CN107002146B - 用于检测耐药性结核分枝杆菌的组合物和方法 - Google Patents

Abstract

描述了用于快速检测生物或非生物样品中是否存在对利福平耐受的结核分枝杆菌(MTB)(MTB‑RIF)和/或对异烟肼耐受的MTB(MTB‑INH)的方法。所述方法可包括进行扩增步骤、杂交步骤和检测步骤。此外，提供了经设计用于检测MTB‑RIF和/或MTB‑INH的靶向rpoB、inhA和katG基因的引物、探针，连同试剂盒。

Description

用于检测耐药性结核分枝杆菌的组合物和方法

发明领域

本发明涉及病毒诊断领域，并且更具体地，涉及用于检测耐药性结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)的利用水解探针的PCR检测方法。

发明背景

结核病(TB)是一种最常见于肺部的由各种分枝杆菌菌株，如结核分枝杆菌(MTB)，引起的细菌性疾病。当患有肺或喉结核的个体咳嗽、打喷嚏或吐痰，并将MTB推进到空气中时，结核病通过空气而在人与人之间传播。据估计，世界人口的三分之一感染有MTB，而每年有9百万人发展成TB。TB一直是人类传染病的主要原因，并且MTB耐药菌株正在增加，尤其是在发展中国家中。

用于治疗MTB的两种常用一线药物包括异烟肼(INH)和利福平(RIF)，而患者可以通过居住在或访问耐药性普遍的地方而获得耐药MTB。当患者的抗生素治疗方案被打断时，也可以发展出耐药MTB。在固体或液体培养基上培养仍然被视为用于MTB和MTB耐药性检测的黄金标准，但培养可花费长达八周的时间以获得结果。许多针对MTB耐药性的商用核酸测试具有非常快速的周转时间，但无法检测在包含野生型和突变种二者的混合感染中，突变种占小百分比的群体。因此，本领域需要快速且可靠的方法从而以灵敏的方式特异性检测对利福平耐受的MTB (MTB-RIF)和/或对异烟肼耐受的MTB (MTB-INH)。

发明概述

本文所述的实施方案涉及快速检测生物或非生物样品中是否存在MTB-RIF和/或MTB-INH的方法，例如，通过实时聚合酶链式反应在单个试管中多重检测MTB-RIF和/或MTB-INH。实施方案包括检测MTB-RIF和/或MTB-INH的方法，该方法包括进行至少一个循环步骤，其可包括扩增步骤和杂交步骤。此外，实施方案包括设计用于在单个试管中检测单一MTB-RIF或MTB-INH感染或MTB-RIF和MTB-INH混合感染的引物、探针以及试剂盒。所述检测方法被设计用于同时特异性识别靶MTB基因中rpoB (β亚基原核RNA聚合酶)、inhA (烯酰基-酰基载体蛋白还原酶)和katG (过氧化氢酶-过氧化物酶)的单多态性(SNP)，其允许在单次测试中检测并区分MTB-RIF和/或MTB-INH感染。例如，在rboB基因中存在17种赋予MTB中对利福平的抗性的SNP，其包括：rpoB 531L、rpoB 531W、rpoB 526L、rpoB 526Y、rpoB 526D、rpoB526N、rpoB 513L、rpoB 513K、rpoB 513P、rpoB 522L、rpoB 522Q、rpoB 522W、rpoB 516V、rpoB 516Y、rpoB 533P、rpoB 511P和rpoB 526R；在inhA基因中存在3种赋予MTB中对异烟肼的抗性的SNP，其包括：inhA-15T、inhA-8A和inhA-8C；且在katG基因中存在4种也赋予MTB中对异烟肼的抗性的SNP，其包括：katG 315I、katG 315N、katG 315T和katG 315T2。

在一个方面，提供了检测样品中MTB-RIF和/或MTB-INH的方法，包括进行扩增步骤，其包括使所述样品与至少一组rpoB引物、一组inhA引物以及一组katG引物接触，从而，如果在所述样品中存在任何rpoB、inhA和katG靶核酸，则产生一种或多种扩增产物；进行杂交步骤，其包括使所述一种或多种扩增产物与多种可检测的rpoB探针、多种可检测的inhA探针以及多种可检测的katG探针接触，包括：用于检测赋予MTB利福平抗性的17种单核苷酸多态性SNP中的一种或多种的至少17种rpoB探针；用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP中的一种或多种的至少3种inhA探针；和用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP中的一种或多种的至少4种katG探针；以及检测所述一种或多种扩增产物的存在与否，其中存在所述一种或多种扩增产物表明样品中存在MTB-RIF和/或MTB-INH，而其中不存在所述一种或多种扩增产物表明样品中不存在MTB-RIF和/或MTB-INH；其中所述多种rpoB探针包括用于检测赋予MTB利福平抗性的17种SNP中的每一种的水解探针，包括：rpoB 531L、rpoB 531W、rpoB526L、rpoB 526Y、rpoB 526D、rpoB 526N、rpoB 513L、rpoB 513K、rpoB 513P、rpoB 522L、rpoB 522Q、rpoB 522W、rpoB 516V、rpoB 516Y、rpoB 533P、rpoB 511P和rpoB 526R；其中所述多种inhA探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP中的每一种的水解探针，包括：inhA-15T、inhA-8A和inhA-8C；且其中所述多种katG探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP中的每一种的水解探针，包括：katG 315I、katG 315N、katG 315T和katG 315T2。在某些实施方案中，rpoB探针包含选自SEQ ID NO: 1-289和437-438的核酸序列或其互补物，或由其组成；inhA探针包含选自SEQ ID NO: 344-409和436的核酸序列或其互补物，或由其组成；且katG探针包含选自SEQ ID NO: 290-343和434-435的核酸序列或其互补物，或由其组成。在一些实施方案中，rpoB探针选自SEQ ID NO: 1-289和437-438或其互补物；inhA探针选自SEQ ID NO: 344-409和436或其互补物；且katG探针选自SEQ ID NO: 290-343和434-435或其互补物。在一些实施方案中，多种可检测的rpoB、inhA和katG探针中的每一种均用供体荧光部分和对应的受体荧光部分标记，且检测步骤包括检测一种或多种的rpoB、inhA和katG探针中的所述供体荧光部分与所述受体荧光部分之间是否存在荧光共振能量转移(FRET)，其中荧光发射的存在与否表明样品中是否存在MTB-RIF和/或MTB-INH。在一些实施方案中，所述扩增采用具有5'至3'核酸酶活性的聚合酶。在一些实施方案中，所述供体和受体荧光部分在所述探针上彼此相距不超过8个核苷酸。在一些实施方案中，所述受体荧光部分为猝灭剂。

在另一方面，提供了寡核苷酸，其包含选自SEQ ID NO: 1-409和434-438的核苷酸序列或其互补物，或由其组成，该寡核苷酸具有100个或更少的核苷酸。在另一方面，本公开提供了寡核苷酸，其包含与SEQ ID NO: 1-409和434-438之一或其互补物具有至少70%序列同一性(例如，至少75%、80%、85%、90%或95%等)的核酸，该寡核苷酸具有100个或更少的核苷酸。一般来讲，在这些实施方案中，这些寡核苷酸可以是引物核酸、探针核酸等。在这些实施方案的某些中，寡核苷酸具有40个或更少的核苷酸(例如，35个或更少的核苷酸、30个或更少的核苷酸，等)。在一些实施方案中，寡核苷酸包含至少一个经修饰的核苷酸，例如，以相对于未经修饰的核苷酸改变核酸杂交稳定性。在一些实施方案中，寡核苷酸包含一个或多个可检测标记。任选地，寡核苷酸包含至少一个标记和/或至少一个猝灭剂部分。在一些实施方案中，寡核苷酸包括至少一种保守修饰的变异(variation)。特定核酸序列的“保守修饰的变异”或简称“保守变异”是指那些核酸，其编码相同或基本上相同的氨基酸序列，或当其中所述核酸不编码氨基酸序列时，是指基本上相同的序列。技术人员将认识到，改变、添加或缺失所编码的序列中的单个氨基酸或小百分比的氨基酸(通常小于5%，更通常小于4%、2%或1%)的单独的取代、缺失或添加是“保守修饰的变异”，其中所述改变导致氨基酸的缺失、氨基酸的添加、或氨基酸被化学上相似的氨基酸取代。在一个方面，扩增可以采用具有5'至3'核酸酶活性的聚合酶。因此，第一和第二荧光部分可沿着探针的长度方向彼此相距不超过8个核苷酸。

在另一方面，提供了一组寡核苷酸，其包括专门用于检测rpoB、inhA和katG扩增产物的多种可检测rpoB、inhA和katG探针，包括：用于检测赋予MTB利福平抗性的17种SNP中的一种或多种的17种rpoB探针；用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP中的一种或多种的3种inhA探针；和用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP中的一种或多种的4种katG探针；其中所述多种rpoB探针包括用于检测赋予MTB利福平抗性的17种SNP中的每一种的水解探针，包括：rpoB 531L、rpoB 531W、rpoB 526L、rpoB 526Y、rpoB 526D、rpoB 526N、rpoB 513L、rpoB513K、rpoB 513P、rpoB 522L、rpoB 522Q、rpoB 522W、rpoB 516V、rpoB 516Y、rpoB 533P、rpoB 511P和rpoB 526R；其中所述多种inhA探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP中的每一种的水解探针，包括：inhA-15T、inhA-8A和inhA-8C；且其中所述多种katG探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP中的每一种的水解探针，包括：katG 315I、katG315N、katG 315T和katG 315T2。在本文中，所述寡核苷酸组适用于检测样品中对利福平耐受的结核分枝杆菌(MTB-RIF)和/或对异烟肼耐受的MTB (MTB-INH)的核酸。在一些实施方案中，rpoB探针包含选自SEQ ID NO: 1-289和437-438的核酸序列或其互补物；inhA探针包含选自SEQ ID NO: 344-409和436的核酸序列或其互补物；且katG探针包含选自SEQ IDNO: 290-343和434-435的核酸序列或其互补物。在一些实施方案中，在该组内的寡核苷酸具有100个或更少的核苷酸。在这些实施方案的某些中，寡核苷酸具有40个或更少的核苷酸(例如，35个或以下的核苷酸、30个或更少的核苷酸等)。在一些实施方案中，寡核苷酸包含至少一个经修饰的核苷酸，例如，以相对于未经修饰的核苷酸改变核酸杂交稳定性。任选地，寡核苷酸包含至少一个标记和/或至少一个猝灭剂部分。在一些实施方案中，寡核苷酸包括至少一种保守修饰的变异。在一些实施方案中，寡核苷酸包含第一和第二荧光部分，这两部分可沿着探针的长度方向彼此相距不超过8个核苷酸。

在另外的方面，提供了用于检测MTB-RIF和/或MTB-INH的一种或多种核酸的试剂盒。所述试剂盒可以包括专门用于扩增rpoB、inhA和katG基因靶标的多组rpoB、inhA和katG引物；和专门用于检测rpoB、inhA和katG扩增产物的多种可检测的rpoB、inhA和katG探针。在一些实施方案中，所述多种可检测的rpoB、inhA和katG特异性探针至少包括：用于检测赋予MTB利福平抗性的17种SNP中的一种或多种的17种rpoB探针；用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP中的一种或多种的3种inhA探针；和用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP中的一种或多种的4种katG探针；其中所述多种rpoB探针包括用于检测赋予MTB利福平抗性的17种SNP中的每一种的水解探针，包括：rpoB 531L、rpoB 531W、rpoB 526L、rpoB 526Y、rpoB526D、rpoB 526N、rpoB 513L、rpoB 513K、rpoB 513P、rpoB 522L、rpoB 522Q、rpoB 522W、rpoB 516V、rpoB 516Y、rpoB 533P、rpoB 511P和rpoB 526R；其中所述多种inhA探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP中的每一种的水解探针，包括：inh15T、inhA-8A和inh8C；且其中所述多种katG探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP中的每一种的水解探针，包括：katG 315I、katG 315N、katG 315T和katG 315T2。在一些实施方案中，rpoB探针包含选自SEQ ID NO: 1-289和437-438的核酸序列或其互补物，或由其组成；inhA探针包含选自SEQ ID NO: 344-409和436的核酸或其互补物，或由其组成；且katG探针包含选自SEQ ID NO: 290-343和434-435的核酸或其互补物，或由其组成。在一些实施方案中，rpoB探针选自SEQ ID NO: 1-289和437-438或其互补物；inhA探针选自SEQ ID NO: 344-409和436或其互补物；且katG探针选自SEQ ID NO: 290-343和434-435或其互补物。在一些实施方案中，所述试剂盒可包括已经用供体和对应的受体荧光部分标记的探针，或可以包括用于标记这些探针的荧光部分。在一些实施方案中，所述多种可检测的rpoB、inhA和katG探针中的每一种探针均包含供体荧光部分和对应的受体荧光部分。在一些实施方案中，所述受体荧光部分为猝灭剂。所述试剂盒还可以包括三磷酸核苷、核酸聚合酶以及对于核酸聚合酶功能所必需的缓冲液。所述试剂盒还可以包括药品说明书以及使用所述引物、探针和荧光部分以检测样品中是否存在MTB-RIF和/或MTB-INH的说明。

除非另行定义，否则本文中所用的全部技术与科学术语具有与本发明所属领域普通技术人员通常所理解的相同的含义。在下文中描述了合适的方法和材料，但与本文所述那些类似或等同的方法和材料也可用于实践或测试本主题。另外，所述材料、方法和实施例仅为说明性，且非旨在限制。

在以下的附图和说明书中描述了一个或多个实施方案的详细内容。其它特征、目标和优点将体现于所述附图和详细描述以及权利要求书。

附图简述

图1A和1B显示了针对rpoB基因靶标的野生型和突变型扩增子序列并指明了赋予MTB利福平抗性的17种SNP中的每一种。

图2A和2B显示了针对inhA基因靶标的野生型和突变型扩增子序列并指明了赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP中的每一种。

图3A和3B显示了针对katG基因靶标的野生型和突变型扩增子序列并指明了赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP中的每一种。

图4A 和4B显示了相比使用针对522L SNP的修饰探针，使用针对522L SNP的未经修饰的探针的单重PCR SNP特异性探针检测的生长曲线测定(MT靶标(~ 1 e6、1 e2、1 e310c/PCR)，相比WT)。

发明详述

通过核酸扩增诊断MTB-RIF和/或MTB-INH感染提供了用于迅速且准确检测MTB-RIF和/或MTB-INH感染的方法。在本文中描述了用于检测样品中MTB-RIF和/或MTB-INH的实时测定。提供了用于检测MTB-RIF和/或MTB-INH的rpoB、inhA和katG靶核酸的引物和探针，以及含有此类引物和探针的制品或试剂盒。用于检测MTB-RIF和/或MTB-INH的实时PCR相比其它方法在灵敏度上的提升，以及实时PCR的改进特征(包括样品控制(samplecontainment)和对扩增产物的实时检测)，使得将这项技术的实施适宜用于在临床实验室中对MTB-RIF和/或MTB-INH感染的常规诊断。

识别耐药MTB需要检测MTB基因组中位于多个不同基因上的大量单核苷酸多态性(SNP)。使用水解探针(也称为TaqMan探针)设计的新变型，创建了多重高分辨率TaqMan探针，其中每个TaqMan探针可以检测单一SNP而没有交叉反应性。所述探针被设计得很短并且高度稳定，从而仅对完全匹配的耐药(突变型)序列以高特异性结合并切割。

本公开提供了Taqman探针，其用于检测赋予MTB-RIF和MTB-INH抗性的多种SNP。TaqMan相容的探针一般无法检测单个碱基对错配。一般来讲，TaqMan探针被设计得长得多，并且具有明显高于相关PCR引物的解链温度，从而确保足够的探针先于引物结合至靶序列并在PCR期间获得最大的探针切割。由于此类探针的高解链温度和长度，其一般非常耐受在探针区域下的单个碱基错配，并因此并不分辨仅相差单个碱基的两个靶标。在本公开中，水解TaqMan探针能够成功地仅检测耐药MTB，并且不与可能仅相差单个碱基的药物敏感MTB交叉反应。本公开提供了大量短的、经高度修饰的探针，其可以检测探针区域下的单个碱基对错配。在探针设计中，可以被取代的经修饰的碱基包括：丙炔基-dC、叔丁基-苄基dC、丙炔基-dU、G夹、甲基-dC、N6-甲基dA和7-脱氮-dG。在设计探针时，本发明人策略性地将多个经修饰的碱基对置于探针序列内，从而使探针的分辨能力最大化。发现一些修饰的效果优于其它，并且分辨能力受到修饰在探针中的位置的影响。

本公开提供了用于多重测定的方法和试剂盒，所述多重测定可以利用多种经高度修饰的TaqMan探针，其中每种探针可以检测在MTB基因组中已知赋予利福平(RIF)和异烟肼(INH)耐药性的单一SNP，而不与药物敏感(野生型) MTB发生显著交叉反应。本公开的TaqMan探针的检测突变型SNP而没有显著WT交叉反应性的独特能力使得所述测定能够检测混合于野生型(WT)的背景中时的少量存在的耐药MTB。已经报道了混合感染的存在，并且其已经表明，由于现有商用测定不能在存在药物敏感MTB的情况下检测耐药MTB，所以混合感染的流行程度被低估了。据疾病控制中心(CDC)报道，患者在WT的背景下感染了低至1%的耐药MTB可能导致其建议的治疗方案失败。

所述方法可包括进行至少一个循环步骤，其包括使用多对引物从样品扩增rpoB、inhA和katG核酸分子基因靶标的一个或多个部分，所述引物包括如本文所用称为寡核苷酸引物的rpoB、inhA和katG特异性引物，其分别特异性退火至编码rpoB、inhA和katG的核酸序列，并在适当的条件下由此引发合成。所讨论的rpoB、inhA和katG引物中的每一种退火至各自的rpoB、inhA和katG靶核酸分子内的或与之相邻的靶标，使得每种扩增产物的至少一部分包含对应于各自靶标的核酸序列。只要样品中存在rpoB、inhA和katG核酸中的一种或多种，就产生所述rpoB、inhA和katG扩增产物中的一种或多种，因此，存在所述rpoB、inhA和katG扩增产物中的一种或多种表明样品中存在rpoB、inhA和katG。所述扩增产物应当包含与一种或多种可检测的探针互补的核酸序列，所述探针用于检测rpoB、inhA和katG中赋予MTB利福平和/或异烟肼抗性的SNP。每个循环步骤均包括扩增步骤、杂交步骤和检测步骤，在检测步骤中使样品与针对rpoB、inhA和katG的一种或多种可检测的探针接触，以检测样品中是否存在MTB-RIF和/或MTB-INH。

如本文所用，术语“扩增”是指合成与模板核酸分子(例如，rpoB、inhA和katG核酸分子)的一条链或两条链互补的核酸分子的方法。扩增核酸分子通常包括使模板核酸变性、在低于引物解链温度的温度将引物退火至模板核酸以及从引物酶促延伸以生成扩增产物。扩增通常需要存在脱氧核糖核苷三磷酸、DNA聚合酶(例如，Platinum® Taq)以及用于聚合酶活性最优化的合适的缓冲液和/或辅助因子(例如，MgCl₂和/或KCl)。

本文中所用的术语“引物”是本领域技术人员已知的并且是指低聚化合物，主要指寡核苷酸但也指经修饰的寡核苷酸，其能够通过模板依赖性DNA聚合酶“引导”DNA合成，即，例如，寡核苷酸的3'端提供游离的3'-OH基团，而可以通过模板依赖性DNA聚合酶，将另外的“核苷酸”连接到其上形成3'至5'磷酸二酯键，由此使用脱氧核苷三磷酸，并且由此释放焦磷酸。因此，可能除了对于所预期的功能之外，“引物”、“寡核苷酸”或“探针”之间不存在根本的区别。

术语“杂交”是指一个或多个探针退火至扩增产物。杂交条件通常包括低于探针的解链温度但避免探针的非特异性杂交的温度。

术语“5'至3'核酸酶活性”是指核酸聚合酶的活性，其通常与核酸链的合成有关，由此将核苷酸从核酸链的5'端移除。

术语“热稳定聚合酶”是指热稳定的聚合酶，即，该酶催化与模板互补的引物延伸产物的形成，并且当其经受引起双链模板核酸变性所必要的时间的高温时，不会不可逆地变性。一般来讲，合成起始于每个引物的3'端并以5'至3'的方向沿着模板链进行。已经从黄栖热菌(Thermus flavus)、红栖热菌(T. ruber)、嗜热栖热菌(T. thermophilus)、水生栖热菌(T. aquaticus)、乳栖热菌(T. lacteus)、红色栖热菌(T. rubens)、嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillus stearothermophilus)和炽热甲烷嗜热菌(Methanothermus fervidus)中分离出了热稳定聚合酶。尽管如此，非热稳定的聚合酶也可被用于PCR测定，前提是不断补充该酶。

术语“其互补物”是指与给定的核酸不仅长度相同并且还完全互补的核酸。

当谈到核酸而使用时，术语“延伸”或“延长”是指额外的核苷酸(或其它类似分子)被掺入到核酸中的情况。例如，核酸任选地被掺入核苷酸的生物催化剂延伸，如聚合酶，其通常在核酸的3'末端添加核苷酸。

在两个或更多个核酸序列的语境中，术语“相同的”或“同一性”百分比是指两个或更多个序列或子序列，其在就最大对应程度进行比较和比对(例如，使用技术人员可获得的序列比较算法或通过目测进行测量)时，是相同的或具有特定百分比的相同核苷酸。适用于确定序列同一性和序列相似性百分比的示例性算法为BLAST程序，其描述在，例如，Altschul等人(1990)“Basic local alignment search tool”J. Mol.Biol.215:403-410,Gish等人(1993) “Identification of protein coding regions by databasesimilarity search”Nature Genet.3:266-272, Madden等人(1996)“Applications ofnetwork BLAST server”Meth.Enzymol.266:131-141, Altschul等人(1997)“GappedBLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs”Nucleic Acids Res.25:3389-3402以及Zhang等人(1997)“PowerBLAST: A new networkBLAST application for interactive or automated sequence analysis andannotation” Genome Res.7:649-656。

在寡核苷酸的语境中，“经修饰的核苷酸”是指一种改变，其中寡核苷酸序列的至少一个核苷酸被不同的核苷酸所替换，这为寡核苷酸提供了所需的特性。本文中所述的寡核苷酸中可被取代的示例性的经修饰的核苷酸包括，例如，C5-甲基-dC、C5-乙基-dC、C5-甲基-dU、C5-乙基-dU、2,6-二氨基嘌呤、C5-丙炔基-dC、C5-丙炔基-dU、C7-丙炔基-dA、C7-丙炔基-dG、C5-炔丙基氨基-dC、C5-炔丙基氨基-dU、C7-炔丙基氨基-dA、C7-炔丙基氨基-dG、7-脱氮-2-脱氧黄嘌呤核苷、吡唑并嘧啶类似物、伪-dU、硝基吡咯、硝基吲哚、2'-0-甲基核糖-U、2'-0-甲基核糖-C、N4-乙基-dC、N6-甲基-dA等。所述寡核苷酸中可被取代的许多其它经修饰的核苷酸在本文中提到，或以其他方式为本领域中已知。在某些实施方案中，相对于对应的未经修饰的寡核苷酸的解链温度，经修饰的核苷酸取代改变了寡核苷酸的解链温度(Tm)。为了进一步说明，在一些实施方案中，某些经修饰的核苷酸取代可以减少非特异性核酸扩增(例如，最小化引物二聚体的形成等)，和/或增加预定靶扩增子的产率等。这些类型的核苷酸修饰的实例描述在，例如美国专利No. 6,001,611中。

MTB-RIF和/或MTB-INH核酸以及寡核苷酸

本公开提供了通过扩增，例如，一种或多种的rpoB、inhA和katG核酸序列的一部分，来检测MTB-RIF和/或MTB-INH的方法。rpoB、inhA和katG的核酸序列可例如通过GenBank得到。具体地，本公开的实施方案中提供了用于扩增和检测rpoB、inhA和katG核酸分子靶标的引物和探针。

更具体地，寡核苷酸的实施方案各自包括了这样的核酸，所述核酸具有选自SEQID NO: 1-409和434-438的序列、其基本上相同的变体，其中所述变体与SEQ ID NO: 1-409和434-438之一具有至少例如80%、90%或95%序列同一性，或SEQ ID NO: 1-409和434-438以及所述变体的互补物。

表I：用于rpoB、inhA和katG核酸分子靶标的探针

rpoB 531L		TCG/TTG	Ser/Leu
				寡聚物名称	SEQ ID NO	序列	修饰
RMRPO3SP531L09	1	FGTTGGQJGCTGGGGCP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 , J-G-夹
				RMRPO3SP531L18	2	FACTGTTQGGLGLTGGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
RMRPO3SP531L19	3	FCTGTTQGGLGLUGGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3S531L18B	4	FACTGTTQGGLGLUGGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3S531L18C	5	FCTGTUQGGLGLUGGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3531L1B	6	FCTGTTQGGLGCTGGGGCP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
RMRPO3SP531L20	7	FALUGTTQGGLGLUGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3S531L20	8	JCCGALTGTTGQGLGLUP	J-Threo-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3SP531L22	9	JCTGTTGGCGLUGQGGP	J-Threo-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3SP531L24	10	FLUGUUQGGLGLTGGGGLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3SP531L25	11	FLUGUUQGGLGLTGGGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3SP531L26	12	FUGUUGQGLGLTGGGGLLLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3S531L20B	13	FALUGUUQGGLGLUGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3S531L20C	14	EALUGUUQGGLGLUGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3S531L20D	15	FALUGUTQGGLGLUGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3S531L25B	16	ELUGUUQGGLGLUGGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3S531L25C	17	ELUGUUQGGLGLUGGLP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3S531L20F	18	EALUGUUQGGLGLUGLAGLP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3531L20HS	19	EALUGUUQJGGLGLUGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3531L25C2	20	ELUGUUGQGLGLUGGLP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3531L20C2	21	EALUGUUQGGLGLUGLP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3531L25C3	22	EALUGUUQGGLGLUGGLP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3S531F1	23	EALUGUUQLGLGLUGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3531L25B2	24	ELUGUUQGGLGLTGGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3531L31	25	EUGUUGQGLGLTGGGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3531L25B3	26	ELUGUUGQGLGLTGGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3531L25B4	27	ELUGUUGQGLGLTGGCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3F531L	28	FCCJACAQGTCGGCGCTTGP	F-Threo-FAM::J-叔丁基苄基-dA::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3F531L 02	29	FCCJACAQGTCGGCGCTTGTGGGTCP	F-Threo-FAM::J-叔丁基苄基-dA::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3F531L 04	30	FCCAACAQGTLGGLGLTTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
RMRPO3F531L05	31	FCCAACQAGTLGGLGLTTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
				RMRPO3F531L06	32	FCCAACAQGULGGLGLTUGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3AP531L11	33	FCCAACAQGTJGGCGCTTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 , J-G-夹
				RMRPO3AP531L12	34	FCCAAJAQGTCGGCGCTTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 , J-G-夹
RMRPO3AP531L13	35	FCCAACAQGTCGGJGCTTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 , J-G-夹
				RMRPO3AP531L14	36	FCCAACAQGTCGGCGJTTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 , J-G-夹
RMRPO3A531L12B	37	FCCAALQAGUCGGCGCTTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3AP531L17	38	FCCAALAQGTLGGLGLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
RMRPO3A531L17B	39	FCCAALQAGTLGGLGLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
				RMRPO3A531L19	40	FCCAALQAGTLGGLGCTP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
RMRPO3A531L20	41	ECCAALAQGTLGGLGCTP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
				RMRPO3A531L18D	42	JCCAALAGULGGCQGLTP	J-Threo-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3A531L12C	43	ECCAALQAGUCGGCGCTTGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3A531L12D	44	ECCAALQAGULGGCGCTTGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3531L17B2	45	ECCAALAQGULGGLGLP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3531L17B3	46	ELLAALAQGULGGLGLP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3A531L21	47	FLLAALQAGULGGLGLUP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3A531L22	48	FLLJALQAGULGGLGLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU, J-G-夹
RMRPO3531L17B4	49	FLLAALQAGULGGLGLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3531L17B5	50	FLLJALQAGULGGLGLP	E-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU,叔丁基苄基-dA
RMRPO3A531L20B	51	ELLAALAQGULGGLGLP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
				RM5L17B3a	52	ELLAALAQGTLGGLGLP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC

rpoB 531W		TCG/TGG	Ser/Trp
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
RMRPO3F531W	53	FCCLACAQGTCGGCGCTTGP	F= Threo-FAM; Q= 叔丁基苄基-dC; P= 磷酸; Q= BHQ-2
				RMRPO3F531W02	54	FCCLACAQGTCGGCGCTTGTP	F= Threo-FAM; L= 叔丁基苄基-dC; P= 磷酸; Q= BHQ-2
RMRPO3F531W06	55	FCCJACAQGTCGGCGCP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 , J-G-夹

rpoB 526L		CAC/CTC	His/Leu
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
RMRPO3A07	56	FLUUGAGQGGULAALLLLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
				RMRPO3A07B2	57	FTTGAGGQGTLAALCCCGACGGGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
RMRPO3A08	58	FALLLULQAAGLGLLGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
				RMRPO3A08B	59	FALLLULQAAGLGLLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
RMRPO3A08C	60	FALLLULQAAGCGLLGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
				RMRPO3A09	61	JLUUGAGGGULAAQLLLLP	J-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
AYRPO3526LFM07	62	FLUUGAGGGQULAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526LFM08	63	FGLUUGAGQGGULAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526LFM09	64	FGLUUGAGGQGULAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526LFM10	65	FGLUUGAGGGQULAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526LFM11	66	FGLUUGAGGQGJLAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526LFM12	67	FGLUUGAGGGQUJAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526LJA01	68	FGLUUGAGGQGULAALLLLGAP	F-th-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526LJA02	69	FGLUUGAGGGQULAALLLLGAP	F-th-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526LJA03	70	FGLUUGAGGQGJLAALLLLGAP	F-th-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526LJA04	71	FGLUUGAGGGQUJAALLLLGAP	F-th-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526LJA05	72	FGLUUGAGGGJQLAALLLLGAP	F-th-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526LJA06	73	FGLUUGAGGGJLAAQLLLLGAP	F-th-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹::L -pdC:: U-pdU

rpoB 526Y		CAC/TAC	His/Tyr
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
RMRPO3A06E	74	JUUGUAGGULAALQLLLGAP	J-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				AYRPO3526YFM07	75	FLUUGUJGGQULAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-T-propdA::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526YFM08	76	FLUUGQUJGGULAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-T-propdA::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526YFM09	77	FLUUGUJGQGULAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-T-propdA::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526YFM10	78	FLUUGUAGQGULAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526YHX01	79	FLUUGUJGQGULAALLLLGAP	F-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-T-propdA::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526YHX02	80	FLUUGUAGQGULAALLLLGAP	F-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526YHX03	81	FUUGUJGQGULAALLLLGAP	F-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-T-propdA::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526YHX04	82	FUUGUJGQGULAALLLLP	F-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-T-propdA::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526YHX05	83	FUUGUJQGGULAALLLLP	F-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-T-propdA::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526YHX06	84	FLUUp66GUAGQGJLAALLLLGAP	F-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526YHX07	85	FLUUGUAGQGULAALLLLGALAP	F-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526YHX08	86	FLGLUUGUAGQGULAALLLLGAP	F-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
				AYRPO3526YHX09	87	FGLUUGUAGQGULAALLLLGALAP	F-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU
AYRPO3526YHX10	88	FLGLUUGUAGQGULAALLLLGALAP	F-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU

rpoB: 526D		CAC/GAC	His/Asp
				名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
RMRPO3A03C	89	FLUUGULQGGUCAACLLLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
				RMRPO3A03D	90	JLUUGULGGULAAQLLCCP	J-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
AYRPO3526DFM03	91	FTGTJGQGTCAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYRPO3526DFM04	92	FTGTJGGQTCAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYRPO3526DFM05	93	FGTTGTQJGGTCAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYRPO3526DFM06	94	FGTTGTJGGQTCAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYRPO3526DJA07	95	FUUGUJGGULAQALLLLP	F-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU::J-G-夹
				AYRPO3526DJA08	96	FLUUGUJGGULAQALLLLP	F-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU::J-G-夹
AYRPO3526DJA09	97	FUUGUJGGULAQALLLLGAP	F-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU::J-G-夹
				AYRPO3526DJA10	98	FLUUGUJGGULAQALLLLGAP	F-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU::J-G-夹
AYRPO3526DJA11	99	FGLUUGUJGGULAQALLLLGAP	F-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2::L -pdC:: U-pdU::J-G-夹

rpoB 526N		CAC/AAC	His/Asn
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
RMRPO3SP526R2	100	FACCAAQLAAGLGLLGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
				RMRPO3SP526R3	101	FALLAAQLAAGLGLLGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
RMRPO3AP526R1	102	FTTGTTQGGTLAALLCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
				RMRPO3AP526N1	103	FUUGUUQGGULAALLLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
RMRPO3AP526N2	104	FUUGUUQGGULAALLLGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
				RMRPO3AP526N2B	105	FUUGUUQGGULJJLLLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
RMRPO3SP526N4	106	FALLAALQAAGLGLLGALUP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
				RMRPO3SP526N4B	107	EALLAALQAAGLGLLGALUP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
RMRPO3SP526N4B2	108	EALLAAQLAAGLGLLGALP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
				RMRPO3SP526N4B2b	109	EALLAAQLAAGLGLLGAP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
RMRPO3SP526N4B3	110	FLAALQAAGLGLLGALUGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
				RMRPO3SP526N4C	111	FALLAALQAAGLGLLGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC
RMRPO3SP526N5	112	FALLAAQLAAGLGLLGALUP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
				RMRPO3AP526N6	113	FUUGUUQGGULAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
RMRPO3AP526N7	114	FUUGUQUGGULAALLLLGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
				RMRPO3AP526N8	115	FUUGUUQGGULAALLLLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
RMRPO3AP526N9	116	FUUGUUQGGULOOLLLLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU,O-叔丁基苄基dA
				RMRPO3AP526N1B	117	FUUGUUQGGULJJLLLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC ,J-N6 甲基dA
RMRPO3A526N8B	118	FUUGUUGQGULAALLLLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC:U=丙炔基dU
				RM_NEW526N11B3	438	ETTGTTGQGTCAACCCCGACGJGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-7_Dz_dG

rpoB 533P		CTG/CCG	Leu/Pro
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
RMRPO3H533P10B	119	ECGCJGGQGGCCCGGCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,J-G-夹
				RMRPO3H533P10D	120	FLGLLGGQGGLLLGGLGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 , J-G-夹 ,L= 丙炔基dC
RMRPO3H533P10	121	ECGCCGGQGGCCCGGCGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2

rpoB: 513L		CAA/CTA	Gln/Leu
				名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
JJS513L44PJ12	122	FLAGLUGAGLLUAQUULP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS513L68PJ12	123	FLLUAUULAUGGAQLLAGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJS513L59PJ12	124	FLLAGLUGAGLLUQAUULP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS513L101PJ12	125	FAGLLUAUULAUGQGALLAGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJS513L84PJ12	126	FGLLUAUULATGGQALLAGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513L60PJ12	127	FUGAAUAGGLULAQGLUGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513L68PJ12	128	FLUGGULLAUGAAQTAGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513L103PJ12	129	FUULUGGULLAUGQAAUAGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513L61PJ12	130	FAUGAAUAGGLULQAGLUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513L76PJ12	131	FUGAAUAGGLULAQGLUGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513L59PJ12	132	FGAAUAGGLULAGQLUGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513L95PJ12	133	FLAUGAAUAGGLUQLAGLUGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513L924PJ2	134	FGAAUAGGLULAGQUUGGLUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513L928PJ2	135	FGAAUAGGUULAGQLUGGLUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513L927PJ2	136	FGAAUAGGLUUAGQLUGGLUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513L9232PJ2	137	FGAAUAGGLUGAGQLUGGLUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513L9243PJ2	138	FGAAUAGGLULLGQLUGGLUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513L9217PJ2	139	FGAAUAGGLULAGQLAGGLUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513L9218PJ2	140	FGAAUAGGLULAGQAUGGLUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513L9222PJ2	141	FGAAUAGGAULAGQLUGGLUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513L75PJ12	142	FGAAUAGGLULAGQLUGGLP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513L75PCA12	143	FGAAUAGGLULAGQLUGGLP	L=pdC, U=pdU, F= 卡尔氟红635, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513L75PCB12	144	FGAAUAGGLULAGQLUGGLP	L=pdC, U=pdU, F= 卡尔氟红635 dT, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513L77PJ12	145	FAUGAAUAGGLULQAGLUGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513L93PJ12	146	FUGAAUAGGLULAQGLUGGLP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS513L85PJ12	147	FLLUAUULAUGGAQLLAGAP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸

rpoB: 513K		CAA/AAA	Gln/Lys
				名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
JJS513K84PJ12	148	FAGLAAAUULAUGQGALLAP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS513K77PJ12	149	FLLAGLUGAGLAAQAUULAP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJS513K79PJ12	150	FAGLUGAGLAAAUQULAUGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS513K85PJ12	151	FGLAAAUULAUGGQALLAGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513K43PJ12	152	FAUUUGLULAGLUQGGLP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513K77PJ12	153	FUGAAUUUGLULAQGLUGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513K60PJ12	154	FGAAUUUGLULAGQLUGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513K76PJ12	155	FGAAUUUGLULAGQLUGGLP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513K76PCA12	156	FGAAUUUGLULAGQLUGGLP	L=pdC, U=pdU, F= 卡尔氟红635, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513K76PCB12	157	FGAAUUUGLULAGQLUGGLP	L=pdC, U=pdU, F= 卡尔氟红635 dT, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513K44PJ12	158	FAAUUUGLULAGLQUGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513K80PJ12	159	FLLAUGAAUUUGLQULAGLP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513K59PJ12	160	FAAUUUGLULAGLQUGGLP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513K75PJ12	161	FAAUUUGLULAGQLUGGLUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸

rpoB: 513P		CAA/CCA	Gln/Pro
				名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
JJS513P66PJ12	162	FAGLLLAUULAUGQGALLP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS513P83PJ12	163	FAGLLLAUULAUGQGALLAP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJS513P68PJ12	164	FLLLAUULAUGGAQLLAGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JS513P81PJ12	165	FUGAGLLLAUULAQUGGALP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA513P60PJ12	166	FUGAAUGGGLULAQGLUGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA513P76PJ12	167	FUGAAUGGGLTLAQGLUGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJS513P66GJ12	168	FAGLLEAUULAUGQGALLP	E=G-夹, L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS513P83GJ12	169	FAGLLEAUULAUGQGALLAP	E=G-夹, L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJS513P84PJ12	170	FGLLLAUULAUGGQALLAGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS513P82PJ12	171	FGAGLLLAUULAUQGGALLP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJS513P84GJ12	172	FGLLEAUUCAUGGQALLAGP	E=G-夹, L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS513P82GJ12	173	FGAGLLEAUULAUQGGALLP	E=G-夹, L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸

rpoB: 522L		TCG/TTG	Ser/Leu
				名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
JJA522L50PJ12	174	FGGULAALLLLAAQLAGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522L18PJ12	175	FALLLLAALAGLGQGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522L16PJ12	176	FLLLAALAGLGGGQUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522L17PJ12	177	FLLLLAALAGLGGQGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522L83PJ12	178	FUGGGULAALLLLQAALAGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522L32PJ12	179	FAALLLLAALAGLQGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522L33PJ12	180	FLAALLLLAALAGQLGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522L48PJ12	181	FULAALLLLAALAQGLGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522L30PJ12	182	FLLLLAALAGLGGQGUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522L31PJ12	183	FALLLLAALAGLGQGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522L63PJ12	184	FULAALLLLAALAQGLGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522L47PJ12	185	FLAALLLLAALAGQLGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸

rpoB: 522Q		TCG/CAG	Ser/Gln
				名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
JJS522Q48J12	186	FCCGCTGCAGGGGQTTGAP	F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS522Q32J12	187	FCCCGCTGCAGGGQGTTP	F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJS522Q49J12	188	FCGCTGCAGGGGTQTGACP	F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522Q31J12	189	FACCCCTGCAGCGQGGTP	F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522Q33J12	190	FCAACCCCTGCAGQCGGP	F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522Q43J12	191	FCCCTGCAGCGGGQTTGTP	F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522Q31PJ12	192	FALLLLUGCAGLGQGGUP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS522Q49PJ12	193	FLGLUGLAGGGGUQUGALP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522Q18PJ12	194	FALLLLUGLAGLGQGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJS522Q34PJ12	195	FLGLUGLAGGGGUQUGAP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522Q20PJ12	196	FLAALLLLUGLAGQLGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522Q33PJ12	197	FLAALLLLUGLAGQLGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522Q47PJ12	198	FLAALLLLUGLAGQLGGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸

rpoB: 522W		TCG/TGG	Ser/Trp
				名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
JJA522W33PJ12	199	FLAALLLLLALAGQLGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522W33GJ12	200	FLAALLLLEALAGQLGP	E=G-夹, L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522W47J12	201	FLAALLLLLALAGQLGGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522W47GJ12	202	FLAALLLLEALAGQLGGP	E=G-夹,L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
JJA522W48PJ12	203	FULAALLLLLALAQGLGP	L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸
				JJA522W48GJ12	204	FULAALLLLEALAQGLGP	E=G-夹,L=pdC, U=pdU, F=th-JA270, Q=BHQ2, p=磷酸

rpoB 516V		GAC/GTC	Asp/Val
				名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
RMRPO3F516V	205	FCTGGJCQCATGAATTGGCTCP	F-Threo-FAM::J-叔丁基苄基-dA::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3UNF516V	206	FCTGGACQCATGAATTGGCTCP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3SP516V	207	FTGGTCQCAGAACAACCCGCTP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3SP516Y	208	EATGTACQCAGAACAACCCGCTGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3AP516Y	209	ECTGGTACQATGAATTGGCTCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3A2P516Y	210	ECTGGTACQATGAATTGGCTCAGCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3F516V02	211	FCTGGJCQLATGAATTGGLTLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,L= 丙炔基dC , J-叔丁基苄基-dA
				RMRPO3SP516V03	212	FTGGTCQCAGAACAACCCGCTGCGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3SP516V04	213	FTGGTCQCAAAACAACCCGCTP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3SP516V05	214	FTGGTEQCAGAACAACCCGCTP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 , E-G-夹
RMRPO3SP516V06	215	FTGGTCQEAGAACAACCCGCTP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 , E-G-夹
				RMRPO3SP516Y02	216	EATGTACQCAGAACAACCCGGGGTP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3SP516V07	217	FTGGTCQCAGAATAACCCGCTGCGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3SP516V08	218	FTGGTCQCAAAACAACCCGCTGCGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3SP516V09	219	FGGTCCQAGAACAACCCGCTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3SP516V10	220	FATGGTCQCAGAACAACCCGCTP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3SP516V11	221	ECATGGTCQCAGAACAACCCGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3SP516V12	222	FATGGTCQCAGAACAACCGGTTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3S516V11B	223	FCATGGTQCCAGAACAACCCGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3S516V11C	224	FLAUGGUQLLAGAALAALLLGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2, L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3S516V11D	225	FCATGGQTCCAGAACAACCCGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3S516V11E	226	FATGGTQCCAGAACAACCCGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3S516V11F	227	JCATGGTCCAGAAQCAACCCGP	J-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3S516V11G	228	JLAUGGULLAGAAQLAALP	J-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3516V11C2	229	FLAUGGUQLLJGAJLAJLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2, L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU,J: N6-苄基dA
				RM516V11G2	230	FLLUGGUQLLAGAALAALP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3516V11G2	231	JLAUGGULLAGAAQLAP	J-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
				RMRPO3516V11G3	232	JLAUGGTLLAGAAQLAP	J-JA270::P-磷酸::Q-BHQ-2,L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3S516V12B	233	FCATGGTCQCAGAACAACCGGTTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3516V11C4	234	FLAUGGUQLLAGAALAALLP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2, L= 丙炔基dC , U=丙炔基dU
RMRPO3516V11E2	235	FTGGTQCCAGAACAACCCGCTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3516V11E3	236	FATGGTQCCAGAACAACAGTTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3516V11E5	237	FTGGTQCCAGAACAACCCGCTP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3516V11E6	238	FTGGTCCQAGAACAACCCGCTP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2

rpoB 516Y		GAC/TAC	Asp/Tyr
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
RMRPO3SP516Y03	239	EATGTAJCQAGAACAACCCGCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,J-G-夹
				RMRPO3S516YB2	240	FATGTQACCAGAACAACCCGCTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3SP516Y	241	EATGTACQCAGAACAACCCGCTGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3AP516Y	242	ECTGGTACQATGAATTGGCTCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3A2P516Y	243	ECTGGTACQATGAATTGGCTCAGCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3SP516Y02	244	EATGTACQCAGAACAACCCGGGGTP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3SP516Y4B	245	EATGTACQCAGAACAACCCGCTGTP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3S516YB	246	FATGTACQCAGAACAACCCGCTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3S516YC	247	FATGTAQCCAGAACAACCCGCTGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2

rpoB 533P		CTG/CCG	Leu/Pro
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
RMRPO3H533P10B	248	ECGCJGGQGGCCCGGCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2 ,J-G-夹
				RMRPO3H533P10D	249	FLGLLGGQGGLLLGGLGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2 , J-G-夹
RMRPO3H533	250	ECCGGCGQCCGACAGTCGGCGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3H533P02	251	ECCGGCGQCCGACAGTCGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3H533P03	252	ECCGGCGQCCTACAGTCGGCGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3H533P04	253	ECCGGCGQCCAACAGTCGGCGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3H533P05	254	ECCGGCGQCCCACAGTCGGCGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3H533P06	255	ECCGGCQACCGACAGTCGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3H533P07	256	ECCGGCGQTCGACAGTCGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3H533P08	257	ECCGGCQGCCGACAGTCGGCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3H533P09	258	ECCGGCQACCGACAGTCGGCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3H533P10	259	ECGCCGGQGGCCCGGCGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3H533P11	260	ECGCCGQGGGCCCGGCGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3H533P12	261	ECGCCGGQGGCCCGGCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3H533P8B	262	ECCGGCQGCCGACAGTCGGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3H533P8C	263	ECCGGCQGCCGACAGTCGP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3H533P13	264	FCGCCGQGGGCCGGCCP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3H533P10C	265	FCGCCGGQGGCCCGGCGGP	F-Threo-FAM:P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3H533P10E	266	FCGCCGQGGGCCCGGCGGP	F-Threo-FAM:P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3533P10C2	267	FCGCCGGQGGCCCGGCP	F-Threo-FAM:P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3533P12B	268	FCGCCGQGGGCCCGGCP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3533P12C	269	FCGCCQGGGGCCCGGCP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3533P12B2	270	FCGCCGQGGGCCCGGCGCP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3533P12C2	271	FCGCCQGGGGCCCGGCGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3533P12C3	272	FCGCCQGAGGCCCGGCGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3533P12C4	273	FAGCCQGGGGCCCGGCGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3533P13	274	FCCGGGQGCCCGGCGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				RMRPO3533P14	275	FCCGGGGQCCCGGCGGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMRPO3H533P02B	276	ECCGGCGQCCGACAGTCP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2

rpoB 511P		CTG/CCG	Leu/Pro
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
AYRPO3511PFM01	277	FCAGCQCGAGCCAATTCATGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYRPO3511PFM02	278	FCAGCCQGAGCCAATTCATGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYRPO3511PFM03	279	FCAGCQJGAGCCAATTCATGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYRPO3511PFa0	280	FCAGCJGQAGCCAATTCATGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYRPO3511PFM05	281	FCAGCCGQAGCCAATTCATGP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2

rpoB 526R		CAC/CGC	His/Arg
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
AYRPO3526RFM01	282	FCTTGCGQGGTCAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYRPO3526RFM02	283	FTGCGGGQTCAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYRPO3526RFM03	284	FTGCGGGTCQAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYRPO3526RFM04	285	FCTTGCGGGQTCAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYRPO3526RFM05	286	FCTTGJGQGGTCAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYRPO3526RFM06	287	FTGJGGGQTCAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYRPO3526RFM07	288	FTGJGGGTCQAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYRPO3526RFM08	289	FCTTGJGGGQTCAACCCCGAP	F-Threo-FAM::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYRPO3526RFM11	437	ECTTGJQGGGTCAACCCCGAP	E-Threo-HEX::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹

katG 315I		AGC/ATC
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
AYKAT315ICM01	290	FGATCACCATCGGCATCGAQ	F-Threo-Coum343::Q-BHQ-2
				AYKAT315ICM02	291	FCACCATQCGGCATCGAGGTCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315ICM03	292	FCATCGGQCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315ICM04	293	FCACCATQCGGCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315ICM05	294	FATCGGCQATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315ICM06	295	FAUCGGCQAUCGAGGUCGUAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2:: U-5-丙炔基dU
AYKAT315ICM07	296	FAULGGLQAULGAGGULGUAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2:: U-5-丙炔基dU:: L-5-丙炔基dC
				AYKAT315ICM03a	297	FCATCGQGCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315ICM03b	298	FCATCGGCAQTCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315ICM03c	299	FCATCGGCATCQGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315ICM03d	300	FCATCGGCQATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315ICY03a1	301	FCATCGQGCATCGAGGTCGTAP	F-CY5.5::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315ICY03a2	302	FCATCGGCAQTCGAGGTCGTAP	F-CY5.5::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315ICY03a3	303	FCATCGGCATCQGAGGTCGTAP	F-CY5.5::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315ICY03a4	304	FCATCGGCATCGAQGGTCGTAP	F-CY5.5::P-磷酸::Q-BHQ-2

katG 315N		AGC/AAC
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
AYKAT315NCM01	305	FCAACGQGCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315NCM02	306	FCAACGGCAQTCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315NCM03	307	FCAACGGCATCQGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315NCM04	308	FCAACGGQCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315NCM05	309	FCAACGGCQATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315NCM04a	310	FCAACGGQCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315NCM05a	311	FCAACGGCQATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315NCM07	312	FCAALGQGCATLGAGGTLGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::L-5_Me_dC
AYKAT315NCM08	313	FAACGGCQATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315NCM09	314	FCACCAAQCGGCATCGAGGTCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315NCM10	315	FCACCAAQCGGCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315NCM11	316	FLAALGQGLATLGAGGTLGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315NCM12	317	FAALGGLQATLGAGGTLGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::L-5_Me_dC
				AYKAT315NCM13	318	FLALLAAQLGGLATLGAGGTLP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::L-5_Me_dC
AYKAT315NCM14	319	FLALLAAQLGGLATLGAGGTLGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::L-5_Me_dC
				AYKAT315NCM15	320	FLAALGQGLATLGAGGTLGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2:: L-5-丙炔基dC
AYKAT315NCM16	321	FAALGGLQATLGAGGTLGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2:: L-5-丙炔基dC
				AYKAT315NCM17	322	FLALLAAQLGGLATLGAGGTLP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2:: L-5-丙炔基dC
AYKAT315NCM18	323	FLALLAAQLGGLATLGAGGTLGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2:: L-5-丙炔基dC
				AYKAT315NCM19	324	FCAACQGGCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315NCM20	325	FCCAACGQGCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315NCM21	326	FCCAACQGGCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYKAT315NCM22	327	FACCAACQGGCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315NCM23	328	FACCAAQCGGCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
RM315N2B	434	FCAAJQGCAUCGAGGUCGUAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹::U-5-丙炔基dU

katG 315T		AGC/ACC
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
AYKAT315TCM01	329	FCACCACQCGGCATCGAGGTCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYKAT315TCM02	330	FCACCAJQCGGCATCGAGGTCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYKAT315TCM03	331	FCAJCGGQCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYKAT315TCM04	332	FCAJCGGQCATCGAGGTCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYKAT315TCM05	333	FCACCAJQCGGCATCGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYKAT315TCM05a	334	FCACCAQJCGGCATCGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYKAT315TCM05b	335	FCACCAJCGQGCATCGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYKAT315TCM05c	336	FCACCAJCGGCQATCGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYKAT315TCY05b1	337	FCACCAJCGQGCATCGAP	F-CY5.5::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYKAT315TCY05b2	338	FCACCAJCGGCQATCGAP	F-CY5.5::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYKAT315TCY05b3	339	FCACCAJCGGCATQCGAP	F-CY5.5::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYKAT315TCY05b4	340	FCACCAJCGGCATCGAQ	F-CY5.5::Q-BHQ-2::J-G-夹

katG 315T2		AGC/ACA
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
AYKAT315T2CM01	341	FCACCAQJAGGCATCGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYKAT315T2CM02	342	FCACCAJAGQGCATCGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYKAT315T2CM03	343	FCACCAJAGGCQATCGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				RM315T2	435	FACCACAQGGCATCGAGGTCGTAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2

inhA探针设计
				inhA -15T		C -> T
寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
				AYINHA15TCM01	344	FGCGAGAQTGATAGGTTGTCGGP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHA15TCM02	345	FGAGATGQATAGGTTGTCGGGGTGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHA15TCM03	346	FGLGAGAQUGAUAGGUUGULGGP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::L-5-丙炔基dC::U-5-丙炔基dU
AYINHA15TCM04	347	FAGATGAQTAGGTTGTCGGGGTGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHA15TCM05	348	FAGAUGAQUAGGUUGULGGGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::L-5-丙炔基dC::U-5-丙炔基dU
AYINHA15TCM06	349	FGATGATQAGGTTGTCGGGGTGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHA15TCM04a	350	FAGATGATAQGGTTGTCGGGGTGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHA15TCM04b	351	FAGATGATAGGQTTGTCGGGGTGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHA15TCM04c	352	FAGATQGATAGGTTGTCGGGGTGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHA15TCM04d	353	FAGATQGATAGGTTGTCGGGGTGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHA15TCM07	354	FAGAUGAQUAGGUUGUCGGGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
AYINHA15TCM08	355	FGAUGAQUAGGUUGUCGGGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
				AYINHA15TCM09	356	FAUGAQUAGGUUGUCGGGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
AYINHA15TCM09a	357	FAUGAUQAGGUUGUCGGGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
				AYINHA15TCM09b	358	FATGAUQAGGUUGUCGGGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
AYINHA15TCM06a	359	FGAUGAUQAGGUUGUCGGGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
				AYINHA15TCM06b	360	FGATGAQUAGGUUGUCGGGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
JFINHA15TCM06A_1	361	FGAUGAUQAGGUUGUCGJGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG
				JFINHA15TCM06A_2	362	FGAUGAUQAGGUUGUCGGJGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG
JFINHA15TCM06B_1	363	FGATGAQUAGGUUGUCGJGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG
				JFINHA15TCM06B_2	364	FGATGAQUAGGUUGUCGGJGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG
JFYINHA15TCM09A_1	365	FAUGAUQAGGUUGUCGJGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG
				JFINHA15TCM09A_1	366	FAUGAUQAGGUUGUCGGJGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG
JFINHA15TCM09B_1	367	FATGAUQAGGUUGUCGJGGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG
				JFINHA15TCM09B_2	368	FATGAUQAGGUUGUCGGJGUGAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG
AYINHAR15TCM01	369	FCTATCAQTCTCGCCGCGGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHAR15TCM02	370	FCTATCAQTCTCGCCGCGGCCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHAR15TCM03	371	FCTATCAQTCTCGCCGCGGCCGP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHAR15TCM04	372	FTATCATQCTCGCCGCGGCCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2

inhA -8A		T -> A
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
AYINHA8ACM01	373	FTAGGATQGTCGGGGTGACTGCCAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHA8ACM02	374	FTAGGATQGTCGGGGTGACTGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHA8ACM03	375	FGATAGGQATGTCGGGGTGACTGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHA8ACM04	376	FUAGGAUQGULGGGGUGALUP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
AYINHA8ACM05	377	FTAGGAQTGTCGGGGTGACTGCCAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHA8ACM06	378	FTAGGATGTQCGGGGTGACTGCCAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHA8ACM07	379	FTAGGATGTCGQGGGTGACTGCCAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHA8ACM08	380	FTAGGQATGTCGGGGTGACTGCCAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHA8ACM08a	381	FUAGGQAUGUCGGGGUGACUGCCAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
				AYINHA8ACM08b	382	FUAGGQAUGULGGGGUGALUGLLAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
AYINHAR8ACM01	383	FCGACATQCCTATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHAR8ACM02	384	FGACATCQCTATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHAR8ACM03	385	FACATCCQTATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHAR8ACM04	386	FCATCCTQATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHAR8ACM05	387	FCGACATQCCTATCGTCTCGCCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHAR8ACM02a	388	FGACATCQCTATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHAR8ACM02b	389	FGACATCCQTATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHAR8ACM02c	390	FGACATCCTAQTCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHAR8ACM02d	391	FGACATQCCTATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHAR8ACM02e	392	FGACATCQCUAUCGUCUCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
AYINHAR8ACM02f	393	FGACATCCQUAUCGUCUCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
				AYINHAR8ACM02g	394	FGACATCCUAQUCGUCUCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
AYINHAR8ACM02h	395	FGACATQCCUAUCGUCUCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU
				JFINHA8ACM08A_1	396	FUAGGQAUGUCGJGGUGACUGCCAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG
JFINHA8ACM08A_2	397	FUAGGQAUGUCGGJGUGACUGCCAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG
				JFINHA8ACM08B_1	398	FUAGGQAUGULGJGGUGALUGLLAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG::L-5_Me_dC
JFINHA8ACM08B_2	399	FUAGGQAUGULGGJGUGALUGLLAP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::U-5-丙炔基dU::J-7_Dz_dG::L-5_Me_dC

inhA -8C		T -> C
				寡聚物名称	SEQ ID NO:	序列	修饰
AYINHA8ACM01	400	FTAGGCTQGTCGGGGTGACTGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHA8ACM02	401	FTAGGJTQGTCGGGGTGACTGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYINHA8ACM03	402	FGATAGGQJTGTCGGGGTGACTGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYINHA8ACM04	403	FATAGGJQTGTCGGGGTGACTGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
AYINHA8ACM05	404	FAGGJTGQTCGGGGTGACTGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2::J-G-夹
				AYINHAR8CCM01	405	FCGACAGQCCTATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHAR8CCM02	406	FGACAGCQCTATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHAR8CCM03	407	FACAGCCQTATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
AYINHAR8CCM04	408	FCAGCCTQATCGTCTCGCCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
				AYINHAR8CCM05	409	FCGACAGQCCTATCGTCTCGCCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2
RMINHA8C4BB	436	FACAGCQCUAUCGUCUCGCP	F-Threo-Coum343::P-磷酸::Q-BHQ-2:: U-5-丙炔基dU

在一个实施方案中，使用了上述多组rpoB、inhA和katG引物和探针，从而提供在疑似含有MTB-RIF和/或MTB-INH的生物样品中的MTB-RIF和/或MTB-INH的检测。这些引物和探针的组可包括特异于rpoB、inhA和katG核酸序列的引物和探针，或由其组成，其包括SEQ IDNO: 1-409和434-438的核酸序列，或由其组成。在另一个实施方案中，针对rpoB、inhA和katG靶标的引物和探针包括SEQ ID NO: 1-409和434-438的引物中任一者的功能活性变体，或由其组成。

SEQ ID NO: 1-409和434-438的探针中任一者的功能活性变体可通过使用所公开方法中的探针识别。SEQ ID NO: 1-409和434-438中任一者的探针的功能活性变体属于这样的引物，相比SEQ ID NO: 1-409和434-438的各自的序列，其在本文所述方法或试剂盒中提供相似或更高的特异性和灵敏度。

所述变体可例如通过一个或多个核苷酸添加、缺失或取代而不同于与SEQ ID NO:1-409和434-438的序列，如在SEQ ID NO: 1-409和434-438的各自的序列的5'端和/或3'端的一个或多个核苷酸添加、缺失或取代。如上文详述的，引物(和/或探针)可以经化学修饰，即，引物和/或探针可包含经修饰的核苷酸或非核苷酸化合物。这样，探针(或引物)即为经修饰的寡核苷酸。“经修饰的核苷酸”(或“核苷酸类似物”)通过一些修饰而不同于天然“核苷酸”，但仍然由碱基或碱基样化合物、戊呋喃糖或戊呋喃糖样化合物、磷酸部分或磷酸样部分或其组合组成。例如，可以将“标记”连接到“核苷酸”的碱基部分，从而得到“经修饰的核苷酸”。同样地，还可以用，例如，7-脱氮嘌呤替换“核苷酸”中的天然碱基，从而得到“经修饰的核苷酸”。术语“经修饰的核苷酸”或“核苷酸类似物”在本申请中可互换使用。“经修饰的核苷”(或“核苷类似物”)以如上文对于“经修饰的核苷酸”(或“核苷酸类似物”)所概括的方式，通过一些修饰而不同于天然核苷。

可以使用例如计算机程序如OLIGO (Molecular Biology Insights Inc.,Cascade, Colo.)设计包括经修饰的寡核苷酸和寡核苷酸类似物在内的寡核苷酸，其扩增编码rpoB、inhA和katG核酸序列的核酸分子，例如，编码rpoB、inhA和katG的替代部分的核酸。在设计待用作扩增引物的寡核苷酸时的重要特征包括但不限于适当大小的扩增产物以方便检测(例如，通过电泳)、引物对的成员的相似的解链温度、以及每个引物的长度(即，引物需要足够长，以序列特异性地退火并启动合成，但又不过长使得在寡核苷酸合成过程中保真度降低)。通常，寡核苷酸引物的长度为8至50、特别是10至40或12至40个核苷酸(例如，长度为8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48或50个核苷酸)。

除了引物组，所公开的方法可使用一种或多种探针以检测MTB-RIF和/或MTB-INH的存在与否。术语“探针”是指合成或生物产生的核酸(DNA或RNA)，其经过设计或选择而含有特定的核苷酸序列，以允许其在明确的预定严格性下与“靶核酸”特异性地(即，优先地)杂交，在本发明的情况下，与MTB-RIF和/或MTB-INH (靶标)核酸特异性地杂交。“探针”可被称为“检测探针”，意味着其检测靶核酸。

在一些实施方案中，所述rpoB、inhA和katG探针可以用至少一种荧光标记进行标记。在一个实施方案中，所述rpoB、inhA和katG探针可以用供体荧光部分(例如，荧光染料)和对应的受体荧光部分(例如，猝灭剂)来标记。

在一个实施方案中，所述探针包含荧光部分和所述核酸序列或由其组成，所述核酸序列包含SEQ ID NO: 1-409和434-438，或由其组成。

待用作杂交探针的寡核苷酸的设计可以与设计引物类似的方式进行。实施方案可使用单一探针或探针对以检测扩增产物。取决于实施方案，所用探针可包含至少一个标记和/或至少一个猝灭剂部分。如引物一样，探针通常具有相似的解链温度，并且每个探针的长度必须足以使序列特异性杂交发生，但又不过长使得在合成过程中保真度降低。寡核苷酸探针通常具有40个或更少的核苷酸，并且特别是在12至40、15至40以及15至30 (例如，16、18、20、21、22、23、24或25)个核苷酸之间的长度。

聚合酶链式反应(PCR)

美国专利No.4,683,202、4,683,195、4,800,159和4,965,188公开了常规的PCR技术。PCR通常采用两种寡核苷酸引物，其结合所选的核酸模板(例如，DNA或RNA)。可用于一些实施方案中的引物包括能够充所述rpoB、inhA和katG核酸序列内的核酸合成起始点的寡核苷酸。引物可通过常规方法从限制性酶切产物中纯化，或其可以经合成产生。就最大扩增效率而言，引物优选地为单链的，但引物也可以是双链的。双链引物首先经过变性，即，处理以使链分离。使双链核酸变性的一种方法是通过加热。

如果模板核酸是双链的，那么有必要在其可被用作PCR中的模板之前，将两条链分离。链的分离可以通过任何合适的变性方法(包括物理、化学或酶促方式)而实现。分离核酸链的一种方法涉及加热核酸直到其大部分变性(例如，大于50%、60%、70%、80%、90%或95%变性)。使模板核酸变性所必要的加热条件将取决于，例如，缓冲液的盐浓度以及待变性的核酸的长度和核苷酸组成，但通常在约90℃至约105℃的范围内进行一段时间，而时间取决于反应的特征(如温度和核酸长度)。变性通常进行约30秒至4分钟(例如，1分钟至2分30秒，或1.5分钟)。

如果通过加热使双链模板核酸变性，则允许反应混合物冷却至促进每个引物退火至所述rpoB、inhA和katG核酸分子上的其靶序列的温度。退火温度通常为约35℃至约65℃(例如，约40℃至约60℃；约45℃至约50℃)。退火时间可以为约10秒至约1分钟(例如，约20秒至约50秒；约30秒至约40秒)。然后，调节反应混合物至促进或优化聚合酶活性的温度，即，足以发生从退火引物的延伸以生成与模板核酸互补的产物的温度。该温度应当足以从每个退火至核酸模板的引物合成延伸产物，但不应当过高而使延伸产物从其互补模板变性，例如，用于延伸的温度通常在约40℃至约80℃的范围内(例如，约50℃至约70℃；约60℃)。延伸时间可以为约10秒至约5分钟(例如，约30秒至约4分钟；约1分钟至约3分钟；约1分30秒至约2分钟)。

PCR测定可采用MTB-RIF和/或MTB-INH核酸如RNA或DNA (cDNA)。模板核酸不需要经过纯化；其可以是复杂混合物的一小部分，如包含在人类细胞中的MTB-RIF和/或MTB-INH核酸。MTB-RIF和/或MTB-INH核酸分子可以通过如那些在Diagnostic MolecularMicrobiology: Principles and Applications (Persing 等人(编撰), 1993, AmericanSociety for Microbiology, Washington D.C.)中所述的常规技术从生物样品中提取。核酸可得自多种来源，如质粒或天然来源(包括细菌、酵母、病毒、细胞器)或高等生物(如植物或动物)。

在诱导引物延伸的反应条件下，将寡核苷酸引物与PCR试剂组合。例如，链式延伸反应一般包含50 mM KCl、10 mM Tris-HCl (pH 8.3)、15 mM MgCl₂、0.001% (w/v)明胶、0.5-1.0 µg变性的模板DNA、50皮摩尔的每种寡核苷酸引物、2.5 U Taq聚合酶和10% DMSO。反应通常含有各150至320 µM的dATP、dCTP、dTTP、dGTP或其一种或多种类似物。

新合成的链形成双链分子，其可被用于反应的后续步骤中。链分离、退火和延伸的步骤可根据需要的频次重复，以产生所需数量的对应于靶标MTB-RIF和/或MTB-INH核酸分子的扩增产物。反应的限制因素是存在于反应中的引物、热稳定酶和三磷酸核苷的量。优选地，将循环步骤(即，变性、退火和延伸)重复至少一次。就检测用途而言，循环步骤的次数将取决于，例如，样品的性质。如果样品是核酸的复杂混合物，则将需要更多的循环步骤以扩增足以用于检测的靶序列。通常，循环步骤重复至少约20次，但也可能重复多达40、60或甚至100次。

荧光共振能量转移(FRET)

FRET技术(参见，例如，美国专利No.4,996,143、5,565,322、5,849,489和6,162,603)是基于这样的概念：当供体荧光部分和对应的受体荧光部分被置于彼此一定距离之内时，两个荧光部分之间发生能量转移，其可以被目测或检测和/或定量。当供体经适当波长的光辐射激发时，供体通常向受体转移能量。受体通常将转移来的能量以不同波长的光辐射的形式重新发射出去。

在一个实例中，寡核苷酸探针可含有供体荧光部分和对应的猝灭剂，所述猝灭剂可以是或不是荧光的，并且其将转移来的能量以光以外的形式耗散掉。当探针完整时，能量转移通常发生在两个荧光部分之间，这样使得来自供体荧光部分的荧光发射被猝灭。在聚合酶链式反应的延伸步骤期间，结合至扩增产物的探针通过例如，Taq聚合酶的5'至3'核酸酶活性被裂解，这样使得供体荧光部分的荧光发射不再被淬灭。用于此目的的示例性探针描述在，例如美国专利号5,210,015、5,994,056和6,171,785。常用的供体-受体对包括FAM-TAMRA对。常用的猝灭剂为DABCYL和TAMRA。常用的暗猝灭剂包括BlackHole Quenchers™(BHQ) (Biosearch Technologies, Inc., Novato, Cal.)、Iowa Black™ (IntegratedDNA Tech., Inc., Coralville, Iowa)、BlackBerry™ Quencher 650 (BBQ-650) (Berry& Assoc., Dexter, Mich.)。

在另一个实例中，两个寡核苷酸探针(其各自含有荧光部分)可以在由所述寡核苷酸探针与所述MTB-RIF和/或MTB-INH靶核酸序列的互补性决定的特定位置杂交至扩增产物。当所述寡核苷酸探针在适当的位置杂交至所述扩增产物核酸后，生成FRET信号。杂交温度可以在约35℃至约65℃的范围，持续约10秒至约1分钟。

可以使用，例如，光子计数反射荧光显微镜系统(包含用于在特定范围监测荧光发射的合适的分色镜与滤光器)、光子计数光电倍增管系统或荧光计来进行荧光分析。可使用氩离子激光器、高强度汞(Hg)弧灯、光纤光源或针对在所需范围内的激发经适当过滤的其它高强度光源来进行激发以引发能量转移。

如本文中所用，关于供体和对应的受体荧光部分，“对应的”是指受体荧光部分具有与供体荧光部分的激发光谱重叠的发射光谱。受体荧光部分发射光谱的最大波长应当比供体荧光部分激发光谱的最大波长大至少100 nm。因此，它们之间可以产生有效的非辐射能量转移。

对荧光供体和对应的受体部分的选择通常是根据(a) 高效率的Forster能量转移；(b) 大的最终Stokes位移(>100 nm)；(c) 向可见光谱红区(>600 nm)尽可能远的发射位移；以及(d) 发射位移至比通过供体激发波长激发所产生的Raman水荧光发射更高的波长。例如，可选择那些具有以下的供体荧光部分：其最大激发在激光谱线附近(例如，氦-镉442 nm或氩488 nm)、高消光系数、高量子产率以及其荧光发射与对应的受体荧光部分的激发光谱的良好重叠。可选择那些具有以下的对应的受体荧光部分：高消光系数、高量子产率、其激发与供体荧光部分的发射的良好重叠，以及发射位于可见光谱的红区(>600 nm)。

可在FRET技术中与各种受体荧光部分一起使用的代表性的供体荧光部分包括荧光素、荧光黄、B-藻红蛋白、9-异硫氰酸吖啶酯、荧光黄VS、4-乙酰氨基-4'-异硫氰酰二苯乙烯-2,2'-二磺酸、7-二乙氨基-3-(4'-异硫氰酰苯基)-4-甲基香豆素、1-芘丁酸琥珀酰亚胺酯以及4-乙酰氨基-4'-异硫氰酰二苯乙烯-2,2'-二磺酸的衍生物。取决于所用供体荧光部分，代表性的受体荧光部分包括LC Red 640、LC Red 705、Cy5、Cy5.5、丽丝胺罗丹明B磺酰氯、四甲基异硫氰酸罗丹明、异硫氰酸罗丹明X、异硫氰酸赤藓红、荧光素、二亚乙基三胺五乙酸酯或其它镧系元素离子(例如，铕或铽)的螯合物。供体和受体荧光部分可得自，例如，Molecular Probes (Junction City, Oreg.)或Sigma Chemical Co. (St. Louis, Mo.)。

可通过连接臂将供体和受体荧光部分连接至合适的探针寡核苷酸。每个连接臂的长度很重要，因为连接臂将影响供体和受体荧光部分之间的距离。连接臂的长度为从核苷酸碱基到荧光部分的距离(以埃(Å)计)。一般来讲，连接臂为约10 Å至约25 Å。连接臂可能是WO 84/03285中所述的那种。WO 84/03285还公开了用于将连接臂连接至特定核苷酸碱基，以及还用于将荧光部分连接至连接臂的方法。

可将受体荧光部分(如LC Red 640)与含有氨基接头(例如，C6-氨基亚磷酰胺，可得自ABI (Foster City, Calif.)或Glen Research (Sterling, Va.))的寡核苷酸组合以产生，例如，LC Red 640标记的寡核苷酸。经常用于将供体荧光部分(如荧光素)偶联至寡核苷酸的接头包括硫脲接头(衍生自FITC的，例如，来自Glen Research或ChemGene(Ashland, Mass.)的荧光素-CPG's)、酰胺接头(衍生自荧光素-NHS-酯的，如来自BioGenex(San Ramon, Calif.)的CX-荧光素-CPG)或需要在寡核苷酸合成后偶联荧光素-NHS-酯的3'-氨基-CPG。

MTB-RIF和/或MTB-INH的检测

本公开提供了用于检测生物或非生物样品中是否存在MTB-RIF和/或MTB-INH的方法。本文所提供的方法避免了样品污染、假阴性和假阳性的问题。所述方法包括进行至少一个循环步骤和FRET检测步骤，所述循环步骤包括使用多对rpoB、inhA和katG引物从样品中扩增rpoB、inhA和katG靶核酸分子的一部分。优选地，在热循环仪中进行多个循环步骤。本文所述的方法可以使用rpoB、inhA和katG引物和探针进行以检测rpoB、inhA和katG靶标的存在，并且检测到rpoB、inhA和katG靶标中的所述SNP表明样品中存在MTB-RIF和/或MTB-INH。

如本文中所述，可使用利用FRET技术的经标记的杂交探针检测扩增产物。一种FRET方式使用TaqMan®技术以检测扩增产物的存在与否，并由此检测靶核酸的存在与否。TaqMan®技术利用一种经例如一种荧光染料和一种猝灭剂标记的单链杂交探针，所述猝灭剂可以是或不是荧光的。当第一荧光部分由合适波长的光激发时，所吸收的能量根据FRET原理被转移至第二荧光部分。第二荧光部分通常为猝灭剂分子。在PCR反应的退火步骤期间，经标记的杂交探针结合至靶DNA (即，扩增产物)并在后续的延伸阶段通过例如Taq聚合酶的5'至3'核酸酶活性被降解。因此，荧光部分和淬灭剂部分在空间上变得彼此分离。作为结果，当猝灭剂不存在时激发第一荧光部分后，则可以检测到来自第一荧光部分的荧光发射。举例来说，ABI PRISM® 7700 序列检测系统(Applied Biosystems)使用TaqMan®技术，并且适用于实施本文中所述的用于检测样品中靶核酸存在与否的方法。

一般来讲，存在FRET表明样品中存在MTB-RIF和/或MTB-INH，而不存在FRET则表明样品中不存在MTB-RIF和/或MTB-INH。然而，标本采集不足、运输延误、不恰当的运输条件或使用某些采集拭子(藻酸钙或铝轴(aluminum shaft))均是可以影响测试结果的成功和/或准确度的条件。使用本文所公开的方法，在例如，45个循环步骤之内检测到FRET表明存在MTB-RIF和/或MTB-INH感染。

可以使用的代表性的生物样品包括但不限于皮肤拭子、鼻腔拭子、伤口拭子、血液培养物、皮肤和软组织感染。生物样品的采集和保存方法是本领域技术人员已知的。生物样品可经过处理(例如，通过本领域已知的核酸提取方法和/或试剂盒)以释放MTB-RIF和/或MTB-INH核酸，或在一些情况下，生物样品可以与PCR反应组分以及合适的寡核苷酸直接接触。

在热循环仪的每次运行中，对照样品也可以被循环。使用例如，对照引物和对照探针，阳性对照样品可以扩增靶核酸对照模板(而不是所述靶基因的扩增产物)。阳性对照样品还可以扩增，例如，含有靶核酸分子的质粒构建体。可以使用与用于检测所期望靶标相同的引物和探针，对此类质粒对照进行内部扩增(例如，在样品内)或在单独的样品中与患者样品并排运行。此类对照是扩增、杂交和/或FRET反应成功与否的指标。热循环仪的每次运行还可以包含阴性对照，例如，其缺乏靶模板DNA。阴性对照可以测量污染。这确保了系统和试剂将不会产生假阳性信号。因此，对照反应可容易地确定，例如，引物序列特异性地退火和启动延伸的能力以及探针序列特异性地杂交和进行FRET的能力。

在实施方案中，所述方法包括避免污染的步骤。例如，在美国专利No. 5,035,996、5,683,896和5,945,313中描述了使用尿嘧啶DNA糖苷酶的酶促方法以减少或消除热循环仪的一次运行与下一次之间的污染。

可以使用结合了FRET技术的常规PCR方法。在一个实施方案中，使用了LightCycler®仪器。下列专利申请描述了如LightCycler®技术中所用到的实时PCR：WO97/46707、WO 97/46714和WO 97/46712。

LightCycler®可以使用PC工作站进行操作并且可以使用Windows NT操作系统。机器将毛细管依次置于光学元件上方而获取来自样品的信号。软件可以在每次测量后立刻实时显示荧光信号。荧光采集时间为10-100毫秒(msec)。在每个循环步骤之后，可持续更新所有样品相对于循环次数的荧光定量显示。生成的数据可以被保存用于进一步分析。

应当理解，本文所述的实施方案不受限于一种或多种市售仪器的配置。

制品/试剂盒

本公开的实施方案还提供了用以检测MTB-RIF和/或MTB-INH的制品或试剂盒。制品可包括用于检测rpoB、inhA和katG的引物和探针，连同合适的包装材料。用于检测MTB-RIF和/或MTB-INH的代表性的引物和探针能够杂交至rpoB、inhA和katG靶核酸分子。此外，试剂盒还可包括DNA固定、杂交和检测所需的适当包装的试剂和材料，如固相支持物、缓冲液、酶和DNA标准品。本文中公开了设计引物和探针的方法，并提供了扩增和杂交rpoB、inhA和katG靶核酸分子的引物和探针的代表性的实例。

制品还可以包括用于标记探针的一种或多种荧光部分，或者可选地，试剂盒所提供的探针可以是经标记的。例如，制品可包括用于标记rpoB、inhA和katG探针的供体和/或受体荧光部分。上文提供了合适的FRET供体荧光部分和对应的受体荧光部分的实例。

制品还可以包括药品说明书或药品标记，其上具有关于使用rpoB、inhA和katG引物和探针以检测样品中的MTB-RIF和/或MTB-INH的说明。制品可额外包括用于实施本文所公开方法的试剂(例如，缓冲液、聚合酶、辅助因子或防止污染的试剂)。此类试剂可专用于本文所述的市售仪器之一。

将在以下实施例中进一步描述本公开的实施方案，其不限制权利要求书中所述的本发明的范围。

实施例

使用示例性rpoB、inhA和katG探针检测特定的SNP

检查了示例性探针检测以下的能力：rboB基因中赋予MTB对利福平的抗性的17种SNP，包括：rpoB 531L、rpoB 531W、rpoB 526L、rpoB 526Y、rpoB 526D、rpoB 526N、rpoB513L、rpoB 513K、rpoB 513P、rpoB 522L、rpoB 522Q、rpoB 522W、rpoB 516V、rpoB 516Y、rpoB 533P、rpoB 511P和rpoB 526R；inhA基因中赋予MTB对异烟肼的抗性的3种SNP，包括：inhA-15T、inhA-8A和inhA-8C；以及katG基因中也赋予MTB对异烟肼的抗性的4种SNP，包括：katG 315I、katG 315N、katG 315T和katG 315T2。

使用了包含各自核酸(每一种代表了一种、两种或三种SNP)的各种质粒。在本文中，在每个孔中，包含缓冲液、ZO5 DNA聚合酶、三磷酸核苷、能够扩增rpoB、inhA和katG靶标区域的引物对以及表II中所示的示例性探针的主混合物(MMX)掺杂了一种类型的质粒DNA(每一种包含如表II中所展示的一种、两种或三种特定SNP)。包含16S序列的质粒被用作阳性对照，使用16S特异性引物对和探针。随后，将多孔板加载到cobas® 6800系统(RocheMolecular Systems)上并进行扩增和检测反应。结果在表II 中给出。

表II：rpoB、inhA和katG的示例性探针的结果

虽然出于清楚和理解的目的较为详细地描述了上述发明，但是通过阅读本公开，本领域技术人员将清楚，可在形式和细节上做出各种变化而不脱离本发明的真实范围。例如，上述所有技术和装置可以各种组合使用。

序列表

<110> Roche Diagnostics GmbH

F. Hoffmann-La Roche AG

Roche Molecular Systems, Inc.

<120> 用于检测耐药性结核分枝杆菌的组合物和方法

<130> P32319-WO-HS

<150> US 14/575879

<151> 2014-12-18

<160> 438

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3SP531L09

<400> 1

gttggcgctg gggc 14

<210> 2

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> RMRPO3SP531L18

<400> 2

actgttggcg ctggg 15

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<212> DNA

<213> 人工序列

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

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<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> RMRPO3S531L18B

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<212> DNA

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<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> RMRPO3SP531L20

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<212> DNA

<213> 人工序列

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> RMRPO3S531L20

<400> 8

ccgactgttg gcgcu 15

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<212> DNA

<213> 人工序列

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> RMRPO3SP531L22

<400> 9

ctgttggcgc uggg 14

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> RMRPO3SP531L24

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cuguuggcgc tggggc 16

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<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3SP531L25

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cuguuggcgc tgggg 15

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3SP531L26

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uguuggcgct ggggccc 17

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<400> 13

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<210> 14

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<212> DNA

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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cuguuggcgc uggg 14

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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cuguuggcgc uggc 14

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

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acuguucgcg cugg 14

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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ccaacagucg gcgcttg 17

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<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3AP531L17

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

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<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3A531L12D

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ccaacagucg gcgcttg 17

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<212> DNA

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

<223> RMRPO3531L17B2

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

<223> RMRPO3A531L22

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3531L17B5

<400> 50

ccaacagucg gcgc 14

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<212> DNA

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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ccaacagucg gcgc 14

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3F531W02

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3F531W06

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cccacagtcg gcgc 14

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

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<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3A08C

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3A09

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3526LFM08

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<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

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gcuugagggu caaccccga 19

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<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

<223> AYRPO3526LJA05

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3526LJA06

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gcuugagggc caaccccga 19

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

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<220>

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<220>

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<212> DNA

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<220>

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<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P10D

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cgccggggcc cggcgg 16

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P10

<400> 121

cgccggggcc cggcgg 16

<210> 122

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJS513L68PJ12

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJS513L59PJ12

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ccagcugagc cuauuc 16

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJS513L101PJ12

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agccuauuca uggaccag 18

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<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<220>

<223> JJA513L68PJ12

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<212> DNA

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<220>

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<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

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<220>

<223> JJA513L61PJ12

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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ugaauaggcu cagcugg 17

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522Q31PJ12

<400> 192

accccugcag cgggu 15

<210> 193

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJS522Q49PJ12

<400> 193

cgcugcaggg guugac 16

<210> 194

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522Q18PJ12

<400> 194

accccugcag cggg 14

<210> 195

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJS522Q34PJ12

<400> 195

cgcugcaggg guuga 15

<210> 196

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522Q20PJ12

<400> 196

caaccccugc agcg 14

<210> 197

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522Q33PJ12

<400> 197

caaccccugc agcgg 15

<210> 198

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522Q47PJ12

<400> 198

caaccccugc agcggg 16

<210> 199

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522W33PJ12

<400> 199

caacccccac agcg 14

<210> 200

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522W33GJ12

<400> 200

caacccccac agcg 14

<210> 201

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522W47J12

<400> 201

caacccccac agcgg 15

<210> 202

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522W47GJ12

<400> 202

caacccccac agcgg 15

<210> 203

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522W48PJ12

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ucaaccccca cagcg 15

<210> 204

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> JJA522W48GJ12

<400> 204

ucaaccccca cagcg 15

<210> 205

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

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<220>

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ctggaccatg aattggctc 19

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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ctggaccatg aattggctc 19

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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tggtccagaa caacccgct 19

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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atgtaccaga acaacccgct g 21

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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ctggtacatg aattggctc 19

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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ctggtacatg aattggctca gc 22

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<212> DNA

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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ctggaccatg aattggctc 19

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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tggtccagaa caacccgctg cgg 23

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<212> DNA

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<220>

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<220>

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<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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tggtccagaa caacccgct 19

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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tggtccagaa caacccgct 19

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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atgtaccaga acaacccggg gt 22

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<400> 217

tggtccagaa taacccgctg cgg 23

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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tggtccaaaa caacccgctg cgg 23

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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ggtccagaac aacccgctg 19

<210> 220

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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atggtccaga acaacccgct 20

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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catggtccag aacaacccg 19

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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atggtccaga acaaccggtt g 21

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<212> DNA

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<220>

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<220>

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catggtccag aacaacccg 19

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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caugguccag aacaacccg 19

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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catggtccag aacaacccg 19

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3S516V11F

<400> 227

catggtccag aacaacccg 19

<210> 228

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3516V11C2

<400> 229

caugguccag aacaac 16

<210> 230

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RM516V11G2

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ccugguccag aacaac 16

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3516V11G2

<400> 231

caugguccag aaca 14

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3516V11G3

<400> 232

cauggtccag aaca 14

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<212> DNA

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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catggtccag aacaaccggt tg 22

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3516V11C4

<400> 234

caugguccag aacaacc 17

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<212> DNA

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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tggtccagaa caacccgctg 20

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3516V11E3

<400> 236

atggtccaga acaacagttg 20

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3516V11E5

<400> 237

tggtccagaa caacccgct 19

<210> 238

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3516V11E6

<400> 238

tggtccagaa caacccgct 19

<210> 239

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3SP516Y03

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atgtaccaga acaacccgc 19

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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atgtaccaga acaacccgct g 21

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<212> DNA

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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atgtaccaga acaacccgct g 21

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<212> DNA

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3AP516Y

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ctggtacatg aattggctc 19

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3A2P516Y

<400> 243

ctggtacatg aattggctca gc 22

<210> 244

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3SP516Y02

<400> 244

atgtaccaga acaacccggg gt 22

<210> 245

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3SP516Y4B

<400> 245

atgtaccaga acaacccgct gt 22

<210> 246

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3S516YB

<400> 246

atgtaccaga acaacccgct g 21

<210> 247

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<400> 247

atgtaccaga acaacccgct g 21

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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cgccggggcc cggc 14

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<212> DNA

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<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P10D

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cgccggggcc cggcgg 16

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P02

<400> 251

ccggcgccga cagtcgg 17

<210> 252

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P03

<400> 252

ccggcgccta cagtcggcg 19

<210> 253

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

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ccggcgccca cagtcggcg 19

<210> 255

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P06

<400> 255

ccggcaccga cagtcgg 17

<210> 256

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P07

<400> 256

ccggcgtcga cagtcgg 17

<210> 257

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P08

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ccggcgccga cagtcggc 18

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P09

<400> 258

ccggcaccga cagtcggc 18

<210> 259

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P10

<400> 259

cgccggggcc cggcgg 16

<210> 260

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P11

<400> 260

cgccggggcc cggcg 15

<210> 261

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P12

<400> 261

cgccggggcc cggc 14

<210> 262

<211> 17

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P8B

<400> 262

ccggcgccga cagtcgg 17

<210> 263

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P8C

<400> 263

ccggcgccga cagtcg 16

<210> 264

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P13

<400> 264

cgccggggcc ggcc 14

<210> 265

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P10C

<400> 265

cgccggggcc cggcgg 16

<210> 266

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P10E

<400> 266

cgccggggcc cggcgg 16

<210> 267

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3533P10C2

<400> 267

cgccggggcc cggc 14

<210> 268

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3533P12B

<400> 268

cgccggggcc cggc 14

<210> 269

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3533P12C

<400> 269

cgccggggcc cggc 14

<210> 270

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3533P12B2

<400> 270

cgccggggcc cggcgc 16

<210> 271

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3533P12C2

<400> 271

cgccggggcc cggcgg 16

<210> 272

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3533P12C3

<400> 272

cgccgaggcc cggcgg 16

<210> 273

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3533P12C4

<400> 273

agccggggcc cggcgg 16

<210> 274

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3533P13

<400> 274

ccggggcccg gcgg 14

<210> 275

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3533P14

<400> 275

ccggggcccg gcgg 14

<210> 276

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> RMRPO3H533P02B

<400> 276

ccggcgccga cagtc 15

<210> 277

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3511PFM01

<400> 277

cagccgagcc aattcatg 18

<210> 278

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3511PFM02

<400> 278

cagccgagcc aattcatg 18

<210> 279

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3511PFM03

<400> 279

cagccgagcc aattcatg 18

<210> 280

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3511PFM04

<400> 280

cagccgagcc aattcatg 18

<210> 281

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3511PFM05

<400> 281

cagccgagcc aattcatg 18

<210> 282

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3526RFM01

<400> 282

cttgcgggtc aaccccga 18

<210> 283

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3526RFM02

<400> 283

tgcgggtcaa ccccga 16

<210> 284

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3526RFM03

<400> 284

tgcgggtcaa ccccga 16

<210> 285

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3526RFM04

<400> 285

cttgcgggtc aaccccga 18

<210> 286

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3526RFM05

<400> 286

cttgcgggtc aaccccga 18

<210> 287

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3526RFM06

<400> 287

tgcgggtcaa ccccga 16

<210> 288

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3526RFM07

<400> 288

tgcgggtcaa ccccga 16

<210> 289

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

<220>

<223> AYRPO3526RFM08

<400> 289

cttgcgggtc aaccccga 18

<210> 290

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM01

<400> 290

gatcaccatc ggcatcga 18

<210> 291

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM02

<400> 291

caccatcggc atcgaggtc 19

<210> 292

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM03

<400> 292

catcggcatc gaggtcgta 19

<210> 293

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM04

<400> 293

caccatcggc atcgaggtcg ta 22

<210> 294

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM05

<400> 294

atcggcatcg aggtcgta 18

<210> 295

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM06

<400> 295

aucggcaucg aggucgua 18

<210> 296

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM07

<400> 296

aucggcaucg aggucgua 18

<210> 297

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM03a

<400> 297

catcggcatc gaggtcgta 19

<210> 298

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM03b

<400> 298

catcggcatc gaggtcgta 19

<210> 299

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM03c

<400> 299

catcggcatc gaggtcgta 19

<210> 300

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICM03d

<400> 300

catcggcatc gaggtcgta 19

<210> 301

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

探针

<220>

<223> AYKAT315ICY03a1

<400> 301

catcggcatc gaggtcgta 19

<210> 302

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICY03a2

<400> 302

catcggcatc gaggtcgta 19

<210> 303

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

探针

<220>

<223> AYKAT315ICY03a3

<400> 303

catcggcatc gaggtcgta 19

<210> 304

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315ICY03a4

<400> 304

catcggcatc gaggtcgta 19

<210> 305

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

探针

<220>

<223> AYKAT315NCM01

<400> 305

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 306

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM02

<400> 306

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 307

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM03

<400> 307

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 308

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM04

<400> 308

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 309

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM05

<400> 309

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 310

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM04a

<400> 310

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 311

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM05a

<400> 311

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 312

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM07

<400> 312

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 313

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM08

<400> 313

aacggcatcg aggtcgta 18

<210> 314

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM09

<400> 314

caccaacggc atcgaggtc 19

<210> 315

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM10

<400> 315

caccaacggc atcgaggtcg ta 22

<210> 316

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM11

<400> 316

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 317

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM12

<400> 317

aacggcatcg aggtcgta 18

<210> 318

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM13

<400> 318

caccaacggc atcgaggtc 19

<210> 319

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM14

<400> 319

caccaacggc atcgaggtcg ta 22

<210> 320

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM15

<400> 320

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 321

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM16

<400> 321

aacggcatcg aggtcgta 18

<210> 322

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM17

<400> 322

caccaacggc atcgaggtc 19

<210> 323

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM18

<400> 323

caccaacggc atcgaggtcg ta 22

<210> 324

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM19

<400> 324

caacggcatc gaggtcgta 19

<210> 325

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM20

<400> 325

ccaacggcat cgaggtcgta 20

<210> 326

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM21

<400> 326

ccaacggcat cgaggtcgta 20

<210> 327

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM22

<400> 327

accaacggca tcgaggtcgt a 21

<210> 328

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315NCM23

<400> 328

accaacggca tcgaggtcgt a 21

<210> 329

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCM01

<400> 329

caccaccggc atcgaggtc 19

<210> 330

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCM02

<400> 330

caccaccggc atcgaggtc 19

<210> 331

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCM03

<400> 331

caccggcatc gaggtcgta 19

<210> 332

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCM04

<400> 332

caccggcatc gaggtc 16

<210> 333

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCM05

<400> 333

caccaccggc atcga 15

<210> 334

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCM05a

<400> 334

caccaccggc atcga 15

<210> 335

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCM05b

<400> 335

caccaccggc atcga 15

<210> 336

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCM05c

<400> 336

caccaccggc atcga 15

<210> 337

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCY05b1

<400> 337

caccaccggc atcga 15

<210> 338

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCY05b2

<400> 338

caccaccggc atcga 15

<210> 339

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCY05b3

<400> 339

caccaccggc atcga 15

<210> 340

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315TCY05b4

<400> 340

caccaccggc atcga 15

<210> 341

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315T2CM01

<400> 341

caccacaggc atcga 15

<210> 342

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315T2CM02

<400> 342

caccacaggc atcga 15

<210> 343

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYKAT315T2CM03

<400> 343

caccacaggc atcga 15

<210> 344

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM01

<400> 344

gcgagatgat aggttgtcgg 20

<210> 345

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM02

<400> 345

gagatgatag gttgtcgggg tga 23

<210> 346

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM03

<400> 346

gcgagaugau agguugucgg 20

<210> 347

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM04

<400> 347

agatgatagg ttgtcggggt ga 22

<210> 348

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM05

<400> 348

agaugauagg uugucggggu ga 22

<210> 349

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM06

<400> 349

gatgataggt tgtcggggtg a 21

<210> 350

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM04a

<400> 350

agatgatagg ttgtcggggt ga 22

<210> 351

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM04b

<400> 351

agatgatagg ttgtcggggt ga 22

<210> 352

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM04c

<400> 352

agatgatagg ttgtcggggt ga 22

<210> 353

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM04d

<400> 353

agatgatagg ttgtcggggt ga 22

<210> 354

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM07

<400> 354

agaugauagg uugucggggu ga 22

<210> 355

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM08

<400> 355

gaugauaggu ugucggggug a 21

<210> 356

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM09

<400> 356

augauagguu gucgggguga 20

<210> 357

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM09a

<400> 357

augauagguu gucgggguga 20

<210> 358

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM09b

<400> 358

atgauagguu gucgggguga 20

<210> 359

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM06a

<400> 359

gaugauaggu ugucggggug a 21

<210> 360

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA15TCM06b

<400> 360

gatgauaggu ugucggggug a 21

<210> 361

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA15TCM06A_1

<400> 361

gaugauaggu ugucggggug a 21

<210> 362

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA15TCM06A_2

<400> 362

gaugauaggu ugucggggug a 21

<210> 363

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA15TCM06B_1

<400> 363

gatgauaggu ugucggggug a 21

<210> 364

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA15TCM06B_2

<400> 364

gatgauaggu ugucggggug a 21

<210> 365

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFYINHA15TCM09A_1

<400> 365

augauagguu gucgggguga 20

<210> 366

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA15TCM09A_1

<400> 366

augauagguu gucgggguga 20

<210> 367

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA15TCM09B_1

<400> 367

atgauagguu gucgggguga 20

<210> 368

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA15TCM09B_2

<400> 368

atgauagguu gucgggguga 20

<210> 369

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR15TCM01

<400> 369

ctatcatctc gccgcggc 18

<210> 370

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR15TCM02

<400> 370

ctatcatctc gccgcggcc 19

<210> 371

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR15TCM03

<400> 371

ctatcatctc gccgcggccg 20

<210> 372

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR15TCM04

<400> 372

tatcatctcg ccgcggcc 18

<210> 373

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM01

<400> 373

taggatgtcg gggtgactgc ca 22

<210> 374

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM02

<400> 374

taggatgtcg gggtgactgc 20

<210> 375

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM03

<400> 375

gataggatgt cggggtgact gc 22

<210> 376

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM04

<400> 376

uaggaugucg gggugacu 18

<210> 377

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM05

<400> 377

taggatgtcg gggtgactgc ca 22

<210> 378

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM06

<400> 378

taggatgtcg gggtgactgc ca 22

<210> 379

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM07

<400> 379

taggatgtcg gggtgactgc ca 22

<210> 380

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM08

<400> 380

taggatgtcg gggtgactgc ca 22

<210> 381

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM08a

<400> 381

uaggaugucg gggugacugc ca 22

<210> 382

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM08b

<400> 382

uaggaugucg gggugacugc ca 22

<210> 383

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM01

<400> 383

cgacatccta tcgtctcgcc gc 22

<210> 384

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM02

<400> 384

gacatcctat cgtctcgccg c 21

<210> 385

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的寡核苷酸

探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM03

<400> 385

acatcctatc gtctcgccgc 20

<210> 386

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM04

<400> 386

catcctatcg tctcgccgc 19

<210> 387

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM05

<400> 387

cgacatccta tcgtctcgcc 20

<210> 388

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM02a

<400> 388

gacatcctat cgtctcgccg c 21

<210> 389

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM02b

<400> 389

gacatcctat cgtctcgccg c 21

<210> 390

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM02c

<400> 390

gacatcctat cgtctcgccg c 21

<210> 391

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM02d

<400> 391

gacatcctat cgtctcgccg c 21

<210> 392

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM02e

<400> 392

gacatccuau cgucucgccg c 21

<210> 393

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM02f

<400> 393

gacatccuau cgucucgccg c 21

<210> 394

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM02g

<400> 394

gacatccuau cgucucgccg c 21

<210> 395

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8ACM02h

<400> 395

gacatccuau cgucucgccg c 21

<210> 396

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA8ACM08A_1

<400> 396

uaggaugucg gggugacugc ca 22

<210> 397

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA8ACM08A_2

<400> 397

uaggaugucg gggugacugc ca 22

<210> 398

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA8ACM08B_1

<400> 398

uaggaugucg gggugacugc ca 22

<210> 399

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> JFINHA8ACM08B_2

<400> 399

uaggaugucg gggugacugc ca 22

<210> 400

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM01

<400> 400

taggctgtcg gggtgactgc 20

<210> 401

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM02

<400> 401

taggctgtcg gggtgactgc 20

<210> 402

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM03

<400> 402

gataggctgt cggggtgact gc 22

<210> 403

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM04

<400> 403

ataggctgtc ggggtgactg c 21

<210> 404

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHA8ACM05

<400> 404

aggctgtcgg ggtgactgc 19

<210> 405

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8CCM01

<400> 405

cgacagccta tcgtctcgcc gc 22

<210> 406

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8CCM02

<400> 406

gacagcctat cgtctcgccg c 21

<210> 407

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8CCM03

<400> 407

acagcctatc gtctcgccgc 20

<210> 408

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8CCM04

<400> 408

cagcctatcg tctcgccgc 19

<210> 409

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYINHAR8CCM05

<400> 409

cgacagccta tcgtctcgcc 20

<210> 410

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的正向引物

<220>

<223> AYKATG003

<400> 410

gcggtcacac tttcggta 18

<210> 411

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的反向引物

<220>

<223> AYKATG002

<400> 411

cttggcggtg tattgc 16

<210> 412

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的正向引物

<220>

<223> AYINHA001

<400> 412

gaagtgtgct gagtcacacc 20

<210> 413

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的反向引物

<220>

<223> AYINHA002

<400> 413

ggactgaacg ggatacga 18

<210> 414

<211> 266

<212> DNA

<213> 结核分枝杆菌

<220>

<223> katG WT 扩增子

<400> 414

gcggtcacac tttcggtaag acccatggcg ccggcccggc cgatctggtc ggccccgaac 60

ccgaggctgc tccgctggag cagatgggct tgggctggaa gagctcgtat ggcaccggaa 120

ccggtaagga cgcgatcacc agcggcatcg aggtcgtatg gacgaacacc ccgacgaaat 180

gggacaacag tttcctcgag atcctgtacg gctacgagtg ggagctgacg aagagccctg 240

ctggcgcttg gcaatacacc gccaag 266

<210> 415

<211> 191

<212> DNA

<213> 结核分枝杆菌

<220>

<223> inhA WT 扩增子

<400> 415

gaagtgtgct gagtcacacc gacaaacgtc acgagcgtaa ccccagtgcg aaagttcccg 60

ccggaaatcg cagccacgtt acgctcgtgg acataccgat ttcggcccgg ccgcggcgag 120

acgataggtt gtcggggtga ctgccacagc cactgaaggg gccaaacccc cattcgtatc 180

ccgttcagtc c 191

<210> 416

<211> 184

<212> DNA

<213> 结核分枝杆菌

<220>

<223> RIF WT 扩增子

<400> 416

ggacgtggag gcgatcacac cgcagacgtt gatcaacatc cggccggtgg tcgccgcgat 60

caaggagttc ttcggcacca gccagctgag ccaattcatg gaccagaaca acccgctgtc 120

ggggttgacc cacaagcgcc gactgtcggc gctggggccc ggcggtctgt cacgtgagcg 180

tgcc 184

<210> 417

<211> 184

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> RIF MT03 扩增子

<400> 417

ggacgtggag gcgatcacac cgcagacgtt gatcaacatc cggccggtgg tcgccgcgat 60

caaggagttc ttcggcacca gccagccgag ccaattcatg gaccagaaca acccgctgtc 120

ggggttgacc gacaagcgcc gactgtcggc gcctgggccc ggcggtctgt cacgtgagcg 180

tgcc 184

<210> 418

<211> 184

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> RIF MT04 扩增子

<400> 418

ggacgtggag gcgatcacac cgcagacgtt gatcaacatc cggccggtgg tcgccgcgat 60

caaggagttc ttcggcagca gccagctgag ccaattcatg gtccagaaca acccgctgtc 120

ggggttgacc aacaagcgcc gactgtcggc gctggggtcc ggcggtctgt cacgtgagcg 180

tgcc 184

<210> 419

<211> 184

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> RIF MT05 扩增子

<400> 419

ggacgtggag gcgatcacac cgcagacgtt gatcaacatc cggccggtgg tcgccgcgat 60

caaggagttc ttcggcgcca gccagctgag ccaattcatg taccagaaca acccgctgtc 120

ggggttgacc cgcaagcgcc gactgtcggc gctggggcac ggcggtctgt cacgtgagcg 180

tgcc 184

<210> 420

<211> 184

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> RIF MT06 扩增子

<400> 420

ggacgtggag gcgatcacac cgcagacgtt gatcaacatc cggccggtgg tcgccgcgat 60

caaggagttc ttcggcccca gccagctgag ccaattcatg gaccagaaca acccgctgtc 120

ggggttgacc tacaagcgcc gactgtcggc gccggggccc ggcggtctgt cacgtgagcg 180

tgcc 184

<210> 421

<211> 184

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> RIF MT07 扩增子

<400> 421

ggacgtggag gcgatcacac cgcagacgtt gatcaacatc cggccggtgg tcgccgcgat 60

caaggagttc ttcggcacca gccagcggag ccaattcatg gaccagaaca acccgctgtc 120

ggggttgacc ctcaagcgcc gactgtcggc gctggggccc ggcggtccgt cacgtgagcg 180

tgcc 184

<210> 422

<211> 184

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> RIF MT08 扩增子

<400> 422

ggacgtggag gcgatcacac cgcagacgtt gatcaacatc cggccggtgg tcgccgcgat 60

caaggagttc ttcggcacca gccagctgag cctattcatg gaccagaaca acccgctgca 120

ggggttgacc cacaagcgcc gactgttggc gctggggccc ggcggtctgt cacgtgagcg 180

tgcc 184

<210> 423

<211> 184

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> RIF MT09 扩增子

<400> 423

ggacgtggag gcgatcacac cgcatacgtt gatcaacatc cggccggtgg tcgccgcgat 60

caaggagtcc ttcggcacca gccagctgag caaattcatg gaccagaaca acccgctgtt 120

ggggttgacc cacaagcgcc gactgtgggc gctggggccc ggcggtctgt cacgtgagcg 180

tgcc 184

<210> 424

<211> 184

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> RIF MT10 扩增子

<400> 424

ggacgtggag gcgatcacac cgcagacgtt gatcaacatc cggccggtgg tcgccgcgat 60

caaggagtta ttcggcacca gccagctgag cccattcatg gaccagaaca acccgctgtg 120

ggggttgacc cacaagcgcc gactgtttgc gctggggccc ggcggtctgt cacgtgagcg 180

tgcc 184

<210> 425

<211> 191

<212> DNA

<213> 结核分枝杆菌

<220>

<223> WT_INHA 扩增子

<400> 425

gaagtgtgct gagtcacacc gacaaacgtc acgagcgtaa ccccagtgcg aaagttcccg 60

ccggaaatcg cagccacgtt acgctcgtgg acataccgat ttcggcccgg ccgcggcgag 120

acgataggtt gtcggggtga ctgccacagc cactgaaggg gccaaacccc cattcgtatc 180

ccgttcagtc c 191

<210> 426

<211> 191

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> MT_INHA02 扩增子

<400> 426

gaagtgtgct gagtcacacc gacaaacgtc acgagcgtaa ccccagtgcg aaagttcccg 60

ccggaaatcg cagccacgtt acgctcgtgg acataccgat ttcggcccgg ccgcggcgag 120

atgataggtt gtcggggtga ctgccacagc cactgaaggg gccaaacccc cattcgtatc 180

ccgttcagtc c 191

<210> 427

<211> 191

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> MT_INHA03 扩增子

<400> 427

gaagtgtgct gagtcacacc gacaaacgtc acgagcgtaa ccccagtgcg aaagttcccg 60

ccggaaatcg cagccacgtt acgctcgtgg acataccgat ttcggcccgg ccgcggcgag 120

acgataggta gtcggggtga ctgccacagc cactgaaggg gccaaacccc cattcgtatc 180

ccgttcagtc c 191

<210> 428

<211> 191

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> MT_INHA04 扩增子

<400> 428

gaagtgtgct gagtcacacc gacaaacgtc acgagcgtaa ccccagtgcg aaagttcccg 60

ccggaaatcg cagccacgtt acgctcgtgg acataccgat ttcggcccgg ccgcggcgag 120

acgataggtc gtcggggtga ctgccacagc cactgaaggg gccaaacccc cattcgtatc 180

ccgttcagtc c 191

<210> 429

<211> 266

<212> DNA

<213> 结核分枝杆菌

<220>

<223> WT_KATG01 扩增子

<400> 429

gcggtcacac tttcggtaag acccatggcg ccggcccggc cgatctggtc ggccccgaac 60

ccgaggctgc tccgctggag cagatgggct tgggctggaa gagctcgtat ggcaccggaa 120

ccggtaagga cgcgatcacc agcggcatcg aggtcgtatg gacgaacacc ccgacgaaat 180

gggacaacag tttcctcgag atcctgtacg gctacgagtg ggagctgacg aagagccctg 240

ctggcgcttg gcaatacacc gccaag 266

<210> 430

<211> 266

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> MT_KATG02 扩增子

<400> 430

gcggtcacac tttcggtaag acccatggcg ccggcccggc cgatctggtc ggccccgaac 60

ccgaggctgc tccgctggag cagatgggct tgggctggaa gagctcgtat ggcaccggaa 120

ccggtaagga cgcgatcacc atcggcatcg aggtcgtatg gacgaacacc ccgacgaaat 180

gggacaacag tttcctcgag atcctgtacg gctacgagtg ggagctgacg aagagccctg 240

ctggcgcttg gcaatacacc gccaag 266

<210> 431

<211> 266

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> MT_KATG03 扩增子

<400> 431

gcggtcacac tttcggtaag acccatggcg ccggcccggc cgatctggtc ggccccgaac 60

ccgaggctgc tccgctggag cagatgggct tgggctggaa gagctcgtat ggcaccggaa 120

ccggtaagga cgcgatcacc aacggcatcg aggtcgtatg gacgaacacc ccgacgaaat 180

gggacaacag tttcctcgag atcctgtacg gctacgagtg ggagctgacg aagagccctg 240

ctggcgcttg gcaatacacc gccaag 266

<210> 432

<211> 266

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> MT_KATG04 扩增子

<400> 432

gcggtcacac tttcggtaag acccatggcg ccggcccggc cgatctggtc ggccccgaac 60

ccgaggctgc tccgctggag cagatgggct tgggctggaa gagctcgtat ggcaccggaa 120

ccggtaagga cgcgatcacc accggcatcg aggtcgtatg gacgaacacc ccgacgaaat 180

gggacaacag tttcctcgag atcctgtacg gctacgagtg ggagctgacg aagagccctg 240

ctggcgcttg gcaatacacc gccaag 266

<210> 433

<211> 266

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的多核苷酸

<220>

<223> MT_KATG05 扩增子

<400> 433

gcggtcacac tttcggtaag acccatggcg ccggcccggc cgatctggtc ggccccgaac 60

ccgaggctgc tccgctggag cagatgggct tgggctggaa gagctcgtat ggcaccggaa 120

ccggtaagga cgcgatcacc acaggcatcg aggtcgtatg gacgaacacc ccgacgaaat 180

gggacaacag tttcctcgag atcctgtacg gctacgagtg ggagctgacg aagagccctg 240

ctggcgcttg gcaatacacc gccaag 266

<210> 434

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> RM315N2B

<400> 434

caacgcaucg aggucgua 18

<210> 435

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> RM315T2

<400> 435

accacaggca tcgaggtcgt a 21

<210> 436

<211> 17

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> RMINHA8C4BB

<400> 436

acagccuauc gucucgc 17

<210> 437

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> AYRPO3526RFM11

<400> 437

cttgcgggtc aaccccga 18

<210> 438

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述: 合成的探针

<220>

<223> 组合的DNA/RNA分子的描述: 合成的探针

<220>

<223> RM_NEW526N11B3

<400> 438

ttgttggtca accccgacgg gg 22

Claims (17)

1.多组rpoB、inhA和katG引物和多种可检测的rpoB、inhA和katG探针在制造试剂盒中的用途，所述试剂盒用于通过以下方法检测样品中对利福平耐受的结核分枝杆菌(MTB-RIF)和/或对异烟肼耐受的结核分枝杆菌(MTB-INH)，所述方法包括多重实时聚合酶链式反应测定，其包括：

- 进行扩增步骤，其包括使所述样品与至少一组rpoB引物、一组inhA引物和一组katG引物接触，从而，如果所述样品中存在任何rpoB、inhA和katG靶核酸，则产生一种或多种扩增产物；

- 进行杂交步骤，其包括使所述一种或多种扩增产物与多种可检测的rpoB探针、多种可检测的inhA探针和多种可检测的katG探针接触，所述探针至少包括：

- 17种rpoB探针，其用于检测赋予结核分枝杆菌(MTB)利福平抗性的17种单核苷酸多态性SNP；

- 3种inhA探针，其用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP；和

- 4种katG探针，其用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP；以及

- 检测是否存在所述一种或多种扩增产物，其中存在所述一种或多种扩增产物表明所述样品中存在MTB-RIF和/或MTB-INH，并且其中不存在所述一种或多种扩增产物表明所述样品中不存在MTB-RIF和/或MTB-INH；

其中所述多种rpoB探针包括用于检测赋予MTB利福平抗性的17种SNP中的每一种的水解探针，所述SNP包括：rpoB 531L、rpoB 531W、rpoB 526L、rpoB 526Y、rpoB 526D、rpoB526N、rpoB 513L、rpoB 513K、rpoB 513P、rpoB 522L、rpoB 522Q、rpoB 522W、rpoB 516V、rpoB 516Y、rpoB 533P、rpoB 511P和rpoB 526R；

其中所述多种inhA探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP中的每一种的水解探针，所述SNP包括：inhA-15T、inhA-8A和inhA-8C；并且

其中所述多种katG探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP中的每一种的水解探针，所述SNP包括：katG 315I、katG 315N、katG 315T和katG 315T2，并且其中：

- 所述rpoB探针由SEQ ID NO: 52、55、58、84、99、108、121、142、155、162、180、196、199、238、240、280和437-438的核酸序列或其互补物组成；

- 所述inhA探针由SEQ ID NO: 363、374和436的核酸序列或其互补物组成；并且

- 所述katG探针由SEQ ID NO: 297、335和434-435的核酸序列或其互补物组成。

2.根据权利要求1的用途，其中所述多种可检测的rpoB、inhA和katG探针中的每一种均用供体荧光部分和对应的受体荧光部分标记；并且

其中所述检测步骤包括检测一种或几种的所述rpoB、inhA和katG探针的所述供体荧光部分与所述受体荧光部分之间是否存在荧光共振能量转移(FRET)，其中荧光发射的存在与否表明所述样品中是否存在MTB-RIF和/或MTB-INH。

3.根据权利要求1的用途，其中所述扩增采用具有5'至3'核酸酶活性的聚合酶。

4.根据权利要求2的用途，其中所述供体和受体荧光部分在所述探针上彼此相距不超过8个核苷酸。

5.根据权利要求2或4的用途，其中所述受体荧光部分为猝灭剂。

6.用于检测对利福平耐受的结核分枝杆菌(MTB-RIF)和/或对异烟肼耐受的结核分枝杆菌(MTB-INH)的核酸的试剂盒，包括：

- 专门用于扩增rpoB、inhA和katG基因靶标的多组rpoB、inhA和katG引物；和

- 专门用于检测rpoB、inhA和katG扩增产物的多种可检测的rpoB、inhA和katG探针，包括：

- 17种rpoB探针，其用于检测赋予MTB利福平抗性的17种SNP；

- 3种inhA探针，其用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP；和

- 4种katG探针，其用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP；

其中所述多种rpoB探针包括用于检测赋予MTB利福平抗性的17种SNP中的每一种的水解探针，所述SNP包括：rpoB 531L、rpoB 531W、rpoB 526L、rpoB 526Y、rpoB 526D、rpoB526N、rpoB 513L、rpoB 513K、rpoB 513P、rpoB 522L、rpoB 522Q、rpoB 522W、rpoB 516V、rpoB 516Y、rpoB 533P、rpoB 511P和rpoB 526R；

其中所述多种inhA探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP中的每一种的水解探针，所述SNP包括：inhA-15T、inhA-8A和inhA-8C；并且

其中所述多种katG探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP中的每一种的水解探针，所述SNP包括：katG 315I、katG 315N、katG 315T和katG 315T2，并且其中：

- 所述rpoB探针由SEQ ID NO: 52、55、58、84、99、108、121、142、155、162、180、196、199、238、240、280和437-438的核酸序列或其互补物组成；

- 所述inhA探针由SEQ ID NO: 363、374和436的核酸序列或其互补物组成；并且

- 所述katG探针由SEQ ID NO: 297、335和434-435的核酸序列或其互补物组成。

7.根据权利要求6的试剂盒，其中所述多种可检测的rpoB、inhA和katG探针中的每一种均包含供体荧光部分和对应的受体荧光部分。

8.根据权利要求7的试剂盒，其中所述受体荧光部分为猝灭剂。

9.根据权利要求6至8中任一项的试剂盒，其还包括三磷酸核苷、核酸聚合酶以及对于所述核酸聚合酶功能所必需的缓冲液。

10.寡核苷酸，其包含由SEQ ID NO: 52、55、58、84、99、108、121、142、155、162、180、196、199、238、240、280、297、335、363、374和434-438或其互补物组成的核酸序列，并且还包含一种或多种可检测的标记。

11.根据权利要求10的寡核苷酸，其中所述寡核苷酸包含至少一个经修饰的核苷酸。

12.根据权利要求10或11的寡核苷酸，其中所述寡核苷酸包含至少一个标记部分和/或至少一个猝灭剂部分。

13.检测非生物样品中对利福平耐受的结核分枝杆菌(MTB-RIF)和/或对异烟肼耐受的结核分枝杆菌(MTB-INH)的方法，所述方法包括多重实时聚合酶链式反应测定，其包括：

- 进行扩增步骤，其包括使所述样品与至少一组rpoB引物、一组inhA引物和一组katG引物接触，从而，如果所述样品中存在任何rpoB、inhA和katG靶核酸，则产生一种或多种扩增产物；

- 进行杂交步骤，其包括使所述一种或多种扩增产物与多种可检测的rpoB探针、多种可检测的inhA探针和多种可检测的katG探针接触，所述探针至少包括：

- 17种rpoB探针，其用于检测赋予MTB利福平抗性的17种单核苷酸多态性SNP；

- 3种inhA探针，其用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP；和

- 4种katG探针，其用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP；以及

- 检测是否存在所述一种或多种扩增产物，其中存在所述一种或多种扩增产物表明所述样品中存在MTB-RIF和/或MTB-INH，并且其中不存在所述一种或多种扩增产物表明所述样品中不存在MTB-RIF和/或MTB-INH；

其中所述多种rpoB探针包括用于检测赋予MTB利福平抗性的17种SNP中的每一种的水解探针，所述SNP包括：rpoB 531L、rpoB 531W、rpoB 526L、rpoB 526Y、rpoB 526D、rpoB526N、rpoB 513L、rpoB 513K、rpoB 513P、rpoB 522L、rpoB 522Q、rpoB 522W、rpoB 516V、rpoB 516Y、rpoB 533P、rpoB 511P和rpoB 526R；

其中所述多种inhA探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的3种SNP中的每一种的水解探针，所述SNP包括：inhA-15T、inhA-8A和inhA-8C；并且

其中所述多种katG探针包括用于检测赋予MTB异烟肼抗性的4种SNP中的每一种的水解探针，所述SNP包括：katG 315I、katG 315N、katG 315T和katG 315T2，并且其中：

- 所述rpoB探针由SEQ ID NO: 52、55、58、84、99、108、121、142、155、162、180、196、199、238、240、280和437-438的核酸序列或其互补物组成；

- 所述inhA探针由SEQ ID NO: 363、374和436的核酸序列或其互补物组成；并且

- 所述katG探针由SEQ ID NO: 297、335和434-435的核酸序列或其互补物组成；

其中所述方法用于非诊断目的。

14.根据权利要求13的方法，其中所述多种可检测的rpoB、inhA和katG探针中的每一种均用供体荧光部分和对应的受体荧光部分标记；并且

其中所述检测步骤包括检测一种或几种的所述rpoB、inhA和katG探针的所述供体荧光部分与所述受体荧光部分之间是否存在荧光共振能量转移(FRET)，其中荧光发射的存在与否表明所述样品中是否存在MTB-RIF和/或MTB-INH。

15.根据权利要求13的方法，其中所述扩增采用具有5'至3'核酸酶活性的聚合酶。

16.根据权利要求14的方法，其中所述供体和受体荧光部分在所述探针上彼此相距不超过8个核苷酸。

17.根据权利要求14或16的方法，其中所述受体荧光部分为猝灭剂。

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