CN107429289A - 用于癌症治疗的联合疗法 - Google Patents

用于癌症治疗的联合疗法 Download PDF

Info

Publication number
CN107429289A
CN107429289A CN201580056060.8A CN201580056060A CN107429289A CN 107429289 A CN107429289 A CN 107429289A CN 201580056060 A CN201580056060 A CN 201580056060A CN 107429289 A CN107429289 A CN 107429289A
Authority
CN
China
Prior art keywords
another embodiment
bacterial strain
therapy
recombinant
listeria bacterium
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201580056060.8A
Other languages
English (en)
Inventor
Y·佩特森
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
University of Pennsylvania Penn
Original Assignee
University of Pennsylvania Penn
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by University of Pennsylvania Penn filed Critical University of Pennsylvania Penn
Publication of CN107429289A publication Critical patent/CN107429289A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/40—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil
    • A61K31/407—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil condensed with other heterocyclic ring systems, e.g. ketorolac, physostigmine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/513—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim having oxo groups directly attached to the heterocyclic ring, e.g. cytosine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005—Vertebrate antigens
    • A61K39/0011—Cancer antigens
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/12—Viral antigens
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61N—ELECTROTHERAPY; MAGNETOTHERAPY; RADIATION THERAPY; ULTRASOUND THERAPY
    • A61N5/00—Radiation therapy
    • A61N5/10—X-ray therapy; Gamma-ray therapy; Particle-irradiation therapy
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • C07K16/3046—Stomach, Intestines
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/52—Bacterial cells; Fungal cells; Protozoal cells
    • A61K2039/522—Bacterial cells; Fungal cells; Protozoal cells avirulent or attenuated
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/52—Bacterial cells; Fungal cells; Protozoal cells
    • A61K2039/523—Bacterial cells; Fungal cells; Protozoal cells expressing foreign proteins
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/54—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the route of administration
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/545—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the dose, timing or administration schedule
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/57—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2
    • A61K2039/572—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2 cytotoxic response
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/58—Medicinal preparations containing antigens or antibodies raising an immune response against a target which is not the antigen used for immunisation
    • A61K2039/585—Medicinal preparations containing antigens or antibodies raising an immune response against a target which is not the antigen used for immunisation wherein the target is cancer
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/60—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characteristics by the carrier linked to the antigen
    • A61K2039/6031—Proteins
    • A61K2039/6037—Bacterial toxins, e.g. diphteria toxoid [DT], tetanus toxoid [TT]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2300/00—Mixtures or combinations of active ingredients, wherein at least one active ingredient is fully defined in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011—Details
    • C12N2710/20011—Papillomaviridae
    • C12N2710/20034—Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Radiology & Medical Imaging (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

本发明提供治疗肛门或阴道肿瘤和癌症的方法，所述方法包括向受试者施用包括化放疗疗法和重组李斯特菌菌株的联合疗法的步骤。在一个方面，本发明涉及一种治疗人受试者中的肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症的方法，所述方法包括向所述受试者施用包括化放疗疗法和重组李斯特菌菌株的联合疗法的步骤，所述李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，从而治疗所述人受试者中的所述肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症。

Description

用于癌症治疗的联合疗法
技术领域
本发明提供治疗肛门或阴道肿瘤和肛门或阴道癌症的方法，该方法包括向受试者施用包括化放疗疗法和重组李斯特菌(Listeria)菌株的联合疗法的步骤。
背景技术
单核细胞增多性李斯特菌(Listeria monocytogenes)(Lm)是一种食源性革兰氏阳性菌，偶尔会在人类尤其是老年人、新生儿、孕妇和免疫低下个体中导致疾病。除了强烈激活先天免疫并诱导增强抗原呈递细胞(APC)功能的细胞因子应答外，Lm还能够在从吞噬溶酶体逃离后在APC的胞质溶胶中复制，这主要是通过李斯特菌溶血素O(LLO)蛋白的作用。这种独特的胞内生命周期使得由Lm分泌的抗原可在MHC I类和II类分子的背景下加工和呈递，从而导致强效的细胞毒性CD8+和Th1CD4+T细胞介导的免疫应答。Lm已在临床前模型中作为癌症免疫疗法的载体得到了广泛研究。
高致癌风险人乳头瘤病毒(HR-HPV)型持续感染被视为是宫颈浸润癌(ICC)必要但非充分的原因。HPV 16和18是恶性病变中最普遍的类型，占ICC的70％以上，高等级前期病变的50％以上。
肛门癌是一种始于作为直肠末端的开口的肛门中的罕见恶性肿瘤。美国癌症协会(American Cancer Society)估计，在2015年将诊断出7,270例肛门癌(发病率仍在不断增加)，并且那一年将发生约1,010例肛门癌死亡。所有肛门癌中大约有一半能在恶性扩散到原发性部位之外前被诊断出，而13％至25％在癌症已扩散到淋巴结后才被诊断出，10％在癌症已扩散到远处器官或已转移后才被诊断出。当及早发现时，肛门癌是高度可治疗的，但是，如果癌症已扩散到远处器官，则大约五分之一的患者只能存活五年或更长。
接受肛交与肛门癌的发生强烈相关。肛门被人乳头瘤病毒(HPV)感染导致生殖器疣是该癌症的主要风险因素，并且免疫低下患者易患肛门癌。在该亚组中，预后相比非免疫低下患者而言较差。
肛门癌主要通过化疗和放疗联合治疗。这降低结肠造口术的需要，并使5年生存率超过70％。尽管如此，以这种方式治疗肛门癌从1974年来就没有改变过，并且仅在患者对上述疗法无效时才施行手术。因此，需要治疗肛门癌的替代方法。一种这样的方法是使用重组减毒活疫苗载体诸如单核细胞增多性李斯特菌疫苗载体的免疫疗法。本发明提供用于治疗肛门癌的减毒活李斯特菌疫苗载体。
发明内容
在一个方面，本发明涉及一种治疗人受试者中的肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症的方法，该方法包括向所述受试者施用包括化放疗疗法和重组李斯特菌菌株的联合疗法的步骤，所述李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，从而治疗所述人受试者中的所述肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症。
在另一个方面，本发明涉及一种治疗人受试者中的肛门或阴道瘤变的方法，该方法包括向所述受试者施用包括化放疗疗法和重组李斯特菌菌株的联合疗法的步骤，所述李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，从而治疗所述人受试者中的所述肛门或阴道瘤变。
在又一个方面，本发明涉及包含重组李斯特菌菌株的组合物治疗人受试者中的肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症的用途，所述李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，所述治疗还包括向所述受试者施用化放疗疗法的步骤，从而治疗所述人受试者中的所述肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症。
在再一个方面，本发明涉及包含重组李斯特菌菌株的组合物治疗人受试者中的肛门或阴道瘤变的用途，所述李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，所述治疗还包括向所述受试者施用化放疗疗法的步骤，从而治疗所述人受试者中的所述肛门或阴道瘤变。
在一个相关方面，本发明涉及一种引起人受试者中的抗肿瘤细胞毒性T细胞应答的方法，该方法包括向所述受试者施用所述联合疗法。
本文所公开的其他特征和优点将由于以下详细描述的实例和附图而变得显而易见。但是，应当理解，该详细描述和具体实例尽管指出了本发明的优选实施例，但是仅仅通过例证给出，因为本发明的精神和范围内的各种变化和修改对阅读了该详细描述的本领域技术人员而言将是显而易见的。
附图说明
被视为本发明的主题在说明书的结论部分特别指出并明确要求进行保护。然而，在结合附图阅读时，通过参考以下具体实施方式，可以最好地理解本发明(对组织和操作方法来说皆是如此)及其目的、特征和优点，在附图中：
图1.Lm-E7和Lm-LLO-E7使用不同的表达系统来表达和分泌E7。通过将基因盒引入单核细胞增多性李斯特菌基因组的orfZ域中来产生Lm-E7(A)。hly启动子驱动hly信号序列和LLO的前五个氨基酸(AA)以及随后的HPV-16E7的表达。B)通过以质粒pGG-55转化PrfA-菌株XFL-7来产生Lm-LLO-E7。pGG-55具有驱动LLO-E7非溶血性融合体的表达的hly启动子。pGG-55也含有PrfA基因，以选择XFL-7在体内对质粒的保留。
图2.Lm-E7和Lm-LLO-E7分泌E7。使Lm-Gag(泳道1)、Lm-E7(泳道2)、Lm-LLO-NP(泳道3)、Lm-LLO-E7(泳道4)、XFL-7(泳道5)和10403S(泳道6)在Luria-Bertoni液体培养基中于37℃生长过夜。沉淀相等数目的细菌(通过600nm处吸光度OD确定)，并将18ml的每种上清液进行TCA沉淀。通过Western印迹分析E7表达。用抗E7 mAb、随后用HRP-偶联的抗小鼠(Amersham)探测该印迹，接着使用ECL检测试剂显影。
图3.LLO-E7融合体的肿瘤免疫抑制功效。显示了肿瘤接种后第7、第14、第21、第28和第56天小鼠中以毫米计的肿瘤大小。未暴露的小鼠：空心圆圈；Lm-LLO-E7：实心圆圈；Lm-E7：正方形；Lm-Gag：空心菱形；和Lm-LLO-NP：实心三角形。
图4.来自Lm-LLO-E7-免疫的小鼠的脾细胞在暴露于TC-1细胞时增殖。将C57BL/6小鼠用Lm-LLO-E7、Lm-E7或对照rLm菌株免疫和强化。在强化后6天收获脾细胞，并以显示的比率与经照射的TC-1细胞一起铺板。将细胞用3H胸苷脉冲处理并收获。将Cpm定义为(实验cpm)-(无TC-1对照)。
图5A.在施用TC-1肿瘤细胞并随后施用Lm-E7、Lm-LLO-E7、Lm-ActA-E7或无疫苗(未暴露的)的小鼠中，脾中E7特异性的分泌IFN-γ的CD8+T细胞的诱导和浸润肿瘤的数目。图5B.针对(A)描述的小鼠的脾和肿瘤中E7特异性的CD8+细胞的诱导和浸润。
图6.含有PEST区域的李斯特菌构建体在肿瘤中诱导更高百分比的E7特异性淋巴细胞。图6A.来自1个实验的代表性数据。图6B.来自所有3个实验的数据的平均值和SE。
图7A.传代对重组李斯特菌疫苗载体的细菌负荷(毒力)的作用。上图：Lm-Gag.下图：Lm-LLO-E7图7B.传代对脾脏中重组Lm-E7的细菌负荷的作用。描绘了来自四只小鼠的每毫升脾匀浆的平均活细菌CFU。
图8显示了在施用经传代的Lm-Gag与未传代的Lm-Gag后对于HIV-Gag和LLO而言的抗原特异性CD8+T细胞的诱导。将小鼠用103个(A、B、E、F)或105个(C、D、G、H)CFU的经传代的李斯特菌疫苗载体免疫，并分析抗原特异性T细胞。B、D、F、H：未传代的李斯特菌疫苗载体。A-D：对MHC I类HIV-Gag肽的免疫应答。E-H：对LLO肽的免疫应答。I：来自用105个CFU经传代的Lm-Gag免疫的小鼠的脾细胞用来自HPV E7的对照肽刺激。
图9A显示了在整个LB稳定性研究中的质粒分离。图9B显示了在整个TB稳定性研究中的质粒分离。图9C显示了TB稳定性研究的定量。
图10显示了来自在LB中生长的细菌的活细菌氯霉素(CAP)抗性和CAP敏感性集落形成单位(CFU)的数量。深色条：CAP+；白色条：CAP-。每个时间点的两个深色条和两个白色条代表重复样。
图11显示了来自在TB中生长的细菌的活细菌CAP抗性和CAP敏感性CFU的数量。深色条：CAP+；白色条：CAP。每个时间点的两个深色条和两个白色条代表重复样。
图12.显示了D133V突变区(箭头)的实际色谱图。混合物比率在括号中示出。
图13.ADV451、452和453引物以及在反应中扩增的PrfA基因片段的位置的表示。
图14.使用引物ADV451和ADV453的PCR反应的特异性。
图15.使用引物ADV452和ADV453的PCR反应的特异性。
图16.使用引物ADV452和1ng初始量的DNA进行PCR反应来检测野生型PrfA序列的灵敏度。
图17.使用引物ADV452和5ng初始量的DNA进行PCR反应来检测野生型PrfA序列的灵敏度。
图18.来自图16中描绘的PCR的条带的平均密度。
图19.来自图17中描绘的PCR的条带的平均密度。
图20.对使用引物ADV452进行PCR反应来检测野生型PrfA序列进行的验证。
图21.来自图16中描绘的PCR的条带的平均密度。
图22.对Lm-LLO-E7中的D133V PrfA突变的分析。A，用于密度测量技术的原始图像；B，对图像进行数字增强以有利于观察低密度条带。
图23.显示患者的治疗计划#1。该计划包括在化放疗前施用第一剂ADXS-HPV(ADX)，然后在完成放疗后每28天给予第2-4剂。
图24.显示患者的治疗计划#2，其中在化放疗期间施用第二剂ADXS-HPV。
应当理解，为了阐述的简洁和清楚，显示在图中的要素未必是按比率绘制的。例如，为了清楚，一些要素的尺寸可以是相对其他要素而放大的。另外，在认为适合时，附图标记可以在附图之间重复，以指出对应的或类似的要素。
具体实施方式
本发明在一些实施例中公开治疗疾病、防御疾病以及诱导对疾病的免疫应答的方法，该方法包括向受试者施用重组李斯特菌菌株的步骤，所述菌株表达融合肽，所述融合肽包含李斯特菌溶血素O(LLO)片段和所述疾病表达的异源性抗原或其片断。本发明还提供诱导人受试者中的抗疾病细胞毒性T细胞(CTL)应答并治疗与所述疾病相关的障碍和症状的方法，该方法包括施用重组李斯特菌菌株。在一个实施例中，本文提供一种重组李斯特菌菌株，所述重组李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的第一N末端片段，并且其中所述重组核酸还包含第二开放阅读框，所述第二开放阅读框编码突变体prfA基因。在一个实施例中，突变体PrfA基因是编码第133号氨基酸位置处从氨基酸D或Asp或天冬氨酸盐(或天冬氨酸)到氨基酸V或Val或缬氨酸的点突变的基因。在一个实施例中，本文所公开的重组李斯特菌菌株包含由相同李斯特菌包含的质粒补充的prfA突变或缺失，其中该质粒包含突变体prfA基因，该基因编码包含D133V氨基酸置换的突变体PrfA蛋白。
在另一个实施例中，该重组李斯特菌是减毒的李斯特菌。“减毒”和“减毒的”可涵盖经过修饰以降低对宿主毒性的细菌、病毒、寄生虫、感染性生物体、朊病毒、肿瘤细胞、感染性生物体中的基因等。宿主可以是人或动物宿主，或器官、组织或细胞。以非限制性方式举例，细菌可被减毒以减少与宿主细胞的结合，减少从一个宿主细胞向另一宿主细胞的传播，减少胞外生长，或减少在宿主细胞中的细胞内生长。减毒可通过测量例如毒性的一个或多个指标、LD50、从器官中的清除率或竞争指数而评估(参见例如Auerbuch等人(2001)Infect.Immunity 69:5953-5957)。通常，减毒导致LD50增加和/或清除率增加至少25％；更通常增加至少50％；最通常增加至少100％(2倍)；正常增加至少5倍；更正常增加至少10倍；最正常增加至少50倍；经常增加至少100倍；更经常增加至少500倍；并且最经常增加至少1000倍；一般增加至少5000倍；更一般增加至少10,000倍；并且最一般增加至少50,000倍；并且最经常增加至少100,000倍。
技术人员将容易认识到，术语“减毒基因”可涵盖介导对宿主的毒性、病理或毒力、在宿主内生长或在宿主内存活的基因，其中该基因以减轻、降低或消除毒性、病理或毒力的方式突变。可通过比较由突变基因介导的毒力或毒性与由非突变(或亲本)基因介导的毒力或毒性来评估所述降低或消除。“突变基因”涵盖基因调控区、基因编码区、基因非编码区或其任意组合中的缺失、点突变和移码突变。在一个实施例中，本文提供一种治疗人受试者中的肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症的方法，该方法包括向所述受试者施用包括化放疗疗法和重组李斯特菌菌株的联合疗法的步骤，所述李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，从而治疗所述人受试者中的所述肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症。
在一个实施例中，所述化放疗疗法在第一次施用所述重组李斯特菌菌株之后施用。在另一个实施例中，所述化放疗疗法在施用所述重组李斯特菌菌株之前施用。在另一个实施例中，所述化放疗疗法在第一次施用所述重组李斯特菌菌株之后并在一至三次加强施用所述重组李斯特菌菌株之前施用。在另一个实施例中，所述化放疗疗法与所述重组李斯特菌菌株同时施用。
在一个实施例中，本文所公开的方法包括施用四剂本文所提供的重组李斯特菌。在一个实施例中，该重组李斯特菌表达N末端LLO和异源性抗原的融合蛋白。在另一个实施例中，该异源性抗原为人乳头瘤病毒E7抗原(HPV-E7)。在另一个实施例中，该HPV抗原为HPVE6。
在一个实施例中，在本文所提供的联合疗法中的第一剂所述重组李斯特菌在化放疗疗法之前施用，第2至4剂在完成放疗后每28天施用(参见本文实例11)。在另一个实施例中，第一剂所述重组李斯特菌在化放疗疗法之前施用，第二剂ADXS-HPV在化放疗疗法期间施用，第3至4剂在完成化放疗疗法之后每28天施用(参见实例11)。
在一个实施例中，本文提供与本文所提供的重组李斯特菌联合使用的化放疗方案或化放疗疗法。在另一个实施例中，本文提供的化放疗疗法包括丝裂霉素和氟尿嘧啶(5-FU)以及放射疗法。在另一个实施例中，该化放疗疗法可包括本领域已知的任何其他化疗剂，包括但不限于
在一个实施例中，本文提供的化放疗方案或化放疗疗法包括施用2个疗程的丝裂霉素、5-FU与并行放疗(54Gy，分割成30次，调强放疗)。
在一个实施例中，本文提供的放射持续约6周。在另一个实施例中，该放射持续3周。在另一个实施例中，该放射持续4周。在另一个实施例中，该放射持续5周。在另一个实施例中，该放射持续7周。在另一个实施例中，该放射持续8周。在另一个实施例中，该放射持续6-8周。在另一个实施例中，该放射持续4-6周。在另一个实施例中，该放射持续2-4周。在另一个实施例中，该放射持续8-10周。
在另一个实施例中，本文提供一种引起人受试者中的抗肿瘤细胞毒性T细胞应答的方法，该方法包括向所述受试者施用所述联合疗法。
在一个实施例中，本文提供一种诱导人受试者中对肿瘤或癌症的免疫应答的方法，该方法包括向所述受试者施用包含重组核酸的重组李斯特菌菌株的步骤，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，其中所述重组核酸还包含第二开放阅读框，所述第二开放阅读框编码突变体prfA基因，从而诱导对肿瘤或癌症的免疫应答。在一个实施例中，本发明提供一种治疗人受试者中的癌症的方法，该方法包括向所述受试者施用本文所提供的重组李斯特菌菌株的步骤。在另一个实施例中，本发明提供一种避免人受试者罹患宫颈癌的方法，该方法包括向所述受试者施用本文所提供的重组李斯特菌菌株的步骤。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株表达重组多肽。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含编码重组多肽的质粒。在另一个实施例中，该方法还包括用本发明的重组李斯特菌菌株强化人受试者的步骤。在另一个实施例中，该方法还包括用包含本文所提供的异源性抗原或其片段的免疫原性组合物强化人受试者的步骤。在另一个实施例中，该方法还包括用免疫原性组合物强化人受试者的步骤，该组合物引导受试者的细胞表达该异源性抗原。在另一个实施例中，细胞是肿瘤细胞。在另一个实施例中，该方法还包括用本发明的疫苗强化人受试者的步骤。
在一个实施例中，本发明提供一种诱导人受试者中的抗肿瘤或抗癌症免疫应答的方法，该方法包括向所述受试者施用包含重组李斯特菌菌株的组合物的步骤，所述重组李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，其中所述重组核酸还包含第二开放阅读框，所述第二开放阅读框编码代谢酶，从而诱导对肿瘤或癌症的免疫应答。在另一个实施例中，所述李斯特菌在内源性prfA基因中包含突变。在另一个实施例中，所述李斯特菌在内源性dal/dat和actA基因中包含突变或缺失。
在一个实施例中，本文提供的核酸分子包含编码重组多肽的第一开放阅读框，该重组多肽包含异源性抗原或其片段。在另一个实施例中，该重组多肽还包含融合至异源性抗原的N末端LLO。在另一个实施例中，本文提供的核酸分子还包含编码代谢酶的第二开放阅读框。在另一个实施例中，该代谢酶补充重组李斯特菌菌株的染色体中缺乏的内源性基因。在另一个实施例中，由该第二开放阅读框编码的代谢酶为丙氨酸消旋酶(dal)。在另一个实施例中，由该第二开放阅读框编码的代谢酶为D-氨基酸转移酶(dat)。在另一个实施例中，本文所提供的李斯特菌菌株在基因组dal、dat或actA基因中包含突变、缺失或失活。在另一个实施例中，本文所提供的李斯特菌菌株在基因组dal、dat和actA基因中包含突变、缺失或失活。在另一个实施例中，该李斯特菌缺乏基因组dal、dat或actA基因。在另一个实施例中，该李斯特菌缺乏基因组dal、dat和actA基因。
在一个实施例中，在本文所公开的LLO蛋白和ActA蛋白的背景下的片段是指包含LLO或ActA蛋白的至少5个连续氨基酸残基的氨基酸序列的肽或多肽。在另一个实施例中，该术语是指包含LLO或ActA蛋白或多肽的至少10个连续氨基酸残基、至少15个连续氨基酸残基、至少20个连续氨基酸残基、至少25个连续氨基酸残基、至少40个连续氨基酸残基、至少50个连续氨基酸残基、至少60个连续氨基酸残基、至少70个连续氨基酸残基、至少80个连续氨基酸残基、至少90个连续氨基酸残基、至少100个连续氨基酸残基、至少125个连续氨基酸残基、至少150个连续氨基酸残基、至少175个连续氨基酸残基、至少200个连续氨基酸残基、至少250个连续氨基酸残基、至少300个连续氨基酸残基、至少350个连续氨基酸残基、至少400个连续氨基酸残基或至少450个连续氨基酸残基的氨基酸序列的肽或多肽。
在另一个实施例中，该片段是当呈N末端LLO/异源性抗原融合蛋白或N末端ActA/异源性抗原融合蛋白形式时引起对疾病相关抗原的免疫应答的功能性片段。在另一个实施例中，该片段为免疫原性片段。在另一个实施例中，该片段为功能性的，形式为非融合的。
本发明在某些实施例中提供李斯特菌异源性核酸或李斯特菌内源性核酸的密码子优化。针对每种氨基酸由单核细胞增多性李斯特菌使用的最佳密码子在美国专利公开2007/0207170中示出，该专利据此以引用方式并入本文。如果核酸中的至少一个密码子被下述密码子替换，则核酸为密码子优化的：单核细胞增多性李斯特菌将该密码子比原始序列中的密码子更频繁地用于所述氨基酸。
N末端LLO蛋白片段和异源性抗原在另一个实施例中直接互相融合。在另一个实施例中，编码N末端LLO蛋白片段和异源性抗原的基因直接互相融合。在另一个实施例中，N末端LLO蛋白片段和异源性抗原通过接头肽连接。在另一个实施例中，N末端LLO蛋白片段和异源性抗原通过异源性肽连接。在另一个实施例中，N末端LLO蛋白片段是异源性抗原的N末端。在另一个实施例中，N末端LLO蛋白片段是融合蛋白的最N末端部分。如本文所公开，表达LLO-抗原融合体的重组李斯特菌菌株诱导抗肿瘤免疫(实例1)、引起抗原特异性T细胞增殖(实例2)、产生抗原特异性和肿瘤浸润性T细胞(实例3)。
在另一个实施例中，本发明提供一种治疗人受试者中的宫颈癌的方法，该方法包括向受试者施用重组李斯特菌菌株的步骤，该重组李斯特菌菌株包含含有LLO蛋白的N末端片段和HPV E7抗原的重组多肽，由此重组李斯特菌菌株诱导对E7抗原的免疫应答，从而治疗人受试者中的宫颈癌。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株表达重组多肽。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含编码重组多肽的质粒。
在另一个实施例中，本发明提供一种避免人受试者罹患宫颈癌的方法，该方法包括向受试者施用重组李斯特菌菌株的步骤，该重组李斯特菌菌株包含含有LLO蛋白的N末端片段和HPV E7抗原的重组多肽，由此重组李斯特菌菌株诱导对E7抗原的免疫应答，从而避免人受试者罹患宫颈癌。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株表达重组多肽。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含编码重组多肽的质粒。
在另一个实施例中，本发明提供一种诱导人受试者中对宫颈癌的免疫应答的方法，该方法包括向受试者施用重组李斯特菌菌株的步骤，该重组李斯特菌菌株包含含有LLO蛋白的N末端片段和HPV E7抗原的重组多肽，从而诱导人受试者中对宫颈癌的免疫应答。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株表达重组多肽。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含编码重组多肽的质粒。
在另一个实施例中，本发明提供一种治疗人受试者中的宫颈癌的方法，该方法包括向受试者施用重组李斯特菌菌株的步骤，该重组李斯特菌菌株包含含有ActA蛋白的N末端片段和异源性抗原的重组多肽，由此重组李斯特菌菌株诱导对异源性抗原的免疫应答，从而治疗人受试者中的宫颈癌。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株表达重组多肽。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含编码重组多肽的质粒。
在另一个实施例中，本发明提供一种避免人受试者罹患宫颈癌的方法，该方法包括向受试者施用重组李斯特菌菌株的步骤，该重组李斯特菌菌株包含含有ActA蛋白的N末端片段和异源性抗原的重组多肽，由此重组李斯特菌菌株诱导对异源性抗原的免疫应答，从而避免人受试者罹患宫颈癌。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株表达重组多肽。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含编码重组多肽的质粒。
在另一个实施例中，本发明提供一种诱导人受试者中对宫颈癌的免疫应答的方法，该方法包括向受试者施用重组李斯特菌菌株的步骤，该重组李斯特菌菌株包含含有异源性蛋白的N末端片段和异源性抗原的重组多肽，从而诱导人受试者中对宫颈癌的免疫应答。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株表达重组多肽。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含编码重组多肽的质粒。
N末端ActA蛋白片段和异源性抗原在另一个实施例中直接互相融合。在另一个实施例中，编码N末端ActA蛋白片段和异源性抗原的基因直接互相融合。在另一个实施例中，N末端ActA蛋白片段和异源性抗原通过接头肽连接。在另一个实施例中，N末端ActA蛋白片段和异源性抗原通过异源性肽连接。在另一个实施例中，N末端ActA蛋白片段是异源性抗原的N末端。在另一个实施例中，N末端ActA蛋白片段是融合蛋白的最N末端部分。
在另一个实施例中，本发明提供一种诱导人受试者中对宫颈癌的免疫应答的方法，该方法包括向受试者施用重组李斯特菌菌株的步骤，该重组李斯特菌菌株包含重组多肽，该重组多肽包含含PEST氨基酸序列的肽和异源性抗原，由此重组李斯特菌菌株诱导对异源性抗原的免疫应答，从而治疗人受试者中的宫颈癌。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株表达重组多肽。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含编码重组多肽的质粒。在另一个实施例中，该方法避免人受试者罹患宫颈癌。在另一个实施例中，该方法治疗所述人受试者中的宫颈癌。
含PEST氨基酸序列的肽和异源性抗原在另一个实施例中直接互相融合。在另一个实施例中，编码含PEST氨基酸序列的肽和异源性抗原的基因直接互相融合。在另一个实施例中，含PEST氨基酸序列的肽和异源性抗原通过接头肽连接。在另一个实施例中，含PEST氨基酸序列的肽和异源性抗原通过异源性肽连接。在另一个实施例中，含PEST氨基酸序列的肽是异源性抗原的N末端。在另一个实施例中，含PEST氨基酸序列的肽是融合蛋白的最N末端部分。
在另一个实施例中，本发明提供一种对人受试者进行疫苗接种以防HPV的方法，该方法包括向受试者施用本文所提供的重组李斯特菌菌株的步骤，其中该李斯特菌表达HPVE7抗原并且其中该李斯特菌表达突变体PrfA基因。在另一个实施例中，该突变体PrfA基因为D133V PrfA突变。在另一个实施例中，该突变体PrfA基因在所述重组李斯特菌中的质粒中。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株表达重组多肽。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含编码重组多肽的质粒。在一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含二价游离型表达载体，该载体包含编码异源性抗原多肽或其功能片段的第一和第二核酸分子，其中该第一和第二核酸分子各自编码异源性抗原多肽或其功能片段，与N末端或截短的或脱毒性的李斯特菌溶血素O蛋白(LLO)、或截短的ActA蛋白或PEST氨基酸序列一起处于开放读框中。
在一个实施例中，由二价表达载体表达的异源性抗原为HPV16 E7和HPV18E7。
在一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含三价游离型表达载体，该载体包含第一、第二和第三核酸分子，它们各自编码异源性抗原多肽或其功能片段，其中该第一至第三核酸分子各自编码异源性抗原多肽或其功能片段，与N末端或截短的或脱毒性的李斯特菌溶血素O蛋白(LLO)、截短的ActA蛋白或PEST氨基酸序列一起处于开放读框中。
在一个实施例中，本文所公开的二价、三价或四价重组李斯特菌菌株从染色体外质粒或游离体中的开放阅读框表达至少一种异源性抗原。在另一个实施例中，本文所公开的二价或三价重组李斯特菌菌株从至少一个染色体外质粒或游离体中的开放阅读框表达至少一种异源性抗原。在另一个实施例中，本文所公开的二价重组李斯特菌菌株从两个染色体外质粒或游离体的开放阅读框表达两种异源性抗原。在另一个实施例中，本文所公开的三价重组李斯特菌菌株从三个染色体外质粒或游离体的开放阅读框表达三种异源性抗原。在另一个实施例中，本文所公开的四价重组李斯特菌菌株从四个染色体外质粒或游离体的开放阅读框表达四种异源性抗原。
在另一个实施例中，本文所公开的二价、三价或四价重组李斯特菌菌株从李斯特菌基因组中的开放阅读框表达至少一种异源性抗原。在另一个实施例中，本文所提供的二价、三价或四价重组李斯特菌菌株从染色体外质粒或游离体以及从本文所提供的李斯特菌的基因组两者表达至少一种异源性抗原。在另一个实施例中，各异源性抗原与本文所提供的含PEST的多肽或肽在融合蛋白中表达。
在一个实施例中，本发明涵盖的二价和多价重组李斯特菌包括在美国专利公布No.2011/0129499和美国专利公布No.2012/0135033中所述的那些，这两篇专利均全文以引用方式并入本文。
在另一个实施例中，受试者处于发生HPV介导的癌变(例如，宫颈癌)风险中。在另一个实施例中，受试者为HPV阳性的。在另一个实施例中，受试者表现出宫颈上皮内瘤样病变。在另一个实施例中，受试者表现出鳞状上皮内病变。在另一个实施例中，受试者表现出宫颈发育异常。
在一个实施例中，该异源性抗原是本领域已知的且本文所提供的任何肿瘤相关抗原。在另一个实施例中，该异源性抗原是自身免疫抗原。在另一个实施例中，该异源性抗原是感染性疾病抗原。在另一个实施例中，该异源性抗原是HPV相关抗原。
为本文所公开的方法的靶标的HPV在另一个实施例中为HPV 16。在另一个实施例中，该HPV为HPV-18。在另一个实施例中，该HPV选自HPV-16和HPV-18。在另一个实施例中，该HPV为HPV-31。在另一个实施例中，该HPV为HPV-35。在另一个实施例中，该HPV为HPV-39。在另一个实施例中，该HPV为HPV-45。在另一个实施例中，该HPV为HPV-51。在另一个实施例中，该HPV为HPV-52。在另一个实施例中，该HPV为HPV-58。在另一个实施例中，该HPV为高风险HPV型。在另一个实施例中，该HPV为粘膜HPV型。
在另一个实施例中，本发明提供一种针对目的抗原对人受试者进行疫苗接种的方法，该方法包括向人受试者静脉内施用包含或表达该目的抗原的重组李斯特菌菌株的步骤，其中第一肽选自(a)LLO蛋白的N末端片段、(b)ActA蛋白或其N末端片段和(c)含PEST氨基酸序列的肽，从而针对目的抗原对人受试者进行疫苗接种。
在另一个实施例中，本发明提供一种针对目的抗原对人受试者进行疫苗接种的方法，该方法包括向人受试者静脉内施用免疫原性组合物的步骤，该组合物包含第一肽与目的抗原的融合体，其中该第一肽选自(a)LLO蛋白的N末端片段、(b)ActA蛋白或其N末端片段和(c)含PEST氨基酸序列的肽，从而针对目的抗原对人受试者进行疫苗接种。
在另一个实施例中，本发明提供一种针对目的抗原对人受试者进行疫苗接种的方法，该方法包括向人受试者静脉内施用包含重组多肽的重组李斯特菌菌株的步骤，该重组多肽包含融合至目的抗原的第一肽，其中该第一肽选自(a)LLO蛋白的N末端片段、(b)ActA蛋白或其N末端片段和(c)含PEST氨基酸序列的肽，从而针对目的抗原对人受试者进行疫苗接种。
在另一个实施例中，本发明提供一种诱导人受试者中针对目的抗原的CTL应答的方法，该方法包括向人受试者施用包含或表达目的抗原的重组李斯特菌菌株的步骤，从而诱导人受试者中针对目的抗原的CTL应答。在另一个实施例中，施用步骤为静脉内施用。
如本文所公开，表达LLO-抗原融合体的重组李斯特菌菌株诱导抗肿瘤免疫(实例1)、引起抗原特异性T细胞增殖(实例2)、产生抗原特异性和肿瘤浸润性T细胞(实例3)。因此，本文所公开的疫苗有效诱导对E7和E6的免疫应答。
在另一个实施例中，本发明提供一种诱导受试者中的癌症消退的方法，该方法包括向受试者施用本文所提供的重组李斯特菌菌株的步骤。
在另一个实施例中，本发明提供一种降低受试者中的癌症的发生率或复发率的方法，该方法包括向受试者施用本文所提供的重组李斯特菌菌株的步骤。
在另一个实施例中，本发明提供一种抑制受试者中的肿瘤形成的方法，该方法包括向受试者施用本文所提供的重组李斯特菌菌株的步骤。
在另一个实施例中，本发明提供一种诱导受试者中的癌症缓解的方法，该方法包括向受试者施用本文所提供的重组李斯特菌菌株的步骤。
在另一个实施例中，本发明提供一种阻遏人受试者中的肿瘤生长的方法，该方法包括向受试者施用本文所提供的重组李斯特菌菌株的步骤。
在另一个实施例中，本发明提供一种减小受试者中的肿瘤大小的方法，该方法包括向受试者施用本文所提供的重组李斯特菌菌株的步骤。
在一个实施例中，疾病为感染性疾病、自身免疫疾病、呼吸疾病、癌前病症或癌症。
技术人员将容易认识到，术语“癌前病症”可涵盖发育异常、肿瘤发生前结节；大再生结节(MRN)；低级别异型增生结节(LG-DN)；高级别异型增生结节(HG-DN)；胆管上皮发育异常；变异肝细胞病灶(FAH)；变异肝细胞结节(NAH)；染色体失衡；端粒酶异常活化；端粒酶催化亚单位再表达；内皮细胞标记物诸如CD31、CD34和BNH9的表达(参见例如Terracciano和Tomillo(2003)Pathologica 95:71-82；Su和Bannasch(2003)Toxicol.Pathol.31:126-133；Rocken和Carl-McGrath(2001)Dig.Dis.19:269-278；Kotoula等人(2002)Liver 22:57-69；Frachon等人(2001)J.Hepatol.34:850-857；Shimonishi等人(2000)J.Hepatobiliary Pancreat.Surg.7:542-550；Nakanuma等人(2003)J.HepatobiliaryPancreat.Surg.10:265-281)。诊断癌症和发育异常的方法已有公开(参见例如Riegler(1996)Semin.Gastrointest.Dis.7:74-87；Benvegnu等人(1992)Liver 12:80-83；Giannini等人(1987)Hepatogastroenterol.34:95-97；Anthony(1976)Cancer Res.36:2579-2583)。
在一个实施例中，感染性疾病为由以下病原体的任一种但并不限于它们所引起的感染性疾病：BCG/结核病、疟疾、恶性疟原虫、三日疟原虫、间日疟原虫、轮状病毒、霍乱、白喉-破伤风、百日咳、流感嗜血杆菌、乙型肝炎、人乳头瘤病毒、季节性流感)、A型流感(H1N1)流行病、麻疹和风疹、腮腺炎、脑膜炎球菌A+C、口服脊髓灰质炎疫苗(单价、二价和三价)、肺炎球菌、狂犬病、破伤风类毒素、黄热病、炭疽芽孢杆菌(炭疽)、肉毒棱状芽孢杆菌毒素(肉毒中毒)、鼠疫耶尔森菌(瘟疫)、重型天花(天花)和其他有关的痘病毒、土拉热弗朗西丝菌(土拉菌病)、病毒性出血热、沙粒病毒(LCM、胡宁病毒、马丘波病毒、瓜纳瑞托病毒、拉沙热)、布尼亚病毒(汉坦病毒属、裂谷热)、黄病毒属(登革热)、线状病毒(埃博拉病毒、马尔堡病毒)、假鼻疽伯克霍尔德菌、伯内特考克斯体(Q热)、布鲁杆菌属种(布鲁杆菌病)、鼻疽伯克霍尔德菌(鼻疽)、鹦鹉衣原体(鹦鹉热)、蓖麻蛋白毒素(来自蓖麻)、产气荚膜梭菌的ε毒素、葡萄球菌肠毒素B、斑疹伤寒热(普氏立克次体)、其他立克次体、食品和水传播的病原体、细菌(致腹泻性的大肠杆菌、致病性的弧菌属、志贺氏菌属种、沙门氏菌属BCG/、空肠弯曲杆菌、小肠结肠炎耶尔森菌)、病毒(杯状病毒、甲型肝炎、西尼罗病毒、LaCrosse、加利福尼亚脑炎、VEE、EEE、WEE、日本脑炎病毒、科萨努尔森林病毒、尼帕病毒、汉坦病毒属、蜱传出血热病毒、切昆贡亚病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、蜱传脑炎病毒、乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、单纯疱疹病毒(HSV)、人免疫缺陷病毒(HIV)、人乳头状瘤病毒(HPV)、原生动物(小隐孢子虫、卡晏环孢子虫、兰伯贾第虫、溶组织内阿米巴、弓形虫属)、真菌(微孢子目)、黄热病、结核病(包括耐药的TB)、狂犬病、朊病毒、严重急性呼吸综合征相关的冠状病毒(SARS-CoV)、Coccidioides posadasii、粗球孢子菌、细菌性阴道病、沙眼衣原体、巨细胞病毒、腹股沟肉芽肿、杜克雷嗜血杆菌、淋病奈瑟球菌、苍白密螺旋体、阴道毛滴虫或本领域已知的在本文中没有列出的任何其他感染性疾病。
在另一个实施例中，该感染性疾病是家畜感染性疾病。在另一个实施例中，家畜疾病可传播给人，并被称作“人畜共患病”。在另一个实施例中，这些疾病包括但不限于口蹄疫、西尼罗病毒、狂犬病、犬细小病毒、猫白血病病毒、马流感病毒、传染性牛鼻气管炎(IBR)、伪狂犬病、古典猪瘟(CSF)、由牛1型牛疱疹病毒(BHV-1)感染造成的IBR以及猪伪狂犬病(奥尔斯基病)、弓形虫病、炭疽、水疱性口炎病毒、马红球菌、土拉菌病、瘟疫(鼠疫耶尔森菌)、毛滴虫。
在另一个实施例中，本文提供的疾病为呼吸道疾病或炎症性疾病。在另一个实施例中，该呼吸道疾病或炎症性疾病为慢性阻塞性肺病(COPD)。在另一个实施例中，该疾病为哮喘。
在一个实施例中，活的减毒李斯特菌菌株能够缓解哮喘症状，无需其他治疗剂的共施用，例如抗炎剂或支气管扩张剂。在一个实施例中，本文提供的方法还包括以活的减毒李斯特菌菌株和一种或多种治疗剂向受试者共施用的步骤。在另一个实施例中，该治疗剂为平喘药。在另一个实施例中，该治疗剂为抗炎剂、非甾体抗炎剂、抗生素、抗胆碱能药、支气管扩张药、皮质类固醇、短效β受体激动剂、长效β受体激动剂、组合吸入剂、抗组织胺药或它们的组合。
在一个实施例中，本文提供的疾病为癌症或肿瘤。在一个实施例中，该肿瘤为癌性的。在另一个实施例中，该癌症为乳腺癌。在另一个实施例中，该癌症为宫颈癌。在另一个实施例中，该癌症为含Her2癌症。在另一个实施例中，该癌症为黑素瘤。在另一个实施例中，该癌症为胰腺癌。在另一个实施例中，该癌症为卵巢癌。在另一个实施例中，该癌症为胃癌。在另一个实施例中，该癌症为胰腺的癌性病变。在另一个实施例中，该癌症为肺腺癌。在另一个实施例中，其为多形性胶质母细胞瘤。在另一个实施例中，该癌症为结直肠腺癌。在另一个实施例中，该癌症为肺鳞癌。在另一个实施例中，该癌症为胃腺癌。在另一个实施例中，该癌症为卵巢表面上皮肿瘤(例如其良性的、增生性的或恶性的种类)。在另一个实施例中，该癌症为口腔鳞状细胞癌。在另一个实施例中，该癌症为非小细胞肺癌。在另一个实施例中，该癌症为子宫内膜癌。在另一个实施例中，该癌症为膀胱癌。在另一个实施例中，该癌症为头颈癌。在另一个实施例中，该癌症为前列腺癌。在另一个实施例中，该癌症为口咽癌。在另一个实施例中，该癌症为肺癌。在另一个实施例中，该癌症为肛门癌。在另一个实施例中，该癌症为结肠直肠癌。在另一个实施例中，该癌症为阴道癌。在另一个实施例中，该癌症为食道癌。本文所公开的方法靶向的宫颈肿瘤在另一个实施例中为鳞状细胞癌。在另一个实施例中，该宫颈肿瘤为腺癌。在另一个实施例中，该宫颈肿瘤为腺鳞癌。在另一个实施例中，该宫颈肿瘤为小细胞癌。在另一个实施例中，该宫颈肿瘤为本领域已知的任何其他类型的宫颈肿瘤。
在一个实施例中，本文提供的疾病为瘤变。在另一个实施例中，该瘤变为肛门上皮内瘤变(AIN)。在另一个实施例中，该瘤变为阴道上皮内瘤变(VIN)。
本文所公开的方法靶向的宫颈肿瘤在另一个实施例中为鳞状细胞癌。在另一个实施例中，该宫颈肿瘤为腺癌。在另一个实施例中，该宫颈肿瘤为腺鳞癌。在另一个实施例中，该宫颈肿瘤为小细胞癌。在另一个实施例中，该宫颈肿瘤为本领域已知的任何其他类型的宫颈肿瘤。
在一个实施例中，本文所提供的抗原为异源性肿瘤抗原，其在本文也称为“肿瘤抗原、“抗原性多肽”或“外源抗原”。在另一个实施例中，该抗原为人类乳头瘤病毒E7(HPV-E7)抗原，其在一个实施例中来自HPV16(在一个实施例中，GenBank登录号AAD33253)，在另一个实施例中来自HPV18(在一个实施例中，GenBank登录号P06788)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为HPV-E6，其在一个实施例中来自HPV16(在一个实施例中，GenBank登录号AAD33252、AAM51854、AAM51853或AAB67615)，在另一个实施例中来自HPV18(在一个实施例中，GenBank登录号P06463)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为Her/2-neu抗原。在另一个实施例中，该抗原性多肽为前列腺特异性抗原(PSA)(在一个实施例中GenBank登录号CAD30844、CAD54617、AAA58802或NP_001639)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为角质层胰凝乳蛋白酶(SCCE)抗原(在一个实施例中，GenBank登录号AAK69652、AAK69624、AAG33360、AAF01139或AAC37551)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为Wilms肿瘤抗原1，其在另一个实施例中为WT-1端粒酶(GenBank登录号P49952、P22561、NP_659032、CAC39220.2或EAW68222.1)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为hTERT或端粒酶(GenBank登录号NM003219(变体1)、NM198255(变体2)、NM 198253(变体3)或NM 198254(变体4)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为蛋白酶3(在一个实施例中，GenBank登录号M29142、M75154、M96839、X55668、NM 00277、M96628或X56606)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为酪氨酸酶相关蛋白2(TRP2)(在一个实施例中，GenBank登录号NP_001913、ABI73976、AAP33051或Q95119)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为高分子量黑素瘤相关抗原(HMW-MAA)(在一个实施例中，GenBank登录号NP_001888、AAI28111或AAQ62842)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为Testisin(在一个实施例中，GenBank登录号AAF79020、AAF79019、AAG02255、AAK29360、AAD41588或NP_659206)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为NY-ESO-1抗原(在一个实施例中，GenBank登录号CAA05908、P78358、AAB49693或NP_640343)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为PSCA(在一个实施例中，GenBank登录号AAH65183、NP_005663、NP_082492、O43653或CAB97347)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为白介素(IL)13受体α(在一个实施例中，GenBank登录号NP_000631、NP_001551、NP_032382、NP_598751、NP_001003075或NP_999506)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为碳酸酐酶IX(CAIX)(在一个实施例中，GenBank登录号CAI13455、CAI10985、EAW58359、NP_001207、NP_647466或NP_001101426)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为癌胚抗原(CEA)(在一个实施例中，GenBank登录号AAA66186、CAA79884、CAA66955、AAA51966、AAD15250或AAA51970)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为MAGE-A(在一个实施例中，GenBank登录号NP_786885、NP_786884、NP_005352、NP_004979、NP_005358或NP_005353)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为存活素(在一个实施例中，GenBank登录号AAC51660、AAY15202、ABF60110、NP_001003019或NP_001082350)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为GP100(在一个实施例中，GenBank登录号AAC60634、YP_655861或AAB31176)。在另一个实施例中，该抗原性多肽为本领域已知的任何其他抗原性多肽。在另一个实施例中，本文所公开的组合物和方法的抗原性肽包含所述抗原性多肽的免疫原性部分。
在另一个实施例中，该抗原为HPV-E6。在另一个实施例中，该抗原为端粒酶(TERT)。在另一个实施例中，该抗原为LMP-1。在另一个实施例中，该抗原为p53。在另一个实施例中，该抗原为间皮素。在另一个实施例中，该抗原为EGFRVIII。在另一个实施例中，该抗原为碳酸酐酶IX(CAIX)。在另一个实施例中，该抗原为PSMA。在另一个实施例中，该抗原为HMW-MAA。在另一个实施例中，该抗原为HIV-1Gag。在另一个实施例中，该抗原为酪氨酸酶相关蛋白2。在另一个实施例中，该抗原选自HPV-E7、HPV-E6、Her-2、HIV-1Gag、LMP-1、p53、PSMA、癌胚抗原(CEA)、LMP-1、激肽释放酶相关肽酶3(KLK3)、KLK9、Muc、酪氨酸酶相关蛋白2、Muc1、FAP、IL-13Rα2、PSA(前列腺特异性抗原)、gp-100、热休克蛋白70(HSP-70)、β-HCG、EGFR-III、粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、血管生成素、促血管生成素-1、Del-1、成纤维细胞生长因子：酸性(aFGF)或碱性(bFGF)、卵泡抑素、粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、肝细胞生长因子(HGF)/分散因子(SF)、白细胞介素-8(IL-8)、痩素、中期因子、胎盘生长因子、血小板衍生内皮细胞生长因子(PD-ECGF)、血小板衍生生长因子-BB(PDGF-BB)、多效生长因子(PTN)、颗粒蛋白前体、增殖素、转化生长因子-α(TGF-α)、转化生长因子-β(TGF-β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、血管内皮生长因子(VEGF)/血管渗透因子(VPF)、VEGFR、VEGFR2(KDR/FLK-1)或其片段、FLK-1或其表位、FLK-E1、FLK-E2、FLK-I1、内皮因子或其片段、神经菌毛素1(NRP-1)、促血管生成素-1(Ang1)、Tie2、血小板衍生生长因子(PDGF)、血小板衍生生长因子受体(PDGFR)、转化生长因子-β(TGF-β)、内皮因子、TGF-β受体、单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)、VE-钙粘蛋白、CD31、ephrin、ICAM-1、V-CAM-1、VAP-1、E-选择素、纤溶酶原激活物、纤溶酶原激活物抑制剂-1、一氧化氮合酶(NOS)、COX-2、AC133或Id1/Id3、促血管生成素3、促血管生成素4、促血管生成素6、CD105、EDG、HHT1、ORW、ORW1或TGFβ共受体或它们的组合。在另一个实施例中，所述抗原为美国专利申请公开No.2011/0142791中公开的嵌合Her2抗原，通过引用将该专利全文并入本文。对本文提供的抗原的片段的使用也涵盖在本发明中。
在另一个实施例中，本文所提供的异源性肿瘤抗原为肿瘤相关抗原，其在一个实施例中为以下肿瘤抗原之一：MAGE(黑素瘤相关抗原E)蛋白，例如MAGE 1、MAGE 2、MAGE 3、MAGE 4、酪氨酸酶；突变体ras蛋白；突变体p53蛋白；p97黑素瘤抗原、与晚期癌症相关的ras肽或p53肽；与宫颈癌相关的HPV 16/18抗原、与乳腺癌相关的KLH抗原、与结肠直肠癌相关的CEA(癌胚抗原)、与黑素瘤相关的MART1抗原或与前列腺癌相关的PSA抗原。在另一个实施例中，用于本文提供的组合物和方法的抗原为黑素瘤相关抗原，其在一个实施例中为TRP-2、MAGE-1、MAGE-3、gp-100、酪氨酸酶、HSP-70、β-HCG或它们的组合。应当理解，技术人员能够将本文未提到但本领域已知的任何异源抗原用在本文提供的方法和组合物中。还应当理解的是，本发明提供但不限于编码本文所公开的至少一种抗原的核酸的减毒李斯特菌。本发明涵盖编码所公开的抗原的突变体、突变蛋白、剪接变体、片段、截短的变体、可溶性变体、胞外域、胞内域、成熟序列等的核酸。提供了编码这些抗原的表位、寡肽和多肽的核酸。还提供了密码子优化的实施例，即针对在李斯特菌中的表达而优化。所引用的参考文献、GenBank登录号以及本文所公开的核酸、肽和多肽均整体以引用方式并入本文。在另一个实施例中，所选的核酸序列可编码全长或截短的基因、融合或标记的基因，并且可以是cDNA、基因组DNA或DNA片段，优选cDNA。其根据需要可以突变或以其他方式修饰。这些修饰包括密码子优化以优化密码子在所选宿主细胞或细菌即李斯特菌中的使用。所选的序列也可以编码分泌的、细胞质的、细胞核的、膜结合的或细胞表面的多肽。
在一个实施例中，血管内皮生长因子(VEGF)为重要的参与血管发生(胚胎循环系统的形成)和血管生成(从现存脉管系统生长血管)的信号蛋白。在一个实施例中，VEGF活性主要限于血管内皮的细胞，尽管其对有限数量的其他细胞类型有作用(例如刺激单核细胞/巨噬细胞迁移)。VEGF在体外已显示出刺激内皮细胞有丝分裂和细胞迁移。VEGF还增强微血管渗透性，并且有时也被称为血管通透性因子。
在一个实施例中，VEGF家族的所有成员都刺激细胞应答，这通过结合细胞表面上的酪氨酸激酶受体(VEGFR)，导致它们二聚化并经由转磷酸作用而被活化来实现。该VEGF受体具有由7个免疫球蛋白样域组成的胞外部分、单个跨膜区和含有分开的酪氨酸激酶域的胞内部分。
在一个实施例中，VEGF-A为VEGFR-2(KDR/Flk-1)配体以及VEGFR-1(Flt-1)配体。在一个实施例中，VEGFR介导几乎全部已知的对VEGF的细胞应答。VEGFR-1的功能不太明确，尽管在一个实施例中认为其通过隔离VEGF与VEGFR-2结合而调节VEGFR-2信号转导，在一个实施例中，这在胚胎的血管发生期间是尤其重要的。在一个实施例中，VEGF-C和VEGF-D为VEGFR-3受体的配体，该VEGFR-3受体在一个实施例中介导淋巴管生成。
在一个实施例中，本文所公开的组合物包含VEGF受体或其片段，其在一个实施例中为VEGFR-2，在另一个实施例中为VEGFR-1，以及在另一个实施例中为VEGFR-3。
在一个实施例中，血管内皮生长因子受体2(VEGFR2)在活化的内皮细胞(EC)上高表达并参与新血管的形成。在一个实施例中，VEGFR2结合VEGF的全部5个同种型。在一个实施例中，VEGF经由VEGFR2在EC上的信号转导诱导增殖、迁移和最终的分化。在一个实施例中，VEGFR2的小鼠同源物为胎儿肝激酶基因-1(Flk-1)，其为强治疗靶标，并在肿瘤生长、入侵和转移中起重要作用。在一个实施例中，VEGFR2也称为激酶插入区受体(III型受体酪氨酸激酶)(KDR)、分化群309(CD309)、FLK1、Ly73、Krd-1、VEGFR、VEGFR-2或6130401C07。
在一个实施例中，抗原源自真菌病原体、细菌、寄生虫、蠕虫或病毒。在另一个实施例中，该抗原选自破伤风类毒素、来自流感病毒的血凝素分子、白喉类毒素、HIV gp120、HIVgag蛋白、IgA蛋白酶、胰岛素肽B、马铃薯粉痂病菌(Spongospora subterranea)抗原、弧菌抗原、沙门氏菌(Salmonella)抗原、肺炎球菌抗原、呼吸道合胞体病毒抗原、流感嗜血杆菌(Haemophilus influenza)外膜蛋白、幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)脲酶、脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidis)菌毛蛋白、淋病奈瑟菌(N.gonorrhoeae)菌毛蛋白、黑素瘤相关抗原(TRP-2、MAGE-1、MAGE-3、gp-100、酪氨酸酶、MART-1、HSP-70、β-HCG)、来自HPV-16、HPV-18、HPV-31、HPV-33、HPV-35或HPV-45型人类乳头瘤病毒的人类乳头瘤病毒抗原E1和E2、肿瘤抗原CEA、突变或者其他形式的ras蛋白、突变或者其他形式的p53蛋白、Muc1或pSA。
在其他实施例中，抗原与以下疾病之一相关：霍乱、白喉、嗜血杆菌、甲型肝炎、乙型肝炎、流感、麻疹、脑膜炎、腮腺炎、百日咳、天花、肺炎球菌肺炎、脑灰质炎、狂犬病、风疹、破伤风、肺结核、伤寒、水痘-带状疱疹、百日咳、黄热病、来自爱迪生氏病的免疫原和抗原、过敏症、过敏反应、布鲁顿综合征、癌症、包括实体和血源性肿瘤、湿疹、桥本氏甲状腺炎、多肌炎、皮肌炎、1型糖尿病、获得性免疫缺陷综合征、移植排斥、例如肾、心脏、胰腺、肺、骨骼和肝脏移植物、格雷夫斯病、多内分泌自身免疫病、肝炎、显微镜下多动脉炎、结节性多动脉炎、天疱疮、原发性胆汁性肝硬化、恶性贫血、乳糜泻、抗体介导的肾炎、血管球性肾炎、风湿病、全身性红斑狼疮、类风湿性关节炎、血清阴性脊椎关节病、鼻炎、Sjogren综合征、全身性硬化症、硬化性胆管炎、韦格纳氏肉芽肿、疱疹样皮炎、牛皮癣、白癜风、多发性硬化症、脑脊髓炎、吉兰-巴雷综合征、重症肌无力、兰伯特-伊顿综合征、巩膜、巩膜外层、色素层炎、慢性粘膜皮肤念珠菌病、风疹、婴儿短暂性低丙种球蛋白血症、骨髓瘤、X-连锁高IgM综合征、斯科特-奥尔德里奇综合征、共济失调性毛细血管扩张症、自身免疫性溶血性贫血、自身免疫性血小板减少症、自身免疫性中性粒细胞减少症、瓦尔登斯特伦巨球蛋白血、淀粉样变性、慢性淋巴细胞白血病、非霍奇金淋巴瘤、恶性疟原虫环子孢子蛋白、微生物抗原、病毒抗原、自身抗原以及李斯特菌病。
在另一个实施例中，在用于治疗宫颈癌、防御宫颈癌或诱导对宫颈癌的免疫应答的本文所公开的方法中，代替E7抗原或作为其补充，使用HPV E6抗原。
在另一个实施例中，在用于治疗宫颈癌、防御宫颈癌或诱导对宫颈癌的免疫应答的本文所公开的方法中，代替LLO片段或作为其补充，使用ActA蛋白片段。
在另一个实施例中，在用于治疗宫颈癌、防御宫颈癌或诱导对宫颈癌的免疫应答的本文所公开的方法中，代替LLO片段或作为其补充，使用含PEST氨基酸序列的蛋白片段。
在另一个实施例中，本文公开了包含本发明的重组李斯特菌的免疫原性组合物。在另一个实施例中，本文所公开的方法和组合物的免疫原性组合物包含本发明的重组疫苗载体。在另一个实施例中，免疫原性组合物包含本发明的质粒。在另一个实施例中，免疫原性组合物包含佐剂。在一个实施例中，本文所公开的载体可作为疫苗组合物的一部分施用。
在另一个实施例中，本文所公开的疫苗与佐剂一起递送。在一个实施例中，佐剂有利于主要由Th1介导的免疫应答。在另一个实施例中，佐剂有利于Th1型免疫应答。在另一个实施例中，佐剂有利于Th1介导的免疫应答。在另一个实施例中，佐剂有利于细胞介导的免疫应答超过抗体介导的应答。在另一个实施例中，佐剂是本领域已知的任何其他类型的佐剂。在另一个实施例中，免疫原性组合物诱导针对存在于肿瘤细胞上的靶蛋白的T细胞免疫应答的形成。
在另一个实施例中，本发明提供一种诱导人受试者中的抗E7细胞毒性T细胞(CTL)应答的方法，该方法包括向受试者施用重组李斯特菌菌株的步骤，该重组李斯特菌菌株包含含有LLO蛋白的N末端片段和HPV E7抗原的重组多肽，从而诱导人受试者中的抗E7CTL应答。在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株包含编码重组多肽的质粒。在另一个实施例中，该方法还包括用本发明的重组李斯特菌菌株强化受试者的步骤。在另一个实施例中，该方法还包括用包含E7抗原的免疫原性组合物强化受试者的步骤。在另一个实施例中，该方法还包括用免疫原性组合物强化受试者的步骤，该组合物引导受试者的细胞表达E7抗原。在另一个实施例中，CTL应答能够对HPV介导的疾病、障碍或症状产生治疗性功效。在另一个实施例中，CTL应答能够对HPV介导的疾病、障碍或症状产生预防性功效。
在另一个实施例中，本发明提供治疗或改善受试者中的HPV介导的疾病、障碍或症状的方法，该方法包括向受试者施用重组李斯特菌菌株的步骤，该重组李斯特菌菌株包含含有LLO蛋白的N末端片段和HPV E7抗原的重组多肽，由此重组李斯特菌菌株诱导对E7抗原的免疫应答，从而治疗或改善受试者中的HPV介导的疾病、障碍或症状。在另一个实施例中，受试者是人受试者。在另一个实施例中，受试者是非人受试者。在另一个实施例中，受试者是本领域已知的任何其他类型的受试者。
导致疾病、障碍或症状的HPV在另一个实施例中为HPV 16。在另一个实施例中，该HPV为HPV-18。在另一个实施例中，该HPV为HPV-31。在另一个实施例中，该HPV为HPV-35。在另一个实施例中，该HPV为HPV-39。在另一个实施例中，该HPV为HPV-45。在另一个实施例中，该HPV为HPV-51。在另一个实施例中，该HPV为HPV-52。在另一个实施例中，该HPV为HPV-58。在另一个实施例中，该HPV为高风险HPV型。在另一个实施例中，该HPV为粘膜HPV型。
在另一个实施例中，HPV介导的疾病、障碍或症状为生殖器疣。在另一个实施例中，HPV介导的疾病、障碍或症状为非生殖器疣。在另一个实施例中，HPV介导的疾病、障碍或症状为呼吸道乳头瘤。在另一个实施例中，HPV介导的疾病、障碍或症状为本领域已知的任何其他HPV介导的疾病、障碍或症状。
在另一个实施例中，在用于治疗或改善HPV介导的疾病、障碍或症状的本文所公开的方法中，代替E7抗原或作为其补充，使用HPV E6抗原。
在另一个实施例中，在用于治疗或改善HPV介导的疾病、障碍或症状的本文所公开的方法中，代替LLO片段或作为其补充，使用ActA蛋白片段。
在另一个实施例中，在用于治疗或改善HPV介导的疾病、障碍或症状的本文所公开的方法中，代替LLO片段或作为其补充，使用含PEST氨基酸序列的蛋白片段。
在另一个实施例中，在用于治疗或改善HPV介导的疾病、障碍或症状的本文所公开的方法中，代替E7抗原或作为其补充，使用HPV E6抗原。
本文所公开的方法和组合物的抗原在另一个实施例中为HPV E7蛋白。在另一个实施例中，该抗原为HPV E6蛋白。在另一个实施例中，该抗原为本领域已知的任何其他HPV蛋白。
“E7抗原”在另一个实施例中是指E7蛋白。在另一个实施例中，该术语是指E7片段。在另一个实施例中，该术语是指E7肽。在另一个实施例中，该术语是指本领域已知的任何其他类型的E7抗原。
本文所公开的方法和组合物的E7蛋白在另一个实施例中为HPV 16E7蛋白。在另一个实施例中，该E7蛋白为HPV-18E7蛋白。在另一个实施例中，该E7蛋白为HPV-31E7蛋白。在另一个实施例中，该E7蛋白为HPV-35E7蛋白。在另一个实施例中，该E7蛋白为HPV-39E7蛋白。在另一个实施例中，该E7蛋白为HPV-45E7蛋白。在另一个实施例中，该E7蛋白为HPV-51E7蛋白。在另一个实施例中，该E7蛋白为HPV-52E7蛋白。在另一个实施例中，该E7蛋白为HPV-58E7蛋白。在另一个实施例中，该E7蛋白为高风险HPV型E7蛋白。在另一个实施例中，该E7蛋白为粘膜HPV型E7蛋白。
“E6抗原”在另一个实施例中是指E6蛋白。在另一个实施例中，该术语是指E6片段。在另一个实施例中，该术语是指E6肽。在另一个实施例中，该术语是指本领域已知的任何其他类型的E6抗原。
本文所公开的方法和组合物的E6蛋白在另一个实施例中为HPV 16E6蛋白。在另一个实施例中，该E6蛋白为HPV-18E6蛋白。在另一个实施例中，该E6蛋白为HPV-31E6蛋白。在另一个实施例中，该E6蛋白为HPV-35E6蛋白。在另一个实施例中，该E6蛋白为HPV-39E6蛋白。在另一个实施例中，该E6蛋白为HPV-45E6蛋白。在另一个实施例中，该E6蛋白为HPV-51E6蛋白。在另一个实施例中，该E6蛋白为HPV-52E6蛋白。在另一个实施例中，该E6蛋白为HPV-58E6蛋白。在另一个实施例中，该E6蛋白为高风险HPV型E6蛋白。在另一个实施例中，该E6蛋白为粘膜HPV型E6蛋白。
本文所公开的方法和组合物所诱导的免疫应答在另一个实施例中为T细胞应答。在另一个实施例中，免疫应答包括T细胞应答。在另一个实施例中，该应答为CD8+T细胞应答。在另一个实施例中，该应答包括CD8+T细胞应答。
在一个实施例中，本文所公开的组合物诱导强烈的干扰素-γ先天刺激，该干扰素-γ在一个实施例中具有抗血管新生性质。在一个实施例中，本文所公开的李斯特菌诱导强烈的干扰素-γ先天刺激，该干扰素-γ在一个实施例中具有抗血管新生性质(Dominiecki等人,Cancer Immunol Immunother.2005年5月；54(5):477-88.2004年10月6日电子版，以引用方式全文并入本文；Beatty和Paterson,J Immunol.2001年2月15日；166(4):2276-82，以引用方式全文并入本文)。在另一个实施例中，本文所公开的方法增加产干扰素γ细胞的水平。在一个实施例中，李斯特菌的抗血管新生性质通过CD4+T细胞介导(Beatty和Paterson，2001)。在另一个实施例中，李斯特菌的抗血管新生性质通过CD8+T细胞介导。在另一个实施例中，因李斯特菌疫苗接种导致的IFN-γ分泌由NK细胞、NKT细胞、Th1CD4+T细胞、TC1CD8+T细胞或它们的组合介导。
在另一个实施例中，本文所公开的组合物诱导一种或多种抗血管新生蛋白或因子的生成。在一个实施例中，该抗血管新生蛋白为IFN-γ。在另一个实施例中，该抗血管新生蛋白为色素上皮衍生因子(PEDF)、血管新生抑制素、内皮抑素、fms样酪氨酸激酶(sFlt)-1或可溶性内皮因子(sEng)。在一个实施例中，本文所公开的李斯特菌参与抗血管新生因子的释放，由此，在一个实施例中，除了作为用于将抗原引入受试者的载体之外还具有治疗作用。
在另一个实施例中，施用本文所公开的组合物诱导稳健的系统性抗原特异性免疫。在另一个实施例中，施用本文所公开的组合物诱导表位扩展。在另一个实施例中，施用本文所公开的组合物诱导对自身来源的肿瘤或瘤变抗原的广泛应答。在另一个实施例中，由本文所公开的方法和组合物诱导的免疫应答包括改善肿瘤或瘤变微环境(TME)中抑制性与效应免疫细胞的总体平衡。在另一个实施例中，由本文所公开的方法和组合物诱导的免疫应答包括改善抑制性与效应免疫细胞的系统平衡。
在一个实施例中，本文所公开的组合物及其使用方法生成能够浸润肿瘤或瘤变、破坏肿瘤细胞并根除疾病的效应T细胞。在另一个实施例中，本发明的使用方法增加效应T细胞产生的肿瘤浸润。在另一个实施例中，效应T细胞包括CD8+T细胞。在另一个实施例中，效应T细胞包括CD4+T细胞。
在一个实施例中，肿瘤浸润性淋巴细胞(TIL)与多种肿瘤诸如结肠癌、卵巢癌和黑素瘤中更好的预后相关。在结肠癌中，不具有微转移信号的肿瘤具有增加的免疫细胞浸润和Th1表达谱，这与改善的患者存活相关。此外，T细胞对肿瘤的浸润在临床前和临床试验中都已与免疫疗法的成功相关。在一个实施例中，淋巴细胞浸润到肿瘤部位中依赖于肿瘤血管的内皮细胞中粘附分子的上调，这种上调通常通过促炎性细胞因子诸如IFN-γ、TNF-α和IL-1进行。若干粘附分子已在淋巴细胞浸润到肿瘤中的过程中牵涉，包括细胞间粘附分子1(ICAM-1)、血管内皮细胞粘附分子1(V-CAM-1)、血管粘附蛋白1(VAP-1)和E-选择素。然而，这些细胞粘附分子通常在肿瘤血管中下调。因此，在一个实施例中，如本文所公开的癌症疫苗增加TIL，上调粘附分子(在一个实施例中，ICAM-1、V-CAM-1、VAP-1、E-选择素或它们的组合)，上调促炎性细胞因子(在一个实施例中，IFN-γ、TNF-α、IL-1或它们的组合)或它们的组合。
本文所公开的方法和组合物的N末端LLO蛋白片段在另一个实施例中包含SEQ IDNo:2。在另一个实施例中，该片段包含LLO信号肽。在另一个实施例中，该片段包含SEQ IDNo:2。在另一个实施例中，该片段大约由SEQ ID No:2组成。在另一个实施例中，该片段基本上由SEQ ID No:2组成。在另一个实施例中，该片段对应于SEQ ID No:2。在另一个实施例中，该片段与SEQ ID No:2同源。在另一个实施例中，该片段与SEQ ID No:2的片段同源。用于一些实例的ΔLLO的长度为416个AA(不包括信号序列)，因为包括含有半胱氨酸484的激活域在内的氨基末端的88个残基被截短。本领域的技术人员将会知道，无激活域具体地讲无半胱氨酸484的任何ΔLLO均适用于本发明的方法和组合物。在另一个实施例中，E7或E6抗原与任何ΔLLO(包括PEST氨基酸序列，SEQID NO:1)的融合增强抗原的细胞介导的抗肿瘤免疫性。
用于构建本文所公开的疫苗的LLO蛋白在另一个实施例中具有以下序列：
MKKIMLVFITLILVSLPIAQQTEAKDASAFNKENSISSMAPPASPPASPKTPIEKKHADEIDKYIQGLDYNKNNVLVYHGDAVTNVPPRKGYKDGNEYIVVEKKKKSINQNNADIQVVNAISSLTYPGALVKANSELVENQPDVLPVKRDSLTLSIDLPGMTNQDNKIVVKNATKSNVNNAVNTLVERWNEKYAQAYPNVSAKIDYDDEMAYSESQLIAKFGTAFKAVNNSLNVNFGAISEGKMQEEVISFKQIYYNVNVNEPTRPSRFFGKAVTKEQLQALGVNAENPPAYISSVAYGRQVYLKLSTNSHSTKVKAAFDAAVSGKSVSGDVELTNIIKNSSFKAVIYGGSAKDEVQIIDGNLGDLRDILKKGATFNRETPGVPIAYTTNFLKDNELAVIKNNSEYIETTSKAYTDGKINIDHSGGYVAQFNISWDEVNYDPEGNEIVQHKNWSENNKSKLAHFTSSIYLPGNARNINVYAKECTGLAWEWWRTVIDDRNLPLVKNRNISIWGTTLYPKYSNKVDNPIE(GenBank登录号P13128；SEQ ID NO:3；核酸序列在GenBank登录号X15127中示出)。对应于该序列的前蛋白的前25个AA为信号序列，并在由细菌分泌时从LLO切除。因此，在本实施例中，全长的活性LLO蛋白为504个残基长。在另一个实施例中，将以上LLO片段用作并入本发明的疫苗中的LLO片段的来源。
在另一个实施例中，用于本文所公开的组合物和方法的LLO蛋白的N末端片段具有以下序列：
MKKIMLVFITLILVSLPIAQQTEAKDASAFNKENSISSVAPPASPPASPKTPIEKKHADEIDKYIQGLDYNKNNVLVYHGDAVTNVPPRKGYKDGNEYIVVEKKKKSINQNNADIQVVNAISSLTYPGALVKANSELVENQPDVLPVKRDSLTLSIDLPGMTNQDNKIVVKNATKSNVNNAVNTLVERWNEKYAQAYSNVSAKIDYDDEMAYSESQLIAKFGTAFKAVNNSLNVNFGAISEGKMQEEVISFKQIYYNVNVNEPTRPSRFFGKAVTKEQLQALGVNAENPPAYISSVAYGRQVYLKLSTNSHSTKVKAAFDAAVSGKSVSGDVELTNIIKNSSFKAVIYGGSAKDEVQIIDGNLGDLRDILKKGATFNRETPGVPIAYTTNFLKDNELAVIKNNSEYIETTSKAYTDGKINIDHSGGYVAQFNISWDEVNYD(SEQ ID NO:2)。
在另一个实施例中，该LLO片段对应于本文所用的LLO蛋白的约AA20-442。
在另一个实施例中，LLO片段具有以下序列：
MKKIMLVFITLILVSLPIAQQTEAKDASAFNKENSISSVAPPASPPASPKTPIEKKHADEIDKYIQGLDYNKNNVLVYHGDAVTNVPPRKGYKDGNEYIVVEKKKKSINQNNADIQVVNAISSLTYPGALVKANSELVENQPDVLPVKRDSLTLSIDLPGMTNQDNKIVVKNATKSNVNNAVNTLVERWNEKYAQAYSNVSAKIDYDDEMAYSESQLIAKFGTAFKAVNNSLNVNFGAISEGKMQEEVISFKQIYYNVNVNEPTRPSRFFGKAVTKEQLQALGVNAENPPAYISSVAYGRQVYLKLSTNSHSTKVKAAFDAAVSGKSVSGDVELTNIIKNSSFKAVIYGGSAKDEVQIIDGNLGDLRDILKKGATFNRETPGVPIAYTTNFLKDNELAVIKNNSEYIETTSKAYTD(SEQ IDNO:4)。
在另一个实施例中，“截短的LLO”或“ΔLLO”是指包含PEST氨基酸域的LLO片段。在另一个实施例中，该术语是指包含PEST序列的LLO片段。
在另一个实施例中，该术语是指不包含氨基末端的活化域并且不包含胱氨酸484的LLO片段。在另一个实施例中，该术语是指非溶血性LLO片段。在另一个实施例中，LLO片段因活化域的缺失或突变而成为非溶血的。在另一个实施例中，LLO片段因半胱氨酸484的缺失或突变而成为非溶血的。在另一个实施例中，LLO片段因另一位置的缺失或突变而成为非溶血的。
在另一个实施例中，LLO片段由LLO蛋白的大约前441个AA构成。在另一个实施例中，LLO片段由LLO的大约前420个AA构成。在另一个实施例中，该LLO片段为LLO蛋白的非溶血形式。
在另一个实施例中，LLO片段包含对应于以上AA范围之一的同源LLO蛋白的残基。残基编号在另一个实施例中不必精确对应以上列举的残基编号；例如，如果该同源LLO蛋白相对于本文所用的LLO蛋白具有插入或缺失，则可因此而调整该残基编号。
在另一个实施例中，该LLO片段为本领域已知的任何其他LLO片段。
在另一个实施例中，将重组李斯特菌菌株以1×109-3.31×1010个CFU的剂量施用给人受试者。在另一个实施例中，剂量为5-500×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为7-500×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为10-500×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为20-500×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为30-500×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为50-500×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为70-500×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为100-500×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为150-500×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为5-300×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为5-200×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为5-150×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为5-100×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为5-70×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为5-50×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为5-30×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为5-20×108个CFU。在另一个实施例中，剂量为1-30×109个CFU。在另一个实施例中，剂量为1-20×109个CFU。在另一个实施例中，剂量为2-30×109个CFU。在另一个实施例中，剂量为1-10×109个CFU。在另一个实施例中，剂量为2-10×109个CFU。在另一个实施例中，剂量为3-10×109个CFU。在另一个实施例中，剂量为2-7×109个CFU。在另一个实施例中，剂量为2-5×109个CFU。在另一个实施例中，剂量为3-5×109个CFU。
在另一个实施例中，剂量为1×109个生物体。在另一个实施例中，剂量为1.5×109个生物体。在另一个实施例中，剂量为2×109个生物体。在另一个实施例中，剂量为3×109个生物体。在另一个实施例中，剂量为4×109个生物体。在另一个实施例中，剂量为5×109个生物体。在另一个实施例中，剂量为6×109个生物体。在另一个实施例中，剂量为7×109个生物体。在另一个实施例中，剂量为8×109个生物体。在另一个实施例中，剂量为10×109个生物体。在另一个实施例中，剂量为1.5×1010个生物体。在另一个实施例中，剂量为2×1010个生物体。在另一个实施例中，剂量为2.5×1010个生物体。在另一个实施例中，剂量为3×1010个生物体。在另一个实施例中，剂量为3.3×1010个生物体。在另一个实施例中，剂量为4×1010个生物体。在另一个实施例中，剂量为5×1010个生物体。
在另一个实施例中，本文所公开的方法的重组多肽由重组李斯特菌菌株表达。在另一个实施例中，该表达由重组李斯特菌菌株携带的核苷酸分子介导。
在另一个实施例中，该重组李斯特菌菌株通过编码重组多肽的质粒表达重组多肽。在另一个实施例中，该质粒包含编码细菌转录因子的基因。在另一个实施例中，该质粒编码李斯特菌转录因子。在另一个实施例中，该转录因子为PrfA。在另一个实施例中，该PrfA为突变体PrfA。在另一个实施例中，该PrfA突变体蛋白包含D133V氨基酸突变。
在另一个实施例中，该质粒包含编码代谢酶的基因。在另一个实施例中，该代谢酶为细菌代谢酶。在另一个实施例中，该代谢酶为李斯特菌代谢酶。在另一个实施例中，该代谢酶为氨基酸代谢酶。在另一个实施例中，该氨基酸代谢酶涉及细胞壁合成途径。在另一个实施例中，该代谢酶是D-氨基酸氨基转移酶基因(dat)的产物。在另一个实施例中，该代谢酶是丙氨酸消旋酶基因(dal)的产物。在另一个实施例中，该代谢酶是本领域已知的任何其他代谢酶。
在另一个实施例中，本发明的方法还包括用本发明的重组李斯特菌菌株强化人受试者的步骤。在另一个实施例中，用于强化接种的重组李斯特菌菌株与用于初始的“初免”接种的菌株相同。在另一个实施例中，强化菌株不同于初免菌株。在另一个实施例中，将相同的剂量用于初免和强化接种。在另一个实施例中，将大剂量用于强化。在另一个实施例中，将小剂量用于强化。
在另一个实施例中，本发明的方法还包括用包含E7抗原的免疫原性组合物接种人受试者的步骤。在另一个实施例中，免疫原性组合物包含重组E7蛋白或其片段。在另一个实施例中，免疫原性组合物包含表达重组E7蛋白或其片段的核苷酸分子。在另一个实施例中，在李斯特菌接种之后施用非李斯特菌接种。在另一个实施例中，在李斯特菌接种之前施用非李斯特菌接种。
在另一个实施例中，“强化”是指给受试者施用另外的疫苗剂量。在本发明方法的另一个实施例中，施用2次强化(或总共3次接种)。在另一个实施例中，施用3次强化。在另一个实施例中，施用4次强化。在另一个实施例中，施用5次强化。在另一个实施例中，施用6次强化。在另一个实施例中，施用超过6次强化。
本文所所公开的方法和组合物的重组李斯特菌菌株在另一个实施例中是重组单核细胞增多性李斯特菌菌株。在另一个实施例中，李斯特菌菌株是重组西尔李斯特菌(Listeria seeligeri)菌株。在另一个实施例中，李斯特菌菌株是重组格雷李斯特菌(Listeria grayi)菌株。在另一个实施例中，李斯特菌菌株是重组伊万诺夫李斯特菌(Listeria ivanovii)菌株。在另一个实施例中，李斯特菌菌株是重组默里李斯特菌(Listeria murrayi)菌株。在另一个实施例中，李斯特菌菌株是重组威耳逊李斯特菌(Listeria welshimeri)菌株。在另一个实施例中，该李斯特菌菌株是本领域已知的任何其他李斯特菌属菌种的重组菌株。
本发明提供多种用于制备或工程化本发明的减毒李斯特菌的李斯特菌属菌种和菌株。在一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌10403S野生型(参见Bishop和Hinrichs(1987)J.Immunol.139:2005–2009；Lauer等人(2002)J.Bact.184:4177–4186)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4056(噬菌体解离的)(参见Lauer等人(2002)J.Bact.184:4177–4186)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4027，其为噬菌体解离的并为hly基因缺失的(参见Lauer等人(2002)J.Bact.184:4177–4186；Jones和Portnoy(1994)Infect.Immunity 65:5608–5613)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4029，其为噬菌体解离的、ActA缺失的(参见Lauer等人(2002)J.Bact.184:4177–4186；Skoble等人(2000)J.Cell Biol.150:527–538)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4042(ΔPEST)(参见Brockstedt等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:13832–13837；支持信息)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4097(LLO-S44A)(参见Brockstedt等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:13832–13837；支持信息)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4364(ΔlplA；脂蛋白连接酶(lipoate protein ligase))(参见Brockstedt等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:13832–13837；支持信息)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4405(ΔinlA)(参见Brockstedt等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:13832–13837；支持信息)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4406(ΔinlB)(参见Brockstedt等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:13832–13837；支持信息)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌CS-L0001(ΔActA-deltainlB)(参见Brockstedt等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:13832–13837；支持信息)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌CS-L0002(ΔActA-delta lplA)(参见Brockstedt等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:13832–13837；支持信息)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌CS-L0003(L461T-ΔlplA)(参见Brockstedt等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:13832–13837；支持信息)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4038(ΔActA-LLO L461T)(参见Brockstedt等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:13832–13837；支持信息)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4384(S44A-LLO L461T)(参见Brockstedt等人(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:13832–13837；支持信息)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌。脂蛋白中的突变(参见O'Riordan等人(2003)Science 302:462–464)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DP-L4017(10403S hly(L461T)，其在溶血素基因中具有点突变(参见美国临时专利申请No.60/490,089，2003年7月24日提交)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌EGD(参见GenBank登录号AL591824)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌EGD-e(参见GenBank登录号NC_003210，ATCC登录号BAA-679)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为uvrAB缺失的单核细胞增多性李斯特菌DP-L4029(参见2004年2月2日提交的美国临时专利申请No.60/541,515、2003年7月24日提交的美国临时专利申请No.60/490,080)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌ActA-/inlB-双突变体(参见ATCC登录号PTA-5562)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌lplA突变体或hly突变体(参见授予Portnoy等人的美国专利申请No.20040013690)。在另一个实施例中，李斯特菌菌株为单核细胞增多性李斯特菌DAL/DAT双突变体。(参见授予Frankel和Portnoy的美国专利申请No.20050048081)。本发明涵盖包含上述李斯特菌菌株的试剂和方法，以及例如通过质粒和/或通过基因组整合进行修饰以包含以下核酸的这些菌株，即编码以下基因之一或其任意组合的核酸：hly(LLO，李斯特菌溶血素)、iap(p60)、inlA、inlB、inlC、dal(丙氨酸消旋酶)、dat(D-氨基酸氨基转移酶)、plcA、plcB、actA；或介导以下方面的核酸：单壁囊泡的生长、传播、破裂，双壁囊泡的破裂，与宿主细胞的结合，由宿主细胞摄取。本发明不受上文公开的特定菌株的限制。
在另一个实施例中，本文所公开的重组李斯特菌菌株已经在动物宿主中传代。在另一个实施例中，该传代让该菌株作为疫苗载体的效能最佳化。在另一个实施例中，该传代稳定李斯特菌菌株的免疫原性。在另一个实施例中，该传代稳定李斯特菌菌株的毒力。在另一个实施例中，该传代增强李斯特菌菌株的免疫原性。在另一个实施例中，该传代增强李斯特菌菌株的毒力。在另一个实施例中，该传代除去李斯特菌菌株的不稳定亚株。在另一个实施例中，该传代降低李斯特菌菌株的不稳定亚株的普遍性。在另一个实施例中，李斯特菌菌株包含编码含抗原重组肽的基因的基因组插入。在另一个实施例中，李斯特菌菌株携带包含编码含抗原重组肽的基因的质粒。在另一个实施例中，该传代如本文所述进行(例如，在实例12中)。在另一个实施例中，该传代通过本领域已知的任何其他方法进行。
在另一个实施例中，用于本文所公开的方法中的重组李斯特菌菌株已储存在冷冻细胞库中。在另一个实施例中，重组李斯特菌菌株已储存在冻干细胞库中。
在另一个实施例中，本文所公开的方法和组合物的细胞库为主细胞库。在另一个实施例中，细胞库为工作细胞库。在另一个实施例中，细胞库为良好生产规范(GMP)细胞库。在另一个实施例中，细胞库旨在用于制备临床级材料。在另一个实施例中，细胞库符合人用监管规范。在另一个实施例中，细胞库是本领域已知的任何其他类型的细胞库。
“良好生产规范”在另一个实施例中由美国联邦法规(United States Code ofFederal Regulations)的(21CFR 210–211)定义。在另一个实施例中，“良好生产规范”由生产临床级材料或供人类消耗的其他标准定义，例如美国之外的国家/地区的标准。
在另一个实施例中，本文所公开的方法中所用的重组李斯特菌菌株来自一批疫苗剂量。
在另一个实施例中，本文所公开的方法中所用的重组李斯特菌菌株来自由美国专利No.8,114,414中所公开的方法制备的冷冻或冻干储备品，该专利以引用方式并入本文。
在另一个实施例中，本文所公开的肽为融合肽。在另一个实施例中，“融合肽”是指包含2个或更多个通过肽键或其他化学键连接在一起的蛋白的肽或多肽。在另一个实施例中，蛋白通过肽或其他化学键直接连接在一起。在另一个实施例中，蛋白通过2个或更多个蛋白之间的1个或更多个氨基酸(例如，“间隔物”)连接在一起。
在另一个实施例中，本文所公开的疫苗还包含佐剂。本文所公开的方法和组合物所用的佐剂在另一个实施例中为粒细胞/巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)蛋白。在另一个实施例中，该佐剂包含GM-CSF蛋白。在另一个实施例中，该佐剂为编码GM-CSF的核苷酸分子。在另一个实施例中，该佐剂为包含编码GM-CSF的核苷酸分子。在另一个实施例中，该佐剂为皂苷QS21。在另一个实施例中，该佐剂包含皂苷QS21。在另一个实施例中，该佐剂为单磷酰脂质A。在另一个实施例中，该佐剂包含单磷酰脂质A。在另一个实施例中，该佐剂为SBAS2。在另一个实施例中，该佐剂包含SBAS2。在另一个实施例中，该佐剂为含有未甲基化的CpG的寡核苷酸。在另一个实施例中，该佐剂包含含有未甲基化的CpG的寡核苷酸。在另一个实施例中，该佐剂为免疫刺激性细胞因子。在另一个实施例中，该佐剂包含免疫刺激性细胞因子。在另一个实施例中，该佐剂为编码免疫刺激性细胞因子的核苷酸分子。在另一个实施例中，该佐剂包含编码免疫刺激性细胞因子的核苷酸分子。在另一个实施例中，该佐剂为或包含刺糖苷(quill glycoside)。在另一个实施例中，该佐剂为或包含细菌有丝分裂原。在另一个实施例中，该佐剂为或包含细菌毒素。在另一个实施例中，该佐剂为或包含本领域已知的任何其他佐剂。
在另一个实施例中，本文所公开的核苷酸可操作地连接至驱动编码肽在李斯特菌菌株中表达的启动子/调控序列。可用于驱动基因的组成型表达的启动子/调控序列是本领域熟知的，并且包括但不限于例如李斯特菌的PhlyA、PActA和p60启动子，链球菌(Streptococcus)bac启动子，灰色链霉菌(Streptomyces griseus)sgiA启动子以及苏云金芽孢杆菌(B.thuringiensis)phaZ启动子。在另一个实施例中，编码本文所公开的肽的核酸的诱导型和组织特异性表达通过将编码该肽的核酸置于诱导型或组织特异性启动子/调控序列的调控下实现。可用于此目的的组织特异性或诱导型启动子/调控序列的例子包括但不限于MMTV LTR诱导型启动子和SV40晚期增强子/启动子。在另一个实施例中，采用响应于诱导剂(诸如金属、糖皮质素等等)而诱导的启动子。因此，应当理解，本发明包括使用任何已知或未知的并且能够驱动与其可操作地连接的所需蛋白的表达的启动子/调控序列。
本文所公开的方法和组合物中利用的ActA蛋白的N末端片段在另一个实施例中具有SEQ ID NO:5:
MRAMMVVFITANCITINPDIIFAATDSEDSSLNTDEWEEEKTEEQPSEVNTGPRYETAREVSSRDIKELEKSNKVRNTNKADLIAMLKEKAEKGPNINNNNSEQTENAAINEEASGADRPAIQVERRHPGLPSDSAAEIKKRRKAIASSDSELESLTYPDKPTKVNKKKVAKESVADASESDLDSSMQSADESSPQPLKANQQPFFPKVFKKIKDAGKWVRDKIDENPEVKKAIVDKSAGLIDQLLTKKKSEEVNASDFPPPPTDEELRLALPETPMLLGFNAPATSEPSSFEFPPPPTDEELRLALPETPMLLGFNAPATSEPSSFEFPPPPTEDELEIIRETASSLDSSFTRGDLASLRNAINRHSQNFSDFPPIPTEEELNGRGGRP。在另一个实施例中，ActA片段包含SEQ ID NO:5.在另一个实施例中，ActA片段为本领域已知的任何其他ActA片段。
在另一个实施例中，编码ActA蛋白的片段的重组核苷酸包含SEQ ID NO:6:
Atgcgtgcgatgatggtggttttcattactgccaattgcattacgattaaccccgacataatatttgcagcgacagatagcgaagattctagtctaaacacagatgaatgggaagaagaaaaaacagaagagcaaccaagcgaggtaaatacgggaccaagatacgaaactgcacgtgaagtaagttcacgtgatattaaagaactagaaaaatcgaataaagtgagaaatacgaacaaagcagacctaatagcaatgttgaaagaaaaagcagaaaaaggtccaaatatcaataataacaacagtgaacaaactgagaatgcggctataaatgaagaggcttcaggagccgaccgaccagctatacaagtggagcgtcgtcatccaggattgccatcggatagcgcagcggaaattaaaaaaagaaggaaagccatagcatcatcggatagtgagcttgaaagccttacttatccggataaaccaacaaaagtaaataagaaaaaagtggcgaaagagtcagttgcggatgcttctgaaagtgacttagattctagcatgcagtcagcagatgagtcttcaccacaacctttaaaagcaaaccaacaaccatttttccctaaagtatttaaaaaaataaaagatgcggggaaatgggtacgtgataaaatcgacgaaaatcctgaagtaaagaaagcgattgttgataaaagtgcagggttaattgaccaattattaaccaaaaagaaaagtgaagaggtaaatgcttcggacttcccgccaccacctacggatgaagagttaagacttgctttgccagagacaccaatgcttcttggttttaatgctcctgctacatcagaaccgagctcattcgaatttccaccaccacctacggatgaagagttaagacttgctttgccagagacgccaatgcttcttggttttaatgctcctgctacatcggaaccgagctcgttcgaatttccaccgcctccaacagaagatgaactagaaatcatccgggaaacagcatcctcgctagattctagttttacaagaggggatttagctagtttgagaaatgctattaatcgccatagtcaaaatttctctgatttcccaccaatcccaacagaagaagagttgaacgggagaggcggtagacca中示出的序列。在另一个实施例中，重组核苷酸具有SEQ ID NO:6.在另一个实施例中，重组核苷酸包含任何其他的编码ActA蛋白的片段的序列。
在本发明的方法和组合物的另一个实施例中，PEST氨基酸序列融合至E7或E6抗原。如本文所公开，表达PEST氨基酸序列-抗原融合体的重组李斯特菌菌株诱导抗肿瘤免疫(实例3)并产生抗原特异性、肿瘤浸润性T细胞(实例4)。另外，证实了包含抗原和含PEST氨基酸序列KENSISSMAPPASPPASPKTPIEKKHADEIDK(SEQ ID NO:1)的LLO的融合蛋白增强的细胞介导的免疫。
因此，抗原融合至来源于其他原核生物体的其他LM PEST氨基酸序列和PEST氨基酸序列也将增强抗原的免疫原性。在另一个实施例中，PEST氨基酸序列具有选自SEQ IDNO:7-12的序列。在另一个实施例中，PEST氨基酸序列为来自LM ActA蛋白的PEST氨基酸序列。在另一个实施例中，PEST氨基酸序列为KTEEQPSEVNTGPR(SEQ ID NO:7)、KASVTDTSEGDLDSSMQSADESTPQPLK(SEQ ID NO:8)、KNEEVNASDFPPPPTDEELR(SEQ ID NO:9)或RGGIPTSEEFSSLNSGDFTDDENSETTEEEIDR(SEQ ID NO:10)。在另一个实施例中，该PEST氨基酸序列来自链球菌属菌种(Streptococcus sp)的链球菌溶血素O蛋白。在另一个实施例中，PEST氨基酸序列来自酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes)的链球菌溶血素O，例如AA35-51处的KQNTASTETTTTNEQPK(SEQ ID NO:11)。在另一个实施例中，PEST氨基酸序列来自类马链球菌(Streptococcus equisimilis)的链球菌溶血素O，例如AA 38-54处的KQNTANTETTTTNEQPK (SEQ ID NO:12)。在另一个实施例中，该PEST氨基酸序列为源自原核生物体的另一PEST氨基酸序列。在另一个实施例中，该PEST氨基酸序列为本领域已知的任何其他PEST氨基酸序列。
可根据诸如由例如Rechsteiner和Rogers(1996,Trends Biochem.Sci.21:267-271)针对LM所述的方法来鉴定其他原核生物体的PEST氨基酸序列。或者，来自其他原核生物体的PEST氨基酸序列也可基于这种方法来鉴定。可预期其中PEST氨基酸序列的其他原核生物体包括但不限于其他的李斯特菌菌种。在另一个实施例中，PEST氨基酸序列嵌入抗原性蛋白内。因此，在另一个实施例中，“融合体”是指既包含抗原也包含连接在抗原的一端或嵌入抗原内的PEST氨基酸序列的抗原性蛋白。
在另一个实施例中，使用本领域已知的任何其他方法或算法，例如CaSPredictor(Garay-Malpartida HM,Occhiucci JM,Alves J,Belizario JE.Bioinformatics.2005年6月；21增刊1:i169-76)来鉴定PEST氨基酸序列。在另一个实施例中，采用以下方法：
通过将1的值分配给氨基酸Ser、Thr、Pro、Glu、Asp、Asn或Gln，计算每30-35个氨基酸的段的PEST指数。每个PEST残基的系数值(CV)为1，每个其他氨基酸(非-PEST)的系数值为0。
在另一个实施例中，本文所公开的LLO蛋白、ActA蛋白或其片段不需要精确地如本文所示的序列那样，而是可以作出其他保持如本文其他地方所示的融合至抗原的LLO或ActA蛋白的功能特性的改变、修饰或变化。在另一个实施例中本发明利用LLO蛋白、ActA蛋白或其片段的类似物。类似物在另一个实施例中与天然存在的蛋白或肽的不同之处在于保守氨基酸序列差异或不对序列产生影响的修饰或以上两者。
在另一个实施例中，整个E7蛋白或其片段融合至LLO蛋白、ActA蛋白或含PEST氨基酸序列的肽以生成本发明的方法的重组肽。所用的E7蛋白(作为整体或作为片段的来源)在另一个实施例中具有序列
MHGDTPTLHEYMLDLQPETTDLYCYEQLNDSSEEEDEIDGPAGQAEPDRAHYNIVTFCCKCDSTLRLCVQSTHVDIRTLEDLLMGTLGIVCPICSQKP(SEQ ID No:13)。在另一个实施例中，该E7蛋白为SEQ ID No:13的同源物。在另一个实施例中，该E7蛋白为SEQ ID No:13的变体。在另一个实施例中，该E7蛋白为SEQ ID No:13的异构体。在另一个实施例中，该E7蛋白为SEQ ID No:13的片段。在另一个实施例中，该E7蛋白为SEQ ID No:13的同源物的片段。在另一个实施例中，该E7蛋白为SEQ ID No:13的变体的片段。在另一个实施例中，该E7蛋白为SEQ ID No:13的异构体的片段。
在另一个实施例中，E7蛋白的序列为：
MHGPKATLQDIVLHLEPQNEIPVDLLCHEQLSDSEEENDEIDGVNHQHLPARRAEPQRHTMLCMCCKCEARIELVVESSADDLRAFQQLFLNTLSFVCPWCASQQ(SEQ ID No:14)。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ IDNo:14的同源物。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:14的变体。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:14的异构体。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:14的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:14的同源物的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:14的变体的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:14的异构体的片段。
在另一个实施例中，该E7蛋白具有以下GenBank条目之一中示出的序列：M24215、NC_004500、V01116、X62843或M14119。在另一个实施例中，该E7蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的同源物。在另一个实施例中，该E7蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的变体。在另一个实施例中，该E7蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的异构体。在另一个实施例中，该E7蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的片段。在另一个实施例中，该E7蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的同源物的片段。在另一个实施例中，该E7蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的变体的片段。在另一个实施例中，该E7蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的异构体的片段。
在另一个实施例中，整个E6蛋白或其片段融合至LLO蛋白、ActA蛋白或含PEST氨基酸序列的肽以生成本发明的方法的重组肽。所用的E6蛋白(作为整体或作为片段的来源)在另一个实施例中具有序列
MHQKRTAMFQDPQERPRKLPQLCTELQTTIHDIILECVYCKQQLLRREVYDFAFRDLCIVYRDGNPYAVCDKCLKFYSKISEYRHYCYSLYGTTLEQQYNKPLCDLLIRCINCQKPLCPEEKQRHLDKKQRFHNIRGRWTGRCMSCCRSSRTRRETQL(SEQ ID No:15)。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:15的同源物。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:15的变体。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:15的异构体。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:15的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:15的同源物的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:15的变体的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:15的异构体的片段。
在另一个实施例中，E6蛋白的序列为：
MARFEDPTRRPYKLPDLCTELNTSLQDIEITCVYCKTVLELTEVFEFAFKDLFVVYRDSIPHAACHKCIDFYSRIRELRHYSDSVYGDTLEKLTNTGLYNLLIRCLRCQKPLNPAEKLRHLNEKRRFHNIAGHYRGQCHSCCNRARQERLQRRRETQV(SEQ ID No:16)。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:16的同源物。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:16的变体。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:16的异构体。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:16的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:16的同源物的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:16的变体的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为SEQ ID No:16的异构体的片段。
在另一个实施例中，该E6蛋白具有以下GenBank条目之一中示出的序列：M24215、M14119、NC_004500、V01116、X62843或M14119。在另一个实施例中，该E6蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的同源物。在另一个实施例中，该E6蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的变体。在另一个实施例中，该E6蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的异构体。在另一个实施例中，该E6蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的同源物的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的变体的片段。在另一个实施例中，该E6蛋白为来自以上GenBank条目之一的序列的异构体的片段。
在另一个实施例中，“同源性”是指与LLO序列(如，与SEQ ID No:2-4之一)的同一性大于70％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于64％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于68％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于72％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于75％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQID No:2-4之一的同一性大于78％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于80％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于82％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于83％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于85％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于87％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于88％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ IDNo:2-4之一的同一性大于90％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于92％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于93％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于95％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于96％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于97％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于98％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性大于99％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:2-4之一的同一性为100％。
在另一个实施例中，“同源性”是指与E7序列(如，与SEQ ID No:13-14之一)的同一性大于70％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于62％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于64％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于68％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于72％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于75％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于78％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于80％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于82％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于83％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于85％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于87％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于88％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于90％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于92％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于93％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于95％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于96％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于97％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于98％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性大于99％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:13-14之一的同一性为100％。
在另一个实施例中，“同源性”是指与E6序列(如，与SEQ ID No:15-16之一)的同一性大于70％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于64％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于68％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于72％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于75％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于78％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于80％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于82％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于83％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于85％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于87％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于88％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于90％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于92％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于93％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于95％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于96％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于97％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于98％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性大于99％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:15-16之一的同一性为100％。
在另一个实施例中，“同源性”是指与PEST氨基酸序列(如，与SEQ ID No:1和7-12之一)或与ActA序列(如，与SEQ ID No:5-6之一)的同一性大于70％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于60％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于64％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于68％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于72％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于75％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ IDNo:5-6之一的同一性大于78％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于80％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于82％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于83％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于85％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于87％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于88％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于90％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于92％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于93％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ IDNo:5-6之一的同一性大于95％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于96％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于97％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于98％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性大于99％。在另一个实施例中，“同源性”是指与SEQ ID No:1和7-12或SEQ ID No:5-6之一的同一性为100％。
在一个实施例中，通过本领域充分描述的方法确定蛋白和/或肽对本文列出的任何氨基酸序列的同源性，包括免疫印迹分析，或通过建立的方法采用多种可用软件包中的任一种通过氨基酸序列的计算机算法分析进行。这些软件包中的一些例如包括FASTA、BLAST、MPsrch或Scanps软件包，并且在其他实施例中采用Smith和Waterman算法，和/或整体/局部或BLOCKS比对用于分析。
在另一个实施例中，LLO蛋白、ActA蛋白或其片段通过化学偶联连接到抗原。在另一个实施例中，将戊二醛用于偶联。在另一个实施例中，偶联采用本领域已知的任何合适的方法进行。
在另一个实施例中，本文所公开的融合蛋白通过任何合适的方法制备，这些方法包括例如克隆和适当序列的限制或通过下文讨论的方法直接化学合成。在另一个实施例中，克隆子序列，并使用适当的限制性酶切割适当的子序列。在另一个实施例中，然后连接片段生成所需的DNA序列。在另一个实施例中，编码融合蛋白的DNA使用DNA扩增法例如聚合酶链式反应(PCR)制备。首先，在天然DNA片段的新末端的任一侧单独扩增。一个扩增的序列的5'末端编码肽接头，而另一个扩增的序列的3'末端也编码肽接头。由于第一片段的5'末端与第二片段的3'末端互补，两个片段(在部分纯化后，如在LMP琼脂糖上)可在第三PCR反应中用作重叠模板。扩增的序列将包含密码子、开口位点羧基侧上的片段(现在形成氨基序列)、接头和开口位点氨基侧上的序列(现在形成羧基序列)。然后将插入片段连接进质粒。
在另一个实施例中，LLO蛋白、ActA蛋白或其片段以及抗原或其片段通过本领域技术人员已知的方式偶联。在另一个实施例中，抗原或其片段直接地或通过接头(间隔物)偶联到ActA蛋白或LLO蛋白。在另一个实施例中，嵌合分子作为单链融合蛋白以重组方式表达。
在另一个实施例中，本文所公开的融合肽使用标准化学肽合成技术而合成。在另一个实施例中，嵌合分子作为单个连续多肽合成。在另一个实施例中，LLO蛋白、ActA蛋白或其片段以及抗原或其片段单独地合成，然后通过一个分子的氨基末端与另一个分子的羧基末端的缩合而融合，从而形成肽键。在另一个实施例中，ActA蛋白或LLO蛋白和抗原各自与肽间隔分子的一端缩合，从而形成连续的融合蛋白。
在另一个实施例中，本文所公开的肽和蛋白通过固相肽合成(SPPS)而制备，如由Stewart等人在Solid Phase Peptide Synthesis,第2版,1984,Pierce ChemicalCompany,Rockford,Ill.中所述，或由Bodanszky和Bodanszky(The Practice of PeptideSynthesis,1984,Springer-Verlag,New York)所述。在另一个实施例中，适当保护的氨基酸残基通过其羧基基团连接到衍生化的不溶性聚合物支持物，诸如交联的聚苯乙烯或聚酰胺树脂。“适当保护的”是指在氨基酸的α-氨基基团和任何侧链官能团上均存在保护基团。侧链保护基团通常是对整个合成过程中所用的溶剂、试剂和反应条件稳定的，并且可在不会影响最终肽产物的条件下移除。寡肽的逐步合成通过以下方式进行：从初始氨基酸移除N保护基团，然后将所需肽的序列中的下一个氨基酸的羧基端偶合到其上。该氨基酸也加以适当保护。可使新来的氨基酸的羧基失活以与支持物结合的氨基酸的N末端反应，反应方式是通过形成反应性基团，诸如形成碳二亚胺、对称酸酐或“活性酯”基团，诸如羟基苯并三唑或五氟苯基酯。
在另一个实施例中，本发明提供一种试剂盒，该试剂盒包括本发明的疫苗、施用装置和描述本发明的使用方法的说明性材料。虽然下文描述了模型试剂盒，但是其他可用试剂盒的内容物根据本公开对技术人员而言将是显而易见的。
实验细节章节
实例1：LLO-抗原融合蛋白诱导抗肿瘤免疫
材料和实验方法(实例1-2)
细胞系
C57BL/6同基因TC-1肿瘤经HPV-16 E6和E7永生化并以c-Ha-ras癌基因转化。T.C.Wu(Johns Hopkins University School of Medicine,Baltimore,MD)提供的TC-1为高度致瘤的肺上皮细胞，该细胞表达低水平的HPV-16 E6和E7，并被c-Ha-ras癌基因转化。让TC-1于37℃及10％CO2下生长在RPMI 1640、10％FCS、2mM L-谷氨酰胺、100U/ml青霉素、100μg/ml链霉素、100μM非必需氨基酸、1mM丙酮酸钠、50微摩尔(mcM)2-ME、400微克(mcg)/ml G418以及10％国家典型菌种保藏中心-109培养基(National Collection TypeCulture-109medium)中。C3为来自C57BL/6小鼠的小鼠胚胎细胞，该细胞经完整HPV 16基因组永生化并经pEJ-ras转化。EL-4/E7为经E7逆转录病毒转导的胸腺瘤EL-4。
单核细胞增多性李斯特菌菌株和繁殖
所用的李斯特菌菌株为Lm-LLO-E7(在游离型表达系统中的hly-E7融合基因；图1A)、Lm-E7(整合进李斯特菌基因组中的单拷贝E7基因盒)、Lm-LLO-NP(“DP-L2028”；在游离型表达系统中的hly-NP融合基因)和Lm-Gag(“ZY-18”；整合进染色体中的单拷贝HIV-1 Gag基因盒)。将E7用引物5'-GGCTCGAGCATGGAGATACACC-3'(SEQ ID No:17；XhoI位点标有下划线)和5'-GGGGACTAGTTTATGGTTTCTGAGAACA-3'(SEQ ID No:18；SpeI位点标有下划线)通过PCR扩增并连接进pCR2.1(Invitrogen,San Diego,CA)。通过XhoI/SpeI消化从pCR2.1切离E7，并将其连接进pGG-55。将hly-E7融合基因和多能转录因子PrfA克隆进pAM401，即一种多拷贝穿梭质粒(Wirth R等人,JBacteriol,165:831,1986)，从而生成pGG-55。hly启动子驱动hly基因产物的前441个氨基酸(缺乏溶血性C-端，在下文中被称作“ΔLLO”，并具有SEQID No:25中示出的序列)的表达，其通过XhoI位点连接至E7基因，从而产生hly-E7融合基因，该基因被转录和分泌成LLO-E7。用为了在体内保留质粒而选择的pGG-55转化PrfA阴性李斯特菌菌株XFL-7(由Hao Shen博士提供，University of Pennsylvania)(图1A-B)。使用引物5'-GGGGGCTAGCCCTCCTTTGATTAGTATATTC-3'(SEQ ID No:19；NheI位点标有下划线)和5'-CTCCCTCGAGATCATAATTTACTTCATC-3'(SEQ ID No:20；XhoI位点标有下划线)生成hly启动子和基因片段。将PrfA基因用引物5'-GACTACAAGGACGATGACCGACAAGTGATAACCCGGGATCTAAATAAATCCGTTT-3'(SEQ ID No:27；XbaI位点标有下划线)和5'-CCCGTCGACCAGCTCTTCTTGGTGAAG-3'(SEQ ID No:21；SalI位点标有下划线)进行PCR扩增。通过将含有驱动E7的表达和分泌的hly启动子和信号序列的表达盒引入LM基因组的orfZ域中，产生Lm-E7。将E7用引物5'-GCGGATCCCATGGAGATACACCTAC-3'(SEQ ID No:22；BamHI位点标有下划线)和5'-GCTCTAGATTATGGTTTCTGAG-3'(SEQ ID No:23；XbaI位点标有下划线)通过PCR扩增。然后将E7连接进pZY-21穿梭载体。用得到的质粒pZY-21-E7转化LM菌株10403S，该质粒包括插入在与LM基因组的orfX、Y、Z域对应的1.6-kb序列的中央的表达盒。该同源域允许E7基因盒通过同源重组插入orfZ域中。针对E7基因盒在orfZ域中的整合，筛选克隆。在含有(Lm-LLO-E7和Lm-LLO-NP)或不含(Lm-E7和ZY-18)氯霉素(20μg/ml)的脑心浸液培养基中培养细菌。在-80℃以等分试样冷冻细菌。通过Western印迹法验证表达(图2)。
Western印迹法
使李斯特菌菌株在Luria-Bertoni培养基中于37℃生长，并在600nm处测得的相同光密度下收获。将上清液TCA沉淀，并重悬于补充了0.1N NaOH的1x样品缓冲液中。将相同量的每种细胞沉淀物或每种经TCA沉淀的上清液上样至4-20％Tris-甘氨酸SDS-PAGE凝胶(NOVEX,San Diego,CA)。将凝胶转移至聚偏二氟乙烯，并用抗-E7单克隆抗体(mAb)(ZymedLaboratories,South San Francisco,CA)探测，然后与HRP-偶联的抗小鼠二抗(AmershamPharmacia Biotech,Little Chalfont,U.K.)一起温育，用Amersham ECL检测试剂显影，并暴露于Hyperfilm(Amersham Pharmacia Biotech)。
肿瘤生长的测量
每隔一天用卡尺跨最短和最长表面直径测量肿瘤。将这两个测量结果的平均值作为平均肿瘤直径(以毫米计)相对于不同时间点作图。当肿瘤直径达到20mm时，处死小鼠。仅显示存活小鼠在每个时间点的肿瘤测量结果。
李斯特菌重组体对建立的肿瘤生长的影响
6-8周龄C57BL/6小鼠(Charles River)在左胁腹皮下接受2×105个TC-1细胞。肿瘤接种后一周，肿瘤已经达到直径为4-5mm的可触知大小。然后在第7和14天用0.1LD50腹膜内Lm-LLO-E7(107个CFU)、Lm-E7(106个CFU)、Lm-LLO-NP(107个CFU)或Lm-Gag(5×105个CFU)处理8只小鼠的组。
51Cr释放测定
以0.1LD50Lm-LLO-E7、Lm-E7、Lm-LLO-NP或Lm-Gag腹膜内免疫6-8周龄C57BL/6小鼠。免疫接种后十天，收获脾。将经照射的TC-1细胞作为饲养细胞，在培养物中建立脾细胞(100:1，脾细胞:TC-1)；在体外刺激5天，然后用在标准51Cr释放测定中，其中使用下述靶标：EL-4、EL-4/E7或经E7H-2b肽(RAHYNIVTF)脉冲处理的EL-4。一式三份地进行的E:T细胞比率为：80:1、40:1、20:1、10:1、5:1和2.5:1。在37℃温育4h以后，将细胞沉淀，并从每个孔取出50μl上清液。以Wallac 1450闪烁计数器(Gaithersburg,MD)测定样品。将特异性裂解百分比确定为[(每分钟的实验计数(cpm)-自发cpm)/(总cpm-自发cpm)]×100。
TC-1特异性增殖
将C57BL/6小鼠用0.1LD50免疫，并在20天后通过腹膜内注射1 LD50Lm-LLO-E7、Lm-E7、Lm-LLO-NP或Lm-Gag进行强化。强化后六天，从经免疫的小鼠和未暴露的小鼠收获脾。以2.5×104、1.25×104、6×103或3×103个经照射的TC-1细胞/孔作为E7Ag的来源，或不用TC-1细胞或用10μg/ml Con A，在平底96孔平板中以5×105个/孔在培养物中建立脾细胞。45h后以0.5μCi[3H]胸苷/孔脉冲处理细胞。18h以后，采用Tomtec采集器96(Orange,CT)收获平板，并用Wallac 1450闪烁计数器评估增殖。将以cpm计的变化计算为实验cpm–无Ag cpm。
流式细胞术分析
将C57BL/6小鼠用0.1 LD50 Lm-LLO-E7或Lm-E7静脉内(i.v.)免疫，并在30天后强化。采用带软件(Becton Dickinson,Mountain View,CA)的流式细胞计对CD8(53-6.7，PE偶联的)、CD62配体(CD62L；MEL-14，APC偶联的)和E7H-2Db四聚体进行三色流式细胞术。将强化后第5天收获的脾细胞在室温(rt)用负载了E7肽(RAHYNIVTF)或对照(HIV-Gag)肽的H-2Db四聚体染色。以1/200稀释度使用四聚体，其由Larry R.Pease博士(Mayo Clinic,Rochester,MN)以及由NIAID Tetramer Core Facility和NIH AIDS Research and Reference Reagent Program提供。分析了四聚体+、CD8+、CD62L低细胞。
B16F0-Ova实验
给24只C57BL/6小鼠接种5×105个B16F0-Ova细胞。在第3、10和17天，将8只小鼠的组用0.1LD50Lm-OVA(106个cfu)、Lm-LLO-OVA(108个cfu)免疫，另八只动物保持不处理。
统计
为了对比肿瘤直径，确定每个组的肿瘤大小的平均值和SD，并通过学生t检验确定统计显著性。p≤0.05视作显著的。
结果
对比了Lm-E7和Lm-LLO-E7影响TC-1生长的能力。在C57BL/6小鼠的左胁腹上建立皮下肿瘤。七天后，肿瘤已经达到可触知的大小(4-5mm)。在第7和14天，给小鼠接种0.1 LD50Lm-E7、Lm-LLO-E7或作为对照的Lm-Gag和Lm-LLO-NP。Lm-LLO-E7诱导75％的建立的TC-1肿瘤的完全消退，而在该组中的其他2只小鼠中控制了肿瘤生长(图3)。相反，使用Lm-E7和Lm-Gag的免疫接种没有诱导肿瘤消退。该实验重复多次，总是得到非常类似的结果。另外，在不同的免疫方案下，Lm-LLO-E7也得到了类似的结果。在另一实验中，单次免疫能够治愈小鼠建立的5mm TC-1肿瘤。
在其他实验中，用另外2个表达E7的肿瘤细胞系得到了类似的结果：C3和EL-4/E7。为了确认以Lm-LLO-E7接种的效力，分别在第60天或第40天用TC-1或EL-4/E7肿瘤细胞重新挑战已经消除了它们的肿瘤的动物。经Lm-LLO-E7免疫的动物保持无肿瘤直到实验终止(就TC-1而言，第124天；就EL-4/E7而言，第54天)。
因此，抗原作为与ΔLLO的融合蛋白的表达会增强所述抗原的免疫原性。
实例2：LM-LLO-E7处理引起TC-1特异性脾细胞增殖
为了用Lm-LLO-E7测量Lm-E7对T细胞的诱导，在经免疫的小鼠中测量了TC-1特异性增殖性应答(抗原特异性免疫活性的度量)。来自经Lm-LLO-E7免疫的小鼠的脾细胞当以20:1、40:1、80:1和160:1的脾细胞:TC-1比率暴露于经照射的TC-1细胞(作为E7的来源)时发生增殖(图4)。反之，来自经Lm-E7和rLm对照免疫的小鼠的脾细胞仅表现出背景水平的增殖。
实例3：E7与LLO、ActA或PEST氨基酸序列的融合增强E7特异性免疫并产生浸润肿 瘤的E7特异性CD8+细胞
材料和实验方法
在12只C57BL/6小鼠(n＝3)的左胁腹皮下植入500mcl(微升)其包含100微升的在磷酸盐缓冲盐水(PBS)中的2×105个TC-1肿瘤细胞和400微升的(BD Biosciences,Franklin Lakes,N.J.)。在第7、14和21天腹膜内免疫小鼠，并在第28天收获脾和肿瘤。将肿瘤MATRIGEL从小鼠取出，并在含有2毫升(ml)RP 10培养基的试管中在冰上4℃温育过夜。将肿瘤用镊子切碎，切成2mm块，并与3ml酶混合物(PBS中0.2mg/ml胶原酶P、1mg/mlDNAse-1)一起在37℃温育1小时。将组织悬液穿过尼龙网过滤，并用5％胎牛血清+0.05％的NaN3在PBS中的溶液洗涤，以用于四聚体和IFN-γ染色。
在存在布雷菲德菌素A的情况下以107个细胞/ml将脾细胞和肿瘤细胞与1微摩尔(mcm)E7肽一起温育5小时。将细胞洗涤两次，并在50微升的抗小鼠Fc受体上清液(2.4G2)中4℃温育1小时或过夜。针对表面分子CD8和CD62L将细胞染色，渗透化，使用渗透化试剂盒Golgi-或Golgi-(Pharmingen,San Diego,Calif.)固定，并针对IFN-γ染色。使用双激光流式细胞计FACSCalibur获取500,000个事件，并使用Cellquest软件(BectonDickinson,Franklin Lakes,NJ)分析。计算活化的(CD62L低)CD8+T细胞内的IFN-γ分泌细胞的百分比。
对于四聚体染色，让H-2Db四聚体负载藻红蛋白(PE)偶联的E7肽(RAHYNIVTF,SEQID NO:24)，在室温染色1小时，并用抗别藻蓝蛋白(APC)偶联的MEL-14(CD62L)和FITC偶联的CD8在4℃染色30min。通过对比脾中和肿瘤中的四聚体+CD8+CD62L低细胞来分析细胞。
结果
为了分析Lm-ActA-E7增强抗原特异性免疫的能力，给小鼠植入TC-1肿瘤细胞，并用Lm-LLO-E7(1×107个CFU)、Lm-E7(1×106个CFU)或Lm-ActA-E7(2×108个CFU)免疫，或者不处理(未暴露的)。来自Lm-LLO-E7和Lm-ActA-E7组的小鼠肿瘤含有比在Lm-E7或未暴露的小鼠中更高百分比的分泌IFN-γ的CD8+细胞(图5A)和四聚体特异性CD8+细胞(图5B)。
在另一个实验中，给荷瘤小鼠施用Lm-LLO-E7、Lm-PEST-E7、Lm-ΔPEST-E7或Lm-E7epi，并测量肿瘤内的E7特异性淋巴细胞的水平。在第7和14天用0.1LD50的4种疫苗处理小鼠。在第21天收获肿瘤，并用针对CD62L、CD8的抗体和用E7/Db四聚体染色。在接种Lm-LLO-E7和Lm-PEST-E7的小鼠中观察到四聚体阳性的淋巴细胞在肿瘤内增加的百分比(图6A)。该结果在三个实验中是可再现的(图6B)。
因而，Lm-LLO-E7、Lm-ActA-E7和Lm-PEST-E7各自有效地诱导浸润肿瘤的CD8+T细胞和肿瘤消退。
实例4：李斯特菌疫苗载体通过小鼠传代引起对异源性和内源性抗原的增强的免 疫应答
材料和实验方法
细菌菌株
单核细胞增多性李斯特菌菌株10403S血清型1(ATCC,Manassas,Va.)是用于这些研究的野生型生物体和下述构建体的亲本菌株。菌株10403S在腹膜内注入BALB/c小鼠时具有大约5×104个CFU的LD50。“Lm-Gag”是包含HIV-1菌株HXB(具有形成合胞体的表型的B亚型实验室菌株)gag基因的拷贝的重组LM菌株，该基因使用经修饰的穿梭载体pKSV7稳定整合进李斯特菌染色体。Gag蛋白由该菌株表达和分泌，如通过Western印迹所测定。所有菌株均在脑心浸液(BHI)肉汤或琼脂板(Difco Labs,Detroit,Mich)中生长。
细菌培养
选择来自表达过客抗原(passenger antigen)和/或融合蛋白的单个克隆的细菌并在BHI肉汤中培养过夜。将该培养物的等分试样在-70℃下冷冻，不添加添加剂。通过该储备液，使培养物生长到600nm下0.1-0.2的O.D.，并将等分试样在-70℃下再次冷冻，不添加添加剂。为了制备克隆的细菌库，使用以上程序，但在每次传代后，选择多个细菌克隆，并检查靶抗原的表达，如本文所述。将在其中确认了异源抗原的表达的克隆用于下一次传代。
细菌在小鼠中传代
6-8周龄雌性BALB/c(H-2d)小鼠购自Jackson Laboratories(Bar Harbor,Me)并维持在无病原体的微隔离环境中。冷冻储存在-70℃下的储备培养物的等分试样中的活细菌滴度通过在解冻后且在使用前在BHI琼脂板上铺板而测定。总计，将5×105个细菌静脉内注射进BALB/c小鼠。3天后，收获脾脏，匀化，并将脾脏匀浆的系列稀释样在BHI肉汤中温育过夜，然后在BHI琼脂板上铺板。对于进一步传代，再次使等分试样生长到0.1-0.2O.D.，在-70℃下冷冻，并再次通过系列稀释来测定细菌滴度。在初始传代(0次传代)后，将该过程总共重复4次。
针对IFN-γ的胞内细胞因子染色
将淋巴细胞在补充了50U/ml人重组IL-2和1微升/ml Brefeldin A(GolgistopTM；PharMingen,San Diego,CA)的完全RPMI-10培养基中在存在或不存在HIV-GAG的细胞毒性T细胞培(CTL)表位(AMQMLKETI；SEQ ID No:25)、李斯特菌LLO(GYKDGNEYI；SEQ ID No:26)或HPV病毒基因E7(RAHYNIVTF；SEQ ID No:24)的情况下以1微摩尔的浓度培养5小时。首先对细胞进行表面染色，然后洗涤并接受使用Cytofix/Cytoperm试剂盒根据制造商建议(PharMingen,San Diego,CA)进行的胞内细胞因子染色。对于胞内IFN-γ染色，使用了FITC偶联的大鼠抗小鼠IFN-γ单克隆抗体(克隆XMG 1.2)及其同种型对照Ab(大鼠IgG1；均得自PharMingen)。总计，在4℃下将106个细胞在含有1％牛血清白蛋白和0.02％叠氮化钠的PBS(FACS缓冲液)中染色30分钟，然后在FACS缓冲液中洗涤3次。在FACScanTM流式细胞仪或FACSCaliburTM仪器(Becton Dickinson,San Jose,CA)上采集样品数据。使用FACSCaliburTM流式细胞仪进行CD8(PERCP偶联的，大鼠抗小鼠，克隆53-6.7Pharmingen,SanDiego,Calif.)、CD62L(APC偶联的，大鼠抗小鼠，克隆MEL-14)和胞内IFN-γ的三色流式细胞术，并通过CELLQuest software(Becton Dickinson,Mountain View,CA)对数据进行进一步分析。将细胞进行CD8高和CD62L低设门，然后分析它们的CD8+和胞内IFN-γ染色。
结果
在小鼠中传代增强重组单核细胞增多性李斯特菌的毒力
将三个不同的构建体用于确定传代对重组李斯特菌疫苗载体的影响。这些构建体中的两个携带过客抗原的基因组插入：第一个包含HIV gag基因(Lm-Gag)，而第二个包含HPV E7基因(Lm-E7)。第三个(Lm-LLO-E7)包含的质粒具有与截短形式的LLO融合的过客抗原(HPV E7)的融合基因和编码PrfA的基因，prfA是控制李斯特菌毒力因子的正调控因子。该质粒用于补充PrfA阴性突变体，以使得在活的宿主中，选择压力将有利于质粒保种，因为没有质粒细菌则无毒性。所有3个构建体均已在体外在细菌中广泛繁殖了许多代。
细菌传代导致了细菌毒力的增加，如通过脾脏中的存活细菌数所测量，每一者都是前2代。对于Lm-Gag和Lm-LLO-E7，毒力随着每次传代而增加，直至第2代(图7A)。含质粒的构建体Lm-LLO-E7展现出最显著的毒力增加。在传代前，Lm-LLO-E7的初始免疫剂量必须增至107个细菌，并且脾脏必须在第2天收获以便回收细菌(而对于Lm-Gag的105个细菌的初始剂量则在第3天收获)。在初始传代后，Lm-LLO-E7的标准剂量足以使得可以在第3天收获。对于Lm-E7，经未传代的细菌，毒力增加1.5个数量级(图7B)。
因此，通过小鼠传代增加了李斯特菌疫苗菌株的毒力。
传代增加单核细胞增多性李斯特菌诱导CD8+T细胞的能力
接下来，使用HIV-Gag肽AMQMLKETI(SEQ ID No:25)和LLO 91-99(GYKDGNEYI；SEQID No:26)，通过用MHC I类特异性免疫显性表位进行细胞内细胞因子染色，而确定传代对抗原特异性CD8+T细胞的作用。将103个CFU的传代细菌(Lm-Gag)注射进小鼠产生了大量的HIV-Gag特异性CD8+T细胞，而相同剂量的未传代Lm-Gag未诱导可检测的Gag特异性CD8+T细胞。甚至将未传代细菌的剂量增加100倍也未补偿它们的相对毒力；事实上，甚至在更高的剂量下也未引起可检测的Gag特异性CD8+T细胞。采用传代细菌的相同剂量将Gag特异性T细胞诱导增加了50％(图8)。采用LLO特异性CD8+T细胞，观察到了相同的抗原特异性CD8+T细胞诱导模式，表明这些结果不是由过客抗原的性质导致的，因为它们在用内源性李斯特菌抗原LLO时观察到。
因此，通过小鼠传代增加了李斯特菌疫苗菌株的免疫原性。
实例5：含PrfA的质粒在不存在抗生素的情况下在具有PrfA缺失的LM菌株中是稳 定的
材料和实验方法
细菌
单核细胞增多性李斯特菌菌株XFL7在PrfA基因中包含300个碱基对缺失。XFL7携带部分地恢复毒力并赋予CAP抗性的pGG55，并在美国专利申请公开No.200500118184中有所描述。
从李斯特菌提取质粒的方案开发
将1mL单核细胞增多性李斯特菌Lm-LLO-E7研究工作细胞库病毒接种到含有34μg/mL CAP的27mL BH1培养基中，并在37℃和200rpm下生长24小时。
使七个2.5mL的培养物样品沉淀(15000rpm持续5分钟)，并将沉淀物在37℃下与50μl溶菌酶溶液温育从0-60分钟的不同时长。
溶菌酶溶液：
-29μl 1M磷酸氢二钾
-21μl 1M磷酸二氢钾
-500μl 40％蔗糖(通过0.45μm过滤器除菌过滤)
-450μl水
-60μl溶菌酶(50mg/mL)
在与溶菌酶温育后，将悬浮液如前所述离心，并丢弃上清液。然后使各沉淀接受通过经修改版本的QIAprep Spin Miniprep(Qiagen,Germantown,Maryland)方案进行的质粒提取。方案的修改如下：
1.缓冲液PI、P2和N3的体积均提高三倍，以使得增加的生物质可被完全裂解。
2.将2mg/mL的溶菌酶加入重悬的细胞中，然后添加P2。然后将裂解溶液在37℃下温育15分钟，再进行中和。
3.将质粒DNA重悬在30μL而不是50μL中以提高浓度。
在其他实验中，将细胞在P1缓冲液+溶菌酶中温育15分钟，然后在室温下用P2(裂解缓冲液)和P3(中和缓冲液)温育。
将相等体积的得自各继代培养的分离的质粒DNA在0.8％琼脂糖凝胶上运行，用溴化乙锭染色并观察结构或分离不稳定性的迹象。
结果表明从单核细胞增多性李斯特菌Lm-LLO-E7的质粒提取效率随着溶菌酶温育时间的延长而提高，在大约50分钟温育时达到最佳水平。
这些结果提供从李斯特菌疫苗菌株提取质粒的有效方法。
影印培养法
将原始培养物的稀释样在不存在或存在34μg/mL CAP的情况下在含LB或TB琼脂的板上铺板。将选择性与非选择性琼脂之间的计数差异用于确定是否存在质粒任何明显的分离不稳定性。
结果
在不存在抗生素的情况下pGG55质粒在单核细胞增多性李斯特菌菌株XFL7中的遗传稳定性(即，在不存在选择压力例如抗生素选择压力的情况下质粒被细菌保持的程度或质粒保持与细菌稳定相关联的程度)通过在Luria-Bertani培养基(LB：5g/L NaCl、10g/ml大豆蛋白胨、5g/L酵母提取物)和Terrific Broth培养基(TB：10g/L葡萄糖、11.8g/L大豆蛋白胨、23.6g/L酵母提取物、2.2g/LKH2PO4、9.4g/L K2HPO4)两者中以一式两份培养的方式通过系列传代培养而评估。将250mL带挡板的摇瓶中的50mL新鲜培养基用固定数量的细胞(1ODmL)接种，然后以24小时的间隔传代培养。将培养物在定轨摇床中在37℃和200rpm下温育。在每次传代培养时，测量OD600，并将其用于计算已经过的细胞倍增时间(或代数)，直到在LB和TB中分别达到30代和42代。通过离心法沉淀每个传代培养阶段(大约每4代)的已知数量的细胞(15ODmL)，然后使用上述Qiagen QIAprep Spin方案提取质粒DNA。纯化后，使质粒DNA接受琼脂糖凝胶电泳，然后进行溴化乙锭染色。虽然制备物中的质粒的量在样品之间略有变化，但是相对于细菌的代数而言总体趋势是质粒的量恒定(图9A-B)。因此，pGG55在菌株XFL7中表现出稳定性，甚至在不存在抗生素的情况下。
还通过在每个传代培养阶段在琼脂板上的影印培养而在稳定性研究期间监测质粒稳定性。与得自琼脂糖凝胶电泳的结果一致，在LB或TB液体培养(分别为图10和图11)中在整个研究期间含质粒的细胞的数量均无整体变化。
这些发现证明编码PrfA的质粒在不存在抗生素的情况下在含rfA基因突变的李斯特菌菌株中表现出稳定性。
材料与方法(实例6-10)
PCR试剂：
用于扩增PrfA基因及辨别D133V突变的引物在表1中示出。通过将引物在TE缓冲液中稀释到400μM而制备了引物ADV451、452和453的储备溶液。将储备溶液的等分试样在水(PCR级)中进一步稀释到20μM以制备工作溶液。将引物储存在-20℃。PCR中所用的试剂在表2中示出。
表1.引物ADV451、452和453。
表2.PCR试剂。
质粒DNA制备
使用PureLinkTMHiPure质粒中量提取试剂盒(Invitrogen,K2100-05)根据制造商的说明从大肠杆菌或单核细胞增多性李斯特菌通过中量制备而提取并纯化具有(pGG55D133V)和不具有(pGG55 WT)prfA突变的pGG55质粒。对于从李斯特菌的质粒纯化，将携带pGG55 D133V或WT质粒的细菌菌株从冷冻的储备品划线接种到补充了氯霉素(25μg/ml)的BHI琼脂板中。使来自每个菌株的单个集落在5ml选择性培养基(具有25μg/ml氯霉素的BHI肉汤)中在37℃和剧烈摇晃下生长6小时，然后以1:500传代接种在100ml选择性培养基中在相似的条件下生长过夜。将来自过夜培养的细菌通过在4,000xg下离心10分钟而收获，然后重悬在含有2mg/ml溶菌酶(Sigma,L7001)的缓冲液R3(重悬缓冲液)中。将细菌悬液在37℃下温育至少1小时，然后转到常规方案。在分光光度计中在260nm和280nm下测量经稀释的质粒的浓度和纯度。为了制备模板DNA，从中量制备储备溶液将pGG55 D133V和WT质粒重悬在水中达到1ng/μl的最终浓度。对于pGG55WT质粒，从1ng/μl溶液制备了系列10倍稀释样，对应于从10-1至10-7的稀释。
测试临床级材料的prfA特异性PCR方案
反应混合物包含1x PCR缓冲液、1.5mM MgCl2、0.8mM dNTP、0.4μM的各引物、0.05U/μl Taq DNA聚合酶和0.04ng/μl pGG55 D133V模板质粒。对于各测试，需要10根管，在25μl反应中每根管的关键组分在表3中示出。对于PCR反应，用如表4所示的足够11次反应的试剂制备主混合物，然后将24μl该PCR混合物加入各管中。随后，将总共1μl系列稀释的pGG55WT质粒加入对应的管中：管3中1ng；管4中100pg；管5中10pg；管6中1pg；管7中100fg；管8中10fg；管9中1fg；管10中0.1fg。将该系列稀释样用于校准标准曲线以确定方法灵敏度。另外，将0.5μl水和0.5μl引物ADV451(20μM储备液)加入管1中，并将1μl水加入管2中，达到25μl的最终体积。对于25μl反应，每根管的每种试剂的量在表5中示出。用在反应中的PCR循环条件在表6中示出。
在PCR反应结束后，将5μl凝胶上样缓冲液(6x，具有溴酚蓝)加到每个样品中，并通过在TBE缓冲液中的1.2％琼脂糖凝胶上电泳分析10μl。凝胶尺寸为7cm×7cm×1cm，具有15个样品孔(1mm×2mm)的梳。凝胶在100V下运行约30分钟，直到溴酚蓝染料到达凝胶的中间。将凝胶在溴化乙锭(0.5μg/ml)中染色20分钟，在水中脱色10分钟。通过用紫外光照射而观察凝胶，并拍照。使用条带密度测量软件(Quantity One 4.5.1版，BioRad)分析图像。
表3.一套单独的PCR反应对方法进行验证以检测野生型prfA序列在Lm-LLO-E7样品中的存在性。
表4.主PCR混合物制备。
表5.使用引物ADV451、452和453对方法进行验证以检测野生型prfA序列的存在性的PCR方案。
apGG55WT(管3中1ng；管4中100pg；管5中10pg；管6中1pg；管7中100fg；管8中10fg；管9中1fg；管10中0.1fg)。
b在管1中，添加0.5μl水和0.5μl引物ADV451(20μM储备液)；在管2中添加1μl水。
表6.使用引物ADV451、452和453检测野生型prfA序列的存在性的PCR循环条件。
测序：
使用双脱氧测序法进行了质粒的测序。将质粒pGG55D133V和pGG55WT以不同的比率(1:1、1:10、1；100、1:1,000和1:10,000)混合。将混合物中质粒的总量保持恒定(500μg)，并将包含野生型序列的质粒关于D133V质粒进行10倍系列稀释以确定方法的灵敏度。
结果
实例6：测序不是检测D133V突变的回复的灵敏方法。
为了估计测序在检测野生型prfA序列中的灵敏度，将pGG55D133V和WT质粒以不同的比率混合并测序。结果在图12中示出，并揭示测序在辨别prfAD133V突变中具有高度特异性(图12)。在另一方面，灵敏度较低，并且在序列中具有可检测峰的野生型prfA pGG55质粒的最大稀释度是1/10(图12)。总之，虽然测序具有非常高的特异性，但是该方法的灵敏度较低，且不适于筛选罕见事件(诸如prfA D133V突变在Lm-LLO-E7样品中的回复体)的存在性。
实例7：开发高度特异性且灵敏的PCR方法来检测D133V突变的回复。
鉴于用测序来检测罕见事件的低灵敏度，有必要开发具有类似特异性的更灵敏的方法来检测野生型D133V突变的回复。为了实现该目标，我们设计了一种基于PCR的方法，该方法特异性扩增野生型序列并且足够灵敏检测10,000,000个D133V突变序列拷贝中的至少1个野生型prfA拷贝。我们设计了3个引物用于该方法：ADV451、ADV452和ADV453(表1)。ADV451和ADV452均为正向引物，且差异在于3’位置的最后一个核苷酸以区分prfA基因的位置398处的A→T(D133V)突变。ADV453引物是位于ADV451和ADV452引物的退火位点下游大约300bp处的反向引物(图13)。引物ADV451或ADV452和ADV453所得的预期PCR条带为326bp。在严格条件下，ADV451引物不应扩增pGG55D133V质粒，而ADV452将为野生型prfA序列特异性的。
实例8：PCR方法的特异性。
使用引物ADV451的反应具有非常高的特异性，并扩增了突变的D133VprfA序列(泳道1至3)，但未扩增野生型序列(泳道4至6)。然而，当使用5ng的模板DNA而不是使用1ng时，可在泳道4中检测到非常弱的条带(图14)。
如图15中所示，使用ADV452引物的反应仅扩增了野生型prfA序列(泳道4、5和6)，当将携带D133V prfA突变的pGG55用作模板时未检测到条带(泳道1、2和3)，甚至当在反应中使用5ng质粒时也是如此(图16)。总之，使用引物ADV451和ADV452的PCR反应具有非常高的特异性，并且能够辨别在pGG55质粒中的prfA基因的位置398处的(D133V)突变。基于这些结果，我们选择1ng的量作为将用在反应中的模板DNA的标准量。
实例9：PCR方法的灵敏度。
使用1ng的模板DNA测试了反应的灵敏度。对于携带野生型prfA序列的质粒，还将降低的DNA量(对应于从10-1至10-7的10倍稀释)包括在反应中以估计灵敏度。在这些反应中，仅使用了引物ADV452和ADV453。在具有30个循环(10个循环的退火温度为53℃，另20个循环的退火温度为50℃)的PCR反应中，方法的灵敏度为1/100,000(数据未示出)。如图5中所示，对于D133V回复体的检测，将PCR循环数增至37将方法的视觉灵敏度提高至10-6，而不明显损害特异性。当将1ng质粒用作初始DNA量时，在10-6稀释下可见明显的条带，这对应于一百万个D133V突变体中1个野生型序列拷贝的检测水平。在较长的暴露后在泳道1和9中仅可观察到非常弱的条带，再次确保了方法可靠的特异性。在另一方面，当以5ng DNA开始时，在10-7稀释下可容易地检测到条带，从而提高了PCR的灵敏度。然而，使用pGG55 D133V质粒也可检测到类似强度的条带，从而表明方法的特异性限度(图17)。通过pGG55 D133V质粒观察到的该条带可能是由于用引物ADV452对D133V突变的非特异性扩增，通过增加的循环数，该突变可以明显蓄积。这些结果表明在不明显损害特异性的情况下该方法的灵敏度限度位于1:1,000,000与1:10,000,000之间。
实例10：表达LLO与E7的融合蛋白(LM-LLO-E7)的重组李斯特菌
该菌株的减毒程度比野生型亲本菌株10403S高大约4-5个数量级，并分泌融合蛋白tLLO-E7。该免疫疗法基于骨架XFL7，其通过毒力基因转录激活因子prfA中的不可逆缺失而衍生自10403S。PrfA调控若干毒力基因诸如李斯特菌溶血素O(LLO)、ActA、PlcA(磷脂酶A)、PlcB(磷脂酶B)等的转录，这些基因是单核细胞增多性李斯特菌的体内胞内生长和存活所需的。质粒pGG55借助“氯霉素”的选择而由Lm-LLO-E7在体外保持。然而，对于Lm-LLO-E7对质粒的体内保持而言，其携带突变的prfA(D133V)的拷贝，已证实其在DNA结合和激活毒力基因的转录方面的活性不如野生型prfA。我们已观察到，与突变的prfA的互补作用导致与野生型菌株10403S相比从Lm-LLO-E7分泌的LLO的量降低大约40倍。这暗示：菌株Lm-LLO-E7可能表现出降低的受prfA调控的毒力基因诸如actA、inlA、inlB、inlC、plcB等的表达。在Lm-LLO-E7中，与突变的prfA拷贝的互补作用可能导致受prfA调控的不同毒力基因的表达降低，从而导致总体减毒大约4-5个数量级。
实例11：肛门癌免疫疗法与化放疗
I-II期研究
合格标准
●新诊断的局部晚期肛门癌：
●分期：T>4cm或淋巴结+。
●PS 0-1
●通过CT/MRI或PET扫描分期。
●无严重的心脏或肺部疾病。足够的骨髓和肾功能。
ADXS-HPV治疗
●ADXS-HPV以1×109个cfu施用
O经30分钟静脉内输注500ml
●ADXS-HPV治疗前的用药：
O萘普生(Naprosyn)500mg BID，第-1、0天
O异丙嗪25mg PO，BID(给药前，8小时)
●输注后抗生素
O氨苄西林500mg QID，第3-9天
治疗计划(参见图23-24)。
新诊断出肛门癌且原发性肿瘤>4cm或累及淋巴结、无远处转移的患者合格。所有患者接受2个疗程的丝裂霉素、5-FU与并行放疗(54Gy，分割成30次，调强放疗[IMRT])。患者接受4次ADXS-HPV治疗，大约每28天静脉内施用一次1×109个集落形成单位。在治疗计划#1(图23)中，在化放疗前给予第一剂，在完成放疗后每28天给予第2-4剂。在治疗计划#2(图24)中，在化放疗期间施用第二剂ADXS-HPV。
结果
8名患者已在局部晚期肛门癌试验中接受了治疗。七名完成了治疗，且无疾病证据(NED)(表1)。(仅具有5级不相关心脏事件的患者未能存活，且具有疾病证据–参见表1)
毒性
●持续约24小时的通常需要杜冷丁的寒颤是最常见的毒性。
●无细菌感染的证据。
●与化放疗无重叠毒性(1例3级嗜中性白血球减少症)。
虽然本文已示出和描述了本发明的某些特征，但现在本领域的普通技术人员将想到许多修改、置换、变化和等同形式。因此，应当理解，所附权利要求书旨在涵盖落在本发明的真实精神范围内的所有此类修改和变化。

Claims (150)

1.一种治疗人受试者中的肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症的方法，所述方法包括向所述受试者施用包括化放疗疗法和重组李斯特菌菌株的联合疗法的步骤，所述李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，从而治疗所述人受试者中的所述肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述肛门肿瘤或肛门癌症为肛门上皮内癌症。
3.根据权利要求1所述的方法，其中所述阴道肿瘤或阴道癌症为阴道上皮内癌症。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法在第一次施用所述重组李斯特菌菌株之后施用。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法在施用所述重组李斯特菌菌株之前施用。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法在第一次施用所述重组李斯特菌菌株之后并在一至三次加强施用所述重组李斯特菌菌株之前施用。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法与所述重组李斯特菌菌株同时施用。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中所述方法包括施用四剂所述重组李斯特菌。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法，其中第一剂所述重组李斯特菌在化放疗疗法之前施用，第2至4剂在完成放疗后每28天施用。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的方法，其中所述第一剂所述重组李斯特菌在化放疗疗法之前施用，其中第二剂ADXS-HPV在化放疗疗法期间施用，并且其中第3至4剂在完成化放疗疗法之后每28天施用。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法包括丝裂霉素和氟尿嘧啶(5-FU)以及放射疗法。
12.根据权利要求1至11中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法包括施用2个疗程的丝裂霉素、5-FU与并行放疗(54Gy，分割成30次，调强放疗)。
13.根据权利要求1至12中任一项所述的方法，其中所述放射疗法持续约6周。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的方法，其中所述李斯特菌在内源性prfA基因中包含突变或缺失。
15.根据权利要求1至14中任一项所述的方法，其中所述重组核酸还包含第二开放阅读框，所述第二开放阅读框编码突变体prfA基因，从而诱导对所述肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症的免疫应答。
16.根据权利要求1至15中任一项所述的方法，其中所述突变体prfA基因编码包含D133V突变的PrfA蛋白。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的重组李斯特菌，其中所述突变体PrfA蛋白补充prfA基因组突变或缺失。
18.根据权利要求1至17中任一项所述的方法，其中所述施用为静脉内或经口施用。
19.根据权利要求1至18中任一项所述的方法，其中所述LLO蛋白的N末端片段包含SEQID NO:2。
20.根据权利要求1至19中任一项所述的方法，其中所述重组李斯特菌菌株以1×109-3.31×1010个生物体的剂量施用给所述人受试者。
21.根据权利要求1至20中任一项所述的方法，其中所述重组李斯特菌菌株是重组单核细胞增多性李斯特菌菌株。
22.根据权利要求1至21中任一项所述的方法，其中所述重组李斯特菌菌株已在所述施用步骤之前通过动物宿主传代。
23.根据权利要求1至22中任一项所述的方法，其中所述重组多肽由所述重组李斯特菌菌株表达。
24.根据权利要求1至23中任一项所述的方法，其中所述重组李斯特菌菌株包含编码所述重组多肽的质粒。
25.根据权利要求1至24中任一项所述的方法，还包括用所述重组李斯特菌菌株强化所述人受试者的步骤。
26.根据权利要求1至25中任一项所述的方法，还包括用包含所述E7抗原或引导所述E7抗原表达的免疫原性组合物接种所述人受试者的步骤。
27.根据权利要求1至26中任一项所述的方法，其中所述重组李斯特菌菌株已储存在冷冻或冻干细胞库中。
28.一种诱导人受试者中的抗肿瘤细胞毒性T细胞应答的方法，包括向所述受试者施用根据权利要求1至27中任一项所述的联合疗法的步骤。
29.一种治疗人受试者的肿瘤或癌症的方法，包括向所述受试者施用根据权利要求1至28中任一项所述的重组李斯特菌菌株的步骤。
30.根据权利要求1至29中任一项所述的方法，其中所述施用为静脉内或经口施用。
31.根据权利要求1至30中任一项所述的方法，其中所述免疫应答包括增加产干扰素-γ的细胞的水平。
32.根据权利要求1至31中任一项所述的方法，其中所述免疫应答包括增加产TNF-α的细胞的水平。
33.根据权利要求1至32中任一项所述的方法，其中所述免疫应答包括增加效应T细胞对肿瘤的浸润。
34.根据权利要求1至33中任一项所述的方法，其中所述效应T细胞是CD8+T细胞或CD4+T细胞。
35.根据权利要求1至34中任一项所述的方法，其中所述免疫应答还包括表位扩展。
36.根据权利要求1至35中任一项所述的方法，其中所述免疫应答还包括诱导对自身来源的肿瘤抗原的广泛应答。
37.根据权利要求1至36中任一项所述的方法，其中所述免疫应答还包括改善肿瘤微环境中抑制性与效应免疫细胞的总体平衡。
38.根据权利要求1至37中任一项所述的方法，其中所述免疫应答还包括改善抑制性与效应免疫细胞的系统平衡。
39.一种治疗人受试者中的肛门或阴道瘤变的方法，所述方法包括向所述受试者施用包括化放疗疗法和重组李斯特菌菌株的联合疗法的步骤，所述李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，从而治疗所述人受试者中的所述肛门或阴道瘤变。
40.根据权利要求39所述的方法，其中所述肛门瘤变为肛门上皮内瘤变。
41.根据权利要求40所述的方法，其中所述阴道瘤变为阴道上皮内瘤变。
42.根据权利要求39至41中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法在第一次施用所述重组李斯特菌菌株之后施用。
43.根据权利要求39至42中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法在施用所述重组李斯特菌菌株之前施用。
44.根据权利要求39至43中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法在第一次施用所述重组李斯特菌菌株之后并在一至三次加强施用所述重组李斯特菌菌株之前施用。
45.根据权利要求39至44中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法与所述重组李斯特菌菌株同时施用。
46.根据权利要求39至45中任一项所述的方法，其中所述方法包括施用四剂所述重组李斯特菌。
47.根据权利要求39至46中任一项所述的方法，其中第一剂所述重组李斯特菌在化放疗疗法之前施用，第2至4剂在完成放疗后每28天施用。
48.根据权利要求39至47中任一项所述的方法，其中所述第一剂所述重组李斯特菌在化放疗疗法之前施用，其中第二剂ADXS-HPV在化放疗疗法期间施用，并且其中第3至4剂在完成化放疗疗法之后每28天施用。
49.根据权利要求39至48中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法包括丝裂霉素和氟尿嘧啶(5-FU)以及放射疗法。
50.根据权利要求39至49中任一项所述的方法，其中所述化放疗疗法包括施用2个疗程的丝裂霉素、5-FU与并行放疗(54Gy，分割成30次，调强放疗)。
51.根据权利要求39至50中任一项所述的方法，其中所述放射疗法持续约6周。
52.根据权利要求39至51中任一项所述的方法，其中所述李斯特菌在内源性prfA基因中包含突变或缺失。
53.根据权利要求39至52中任一项所述的方法，其中所述重组核酸还包含第二开放阅读框，所述第二开放阅读框编码突变体prfA基因，从而诱导对所述肛门或阴道瘤变的免疫应答。
54.根据权利要求39至53中任一项所述的方法，其中所述突变体prfA基因编码包含D133V突变的突变体PrfA蛋白。
55.根据权利要求39至54中任一项所述的重组李斯特菌，其中所述突变体PrfA蛋白补充prfA基因组突变或缺失。
56.根据权利要求39至55中任一项所述的方法，其中所述施用为静脉内或经口施用。
57.根据权利要求39至56中任一项所述的方法，其中所述LLO蛋白的N末端片段包含SEQID NO:2。
58.根据权利要求39至57中任一项所述的方法，其中所述重组李斯特菌菌株以1×109-3.31×1010个生物体的剂量施用给所述人受试者。
59.根据权利要求39至58中任一项所述的方法，其中所述重组李斯特菌菌株是重组单核细胞增多性李斯特菌菌株。
60.根据权利要求39至59中任一项所述的方法，其中所述重组李斯特菌菌株已在所述施用步骤之前通过动物宿主传代。
61.根据权利要求39至60中任一项所述的方法，其中所述重组多肽由所述重组李斯特菌菌株表达。
62.根据权利要求39至61中任一项所述的方法，其中所述重组李斯特菌菌株包含编码所述重组多肽的质粒。
63.根据权利要求39至62中任一项所述的方法，还包括用所述重组李斯特菌菌株强化所述人受试者的步骤。
64.根据权利要求39至63中任一项所述的方法，还包括用包含所述E7抗原或引导所述E7抗原表达的免疫原性组合物接种所述人受试者的步骤。
65.根据权利要求39至64中任一项所述的方法，其中所述重组李斯特菌菌株已储存在冷冻或冻干细胞库中。
66.一种诱导人受试者中的抗瘤变细胞毒性T细胞应答的方法，包括向所述受试者施用根据权利要求39至65中任一项所述的联合疗法的步骤。
67.一种治疗人受试者的肛门或阴道瘤变的方法，包括向所述受试者施用根据权利要求39至66中任一项所述的重组李斯特菌菌株的步骤。
68.根据权利要求39至67中任一项所述的方法，其中所述施用为静脉内或经口施用。
69.根据权利要求39至68中任一项所述的方法，其中所述免疫应答包括增加产干扰素-γ的细胞的水平。
70.根据权利要求39至69中任一项所述的方法，其中所述免疫应答包括增加产TNF-α的细胞的水平。
71.根据权利要求39至70中任一项所述的方法，其中所述免疫应答包括增加效应T细胞对瘤变的浸润。
72.根据权利要求39至71中任一项所述的方法，其中所述效应T细胞是CD8+T细胞或CD4+T细胞。
73.根据权利要求39至72中任一项所述的方法，其中所述免疫应答还包括表位扩展。
74.根据权利要求39至73中任一项所述的方法，其中所述免疫应答还包括诱导对自身来源的瘤变抗原的广泛应答。
75.根据权利要求39至74中任一项所述的方法，其中所述免疫应答还包括改善瘤变微环境中抑制性与效应免疫细胞的总体平衡。
76.根据权利要求39至75中任一项所述的方法，其中所述免疫应答还包括改善抑制性与效应免疫细胞的系统平衡。
77.包含重组李斯特菌菌株的组合物治疗人受试者中的肛门或阴道肿瘤或癌症的用途，所述李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，所述治疗还包括向所述受试者施用化放疗疗法的步骤，从而治疗所述人受试者中的所述肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症。
78.根据权利要求77所述的用途，其中所述化放疗疗法在第一次施用所述重组李斯特菌菌株之后施用。
79.根据权利要求77至78中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法在施用所述重组李斯特菌菌株之前施用。
80.根据权利要求77至79中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法在第一次施用所述重组李斯特菌菌株之后并在一至三次加强施用所述重组李斯特菌菌株之前施用。
81.根据权利要求77至80中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法与所述重组李斯特菌菌株同时施用。
82.根据权利要求77至81中任一项所述的用途，其中所述方法包括施用四剂所述重组李斯特菌。
83.根据权利要求77至82中任一项所述的用途，其中第一剂所述重组李斯特菌在化放疗疗法之前施用，第2至4剂在完成放疗后每28天施用。
84.根据权利要求77至83中任一项所述的用途，其中所述第一剂所述重组李斯特菌在化放疗疗法之前施用，其中第二剂ADXS-HPV在化放疗疗法期间施用，并且其中第3至4剂在完成化放疗疗法之后每28天施用。
85.根据权利要求77至84中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法包括丝裂霉素和氟尿嘧啶(5-FU)以及放射疗法。
86.根据权利要求77至85中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法包括施用2个疗程的丝裂霉素、5-FU与并行放疗(54Gy，分割成30次，调强放疗)。
87.根据权利要求77至86中任一项所述的用途，其中所述放射疗法持续约6周。
88.根据权利要求77至87中任一项所述的用途，其中所述李斯特菌在内源性prfA基因中包含突变或缺失。
89.根据权利要求77至88中任一项所述的用途，其中所述重组核酸还包含第二开放阅读框，所述第二开放阅读框编码突变体prfA基因，从而诱导对所述肛门或阴道肿瘤或肛门或阴道癌症的免疫应答。
90.根据权利要求77至89中任一项所述的用途，其中所述突变体prfA基因编码包含D133V突变的突变体PrfA蛋白。
91.根据权利要求77至90中任一项所述的重组李斯特菌，其中所述突变体PrfA蛋白补充prfA基因组突变或缺失。
92.根据权利要求77至91中任一项所述的用途，其中所述施用为静脉内或经口施用。
93.根据权利要求77至92中任一项所述的用途，其中所述LLO蛋白的N末端片段包含SEQID NO:2。
94.根据权利要求77至93中任一项所述的用途，其中将所述重组李斯特菌菌株以1×109-3.31×1010个生物体的剂量施用给所述人受试者。
95.根据权利要求77至94中任一项所述的用途，其中所述重组李斯特菌菌株是重组单核细胞增多性李斯特菌菌株。
96.根据权利要求77至95中任一项所述的用途，其中所述重组李斯特菌菌株已在所述施用步骤之前通过动物宿主传代。
97.根据权利要求77至96中任一项所述的用途，其中所述重组多肽由所述重组李斯特菌菌株表达。
98.根据权利要求77至97中任一项所述的用途，其中所述重组李斯特菌菌株包含编码所述重组多肽的质粒。
99.根据权利要求77至98中任一项所述的用途，还包括用所述重组李斯特菌菌株强化所述人受试者的步骤。
100.根据权利要求77至99中任一项所述的用途，还包括用包含所述E7抗原或引导所述E7抗原表达的免疫原性组合物接种所述人受试者的步骤。
101.根据权利要求77至100中任一项所述的用途，其中所述重组李斯特菌菌株已储存在冷冻或冻干细胞库中。
102.一种诱导人受试者中的抗肿瘤细胞毒性T细胞应答的方法，包括向所述受试者施用根据权利要求77至101中任一项所述的联合疗法的步骤。
103.根据权利要求77至102中任一项所述的用途，其中治疗人受试者的肿瘤或癌症包括向所述受试者施用所述重组李斯特菌菌株的步骤。
104.根据权利要求77至103中任一项所述的用途，其中所述施用为静脉内或经口施用。
105.根据权利要求77至104中任一项所述的用途，其中所述免疫应答包括增加产干扰素-γ的细胞的水平。
106.根据权利要求77至105中任一项所述的用途，其中所述免疫应答包括增加产TNF-α的细胞的水平。
107.根据权利要求77至106中任一项所述的用途，其中所述免疫应答包括增加效应T细胞对肿瘤的浸润。
108.根据权利要求77至107中任一项所述的用途，其中所述效应T细胞是CD8+T细胞或CD4+T细胞。
109.根据权利要求77至108中任一项所述的用途，其中所述免疫应答还包括表位扩展。
110.根据权利要求77至109中任一项所述的用途，其中所述免疫应答还包括诱导对自身来源的肿瘤抗原的广泛应答。
111.根据权利要求77至110中任一项所述的用途，其中所述免疫应答还包括改善肿瘤微环境中抑制性与效应免疫细胞的总体平衡。
112.根据权利要求77至111中任一项所述的用途，其中所述免疫应答还包括改善抑制性与效应免疫细胞的系统平衡。
113.包含重组李斯特菌菌株的组合物治疗人受试者中的肛门或阴道瘤变的用途，所述李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的N末端片段，所述治疗还包括向所述受试者施用化放疗疗法的步骤，从而治疗所述人受试者中的所述肛门或阴道瘤变。
114.根据权利要求113所述的用途，其中所述肛门瘤变为肛门上皮内瘤变。
115.根据权利要求113所述的用途，其中所述阴道瘤变为阴道上皮内瘤变。
116.根据权利要求113至115中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法在第一次施用所述重组李斯特菌菌株之后施用。
117.根据权利要求113至116中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法在施用所述重组李斯特菌菌株之前施用。
118.根据权利要求113至117中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法在第一次施用所述重组李斯特菌菌株之后并在一至三次加强施用所述重组李斯特菌菌株之前施用。
119.根据权利要求113至118中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法与所述重组李斯特菌菌株同时施用。
120.根据权利要求113至119中任一项所述的用途，其中所述方法包括施用四剂所述重组李斯特菌。
121.根据权利要求113至120中任一项所述的用途，其中第一剂所述重组李斯特菌在化放疗疗法之前施用，第2至4剂在完成放疗后每28天施用。
122.根据权利要求113至121中任一项所述的用途，其中所述第一剂所述重组李斯特菌在化放疗疗法之前施用，其中第二剂ADXS-HPV在化放疗疗法期间施用，并且其中第3至4剂在完成化放疗疗法之后每28天施用。
123.根据权利要求113至122中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法包括丝裂霉素和氟尿嘧啶(5-FU)以及放射疗法。
124.根据权利要求113至123中任一项所述的用途，其中所述化放疗疗法包括施用2个疗程的丝裂霉素、5-FU与并行放疗(54Gy，分割成30次，调强放疗)。
125.根据权利要求113至124中任一项所述的用途，其中所述放射疗法持续约6周。
126.根据权利要求113至125中任一项所述的用途，其中所述李斯特菌在内源性prfA基因中包含突变或缺失。
127.根据权利要求113至126中任一项所述的用途，其中所述重组核酸还包含第二开放阅读框，所述第二开放阅读框编码突变体prfA基因，从而诱导对所述肛门或阴道瘤变的免疫应答。
128.根据权利要求113至127中任一项所述的用途，其中所述突变体prfA基因编码包含D133V突变的突变体PrfA蛋白。
129.根据权利要求113至128中任一项所述的重组李斯特菌，其中所述突变体PrfA蛋白补充prfA基因组突变或缺失。
130.根据权利要求113至129中任一项所述的用途，其中所述施用为静脉内或经口施用。
131.根据权利要求113至130中任一项所述的用途，其中所述LLO蛋白的N末端片段包含SEQ ID NO:2。
132.根据权利要求113至131中任一项所述的用途，其中将所述重组李斯特菌菌株以1×109-3.31×1010个生物体的剂量施用给所述人受试者。
133.根据权利要求113至132中任一项所述的用途，其中所述重组李斯特菌菌株是重组单核细胞增多性李斯特菌菌株。
134.根据权利要求113至133中任一项所述的用途，其中所述重组李斯特菌菌株已在所述施用步骤之前通过动物宿主传代。
135.根据权利要求113至134中任一项所述的用途，其中所述重组多肽由所述重组李斯特菌菌株表达。
136.根据权利要求113至135中任一项所述的用途，其中所述重组李斯特菌菌株包含编码所述重组多肽的质粒。
137.根据权利要求113至136中任一项所述的用途，还包括用所述重组李斯特菌菌株强化所述人受试者的步骤。
138.根据权利要求113至137中任一项所述的用途，还包括用包含所述E7抗原或引导所述E7抗原表达的免疫原性组合物接种所述人受试者的步骤。
139.根据权利要求113至138中任一项所述的用途，其中所述重组李斯特菌菌株已储存在冷冻或冻干细胞库中。
140.一种诱导人受试者中的抗瘤变细胞毒性T细胞应答的方法，包括向所述受试者施用根据权利要求113至139中任一项所述的联合疗法的步骤。
141.根据权利要求113至140中任一项所述的用途，其中治疗人受试者的肛门或阴道瘤变包括向所述受试者施用所述重组李斯特菌菌株的步骤。
142.根据权利要求113至141中任一项所述的用途，其中所述施用为静脉内或经口施用。
143.根据权利要求113至142中任一项所述的用途，其中所述免疫应答包括增加产干扰素-γ的细胞的水平。
144.根据权利要求113至143中任一项所述的用途，其中所述免疫应答包括增加产TNF-α的细胞的水平。
145.根据权利要求113至144中任一项所述的用途，其中所述免疫应答包括增加效应T细胞对瘤变的浸润。
146.根据权利要求113至145中任一项所述的用途，其中所述效应T细胞是CD8+T细胞或CD4+T细胞。
147.根据权利要求113至146中任一项所述的用途，其中所述免疫应答还包括表位扩展。
148.根据权利要求113至147中任一项所述的用途，其中所述免疫应答还包括诱导对自身来源的瘤变抗原的广泛应答。
149.根据权利要求113至148中任一项所述的用途，其中所述免疫应答还包括改善瘤变微环境中抑制性与效应免疫细胞的总体平衡。
150.根据权利要求113至149中任一项所述的用途，其中所述免疫应答还包括改善抑制性与效应免疫细胞的系统平衡。
CN201580056060.8A 2014-10-14 2015-10-14 用于癌症治疗的联合疗法 Pending CN107429289A (zh)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201462063828P 2014-10-14 2014-10-14
US62/063,828 2014-10-14
US201462065973P 2014-10-20 2014-10-20
US62/065,973 2014-10-20
PCT/US2015/055462 WO2016061182A1 (en) 2014-10-14 2015-10-14 Combination therapy for use in cancer therapy

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN107429289A true CN107429289A (zh) 2017-12-01

Family

ID=55747250

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201580056059.5A Pending CN107250366A (zh) 2014-10-14 2015-10-14 重组李斯特菌疫苗菌株及其用于癌症免疫疗法的方法
CN201580056060.8A Pending CN107429289A (zh) 2014-10-14 2015-10-14 用于癌症治疗的联合疗法

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201580056059.5A Pending CN107250366A (zh) 2014-10-14 2015-10-14 重组李斯特菌疫苗菌株及其用于癌症免疫疗法的方法

Country Status (11)

Country Link
US (3) US10010593B2 (zh)
EP (2) EP3207142A4 (zh)
JP (2) JP2017532328A (zh)
KR (2) KR20170068560A (zh)
CN (2) CN107250366A (zh)
AU (2) AU2015333632A1 (zh)
CA (2) CA2964764A1 (zh)
IL (2) IL251630A0 (zh)
MX (2) MX2017004897A (zh)
SG (3) SG11201702611YA (zh)
WO (2) WO2016061182A1 (zh)

Families Citing this family (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8791237B2 (en) 1994-11-08 2014-07-29 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Compositions and methods for treatment of non-hodgkins lymphoma
US9012141B2 (en) 2000-03-27 2015-04-21 Advaxis, Inc. Compositions and methods comprising KLK3 of FOLH1 antigen
US8771702B2 (en) * 2001-03-26 2014-07-08 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Non-hemolytic LLO fusion proteins and methods of utilizing same
EP2683400A4 (en) 2011-03-11 2014-09-17 Advaxis ADJUVANZIA ON LISTERIA BASE
SG10201700392UA (en) 2012-03-12 2017-03-30 Advaxis Inc Suppressor cell function inhibition following listeria vaccine treatment
SG11201606677XA (en) 2014-02-18 2016-09-29 Advaxis Inc Biomarker directed multi-target immunotherapy
SG11201608820WA (en) 2014-04-24 2016-11-29 Advaxis Inc Recombinant listeria vaccine strains and methods of producing the same
MA41644A (fr) 2015-03-03 2018-01-09 Advaxis Inc Compositions à base de listeria comprenant un système d'expression de minigènes codant pour des peptides, et leurs procédés d'utilisation
JP7197481B2 (ja) 2016-11-30 2022-12-27 アドバクシス， インコーポレイテッド 反復性がん突然変異を標的とする免疫原性組成物およびその使用の方法
AR110730A1 (es) * 2017-01-05 2019-04-24 Advaxis Inc Vacunas de cepas recombinantes de listeria y método para usarlas en inmunoterapia de cáncer
WO2018170313A1 (en) * 2017-03-16 2018-09-20 Advaxis, Inc. Methods and compositions for increasing efficacy of vaccines
CN106978381A (zh) * 2017-03-23 2017-07-25 上海理工大学 prfA基因缺失单核细胞增生李斯特氏菌及制备方法
WO2019006401A2 (en) * 2017-06-30 2019-01-03 Advaxis, Inc. LISTERIA-BASED IMMUNOGENIC COMPOSITIONS COMPRISING HETERICCLIENT WILMS TUMOR PROTEIN ANTIGENS AND METHODS OF USE THEREOF
WO2019060115A1 (en) 2017-09-19 2019-03-28 Advaxis, Inc. COMPOSITIONS AND METHODS FOR LYOPHILIZATION OF BACTERIA OR LISTERIA STRAINS
CN111349645B (zh) * 2018-12-24 2022-05-17 上海若泰医药科技有限公司 一种提高非整合减毒李斯特菌疫苗安全性的方法
US10973908B1 (en) 2020-05-14 2021-04-13 David Gordon Bermudes Expression of SARS-CoV-2 spike protein receptor binding domain in attenuated salmonella as a vaccine

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20060210540A1 (en) * 2001-03-26 2006-09-21 Yvonne Paterson Compositions and methods for enhancing the immunogenicity of antigens
WO2008109155A2 (en) * 2007-03-08 2008-09-12 The Trustees Of The University Pennsylvania Compositions and methods for treatment of cervical cancer

Family Cites Families (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7635479B2 (en) 2000-03-29 2009-12-22 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Composition and methods for enhancing immunogenecity of antigens
US6099848A (en) 1997-11-18 2000-08-08 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Immunogenic compositions comprising DAL/DAT double-mutant, auxotrophic, attenuated strains of Listeria and their methods of use
US6855320B2 (en) 2000-03-29 2005-02-15 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Fusion of non-hemolytic, truncated form of listeriolysin O to antigens to enhance immunogenicity
US8771702B2 (en) * 2001-03-26 2014-07-08 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Non-hemolytic LLO fusion proteins and methods of utilizing same
US7794728B2 (en) 2002-05-29 2010-09-14 The Regents Of The University Of California Attenuated Listeria spp. and methods for using the same
JP4545151B2 (ja) 2003-02-06 2010-09-15 シーラス コーポレイション 非食細胞中への侵入について減弱化されているリステリア、そのリステリアを含むワクチン、およびそれらの使用法
KR101173871B1 (ko) 2003-02-06 2012-08-16 앤저 테라퓨틱스 인코퍼레이티드 변형된 독립생존 미생물, 백신 조성물 및 그것의 사용방법
AU2004281834A1 (en) * 2003-10-15 2005-04-28 Cerus Corporation Listeria-based EphA2 vaccines
EP2942391B1 (en) * 2004-08-13 2018-05-23 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Methods for constructing antibiotic resistance free vaccines
WO2007059030A2 (en) * 2005-11-10 2007-05-24 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Llo-encoding dna/nucleic acid vaccines and methods comprising same
BRPI0810305A2 (pt) * 2007-05-15 2018-07-10 Transgene Sa "vetor, molécula de ácido nucléico substancialmente isolada, célula hospedeira, composição farmacêutica, uso de uma molécula de ácido nucléico, uso de um vetor, uso de uma célula hospedeira e uso de uma composição"
US8114484B2 (en) 2007-07-19 2012-02-14 Applied Materials, Inc. Plasma enhanced chemical vapor deposition technology for large-size processing
EP2498808A4 (en) * 2009-11-11 2014-01-08 Advaxis COMPOSITIONS AND METHOD FOR PREVENTING FLUID MUTATIONS IN THE TREATMENT OF TUMORS WITH HER2 / NEW OVEREXPRESSION
US20110223187A1 (en) 2010-02-15 2011-09-15 Vafa Shahabi Live listeria-based vaccines for central nervous system therapy
PL2640842T3 (pl) * 2010-11-17 2018-11-30 Aduro Biotech, Inc. Sposoby i kompozycje do indukowania odpowiedzi immunologicznej na EGFRVIII
SG10201700392UA (en) * 2012-03-12 2017-03-30 Advaxis Inc Suppressor cell function inhibition following listeria vaccine treatment
KR101621470B1 (ko) 2013-07-31 2016-05-16 건국대학교 산학협력단 MoS2 박막 및 이의 제조방법
EP3113794A4 (en) * 2014-03-05 2017-09-06 Advaxis, Inc. Methods and compositions for increasing a t-effector cell to regulatory t cell ratio
SG11201608820WA (en) * 2014-04-24 2016-11-29 Advaxis Inc Recombinant listeria vaccine strains and methods of producing the same

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20060210540A1 (en) * 2001-03-26 2006-09-21 Yvonne Paterson Compositions and methods for enhancing the immunogenicity of antigens
WO2008109155A2 (en) * 2007-03-08 2008-09-12 The Trustees Of The University Pennsylvania Compositions and methods for treatment of cervical cancer

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ANU WALLECHA,ET AL: "Lm-LLO-Based Immunotherapies and HPV-Associated Disease", 《JOURNAL OF ONCOLOGY》 *
GEORGE R. GUNN，ET AL: "Two Listeria monocytogenes Vaccine Vectors That Express Different Molecular Forms of Human Papilloma Virus-16 (HPV-16) E7 Induce Qualitatively Different T Cell Immunity That Correlates with Their Ability to Induce Regression of Established Tumors", 《J IMMUNOL》 *
HOWARD SAFRAN: ""A Phase I/II Evaluation of ADXS11-001，Mitomycin, 5-fluorouracil (5-FU)and IMRT for Anal Cancer (276)"", 《CLINICALTRIALS.GOV》 *
PAULO CESAR MACIAG，ET AL: "The first clinical use of a live-attenuated Listeria monocytogenes vaccine:A Phase I safety study of Lm-LLO-E7 in patients with advanced carcinoma of the cervix", 《VACCINE》 *

Also Published As

Publication number Publication date
AU2015333632A1 (en) 2017-06-01
CA2964574A1 (en) 2016-04-21
US20190030145A1 (en) 2019-01-31
JP2017532328A (ja) 2017-11-02
IL251624A0 (en) 2017-06-29
EP3207162A1 (en) 2017-08-23
EP3207162A4 (en) 2018-07-04
KR20170068560A (ko) 2017-06-19
US10010593B2 (en) 2018-07-03
KR20170066641A (ko) 2017-06-14
EP3207142A1 (en) 2017-08-23
AU2015332524A1 (en) 2017-06-01
CA2964764A1 (en) 2016-04-21
CN107250366A (zh) 2017-10-13
IL251630A0 (en) 2017-06-29
MX2017004729A (es) 2018-01-09
SG10201903349YA (en) 2019-05-30
US20160228530A1 (en) 2016-08-11
MX2017004897A (es) 2018-02-09
WO2016061182A1 (en) 2016-04-21
EP3207142A4 (en) 2018-07-04
SG11201702611YA (en) 2017-04-27
SG11201702857PA (en) 2017-05-30
WO2016061277A1 (en) 2016-04-21
JP2017536095A (ja) 2017-12-07
US20160367650A1 (en) 2016-12-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN107429289A (zh) 用于癌症治疗的联合疗法
JP7300041B2 (ja) 組み換え型リステリアワクチン株およびこれを生産する方法
CN108368513A (zh) 重组李斯特菌疫苗菌株及其用于癌症免疫疗法的方法
CN108348591A (zh) 重组李斯特菌疫苗菌株及其用于癌症免疫疗法的方法
CN107406822A (zh) 包含肽微基因表达系统的基于李斯特菌的组合物及其使用方法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication
WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication

Application publication date: 20171201