CN107841469A - 一种表达猪小肠抗菌肽pf1基因的重组乳酸克鲁维酵母及构建方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母的构建方法,包括以下步骤:首先按乳酸克鲁维酵母密码子优化合成的猪小肠抗菌肽PF1基因;将猪小肠抗菌肽PF1基因与乳酸克鲁维酵母质粒pKLAC2同时双酶切反应、琼脂糖凝胶电泳回收,并进行4℃过夜连接,将连接产物转化大肠杆菌JM109,提重组质粒PF1‑pKLAC2;使用限制性内切酶SacII线性化处理重组质粒;再将线性化重组质粒转化乳酸克鲁维酵母GG799,得到重组乳酸克鲁维酵母PF1‑pKLAC2‑GG799。本发明使用乳酸克鲁维酵母对猪小肠抗菌肽PF1进行表达,同时表达产物分泌胞外,降低了后续的分离纯化成本。
Description
技术领域
本发明涉及一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母及构建方法。
背景技术
抗菌肽是一种小分子短肽,具有广谱抗菌性, 一般由小于 60 个氨基酸残基组成,由于分子量小,因此可以在水中溶解,高温下不易分解, 抗菌肽是在诱导条件下,动物免疫系统产生的一类防御性肽类物质,是免疫防御系统的重要组成部分。
PF1最早是科研人员从猪小肠中发现的,是 Cathelicidin 抗菌肽家庭中富含精氨酸和脯氨酸的线状抗菌肽,分子量约为 9KDa,主要含 42 个脯氨酸残基和 15个苯丙氨酸残基,是一种高抗菌活性,相对稳定的抗菌肽。
发明内容
本发明其目的就在于提供一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母及构建方法,使用乳酸克鲁维酵母对猪小肠抗菌肽 PF1进行表达,同时表达产物分泌胞外,降低了后续的分离纯化成本。
为实现上述目的而采取的技术方案是,
一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母,所述重组乳酸克鲁维酵母为PF1-pKLAC2-GG799。
一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母的构建方法,包括如下步骤:
(1)按乳酸克鲁维酵母密码子优化合成猪小肠抗菌肽PF1基因;
(2)将猪小肠抗菌肽PF1基因与乳酸克鲁维酵母质粒pKLAC2同时双酶切反应、琼脂糖凝胶电泳回收,并进行4℃过夜连接,将连接产物转化大肠杆菌JM109,提重组质粒PF1-pKLAC2;
(3)使用限制性内切酶SacII线性化处理重组质粒;
(4)线性化重组质粒转化乳酸克鲁维酵母 GG799,构建重组乳酸克鲁维酵母PF1-pKLAC2-GG799。
有益效果
与现有技术相比本发明具有以下优点。
本发明的优点是使用乳酸克鲁维酵母对猪小肠抗菌肽PF1进行表达,同时表达产物分泌胞外,降低了后续的分离纯化成本,因此具有更广阔的应用前景。
附图说明
以下结合附图对本发明作进一步详述。
图1为猪小肠抗菌肽 PF1 基因与 pKLAC2 质粒连接的阳性转化子 PCR 鉴定电泳图(引物 PF1-F 和 PF1-R,产物约 267bp);
图2为乳酸克鲁维酵母 GG799 表达 PF1 的 SDS-PAGE 图(蛋白大小在 9KD 左右);
图3为 pKLAC2 质粒图谱;
图4为 pKLAC2 质粒的多克隆位点图谱。
具体实施方式
一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母,所述重组乳酸克鲁维酵母为PF1-pKLAC2-GG799。
所述基因的乳酸克鲁维酵母质粒pKLAC2。
所述质粒的乳酸克鲁维酵母为GG799。
一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母的构建方法,如图1-4所示,包括如下步骤:
(1)按乳酸克鲁维酵母密码子优化合成猪小肠抗菌肽PF1基因;
(2)将猪小肠抗菌肽PF1基因与乳酸克鲁维酵母质粒pKLAC2同时双酶切反应、琼脂糖凝胶电泳回收,并进行4℃过夜连接,将连接产物转化大肠杆菌JM109,提重组质粒PF1-pKLAC2;
(3)使用限制性内切酶SacII线性化处理重组质粒;
(4)线性化重组质粒转化乳酸克鲁维酵母 GG799,构建重组乳酸克鲁维酵母PF1-pKLAC2-GG799。
实施例 1
PF1基因的获得
抗菌肽PF1的氨基酸序列为:
AFPPPNVPGPRFPPPNFPGPRFPPPNFPGPRFPPPNFPGPRFPPPNFPGPPFPPPIFPGPWFPPPPPFRPPPFGPPRFP
按乳酸克鲁维酵母密码子偏好性优化,两端分别添加酶切位点 NcoI 和EcoRI及酶切位点保护性碱基, 并在上游添加 6 个组氨酸的核苷酸序列,优化好的序列为:
CATGCCATGGCATCATCATCATCATCATGCTTTCCCACCACCAAACGTTCCAGGTCCAAGATTTCCACCACCAAATTTTCCAGGTCCAAGATTCCCACCACCTAACTTCCCAGGTCCAAGATTCCCTCCACCAAACTTCCCAGGTCCTAGATTCCCACCTCCAAACTTCCCTGGTCCACCATTTCCACCACCTATTTTTCCAGGTCCTTGGTTTCCACCACCACCACCTTTCAGACCACCACCATTTGGTCCACCAAGATTCCCAGAATTCGC
合成序列后放-20℃备用。
实施例 2
重组质粒 PF1- pKLAC2 的构建
合成的包含NcoI和EcoRI酶切位点的基因和 pKLAC2 质粒分别进行NcoI和EcoRI的双酶切反应,琼脂糖凝胶回收酶切产物,T4 连接酶进行4℃过夜连接反应,连接产物转化大肠杆菌 JM109 大肠杆菌感受态细胞,转化子经菌落 PCR 鉴定后测序,PCR 鉴定引物为:
PF1-F:CCATGGCATCATCATCATCATCAT;
PF1-R:GAATTCTGGGAATCTTGGTGGACC
实施例 3
重组乳酸克鲁维酵母 PF1- pKLAC2-GG799 的构建
使用 SacII 对重组质粒 PF1- pKLAC2 进行酶切线性化,酶切反应体系为:SacII 2uL,PF1-pKLAC2 重组质粒34uL,10× H buffer 4 uL,共 40 uL,于 37℃温箱反应3h,酶切完成后,回收线性化质粒,转化乳酸克鲁维酵母 GG799 感受态细胞,乳酸克鲁维酵母GG799 感受态细胞过程及转化步骤如下:
1.1、于 YPD 平板上划线分离乳酸克鲁维酵母 GG799,30℃培养 48-64h;
1.2、挑取乳酸克鲁维酵母 GG799 单菌落接种于 50 mL YPD 液体培养基,250rpm ,30℃过夜培养种子液;
1.3、取 50uL 过夜培养的种子液,接种于 100 mL YPD 液体培养基,250rpm,30℃培养至 OD600=0.8-1.0;
1.4 、4℃ 4000rpm 离心 5min,收集菌体,用预冷的无菌水 25 mL 缓慢重悬;
1.5 、4℃ 4000rpm 离心 5min,收集菌体, 加 1mL 100mM 的氯化锂,转入1.5mL EP管中,12000rpm 离心 30sec;
1.6、用 400ul 100mM 氯化锂缓慢重悬菌体,50uL/管分装;
1.7、取一管新鲜制备的感受态细胞,依次加入 50% PEG3350 240uL、1M 氯化锂 36ul、2mg/mL 单链鲑鱼精 DNA 25uL、10ug/50uL 线性化质粒,剧烈涡旋;
1.8、30℃培养 30min,再于 42℃培养 20min;
1.9、4℃ 4000rpm 收集菌体,用 1mL YPD 液体培养基缓慢重悬菌体,30℃,120rpm培养4h;
1.10 、4℃ 4000rpm 收集菌体,用 1mL 无菌水缓慢重悬,涂布于添加5mM乙酰胺的YCB 平板,30℃静置3-5天。
使用酵母基因组提取试剂盒提取疑似阳性转化子的基因组,以该基因组为模板进行 PCR 扩增鉴定,从而筛选出阳性转化子。
实施例 4
重组抗菌肽 PF1 的表达
于YPD平板上划线分离重组乳酸克鲁维酵母PF1- pKLAC2-GG799,30℃培养48-64h,挑取乳酸克鲁维酵母GG799单菌落接种于10 mL YPD 液体培养基,250rpm ,30℃过夜培养种子液,取 5mL 过夜培养的种子液,接种于 500 mL YPG 液体培养基(1%酵母提取物;2%蛋白胨;2%半乳糖) ,250rpm,30℃培养 48h,5000rpm
离心10min,所得上清液进行蛋白纯化和 SDS-PAGE。
实施例 5
重组抗菌肽 PF1 的纯化
1、饱和硫酸铵沉淀培养基上清中的 PF1
培养完成的菌液最大转速离心 30min,弃菌体沉淀,将等体积的饱和硫酸铵溶液(4.1mol/L,25℃)边搅拌边慢慢加入,加完放磁力搅拌器上 4℃搅拌过夜,使蛋白充分沉淀。10000rpm 4 ℃离心 30min ,弃上清保留沉淀,将沉淀溶于少量(10-20mL)PBS-0.2g/L叠氮钠中,使沉淀溶解,再使用透析袋 4℃透析 48h,每隔 6 小时更
换透析缓冲液,以彻底去除硫酸铵。
2、重组抗菌肽 PF1 蛋白镍柱纯化
相关试剂如下:
母液 1:29.22g 氯化钠,2.42gTris-Base,ddH2O定溶至1L,调节pH=8.0。
母液2:6.06gTris-Base,ddH2O定溶至 1L,调节 pH=8.0
Binding buffer:0.1702g 咪唑,溶于 500 mL 母液 1。
Elution buffer:17.02g 咪唑,溶于 500 mL 母液 1。
Washing buffer: 2.3828g 咪唑,溶于 500 mL 母液 2。
先用 Binding buffer 平衡镍离子亲和层析柱,然后将待纯化的样品上样于镍柱,结合 30min 左右,收集留出液 Flow Through,用 Washing buffer 洗 3 个柱体积,收集 Wash throngh,最后用 Elution buffer 洗脱蛋白,收集 Eluent.将 Binding buffer,Wash throngh,Eluent。将镍柱收集的蛋白用 Milipore 压力超滤浓缩装置通过 30kDa 超滤膜截留浓缩至10mL左右,将样品通过 Gel filtration buffer 平衡过的 Superdex200分子筛进行分离。
实施例 6
重组抗菌肽 PF1 的 Tricine-SDS-PAGE
1、相关试剂的配制
1.1、 AB-3 浓缩胶:9.6g丙烯酰胺,0.3g甲叉双丙烯酰胺,溶于20ml水;AB-6分离胶:9.3g 丙烯酰胺,0.6g甲叉双丙烯酰胺, 溶于20ml水;凝胶缓冲液:2.422g Tris,0.02gSDS,溶于 20ml 水,pH=8.45。
1.2、15%分离胶(Separating gel)
成分 体积(mL)
ddH2O 7.5
AB-6 5
凝胶缓冲液 1
甘油 1.5
10%过硫酸铵 0.05
TEMED 0.005
总体积 15
1.3、10%浓缩胶(Spacer gel)
成分 体积(mL)
ddH2O 1.1
AB-3 0.6
凝胶缓冲液 1
甘油 0.3
10%过硫酸铵 0.015
TEMED 0.0015
总体积 3
1.4、4%浓缩胶(Stacking gel)
成分 体积(mL)
ddH2O 4
AB-3 0.5
凝胶缓冲液 1.5
10%过硫酸铵 0.045
TEMED 0.0045
总体积 6
1.5、考马斯亮蓝染色液:称取 1.0g 考马斯亮蓝 R-250,加入 50ml 冰醋酸、25ml无水乙醇和 425mlddH2O,搅拌溶解后过滤;
1.6、考马斯亮蓝脱色液:50ml 冰醋酸、25ml 无水乙醇,用 ddH2O 定容至 500ml;
2、纯化抗菌肽 PF1 的 Tricine-SDS-PAGE
将纯化的重组抗菌肽 PF1 中添加 SDS-PAGE loading buffer,沸水浴 15min,以蛋白质标准分子量为参考, 在 Tricine-SDS-PAGE 蛋白胶上电泳,由15% Separating gel,10%Spacer gel,4% Stacking gel灌制三层的 Tricine-SDS-PAGE蛋白胶, 插入 1mm 胶梳,室温下凝固。制备完成后拔下胶梳,立即将胶板固定于电泳装置上,电泳槽内加入电泳缓冲液,排尽凝胶底部玻璃板间的气泡, 每孔加样 20μL,接通电源,进入分离胶之前 30V,之后100 V,在跑至分离胶底部之前调至200V,电泳完成后取下凝胶,考马斯亮蓝染色液中染色过夜,过夜染色完成后,使用考马斯亮蓝脱色液进行脱色,每 30 分钟换脱色液,直到看到清晰的条带为止,结果如图 2 所示。
Claims (4)
1.一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母,其特征在于,所述重组乳酸克鲁维酵母为PF1-pKLAC2-GG799。
2.根据权利要求1所述的一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母,其特征在于,包含权利要求 1 所述基因的乳酸克鲁维酵母质粒pKLAC2。
3.根据权利要求1所述的一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母,其特征在于,包含权利要求 2 所述质粒的乳酸克鲁维酵母为GG799。
4.根据权利要求1所述的一种表达猪小肠抗菌肽PF1基因的重组乳酸克鲁维酵母的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
按乳酸克鲁维酵母密码子优化合成猪小肠抗菌肽PF1基因;
将猪小肠抗菌肽PF1基因与乳酸克鲁维酵母质粒pKLAC2同时双酶切反应、琼脂糖凝胶电泳回收,并进行4℃过夜连接,将连接产物转化大肠杆菌JM109,提重组质粒PF1-pKLAC2;
使用限制性内切酶SacII线性化处理重组质粒;
线性化重组质粒转化乳酸克鲁维酵母 GG799,构建重组乳酸克鲁维酵母PF1-pKLAC2-GG799。
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