaatggc tgctggtgct 120
tggccaattt tgggtcactt gcacttgttc ggttcaggtg agttgccaca caagatgttg 180
gcagctatgg ctgaaaaata tggttctgct tttatgatga agtttggtaa acatactaca 240
ttggtcgttt cagacacaag aattgttaaa gaatgtttta ctactaatga tacattgttt 300
gctaacagac catctactac tgctttcgat ttgatgactt atgctaatga ttctgttgct 360
tttactccat atggtccata ttggagagaa ttgagaaaga tttctacatt gaaattgttg 420
tcaaaccata gattgcaagc aattaaggat gttagagctt ctgaagttaa tgtttgtttt 480
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gtcgatatga aaaagtggtt tgaagaagtt tctaacaatg ttgttatgag agttattgtt 600
ggtagacaaa attttggttc taaaattgtt agaggtgaag aagaagcagt taattacaaa 660
aaagttatgg atgaattgtt gagattggct tcattgtcta tgttgtctga cttcgctcca 720
ttgttgggtt ggttggatat ttttcaaggt aacatgtctg ctatgaaaag aaatgctaaa 780
aaagttgata caattttgga aggttggttg gaggaacata gaaataagaa aaagaagtct 840
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caagatttca tggatgttat gttgtctatt attgaagaaa ctaagttgtc tggtagagat 960
gctgatactg ttattaaagc tacttgtttg gctatgatta tgggtggtac tgatactact 1020
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<211> 1644
<212> DNA
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accaacaaga aaataattaa taagaaatta ttaccaccca tggcaacagg tgcatggcca 180
attcttggtc atctccatct gtttaaagag ggtgagttgc ctcaccacat gcttaaatcc 240
atggctgata agtacggccc tgccttcctc atgaatttcg ggcaacaccg atccctcgtt 300
gtgagcgatc atcgcttcgt taaagaatgt ttcactacta atgacacctt gttttgtaac 360
cgtccatcca ccacagcctt cgatgtcatg acttacgcca atgactcggt agctttcaca 420
ccttacagtc cttactggcg ggagcttaga aagatatcca ctctcaaact tctctctaac 480
caccgcctcc aggccatcaa gaacctccga gaaggggagg tgaatgtatg cttcaggggg 540
ttgtatgatt tatggaagaa taataaaact gatgagcagg gtgtcgtggg tgatgaacga 600
gcagctccgg ttttggtcga tatgaagaaa tggttcgaag aggtggcaaa caatgtagtg 660
attagagtaa tcgtgggtaa acataatttt gggactaaga ttgtgaatgg tgaaaaggag 720
gctgtcgaat acaagacaat catggatgag ctcttacgtc tcgctagtct atctttgtta 780
tccgatttcg cccctttact tggttggttt gatctcttcc aagggcacgt tcgcaccatg 840
aaacgaaatg gcaagaaact agacgttcta cttcaaaagt ggttggagga gcatcggaac 900
aagacgagct cacccgagga tgagcaagac ttcatggatg ttatgttgtc gatcgtcgag 960
gagagcaaac tgtctggcca cgacgctgat accgtcatta aagctacttg cctggccatg 1020
atcatgggtg ggacagacac cacggcggtg agtctaacat ggatcgtctc tttactgatg 1080
aacaatcgtc atgcactgaa aaaggctcga gaagaattag acgcgcatgt agggaaggat 1140
agacaagttg aagattcaga tttgaagaat ttggtttact tgaatgccat cgttaaggaa 1200
acgatgcgat tatacccact gggtactctt cttgaacgtg aaaccaagga agattgtgag 1260
gttggtgggt tccagctcca agccggcacg cgtttactag ttaacatatg gatggtacaa 1320
cgagacccag ccgtgtggac tgatccaaca aaatttatac cggagaggtt cctaacggag 1380
aaggcggaca tagacgtcgg gggtcagcat ttcgaactta taccattcgg ggcgggtaga 1440
agggtgtgcc ccggggtgtc cttcgcactc caattcctac atttggtatt ggctcgactc 1500
atccatgggt atgaattggg aaccctaaat gatgaagatg tggacctaac tgagagcaca 1560
gaaggacatg ttaaccacaa agcatcccct ctcgatctcc tcctcacccc acgcttcagc 1620
aaccctaagc tctatgatta ttaa 1644
<210> 4
<211> 1626
<212> DNA
<213> PsP6H序列
<400> 4
atggatttct catcactact attactactt ctaaacacat ggatttcagc ttattccatg 60
gctgctcttc ttgccttagt tcttgtctac aatctcagga tgacgaagtc atcatcttcc 120
aaaaccactt ctctgaaggg caagaagatt attactaggc caccagcagt aacaggcgca 180
tggccggttt ttggtcacct gcatttgttt ggatcaggtg agcatccaca tgagatgttg 240
tcaaagttgg cagaaaaata tggaccttcc tttacaatga agttcgggaa gcacacaaca 300
ctagttgtga gcgatacccg agtcgtcaaa gaatgtttta caactaatga taccctcttc 360
tccaaccgcc catccaccat agctttcgat cttatgactt atgcaaccga ctccatagct 420
ttcactcctt atagtcctta ctggcgtgaa ctcaggaaga tatctactct caaacttctc 480
tctaacaacc gtcttgaatc gatcaaacaa cttcgaacct cagaggtgag cgtatgcttc 540
aaggaactat acgacctaac caacaaaaaa aacgataacg gagctccagt tccaatcgat 600
ttgaagagat ggtttgatga ggtttcaaac aatgtaatta tgagagtaat ctttgggaaa 660
caaaattttg gatccaagat tgtactcggg gaagatcaag aggcagtcca ttataaaaaa 720
atcatggacg aactttcacg tctttctagt ttgactatgt tgtcggacat ggttccttta 780
cttggttggt tggattactt caaaggcgat ttgagggcaa tgaaacgaaa cggcaaagaa 840
cttaactcca tactccagaa atggttggag gaacataaaa gcaagaaaag ttcagatgct 900
cgacaagatt tcatggatgt tatgttgtca atttccaagg acacccaact ctatggccac 960
gaccaagata cttttattaa agctacttgt cttgccatga tcatgggtgg aacaaacagt 1020
acggaagtgg ctctaacatg gatcttgtcc ttacttatga acaacagatg cgcattgcat 1080
aaggctcgag aagaaataga cttactcgtt gggaaggata gacaagtgga agattcagat 1140
gtcaagaatt tgacatacat gaatgccatc attaaagaaa caatgcgatt atacccatta 1200
ggttttcttc tagaacgcga taccaaggaa gactgtgaag ttagcgggtt caacatcaaa 1260
ggtggtacaa gattactgat aaatgtgtgg aagttacaac gagacccgaa cgtgtggaca 1320
gaccccatgg aattcaaacc agagagattt ctaacagaga atgcagacat agatgttggt 1380
ggtcaacatt tcgaactact gccatttggt gctggtagaa gggtgtgtcc tggtgtgtcc 1440
ttcgcactac agttcatgca tttggttctc gcccgtctta tccatggcta tgatatggaa 1500
accctaaatg gtgaagatgt tgatttgagt gttagtagcg ggggacatgt taacatcaaa 1560
tcaaccccac ttgagctcat ccttactcct cgccttcacc cagagcttta cgattgtgaa 1620
acataa 1626
<210> 5
<211> 1575
<212> DNA
<213> EcP6H序列
<400> 5
atggattcct taatgcttgc ttatttgttt ccaatttcag ttgcttctat tattgctttt 60
gttttcctct acaatctctt ttcttcaaga actcttaaaa ataagaagat taggacagca 120
cccatggcaa caggtgcttg gcctgttctt ggtcatctcc atctctttgg ttctggtgaa 180
ttgcctcata aaatgttagc tgccatggct gacaagtatg gctcagcctt caggatgaag 240
ttcggtaaac acacaacact agttgtgagt gatacccgta tcgttaaaga atgtttcact 300
accaacgata ccctcttctc taaccgtcct tccactaaag cttttcaact catgacttac 360
gataatgagt cggttgcctt tacaccttac ggttcttact ggcgcgagat tagaaagata 420
tccactctta aacttctatc caaccatcgt ctccaagcca tcaaggacgt aagagcctcg 480
gaggtaaacg tctgcttcaa aaccttatac gaccagtgta agaatccaag tggatcagct 540
cctattttga tcgatatgaa gaaatggttc gaagaggtct cgaacaacgt ggtgatgagg 600
gtaattgtgg ggagacaaaa ctttgggtct aagattgtgc aaggtgagga ggaagctatc 660
cattacaaga aggtcatgga tgagctctta cgtctcgcta gcttgtctat gttctcggat 720
tttgctcctt tacttggttt cgtggacatc tttcaaggaa acttgagtgc catgaaacga 780
aacgccaaga aggtagatgc aatcctggag aactggttgg aagagcatcg caagaagaag 840
aactcagttg ctgaaagcca gcaagatttc atggatgtta tgttgtcgat tgttgaggag 900
agcaagttgt ctggtcacga tgctgatgcc gtaattaaag ctacttgtct agccatgatc 960
atgggcggaa cagataccac agcagtgagt ctaacatgga tcatttcttt attaatgaat 1020
aatcgtcacg ctttgaagaa agctcgagaa gagttagatg cactagtagg aaaggacaga 1080
caagttgaag attcggattt gaagaattta gtttacatga atgctattgt taaggaaaca 1140
atgagaatgt acccattagg tactcttctc gaacgtgaga ctaaggagga ttgtgagatc 1200
gacgggtttc atgtcaaagg tgggactagg ttgctagtga atgtgtggaa gttgcaacga 1260
gacccaaatg tatgggttga tccaacagaa tttagacccg aaagatttct aacggagaat 1320
gcagatatag atgttggagg tcagcatttt gagttgctac catttggagc aggacgaagg 1380
gtgtgccctg gggtgtcgtt tgcactacaa ttcatgcatt tagtacttgc tcgcctcatc 1440
catggatacg atttgaatac tctaaacgaa gaaaatgtgg atctgacgga gagcccagaa 1500
ggacatgtga accacaaagc atcgcctctt gatctcatcc tcacccctcg tctacattac 1560
aagttgtacg aatag 1575
<210> 6
<211> 1584
<212> DNA
<213> MC6408序列
<400> 6
atggggtact tctcaagatc atctgcaatc ctctcaatct tttctttcct tgtcttctca 60
gcttctttgg gaatttcgag ttcagctcgc gacgactttg ttcaatgtct ttccctccaa 120
caaccttcca tcccagtccc tatctacaca ccaaacacca cgaattatac aacacttttc 180
agatcctctg cacgaaacct tagatattta tctaacactt ctcttacacc tgaagttatt 240
attacaccta cccatgaatc ccatgttcaa gcagctgtta tttgctgtaa gaaacatggg 300
ttagacctca aagttcgaag cggtggccat gatgtcgaag gcctctctta tgcatccgat 360
aaaccatttg ttatcgttga cttggtcgat tatagaaacg tcaccgttga tctaaaagac 420
aacactgcat gggtccaagc tggtgcttcc cttggggaag tttattatag aattggagag 480
aagagcaaga cccttgggtt cccagccggg ttttgcccca ccgttggtgt tggtgggcat 540
attagtggag gtggattcgg tgctttggtg cgaaaatatg gccttgcatc tgatcaagtc 600
attgatgctt acatagtcac tgttgatggc aagattctta acaaagaaac aatgggagaa 660
gatctatttt gggccattag aggtggggga gcatcgagct tcggagttat tctctcatgg 720
aaaatcaaat tggttcctgt tccacctatt gttactgttg ccacggtcga tagaacctta 780
gaacaaggag caacaggcct tgttcataag tggcaatata tcgccgataa actcgatgca 840
gacctctaca tggcgcccac atttactgtg gttaattcta gtagacaagg tgagaaaacg 900
gtgcaagctc aattctcctt cttgttcctt ggcggtgttg acaagctcct ccaaatcatg 960
gaagctaact tccctgaatt gggtttgaag agaaacgaca ccatggaaat gagttgggtc 1020
gaatctcatg tctatttcta caggcgtgga agtccattag aacttctatt ggacagagat 1080
cctataatga agagcttcct caaagtaaaa tctgactatg taaaggaacc aatatcagaa 1140
gctggattag aagagatatg gaaaaggtat atcgaaggag atgcaccagc aatgctattc 1200
actccttttg gtggaaggat gaatgagatc tctgagtttg cacttcctta cccacataga 1260
gccggaaaca tatacaatat tatgtacgtc tcgaactggc tacaagaaag tgaatcagaa 1320
aaacagttag actggttgcg aaaattctac agtttcatgg gtcaatatgt ttctaagttc 1380
ccaagaagtg catatctcaa ctacaaggat cttgacttgg gagtaaataa caaccaggat 1440
ggtatctcag gttacttaaa tgcgaaaatt tggggaacta aatactttaa gcttaacttc 1500
gagagattgg tacttgtgaa gaccacggtt gatcctgaaa atttcttcaa gaacaaacaa 1560
agtattccat ccattacttc atag 1584
<210> 7
<211> 1584
<212> DNA
<213> MC6408 opt序列
<400> 7
atgggttatt tttctagatc ttctgctatt ttgtctattt tttctttttt ggttttttct 60
gcttctttgg gtatttcttc ttctgctagg gatgacttcg tccagtgctt gtctttgcag 120
cagccatcta ttccagttcc aatttatact ccaaatacta ctaattatac tactttgttt 180
agatcttctg ctagaaattt gagatatttg tctaatactt ctttgactcc agaagttatt 240
attactccaa ctcacgaatc tcacgtccaa gctgctgtta tttgttgtaa aaaacatggt 300
ttggacttga aggttagatc tggtggtcac gacgtcgaag gtttgtctta cgcttcagat 360
aaaccatttg ttattgttga tttggttgat tatagaaacg ttactgttga tttgaaagat 420
aacactgctt gggtccaagc aggtgcttct ttgggtgaag tttattatag aattggtgaa 480
aaatctaaga ctttgggttt cccagctggt ttctgtccaa ctgttggtgt cggtggtcac 540
atttctggtg gtggtttcgg tgctttggtc aggaagtacg gtttggcttc tgaccaagtt 600
attgatgctt atattgttac tgttgacgga aaaattttga ataaagaaac tatgggtgaa 660
gacttgttct gggctattag gggtggtggt gcttcttctt tcggtgtcat tttgtcttgg 720
aagattaagt tggtcccagt cccaccaatt gtcacagtcg ctactgtcga caggactttg 780
gagcaaggtg ctactggttt ggttcataaa tggcaatata ttgctgataa attagatgct 840
gatttgtata tggctccaac ttttactgtt gttaactctt ctagacaagg tgaaaaaact 900
gttcaagctc aattttcttt cttgtttttg ggtggtgttg ataaattgtt gcaaattatg 960
gaagctaact tcccagaatt aggtttgaag agaaacgata caatggaaat gtcttgggtt 1020
gaatctcatg tttattttta tagaagaggt tctccattgg aattgttgtt ggacagagat 1080
ccaattatga aatcattttt gaaagttaaa tcagattatg ttaaggaacc aatttcagaa 1140
gctggtttgg aagaaatttg gaagagatac attgagggtg acgctcctgc tatgttgttc 1200
actccattcg gtggtagaat gaatgaaatt tctgagttcg ctttgcctta cccacacaga 1260
gctggtaaca tttacaatat tatgtatgtt tctaattggt tgcaagagtc tgaatctgaa 1320
aaacaattag attggttgag aaaattttat tcttttatgg gacaatatgt ttctaaattt 1380
ccaagatctg cttacttaaa ttataaagat ttggatttgg gtgtcaataa taatcaagat 1440
ggtatttctg gttacttgaa cgcaaaaatt tggggtacta agtattttaa attgaatttt 1500
gaaagattgg ttttggttaa aactactgtt gatccagaaa acttttttaa aaacaagcaa 1560
tctattccat ctattacttc ttaa 1584
<210> 8
<211> 1575
<212> DNA
<213> MC6407序列
<400> 8
atggggttct caaaatctgc aatactttct atcttttctt tccttgtgtt ctcagcttct 60
ttagccattt caagttcagc tcgtgacgac tttgttcaat gtctttccct tcaaaaacct 120
tctgtcccag tgcctatata cacccctaac acggcgaatt atacaacagt tttcagatcc 180
tcagtacgaa acctcagata catatcgaac acttctctta cacctgaagt tattattaca 240
cctacccatg aatcccatgt tcaagcagct gttatttgct gtaagaaaca tgggttagac 300
ctcaaagttc gaagcggtgg ccatgacgtc gaaggcctct cttatgcatc cgataaacca 360
tttgttatcg ttgacttggt cgattataga aacgtcaccg ttgatctaaa agacaacact 420
gcatgggttc aagccggtgc ttccctcggg gaagtttatt atagaatcgg agagaagagc 480
aagacccttg ggttcccagc cgggttttgc cccaccgttg gagttggtgg acatattagt 540
ggaggtggat tcggtgcctt ggtgcgaaaa tatggccttg catctgatca agtcattgat 600
gcttacatag tcactgttga tggcaagatt cttaacaaag aaacaatggg agaagatcta 660
ttttgggcca ttagaggtgg gggagcatcg agcttcggag ttattctctc atggaaaatc 720
aaattggttc ctgttccacc tattgttact gttgccacgg tcgatagaac cttagaacaa 780
ggagcaacag gccttgttca taagtggcaa tatatcgccg ataaactcga tgcagacctc 840
tacatggcgc ccacatttac tgtggttaat tctagtagac aaggtgagaa aacggtgcaa 900
gctcaattct ccttcttgtt ccttggcggt gttgacaagc tcctccaaat catggaagct 960
aacttccctg aattgggttt gaagagaaac gacaccatgg aaatgagttg ggtcgaatct 1020
catgtctatt tctacaggcg tggaagtcca ttagaacttc tattggacag agatcctata 1080
atgaagagct tcctcaaagt aaaatctgac tatgtaaagg aaccaatatc agaagctgga 1140
ttagaagaga tatggaaaag gtatatcgaa ggagatgcac cagcaatgct attcactcct 1200
tttggtggaa ggatgaatga gatctctgag tttgcacttc cttacccaca tagagccgga 1260
aacatataca atattatgta cgtctcgaac tggctacaag aaagtgaatc agaaaaacag 1320
ttagactggt tgcgaaaatt ctacagtttc atgggtcagt atgtttctaa gttcccaaga 1380
actgcatatc tcaactacaa agatcttgac ttgggtgtca ataacaagga tggtgtcttc 1440
agttacttag atgccaaggt ttggggaatt aaatacttca agcttaacta cgaaagattg 1500
gtacttgtaa agaccacagt cgatcctgat aatttcttca agaacaaaca aagcattcca 1560
tccattactt cttag 1575
<210> 9
<211> 1614
<212> DNA
<213> PsDBOX序列
<400> 9
atgatgatga gttcatctaa tattctcccc ttagttacat tccttgtatt agtattcttc 60
tcaagtggtt cttgggcagc taataattca cttaatggag attttctcca atgcattaag 120
aagaatgagt actcctcaat tccaatccca atttttacac ctgataattc ttcatttaca 180
actatctttc ggtcttcggc tcggaacctt agatttctaa cacccaactc aacacaaaca 240
cctcagttta taatcacacc aacccatgaa tctcatgttc aatcagctgt tgtttgttct 300
caaaaacatg ggtttgatct taaagtacga agtggtggtc atgacgtcga aggtttatct 360
tacgtatctg acacgccata cgtcttggtc gacttaatta attttcgaaa cattattgtt 420
gatttgaaag aaaagactgc atggattcaa gctggtgctt cacttggaga ggtttattat 480
caagctgcaa acaagagcaa caacaccctt ggatttccgg caggattttg tcctactgta 540
ggtgttgctg gacacattag tggaggtggg tttggtgcct tggtacgaaa atatggcctt 600
gcgtcagacc aggtcattga tgctcgcatt gtcactgttg acggcaaaat ttacaccaaa 660
gaaaccatgg ggaaagatct gtattgggct attagaggag gtggtgctaa taactttgga 720
gtgcttcttt cctggaaggt caagttggtt cctgtcacac ccgtcgtgac tgttgctacg 780
atcagcagaa cattagaaca aggtgccacg gacctagttc ataagtggca atttgttgcc 840
gatagactcc acgaggacgt atacattggg ctcacatttt cggtcgctaa ctctagccga 900
gcaggaggaa aaacggtatc agttcaattc gcgttcttgt tcttaggagg cagtgacaga 960
cttcttgaac tcatggagga gagcttccct gaattgggtt tgaagcgaaa tgaaactact 1020
gaaatgaaat gggttgaatc tcatgtatac ttctacgcac gaggtagacc aatcgagcta 1080
ttatgggata gagatcatgc aacaaagagt ttcctaaaaa taaaagctga ttacgtgagg 1140
gaaccaatat caaaatccgg tttagaagct atttggagaa ggtttgtagg aggagattca 1200
ccagcaatgt tatggactcc ttttggtggt agaatgaacg agatttcgga atttgaaact 1260
ccttacccac atagagctgg caatatttac aacattatgt acgtcggaaa ttggatgaat 1320
gagactgaat cagagaagca gattgattgg atgagaaggt tttataactc catggctcgt 1380
tatgtttcca agaatccaag atcagcatat atcaactaca aagatctcga cttaggagtt 1440
aaccgtaaca acgttagcga ggcggtgggg tacgtacaag caagatcatg gggtagaaaa 1500
tacttcaaaa gtaactttga aagattagtc aaagttaaga gcatggttga tcctggtaat 1560
ttcttcaaga acaaacaaag tattcctcct gttagtactt ggggcaagca gtag 1614
<210> 10
<211> 2127
<212> DNA
<213> CuCPR序列
<400> 10
atgcaatcgg aatccagttc tatgaaggct tctccatttg acttcatgtc ggctataatt 60
aagggcagga tggatccgtc taattcttca tttcaatcga ctggcgaggg tgcctcagtt 120
attttcgaga atcgcgagct ggttgcgatc ttaactacct cgatcgctgt catgattggc 180
tgctttgttg ttcttgtgtg gcgaagatcc ggaaatcgaa aagttaagac tatagagctt 240
cctaagccgt tgcttgggaa ggagccagag ccagaagttg acgacgggaa gaagaaggtt 300
acgatattct ttggtacgca gactggtact gctgaaggct ttgcaaaggc tctatctgac 360
gaggcgaaag cacggtacga taaggccaag tttagagttg ttgatttgga tgattatggg 420
gctgacgaag atgaatacga acaaaaattg aaaaaggagt ctgtagctgt tttcttcttg 480
gcaacgtatg gcgatggaga gcccactgat aatgccgcaa gattctataa atggttcacc 540
gagggtaaag agagagggga atgtcttcag aacctcaatt atgcagtctt tggccttggc 600
aaccgacaat atgagcattt taataagatt gcaaaagtgg ttgatgagct gcttgagact 660
cagggtggta agcgccttgt aaaagttgga cttggagatg acgatcagtg catagaggat 720
gacttctctg cttggcgaga atcattgtgg cctgagttgg atcaattgct tcgggatgag 780
gatgatgcag caactgtgac cacaccttac acagctgcca tatcagaata ccgagtggta 840
ttccatgatc cttcagatgt aactgatgac aaaaagaact ggatgaatgc aaatggtcat 900
gctgtacatg acgcacaaca tccattcaga tctaatgtgg ttgtgagaaa ggagctccat 960
acacctgcgt ctgatcgttc ttgtactcat ctagagtttg atatttctga gtctgcactc 1020
aaatatgaaa caggggatca tgttggtgtt tactgtgaaa atttaaccga gactgttgat 1080
gaggctctaa atttattggg tttgtctcct gaaacgtatt tctccattca tactgataat 1140
gaggatggca cccaactagg tggaagctct ttaccacctc cttttccatc ctgcaccctc 1200
agaacagcat tgactcgata tgcagatctt ttaaattcac ccaaaaagtc agcattgctc 1260
gcattagcag cacatgcttc aaatcctata gaggctgacc gattaagata tcttgcatca 1320
cctgctggga aggatgaata ttctcagtct gtggttggta gccagaaaag cctgcttgaa 1380
gtcatggctg aatttccttc tgccaagcct ccacttggtg tcttctttgc agctgttgca 1440
ccacgtttac agcctcgatt ctactccata tcatcatctc caaggatggc tccatctaga 1500
attcatgtta cttgtgctct tgtctatgac aaaatgccaa ctggacgtat tcataaagga 1560
atttgctcta cttggatgaa gaattctgtg cccatggaga aaatccatga gtgcagttgg 1620
gctccaattt ttgtgaggca atcaaacttc aagcttcctt ctgatagtaa agtgcctatt 1680
atcatggttg gtcctggaac tggattggct cctttcagag gtttcttaca ggaaagatta 1740
gctttgaaag aatctggagt agaattgggg ccttccatat tgttctttgg atgcagaaac 1800
cgtgcaatgg attatatata cgaggatgag ctgaacaact ttgtcgagac tggtgctctc 1860
tccgagttgg ttatcgcctt ctcgcgtgaa ggtccaacga aagaatacgt gcaacataaa 1920
atgacagaga aggcgtcaga catctggaat ttgatatcac aaggtgctta cttatatgta 1980
tgcggtgatg caaagggaat ggctagagac gtccacagaa ctctccacac catcgtgcaa 2040
gaacagggat ctcttgacag ctcgaaagct gagagcatgg tgaagaatct acaaacgagc 2100
ggaaggtatc tgcgtgatgt gtggtga 2127
<210> 11
<211> 2052
<212> DNA
<213> PsCPR序列
<400> 11
atggggtcaa acaacctggc aaactctatc gagtctatgc ttgggatatc tattggaagt 60
gaatacattt cagatcctat ctttatcatg gtaaccaccg tggcttctat gctaataggc 120
tttgggtttt tcgcatgcat gaaaagttcc tcatcacaat caaaacctat tgaaacatac 180
aaacctatca ttgataagga ggaagaggaa atcgaagtcg accctgggaa gataaagctc 240
acaatctttt tcgggacaca aacaggaaca gctgaaggat tcgcaaaggc cttggctgaa 300
gagatcaaag ctaagtacaa aaaggccgtg gttaaggtgg ttgaccttga tgattatgcc 360
gcggaggatg atcagtacga ggaaaaactc aaaaaggaaa gtctcgtgtt tttcatggtt 420
gctacttatg gggacggaga accaacggat aatgccgcaa gattctacaa gtggtttact 480
caagagcacg aaagaggtga atggttacaa cagctgactt atggtgtatt cggcttgggt 540
aatagacaat acgaacattt caataagatt gcagtagacg ttgatgaaca attaggaaag 600
caaggcgcaa agagaatagt tcaagtaggt ttaggtgacg atgatcaatg tatcgaagat 660
gatttcacag catggagaga actcttatgg actgaactag accagcttct caaggacgaa 720
gatgccgctc cttctgtcgc tactccatac attgcaacag taccagagta cagagtcgtt 780
attcatgaaa ccactgttgc ggctctagat gataagcata tcaacacagc caacggagat 840
gttgcgttcg atattctgca tccatgtaga acgattgttg cacaacagag agaacttcat 900
aagccaaagt ccgaccgaag ctgcattcac ttggaatttg atatctctgg ttcctccttg 960
acatacgaaa ctggtgatca tgtaggagtt tacgcggaaa actgtgacga gactgtcgag 1020
gaagcaggaa agttattggg ccagccactt gatttgttat tctctatcca cacggataaa 1080
gaggacggtt ctccacaagg ttcatcttta cctcctccat tccctggtcc atgtacttta 1140
cgtagtgctc tagcaagata cgcagactta ttgaatccac cacgtaaggc ctctctaata 1200
gctctttctg ctcatgcctc tgttccatca gaggctgaaa gactaaggtt tttgtcatct 1260
ccattgggca aaaacgaata ctcaaaatgg gtagtaggct ctcaaagatc attgttagag 1320
attatggctg aatttccatc tgctaagcct cctttgggtg tgtttttcgc tgctgttgca 1380
cctcgactac caccaagata ctatagcatt tctagttctc caaagtttgc tccatccaga 1440
atacatgtta catgcgccct ggtatatggt caatcaccaa ctggtagagt ccacagggga 1500
gtctgcagca cgtggatgaa gcacgccgtt cctcaagata gttgggctcc tatcttcgtt 1560
agaacttcca atttcaagtt accagccgac ccaagtaccc caatcatcat ggtgggacca 1620
ggtacaggcc tagctccatt tcgaggcttc ctccaagaga gaatggcttt gaaagagaac 1680
ggtgcgcaac ttggccctgc cgttttgttt ttcggatgta ggaacagaaa catggatttc 1740
atatacgaag atgaacttaa caatttcgtc gaacgtggtg tcatttctga gctagtaatc 1800
gccttctcaa gagagggtga gaaaaaggaa tatgtgcaac acaagatgat ggaaaaagct 1860
accgatgttt ggaatgttat ctctggggat ggttatctgt acgtctgtgg cgatgcaaag 1920
ggcatggcta gagatgtcca tagaacactg cacacaattg ctcaagagca aggtccaatg 1980
gaatcatccg ccgcagaagc agcagtcaaa aagttacaag ttgaagagag atacttgaga 2040
gatgtatggt aa 2052
<210> 12
<211> 2079
<212> DNA
<213> AtCPR序列
<400> 12
atgacttctg ctttgtatgc ttccgatttg tttaagcagc tcaagtcaat tatggggaca 60
gattcgttat ccgacgatgt tgtacttgtg attgcaacga cgtctttggc actagtagct 120
ggatttgtgg tgttgttatg gaagaaaacg acggcggatc ggagcgggga gctgaagcct 180
ttgatgatcc ctaagtctct tatggctaag gacgaggatg atgatttgga tttgggatcc 240
gggaagacta gagtctctat cttcttcggt acgcagactg gaacagctga gggatttgct 300
aaggcattat ccgaagaaat caaagcgaga tatgaaaaag cagcagtcaa agtcattgac 360
ttggatgact atgctgccga tgatgaccag tatgaagaga aattgaagaa ggaaactttg 420
gcatttttct gtgttgctac ttatggagat ggagagccta ctgacaatgc tgccagattt 480
tacaaatggt ttacggagga aaatgaacgg gatataaagc ttcaacaact agcatatggt 540
gtgtttgctc ttggtaatcg ccaatatgaa cattttaata agatcgggat agttcttgat 600
gaagagttat gtaagaaagg tgcaaagcgt cttattgaag tcggtctagg agatgatgat 660
cagagcattg aggatgattt taatgcctgg aaagaatcac tatggtctga gctagacaag 720
ctcctcaaag acgaggatga taaaagtgtg gcaactcctt atacagctgt tattcctgaa 780
taccgggtgg tgactcatga tcctcggttt acaactcaaa aatcaatgga atcaaatgtg 840
gccaatggaa atactactat tgacattcat catccctgca gagttgatgt tgctgtgcag 900
aaggagcttc acacacatga atctgatcgg tcttgcattc atctcgagtt cgacatatcc 960
aggacgggta ttacatatga aacaggtgac catgtaggtg tatatgctga aaatcatgtt 1020
gaaatagttg aagaagctgg aaaattgctt ggccactctt tagatttagt attttccata 1080
catgctgaca aggaagatgg ctccccattg gaaagcgcag tgccgcctcc tttccctggt 1140
ccatgcacac ttgggactgg tttggcaaga tacgcagacc ttttgaaccc tcctcgaaag 1200
tctgcgttag ttgccttggc ggcctatgcc actgaaccaa gtgaagccga gaaacttaag 1260
cacctgacat cacctgatgg aaaggatgag tactcacaat ggattgttgc aagtcagaga 1320
agtcttttag aggtgatggc tgcttttcca tctgcaaaac ccccactagg tgtatttttt 1380
gctgcaatag ctcctcgtct acaacctcgt tactactcca tctcatcctc gccaagattg 1440
gcgccaagta gagttcatgt tacatccgca ctagtatatg gtccaactcc tactggtaga 1500
atccacaagg gtgtgtgttc tacgtggatg aagaatgcag ttcctgcgga gaaaagtcat 1560
gaatgtagtg gagccccaat ctttattcga gcatctaatt tcaagttacc atccaaccct 1620
tcaactccaa tcgttatggt gggacctggg actgggctgg caccttttag aggttttctg 1680
caggaaagga tggcactaaa agaagatgga gaagaactag gttcatcttt gctcttcttt 1740
gggtgtagaa atcgacagat ggactttata tacgaggatg agctcaataa ttttgttgat 1800
caaggcgtaa tatctgagct catcatggca ttctcccgtg aaggagctca gaaggagtat 1860
gttcaacata agatgatgga gaaggcagca caagtttggg atctaataaa ggaagaagga 1920
tatctctatg tatgcggtga tgctaagggc atggcgaggg acgtccaccg aactctacac 1980
accattgttc aggagcagga aggtgtgagt tcgtcagagg cagaggctat agttaagaaa 2040
cttcaaaccg aaggaagata cctcagagat gtctggtga 2079
<210> 13
<211> 2061
<212> DNA
<213> Mc19967序列
<400> 13
atggcttcga attttgctaa ttcgctcgaa tcgatcttcg gaatctcatt aggatcatca 60
gaatacgttt ctgaaccgat tcttattatc atcacaacct cagttgcagt gttaattgga 120
cttggtttct tcatatggat gaaatcttct acttcttcga ggccggttga acctctgaag 180
ccggtgtcgt ttatgaaaga agaagaggaa gttgaagttg atccgggaaa aactaagatc 240
acgatcttct ttggtactca aactggcact gctgaaggat ttgccaaggc attggcagaa 300
gagattaagg caagatacga gaaagcagtt gtcaaagtaa ttgacctgga tgattatgcg 360
gcagaagatg atctgtatga ggagaaacta aagaaagaga ctttagcgtt tttcatgcta 420
gccacttatg gtgatggtga gccaacggac aatgctgcga gattttacaa atggtttact 480
caggaacatg aaaggggagt ctggctccag caactaactt atggtgtttt tggtctgggt 540
aaccgtcaat atgagcattt caataaggtc aacggaattc gtgttgcttc tttgataggt 600
gcaaagcgtc ttgttccagt ggggctcggt gatgacgatc aatgcattga agatgacttc 660
agcgcttggc gagaattatt gtggacggaa ttggatcagg tactccgaga tgaggatggt 720
cctaatacag tatctactcc gtatactgct gctgttcctg aatatcgggt agtgattcat 780
gatcctactg ttacagcctt ggatgataaa caattaagta cggcaaatgg gattgttgct 840
tttgatattc accatccttg cagagccaat gttgctgttc aaagagagct ccacaaacct 900
gattctgaca gatcttgcat acatctggag tttgacatat caggcactgg ccttacatat 960
gaaactggag accatgtggg tgtttatact gagaactgtg atgaaactgt tgaggaagga 1020
ggaaaaatgt tgggtcaacc catggatcta ctgttttcgc ttcacaccga taaagaggat 1080
gggacaccct tgggcagctc gctaccacct cctttccctg gtccttgcac cttacgaact 1140
gcactggcac gttatgctga tctcttgaat cctcctagaa aggctgctct gattgctttg 1200
gctgctcatg catctgtacc tagtgaagca gagaaactaa agtttttgtc atcacctcag 1260
ggaaaggatg aatattcaca atgggttgtt ggaagtcaga gaagtcttct ggaagtaatg 1320
gctgaatttc catcagcaaa acctcctctt ggtgttttct ttgcagcagt agcccctcgc 1380
ttacagcctc gatactattc tatctcatcc tctcctagat ttgctccttc aagaattcat 1440
gtaacctgcg ccttggttta tggtccaagt cctacaggaa ggattcaccg aggagtgtgt 1500
tcaacatgga tgaagcatgc agttgctcta gagaaaagcc atgactgtag ctgggctccg 1560
gtttttgttc gaacatcaaa ttttaagtta ccagccgacc cttcaattcc aatcgtcatg 1620
gtgggacctg gtacaggtct agctcctttc agaggatttc tgcaggaaag actggccctt 1680
aaagaagatg gtgctcaact tggtcctgca atgctctttt ttggctgtag gaatcgcaga 1740
atggacttca tttatgaaga tgaactcaac aactttgttg aacaaggagc gatatcggag 1800
ctgattgttg ccttctcacg tgaaggagaa aagaaggaat atgttcaaca taagatgatg 1860
gagaaagcag cacaattatg gagtgtaata tctagtggcg gttatctctg tgtgtgtggt 1920
gatgctaagg gaatggccag agatgttcat cggacattgc ataccattgc tcaagagcag 1980
ggaggtatgg actcatctgg tgccgagtcc acagtaaaga aactccagat ggaagggcga 2040
tatcttagag atgtgtggtg a 2061
<210> 14
<211> 2097
<212> DNA
<213> Mc13802序列
<400> 14
atggagtcaa gttccatgaa aatctctctg tttgatctca tgtctgcgtt agttaacgga 60
aagttagatc cgtcggattc tagtgcagct attttgattg agaatcgcga gcttttaatg 120
atcttaacaa ccgcgatcgc tgtttttatt ggctgtggat ttctctacgt ttggagaaga 180
tctttgaaga aatcgagcaa aattgttgaa cctccgaaaa tttcgatcat taaggagtcg 240
gaaccggaga ttgatgacgg taagaagaag gttacgatct tcttcggtac acaaactggt 300
acagctgaag gattcgcaaa ggcacttgcg gaagaggcta aagcacgata tgataaagcc 360
atctttaaag tggttgatct ggatgattac gcagctgacg atgatgaatt tgaagagaaa 420
ttgaagaaag aaactttagc acttttcttt ttggcaacat atggagacgg tgaaccgaca 480
gacaatgctg ccagatttta taaatggttt acagagggaa aagagaagga actctggctt 540
cagaatcttc attatggtgt gttcggtctt ggcaatagac agtatgaaca tttcaataag 600
gtctttaatg tgttccttgt cactttaata ggtgggaagc gtcttgttcc tgtgggcctt 660
ggagacgatg atcaatgcat agaagatgac ttcacagcat ggcgagaatt ggtatggcct 720
gaattggatc agttgctcct tgatgaaaat gatgcaacaa gtgtttctac cccttacact 780
gctgctgtag cagaatatag agtggtattc catgatgctg cagatgcacc tctacaggaa 840
aaaaattgga gtaatgcaaa tggccatgct gttcatgaca ttctacaccc atgcagagcc 900
aatgtggctg taagaaggga gcttcacaca ccagcttcag atcgttcttg tattcatctg 960
gaattcgaca tttcaggctc tgggctttct tatgaaacag gagaccatgt tggtgtatat 1020
tctgagaatt gtattgaaac tgtggaggaa gcggagaggt tgttgggtta ttcatcagat 1080
actttctttt ccatccatgt tgataaagag gatggcacac caattagtgg aagcgcatta 1140
cctccccctt ttccatctcc ctgcacttta agagctgcac tgacccgata tgcagatctg 1200
ttgaattttc ctaagaaggc tgctctgcat gctttagctg cttatgcatc tgatccaaag 1260
gaagctgagc gattaagatt tcttgcatca cctgctggga aggatgaata tgcacagtgg 1320
gtagttgcaa gtcagagaag tctgctagag gtcatggctg aatttccatc agcaaagcct 1380
cctcttggag ttttctttgc tgcaatagct ccgcgcttgc agcccagata ctattcgatt 1440
tcgtcctccc ataggatggc accctctaga attcatgtca catgtgcatt agtgtatgag 1500
acaacaccag caggtcgggt tcacaaagga gtgtgttcaa cctggatgaa gaattctgtg 1560
cctttggaag aaagccgtaa ttgcagctgg gcaccaattt ttgtgagaca atctaatttc 1620
aaacttccta ctgattctac cgtaccaatt atcatgattg gccctgggac tgggttggct 1680
ccttttaggg gattcatgca ggatcgacta gctctgaaag aagctggtgt agaactggga 1740
cccgcaatac tgttctttgg atgcaggaac agaaggatgg attacatata cgaagaggag 1800
ttgaatggct ttgtggaagc aggtgctatc tctgagctgg ttgttgcttt ctcacgggag 1860
gggcctacaa aggaatatgt ccagcataag atgctggaga aggcctccga tatctggaat 1920
atgatctctc agggtggtta tctttatgtc tgtggtgatg ccaaaggcat ggccagggat 1980
gtgcatcgaa ctcttcacac cattgttcaa gagcagggat ctttggacag ctccaagact 2040
gaaagcttag tgaagaacct gcagatggac gggaggtatc tacgtgatgt ctggtga 2097
<210> 15
<211> 40
<212> DNA
<213> PsP6H-Ura-F序列
<400> 15
ggaatattaa gcttgatgga tggatttctc atcactacta 40
<210> 16
<211> 39
<212> DNA
<213> PsP6H-Ura-R序列
<400> 16
gatgcggccc tctagctatt atgtttcaca atcgtaaag 39
<210> 17
<211> 45
<212> DNA
<213> EcP6H-Ura-F序列
<400> 17
ggaatattaa gcttgatgga ttccttaatg cttgcttatt tgttt 45
<210> 18
<211> 45
<212> DNA
<213> EcP6H-Ura-R序列
<400> 18
gatgcggccc tctagctatt cgtacaactt gtaatgtaga cgagg 45
<210> 19
<211> 38
<212> DNA
<213> MC11229-Ura-F序列
<400> 19
ggaatattaa gcttgatggc tgctcttctt gccttggt 38
<210> 20
<211> 48
<212> DNA
<213> MC11229-Ura-R序列
<400> 20
gatgcggccc tctagctaat actcataaag cttgggatgg aggcgtgg 48
<210> 21
<211> 54
<212> DNA
<213> MC11218-Ura-F序列
<400> 21
ggaatattaa gcttgatgga atattcatcc cttctaactc tccagtatgg ctgc 54
<210> 22
<211> 49
<212> DNA
<213> MC11218-Ura-R序列
<400> 22
gatgcggccc tctagttaat aatcatagag cttagggttg ctgaagcgt 49
<210> 23
<211> 36
<212> DNA
<213> AtCPR-Leu-F序列
<400> 23
ggaatattaa gcttgatgac ttctgctttg tatgct 36
<210> 24
<211> 36
<212> DNA
<213> AtCPR-Leu-R序列
<400> 24
gatgcggccc tctagtcacc agacatctct gaggta 36
<210> 25
<211> 21
<212> DNA
<213> YES2-Detect-F序列
<400> 25
accccggatc ggactactag c 21
<210> 26
<211> 24
<212> DNA
<213> YES2-Detect-R序列
<400> 26
tccttccttt tcggttagag cgga 24
<210> 27
<211> 36
<212> DNA
<213> MC11229opt-His-F序列
<400> 27
ttaagcttgg taccgatggc agctttgttg gctttg 36
<210> 28
<211> 36
<212> DNA
<213> MC11229opt-His-R序列
<400> 28
gatgcggccc tctagttaat attcatacaa ttttgg 36
<210> 29
<211> 36
<212> DNA
<213> CuCPR-Leu-F序列
<400> 29
ggaatattaa gcttgatgca atcggaatcc agttct 36
<210> 30
<211> 36
<212> DNA
<213> CuCPR-Leu-R序列
<400> 30
gatgcggccc tctagtcacc acacatcacg cagata 36
<210> 31
<211> 40
<212> DNA
<213> MC6408-Trp-F序列
<400> 31
ggaatattaa gcttgatggg gtacttctca agatcatctg 40
<210> 32
<211> 40
<212> DNA
<213> MC6408-Trp-R序列
<400> 32
gcggccctct agatgctatg aagtaatgga tggaatactt 40
<210> 33
<211> 40
<212> DNA
<213> MC6407-Trp-F序列
<400> 33
ggaatattaa gcttgatggg gttctcaaaa tctgcaatac 40
<210> 34
<211> 40
<212> DNA
<213> MC6407-Trp-R序列
<400> 34
gcggccctct agatgctaag aagtaatgga tggaatgctt 40
<210> 35
<211> 36
<212> DNA
<213> PsDBOX-Trp-F序列
<400> 35
ggaatattaa gcttgtggag aaggtttgta ggagga 36
<210> 36
<211> 36
<212> DNA
<213> PsDBOX-Trp-R序列
<400> 36
gcggccctct agatgctact gcttgcccca agtact 36
<210> 37
<211> 36
<212> DNA
<213> MC6408opt-Trp-F序列
<400> 37
ggaatattaa gcttgatggg ttatttttct agatct 36
<210> 38
<211> 36
<212> DNA
<213> MC6408opt-Trp-R序列
<400> 38
gcggccctct agatgttaag aagtaataga tggaat 36
<210> 39
<211> 36
<212> DNA
<213> PsCPR-Leu-F序列
<400> 39
ggaatattaa gcttgatggg gtcaaacaac ctggca 36
<210> 40
<211> 36
<212> DNA
<213> PsCPR-Leu-R序列
<400> 40
gatgcggccc tctagttacc atacatctct caagta 36
<210> 41
<211> 48
<212> DNA
<213> Mc19967-Leu-F序列
<400> 41
ggaatattaa gcttgatggc ttcgaatttt gctaattcgc tcgaatcg 48
<210> 42
<211> 45
<212> DNA
<213> Mc19967-Leu-R序列
<400> 42
gatgcggccc tctagtcacc acacatctct aagatatcgc ccttc 45
<210> 43
<211> 39
<212> DNA
<213> Mc13802-Leu-F序列
<400> 43
ggaatattaa gcttgatgat ggagtcaagt tccatgaaa 39
<210> 44
<211> 37
<212> DNA
<213> Mc13802-Leu-R序列
<400> 44
gatgcggccc tctagttcac cagacatcac gtagata 37
Claims (3)
1.一种高效酶催化合成血根碱和白屈菜红碱的方法,其特征在于,具体包括如下步骤:
S1、对参与血根碱和白屈菜红碱生物合成的基因进行密码子优化:首先根据血根碱和白屈菜红碱的生物合成途径,分别从已知的普罗托品-6-羟基化酶基因、二氢苯并菲啶氧化酶基因及细胞色素P450还原酶基因中通过异源表达和结果比对分析,分别筛选出表达效率高的最优基因,然后对筛选出的普罗托品-6-羟基化酶基因、二氢苯并菲啶氧化酶基因最优基因进行密码子优化,具体如下:
从已知的普罗托品-6-羟基化酶基因MC11229和MC11218中通过异源表达和结果比对分析,筛选出表达效率高的最优基因MC11229,然后对筛选出的最优基因MC11229进行密码子优化得到优化后的基因MC11229opt;其中:MC11229的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,MC11229opt的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,MC11218的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;
从已知的二氢苯并菲啶氧化酶基因MC6408和MC6407中通过异源表达和结果比对分析,筛选出表达效率高的最优基因MC6408,然后对筛选出的最优基因MC6408进行密码子优化得到优化后的基因MC6408opt;其中:MC6408的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示,MC6408 opt的核苷酸序列如SEQ ID No.7所示,MC6407的核苷酸序列如SEQ ID No.8所示;
从已知的细胞色素P450还原酶基因CuCPR、PsCPR、AtCPR、Mc19967和Mc13802中通过异源表达和结果比对分析,筛选出表达效率高的最优基因CuCPR,CuCPR的核苷酸序列如SEQID No.10所示;
S2、将博落回普罗托品-6-羟基化酶基因优化序列MC11229opt与辅酶基因CuCPR、二氢苯并菲啶氧化酶基因优化序列MC6408 opt一起构建到表达载体上,然后转入酵母工程菌中,并进行转化,获得重组酵母工程菌株;
S3、将博落回的叶片原料液与步骤S3构建的重组酵母工程菌进行发酵,发酵条件为:将博落回叶片原液作为底物,前体饲喂步骤S2构建的酵母工程菌;温度30°下,发酵培养24小时;然后收集培养后的酵母工程菌,裂解菌体、分离纯化,即得血根碱和白屈菜红碱;
博落回叶片原液的制备方法如下:
(1)将博落回叶片放于35~45℃的恒温干燥箱中烘干,并粉碎得叶片粉末备用;
(2)然后将制得的叶片粉末按比例加入一定体积pH=8.0的TE缓冲溶液中,配置呈一定比例的缓冲液;
(3)最后将所述缓冲液先放入高压蒸汽灭菌锅中110~120℃灭菌25~35min或者放入超声波清洗器中超声25~35min,然后4500~5500rpm离心4~6min,上清液过0.2~0.25μm滤膜,即得。
2.根据权利要求1所述的高效酶催化合成血根碱和白屈菜红碱的方法,其特征在于,步骤S2中,所述表达载体的质粒选自PYES2。
3.根据权利要求1所述的高效酶催化合成血根碱和白屈菜红碱的方法,其特征在于,步骤S2中,所述酵母工程菌株的宿主菌选自酵母菌株ivf。
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---|---|---|---|
CN201811423227.1A CN109468351B (zh) | 2018-11-27 | 2018-12-06 | 高效酶催化合成血根碱与白屈菜红碱的方法 |
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Cucumis sativus NADPH--cytochrome P450 reductase 2-like (LOC101219498) , mRNA. GENBANK ACCESSION NO.: XM_004146269;PREDICTED;《GENBANK》;20150323;FEATURE * |
Integration of Transcriptome, Proteome and Metabolism Data Reveals the Alkaloids Biosynthesis in Macleaya cordata and Macleaya microcarpa;ZENG Jiangguo et al.;《PLOS ONE》;20130109;第8卷(第1期);第1页右栏第1段,第2页左栏第2段,右栏第5段,第13页右栏第1段,第14页右栏第4段至第15页左栏第1段,图1,表1 * |
LIU Xiubin et al..The Genome of Medicinal Plant Macleaya cordata Provides New Insights into Benzylisoquinoline Alkaloids Metabolism.《Molecular Plant》.2017,第10卷(第7期),第977页左栏第1段至右栏第2段,第980页左栏第3段至右栏第1段,图1、2、4、5,图S20-S22. * |
The Genome of Medicinal Plant Macleaya cordata Provides New Insights into Benzylisoquinoline Alkaloids Metabolism;LIU Xiubin et al.;《Molecular Plant》;20170705;第10卷(第7期);第977页左栏第1段至右栏第2段,第980页左栏第3段至右栏第1段,图1、5,图S20-S22 * |
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