CN108918571B - 代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用 - Google Patents
代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN108918571B CN108918571B CN201810617332.2A CN201810617332A CN108918571B CN 108918571 B CN108918571 B CN 108918571B CN 201810617332 A CN201810617332 A CN 201810617332A CN 108918571 B CN108918571 B CN 108918571B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- nephrotic syndrome
- marker
- analysis
- progressive
- urine
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N24/00—Investigating or analyzing materials by the use of nuclear magnetic resonance, electron paramagnetic resonance or other spin effects
- G01N24/08—Investigating or analyzing materials by the use of nuclear magnetic resonance, electron paramagnetic resonance or other spin effects by using nuclear magnetic resonance
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N24/00—Investigating or analyzing materials by the use of nuclear magnetic resonance, electron paramagnetic resonance or other spin effects
- G01N24/08—Investigating or analyzing materials by the use of nuclear magnetic resonance, electron paramagnetic resonance or other spin effects by using nuclear magnetic resonance
- G01N24/088—Assessment or manipulation of a chemical or biochemical reaction, e.g. verification whether a chemical reaction occurred or whether a ligand binds to a receptor in drug screening or assessing reaction kinetics
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/34—Genitourinary disorders
- G01N2800/347—Renal failures; Glomerular diseases; Tubulointerstitial diseases, e.g. nephritic syndrome, glomerulonephritis; Renovascular diseases, e.g. renal artery occlusion, nephropathy
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- High Energy & Nuclear Physics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
本发明属于肾病综合征标志物筛选鉴定技术领域,为了解决现有技术不能确定肾病综合征病变进程的缺点,提供了一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用。所述代谢标志物为亮氨酸、2‑羟基丁酸、N‑乙酰‑谷氨酸和甲硫氨酸的组合。所述代谢标志物源于尿液。所述代谢标记物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的用途。通过机体终端产物尿液中内源性生物标志物含量的动态变化过程,筛选可以反映肾病综合征病变进程的生物标志物,为解决现有肾病综合征病变进程尚无评价方法的缺点。最终依据确定的进展性标志物对肾病综合征模型早期病变及病程进行评价。本发明用于动态代谢物鉴定领域,从而针对性的评价肾病综合征的发病进程。
Description
技术领域
本发明属于肾病综合征标志物筛选鉴定技术领域,具体涉及一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用。利用阿霉素肾病模型和NMR技术分析获得的与肾病综合征病变进程相关的进展性标志物及其在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的用途。
背景技术
肾病综合征是由于各种病因导致的肾小球滤过膜通透性发生改变的一个症候群,大量蛋白尿是其主要特点和诱因,且肾病综合征为儿童多发难治性疾病,发病率髙达2~10/100000,为仅次于急性肾小球肾炎的第二大肾脏疾病,严重影响人类健康。
阿霉素诱导的大鼠肾病模型是公认的模拟人类肾脏疾病的动物模型,其临床表现接近肾病综合征的特征。实验中可依据24 h尿蛋白定量判断肾病综合征模型复制成功与否,而肾病的病理类型及病变程度主要依据肾组织病理学检查,不仅主观性强且耗时耗力,目前尚无肾病综合征病变进程动态评价方法,因而需要建立一种整体非入侵、快速、高灵敏度、专属性好的可用于早期肾病诊断以及动态反映疾病的病程的方法。
代谢组学以其不断增加的覆盖范围及其内在的高通量能力在许多领域中得到应用,如疾病诊断和治疗,药物毒性研究,生物标志物发现以及疾病机制探索等。尿液作为肾脏的终端产物,在反映肾脏状态方面具有很大优势,且可以无创伤的获得大量样本。
发明内容
本发明为了解决现有技术不能确定肾病综合征病变进程的缺点,提供了一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用。
本发明由如下技术方案实现的:一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用,所述代谢标志物为亮氨酸、2-羟基丁酸、N-乙酰-谷氨酸和甲硫氨酸的组合。
所述代谢标志物源于尿液。所述代谢标记物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的用途。
所述代谢标记物的筛选方法为:
(1)阿霉素肾病模型的复制与传统评价:将大鼠随机分为空白对照组与阿霉素肾病模型组,阿霉素肾病模型组采用尾静脉注射阿霉素进行诱导,建立阿霉素肾病模型;利用肾组织病理切片与尿蛋白定量水平进行阿霉素肾病模型评价;
(2)差异代谢物的寻找:在不同时间阶段收集各组大鼠的尿液样品,并分装成2份备用;对其中1份尿液进行核磁共振即Nuclear Magnetic Resonance,NMR分析,归属出代谢物;对另1份进行尿蛋白定量测定;核磁图谱转换为数据矩阵,导入到SIMCA-P软件进行差异代谢物寻找;
(3)计算各差异代谢物的变化率,并结合线性回归分析、主成分分析、累计方差贡献率分析、相关分析方法筛选、确定肾病综合征病变进程的进展性标志物;
(4)依据ROC曲线下面积,评估进展性标志物的诊断准确性,进展性标志物的曲线下面积大于0.9的标志物,作为反映肾病综合征病变进程的代谢标志物。
步骤(2)中核磁图谱经处理转换为数据矩阵,导入到SIMCA-P软件进行差异代谢物寻找的具体过程为:对所有图谱以TSP的化学位移δ 0.00定标,进行手动相位、基线调整,以δ 0.01对化学位移δ 0.83-8.48进行积分;其中残余水峰δ 4.68-5.20不积分,以消除残余水峰的影响;积分数据采用面积归一化处理;最终导出积分数据矩阵;
对各不同时期空白对照组与阿霉素肾病模型组尿液代谢轮廓数据进行主成分分析Principal component analysis, PCA、偏最小二乘法判别分析Partial least squarediscriminate analysis, PLS-DA和正交偏最小二乘法判别分析Orthogonal signalcorrection-partial least square discriminate analysis, OPLS-DA,依据S-plot分析中相关系数Coefficient>0.7、VIP>1以及两组间t-test(p<0.05)作为判别条件,寻找差异代谢物。
步骤(3)中具体过程为:以不同时间点为横坐标,以各差异代谢物相对含量的变化率[(M-C)/C]为纵坐标,分别对各差异代谢物进行线性回归分析,选择实验进程中变化趋势一致的差异代谢物,且线性相关系数R2≥0.7作为潜在进展性标志物;以潜在进展性标志物为变量进行PCA,依据各潜在进展性标志物的累计方差贡献率>0.80,筛选出主要的主成分贡献变量,进一步筛选出潜在进展性标志物;以上述潜在进展性标志物和各时间点大鼠尿蛋白定量为变量,通过判别每组数据的数据特征,选择合适的相关分析方法,计算二者的相关系数,确定进展性标志物。
以潜在进展性标志物为变量进行PCA,依据各潜在进展性标志物的累计方差贡献率>0.80,筛选出主要的主成分贡献变量,进一步筛选出潜在进展性标志物;具体过程为:
以在整个实验周期中变化趋势一致的潜在进展性标志物为变量进行PCA,依据各潜在进展性标志物在不同因子上的载荷,选择载荷值>0.80,得出亮氨酸、2-羟基丁酸、鸟氨酸、N-乙酰-谷氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸和马尿酸为主要的主成分贡献变量,可作为潜在进展性标志物。
本发明采用阿霉素大鼠肾病模型模拟肾病综合征,结合1H NMR尿液代谢组学技术与数理统计方法寻找与肾病综合征病变进程相关的潜在进展性标志物,并采用ROC曲线确证该标志物的诊断能力。最终确定了反映肾病综合征进展性病变的代谢标志物,即以亮氨酸、2-羟基丁酸、N-乙酰-谷氨酸和甲硫氨酸这四个进展性标志物的动态变化为依据,用于肾病综合征模型早期病变及病程进行评价。
与传统血清生化指标或肾脏组织病理分析相比,可量化,具有快速、灵敏度高、特异性强且无创伤的特点,能够反映肾病的病变进程。
附图说明
图1为空白组与阿霉素肾病模型组大鼠肾脏组织HE染色;图2为空白组与阿霉素肾病模型组大鼠尿液1H NMR代谢物指纹谱;图3为空白组与阿霉素肾病模型组大鼠尿液PCA散点图;图4为空白组与阿霉素肾病模型组大鼠PLS-DA排列实验图;图5为空白组与阿霉素肾病模型组大鼠尿液OPLS-DA散点图;图6为空白组与阿霉素肾病模型组大鼠尿液S-plot。
具体实施方式
一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用,所述代谢标志物为亮氨酸、2-羟基丁酸、N-乙酰-谷氨酸和甲硫氨酸的组合。所述代谢标志物源于尿液。所述代谢标记物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的用途。
实验材料、仪器:Bruker 600-MHz AVANCE III NMR检测仪(德国布鲁克公司);TGL-16高速台式冷冻离心机(湖南湘仪离心机仪器有限公司);KYJ-3 氮吹仪专用空气源(北京斯珀特科技有限公司);超声波细胞粉碎机(宁波新芝生物科技股份有限公司);Sartorius BSA124S分析天平(德国Sartorius公司)。
实验试剂:三甲基硅烷丙酸钠盐(TSP, Cambridge Isotope Laboratories Inc,MA);阿霉素(注射用盐酸多柔比星,深圳万乐药业股份有限公司,批号:1409E3);NMR试剂重水(Norell, Landisville, USA);分析级甲醇。
实验动物:SPF级雄性SD大鼠,北京维通利华实验动物技术有限公司提供,动物许可证号SCXK (京) 2013-0014;动物饲养室保持温度(23±1.5)℃,相对湿度(45±15)%。
代谢标记物的筛选方法具体步骤如下:
(1)阿霉素肾病模型的复制与传统评价:
A、阿霉素肾病模型的复制:雄性SD大鼠共30只,适应环境一周,收集30只大鼠24 h的尿液,并记录尿液体积。以大鼠的尿蛋白定量和体重为依据进行初筛,去除尿蛋白或体重过高与过低的不合格大鼠,将合格大鼠随机分为空白对照组(C组)与阿霉素肾病模型组(M组),每组10只,实验过程中自由饮水进食;
B、病理组织切片分析:C、M组大鼠于第50天腹腔注射水合氯醛,进行解剖,取出右肾放到10%福尔马林中固定。
具体病理组织切片分析流程:第一步,制片:修取经10%中性福尔马林固定的肾组织,按常规脱水、透明、浸蜡、包埋、切片。第二步,脱水及包埋:取肾组织经自来水冲洗固定液,酒精梯度脱水后(70%、80%、95%Ⅰ、95%Ⅱ、100%Ⅰ、100%Ⅱ),对组织进行透明(二甲苯Ⅰ、二甲苯Ⅱ),浸蜡(石蜡Ⅰ、石蜡Ⅱ)后包埋。第三步,切片:包埋后的组织3~5 µm切片,经60℃烤片后待染色。第四步,染色:HE染色(二甲苯Ⅰ、二甲苯Ⅱ脱蜡、过100%Ⅰ、100%Ⅱ、95%Ⅰ、95%Ⅱ、80%、70%的梯度酒精,苏木素染色、分化、反蓝、伊红染色、过70%、80%、95%Ⅰ、95%Ⅱ、100%Ⅰ、100%Ⅱ梯度酒精)。第五步,透明及封片:二甲苯Ⅰ、二甲苯Ⅱ透明后树胶封片,待镜检。第六步,光镜检查。
C、尿蛋白定量分析:尿蛋白定量测定在模型复制过程中,分别于第0天、第14天、第28天、第42天、第49天早上9:00将C组和M组大鼠分别置于大鼠代谢笼中,于次日早上9:00收集尿液,并记录尿液体积,对收集的尿液样品于4℃,3500 rpm离心15 min后取上清液,分装成2份,每份1 mL,置于-80℃冰箱备用。
采用双辛丁酸(BCA)法进行尿蛋白定量测定,于562 nm测定大鼠24 h尿液吸光度,依据标准曲线计算尿蛋白浓度。通过将尿蛋白浓度(mg/mL)乘以24 h尿体积(mL)来计算24h尿蛋白排泄量(Upro)。
(2)差异代谢物的寻找:
尿液样品的数据采集:将收集的C组和M组尿液样本进行NMR分析。首先将尿液样品于4℃解冻,精密取尿液500 μL置于1.5 mL EP管中,再加入200 μL磷酸缓冲液(含0.01%TSP,0.2 M磷酸缓冲盐,pH =7.4),涡旋混匀10 s,于4℃,13000 r/min离心15 min,于测试前将600 μL上清液转移到5 mm核磁管。
样品于600 MHz 1H NMR(25°C)仪上测定,采用cpmgprld脉冲序列,扫描次数为64,谱宽12 345.7 Hz,脉冲时间14 μs,采样时间2.654 s,延迟时间1.0 s,采样数据点65536,采样间隔40.5 μs, 内标为TSP。
核磁图谱采用MestReNova (version 8.0.1, Mestrelab Research, Santiagode Compostella, Spain) 软件处理。对其中1份尿液进行NMR分析测试,得到C组与M组代谢物指纹图谱(见图2),参照文献(牛倩云等,药学学报,2015,50(6):708-713;张天舒等,中国药科大学学报,2016,47(2):188-198)以及利用HMDB数据库对氨基酸类、有机酸类,胆碱类,胺类化合物以及嘧啶类化合物进行标准品比对,最终归属出43个代谢物。
对所有图谱以TSP的化学位移δ 0.00定标,进行手动相位、基线调整,以δ 0.01对化学位移δ 0.83-8.48进行积分;其中残余水峰(δ 4.68-5.20)不积分,以消除残余水峰的影响;积分数据采用面积归一化处理,最终导出积分数据矩阵。
尿液样品的数据处理:将积分数据矩阵导入SIMCA-P 13.0(Umetrics,Umea,Sweden)软件中。
(a)以C组和M组构建无监督的模式识别主成分分析(PCA),可以反映数据的原始状态,较直观显示不同样品之间的整体差异;
(b)以C组和M组构建偏最小二乘法判别分析(PLS-DA),以排列实验(permutationtest)表征模型是否成功,并用于后续差异代谢物的鉴定;
(c)以C组和M组构建正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA),以及相应的S-plot(coefficient>0.7)结合VIP(>1)寻找对二者分组贡献较大的差异代谢物,进一步通过t-test(p<0.05)确定具有显著性的差异代谢物。
(3)计算各差异代谢物的变化率,并结合线性回归分析、主成分分析、累计方差贡献率分析、相关分析方法筛选、确定肾病综合征病变进程的进展性标志物;
潜在进展性标志物的初筛(各差异代谢物变化率计算):对C组与M组的差异代谢物,以不同时间点(第0天、14天、28天、42天、49天)为横坐标,以差异代谢物相对含量的变化率[(M-C)/C]为纵坐标,分别对各差异代谢物进行线性回归分析,选择实验周期进程中变化趋势一致的差异代谢物,且(线性相关系数R2≥0.7),作为潜在进展性标志物。
潜在进展性标志物的进一步筛选(主成分分析):以上述潜在进展性标志物为变量进行主成分分析,依据各潜在进展性标志物的累计方差贡献率(>0.80),进一步筛选出潜在进展性标志物。
进展性标志物的确定(相关性分析):以上述潜在进展性标志物和各时间点大鼠尿蛋白定量为变量,通过判别每组数据的数据特征,选择合适的相关分析方法,计算二者的相关系数,确定进展性标志物。
(4)依据ROC曲线下面积,评估进展性标志物的诊断准确性,进展性标志物的曲线下面积大于0.9的标志物,作为反映肾病综合征病变进程的代谢标志物。
进展性标志物的诊断能力的评估(ROC分析):依据ROC曲线下面积,评估进展性标志物的诊断准确性,通常认为AUC<0.5为无诊断能力,0.5<AUC<0.7为诊断准确性较低,0.7<AUC<0.9为诊断准确性较好,AUC>0.9为诊断准确性最好。以AUC>0.7的代谢物,最终被认为可作为反映肾病综合征进程的进展性标志物。
模型传统评价结果:由尿蛋白定量分析结果(见表1)可知,与C组比较,M组大鼠造模后尿蛋白定量随时间呈现稳定上升趋势,且于第14天具有显著性差异(p<0.05),表明造模成功。
表1 空白组与阿霉素肾病模型组大鼠尿蛋白定量动态分析
“*”代表与空白对照组相比,*p<0.0
由组织病理切片图分析结果(图1)可知,与C组比较,M组肾小管上皮细胞中至重度水样变性,小管嗜碱性变及蛋白管型多见,成纤维细胞中至重度成纤维细胞增生,间质炎细胞中至重度炎细胞浸润,部分小管上皮细胞萎缩,管腔变大,表明模型复制成功。
差异代谢物的寻找结果:
空白和模型组大鼠血清1H NMR指纹谱代谢物归属:参照文献以及比对标准品,共归属指认出化合物43个(见表2与图2),包括氨基酸(亮氨酸、丙氨酸、谷氨酸、甘氨酸、鸟氨酸等)、有机酸(丁酸类化合物、马尿酸),胆碱类代谢物,胺类化合物以及嘧啶类化合物。
表2 大鼠血清中主要化合物的1H NMR数据归属
δ代表化学位移
对各不同时期C组与M组尿液代谢轮廓数据进行PCA(见图3)、PLS-DA排列实验(见图4)和OPLS-DA(见图5),可以看出,图3中C组与M组二者明显分开,其中PC1=0.336,PC2=0.111,说明模型复制成功。图4中R2=0.603代表能够解释原始变量的60.3%,Q2=0.829代表模型预测能力良好,即R2和Q2所有排列值均小于原始值,且R2和Q2均接近1,说明所建分类模型稳定可靠,可用于后面差异代谢物的寻找。图5因消除与分组变量无关的因素,而获得最大的分离趋势,其模型验证CV-ANOVA参数p=8.71749E-008<0.05,表示模型稳健。相应的S-plot(图6)结合VIP(>1),并经过t-test筛选,找到对分组贡献较大的代谢物。结果显示,与空白对照组相比,阿霉素肾病大鼠尿液中的代谢物亮氨酸、2-羟基异丁酸、丙氨酸、鸟氨酸、N-乙酰谷氨酸、醋酸、N-乙酰糖蛋白、甲硫氨酸、谷氨酰胺以及二甲基甘氨酸含量升高,而丁酸、酮戊二酸、柠檬酸、肉毒碱、氧化三甲胺、尿囊素、苯丙氨酸以及马尿酸含量降低,以这18种代谢物作为差异代谢物。
进展性标志物的筛选结果
潜在进展性标志物的筛选:对C组与M组的差异代谢物,以不同时间点为横坐标,以差异代谢物相对含量的变化率[(M-C)/C]为纵坐标,分别对各差异代谢物进行线性回归分析(见表3),最终得出亮氨酸、2-羟基丁酸、丙氨酸、鸟氨酸、N-乙酰-谷氨酸、N-乙酰糖蛋白、甲硫氨酸、苯丙氨酸和马尿酸9个差异代谢物变异趋势随时间动态变化一致,可作为阿霉素肾病病变进程的潜在进展性标志物。
表3 各差异代谢物随时间动态变化趋势分析
“*”表示与空白对照组相比,*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001
潜在进展性标志物的进一步筛选:
主成分分析:以上述9个潜在进展性标志物做主成分分析,由表4研究结果发现前3个因子的累计方差贡献率为88.593%,大于85%,故提取前3个主成分进行评价。表5得出第一主成分贡献度最显著,其中亮氨酸、2-羟基丁酸、鸟氨酸、N-乙酰-谷氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸和马尿酸这7个代谢物的载荷较高,可作为潜在进展性标志物。
表4 方差贡献表
表5 因子载荷矩阵a
相关性分析:以上述7个潜在进展性标志物和各时间点大鼠尿蛋白定量为变量,通过判别每组数据的数据特征,计算二者的相关系数(见表6),研究结果发现阿霉素肾病模型自第0天尾静脉注射起,大鼠内源性代谢随时间发生不同程度变异,第49天、42天、28天尿蛋白定量与亮氨酸、2-羟基丁酸、N-乙酰-谷氨酸、甲硫氨酸和谷氨酸变异均呈正相关,与苯丙氨酸和马尿酸均呈负相关,相关系数均大于0.7(除苯丙氨酸和马尿酸);且第28天尿蛋白定量几乎与所有代谢物相关性系数最大,且具有统计学差异;从第14天开始,尿蛋白定量与个别代谢物具有相关性可作为成模转折点,称作病变初期;而第0天尿蛋白定量与所有代谢物均无显著相关性(r<0.3,p>0.05);经上述分析得出亮氨酸、2-羟基丁酸、N-乙酰-谷氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸和马尿酸变异趋势随时间变化一致,且与尿液动态尿蛋白定量关系密切,确定为进展性标志物。
表6 潜在进展性标志物与24 h动态尿蛋白定量(24 h Upro)关系
“*”表示与空白对照组相比,*p<0.05,**p<0.01.***p<0.001
进展性标志物的诊断评估结果:采用ROC曲线对进展性标志物的诊断能力进行评估(见表7),最终得出亮氨酸、2-羟基丁酸、N-乙酰-谷氨酸和甲硫氨酸的曲线下面积均大于0.9,可作为进展性标志物,用于肾病综合征模型早期病变及病程的评价。
表7 AUC曲线评估分析
Claims (6)
1.一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用,其特征在于:所述代谢标志物为亮氨酸、2-羟基丁酸、N-乙酰-谷氨酸和甲硫氨酸的组合。
2.根据权利要求1所述的一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用,其特征在于:所述代谢标志物源于尿液。
3.根据权利要求1所述的一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用,其特征在于:所述代谢标记物的筛选方法为:
(1)阿霉素肾病模型的复制与传统评价:将大鼠随机分为空白对照组与阿霉素肾病模型组,阿霉素肾病模型组采用尾静脉注射阿霉素进行诱导,建立阿霉素肾病模型;利用肾组织病理切片与尿蛋白定量水平进行阿霉素肾病模型评价;
(2)差异代谢物的寻找:在不同时间阶段收集各组大鼠的尿液样品,并分装成2份备用;对其中1份尿液进行核磁共振即Nuclear Magnetic Resonance,NMR分析,归属出代谢物;对另1份进行尿蛋白定量测定;核磁图谱转换为数据矩阵,导入到SIMCA-P软件进行差异代谢物寻找;
(3)计算各差异代谢物的变化率,并结合线性回归分析、主成分分析、累计方差贡献率分析、相关分析方法筛选、确定肾病综合征病变进程的进展性标志物;
(4)依据ROC曲线下面积,评估进展性标志物的诊断准确性,进展性标志物的曲线下面积大于0.9的标志物,作为反映肾病综合征病变进程的代谢标志物。
4.根据权利要求3所述的一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用,其特征在于:步骤(2)中核磁图谱经处理转换为数据矩阵,导入到SIMCA-P软件进行差异代谢物寻找的具体过程为:对所有图谱以TSP的化学位移δ 0.00定标,进行手动相位、基线调整,以δ 0.01对化学位移δ 0.83-8.48进行积分;其中残余水峰δ 4.68-5.20不积分,以消除残余水峰的影响;积分数据采用面积归一化处理;最终导出积分数据矩阵;
对各不同时期空白对照组与阿霉素肾病模型组尿液代谢轮廓数据进行主成分分析Principal component analysis, PCA、偏最小二乘法判别分析Partial least squarediscriminate analysis, PLS-DA和正交偏最小二乘法判别分析Orthogonal signalcorrection-partial least square discriminate analysis, OPLS-DA,依据S-plot分析中相关系数Coefficient>0.7、VIP>1以及两组间t-test(p<0.05)作为判别条件,寻找差异代谢物。
5.根据权利要求3所述的一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用,其特征在于:步骤(3)中具体过程为:以不同时间点为横坐标,以各差异代谢物相对含量的变化率[(M-C)/C]为纵坐标,分别对各差异代谢物进行线性回归分析,选择实验进程中变化趋势一致的差异代谢物,且线性相关系数R2≥0.7作为潜在进展性标志物;以潜在进展性标志物为变量进行PCA,依据各潜在进展性标志物的累计方差贡献率>0.80,筛选出主要的主成分贡献变量,进一步筛选出潜在进展性标志物;以上述潜在进展性标志物和各时间点大鼠尿蛋白定量为变量,通过判别每组数据的数据特征,选择合适的相关分析方法,计算二者的相关系数,确定进展性标志物。
6.根据权利要求5所述的一种代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用,其特征在于:以潜在进展性标志物为变量进行PCA,依据各潜在进展性标志物的累计方差贡献率>0.80,筛选出主要的主成分贡献变量,进一步筛选出潜在进展性标志物;具体过程为:
以在整个实验周期中变化趋势一致的潜在进展性标志物为变量进行PCA,依据各潜在进展性标志物在不同因子上的载荷,选择载荷值>0.80,得出亮氨酸、2-羟基丁酸、鸟氨酸、N-乙酰-谷氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸和马尿酸为主要的主成分贡献变量,可作为潜在进展性标志物。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201810617332.2A CN108918571B (zh) | 2018-06-15 | 2018-06-15 | 代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201810617332.2A CN108918571B (zh) | 2018-06-15 | 2018-06-15 | 代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN108918571A CN108918571A (zh) | 2018-11-30 |
CN108918571B true CN108918571B (zh) | 2021-02-02 |
Family
ID=64421675
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201810617332.2A Active CN108918571B (zh) | 2018-06-15 | 2018-06-15 | 代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN108918571B (zh) |
Families Citing this family (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN110286189B (zh) * | 2019-06-13 | 2021-09-28 | 山西大学 | 肾病综合征病变进程相关代谢标志物及其应用 |
CN112305089B (zh) * | 2019-07-26 | 2022-04-29 | 长沙都正生物科技股份有限公司 | 一种慢性肾病诊断生物标记物及其应用 |
CN110887719A (zh) * | 2019-12-20 | 2020-03-17 | 云南中医药大学 | 一种组织病理学的组织样本的处理方法 |
CN111208229B (zh) * | 2020-01-17 | 2021-02-26 | 华中农业大学 | 蛋鸡低骨密度联合诊断血清代谢标志物的筛选方法及其应用 |
CN111413431B (zh) * | 2020-04-17 | 2022-03-01 | 中国药科大学 | 一种药源性急性肾损伤病变进程代谢标志物的筛选方法 |
CN111426766A (zh) * | 2020-04-17 | 2020-07-17 | 中国药科大学 | 一种药源性急性肾损伤小鼠模型的构建及评价方法 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2000014543A1 (fr) * | 1998-09-04 | 2000-03-16 | Maruha Corporation | Procede de detection des maladies du rein et procede de surveillance pathologique |
CN102460160A (zh) * | 2009-06-02 | 2012-05-16 | 比奥克拉泰斯生命科学股份公司 | 用于评估肾脏疾病的新生物标记物 |
CN102901790A (zh) * | 2012-09-21 | 2013-01-30 | 中国人民解放军南京军区南京总医院 | 糖尿病肾病早期诊断的尿液代谢标志物测定方法 |
CN107405381A (zh) * | 2014-12-30 | 2017-11-28 | 罗格斯新泽西州立大学 | 预防和修复急性肾损伤的组合物和方法 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
TR201809571T4 (tr) * | 2013-03-15 | 2018-07-23 | Hoffmann La Roche | Ll-22 polipeptidleri ile ıl-22 fc füzyon proteinleri ve kullanım yöntemleri. |
-
2018
- 2018-06-15 CN CN201810617332.2A patent/CN108918571B/zh active Active
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2000014543A1 (fr) * | 1998-09-04 | 2000-03-16 | Maruha Corporation | Procede de detection des maladies du rein et procede de surveillance pathologique |
CN102460160A (zh) * | 2009-06-02 | 2012-05-16 | 比奥克拉泰斯生命科学股份公司 | 用于评估肾脏疾病的新生物标记物 |
CN102901790A (zh) * | 2012-09-21 | 2013-01-30 | 中国人民解放军南京军区南京总医院 | 糖尿病肾病早期诊断的尿液代谢标志物测定方法 |
CN107405381A (zh) * | 2014-12-30 | 2017-11-28 | 罗格斯新泽西州立大学 | 预防和修复急性肾损伤的组合物和方法 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
基于代谢组学的阿霉素肾病大鼠模型损伤程度评价;张王宁 等;《中草药》;20180131;第49卷(第2期);360-367页 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN108918571A (zh) | 2018-11-30 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN108918571B (zh) | 代谢标志物在制备肾病综合征病变进程诊断鉴别试剂中的应用 | |
CN110286189B (zh) | 肾病综合征病变进程相关代谢标志物及其应用 | |
US8321154B2 (en) | Methods for detecting coronary artery disease | |
JP2019035767A (ja) | 乳癌検出用唾液バイオマーカー、及び、これを用いた乳癌患者を健常者から識別する方法 | |
US8653006B2 (en) | Metabolite biomarkers for the detection of esophageal cancer using NMR | |
EP3577463B1 (en) | Nanoplasmonic quantification of tumor-derived extracellular vesicles in plasma microsamples | |
WO2014063743A1 (en) | Methylglyoxal as a marker of cancer | |
CN103814295A (zh) | 用于评估肾毒性的手段和方法 | |
Boulangé et al. | NMR and MS urinary metabolic phenotyping in kidney diseases is fit-for-purpose in the presence of a protease inhibitor | |
CN103278579B (zh) | 人类肠管无神经节细胞症相关的血浆代谢小分子标志物及其应用 | |
CN109580931A (zh) | 一种α1-微球蛋白检测试剂盒 | |
CN111157563A (zh) | 一种联合型代谢标志物的筛选方法及应用 | |
EP3936870B1 (en) | Method for quantitation of her2 in breast cancer sample by mass spectrometry and scoring of her2 state by using same | |
KR101140646B1 (ko) | HBx 형질전환 마우스 유래의 단백질 마커에 특이적인 항체를 포함하는 간암 진단 및 스크리닝용 키트 및 이를 이용한 간암 진단 및 스크리닝 방법 | |
CN105954518A (zh) | 凝集素芯片在尿蛋白糖链谱分析中的应用 | |
Gu et al. | Analysis of urinary proteomic patterns for diabetic nephropathy by ProteinChip | |
Yang et al. | Predicting diabetic nephropathy by serum proteomic profiling in patients with type 2 diabetes. | |
CN109374904A (zh) | 一种蛋白质类脓毒症标志物及其在严重脓毒症早期预警的应用及其筛选方法 | |
TWI688770B (zh) | 一種檢測糖尿病腎病變的方法 | |
CN108828229A (zh) | 食管癌肿瘤标志物组合及其应用 | |
CN117147737B (zh) | 用于食管鳞癌诊断的血浆组合标志物及试剂盒与检测方法 | |
CN111413431B (zh) | 一种药源性急性肾损伤病变进程代谢标志物的筛选方法 | |
CN116735889B (zh) | 一种用于结直肠癌早期筛查的蛋白质标志物、试剂盒及应用 | |
CN116359272B (zh) | 一种代谢标志物及其在诊断、预测食管癌中的应用 | |
CN111624264B (zh) | 一种用于早期检测移植肾急性排异的代谢组合物、筛选方法及应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |