具体实施方式
下面结合附图和具体的实施例对本发明的技术方案做进一步介绍。
本实施例是一种共同表达hsa-miR-301a模拟物或阻遏物,和表达CD19-CAR的基于pFIV载体的pFIV-miR-301a-CD19CAR系统构建方法,其步骤为:
(1)查找miRBase数据中hsa-miR-301a(Accession ID:MIMAT0000688)的序列,通过设计优化并合成hsa-miR-301a的模拟物和阻遏物;其中pre-miR-301a促进hsa-miR-301a表达升高,sponge-miR-301a抑制hsa-miR-301a表达,其设计优化基因序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2。
(2)合成的hsa-miR-301a的模拟物(阻遏物)两条单链的磷酸化和退火延伸,反应体系为:hsa-miR-301a的模拟物(阻遏物)单链1,hsa-miR-301a的模拟物(阻遏物)单链2,T4PolynucleotideKinase,10mM ATP。反应条件为:37℃30分钟,95℃2分钟,放置室温。
(3)BamHI和EcoRI酶切pFIV质粒,使用Qiagen PCRpurification试剂盒纯化线性质粒,T4DNA连接酶将hsa-miR-301a的模拟物(阻遏物)与线性pFIV质粒连接,并转化大肠杆菌感受态DH5α,提取质粒。
(4)设计合成由EF1α驱动的CD19-CAR,主要包括:CD19的单链抗体可变区scFv基因片段序列,CD8来源的连接和穿膜片段序列,传递信号的效应分子CD3ζ序列和胞内信号分子CD28和4-1BB片段序列组成,其设计优化基因序列如SEQ ID NO.3。使用XbaI和SalI从pUC57质粒上切下CD19-CAR,并经T4DNA连接酶连接到含有has-miR-301a的模拟物(阻遏物)的pFIV载体上,转化大肠杆菌感受态DH5α,提取质粒。
(5)构建后的基因时序图如图1所示,采用质粒载体引物进行PCR和测序验证连接序列的正确性;其中hsa-miR-301a模拟物或阻遏物测序引物序列为:5’-TGTCTTTGGATTTGGGAATCTTAT-3’;CD19-CAR测序引物为:5’-ATTTATTGTATCTGTGGGAGCCTC-3’。
(6)使用转染试剂lipofectamine3000,共转染质粒pFIV-miR-301a-CD19CAR和FIV慢病毒包装质粒(pFIV-34N和pVSV-G质粒)于293T细胞,收集293T细胞上清,并制备慢病毒颗粒,感染Jurkat细胞。
(7)慢病毒感染Jurkat细胞48小时后,收集细胞,提取RNA,采用荧光定量PCR检测miR-301a表达;收集细胞,清洗后,myc-tag荧光抗体标记,流式细胞技术检测myc-tag标签来显示CD19-CAR在细胞膜的表达水平。
实验证明基因序列与所设计合成的基因序列(图1)完全一致;图2是插入后挑选阳性克隆进行PCR鉴定图;图3为测序验证的hsa-miR-301a的模拟物(阻遏物)基因序列;图4是测序验证的CD19-CAR的基因序列;图5为本发明转染Jurkat细胞后,miR-301a表达的验证图;图6为本发明转染Jurkat细胞后,CD19-CAR表达的验证图。
实验中,引物、寡核苷酸和全基因序列合成由广州天一辉远基因科技有限公司合成;各种限制性内切酶、T4Polynucleotide Kinase和T4DNA连接酶均购自NEB公司;质粒提取和PCR纯化试剂盒购自Qiagen;转染试剂lipofectamine3000和RPIM1640培养基购自Invitrogen公司;RNA抽提试剂盒和hsa-miR-301a Taqman荧光定量PCR试剂盒购自ThermoFisher;myc-tag荧光抗体购自Cell SignalingTechnology公司。
序列表
<110> 马晓冬
<120> 一种整合microRNA和CAR功能的载体构建方法
<141> 2017-11-28
<160> 4
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 98
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
gatccgactg ctaacgaatg ctctgacttt attgcactac tgtactttac agctagcagt 60
gcaatagtat tgtcaaagca tctgaaagca ggtttttg 98
<210> 2
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
gatccgcttt gacaatcggt tgcactgaat tgctttgaca atcggttgca ctgg 54
<210> 3
<211> 8892
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
catatgccaa gtacgccccc tattgacgtc aatgacggta aatggcccgc ctggcattat 60
gcccagtaca tgaccttatg ggactttcct acttggcagt acatctacgt attagtcatc 120
gctattacca tggtgatgcg gttttggcag tacatcaatg ggcgtggata gcggtttgac 180
tcacggggat ttccaagtct ccaccccatt gacgtcaatg ggagtttgtt ttggcaccaa 240
aatcaacggg actttccaaa atgtcgtaac aactccgccc cattgacgca aatgggcggt 300
aggcgtgtac ggtgggaggt ctatataagc agagcttgtg aaacttcgag gagtctcttt 360
gttgaggact tttgagttct cccttgaggc tcccacagat acaataaata tttgagattg 420
aaccctgtcg agtatctgtg taatcttttt tacctgtgag gtctcggaat ccgggccgag 480
aacttcgcag ttggcgcccg aacagggact tgattgagag tgattgagga agtgaagcta 540
gagcaataga aagctgttaa gcagaactcc tgctgaccta aatagggaag cagtagcaga 600
cgctgctaac agtgagtatc tctagtgaag cagactcgag ctcataatca agtcattgtt 660
taaaggccca gataaattac atctggtgac tcttcgcgga ccttcaagcc aggagattcg 720
ccgagggaca gtcaacaagg taggagagat tctacagcaa catggggaat ggacaggggc 780
gagattggaa aatggccatt aagagatgta gtaatgttgc tgtaggagta ggggggaaga 840
gtaaaaaatt tggagaaggg aatttcagat gggccattag aatggctaat gtatctacag 900
gacgagaacc tggtgatata ccagagactt tagatcaact aaggttggtt atttgcgatt 960
tacaagaaag aagagaaaaa tttggatcta gcaaagaaat tgatatggca attcctgcat 1020
tgaggagaaa tggtaggcaa tgtggcatgt ctgaaaaaga ggaggaatga tgaagtatct 1080
cagacttatt ttataaggga gatactgtgc tgagttcttc cctttgagga aggtatgtca 1140
tatcctagac atagtctcaa ttttaaaaga agaggtagga taggagggat ggccccttat 1200
gaattattag cacaacaaga atccttaaga atacaagatt atttttctgc aataccacaa 1260
aaattgcaag cacagtggat ttattataaa gatcaaaaag ataagaaatg gaaaggacca 1320
atgagagtag aatactgggg acagggatca gtattattaa aggatgaaga gaagggatat 1380
tttcttataa tcggtactag tgctccggtg cccgtcagtg ggcagagcgc acatcgccca 1440
cagtccccga gaagttgggg ggaggggtcg gcaattgaac cggtgcctag agaaggtggc 1500
gcggggtaaa ctgggaaagt gatgtcgtgt actggctccg cctttttccc gagggtgggg 1560
gagaaccgta tataagtgca gtagtcgccg tgaacgttct ttttcgcaac gggtttgccg 1620
ccagaacaca ggtaagtgcc gtgtgtggtt cccgcgggcc tggcctcttt acgggttatg 1680
gcccttgcgt gccttgaatt acttccacgc ccctggctgc agtacgtgat tcttgatccc 1740
gagcttcggg ttggaagtgg gtgggagagt tcgaggcctt gcgcttaagg agccccttcg 1800
cctcgtctgc ttgagttgag gcctggcttg ggcgctgggg ccgccgcgtg cgaatctggt 1860
ggcaccttcg cgcctgtctc gctgctttcg ataagtctct agccatttaa aatttttgat 1920
gacctgctgc gacgcttttt ttctggcaag atagtcttgt aaatgcgggc caagatctgc 1980
acactggtat ttcggttttt ggggccgcgg gcggcgacgg ggcccgtgcg tcccagcgca 2040
catgttcggc gaggcggggc ctgcgagcgc ggccaccgag aatcggacgg gggtagtctc 2100
aagctggccg gcctgctctg gtgcctggcc tcgcgccgcc gtgtatcgcc ccgccctggg 2160
cggcaaggct ggcccggtcg gcaccagttg cgtgagcgga aagatggccg cttcccggcc 2220
ctgctgcagg gagctcaaaa tggaggacgc ggcgctcggg agagcgggcg ggtgagtcac 2280
ccacacaaag gaaaagggcc tttccgtcct cagccgtcgc ttcatgtgac tccacggagt 2340
accgggcgcc gtccaggcac ctcgattagt tctcgagctt ttggagtacg tcgtctttag 2400
gttgggggga ggggttttat gcgatggagt ttccccacac tgagtgggtg gagactgaag 2460
ttaggccagc ttggcacttg atgtaattct ccttggaatt tgcccttttt gagtttggat 2520
cttggttcat tctcaagcct cagacagtgg ttcaaagttt ttttcttcca tttcaggtgt 2580
cgtgatctag agccaccatg ctgctgctgg tcacttctct gctgctgtgc gaactgcccc 2640
accccgcctt tctgctgatt cccgacatcc agatgacaca gactacatcc tccctgtctg 2700
cctctctggg agacagagtc accatcagtt gcagggcaag tcaggacatt agtaaatatt 2760
taaattggta tcagcagaaa ccagatggaa ctgttaaact cctgatctac catacatcaa 2820
gattacactc aggagtccca tcaaggttca gtggcagtgg gtctggaaca gattattctc 2880
tcaccattag caacctggag caagaagata ttgccactta cttttgccaa cagggtaata 2940
cgcttccgta cacgttcgga ggggggacca agctggagat cacaggtggc ggtggctcgg 3000
gcggtggtgg gtcgggtggc ggcggatctg aggtgaaact gcaggagtca ggacctggcc 3060
tggtggcgcc ctcacagagc ctgtccgtca catgcactgt ctcaggggtc tcattacccg 3120
actatggtgt aagctggatt cgccagcctc cacgaaaggg tctggagtgg ctgggagtaa 3180
tatggggtag tgaaaccaca tactataatt cagctctcaa atccagactg accatcatca 3240
aggacaactc caagagccaa gttttcttaa aaatgaacag tctgcaaact gatgacacag 3300
ccatttacta ctgtgccaaa cattattact acggtggtag ctatgctatg gactactggg 3360
gccaaggaac ctcagtcacc gtctcctcag aacagaaact gatttccgag gaagatctgt 3420
tcgtccccgt gttcctgcct gccaagccaa caactacccc tgctccacga ccacctactc 3480
cagcacctac catcgcaagt cagcccctgt cactgcgacc tgaggcttgc cggccagcag 3540
ctggaggagc agtgcacacc cgaggcctgg acttcgcatg cgatatctac atttgggcac 3600
cactggctgg aacctgtggg gtcctgctgc tgagcctggt catcaccctg tattgtaacc 3660
acagaaatag gagcaaacgc tcccgactgc tgcattccga ctacatgaac atgacacctc 3720
ggagaccagg ccccactaga aagcattacc agccatatgc cccacccagg gatttcgcag 3780
cctatcggag ccggttcagc gtcgtgaaaa gggggcgcaa gaaactgctg tacatcttca 3840
agcagccttt tatgcgccca gtgcagacaa ctcaggagga agacggatgc tcttgtcggt 3900
tcccagagga ggaggaagga ggctgcgagc tgagagtgaa gttcagccgg agcgccgatg 3960
caccagcata tcagcaggga cagaatcagc tgtacaacga gctgaatctg ggcaggcgcg 4020
aggaatatga cgtgctggat aagcgacgag gacgggaccc cgaaatggga ggaaaaccca 4080
gaaggaagaa ccctcaggag gggctgtata atgaactgca gaaagacaag atggctgagg 4140
catacagcga aattggaatg aaaggagagc gccgacgggg gaagggacac gatgggctgt 4200
accagggact gtcaaccgcc actaaagata cctacgacgc actgcacatg caggctctgc 4260
ccccaagaga attcgaagga tccgcggccg ctgagggcag aggaagtctt ctaacatgcg 4320
gtgacgtgga ggagaatccc ggcccttccg ggatgaccga gtacaagccc acggtgcgcc 4380
tcgccacccg cgacgacgtc cccagggccg tacgcaccct cgccgccgcg ttcgccgact 4440
accccgccac gcgccacacc gtcgatccgg accgccacat cgagcgggtc accgagctgc 4500
aagaactctt cctcacgcgc gtcgggctcg acatcggcaa ggtgtgggtc gcggacgacg 4560
gcgccgcggt ggcggtctgg accacgccgg agagcgtcga agcgggggcg gtgttcgccg 4620
agatcggccc gcgcatggcc gagttgagcg gttcccggct ggccgcgcag caacagatgg 4680
aaggcctcct ggcgccgcac cggcccaagg agcccgcgtg gttcctggcc accgtcggcg 4740
tctcgcccga ccaccagggc aagggtctgg gcagcgccgt cgtgctcccc ggagtggagg 4800
cggccgagcg cgccggggtg cccgccttcc tggagacctc cgcgccccgc aacctcccct 4860
tctacgagcg gctcggcttc accgtcaccg ccgacgtcga ggtgcccgaa ggaccgcgca 4920
cctggtgcat gacccgcaag cccggtgcct gaatctaggt cgacaatcaa cctctggatt 4980
acaaaatttg tgaaagattg actggtattc ttaactatgt tgctcctttt acgctatgtg 5040
gatacgctgc tttaatgcct ttgtatcatg ctattgcttc ccgtatggct ttcattttct 5100
cctccttgta taaatcctgg ttgctgtctc tttatgagga gttgtggccc gttgtcaggc 5160
aacgtggcgt ggtgtgcact gtgtttgctg acgcaacccc cactggttgg ggcattgcca 5220
ccacctgtca gctcctttcc gggactttcg ctttccccct ccctattgcc acggcggaac 5280
tcatcgccgc ctgccttgcc cgctgctgga caggggctcg gctgttgggc actgacaatt 5340
ccgtggtgtt gtcggggaaa tcatcgtcct ttccttggct gctcgcctgt gttgccacct 5400
ggattctgcg cgggacgtcc ttctgctacg tcccttcggc cctcaatcca gcggaccttc 5460
cttcccgcgg cctgctgccg gctctgcggc ctcttccgcg tctccgcctt cgccctcaga 5520
cgagtcggat ctccctttgg gccgcctccc cgcctggtac cgatgacaga gttagaagat 5580
cgcttcagga agctatttgg cacgacttct acaacgggag acagcacagt agattctgaa 5640
gatgaacctc ctaaaaaaga aaaaagggtg gactgggatg agtattggaa ccctgaaatc 5700
gatgaacgct gacgtcatca acccgctcca aggaatcgcg ggcccagtgt cactaggcgg 5760
gaacacccag cgcgcgtgcg ccctggcagg aagatggctg tgagggacag gggagtggcg 5820
ccctgcaata tttgcatgtc gctatgtgtt ctgggaaatc accataaacg tgaaatgtct 5880
ttggatttgg gaatcttata agttctgtat gagaccactt ggatccgata tcagatctca 5940
attgaagctt ttttgaattc tagcgtccat aagcattctt tctttcgata gcttccagtg 6000
ctttgtgaaa cttcgaggag tctctttgtt gaggactttt gagttctccc ttgaggctcc 6060
cacagataca ataaatattt gagattgaac cctgtcgagt atctgtgtaa tcttttttac 6120
ctgtgaggtc tcggaatccg ggccgagaac ttcgcagcga gctcattgta ccgcgaactt 6180
gtttattgca gcttataatg gttacaaata aagcaatagc atcacaaatt tcacaaataa 6240
agcatttttt tcactgcatt ctagttgtgg tttgtccaaa ctcatcaatg tatcttatca 6300
tgtctggctc tagctatccc gcccctaact ccgcccagtt ccgcccattc tccgccccat 6360
ggctgactaa ttttttttat ttatgcagag gccgaggccg cctcggcctc tgagctattc 6420
cagaagtagt gaggaggctt ttttggaggc ctagactttt gcagagacgg cccaaattcg 6480
taatcatggt catagctgtt tcctgtgtga aattgttatc cgctcacaat tccacacaac 6540
atacgagccg gaagcataaa gtgtaaagcc tggggtgcct aatgagtgag ctaactcaca 6600
ttaattgcgt tgcgctcact gcccgctttc cagtcgggaa acctgtcgtg ccagctgcat 6660
taatgaatcg gccaacgcgc ggggagaggc ggtttgcgta ttgggcgctc ttccgcttcc 6720
tcgctcactg actcgctgcg ctcggtcgtt cggctgcggc gagcggtatc agctcactca 6780
aaggcggtaa tacggttatc cacagaatca ggggataacg caggaaagaa catgtgagca 6840
aaaggccagc aaaaggccag gaaccgtaaa aaggccgcgt tgctggcgtt tttccatagg 6900
ctccgccccc ctgacgagca tcacaaaaat cgacgctcaa gtcagaggtg gcgaaacccg 6960
acaggactat aaagatacca ggcgtttccc cctggaagct ccctcgtgcg ctctcctgtt 7020
ccgaccctgc cgcttaccgg atacctgtcc gcctttctcc cttcgggaag cgtggcgctt 7080
tctcatagct cacgctgtag gtatctcagt tcggtgtagg tcgttcgctc caagctgggc 7140
tgtgtgcacg aaccccccgt tcagcccgac cgctgcgcct tatccggtaa ctatcgtctt 7200
gagtccaacc cggtaagaca cgacttatcg ccactggcag cagccactgg taacaggatt 7260
agcagagcga ggtatgtagg cggtgctaca gagttcttga agtggtggcc taactacggc 7320
tacactagaa ggacagtatt tggtatctgc gctctgctga agccagttac cttcggaaaa 7380
agagttggta gctcttgatc cggcaaacaa accaccgctg gtagcggtgg tttttttgtt 7440
tgcaagcagc agattacgcg cagaaaaaaa ggatctcaag aagatccttt gatcttttct 7500
acggggtctg acgctcagtg gaacgaaaac tcacgttaag ggattttggt catgagatta 7560
tcaaaaagga tcttcaccta gatcctttta aattaaaaat gaagttttaa atcaatctaa 7620
agtatatatg agtaaacttg gtctgacagt taccaatgct taatcagtga ggcacctatc 7680
tcagcgatct gtctatttcg ttcatccata gttgcctgac tccccgtcgt gtagataact 7740
acgatacggg agggcttacc atctggcccc agtgctgcaa tgataccgcg agacccacgc 7800
tcaccggctc cagatttatc agcaataaac cagccagccg gaagggccga gcgcagaagt 7860
ggtcctgcaa ctttatccgc ctccatccag tctattaatt gttgccggga agctagagta 7920
agtagttcgc cagttaatag tttgcgcaac gttgttgcca ttgctacagg catcgtggtg 7980
tcacgctcgt cgtttggtat ggcttcattc agctccggtt cccaacgatc aaggcgagtt 8040
acatgatccc ccatgttgtg caaaaaagcg gttagctcct tcggtcctcc gatcgttgtc 8100
agaagtaagt tggccgcagt gttatcactc atggttatgg cagcactgca taattctctt 8160
actgtcatgc catccgtaag atgcttttct gtgactggtg agtactcaac caagtcattc 8220
tgagaatagt gtatgcggcg accgagttgc tcttgcccgg cgtcaatacg ggataatacc 8280
gcgccacata gcagaacttt aaaagtgctc atcattggaa aacgttcttc ggggcgaaaa 8340
ctctcaagga tcttaccgct gttgagatcc agttcgatgt aacccactcg tgcacccaac 8400
tgatcttcag catcttttac tttcaccagc gtttctgggt gagcaaaaac aggaaggcaa 8460
aatgccgcaa aaaagggaat aagggcgaca cggaaatgtt gaatactcat actcttcctt 8520
tttcaatatt attgaagcat ttatcagggt tattgtctca tgagcggata catatttgaa 8580
tgtatttaga aaaataaaca aataggggtt ccgcgcacat ttccccgaaa agtgccacct 8640
gacgtctaag aaaccattat tatcatgaca ttaacctata aaaataggcg tatcacgagg 8700
ccctttcgtc tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg 8760
gagacggtca cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg 8820
tcagcgggtg ttggcgggtg tcggggctgg cttaactatg cggcatcaga gcagattgta 8880
ctgagagtgc ac 8892
<210> 4
<211> 285
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
aggttcagtg gcagtgggtc tggaacagat tattctctca ccattagcaa cctggagcaa 60
gaagatattg ccacttactt ttgccaacag ggtaatacgc ttccgtacac gttcggaggg 120
gggaccaagc tggagatcac aggtggcggt ggctcgggcg gtggtgggtc gggtggcggc 180
ggatctgagg tgaaactgca ggagtcagga cctggcctgg tggcgccctc acagagcctg 240
tccgtcacat gcactgtctc aggggtctca ttacccgact atggt 285