CN109136119A - 微生物及其用途 - Google Patents
微生物及其用途 Download PDFInfo
- Publication number
- CN109136119A CN109136119A CN201710464229.4A CN201710464229A CN109136119A CN 109136119 A CN109136119 A CN 109136119A CN 201710464229 A CN201710464229 A CN 201710464229A CN 109136119 A CN109136119 A CN 109136119A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- gene
- fermentation
- lycopene
- microorganism
- seq
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/37—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
- C07K14/39—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi from yeasts
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P5/00—Preparation of hydrocarbons or halogenated hydrocarbons
- C12P5/007—Preparation of hydrocarbons or halogenated hydrocarbons containing one or more isoprene units, i.e. terpenes
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明提出了一种微生物及其用途和获得番茄红素的方法,该微生物过表达TmCrtE,PagCrtB和BtCrtI基因;以及沉默Exg1和Ypl062W基因。利用根据本发明实施例的微生物,现对于现有技术,生产番茄红素的产量显著提高,生产周期短,生产效率高。
Description
技术领域
本发明涉及生物工程领域,具体的,本发明涉及微生物及其用途,更具体的,本发明涉及微生物、获得番茄红素的方法和微生物在制备番茄红素中的用途。
背景技术
番茄红素的开发生产主要有天然产物提取、化学合成、微生物发酵等方法。天然产物提取主要是通过成熟果实的萃取纯化获得番茄红素,然而这种生产方式受气候、品种、地理位置、成熟度等诸多不可控因素影响,具有明显的季节性,含量不稳定性,并且大面积种植、养殖的成本较高,含量通常也比较低。另外,高纯度的番茄红素在萃取纯化技术上非常困难,这些共同造成了番茄红素的成品十分昂贵。化学合成法具有原料易得价廉、反应条件温和、反应速率快、产物容易与反应体系分离的优点,但由于双键立体选择性难以控制及不同程度的化学试剂残留,其产品的质量、安全性及使用范围都受到了限制。微生物发酵法主要是利用微生物的生物代谢,将葡萄糖、淀粉、黄豆饼粉等廉价原料转化为番茄红素,这种方法不受季节、地域、气候等因素的影响,原料易获取、生产周期短、工艺操作简单、成本低廉、产物质量可控、产物易纯化、安全性高,并且环境污染较少,不仅解决了因种植植物等而占用大量耕地的问题,也解决了化学合成不环保的弊端。最重要的是,发酵法生产的番茄红素属于天然型产品,其活性与天然植物提取的活性成分一致,被认为是番茄红素生产最有前景的方法。
发明内容
本发明旨在至少在一定程度上解决相关技术中的技术问题之一。
目前研究较多的番茄红素产生菌的主要是三孢布拉氏霉菌。但是三孢布拉氏霉菌在传代过程中容易发生退化现象,使得番茄红素产量减少,另伴有黄曲霉毒素等有毒成分的合成,另一方面,这两种微生物的生长周期相较于酵母和大肠杆菌较长,大大降低了其生产效率,从而造成了生产番茄红素的难度加大。
为此,本发明的一个目的在于提出了一种微生物,该微生物生产番茄红素的产量高,生产周期短,生产效率高。
在本发明的第一方面,本发明提出了一种微生物。根据本发明的实施例,所述微生物过表达TmCrtE,PagCrtB和BtCrtI基因;以及沉默Exg1和Ypl062W基因。利用根据本发明实施例的微生物,现对于现有技术,生产番茄红素的产量显著提高,生产周期短,生产效率高。
根据本发明的实施例,上述微生物还可以进一步包括如下附加技术特征至少之一:
根据本发明的实施例,所述微生物进一步过表达包括选自tHMG1,INO2,yap1,spt15-5,taf25-3,GapN,PYC2,SMAE1,MDH2,POS5,pntAB,ADH2,ACS6,ALD6,EUTE,ERG12,IDI1,ERG10,MVD1,ERG13,ERG8基因的至少之一。发明人发现,所述微生物进一步过表达上述基因的至少之一,其番茄红素的产量进一步提高。
根据本发明的实施例,所述微生物进一步沉默包括选自GAL1,GAL7,GAL10,GAL80,ROX1,VBA5,DOS2,Yjl064W,Yer130C,Yer134C,Ynr063W,Yor292C,Sfk1,Mef1基因的至少之一。发明人发现,所述微生物进一步沉默上述基因的至少之一,其番茄红素的产量进一步提高。
根据本发明的实施例,所述微生物是酵母菌。酵母菌的生长周期短,利用本发明实施例的微生物生产番茄红素的效率进一步提高。
根据本发明的实施例,所述微生物进一步包括可操作调控ERG9基因。根据本发明的实施例,所述可操作调控ERG9基因包括但不限于替换ERG9基因的启动子,进而使得ERG9基因的表达可以根据需要进行调控,使微生物生产番茄红素的效率进一步提高。
在本发明的第二方面,本发明提出了一种获得番茄红素的方法。根据本发明的实施例,所述方法包括:将前面所述的微生物进行发酵处理;以及将发酵处理产物进行萃取处理,以便获得所述番茄红素。利用根据本发明实施例的获得番茄红素的方法,能够高产量、高效率获得番茄红素,且番茄红素的纯度高。
根据本发明的实施例,上述获得番茄红素的方法还可以进一步包括如下附加技术特征至少之一:
根据本发明的实施例,利用根据本发明实施例的获得番茄红素的方法,获得的番茄红素产量更高、效率更高,纯度也更高。
根据本发明的实施例,所述发酵处理是通过如下方式实现的:将所述微生物进行基础发酵处理和两级分批补料发酵处理,所述基础发酵处理是在基本发酵培养基中进行的,所述两级分批补料发酵处理是通过在所述基本发酵培养基基础上依次补加第一补料培养基和第二补料培养基实现的,其中,所述基本发酵培养基为含有24g/L蛋白胨,12g/L酵母提取物和12g/L葡萄糖的YPD培养基;所述第一补料培养基为含有500g/L葡萄糖和15g/L酵母抽提物的YPD培养基;所述第二补料培养基为75%乙醇和/或50%甘油。发明人通过实验发现,采用上述发酵处理方式,微生物的扩增速率高、番茄红素的产率也进一步提高。
根据本发明的实施例,所述萃取处理包括:将所述发酵处理产物进行超声破碎处理及有机萃取处理。发明人对发酵产物进行萃取处理过程中发现,将发酵处理后产物进行超声破碎处理,相比于采用盐酸蒸煮的方法,番茄红素的降解大幅降低,萃取处理后获得的番茄红素的产量进一步提高。
在本发明的第三方面,本发明提出了前面所述微生物在制备番茄红素中的用途。如前所述,利用本发明实施例的微生物,现对于现有技术,生产番茄红素的产量显著提高,生产周期短,生产效率高。
附图说明
图1是根据本发明实施例1的敲除盒片段1的结构示意图;
图2是根据本发明实施例1的敲除盒片段2的结构示意图;
图3是根据本发明实施例1的敲除盒片段3的结构示意图;
图4是第二代工程菌株摇瓶发酵结果;
图5是根据本发明实施例4的敲除盒片段4的结构示意图;以及
图6是根据本发明实施例的发酵培养基的筛选结果图。
具体实施方式
下面详细描述本发明的实施例。下面描述的实施例是示例性的,仅用于解释本发明,而不能理解为对本发明的限制。
微生物
在本发明的第一方面,本发明提出了一种微生物。根据本发明的实施例,该微生物过表达TmCrtE,PagCrtB和BtCrtI基因;以及沉默Exg1和Ypl062W基因。利用根据本发明实施例的微生物,生产番茄红素的产量显著提高,生产周期短,生产效率高。
本申请所述的微生物用于生产番茄红素,相比于现有技术,其产量得到了显著提高,能够至少达到2.5g/L。
根据本发明的具体实施例,该微生物可进一步过表达包括选自tHMG1,INO2,yap1,spt15-5,taf25-3,GapN,PYC2,SMAE1,MDH2,POS5,pntAB,ADH2,ACS6,ALD6,EUTE,ERG12,IDI1,ERG10,MVD1,ERG13,ERG8基因的至少之一。
根据本你发明的再一具体实施例,该微生物可进一步沉默包括选自GAL1,GAL7,GAL10,GAL80,ROX1,VBA5,DOS2,Yjl064W,Yer130C,Yer134C,Ynr063W,Yor292C,Sfk1,Mef1基因的至少之一。
发明人发现,所述微生物进一步过表达或沉默上述基因的至少之一,微生物生产番茄红素的产量进一步显著提高。
根据本发明的具体实施例,所述微生物还可以进一步包括可操作调控ERG9基因。本申请所述的可操作调控ERG9基因是指替换ERG原始的启动子,从而实现通过葡萄糖调控ERG9的表达,从而增加番茄红素的产量。
需要说明的是,发明人通过实验,发现:表达TmCrtE,PagCrtB,BtCrtI基因能够达到在酵母体内高效合成番茄红素的目的;沉默GAL1,7,10或GAL1,7,10,80能够达到利用半乳糖诱导或利用葡萄糖浓度调节生产番茄红素的目的;过表达INO2,yap1,spt15-5,taf25-3基因是抗逆基因,可以增加番茄红素的产量;表达GapN,PYC2,SMAE1,MDH2,POS5,pntAB中的一个或多个基因能够平衡酵母体内的还原力,可以增加番茄红素的产量;过表达ADH2,ALD6,EUTE中的一个或多个基因能够增加合成番茄红素的前体物质的供应,增加番茄红素的产量;表达ERG12,IDI1,ERG10,MVD1,ERG13,ERG8中的一个或多个基因,能够平衡有关番茄红素合成中的MVA途径,增加番茄红素的产量;沉默Exg1以及Ypl062W基因以及任选地ROX1,VBA5,DOS2,Yjl064W,Yer130C,Yer134C,Ynr063W,Yor292C,Sfk1,Mef1基因的至少之一,能够从整体上调节酵母系统,从而增加番茄红素的产量。利用根据本发明实施例的微生物,番茄红素的产量得到显著提高。
获得番茄红素的方法
在本发明的第二方面,本发明提出了一种获得番茄红素的方法。根据本发明的实施例,该方法包括:将前面所述的微生物进行发酵处理;以及将发酵处理产物进行萃取处理,以便获得所述番茄红素。利用根据本发明实施例的获得番茄红素的方法,能够高产量、高效率获得番茄红素,且番茄红素的纯度高。
根据本发明的具体实施例,所述发酵处理是通过基础发酵处理和两级分批补料发酵处理进行的,具体如下所述:
将发酵罐装入少量纯水后115度进行空灭30分钟。配制分批培养的发酵液以及补料液,校准发酵罐的pH电极,夹住发酵罐的各个管路,115度灭菌30分钟。取出发酵罐,连接空气管路,进行少量通气(0.1vvm左右即可),同时打开冷却水装置进行冷却。待温度降至50度左右时,打开转速至100rpm。校准溶氧电极。未连接线路的状态设定溶氧值为0%,随后将转速升至600rpm,同时将通气量调至2vvm,连接溶氧电极线路,待溶氧稳定后设定该值为100%。随后将通气量和转速降低至发酵所需值(通气量1.5vvm,转速300rpm-600rpm)。先自然pH,将温度调节至30度。开始接种,初始接种OD调至0.5,所需种子液体积根据公式进行计算。(如发酵液体积为2500mL,种子液OD值为n,则接种种子液体积为2500x0.5/n mL)。开始发酵后,上罐时培养基用2M NaOH来控制pH值为5.5,初始通气量为1.5vvm,初始搅拌速率设置为300rpm,溶氧维持在30%以上(关联搅拌速率,300-600rpm)。
当葡萄糖浓度降至2g/L左右时开始补料葡萄糖,初始补料速率为10mL/L发酵液/h,以维持发酵液中葡萄糖的残留浓度在2-3g/L左右(不要降至0g/L),每两个小时取样测量一次OD600值和检测一次葡萄糖含量,当葡萄糖浓度低于1g/L时增加补料速率。当OD值增加缓慢时(开始进入稳定期)停止补料葡萄糖,此时开始监测乙醇残留量,当乙醇浓度降至5-10g/L时开始补料乙醇甘油,初始补料速率为2mL/L发酵液/h。随后每4h取样检测一次乙醇和甘油含量,当调整补料速率使乙醇和甘油维持在5-10g/L范围内。颜色有变化后开始提取产物检测产物变化,当番茄红素浓度不再增加时结束发酵。
其中,发明人发现,在基本发酵培养基中培养菌体,相比于现有技术的培养基,菌体的生长速度和生长状态均显著优于现有技术,补加的第一补料培养基,有效保证了菌体的快速和健康的生长,补加的第二补料培养基,有效提高了番茄红素的产量。根据本发明的再一具体实施例,所述萃取处理包括:将所述发酵处理后产物进行超声破碎处理以及有机萃取处理。发明人对发酵处理后的萃取过程进行了优化筛选,发明人发现,采用超声处理的方式相比于采用盐酸蒸煮的方式,番茄红素的降解速率大幅降低,番茄红素的产量稳定。另外,需要说明的是,本申请所述的“有机萃取处理”是指采取有机溶剂对超声破碎处理产物进行萃取,有机萃取的方式不受特别限制,如根据本发明的具体实施例,可以采用丙酮溶剂从超声破碎处理产物中萃取番茄红素。
用途
在本发明的第三方面,本发明提出了前面所述的微生物在制备番茄红素中的用途。发明人经过实验证实,本申请所述的微生物在生产番茄红素方面具有显著的优势,番茄红素的产量高、番茄红素的降解速率低,生产周期短。
下面详细描述本发明的实施例。下面描述的实施例是示例性的,仅用于解释本发明,而不能理解为对本发明的限制。实施例中未注明具体技术或条件的,按照本领域内的文献所描述的技术或条件或者按照产品说明书进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过市购获得的常规产品。
实施例1第一代工程菌株J1011-B-B-1的构建
在本实施例中,发明人详细介绍了J1011-B-B-3菌株的构建过程。
首先构建ΔLEU2:pGAL1-TmCrtE(Taxus x media)敲除盒,即敲除盒片段1,设计上、下游引物PCR扩增各片段,使其相互之间有60-80bp的重叠片段,再通过同源重组的方式将所有片段重组在一起,通过酶切线性化得到ΔLEU2::pGAL1-TmCrtE(Taxus x media)敲除盒,如敲除盒片段1如图1所示,敲除盒片段1具有如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。利用酵母自身的同源重组机制将该片段通过醋酸锂法酵母转化分别整合到酵母30000B基因组上,整合位点为LEU2,由于原酵母中的LEU2没有活性,而整合后的同源左臂含有LEU2完整基因,固转化后采用SD-Leu固体板(合成酵母氮源YNB 6.7g/L,葡萄糖20g/L,缺亮氨酸的混合氨基酸粉末1.3g/L,2%琼脂粉)进行筛选,得到的转化子通过分纯培养后提取酵母基因组进行PCR验证,成功验证的菌株命名为J1011-B-1。
ATAACGAGAACACACAGGGGCGCTATCGCACAGAATCAAATTCGATGACTGGAAATTTTTTGTTAATTTCAGAGGTCGCCTGACGCATATACCTTTTTCAACTGAAAAATTGGGAGAAAAAGGAAAGGTGAGAGCGCCGGAACCGGCTTTTCATATAGAATAGAGAAGCGTTCATGACTAAATGCTTGCATCACAATACTTGAAGTTGACAATATTATTTAAGGACCTATTGTTTTTTCCAATAGGTGGTTAGCAATCGTCTTACTTTCTAACTTTTCTTACCTTTTACATTTCAGCAATATATATATATATATTTCAAGGATATACCATTCTAATGTCTGCCCCTAAGAAGATCGTCGTTTTGCCAGGTGACCACGTTGGTCAAGAAATCACAGCCGAAGCCATTAAGGTTCTTAAAGCTATTTCTGATGTTCGTTCCAATGTCAAGTTCGATTTCGAAAATCATTTAATTGGTGGTGCTGCTATCGATGCTACAGGTGTTCCACTTCCAGATGAGGCGCTGGAAGCCTCCAAGAAGGCTGATGCCGTTTTGTTAGGTGCTGTGGGTGGTCCTAAATGGGGTACCGGTAGTGTTAGACCTGAACAAGGTTTACTAAAAATCCGTAAAGAACTTCAATTGTACGCCAACTTAAGACCATGTAACTTTGCATCCGACTCTCTTTTAGACTTATCTCCAATCAAGCCACAATTTGCTAAAGGTACTGACTTCGTTGTTGTCAGAGAATTAGTGGGAGGTATTTACTTTGGTAAGAGAAAGGAAGACGATGGTGATGGTGTCGCTTGGGATAGTGAACAATACACCGTTCCAGAAGTGCAAAGAATCACAAGAATGGCCGCTTTCATGGCCCTACAACATGAGCCACCATTGCCTATTTGGTCCTTGGATAAAGCTAATGTTTTGGCCTCTTCAAGATTATGGAGAAAAACTGTGGAGGAAACCATCAAGAACGAATTCCCTACATTGAAGGTTCAACATCAATTGATTGATTCTGCCGCCATGATCCTAGTTAAGAACCCAACCCACCTAAATGGTATTATAATCACCAGCAACATGTTTGGTGATATCATCTCCGATGAAGCCTCCGTTATCCCAGGTTCCTTGGGTTTGTTGCCATCTGCGTCCTTGGCCTCTTTGCCAGACAAGAACACCGCATTTGGTTTGTACGAACCATGCCACGGTTCTGCTCCAGATTTGCCAAAGAATAAGGTCAACCCTATCGCCACTATCTTGTCTGCTGCAATGATGTTGAAATTGTCATTGAACTTGCCTGAAGAAGGTAAGGCCATTGAAGATGCAGTTAAAAAGGTTTTGGATGCAGGTATCAGAACTGGTGATTTAGGTGGTTCCAACAGTACCACCGAAGTCGGTGATGCTGTCGCCGAAGAAGTTAAGAAAATCCTTGCTTAAATTTAACTCCTTAAGTTACTTTAATGATTTAGTTTTTATTATTAATAATTCATGCTCATGACATCTCATATACACGTTTATAAAACTTAAATAGATTGAAAATGTATTAAAGATTCCTCAGGGATTCGATTTTTTTGGAAGTTTTTGTTTTTTTTTCCTTGAGATGCTGTAGTATTTGGGAACAATTATACAATCGAAAGATATATGCTTACATTCGACCGTTTTAGCCGTGATCATTATCCTATAGTAACATAACCTGAAGCATAACTGACACTACTATCATCAATACTTGTCACATGAGAACTCTGTGAATAATTAGGCCACTGAAATTTGATGCCTGAAGGACCGGCATCACGGATTTTCGATAAAGCACTTAGTATCACACTAATTGGCTTTTCGCGCAAATTAAAGCCTTCGAGCGTCCCAAAACCTTCTCAAGCAAGGTTTTCAGTATAATGTTACATGCGTACACGCGTTTGTACAGAAAAAAAAGAAAAATTTGAAATATAAATAACGTTCTTAATACTAACATAACTATAAAAAAATAAATAGGGACCTAGACTTCAGGTTGTCTAACTCCTTCCTTTTCGGTTAGAGCGGATGTGGGGGGAGGGCGTGAATGTAAGCGTGACATAACTAATTACATGATATCGACAAAGGAAAAGGGGCCTGTTTATATTGAATTTTCAAAAATTCTTACTTTTTTTTTGGATGGACGCAAAGAAGTTTAATAATCATATTACATGGCAATACCACCATATACATATCCATATCTAATCTTACTTATATGTTGTGGAAATGTAAAGAGCCCCATTATCTTAGCCTAAAAAAACCTTCTCTTTGGAACTTTCAGTAATACGCTTAACTGCTCATTGCTATATTGAAGTACGGATTAGAAGCCGCCGAGCGGGCGACAGCCCTCCGACGGAAGACTCTCCTCCGTGCGTCCTGGTCTTCACCGGTCGCGTTCCTGAAACGCAGATGTGCCTCGCGCCGCACTGCTCCGAACAATAAAGATTCTACAATACTAGCTTTTATGGTTATGAAGAGGAAAAATTGGCAGTAACCTGGCCCCACAAACCTTCAAATCAACGAATCAAATTAACAACCATAGGATAATAATGCGATTAGTTTTTTAGCCTTATTTCTGGGGTAATTAATCAGCGAAGCGATGATTTTTGATCTATTAACAGATATATAAATGCAAAAGCTGCATAACCACTTTAACTAATACTTTCAACATTTTCGGTTTGTATTACTTCTTATTCAAATGTCATAAAAGTATCAACAAAAAATTGTTAATATACCTCTATACTTTAACGTCAAGGAGAAAAAACTATAATGGCTTATACCGCAATGGCAGCAGGAACTCAGTCATTGCAGTTGAGGACAGTCGCCTCTTACCAGGAGTGCAACTCAATGAGGTCTTGCTTCAAGTTGACCCCATTCAAGTCATTCCACGGTGTCAACTTCAACGTTCCTTCTTTAGGTGCCGCCAACTGCGAAATCATGGGTCACTTGAAATTGGGTTCTTTGCCATACAAACAGTGTTCAGTATCATCTAAGTCAACTAAGACTATGGCCCAGTTGGTAGATTTGGCAGAGACCGAGAAAGCCGAGGGAAAGGATATCGAGTTCGATTTTAACGAGTATATGAAGTCTAAGGCTGTCGCTGTTGATGCAGCCTTGGATAAGGCCATCCCTTTGGAGTATCCAGAGAAGATCCATGAGTCTATGAGGTACTCATTGTTGGCCGGAGGAAAAAGGGTCAGACCTGCATTATGCATCGCTGCTTGCGAGTTAGTAGGTGGTTCTCAGGACTTGGCCATGCCAACCGCATGTGCCATGGAAATGATTCATACCATGTCATTGATTCACGATGATTTGCCTTGCATGGACAACGACGACTTCAGAAGGGGAAAGCCTACCAATCACAAGGTTTTCGGAGAGGACACTGCTGTTTTAGCCGGTGACGCATTGTTATCTTTCGCTTTTGAACACATCGCCGTTGCCACATCAAAAACTGTCCCATCTGACAGGACCTTGAGAGTCATTTCTGAGTTGGGTAAAACCATCGGTTCACAGGGATTGGTCGGAGGTCAGGTAGTCGACATCACTTCTGAGGGAGACGCCAACGTCGACTTAAAGACATTGGAGTGGATTCACATTCACAAGACTGCCGTCTTGTTGGAATGCTCTGTTGTTTCTGGAGGAATCTTGGGTGGAGCTACCGAGGATGAGATTGCTAGAATAAGAAGATACGCCAGGTGCGTCGGTTTGTTGTTCCAGGTTGTCGACGACATTTTGGATGTCACCAAGTCTTCAGAGGAATTGGGAAAGACCGCCGGTAAAGACTTATTGACCGACAAGGCTACCTACCCTAAGTTGATGGGTTTGGAGAAGGCCAAAGAGTTTGCAGCAGAATTAGCTACCAGGGCAAAGGAAGAGTTGTCATCATTCGACCAGATCAAGGCAGCCCCTTTGTTAGGATTGGCCGATTACATCGCTTTCAGGCAAAACTAAGTCTGAAGAATGAATGATTTGATGATTTCTTTTTCCCTCCATTTTTCTTACTGAATATATCAATGATATAGACTTGTATAGTTTATTATTTCAAATTAAGTAGCTATATATAGTCAAGATAACGTTTGTTTGACACGATTACATTATTCGTCGACATCTTTTTTCAGCCTGTCGTGGTAGCAATTTGAGGAGTATTATTAATTGAATAGGTTCATTTTGCGCTCGCATAAACAGTTTTCGTCAGGGACAGTATGTTGGAATGAGTGGTAATTAATGGTGACATGACATGTTATAGCAATAACCTTGATGTTTACATCGTAGTTTAATGTACACCCCGCGAATTCGTTCAAGTAGGAGTGCACCAATTGCAAAGGGAAAAGCTGAATGGGCAGTTCGAATAAAAGATTCTCTTTTTTTATGATATTTGTACATAAACTTTATAAATGAAATTCATAATAGAAACGACACGAAATTACAAAATGGAATATGTTCATAGGGTAGACGAAACTATATACGCAATCTACATACATTTATCAAGAAGGAGAAAAAGGAGGATGTAAAGGAATACAGGTAAGCAAATTGATACTAATGGCTCAACGTGATAAGGAAAAAGAATTGCACTTTAACATTAATATTGACAAGGAGGAGGGCACCACACAAAAAGTTAGGTGTAACAGAAAATCATGAAACTATGATTCCTAATTTATATATTGGAGGATTTTCTCTAAAAAAAAAAAAATACAACAAATAAAAAACACTCAATGACCTGACCATTTGATGGAGTTTAAGTCAATACCTTCTTGAACCATTTCCCATAATGGTGAAAGTTCCCTCAAGAATTTTACTCTGTCAGAAACGGCCTTAACGACGTAGTCGACCTCCTCTTCAGTACTAAATCTACCAATACCAAATCTGATGGAAGAATGGGCTAATGCATCATCCTTACCCAGCGCATGTAAAACATAAGAAGGTTCTAGGGAAGCAGATGTACAGGCTGAACCCGAGGATAATGCGATATCCCTTAGTGCCATCAATAAAGATTCTCCTTCCACGTAGGCGAAAGAAACGTTAACACACCCTGGATAACGATGATCTGGAGATCCGTTCAACGTGGTATGTTCAGCGGATAATAGACCTTTGACTAATTTATCGGATAGTCTTTTGATGTGAGCTTGGTCGTTGTC(SEQ ID NO:1)。
再构建ΔURA3:pGAL1-PagCrtB(Pantoea agglomerans);pGAL10-BtCrtI(Blakeslea trispora)敲除盒,即敲除盒片段2,敲除盒片段2具有如SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列。设计上、下游引物PCR扩增各片段,使其相互之间有60-80bp的重叠片段,再通过同源重组的方式将所有片段重组在一起,通过酶切线性化得到ΔURA3::pGAL1-PaCrtB(Pantoea agglomerans);pGAL10-BtCrtI(Blakeslea trispora)敲除盒,敲除盒片段2如图2所示。利用酵母自身的同源重组机制将该片段通过醋酸锂法酵母转化分别整合到酵母J1011-B-1基因组上,整合位点为URA3,转化后采用SD-HIS固体板(合成酵母氮源YNB6.7g/L,葡萄糖20g/L,缺组氨酸的混合氨基酸粉末1.3g/L,2%琼脂粉)进行筛选,得到的转化子通过分纯培养后提取酵母基因组进行PCR验证,成功验证的菌株命名为J1011-B-2。
ACGCAGATAATTCCAGGTATTTTGAAGCAGAACTTTTATTTATCATCGAATTGACTATTGCATTATTTCTATTTTGCAAAGAGGAGAAAGAATTAGGAAAGTTCATACTTCAAAAAGTTTTCCAACTTTCTCACACGAAAGGCCTCACGAAAAGGACTGTTCGTAGAATGCTAACATACAAAATTTTGTTAATTTCGTTATGTGCGGATCAGACGGAGTACTTGTCCAAATTAATAAACGATGAGCTGTTAAAAAAGGGGGATATTTTTACCCAAAAATTTTTTGCAACTAATCAAGGTAAGGAATTTTTGAAGAGACTATTTTCATTGACCGAATCAGAGTTTTATAGAGGATTTTTACTAGGAAATGAGAATTTTTGGAAATTTTTAAGAAAAGTTACAGCAATGAAAGAGCAGAGCGAGAGCATTTTTGAATATTTAAATGAATCGATCAAGACAGACAGCAATATTTTGACAAATGAGAACTTCATGTGGGTCCTAGGACTATTAGATGAAATTTCATCAATGGGTGCCGTTGGAAATCACTGGGAAATAGAATACAAGAAATTGACAGAAAGTGGTCATAAAATTGATAAGGAGAATCCATACAAGAAATCGATCGAATTATCATTGAAATCCATTCAACTAACATCACACTTGCTGGAAGATAATAACGATCTGCGTAAAAACGAGATATTCGCTATTATTCAAGCTTTGGCACATCAATGCATCAATCCGTGTAAGCAGATAAGTGAATTTGCAGTGGTAACGCTAGAGCAGACGCTCATCAATAAAATCGAAATTCCAACTAATGAGATGGAATCGGTAGAAGAATTAATTGAGGGCGGATTACTACCGTTGCTAAATTCGAGTGAAACACAGGAAGACCAGAAAATCCTCATTTCATCCATATTAACAATAATTTCAAATGTTTATTTGCATTATTTGAAACTAGGGAAGACAAGCAACGAAACGTTTTTGAAAATTTTGAGTATTTTCAATAAATTTGTAGAGGACTCAGATATTGAAAAAAAGCTACAGCAATTAATACTTGATAAGAAGAGTATTGAGAAGGGCAACGGTTCATCATCTCATGGATCTGCACATGAACAAACACCAGAGTCAAACGACGTTGAAATTGAGGCTACTGCGCCAATTGATGACAATACAGACGATGATAACAAACCGAAGTTATCTGATGTAGAAAAGGATTAAAGATGCTAAGAGATAGTGATGATATTTCATAAATAATGTAATTCTATATATGTTAATTACCTTTTTTGCGAGGCATATTTATGGTGAAGGATAAGTTTTGACCATCAAAGAAGGTTAATGTGGCTGTGGTTTCAGGGTCCATAAAGCTTTTCAATTCATCATTTTTTTTTTATTCTTTTTTTTGATTTCGGTTTCCTTGAAATTTTTTTGATTCGGTAATCTCCGAACAGAAGGAAGAACGAAGGAAGGAGCACAGACTTAGATTGGTATATATACGCATATGTAGTGTTGAAGAAACATGAAATTGCCCAGTATTCTTAACCCAACTGCACAGAACAAAAACCTGCAGGAAACGAAGGTACCCAATTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTACGCGCGCTCACTGGCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCGCCTTGCAGCACATCCCCCTTTCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGGCCCGCACCGATCGCCCTTCCCAACAGTTGCGCAGCCTGAATGGCGAATGGCGCGACGCGCCCTGTAGCGGCGCATTAAGCGCGGCGGGTGTGGTGGTTACGCGCAGCGTGACCGCTACACTTGCCAGCGCCCTAGCGCCCGCTCCTTTCGCTTTCTTCCCTTCCTTTCTCGCCACGTTCGCCGGCTTTCCCCGTCAAGCTCTAAATCGGGGGCTCCCTTTAGGGTTCCGATTTAGTGCTTTACGGCACCTCGACCCCAAAAAACTTGATTAGGGTGATGGTTCACGTAGTGGGCCATCGCCCTGATAGACGGTTTTTCGCCCTTTGACGTTGGAGTCCACGTTCTTTAATAGTGGACTCTTGTTCCAAACTGGAACAACACTCAACCCTATCTCGGTCTATTCTTTTGATTTATAAGGGATTTTGCCGATTTCGGCCTATTGGTTAAAAAATGAGCTGATTTAACAAAAATTTAACGCGAATTTTAACAAAATATTAACGTTTACAATTTCCTGATGCGGTATTTTCTCCTTACGCATCTGTGCGGTATTTCACACCGCATAGATCCGTCGAGTTCAAGAGAAAAAAAAAGAAAAAGCAAAAAGAAAAAAGGAAAGCGCGCCTCGTTCAGAATGACACGTATAGAATGATGCATTACCTTGTCATCTTCAGTATCATACTGTTCGTATACATACTTACTGACATTCATAGGTATACATATATACACATGTATATATATCGTATGCTGCAGCTTTAAATAATCGGTGTCACTACATAAGAACACCTTTGGTGGAGGGAACATCGTTGGTACCATTGGGCGAGGTGGCTTCTCTTATGGCAACCGCAAGAGCCTTGAACGCACTCTCACTACGGTGATGATCATTCTTGCCTCGCAGACAATCAACGTGGAGGGTAATTCTGCTAGCCTCTGCAAAGCTTTCAAGAAAATGCGGGATCATCTCGCAAGAGAGATCTCCTACTTTCTCCCTTTGCAAACCAAGTTCGACAACTGCGTACGGCCTGTTCGAAAGATCTACCACCGCTCTGGAAAGTGCCTCATCCAAAGGCGCAAATCCTGATCCAAACCTTTTTACTCCACGCGCCAGTAGGGCCTCTTTAAAAGCTTGACCGAGAGCAATCCCGCAGTCTTCAGTGGTGTGATGGTCGTCTATGTGTAAGTCACCAATGCACTCAACGATTAGCGACCAGCCGGAATGCTTGGCCAGAGCATGTATCATATGGTCCAGAAACCCTATACCTGTGTGGACGTTAATCACTTGCGATTGTGTGGCCTGTTCTGCTACTGCTTCTGCCTCTTTTTCTGGGAAGATCGAGTGCTCTATCGCTAGGGGACCACCCTTTAAAGAGATCGCAATCTGAATCTTGGTTTCATTTGTAATACGCTTTACTAGGGCTTTCTGCTCTGTCATCTTTGCCTTCGTTTATCTTGCCTGCTCATTTTTTAGTATATTCTTCGAAGAAATCACATTACTTTATATAATGTATAATTCATTATGTGATAATGCCAATCGCTAAGAAAAAAAAAGAGTCATCCGCTAGGGGAAAAAAAAAAATGAAAATCATTACCGAGGCATAAAAAAATATAGAGTGTACTAGAGGAGGCCAAGAGTAATAGAAAAAGAAAATTGCGGGAAAGGACTGTGTTATGACTTCCCTGACTAATGCCGTGTTCAAACGATACCTGGCAGTGACTCCTAGCGCTCACCAAGCTCTTAAAACGGGAATTTATGGTGCACTCTCAGTACAATCTGCTCTGATGCCGCATAGTTAAGCCAGCCCCGACACCCGCCAACACGCGCTGACGCGCCCTGACGGGCTTGTCTGCTCCCGGCATCCGCTTACAGACAAGCTGTGAGCAAATTAAAGCCTTCGAGCGTCCCAAAACCTTCTCAAGCAAGGTTTTCAGTATAATGTTACATGCGTACACGCGTTTGTACAGAAAAAAAAGAAAAATTTGAAATATAAATAACGTTCTTAATACTAACATAACTATAAAAAAATAAATAGGGACCTAGACTTCAGGTTGTCTAACTCCTTCCTTTTCGGTTAGAGCGGATGTGGGGGGAGGGCGTGAATGTAAGCGTGACATAACTAATTACATGATATCGACAAAGGAAAAGGGGCCTGTTTATATCCTAATATCGTTAGAGTTCTGTCCTTGGAAGACGTTTGGCAACAACTGATTAATAAAAGATGCTGGAGTAGTAGTGTCGTCCCTAGGAAAGAAATAGAAGAACAAGAAAGTGACAAAGTAGCATGCTAAGCAGTAATAAATCCAGTGTGACTCAGTCTTCCTTGTTTGCTCAGGTGCATATTTCTTCTGAGAGTCCTGTAACTTCCTAGGCAAAGGGTTTTGTCCGAATGACTTACAGACCTGGTCAGAAGTTAATTTAGATCCTGCCAAGACTATTGGGACTCCTGTACCAGGGTGAGTTGATGCACCGACGAAAAATAAATTGTCATATCTGTTAGTAGAGTCCTTTGTTGAAGGTCTGAACCACAAAACCTGAAAGACATCATGTGATAAACCTAATATTGATCCCCTCCACAAGTTGAACTTAGATTGCCAGACTGATGGGTCGTTGACCTCCTCGTGTTCTATCAAGTTAGCGAAGTTGTTGACTCCCAACCTCCTCTCTATGACCTCCAAGACCATCTTTCTAGCCCTGTTGACCAACTCTGGGTAGTTCTCCTCTGCTGAGTTACCTGTCTTAGACTTCATGTGACCAATTGGAACTAAAACTATAATTGAGTCCTTATTTGGAGGTGCTGCAGACTCGTCTATCCTTGAAGGAACGTTGACGTAGAAAGATGCTTCAGAAGGCAAACCGAAATCGTTAAAAATCTCGTCGAATGACTCCTTGTAAGCCTCAGCCAAGAAAATGTTGTGGACGTCCAATTGAGGGACCTTAGTAGACATTGACCAGTAAAAAGAAATTGATGAAGATGTTAATTTCTTAGATGCCAAAGTCTTCTTTGTCCAGTTGCAAGGTGGCAACAAGTGGTGGTAAGCGTAGACCAAGTCAGCGTTGCAGACGACAGCGTCTGCCTCAATGACTTCTCCAGACTCCAAAGTGACACCAGTGACCCTCTTGTCTTTATCGACAGTGTTAATCTTAGCGACAGGAGATTGGTACCTGAACTCAGCTCCGTACTTCTTAGAAGCTATAGACTCCAACTTTTGGACGACCATGTTGAAACCACCCCTTGGGTACCAAATTCCCTCTGCGAACTCTGTATATTGCAACAATGAGTAGACTGCAGGTGCGTCGTAAGGTGACATACCCATGTACATTGTTTGAAAAGTAAAAGCCATCCTCATCTTTTTTGTTTGGAAGTATTTTGATGCTCTGTCGTATATCTTACCGAATAAGTGCAACCTAAAAATCTCTGGGACGTACTGTAACCTTATTAAGTCCCATATAGTTTCGAAGTTTCTCTTTATAGCAATGAATGTACCCTGCTCGTAGTGGACGTGTGTCTCTTTCATGAAATCTAAGAACCTACCGAATCCTAAAGGTCCCTCAATCCTGTCCAACTCACCCTTCATCTTTGTTAAGTCTGATGACAATTGGACAGCGTCACCGTCGTCGAAATGGACTTTGTAATTGTTGTCACATCTTAATAAGTCCAAGTGGTCTCCTATCCTCTCGTCTAAGTCAGCGAAAGCGTCCTCAAACAACTTAGGCATCAAGTACAATGAAGGTCCCTGGTCGAACCTGTGACCGTCGTGGTGAATGAAAGAGCACCTTCCTCCAGAGAAGTCGTTCTTCTCGACGACAGTGACTCTGAAACCCTCCCTTGCTAACCTTGCTGCTGTTGCAGTACCTCCTATTCCAGCACCTATGACGACAATGTGCTTCTTCTGATCAGACATTTATATTGAATTTTCAAAAATTCTTACTTTTTTTTTGGATGGACGCAAAGAAGTTTAATAATCATATTACATGGCAATACCACCATATACATATCCATATCTAATCTTACTTATATGTTGTGGAAATGTAAAGAGCCCCATTATCTTAGCCTAAAAAAACCTTCTCTTTGGAACTTTCAGTAATACGCTTAACTGCTCATTGCTATATTGAAGTACGGATTAGAAGCCGCCGAGCGGGCGACAGCCCTCCGACGGAAGACTCTCCTCCGTGCGTCCTGGTCTTCACCGGTCGCGTTCCTGAAACGCAGATGTGCCTCGCGCCGCACTGCTCCGAACAATAAAGATTCTACAATACTAGCTTTTATGGTTATGAAGAGGAAAAATTGGCAGTAACCTGGCCCCACAAACCTTCAAATCAACGAATCAAATTAACAACCATAGGATAATAATGCGATTAGTTTTTTAGCCTTATTTCTGGGGTAATTAATCAGCGAAGCGATGATTTTTGATCTATTAACAGATATATAAATGCAAAAGCTGCATAACCACTTTAACTAATACTTTCAACATTTTCGGTTTGTATTACTTCTTATTCAAATGTCATAAAAGTATCAACAAAAAATTGTTAATATACCTCTATACTTTAACGTCAAGGAGAAAAAACTATAATGTCACAACCACCATTATTGGACCACGCTACACAAACTATGGCAAACGGTTCTAAATCTTTCGCTACTGCTGCTAAATTATTCGACCCAGCAACAAGAAGATCTGTATTGATGTTGTACACCTGGTGTAGACATTGCGATGACGTTATAGATGACCAAACTCACGGTTTTGCTTCAGAAGCTGCAGCCGAAGAAGAAGCTACACAAAGATTGGCAAGATTAAGAACTTTGACATTAGCTGCATTCGAAGGTGCCGAAATGCAAGATCCAGCTTTTGCCGCTTTCCAAGAAGTTGCATTAACCCATGGTATTACTCCTAGAATGGCTTTGGATCACTTAGACGGTTTTGCAATGGATGTCGCCCAAACAAGATACGTAACCTTCGAAGACACTTTAAGATATTGTTACCATGTCGCCGGTGTTGTCGGTTTGATGATGGCTAGAGTAATGGGTGTTAGAGATGAAAGAGTTTTAGATAGAGCATGTGACTTGGGTTTAGCCTTCCAATTGACAAACATAGCTAGAGATATAATAGATGACGCAGCCATAGACAGATGCTATTTGCCAGCTGAATGGTTACAAGATGCAGGTTTGACTCCTGAAAATTACGCTGCAAGAGAAAACAGAGCCGCTTTAGCCAGAGTTGCTGAAAGATTGATAGATGCAGCCGAACCATATTACATCTCTTCACAAGCTGGTTTGCATGATTTGCCACCTAGATGCGCATGGGCCATTGCTACCGCAAGATCTGTTTACAGAGAAATCGGTATTAAAGTCAAGGCTGCAGGTGGTTCCGCATGGGATAGAAGACAACACACTTCTAAAGGTGAAAAGATCGCTATGTTGATGGCCGCTCCTGGTCAAGTTATTAGAGCAAAGACCACCAGAGTCACCCCAAGACCAGCCGGTTTATGGCAAAGACCTGTTTAAATTGAATTGAATTGAAATCGATAGATCAATTTTTTTCTTTTCTCTTTCCCCATCCTTTACGCTAAAATAATAGTTTATTTTATTTTTTGAATATTTTTTATTTATATACGTATATATAGACTATTATTTATCTTTTAATGATTATTAAGATTTTTATTAAAAAAAATTACGCTCCTCTTTTAATGCCTTTATGCAGTTTTTTTTCCCATTCGATATTTCTATGTTCGGGTTCAGCGTATTTTAAGTTTAATAACTCGAAAATTCTGCGTTCGTTGTAAATGCATGTATACTAAACTCACAAATTAGAGCTTCAATTTAATTATATCAGTTATTACCCGGGAATCTCGGTCGTAATGATTTCTATAATGACGAAAAAAAAAAAATTGGAAAGAAAAAGCTTCATGGCCTTTATAAAAAGGAACTATCCAATACCTCGCCAGAACCAAGTAACAGTATTTTACGGGGCACAAATCAAGAACAATAAGACAGGACTGTAAAGATGGACGCATTGAACTCCAAAGAACAACAAGAGTTCCAAAAAGTAGTGGAACAAAAGCAAATGAAGGATTTCATGCGTTTGTACTCTAATCTGGTAGAAAGATGTTTCACAGACTGTGTCAATGACTTCACAACATCAAAGCTAACCAATAAGGAACAAACATGCATCATGAAGTGCTCAGAAAAGTTCTTGAAGCATAGCGAACGTGTAGGGCAGCGTTTCCAAGAACAAAACGCTGCCTTGGGACAAGGCTTGGGCCGATAAGGTGTACTGGCGTATATATATCTAATTATGTATCTCTGGTGTAGCCCATTTTTAGCATGTAAATATAAAGAGAAACCATATCTAATCTAACCAAATCCAAACAAAATTCAATAGTTACTATCGCTTTTTTCTTTCTGTATCGCAAATAAGTGAAAATTAAAAAAGAAAGATTAAATTGGAAGTTGGATATGGGCTGGAACAGCAGCAGTAATCGGTATCGGGTTCGCCACTAATGACGTCCTACGATTGCACTCAACAGACCTTGACGCTCACGCCGTAGCGGGCGACAAGTCAAACGGAACAACCGTTGCCGTTCCCATCGGAGTCCGACCTAGGCCGAACTCCGTGAATTTCTGATAACAACGGTCGGTAAAGACTGGTTCCCCAGTATATTTCTTCTCTCAGGAGCAGGGGCCAATGCCAAAAGCGACATTAACCCGGAGGACAAGGCTCCACTGTGTTCCACCGAATTTCCCACCTGATAATATCTGATAACCCGCCCATAGGTGGGGATCCTTCTGTAAACAGGTTTCTTAATCGTAGGAATTACCACTGTTCCACTGCCAATCGCAGCTCCCAGAGTTTCGTTCCCAGCCGCGAGCACCACAGCGTACCATGTGCGCCACGAGGCCTCAAACGTAAAACAATCGAAACGAAAAGAAACAGACTATAGGGGAGTATAGAGACAGCCGGCCAATAAGAAGAGGAAAAAGAAATACTAGCGTTTATCAATGTGGGTCGTTAACATATCCTGTTGACAATGATTACAGGTTAAAAGGTAGCGTAAGTGAATATTAACTATGGATATTCTTATACTTAGATAAGAGACATATAAAACACACGATGATTGATTGATTTTTATGACCAATATATGTAATTCGTAATTCAGATAGTTTTTATACTTTTAATGTGTGCCGAACCATATTACTAGTATATGTAACTACCATGTTATGTTCAATTGGCAGATCTTTAACTCGGCTTTAGTTATCCAAGTTACTTGCAATATTTCCTTCTGCGAGAGTACATTTGCCCTTAAACG(SEQ ID NO:2)。
再构建Δgal1,Δgal7,Δgal10:pGAL10-tHMG1敲除盒,即敲除盒片段3,敲除盒片段3具有如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列。设计上、下游引物PCR扩增各片段,使其相互之间有60-80bp的重叠片段,再通过同源重组的方式将所有片段重组在一起,通过酶切线性化得到Δgal1,Δgal7,Δgal10::pGAL10-tHMG1敲除片段,敲除盒片段3的结构如图3所示。利用酵母自身的同源重组机制将该片段通过醋酸锂法酵母转化分别整合到酵母J1011-B-2基因组上,整合位点为GAL1,GAL7和GAL10,转化后采用SD-Trp固体板(合成酵母氮源YNB6.7g/L,葡萄糖20g/L,缺色氨酸的混合氨基酸粉末1.3g/L,2%琼脂粉)进行筛选,得到的转化子通过分纯培养后提取酵母基因组进行PCR验证,成功验证的菌株命名为J1011-B-3.
TTCACCGATTCTGAGCGAATCACAGGTGAGAAATTTGGATTCGAAATAAACCTAAAAAAACTATCCAATAAGGCTTCCATAGGCTTCGTATTTCCCGACCATTCCAATTGGAAAAATTGAGCGCTGTCTTCCATGATCTTAGATAAAGCCTTAATACTTGGCTCATTTCCATTTGAGGTTAGCTCTAGCAACTGGTAAAGCATTTGAAGACCAGTTGGATCATCTCTATGCTGCCTATAGTAAGTGGAAAATAAAGTAGTAATAACGATACCTGTCACGTTCGAAACGAGATTATTGTTCGAATTATAAAGGCCATGTATAATGTTTGATTTGACGTATCCTAAGTCGTGGCTATTGCTCTTAATTAAATTGTTTCCCCCTAGCATTGAATTTTTCAACAGCATACCGGCGGTAGCTCTATTGTTCTGAAGATCCTGTAGGGAGTAGTGTTGCTTCAATACATCATCAGATTCGCCTTCAATTAAAATATAACACAAATAATTGAGAAATTCAGGTTGCAGCTGGAAGTTCTCCATAGCTTCCATTGCGTTATTACGAATCTCTGGATTTGGTGACATACAGTTCTGTAAAAGAGTTGCTAGTTGCAACACATAGTCTTCGGCGGGCTTCCATGTCGATGCCATCTTTATTCACTTAACTACTGCTAACAATTCTGGAAACCAAAGACTGCGGAATATTCTGATATGTATTACTACTATTCGCTGCTCTTCTGCATAATTAATACTGAAAAGTTTTTCATACTTTTAAACATAACCTTTTTTTAAGCAAAACTCTATGACCCGGATTAGAAAACTACGAAAAGAGGGTAATAACATAGGTGCAGGATTTCCATCGATAACGACGCCGACAATGAGCCTTGCTGCAACATCCAATTAGGACTAATAACTATCGTAGGAATTTCTACGTAATAAACTTCAACAGAGCCTAAAATTTGAAAATAAATAATCTAGAGGGGAAACTTAAAGAAATTCTATTCTTGTCAATAAAGTGGAAATCTGTCAGATGTCACAGTTTCTTTATTTGTGACACATATTTTCAACATAAATTCAGGCATTAGTGCTGTAAGCACAAAAAGTTGTGGCGATATGAATATTCCAGATTTTACTTACAAGCTGCATTGTAGTCTTACAATTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTATGGAAAGGACCACTCTTACATAACTAGAATAGCATTAAGAATCAGATTTACAGATAAAGATGACATTATTTTATATATATATTGTCACTCCGTTCAAGTCGACAACCAATAAAAAATTTAAAAAAAGCCAGGCAGTTAATAGAAAAAATATGATATGAATGAATATTCCACTTTCTTTTCACAGCTTGTCTGTAAGCGGATGCCGGGAGCAGACAAGCCCGTCAGGGCGCGTCAGCGGGTGTTGGCGGGTGTCGGGGCTGGCTTAACTATGCGGCATCAGAGCAGATTGTACTGAGAGTGCACCATAAACGACATTACTATATATATAATATAGGAAGCATTTAATAGACAGCATCGTAATATATGTGTACTTTGCAGTTATGACGCCAGATGGCAGTAGTGGAAGATATTCTTTATTGAAAAATAGCTTGTCACCTTACGTACAATCTTGATCCGGAGCTTTTCTTTTTTTGCCGATTAAGAATTAATTCGGTCGAAAAAAGAAAAGGAGAGGGCCAAGAGGGAGGGCATTGGTGACTATTGAGCACGTGAGTATACGTGATTAAGCACACAAAGGCAGCTTGGAGTATGTCTGTTATTAATTTCACAGGTAGTTCTGGTCCATTGGTGAAAGTTTGCGGCTTGCAGAGCACAGAGGCCGCAGAATGTGCTCTAGATTCCGATGCTGACTTGCTGGGTATTATATGTGTGCCCAATAGAAAGAGAACAATTGACCCGGTTATTGCAAGGAAAATTTCAAGTCTTGTAAAAGCATATAAAAATAGTTCAGGCACTCCGAAATACTTGGTTGGCGTGTTTCGTAATCAACCTAAGGAGGATGTTTTGGCTCTGGTCAATGATTACGGCATTGATATCGTCCAACTGCATGGAGATGAGTCGTGGCAAGAATACCAAGAGTTCCTCGGTTTGCCAGTTATTAAAAGACTCGTATTTCCAAAAGACTGCAACATACTACTCAGTGCAGCTTCACAGAAACCTCATTCGTTTATTCCCTTGTTTGATTCAGAAGCAGGTGGGACAGGTGAACTTTTGGATTGGAACTCGATTTCTGACTGGGTTGGAAGGCAAGAGAGCCCCGAAAGCTTACATTTTATGTTAGCTGGTGGACTGACGCCAGAAAATGTTGGTGATGCGCTTAGATTAAATGGCGTTATTGGTGTTGATGTAAGCGGAGGTGTGGAGACAAATGGTGTAAAAGACTCTAACAAAATAGCAAATTTCGTCAAAAATGCTAAGAAATAGGTTATTACTGAGTAGTATTTATTTAAGTATTGTTTGTGCACTTGCCTATGCGGTGTGAAATACCGCACAGATGCGTAAGGAGAAAATACCGCATCAGGAAATTGTAAACGTTAATATTTTGTTAAAATTCGCGTTAAATTTTTGTTAAATCAGCTCATTTTTTAACCAATAGGCCGAAATCGGCAAAATCCCTTATAAATCAAAAGAATAGACCGAGATAGGGTTGAGTGTTGTTCCAGTTTGGAACAAGAGTCCACTATTAAAGAACGTGGACTCCAACGTCAAAGGGCGAAAAACCGTCTATCAGGGCGATGGCCCACTACGTGAACCATCACCCTAATCAAGTTTTTTGGGGTCGAGGTGCCGTAAAGCACTAAATCGGAACCCTAAAGGGAGCCCCCGATTTAGAGCTTGACGGGGAAAGCCGGCGAACGTGGCGAGAAAGGAAGGGAAGAAAGCGAAAGGAGCGGGCGCTAGGGCGCTGGCAAGTGTAGCGGTCACGCTGCGCGTAACCACCACACCCGCCGCGCTTAATGCGCCGCTACAGGGCGCGTCGCGCCATTCGCCATTCAGGCTGCGCAACTGTTGGGAAGGGCGATCGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAGCGCGCGTAATACGACTCACTATAGGGCGAATTGGGTACTACACGGTCCAATGGATAAACATTTTTTATCAACACTATGATATATAAATATAATAGTTTTTCGTATATATATTCCTTTTTTTGGTCAATTTTTGAAATTTTCGTAGAAAAGGGAGAGACAAAACACATTATATCAATGAAAACGTACAAAAAGTAGATAAAGTCAGTGCTTAAACACGTCTTTTCCTTAAAAATACTTTATTATTTTTATTTTATTGAGAGGGTGGTTTAAAAATAGAAATAGAGAGAGAGGTACATACATAAACATACGCGCACAAAAGCAGAGATTAGGATTTAATGCAGGTGACGGACCCATCTTTCAAACGATTTATATCAGTGGCGTCCAAATTGTTAGGTTTTGTTGGTTCAGCAGGTTTCCTGTTGTGGGTCATATGACTTTGAACCAAATGGCCGGCTGCTAGGGCAGCACATAAGGATAATTCACCTGCCAAGACGGCACAGGCAACTATTCTTGCTAATTGACGTGCGTTGGTACCAGGAGCGGTAGCATGCGGGCCTCTTACACCTAATAAGTCCAACATGGCACCTTGTGGTTCTAGAACAGTACCACCACCGATGGTACCTACTTCGATGGATGGCATGGATACGGAAATTCTCAAATCACCGTCCACTTCTTTCATCAATGTTATACAGTTGGAACTTTCAACATTTTGTGCAGGATCTTGTCCTAATGCCAAGAAAACAGCTGTCACTAAATTAGCTGCATGTGCGTTAAATCCACCAACAGACCCAGCCATTGCAGATCCAACCAAATTCTTAGCAATGTTCAACTCAACCAATGCGGAAACATCACTTTTTAACACTTTTCTGACAACATCACCAGGAATAGTAGCTTCTGCGACGACACTCTTACCACGACCTTCGATCCAGTTGATGGCAGCTGGTTTTTTGTCGGTACAGTAGTTACCAGAAACGGAGACAACCTCCATATCTTCCCAGCCATACTCTTCTACCATTTGCTTTAATGAGTATTCGACACCTTTAGAAATCATATTCATACCCATTGCGTCACCAGTAGTTGTTCTAAATCTCATGAAGAGTAAATCTCCTGCTAGACAAGTTTGAATATGTTGCAGACGTGCAAATCTTGATGTAGAGTTAAAAGCTTTTTTAATTGCGTTTTGTCCCTCTTCTGAGTCTAACCATATCTTACAGGCACCAGATCTTTTCAAAGTTGGGAAACGGACTACTGGGCCTCTTGTCATACCATCCTTAGTTAAAACAGTTGTTGCACCACCGCCAGCATTGATTGCCTTACAGCCACGCATGGCAGAAGCTACCAAACAACCCTCTGTAGTTGCCATTGGTATATGATAAGATGTACCATCGATAACCAAGGGGCCTATAACACCAACGGGCAAAGGCATGTAACCTATAACATTTTCACAACAAGCGCCAAATACGCGGTCGTAGTCATAATTTTTATATGGTAAACGATCAGATGCTAATACAGGAGCTTCTGCCAAAATTGAAAGAGCCTTCCTACGTACCGCAACCGCTCTCGTAGTATCACCTAATTTTTTCTCCAAAGCGTACAAAGGTAACTTACCGTGAATAACCAAGGCAGCGACCTCTTTGTTCTTCAATTGTTTTGTATTTCCACTACTTAATAATGCTTCTAATTCTTCTAAAGGACGTATTTTCTTATCCAAGCTTTCAATATCGCGGGAATCATCTTCCTCACTAGATGATGAAGGTCCTGATGAGCTCGATTGCGCAGATGATAAACTTTTGACTTTCGATCCAGAAATGACTGTTTTATTGGTTAAAACCATTTATATTGAATTTTCAAAAATTCTTACTTTTTTTTTGGATGGACGCAAAGAAGTTTAATAATCATATTACATGGCAATACCACCATATACATATCCATATCTAATCTTACTTATATGTTGTGGAAATGTAAAGAGCCCCATTATCTTAGCCTAAAAAAACCTTCTCTTTGGAACTTTCAGTAATACGCTTAACTGCTCATTGCTATATTGAAGTACGGATTAGAAGCCGCCGAGCGGGCGACAGCCCTCCGACGGAAGACTCTCCTCCGTGCGTCCTGGTCTTCACCGGTCGCGTTCCTGAAACGCAGATGTGCCTCGCGCCGCACTGCTCCGAACAATAAAGATTCTACAATACTAGCTTTTATGGTTATGAAGAGGAAAAATTGGCAGTAACCTGGCCCCACAAACCTTCAAATCAACGAATCAAATTAACAACCATAGGATAATAATGCGATTAGTTTTTTAGCCTTATTTCTGGGGTAATTAATCAGCGAAGCGATGATTTTTGATCTATTAACAGATATATAAATGCAAAAGCTGCATAACCACTTTAACTAATACTTTCAACATTTTCGGTTTGTATTACTTCTTATTCAAATGTCATAAAAGTATCAACAAAAAATTGTTAATATACCTCTATACTTTAACGTCAAGGAGAAAAAACTATAGCGCAATGATTGAATAGTCAAAGATTTTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTTTCATAGAACTTTTTATTTAAATAAATCACGTCTATATATGTATCAGTATAACGTAAAAAAAAAAACACCGTCAGTTAAACAAAACATAAATAAAAAAAAAAAGAAGTGTCAAATCAAGTGTCAAATGTATACTTCTTTTTTTTACTTTGTTCAGAACAACTTCTCATTTTTTTCTACTCATAACTTTAGCATCACAAAGTACACAATAATAACGAGTAGTAACACTTTTATAGTTCATACATGCTTCAACTACTTAATAAATGATTGTATGATAATGTTTTCAATGTAAGAGATTTCGATTATCCACAAACTTTGAAACACAGGGACACAATTCTTGATATGCTTTCAACCGCTGCGTTTTGGATACCTATTCTTGACATAATATGACTACCATTTTGTTATTGTACGTGGGGCAGTTGACGTCTTATCATATGTCAAAGTCATTTGCGAAGTTCTTGGCAAGTTGCCAACTGACGAGATGCAGTAAAAAGAGATTGCCGTCTTGAAACTTTTTGTCCTTTTTTTTTTCCGGGGACTCTACGAGAACCCTTTGTCCTACTGATTAATTTTGTACTGAATTTGGACAATTCAGATTTTAGTAGACAAGCGCGAGGAGGAAAAGAAATGACAGAAAAATTCCGATGGACAAGAAGATAGGAAAAAAAAAAAGCTTTCACCGATTTCCTAGACCGGAAAAAAGTCGTATGACATCAGAATGAAAAATTTTCAAGTTAGACAAGGACAAAATCAGGACAAATTGTAAAGATATGATAAATCATTTGATTCAGCGCCAATTTGCCCTTTTCCATTTTCCATTAAATCTCTGTTCTCTCTTACTTATATGATGATTAGGTATCATCTGTATAAAACTCCTTTCTTAATTTCACTCTAAAGCATACCCCATAGAGAAGATCTTTCGGTTCGAAGACATTCCTACGCATAATAAGAATAGGAGGGAATAATGCCAGACAATCTATCATTACATTTAAGCGGCTCTTCAAAAAGATTGAACTCTCGCCAACTTATGGAATCTTCCAATGAGACCTTTGCGCCAAATAATGTGGATTTGGAAAAAGAGTATAAGTCATCTCAGAGTAATATAACTACCGAAGTTTATGAGGCATCGAGCTTTGAAGAAAAAGTAAGCTCAGAAAAACCTCAATACAGCTCATTCTGGAAGAAAATCTATTATGAATATGTGGTCGTTGACAAATCAATCTTGGGTGTTTCTATTCTGGATTCATTTATGTACAACCAGGACTTGAAGCCCGTCGAAAAAGAAAGGCGGGTTTGGTCCTGGTACAATTATTGTTACTTCTGGCTTGCTGAATGTTTCAATATCAACACTTGGCAAATTGCAGCTACAGGTCTACAACTGGGTCTAAATTGGTGGCAGTGTTGGATAACAATTTGGATTGGGTACGGTTTCGTTGGTGCTTTTGTTGTTTTGGCCTCTAGAGTTGGATCTGCTTATCATTTGTCATTCCCTATATCATCTAGAGCATCATTCGGTATTTTCTTCTCTTTATGGCCTGTTATTAATAGAGTCGTCATGGCCATCGTTTGGTATAGTGTCCAAGCTTATATTGCGGCAACTCCCGTATCATTAA(SEQ ID NO:3)。
更进一步,发明人通过实验验证,J1011-B-3具有高产番茄红素的性能,同时过表达TmCrtE,PagCrtB,BtCrtI基因所获得的酵母菌株,其番茄红素的产量优于其它基因组合。
在以下实验中,发明人进一步对J1011-B-3菌株进行改造,具体如下所述:
实施例2启动子和终止子的选择
为了能用半乳糖进行诱导,需要敲除代谢半乳糖的基因GAL1,GAL7,GAL10。因此特征启动子的背景菌株为敲除基因GAL1,7,10。半乳糖价格较高,并不适用于工业化生产,因此在敲除基因GAL1,7,10的基础上敲除GAL80,以期通过对葡萄糖量的控制达到对基因表达的调控。所得到的启动子信息用于构建控制类胡萝卜素合成相关基因的表达。
结果显示,在ΔGAL1/7/10/80菌株和ΔGAL1/7/10菌株中不论是诱导型启动子或是组成型启动子在稳定期强度基本一致。可见,敲除GAL80可以起到不加半乳糖即可诱导基因表达,诱导强度跟与半乳糖诱导强度相当。
酵母属于真核生物,在其体内过表达基因需要选择合适的启动子和终止子,经过反复多次实验,发明人选择了PGAL1,PGAL7,PGAL10,PGAL1-10,PGAL10-1和PHXT1作为表达基因的启动子。其中,PGAL1具有如SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列,PGAL7具有如SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列,PGAL10具有如SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列,PGAL1-10具有如SEQID NO:7所示的核苷酸序列,PGAL10-1具有如SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列,PHXT1具有如SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列。
AGTACGGATTAGAAGCCGCCGAGCGGGCGACAGCCCTCCGACGGAAGACTCTCCTCCGTGCGTCCTGGTCTTCACCGGTCGCGTTCCTGAAACGCAGATGTGCCTCGCGCCGCACTGCTCCGAACAATAAAGATTCTACAATACTAGCTTTTATGGTTATGAAGAGGAAAAATTGGCAGTAACCTGGCCCCACAAACCTTCAAATCAACGAATCAAATTAACAACCATAGGATAATAATGCGATTAGTTTTTTAGCCTTATTTCTGGGGTAATTAATCAGCGAAGCGATGATTTTTGATCTATTAACAGATATATAAATGCAAAAGCTGCATAACCACTTTAACTAATACTTTCAACATTTTCGGTTTGTATTACTTCTTATTCAAATGTCATAAAAGTATCAACAAAAAATTGTTAATATACCTCTATACTTTAACGTCAAGGAGAAAAAACTATA(SEQID NO:4)。
GACGGTAGCAACAAGAATATAGCACGAGCCGCGAAGTTCATTTCGTTACTTTTGATATCGCTCACAACTATTGCGAAGCGCTTCAGTGAAAAAATCATAAGGAAAAGTTGTAAATATTATTGGTAGTATTCGTTTGGTAAAGTAGAGGGGGTAATTTTTCCCCTTTATTTTGTTCATACATTCTTAAATTGCTTTGCCTCTCCTTTTGGAAAGCTATACTTCGGAGCACTGTTGAGCGAAGGCTCATTAGATATATTTTCTGTCATTTTCCTTAACCCAAAAATAAGGGAAAGGGTCCAAAAAGCGCTCGGACAACTGTTGACCGTGATCCGAAGGACTGGCTATACAGTGTTCACAAAATAGCCAAGCTGAAAATAATGTGTAGCTATGTTCAGTTAGTTTGGCTAGCAAAGATATAAAAGCAGGTCGGAAATATTTATGGGCATTATTATGCAGAGCATCAACATGATAAAAAAAAACAGTTGAATATTCCCTCAAAA(SEQ ID NO:5)。
TACTTCAATATAGCAATGAGCAGTTAAGCGTATTACTGAAAGTTCCAAAGAGAAGGTTTTTTTAGGCTAAGATAATGGGGCTCTTTACATTTCCACAACATATAAGTAAGATTAGATATGGATATGTATATGGTGGTATTGCCATGTAATATGATTATTAAACTTCTTTGCGTCCATCCAAAAAAAAAGTAAGAATTTTTGAAAATTCAATATAA(SEQ ID NO:6)。
TATAGTTTTTTCTCCTTGACGTTAAAGTATAGAGGTATATTAACAATTTTTTGTTGATACTTTTATGACATTTGAATAAGAAGTAATACAAACCGAAAATGTTGAAAGTATTAGTTAAAGTGGTTATGCAGCTTTTGCATTTATATATCTGTTAATAGATCAAAAATCATCGCTTCGCTGATTAATTACCCCAGAAATAAGGCTAAAAAACTAATCGCATTATTATCCTATGGTTGTTAATTTGATTCGTTGATTTGAAGGTTTGTGGGGCCAGGTTACTGCCAATTTTTCCTCTTCATAACCATAAAAGCTAGTATTGTAGAATCTTTATTGTTCGGAGCAGTGCGGCGCGAGGCACATCTGCGTTTCAGGAACGCGACCGGTGAAGACCAGGACGCACGGAGGAGAGTCTTCCGTCGGAGGGCTGTCGCCCGCTCGGCGGCTTCTAATCCGTACTTCAATATAGCAATGAGCAGTTAAGCGTATTACTGAAAGTTCCAAAGAGAAGGTTTTTTTAGGCTAAGATAATGGGGCTCTTTACATTTCCACAACATATAAGTAAGATTAGATATGGATATGTATATGGTGGTATTGCCATGTAATATGATTATTAAACTTCTTTGCGTCCATCCAAAAAAAAAGTAAGAATTTTTGAAAATTCAATATAA(SEQ ID NO:7)。
TTATATTGAATTTTCAAAAATTCTTACTTTTTTTTTGGATGGACGCAAAGAAGTTTAATAATCATATTACATGGCAATACCACCATATACATATCCATATCTAATCTTACTTATATGTTGTGGAAATGTAAAGAGCCCCATTATCTTAGCCTAAAAAAACCTTCTCTTTGGAACTTTCAGTAATACGCTTAACTGCTCATTGCTATATTGAAGTACGGATTAGAAGCCGCCGAGCGGGCGACAGCCCTCCGACGGAAGACTCTCCTCCGTGCGTCCTGGTCTTCACCGGTCGCGTTCCTGAAACGCAGATGTGCCTCGCGCCGCACTGCTCCGAACAATAAAGATTCTACAATACTAGCTTTTATGGTTATGAAGAGGAAAAATTGGCAGTAACCTGGCCCCACAAACCTTCAAATCAACGAATCAAATTAACAACCATAGGATAATAATGCGATTAGTTTTTTAGCCTTATTTCTGGGGTAATTAATCAGCGAAGCGATGATTTTTGATCTATTAACAGATATATAAATGCAAAAGCTGCATAACCACTTTAACTAATACTTTCAACATTTTCGGTTTGTATTACTTCTTATTCAAATGTCATAAAAGTATCAACAAAAAATTGTTAATATACCTCTATACTTTAACGTCAAGGAGAAAAAACTATA(SEQ ID NO:8)。
GATTTTACGTATATCAACTAGTTGACGATTATGATATCTTTATAGATTTTAAGGTGGGGAAAGAACATGAGACCCCAGATGGAATTGATTATGGGGACATTGTTGCCTTTATATATAATTTCAATATACTAATTCAAATGATTAAAAACGTGAGGGGGACACGCAACTTCGGGTGTTAAGAAATATTTTGCTACATTAGATAATGGTGGAGTTTCCTGGCTTGTCGGATAAAAGCCATCAAATGTCGCAGCAGCTCATGTTTACGTTTGCTGTCTTCTGCCCACGTCATATGAGTGGTATTCTTCTATCAGCACTTGATGAATATTCTTTTTCTCATATATCTGAAAGACAAAAGATCGGCACGGCAATGCCCTGCAGCATTTCTTCCTAGTTTTTCCGAATTTCCATTACGTATTGGATCTTGTGCGCATATTTGTCAGTCCTTCACGGAAAAAAAAAAAGAGCACTGGGTCACTTCGGAAAAACTTTTGACTCAATGCAACAGTGTCATAATCCTTTGCGCTGTCTCTTTGAAGAAAAATCAGGAGTGCAAGATATCGATTAATTCCTTGGAAGTTATGATGGTTAGTCTTAGTTTAACTCTCTTGAAGAAGGGTTTTTTCAGTTGGTCAACACTCTTTAGAGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAATTCTTCATGTAATTTACCATGATTCTACGTTTTTGCAAGCAAAAATGAAGATAATCCGAGCGCATGCGCAAGTAGTCCCTGCCATGCCGCTTCGGAAAAACTTTCGAAACCAATACTCCTTACATCCGCCTTGAATTTAGGACCTACAATTGTTGTCTCTTCTGCTTGAACCAATAAGCCCTAGAAACCTTACACCCTAATTTGCACAAGAAAACTACGAAAAAATTTTTTCCTCTTTTTTCCGCAGCTCCAATCTCGCCCTGCTATTTTTTTGGTTCGGAGAAAAATAGTCGGTCGATATGAATTGAAGTTTCATTGTGGCCACTCGTTTAGGAATGGAATAACCTCCGCGAATGGAAAAAAAGAACTCGGAATATCAAAAATTCCGGCTCAAAGGAAAAATTTGCTTCAGGAGGGGGGAATTATATTCCAGATGAGACCTGCA(SEQ ID NO:9)。
选择任意的终止子(比如TADH2,TGAL10,TCYC1,TGPM1和TPGK1等)作为表达基因的终止子,这些元件的组合搭配能够实现多个基因的过表达。
实施例3第二代工程菌株的构建
在本实施例中,发明人以J1011-B-3菌株为基础,在J1011-B-3菌株上调整TmCrtE(Taxus x media),PagCrtB(Pantoea Agglomerans)和BtCrtI(Blakeslea trispora)这三个基因的拷贝数,获得第二代菌株。
其中第二代工程菌株的具体特性如表1所示。按照设计选择合适的启动子和终止子,用上、下游引物PCR扩增各片段,使其相互之间有60-80bp的重叠片段,再通过同源重组的方式将所有片段重组在一起,通过酶切线性化得到各相应片段,利用酵母自身的同源重组机制将该片段通过醋酸锂法酵母转化分别整合到酵母J1011-B-3基因组上,转化后采用筛选抗性固体板进行筛选,得到的转化子通过分纯培养后提取酵母基因组进行PCR验证,成功验证的菌株详见表1。
表1:第二代工程菌株
其中,BtCrtI具有如SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列,PagCrtB具有如SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列,TmCrtE具有如SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列。
TTATATCCTAATATCGTTAGAGTTCTGTCCTTGGAAGACGTTTGGCAACAACTGATTAATAAAAGATGCTGGAGTAGTAGTGTCGTCCCTAGGAAAGAAATAGAAGAACAAGAAAGTGACAAAGTAGCATGCTAAGCAGTAATAAATCCAGTGTGACTCAGTCTTCCTTGTTTGCTCAGGTGCATATTTCTTCTGAGAGTCCTGTAACTTCCTAGGCAAAGGGTTTTGTCCGAATGACTTACAGACCTGGTCAGAAGTTAATTTAGATCCTGCCAAGACTATTGGGACTCCTGTACCAGGGTGAGTTGATGCACCGACGAAAAATAAATTGTCATATCTGTTAGTAGAGTCCTTTGTTGAAGGTCTGAACCACAAAACCTGAAAGACATCATGTGATAAACCTAATATTGATCCCCTCCACAAGTTGAACTTAGATTGCCAGACTGATGGGTCGTTGACCTCCTCGTGTTCTATCAAGTTAGCGAAGTTGTTGACTCCCAACCTCCTCTCTATGACCTCCAAGACCATCTTTCTAGCCCTGTTGACCAACTCTGGGTAGTTCTCCTCTGCTGAGTTACCTGTCTTAGACTTCATGTGACCAATTGGAACTAAAACTATAATTGAGTCCTTATTTGGAGGTGCTGCAGACTCGTCTATCCTTGAAGGAACGTTGACGTAGAAAGATGCTTCAGAAGGCAAACCGAAATCGTTAAAAATCTCGTCGAATGACTCCTTGTAAGCCTCAGCCAAGAAAATGTTGTGGACGTCCAATTGAGGGACCTTAGTAGACATTGACCAGTAAAAAGAAATTGATGAAGATGTTAATTTCTTAGATGCCAAAGTCTTCTTTGTCCAGTTGCAAGGTGGCAACAAGTGGTGGTAAGCGTAGACCAAGTCAGCGTTGCAGACGACAGCGTCTGCCTCAATGACTTCTCCAGACTCCAAAGTGACACCAGTGACCCTCTTGTCTTTATCGACAGTGTTAATCTTAGCGACAGGAGATTGGTACCTGAACTCAGCTCCGTACTTCTTAGAAGCTATAGACTCCAACTTTTGGACGACCATGTTGAAACCACCCCTTGGGTACCAAATTCCCTCTGCGAACTCTGTATATTGCAACAATGAGTAGACTGCAGGTGCGTCGTAAGGTGACATACCCATGTACATTGTTTGAAAAGTAAAAGCCATCCTCATCTTTTTTGTTTGGAAGTATTTTGATGCTCTGTCGTATATCTTACCGAATAAGTGCAACCTAAAAATCTCTGGGACGTACTGTAACCTTATTAAGTCCCATATAGTTTCGAAGTTTCTCTTTATAGCAATGAATGTACCCTGCTCGTAGTGGACGTGTGTCTCTTTCATGAAATCTAAGAACCTACCGAATCCTAAAGGTCCCTCAATCCTGTCCAACTCACCCTTCATCTTTGTTAAGTCTGATGACAATTGGACAGCGTCACCGTCGTCGAAATGGACTTTGTAATTGTTGTCACATCTTAATAAGTCCAAGTGGTCTCCTATCCTCTCGTCTAAGTCAGCGAAAGCGTCCTCAAACAACTTAGGCATCAAGTACAATGAAGGTCCCTGGTCGAACCTGTGACCGTCGTGGTGAATGAAAGAGCACCTTCCTCCAGAGAAGTCGTTCTTCTCGACGACAGTGACTCTGAAACCCTCCCTTGCTAACCTTGCTGCTGTTGCAGTACCTCCTATTCCAGCACCTATGACGACAATGTGCTTCTTCTGATCAGACAT(SEQ ID NO:10)。
ATGTCACAACCACCATTATTGGACCACGCTACACAAACTATGGCAAACGGTTCTAAATCTTTCGCTACTGCTGCTAAATTATTCGACCCAGCAACAAGAAGATCTGTATTGATGTTGTACACCTGGTGTAGACATTGCGATGACGTTATAGATGACCAAACTCACGGTTTTGCTTCAGAAGCTGCAGCCGAAGAAGAAGCTACACAAAGATTGGCAAGATTAAGAACTTTGACATTAGCTGCATTCGAAGGTGCCGAAATGCAAGATCCAGCTTTTGCCGCTTTCCAAGAAGTTGCATTAACCCATGGTATTACTCCTAGAATGGCTTTGGATCACTTAGACGGTTTTGCAATGGATGTCGCCCAAACAAGATACGTAACCTTCGAAGACACTTTAAGATATTGTTACCATGTCGCCGGTGTTGTCGGTTTGATGATGGCTAGAGTAATGGGTGTTAGAGATGAAAGAGTTTTAGATAGAGCATGTGACTTGGGTTTAGCCTTCCAATTGACAAACATAGCTAGAGATATAATAGATGACGCAGCCATAGACAGATGCTATTTGCCAGCTGAATGGTTACAAGATGCAGGTTTGACTCCTGAAAATTACGCTGCAAGAGAAAACAGAGCCGCTTTAGCCAGAGTTGCTGAAAGATTGATAGATGCAGCCGAACCATATTACATCTCTTCACAAGCTGGTTTGCATGATTTGCCACCTAGATGCGCATGGGCCATTGCTACCGCAAGATCTGTTTACAGAGAAATCGGTATTAAAGTCAAGGCTGCAGGTGGTTCCGCATGGGATAGAAGACAACACACTTCTAAAGGTGAAAAGATCGCTATGTTGATGGCCGCTCCTGGTCAAGTTATTAGAGCAAAGACCACCAGAGTCACCCCAAGACCAGCCGGTTTATGGCAAAGACCTGTTTAA(SEQ ID NO:11)。
ATGGCTTATACCGCAATGGCAGCAGGAACTCAGTCATTGCAGTTGAGGACAGTCGCCTCTTACCAGGAGTGCAACTCAATGAGGTCTTGCTTCAAGTTGACCCCATTCAAGTCATTCCACGGTGTCAACTTCAACGTTCCTTCTTTAGGTGCCGCCAACTGCGAAATCATGGGTCACTTGAAATTGGGTTCTTTGCCATACAAACAGTGTTCAGTATCATCTAAGTCAACTAAGACTATGGCCCAGTTGGTAGATTTGGCAGAGACCGAGAAAGCCGAGGGAAAGGATATCGAGTTCGATTTTAACGAGTATATGAAGTCTAAGGCTGTCGCTGTTGATGCAGCCTTGGATAAGGCCATCCCTTTGGAGTATCCAGAGAAGATCCATGAGTCTATGAGGTACTCATTGTTGGCCGGAGGAAAAAGGGTCAGACCTGCATTATGCATCGCTGCTTGCGAGTTAGTAGGTGGTTCTCAGGACTTGGCCATGCCAACCGCATGTGCCATGGAAATGATTCATACCATGTCATTGATTCACGATGATTTGCCTTGCATGGACAACGACGACTTCAGAAGGGGAAAGCCTACCAATCACAAGGTTTTCGGAGAGGACACTGCTGTTTTAGCCGGTGACGCATTGTTATCTTTCGCTTTTGAACACATCGCCGTTGCCACATCAAAAACTGTCCCATCTGACAGGACCTTGAGAGTCATTTCTGAGTTGGGTAAAACCATCGGTTCACAGGGATTGGTCGGAGGTCAGGTAGTCGACATCACTTCTGAGGGAGACGCCAACGTCGACTTAAAGACATTGGAGTGGATTCACATTCACAAGACTGCCGTCTTGTTGGAATGCTCTGTTGTTTCTGGAGGAATCTTGGGTGGAGCTACCGAGGATGAGATTGCTAGAATAAGAAGATACGCCAGGTGCGTCGGTTTGTTGTTCCAGGTTGTCGACGACATTTTGGATGTCACCAAGTCTTCAGAGGAATTGGGAAAGACCGCCGGTAAAGACTTATTGACCGACAAGGCTACCTACCCTAAGTTGATGGGTTTGGAGAAGGCCAAAGAGTTTGCAGCAGAATTAGCTACCAGGGCAAAGGAAGAGTTGTCATCATTCGACCAGATCAAGGCAGCCCCTTTGTTAGGATTGGCCGATTACATCGCTTTCAGGCAAAACTAA(SEQ ID NO:12)。
更进一步,发明人通过实验验证,结果如图4所示,在摇瓶条件下,J1011-B-5,6,7和J1011-B-33~36具有比J1011-B-3更高产番茄红素的性能。
实施例4沉默基因的工程菌株的构建
在本实施例中,发明人详细介绍了在上述工程菌的基础上敲除另外一些基因获得沉默基因工程菌株的实验过程。
在酿酒酵母中,有很多潜在的基因在敲除后对细胞积累番茄红素化合物有明显的影响,因此构建一系列背景菌株用于增加番茄红素产量。构建方法为在需要灭活的基因中以潮霉素抗性基因为标记构建相应的敲除盒片段,敲除盒片段见图4。将该片段通过醋酸锂法酵母转化分别整合到上述工程菌中,最后用含有潮霉素抗性的平板进行筛选得到疑似带有抗性的菌株,用PCR进行验证,得到的第四代工程菌株见表2。其中,敲除盒片段中的灭活基因序列可从NCBI上下载,从而可以设计得到图5的敲除框。
表2:沉默工程菌株特性
更进一步,发明人通过实验验证,J1011-B-9,10,11,13,15,19都具有比J1011-B-3更高产番茄红素的性能。
实施例5过表达基因的工程菌株的构建
在本实施例中,发明人详细介绍了在上述工程菌株上过表达相关的实验过程。
选择合适的启动子和终止子构建表3中相关基因的表达框,在实施例4的基础上选择合适的基因作为插入位点,通过设计上、下游引物PCR扩增各片段,使其相互之间有60-80bp的重叠片段,再通过同源重组的方式将所有片段重组在一起,通过酶切线性化得到即可实现沉默基因又能过表达基因的基因片段。利用酵母自身的同源重组机制将该片段通过醋酸锂法酵母转化分别整合到上述工程菌株基因组上,转化后采用筛选平板进行筛选,得到的转化子通过分纯培养后提取酵母基因组进行PCR验证,成功验证的菌株详见表3。
更进一步,发明人通过实验验证,J1011-B-4和J1011-B-20~32都具有高产番茄红素的性能。
表3:过表达基因的工程菌株
其中,INO2基因具有如SEQ ID NO:13所示的核苷酸序列,gapN基因具有如SEQIDNO:14所示的核苷酸序列,PYC2基因具有如SEQ ID NO:15所示的核苷酸序列,SMAE1基因具有如SEQ ID NO:16所示的核苷酸序列,MDH2基因具有如SEQ ID NO:17所示的核苷酸序列,POS5基因具有如SEQ ID NO:18所示的核苷酸序列,pntA基因具有如SEQID NO:19所示的核苷酸序列,pntB基因具有如SEQ ID NO:20所示的核苷酸序列,ADH2基因具有如SEQ IDNO:21所示的核苷酸序列,ACS6基因具有如SEQ ID NO:22所示的核苷酸序列,ALD6基因具有如SEQ ID NO:23所示的核苷酸序列,EUTE基因具有如SEQID NO:24所示的核苷酸序列,ERG12基因具有如SEQ ID NO:25所示的核苷酸序列,IDI1基因具有如SEQ ID NO:26所示的核苷酸序列,ERG10基因具有如SEQ ID NO:27所示的核苷酸序列,MVD1基因具有如SEQ IDNO:28所示的核苷酸序列,ERG13基因具有如SEQ ID NO:29所示的核苷酸序列,tHMG1基因具有如SEQ ID NO:30所示的核苷酸序列,ERG8基因具有如SEQ ID NO:31所示的核苷酸序列,yap1基因具有如SEQ ID NO:32所示的核苷酸序列。spt15-5基因具有如SEQ ID NO:51所示的核苷酸序列。taf25-3基因具有如SEQ ID NO:52所示的核苷酸序列。
ATGTCCCAAGCAACTGGGAACGAATTACTGGGTATCCTAGATCTGGATAACGATATAGACTTTGAAACTGCTTACCAAATGCTCAGCAGTAACTTCGACGACCAAATGTCTGCGCACATACATGAAAACACGTTTAGTGCAACTTCCCCTCCTCTGTTAACACACGAGCTCGGCATAATTCCTAACGTGGCAACCGTGCAACCCTCTCACGTAGAAACTATACCTGCCGATAACCAAACTCATCATGCTCCTTTGCATACTCATGCTCACTATCTAAATCACAACCCTCATCAACCAAGCATGGGTTTTGATCAAACGCTTGGTCTCAAGTTGTCTCCTTCCAGTTCGGGGTTGTTGAGCACGAATGAATCGAATGCCATTGAACAGTTTTTAGACAATCTAATATCACAGGATATGATGTCTTCCAACGCTTCCATGAACTCCGATTCACATCTACATATAAGATCACCAAAAAAGCAGCATAGGTATACCGAATTAAATCAAAGATATCCTGAAACACATCCACACAGTAACACAGGGGAGTTACCCACAAACACAGCAGATGTGCCAACTGAGTTCACCACGAGGGAAGGACCTCATCAGCCTATCGGCAATGACCACTACAACCCGCCACCGTTTTCAGTACCTGAGATACGAATCCCAGACTCTGATATTCCAGCCAATATCGAGGACGACCCTGTGAAGGTACGGAAATGGAAACACGTTCAAATGGAGAAGATACGAAGAATAAACACCAAAGAAGCCTTTGAAAGGCTCATTAAATCAGTAAGGACCCCACCAAAGGAAAACGGGAAAAGAATTCCCAAGCATATTCTTTTAACTTGTGTAATGAACGATATCAAGTCCATTAGAAGCGCAAATGAAGCACTACAGCACATACTGGATGATTCCTGA(SEQ IDNO:13)。
ATGACTAAGCAATACAAGAACTACGTTAACGGTGAATGGAAGTTGTCTGAAAACGAAATTAAAATCTATGAACCTGCTTCAGGTGCAGAATTAGGTTCCGTTCCAGCTATGAGTACAGAAGAAGTAGATTACGTTTACGCTTCTGCTAAGAAAGCCCAACCTGCTTGGAGAGCATTGTCATATATCGAAAGAGCTGCATACTTACATAAGGTTGCTGATATATTGATGAGAGACAAGGAAAAGATTGGTGCAATCTTATCTAAAGAAGTAGCCAAGGGTTATAAATCCGCTGTTAGTGAAGTTGTCAGAACCGCTGAAATTATAAACTACGCCGCTGAAGAAGGTTTAAGAATGGAAGGTGAAGTTTTGGAAGGTGGTTCTTTCGAAGCAGCCTCTAAAAAGAAAATTGCAGTAGTTAGAAGAGAACCTGTCGGTTTAGTATTGGCCATTTCCCCTTTCAATTATCCAGTAAACTTAGCTGGTAGTAAGATCGCCCCAGCTTTGATTGCTGGTAATGTTATAGCCTTTAAACCACCTACACAAGGTTCTATTTCAGGTTTGTTATTGGCAGAAGCCTTCGCTGAAGCAGGTTTGCCTGCTGGTGTTTTTAACACAATTACCGGTAGAGGTTCCGAAATCGGTGACTACATTGTCGAACACCAAGCTGTAAACTTCATCAACTTCACTGGTTCTACAGGTATAGGTGAAAGAATCGGTAAAATGGCTGGTATGAGACCAATTATGTTAGAATTGGGTGGTAAAGATTCTGCAATAGTTTTAGAAGATGCCGACTTAGAATTGACCGCTAAGAATATCATTGCCGGTGCTTTTGGTTATTCCGGTCAAAGATGTACTGCAGTCAAAAGAGTTTTAGTCATGGAAAGTGTTGCCGATGAATTGGTCGAAAAGATAAGAGAAAAGGTTTTGGCATTGACTATCGGTAATCCTGAAGATGACGCCGACATCACTCCATTGATCGATACAAAGTCAGCTGACTACGTTGAAGGTTTGATTAATGATGCAAACGACAAGGGTGCAACCGCCTTGACTGAAATTAAAAGAGAGGGTAACTTAATCTGCCCAATCTTGTTCGATAAGGTTACTACAGACATGAGATTAGCTTGGGAAGAACCATTTGGTCCTGTCTTGCCAATAATCAGAGTTACATCTGTCGAAGAAGCTATCGAAATATCTAATAAGTCAGAATATGGTTTGCAAGCATCAATCTTTACAAACGATTTCCCTAGAGCCTTTGGTATTGCTGAACAATTGGAAGTAGGTACCGTTCATATCAACAACAAGACACAAAGAGGTACCGATAATTTTCCATTCTTGGGTGCTAAGAAATCTGGTGCAGGTATCCAAGGTGTCAAATACTCCATTGAAGCTATGACCACTGTAAAGAGTGTCGTATTTGATATTAAATAA(SEQ ID NO:14)。
ATGTATCCAAGGGTCTATGAAGATTTCCAAAAGATCAGAGAAACATACGGTGATTTATCAGTTCTACCAACCAAAAATTTCCTAGCACCAGCAGAACCTGATGAAGAAATCGAAGTCACCATCGAACAAGGTAAGACTTTGATTATCAAATTGCAAGCTGTTGGTGACTTAAATAAGAAAACTGGGCAAAGAGAAGTGTATTTTGAATTGAACGGTGAATTAAGAAAGATCAGAGTTGCAGACAAGTCACAAAACATACAATCTGTTGCTAAACCAAAGGCTGATGTCCACGATACTCACCAAATCGGTGCACCAATGGCTGGTGTTATCATAGAAGTTAAAGTACATAAAGGGTCTTTGGTGAAAAAGGGCGAATCGATTGCTGTTTTGAGTGCCATGAAAATGGAAATGGTTGTCTCTTCACCAGCAGATGGTCAAGTTAAAGATGTTTTCATTAGGGATGGTGAAAGTGTTGACGCATCAGATTTGTTGGTTGTCCTAGAAGAAGAAACCCTACCCCCATCCCAAAAAAAGTAA(SEQ ID NO:15)。
ATGTGGCCTATTCAGCAATCGCGTTTATATTCTTCTAACACTAGATCGCATAAAGCTACCACAACAAGAGAAAATACTTTCCAAAAGCCATACAGCGACGAGGAGGTCACTAAAACACCCGTCGGTTCTCGCGCCAGAAAGATCTTCGAAGCTCCTCACCCACATGCCACTCGTTTGACTGTAGAAGGTGCCATAGAATGTCCCTTGGAGAGCTTTCAACTTTTAAACTCTCCTTTATTTAACAAGGGTTCTGCATTTACACAAGAAGAAAGGGAAGCGTTTAATTTAGAAGCATTGCTACCACCACAAGTGAACACTTTGGACGAACAACTGGAAAGAAGCTACAAGCAGTTATGCTATTTGAAGACGCCCTTGGCCAAAAACGACTTCATGACGTCTTTGAGAGTACAGAACAAAGTCCTATATTTTGCATTAATAAGGAAACATATCAAGGAATTAGTTCCTATCATTTACACCCCAACCGAAGGTGATGCTATTGCTGCCTATTCCCACAGGTTCAGAAAGCCAGAAGGTGTGTTTTTAGACATTACCGAACCTGATTCCATCGAACGTAGATTGGCTACATACGGTGGAGACAAAGATGTAGACTACATCGTTGTGTCGGATTCGGAAGGTATTCTGGGAATTGGTGACCAAGGTATCGGTGGTGTACGTATTGCTATCTCCAAATTGGCATTGATGACGCTGTGCGGTGGTATTCATCCCGGCCGTGTGCTACCTGTGTGTTTGGACGTCGGTACTAACAACAAGAAACTAGCCCGTGACGAATTGTACATGGGTAACAAGTTCTCCAGAATCAGGGGTAAGCAATATGACGACTTCTTGGAAAAATTCATCAAGGCCGTTAAGAAAGTGTATCCAAGCGCCGTTCTGCATTTCGAAGATTTCGGTGTTAAGAACGCTAGAAGATTGCTAGAAAAGTACAGGTACGAATTGCCATCATTCAACGATGACATTCAGGGCACCGGTGCCGTCGTGATGGCCTCGTTGATTGCTGCTTTGAAACATACCAACAGAGACTTGAAAGACACCAGAGTGCTTATTTACGGTGCCGGGTCTGCGGGCCTCGGTATCGCAGACCAAATTGTGAATCATATGGTCACGCACGGCGTTGACAAGGAAGAAGCGCGCAAGAAAATCTTCTTGATGGACAGACGTGGGTTAATTCTACAATCTTACGAGGCTAACTCCACTCCCGCCCAACACGTATACGCTAAGAGTGATGCGGAATGGGCTGGTATCAACACCCGCTCTTTACATGATGTGGTGGAGAACGTCAAACCAACGTGTTTGGTTGGCTGCTCCACACAAGCAGGCGCATTCACTCAAGATGTCGTAGAAGAAATGCACAAGCACAATCCTAGACCGATCATTTTCCCATTATCCAACCCTACTAGACTACACGAAGCCGTTCCTGCCGATTTAATGAAGTGGACCAACAACAACGCTCTTGTAGCTACCGGATCTCCTTTCCCACCTGTTGACGGTTACCGTATCTCGGAGAACAACAATTGTTACTCTTTCCCAGGTATCGGTTTAGGTGCCGTACTATCGCGTGCCACCACTATCACAGACAAGATGATCTCCGCTGCAGTGGACCAACTAGCCGAATTGTCGCCACTAAGAGAGGGCGACTCGAGACCTGGGTTGCTACCCGGCCTGGACACCATCACCAACACCTCTGCGCGTCTAGCTACCGCTGTGATCTTGCAAGCACTCGAGGAGGGAACCGCCCGTATCGAGCAAGAACAAGTACCGGGAGGAGCTCCCGGCGAAACTGTCAAGGTTCCTCGTGACTTTGACGAATGTTTACAGTGGGTCAAAGCCCAAATGTGGGAGCCTGTGTACAGACCTATGATCAAGGTCCAACATGACCCATCGGTGCACACCAACCAATTGTAG(SEQ ID NO:16)。
ATGCCTCACTCAGTTACACCATCCATAGAACAAGATTCGTTAAAAATTGCCATTTTAGGTGCTGCCGGTGGTATCGGGCAGTCGTTATCGCTGCTTTTGAAAGCTCAGTTGCAATACCAGTTAAAGGAGAGCAACCGGAGCGTTACCCACATTCATCTGGCTCTTTACGATGTCAACCAAGAAGCCATCAACGGTGTTACCGCCGACTTGTCTCATATAGACACCCCCATTTCCGTGTCGAGCCACTCTCCTGCAGGTGGCATTGAGAACTGTTTGCATAACGCTTCTATTGTTGTCATTCCTGCAGGTGTTCCAAGAAAACCTGGCATGACTCGTGATGACTTATTTAACGTGAATGCTGGTATCATTAGCCAGCTCGGTGATTCTATTGCAGAATGTTGTGATCTTTCCAAGGTCTTCGTTCTTGTCATTTCCAACCCTGTTAATTCTTTAGTCCCAGTGATGGTTTCTAACATTCTTAAGAACCATCCTCAGTCTAGAAATTCCGGCATTGAAAGAAGGATCATGGGTGTCACCAAGCTCGACATTGTCAGAGCGTCCACTTTTCTACGTGAGATAAACATTGAGTCAGGGCTAACTCCTCGTGTTAACTCCATGCCTGACGTCCCTGTAATTGGCGGGCATTCTGGCGAGACTATTATTCCGTTGTTTTCACAGTCAAACTTCCTATCGAGATTAAATGAGGATCAATTGAAATATTTAATACATAGAGTCCAATACGGTGGTGATGAAGTGGTCAAGGCCAAGAACGGTAAAGGTAGTGCTACCTTATCGATGGCCCATGCCGGTTATAAGTGTGTTGTCCAATTTGTTTCTTTGTTATTGGGTAACATTGAGCAGATCCATGGAACCTACTATGTGCCATTAAAAGATGCGAACAACTTCCCCATTGCTCCTGGGGCAGATCAATTATTGCCTCTGGTGGACGGTGCAGACTACTTTGCCATACCATTAACTATTACTACAAAGGGTGTTTCCTATGTGGATTATGACATCGTTAATAGGATGAACGACATGGAACGCAACCAAATGTTGCCAATTTGCGTCTCCCAGTTAAAGAAAAATATCGATAAGGGCTTGGAATTCGTTGCATCGAGATCTGCATCATCTTAA(SEQ ID NO:17)。
ATGTTTGTCAGGGTTAAATTGAATAAACCAGTAAAATGGTATAGGTTCTATAGTACGTTGGATTCACATTCCCTAAAGTTACAGAGCGGCTCGAAGTTTGTAAAAATAAAGCCAGTAAATAACTTGAGGAGTAGTTCATCAGCAGATTTCGTGTCCCCACCAAATTCCAAATTACAATCTTTAATCTGGCAGAACCCTTTACAAAATGTTTATATAACTAAAAAACCATGGACTCCATCCACAAGAGAAGCGATGGTTGAATTCATAACTCATTTACATGAGTCATACCCCGAGGTGAACGTCATTGTTCAACCCGATGTGGCAGAAGAAATTTCCCAGGATTTCAAATCTCCTTTGGAGAATGATCCCAACCGACCTCATATACTTTATACTGGTCCTGAACAAGATATCGTAAACAGAACAGACTTATTGGTGACATTGGGAGGTGATGGGACTATTTTACACGGCGTATCAATGTTCGGAAATACGCAAGTTCCTCCGGTTTTAGCATTTGCTCTGGGCACTCTGGGCTTTCTATTACCGTTTGATTTTAAGGAGCATAAAAAGGTCTTTCAGGAAGTAATCAGCTCTAGAGCCAAATGTTTGCATAGAACACGGCTAGAATGTCATTTGAAAAAAAAGGATAGCAACTCATCTATTGTGACCCATGCTATGAATGACATATTCTTACATAGGGGTAATTCCCCTCATCTCACTAACCTGGACATTTTCATTGATGGGGAATTTTTGACAAGAACGACAGCAGATGGTGTTGCATTGGCCACTCCAACGGGTTCCACAGCATATTCATTATCAGCAGGTGGATCTATTGTTTCCCCATTAGTCCCTGCTATTTTAATGACACCAATTTGTCCTCGCTCTTTGTCATTCCGACCACTGATTTTGCCTCATTCATCCCACATTAGGATAAAGATAGGTTCCAAATTGAACCAAAAACCAGTCAACAGTGTGGTAAAACTTTCTGTTGATGGTATTCCTCAACAGGATTTAGATGTTGGTGATGAAATTTATGTTATAAATGAGGTCGGCACTATATACATAGATGGTACTCAGCTTCCGACGACAAGAAAAACTGAAAATGACTTTAATAATTCAAAAAAGCCTAAAAGGTCAGGGATTTATTGTGTCGCCAAGACCGAGAATGACTGGATTAGAGGAATCAATGAACTTTTAGGATTCAATTCTAGCTTTAGGCTGACCAAGAGACAGACTGATAATGATTAA(SEQ ID NO:18)。
ATGCGAATTGGCATACCAAGAGAACGGTTAACCAATGAAACCCGTGTTGCAGCAACGCCAAAAACAGTGGAACAGCTGCTGAAACTGGGTTTTACCGTCGCGGTAGAGAGCGGCGCGGGTCAACTGGCAAGTTTTGACGATAAAGCGTTTGTGCAAGCGGGCGCTGAAATTGTAGAAGGGAATAGCGTCTGGCAGTCAGAGATCATTCTGAAGGTCAATGCGCCGTTAGATGATGAAATTGCGTTACTGAATCCTGGGACAACGCTGGTGAGTTTTATCTGGCCTGCGCAGAATCCGGAATTAATGCAAAAACTTGCGGAACGTAACGTGACCGTGATGGCGATGGACTCTGTGCCGCGTATCTCACGCGCACAATCGCTGGACGCACTAAGCTCGATGGCGAACATCGCCGGTTATCGCGCCATTGTTGAAGCGGCACATGAATTTGGGCGCTTCTTTACCGGGCAAATTACTGCGGCCGGGAAAGTGCCACCGGCAAAAGTGATGGTGATTGGTGCGGGTGTTGCAGGTCTGGCCGCCATTGGCGCAGCAAACAGTCTCGGCGCGATTGTGCGTGCATTCGACACCCGCCCGGAAGTGAAAGAACAAGTTCAAAGTATGGGCGCGGAATTCCTCGAGCTGGATTTTAAAGAGGAAGCTGGCAGCGGCGATGGCTATGCCAAAGTGATGTCGGACGCGTTCATCAAAGCGGAAATGGAACTCTTTGCCGCCCAGGCAAAAGAGGTCGATATCATTGTCACCACCGCGCTTATTCCAGGCAAACCAGCGCCGAAGCTAATTACCCGTGAAATGGTTGACTCCATGAAGGCGGGCAGTGTGATTGTCGACCTGGCAGCCCAAAACGGCGGCAACTGTGAATACACCGTGCCGGGTGAAATCTTCACTACGGAAAATGGTGTCAAAGTGATTGGTTATACCGATCTTCCGGGCCGTCTGCCGACGCAATCCTCACAGCTTTACGGCACAAACCTCGTTAATCTGCTGAAACTGTTGTGCAAAGAGAAAGACGGCAATATCACTGTTGATTTTGATGATGTGGTGATTCGCGGCGTGACCGTGATCCGTGCGGGCGAAATTACCTGGCCGGCACCGCCGATTCAGGTATCAGCTCAGCCGCAGGCGGCACAAAAAGCGGCACCGGAAGTGAAAACTGAGGAAAAATGTACCTGCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCAGCATTAATATTTTCGGTGGCTTCACCGTGACTCAGCGCATGCTGAAAATGTTCCGCAAAAATTAA(SEQ IDNO:19)
ATGTCTGGAGGATTAGTTACAGCTGCATACATTGTTGCCGCGATCCTGTTTATCTTCAGTCTGGCCGGTCTTTCGAAACATGAAACGTCTCGCCAGGGTAACAACTTCGGTATCGCCGGGATGGCGATTGCGTTAATCGCAACCATTTTTGGACCGGATACGGGTAATGTTGGCTGGATCTTGCTGGCGATGGTCATTGGTGGGGCAATTGGTATCCGTCTGGCGAAGAAAGTTGAAATGACCGAAATGCCAGAACTGGTGGCGATCCTGCATAGCTTCGTGGGTCTGGCGGCAGTGCTGGTTGGCTTTAACAGCTATCTGCATCATGACGCGGGAATGGCACCGATTCTGGTCAATATTCACCTGACGGAAGTGTTCCTCGGTATCTTCATCGGGGCGGTAACGTTCACGGGTTCGGTGGTGGCGTTCGGCAAACTGTGTGGCAAGATTTCGTCTAAACCATTGATGCTGCCAAACCGTCACAAAATGAACCTGGCGGCTCTGGTCGTTTCCTTCCTGCTGCTGATTGTATTTGTTCGCACGGACAGCGTCGGCCTGCAAGTGCTGGCATTGCTGATAATGACCGCAATTGCGCTGGTATTCGGCTGGCATTTAGTCGCCTCCATCGGTGGTGCAGATATGCCAGTGGTGGTGTCGATGCTGAACTCGTACTCCGGCTGGGCGGCTGCGGCTGCGGGCTTTATGCTCAGCAACGACCTGCTGATTGTGACCGGTGCGCTGGTCGGTTCTTCGGGGGCTATCCTTTCTTACATTATGTGTAAGGCGATGAACCGTTCCTTTATCAGCGTTATTGCGGGTGGTTTCGGCACCGACGGCTCTTCTACTGGCGATGATCAGGAAGTGGGTGAGCACCGCGAAATCACCGCAGAAGAGACAGCGGAACTGCTGAAAAACTCCCATTCAGTGATCATTACTCCGGGGTACGGCATGGCAGTCGCGCAGGCGCAATATCCTGTCGCTGAAATTACTGAGAAATTGCGCGCTCGTGGTATTAATGTGCGTTTCGGTATCCACCCGGTCGCGGGGCGTTTGCCTGGACATATGAACGTATTGCTGGCTGAAGCAAAAGTACCGTATGACATCGTGCTGGAAATGGACGAGATCAATGATGACTTTGCTGATACCGATACCGTACTGGTGATTGGTGCTAACGATACGGTTAACCCGGCGGCGCAGGATGATCCGAAGAGTCCGATTGCTGGTATGCCTGTGCTGGAAGTGTGGAAAGCGCAGAACGTGATTGTCTTTAAACGTTCGATGAACACTGGCTATGCTGGTGTGCAAAACCCGCTGTTCTTCAAGGAAAACACCCACATGCTGTTTGGTGACGCCAAAGCCAGCGTGGATGCAATCCTGAAAGCTCTGTAA(SEQ ID NO:20)
ATGTCTATTCCAGAAACTCAAAAAGCCATTATCTTCTACGAATCCAACGGCAAGTTGGAGCATAAGGATATCCCAGTTCCAAAGCCAAAGCCCAACGAATTGTTAATCAACGTCAAGTACTCTGGTGTCTGCCACACCGATTTGCACGCTTGGCATGGTGACTGGCCATTGCCAACTAAGTTACCATTAGTTGGTGGTCACGAAGGTGCCGGTGTCGTTGTCGGCATGGGTGAAAACGTTAAGGGCTGGAAGATCGGTGACTACGCCGGTATCAAATGGTTGAACGGTTCTTGTATGGCCTGTGAATACTGTGAATTGGGTAACGAATCCAACTGTCCTCACGCTGACTTGTCTGGTTACACCCACGACGGTTCTTTCCAAGAATACGCTACCGCTGACGCTGTTCAAGCCGCTCACATTCCTCAAGGTACTGACTTGGCTGAAGTCGCGCCAATCTTGTGTGCTGGTATCACCGTATACAAGGCTTTGAAGTCTGCCAACTTGAGAGCAGGCCACTGGGCGGCCATTTCTGGTGCTGCTGGTGGTCTAGGTTCTTTGGCTGTTCAATATGCTAAGGCGATGGGTTACAGAGTCTTAGGTATTGATGGTGGTCCAGGAAAGGAAGAATTGTTTACCTCGCTCGGTGGTGAAGTATTCATCGACTTCACCAAAGAGAAGGACATTGTTAGCGCAGTCGTTAAGGCTACCAACGGCGGTGCCCACGGTATCATCAATGTTTCCGTTTCCGAAGCCGCTATCGAAGCTTCTACCAGATACTGTAGGGCGAACGGTACTGTTGTCTTGGTTGGTTTGCCAGCCGGTGCAAAGTGCTCCTCTGATGTCTTCAACCACGTTGTCAAGTCTATCTCCATTGTCGGCTCTTACGTGGGGAACAGAGCTGATACCAGAGAAGCCTTAGATTTCTTTGCCAGAGGTCTAGTCAAGTCTCCAATAAAGGTAGTTGGCTTATCCAGTTTACCAGAAATTTACGAAAAGATGGAGAAGGGCCAAATTGCTGGTAGATACGTTGTTGACACTTCTAAATAA(SEQ ID NO:21)。
ATGTCTCAGACTCACAAGCATGCTATTCCTGCTAACATAGCTGACAGATGCTTAATAAATCCAGAACAGTATGAAACTAAATACAAGCAATCTATAAACGATCCTGACACTTTCTGGGGAGAGCAGGGTAAGATATTGGACTGGATTACACCATACCAAAAGGTCAAGAACACTTCATTTGCTCCTGGTAATGTTTCTATTAAATGGTACGAGGACGGTACATTAAACTTAGCAGCAAACTGCTTGGACAGGCACTTGCAAGAGAACGGAGACAGAACTGCAATAATTTGGGAGGGTGACGACGCATCTCAATCTAAGCACATATCATACAGAGAGTTACACAGAGACGTTTGCAGATTCGCTAACACATTGTTGGATTTGGGAATAAAGAAAGGTGACGTTGTTGCAATTTATATGCCTATGGTTCCTGAGGCTGCTGTCGCTATGTTGGCTTGCGCAAGGATAGGAGCTGTCCATTCTGTCATTTTTGGTGGTTTTTCACCTGAGGCAATAGCAGGTAGGATAATTGATTCATCTTCAAGGTTGGTCATAACTGCAGATGAGGGAGTCAGGGCAGGAAGATCTATTCCATTGAAGAAGAACGTTGACGATGCATTGAAGAACCCAAACGTTACTTCTGTCGAGCACGTCATTGTCTTAAAAAGAACTGGAAACGACATAGACTGGCAAGAGGGTAGGGACTTATGGTGGAGGGACTTGATTGAGAAGGCTTCACCTGAACACCAGCCAGAGGCAATGAATGCAGAAGACCCATTGTTTATTTTATATACATCTGGATCTACAGGAAAGCCAAAGGGAGTCTTGCATACTACAGGTGGTTACTTGGTCTATGCAGCAACAACTTTTAAGTATGTCTTCGACTACCACCCTGGTGACATTTACTGGTGCACAGCTGACGTTGGATGGGTCACAGGTCACTCTTACTTGTTGTACGGACCTTTGGCATGCGGTGCTACTACATTGATGTTCGAGGGAGTCCCTAACTGGCCTACACCTGCTAGGATGTGCCAGGTTGTCGACAAGCACCAGGTCAACATACTGTACACAGCACCAACAGCTATTAGGGCATTGATGGCAGAGGGTGACAAGGCAATTGAGGGAACAGACAGGTCTTCTTTGAGAATATTGGGATCTGTCGGTGAGCCAATAAACCCAGAGGCATGGGAGTGGTACTGGAAGAAGATAGGAAAGGAGAAATGTCCAGTCGTCGACACATGGTGGCAGACAGAGACAGGTGGATTTATGATAACTCCTTTGCCAGGAGCTATAGAGTTGAAGGCTGGTTCAGCAACAAGGCCATTCTTCGGAGTCCAGCCTGCATTGGTCGACAACGAGGGTCATCCACAGGAAGGTGCTACAGAGGGTAACTTAGTCATTACTGACTCTTGGCCTGGTCAGGCTAGGACATTGTTCGGTGACCATGAGAGGTTCGAGCAGACTTACTTTTCTACATTTAAAAATATGTACTTTTCTGGAGACGGTGCTAGAAGGGATGAAGATGGTTACTATTGGATAACTGGTAGGGTCGATGATGTCTTAAACGTCTCAGGACACAGGTTGGGAACTGCTGAAATTGAATCAGCATTGGTCGCTCACCCTAAGATAGCTGAGGCAGCTGTCGTCGGAATTCCTCACGCAATTAAGGGACAGGCAATTTACGCATACGTCACTTTGAACCACGGTGAAGAGCCATCACCAGAGTTGTACGCAGAGGTTAGGAACTGGGTCAGGAAGGAGATTGGACCTTTGGCAACTCCAGACGTCTTGCACTGGACAGACTCATTGCCTAAGACAAGGTCTGGAAAAATAATGAGGAGAATATTGAGGAAAATTGCTGCTGGAGATACTTCAAACTTGGGTGACACTTCTACATTGGCTGACCCAGGTGTTGTCGAGAAACCATTGGAGGAAAAACAGGCAATAGCTATGCCATCTTAA(SEQID NO:22)。
ATGACTAAGCTACACTTTGACACTGCTGAACCAGTCAAGATCACACTTCCAAATGGTTTGACATACGAGCAACCAACCGGTCTATTCATTAACAACAAGTTTATGAAAGCTCAAGACGGTAAGACCTATCCCGTCGAAGATCCTTCCACTGAAAACACCGTTTGTGAGGTCTCTTCTGCCACCACTGAAGATGTTGAATATGCTATCGAATGTGCCGACCGTGCTTTCCACGACACTGAATGGGCTACCCAAGACCCAAGAGAAAGAGGCCGTCTACTAAGTAAGTTGGCTGACGAATTGGAAAGCCAAATTGACTTGGTTTCTTCCATTGAAGCTTTGGACAATGGTAAAACTTTGGCCTTAGCCCGTGGGGATGTTACCATTGCAATCAACTGTCTAAGAGATGCTGCTGCCTATGCCGACAAAGTCAACGGTAGAACAATCAACACCGGTGACGGCTACATGAACTTCACCACCTTAGAGCCAATCGGTGTCTGTGGTCAAATTATTCCATGGAACTTTCCAATAATGATGTTGGCTTGGAAGATCGCCCCAGCATTGGCCATGGGTAACGTCTGTATCTTGAAACCCGCTGCTGTCACACCTTTAAATGCCCTATACTTTGCTTCTTTATGTAAGAAGGTTGGTATTCCAGCTGGTGTCGTCAACATCGTTCCAGGTCCTGGTAGAACTGTTGGTGCTGCTTTGACCAACGACCCAAGAATCAGAAAGCTGGCTTTTACCGGTTCTACAGAAGTCGGTAAGAGTGTTGCTGTCGACTCTTCTGAATCTAACTTGAAGAAAATCACTTTGGAACTAGGTGGTAAGTCCGCCCATTTGGTCTTTGACGATGCTAACATTAAGAAGACTTTACCAAATCTAGTAAACGGTATTTTCAAGAACGCTGGTCAAATTTGTTCCTCTGGTTCTAGAATTTACGTTCAAGAAGGTATTTACGACGAACTATTGGCTGCTTTCAAGGCTTACTTGGAAACCGAAATCAAAGTTGGTAATCCATTTGACAAGGCTAACTTCCAAGGTGCTATCACTAACCGTCAACAATTCGACACAATTATGAACTACATCGATATCGGTAAGAAAGAAGGCGCCAAGATCTTAACTGGTGGCGAAAAAGTTGGTGACAAGGGTTACTTCATCAGACCAACCGTTTTCTACGATGTTAATGAAGACATGAGAATTGTTAAGGAAGAAATTTTTGGACCAGTTGTCACTGTCGCAAAGTTCAAGACTTTAGAAGAAGGTGTCGAAATGGCTAACAGCTCTGAATTCGGTCTAGGTTCTGGTATCGAAACAGAATCTTTGAGCACAGGTTTGAAGGTGGCCAAGATGTTGAAGGCCGGTACCGTCTGGATCAACACATACAACGATTTTGACTCCAGAGTTCCATTCGGTGGTGTTAAGCAATCTGGTTACGGTAGAGAAATGGGTGAAGAAGTCTACCATGCATACACTGAAGTAAAAGCTGTCAGAATTAAGTTGTAA(SEQID NO:23)。
ATGAATCAACAGGATATTGAACAGGTGGTGAAAGCGGTACTGCTGAAAATGCAAAGCAGTGACACGCCGTCCGCCGCCGTTCATGAGATGGGCGTTTTCGCGTCCCTGGATGACGCCGTTGCGGCAGCCAAAGTCGCCCAGCAAGGGTTAAAAAGCGTGGCAATGCGCCAGTTAGCCATTGCTGCCATTCGTGAAGCAGGCGAAAAACACGCCAGAGATTTAGCGGAACTTGCCGTCAGTGAAACCGGCATGGGGCGCGTTGAAGATAAATTTGCAAAAAACGTCGCTCAGGCGCGCGGCACACCAGGCGTTGAGTGCCTCTCTCCGCAAGTGCTGACTGGCGACAACGGCCTGACCCTAATTGAAAACGCACCCTGGGGCGTGGTGGCTTCGGTGACGCCTTCCACTAACCCGGCGGCAACCGTAATTAACAACGCCATCAGCCTGATTGCCGCGGGCAACAGCGTCATTTTTGCCCCGCATCCGGCGGCGAAAAAAGTCTCCCAGCGGGCGATTACGCTGCTCAACCAGGCGATTGTTGCCGCAGGTGGGCCGGAAAACTTACTGGTTACTGTGGCAAATCCGGATATCGAAACCGCGCAACGCTTGTTCAAGTTTCCGGGTATCGGCCTGCTGGTGGTAACCGGCGGCGAAGCGGTAGTAGAAGCGGCGCGTAAACACACCAATAAACGTCTGATTGCCGCAGGCGCTGGCAACCCGCCGGTAGTGGTGGATGAAACCGCCGACCTCGCCCGTGCCGCTCAGTCCATCGTCAAAGGCGCTTCTTTCGATAACAACATCATTTGTGCCGACGAAAAGGTACTGATTGTTGTTGATAGCGTAGCCGATGAACTGATGCGTCTGATGGAAGGCCAGCACGCGGTGAAACTGACCGCAGAACAGGCGCAGCAGCTGCAACCGGTGTTGCTGAAAAATATCGACGAGCGCGGAAAAGGCACCGTCAGCCGTGACTGGGTTGGTCGCGACGCAGGCAAAATCGCGGCGGCAATCGGCCTTAAAGTTCCGCAAGAAACGCGCCTGCTGTTTGTGGAAACCACCGCAGAACATCCGTTTGCCGTGACTGAACTGATGATGCCGGTGTTGCCCGTCGTGCGCGTCGCCAACGTGGCGGATGCCATTGCGCTAGCGGTGAAACTGGAAGGCGGTTGCCACCACACGGCGGCAATGCACTCGCGCAACATCGAAAACATGAACCAGATGGCGAATGCTATTGATACCAGCATTTTCGTTAAGAACGGACCGTGCATTGCCGGGCTGGGGCTGGGCGGGGAAGGCTGGACCACCATGACCATCACCACGCCAACCGGTGAAGGGGTAACCAGCGCGCGTACGTTTGTCCGTCTGCGTCGCTGTGTATTAGTCGATGCGTTTCGCATTGTTTAA(SEQ ID NO:24)。
ATGTCATTACCGTTCTTAACTTCTGCACCGGGAAAGGTTATTATTTTTGGTGAACACTCTGCTGTGTACAACAAGCCTGCCGTCGCTGCTAGTGTGTCTGCGTTGAGAACCTACCTGCTAATAAGCGAGTCATCTGCACCAGATACTATTGAATTGGACTTCCCGGACATTAGCTTTAATCATAAGTGGTCCATCAATGATTTCAATGCCATCACCGAGGATCAAGTAAACTCCCAAAAATTGGCCAAGGCTCAACAAGCCACCGATGGCTTGTCTCAGGAACTCGTTAGTCTTTTGGATCCGTTGTTAGCTCAACTATCCGAATCCTTCCACTACCATGCAGCGTTTTGTTTCCTGTATATGTTTGTTTGCCTATGCCCCCATGCCAAGAATATTAAGTTTTCTTTAAAGTCTACTTTACCCATCGGTGCTGGGTTGGGCTCAAGCGCCTCTATTTCTGTATCACTGGCCTTAGCTATGGCCTACTTGGGGGGGTTAATAGGATCTAATGACTTGGAAAAGCTGTCAGAAAACGATAAGCATATAGTGAATCAATGGGCCTTCATAGGTGAAAAGTGTATTCACGGTACCCCTTCAGGAATAGATAACGCTGTGGCCACTTATGGTAATGCCCTGCTATTTGAAAAAGACTCACATAATGGAACAATAAATACAAACAATTTTAAGTTCTTAGATGATTTCCCAGCCATTCCAATGATCCTAACCTATACTAGAATTCCAAGGTCTACAAAAGATCTTGTTGCTCGCGTTCGTGTGTTGGTCACCGAGAAATTTCCTGAAGTTATGAAGCCAATTCTAGATGCCATGGGTGAATGTGCCCTACAAGGCTTAGAGATCATGACAAAGTTAAGTAAATGTAAAGGCACCGATGACGAGGCCGTAGAAACTAATAATGAACTGTATGAACAACTATTGGAATTGATAAGAATAAATCATGGACTGCTTGTCTCAATCGGTGTTTCTCATCCTGGATTAGAACTTATTAAAAATCTGAGCGATGATTTGAGAATTGGCTCCACAAAACTTACCGGTGCTGGTGGCGGCGGTTGCTCTTTGACTTTGTTACGAAGAGACATTACTCAAGAGCAAATTGACAGTTTCAAAAAGAAATTGCAAGATGATTTTAGTTACGAGACATTTGAAACAGACTTGGGTGGGACTGGCTGCTGTTTGTTAAGCGCAAAAAATTTGAATAAAGATCCTAAAATCAAATCCCTAGTATTCCAATTATTTGAAAATAAAACTACCACAAAGCAACAAATTGACGATCTATTATTGCCAGGAAACACGAATTTACCATGGACTTCATAA(SEQ ID NO:25)。
ATGACTGCCGACAACAATAGTATGCCCCATGGTGCAGTATCTAGTTACGCCAAATTAGTGCAAAACCAAACACCTGAAGACATTTTGGAAGAGTTTCCTGAAATTATTCCATTACAACAAAGACCTAATACCCGATCTAGTGAGACGTCAAATGACGAAAGCGGAGAAACATGTTTTTCTGGTCATGATGAGGAGCAAATTAAGTTAATGAATGAAAATTGTATTGTTTTGGATTGGGACGATAATGCTATTGGTGCCGGTACCAAGAAAGTTTGTCATTTAATGGAAAATATTGAAAAGGGTTTACTACATCGTGCATTCTCCGTCTTTATTTTCAATGAACAAGGTGAATTACTTTTACAACAAAGAGCCACTGAAAAAATAACTTTCCCTGATCTTTGGACTAACACATGCTGCTCTCATCCACTATGTATTGATGACGAATTAGGTTTGAAGGGTAAGCTAGACGATAAGATTAAGGGCGCTATTACTGCGGCGGTGAGAAAACTAGATCATGAATTAGGTATTCCAGAAGATGAAACTAAGACAAGGGGTAAGTTTCACTTTTTAAACAGAATCCATTACATGGCACCAAGCAATGAACCATGGGGTGAACATGAAATTGATTACATCCTATTTTATAAGATCAACGCTAAAGAAAACTTGACTGTCAACCCAAACGTCAATGAAGTTAGAGACTTCAAATGGGTTTCACCAAATGATTTGAAAACTATGTTTGCTGACCCAAGTTACAAGTTTACGCCTTGGTTTAAGATTATTTGCGAGAATTACTTATTCAACTGGTGGGAGCAATTAGATGACCTTTCTGAAGTGGAAAATGACAGGCAAATTCATAGAATGCTATAA(SEQID NO:26)。
ATGTCTCAGAACGTTTACATTGTATCGACTGCCAGAACCCCAATTGGTTCATTCCAGGGTTCTCTATCCTCCAAGACAGCAGTGGAATTGGGTGCTGTTGCTTTAAAAGGCGCCTTGGCTAAGGTTCCAGAATTGGATGCATCCAAGGATTTTGACGAAATTATTTTTGGTAACGTTCTTTCTGCCAATTTGGGCCAAGCTCCGGCCAGACAAGTTGCTTTGGCTGCCGGTTTGAGTAATCATATCGTTGCAAGCACAGTTAACAAGGTCTGTGCATCCGCTATGAAGGCAATCATTTTGGGTGCTCAATCCATCAAATGTGGTAATGCTGATGTTGTCGTAGCTGGTGGTTGTGAATCTATGACTAACGCACCATACTACATGCCAGCAGCCCGTGCGGGTGCCAAATTTGGCCAAACTGTTCTTGTTGATGGTGTCGAAAGAGATGGGTTGAACGATGCGTACGATGGTCTAGCCATGGGTGTACACGCAGAAAAGTGTGCCCGTGATTGGGATATTACTAGAGAACAACAAGACAATTTTGCCATCGAATCCTACCAAAAATCTCAAAAATCTCAAAAGGAAGGTAAATTCGACAATGAAATTGTACCTGTTACCATTAAGGGATTTAGAGGTAAGCCTGATACTCAAGTCACGAAGGACGAGGAACCTGCTAGATTACACGTTGAAAAATTGAGATCTGCAAGGACTGTTTTCCAAAAAGAAAACGGTACTGTTACTGCCGCTAACGCTTCTCCAATCAACGATGGTGCTGCAGCCGTCATCTTGGTTTCCGAAAAAGTTTTGAAGGAAAAGAATTTGAAGCCTTTGGCTATTATCAAAGGTTGGGGTGAGGCCGCTCATCAACCAGCTGATTTTACATGGGCTCCATCTCTTGCAGTTCCAAAGGCTTTGAAACATGCTGGCATCGAAGACATCAATTCTGTTGATTACTTTGAATTCAATGAAGCCTTTTCGGTTGTCGGTTTGGTGAACACTAAGATTTTGAAGCTAGACCCATCTAAGGTTAATGTATATGGTGGTGCTGTTGCTCTAGGTCACCCATTGGGTTGTTCTGGTGCTAGAGTGGTTGTTACACTGCTATCCATCTTACAGCAAGAAGGAGGTAAGATCGGTGTTGCCGCCATTTGTAATGGTGGTGGTGGTGCTTCCTCTATTGTCATTGAAAAGATATGA(SEQ ID NO:27)。
ATGACCGTTTACACAGCATCCGTTACCGCACCCGTCAACATCGCAACCCTTAAGTATTGGGGGAAAAGGGACACGAAGTTGAATCTGCCCACCAATTCGTCCATATCAGTGACTTTATCGCAAGATGACCTCAGAACGTTGACCTCTGCGGCTACTGCACCTGAGTTTGAACGCGACACTTTGTGGTTAAATGGAGAACCACACAGCATCGACAATGAAAGAACTCAAAATTGTCTGCGCGACCTACGCCAATTAAGAAAGGAAATGGAATCGAAGGACGCCTCATTGCCCACATTATCTCAATGGAAACTCCACATTGTCTCCGAAAATAACTTTCCTACAGCAGCTGGTTTAGCTTCCTCCGCTGCTGGCTTTGCTGCATTGGTCTCTGCAATTGCTAAGTTATACCAATTACCACAGTCAACTTCAGAAATATCTAGAATAGCAAGAAAGGGGTCTGGTTCAGCTTGTAGATCGTTGTTTGGCGGATACGTGGCCTGGGAAATGGGAAAAGCTGAAGATGGTCATGATTCCATGGCAGTACAAATCGCAGACAGCTCTGACTGGCCTCAGATGAAAGCTTGTGTCCTAGTTGTCAGCGATATTAAAAAGGATGTGAGTTCCACTCAGGGTATGCAATTGACCGTGGCAACCTCCGAACTATTTAAAGAAAGAATTGAACATGTCGTACCAAAGAGATTTGAAGTCATGCGTAAAGCCATTGTTGAAAAAGATTTCGCCACCTTTGCAAAGGAAACAATGATGGATTCCAACTCTTTCCATGCCACATGTTTGGACTCTTTCCCTCCAATATTCTACATGAATGACACTTCCAAGCGTATCATCAGTTGGTGCCACACCATTAATCAGTTTTACGGAGAAACAATCGTTGCATACACGTTTGATGCAGGTCCAAATGCTGTGTTGTACTACTTAGCTGAAAATGAGTCGAAACTCTTTGCATTTATCTATAAATTGTTTGGCTCTGTTCCTGGATGGGACAAGAAATTTACTACTGAGCAGCTTGAGGCTTTCAACCATCAATTTGAATCATCTAACTTTACTGCACGTGAATTGGATCTTGAGTTGCAAAAGGATGTTGCCAGAGTGATTTTAACTCAAGTCGGTTCAGGCCCACAAGAAACAAACGAATCTTTGATTGACGCAAAGACTGGTCTACCAAAGGAATAA(SEQ ID NO:28)。
ATGAAACTCTCAACTAAACTTTGTTGGTGTGGTATTAAAGGAAGACTTAGGCCGCAAAAGCAACAACAATTACACAATACAAACTTGCAAATGACTGAACTAAAAAAACAAAAGACCGCTGAACAAAAAACCAGACCTCAAAATGTCGGTATTAAAGGTATCCAAATTTACATCCCAACTCAATGTGTCAACCAATCTGAGCTAGAGAAATTTGATGGCGTTTCTCAAGGTAAATACACAATTGGTCTGGGCCAAACCAACATGTCTTTTGTCAATGACAGAGAAGATATCTACTCGATGTCCCTAACTGTTTTGTCTAAGTTGATCAAGAGTTACAACATCGACACCAACAAAATTGGTAGATTAGAAGTCGGTACTGAAACTCTGATTGACAAGTCCAAGTCTGTCAAGTCTGTCTTGATGCAATTGTTTGGTGAAAACACTGACGTCGAAGGTATTGACACGCTTAATGCCTGTTACGGTGGTACCAACGCGTTGTTCAACTCTTTGAACTGGATTGAATCTAACGCATGGGATGGTAGAGACGCCATTGTAGTTTGCGGTGATATTGCCATCTACGATAAGGGTGCCGCAAGACCAACCGGTGGTGCCGGTACTGTTGCTATGTGGATCGGTCCTGATGCTCCAATTGTATTTGACTCTGTAAGAGCTTCTTACATGGAACACGCCTACGATTTTTACAAGCCAGATTTCACCAGCGAATATCCTTACGTCGATGGTCATTTTTCATTAACTTGTTACGTCAAGGCTCTTGATCAAGTTTACAAGAGTTATTCCAAGAAGGCTATTTCTAAAGGGTTGGTTAGCGATCCCGCTGGTTCGGATGCTTTGAACGTTTTGAAATATTTCGACTACAACGTTTTCCATGTTCCAACCTGTAAATTGGTCACAAAATCATACGGTAGATTACTATATAACGATTTCAGAGCCAATCCTCAATTGTTCCCAGAAGTTGACGCCGAATTAGCTACTCGCGATTATGACGAATCTTTAACCGATAAGAACATTGAAAAAACTTTTGTTAATGTTGCTAAGCCATTCCACAAAGAGAGAGTTGCCCAATCTTTGATTGTTCCAACAAACACAGGTAACATGTACACCGCATCTGTTTATGCCGCCTTTGCATCTCTATTAAACTATGTTGGATCTGACGACTTACAAGGCAAGCGTGTTGGTTTATTTTCTTACGGTTCCGGTTTAGCTGCATCTCTATATTCTTGCAAAATTGTTGGTGACGTCCAACATATTATCAAGGAATTAGATATTACTAACAAATTAGCCAAGAGAATCACCGAAACTCCAAAGGATTACGAAGCTGCCATCGAATTGAGAGAAAATGCCCATTTGAAGAAGAACTTCAAACCTCAAGGTTCCATTGAGCATTTGCAAAGTGGTGTTTACTACTTGACCAACATCGATGACAAATTTAGAAGATCTTACGATGTTAAAAAATAA(SEQ ID NO:29)。
ATGGTTTTAACCAATAAAACAGTCATTTCTGGATCGAAAGTCAAAAGTTTATCATCTGCGCAATCGAGCTCATCAGGACCTTCATCATCTAGTGAGGAAGATGATTCCCGCGATATTGAAAGCTTGGATAAGAAAATACGTCCTTTAGAAGAATTAGAAGCATTATTAAGTAGTGGAAATACAAAACAATTGAAGAACAAAGAGGTCGCTGCCTTGGTTATTCACGGTAAGTTACCTTTGTACGCTTTGGAGAAAAAATTAGGTGATACTACGAGAGCGGTTGCGGTACGTAGGAAGGCTCTTTCAATTTTGGCAGAAGCTCCTGTATTAGCATCTGATCGTTTACCATATAAAAATTATGACTACGACCGCGTATTTGGCGCTTGTTGTGAAAATGTTATAGGTTACATGCCTTTGCCCGTTGGTGTTATAGGCCCCTTGGTTATCGATGGTACATCTTATCATATACCAATGGCAACTACAGAGGGTTGTTTGGTAGCTTCTGCCATGCGTGGCTGTAAGGCAATCAATGCTGGCGGTGGTGCAACAACTGTTTTAACTAAGGATGGTATGACAAGAGGCCCAGTAGTCCGTTTCCCAACTTTGAAAAGATCTGGTGCCTGTAAGATATGGTTAGACTCAGAAGAGGGACAAAACGCAATTAAAAAAGCTTTTAACTCTACATCAAGATTTGCACGTCTGCAACATATTCAAACTTGTCTAGCAGGAGATTTACTCTTCATGAGATTTAGAACAACTACTGGTGACGCAATGGGTATGAATATGATTTCTAAAGGTGTCGAATACTCATTAAAGCAAATGGTAGAAGAGTATGGCTGGGAAGATATGGAGGTTGTCTCCGTTTCTGGTAACTACTGTACCGACAAAAAACCAGCTGCCATCAACTGGATCGAAGGTCGTGGTAAGAGTGTCGTCGCAGAAGCTACTATTCCTGGTGATGTTGTCAGAAAAGTGTTAAAAAGTGATGTTTCCGCATTGGTTGAGTTGAACATTGCTAAGAATTTGGTTGGATCTGCAATGGCTGGGTCTGTTGGTGGATTTAACGCACATGCAGCTAATTTAGTGACAGCTGTTTTCTTGGCATTAGGACAAGATCCTGCACAAAATGTTGAAAGTTCCAACTGTATAACATTGATGAAAGAAGTGGACGGTGATTTGAGAATTTCCGTATCCATGCCATCCATCGAAGTAGGTACCATCGGTGGTGGTACTGTTCTAGAACCACAAGGTGCCATGTTGGACTTATTAGGTGTAAGAGGCCCGCATGCTACCGCTCCTGGTACCAACGCACGTCAATTAGCAAGAATAGTTGCCTGTGCCGTCTTGGCAGGTGAATTATCCTTATGTGCTGCCCTAGCAGCCGGCCATTTGGTTCAAAGTCATATGACCCACAACAGGAAACCTGCTGAACCAACAAAACCTAACAATTTGGACGCCACTGATATAAATCGTTTGAAAGATGGGTCCGTCACCTGCATTAAATCCTAA(SEQID NO:30)
ATGTCAGAGTTGAGAGCCTTCAGTGCCCCAGGGAAAGCGTTACTAGCTGGTGGATATTTAGTTTTAGATACAAAATATGAAGCATTTGTAGTCGGATTATCGGCAAGAATGCATGCTGTAGCCCATCCTTACGGTTCATTGCAAGGGTCTGATAAGTTTGAAGTGCGTGTGAAAAGTAAACAATTTAAAGATGGGGAGTGGCTGTACCATATAAGTCCTAAAAGTGGCTTCATTCCTGTTTCGATAGGCGGATCTAAGAACCCTTTCATTGAAAAAGTTATCGCTAACGTATTTAGCTACTTTAAACCTAACATGGACGACTACTGCAATAGAAACTTGTTCGTTATTGATATTTTCTCTGATGATGCCTACCATTCTCAGGAGGATAGCGTTACCGAACATCGTGGCAACAGAAGATTGAGTTTTCATTCGCACAGAATTGAAGAAGTTCCCAAAACAGGGCTGGGCTCCTCGGCAGGTTTAGTCACAGTTTTAACTACAGCTTTGGCCTCCTTTTTTGTATCGGACCTGGAAAATAATGTAGACAAATATAGAGAAGTTATTCATAATTTAGCACAAGTTGCTCATTGTCAAGCTCAGGGTAAAATTGGAAGCGGGTTTGATGTAGCGGCGGCAGCATATGGATCTATCAGATATAGAAGATTCCCACCCGCATTAATCTCTAATTTGCCAGATATTGGAAGTGCTACTTACGGCAGTAAACTGGCGCATTTGGTTGATGAAGAAGACTGGAATATTACGATTAAAAGTAACCATTTACCTTCGGGATTAACTTTATGGATGGGCGATATTAAGAATGGTTCAGAAACAGTAAAACTGGTCCAGAAGGTAAAAAATTGGTATGATTCGCATATGCCAGAAAGCTTGAAAATATATACAGAACTCGATCATGCAAATTCTAGATTTATGGATGGACTATCTAAACTAGATCGCTTACACGAGACTCATGACGATTACAGCGATCAGATATTTGAGTCTCTTGAGAGGAATGACTGTACCTGTCAAAAGTATCCTGAAATCACAGAAGTTAGAGATGCAGTTGCCACAATTAGACGTTCCTTTAGAAAAATAACTAAAGAATCTGGTGCCGATATCGAACCTCCCGTACAAACTAGCTTATTGGATGATTGCCAGACCTTAAAAGGAGTTCTTACTTGCTTAATACCTGGTGCTGGTGGTTATGACGCCATTGCAGTGATTACTAAGCAAGATGTTGATCTTAGGGCTCAAACCGCTAATGACAAAAGATTTTCTAAGGTTCAATGGCTGGATGTAACTCAGGCTGACTGGGGTGTTAGGAAAGAAAAAGATCCGGAAACTTATCTTGATAAATAG(SEQ ID NO:31)。
ATGAGTGTGTCTACCGCCAAGAGGTCGCTGGATGTCGTTTCTCCGGGTTCATTAGCGGAGTTTGAGGGTTCAAAATCTCGTCACGATGAAATAGAAAATGAACATAGACGTACTGGTACACGTGATGGCGAGGATAGCGAGCAACCGAAGAAGAAGGGTAGCAAAACTAGCAAAAAGCAAGATTTGGATCCTGAAACTAAGCAGAAGAGGACTGCCCAAAATCGGGCCGCTCAAAGAGCTTTTAGGGAACGTAAGGAGAGGAAGATGAAGGAATTGGAGAAGAAGGTACAAAGTTTAGAGAGTATTCAGCAGCAAAATGAAGTGGAAGCTACTTTTTTGAGGGACCAGTTAATCACTCTGGTGAATGAGTTAAAAAAATATAGACCAGAGACAAGAAATGACTCAAAAGTGCTGGAATATTTAGCAAGGCGAGATCCTAATTTGCATTTTTCAAAAAATAACGTTAACCACAGCAATAGCGAGCCAATTGACACACCCAATGATGACATACAAGAAAATGTTAAACAAAAGATGAATTTCACGTTTCAATATCCGCTTGATAACGACAACGACAACGACAACAGTAAAAATGTGGGGAAACAATTACCTTCACCAAATGATCCAAGTCATTCGGCTCCTATGCCTATAAATCAGACACAAAAGAAATTAAGTGACGCTACAGATTCCTCCAGCGCTACTTTGGATTCCCTTTCAAATAGTAACGATGTTCTTAATAACACACCAAACTCCTCCACTTCGATGGATTGGTTAGATAATGTAATATATACTAACAGGTTTGTGTCAGGTGATGATGGCAGCAATAGTAAAACTAAGAATTTAGACAGTAATATGTTTTCTAATGACTTTAATTTTGAAAACCAATTTGATGAACAAGTTTCGGAGTTTTGTTCGAAAATGAACCAGGTATGTGGAACAAGGCAATGTCCCATTCCCAAGAAACCCATCTCGGCTCTTGATAAAGAAGTTTTCGCGTCATCTTCTATACTAAGTTCAAATTCTCCTGCTTTAACAAATACTTGGGAATCACATTCTAATATTACAGATAATACTCCTGCTAATGTCATTGCTACTGATGCTACTAAATATGAAAATTCCTTCTCCGGTTTTGGCCGACTTGGTTTCGATATGAGTGCCAATCATTACGTCGTGAATGATAATAGCACTGGTAGCACTGATAGCACTGGTAGCACTGGCAATAAGAACAAAAAGAACAATAATAATAGCGATGATGTACTCCCATTCATATCCGAGTCACCGTTTGATATGAACCAAGTTACTAATTTTTTTAGTCCGGGATCTACCGGCATCGGCAATAATGCTGCCTCTAACACCAATCCCAGCCTACTGCAAAGCAGCAAAGAGGATATACCTTTTATCAACGCAAATCTGGCTTTCCCAGACGACAATTCAACTAATATTCAATTACAACCTTTCTCTGAATCTCAATCTCAAAATAAGTTTGACTACGACATGTTTTTTAGAGATTCATCGAAGGAAGGTAACAATTTATTTGGAGAGTTTTTAGAGGATGACGATGATGACAAAAAAGCCGCTAATATGTCAGACGATGAGTCAAGTTTAATCAAGAACCAGTTAATTAACGAAGAACCAGAGCTTCCGAAACAATATCTACAATCGGTACCAGGAAATGAAAGCGAAATCTCACAAAAAAATGGCAGTAGTTTACAGAATGCTGACAAAATCAATAATGGCAATGATAACGATAATGATAATGATGTCGTTCCATCTAAGGAAGGCTCTTTACTAAGGTGTTCGGAAATTTGGGATAGAATAACAACACATCCGAAATACTCAGATATTGATGTCGATGGTTTATGTTCCGAGCTAATGGCAAAGGCAAAATGTTCAGAAAGAGGGGTTGTCATCAATGCAGAAGACGTTCAATTAGCTTTGAATAAGCATATGAACTAA(SEQ ID NO:32)。
ATGGCCGATGAGGAACGTTTAAAGGAGTTTAAAGGGGCAAACAAGATAGTGTTTGATCCAAATACCAGACAAGTATGGGAAAACCAGAATCGAGATGGAACAAAACCAGCAACTACTTTCCAGAGTGAAGAGGTCATAAAAAGAGCTGCCCCAGAATCTGAAAAAGACACCTCCGCCACATCAAGTATTGTTCCAGAGCTATAGAACATTGTGGCAACTGTGACTTTGGGGAGCAGGTTAGATCTGAAAACAGTTGCGCTACATGCCCGTATGCAGAATATAACCCCTAGCGTTTTGCTGCTGTCATCATGCGTATAGAGAGCCAAAAACTACAGCTTTAATTTTTGCCTCAGGGAAAATGGTTGTTACCGGTGCAAAAAGTGAGGATGACTCAAAGCTGGCCAGAAGAATATATGCAGGAATTATCCAAAAAATCAGGTTTGCAGCTAAATTCACAGACTTCAAAATACAAAATATTGTCGGTTCGTGTGACGTTAATTTCCCTATACGTCTAGAAGGGTTAGCATTCAGTCATGGTACTTTCTCCTCCTATGAGCCAGAATTGTTTCCTGGTTTGATCTATAGAATGGTGAAGCCGAAAATTGTGTTGTTAATTTTTGTTTCAGGAAAGATTGTTCTTCTGGAGCAAAGCAAAGGGAGGAAATTTACCAAGCTTTTGAAGCTATATACCCAGTTCTAAGTGAATTTAGAAAAATGTGA(SEQ ID NO:51)
ATGGATTTTGAGGAAGATTACGATGCGGAGTTTGATGATAATCAAGAAGGACAATTAGAAACACCTTTTCCATCGGTTGCGGGAGCCGATGATGGGGACAATGATAATGATGACTCTGTCGCAGAAAACATGAAGAAGAAGCAAAAGAGAGAGGCTGTAGTGGATGATGGGAGTGAAAATGCATTTGGTATACCCGAATTTACAAGAAAAGATAAGACTCTGGAGGAGATTTTAGAGATGATGGACAGTACTCCTCCTATCATTCCCGATGCAGTAATAGACTACTATTTAACCAAAAACGGGTTTAACGTAGCATATGTACAAGTGAAACGACTTTTAGCACTTGCTACTCAGAAATTTGTTAGTGATATAGCTAAGGATGCCTACGAATATTCCAGGATCAGGTCTTCCGTAGCGGTATCTAATGCTAACAACAGTCAGGCGAGAGCTAGGCAGCTATTGCAAGGACAGCGACAGACTGGCGTGCAGCAGATTTCACAACAACAACATCAACAGAATGAGAAGACTACAGCAAGCATAGTTGTTCTGACGGTGAACGATCCCAGTAGCGCTGTTGCTGAATACGGGCTCAATATAGGTCGCCCAGACTTTTATCGTTAG(SEQ ID NO:52)
实施例8新一代工程菌株的构建
根据实施例1~7,将有效果的改造进行叠加组合,如将有效果的敲除基因Ypl062W,Yer130C,Yer134c,Exg1等两两组合进行敲除,结果显示双基因敲除会得到产量更高的菌株。
在此基础上,我们将有效果的改造进行叠加组合,形成新一代的工程菌株,菌株特性如下表4.
表4.新一代工程菌株的特征
注:“√”代表该基因被敲除,"+"代表该基因过表达一个拷贝,"*"代表该基因过表达至少2个拷贝,“-”代表该基因不被操作(即不被敲除或不过表达)
更进一步,发明人通过研究证明,新一代工程菌株J1011-B-37~84具有高产番茄红素的性能。
实施例9新二代工程菌株的构建
在上一代工程菌株的基础上,我们挑选了18个优势菌株,在此基础上构建了新二代的工程菌株探究gapN和EUTE基因对番茄红素产量的影响,菌株特性如下表5.
表5.新二代工程菌株的特征
注:“√”代表该基因被过表达,“-”代表该基因不被过表达
更进一步,发明人通过研究证明,新一代工程菌株J1011-B-85~138具有高产番茄红素的性能。
实施例10工程菌摇瓶培养发酵过程
在本实施例中,发明人详细介绍了实施例1~9所获得的工程菌株的发酵培养过程。
摇瓶发酵采用两级种子培养,将平板上的重组菌株挑到含有5mL YPD培养基的PA瓶中,30度摇床摇起一级种子液,过夜培养(一般14-18h)后,菌体长到对数生长期(OD在5-8左右),再以1%的接种量将菌株转移到含有50mL YPD培养基的250mL摇瓶中,摇瓶培养得到二级种子液。约14-18h后,测二级种子的OD600值,然后计算接种到含有200mL发酵培养基YPDG的500mL摇瓶中,使菌体终浓度OD600=0.5,需要多少的二级种子液,然后取出算出的体积并离心,去掉上清,再用对应的发酵培养基将菌体悬浮并加入相应的500mL摇瓶中,置于30度摇床开始摇瓶发酵。每隔一段时间(约4h)取样测定细胞浓度,并在8h后将摇瓶上的报纸去掉,约48h后开始取样存于-80度冰箱留待测定番茄红素的产生情况。
实施例11产物萃取方式比较
在本实施例中,发明人对发酵处理后所获得的产物进行萃取的方式进行了筛选,筛选过程如下所述。
方法一:从冰箱中取出样品解冻,取500μL发酵液于15mL离心管(冰上预冷)中,5000g 4度离心2min来收集菌体,去上清后再用1mL纯水重悬洗涤菌体,再加入1mL 3N的HCl并沸水浴3min来破碎细胞,离心去掉HCl后用水洗涤一次。再向其中加入1mL的丙酮(HPLC级别),0.2g玻璃珠,1%的抗氧化剂,震荡5min,然后5000g 4度离心2min,转移上清到50mL的离心管中;再次重复加入上述提取液,并震荡,然后收集萃取液,直至菌体无明显黄色;混匀收集到的丙酮萃取液,取出2mL,12000rpm离心10分钟,再取上清1.2mL至棕色的HPLC进样瓶中,进行HPLC分析。
方法二:从冰箱中取出样品解冻,取500μL发酵液于15mL离心管(冰上预冷)中,5000g 4度离心2min来收集菌体,去上清后再用1mL纯水重悬并洗涤菌体。再向其中加入4mL的丙酮(HPLC级别),0.2g玻璃珠,1%的抗氧化剂,震荡5min,然后冰浴超声5-10min,然后5000g 4度离心2min,转移上清到50mL的离心管中;再次重复加入上述提取液,并震荡,然后收集萃取液,直至菌体无明显黄色;混匀收集到的丙酮萃取液,取出2mL,12000rpm离心10分钟,再取上清1.2mL至棕色的HPLC进样瓶中,进行HPLC分析。
检测方法:番茄红素的检测使用四元HPLC进行的,检测器是紫外检测器,番茄红素的吸收波长是474nm,色谱柱Agilent Zorbax C18(150mm*4.6mm*5μm),流动相A(乙腈:水=9:1)和流动相B(甲醇:异丙醇=3:2)按如下条件分析:0-90%B(0-15min),90%B(15-30min),90%-0B(30-35min),流速1mL/min。
结果显示:方法一中产物经盐酸煮过后,番茄红素会降解,产量检测不稳定,且该方法得到的样品间隔一段时间再检测,甚至能从100mg/L降解到10mg/L,方法二得到的样品比较稳定,间隔一段时间再检测,只从100mg/L到90mg/L。说明方法二的提取方案比方法一更稳定更好。
实施例12工程菌发酵罐培养发酵方法比较
在本实施例中,发明人对发酵培养基的条件进行了优化筛选,实验过程如下所述:
本实施例中的菌种采用J1011-B-3,种子培养基采用YPD培养基,发酵培养基采用摇瓶优化过的4种培养基进一步探索发酵罐水平的最优培养基,各种培养基配方如下:
①培养基2号:YPD含盐培养基
2.5L分批培养基:2%蛋白胨,1%酵母提取物,0.8%KH2PO4和2%葡萄糖;
1L葡萄糖补料培养基:500g/L葡萄糖,5g/L MgSO4,3.5g/L K2SO4,0.28g/L Na2SO4,10g/L酵母提取物。
1L乙醇补料培养基:100%乙醇。
②培养基5号:YPD丰富培养基
2.5L分批培养基:60g蛋白胨,30酵母提取物和30g葡萄糖(比YPD更加丰富);
1L补料培养基1:500g/L葡萄糖,15g/L酵母抽提物
500mL补料培养基2:300mL无水乙醇,100ml甘油,100mL纯水。
上罐培养采用fed-batch方式,首先是分批培养,待碳源葡糖糖基本消耗完后开始补料,补料采用两级补料方式,分别为葡萄糖补料阶段(用于合成生物量)和乙醇甘油补料阶段(用于产物合成)。具体方法如下。
将发酵罐装入少量纯水后115度进行空灭30分钟。配制分批培养的发酵液以及补料液,校准发酵罐的pH电极,夹住发酵罐的各个管路,115度灭菌30分钟。取出发酵罐,连接空气管路,进行少量通气(0.1vvm左右即可),同时打开冷却水装置进行冷却。待温度降至50度左右时,打开转速至100rpm。校准溶氧电极。未连接线路的状态设定溶氧值为0%,随后将转速升至600rpm,同时将通气量调至2vvm,连接溶氧电极线路,待溶氧稳定后设定该值为100%。随后将通气量和转速降低至发酵所需值(通气量1.5vvm,转速300rpm-600rpm)。先自然pH,将温度调节至30度。开始接种,初始接种OD调至0.5,所需种子液体积根据公式进行计算。(如发酵液体积为2500mL,种子液OD值为n,则接种种子液体积为2500x0.5/n mL)。开始发酵后,上罐时培养基用2M NaOH来控制pH值为5.5,初始通气量为1.5vvm,初始搅拌速率设置为300rpm,溶氧维持在30%以上(关联搅拌速率,300-600rpm)。
发酵程序:当分批培养时葡萄糖浓度降至2g/L左右时开始补料葡萄糖,初始补料速率为10mL/L发酵液/h,以维持发酵液中葡萄糖的残留浓度在2-3g/L左右(不要降至0g/L),每两个小时取样测量一次OD600值和检测一次葡萄糖含量,当葡萄糖浓度低于1g/L时增加补料速率。当OD值增加缓慢时(开始进入稳定期)停止补料葡萄糖,此时开始监测乙醇残留量,当乙醇浓度降至5-10g/L时开始补料乙醇甘油,初始补料速率为2mL/L发酵液/h。随后每4h取样检测一次乙醇和甘油含量,当调整补料速率使乙醇和甘油维持在5-10g/L范围内。颜色有变化后开始提取产物检测产物变化,当番茄红素浓度不再增加时结束发酵。
产物检测方式与实施例9中方法二相同。
结果显示:培养基5号产量优于培养基2号,所以该培养基为最优培养基,发酵策略是优化的两步补料发酵,先补葡萄糖长菌体,在生长的稳定期补乙醇来提高产量。
实施例13菌株的上罐发酵培养
在本实施例中,发明人按照实施例12中得到的最佳发酵培养方式对构建的部分工程菌株进行了发酵,结果如表6所示。
表6:
可以看出,根据本发明实施例构建的工程菌株具有高产番茄红素的性能。
在本说明书的描述中,参考术语“一个实施例”、“一些实施例”、“示例”、“具体示例”、或“一些示例”等的描述意指结合该实施例或示例描述的具体特征、结构、材料或者特点包含于本发明的至少一个实施例或示例中。在本说明书中,对上述术语的示意性表述不必须针对的是相同的实施例或示例。而且,描述的具体特征、结构、材料或者特点可以在任一个或多个实施例或示例中以合适的方式结合。此外,在不相互矛盾的情况下,本领域的技术人员可以将本说明书中描述的不同实施例或示例以及不同实施例或示例的特征进行结合和组合。
尽管上面已经示出和描述了本发明的实施例,可以理解的是,上述实施例是示例性的,不能理解为对本发明的限制,本领域的普通技术人员在本发明的范围内可以对上述实施例进行变化、修改、替换和变型。
Claims (9)
1.一种微生物,其特征在于,
过表达TmCrtE,PagCrtB和BtCrtI基因;以及
沉默Exg1和Ypl062W基因。
2.根据权利要求1所述的微生物,其特征在于,进一步过表达包括选自tHMG1,INO2,yap1,spt15-5,taf25-3,GapN,PYC2,SMAE1,MDH2,POS5,pntAB,ADH2,ACS6,ALD6,EUTE,ERG12,IDI1,ERG10,MVD1,ERG13,ERG8基因的至少之一。
3.根据权利要求1所述的微生物,其特征在于,进一步沉默包括选自GAL1,GAL7,GAL10,GAL80,ROX1,VBA5,DOS2,Yjl064W,Yer130C,Yer134C,Ynr063W,Yor292C,Sfk1,Mef1基因的至少之一。
4.根据权利要求1所述的微生物,其特征在于,所述微生物是酵母菌。
5.根据权利要求1所述的微生物,其特征在于,进一步包括可操作调控ERG9基因。
6.一种获得番茄红素的方法,其特征在于,包括:
将权利要求1~5任一项所述的微生物进行发酵处理;以及
将发酵处理产物进行萃取处理,以便获得所述番茄红素。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述发酵处理是通过如下方式实现的:
将所述微生物进行基础发酵处理和两级分批补料发酵处理,所述基础发酵处理是在基本发酵培养基中进行的,所述两级分批补料发酵处理是通过在所述基本发酵培养基基础上依次补加第一补料培养基和第二补料培养基实现的,
其中,所述基本发酵培养基为含有24g/L蛋白胨,12g/L酵母提取物和12g/L葡萄糖的YPD培养基;
所述第一补料培养基为含有500g/L葡萄糖和15g/L酵母抽提物的YPD培养基;
所述第二补料培养基为75%乙醇和/或50%甘油。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述萃取处理包括:
将所述发酵处理产物进行匀浆破碎或酶解破碎处理以及有机萃取处理。
9.权利要求1~5任一项所述微生物在制备番茄红素中的用途。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201710464229.4A CN109136119B (zh) | 2017-06-19 | 2017-06-19 | 微生物及其用途 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201710464229.4A CN109136119B (zh) | 2017-06-19 | 2017-06-19 | 微生物及其用途 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN109136119A true CN109136119A (zh) | 2019-01-04 |
CN109136119B CN109136119B (zh) | 2022-05-13 |
Family
ID=64804415
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201710464229.4A Active CN109136119B (zh) | 2017-06-19 | 2017-06-19 | 微生物及其用途 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN109136119B (zh) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN110144300A (zh) * | 2019-05-14 | 2019-08-20 | 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) | 一种重组酵母菌株及其在类胡萝卜素合成中的应用 |
WO2021259383A1 (zh) * | 2020-12-18 | 2021-12-30 | 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) | 一种酿酒酵母调控元件及其在类胡萝卜素合成中的应用 |
CN117126875A (zh) * | 2023-10-20 | 2023-11-28 | 中国农业科学院生物技术研究所 | 一种适用于毕赤酵母的4-异丙基苯甲酸诱导表达系统及诱导表达方法 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20100227370A1 (en) * | 2007-05-04 | 2010-09-09 | Sk Energy Co., Ltd | Method of producing lycopene using recombinant esherichia coli |
CN105779319A (zh) * | 2016-03-23 | 2016-07-20 | 天津大学 | 一种重组酵母菌株及其构建方法和应用 |
-
2017
- 2017-06-19 CN CN201710464229.4A patent/CN109136119B/zh active Active
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20100227370A1 (en) * | 2007-05-04 | 2010-09-09 | Sk Energy Co., Ltd | Method of producing lycopene using recombinant esherichia coli |
CN105779319A (zh) * | 2016-03-23 | 2016-07-20 | 天津大学 | 一种重组酵母菌株及其构建方法和应用 |
Non-Patent Citations (4)
Title |
---|
TRIKKA, FOTINI A. 等: "Iterative carotenogenic screens identify combinations of yeast gene deletions that enhance sclareol production", 《MICROBIAL CELL FACTORIES》 * |
YAN CHEN 等: "Lycopene overproduction in Saccharomyces cerevisiae through combining pathway engineering with host engineering", 《MICROBIAL CELL FACTORIES》 * |
谢碧霞 等: "《绿色食品开发利用》", 31 January 2003, 中国中医药出版社 * |
赵娟娟: "溶剂浸提法和超声法提取番茄红素比较研究", 《江苏农业科学》 * |
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN110144300A (zh) * | 2019-05-14 | 2019-08-20 | 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) | 一种重组酵母菌株及其在类胡萝卜素合成中的应用 |
WO2021259383A1 (zh) * | 2020-12-18 | 2021-12-30 | 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) | 一种酿酒酵母调控元件及其在类胡萝卜素合成中的应用 |
CN117126875A (zh) * | 2023-10-20 | 2023-11-28 | 中国农业科学院生物技术研究所 | 一种适用于毕赤酵母的4-异丙基苯甲酸诱导表达系统及诱导表达方法 |
CN117126875B (zh) * | 2023-10-20 | 2024-02-06 | 中国农业科学院生物技术研究所 | 一种适用于毕赤酵母的4-异丙基苯甲酸诱导表达系统及诱导表达方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN109136119B (zh) | 2022-05-13 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN105420134B (zh) | 一种重组酵母菌株及其构建方法和应用 | |
CN105779319B (zh) | 一种重组酵母菌株及其构建方法和应用 | |
CN104962488B (zh) | 一种重组酵母菌株及其构建方法和应用 | |
CN106566779B (zh) | 一种重组酵母菌株及其构建方法和应用 | |
CN105087406B (zh) | 一种重组酵母菌株及其构建方法和应用 | |
CN105176903B (zh) | 一种积累乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其应用 | |
CN103243066B (zh) | 一种生产番茄红素的菌株及其应用 | |
CN105861538B (zh) | 一种重组质粒及重组酵母菌株及其构建方法和应用 | |
CN103898037B (zh) | 一种联产香叶醇和橙花醇的基因工程菌及其构建方法和应用 | |
CN101531988B (zh) | 碱性果胶酶基因工程菌及其构建方法 | |
CN109136119A (zh) | 微生物及其用途 | |
CN106350476B (zh) | 联产异戊二烯和1,3-丙二醇的基因工程菌及构建方法和应用 | |
CN105143447B (zh) | 具有木糖异构酶活性的蛋白质及其用途 | |
CN112695003B (zh) | 一种高产西柏三烯一醇的基因工程菌及其构建方法与应用 | |
CN105950493B (zh) | 一种工程菌及其构建方法与在制备藏红花酸中的应用 | |
CN107805640A (zh) | 一种提高链霉菌次级代谢产物产量的方法 | |
CN109810999B (zh) | 一种利用微生物发酵生产橙花醇的方法 | |
CN109136120A (zh) | 微生物及其用途 | |
CN104762242B (zh) | 甲羟戊酸的生产菌以及生产甲羟戊酸的方法 | |
CN108138126A (zh) | 一种分枝杆菌基因工程菌及其在制备甾体化合物中的应用 | |
CN105925519A (zh) | 一种在辅酶q10生产菌株sz中降低或消除副产物d的方法、辅酶q10高产菌株及其应用 | |
CN109913508A (zh) | 一种利用蓝藻合成根皮素的方法 | |
CN105779513A (zh) | 利用重组大肠杆菌以甘油为碳源发酵生产琥珀酸的方法 | |
CN116083332A (zh) | 一株产己二酸的重组大肠杆菌的构建及其应用 | |
CN114774297A (zh) | 产t-杜松醇的重组酿酒酵母及其应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |