CN108504752A - 一种与母猪繁殖性状关联的分子标记及应用 - Google Patents

一种与母猪繁殖性状关联的分子标记及应用 Download PDF

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Abstract

本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与母猪繁殖性状关联的分子标记及应用。所述的母猪繁殖性状包括母猪产活仔数、有效活仔数、仔猪初生重变异系数、死胎数和木乃伊胎数性状。该分子标记位于母猪3号染色体上，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，在该序列的261位碱基处有一个等位基因突变(C/G)，该突变导致PCR‑Hpy188III‑RFLP多态性。本发明还公开了该分子标记在母猪繁殖性状特别是在母猪产活仔数、有效活仔数、仔猪初生重变异系数、死胎数和木乃伊胎数性状关联分析中的应用。

Description

一种与母猪繁殖性状关联的分子标记及应用
技术领域
本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与母猪繁殖性状关联的分子标记及应用。所述的母猪繁殖性状包括母猪产活仔数(NBA)、有效活仔数(ENBA)、仔猪初生重变异系数(CV)、死胎数(Stillborn)以及木乃伊胎数(Mummy)。该分子标记位于母猪的3号染色体上。本发明涉及了该分子标记在母猪繁殖性状关联分析中的应用。
背景技术
在养猪业中，母猪的总产仔数、仔猪均匀度、死胎数以及木乃伊胎数等繁殖性状对母猪生产的经济效益具有重要意义，对母猪的繁殖性状不断进行改良提高母猪繁殖性能，在实际生产中显得尤为重要。根据21世纪初部分学者的统计可以发现，随着母猪的产仔数增加1头，经济收益平均将增加100元左右。目前，对母猪繁殖性状的改良重点主要包括总产仔数、产活仔数、有效活仔数和仔猪均匀度等。在2012年，刘小磊等(刘小磊和杨松柏，2012)在大白和大白与长白的杂交母猪中，找到50个与总产仔数、产活仔数显著关联的SNP。Lopes等(Lopes et al，2013)人对乳头数在1550头长白母猪中进行GWAS分析，找到21个显著关联的SNP位点。但是，到目前为止与母猪繁殖性状关联的分子标记相对而言依然十分有限，迫切需要寻找和发现更多与母猪繁殖性状关联的分子标记，为母猪繁殖性状的遗传改良提供理论基础。
在2016年Guo等(Guo et al,2016)的研究发现在大白和长白母猪的3号染色体上存在与总产仔数关联的QTL区域，但具体的分子标记的核苷酸序列未知。因此，申请人猜想3号染色体上可能还有与繁殖性状显著关联的其它区域及SNP分子标记。所以，申请人对3号染色体上的SNP位点进行了分型，对分型成功的SNP位点与母猪繁殖性状进行关联分析，寻找与母猪繁殖性状显著关联的分子标记，以期为母猪繁殖性状的改良工作奠定分子基础和提供理论参考依据。
本发明中涉及的突变位点虽然在SNP数据库中已存在，但其在猪繁殖性状关联分析中的应用并未见报道。本发明检测了该位点在试验猪群中的多态性，并检测了其在母猪产活仔数、有效活仔数、仔猪初生重变异系数、死胎数和木乃伊胎数等性状关联分析中的应用。
发明内容
发明的目的在于克服现有技术的缺陷，获得一种与母猪繁殖性状关联的分子标记。所述的母猪繁殖性状包括母猪的产活仔数、有效活仔数、仔猪初生重变异系数、死胎数以及木乃伊胎数，本发明为母猪繁殖性状检测提供一种新的分子标记和应用。
本发明的技术方案如下：
一种与母猪繁殖性状特别是与母猪的产活仔数、有效活仔数、仔猪初生重变异系数、死胎数和木乃伊胎数性状关联的分子标记，该分子标记的核苷酸序列如下所示：
GTCTGTTCTCTGACCTAGAAGGCAAGCTTAACTCTCCTTTGTGCTAAACTGAAATATTAATAAATATGAGCAACGTATATAAAACAAAATTAGCAATGATAGGAAGTGTTTTAAATTTAAACCCTCAGTGACTAATCTTTAGGGAAAATAACATTTTTCTAAAGAGAGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTGCTTGAAAAAACAAATAGCATTGAGGAGAGTGTCAGGGATGATATTGATGAGTAAACAAATGTAATATYAGGAAGGGCTTTCTAGGCTATGCTGCTTTGGGTTCTATTGTCAAGGTGATGGGAATTTGGAAAGGATTAAAAGAGAATAATAGATTTACATATTTTAAATTTATCTCTCTCAGCAGAATGGAGTGCTGTTA，
上述序列的261位碱基处中Y是C或G，该突变导致PCR-Hpy188III-RFLP多态性。
申请人提供了一种检测上述分子标记的引物对，该引物对的DNA序列如下所示：
正向引物：5’-GTCTGTTCTCTGACCTAGAAGGC-3’
反向引物：5’-TAACAGCACTCCATTCTGCTG-3’。
申请人提供了一种与母猪繁殖性状关联的分子标记的筛选和应用方法，包括下列步骤：
(1)依据NCBI数据库中的SNP信息，在猪的3号染色体上筛选到一个候选SNP位点rs335824784。
(2)提取猪基因组DNA，根据Ensmble 11.1版本公布的参考基因组，在该位点上下游设计引物，用引物对(请见下文)进行PCR扩增，得到392bp的片段的核苷酸序列，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1和图1所示，电泳结果如图3所示，将PCR产物送至武汉擎科生物公司测序，得到如图2所示的结果。应用PCR-RFLP方法对该位点的多态性进行检测，得到如图4所述的结果。
(3)对大白猪的不同基因型与产活仔数、有效活仔数、仔猪初生重变异系数、死胎数以及木乃伊胎数性状的关联分析。
(4)SNP检测方法建立：申请人设计了扩增引物(正向引物：5’-GTCTGTTCTCTGACCTAGAAGGC-3’，反向引物：5’-TAACAGCACTCCATTCTGCTG-3’)，扩增了包含此SNP目标DNA序列。在扩增的392bp的核苷酸序列中，存在一个Hpy188III的酶切位点，电泳检测结果显示在该DNA目标序列的第261个碱基位点(即C/G)存在3种基因型GG基因型(392bp)，CG基因型(392bp、261bp、131bp)，CC基因型(261bp、131bp)。酶切电泳结果证实了靶序列中存在该突变位点的存在。
本发明的分子标记可在猪繁殖性状相关性状标记辅助选择中应用。
本发明的引物对可在猪繁殖性状标记辅助选择中的应用。
更详细的技术方案见《具体实施方式》。
附图说明
序列表SEQ ID NO：1是本发明筛选的分子标记的核苷酸序列，序列长度为392bp,该序列序列的261位碱基处中Y是C或G，该突变导致PCR-Hpy188III-RFLP多态性(SEQ IDNO:1中显示的261位突变位点是突变后的碱基G)。
图1：是利用Ensmble11.1版本参考基因组中设计引物后扩增的DNA序列。该序列就是本发明筛选得到的与母猪繁殖性状关联的分子标记的核苷酸序列。附图标记说明：在图1中，下划线部分是PCR扩增该位点的引物序列。
图2：是图1所示突变位点的测序结果图。
图3：是图1所示突变位点的PCR产物电泳图。附图标记说明：M泳道为DNA分子量标记(DL2000)。扩增产物长度为392bp。
图4：是本发明所示的突变位点rs335824784的Hpy188III-RFLP三种基因型(GG CGCC)电泳结果。附图标记说明：M泳道为DNA分子量标记(DL2000)。
具体实施方式
实施例1测序和PCR‐RFLP诊断方法的建立
(1)引物序列：
正向引物：5’-GTCTGTTCTCTGACCTAGAAGGC-3’
反向引物：5’-TAACAGCACTCCATTCTGCTG-3’
(2)PCR扩增条件
PCR反应总体积为10μl，其中猪基因组DNA约100ng，5μLPCR Mix，正向引物、反向引物各0.2μl。
PCR扩增程序：94℃5min，循环30次94℃30s，60℃30s，然后72℃30s，最后72℃延伸5min。
PCR反应产物用1.5％琼脂糖凝胶电泳检测，得到392bp特异扩增片段，结果如图3所示。将PCR所得序列送至武汉擎科生物公司测序，测序结果如图2所示。测序结果发现该261bp片段存在一个Hpy188III酶切位点，其中第261bp处为多态性位点。
(3)PCR-RFLP检测条件
PCR产物酶切反应体积为10μl，其中1×buffer 2.5μL，PCR产物5μL，限制性内切酶Hpy188III为1μL(5U)，用双蒸水补足至10μL。将样品混匀后离心，37℃水浴2h，用3％琼脂糖凝胶电泳检测酶切结果，记录基因型，在紫外灯下拍照，结果如图4所示。对该位点两个纯合子的测序结果显示，当第261bp位置是G时，则该Hpy188III酶切位点不存在，Hpy188III酶切后检测结果只有1个片段，长度为392bp(定为等位基因G)；但存在G261→C261替换时，其结果导致第261bp处一个Hpy188III酶切位点的产生，得到2个片段，长度分别为261bp和131bp(定为等位基因C)，三种基因型为GG、GC、CC。
实施例2本发明的分子标记在经产猪产活仔数标记性状关联分析中的应用
本实施例关联分析所用的实验猪群来自我国南方某猪场的大白猪群体，包括811头母猪，其中丹系大白猪为547头，美系大白猪为264头。繁殖性状取自猪场2016-2017年的繁殖记录资料，记录母猪繁殖性状包括产活仔数(NBA)、有效产仔数(ENBA)、仔猪初生重变异系数(CV)、死胎数(Stillborn)和木乃伊胎数(Mummy)等。
根据采集样本的繁殖记录信息和群体结构，申请人运用混合线性模型来统计分析SNP位点rs335824784的基因型效应及其与产活仔数的关系。
采用SAS软件对该突变位点的多态性进行性状分析，具体模型如下：
大白猪：Yijklm＝μ+genei+parityj+sow_linek+mate_seasonl+eijklm+TNB
丹系大白猪：Yijlm＝μ+genei+parityj+mate_seasonl+eijlm+TNB
在上述模型中：Y为性状值，μ为总体均数，其中固定效应包括：基因型效应genei，胎次效应parityj，品系效应sow_linek；随机效应包括：配种季节效应mate_seasonl；e为随机误差；TNB为协变量。
对位点rs335824784的多态性在大白猪经产群体中进行性状关联分析，该突变位点分型654头母猪，包括317个CC基因型的母猪，产仔807窝；296个CG基因型的母猪，产仔753窝；41个GG基因型的母猪，产仔110窝。运用关联分析方法，发现该SNP与大白经产母猪(3胎及以上)的产活仔数有极显著关联(P<0.01)，其中GG和CG基因型母猪的产活仔数显著高于CC基因型母猪。结果见表1。
表1 位点rs335824784与大白经产母猪(3胎及以上)产活仔数的关联分析结果
注：表1中的基因型差值是各基因型的表型均值差，P<0.05代表有显著性差异，P<0.01代表有极显著差异。
实施例3本发明的分子标记在经产猪有效活仔数标记性状关联分析中的应用
本实施例关联分析所用的实验猪群来自我国南方某猪场的大白猪群体，包括811头母猪，其中丹系大白猪547头，美系大白猪264头。繁殖性状取自该猪场2016-2017年的繁殖记录资料，记录母猪繁殖性状包括产活仔数(NBA)、有效产仔数(ENBA)、仔猪初生重变异系数(CV)、死胎数和木乃伊胎数等。
根据采集样本的繁殖记录信息和群体结构，申请人运用混合线性模型来统计分析SNP位点rs335824784的基因型效应及其与有效活仔数的关系。
采用SAS软件对该突变位点的多态性进行性状分析，具体模型如下：
大白猪：Yijklm＝μ+genei+parityj+sow_linek+mate_seasonl+eijklm+TNB
丹系大白猪：Yijlm＝μ+genei+parityj+mate_seasonl+eijlm+TNB
在上述模型中：Y为性状值，μ为总体均数，其中固定效应包括：基因型效应genei，胎次效应parityj，品系效应sow_linek；随机效应包括：配种季节效应mate_seasonl；e为随机误差；TNB为协变量。
对位点rs335824784的多态性在大白猪经产群体中进行性状关联分析，该突变位点分型654头母猪，包括317个CC基因型的母猪，产仔807窝；296个CG基因型的母猪，产仔753窝；41个GG基因型的母猪，产仔110窝。运用关联分析方法，发现此SNP与大白经产母猪(3胎及以上)的有效活仔数有显著关联(P<0.05)，其中GG基因型母猪的有效活仔数均显著高于CC基因型母猪。结果见表2。
表2 位点rs335824784与大白经产母猪(3胎及以上)有效活仔数的关联分析结果
注：表2中的基因型差值是各基因型的表型均值差，P<0.05代表有显著性差异，P<0.01代表有极显著差异。
实施例4本发明的分子标记在经产猪的仔猪初生重变异系数标记性状关联分析中的应用
本实施例关联分析所用的实验猪群来自我国南方某猪场的大白猪群体，包括654头母猪，其中丹系大白猪396头，美系大白猪258头。繁殖性状取自该猪场2016-2017年的繁殖记录资料，记录母猪繁殖性状包括产活仔数(NBA)、有效产仔数(ENBA)、仔猪初生重变异系数(CV)、死胎数和木乃伊胎数等。
根据采集样本的繁殖记录信息和群体结构，申请人运用混合线性模型来统计分析SNP位点rs335824784的基因型效应及其与仔猪初生重变异系数(CV)的关系。
采用SAS软件对该突变位点的多态性进行性状分析，具体模型如下：
大白猪：Yijklm＝μ+genei+parityj+mate_seasonk+eijkl
在上述模型中：Y为性状值，μ为总体均数，其中固定效应包括：基因型效应genei，胎次效应parityj；随机效应包括：配种季节效应mate_seasonl；e随机误差。
对位点rs335824784的多态性在丹系大白猪经产群体中进行性状关联分析，该突变位点分型258头母猪，包括103个CC基因型的母猪，产仔122窝；137个CG基因型的母猪，产仔177窝；18个GG基因型的母猪，产仔26窝。运用关联分析方法，发现此SNP与丹系大白经产母猪(3胎及以上)的仔猪初生重均匀度有极显著关联(P<0.01)，其中GG基因型母猪的仔猪初生重均匀度显著小于CC和CG基因型母猪。结果见表3。
表3 位点rs335824784与丹系大白经产母猪(3胎及以上)仔猪初生重变异系数的关联分析
注：表3中的基因型差值是各基因型的表型均值差，P<0.05代表有显著性差异，P<0.01代表有极显著差异。
实施例5本发明的分子标记在经产猪死胎数标记性状关联分析中的应用
本实施例关联分析所用的实验猪群来自我国南方某猪场的大白猪群体，包括654头母猪，其中丹系大白猪396头，美系大白猪258头。繁殖性状取自猪场2016-2017年的繁殖记录资料，记录母猪繁殖性状包括产活仔数(NBA)、有效产仔数(ENBA)、仔猪初生重变异系数(CV)、死胎数和木乃伊胎数等。
根据采集样本的繁殖记录信息和群体结构，申请人运用混合线性模型来统计分析SNP位点rs335824784的基因型效应及其与死胎数的关系。
采用SAS软件对该突变位点的多态性进行性状分析，具体模型如下：
大白猪：Yijklm＝μ+genei+parityj+sow_linek+mate_seasonl+eijklm+TNB
丹系大白猪：Yijlm＝μ+genei+parityj+mate_seasonl+eijlm+TNB
其中：Y为性状值，μ为总体均数，其中固定效应包括：基因型效应genei，胎次效应parityj，品系效应sow_linek；随机效应包括：配种季节效应mate_seasonl；e为随机误差；TNB为协变量。
对位点rs335824784的多态性在大白猪经产群体中进行性状关联分析，该突变位点分型654头母猪，包括317个CC基因型的母猪，产仔807窝；296个CG基因型的母猪，产仔753窝；41个GG基因型的母猪，产仔110窝。运用关联分析方法，发现此SNP与大白经产母猪(3胎及以上)的产死胎数有极显著关联(P<0.01)，其中GG和CG基因型母猪的产死胎数显著低于CC基因型母猪。结果见表4。
表4 位点rs335824784与大白经产母猪(3胎及以上)死胎数的关联分析结果
注：表4中的基因型差值是各基因型的表型均值差，P<0.05代表有显著性差异，P<0.01代表有极显著差异。
实施例6本发明的分子标记在经产猪木乃伊胎数标记性状关联分析中的应用
本实施例关联分析所用的实验猪群来自我国南方某猪场的大白猪群体，包括654头母猪，其中丹系大白猪396头，美系大白猪258头。繁殖性状取自猪场2016-2017年的繁殖记录资料，记录母猪繁殖性状包括产活仔数(NBA)、有效产仔数(ENBA)、仔猪初生重变异系数(CV)、死胎数和木乃伊胎数等。
根据采集样本的繁殖记录信息和群体结构，申请人运用混合线性模型来统计分析SNP位点rs335824784的基因型效应及其与木乃伊胎数的关系。
采用SAS软件对该突变位点的多态性进行性状分析，具体模型如下：
大白猪：Yijklm＝μ+genei+parityj+sow_linek+mate_seasonl+eijklm+TNB
丹系大白猪：Yijlm＝μ+genei+parityj+mate_seasonl+eijlm+TNB
其中：Y为性状值，μ为总体均数，其中固定效应包括：基因型效应genei，胎次效应parityj，品系效应sow_linek；随机效应包括：配种季节效应mate_seasonl；e为随机误差；TNB为协变量。
对位点rs335824784的多态性在大白猪经产群体中进行性状关联分析(结果见表5)。
表5 位点rs335824784与大白经产母猪(3胎及以上)的木乃伊胎数的关联分析结果
注：表5中的基因型差值是各基因型的表型均值差，P<0.05代表有显著性差异，P<0.01代表有极显著差异。
该突变位点分型654头母猪，包括317个CC基因型的母猪，产仔807窝；296个CG基因型的母猪，产仔753窝；41个GG基因型的母猪，产仔110窝。运用关联分析方法，发现此SNP与大白经产母猪(3胎及以上)的产木乃伊胎数有显著关联(P<0.05)，其中GG和CG基因型母猪的产死胎数显著低于CC基因型母猪。
序列表
<110> 华中农业大学
<120> 一种与母猪繁殖性状关联的分子标记
<141> 2018-06-25
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 392
<212> DNA
<213> 猪(Sus scrofa)
<220>
<221> gene
<222> (1)..(392)
<400> 1
gtctgttctc tgacctagaa ggcaagctta actctccttt gtgctaaact gaaatattaa 60
taaatatgag caacgtatat aaaacaaaat tagcaatgat aggaagtgtt ttaaatttaa 120
accctcagtg actaatcttt agggaaaata acatttttct aaagagaggg tttttttttt 180
ttttttttta gtgcttgaaa aaacaaatag cattgaggag agtgtcaggg atgatattga 240
tgagtaaaca aatgtaatat gaggaagggc tttctaggct atgctgcttt gggttctatt 300
gtcaaggtga tgggaatttg gaaaggatta aaagagaata atagatttac atattttaaa 360
tttatctctc tcagcagaat ggagtgctgt ta 392
<210> 2
<211> 23
<212> DNA
<213> 猪(Sus scrofa)
<220>
<221> primer_bind
<222> (1)..(23)
<400> 2
gtctgttctc tgacctagaa ggc 23
<210> 3
<211> 21
<212> DNA
<213> 猪(Sus scrofa)
<220>
<221> primer_bind
<222> (1)..(21)
<400> 3
taacagcact ccattctgct g 21

Claims (4)

1.突变位点rs335824784的一种分子标记PCR-Hpy188III-RFLP在母猪繁殖性状标记关联分析中的应用，其特征在于，所述的分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.一种检测如序列表SEQ ID NO:1所示序列的突变位点rs335824784的PCR-Hpy188III-RFLP的分子标记的引物对，其DNA序列如下所示：
正向引物：GTCTGTTCTCTGACCTAGAAGGC，
反向引物：TAACAGCACTCCATTCTGCTG。
3.权利要求2所述引物对在母猪繁殖性状标记关联分析中的应用。
4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述的母猪繁殖性状包括母猪产活仔数、有效活仔数、仔猪初生重变异系数、死胎数和木乃伊胎数性状。
CN201810672815.2A 2018-06-26 2018-06-26 一种与母猪繁殖性状关联的分子标记及应用 Active CN108504752B (zh)

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Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111041107A (zh) * 2020-01-01 2020-04-21 华中农业大学 一种与猪胎间距性状相关的snp分子标记
CN111139306A (zh) * 2020-03-09 2020-05-12 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 与猪繁殖性状相关的分子标记及其组合应用
CN113736889A (zh) * 2021-07-30 2021-12-03 华南农业大学 一种猪7号染色体上与猪死胎数、活仔率相关的snp分子标记及其用途
CN114214431A (zh) * 2021-12-21 2022-03-22 华中农业大学 一种分子标记在猪繁殖性状关联分析中的应用
CN114292927A (zh) * 2022-03-11 2022-04-08 佛山科学技术学院 与母猪产仔均匀度相关的分子标记及其获得方法和应用
CN114292928A (zh) * 2022-03-11 2022-04-08 佛山科学技术学院 一种与母猪繁殖性状有关的分子标记及筛选方法和应用
CN114717329A (zh) * 2022-03-25 2022-07-08 华中农业大学 与母猪产死胎性状相关的snp分子标记及其应用
CN114736975A (zh) * 2022-05-24 2022-07-12 广西扬翔股份有限公司 与母猪产仔数性状相关的snp分子标记及其应用

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1568370A (zh) * 2001-01-16 2005-01-19 根瑟特公司 用d－氨基酸氧化酶和d－天冬氨酸氧化酶拮抗剂治疗中枢神经系统障碍
CN102080081A (zh) * 2010-11-19 2011-06-01 华南农业大学 与母猪产仔数相关的snp标记及其应用
CN103421768A (zh) * 2012-07-02 2013-12-04 华中农业大学 一种与猪初生重性状相关的分子标记及应用
CN107022604A (zh) * 2016-07-12 2017-08-08 华中农业大学 猪ntf3启动子区snp作为公猪繁殖性状分子标记与应用
KR101855665B1 (ko) * 2016-11-10 2018-05-09 대한민국 돼지의 이유두수 예측용 snp 마커 및 이를 이용한 이유두수 예측방법

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1568370A (zh) * 2001-01-16 2005-01-19 根瑟特公司 用d－氨基酸氧化酶和d－天冬氨酸氧化酶拮抗剂治疗中枢神经系统障碍
CN102080081A (zh) * 2010-11-19 2011-06-01 华南农业大学 与母猪产仔数相关的snp标记及其应用
CN103421768A (zh) * 2012-07-02 2013-12-04 华中农业大学 一种与猪初生重性状相关的分子标记及应用
CN107022604A (zh) * 2016-07-12 2017-08-08 华中农业大学 猪ntf3启动子区snp作为公猪繁殖性状分子标记与应用
KR101855665B1 (ko) * 2016-11-10 2018-05-09 대한민국 돼지의 이유두수 예측용 snp 마커 및 이를 이용한 이유두수 예측방법

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
DBSNP: ""rs335824784"", 《ENSEMBL》 *
YING WANG等: ""Molecular characterization of thyroid peroxidase gene in porcine(sus scrofa)"", 《JOURNAL OF GENETICS AND GENOMICS》 *
王围围等: ""猪3号染色体上与产仔性状和窝内仔猪初生重整齐度显著关联的标记鉴定"", 《中国畜牧兽医》 *
王源: "猪繁殖性状全基因组关联分析及拷贝数变异检测"", 《中国博士学位论文全文数据库 农业科技辑》 *

Cited By (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111041107A (zh) * 2020-01-01 2020-04-21 华中农业大学 一种与猪胎间距性状相关的snp分子标记
CN111139306B (zh) * 2020-03-09 2022-12-09 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 与猪繁殖性状相关的分子标记及其组合应用
CN111139306A (zh) * 2020-03-09 2020-05-12 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 与猪繁殖性状相关的分子标记及其组合应用
CN113736889A (zh) * 2021-07-30 2021-12-03 华南农业大学 一种猪7号染色体上与猪死胎数、活仔率相关的snp分子标记及其用途
CN113736889B (zh) * 2021-07-30 2023-07-11 华南农业大学 一种猪7号染色体上与猪死胎数、活仔率相关的snp分子标记及其用途
CN114214431A (zh) * 2021-12-21 2022-03-22 华中农业大学 一种分子标记在猪繁殖性状关联分析中的应用
CN114292927B (zh) * 2022-03-11 2022-05-13 佛山科学技术学院 与母猪产仔均匀度相关的分子标记及其获得方法和应用
CN114292928A (zh) * 2022-03-11 2022-04-08 佛山科学技术学院 一种与母猪繁殖性状有关的分子标记及筛选方法和应用
CN114292927A (zh) * 2022-03-11 2022-04-08 佛山科学技术学院 与母猪产仔均匀度相关的分子标记及其获得方法和应用
CN114717329A (zh) * 2022-03-25 2022-07-08 华中农业大学 与母猪产死胎性状相关的snp分子标记及其应用
CN114717329B (zh) * 2022-03-25 2023-09-01 华中农业大学 与母猪产死胎性状相关的snp分子标记及其应用
CN114736975A (zh) * 2022-05-24 2022-07-12 广西扬翔股份有限公司 与母猪产仔数性状相关的snp分子标记及其应用
CN114736975B (zh) * 2022-05-24 2023-09-26 广西扬翔股份有限公司 与母猪产仔数性状相关的snp分子标记及其应用

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