CN107207521A - 作为沉默调节蛋白调节剂的取代的桥连脲类似物 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及式(I)的新的取代的桥连脲类似物化合物或其药学上可接受的盐、相应的药物组合物、制备和使用所述化合物的方法，所述化合物单独或与其他治疗剂组合作为沉默调节蛋白调节剂用于提高细胞寿命，以及治疗和/或预防宽范围的多种疾病和障碍，所述疾病和障碍包括但不限于，例如，与衰老或应激反应有关的疾病或障碍、糖尿病、肥胖症、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固障碍、炎症、癌症和/或潮红，以及受益于线粒体的活性增加的疾病或障碍。

Description

作为沉默调节蛋白调节剂的取代的桥连脲类似物
技术领域
大体上，本发明涉及式(I)至(V)的取代的桥连脲类似物化合物、其相应的类似物或衍生物，或其药学上可接受的盐，相应的药物组合物，制备所述化合物的方法，所述化合物单独或与其他治疗剂组合作为沉默调节蛋白(Sirtuin)调节剂用于以下的方法和用途：提高细胞寿命，以及治疗和/或预防宽范围的多种疾病和障碍，所述疾病和障碍包括但不限于，例如，与衰老或应激反应有关的疾病或障碍、糖尿病、肥胖症、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固障碍、炎症、癌症和/或潮红，以及受益于线粒体的活性增加的疾病或障碍。
背景技术
沉默信息调节剂(Silent Information Regulator，SIR)基因家族代表存在于范围从古细菌(archaebacteria)至真核生物的生物体的基因组中的一组高度保守的基因。编码的SIR蛋白涉及从基因沉默的调节至DNA修复的各种不同过程。此家族中完善表征的基因为酿酒酵母SIR2(S.cerevisiae SIR2)，其牵涉使含有规定酵母交配型、端粒位置效应及细胞衰老的信息的HM基因座沉默。酵母Sir2蛋白属于组蛋白脱乙酰基酶的家族。由SIR基因家族成员编码的蛋白显示：在250个氨基酸的核心结构域中有高度序列保守。于鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)中的Sir2同系物CobB起到NAD(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)-依赖性ADP-核糖基转移酶的作用。
Sir2蛋白为使用NAD作为协同底物的第III类脱乙酰基酶。不同于其它脱乙酰基酶，这些中的许多涉及基因沉默，Sir2对第I类及第II类组蛋白脱乙酰基酶抑制剂(例如曲古抑菌素A(trichostatin A，TSA))不具敏感性。
通过Sir2进行的乙酰基-赖氨酸的脱乙酰基化与NAD水解作用紧密结合，产生烟酰胺和新的乙酰基-ADP核糖化合物。Sir2的NAD-依赖性脱乙酰基酶活性对于可以将其生物学作用与酵母中的细胞代谢作用结合的这一功能而言是必需的。哺乳动物Sir2同系物具有NAD-依赖性组蛋白脱乙酰基酶活性。
生物化学的研究已显示，Sir2可容易地将组蛋白H3与H4的氨基末端尾部脱乙酰基化，导致形成2’/3’-O-乙酰基-ADP-核糖(OAADPR)与烟酰胺。具有SIR2的额外拷贝的菌株显示rDNA沉默增加且寿命增长30％。还已经表明，秀丽隐杆线虫(C.elegans)SIR2同系物(sir-2.1)及果蝇(D.melanogaster)dSir2基因的额外拷贝会延长那些生物体的寿命。这暗示了针对衰老(aging)的SIR2-依赖性调节途径在进化早期出现且已经是相当保守的。现今，认为Sir2基因已经进化为增强生物体的健康与应激抵抗，以增加其逆境存活的机会。
在人中有7种Sir2样基因(SIRT1-SIRT7)，它们共享Sir2的保守催化结构域。SIRT1为具有与Sir2最高程度序列相似性的核蛋白。SIRT1通过脱乙酰化作用调节多种细胞靶点，包括肿瘤抑制基因p53、细胞信号传导因子NF-kB和FOXO转录因子。
SIRT3为SIRT1的同系物，其在原核生物与真核生物中具保守性。SIRT3蛋白通过位于N-末端的独特结构域而靶向至线粒体嵴(cristae)。SIRT3具有NAD+-依赖性蛋白脱乙酰基酶活性，且普遍表达，特别是在代谢活性的组织中。在转移至线粒体后，认为SIRT3被线粒体基质加工肽酶(MPP)断裂成更小的活性形式。
热量限制(caloric restriction)增进哺乳动物的健康并延长寿命这一事实为人所知70年以上。酵母寿命(如后生动物的寿命)也通过类似热量限制(例如低葡萄糖)的介入来增长。发现缺乏SIR2基因的酵母与蝇类在热量限制时并不活得更长，这为SIR2基因介导限制性热量饮食的有益健康效应提供了证据。而且，降低酵母葡萄糖-响应性cAMP(腺苷3',5'-单磷酸)-依赖性(PKA)途径活性的突变延长了野生型细胞的寿命，但在突变型sir2菌株中则不会延长，这证明SIR2可能是热量限制途径的关键下游组分。
除了治疗潜力，SIRT1活性的结构和生物物理研究以及经小分子沉默调节蛋白(sirtuin)调节剂的活化将用于推进对沉默调节蛋白的生物学功能的了解、进一步了解沉默调节蛋白活化的作用机理以及帮助研发用于鉴定新的沉默调节蛋白调节剂的试验。
本发明旨在解决本领域中遇到的这些和其他问题。
发明内容
大体上，本发明涉及式(I)至(V)的取代的桥连脲类似物化合物、其相应的类似物或衍生物，或其药学上可接受的盐，相应的药物组合物，制备所述化合物的方法，以及所述化合物单独或与其他治疗剂组合作为沉默调节蛋白调节剂用于以下的用途：提高细胞寿命，以及治疗和/或预防宽范围的多种疾病和障碍，所述疾病和障碍包括但不限于，例如，与衰老或应激反应有关的疾病或障碍、糖尿病、肥胖症、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固障碍、炎症、癌症和/或潮红，以及受益于线粒体的活性增加的疾病或障碍。
具体地，本发明涉及式(I)至(V)的新化合物、相应的类似物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)和分别包含式(I)至(V)的化合物的相应的药物组合物。
本发明还涉及分别制备式(I)至(V)的化合物和相应的类似物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)的方法。
本发明还涉及使用本申请定义的沉默调节蛋白调节剂化合物在治疗、预防宽范围的多种疾病和障碍、或用于宽范围的多种疾病和障碍的疗法中的方法和用途，所述疾病和障碍包括但不限于，例如，与衰老或应激反应有关的疾病或障碍、糖尿病、肥胖症、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固障碍、炎症、癌症和/或潮红，以及受益于线粒体的活性增加的疾病或障碍，其还可选自或包括但不限于，银屑病、特应性皮炎、痤疮、酒渣鼻、炎性肠病、骨质疏松症、败血症、关节炎、COPD、系统性红斑狼疮和眼科炎症。
发明详述
大体上，本发明涉及式(I)至(V)的取代的桥连脲类似物化合物、其相应的类似物或衍生物，或其药学上可接受的盐，相应的药物组合物，制备所述化合物的方法，以及所述化合物单独或与其他治疗剂组合作为沉默调节蛋白调节剂用于以下的用途：提高细胞寿命，以及治疗和/或预防宽范围的多种疾病和障碍，所述疾病和障碍包括但不限于，例如，与衰老或应激反应有关的疾病或障碍、糖尿病、肥胖症、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固障碍、炎症、癌症和/或潮红，以及受益于线粒体的活性增加的疾病或障碍。
化合物
具体地，本发明涉及式(I)至(V)的新化合物、相应的类似物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)和分别包含式(I)至(V)的化合物的相应的药物组合物。
国际专利申请WO09/061879(国际申请日2014年5月13日)披露了式(I)的调节沉默调节蛋白的取代的桥连脲和相关类似物化合物：
或
其药学上可接受的盐，相应的药物组合物，与其他治疗剂的组合，其制备方法以及用于以下的方法和用途：提高细胞寿命，以及治疗和/或预防宽范围的多种疾病和障碍，所述疾病和障碍包括，例如，与衰老或应激反应有关的疾病或障碍、糖尿病、肥胖症、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固障碍、炎症、癌症和/或潮红，以及受益于线粒体的活性增加的疾病或障碍。
在一个方面，本发明结构式(I)至(V)的新的调节沉默调节蛋白的化合物、各自的相应的类似物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)，如下文详细描述。
在一个方面，本发明涉及式(I)化合物：
其中：
X1或X2独立选自-N或-C；
R1为氢、卤素、-CN、碳环基、杂环基、-N-取代的杂环基、芳基、杂芳基、-C(O)Ra或-C(O)-NRbRc；
R2为卤素、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基，或-C(O)-NRbRc；
R3为氢、卤素、-羟基、直链或支链C1-C6烷基，或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
R4为氢或–C(O)NRbRc；
其中：
当X2是-N时，R2不存在；或
当X2是-C时，R2如上所定义；
如上定义的各R1、R2、R3或R4任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH、-C≡N、-NRdRe、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链C1-C6卤代烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)，或-C(O)ORf；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re或Rf独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6-环烷基、-(CH2)xC1-C6-环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基、-(CHRg)x杂芳基；
其中：
Rg为直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re或Rf任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-C≡N、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、碳环基、-(CH2)x-碳环基、-杂环基、-O-杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)、-(CH2)x-OH，或-C(O)-OH；
m为整数1至3；
n为选自1至3的整数；
x为0或整数1至6；或
其药学上可接受的盐。
在另一方面，本发明涉及如上文和如本申请通篇定义的本发明化合物，即，结构式(I)至(V)的化合物、各自的相应的类似物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)，其中条件是：
当n＝1时，以及
当n＝3时，
在另一方面，本发明涉及本发明化合物，其中R2是C(O)-NRbRc；其中Rb和Rc如上文和如本申请通篇所定义。
在另一方面，本发明涉及式(I)化合物，其中：
m是1；
n是2或3；以及
R4是氢。
在另一方面，本发明涉及式(I)化合物，其中：
m是1；
n是2或3；以及
R4是–C(O)NRbRc，其中各Rb和Rc如上所定义。
在另一方面，本发明涉及式(I)化合物，其中：
m是1；
n是2或3；
R1为氢、卤素、-CN、碳环基、杂环基、-N-取代的杂环基、芳基或杂芳基；以及
R4是–C(O)NRbRc，其中Rb和Rc如上文权利要求1中所定义。
在一个方面，本发明涉及式(II)化合物：
其中：
X1或X2独立选自-N或-C；
R1为氢、卤素、-CN、碳环基、杂环基、-N-取代的杂环基、芳基或杂芳基；
R2为卤素、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基，或-C(O)-NRbRc；
R3为氢、卤素、-羟基、直链或支链C1-C6烷基，或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
R4为氢或–C(O)NRbRc；
其中：
当X2是-N时，R2不存在；或
当X2是-C时，R2如上所定义；
如上定义的各R1、R2、R3或R4任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH、-C≡N、-NRdRe、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链C1-C6卤代烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)，或-C(O)ORf；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re或Rf独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6-环烷基、-(CH2)xC1-C6-环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基、-(CHRg)x杂芳基；
其中：
Rg为直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re或Rf任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-C≡N、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、碳环基、-(CH2)x-碳环基、-杂环基、-O-杂环基芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)、-(CH2)x-OH，或-C(O)-OH；
m为整数1至3；
n为选自1至3的整数；
x为0或整数1至6；或
其药学上可接受的
在另一方面，本发明涉及如上文和本申请通篇定义的本发明化合物(即，结构式(I)至(V)的化合物,各自的相应的类似物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)，其中条件是：
当n＝1时，以及
当n＝3时，
在另一方面，本发明涉及本发明化合物，其中R2是C(O)-NRbRc；其中Rb和Rc如上文和如本申请通篇所定义.
在另一方面，本发明涉及式(I)化合物，其中：
m是1；
n是2或3；以及
R4是氢。
在另一方面，本发明涉及式(I)化合物，其中：
m是1；
n是2或3；以及
R4是–C(O)NRbRc，其中各Rb和Rc如上所定义。
在另一方面，本发明涉及式(III)化合物：
其中：
X1或X2独立选自-N或-C；
其中：
当X2是-N时，R2不存在；或
当X2是-C时，R2如上所定义；
R1为氢、卤素、-CN、碳环基、杂环基、-N-取代的杂环基、芳基或杂芳基；
R2为卤素、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基，或-C(O)-NRbRc；
R3为氢、卤素、-羟基、直链或支链C1-C6烷基，或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
各R5和R6独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)xC1-C6环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基、-(CHRg)x杂芳基；
其中：
如上定义的各R1、R2、R3、R5和R6任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH、-C≡N、-NRdRe、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链C1-C6卤代烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)，或-C(O)ORf；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf或Rg独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6-环烷基、-(CH2)xC1-C6-环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基；
其中：
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf或Rg任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH，-C≡N,NRhRi、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链-C1-C6卤代烷氧基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、-杂环基、-O-杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)、-(CH2)x-OH，或-C(O)ORj；
其中：
各Rh、Ri和Rj独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
m为整数1至3；
n为选自2至3的整数；
x为0或整数1至6；或
其药学上可接受的盐。
在另一方面，本发明涉及本发明化合物，其中n是2或3且m是1。
在另一方面，本发明涉及式(IV)化合物：
其中：
R1为氢、卤素、-CN、碳环基、杂环基、-N-取代的杂环基、芳基、杂芳基、-C(O)Ra或-C(O)-NRbRc；
R2为卤素、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基，或-C(O)-NRbRc；
R3为氢、卤素、-羟基、直链或支链C1-C6烷基，或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
各R5和R6独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)xC1-C6环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基、-(CHRg)x杂芳基；
其中：
如上定义的各R1、R2、R3、R5和R6任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH、-C≡N、-NRdRe、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链C1-C6卤代烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)，或-C(O)ORf；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf或Rg独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6-环烷基、-(CH2)xC1-C6-环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基；
其中：
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf或Rg任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH，-C≡N、-NRhRi、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链-C1-C6卤代烷氧基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、-杂环基、-O-杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)、-(CH2)x-OH，或-C(O)ORj；
其中：
各Rh、Ri和Rj独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
m为整数1至3；
n为选自2至3的整数；
x为0或整数1至6；或
其药学上可接受的盐。
在另一方面，本发明涉及式(V)化合物：
其中：
R1为氢、卤素、-CN、碳环基、杂环基、-N-取代的杂环基、芳基或杂芳基；
R2为卤素、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基，或-C(O)-NRbRc；
R3为氢、卤素、-羟基、直链或支链C1-C6烷基，或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
各R5和R6独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)xC1-C6环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基、-(CHRg)x杂芳基；
其中：
如上定义的各R1、R2、R3、R5和R6任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH、-C≡N、-NRdRe、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链C1-C6卤代烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)，或-C(O)ORf；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf或Rg独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6-环烷基、-(CH2)xC1-C6-环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基；
其中：
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf或Rg任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH，-C≡N、-NRhRi、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链-C1-C6卤代烷氧基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、-杂环基、-O-杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)、-(CH2)x-OH，或-C(O)ORj；
其中：
各Rh、Ri和Rj独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
m为整数1至3；
n为选自2至3的整数；
x为0或整数1至6；或
其药学上可接受的盐。
在另一方面，本发明分别涉及式(I)至(V)的化合物，其中R1选自：
在另一方面，本发明分别涉及式(I)至(V)的化合物，其中R1选自：
在另一方面，本发明分别涉及式(I)至(V)的化合物，其中R4选自：
在另一方面，本发明分别涉及式(I)至(V)的化合物，其中R4选自：
在另一方面，本发明涉及本申请表1中定义的化合物，起始于第684页：
在另一方面，本发明涉及化合物，其包括，但不限于下文列出的表中定义的化合物：
表1
在另一方面，本发明涉及化合物，其为本发明的相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)：
表2-非间位取代吡啶化合物(其中，ISOMER＝异构体)
术语和定义
部分1
本发明的一些化合物可以以特定的几何异构或立体异构形式存在。本发明包括所有的此类化合物，包括顺式-和反式-异构体、(R)-和(S)-对映异构体、非对映异构体、(D)-异构体、(L)-异构体、其外消旋混合物，和它们的其他混合物，如落入本发明范围内的那些。其他的不对称碳原子可存在于取代基(例如烷基)中。所有此类异构体及其混合物均包括于本发明中。
本文中所述的化合物及其盐也可以相应的水合物(例如，半水合物、单水合物、二水合物、三水合物、四水合物)或溶剂合物存在。用于制备溶剂合物和水合物的适宜溶剂通常可由本领域技术人员选择。
所述化合物及其盐可以以无定形或结晶(包括共晶体和多晶型)形式存在。
本发明的调节沉默调节蛋白的化合物有利地调节沉默调节蛋白的水平和/或活性，尤其是沉默调节蛋白的脱乙酰基酶活性。
单独地或除了上述性质外，本发明的一些调节沉默调节蛋白的化合物在有效调节沉默调节蛋白(例如，SIRT1和/或SIRT3蛋白)的脱乙酰化活性的浓度时基本上不具有一个或多个下列活性：抑制PI3-激酶、抑制糖醛还原酶(aldoreductase)、抑制酪氨酸激酶、转活化EGFR酪氨酸激酶、冠状动脉扩张或解痉活性。
“烷基”或“烷烃”是完全饱和的直链的或支链的非芳香烃基。典型地，直链的或支链的烷基具有1至大约20个碳原子，优选具有1至大约10个碳原子，除非另有说明。直链的和支链的烷基的实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、叔丁基、戊基、己基、庚基和辛基。C1-C4直链的或支链的烷基也称为"低级烷基"。
在任一前述实施方案中，C1-C4烷氧基-取代的基团可包括一个或多个烷氧基取代基，例如一个、两个或三个甲氧基，或甲氧基和乙氧基，例如。示例性的C1-C4烷氧基取代基包括甲氧基、乙氧基、异丙氧基和叔丁氧基。
在任一前述实施方案中，羟基-取代的基团可包括一个或多个羟基取代基，例如两个或三个羟基基团。
“卤素”是指F、Cl、Br或I。
“卤素-取代”或“卤代”表示一个或多个氢被F、Cl、Br或I替换。
在一个方面，术语卤代烷基被定义为一个或多个氢原子被卤素原子替换的烷基残基。在任一前述实施方案中，“卤素-取代的”基团包括一个卤素取代基至最多至全卤代取代基。示例性的卤素-取代的C1-C4烷基包括CFH2、CClH2、CBrH2、CF2H、CCl2H、CBr2H、CF3、CCl3、CBr3、CH2CH2F、CH2CH2Cl、CH2CH2Br、CH2CHF2、CHFCH3、CHClCH3、CHBrCH3、CF2CHF2、CF2CHCl2、CF2CHBr2、CH(CF3)2和C(CF3)3。全卤代的C1-C4烷基例如包括CF3、CCl3、CBr3、CF2CF3、CCl2CF3和CBr2CF3。
术语“烯基”(“烯烃”)和“炔基”(“炔烃”)指的是在长度上和可能取代上与上述烷基类似的不饱和的脂肪族基团，但各自包含至少一个双键或叁键。
在任一前述实施方案中，“碳环”可以指单环碳环实施方案和/或多环碳环实施方案，例如稠合的、桥连的或双环碳环实施方案。本发明的“碳环”基团可进一步指芳香碳环实施方案和/或非芳香碳环实施方案，或在多环实施方案的情况下，具有一个或多个芳香环和/或一个或多个非芳香环两者的碳环。多环碳环实施方案可为双环、稠合环或桥连双环。非限制性的示例性的碳环包括苯基、环己烷、环戊烷或环己烯、金刚烷胺、环戊烷、环己烷、双环[2.2.1]庚烷、1,5-环辛二烯、1,2,3,4-四氢萘、双环[4.2.0]辛-3-烯、萘、金刚烷、十氢化萘、萘、1,2,3,4-四氢萘、降莰烷、十氢化萘、螺戊烷、美金刚胺(memantine)、吡派立登(biperiden)、金刚乙胺(rimantadine)、樟脑、胆甾醇、4-苯基环己醇、双环[4.2.0]辛烷、美金刚胺和4,5,6,7-四氢-1H-茚和双环[4.1.0]庚-3-烯。
在任一前述实施方案中，“杂环”基团可以指单环杂环实施方案和/或多环杂环实施方案，例如稠合的、桥连的或双环杂环实施方案。本发明的“杂环”基团可以进一步指芳香杂环实施方案和/或非芳香杂环实施方案，或在多环实施方案的情况下，具有一个或多个芳香环和/或一个或多个非芳香环两者的杂环。多环杂环实施方案可为双环、稠合环或桥连环。非限制性的示例性杂环包括吡啶、吡咯烷、哌啶、哌嗪、吡咯烷、吗啉、嘧啶、苯并呋喃、吲哚、喹啉、内酯、内酰胺、苯并二氮杂吲哚、喹啉、嘌呤、腺嘌呤、鸟嘌呤、4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑、环六亚甲基四胺(hexamine)和乌洛托品(methenamine)。
“烯基”是指具有指定数量的成员碳原子并且在链内具有一个或多个碳-碳双键的不饱和烃链。例如，C2-C6烯基是指具有2至6个成员碳原子的烯基。在某些实施方案中，烯基在链内具有一个碳-碳双键。在其它实施方案中，烯基在链内具有多于一个碳-碳双键。烯基可以任选被一个或多个如本文定义的取代基取代。烯基可以是直链或支链的。代表性的支链烯基具有一个，两个或三个分支。烯基包括乙烯基，丙烯基，丁烯基，戊烯基和己烯基。
“烷氧基”是指通过氧桥连接的烷基部分(即其中C1-C6在本文中定义的-O-C1-C6烷基)。这些基团的实例包括甲氧基，乙氧基，丙氧基，丁氧基，戊氧基和己氧基。
“炔基”是指具有指定数目的成员碳原子并且在链内具有一个或多个碳-碳叁键的不饱和烃链。例如，C2-C6炔基是指具有2至6个成员原子的炔基。在某些实施方案中，炔基在链内具有一个碳-碳叁键。在其它实施方案中，炔基在链内具有多于一个碳-碳叁键。为了清楚起见，在链内具有一个或多个碳-碳叁键的不饱和烃链且在链内具有一个或多个碳-碳双键的不饱和烃链被称为炔基。炔基可以任选被一个或多个如本文定义的取代基取代。代表性的支链炔基具有一个，两个或三个分支。炔基包括乙炔基，丙炔基，丁炔基，戊炔基和己炔基。
术语“芳香碳环”指的是包含至少一个芳香环的芳香性烃环体系。该环可稠合至或连接至其他的芳香碳环上或非芳香碳环上。芳香碳环基团的实例包括碳环芳香基团例如苯基、萘基和蒽基。
“氮杂双环”指的是在环骨架中包含氮原子的双环分子。双环的两个环可以在两个互相键接的原子处稠合，例如吲哚，跨越一系列的原子稠合，例如氮杂双环[2.2.1]庚烷，或在单个原子处连接，例如，螺环。
“双环”或“双环的”指的是二环体系，其中这两个环之间共享一个、两个或三个或更多个原子。双环包括稠合双环，其中两个相邻的原子被这两个环各自所共享，例如，十氢化萘、吲哚。双环也包括螺双环，其中两个环共享一个原子，例如，螺[2.2]戊烷、1-氧杂-6-氮杂螺[3.4]辛烷。双环还包括桥连的双环，其中至少三个原子被两个环所共享，例如，降莰烷。
“桥连双环”化合物为双环体系，其中至少三个原子被该体系的两个环均共享，即它们包括连接两个桥头原子的一个或多个原子中的至少一个桥。桥连的氮杂双环指的是在至少一个环中包含氮原子的桥连的双环分子。
术语“Boc”是指叔丁基氧基羰基(常用的胺保护基)。
本文使用的术语“碳环”和“碳环的”指的是饱和的或不饱和的环，其中该环的各个原子是碳。术语碳环包括芳香碳环和非芳香碳环两者。非芳香碳环包括环烷烃环(其中所有的碳原子是饱和的)和环烯烃环(其包含至少一个双键)两者。“碳环”包括5-7元单环和8-12元双环。双环碳环的各个环可选自非芳香环和芳香环。碳环包括双环分子，其中一个、两个或三个或多个原子被这两个环所共享。术语“稠合碳环”指的是其中各个环与另一个环共享两个相邻的原子的双环碳环。稠合碳环的各个环可选自非芳香环和芳香环。在示例性的实施方案中，芳香环(例如苯基)可以稠合至非芳香环或芳香环，例如，环己烷、环戊烷或环己烯。非芳香和芳香双环的任一组合(只要价键允许)包括在碳环的定义中。示例性的“碳环”包括环戊烷、环己烷、双环[2.2.1]庚烷、1,5-环辛二烯、1,2,3,4-四氢萘、双环[4.2.0]辛-3-烯、萘和金刚烷。示例性的稠合碳环包括十氢化萘、萘、1,2,3,4-四氢萘、双环[4.2.0]辛烷、4,5,6,7-四氢-1H-茚和双环[4.1.0]庚-3-烯。“碳环”可在任一个或多个能够具有氢原子的位置被取代。
“环烷基”是具有指定数目的成员碳原子的环状烃环，其为完全饱和(非芳香)的。通常，环烷基基团具有3至约10个碳原子，更典型地3至8个碳原子，除非另有定义。环烷基是单环体系。例如，C3-C6环烷基是指具有3至6个成员原子的环烷基。环烷基可以任选地被一个或多个如本文定义的取代基取代。环烷基包括环丙基，环丁基，环戊基和环己基。
“环烯基”是环中含有一个或多个双键的环状烃环。例如，C3-C6环烯基是指具有3至6个成员碳原子的环烯基。在一些实施方案中，环烯基在环内具有一个碳-碳双键。在其它实施方案中，环烯基在环内具有多于一个的碳-碳双键。环烯基环不是芳香的。环烯基是单环体系。环烯基可以任选被一个或多个如本文定义的取代基取代。环烯基包括环丙烯基，环丁烯基，环戊烯基，环己烯基和环己二烯基。
“芳基”是指芳香烃环体系。芳基是单环体系或双环体系。单环芳环是指苯基。双环芳环指萘基和其中苯基与具有5、6或7个成员碳原子的环烷基或环烯基环稠合的环。芳基可以任选被一个或多个如本文定义的取代基取代。
术语“杂芳基”或“芳香杂环”包括取代的或未取代的芳香单环结构，优选地5至7-元环，更优选地5至6元环，其中环结构包括至少一个杂原子，优选地1-4个杂原子，更优选地1或2个杂原子。术语“杂芳基”还包括具有一个或两个环的环体系，其中至少一个环为杂芳香环(例如)且另一环可为环烷基、环烯基、环炔基、芳香碳环、杂芳基和/或杂环基。杂芳基包括，例如，吡咯、呋喃、噻吩、咪唑、噁唑、噻唑、吡唑、吡啶、吡嗪、哒嗪和嘧啶。
本文中使用的术语“杂环”和“杂环的”指的是非芳香或芳香环，其包含一个或多个选自例如N、O、B和S原子，优选N、O或S的杂原子。术语“杂环”包括“芳香杂环”和“非芳香杂环”两者。杂环包括4-7元单环和8-12元双环。杂环包括双环分子，其中一个、两个或三个或多个原子为两个环所共享。双环杂环的各个环可以选自非芳香环和芳香环。术语“稠合杂环”指的是双环杂环，其中每个环与其他环共享两个相邻的原子。稠合杂环的各个环可选自非芳香环和芳香环。在示例性的实施方案中，芳香环(例如吡啶基)可以稠合至非芳香环或芳香环，例如环己烷、环戊烷、吡咯烷、2,3-二氢呋喃或环己烯。“杂环”基团包括，例如，哌啶、哌嗪、吡咯烷、吗啉、嘧啶、苯并呋喃、吲哚、喹啉、内酯和内酰胺。示例性的“稠合杂环”包括苯并二氮杂吲哚、喹啉、嘌呤和4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑。“杂环”可在任一个或多个能够具有氢原子的位置被取代。
“单环”包括5-7元芳香碳环或杂芳基、3-7元环烷基或环烯基，和5-7元非芳香杂环基。示例性的单环基团包括取代的或未取代的杂环或碳环，例如，噻唑基、噁唑基、噁嗪基、噻嗪基、二硫杂环己烷基、二噁烷基、异噁唑基、异噻唑基、三唑基、呋喃基、四氢呋喃基、二氢呋喃基、吡喃基、四唑基、吡唑基、吡嗪基、哒嗪基、咪唑基、吡啶基、吡咯基、二氢吡咯基、吡咯烷基、哌啶基、哌嗪基、嘧啶基、吗啉基、四氢噻吩基、噻吩基、环己基、环戊基、环丙基、环丁基、环庚基、氮杂环丁烷基、氧杂环丁烷基、硫杂环丙烷基、氧杂环丙烷基、氮杂环丙烷基和硫吗啉基。
“成员原子”是指形成链或环的一个或多个原子。当链中和环内存在多于一个成员原子时，每个成员原子与链或环中相邻的成员原子共价结合。构成链或环上的取代基的原子不是链或环中的成员原子。
“任选取代的”表示基团，例如烷基，烯基，炔基，芳基，环烷基，环烯基，杂环烷基或杂芳基可以是未取代的，或者该基团可以取代有一个或多个如本文所定义的取代基。
如本文所用，“取代的”是指用除氢以外的原子或分子取代结构中的氢原子。提及基团时的“取代”表示与基团中的成员原子连接的一个或多个氢原子被选自所定义的取代基组的取代基替代。可取代的原子如“可取代的氮”是以至少一种共振形式带有氢原子的原子。氢原子可以被另外的原子或基团取代，例如CH3或OH基团。例如，如果氮与氢原子结合，则哌啶分子中的氮是可取代的。例如，如果哌啶的氮键合于除氢以外的原子，则氮是不可取代的。不能以任何共振形式带有氢原子的原子是不可取代的。应当理解，术语“取代的”包括这样的隐含条件：这种取代符合受取代的原子和取代基的允许的化合价，并且取代产生稳定的化合物(即不会自发地例如通过水解，重排，环化或消除进行转化的化合物，并且足够坚实以耐受从反应混合物中分离)。当指出基团可以含有一个或多个取代基时，基团中的一个或多个(视需要)成员原子可以被取代。此外，只要这种取代符合原子的允许的化合价，则该基团中的单个成员原子可以被多于一个的取代基取代。对于每个取代或任选取代的基团，合适的取代基在本文中定义。
本发明涉及取代基与变量的组合，条件是形成稳定化合物。本文所使用的术语“稳定的”是指化合物具有允许其制备且可使所述化合物的完整性维持足够时间以用于本文中所详述目的的足够稳定性。
氘代的化合物
本文中所公开的化合物也包括经部分及完全氘代的变体。在一些实施方案中，氘代的变体可用于动力学研究。本领域普通技术人员可选择所述氘原子存在的位点。
本发明还包括式(I)化合物或其药学上可接受的盐的各种氘代形式。与碳原子连接的每个可用的氢原子可以独立地被氘原子代替。本领域普通技术人员将知晓如何合成本发明式(I)至(II)化合物的氘化形式。例如，氘代的材料例如烷基可以通过常规技术制备(参见例如：得自Aldrich Chemical Co.,Milwaukee,WI,目录号489,689-2的甲基-d3-胺)。
同位素
本发明还包括同位素标记的与式(I)和(II)中所述相同的化合物，但是以下事实不同：一个或多个原子被原子质量或质量数不同于自然界中最常见的原子质量或质量数的原子替代。可并入本发明化合物的同位素的实例包括氢，碳，氮，氧，氟，碘和氯的同位素，例如3H、11C、14C、18F、123I或125I。
含有上述同位素和/或其他原子的其他同位素的本发明化合物和所述化合物的药学上可接受的盐在本发明的范围内。本发明的同位素标记的化合物，例如已经掺入放射性同位素如3H或14C的那些化合物可用于药物和/或底物组织分布测定。由于易于制备和可检测性，氚化的即3H和碳-14即14C同位素是特别优选的。11C和18F同位素在PET(正电子发射断层摄影术)中特别有用。
纯度
因为本发明的化合物旨在用于药物组合物中，所以容易理解，它们各自优选以基本上纯的形式提供，例如至少60％纯，更合适地至少75％纯，优选至少85％，特别是至少98％纯(％是以重量计)。化合物的不纯制剂可用于制备药物组合物中使用的更纯的形式。
盐
在某些实施方案中，式I的化合物或其药学上可接受的盐可含有酸性官能团。在某些其他实施方案中，式I的化合物可含有碱性官能团。由此，本领域技术人员将理解，可制备式I化合物的盐。实际上，在本发明的某些实施方案中，式I化合物的盐相对于各自的游离碱或游离酸可能是优选的，因为，例如这样的盐可赋予所述分子更大的稳定性或溶解性，由此有利于配制为剂型。
由于其在医药中的潜在用途，式(I)化合物的盐合适的为药学上可接受的盐。合适的药学上可接受的盐包括Berge、Bighley和Monkhouse，J.Pharm.Sci.(1977)66，第1-19页中描述的那些。
本发明也包括本文所述的化合物的盐，特别是药学上可接受的盐。具有足够酸性、足够碱性或酸性和碱性两者的官能团的本发明化合物，可以和许多的无机碱、及无机与有机酸中的任一种反应形成盐。或者，固有带电荷的化合物(例如具有季氮的化合物)可与适当抗衡离子(例如，卤离子如溴离子、氯离子或氟离子，特别是溴离子)形成盐。
一般用于形成酸加成盐的酸为无机酸，例如氢氯酸、氢溴酸、氢碘酸、硫酸、磷酸等，及有机酸类，例如对-甲苯磺酸、甲磺酸、草酸、对-溴苯基-磺酸、碳酸、琥珀酸、柠檬酸、苯甲酸、醋酸等。此类盐的实例包括硫酸盐、焦硫酸盐、酸式硫酸盐、亚硫酸盐、酸式亚硫酸盐、磷酸盐、磷酸单氢盐、磷酸二氢盐、偏磷酸盐、焦磷酸盐、氯化物、溴化物、碘化物、醋酸盐、丙酸盐、癸酸盐、辛酸盐、丙烯酸盐、甲酸盐、异丁酸盐、己酸盐、庚酸盐、丙炔酸盐、草酸盐、丙二酸盐、琥珀酸盐、辛二酸盐、癸二酸盐、富马酸盐、马来酸盐、丁炔-1,4-二酸盐、己炔-1,6-二酸盐、苯甲酸盐、氯苯甲酸盐、甲基苯甲酸盐、二硝基苯甲酸盐、羟基苯甲酸盐、甲氧基苯甲酸盐、酞酸盐、磺酸盐、二甲苯磺酸盐、苯基乙酸盐、苯基丙酸盐、苯基丁酸盐、柠檬酸盐、乳酸盐、γ-羟基丁酸盐、乙醇酸盐、酒石酸盐、甲磺酸盐、丙磺酸盐、萘-1-磺酸盐、萘-2-磺酸盐、扁桃酸盐等。
碱加成盐包括衍生自无机碱，例如铵或碱金属或碱土金属氢氧化物、碳酸盐、碳酸氢盐等的那些盐。因此此类可用于制备本发明盐的碱包括氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化铵、碳酸钾等。
“对映体过量”或“ee”是一种对映异构体相对于另一种过量，以百分比表示。因此，当两种对映异构体以相等的量存在于外消旋混合物中时，所述对映体过量为零(0％ee)。但是，如果一种对映异构体富集以致于构成该产物的95％时，那么该对映体过量为90％ee(富集的对映异构体的量，95％，减去另一对映异构体的量，5％)。
“对映体富集”是指其对映异构体过量大于零的产物。例如，对映异构体富集是指其对映体过量大于50％ee，大于75％ee或大于90％ee的产物。
“对映异构纯”是指其对映体过量为99％ee或更大的产物。
“药学上可接受的”是指在合理的医学判断范围内，适用于与人和动物的组织接触而没有过度的毒性、刺激性或其他问题或并发症，且具有合理的利益/风险比的那些化合物、物质、组合物和剂型。
式(I)化合物或其药学上可接受的盐可含有一个或多个不对称中心(也称为手性中心)，因此可以单独的对映体、非对映体或其它立体异构体的形式或以其混合物的形式存在。
手性中心诸如手性碳原子也可存在于取代基诸如烷基中。当存在于式I或本文所说明的任何化学结构中的手性中心的立体化学未指明时，该结构意在包含所有单独的立体异构体及其所有的混合物。
因此，含有一个或多个手性中心的式(I)化合物或其药学上可接受的盐可以用作外消旋混合物、非对映体混合物、对映体富集的混合物、非对映体富集的混合物或用作对映体和非对映体纯的单独的立体异构体。
含有一个或多个不对称中心的(I)的化合物或其药学上可接受的盐的单独立体异构体可以通过本领域技术人员已知的方法拆分。例如，可如下进行所述拆分：(1)通过形成非对映异构体盐、复合物或其它衍生物；(2)通过与立体异构体特异性试剂的选择性反应，例如通过酶促氧化或还原；或(3)通过在手性环境中的气-液色谱或液相色谱，所述手性环境例如在手性载体(例如连接有手性配体的硅胶)或在手性溶剂存在下。本领域技术人员将会理解，当将所需立体异构体转化成另一非对映异构体盐时，需要其它步骤来释放所需形式。或者，特定的立体异构体可通过使用光学活性试剂、基质、催化剂或溶剂的不对称合成法来合成，或通过不对称转化将一种对映异构体转化成另一种对映异构体。
当所公开的化合物或其盐被命名或用结构描述时，应当理解，化合物或其盐包括其溶剂合物(特别是其水合物)可以以结晶形式、非结晶形式或其混合物存在。化合物或盐或其溶剂合物(特别是水合物)也可以表现出多晶型现象(即以不同结晶形式存在的能力)。这些不同的结晶形式通常被称为“多晶型物”。
鉴于此，本发明的盐形式(即，其包括其不同的多晶型物、无水形式、溶剂化物或水合物)可呈现特征性多晶型现象。如本领域常规理解的那样，多晶型现象被定义为化合物以多于一种不同的结晶或“多晶型”物种结晶的能力。多晶型物被定义为化合物的固体结晶相，其具有固态的所述化合物分子的至少两种不同排列或多晶型形式。
任何给定化合物(包括本发明的化合物)的多晶形式由相同的化学式或组成定义，并且就作为结晶结构的化学结构而言是两种不同的化合物。所述化合物可能在各自的晶格的堆积、几何排列方面不同。
应当理解，当由结构命名或描述时，所公开的化合物或溶剂化物(特别是其水合物)也包括其所有多晶型物。多晶型物具有相同的化学组成，但在结晶固态的堆积、几何排列和其它描述性特性方面不同。
鉴于上述，化学和/或物理性质或特性随每个不同的多晶形式而变化，其可包括溶解度，熔点，密度，硬度，晶体形状，光学和电学性质，蒸汽压力，稳定性等的变化。
当在结晶过程中将溶剂分子掺入到化合物分子的晶格结构中时，也可以形成本发明的结晶盐形式的溶剂合物和/或水合物。例如，本发明的溶剂化物形式可以引入如下文所述的非水溶剂如甲醇等。水合物形式是将水作为溶剂掺入晶格中的溶剂合物形式。
关于固态多晶型现象的无水是指在晶格中不含重复的结晶溶剂的晶体结构。然而，结晶物质可以是多孔的并且可以表现出水的可逆表面吸附。
术语和定义
部分2
1.定义
用于本文的下列术语及短语应具有于下文所叙述的含义。除非另行定义，所有于本文中使用的技术与科学术语具有与本领域普通技术人员通常理解的相同含义。
本文中术语“药剂(agent)”用于表示化合物、化合物的混合物、生物大分子(例如核酸、抗体、蛋白或其部分例如肽)、或从生物材料例如细菌、植物、真菌或动物(特别是哺乳动物)细胞或组织制得的提取物。
术语“生物可利用的”当涉及化合物时为本领域所公知的，且所考虑到的涉及化合物形式，其中所给药化合物的量的全部或一部分能够被所给药的受试者或患者吸收、引入或以其它方式在生理学上被利用。
“沉默调节蛋白的生物学活性的部分”是指具有生物活性(例如脱乙酰基化能力)(“催化活性”)的沉默调节蛋白的一部分。沉默调节蛋白的催化活性部分可包含沉默调节蛋白的核心结构域。具有GenBank登录编号NP_036370的SIRT1的催化活性部分，包括NAD+结合结构域与底物结合结构域，例如，可包括但不限于GenBank登录编号NP_036370的氨基酸240-664或240-505，其由GenBank登录编号NM_012238的多核苷酸所编码。因此，此区域有时被称作核心结构域。SIRT1的其它催化活性部分(也有时也被称作核心结构域)包括GenBank登录编号NP_036370的大致氨基酸261至447，其由GenBank登录编号NM_012238的核苷酸834至1394所编码；GenBank登录编号NP_036370的大致氨基酸242至493，其由GenBank登录编号NM_012238的核苷酸777至1532所编码；或GenBank登录编号NP_036370的大致氨基酸254至495，其由GenBank登录编号NM_012238的核苷酸813至1538所编码。SIRT1的另一个“生物学活性”部分为GenBank登录编号NP_036370的氨基酸62-293或183-225，其包括对于化合物结合位点重要的核心结构域的N-末端结构域。
术语“陪伴动物”是指猫与狗。用于本文的术语“狗”是指犬科家族的任一成员，其中有许多不同品种。术语“猫”是指猫科动物，包括驯养猫及猫科猫属的其它成员。
“糖尿病”是指高血糖或酮酸中毒，以及因长期高血糖状态或葡萄糖耐受性减低所引起的慢性、一般性代谢异常。“糖尿病”包含该疾病的I与II型(非胰岛素依赖性糖尿病或NIDDM)两种形式。糖尿病的危险因素包括下列因素：男子腰围超过40英寸或女子腰围超过35英寸，血压为130/85mmHg或以上，甘油三酸酯高于150mg/dl，空腹血糖大于100mg/dl，或男子高密度脂蛋白少于40mg/dl或女子高密度脂蛋白少于50mg/dl。
术语“ED50”是本领域公知的有效剂量的度量。在一些实施方式中，ED50是指药物产生其最大响应或功效的50％时的剂量，或者在50％的测试受试者或制品(例如分离的组织或细胞)中产生预定响应的剂量。术语“LD50”是本领域公知的致死剂量的度量。在一些实施方式中，LD50是指药物使50％的测试受试者致死的剂量。术语“治疗指数”为本领域所公知的术语，是指药物的治疗指数，定义为LD50/ED50。
术语“高胰岛素血症”是指个体血液中胰岛素水平高于正常值的状态。
术语“胰岛素抵抗”是指这样的一种状态，其中相对于在不具有胰岛素抵抗的受试者中的生物响应而言，正常量胰岛素产生低于正常(subnormal)生物响应的状态。
本文所讨论的“胰岛素抵抗病症”是指由胰岛素抵抗所引起或促成的任何疾病或病症。实例包括：糖尿病、肥胖症、代谢综合征、胰岛素抵抗综合征、综合征X、胰岛素抵抗、高血压、血压过高、高血胆固醇、血脂异常、高脂血症、动脉粥样硬化疾病，包括中风、冠状动脉疾病或心肌梗塞、高血糖症、高胰岛素血症和/或高胰岛素原血症、葡萄糖耐受性不良、延迟胰岛素释放、糖尿病并发症，包括冠心病、心绞痛、充血性心脏衰竭、中风、痴呆的认知功能、视网膜病、周围神经病、肾病、肾小球肾炎、肾小球硬化症、肾病综合征、高血压性肾硬化、一些类型癌症(如子宫内膜癌、乳腺癌、前列腺癌与结肠癌)、妊娠并发症、女性生殖健康不良(例如月经不调、不育、不定期排卵、多囊卵巢性综合征(PCOS))、脂肪营养不良、胆固醇相关病症例如胆结石、胆囊炎与胆石病，痛风、阻塞性睡眠呼吸暂停与呼吸问题、骨关节炎，以及骨丢失，例如尤其是骨质疏松症。
术语“家畜动物”是指经驯化的四足动物，其包括那些为肉类与各类副产品而饲养的动物，例如牛类动物，包括牛与牛属的其它成员，猪类动物，包括驯养猪与猪属的其它成员，羊类动物，包括绵羊与羊属(genus Ovis)的其它成员、驯养山羊与山羊属的其它成员；为特定任务例如用做负重畜牲而饲养的经驯化的四足动物，例如马类动物，包括驯养马与马科马属的其它成员。
术语“哺乳动物”为本领域已知的，且示例性哺乳动物包括人、灵长类、家畜动物(包括牛类、猪类等)、陪伴动物(例如犬类、猫类等)及啮齿类(例如小鼠与大鼠)。
“肥胖”个体或患有肥胖症的个体，一般指具有的体重指数(BMI)为至少25或以上的个体。肥胖可以与或不与胰岛素抵抗相关。
术语“经肠胃外给药”及“经肠胃外进行给药”为本领域公认的，且指肠给药与局部给药以外的给药模式，一般经由注射，且包括但不限定于：静脉内、肌肉内、动脉内、鞘内、囊内、眶内、心内、真皮内、腹膜内、经气管、皮下、表皮下、关节内、囊下、蛛网膜下、脊柱内与胸骨内注射及输注给药。
“患者”、“受试者”、“个体”或“宿主”是指人或非人动物。
术语“药学上可接受的载体”为本领域公认的，且是指与携带或运送任何主体组合物或其组分有关的药学上可接受的材料、组合物或媒介物，例如液体或固体填充剂、稀释剂、赋形剂、溶剂或包封材料。各种载体就其可与主体组合物或其组分相容的意义而言必须为“可接受的”，且对患者是无害的。可用作药学上可接受载体的材料的一些实例包括：(1)糖类，例如乳糖、葡萄糖和蔗糖；(2)淀粉，例如玉米淀粉与马铃薯淀粉；(3)纤维素与其衍生物，例如羧甲基纤维素钠、乙基纤维素和醋酸纤维素；(4)粉末状西黄耆胶；(5)麦芽；(6)明胶；(7)滑石粉；(8)赋形剂，例如可可脂与栓剂蜡；(9)油类，例如花生油、棉籽油、红花油、芝麻油、橄榄油、玉米油与大豆油；(10)二醇类，例如丙二醇；(11)多元醇类，例如甘油、山梨糖醇、甘露糖醇与聚乙二醇；(12)酯类，例如油酸乙酯与月桂酸乙酯；(13)琼脂；(14)缓冲剂，例如氢氧化镁与氢氧化铝；(15)海藻酸；(16)无热源水；(17)等渗盐水；(18)林格氏溶液；(19)乙醇；(20)磷酸盐缓冲溶液；及(21)其它用于医药制剂的无毒相容物质。
术语“预防”为本领域所公知的，且在涉及病症(例如局部复发(如疼痛))、疾病(例如癌症)、综合征(例如心力衰竭)或任何其他医学病症使用时，其在本领域中是公知的，包括给药组合物，与没有接受该组合物的受试者相比，给药组合物在受试者中降低了医学病症的症状的频率或延迟了其发作。因此，癌症的预防包括，例如，在接受预防性治疗的患者群中降低了可检测到的癌生长的数量(相对于未治疗的对照人群)，和/或在治疗的人群中延迟了可检测癌生长的出现(与未治疗的对照人群相比)，例如，以统计学和/或临床显著的量。感染的预防包括，例如，在治疗的人群中降低了诊断的感染的数量(与未治疗的对照人群相比)，和/或在治疗的人群中延迟了感染症状的发作(与未治疗的对照人群相比)。疼痛的预防包括，例如，在治疗的人群中降低了由该受试者觉察到的疼痛感的程度或者延迟了该感觉(与未治疗的对照人群相比)。
术语“预防性”或“治疗性”治疗为本领域所公知的，且指将药物给药至宿主。如果在不希望的病症(例如，宿主动物的疾病或其它不希望状态)有临床显现之前进行给药，则该治疗为预防性，即其保护宿主不会发展成该不希望病症，而如果在不希望病症显现之后进行给药，则该治疗为治疗性的(即意在减少、改善或维持现有的不希望病症或由其产生的副作用)。
术语“无热源(pyrogen-free)”在涉及组合物时，是指热源含量不会在已给药该组合物的受试者中导致有害作用(例如，刺激、发热、炎症、腹泻、呼吸窘迫、内毒素性休克等)的组合物。例如，该术语意包括不含或基本上不含诸如脂多糖(LPS)的内毒素的组合物。
细胞的“复制寿命”是指由单个“母细胞”所产生的子细胞数量。另一方面，“时序衰老(chronolo gical aging)”或“时序寿命”是指一群不分裂的细胞当被除去养分时仍保持存活的时间长度。“增加细胞寿命”或“延长细胞寿命”当应用于细胞或生物体时，是指增加由一个细胞所产生的子细胞数量；增加细胞或生物体对抗应激及对抗损伤(例如对DNA、蛋白的应激和损伤)的能力；和/或增加细胞或生物体在特别条件例如应激(如热休克、渗透压力、高能量照射、化学诱导的应激、DNA损伤、不充足的盐水平、不充足的氮水平或不充足的营养物水平)下存活和生存的状态存在较长时间的能力。使用本文中所述的方法，寿命可增加至少约10％、20％、30％、40％、50％、60％，或20％至70％、30％至60％、40％至60％或以上。
“调节沉默调节蛋白的化合物”是指增加沉默调节蛋白水平，和/或增加沉默调节蛋白的至少一种活性的化合物。在示例性的实施方式中，调节沉默调节蛋白的化合物可使沉默调节蛋白的至少一种生物活性增加至少约10％、25％、50％、75％、100％或以上。沉默调节蛋白的示例性生物活性包括例如组蛋白与p53的脱乙酰基化；延长寿命；增加基因组的稳定性；沉默转录作用；及调控母细胞与子细胞间的经氧化蛋白的分离。
蛋白包括脱乙酰化，例如，乙酰化肽底物的脱乙酰化。
“沉默调节蛋白”是指沉默调节蛋白的脱乙酰基酶蛋白家族的一员或优选指sir2家族的一员，其包括酵母Sir2(GenBank登录编号P53685)、秀丽隐杆线虫Sir-2.1(GenBank登录编号NP_501912)及人SIRT1(GenBank登录编号NM_012238与NP_036370(或AF083106))与SIRT2(GenBank登录编号NM_012237、NM_030593、NP_036369、NP_085096与AF083107)蛋白。其它家族成员包括称作“HST基因”(Sir2的同系物)的四种其它酵母Sir2样基因即HST1、HST2、HST3与HST4，及五种其它人同系物hSIRT3、hSIRT4、hSIRT5、hSIRT6与hSIRT7(Brachmann等人，(1995)Genes Dev.9：2888及Frye等人(1999)BBRC 260：273)。
“SIRT1蛋白”是指沉默调节蛋白的脱乙酰基酶的Sir2家族的一员。在一些实施方式中，SIRT1蛋白包括酵母Sir2(GenBank登录编号P53685)、秀丽隐杆线虫Sir-2.1(GenBank登录编号NP_501912)、人SIRT1(GenBank登录编号NM_012238或NP_036370(或AF083106))、小鼠SIRT1(GenBank登录编号NM_019812或NP_062786)及其等同物与片段。在另一个实施方式中，SIRT1蛋白包括多肽，其包含由或基本上由GenBank登录编号NP_036370、NP_501912、NP_085096、NP_036369或P53685中所示的氨基酸序列所组成的序列。SIRT1蛋白包括含有下列氨基酸序列的全部或一部分的多肽及其功能性片段：GenBank登录编号NP_036370、NP_501912、NP_085096、NP_036369或P53685中所示的氨基酸序列；GenBank登录编号NP_036370、NP_501912、NP_085096、NP_036369或P53685中所示的具有1至约2、3、5、7、10、15、20、30、50、75或更多保守性氨基酸取代的氨基酸序列；与GenBank登录编号NP_036370、NP_501912、NP_085096、NP_036369或P53685至少60％、70％、80％、90％、95％、96％、97％、98％或99％相同的氨基酸序列及其功能性片段。本发明中的多肽也包括GenBank登录编号NP_036370、NP_501912、NP_085096、NP_036369或P53685的同源物(直向同源物(orthologs)与侧向同源物(paralogs))、变体或片段。
本文使用的“SIRT2蛋白”、“SIRT3蛋白”、“SIRT4蛋白”、“SIRT5蛋白”、“SIRT6蛋白”和“SIRT7蛋白”指的是其他的哺乳动物(例如人)的沉默调节蛋白的脱乙酰基酶蛋白(其与SIRT1蛋白同源)，尤其在约275氨基酸保守催化结构域。例如，“SIRT3蛋白”指的是沉默调节蛋白的脱乙酰基酶蛋白家族(其与SIRT1蛋白同源)的成员。在一个实施方式中，SIRT3蛋白包括人SIRT3(GenBank登录编号AAH01042、NP_036371或NP_001017524)与小鼠SIRT3(GenBank登录编号NP_071878)蛋白，及其等同物与片段。在一些实施方案中，SIRT4蛋白包括人SIRT4(GenBank登录编号NM_012240或NP_036372)。在一些实施方案中，SIRT5蛋白包括人SIRT5(GenBank登录编号NM_012241或NP_036373)。在一些实施方案中，SIRT6蛋白包括人SIRT6(GenBank登录编号NM_016539或NP_057623)。在另一个实施方式中，SIRT3蛋白包括多肽，其包含由或基本上由GenBank登录编号AAH01042、NP_036371、NP_001017524或NP_071878中所示的氨基酸序列所组成的序列。SIRT3蛋白包括含有下列氨基酸序列的全部或一部分的多肽及其功能性片段：GenBank登录编号AAH01042、NP_036371、NP_001017524或NP_071878中所示的氨基酸序列；GenBank登录编号AAH01042、NP_036371、NP_001017524或NP_071878中所示的具有1至约2、3、5、7、10、15、20、30、50、75或更多保守性氨基酸取代的氨基酸序列；与GenBank登录编号AAH01042、NP_036371、NP_001017524或NP_071878至少60％、70％、80％、90％、95％、96％、97％、98％或99％相同的氨基酸序列及其功能性片段。本发明中的多肽也包括GenBank登录编号AAH01042、NP_036371、NP_001017524或NP_071878的同源物(直向同源物与侧向同源物)、变体或片段。在一些实施方式中，SIRT3蛋白包括以线粒体基质加工肽酶(MPP)和/或线粒体中间体肽酶(MIP)裂解而产生的SIRT3蛋白片段。
本文中所使用的术语“立体异构体”为本领域所公知的，且指两个或更多个具有相同分子组成且仅在空间上它们的原子的三维排列不同的异构体中的任一个。当在文中用于描述化合物或通式化合物时，立体异构体包括所述化合物的任一部分或整个化合物。例如，非对映异构体和对映异构体是立体异构体。
术语“全身性给药”和“全身地给药”为本领域所公知的，且指将主题组合物、治疗剂或其它物质肠内给药或肠胃外给药。
本文中使用的术语“互变异构体”为本领域所公知的，且指由互变异构现象造成的可能存在的结构中的任一个，其指的是构造异构形式，其中结构可以以两种或多种构造排列形式存在，尤其是就连接至氧的氢的位置而言。当在文中用于描述化合物或通式化合物时，进一步理解“互变异构体”是容易互相转变的且处于平衡状态。例如，酮式和烯醇式互变异构体以一定的比例存在，这取决于针对给定条件或条件组的平衡位置：
术语“治疗剂”为本领域所公知的，且是指可于受试者内局部或全身性起作用的生物学、生理学或药理学活性物质。该术语也是指欲用于诊断、治愈、减轻、治疗或预防疾病的任何物质，或用于增进动物或人的希望的身体或精神发育和/或状况的任意物质。
术语“治疗效果”为本领域所公知的，且指动物(特别是哺乳动物，且更特别地为人)中由药理学活性物质产生的有益的局部或全身性效果。短语“治疗有效量”是指，使物质能以适于治疗的合理效益/风险比产生某种所希望的局部或全身效果的量。物质的治疗有效量将随欲受治疗的受试者与病症、受试者的体重与年龄、病症的严重度、给药方式等而有所变化，其可由本领域普通技术人员容易地确定。例如，本文所述的一些组合物能以适于治疗的合理效益/风险比应用从而产生所希望效果的足够量来进行给药。
“治疗”病症或疾病是指治愈以及改善该病症或疾病的至少一种症状。
术语“视力损伤”是指视力减弱，其在进行治疗(例如手术)时往往仅部分可逆或不可逆。特别严重的视力损伤称为“盲”或“视力丧失”，其是指视力完全丧失、视力差于20/200以致无法经由矫正镜片改善，或视野小于20度直径(10度半径)。
缩写和符号
在描述本发明时，化学元素根据元素周期表进行鉴别。本文使用的缩写和符号符合化学和生物学领域的技术人员对这些缩写和符号的常用用途。
具体地，在实施例和说明书通篇使用以下缩写：
g(克) mg(毫克)；
kg(千克) μg(微克)；
L(升) mL(毫升)；
μL(微升) psi(磅/平方英寸)；
M(摩尔每升) mM(毫摩尔每升)；
μM(微摩尔每升) nM(纳摩尔每升)；
pM(皮摩尔每升) nm(纳米)；
毫米(毫米) 重量(重量)；
N(标准) CFU(菌落形成单位)；
I.V.(静脉内) Hz(赫兹)；
MHz(兆赫兹) 摩尔(摩尔)；
mmol(毫摩尔) RT(室温)；
min(分钟) h(小时)；
b.p.(沸点) TLC(薄层色谱)；
Tr(保留时间) RP(反相)；
MeOH(甲醇) i-PrOH(异丙醇)；
TEA(三乙胺) TFA(三氟乙酸)；
TFAA(三氟乙酸酐) THF(四氢呋喃)；
DMSO(二甲基亚砜) EtOAc(乙酸乙酯)；
DME(1,2-二甲氧基乙烷) DCM(二氯甲烷)；
DCE(二氯乙烷) DMF(N,N-二甲基甲酰胺)；
DMPU(N,N'-二甲基丙烯基脲) CDI(1,1-羰基二咪唑)；
IBCF(氯甲酸异丁酯) AcOH(乙酸)；
HOAt(1-羟基-7-氮杂苯并三唑)；
THP(四氢吡喃) NMM(N-甲基吗啉)；
Pd/C(钯/碳) MTBE(叔丁基甲基醚)；
HOBT(1-羟基苯并三唑) mCPBA(间氯过苯甲酸)；
EDC(1-[3-二甲基氨基]丙基]-3-乙基碳二亚胺盐酸盐)；
Boc(叔丁氧羰基) FMOC(9-芴基甲氧基羰基)；
DCC(二环己基碳二亚胺) CBZ(苄氧羰基)；
Ac(乙酰基) atm(大气压)；
TMSE(2-(三甲基甲硅烷基)乙基) TMS(三甲基甲硅烷基)；
TIPS(三异丙基甲硅烷基) TBS(叔丁基二甲基甲硅烷基)；
DMAP(4-二甲基氨基吡啶) BSA(牛血清白蛋白)；
NAD(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)；
HPLC(高压液相色谱)；
LC/MS(液相色谱/质谱)；
BOP(双(2-氧代-3-噁唑烷基)次膦酰氯)；
TBAF(四正丁基氟化铵)；
HBTU(O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐)；
HEPES(4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸)；
DPPA(二苯基磷酰基叠氮化物) LAH(氢化铝锂)；
fHNO3(发烟HNO3) NaOMe(甲醇钠)；
EDTA(乙二胺四乙酸)；
TMEDA(N,N,N',N'-四甲基-1,2-乙二胺)；
NBS(N-溴琥珀酰亚胺) DIPEA(二异丙基乙胺)；
dppf(1,1'-二(二苯基膦基)二茂铁)；以及
NIS(N-碘代琥珀酰亚胺)。
所有提及的醚都是乙醚，盐水是指NaCl的饱和水溶液。
合成方案和一般制备方法
本发明还分别涉及制备式(I)至(IV)化合物、相应的类似物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)和/或其中间体化合物的方法。
式(I)至(IV)化合物，相应的类似物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)，和/或其中间体化合物或其药学上可接受的盐，可以通过使用以下方案中所示的合成操作或利用熟练的有机化学家的知识来获得。
这些方案(I)至(VI)中提供的合成适用于生产具有各种不同官能团的本发明的化合物，使用合适的前体，如果需要适当保护，以实现与本文概述的反应的相容性。随后视需要脱保护，提供具有大体公开的性质的化合物。虽然方案是针对化合物示出的，但它们也解释说明了用于制备本发明化合物的方法。
中间体(用于制备本发明化合物的化合物)也可以盐形式存在。因此，关于中间体，短语“式(某某数字)的化合物”是指具有该结构式的化合物或其药学上可接受的盐。
本发明还分别涉及制备式(I)至(IV)化合物，相应的类似物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)，和/或其中间体化合物，或其药学上可接受的盐的方法。
式(I)至(II)的化合物分别使用常规有机合成制备。本发明还涉及制备式(I)至(IV)化合物，相应的类似物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)，和/或其中间体化合物，或其药学上可接受的盐的方法。
本发明的化合物可以通过使用以下方案中所示的合成操作或利用熟练的有机化学家的知识来获得。
合适的合成路线在下面的一般反应方案中描述。
化合物制备
根据另一个实施方案，本发明提供了制备上文定义的化合物的方法。化合物可以使用常规技术合成。有利地，这些化合物通常由容易获得的原料合成。
可用于合成本文所述化合物的合成化学转化和方法学是本领域已知的，并且包括例如以下文献所述的那些：R.Larock,Comprehensive Organic Transformations(1989)；T.W.Greene and P.G.M.Wuts,Protective Groups in Organic Synthesis,2d.Ed.(1991)；L.Fieser and M.Fieser,Fieser and Fieser's Reagents for OrganicSynthesis(1994)；以及L.Paquette,ed.,Encyclopedia of Reagents for OrganicSynthesis(1995)。
一般操作
方案I
试剂:(a)THF,NaHCO3,45℃；(b)Fe,i-PrOH,HOAc,70℃；(c)LiAlH4,THF,60℃；(d)POCl3。
在非质子溶剂(例如THF，DMF，二噁烷)中，在碱(以清除HCl)存在下，将市售氯代吡啶(I-1)与亲核性胺(I-2)反应，提供区域选择性加成产物(I-3)。在Bronstead酸(HCl，HOAc)和质子溶剂的存在下，使用Fe(0)还原物质(I-3)的硝基官能团(参见Bechampreduction,Org React.2,428,1944)。可以使用其它金属，例如Sn来实现该还原。原位形成的中间体胺类物质在升高的温度下与酯官能团反应形成环酰胺I-4。使强的氢化物还原剂如LiAlH4与化合物I-4反应，导致将酯还原成相应的醇，同时将内酰胺还原成环状胺。这种类型的还原是本领域技术人员所熟知的，见H.C.Brown和S.Krishnamurthy，Tetrahedron，Tetrahedron,1979,35,567。醇(I-5)与活化基团(如POCl3)的反应能够形成容易得到(facile)的离去基团，提供双环胺化合物(I-6)。
方案II
试剂:(a)Pd2(dba)3,X-Phos,K3PO4,ArB(OH)2,二噁烷/H2O；(b)NBS,CHCl3,60℃；(c)NCS,CHCl3,60℃；(d)NIS,CHCl3,60℃；(e)N-氟-N'-氯甲基三亚乙基二胺双(四氟硼酸盐),三氟甲磺酸,60℃。
使用Suzuki偶联化学将化合物I-6的氯官能团与硼酸偶联得到II-1。通常使用诸如Pd(PPh3)4的钯(0)催化剂与无机碱例如K2CO3、Na2CO3或K3PO4在含有醚溶剂如DME，二噁烷或THF的水性混合物中进行Suzuki样偶联。钯介导偶联的方法在标准参考手册中描述，例如Schlosser“Organometallics in Synthesis”(由Wiley and sons出版)。将化合物II-1与亲电性卤化试剂如NCS，NBS，NIS或N-氟-N'-氯甲基三亚乙基二胺双(四氟硼酸盐)在合适的溶剂中反应，以区域选择性方式得到相应的卤化物质II-2。存在许多方法来实现芳环的卤化，并且是本领域技术人员所熟知的。
方案III
试剂:(a)Zn(CN)2,Zn(OAc)2,DPPF,Pd2(dba)3,DMF,110℃(b)CuCl,KOt-Bu,CF3Si(CH3)3,1,10-菲咯啉,DMPU,35℃.(c)CH3B(OH)2,K3PO4,X-Phos,Pd2(dba)3,二噁烷/H2O,75℃。
化合物III-1的卤素基团可以使用金属介导的中间体用各种官能团取代，得到化合物III-2。有机金属偶联通常使用钯(0)催化剂如Pd(PPh3)4或其它金属如Cu或Sn，与碱例如KOt-Bu或K3PO4在含有极性溶剂如DMPU、二噁烷或DMF的混合物中进行。钯介导偶联的方法在标准参考手册中描述，例如Schlosser“Organometallics in Synthesis”(由Wiley andsons出版)。存在许多方法来实现芳族环上的卤化物的金属催化的取代，并且是本领域技术人员所熟知的。
方案IV
试剂:(a)TEA,三光气,DCM；(b)苯胺,TEA,DCM；(c)DPPA,ArCO2H,60℃；(d)Pd2(dba)3,X-Phos,K3PO4,二噁烷/H2O。
将胺(IV-1)与酰化试剂如三光气或羰基二咪唑在非质子溶剂(DCM、CHCl3、THF等)中反应，得到反应性酰基中间体物质(IV-2)。在叔烷基胺碱存在下，用苯胺化合物或烷基胺原位处理反应性酰基化合物(IV-2)，形成脲物质(IV-3)。或者，可以用DPPA处理合适的羧酸，然后在升高的温度下原位加入胺(IV-1)，产生脲(IV-3)。这种反应涉及Curtius重排(Org.React.3,3371946)，并且是本领域技术人员所熟知的。使用Suzuki偶联化学将脲IV-3的氯官能团与硼酸选择性偶联，得到(IV-4)。通常使用诸如Pd(PPh3)4的钯(0)催化剂与无机碱例如K2CO3、Na2CO3或K3PO4在含有醚溶剂如DME、二噁烷或THF的水性混合物中进行Suzuki样偶联。钯介导偶联的方法在标准参考手册中描述，例如Schlosser“Organometallics inSynthesis”(由Wiley and sons出版)。可以颠倒该反应顺序，使得IV-1首先在Suzuki条件下反应，然后使用上述条件形成脲，得到IV-4。
方案VI
试剂:(a)乙酸钯,K2CO3,二噁烷/H2O,二环己基(2',4',6'-三异丙基-[1,1'-联苯]-2-基)膦
使用Buchwald-Hartwig胺化条件，通过烷基胺选择性地置换尿素IV-3的氯官能团，得到(VI-1)。Buchwald-Hartwig反应通常使用钯(0)催化剂如Pd(PPh3)4与大体积的Bronstead碱例如KOt-Bu或KHMDS，在包含醚溶剂如DME、二噁烷或THF的混合物中进行反应。钯介导的胺偶联的方法描述于Hartwig,J.F.(1998),Transition Metal CatalyzedSynthesis of Arylamines and Aryl Ethers from Aryl Halides and Triflates:Scopeand Mechanism,Angew.Chem.Int.Ed.37:2046–2067。
化合物特征和性质
在一个示例性的实施方案中，治疗性化合物可能穿过细胞的胞质膜。例如，化合物可具有至少约20％、50％、75％、80％、90％或95％的细胞-通透性。
本文所述的化合物也可具有一个或多个下列特性：所述化合物可基本上对细胞或受试者无毒性；所述化合物可为有机分子或具有2000amu或小于2000amu，1000amu或小于1000amu的小分子；所述化合物可于正常大气条件下具有至少约30天、60天、120天、6个月或1年的半衰期；所述化合物于溶液中可具有至少约30天、60天、120天、6个月或1年的半衰期；所述化合物可于溶液中，较白藜芦醇稳定至少约50％、2倍、5倍、10倍、30倍、50倍或100倍；所述化合物可促进DNA修复因子Ku70的脱乙酰基化作用；所述化合物可促进RelA/p65的脱乙酰基化作用；所述化合物可增加一般转换率，及增强细胞对TNF-诱发的细胞凋亡的敏感性。
在一些实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物在(例如体内)有效调节沉默调节蛋白的脱乙酰基酶活性的浓度下，不具有抑制第I类组蛋白脱乙酰基酶(HDAC)、和/或第II类HDAC的任何实质能力。例如，在优选的实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物为一种调节沉默调节蛋白的化合物，其经选择所具有的对活化沉默调节蛋白的脱乙酰基酶活性的EC50值比抑制HDAC I和/或HDAC II的EC50值小至少5倍，且甚至优选小至少10倍、小100倍或小甚至1000倍。用于分析HDAC I和/或HDAC II活性的方法为本领域所熟知，且进行此类测定的试剂盒可市场上购得。参见例如，BioVision，Inc.(Mountain View，CA；网址biovision.com)及Thomas Scientific(Swedesboro，NJ；网址thomassci.com)。
在一些实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物不具有调节沉默调节蛋白同系物的任何实质能力。在一些实施方案中，人沉默调节蛋白的活化剂，在(例如活体内)有效活化人沉默调节蛋白的脱乙酰基酶活性的浓度下，可能不具有活化得自低等真核生物，特别是酵母或人病原体的沉默调节蛋白的任何实质能力。例如，调节沉默调节蛋白的化合物可经选择所具有的对于活化人沉默调节蛋白(例如SIRT1和/或SIRT3)脱乙酰基酶活性的EC50值比活化酵母沉默调节蛋白(例如Sir2(如念珠菌属、酿酒酵母等))的EC50值小至少5倍，且甚至更优选小至少10倍、小100倍或甚至小1000倍。在另一实施方案中，得自低等真核生物(特别是酵母或人病原体)的沉默调节蛋白的抑制剂，在(例如活体内)有效抑制得自低等真核生物的沉默调节蛋白的脱乙酰基酶活性的浓度下，不具有抑制得自人的沉默调节蛋白的任何实质能力。例如，沉默调节蛋白的抑制性化合物可经选择所具有的对于抑制人沉默调节蛋白(例如SIRT1和/或SIRT3)的脱乙酰基酶活性的IC50值比抑制酵母沉默调节蛋白(例如Sir2(如念珠菌属、酿酒酵母等))的IC50值小至少5倍，且甚至更优选小至少10倍、小100倍或甚至小1000倍。
在一些实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物可具有调节一种或多种沉默调节蛋白同系物，诸如一种或多种人SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT4、SIRT5、SIRT6或SIRT7的能力。在一些实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物具有调节SIRT1及SIRT3蛋白的能力。
在其它实施方案中，SIRT1调节剂在(例如活体内)有效调节人SIRT1的脱乙酰基酶活性的浓度下，不具有调节其它沉默调节蛋白同系物，诸如一种或多种人SIRT2、SIRT3、SIRT4、SIRT5、SIRT6或SIRT7的任何实质能力。例如，调节沉默调节蛋白的化合物可经选择所具有的对于调节人SIRT1脱乙酰基酶活性的ED50值比调节一种或多种人SIRT2、SIRT3、SIRT3、SIRT4、SIRT5、SIRT6或SIRT7的ED50值小至少5倍，且甚至更优选小至少10倍、小100倍或甚至小1000倍的那些化合物。在一些实施方案中，SIRT1调节剂不具有调节SIRT3蛋白的任何实质能力。
在其它实施方案中，SIRT3调节剂在(例如，体内)有效调节人SIRT3的脱乙酰基酶活性的浓度不具有任何调节其它沉默调节蛋白同源物(例如人SIRT1、SIRT2、SIRT4、SIRT5、SIRT6或SIRT7中的一个或多个)的实质能力。例如，调节沉默调节蛋白的化合物可经选择所具有的对于调节人SIRT3脱乙酰基酶活性的ED50值比调节一种或多种人SIRT1、SIRT2、SIRT4、SIRT5、SIRT6或SIRT7的ED50值小至少5倍，且甚至更优选小至少10倍、小100倍或甚至小1000倍。在一个实施方案中，SIRT3调节剂不具有调节SIRT1蛋白的任何实质能力。
在一些实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物对于沉默调节蛋白的结合亲和力可为约10-9M、10-10M、10-11M、10-12M或以下。调节沉默调节蛋白的化合物可将沉默调节蛋白对于其底物或NAD+(或其它辅因子)的表观Km值减少(活化剂)或增加(抑制剂)达至少约2、3、4、5、10、20、30、50或100倍。在一些实施方案中，Km值使用本文所述的质谱分析测定。优选的活化化合物减少沉默调节蛋白对于其底物或辅因子的Km值的程度较由白藜芦醇在相似浓度下所引起的程度大，或减少沉默调节蛋白对于其底物或辅因子的Km值达到由白藜芦醇在较低浓度下所引起的Km值。调节沉默调节蛋白的化合物可使沉默调节蛋白的Vmax值增加至少约2、3、4、5、10、20、30、50或100倍。调节沉默调节蛋白的化合物调节SIRT1和/或SIRT3蛋白的脱乙酰基酶活性的ED50值少于约1nM，少于约10nM，少于约100nM，少于约1μM，少于约10μM，少于约100μM，或从约1-10nM，从约10-100nM，从约0.1-1μM，从约1-10μM或从约10-100μM。调节沉默调节蛋白的化合物可调节SIRT1和/或SIRT3蛋白的脱乙酰基酶活性达至少约5、10、20、30、50或100倍，其是通过细胞分析或以细胞为基础的分析测定的。相对于相同浓度的白藜芦醇，调节沉默调节蛋白的化合物可诱导沉默调节蛋白的脱乙酰基酶活性达至少约10％、30％、50％、80％、2倍、5倍、10倍、50倍或100倍。调节沉默调节蛋白的化合物调节SIRT5的ED50值比调节SIRT1和/或SIRT3的ED50值大至少约10倍、20倍、30倍、50倍。
示例性的用途
在一些方面，本发明提供用于调节沉默调节蛋白的水平和/或活性的方法和用途，及其使用方法。
在一些实施方案中，本发明提供使用调节沉默调节蛋白的化合物的方法和用途，其中调节沉默调节蛋白的化合物活化沉默调节蛋白，例如增加沉默调节蛋白的水平和/或活性。增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于各种治疗应用，包括例如增加细胞寿命，及治疗和/或预防许多种疾病与病症，包括例如与衰老或应激有关的疾病或障碍、糖尿病、肥胖、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固病症、炎症、癌症和/或潮红等。本发明的方法和用途包含将药学上有效量的调节沉默调节蛋白的化合物，例如调节沉默调节蛋白的化合物给予对其有需要的患者。
不希望受限于理论，但相信本发明的活化剂可在沉默调节蛋白内的相同部位(例如，活性位置或影响该活性位置的Km或Vmax的位置)与沉默调节蛋白相互作用。认为此即一些类型的沉默调节蛋白的活化剂和抑制剂为何能具有实质结构相似性的原因。
在一些实施方案中，本文中所述的调节沉默调节蛋白的化合物可单独使用或与其它化合物组合使用。在一些实施方案中，可将两种或更多种调节沉默调节蛋白的化合物的混合物给予对其有需要的受试者。在另一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可与一种或多种下列化合物一起给药：白藜芦醇、紫铆花素、非瑟素、白皮杉醇(piceatannol)或槲皮素。在一个示例性的实施方案中，将增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物与烟酸或烟酰胺核糖苷组合给药。在另一个实施方案中，减少沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可与一种或多种下列化合物一起给药：烟酰胺(NAM)、舒拉宁(suranim)；NF023(一种G-蛋白拮抗剂)；NF279(一种嘌呤能受体拮抗剂)；托洛索(Trolox)(6-羟基-2,5,7,8-四甲基色满-2-甲酸)；(-)-表没食子儿茶酚(羟基位于位置3,5,7,3',4',5')；(-)-表没食子儿茶酚没食子酸酯(羟基位置5,7,3',4',5'，且没食子酸酯位于位置3)；氯化花青素(3,5,7,3',4'-五羟基氯化黄鎓(flavylium)盐)；氯化翠雀色素(3,5,7,3',4',5'-六羟基氯化黄鎓盐)；杨梅黄酮(大麻双酮；3,5,7,3',4',5'-六羟基黄酮)；3,7,3',4',5'-五羟基黄酮；棉黄素(3,5,7,8,3',4'-六羟基黄酮)、瑟汀诺(sirtinol)；及斯托米辛(splitomicin)。。在另一实施方案中，一种或多种调节沉默调节蛋白的化合物可与一种或多种用于治疗或预防各种疾病(包括例如癌症、糖尿病、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固、炎症、潮红、肥胖、衰老、应激等)的治疗剂一起进行给药。在多种实施方案中，包含调节沉默调节蛋白的化合物的组合疗法可涉及(1)包含一种或多种调节沉默调节蛋白的化合物与一种或多种治疗剂(例如，一种或多种于本文中所描述的治疗剂)的药物组合物；及(2)一种或多种调节沉默调节蛋白的化合物与一种或多种治疗剂的共同给药，其中所述调节沉默调节蛋白的化合物与治疗剂未配制在同一组合物中(但是可存在于相同试剂盒或包装中，例如泡罩包装或其它多隔室包装内；存在于可由使用者自行分开的相连结的、分别密封的容器(例如锡箔小袋)内；或存在于其中所述化合物与其它治疗剂处于分开的容器中的试剂盒内)。当使用分开的制剂时，调节沉默调节蛋白的化合物可与另一治疗剂的给药同时、间歇、交错、在其之前、在其之后进行，或以这些方式的组合进行。
在一些实施方案中，使用本文所述的化合物以减轻、预防或治疗疾病或障碍的方法和用途也可包括增加沉默调节蛋白(例如人SIRT1、SIRT2和/或SIRT3，或其同系物)的蛋白水平。增加蛋白水平可通过将编码沉默调节蛋白的一个或多个核酸拷贝引入细胞中而完成。例如，可通过将编码沉默调节蛋白的核酸引入哺乳动物细胞中来增加哺乳动物细胞中沉默调节蛋白的水平，例如通过将编码GenBank登录编号NP_036370中所示的氨基酸序列的核酸引入来增加SIRT1的水平，和/或通过将编码GenBank登录编号AAH01042中所示的氨基酸序列的核酸引入来增加SIRT3的水平。
被引入细胞中以增加沉默调节蛋白水平的核酸可编码与沉默调节蛋白(例如SIRT1和/或SIRT3蛋白)的序列至少约80％、85％、90％、95％、98％或99％相同的蛋白。例如，编码该蛋白的核酸可与编码SIRT1(例如GenBank登录编号NM_012238)和/或SIRT3(例如GenBank登录编号BC001042)蛋白的核酸至少约80％、85％、90％、95％、98％或99％相同。核酸也可为优选于严格杂交条件下与编码野生型沉默调节蛋白(例如SIRT1和/或SIRT3蛋白)的核酸杂交的核酸。严格杂交条件可包括在0.2×SSC中于65℃下杂交并且清洗。当使用所编码的蛋白(例如其为野生型沉默调节蛋白的片段的蛋白)与野生型沉默调节蛋白不同的核酸时，该蛋白优选是生物学活性的，例如能够进行脱乙酰基化作用。仅需要在细胞中表达具有生物学活性的沉默调节蛋白的一部分。例如，与具有GenBank登录编号NP_036370的野生型SIRT1不同的蛋白，优选含有其核心结构。该核心结构有时指GenBank登录编号NP_036370的氨基酸62-293，其由GenBank登录编号NM_012238的核苷酸237至932编码，其包含NAD结合以及底物结合结构域。SIRT1的核心结构域也可指：GenBank登录编号NP_036370的大约氨基酸261至447，其由GenBank登录编号NM_012238的核苷酸834至1394所编码；GenBank登录编号NP_036370的大约氨基酸242至493，其由GenBank登录编号NM_012238的核苷酸777至1532所编码；或GenBank登录编号NP_036370的大约氨基酸254至495，其由GenBank登录编号NM_012238的核苷酸813至1538所编码。可根据本领域已知的方法测定蛋白是否保留生物功能，例如脱乙酰基化能力。
在一些实施方案中，使用调节沉默调节蛋白的化合物以减轻、预防或治疗疾病或障碍的方法和用途也可包括降低沉默调节蛋白(例如人SIRT1、SIRT2和/或SIRT3，或其同系物)的蛋白水平。降低沉默调节蛋白水平可根据本领域已知的方法实现。例如，可于细胞中表达靶向沉默调节蛋白的siRNA、反义核酸或核酶。也可使用显性阴性(dominantnegative)的沉默调节蛋白的突变体，例如不能进行脱乙酰基化的突变体。例如，可使用经描述于例如Luo等人(2001)Cell 107：137中的SIRT1突变体H363Y。或者，可使用抑制转录作用的试剂。
用于调节沉默调节蛋白水平的方法和用途也包括调节编码沉默调节蛋白的基因的转录作用的方法和用途，稳定化/去稳定化相对应mRNA的方法和用途，及本领域已知的其它方法和用途。
衰老/应激
在一个方面，本发明提供通过将细胞与本发明的增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物接触，从而延长细胞寿命、增加细胞增殖能力、减缓细胞衰老、促进细胞存活、延迟细胞衰老、模拟热量限制作用、增加细胞对应激的抗性或防止细胞凋亡的方法。在一个示例性的实施方案中，本发明的方法和用途包括将细胞与调节沉默调节蛋白的化合物接触。
本文所述的方法和用途可用于增加细胞、特别是原生细胞(即得自生物体，例如人的细胞)在细胞培养物中可保持存活的时间。胚胎干细胞(ES)与多潜能细胞(pluripotentcell)及由其分化的细胞也可用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物来处理，以使细胞或其子代在培养物中保持较长的时间。此类细胞也可用于例如在进行离体修饰(ex vivo modification)后移植入受试者中。
在一个方面，可用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物处理要长时间保存的细胞。细胞可存在于悬浮液(例如血细胞、血清、生物学生长培养基等)中，或存在于组织或器官中。例如，可用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物处理收集来自个体的供输血的血液，使血细胞保存较长的时间。此外，用于法医目的血液也可使用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物进行保存。其它可经处理以延长其寿命或保护其对抗凋亡的细胞包括供消耗的细胞例如得自非人哺乳动物的细胞(例如肉类)，或植物细胞(例如蔬菜)。
也可在哺乳动物、植物、昆虫或微生物的发育及生长期施用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，以例如改变、减缓或加速发育和/或生长过程。
在另一个方面，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于处理用于移植或细胞疗法的细胞，包括例如实体组织移植物、器官移植物、细胞悬浮液、干细胞、骨髓细胞等。细胞或组织可为自体移植物、同种异体移植物(allograft)、同种同基因移植物(syngraft)或异种移植物。可将细胞或组织于给药/植入之前、于给药/植入的同时、和/或于给药/植入受试者之后，用调节沉默调节蛋白的化合物进行处理。可将细胞或组织于从供给者个体取出细胞之前、于从供给者个体取出后细胞或组织离体地(exvivo)、或于植入接受体之后进行处理。例如，可用调节沉默调节蛋白的化合物对供给者或接受体个体进行全身性处理，或用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物对细胞/组织亚组(subset)进行局部性处理。在一些实施方案中，可另外地用另一种用于延长移植物存活的治疗剂，例如免疫抑制剂、细胞因子、血管生成因子等处理细胞或组织(或供给者/接受者个体)。
在其它的实施方案中，可在体内用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物处理细胞，以例如增加其寿命或防止细胞凋亡。例如，可通过用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物来处理皮肤或表皮细胞来保护皮肤以防衰老(例如，形成皱纹、丧失弹性等)。在一个示例性的实施方案中，将皮肤与包含增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物的药物组合物或化妆品组合物接触。可根据本文所述方法和用途处理的示例性皮肤疾病或皮肤病症，包括与炎症、晒伤或自然衰老相关或由其引起的病症或疾病。例如，组合物可用于预防或治疗接触性皮炎(包括刺激性接触性皮炎和过敏性接触性皮炎)、特应性皮炎(也称作变应性湿疹)、光化性角化病、角质化病症(包括湿疹)、大疱性表皮松解病(包括天疱疮)、剥脱性皮炎、脂溢性皮炎、红斑(包括多形红斑与结节性红斑)、由日晒或其它光源引起的损伤、盘状红斑狼疮、皮肌炎、银屑病、皮肤癌及自然衰老作用。在另一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于创伤处理和/或烧伤以促进愈合，包括例如一度、二度或三度烧伤和/或热烧伤、化学烧伤或电烧伤。可将制剂局部地给药至皮肤或粘膜组织。
包含一种或多种增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物的局部制剂，也可用作为预防性(例如化学预防性)组合物。当使用于化学预防性方法中时，在具体个体中出现可见病症之前处理易感染的皮肤。
可将调节沉默调节蛋白的化合物局部或全身性地递送至受试者。在一个实施方案中，通过注射、局部制剂等，将调节沉默调节蛋白的化合物局部地给药至受试者的组织或器官。
在另一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防因受试者中细胞衰老所诱发或加重的疾病或障碍；用于减低受试者衰老速度(例如在开始衰老之后)的方法和用途；用于延长受试者寿命的方法和用途；用于治疗或预防与寿命有关的疾病或障碍的方法和用途；用于治疗或预防与细胞增殖能力有关的疾病或障碍的方法和用途；及用于治疗或预防由细胞损伤或死亡所导致的疾病或障碍的方法和用途。在一些实施方案中，该方法并非通过减低那些缩短受试者寿命的疾病的发生率而起作用。在一些实施方案中，该方法并非通过减低由疾病(例如癌症)所引起的致死率而起作用。
在另一个实施方案中，为了一般性地增加受试者的细胞寿命以及为了保护其细胞对抗应激和/或对抗凋亡的目的，可将增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物给予受试者。可以相信以本文所述的化合物治疗受试者，类似于使受试者经历毒物刺激作用(hormesis)即，对生物体有益且可延长其寿命的温和应激。
可将增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物给予受试者，以预防衰老及与衰老有关的后果或疾病，例如中风、心脏病、心脏衰竭、关节炎、高血压及阿尔茨海默病。其它可被治疗的病症包括眼疾病，例如与眼睛衰老有关的眼病症，例如白内障、青光眼及黄斑变性。也可将增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物给予受试者，用来治疗与细胞死亡有关的疾病，例如慢性疾病，以保护细胞不死亡的目的。示例性疾病包括那些与神经细胞死亡、神经元功能障碍、或肌肉细胞死亡或功能障碍有关的疾病，例如帕金森病、阿尔茨海默病、多发性硬化、肌萎缩性侧索硬化(amniotropic lateral sclerosis)与肌营养不良；AIDS；暴发性肝炎；与脑退化相关的疾病，例如克-雅病(Creutzfeldt-Jakob disease)、色素性视网膜炎与小脑变性；脊髓发育不良例如再生障碍性贫血；缺血性疾病例如心肌梗塞与中风；肝病例如酒精性肝炎、乙型肝炎与丙型肝炎；关节疾病例如骨关节炎；动脉粥样硬化；脱发；由UV光引起的皮肤损伤；扁平苔藓；皮肤萎缩；白内障；以及移植物排斥。细胞死亡也可由手术、药物治疗、化学品接触或放射接触所引起。
也可将增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物给予患有急性疾病，例如器官或组织伤害的受试者，例如患有中风或心肌梗塞的受试者，或患有脊髓损伤的受试者。增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物也可用于修复酒精性肝(alcoholic’s liver)。
心血管疾病
在另一个实施方案中，本发明提供一种治疗和/或预防心血管疾病的方法，其通过将增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物给予有需要的受试者。
可使用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物治疗或预防的心血管疾病，包括心肌病或心肌炎，例如特发性心肌病、代谢性心肌病、酒精中毒性心肌病、药物引发的心肌病、缺血性心肌病及高血压性心肌病。也可使用本文所述化合物与方法和用途治疗或预防的疾病为例如主动脉、冠状动脉、颈动脉、脑血管动脉、肾动脉、髂动脉、股动脉及腘动脉(popliteal arteries)等主要血管的粥样硬化病症(大血管疾病)。其它可被治疗或预防的血管疾病包括那些与血小板聚集、视网膜小动脉、肾小球小动脉(glomerular arteriole)、神经滋养血管(vasa nervorum)、心小动脉，及眼、肾脏、心脏与中枢及周围神经系统相关的毛细血管床相关的血管疾病。增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物也可用于增加个体血浆内的HDL水平。
可以用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物治疗的其它病症包括再狭窄(例如在冠状动脉介入治疗后)，及与高密度及低密度胆固醇异常水平有关的病症。
在一些实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可以作为组合疗法的一部分与另一种心血管药剂一起给药。在一些实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可以作为组合疗法的一部分与抗心率失常药剂一起给药。在另一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可以作为组合疗法的一部分与其它心血管药剂一起给药。
细胞死亡/癌症
增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可给予最近已接受或可能将接受一定剂量辐射或毒素的受试者。在一个实施方案中，接受辐射或毒素的剂量作为工作相关程序或医药程序的一部分，例如作为预防措施给药。在一些实施方案中，非故意地接受辐射或毒素的暴露。在这种情况下，优选在暴露后尽快给药所述化合物，以抑制细胞凋亡及后续发展成急性辐射综合征。
调节沉默调节蛋白的化合物还可以用于治疗和/或预防癌症。在一些实施方案中，该增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗和/或预防癌症。能量限制已经与年龄相关疾病(例如癌症)的发病率的降低建立起了联系。相应地，沉默调节蛋白的水平和/或活性的增加可有利地用于治疗和/或预防年龄相关疾病(例如癌症)的发病率。可以利用调节沉默调节蛋白的化合物治疗的示例性的癌症为脑部和肾脏的癌症；激素-依赖的癌症，包括乳腺癌、前列腺癌、睾丸癌和卵巢癌；淋巴瘤和白血病。在与实体肿瘤有关的癌症中，可将调节性化合物直接给予至该肿瘤中。血液细胞的癌症(例如白血病)可通过将调节性化合物给药至血流中或骨髓中而进行治疗。也可治疗良性细胞生长例如疣。可被治疗的其它疾病包括自身免疫疾病，例如全身性红斑狼疮、硬皮病及关节炎，其中应将自身免疫细胞去除。也可通过给药调节沉默调节蛋白的化合物治疗与病毒感染(例如疱疹、HIV、腺病毒及HTLV-1)有关的恶性与良性病症。或者，可自受试者获取细胞，经体外处理以去除一些不希望的细胞(例如癌细胞)，并再返回给予相同或不同的受试者。
也可将化学治疗剂与本文所述具有抗癌活性的调节性化合物(例如诱发细胞凋亡的化合物、减短寿命的化合物或使细胞对应激敏感的化合物)共同给药。化学治疗剂本身可与本文所述可诱发细胞死亡或减短寿命或增加对应激敏感的调节沉默调节蛋白的化合物组合使用，和/或与其它化学治疗剂组合使用。除了常规化学治疗剂之外，本文所述的调节沉默调节蛋白的化合物也可与反义RNA、RNAi，或其它多核苷酸一起使用以抑制会引起不希望细胞增殖的细胞组分的表达。
包含调节沉默调节蛋白的化合物与常规化学治疗剂的组合疗法可能优于本领域已知的组合疗法，因为该组合可使常规化学治疗剂在较低剂量下起更大功效。在优选的实施方案中，当与调节沉默调节蛋白的化合物组合使用时，对于化学治疗剂或常规化学治疗剂的组合，有效剂量(ED50)比单独的该化学治疗剂的ED50小至少2倍，且甚至更优选小5倍、小10倍或甚至小25倍。反之，当与本文所述调节沉默调节蛋白的化合物组合使用时，对于此类化学治疗剂或此类化学治疗剂的组合的治疗指数(TI)而言，其比单独的常规化学治疗方案的TI高至少2倍，且甚至更优选地高5倍、高10倍或甚至高25倍。
神经元疾病/病症
在一些方面，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗患有神经变性疾病，及中枢神经系统(CNS)、脊髓或周围神经系统(PNS)的创伤或机械性损伤的患者。神经变性疾病通常涉及人脑部质量与体积的减少，其可能由于脑细胞萎缩和/或死亡所致，这比健康人因衰老所引起的人脑部质量与体积的减少更显著。神经变性疾病可在执行长期正常脑功能后，由于特定脑区域的渐进性退化(例如神经细胞功能不足及死亡)而逐渐进展。另一方面，神经变性疾病可快速发作，例如那些与创伤或毒素相有关的神经变性疾病。脑退化的实际发作可能较临床表达早许多年。神经变性疾病的实例包括(但不限定于)阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)、亨廷顿病(HD)、肌萎缩性侧索硬化(ALS；罗杰里格氏病(Lou Gehrig’s disease))、弥散性路易体病(diffuse Lewy bodydisease)、舞蹈病-棘红细胞增多症、原发性侧索硬化、眼疾病(眼神经炎)、化学疗法诱发的神经病变(例如源自长春新碱、紫杉醇、硼替佐米)、糖尿病诱发的神经病变及佛里德赖希共济失调。增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗这些病症及如下文所描述的其它病症。
AD为导致记忆丧失、异常行为、个性改变及思考能力衰退的CNS病症。这些丧失与特定类型的脑细胞死亡、及脑细胞间的连结与其支撑网络(例如神经胶质细胞)损坏有关。最早期症状包括丧失最近的记忆、错误判断及个性改变。PD为导致身体运动不受控制、僵硬、颤抖及运动障碍的CNS病症，与脑部制备多巴胺的区域中的脑细胞死亡关联。ALS(运动神经元疾病)为攻击运动神经元(CNS中将脑与骨骼肌连结的组分)的CNS病症。
HD为另一种引起运动不受控制、智力丧失及情绪失调的神经变性疾病。泰-萨病(Tay-Sachs disease)与桑德霍夫病(Sandhoff disease)，是其中GM2神经节苷脂与β-氨基己糖苷酶(hexosaminidase)的相关糖脂类底物累积于神经系统中并引发急性神经变性的糖脂储存疾病(glycolipid storage diseases)。
已熟知，细胞凋亡在免疫系统的AIDS病变方面起作用。然而，HIV-1也诱发可以用本发明的调节沉默调节蛋白的化合物治疗的神经学疾病。
神经元丧失(neuronal loss)也为朊病毒病(prion diseases)(例如人克-雅病、牛BSE(疯牛病)、绵羊与山羊的瘙痒病及猫的猫类海绵状脑病(FSE))的突出特征。增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防由这些疾病引起的神经元丧失。
在另一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防任何涉及轴突病(axonopathy)的疾病或障碍。远端轴突病为一类由周围神经系统(PNS)神经元的某种代谢或毒性错乱所产生的周围神经病。其为神经对代谢或毒性紊乱的最通常响应，而因此可能由代谢性疾病例如糖尿病、肾衰竭、缺乏综合征例如营养不良及酒精中毒，或由毒素或药物的作用所引起。那些患有远端轴突病的患者通常呈现对称性手套-袜样感觉-运动紊乱。在受影响区域也发生深层腱反射及自主神经系统(ANS)功能丧失或缩减。
糖尿病性神经病变为与糖尿病有关的神经病症。与糖尿病性神经病变有关的较常见病症包括第三神经麻痹；单一神经病变；多发性单神经炎；糖尿病性肌肉萎缩；疼痛性多神经病；自主神经病；及胸腹神经病。
周围神经病变为用于对周围神经系统的神经损伤的医学术语，其可能是由神经疾病或由全身性疾病的副作用所引起。周围神经病变的主要原因包括癫痫发作、营养缺乏及HIV，但糖尿病是最可能的原因。
在一个示例性的实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防多发性硬化(MS)，包括复发性MS与单症状MS，及其它脱髓鞘病症(demyelinating condition)，例如慢性炎性脱髓鞘多神经病(CIDP)或与其有关的病症。
在又一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物也可用于治疗神经创伤，包括由于疾病、损伤(包括手术介入)或环境创伤(例如神经毒素、酒精中毒等)所引起的创伤。
增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物也可用于预防、治疗及缓解各种PNS病症的症状。术语“周围神经病变”涵括广范围的位于脑与脊髓外部的神经(即周围神经)已经受损的病症。周围神经病变也可指周围神经炎，或者如果涉及许多神经时，可使用术语多神经病或多神经炎。
可以用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物治疗的PNS疾病包括：糖尿病、麻疯、夏-马-图三氏病(Charcot-Marie-Tooth disease)、格-巴二氏综合征(Guillain-Barré syndrome)和壁神经丛神经病(Brachial Plexus Neuropathy)(颈与第一胸根、神经干、索(cord)及臂神经丛的周围神经组分的疾病)。
在另一个实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防多谷氨酰胺疾病。示例性多谷胺酰胺疾病包括脊髓延髓肌肉萎缩(肯尼迪病)、亨廷顿病(HD)、齿状核红核苍白球丘脑下部核萎缩(Dentatorubral-pallidoluysian atrophy)(郝乌河综合征(HawRiver syndrome))、1型脊髓小脑性共济失调、2型脊髓小脑性共济失调、3型脊髓小脑性共济失调(马-约病(Machado-Joseph disease))、6型脊髓小脑性共济失调、7型脊髓小脑性共济失调及17型脊髓小脑性共济失调。
在一些实施方案中，本发明提供治疗中枢神经系统细胞以防止因响应于血液流向细胞减低所引起的伤害的方法。通常可被预防的伤害严重度将大部分取决于血液流向细胞的减低程度及减少的持续时间。在一个实施方案中，可预防凋亡性或坏死细胞死亡。在再一个实施方案中，可预防缺血所介导的伤害，例如细胞毒性水肿或中枢神经系统组织缺氧血症。在各实施方案中，中枢神经系统细胞可为脊髓细胞或脑细胞。
另一方面包括将调节沉默调节蛋白的化合物给予受试者，以治疗中枢神经系统缺血性病症。有许多中枢神经系统缺血性病症可由本文所述的调节沉默调节蛋白的化合物治疗。在一个实施方案中，缺血性病症为导致任何类型缺血性中枢神经系统损伤，例如凋亡性或坏死性细胞死亡、细胞毒性水肿或中枢神经系统组织缺氧的中风。中风可能影响脑部任何区域，或由任何一般已知会导致中风发生的病因所引起。在该实施方案的另一选择中，中风为脑干中风。在本实施方案的另一选择中，中风为小脑中风。在本实施方案的另一选择中，中风为栓塞性中风(embolic stroke)。在本实施方案的另一选择中，中风为出血性中风。在其它实施方案中，中风为血栓性中风。
在另一方面，可给药调节沉默调节蛋白的化合物，以在中枢神经系统缺血性病症后减少缺血核心的梗塞大小。而且，也可有益地给药调节沉默调节蛋白的化合物，以在中枢神经系统缺血性病症后，减少缺血性半影或过渡区域的大小。
在一个实施方案中，组合药物疗法可包括用于治疗或预防神经变性性病症、或与这些病症有关的继发病症的药物或化合物。因此，组合药物疗法可包括一种或多种沉默调节蛋白的活化剂与一种或多种抗神经变性药物。
血液凝固病症
在其它方面，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防血液凝固病症(或止血病症)。如可交换地用于本文，术语“止血”、“血液凝固”及“血液凝结”是指控制流血，包括血管收缩与凝结的生理特性。血液凝固协助维持哺乳动物在受伤、炎症、疾病、先天缺陷、功能障碍或其它破坏(disruption)后的循环完整性。而且，血块的形成在受伤的情况中不仅限制出血(止血作用)，也可能在动脉粥样硬化疾病方面，因阻塞重要动脉或静脉而导致严重器官损伤及死亡。因此血栓是在错误时间及地点形成的血液凝块。
于是，本发明提供抗凝结与抗血栓治疗，其目的在于抑制血液凝块形成，以预防或治疗血液凝固病症，例如心肌梗塞、中风、因周围动脉疾病导致的肢体损失或肺栓塞。
本文可交换地使用的术语“调制止血”及“调节止血”包括诱导(例如刺激或增加)止血，也包括抑制(例如减低或减少)止血。
在一方面，本发明提供通过给药增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，以减低或抑制受试者中止血的方法。本文所公开的组合物、方法和用途可用于治疗或预防血栓形成疾病。本文使用的术语“血栓形成病症”包括以过量或不希望的凝血或止血活性，或凝固性过高的状态为特征的任何病症或疾病。血栓形成疾病包括涉及血小板粘附与血栓形成的疾病或障碍，且可能显示为形成血栓的可能性增加，例如形成血栓数量增加、在低年龄期出现血栓形成、血栓形成的家族性倾向及在罕见部位出现血栓形成。
在另一个实施方案中，组合药物方案可包括用于治疗或预防血液凝固病症，或与这些病症有关的继发病症的药物或化合物。因此，组合药物方案可包括一种或多种增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物与一种或多种抗凝结或抗血栓形成药物。
体重控制
在另一方面，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防受试者的体重增加或肥胖。例如，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于例如治疗或预防遗传性肥胖症、饮食性肥胖症、激素相关的肥胖症、与给药药物有关的肥胖症，用于减轻受试者体重或减轻或预防受试者体重增加。需要此类治疗的受试者可为其已经肥胖、有可能变成肥胖、过重或有可能变成过重的受试者。可能变成肥胖或过重的受试者，可例如基于家族史、遗传学、饮食、活动程度、药物摄取或其各种组合来确定。
在其它的实施方案中，可将增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物给予患有各种可通过促进受试者的体重减轻而治疗或预防的其它疾病和病症的受试者。此类疾病包括例如高血压、血压过高、高血胆固醇、血脂异常、II型糖尿病、胰岛素抵抗、葡萄糖耐受不良、高胰岛素血症、冠心病、心绞痛、充血性心力衰竭、中风、胆结石、胆囊炎与胆石病、痛风、骨关节炎、阻碍性睡眠呼吸暂停与呼吸问题、一些类型癌症(例如子宫内膜癌、乳腺癌、前列腺癌与结肠癌)、妊娠并发症、女性生殖健康不良(例如月经不规则、不孕、不规则排卵)、膀胱控制问题(例如应激性尿失禁)；尿酸肾石病；精神性病症(例如忧郁、进食障碍病、扭曲的身体意象与自尊降低)。最后，患有AIDS的患者会针对AIDS的组合疗法响应，而发展成脂肪营养障碍或胰岛素抵抗。
在另一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于在体外或体内抑制脂肪形成或脂肪细胞分化。此类方法和用途可用于治疗或预防肥胖症。
在其它实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于减低食欲和/或增加饱食感，因此引起体重减轻或避免体重增加。需要此类治疗的受试者可为已经过重、肥胖的受试者，或有可能变成过重或肥胖的受试者。该方法包含将一定剂量(例如呈丸剂(pill)的形式)每日一次或每二日一次或一周一次给予受试者。该剂量可为“食欲减低剂量”。
在一个示例性的实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，可以以治疗或预防体重增加或肥胖症的组合疗法进行给药。例如，可将一种或多种增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物与一种或多种抗肥胖药组合给药。
在另一个实施方案中，可给药增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，以减低由药物引发的体重增加。例如，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，能够与可以刺激食欲或引起体重增加(尤其是由于除了水滞留以外的因素引起的体重增加)的药物通过组合疗法进行给药。
代谢病症/糖尿病
在另一方面，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防代谢病症，例如胰岛素抵抗、前期糖尿病、II型糖尿病、和/或其并发症。增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物的给药可增加受试者的胰岛素敏感性和/或减低胰岛素水平。需要此类治疗的受试者可为具有胰岛素抵抗或II型糖尿病的其它前驱症状、具有II型糖尿病或有可能发展任何这些病症的受试者。例如，该受试者可为具有胰岛素抵抗，例如具有高胰岛素循环水平和/或相关联病症，例如高血脂症、脂肪生成障碍、高胆固醇血症、葡萄糖耐受不良、高血糖水平、综合征X的其它表现、高血压、动脉粥样硬化及脂肪营养不良的受试者。
在一个示例性的实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可以以治疗或预防代谢障碍的组合疗法进行给药。例如，可将一种或多种增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物与一种或多种抗糖尿病药组合给药。
炎性疾病
在另一方面，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防与炎症有关的疾病或障碍。可于炎症发作前、发作时或发作之后给药增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物。当预防性使用时，所述化合物优选在任何炎症反应或症状之前给药。所述化合物的给药可预防或减弱炎症反应或症状。
在另一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防变态反应及呼吸病症，包括哮喘、支气管炎、肺纤维化、过敏性鼻炎、氧中毒、肺气肿、慢性支气管炎、急性呼吸窘迫综合征及任何慢性阻塞性肺病(COPD)。所述化合物可用于治疗肝炎感染，包括乙型肝炎及丙型肝炎。
此外，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗自身免疫疾病，和/或与自身免疫疾病有关的炎症，例如关节炎，包括类风湿性关节炎、银屑病性关节炎和强直性脊柱炎，以及器官-组织自身免疫疾病(例如雷诺氏综合征(Raynaud's syndrome))、溃疡性结肠炎、克罗恩病、口腔粘膜炎、硬皮病、重症肌无力、移植排斥、内毒素休克、脓毒病、银屑病、湿疹、皮炎、多发性硬化、自身免疫性甲状腺炎、葡萄膜炎、全身性红斑狼疮、阿狄森病(Addison's disease)、自身免疫多腺性疾病(也称为自身免疫多腺性综合征)及格雷夫斯病。
在一些具体实施方案中，一种或多种增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可单独使用，或与用于治疗或预防炎症的其它化合物组合使用。
潮红
另一方面，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于减低作为病症的症状的潮红和/或潮热(hot flash)的发生率或严重性。例如，所述方法包括使用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，单独或与其它药剂组合使用，以减低癌症患者的潮红和/或潮热的发生率或严重性。在其它实施方案中，该方法提供使用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物以减低绝经及绝经后妇女的潮红和/或潮热的发生率或严重性。
另一方面，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用作减低作为另一种药物疗法的副作用的潮红和/或潮热(例如，药物诱发的潮红)的发生率或严重度的疗法。在一些实施方案中，用于治疗和/或预防药物诱发的潮红的方法包括将含有至少一种诱发潮红的化合物与至少一种增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物的制剂给予有需要的患者。在其它实施方案中，用于治疗药物所诱发的潮红的方法包括，分别给药一种或多种诱发潮红的化合物与一种或多种调节沉默调节蛋白的化合物，例如其中调节沉默调节蛋白的化合物与诱发潮红的药物未被配制于同一组合物中。当使用分开的制剂时，可将调节沉默调节蛋白的化合物(1)与诱发潮红的药物同时给药，(2)与诱发潮红的药物一起间歇给药，(3)与诱发潮红的药物错开给药，(4)在诱发潮红的药物给药之前给药，(5)在诱发潮红的药物给药之后给药，及(6)以其各种不同组合进行给药。示例性潮红诱发药物包括例如烟酸、雷洛昔芬(faloxifene)、抗忧郁剂、抗精神病药、化学治疗剂、钙通道阻断剂及抗生素。
在一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于减少血管扩张剂或抗血脂药(包括抗胆固醇血症药物与抗脂肪肝药)的潮红副作用。在一个示例性的实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于减少与给药烟酸有关的潮红。
在另一个实施方案中，本发明提供治疗和/或预防高血脂症并减低潮红副作用的方法。在另一代表性的实施方案中，该方法包括使用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，以减少雷洛昔芬的潮红副作用。在另一代表性的实施方案中，该方法包括使用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，以减少抗忧郁药或抗精神病药的潮红副作用。举例而言，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可与5-羟色胺再吸收抑制剂或5HT2受体拮抗剂共同使用(分开或一起给药)。
在一些实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用作5-羟色胺再吸收抑制剂(SRI)的治疗的一部分以减少潮红。在另一代表性的实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于减少化学治疗剂如环磷酰胺及他莫昔芬的潮红副作用。
在另一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于减少钙通道阻断剂如氨氯地平的潮红副作用。
在另一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于减少抗生素的潮红副作用。例如，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可与左氧氟沙星组合使用。
眼病症
本发明的一方面为用于抑制、减低或治疗视力损伤的方法，该方法通过将治疗剂量的选自本文所公开化合物的沉默调节蛋白的调节剂或其药学上可接受的盐、前药或代谢衍生物给予患者。
在本发明的一些方面，视力损伤是由于对视神经或中枢神经系统的伤害所引起。在具体的实施方案中，视神经伤害由高眼内压(例如由青光眼引起的高眼内压)所引起。在其它具体的实施方案中，视神经伤害由神经肿胀(其往往与感染或免疫(例如自身免疫)反应(如在视神经炎中)有关)所引起。
在本发明的一些方面，视力损伤由视网膜的伤害所引起。在具体的实施方案中，视网膜的伤害由流向眼睛的血流中的障碍(例如，动脉粥样硬化、血管炎)所引起。在具体的实施方案中，视网膜的伤害是由黄斑破坏(disruption of macula)(例如，渗出性或非渗出性黄斑变性)所引起。
示例性视网膜的疾病包括渗出性年龄相关的黄斑变性、非渗出性年龄相关的黄斑变性、视网膜电子假体和RPE移植年龄相关的黄斑变性、急性多病灶板状色素上皮病、急性视网膜坏死、贝斯特病、视网膜分支动脉闭塞、视网膜分支静脉闭塞、癌症关联和相关的自身免疫性视网膜病、视网膜中央动脉阻塞、视网膜中央静脉阻塞、中心性浆液性脉络膜视网膜病变(central serous chorioretinopathy)、伊尔斯病(Eales Disease)、黄斑前膜(epimacular membrane)、点阵变性、巨动脉瘤、糖尿病性黄斑水肿、艾尔温-盖斯黄斑水肿(Irvine-Gass Macular Edema)、黄斑裂孔(macular hole)、视网膜下新血管膜、弥散性单侧亚急性视神经视网膜炎、非假晶状体囊样黄斑水肿(nonpseudophakic cystoid macularedema)、眼假组织胞浆菌病综合征(presumed ocular histoplasmosis syndrome)、渗出性视网膜脱离、手术后视网膜脱离、增殖性视网膜脱离、孔源性视网膜脱离、牵引性视网膜脱离、色素性视网膜炎、CMV视网膜炎、成视网膜细胞瘤、早熟性视网膜病、散弹状视网膜病(birdshot retinopathy)、背景性糖尿病性视网膜病、增殖性糖尿病性视网膜病、血红蛋白病性视网膜病、普尔沙视网膜病(Purtscher Retinopathy)、瓦尔萨尔瓦视网膜病(Valsalva Retinopathy)、青年性视网膜劈裂症(juvenile retinoschisis)、老年性视网膜劈裂症、泰尔松综合征(Terson Syndrome)及白点综合征(white dot syndromes)。
其它示例性疾病包括眼细菌感染(例如，结膜炎、角膜炎、结核病、梅毒、淋病)、病毒感染(例如眼单纯疱疹病毒(ocular herpes simplex Virus)、水痘带状疱疹病毒、巨细胞病毒性视网膜炎、人免疫缺陷病毒(HIV))以及继发于HIV的进行性外部视网膜坏死或其它HIV-关联及其它免疫缺陷-关联性眼疾病。此外，眼疾病包括真菌感染(例如念珠菌性脉络膜炎(Candida choroiditis)、组织胞浆菌病)、原生动物感染(例如弓形体病)及其它疾病例如眼弓蛔虫病与肉样瘤病。
本发明的一方面为用于抑制、减低或治疗以化学治疗药物(例如，神经毒性药物、升高眼内压力的药物例如类固醇)治疗的受试者视力损伤的方法，其通过将治疗剂量的本文所公开的沉默调节蛋白的调节剂给予有此类治疗需要的受试者。
本发明的另一方面为用于抑制、减低或治疗在进行手术(包括眼或其它于俯卧位的手术，例如脊髓手术时)的受试者视力损伤的方法，其通过将治疗剂量的本文所公开的沉默调节蛋白的调节剂给予有此类治疗需要的受试者。眼手术包括白内障、虹膜切开术和晶状体置换。
本发明的另一方面为治疗(包括抑制与预防性治疗)年龄相关的眼疾病，包括白内障、干眼症、年龄相关的黄斑变性(AMD)、视网膜损害等的方法，其通过将治疗剂量的本文所公开的沉默调节蛋白的调节剂给予有此类治疗需要的受试者。
本发明的另一方面为预防或治疗由应激、化学伤害或照射所引起的眼睛损伤的方法，其通过将治疗剂量的本文所公开的沉默调节蛋白的调节剂给予有此类治疗需要的受试者。对眼睛的照射或电磁性损伤可包括由CRT或暴露于阳光或UV所引起的那些损伤。
在一些实施方案中，组合药物方案可包括用于治疗或预防眼病症或与这些病症有关的继发病症的药物或化合物。因此，组合药物方案可包括一种或多种沉默调节蛋白的活化剂与一种或多种用于治疗眼病症的治疗剂。
在一些实施方案中，可将沉默调节蛋白的调节剂与用于减低眼内压的疗法结合进行给药。在另一个实施方案中，可将沉默调节蛋白的调节剂与用于治疗和/或预防青光眼的疗法结合进行给药。在另一实施方案中，可将沉默调节蛋白的调节剂与用于治疗和/或预防视神经炎的疗法结合进行给药。在一些实施方案中，可将沉默调节蛋白的调节剂与用于治疗和/或预防CMV视网膜病的疗法结合进行给药。在另一个实施方案中，可将沉默调节蛋白的调节剂与用于治疗和/或预防多发性硬化的疗法结合进行给药。
线粒体有关的疾病和障碍
在一些实施方案中，本发明提供用于治疗因线粒体活性增加而获益的疾病或障碍的方法和用途。本发明的方法和用途包括将治疗上有效量的调节沉默调节蛋白的化合物给予需要的受试者。线粒体活性增加是指在维持线粒体的总量(例如线粒体的质量)的同时增加线粒体的活性、增加线粒体的数量并因此增加线粒体的活性(例如，通过刺激线粒体的生物生成)，或其组合。在一些实施方案中，因线粒体活性增加而获益的疾病或障碍，包括与线粒体功能障碍有关的疾病或障碍。
在一些实施方案中，用于治疗因线粒体活性增加而获益的疾病或障碍的方法和用途可包括确定患有线粒体功能障碍的受试者。用于诊断线粒体功能障碍的方法和用途可包括分子遗传学、病理学和/或生物化学分析。与线粒体功能障碍有关的疾病或障碍包括这样的疾病和病症，其中线粒体的呼吸链活性不足导致哺乳动物中此类疾病或障碍的病理生理学的发展。因线粒体活性增加而获益的疾病或障碍一般包括例如，由自由基介导的氧化损伤导致的组织变性的疾病、细胞不适当地进行凋亡的疾病，及细胞无法进行凋亡的疾病。
在一些实施方案中，本发明提供用于治疗因线粒体活性增加而获益的疾病或障碍的方法和用途，该方法包括将一种或多种调节沉默调节蛋白的化合物与另一种治疗剂(例如可用于治疗线粒体功能障碍的药剂，或可用于减少与涉及线粒体功能障碍的疾病或障碍有关的症状的药剂)组合给予有需要的受试者。
在示例性的实施方案中，本发明提供用于治疗因线粒体活性增加而获益的疾病或障碍的方法和用途，通过将治疗上有效量的调节沉默调节蛋白的化合物给予受试者。示例性疾病或障碍包括例如神经肌肉病症(例如佛里德赖希共济失调(Friedreich’s Ataxia)、肌营养不良、多发性硬化等)、神经元不稳定性病症(例如癫痫发作、偏头痛等)、发育迟缓、神经变性病症(例如阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩性侧索硬化等)、缺血、肾小管性酸中毒、年龄相关的神经变性与认知衰退、化学疗法疲劳、年龄相关或化学疗法诱发的绝经或月经周期或排卵不规则、线粒体性肌病、线粒体损害(例如钙累积、兴奋性中毒、一氧化氮暴露、缺氧等)及线粒体失调。
肌营养不良指一类涉及肌肉神经组织构造与功能恶化的疾病，其往往导致骨骼肌萎缩及心肌功能障碍，例如杜兴氏肌营养不良(Duchenne muscular dystrophy)。在一些实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物可用于减低肌肉功能能力的衰退速率，及用于增强患有肌营养不良患者肌肉的功能状态。
在一些实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗线粒体性肌病。线粒体性肌病范围从外眼部肌肉的轻微缓慢进行性衰弱，到严重致命的婴儿期肌病与多系统脑肌病(encephalomyopathy)。一些综合征已经确定，它们之间有些重叠。影响肌肉的已确立的综合征包括进行性外眼肌麻痹、卡-塞综合征(Kearns-Sayre syndrome)(具有眼肌麻痹、色素性视网膜病、心脏传导缺陷、小脑共济失调与感觉神经性耳聋)、MELAS综合征(线粒体性脑肌病、乳酸性酸中毒与中风样发作(stroke-like episodes))、MERFF综合征(肌阵挛型癫痫、不整齐的红纤维(ragged red fibers))、肢带分配衰弱(limb-girdle distributionweakness)及婴儿肌病(良性、重度与致死)。
在一些实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗遭受线粒体的毒性损害，例如由于钙累积、兴奋性中毒、一氧化氮暴露、药物诱导的毒性损害或缺氧引起的毒性损害的患者。
在一些实施方案中，调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗与线粒体失调有关的疾病或障碍。
肌肉性能
在其它实施方案中，本发明提供用于增强肌肉性能的方法和用途，其通过给药治疗上有效量的调节沉默调节蛋白的化合物。例如，调节沉默调节蛋白的化合物可用于改善身体耐久力(例如，进行身体工作例如运动、体力劳动、运动活动等)、抑制或延迟身体疲劳、增加血液氧水平、增进健康个体的能量、加强工作能力与持久性、减少肌肉疲劳、减低压力、增强心脏与心血管功能、改善性能力、增加肌肉ATP水平和/或减少血液中的乳酸。在一些实施方案中，该方法和用途包括给药一定量的增加线粒体活性、增进线粒体的生物生成和/或增加线粒体质量的调节沉默调节蛋白的化合物。
运动性能是指运动员的肌肉在参与运动活动时所呈现的能力。所增强的运动效能、强度、速度及持久力，是通过肌肉收缩强度的增加、肌肉收缩幅度的增加、在刺激与收缩之间的肌肉反应时间的缩短而进行测量。运动员指以任何程度参与运动，以及寻求能在其机能上达到增进强度、速度与耐久力水平的个人，例如健身者(body builder)、自行车运动员、长跑运动员、短跑运动员等。所增强的运动效能由能克服肌肉疲劳的能力、保持较长时间活力的能力及具有更有效锻炼的能力显示。
在运动员肌肉性能的情况下，期望产生允许在长期较高耐性水平下进行比赛或训练的状况。
预期本发明的方法和用途在治疗肌肉相关的病理病症方面也是有效的，包括急性肌肉减少症(acute sarcopenia)，例如肌肉萎缩和/或与烧伤、卧床、肢体固定术或胸部、腹部和/或整形外科大手术有关的恶病质。
在一些实施方案中，本发明提供包含沉默调节蛋白的调节剂的新型膳食组合物，其制备方法及使用该组合物以改善运动效能的方法。于是，本发明向参与广泛定义的运动，包括需要耐力的运动与需要重复性肌肉运动的劳动的人们提供具有改善身体耐力和/或抑制身体疲劳的作用的治疗性组合物、食品与饮料。此类膳食组合物可另外包含电解质、咖啡因、维生素、碳水化合物等。
其它用途
增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于治疗或预防病毒感染(例如流感病毒、疱疹病毒或乳头状瘤病毒感染)或作为抗真菌剂。在一些实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，可以作为组合药物疗法的一部分与另一种用于治疗病毒性疾病的治疗剂一起给药。在另一个实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，可作为组合药物疗法的一部分与另一种抗真菌剂一起给药。
可如本文所述进行治疗的受试者包括真核生物，例如哺乳动物例如人、羊类、牛类、马类、猪类、犬类、猫类、非人灵长类、小鼠及大鼠。可处理的细胞包括真核细胞，例如得自前述受试者的细胞，或植物细胞、酵母细胞及原核细胞例如细菌细胞。例如，可将调节性化合物给予农场动物，以改善其能更长期承受农场条件的能力。
增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物也可用于增加植物寿命、应激抗性及对于细胞凋亡的抗性。在一个实施方案中，将化合物施予植物(例如周期性)，或施予真菌。在另一些实施方案中，植物经遗传修饰以产生化合物。在另一个实施方案中，将植物与果实在采收与运送前先以化合物处理，以增加在运送期间对于损伤的抗性。也可将植物种子与本文所述的化合物接触，以例如使其得以保存。
在其它实施方案中，增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可用于调节酵母细胞的寿命。其中希望延长酵母细胞寿命的情况包括其中使用酵母的任何工艺过程，例如啤酒、酸奶与烘焙物品(例如面包)的制备。使用具有延长寿命的酵母，可以使用更少酵母，或使酵母具有活性的时间更长。也可将用于重组制备蛋白的酵母或其它哺乳动物细胞进行如本文所述的处理。
增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物也可用于增加昆虫寿命、应激抗性及对于细胞凋亡的抗性。在此实施方案中，化合物将被施用至有用的昆虫，例如蜜蜂及其它涉及植物授粉的昆虫。在一个具体的实施方案中，化合物将被施用至涉及生产蜂蜜的蜜蜂。一般而言，本文所述的方法和用途可应用至任何生物体，例如具有商业重要性的真核生物。例如，可将本文所述的化合物应用至鱼类(水产养殖)及禽类(例如鸡与飞禽)。
也可使用较高剂量的增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物作为杀虫剂，这是通过干扰发育期间沉默基因的调节以及细胞凋亡的调节进行的。在该实施方案中，可通过本领域已知的方法将所述化合物施用至植物，并确保所述化合物对于昆虫幼虫(且不是对于植物)为生物可利用的。
至少就生殖与寿命间的联系的观点而言，可施用增加沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物，来影响诸如昆虫、动物及微生物等生物体的生殖。
其他实施方案
在一个方面，本发明涉及在细胞中增加沉默调节蛋白-1活性的方法，包括使细胞分别与式(I)化合物或其药学上可接受的盐或其相应的药物组合物接触的步骤。
在一个方面，本发明涉及治疗胰岛素抵抗、代谢综合征、糖尿病或它们的并发症或增加胰岛素敏感性的方法，包括向有此需要的受试者分别给予化合物或其药学上可接受的盐或其相应的药物组合物。
在一个方面，本发明涉及治疗代谢功能障碍的方法，包括向有此需要的受试者分别给予化合物或其药学上可接受的盐或其相应的药物组合物。
在一个方面，本发明涉及治疗由SIRT1表达或活性减少引起的疾病或障碍的方法，其包括包括向有此需要的受试者分别给予化合物或其药学上可接受的盐或其相应的药物组合物。
在一个方面，本发明涉及一种方法，其中由SIRT1表达或活性减少引起的疾病或障碍选自但不限于，衰老或应激、糖尿病、代谢功能障碍、神经变性疾病、心血管疾病、癌症或炎性疾病。
在一个方面，本发明涉及一种方法，其中与衰老或应激有关的疾病、糖尿病、代谢功能障碍、神经变性疾病、心血管疾病、癌症或炎性疾病选自银屑病、特应性皮炎、痤疮、酒渣鼻、炎性肠病、骨质疏松症、败血症、关节炎、COPD、系统性红斑狼疮和眼科炎症。
在一个方面，本发明涉及种方法，其中与衰老或应激有关的疾病、糖尿病、代谢功能障碍、神经变性疾病、心血管疾病、癌症或炎性疾病选自银屑病、特应性皮炎、痤疮、酒渣鼻、炎性肠病、骨质疏松症、败血症、关节炎、COPD、系统性红斑狼疮和眼科炎症。
在一个方面，本发明涉及治疗银屑病的方法，其包括向有此需要的受试者分别给予化合物或其药学上可接受的盐或其相应的药物组合物。
在一个方面，本发明涉及分别给予化合物或其药学上可接受的盐或其相应的药物组合物，用在疗法中，用于治疗患有或易患胰岛素抵抗、代谢综合征、糖尿病或它们的并发症的受试者或用于在受试者中增加胰岛素敏感性。
在一个方面，本发明涉及分别给予化合物或其药学上可接受的盐或其相应的药物组合物在制备用于治疗胰岛素抵抗、代谢综合征、糖尿病或它们的并发症或用于在受试者中增加胰岛素敏感性的药物中的用途。
测定
在本文中所涵盖的其它方法和用途包括用于鉴定调节沉默调节蛋白的化合物或药物的筛选方法。试剂可为核酸，例如适体(aptamer)。测定可以基于细胞或不含细胞的形式进行。例如，测定可包含在沉默调节蛋白可被已知调节沉默调节蛋白的试剂所调节的条件下，将沉默调节蛋白与测试试剂孵育(或接触)，并相对于缺乏测试试剂，在该测试试剂存在下监控或测定沉默调节蛋白的调节水平。沉默调节蛋白的调节水平可通过测定其将底物脱乙酰基化的能力而确定。示例性底物为可购自BIOMOL(Plymouth Meeting，PA)的乙酰化肽类。优选底物包括p53的肽类，例如那些包含乙酰化K382的肽类。尤其优选的底物为Fluorde Lys-SIRT1(BIOMOL)，即乙酰化肽Arg-His-Lys-Lys。其它底物为得自人组蛋白H3与H4的肽类或乙酰化氨基酸。底物可为荧光的(fluorogenic)。所述沉默调节蛋白可为SIRT1、Sir2、SIRT3或其部分。例如，重组SIRT1可得自BIOMOL。反应可进行约30分钟，并例如以烟酰胺终止。可使用HDAC荧光活性测定/药物发现试剂盒(drug discovery kit)(AK-500，BIOMOL Research Laboratories)测定乙酰化水平。类似的测定描述于Bitterman等人(2002)J.Biol.Chem.277：45099中。可将测定中的沉默调节蛋白的调节水平与在一种或多种(分开或同时)本文所述化合物(其可作为阳性或阴性对照组)存在下的沉默调节蛋白的调节水平进行比较。用于测定的沉默调节蛋白可为全长沉默调节蛋白或其部分。因为在本文中已显示活化化合物表现出与SIRT1的N-末端作用，故用于所述测定的蛋白包括沉默调节蛋白的N-末端部分，例如SIRT1的大致为氨基酸1-176或1-255；Sir2的大致为氨基酸1-174或1-252部分。
在一个实施方案中，筛选测定包括(i)在适合在无测试试剂存在下沉默调节蛋白将底物脱乙酰化的条件下，使沉默调节蛋白与测试试剂与乙酰化底物接触；及(ii)测定底物的乙酰化水平，其中在该测试试剂存在下底物的乙酰化程度相对于无该测试试剂存在下较低则表示：该测试试剂刺激由沉默调节蛋白进行的脱乙酰化作用，而在该测试试剂存在下底物的乙酰化程度相对于无该测试试剂存在下较高则表示：该测试试剂抑制由沉默调节蛋白进行的脱乙酰化作用。
在另一实施方案中，该筛选测定可检测沉默调节蛋白介导的NAD依赖性脱乙酰化的2’/3’-O-乙酰基-ADP-核糖产物的形成。该O-乙酰基-ADP-核糖产物以与沉默调节蛋白脱乙酰化反应的脱乙酰化肽产物等摩尔量形成。相应地，该筛选测定可包括(i)在适合在无测试试剂存在下沉默调节蛋白将底物脱乙酰化的条件下，使沉默调节蛋白与测试试剂及乙酰化底物接触；及(ii)测定O-乙酰基-ADP-核糖形成的量，其中O-乙酰基-ADP-核糖形成在测试试剂存在下相对于不存在该测试试剂时的量增加则表示：该测试试剂刺激由沉默调节蛋白进行的脱乙酰化作用，而O-乙酰基-ADP-核糖形成在测试试剂存在下相对于不存在该测试试剂时的量降低则表示：该测试试剂抑制由沉默调节蛋白进行的脱乙酰化作用。
用于鉴定于体内调节(例如刺激)沉默调节蛋白的试剂的方法和用途可包括(i)在I类与II类HDAC的抑制剂存在下，在适合沉默调节蛋白在无测试试剂存在下将底物脱乙酰化的条件下，使细胞与测试试剂及能够进入细胞的底物接触；及(ii)测定底物的乙酰化水平，其中在该测试试剂存在下底物的乙酰化水平相对于无该测试试剂存在下较低则表示：该测试试剂刺激由沉默调节蛋白进行的脱乙酰化作用，而在该测试试剂存在下底物的乙酰化水平相对于无该测试试剂存在下较高则表示：该测试试剂抑制由沉默调节蛋白进行的脱乙酰化作用。优选底物为乙酰化肽，其也优选为荧光的，如本文中进一步描述的。该方法可进一步包含将细胞裂解(lysing)，以测定底物的乙酰化程度。可将底物以范围介于约1μM至约10mM，优选地约10μM至1mM，甚至更优选约100μM至1mM，例如约200μM的浓度加至细胞中。优选底物为乙酰化赖氨酸，例如ε-乙酰基赖氨酸(Fluor de Lys，FdL)或Fluor de Lys-SIRT1。I类与II类HDAC的优选抑制剂为曲古抑菌素A(trichostatin A)(TSA)，其可以范围介于约0.01μM至100μM，优选约0.1μM至10μM，例如1μM的浓度使用。细胞与测试化合物及底物的孵育可进行约10分钟至5小时，优选约1-3小时。因为TSA抑制所有I类与II类HDAC，且一些底物例如Fluor de Lys对于SIRT2为较差的底物，对于SIRT3-7为甚至更差的底物，故此类测定可用于鉴定体内SIRT1的调节剂。
在疗法中的方法和用途
本发明还涉及使用如本文定义的沉默调节蛋白调节剂化合物治疗和/或预防宽范围的多种疾病和障碍的方法和用途，所述疾病和障碍包括但不限于，例如，与衰老或应激反应有关的疾病或障碍、糖尿病、肥胖症、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固障碍、炎症、癌症和/或潮红，以及受益于线粒体的活性增加的疾病或障碍，所述疾病和障碍还可选自或包括但不限于银屑病、特应性皮炎、痤疮、酒渣鼻、炎性肠病、骨质疏松症、败血症、关节炎、COPD、系统性红斑狼疮和眼科炎症。
在另一方面，本发明提供了使用调节沉默调节蛋白的化合物或包含调节沉默调节蛋白的化合物的组合物的方法和用途。在某些实施方案中，提高沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可以用于各种治疗应用，包括，例如，增加细胞寿命，治疗和/或预防宽范围的多种疾病和病症，包括，例如，与衰老或应激反应有关的疾病或障碍，糖尿病，肥胖症，神经变性疾病，化学疗法诱导的神经病，与缺血事件有关的神经病，眼睛疾病和/或病症，心血管疾病，血液凝固病症，炎症，和/或潮红，等等。提高沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物也可以用于治疗患者的受益于线粒体活性增加的疾病或障碍，用于增强肌肉性能，用于提高肌肉ATP水平，或用于治疗或预防与缺氧或缺血有关的肌肉组织损伤。在其它实施方案中，降低沉默调节蛋白的水平和/或活性的调节沉默调节蛋白的化合物可以用于各种治疗应用，包括，例如，提高细胞对应激反应的敏感性，增加细胞凋亡，治疗癌症，刺激食欲，和/或刺激体重增加，等等。如下面进一步所描述，所述方法和用途包括向有此需要的受试者给药药学上有效量的调节沉默调节蛋白的化合物。
在一些方面，所述调节沉默调节蛋白的化合物可单独给药与其他化合物组合给药，所述其他化合物包括其他调节沉默调节蛋白的化合物或其他治疗剂。
在另一方面，本发明涉及增加细胞中沉默调节蛋白-1活性的方法，其包括使细胞接触本发明的式(I)至(IV)的化合物，其相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)的步骤。
在另一方面，本发明涉及增加细胞中沉默调节蛋白-1活性的方法，包括使细胞接触本文定义的本发明的药物组合物的步骤。
在另一方面，本发明涉及治疗胰岛素抵抗、代谢综合征、糖尿病或它们的并发症或增加胰岛素敏感性的方法，其包括向有此需要的受试者给予本发明的式(I)至(IV)的化合物、其相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)的步骤。
在另一方面，本发明涉及治疗患有或易患胰岛素抵抗、代谢综合征、糖尿病或它们的并发症的受试者或用于在受试者中增加胰岛素敏感性的方法，包括将本发明的药物组合物给予有此需要的受试者.
在另一方面，本发明涉及治疗胰岛素抵抗、代谢综合征、糖尿病或它们的并发症或增加胰岛素敏感性的方法，包括将本发明的药物组合物给予有此需要的受试者。
在另一方面，本发明涉及增加细胞中沉默调节蛋白-1活性的方法，其包括使细胞接触本发明的式(I)至(IV)的化合物，其相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)或其药学上可接受的盐的步骤。
在另一方面，本发明涉及增加细胞中沉默调节蛋白-1活性的方法，其包括使细胞接触本发明的药物组合物的步骤。
在另一方面，本发明涉及治疗代谢功能障碍的方法，其包括向有此需要的受试者给予式(I)至(IV)的化合物、其相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)或其药学上可接受的盐的步骤。
在另一方面，本发明涉及治疗代谢功能障碍的方法，包括将本发明的药物组合物给予有此需要的受试者。
在另一方面，本发明涉及治疗由SIRT1表达或活性减少引起的疾病或障碍的方法，其包括向有此需要的受试者给予式(I)至(IV)的化合物，其相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)或其药学上可接受的盐。
在另一方面，本发明涉及一种方法，其中所述由SIRT1表达或活性减少引起的疾病或障碍选自但不限于，衰老或应激、糖尿病、代谢功能障碍、神经变性疾病、心血管疾病、癌症或炎性疾病。
在另一方面，本发明涉及一种方法，其中所述与衰老或应激有关的疾病、糖尿病、代谢功能障碍、神经变性疾病、心血管疾病、癌症或炎性疾病选自银屑病、特应性皮炎、痤疮、酒渣鼻、炎性肠病、骨质疏松症、败血症、关节炎、COPD、系统性红斑狼疮和眼科炎症。
在另一方面，本发明涉及治疗银屑病的方法，其包括向有此需要的受试者给予式(I)至(V)的化合物，其相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)或其药学上可接受的盐。
在另一方面，本发明涉及治疗银屑病的方法，其包括向有此需要的受试者给予本发明的药物组合物。
药物组合物和制剂
通常，本发明涉及式(I)至(V)的取代的桥连脲类似物化合物、其相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)，或其药学上可接受的盐，相应的药物组合物，制备所述化合物的方法，以及所述化合物单独或与其他治疗剂组合作为沉默调节蛋白调节剂用于以下的用途：提高细胞寿命，以及治疗和/或预防宽范围的多种疾病和障碍，所述疾病和障碍包括但不限于，例如，与衰老或应激反应有关的疾病或障碍、糖尿病、肥胖症、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固障碍、炎症、癌症和/或潮红，以及受益于线粒体的活性增加的疾病或障碍。
具体地，本发明涉及式(I)至(V)的新化合物，其相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)或其药学上可接受的盐，和分别包含式(I)至(V)的化合物的相应的药物组合物。
在另一方面，本发明涉及药物组合物，其包含药学上可接受的载体或稀释剂和式(I)至(V)的化合物，其相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)或其药学上可接受的盐。
在另一方面，本发明涉及本发明的药物组合物，其还包含其他活性剂。
在另一方面，本发明涉及药物组合物，其包式(I)至(V)的化合物，其相应的类似物或衍生物(即，在R2位置具有氢取代的类似物)或其药学上可接受的盐和至少一种药学上可接受的载体。
本文所述的化合物可以通过常规方法，使用一种或多种生理学上或药学上可接受的载体或赋形剂配制。例如，化合物及其药学上可接受的盐与溶剂合物可配制成用于通过例如注射(例如SubQ、IM、IP)、吸入或吹入(通过口或鼻)或口服、含服、舌下、经皮、鼻、肠胃外或直肠给药的制剂。在一些实施方案中，所述化合物可局部地，在标靶细胞存在的部位，即在特定组织、器官或体液(例如血液、脑脊髓液等)中进行给药。
化合物可配制成用于各种给药方式，包括全身及局部或区域性给药的制剂。技术与制剂一般可见于Remington’s Pharmaceutical Sciences，Meade Publishing Co.，Easton，PA。对于肠胃外给药，以注射为优选，包括肌肉内、静脉内、腹膜内及皮下。对于注射，可将所述化合物配制成液态溶液，优选用生理学上相容的缓冲液，例如汉克氏溶液或林格氏溶液。此外可将所述化合物配制成固体形式，并于使用前立即再溶解或悬浮。也可包括冷冻干燥形式。
对于口服给药，药物组合物可采用例如通过常规方法，用药学上可接受的赋形剂例如粘合剂(例如，预凝胶化的玉米淀粉、聚乙烯基吡咯烷酮或羟丙基甲基纤维素)；填充剂(例如乳糖、微晶纤维素或磷酸氢钙)；润滑剂(例如硬脂酸镁、滑石或硅石)；崩解剂(例如马铃薯淀粉或淀粉羟基乙酸钠)；或湿润剂(例如月桂基硫酸钠)制备的片剂、锭剂或胶囊的形式。片剂可通过本领域已熟知的方法包衣。用于口服给药的液体制剂可采用例如溶液、糖浆或悬浮液的形式，或它们可制成干燥产物，在使用前以水或其它适宜载体构造。此类液体制剂可通过常规方法，用药学上可接受的添加剂例如悬浮剂(例如，山梨糖醇糖浆、纤维素衍生物或氢化食用脂类)；乳化剂(例如卵磷脂或阿拉伯胶)；非水媒介物(例如扁桃油、酯油类、乙醇或分级植物油)；及防腐剂(例如对-羟基苯甲酸甲基酯或对-羟基苯甲酸酯丙基酯或山梨酸)制备。如果适当，该制剂也可含有缓冲盐、调味剂、着色剂与甜味剂。用于口服给药的制剂可适宜地配制，以使活性化合物受控地释放。
对于通过吸入(例如肺递送)给药，可方便地将化合物以气溶胶喷雾制剂形式从经加压包装或喷雾器中提供来递送，其中使用适宜的推进剂例如二氯二氟甲烷、三氯氟甲烷、二氯四氟乙烷、二氧化碳或其它适合气体。在经加压气溶胶的情况下，剂量单位可通过提供用于递送已计量的量的阀来确定。可配制用于吸入器或吹入器的例如明胶胶囊或药筒(cartridge)，其含所述有化合物与适宜粉末基质例如乳糖或淀粉的粉末混合物。
化合物可经配制成用于通过注射(例如通过推注或持续输注)肠胃外给药。用于注射的配制剂可以单位剂量形式提供，例如，以安瓿或多剂量容器(添加防腐剂)提供。组合物可采用诸如在油性或含水媒介物中的悬浮液、溶液或乳液的形式，且可含有配制剂，例如悬浮剂、稳定剂和/或分散剂。或者，活性成分可以是粉末形式，在使用前可以用适宜媒介物，例如灭菌无热源水构造。
所述化合物也可配制成直肠组合物，例如栓剂或保留灌肠剂，例如含有常规的栓剂基质如可可脂或其它甘油酯类。
除了先前所述的制剂外，化合物也可配制成储库制剂(depot preparation)。此类储库制剂可通过植入(例如以皮下或肌肉内)，或经由肌肉内注射给药。因此，例如，可将化合物用适宜的聚合或疏水性材料(例如在可接受油中的乳液)或离子交换树脂配制，或呈微溶性衍生物形式，例如呈微溶性盐形式。受控释放制剂也包括贴剂。
在一些实施方案中，本文所述的化合物可配制成用于递送至中枢神经系统(CNS)(见综述，Begley，Pharmacology&Therapeutics 104：29-45(2004))。用于药物递送至CNS的常规方法包括：神经外科策略(例如脑内注射或脑室内输注)；试剂的分子操作(例如生成包含与药剂组合的转运肽的嵌合融合蛋白，所述转运肽对内皮细胞表面分子具有亲合力，而所述药剂本身不能穿越BBB)，以尝试开发BBB的内源性运送途径之一；设计用于增加试剂的脂溶度的药理策略(例如，将水溶性试剂缀合(conjugation)至脂质或胆固醇载体)；及通过高渗破坏短暂破坏BBB完整性(源自将甘露糖醇溶液输注入颈动脉中或使用生物活性剂例如血管紧张肽)。
脂质体为另一种容易可注射的药物递送系统。于是，在本发明方法中也可将活性化合物以脂质体递送系统的形式给药。脂质体为本领域熟练技术人员已熟知的。脂质体可由各种磷脂例如胆固醇、磷酯酰胆碱类的硬脂胺形成。可用于本发明方法的脂质体包含所有类型脂质体，包括但不限定于小单层囊泡、大单层囊泡及多层囊泡。
另一种制备本文所述的化合物的制剂(尤其是溶液)的方法是通过使用环糊精。环糊精是指α-、β-或γ-环糊精。环糊精详细描述于Pitha等人，U.S专利4,727,064中。环糊精为葡萄糖的环状寡聚物；这些化合物与任何药物形成包合复合物(inclusion complex)，所述药物的分子能适配于环糊精分子的亲脂搜寻空腔(lipophile-seeking cavity)中。
快速崩解或溶解剂型可用于医药活性剂的快速吸收，尤其是含服与舌下吸收。快速溶解(fast melt)剂型对具有吞咽常见的固体剂型例如囊片(caplet)与片剂困难的患者(例如老年人及幼儿患者)有益。此外，快速溶解剂型克服了与例如咀嚼剂型有关的缺点，其中活性剂在患者口中保持的时间长度在确定味觉掩盖量及患者可能感受到活性剂的喉咙粗砂质感的程度方面起重要作用。
药物组合物(包括化妆品制剂)可包含约0.00001％至100％，例如0.001至10％或0.1％至5％(按重量计)的一种或多种本文所述的化合物。在其他实施方案中，该药物组合物包含：(i)0.05至1000mg的本发明的化合物或其药学上可接受的盐，和(ii)0.1至2克的一种或多种药学上可接受的赋形剂。
在一些实施方案中，将本文所述的化合物混入含有一般适用于局部药物给药的局部给药载体且包含本领域已知的任何此类物质的局部制剂中。可选择局部给药载体以使组合物呈所希望的形式，例如呈软膏、洗剂、乳膏、微乳剂、凝胶、油、溶液等，且其可由天然存在或合成来源的材料组成。优选所选择的载体不会有害地影响活性剂或局部制剂的其它组分。用于本文的适宜局部给药载体实例包括水、醇类及其它无毒性有机溶剂、甘油、矿物油、硅酮、凡士林、羊毛脂、脂肪酸、植物油、对羟基苯甲酸酯、蜡类等。
制剂可为无色无味的软膏、洗剂、乳膏、微乳剂及凝胶。
所述化合物可混入一般为半固体制剂的软膏中，其通常以凡士林或其它石油衍生物为基质。所使用的本领域技术人员所了解的具体软膏基质是能够提供最佳药物递送，且优选可提供其它所希望特征以及例如软化性或类似特性的基质。与其它载体或赋形剂一样，软膏基质应为惰性、稳定、无刺激性且非致敏性的。
所述化合物可混入洗剂中，其一般为要无摩擦施用于皮肤表面的制剂，且通常为其中固体颗粒(包括活性剂)存在于水或醇类基质中的液态或半液态制剂。洗剂通常为固体的悬浮液，且可包括水包油型的液体油性乳液。
所述化合物可混入乳膏中，其一般为粘稠性液体或半固态乳液，为水包油或油包水型。乳剂基质为可水洗的，且含有油相、乳化剂与水相。油相一般由凡士林与脂肪醇(例如鲸蜡醇或硬脂醇)所组成；水相通常(虽然不必然)在体积上超过油相，且一般含有湿润剂。乳膏制剂中的乳化剂如于前述Reminton的文献中所说明的，一般为非离子型、阴离子型、阳离子型或两性表面活性剂。
所述化合物可混入微乳剂中，其一般为两种不相混溶的液体(例如油与水)经由表面活性剂分子的界面膜稳定化的热动力学上稳定、各向同性的澄清的分散体(Encyclopedia of Pharmaceutical Technology(New York：Marcel Dekker，1992)，第9卷)。
所述化合物可混入凝胶制剂中，其一般为半固体系统，该半固体系统由小的无机粒子组成的悬浮液(二相系统)组成，或由基本上均匀分布于整个载体液体(单相凝胶)中的大的有机分子所组成。虽然凝胶一般使用含水载体液体，也可使用醇类与油类作为载体液体。
在制剂中也可包括其它活性剂，例如其它消炎剂、镇痛剂、抗微生物剂、抗真菌剂、抗生素、维生素、抗氧化剂及一般存在于防晒制剂中的阳光阻断剂，包括但不限定于邻氨基苯甲酸酯、二苯甲酮(尤其是二苯甲酮-3)、樟脑衍生物、肉桂酸酯(例如甲氧基肉桂酸辛酯)、二苯甲酰基甲烷(例如丁基甲氧基二苯甲酰基甲烷)、对-氨基苯甲酸(PABA)及其衍生物，及水杨酸酯(例如水杨酸辛酯)。
在一些局部制剂中，活性剂以该制剂的大约0.25重量％至75重量％，优选地为该制剂的大约0.25重量％至30重量％，更优选地为该制剂的大约0.5重量％至15重量％，且最优选地为该制剂的大约1.0重量％至10重量％范围的量存在。
眼疾病可通过例如全身性、局部、眼内注射化合物，或通过嵌入可释放化合物的持续释放装置而治疗或预防。可将化合物在药学上可接受的眼媒介物中进行递送，以使所述化合物能保持与眼表面接触足够的时间以让所述化合物穿透角膜与眼睛的内部区域，例如前室、后室、玻璃体、房水、玻璃体液、角膜、虹膜/睫状体(ciliary)、晶状体、脉络膜/视网膜及巩膜。药学上可接受的眼媒介物可例如为软膏、植物油或包封材料。另一方面，可将本发明化合物直接注射入玻璃体液与房水中。在另一选择中，所述化合物可全身性给药(例如通过静脉内输注或注射)用于眼的治疗。
本文所述的化合物可储存于无氧环境中。例如，可将组合物配制于供口服给药的密封胶囊中，例如购自Pfizer，Inc.的Capsugel。
可将用例如本文中所述的化合物体外处理的细胞根据用于将移植物给药于患者的方法进行给药，其可伴随例如给药免疫抑制药物例如环孢菌素A。关于药物配制的一般原理，读者可参考Cell Therapy：Stem Cell Transplantation，Gene Therapyand CellularImmunotherapy，G.Morstyn和W.Sheridan编，Cambridge University Press，1996；及Hematopoietic Stem Cell Therapy，E.D.Ball，J.Lister和P.Law，ChurchillLivingstone，2000。
化合物的毒性与治疗功效可通过在细胞培养物或实验动物中用标准药学方法测定。LD50为使50％群体致死的剂量。ED50为对于50％群体治疗上有效的剂量。毒性与治疗功效间的剂量比值(LD50/ED50)为治疗指数。优选具有高治疗指数的化合物。虽然可使用具有毒副作用的化合物，但应小心设计将此类化合物靶向至受感染组织位置的递送系统，以使得可以将对于未受感染细胞可能的伤害减至最低，并由此减少副作用。
得自细胞培养试验及动物研究的数据可用于配制在人中使用的剂量范围。此类化合物的剂量可在其包括具有非常小毒性或无毒性的ED50值的循环浓度范围内。该剂量可在此范围内根据所使用的剂型及所利用的给药途径而有所变化。对于任何化合物，可最初由细胞培养试验评估治疗上有效的剂量。可用动物模型调配剂量，以达到包括如在细胞培养中所测定的IC50值(即，达到对症状的半数最大抑制作用的测试化合物浓度)的循环血浆浓度范围。此类信息可用于更准确地测定对人的有效剂量。可例如通过高效液相色谱法测量血浆中的浓度。
试剂盒
本发明也提供试剂盒，例如用于治疗目的试剂盒，或用于调节细胞寿命或调节细胞凋亡的试剂盒。试剂盒可包括一种或多种例如以预先测量的剂量的本文中所述的化合物。试剂盒可任选地包括用于将细胞与所述化合物接触的装置及使用说明书。该装置包括注射器、支架及其它用于将化合物引入到患者(例如患者的血管)中或将其涂覆于患者皮肤的装置。
在另一个实施方案中，本发明提供一种组合物，其包含本发明的化合物与另一种治疗剂(与用于组合疗法及联合组合物中的那些相同的治疗剂)，它们存在于独立的剂型中但彼此互相关联。本文使用的术语“互相关联”是指，将独立的剂型包装在一起，或者相互依附，从而使得可以容易地明白这些独立的剂型欲被销售且欲作为相同方案的一部分给药。优选将所述化合物和其他药剂一起包装于泡罩包装或其它多室包装中，或作为可由使用者自行分开(例如，通过在两个容器间的刻划线处撕开)的连结的、分开密封的容器(例如锡箔小袋等)。
在另一个实施方案中，本发明提供试剂盒，其在独立的容器中包含a)本发明的化合物；及b)另一种治疗剂，例如那些描述于说明书其它部分的治疗剂。
除非另有说明，本发明方法的实施将利用本领域普通技术人员所知的细胞生物学、细胞培养、分子生物学、转基因生物学、微生物学、重组DNA及免疫学的常规技术。这些技术在文献中有详尽的解释。参见，例如：Molecular Cloning ALaboratorymanual，第2版，Sambrook、Fritsch和Maniatis编著(Cold Sp Spring Harbor Laboratory Press：1989)；DNA Cloning，第I与II卷(D.N.Glover编著，1985)；Oligonucleotide Synthesis(M.J.Gait编著，1984)；Mullis等人美国专利：4,683,195；Nucleic Acid Hybridization(B.D.Hames&S.J.Higgins编著1984)；Transcription And Translation(B.D.Hames&S.J.Higgins编著，1984)；Culture of Animal Cells(R.I.Freshney，Alan R.Liss，Inc.，1987)；ImmobilizedCells And Enzymes(IRLPress，1986)；B.Perbal，Practical Guide To MolecularCloning(1984)；专题论文，Methods In Enzymology(Academic Press，Inc.，N.Y.)；GeneTransfer Vectors For Mammalian Cells(J.H.Millerh和M.P.Calos编著，1987，ColdSpring Harbor Laboratory)；Methods In Enzymology，卷154和155(Wu等人编著)，Immunochemical Methods In Cell And Molecular Biology(Mayer和Walker编著，Academic Press，London，1987)；Handbook of Experimental Immunology，卷I-IV(D.M.Weir和C.C.Blackwell编著，1986)；Manipulating the Mouse Embryo(Cold SpringHarbor Laboratory Press，Cold Spring Harbor，N.Y.，1986)。
以下示出的实施例是对本发明的说明，并非意欲以任何方式限制本发明的范围。
实施例
以下示出的实施例是对本发明的说明，并非意欲以任何方式限制本发明的范围，而是为本领域技术人员制备和使用本发明的化合物，组合物和方法或用途提供指导。
虽然描述了本发明的特定实施例，但是本领域技术人员将理解，在不脱离本发明的精神和范围的情况下，可以进行各种改变和修改。
如本文在所述方法，方案和实施例中使用的符号和惯例与当代科学文献(例如Journal of the American Chemical Society or the Journal of BiologicalChemistry)中使用的符号和惯例一致。通常使用标准单字母或三个字母的缩写来表示氨基酸残基，除非另有说明，否则这些缩写被假设是L-构型。除非另有说明，所有起始原料均由商业供应商获得，不经进一步纯化即可使用。
所有提及醚的是乙醚；盐水是指NaCl的饱和水溶液。除非另有说明，所有温度均以℃(摄氏度)表示。除非另有说明，否则所有反应均在惰性气氛下在室温下进行，除非另有说明，所有溶剂均为可得的最高纯度。
使用的设备
具有PDA的LCMS:
Waters Allaince2695-2996/Quattromicro
Agilent-1200/SQD
具有UV检测器的制备型LC(制备型HPLC):
Waters-2545/2998PDA和2487UV
Shimadzu–LC-20AP/20AV-UV
Gilson-333,334/115-UV
手性HPLC:
Waters Alliance-2695/2998&2996
SFC纯化系统:
Thar-SFC-80
Waters SFC–200
NMR(400MHz):
Varian-400MHz
使用2014ACD实验室软件生成1H-NMR图。
在Varian-400MHz光谱仪上记录1H NMR(以下也称为“NMR”)光谱。化学位移以百万分之一(ppm，δ单位)表示。偶合常数单位为赫兹(Hz)。裂分模式表现出表观多重性，并被指定为s(单重峰)，d(双重峰)，t(三重峰)，q(四重峰)，quint(五重峰)，m(多重峰)，br(宽峰)。
使用的LCMS方法
Acq.方法条件:RND-ABC-6-MIN。
柱：XBridge BEH C18(50mm×4.6mm,2.5μm)
流动相:A:5mM碳酸氢铵水溶液(PH-10，含有氨水):ACN
时间(min)/％ACN:0/5,0.5/5,1/15,3.3/98,5.2/98,5.5/5,6.0/5
柱温：35℃,流速1.3ml/min。
MS参数:
质量范围:100-1000
扫描时间:0.5秒
扫描间延迟:0.1秒
运行时间:6.0min。
Acq.方法条件:RND-FA-4.5-MIN。
柱：Acquity BEH C18(50mm×2.1mm,1.7um)
流动相:A:0.1％FA水溶液；B:0.1％FA/ACN
时间(min)/％B:0/3,0.4/3,3.2/98,3.8/98,4.2/3,4.5/3
柱温：35℃,流速:0.6mL/min。
MS参数:
质量范围:100-1000
扫描时间:0.5秒
扫描间延迟:0.1秒
运行时间:4.5min。
Acq.方法条件:RND-FA-4.5-MIN。
柱：Acquity BEH C18(50mm×2.1mm,1.7um)
流动相:A:0.1％FA水溶液；B:0.1％FA/ACN
时间(min)/％B:0/3,0.4/3,3.2/98,3.8/98,4.2/3,4.5/3
柱温：35℃,流速:0.6mL/min。
MS参数:
质量范围:100-1000
碎裂电压(Fragmentor):100
步长:0.1
运行时间:4.5min。
Acq.方法条件:RND-ABC-6.5-MIN。
柱：XBridge BEH C18(50mm×4.6mm,2.5μm)
流动相:A:5mM碳酸氢铵水溶液(PH-10，含有氨水):ACN
时间(min)/％ACN:0/5,0.5/5,1/15,3.3/98,6.0/98,6.1/5,6.5/5
柱温：35℃,流速1.3ml/min
MS参数:
质量范围:100-1000
碎裂电压:100
步长:0.1
运行时间:6.5min。
Acq.方法条件:RND-ABC-10-MIN。
柱：XBridge BEH C18(50mm×4.6mm,2.5μm)
流动相:A:5mM碳酸氢铵水溶液(PH-10，含有氨水):ACN
时间(min)/％ACN:0/5,0.5/5,1.5/15,7/98,9.0/98,9.5/5,10/5
柱温：35℃,流速1.3ml/min。
MS参数:
质量范围:100-1000
碎裂电压:100
步长:0.1
运行时间:10.0min。
中间体
合成双环吡啶核
合成(S)-2-((6-氯-3-硝基吡啶-2-基)氨基)琥珀酸二甲酯
向配备有温度计、回流冷凝器和机械搅拌子的2L烧瓶中加入2,6-二氯-3-硝基吡啶(100g,0.52mol)、(S)-天冬氨酸二甲酯盐酸盐(205g,1.04mol)、NaHCO3(174g,2.07mol)和四氢呋喃(1L)。将反应混合物在40℃搅拌16h，然后经HPLC监测2,6-二氯代吡啶的消失。反应完成后，将固体滤除，然后用乙酸乙酯洗涤(3×300mL)。合并的滤液和洗涤物浓缩至干，将残余物吸收于1L乙酸乙酯中。将溶液与炭(200g)一起在环境温度搅拌2h，然后将炭滤除，并用额外的乙酸乙酯(3×200mL)洗涤。合并的滤液和洗涤物真空浓缩，获得粗物质(S)-2-((6-氯-3-硝基吡啶-2-基)氨基)琥珀酸二甲酯(180g,>100％)，其为黄色油状物。其不经进一步纯化就用于下一步。LRMS(m/z):318.0[M+H]+；HRMS(m/z):[M+H]+C11H13N3O6Cl的计算值,318.0493；实测值，318.0492；1H-NMR(300MHz,DMSO-d6):δ9.00(d,J＝7.9Hz,1H,-NH),8.50(d,J＝8.6Hz,1H),6.92(d,J＝8.6Hz,1H),5.23(m,J＝5.7,7.9Hz,1H,-CHNH),3.67(s,3H),3.63(s,3H),3.06(m,J＝5.8Hz,2H,-CHCH2)；13C-NMR(APT)(75MHz,DMSO-d6):δ170.93(C),170.65(C),154.65(C),150.59(C),138.82(CH),127.28(C),112.81(CH),52.23(CH3),51.74(CH3),50.20(CH),35.31(CH2)。
合成(S)-2-(6-氯-2-氧代-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙酸甲基酯
向配备有温度计、回流冷凝器和机械搅拌子的5L三颈烧瓶中装入粗物质(S)-2-((6-氯-3-硝基吡啶-2-基)氨基)琥珀酸二甲酯(180g,0.52mol)、铁粉(146g,2.59mol)、2-丙醇(2L)和水(700mL)。将混合物在40℃搅拌，然后加入乙酸(15.5g,0.259mmol)，添加速度足以保持内部温度低于70℃。将反应混合物在70℃搅拌30min，HPLC指示反应完成。将混合物冷却至40℃，然后加入Na2CO3(165g,1.55mol)，将混合物搅拌1h。过滤固体，然后将固体用四氢呋喃洗涤(3×500mL)。合并的滤液和洗涤物真空浓缩，然后将残余物在乙醇中(1L)搅拌12小时。将固体过滤并用冷的乙醇洗涤，然后真空干燥，获得(S)-2-(6-氯-2-氧代-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙酸甲基酯，其为灰白色固体(91g,68％)。LRMS(m/z):256.0[M+H]+；HRMS(m/z):[M+H]+C10H11N3O3Cl的计算值,256.0489；实测值，256.0487；1H-NMR(300MHz,DMSO-d6):δ10.55(br s,1H,-NHCO),7.35(br s,1H,-NHCH),6.92(d,J＝7.9Hz,1H),6.57(d,J＝7.8Hz,1H),4.43(m,J＝1.4,5.1Hz,1H,-NHCH),3.57(s,3H,-CO2Me),2.79(m,J＝5.1,16.4Hz,2H,-CHCH2)；13C-NMR(APT)(75MHz,DMSO-d6):δ170.32(C),164.96(C),146.13(C),140.32(C),122.41(CH),119.47(C),111.31(CH),51.81(CH),51.39(CH3),37.01(CH2)。
合成(S)-2-(6-氯-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙醇
向配备有机械搅拌子、回流冷凝器和氮气入口的5L 3-颈烧瓶中装入LiAlH4(60g,1.58mol)。烧瓶用冰浴冷却，然后加入四氢呋喃(500mL)。将搅拌的混合物冷却至0℃，然后加入(S)-2-(6-氯-2-氧代-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙酸甲基酯(81g,0.32mol)于四氢呋喃(2L)中的溶液，同时保持内部温度低于5℃。加入结束后，将反应混合物回流加热16h，同时通过HPLC监测产物的出现。迅速发生酯的还原，而内酰胺还原需要更长的时间来完成。将反应混合物冷却至5℃，然后加入水(60mL)同时保持内部温度低于10℃。加入结束后，将反应混合物搅拌15min，然后加入15％(w/w)NaOH(水溶液)(60mL)，同时保持内部温度低于5℃。加入结束后，将反应混合物搅拌15min，然后加入水(180mL)，然后将混合物在环境温度搅拌1h。将固体滤出，然后用四氢呋喃洗涤(3×150mL)。滤液和洗涤物真空浓缩，然后将固体残余物真空干燥，获得(S)-2-(6-氯-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙醇，其为棕色固体(55g,81％)。LRMS(m/z):214.1[M+H]+；HRMS(m/z):[M+H]+C9H13N3OCl的计算值,214.0747；实测值，214.0743；1H-NMR(300MHz,DMSO-d6):δ6.60(br s,1H,-NHCH(CH2)2OH),6.58(d,J＝7.8Hz,1H),6.32(d,J＝7.8Hz,1H),5.69(m,1H,-NHCH2),4.57(t,J＝5.0Hz,1H,-OH),3.56(m,J＝5.8Hz,2H,-CH2OH),3.47(m,1H,-NHCH(CH2)2OH),3.22(m,J＝2.7,11.1Hz,1H,-NHCHH’),2.84(m,J＝1.6,6.7,11.1Hz,1H,-NHCHH’),1.65(m,J＝6.7Hz,1H,-CHH’CH2OH),1.54(m,J＝6.3Hz,1H,-CHH’CH2OH)；13C-NMR(APT)(75MHz,DMSO-d6):δ146.75(C),134.44(C),128.20(C),118.97(CH),110.59(CH),57.97(CH2),47.47(CH),43.99(CH2),36.60(CH2)。
合成(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(S)-2-(6-氯-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙醇(5；50g,0.234mol)在CH2Cl2(500mL)中的溶液中加入三乙胺(95g,0.936mol)。将混合物在环境温度搅拌直到其均匀，然后冷却至0℃。向反应混合物中滴加POCl3(54g,0.351mol)，同时维持温度在0-5℃之间。移除冷却浴，然后将反应混合物在环境温度搅拌2h,同时经由HPLC监测起始醇的消失。反应完成后，加入1.2M NaHCO3(aq.)(200mL)。分离各层，并将水层用CH2Cl2萃取。合并的CH2Cl2层用1M HCl(aq.)(4×300mL)萃取，合并的HCl层用固体NaHCO3调节至pH 8。将所得混合物用CH2Cl2萃取(4×300mL)，然后将该部分CH2Cl2层干燥(Na2SO4)，过滤，并用炭处理(50g)。将混合物在环境温度搅拌3h，过滤，然后将炭用CH2Cl2(200mL)洗涤。合并的滤液和洗涤溶液浓缩至干，并将固体残余物真空干燥，获得(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂其为灰白色结晶固体(30g,66％)。LRMS(m/z):196.1[M+H]+；HRMS(m/z):[M+H]+C9H11N3Cl的计算值,196.0642；实测值，196.0637；1H-NMR(300MHz,DMSO-d6):δ7.47(br d,J＝4.5Hz,1H,-NH),7.09(d,J＝7.7Hz,1H),6.39(d,J＝7.7Hz,1H),3.89(m,J＝5.0Hz,1H,CHNH),2.95-3.13(m,2H,-NCH2CH2CHNH),2.77(m,2H,-NCHH’CHNH),1.98(m,J＝5.0Hz,1H,-NHCHCHH’CH2N),1.86(m,J＝6.9Hz,1H,-NHCHCHH’CH2N)；13C-NMR(APT)(75MHz,DMSO-d6):δ153.45(C),144.50(C),134.32(CH),133.19(C),109.73(CH),59.88(CH2),53.07(CH2),50.08(CH),38.38(CH2)。
合成3取代的双环吡啶核
合成(4S)-7-氯-8-氟-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在室温将N-氟-N'-氯甲基三亚乙基二胺双(四氟硼酸盐)(15.20g,42.9mmol)加至(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(7g,35.8mmol)在三氟甲磺酸(70mL)中的溶液中，然后加热至70℃，保持36h。然后将反应混合物用NaHCO3水溶液中和并用乙酸乙酯萃取(3x500mL)。合并的有机层用水(2x500mL)和盐水(100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，然后减压除去溶剂，获得粗制残余物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：1％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-氯-8-氟-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.805mmol,收率：2.25％)，其为灰白色固体。(TLC:洗脱剂：5％甲醇/DCM,Rf:0.4)，LCMS(m/z)214.1[M+H]+。
(4S)-7-氯-8-碘-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(10g,51.1mmol)在氯仿(170mL)中的搅拌的溶液中加入NIS(14.95g,66.4mmol)。将反应混合物在70℃搅拌1h。使反应混合物到达室温，用水稀释(50ml)并用CHCl3萃取(2x100ml)。合并的有机层用盐水溶液洗涤并经无水Na2SO4干燥，减压蒸发，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目)，得到(4S)-7-氯-8-碘-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(7.4g,20.53mmol,40.2％收率)，其为黄色固体(TLC系统：净EtOAc,(Rf:0.4).LCMS(m/z)321.96,[M+H]+。
合成(4S)-7-氯-8-(三氟甲基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在室温向碘化亚铜(I)(1.355g,13.68mmol)、叔丁醇钾(1.535g,13.68mmol)在DMPU(34mL)中的搅拌的溶液中加入三氟甲基三甲基硅烷(1.983mL,13.68mmol)、1,10-菲咯啉(2.466g,13.68mmol)和(4S)-7-氯-8-碘-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(2.2g,6.84mmol)。将反应混合物在室温搅拌24h，然后将反应混合物倾倒至冷水(210mL)中，并用乙酸乙酯萃取(2x200mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥,真空浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％CH2Cl2/EtOAc)，得到(4S)-7-氯-8-(三氟甲基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(650mg,2.465mmol,收率：36.0％)，其为灰白色固体(TLC系统：净EtOAc，Rf:0.5).LCMS(m/z):264.14[M+H]+,Rt＝1.78min。
合成(R)-2-((6-氯-3-硝基吡啶-2-基)氨基)琥珀酸二甲酯
在氮气下向(R)-2-氨基琥珀酸二甲酯盐酸盐(25g,127mmol)在四氢呋喃(THF)(130mL)中的混悬液中加入碳酸氢钠(21.25g,253mmol)和2,6-二氯-3-硝基吡啶(12.21g,63.3mmol)。将反应混合物在40℃搅拌16hr。将反应混合物过滤并用EtOAc洗涤(3×25mL)，浓缩滤液，得到粗产物，然后将其加至硅胶柱中，用(9:1)Hex/EtOAc洗脱。将收集的级分蒸发，获得期望的产物(16g,49.4mmol,39.0％)，LCMS(m/z)318.1[M+H]+。
合成(R)-2-(6-氯-2-氧代-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙酸甲基酯
向(R)-2-((6-氯-3-硝基吡啶-2-基)氨基)琥珀酸二甲酯(16g,50.4mmol)于异丙醇(200mL)和水(60mL)中的溶液中加入铁(14.06g,252mmol)并加热至40℃。向反应混合物中加入乙酸(1.442mL,25.2mmol)，然后加热至70℃，保持1hr。将反应混合物冷却至室温，经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤(3×20mL)，浓缩滤液并干燥。反应粗产物从乙醇重结晶，得到期望的产物(11.5g,43.4mmol,86％)，LCMS(m/z)256.1[M+H]+。
合成(R)-2-(6-氯-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙醇
在0℃在氮气气氛下向氢化铝锂(8.54g,225mmol)在四氢呋喃(THF)(12mL)中的混悬液中滴加(R)-2-(6-氯-2-氧代-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙酸甲基酯(11.5g,45.0mmol)在四氢呋喃(THF)(60mL)中的溶液。将反应混合物加热至70℃，保持16hr。将反应混合物冷却至0℃，用水淬灭(8mL)，保持内部温度低于5℃。加入结束后，将反应混合物搅拌15min。接着，加入10mL 15％(W/W)NaOH(aq.)，保持内部温度低于5℃,加入结束后，将反应混合物搅拌15min。为了完成后处理，加入12mL水，然后将混合物在室温搅拌1h。将固体过滤并用THF(3x20mL)洗涤，滤液和洗涤物真空浓缩。将粗产物加至硅胶柱并用(3:7)Hex/EtOAc洗脱。将收集的级分蒸发，获得期望的产物(6g,27.0mmol,60.1％)，LCMS(m/z)214.1[M+H]+。
合成(4R)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在氮气下向(R)-2-(6-氯-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙醇(7g,32.8mmol)在二氯甲烷(DCM)(70mL)中的溶液中加入三乙胺(18.27mL,131mmol)。将混合物在室温搅拌直到其均匀，然后将其冷却至0℃。接着滴加POCl3(4.58mL,49.1mmol)，维持温度为0℃至5℃。将反应混合物在25℃搅拌2hr。反应完成后，加入100mL 1.2M NaHCO3(aq.)。分离各层并将水层用DCM萃取(2x200mL)。合并的有机层浓缩至干。将固体残余物真空干燥。粗产物8g加至硅胶柱并用70％EtOAc/石油醚洗脱。将收集的级分蒸发，获得期望的产物(5.2g,26.5mmol,81％收率)，LCMS(m/z)195.9[M+H]+。
合成4取代的双环吡啶核
合成2,6-二氯-4-甲基-3-硝基吡啶
在氮气下在0℃将硝酸(1.5mL,33.6mmol)加至搅拌的硫酸(2.5mL,46.9mmol)溶液中。然后在0℃加入2,6-二氯-4-甲基吡啶(0.500g,3.09mmol)。然后将反应混合物在100℃搅拌16hr。通过TLC监测反应。完成后，将反应混合物用碎冰淬灭，用NH4OH溶液中和并过滤固体，然后真空干燥，得到期望的产物(0.300g,1.443mmol,46.8％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z)206.8[M+H]+。
合成(S)-2-((6-氯-4-甲基-3-硝基吡啶-2-基)氨基)琥珀酸二甲酯
在0℃在氮气下将2,6-二氯-4-甲基-3-硝基吡啶(300mg,1.449mmol)和碳酸氢钠(243mg,2.90mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL))中的混悬液加至(S)-2-氨基琥珀酸二甲酯盐酸盐(430mg,2.174mmol)中。然后将反应混合物在65℃搅拌24hr。通过TLC监测反应。将反应物质过滤并用EtOAc洗涤(2×30mL)。减压浓缩滤液，得到粗物质。将粗产物加至中性氧化铝柱中并用Hex/EtOAc(9:1)洗脱。将收集的级分减压浓缩，得到期望的产物(250mg,0.742mmol,51.2％收率)，其为黄色胶状液体，LCMS(m/z)339.1(M+H)+。
合成(S)-2-(6-氯-8-甲基-2-氧代-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙酸甲酯
向在40℃搅拌的(S)-2-((6-氯-4-甲基-3-硝基吡啶-2-基)氨基)琥珀酸二甲酯(6.0g,18.09mmol)和铁(5.05g,90mmol)在异丙醇(80mL)和水(20mL)中的混悬液中加入乙酸(1.553mL,27.1mmol)。将反应混合物在80℃搅拌1hr。通过TLC监测反应。将反应混合物冷却至室温，然后用饱和碳酸氢钠溶液淬灭并用EtOAc萃取。有机层用盐水溶液洗涤并用硫酸钠干燥脱水，过滤并蒸发，得到期望的产物(4.0g,14.32mmol,79％收率)，LCMS(m/z)269.9[M+H]+。
合成(S)-2-(6-氯-8-甲基-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙醇
以控制气体逸出的速率，向在氮气下搅拌的氯化铝(0.173g,1.298mmol)在四氢呋喃(THF)(2.5mL)中的溶液中滴加2M氢化铝锂(2.220mL,4.44mmol)在THF中的溶液中。这得到氢化铝(AlH3)的THF溶液。在一个单独的烧瓶中，在氮气下制备(S)-2-(6-氯-8-甲基-2-氧代-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙酸甲酯(0.250g,0.927mmol)在四氢呋喃(THF)(5mL)中的溶液，在-78℃向其中滴加氢化铝溶液，历时15分钟。加入结束后，移除冷却浴，并使得反应混合物温热至环境温度。通过TLC监测反应。在0℃将反应混合物用10％NaOH溶液淬灭，然后搅拌1hr并用EtOAc萃取。EtOAc层先后用水和盐水溶液洗涤并用硫酸钠干燥脱水，过滤并浓缩，得到期望的产物(150mg,0.407mmol,43.9％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z)228.2[M+H]+。
合成(4S)-7-氯-9-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(S)-2-(6-氯-8-甲基-1,2,3,4-四氢吡啶并[2,3-b]吡嗪-3-基)乙醇(1.8g,7.91mmol)中加入HBr(4mL,35.4mmol)，将反应混合物在90℃搅拌18hr。通过TLC监测反应。完成后，将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液淬灭并用EtOAc萃取。EtOAc层先后用水和盐水溶液洗涤并用硫酸钠干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。将粗产物加至中性氧化铝中并用20％EtOAc/己烷洗脱。将收集的级分蒸发，得到期望的产物(0.900g,4.27mmol,54.0％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z)210.2[M+H]+。
氯化偶联反应
合成(4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-甲酸甲酯
向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(5g,25.55mmol)在无水MeOH(250ml)中的脱气的溶液中加入TEA(17.77mL,127.77mmol)和Pd(dppf)Cl2(934mg,1.2755mmol)并将反应混合物在300psi一氧化氮气氛下在110℃搅拌20h。将混悬液冷却至室温并将混合物减压浓缩，得到粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，用2％甲醇/DCM洗脱)，得到(4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-甲酸甲酯(3g,13.68mmol,53.5％收率)，其为淡棕色固体(TLC系统:5％甲醇/DCM,Rf值：0.2)，LCMS(m/z)220.3[M+H]+。
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-8-(三氟甲基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4S)-7-氯-8-(三氟甲基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350mg,1.328mmol)、(6-甲基吡啶-3-基)硼酸(273mg,1.991mmol)和K3PO4(1096mg,3.98mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(3mL)中的脱气的溶液中加入Pd2(dba)3(122mg,0.133mmol)和x-phos(633mg,1.328mmol)。将反应混合物在100℃搅拌7h。使得反应混合物达到室温并用水稀释(70mL)，用乙酸乙酯萃取(3×150mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，得到粗产物。粗制混合物用石油醚研磨(3x25mL)且真空干燥，得到(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-8-(三氟甲基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(370mg,1.040mmol,收率：78％)，其为灰白色固体(TLC系统:5％甲醇/EtOAc,Rf:0.3).LCMS(m/z)320.90[M+H]+。
合成(4S)-8-氟-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将K3PO4(397mg,1.872mmol)加至(4S)-7-氯-8-氟-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.936mmol)&(6-甲基吡啶-3-基)硼酸(167mg,1.217mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(1mL)中的搅拌的溶液中，然后脱气15min，接着先后加入x-phos(44.6mg,0.094mmol)和Pd2(dba)3(42.9mg,0.047mmol)。将反应混合物在90℃加热2h 45min。将反应混合物冷却至室温，通过硅藻土垫过滤，用乙酸乙酯洗涤(10mL x2)，然后减压除去溶剂。有机化合物用乙酸乙酯萃取(20mL x2)，用水(2×20mL)和盐水(20mL)洗涤。萃取物经无水Na2SO4干燥，真空除去溶剂，得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶并用1％MeOH/DCM洗脱，得到(4S)-8-氟-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(220mg,0.705mmol,75％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z)271.15[M+H]+。
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(30g,153mmol)，(2-甲基吡啶-4-基)硼酸(25.2g,184mmol)和磷酸三钾(65.1g,307mmol)在1-丁醇(300mL)和水(50.0mL)中的脱气的溶液中加入三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(7.02g,7.67mmol)和二环己基(2',4',6'-三异丙基-[1,1'-联苯]-2-基)膦(7.31g,15.33mmol)。将反应混合物在100℃加热3h。减压蒸发正丁醇溶剂。所得残余物用水稀释(200mL)并用DCM萃取(2x400ml)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗产物用乙醚和正戊烷(1:1)研磨3次(3X250mL，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(25g,99.2mmol,62％)，其为灰白色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc Rf:0.2)，LCMS(m/z)252.9[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ8.45(dd,J＝5.2,0.8Hz,1H),7.73(dt,J＝1.4,0.7Hz,1H),7.67-7.60(m,1H),7.24-7.16(m,2H),7.10(d,J＝7.7Hz,1H),3.93(td,J＝5.0,2.5Hz,1H),3.19-2.98(m,2H),2.92-2.71(m,2H),2.50(s,3H),2.11-1.96(m,1H),1.94-1.81(m,1H)。
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(10g,51.1mmol)、(6-甲基吡啶-3-基)硼酸(10.50g,77mmol)和磷酸三钾(21.70g,102mmol)在1,4-二噁烷(100mL)和水(20.0mL)中的脱气的溶液中加入三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(4.68g,5.11mmol)和x-phos(4.87g,10.22mmol)。将反应混合物在100℃加热8h。减压蒸发溶剂；将获得的残余物用水稀释(200mL)并用DCM萃取(2x100ml)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗产物用乙醚和正戊烷(1:1)研磨3次(3X100mL)，得到(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(11.2g,44.4mmol,65％)，其为灰白色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc Rf:0.3).LCMS(m/z):253.1[M+H],Rt＝2.86min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 8.97(d,J＝2.19Hz,1H),8.06(dd,J＝8.11,2.41Hz,1H),7.28-7.11(m,1H),6.94(d,J＝7.89Hz,1H),6.74(d,J＝7.67Hz,1H),5.21(s,1H)，4.08–3.98(m,1H),3.36-3.12(m,3H),2.99-2.89(m,1H),2.56(s,3H),2.17-2.10(m,2H)。
合成(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(20g,102mmol)、(3-(三氟甲基)苯基)硼酸(29.1g,153mmol)和Cs2CO3(100g,307mmol)在1,4-二噁烷(100mL)和水(10mL)中的混悬液搅拌并用氩气在室温脱气15分钟。接着，将乙酸钯(II)(0.574g,2.56mmol)和2-二环己基膦基-2′,4′,6′-三异丙基联苯(2.437g,5.11mmol)加至反应混合物中。然后将反应混合物在110℃搅拌2hr。反应物质经硅藻土过滤并浓缩。将残余物用EtOAc稀释并先后用饱和NaHCO3和盐水溶液洗涤，然后用硫酸钠干燥脱水，过滤并蒸发。粗产物加至硅胶柱并用Hex/EtOAc(1:1)洗脱。将收集的级分蒸发，得到(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(18g,58.3mmol,57.0％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z)306.1(M+H)+。
合成(4S)-9-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将(4S)-7-氯-9-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.900g,4.29mmol)、(6-甲基吡啶-3-基)硼酸(0.882g,6.44mmol)和磷酸三钾(2.73g,12.88mmol)在1,4-二噁烷(14.4mL)&水(3.6mL)中的混悬液搅拌并用氩气在室温脱气15分钟。然后将Pd2(dba)3(0.393g,0.429mmol)和X-Phos(0.409g,0.858mmol)加至反应混合物中。将反应混合物在90℃搅拌16hr。通过TLC监测反应(50％EtOAc/己烷)。将反应混合物冷却至室温，然后经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤。浓缩滤液，然后用EtOAc溶解。EtOAc层先后用水和盐水溶液洗涤，然后经硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到粗物质(4S)-9-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.700g,2.60mmol,60.7％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z)267.0[M+H]+。
合成(2R)-2-乙基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉
将(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(900mg,4.60mmol)、(R)-2-乙基吗啉(1060mg,9.20mmol)和KOtBu(1032mg,9.20mmol)在1,2-二甲氧基乙烷(DME)(20mL)中的混悬液在氮气下搅拌并在室温脱气15min，加入(1,3-二(2,6-二异丙基苯基)-4,5-二氢咪唑-2-亚基)氯)(3-苯基烯丙基)钯(2)(120mg,0.184mmol)。将反应混合物在90℃搅拌12hr。反应物质经硅藻土垫过滤并浓缩滤液。反应混合物用水稀释，并用EtOAc萃取(2×20mL)。有机层先后用水和盐水溶液洗涤并用硫酸钠干燥脱水。有机层减压浓缩。粗制化合物经柱色谱纯化(中性氧化铝)。产物用20％乙酸乙酯/己烷洗脱。将收集的级分减压蒸发并在高真空干燥，得到(2R)-2-乙基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(750mg,2.73mmol,59.4％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z)275.3[M+H]+。
合成(2S,6S)-2,6-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉
将(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.800g,4.09mmol)、(2S,6S)-2,6-二甲基吗啉(0.942g,8.18mmol)和KOtBu(0.918g,8.18mmol)在1,2-二甲氧基乙烷(DME)(30mL)中的混悬液中搅拌并用氩气在室温脱气15分钟。然后将(1,3-二(2,6-二异丙基苯基)-4,5-二氢咪唑-2-亚基)氯)(3-苯基烯丙基)钯(II)(0.106g,0.164mmol)加至反应混合物中。然后将反应混合物在90℃搅拌16hr。通过TLC监测反应。完成后，反应物质经硅藻土过滤，然后减压浓缩滤液。将所得反应混合物用EtOAc稀释并先后用水和盐水溶液洗涤并用硫酸钠干燥脱水，过滤并蒸发得到粗产物。将粗产物加至中性氧化铝中并用(1:2)EtOAc/己烷洗脱。将收集的级分蒸发，得到(2S,6S)-2,6-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(0.780g,2.79mmol,68％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z)275.3[M+H]+。
合成(2R,6R)-2,6-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉
将(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.800g,4.09mmol)、(2R,6R)-2,6-二甲基吗啉(0.942g,8.18mmol)和KOtBu(0.918g,8.18mmol)中的混悬液中在1,2-二甲氧基乙烷(DME)(30mL)中搅拌并用氩气在室温脱气15分钟。然后将(1,3-二(2,6-二异丙基苯基)-4,5-二氢咪唑-2-亚基)氯)(3-苯基烯丙基)钯(2)(0.106g,0.164mmol)加至反应混合物中。然后将反应混合物在90℃搅拌16hr。通过TLC监测反应(TLC:100％EtOAcRf值：0.2)。反应物质经硅藻土过滤并完全蒸馏出溶剂。反应混合物用EtOAc稀释并先后用水和盐水溶液洗涤并用硫酸钠干燥脱水，过滤并蒸发得到粗产物。粗产物加至中性氧化铝中并用(1:1)EtOAc/己烷洗脱。将收集的级分蒸发，得到(2R,6R)-2,6-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(0.800g,2.75mmol,67.3％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z)275.0[M+H]+。
合成(2S,6R)-2,6-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉
将(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.00g,5.11mmol)、(2S,6R)-2,6-二甲基吗啉(1.177g,10.22mmol)和KOtBu(1.147g,10.22mmol)在1,2-二甲氧基乙烷(DME)(20mL)中的混悬液搅拌并用氩气在室温脱气15分钟。然后将(1,3-二(2,6-二异丙基苯基)-4,5-二氢咪唑-2-亚基)氯)(3-苯基烯丙基)钯(II)(0.133g,0.204mmol)加至反应混合物中。将反应混合物在90℃搅拌16hr。反应物质经硅藻土过滤并蒸发溶剂。将反应混合物用EtOAc稀释并先后用水和盐水溶液洗涤，然后经硫酸钠干燥，过滤并蒸发，得到粗物质(2S,6R)-2,6-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(0.820g,2.86mmol,56.0％收率)。粗产物加至中性氧化铝中并用20％EtOAc/己烷洗脱，得到(2S,6R)-2,6-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(0.820g,2.86mmol,56.0％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z)275.2[M+H]+。
合成2-环丙基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-吗啉
在搅拌下在0℃向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,5.11mmol)在1,2-二甲氧基乙烷(DME)(15mL)中的溶液中加入2-环丙基吗啉(0.650g,5.11mmol)和叔丁醇钾(0.574g,5.11mmol)。将溶液然后脱气15min，并加入肉桂酰基氯[1,3-二(二异丙基苯基)-2-咪唑烷基亚基]Pd(II)(3.32g,5.11mmol)。然后将反应混合物在90℃搅拌16h。将反应混合物用15ml水淬灭并用15ml乙酸乙酯萃取。有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。将粗产物加至100-200硅胶柱并用2％DCM/MeOH洗脱，得到产物2-环丙基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(1g,3.49mmol,68.3％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z)287.2[M+H]+。
合成2,2-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉
将(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.0g,5.11mmol)、2,2-二甲基吗啉(1.177g,10.22mmol)和KOtBu(1.147g,10.22mmol)在1,2-二甲氧基乙烷(DME)(20mL)中的混悬液中搅拌并用氩气在室温脱气15分钟。然后将(1,3-二(2,6-二异丙基苯基)-4,5-二氢咪唑-2-亚基)氯)(3-苯基烯丙基)钯(2)(0.133g,0.204mmol)加至反应混合物。将反应混合物在90℃搅拌16hr。反应物质经硅藻土过滤并蒸发溶剂。将反应混合物用EtOAc稀释并先后用水和盐水溶液洗涤。将溶液经硫酸钠干燥，过滤并蒸发，得到粗产物。将粗产物加至中性氧化铝柱并用DCM洗脱，得到2,2-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(0.800g,2.67mmol,52.3％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z)275.0[M+H]+。
合成(4S)-7-(3-(三氟甲基)哌啶-1-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在30℃向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,2.56mmol)、3-(三氟甲基)哌啶(783mg,5.11mmol(S-异构体，含有不等量的对映体混合物))在1,2-二甲氧基乙烷(15mL)中的脱气的溶液中加入叔丁醇钾(574mg,5.11mmol)和Umicore催化剂(33.2mg,0.051mmol)。将反应混合物在80℃加热17h。将反应混合物冷却至室温并倒入冷水(70mL)中，用乙酸乙酯萃取(2x150mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：1至3％甲醇/乙酸乙酯)，得到400mg(4S)-7-(3-(三氟甲基)哌啶-1-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂手性HPLC指示53:44对映体混合物，该不等量的对映体混合物经手性制备型HPLC纯化，获得两个分离的峰(手性制备型条件：4g-40％-100巴10 0.5％DEA/甲醇，chiralpak,AD-H(4.6mm*250mm))，为最快洗脱出的峰:210mg(峰-I,0.673mmol,15％收率)，其为白色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc Rf:0.4)，和最慢洗脱出的峰:310mg(峰-II,310mg,0.993mmol,22％)，其为白色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc,Rf:0.4)，LCMS(m/z)313.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 6.92(d,J＝8.33Hz,1H),6.56(d,J＝4.38Hz,1H),5.83(d,J＝8.11Hz,1H),4.43(d,J＝12.28Hz,1H),3.93(d,J＝12.28Hz,1H),3.87-3.72(m,1H),3.10–2.83(m,2H),2.82-2.71(m,1H),2.70-2.55(m,3H),2.46-2.18(m,1H),2.11–1.86(m,2H),1.86-1.65(m,2H),1.55-1.32(m,2H)。
合成(4S)-7-(3-(三氟甲基)哌啶-1-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在30℃向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,2.56mmol)、(R-异构体，含有不等量的对映体混合物)3-(三氟甲基)哌啶(783mg,5.11mmol)在1,2-二甲氧基乙烷(15mL)中的脱气的溶液中加入叔丁醇钾(574mg,5.11mmol)和Umicore催化剂(33.2mg,0.051mmol)。将反应混合物在80℃加热17h。将反应混合物冷却至室温并倒入冷水中(70mL)，用乙酸乙酯萃取(2x150mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：1至3％甲醇/乙酸乙酯)，得到(4S)-7-(3-(三氟甲基)哌啶-1-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂柱色谱后分离500mg化合物，手性HPLC指示36:63对映体混合物，该不等量的对映体混合物经手性制备型HPLC纯化，获得两个分离的峰(手性制备型条件：4g-40％-100巴100.5％DEA/甲醇，chiralpak,AD-H(4.6*250)mm5u)，为最快洗脱的峰:140mg(峰-I)，以及最慢洗脱出的峰:310mg(峰-II,310mg,0.993mmol,22％)，其为白色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc,Rf:0.4)，LCMS(m/z)313.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 6.92(d,J＝8.33Hz,1H),6.56(d,J＝4.60Hz,1H),5.83(d,J＝8.33Hz,1H)，4.41(dt,J＝12.50,1.86Hz,1H),3.93(d,J＝12.50Hz,1H),3.81(td,J＝4.88,2.74Hz,1H),3.07–2.88(m,2H),2.80-2.55(m,4H),2.48-2.27(m,1H),2.01–1.88(m,2H),1.85-1.65(m,2H),1.52-1.38(m,1H),1.36-1.20(m,1H)。
修饰3-取代的吡啶联芳基化合物
合成(4S)-8-溴-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在20℃向在氮气下搅拌的(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.96mmol)在氯仿(10mL)中的溶液中加入NBS(0.776g,4.36mmol)。将反应混合物在70℃搅拌2h。使得反应混合物达到室温并用饱和NaHCO3淬灭，用CHCl3萃取(2x100ml)。合并的有机层用盐水溶液洗涤并经无水Na2SO4干燥，减压蒸发，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/EtOAc)，得到(4S)-8-溴-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(650mg,1.962mmol,收率：49.5％)，其为黄色固体(TLC系统:10％MeOH/EtOAc，Rf:0.4)，LCMS(m/z)331.1[M+H]+。
合成(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在25℃向在氮气下搅拌的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(10g,39.6mmol)在氯仿(150mL)中的溶液中加入NBS(7.76g,43.6mmol)。将反应混合物在70℃搅拌2h。使得反应混合物达到室温，并将反应混合物用饱和NaHCO3(100ml)淬灭并用CHCl3萃取(2x150ml)。合并的有机层用盐水溶液洗涤并经Na2SO4干燥。然后减压蒸发，得到粗制化合物。粗产物经快速色谱纯化(100-200目)，获得(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(4.5g,13.27mmol,33.5％收率)，其为黄色固体(TLC系统:10％MeOH/EtOAC,Rf0.3)，LCMS(m/z)330.9[M+H]+。
合成(4S)-8-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.02mmol)、甲基硼酸(0.271g,4.53mmol)和K3PO4(2.493g,9.06mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(5mL)中的脱气的溶液中加入固体Pd2(dba)3(0.276g,0.302mmol)和X-Phos(0.288g,0.604mmol)。将反应混合物在100℃搅拌15hr。通过TLC和LCMS监测反应(TLC系统:-5％甲醇/乙酸乙酯,Rf:0.3)。将反应混合物用水稀释(150mL)并用乙酸乙酯萃取(3×350mL)。有机层经无水Na2SO4干燥，减压浓缩，得到半纯的化合物。将粗产物加至硅胶柱并用DCM/EtOAc洗脱。将收集的级分浓缩，得到(4S)-8-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.45g,1.436mmol,47.6％收率)，LCMS(m/z)267.0[M+H]+。
合成(4S)-8-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4S)-8-溴-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.02mmol)、甲基硼酸(0.271g,4.53mmol)和K3PO4(2.493g,9.06mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(5mL)中的脱气的溶液中加入Pd2(dba)3(0.276g,0.302mmol)和x-phos(0.288g,0.604mmol)。将反应混合物在100℃搅拌15h。将反应混合物冷却至室温，用水稀释(150mL)并用乙酸乙酯萃取(3×350mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用3％CH2Cl2/EtOAc洗脱)，得到(4S)-8-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(550mg,2.044mmol,67.7％)，其为黄色固体(TLC系统:5％甲醇/乙酸乙酯,Rf:0.3)，LCMS(m/z).267.3[M+H]+。
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-8-甲腈
在室温向(4S)-8-溴-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,1.812mmol)、Zn(CN)2(638mg,5.43mmol)和Zn(OAc)2(199mg,1.087mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(DMF)(12mL)中的溶液中加入Pd2(dba)3(332mg,0.362mmol)和DPPF(402mg,0.725mmol)。将反应混合物在100℃搅拌3h，然后使其到达室温，用水稀释(30mL)，用乙酸乙酯萃取(3×40mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目)，得到(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-8-甲腈(350mg,1.262mmol,收率：69.7％)，其为黄色固体(TLC系统:10％MeOH/EtOAc，Rf:0.3)，LCMS(m/z)278.2,[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在室温向(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.96mmol)在氯仿(15mL)中的搅拌的溶液中加入N-氯琥珀酰亚胺(NCS,1.058g,7.93mmol)。将反应混合物在70℃搅拌3h，然后使其到达室温，用水稀释(20ml)并用CH2Cl2萃取(2x20ml)。合并的有机层用盐水洗涤，然后经硫酸钠干燥，减压蒸发，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/EtOAc)，得到(4S)-8-氯-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.032mmol,26.0％收率)，其为灰白色固体(TLC系统:10％MeOH/EtOAc,Rf0.4)，LCMS(m/z)287.11[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(2.5g,9.91mmol)在CHCl3(25mL)中的搅拌的溶液中加入1-氯吡咯烷-2,5-二酮(1.59g,11.9mmol)。使反应溶液在60℃搅拌2h。反应溶液在CHCl3和H2O之间分配。分离有机层，经Na2SO4干燥，真空浓缩并直接施加至硅胶柱，使用EtOAc/EtOH(3:1)作为洗脱剂，得到(1.5g,52％)，其为黄色泡沫。LCMS(m/z)287[M+H]+。
合成(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在0℃向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.2g,6.13mmol)在四氢呋喃(THF)(50mL)中的搅拌溶液中加入3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(1.768g,7.36mmol)。将反应混合物在80℃搅拌16hr，然后倒入冷水(100mL)中并用乙酸乙酯萃取(200mL)，有机层相继用水(70mL)和盐水(70mL)洗涤，在减压下经无水硫酸钠干燥。粗制残余物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)和30％至70％梯度混合物作为洗脱剂，得到1.3g(66％)标题化合物，其为灰白色物质，LCMS(m/z)316.2(M+H)+。
合成(4R)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在0℃搅拌向吡嗪-2-甲酸(800mg,6.45mmol)中加入DPPA(3548mg,12.89mmol)和三乙胺(4.49mL,32.2mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的溶液。将反应混合物搅拌并温热至室温，保持2h。接着，加入(4R)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1009mg,5.16mmol)。将反应混合物在90℃搅拌16hr。将反应混合物用水稀释(100mL)并用乙酸乙酯萃取(200mL X2)。有机层经无水Na2SO4干燥，减压浓缩，得到半纯的化合物。粗产物加至硅胶柱并用Hex/EtOAc洗脱。收集级分得到期望的产物(1.4g,3.71mmol,58％)，LCMS(m/z)317.2(M+H)+。
合成(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将DIPEA(31.9mL,183mmol)和DPPA(15.09g,54.8mmol)先后加至烟酸(4.5g,36.6mmol)在四氢呋喃(THF)(60mL)中的搅拌的溶液中并搅拌2h。然后将(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(5.01g,25.6mmol)加至反应混合物，然后搅拌至80℃，保持16h。将反应混合物冷却至室温，用水稀释(60mL)，用乙酸乙酯萃取(2X50mL)，用盐水洗涤(50mL)。分离有机层，经硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目),1％甲醇/DCM，得到期望的产物(4g,12.03mmol,32.9％收率)，LCMS:(m/z)316.2(M+H)+。
合成(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向吡嗪-2-甲酸(4.08g,32.9mmol)在四氢呋喃(THF)(100ml)中的搅拌的溶液中先后加入叠氮磷酸二苯酯(14.19ml,65.8mmol)和TEA(22.94ml,165mmol)。将溶液温热至室温并继续搅拌3h。接着，加入固体(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(5.6g,28.6mmol)并将混合物加热至回流。将反应混合物搅拌2h回流下，然后冷却至室温并继续搅拌过夜。次日，将混合物用水稀释并用EtOAc萃取(三次)。合并的EtOAc萃取物经Na2SO4干燥并浓缩，得到粗产物。深色残余物经硅胶色谱纯化:330g柱，100ml/min,0-25％EtOAc/MeOH，历时30min。合并含产物的级分，得到期望的产物，其为黄色油状物。向该油状物中加入Et2O(50mL)并将其减压浓缩。这引起产物结晶，得到淡黄色固体(6.9g,76％收率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ＝12.61(s,1H),9.47(d,J＝1.4Hz,1H),8.68–7.99(m,2H),7.50(d,J＝8.0Hz,1H),6.96(d,J＝8.0Hz,1H),5.65(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.30–3.15(m,1H),3.11(dt,J＝12.1,2.1Hz,1H),3.00(dd,J＝12.1,3.2Hz,1H),2.39–2.22(m,1H),2.11–1.97(m,2H)；LCMS(m/z)316.9(M+H)+。
合成(4S)-7-氯-8-氟-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
先后将三乙胺(1.63mL,11.737mmol)和三光气(696mg,2.347mmol)加至(4S)-7-氯-8-氟-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,2.347mmol)在THF(20mL)中的溶液中，然后在室温搅拌30min并加入3-氨基吡啶(441mg,4.694mmol)，然后加热至70℃，保持16h。然后将反应混合物冷却至室温并用水稀释。将反应混合物用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层用水(2x50mL)和盐水(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，减压除去溶剂，获得粗制残余物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：90％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-7-氯-8-氟-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(410mg,1.231mmol,0.805mmol,收率：34.6％)，其为灰白色固体(TLC:洗脱剂：净乙酸乙酯,Rf:0.4)LCMS(m/z)333.9(M+H)+。
合成(4S)-7-氯-8-氟-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
先后将三乙胺(1.63mL,11.737mmol)和三光气(696mg,2.347mmol)加至(4S)-7-氯-8-氟-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,2.347mmol)在THF(20mL)中的溶液中，然后在室温搅拌30min并加入2-氨基吡啶(441mg,4.694mmol)，然后加热至70℃，保持16h。然后将反应混合物冷却至室温，用水稀释。将水层用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层用水(2x50mL)洗涤和盐水(50mL)，经无水Na2SO4干燥，然后减压除去溶剂，获得粗制残余物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：90％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-7-氯-8-氟-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,1.051mmol,34.18％收率)，其为灰白色固体(TLC:洗脱剂：100％乙酸乙酯,Rf:0.4)，LCMS(m/z)334.1(M+H)+。
合成(4S)-7-氯-N-(哒嗪-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在30℃向哒嗪-4-甲酸(0.5g,4.03mmol)溶液中加入叠氮磷酸二苯酯(1.308mL,6.04mmol)和DIPEA(2.111mL,12.09mmol)在THF(10mL)中的溶液中，将其在氮气下在0℃搅拌。将反应混合物在30℃搅拌2h，然后加入(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.473g,2.417mmol)。将反应混合物在90℃搅拌6h。将THF减压蒸发，然后将残余物用水稀释并萃取到DCM中。有机层用水、盐水洗涤，然后经硫酸钠干燥。减压蒸发溶剂。粗制化合物通过用乙醚和正戊烷(1:1)研磨纯化，得到产物(320mg,0.91mmol,23％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z)316.9[M+H]+。
合成(4S)-N-(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-d]嘧啶-7-基)-7-氯-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,2.56mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(758mg,2.56mmol)并在室温搅拌30min，然后加入三乙胺(0.356mL,2.56mmol)和3H-[1,2,3]三唑并[4,5-d]嘧啶-7-胺(417mg,3.07mmol)。将反应混合物在60℃搅拌16hr。通过TLC监测反应(10％甲醇/DCM)。将反应混合物用25ml水淬灭，并用25ml乙酸乙酯萃取。有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。将粗产物加至100-200硅胶柱并用3％DCM/MeOH洗脱，得到纯的化合物(4S)-N-(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-d]嘧啶-7-基)-7-氯-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.527mmol,20.63％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z)357.9[M+H]+。
合成3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮
在室温向氮气下搅拌的吡啶-2-甲酸(1g,8.12mmol)在甲苯(25mL)中的溶液中加入叠氮磷酸二苯酯(2.235g,8.12mmol)和TEA(1.132mL,8.12mmol)并在室温搅拌30min。此后将反应混合物在80℃搅拌2hr。接着，反应混合物冷却至室温并过滤，将固体用甲苯洗涤，得到化合物3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(600mg,2.352mmol,29.0％收率)，LCMS(m/z)241.2[M+H]+。
合成(R)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺
在密封管中加入(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(3.000g,22.70mmol)、4-氯吡啶-2-胺(1.459g,11.35mmol)和钠(0.522g,22.70mmol)的混悬液。将反应混合物在140℃搅拌16h。接着，将反应混合物冷却至室温，溶于MeOH中，并倒入冰水中并用EtOAc萃取。有机相用盐水溶液洗涤，然后经硫酸钠干燥，过滤并蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经硅胶柱色谱纯化并用2-3％MeOH/DCM洗脱，得到纯的化合物(1.1g,21％)，LCMS(m/z)225.2[M+H]+。
合成(S)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺
在密封管中加入(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(3.000g,22.70mmol)、4-氯吡啶-2-胺(1.459g,11.35mmol)和钠(0.522g,22.70mmol)的混悬液。将反应混合物在140℃搅拌16h，然后冷却至室温,溶于MeOH并倒入冰水中并用EtOAc萃取。有机相用盐水溶液洗涤，然后经硫酸钠干燥，过滤并蒸发。粗物质经硅胶柱色谱纯化，用2-3％MeOH/DCM洗脱，得到期望的产物(1.2g,22％)，LCMS(m/z)225.2[M+H]+。
合成(R)-2-(四氢呋喃-3-基氧基)嘧啶-4-胺
向(R)-四氢呋喃-3-醇(2.72g,30.9mmol)在THF(30mL)中的搅拌的溶液中加入NaH(0.926g,23.16mmol)，然后在室温搅拌30min。向其中分批加入2-氯嘧啶-4-胺(2.0g,15.44mmol)，历时约15min，然后在70℃加热16h。使得反应混合物达到室温，随后冷却至0℃，用冰冷的水淬灭并用乙酸乙酯萃取(3x50ml)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目)，得到(R)-2-(四氢呋喃-3-基氧基)嘧啶-4-胺(1.6g,8.839mmol,51.5％收率)，其为灰白色固体。
合成(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺
在氮气下在0℃搅拌下向6-氯吡嗪-2-胺(5g,38.6mmol)中加入氢化钠(2.316g,57.9mmol)和(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(5.61g,42.5mmol)在四氢呋喃(THF)(50mL)中的溶液。反应混合物在80℃搅拌16h。反应混合物用冰冷的水淬灭，然后萃取到乙酸乙酯中。有机层经Na2SO4干燥.减压蒸发溶剂，得到粗产物。粗产物加至硅胶柱并用DCM/MeOH洗脱。合并含产物的级分并减压蒸发，得到所需产物(2.8g,11.9mmol,31％)，LCMS(m/z)225.9[M+H]+。
N31748-19
合成(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺
将6-氯吡嗪-2-胺(0.980g,7.57mmol)，(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(2g,15.13mmol)和钠(0.348g,15.13mmol)加到密封管中，然后在130℃加热16hr，然后将反应混合物用甲醇和冰冷的水(100mL)淬灭并用乙酸乙酯萃取(5×50mL)。合并的有机层用水、饱和盐水溶液洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到产物(1g,4.26mmol,28.2％收率)，LCMS(m/z)265.1[M+H]+。
合成(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺
向在氮气下在室温搅拌的(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(10.20g,77mmol)和NaH(4.63g,116mmol)在四氢呋喃(THF)(50mL)中的混悬液中滴加2-氯嘧啶-4-胺(5g,38.6mmol)，历时15min。将反应混合物在70℃搅拌16hr。接着，将反应混合物用NaHCO3水溶液淬灭，然后用EtOAc萃取，经Na2SO4干燥并蒸发。粗产物加至硅胶柱并用50％Hex/EtOAc洗脱。将收集的级分蒸发，得到期望的产物(3g,11.84mmol,30.7％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z)226.2[M+H]+。
合成(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺
历时1min在室温向氢化钠(0.817g,34.1mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的溶液中加入(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(3g,22.70mmol)在THF(5mL)中的溶液中，然后在室温搅拌15min，然后在室温滴加2-氯嘧啶-4-胺(2.059g,15.89mmol)。将反应混合物在65℃搅拌16h。将反应混合物倒入水中并用EtOAc萃取(3×100mL)。然后将合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发得到4.0g粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶目且用2-3％MeOH/DCM洗脱，得到纯的化合物(2.5g,10.42mmol,46％)，LCMS(m/z)226.2[M+H]+。
合成(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺
向2-氯吡啶-4-胺(1.459g,11.35mmol)，(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(3.0g,22.70mmol)中的混悬液中加入钠(0.522g,22.70mmol)。将反应混合物在140℃搅拌16hr，监测反应进程。
将反应混合物溶于MeOH，倒入冰水中并用EtOAc萃取(3×100mL)。然后将合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发得到4.0g粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶目且用2-3％MeOH/DCM洗脱，得到(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(2.5g,10.73mmol,47.3％收率)，LCMS(m/z)225.3[M+H]+。
合成(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺
在室温在密封管中加入2-氯吡啶-4-胺(4g,31.1mmol)，(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(2.056g,15.56mmol)和钠(0.715g,31.1mmol)的溶液。将反应混合物在140℃搅拌48hr。将反应混合物冷却至室温并先后用MeOH和水淬灭。然后将反应物质用EtOAc萃取。然后有机层先后用水和盐水溶液洗涤并用硫酸钠干燥脱水，过滤并完全蒸馏。粗产物加至硅胶柱并用Hex/EtOAc(1:1)洗脱。将收集的级分蒸发，得到期望的产物(2.250g,9.93mmol,31.9％收率)，LCMS(m/z)225.0[M+H]+。
合成(S)-2-((四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-胺
在室温向2-氯嘧啶-4-胺(2g,15.44mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的搅拌的溶液中滴加NaH(0.741g,30.9mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在30℃搅拌约10min。在30℃向上述反应混合物中加入(S)-四氢呋喃-3-醇(1.088g,12.35mmol)，然后在80℃搅拌8小时。将反应混合物用冰冷的水在0℃淬灭并用乙酸乙酯萃取。有机层用水充分洗涤，并经Na2SO4干燥。减压蒸发溶剂，得到产物。粗产物用石油醚研磨,LCMS(m/z)182.2[M+H]+。
合成(1-甲基-1H-吡唑-4-基)氨基甲酸苯基酯
在0℃将氯甲酸苯酯(2.90g,18.53mmol)加至吡啶(3.12mL,38.6mmol)在二氯甲烷(DCM)(50mL)中的搅拌的溶液中，然后搅拌15min，接着在相同的温度加入1-甲基-1H-吡唑-4-胺(1.5g,15.45mmol)。将反应混合物在室温搅拌4h。起始原料耗尽后(经TLC监测)，加入冰冷的水，分离的有机层用水和盐水洗涤。有机层过滤通过硫酸钠并浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用60-120(硅胶)且在50％乙酸乙酯/己烷中洗脱，得到期望的产物(1.6g,6.41mmol,42％收率)，其为浅棕色固体，LCMS(m/z)218.1(M+H)+。
合成吡啶-3-基氨基甲酸苯酯
在氮气搅拌下在室温向氯甲酸苯酯(2.163g,13.81mmol)和吡啶(1.375mL,17.00mmol)在二氯甲烷(DCM)(30mL)中的溶液中加入吡啶-3-胺(1.0g,10.63mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液淬灭。分离有机层，将水层用DCM(50mL)萃取。合并的DCM层用水洗涤并用硫酸钠干燥脱水，过滤并高真空浓缩，得到粗产物。粗产物加至硅胶柱并用20％EtOAc/己烷洗脱。将收集的级分蒸发，得到期望的产物(1.3g,6.01mmol,57％)，其为白色固体,LCMS(m/z)215.1(M+H)+。
合成嘧啶-2-基氨基甲酸苯酯
在氮气下在室温向搅拌的氯甲酸苯酯(2.140g,13.67mmol)和吡啶(1.361mL,16.82mmol)在二氯甲烷(DCM)(10mL)中的溶液中加入嘧啶-2-胺(1.0g,10.51mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液淬灭。分离有机层，将水层用DCM(50mL)萃取。合并的DCM层用水洗涤并用硫酸钠干燥脱水，过滤并高真空浓缩，得到粗产物。将其加至硅胶柱并用20％EtOAc/己烷洗脱。将收集的级分蒸发，得到期望的产物(1.6g,6.49mmol,61.7％)，LCMS(m/z)216.3(M+H)+。
合成(5-氟吡啶-2-基)氨基甲酸苯基酯
在氮气下在室温向搅拌的氯甲酸苯酯(1.397g,8.92mmol)和吡啶(0.721mL,8.92mmol)在二氯甲烷(DCM)(40mL)中的溶液中加入5-氟吡啶-2-胺(1.0g,8.92mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液淬灭。分离有机层，将水层用DCM萃取(20mL)。合并的有机层先后用水和盐水溶液洗涤并用硫酸钠干燥脱水，过滤并真空浓缩，得到期望的产物(1.4g,5.94mmol,67％)，LCMS(m/z)233.2(M+H)+。
合成(2-甲基-2H-吲唑-5-基)氨基甲酸苯基酯
在氮气搅拌下在室温向氯甲酸苯酯(1.064g,6.79mmol)和吡啶(0.550mL,6.79mmol)在二氯甲烷(DCM)(40mL)中的溶液中加入2-甲基-2H-吲唑-5-胺(1g,6.79mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液淬灭。分离有机层，水层用DCM萃取(20mL)。合并的有机层先后用水和盐水溶液洗涤并用硫酸钠干燥脱水且真空浓缩，得到(2-甲基-2H-吲唑-5-基)氨基甲酸苯基酯(1.3g,4.82mmol,70.9％收率)，LCMS(m/z)268.1(M+H)+。
合成(5-乙基吡嗪-2-基)氨基甲酸苯基酯
在室温将吡啶(1.051mL,12.99mmol)滴加至氯甲酸苯酯(1.324mL,10.56mmol)在二氯甲烷(DCM)(20ml)中的搅拌的溶液中且搅拌30分钟。然后在室温滴加5-乙基吡嗪-2-胺(1g,8.12mmol)于二氯甲烷(DCM)(10ml)中的溶液，然后在50℃搅拌16h。使反应混合物达到室温，用DCM(3X50mL)稀释，用水(2X30mL)和盐水(30mL)洗涤。分离有机层，然后经硫酸钠干燥，过滤并浓缩。残余物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，以10％乙酸乙酯/石油醚作为洗脱剂，得到所需产物，其为灰白色絮状固体(1.6g,6.58mmol,81％)，LCMS(m/z)244.2(M+H)+。
合成(5-环丙基吡嗪-2-基)氨基甲酸苯基酯
在0℃将吡啶(0.598mL,7.40mmol)滴加至氯甲酸苯酯(0.928mL,7.40mmol)在二氯甲烷(DCM)(15ml)中的搅拌的溶液中，然后在室温搅拌30分钟。然后在0℃滴加5-环丙基吡嗪-2-胺(1g,7.40mmol)于二氯甲烷中的溶液(DCM)(5ml)，然后在室温搅拌3h。将反应混合物用DCM稀释(3X50mL)，用水(2X20mL)和盐水(20mL)洗涤。分离有机层，然后经硫酸钠干燥，过滤并浓缩。残余物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，以10％乙酸乙酯/石油醚作为洗脱剂，得到期望的产物(1.4g,5.31mmol,72％)，其为灰白色絮状固体，LCMS(m/z)256.2(M+H)+。
合成(6-乙氧基吡嗪-2-基)氨基甲酸苯基酯
在室温将吡啶(0.930mL,11.50mmol)加至氯甲酸苯酯(1.463g,9.34mmol)在DCM(15mL)中的溶液中且搅拌20min，然后加入6-乙氧基吡嗪-2-胺(1.0g,7.19mmol)在DCM(15mL)中的溶液，然后再继续搅拌40min。将反应混合物用DCM稀释(2X20mL)，用水(20mL×2)和盐水(10mL)洗涤。有机萃取物经Na2SO4干燥，然后真空除去溶剂，获得期望的产物(1.65g,5.22mmol,72.6％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z)260.2(M+H)+。
合成哒嗪-3-基氨基甲酸苯酯
在氮气搅拌下在25℃向氯甲酸苯酯(1.070g,6.83mmol)，吡啶(0.665g,8.41mmol)在二氯甲烷(10ml)中的溶液中加入哒嗪-3-胺(0.5g,5.26mmol)在二氯甲烷(5ml)中的混悬液，持续5min。将反应混合物在25℃搅拌1hr.接着，有机相用3mL水、3mL饱和盐水洗涤，经硫酸钠干燥且真空浓缩，得到粗产物，其为白色固体。化合物用己烷洗涤，减压干燥，LCMS(m/z)216.2(M+H)+。
合成嘧啶-4-基氨基甲酸苯酯
在氮气搅拌下在25℃向氯甲酸苯酯(1.070g,6.83mmol)，吡啶(0.665g,8.41mmol)在DCM(15ml)中的溶液中滴加嘧啶-4-胺(0.5g,5.26mmol)在DCM(5ml)中的混悬液中，持续5min。将反应混合物在25℃搅拌1hr。有机相用3mL水、3mL盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗产物，其为灰白色固体。粗制化合物用己烷洗涤，然后减压干燥，得到期望的产物(500mg,1.95mmol,37％)，LCMS(m/z)215.9(M+H)+。
合成高级的双环中间体
合成(4S)-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向(4R)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(499.5mg,1.636mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中加入TEA(1.368mL,9.82mmol)、三光气(486mg,1.636mmol)。将其在室温搅拌15min，然后历时5min滴加(R)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(1101mg,4.91mmol)在THF(5mL)中的溶液。将反应混合物在65℃搅拌16h，然后倒入水中并用EtOAc萃取(3×100mL)。然后将合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗产物。粗制化合物经反相色谱(0.1％HCOOH&水)/MeOH纯化，得到期望的产物(450mg,49％)，LCMS(m/z)555.9(M+H)+。
合成(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在30℃向(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(803mg,3.57mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中加入三光气(423mg,1.427mmol)，然后在相同的温度搅拌30min。然后在室温先后加入TEA(1.657mL,11.89mmol)和(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)。将反应混合物在65℃搅拌16hr。通过TLC和粗LCMS监测反应。将THF减压蒸发，残余物用水稀释，然后萃取到DCM中。有机层经Na2SO4干燥，减压蒸发溶剂，得到粗产物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用硅胶作为固定相(100-200目)和2-3％MeOH/EtOAc作为洗脱剂。将纯的级分收集并减压浓缩，得到纯的产物0.4g，其为灰白色固体(450mg,0.71mmol,30％)，LCMS(m/z)504.3(M+H)+。
合成(4S)-N-(4-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向(4R)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(545mg,1.785mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中加入TEA(1.493mL,10.71mmol)，三光气(530mg,1.785mmol)。然后将反应混合物搅拌15min，然后历时5min滴加(S)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(1201mg,5.36mmol)在THF(5mL)中的溶液。将反应混合物在65℃搅拌16h，然后冷却至室温并倒入水中并用EtOAc萃取(3×100mL)。然后将合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗产物。将其经反相柱色谱纯化(0.1％HCOOH&水)/MeOH，得到期望的产物(500mg,49％)，LCMS(m/z)556.3(M+H)+。
合成(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(850mg,2.78mmol)在40mL THF(密封管)中的搅拌的溶液中加入三光气(324mg,1.093mmol)且搅拌30min。向该反应混合物中加入(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(938mg,4.16mmol)，然后将反应混合物在65℃搅拌16h。使得反应混合物冷却至室温并将混合物倒入冷水(70mL)中，并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶；100-200目，用1至2％甲醇/二氯甲烷洗脱)，得到(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(900mg,1.618mmol 57％收率)，其为白色固体(TLC:洗脱剂：10％MeOH/DCM,Rf＝0.3)，LCMS(m/z)557.3(M+H)+。
合成(4S)-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(723mg,2.368mmol)在四氢呋喃(THF)(25mL)中的溶液中加入三光气(351mg,1.184mmol)，然后将反应混合物在室温搅拌30min，接着加入TEA(1.650mL,11.84mmol)和(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(800mg,3.55mmol)。将反应混合物在65℃搅拌16hr，然后冷却至室温并倒入水中并用EtOAc萃取(3×100mL)。然后将合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物，将其经反相柱纯化且用83％(0.1％HCOOH&水)/MeOH洗脱，得到纯的化合物(300mg,0.534mmol,23％)，LCMS(m/z)557.4(M+H)+。
合成(4S)-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,1.965mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(583mg,1.965mmol)、TEA(1.644mL,11.79mmol)，在室温搅拌15min，然后加入(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(1328mg,5.90mmol)在THF(5mL)中的溶液，历时1min。将反应混合物在65℃搅拌16hr，然后倒入水中并用EtOAc萃取(3×50mL)。然后将合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到600mg。粗制化合物经反相柱纯化且用90％(0.1％HCOOH&水)/MeOH洗脱，得到期望的化合物(450mg,0.76mmol,39％)，LCMS(m/z)557.2(M+H)+。
合成(4S)-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,1.965mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入TEA(1.644mL,11.79mmol)、三光气(583mg,1.965mmol)，搅拌15min并滴加(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(1322mg,5.90mmol)。将反应混合物在65℃搅拌16hr，并通过TLC监测反应进程。将反应混合物倒入冰水中并用EtOAc萃取(3×100mL)。然后将合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗产物。粗制化合物经反相柱纯化且用93％(0.1％HCOOH&水)/MeOH洗脱，得到期望的产物(450mg,0.807mmol,41.1％收率)，LCMS(m/z)556.4(M+H)+。
合成(4S)-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4R)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.310mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入TEA(1.096mL,7.86mmol)，三光气(389mg,1.310mmol)，在室温搅拌15min。加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(885mg,3.93mmol)在THF(2.0mL)中的溶液。将反应混合物在65℃搅拌16hr。将反应混合物倒入水中并用EtOAc萃取(3×100mL)。然后将合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发至干。粗制化合物经反相柱纯化且用90％(0.1％HCOOH&水)/MeOH洗脱，得到纯的化合物(350mg,0.602mmol,46％)，LCMS(m/z)557.0(M+H)+。
合成(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.28mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的溶液中加入TEA(2.74mL)和三光气的溶液，搅拌30分钟。向其中加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(2.204g,9.83mmol)在四氢呋喃(THF)(8mL)(2.204g)加入。将反应混合物在60℃搅拌16hr。将反应混合物浓缩，将残余物吸收于DCM(100mL)中。将溶液用水和盐水洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩。粗产物加至硅胶柱并用EtOAc/石油醚(60:20)洗脱，将收集的级分蒸发，得到期望的产物(600mg,0.92mmol,28％)，其为灰白色半固体，LCMS(m/z)556.3(M+H)+。
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(吡啶-3-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气下在室温搅拌的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.585mmol)、三乙胺(1.105mL,7.93mmol)和三光气(282mg,0.951mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中加入2-(吡啶-3-基)乙胺(387mg,3.17mmol)在THF(5mL)中的溶液。将反应混合物在65℃搅拌16hr，并通过TLC监测反应进程。将反应混合物倒入冰水中并用EtOAc萃取(3×100mL)。然后将合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物。粗制化合物经反相柱纯化且25-30％(0.1％HCOOH&水)/MeOH洗脱，得到最终产物(250mg,0.599mmol,37.8％收率)，LCMS(m/z)401.1(M+H)+。
合成4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
在20℃向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)和哌嗪-1-甲酸叔丁酯(706mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中的脱气的溶液中相继加入Cs2CO3(1852mg,5.68mmol)，xphos(361mg,0.758mmol)和PdOAc2(85mg,0.379mmol)。将反应混合物在100℃搅拌16hr。将反应混合物倒入冷水(20mL)中并用乙酸乙酯萃取(50mL)。有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗产物。粗产物加至硅胶柱并用3％DCM/MeOH洗脱，得到4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(359mg,0.616mmol,32.5％收率)，LCMS(m/z)467.3(M+H)+。
合成3-甲基-4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
在20℃向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(800mg,2.53mmol)，3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1012mg,5.05mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中的脱气的溶液中相继加入Cs2CO3(2469mg,7.58mmol)和xphos(482mg,1.010mmol)，PdOAc2(113mg,0.505mmol)。将反应混合物在100℃搅拌16hr。通过TLC监测反应。将反应混合物倒入冷水(20mL)中并用乙酸乙酯萃取(50mL)。有机层经无水硫酸钠干燥，减压浓缩，得到粗产物。粗产物加至硅胶柱并用2％DCM/MeOH洗脱。将收集的级分蒸发，得到期望的产物(397.5mg,0.670mmol,26.5％收率)，LCMS(m/z)481.1(M+H)+。
合成(4S)-7-(4-苄基-3-甲基哌嗪-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在20℃向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.579mmol)，1-苄基-2-甲基哌嗪(601mg,3.16mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的脱气的溶液中相继加入Cs2CO3(1543mg,4.74mmol)和肉桂酰基氯[1,3-二(二异丙基苯基)-2-咪唑烷基亚基]Pd(II)(51.3mg,0.079mmol)。将反应混合物在110℃搅拌16小时。将反应混合物倒入冷水(50mL)并用乙酸乙酯萃取(200mL)。有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗产物。粗产物加至硅胶柱并用3％DCM/MeOH洗脱，得到(4S)-7-(4-苄基-3-甲基哌嗪-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(501.5mg,0.885mmol,56.0％收率)，LCMS(m/z)471.3(M+H)+。
合成4-溴-2-(二氟甲基)吡啶
在0℃将DAST(0.620mL,4.69mmol)滴加至4-溴吡啶-2-甲醛(700mg,3.76mmol)在氯仿(21mL)中的溶液中。将反应混合物在20℃搅拌12h。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(20mL)中，并用DCM萃取(2X20mL)。DCM层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到4-溴-2-(二氟甲基)吡啶(400mg,1.870mmol,49.7％收率)，其为浅黄色固体，LCMS(m/z)208.0[M+H]+。
合成(2-(二氟甲基)吡啶-4-基)硼酸
在28℃将乙酸钾(472mg,4.81mmol)加至4-溴-2-(二氟甲基)吡啶(400mg,1.923mmol)，和双(频那醇合)二硼烷(610mg,2.404mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中的溶液。将反应混合物脱气15min，加入PdCl2(dppf)(4.22mg,5.77μmol)。将反应混合物再脱气15min，并将反应混合物在80℃搅拌48hr。将反应混合物冷却至28℃，蒸发，将粗产物分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离EtOAc层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤，且将滤液蒸发，得到(2-(二氟甲基)吡啶-4-基)硼酸(330mg,1.107mmol,57.6％收率)，其为棕色固体，LCMS(m/z)174.1[M+H]+。
合成4-苄基-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯
在0℃向3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1g,4.99mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(DMF)(100mL)中的溶液中加入K2CO3(2.070g,14.98mmol)。在0℃搅拌10min后，滴加苄基溴(0.891mL,7.49mmol)且将反应混合物在35℃搅拌16hr并通过TLC监测反应。将反应混合物倒入NaHCO3水溶液(50mL)中并用乙酸乙酯萃取(200mL)，用先后水和盐水洗涤。有机层经无水硫酸钠干燥，减压浓缩，得到粗产物。粗产物加至硅胶柱并用10％Hex/EtOAc洗脱。将收集的级分蒸发，得到4-苄基-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1g,3.17mmol,63.4％收率)，LCMS(m/z)174.1[M+H]+。
合成1-苄基-2-甲基哌嗪
在0℃向4-苄基-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.4g,4.82mmol)在二氯甲烷(DCM)(25mL)中的溶液中加入TFA(1.857mL,24.10mmol)并将反应混合物在35℃搅拌3hr。通过TLC监测反应。减压蒸发溶剂，得到粗产物。将残余物用乙醚研磨(2×50mL)。将所得固体过滤并用乙醚洗涤。将其减压干燥，得到1-苄基-2-甲基哌嗪三氟乙酸盐(800mg,2.63mmol,54.5％收率)
合成((R)-2-甲基吗啉代)(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮:
在室温将三光气(0.529g,1.783mmol)加至三乙胺(1.243mL,8.92mmol)和(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.45g,1.783mmol)在四氢呋喃(50mL)中的搅拌的溶液中且搅拌1h，接着加入(R)-2-甲基吗啉盐酸盐(0.368g,2.68mmol)，然后加热至70℃，保持15h。冷却至室温，然后用乙酸乙酯(100mL)和水(100mL)稀释。分离的有机层用水和盐水洗涤。有机层经硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：10％MeOH/乙酸乙酯；UV活化；Rf～0.4)。粗制化合物通过柱色谱纯化，使用中性氧化铝且在50％乙酸乙酯/己烷中洗脱，得到(R)-2-甲基吗啉代)((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮(0.2g,0.514mmol,32.4％收率)，其为胶状化合物,LCMS(m/z)380.3(M+H)+。
合成((S)-2-甲基吗啉代)((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮
在室温将三光气(0.470g,1.585mmol)加至三乙胺(1.105mL,7.93mmol)和(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.4g,1.585mmol)在四氢呋喃(50mL)中的搅拌的溶液中且搅拌1h，接着加入(S)-2-甲基吗啉盐酸盐(0.327g,2.378mmol)，然后加热至70℃，保持15h。冷却至室温且用乙酸乙酯(100mL)和水(100mL)稀释。分离的有机层用水和盐水洗涤。有机层经硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：10％MeOH/乙酸乙酯；UV活化；Rf～0.4)。粗制化合物通过柱色谱纯化，使用氧化铝且在50％乙酸乙酯/己烷中洗脱，得到(S)-2-甲基吗啉代)((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮(0.2g,0.514mmol,32.4％收率)，其为胶状化合物,LCMS(m/z)480.3(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在氮气搅拌下在0℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(10.0g,32.8mmol)在氯仿(50mL)中的溶液中滴加N-氯琥珀酰亚胺(6.56g,49.1mmol)，持续10min。将反应混合物在50℃搅拌6hr。反应结束后，将混合物用冰冷的水(60mL)淬灭并用DCM萃取(3x60ml)，分离DCM层并用盐水洗涤(2x30ml)，分离DCM层并经无水硫酸钠干燥，将其过滤并浓缩，得到粗物质。将粗物质经中性氧化铝快速色谱纯化。将粗物质用DCM稀释，然后用中性氧化铝吸收且用30％EtOAc/石油醚–50％EtOAc/石油醚洗脱。收集级分并浓缩，得到(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(6.3g,18.12mmol,55.3％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z)340.1[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃将(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)，三乙胺(1.231mL,8.83mmol)吸收在四氢呋喃(THF)(50mL)中，将所得黄色溶液搅拌10min。然后在0℃一次性加入三光气(437mg,1.472mmol)。在0℃将所得黄色混悬液在室温搅拌45min。在0℃，将(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺(330mg,1.472mmol)的THF(4mL)溶液加至上述黄色混悬液，历时5min的时间。将所得黄色混悬液加热至70℃，保持24hr。反应进程经TLC10％MeOH/DCM监测，TLC指示24h后形成多个斑点。将反应物质冷却至室温，用水(20mL)、乙酸乙酯(30mL*2)稀释。合并的有机层用盐水洗涤(15mL)，经硫酸钠干燥过滤，减压浓缩，得到棕色固体。粗产物经combiflash色谱在230-400目尺寸的硅胶上纯化。将柱用MeOH/DCM的梯度洗脱。期望的化合物用7％MeOH/DCM洗脱。将含纯的化合物的级分减压浓缩，得到(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.331mmol,22.47％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):590.15[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(7g,20.60mmol)在四氢呋喃(THF)(120mL)中的溶液中加入三乙胺(17.23mL,124mmol)和三光气(6.11g,20.60mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。向该反应混合物中加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(11.60g,51.5mmol)且在65℃搅拌12hr。将反应混合物冷却至室温，减压下完全蒸发溶剂，且分配在水(100mL)和EtOAc(2×200mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用25-30％EtOAc/己烷(梯度系统)洗脱，得到期望的产物(7.2g)，其为白色固体。产物(6.9g)在乙醇中(100mL)稀释，然后用Silicycle钯清除剂(3.5g)处理，然后在55℃搅拌3hr。将反应混合物通过硅藻土垫过滤，并将硅藻土垫用热乙醇(50ml)洗涤，将获得的滤液减压浓缩，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(6.9g,11.65mmol,56.6％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):591.16[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(4-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向固体(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(3.0g,8.83mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的溶液中加入固体三光气(1.572g,5.30mmol)，在氮气下在室温搅拌30分钟。随后向其中加入DIPEA(7.71mL,44.2mmol)和(S)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(2.97g,13.25mmol)，在密封管条件下在75℃保持16h。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物浓缩，将残余物吸收于二氯甲烷(100mL)。将溶液用水和盐水洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗产物加至中性氧化铝中，并用50％EtOAc/石油醚洗脱。收集级分并浓缩得到化合物，用戊烷洗涤，得到纯的化合物,LCMS(m/z)590.43[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(437mg,1.472mmol)，接着加入三乙胺(1.231mL,8.83mmol)。将反应混合物搅拌45min，然后加入(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(663mg,2.94mmol)在四氢呋喃(THF)(5mL)中的溶液。将反应混合物在65℃搅拌12hr。TLC指示起始原料耗尽且形成新的斑点。将水(25mL)加至反应混合物。将水层用EtOAc萃取(2×25mL)，合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，获得期望的粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶(洗脱剂35-50％EtOAc/石油醚)，获得期望的纯的产物(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,0.837mmol,56.9％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):590.8[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃先后将DIPEA(13.69g,106mmol)和三光气(10.48g,35.3mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(12.0g,35.3mmol)在四氢呋喃(THF)(200mL)中的溶液中,搅拌1h并加入(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(15.91g,70.6mmol)且在70℃加热18h。将反应混合物冷却至28℃，并分配在水(50mL)和EtOAc(100mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗产物。粗产物经combiflash柱色谱纯化(柱：C18，用90％ACN/1％甲酸的水溶液洗脱)，进一步用乙醇研磨，得到(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(6.0g,10.14mmol,28.7％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):591.25[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(4-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将NaH(0.283g,5.89mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.0g,2.94mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的溶液中，搅拌1h并缓慢加入(S)-(4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)氨基甲酸苯基酯(2.033g,5.89mmol)，然后在70℃搅拌18h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(20mL)和EtOAc(50mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗产物。粗制化合物经combiflash柱色谱纯化(柱：C18，用90％ACN/1％甲酸的水溶液洗脱)，进一步经柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用90％EtOAc/己烷洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(4-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.659mmol,22.38％收率)，其为白色固体LCMS(m/z),591.50(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(15g,44.2mmol)溶解在四氢呋喃(THF)(200mL)中，在0℃在氮气搅拌下加入三光气(10.48g,35.3mmol)，三乙胺(30.8mL,221mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。向其中加入(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(14.85g,66.2mmol)且在80℃搅拌16h。使得反应混合物达到室温并用500ml水淬灭，用3x800ml乙酸乙酯萃取。合并的有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目)，得到(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(9.3g,15.66mmol,35.5％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):590.16[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)在THF(30mL)中的溶液中加入三光气(218mg,0.736mmol)，然后搅拌至室温，持续1h。然后相继加入DIPEA(0.771mL,4.42mmol)和(R)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺(663mg,2.94mmol)，在密封管条件下在75℃保持16h。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(50mL)中并用乙酸乙酯萃取(2x100mL)。有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，得到粗物质。粗物质经柱色谱纯化(100-200硅胶)，使用5％甲醇/DCM的梯度混合物作为洗脱剂，得到(4S)-8-氯-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.335mmol,22.77％收率)，其为白色固体LCMS(m/z):591.38[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(437mg,1.472mmol)，接着加入三乙胺(1.231mL,8.83mmol)。将反应混合物搅拌45min，然后加入(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(497mg,2.208mmol)在四氢呋喃(THF)(5mL)中的溶液。将反应混合物在65℃搅拌12hr。TLC指示起始原料耗尽且形成新的斑点。将水(25mL)加至反应混合物。将水层用EtOAc萃取(2×25mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，获得期望的粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶(洗脱剂35-50％EtOAc/石油醚)，获得期望的纯的产物(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,0.834mmol,56.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):591.16[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(30g,88mmol)、三光气(26.2g,88mmol)和三乙胺(61.5mL,442mmol)在四氢呋喃(THF)(300mL)中的溶液在氮气下在室温搅拌15min。向该反应混合物中加入(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(59.7g,265mmol)。将反应混合物在70℃搅拌16h，并通过TLC监测反应进程。将反应混合物冷却至室温,倒入水(200mL)中并用EtOAc萃取(3×200mL)。合并的有机层用水(200mL)、盐水溶液(200mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用20％EtOAc/石油醚洗脱，得到纯的(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(23g,38.8mmol,44.0％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):591.4[M+H]+
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将TEA(0.821mL,5.89mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.4g,1.177mmol)在四氢呋喃(THF)(50mL)中搅拌的溶液中，接着在相同的温度加入三光气(0.349g,1.177mmol)且搅拌1h。加入(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(0.796g,3.53mmol)且在65℃搅拌15h。冷却至室温并用乙酸乙酯(100mL)和水(100mL)稀释。分离的有机层用水(50mL)和盐水(50mL)洗涤。有机层经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。使用氧化铝经柱色谱纯化且以50％乙酸乙酯/己烷洗脱，得到(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.25g,0.414mmol,35.2％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):591.1[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将三乙胺(24.62mL,177mmol)和三光气(8.73g,29.4mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(10g,29.4mmol)在THF中的搅拌的溶液中。将反应混合物搅拌45min并加入(R)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(13.20g,58.9mmol)。将反应混合物在65℃搅拌16hr。将反应混合物冷却至室温，完全减压蒸发溶剂，然后分配在水(100mL)和EtOAc(500mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。粗产物使用中性氧化铝经柱色谱纯化，并用30％EtOAc/己烷(梯度系统)洗脱，得到期望的产物(8.50g)，其为白色固体。产物(8.50g)稀释在乙醇中(100mL)，并用Silicycle钯清除剂(4.25g)处理，然后在65℃搅拌3hr。将反应混合物通过硅藻土垫过滤，并将硅藻土垫用热乙醇(50ml)洗涤,将获得的滤液减压浓缩，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(8.0g,13.52mmol,45.9％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):590.07[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在0℃向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(25g,73.6mmol)，三光气(13.10g,44.2mmol)在四氢呋喃(THF)(400mL)中的溶液中加入DIPEA(64.3mL,368mmol)。然后将反应混合物在30℃搅拌30min并加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(18.15g,81mmol)，然后将反应混合物在70℃搅拌16h。将反应经LCMS和TLC监测。将反应混合物倒入冷水(100mL)中并用乙酸乙酯萃取(2x300mL)。有机层经无水Na2SO4干燥且真空浓缩。粗制化合物经快速色谱纯化(100-200目，90％乙酸乙酯/石油醚)，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(18.5g,30.9mmol,41.9％收率)，其为黄色固体。LCMS(m/z):590.12[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将TEA(1.026mL,7.36mmol)和三光气(437mg,1.472mmol)加至溶液(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中且搅拌1h，加入(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺(330mg,1.472mmol)，然后在80℃加热15h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(25mL)和EtOAc(30mL×3)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗物质，然后将其进一步经柱色谱纯化(使用100-200硅胶柱，用50％乙酸乙酯/己烷洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.593mmol,40.3％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):590.16[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃先后将DIPEA(571mg,4.42mmol)和三光气(437mg,1.472mmol)加至(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(660mg,2.94mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中，搅拌1h并加入(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)，然后在70℃加热18hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(20mL)和EtOAc(50mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗物质(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯Rf:0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化(C-18:用70％甲醇/1％甲酸水溶液洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.339mmol,23.03％收率)，其为呈褐色的粘稠状物，LCMS(m/z)590.43(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃将(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(8g,23.55mmol)，TEA(16.41mL,118mmol)吸收在四氢呋喃(THF)(80mL)中，所得黄色溶液在室温搅拌10min。然后在0℃一次性加入三光气(6.99g,23.55mmol)。在室温将所得黄色混悬液搅拌45min。在0℃将(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺(7.92g,35.3mmol)的THF(10mL)溶液加至上述黄色混悬液，历时2min的一段时间。将所得黄色混悬液加热至70℃，保持24hr。反应进程经TLC 5％MeOH/DCM监测，TLC指示形成多个斑点，24h后起始原料耗尽。将反应混合物冷却至室温，然后用水稀释(20mL)，用EtOAc萃取(2×40mL),分离的有机层，用盐水(20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制的黄色固体。粗物质经combiflash纯化，使用硅胶柱(12g,5％MeOH/DCM)。将含纯的化合物的级分合并并浓缩，得到期望的化合物(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(11g,18.53mmol,79％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z):590.06[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.177mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的溶液中加入三乙胺(0.985mL,7.06mmol)和三光气(349mg,1.177mmol)，在氮气下在室温搅拌30min，向该反应混合物中加入6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡啶-2-胺(701mg,2.94mmol)且在65℃搅拌16hr。TLC洗脱剂：70％乙酸乙酯/己烷Rf:0.3,UV活化的。将反应混合物冷却至室温，减压完全蒸发溶剂，然后分配在水(10mL)和EtOAc(2×50mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体。将粗物质用DCM稀释，然后用中性氧化铝吸收且用25-30-％EtOAc/石油醚洗脱，收集级分并浓缩，得到(4S)-8-氯-N-(6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.478mmol,40.6％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):604.14[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在28℃将三光气(437mg,1.472mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)和TEA(1.231mL,8.83mmol)在四氢呋喃(THF)(50mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在室温搅拌30min，且加入(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺(663mg,2.94mmol)。将反应混合物在65℃搅拌。将反应混合物冷却至28℃；将反应混合物分配在水(2mL)和EtOAc(2x25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质。将粗物质经GRACE纯化，使用C-18反相柱，流动相A:0.1％甲酸/水；B:ACN,产物以50％ACN/0.1％甲酸/水洗脱。蒸发溶剂并用饱和NaHCO3碱化。过滤析出的固体，并干燥，得到(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.495mmol,33.6％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):591.19[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将三光气(393mg,1.325mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(450mg,1.325mmol)和三乙胺(1.108mL,7.95mmol)在三光气(393mg,1.325mmol)中搅拌的溶液中。将反应混合物搅拌2h并加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-胺(746mg,3.31mmol)。将反应混合物在65℃搅拌10hr。将反应混合物冷却至室温，减压完全蒸发溶剂，然后分配在水(40mL)和EtOAc(2×50mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体。将粗物质用DCM稀释，然后用中性氧化铝吸收且用40-45％EtOAc/石油醚洗脱，收集级分并浓缩，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.761mmol,57.4％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):591.17[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃将三光气(21.84g,73.6mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(25.0g,73.6mmol)，和TEA(51.3mL,368mmol)在四氢呋喃(THF)(200mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物搅拌60min并加入(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(49.5g,221mmol)。将反应混合物在72℃搅拌10hr。将反应混合物冷却至25℃，将析出的固体过滤并用乙酸乙酯洗涤(100ml)。滤液用水(20ml)和盐水溶液(20ml)洗涤。分离有机相，然后经无水Na2SO4干燥，过滤，且将滤液蒸发得到粗物质。将该粗物质经中性氧化铝快速色谱纯化，用30-40％EtOAc/石油醚洗脱，得到期望的化合物，其为固体。将其再次用30％乙醚/戊烷研磨，得到期望的化合物，其为灰白色固体。将该化合物在乙醇中(600mL)稀释，并用Silicycle钯清除剂(12g)处理，然后在50℃搅拌3hr。将其通过硅藻土垫过滤，并将硅藻土垫用热乙醇(50ml)洗涤，将获得的滤液减压浓缩，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(22.0g,37.1mmol,50.4％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):590.07[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(8.5g,25.02mmol)在四氢呋喃(THF)(250mL)中的溶液中加入三光气(7.42g,25.02mmol)，接着加入三乙胺(20.92mL,150mmol)，所得混悬液在室温搅拌20min。将(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(11.27g,50.0mmol)加至反应物质中并将所得混悬液加热至70℃，保持16hr。通过TLC监测反应(其显示不存在起始原料并且在Rf:0.6形成新斑点)。粗物质经硅胶柱色谱纯化(100-200硅胶,0-3％MeOH/DCM)。将含纯的化合物的级分合并并浓缩，得到期望的化合物(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(8.5g,13.19mmol,52.7％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):591.07(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃将(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)和三光气(262mg,0.883mmol)中的溶液搅拌至室温，持续30分钟。然后先后加入DIPEA(1.285mL,7.36mmol)和(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(578mg,2.58mmol)，然后在75℃搅拌15hr 30分钟。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(50mL)并用乙酸乙酯萃取(2x150mL)。有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。粗物质经柱色谱纯化(100-200硅胶)，使用80％EtOAc/石油醚的梯度混合物作为洗脱剂，得到纯的化合物(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.691mmol,47.0％收率)，LCMS(m/z):590.37(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将三光气(437mg,1.472mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)和TEA(1.231mL,8.83mmol)在四氢呋喃(THF)(25mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物搅拌4h，然后加入6-(3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙氧基)吡啶-2-胺(743mg,2.94mmol)。将反应混合物在65℃搅拌16h。通过TLC监测反应。将反应混合物减压蒸发，然后在500ml乙酸乙酯中重构。有机层先后用水(200mL)和盐水溶液(100mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物通过LCMS确定。粗产物在下一步中纯化,LCMS(m/z):618.10(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃先后将DIPEA(571mg,4.42mmol)和三光气(437mg,1.472mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中,搅拌1h，然后加入(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺(660mg,2.94mmol)，然后在70℃加热18hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(20mL)和EtOAc(50mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗物质(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯Rf:0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化(C-18:用70％甲醇/1％甲酸水溶液洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.583mmol,39.6％收率),其为呈褐色的粘稠状物，LCMS(m/z):590.43(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
先后将TEA(0.821mL,5.89mmol)和三光气(175mg,0.589mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.177mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的搅拌的溶液中，在室温搅拌1h并加入2-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)嘧啶-4-胺(310mg,1.295mmol)，然后在80℃加热15h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(15mL)和EtOAc(30mL×2)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗物质，为胶状物。将其经柱色谱纯化(使用100-200硅胶,柱在90％乙酸乙酯/己烷中洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(2-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(310mg,0.505mmol,42.9％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):603.41(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.177mmol)，三光气(349mg,1.177mmol)和三乙胺(0.821mL,5.89mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中在氮气下在室温搅拌15min。向该反应混合物中加入(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺(796mg,3.53mmol)。将反应混合物在70℃搅拌16h，并通过TLC监测反应进程。将反应混合物冷却至室温,倒入水(10mL)并用EtOAc萃取(3×20mL)。合并的有机层用水(20mL)，盐水溶液(20mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并蒸发得到粗制化合物。TLC洗脱剂：100％EtOAc/己烷,Rf:0.1,UV活化的。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用50％EtOAc/石油醚洗脱，得到纯的(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.590mmol,50.1％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):591.26[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温将TEA(0.985mL,7.06mmol)和三光气(349mg,1.177mmol)加至(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.177mmol)在四氢呋喃(THF)(40mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在室温搅拌30min。加入(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-胺(530mg,2.355mmol)并将反应混合物在65℃搅拌15h。将反应混合物冷却至室温，减压完全蒸发溶剂，然后分配在水(30mL)和EtOAc(100mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用30％EtOAc/己烷(梯度系统)洗脱，得到期望的产物((4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.495mmol,42.1％收率)，其为淡黄色固体(TLC洗脱剂：70％EtOAc/己烷:Rf0.5；UV活化的)，LCMS(m/z):591.19[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(10g,29.4mmol)在THF(300mL)中的溶液中加入三光气(4.37g,14.72mmol)，然后搅拌至室温，持续1h。然后先后加入TEA(20.51mL,147mmol)和(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(13.20g,58.9mmol)，在密封管条件下在75℃保持16h。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(300mL)并用乙酸乙酯萃取(1000mL)。有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，得到粗物质。粗物质经柱色谱纯化(100-200硅胶)，使用80％EtOAc/石油醚的梯度混合物作为洗脱剂，得到(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(8.2g,13.81mmol,46.9％收率)。然后将该物质经Pd清除剂树脂工艺纯化。在50℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(8.2g)在乙醇中(250ml)中的搅拌的溶液中加入Pd清除剂树脂(4.5g)且在70℃搅拌5h。然后冷却至40℃，将反应混合物过滤并减压浓缩，得到((4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(8g)，其为白色固体,LCMS(m/z)590.12[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温将三乙胺(1.312ml,9.42mmol)和三光气(466mg,1.569mmol)加至(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(450mg,1.569mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在室温搅拌30min。加入(R)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(704mg,3.14mmol)并将反应混合物在65℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温；减压完全蒸发溶剂，然后分配在水(30mL)和EtOAc(100mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体。粗物质经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用50％EtOAc/己烷洗脱，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.383mmol,24.40％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):536.9[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.744mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(517mg,1.744mmol)，接着加入三乙胺(1.458mL,10.46mmol)。将反应混合物搅拌45min，然后加入(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(785mg,3.49mmol)在四氢呋喃(THF)(5mL)中的溶液。将反应混合物在65℃搅拌16hr。通过TLC监测反应进程。TLC指示起始原料被耗尽。冷却反应物质至室温，用水稀释(50mL)并用乙酸乙酯萃取(50mL×2)。合并有机层并经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗物质，其为棕色粘稠的化合物。粗产物在combiflash硅胶柱(40g)中纯化并用Hex/EtOAc洗脱。收集级分:50％EtOAc/石油醚，洗脱产物。浓缩产物级分，得到(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.447mmol,25.6％收率)，其为浅黄色固体。
LCMS(m/z):538.14[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.744mmol)在四氢呋喃(THF)(5mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(517mg,1.744mmol)，将反应混合物在室温搅拌30min，然后将(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(589mg,2.62mmol)加至反应混合物,将反应混合物在70℃搅拌18hr。通过TLC监测反应进程。反应混合物用水稀释(30mL)用EtOAc萃取(3×30mL),有机层合并并用盐水溶液洗涤(30mL),有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物，粗物质经柱色谱纯化，使用100-200目硅胶并用40％EtOAc/己烷洗脱化合物，得到(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.807mmol,46.3％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):538.47(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在0℃向(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350mg,1.221mmol)，三光气(217mg,0.732mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的溶液中加入三光气(217mg,0.732mmol)。然后将反应混合物在30℃搅拌30min并加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(411mg,1.831mmol)，然后将反应混合物在70℃搅拌15h 30min。反应混合物经LCMS监测。将反应混合物倒入冷水(20mL)中并用乙酸乙酯萃取(2x20mL)。有机层经无水Na2SO4干燥且真空浓缩，获得粗产物。粗制化合物经快速色谱纯化(100-200目)，获得(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.778mmol,63.7％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z):536.9[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(4-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在0℃向(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(250mg,0.872mmol)，三光气(155mg,0.523mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中加入DIPEA(0.761mL,4.36mmol)。然后将反应混合物在30℃搅拌30min并加入(S)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(293mg,1.308mmol)，然后将反应混合物在70℃搅拌15h 30min。将反应经LCMS和TLC监测。将反应混合物倒入冷水(20mL)中并用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。有机层经无水Na2SO4干燥且真空浓缩。粗制化合物经快速色谱纯化(100-200目，90％乙酸乙酯/石油醚)，得到(4S)-8-氯-N-(4-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(230mg,0.417mmol,47.9％收率)，LCMS(m/z):537.05[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.395mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的溶液中加入三光气(400mg,1.348mmol)，所得溶液在室温搅拌20min。将(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(626mg,2.79mmol)在THF(10mL)中的溶液加至反应物质并将所得混悬液加热至60℃，保持16hr。反应完成后(经TLC监测，观察到极性和非极性的两个斑点)，将水(20ml)加至反应物质并用乙酸乙酯萃取(2X20ml)。有机层经Na2SO4干燥过滤并减压浓缩，获得深棕色液体。粗物质经combiflash纯化，使用硅胶柱(12g,80％EtOAc/石油醚)。将含纯的化合物的级分合并并浓缩，得到期望的化合物(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(330mg,0.596mmol,42.7％收率)，其为淡棕色固体。LCMS(m/z):537.2(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将三乙胺(1.458mL,10.46mmol)和三光气(517mg,1.744mmol)加至(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.744mmol)在四氢呋喃(THF)(25mL)中的搅拌的溶液中，搅拌30min。将(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(589mg,2.62mmol)加至上述反应混合物，在70℃搅拌16h。使反应混合物达到室温，通过旋转蒸发从反应混合物中除去有机溶剂，将残余物分配在水(40mL)和EtOAc(80mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，40％乙酸乙酯/己烷作为洗脱剂，得到(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(225mg,0.383mmol,21.94％收率)，其为淡黄色固体。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM Rf:0.4；UV活化的).LCMS(m/z):538.28[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.744mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的溶液中加入三乙胺(1.458mL,10.46mmol)和三光气(517mg,1.744mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。向该反应混合物中加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(1178mg,5.23mmol)且在65℃搅拌.通过TLC监测反应。减压除去溶剂，用水稀释(20mL)并用乙酸乙酯萃取(2×50mL)。合并的有机层用水(30mL),饱和盐水溶液(10mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩。将粗制化合物溶于DCM(15mL)中。将中性氧化铝加至粗制化合物并经柱色谱纯化。产物用30-35％乙酸乙酯/己烷洗脱。将收集的级分减压蒸发，得到纯的(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.370mmol,21.23％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):536.25(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃先后将TEA(0.729mL,5.23mmol)和三光气(517mg,1.744mmol)加至(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.744mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中,搅拌1h并加入(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(785mg,3.49mmol)，然后在70℃加热15h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(50mL)和EtOAc(100mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗物质，为胶状物(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯Rf:0.4；UV活化的)。粗产物经柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用90％EtOAc/己烷洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.428mmol,24.53％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):538.35(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气气氛下在室温搅拌的(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.744mmol)在四氢呋喃(THF)(50mL)中的溶液中加入三乙胺(1.458mL,10.46mmol)和三光气(517mg,1.744mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min，随后加入(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(785mg,3.49mmol)。然后将反应混合物在65℃搅拌16h。通过TLC监测反应。将反应混合物减压蒸发，然后在200ml乙酸乙酯中重构。有机层先后用水(100mL)和盐水溶液(50mL)洗涤并用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物进行硅胶(100-200目)，并用100％乙酸乙酯洗脱，得到化合物(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(230mg,0.396mmol,22.72％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):537.9(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将三光气(414mg,1.395mmol)加至(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400.0mg,1.395mmol)，和TEA(0.972mL,6.97mmol)在四氢呋喃(THF)(20.0mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物搅拌30min并加入(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(938mg,4.18mmol)。将反应混合物在72℃搅拌10hr。将反应混合物冷却至25℃，将析出的固体过滤并用乙酸乙酯洗涤(40mL)。滤液用水(10ml)和盐水溶液(10mL)洗涤。分离有机相，然后经无水Na2SO4干燥，过滤，且将滤液蒸发得到粗物质。将该粗物质经中性氧化铝快速色谱纯化，用20-30％EtOAc/石油醚洗脱，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(380.0mg,0.677mmol,48.5％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):537.34(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将三光气(414mg,1.395mmol)加至(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.395mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在室温搅拌45min，然后依次加入三乙胺(1.167mL,8.37mmol)和(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(626mg,2.79mmol)。将反应混合物在65℃搅拌6hr。通过TLC监测反应。TLC示出一个极性斑点且起始原料被耗尽。停止反应。将反应混合物减压浓缩至干。将残余物吸收在DCM(100mL)中，将有机层先后用水和盐水溶液洗涤。有机层经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物经硅胶柱色谱纯化(100-200目)，并将柱用30％EtOAc/己烷洗脱。收集纯的级分并蒸发，得到所需产物((4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.531mmol,38.0％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):537.2[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将TEA(0.972mL,6.97mmol)加至(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.4g,1.395mmol)在四氢呋喃(THF)(50mL)中的搅拌的溶液中，接着在相同的温度加入三光气(0.414g,1.395mmol)且搅拌1h。加入(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(0.943g,4.18mmol)，然后在65℃搅拌15h。冷却至室温，然后用乙酸乙酯(50mL)和水(50mL)稀释。分离的有机层用水(50mL)和盐水(50mL)洗涤。有机层经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物通过柱色谱纯化，使用氧化铝且在50％乙酸乙酯/己烷中洗脱，得到(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.350g,0.644mmol,46.2％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):538.28[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.046mmol)，三光气(310mg,1.046mmol)和三乙胺(0.875mL,6.28mmol)在四氢呋喃(THF)(5mL)中的溶液在氮气下在室温搅拌15min。向该反应混合物中加入(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(707mg,3.14mmol)。将反应混合物在70℃搅拌16hr，并通过TLC监测反应进程。将反应混合物冷却至室温,倒入水(10mL)中并用EtOAc萃取(3×20mL)。然后将合并的有机层用水(10mL)，盐水溶液(10mL)洗涤，经Na2SO4干燥并蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用100％EtOAc洗脱，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.379mmol,36.2％收率)，LCMS(m/z):537.9[M+H]+。
合成(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向固体(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.585mmol)在THF(30mL)中的溶液加入固体三光气(282mg,0.951mmol)，在氮气下在室温搅拌30分钟。随后向其中加入DIPEA(1.384mL,7.93mmol)和(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(533mg,2.378mmol)，在密封管条件下在75℃保持16h。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物浓缩，将残余物吸收于DCM(200mL)。将溶液用水和盐水洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗产物加至中性氧化铝中，并用50％EtOAc/石油醚洗脱。收集级分并浓缩，又得到相同的不纯的化合物，用制备型HPLC纯化，得到纯的化合物(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.298mmol,18.83％收率)，LCMS(m/z):503.39[M+H]+。
合成(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.189mmol)在四氢呋喃(THF)(5mL)中的溶液中加入三光气(353mg,1.189mmol)和TEA(0.166mL,1.189mmol)并搅拌2h,向其中加入(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(268mg,1.189mmol)加入并将反应混合物在60℃搅拌16hr。反应混合物用冰水淬灭并用2x15ml乙酸乙酯萃取,合并的有机层用10ml水和5ml盐水溶液洗涤，有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩，得到粗制化合物,LCMS(m/z):504.40[M+H]+。
合成(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的溶液中加入三光气(588mg,1.982mmol)和TEA(1.657mL,11.89mmol)搅拌2h,向其中加入(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(889mg,3.96mmol)并将反应混合物在60℃搅拌16hr。通过TLC监测反应。反应混合物用冰水淬灭并用2x15ml乙酸乙酯萃取,合并的有机层用15ml水和15ml盐水溶液洗涤，有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。将粗产物加至100-200硅胶柱并用2％的DCM/MeOH洗脱，得到纯的化合物(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.612mmol,30.9％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):503.39[M+H]+。
合成(4S)-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.189mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(353mg,1.189mmol)和TEA(0.994mL,7.13mmol)并搅拌2h，向其中加入(R)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(533mg,2.378mmol)并将反应混合物在60℃搅拌16hr。通过TLC监测反应。反应混合物用冰水淬灭并用2x15ml乙酸乙酯萃取,合并的有机层用15ml水和15ml盐水溶液洗涤，有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。将粗产物加至100-200硅胶柱并用2％DCM/MeOH洗脱，得到纯的化合物(4S)-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.277mmol,23.27％收率)，其为淡棕色固体，LCMS(m/z):503.45[M+H]+。
合成(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将三乙胺(1.381mL,9.91mmol)和三光气(294mg,0.991mmol)加至(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(580mg,2.58mmol)在四氢呋喃(THF)(100mL)中的搅拌的溶液中且搅拌5h。然后在室温将(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)加至反应混合物，然后在80℃搅拌15h。将反应混合物冷却至室温，用水稀释(50mL)，用乙酸乙酯萃取(2×75mL)并用盐水洗涤(100mL)。分离有机层，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物,LCMS:(m/z):504.46[M+H]+。
合成(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将三光气(353mg,1.189mmol)和三乙胺(1.657mL,11.89mmol)加至(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(893mg,3.96mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的搅拌的溶液中且搅拌1h。然后将(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)加至反应混合物，然后在80℃搅拌15h。将反应混合物冷却至室温，用水稀释(50mL)，用乙酸乙酯萃取(2X70mL)，用盐水溶液洗涤(20mL)。分离有机层，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物,LCMS(m/z):504.28[M+H]+。
合成(4R)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气下在20℃搅拌的烟酸(2.8g,22.74mmol)在四氢呋喃(100mL)中的混悬液中加入DPPA(9.39g,34.1mmol)、DIPEA(11.92mL,68.2mmol)的溶液，然后在相同的温度再搅拌1h,加入固体(4R)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(3.56g,18.20mmol)。将反应混合物在80℃搅拌16hr。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物直接减压蒸发,用乙酸乙酯(200mL)稀释，随后用水洗涤。有机层经无水Na2SO4干燥，减压浓缩得到粗物质，经柱色谱纯化(100-200硅胶)，使用1％甲醇/EtOAc的梯度混合物作为洗脱剂，得到(4R)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(4g,12.13mmol,53.3％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):316.19[M+H]+。
合成(4R)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4R)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(2g,10.22mmol)，(2-甲基吡啶-4-基)硼酸(2.100g,15.33mmol)和K3PO4(6.51g,30.7mmol)在1,4-二噁烷(40mL)和水(10mL)中脱气的溶液中加入x-phos(1.949g,4.09mmol)，Pd2(dba)3(1.872g,2.044mmol)。将反应混合物在110℃搅拌3hr。通过TLC监测反应。将反应混合物倒入冷水(50mL)并用乙酸乙酯萃取(2x100mL)。有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩。粗产物加至硅胶柱并用2％DCM/MeOH洗脱。将收集的级分蒸发，得到(4R)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.2g,4.71mmol,46.1％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):253.0[M+H]+。
合成(4R)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向固体(4R)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.2g,4.76mmol)在四氢呋喃(THF)(80mL)中加入固体三光气(0.847g,2.85mmol)，在氮气下在室温搅拌30分钟。向其中加入DIPEA(4.15mL,23.78mmol)和4-溴吡啶-2-胺(1.234g,7.13mmol)。将反应混合物在75℃搅拌16hr。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物用水稀释(60ml)并用乙酸乙酯萃取(3X100ml)。分离有机层并经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，得到粗产物。将粗物质通过快速色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，使用2.5％甲醇-DCM作为洗脱剂，得到纯的化合物(4R)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(1g,2.194mmol,46.1％收率)，其为淡黄色固体LCMS(m/z)453.26[M+H]+。
合成(4S)-8-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.02mmol)，甲基硼酸(0.361g,6.04mmol)和K3PO4(1.923g,9.06mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(5mL)中的脱气的溶液中加入固体Pd2(dba)3(0.276g,0.302mmol)和x-phos(0.288g,0.604mmol)。将反应混合物在100℃搅拌15.5hr。将反应混合物用水稀释(50mL)并用乙酸乙酯萃取(3×50mL)。有机层经无水Na2SO4干燥，减压浓缩得到半纯的化合物。粗产物经快速色谱(100-200目)纯化并用3％DCM/EtOAc洗脱，获得(4S)-8-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.802mmol,59.7％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z):267.1[M+H]+。
合成(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在0℃搅拌下向(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,1.812mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中加入NaH(65.2mg,2.72mmol)。然后将反应混合物在30℃搅拌1h，加入3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(522mg,2.174mmol)，然后将反应混合物在70℃搅拌15h。经LCMS监测。将反应混合物倒入冷水(20mL)中并用乙酸乙酯萃取(0mL)。有机层经无水Na2SO4干燥且真空浓缩。粗制化合物经快速色谱纯化(100-200目，2％MeOH/DCM作为洗脱剂)，得到期望的产物(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(320mg,0.579mmol,31.9％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):450.8[M+H]+。
合成(4S)-N-(6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将TEA(1.141mL,8.19mmol)和三光气(486mg,1.638mmol)加至(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.638mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中且搅拌1h，然后加入6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡嗪-2-胺(431mg,1.802mmol)并在80℃加热15h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在之间水(25mL)和EtOAc(30mL×2)。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到(4S)-N-(6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(310mg,0.498mmol,30.4％收率)，其为灰白色固体，LCMS:571.35(M+H)+。
合成(4S)-N-(2-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将TEA(1.141mL,8.19mmol)和三光气(486mg,1.638mmol)加至(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.638mmol)在四氢呋喃(THF)(25mL)中的溶液中，然后搅拌1h并加入2-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)嘧啶-4-胺(431mg,1.802mmol)，且在80℃加热15h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(25mL)和EtOAc(25mL×2)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到(4S)-N-(2-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.510mmol,31.1％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):571.11(M+H)+。
合成(4S)-N-(6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350mg,1.146mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中加入三乙胺(0.959mL,6.88mmol)和三光气(340mg,1.146mmol)，在氮气下在室温搅拌1h,向该反应混合物中加入6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡啶-2-胺(820mg,3.44mmol)且在65℃搅拌16h。TLC洗脱剂：70％乙酸乙酯/己烷Rf:0.3,UV活化的。将反应混合物冷却至室温；减压完全蒸发溶剂，然后分配在水(10mL)和EtOAc(2×50mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体。将粗物质用DCM稀释，然后用中性氧化铝吸收且用30-35-％EtOAc/石油醚洗脱，收集级分并浓缩，得到(4S)-N-(6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.524mmol,45.7％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):570.2[M+H]+。
合成(4S)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在室温将4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-2-(三氟甲基)吡啶(9.07g,33.2mmol)和K3PO4(16.27g,77mmol)加至(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(5.0g,25.6mmol)在1,4-二噁烷(160mL)和水(40mL)中的搅拌的溶液中并脱气30min。然后在室温将Pd2(dba)3(2.340g,2.56mmol)和X-phos(2.437g,5.11mmol)加至反应混合物且再次脱气5分钟。然后将反应混合物在80℃搅拌18hr。将反应混合物冷却至室温，用水稀释(100mL)，用乙酸乙酯萃取(2X100mL)并用盐水洗涤(50mL)。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯Rf 0.2；UV活化的)。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶60-120目)，用80％的乙酸乙酯/石油醚洗脱，得到(4S)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(6.5g,20.88mmol,82％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z):307.0(M+H)+。
合成(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃先后将DIPEA(7.60g,58.8mmol)和三光气(5.81g,19.59mmol)加至(4S)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(6.0g,19.59mmol)在四氢呋喃(THF)(120mL)中的溶液中,搅拌1h并加入4-溴吡啶-2-胺(6.78g,39.2mmol)，然后在70℃加热18hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(100mL)和EtOAc(100mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯Rf0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化(60-120目)硅胶，用70％乙酸乙酯/己烷洗脱)，得到(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(4.5g,8.40mmol,42.9％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):506.94(M+H)+。
合成(4S)-7-(2,2-二氟苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.6g,3.07mmol)在1,4-二噁烷(20mL)、水(4.00mL)中的溶液中用氮气吹洗10min，然后加入(2,2-二氟苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)硼酸(0.929g,4.60mmol)和K2CO3(1.272g,9.20mmol)，再次用氮气吹洗10min，然后加入Pd(Ph3P)4(0.106g,0.092mmol)。将所得反应混合物在100℃加热16hr。将反应混合物冷却至室温，加入水(50mL)并搅拌20min。将获得的固体过滤，用乙醚(10mL)和正戊烷(5mL)洗涤，得到(4S)-7-(2,2-二氟苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(420mg,1.055mmol,34.4％收率)，其为棕色固体，LCMS(m/z):318.10(M+H)+。合成(4S)-8-溴-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在70℃在氮气气氛下向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(3g,15.33mmol)在氯仿(20mL)中的搅拌的溶液中加入NBS(3.00g,16.87mmol)。将所得反应混合物在70℃搅拌1hr。通过TLC监测反应进程,TLC指示起始物质耗尽，形成非极性斑点。将反应混合物冷却至RT并用水稀释(100mL)，用DCM萃取(2x100mL)。有机层合并并用水(100mL)，盐水溶液(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到黄色粘稠的化合物，将其用正戊烷洗涤并充分干燥，得到(4S)-8-溴-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(2g,7.28mmol,47.5％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z):276.05(M+H)+。
合成(4S)-8-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将(4S)-7-氯-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.908mmol)，(3-(三氟甲基)苯基)硼酸(290mg,1.526mmol)和碳酸铯(622mg,1.908mmol)在1,4-二噁烷(10mL)&水(3.3mL)中的混悬液搅拌并用氩气在室温脱气15min，将PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(1558mg,1.908mmol)加至反应混合物。然后将反应混合物在90℃搅拌16hr。将反应混合物冷却至室温，然后经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤(100ml)。吸取滤液并浓缩并用EtOAc溶解(50ml)。EtOAc层先后用水(100ml)和盐水溶液(100mL)洗涤并用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。纯化粗产物，使用硅胶(100-200目)和50％EtOAc/己烷作为洗脱剂，得到(4S)-8-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.518mmol,80％收率)(TLC洗脱剂：净EtOAc:Rf-0.4.；UV活化的)，LCMS(m/z):320.18[M+H]+。
合成(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-8-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向固体(4S)-8-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.566mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的溶液中加入固体三光气(279mg,0.939mmol)，DIPEA(1.641mL,9.39mmol)且在氮气下在室温搅拌30分钟。随后向其中加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(562mg,2.505mmol)，在密封管条件下在80℃保持15h 30分钟。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物用水稀释(100ml)并用乙酸乙酯萃取(2×100ml)。合并的有机层用无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200)并用70％EtOAc/己烷(梯度系统)洗脱，得到(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-8-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.689mmol,44.0％收率)，LCMS(m/z):570.34[M+H]+。
合成(4S)-N-(4-(2,2-二甲基-3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温将TEA(0.998mL,7.16mmol)和三光气(354mg,1.194mmol)加至(4S)-7-(间甲苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.194mmol)在四氢呋喃(THF)(50mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在室温搅拌30min，加入4-(2,2-二甲基-3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡啶-2-胺(731mg,3.58mmol)并将反应混合物在65℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温，减压完全蒸发溶剂，然后分配在水(20mL)和EtOAc(50mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物(4S)-N-(4-(2,2-二甲基-3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(220mg,0.370mmol,31.0％收率)，其为棕色固体，LCMS(m/z):483.26[M+H]+。
合成7-氯-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将8-溴-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.64mmol)，2,4,6-三甲基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三硼杂环己烷(0.457g,3.64mmol)和碳酸钾(1.510g,10.93mmol)在1,4-二噁烷(15mL)&水(5mL)中的混悬液中搅拌并用氩气在室温脱气15min，将PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(2.97g,3.64mmol)加至反应混合物。然后将反应混合物在90℃搅拌16hr。将反应混合物冷却至室温，然后经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤(100mL)。将滤液浓缩用EtOAc溶解(100ml)。EtOAc层先后用水(100ml)和盐水溶液(50mL)洗涤，用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用40％EtOAc/己烷(梯度系统)洗脱，得到期望的产物7-氯-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,2.194mmol,60.2％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):210.11[M+H]+。
合成(4S)-7-(3-(二氟甲基)苯基)-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将(4S)-7-氯-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.908mmol)，(3-(二氟甲基)苯基)硼酸(328mg,1.908mmol)和碳酸钾(791mg,5.72mmol)在1,4-二噁烷(15mL)&水(4mL)中的混悬液中搅拌并用氩气在室温脱气15min，将PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(1558mg,1.908mmol)加至反应混合物。然后将反应混合物在90℃搅拌16hr。将反应混合物冷却至室温，然后经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤(100ml)。将滤液浓缩用EtOAc溶解(50ml)。EtOAc层先后用水(50ml)和盐水溶液(50mL)洗涤并用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200)并用50％EtOAc/己烷(梯度系统)洗脱，得到期望的产物(4S)-7-(3-(二氟甲基)苯基)-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.969mmol,50.8％收率)，其为淡黄色固体LCMS(m/z):302.11[M+H]+。
合成(4S)-7-(3-(二氟甲基)苯基)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-8-甲基-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向固体(4S)-7-(3-(二氟甲基)苯基)-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(250mg,0.830mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的溶液中加入固体三光气(148mg,0.498mmol)，DIPEA(0.869mL,4.98mmol)且在氮气下在室温搅拌30分钟。随后向其中加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(298mg,1.327mmol)，在密封管条件下在75℃保持15h 30分钟。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物用水稀释(10ml)并用乙酸乙酯萃取(2×50ml)。合并的有机层用无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物,LCMS(m/z):551.91[M+H]+。
合成(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向固体(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(2.5g,9.91mmol)在四氢呋喃(THF)(40mL)中的溶液中加入固体三光气(1.764g,5.94mmol)，在氮气下在室温搅拌30分钟。向其中加入DIPEA(8.65mL,49.5mmol)和4-溴吡啶-2-胺(2.57g,14.86mmol)。将反应混合物在65℃搅拌16hr。通过TLC监测反应。将有机相加入乙酸乙酯中并用水50mL和饱和盐水100mL洗涤，经Na2SO4干燥并真空蒸发，得到粗产物，其为棕色固体，粗产物加至中性氧化铝中并用EtOAc洗脱，收集级分得到化合物，用乙醚和戊烷洗涤，然后过滤并用乙醚洗涤，得到纯的化合物(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(1.72g,2.97mmol,30.0％收率)，LCMS(m/z):453.20[M+H]+。
合成(4S)-N-(5-溴吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(8g,31.7mmol)在四氢呋喃(THF)(130mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(5.65g,19.02mmol)，DIPEA(27.7mL,159mmol)。在氮气下在室温搅拌30分钟。随后向其中加入5-溴吡啶-3-胺(8.23g,47.6mmol)，在密封管条件下在75℃保持16h。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物分配在乙酸乙酯(200mL)和水(100mL)之间。有机溶液用水和盐水洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗产物加至中性氧化铝柱中，然后用50％EtOAc/石油醚洗脱。收集级分并浓缩，得到化合物并用戊烷洗涤，得到纯的化合物(4S)-N-(5-溴吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(6.2g,12.72mmol,40.1％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):451.19[M+H]+。
合成(4S)-N-(5-溴-1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气气氛下向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.0g,3.96mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的搅拌的溶液中加入TEA(2.76mL,19.82mmol)和三光气(1.176g,3.96mmol)。将所得反应混合物在室温搅拌1hr。将3-氨基-5-溴-1-甲基吡啶-2(1H)-酮(0.805g,3.96mmol)加至反应混合物，然后在70℃搅拌16hr。通过TLC监测反应进程。反应混合物用水稀释(50mL)，用EtOAc萃取(3X50mL),有机层合并并经无水Na2SO4干燥，过滤并真空浓缩，得到粗制化合物。粗物质经柱色谱纯化(100-200目硅胶，用2％MeOH/DCM洗脱)，得到(4S)-N-(5-溴-1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(800mg,1.338mmol,33.8％收率)，为棕色固体化合物,LCMS(m/z):481.22[M+H]+。
合成(4S)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在氮气搅拌下在室温向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(3g,15.33mmol)，1-乙基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(4.09g,18.40mmol)在1,4-二噁烷(40mL)、水(10.00mL)中的溶液中加入磷酸三钾(9.76g,46.0mmol)。用氮气将反应物质脱气15min。在室温向其中加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(1.252g,1.533mmol)且再脱气15min。将反应混合物在100℃搅拌16hr。通过TLC监测反应进程。TLC指示起始原料耗尽，形成新的斑点。冷却反应物质至室温，用乙酸乙酯(100mL)稀释，过滤通过硅藻土，收集滤液，并用水(100mL)洗涤。有机层经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗产物加至硅胶(100-200)柱并用DCM/MeOH,5％MeOH/DCM洗脱。浓缩产物级分，得到(4S)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(2g,7.83mmol,51.1％收率)，其为绿色固体，LCMS(m/z):256.22(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在氮气搅拌下在室温向(4S)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(2g,7.83mmol)在氯仿(20mL)中的溶液中加入NCS(1.255g,9.40mmol)。将反应混合物在室温搅拌1hr。通过TLC监测反应进程。TLC指示起始原料耗尽，形成新的斑点，Rf为0.3。将水(50mL)加至反应混合物并用DCM萃取(50mL)。有机层经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗物质，其为棕色粘稠的化合物。粗产物加至硅胶(100-200)柱并用CH2Cl2/MeOH、3％甲醇/DCM洗脱，洗脱产物。浓缩产物级分，得到(4S)-8-氯-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.2g,3.15mmol,40.2％收率)，其为浅棕色粘稠的化合物,LCMS(m/z):290.04(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向(4S)-8-氯-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.726mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中加入TEA(1.203mL,8.63mmol)，三光气(512mg,1.726mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。向其中加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(387mg,1.726mmol)。在室温，将反应混合物在80℃搅拌6hr。通过TLC监测反应进程。TLC指示起始原料耗尽，形成新的斑点，Rf为0.4Rf。冷却反应物质至室温，用水稀释(100mL)并用乙酸乙酯萃取(100mL)。有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗物质，其为棕色粘稠的化合物。将粗产物加至combiflash硅胶(40g)柱并用3％DCM/MeOH洗脱。浓缩纯的产物级分，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,0.881mmol,51.1％收率)(N37522-56-A2)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):539.95(M+H)+。
合成(4S)-7,8-二氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在0℃向(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(5g,25.6mmol)在氯仿(50mL)中的搅拌的溶液中分批加入NCS(5.12g,38.3mmol)，且在26℃搅拌6hr。将反应混合物真空浓缩并将残余物分配在水(50mL)和DCM(2X100mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到纯的(4S)-7,8-二氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(5g,18.83mmol,73.7％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):230.02[M+H]
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温向(4S)-8-氯-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.726mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的溶液中加入TEA(1.203mL,8.63mmol)，三光气(512mg,1.726mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。在室温向其中加入(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(387mg,1.726mmol)。将反应混合物在80℃搅拌6hr。通过TLC监测反应进程。TLC指示起始原料被耗尽。冷却反应混合物至室温，用水稀释(50mL)，用乙酸乙酯萃取(100mL)。有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗物质，其为棕色粘稠的化合物。将粗产物加至combiflash硅胶(40g)柱并用DCM/MeOH、2％甲醇/DCM洗脱。洗脱产物。浓缩产物级分，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.802mmol,46.5％收率)，LCMS(m/z):540.30(M+H)+。
合成(4S)-7-氯-8-碘-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酸叔丁酯
向(4S)-7-氯-8-碘-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(31g,96mmol)在四氢呋喃(THF)(300mL)中的混悬液中加入Boc2O(33.6mL,145mmol)和DMAP(14.13g,116mmol)。然后将反应混合物在65℃搅拌20hr。通过TLC监测反应。反应物质用水稀释(100mL)并用EtOAc萃取两次(2×250mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤并用Na2SO4干燥脱水，过滤并蒸发得到粗产物。粗产物进行中性氧化铝色谱，用3％乙酸乙酯/石油醚洗脱，得到纯的化合物(4S)-7-氯-8-碘-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酸叔丁酯(26.8g,51.3mmol,53.2％收率)，LCMS(m/z):422.00(M+H)+。
合成(4S)-7-氯-9-碘-8-甲基-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酸叔丁酯
在氮气搅拌下在-78℃将LDA(23.72mL,47.4mmol)加至(4S)-7-氯-8-碘-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酸叔丁酯(10.0g,23.72mmol)在四氢呋喃(THF)(100mL)中的搅拌的溶液中。然后将反应混合物在-78℃搅拌30分钟。然后在-78℃将碘甲烷(2.97mL,47.4mmol)加至反应混合物。然后将反应混合物温热至室温。然后将反应混合物在室温搅拌16hr。通过TLC监测反应。将反应混合物用饱和NH4Cl溶液淬灭并用EtOAc萃取。EtOAc层先后用水和盐水溶液洗涤并用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物加至中性氧化铝中并用1％EtOAc/己烷洗脱。将收集的级分蒸发，得到(4S)-7-氯-9-碘-8-甲基-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酸叔丁酯(4.0g,8.07mmol,34.0％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):436.04(M+H)+。
合成(4S)-7-氯-9-碘-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在氮气下在0℃将乙醚/HCl加至(4S)-7-氯-9-碘-8-甲基-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酸叔丁酯(1.5g,3.44mmol)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在26℃搅拌6hr。通过TLC监测反应。过滤反应物质，取出固体，用饱和NaHCO3溶液(50mL)淬灭并用DCM萃取(100ml)。DCM层先后用水和盐水溶液洗涤并用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗物质(4S)-7-氯-9-碘-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.0g,2.55mmol,74.2％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):336.8(M+H)+。
合成(4S)-7-氯-8,9-二甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将(4S)-7-氯-9-碘-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(2.5g,7.45mmol)、三甲基三氧杂三硼杂环己烷(Trimethylboroxine)(2.483mL,7.45mmol)和碳酸钾(3.09g,22.35mmol)在1,4-二噁烷(50mL)&水(5mL)中的混悬液搅拌并用氩气在室温脱气15分钟，将四(三苯基膦)钯(0)(0.861g,0.745mmol)加至反应混合物。然后将反应混合物在90℃搅拌16hr。通过TLC监测反应。将反应混合物冷却至室温，然后经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤。浓缩滤液并用EtOAc溶解。EtOAc层先后用水和盐水溶液洗涤并用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物加至中性氧化铝中并用10％EtOAc/己烷洗脱。将收集的级分蒸发，得到(4S)-7-氯-8,9-二甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.2g,5.08mmol,68.2％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):224.08(M+H)+。
合成(4S)-8,9-二甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将(4S)-7-氯-8,9-二甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.200g,5.36mmol)、(2-甲基吡啶-4-基)硼酸(0.918g,6.71mmol)和磷酸三钾(3.42g,16.09mmol)在1,4-二噁烷(20mL)&水(3.0mL)中的混悬液搅拌并用氩气在室温脱气15分钟。然后将Pd2(dba)3(0.246g,0.268mmol)和X-Phos(0.256g,0.536mmol)加至反应混合物中。然后将反应混合物在90℃搅拌16hr。通过TLC监测反应。将反应混合物冷却至室温，然后经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤。吸取滤液并浓缩并用EtOAc溶解。EtOAc层先后用水和盐水溶液洗涤并用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物加至中性氧化铝中并用DCM洗脱。将收集的级分蒸发，得到(4S)-8,9-二甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.700g,2.495mmol,46.5％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):281.30(M+H)+。
合成(4S)-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在室温将磷酸三钾(6.51g,30.7mmol)和1-环丙基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(2.87g,12.27mmol)加至(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(2g,10.22mmol)在1,4-二噁烷(40mL)、水(10.00mL)的混合物中的搅拌的溶液中。用氩气净化5min，然后加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(0.835g,1.022mmol)，在110℃搅拌反应混合物，保持16h。使反应混合物达到RT，用水稀释(150mL)并用乙酸乙酯萃取(2x300mL)，用盐水洗涤(200mL)。合并的有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目)且用10％MeOH-DCM洗脱，得到(4S)-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.52mmol,34.4％收率)，LCMS(m/z):268.13[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将(4S)-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.74mmol)溶解在氯仿(100mL)中，在氮气搅拌下在0℃加入NCS(0.500g,3.74mmol)。将反应混合物在室温搅拌20min。使得反应混合物达到室温并用90ml水淬灭并用2x150mL DCM萃取。合并的有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗物质。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目)并用10％MeOH-DCM洗脱，得到(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(850mg,2.54mmol,67.8％收率)，LCMS(m/z):302.42[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.325mmol)溶解在四氢呋喃(THF)(20mL)中，在氮气搅拌下在0℃加入三光气(393mg,1.325mmol)、TEA(0.924mL,6.63mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。向其中加入(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(446mg,1.988mmol)且在密封管中在80℃搅拌16h。使得反应混合物达到室温并用50ml水淬灭并用2x150ml乙酸乙酯萃取。合并的有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目)并用1％MeOH-DCM洗脱，得到(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(285mg,0.510mmol,38.4％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):552.50[M+H]+。
合成(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-9-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-9-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(450mg,1.409mmol)在THF(30mL)中的溶液中加入三光气(251mg,0.846mmol)。然后加入TEA(0.196mL,1.409mmol)，然后搅拌至室温，持续1h，随后加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(474mg,2.114mmol)，在75℃保持16h。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(30mL)并用乙酸乙酯萃取(2x100mL)。有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，得到粗产物。粗产物加至中性氧化铝柱并用20％乙酸乙酯/石油醚洗脱。将收集的级分蒸发，得到(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-9-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.690mmol,48.9％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):569.93[M+H]+。
合成(4S)-9-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4S)-7-氯-9-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.86mmol)、(3-(三氟甲基)苯基)硼酸(815mg,4.29mmol)和K3PO4(1822mg,8.58mmol)在1,4-二噁烷(40mL)、水(10mL)中的脱气的溶液中加入x-phos(273mg,0.572mmol)、Pd2(dba)3(262mg,0.286mmol)。将反应混合物在110℃搅拌3hr。通过TLC监测反应。将反应混合物倒入冰(50mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x100mL)。有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗产物，将加至中性氧化铝柱并用40％乙酸乙酯/石油醚洗脱。将收集的级分蒸发，得到(4S)-9-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,1.691mmol,59.1％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):320.13[M+H]+。
合成(4S)-9-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
向(4S)-7-氯-9-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,2.385mmol)、(2-甲基吡啶-4-基)硼酸(490mg,3.58mmol)和K3PO4(1519mg,7.15mmol)在1,4-二噁烷(40mL)，水(10mL)中的脱气的溶液中加入x-phos(227mg,0.477mmol)、Pd2(dba)3(218mg,0.238mmol)。将反应混合物在110℃搅拌3hr。通过TLC监测反应。将反应混合物倒入冰(50mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x100mL)。有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗产物，将其加至中性氧化铝柱并用40％乙酸乙酯/石油醚洗脱。将收集的级分蒸发，得到(4S)-9-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(450mg,1.653mmol,69.3％收率)，其为淡黄色固体LCMS(m/z)267.21[M+H]+。
合成三氟甲磺酸2,2-二甲基-3,6-二氢-2H-吡喃-4-基酯
在-78℃将LDA(2.75mL,20.29mmol)加至2,2-二甲基二氢-2H-吡喃-4(3H)-酮(2.0g,15.60mmol)在四氢呋喃(THF)(40mL)中的搅拌的溶液中且搅拌20分钟。在-78℃加入1,1,1-三氟-N-苯基-N-((三氟甲基)磺酰基)甲磺酰胺(3.98mL,18.73mmol)，然后在28℃搅拌19hr。反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液淬灭，用水稀释(10mL),用乙醚萃取(2X30mL)，用盐水溶液洗涤(20mL)。分离有机层，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用(100-200)硅胶柱色谱纯化，并用15％EtOAc/己烷(梯度系统)洗脱，得到期望的产物三氟甲磺酸2,2-二甲基-3,6-二氢-2H-吡喃-4-基酯(2.4g,5.98mmol,38.3％收率)，其为淡黄色液体。GCMS(m/z):260[M+H]+。
合成4-(2,2-二甲基-3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡啶-2-胺
将4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-胺(1.0g,4.54mmol)、三氟甲磺酸2,2-二甲基-3,6-二氢-2H-吡喃-4-基酯(2.365g,9.09mmol)和磷酸三钾(2.89g,13.63mmol)在1,4-二噁烷(30mL)中的混悬液搅拌并用氩气在室温脱气15分钟。将PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(0.186g,0.227mmol)加至反应混合物。然后将反应混合物在90℃搅拌4hr。通过TLC监测反应。将反应混合物冷却至室温，然后经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤(20ml)。吸取滤液并浓缩并用EtOAc溶解(20ml)。EtOAc层先后用水(10ml)和盐水溶液(10mL)洗涤，用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用100％DCM(梯度系统)洗脱，得到期望的产物4-(2,2-二甲基-3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡啶-2-胺(0.8g,3.79mmol,83％收率)，其为棕色固体，LCMS(m/z):205.2[M+H]+。
合成4-(1H-1,2,3-三唑-5-基)吡啶-2-胺
在微波中在150℃向4-乙炔基吡啶-2-胺(350mg,2.96mmol)在TMSN3(0.5mL,3.77mmol)中的搅拌的混悬液中。将所得反应混合物在相同的温度搅拌30min。通过TLC监测反应进程。反应混合物过滤，固体化合物用DCM(2mL)洗涤并干燥，得到4-(1H-1,2,3-三唑-5-基)吡啶-2-胺(360mg,1.832mmol,61.8％收率)浅黄色固体，LCMS(m/z):162.1[M+H]+。
合成3-(2-氨基吡啶-4-基)噁唑烷-2-酮
在室温向4-溴吡啶-2-胺(1g,5.78mmol)在1,4-二噁烷(10ml)中的搅拌的溶液中加入噁唑烷-2-酮(0.755g,8.67mmol)、碳酸钾(1.598g,11.56mmol)、碘化亚铜(I)(0.110g,0.578mmol)、N,N'-二甲基乙二胺(0.102g,1.156mmol)。将所得反应混合物在微波中在110℃搅拌1hr。通过TLC监测反应进程。将反应混合物的溶剂蒸发,用水稀释(10mL)并搅拌20分钟，形成固体，过滤并干燥，获得3-(2-氨基吡啶-4-基)噁唑烷-2-酮(580mg,3.11mmol,53.8％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):180.0[M+H]+。
合成4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)吡啶-2-胺和4-(2H-1,2,3-三唑-2-基)吡啶-2-胺
在室温向1H-1,2,3-三唑(0.599g,8.67mmol)、4-溴吡啶-2-胺(1g,5.78mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中的溶液中加入K2CO3(1.598g,11.56mmol)、碘化亚铜(I)(0.110g,0.578mmol)和N,N-二甲基乙二胺(0.126mL,1.156mmol)。将反应混合物在微波中在110℃搅拌1hr。将反应混合物用水(30mL)淬灭，并先后用乙酸乙酯(2×50mL)和盐水溶液(50mL)萃取，分离各层,用无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗产物。纯化粗产物，得到4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)吡啶-2-胺(0.1g,0.562mmol,9.72％收率)，其为灰白色固体，和4-(2H-1,2,3-三唑-2-基)吡啶-2-胺(0.3g,1.787mmol,30.9％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):162.0[M+H]+。
合成(E)-2-氨基-N-((二甲基氨基)次甲基)异烟酰胺
在室温向2-氨基吡啶-4-甲酰胺(5g,36.5mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(DMF)(50mL)中的搅拌的溶液中加入1,1-二甲氧基-N,N-二甲基甲胺(9.76mL,72.9mmol)。将所得反应混合物在27℃搅拌4hr。通过TLC监测反应进程。将反应混合物的溶剂蒸发,用EtOAc(5X20mL)和冰冷的水稀释，分离的有机层并真空浓缩，获得(E)-2-氨基-N-((二甲基氨基)次甲基)吡啶-4-甲酰胺(4.5g,23.41mmol,64.2％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):193.01[M+H]+。
合成4-(1H-1,2,4-三唑-5-基)吡啶-2-胺
在室温向(E)-2-氨基-N-((二甲基氨基)次甲基)异烟酰胺(4g,20.81mmol)在乙醇中(40mL)中的搅拌的混悬液中加入水合肼(1.042g,20.81mmol)。将所得反应混合物在相同的温度搅拌16hr。通过TLC监测反应进程。反应混合物过滤，固体化合物用EtOAc洗涤(20mL)并将滤液干燥，得到2g(LCMS显示，40％为期望的产物)固体化合物。将化合物经制备型HPLC纯化，得到4-(1H-1,2,4-三唑-5-基)吡啶-2-胺(750mg,4.40mmol,21.13％收率)，其为棕色固体，LCMS(m/z):162.0[M+H]+。
合成6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡啶-2-胺
在0℃将2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙醇(1.5g,10.26mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(4mL)中的溶液加至NaH(0.616g,25.7mmol)的混悬液中，并将反应混合物在28℃搅拌30min。在0℃将6-氟吡啶-2-胺(1.150g,10.26mmol)加至反应混合物，并将反应混合物在120℃搅拌16hr。将反应混合物用冷水淬灭并用二氯甲烷(2×60mL)萃取。有机层用水(30mL)和饱和盐水溶液(20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩。将粗物质经中性氧化铝快速色谱纯化。将粗物质用DCM稀释，然后用中性氧化铝吸收且用20-25-％EtOAc/石油醚洗脱，收集级分并浓缩，得到6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡啶-2-胺(700mg,2.66mmol,25.9％收率)，LCMS(m/z):239.0[M+H]+。
合成3-((6-氨基吡啶-2-基)氧基)丙-1-醇
在0℃将丙-1,3-二醇(1.358g,17.84mmol)加至NaH(1.070g,44.6mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(5mL)中的搅拌的溶液中且搅拌1h，接着加入6-氟吡啶-2-胺(1.0g,8.92mmol)并在80℃搅拌2h。将反应物质冷却至室温，缓慢加至冰冷的水中并用乙酸乙酯稀释。分离的有机层用水和盐水洗涤。有机层经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物使用100-200硅胶纯化且在100％乙酸乙酯中洗脱，得到3-((6-氨基吡啶-2-基)氧基)丙-1-醇(0.4g,1.760mmol,19.73％收率)，其为棕色粘稠物，LCMS(m/z):169.22[M+H]+。
合成6-(3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙氧基)吡啶-2-胺
在0℃将3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙-1-醇(4.2g,26.2mmol)/1,4-二噁烷(20mL)加至NaH(1.307g,32.7mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的溶液中，并将反应混合物在28℃搅拌30min。在0℃将6-氯吡啶-2-胺(2.8g,21.78mmol)/1,4-二噁烷(20mL)加至反应混合物，并将反应混合物在100℃搅拌10hr。将反应混合物分配在水(20mL)和DCM(2×25mL)之间。DCM层用饱和NaHCO3溶液洗涤，分离并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制的6-(3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙氧基)吡啶-2-胺(5.5g,18.12mmol,83％收率)，其为棕色油状物，LCMS(m/z):253.2[M+H]+。
合成3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙-1-醇
在0℃将对甲苯磺酸一水合物(0.678g,3.57mmol)加至丙-1,3-二醇(5.43g,71.3mmol)和3,4-二氢-2H-吡喃(3g,35.7mmol)在二氯甲烷(DCM)(50mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在28℃搅拌2h。将反应混合物分配在水(20mL)和DCM(2×25mL)之间。DCM层用饱和NaHCO3溶液洗涤，分离并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制的3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙-1-醇(4.2g,26.2mmol,73.5％收率)，其为无色油状物。
合成3-((6-氨基吡啶-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇
在0℃将2,2-二甲基丙-1,3-二醇(3.0g,28.8mmol)加至NaH(2.304g,57.6mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(25mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在室温搅拌30min。在0℃将6-氯吡啶-2-胺(4.44g,34.6mmol)加至反应混合物。将反应混合物在100℃搅拌16h，并通过TLC监测反应进程。将反应混合物冷却至室温，用冰冷的水淬灭并用乙酸乙酯萃取(3X30mL)。有机层用水(30mL)和饱和盐水溶液(30mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物，TLC洗脱剂：50％EtOAc/己烷,Rf:0.3,UV活化的。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用5％EtOAc/石油醚洗脱，获得纯的3-((6-氨基吡啶-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇(1.5g,6.79mmol,23.56％收率)，其为灰白色固体。LCMS:(m/z):197.16[M+H]+。
合成4-((6-氨基吡啶-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇
在0℃。向在氮气下在0℃搅拌的NaH(1.167g,29.2mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(2mL)中的混悬液中滴加3-甲基丁-1,3-二醇(3.04g,29.2mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(2mL)中的溶液中，持续10min。10min后，在0℃滴加6-氯吡啶-2-胺(2.5g,19.45mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(2mL)中的溶液，持续10min。将反应混合物在120℃加热16hr。反应进程经TLC监测。将反应混合物倒入冰水并用EtOAc萃取(3X30ml),有机溶剂经Na2SO4干燥且真空浓缩，得到粗物质。粗物质经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，用50-70％EtOAc/己烷洗脱，得到4-((6-氨基吡啶-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇(1.5g,7.51mmol,38.6％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):197.29[M+H]+。
合成3-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇
在氮气下在0℃向NaH(2.316g,57.9mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的搅拌的混悬液中滴加2,2-二甲基丙-1,3-二醇(4.02g,38.6mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的溶液，持续10min。10min后，在0℃滴加6-氯吡嗪-2-胺(5g,38.6mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的溶液，持续10min。将反应混合物在120℃加热48hr。TLC指示少量的起始原料以及产物。将反应混合物倒入冰冷的水(60mL)中,水层用EtOAc萃取(2×100mL)。有机层用盐水洗涤(50mL)。有机层经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶，(0-50％EtOAc/石油醚)作为洗脱剂，获得3-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇(1g,4.95mmol,12.84％收率)，LCMS(m/z):198.00[M+H]+。
合成3-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)丙-1-醇
在氮气下在0℃向NaH(1.389g,34.7mmol)在NMP(2mL)中的混悬液中加入丙-1,3-二醇(2.64g,34.7mmol)在NMP(2mL)中的溶液，将反应混合物在室温搅拌1h。然后在0℃历时15min滴加6-氯吡嗪-2-胺(3g,23.16mmol)在NMP(6mL)中的溶液，且在140℃加热16hr。将反应混合物冷却至室温，用水淬灭(50mL)并用EtOAc萃取(3x150mL)。合并的有机物用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗产物。将粗产物加至硅胶柱并用(70％)EtOAc/石油醚洗脱。将收集的级分蒸发，获得化合物3-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)丙-1-醇(1.5g,8.21mmol,35.5％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):170.09[M+H]+。
合成6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡嗪-2-胺
在0℃将NaH(60％)(0.556g,23.16mmol)加至2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙醇(3.39g,23.16mmol)在1,4-二噁烷(100mL)中的搅拌的溶液中，然后在室温搅拌30min并在0℃加入6-氯吡嗪-2-胺(3g,23.16mmol)，然后将其保持在80℃16h。将反应混合物冷却至室温，并用冰冷的水(50mL)淬灭，然后分配在冰冷的水(20mL×2)和乙酸乙酯(20mL×2)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物，然后将其用柱色谱纯化(使用100-200硅胶柱，用60％乙酸乙酯/己烷洗脱)，得到6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡嗪-2-胺(5g,20.06mmol,87％收率)为胶状油状物,LCMS(m/z):240.13[M+H]+。
合成4-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇
在氮气下在0℃向NaH(0.463g,11.58mmol)在1,4-二噁烷(5.00mL)中的搅拌的混悬液中滴加3-甲基丁-1,3-二醇(1.206g,11.58mmol)在1,4-二噁烷(5.00mL)中的溶液，在0℃持续10min。10min后，在0℃历时10min滴加6-氯吡嗪-2-胺(1.0g,7.72mmol)在1,4-二噁烷(10.00mL)中的溶液。将反应混合物在100℃搅拌16hr。反应进程经TLC监测。将反应混合物倒入冰水并用EtOAc萃取(3X25ml),有机溶剂经Na2SO4干燥且真空浓缩，得到粗物质。粗物质经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，用50-70％EtOAc/己烷洗脱，得到4-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇(1.0g,5.04mmol,65.3％收率)，其为棕色固体，LCMS(m/z):199.08[M+H]+。
合成(S)-3-溴-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶
将碳酸铯(37.0g,114mmol)吸收到多颈RB中。然后将烧瓶冷却至0℃，且历时3分钟的时间缓慢加入N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(100mL)。将所得反应混合物在氮气下搅拌15min。然后历时5分钟的时间在0℃滴加(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(10g,76mmol)。该混悬液在室温搅拌1h。加入3-溴-5-氟吡啶(7.62mL,73.9mmol)后混悬液变成淡黄色溶液。所得溶液在75℃搅拌24hr。反应进程经TLC 40％EtOAc/己烷监测。TLC指示起始物质耗尽，且24h后形成新的斑点。将反应物质冷却至室温，用水稀释(500mL)。将水层用乙酸乙酯萃取(2X300mL)。有机层用盐水洗涤(250mL)，经Na2SO4干燥并过滤，减压浓缩，得到棕色油状物。粗产物经柱色谱纯化，用100-200目尺寸的硅胶。将柱用EtOAc/己烷的梯度洗脱。期望的化合物用20％EtOAc/己烷洗脱。将含纯的化合物的级分减压浓缩，得到(S)-3-溴-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶(10g,34.0mmol,44.9％收率)，其为淡黄色粘稠油状物,LCMS(m/z):289.99[M+H]+。
合成(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺
将(R)-3-溴-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶(50g,174mmol)，液态氨(25mL,1155mmol)装在密封管中。然后在0℃加入硫酸铜(II)(5.54g,34.7mmol)。所得蓝色溶液加热至120℃，保持2hr。反应进程经TLC10％MeOH/DCM监测，TLC指示形成新的斑点且24h后起始物质耗尽。完成后，反应物质冷却至室温。用20％NaOH将反应物质的pH变为10,用NaCl饱和，用乙酸乙酯萃取(30mL*2)。合并的有机层用盐水洗涤(20mL)，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制棕色固体，将其用乙醚研磨且搅拌4小时，然后过滤，得到(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺(35.4g,146mmol,84％收率)，其为淡棕色固体，LCMS(m/z):225.29[M+H]+。
合成(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺
将(S)-3-溴-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶(10g,34.7mmol)，液态氨(100mL,4621mmol)装在密封管中。将所得棕色溶液加热至120℃，保持24hr。反应进程经TLC(10％MeOH/DCM)监测，TLC指示形成新的斑点且24h后起始物质耗尽。完成后，反应物质冷却至室温。用20％NaOH将反应物质的pH变为10，用NaCl饱和，用乙酸乙酯萃取(30mL*2)。合并的有机层用盐水洗涤(20mL)，经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺(6g,25.8mmol,74.2％收率)，其为淡棕色固体，LCMS(m/z):225.10[M+H]+。
合成(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺
在氮气下在0℃向NaH(11.35g,473mmol)在THF(100mL)中的混悬液中滴加(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(25g,189mmol)在THF(150mL)中的溶液。将所得混悬液在室温搅拌1h。在室温，将6-氯嘧啶-4-胺(19.61g,151mmol)滴加至反应混合物并将所得混悬液加热至90℃，保持48hr。反应完成后(经TLC监测,其显示少量的起始物质和观察到新的斑点在极性位置形成),将反应混合物倒入冰水(500mL)中，水层用EtOAc萃取(2×1000mL)。合并的有机物经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到浅棕色固体(粗制物)。粗物质经硅胶柱纯化(100-200,3％MeOH/DCM)。将含纯的化合物的级分合并并浓缩，得到期望的产物(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(13g,53.9mmol,28.5％收率)，其为灰白色固体，还得到不纯的化合物(10g).LCMS(m/z):226.17(M+H)+。
合成(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺
在氮气下在0℃向NaH(9.08g,378mmol)在THF(150mL)中的混悬液中滴加(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(20g,151mmol)在THF(200mL)中的溶液，将所得混悬液在室温搅拌1h。在室温将6-氯嘧啶-4-胺(15.68g,121mmol)滴加至反应物质并将所得混悬液加热至90℃，保持48hr。反应完成后(经TLC监测,起始原料完全耗尽且观察到新的斑点在极性位置形成),将反应物质倒入冰水(200mL)中并用乙酸乙酯萃取(2X400mL)。合并的有机物经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到浅棕色固体。将获得的固体在乙醚(200ml)中搅拌30min。过滤并真空干燥，得到(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-胺(13g,57.3mmol,37.9％收率)，其为浅棕色固体，LCMS(m/z):225.96[M+H]+。
合成2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)嘧啶-4-胺
在27℃向在氮气搅拌下的四氢-2H-吡喃-4-醇(25g,245mmol)在四氢呋喃(THF)(500mL)中的溶液中加入NaH(22.52g,563mmol)，历时10min，1hr后在27℃加入2-氯嘧啶-4-胺(22.20g,171mmol)。将反应混合物在85℃搅拌36hr。通过TLC监测反应进程。TLC指示极性斑点以及起始物质。将反应物质倒入200ml冰冷的水中，用EtOAc萃取(3X200ml),合并的有机层经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，用柱色谱纯化，使用(60-120)目硅胶，起始物质用50％EtOAc/己烷洗脱，所需化合物在90％EtOAc/己烷中洗脱,浓缩合并的化合物级分，得到2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)嘧啶-4-胺(9g,39.9mmol,16.31％收率)，LCMS(m/z):196.00[M+H]+。
合成4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)嘧啶-2-胺
将4-氯嘧啶-2-胺(800mg,6.18mmol)，固体1-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(1927mg,9.26mmol)和K3PO4(3932mg,18.53mmol)在1,4-二噁烷(20mL)、水(5.00mL)中脱气的溶液在室温搅拌。然后加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(756mg,0.926mmol)并脱气5min。然后将反应混合物在80℃搅拌15h 30min。通过TLC监测反应。将反应混合物冷却至RT。有机相蒸发，加入50mL水并用乙酸乙酯萃取(3x70ml)，用50mL饱和盐水洗涤，经Na2SO4干燥并真空蒸发，得到粗产物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：90％EtOAc/石油醚)，得到4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)嘧啶-2-胺(600mg,3.42mmol,55.5％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):176.1[M+H]+。
合成4-(2-甲基噁唑-5-基)嘧啶-2-胺
在室温向4-氯嘧啶-2-胺(1.5g,11.58mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(5mL)混合物中的搅拌的溶液中加入磷酸钾(3.69g,17.37mmol)和2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(2.421g,11.58mmol)。将反应物质用氮气脱气15min，加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(0.095g,0.116mmol)并将所得反应物质在80℃在氮气下搅拌16hr,通过TLC监测反应进程,TLC指示形成多个极性斑点和起始物质被耗尽。将反应物质浓缩，然后用50ml水和60ml DCM稀释，通过Hi-flow床，分离有机层，用DCM萃取(2X50ml),合并有机层，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗产物经combiflash色谱纯化，使用硅胶柱(24g,60％EtOAc/石油醚)。将柱用EtOAc/己烷的梯度洗脱。期望的化合物用60％EtOAc/己烷洗脱。将含纯的化合物的级分减压浓缩，得到4-(2-甲基噁唑-5-基)嘧啶-2-胺(1.2g,6.66mmol,57.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):177.11[M+H]+。
合成(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺
在氮气下在0℃向NaH(11.67g,292mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(100mL)中的搅拌的混悬液中滴加(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(25.7g,194mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(100mL)中的溶液，在0℃持续10min。10min后，在0℃滴加6-氯吡啶-2-胺(25g,194mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(100mL)中的溶液，持续10min。将反应混合物在100℃加热36hr。TLC指示少量的起始原料以及产物。
将反应混合物倒入冰冷的水(600mL)中,水层用EtOAc萃取(2×500mL)。有机层用水(3×300mL)洗涤以除去过量NMP。有机层经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶，(12-15％EtOAc/石油醚)作为洗脱剂，获得(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(10g,44.6mmol,22.93％收率)，其为黄色稠厚的液体。
合成(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺
在氮气下在0℃向NaH(62.2g,1556mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(800mL)中的搅拌的混悬液中滴加(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(206g,1556mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(300mL)中的溶液，持续2h。再搅拌10min后，在0℃滴加6-氯吡啶-2-胺(200g,1556mmol)在N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)(300mL)中的溶液，持续30min。将反应混合物在120℃搅拌48hr。TLC指示起始原料耗尽。将反应混合物倒入冰冷的水(2000mL)中，水层用EtOAc萃取(3×1000mL)。合并的有机层用水(3×1000mL)洗涤以除去过量NMP。有机层经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶(洗脱剂12-15％EtOAc/石油醚)，获得期望的纯的产物(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(75g,325mmol,20.92％收率)，其为黄色粘稠的液体。LCMS(m/z):225[M+H]+。
合成(R)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺
在氮气下在0℃向NaH(9.08g,378mmol)在THF(150mL)中的混悬液中滴加(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(20g,151mmol)在THF(250mL)中的溶液。所得混悬液在室温搅拌1h。在室温将4-氯嘧啶-2-胺(15.68g,121mmol)滴加至反应混合物并将所得混悬液加热至90℃，保持48hr。反应完成后(经TLC监测，起始原料耗尽且观察到新的斑点在极性位置形成),将反应混合物倒入冰水(250mL)中，水层用EtOAc萃取(2×300mL)。合并的有机物经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到淡黄色液体(粗制物)。获得的粗物质通过柱纯化(100-200硅胶)，使用0-50％EtOAc-石油醚，得到(R)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺(13g,57.0mmol,37.7％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):226.20[M+H]+。
合成(S)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺
在氮气下在0℃向NaH(8.25g,189mmol)在1,4-二噁烷(200mL)中的混悬液中滴加(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(10g,76mmol)在1,4-二噁烷(50mL)中的溶液。所得混悬液在室温搅拌1h。在室温将4-氯嘧啶-2-胺(7.84g,60.5mmol)滴加至反应混合物并将所得混悬液加热至90℃，保持48hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(200mL)和EtOAc(200mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗物质(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯Rf0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化(100-200目硅胶，在60％乙酸乙酯/己烷中洗脱)，得到(S)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺(8.0g,35.4mmol,46.8％收率)，其为淡黄色固体LCMS(m/z)226.30(M+H)+。
合成(R)-(4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)氨基甲酸苯基酯
在氮气搅拌下在室温向氯甲酸苯酯(2.71g,17.31mmol)和吡啶(1.724mL,21.31mmol)在二氯甲烷(DCM)(50mL)中的溶液中加入(R)-4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺(3.0g,13.32mmol)。将反应混合物在28℃搅拌2hr。通过TLC监测反应。将反应混合物用水稀释(75mL)用DCM萃取(2×75mL)。分离有机层并用Na2SO4干燥脱水，过滤并高真空浓缩，得到粗产物。向粗产物中加入乙醚和戊烷(3:1)的混合物且搅拌10min并过滤，得到化合物(R)-(4-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)氨基甲酸苯基酯(2.5g,2.375mmol,17.83％收率)，LCMS(m/z):346.21[M+H]+。
合成2-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)嘧啶-4-胺
在0℃将NaH(0.741g,30.9mmol)加至2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙醇(4.51g,30.9mmol)在1,4-二噁烷(120mL)中的搅拌的溶液中，然后在室温搅拌30min并在0℃加入2-氯嘧啶-4-胺(4g,30.9mmol)，然后将其在80℃保持16h。将反应混合物冷却至室温，并用冰冷的水(50mL)淬灭，然后分配在冰冷的水(50mL×2)和乙酸乙酯(50mL×2)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物，然后将其用柱色谱纯化(使用100-200硅胶，将柱用60％乙酸乙酯/己烷洗脱)，得到2-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)嘧啶-4-胺(4g,16.05mmol,52.0％收率)，其为胶状油状物LCMS(m/z):239.9[M+H]+。
合成3-((4-氨基嘧啶-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇
在氮气下在0℃向NaH(2.316g,57.9mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的搅拌的混悬液中滴加2,2-二甲基丙-1,3-二醇(4.02g,38.6mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液，持续10min。10min后，在0℃滴加2-氯嘧啶-4-胺(5g,38.6mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液，持续10min。将反应混合物在120℃加热16hr。TLC指示少量的起始原料以及产物。将反应混合物倒入冰冷的水(60mL)中，水层用EtOAc萃取(2×100mL)。有机层用盐水洗涤(50mL)。有机层经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶，洗脱剂(0-50％EtOAc/石油醚)，得到3-((4-氨基嘧啶-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇(800mg,4.04mmol,10.47％收率)，LCMS(m/z):198.09[M+H]+。
合成4-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇
在氮气下在0℃向NaH(0.463g,11.58mmol)在1,4-二噁烷(5.00mL)中的搅拌的混悬液中滴加3-甲基丁-1,3-二醇(1.206g,11.58mmol)在1,4-二噁烷(5.00mL)中的溶液，在0℃持续10min。10min后，在0℃滴加6-氯吡嗪-2-胺(1.0g,7.72mmol)在1,4-二噁烷(10.00mL)中的溶液，持续10min。将反应混合物在100℃搅拌16hr。通过TLC监测反应进程。将反应混合物倒入冰水并用EtOAc萃取(3X25ml)，有机溶剂经Na2SO4干燥且真空浓缩，得到粗物质。粗物质经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，用50-70％EtOAc/己烷洗脱，得到4-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇(1.0g,5.04mmol,65.3％收率)，其为棕色固体，LCMS(m/z):199.08[M+H]+。
合成4-((4-氨基嘧啶-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇
N35296-64
在氮气下在0℃向NaH(1.698g,42.5mmol)在1,4-二噁烷(100mL)中的搅拌的混悬液中滴加3-甲基丁-1,3-二醇(4.42g,42.5mmol)在1,4-二噁烷(50mL)中的溶液，在0℃持续15min。10min后，在0℃滴加2-氯嘧啶-4-胺(5.00g,38.6mmol)，持续15min。将反应混合物在100℃加热16hr。通过TLC监测反应进程。将反应混合物倒入冰水中,浓缩，得到作为粗物质的粘稠的物质。粗物质经柱色谱纯化，使用硅胶(60-120目)，用50-70％EtOAc/己烷洗脱，得到4-((4-氨基嘧啶-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇(6.3g,29.6mmol,77％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):198.30[M+H]+。
合成(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺
N35281-46
在密封管中向(R)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪(12g,49.0mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的搅拌的溶液中加入氢氧化铵(300mL,1926mmol)和硫酸铜(II)(1.566g,9.81mmol)。将反应混合物在120℃搅拌18hr。通过TLC监测反应进程,TLC指示形成极性斑点以及存在未反应的起始物质。反应混合物用水稀释(300mL)，用EtOAc萃取(3x200mL),有机层合并并用水(100mL)，盐水溶液(100mL)洗涤,有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(10g,3.97mmol,8.09％收率)，其为黄色油状的粗制化合物,LCMS(m/z):226.13(M+H)+。
合成(S)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪
在氮气搅拌下在0℃向(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(8.87g,67.1mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(DMF)(50mL)中的混悬液中加入碳酸铯(32.8g,101mmol)，将所得反应混合物在0℃搅拌1hr。向其中加入2,5-二氯吡嗪(10g,67.1mmol)。将所得反应混合物在100℃搅拌6hr。通过TLC监测反应进程。TLC指示起始原料耗尽，形成新的极性斑点，Rf为0.3。反应物质冷却至室温，加入水(100mL)并用乙酸乙酯(100mL)萃取。有机层用水洗涤(100mL×2)。有机层经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗物质，其为浅棕色液体。粗产物加至硅胶(60-120)柱并用Hex/EtOAc洗脱。收集级分，用30％EtOAc/己烷洗脱产物。浓缩产物级分，得到(S)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪(12g,47.7mmol,71.0％收率)，其为浅棕色液体,LCMS(m/z):244.90[M+H]+。
合成(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺
在室温向在室温搅拌下的(S)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪(10g,40.9mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入氢氧化铵(63.7mL,409mmol)和硫酸铜(II)(3.26g,20.44mmol)。将反应混合物在密封管中在130℃搅拌2天。通过TLC监测反应进程。TLC指示起始原料被耗尽。冷却反应物质至室温，用水稀释(100mL)，用乙酸乙酯萃取(250mL×2)。有机层经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物，其为棕色粘稠的化合物。粗产物加至硅胶柱并用DCM/EtOAc洗脱。收集的级分，用50％EtOAc/石油醚洗脱产物。浓缩产物级分，得到(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(2g,8.77mmol,21.46％收率)(N35119-51-A2)，其为浅棕色固体。NMR:在CDCl3中，一致,LCMS(m/z):226.09[M+H]+。
合成(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)哒嗪-3-胺
在氮气下在0℃向KOtBu(12.99g,116mmol)在1,4-二噁烷(300mL)中的混悬液中滴加(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(4.08g,30.9mmol)的20ml溶液。所得混悬液在室温搅拌1h。在室温滴加6-氯哒嗪-3-胺(5g,38.6mmol)至反应混合物并将所得混悬液加热至110℃，保持16hr。反应完成后(经TLC监测,其显示少量的起始物质和观察到新的斑点在极性位置形成),将反应混合物倒入冰水(50mL)中，水层用EtOAc萃取(2×50mL)。合并的有机物经Na2SO4干燥.LCMS(m/z):226.19[M+H]+。
合成(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺
在0℃将(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(27.8g,210mmol)加至KOtBu(45.8g,408mmol)在NMP(200mL)中的搅拌的溶液中，然后在室温搅拌1h，冷却至0℃,加入6-氯吡啶-3-胺(15g,117mmol)，然后加热至110℃，保持144h。将反应混合物冷却至室温并分配在水(500mL×2)和EtOAc(200mL×4)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制物，且经柱色谱纯化(使用100-200硅胶，柱用50％乙酸乙酯/己烷洗脱)，得到(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺(8g,35.1mmol,30.1％收率)，其为棕色油状物，LCMS(m/z):225.16[M+H]+。
合成(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺
在0℃将(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(18.50g,140mmol)加至KOtBu(30.5g,272mmol)在NMP(600mL)中的搅拌的溶液中，然后在室温搅拌1h，冷却至0℃,加入6-氯吡啶-3-胺(10.0g,78mmol)，然后加热至110℃，保持88h。将反应混合物冷却至室温并分配在水(50mL×2)和EtOAc(100mL×2)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物，其为胶状物。(TLC:洗脱剂：100％乙酸乙酯,Rf0.5；UV活化的)。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目)，用50％EtOAc/己烷洗脱，得到(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺(10.0g,41.7mmol,53.6％收率)，其为深色粘稠的物质,LCMS(m/z)225.0(M+H)+。
合成(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺
在0℃将(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(30.7g,232mmol)加至KOtBu(70.1g,624mmol)在NMP(800mL)中的搅拌的溶液中，然后在室温搅拌1h并冷却至0℃，然后加入5-氟吡啶-2-胺(20g,178mmol)，然后加热至110℃，保持114h。将反应混合物冷却至室温并分配在水(500mL×2)和EtOAc(500mL×4)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物，然后将其用柱色谱纯化(使用100-200硅胶，用80％乙酸乙酯/己烷洗脱柱)，得到(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(10g,40.1mmol,22.50％收率)，其为棕色油,LCMS:225.0(M+H)。
合成(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺
在0℃将NaH(12.84g,268mmol)加至(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(31.8g,241mmol)在二甲基亚砜(DMSO)(100mL)中的搅拌的溶液中，然后在室温搅拌1h并冷却至0℃,加入5-氟吡啶-2-胺(15.0g,134mmol)，然后加热至110℃，保持60h。将反应混合物冷却至室温，并分配在水(50mL)和EtOAc(100mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物(TLC:洗脱剂：100％乙酸乙酯,Rf0.5；UV活化的),粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目)用50％EtOAc/己烷洗脱，得到(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-胺(7.2g,32.1mmol,23.99％收率)，其为淡黄色粘稠物，LCMS(m/z):225.1(M+H)+。
合成(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-胺
在0℃将四氢呋喃(75mL)加至NaH(5.56g,232mmol)中，在0℃,将(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(12.46mL,100mmol)在四氢呋喃(50mL)中的溶液加至反应混合物并将反应混合物在28℃搅拌1h。加入2-氯嘧啶-5-胺(10g,77mmol)在四氢呋喃(25mL)且在70℃搅拌16hr。将反应混合物用冷水(30mL)淬灭并用乙酸乙酯(3×80mL)萃取。有机层用水(2×50mL)和饱和盐水溶液(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩。粗制化合物经柱色谱纯化(中性氧化铝)产物用40-45％乙酸乙酯/己烷洗脱，得到(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-胺(6.5g,28.3mmol,36.6％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):226.0[M+H]+。
合成(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-胺
在0℃向NaH(6.17g,154mmol)在THF(100ml)中的混悬液中加入(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(13.26g,100mmol)在THF(50ml)中的溶液，并将反应混合物在25℃搅拌1h。在0℃向其中2-氯嘧啶-5-胺(10g,77mmol)在THF(50mL)中的溶液，并缓慢加热至80℃且在80℃搅拌16hr。反应完成后，反应混合物用氯化铵(10mL)淬灭且用乙酸乙酯(3x20ml)萃取。分离有机层并用盐水洗涤，经Na2SO4干燥，将其过滤并减压浓缩，得到粗物质。该粗物质用乙醚研磨，得到(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-胺(5.0g,19.77mmol,25.6％收率)，其为棕色固体，LCMS(m/z):226.1[M+H]+。
合成苯并[d]噁唑-2-基氨基甲酸苯酯
在氮气搅拌下在室温向吡啶(0.965mL,11.93mmol)，氯甲酸苯酯(1.517g,9.69mmol)在二氯甲烷(DCM)(15mL)中的溶液中加入苯并[d]噁唑-2-胺(1g,7.46mmol)。将反应混合物在30℃搅拌3hr。通过TLC监测反应。将反应混合物用水(20mL),二氯甲烷(2×50mL)稀释，分离有机层。有机层用饱和盐水溶液洗涤(25mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩。粗物质用50％乙醚/己烷研磨，并进行分析，LCMS(m/z):255.19[M+H]+。
合成(4-溴吡啶-2-基)氨基甲酸苯基酯
在室温向氯甲酸苯酯(4.98g,31.8mmol)和Py(3.04mL,37.6mmol)在DCM(40mL)中的混合物中滴加4-溴吡啶-2-胺(5g,28.9mmol)在DCM(30mL)中的溶液。将所得溶液在室温搅拌2hr。反应完成后(经TLC监测,起始原料完全耗尽且恰好在起始物质上方观察到新的斑点)，将饱和碳酸氢钠溶液(60mL)加至反应物质并将水层用DCM萃取(2×70ML)。合并的有机层经Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到灰白色固体。将获得的固体在石油醚(50mL)中搅拌，过滤并干燥，得到(4-溴吡啶-2-基)氨基甲酸苯基酯(4g,6.66mmol,23.03％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):293.2(M+H)+。
合成(2-氨基-3,3,3-三氟丙基)氨基甲酸叔丁酯
在室温向在氮气下在室温搅拌的3,3,3-三氟丙-1,2-二胺二盐酸盐(1g,4.97mmol)，DIPEA(2.61mL,14.92mmol)在二氯甲烷(DCM)(60mL)中的溶液中滴加Boc2O(0.924mL,3.98mmol)在二氯甲烷(DCM)(10mL)中的溶液。将反应混合物在室温搅拌3hr。通过TLC监测反应进程。TLC指示形成非极性斑点，起始物质完全耗尽。将反应混合物用冷水(50mL)稀释并用DCM萃取(2×30ml)。合并的有机层用盐水洗涤(10mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得(2-氨基-3,3,3-三氟丙基)氨基甲酸叔丁酯(800mg,3.51mmol,70.5％收率)，其为无色油状物。
合成(S)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲基)吡嗪
在0℃向碳酸铯(492g,1510mmol)在DMF(1000mL)中的搅拌的溶液中加入(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(133g,1007mmol)。将所得反应混合物在室温搅拌30min。然后在0℃加入2,5-二氯吡嗪(150g,1007mmol)在DMF(500mL)中的溶液，将所得反应混合物在100℃搅拌4h。(TLC系统:20％乙酸乙酯/石油醚,Rf:0.5,UV活化的)。将反应混合物用冰冷的水(500mL)稀释，用EtOAc萃取(3×300mL)。合并的有机层用水(2×200mL)和盐水溶液(100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：10％EtOAc/己烷)，得到期望的产物(S)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪(200g,768mmol,76％收率)，其为黄色液体。LCMS(m/z):245.1[M+H]+。
合成(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺
在密封管中向(S)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪(120g,490mmol)在THF(30mL)中的搅拌的溶液中加入氢氧化铵(1000mL,6420mmol)和硫酸铜(II)(15.66g,98mmol)，然后将所得反应混合物在120℃搅拌48h(TLC系统:50％乙酸乙酯/石油醚,Rf:0.4,UV活化的)。将反应混合物用水稀释(300mL)，用EtOAc萃取(3x500mL)。合并的有机层用水(200mL)和盐水溶液(200mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物。粗物质经快速柱色谱纯化(使用100-200目硅胶并用40％EtOAc/己烷洗脱化合物)，得到期望的产物(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(65g,280mmol,57.2％收率)，其为黄色结晶固体。LCMS(m/z):226.13[M+H]+。
合成(R)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪
在0℃向碳酸铯(32.8g,101mmol)在DMF(100mL)中的搅拌的混悬液中加入(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(8.87g,67.1mmol)，然后在室温搅拌30min。加入然后2,5-二氯吡嗪(10g,67.1mmol)，将所得反应混合物在100℃搅拌4h。(TLC系统:20％乙酸乙酯/己烷,Rf:0.5,UV活化的)。将反应混合物用冰冷的水(200mL)稀释，用EtOAc萃取(3×100mL)。合并的有机层用水(2x50mL)和盐水溶液(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到(R)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪(12g,43.8mmol,65.3％收率)，其为黄色油状的化合物。LCMS(m/z):244.99[M+H]+。
合成(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺
在密封管中向(R)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪(8g,32.7mmol)在四氢呋喃(10mL)中的搅拌的溶液中加入氢氧化铵(400mL,2568mmol)和硫酸铜(II)(1.044g,6.54mmol)并将反应混合物在120℃搅拌48h。(TLC系统:50％乙酸乙酯/己烷,Rf:0.4,UV活化的)。将反应混合物用水稀释(200mL)，用EtOAc萃取(3x50mL)。合并的有机层用水(50mL)，盐水溶液(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物。粗物质经快速柱色谱纯化(使用100-200目硅胶并用40％EtOAc/己烷洗脱化合物),收集纯的级分并减压浓缩，得到(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-胺(2g,8.65mmol,26.4％收率)，其为黄色结晶固体。LCMS(m/z):226.10[M+H]+。
合成(S)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶
在0℃向2-氯嘧啶-5-醇(13g,100mmol)在THF(100mL)中的搅拌的溶液中加入(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(13.16g,100mmol)、三苯基膦(32.7g,124mmol)，接着加入DEAD(19.71mL,124mmol)，将反应混合物在室温搅拌4h。(TLC洗脱系统:30％EtOAc/石油醚；Rf-0.5；UV活化的)。将反应混合物用水淬灭(50mL)并萃取到EtOAc中(2x75mL)。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。将粗物质经色谱纯化(硅胶,洗脱剂：20％EtOAc/己烷)，得到(S)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶(20g,79mmol,79％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):245.10；[M+H]+。
合成(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺
将(S)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶(10g,40.9mmol)和氨水溶液(66.3ml,1226mmol)的混合物在密封管中在120℃加热24h。(TLC洗脱系统:100％EtOAc；Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，用水淬灭(50mL)并萃取到EtOAc(2x75mL)中。分离有机层，经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物，其为黄色固体。粗制化合物用正戊烷(50mL)研磨，得到(S)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺(6.6g,28.6mmol,70.0％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):226.17；[M+H]+。
合成(R)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶
在0℃向2-氯嘧啶-5-醇(20g,153mmol)在THF(100mL)中的搅拌的溶液中加入(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(24.30g,184mmol)、三苯基膦(50.2g,192mmol)，接着加入DEAD(30.3mL,192mmol)并将反应混合物在室温搅拌12h。(TLC洗脱系统:70％EtOAc/石油醚；Rf-0.5；UV活化的)。将反应混合物用水淬灭(100mL)并萃取到EtOAc中(200mL)。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。将粗物质经色谱纯化(硅胶,洗脱剂：35％EtOAc/己烷)，得到(R)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶(23g,91mmol,59.5％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):245.06；[M+H]+。
合成(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺
将(R)-2-氯-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶(5g,20.44mmol)和氨水溶液(50ml,924mmol)的混合物在密封管中在120℃加热48h。(TLC洗脱系统:100％EtOAc；Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，用水淬灭(50mL)并萃取到DCM中(2x75mL)。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-胺(2.7g,11.5mmol,57.5％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):226.02；[M+H]+。
合成(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)哒嗪-4-胺
在0℃向叔丁醇钾(3.90g,34.7mmol)在1,4-二噁烷(50mL)中的搅拌的混悬液中加入(S)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(2.75g,20.84mmol)的混合物，并将反应混合物在氮气气氛下在25℃搅拌1h。然后，将6-氯哒嗪-4-胺(1.5g,11.58mmol)加至反应混合物，将所得反应混合物在110℃搅拌16h。(TLC系统:净乙酸乙酯,Rf:0.3)。将反应混合物倒入冰冷的水(40mL)中并用EtOAc萃取(2x80mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(50mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物。粗物质经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：65％乙酸乙酯/石油醚)，得到期望的产物(S)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)哒嗪-4-胺(1.0g,4.28mmol,37.0％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):226.20[M+H]+。
合成(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)哒嗪-4-胺
在0℃向叔丁醇钾(7.80g,69.5mmol)在1,4-二噁烷(50mL)中的搅拌的混悬液中加入(R)-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲醇(5.20mL,41.7mmol)并将反应混合物在氮气气氛下在25℃搅拌1h。然后将6-氯哒嗪-4-胺(3g,23.16mmol)加至反应混合物，将所得反应混合物在110℃搅拌16h。(TLC系统乙酸乙酯,Rf:0.3)。将反应混合物倒入冰冷的水(40mL)并用EtOAc萃取(2x80mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(50mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：65％乙酸乙酯/石油醚)，得到期望的产物(R)-6-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)哒嗪-4-胺(2.2g,9.66mmol,41.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):226.05[M+H]+,Rt＝1.00min。
(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向溶解在四氢呋喃(THF)(30mL)中的(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.325mmol)在氮气搅拌下在0℃加入三光气(393mg,1.325mmol)，TEA(0.924mL,6.63mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。向其中加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(297mg,1.325mmol)且在密封管中在80℃搅拌16h。使得反应混合物达到室温并用50ml水淬灭并用2x150ml乙酸乙酯萃取,合并的有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目)并用2％MeOH-DCM洗脱，得到(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.377mmol,28.4％收率)，LCMS(m/z):552.10[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向(4S)-8-氯-7-(2-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(550mg,1.483mmol)在四氢呋喃(THF)(50mL)中的搅拌的溶液中加入TEA(1.241mL,8.90mmol)和三光气(440mg,1.483mmol)且搅拌1hr，加入然后(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(665mg,2.97mmol)，在65℃加热15hr。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩并将残余物分配在水(20mL)和DCM(2X30mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗产物经GRACE纯化，使用C-18反相柱，流动相A:0.1％甲酸/水；B:ACN,产物用81％ACN/0.1％甲酸/水洗脱。蒸发溶剂并用饱和NaHCO3碱化。将水层用DCM萃取。DCM层经无水Na2SO4干燥，过滤并蒸发，得到纯的(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.597mmol,40.2％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):621.22[M+H]+。
(4S)-8-氯-7-(2-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在室温将(4S)-7,8-二氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.0g,4.35mmol)、(2-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)硼酸(1.152g,5.22mmol)和Cs2CO3(4.25g,13.04mmol)在1,4-二噁烷(10mL)&水(1mL)中的搅拌的溶液用氩气在室温脱气15分钟。将PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(0.355g,0.435mmol)加至反应混合物。然后将反应混合物在110℃搅拌16hr。通过TLC监测反应。将反应混合物冷却至室温，然后经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤。吸取滤液并浓缩并用EtOAc溶解。EtOAc层先后用水和盐水溶液洗涤并用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物经GRACE纯化，使用C-18反相柱，流动相A:0.1％甲酸/水；B:ACN,产物在72％ACN/0.1％甲酸/水中洗脱。蒸发溶剂并用饱和NaHCO3碱化。将水层用DCM萃取。DCM层经无水Na2SO4干燥，过滤并蒸发，得到纯的(4S)-8-氯-7-(2-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(650mg,1.578mmol,36.3％收率)，其为棕色固体，LCMS(m/z):371.45[M+H]+。
合成(4S)-8-氰基-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-8-甲腈(300mg,0.908mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的搅拌的溶液中加入TEA(0.760mL,5.45mmol)和三光气(270mg,0.908mmol)且搅拌1hr，然后加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(407mg,1.816mmol)，且在65℃加热15hr。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩并将残余物分配在水(20mL)和DCM(2X30mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗产物与另一批次的相同物质合并，然后经GRACE纯化，使用C-18反相柱，流动相A:0.1％甲酸/水；B:ACN,产物在84％ACN/0.1％甲酸/水中洗脱。蒸发溶剂并用饱和NaHCO3碱化。将水层用DCM萃取.DCM层经无水Na2SO4干燥，过滤并蒸发，得到纯的(4S)-8-氰基-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.381mmol,41.9％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):581.23[M+H]+。
合成(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-8-甲腈
在室温将(4S)-8-溴-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.301mmol)、Zn(CN)2(764mg,6.51mmol)和Zn(OAc)2(287mg,1.562mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(DMF)(20mL)中的搅拌的溶液用氩气在室温脱气15分钟。将Pd2(dba)3(238mg,0.260mmol)&DPPF(289mg,0.521mmol)加至反应混合物。然后将反应混合物在110℃搅拌16hr。通过TLC监测反应。将反应混合物冷却至室温，然后经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤。吸取滤液并浓缩并用EtOAc溶解。EtOAc层先后用水和盐水溶液洗涤并用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物经GRACE纯化，使用C-18反相柱，流动相A:0.1％甲酸/水；B:ACN,产物在60％ACN/0.1％甲酸/水中洗脱。蒸发溶剂并用饱和NaHCO3碱化。将水层用DCM萃取.DCM层经无水Na2SO4干燥，过滤并蒸发，得到纯的(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-8-甲腈(350mg,1.016mmol,78％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):331.11[M+H]+。
合成(4S)-8-溴-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在0℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.28mmol)在氯仿(15mL)中的搅拌的溶液中分批加入NBS(0.758g,4.26mmol)且在30℃搅拌5hr。将反应混合物真空浓缩并将残余物分配在水(20mL)和DCM(2X20mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到纯的(4S)-8-溴-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.800g,2.025mmol,61.8％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):384.07[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向(4S)-8-氯-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(440mg,1.596mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入TEA(1.112mL,7.98mmol)，接着加入三光气(474mg,1.596mmol),搅拌1h并加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(358mg,1.596mmol)，然后在80℃加热15h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(100mL)和EtOAc(2×100mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗产物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝，1-2％MeOH/DCM作为洗脱剂，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(330mg,0.593mmol,37.1％收率)，LCMS(m/z):526.18[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在室温向(4S)-7,8-二氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(4.300g,18.69mmol)和1-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(4.67g,22.43mmol)在1,4-二噁烷(100.0mL)和水(25.00mL)中的溶液中加入Cs2CO3(18.27g,56.1mmol)并脱气20min。然后将PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(1.526g,1.869mmol)加至反应混合物在室温且再次脱气10分钟。然后将反应混合物搅拌至110℃，保持16h(TLC洗脱剂：10％MeOH/乙酸乙酯Rf:0.3；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，用水稀释(100mL)，用乙酸乙酯萃取(2X100mL)。有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用100-200目硅胶，0-15％甲醇/DCM作为洗脱剂。将收集的级分减压浓缩，得到(4S)-8-氯-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.5g,3.41mmol,18.27％收率)。产物的纯度为62.76％，且其显示34.97％的起始物质。LCMS(m/z):276.53[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向(4S)-8-氯-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(700mg,2.54mmol)在四氢呋喃(THF)(100mL)中的溶液中加入TEA(1.769mL,12.69mmol)，接着加入三光气(753mg,2.54mmol)，搅拌1h并加入(S)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(569mg,2.54mmol)，在80℃加热15h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(100mL)和EtOAc(2×100mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗产物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用100-200目硅胶，以及2-6％MeOH/DCM作为洗脱剂，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.659mmol,26.0％收率)，其为浅棕色固体，LCMS(m/z):526.29[M+H]+。
合成(4S)-7-(3-(二氟甲基)苯基)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-8-甲基-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向固体(4S)-7-(3-(二氟甲基)苯基)-8-甲基-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.327mmol)在四氢呋喃(THF)(5mL)中的溶液中加入固体三光气(236mg,0.796mmol)、DIPEA(1.391mL,7.96mmol)且在氮气下在室温搅拌30分钟。随后向其中加入(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(476mg,2.124mmol)，在密封管条件下在75℃保持15h 30分钟。通过TLC和LCMS监测反应。将反应混合物用水稀释(50ml)并用乙酸乙酯萃取(2×50ml)。合并的有机层用无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。将粗物质进行分析，LCMS(m/z):572.16[M+H]+。
(4S)-8-氯-7-(3-(二氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
将(4S)-7,8-二氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.738mmol)、(3-(二氟甲基)苯基)硼酸(299mg,1.738mmol)和碳酸钾(721mg,5.22mmol)在1,4-二噁烷(10mL)&水(1.5mL)中的混悬液中搅拌并用氩气在室温脱气15分钟，将PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(1420mg,1.738mmol)加至反应混合物。然后将反应混合物在90℃搅拌16hr。将反应混合物冷却至室温，然后经硅藻土过滤并用EtOAc洗涤(100mL)。吸取滤液并浓缩并用EtOAc溶解(50ml)。EtOAc层先后用水(100ml)和盐水溶液(100mL)洗涤且用Na2SO4干燥脱水，过滤并浓缩，得到粗产物。粗产物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200)，以及用50％EtOAc/己烷(梯度系统)洗脱，得到期望的产物(4S)-8-氯-7-(3-(二氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.554mmol,89％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):302.11[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350mg,1.027mmol)在四氢呋喃(THF)(50mL)中的搅拌的溶液中加入TEA(1.432mL,10.27mmol)和三光气(610mg,2.054mmol)。将反应混合物在室温搅拌1h。然后将(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(230mg,1.027mmol)加至反应混合物。将所得反应混合物在65℃搅拌16hr。通过TLC监测反应进程，其显示起始原料被耗尽。将反应混合物冷却至RT，用水稀释(100mL)且用乙酸乙酯萃取(2*60ml)，合并的有机层用盐水溶液洗涤并经Na2SO4干燥，过滤并真空蒸发，得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用氧化铝，在(2:8)EtOAc&己烷中洗脱。将级分真空浓缩，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.286mmol,27.8％收率)，其为浅黄色胶状物,LCMS(m/z):591.2(M+H)+。
(4S)-8-氯-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在氮气搅拌下在0℃向(4S)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.4g,4.57mmol)在氯仿(20mL)中的搅拌的混悬液中加入NCS(0.610g,4.57mmol)。将反应混合物在室温搅拌12h。将反应混合物用水稀释(100mL)并用EtOAc萃取(2*100ml)，合并的有机物用盐水溶液洗涤并经Na2SO4干燥，过滤并真空蒸发，得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝，在(1:9)EtOAc&己烷中洗脱。将级分真空蒸发，得到(4S)-8-氯-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(700mg,1.883mmol,41.2％收率)，其为胶状化合物,LCMS(m/z):340.97(M+H)+。
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在0℃在密封管中向(4S)-8-氯-7-(5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.880mmol)在THF中(15mL)的搅拌的溶液中加入TEA(0.736mL,5.28mmol)和三光气(261mg,0.880mmol)。将反应混合物在25℃搅拌1hr。然后在0℃将(R)-2-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-胺(395mg,1.761mmol)加至反应物质，将反应混合物加热至70℃，将其在70℃维持16hr。将反应混合物冷却至室温,加入水(50mL)并用EtOAc萃取(2x40mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(50mL)，有机层经Na2SO4干燥并将其浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化(C-18:用65％ACN/1％碳酸氢铵水溶液洗脱，得到(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(185mg,0.313mmol,35.6％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):591.20[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-7-(6-(三氟甲基)吡啶-2-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂
在氮气下在0℃向(4S)-7-(6-(三氟甲基)吡啶-2-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(150mg,0.490mmol)在氯仿(10mL)中的搅拌的溶液中加入NCS(65.4mg,0.490mmol)。使反应混合物达到室温且将其在25℃维持16hr。反应混合物用水淬灭(20mL)并用EtOAc萃取(2x30mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(50mL)，有机层经Na2SO4干燥并将其浓缩，得到粗制化合物。粗产物加至硅胶(60-120)柱并用50％EtOAC-石油醚洗脱。将收集的级分浓缩，得到(4S)-8-氯-7-(6-(三氟甲基)吡啶-2-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(60mg,0.154mmol,31.4％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):341.15[M+H]+。
合成4-((2S,6R)-2,6-二甲基吗啉代)吡啶-2-胺
在室温向4-氟吡啶-2-胺(2.0g,17.84mmol)在(2S,6R)-2,6-二甲基吗啉(4.11g,35.7mmol)中的混悬液中加入碳酸钾(7.40g,53.5mmol)，碘化亚铜(I)(0.340g,1.784mmol)和N,N'-二甲基乙二胺(0.315g,3.57mmol)。将所得反应混合物在微波中在110℃搅拌1hr(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf-:0.1；UV活化的)。将反应混合物在冰水中淬灭(20mL)并用EtOAc萃取(3X40mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝，在50％EtOAc/石油醚中洗脱，得到4-((2S,6R)-2,6-二甲基吗啉代)吡啶-2-胺(1.0g,4.72mmol,26.4％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):208.05[M+H]+。
合成(4S)-N-(4-氯嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在-78℃向4-氯嘧啶-2-胺(2.61g,20.14mmol)在四氢呋喃(THF)(60mL)中的搅拌的溶液中加入LiHMDS(67.1mL,67.1mmol)并在-78℃搅拌1hr，然后加入(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酸苯基酯(5g,13.43mmol)，然后在25℃搅拌18hr。将反应混合物分配在水(50mL)和EtOAc(800mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。将残余物用乙醚研磨(3×30mL)。将所得固体过滤，得到(4S)-N-(4-氯嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(2.1g,4.86mmol,36.2％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):408.17[M+H]+。
(4S)-N-(4-(2-((S)-1,4-二氧杂螺[4.5]癸-2-基)乙基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温在氮气气氛下向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.962g,3.81mmol)在四氢呋喃(THF)(40mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(0.905g,3.05mmol)和TEA(1.594mL,11.44mmol)。将所得反应混合物在室温搅拌1hr。向反应混合物中加入(S)-4-(2-(1,4-二氧杂螺[4.5]癸-2-基)乙基)吡啶-2-胺(1.0g,3.81mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液。将所得反应混合物在70℃搅拌16hr。通过TLC监测反应进程。反应混合物用水稀释(50mL)，用EtOAc萃取(3×50mL)。有机层合并并用盐水溶液洗涤(30mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗物质经柱色谱纯化(100-200目硅胶,洗脱剂为4％MeOH/DCM)，得到(4S)-N-(4-(2-((S)-1,4-二氧杂螺[4.5]癸-2-基)乙基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(800mg,1.219mmol,32.0％收率)，其为棕色固体，LCMS(m/z):541.27[M+H]+。
合成(1H-咪唑-1-基)((4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮
在28℃将TEA(1.370mL,9.83mmol)加至(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.28mmol)在四氢呋喃(THF)(40mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在28℃搅拌1h。将CDI(1.062g,6.55mmol)加至反应混合物，并在60℃搅拌12h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(20mL)和EtOAc(2X35mL)之间。分离EtOAc层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质。将粗物质纯化，用乙醚(2X25mL)洗涤，得到纯的(1H-咪唑-1-基)((4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮(850mg,2.097mmol,64.0％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):400.30[M+H]+。
合成(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃将(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.5g,1.744mmol)、三乙胺(1.458mL,10.46mmol)吸收在四氢呋喃(THF)(20mL)中，将所得黄色溶液搅拌10min。然后在0℃一次性加入三光气(0.517g,1.744mmol)。所得黄色混悬液在室温搅拌45min。在0℃将(R)-5-((2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-胺(0.391g,1.744mmol)的THF(4mL)溶液加至上述黄色混悬液，历时5min的时间。所得黄色混悬液加热至70℃，保持24hr。反应进程经TLC10％MeOH/DCM监测,TLC指示24h后形成多个斑点。反应物质冷却至室温，用水稀释(20mL),乙酸乙酯(30mL*2)。合并的有机层用盐水洗涤(15mL)，经Na2SO4干燥过滤，减压浓缩，得到棕色粘稠油状物。将粗反应物质不经任何纯化进行下一步,LCMS(m/z):537.00[M+H]+。
合成4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑
在室温向4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(5.0g,25.8mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(DMF)(50mL)中的溶液中加入Cs2CO3(16.79g,51.5mmol)，然后在室温滴加三氟甲磺酸2,2,2-三氟乙基酯(4.45mL,30.9mmol)。将反应混合物在100℃搅拌3hr。将反应混合物用水稀释(100mL)并用EtOAc萃取(2×100mL),合并的有机物用冷水(3×100ml)和盐水溶液(100mL)洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并真空蒸发，得到4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑(1.8g,3.39mmol,13.16％收率)，其为灰白色胶状物液体。
化合物实施例
实施例1
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-8-(三氟甲基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-8-(三氟甲基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.624mmol)、三光气(111mg,0.375mmol)在四氢呋喃(10mL)中的溶液中加入固体吡啶-3-胺(88mg,0.937mmol)和DIPEA(242mg,1.873mmol)，然后将其搅拌30min。在密封管中将反应混合物加热至75℃，保持16h。使其冷却至室温，倒入饱和NaHCO3溶液(100mL)中，并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，减压浓缩，获得粗制化合物，将其通过快速柱色谱纯化，得到(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-8-(三氟甲基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(127mg,45.3％收率)，其为灰白色固体(TLC:洗脱剂，5％甲醇/乙酸乙酯；Rf＝0.3)，LCMS(m/z):441.23[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.67(s,1H),8.69(d,J＝2.19Hz,2H),8.37-8.16(m,4H),8.03(ddd,J＝8.33,2.63,1.53Hz,2H),7.89(s,2H),7.76(dd,J＝8.00,2.30Hz,2H),7.32(d,J＝7.89Hz,2H),7.27-7.20(m,2H),5.70(dd,J＝5.81,3.18Hz,2H),3.38-3.12(m,4H),3.11-3.02(m,2H),2.68(s,6H),2.37(dddd,J＝14.20,10.03,6.03,4.17Hz,2H),2.24-2.01(m,2H)。
实施例2
合成(4S)-8-溴-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-溴-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350mg,1.057mmol)在THF(20mL)中的搅拌的溶液中加入NaH(38.0mg,1.585mmol)。然后将反应混合物在30℃搅拌1h，加入3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(305mg,1.268mmol)。将反应混合物在70℃搅拌15h。使其冷却至RT并将反应混合物倒入冷水(20mL)中并用乙酸乙酯萃取(2X20mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥且真空浓缩，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/EtOAc)，获得500mg，通过LCMS测定纯度为90％。半纯的化合物经制备型HPLC纯化(柱：XS PHENYL HEXYL(250X4.6mm,5μ),流动相:A:0.01M碳酸氢铵B:ACN,梯度：时间/％B:0/10,1/10,10/50,15/50,18/98,20/98,20.1/10,25/10，柱温：环境温度，流速:1.0ml/min,稀释剂：ACN)，得到(4S)-8-溴-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(275mg,0.61mmol,47％收率)，其为灰白色固体(TLC:10％MeOH/乙酸乙酯,Rf:0.5)，LCMS(m/z):451.13[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.89(s,1H),8.88(d,J＝2.19Hz,1H),8.32(d,J＝2.41Hz,1H),8.26(dd,J＝4.82,1.32Hz,1H),8.04(d,J＝8.20Hz1H),7.83(s,1H),7.66(t,J＝7.20Hz 1H),7.33(d,J＝7.89Hz,1H),6.98(m,1H),5.67(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.49(d,J＝5.04Hz,1H),3.37-3.17(m,2H),3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.67(s,3H),2.34(dddd,J＝14.14,10.08,6.03,3.95Hz,1H),2.18-2.01(m,1H)。
实施例3
合成(4S)-8-氯-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将吡啶-3-甲酸(180mg,1.465mmol)、DPPA(537mg,1.953mmol)和三乙胺(0.680mL,4.88mmol)在THF(20mL)中的溶液在30℃搅拌2h，加入(4S)-8-氯-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(280mg,0.976mmol)。将反应混合物在70℃搅拌14h。将反应混合物倒入冷水(50mL)中并用乙酸乙酯萃取(2X30mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/EtOAc)，得到(4S)-8-氯-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(90mg,0.22mmol,15％收率)，其为白色固体(TLC:10％MeOH/乙酸乙酯,Rf:0.3)，LCMS(m/z):407.25[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.63(s,1H),8.90(d,J＝1.97Hz,1H),8.36(d,J＝2.19Hz,1H),8.31-8.21(m,1H),8.21-8.02(m,1H),8.02–7.92(m,1H),7.66(s,1H),7.34(d,J＝8.11Hz,1H),7.27-7.21(m,1H),5.67(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.37-3.11(m,2H),3.11–2.92(m,2H),2.67(s,3H),2.42-2.22(m,1H),2.21-2.04(m,1H)。
实施例4
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-8-(三氟甲基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-8-(三氟甲基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.624mmol)在THF(10mL)中的溶液中加入三光气(111mg,0.375mmol)，然后在室温搅拌30min。然后加入吡啶-3-胺(88mg,0.937mmol)和DIPEA(242mg,1.873mmol)。在密封管中将反应混合物在75℃加热16h。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(100mL)中并用乙酸乙酯萃取(3X50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得半纯的化合物。其经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-8-(三氟甲基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(127mg,0.288mmol,45.3％)，其为灰白色固体(TLC:Rf＝0.3,5％甲醇/乙酸乙酯)，LCMS(m/z):441.23[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.67(s,1H),8.69(d,J＝2.19Hz,1H),8.37-8.16(m,2H),8.03(ddd,J＝8.33,2.63,1.53Hz,1H),7.89(s,1H),7.76(dd,J＝8.00,2.30Hz,1H),7.32(d,J＝7.89Hz,1H),7.27-7.20(m,1H),5.70(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.38-3.12(m,3H),3.02-3.11(m,1H),2.68(s,3H)，2.39(s,3H)，2.37(dddd,J＝14.20,10.03,6.03,4.17Hz,1H),2.24-2.01(m,1H)。
实施例5
合成(4S)-8-氟-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将三乙胺(0.516mL,3.70mmol)和三光气(220mg,0.740mmol)加至(4S)-8-氟-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.740mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL,在密封管中)中的搅拌的溶液中且搅拌30min，然后加入吡啶-2-胺(84mg,0.888mmol)，在80℃加热15h。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间,分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制混合物经制备型HPLC纯化(流动相-A:10mM碳酸氢铵(水溶液):流动相-B：乙腈。柱：YMC填充的(100x25)5μ:方法-T/％B:0.1/50,9/50,9.1/100,12/100,12.1/50.流速：20ml/min.洗脱剂(solubility)：THF+ACN+MeOH.)，得到(4S)-8-氟-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(65mg,0.165mmol,22.33％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯Rf:0.5)，LCMS(m/z):391.23[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm:13.09(s,1H),9.18(s,1H),8.47(dd,J＝8.4,2.41Hz,1H),8.36-8.34(m,1H),8.14(d,J＝7.6Hz,1H),7.71–7.66(m,1H)7.42(d,J＝10.4Hz,1H),7.35(d,J＝8Hz,1H),5.68(dd,J＝6.03,3.2Hz,2.8Hz,1H),7.01-6.96(m,1H),3.36-3.14(m,3H),3.02-2.88(m,1H),2.66(s,3H),2.30-2.29(m,1H),2.10–2.04(m,1H)。
实施例6
合成(4S)-8-溴-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-溴-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(250mg,0.755mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(134mg,0.453mmol)。然后将反应混合物在30℃搅拌30min并加入吡啶-3-胺(142mg,1.510mmol)。将反应混合物在70℃搅拌15h。使其冷却至RT并将反应混合物倒入冷水(20mL)中并用乙酸乙酯萃取(2X20mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥且真空浓缩，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/EtOAc)，得到500mg，通过LCMS测定纯度为90％。半纯的化合物经制备型HPLC纯化(柱：XS PHENYL HEXYL(250X4.6mm,5μ),流动相:A:0.01M碳酸氢铵B:ACN,梯度：时间/％B:0/10,1/10,10/50,15/50,18/98,20/98,20.1/10,25/10，柱温：环境温度，流速:1.0ml/min,稀释剂：ACN)，获得(4S)-8-溴-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(195mg,0.413mmol,54.7％收率)，其为黄色固体(TLC:10％MeOH/乙酸乙酯,Rf:0.4)，LCMS(m/z):451.17[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.60(s,1H),8.88(d,J＝2.19Hz,1H),8.36-8.22(m,2H),8.12-8.02(m,1H),7.90(dd,J＝8.00,2.30Hz,1H),7.83(s,1H),7.33(d,J＝7.89Hz,1H),7.22(dd,J＝8.44,4.71Hz,1H),5.67(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.39-3.09(m,3H),3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.67(s,3H),2.34(dddd,J＝14.14,10.08,6.03,3.95Hz,1H),2.18-2.04(m,1H)
实施例7
合成(4S)-8-氟-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将三乙胺(0.516mL,3.70mmol)和DPPA(407mg,1.480mmol)加至烟酸(109mg,0.888mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中，2h后加入(4S)-8-氟-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.740mmol)，然后加热至80℃，保持16h。将反应混合物冷却至室温且分配在水(25mL)和EtOAc(30mL)之间,分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液减压蒸发，获得粗制化合物。粗制混合物经制备型HPLC纯化(流动相-A:10mM碳酸氢铵(水溶液):流动相-B：乙腈柱：YMC填充的(100x25)5μ:方法-T/％B:0.1/40,9/40,9.1/100,13/100,13.1/40.流速：20ml/min洗脱剂：THF+ACN+MeOH)，得到(4S)-8-氟-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(52mg,0.133mmol,17.93％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM,Rf:0.2)，LCMS(m/z):391.30[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3-d):δppm 12.65(s,1H),8.96(s,1H),8.48(d,J＝2.4Hz,1H),8.28(dd,J＝4.6,1.2Hz,1H),8.18-8.14(m,1H),8.05-7.89(m,1H),7.44(d,J＝10Hz,1H),7.35(d,J＝8Hz,1H),7.28-7.22(m,1H),5.68(dd,J＝6,3.2Hz,1H),3.36-3.14(m,3H)，3.05-3.00(m,1H)，2.66(s,3H),2.39-2.31(m,1H),2.13-2.04(m,1H)。
实施例8
合成(4S)-8-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.751mmol)在THF(15ml)中的搅拌的溶液中加入三光气(134mg,0.451mmol)，然后搅拌至室温，持续1h。随后加入吡啶-2-胺(106mg,1.126mmol)和DIPEA(291mg,2.253mmol)。在密封管中将反应混合物在75℃加热16h。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(50mL)并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，使用1％甲醇/二氯甲烷的梯度混合物)，得到(4S)-8-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.386mmol,51.4％收率)，其为白色固体(TLC系统:Rf:0.3,洗脱剂：5％甲醇/二氯甲烷)，LCMS(m/z):387.29[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.32(s,1H),8.79(d,J＝2.41Hz,1H),8.27(ddd,J＝4.82,1.97,0.88Hz,1H),8.15-8.06(m,2H),7.64(td,J＝7.78,1.97Hz,1H),7.44(s,1H),7.33(d,J＝8.11Hz,1H),6.94(ddd,J＝7.29,4.88,0.99Hz,1H),5.65(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.37-3.12(m,3H),2.99(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.65(s,3H),2.41(s,3H),2.35-2.25(m,1H),2.16-2.06(m,1H)。
实施例9
合成(4S)-9-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温将氢化钠(NaH)(0.270g,6.76mmol)加至(4S)-9-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.300g,1.126mmol)在四氢呋喃(30mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物搅拌30分钟。在室温加入3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(0.406g,1.690mmol)，然后在65℃搅拌24小时。将反应混合物冷却至室温，然后分配在冰冷的水(30mL)和EtOAc(100mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：70％EtOAc/己烷:Rf-0.3；UV活化的)。粗制残余物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用20％EtOAc/己烷洗脱，得到纯的(4S)-9-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(75.7mg,0.193mmol,17.15％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):387.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.59-14.03(m,1H),9.07(d,J＝2.19Hz,1H),8.59(dd,J＝8.22,2.52Hz,1H),8.30-8.51(m,1H),8.18(d,J＝8.55Hz,1H),7.58-7.83(m,1H),7.28-7.40(m,2H),6.91-7.05(m,1H),5.69(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.06-3.23(m,3H),2.94-3.05(m,1H),2.63(s,3H),2.49(s,3H),2.24-2.38(m,1H),1.99-2.12(m,1H)
实施例10
合成(4S)-8-氰基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-8-甲腈(200mg,0.721mmol)在THF(15ml,在密封管中)中的搅拌的溶液中加入三光气(128mg,0.433mmol)，然后搅拌至室温，持续1h。随后加入吡啶-3-胺(102mg,1.082mmol)和DIPEA(280mg,2.164mmol)，在75℃加热16h。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(50mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经柱色谱纯化(硅胶：100-200目，使用1％甲醇/二氯甲烷的梯度混合物作为洗脱剂)，得到(4S)-8-氰基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(140mg,0.350mmol,48.5％收率)，其为灰白色固体(TLC系统:Rf:0.3,洗脱剂：5％甲醇/二氯甲烷)，LCMS(m/z):398.29[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.58(s,1H),8.98(d,J＝2.19Hz,1H),8.44(d,J＝2.41Hz,1H),8.31(dd,J＝4.71,1.43Hz,1H),8.12-8.02(m,2H),7.84(s,1H),7.38(d,J＝8.11Hz,1H),7.29-7.24(m,1H),5.71(dd,J＝5.92,2.85Hz,1H),3.33-3.21(m,2H),3.02-3.17(m,2H),2.69(s,3H),2.45-2.32(m,1H),2.22-2.08(m,1H)。
实施例11
合成(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.906mmol)在THF(20mL)中的搅拌的溶液中加入NaH(65.2mg,2.72mmol)。然后将反应混合物在30℃搅拌1h，加入3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(435mg,1.812mmol)，然后将反应混合物在70℃搅拌15h。将反应混合物倒入冷水(10mL)中并用乙酸乙酯萃取(2x20mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/EtOAc)，得到(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(290mg,0.639mmol,70.5％收率)，其为灰白色固体(TLC系统:Rf-0.3,洗脱剂：5％甲醇/二氯甲烷)，LCMS(m/z):451.24[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.85(s,1H),8.63(d,J＝5.26Hz,1H),8.30-8.25(m,1H),8.15-8.09(m,1H),7.82(s,1H),7.76(s,1H),7.70-7.63(m,2H),7.02–6.93(m,1H),5.66(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.38-3.09(m,3H),3.01(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.72(s,3H),2.34(dddd,J＝14.20,10.08,6.08,3.84Hz,1H),2.16-2.02(m,1H)。
实施例12
合成(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(250mg,0.755mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(134mg,0.453mmol)。然后将反应混合物在30℃搅拌30min并加入吡啶-3-胺(142mg,1.510mmol)。将反应混合物在70℃搅拌15h。使其冷却至RT并将反应混合物倒入冷水(20mL)中并用乙酸乙酯萃取(2X20mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/EtOAc)，获得500mg，通过LCMS测定纯度为90％。半纯的化合物经制备型HPLC纯化(柱：XS PHENYL HEXYL(250X4.6mm,5μ),流动相:A:0.01M碳酸氢铵B:ACN,梯度：时间/％B:0/10,1/10,10/50,15/50,18/98,20/98,20.1/10,25/10,柱温：环境温度，流速:1.0ml/min,稀释剂：ACN)，得到(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(175mg,0.387mmol,51.3％收率)，其为灰白色固体(TLC:10％MeOH/乙酸乙酯,Rf:0.3)，LCMS(m/z):451.21[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.56(s,1H),8.69(d,J＝5.26Hz,1H),8.43(d,J＝2.63Hz,1H),8.28(dd,J＝4.71,1.42Hz,1H),8.02–7.94(m,1H),7.83(s,1H),7.49-7.41(m,2H),7.21(dd,J＝8.33,4.82Hz,1H),5.67(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.38-3.11(m,3H),3.05-2.98(m,1H),2.69(s,3H),2.35(dddd,J＝14.20,10.03,6.03,3.95Hz,1H),2.15-2.01(m,1H)。
实施例13
合成(4S)-9-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气气氛下在室温将N,N-二甲基氨基吡啶(0.482g,3.94mmol)加至(4S)-9-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.350g,1.314mmol)和吡啶-3-基氨基甲酸苯酯(0.845g,3.94mmol)在四氢呋喃(20mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在65℃搅拌48小时。将反应混合物冷却至室温并减压除去溶剂，然后分配在水(20mL)和EtOAc(70mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.3；UV活化的)。添加乙酸乙酯至反应物质中且搅拌10分钟。过滤反应物质并用EtOAc洗涤。将滤液浓缩，得到棕色固体(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用60％EtOAc/己烷洗脱，得到纯的(4S)-9-甲基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.115g,0.296mmol,22.56％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z)387.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.29(s,1H),8.92(d,J＝1.97Hz,1H),8.53(d,J＝2.19Hz,1H),8.28(br d,J＝3.51Hz,1H),8.19(br d,J＝8.33Hz,1H),7.99(dd,J＝8.00,2.30Hz,1H),7.32(d,J＝7.89Hz,1H),7.22-7.29(m,1H),7.19(s,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.17(t,J＝7.34Hz,2H),3.07-3.13(m,1H),2.97-3.05(m,1H),2.64(s,3H),2.50(s,3H),2.32(td,J＝13.76,6.47Hz,1H),1.99-2.14(m,1H)
实施例14
合成(4S)-8-氟-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将K3PO4(515mg,2.427mmol)加至(4S)-7-氯-8-氟-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(405mg,1.213mmol)、(2-甲基吡啶-4-基)硼酸(216mg,1.578mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(3mL)中的溶液中。将反应混合物脱气15min，然后在室温加入Pd2(dba)3(55.6mg,0.061mmol)和X-phos(57.8mg,0.121mmol)，且将反应混合物在80℃加热3h。将反应混合物冷却至室温且分配在水(25mL)和EtOAc(60mL)之间。分离的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗产物。粗制化合物经纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：90％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-8-氟-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(195mg,0.487mmol,40.1％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯Rf:0.2)，LCMS(m/z):391.30[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3-d):δppm 12.7(s,1H),8.68(d,J＝4.8Hz,1H),8.58(d,J＝2.4Hz,1H),8.31(dd,J＝1.6Hz,4.8Hz,1H),8.11-8.07(m,1H),7.60(s,1H),7.55-7.53(m,1H),7.45(d,J＝10.4Hz,1H),7.27-7.24(m,1H),5.70-5.68(m,1H),3.33-3.14(m,3H),3.05-3.01(m,1H),2.68(s,3H),2.38-2.30(m,1H),2.12-2.06(m,1H)。
实施例15
合成(4S)-8-氟-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将K3PO4(445mg,2.097mmol)加至(4S)-7-氯-8-氟-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,1.049mmol)、(2-甲基吡啶-4-基)硼酸(187mg,1.363mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(2mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(48.0mg,0.052mmol)和x-phos(50.0mg,0.105mmol)。将反应混合物在80℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温且分配在水(25mL)和EtOAc(60mL)之间。分离的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：90％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-8-氟-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.306mmol,29.2％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯Rf:.0.4)，LCMS(m/z):391.27[M+H]+
1H NMR(400MHz,CDCl3-d):δppm 13.05(s,1H),8.63(d,J＝5.6Hz,1H),8.35-8.33(m,1H),8.19(d,J＝8.4Hz,1H),8.09(s,1H),7.81-7.80(m,1H),7.71-7.67(m,1H),7.43(d,J＝10.4Hz,1H),7.25-6.99(m,1H),5.71-5.68(m,1H),3.32-3.14(m,3H),3.03-2.99(m,1H),2.74(s,3H),2.36-2.32(m,1H),2.09-2.05(m,1H).
实施例16
合成(4S)-8-氯-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在0℃搅拌(4S)-8-氯-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350mg,1.221mmol)、NaH(43.9mg,1.831mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液。然后将反应混合物在30℃搅拌30min并加入3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(352mg,1.465mmol)。将反应混合物在70℃搅拌16h。将反应混合物倒入冷水(50mL)中并用乙酸乙酯萃取(2x75mL)。有机层经无水硫酸镁干燥，过滤并真空浓缩，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/EtOAc)，获得500mg，通过LCMS测定纯度为90％。半纯的化合物经制备型HPLC纯化(柱：XS PHENYL HEXYL(250X4.6mm,5μ),流动相:A:0.01M碳酸氢铵B:ACN,梯度：时间/％B:0/10,1/10,10/50,15/50,18/98,20/98,20.1/10,25/10，柱温：环境温度，流速:1.0ml/min,稀释剂：ACN)，得到(4S)-8-氯-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(240mg,0.589mmol,48.3％收率)，其为灰白色固体(TLC系统；Rf-0.3,5％甲醇/二氯甲烷)，LCMS(m/z):407.29[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 12.93(s,1H),9.07(d,J＝2.19Hz,1H),8.28(ddd,J＝4.82,1.97,0.88Hz,1H),8.21(dd,J＝8.11,2.41Hz,1H),8.11-8.06(m,1H),7.68-7.63(m,2H),7.33(d,J＝8.11Hz,1H),6.96(ddd,J＝7.29,4.88,0.99Hz,1H),5.66(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.35-3.12(m,3H),3.01(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.63(s,3H)，2.33(dddd,J＝14.14,10.03,5.86,3.73Hz,1H),2.09(dt,J＝14.20,7.04Hz,1H)。
实施例17
合成(4S)-8-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气下在20℃搅拌30min的(4S)-8-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.126mmol)、三光气(201mg,0.676mmol)、DIPEA(728mg,5.63mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入固体吡啶-3-胺(159mg,1.690mmol)。将反应混合物在65℃搅拌16h。将反应混合物用饱和NaHCO3溶液稀释并用乙酸乙酯萃取(3×150mL)。有机层经无水Mg2SO4干燥，过滤，真空浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/EtOAc)，获得(4S)-8-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.499mmol,44.3％收率)，其为灰白色固体。(TLC系统:-Rf:-0.5,10％甲醇/乙酸乙酯)，LCMS(m/z):387.31[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 13.01(s,1H),8.67(d,J＝5.26Hz,1H),8.45(d,J＝2.41Hz,1H),8.26(dd,J＝4.82,1.32Hz,1H),8.09-7.94(m,1H),7.47(s,1H),7.34(s,1H),7.20(dd,J＝8.33,4.60Hz,1H),5.66(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.35-3.11(m,3H),3.00(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.68(s,3H),2.38-2.28(m,4H),2.11-1.98(m,1H),2.11-1.98(m,1H)。
实施例18
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.883mmol)在THF(15mL,在密封管中)中的搅拌的溶液中加入三光气(157mg,0.530mmol)，且搅拌30min，然后加入TEA(0.738mL,5.30mmol)和(R)-2-((四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-胺(192mg,1.060mmol)，然后在80℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc,Rf:0.6)。将反应混合物冷却至室温；将THF蒸馏出，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：1％甲醇/乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(110mg,0.195mmol,22.12％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):547.10[M+H]+,Rt＝2.65min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.02(s,1H),8.41(d,J＝5.48Hz,1H),8.08-7.97(m,2H),7.95-7.86(m,1H),7.86-7.73(m,2H),7.73-7.57(m,1H),5.46(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.92(dd,J＝4.38,1.53Hz,1H),3.76(q,J＝7.60Hz,1H),3.69-3.59(m,1H),3.54(dd,J＝10.52,1.75Hz,1H),3.39(dd,J＝10.41,4.71Hz,1H),3.29(s,1H),3.25-3.07(m,2H),3.07-2.79(m,1H),2.41-2.13(m,1H),1.99(t,J＝6.69Hz,1H),1.91-1.63(m,2H)。
实施例19
合成(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.177mmol)在THF(10mL,在密封管中)中的搅拌的溶液中加入三光气(349mg,1.177mmol)和TEA(0.985mL,7.06mmol)在室温，且搅拌30min，然后加入(S)-2-((四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-胺(427mg,2.355mmol)，然后在80℃加热16h。(TLC洗脱剂：净EtOAc,Rf:0.2)。将反应混合物冷却至室温；将THF蒸馏出，然后分配在水(25mL)和EtOAc(2x30mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：90％EtOAc/己烷)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.272mmol,23.10％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):547.07[M+H]+,Rt＝2.62min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.97(s,1H),8.34(d,J＝5.70Hz,1H),8.12-7.92(m,2H),7.87-7.46(m,4H),5.65(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),5.07(ddt,J＝6.77,4.63,2.19,2.19Hz,1H),4.07-3.46(m,4H),3.38-3.09(m,3H),3.03(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.36(dddd,J＝14.22,10.06,6.08,4.06Hz,1H),2.16-1.97(m,2H),1.94-1.81(m,1H)。
实施例20
合成(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(((S)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.046mmol)在THF(15mL,在密封管中)中的搅拌的溶液中加入三光气(310mg,1.046mmol)和TEA(0.875mL,6.28mmol)，且搅拌30min，然后加入(S)-2-((四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-胺(379mg,2.092mmol)，然后在80℃加热16h。(TLC洗脱剂：净EtOAc,Rf:0.3)。将反应混合物冷却至室温；将THF蒸馏出，然后分配在水(25mL)和EtOAc(2x30mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：90％EtOAc/己烷)，得到半纯的化合物并进一步通过制备型HPLC纯化(条件：柱：XBridge C 18(75X4.6mm,3.5μ)流动相:A:0.01M碳酸氢铵B:ACN:梯度：时间/％B:0/5,0.8/5,5/50,8/95,12/95,12.1/5,15/5:柱温度：环境温度，流速:1.0ml/min:稀释剂：ACN)，得到期望的产物(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(((S)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(110mg,0.221mmol,21.13％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):494.04[M+H]+,Rt＝1.67min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.93(s,1H),8.68(d,J＝5.26Hz,1H),8.33(d,J＝5.48Hz,1H),7.73(d,J＝5.70Hz,1H),7.68(s,1H),7.63(s,1H),7.59(s,1H),5.63(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),5.19(dq,J＝5.97,3.05Hz,1H),4.01-3.88(m,2H),3.85-3.72(m,2H),3.37-3.21(m,2H),3.18-3.11(m,1H),3.01(dd,J＝12.28,3.07Hz,1H),2.73(s,3H),2.42-2.29(m,1H),2.11-2.05(m,3H)。
实施例21
合成(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)嘧啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.046mmol)在THF(10mL,在密封管中)中的搅拌的溶液中加入三光气(155mg,0.523mmol)，且搅拌30min，然后加入DIPEA(0.914mL,5.23mmol)和2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)嘧啶-4-胺(408mg,2.092mmol)，然后在80℃搅拌16h。(TLC系统:Rf-0.2,EtOAc)。将反应混合物冷却至室温且蒸馏出THF,将粗产物分配在水(25mL)和EtOAc(2x40mL)之间。分离的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：80％乙酸乙酯/己烷)，获得57％纯物质，因此将其再次通过制备型HPLC纯化(条件：柱：XS PHENYL HEXYL(250X4.6mm,5μ),流动相:A:0.01M碳酸氢铵B:ACN,梯度：时间/％B:0/10,1/10,10/50,15/50,18/98,20/98,20.1/10,25/10柱温：环境温度，流速:0.8ml/min,稀释剂：ACN)，得到期望的产物(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)嘧啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(96.6mg,0.183mmol,17.45％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):508.1[M+H]+,Rt＝1.75min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.92(s,1H),8.68(d,J＝5.26Hz,1H),8.35(d,J＝5.70Hz,1H),7.73(d,J＝5.48Hz,1H),7.68(s,1H),7.63(s,1H),7.59(d,J＝4.82Hz,1H),5.67-5.60(m,1H),4.92(dt,J＝8.22,4.22Hz,1H),4.03-3.86(m,2H),3.56-3.45(m,2H),3.37-3.22(m,2H),3.19-3.11(m,1H),3.02(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.72(s,3H),2.40-2.29(m,1H),2.07(dt,J＝14.52,7.54Hz,1H),1.94(br s,2H),1.82-1.70(m,2H)。
实施例22
合成(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(((R)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃在氮气下向(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.697mmol)在THF(20mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(0.486mL,3.49mmol)和三光气(103mg,0.349mmol)，然后在室温搅拌30min。向该反应混合物中加入(R)-2-((四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-胺(164mg,0.907mmol)，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:5％甲醇/乙酸乙酯.Rf值：0.5.)。将反应混合物用水稀释(10mL)且用乙酸乙酯萃取(2x15mL)。合并的有机层用水洗涤(10mL)，经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，用1％MeOH/乙酸乙酯洗脱)，得到期望的产物(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(((R)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.237mmol,33.9％收率)，其为淡粉色固体。LCMS(m/z):494.07[M+H]+,Rt＝1.69min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.98(s,1H),8.66(d,J＝5.04Hz,1H),8.34(d,J＝5.70Hz,1H),7.74(d,J＝5.48Hz,1H),7.68(s,1H),7.58(s,1H),7.55-7.52(m,1H),5.64(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),5.17(tt,J＝5.26,2.52Hz,1H),3.97-3.85(m,2H),3.77-3.65(m,2H),3.35-3.11(m,3H),3.03(dd,J＝12.28,3.07Hz,1H),2.71(s,3H),2.42-2.28(m,1H),2.15-1.96(m,3H)。
实施例23
合成(4S)-8-氯-N-(5-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.339mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(1.0ml,32.9mmol)，历时10min，然后在0℃搅拌1h。(TLC洗脱剂：10％甲醇/DCM,Rf:0.1；UV活化的)。将反应物质减压浓缩并将所得棕色粘稠油状物溶于水，用饱和碳酸氢钠水溶液(10mL)碱化，然后用10％甲醇/DCM(40mL)萃取。有机层用盐水洗涤(20mL)，经硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，得到(4S)-8-氯-N-(5-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.217mmol,64.1％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.09[M+H]+,Rt＝2.03min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.55(s,1H),8.02-8.18(m,2H),7.75-8.01(m,5H),7.62(s,1H),5.47(br s,1H),5.00(br s,2H),4.00(br dd,J＝9.21,3.73Hz,1H),3.73-3.92(m,2H),3.34-3.60(m,2H),2.83-3.25(m,4H),2.12-2.30(m,1H),1.83-2.09(m,1H)。
实施例24
合成(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.25g,0.423mmol)在DCM(5mL)和甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入4MHCl的二噁烷溶液(1.586mL,6.35mmol)，然后在0℃搅拌4h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf-0.3；UV活化的)。将反应混合物通过加入饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)，然后浓缩挥发物。将残余物用水稀释(10mL)并萃取到乙酸乙酯中(2x25mL)。合并的有机萃取物经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。粗物质经柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：50％乙酸乙酯/己烷)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7(3(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺，其为白色固体。LCMS(m/z):551.03[M+H]+,Rt＝2.35min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.14(s,1H),8.34(s,1H),8.16(s,1H),8.08(br d,J＝7.67Hz,1H),7.77-7.58(m,3H),7.53(s,1H),5.63(br s,1H),4.57-4.36(m,2H),4.03(br s,1H),3.69(br d,J＝12.93Hz,2H),3.44(br s,1H),3.30-3.03(m,3H),2.97-2.63(m,1H),2.49(br s,1H),2.35(br dd,J＝9.76,4.93Hz,1H),2.11-2.00(m,1H)。
实施例25
合成(4S)-8,9-二甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在0℃向(4S)-8,9-二甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(250mg,0.892mmol)在THF(25mL)中的溶液中加入NaH(214mg,5.35mmol)，然后在室温搅拌30min。然后加入3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(321mg,1.338mmol)并将反应混合物在65℃加热16h。(TLC洗脱剂：70％EtOAc/己烷:Rf-0.4；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温且分配在水(30mL)和EtOAc(100mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液浓缩，得到粗产物。粗物质经柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：50％乙酸乙酯/己烷)，得到期望的产物(4S)-8,9-二甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.164g,0.403mmol,45.1％收率)，其为白色固体LCMS(m/z):401.15[M+H]+,Rt＝1.55min。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.43(s,1H),8.59(d,J＝5.26Hz,1H),8.26(dt,J＝4.82,0.99Hz,1H),8.12(d,J＝8.55Hz,1H),7.67-7.53(m,2H),7.32(dd,J＝5.26,1.10Hz,1H),6.93(ddd,J＝7.29,4.88,0.99Hz,1H),5.63(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.22-3.05(m,3H),3.05-2.96(m,1H),2.70(s,3H),2.46(s,3H),2.36-2.24(m,4H),2.12-1.97(m,1H)
实施例26
合成(4S)-8-氯-N-(4-苯基嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350mg,1.030mmol)在THF(35mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(0.862mL,6.18mmol)、三光气(306mg,1.030mmol)并搅拌30min。然后加入4-苯基嘧啶-2-胺(176mg,1.030mmol)并将反应混合物在65℃加热16h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，浓缩，残余物分配在水(30mL)和DCM(100mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制化合物。粗物质经柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：70％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-8-氯-N-(4-苯基嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(262mg,0.488mmol,47.4％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):537.13[M+H]+,Rt＝2.84min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.27(s,1H),8.65(d,J＝5.26Hz,1H),8.13(s,1H),8.05(d,J＝7.89Hz,1H),7.89-7.81(m,2H),7.72(d,J＝7.89Hz,1H),7.68(s,1H),7.58-7.46(m,2H),7.44-7.35(m,3H),5.78(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.38-3.13(m,3H),3.03(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.43-2.31(m,1H),2.19-2.07(m,1H)。
实施例27
合成(4S)-8-氯-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.838mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.509mL,16.76mmol,36％)，然后在0℃搅拌2h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物分配在水(10mL)和二氯甲烷(2x20mL)之间。分离有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液真空蒸发，得到粗制化合物。粗物质经柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：5％MeOH/DCM)，得到所需产物(4S)-8-氯-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(195mg,0.389mmol,46.4％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):497.10[M+H]+,Rt＝1.24min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.91(s,1H),8.63(d,J＝5.48Hz,1H),8.08(d,J＝5.70Hz,1H),7.80(s,1H),7.76(d,J＝2.19Hz,1H),7.68(dd,J＝5.15,1.21Hz,1H),7.65(s,1H),6.69-6.46(m,1H),5.63(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.13(s,3H),3.87-3.81(m,1H),3.79-3.72(m,1H),3.36-3.13(m,3H),3.01(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.71(s,4H),2.41-2.28(m,1H),2.20-2.03(m,2H)。
实施例28
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.363mmol)在甲醇(5mL)中的溶液中加入2M HCl的乙醚溶液(5mL,165mmol)，然后在室温搅拌2h。(TLC洗脱剂：15％MeOH/DCM:Rf＝0.2.；UV活化的)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用正戊烷研磨(2x10mL)，得到(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(160mg,0.270mmol,74.4％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.10[M+H]+,Rt＝2.17min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.95(s,1H),8.44(d,J＝5.70Hz,1H),8.13-8.08(m,1H),8.06(s,1H),7.98(s,1H),7.90-7.83(m,2H),7.68(d,J＝5.70Hz,1H),5.49(dd,J＝6.03,2.96Hz,1H),3.99-3.85(m,2H),3.75-3.68(m,1H),3.43-3.32(m,3H),3.28-3.17(m,2H),3.11(dd,J＝11.73,3.18Hz,1H),2.35-2.23(m,1H),2.04(dt,J＝13.98,6.93Hz,1H)。
实施例29
合成(4S)-8-氯-N-(5-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(220mg,0.409mmol)在甲醇(5mL)中的溶液中加入HCl水溶液(5mL,10.00mmol)并搅拌3h。(TLC系统5％甲醇/DCM。Rf值：0.1)。将甲醇真空除去并在0℃将残余物用饱和NaHCO3溶液碱化，并将水层用DCM萃取(2x20mL)。分离有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗产物。粗制化合物用乙醚研磨(5mL)，得到(4S)-8-氯-N-(5-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(145mg,0.282mmol,69.0％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):498.14[M+H]+,Rt＝1.44min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.72-13.12(m,1H),8.92(d,J＝1.32Hz,1H),8.63(d,J＝5.26Hz,1H),7.96(d,J＝1.32Hz,1H),7.70(s,1H),7.66(s,1H),7.62(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),5.66(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.37-4.50(m,2H),4.04-4.14(m,1H),3.66-3.83(m,2H),3.11-3.37(m,4H),2.98-3.07(m,1H),2.70(s,3H)，2.29-2.44(m,2H),2.08(dt,J＝14.58,7.40Hz,1H)。
实施例30
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(6.5g,11.00mmol)在甲醇(65mL)中的溶液中加入HCl水溶液(15mL,494mmol,36％)，然后在室温搅拌2h。(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯:Rf＝0.2；UV活化的)。在0℃将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物用水稀释(30mL)并萃取到DCM中(2x100mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，将粗制物用乙醚研磨(50mL)，得到(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(5.2g,9.29mmol,84％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.06[M+H]+,Rt＝2.14min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.05(s,1H),8.32(d,J＝5.70Hz,1H),8.13-7.92(m,2H),7.81-7.64(m,4H),5.64(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.21-4.12(m,2H),3.97(dq,J＝9.95,5.09Hz,1H),3.73-3.57(m,2H),3.38-3.10(m,4H),3.02(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.50(t,J＝6.36Hz,1H),2.35(dddd,J＝14.17,10.00,5.97,4.06Hz,1H),2.14-2.00(m,1H)。
实施例31
合成(4S)-8-氯-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(4-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(3.2g,5.42mmol)在甲醇(30mL)中搅拌的溶液中加入盐酸(5mL,165mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在30℃搅拌2h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.5；UV活化的)。将溶剂蒸发且用碳酸氢钠溶液中和，过滤获得的固体并用水和正戊烷(2x20mL)洗涤，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(1.2g,2.179mmol,40.2％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):550.09[M+H]+,Rt＝1.94min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.93(s,1H),8.20(s,1H),8.12(d,J＝7.67Hz,1H),8.04(d,J＝5.92Hz,1H),7.78-7.70(m,2H),7.68-7.59(m,2H),6.53(dd,J＝5.70,2.41Hz,1H),5.63(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),4.18-4.08(m,3H),3.87-3.68(m,2H),3.36-3.12(m,3H),3.01(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.34(dddd,J＝14.11,10.00,6.03,4.06Hz,1H),2.15-2.01(m,2H),1.58(s,1H)。
实施例32
合成(4S)-8-氯-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在0℃向(4S)-8-氯-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(100mg,0.182mmol)在甲醇(10mL)中搅拌的溶液中加入乙醚HCl(2M)(4.55mL,9.09mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在30℃搅拌2h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM:Rf-0.5；UV活化的)。将溶剂蒸发并用正戊烷洗涤(2×20mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(65mg,0.110mmol,60.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.09[M+H],+Rt＝1.94min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.06(s,1H),8.22-8.07(m,4H),7.96-7.88(m,1H),7.79-7.85(m,1H),7.18(s,1H),6.91(d,J＝5.70Hz,1H),5.50(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.13(dd,J＝9.98,3.84Hz,1H),3.97(dd,J＝9.87,6.36Hz,1H),3.90-3.80(m,3H),3.53-3.23(m,6H),2.43-2.28(m,1H),2.11(dt,J＝13.65,7.10Hz,1H)。
实施例33
合成(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,0.846mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(2mL,65.8mmol)并搅拌1h。(TLC系统:5％MeOH/DCM,Rf值：0.3)。将反应混合物蒸发以除去甲醇，然后在10℃将残余物用饱和NaHCO3(10mL)溶液碱化，将获得的固体过滤，用水洗涤(10mL)并在高真空干燥，获得期望的纯的产物(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.543mmol,64.2％收率)，其为浅黄色固体。LCMS(m/z):551.03[M+H]+,Rt＝2.35min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.95(s,1H),8.89(d,J＝1.32Hz,1H),8.14(s,1H),8.06(d,J＝8.11Hz,1H),7.93(d,J＝1.32Hz,1H),7.57-7.78(m,3H)，5.67(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.32-4.52(m,2H),4.07(dq,J＝9.65,4.75Hz,1H),3.64-3.80(m,2H),3.11-3.37(m,4H),3.02(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.22-2.47(m,2H),2.09(dt,J＝14.20,7.04Hz,1H)。
实施例34
合成(4S)-8-氯-N-(5-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,0.846mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.026mL,0.846mmol)并搅拌1h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM Rf:0.3；UV活化的)。将反应混合物蒸发以除去甲醇，残余物在10℃用饱和NaHCO3碱化(10mL)溶液，将获得的固体过滤，用水洗涤(10mL)并在高真空干燥，获得期望的纯的产物(4S)-8-氯-N-(5-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.631mmol,74.6％收率)，其为浅黄色固体。LCMS(m/z):551.03[M+H]+；Rt＝2.45min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.95(s,1H),8.89(d,J＝1.32Hz,1H),8.14(s,1H),8.06(d,J＝7.67Hz,1H),7.93(d,J＝1.32Hz,1H),7.56-7.79(m,3H),5.67(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.34-4.53(m,2H),4.07(dq,J＝9.87,4.97Hz,1H),3.64-3.82(m,2H),3.11-3.36(m,4H),3.02(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.23-2.44(m,2H),1.94-2.20(m,1H)。
实施例35
合成(4S)-8-氯-N-(吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.883mmol)在THF(20mL)中的搅拌的溶液中加入NaH(31.8mg,1.325mmol)。然后将反应混合物在30℃搅拌30min并加入3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(255mg,1.060mmol)。将反应混合物在70℃搅拌15h。(TLC:10％MeOH/乙酸乙酯,Rf:0.8)。使其冷却至室温，以及用冷水稀释(20mL)，用乙酸乙酯萃取(2X40mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥且真空浓缩，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：90％EtOAc/石油醚)，接着进行制备型HPLC(MP-A:5mM碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈柱：symmetryc8(300x21.2)7μ方法：T/％B:ISO(20:80)流速：18ml/min洗脱剂：过量的THF+ACN+MEOH)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(205mg,0.446mmol,50.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):460.01[M+H]+,Rt:2.83min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.91(s,1H),8.26-8.20(m,2H),8.16-8.06(m,2H),7.73(d,J＝7.67Hz,1H),7.68-7.58(m,3H),6.95(ddd,J＝7.29,4.88,0.99Hz,1H),5.68(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.37-3.13(m,3H),3.06-2.94(m,1H),2.34(dddd,J＝14.20,10.08,6.08,4.06Hz,1H),2.17-1.98(m,1H)。
实施例36
合成(4S)-8-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.126mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的溶液中加入NaH(54.1mg,2.253mmol)。然后在氮气下将反应混合物在30℃搅拌1h。加入3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(541mg,2.253mmol)然后将反应混合物在70℃搅拌15h。(TLC系统；.Rf-0.5,5％甲醇/二氯甲烷)。使得反应混合物冷却至室温并倒入冷水(30mL)中，用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥且真空浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/EtOAc)并进一步通过制备型HPLC纯化(条件：MP-A:5mM碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈柱：Xterra C18(250x19)10u方法：50:50流速：18ml/min洗脱剂：ACN+THF)，得到期望的产物(4S)-8-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(132mg,0.339mmol,30.1％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):387.0[M+H]+，Rt:3.41min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.28(s,1H),8.61(d,J＝5.26Hz,1H),8.31-8.24(m,1H),8.13(d,J＝8.55Hz,1H),7.71-7.62(m,2H),7.45(s,1H),7.39(dd,J＝5.04,1.53Hz,1H),6.95(ddd,J＝7.29,4.99,0.88Hz,1H),5.66(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.34-3.11(m,3H),3.05-2.96(m,1H),2.71(s,3H),2.42(s,3H),2.36-2.26(m,1H),2.06(dt,J＝14.03,7.02Hz,1H)。
实施例37
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.652mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中滴加HCl(3.96μL,0.130mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在30℃搅拌2h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.6)并真空浓缩，用饱和NaHCO3溶液中和，过滤获得的固体，用乙醚洗涤(2x20mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(180mg,0.361mmol,55.3％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):497.10[M+H]+,Rt:1.41min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.71(s,1H),8.66(d,J＝5.04Hz,1H),7.98(d,J＝5.70Hz,1H),7.88(s,1H),7.62(s,1H),7.58(d,J＝5.26Hz,1H),6.85(d,J＝1.53Hz,1H),6.80-6.76(m,1H),5.44(dd,J＝5.92,2.85Hz,1H),4.85(d,J＝5.04Hz,1H),4.59(t,J＝5.70Hz,1H),4.22(dd,J＝10.85,4.49Hz,1H),4.11(dd,J＝10.96,6.14Hz,1H),3.76(dq,J＝10.61,5.45Hz,1H),3.42(t,J＝5.81Hz,2H),3.23-3.29(m,1H),3.14-3.06(m,2H),3.02-2.94(m,1H),2.61(s,3H),2.29-2.19(m,1H),2.01-1.90(m,1H)。
实施例38
合成(4S)-8-氯-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(4-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(180mg,0.335mmol)在甲醇(8mL)中的搅拌的溶液中滴加HCl(0.102mL,3.35mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在30℃搅拌2h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.1；UV活化的)，并蒸发溶剂。将反应混合物用碳酸氢钠溶液中和且过滤获得的固体，用乙醚洗涤(2x15mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(88mg,0.174mmol,51.8％收率)，其为棕色固体。LCMS(m/z):497.1[M+H]+,Rt＝1.26min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.91(s,1H),8.62(d,J＝4.82Hz,1H),8.08(d,J＝5.48Hz,1H),7.78(d,J＝18.20Hz,2H),7.69-7.62(m,2H),6.56(d,J＝3.73Hz,1H),4.13(s,3H),3.89-3.70(m,2H),3.37-3.10(m,3H),3.01(d,J＝12.50Hz,1H),2.71(m,4H),2.65-2.62(m,1H),2.33(s,1H),2.21(s,1H),2.14-2.00(m,1H)。
实施例39
合成(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350.0mg,0.652mmol)在甲醇(5.0mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.990mL,32.6mmol)且搅拌5h。在0℃将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并浓缩。将残余物用水稀释(8mL)并萃取到EtOAc(3x10mL)中。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液真空蒸发，得到纯的(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(190.5mg,0.375mmol,57.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):497.10[M+H]+,Rt＝1.40min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.80(s,1H),8.70(d,J＝5.70Hz,1H),7.90(d,J＝5.92Hz,1H),7.68(s,1H),7.49-7.45(m,2H),6.94(d,J＝1.75Hz,1H),6.85(dd,J＝5.92,1.75Hz,1H),5.64(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.43-4.41(m,2H),4.29(d,J＝5.48Hz,1H),4.01-3.95(m,1H),3.72-3.60(m,2H),3.35-3.19(m,2H),3.16-3.10(m,1H),3.05-3.00(m,1H),2.92(t,J＝6.47Hz,1H),2.69(s,3H),2.40-2.30(m,1H),2.07(dt,J＝14.20,7.26Hz,1H)。
实施例40
合成(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.836mmol)在甲醇(20mL)中的搅拌的溶液中加入2.0M HCl(5mL,10.00mmol)。将所得反应混合物在室温搅拌1h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf:0.4)。将反应混合物减压浓缩以除去甲醇，然后用饱和碳酸氢钠溶液碱化(20mL)，用DCM萃取(3X30mL)。合并的有机层用水(20mL)，盐水溶液(20mL)洗涤并经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得的半固体用乙醚洗涤，获得固体化合物，将其过滤，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(205mg,0.407mmol,48.7％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):498.14[M+H]+,Rt＝1.14min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.95(s,1H)8.92(d,J＝1.32Hz,1H)8.63(d,J＝5.26Hz,1H)7.97(d,J＝1.32Hz,1H)7.71(s,1H)7.67(s,1H)7.63(d,J＝5.04Hz,1H)5.66(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H)4.50-4.36(m,2H)4.09(br s,1H)3.81-3.66(m,2H)3.37-3.11(m,4H)3.06-2.99(m,1H)2.69(s,3H)2.46-2.31(m,2H)2.09(dt,J＝14.03,7.02Hz 1H)。
实施例41
合成(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺在甲醇(6mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(6mL,12.00mmol,2M)，历时10min的一段时间，将澄清溶液在室温搅拌30min。(TLC系统:10％甲醇/DCM.Rf:0.2)。将反应混合物真空浓缩，得到黄色粘稠油状物且用饱和碳酸氢钠溶液中和，得到橙色沉淀。将橙色固体过滤并真空干燥，得到(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(159mg,0.316mmol,56.6％收率)，其为橙色固体。LCMS(m/z):497.1[M+H]+,Rt＝1.54min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.44(s,1H),8.65(d,J＝5.04Hz,1H),7.85(s,1H),7.57-7.71(m,2H),7.40-7.57(m,2H),6.44(dd,J＝7.67,1.10Hz,1H),5.48(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),4.76(br s,1H),4.57(br s,1H),3.76(br d,J＝7.23Hz,1H),3.61-3.71(m,2H),3.32-3.49(m,2H),3.22(m，1H),3.04-3.19(m,2H),2.97(br dd,J＝12.06,3.07Hz,1H),2.53-2.58(m,3H),2.22(m,1H),1.84-1.95(m,1H)。
实施例42
合成(4S)-8-氯-N-(2-(3-羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.883mmol)在四氢呋喃(10mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(157mg,0.530mmol)和三乙胺(0.738mL,5.30mmol)且搅拌30min。然后在28℃将3-((4-氨基嘧啶-2-基)氧基)丙-1-醇(299mg,1.766mmol)加至反应混合物，然后在80℃搅拌16h。(TLC系统:5％甲醇/乙酸乙酯.Rf值：0.4,UV)。使得反应混合物冷却至室温并用水稀释(40mL)，用乙酸乙酯萃取(2X50mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(30mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：80％乙酸乙酯/石油醚)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-(3-羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(65mg,0.117mmol,13.27％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):535.15[M+H]+,Rt＝2.38min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.97(s,1H),8.40(d,J＝5.70Hz,1H),8.07(d,J＝7.89Hz,1H),8.04(s,1H),7.92-7.86(m,2H),7.83-7.78(m,1H),7.64(d,J＝5.70Hz,1H),5.46(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),4.48(t,J＝5.15Hz,1H),3.97-3.87(m,2H),3.50-3.42(m,2H),3.25(s,1H),3.17-3.06(m,2H),2.99(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.34-2.19(m,1H),2.04-1.92(m,1H),1.72(quin,J＝6.30Hz,2H)。
实施例43
合成(4S)-8-氯-N-(6-(3-羟基-2,2-二甲基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在10℃向3-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇(406mg,2.060mmol)在四氢呋喃(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(183mg,0.618mmol)和三乙胺(0.862mL,6.18mmol)且搅拌30min。然后在28℃将(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350mg,1.030mmol)加至反应混合物，然后在80℃搅拌16h。(TLC系统:5％甲醇/乙酸乙酯.Rf值：0.4,UV)。使反应混合物冷却至室温并用水稀释(40mL)，用乙酸乙酯萃取(2X70mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(30mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，100％乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-(3-羟基-2,2-二甲基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(146mg,0.256mmol,24.83％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):563.19[M+H]+,Rt＝2.71min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.67(s,1H),8.88(s,1H),8.03(s,1H),7.96(d,J＝7.67Hz,1H),7.90(s,1H),7.75-7.70(m,1H),7.70-7.61(m,2H),5.70(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.74-3.63(m,2H),3.36-3.20(m,4H),3.11-3.19(m,2H),3.02(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.43-2.30(m,1H),2.09(dt,J＝14.31,7.21Hz,1H),0.87(d,J＝1.75Hz,6H)。
实施例44
合成(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(185mg,0.344mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入盐酸(0.145mL,1.719mmol)，然后在室温搅拌2h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM Rf:0.4；UV活化的)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用NaHCO3水溶液中和并将获得的固体过滤，然后用正戊烷洗涤(2x10mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(148mg,0.284mmol,82％收率)，其为淡棕色固体。LCMS(m/z):498.0[M+H]+,Rt＝1.38min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.03(s,1H),8.62(d,J＝5.26Hz,1H),8.47(d,J＝0.88Hz,1H),7.88(s,1H),7.70(s,1H),7.65(dd,J＝5.26,1.32Hz,1H),7.41(d,J＝0.88Hz,1H),5.45(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.97(s,1H),4.67(br s,1H),4.35(dd,J＝10.74,4.17Hz,1H),4.20(dd,J＝10.85,6.47Hz,1H),3.82-3.77(m,1H),3.46-3.41(m,2H),3.27-3.23(m,1H),3.16-3.09(m,2H),2.98(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.61(s,3H),2.25(td,J＝6.85,4.06Hz,1H),2.01-1.93(m,1H)。
实施例45
合成(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(6.0g,10.15mmol)在1,4-二噁烷(30mL)中的搅拌的溶液中加入4M HCl的二噁烷溶液(15.06g,50.8mmol)且再搅拌4h。(TLC系统:100％乙酸乙酯.Rf值：0.2)。将反应混合物蒸发，加入饱和NaHCO3溶液(50mL),过滤获得的固体并真空干燥，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(5.4g,9.80mmol,97％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):551.13[M+H]+,Rt＝2.18min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.69(s,1H),8.87(s,1H),8.05-7.99(m,2H),7.94-7.80(m,4H),5.50(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.89(d,J＝5.04Hz,1H),4.62(t,J＝5.59Hz,1H),3.83-3.66(m,3H),3.40-3.23(m,3H),3.18-3.07(m,2H),3.01-2.94(m,1H),2.30-2.20(m,1H),1.98(dt,J＝14.14,7.18Hz,1H)。
实施例46
合成(4S)-8-氯-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-N-(4-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.338mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.294mL,3.38mmol)且搅拌2h。(TLC系统:100％乙酸乙酯,Rf值：0.3)。然后将反应混合物用饱和NaHCO3溶液淬灭(10mL)并用DCM萃取(2x30mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(130mg,0.236mmol,69.6％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):551.10[M+H]+,Rt＝1.92min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.94(s,1H),8.22(d,J＝5.70Hz,1H),8.11-8.05(m,2H),7.88-7.75(m,3H),6.55(d,J＝5.70Hz,1H),5.46(dd,J＝6.03,2.96Hz,1H),4.93(d,J＝4.82Hz,1H),4.63(t,J＝5.70Hz,1H),4.23-4.16(m,1H),4.13-4.08(m,1H),3.78-3.71(m,1H),3.42-3.34(m,2H),3.28-3.24(m,1H),3.16-3.06(m,2H),2.98(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.29-2.19(m,1H),1.95(dt,J＝14.09,7.32Hz,1H)。
实施例47
合成(4S)-8-氯-N-(3-氟-5-(吡啶-3-基)苯基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在密封管中，在室温向(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.046mmol)在THF中的搅拌的溶液中(15mL)加入三光气(186mg,0.628mmol)和三乙胺(0.875mL,6.28mmol)且搅拌30min。然后，加入3-氟-5-(吡啶-3-基)苯胺(236mg,1.255mmol)，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:Rf-0.3,5％MeOH/EtOAc)。使得反应混合物冷却至室温并用水稀释(25mL)，用EtOAc萃取(2x40mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：1％甲醇/乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(3-氟-5-(吡啶-3-基)苯基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.295mmol,28.2％收率)，其为黄色固体。LCMS(m/z):501.09[M+H]+,Rt＝1.89min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.80(s,1H),8.77-8.74(m,1H),8.68-8.65(m,1H),8.63(dd,J＝4.82,1.75Hz,1H),7.71-7.66(m,2H),7.50-7.45(m,2H),7.40-7.30(m,3H),7.00-6.95(m,1H),5.67(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.37-3.12(m,3H),3.06-3.00(m,1H),2.55(s,3H),2.40-2.31(m,1H),2.14-2.05(m,1H)。
实施例48
合成(4S)-8-氯-N-(2-(3-羟基-3-甲基丁氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在密封管中，在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.883mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(157mg,0.530mmol)和三乙胺(0.738mL,5.30mmol)且搅拌30min。然后，加入4-((4-氨基嘧啶-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇(348mg,1.766mmol)，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:Rf-0.4，5％MeOH/EtOAc)。使得反应混合物冷却至室温并用水稀释(25mL)，用EtOAc萃取(2x40mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：1％甲醇/乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-(3-羟基-3-甲基丁氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(110mg,0.192mmol,21.75％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):563.12[M+H]+,Rt＝2.58min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.01(s,1H),8.34(d,J＝5.70Hz,1H),8.07-7.97(m,2H),7.76-7.63(m,4H),5.64(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.30-4.11(m,2H),3.43-3.11(m,3H),3.02(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.40-2.28(m,1H),2.13-2.04(m,2H),1.88(t,J＝6.25Hz,2H),1.26(s,6H)。
实施例49
合成(4S)-8-氯-N-(6-(3-羟基-2,2-二甲基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.883mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(0.738mL,5.30mmol)，三光气(262mg,0.883mmol)，然后在室温搅拌30min。向该反应混合物中加入3-((6-氨基吡啶-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇(520mg,2.65mmol)，然后在70℃加热16h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc/己烷,Rf:0.3,UV活化的)。将反应混合物冷却至RT，加入水(10mL)并用EtOAc萃取(3x10mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并蒸发得到粗产物。将粗物质通过制备型HPLC纯化(条件-柱：Xterra(250X21.1mm,10μ)；流动相-A:10mM碳酸氢铵；流动相-B:乙腈；柱温：环境温度；流速:18ml/min:稀释剂：THF+MEOH+ACN)，得到(4S)-8-氯-N-(6-(3-羟基-2,2-二甲基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(128mg,0.224mmol,25.3％收率)。LCMS(m/z):562.11[M+H]+,Rt＝2.93min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.56(s,1H),8.06(s,1H),8.01(d,J＝7.67Hz,1H),7.73–7.61(m,3H),7.57-7.51(m,2H),6.45-6.38(m,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.67(q,J＝11.18Hz,2H),3.35-3.18(m,2H),3.13(br d,J＝7.02Hz,3H),3.00(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.79(br t,J＝6.91Hz,1H),2.39-2.27(m,1H),2.14-2.03(m,1H),0.79(d,J＝5.04Hz,6H)。
实施例50
合成(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
氮气下在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(20g,33.8mmol)在甲醇(100mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(10mL,40.0mmol,36％)，然后在室温搅拌1h。(TLC洗脱剂：5％甲醇/DCM,Rf:0.3,UV活化的)。将反应混合物浓缩，残余物用饱和NaHCO3溶液碱化(直到pH-8-9)且在室温搅拌15min。所得固体通过过滤分离并吸收在DMSO(20mL)和水(600mL)混合物中，然后在室温搅拌16h。将固体过滤，干燥，得到纯的(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(15.3g,27.7mmol,82％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.13[M+H]+,Rt＝2.15min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.02(s,1H),8.30(d,J＝5.70Hz,1H),8.06-7.97(m,2H),7.80-7.67(m,4H),5.62(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.18-4.04(m,2H),3.97(dq,J＝9.92,5.10Hz,1H),3.77(d,J＝5.48Hz,1H),3.71-3.58(m,2H),3.37-3.20(m,2H),3.19-3.10(m,2H),3.02(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.40-2.29(m,1H),2.14-2.01(m,1H)。
实施例51
合成(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在氮气下在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.454mmol)在乙醚(5mL)中的搅拌的溶液中加入2.0M HCl的乙醚溶液(3mL,6.00mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM,Rf-0.3,UV活化的)。将溶剂减压蒸发，将粗制物用乙醚研磨(2x10mL)，得到(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(220mg,0.369mmol,81％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):551.0[M+H]+,Rt＝3.45min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.93(s,1H),8.45(d,J＝5.70Hz,1H),8.15-7.97(m,3H),7.93-7.77(m,2H),7.69(d,J＝5.70Hz,1H),5.80(brs,4H),5.50(br dd,J＝5.48,2.85Hz,1H),4.03-3.82(m,2H),3.77-3.64(m,1H),3.54-3.09(m,6H),2.42-2.28(m,1H),2.07(dt,J＝13.92,7.07Hz,1H)。
实施例52
合成(4S)-8-氯-N-环丙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(15g,44.2mmol)在THF(600mL,在密封管中)中的搅拌的溶液中加入三光气(6.55g,22.08mmol)和DIPEA(38.6mL,221mmol)且搅拌30min。然后加入环丙胺(6.30mL,88mmol)，然后在80℃搅拌16h。(TLC系统:Rf-0.4,90％EtOAc-石油醚)。使得反应混合物冷却至室温，将其用水稀释(500ml),用乙酸乙酯萃取(3x900ml)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：80％乙酸乙酯/己烷)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-环丙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(5.1g,11.96mmol,27.1％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):423.0[M+H]+,Rt＝2.65min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.05(br s,1H),7.94-7.85(m,2H),7.71(d,J＝7.89Hz,1H),7.63-7.53(m,2H),5.63(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.34-3.13(m,2H),3.11-3.02(m,1H),2.97-2.90(m,1H),2.77(tq,J＝7.13,3.65Hz,1H),2.27(dddd,J＝14.09,10.03,6.14,3.95Hz,1H),2.05-1.96(m,1H),0.78-0.65(m,2H),0.46-0.35(m,2H)。
实施例53
合成(4S)-8-氯-N-环丙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在0℃向(4S)-8-氯-N-环丙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(100mg,0.237mmol)在1,4-二噁烷(3mL)中的搅拌的溶液中加入4M HCl在1,4二噁烷(0.473mL,1.892mmol)中的溶液且搅拌2h。(TLC系统:Rf-0.1,EtOAc)在室温。将反应混合物减压浓缩，获得残余物，并将其用正戊烷研磨(3×10mL)。所得固体过滤通过布氏漏斗，用正戊烷冲洗(5mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-环丙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(50mg,0.108mmol,45.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):423.0[M+H]+,Rt＝2.67min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 9.65(s,1H),8.57(s,1H),7.96-7.86(m,2H),7.79(d,J＝7.89Hz,1H),7.70-7.63(m,1H),5.91(s,1H),4.03(s,1H),3.81-3.69(m,2H),3.59(s,1H),2.82-2.62(m,2H),2.47(s,1H),0.77(q,J＝6.36Hz,2H),0.49-0.39(m,2H)。
实施例54
合成(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(50mg,0.091mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(0.028mL,0.908mmol)，然后在室温搅拌4h。(TLC系统:Rf-0.1,EtOAc)。将反应混合物减压浓缩，获得残余物。将残余物用正戊烷研磨(3×10mL)。所得固体过滤通过布氏漏斗，用正戊烷冲洗(5mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(20mg,0.034mmol,37.4％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.1[M+H]+,Rt＝2.19min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.62(s,1H),8.86(s,1H),8.05-7.99(m,3H),7.94(s,1H),7.89-7.84(m,2H),5.54(dd,J＝5.70,2.85Hz,1H),3.82-3.67(m,5H),3.44-3.14(m,6H),2.38-2.28(m,1H),2.12-2.02(m,1H)。
实施例55
合成(4S)-8-氯-N-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
在密封管中,在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.883mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(131mg,0.442mmol)且搅拌30min，然后加入DIPEA(0.771mL,4.42mmol)和2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)嘧啶-4-胺(345mg,1.766mmol)，然后在80℃搅拌16h。(TLC系统:Rf-0.4,40％EtOAc-石油醚)。使得反应混合物达到室温并用水淬灭(30ml),用乙酸乙酯萃取(2x50ml)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：40％乙酸乙酯/己烷)并将其再次通过制备型HPLC纯化(条件:柱：XBridge C 18(75X4.6mm,3.5μ)流动相:A:0.01M碳酸氢铵B:CAN梯度：时间/％B:0/5,0.8/5,5/50,8/95,12/95,12.1/5,15/5柱温：环境温度，流速:1.0ml/min稀释剂：ACN)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(111.4mg,0.198mmol,22.46％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):561.1[M+H]+,Rt＝2.70min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.94(s,1H),8.33(d,J＝5.70Hz,1H),8.07(dd,J＝2.52,1.86Hz,2H),7.79-7.73(m,1H),7.73-7.64(m,3H),5.64(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.87(tt,J＝7.56,3.73Hz,1H),3.97-3.85(m,2H),3.51(ddt,J＝11.46,7.62,3.51,3.51Hz,2H),3.36-3.10(m,3H),3.02(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.35(dddd,J＝14.14,10.03,6.08,3.95Hz,1H),2.08(dt,J＝14.25,6.91Hz,1H),1.91-1.80(m,2H),1.77-1.62(m,2H)。
实施例56
合成(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(9.1g,15.42mmol)在甲醇(100mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(4.69mL,154mmol)。将反应混合物搅拌1h。(TLC系统:Rf-0.4,净EtOAc)在室温并减压浓缩，获得残余物。将残余物用饱和碳酸氢钠溶液中和，将获得的固体产物过滤并干燥，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(5.75g,10.39mmol,67.3％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.16[M+H]+,Rt＝4.23min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.44(s,1H),8.07-7.99(m,2H),7.90-7.80(m,3H),7.69-7.57(m,2H),6.43(dd,J＝7.45,1.10Hz,1H),5.49(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.76(d,J＝4.82Hz,1H),4.53(t,J＝5.59Hz,1H),3.76-3.59(m,3H),3.37-3.30(m,3H),3.17-3.08(m,2H),2.98(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.33-2.19(m,1H),2.05-1.88(m,1H)。
实施例57
合成(4S)-8-氯-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.338mmol)在甲醇(8mL)中的搅拌的溶液中加入盐酸(1.0mL,11.85mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC系统:净乙酸乙酯,Rf:0.2)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用饱和NaHCO3溶液中和并将获得的固体过滤，然后用正戊烷(2x10mL),乙醚(2x10mL)洗涤，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(92mg,0.162mmol,47.8％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.13[M+H]+,Rt＝1.94min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.40(s,1H),8.19(d,J＝5.70Hz,1H),8.15(s,1H),8.07(d,J＝7.45Hz,1H),7.74(s,1H),7.68(s,1H),7.66-7.59(m,1H),6.42(d,J＝5.70Hz,1H),5.73(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.65(dd,J＝12.17,5.15Hz,1H),4.48(dd,J＝12.06,4.60Hz,1H),4.25(d,J＝6.36Hz,1H),3.97-3.88(m,1H),3.67-3.59(m,2H)，3.41-3.10(m,4H),2.99(dd,J＝12.39,3.40Hz,1H),2.33(qd,J＝10.05,3.62Hz,1H),2.14-2.00(m,1H)。
实施例58
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺，盐酸盐
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(100mg,0.182mmol)在乙醚(10mL)中的搅拌的溶液中滴加2M HCl的乙醚溶液(5mL,0.182mmol)，历时2min的一段时间。然后将反应混合物在30℃搅拌2h。(TLC系统:5％甲醇/二氯甲烷,Rf:0.1)，然后将反应混合物蒸发并用正戊烷洗涤(2×20mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(92mg,0.155mmol,85％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.16[M+H]+,Rt＝2.20min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.76(s,1H),8.11(d,J＝1.32Hz,2H),7.99-7.92(m,2H),7.89-7.82(m,1H),7.09(d,J＝1.32Hz,1H),6.66(dd,J＝6.03,1.64Hz,1H),5.46(dd,J＝5.59,2.96Hz,1H),4.23(dd,J＝10.52,4.38Hz,1H),4.11(dd,J＝10.52,6.14Hz,1H),3.82-3.73(m,1H),3.43(d,J＝5.70Hz,1H),3.39-3.30(m,3H),3.25-3.16(m,2H),3.13-3.07(m,3H),2.37-2.25(m,1H),2.01(dt,J＝14.09,7.10Hz,1H)。
实施例59
合成(4S)-8-氯-N-(6-(3-羟基-3-甲基丁氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.472mmol)在THF(40mL)中的搅拌的溶液中加入TEA(1.026mL,7.36mmol)，三光气(262mg,0.883mmol)并搅拌30min。然后加入4-((6-氨基吡啶-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇(578mg,2.94mmol)并将反应混合物在100℃加热16h。(TLC洗脱剂系统:100％EtOAc,Rf-0.5,UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(5mL)和EtOAc(15mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗产物。粗制化合物经色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：30％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-8-氯-N-(6-(3-羟基-3-甲基丁氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(590mg,1.049mmol,71.3％收率)，其为白色固体LCMS(m/z):561.98[M]+,Rt＝2.85min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.51(s,1H),8.02(s,1H),7.83-7.98(m,1H),7.58-7.76(m,4H),7.58-7.76(m,1H),6.36(d,J＝8.11Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.79-3.95(m,2H),3.11-3.36(m,3H),2.94-3.11(m,1H),2.34(br dd,J＝9.98,4.06Hz,1H),2.21-2.29(m,1H),1.95-2.21(m,1H),1.72(t,J＝5.92Hz,2H),1.19(s,6H)。
实施例60
合成(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐:
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(22.0g,37.3mmol)在甲醇(50mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(22mL,261mmol,36％)，然后在室温搅拌5h。反应完成后,将挥发物减压蒸发，得到粗物质。粗物质用乙酸乙酯(2x10mL),乙醚(10mL)研磨，将固体冻干，得到纯的(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(15.792g,26.9mmol,72.1％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.16[M+H]+,Rt＝2.21min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.78(s,1H),8.13-8.03(m,3H),8.00(d,J＝6.14Hz,1H),7.96-7.92(m,1H),7.89-7.83(m,1H),7.13(brS,3H),6.71(dd,J＝6.14,1.75Hz,1H),5.48(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.24(dd,J＝10.52,4.17Hz,1H),4.12(dd,J＝10.52,6.36Hz,1H),3.83-3.76(m,1H),3.62-3.51(m,1H),3.51-3.41(m,5H),2.49-2.40(m,1H),2.20-2.03(m,1H)。
实施例61
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(18.4g,31.2mmol)在甲醇(50mL)中的搅拌的溶液中滴加HCl(9.48mL,312mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在30℃搅拌2h。(TLC:洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.5；UV活化的)并蒸发溶剂。将反应混合物用碳酸氢钠溶液中和且过滤获得的固体，用乙醚(2x50mL)和正戊烷(2x50mL)洗涤，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(15.6g,28.3mmol,91％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.09[M+H]+,Rt:2.22min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.77(s,1H),7.98(s,1H),7.93(d,J＝7.67Hz,1H),7.85(d,J＝5.92Hz,1H),7.80(d,J＝7.67Hz,1H),7.66-7.72(m,2H),7.03(d,J＝1.32Hz,1H),6.70(dd,J＝5.81,1.64Hz,1H),5.65(dd,J＝5.48,2.85Hz,1H),4.43(d,J＝4.38Hz,2H),4.28(d,J＝4.60Hz,1H),3.97(d,J＝4.38Hz,1H),3.60-3.70(m,2H),3.10-3.36(m,3H),2.99-3.05(m,1H),2.86(s,1H),2.29-2.41(m,1H),2.07(dt,J＝14.31,7.43Hz,1H)。
实施例62
合成(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺，盐酸盐
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.363mmol)在乙醚(5mL)中搅拌的溶液中加入2M HCl的乙醚溶液(3.63mL,7.26mmol)并搅拌4h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0；UV活化的)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用正戊烷研磨(2x10mL)，得到(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(151mg,0.249mmol,68.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.03[M+H]+,Rt＝2.18min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.63(s,1H),8.86(s,1H),8.06-8.02(m,2H),7.99(s,1H),7.93(s,1H),7.88-7.81(m,2H),5.66-5.30(m,1H),3.90-3.61(m,3H),3.48-3.07(m,6H),2.45-2.23(m,1H),2.12-1.95(m,1H)
实施例63
合成(4S)-8-氯-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(8.0g,13.56mmol)在甲醇(80mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(8.24mL,271mmol,36％)，然后在0℃搅拌2h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物分配在水(40mL)和DCM(150mL)之间。分离有机层，经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液真空蒸发，将粗物质用乙醚研磨(50mL)，得到(4S)-8-氯-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(5.8g,10.53mmol,78％收率)，其为白色固体LCMS(m/z):550.09[M+H]+,Rt＝1.96min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.93(s,1H),8.20(s,1H),8.12(d,J＝7.89Hz,1H),8.04(d,J＝5.70Hz,1H),7.77-7.71(m,2H),7.68-7.58(m,2H),6.53(dd,J＝5.81,2.30Hz,1H),5.64(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),4.19-4.08(m,3H),3.88-3.79(m,1H),3.79-3.66(m,1H),3.37-3.11(m,3H),3.01(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.58(d,J＝4.17Hz,1H),2.34(dddd,J＝14.17,10.00,5.97,4.06Hz,1H),2.15-1.98(m,2H)。
实施例64
合成(4S)-8-氯-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在0℃向(4S)-8-氯-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.364mmol)在乙醚(5mL)中的搅拌的溶液中加入2M HCl的乙醚溶液(3.64mL,7.27mmol)并搅拌4h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0；UV活化的)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用正戊烷研磨(2x10mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(178mg,0.295mmol,81％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.13[M+H]+,Rt＝1.95min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.06(br s,1H),8.19-8.12(m,2H),8.08(br d,J＝6.14Hz,1H),8.03(s,1H),7.94-7.87(m,1H),7.86-7.77(m,1H),7.24(br s,1H),6.86(brd,J＝3.73Hz,1H),5.49(br dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),4.11(dd,J＝9.98,3.84Hz,1H),3.97(dd,J＝9.98,6.25Hz,1H),3.86-3.78(m,1H),3.53-3.39(m,3H),3.33-3.14(m,3H),2.39-2.28(m,1H),2.13-2.00(m,1H)。
实施例65
合成(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(7.25g,12.27mmol)在甲醇(75mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(7.45mL,245mmol,36％)且搅拌2h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物用水稀释(50mL)并萃取到二氯甲烷中(4x50mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液真空蒸发，将粗物质用乙醚研磨(50mL)，得到(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(5.2g,9.38mmol,76％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):551.10[M+H]+,Rt＝2.16min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.76(s,1H),8.88(s,1H),8.00(s,1H),7.95-7.89(m,2H),7.77-7.73(m,1H),7.70-7.65(m,2H),5.69(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.04-3.84(m,3H),3.67-3.46(m,2H),3.37-3.21(m,2H),3.18-3.12(m,1H),3.03(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.58(d,J＝4.60Hz,1H),2.36(dddd,J＝14.20,10.03,6.03,3.95Hz,1H),2.14-2.03(m,2H)。
实施例66
合成(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.423mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.357mL,4.23mmol,36％)且搅拌2h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物用水稀释(5mL)并萃取到二氯甲烷中(2x10mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液真空蒸发，将粗物质用乙醚(10mL)和戊烷(10mL)研磨，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(157mg,0.278mmol,65.8％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.13[M+H]+,Rt＝2.15min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.56(s,1H),8.56(s,2H),7.98(s,1H),7.90(d,J＝7.67Hz,1H),7.77(br d,J＝7.89Hz,1H),7.70-7.59(m,2H),5.65(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),4.51-4.38(m,2H),4.14-4.06(m,1H),3.81-3.65(m,2H),3.38-3.19(m,4H),3.07-3.00(m,1H),2.41-2.26(m,2H),2.09(dt,J＝14.31,7.21Hz,1H)
实施例67
合成(4S)-8-氯-N-(6-(3-羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(3-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.405mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.184mL,6.07mmol)，搅拌4h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM,Rf:0.3)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用饱和NaHCO3溶液碱化(5mL)。所得固体过滤，用戊烷研磨(15mL)，减压干燥，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-(3-羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(61mg,0.113mmol,28.0％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):534.14[M+H]+,Rt＝2.62min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.58(s,1H),7.89-8.03(m,2H),7.68-7.75(m,1H),7.63-7.67(m,1H),7.56-7.61(m,1H),7.50-7.55(m,1H),6.36(dd,J＝7.78,0.77Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.81-3.94(m,2H),3.58(q,J＝5.70Hz,2H),3.19-3.36(m,2H),3.11-3.18(m,1H),3.01(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.27-2.40(m,1H),2.02-2.17(m,2H),1.72(quin,J＝5.81Hz,2H)。
实施例68
合成(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(100mg,0.182mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入2M HCl的乙醚溶液(8mL,0.182mmol)，然后在室温搅拌2h。(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯,Rf:0.1)。然后真空浓缩并将残余物用正戊烷研磨(10mLx3)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(40mg,0.068mmol,37.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.09[M+H]+,Rt＝2.35min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.16(s,1H),8.51(s,1H),8.02-7.95(m,2H),7.81(d,J＝7.67Hz,1H),7.74-7.69(m,1H),7.62-7.56(m,1H),7.50(d,J＝7.67Hz,1H),6.48(d,J＝7.67Hz,1H),5.91(s,1H),4.02-3.47(m,11H),2.66(s,1H),2.47(s,1H)。
实施例69
合成(4S)-8-氯-N-(6-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.331mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(1mL,32.9mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC系统:净乙酸乙酯,Rf:0.3)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用饱和NaHCO3溶液中和，过滤获得的固体，用水(20mLx3)和正戊烷(20mL×2)洗涤，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(130mg,0.247mmol,74.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):521.07[M+H]+,Rt＝2.39min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.75(s,1H),8.95(s,1H),7.98(s,1H),7.93-7.87(m,2H),7.74-7.70(m,1H),7.69(s,1H),7.67-7.61(m,1H),5.68(dd,J＝6.03,2.96Hz,1H),3.88-3.83(m,2H),3.76-3.72(m,2H),3.36-3.21(m,3H),3.19-3.13(m,1H),3.04(dd,J＝12.28,3.07Hz,1H),2.41-2.31(m,1H),2.14-2.04(m,1H)。
实施例70
合成(4S)-8-氯-N-(2-(2-羟基乙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.331mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(0.5mL,13.71mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯,Rf:0.4)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用饱和NaHCO3溶液中和，过滤获得的固体，用正戊烷洗涤(20mLx3)，得到(4S)-8-氯-N-(2-(2-羟基乙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(140mg,0.267mmol,81％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):521.04[M+H]+,Rt＝2.33min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.04(s,1H),8.34(d,J＝5.48Hz,1H),8.05-7.98(m,2H),7.76-7.67(m,4H),5.64(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.11-4.07(m,2H),3.84-3.80(m,2H),3.36-3.20(m,2H),3.18-3.13(m,1H),3.03(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.50(t,J＝6.25Hz,1H),2.41-2.31(m,1H),2.13-2.04(m,1H)。
实施例71
合成(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(8g,13.56mmol)在甲醇(70mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(30mL,987mmol)，然后在室温搅拌2h。(TLC系统:净乙酸乙酯,Rf:0.3)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用饱和NaHCO3溶液中和，过滤获得的固体，用正戊烷洗涤(10mL×2)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(6g,10.87mmol,80％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.09[M+H]+,Rt＝2.33min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.61(s,1H),8.02-7.95(m,2H),7.76-7.72(m,1H),7.69-7.64(m,2H),7.58-7.53(m,1H),7.51-7.48(m,1H),6.42(dd,J＝7.89,0.66Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.97-3.88(m,2H),3.75(dq,J＝10.14,5.10Hz,1H),3.54-3.42(m,2H),3.36-3.19(m,2H),3.17-3.12(m,1H),3.01(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.81(d,J＝5.92Hz,1H),2.38-2.28(m,2H),2.13-2.04(m,1H)。
实施例72
合成(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.424mmol)在甲醇(5mL)和四氢呋喃(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(0.2mL,6.58mmol)，然后在室温搅拌3h。(TLC系统:净乙酸乙酯,Rf:0.1)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用饱和NaHCO3溶液中和并用乙酸乙酯萃取(30mL×2)。合并的有机层用水(15mL×2)和盐水(20mL)洗涤，经无水硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，获得粗物质。粗物质用正戊烷研磨(15mL×3)且过滤，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(175mg,0.318mmol,75％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.09[M+H]+,Rt＝2.28min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.40(s,1H),8.07(d,J＝2.41Hz,1H),7.99(s,1H),7.93(d,J＝7.89Hz,1H),7.78-7.74(m,2H),7.68-7.63(m,2H),6.73(d,J＝8.99Hz,1H),5.66(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.42(dd,J＝4.60,1.10Hz,2H),4.02-3.93(m,2H),3.72-3.61(m,2H),3.36-3.20(m,2H),3.16-3.11(m,1H),3.05-3.00(m,1H),2.67(t,J＝6.47Hz,1H),2.38-2.29(m,1H),2.09(dt,J＝14.25,7.13Hz,1H)。
实施例73
合成(4S)-8-氯-N-(6-(3-羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.883mmol)在四氢呋喃(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(131mg,0.442mmol)且搅拌30min。向该反应混合物中加入三乙胺(0.615mL,4.42mmol)和3-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)丙-1-醇(194mg,1.148mmol)，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:5％甲醇/乙酸乙酯。Rf值：0.3)。将反应混合物用水稀释(40mL)并用乙酸乙酯萃取(2x50ml)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(30mL)，经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，用1％MeOH/EtOAc洗脱)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-(3-羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(80mg,0.144mmol,16.33％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):535.08[M+H]+,Rt＝2.45min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.73(s,1H),8.91(s,1H),7.99(s,1H),7.91(d,J＝7.67Hz,1H),7.87(s,1H),7.75-7.70(m,1H),7.68(s,1H),7.66-7.59(m,1H),5.69(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.97-3.86(m,2H),3.67(q,J＝5.92Hz,2H),3.37-3.08(m,3H),3.03(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.43-2.28(m,1H),2.17-2.00(m,1H),1.81(q,J＝5.97Hz,2H),1.67(t,J＝5.70Hz,1H)。
实施例74
合成(4S)-8-氯-N-(2-(3-羟基-2,2-二甲基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.177mmol)在四氢呋喃(20mL)中的溶液中加入三光气(175mg,0.589mmol)且搅拌30min。向该反应混合物中加入三乙胺(0.821mL,5.89mmol)和3-((4-氨基嘧啶-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇(302mg,1.531mmol)，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:乙酸乙酯.Rf值：0.5)。使得反应混合物冷却至室温并用水稀释(20mL)，用乙酸乙酯萃取(2x50ml)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(20mL)，经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，用5％MeOH/EtOAc洗脱)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-(3-羟基-2,2-二甲基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.211mmol,17.92％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):563.12[M+H]+,Rt＝2.66min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.06(s,1H),8.32(d,J＝5.70Hz,1H),8.10(s,2H),7.66-7.79(m,4H),5.64(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.09-3.92(m,2H),3.36-3.29(m,3H),3.28-3.19(m,1H),3.18-3.12(m,1H),3.02(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.94(brs,1H),2.41-2.30(m,1H),2.07(dt,J＝14.36,7.07Hz,1H),0.97(d,J＝1.75Hz,6H)。
实施例75
合成(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(8.5g,14.38mmol)在甲醇(30mL)中的搅拌的混悬液中加入HCl水溶液(50mL,100mmol,2M)，然后在室温搅拌1h。(TLC系统:10％甲醇/DCM.Rf:0.2)。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化。将所得白色沉淀过滤并干燥，得到粗产物。将粗产物经柱色谱纯化(硅胶，用12％MeOH/CH2Cl2洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(5.445g,9.88mmol,68.7％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z)＝551.1[M+H]+,Rt＝2.37min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.06(s,1H),8.30(d,J＝0.88Hz,1H),8.04-8.21(m,2H),7.85-7.94(m,2H),7.69-7.85(m,1H),7.39(d,J＝1.10Hz,1H),5.46(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.95(d,J＝5.26Hz,1H),4.65(t,J＝5.70Hz,1H),4.34(dd,J＝10.85,4.06Hz,1H),4.19(dd,J＝10.96,6.58Hz,1H),3.74-3.86(m,1H),3.35-3.54(m,2H),3.22-3.28(m,1H),2.94-3.22(m,3H),2.15-2.32(m,1H),1.88-2.09(m,1H)。
实施例76
合成(4S)-8-氯-N-(5-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
在0℃向(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.339mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入盐酸(0.103mL,3.39mmol)，然后在室温搅拌2h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf:0.3)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用NaHCO3水溶液中和,并将获得的固体过滤，然后用水洗涤(2x10mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(5-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.271mmol,80％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.13[M+H]+,Rt＝2.28min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.84(s,1H),8.19(s,1H),8.10(d,J＝7.89Hz,1H),8.03(d,J＝8.99Hz,1H),7.95(d,J＝3.07Hz,1H),7.73(d,J＝7.67Hz,1H),7.67-7.59(m,2H),7.23(d,J＝3.07Hz,1H),5.66(dd,J＝6.14,3.07Hz,1H),4.15-4.08(m,1H),4.08-4.02(m,2H),3.89-3.82(m,1H),3.79-3.74(m,1H),3.34-3.12(m,3H),3.01(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.54(d,J＝4.17Hz,1H),2.38-2.28(m,1H),2.15-2.04(m,1H),1.94(t,J＝5.70Hz,1H)。
实施例77
合成(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.593mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(0.180mL,5.93mmol)，然后在室温搅拌2h。(TLC系统:100％乙酸乙酯,Rf值：0.2)。将反应混合物用NaHCO3溶液(10mL)淬灭并用DCM萃取(2x30mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制残余物。将残余物用正戊烷研磨(3×10mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(160mg,0.291mmol,49.0％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):550.16[M+H]+,Rt＝2.26min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.40(s,1H),8.07(d,J＝2.85Hz,1H),7.99(s,1H),7.93(d,J＝7.89Hz,1H),7.78-7.73(m,2H),7.68-7.62(m,2H),6.73(d,J＝8.77Hz,1H),5.66(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.42(dd,J＝4.60,2.41Hz,2H),4.02-3.91(m,2H),3.72-3.60(m,2H),3.36-3.18(m,2H),3.17-3.11(m,1H),3.05-2.98(m,1H),2.68(t,J＝6.14Hz,1H),2.34(dddd,J＝14.06,10.00,5.97,3.95Hz,1H),2.14-2.02(m,1H)。
实施例78
合成(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(9g,15.25mmol)在甲醇(30mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(5mL,165mmol)，搅拌5h。(TLC洗脱剂：流动相:10％MeOH/DCM；Rf:0.2；UV活化的)。将反应物质真空浓缩，得到棕色粘稠油状物，溶于冰冷的水(10mL)中，用饱和碳酸氢钠溶液中和并用10％MeOH/DCM(2x50mL)萃取。合并的有机层用盐水洗涤(20mL)，经硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，得到灰白色固体。将粗产物经柱色谱纯化(硅胶，用10％MeOH/CH2Cl2洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(6.5g,11.81mmol,77％收率)，其为灰白色固体。LC-MS(m/z):550.13[M+H]+,Rt＝2.04min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.55(s,1H),8.07-8.12(m,2H),7.90-7.96(m,2H),7.88(s,1H),7.80-7.86(m,2H),7.63(t,J＝2.30Hz,1H),5.47(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),4.97(d,J＝5.04Hz,1H),4.67(t,J＝5.70Hz,1H),4.00(dd,J＝9.43,3.73Hz,1H),3.76-3.88(m,2H),3.41-3.48(m,2H),3.22-3.32(m,1H),3.10(br d,J＝11.84Hz,2H),2.95-3.03(m,1H),2.19-2.32(m,1H),1.91-2.01(m,1H)。
实施例79
合成(4S)-8-氯-N-(6-(2-羟基乙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.414mmol)在甲醇(10mL)中的溶液中加入HCl水溶液(0.6mL,19.75mmol,36％)且搅拌1h。(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物用水稀释(10mL)并萃取到DCM中(2x20mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，将粗物质用10％乙酸乙酯/己烷研磨，得到(4S)-8-氯-N-(6-(2-羟基乙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(62mg,0.117mmol,28.4％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):520.17[M+H]+,Rt＝2.57min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.56(s,1H),7.99(s,1H),7.92(d,J＝7.45Hz,1H),7.75-7.69(m,1H),7.69-7.58(m,3H)，7.57-7.50(m,1H),6.41(d,J＝7.89Hz,1H),5.68(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.89-3.73(m,2H)，3.71-3.58(m,2H),3.38-3.19(m,2H),3.18-3.10(m,1H),3.03(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.43-2.24(m,1H),2.19-2.00(m,2H)。
实施例80
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.508mmol)在甲醇(10mL)中的溶液中加入HCl水溶液(1.2mL,0.508mmol,36％)且搅拌2h。(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯Rf-0.2；UV活化的)。在0℃将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物用水稀释且搅拌15min。然后所得固体通过布氏漏斗过滤，干燥，得到(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.358mmol,70.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.17[M+H]+,Rt＝3.86min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.28(s,1H),8.60-8.46(m,2H),8.16-8.08(m,2H),7.95-7.86(m,2H),7.84-7.74(m,1H),5.45(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),4.91(d,J＝5.26Hz,1H),4.62(t,J＝5.70Hz,1H),4.27(dd,J＝10.85,4.28Hz,1H),4.15(dd,J＝10.85,6.47Hz,1H),3.79(dq,J＝10.74,5.55Hz,1H),3.43(t,J＝5.70Hz,2H),3.21-3.32(m,1H),3.18-3.04(m,2H),3.04-2.94(m,1H),2.33-2.20(m,1H),1.95(dt,J＝13.81,7.13Hz,1H)。
实施例81
合成(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.678mmol)在甲醇(15mL)中的溶液中加入HCl水溶液(0.016mL,0.542mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC系统:Rf:0.6,10％MeOH/DCM)。将反应混合物蒸发且用NaHCO3溶液中和，将获得的固体过滤并用乙醚洗涤(2x10mL)，获得半纯的化合物(93％纯度，通过LCMS测定)。将半纯的化合物再次通过制备型HPLC纯化((条件：MP-A:10Mm碳酸氢铵MP-B：乙腈柱：Xbridge(250x19)方法-T/％B-0/10,1/10,10/55流速：25ml/min洗脱剂：ACN+MeOH+THF)，得到期望的化合物(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(175mg,0.318mmol,46.9％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):550.20[M+H]+,Rt＝2.28min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.84(s,1H),8.19(s,1H),8.10(d,J＝7.89Hz,1H),8.03(d,J＝8.99Hz,1H),7.95(d,J＝2.85Hz,1H),7.73(d,J＝7.89Hz,1H),7.65(s,1H),7.65-7.60(m,1H),7.25-7.22(m,1H),5.66(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.14-4.02(m,3H),3.88-3.82(m,1H),3.79-3.72(m,1H),3.36-3.12(m,3H),3.01(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.58(s,1H),2.38-2.28(m,1H),2.09(dt,J＝14.14,6.96Hz,1H),1.98(s,1H)。
实施例82
合成(4S)-8-氯-N-(5-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在0℃向(4S)-8-氯-N-(5-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.508mmol)在甲醇(15mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.015mL,0.508mmol,36％)，然后在室温搅拌1h.(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf-0.1；UV活化的)。在0℃将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并浓缩。将残余物用水稀释(8mL)并萃取到DCM中(2x25mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液减压蒸发，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(5-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(130mg,0.229mmol,45.1％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):551.10[M+H]+,Rt＝2.12min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.21(s,1H),8.29(s,2H),8.15(s,1H),7.90-8.11(m,1H),7.72(br d,J＝7.67Hz,1H),7.66(s,1H),7.57-7.64(m,1H),5.72(dd,J＝5.59,3.18Hz,1H),4.00-4.22(m,3H),3.71-3.97(m,2H),3.08-3.37(m,3H),2.82-3.08(m,1H),2.63(br s,1H),2.26-2.45(m,1H),1.96-2.19(m,2H)。
实施例83
合成(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在0℃向(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.508mmol)在甲醇(10mL)中的溶液中加入HCl水溶液(1mL,32.9mmol,36％)，然后在室温搅拌1h。(TLC洗脱剂：5％甲醇/DCM,Rf:0.3,UV活化的)。向反应混合物中加入饱和NaHCO3溶液(直到pH-8-9)，然后萃取到EtOAc(3x10mL)中。合并的有机萃取物经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗产物。粗物质用乙醚研磨(2x10mL)，得到(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.449mmol,88％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.13[M+H]+,Rt＝2.10min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.21(s,1H),8.32-8.27(m,2H),8.15(s,1H),8.06(d,J＝7.67Hz,1H),7.72(d,J＝7.89Hz,1H),7.67(s,1H),7.63-7.56(m,1H),5.72(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.16-4.05(m,3H),3.90-3.82(m,1H),3.80-3.73(m,1H),3.36-3.11(m,3H),3.01(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.68(br s,1H),2.38-2.27(m,1H),2.10(dt,J＝14.03,7.02Hz,2H)。
实施例84
合成(4S)-9-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-9-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.502mmol)在四氢呋喃(30ml)中的搅拌的溶液中加入三光气(267mg,0.901mmol)和DIPEA(0.787mL,4.51mmol)。然后将反应混合物在室温搅拌30min。30min后加入吡啶-3-胺(212mg,2.253mmol)，然后在75℃搅拌16h。(TLC系统：净EtOAc,Rf:0.5)。然后使得反应混合物冷却至室温，倒入饱和NaHCO3溶液(30mL)中，用EtOAc萃取(2×100mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗物质经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：50％EtOAc/石油醚)，得到期望的产物(4S)-9-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(294mg,0.756mmol,50.3％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):387.18[M+H]+,Rt＝1.27min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.25(s,1H),8.68-8.61(m,2H),8.31(dd,J＝4.71,1.42Hz,1H),8.19-8.11(m,1H),7.58(d,J＝0.66Hz,1H),7.49(dd,J＝5.26,1.10Hz,1H),7.29-7.26(m,2H),5.69(dd,J＝6.03,2.96Hz,1H),3.18(t,J＝7.45Hz,2H),3.13-2.99(m,2H),2.67(s,3H),2.51(s,3H),2.39-2.26(m,1H),2.12-2.00(m,1H)。
实施例85
合成(4S)-9-甲基-N-(吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-9-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(250mg,0.783mmol)在四氢呋喃(30ml)中的搅拌的溶液中加入三光气(139mg,0.470mmol)和三乙胺(0.109mL,0.783mmol)且搅拌30min。30min后，加入吡啶-2-胺(111mg,1.174mmol)，然后在75℃搅拌16h。(TLC系统:EtOAc,Rf:0.6)。然后使得反应混合物冷却至室温，倒入饱和NaHCO3溶液(30mL)中，用EtOAc萃取(2×100mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗物质经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：20％EtOAc/石油醚)，得到期望的产物(4S)-9-甲基-N-(吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(70mg,0.158mmol,20.21％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):440.22[M+H]+,Rt＝3.05min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.68(br s,1H),8.46-8.30(m,3H),8.17(d,J＝8.33Hz,1H),7.74-7.59(m,3H),7.36-7.24(m,1H),7.02-6.92(m,1H),5.71(dd,J＝5.59,2.96Hz,1H),3.26-3.08(m,3H),3.04-2.95(m,1H),2.50(s,3H),2.32(td,J＝13.76,5.81Hz,1H),2.17-2.01(m,1H)。
实施例86
合成(4S)-9-甲基-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-9-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.939mmol)在四氢呋喃(30ml)中的搅拌的溶液中加入三光气(167mg,0.564mmol)和DIPEA(0.820mL,4.70mmol)且搅拌30min。然后加入4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-胺(247mg,1.409mmol)，然后在75℃搅拌16h。(TLC系统:EtOAc,Rf:0.3)。然后使反应混合物冷却至室温，倒入饱和NaHCO3溶液(30mL)，用EtOAc萃取(2×100mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗物质经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：40％EtOAc/石油醚)，得到期望的产物(4S)-9-甲基-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(126mg,0.241mmol,25.7％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):521.29[M+H]+；Rt＝3.13min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.81(s,1H),8.51-8.29(m,4H),7.72-7.60(m,2H),7.45(s,1H),7.32(s,1H),7.17(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),5.72(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.23-3.09(m,3H),3.08-2.96(m,1H),2.53(s,3H),2.51(s,3H),2.34(td,J＝13.76,6.47Hz,1H),2.16-2.02(m,1H)。
实施例87
合成(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-9-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-9-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.702mmol)在甲醇(30mL)中的搅拌的溶液中加入盐酸(2mL,23.70mmol)且搅拌1h。(TLC系统：净EtOAc,Rf:0.3)。1h后，将反应混合物减压浓缩并用饱和NaHCO3溶液淬灭(30mL),用5％MeOH/DCM(2x50mL)萃取。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得半固体，将其用戊烷洗涤(2x20mL)并干燥，得到期望的产物(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-9-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(288mg,0.538mmol,77％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):530.29[M+H]+,Rt＝2.32min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.43(s,1H),8.05(s,1H),8.00-7.88(m,2H),7.78-7.62(m,2H),7.23(s,1H),7.16(s,1H),6.94(d,J＝4.38Hz,1H),5.67(dd,J＝5.26,2.85Hz,1H),4.45(d,J＝4.38Hz,3H),4.03-3.93(m,1H),3.74-3.59(m,2H),3.23-2.99(m,5H),2.50(s,3H),2.33(td,J＝13.54,6.25Hz,1H),2.13-1.99(m,1H)。
实施例88
合成(4S)-8-氯-N-(6-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气气氛下在室温向(4S)-8-氯-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,1.766mmol)在四氢呋喃(10mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(524mg,1.766mmol)和TEA(0.738mL,5.30mmol)，然后将其搅拌30min。随后在室温向其中加入6-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-胺(523mg,3.53mmol)，然后在75℃搅拌15h。(TLC 5％MeOH\DCM Rf:0.3；UV活化的)。将反应混合物用水稀释(10mL)且用乙酸乙酯萃取(2×20ml)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤，然后经无水硫酸钠干燥，减压浓缩，得到粗制化合物，将其通过柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：80％EtOAc/石油醚)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(243mg,0.451mmol,25.5％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):514.23[M+H]+,Rt＝2.54min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6+1滴TFA):δppm 8.54-8.36(m,1H),8.17-8.01(m,3H),7.92(d,J＝7.7Hz,1H),7.80(t,J＝7.8Hz,1H),7.18-7.00(m,1H),5.63(dd,J＝3.0,5.6Hz,1H),3.57-3.38(m,4H),2.69-2.56(m,3H),2.49-2.32(m,1H),2.23(td,J＝7.1,13.9Hz,1H)。
实施例89
合成(4S)-7-(3-(二氟甲基)苯基)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-8-甲基-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(3-(二氟甲基)苯基)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-8-甲基-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.2g,0.363mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中滴加HCl(5.51μL,0.181mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在30℃搅拌2h(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)。2h后，将反应混合物真空浓缩并将残余物用NaHCO3水溶液中和并将获得的固体过滤并用乙醚(2x50mL),正戊烷(2x50mL)洗涤，得到期望的产物(4S)-7-(3-(二氟甲基)苯基)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-8-甲基-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(110mg,0.215mmol,59.2％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):512.25[M+H]+,Rt＝1.95min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.28(s,1H),7.88-7.80(m,3H),7.74-7.70(m,2H),7.61(s,1H),7.29-7.00(m,2H),6.52(dd,J＝5.70,1.75Hz,1H),5.44(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.85(s,1H),4.58(s,1H),4.20(dd,J＝10.74,4.60Hz,1H),4.08(dd,J＝10.85,6.25Hz,1H),3.76(d,J＝5.04Hz,1H),3.42(s,2H),3.26-3.17(m,1H),3.14-3.05(m,2H),2.94(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.31(s,3H),2.26-2.20(m,1H),1.95-1.85(m,1H)。
实施例90
合成(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
在氮气下在室温向(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.741mmol)在甲醇(5mL)中的溶液中加入HCl(2mL,65.8mmol)并搅拌2h。(TLC系统5％甲醇/DCM.Rf值：0.1)。将反应混合物浓缩，残余物在0℃用饱和NaHCO3溶液碱化。将所得固体过滤并干燥，得到粗制化合物,将固体用乙醚研磨(10mL)，得到(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(230mg,0.458mmol,61.8％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):500.26[M+H]+,Rt＝1.75min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.66(s,1H),8.43(s,1H),8.01(t,J＝2.7Hz,2H),7.74(s,1H),7.10-6.87(m,2H),5.41(br d,J＝3.1Hz,1H),4.86(d,J＝5.0Hz,1H),4.59(br t,J＝5.7Hz,1H),4.40-4.19(m,3H),4.19-3.96(m,1H),3.93-3.65(m,1H),3.43(br t,J＝5.7Hz,2H),3.22(br s,1H),3.16-3.00(m,2H),2.93(brdd,J＝3.1,12.1Hz,1H),2.37-2.08(m,1H),1.93(brdd,J＝6.4,13.8Hz,1H),1.46(t,J＝7.2Hz,3H)。
实施例91
合成(4S)-8,9-二甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气气氛下在室温向(4S)-8,9-二甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.070mmol)在THF(30mL)中的搅拌的溶液中加入吡啶-3-基氨基甲酸苯酯(688mg,3.21mmol)，接着加入DMAP(392mg,3.21mmol)且在65℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，浓缩，将残余物分配在水(20mL)和EtOAc(50mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制化合物。将粗产物经柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：70％EtOAc/己烷)，得到期望的产物(4S)-8,9-二甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(238mg,0.590mmol,55.1％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):401.12[M+H]+,Rt＝1.35min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.19(s,1H),8.65(d,J＝5.04Hz,1H),8.42(br s,1H),8.24(br d,J＝4.17Hz,1H),8.03-7.94(m,1H),7.29(s,1H),7.23-7.16(m,2H),5.64(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),3.25-3.14(m,2H),3.12-3.00(m,2H),2.67(s,3H),2.47(s,3H),2.38-2.28(m,1H),2.24(s,3H),2.12–1.99(m,1H)。
实施例92
合成(4S)-8-氰基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-8-溴-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.665mmol)，Zn(CN)2(234mg,1.994mmol)和Zn(OAc)2(73.2mg,0.399mmol)在N,N-二甲基甲酰胺(12mL)中的脱气的溶液中加入固体Pd2(dba)3(122mg,0.133mmol)和DPPF(147mg,0.266mmol)。然后将反应混合物在100℃搅拌15h。(TLC系统；Rf-0.4,5％甲醇/二氯甲烷)。使得反应混合物冷却至室温并用水稀释(30mL)，用乙酸乙酯萃取(3×50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(100-200目)并将其进一步通过制备型HPLC纯化(条件：MP-A:5mM碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈柱：KROMOSIL C18(250x21.2)10μ方法：0/50,12/50,12.5/100,18/100,18.1/50流速：19ml/min洗脱剂：MeOH+THF+ACN)，得到期望的产物(4S)-8-氰基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(85mg,0.211mmol,31.8％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):398.06[M+H]+,Rt＝1.97min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.92(s,1H),8.71(d,J＝5.26Hz,1H),8.34-8.29(m,1H),8.17-8.12(m,1H),7.96(d,J＝1.53Hz,1H),7.86-7.79(m,2H),7.74-7.67(m,1H),7.03(ddd,J＝7.29,4.88,0.99Hz,1H),5.71(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),3.33-3.22(m,2H),3.16-3.02(m,2H),2.75(s,3H),2.44-2.31(m,1H),2.18-2.05(m,1H)。
实施例93
合成(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.466mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入3M HCl(10mL,30.0mmol)。将所得混合物在室温搅拌1h。(TLC5％MeOH/DCM Rf:0.2；UV活化的)并将反应物质用饱和碳酸氢钠溶液(10mL)碱化，用DCM萃取(2X20mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(10mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，得到棕色固体，并将其用戊烷研磨(10mL)且真空干燥，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(115mg,0.220mmol,47.3％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):497.1[M+H]+,Rt＝1.54min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.44(s,1H),8.65(d,J＝5.04Hz,1H),7.85(s,1H),7.69-7.57(m,2H),7.54-7.45(m,2H),6.44(dd,J＝7.67,0.88Hz,1H),5.48(dd,J＝5.70,2.85Hz,1H),4.74(d,J＝4.60Hz,1H),4.67-4.44(m,1H),3.81-3.58(m,3H),3.46-3.38(m,2H),3.32-3.25(m,1H),3.19-3.03(m,2H),3.04–2.83(m,1H),2.49(s,3H),2.36-2.05(m,1H),1.95(dt,J＝13.76,7.04Hz,1H)。
实施例94
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.279mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.5mL,16.46mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM,Rf＝0.3；UV活化的)。将反应混合物减压浓缩，并将残余物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并将水层用DCM萃取(2×40mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。粗制化合物用乙醚研磨(2x15mL)，得到(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(125mg,0.241mmol,87％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):498.10[M+H]+,Rt＝1.43min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.01(s,1H),8.68(d,J＝5.04Hz,1H),8.34(d,J＝5.70Hz,1H),7.74(d,J＝5.48Hz,1H),7.69(s,1H),7.57(s,1H),7.52(br d,J＝5.26Hz,1H)，5.63(br dd,J＝5.59,2.74Hz,1H),3.93-4.09(m,3H),3.54-3.75(m,4H),3.19-3.37(m,2H),3.10-3.18(m,1H),2.99-3.08(m,1H),2.69(s,3H),2.28-2.43(m,1H),2.07(dt,J＝14.41,7.15Hz,1H)。
实施例95
合成(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.12g,0.223mmol)在DCM(5mL)和甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(0.558mL,2.230mmol,4M在二噁烷中)且搅拌4h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf-0.3；UV活化的)。将反应混合物通过加入饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH＝8-9)，然后浓缩。将残余物用水稀释(10mL)并萃取到EtOAc中(2x25mL)中。合并的有机萃取物经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。粗制化合物经柱色谱纯化(使用中性氧化铝，用50％乙酸乙酯/己烷洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.09g,0.174mmol,78％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):498.07[M+H]+,Rt＝1.40min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.02(s,1H),8.62(d,J＝5.26Hz,1H),8.46(s,1H),7.88(s,1H),7.61-7.73(m,2H),7.41(s,1H),5.45(br d,J＝2.63Hz,1H),4.74-5.14(m,2H),4.35(br dd,J＝10.85,4.06Hz,1H),4.21(br dd,J＝10.74,6.36Hz,1H),3.76-3.86(m,1H),3.43(br d,J＝5.04Hz,2H),3.19-3.26(m,1H),3.06-3.15(m,2H),2.97(brdd,J＝12.06,2.85Hz,1H),2.61(s,3H),2.20-2.28(m,1H),1.91-2.05(m,1H)。
实施例96
合成(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃在氮气气氛下向(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.465mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(1.0ml,4.00mmol)。将反应混合物在25℃搅拌1h。(TLC洗脱剂：5％甲醇/DCM,Rf:0.3,UV活化的)。减压蒸发溶剂,用水稀释,用饱和NaHCO3溶液碱化(直到pH:8-9)并用二氯甲烷萃取(3×10mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(10mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并蒸发，获得粗制化合物。粗物质用乙醚研磨(10mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(125mg,0.247mmol,53.3％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):498.07[M+H]+,Rt＝1.44min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.02(s,1H),8.68(d,J＝5.04Hz,1H),8.34(d,J＝5.70Hz,1H),7.75(d,J＝5.70Hz,1H),7.69(s,1H),7.56(s,1H),7.51(d,J＝4.17Hz,1H),5.63(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),4.07–3.97(m,3H),3.70(d,J＝4.60Hz,2H),3.60-3.10(m,5H),3.08–2.99(m,1H),2.68(s,3H),2.41-2.29(m,1H),2.07(m,1H)。
实施例97
合成(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(180mg,0.335mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.2mL,6.58mmol)并将反应混合物在0℃搅拌2h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM；Rf值：0.3；UV活化的)。将反应混合物真空浓缩，在0℃将获得的残余物用饱和NaHCO3溶液中和(20mL)并用DCM萃取(2×40mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。该化合物经正戊烷纯化(30mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(116mg,0.228mmol,68.3％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):498.07[M+H]+,Rt＝1.44min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.70(s,1H),9.00(s,1H),8.65(d,J＝5.26Hz,1H),7.93(s,1H),7.68(s,1H),7.59-7.53(m,1H),7.49-7.42(m,1H),5.67(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.01-3.91(m,1H),3.80-3.50(m,4H),3.39-3.20(m,2H),3.20-3.09(m,1H),3.09-2.99(m,1H),2.71-2.58(m,3H),2.47-2.26(m,1H),2.08(dt,J＝14.09,7.10Hz,1H)。
实施例98
合成(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-8-氯-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.372mmol)在1,4-二噁烷(5.0mL)中的搅拌的溶液中加入4M HCl的二噁烷溶液(0.929mL,3.72mmol)，在相同温度搅拌4h(TLC:洗脱剂：净乙酸乙酯,Rf:0.3)。将反应混合物分配在饱和NaHCO3水溶液(10mL)和EtOAc(30mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗产物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：60％乙酸乙酯/己烷)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.240mmol,64.7％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):498.07[M+H]+,Rt＝1.44min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.70(s,1H),8.86(s,1H),8.65(d,J＝5.04Hz,1H),7.94(s,1H),7.89(s,1H),7.55(s,1H),7.49(s,1H),5.49(dd,J＝5.70,2.85Hz,1H),4.88(d,J＝5.04Hz,1H),4.65(t,J＝5.70Hz,1H),3.88-3.77(m,2H),3.75-3.67(m,1H),3.39(t,J＝5.81Hz,2H),3.32-3.30(m,1H),3.16-3.09(m,2H),2.99(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.55(s,3H),2.30-2.20(m,1H),2.04-1.81(m,1H)。
实施例99
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(6-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(6-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(330mg,0.531mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.448mL,5.31mmol)并搅拌2h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物用水稀释(5mL)并萃取到二氯甲烷中(2x10mL)中。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液真空蒸发，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(6-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(264mg,0.453mmol,85％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):581.19[M+H]+,Rt＝2.24min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.85-12.54(m,1H),8.77(d,J＝2.2Hz,1H),8.24(d,J＝2.0Hz,1H),7.90(d,J＝5.9Hz,1H),7.68(s,1H),7.02(d,J＝1.5Hz,1H),6.78(dd,J＝1.9,5.8Hz,1H),5.65(dd,J＝3.1,5.9Hz,1H),4.48-4.40(m,2H),4.24(br s,1H),4.16(s,3H),3.98(br t,J＝4.5Hz,1H),3.71-3.57(m,2H),3.35-3.18(m,2H),3.16-3.08(m,1H),3.06-2.95(m,1H),2.85(br t,J＝6.4Hz,1H),2.44-2.25(m,1H),2.07(td,J＝7.1,14.3Hz,1H)。
实施例100
合成(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.453mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(0.069mL,2.264mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC系统:Rf-0.1,EtOAc)。将反应混合物浓缩，将残余物用饱和碳酸氢钠溶液中和。将所得固体过滤并干燥，获得(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(175mg,0.337mmol,74.4％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):512.18[M+H]+.Rt＝1.79min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.80(s,1H),8.10(s,1H),8.02(s,1H),7.97(s,1H),7.59(s,1H),7.13-7.01(m,2H),5.62(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.52-4.40(m,2H),4.33(d,J＝5.70Hz,1H),4.00(dq,J＝9.98,5.01Hz,1H),3.75-3.61(m,3H),3.35-3.07(m,3H),3.02-2.88(m,2H),2.38-2.23(m,1H),2.14-1.94(m,1H),1.28-1.19(m,2H),1.14-1.03(m,2H)。
实施例101
合成(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-8-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-8-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.527mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中滴加HCl(8.00μL,0.263mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在30℃搅拌1h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)并蒸发溶剂。将反应混合物用碳酸氢钠溶液中和并过滤所得固体，用乙醚(2x50ml),正戊烷(2x50ml)洗涤，得到纯的产物(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-8-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.380mmol,72.1％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):530.29[M+H]+,Rt＝2.04min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 2.05(dt,J＝14.09,7.10Hz,1H),2.37-2.30(m,4H),2.96-2.93(m,1H),3.00(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),3.34-3.13(m,3H),3.67-3.60(m,2H),4.00-3.92(m,1H),4.38(s,1H),4.42(d,J＝4.60Hz,2H),5.63(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),6.68(dd,J＝5.81,1.86Hz,1H),7.03(d,J＝1.53Hz,1H),7.49(s,1H),7.69-7.64(m,1H),7.79-7.71(m,2H),7.85-7.81(m,2H),13.22(s,1H)。
实施例102
合成(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.362mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(0.055mL,1.812mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC系统:Rf-0.1,EtOAc)。将反应混合物减压浓缩并将残余物用饱和碳酸氢钠溶液中和。将所得固体过滤并干燥，得到(4S)-8-氯-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(160mg,0.309mmol,85％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):512.00[M+H]+.Rt＝3.15min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.81(s,1H),8.10(s,1H),8.02(s,1H)7.98(d,J＝5.70Hz,1H),7.59(s,1H),7.15-6.99(m,2H),5.62(dd,J＝5.92,3.07Hz(1H),4.53-4.38(m,2H),4.01(quin,J＝4.82Hz,1H),3.75-3.64(m,3H),3.36-3.08(m,3H),2.98(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.32(qd,J＝9.68,4.93Hz,1H),2.04(dt,J＝14.25,7.34Hz,1H),1.29-1.17(m,2H),1.14-1.04(m,2H)。
实施例103
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.564mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.476mL,5.64mmol)，在0℃搅拌2h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物用水稀释(10mL)并萃取到二氯甲烷中(2x20mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液真空蒸发，得到粗产物。粗制化合物用乙醚研磨(5mL)，得到期望的产物(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲氧基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(262mg,0.448mmol,80％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):581.23[M+H]+,Rt＝2.17min。
1H NMR(400MHz,CdCl3):δppm 12.86-12.53(m,1H),8.63(d,J＝1.32Hz,1H),7.96(d,J＝2.19Hz,1H),7.86(d,J＝5.92Hz,1H),7.66(s,1H),7.00-6.97(m,1H),6.62(dd,J＝5.81,1.86Hz,1H),5.63(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),4.43(d,J＝5.04Hz,2H),4.27-4.19(m,1H),4.03(s,3H),3.97(br s,1H),3.72-3.58(m,2H),3.37-3.18(m,2H),3.17-3.08(m,1H),3.02(dd,J＝12.28,3.07Hz,1H),2.82(br t,J＝6.47Hz,1H),2.40-2.26(m,1H),2.08(dt,J＝14.36,7.29Hz,1H)。
实施例104
合成(4S)-8-氰基-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氰基-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(220mg,0.379mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.320mL,3.79mmol)并搅拌2h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物用水稀释(5mL)并萃取到二氯甲烷中(2x10mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液真空蒸发，得到粗产物。将粗产物用乙醚研磨(5mL)，得到期望的产物(4S)-8-氰基-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(201mg,0.366mmol,96％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):541.20[M+H]+,Rt＝2.00min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.81-12.55(m,1H),8.17-8.01(m,2H),7.97-7.82(m,3H),7.81-7.71(m,1H),7.06(d,J＝1.75Hz,1H),6.76(dd,J＝5.81,1.86Hz,1H),5.69(dd,J＝5.81,2.74Hz,1H),4.44(d,J＝5.04Hz,2H),4.29-4.07(m,1H),4.02-3.91(m,1H),3.65(br s,2H),3.38-3.21(m,2H),3.18-3.01(m,2H),2.80(br s,1H),2.44-2.33(m,1H),2.12(dt,J＝14.52,7.54Hz,1H)。
实施例105
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(280mg,0.532mmol)在甲醇(20mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(2.0ml,65.8mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC系统:10％MeOH/DCM.Rf值：0.2)。将反应混合物减压浓缩并将残余物用10％NaHCO3水溶液中和(30mL)。过滤析出的固体，减压干燥，获得粗制化合物。产物用戊烷和乙醚(1:1)研磨，得到(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.304mmol,57.1％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):486.15[M+H]+,Rt＝1.62min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.85-12.83(m,1H),8.06-7.96(m,3H),7.59(s,1H),7.14-6.97(m,2H),5.63(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.49-4.42(m,2H),4.03(s,4H),3.72-3.64(m,2H),3.32-3.07(m,3H),3.02-2.88(m,1H),2.35-2.27(m,1H),2.04(dt,J＝14.14,7.18Hz,1H)。
实施例106
合成(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(290mg,0.551mmol)在甲醇(10mL)中的溶液中加入HCl(2.0ml,65.8mmol)，然后在室温搅拌1h。将反应混合物减压蒸发以除去甲醇溶剂，然后用10％NaHCO3溶液(20mL)中和。将所得固体过滤并用水(3x20mL)充分洗涤，真空干燥，得到(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(160mg,0.327mmol,59.3％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):486.19[M+H]+,Rt＝1.63min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.82(s,1H),8.07-7.92(m,3H),7.59(s,1H),7.11-7.04(m,2H),5.62(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.49-4.40(m,2H),4.36(br d,J＝4.17Hz,1H),4.03-3.96(m,4H),3.70-3.64(m,2H),3.35-3.17(m,2H),3.14-3.09(m,1H),3.04-2.95(m,2H),2.42-2.29(m,1H),2.04(dt,J＝14.20,7.04Hz,1H)。
实施例107
合成(4S)-8-氯-7-(3-(二氟甲基)苯基)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-7-(3-(二氟甲基)苯基)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.524mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(7.97μL,0.262mmol)滴加，历时5min的时间。然后将反应混合物在30℃搅拌1h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)，并蒸发溶剂。将反应混合物用碳酸氢钠溶液中和(10mL)且过滤所得固体，用乙醚(2x50mL)和正戊烷(2x50ml)洗涤，得到纯的产物(4S)-8-氯-7-(3-(二氟甲基)苯基)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(100mg,0.188mmol,35.8％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):532.37[M+H]+,Rt＝2.06min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.86(s,1H),7.86(d,J＝5.48Hz,3H),7.73-7.57(m,3H),7.01(s,1H),6.91-6.58(m,2H),5.65(d,J＝2.85Hz,1H),4.43(d,J＝4.60Hz,2H),4.29(d,J＝5.04Hz,1H),3.97(d,J＝4.82Hz,1H),3.73-3.53(m,2H),3.37-3.18(m,2H),3.17-3.10(m,1H),3.02(dd,J＝12.39,2.96Hz,1H),2.89(t,J＝6.36Hz,1H),2.35(td,J＝9.32,4.17Hz,1H),2.07(dt,J＝14.20,7.26Hz,1H)。
实施例108
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.423mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(2mL,24.00mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物减压浓缩并将残余物用饱和NaHCO3溶液中和(20mL)，然后用10％MeOH/DCM萃取(2×50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。将粗物质经色谱纯化(GRACE使用C-18反相柱，流动相A:0.1％甲酸/水；B:乙腈,洗脱剂55-59％B/A)。将合并的产物级分浓缩,用饱和NaHCO3溶液碱化。将析出的固体过滤并干燥，得到(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(186mg,0.337mmol,80％收率)。LCMS(m/z):551.17[M+H]+。Rt＝1.98min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.34(s,1H),9.00(d,J＝5.04Hz,1H),8.27-8.31(m,1H),8.14(d,J＝4.82Hz,1H),7.94(s,1H),7.90(d,J＝5.70Hz,1H),7.00(d,J＝1.75Hz,1H),6.58(dd,J＝5.81,1.86Hz,1H),5.45(dd,J＝5.92,2.85Hz,1H),4.85(br s,1H),4.58(br d,J＝1.10Hz,1H),4.21(dd,J＝10.74,4.60Hz,1H),4.10(dd,J＝10.85,6.25Hz,1H),3.73-3.79(m,1H),3.42(br d,J＝5.26Hz,2H),3.23-3.28(m,3H),3.06-3.17(m,1H),2.22-2.34(m,1H),1.90-2.00(m,1H)。
实施例109
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(180mg,0.305mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(3ml,99mmol)，然后在室温搅拌2h。(TLC系统:10％MeOH/DCM，Rf值：0.25)。将反应混合物用饱和NaHCO3溶液碱化(直至pH 8-9)并用乙酸乙酯萃取(3x30mL)。合并的有机层经硫酸钠干燥,浓缩，经柱色谱纯化(GRACE仪器，C-18反相柱，用27％乙腈/1％甲酸洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(105mg,0.190mmol,62.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.17[M+H]+。Rt＝1.93min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.37(s,1H),9.29(d,J＝1.97Hz,1H),9.16(d,J＝1.32Hz,1H),8.63(s,1H),7.94(s,1H),7.88(d,J＝5.70Hz,1H),7.00(d,J＝1.75Hz,1H),6.56(dd,J＝5.81,1.86Hz,1H),5.45(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.84(d,J＝5.04Hz,1H),4.57(t,J＝5.70Hz,1H),4.21(dd,J＝10.74,4.60Hz,1H),4.09(dd,J＝10.85,6.25Hz,1H),3.76(dq,J＝10.80,5.54Hz,1H),3.37-3.46(m,2H),3.22-3.33(m,1H),3.05-3.19(m,2H),2.96-3.04(m,1H),2.17-2.36(m,1H),1.85-2.00(m,1H)
实施例110
合成(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(5-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.4g,0.745mmol)在甲醇(6mL)中的溶液中加入HCl(5mL,165mmol)，历时10min的一段时间，然后在室温搅拌5h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM,Rf值：0.2；UV活化的)。将反应混合物浓缩，将残余物吸收在水中(30mL)且用饱和碳酸氢钠溶液中和，水层用10％MeOH/DCM萃取(3x30mL)。合并的有机层用盐水洗涤(20mL),经无水硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物。将粗物质与先前的批次合并，共计430mg通过使用combiflash色谱(硅胶，用10％MeOH/DCM洗脱)纯化，得到(4S)-8-氯-N-(5-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]-二氮杂-5(2H)-甲酰胺(140mg,0.272mmol,36.5％收率)，其为黄色固体。LCMS(m/z):497.35[M+H]+,Rt＝1.32min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.60(s,1H),8.65(d,J＝5.04Hz,1H),7.97(d,J＝2.63Hz,1H),7.93(d,J＝2.19Hz,1H),7.88(s,1H),7.67-7.61(m,2H),7.58(dd,J＝5.15,1.21Hz,1H),5.46(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.97(d,J＝5.04Hz,1H),4.68(t,J＝5.59Hz,1H),4.02(dd,J＝9.65,3.73Hz,1H),3.91-3.85(m,1H),3.83-3.75(m,1H),3.45(t,J＝5.70Hz,2H),3.32-3.27(m,1H),3.16-3.06(m,2H),3.02-2.96(m,1H),2.58(s,3H),2.31-2.19(m,1H),2.01-1.91(m,1H)
实施例111
合成(4S)-7-氯-N-(2-(3,3,3-三氟丙基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温搅拌下将(4S)-7-氯-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(250mg,1.278mmol)溶解在四氢呋喃(THF)(10mL)中，依次加入三光气(190mg,0.639mmol)，TEA(0.534mL,3.83mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min。向其中加入2-(3,3,3-三氟丙基)苯胺(483mg,2.56mmol)且在密封管中在80℃搅拌16h。使反应混合物到达室温，用15ml水淬灭并用2x25ml乙酸乙酯萃取,有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。将粗产物经柱色谱纯化(硅胶：100-200目)，得到(4S)-7-氯-N-(2-(3,3,3-三氟丙基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(240mg,0.563mmol,44.1％收率)，其为白色固体,(Rf值：0.35,10％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):411.16[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 11.49(s,1H),7.79(dd,J＝8.00,0.99Hz,1H),7.61(d,J＝8.11Hz,1H),7.35-7.31(m,1H),7.24-7.29(m,1H),7.17-7.09(m,2H),5.44(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.21–2.90(m,6H),2.66-2.53(m,2H),2.20(dddd,J＝13.67,9.95,6.08,3.62Hz,1H),1.91(dt,J＝13.70,6.96Hz,1H)。
实施例112
合成(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-(4-(三氟甲基)哌啶-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向((4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,2.217mmol)，4-(三氟甲基)哌啶(679mg,4.43mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的脱气的溶液中加入二环己基(2',4',6'-三异丙基-[1,1'-联苯]-2-基)膦(423mg,0.887mmol)，碳酸钾(919mg,6.65mmol)和乙酸钯(II)(100mg,0.443mmol)。在密封管中将反应混合物在90℃搅拌16h。使其冷却至室温并将混合物倒入冷水(70mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶；100-200目，用1至2％甲醇/二氯甲烷洗脱)，得到(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-(4-(三氟甲基)哌啶-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(320mg,32％收率)，其为白色固体(TLC:洗脱剂；乙酸乙酯,Rf＝0.4)，LCMS(m/z):433.22[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.15(s,1H),8.34-8.18(m,1H),8.09(dt,J＝8.39,0.96Hz,1H),7.77(ddd,J＝8.55,7.13,1.86Hz,1H),7.36(d,J＝8.77Hz,1H)7.04(ddd,J＝7.29,4.88,0.99Hz,1H)6.51(d,J＝8.55Hz,1H)5.43(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H)4.39(d,J＝12.93Hz,2H),3.17-3.04(m,1H),3.02-2.76(m,5H),2.72-2.52(m,1H),2.25-2.04(m,1H),1.96-1.76(m,3H),1.57-1.39(m,2H)。
实施例113
合成(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-((R)-3-(三氟甲基)哌啶-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(750mg,2.375mmol)和(70:30-R/S)-3-(三氟甲基)哌啶(728mg,4.75mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的脱气的溶液中加入碳酸钾(985mg,7.13mmol)和乙酸钯(II)(107mg,0.475mmol)。在密封管中将反应混合物在90℃搅拌16h。使得反应混合物冷却至室温，倒入冷水(70mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用1％至2％甲醇/二氯甲烷洗脱)，得到(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-((R/S)-3-(三氟甲基)哌啶-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺的(70:30,R:S)的非对映异构体混合物(310mg，收率29.6％)，其为灰白色固体(TLC:洗脱剂，100％乙酸乙酯,Rf:0.4)，LCMS(m/z):433.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.10-12.94(m,1H),8.22(d,J＝5.15Hz,1H),8.15-7.98(m,1H),7.76(t,J＝7.48Hz,1H)，7.45-7.28(m,1H),7.04(ddd,J＝7.34,4.93,0.88Hz,1H),6.54(d,J＝8.55Hz,1H),5.48-5.32(m,1H),4.35-4.12(m,2H),-3.12-2.89(m,5H),2.88-2.78(m,1H),2.61-2.52(m,1H),2.25-2.04(m,1H),2.04-1.92(m,1H),1.90-1.74(m,2H),1.71-1.46(m,2H)。
实施例114
合成(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-((S)-3-(三氟甲基)哌啶-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在室温向(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(550mg,1.742mmol)、(33:66-R/S)-3-(三氟甲基)哌啶(534mg,3.48mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的脱气的溶液中加入碳酸钾(722mg,5.23mmol)，二环己基(2',4',6'-三异丙基-[1,1'-联苯]-2-基)膦(332mg,0.697mmol)和乙酸钯(II)(78mg,0.348mmol)。在密封管中将反应混合物在90℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温，倒入冷水(70mL)中。粗产物用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤，减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用1至2％甲醇/二氯甲烷洗脱)，得到(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-((S/R)-3-(三氟甲基)哌啶-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺的(33:67,S:R)的非对映异构混合物(250mg,33.2％收率)，其为白色固体(TLC:洗脱剂，100％乙酸乙酯,Rf0.4)，LCMS(m/z):433.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.06-12.99(m,1H),8.22(d,J＝5.01Hz,1H),8.07(dt,J＝8.33,0.88Hz,1H),7.76(ddd,J＝8.55,7.13,1.86Hz,1H),7.47-7.29(m,1H),7.04(ddd,J＝7.29,4.88,0.99Hz,1H),6.54(d,J＝8.55Hz,1H),5.51-5.36(m,1H),4.37-4.15(m,2H),3.12-2.80(m,6H),2.60-2.52(m,1H),2.25-2.04(m,1H),2.04-1.93(m,1H),1.90-1.74(m,2H),1.72-1.48(m,2H)。
实施例115
合成(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-((R)-2-(三氟甲基)吡咯烷-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,2.217mmol)、(R)-2-(三氟甲基)吡咯烷(617mg,4.43mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的脱气的溶液中加入二环己基(2',4',6'-三异丙基-[1,1'-联苯]-2-基)膦(423mg,0.887mmol)、碳酸钾(919mg,6.65mmol)和乙酸钯(II)(100mg,0.443mmol)。将反应混合物在密封管中在90℃加热16h。将反应混合物倒入冷水(70mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，用1至2％甲醇/二氯甲烷洗脱)，得到(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-((R)-2-(三氟甲基)吡咯烷-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(220mg,0.52mmol,32％收率)，其为灰白色固体(TLC:100％乙酸乙酯,Rf＝0.4)，LCMS(m/z):419.21[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.16(s,1H),8.20(d,J＝6.33,1H),8.06(d,J＝8.33Hz,1H),7.77(td,J＝7.84,1.86Hz,1H),7.40(d,J＝8.55Hz,1H),7.05(ddd,J＝7.29,4.88,0.99Hz,1H),6.36(d,J＝8.77Hz,1H),5.40(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),5.28-5.06(m,1H),3.84(dt,J＝10.14,5.12Hz,1H),3.65-3.36(m,1H),3.17-2.91(m,2H),2.90-2.80(m,2H),2.25-2.04(m,5H),1.84(dt,J＝13.65,7.10Hz,1H)。
实施例116
合成(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吗啉代)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,2.217mmol)、2-(三氟甲基)吗啉(688mg,4.43mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的脱气的溶液中加入二环己基(2',4',6'-三异丙基-[1,1'-联苯]-2-基)膦(423mg,0.887mmol)、碳酸钾(919mg,6.65mmol)和乙酸钯(II)(100mg,0.443mmol)。将反应混合物在密封管中在90℃加热16h，然后冷却至室温，然后倒入冷水(70mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用1至2％甲醇/二氯甲烷洗脱)，得到(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吗啉代)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.69mmol,46％收率)，其为灰白色固体(TLC:100％乙酸乙酯,Rf＝0.4)，LCMS(m/z):435.20[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.99(d,J＝4.82Hz,1H),8.20(dt,J＝4.82,0.88Hz,1H),8.07(dd,J＝8.44,0.77Hz,1H)，7.77(td,J＝7.84,1.86Hz,1H),7.43(d,J＝8.55Hz,1H),7.05(ddd,J＝7.29,4.88,0.77Hz,1H),6.62(d,J＝8.55Hz,1H),5.44(ddd,J＝9.98,6.25,3.29Hz,1H),4.34(dd,J＝7.13,3.40Hz,1H),4.25(d,J＝12.28Hz,1H),4.14(dd,J＝11.62,1.75Hz,1H),4.10-3.94(m,1H),3.87-3.67(m,1H),3.15-2.91(m,6H),2.30-2.14(m,1H),1.72-1.65(m,1H)。
实施例117
合成(4S)-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.810mmol)在二氯甲烷(12mL)和水(1.12mL)中的搅拌的溶液中滴加4.0M盐酸的二噁烷溶液(1.68mL,0.810mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在30℃搅拌3h并蒸发溶剂。将反应混合物用碳酸氢钠溶液中和并用乙酸乙酯萃取(3×50mL)，然后将合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，且经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf＝0.2；UV活化的)。粗制化合物用正戊烷洗涤，得到纯的(4S)-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(340mg,0.635mmol,78.0％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):516.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.42(s,1H)8.54-8.44(m,2H)8.10(d,J＝5.92Hz,1H)7.85-7.81(m,1H)7.80-7.68(m,4H)6.71(dd,J＝5.70,2.41Hz,1H)5.51(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H)5.01(d,J＝5.26Hz,1H)4.70(t,J＝5.70Hz,1H)4.11(dd,J＝9.76,3.84Hz,1H)3.96(dd,J＝9.87,6.36Hz,1H)3.87-3.79(m,1H)3.51-3.42(m,2H)3.26-3.17(m,1H)3.15-3.06(m,2H)2.96(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H)2.25(dddd,J＝13.65,9.92,6.14,3.62Hz,1H)1.95(dt,J＝13.81,6.91Hz,1H)。
实施例118
合成(4S)-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在0℃向(4S)-N-(4-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,0.900mmol)在二氯甲烷(12.5mL)和水(1.25ml)中的溶液中一次性加入4.0M盐酸的二噁烷溶液(2mL,0.900mmol)，历时1min。将反应混合物在30℃搅拌3h并蒸发溶剂。将反应混合物用碳酸氢钠溶液中和并用乙酸乙酯萃取(3×50mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，且经无水硫酸钠干燥并蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf＝0.2；UV活化的)。粗制化合物用正戊烷洗涤，得到纯的(4S)-N-(4-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(340mg,0.612mmol 68.0％收率)，其为白色固体，LCMS(m/z):516.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.42(s,1H)8.58-8.44(m,2H)8.10(d,J＝5.70Hz,1H)7.85–7-68(m,5H)6.71(dd,J＝5.81,2.30Hz,1H)5.52(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H)5.01(d,J＝5.26Hz,1H)4.70(t,J＝5.59Hz,1H)4.11(dd,J＝9.76,3.84Hz,1H)3.96(dd,J＝9.76,6.25Hz,1H)3.87-3.79(m,1H)3.50-3.43(m,2H)3.27-3.17(m,1H)3.16-3.05(m,2H)2.96(dd,J＝12.06,3.07Hz,1H)2.30-2.20(m,1H)1.95(dt,J＝13.92,7.07Hz,1H)。
实施例119
合成(4S)-N-(2-(((R)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在30℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,1.965mmol)在THF(20mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(0.822mL,5.90mmol)和三光气(292mg,0.983mmol)，然后在相同温度搅拌1h。然后在30℃加入(R)-2-((四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-胺(1068mg,5.90mmol)并将反应混合物在70℃加热16h。使反应混合物达到室温并减压蒸发溶剂,将获得的残余物用水稀释(15mL)并用DCM萃取(2x20ml)。合并的有机层用水、盐水洗涤，并经无水硫酸钠干燥。减压蒸发有机溶剂，得到粗产物。粗制混合物经制备型HPLC纯化(甲酸/水和乙腈30％)，得到(4S)-N-(2-(((R)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(310mg,0.605mmol,30.6％收率)，其为灰白色固体。(TLC:Rf＝0.25,10％MeOH/EtOAc)，LCMS(m/z):513.26[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.61(s,1H),8.50(d,J＝7.49Hz,1H),8.45(d,J＝5.62Hz,1H),8.25(s,1H),7.87(d,J＝7.67Hz,1H),7.81-7.68(m,4H),5.47(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),5.32(ddt,J＝6.49,4.36,2.14,2.14Hz,1H),3.91-3.76(m,1H),3.76-3.59(m,3H),3.28-3.05(m,3H),2.96(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.38-2.15(m,1H),2.14–1.88(m,3H)。
实施例120
合成(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-((S)-2-(三氟甲基)吡咯烷-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,2.217mmol)，(S)-2-(三氟甲基)吡咯烷(617mg,4.43mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的脱气的溶液中加入二环己基(2',4',6'-三异丙基-[1,1'-联苯]-2-基)膦(423mg,0.887mmol)和乙酸钯(II)(100mg,0.443mmol)。将反应混合物在密封管中在90℃加热16h。将反应混合物倒入冷水(70mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，用1至2％MeOH/DCM洗脱)，得到(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-((S)-2-(三氟甲基)吡咯烷-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.598mmol,35％收率)，其为白色固体(TLC:100％乙酸乙酯,Rf＝0.4)，LCMS(m/z):419.18[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.13(s,1H),8.30-8.18(d,J＝7.2,1H),8.18-7.96(d,J＝8.40,1H),7.77(ddd,J＝8.55,7.13,1.86Hz,1H),7.41(d,J＝8.55Hz,1H),7.04(ddd,J＝7.23,4.82,1.10Hz,1H),6.38(d,J＝8.55Hz,1H),5.48(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),5.12-5.01(m,1H)，3.84(m,1H),3.49(q,J＝9.65,J＝5.70Hz，1H),3.04-2.90(m,4H),2.33-2.12(m,5H),1.72-1.80(m,1H)。
实施例121
合成(4S)-N-(2,3-二氢苯并[b][1,4]二氧杂环己二烯-6-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在THF(30ml)中的溶液中加入三光气(294mg,0.991mmol)，然后在室温搅拌1h。然后相继加入2,3-二氢苯并[b][1,4]二氧杂环己二烯-6-胺(899mg,5.94mmol)和三乙胺(1.381mL,9.91mmol)。将反应混合物在密封管中在70℃加热16h。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(150mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，使用1％甲醇/二氯甲烷的梯度混合物作为洗脱剂)，得到(4S)-N-(2,3-二氢苯并[b][1,4]二氧杂环己二烯-6-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(315mg,0.734mmol,51％收率)，其为棕色固体(TLC:5％甲醇/二氯甲烷,Rf＝0.3)，LCMS(m/z):430.0[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.69(s,1H),8.59(d,J＝5.26Hz,1H),7.75-7.59(m,4H),7.16(s,1H),6.96-6.75(dd,J＝5.81,2.41,2H),5.46(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),4.27-4.10(m,4H),3.24-3.02(m,2H),3.00-2.76(m,2H),2.50(s,3H),2.25-2.09(m,1H),1.91-1.71(m,1H)。
实施例122
合成(4S)-N-(6-乙基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在THF(25ml)中的溶液中加入三光气(294mg,0.991mmol)，然后搅拌至室温，持续1h。然后相继加入6-乙基吡嗪-2-胺(317mg,2.58mmol)，三乙胺(1.381mL,9.91mmol)并在密封管中在70℃加热反应混合物16h。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(150mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：1％甲醇/二氯甲烷)，得到(4S)-N-(6-乙基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(260mg,0.640mmol,32.3％收率)，其为淡黄色固体(TLC:5％MeOH/DCM,Rf＝0.3)，LCMS(m/z):402.23[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.47(s,1H),9.23(s,1H),8.59(d,J＝5.26Hz,1H),8.29(s,1H),8.02(d,J＝4.82Hz,2H),7.88(s,1H),7.64-7.84(d,J＝7.68Hz，1H),5.52(dd,J＝6.03,2.96Hz,1H),3.08-3.33(m,2H),2.89-3.08(m,2H),2.78(q,J＝7.60Hz,2H),2.57(s,3H),2.39-2.13(m,1H),2.12–1.88(m,1H)1.21-1.30(m,3H)。
实施例123
合成(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.078mmol)在CH2Cl2(16mL)和水(1.6mL)中的溶液中滴加4N HCl的二噁烷溶液(2.24mL,8.96mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在室温搅拌3h。将反应混合物减压浓缩，获得粗产物。粗产物用水稀释且用碳酸氢钠(15ml)中和并将水层用EtOAc(2x15ml)萃取。合并的有机层用水、盐水洗涤，并经无水Na2SO4干燥,减压蒸发有机溶剂，得到粗产物。粗产物用乙醚研磨，得到(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(346mg,64％收率,0.67mmol)，其为灰白色固体(TLC:5％MeOH/CH2Cl2,Rf＝0.3)，LCMS(m/z):517.18[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.14(s,1H),8.95(s,1H),8.36(d,J＝7.7Hz,1H),8.22(s,1H),7.99(s,1H),7.89-7.79(m,2H),7.74(q,J＝8.0Hz,2H),5.54(s,1H),4.95(d,J＝5.1Hz,1H),4.64(t,J＝5.5Hz,1H),4.09(qd,J＝10.7,5.1Hz,2H),3.77(d,J＝5.2Hz,1H),3.45-3.33(m,2H),3.23-3.06(m,3H),2.97(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.25(ddt,J＝14.0,9.8,4.8Hz,1H),1.97(dt,J＝14.1,7.3Hz,1H)。
实施例124
(4S)-7-((R)-2-甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,2.210mmol)、(R)-2-甲基吗啉盐酸盐(335mg,2.431mmol)、Cs2CO3(1440mg,4.42mmol)和2-二环己基膦基-2',4’,6’-三异丙基联苯(421mg,0.884mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中脱气的溶液中加入Pd(OAc)2(99mg,0.442mmol)。然后将反应混合物在100℃加热16h。使得反应混合物达到室温，用2x15ml水淬灭并用2x50ml乙酸乙酯萃取。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经柱色谱纯化，得到(4S)-7-((R)-2-甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(275mg,0.696mmol,31.5％收率)，其为灰白色固体(TLC:Rf值：0.3,5％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):383.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.40(s,1H),9.38(d,J＝1.3Hz,1H),8.46-8.17(m,2H),7.40(d,J＝8.6Hz,1H),6.53(d,J＝8.6Hz,1H),5.44(dd,J＝6.1,3.1Hz,1H),4.20-4.04(m,1H),4.00-3.93(m,1H),3.91-3.80(m,1H),3.70-3.53(m,2H),3.17-3.05(m,1H),3.03-2.92(m,2H),2.87(ddd,J＝19.7,11.9,3.4Hz,2H),2.58(dd,J＝12.6,10.4Hz,1H),2.21-2.12(m,1H),1.86(dd,J＝14.3,7.2Hz,1H),1.22(d,J＝6.2Hz,3H)。
实施例125
合成(4S)-7-((S)-2-甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,2.210mmol)、(S)-2-甲基吗啉盐酸盐(335mg,2.431mmol)、Cs2CO3(1440mg,4.42mmol)和2-二环己基膦基-2',4’,6’-三异丙基联苯(421mg,0.884mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中脱气的溶液中加入Pd(OAc)2(99mg,0.442mmol)。然后将反应混合物在100℃加热16h。使得反应混合物达到室温，用2x15ml水淬灭并用2x50ml乙酸乙酯萃取。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经柱色谱纯化，得到(4S)-7-((S)-2-甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(285mg,0.725mmol,32.8％收率)，其为灰白色固体(TLC:Rf值：0.3,5％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):383.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.40(s,1H),9.38(d,J＝1.4Hz,1H),8.40-8.14(m,2H),7.40(d,J＝8.6Hz,1H),6.53(d,J＝8.6Hz,1H),5.44(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),4.12(s,1H),3.96(ddd,J＝11.5,3.6,1.4Hz,1H),3.86(d,J＝12.8Hz,1H),3.62(dd,J＝11.8,2.8Hz,2H),3.09(dd,J＝11.4,8.4Hz,1H),2.96(s,2H),2.93-2.78(m,2H),2.58(dd,J＝12.6,10.4Hz,1H),2.17(s,1H),1.85(dt,J＝14.3,7.3Hz,1H),1.23(d,J＝6.2Hz,3H)。
实施例126
合成(4S)-N-(3,4-二氢-2H-苯并[b][1,4]二氧杂-7-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在THF(30ml)中的溶液中加入三光气(294mg,0.991mmol)，然后搅拌至室温，持续1h。然后相继加入3,4-二氢-2H-苯并[b][1,4]二氧杂-7-胺(426mg,2.58mmol)和三乙胺(1.381mL,9.91mmol)并在密封管中在70℃加热反应混合物16h。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(150mL)并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶；100-200目，使用1％MeOH/DCM的梯度混合物作为洗脱剂)，得到(4S)-N-(3,4-二氢-2H-苯并[b][1,4]二氧杂-7-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(394mg,0.889mmol,68％收率)，其为淡黄色固体(TLC:5％MeOH/DCM,Rf＝0.3)，LCMS(m/z):444.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.76(s,1H),8.59(d,J＝5.04Hz,1H),7.79-7.58(m,3H),7.24-7.06(m,2H),6.96(d,J＝8.77Hz,1H),5.46(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),4.10(dt,J＝19.51,5.37Hz,4H),3.15-3.02(m,1H),3.02-2.77(m,3H),2.50(s，3H),2.46-2.18(m,1H),2.17-2.01(m,2H),2.01-1.83-(m,2H)。
实施例127
合成(4S)-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.809mmol)在二氯甲烷(12mL),水(1.2mL)中的溶液中加入4.0M盐酸在1,4-二噁烷中(1.68mL,0.809mmol)。将反应混合物在30℃搅拌3h并浓缩溶剂。将反应混合物分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。有机层用水、盐水溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥&过滤并将滤液蒸发，得到粗物质(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.2；UV活化的)。将粗物质纯化，用正戊烷洗涤并悬浮在水中(5mL),搅拌15min并过滤，得到纯的(4S)-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(260mg,0.480mmol,59.4％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):517.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.58(s,1H),8.60(d,J＝7.5Hz,1H),8.46(d,J＝5.6Hz,1H),8.27(s,1H),7.91-7.78(m,3H),7.75-7.60(m,2H),5.48(dd,J＝5.9,3.0Hz,1H),4.91(d,J＝4.8Hz,1H),4.62(t,J＝5.5Hz,1H),4.22(dd,J＝10.8,4.4Hz,1H),4.13(dd,J＝10.7,5.9Hz,1H),3.80(q,J＝5.4Hz,1H),3.43(t,J＝5.7Hz,2H),3.21(s,1H),3.16-3.05(m,2H),2.96(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.29-2.10(m,1H),2.04-1.84(m,1H)。
实施例128
合成(4S)-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(6-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.539mmol)在二氯甲烷(8.0mL)、水(0.8mL)中的溶液中加入4.0M盐酸在1,4-二噁烷中(1.12mL,0.539mmol)，历时1min(滴加)。将反应混合物在30℃搅拌3h并浓缩溶剂。将反应混合物分配在水(10mL)和乙酸乙酯(25mL)之间。有机层用水、盐水溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf＝0.2；UV活化的)。粗制化合物用正戊烷洗涤并悬浮在水中(5mL),搅拌15min并过滤，得到纯的(4S)-N-(6-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(280mg,0.533mmol,99％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):517.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.15(s,1H),8.95(s,1H),8.36(d,J＝7.7Hz,1H),8.22(s,1H),7.99(s,1H),7.86(t,J＝7.8Hz,1H),7.80(d,J＝7.8Hz,1H),7.74(q,J＝8.0Hz,2H),5.52(dd,J＝5.8,3.0Hz,1H),4.95(d,J＝5.1Hz,1H),4.64(t,J＝5.5Hz,1H),4.14(dd,J＝10.7,4.0Hz,1H),4.03(dd,J＝10.7,6.1Hz,1H),3.77(q,J＝5.2Hz,1H)，3.36(hept,J＝5.8Hz,2H),3.22(s,1H),3.12(d,J＝11.3Hz,2H),2.97(dd,J＝11.9,3.3Hz,1H),2.26(t,J＝7.0Hz,1H),2.03-1.90(m,1H)。
实施例129
合成(4S)-N-(6-乙氧基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将DMAP(726mg,5.94mmol)和(6-乙氧基吡嗪-2-基)氨基甲酸苯基酯(1541mg,5.94mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在THF中的搅拌的溶液中。在密封管中将混合物加热至80℃，保持20h。冷却至室温后,蒸发溶剂并粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，5％MeOH/DCM作为洗脱剂)。将回收的物质吸收于乙醇中，分离出的固体经过滤进行分离，得到(4S)-N-(6-乙氧基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(416mg,0.978mmol,49.3％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM,Rf:0.4)，LCMS(m/z):418.28[M+H]+。
1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ13.18(s,1H),8.95(s,1H),8.53(dd,J＝5.0,1.0Hz,1H),7.98(d,J＝0.5Hz,1H),7.86-7.79(m,2H),7.73(s,2H),5.51(dd,J＝5.9,3.1Hz,1H),4.22(qd,J＝7.1,2.3Hz,2H),3.25-3.17(m,1H),3.11(dt,J＝11.7,2.4Hz,2H),2.97(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.58(s,3H),2.25(dddd,J＝13.7,9.9,6.2,3.8Hz,1H),2.04-1.90(m,1H),1.27(t,J＝7.0Hz,3H)。
实施例130
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.189mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(176mg,0.594mmol)且搅拌30min。30分钟后，加入三乙胺(0.829mL,5.94mmol)和1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-5-胺(191mg,1.427mmol)。将反应混合物在密封管中在65-70℃搅拌16h。反应混合物用2x15ml水淬灭并用2x15ml乙酸乙酯萃取。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制混合物经柱色谱纯化，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(1H-吡唑并[3,4-c]吡啶-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(330mg,0.764mmol,64.3％收率)，其为淡黄色固体(Rf值：0.25,净乙酸乙酯)，LCMS(m/z):413.24[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.47(s,2H),8.89(t,J＝1.1Hz,1H),8.71-8.57(m,1H),8.44(t,J＝1.0Hz,1H),8.28-8.10(m,2H),8.05-7.93(m,1H),7.79(d,J＝8.0Hz,1H),7.71(d,J＝8.0Hz,1H),5.56(dd,J＝5.9,3.1Hz,1H),3.22(tt,J＝8.1,3.0Hz,1H),3.15-3.04(m,2H),2.97(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.67(s,3H),2.36-2.16(m,1H),1.96(dd,J＝14.0,7.1Hz,1H)。
实施例131
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(喹喔啉-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在THF(30ml)中的溶液中加入三光气(294mg,0.991mmol)，然后在室温搅拌1h。然后相继在室温加入喹喔啉-5-胺(374mg,2.58mmol)和三乙胺(1.381mL,9.91mmol)，然后将反应混合物在70℃加热16h。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(150mL)中并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，使用1％MeOH/DCM的梯度混合物作为洗脱剂)，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(喹喔啉-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.709mmol,55％收率)，其为淡黄色固体(TLC:5％MeOH/DCM,Rf＝0.3)，LCMS(m/z):424.26[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.50(s,1H),8.91(s,1H),8.68(dd,J＝7.89,1.10Hz,1H),8.48(d,J＝5.26Hz,1H),7.92-7.80(m,2H),7.80-7.62(m,4H),5.58(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),3.20-3.08(m,4H),3.08-2.86(m,1H),2.26(s,4H),2.00-1.95(m,1H)。
实施例132
合成(4S)-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.810mmol)在二氯甲烷(12mL)，水(1.2mL)中的溶液中滴加4.0M盐酸在1,4-二噁烷的溶液(1.68mL,0.810mmol)中的溶液，持续1min。将反应混合物在30℃搅拌3h并浓缩溶剂。将反应混合物分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。有机层用水、盐水溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.2；UV活化的)。粗制化合物用正戊烷洗涤，将化合物悬浮在水(5mL)中,搅拌15min并过滤，得到纯的(4S)-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(310mg,0.600mmol,74.0％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):516.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.02(s,1H),8.27-8.15(m,2H),7.94(d,J＝5.7Hz,1H),7.89(d,J＝7.8Hz,1H),7.82(t,J＝7.7Hz,1H),7.72(d,J＝8.0Hz,1H),7.66(d,J＝8.0Hz,1H),7.11(d,J＝1.8Hz,1H),6.80(dd,J＝5.8,1.9Hz,1H),5.47(dd,J＝5.9,3.0Hz,1H),4.85(d,J＝5.1Hz,1H),4.59(t,J＝5.7Hz,1H),4.23(dd,J＝10.9,4.6Hz,1H),4.13(dd,J＝10.9,6.2Hz,1H),3.81-3.65(m,1H),3.43(t,J＝5.6,1.3Hz,2H),3.25-3.03(m,3H),2.97(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.25(m,J＝13.8,9.7,4.7Hz,1H),1.95(m,J＝14.3,7.6Hz,1H)。
实施例133
(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(353mg,1.189mmol)且搅拌30min，向其中加入三乙胺(1.657mL,11.89mmol)和1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-5-胺(319mg,2.378mmol)。将反应混合物在60℃搅拌16h。反应混合物用2x15ml水淬灭并用2x15ml乙酸乙酯萃取。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经柱色谱纯化(100-200目)，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(265mg,0.622mmol,26.2％收率)，其为淡黄色固体(TLC:Rf值：0.25,净乙酸乙酯)，LCMS(m/z):413.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.55(s,1H),13.27(s,1H),8.66(dd,J＝5.4,0.8Hz,1H),8.32(d,J＝9.2Hz,1H),8.16-7.94(m,4H),7.94-7.51(m,2H),5.55(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),3.21(d,J＝8.7Hz,1H),3.18-3.05(m,2H),2.97(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.69(s,3H),2.35-2.17(m,1H),1.96(dt,J＝14.2,7.6Hz,1H)。
实施例134
合成(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.629mmol)在二氯甲烷(8mL)，水(0.8mL)中的溶液中滴加4.0M盐酸的1,4-二噁烷溶液(1.12mL,0.629mmol)，历时1min。将反应混合物在30℃搅拌3h并浓缩溶剂。将反应混合物分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。有机层用水、盐水溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf＝0.2；UV活化的)。将粗物质通过手性分离纯化，得到(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.405mmol,64.3％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):517.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.59(s,1H),8.60(d,J＝7.5Hz,1H),8.46(d,J＝5.7Hz,1H),8.27(s,1H),7.90-7.78(m,3H),7.76-7.69(m,2H),5.48(dd,J＝5.8,3.0Hz,1H),4.91(d,J＝5.0Hz,1H),4.63(t,J＝5.5Hz,1H),4.46-4.01(m,2H),3.80(h,J＝5.5Hz,1H),3.44(t,J＝5.5Hz,2H),3.21(s,1H),3.12(dd,J＝10.1,5.5Hz,2H),2.96(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.24(d,J＝8.7Hz,1H),2.03-1.90(m,1H)。
实施例135
合成(4S)-7-(2,6-二甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)，(2,6-二甲基吡啶-4-基)硼酸(343mg,2.273mmol)在1-丁醇(10mL)和水(1.667mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)，和X-phos(90mg,0.189mmol)。将反应混合物再脱气15min，并将反应混合物在100℃搅拌3hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc；Rf＝0.3；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶并用5-10％MeOH/EtOAc洗脱，得到纯的(4S)-7-(2,6-二甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(355mg,0.916mmol,48.3％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):387.44[M+H]+。
1H NMR(DMSO-d6,400MHz,):δ13.77(s,1H),9.43(d,J＝1.5Hz,1H),8.53-8.28(m,2H),7.91-7.59(m,4H),5.51(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),3.25-2.81(m,4H),2.56-2.46(m,6H),2.26(dddd,J＝13.7,9.9,6.1,3.7Hz,1H),1.97(dq,J＝14.4,7.5,6.8Hz,1H)。
实施例136
合成(4S)-7-(2-环丙基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将磷酸三钾(670mg,3.16mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.579mmol)、(2-环丙基吡啶-4-基)硼酸(309mg,1.894mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(1.667mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(72.3mg,0.079mmol)，和X-phos(75mg,0.158mmol)。将反应混合物再脱气15min，并将反应混合物在100℃搅拌3hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc；Rf-0.3；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶并用5-10％MeOH/EtOAc洗脱，得到纯的(4S)-7-(2-环丙基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(260mg,0.645mmol,40.8％收率)，其为灰白色固体,LCMS
(m/z):400.28[M+H]+。
1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ13.75(s,1H),9.43(d,J＝1.5Hz,1H),8.54(d,J＝5.4Hz,1H),8.46-8.28(m,2H),8.19-8.01(m,1H),7.89-7.62(m,3H),5.52(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),3.30-2.86(m,4H),2.27(ddd,J＝13.2,6.4,4.1Hz,2H),1.98(dt,J＝14.5,7.6Hz,1H),1.17-0.88(m,4H).
实施例137
合成(4S)-7-(2-异丙基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将磷酸三钾(670mg,3.16mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.579mmol)、(2-异丙基吡啶-4-基)硼酸(313mg,1.894mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(1.667mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(72.3mg,0.079mmol)和X-phos(75mg,0.158mmol)。将反应混合物再脱气15min，并将反应混合物在100℃搅拌3hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf＝0.3；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶，以及用5-10％MeOH/EtOAc洗脱，得到纯的(4S)-7-(2-异丙基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(320mg,0.793mmol,50.2％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):402.33[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ13.65(s,1H),9.57(d,J＝1.5Hz,1H),8.68(d,J＝5.2Hz,1H),8.44-8.07(m,2H),8.02-7.87(m,1H),7.75-7.58(m,2H),7.48(d,J＝8.0Hz,1H),5.73(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.43-3.14(m,4H),3.04(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.35(dt,J＝11.7,5.0Hz,1H),2.22-2.00(m,1H),1.41(dd,J＝6.9,0.9Hz,6H).
实施例138
合成(4S)-N-(1-甲基-1H-1,2,3-三唑-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃将三光气(0.588g,1.982mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.5g,1.982mmol)在四氢呋喃(20mL)中的搅拌的溶液中,接着在0℃加入三乙胺(0.829mL,5.94mmol)并搅拌30min。加入1-甲基-1H-1,2,3-三唑-4-胺hydro-chloride(0.4g,2.97mmol)，然后在70℃加热48h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和乙酸乙酯(50mL)之间。分离有机层并用水和盐水洗涤。有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制的黄色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf＝0.2；UV活化的)。粗制化合物经100-200硅胶纯化，用5％MeOH/乙酸乙酯洗脱，得到(4S)-N-(1-甲基-1H-1,2,3-三唑-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.260g,0.686mmol,34.6％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):377.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.52(s,1H),8.58(dd,J＝5.3,0.8Hz,1H),8.07(s,1H),8.00(d,J＝1.7Hz,1H),7.85-7.75(m,2H),7.71(d,J＝8.0Hz,1H),5.46(dd,J＝5.9,3.0Hz,1H),4.06(s,3H),3.30(s,1H),3.24-3.05(m,2H),2.96(dd,J＝12.0,3.2Hz,1H),2.63(s,3H),2.23(dd,J＝13.7,9.8,6.1,3.7Hz,1H),2.00-1.86(m,1H)。
实施例139
合成(4S)-7-(2-乙基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、(2-乙基吡啶-4-基)硼酸(343mg,2.273mmol)在正丁醇(10mL)和水(1.667mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min。加入Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)和X-phos(90mg,0.189mmol)。将反应混合物再脱气15min，然后在100℃搅拌5hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤。蒸发滤液得到粗物质(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf:0.2；UV活化的)。粗制化合物经(100-200目)硅胶纯化，用20％MeOH/EtOAc洗脱，得到(4S)-7-(2-乙基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(418mg,1.074mmol,56.7％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):388.26[M+H]+。
1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ13.72(s,1H),9.43(d,J＝1.5Hz,1H),8.62(dd,J＝5.3,0.8Hz,1H),8.53-8.21(m,2H),8.08(d,J＝1.7Hz,1H),7.97-7.64(m,3H),5.52(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),3.30(s,1H),3.23-3.08(m,3H),3.03-2.81(m,2H),2.34-2.16(m,1H),1.99(d,J＝6.8Hz,1H),1.31(t,J＝7.6Hz,3H)。
实施例140
合成(4S)-7-(2-乙氧基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、(2-乙氧基吡啶-4-基)硼酸(380mg,2.273mmol)在1-丁醇(10mL)和水(1.667mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)，和X-phos(90mg,0.189mmol)。将反应混合物再脱气15min，然后在100℃搅拌4hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(100mL)和EtOAc(120mL)之间。分离EtOAc层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗物质(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf＝0.4；UV活化的)。粗制化合物经(100-200目)硅胶纯化,用10％MeOH/乙酸乙酯洗脱，得到(4S)-7-(2-乙氧基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(435mg,1.063mmol,56.1％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):404.28[M+H]+。
1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ13.73(s,1H),9.39(d,J＝1.5Hz,1H),8.50-8.33(m,1H),8.31-8.21(m,2H),7.79(d,J＝8.0Hz,1H),7.77-7.62(m,2H),7.60(d,J＝2.2Hz,1H),5.50(dd,J＝5.9,3.0Hz,1H),4.37(q,J＝7.0Hz,2H),3.30(s,1H),3.25-3.03(m,2H),2.97(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.36-2.12(m,1H),2.07-1.87(m,1H),1.38(t,J＝7.0Hz,3H)。
实施例141
合成(4S)-7-(2-甲氧基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、(2-甲氧基吡啶-4-基)硼酸(348mg,2.273mmol)在1,4-二噁烷(12mL)和水(2.000mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)和X-phos(90mg,0.189mmol)。将反应混合物再脱气15min，然后在100℃搅拌5hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(25mL)和EtOAc(60mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗物质(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc；Rf＝0.2；UV活化的)。粗制化合物经(100-200目)硅胶纯化，用20％MeOH/乙酸乙酯洗脱，得到(4S)-7-(2-甲氧基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(310mg,0.793mmol,41.8％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):390.20[M+H]+。
1H NMR(DMSO-d6，400MHz):δ13.71(s,1H),9.38(d,J＝1.5Hz,1H),8.43(dd,J＝2.5,1.5Hz,1H),8.38(s,1H),8.37(d,J＝2.5Hz,1H),7.75(d,J＝22.0Hz,1H),7.77-7.62(m,2H),7.60(s,1H),5.50(dd,J＝5.9,3.0Hz,1H),3.94(s,3H),3.30(s,1H),3.25-3.03(m,2H),3.03-2.88(m,1H),2.25(dd,J＝9.9,3.9Hz,1H),1.98(dd,J＝14.2,7.2Hz,1H)。
实施例142
合成(4S)-7-(2-甲氧基-6-甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、(2-甲氧基-6-甲基吡啶-4-基)硼酸(380mg,2.273mmol)在1,4-二噁烷(12mL)和水(2.000mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)和X-phos(90mg,0.189mmol)。将反应混合物再脱气15min，然后在100℃搅拌5hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(25mL)和EtOAc(60mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤。蒸发滤液得到粗物质(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc；Rf＝0.3；UV活化的)。粗制化合物经(100-200目)硅胶纯化，用20％MeOH/乙酸乙酯洗脱，得到(4S)-7-(2-甲氧基-6-甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(225mg,0.547mmol,28.9％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):404.24[M+H]+。
1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ13.72(s,1H),9.41(d,J＝1.5Hz,1H),8.55-8.26(m,2H),7.86-7.64(m,3H),7.31(dd,J＝1.4,0.7Hz,1H),5.51(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),3.91(s,3H),3.22-3.00(m,3H),2.97(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.63-2.41(m,3H),2.25(dddd,J＝13.8,9.8,6.1,3.6Hz,1H),1.97(dt,J＝14.3,7.6Hz,1H)。
实施例143
合成(4S)-N-(1-甲基-1H-1,2,4-三唑-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃将三光气(0.588g,1.982mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.5g,1.982mmol)在四氢呋喃(20mL)中的搅拌的溶液中且搅拌30min。在0℃加入三乙胺(0.829mL,5.94mmol)和1-甲基-1H-1,2,4-三唑-3-胺(0.486g,4.95mmol)。将反应混合物在70℃搅拌48h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(50mL)和DCM(50mL)之间。分离的有机层用水和盐水洗涤。有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制的黄色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf-0.3；UV活化的)。粗制化合物经(100-200目)硅胶纯化，并用5％MeOH/乙酸乙酯洗脱，得到(4S)-N-(1-甲基-1H-1,2,4-三唑-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.215g,0.563mmol,28.4％收率)，其为浅黄色固体，LCMS(m/z):377.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.44(s,1H),8.55(d,J＝5.2Hz,1H),8.36(s,1H),7.96(s,1H),7.86-7.61(m,3H),5.44(dd,J＝5.8,3.0Hz,1H),3.83(s,3H),3.27(d,J＝30.5Hz,3H),2.95(dd,J＝12.0,3.2Hz,1H),2.59(s,3H),2.23(ddt,J＝16.9,9.7,4.4Hz,1H),1.91(dt,J＝14.7,7.4Hz,1H)。
实施例144
合成(4S)-7-(2-(甲基氨基)吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.579mmol)、N-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-胺(443mg,1.894mmol)和磷酸三钾(670mg,3.16mmol)在1,4-二噁烷(15mL)和水(2mL)中脱气的溶液中加入Pd(OAc)2(17.72mg,0.079mmol)和二环己基(2',4',6'-三异丙基-[1,1'-联苯]-2-基)膦(75mg,0.158mmol)并将反应混合物在120℃加热4h。减压蒸发正丁醇溶剂，获得的残余物用水稀释并用DCM萃取(2x50mL)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经无水硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-(2-(甲基氨基)吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(325mg,0.820mmol,51.9％收率)，其为白色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc,Rf:0.2)，LCMS(m/z):389.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.64(s,1H),9.40(d,J＝1.53Hz,1H),8.46-8.31(m,2H),8.14(d,J＝5.48Hz,1H),7.71(m,J＝8.11Hz,1H),7.61(d,J＝8.11Hz,1H),7.22(dd,J＝5.37,1.64Hz,1H),7.03(d,J＝0.88Hz,1H),6.40(q,J＝4.75Hz,1H),5.51(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.35-3.04(m,3H),2.96(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.85(d,J＝5.04Hz,3H),2.25(dddd,J＝13.59,9.87,6.03,3.62Hz,1H),1.97(dt,J＝13.87,6.99Hz,1H)。
实施例145
(4S)-N-(1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温将(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(700mg,2.77mmol)溶解在四氢呋喃(THF)(10mL)，加入三光气(412mg,1.387mmol)，然后在室温搅拌30min，向其中加入三乙胺(1.933mL,13.87mmol)和1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-胺(372mg,2.77mmol)，然后将反应混合物在60℃搅拌16hr。反应混合物用2x15ml水淬灭并用2x15ml乙酸乙酯萃取,有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经柱色谱纯化(100-200目)，得到纯的化合物(4S)-N-(1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(225mg,0.531mmol,19.14％收率)，其为淡黄色固体。(Rf值：0.4,10％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):413.1[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ14.03(s,1H),11.93(s,1H),8.65(d,J＝5.3Hz,1H),8.35-7.86(m,3H),7.86-7.37(m,4H),5.72(dd,J＝5.9,3.2Hz,1H),3.21(m,3H),3.06(dd,J＝12.2,3.3Hz,1H),2.78(s,3H),2.38(dddd,J＝14.0,9.9,6.2,4.2Hz,1H),2.13(dt,J＝14.3,7.2Hz,1H)。
实施例146
合成(4S)-7-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将磷酸钾(402mg,1.894mmol)和(2-甲氧基嘧啶-5-基)硼酸(175mg,1.137mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.947mmol)在1-丁醇(6mL)和水(2.0mL)混合物中的搅拌的溶液中，将混合物用氩气脱气25min，然后加入Pd2(dba)3(43.4mg,0.047mmol)和X-phos(45.2mg,0.095mmol)，在120℃加热2h。使反应混合物达到室温，用水稀释(40mL)并用乙酸乙酯萃取(3x30mL)，用盐水洗涤(30mL)。分离的有机层浓缩，经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，80％乙酸乙酯/石油醚作为洗脱剂)。将回收的物质使用乙醇和戊烷重结晶，得到(4S)-7-(2-甲氧基嘧啶-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(190mg,0.481mmol,50.8％收率)，其为灰白色固体。(流动相:100％乙酸乙酯,Rf:0.1)，LCMS(m/z):391.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.64(s,1H),9.52(d,J＝1.5Hz,1H),9.24(s,2H),8.40-8.25(m,2H),7.64(d,J＝7.9Hz,1H),7.34(d,J＝8.0Hz,1H),5.70(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),4.12(s,3H),3.33-3.13(m,3H),3.02(d,J＝3.3Hz,1H),2.36(dddd,J＝13.9,9.9,5.9,4.0Hz,1H),2.17-2.04(m,1H)。
实施例147
合成(4S)-7-(6-(羟基甲基)吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将磷酸钾(535mg,2.53mmol)和(6-(羟基甲基)吡啶-3-基)硼酸(232mg,1.515mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,1.263mmol)在1-丁醇(6mL)和水(2.0mL)的混合物中的搅拌的溶液中。将混合物用氩气脱气10min，然后加入Pd2(dba)3(57.8mg,0.063mmol)和X-phos(60.2mg,0.126mmol)。将混合物在120℃加热20h。使反应混合物达到室温，并通过硅藻土垫过滤，用乙酸乙酯洗涤(10mL×2)，减压除去滤液的溶剂，得到粗制化合物。上述粗制物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，用80％乙酸乙酯/正己烷洗脱)，得到(4S)-7-(6-(羟基甲基)吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(225mg,0.558mmol,44.2％收率)，其为灰白色固体。(TLC:洗脱剂：100％乙酸乙酯Rf:0.1)，LCMS(m/z):390.35(M+H)+。
1HNMR(400MHz,CDCl3):δ13.73(s,1H),9.54(d,J＝1.3Hz,1H),9.19(dd,J＝2.3,0.9Hz,1H),8.51(dd,J＝8.2,2.3Hz,1H),8.44-8.20(m,2H),7.64(d,J＝8.0Hz,1H),7.50-7.39(m,2H),5.71(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),4.86(d,J＝2.4Hz,2H),3.67(s,1H),3.46-3.13(m,3H),3.03(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.43-2.26(m,1H),2.19-1.98(m,1H)。
实施例148
合成(4S)-N-(2,3-二氢-[1,4]二氧杂环己二烯并[2,3-b]吡啶-7-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气搅拌下在室温将(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(700mg,2.77mmol)溶解在四氢呋喃(THF)中(10mL)，加入三光气(412mg,1.387mmol)并在室温搅拌30min，向其中加入三乙胺(1.933mL,13.87mmol)和2,3-二氢-[1,4]二氧杂环己二烯并[2,3-b]吡啶-7-胺(422mg,2.77mmol)。将反应混合物在60℃搅拌16hr。反应混合物用2x15ml水淬灭并用2x20ml乙酸乙酯萃取,有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物(800mg)。粗产物经柱色谱纯化，得到纯的化合物(4S)-N-(2,3-二氢-[1,4]二氧杂环己二烯并[2,3-b]吡啶-7-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(325mg,0.732mmol,26.4％收率)，其为淡黄色固体。Rf值：0.4,10％甲醇/DCM,LCMS(m/z):413.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ12.81(s,1H),8.58(d,J＝5.2Hz,1H),7.82(d,J＝2.4Hz,1H),7.78-7.40(m,5H),5.45(dd,J＝5.9,3.0Hz,1H),4.46-4.31(m,2H),4.29-4.16(m,2H),3.19(d,J＝8.8Hz,1H),3.14-3.03(m,2H),2.96(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.55(s,3H),2.23(d,J＝7.0Hz,1H),1.93(dd,J＝14.1,7.1Hz,1H)。
实施例149
合成(4R)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4R)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,2.210mmol)、(2-甲基吡啶-4-基)硼酸(454mg,3.31mmol)和K3PO4(1825mg,6.63mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(5.00mL)中的脱气的溶液中加入X-Phos(211mg,0.442mmol)和Pd2(dba)3(202mg,0.221mmol)。将反应混合物在110℃加热2h，使其冷却至室温。用水稀释(100mL)并用乙酸乙酯萃取(3x100mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化，得到(4R)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(392mg,49.2％收率)，其为灰白色固体(TLC:洗脱剂；10％甲醇/二氯甲烷,Rf＝0.3)，LCMS(m/z):374.18[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.76(s,1H),9.43(d,J＝1.53Hz,1H),8.59(d,J＝5.26Hz,1H),8.46(dd,J＝2.63,1.53Hz,1H),8.39(d,J＝2.41Hz,1H),8.31(s,1H),8.16-8.06(m,1H),7.92-7.78(m,1H),7.78-7.69(m,1H),5.52(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.37(m,1H),3.28-3.06(m,2H),2.98(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.61(s,3H),2.41-2.15(m,1H),2.05-1.84(m,1H)。
实施例150
((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)(吗啉代)甲酮
在氮气搅拌下在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(700mg,2.77mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液加入三光气(412mg,1.387mmol)并在室温搅拌30min，向其中加入三乙胺(1.933mL,13.87mmol)和吗啉(314mg,3.61mmol)。将反应混合物在60℃搅拌16hr。反应混合物用2x15ml水淬灭并用2x20ml乙酸乙酯萃取,有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。将粗产物加至100-200硅胶柱并用4％甲醇/DCM洗脱，得到纯的化合物((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)(吗啉代)甲酮(270mg,0.735mmol,26.5％收率)，其为淡棕色固体(Rf值：0.4,10％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):366.19[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.52(d,J＝5.2Hz,1H),7.85-7.75(m,1H),7.70(dd,J＝5.2,1.7Hz,1H),7.57-7.30(m,1H),4.38(s,1H),3.50(d,J＝72.2Hz,8H),3.23-2.95(m,1H),2.89(dd,J＝11.6,3.2Hz,1H),2.58-2.32(m,6H),2.33-1.92(m,2H).
实施例151
((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)(哌啶-1-基)甲酮
在氮气搅拌下在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(700mg,2.77mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(412mg,1.387mmol)，然后在室温搅拌30min。向其中加入三乙胺(1.933mL,13.87mmol)和哌啶(236mg,2.77mmol)。将反应混合物在60℃搅拌16hr。反应混合物用2x15ml水淬灭并用2x20ml乙酸乙酯萃取,有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经柱色谱纯化，得到纯的化合物((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)(哌啶-1-基)甲酮(220mg,0.583mmol,21.03％收率)，其为棕色固体.(Rf值：0.4,10％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):364.21[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.50(d,J＝5.2Hz,1H),7.79(d,J＝1.8Hz,1H),7.74-7.62(m,1H),7.51-7.30(m,2H),4.33(t,J＝4.2Hz,1H),3.49(d,J＝71.1Hz,4H),3.22-2.95(m,2H),2.88(dd,J＝11.6,3.2Hz,1H),2.61-2.35(m,6H),2.24-1.94(m,1H),1.55(s,5H)。
实施例152
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶并[3,4-b]吡嗪-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)在THF(30ml)中的溶液中加入三光气(353mg,1.189mmol)，然后搅拌至室温，持续1h。然后相继在室温加入吡啶并[3,4-b]吡嗪-5-胺(452mg,3.09mmol)和三乙胺(1.657mL,11.89mmol)，在密封管中在70℃加热反应混合物16h。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(150mL)中并用乙酸乙酯萃取(250mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，使用1％MeOH/DCM的梯度混合物作为洗脱剂)，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶并[3,4-b]吡嗪-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(260mg,0.613mmol,38％收率)，其为棕色固体(TLC:5％MeOH/DCM,Rf＝0.3)，LCMS(m/z):425.27[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.84(s,1H),9.11(d,J＝1.97Hz,1H),8.58(d,J＝5.70Hz,1H),8.37-8.51(m,1H),8.19(d,J＝1.97Hz,1H),7.59-7.78(m,5H),5.54-5.50(m,1H),3.22-3.33(m,1H),3.07-3.19(m,1H),3.00(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.50(dt,J＝3.67,1.78Hz,1H),2.21-2.33(m,4H),1.98(dt,J＝13.92,7.07Hz,1H)。
实施例153
合成(4S)-N-(3-甲基噌啉-5-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)在THF(30ml)中的溶液中加入三光气(353mg,1.189mmol)，然后搅拌至室温，持续1h。然后相继在室温加入3-甲基噌啉-5-胺(492mg,3.09mmol)和三乙胺(1.657mL,11.89mmol)，将反应混合物在70℃加热16h。将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液(150mL)中并用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，使用1％MeOH/DCM的梯度混合物作为洗脱剂)，得到(4S)-N-(3-甲基噌啉-5-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(280mg,0.647mmol,42％收率)，其为淡黄色固体(TLC:5％MeOH/DCM,Rf＝0.25)，LCMS(m/z):438.26[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.43(s,1H),9.11(s,1H),8.49(d,J＝5.92Hz,1H),8.39(d,J＝7.45Hz,1H),8.19(s,1H),7.81(t,J＝8.11Hz,1H),7.65(d,J＝7.5Hz 1H),7.35-7.31(m,3H),5.77(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.41-3.15(m,3H),2.91(m,1H),2.30-2.25(m,3H),2.24(s,3H),2.10-1.92(m,1H)。
实施例154
合成(4S)-7-(5-甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向用氩气脱气20min的(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)，(5-甲基吡啶-3-基)硼酸(311mg,2.273mmol)和K3PO4(804mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(12.00mL)、水(4.00mL)中的溶液中加入X-Phos(90mg,0.189mmol)和三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(87mg,0.095mmol)，再次用氩气脱气10min。将反应混合物在100℃搅拌4h，然后冷却至室温。将反应混合物经硅藻土过滤，然后滤液用水稀释并用EtOAc萃取(3×10mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，且经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶目且用1至3％MeOH/DCM洗脱，得到纯的(4S)-7-(5-甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(356mg,0.938mmol,49.5％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):374.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.81(s,1H),9.57(d,J＝1.4Hz,1H),8.99(dd,J＝2.1,0.8Hz,1H),8.52(dd,J＝2.0,0.9Hz,1H),8.47(m,J＝2.2,1.1Hz,1H),8.32-8.28(m,2H),7.64(d,J＝8.0Hz,1H),7.47(d,J＝8.0Hz,1H),5.71(dd,J＝6.1,3.2Hz,1H),3.35-3.16(m,3H),3.03(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.51(s,3H),2.35(dddd,J＝14.0,9.9,6.1,4.0Hz,1H),2.15-2.03(m,1H)。
实施例155
合成(4S)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向用氩气脱气20min(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)，(1-甲基-1H-吡唑-4-基)硼酸(286mg,2.273mmol)和K3PO4(804mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(12.00mL)、水(4.00mL)中的溶液中加入X-Phos(90mg,0.189mmol)和三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(87mg,0.095mmol)，再次用氩气脱气10min。将反应混合物在100℃搅拌4h，然后冷却至室温。将反应混合物经硅藻土过滤，然后滤液用水稀释并用EtOAc萃取(3×10mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶目且用1.5-3％MeOH/DCM洗脱，得到纯的(4S)-7-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(354mg,0.963mmol,50.9％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):363.1[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ14.09(s,1H),9.39(d,J＝1.5Hz,1H),8.51(d,J＝0.8Hz,1H),8.47(dd,J＝2.6,1.6Hz,1H),8.37-8.36(m,1H),8.26(d,J＝0.8Hz,1H),7.56(d,J＝8.0Hz,1H),7.34(d,J＝8.0Hz,1H),5.46(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),3.92(s,3H),3.22-3.13(m,1H),3.12-3.02(m,2H),2.94(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.24(dddd,J＝13.6,9.8,6.1,3.8Hz,1H),1.92(m,J＝14.4,7.4Hz,1H)。
实施例156
合成(4S)-7-(6-乙基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向用氩气脱气20min的(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)，(6-乙基吡啶-3-基)硼酸(343mg,2.273mmol)和K3PO4(804mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(12.00mL),水(3.00mL)中的溶液中加入X-Phos(90mg,0.189mmol)和三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(87mg,0.095mmol)，再次用氩气脱气10min。将反应混合物在100℃搅拌4h，然后冷却至室温。将反应混合物经硅藻土过滤，然后滤液用水稀释并用EtOAc萃取(3×10mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶目且用1.5-3％MeOH/DCM洗脱，得到纯的(4S)-7-(6-乙基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(354mg,0.883mmol,46.6％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):388.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.77(s,1H),9.54(d,J＝1.5Hz,1H),9.22-9.01(d,1H),8.47(dd,J＝2.5Hz,1H),8.35(d,J＝2.4Hz,1H),8.29(d,J＝2.6Hz,1H),7.63(d,J＝8.0Hz,1H),7.42(d,J＝8.0Hz,1H),7.35-7.32(d,1H),5.70(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.39-3.13(m,3H),3.02(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.92(q,J＝7.6Hz,2H),2.35(dddd,J＝13.9,9.9,6.1,4.0Hz,1H),2.21-1.98(m,1H),1.38(t,J＝7.6Hz,3H)。
实施例157
合成(4S)-N-(1H-吲唑-5-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)在THF(30ml)中的溶液中加入三光气(353mg,1.189mmol)，然后搅拌至室温，持续1h。然后相继在室温加入1H-吲唑-5-胺(412mg,3.09mmol)和三乙胺(1.657mL,11.89mmol)。将反应混合物在密封管中在70℃加热16h，倒入饱和NaHCO3溶液(180mL)，用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经制备型HPLC纯化(碳酸氢铵和乙腈)，得到(4S)-N-(1H-吲唑-5-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.489mmol,20.54％收率)，其为淡棕色固体(TLC:5％MeOH/DCM,Rf＝0.3)，LCMS(m/z):412.27[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.98(s,1H),12.92(s,1H),8.65(d,J＝5.04Hz,1H),8.09-7.94(d,J＝4.5Hz,1H),7.58-7.47(m,2H),7.47-7.41(m,2H),7.41-7.32(d,J＝8.4Hz，1H),7.32-7.17(d,J＝8.3Hz,1H),5.74(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),3.37-3.11(m,3H),3.11-2.86(m,1H),2.60(s,3H),2.22(dt,J＝14.03,7.02Hz,2H),1.99-1.81(m,1H)。
实施例158
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(哒嗪-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在30℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(700mg,2.77mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(412mg,1.387mmol)且搅拌1h。然后在30℃加入哒嗪-3-胺(792mg,8.32mmol)和三乙胺(1.160mL,8.32mmol)，将反应混合物在75℃加热16h。使得反应混合物30℃并倒入冷水(30mL)中，用DCM萃取(2x35ml)。合并的有机层用盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱(硅胶：100-200目，溶剂系统)和制备型HPLC((10mM碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈柱：xbridge C18(150x30)mm 5μ方法-t％b 0/60,13.5/60,14/100,17/100,17.1/60流速：30ml/min,洗脱剂：THF+ACN.+水)纯化，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(哒嗪-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(270mg,0.723mmol,25.7％)，其为淡黄色固体(TLC:Rf:0.4,10％MeOH/EtOAc)，LCMS(m/z):374.26[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ14.16(s,1H),8.94(dd,J＝4.7,1.5Hz,1H),8.66(d,J＝5.3Hz,1H),8.48(dd,J＝9.1,1.5Hz,1H),8.38-830(m,1H),8.22(s,1H),7.83-7.50(m,3H),5.69(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.41-3.16(m,3H),3.03(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.81(s,3H),2.35(dddd,J＝13.9,10.0,6.1,4.0Hz,1H),2.22-2.00(m,1H)。
实施例159
合成(4S)-7-(2,5-二甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)，2,5-二甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶(662mg,2.84mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(1.667mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)和X-phos(90mg,0.189mmol)。将反应混合物再脱气15min，并将反应混合物在100℃搅拌3hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，为粉色固体(TLC洗脱系统:10％甲醇/EtOAc；Rf＝0.3)。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶，并用5-8％甲醇/EtOAc洗脱，得到纯的(4S)-7-(2,5-二甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(337mg,0.860mmol,45.4％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):388.19[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ13.48(s,1H),9.49(d,J＝1.6Hz,1H),8.46(s,1H),8.34-8.10(m,2H),7.63(d,J＝7.8Hz,1H),7.45(s,1H),7.15(d,J＝7.9Hz,1H),5.71(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.51-3.09(m,3H),3.04(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.63(s,3H),2.43(s,3H),2.40-2.27(m,1H),2.20-1.96(m,1H)。
实施例160
合成(4S)-7-吗啉代-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)和吗啉(0.330mL,3.79mmol)在1,4-二噁烷(6mL)中脱气的溶液中加入Cs2CO3(1234mg,3.79mmol)，x-phos(361mg,0.758mmol)和Pd(OAc)2(85mg,0.379mmol)。将反应混合物在110℃搅拌16h。将反应混合物倒入冷水(50mL)并用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥，减压浓缩，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-吗啉代-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(268mg,0.707mmol,37.3％收率)，其为淡黄色固体(TLC:Rf:0.2,净EtOAc)，LCMS(m/z):368[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.41(s,1H),9.53(d,J＝1.5Hz,1H),8.37-7.90(m,2H),7.39(d,J＝8.6Hz,1H),6.29(d,J＝8.6Hz,1H),5.62(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.98-3.72(m,4H),3.62-3.46(m,4H),3.22(dddd,J＝12.2,8.5,3.7,2.2Hz,1H),3.18-3.05(m,2H),2.93(dd,J＝11.8,3.3Hz,1H),2.27(dd,J＝10.1,4.0Hz,1H),2.01(d,J＝6.9Hz,1H)。
实施例161
合成(4S)-N-(5-乙基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将(5-乙基吡嗪-2-基)氨基甲酸苯基酯(1446mg,5.94mmol)和DMAP(726mg,5.94mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的搅拌的溶液，然后将反应混合物在80℃搅拌16h。使反应混合物达到室温，用乙酸乙酯稀释(2X30mL)用水(40mL)和盐水(20mL)洗涤。分离有机层，然后经硫酸钠干燥，过滤并浓缩。残余物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，1％甲醇/DCM作为洗脱剂，得到所需产物。将化合物使用乙醇和戊烷重结晶，得到(4S)-N-(5-乙基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(245mg,0.602mmol,30.4％收率)，其为灰白色固体。(TLC:5％甲醇/DCM.Rf:0.4UV)，LCMS(m/z):402.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ13.46(s,1H),9.37(s,1H),8.67(dd,J＝5.3,0.8Hz,1H),8.20(d,J＝0.6Hz,1H),7.98(ddd,J＝5.4,1.8,0.7Hz,1H),7.74-7.54(m,2H),7.48(d,J＝7.9Hz,1H),5.72(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.37-3.17(m,1H),3.03(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.80(q,J＝7.6Hz,2H),2.62(s,3H)，2.35(dddd,J＝14.0,9.9,6.1,4.1Hz,1H),2.22-1.92(m,3H),1.32(t,J＝7.6Hz,3H)。
实施例162
合成(4S)-7-(2-甲基噁唑-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在28℃将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(475mg,2.273mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(1.667mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)和X-phos(90mg,0.189mmol)。将反应混合物再脱气15min，并将反应混合物在100℃搅拌3hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc；Rf＝0.2；UV活化的)。将粗物质通过制备型HPLC纯化，得到期望的产物(4S)-7-(2-甲基噁唑-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(153mg,0.418mmol,22.04％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):364.32[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ13.72(s,1H),9.54(d,J＝1.5Hz,1H),8.44-8.17(m,2H),8.07(s,1H),7.57(d,J＝7.9Hz,1H),7.30-7.13(m,1H),5.67(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.45-3.08(m,3H),3.01(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.58(s,3H),2.34(dddd,J＝14.1,9.9,6.1,4.2Hz,1H),2.22-1.95(m,1H)。
实施例163
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(嘧啶-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在30℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(700mg,2.77mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(823mg,2.77mmol)且搅拌1h。然后加入嘧啶-5-胺(317mg,3.33mmol)和TEA(0.387mL,2.77mmol)，将反应混合物在75℃加热16h。使得反应混合物到达30℃并倒入冷水(30mL)中，用DCM萃取(2x50ml)。合并的有机层用盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，3％MeOH/乙酸乙酯)，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(嘧啶-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(275mg,0.737mmol,32％)，其为淡黄色固体(TLC:Rf:0.4,10％MeOH/EtOAc)，LCMS(m/z):374.22[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.25(s,1H),9.01(s,2H),8.94(s,1H),8.68(d,J＝0.8Hz,1H),7.67(d,J＝7.9Hz,1H),7.55(dt,J＝1.6,0.8Hz,1H),7.47(ddd,J＝5.2,1.7,0.7Hz,1H),7.39(s,1H),5.69(dd,J＝5.9,3.2Hz,1H),3.33-3.13(m,3H),3.04(dd,J＝12.2,3.2Hz,1H),2.69(s,3H),2.36(dd,J＝10.1,4.1Hz,1H),2.15-2.04(m,1H)。
实施例164
合成(4S)-N-(5-环丙基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将(5-环丙基吡嗪-2-基)氨基甲酸苯基酯(1214mg,4.76mmol)和DMAP(581mg,4.76mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.585mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中并将反应混合物在80℃搅拌16h。使反应混合物达到室温，用乙酸乙酯稀释(2X30mL)，用水(20mL)和盐水(20mL)洗涤。分离有机层，然后经硫酸钠干燥，过滤并浓缩。残余物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目),2％甲醇/DCM作为洗脱剂，得到所需产物。将化合物通过乙醇和戊烷重结晶，得到(4S)-N-(5-环丙基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(260mg,0.623mmol,45.2％)，其为灰白色固体，(Rf:0.4,TLC:5％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):414.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.59(s,1H),9.35(d,J＝1.5Hz,1H),8.62(dd,J＝5.3,0.8Hz,1H),8.20(d,J＝1.5Hz,1H),8.07(q,J＝0.9Hz,1H),7.71-7.59(m,2H),7.48(d,J＝8.0Hz,1H),5.71(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.37-3.10(m,3H),3.02(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.74(s,3H),2.34(dd,J＝10.1,4.1Hz,1H),2.07(d,J＝8.0Hz,1H),1.21-0.66(m,5H)。
实施例165
合成(4S)-7-(2-甲基嘧啶-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、(2-甲基嘧啶-5-基)硼酸(314mg,2.273mmol)在1,4-二噁烷(12mL)和水(2.000mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入X-phos(90mg,0.189mmol)和Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)。将反应混合物再脱气15min，然后在100℃搅拌6hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(30mL)和EtOAc(70mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤。蒸发滤液得到粗物质(TLC洗脱剂：5％MeOH/CHCl3:Rf＝0.2；UV活化的)。粗制化合物经100-200硅胶纯化，通过20％MeOH/乙酸乙酯洗脱，得到(4S)-7-(2-甲基嘧啶-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(353mg,0.938mmol,49.5％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):375.19[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ13.57(s,1H),9.53(d,J＝1.5Hz,1H),9.33(s,2H),8.38(d,J＝1.6Hz,1H),8.30(s,1H),7.66(d,J＝8.0Hz,1H),7.40(d,J＝8.0Hz,1H),5.71(dd,J＝5.9,3.2Hz,1H),3.41-3.11(m,3H),3.04(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.84(s,3H),2.36(dddd,J＝14.0,9.9,6.1,4.1Hz,1H),2.11(d,J＝7.1Hz,1H)。
实施例166
合成(4S)-N-(6-环丙基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,0.198mmol)在THF(30mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(353mg,0.099mmol)且搅拌30min。然后在室温加入6-环丙基吡嗪-2-胺(321mg,2.378mmol)和Et3N(1.657mL,0.991mmol)。将反应混合物在65℃搅拌16h。将反应混合物倒入NaHCO3溶液中并用CH2Cl2萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用2％MeOH/CH2Cl2洗脱)，得到(4S)-N-(6-环丙基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(208mg,0.479mmol,30.2％收率)，其为白色固体(TLC:10％MeOH/CH2Cl2,Rf:0.5)，LCMS(m/z):414.29[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.11(s,1H),9.29(s,1H),8.80(d,J＝5.26Hz,1H),8.57(d,J＝4.60Hz,1H),8.15(s,1H),7.97-7.67(m,1H),7.64(d,J＝7.89Hz,1H),7.59-7.42(m,1H),5.72(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.34-3.10(m,3H),3.39-3.09(m,1H),2.62(s,3H),2.44-2.18(m,1H),2.17–1.97(m,1H),1.13–0.93(m,4H)。
实施例167
(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(1H-1,2,3-三唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃将三光气(0.588g,1.982mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.5g,1.982mmol)在四氢呋喃(50mL)中的搅拌的溶液中，接着在0℃加入三乙胺(0.829mL,5.94mmol)和1H-1,2,3-三唑-4-胺盐酸盐(0.597g,4.95mmol)。将反应混合物在70℃搅拌48h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(50mL)和EtOAc(50mL)之间。分离有机层并用水和盐水洗涤。有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制的黄色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf＝0.35；UV活化的)。粗制化合物经100-200硅胶纯化，用5％MeOH/乙酸乙酯洗脱，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(1H-1,2,3-三唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.21g,0.558mmol,28.2％收率)，其为浅黄色固体，LCMS(m/z):363.24[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ14.58(s,1H),13.55(s,1H),8.58(d,J＝5.2Hz,1H),7.94(s,2H),7.84-7.75(m,2H),7.71(d,J＝8.0Hz,1H),5.47(dd,J＝5.8,3.0Hz,1H),3.27-3.16(m,1H),3.16-3.01(m,2H),2.97(dd,J＝12.0,3.2Hz,1H),2.64(s,3H),2.24(dddd,J＝13.7,9.8,5.9,3.7Hz,1H),1.94(dddd,J＝14.5,8.7,4.5Hz,1H)。
实施例168
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-((S)-1-(吡啶-2-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在四氢呋喃(10mL)中的溶液中加入三光气(588mg,1.982mmol)和三乙胺(1.657mL,11.89mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min，加入(S)-1-(吡啶-2-基)乙胺，然后在70℃搅拌16h。减压除去溶剂并用水稀释并用乙酸乙酯萃取(2×50mL)。合并的有机层用水(30mL)、饱和盐水溶液洗涤。有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物，为棕色固体。(TLC洗脱剂：10％甲醇/二氯甲烷,Rf＝0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化(中性氧化铝)，产物用55-60％乙酸乙酯/己烷洗脱。将收集的级分减压蒸发，得到纯的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-((S)-1-(吡啶-2-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(277mg,0.684mmol,34.5％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):401.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ11.09(d,J＝7.6Hz,1H),8.56(dd,J＝5.3,0.8Hz,1H),8.36(ddd,J＝4.8,1.8,0.9Hz,1H),7.78(dt,J＝1.4,0.7Hz,1H),7.63-7.60(m,2H),7.59(dd,J＝7.7,1.9Hz,1H),7.31-7.29(m,2H),7.11(ddd,J＝7.6,4.8,1.2Hz,1H),5.64(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),5.32-5.23(m,1H),3.27-3.06(m,3H),2.95(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.60(s,3H),2.22(dd,J＝10.0,4.0Hz,1H),2.03-1.89(m,1H),1.62(d,J＝6.9Hz,3H)。
实施例169
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-((R)-1-(吡啶-2-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在四氢呋喃(10mL)中的溶液中加入三光气(588mg,1.982mmol)和三乙胺(1.657mL,11.89mmol)。将反应混合物在室温搅拌30min，加入(R)-1-(吡啶-2-基)乙胺(726mg,5.94mmol)且在70℃搅拌16h。减压除去溶剂，用水稀释(15mL)，并用乙酸乙酯萃取(2×50mL)。合并的有机层用水(30mL)、饱和盐水溶液洗涤，然后经无水硫酸钠干燥。将溶液过滤并浓缩，得到粗产物，为棕色固体。(TLC洗脱剂：10％甲醇/二氯甲烷,Rf＝0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化(中性氧化铝)产物用55-60％乙酸乙酯/己烷洗脱，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-((R)-1-(吡啶-2-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(240mg,0.595mmol,30.0％收率)，其为黄色胶状物，LCMS(m/z):401.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ11.06(d,J＝7.5Hz,1H),8.57(dd,J＝5.2,0.8Hz,1H),8.43(ddd,J＝4.8,1.8,0.9Hz,1H),7.78(q,J＝0.9Hz,1H),7.63(ddd,J＝5.1,1.9,0.7Hz,1H),7.61(dd,J＝7.8,1.9Hz,1H),7.55(d,J＝7.9Hz,1H),7.36-7.30(m,2H),7.13(ddd,J＝7.6,4.8,1.2Hz,1H),5.62(dd,J＝5.9,3.2Hz,1H),5.27(p,J＝7.0Hz,1H),3.30-3.21(m,1H),3.18(ddd,J＝12.2,9.9,6.9Hz,1H),3.06(dt,J＝12.0,2.1Hz,1H),2.92(dd,J＝11.9,3.3Hz,1H),2.60(s,3H),2.27(dddd,J＝13.9,9.9,6.1,3.9Hz,1H),2.07(dt,J＝14.0,7.5Hz,1H),1.62(d,J＝6.9Hz,3H)。
实施例170
合成(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.080mmol)的溶液中加入4.0M盐酸的二噁烷溶液(10mL,1.080mmol)。将反应混合物在室温搅拌3h。蒸发反应混合物的溶剂，然后用碳酸氢钠中和并用EtOAc萃取(3×50mL),合并的有机层用盐水溶液洗涤，然后经硫酸钠干燥并蒸发，得到350mg粗制化合物。粗产物加至硅胶柱并用2％MeOH/DCM洗脱，将收集的级分蒸发，得到(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(253mg,0.487mmol,45.1％收率)，其为灰白色固体。(TLC:Rf:0.2,5％MeOH/DCM)，LCMS(m/z):516.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 13.02(s,1H),8.08-8.33(m,2H),7.77-8.00(m,3H),7.76-7.59(m,2H),7.11(d,J＝1.53Hz,1H),6.80(dd,J＝5.70,1.75Hz,1H),5.47(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.85(d,J＝5.26Hz,1H),4.58(t,J＝5.70Hz,2H),4.23(dd,J＝10.85,4.49Hz,1H),4.12(dd,J＝10.74,6.14Hz,1H),3.78(dq,J＝10.69,5.43Hz,1H),3.53-3.32(m,1H),3.25-3.05(m,3H),2.97(dd,J＝11.95,3.18Hz,2H),2.37-2.18(m,1H),2.03–1.86(m,1H)。
实施例171
合成(4S)-7-(5,6-二甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、(5,6-二甲基吡啶-3-基)硼酸(343mg,2.273mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(1.667mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)和X-phos(90mg,0.189mmol)。将反应混合物再脱气15min，并将反应混合物在100℃搅拌3hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc；Rf＝0.3；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶并用5-10％MeOH/EtOAc洗脱，得到纯的(4S)-7-(5,6-二甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(420mg,1.078mmol,56.9％收率)，其为灰白色固体,LCMS
(m/z):388.19[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ13.85(s,1H),9.57(d,J＝1.4Hz,1H),8.86(d,J＝2.3Hz,1H),8.54-8.34(m,1H),8.34-8.19(m,2H),7.62(d,J＝8.0Hz,1H),7.44(d,J＝8.0Hz,1H),5.71(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.45-3.08(m,3H),3.02(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.59(s,3H),2.47(d,J＝0.8Hz,3H),2.35(dddd,J＝14.0,10.0,6.1,4.0Hz,1H),2.22-2.00(m,1H)。
实施例172
合成(4S)-7-(3-(二甲基氨基)苯基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在28℃将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、(3-(二甲基氨基)苯基)硼酸(469mg,2.84mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(1.667mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)和X-phos(90mg,0.189mmol)。将反应混合物再脱气15min，并将反应混合物在100℃搅拌3hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并蒸发滤液，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc；Rf＝0.5；UV活化的)。将粗物质通过使用柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶并用0-5％MeOH/EtOAc洗脱，得到纯的(4S)-7-(3-(二甲基氨基)苯基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(273mg,0.660mmol,34.8％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):402.26[M+H]+。
1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ13.66(s,1H),9.39(s,1H),8.35(q,J＝2.7Hz,2H),7.81-7.42(m,1H),7.44-7.19(m,4H),6.92-6.77(m,1H),5.53(dd,J＝5.9,3.1Hz,1H),3.29-3.00(m,3H),2.98(s,7H),2.25(ddd,J＝13.8,10.3,5.4Hz,1H),1.96(dt,J＝14.9,7.8Hz,1H)。
实施例173
合成((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)(吡咯烷-1-基)甲酮
向在氮气下在室温搅拌的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(294mg,0.991mmol)，然后在室温搅拌30min。30分钟后，加入三乙胺(1.381mL,9.91mmol)和吡咯烷(183mg,2.58mmol)。将反应混合物在60℃搅拌16hr。反应混合物用2x15ml水淬灭并用2x20ml乙酸乙酯萃取,有机层用水洗涤，然后经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经100-200硅胶纯化柱并用4％甲醇/DCM洗脱，得到纯的化合物((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)(吡咯烷-1-基)甲酮(350mg,0.993mmol,50.1％收率)，其为黄色固体(Rf值：0.4,10％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):350.25[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.49(dd,J＝5.2,0.8Hz,1H),7.75(dt,J＝1.4,0.7Hz,1H),7.67(ddd,J＝5.4,1.7,0.7Hz,1H),7.50(d,J＝7.9Hz,1H),7.44(d,J＝7.9Hz,1H),4.42(d,J＝3.8Hz,1H),3.44-3.24(m,4H),3.14(ddt,J＝12.0,6.1,3.3Hz,1H),3.03(dd,J＝13.8,5.2Hz,2H),2.89(dd,J＝11.6,3.3Hz,1H),2.55(s,3H),2.23-2.01(m,2H),1.99-1.86(m,4H).
实施例174
合成(4-甲基哌嗪-1-基)((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮
向在室温在氮气下搅拌的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(294mg,0.991mmol)，然后在室温搅拌30min。30分钟后，加入三乙胺(1.381mL,9.91mmol)和1-甲基哌嗪(258mg,2.58mmol)。将反应混合物在60℃搅拌16hr。使得反应混合物达到室温并用2x15ml水淬灭并用2x20ml乙酸乙酯萃取,有机层用水洗涤，然后经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物500mg。粗产物经柱色谱纯化，得到纯的化合物(4-甲基哌嗪-1-基)((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮(280mg,0.725mmol,36.6％收率)，其为黄色固体，(Rf值：0.25,10％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):379.1[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.51(dd,J＝5.3,0.8Hz,1H),7.83-7.72(m,1H),7.70(ddd,J＝5.2,1.7,0.7Hz,1H),7.53-7.36(m,2H),4.36(d,J＝3.9Hz,1H),3.60(s,1H),3.42(s,2H),3.22-2.90(m,3H),2.61-2.44(m,9H),2.15(d,J＝10.0Hz,5H)。
实施例175
合成(4S)-N-环戊基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在室温在氮气下搅拌的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(294mg,0.991mmol)，然后在室温搅拌30min。向其中加入三乙胺(1.381mL,9.91mmol)和环戊基胺(219mg,2.58mmol)。将反应混合物在60℃搅拌16hr。反应混合物用2x15ml水淬灭并用2x20ml乙酸乙酯萃取,有机层用水洗涤，然后经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物500mg。粗产物经柱色谱纯化，得到纯的化合物(4S)-N-环戊基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(275mg,0.727mmol,36.7％收率)，其为黄色固体，(Rf值：0.4,10％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):364.29(M+H)+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 10.30(d,J＝6.58Hz,1H),8.56(d,J＝5.04Hz,1H),7.67-7.52(m,4H),5.41(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),4.14-4.06(m,1H),3.21-3.02(m,2H),2.99-2.85(m,2H),2.54(s,3H),2.17(dd,J＝9.76,3.84Hz,1H),2.03–1.79(m,3H),1.64-1.43(m,6H)。
实施例176
合成(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-(1H-吡唑-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向用氩气脱气20min的(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.947mmol)、(1H-吡唑-5-基)硼酸(127mg,1.137mmol)和K3PO4(402mg,1.894mmol)在1,4-二噁烷(9mL),水(3mL)中的溶液中加入X-phos(45.2mg,0.095mmol)和三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(43.4mg,0.047mmol)，再次用氩气脱气10min。将反应混合物在100℃搅拌4h，然后冷却至室温。将反应混合物经硅藻土过滤，然后滤液用水稀释并用EtOAc萃取(3×10mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用100-200硅胶目且用2-3％MeOH/DCM洗脱，得到纯的(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-(1H-吡唑-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(100mg,0.280mmol,29.5％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):349.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ14.58(s,1H),12.8-11.0(br,1H),9.50(d,J＝1.5Hz,1H),8.41(dd,J＝2.6,1.5Hz,1H),8.34(d,J＝2.6Hz,1H),7.69(d,J＝2.0Hz,1H),7.60(d,J＝7.9Hz,1H),7.41(d,J＝7.6Hz,1H),6.97(d,J＝17.7Hz,1H),5.63(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.33-3.14(m,3H),3.03(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.35(dddd,J＝14.0,9.9,6.1,4.1Hz,1H),2.17-2.02(m,1H)。
实施例177
合成4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吡啶-2-甲酸
将磷酸三钾(6.03g,28.4mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(3g,9.47mmol)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3-二氧杂环戊烷-2-基)吡啶-2-甲酸甲酯(3.02g,11.37mmol)在1,4-二噁烷(25mL)和水(4.17mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(0.434g,0.474mmol)和X-phos(0.452g,0.947mmol)。将反应混合物再脱气15min，然后在100℃搅拌24hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(50mL)和EtOAc(200mL)之间。水层用饱和枸橼酸溶液中和，将析出的固体过滤并干燥。将粗制固体用甲醇和水研磨，得到4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吡啶-2-甲酸(272mg,0.667mmol,7.04％收率)，其为灰白色固体。(TLC洗脱剂：20％MeOH/DCM:Rf:0.1；UV活化的)，LCMS(m/z):404.1[M+H]+。
1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ13.66(s,1H),9.37(d,J＝0.8Hz,1H),8.87(d,J＝4.8Hz,1H),8.62(s,1H),8.42(s,1H),8.38-8.34(dd,J＝8.4,2.4Hz,2H),7.887(d,J＝8Hz,1H),7.762(d,J＝8.4Hz,1H)5.53-5.51(dd,J＝5.6,2.8Hz,1H),3.31-3.23(m,1H),3.15-3.09(m,2H),3.08-2.97(dd,J＝12,2.8Hz,1H),2.28-2.24(m,1H),2.02-1.97(m,1H)。
实施例178
合成(4S)-N-(6-甲基吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在30℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.585mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(282mg,0.951mmol)且搅拌1h。然后在30℃加入Et3N(1.105mL,7.93mmol)和6-甲基吡啶-3-胺(257mg,2.378mmol)，将反应混合物在65℃加热16h。将反应混合物倒入冷水(50mL)中并用DCM萃取(2x50ml)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：0-15％MeOH/DCM)，得到(4S)-N-(6-甲基吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(320mg,0.829mmol,52％收率)，其为灰白色固体(TLC:4％MeOH/DCM,Rf:0.35)，LCMS(m/z):387.25[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.94(s,1H),8.66(d,J＝5.26Hz,1H),8.56(d,J＝2.63Hz,1H),8.00(dd,J＝8.44,2.74Hz,1H),7.63(d,J＝8.14Hz,1H),7.57(s,1H),7.50(d,J＝5.35Hz,1H),7.25-7.38(m,1H),7.13(d,J＝8.55Hz,1H),5.70(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.10-3.35(m,3H),3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.58(s,3H),2.48(s,3H)2.03-2.22(m,1H)2.34(dddd,J＝14.03,9.87,5.92,4.17Hz,1H)。
实施例179
合成(4S)-7-(2-(二甲基氨基)吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.947mmol)、K3PO4(603mg,2.84mmol)在1,4-二噁烷(30mL)和水(0.3mL)中脱气的溶液中加入x-phos(45.2mg,0.095mmol)和乙酸钯(II)(10.63mg,0.047mmol)。然后将反应混合物在120℃加热12h。减压蒸发溶剂并用DCM萃取(2x40ml)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经无水硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-(2-(二甲基氨基)吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.496mmol,52.3％收率)，其为灰白色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc,Rf:0.2)，LCMS(m/z):403.31[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.56(s,1H),9.54(s,1H)，8.25-8.11(m,3H),7.62(m,J＝7.89Hz,1H),7.41(d,J＝7.89Hz,1H),7.19-7.01(m,2H),5.72(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.31-3.14(m,9H),3.02(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.50-2.23(m,1H),2.10(d,J＝7.02Hz,1H)。
实施例180
合成(4S)-7-(6-环丙基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将磷酸钾(402mg,1.894mmol)和(6-环丙基吡啶-3-基)硼酸(185mg,1.137mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.947mmol)在1-丁醇(6mL)和水(2.0mL)的混合物中的搅拌的溶液中。用氩气净化30min，然后加入Pd2(dba)3(43.4mg,0.047mmol)和x-phos(45.2mg,0.095mmol))，将反应混合物在120℃搅拌3h。使反应混合物达到室温，用乙酸乙酯稀释(100mL)，用水(30mL)和盐水(40mL)洗涤。有机层经Na2SO4干燥并浓缩。将残余物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，80％乙酸乙酯/石油醚作为洗脱剂)。将回收的物质使用乙醇和戊烷重结晶，得到(4S)-7-(6-环丙基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(130mg,0.322mmol,34.0％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯,Rf:0.2)，LCMS(m/z):400.25[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.79(s,1H),9.53(d,J＝1.5Hz,1H),9.01(dd,J＝2.4,0.8Hz,1H),8.42-8.22(m,3H),7.61(d,J＝8.0Hz,1H),7.45-7.19(m,2H),5.70(dd,J＝5.9,3.2Hz,1H),3.34-3.16(m,3H),3.02(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.34(dd,J＝10.1,4.1Hz,1H),2.19-2.02(m,2H),1.20-0.96(m,4H).
实施例181
合成(4S)-7-(哌啶-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)和哌啶(0.375mL,3.79mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中脱气的溶液中加入Cs2CO3(1852mg,5.68mmol)、x-phos(361mg,0.758mmol)和Pd(OAc)2(85mg,0.379mmol)。将反应混合物在100℃搅拌16h，将其倒至冷水(20mL)中，用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：5％甲醇/DCM)，获得(4S)-7-(哌啶-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(284mg,0.762mmol,40.2％收率)，其为淡黄色固体(TLC:Rf:0.2,净EtOAc)，LCMS(m/z):366.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.51(s,1H),9.52(d,J＝1.5Hz,1H),8.29-8.19(m,1H),8.18(s,1H),7.33(d,J＝8.6Hz,1H),6.29(d,J＝8.6Hz,1H),5.61(dd,J＝6.1,3.3Hz,1H),3.55(t,J＝4.9Hz,4H),3.22(dddd,J＝12.2,8.6,3.7,2.3Hz,1H),3.16-3.07(m,2H),2.90(dd,J＝11.8,3.3Hz,1H),2.34-2.22(m,1H),2.00(dddd,J＝14.1,8.7,6.8,2.0Hz,1H),1.78-1.64(m,6H).
实施例182
合成(4S)-N-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.793mmol)、Et3N(0.331mL,2.378mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(118mg,0.396mmol)，然后将反应混合物在室温搅拌30分钟。然后滴加1-甲基-1H-吡唑-3-胺(231mg,2.378mmol)在THF(2ml)中的溶液。将反应混合物在65℃搅拌16h。将有机溶剂真空蒸发并将粗物质用DCM稀释(20ml)。有机层用水(5mL)、饱和盐水(5mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并真空蒸发，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％MeOH/DCM)，得到(4S)-N-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(185mg,0.490mmol,61.8％收率)，其为白色固体(TLC:5％MeOH/DCM,Rf:0.5)，LCMS(m/z):376.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.37(s,1H),8.61(d,J＝5.26Hz,1H),8.05-7.83(m,1H),7.68-7.55(m,2H)，7.43(d,J＝7.89Hz,1H),7.35-7.17(m,1H)，6.63(d,J＝2.19Hz,1H),5.69(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.84(s,3H),3.34-3.10(m,3H),3.00(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.75(s,3H),2.32(dddd,J＝14.03,9.92,5.97,4.06Hz,1H)2.21–1.99(m,1H)。
实施例183
合成(4S)-N-环丁基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-亚甲基-吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气下在室温搅拌30min的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.585mmol)、三乙胺(1.105mL,7.93mmol)和三光气(282mg,0.951mmol)在四氢呋喃(20mL)中的溶液中加入环丁基胺(225mg,3.17mmol)在THF(5mL)中的溶液。将反应混合物在65℃搅拌16h，然后冷却至室温。将反应混合物倒入冰水中并用EtOAc萃取(3×15mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)。粗制化合物经GRACE反相柱纯化，且用30％(0.1％HCOOH的水溶液)/MeOH洗脱，得到(4S)-N-环丁基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(369mg,1.053mmol,66.4％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):350.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ10.76-10.60(m,1H),8.61(dd,J＝5.3,0.8Hz,1H),7.60(dt,J＝1.6,0.7Hz,1H),7.55(d,J＝7.8Hz,1H),7.49(ddd,J＝5.3,1.7,0.7Hz,1H),7.32(d,J＝7.9Hz,1H),5.62(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),4.52-4.36(m,1H),3.28-3.13(m,2H),3.07(dt,J＝11.9,2.1Hz,1H),2.94(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.65(s,3H),2.51-2.39(m,2H),2.26(dddd,J＝13.9,10.0,6.1,4.1Hz,1H),2.08-1.90(m,3H),1.84-1.72(m,2H).
实施例184
合成(4S)-N-环丙基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃将三光气(706mg,2.378mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)和TEA(1.657mL,11.89mmol)在四氢呋喃(25mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物搅拌1hr并加入环丙胺(272mg,4.76mmol)，在60℃搅拌16hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制的黄色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶并用10％MeOH/EtOAc洗脱，得到纯的(4S)-N-环丙基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(218mg,0.638mmol,26.8％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z):336.24[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ10.59(s,1H),8.60(d,J＝5.4Hz,1H),7.68-7.50(m,2H),7.42(dd,J＝5.2,1.7Hz,1H),7.38-7.21(m,1H),5.66(dd,J＝5.9,3.2Hz,1H),3.36-3.12(m,2H),3.07(dt,J＝12.0,2.1Hz,1H),3.01-2.82(m,2H),2.66(s,3H),2.27(dddd,J＝13.8,9.9,6.0,4.0Hz,1H),2.02(dt,J＝14.6,7.3Hz,1H),0.91-0.79(m,2H),0.69-0.51(m,2H).
实施例185
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基甲基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃将三光气(706mg,2.378mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)和TEA(1.657mL,11.89mmol)在四氢呋喃(30mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物搅拌1hr并加入吡啶-3-基甲胺(514mg,4.76mmol)，在60℃搅拌16hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制的黄色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf＝0.2；UV活化的)。粗制化合物经反相柱纯化(柱：C18,40μm)且用20％(0.1％HCOOH&水)/MeOH洗脱，得到纯的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基甲基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(193mg,0.498mmol,20.93％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z):387.32[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ10.89(t,J＝5.7Hz,1H),8.75-8.60(m,1H),8.56(dd,J＝4.8,1.7Hz,1H),8.40(d,J＝5.3Hz,1H),7.72(dt,J＝7.9,2.0Hz,1H),7.57(d,J＝7.9Hz,1H),7.44-7.21(m,3H),7.15(dd,J＝5.3,1.8Hz,1H),5.66(dd,J＝5.9,3.2Hz,1H),4.63(d,J＝5.4Hz,2H),3.37-3.15(m,2H),3.11(dt,J＝12.2,2.1Hz,1H),2.98(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.49(s,3H),2.39-2.23(m,1H),2.05(dt,J＝14.6,7.8Hz,1H)。
实施例186
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基甲基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃将三光气(706mg,2.378mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)和TEA(1.657mL,11.89mmol)在四氢呋喃(25mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物搅拌1hr并加入吡啶-2-基甲胺(514mg,4.76mmol)，在60℃搅拌16hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离EtOAc层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为黄色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf＝0.2；UV活化的)。粗制化合物经反相柱纯化(柱：C18,40μm)且用20％(0.1％HCOOH&水)/MeOH洗脱，得到纯的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-2-基甲基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(190mg,0.492mmol,20.67％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):387.22[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ11.04(t,J＝5.4Hz,1H),8.45(d,J＝5.2Hz,1H),8.40(dt,J＝4.7,1.5Hz,1H),7.64(td,J＝7.7,1.9Hz,1H),7.60-7.49(m,2H),7.44(dd,J＝5.3,1.7Hz,1H),7.36(d,J＝7.8Hz,1H),7.33-7.22(m,1H),7.22-7.10(m,1H),5.68(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),4.78(d,J＝5.0Hz,2H),3.34-3.04(m,3H),2.97(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.49(s,3H),2.28(dddd,J＝13.8,10.0,5.9,4.0Hz,1H),2.06(dt,J＝14.5,7.3Hz,1H)。
实施例187
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(1,2,4-三嗪-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气下在室温搅拌的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.250g,0.991mmol)在四氢呋喃(30mL)中的溶液中加入三乙胺(2.486mL,17.83mmol)和三光气(0.294g,0.991mmol)。然后将反应混合物在室温搅拌30分钟。在室温加入1,2,4-三嗪-5-胺(0.286g,2.97mmol)。然后将反应混合物在65℃搅拌16hr。将反应混合物冷却至室温，完全蒸馏出溶剂，然后分配在水(20mL)和EtOAc(50mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.4；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶并用100％EtOAc洗脱，得到纯的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(1,2,4-三嗪-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.044g,0.117mmol,11.76％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):375.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ14.23(s,1H),10.27(d,J＝2.0Hz,1H),9.27(d,J＝2.1Hz,1H),8.65(dd,J＝5.3,0.8Hz,1H),7.96(dt,J＝1.9,0.7Hz,1H),7.73-7.61(m,2H),7.54(d,J＝8.0Hz,1H),5.69(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.31-3.14(m,3H),3.05(dd,J＝12.2,3.3Hz,1H),2.73(s,3H),2.38(dddd,J＝13.9,9.9,6.1,4.2Hz,1H),2.15-2.02(m,1H)。
实施例188
(4S)-N-环己基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在室温在氮气下搅拌的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(294mg,0.991mmol)，然后在室温搅拌30min。向加入其中三乙胺(1.381mL,9.91mmol)和环己基胺(255mg,2.58mmol)，然后将反应混合物在60℃搅拌16hr。反应混合物用2x15ml水淬灭并用2x20ml乙酸乙酯萃取,有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经柱色谱纯化，得到纯的化合物(4S)-N-环己基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(265mg,0.701mmol,35.4％收率)，其为灰白色固体,(Rf值：0.4,10％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):378.36[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 10.36(d,J＝7.02Hz,1H),8.59(d,J＝5.26Hz,1H),7.56(d,J＝5.26Hz,1H),7.54-7.52(m,1H),7.45(dd,J＝5.15,1.21Hz,1H),7.29(d,J＝7.89Hz,1H),5.64(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.87-3.74(m,1H),3.06-3.30(m,3H),2.95(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.65(s,3H),2.26(dddd,J＝14.00,9.89,5.92,4.17Hz,1H),2.14–1.98(m,3H),1.81-1.61(m,3H),1.45-1.14(m,5H)
实施例189
合成(4S)-N-(1H-咪唑并[4,5-b]吡啶-5-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)在THF(30ml)中的溶液中加入三光气(353mg,1.189mmol)，然后在室温搅拌1h。然后相继加入1H-咪唑并[4,5-b]吡啶-5-胺(415mg,3.09mmol)和三乙胺(1.657mL,11.89mmol)并将反应混合物在密封管中在70℃加热16h。使得反应混合物冷却至室温,倒入饱和NaHCO3溶液(150mL)并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，使用1％甲醇/二氯甲烷中的梯度混合物作为洗脱剂)，得到(4S)-N-(1H-咪唑并[4,5-b]吡啶-5-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(160mg,0.388mmol,25％)，其为淡黄色固体(TLC:5％甲醇/DCM,Rf＝0.3)，LCMS(m/z):413.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ13.43(s,1H),12.30-11.54(m,1H)，8.72(d,J＝5.4Hz,1H),8.34(s,1H),8.19-8.10(m,3H),8.04(d,J＝8.7Hz,1H),7.80(d,J＝8.0Hz,1H),7.72(d,J＝8.0Hz,1H),5.55(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),3.12(d,J＝11.5Hz,2H),2.98(d,J＝3.3Hz,1H),2.95(d,J＝3.3Hz,1H),2.70(s,3H),2.25(m,J＝13.9,4.7Hz,1H),1.96(dt,J＝14.3,7.4Hz,1H)。
实施例190
合成(4S)-N-(6-氟吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃将三乙胺(1.105mL,7.93mmol)和三光气(235mg,0.793mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.585mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的搅拌的溶液中,30min后，加入6-氟吡嗪-2-胺(359mg,3.17mmol)，然后加热至70℃，保持16h。使反应混合物达到室温,有机溶剂通过旋转蒸发除去。残余物用水稀释(50mL)并用乙酸乙酯萃取(3x60mL)。合并的有机层用盐水洗涤(60mL)，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，2％MeOH/DCM作为洗脱剂)，得到(4S)-N-(6-氟吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.522mmol,32.9％收率)，其为淡黄色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM,Rf:0.4)，LCMS(m/z):392.26[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.82(s,1H),9.48(d,J＝4.6Hz,1H),8.66(d,J＝5.3Hz,1H),8.15(d,J＝8.4Hz,1H),7.92(d,J＝2.2Hz,1H),7.71-7.40(m,2H),7.26(s,1H),5.75-5.63(m,1H),3.26(dd,J＝9.7,6.9Hz,3H),3.05(d,J＝3.3Hz,1H),2.75(s,3H),2.36(dddd,J＝13.9,9.9,5.9,3.9Hz,1H),2.16-1.93(m,1H)。
实施例191
合成(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-(4-(三氟甲基)哌啶-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(800mg,2.53mmol)和4-(三氟甲基)哌啶(580mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(15mL)中的脱气的溶液中加入Cs2CO3(2469mg,7.58mmol)，用氩气净化15min，接着加入x-phos(241mg,0.505mmol)，乙酸钯(II)(56.7mg,0.253mmol)。将反应混合物在密封管中在100℃搅拌16h。使得反应混合物冷却至室温,倒入冷水(30mL)中并用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥，减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，使用2％MeOH/DCM的梯度混合物作为洗脱剂)，得到(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-(4-(三氟甲基)哌啶-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(255mg,0.559mmol,22.13％收率)，其为灰白色固体(TLC:100％乙酸乙酯,Rf＝0.3)，LCMS(m/z):434.1[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.39(s,1H),9.54(d,J＝1.5Hz,1H),8.25(d,J＝2.5Hz,1H),8.19(dd,J＝2.6,1.6Hz,1H),7.37(d,J＝8.6Hz,1H),6.32(d,J＝8.6Hz,1H),5.62(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),4.41–4.30(m,2H),3.30–3.18(m,1H),3.16–3.08(m,2H),3.00–2.88(m,3H),2.37–2.19(m,2H),2.09–1.97(m,3H),1.75–1.61(m,2H).
实施例192
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(吡啶-3-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在0℃将2.0M盐酸的乙醚溶液(2mL,4.00mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(吡啶-3-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.624mmol)中。将反应混合物在28℃搅拌4h并浓缩，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.1；UV活化的)。粗制化合物用乙醚洗涤(2x5mL)，得到纯的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(吡啶-3-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(274mg,0.606mmol,97％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z):401.1[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.89(s,2H),8.72(d,J＝4.7Hz,1H),8.65(d,J＝6.7Hz,1H),8.44(s,1H),8.32(s,1H),8.17(d,J＝7.1Hz,1H),8.06-7.92(m,2H),5.67(d,J＝5.2Hz,1H),3.99-3.75(m,6H),3.32-3.20(m,2H),2.93(s,3H),2.72-2.53(m,1H),2.42-2.37(s,1H)。
实施例193
合成((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)(3-甲基吡咯烷-1-基)甲酮
向在室温在氮气下搅拌的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.5g,5.94mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中加入三光气(0.882g,2.97mmol)，然后在室温搅拌30min。30分钟后，加入三乙胺(4.14mL,29.7mmol)和3-甲基吡咯烷(0.658g,7.73mmol)，然后将反应混合物在60℃搅拌16hr。反应混合物用2x25ml水淬灭并用2x50ml乙酸乙酯萃取,有机层经硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经柱色谱纯化并进行SFC,分离的峰为峰-I分离收率((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)(3-甲基吡咯烷-1-基)甲酮(210mg,0.574mmol,9.65％收率)，其为淡棕色固体，和峰-II分离收率((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)(3-甲基吡咯烷-1-基)甲酮(180mg,0.494mmol,6.79％收率)，其为淡棕色固体，(Rf值：0.4,10％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):364.32[M+H]+。
峰-1
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.50(d,J＝5.04Hz,1H),7.76(d,J＝0.66Hz,1H),7.68(dd,J＝5.26,1.10Hz,1H),7.52-7.48(m,1H),7.47-7.38(m,1H),4.40(br d,J＝2.85Hz,1H),3.48(br s,3H),3.16–2.98(m,4H),2.89(dd,J＝11.62,3.29Hz,1H),2.53-2.46(m,3H),2.32-2.20(m,3H),2.14(br d,J＝4.60Hz,2H),1.48(dt,J＝19.51,9.76Hz,1H),1.12–0.98(m,2H)。
峰-II
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm 8.48(d,J＝5.26Hz,1H),7.76(s,1H),7.68(dd,J＝5.26,1.32Hz,1H),7.40-7.54(m,2H),4.44(br s,1H),3.36-3.69(m,3H),2.99-3.18(m,4H),2.89(dd,J＝11.62,3.29Hz,1H),2.03-2.33(m,4H),1.81-1.52(m,2H),1.01(br s,2H)。
实施例194
合成(4S)-N-(5-甲基吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在30℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(423mg,1.427mmol)且搅拌1h。然后加入Et3N(1.657mL,11.89mmol)和5-甲基吡啶-3-胺(771mg,7.13mmol)并将反应混合物在65℃加热16h。将反应混合物倒入冷水(50mL)并用DCM萃取(2x50ml)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：0-15％MeOH/DCM)，得到(4S)-N-(5-甲基吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.777mmol,45％收率)，其为黄色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc,Rf:0.4)，LCMS(m/z):387.36[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.00(s,1H),8.66(d,J＝5.04Hz,1H),8.47(s,1H),8.16(s,1H),7.99(s,1H),7.71-7.57(m,2H),7.50(d,J＝5.26Hz,1H),7.38(d,J＝7.89Hz,1H),5.70(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.37-3.10(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.07Hz,1H),2.68(s,3H),2.45-2.25(m,4H),2.22–1.98(m,1H)。
实施例195
合成(4S)-N-(苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-5-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)在THF(15mL)中的溶液中加入三光气(353mg,1.189mmol)，然后在27℃搅拌2h，然后在27℃加入苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-5-胺(391mg,2.85mmol)和N-乙基-N-异丙基丙-2-胺(307mg,2.378mmol),加热至50℃，保持16h。使得反应混合物达到室温并将反应混合物倒入饱和NaHCO3溶液中并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用2％甲醇/二氯甲烷洗脱)，得到(4S)-N-(苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-5-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(270mg,26.2％收率)(TLC:洗脱剂，5％甲醇/DCM；Rf＝0.4)，LCMS(m/z):416.30[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.81(s,1H),8.63(d,J＝5.26Hz,1H),7.64-7.59(m,2H),7.49(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),7.37-7.31(m,2H),6.85(dd,J＝8.33,2.19Hz,1H),6.75(d,J＝8.33Hz,1H),5.97-5.92(m,2H),5.73-5.66(m,1H),3.33-3.10(m,3H),3.01(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.65(s,3H),2.32(dddd,J＝14.11,9.84,5.86,4.17Hz,1H),2.09(dt,J＝14.03,6.80Hz,1H)。
实施例196
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(吡啶-2-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在0℃将2.0M盐酸的乙醚溶液(2mL,4.00mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(吡啶-2-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.749mmol)中。将反应混合物在28℃搅拌4h并浓缩，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.1；UV活化的)。粗制化合物用乙醚洗涤(3x5mL)，得到纯的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(2-(吡啶-2-基)乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(296mg,0.675mmol,90％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z)401.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ9.88(t,J＝5.9Hz,1H),8.89(d,J＝6.1Hz,1H),8.66(dd,J＝5.6,1.7Hz,1H),8.40-8.35(m,1H),8.31-8.29(m,1H),8.14(dd,J＝6.2,1.9Hz,1H),8.08(d,J＝7.8Hz,1H),7.95(dd,J＝7.9,4.9Hz,2H),7.74(t,J＝6.7Hz,1H),5.40(dd,J＝5.6,2.9Hz,1H),3.97-3.78(m,2H),3.58-3.26(m,6H),2.84(s,3H),2.32-2.25(m,1H),2.19-2.03(m,1H)。
实施例197
合成(4S)-7-(哌嗪-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(359mg,0.770mmol)在THF(5mL)中的溶液中加入2M HCl的乙醚溶液(1.924mL,3.85mmol)并将反应混合物在35℃搅拌4h，并将反应混合物冷却至0℃，用NaHCO3水溶液中和并用CH2Cl2萃取(2x50mL)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-(哌嗪-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(277mg,0.741mmol,96％收率)，其为灰白色固体(TLC:Rf:0.3；5％MeOH/DCM)，LCMS(m/z):367.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.41(s,1H),9.53(d,J＝1.5Hz,1H),8.24(d,J＝2.5Hz,1H),8.17(dd,J＝2.5,1.5Hz,1H),7.38(d,J＝8.6Hz,1H),6.30(d,J＝8.6Hz,1H),5.62-5.55(m,1H),3.63(t,J＝5.2Hz,4H),3.26-3.17(m,1H),3.17-3.06(m,6H),2.92(dd,J＝11.9,3.3Hz,1H),2.27(dddd,J＝13.7,9.9,6.2,3.8Hz,1H),2.07-1.96(m,2H).
实施例198
合成(4S)-7-(4-甲基哌啶-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)，4-甲基哌啶(376mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中脱气的溶液中加入Cs2CO3(1852mg,5.68mmol)、x-phos(361mg,0.758mmol)和Pd(OAc)2(106mg,0.474mmol)。将反应混合物在110℃搅拌16h，倒入冷水(20mL)中，用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：4％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-(4-甲基哌啶-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.775mmol,40.9％收率)，其为灰白色固体(TLC:Rf:0.4；净EtOAc)，LCMS(m/z):380.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.51(s,1H),9.52(d,J＝1.5Hz,1H),8.23(dd,J＝2.5,0.4Hz,1H),8.20(dd,J＝2.5,1.5Hz,1H),7.33(d,J＝8.6Hz,1H),6.30(d,J＝8.7Hz,1H),5.61(dd,J＝6.1,3.2Hz,1H),4.20(ddd,J＝11.4,3.6,2.1Hz,2H),3.22(dddd,J＝12.3,8.6,3.7,2.2Hz,1H),3.15-3.05(m,2H),3.00-2.86(m,3H),2.26(dddd,J＝13.8,9.9,6.2,3.8Hz,1H),2.04-1.94(m,1H),1.84-1.72(m,2H),1.68-1.60(m,1H),1.33-1.18(m,2H),0.99(d,J＝6.5Hz,3H)。
实施例199
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.833mmol)在甲醇(5mL)中的溶液中加入HCl(3mL,99mmol)并搅拌2h。(TLC系统5％甲醇/DCM.Rf值:0.1)，将反应混合物浓缩，残余物在0℃用饱和NaHCO3溶液碱化。所得固体过滤，干燥，得到粗制化合物，将其用乙醚研磨(10mL)，得到(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(280mg,0.556mmol,66.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):500.26[M+H]+,Rt＝1.74min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.66(s,1H),8.43(s,1H),8.10-7.92(m,2H),7.73(s,1H),7.11-6.84(m,2H),5.52-5.33(m,1H),4.87(br s,1H),4.74-4.46(m,1H),4.34-4.19(m,3H),4.19-3.96(m,1H),3.86-3.68(m,1H),3.43(br d,J＝5.5Hz,2H),3.27-3.15(m,1H),3.14-2.99(m,2H),2.99-2.72(m,1H),2.36-2.08(m,1H),1.93(br dd,J＝6.4,13.8Hz,1H),1.46(t,J＝7.2Hz,3H)。
实施例200
合成(4S)-7-(2,6-二甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将K3PO4(535mg,2.53mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,1.263mmol)&(2,6-二甲基吡啶-3-基)硼酸(248mg,1.642mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(1mL)中的搅拌的溶液中，然后脱气15min并加入x-phos(60.2mg,0.126mmol)，接着加入Pd2(dba)3(57.8mg,0.063mmol)，然后将反应混合物在90℃加热2h 45min，然后使其冷却至室温,通过硅藻土垫过滤，用乙酸乙酯洗涤(10mL×2),从滤液减压除去有机溶剂。将水层用乙酸乙酯萃取(20mL×2)，用水(20mL×2)，盐水(20mL)洗涤，经Na2SO4干燥。真空除去有机溶剂，得到粗制化合物。上述化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用80％乙酸乙酯/己烷洗脱)，得到(4S)-7-(2,6-二甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(330mg,0.848mmol,67.2％收率)，其为灰白色固体(TLC:洗脱剂：100％乙酸乙酯Rf:0.3,UV活化的)，LCMS(m/z):388.28[M+H]+。
1H-NMR(CDCl3,400MHz):δ13.5(s,1H),9.45(s,1H),8.22-8.25(m,1H),8.18-8.20(m,1H),7.77(d,1H,J＝7.6Hz),7.6(d,1H,J＝8Hz),7.08–7.14(m,2H),5.68–5.72(m,1H),3.18-3.34(m,3H),3.01–3.06(m,1H),2.65(s,3H),2.5(s,3H),2.31-2.39(m,1H),2.08-2.15(m,1H)。
实施例201
合成(4S)-7-(2,6-二甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将K3PO4(537mg,2.53mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,1.267mmol)&(2,6-二甲基吡啶-3-基)硼酸(249mg,1.647mmol)在1,4-二噁烷(15mL)和水(1mL)中的搅拌的溶液中，然后脱气15min并先后加入二环己基(2',4',6'-三异丙基-[1,1'-联苯]-2-基)膦(60.4mg,0.127mmol)和Pd2(dba)3(58.0mg,0.063mmol)，然后在100℃加热2h 45min。使反应混合物达到室温，通过硅藻土垫过滤，用乙酸乙酯洗涤(10mL×2)，减压除去滤液的溶剂。将有机化合物用乙酸乙酯萃取(20mL×2)。合并的有机层用水(20mL×2)、盐水(20mL)洗涤，经Na2SO4干燥。将有机溶剂真空除去，得到粗制化合物。上述粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，化合物用90％乙酸乙酯/己烷洗脱)，得到(4S)-7-(2,6-二甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(304mg,0.777mmol,61.3％收率)，其为灰白色固体(TLC:洗脱剂：100％乙酸乙酯Rf:0.4,UV活化的)，LCMS(m/z):387.31[M+H]+。
1H-NMR(CDCl3,400MHz):δ13.13(s,1H),8.33–8.35(m,1H),8.24–8.26(m,1H),8.10–8.14(m,1H),7.6(d,1H,J＝7.6Hz),7.59(d,1H,J＝8Hz),7.19-7.24(m,1H),7.15(d,1H,J＝8Hz H),7.05(d,1H,J＝7.6Hz),5.67–5.71(m,1H),3.35-3.4(m,1H),3.19-3.25(m,2H),3.1–3.36(m,1H),2.6(s,6H),2.29-2.38(m,1H),2.17–2.26(m,1H)。
实施例202
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(6-甲基噻唑并[3,2-b][1,2,4]三唑-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气下在室温搅拌30min的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.189mmol)、三乙胺(0.829mL,5.94mmol)和三光气(212mg,0.713mmol)在四氢呋喃(10mL)中的溶液中滴加6-甲基噻唑并[3,2-b][1,2,4]三唑-2-胺(367mg,2.378mmol)在THF(2mL)中的溶液，持续1min。将反应混合物在65℃搅拌16h，然后冷却至室温。将反应混合物倒入水中并用EtOAc萃取(3×10mL)。然后合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM:Rf-0.1；UV活化的)。粗制化合物经反相柱纯化且用90％(0.1％HCOOH的水溶液)/MeOH洗脱，得到纯的(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(6-甲基噻唑并[3,2-b][1,2,4]三唑-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(390mg,0.892mmol,75％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):433.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.88(s,1H),8.63(d,J＝5.2Hz,1H),7.91(d,J＝1.9Hz,1H),7.69-7.52(m,2H),7.46(d,J＝8.0Hz,1H),6.48(d,J＝1.6Hz,1H),5.75(dd,J＝5.9,3.1Hz,1H),3.35-3.10(m,3H),3.02(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.72(s,3H),2.57(d,J＝1.4Hz,3H),2.40-2.25(m,1H),2.19-2.05(m,1H)。
实施例203
合成(4S)-7-((S)-3-(羟基甲基)吗啉代)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将Cs2CO3(5778mg,17.74mmol)和(S)-吗啉-3-基甲醇(390mg,3.33mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,2.217mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中的搅拌的溶液中，然后用氩气净化25min，然后加入乙酸钯(II)(49.8mg,0.222mmol)和X-phos(211mg,0.443mmol)。将反应混合物在100℃搅拌8h，然后使反应混合物温热至室温。将有机溶剂通过旋转蒸发除去，用水稀释(60mL)并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层用盐水洗涤(50mL)，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制残余物。粗制残余物经柱色谱纯化(硅胶：100-200目，2％甲醇/二氯甲烷作为洗脱剂)，得到(4S)-7-((S)-3-(羟基甲基)吗啉代)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(275mg,0.691mmol,31.2％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM Rf:0.4)，LCMS(m/z):397.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ12.38(s,1H),8.51(d,J＝2.6Hz,1H),8.36-8.24(m,1H),8.16(ddd,J＝8.4,2.7,1.5Hz,1H),7.44-7.16(m,2H),6.25(d,J＝8.6Hz,1H),5.63(dd,J＝6.2,3.2Hz,1H),4.06(d,J＝7.4Hz,2H),3.81(t,J＝2.7Hz,2H),3.69-3.48(m,2H),3.38-3.03(m,4H),2.90(dd,J＝11.8,3.3Hz,1H),2.26(dd,J＝10.1,3.9Hz,1H),2.11-1.87(m,1H),1.26(d,J＝6.6Hz,3H)。
实施例204
合成(4S)-7-((R)-3-甲基吗啉代)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-亚甲基-吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将(R)-3-甲基吗啉(320mg,3.17mmol)和碳酸铯(516mg,1.583mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.583mmol)在1,4-二噁烷(8mL)中的搅拌的溶液中，然后脱气30min。然后在室温将Pd(OAc)2(71.1mg,0.317mmol)和X-phos(755mg,1.583mmol)加至反应混合物且再次脱气15min。将反应混合物在110℃搅拌6h，然后冷却至室温，用水稀释(30mL)，用乙酸乙酯萃取(2X50mL)。合并的有机层用盐水洗涤(20mL)，经硫酸钠干燥，过滤并浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-((R)-3-甲基吗啉代)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(100mg,0.258mmol,16.27％收率)，其为灰白色固体(TLC:Rf0.4,10％MeOH/DCM)，LCMS(m/z):381.26[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ12.38(s,1H),8.51(d,J＝2.6Hz,1H),8.36-8.24(m,1H),8.16(ddd,J＝8.4,2.7,1.5Hz,1H),7.44-7.16(m,2H),6.25(d,J＝8.6Hz,1H),5.63(dd,J＝6.2,3.2Hz,1H),4.06(d,J＝7.4Hz,2H),3.81(t,J＝2.7Hz,2H),3.69-3.48(m,2H),3.38-3.03(m,4H),2.90(dd,J＝11.8,3.3Hz,1H),2.26(dd,J＝10.1,3.9Hz,1H),2.11-1.87(m,1H),1.26(d,J＝6.6Hz,3H)。
实施例205
合成(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.4g,0.794mmol)在二氯甲烷(10mL)中的溶液中加入4M HCl的二噁烷溶液(0.198g,1.589mmol)。然后将反应混合物在35℃搅拌6h。将反应混合物用NaHCO3溶液中和并用DCM萃取(2x30ml)。合并的有机层用水(20mL)、盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥并减压蒸发，获得粗产物。粗制化合物用乙醚(40mL)和戊烷(20ml)研磨，得到纯的产物(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.21g,0.453mmol,65％收率)，其为白色固体(TLC:10％MeOH/乙酸乙酯,Rf:0.2)，LCMS(m/z):464.27[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.99(s,1H),9.33(d,J＝2.19Hz,1H)，9.13(s,1H),8.00(d,J＝7.78Hz,2H),7.97(s,1H),7.64(d,J＝8.11Hz,1H),7.19-7.37(m,2H),5.87(brs,1H),5.73(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.74(dd,J＝10.96,5.70Hz,1H),4.40(dd,J＝10.96,7.45Hz,1H),4.08-4.30(m,1H),3.65-3.90(m,2H),3.10-3.34(m,4H),3.02(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.62(s,3H),2.36(dddd,J＝14.14,9.87,5.81,4.17Hz,1H),2.00-2.22(m,1H)。
实施例206
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶并[3,4-b]吡嗪-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(800mg,2.53mmol)和1-甲基哌嗪(379mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(15mL)中的脱气的溶液中加入碳酸铯(2469mg,7.58mmol)、x-phos(241mg,0.505mmol)和乙酸钯(II)(56.7mg,0.253mmol)。将反应混合物在100℃加热16h并倒入冷水(45mL)中，用乙酸乙酯萃取(2x100mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用2％MeOH/DCM洗脱)，得到(4S)-7-(4-甲基哌嗪-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(268mg,0.693mmol,27.5％收率)，其为黄色固体(TLC:100％乙酸乙酯,Rf＝0.23)，LCMS(m/z):381.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.46(s,2H),9.53(s,1H),8.29-8.12(m,2H),7.36(d,J＝8.55Hz,1H),6.30(d,J＝8.55Hz,2H),5.61(dd,J＝5.92,3.29Hz,2H),3.65-3.63(m,4H),3.27-3.03(m,3H),2.91(dd,J＝11.73,3.40Hz,1H),2.42-2.39(m,1H),2.39(s,3H),2.33-2.14-(m,1H),2.13-1.93(m,1H)。
实施例207
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(5-(三氟甲基)吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向5-(三氟甲基)吡嗪-2-胺(1164mg,7.13mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(1.989mL,14.27mmol)和三光气(706mg,2.378mmol)且搅拌1h。然后加入(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)，然后在密封管中在100℃加热15h。将反应混合物冷却至室温并用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层用水(20mL×2)，盐水(10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(5-(三氟甲基)吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(125mg,0.283mmol,32％收率)，其为灰白色固体(TLC:洗脱剂：5％甲醇/DCM,Rf:0.3)，LCMS(m/z):442.24[M+H]+。
1H-NMR(CDCl3,400MHz):14.1(s,1H),9.7(s,1H),8.66-8.62(m,2H),8.0(s,1H),7.69-7.64(m,2H),7.5(d,J＝8Hz,1H),5.74-5.69(m,1H),3.34-3.16(m,3H),3.08-3.02(m,1H),2.75(s,3H),2.32-2.42(m,1H),2.14-2.06(m,1H)。
实施例208
合成(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-(6-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)，5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-2-(三氟甲基)吡啶(776mg,2.84mmol)和K3PO4(804mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(3mL)中的溶液用氩气在室温脱气15分钟。将X-phos(90mg,0.189mmol)，和Pd2(dba)3(87mg,0.095mmol)加至反应混合物。将反应混合物再脱气15min并在90℃搅拌16h。将反应混合物冷却至28℃，然后通过硅藻土垫过滤并蒸发滤液，得到粗制残余物。粗制残余物用水稀释(20mL)并用乙酸乙酯萃取(2×80mL)。合并的有机层先后用水(20mL)和盐水溶液(10mL)洗涤。有机层经硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，得到棕色固体。(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯,Rf-0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化(中性氧化铝),产物用45-50％乙酸乙酯/己烷洗脱，得到(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-(6-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(360mg,0.824mmol,43.5％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):428.17[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.60(s,1H),9.52(d,J＝1.1Hz,1H),9.28(d,J＝2.2Hz,1H),8.71(dd,J＝8.1,1.97Hz,1H),8.25-8.33(m,2H),7.84(d,J＝8.3Hz,1H),7.67(d,J＝7.9Hz,1H),7.5(d,J＝8Hz,1H),5.70(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.11-3.36(m,3H),2.96-3.11(m,1H),2.22-2.43(m,1H),1.97-2.21(m,1H)。
实施例209
合成(4S)-N-(异喹啉-5-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气下在室温搅拌的(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.750g,2.97mmol)在四氢呋喃(THF)(40mL)中的溶液中加入三乙胺(2.486mL,17.83mmol)和三光气(0.882g,2.97mmol)。将反应混合物在室温搅拌30分钟，然后加入异喹啉-5-胺(1.286g,8.92mmol)。将反应混合物在65℃搅拌16hr，然后将反应混合物冷却至室温并减压浓缩。将残余物分配在水(30mL)和二氯甲烷(100mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用100％二氯甲烷洗脱，得到纯的(4S)-N-(异喹啉-5-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.315g,0.743mmol,25.00％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):423.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.21(s,1H),9.20(s,1H),8.88(d,J＝2.19Hz,1H),8.37(d,J＝7.23Hz,1H),7.94(d,J＝6.14Hz,1H),7.88(dd,J＝8.11,2.41Hz,1H),7.75(d,J＝8.11Hz,1H),7.61-7.69(m,2H),7.47(d,J＝5.92Hz,1H),7.31(d,J＝7.89Hz,1H),7.08(d,J＝7.89Hz,1H),5.77(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.21-3.36(m,3H),3.06(dd,J＝12.06,3.07Hz,1H),2.59(s,3H),2.32-2.43(m,1H),2.17(dt,J＝14.03,7.02Hz,1H。
实施例210
(9S)-4-氯-5-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-1,6,8-三氮杂三环[7.2.1.0{2，7}]十二碳-2，4，6-三烯-8-甲酰胺
在0℃向烟酸(0.644g,5.23mmol在THF(50mL)中的搅拌的溶液中相继加入三乙胺(3.6mL,26.2mmol)和叠氮磷酸二苯酯(2.26mL,10.46mmol)。使反应溶液在室温搅拌2h。加入固体(4S)-8-氯-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1.25g,4.36mmol)，将反应溶液加热至70℃，保持36小时。将反应溶液分配在EtOAc和H2O之间。分离有机层，经Na2SO4干燥,真空浓缩并直接施加至硅胶柱，使用EtOAc/EtOH(3:1)作为洗脱剂，得到(1g,56％)，其为白色固体。将所得固体用Et2O研磨，然后真空干燥,LCMS(m/z):407.4[M+H]+。
1H-NMR(400MHz,CHCl3-d)δppm:d ppm 2.05-2.21(m,1H)2.28-2.50(m,1H)2.71(s,3H)2.97-3.46(m,4H)5.69(dd,J＝5.81,3.03Hz,1H)7.14-7.32(m,1H)7.43-7.58(m,1H)7.69(s,1H)7.94-8.09(m,1H)8.31(dd,J＝4.67,1.39Hz,1H)8.48(d,J＝2.27Hz,1H)8.71(d,J＝5.05Hz,1H)12.64(s,1H)。
实施例211
合成(4S)-7-(2,2-二甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向吡嗪-2-甲酸(350mg,2.82mmol)在THF(15mL)中的溶液中加入叠氮磷酸二苯酯(1164mg,4.23mmol)和DIPEA(2.463mL,14.10mmol)。将反应混合物在氮气下在30℃搅拌2h。加入2,2-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(542mg,1.974mmol)并将反应混合物在65℃搅拌16h。减压除去溶剂。粗物质用水稀释(20mL)并用乙酸乙酯萃取(2×30mL)。合并的有机层用水(10mL),饱和盐水溶液洗涤。有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。粗制化合物经柱色谱纯化(中性氧化铝)产物用10％乙酸乙酯/己烷洗脱。将收集的级分减压浓缩，得到(4S)-7-(2,2-二甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.303mmol,10.74％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):396.3[M+H]+。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ13.40(s,1H),9.56(d,J＝1.2Hz,1H),8.26(d,J＝2.41Hz,1H),8.06-8.22(m,1H),7.38(d,J＝8.8Hz,1H),6.28(d,J＝8.5Hz,1H),5.63(dd,J＝5.7,3.3Hz,1H),3.90(t,J＝5Hz,2H),3.47(s,2H),3.41(t,J＝5Hz,2H),3.04-3.31(m,3H),2.92(dd,J＝11.9,3.18Hz,1H),2.14-2.35(m,1H),1.89-2.12(m,1H),1.36(s,6H)。
实施例212
合成(4S)-7-(6-甲基哒嗪-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,1.263mmol)，3-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)哒嗪(306mg,1.389mmol)和K3PO4(536mg,2.53mmol)在1,4-二噁烷(15mL)和水(2mL)中的脱气的溶液中加入Pd(OAc)2(14.18mg,0.063mmol)和x-phos(60.2mg,0.126mmol)。然后将反应混合物在100℃搅拌8hr，然后使反应混合物冷却至RT并真空蒸发二噁烷。然后将其用水稀释并用DCM萃取(3x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压除去溶剂，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2-3％MeOH/EtOAc)，得到(4S)-7-(6-甲基哒嗪-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(260mg,0.689mmol,54.6％收率)，其为灰白色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc,Rf:0.4)，LCMS(m/z):375.25[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.69(s,1H),9.62-9.53(s,2H),8.38-8.29(m,3H),7.71(d,J＝8.11Hz,1H),7.59(d,J＝8.11Hz,1H),5.72(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H)，3.35-3.15(m,2H)，3.12-3.00(m,2H)，2.90(s,3H)，2.48-2.25(m,1H)，2.11(dt,J＝14.03,6.80Hz,1H)。
实施例213
合成(4S)-N-(6-氟苯并[d]噻唑-2-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气下在室温搅拌的(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.750g,2.97mmol)在四氢呋喃(THF)(40mL)中的溶液中加入三乙胺(2.486mL,17.83mmol)和三光气(0.882g,2.97mmol)。将反应混合物在室温搅拌30分钟，然后在室温加入6-氟苯并[d]噻唑-2-胺(1.500g,8.92mmol)并将反应混合物在65℃搅拌16hr，然后冷却至室温并减压除去溶剂。将所得残余物分配在水(30mL)和EtOAc(100mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用中性氧化铝，以及用100％二氯甲烷洗脱，得到纯的(4S)-N-(6-氟苯并[d]噻唑-2-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.313g,0.700mmol,23.53％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):447.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 14.74(s,1H),9.06(d,J＝2.19Hz,1H),8.43(dd,J＝8.11,2.41Hz,1H),7.75(dd,J＝8.88,4.71Hz,1H),7.66(d,J＝8.11Hz,1H),7.41-7.52(m,3H),7.14(td,J＝8.99,2.63Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.17-3.33(m,3H),3.04(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.68(s,3H),2.32-2.43(m,1H),2.12(dt,J＝14.20,7.04Hz,1H)
实施例214
合成(4S)-7-(2-甲基噻唑-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将氟化铯(767mg,5.05mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(800mg,2.53mmol)、2-甲基-5-(三丁基甲锡烷基)噻唑(1177mg,3.03mmol)和三叔丁基膦(511mg,2.53mmol)在1,4-二噁烷(40mL)中的搅拌的溶液中，脱气15min，加入乙酸钯(II)(11.34mg,0.051mmol)和碘化亚铜(I)(19.24mg,0.101mmol)。将反应混合物再脱气10min，然后在100℃搅拌15hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(50mL)和EtOAc(125mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤。蒸发滤液得到粗物质。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶，用5％MeOH/EtOAc洗脱，得到(4S)-7-(2-甲基噻唑-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(230mg,0.600mmol,23.77％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):380.18[M+H]+。
1H-NMR(CDCl3,400MHz):δ13.30(s,1H),9.53(d,J＝1.6Hz,1H),8.43(s,1H),8.36-8.35(dd,J＝2.4,1.6Hz,1H),8.30(d,J＝2.8Hz 1H),7.53(d,J＝8.0Hz,1H),7.18(d,J＝8.0Hz,1H),5.68(dd,J＝6,3.2Hz,1H),3.28-3.22(m,2H),3.20-3.13(m,1H),3.02-2.98(dd,J＝12.4,3.6Hz,1H),2.78(s,3H),2.35-2.32(m,1H),2.10-2.04(m,1H).
实施例215
合成4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吡啶-2-甲酸甲酯
将磷酸三钾(2.68g,12.63mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(2g,6.31mmol)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-甲酸甲酯(1.994g,7.58mmol)在1,4-二噁烷(60mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min。加入Pd2(dba)3(0.289g,0.316mmol)和X-phos(0.301g,0.631mmol)。将反应混合物再脱气15min，然后在100℃搅拌18hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(50mL)和EtOAc(200mL)之间。分离有机层且真空浓缩，得到粗物质(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf＝0.3；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶，用10％MeOH/EtOAc洗脱，得到4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吡啶-2-甲酸甲酯(780mg,1.806mmol,28.6％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):418.23[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ13.63(s,1H),9.54(d,J＝1.2Hz,1H),8.91-8.89(dd,J＝5.2,0.8Hz,1H),8.68-8.68(dd,J＝2,0.4Hz,1H),8.34-8.29(m,3H),7.69(d,J＝8.0Hz,1H),7.59(d,J＝8.0Hz,1H),4.05(s,3H),3.34-3.16(m,3H),3.07-3.03(dd,J＝12.4,3.2Hz,1H),2.41-2.33(m,1H),2.15-2.07(m,1H)。
实施例216
合成(4S)-7-(2-(二氟甲基)吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将磷酸三钾(670mg,3.16mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.579mmol)、(2-(二氟甲基)吡啶-4-基)硼酸(328mg,1.894mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(1.667mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(145mg,0.158mmol)，和X-phos(75mg,0.158mmol)。将反应混合物再脱气15min并将反应混合物在微波下在100℃搅拌1hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf＝0.3；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶，并用5-10％MeOH/EtOAc洗脱，得到纯的(4S)-7-(2-(二氟甲基)吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(112mg,0.273mmol,17.27％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):410.17[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ13.63(s,1H),9.54(s,1H),8.79(d,J＝5.2Hz,1H),8.40(s,1H),8.32(d,J＝3.2Hz,2H),8.06(dd,J＝5.2,0.8Hz,1H),7.68(d,J＝7.6Hz,1H),7.54(d,J＝8Hz,1H),6.90-6.62(t,J＝55.2Hz,1H),5.73-5.71(dd,J＝5.6,2.8Hz,1H),3.33-3.16(m,3H),3.06-3.03(dd,J＝12.0,3.2Hz,1H),2.41-2.33(m，1H),2.14-2.07(m,1H)。
实施例217
合成(4S)-7-(5-氟-2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、5-氟-2-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶(674mg,2.84mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(3.33mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，加入Pd2(dba)3(173mg,0.189mmol)，和X-phos(90mg,0.189mmol)。将反应混合物再脱气15min，并将反应混合物在微波中在100℃搅拌1hr。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc；Rf＝0.3；UV活化的)。粗产物用甲醇和乙醚洗涤，得到(4S)-7-(5-氟-2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(317mg,0.788mmol,41.6％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):392.20[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ13.54(s，1H),9.57(d,J＝1.6Hz,1H),8.45(d,J＝3.2Hz,1H),8.31(d,J＝2.8Hz,1H),8.27-8.26(t,J＝1.6Hz,1H),8.09(d,J＝6.8Hz,1H),7.66-7.62(t,J＝8Hz,2H),5.73-5.71(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.34-3.17(m,3H),3.06-3.02(dd,J＝12.0,3.2Hz,1H),2.71(s,3H),2.40-2.33(m,1H),2.13-2.06(m,1H)。
实施例218
合成4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吡啶-2-甲酸甲酯:
在0℃将NaBH4(136mg,3.59mmol)加至4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吡啶-2-甲酸甲酯(600mg,1.437mmol)在THF(100mL)中的溶液中。将反应混合物在28℃搅拌8h。将溶剂通过旋转蒸发除去，并将残余物分配在乙酸乙酯(40mL)和水(20mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥并过滤；将滤液真空蒸发，得到粗物质。将粗物质通过制备型HPLC纯化，得到(4S)-7-(2-(羟基甲基)吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(135mg,0.345mmol,24.00％)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):390.22[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ13.66(s,1H),9.60(s,1H),8.68(d,J＝5.2Hz,1H),8.33(s,2H),8.19(s,1H)7.74-7.72(dd,J＝5.2,1.6Hz,1H),7.67(d,J＝8.0Hz,1H),7.52(d,J＝8.0Hz,1H),5.73-5.70(dd,J＝6.0,3.6Hz,1H),4.93(s,2H),3.31-3.16(m,3H),3.06-3.02(dd,J＝12.4,3.2Hz,1H),2.38-2.35(m,1H),2.12-2.08(t,J＝7.6Hz,1H)。
实施例219
合成(4S)-7-(6-氰基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-甲腈(523mg,2.273mmol)和K3PO4(804mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(20mL)、水(3mL)中的溶液用氩气脱气20min，加入X-Phos(90mg,0.189mmol)，三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(87mg,0.095mmol)，再次用氩气脱气10min。将反应混合物在100℃搅拌16h，然后冷却至室温。将反应混合物经硅藻土过滤，然后滤液用水稀释并用EtOAc萃取(3×15mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.1；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用30％EtOAc/石油醚洗脱，得到纯的(4S)-7-(6-氰基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(220mg,0.568mmol,30.0％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):385.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.54(s,1H)9.54(d,J＝1.32Hz,1H)9.34(dd,J＝2.30,0.77Hz,1H)8.66(dd,J＝8.11,2.41Hz,1H)8.35-8.30(m,2H)7.86(dd,J＝8.11,0.88Hz,1H)7.70(d,J＝7.89Hz,1H)7.50(d,J＝8.11Hz,1H)5.71(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H)3.35-3.14(m,3H)3.09-3.02(m,1H)2.43-2.32(m,1H)2.16-2.05(m,1H)。
实施例220
合成(4S)-N-(5-乙基吡嗪-2-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气下在室温搅拌30min的(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)，三光气(706mg,2.378mmol)和三乙胺(1.989mL,14.27mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的溶液中加入5-乙基吡嗪-2-胺(879mg,7.13mmol)。将反应混合物在70℃搅拌16h，然后冷却至室温，然后将反应混合物倒入水中并用EtOAc萃取(3×15mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.1；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用30％EtOAc/石油醚洗脱，得到纯的(4S)-N-(5-乙基吡嗪-2-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(383mg,0.953mmol,40.1％收率)，LCMS(m/z):402.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.65(s,1H)9.41(d,J＝1.53Hz,1H)9.11(d,J＝2.19Hz,1H)8.41(dd,J＝8.22,2.52Hz,1H)8.22(d,J＝1.32Hz,1H)7.61(d,J＝7.89Hz,1H)7.40(d,J＝8.11Hz,1H)7.32(d,J＝8.11Hz,1H)5.70(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H)3.34-3.13(m,3H)3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H)2.83(q,J＝7.53Hz,2H)2.64(s,3H)2.40-2.34(m,1H)2.15-2.03(m,1H)1.33(t,J＝7.56Hz,3H)。
实施例221
合成(4S)-N-(6-异丙氧基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将三乙胺(1.326mL,9.51mmol)和三光气(470mg,1.585mmol)加至(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.585mmol)在四氢呋喃(THF)(8mL)中的搅拌的溶液中且搅拌30min，然后将6-异丙氧基吡嗪-2-胺(486mg,3.17mmol)加至反应混合物，然后搅拌至80℃，保持16h。将反应混合物冷却至室温，用水稀释(50mL)，用乙酸乙酯萃取(2x40mL)，用盐水洗涤(30mL)。分离有机层，经硫酸钠干燥，过滤并浓缩。残余物经快速色谱纯化，使用硅胶(100-200目),2％甲醇/DCM，得到(4S)-N-(6-异丙氧基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(60mg,0.132mmol,8.33％收率)，其为灰白色固体(TLC:Rf:0.4,5％甲醇/DCM)，LCMS(m/z):432.27[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 1.24(dd,J＝13.15,6.14Hz,6H)2.09(dt,J＝14.14,6.96Hz,1H)2.22-2.45(m,1H)2.65(s,3H)3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H)3.13-3.38(m,3H)5.10(dt,J＝12.44,6.17Hz,1H)5.71(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H)7.27-7.46(m,1H)7.51-7.68(m,2H)7.73(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H)7.88(s,1H)8.58(d,J＝5.26Hz,1H)9.03(s,1H)13.04(s,1H)。
实施例222
合成(4S)-7-(6-氰基-5-甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.579mmol)、3-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-甲腈(501mg,2.052mmol)和K3PO4(1.005g,4.74mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(3mL)中脱气的溶液中加入X-phos(75mg,0.158mmol)和Pd(OAc)2(17.72mg,0.079mmol)。将反应混合物再脱气15min并将反应混合物在90℃搅拌16h。将反应混合物冷却至28℃，并通过硅藻土垫过滤并将滤液蒸发，得到残余物。将残余物用水稀释(20mL)并用乙酸乙酯萃取(2×70mL)。合并的有机层先后用水(10mL)和盐水溶液(10mL)洗涤。有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制物。(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯,Rf-0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝，产物用55-60％乙酸乙酯/己烷洗脱，得到纯的(4S)-7-(6-氰基-5-甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.835mmol,52.9％收率)，其为淡黄色固体，LCMS(m/z):399.22[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.61(s,1H),9.58(d,J＝1.5Hz,1H),9.07(d,J＝2.2Hz,1H),8.63-8.69(m,1H),8.33(d,J＝2.8Hz,1H),8.28(dd,J＝1.4,2.6Hz,1H),7.69(d,J＝8.1Hz,1H),7.52(m,J＝8.1Hz,1H),5.72(dd,J＝5.9,3.07Hz,1H),3.13-3.36(m,3H),3.05(dd,J＝12.28,3.3Hz,1H),2.73(S,3H),2.25-2.44(m,1H),2.04-2.24(m,1H)。
实施例223
合成(4S)-7-(2-甲基-6-(三氟甲基)吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,1.263mmol)、2-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-6-(三氟甲基)吡啶(471mg,1.642mmol)和K3PO4(804mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(3mL)中的脱气的溶液中加入X-phos(60.2mg,0.126mmol)和Pd2(dba)3(57.8mg,0.063mmol)。将反应混合物再脱气15min并将反应混合物在90℃搅拌16h。将反应混合物冷却至28℃，并通过硅藻土垫过滤并蒸发滤液，得到残余物。将残余物用水稀释(20mL)并用乙酸乙酯萃取(2×70mL)。合并的有机层先后用水(10mL)和盐水溶液(10mL)洗涤。有机层经硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯,Rf＝0.4；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化(中性氧化铝)，将产物用45-50％乙酸乙酯/己烷洗脱，得到(4S)-7-(2-甲基-6-(三氟甲基)吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(318mg,0.719mmol,56.9％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):442.24[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.63(s,1H),9.57(d,J＝1.3Hz,1H),8.22-8.40(m,2H),8.14(s,1H),8.11(s,1H),7.69(d,J＝8.1Hz,1H),7.53(d,J＝7.9Hz,1H),5.73(dd,J＝5.9,3.0Hz,1H),3.12-3.37(m,3H),2.95-3.12(m,1H),2.79(S,3H),2.25-2.46(m,1H),2.00-2.21(m,1H)。
实施例224
合成(4S)-N-(吡啶-3-基)-7-(6-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.583mmol)、5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-2-(三氟甲基)吡啶(562mg,2.059mmol)和K3PO4(1008mg,4.75mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(3mL)中脱气的溶液中加入X-phos(75mg,0.158mmol)和Pd2(dba)3(72.5mg,0.079mmol)。将反应混合物再脱气15min并将反应混合物在90℃搅拌16h。将反应混合物冷却至28℃，并通过硅藻土垫过滤并蒸发滤液，得到粗制残余物。粗制残余物用水稀释(20mL)并用乙酸乙酯萃取(2×70mL)。合并的有机层先后用水(10mL)和盐水溶液(10mL)洗涤。有机层经硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，得到棕色固体(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯,Rf-0.4；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝，将产物用35-40％乙酸乙酯/己烷洗脱，得到(4S)-N-(吡啶-3-基)-7-(6-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.924mmol,58.3％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):427.20[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ12.79(s,1H),9.16(d,J＝1.9Hz,1H),8.54(d,J＝2.4Hz,1H),8.32(dd,J＝1.2,4.8Hz,1H),8.29(dd,J＝2,8.4Hz,1H),7.99-8.19(m,1H),7.87(d,J＝8.3Hz,1H),7.69(d,J＝7.6Hz,1H),7.38(d,J＝7.9Hz,1H),7.28-7.30(m,1H),5.71(dd,J＝5.8,3.2Hz,1H),3.12-3.36(m,3H),2.94-3.12(m,1H),2.25-2.43(m,1H),2.00-2.23(m,1H)。
实施例225
合成(4S)-7-(2,5-二甲基吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
将Pd2(dba)3(0.087g,0.095mmol)和X-phos(0.018g,0.047mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.3g,0.947mmol)，1-乙基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(0.316g,1.421mmol)和磷酸二氢钾(0.258g,1.894mmol)在1,4-二噁烷(5mL):水(1mL)中的脱气(氩气)的溶液中。将反应混合物再脱气10min并在90℃搅拌15h。将反应混合物冷却至28℃，然后通过硅藻土垫过滤。滤液用水(50mL)和乙酸乙酯(50mL)稀释。分离有机层并用水和盐水洗涤。有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc；Rf-0.35UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用75％乙酸乙酯/己烷洗脱，得到(4S)-7-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.26g,0.688mmol,72.6％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):377.30[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ14.15(s,1H),9.60(d,J＝1.53Hz,1H),8.56(s,1H),8.22-8.30(m,2H),8.07(s,1H),7.50(d,J＝7.89Hz,1H),7.14(d,J＝7.89Hz,1H),5.66(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.28(q,J＝7.38Hz,2H),3.11-3.38(m,3H),2.97-3.07(m,1H),2.32(dddd,J＝14.03,9.98,6.03,3.95Hz,1H),1.97-2.13(m,1H),1.60(d,J＝7.20Hz,3H)。
实施例226
合成(4S)-7-(6-(二氟甲氧基)吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将Pd2(dba)3(0.087g,0.095mmol)和X-phos(0.018g,0.047mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.3g,0.947mmol)、2-(二氟甲氧基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶(0.385g,1.421mmol)和磷酸二氢钾(0.258g,1.894mmol)在1,4-二噁烷(5mL):水(1mL)中脱气的溶液中。将反应混合物再脱气10min并在90℃搅拌15h。将反应混合物冷却至28℃，然后通过硅藻土垫过滤。滤液用水(50mL)和乙酸乙酯(50mL)稀释。分离有机层并用水和盐水洗涤。有机层经无水硫酸钠干燥，过滤，且将滤液蒸发得到粗制化合物(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf-0.4UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用75％乙酸乙酯/己烷洗脱，得到(4S)-7-(6-(二氟甲氧基)吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.210g,0.493mmol,52.1％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):426.22[M+H]+。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ13.70(s,1H),9.54(d,J＝1.53Hz,1H),8.81(dd,J＝2.63,0.66Hz,1H),8.57(dd,J＝8.55,2.63Hz,1H),8.27-8.32(m,2H),7.74(s,1H),7.63(d,J＝8.11Hz,1H),7.37-7.75(m,1H),7.06(dd,J＝8.55,0.66Hz,1H),5.70(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.13-3.33(m,3H),3.03(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.29-2.41(m,1H),2.07-2.13(m,1H)。
实施例227
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(2-(((S)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(S)-2-((四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-胺(862mg,4.76mmol)、三光气(423mg,1.427mmol)在THF(15mL)中的溶液中加入DIPEA(2.077mL,11.89mmol)和(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)。将反应混合物在80℃搅拌16h，然后将THF减压蒸发，残余物用水稀释并用DCM萃取(2x25mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压蒸发，得到粗制化合物。使用制备型HPLC将粗制化合物纯化，得到(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(2-(((S)-四氢呋喃-3-基)氧基)嘧啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(195mg,0.421mmol,17.72％收率)，其为白色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc,Rf:0.4)，LCMS(m/z):460.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.67(s,1H),9.16(d,J＝2.19Hz,1H),8.38(d,J＝5.70Hz,1H),8.34-8.07(m,1H),7.80(d,J＝5.70Hz,1H),7.63(d,J＝7.89Hz,1H),7.39(d,J＝8.11Hz,1H),7.33-7.23(m,1H),5.76-5.58(m,1H),4.03–3.83(m,4H),3.35-3.10(m,3H),2.49-2.24(m,1H),2.23-2.00(m,3H)。
实施例228
合成(4S)-7-(2-甲基哌嗪-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向3-甲基-4-((4S)-5-(吡嗪-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(397mg,0.826mmol)在THF(5mL)中的搅拌的溶液中加入2M HCl的乙醚溶液(2.065mL,4.13mmol)并将反应混合物在35℃搅拌4h。将反应混合物用NaHCO3水溶液中和并用CH2Cl2萃取(3x50mL)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经制备型HPLC纯化，得到(4S)-7-(2-甲基哌嗪-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(270mg,0.710mmol,85％收率)，其为灰白色固体(TLC:5％MeOH/DCM,Rf:0.3)，LCMS(m/z):381[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.36-13.49(m,1H),9.39(m,1H),8.41-8.22(m,2H),7.44-7.29(m,1H),6.41(dd,J＝8.77,2.63Hz,1H),5.44(dd,J＝5.26,2.63Hz,1H),4.42-4.25(m,1H),3.93-3.68(m,1H),3.16–2.98(m,4H),2.90-2.73(m,3H),2.69-2.53(m,1H),2.37-2.27(m,2H),2.26-2.10(m,1H),1.99-1.79(m,1H),1.12(dd,J＝6.58,3.95Hz,3H)。
实施例229
合成(4S)-7-(3-甲基哌嗪-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温在氢气气氛下(气囊压力)向(4S)-7-(4-苄基-3-甲基哌嗪-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.956mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入乙酸(0.027mL,0.478mmol)和10％氢氧化钯/炭(67.1mg,0.096mmol)并将反应混合物在35℃搅拌4h。反应完成后，将反应混合物经硅藻土垫过滤,将滤液真空蒸发，得到粗产物。粗制混合物经制备型HPLC纯化，得到(4S)-7-(3-甲基哌嗪-1-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(280mg,0.736mmol,76％收率)，其为淡棕色固体(TLC:Rf:20％MeOH/DCM,0.4)，LCMS(m/z):381.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.43(s,1H),9.55(d,J＝1.53Hz,1H),8.24(d,J＝2.63Hz,1H),8.09-8.20(m,2H),7.36(d,J＝8.55Hz,1H),6.30(d,J＝8.55Hz,1H),5.62(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.20(d,J＝12.06Hz,1H),3.95(d,J＝11.84Hz,1H),3.08–2.87(m,4H)3.25-3.08(m,4H),2.57(ddd,J＝12.33,10.25,2.19Hz,1H),2.27(dddd,J＝13.92,9.98,6.14,3.73Hz,1H),2.00(dt,J＝14.41,7.37Hz,1H),1.21(d,J＝6.14Hz,3H)。
实施例230和实施例231
(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-((±)-2-(三氟甲基)吗啉代)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(2g,6.31mmol)和2-(三氟甲基)吗啉(1.469g,9.47mmol)在1,4-二噁烷(30mL)中脱气的溶液中加入碳酸铯(6.17g,18.94mmol)、x-phos(1.204g,2.53mmol)和乙酸钯(II)(0.284g,1.263mmol)。将反应混合物在密封管中在100℃搅拌16h。将反应混合物倒入冷水(80mL)并用乙酸乙酯萃取(3x100mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％MeOH/CH2Cl2)，得到(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-((±)-2-(三氟甲基)吗啉代)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺的对映异构体的混合物。将混合物经手性制备型SFC分离(条件：(纤维素-2(250×30)mm,55.0％(100％MeOH)，90.0g/min,100.0巴，42nm,8.5min))，得到峰-I(最快洗脱物：320mg,0.736mmol,42％收率)，和峰-II(最慢洗脱物：305mg,0.701mmol,40.5％收率)，其为灰白色固体(TLC：净EtOAc,Rf:-0.21)，LCMS(m/z):436.25[M+H]+。
最快洗脱的峰:1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.19(s,1H),9.52(s,1H)，8.25(d,J＝2.41Hz,1H)，8.21-8.09(m,1H),7.43(d,J＝8.33Hz,1H),6.35(d,J＝8.55Hz,1H),5.64(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.21(dd,J＝11.84,1.97Hz,1H),4.15-4.00(m,1H),4.00-3.77(m,3H),3.26-3.04(m,5H),3.04–2.82(m,1H),2.28(dddd,J＝13.95,10.00,6.19,3.84Hz,1H),2.07–1.92(m,1H)。
最慢洗脱的峰:1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.20(s,1H),9.52(d,J＝1.53Hz,1H),8.26(d,J＝2.41Hz,1H),8.16(dd,J＝2.41,1.53Hz,1H),7.43(d,J＝8.55Hz,1H),6.35(d,J＝8.55Hz,1H),5.63(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.21(d,J＝12.06Hz,1H),4.08(ddd,J＝10.69,6.19,2.85Hz,1H),4.00–3.92(m,2H),3.84(td,J＝11.56,2.96Hz,1H),3.26-3.07(m,5H),3.07–2.82(m,1H),2.43-2.24(m,1H),2.21–1.95(m,1H)。
实施例232
合成((R)-2-甲基吗啉代)((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮盐酸盐
在0℃将1.0M盐酸的二噁烷溶液(1.6mL)加至(R)-2-甲基吗啉代)((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮(0.21g,0.544mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物蒸发，得到粗制化合物。粗制化合物用乙醚研磨(3x5mL)，得到纯的((R)-2-甲基吗啉代)((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮盐酸盐(105mg,0.253mmol,45％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z):380.25[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ8.86(br d,J＝5.92Hz,1H),8.41(br s,1H),8.28(brs,1H),7.82-8.07(m,2H),4.64(br s,1H),3.23-4.11(m,9H),2.99-3.14(m,1H),2.53-2.87(m,4H),2.19-2.43(m,2H),0.89-1.15(m,3H)
实施例233
合成(4S)-7-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,1.267mmol)，磷酸钾(537mg,2.53mmol)和(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)硼酸(291mg,1.900mmol)在1,4-二噁烷(9mL)和水(1mL)的混合物中的脱气的溶液中加入X-Phos(60.4mg,0.127mmol)和Pd(OAc)2(14.22mg,0.063mmol)，然后在100℃加热16h。使反应混合物达到室温，有机溶剂通过旋转蒸发除去并用水稀释(50mL)，用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层用盐水洗涤(50mL)，经无水Na2SO4干燥并浓缩，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：03％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.383mmol,30.2％收率)，其为灰白色固体(TLC:Rf0.4,10％MeOH/DCM)，LCMS(m/z):389.22[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm12.92(s,1H),8.57(d,J＝2.63Hz,1H),，8.06-8.32(m,2H),7.62(d,J＝7.89Hz,1H),7.48(d,J＝7.02Hz,1H),7.25-7.32(m,2H),6.95(d,J＝1.75Hz,1H),6.63(dd,J＝7.02,1.97Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.62(s,3H),3.19-3.39(m,2H),3.15(d,J＝12.06Hz,1H),2.84-3.09(m,1H),2.19-2.39(m,1H),2.05-2.19(m,1H)。
实施例234
合成((S)-2-甲基吗啉代)((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮盐酸盐
在0℃将1.0M盐酸的二噁烷溶液(1.74mL)加至(S)-2-甲基吗啉代)(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮(0.22g,0.580mmol)在甲醇(5mL)中搅拌的溶液中。将反应混合物在28℃搅拌4h。将反应混合物蒸发，得到粗制化合物。粗制化合物用乙醚研磨(3x5mL)，得到纯的((S)-2-甲基吗啉代)((4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮盐酸盐(110mg,0.265mmol,45％收率)，其为黄色固体，LCMS(m/z):380.25[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ8.86(d，J＝6.36Hz,1H),8.38-8.45(m,1H),8.24-8.34(m,1H),7.86-7.99(m,2H),4.57-4.64(m,1H),4.07(brd,J＝10.30Hz,1H)，3.35-3.85(m,10H),3.07(br t,J＝12.06Hz,1H),2.81(s,4H),2.39(s,2H),0.96-1.17(m,3H)。
实施例235
合成(4S)-N-7-二(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.8g,3.17mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(0.565g,1.902mmol)且搅拌30min。然后在室温加入2-甲基吡啶-4-胺(0.686g,6.34mmol)和DIPEA(1.661mL,9.51mmol)。将反应混合物在80℃加热15h。将THF减压蒸发并用水稀释(15mL)并用DCM萃取(2x20ml)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化，得到(4S)-N-7-二(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.31mmol,22％)，其为白色固体(TLC:10％MeOH/EtOAc,Rf:0.4)，LCMS(m/z):387.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.15(s,1H),8.68(d,J＝5.26Hz,1H)，8.36(d,J＝5.48Hz,1H),7.70-7.56(m,1H),7.56-7.47(m,1H)，7.34-7.42(m,2H),7.31-7.25(m,2H),5.68(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.20-3.11(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.63(s,3H),2.52(s,3H),2.43-2.25(m,1H),2.15-2.03(m,1H)。
实施例236
合成(4S)-7-(4,6-二甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,1.267mmol)，2,4-二甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶(591mg,2.53mmol)和Cs2CO3(1238mg,3.80mmol)在1,4-二噁烷(9mL)和水(1mL)的混合物中脱气的溶液中加入Pd(OAc)2(14.22mg,0.063mmol)和X-Phos(60.4mg,0.127mmol)，然后在100℃加热16h。使反应混合物达到室温，有机溶剂通过旋转蒸发除去并用水稀释(50mL)，用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层用盐水洗涤(50mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，获得粗产物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-(4,6-二甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(115mg,0.295mmol,23.30％收率)，其为灰白色固体(TLC:Rf:0.4,10％MeOH/DCM)，LCMS(m/z):387.25[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.07(br s,1H),8.51(s,1H),8.24(brd,J＝4.17Hz,1H),8.18-7.97(m,1H),7.61(br d,J＝7.67Hz,1H),7.34-7.16(m,2H),7.13(m,1H),5.68(br d,J＝2.19Hz,1H),3.38-3.11(m,3H),3.11-2.89(m,1H),2.60(s,3H),2.36(s,4H)2.30-2.03(m,1H),1.36-1.12-(m,1H)。
实施例237
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-新戊基-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-亚甲基苯并[b][1,4]二氮杂(250mg,0.991mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(176mg,0.594mmol)且搅拌30min。然后将DIPEA(0.519mL,2.97mmol)和2,2-二甲基丙-1-胺(130mg,1.486mmol)加至上述反应混合物，然后在80℃搅拌16h。使反应混合物温热至室温，用水稀释(60mL)并用乙酸乙酯萃取(3x50mL)。合并的有机层用盐水洗涤(60mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，获得粗产物。粗物质经快速柱色谱纯化(硅胶100-200目，洗脱剂：2％MeOH/DCM)，得到(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-新戊基-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(163mg,0.441mmol,44.5％收率)，其为淡黄色固体(TLC:Rf:0.4,10％MeOH/DCM)，LCMS(m/z):366.29[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.45(br s,1H),8.88(s,1H),7.93(br d,J＝7.89Hz,1H),7.54(d,J＝7.89Hz,1H),7.34-7.11(m,2H),5.77-5.51(m,1H)，3.33-3.14(m,5H),2.95(brdd,J＝11.84,3.07Hz,1H),2.61(s,3H),2.35-2.18(m,1H),2.18-1.89(m,1H),0.90(s,9H)。
实施例238
合成(4S)-N-(6-甲基吡嗪-2-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向在氮气下在室温搅拌30min的(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.378mmol)、三光气(706mg,2.378mmol)和三乙胺(1.989mL,14.27mmol)在四氢呋喃(15mL)中的溶液中加入6-甲基吡嗪-2-胺(778mg,7.13mmol)。将反应混合物在70℃搅拌16h，然后冷却至室温。将反应混合物倒入水中并用EtOAc萃取(3×15mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.1；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用30％EtOAc/石油醚洗脱，得到纯的(4S)-N-(6-甲基吡嗪-2-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(151mg,0.389mmol,16.38％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):388.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.79(s,1H)9.33(s,1H)9.10(d,J＝2.41Hz,1H)8.55(dd,J＝8.11,2.41Hz,1H)8.19(s,1H)7.62(d,J＝7.89Hz,1H)7.43(d,J＝7.89Hz,1H)7.31(d,J＝8.11Hz,1H)5.70(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H)3.36-3.14(m,3H)3.02(dd,J＝11.95,3.40Hz,1H)2.65(s,3H)2.56(s,3H)2.42-2.32(m,1H)2.18-2.01(m,1H)。
实施例239
合成(4S)-7-(6-环丙基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向用氩气脱气20min的(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.894mmol)、2-环丙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-3-(三氟甲基)吡啶(mg，mmol)和K3PO4(804mg,3.79mmol)在1,4-二噁烷(20mL)、水(3mL)中的溶液中加入X-Phos(90mg,0.189mmol)，三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(87mg,0.095mmol)，再次用氩气脱气10min。将反应混合物在100℃搅拌16h，然后冷却至室温。将反应混合物经硅藻土过滤，然后滤液用水稀释并用EtOAc萃取(3×15mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.2；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用30％EtOAc/石油醚洗脱，得到纯的(4S)-7-(6-环丙基-5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(380mg,0.813mmol,42.85％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):468.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.66(s,1H)9.51(d,J＝1.53Hz,1H)9.08(d,J＝1.97Hz,1H)8.58(d,J＝2.19Hz,1H)8.31-8.24(m,2H)7.64(d,J＝7.89Hz,1H)7.38(d,J＝7.89Hz,1H)5.71(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H)3.34-3.14(m,3H)3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H)2.47-2.30(m,2H)2.15-2.04(m,1H)1.33-1.28(m,2H)1.16-1.10(m,2H)。
实施例240
合成(4S)-7-(2-环丙基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在0℃向吡嗪-2-甲酸(550mg,4.43mmol)在THF(10mL)的溶液中加入叠氮磷酸二苯酯(2439mg,8.86mmol)和TEA(3.09mL,22.16mmol)并在室温搅拌2h。向该反应混合物中加入2-环丙基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(888mg,3.10mmol)，然后在100℃搅拌16h。将反应混合物用水稀释并用乙酸乙酯萃取(2x25ml)。合并的有机层用盐水溶液洗涤，经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，用2％MeOH/CH2Cl2洗脱)，得到化合物(4S)-7-(2-环丙基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(90mg,0.219mmol,4.95％收率)，其为淡棕色固体。(TLC系统:5％甲醇/DCM.Rf值：0.3)，LCMS(m/z):408.33[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.32(s,1H),9.37(d,J＝1.32Hz,1H),8.43-8.13(m,2H),7.41(d,J＝8.55Hz,1H),6.56(d,J＝8.77Hz,1H),5.56-5.28(m,1H),4.13-3.73(m,3H),3.55(td,J＝11.56,2.52Hz,1H),3.16-2.63(m,7H),2.31-1.99(m,1H),1.85(dt,J＝13.92,6.85Hz,1H),1.08-0.76(m,1H),0.59-0.12(m,4H)
实施例241
合成(4S)-7-(4,6-二甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将Cs2CO3(1237mg,3.797mmol)和2,4-二甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶(590mg,2.531mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,1.265mmol)在1,4-二噁烷(9mL)和水(1mL)的混合物中的溶液中。将反应混合物用氩气净化30min。将PdOAc2(28.3mg,0.126mmol)和X-Phos(120.6mg,0.253mmol)加至上述反应混合物，在100℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩并将残余物分配在水(40mL)和EtOAc(80mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，2％甲醇/二氯甲烷作为洗脱剂，得到(4S)-7-(4,6-二甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(135mg,0.332mmol,52.5％收率)，其为灰白色固体。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM Rf:0.4；UV活化的)，LCMS(m/z):388.28[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.37(s,1H),9.45(d,J＝1.32Hz,1H),8.54(s,1H),8.22(d,J＝2.63Hz,1H),8.16-8.20(m,1H),7.62(d,J＝7.67Hz,1H),7.12(s,1H),7.07(d,J＝7.89Hz,1H),5.71(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),3.15-3.36(m,3H),3.03(dd,J＝12.17,3.40Hz,1H),2.59(s,3H),2.46(s,3H),2.28-2.38(m,1H),2.04-2.17(m,1H)。
实施例242
合成(4S)-N-(3,3-二氟环丁基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将三光气(212mg,0.714mmol)分批缓慢加入至(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.190mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的搅拌的溶液中。将该反应混合物搅拌30min。将DIPEA(0.623mL,3.57mmol)和3,3-二氟环丁基胺(191mg,1.785mmol)加至上述反应混合物，在80℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩并将残余物分配在水(40mL)和EtOAc(80mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，2％甲醇/二氯甲烷作为洗脱剂，得到(4S)-N-(3,3-二氟环丁基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(113mg,0.283mmol,28.5％收率)，其为灰白色固体。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM Rf:0.4；UV活化的)，LCMS(m/z):386.27[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.93(br d,J＝5.92Hz,1H),8.88(d,J＝2.19Hz,1H),7.94(dd,J＝8.11,2.41Hz,1H),7.56(d,J＝7.67Hz,1H),7.31-7.22(m,2H),5.59(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.29(br s,1H),3.00-3.29(m,5H),2.95(dd,J＝11.95,3.40Hz,1H),2.66-2.50(m,5H),2.31-2.21(m,1H),2.06-1.98(m,1H)
实施例243
合成(4S)-7-(1-甲基-6-氧代-1,6-二氢吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将磷酸三钾(804mg,3.79mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.579mmol)和1-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2(1H)-酮(445mg,1.894mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(2.000mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气10min，然后加入Pd2(dba)3(72.3mg,0.079mmol)，和X-phos(75mg,0.158mmol)。将反应混合物再脱气15min。将反应混合物在微波中在100℃搅拌1小时。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和乙酸乙酯(2×15mL)之间。分离乙酸乙酯层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用(100-200目)硅胶并用2％MeOH/EtOAc洗脱，得到(4S)-7-(1-甲基-6-氧代-1,6-二氢吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(330mg,0.840mmol,53.2％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):390.26[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.78(s,1H),9.61(d,J＝1.53Hz,1H),8.57(d,J＝2.63Hz,1H),8.33(d,J＝2.63Hz,1H),8.22(dd,J＝2.52,1.64Hz,1H),7.88(dd,J＝9.54,2.74Hz,1H),7.57(d,J＝7.89Hz,1H),7.18(d,J＝8.11Hz,1H),6.69(d,J＝9.43Hz,1H),5.69(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.78(s,3H),3.12-3.30(m,3H),3.01(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.28-2.41(m,1H),2.00-2.13(m,1H)
实施例244
合成(4S)-7-(1-甲基-6-氧代-1,6-二氢吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将磷酸三钾(672mg,3.17mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.583mmol)，和1-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2(1H)-酮(447mg,1.900mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(2.000mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气10min，然后加入Pd2(dba)3(72.5mg,0.079mmol)和X-phos(75mg,0.158mmol)。将反应混合物再脱气15min。将反应混合物在微波中在100℃搅拌1小时。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(10mL)和EtOAc(25mL)之间。分离EtOAc层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，将产物用2％MeOH/乙酸乙酯洗脱，得到(4S)-7-(1-甲基-6-氧代-1,6-二氢吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(272mg,0.679mmol,42.9％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):389.27[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.93(s,1H),8.61(d,J＝2.41Hz,1H),8.33(dd,J＝4.71,1.43Hz,1H),8.05-8.20(m,1H),7.74-7.87(m,2H),7.57(d,J＝7.89Hz,1H),7.22-7.33(m,1H),7.09(d,J＝7.89Hz,1H),6.65-6.82(m,1H),5.67(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.64(s,3H),3.08-3.28(m,3H),3.00(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.33(qd,J＝9.98,4.49Hz,1H),2.00-2.12(m,1H)。
实施例245
合成(4S)-N-(1-甲基-1H-1,2,3-三唑-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将Pd2(dba)3(0.043g,0.047mmol)和X-phos(0.036g,0.095mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.3g,0.947mmol)，3-氟-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-甲腈(0.352g,1.421mmol)和磷酸二氢钾(0.258g,1.894mmol)在1,4-二噁烷(5mL):水(1mL)中脱气的溶液中，然后加热至90℃，保持15小时。冷却至室温，然后通过硅藻土垫过滤。滤液用水(25mL)和乙酸乙酯(50mL)稀释。分离的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并蒸发得到粗物质(TLC洗脱剂：10％MeOH/乙酸乙酯；UV活化；Rf:0.25)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且在75％乙酸乙酯/己烷中洗脱，得到(4S)-7-(6-氰基-5-氟吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,-4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.105g,0.251mmol,26.5％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):403.18[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.57(s,1H),9.53(d,J＝1.53Hz,1H),9.11(t,J＝1.43Hz,1H),8.69(dd,J＝9.87,1.75Hz,1H),8.27-8.40(m,2H),7.71(d,J＝8.11Hz,1H),7.54(d,J＝8.11Hz,1H),5.71(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.01-3.37(m,4H),2.32-2.45(m,1H),2.01-2.21(m,1H)。
实施例246
合成(4S)-7-(6-氰基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-亚甲基-吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向用氩气脱气20min的(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.900mmol)，5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-甲腈(525mg,2.280mmol)和K3PO4(807mg,3.80mmol)在1,4-二噁烷(20mL),水(3mL)中的溶液中加入X-phos(91mg,0.190mmol)，三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(87mg,0.095mmol)，再次用氩气脱气10min。将反应混合物在100℃搅拌16小时，然后冷却至室温。将反应混合物经硅藻土过滤，然后滤液用水稀释并用EtOAc萃取(3×20mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用30-40％EtOAc/己烷洗脱，得到纯的(4S)-7-(6-氰基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(399mg,1.033mmol,54.4％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):384.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ12.71(s,1H),9.17(dd,J＝2.2,0.7Hz,1H),8.54(d,J＝2.4Hz,1H),8.33(dd,J＝4.7,1.4Hz,1H),8.23(dd,J＝8.0,2.3Hz,1H),8.07-8.12(m,1H),7.87(d,J＝8.1Hz,1H),7.69(d,J＝8.1Hz,1H),7.38(d,J＝7.9Hz,1H),7.26-7.31(m,1H),5.71(dd,J＝5.9,2.8Hz,1H),3.12-3.34(m,3H),3.01-3.09(m,1H),2.36(m,1H),2.1(m,1H)。
实施例247
合成(4S)-7-((S)-3-甲基吗啉代)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将Cs2CO3(3.10g,9.50mmol)，(S)-3-甲基吗啉(0.641g,6.33mmol)加至在密封管中的(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(1.0g,3.17mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中的溶液中，同时用氩气净化25min。随后将PdOAc2(0.142g,0.633mmol)和X-phos(0.604g,1.267mmol)加至反应混合物，然后在100℃搅拌4h。将反应混合物冷却至室温，减压除去溶剂，将残余物分配在水(40mL)和EtOAc(80mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制化合物。将其用柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，2％甲醇/二氯甲烷作为洗脱剂，得到(4S)-7-((S)-3-甲基吗啉代)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(140mg,0.366mmol,11.56％收率)，其为灰白色固体。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM,Rf:0.4；UV活化的)，LCMS(m/z):381.30[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.42(s,1H),8.50(d,J＝2.41Hz,1H),8.31(d,J＝4.60Hz,1H),8.16(br d,J＝8.55Hz,1H),7.39(d,J＝8.55Hz,1H),7.31-7.26(m,1H),6.24(d,J＝8.55Hz,1H),5.60(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.06(brdd,J＝11.18,3.51Hz,2H),3.85-3.79(m,2H),3.69-3.51(m,2H),3.37-3.04(m,4H),2.91(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.31-2.18(m,1H),2.07-1.97(m,1H),1.27(d,J＝6.80Hz,3H)
实施例248
合成(4S)-N-(4-甲基吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.585mmol)在THF(15mL,在密封管中)中的搅拌的溶液中加入三光气(282mg,0.951mmol)，且搅拌30min，然后加入三乙胺(1.105mL,7.93mmol)和4-甲基吡啶-2-胺(257mg,2.378mmol)并在65℃加热15h。将反应混合物冷却至室温。蒸馏出THF，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：2％甲醇/DCM)，获得600mg，LCMS纯度为60％。粗制化合物经制备型HPLC纯化(条件：MP-A:10mM碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈柱：X-Bridge(250x30)mm 10μ方法：0/30,10/50,10.1/30,15/30流速：30ml/min洗脱剂：THF+ACN+MeOH)，得到(4S)-N-(4-甲基吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.541mmol,34.1％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc,Rf:0.4)，LCMS(m/z):387.27[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm:13.48(s,1H),8.61(d,J＝5.26Hz,1H),8.25-8.17(m,2H),8.07(s,1H),7.71(d,J＝3.95Hz,1H),7.61(d,J＝7.89Hz,1H),7.48(d,J＝8.11Hz,1H),6.85(d,J＝4.82Hz,1H),5.70(dd,J＝5.70,3.51Hz,1H),3.33-3.14(m,3H),3.14-2.89(m,1H),2.74(s,3H),2.41-2.32(m,4H),2.13-2.00(m,1H)。
实施例249
合成(4S)-N-(6-异丙基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向6-异丙基吡嗪-2-胺(141mg,1.030mmol)在THF(5mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(0.663mL,4.76mmol)和三光气(235mg,0.793mmol)且搅拌30min。然后加入(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.793mmol)，然后在80℃加热16h。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：2％甲醇/DCM)，获得(4S)-N-(6-异丙基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(60mg,0.144mmol,18.15％收率)，其为灰白色固体(TLC:洗脱剂：5％甲醇/DCM,Rf:0.4)，LCMS(m/z):416.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.34(s,1H),9.37(s,1H),8.70(d,J＝5.26Hz,1H),8.21(s,1H),8.00(br d,J＝3.73Hz,1H),7.60-7.69(m,2H),7.47(d,J＝8.11Hz,1H),5.73(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.14-3.37(m,3H),2.98-3.09(m,2H),2.66(s,3H),2.27-2.46(m,1H),2.09(dt,J＝14.03,7.23Hz,1H),1.33(dd,J＝7.02,1.10Hz,6H)。
实施例250
合成(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)吡咯烷-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)吡咯烷-1-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(峰1，来自中间体SFC的分离)(440mg,1.475mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入NaH(295mg,7.37mmol)。30min后加入3-(吡啶-2-基)-2H-吡啶并[1,2-a][1,3,5]三嗪-2,4(3H)-二酮(531mg,2.212mmol)并将反应混合物在70℃搅拌16h。将反应混合物倒在冷水(50mL)上并用乙酸乙酯萃取(2x30mL)。有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：90％Hex/EtOAc)，获得(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)吡咯烷-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(266.8mg,0.631mmol,42.8％收率)，其为灰白色固体。(TLC系统:Rf:04,:EtOAc)，LCMS(m/z):419.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.33(s,1H),8.19(d,J＝3.73Hz,1H),8.15(d,J＝8.33Hz,1H),7.66-7.60(m,1H),7.32(d,J＝8.55Hz,1H),6.91(dd,J＝6.58,5.04Hz,1H),5.96(d,J＝8.33Hz,1H),5.58(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.01-3.95(m,1H),3.86(dd,J＝11.29,7.34Hz,1H),3.66(td,J＝8.99,4.60Hz,1H),3.60-3.53(m,1H),3.23-3.05(m,4H),2.89(dd,J＝11.84,3.51Hz,1H),2.37-2.18(m,3H),1.98(dt,J＝13.81,6.91Hz,1H)。
实施例251
合成(4S)-7-(1-甲基-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.400g,1.263mmol)，1-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-3-(三氟甲基)-1H-吡唑(0.697g,2.53mmol)和磷酸三钾(0.803g,3.79mmol)在1,4-二噁烷(25mL)和水(4mL)中的混悬液用氩气在室温脱气15min，然后加入X-phos(0.0601g,0.126mmol)和Pd(dba)2(0.046g,0.051mmol)。将反应混合物再脱气15min并在100℃搅拌16小时。反应完成后(通过TLC指示)，将反应混合物冷却至28℃并用水稀释(15mL)并用EtOAc萃取(2X25mL)。有机层先后用水和盐水溶液洗涤，然后经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗物质(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯/己烷,Rf值：0.3,UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用中性氧化铝，用40％乙酸乙酯/石油醚洗脱产物，得到(4S)-7-(1-甲基-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.208g,0.482mmol,38.2％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):431.23[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.08(s,1H),9.51(d,J＝1.5Hz,1H),8.29(d,J＝2.6Hz,1H),8.25-8.22(m,1H),7.65(d,J＝7.9Hz,1H),7.21(d,J＝7.9Hz,1H),7.05(s,1H),5.71(dd,J＝5.8,3.2Hz,1H),4.24(s,3H),3.33-3.15(m,3H),3.04(dd,J＝12.2,3.2Hz,1H),2.42-2.30(m,1H),2.10(dt,J＝14.1,6.9Hz,1H)。
实施例252
合成(4S)-7-氰基-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将X-phos(0.018g,0.047mmol)和(1,3-二(2,6-二异丙基苯基)-4,5-二氢咪唑-2-亚基)氯)(3-苯基烯丙基)钯(2)(0.031g,0.047mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.3g,0.947mmol)和铁氰化钾(0.174g,0.474mmol)在1,4-二噁烷(5mL):水(1mL)中脱气的溶液中，然后加热至100℃，保持15h。冷却至室温，然后经硅藻土垫过滤。滤液用水(25mL)和乙酸乙酯(100mL)稀释。分离的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并蒸发，获得粗制化合物(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯；UV活化；Rf～0.3)。粗制混合物使用氧化铝经柱色谱纯化且在50％乙酸乙酯/己烷中洗脱，得到(4S)-7-氰基-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.13g,0.415mmol,43.8％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):308.19[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.48(br s,1H),9.45(s,1H),8.32(s,2H),7.62(d,J＝7.89Hz,1H),7.37(d,J＝7.89Hz,1H),5.68(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.24(t,J＝7.56Hz,2H),2.99-3.14(m,2H),2.36(td,J＝14.09,6.03Hz,1H),2.01-2.16(m,1H)。
实施例253
合成(4S)-7-(1-异丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向用氩气脱气20min的(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.579mmol)，1-异丙基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(447mg,1.894mmol)和K3PO4(670mg,3.16mmol)在1,4-二噁烷(15mL),水(3mL)中的溶液中加入X-phos(75mg,0.158mmol)，三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(72.3mg,0.079mmol)，再次用氩气脱气5min。将反应混合物在100℃搅拌16小时，然后冷却至室温。将反应混合物经硅藻土过滤，然后滤液用水稀释并用EtOAc萃取(3×20mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.2；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用30-40％EtOAc/己烷洗脱，得到纯的(4S)-7-(1-异丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(418mg,1.070mmol,67.8％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):391.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ14.14(s,1H),9.62(d,J＝1.5Hz,1H),8.64(s,1H),8.26-8.32(m,2H),8.02(s,1H),7.50(d,J＝7.9Hz,1H),7.16(d,J＝8.1Hz,1H),5.67(dd,J＝5.8,3.2Hz,1H),4.61(m,1H),3.12-3.31(m,3H),2.99(dd,J＝11.9,3.2Hz,1H),2.32(m,1H),2.06(m,1H),1.63(d,J＝6.8Hz,6H)。
实施例254
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(四氢呋喃-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.189mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(176mg,0.594mmol。30min后加入DIPEA(1.038mL,5.94mmol)，四氢呋喃-3-胺(155mg,1.783mmol)并将反应混合物在70℃搅拌16h。使得反应混合物达到室温，然后倒在冷水(50mL)上并用乙酸乙酯萃取(2x30mL)。有机层经无水硫酸钠干燥，减压浓缩，得到粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/DCM)，获得(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(四氢呋喃-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(137.1mg,0.371mmol,31.2％收率)，其为灰白色固体。(TLC系统:Rf:0.2,5％MeOH-DCM)，LCMS(m/z):366.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.76(br t,J＝6.80Hz,1H),8.89(s,1H),7.99(dd,J＝8.22,2.08Hz,1H),7.54(d,J＝7.89Hz,1H),7.30-7.21(m,2H),5.62(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),4.56(br dd,J＝4.82,1.97Hz,1H),4.01-3.75(m,4H),3.30-3.06(m,3H),2.99-2.91(m,1H),2.62(s,3H),2.39-2.21(m,2H),2.07-1.85(m,2H)。
实施例255
合成(4S)-7-(5-氟-6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃将磷酸三钾(323mg,1.520mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(240.0mg,0.760mmol)和3-氟-2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶(234mg,0.988mmol)在1,4-二噁烷(5.0mL)和水(1.0mL)中的溶液中。将反应混合物脱气10min。将X-Phos(36.2mg,0.076mmol)和Pd2(dba)3(34.8mg,0.038mmol)加至反应混合物并再脱气10min。将反应混合物在100℃在微波中搅拌1小时。将反应混合物通过硅藻土垫过滤并用乙酸乙酯洗涤。滤液用水和盐水溶液洗涤。分离的有机相经无水硫酸钠干燥，过滤并蒸发得到粗物质(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM；UV活化；Rf～0.3)。在GRACE柱上纯化粗产物，用3-5％MeOH/DCM洗脱，得到纯的(4S)-7-(5-氟-6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(122.0mg,0.312mmol,41.0％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):391.30[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ12.91(s,1H),8.77(t,J＝1.42Hz,1H),8.62(d,J＝2.41Hz,1H),8.32(dd,J＝4.71,1.43Hz,1H),8.12(ddd,J＝8.33,2.63,1.53Hz,1H),7.73(dd,J＝9.87,1.75Hz,1H),7.64(d,J＝7.89Hz,1H),7.27-7.32(m,2H),5.70(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.14-3.34(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.62(d,J＝3.07Hz,3H),2.28-2.38(m,1H),2.05-2.14(m,1H)
实施例256
合成(4S)-7-(5-氟-6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在25℃将磷酸三钾(402mg,1.894mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300.0mg,0.947mmol)、3-氟-2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶(292mg,1.231mmol)在1,4-二噁烷(5.0mL)和水(1.0mL)中的溶液中。将反应混合物脱气10min。将X-Phos(45.2mg,0.095mmol)和Pd2(dba)3(43.4mg,0.047mmol)加至反应混合物，然后再脱气10min。将反应混合物在100℃在微波中搅拌1小时。将反应混合物通过硅藻土垫过滤并用乙酸乙酯洗涤。滤液用水和盐水溶液洗涤，分离的有机相经无水硫酸钠干燥，过滤并蒸发得到粗物质(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM；UV活化；Rf～0.3)。在GRACE柱上纯化粗产物在，用3-5％MeOH/二氯甲烷洗脱，得到纯的(4S)-7-(5-氟-6-甲基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150.0mg,0.365mmol,38.5％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):392.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.79(s,1H),9.53(d,J＝1.5Hz,1H),8.88(t,J＝1.5Hz,1H),8.38(dd,J＝10.7,1.97Hz,1H),8.30-8.34(m,2H),7.64(d,J＝7.9Hz,1H),7.44(d,J＝8.1Hz,1H),5.70(dd,J＝6.03,3.2Hz,1H),3.1-3.3(m,3H),3.03(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.62(s,3H),2.36(dddd,J＝14.1,9.9,5.9,4.1Hz,1H),2.04-2.15(m,1H)
实施例257
合成(4S)-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将Pd2(dba)3(0.087g,0.095mmol)和X-phos(0.018g,0.047mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.3g,0.947mmol)、1-环丙基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(0.333g,1.421mmol)和磷酸二氢钾(0.258g,1.894mmol)在1,4-二噁烷(5mL):水(1mL)中脱气的溶液中，然后加热至90℃，保持15小时。冷却至室温并通过硅藻土垫过滤。滤液用水(25mL)和乙酸乙酯(50mL)稀释。分离的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并蒸发得到粗物质(TLC洗脱剂：10％MeOH/乙酸乙酯；UV活化；Rf～0.30)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且在75％乙酸乙酯/己烷中洗脱，得到(4S)-7-(1-环丙基-1H-吡唑-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.13g,0.332mmol,35.0％收率)灰白色固体，LCMS(m/z):389.32[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 14.14(s,1H),9.60(d,J＝1.10Hz,1H),8.61(s,1H),8.29-8.33(m,2H),8.03(s,1H),7.47-7.58(m,1H),7.13(d,J＝8.11Hz,1H),5.66(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.73(tt,J＝7.43,3.75Hz,1H),3.08-3.34(m,3H),2.99(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.32(dddd,J＝14.11,10.00,6.03,4.06Hz,1H),2.02-2.11(m,1H),1.22-1.32(m,2H),1.07-1.18(m,2H).
实施例258
合成(4S)-7-((2S,6R)-2,6-二甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温在氩气搅拌下将二异丙基乙胺(3.34mL,19.14mmol)加至吡嗪-2-甲酸(0.475g,3.83mmol)在四氢呋喃(30mL)中的搅拌的溶液中。将叠氮磷酸二苯酯(1.053g,3.83mmol)加至反应混合物。将反应混合物在室温搅拌2hr，然后，将(2S,6R)-2,6-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(0.735g,2.68mmol)加至反应混合物，然后在65℃搅拌16小时。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(20mL)和EtOAc(70mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.3；UV活化的)。粗制残余物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用15％EtOAc/己烷洗脱，得到纯的(4S)-7-((2S,6R)-2,6-二甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.132g,0.329mmol,8.58％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):396.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.39(s,1H),9.56(d,J＝1.10Hz,1H),8.26(s,1H),8.25(s,1H),7.39(s,1H)，6.30(s,1H),5.63(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.01(br d,J＝12.50Hz,2H),3.68-3.89(m,2H),3.16-3.28(m,1H),3.05-3.15(m,2H),2.92(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.61(t,J＝11.62Hz,2H),2.27(dddd,J＝13.89,9.95,6.08,3.62Hz,1H),1.93-2.06(m,1H),1.33(d,J＝6.14Hz,6H)
实施例259
合成(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-(2-(三氟甲基)嘧啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.947mmol)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-2-(三氟甲基)嘧啶(260mg,0.947mmol)和K3PO4(603mg,2.84mmol)在1,4-二噁烷(20mL)中的溶液中加入水(3mL)。将反应混合物用氩气在室温脱气15min。然后向其中加入X-Phos(45.2mg,0.095mmol)和Pd2(dba)3(43.4mg,0.047mmol)。将反应混合物在90℃搅拌16hr。反应进程经TLC监测。反应物质经硅藻土过滤并减压浓缩。将残余物用水稀释并用乙酸乙酯萃取(2×50mL)。合并的有机层先后用水和盐水溶液洗涤并用硫酸钠干燥脱水，过滤并浓缩。粗制化合物经柱色谱纯化(中性氧化铝)产物用30％乙酸乙酯/己烷洗脱。将收集的级分减压蒸发，然后在高真空干燥，得到(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-(2-(三氟甲基)嘧啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(230mg,0.534mmol,56.4％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):429.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.60(s,1H),9.59(d,J＝1.32Hz,1H),9.08(d,J＝5.26Hz,1H),8.83(d,J＝5.26Hz,1H),8.22-8.47(m,3H),7.75(d,J＝7.89Hz,1H),5.72(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.15-3.37(m,3H),3.00-3.10(m,1H),2.28-2.46(m,1H),2.03-2.18(m,1H)。
实施例260
合成(4S)-7-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.350g,1.105mmol)、1-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(0.690g,3.31mmol)和磷酸三钾(0.703g,3.31mmol)在1,4-二噁烷(25mL)和水(4mL)中的混悬液中用氩气在室温脱气15分钟。然后,向上述混合物中加入X-phos(53mg,0.110mmol)和Pd(dba)2(0.032g,0.055mmol)并再脱气15分钟。将反应混合物在100℃搅拌16小时。反应完成后(通过TLC指示)，冷却至28℃并用水稀释(15mL)并用EtOAc萃取(2x25mL)。有机层先后用水和盐水溶液洗涤，然后经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制残余物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM,Rf值：0.3,UV活化的)。粗制残余物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝，用50％乙酸乙酯/石油醚洗脱产物，得到(4S)-7-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.192g,0.527mmol,47.7％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):363.30[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.98(s,1H),9.56(d,J＝1.32Hz,1H),8.33-8.27(m,2H),7.66(d,J＝8.11Hz,1H),7.56-7.52(m,1H),7.46(d,J＝2.19Hz,1H),7.42(d,J＝2.41Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.99(s,3H),3.33-3.12(m,3H),2.99(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.36-2.26(m,1H),2.11-1.98(m,1H)
实施例261
合成(4S)-N-(5-乙氧基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(100mg,0.396mmol)在THF(10mL,在密封管中)中的搅拌的溶液中加入DMAP(145mg,1.189mmol)和(5-乙氧基吡嗪-2-基)氨基甲酸苯基酯(308mg,1.189mmol)，然后在90℃加热16h。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制残余物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：2％甲醇/DCM)，得到(4S)-N-(5-乙氧基吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(38mg,0.090mmol,22.79％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：5％甲醇/DCM Rf:0.4)，LCMS(m/z):418.36[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.50(s,1H),9.01(d,J＝1.32Hz,1H),8.61(d,J＝5.26Hz,1H),8.06(s,1H),7.98(m,1H),7.63(m,2H),7.47(d,J＝7.89Hz,1H),5.71(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.40(q,J＝7.02Hz,2H),3.34-3.10(m,3H),3.01(dd,J＝5.94,2.96Hz,1H),2.67(s,3H),2.36-2.10(m,2H),1.42(t,J＝7.13Hz,3H)。
实施例262
合成(4S)-7-((2S,6S)-2,6-二甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将二异丙基乙胺(3.52mL,20.15mmol)加至吡嗪-2-甲酸(0.500g,4.03mmol)在四氢呋喃(30mL)中的搅拌的溶液中，并在氩气下在室温搅拌。将叠氮磷酸二苯酯(1.109g,4.03mmol)加至反应混合物，然后在室温搅拌2小时。接着，将(2S,6S)-2,6-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(0.774g,2.82mmol)加至反应混合物，然后在65℃搅拌16小时。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(20mL)和EtOAc(70mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制残余物，其为棕色固体(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.3；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用中性氧化铝并用20％EtOAc/己烷洗脱，得到纯的(4S)-7-((2S,6S)-2,6-二甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.321g,0.799mmol,19.82％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):396.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.41(s,1H),9.56(d,J＝1.53Hz,1H),8.25(d,J＝2.41Hz,1H),8.16(dd,J＝2.41,1.53Hz,1H),7.37(d,J＝8.55Hz,1H),6.25(d,J＝8.55Hz,1H),5.63(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.11-4.31(m,2H),3.67(dd,J＝12.50,3.29Hz,2H),3.19-3.34(m,3H),3.06-3.18(m,2H),2.92(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.27(dddd,J＝13.95,9.95,6.03,3.84Hz,1H),1.92-2.07(m,1H),1.34(d,J＝6.36Hz,6H)
实施例263
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(哒嗪-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-氯-N-(哒嗪-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.3g,0.947mmol)在1,4-二噁烷(10ml)/水(2ml)中脱气的溶液中加入(2-甲基吡啶-4-基)硼酸(0.195g,1.421mmol)和K3PO4(0.402g,1.894mmol)、三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(0.087g,0.095mmol)和x-phos(0.090g,0.189mmol，在100℃加热16h。将反应混合物冷却至室温并用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：3％甲醇/EtOAc)，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(哒嗪-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(125mg,0.333mmol,35.1％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：10％甲醇/EtOAc,Rf:0.4)，LCMS(m/z):374.21[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm:13.50(s,1H),9.10(d,J＝1.97Hz,1H),8.93-9.05(m,1H),8.72(d,J＝5.04Hz,1H),8.00(dd,J＝5.92,2.85Hz,1H),7.69(d,J＝8.11Hz,1H),7.61-7.53(m,1H),7.48(dd,J＝5.26,1.32Hz,1H),7.41(d,J＝7.58Hz,1H),5.67(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.35-3.13(m,3H),3.05(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.37(dddd,J＝14.17,9.84,5.81,4.17Hz,3H),2.39(m,1H),2.15(m,1H)。
实施例264
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-甲基嘧啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.585mmol)在THF(15mL,密封管)中的搅拌的溶液中加入三光气(282mg,0.951mmol)在室温且搅拌30min。然后加入TEA(1.105mL,7.93mmol)和4-甲基嘧啶-2-胺(260mg,2.378mmol)，在65℃加热15h。将反应混合物冷却至室温；将THF蒸馏出，然后分配在水(25mL)和DCM(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：2％甲醇/DCM)，获得500mg，LCMS纯度为60％，将其通过制备型HPLC纯化(MP-A:10mM乙酸铵(水溶液)MP-B：乙腈柱：x bridge C18(100x19)mm5μ方法-T/％B:0/25/30,10/55，流速：19ml/min洗脱剂：THF+ACN)，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-甲基嘧啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(226mg,0.582mmol,36.7％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/EtOAc,Rf:0.4)，LCMS(m/z):388.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm:13.74(s,1H),8.63(d,J＝5.26Hz,1H),8.52(d,J＝5.04Hz,1H),7.90-7.83(m,2H),7.63(m,J＝8.11Hz,1H),7.47(d,J＝8.11Hz,1H),6.87(d,J＝5.04Hz,1H),5.78(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.32-3.10(m,3H),3.10-2.88(m,1H),2.68(s,3H),2.54(s,3H),2.51-2.23(m,1H),2.23-1.99(m,1H)。
实施例265
合成(4S)-7-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将磷酸钾(939mg,4.43mmol)和(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)硼酸(462mg,3.322mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,2.215mmol)在1,4-二噁烷:水(10mL,8:2)混合物中的溶液中。将该混合物用氩气净化30min。将PdOAc2(49.62mg,0.221mmol)和X-Phos(211.2mg,0.443mmol)加至反应混合物，然后在100℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩，将残余物分配在水(40mL)和EtOAc(80mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，3％甲醇/二氯甲烷作为洗脱剂，得到(4S)-7-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(110mg,0.270mmol,28.5％收率)，其为淡黄色固体。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM Rf:0.4；UV活化的)，LCMS(m/z):390.30[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.53(s,1H),9.53(s,1H)，8.34-8.28(m,2H),7.63(d,J＝8.11Hz,1H),7.43(t,J＝7.78Hz,2H),7.20(d,J＝1.75Hz,1H),7.04(dd,J＝7.23,1.97Hz,1H),5.70(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.62(s,3H),3.33-3.14(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.40-2.30(m,1H),2.09(dt,J＝13.92,6.85Hz,1H)
实施例266
合成(4S)-7-(5-氰基-6-乙氧基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向用氩气脱气20min的(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,1.263mmol)、2-乙氧基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-3-甲腈(519mg,1.894mmol)和K3PO4(536mg,2.53mmol)在1,4-二噁烷(15mL),水(3mL)中的溶液中加入x-phos(60.2mg,0.126mmol)、三(二亚苄基丙酮)二钯(0)(57.8mg,0.063mmol)，再次用氩气脱气5min。将反应混合物在100℃搅拌16小时，然后冷却至室温。将反应混合物经硅藻土过滤，然后滤液用水稀释并用EtOAc萃取(3x20mL)。合并的有机层用水、盐水溶液洗涤，经硫酸钠干燥并蒸发，得到粗制化合物(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)。粗制化合物经柱色谱纯化，使用中性氧化铝且用30-40％EtOAc/己烷洗脱，得到纯的(4S)-7-(5-氰基-6-乙氧基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(173mg,0.398mmol,31.5％收率)，其为灰白色固体,LCMS(m/z):429.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.83(s,1H),9.51(d,J＝1.5Hz,1H),9.16(d,J＝2.4Hz,1H),8.82(d,J＝2.6Hz,1H),8.55(dd,J＝2.6,1.5Hz,1H),8.31(d,J＝2.4Hz,1H),7.62(d,J＝7.9Hz,1H),7.38(d,J＝7.9Hz,1H),5.67(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),4.57(q,J＝7.1Hz,2H),3.12-3.32(m,3H),3.01(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.34(m,1H),2.07(m,1H),1.48(t,J＝7.1Hz,3H)。
实施例267
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将三光气(212mg,0.714mmol)缓慢分批加至(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.190mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的搅拌的溶液中且搅拌30min。将DIPEA(0.622mL,3.57mmol)和四氢-2H-吡喃-4-胺(180mg,1.785mmol)加至上述反应混合物，在70℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温，真空浓缩并将残余物分配在水(40mL)和EtOAc(80mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，2％甲醇/二氯甲烷作为洗脱剂，得到(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(四氢-2H-吡喃-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(110mg,0.290mmol,29.2％收率)，其为淡黄色固体。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM Rf:0.4；UV活化的)，LCMS(m/z):380.36[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.52(br d,J＝7.23Hz,1H),8.88(d,J＝1.97Hz,1H),7.92(dd,J＝8.11,2.41Hz,1H),7.54(d,J＝7.89Hz,1H),7.28(s,1H),7.22(d,J＝7.89Hz,1H),5.62(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.04-3.94(m,3H),3.51(tt,J＝11.59,2.33Hz,2H),3.27-3.15(m,2H),3.13-3.06(m,1H),2.95(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H)2.63(s,3H),2.26(dddd,J＝14.00,9.95,5.97,4.06Hz,1H),2.08-1.98(m,3H),1.62-1.55(m,2H)。
实施例268
合成(4S)-N-(环丙基甲基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.793mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入TEA(0.331mL,2.378mmol)和三光气(141mg,0.476mmol)，然后搅拌至室温，保持30分钟。然后加入环丙基甲胺(85mg,1.189mmol)。将反应混合物在60℃搅拌16h。使得反应混合物达到RT，并将溶剂蒸发，然后用CH2Cl2(25mL)稀释。将溶液用水和盐水洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，用5％MeOH/CH2Cl2洗脱)，获得(4S)-N-(环丙基甲基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(140mg,0.381mmol,48.0％收率)，其为淡黄色固体(TLC:Rf＝0.3,净EtOAc)，LCMS(m/z):350.30[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.52(br s,1H),8.96(d,J＝1.97Hz,1H),8.02(dd,J＝8.00,2.30Hz,1H),7.53(d,J＝7.89Hz,1H),7.26-7.20(m,2H),5.64(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.32-3.05(m,5H),2.95(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.62(s,3H),2.26(dddd,J＝14.00,9.95,5.97,4.06Hz,1H),2.10–1.98(m,1H),1.08(dddt,J＝12.78,7.66,5.04,2.38,2.38Hz,1H),0.65-0.52(m,2H),0.26(q,J＝4.97Hz,2H)。
实施例269
合成(4S)-N-(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-d]嘧啶-7-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将(4S)-N-(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-d]嘧啶-7-基)-7-氯-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.699mmol)和(2-甲基吡啶-4-基)硼酸(124mg,0.908mmol)在1,4-二噁烷(9mL)和水(1mL)中的溶液在25℃脱气15min。向该反应混合物中加入Cs2CO3(455mg,1.398mmol)，然后再脱气15min。最后加入PdCl2(dppf)(51.1mg,0.070mmol)并将反应混合物在100℃搅拌2h。将反应混合物用水稀释(10ml)并用乙酸乙酯萃取(2X10ml)。合并的有机层用水(10mL)、盐水(10ml)洗涤，经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(次)((100-200硅胶，用3％CH2Cl2/MeOH洗脱)，得到化合物。将其-过制备型HPLC再纯化，用3％甲醇/二氯甲烷洗脱，得到纯的(4S)-N-(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-d]嘧啶-7-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(15mg,0.036mmol,5.15％收率)，其为灰白色固体。(TLC系统:5％甲醇/DCM.Rf值：0.3)，LCMS(m/z):414.9[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.23(br s,1H),8.47(br d,J＝19.95Hz,2H),8.08(br s,1H),7.92-8.04(m,1H),7.67-7.81(m,2H),5.48-5.64(m,1H),3.20-3.26(m,1H),3.15(br d,J＝11.40Hz,2H),2.90-3.05(m,1H),2.46(br s,3H),2.20-2.38(m,1H),1.92-2.09(m,1H)。
实施例270
合成(4S)-N-(3-氟吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在THF(10mL,密封管)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(1.657mL,11.89mmol)和三光气(588mg,1.982mmol)且搅拌30min，然后加入3-氟吡嗪-2-胺(336mg,2.97mmol)，然后在80℃加热15h。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：2％甲醇/DCM)，获得(4S)-N-(3-氟吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(27mg,0.068mmol,3.44％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：5％甲醇/DCM,Rf:0.4)，LCMS(m/z):392.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.43(s,1H),8.59(d,J＝5.26Hz,1H),8.32(d,J＝2.63Hz,1H),7.90(d,J＝2.41Hz,1H),7.72-7.55(m,3H),7.37(br d,J＝4.38Hz,1H),5.73(br dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),3.36-3.02(m,4H),2.61(m,3H),2.33(br dd,J＝9.87,4.17Hz,1H),2.12(br dd,J＝9.72，3.86Hz,1H)。
实施例271
合成(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)吡咯烷-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺)
在0℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)吡咯烷-1-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(峰2，来自中间体的SFC分离)(350mg,1.173mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(209mg,0.704mmol)。30min后加入DIPEA(1.025mL,5.87mmol)和吡啶-2-胺(221mg,2.347mmol)，然后将反应混合物在70℃搅拌16h。将反应混合物倒在冷水(50mL)上并用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。有机层经无水硫酸钠干燥，减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％MeOH/DCM)，获得(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)吡咯烷-1-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(50.8mg,0.115mmol,9.83％收率)，其为淡黄色固体。(TLC系统:Rf:02,:EtOAc)，LCMS(m/z):419.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.34(s,1H),8.25-8.11(m,2H),7.69-7.61(m,1H),7.34(d,J＝8.33Hz,1H),6.98-6.90(m,1H),5.98(d,J＝8.55Hz,1H),5.61(dd,J＝6.14,3.29Hz,1H),4.02(dd,J＝11.18,8.55Hz,1H),3.82(dd,J＝11.29,7.34Hz,1H),3.70(td,J＝8.93,4.28Hz,1H),3.63-3.51(m,1H),3.29-3.06(m,4H),2.90(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.39-2.19(m,3H),2.05-1.91(m,1H)。
实施例272
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(9H-嘌呤-6-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(1g,3.96mmol)在四氢呋喃(THF)(20mL)中的溶液中加入三光气(0.588g,1.982mmol)且搅拌1h。加入三乙胺(2.76mL,19.82mmol)，接着加入9H-嘌呤-6-胺(0.696g,5.15mmol)。将反应混合物在70℃搅拌16h。将反应混合物用水稀释并用2x25ml乙酸乙酯萃取。合并的有机层用盐水溶液洗涤，经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，用3％CH2Cl2/MeOH洗脱)，得到期望的化合物，将其通过制备型HPLC纯化，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(9H-嘌呤-6-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(25mg,0.057mmol,1.449％收率)，其为白色固体。(TLC系统:5％甲醇/DCM.Rf值：0.3)，LCMS(m/z):411.9[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 14.08(br s,1H),12.32(br s,1H),8.72(s,1H),8.63(d,J＝5.04Hz,1H),8.45(s,1H),8.20(br s,1H),7.99(dd,J＝5.48,1.53Hz,1H),7.90-7.81(m,1H),7.81-7.74(m,1H),5.57(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),3.27-3.07(m,3H),3.02(br dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.65(s,3H),2.37-2.18(m,1H),2.08(br d,J＝6.58Hz,1H)。
实施例273
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(2,2,2-三氟乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将三光气(212mg,0.74mmol)缓慢分批加至(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.190mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的搅拌的溶液中且搅拌30min。将DIPEA(0.622mL,3.571mmol)和2,2,2-三氟乙胺盐酸盐(242mg,1.785mmol)加至上述反应混合物，在70℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩，将残余物分配在水(40mL)和EtOAc(80mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，2％甲醇/二氯甲烷作为洗脱剂，得到(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(2,2,2-三氟乙基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(235mg,0.615mmol,103％收率)，其为淡黄色固体。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM Rf:0.5；UV活化的)，LCMS(m/z)378.31[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 11.12(br t,J＝6.03Hz,1H),8.88(d,J＝1.97Hz,1H),7.94(dd,J＝8.11,2.41Hz,1H),7.57(d,J＝7.89Hz,1H),7.31-7.22(m,2H),5.62(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.16-4.02(m,2H),3.32-3.08(m,3H),2.96(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.62(s,3H),2.28(dddd,J＝14.06,10.00,6.08,4.06Hz,1H),2.09-1.97(m,1H)
实施例274
合成(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(四氢-2H-吡喃-3-基)-3,4-二氢1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.189mmol)在四氢呋喃(THF)(10mL)中的溶液中加入三光气(176mg,0.594mmol)。30min后加入DIPEA(1.038mL,5.94mmol)，四氢-2H-吡喃-3-胺(180mg,1.783mmol)并将反应混合物在70℃搅拌16h。将反应混合物倒在冷水(50mL)上并用乙酸乙酯萃取(150mL)。有机层经无水硫酸钠干燥，减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：3％MeOH/DCM)，获得(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-N-(四氢-2H-吡喃-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(114.5mg,0.299mmol,25.1％收率)，其为灰白色固体。(TLC系统:Rf:0.2,5％MeOH-DCM)，LCMS(m/z):380.0[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.59(t,J＝7.78Hz,1H),8.92(s,1H),8.07(dt,J＝8.11,2.96Hz,1H),7.52(d,J＝7.89Hz,1H),7.27-7.17(m,2H),5.66-5.59(m,1H),4.10-4.00(m,1H),3.86(dt,J＝11.24,3.70Hz,1H),3.71-3.62(m,2H),3.53(dd,J＝11.18,5.70Hz,1H),3.28-3.06(m,3H),2.97-2.89(m,1H),2.60(s,3H),2.24(dddd,J＝16.66,9.98,6.25,3.51Hz,1H),2.07-1.91(m,2H),1.74-1.66(m,2H),1.56-1.50(m,1H)。
实施例275
合成(4S)-7-((R)-2-乙基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氩气搅拌下在30℃将二异丙基乙胺(2.81mL,16.12mmol)加至吡嗪-2-甲酸(400mg,3.22mmol)在四氢呋喃(15mL)中的搅拌的溶液中。将叠氮磷酸二苯酯(887mg,3.22mmol)加至反应混合物，然后在30℃搅拌2h。然后将(2R)-2-乙基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(619mg,2.256mmol)加至反应混合物且在65℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温且分配在水(20mL)和乙酸乙酯(2×30mL)之间。分离有机层，然后经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制物。(TLC洗脱剂：90％乙酸乙酯/己烷,Rf＝0.3；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用中性氧化铝，将产物用10-15％乙酸乙酯/己烷洗脱，得到纯的(4S)-7-((R)-2-乙基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(35mg,0.088mmol,2.75％收率)，其为灰白色固体，LCMS(m/z):396.31[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.37(s,1H),9.55(d,J＝1.53Hz,1H),8.25(d,J＝2.63Hz,1H),8.09-8.18(m,1H),7.38(d,J＝8.55Hz,1H),6.30(d,J＝8.55Hz,1H),5.63(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.00-4.13(m,2H),3.86(br d,J＝12.93Hz,1H),3.75(td,J＝11.62,2.85Hz,1H),3.45-3.56(m,1H),3.13-3.30(m,1H),3.00-3.17(m,3H),2.92(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.69-2.81(m,1H),2.27(dddd,J＝13.89,9.95,6.08,3.62Hz,1H),2.00(dt,J＝14.09,6.88Hz,1H),1.59-1.78(m,2H),1.05(t,J＝7.45Hz,3H)。
实施例276
合成(4S)-7-(3-甲基-1H-吡唑-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在28℃将磷酸三钾(469mg,2.210mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350.0mg,1.105mmol)，3-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(276mg,1.326mmol)在1,4-二噁烷(10.0ml)和水(2.0ml)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气15min，向其中加入X-phos(52.7mg,0.110mmol)和Pd2(dba)3(50.6mg,0.055mmol)。将反应混合物再脱气15min并在100℃搅拌16小时。然后将混合物冷却至28℃，然后通过硅藻土垫过滤并用乙酸乙酯洗涤(40mL)。滤液用水洗涤(10mL)。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM；Rf-0.3；UV活化的)。将该粗物质经GRACE柱纯化并用2-5％MeOH/二氯甲烷洗脱，得到纯的(4S)-7-(3-甲基-1H-吡唑-5-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(181.5mg,0.492mmol,44.5％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):363.27[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.80(s,1H),9.55(d,J＝1.10Hz,1H),8.52(s,1H),8.20-8.35(m,2H),7.55(d,J＝8.11Hz,1H),7.12(d,J＝7.89Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.11-3.34(m,3H),2.89-3.11(m,1H),2.60(s,3H),2.33(dddd,J＝14.06,9.95,5.92,4.06Hz,1H),1.97-2.17(m,1H)
实施例277
合成(4S)-N-异丙基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃先后将DIPEA(1.038mL,5.94mmol)和三光气(353mg,1.189mmol)加至(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在THF(15mL,在密封管中)中的搅拌的溶液中，然后在室温搅拌30min。然后加入丙-2-胺(176mg,2.97mmol)，然后加热至75℃，保持16h。将反应混合物冷却至室温且分配在水(25mL)和EtOAc(60mL)之间。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％MeOH/DCM)，得到(4S)-N-异丙基-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(130mg,0.384mmol,19.39％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM,Rf:0.3)，LCMS(m/z):338.32[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.38(d,J＝6.4Hz,1H),8.91(d,J＝2Hz,1H),7.94(dd,J＝2.4,8Hz,1H),7.52(d,J＝5.6Hz,1H),7.25-7.20(m,2H),5.66-5.62(m,1H),4.14-4.06(m,1H),3.26-3.06(m,3H),2.97-2.92(m,1H),2.62(s,3H),2.30-2.21(m,1H),2.26-1.98(m,1H),1.27(d,J＝6.8Hz,6H)
实施例278
合成(4S)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将三光气(423.8mg,1.428mmol)缓慢分批加至(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(600mg,2.380mmol)在四氢呋喃(THF)(25mL)中的搅拌的溶液中且搅拌30min。将DIPEA(1.24mL,7.14mmol)和1-甲基哌啶-4-胺(408mg,3.571mmol)加至反应混合物，在70℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩，将残余物分配在水(40mL)和EtOAc(80mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化，使用硅胶(100-200目)，2％甲醇/二氯甲烷作为洗脱剂，得到(4S)-N-(1-甲基哌啶-4-基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(100mg,0.252mmol,21.21％收率)，其为灰白色固体，其为淡黄色固体。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM Rf:0.4；UV活化的)，LCMS(m/z):393.33[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.46(br d,J＝7.45Hz,1H),8.88(d,J＝2.19Hz,1H),7.92(dd,J＝8.11,2.41Hz,1H),7.53(d,J＝7.89Hz,1H),7.29-7.24(m,1H),7.20(d,J＝7.89Hz,1H),5.62(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.82-3.73(m,1H),3.12-3.26(m,2H),3.12-3.06(m,1H),2.94(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.85-2.78(m,1H),2.86-2.77(m,1H),2.62(s,3H),2.30-2.22(m,4H),2.15-1.98(m,5H),1.65-1.53(m,2H)。
实施例279
合成(4S)-7-((2R,6R)-2,6-二甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氩气气氛在室温将叠氮磷酸二苯酯(0.432g,1.571mmol)加至吡嗪-2-甲酸(0.195g,1.571mmol)和DIPEA(1.372mL,7.86mmol)在四氢呋喃(30mL)中的搅拌的溶液中。将反应混合物在室温搅拌2h，随后加入(2R,6R)-2,6-二甲基-4-((4S)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-基)吗啉(0.302g,1.100mmol)并将反应混合物在65℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温并减压完全蒸发溶剂，然后分配在水(20mL)和EtOAc(60mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.3；UV活化的)。粗物质经柱色谱纯化，使用中性氧化铝，以及用20％EtOAc/己烷洗脱，得到纯的(4S)-7-((2R,6R)-2,6-二甲基吗啉代)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.081g,0.203mmol,12.93％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):396.38[M+H]+。
1H NMR(400MHz,cdcl3-d)δppm 13.42(s,1H),9.56(d,J＝1.32Hz,1H),8.25(d,J＝2.63Hz,1H),8.09-8.19(m,1H),7.37(d,J＝8.55Hz,1H),6.24(d,J＝8.55Hz,1H),5.63(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.28-4.15(m,2H),3.67(dd,J＝12.39,3.40Hz,2H),3.32-3.19(m,3H),3.17-3.06(m,2H),2.92(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.27(dddd,J＝13.95,10.00,6.19,3.84Hz,1H),2.00(dt,J＝14.09,7.10Hz,1H),1.34(d,J＝6.36Hz,6H)。
实施例280
合成(4S)-7-(1-(二氟甲基)-1H-吡唑-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将磷酸三钾(469mg,2.210mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,1.105mmol)，1-(二氟甲基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(324mg,1.326mmol)在1,4-二噁烷(10.0ml)和水(2.0ml)中的搅拌的溶液中。将反应混合物脱气10min。将Pd2(dba)3(50.6mg,0.055mmol)和X-phos(52.7mg,0.110mmol)加至反应混合物，然后再脱气15min。将反应混合物在100℃搅拌16小时。将反应混合物冷却至28℃，然后通过硅藻土垫过滤并用乙酸乙酯洗涤(40mL)。滤液用水洗涤(10ml)。分离有机层，然后经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗物质，其为棕色固体(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM:Rf-0.4；UV活化的)。将粗物质经GRACE柱纯化，以及用1-2％MeOH/二氯甲烷洗脱，得到纯的(4S)-7-(1-(二氟甲基)-1H-吡唑-4-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(280.0mg,0.702mmol,63.6％收率)，为白色固体，LCMS(m/z):399.30[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ14.18(s,1H),9.55(d,J＝1.3Hz,1H),9.17(s,1H),8.36-8.27(m,2H),8.22(s,1H),7.56(d,J＝7.9Hz,1H),7.26-7.06(m,2H),5.66(dd,J＝5.9,3.3Hz,1H),3.35-3.11(m,3H),3.01(dd,J＝12.3,3.3Hz,1H),2.34(dddd,J＝14.1,9.8,6.0,4.06Hz,1H),1.93-2.17(m,1H)。
实施例281
合成(4S)-7-(6-(二甲基氨基)-4-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将N,N,4-三甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-胺(274mg,1.045mmol)和K3PO4(605mg,2.85mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.950mmol)在1-丁醇(10mL)中的搅拌的溶液中并脱气20min。然后将Pd2(dba)3(43.5mg,0.048mmol)和X-phos(45.3mg,0.095mmol)加至反应混合物并将反应混合物在80℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化(硅胶:100-200目)，将化合物在70％EtOAc/石油醚中收集，获得(4S)-7-(6-(二甲基氨基)-4-甲基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(100mg,0.236mmol,24.80％收率)，其为灰白色固体。(TLC洗脱剂：100％EtOAc/石油醚Rf:0.4,UV活化的)，LCMS(m/z):416.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 13.31(s,1H),8.36-8.17(m,3H),8.17-7.96(m,1H),7.86-7.57(m,1H),6.99(d,J＝7.89Hz,1H),6.95-6.68(m,1H),6.43(s,1H),5.69(brdd,J＝5.59,3.18Hz,1H),3.31(br d,J＝8.77Hz,1H),3.24-3.10(m,8H),3.10-2.87(m,1H),2.47(s,3H),2.40-2.20(m,1H),2.19-1.92(m,1H)
实施例282
合成(4S)-7-(6-(哌啶-1-基)吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温将(6-(哌啶-1-基)吡啶-3-基)硼酸(215mg,1.045mmol)先后将和K3PO4(605mg,2.85mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.950mmol)在1-丁醇(10mL)中的搅拌的溶液中并脱气20min。然后将Pd2(dba)3(43.5mg,0.048mmol)和X-phos(45.3mg,0.095mmol)加至反应混合物并将反应混合物在80℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化(硅胶:100-200目)，将化合物在70％EtOAc/石油醚中收集，获得(4S)-7-(6-(哌啶-1-基)吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.336mmol,35.3％收率)，其为淡黄色固体。(TLC洗脱剂：100％EtOAc/石油醚,Rf:0.4,UV活化的).,LCMS(m/z):442.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 13.71(s,1H),8.80(d,J＝2.63Hz,1H),8.54(dd,J＝8.99,2.63Hz,1H),8.37(dt,J＝4.93,0.82Hz,1H),8.18(d,J＝8.33Hz,1H),7.78-7.59(m,1H),7.51(d,J＝8.11Hz,1H),7.30-7.25(m,1H),6.97(ddd,J＝7.23,4.82,0.88Hz,1H),6.79(d,J＝8.99Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.70-3.59(m,4H),3.09-3.32(m,3H),3.09-2.84(m,1H),2.31(d,J＝1.97Hz,1H),2.17-1.95(m,1H),1.68(br s,6H)。
实施例283
合成(4S)-N-(叔丁基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将DIPEA(1.038mL,5.94mmol)和三光气(353mg,1.189mmol)加至(4S)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.982mmol)在四氢呋喃(15mL)中的溶液中，然后将其搅拌30min。然后加入2-甲基丙-2-胺(217mg,2.97mmol)，然后加热至75℃，保持16h。将反应混合物冷却至28℃，然后分配在水(25mL)和EtOAc(60mL)之间。分离的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制混合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％MeOH/DCM)，得到(4S)-N-(叔丁基)-7-(6-甲基吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(185mg,0.525mmol,26.5％收率)，其为灰白色固体(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM,Rf:0.3；UV活化的)，LCMS(m/z):352.34[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3-d):δppm 10.4(s,1H),8.90(d,J＝2Hz,1H),7.95(dd,J＝2.4Hz,8Hz,1H),7.51(d,J＝7.6Hz,1H)，7.22(d,J＝8Hz,1H),7.17(d,J＝8Hz,1H),5.64-5.61(m,1H),3.28-3.12(m,2H),3.10-3.05(m,1H),2.96-2.91(m,1H),2.61(s,3H),2.30-2.21(m,1H)，2.06–1.97(m,1H,),1.43(s,9H)。
实施例284
合成(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-(2-(吡咯烷-1-基)嘧啶-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将2-(吡咯烷-1-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)嘧啶(288mg,1.045mmol)和K3PO4(605mg,2.85mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.950mmol)在1-丁醇(10mL)中的搅拌的溶液中并脱气20min。然后将Pd2(dba)3(43.5mg,0.048mmol)和X-phos(45.3mg,0.095mmol)加至反应混合物并将反应混合物在80℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化(硅胶:100-200目)，将化合物在70％EtOAc/石油醚中收集，获得(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-(2-(吡咯烷-1-基)嘧啶-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(170mg,0.377mmol,39.7％收率)，其为黄色固体。(TLC洗脱剂：100％EtOAc/石油醚,Rf:0.4,UV活化的)，LCMS(m/z):429.6[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 13.57(s,1H),9.09(s,2H),8.51-8.26(m,1H),8.14(d,J＝8.33Hz,1H),7.67(td,J＝7.84,1.86Hz,1H),7.54(m,J＝8.11Hz,1H),7.26(s,1H),6.97(ddd,J＝7.29,4.88,0.99Hz,1H),5.68(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.75-3.60(m,4H),3.35-3.09(m,3H),2.99(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.32(m,1H),1.98-2.13(m,5H)
实施例285
合成(4S)-7-(6-(二乙基氨基)吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将N,N-二乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-胺(289mg,1.045mmol)和K3PO4(605mg,2.85mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.950mmol)在1-丁醇(10mL)中的搅拌的溶液中并脱气20min。然后将Pd2(dba)3(43.5mg,0.048mmol)和X-phos(45.3mg,0.095mmol)加至反应混合物并将反应混合物在80℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化(硅胶:100-200目)，将化合物在70％EtOAc/石油醚中收集，获得(4S)-7-(6-(二乙基氨基)吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.271mmol,28.5％收率)，其为灰白色固体。(TLC洗脱剂：100％EtOAc/石油醚,Rf:0.4,UV活化的)，LCMS(m/z):430.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 13.77(s,1H),8.78(d,J＝2.41Hz,1H),8.64-8.43(m,1H),8.43-8.28(m,1H),8.18(d,J＝8.55Hz,1H),7.75-7.59(m,1H),7.51(d,J＝8.11Hz,1H),7.39-7.15(m,1H),6.97(ddd,J＝7.34,4.93,0.88Hz,1H),6.62(d,J＝8.99Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.69-3.50(m,4H),3.34-3.08(m,3H),3.08–2.89(m,1H),2.39-2.19(m,1H),2.08(dt,J＝13.87,6.77Hz,1H),1.24(t,J＝7.02Hz,6H)
实施例286
合成(4S)-7-(6-吗啉代吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温先后将(6-吗啉代吡啶-3-基)硼酸(296mg,1.425mmol)和K3PO4(605mg,2.85mmol)加至(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.950mmol)在1-丁醇(10mL)中的搅拌的溶液中并脱气20min。然后将Pd2(dba)3(43.5mg,0.048mmol)和X-phos(45.3mg,0.095mmol)加至反应混合物并将反应混合物在80℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(25mL)和EtOAc(40mL)之间。分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化(硅胶:100-200目)，将化合物在70％EtOAc/石油醚中收集，获得(4S)-7-(6-吗啉代吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(110mg,0.245mmol,25.8％收率)，其为灰白色固体。(TLC洗脱剂：100％EtOAc/石油醚,Rf:0.4,UV活化的)，LCMS(m/z):444.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3-d)δppm 13.68(s,1H),8.85(s,1H),8.56-8.64(m,1H),8.36(d,J＝3.73Hz,1H),8.19(d,J＝8.33Hz,1H),7.68(t,J＝7.13Hz,1H),7.54(d,J＝8.11Hz,1H),7.32(s,1H),7.02-6.95(m,1H),6.78(d,J＝8.99Hz,1H),5.68(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),3.91-3.83(m,4H),3.70-3.60(m,4H),3.34-3.14(m,3H),2.99(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.42-2.26(m,1H),2.08(dt,J＝13.87,7.21Hz,1H)。
实施例287
合成(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-(2H-四唑-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
将叠氮基三丁基甲锡烷(1.297g，3.90mmol)加至(4S)-7-氰基-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.4g,1.302mmol)在四氢呋喃(25mL)中的搅拌的溶液中，然后在密封管中加热至80-90℃，保持48h。将反应混合物冷却至室温。将四氢呋喃减压浓缩，获得残余物。将残余物用二氯甲烷稀释(100mL)。将有机层用50mL 0.5M HCl,水(50mL)和盐水(50mL)洗涤。有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并蒸发，获得粗物质(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM；UV活化；Rf～0.3)。粗制化合物用乙醚研磨并过滤，得到(4S)-N-(吡嗪-2-基)-7-(2H-四唑-5-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.13g,0.369mmol,28.4％收率)，其为白色固体,LCMS(m/z):351.24[M+H]+。
1H NMR(400MHz,CDCl3-d)δppm 14.75(br s,1H),9.47(d,J＝1.32Hz,1H),8.48-8.40(m,2H),8.02(d,J＝7.89Hz,1H),7.77(d，J＝7.89Hz,1H),5.57(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.37-3.27(m,2H),3.22-3.17(m,1H),3.24-3.04(m,1H),2.39(ddt，J＝14.36,8.88,5.48,5.48Hz,1H),2.18-2.05(m,1H)
实施例288
合成(4S)-N-(1H-苯并[d]咪唑-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.983mmol)在THF(20mL)中的溶液中加入Et3N(0.822mL,5.90mmol)、三光气(292mg,0.983mmol)且搅拌1h。然后加入1H-苯并[d]咪唑-5-胺(393mg,2.95mmol)并将反应混合物在65℃加热15h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，真空浓缩并将残余物分配在水(30mL)和DCM(50mL)之间。分离有机层并经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：70％乙酸乙酯/己烷)，得到期望的产物(4S)-N-(1H-苯并[d]咪唑-5-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(215mg,0.461mmol,47.0％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):465.09[M+H]+,Rt＝1.77min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.02-12.63(m,1H),12.34(br s,1H),8.30-8.20(m,2H),8.16-8.10(m,1H),8.06(s,1H),7.92-7.77(m,2H),7.73-7.67(m,1H),7.67-7.60(m,1H),7.52-7.37(m,1H),7.18–6.91(m,1H),5.53(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),3.22(br t,J＝9.21Hz,1H),3.16-3.05(m,2H),2.97(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.35-2.19(m,1H),1.95(dt,J＝13.37,6.69Hz,1H)。
实施例289
合成(4S)-N-乙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
向(4S)-N-乙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.531mmol)在1,4-二噁烷(10mL)中的搅拌的溶液中加入4M HCl的1,4-二噁烷溶液(5.31mL,21.26mmol)，然后在室温搅拌3h。(TLC:洗脱剂：5％MeOH/DCM,Rf:0.3)。将反应混合物真空浓缩并将所得盐用乙醚研磨(10mL)，得到期望的产物(4S)-N-乙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(130mg,0.307mmol,57.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):377.07[M+H]+,Rt＝2.35min.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 10.01(br s,1H),8.21(d,J＝7.67Hz,1H),8.15(s,1H),7.96(br d,J＝7.89Hz,1H),7.85-7.90(m,1H),7.77-7.84(m,1H),7.73(d,J＝8.11Hz,1H),5.53(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),3.40-3.64(m,4H),3.27-3.37(m,2H),2.33-2.46(m,1H),2.02-2.14(m,1H),1.18(t,J＝7.23Hz,3H)。
实施例290
合成(4S)-N-(苯并[d]噁唑-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.983mmol)在THF(15mL)中的溶液中加入NaH(118mg,2.95mmol)和苯并[d]噁唑-2-基-氨基甲酸苯酯(749mg,2.95mmol)，在90℃在微波中搅拌1h。(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯,Rf＝0.4；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，用冰水淬灭，然后萃取到乙酸乙酯中(2x60mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩。粗制化合物经柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：65％乙酸乙酯/己烷)，得到期望的产物(4S)-N-(苯并[d]噁唑-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.316mmol,32.2％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):466.10[M+H]+,Rt＝2.58min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 14.60(s,1H),8.26(s,1H),8.11(d,J＝7.89Hz,1H),7.74-7.81(m,1H),7.72-7.61(m,3H),7.44(d,J＝8.11Hz,2H),7.50-7.40(m,1H),7.31-7.16(m,1H),5.76(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.34-3.14(m,3H),3.04(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.43-2.28(m,1H),2.12(dt,J＝14.20,7.04Hz,1H)。
实施例291
合成(4S)-N-环丙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(250mg,0.819mmol)在THF(20mL)中的溶液中加入三乙胺(0.685mL,4.91mmol)、三光气(243mg,0.819mmol)，然后在室温搅拌30min。然后加入环丙胺(140mg,2.457mmol)并将反应混合物在65℃加热16h。(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯；Rf＝0.3；UV活化的)。减压除去溶剂，用水稀释(20mL)并用乙酸乙酯萃取(2x40mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩。粗制化合物经柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：20％乙酸乙酯/己烷)。将收集的级分减压浓缩，得到纯的(4S)-N-环丙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(170mg,0.437mmol,53.4％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):389.10[M+H]+,Rt＝2.34min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.54(br s,1H),8.02(s,1H),7.92(d,J＝7.89Hz,1H),7.71-7.65(m,1H),7.64-7.57(m,1H),7.54(d,J＝7.89Hz,1H),7.31-7.26(s,1H),5.66(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.29-3.04(m,3H),2.95(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.85(tq,J＝7.07,3.62Hz,1H),2.27(dddd,J＝14.11,9.95,5.97,3.95Hz,1H),2.07-1.96(m,1H),0.84-0.74(m,2H),0.61-0.53(m,2H)。
实施例292
合成(4S)-N-环丁基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(250mg,0.819mmol)在THF(20mL)中的溶液中加入三乙胺(0.685mL,4.91mmol)、三光气(243mg,0.819mmol)，然后在室温搅拌30min。然后加入环丁基胺(175mg,2.457mmol)并将反应混合物在65℃加热16h。(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯:Rf＝0.3；UV活化的)。减压除去溶剂，用水稀释(20mL)并萃取到乙酸乙酯(2x40mL)中。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩。粗制化合物经制备型HPLC纯化(条件-柱：XBridge C18(75X4.6mm,3.5μ)；流动相-A:0.01M碳酸氢铵B:乙腈；梯度-时间/％B:0/5,0.8/5,5/50,8/95,12/95,12.1/5,15/5；柱温：环境温度；流速:1.0ml/min:稀释剂：ACN)，得到期望的产物(4S)-N-环丁基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(174mg,0.432mmol,52.8％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):403.11[M+H]+,Rt＝2.56min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.62(br d,J＝6.58Hz,1H),8.10(s,1H),7.98(d,J＝7.67Hz,1H),7.73-7.65(m,1H),7.64-7.59(m,1H),7.55(d,J＝7.89Hz,1H),7.28(s,1H),5.63(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.43(dq,J＝16.25,7.96Hz,1H),3.30-3.02(m,3H),2.94(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.46-2.34(m,2H),2.25(dddd,J＝14.03,9.98,6.03,3.95Hz,1H),2.09-1.86(m,3H),1.85-1.63(m,2H)。
实施例293
合成(4S)-N-(6-氟苯并[d]噻唑-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.310mmol)在四氢呋喃(15mL)中的搅拌的溶液中加入Et3N(1.096mL,7.86mmol)和三光气(389mg,1.310mmol)且搅拌1h，然后加入6-氟苯并[d]噻唑-2-胺(441mg,2.62mmol)(固体)并在70℃加热15h。(TLC系统:净乙酸乙酯,Rf:0.3)。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩并将残余物分配在水(40mL)和EtOAc(80mL)之间。分离有机层并经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，洗脱剂：80％乙酸乙酯/己烷)，得到期望的产物(4S)-N-(6-氟苯并[d]噻唑-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(170mg,0.333mmol,25.4％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):500.01[M+H]+,Rt＝3.10min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 14.75(s,1H),8.42(s,2H),7.94-7.75(m,5H),7.68(dd,J＝8.77,4.82Hz,1H),7.31(td,J＝9.10,2.85Hz,1H),5.50(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.27-3.09(m,3H),2.99(dd,J＝11.73,3.18Hz,1H),2.35-2.22(m,1H),2.10-1.96(m,1H)。
实施例294
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(3-(三氟甲基)苯基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.665mmol)、(3-(三氟甲基)苯基)硼酸(189mg,0.997mmol)和磷酸三钾(423mg,1.994mmol)在1,4-二噁烷(18mL)和水(4.50mL)中脱气的溶液中加入x-phos(19.20mg,0.133mmol)和Pd2(dba)3(60.9mg,0.066mmol)。将反应混合物在100℃搅拌16h。(TLC系统:5％MeOH/EtOAc,Rf:0.5)。使得反应混合物冷却至室温并减压蒸发1,4二噁烷溶剂,将获得的残余物用水稀释(50ml)并用乙酸乙酯萃取(2x100ml)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化，使用(硅胶100-200目：洗脱剂：净乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(3-(三氟甲基)苯基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(70mg,0.135mmol,20.34％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):517.11[M+H]+,Rt＝2.16min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.70(s,1H),8.64(d,J＝5.26Hz,1H),8.57-8.53(m,1H),8.45(d,J＝5.04Hz,1H),8.22(s,1H),7.85-7.99(m,2H),7.76-7.57(m,4H),7.50(d,J＝7.89Hz,1H),7.27-7.20(m,1H),5.72(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.34-3.13(m,3H),3.04(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.77(s,3H),2.46-2.29(m,1H),2.21-2.02(m,1H)。
实施例295
合成(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
在0℃向(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.298mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入盐酸(5mL,165mmol)，历时5min的一段时间。然后将反应混合物在30℃搅拌2h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.5；UV活化的),溶剂蒸发，然后将反应混合物用碳酸氢钠溶液中和，用DCM萃取，然后经无水硫酸钠干燥并蒸发得到固体化合物，过滤并用正戊烷洗涤(2×20mL)，得到期望的产物(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(110mg,0.238mmol,80％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):463.15[M+H]+,Rt＝1.20min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.28(s,1H),8.68(d,J＝5.26Hz,1H),7.96(d,J＝5.70Hz,1H),7.65(d,J＝7.89Hz,1H),7.58(s,1H),7.48(dd,J＝5.15,1.21Hz,1H),7.38(d,J＝7.89Hz,1H),7.13-7.05(m,2H),5.67(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.46(dd,J＝4.71,1.21Hz,2H),4.35(d,J＝5.48Hz,1H),3.99(dq,J＝9.95,4.94Hz,1H),3.73-3.61(m,2H),3.33-3.12(m,3H),3.03(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.89(t,J＝6.58Hz,1H),2.69(s,3H),2.35(qd,J＝9.94,4.17Hz,1H),2.08(dt,J＝14.14,6.96Hz,1H)。
实施例296
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(2-甲基噻唑-5-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.554mmol)、2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噻唑(249mg,1.108mmol)和磷酸三钾(353mg,1.662mmol)在1,4-二噁烷(18mL)和水(4.50mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(45.2mg,0.055mmol)。将反应混合物在90℃搅拌16h。(TLC:SiO2；10％MeOH/DCM TLC:SiO2；10％MeOH/DCM)。使得反应混合物冷却至室温并用水稀释(50mL)，用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层用水洗涤(50mL)，经无水硫酸钠干燥并真空蒸发，获得粗产物，为棕色固体。粗产物通过combi快速色谱纯化(120g反相:100％甲醇)，得到期望的产物(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(2-甲基噻唑-5-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(67mg,0.142mmol,25.6％收率)，其为浅绿色固体。LCMS(m/z):470.09[M+H]+,Rt＝1.63min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.65(s,1H),8.63(d,J＝5.26Hz,1H),8.45(dd,J＝1.53,0.66Hz,1H),8.35(dd,J＝5.15,0.77Hz,1H),8.18(d,J＝1.53Hz,1H),8.05(s,1H),7.72(dd,J＝5.37,1.43Hz,1H),7.63(d,J＝7.89Hz,1H),7.49(d,J＝7.89Hz,1H),7.14(dd,J＝5.26,1.75Hz,1H),5.72(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.40-3.14(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.75(d,J＝6.58Hz,6H),2.36(dddd,J＝14.11,9.95,6.08,4.06Hz,1H),2.10(dt,J＝14.25,6.91Hz,1H)。
实施例297
合成(4S)-N-(4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在25℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350.0mg,1.146mmol)在四氢呋喃(20mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(0.799mL,5.73mmol)和三光气(340mg,1.146mmol)且搅拌45min，然后加入4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-胺(565mg,3.44mmol)。将反应混合物在72℃加热6h。(TLC洗脱剂系统:100％EtOAc,Rf-0.4,UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，将析出的固体过滤并将滤液用水洗涤(10mL)并萃取到ETOAc中。分离有机层并经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗产物经制备型HPLC纯化(条件:柱XBridge C18(250X30mm,5μ)；流动相-A:5mM碳酸氢铵B:乙腈；梯度-时间/％B:0/10,10/50,11.5/100,15/100,15.1/10；柱温度：环境温度；流速:20ml/min:稀释剂：THF+MEOH+ACN)，得到所需产物(4S)-N-(4-甲氧基苯并[d]异噁唑-3-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(106.5mg,0.211mmol,18.38％收率)，其为白色固体LCMS(m/z):496.05[M+H]+,Rt＝2.43min。
1HNMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.97(s,1H),8.06(s,1H),7.99(d,J＝7.89Hz,1H),7.62-7.68(m,2H),7.45(t,J＝7.78Hz,1H),7.35-7.41(m,2H)，7.10(d,J＝8.11Hz,1H),6.34(d,J＝7.89Hz,1H),5.77(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.18-3.35(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.90(s,3H),2.30-2.41(m,1H),2.16(dt,J＝14.03,7.02Hz,1H)
实施例298
合成(4S)-N-(1H-苯并[d]咪唑-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.983mmol)在四氢呋喃(40mL)中的搅拌的溶液中加入TEA(0.685mL,4.91mmol)和三光气(292mg,0.983mmol)且搅拌30min。然后加入1H-苯并[d]咪唑-2-胺(393mg,2.95mmol)并将反应混合物加热至60℃，保持16h。固体体(TLC洗脱系统:10％MeOH/DCM；Rf-0.3；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温并用水淬灭(15mL)并萃取到EtOAc中(2x15mL)。分离有机层，经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。将粗物质经色谱纯化(GRACE使用C-18反相柱，流动相A:0.1％甲酸/水；B:MeOH,洗脱剂75％B/A)。将合并的级分蒸发，然后用饱和NaHCO3溶液碱化。将水层用DCM萃取,DCM层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到(4S)-N-(1H-苯并[d]咪唑-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(26mg,0.053mmol,5.43％收率)，其为灰白色LCMS(m/z):465.05[M+H]+,Rt＝2.32min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 14.16(s,1H),11.99(s,1H),8.40-8.50(m,2H),7.86-7.92(m,1H),7.79-7.86(m,2H),7.74-7.78(m,1H),7.46-7.51(m,1H),7.38(d,J＝7.45Hz,1H),7.08(td,J＝7.73,1.43Hz,2H),5.53(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),3.09-3.27(m,3H),3.00(dd,J＝11.95,3.40Hz,1H),2.23-2.35(m,1H),2.03(dt,J＝13.98,7.15Hz,1H)
实施例299
合成(4S)-N-(4-(1,3-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.554mmol)、1,3-二甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(135mg,0.609mmol)和碳酸钠(176mg,1.662mmol)在1,4-二噁烷(7mL):水(3mL)中脱气的溶液中加入Pd(P(Ph)3)4(32.0mg,0.028mmol)并将反应混合物在80℃搅拌15h。(TLC系统:5％甲醇/乙酸乙酯.Rf值：0.3.)。然后使其冷却至室温并用水稀释(30mL)，用乙酸乙酯萃取(2X50mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(20mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：2％MeOH/乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1,3-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.321mmol,57.9％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):467.18[M+H]+,Rt＝1.47min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.56(s,1H),8.62(d,J＝5.26Hz,1H),8.37-8.28(m,2H),8.23(s,1H),7.73(d,J＝1.32Hz,1H),7.67(s,1H),7.63(s,1H),7.49(d,J＝7.89Hz,1H),7.09-7.04(m,1H),5.71(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.89(s,3H),3.32-3.15(m,3H),3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.75(s,3H),2.52(s,3H),2.38-2.30(m,1H),2.15-2.05(m,1H)。
实施例300
合成(4S)-7-(6-氨基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,1.108mmol)、(6-氨基吡啶-3-基)硼酸(229mg,1.663mmol)和磷酸三钾(235mg,1.108mmol)在1,4-二噁烷(18mL):水(4.50mL)中脱气的溶液中加入Pd2(dba)3(50.8mg,0.055mmol)和x-phos(52.8mg,0.111mmol)。将反应混合物在100℃搅拌3h。(TLC:10％MeOH/EtOAc Rf:0.3)。减压蒸发1,4二噁烷溶剂,将获得的残余物用水稀释(50mL)且用乙酸乙酯萃取(2x100ml)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化((硅胶100-200目：洗脱剂：2％MeOH/DCM)，得到半纯的化合物且再次通过制备型HPLC纯化(制备型HPLC条件：MP-A5mM乙酸铵(水溶液))MP-B:MeOH+ACN柱:XBRIDGE250X30方法：-T/％B＝0/20,10/50,11/100流速：28ml/min洗脱剂：THF+MeOH)，得到期望的产物(4S)-7-(6-氨基吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.562mmol,50.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):374.19[M+H]+,Rt＝1.32min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.64(s,1H),8.75(d,J＝2.41Hz,1H),8.50(dd,J＝8.77,2.41Hz,1H),8.38-8.34(m,1H),8.18(dt,J＝8.55,0.88Hz,1H),7.68(td,J＝7.89,1.97Hz,1H),7.54(d,J＝8.11Hz,1H),7.29(d,J＝8.11Hz,1H),7.02-6.94(m,1H),6.67(dd,J＝8.55,0.66Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.65(br s,2H),3.32-3.12(m,3H),2.99(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.31(dddd,J＝13.95,9.95,6.03,3.84Hz,1H),2.12-2.03(m,1H)。
实施例301
合成(4S)-N-(4-(1-甲基-1H-咪唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向1-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-imidazole(138mg,0.665mmol)在1,4-二噁烷(8mL):水(2mL)中脱气的溶液中加入(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.443mmol)、Na2CO3(47.0mg,0.443mmol)。然后将Pd(Ph3P)4(512mg,0.443mmol)加至反应混合物在室温且再次脱气5min。然后将反应混合物在80℃搅拌16h。(TLC系统:(10％MeOH/DCM,Rf:0.5)，将反应混合物冷却至室温，将有机溶剂蒸发，并将其用水稀释，接着用乙酸乙酯(3X20mL)萃取。合并的有机层用盐水洗涤(2x5mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(100-200目，净乙酸乙酯-2％DCM/MeOH)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1-甲基-1H-咪唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(70mg,0.154mmol,34.7％收率)，其为黄色固体。LCMS(m/z):453.14[M+H]+,Rt＝1.18min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.63(s,1H),8.60(d,J＝5.26Hz,1H),8.42(d,J＝5.26Hz,1H),8.33(s,1H),8.23(s,1H),7.94(d,J＝4.60Hz,1H),7.86-7.77(m,2H),7.75-7.68(m,1H),7.39-7.27(m,2H),5.52(br d,J＝2.41Hz,1H),3.83(s,3H),3.45-2.93(m,4H),2.64(s,3H),2.35-2.15(m,1H),2.09-1.86(m,1H)。
实施例302
合成(4S)-7-(6-(二甲基氨基)-5-氟吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(3.2g,10.13mmol)、(6-(二甲基氨基)-5-氟吡啶-3-基)硼酸(2.051g,11.15mmol)和碳酸钠(3.22g,30.4mmol)在1,4-二噁烷(18mL):水(4.50mL)中脱气的溶液中加入Pd(PPh3)4(0.586g,0.507mmol)且在100℃搅拌3h。(TLC系统:净乙酸乙酯,Rf:0.4).减压蒸发1,4-二噁烷溶剂,将获得的残余物用水稀释(50mL)且用乙酸乙酯萃取(2x100ml)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶100-200目：洗脱剂：70％乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-7-(6-(二甲基氨基)-5-氟吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(1.58g,3.76mmol,37.1％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):420.1[M+H]+,Rt＝2.25min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.76(s,1H),8.60(d,J＝1.97Hz,1H),8.56(s,1H),8.38(dd,J＝4.82,1.10Hz,1H),8.16(d,J＝8.55Hz,1H),7.77-7.64(m,1H),7.53(d,J＝8.11Hz,1H),7.31(d,J＝8.11Hz,1H),7.02-6.91(m,1H),5.67(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.25(s,3H),3.23(s,3H),3.22-3.02(m,3H),2.98(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.31(dddd,J＝14.06,9.95,6.03,3.95Hz,1H),2.07(dt,J＝13.98,6.93Hz,1H)。
实施例303
合成(4S)-N-(2-(3-羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.983mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(175mg,0.590mmol)和三乙胺(0.822mL,5.90mmol)且搅拌30min。然后，加入3-((4-氨基嘧啶-2-基)氧基)丙-1-醇(332mg,1.965mmol)，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:Rf-0.2，5％MeOH/EtOAc)。使得反应混合物冷却至室温并用水稀释(25mL)，用EtOAc萃取(2x40mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％甲醇/乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-N-(2-(3-羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(80mg,0.152mmol,15.46％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):501.24[M+H]+,Rt＝2.19min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.65(s,1H),8.46(dd,J＝4.17,2.85Hz,1H),8.36(d,J＝5.70Hz,1H),8.06(s,1H),7.79(d,J＝5.48Hz,1H),7.73(s,2H),7.65(d,J＝8.11Hz,1H),7.43(d,J＝7.89Hz,1H),5.66(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.45-4.40(m,2H),3.76(q,J＝5.19Hz,2H),3.36-3.14(m,3H),3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.50-2.28(m,1H),2.14-1.88(m,4H)。
实施例304
合成(4S)-N-(6-(3-羟基-2,2-二甲基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.983mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(175mg,0.590mmol)和三乙胺(0.822mL,5.90mmol)且搅拌30min。然后，加入3-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇(388mg,1.965mmol)，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:Rf-0.4,5％MeOH/EtOAc)。使得反应混合物冷却至室温并用水稀释(25mL)，用EtOAc萃取(2x40mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：1％甲醇/乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-N-(6-(3-羟基-2,2-二甲基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(130mg,0.240mmol,24.40％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):529.17[M+H]+,Rt＝2.52min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.24(s,1H),8.99(s,1H),8.24-8.18(m,1H),8.05(s,1H),7.94(s,1H),7.71-7.66(m,2H),7.64(d,J＝7.89Hz,1H),7.38(d,J＝7.89Hz,1H),5.71(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.89(s,2H),3.35-3.13(m,5H),3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.40-2.29(m,1H),2.14-1.99(m,2H),0.88(d,J＝2.41Hz,6H)。
实施例305
合成(4S)-N-(2-(3-羟基-3-甲基丁氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.983mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(175mg,0.590mmol)和三乙胺(0.822mL,5.90mmol)，且搅拌30min。然后，加入4-((4-氨基嘧啶-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇(388mg,1.965mmol)，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:Rf-0.3,5％MeOH/EtOAc)。使得反应混合物冷却至室温并用水稀释(25mL)，用EtOAc萃取(2x40mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：1％甲醇/乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-N-(2-(3-羟基-3-甲基丁氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(115mg,0.217mmol,22.04％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):529.25[M+H]+,Rt＝2.37min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.62(s,1H),8.54-8.46(m,1H),8.37(d,J＝5.70Hz,1H),8.04(s,1H),7.80(d,J＝5.70Hz,1H),7.75-7.69(m,2H),7.64(d,J＝8.11Hz,1H),7.43(d,J＝8.11Hz,1H),5.66(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.49-4.39(m,2H),3.37-3.14(m,3H),3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.40-2.29(m,1H),2.17-2.01(m,2H),1.97(t,J＝6.47Hz,2H),1.28(s,6H)。
实施例306
合成(4S)-N-(4-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.443mmol)、1-甲基-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(138mg,0.665mmol)和K3PO4(282mg,1.329mmol)在1,4-二噁烷(8mL):水(2mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)(64.9mg,0.089mmol)并将反应混合物在100℃搅拌6h。(TLC系统:5％甲醇/二氯甲烷,Rf:0.2)。将反应混合物倒入冷水(10mL)中并用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,2％甲醇/DCM)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(110mg,0.241mmol,54.3％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):453.14[M+H]+,Rt＝1.49min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.56(s,1H),8.67-8.58(m,2H),8.37(d,J＝5.26Hz,1H),8.23(s,1H),7.72(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),7.62(d,J＝7.89Hz,1H),7.55-7.46(m,2H),7.41(d,J＝2.19Hz,1H),6.74(d,J＝2.19Hz,1H),5.73(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.98(s,3H),3.14-3.37(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.76(s,3H),2.41-2.29(m,1H),2.19-2.03(m,1H)。
实施例307
合成(4S)-N-(4-(1-甲基-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.443mmol)、1-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-3-(三氟甲基)-1H-吡唑(184mg,0.665mmol)和K3PO4(282mg,1.329mmol)在1,4-二噁烷(8mL):水(2mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)(32.4mg,0.044mmol)并将反应混合物在100℃搅拌6h。(TLC系统:净乙酸乙酯,Rf:0.3)。将反应混合物倒入冷水(10mL)中并用乙酸乙酯萃取(2x50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：2％甲醇/DCM)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1-甲基-3-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(60mg,0.115mmol,25.9％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):521.14[M+H]+,Rt＝1.75min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.64(s,1H),8.63(d,J＝5.48Hz,1H),8.38(d,J＝5.04Hz,1H),8.32(s,1H),8.21(s,1H),7.77-7.70(m,2H),7.63(d,J＝7.89Hz,1H),7.49(d,J＝7.89Hz,1H),7.12(d,J＝5.04Hz,1H),5.70(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.00(s,3H),3.37-3.14(m,3H),3.02(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.76(s,3H),2.41-2.26(m,1H),2.17-2.02(m,1H)。
实施例308
合成(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-((R)-4-(三氟甲基)-4,5-二氢噁唑-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在氮气下在室温向甲磺酸(2R)-3,3,3-三氟-2-((4S)-5-(吡啶-2-基氨基甲酰基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-7-甲酰氨基)丙基酯(300mg,0.583mmol)在DMSO(5mL)中的溶液中加入叠氮化钠(190mg,2.92mmol)且在90℃搅拌1h。(TLC系统:5％甲醇/DCM.Rf值：0.5)。将反应混合物用冰水稀释(25ml)，然后用EtOAc(2x50mL)萃取。合并的有机层用盐水洗涤(25mL)，经硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物。粗物质经combiflash色谱纯化(使用硅胶柱，5％MeOH/DCM)，得到(4S)-N-(吡啶-2-基)-7-((R)-4-(三氟甲基)-4,5-二氢噁唑-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(70mg,0.164mmol,28.1％收率)，其为灰白色固体。LC-MS(m/z):419.04[M+H]+,Rt＝1.61min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.03(s,1H),8.34(dd,J＝4.82,1.10Hz,1H),8.08(d,J＝8.55Hz,1H),7.56-7.77(m,3H),6.98(ddd,J＝7.34,4.93,0.88Hz,1H),5.69(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.90(dquin,J＝10.02,7.31,7.31,7.31,7.31Hz,1H),4.59-4.78(m,2H),3.08-3.30(m,3H),2.92-3.06(m,1H),2.19-2.39(m,1H),1.93-2.17(m,1H)。
实施例309
合成(4S)-N-(6-(3-羟基-3-甲基丁氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.638mmol)在THF(25mL)中的搅拌的溶液中加入TEA(1.141mL,8.19mmol)、三光气(292mg,0.983mmol)，搅拌30min，然后加入4-((6-氨基吡啶-2-基)氧基)-2-甲基丁-2-醇(643mg,3.28mmol)并将反应混合物在100℃搅拌16h。(TLC洗脱剂系统:100％EtOAc,Rf-0.4,UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，然后分配在水(25mL)和EtOAc(2x25mL)之间。分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗产物。粗制化合物经色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：20％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-N-(6-(3-羟基-3-甲基丁氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.225mmol,13.72％收率)，其为灰白色固体LCMS(m/z):528.20[M+H]+,Rt＝2.64min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.97(s,1H),8.31(br d,J＝7.23Hz,1H),8.04(s,1H),7.73(d,J＝7.89Hz,1H),7.55-7.70(m,4H),7.36(d,J＝7.89Hz,1H),6.42(d,J＝8.11Hz,1H),5.70(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),4.18(td,J＝6.14,1.97Hz,2H),3.11-3.37(m,3H),3.01(dd,J＝12.06,3.07Hz,1H),2.25-2.40(m,1H),2.03-2.15(m,2H),1.81(t,J＝6.25Hz,2H),1.18(d,J＝1.32Hz,6H)。
实施例310
合成(4R)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(噁唑-5-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4R)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.886mmol)、K3PO4(564mg,2.66mmol)和5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(259mg,1.329mmol)在1,4-二噁烷(12mL)和水(3mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2(36.2mg,0.044mmol)。将反应混合物再脱气5min。然后将反应混合物在80℃搅拌16h。(TLC系统:(10％MeOH/DCM,Rf:0.4)，然后使其冷却至室温,用水稀释并用乙酸乙酯萃取(3X50mL)。合并的有机层用盐水洗涤(2x5mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，获得粗制残余物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(100-200目，净乙酸乙酯-2％DCM/MeOH)，得到所需产物(4R)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(噁唑-5-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(270mg,0.613mmol,69.2％收率)，其为黄色固体。LCMS(m/z):440.18[M+H]+,Rt:1.46min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.69(s,1H),8.63(d,J＝5.48Hz,1H),8.56(s,1H),8.42(d,J＝5.04Hz,1H),8.18(s,1H),7.99(s,1H),7.72(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),7.66-7.61(m,2H),7.50(d,J＝8.11Hz,1H),7.27(s,1H),5.72(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.37-3.15(m,3H),3.04(dd,J＝12.17,3.40Hz,1H),2.75(s,3H),2.44-2.30(m,1H),2.19-2.06(m,1H)。
实施例311
合成(4S)-N-(4-(2,2-二甲基四氢-2H-吡喃-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-(2,2-二甲基-3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(220mg,0.456mmol)和甲酸铵(287mg,4.56mmol)在甲醇(30mL)中的搅拌的溶液中加入10％Pd-C(48.5mg,0.046mmol)且在65℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3；UV活化的)。将反应混合物冷却，固体经硅藻土过滤并将滤液浓缩，得到粗产物。将粗产物用戊烷(5mL)和乙醚(5ml)研磨，得到期望的(4S)-N-(4-(2,2-二甲基四氢-2H-吡喃-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(57mg,0.117mmol,25.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):485.25[M+H]+,Rt＝1.67min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.54(s,1H),8.61(d,J＝5.26Hz,1H),8.29(d,J＝5.26Hz,1H),8.20(s,1H),8.14(s,1H),7.71(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),7.62(d,J＝7.89Hz,1H),7.48(d,J＝8.11Hz,1H),6.89(dd,J＝5.04,1.32Hz,1H),5.71(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.90-3.74(m,2H),3.36-3.14(m,3H),3.06-2.92(m,2H),2.74(s,3H),2.40-2.30(m,1H),2.09(dt,J＝14.14,6.96Hz,1H),1.84-1.63(m,3H),1.59(s,1H),1.30(d,J＝13.81Hz,6H)
实施例312
合成(4S)-N-(6-(3-羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.4g,1.310mmol)在THF(50mL)中的搅拌的溶液中加入Et3N(0.913mL,6.55mmol)、三光气(0.389g,1.310mmol)并搅拌1h。然后3-((6-氨基吡啶-2-基)氧基)丙-1-醇(0.331g,1.965mmol)加入并将反应混合物在65℃加热16h。(TLC洗脱剂：100％EtOAc:Rf-0.3；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩并将残余物分配在水(30mL)和EtOAc(50mL)之间。分离有机层并经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝，洗脱剂：70％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-N-(6-(3-羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(0.115g,0.226mmol,17.25％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):500.12[M+H]+,Rt＝2.41min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.01(s,1H),8.28(d,J＝7.45Hz,1H),8.04(s,1H),7.66-7.70(m,2H),7.62-7.65(m,1H),7.59-7.61(m,1H),7.55-7.58(m,1H),7.34(d,J＝7.89Hz,1H),6.42(dd,J＝7.89,0.66Hz,1H),5.70(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),4.21-4.15(m,2H),3.65(q,J＝5.85Hz,2H),3.36-3.12(m,3H),3.01(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.33(dddd,J＝14.09,9.87,5.86,4.17Hz,1H),2.16-2.01(m,2H),1.82(quin,J＝5.92Hz,2H)。
实施例313
合成(4S)-N-(1-甲基环丙基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐:
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.983mmol)在四氢呋喃(20mL)中的溶液中加入三乙胺(0.822mL,5.90mmol)和三光气(292mg,0.983mmol)且搅拌30min。然后加入1-甲基环丙胺(140mg,1.965mmol)并在80℃加热15h。(TLC系统:5％MeOH/DCM,Rf:0.4)。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩并将残余物分配在水(25mL)和EtOAc(70mL)之间。分离有机层并经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗物质经快速柱色谱纯化(100-200硅胶,洗脱剂：4％甲醇/二氯甲烷)，得到胶状物质。将该胶状物质溶于乙醚(10mL)并加入2.0MHCl(3mL)的乙醚溶液。将反应混合物在室温搅拌2h并浓缩。所得固体用乙醚洗涤，得到期望的产物(4S)-N-(1-甲基环丙基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(170mg,0.369mmol,37.6％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):403.13,[M+H]+,Rt＝2.49min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 10.44(s,1H),8.21(d,J＝7.89Hz,1H),8.14(s,1H),8.00–7.75(m,2H),7.71(d,J＝8.11Hz,1H),5.50(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),5.15–4.87(m,1H),4.87-4.63(m,1H),3.56-3.29(m,4H),2.43-2.21(m,1H),2.19–1.94(m,1H),1.39(s,3H),0.79-0.59(m,2H),0.08-0.07(m,2H).
实施例314
合成(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.298mmol)在甲醇(3mL)中的搅拌的溶液中滴加盐酸(1mL,32.9mmol)，历时5min的时间，然后在室温搅拌2h(TLC系统:5％甲醇/DCM.Rf值：0.3),蒸发溶剂，用碳酸氢钠溶液中和并过滤所得固体，用水洗涤并干燥，得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％MeOH/CH2Cl2)，得到期望的产物(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(90mg,0.193mmol,64.9％收率)，其为淡棕色固体。LCMS(m/z):464.15[M+H]+,Rt＝1.26min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.14(s,1H),8.97(s,1H),8.65(d,J＝5.04Hz,1H),8.02(s,1H),7.90-7.70(m,4H),5.52(dd,J＝5.59,2.74Hz,1H),4.99(d,J＝4.82Hz,1H),4.65(t,J＝5.59Hz,1H),4.27-4.10(m,2H),3.87-3.71(m,1H),3.41(d,J＝11.40Hz,2H),3.25-3.03(m,3H),2.97(dd,J＝12.06,3.07Hz,1H),2.57(s,3H),2.36-2.17(m,1H),2.04-1.85(m,1H)。
实施例315
合成(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.696mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中滴加盐酸(2mL,65.8mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在室温搅拌2h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM:Rf-0.3)，然后蒸发溶剂，用碳酸氢钠溶液中和，将获得的固体过滤并用水洗涤，干燥，得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％甲醇/DCM)，得到期望的化合物(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.451mmol,64.8％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):463.11[M+H]+,Rt＝1.38min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 12.82(s,1H),8.65(d,J＝5.26Hz,1H),7.92(dd,J＝5.26,1.32Hz,1H),7.85(s,1H),7.79-7.63(m,4H),6.60-6.43(m,1H),5.57-5.46(m,1H),4.88(br s,1H),4.58(br s,1H),4.18-3.99(m,2H),3.83-3.67(m,1H),3.38(t,J＝5.37Hz,2H),3.25-3.03(m,3H),2.95(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.57(s,3H),2.23-2.23(m,1H),1.84-2.02(m,1H)。
实施例316
合成(4S)-N-(4-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(4-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.398mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中滴加盐酸(1mL,32.9mmol)，历时5min的时间。然后将反应混合物在室温搅拌2h(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM:Rf-0.2)，并蒸发溶剂，用碳酸氢钠溶液中和，将获得的固体过滤并用水洗涤，干燥，得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：4％甲醇/DCM)，得到期望的产物(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.451mmol,64.8％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):463.18[M+H]+,Rt＝1.13min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.48(s,1H),8.58(s,1H),8.31-8.16(m,2H),7.95(d,J＝4.82Hz,1H),7.83-7.65(m,3H),6.74(dd,J＝5.70,2.19Hz,1H),5.56-5.44(m,1H),5.07-4.97(m,1H),4.71(br s,1H),4.19-4.04(m,1H),3.97(dd,J＝9.87,6.36Hz,1H),3.84(br s,1H),3.47(brs,2H),3.03-3.39(m,3H),2.96(dd,J＝11.84,2.85Hz,1H),2.6(s,3H),2.33-2.12(m,1H),2.01-1.85(m,1H)。
实施例317
合成(4S)-N-(4-环丙基吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.485mmol)、2-环丙基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(122mg,0.727mmol)和磷酸三钾(308mg,1.455mmol)在1,4-二噁烷(4mL)和水(1mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)(35.5mg,0.048mmol)。将反应混合物在80℃搅拌16h(TLC洗脱剂：5％MeOH/DCM:Rf-0.3)。将反应混合物用水稀释并用乙酸乙酯萃取(2x10mL)。合并的有机层用盐水洗涤(10mL)溶液，然后经无水硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：2％MeOH/乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-N-(4-环丙基吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(70mg,0.169mmol,34.8％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):413.14[M+H]+,Rt＝1.57min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.46(s,1H),8.61(d,J＝5.48Hz,1H),8.20(d,J＝5.92Hz,2H),7.95(s,1H),7.71(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),7.61(d,J＝7.89Hz,1H),7.47(d,J＝7.89Hz,1H),6.71(dd,J＝5.15,1.64Hz,1H),5.70(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.42-3.09(m,3H),3.07-2.91(m,1H),2.67(s,3H)2.42-2.23(m,1H),2.09(dt,J＝14.03,6.80Hz,1H),1.99-1.79(m,1H),1.15-0.95(m,2H),0.93-0.72(m,2H)。
实施例318
合成(4S)-N-(6-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.351mmol)在四氢呋喃(15mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(1mL,2.74mmol)，然后在28℃搅拌1h。(TLC系统:净乙酸乙酯,Rf:0.2)。将反应混合物真空浓缩并将残余物用饱和NaHCO3溶液中和，过滤获得的固体，用水(20mLx3)和正戊烷(10mL×2)洗涤，得到(4S)-N-(6-(2-羟基乙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(98mg,0.201mmol,57.4％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):487.12[M+H]+,Rt＝2.15min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.20(s,1H),9.04(s,1H),8.20(d,J＝7.67Hz,1H),8.04(s,1H),7.97(s,1H),7.72-7.68(m,1H),7.66-7.60(m,2H),7.37(d,J＝7.89Hz,1H),5.71(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.18(td,J＝4.60,1.75Hz,2H),3.87-3.80(m,2H),3.34-3.14(m,3H),3.03(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.35(dddd,J＝14.17,9.95,5.92,4.17Hz,1H),2.14-2.00(m,2H)。
实施例319
合成(4S)-N-(2-(2-羟基乙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(2-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.351mmol)在THF(15mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(1mL,2.74mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC系统:净乙酸乙酯,Rf:0.2)。将反应混合物真空浓缩并将残余物过滤并用水(20mLx3)和正戊烷(10mL×2)洗涤，得到期望的产物(4S)-N-(2-(2-羟基乙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.305mmol,87％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):487.12[M+H]+,Rt＝2.15min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.64(s,1H),8.40(d,J＝6.80Hz,1H),8.36(d,J＝5.70Hz,1H),8.08(s,1H),7.82(d,J＝5.70Hz,1H),7.74-7.64(m,3H),7.42(d,J＝8.11Hz,1H),5.67(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.40-4.37(m,2H),3.94-3.90(m,2H),3.34-3.15(m,3H),3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.74(s,1H),2.40-2.30(m,1H),2.08(dt,J＝14.14,6.96Hz,1H)。
实施例320
合成(4S)-N-(6-(3-羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温向((4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,0.983mmol)在四氢呋喃(20mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(146mg,0.491mmol)且搅拌30min。向该反应混合物中加入三乙胺(0.685mL,4.91mmol)和3-((6-氨基吡嗪-2-基)氧基)丙-1-醇(216mg,1.277mmol)，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:5％甲醇/乙酸乙酯。Rf值：0.5.)。将反应混合物用水稀释(20mL)并用乙酸乙酯萃取(2x50ml)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(20mL)，经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，用15％MeOH/CH2Cl2洗脱)，得到期望的产物(4S)-N-(6-(3-羟基丙氧基)吡嗪-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(110mg,0.212mmol,21.56％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):501.16[M+H]+,Rt＝2.22min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.19(s,1H),9.01(s,1H),8.22(d,J＝7.67Hz,1H),8.03(s,1H),7.93(s,1H),7.73-7.58(m,3H),7.37(d,J＝8.11Hz,1H),5.71(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),4.27-4.14(m,2H),3.72(q,J＝5.70Hz,2H),3.36-3.13(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.41-2.29(m,1H),2.10(dt,J＝14.25,6.91Hz,1H),1.90(quin,J＝5.97Hz,2H),1.69(t,J＝5.26Hz,1H)。
实施例321
合成(4S)-N-(2-(3-羟基-2,2-二甲基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.310mmol)在四氢呋喃(20mL)中的溶液中加入三光气(194mg,0.655mmol)和TEA(0.913mL,6.55mmol)，然后在室温搅拌30min。然后，将3-((4-氨基嘧啶-2-基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-醇(336mg,1.703mmol)加至该反应混合物，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:乙酸乙酯。Rf值：0.4)。将反应混合物用水稀释(20mL)并用乙酸乙酯萃取(2x50ml)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(20mL)，经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，用0-15％甲醇/DCM洗脱)，得到期望的化合物(4S)-N-(2-(3-羟基-2,2-二甲基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(60mg,0.112mmol,8.55％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):529.25[M+H]+,Rt＝2.47min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.74(s,1H),8.53(br d,J＝7.02Hz,1H),8.34(d,J＝5.70Hz,1H),8.06(s,1H),7.78-7.69(m,3H),7.65(d,J＝7.89Hz,1H),7.45(d,J＝8.11Hz,1H),5.66(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.15(s,2H),3.50-3.44(m,3H),3.36(s,3H),3.02(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.40-2.28(m,1H),2.07(dt,J＝14.47,7.45Hz,1H),1.07(s,J＝16.50,9.50Hz,6H)。
实施例322
合成(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在0℃向(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.272mmol)在乙醚(2mL)中的混悬液中加入2M HCl的乙醚溶液(2mL,65.8mmol)并将所得混合物在室温搅拌3h。将反应物质静置5min，固体物质沉降，然后滗出溶剂。获得的固体用乙醚研磨，过滤并真空干燥，得到(4S)-8-氯-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(145mg,0.243mmol,89％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):551.05[M+H]+,Rt＝2.36min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.00(s,1H),8.31(d,J＝0.88Hz,1H),8.09-8.18(m,2H),7.97(s,1H),7.90(d,J＝7.67Hz,1H),7.77-7.85(m,1H),7.38(d,J＝0.88Hz,1H),5.48(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),4.30-4.39(m,1H),4.20(dd,J＝10.85,6.47Hz,1H),3.73-3.86(m,1H),3.30-3.49(m,3H),3.16-3.28(m,2H),3.10(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.23-2.37(m,1H),1.96-2.10(m,1H)。
实施例323
合成(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
在0℃向(4S)-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.596mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(4mL,132mmol)，然后在室温搅拌2h。(TLC系统:5％MeOH/DCM,Rf:0.5)。将反应混合物真空浓缩，并将残余物用NaHCO3水溶液中和并将获得的固体过滤，然后用正戊烷洗涤(2x10mL)，得到期望的产物(4S)-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(83mg,0.175mmol,29.4％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):464.12[M+H]+,Rt:1.28min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.67(s,1H),8.68(d,J＝5.26Hz,1H),8.36(d,J＝5.70Hz,1H),7.85(d,J＝5.70Hz,1H),7.79-7.74(m,2H),7.65(d,J＝7.89Hz,1H),7.46(d,J＝7.89Hz,1H),5.66(dd,J＝5.59,2.96Hz,1H),4.44-4.31(m,2H),4.14-4.02(m,1H),3.77-3.63(m,2H),3.44-3.12(m,5H),3.02(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.72(s,3H),2.41-2.29(m,1H),2.07(dt,J＝14.25,7.34Hz,1H)。
实施例324
合成(4S)-7-(6-氨基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(20g,63.1mmol)、K3PO4(40.2g,189mmol)和5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-胺(16.68g,76mmol)在1,4-二噁烷(400mL)/水(133mL)中脱气的溶液中加入Pd2(dba)3(2.89g,3.16mmol)和X-phos(3.01g,6.31mmol)。将反应混合物再次脱气10min，然后在110℃搅拌16h。(TLC系统:5％MeOH/乙酸乙酯,Rf:0.3)。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩并将残余物用水稀释(500mL)并用EtOAc萃取(2x400mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶,洗脱剂：净乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-7-(6-氨基吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(14.3g,38.2mmol,60.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):375.12[M+H]+,Rt＝1.27min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.80(s,1H),9.40(d,J＝1.31Hz,1H),8.72(d,J＝2.41Hz,1H),8.41-8.31(m,2H),8.17(dd,J＝8.77,2.63Hz,1H),7.59(d,J＝8.11Hz,1H),7.49(d,J＝8.11Hz,1H),6.58(d,J＝8.77Hz,1H),6.35(s,2H),5.50(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.24-3.01(m,3H),2.93(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.23(dddd,J＝13.59,9.81,5.97,3.73Hz,1H),1.95(td,J＝14.25,7.23Hz,1H)。
实施例325
合成(4S)-N-(4-(1,3-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,0.990mmol)在1,4-二噁烷(16.0mL)和水(2.0mL)中脱气的溶液中加入1,3-二甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(330mg,1.484mmol)、磷酸三钾(315mg,1.484mmol)和PdCl2(dppf)-DCM(81mg,0.099mmol)。然后将反应混合物在110℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯Rf:0.1；UV活化的)，然后将反应混合物冷却至室温并用水稀释(50mL),用乙酸乙酯萃取(2×50mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目：洗脱剂：80％乙酸乙酯/石油醚)，接着进行制备型HPLC(制备型HPLC条件：MP-A:10Mm碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈柱：Kinetex c8(150*30)mm,5um方法：50:50流速：30ml/min；洗脱剂：THF+ACN+MEOH)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1,3-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(180mg,0.342mmol,34.6％收率)，其为淡棕色固体。LCMS(m/z):521.1[M+H]+,Rt＝3.75min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.38(s,1H),8.87(d,J＝5.04Hz,1H),8.48(s,1H),8.33-8.25(m,3H),7.70-7.65(m,2H),7.52(d,J＝7.89Hz,1H),7.06(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),5.72(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.89(s,3H),3.32-3.15(m,3H),3.04(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.52(s,3H),2.40-2.31(m,1H),2.11(dt,J＝14.09,7.10Hz,1H)。
实施例326
合成(4S)-N-(6-(2-羟基乙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(6-(2-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)乙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.439mmol)在甲醇(10mL)中的溶液中加入HCl水溶液(0.6mL,19.75mmol,36％)且搅拌1h。(TLC洗脱剂：100％乙酸乙酯:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物用饱和碳酸氢钠溶液碱化(直到pH-8-9)并减压蒸发溶剂。将残余物用水稀释(10mL)并萃取到二氯甲烷中(2x20mL)。合并的有机萃取物经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制化合物。粗物质用10％乙酸乙酯/己烷研磨并减压干燥，得到(4S)-N-(6-(2-羟基乙氧基)吡啶-2-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(195mg,0.401mmol,91％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):486.12[M+H]+,Rt＝2.33min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.99(s,1H),8.26(d,J＝7.67Hz,1H),8.04(s,1H)，7.74-7.53(m,5H),7.34(d,J＝7.89Hz,1H),6.46(d,J＝7.89Hz,1H),5.70(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H)，4.20-4.07(m,2H),3.75(br s,2H)，3.35-3.12(m,3H),3.02(dd,J＝12.06,3.07Hz,1H)，2.43-2.19(m,2H),2.10(dt,J＝14.03,7.02Hz,1H)。
实施例327
合成(4S)-N-(1-甲基-6-氧代-1,6-二氢嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.638mmol)在THF(20mL)中的溶液中加入三光气(340mg,1.146mmol)和DIPEA(0.858mL,4.91mmol)并搅拌30min，然后加入6-氨基-3-甲基嘧啶-4(3H)-酮(246mg,1.965mmol)并将反应混合物在室温搅拌24h。(TLC洗脱剂：10％甲醇/DCM,Rf:0.4)。将反应混合物分配在水(50mL)和EtOAc(100mL)之间，分离有机层并经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物。粗物质经combiflash色谱纯化(硅胶柱,5％MeOH/DCM)，得到(4S)-N-(1-甲基-6-氧代-1,6-二氢嘧啶-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(170mg,0.369mmol,22.53％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):457.13[M+H]+,Rt＝2.12min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.37(s,1H),8.42(s,1H),8.14(m,J＝7.89Hz,1H),7.92(s,1H),7.70(br d,J＝7.67Hz,1H),7.57-7.67(m,2H),7.28-7.46(m,1H),7.23(s,1H),b5.68(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.49(s,3H),3.09-3.34(m,3H),3.00(dd,J＝12.06,3.07Hz,1H),2.20-2.44(m,1H),1.94-2.19(m,1H)。
实施例328
合成(4S)-N-(4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.443mmol)、K3PO4(282mg,1.329mmol)、1-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(138mg,0.665mmol)在1,4-二噁烷(8mL)和水(2mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)(32.4mg,0.044mmol)。然后将反应混合物再脱气5min，然后在80℃搅拌16h。(TLC系统:(10％MeOH/DCM,Rf:0.3),使反应混合物冷却至室温并用水稀释。然后将化合物用乙酸乙酯萃取(3X20mL)。合并的有机层用盐水洗涤(2x5mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩.将化合物经快速柱色谱纯化(100-200目，洗脱剂：净乙酸乙酯-2％DCM/MeOH)并进一步通过制备型HPLC纯化(流动相:5mM碳酸氢铵B:ACN方法：0/10-2/25/10/55洗脱剂:MeOH,THF)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(60mg,0.131mmol,29.5％收率)，其为黄色固体。LCMS(m/z):453.17[M+H]+,Rt＝1.41min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.56(s,1H),8.62(d,J＝5.48Hz,1H),8.37(d,J＝0.66Hz,1H),8.31(d,J＝5.04Hz,1H),8.22(s,1H),7.91(d,J＝0.66Hz,1H),7.82(s,1H),7.72(dd,J＝5.37,1.43Hz,1H),7.63(d,J＝7.89Hz,1H),7.49(d,J＝7.89Hz,1H),7.11(dd,J＝5.15,1.64Hz,1H),5.71(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.96(s,3H),3.35-3.16(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.75(s,3H),2.41-2.31(m,1H),2.17-2.05(m,1H)。
实施例329
合成(4S)-7-(2,2-二氟苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
在氮气下在0℃向(4S)-7-(2,2-二氟苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.4g,1.261mmol)在四氢呋喃(THF)(15mL)中的溶液中加入三乙胺(1.054mL,7.56mmol)和三光气(0.374g,1.261mmol)且在室温搅拌1h。向该反应混合物中加入吡啶-3-胺(0.237g,2.52mmol)，然后在90℃搅拌16h。(TLC系统:100％乙酸乙酯。Rf值：0.5)。将反应混合物用水稀释并用乙酸乙酯萃取(2x30ml)。合并的有机层用盐水溶液洗涤，经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，用50％乙酸乙酯/石油醚洗脱)，得到期望的产物(4S)-7-(2,2-二氟苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.474mmol,37.6％收率)，其为淡棕色固体。LCMS(m/z):438.13[M+H]+,Rt＝1.95min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.25(s,1H),8.53(d,J＝2.19Hz,1H),8.27(dd,J＝4.71,1.42Hz,1H),8.05-7.87(m,1H),7.80-7.66(m,2H),7.57-7.47(m,2H),7.43-7.30(m,2H),5.49(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),3.16-3.07(m,3H),2.97(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.25(J＝13.67,9.89,5.92,3.84Hz,1H),1.96(dt,J＝14.03,7.02Hz,1H)。
实施例330
合成(4S)-7-(6-(甲基氨基)吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
向(4S)-7-氯-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(4.2g,13.26mmol)、N-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-胺(3.41g,14.59mmol)和Na2CO3(4.22g,39.8mmol)在1,4-二噁烷(18mL):水(4.50mL)中脱气的溶液中加入Pd(PPh3)4(0.766g,0.663mmol)。将反应混合物在110℃搅拌16h。(TLC系统:5％甲醇/乙酸乙酯,Rf:0.3)。使得反应混合物冷却至室温，然后减压蒸发1,4-二噁烷溶剂,将获得的残余物用水稀释(50mL)且用乙酸乙酯萃取(2x100ml)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶100-200目：洗脱剂：净乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-7-(6-(甲基氨基)吡啶-3-基)-N-(吡嗪-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(2.50g,6.40mmol,48.3％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):389.16[M+H]+，Rt＝1.31min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.90(s,1H),9.54(d,J＝1.53Hz,1H),8.75(d,J＝2.63Hz,1H),8.36-8.29(m,3H),8.28(s,1H),7.55(d,J＝7.89Hz,1H),6.53(d,J＝8.77Hz,1H),5.69(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.78(d,J＝4.82Hz,1H),3.33-3.13(m,3H),3.07-2.97(m,4H),2.35-2.26(m,1H),2.13-2.03(m,1H)。
实施例331
合成(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-N-(6-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(50mg,0.099mmol)在甲醇(3mL)中的搅拌的溶液中滴加盐酸(1mL,32.9mmol)，历时5min的时间。然后，将反应混合物在28℃搅拌30min。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM:Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物用碳酸氢钠溶液中和且过滤获得的固体，用水洗涤，然后用50％乙醚/戊烷研磨，得到期望的化合物(4S)-N-(6-((S)-2,3-二羟基丙氧基)嘧啶-4-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(80mg,0.165mmol,167％收率)，其为黄色固体。LCMS(m/z):464.15[M+H]+,Rt:1.26min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.72(s,1H),8.62-8.54(m,2H),8.15(s,1H),7.93(s,1H),7.82(d,J＝7.45Hz,1H),7.74(d,J＝7.23Hz,1H),7.47(s,1H),5.49(s,1H),4.98(d,J＝4.38Hz,1H),4.67(s,1H),4.38(d,J＝8.55Hz,1H),4.26-4.18(m,1H),3.82(s,1H),3.45(s,2H),3.29(s,3H),3.14-2.91(m,1H),2.63(s,3H),2.24(s,1H),1.96(s,1H)。
实施例332
合成(4S)-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,0.990mmol)在1,4-二噁烷(20mL):水(5mL)中脱气的溶液中加入K3PO4(630mg,2.97mmol)、2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(310mg,1.484mmol)和PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(81mg,0.099mmol))，然后将反应混合物在85℃搅拌16h。(TLC系统:Rf-0.2,EtOAc)。将反应混合物冷却至室温并用水稀释(120mL)，用乙酸乙酯萃取(2x250mL)，用盐水洗涤(100mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：95％乙酸乙酯/己烷)并将其再次通过制备型HPLC纯化(条件：流动相A:10.0mM碳酸氢铵流动相B:乙腈；等梯度：50:50(A:B)柱：Xbridge C18(250*30)mm,10um洗脱剂：乙腈+体积过量的THF+MeOH流速：30ml/min)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(240mg,0.473mmol,47.8％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):508.1[M+H]+,Rt＝2.37min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.48(s,1H),8.87(d,J＝5.26Hz,1H),8.46(d,J＝12.72Hz,2H),8.36(d,J＝5.26Hz,1H),8.23(dd,J＝5.04,1.32Hz,1H),7.68(d,J＝7.89Hz,1H),7.53(d,J＝8.11Hz,1H),7.46(s,1H),7.21(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),5.73(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.35-3.14-(m,3H),3.06(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.56(s,3H),2.47-2.28(m,1H),2.12(dt,J＝14.20,7.04Hz,1H)。
实施例333
合成(4S)-N-(4-(噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,0.990mmol)在1,4-二噁烷(20mL):水(5mL)中的脱气的溶液中加入K3PO4(630mg,2.97mmol)、5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(289mg,1.484mmol)和PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(81mg,0.099mmol)，然后将反应混合物在85℃搅拌16h。(TLC系统:Rf-0.2,EtOAc)。使反应混合物冷却至RT并用水稀释(120mL)，用乙酸乙酯萃取(2x250mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶：100-200目，洗脱剂：90％乙酸乙酯/己烷)并将其再次通过制备型HPLC纯化(条件：MP-A:10mm碳酸氢铵MP-B：乙腈柱：Xterra(150*19mm,10u)sun方法：T/％B 0/25,1/25,6/65,13/65,13.10/100,16/100,16.10/25,19/25流速：17ml/min洗脱剂：ACN+THF+MEOH)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.423mmol,42.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):494.1[M+H]+,Rt＝8.46min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.53(s,1H),8.89(d,J＝5.04Hz,1H),8.54-8.47(m,2H),8.41(d,J＝5.26Hz,1H),8.22(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),8.00(s,1H),7.70(d,J＝8.11Hz,1H),7.62(s,1H),7.54(d,J＝7.89Hz,1H),7.32-7.27(m,1H),5.74(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.37-3.16(m,3H),3.07(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.46-2.32(m,1H),2.13(dt,J＝14.09,6.88Hz,1H)。
实施例334
合成(4S)-N-(4-(2-甲基噁唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃在氮气下向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(8g,31.7mmol)在四氢呋喃(600mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(5.65g,19.02mmol)和DIPEA(28mL,159mmol)，然后在室温搅拌30min。然后，加入4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-胺(8.33g,47.6mmol)，然后在80℃搅拌16h。(TLC:10％MeOH/乙酸乙酯,Rf:0.3)。使得反应混合物冷却至室温，倒入冷水(150mL)中，用乙酸乙酯萃取(2x300mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,65％乙酸乙酯/石油醚)，得到期望的产物(6g)。将其吸收在乙酸乙酯中(800mL)且加入Silicycle钯清除剂(3g)，然后在50℃搅拌4h。将混合物经硅藻土垫过滤并用热乙酸乙酯洗涤(50ml),将获得的滤液减压浓缩，得到不含Pd的(4S)-N-(4-(2-甲基噁唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(5.5g,12.12mmol,38.2％收率)，其为黄色固体。LCMS(m/z):454.22[M+H]+,Rt＝1.53min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.65(s,1H),8.62(d,J＝5.26Hz,1H),8.47-8.52(m,1H),8.38(dd,J＝5.26,0.66Hz,1H),8.17-8.23(m,1H),7.72(dd,J＝5.15,1.64Hz,1H),7.63(d,J＝7.89Hz,1H),7.43-7.52(m,2H),7.20(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),5.72(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.15-3.37(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.75(s,3H),2.56(s,3H),2.36(dddd,J＝14.00,9.89,5.92,3.95Hz,1H),2.05-2.16(m,1H)。
实施例335
合成(4S)-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐
在0℃向(4S)-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(100mg,0.221mmol)在乙醚(10mL)中的搅拌的溶液中滴加2M HCl的乙醚溶液(2.5mL,0.221mmol)，历时2min的一段时间。然后将反应混合物在30℃搅拌2h。(TLC:10％MeOH/DCM,Rf:0.2)，并减压蒸发溶剂，将获得的固体化合物用正戊烷洗涤(2x20mL)，得到期望的化合物(4S)-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(84mg,0.171mmol,78％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):454.22[M+H]+,Rt＝1.52min。
1H NMR(400MHz,CD3OD):δppm 8.93(d,J＝6.14Hz,1H),8.69(s,1H),8.59(d,J＝5.92Hz,1H),8.45(d,J＝6.14Hz,1H),8.32(d,J＝8.11Hz,1H),8.14(d,J＝8.11Hz,1H),8.04(s,1H),7.96(s,1H),7.78(d,J＝6.14Hz,1H),5.88(d,J＝5.70Hz,1H),4.06-3.98(m,4H),2.95(s,3H),2.84-2.71(m,2H),2.67(s,3H),2.59(dt,J＝14.31,6.99Hz,1H)。
实施例336
合成(4R)-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4R)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.997mmol)、2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(313mg,1.496mmol)和K3PO4(635mg,2.99mmol)在1,4-二噁烷(16mL):水(4mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)(73.0mg,0.100mmol)。将反应混合物在90℃搅拌16h。(TLC:10％MeOH/EtOAc Rf:0.7。减压蒸发1,4-二噁烷溶剂,将获得的残余物用水稀释(50mL)且用乙酸乙酯萃取(2x100mL)。合并的有机层用水、盐水洗涤，经硫酸钠干燥并减压蒸发溶剂，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化((硅胶100-200目：洗脱剂：2％MeOH/DCM)，得到期望的产物(4R)-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.550mmol,55.1％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):454.22[M+H]+,Rt＝1.52min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.66(s,1H),8.63(d,J＝5.26Hz,1H),8.49(s,1H),8.38(d,J＝5.26Hz,1H),8.19(d,J＝1.32Hz,1H),7.72(dd,J＝5.26,1.75Hz,1H),7.63(d,J＝7.89Hz,1H),7.52-7.45(m,2H),7.21(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),5.72(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.36-3.14(m,3H),3.04(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.75(s,3H),2.56(s,3H),2.42-2.30(m,1H),2.11(dt,J＝14.09,7.10Hz,1H)。
实施例337
合成(4S)-N-(4-(2-甲基噻唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,0.990mmol)在1,4-二噁烷(20.0mL)和水(5.0mL)中脱气的溶液中加入2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噻唑(334mg,1.484mmol)，Na2CO3(315mg,2.97mmol)和Pd(TPP)4(57.2mg,0.049mmol)并将反应混合物在110℃搅拌16h。(TLC系统:100％乙酸乙酯，Rf值：0.3)。将反应混合物冷却至室温，用水稀释(30mL)且用乙酸乙酯萃取(2×20mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶100-200目，用40％乙酸乙酯/石油醚洗脱)，接着用制备型HPLC纯化(柱：Xbridge C18(50x19mm)5μ；流动相-A:10M碳酸氢铵；流动相-B：乙腈，方法(T/％B):0/20,/10/55；流速：17ml/min；洗脱剂：乙腈+MeOH+THF+TFA)，得到(4S)-N-(4-(2-甲基噻唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-(三氟甲基)吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(195mg,0.372mmol,37.6％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):524.13[M+H]+,Rt＝2.54min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.47(s,1H),8.87(d,J＝5.26Hz,1H),8.48(s,1H),8.41(d,J＝0.88Hz,1H),8.33(d,J＝5.26Hz,1H),8.22(dd,J＝5.15,1.64Hz,1H),8.05(s,1H),7.68(d,J＝7.89Hz,1H),7.53(d,J＝7.89Hz,1H),7.14(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),5.73(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.36-3.15(m,3H),3.05(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.76(s,3H),2.37(qd,J＝9.90,4.28Hz,1H),2.12(dt,J＝14.14,7.18Hz,1H)。
实施例338
合成(4S)-N-(4-(1H-1,2,3-三唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.189mmol)在四氢呋喃(10mL,密封管)中的搅拌的溶液中加入TEA(0.829mL,5.94mmol)和三光气(353mg,1.189mmol)且搅拌45min。然后在室温将4-(1H-1,2,3-三唑-5-基)吡啶-2-胺(287mg,1.783mmol)加至反应混合物，然后在80℃搅拌16h。(TLC系统:5％MeOH\DCM.Rf值：0.3,UV)。将反应混合物冷却至室温，用水稀释(15mL)，用乙酸乙酯萃取(5X20mL)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤(10mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经制备型HPLC纯化(条件：MP-A:10Mm碳酸氢铵(水溶液),MPB：乙腈,柱：Atlantis T3(250*19mm*5u),方法：0/35,11/35,11.1/100,15/100,15.1/35,19/35,流速：16ml/min,洗脱剂：ACN+THF+MeOH+DMSO)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1H-1,2,3-三唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(60mg,0.133mmol,11.15％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):440.21[M+H]+,Rt＝1.42min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.57(s,1H),8.66(s,1H),8.60(d,J＝5.26Hz,1H),8.49-8.39(m,2H),8.25(s,1H),7.96(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),7.85-7.79(m,2H),7.72(d,J＝7.89Hz,1H),7.56(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),5.54(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),3.17-3.06(m,3H),2.98(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.64(m,3H),2.36-2.20(m,1H),1.98(dt,J＝13.70,6.96Hz,1H)。
实施例339
合成(4S)-N-(5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(5-溴吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.886mmol)，Na2CO3(282mg,2.66mmol)和1-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(277mg,1.329mmol)在1,4-二噁烷(28mL)和水(7.00mL)中脱气的溶液中加入Pd(Ph3P)4(51.2mg,0.044mmol)并将反应混合物在75℃搅拌16h。(TLC系统10％MeOH/乙酸乙酯,Rf:0.2)。将反应混合物用水稀释并用乙酸乙酯萃取(2x100mL)。合并的有机层用水和盐水洗涤，经Na2SO4干燥，过滤并浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：2％MeOH/EtOAc)，得到期望的产物(4S)-N-(5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.262mmol,29.6％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):453.29[M+H]+,Rt＝1.34min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.13(s,1H),8.68(d,J＝5.04Hz,1H),8.46(d,J＝1.75Hz,1H),8.38(q,J＝2.41Hz,2H),7.81(d,J＝0.66Hz,1H),7.67(d,J＝7.02Hz,1H),7.60(s,1H),7.54-7.48(m,2H),7.38(d,J＝7.89Hz,1H),5.70(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.96(s,3H),3.35-3.16(m,3H),3.04(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.67(s,3H),2.28-2.44(m,1H),2.11(dt,J＝14.09,6.88Hz,1H)。
实施例340
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(2-氧代噁唑烷-3-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350mg,1.387mmol)在四氢呋喃(10mL,密封管)中的搅拌的溶液中加入TEA(0.967mL,6.94mmol)、三光气(412mg,1.387mmol)且搅拌45min。然后在室温将3-(2-氨基吡啶-4-基)噁唑烷-2-酮(373mg,2.081mmol)加至反应混合物，然后在80℃搅拌16h。(TLC系统:5％MeOH\DCM.Rf值：0.3,UV)。使反应混合物冷却至室温并用水稀释(15mL)，用乙酸乙酯萃取(5X20mL)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤(10mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并减压浓缩滤液，得到粗制化合物。粗制化合物经制备型HPLC纯化(条件：MP A:10mM碳酸氢铵(水溶液),MP B：乙腈,柱：Kromosil C18(250*21.2)mm 10u,方法：T/％B＝0/40,12/40,12.5/100,16/100,16.5/40,流速：20ml/min,洗脱剂：乙腈+THF+水)，得到期望的产物(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(2-氧代噁唑烷-3-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(54mg,0.117mmol,8.47％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):458.26[M+H]+,Rt＝1.48min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.65(s,1H),8.62(d,J＝5.26Hz,1H),8.30(d,J＝5.70Hz,1H),8.20(s,1H),8.06(d,J＝1.75Hz,1H),7.80(dd,J＝5.81,2.08Hz,1H),7.71(d,J＝4.17Hz,1H),7.63(d,J＝7.89Hz,1H),7.49(d,J＝7.89Hz,1H),5.68(dd,J＝5.70,3.29Hz,1H),4.53(t,J＝8.00Hz,2H),4.15(t,J＝8.00Hz,2H),3.40-3.13(m,3H),3.02(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.74(s,3H),2.44-2.21(m,1H),2.09(dt,J＝13.98,6.71Hz,1H)。
实施例341
合成(4S)-N-(5-(1,3-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(5-溴吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.886mmol)、Na2CO3(282mg,2.66mmol)、1,3-二甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(295mg,1.329mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(5mL)中脱气的溶液中加入Pd(Ph3P)4(51.2mg,0.044mmol)且再次脱气5min。然后将反应混合物在80℃搅拌15h。(TLC系统:10％甲醇/二氯甲烷,Rf:0.2)。将反应混合物冷却至室温，然后从反应混合物中蒸发二噁烷溶剂，获得残余物，用水稀释并用乙酸乙酯萃取(3X50mL)。合并的有机层用盐水洗涤(2x20mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，获得粗制化合物。粗物质经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：90％乙酸乙酯/石油醚)，得到期望的产物(4S)-N-(5-(1,3-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(195mg,0.417mmol,47.1％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):467.1[M+H]+,Rt＝3.27.
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.12(s,1H),8.66(d,J＝5.04Hz,1H),8.42(d,J＝2.41Hz,1H),8.38(d,J＝1.97Hz,1H),8.31(t,J＝2.08Hz,1H),7.65(d,J＝7.89Hz,1H),7.60(s,1H),7.53-7.49(m,2H),7.38(d,J＝7.89Hz,1H),5.70(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.89(s,3H),3.34-3.15(m,3H),3.04(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.66(s,3H),2.42(s,3H),2.40-2.31(m,1H),2.11(dt,J＝14.31,7.43Hz,1H)。
实施例342
合成(4S)-N-(4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(450mg,1.783mmol)在四氢呋喃(10mL,密封管)中的搅拌的溶液中加入TEA(1.243mL,8.92mmol)和三光气(529mg,1.783mmol)且搅拌45min。然后在28℃将4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)吡啶-2-胺(345mg,2.140mmol)加至反应混合物，然后在80℃搅拌4h。(TLC系统:5％MeOH\DCM.Rf值：0.3,UV)。使反应混合物冷却至室温并用水稀释(15mL)，用乙酸乙酯萃取(5X20mL)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤(10mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经制备型HPLC纯化(条件：MP-A:10mM碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈,柱：kromasil(2150*21.1mm)5μ,方法：0/10,1/10,10/55,流速：17ml/min,洗脱剂：ACN+MeOH)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1H-1,2,3-三唑-1-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(175mg,0.398mmol,22.32％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):440.22[M+H]+,Rt＝1.60min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.83(s,1H),9.03(d,J＝1.10Hz,1H),8.81(d,J＝1.53Hz,1H),8.61(t,J＝5.81Hz,2H),8.21(s,1H),8.07(d,J＝1.32Hz,1H),7.95(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),7.87-7.79(m,1H),7.79-7.62(m,1H),5.54(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.28-3.19(m,1H),3.18-3.06(m,3H),2.99(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.62(s,3H),2.48-2.20(m,1H),2.09-1.85(m,1H)。
实施例343
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(5-(2-甲基噻唑-5-基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(5-溴吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.108mmol)、K3PO4(705mg,3.32mmol)、2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噻唑(374mg,1.662mmol)在1,4-二噁烷(16mL)和水(4mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(136mg,0.166mmol)，然后将反应混合物再次脱气5min，然后在80℃搅拌15h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf:0.2)。将反应混合物冷却至室温且蒸发反应混合物，获得粗产物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,80％乙酸乙酯/石油醚)，得到期望的产物(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(5-(2-甲基噻唑-5-基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(190mg,0.393mmol,35.4％收率)，其为棕色固体。LCMS(m/z):470.24[M+H]+,Rt＝1.59min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.21(s,1H),8.69(d,J＝5.04Hz,1H),8.52-8.43(m,3H),7.88(s,1H),7.66(d,J＝7.89Hz,1H),7.58(s,1H),7.51(dd,J＝5.15,1.21Hz,1H),7.39(d,J＝7.89Hz,1H),5.70(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.15-3.36(m,3H),3.04(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.76(s,3H),2.67(s,3H),2.36(qd,J＝10.01,4.17Hz,1H),2.11(dt,J＝13.98,6.93Hz,1H)。
实施例344
合成(4S)-N-(4-(1H-1,2,4-三唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(450mg,1.783mmol)在四氢呋喃(10mL,密封管)中的搅拌的溶液中加入TEA(1.243mL,8.92mmol)和三光气(529mg,1.783mmol)，然后在室温搅拌45min。然后在室温将4-(1H-1,2,4-三唑-5-基)吡啶-2-胺(345mg,2.140mmol)加至反应混合物，然后在80℃搅拌16h。(TLC系统:5％MeOH\DCM.Rf值：0.3,UV)。使反应混合物冷却至室温并用水稀释(15mL)，用乙酸乙酯萃取(5X20mL)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤(10mL)并经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液减压浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经制备型HPLC纯化(制备型HPLC方法：MP-A:10mM碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈,柱：kinetex C8(150*30)mm,5u,方法：0/10,1/10,8/40,12/40,12.1/100,15/100,15.1/10,流速：30ml/min,洗脱剂：乙腈+THF+甲醇+DMSO+DMSO+甲酸)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1H-1,2,4-三唑-5-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(102mg,0.221mmol,12.38％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):440.2[M+H]+,Rt＝3.71min.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 14.52(s,1H),13.63(s,1H),8.84(d,J＝0.88Hz,1H),8.70-8.55(m,1H),8.54-8.38(m,1H),8.37-8.35(d,1H)8.25(s,1H),7.95(dd,J＝5.37,1.43Hz,1H),7.86-7.77(m,1H),7.77-7.64(m,2H),5.54(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.18-3.05(m,3H),2.98(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.78-2.52(m,3H),2.48-2.36(m,1H),2.07(s,1H)。
实施例345
合成(4S)-N-(5-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(5-溴吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(350mg,0.776mmol)、Na2CO3(247mg,2.327mmol)和2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(243mg,1.163mmol)在1,4-二噁烷(20mL)和水(4mL)中的脱气的溶液中加入Pd(Ph3P)4(44.8mg,0.039mmol)并再次脱气5min。然后将所得反应混合物搅拌至80℃，保持15h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf:0.3)并使得反应混合物冷却至室温，从反应混合物中蒸发有机溶剂并将获得的残余物用水稀释,用乙酸乙酯萃取(3X20mL)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤(2x5mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，获得粗物质。粗制化合物经制备型HPLC纯化(条件：MP-A:10mM碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈柱：sunfire C8(150*19)mm,10u方法：-0/10,1/10,10/45流速：18ml/min；洗脱剂：甲醇+CAN+THF)，得到期望的产物(4S)-N-(5-(2-甲基噁唑-5-基)吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(68mg,0.149mmol,19.17％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):454.1[M+H]+,Rt＝3.39min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.24(s,1H),8.69(d,J＝5.26Hz,1H),8.58(d,J＝1.75Hz,1H),8.52(d,J＝2.19Hz,1H),8.48-8.44(m,1H),7.66(d,J＝7.89Hz,1H),7.59(s,1H),7.52(d,J＝5.26Hz,1H),7.39(d,J＝7.89Hz,1H),7.33(s,1H),5.71(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),3.37-3.15(m,3H),3.05(dd,J＝12.17,3.40Hz,1H),2.68(s,3H),2.56(s,3H),2.37(qd,J＝9.79,4.38Hz,1H),2.11(dt,J＝14.36,7.07Hz,1H)。
实施例346
合成(4S)-N-(4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气气氛下在室温在密封管中向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(350mg,1.387mmol)在四氢呋喃(25mL)中的搅拌的溶液中加入三光气(247mg,0.832mmol)、DIPEA(1.211mL,6.94mmol)，然后在室温搅拌30min。向其中加入4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)嘧啶-2-胺(365mg,2.081mmol)，然后在75℃搅拌16h。(TLC系统10％MeOH/乙酸乙酯,Rf:0.1)。使得反应混合物冷却至室温并用水稀释(100mL),用乙酸乙酯萃取(2x100mL)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤(50mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：50％EtOAc/石油醚)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(140mg,0.307mmol,22.11％收率)，其为黄色固体。LCMS(m/z):454.19[M+H]+,Rt＝1.44min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.75(s,1H),8.59(dd,J＝12.06,5.26Hz,2H),7.95(s,1H),7.90-7.84(m,2H),7.76(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),7.64(d,J＝7.89Hz,1H),7.45(d,J＝7.89Hz,1H),7.08(d,J＝5.26Hz,1H),5.78(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.95(s,3H),3.34-3.13(m,3H),3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.61(s,3H),2.43-2.26(m,1H),2.11(dt,J＝14.03,7.02Hz,1H)。
实施例347
合成(4S)-N-(1-甲基-5-(2-甲基噁唑-5-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(5-溴-1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,1.454mmol)和2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(456mg,2.181mmol)在1,4-二噁烷(24mL)和水(6mL)中的搅拌的溶液中加入K3PO4(926mg,4.36mmol)。将所得反应混合物用氮气脱气15min。然后将PdCl2(dppf)(106mg,0.145mmol)加至反应混合物且再次脱气5min。将所得反应混合物在100℃搅拌18h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf:0.6)。将反应混合物用水稀释(30mL)并用EtOAc萃取(3x30mL)。合并的有机层用水(20mL)，盐水溶液(20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗物质经柱色谱纯化(硅胶:100-200目；洗脱剂：4％MeOH/DCM)，获得粘稠的固体。将该粘稠的固体用EtOH(1mL)和乙醚(15mL)洗涤，过滤并充分干燥，得到期望的产物(4S)-N-(1-甲基-5-(2-甲基噁唑-5-基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(95mg,0.188mmol,12.94％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):484.24[M+H]+,Rt＝1.51min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ12.46(s,1H),8.61–8.53(m,2H),8.09(dt,J＝1.9,0.8Hz,1H),7.69–7.65.(d,J＝5.6Hz,1H),7.61-7.59(d,J＝7.9Hz,1H),7.43–7.31(m,2H),7.07(s,1H),5.70(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.64(s,3H),3.35–3.13(m,3H),3.00(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.69(s,3H),2.49(s,3H),2.39-2.34(dddd,J＝13.9,10.0,6.0,4.0Hz,1H),2.16-2.05(dt,J＝14.2,7.3Hz,1H)。
实施例348
合成(4S)-N-丙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺.
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(200mg,0.655mmol)在四氢呋喃(20mL)中的溶液中加入三乙胺(0.548mL,3.93mmol)和三光气(194mg,0.655mmol)且搅拌30min。然后加入丙-1-胺(77mg,1.310mmol)并在80℃加热15h。(TLC系统:5％MeOH/DCM Rf:0.5)。将反应混合物冷却至室温,真空浓缩并将残余物分配在水(25mL)和EtOAc(70mL)之间。分离有机层并经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗物质经快速柱色谱纯化(100-200硅胶,洗脱剂：3％甲醇/二氯甲烷)，得到期望的产物(4S)-N-丙基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(130mg,0.322mmol,49.1％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):391.07[M+H]+,Rt＝2.47min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.67-10.20(m,1H),8.04(s,1H),7.94(d,J＝7.67Hz,1H),7.69-7.65(m,1H),7.62-7.52(m,2H),7.27(s,1H),5.65(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.41(m,2H),3.30(m,3H),2.95(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.45(m,1H),2.09(m,1H),1.76-1.74(m,2H),0.94(t,J＝7.45Hz,3H)。
实施例349
合成(4R)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4R)-7-氯-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(3g,9.50mmol)在1,4-二噁烷(80mL)：水(20mL)中的搅拌和脱气的溶液中加入(2-甲基吡啶-4-基)硼酸(1.952g,14.25mmol)和K3PO4(6.05g,28.5mmol)。然后将反应混合物搅拌15min。且再次用氩气脱气15min。接着加入x-phos(1.812g,3.80mmol)和Pd2(dba)3(1.740g,1.900mmol)，然后在110℃搅拌3h。(TLC系统：净EtOAc,Rf:0.2)。然后使得反应混合物冷却至室温，倒入冰水(100mL)，用EtOAc萃取(2×300mL)。合并的有机层经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗产物。粗物质经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：2％MeOH/DCM)，得到期望的产物(4R)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(2g,5.37mmol,56.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):373.07[M+H]+,Rt＝1.14min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.07(s,1H),8.70-8.62(m,2H),8.32(dd,J＝4.71,1.43Hz,1H),8.20-8.09(m,1H),7.65(d,J＝7.89Hz,1H),7.59(s,1H),7.50(dd,J＝5.26,1.32Hz,1H),7.38(d,J＝7.89Hz,1H),7.30-7.23(m,1H),5.70(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.34-3.16(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.68(s,3H),2.35(dddd,J＝14.14,9.92,5.86,4.06Hz,1H),2.15-2.05(m,1H)。
实施例350
合成(4S)-N-环戊基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300.0mg,0.983mmol)在THF(20mL)中的搅拌的溶液中加入TEA(0.685mL,4.91mmol)、三光气(292mg,0.983mmol)并搅拌45min。然后加入环戊基胺(0.291mL,2.95mmol)并将反应混合物加热至75℃，保持9h。(TLC洗脱系统:100％EtOAc；Rf-0.4；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，将固体过滤并将滤液用水洗涤(5mL)并萃取到EtOAc中(2x15mL)。分离有机层，经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。将粗物质经色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：20-30％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-N-环戊基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(138.4mg,0.331mmol,33.7％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):417.24[M+H]+,Rt＝2.66min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.37(br d,J＝6.14Hz,1H),8.02(s,1H),7.94(d,J＝7.89Hz,1H),7.70-7.65(m,1H),7.62-7.52(m,2H),7.23(d,J＝7.89Hz,1H),5.66(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),4.23(sxt,J＝6.88Hz,1H),3.30-3.06(m,3H),2.94(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.26(dddd,J＝13.98,9.98,5.97,4.06Hz,1H)，2.10-1.99(m,3H),1.59-1.72(m,4H),1.56-1.44(m,2H)。
实施例351
GSK3493927A
合成(4S)-N-(3-羟基丙基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃在氮气气氛下向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.638mmol)在四氢呋喃(20mL)中的混悬液中加入TEA(1.370mL,9.83mmol)和三光气(486mg,1.638mmol)并将反应混合物在室温搅拌1h。在室温向所述得到的反应混合物加入3-氨基丙-1-醇(246mg,3.28mmol)在THF(5mL)中的溶液。添加后将反应混合物在70℃搅拌16h。(TLC:5％MeOH-DCM,Rf值：0.5)。将反应混合物冷却至RT并用水稀释(50mL)，用EtOAc萃取(3x30mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(2x30mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，获得粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：2％MeOH-DCM)，得到期望的产物(4S)-N-(3-羟基丙基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(180mg,0.437mmol,26.7％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):407.09[M+H]+,Rt＝1.95min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ10.38-10.13(m,1H),8.23-8.13(m,2H),7.88-7.68(m,2H),7.66-7.54(m,2H),5.41(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),4.43(t,J＝5.15Hz,1H),3.51-3.31(m,4H),3.20-3.02(m,2H),2.99-2.87(m,2H),2.18(dddd,J＝13.73,9.95,5.92,3.73Hz,1H),1.82(dt,J＝13.98,7.15Hz,1H),1.69(quin,J＝6.69Hz,2H)。
实施例352
合成(4S)-N-环己基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300.0mg,0.983mmol)在THF(20.0mL)中的搅拌的溶液中加入TEA(0.685mL,4.91mmol)、三光气(292mg,0.983mmol)并搅拌45min。然后加入环己基胺(0.339mL,2.95mmol)并将反应混合物加热至75℃，保持6h。(TLC洗脱系统:100％EtOAc；Rf-0.4；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，将固体过滤并将滤液用水洗涤(5mL)并萃取到EtOAc中(2×10mL)。分离有机层，经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。将粗物质经色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：20-30％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-N-环己基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(221.9mg,0.515mmol,52.4％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):431.25[M+H]+,Rt＝2.82min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.32(br d,J＝7.23Hz,1H),8.05(s,1H),7.94(d,J＝7.89Hz,1H),7.70-7.66(m,1H),7.62-7.52(m,2H),7.28-7.25(m,1H),5.65(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.80-3.72(m,1H),3.30-3.06(m,3H),2.94(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.40-2.26(m,1H),2.09-1.98(m,3H),1.77-1.62(m,3H),1.44-1.31(m,3H),1.29-1.10(m,2H)。
实施例353
合成(4S)-N-(叔丁基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.4g,1.310mmol)在四氢呋喃(10mL)中的溶液中加入三乙胺(1.096mL,7.86mmol)、三光气(0.389g,1.310mmol)，将反应混合物在室温搅拌1h，然后加入2-甲基丙-2-胺(0.275mL,2.62mmol)，将反应混合物在80℃搅拌16h。(TLC系统：净EtOAc.Rf值：0.5)，将反应混合物冷却至室温，用乙酸乙酯萃取(2x30mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(2x20mL)并经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：5％MeOH/CH2Cl2)，得到期望的产物(4S)-N-(叔丁基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(180mg,0.436mmol,33.3％收率)，其为黄色固体。LCMS(m/z):405.11[M+H]+,Rt＝2.67min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 10.17(s,1H),8.08-8.16(m,2H),7.70-7.83(m,2H),7.60(d,J＝7.89Hz,1H),7.50(d,J＝7.89Hz,1H),5.41(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),3.01-3.16(m,2H),2.86-2.97(m,2H),2.12-2.21(m,1H),1.75-1.85(m,1H),1.28(s,9H)。
实施例354
合成(4S)-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(4-氯嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(700mg,1.716mmol)在1,4-二噁烷(25mL)和水(5.00mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(70.1mg,0.086mmol)、K3PO4(1093mg,5.15mmol)和2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(466mg,2.231mmol)且在70℃搅拌3h。(TLC系统:10％甲醇/DCM，Rf值：0.4)。向反应混合物中加入水(10.0mL)，并用乙酸乙酯萃取(3×30mL)。合并的分离有机层，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗产物。粗制化合物经制备型HPLC纯化(柱：KROMASIL PHENYL(150*25)mm*10u；MP-A:10mM碳酸氢铵(水溶液),MP-B：乙腈；方法：00/30,13.5/30,14/100,18/100,18.5/30；流速：25ml/min；温度:环境温度；洗脱剂：乙腈+THF+水)，得到(4S)-N-(4-(2-甲基噁唑-5-基)嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.258mmol,15.04％收率)，其为淡黄色固体。LCMS(m/z):455.19[M+H]+,Rt＝1.35min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm:13.87(s,1H),8.69(d,J＝5.04Hz,1H),8.63(d,J＝5.26Hz,1H),7.89(s,1H),7.81-7.76(m,1H),7.71(s,1H),7.64(d,J＝7.89Hz,1H),7.48(d,J＝7.89Hz,1H),7.23(d,J＝5.04Hz,1H),5.79(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),3.33-3.13(m,3H),3.02(dd,J＝12.17,3.18Hz,1H),2.65(s,3H),2.59(s,3H),2.39-2.30(m,1H),2.11(dt,J＝14.47,7.45Hz,1H)。
实施例355
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-吗啉代吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气气氛下在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.189mmol)在四氢呋喃(30mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(0.829mL,5.94mmol)和三光气(353mg,1.189mmol)，然后在室温搅拌1h。然后将4-吗啉代吡啶-2-胺(320mg,1.783mmol)加至反应混合物，然后在70℃搅拌16h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf-0.4；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温并分配在水(30mL)和EtOAc(3X30mL)之间。合并的有机层用盐水溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗产物。粗制化合物经柱色谱纯化(硅胶:中性氧化铝,洗脱剂：20％EtOAc/石油醚)，得到期望的产物(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-吗啉代吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(145mg,0.312mmol,26.3％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):458.29[M+H]+,Rt＝1.23min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.40(s,1H),8.61(d,J＝5.2Hz,1H),8.24(d,J＝1.8Hz,1H),8.09(d,J＝6.0Hz,1H),7.79(d,J＝2.4Hz,1H),7.75-7.68(m,1H),7.61(d,J＝8.0Hz,1H),7.48(d,J＝7.9Hz,1H),6.45(dd,J＝6.0,2.5Hz,1H),5.68(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.88-3.80(m,4H),3.40-3.32(m,4H),3.32-3.20(m,2H),3.24-3.13(m,1H),3.01(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.73(s,3H),2.40-2.26(m,1H),2.08(dt,J＝14.9,7.7Hz,1H)。
实施例356
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(噁唑-5-基)嘧啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(4-氯嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(600mg,1.471mmol)、5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(430mg,2.207mmol)和K3PO4(937mg,4.41mmol)在1,4-二噁烷(30.00mL),水(7.50mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(120mg,0.147mmol)并再脱气5min。然后将反应混合物在80℃搅拌15h。(TLC系统:10％甲醇/DCM.Rf值：0.2)。使得反应混合物冷却至RT并蒸发有机溶剂，用水稀释(50mL)并用乙酸乙酯萃取(3x50ml)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤，然后经无水硫酸钠干燥，过滤并真空蒸发，得到粗产物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：2％甲醇/乙酸乙酯)，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(噁唑-5-基)嘧啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(320mg,0.710mmol,48.3％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):441.23[M+H]+,Rt＝1.30min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.91(s,1H),8.74(dd,J＝5.1,0.6Hz,1H),8.64(d,J＝5.2Hz,1H),8.05(d,J＝0.5Hz,1H),7.90-7.76(m,2H),7.65(dd,J＝8.0,0.6Hz,1H),7.48(dd,J＝8.0,0.6Hz,1H),7.33-7.24(m,2H),5.79(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.35-3.12(m,3H),3.03(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.65(s,3H),2.35(dddd,J＝14.1,9.9,6.0,4.0Hz,1H),2.11(dt,J＝14.6,7.4Hz,1H)。
实施例357
合成(4S)-N-(4-((2S,6R)-2,6-二甲基吗啉代)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下在室温向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.189mmol)在四氢呋喃(THF)(30mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(0.829mL,5.94mmol)和三光气(353mg,1.189mmol)，然后在室温搅拌4h。然后将4-((2S,6R)-2,6-二甲基吗啉代)吡啶-2-胺(493mg,2.378mmol)加至反应混合物，将所得反应混合物在70℃搅拌16h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf-0.4；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，分配在水(30mL)和EtOAc(3X30mL)之间。合并的有机层用盐水溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:中性氧化铝,洗脱剂：25％EtOAc/石油醚)，得到期望的产物(4S)-N-(4-((2S,6R)-2,6-二甲基吗啉代)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.410mmol,34.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):486.33[M+H]+,Rt＝1.37min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.40(s,1H),8.60(d,J＝5.3Hz,1H),8.25(d,J＝1.8Hz,1H),8.07(d,J＝6.0Hz,1H),7.78-7.68(m,2H),7.61(d,J＝7.9Hz,1H),7.48(d,J＝8.0Hz,1H),6.45(dd,J＝6.0,2.5Hz,1H),5.69(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.81-3.64(m,4H),3.32-3.12(m,3H),3.01(dd,J＝12.1,3.3Hz,1H),2.73(s,3H),2.61-2.51(m,2H),2.34(dddd,J＝13.9,10.0,6.0,4.0Hz,1H),2.09(dt,J＝14.3,7.8Hz,1H),1.28(d,J＝6.2Hz,6H)。
实施例358
合成(4S)-N-(4-(1,3-二甲基-1H-吡唑-4-基)嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(4-氯嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(200mg,0.490mmol)、1,3-二甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(109mg,0.490mmol)和K3PO4(104mg,0.490mmol)在1,4-二噁烷(30.00mL)、水(7.50mL)中脱气的溶液中加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(400mg,0.490mmol)并再次脱气5min。然后将反应混合物在80℃搅拌15h。(TLC系统:10％甲醇/DCM.Rf值：0.2)。将反应混合物冷却至室温且蒸发有机溶剂，用水稀释(50mL)并用乙酸乙酯萃取(3x50ml)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤，然后经无水硫酸钠干燥并真空蒸发，获得粗产物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝,洗脱剂：4％甲醇/乙酸乙酯)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1,3-二甲基-1H-吡唑-4-基)嘧啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(120mg,0.256mmol,52.2％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):468.30[M+H]+,Rt＝1.36min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.68(s,1H),8.58(dd,J＝6.6,5.3Hz,1H),7.95(s,1H),7.85(s,1H),7.79(s,1H),7.65(d,J＝8.0Hz,1H),7.46(d,J＝7.9Hz,1H),7.26(s,1H),7.09(d,J＝5.2Hz,1H),5.79(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),3.88(s,3H),3.32-3.12(m,3H),3.02(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.64(s,3H),2.54(s,3H),2.35(ddt,J＝14.3,10.0,4.7Hz,1H),2.11(dt,J＝14.8,7.8Hz,1H)。
实施例359,360
峰-I:合成(4S)-N-(4-(3,4-二羟基丁基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
峰-II:合成(4S)-N-(4-(3,4-二羟基丁基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-(2-(1,4-二氧杂螺[4.5]癸-2-基)乙基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(850mg,1.572mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl(2mL,24.00mmol)。将所得反应混合物在室温搅拌6h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf:0.5)并蒸发溶剂,将获得的残余物用NaHCO3溶液中和并用DCM萃取(3×30mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(20mL)并经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(硅胶:100-200目，洗脱剂：6％MeOH/DCM)，得到外消旋化合物(400mg).The外消旋化合物经手性SFC纯化(条件:柱/尺寸:LuxAmylose-2(250X30)mm,5μ,％CO2溶剂：50.0％,％CO溶剂：50.0％(100％IPA),总流速：90.0g/min,反压:100.0巴，UV:218nm,堆积时间(Stack time):7.5min，负载/注射:20.0mg,洗脱剂：IPA+DCM,仪器细节:制备/模型:Thar SFC-200(NEW-2))峰-I:(4S)-N-(4-(3,4-二羟基丁基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(163mg,0.353mmol,22.48％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):461.35[M+H]+,Rt＝1.25min，和峰-II:(4S)-N-(4-(3,4-二羟基丁基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(67mg,0.142mmol,9.03％收率)，其为黄色粘稠的固体。LCMS(m/z):461.31[M+H]+,Rt＝1.25min。
峰-I:1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.52(s,1H),8.61(d,J＝5.3Hz,1H),8.26(dd,J＝5.0,0.8Hz,1H),8.20(d,J＝1.8Hz,1H),8.13(s,1H),7.71(dd,J＝5.4,1.8Hz,1H),7.62(d,J＝8.0Hz,1H),7.48(d,J＝8.0Hz,1H),6.89(dd,J＝5.1,1.5Hz,1H),5.69(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.81-3.64(m,2H),3.49(dd,J＝11.0,7.4Hz,1H),3.35-3.13(m,3H),3.02(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.92-2.74(m,2H),2.73(s,3H),2.34(ddt,J＝14.5,10.0,5.1Hz,1H),2.09(dt,J＝14.5,7.4Hz,1H),1.88-1.77(m,2H)。
峰-II:1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.52(s,1H),8.61(d,J＝5.3Hz,1H),8.26(dd,J＝5.0,0.8Hz,1H),8.20(d,J＝1.8Hz,1H),8.13(s,1H),7.71(dd,J＝5.4,1.8Hz,1H),7.62(d,J＝8.0Hz,1H),7.48(d,J＝8.0Hz,1H),6.89(dd,J＝5.1,1.5Hz,1H),5.69(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.81-3.64(m,2H),3.49(dd,J＝11.0,7.4Hz,1H),3.35-3.13(m,3H),3.02(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.92-2.74(m,2H),2.73(s,3H),2.34(ddt,J＝14.5,10.0,5.1Hz,1H),2.09(dt,J＝14.5,7.4Hz,1H),1.88-1.77(m,2H)。
实施例361
合成(4S)-7-(6-(甲基氨基)吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-7-氯-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(3g,9.50mmol)在1,4-二噁烷(70mL)和水(24mL)中的搅拌的溶液中加入N-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)吡啶-2-胺(2.447g,10.45mmol)和K3PO4(6.05g,28.5mmol)并脱气20min。然后将Pd2(dba)3(0.435g,0.475mmol)和X-phos(0.453g,0.950mmol)加至反应混合物且再次脱气10min。将反应混合物在100℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯:Rf-0.4；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温并用水稀释，用乙酸乙酯萃取(2X70mL),合并的有机层用盐水溶液洗涤(50mL)，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(使用100-200硅胶,化合物在70％乙酸乙酯/正己烷中洗脱)，得到期望的产物(4S)-7-(6-(甲基氨基)吡啶-3-基)-N-(吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(1.47g,3.78mmol,39.8％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):388.13[M+H]+,Rt＝1.38min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.69(s,1H),8.75(d,J＝2.19Hz,1H),8.52(dd,J＝8.77,2.63Hz,1H),8.43-8.29(m,1H),8.29-8.06(m,1H),7.68(t,J＝7.84Hz,1H),7.52(d,J＝7.89Hz,1H),7.33-7.19(m,1H),6.97(ddd,J＝7.23,4.82,0.88Hz,1H),6.55(d,J＝8.99Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.77(d,J＝4.60Hz,1H),3.33-3.08(m,3H),3.06-2.94(m,4H),2.31(dddd,J＝14.03,9.92,5.97,3.84Hz,1H),2.17-1.93(m,1H)。
实施例362
合成(4S)-N-(5-氟喹唑啉-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在0℃向5-氟喹唑啉-4-胺(250mg,1.532mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中加入NaH(201mg,4.60mmol)并搅拌10min。然后加入(1H-咪唑-1-基)((4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-基)甲酮(612mg,1.532mmol)并将反应混合物在60℃搅拌12h.(TLC洗脱系统:10％MeOH/EtOAc；Rf-0.3；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，用水淬灭(10mL)并萃取到EtOAc中(25mL)。分离有机层且经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。将粗物质经色谱纯化(GRACE使用C-18反相柱，流动相A:0.1％甲酸/水；B:MeOH,洗脱剂65％B/A)。将合并的级分浓缩，并用饱和NaHCO3溶液碱化。将水层用DCM萃取，分离出的DCM层经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发，得到(4S)-N-(5-氟喹唑啉-4-基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(190mg,0.380mmol,24.77％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):495.08[M+H]+,Rt＝2.19min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.86(br d,J＝4.60Hz,1H),9.13(s,1H),7.95(s,1H),7.76-7.88(m,2H),7.68-7.75(m,1H),7.66(d,J＝7.89Hz,1H),7.60(d,J＝7.89Hz,1H),7.32-7.42(m,2H),6.75-6.84(m,1H),5.78(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.17-3.38(m,3H),3.05(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.31-2.43(m,1H),2.13-2.24(m,1H)。
实施例363
合成(4S)-N-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(500mg,1.638mmol)在THF(25mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(1.370mL,9.83mmol)，接着加入三光气(486mg,1.638mmol)并搅拌1h。然后加入2M甲胺的THF溶液(2.457mL,4.91mmol,)并将反应混合物在65℃加热16h。(TLC洗脱剂：50％EtOAc/己烷:Rf-0.3；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，真空浓缩并将残余物分配在水(30mL)和EtOAc(2x35mL)之间。分离有机层并经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝，洗脱剂：50％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-N-甲基-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(161mg,0.444mmol,27.1％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):362.99[M+H]+,Rt＝2.19min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.38(br d,J＝3.51Hz,1H),8.06(s,1H),7.94(d,J＝7.67Hz,1H),7.70-7.66(m,1H),7.63-7.58(m,1H),7.55(d,J＝7.89Hz,1H),7.28(d,J＝7.89Hz,1H),5.65(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.28-3.07(m,3H),3.01-2.92(m,4H),2.27(dddd,J＝13.98,9.92,6.03,4.06Hz,1H),2.08-1.97(m,1H)。
实施例364
合成(4S)-N-((R)-2,3-二羟基丙基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺，盐酸盐
合成(4S)-N-(4-(3-甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.665mmol)在1,4-二噁烷(40mL)和水(10mL)中的搅拌的溶液中加入3-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(207mg,0.997mmol)和K3PO4(423mg,1.994mmol)并脱气15min。然后将Pd2(dba)3(60.9mg,0.066mmol)和x-phos(63.4mg,0.133mmol)加至反应混合物，再次脱气10min，然后将反应混合物在80℃搅拌16h。(TLC系统:10％甲醇/DCM,Rf-0.2；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温并分配在水和乙酸乙酯之间(3x30mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(使用中性氧化铝，在20％乙酸乙酯/石油醚中洗脱)，得到期望的化合物(4S)-N-(4-(3-甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(139mg,0.304mmol,45.7％收率)，其为淡棕色固体。LCMS(m/z):453.21[M+H]+,Rt＝1.36min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.59(s,1H),10.35(br s,1H),8.63(d,J＝5.26Hz,1H),8.44-8.16(m,3H),7.87(s,1H),7.73(d,J＝3.95Hz,1H),7.63(d,J＝8.11Hz,1H),7.49(d,J＝7.89Hz,1H),7.10(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),5.72(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),3.36-3.16(m,3H),3.02(dd,J＝12.06,3.07Hz,1H),2.76(s,3H),2.59(s,3H),2.42-2.29(m,1H),2.10(dt,J＝14.03,7.02Hz,1H)。
实施例365
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(2-氧代吡咯烷-1-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气气氛下向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(400mg,1.585mmol)在THF(40mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(1.105mL,7.93mmol)和三光气(470mg,1.585mmol)，然后在室温搅拌1h。向其中加入1-(2-氨基吡啶-4-基)吡咯烷-2-酮(562mg,3.17mmol)，然后在70℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM,Rf-:0.3,UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，分配在水和乙酸乙酯之间(3X40mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥，然后蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(使用中性氧化铝，在25％乙酸乙酯/石油醚中洗脱)，得到期望的化合物(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(2-氧代吡咯烷-1-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(287mg,0.625mmol,39.5％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):456.20[M+H]+,Rt＝1.40min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.59(s,1H),8.62(d,J＝5.26Hz,1H),8.29(d,J＝5.92Hz,1H),8.21(s,1H),8.12(d,J＝1.97Hz,1H),7.92(dd,J＝5.70,2.19Hz,1H),7.71(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),7.62(d,J＝7.89Hz,1H),7.48(d,J＝8.11Hz,1H),5.69(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),3.96(t,J＝7.13Hz,2H),3.35-3.13(m,3H),3.02(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.74(s,3H),2.65(t,J＝8.11Hz,2H),2.40-2.28(m,1H),2.19(quin,J＝7.62Hz,2H),2.13-2.02(m,1H)。
实施例366
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(1,3,5-三甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.665mmol)在1,4-二噁烷(30mL)和水(6mL)中的搅拌的溶液中加入1,3,5-三甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(235mg,0.997mmol)和K3PO4(423mg,1.994mmol)，脱气10min。然后将PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(54.3mg,0.066mmol)加至反应混合物且再次脱气5min。将反应混合物搅拌至80℃，保持16h。(TLC洗脱剂：10％甲醇/DCM,Rf:0.3；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，分配在水和乙酸乙酯之间(3X30mL)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤并经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(使用中性氧化铝，在30％乙酸乙酯/石油醚中洗脱)，得到纯的化合物(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(1,3,5-三甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(238mg,0.494mmol,74.2％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):481.22[M+H]+,Rt＝1.55min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.57(s,1H),8.63(d,J＝5.26Hz,1H),8.37(dd,J＝5.04,0.66Hz,1H),8.24(s,1H),8.16(d,J＝0.66Hz,1H),7.73(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),7.62(d,J＝7.89Hz,1H),7.49(d,J＝7.89Hz,1H),6.93(dd,J＝5.26,1.53Hz,1H),5.71(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.79(s,3H)3.36-3.13(m,3H),3.01(dd,J＝12.06,3.29Hz,1H),2.76(s,3H),2.36(d,J＝7.67Hz,7H),2.09(dt,J＝14.25,7.34Hz,1H)。
实施例367
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氩气下向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(450mg,0.997mmol)在1,4-二噁烷(50mL)和水(10mL)中脱气的溶液中加入K3PO4(635mg,2.99mmol)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑(358mg,1.296mmol)，然后在室温搅拌10min。然后加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(81mg,0.100mmol)且在80℃搅拌3h。(TLC系统:10％甲醇/DCM，Rf值：0.4)。将水(100mL)加至反应混合物并用乙酸乙酯萃取(3x100mL)。将合并的萃取物用盐水溶液洗涤(100mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗产物经制备型HPLC纯化(柱：XBridge C-18(150*19)mm,5μ；流动相-A:0.1％甲酸；流动相-B：乙腈；流速：15mL/min；方法：0.1/37,1/37,10/37；洗脱剂：乙腈+THF+MeOH)，得到(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(155mg,0.297mmol,29.8％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):521.22[M+H]+,Rt＝1.74min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.61(s,1H),8.63(d,J＝5.48Hz,1H),8.41(s,1H),8.35(d,J＝5.04Hz,1H),8.21(s,1H),8.00(s,1H),7.96(s,1H),7.73(br d,J＝4.38Hz,1H),7.63(d,J＝7.89Hz,1H),7.49(d,J＝7.89Hz,1H),7.13(d,J＝3.95Hz,1H),5.71(dd,J＝5.70,3.07Hz,1H),4.75(q,J＝8.26Hz,2H),3.36-3.12(m,3H),3.03(dd,J＝12.06,3.07Hz,1H),2.75(s,3H),2.36(qd,J＝9.83,4.49Hz,1H),2.11(dt,J＝14.20,7.26Hz,1H)。
实施例368
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(吡咯烷-1-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氮气下向(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(300mg,1.189mmol在THF(30mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(0.829mL,5.94mmol)和三光气(353mg,1.189mmol)，在室温搅拌1h。向其中加入4-(吡咯烷-1-基)吡啶-2-胺(388mg,2.378mmol)，然后在70℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM,Rf-:0.4,UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，分配在水和乙酸乙酯之间(3X30mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(使用中性氧化铝，在20％EtOAc/石油醚中洗脱)，得到期望的产物(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(4-(吡咯烷-1-基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(251mg,0.561mmol,47.2％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):442.3[M+H]+,Rt＝4.78min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.27(s,1H),8.60(d,J＝5.3Hz,1H),8.28(s,1H),8.00(d,J＝5.9Hz,1H),7.72(dd,J＝5.5,1.8Hz,1H),7.59(d,J＝7.9Hz,1H),7.50-7.38(m,2H),6.19(dd,J＝5.9,2.3Hz,1H),5.70(dd,J＝6.0,3.2Hz,1H),3.39(q,J＝6.2,4.8Hz,3H),3.26(s,1H),3.27-3.12(m,3H),3.00(dd,J＝12.0,3.3Hz,1H),2.74(s,3H),2.32(dddd,J＝14.0,10.0,6.2,4.2Hz,1H),2.15-1.97(m,5H)。
实施例369
合成(4S)-N-(4-(1,3-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-9-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-9-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.645mmol)在1,4-二噁烷(40mL)和水(10mL)中的搅拌的溶液中加入1,3-二甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(215mg,0.967mmol)和K3PO4(411mg,1.934mmol)并脱气15min。然后加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(52.6mg,0.064mmol)并脱气5min，然后在80℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯:Rf:0.3；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温并倒入冰水中，用乙酸乙酯萃取(2x100ml)。合并的有机层用饱和盐水(50mL)溶液洗涤，然后经无水硫酸钠干燥并真空蒸发，得到粗产物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(使用中性氧化铝,在60％乙酸乙酯/石油醚中洗脱柱)，得到纯的化合物(4S)-N-(4-(1,3-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-9-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(101mg,0.208mmol,32.3％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):481.33[M+H]+,Rt＝1.70min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.72(s,1H),8.61(d,J＝5.3Hz,1H),8.36-8.29(m,2H),8.22(d,J＝1.7Hz,1H),7.76-7.70(m,1H),7.67(s,1H),7.38(d,J＝0.7Hz,1H),7.06(dd,J＝5.2,1.7Hz,1H),5.71(dd,J＝6.1,3.1Hz,1H),3.88(s,3H),3.22-3.07(m,3H),3.02(dd,J＝12.0,3.2Hz,1H),2.75(s,3H),2.51(d,J＝2.8Hz,6H),2.33(m,1H),2.13-2.00(m,1H)。
实施例370
合成(4S)-9-甲基-N-(4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-9-甲基-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.645mmol)在1,4-二噁烷(40mL)和水(10mL)中的搅拌的溶液中加入1-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(201mg,0.967mmol)和K3PO4(411mg,1.934mmol)并脱气15min。然后加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(52.6mg,0.064mmol)并再脱气5min，然后在80℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯:Rf:0.3；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，然后倒入冰水并用乙酸乙酯萃取(2x100ml)。合并的有机层用饱和盐水溶液洗涤(50mL)，经无水硫酸钠干燥并真空蒸发，得到粗产物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(使用中性氧化铝，在60％乙酸乙酯/石油醚中洗脱柱)，得到纯的化合物(4S)-9-甲基-N-(4-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(126mg,0.269mmol,41.8％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):467.29[M+H]+；Rt＝1.63min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ13.72(s,1H),8.64-8.57(m,1H),8.37(dd,J＝1.6,0.8Hz,1H),8.30(dd,J＝5.2,0.8Hz,1H),8.21(d,J＝1.5Hz,1H),7.91(d,J＝0.8Hz,1H),7.85-7.80(m,1H),7.76-7.70(m,1H),7.41-7.36(m,1H),7.10(dd,J＝5.2,1.6Hz,1H),5.70(dd,J＝6.0,3.1Hz,1H),3.96(s,3H),3.22-3.08(m,3H),3.03(dd,J＝12.0,3.2Hz,1H),2.75(s,3H),2.51(s,3H),2.34(dq,J＝13.3,6.5Hz,1H),2.08(dt,J＝14.4,7.9Hz,1H)。
实施例371
合成(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(270mg,0.455mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.5ml,6.00mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf值：0.3)。将反应混合物用饱和NaHCO3水溶液碱化并用10％MeOH/DCM萃取(2x50mL)。合并的有机层用硫酸钠干燥并浓缩。粗制化合物经色谱纯化(Grace仪器，C-18反相柱，流动相A:0.1％甲酸/水；B：乙腈,产物在60-65％B/A中洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(2-((R)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(220mg,0.393mmol,86％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):554.23[M+H]+,Rt＝1.84min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.67(s,1H),8.14(d,J＝9.21Hz,2H),7.96(d,J＝5.70Hz,1H),7.62(s,1H),7.13(d,J＝1.75Hz,1H),6.95(dd,J＝5.81,1.86Hz,1H),5.63(dd,J＝5.81,2.96Hz,1H),4.82(q,J＝8.33Hz,2H),4.47-4.43-(m,2H),4.27(br d,J＝5.48Hz,1H),3.95-4.01(m,1H),3.62-3.69(m,2H),3.08-3.32(m,3H),3.03-2.96-(m,2H),2.38-2.26-(m,1H),2.09-2.00-(m,1H)。
实施例372
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(250mg,0.421mmol)在甲醇(5mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(0.5ml,6.00mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf值：0.3)。将反应混合物用饱和NaHCO3溶液碱化并用10％MeOH/DCM萃取(2x50mL)。合并的有机层经硫酸钠干燥并浓缩。粗制化合物经色谱纯化(Grace仪器，C-18反相柱，流动相A:0.1％甲酸/水；B:乙腈；产物在59-64％B/A中洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吡唑-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(210mg,0.374mmol,89％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):554.23[M+H]+,Rt＝1.84min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.67(s,1H),8.14(d,J＝10.30Hz,2H),7.96(d,J＝5.92Hz,1H),7.62(s,1H),7.12(d,J＝1.75Hz,1H),6.95(dd,J＝5.81,1.86Hz,1H),5.63(dd,J＝5.92,3.07Hz,1H),4.82(q,J＝8.33Hz,2H),4.40-4.51(m,2H),4.45(dd,J＝4.82,1.75Hz,1H),3.99(t,J＝4.71Hz,1H),3.59-3.75(m,2H),3.15-3.32(m,2H),3.07-3.14(m,1H),2.86-3.03(m,2H),2.25-2.39(m,1H),2.05(dt,J＝14.52,7.54Hz,1H)。
实施例373
合成(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(5-(三氟甲基)吡啶-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺:
在0℃向(4S)-8-氯-N-(2-(((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)甲氧基)吡啶-4-基)-7-(6-(三氟甲基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(60mg,0.102mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的溶液中加入HCl水溶液(1mL,32.9mmol)，然后在室温搅拌2h。(TLC系统:10％MeOH/DCM,Rf值：0.25)。将反应混合物用饱和NaHCO3水溶液碱化并用乙酸乙酯萃取(3x30mL)。合并的有机层经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩。粗制化合物经柱色谱纯化(Grace仪器，反相C-18柱，用27％乙腈/1％甲酸水溶液洗脱)，得到(4S)-8-氯-N-(2-((S)-2,3-二羟基丙氧基)吡啶-4-基)-7-(6-(三氟甲基)吡啶-2-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(32mg,0.058mmol,57.0％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):551.20[M+H]+,Rt＝1.99min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 12.74(s,1H),8.08(t,J＝7.78Hz,1H),7.98(d,J＝7.89Hz,1H),7.91-7.80(m,2H),7.69(s,1H),7.24-7.03(m,1H),6.81(dd,J＝5.92,1.97Hz,1H),5.65(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),4.43(d,J＝4.82Hz,2H),4.29(d,J＝5.92Hz,1H),3.96(br d,J＝5.26Hz,1H),3.70-3.46(m,2H),3.25(br dd,J＝9.65,6.80Hz,2H),3.08-3.18(m,1H),3.07-2.94(m,1H),2.86(dd,J＝7.02,6.14Hz,1H),2.29-2.39(m,1H),2.07(dt,J＝14.47,7.02Hz,1H)
实施例374
合成(4S)-N-(4-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在氩气下向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.108mmol)在1,4-二噁烷(50mL)和水(10mL)中脱气的溶液中加入K3PO4(705mg,3.32mmol)、1-乙基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(320mg,1.440mmol)，然后在室温搅拌10min。然后加入PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(90mg,0.111mmol)且在80℃搅拌3h。(TLC系统:10％甲醇/DCM,Rf值：0.5)。水(100mL)加至反应混合物并用乙酸乙酯萃取(3x100mL)。将合并的萃取物用盐水溶液洗涤(100mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗产物经色谱纯化(中性氧化铝，在DCM中洗脱)，得到(4S)-N-(4-(1-乙基-1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(300mg,0.641mmol,57.9％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):467.25[M+H]+,Rt＝1.57min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.56(s,1H),8.62(d,J＝5.26Hz,1H),8.38(dd,J＝1.43,0.77Hz,1H),8.31(dd,J＝5.26,0.66Hz,1H),8.26-8.15(m,1H),7.92(d,J＝0.66Hz,1H),7.86(s,1H),7.72(dd,J＝5.26,1.32Hz,1H),7.63(d,J＝8.11Hz,1H),7.49(d,J＝8.11Hz,1H),7.25-7.03(m,1H),5.71(dd,J＝5.81,3.18Hz,1H),4.23(q,J＝7.38Hz,2H),3.35-3.16(m,3H),3.03(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.75(s,3H),2.44-2.24(m,1H),2.11(dt,J＝14.31,7.43Hz,1H),1.59-1.53(m,3H)。
实施例375
合成(4S)-N-(4-(1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(4-溴吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(650mg,1.440mmol)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)-1H-吡唑(419mg,2.160mmol)和Na2CO3(458mg,4.32mmol)在1,4-二噁烷(24mL)和水(6mL)中脱气的溶液中加入Pd(Ph3P)4(166mg,0.144mmol)，且在80℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/乙酸乙酯，Rf-0.4,UV活化的)。减压蒸发1,4-二噁烷,将获得的残余物用水稀释(50ml)并用乙酸乙酯萃取(2x100ml)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(30mL)，经无水硫酸钠干燥并减压蒸发，获得粗产物。粗产物经快速柱色谱纯化(使用中性氧化铝,在5％甲醇/乙酸乙酯中洗脱)，得到期望的产物(4S)-N-(4-(1H-吡唑-4-基)吡啶-2-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(150mg,0.333mmol,23.09％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):439.21[M+H]+,Rt＝1.33min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 13.50(s,1H),13.20(br s,1H),8.59(d,J＝5.26Hz,1H),8.42–8.31(m,3H),8.25(s,1H),8.06-7.93(m,2H),7.81(d,J＝8.11Hz,1H),7.75-7.66(m,1H),7.37(dd,J＝5.15,1.43Hz,1H),5.54(dd,J＝5.59,2.96Hz,1H),3.25-3.09(m,3H),2.98(dd,J＝11.95,3.18Hz,1H),2.64(s,3H),2.35-2.18(m,1H),2.06-1.89(m,1H)。
实施例376
合成(4S)-N-(5-(2-甲基噁唑-5-基)哒嗪-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(5-氯哒嗪-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(400mg,0.981mmol)在1,4-二噁烷(16mL)和水(4mL)中的搅拌的溶液中加入2-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(308mg,1.471mmol)和K3PO4(625mg,2.94mmol)。将所得反应混合物用氩气脱气15min。向其中加入Pd(Ph3P)4(113mg,0.098mmol)且再次脱气5min。将所得反应混合物在100℃搅拌18h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM,Rf-0.6,UV活化的)。反应混合物用水稀释并用乙酸乙酯萃取(3×30mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(20mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，在4％MeOH/DCM中洗脱)，接着经制备型HPLC纯化(Prep-HPLC条件:MP-A:10mm碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈柱：KinetexC8(150*30)mm*5u方法：％‘B’:0/10,9/50,9.5/100,13/100,13.5/50,15/50流速：30ml/min洗脱剂：ACN+THF+MeOH温度:环境温度)，得到期望的化合物(4S)-N-(5-(2-甲基噁唑-5-基)哒嗪-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(124mg,0.271mmol,27.6％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):455.19[M+H]+,Rt＝1.38min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.65(s,1H),9.01(d,J＝2.63Hz,1H),8.74(d,J＝5.26Hz,1H),8.28(d,J＝2.63Hz,1H),7.79(s,1H),7.70(d,J＝7.89Hz,1H),7.57(s,1H),7.51(d,J＝5.26Hz,1H),7.42(d,J＝7.89Hz,1H),5.68(dd,J＝5.92,3.29Hz,1H),3.33-3.16(m,3H),3.06(dd,J＝12.28,3.29Hz,1H),2.72(s,3H),2.60(s,3H),2.45-2.29(m,1H),2.17-2.03(m,1H)
实施例377
合成(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(5-(噁唑-5-基)哒嗪-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
向(4S)-N-(5-氯哒嗪-3-基)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(500mg,1.226mmol)在1,4-二噁烷(16mL)和水(4mL)中的搅拌的溶液中加入5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊-2-基)噁唑(359mg,1.839mmol)和K3PO4(781mg,3.68mmol)。将所得反应混合物用氩气脱气15min。向其中加入Pd(Ph3P)4(142mg,0.123mmol)且再次脱气5min。将所得反应混合物在100℃搅拌18h。(TLC洗脱剂：10％MeOH/DCM,Rf-0.6,UV活化的)。反应混合物用水稀释并用乙酸乙酯萃取(3×30mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(20mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并减压浓缩，获得粗制化合物。粗制化合物经快速柱色谱纯化(100-200硅胶，在4％MeOH/DCM中洗脱)，接着经制备型HPLC纯化(Prep-HPLC条件:MP-A:10mm碳酸氢铵(水溶液)MP-B：乙腈柱：Kinetex C8(150*30)mm*5u方法：％‘B’:0/10,9/50,9.5/100,13/100,13.5/50,15/50流速：30ml/min洗脱剂：ACN+THF+MeOH温度:环境温度)，得到期望的产物(4S)-7-(2-甲基吡啶-4-基)-N-(5-(噁唑-5-基)哒嗪-3-基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(49mg,0.111mmol,9.02％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):441.23[M+H]+,Rt＝1.32min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 13.68(s,1H),9.07(d,J＝2.41Hz,1H),8.75(d,J＝5.04Hz,1H),8.35(d,J＝2.41Hz,1H),8.05(s,1H),7.96(s,1H),7.70(d,J＝7.89Hz,1H),7.57(s,1H),7.51(d,J＝5.04Hz,1H),7.42(d,J＝7.89Hz,1H),5.69(dd,J＝6.03,2.96Hz,1H),3.39-3.13(m,3H),3.07(dd,J＝12.28,3.07Hz,1H),2.72(s,3H),2.50-2.29(m,1H),2.11(dt,J＝14.25,7.13Hz,1H)。
在0℃向(4S)-N-((R)-2,3-二羟基丙基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(135mg,0.320mmol)在乙醚(10mL)中的搅拌的混悬液中加入HCl的乙醚溶液(2M)(0.160mL,0.320mmol)，然后在室温搅拌1h。(TLC洗脱剂：10％甲醇/DCM:Rf-0.1；UV活化的)。然后将反应混合物在氮气气氛减压浓缩，得到固体化合物。将固体化合物溶于10ml水和乙腈(1:1)中，减压浓缩，得到纯的化合物(4S)-N-((R)-2,3-二羟基丙基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺盐酸盐(120mg,0.256mmol,80％收率)，其为灰白色固体。LCMS(m/z):423.04[M+H]+,Rt＝1.76min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ10.12(t,J＝5.04Hz,1H),8.38(d,J＝7.67Hz,1H),8.21(s,1H),7.97(d,J＝7.89Hz,1H),7.89-7.71(m,3H),5.59(m,1H),3.68-3.27(m,8H),3.26-3.15(m,1H),2.47-2.30(m,1H),2.19-2.02(m,1H)。
实施例378
合成(4S)-N-(2-羟基乙基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在0℃向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(0.3g,0.983mmol)在THF(10mL)中的搅拌的溶液中加入三乙胺(0.822mL,5.90mmol)和三光气(0.292g,0.983mmol)，然后在室温搅拌1h，加入2-氨基乙醇(0.172mL,1.965mmol)并将反应混合物在80℃搅拌16h。(TLC洗脱剂：净乙酸乙酯:Rf-0.5；UV活化的)。使反应混合物室温并用水稀释，用乙酸乙酯萃取(2x30mL)。合并的有机层用盐水溶液洗涤(2x20mL)，经无水Na2SO4干燥，过滤并浓缩，得到粗制化合物。粗制化合物经柱色谱纯化(100-200硅胶，用5％甲醇/DCM洗脱)，得到期望的化合物(4S)-N-(2-羟基乙基)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(186mg,0.467mmol,47.5％收率)，其为浅绿色胶状物液体。LCMS(m/z):393.08[M+H]+,Rt＝1.89min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δppm 10.34(d,J＝10.52Hz,1H),8.31(s,1H),8.17(s,1H),7.84-7.76(m,1H),7.76-7.59(m,3H),5.48-5.40(m,1H),3.63-3.47(m,2H),3.45-3.30(m,2H),3.28-2.89(m,4H),2.30-2.08(m,1H),1.95-1.75(m,1H)。
实施例379
合成(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺
在室温向(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-2,3,4,5-四氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂(250mg,0.819mmol)在THF(25mL)中的溶液中加入三乙胺(0.685ml,4.91mmol)，接着加入三光气(243mg,0.819mmol)且搅拌30min。然后加入2M氨的THF溶液(1.228mL,2.457mmol)并将反应混合物在65℃加热16h。(TLC洗脱剂：70％EtOAc/己烷:Rf-0.3；UV活化的)。将反应混合物冷却至室温，真空浓缩并将残余物分配在水(30mL)和EtOAc(2x35mL)之间。分离有机层并经无水硫酸钠干燥，过滤并将滤液蒸发得到粗制化合物。粗产物经快速柱色谱纯化(中性氧化铝，洗脱剂：50％乙酸乙酯/己烷)，得到(4S)-7-(3-(三氟甲基)苯基)-3,4-二氢-1,4-桥亚甲基吡啶并[2,3-b][1,4]二氮杂-5(2H)-甲酰胺(225mg,0.644mmol,79％收率)，其为白色固体。LCMS(m/z):349.08[M+H]+,Rt＝1.97min。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 10.23-10.02(m,1H)，8.00(s,1H),7.94(d,J＝7.89Hz,1H),7.69-7.65(m,1H),7.62-7.54(m,2H),7.29(d,J＝7.89Hz,1H),5.63(dd,J＝6.03,3.18Hz,1H),5.23(br s,1H),3.31-3.08(m,3H),2.96(dd,J＝11.84,3.29Hz,1H),2.28(dddd,J＝14.03,9.98,6.03,3.95Hz,1H),2.10-2.00(m,1H)。
实施例380.全长SIRT1的产生
表达全长人SIRT1(hSIRT1)蛋白使之带有C-末端His6标记物并如Hubbard.等人(2013)Science 339，1216中所述进行纯化。在冰上将各细胞糊再混悬于含1,000UBenzonase核酸酶(Sigma Aldrich)的缓冲液A(50mM Tris-HCl pH 7.5，250mM NaCl，25mM咪唑和0.1mM TCEP)，其补充有完整的无EDTA的蛋白酶抑制剂混合片剂(Roche)。细胞经脉冲超声破碎，在40W以50％开启和50％停止总共进行12分钟。通过离心除去不溶性的碎片。将澄清的上清液直接负载至1mL HisTrap FF Crude柱(GE Lifesciences)。用缓冲液A洗涤后，将SIRT1用缓冲液B(50mM Tris-HCl pH 7.5，250mM NaCl，500mM咪唑和0.1mM TCEP)洗脱。将该蛋白进一步用尺寸排阻色谱在缓冲液C(50mM Tris-HCl pH 7.5，300mM NaCl，0.1mM TCEP)中进行纯化，其使用Hi-load Superdex 200 16/60柱(GE Lifesciences)。酶浓度用使用BSA作为标准品的Bradford分析进行确定。最终蛋白纯度用胶体光密度测定法进行评估。蛋白通过LC/MS确认。所有蛋白均大于90％纯度。
实施例382.SIRT1脱乙酰基反应
SIRT1脱乙酰基反应是在25℃反应缓冲液(50mM HEPES-NaOH，pH7.5，150mM NaCl，1mM DTT和1％DMSO)中进行，使用持续性PNC1/GDH偶联分析监测烟酰胺的产生(Smith，B.C.等人(2009)Anal Biochem 394，101)或用质谱监测O-乙酰基ADP核糖(OAcADPr)的产生(Hubbard.等人(2013)Science 339，1216)。所使用的PNC1/GDH偶联系统成分的最终浓度为20单元/mL牛GDH(Sigma-Aldrich)、1uM酵母PNC1、3.4mMα-酮戊二酸和220μM NADH或NADPH。使用6.22mM-1cm-1消光系数和0.81cm光路长度在340nm处转变吸光度，得到所用150uL反应的产物浓度。监测OAcADPr产生的分析是在含0.05％BSA的反应缓冲液中进行且通过用终止溶液淬灭该脱乙酰反应取时间点，所述终止溶液提供1％甲酸和5mM烟酰胺的最终浓度。淬灭的反应混合物用1:1乙腈:甲醇稀释5倍并以5,000x g旋转10分钟用于沉淀蛋白，之后将其用Agilent RapidFire 200高通量质谱系统(Agilent，Wakefield，MA)分析，该质谱系统偶联至装有电喷雾离子源的ABSciex API 4000质谱仪。分别从American Century Peptide和Biopeptide,Inc.得到基于p53的Ac-p53(W5)(Ac-RHKKAcW-NH2)和TAMRA(Ac-EE-K(生物素)-GQSTSSHSK(Ac)NleSTEG–K(5TMR)-EE-NH2)肽。底物KM测定是通过在固定饱和浓度的第二底物的情况下，改变一个底物浓度进行的。SIRT1活化和抑制分析是在25℃，在含0.05％BSA的反应缓冲液中进行并使用OAcADPr分析进行分析。在加入底物前，对酶和化合物进行20分钟预培养。对于全长hSIRT1的活化筛选，化合物一式两份测定其剂量响应。为了对KM-调节的活性剂敏感，使用它们KM值的大约十分之一的底物浓度。测定5个化合物的剂量依赖性且该倍数-活化数据用方程式1描述。
其中vx/v0是存在(vx)与不存在(v0)活化剂(X)的反应速率的比例，RVmax是在无穷大的活化剂浓度下的相对速率，EC50是产生二分之一的RVmax所需活化剂的浓度且b是vx/v0的最小值。
实施例383.生物化学活性
基于质谱的分析用于鉴定SIRT1活性的调节剂。该基于TAMRA的分析使用具有如下所示的20个氨基酸的肽：
Ac-EE-K(生物素)-GQSTSSHSK(Ac)NleSTEG–K(5TMR)-EE-NH2(SEQ ID NO:1)，
其中K(Ac)是乙酰化的赖氨酸残基，Nle是正亮氨酸。该肽在C-末端用荧光团5TMR(激发540nm/发射580nm)标记。该肽底物的序列基于具有几处修饰的p53。另外，用正亮氨酸代替天然存在于序列中的甲硫氨酸残基，因为甲硫氨酸在合成和纯化期间对氧化敏感。基于Trp的分析使用具有如下所示的氨基酸的肽：
Ac-R-H-K-K(Ac)-W-NH2(SEQ ID NO:2)，
基于TAMRA的质谱分析如下进行：在25℃，在反应缓冲液(50mM Tris-乙酸盐，pH8，137mM NaCl，2.7mM KCl，1mM MgCl2，5mM DTT，0.05％BSA)中，将0.5μM肽底物和120μMβNAD+与10nM SIRT1孵育25分钟。SIRT1蛋白如下得到：将SirT1基因克隆到含有T7-启动子的载体中，然后将其在BL21(DE3)细菌细胞中转化并表达。将测试化合物以各种浓度添加到该反应混合物中，监测得到的反应。与SIRT1孵育25分钟后，添加10μL的10％甲酸以终止反应。将得到的反应混合物密封，并冷冻用于之后的质谱分析。测定由沉默调节蛋白介导的NAD-依赖性脱乙酰化反应形成的脱乙酰化的底物肽的量(或者，生成的O-乙酰基-ADP-核糖(OAADPR)的量)，可以精确测量在各种浓度的测试化合物存在下相对于缺少测试化合物的对照反应的相对SIRT1活性。
Trp质谱分析进行如下：在25℃，在反应缓冲液(50mM HEPES pH 7.5、1500mMNaCl、1mM DTT、0.05％BSA)中，将0.5μM肽底物和120μMβNAD+与10nM SIRT1孵育25分钟。SIRT1蛋白如下得到：将SirT1基因克隆到含有T7-启动子的载体中，然后在BL21(DE3)细菌细胞中表达，并纯化，如下面进一步详述的。将测试化合物以各种浓度添加到该反应混合物中，监测得到的反应。与SIRT1孵育25分钟后，添加10μL的10％甲酸以终止反应。将得到的反应混合物密封，并冷冻用于之后的质谱分析。然后通过测定由NAD-依赖性沉默调节蛋白脱乙酰化反应形成的O-乙酰基-ADP-核糖(OAADPR)的量(或者，生成的脱乙酰化Trp肽的量)来测量相对SIRT1活性(各种浓度的测试化合物存在下相对于缺少测试化合物的对照反应)。测试试剂通过SIRT1活化脱乙酰化的程度表达为EC1.5(即，相对于缺少测试化合物的对照，使SIRT1活性增加50％所需要的化合物浓度)，和最大活化百分数(即，对于测试化合物得到的相对于对照(100％)的最大活性)。
在反应开始时，通过加入1μL的500mM烟酰胺作为阴性对照(例如，允许测定最大沉默调节蛋白抑制)来进行沉默调节蛋白活性抑制的对照。沉默调节蛋白活性的活化的对照是如下进行的：使用10nM沉默调节蛋白，用1μL DMSO代替化合物，在分析的线性范围内，在给定时间点测定底物的脱乙酰化量。该时间点与试验化合物所使用的时间点相同，并且在线性范围内，端点代表速度变化。
对于上述分析，SIRT1蛋白表达并纯化如下。将SirT1基因克隆到含有T7-启动子的载体中，并转化到BL21(DE3)中。在18℃，通过用1mM IPTG(作为N-末端His-标记融合蛋白)诱导来表达该蛋白，过夜，并在30,000x g下收获。在裂解缓冲液(50mM Tris-HCl，2mM Tris[2-羧乙基]膦(TCEP)，10μM ZnCl2，200mM NaCl)中，用溶菌酶将细胞裂解，并进一步用超声处理10分钟，以便完全裂解。用Ni-NTA柱(Amersham)纯化蛋白，并合并含有纯蛋白的级分，浓缩，使其运行通过分级柱(Sephadex S200 26/60global)。收集含有可溶性蛋白的峰，并运行通过离子交换柱(MonoQ)。梯度洗脱(200mM-500mM NaCl)得到纯蛋白。将该蛋白浓缩，并用渗析缓冲液(20mM Tris-HCl，2mM TCEP)进行渗析过夜。将蛋白等分，并在使用前在-80℃冷冻。
使用上述分析，鉴定活化SIRT1的式(I)的调节沉默调节蛋白的化合物，如下表1所示。EC1.5值代表导致SIRT1的150％活化的试验化合物的浓度。式(I)的活化化合物的EC1.5值由A(EC1.5<1μM)、B(EC1.5：1-25μM)、C(EC1.5>25μM)代表。最大活化倍数百分数由A(活化倍数≥150％)或B(活化倍数<150％)代表。“NT”表示未测试；“ND”表示测不到。表中编号的化合物从化合物编号10开始，和括号编号(#)对应的是图4的STAC编号系统和实施例90-106(即，化合物编号68也是STAC 1，因此将其表示为68(1)，还有STAC：546(3)、444(4)、314(5)、816(7)、76(8)和81(9))。
值得注意的是，本发明的化合物由两种不同的化学命名规则命名，由两种不同的化学制图和/或化学命名计算机程序产生，即由Chem Axon(JChem-Excel)和Cambridge Sof各自的公司产生。
表1(ISOMER＝异构体)
实施例375
本发明涉及沉默调节蛋白调节剂，其在科学文献中已知用于提高细胞寿命，以及治疗和/或预防宽范围的多种疾病和障碍，所述疾病和障碍包括但不限于，例如，与衰老或应激反应有关的疾病或障碍、糖尿病、肥胖症、神经变性疾病、心血管疾病、血液凝固障碍、炎症、癌症和/或潮红，以及受益于线粒体的活性增加的疾病或障碍
除了治疗潜力外，SIRT1活性和被小分子沉默调节蛋白调节剂激活的结构和生物物理研究还用于促进对沉默调节蛋白的生物学功能、沉默调节蛋白激活的作用机制和辅助开发鉴定新颖的沉默调节蛋白调节剂的测定法的理解。
基于前文，分别引用了以下文献参考文献，以证明本发明化合物作为沉默调节蛋白调节剂的作用及其与各种疾病的关联，如以下参考文献中所例示或公开的那样：
1.Marcia C.Haigis and David A.Sinclair,Mammalian Sirtuins:BiologicalInsights and Disease Relevance,Annu Rev Pathol.2010；5:253–295。
Haigis和Sinclair教导：
“衰老伴随多器官系统健康功能下降，导致由II型糖尿病、神经变性疾病、癌症和心血管疾病等疾病导致的发病率和死亡率上升。历史上，研究人员专注于调查孤立器官中的个体途径，作为确定疾病根源的策略，希望设计出更好的药物。在酵母中衰老的研究产生称为沉默调节蛋白的保守酶的家族，其影响增加生物体的寿命和整体健康的多种途径。自从10年前发现第一个已知的哺乳动物沉默调节蛋白SIRT1以来，我们对沉默调节蛋白的酶学理解、其调控及其广泛改善哺乳动物生理和健康跨度的能力有了重大进展。本综述总结并讨论了过去十年的发现进展以及未来几年将面临的挑战(见其中的“摘要”及参考文献)。
2.Gizem Donmez1等人，SIRT1 and SIRT2:emerging targets inneurodegeneration,EMBO Mol Med(2013)5,344–352.
Gizem Donmez1等人教导：
“沉默调节蛋白是已知具有对抗年龄相关疾病如癌症，糖尿病，心血管和神经变性疾病，具有保护作用的NAD依赖性蛋白脱乙酰酶。在哺乳动物中，有七种沉默调节蛋白(SIRT1-7)，其显示亚细胞定位和功能的多样性。尽管SIRT1由于与寿命延长的初步联系和热量限制的参与而得到广泛研究，其他沉默调节蛋白的重要生物和治疗作用最近才得到认可。在这里，我们回顾了SIRT1和SIRT2在神经变性疾病中的潜在作用和影响。我们讨论了SIRT1和SIRT2在各种神经变性疾病(包括阿尔茨海默病(AD)，帕金森病(PD)和亨廷顿病(HD))中的不同功能和靶标。我们还报道了SIRT1在神经元分化中的作用(由于可能牵涉在神经变性条件中)，并以SIRT1和SIRT2在这些疾病中的潜在治疗价值的前景作为结论(见其中的“摘要”及参考文献)。
3.Bracke等人，Targeted silencing of DEFB4 in a bioengineered skin-humanized mouse model for psoriasis:development of siRNA SECosome-based noveltherapies；Exp Dermatol.2014年3月；23(3):199-201.doi:10.1111/exd.12321。
具体地，Bracke等人教导：
“银屑病是一种复杂的炎症性皮肤病，具有广泛的临床表现。人β防御素-2(hBD-2)在银屑病病变中高度上调，并被定义为疾病活动的生物标志物。我们通过在银屑病的生物工程化的皮肤-人化小鼠模型中局部应用含DEFB4-siRNA的SECosomes探讨了靶向hBD-2的潜在益处。通过组织学检查观察到银屑病表型的显着改善，皮肤结构正常化和皮肤隔室中血管数量和尺寸的减少。治疗导致转谷氨酰胺酶活性、丝聚蛋白表达和角质层外观恢复到与正常再生人皮肤中发现的水平相似的水平。银屑病的可靠的皮肤人化小鼠模型的获得以及使用SECosome技术可能为鉴定潜在的这种疾病的治疗靶点提供了有价值的临床前工具。”
4.Karline Guilloteau等人，Skin Inflammation Induced by the SynergisticAction of IL-17A,IL-22 Recapitulates Some Features of psoriasis Oncostatin M,IL-1a,and TNF-a,J Immunol 2010；184:5263-5270。
Guilloteau等人教导:
“角质形成细胞在调节皮肤炎症，响应于环境和免疫细胞刺激方面发挥关键作用。它们产生的可溶性因子可以以自分泌或旁分泌的方式在免疫细胞上起作用或直接作用于侵袭者。筛选36种细胞因子对角质形成细胞基因表达的活性，鉴定出IL-17A，IL-22，制癌素M，TNF-α和IL-1a作为诱导皮肤炎症的潜在细胞因子。这五种促炎细胞因子协同增加CXCL8和b-防御素2(BD2)的产生。此外，对于人类皮肤外植体的离体研究表明响应于细胞因子的相同组合，BD2，S100A7和CXCL8的表达上调。体内皮内注射这5种细胞因子在小鼠中增加CXCL1，CXCL2，CXCL3，S100A9和BD3表达，与嗜中性粒细胞浸润有关。我们证实并扩展了这种协同效应，使用定量实时PCR分析，观察到9种趋化因子和12种抗微生物肽的表达增加。在这种细胞因子组合存在下刺激的角质形成细胞产生CXCL，CXCL5和CXCL8与增加的嗜中性粒细胞趋化活性相关。类似地，BD2，BD3和S100A7的高产生量与增加的抗微生物活性相关。最后，在炎症角质形成细胞的体外模型中观察到的转录概况与损伤性银屑病皮肤相关。我们的研究结果表明IL-17A，IL-22，制癌素M，TNF-α和IL-1a对角质形成细胞的重要增强活性。这在银屑病的背景下特别有意义，其中这些细胞因子被过表达并且可以协同作用以在趋化因子和抗微生物肽生产的上调中发挥重要作用。The Journal of Immunology，2010,184：5263-5270(见其中的“摘要”及参考文献)”。
实施例376的测定描述
PBMC测定
沉默调节蛋白1(Sirt1)是沉默信息调节剂2(Sir2)的同源物，是NAD依赖性III类组蛋白脱乙酰酶的成员。Sirt1对组蛋白、转录因子和非组蛋白上的赖氨酸残基进行脱乙酰化。Sirt1已被证明参与衰老，细胞周期调节，细胞凋亡，代谢调节和炎症。Sirt1的激活导致核因子kB(NF-kB)转录因子的RelA/p65亚基的赖氨酸310脱乙酰化，其抑制NF-kB转录并下调TNFα的水平。TNFα是一种多效细胞因子，主要由巨噬细胞和单核细胞产生。TNFα密切参与免疫防御和慢性炎症包括银屑病。已知银屑病皮肤中1型细胞因子如TNFα的表达增加，并且在银屑病的病因学中起重要作用(Uyemura K等人，1993，J.Invest Dermatol，101，p701)。重要的是，抗TNF剂已被临床用于银屑病。因此，诱导炎症细胞中TNFα表达降低的Sirt1激活剂在中至重度银屑病患者中应具有治疗作用。
开发了基于PBMC/TNFα细胞的测定，以鉴定抑制响应于外周血单核细胞(PBMC)的脂多糖(LPS)刺激而释放TNFα的Sirt1的激活剂。简而言之，PBMC被LPS刺激，导致TNFα分泌产生的增加。通过TNFαHTRF(均相时间分辨荧光)试剂盒(CisBio，Inc)测量TNFα蛋白水平。根据制造商的说明进行细胞裂解和TNFα检测。在LPS存在下测试Sirt1激活剂以评估其对TNFα释放的抑制作用，并且在剂量–响应实验中测定IC50。
β-防御素2(bD2)测定
沉默调节蛋白是NAD依赖性脱乙酰酶的家族，其具有广泛的生理功能，并且已经涉及许多自身免疫和代谢疾病，包括类风湿性关节炎和I型糖尿病。SIRT1的底物是多种多样的，并且包括在天然和适应性免疫应答中具有确定作用的炎症组分，例如NFκB，AP-1，FOXO和p53。
银屑病是由遗传，自身免疫和环境因素引起的慢性炎性皮肤病。病变的特征在于表皮中角质形成细胞的过度增殖和炎性细胞的浸润，导致白鳞覆盖的慢性红斑斑块。以前的研究表明，通过直接抑制STAT3乙酰化，SIRT1可以阻止IL-22(一种在银屑病中的关键的细胞因子)的作用(Sestito等人，2011)。此外，SIRT1过表达和白藜芦醇治疗(SIRT1激活)都可以诱导角质形成细胞分化(Blander等人，2009)。
β-防御素2(bD2)是一种抗微生物肽，可以从上皮分泌，作为记忆性T细胞，未成熟树突状细胞和嗜中性粒细胞的化学引诱物。因此，bD2是皮肤炎症反应的主要部分。与正常皮肤相比，不仅在银屑病患者的损伤表皮细胞中诱导bD2，而且bD2也是银屑病患者疾病严重程度的血清生物标志物(Jansen等人，2009；Kamsteeg等，2009)。此外，bD2可能与银屑病遗传相关，因为最近的一项研究揭示了增加的β-抗御素素基因拷贝数与银屑病风险之间的显著关联(Hollox等人，2008)。值得注意的是，bD2siRNA的局部递送导致银屑病生物工程化的皮肤-人化小鼠模型中正常皮肤结构和蛋白质表达的恢复(Bracke等人，2014)。
先前描述了产生以模拟银屑病炎症的体外角化细胞炎症测定(Guilloteau等人，2010；Teng等，2014)。在这些研究中，发现IL-1α，IL-17A，IL-22，OSM和TNFα的细胞因子混合物(称为“M5”)在体外在原代人角质形成细胞中协同作用以产生“银屑病炎状”转录谱。在这些研究中，bD2是诱导角质形成细胞炎症反应最强的响应者之一。
因此，进一步开发这项测定，以评估SIRT1激活剂化合物对局部银屑病程序的疗效。具体地，针对用M5细胞因子组合体外处理的永生化人角质形成细胞系(HaCaT)进行了条件优化，以诱导银屑病炎症(如上文参考文献中所述)。在48小时的时间内，通过bD2 ELISA测定(Alpha Diagnostics)测量的bD2分泌与未刺激的角质形成细胞相比显著增加。可以通过治疗已知抑制银屑病炎症的化合物(或重要的是用一小组SIRT1激活剂)处理来抑制该bD2诱导。同时，48小时测定内的细胞毒性由CellTiter-Glo发光细胞活力测定(Promega)确定，以确定毒性是否可能在bD2响应中起作用。
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银屑病&IL-17
银屑病是具有多因素发病机制的慢性、复发性、炎性自身免疫性皮肤病，受遗传，环境和免疫病理因素影响(Griffiths CE等人，Lancet 2007；370：263-71)。银屑病的特征是复发性发作，具有附着的银色鳞片的凸起的、界限清楚的红斑卵形斑块。组织学上，银屑病的特征是存在增厚的成核角质形成细胞层，具有夸大的钉突(rete pegs)，这是由角质形成细胞的过度增殖和活化的T细胞、嗜中性粒细胞和树突状细胞的皮肤浸润引起(Schon MPN.Engl.J.Med。352：1899-1912)。
积累的证据表明，银屑病作为Th17介导的疾病，由其特征性细胞因子IL-17A，IL-17F和IL-22驱动。IL-22诱导角质形成细胞的增殖，而IL-17A刺激角质形成细胞分泌趋化因子和其他促炎介质，所述其他促炎介质募集其他炎性细胞，包括嗜中性粒细胞，树突状细胞和先天性淋巴样细胞(Martin DA等人，J Invest Dermatol 2013；133：17-26)。
IL-17途径在介导银屑病中的临床验证是通过成功的Ph3研究证实的，该研究显示使用靶向IL-17的单克隆抗体治疗疾病的显著改善(Langley等人，NEJM 2014)。此外，在IL-17抑制之后的银屑病病变中的总体转录谱分析将来自角质形成细胞和白细胞亚组的多种炎症因子抑制至与非损伤皮肤中观察到的相似水平(Russell等人，J Immunol 2014,192：3828-3836)。总之，这些发现支持IL-17在介导银屑病发病机制中的作用。
方法(离体皮肤测定)
使用Th17细胞因子混合物在离体人皮肤外植体中刺激皮肤中驻留的免疫细胞，导致Th17相关细胞因子(IL-17A，IL-17F和IL-22)的显著上调，其将该系统建立为基于人组织的银屑病模型。Th17细胞因子混合物刺激后，评估测试化合物调节IL-17A，IL-17F和IL-22表达的能力，使用离体皮肤培养方法。
简单地说，对从腹壁成形术手术获得的离体人皮肤进行加工，以除去脂肪，组织被皮下切割成约750微米。然后将切割的皮肤在含有抗生素/抗真菌溶液的室温PBS中两次连续冲洗清洁5-10分钟，皮肤切片用一次性单一用途活检穿孔器切割成10mm直径的圆形切片，然后将其放置在0.4μmPCF膜Transwell(Millicell#PIHP01250)的上部室中，其含有30μl用角质化培养基制备的64％牛胶原溶液(Organogenesis，#200-055)。将皮肤样品在37℃下在加湿室中在胶原溶液上放置30分钟。将Transwell上的皮肤样品转移到6孔板(每孔1个样品)中，并且将下部室充满1ml完全培养基(角质化培养基)。
腹部成形手术后第一天，将皮肤外植体在角质化培养基中培养，并在37℃下孵育过夜。具体地，用Th17混合物(CD3，1μg/ml，CD28，2μg/ml，IL-1b，10ng/ml，IL-6，5ng/ml，TGFb，1ng/ml，IL-21，10ng/ml，抗IL-4，1μg/ml和抗INFg，1μg/ml)刺激人皮肤外植体(N＝3/条件)。与Th17混合物同时加入1、3和10uM的测试化合物。在Th17活化后24小时收集组织，分离RNA用于使用qPCR对转录物进行定量(IL-17A，IL-17F，IL-22)。
使用Qiagen的Mini RNA分离试剂盒(目录号74106)从约40mg的组织中分离总RNA。简言之，在Precellys-24机器中，使用300μl补充有1％2-β-巯基-乙醇的RLT缓冲液，在6300rpm下将组织切碎并匀化30秒，运行10个周期，其中有2分钟的冷却暂停期(icebreak)。向匀浆中加入490μl含有10μl蛋白酶K的水，并在55℃下消化15分钟。将消化的组织在10,000G离心沉降3分钟以沉淀细胞碎片，并使用Qiagen的RNeasy微型柱根据制造商的方案将上清液用于RNA分离。使用Nanodrop 2000定量总RNA，并在Agilent生物分析仪(随附了文件)上进行分析。使用Invitrogen SuperScript VILO cDNA合成试剂盒(#11754-050)，在20μlPCR体积中使用1.4μgRNA作为模板以产生cDNA模板。然后对于随后的qPCR将cDNA以1:25稀释，针对每个待定量基因使用特定的TaqMan探针，进行定量。使用Delta Delta CT公式计算感兴趣的基因的RNA水平的相对表达。
等同方案
本发明提供了调节沉默调节蛋白的化合物、药物组合物、方法、用途等。尽管已经讨论了主题发明的具体实施方案，但上述说明书是说明性的，不是限制性的。在阅读本说明书后，本发明的许多变化对本领域技术人员来说是明显的。本发明的全部范围应该由权利要求书以及其等同方案的整个范围，以及说明书和所述变化来确定。

Claims (17)

1.式(I)化合物或其药学上可接受的盐，式(I)化合物为:
其中：
X1或X2独立选自-N或-C；
R1为氢、卤素、-CN、碳环基、杂环基、-N-取代的杂环基、芳基、杂芳基、-C(O)Ra或-C(O)-NRbRc；
R2为卤素、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基，或-C(O)-NRbRc；
R3为氢、卤素、-羟基、直链或支链C1-C6烷基，或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
R4为氢或–C(O)NRbRc；
其中：
当X2是-N时，R2不存在；或
当X2是-C时，R2如上所定义；
如上定义的各R1、R2、R3和R4任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH、-C≡N、-NRdRe、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链C1-C6卤代烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)，或-C(O)ORf；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re或Rf独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6-环烷基、-(CH2)xC1-C6-环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基、-(CH2)x杂芳基或-(CHRg)x杂芳基；
其中：
Rg为直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re或Rf任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-C≡N、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、碳环基、-(CH2)x-碳环基、-杂环基、-O-杂环基芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)、-(CH2)x-OH，或-C(O)-OH；
m为整数1至3；
n为选自1至3的整数；
x为0或整数1至6。
2.根据权利要求1的式(I)化合物，其中：
m是1；
n是2或3；以及
R4是–C(O)NRbRc，其中Rb和Rc如权利要求1中所定义。
3.根据权利要求1的式(I)化合物，其中R1选自：
4.根据权利要求1的式(I)化合物，其中R1选自：
5.根据权利要求1的式(I)化合物，其中其中R4选自：
在另一方面，本发明分别涉及式(I)至(IV)的化合物，其中R4选自：
6.式(III)化合物或其药学上可接受的盐：
其中：
X1或X2独立选自-N或-C；
其中：
当X2是-N时，R2不存在；或
当X2是-C时，R2如上所定义；
R1为氢、卤素、-CN、碳环基、杂环基、-N-取代的杂环基、芳基、杂芳基、-C(O)Ra或-C(O)-NRbRc；
R2为卤素、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基，或-C(O)-NRbRc；
R3为氢、卤素、-羟基、直链或支链C1-C6烷基，或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
各R5和R6独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)xC1-C6环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基、-(CHRg)x杂芳基；
其中：
如上定义的各R1、R2、R3、R5和R6任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH、-C≡N、-NRdRe、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链C1-C6卤代烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)，或-C(O)ORf；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf或Rg独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6-环烷基、-(CH2)xC1-C6-环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基；
其中：
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf或Rg任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH，-C≡N、-NRhRi、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链-C1-C6卤代烷氧基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、-杂环基、-O-杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)、-(CH2)x-OH或-C(O)ORj；
其中：
各Rh、Ri和Rj独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
m为整数1至3；
n为选自2至3的整数；
x为0或选自1至6的整数。
7.式(V)化合物或其药学上可接受的盐:
其中：
R1为氢、卤素、-CN、碳环基、杂环基、-N-取代的杂环基、芳基或杂芳基；
R2为卤素、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基，或-C(O)-NRbRc；
R3为氢、卤素、-羟基、直链或支链C1-C6烷基，或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
各R5和R6独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)xC1-C6环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基、-(CHRg)x杂芳基；
其中：
如上定义的各R1、R2、R3、R5和R6任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH、-C≡N、-NRdRe、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链C1-C6卤代烷氧基、-O-直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)，或-C(O)ORf；
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf或Rg独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、-C1-C6-环烷基、-(CH2)xC1-C6-环烷基、杂环基、-N-杂环基、芳基、杂芳基，或-(CH2)x杂芳基；
其中：
如上定义的各Ra、Rb、Rc、Rd、Re、Rf或Rg任选进一步被选自以下的一个或多个取代基取代：氢、卤素、-OH、-(CH2)xOH，-C≡N、-NRhRi、直链或支链C1-C6烷基、直链或支链-C1-C6卤代烷基、直链或支链C1-C6烷氧基、直链或支链-C1-C6卤代烷氧基、-C1-C6环烷基、-(CH2)x-环烷基、杂环基、-杂环基、-O-杂环基、芳基、-杂芳基、-(CH2)x-杂芳基、-O-(CH2)xCH(OH)CH2(OH)、-(CH2)x-OH，或-C(O)ORj；
其中：
各Rh、Ri和Rj独立选自氢、直链或支链C1-C6烷基或直链或支链-C1-C6卤代烷基；
m为整数1至3；
n为选自2至3的整数；
x为0或选自1至6的整数。
8.化合物，其为表I中列出的化合物或其药学上可接受的盐。
9.药物组合物，其包含权利要求1至8中任一项的化合物和药学上可接受的载体。
10.权利要求9的药物组合物，还包含额外的活性剂。
11.用于治疗胰岛素抵抗、代谢综合征、代谢功能障碍、糖尿病或它们的并发症，或用于增加胰岛素敏感性的方法，包括向有此需要的受试者给予权利要求1至8中任一项的化合物或权利要求9或10中任一项的药物组合物。
12.治疗由SIRT1表达或活性减少引起的疾病或障碍的方法，其包括向有此需要的受试者给予权利要求1至8中任一项的化合物或其药学上可接受的盐或权利要求9或10中任一项的药物组合物。
13.根据权利要求12的方法，其中所述由SIRT1表达或活性减少引起的疾病或障碍选自但不限于，衰老或应激、糖尿病、代谢功能障碍、神经变性疾病、心血管疾病、癌症或炎性疾病。
14.根据权利要求13的方法，其中与衰老或应激相关的疾病、糖尿病、代谢功能障碍、神经变性疾病、心血管疾病、癌症或炎性疾病选自银屑病、特应性皮炎、痤疮、酒渣鼻、炎性肠病、骨质疏松症、败血症、关节炎、COPD、系统性红斑狼疮和眼科炎症。
15.治疗银屑病的方法，其包括向有此需要的受试者给予权利要求1至8中任一项的化合物或权利要求9或10的药物组合物。
16.如权利要求1至8化合物中定义的化合物，用于治疗患有或易患胰岛素抵抗、代谢综合征糖尿病或它们的并发症的受试者的疗法中，或用于在受试者中增加胰岛素敏感性。
17.如权利要求1至8化合物中定义的化合物在制备用于在受试者中治疗胰岛素抵抗、代谢综合征、糖尿病或它们的并发症或用于增加胰岛素敏感性的药物中的用途。
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