CN107475410A - 一种检测α‑地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒 - Google Patents

一种检测α‑地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒 Download PDF

Info

Publication number
CN107475410A
CN107475410A CN201710847405.2A CN201710847405A CN107475410A CN 107475410 A CN107475410 A CN 107475410A CN 201710847405 A CN201710847405 A CN 201710847405A CN 107475410 A CN107475410 A CN 107475410A
Authority
CN
China
Prior art keywords
dna
artificial sequence
chip
thalassemia
kit
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201710847405.2A
Other languages
English (en)
Other versions
CN107475410B (zh
Inventor
沈亦平
张淑杰
覃海松
何升
陈碧艳
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Guangxi Maternal and Child Health Hospital
Original Assignee
Guangxi Maternal and Child Health Hospital
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Guangxi Maternal and Child Health Hospital filed Critical Guangxi Maternal and Child Health Hospital
Priority to CN201710847405.2A priority Critical patent/CN107475410B/zh
Publication of CN107475410A publication Critical patent/CN107475410A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN107475410B publication Critical patent/CN107475410B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6834Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
    • C12Q1/6837Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase using probe arrays or probe chips
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C40COMBINATORIAL TECHNOLOGY
    • C40BCOMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
    • C40B40/00Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
    • C40B40/04Libraries containing only organic compounds
    • C40B40/06Libraries containing nucleotides or polynucleotides, or derivatives thereof

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明涉及一种检测α‑地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒,所述基因芯片包括固相载体和固定在该固相载体上的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1~195所示的核苷酸序列;所述使用方法包括如下步骤:(1)制备样品DNA片段;(2)荧光标记上述DNA片段;(3)纯化上述gDNA标记产物;(4)将gDNA标记产物与所述基因芯片杂交;(5)洗涤杂交的基因芯片,扫描芯片杂交信号;本发明还涉及包含前述基因芯片的试剂盒。本发明的基因芯片操作步骤简单、检测特异性高、稳定性好,从样本抽提到获得扫描结果可在两天内完成,成本低,适用于α‑地中海贫血患者缺失或重复突变检测及产前诊断。

Description

一种检测α-地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒
技术领域
本发明涉及一种生物技术领域,具体涉及用于检测α-地中海贫血的基因芯片及使用方法、试剂盒。
背景技术
基因芯片(Gene chip)又称DNA芯片(DNA CHIP)、DNA阵列(DNA arrays)、寡核苷酸微芯片(oligonucleotide micro-chip),是指将许多特定的寡核苷酸片段或基因片段作为探针,有规律地排列固定于支持物上,然后与待测的标记样品的基因按碱基配对原理进行杂交,再通过检测系统等对芯片进行扫描,并配以计算机系统对杂交信号的强度进行分析和处理,从而迅速得出所要的信息。目前,基因芯片技术正逐渐应用到生命科学各个领域中。
地中海贫血( thalassemia),即珠蛋白生成障碍性贫血,又称海洋性贫血,是由于珠蛋白基因发生缺陷,致使珠蛋白链合成减少或缺如,从而导致的一组遗传性溶血性疾病,是一组严重威胁健康的致残、致死性遗传血液病。临床表现根据病情严重程度不同而有所差异,患者主要以溶血性贫血、黄疸、肝脾肿大为主要临床特征。根据珠蛋白肽链合成受到抑制的类型,可分为α-地中海贫血、β-地中海贫血、γ-地中海贫血、δ-地中海贫血、δβ-地中海贫血和、εγδβ-地中海贫血等,其中α-地中海贫血最常见。中国南方地区人群中α-地中海贫血基因携带者检出率为2-18%,其中广西人群携带率最高,为17.55%。此病目前缺乏有效治疗手段,应用相应分析检测技术通过人群筛查及产前诊断阻止重症患儿出生是国内外公认的首选预防措施。
α-地中海贫血主要由α-珠蛋白基因发生缺失所引起,并且缺失范围具有很大的异质性,可以是仅涉及2个α-基因附近的几千个碱基对的缺失,更多的是包含2个α-基因在内的涉及几万到几十万碱基对的缺失,甚至整个α-珠蛋白基因簇的丢失。此外,还有只包含α-基因上游调控区的片段缺失。目前全球已鉴定的α-地中海贫血缺失超过20种,不同种族的α-珠蛋白基因的缺失谱不同,中国人最常见的是(--SEA/)缺失突变,在广西地区该突变的携带者频率高达7.84%。目前临床上用来检测缺失型α-地中海贫血的常用方法是Gap-PCR,首先利用多重Gap-PCR检测中国人群3种常见α-地中海贫血缺失突变(-α3.7/)(-α4.2/)及(--SEA/);检测结果阴性的情况下,再继续检测非常见缺失类型(--THAI/)及(--FIL/)。但Gap-PCR往往是根据已知缺失类型进行引物设计的,仅可检测已知缺失突变,检测范围十分有限,而且不能检测其他未知罕见的缺失类型,极有可能造成漏诊,导致重症患儿出生。此外,对于α-地中海贫血缺失突变也可利用多重连接探针扩增(MLPA)技术对其进行检测,虽然相较于Gap-PCR而言,MLPA不但可以检测α-地中海贫血常见、非常见以及未知罕见缺失突变,但MLPA技术仍存在一定局限性,需要精确测量DNA的浓度、样本容易被污染且存在一定假阳性的可能,尤其对于单个外显子缺失突变的情况,需要利用PCR的方法进行进一步的验证实验。总之,目前尚无一种快速、低成本、大通量和自动化检测α-地中海贫血缺失突变的方法。
比较基因组杂交(CGH)芯片分析技术是一种突破性技术,能够支持研究人员通过微阵列准确研究与疾病有关的染色体的变化。比较基因组杂交芯片分析的原理是在一张芯片上用两份标记不同荧光素的样品(检测样品和对照样品)同时进行杂交,从而快速而又直观地检测实验样品和对照样品之间基因组DNA的拷贝数量的差异,提示样本DNA在染色体特定位置存在的缺失或重复突变。因此,需要一种新的技术方案来克服现有技术的上述不足和缺点。
目前公开文献中也有关于检测α-地中海贫血的基因芯片的相关技术,下面是检索到相关的专利文献:
1、中国专利:诊断α-地中海贫血的核酸膜条及试剂盒;申请号:200710074203.5;申请日: 2007.04.25;申请人:亚能生物技术(深圳)有限公司;摘要:本发明涉及地中海贫血的诊断试剂,尤其涉及一种诊断α-地中海 贫血的核酸膜条及试剂盒。诊断α-地中海贫血的核酸膜条,用于检测 α-珠蛋白基因突变/缺失的特异性寡核苷酸探针固定于基底上;诊断 α-地中海贫血的试剂盒,包括:特异性扩增α-珠蛋白基因或转录本的 引物,和用于检测α-珠蛋白基因突变/缺失的特异性寡核苷酸探针。 本发明所述的诊断α-地中海贫血的核酸杂交膜条及试剂盒制作成本 低,其检测速度快、检测结果稳定,在检测α-珠蛋白基因缺失的同时 可以检测出α-珠蛋白基因突变。在产前诊断中,避免了将含有点突变 的重型地贫--/αTα胎儿误诊成轻型地贫--/αα的可能性,从而避免重 型地贫儿的出生,减轻巨大的家庭负担及社会成本。
2、中国专利:用于诊断地中海贫血的DNA芯片;申请号02117287.0;申请日:2002.04.23;申请人:亚能生物技术(深圳)有限公司;摘要:本发明涉及用于诊断地中海贫血的DNA芯片及其制备方法,提供一种用于临床诊断α-型和β-型地贫的DNA芯片,芯片由一基底和固定于基底上的探针组成,根据迄今已知的α-和β-球蛋白突变基因的序列,根据DNA序列特异性识别的原理设计的诊断这些突变的DNA探针。本发明的用于地中海贫血疾病诊断的DNA芯片,可提高诊断效率和诊断准确性、降低成本、缩短诊断时间。
3、中国专利:一种α-地中海贫血基因检测试剂盒;申请号201610230900.4;申请日: 2016.04.14;申请人:亚能生物技术(深圳)有限公司;摘要:本发明提供了一种可同时检测4种缺失型α-地中海贫血基因(-α3.7 、-α 4.2 、-- SEA 和-- THAI )和3种非缺失α-地中海贫血基因(αCSα、αQSα和αWSα)的试剂盒,包括DNA芯片、PCR反应液I和PCR反应液II,所述DNA芯片包括基底和固定于所述基底上的探针。本发明的有益效果在于:采用PCR-反向点杂交的检测原理,根据各基因型的突变或缺失位点,设计相应的扩增引物和探针,以生物素标记引物,以氨基标记探针,并以DNA芯片(尼龙膜)为基底,将探针固定在尼龙膜上,通过特异性引物扩增出来的PCR产物,与固定在DNA芯片上的探针进行杂交、信号显色盒判读来进行地贫的诊断。
发明内容
本发明的目的在于克服现有技术的不足,提高α-地中海贫血的检测效率,提供一种检测α-地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒。本发明的基因芯片及其试剂盒具有操作步骤简单,检测特异性高,稳定性好,需要时间短,成本低等优点。
为了实现上述目的,本发明通过以下技术方案实现:
第一方面,本发明提供了一种检测α-地中海贫血的基因芯片,包括固相载体和固定在该载体上的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1~195所示的核苷酸序列。
所述固相载体选自载玻片、硅片、硝酸纤维素膜、尼龙膜或聚苯乙烯。
第二方面,本发明还涉及前述检测α-地中海贫血的基因芯片的使用方法,包括以下步骤:
(1)制备样品DNA片段:
取患者血液、采用常规方法抽提全基因组DNA(gDNA);解冻后进行点离,加入到无核酸酶的PCR管中,补充无核酸酶的去离子水;加入酶切反应液,在PCR仪上运行如下反应程序:37℃孵育2小时,65℃孵育20分钟。反应后将反应管立即转移至冰上,取酶切产物在0.8%琼脂糖胶进行电泳,用SYBR Gold染色检测酶切是否完全。
(2)荧光标记上述DNA片段:
随机引物加入到反应管中,在PCR仪上运行如下反应程序:95℃变性3分钟;配制标记混合母液,加入到反应管中,在PCR仪上运行如下反应程序:37℃孵育2小时,65℃孵育10分钟;对照样品gDNA用Cy3-dUTP标记,患者样品gDNA用Cy5-dUTP标记。
(3)纯化上述gDNA标记产物:
将gDNA标记产物离心后加入1×TE(pH 8.0),加入到标记好的纯化柱(Agilent p/n5190-3391),放置于收集管中,离心,弃滤液;多次离心后收集纯化样品,并通过补充1×TE(pH 8.0)或浓缩机浓缩样品,用NanoDrop 2000 UV-VIS检测产量和比活。
(4)将gDNA标记产物与所述基因芯片杂交:
加入无核酸酶的去离子水于10×aCGH Blocking Agent冻干粉的小瓶中,使用或保存前,置于室温60分钟,并涡旋振荡混匀;制备杂交混合母液,加入到反应管中,在PCR仪上运行如下反应程序:98℃孵育3分钟,37℃孵育30分钟,保持样品于37℃,在杂交室内进行杂交。将杂交样品混合液缓慢地以画圈的方式加到垫片垫圈内区域,将组装好的杂交室固定在旋转器上,放入67℃杂交炉中以20rpm的转速转动,杂交24小时。
(5)洗涤杂交的基因芯片,扫描芯片杂交信号:
用Wash Buffer 1(Agilent Oligo aCGH Wash Buffer 1, Agilent p/n 5188-5221)洗涤杂交的基因芯片,并扫描芯片杂交信号,获得结果。
第三方面,本发明还涉及一种用于检测α-地中海贫血的试剂盒,该试剂盒包括前面所述“寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1~195所示的核苷酸序列”的基因芯片。所述试剂盒还包括酶切试剂、标记物、标记产物纯化柱、杂交液和洗涤液,其中所述标记物为荧光素Cy3-dUTP或Cy5-dUTP。
本发明的有益效果是:
1、本发明的基因芯片操作步骤简单、检测特异性高,具有很好的临床意义;在控制较低成本的基础上提高其检测特异性,该芯片经多次试验后重复性高、稳定性好;检测所需的时间短,从样本抽提到获得扫描结果在两天内可完成,在很大程度上提高了检测效率,这是目前很多基因芯片所不及的。
2、本发明的基因芯片及其试剂盒适用于孕妇产前诊断及婴幼儿基因诊断,可以快速检测出α-地中海贫血患者缺失或重复突变,是阻止染色体变异重症婴儿出生的重要技术手段;本发明改进了大多数基因芯片成本高昂、操作精细复杂、速度慢、有漏诊等不足,集多种优点于一身,可大大提高α-地中海贫血的检测效率。
3、广西壮族自治区人群中α-地中海贫血基因携带率为全国最高,该技术的研发及应用将大大推进广西基因疾病的预防工作,在一定程度上可以推动广西地方经济的发展和技术的进步,在广西及全国范围内推广都有着深远的临床医学意义。
具体实施方式
为了更加详细的介绍本发明,下面结合实施例,对本发明做进一步说明。这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,例如Sambrook等分子克隆:实验室手册见New York Cold SpringHarbor Laboratory 出版社1989年版中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实施例1:
本实施例的基因芯片由固相载体和固定在该固相载体上的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1~195所示的核苷酸序列,所述固相载体为玻片。本实施例基因芯片的固相载体也可选用硝酸纤维素膜、硅片、尼龙膜或聚苯乙烯。本实施例的寡核苷酸探针由安捷伦公司生产,同时本实施例的基因芯片也由安捷伦公司按照常规方法生产。
本实施例基因芯片的使用方法,步骤如下:
(1)样品DNA片段的制备
取患者血液、采用常规方法抽提全基因组DNA(gDNA)。
解冻10×Restriction Enzyme Buffer 和BSA(见下表),轻弹管底后点离。
对每个反应来说,将患者样本和同性别的对照样本gDNA分别加入到适当的无核酸酶的PCR管中,并用无核酸酶的去离子水补充体积至10.1μL。
按照下表在冰上准备酶切混合母液:
将2.9μL酶切反应液加入到gDNA反应管中,使体积达到13μL,并用移液枪上下轻轻吹打混匀。在PCR仪上运行如下反应程序:37℃孵育2小时,65℃孵育20分钟;
反应后将反应管立即转移至冰上,取2μL酶切产物在0.8%琼脂糖胶进行电泳,用SYBRGold染色检测酶切是否完全,大部分酶切产物长度介于200bp-500bp。
(2)DNA的荧光标记
将2.5μL随机引物加入到每个反应管中,使体积达到13.5μL,并用移液枪上下轻轻吹打混匀。在PCR仪上运行如下反应程序:95℃变性3分钟,反应后将反应管立即转移至冰上5分钟;
按照下表准备标记混合母液:
将11.5μL标记反应液加入到每个反应管中,使体积达到25μL,并用移液枪上下轻轻吹打混匀。在PCR仪上运行如下反应程序:37℃孵育2小时,65℃孵育10分钟,反应后将反应管立即转移至冰上。对照样品gDNA用Cy3-dUTP标记,患者样品gDNA用Cy5-dUTP标记。
(3)纯化gDNA标记产物
将gDNA标记产物6000g离心1分钟,向每个反应管中加入430μL的1×TE(pH 8.0)。将标记好的纯化柱(Agilent p/n 5190-3391)放置于2mL收集管中,并将gDNA标记产物加入纯化柱中,关盖后,室温下14000g离心10分钟,弃滤液。再向每个纯化柱中加入480μL的1×TE(pH8.0),关盖后,室温下14000g离心10分钟,弃滤液。
将纯化柱倒置于一个新的2mL收集管中,室温1000g下离心1分钟收集纯化样品。通过补充1×TE(pH 8.0)或浓缩机浓缩使得样品终体积达到9.5μL。每个样品管取1.5μL纯化产物,利用NanoDrop 2000 UV-VIS检测产量和比活。将8μL Cy5标记的患者gDNA纯化标记产物及8μL Cy3标记的对照gDNA纯化标记产物混合于无核酸酶的PCR管,体积达到16μL。
(4)样品的预处理
加入1350μL无核酸酶的去离子水于10×aCGH Blocking Agent冻干粉的小瓶中。使用或保存前,置于室温60分钟,并涡旋振荡混匀。
按照下表准备杂交混合母液:
将29μL杂交反应液加入到每个反应管中,使体积达到45μL,并用移液枪上下轻轻吹打混匀并点离。在PCR仪上运行如下反应程序:98℃孵育3分钟(精确时间),37℃孵育30分钟,保持样品于37℃,准备杂交。
(5)芯片杂交
在杂交室(Agilent p/n G2534)底部放置一张干净的垫片,垫片标志朝上,并与杂交室底部的长方形区域对齐。将40μL杂交样品混合液缓慢地以画圈的方式加到垫片垫圈内区域。将芯片活性面(印有“Agilent”标志的一面)朝下放在垫片上,确保两者相互对齐。将杂交室盖子盖在“垫片-杂交样品-芯片”三明治结构上,滑动夹具使之固定,并手动加固杂交室的夹具。垂直旋转组装好的杂交室以润湿芯片,观察气泡是否可以自由流动。如果发现静止的气泡,可以将杂交室放在桌面上通过轻轻敲打芯片或垫片使之移动。将组装好的杂交室固定在旋转器上,放入67℃杂交炉中以20rpm的转速转动,杂交24小时。
(6)芯片洗涤和扫描
室温下将Wash Buffer 1(Agilent Oligo aCGH Wash Buffer 1, Agilent p/n 5188-5221)倒满整个染色缸1#。在染色缸2#中放入一个芯片架及一个磁力搅拌子,在室温下将足够多的Wash Buffer 1装入染色缸2#使之足以覆盖芯片架,并将染色缸2#放在磁力搅拌器上。将染色缸3#中装入3/4 体积的Wash Buffer 2(Agilent Oligo aCGH Wash Buffer 1,Agilent p/n 5188-5222)及一个磁力搅拌子,并在37摄氏度循环水浴锅中过夜预热,将预热后的染色缸3#放在带有加热元件的磁力搅拌器上,打开加热元件,保持Wash Buffer 2的温度于37℃,并用温度计监控温度。
从杂交炉中取出一个杂交室,并记录杂交过程中是否形成气泡以及所有气泡是否可以旋转自由。拆卸杂交室,将杂交室置于水平面上,逆时针旋转螺钉,放松杂交室夹具并移除。将三明治结构迅速转移至染色缸1#中,并保持芯片条形码面朝上。从条形码的一端撬开三明治结构。将干净镊子伸入两张玻片之间,温柔旋转镊子,轻轻分开两张玻片,让垫片落入染色缸1#的底部。 将芯片迅速移至染色缸2#(Wash Buffer 1) 的芯片架上。同时避免让芯片暴露于空气中。开启磁力搅拌器搅拌,以350rpm的转速搅拌5分钟,调整转速以达到良好而不过分的搅拌。
将芯片架转移至装有Wash Buffer 2并预热到37℃的染色缸3#中,开启磁力搅拌器搅拌至少1分钟,但不要超过2分钟。在5-10秒内缓慢将芯片架移出液面,并尽可能减少芯片上的液滴。丢弃用过的Wash Buffer 1和Wash Buffer 2。立即扫描芯片以减少环境中氧化剂对于信号强度的影响。
本实施例的基因芯片操作步骤简单、检测特异性高、稳定性好,该芯片多次试验重复性高;时间短,从样本抽提到获得扫描结果可在两天内完成。
案例1
随机抽取我院就诊的6个α-地中海贫血临床患者样本,利用本发明的基因芯片及目前α-地中海贫血临床常规检测方法(即多重GAP-PCR)进行平行双盲实验,分析结果后将两种方法的结果进行对比,检测结果如表所示:
Gap-PCR方法仅1例患者检测为阳性,其余5例患者均为阴性结果,而本发明芯片检测结果均为阳性。本发明芯片检测范围大,不但可以检测已知α-地中海贫血缺失突变,同时也可以检测α-地中海贫血非常见以及未知罕见缺失突变,并且具有快速、低成本、大通量和自动化等优点。
序列表
<110> 广西壮族自治区妇幼保健院
<120> 一种检测α-地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒
<160> 195
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 1
ctacgattcc cagtcgtcct cgtcctctgc ctgtggctgc tgcgg 45
<210> 2
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2
gctggctaca ctcgctccac tggcctgtgt aacgctcctc ctgtg 45
<210> 3
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 3
tgctgctggc agtccttcct ggtatgaccg aagtgcattt cacat 45
<210> 4
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 4
gggtgtcaga tgcaccctca aactttgatc cggactctga cttag 45
<210> 5
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 5
atgctcttaa ggaactcaca cactctcaac aggcagtagg cactactcta a 51
<210> 6
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 6
atcactgccc aggacaccct ctcctgcact gggtctgtgg acata 45
<210> 7
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 7
aaacatttct gggggttcat ccgggattgg agacgacaga tttacttt 48
<210> 8
<211> 54
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 8
aatgaaaagt ctcagaaaag aaagagaaaa accgttctgc aagaaccaca ggag 54
<210> 9
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 9
actcagacat tgaatactct actgatggaa gcaatttcat actaaaggga gtccaccaa 59
<210> 10
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 10
ggaactgatc aacatgttca aacaataaga aaatagtcat attaaatgta aagattggtg 60
<210> 11
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 11
ggcaatgaga aaaaagaagt gaccacattt aaaaaaagat gctactcatg gctgtcaaaa 60
<210> 12
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 12
tttcactttg agaaacttat cctacacctg acagaaatgg cttcaaacac tctatttctg 60
<210> 13
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 13
taaccatcag ttatctctct cacctctcaa tataacttac atttacgtct tcccctttcc 60
<210> 14
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 14
gatttgttac ctaacaaaaa caacacttca gactccaagt aactgaatag cgcaaacctg 60
<210> 15
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 15
tattagaagg taataagccc tatggaaaca attacaaagg gaaggagaat aaattggaag 60
<210> 16
<211> 53
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 16
tgattgttcc atttgcctca agcgtcaatc atgtgtcaaa gcgtcagtat cat 53
<210> 17
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 17
cttggtcttt tgtaggttac tctggaagaa gtcaactccc aaatagccct agaata 56
<210> 18
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 18
gatcaactat cctgttcact gagtctcaac actgtcgcct gttgcattag 50
<210> 19
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 19
ggcccactgt ataaaataaa cctgtttgct tcttagtttg aaaagtagaa agccacagta 60
<210> 20
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 20
agagcatatt gggaccgagg atccaactgg agatgctccc agact 45
<210> 21
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 21
tcaaactgga ataatgtcac ttgacctttc aagtctccat ctagttctct tgatctactt 60
<210> 22
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 22
aaggatcact ctgccgagtc tatctgaggt ctgaagagcg aacac 45
<210> 23
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 23
ctgggttcta agattgctgt cccattccac aggcaagcca tgaga 45
<210> 24
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 24
agaaaacacc aacacactca tgacctgtat gagatacctg agcaggga 48
<210> 25
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 25
acaactatct gagcacacac tatggtcagg atactgctct aggtgcttga g 51
<210> 26
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 26
ctcgctcacg gtcatatatg gagggcagca caattagaga cagcc 45
<210> 27
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 27
atgttctcac ccagaaaatg gacgaatgct cttagtgagg ccattatgg 49
<210> 28
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 28
gccttgtcta ttaatggcat catgctgaga atgatatttg ctaggccctt tgcaaa 56
<210> 29
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 29
aaaatcgtcc aactcagaaa aaaaggcaga agccaaggaa tccaatcact g 51
<210> 30
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 30
taatgggtgc tctctgaaca caagcaatat caacacaatt ctcatgtaga aggagac 57
<210> 31
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 31
tctgagaatg ggttagggtt agggtctaga ccaaacccag ggttt 45
<210> 32
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 32
aatctgctct ccaagtgatt ctctttcctc ataagaaagg tggggataaa aacac 55
<210> 33
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 33
ctgtctccta ttcggatgct tatttatttt ttttcccatt acagttttgc cgacggatg 59
<210> 34
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 34
ttaatgagcc tacttttagg ttataatcac caagaagaac cagaagagaa ataccagtgc 60
<210> 35
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 35
aatggtatca gtgaaatcct gatcagaaat ttgggatgga aaaggaaaca atgagaaaag 60
<210> 36
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 36
cacaggtcct agtccggcga cttcctaatg gcacagaact ccgag 45
<210> 37
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 37
gaatggacgg gaacttaaag gctttgcttg gcctggattt tatcttgaaa tactttt 57
<210> 38
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 38
ttttaattgt ttaaaaaccg aataaatgtt ttatttctag aaaactgtgc cttagccaga 60
<210> 39
<211> 47
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 39
accatcattt ggaaggtcac tgctttaggg tgctttctgc aactcag 47
<210> 40
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 40
gtgtgacacg cccctcatac ggctgacttg ggaaacgggt agcct 45
<210> 41
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 41
ctccaacttc ctcctgggtg atcagggagc catggcccta gacat 45
<210> 42
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 42
caagtaagaa gacttggtca aaaggactgc aagatatcca gacttcacat gaatttaaga 60
<210> 43
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 43
aaagggttta actttaagga ctggttttgc ctaatagatc tggcacttac tcagatactt 60
<210> 44
<211> 46
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 44
gttttcccat cctatgctgt cttgactccc actgaagaat ggtggt 46
<210> 45
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 45
tatcatgaca cacccaaaat ttacttgtag attctctctg gattgatata aacatgaaga 60
<210> 46
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 46
agggttgtat ggagtggtga gttcttttaa aattctctgt ctcctgaatg ctatgaag 58
<210> 47
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 47
ctttctctca cagactcgcc ttacctctct gagacagaag aacaagtca 49
<210> 48
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 48
cagcaaacat ctgttgattg aagacatgaa tgaatctttc ctaaggaaat tgtcccaaat 60
<210> 49
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 49
atttctggac acaactggat acaaaattat gtgttttaac ttctataaac ggcagagccc 60
<210> 50
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 50
aagaaagaaa aagagaaaca tatttctggc tagccctgga atctgtagtc caacca 56
<210> 51
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 51
ctcacaatga caccagttct aaaataggag caaaacacac acaagttctt ctccaaac 58
<210> 52
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 52
aaaaaaaaag acacctaatt gtaatcaaat tgtatggagc attagaaact ggagagagtt 60
<210> 53
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 53
atgtgggttc caaacagcct accttgaaat ttcaaacgaa agtttatata taggtgcatt 60
<210> 54
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 54
tcaaagccag agggtagtaa ttctctcaac acagagaaaa cattagtgtg ataacaatga 60
<210> 55
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 55
atggcatttt gcatctgttt gatttaaaaa cactttcgga ctctcatgta taacttcggg 60
<210> 56
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 56
tgtcaataac taattttact tattgctaca acaactaggt ctgactttag ttttgttcct 60
<210> 57
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 57
gaagaaattc tctatattct catcagatcc catgttcaca aacagaactc acacctggat 60
<210> 58
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 58
cccaaaaaat acaaactctt tacattatca aaatttctcc tactcgtcaa tatcacggcc 60
<210> 59
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 59
gccattaaca aatcattttg ttttaatttg tagttcctta tttatcaaca aggcaggcct 60
<210> 60
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 60
ctgttttgga gatctgtaaa agatgcataa ttctaattaa ttgagacgac tttctaagga 60
<210> 61
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 61
acaaatcgca cattatcaat cttcagttca aatttttggc cacacatttc agacttggtt 60
<210> 62
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 62
tacaccacag gcataatatg ctttcttcaa aaaccctaaa tggctcactc tgttctataa 60
<210> 63
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 63
atctggccca cagagaaatc tactccccac accttaatat tacaaacata taatgacaaa 60
<210> 64
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 64
accatatcaa ttccatgaga acatttctgc ctctattaag cacactcaat agcatctagg 60
<210> 65
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 65
taaaactaat ctttgtggta aaagttttct catctgcatg acaagaaatc gcctaccgag 60
<210> 66
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 66
ctaataccca gggaacacta catcttttct gaccttggtt tcaagtctta gagaca 56
<210> 67
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 67
gccccaaaag aactttctac tgtgatggga atattccaaa tctgaaccat ttaatatggt 60
<210> 68
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 68
tccctagaaa atatcctcat ggtcatgtca ttataagtct gaaaattaac tgcaggaatt 60
<210> 69
<211> 56
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 69
ctaaacggaa aaaaacaaac accagacttc tcagggagaa aacatctggg tgaata 56
<210> 70
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 70
agcactttat ccaccacaga acttctttca gaattggaag caatgctctc aaact 55
<210> 71
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 71
ccctcacagt gtgggatgac aattaggttg gaaaaagcat aggcaaaata aaaaaaattt 60
<210> 72
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 72
acgcctttcc atttaaaaca aaactcagaa accacaagag attagactga aaactccac 59
<210> 73
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 73
gtaggaaaga actttctttt cataatctaa actcctttgt atctttaaaa ctttctgcca 60
<210> 74
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 74
actgatgaaa tgtcagcagt agttgctttg gtgtggtgaa caatgcatga ttttaatttt 60
<210> 75
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 75
tcgagtcagc gtccctctcg atgttggttt cttcgtttta caaataacac tt 52
<210> 76
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 76
cagttcctga aaggttagag ttaacacaac actcggcaaa tccccctttt agatata 57
<210> 77
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 77
ttgcaagtaa ccctcttgca ccaacactga cactaatgtg tattttgcag aacaaattt 59
<210> 78
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 78
ttgcaaggct ttatccccgt tgtccatgtt ttgattttat gtataatcaa aaggtttgtg 60
<210> 79
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 79
ccactcacac acagtagtaa tagaaataat ttaaaattca tgctgcaagt tcctgagcgc 60
<210> 80
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 80
agaatgaaga gtgttgctgc catgtgcaga acttagaaag tgctcaacag at 52
<210> 81
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 81
acgagaatat cactaagata cagagttggg gagatctaac acataaaagt gacaaaggaa 60
<210> 82
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 82
accactaggg aaaacataag ttggttaacc actgtgaaaa agtttggcat tctttactaa 60
<210> 83
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 83
tggggtgctg tccgctttct aataattcgt taaactatag tctacatctt gtgctatatt 60
<210> 84
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 84
catcatctca tatctcaggc atggaagaat gagggccatt acacgagtaa aacat 55
<210> 85
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 85
gcccttcaca cctcagacaa aagtcatctc aaaatggatt gtagatctca atataaacat 60
<210> 86
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 86
tatggaaagc aatattgcaa tgcctattag cacatgacat taggtgaatt ctcctttgtc 60
<210> 87
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 87
cagccccact taccgcgtaa tgcgccaata aaccaatgaa cgaag 45
<210> 88
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 88
acttaccgcg taatgcgcca ataaaccaat gaacgaagca gcgtc 45
<210> 89
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 89
tgaggataat ttctaataat gaaaataaag aggttagaat ggtgtgtata caatggtgga 60
<210> 90
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 90
gtgttacaca gcaactctga ttgatatcga agccacagca gacagcag 48
<210> 91
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 91
ccgaaagaac tccaaagaca ctctaacact ccgtggttta ttgttcctca taacatatat 60
<210> 92
<211> 54
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 92
attgttgaga tgatttgctg gagacacaca gatgaggaca tcaaatacat ccct 54
<210> 93
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 93
acgcagcaac ggaaaagcat cagtgtgtga agatgcattt tctctctttc ta 52
<210> 94
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 94
agtgagtagg agacagtggg gagaggacag tggagagggg acagt 45
<210> 95
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 95
taactttacc cgaggggagt aaacagatgc ccctaaagtc tgcagtaaa 49
<210> 96
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 96
tgctggcctc ccacctgcag gacgagttca ccgtgcaaat gcaag 45
<210> 97
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 97
caggacgagt tcaccgtgca aatgcaagcg gcgtgggaca agttc 45
<210> 98
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 98
acaagttcct gactggtgtg gccgtggtgc tgaccgaaaa atacc 45
<210> 99
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 99
gccttggtct gtgcctgtca ataaacagag gcccgaacca tctgc 45
<210> 100
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 100
aataaacaga ggcccgaacc atctgcccct gcctgtgtgg tcttt 45
<210> 101
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 101
gagaacttgg ccccacgtta tctacatccc ccaactgttt ttttgttttt 50
<210> 102
<211> 47
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 102
gtagtatctg catcccctga ctctctctcc acagttcctg ggtaaat 47
<210> 103
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 103
cttccttcct caccccacat cccctcacct acattctgca accac 45
<210> 104
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 104
ctgtcctttc cctacccaga gccaagtttg tttatctgtt tacaaccag 49
<210> 105
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 105
cctacccaga gccaagtttg tttatctgtt tacaaccagt atttacctag caagtcttc 59
<210> 106
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 106
agagccaagt ttgtttatct gtttacaacc agtatttacc tagcaagtct tccatcagat 60
<210> 107
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 107
cctccttgca ccggcccttc ctggtctttg aataaagtct gagtg 45
<210> 108
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 108
ctccttgcac cggcccttcc tggtctttga ataaagtctg agtgg 45
<210> 109
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 109
acctaataca tatccttaag tctcacctcc tccaggaagc cctcagacta a 51
<210> 110
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 110
actaaccctg gtcaccttga atgcctcgtc cacacctcca gactt 45
<210> 111
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 111
cctgtgtgtg cctgagtttt ttccctcagc aaacgtgcca ggcat 45
<210> 112
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 112
ctgtgtgtgc ctgagttttt tccctcagca aacgtgccag gcatg 45
<210> 113
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 113
ctttgaggat gcatttgctc tttcccgagt tttattccca gacttttcag attcaat 57
<210> 114
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 114
attgaatctg aaaagtctgg gaataaaact cgggaaagag caaatgcatc ctcaaag 57
<210> 115
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 115
cccgagtttt attcccagac ttttcagatt caatgcaggt ttgctgaaat aatgaattta 60
<210> 116
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 116
ttcccagact tttcagattc aatgcaggtt tgctgaaata atgaatttat ccatctttac 60
<210> 117
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 117
atctttacgt ttctgggcac tcttgtgcca agaactggct ggctt 45
<210> 118
<211> 46
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 118
tttctgcctg ggacgtcact ggtttcccag aggtcctccc acatat 46
<210> 119
<211> 46
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 119
atatgtggga ggacctctgg gaaaccagtg acgtcccagg cagaaa 46
<210> 120
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 120
ccagaggtcc tcccacatat gggtggtggg taggtcagag aagtc 45
<210> 121
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 121
atggctgcat tgatccccca tcgttcccac tagtctccgt aaaac 45
<210> 122
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 122
cactagtctc cgtaaaacct cccagataca ggcacagtct agatgaaatc ag 52
<210> 123
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 123
caattcaata ggggctctac tttcaccccc aggtcacccc agaat 45
<210> 124
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 124
ctagaaggtc ccttctccct ggtgtgtgtt ttctctctgc tgagc 45
<210> 125
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 125
ctgataggaa tatcttttat tccctgagcc catgaatcac ccttggtaaa cacctat 57
<210> 126
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 126
aattgatcag aaccagttat aaatttatca tttccttctc cactcctgct gcttcagttg 60
<210> 127
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 127
ccggacacca aaggtcacaa actgcatgac cccatctata tgcaatat 48
<210> 128
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 128
atctatatgc aatatccgct acagccaaat ccatagggac caaaagcgga ttagt 55
<210> 129
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 129
gtgttcttaa tatcaccaaa ttttatacct gaaaaatggc tacaatggta atttatgtct 60
<210> 130
<211> 58
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 130
aatagaatca agaggcagaa taaactgact tccaatgcca aatccatgcc gaaattca 58
<210> 131
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 131
gaggcagaat aaactgactt ccaatgccaa atccatgccg aaattcagtg ctataataat 60
<210> 132
<211> 46
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 132
taaataccat atagtgaaca cctaagacgg ggggccttgg atccag 46
<210> 133
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 133
tatatttgtc cacataaaac caatcatggt cattgtagaa cttccgaaaa caaggcttgc 60
<210> 134
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 134
ggcaaactgt gtcatgtgta aacaagaaca ggacatggct gtcatatcca a 51
<210> 135
<211> 53
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 135
gcaaactgtg tcatgtgtaa acaagaacag gacatggctg tcatatccaa gag 53
<210> 136
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 136
agtcttctag gcacatgtag agatgctttt cctcagaaat ggtattctca aggtg 55
<210> 137
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 137
atgtagagat gcttttcctc agaaatggta ttctcaaggt gacactgagg aaaagtg 57
<210> 138
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 138
ccacccaaaa aagcaaaaaa caactatttg tctacacata caattttatg cccagatgga 60
<210> 139
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 139
ctcccacaaa tttaggttta aaatatttcc atcagttaat ctccaatggc taggtccttc 60
<210> 140
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 140
cattactctg tccccttcta tagttttgaa accttaaatg ccaccttcta acatctttca 60
<210> 141
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 141
cattcgattc caaaaattaa gtcctaatca caacctacca cttactagaa agtcacccaa 60
<210> 142
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 142
aaaacagtct cactgcaaca aatttctagg cattgtcttg caatcttgac tacttgagat 60
<210> 143
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 143
ggcgtaatca ccacagataa ccttccacta ttcagtcttt tcaaattctt acttcgaata 60
<210> 144
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 144
gggaaaaaag acttactcta agaatacaac aaagactgtt catgggctag aagcatcaaa 60
<210> 145
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 145
aggagaaagg cttactccat ggtattttct ggacagacta caaaacttat tctgtgtaat 60
<210> 146
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 146
aaacctgtgt ttgtcagtta aaatgatgat cctcccaaaa atgttcagtg ccattttcta 60
<210> 147
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 147
aactcgcctt tccacactaa ttagagacct tcttaagtat aatctgttaa gactgacacc 60
<210> 148
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 148
agaatcaagg aatctgtctt taaaaaaagg tttggatgag attgtatgtg cgtaaggagt 60
<210> 149
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 149
caccaaggaa gaaagcagaa taaacatttt tgcactgcct gaaaaacccc 50
<210> 150
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 150
acttaaatta tgtttttaaa caacacatac ttgagaaata ctactaatgg ggatcactgg 60
<210> 151
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 151
cttttgacga aaccaagaat gtgtttgtca agttctgtga gtgttgaggg ag 52
<210> 152
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 152
ttaaaaacat ctgaagggca gggattggac aaacagaact gtgcacgatt t 51
<210> 153
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 153
atgtctcaaa gtggaatgta ttaatactta tcctaaaata tgggacatgc aatatttagt 60
<210> 154
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 154
ggactgacaa actaaaacag tattgagtaa atctggtgtc aatacaaaag aaagagaggg 60
<210> 155
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 155
cagaagtgat aacaaaccaa catcctttct tttcaaccat aaagaaattc ctgacttgga 60
<210> 156
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 156
aattaaaaac acaagcaatt tggagaaaat aaggagcatg gagaaaagac caacatctcc 60
<210> 157
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 157
taaatgcttt aaaaggattc cagcaaggta agatgacaac accaataatg caacataggg 60
<210> 158
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 158
accaaacgtc tttcatatag aactctgaca acaatctgtc tttgcattga ctgaaaacta 60
<210> 159
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 159
aaccatttct tctcttaacc ttttaggcca ttaccagaaa cacagtcaat aaactaatga 60
<210> 160
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 160
gaagggtaaa gtttacatgt cattgtgact tctaagaatt ccgatgttcc taatgactca 60
<210> 161
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 161
gggctactat ttcacatgta atttattccc ccatcactga aattctcaat gaccaatgta 60
<210> 162
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 162
gccttaagtg tgtttatcca tttaactgag gaagaccact tataaaaaat gacccaaagg 60
<210> 163
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 163
atttacggaa ggcctcttac ctttttctca gtcaaggact tttgtggcc 49
<210> 164
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 164
agatctacat aaaaatatgt cttaatatct tagaattttc ctttactcca aaaaacccca 60
<210> 165
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 165
ggaaaacccc attaaagtga cttctttttc ctttcaccta acacattggc aaataaaaac 60
<210> 166
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 166
ataacacatt atagtccagg gaacaattga atggcataac ttcccattag aaacaatggg 60
<210> 167
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 167
gaggtagaaa tgacgccttt atgcaagttg taaggagttg aacagtaaag aggaagtttt 60
<210> 168
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 168
cttcagtgta agtggcctcc cagagacatc tttgactttt taaaaaatct agttattggg 60
<210> 169
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 169
ccacctgttt gcataaacac actttgctac aatcttgcta gtgcgttttc ttaaaagata 60
<210> 170
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 170
gctgcccacc ctgccgccat gtctctgacc aagactgaga ggaccatcat tgtgtccatg 60
<210> 171
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 171
atagcgttcc ctctcagtga ggagagcagg gtaaggaggg aacgattagg agttgcacaa 60
<210> 172
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 172
gtgaaaggtt tcgttctagg cctgaagggc cttacagggc agccagggca ctacagcctc 60
<210> 173
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 173
tttccttccc tggaacgctg ctgggaggtc atgagcctgc agaaggggtg gcgggcaacc 60
<210> 174
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 174
caggcgtgct ggaggcggag ggcgggagat ttggggacca ggctgcacag aacccgtcgg 60
<210> 175
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 175
gccacccgca gaccaagacc tacttcccgc acttcgacct gcacccgggg tccgcgcagt 60
<210> 176
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 176
tgtcccactg cctgctggtc accctggccg cgcgcttccc cgccgacttc acggccgagg 60
<210> 177
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 177
accgctgagc gccgcctccg ggacccccag gacaggctgc ggcccctccc ccgtcctgga 60
<210> 178
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 178
cataaaccct ggcgcgctcg cgggccggca ctcttctggt ccccacagac tcagagagaa 60
<210> 179
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 179
gacaagacca acgtcaaggc cgcctggggt aaggtcggcg cgcacgctgg cgagtatggt 60
<210> 180
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 180
tccctcccct gctccgaccc gggctcctcg cccgcccgga cccacaggcc accctcaacc 60
<210> 181
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 181
acccctcact ctgcttctcc ccgcaggatg ttcctgtcct tccccaccac caagacctac 60
<210> 182
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 182
ggctctgccc aggttaaggg ccacggcaag aaggtggccg acgcgctgac caacgccgtg 60
<210> 183
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 183
gcttcgggtg gacccggtca acttcaaggt gagcggcggg ccgggagcga tctgggtcga 60
<210> 184
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 184
agggcagagg atcacgcggg ttgcgggagg tgtagcgcag gcggcggctg cgggcctggg 60
<210> 185
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 185
gctcctaagc cactgcctgc tggtgaccct ggccgcccac ctccccgccg agttcacccc 60
<210> 186
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 186
actcttctgg tccccacaga ctcagagaga acccaccatg gtgctgtctc ctgccgacaa 60
<210> 187
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 187
gccgacaaga ccaacgtcaa ggccgcctgg ggtaaggtcg gcgcgcacgc tggcgagtat 60
<210> 188
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 188
gcgagtatgg tgcggaggcc ctggagaggt gaggctccct cccctgctcc gacccgggct 60
<210> 189
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 189
cccgggctcc tcgcccgccc ggacccacag gccaccctca accgtcctgg ccccggaccc 60
<210> 190
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 190
ccttccccac caccaagacc tacttcccgc acttcgacct gagccacggc tctgcccagg 60
<210> 191
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 191
gtggcgcacg tggacgacat gcccaacgcg ctgtccgccc tgagcgacct gcacgcgcac 60
<210> 192
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 192
gcttcgggtg gacccggtca acttcaaggt gagcggcggg ccgggagcga tctgggtcga 60
<210> 193
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 193
tgggtcgagg ggcgagatgg cgccttcctc gcagggcaga ggatcacgcg ggttgcggga 60
<210> 194
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 194
ttgcgggagg tgtagcgcag gcggcggctg cgggcctggg ccctcggccc cactgaccct 60
<210> 195
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 195
ttcacccctg cggtgcacgc ctccctggac aagttcctgg cttctgtgag caccgtgctg 60

Claims (5)

1.一种检测α-地中海贫血的基因芯片,包括固相载体和固定在该固相载体上的寡核苷酸探针,其特征在于,所述寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1~195所示的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的检测α-地中海贫血的基因芯片,其特征在于,所述固相载体选自载玻片、硅片、硝酸纤维素膜、尼龙膜或聚苯乙烯。
3.一种如权利要求1所述检测α-地中海贫血的基因芯片的使用方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)制备样品DNA片段;
(2)荧光标记上述DNA片段;
(3)纯化上述gDNA标记产物;
(4)将gDNA标记产物与所述基因芯片杂交;
(5)洗涤杂交的基因芯片,扫描芯片杂交信号。
4.一种用于检测α-地中海贫血的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包括权利要求1所述“寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1~195所示的核苷酸序列”的基因芯片。
5.根据权利要求4所述的用于检测α-地中海贫血的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括酶切试剂、标记物、标记产物纯化柱、杂交液和洗涤液,其中所述标记物为荧光素Cy3-dUTP或Cy5-dUTP。
CN201710847405.2A 2017-09-19 2017-09-19 一种检测α-地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒 Active CN107475410B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201710847405.2A CN107475410B (zh) 2017-09-19 2017-09-19 一种检测α-地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201710847405.2A CN107475410B (zh) 2017-09-19 2017-09-19 一种检测α-地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN107475410A true CN107475410A (zh) 2017-12-15
CN107475410B CN107475410B (zh) 2019-10-08

Family

ID=60585787

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201710847405.2A Active CN107475410B (zh) 2017-09-19 2017-09-19 一种检测α-地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN107475410B (zh)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112342289A (zh) * 2020-11-04 2021-02-09 广州精科医学检验所有限公司 用于长片段pcr富集地中海贫血基因的引物组及其应用
CN116769906A (zh) * 2023-08-10 2023-09-19 赛雷纳(中国)医疗科技有限公司 用于检测α-地中海贫血的试剂盒
WO2024114253A1 (zh) * 2022-11-28 2024-06-06 广东菲鹏生物有限公司 一种检测待测样本所属个体是否患有遗传病的试剂盒

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ARIANE BLATTNER等: "Detection of germline rearrangements in patients with α- and β-thalassemia using high resolution array CGH", 《BLOOD CELLS, MOLECULES AND DISEASES》 *
C HERNANDO等: "Comparative genomic hybridisation shows a partial de novo deletion 16p11.2 in a neonate with multiple congenital malformations", 《J MED GENET》 *
DANIEL E. SABATH: "Molecular Diagnosis of Thalassemias and Hemoglobinopathies An ACLPS Critical Review", 《AM J CLIN PATHOL》 *
MARION PHYLIPSEN等: "Fine-Tiling Array CGH to Improve Diagnostics for α- and β-Thalassemia Rearrangements", 《HUMAN MUTATION》 *
王逾男: "罕见地中海贫血规范化基因诊断临床评价及一种地中海贫血新突变基因的鉴定", 《中国学位论文全文数据库》 *

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112342289A (zh) * 2020-11-04 2021-02-09 广州精科医学检验所有限公司 用于长片段pcr富集地中海贫血基因的引物组及其应用
CN112342289B (zh) * 2020-11-04 2023-08-15 广州精科医学检验所有限公司 用于长片段pcr富集地中海贫血基因的引物组及其应用
WO2024114253A1 (zh) * 2022-11-28 2024-06-06 广东菲鹏生物有限公司 一种检测待测样本所属个体是否患有遗传病的试剂盒
CN116769906A (zh) * 2023-08-10 2023-09-19 赛雷纳(中国)医疗科技有限公司 用于检测α-地中海贫血的试剂盒
CN116769906B (zh) * 2023-08-10 2023-11-17 赛雷纳(中国)医疗科技有限公司 用于检测α-地中海贫血的试剂盒

Also Published As

Publication number Publication date
CN107475410B (zh) 2019-10-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP3258658B2 (ja) ユニバーサル ユーバクテリア核酸プローブ及び方法
EP3348640B1 (en) Amplified nucleic acid detection method and detection device
US20090035767A1 (en) Primer for bacterium genome amplification reaction
CN107475410B (zh) 一种检测α-地中海贫血的基因芯片及其使用方法、试剂盒
CN104611471B (zh) 用于检测口蹄疫病毒的基因芯片及其检测方法
CN109022573B (zh) 乳腺癌pik3ca热点突变检测探针引物序列组合和试剂盒
CN103509858A (zh) 一种人细胞色素酶p450基因多态性检测试剂盒
JP2009034052A (ja) ハイブリダイゼーション方法および装置
CN117757947A (zh) 用于检测膀胱癌生物标志物甲基化水平的引物组、探针组、试剂盒及方法
CN101875970A (zh) Apc基因突变的快速检测
CN109415721B (zh) 用于检测2个以上的目标核酸的引物组、试剂盒及方法
JP2009000099A (ja) 検体中の核酸の検出方法、それに用いるプローブ設計方法、プローブ設計システム
CN105802969A (zh) lncRNA ENST00000581794.1及制剂或诊断剂或药物或试剂盒和应用
CN112029850A (zh) 检测地中海贫血基因的引物对和探针、试剂盒及使用方法
CN111961763A (zh) 一种新型冠状病毒检测基因芯片
JP2001145486A (ja) 多試料用の微小容量化学反応装置
CN100547079C (zh) 检测十字花科植物在胁迫条件下基因表达信息的cDNA芯片
CN103173543A (zh) 一种预测放射不良反应相关基因突变检测芯片
Sun et al. Microarrays for the detection of HBV and HDV
CN113215241A (zh) 一种用于心脑血管疾病风险预警的检测引物组及其应用
JP2003144153A (ja) 遺伝子検出方法、遺伝子検出用プライマー、dnaマイクロアレイ及び遺伝子検出用キット
JPH0690798A (ja) 黄色ブドウ球菌検出用プローブ及び検出方法
CN111235242A (zh) 检测ntrk基因家族融合基因的探针库、试剂、试剂盒及应用
CN1978663A (zh) 葡萄炭疽病生物芯片的制取方法
CN108949965B (zh) Snp标志物在ii型糖尿病诊断中的应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant