CN106967068A - N6‑甲基腺嘌呤的光化学脱甲基方法 - Google Patents

N6‑甲基腺嘌呤的光化学脱甲基方法 Download PDF

Info

Publication number
CN106967068A
CN106967068A CN201710320303.5A CN201710320303A CN106967068A CN 106967068 A CN106967068 A CN 106967068A CN 201710320303 A CN201710320303 A CN 201710320303A CN 106967068 A CN106967068 A CN 106967068A
Authority
CN
China
Prior art keywords
methyl adenine
methyl
adenine
reaction
alkyl
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201710320303.5A
Other languages
English (en)
Other versions
CN106967068B (zh
Inventor
程靓
谢丽君
刘利
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Institute of Chemistry CAS
Original Assignee
Institute of Chemistry CAS
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Institute of Chemistry CAS filed Critical Institute of Chemistry CAS
Priority to CN201710320303.5A priority Critical patent/CN106967068B/zh
Publication of CN106967068A publication Critical patent/CN106967068A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN106967068B publication Critical patent/CN106967068B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D473/00Heterocyclic compounds containing purine ring systems
    • C07D473/26Heterocyclic compounds containing purine ring systems with an oxygen, sulphur, or nitrogen atom directly attached in position 2 or 6, but not in both
    • C07D473/32Nitrogen atom
    • C07D473/34Nitrogen atom attached in position 6, e.g. adenine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H1/00Processes for the preparation of sugar derivatives
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/16Purine radicals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/16Purine radicals
    • C07H19/167Purine radicals with ribosyl as the saccharide radical

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)

Abstract

本发明涉及N6‑甲基腺嘌呤的特异性光化学脱甲基化方法及其应用。该方法是利用光作为引发剂,在溶剂存在下,在光照条件下使式I所示N6‑甲基腺嘌呤或其衍生物与光敏剂和氧化剂反应,得到式II所示的脱甲基化产物,即可实现脱甲基化。利用本发明的N6‑甲基腺嘌呤的光化学脱甲基化方法及相关化合物,可实现非酶条件下的对核酸的化学调节。本发明为表观遗传学及化学生物学研究领域提供了核酸去甲基化的有效研究方法。

Description

N6-甲基腺嘌呤的光化学脱甲基方法
技术领域
本发明涉及化学生物学和有机化学领域,具体涉及N6-甲基腺嘌呤及其衍生物的光化学脱甲基方法。
背景技术
在表观遗传学领域,核酸的甲基化和去甲基化研究是最为重要的内容之一。基因调控区的高度甲基化通常导致下游基因的沉默,而去甲基化过程则通常伴随着下游基因的表达激活,从而参与相应的生物学过程。N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物最常见和最丰富的化学修饰之一,在人类7000多个基因中存在约12000个N6-甲基腺嘌呤修饰位点,在广谱基因表达中发挥基础性调节作用。N6-甲基腺嘌呤在RNA如tRNA,rRNA和snRNA中广泛分布,占到了RNA碱基甲基化修饰的80%以上,对mRNA的N6-甲基腺嘌呤修饰研究开辟了以“RNA修饰与调控”为核心内容的表观遗传学研究领域中的前沿新方向——“RNA表观遗传学”。研究表明,N6-甲基腺嘌呤修饰参与调控mRNA的剪接、运输、稳定性和翻译效率等,并且与肥胖和肿瘤等多种生理功能异常及疾病相关。
N6-甲基腺嘌呤具有序列特异性、甲基化位点选择性及修饰水平动态性特征,是一个动态的过程,涉及到一系列的相关蛋白:由N6-甲基腺嘌呤甲基转移酶复合物WTAP/METTL3/METTL14催化形成及去甲基化酶ALKBH5和FTO催化去甲基化,并被结合蛋白YTHDF2和YTHDC1识别。在N6-甲基腺嘌呤研究中一般将插入甲基的蛋白称为“书写器”(writer),将去甲基化酶称为“擦除器”(eraser),将识别N6-甲基腺嘌呤的蛋白称为“阅读器”(reader)。目前已经证实“擦除器”(去甲基化酶)FTO蛋白是通过氧化N6-甲基腺嘌呤中的甲基生成羟甲基(hm6A)和醛基(f6A)的方式进行脱甲基化反应(He,C.et al.Nat.Commun.2013,4,1798),而ALKBH5酶作用于N6-甲基腺嘌呤的机理尚不清楚。
研究此类表观遗传碱基生物学功能的一个重要领域是利用化学方法实现对核酸的甲基化和去甲基化,以此研究“书写器”以及“擦除器”蛋白的生物学机制,但是利用小分子化合物是否可以调控核酸上甲基化修饰尚属罕见。目前针对N6-甲基腺嘌呤去甲基化化学反应的研究主要着眼于对N6-甲基的氧化,据文献报道,碳酸氢铵活化的过氧化氢氧化试剂可以部分氧化N6-甲基腺嘌呤,生成脱甲基产物腺嘌呤(A)(39%)、N6-过氧甲基腺嘌呤(oxm6A)和N6-羟甲基腺嘌呤(hm6A)(Zhou,X.et al.Chem.Sci.2015,6,3013;中国专利CN104262434),并将其用于与转录组RNA的去甲基化研究。此方法对研究相关的去甲基化蛋白的机理起到了推动作用,但是该方法需要使用过量的过氧化氢(50-100当量),生物容忍度低且转化效率较低(39%)等多种缺陷。因此需要发展一种新的高选择性、高效、高生物相容性的N6-甲基腺嘌呤化学转化方法,这对进一步推进表观遗传去甲基化研究具有积极的作用。
发明内容
为了克服现有技术的不足,本发明提供了一种特异性(只针对N6-甲基和N,N6-二甲基)针对N6-甲基腺嘌呤或其衍生物的高效的光化学脱甲基的方法。
本发明所提供的N6-甲基腺嘌呤及其衍生物的光化学脱甲基方法,包括如下步骤:
在溶剂存在下,在光照条件下使式I所示N6-甲基腺嘌呤或其衍生物与光敏剂和氧化剂反应,得到式II所示的脱甲基化产物,即可实现脱甲基化。
上述式I中,R’为H或甲基。
R为H,R’为H时,式I所示化合物为N6-甲基腺嘌呤。
R为H,R’为甲基时,式I所示化合物为N6,N6-二甲基腺嘌呤。
R非H,R’为H时,式I所示化合物为N6-甲基腺嘌呤1号位氢原子取代衍生物。
R非H,R’为甲基时,式I所示化合物为N6,N6-甲基腺嘌呤1号位氢原子取代衍生物。
为方便阐述,如无特殊说明,后文所有“N6-甲基腺嘌呤”或“m6A”均指N6-甲基腺嘌呤或其1号位的所有相关取代衍生物。
其中,N6-甲基腺嘌呤1号位氢原子取代衍生物可选自核苷或脱氧核苷、核苷酸或脱氧核苷酸、核糖核酸(RNA,单链或双链)或脱氧核糖核酸(DNA,单链或双链)中以糖苷键与N6-甲基腺嘌呤1号位键合的相关小分子化合物或聚合大分子化合物(相应取代基R表示分子内除N6-甲基腺嘌呤外的其他结构),分别构成N6-甲基腺嘌呤核糖核苷或N6-甲基腺嘌呤脱氧核糖核苷、N6-甲基腺嘌呤核糖核苷酸或N6-甲基腺嘌呤脱氧核糖核苷酸、含N6-甲基腺嘌呤碱基的RNA或含N6-甲基腺嘌呤碱基的DNA。除上述含核糖基或脱氧核糖基的衍生物外,N6-甲基腺嘌呤1号位取代衍生物的取代基R也可代表烃基、或带-OH、-NH2、-CHO和/或-COOH等功能性取代基团的烃基,其中,所述烃基可以是烷基、环烷基、烯基或炔基,优选为C1~C30的直链或支链烷基、C1~C30的直链或支链烯基或Cl~C30的直链或支链炔基,更优选C1~C10的直链或支链烷基、C1~C10的直链或支链烯基或C1~C10的直链或支链炔基。
N6,N6-甲基腺嘌呤1号位氢原子取代衍生物可选自核苷或脱氧核苷、核苷酸或脱氧核苷酸、核糖核酸(RNA,单链或双链)或脱氧核糖核酸(DNA,单链或双链)中以糖苷键与N6,N6-甲基腺嘌呤1号位键合的相关小分子化合物或聚合大分子化合物(相应取代基R表示分子内除N6,N6-甲基腺嘌呤外的其他结构),分别构成N6,N6-甲基腺嘌呤核糖核苷或N6,N6-甲基腺嘌呤脱氧核糖核苷、N6,N6-甲基腺嘌呤核糖核苷酸或N6,N6-甲基腺嘌呤脱氧核糖核苷酸、含N6,N6-甲基腺嘌呤碱基的RNA或含N6,N6-甲基腺嘌呤碱基的DNA。除上述含核糖基或脱氧核糖基的衍生物外,N6,N6-甲基腺嘌呤1号位取代衍生物的取代基R也可代表烃基、或带-OH、-NH2、-CHO和/或-COOH等功能性取代基团的烃基,其中,所述烃基可以是烷基、环烷基、烯基或炔基,优选为C1~C30的直链或支链烷基、C1~C30的直链或支链烯基或Cl~C30的直链或支链炔基,更优选C1~C10的直链或支链烷基、C1~C10的直链或支链烯基或C1~C10的直链或支链炔基。
所述取代基R例如但不仅限于:-CH3、-CH2CH3、-CH2OH、-CHO、-CH2CHO、-COOH、等。
式II所示产物中取代基R不受影响,其可选范围与原料相同。
上述方法中,所述光敏剂是指在经过光照射后会产生自由基,并通过自由基的传递进行氧化反应的自由基引发剂和光敏染料,根据反应原料性质和R取代基的不同而异。
本发明中对光敏剂的种类没有特殊要求,其可直接采用现有技术中常用的各种光敏剂。
所述光敏剂可以包括但不局限于下列:1-羟基环己基苯甲酮、N-乙烯基咔唑、二异丙基噻唑酮、二苯乙二酮、二苯乙醇酮、二苯甲酮、吩噻嗪、苯甲酰、蒽、1,2,4,5-四氰基苯、1,4-二氰基苯、10-(2-hydroxyethyl)benzo[g]pteridine-2,4-dione、2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌、2,4,6-三苯基吡喃鎓高氯酸盐、2,5-dioctyl-3,6-diphenyl-pyrrolo[3,4-c]pyrrole-1,4-dione、2,7-dipropy-1,2,3,6,7,8-hexahydrobenzo-[lmn][3,8]phenanthroline、4,4’-二(N,N-二甲氨基)二苯甲酮、5-ethyl-1,3-dimethyl-8-(trifluoromethyl)alloxazinium perchlorate、9,10-二氰基蒽、9-均三甲苯基-2,7,10-三甲基吖啶高氯酸盐、N,N’-Dihexyl-3,4,9,10-perylenedicarboximide、二苯甲酮、亚甲兰、四苯基卟啉、曙红、硫酸原黄素、维生素B2、罗丹明B、蒽醌、血卟啉二盐酸盐、酸性红94、三(2,2’-联吡啶)二氯化钌、安息香二甲醚等。
在本发明的一些具体示例中,可以使用直接市场购买的产品作为光敏剂。
上述方法中所述氧化剂是指在反应过程中通过电子的传递使反应得以进行的氧化物种,根据反应原料性质和R取代基的不同而异。
本发明中,对氧化剂的种类没有特殊要求,其可直接采用现有技术中常用的各种氧化剂。例如,所述氧化剂可以包括但不局限于下列:N-氟代双苯磺酰胺、N-氯代丁二酰亚胺、N-溴代丁二酰亚胺、N-碘代丁二酰亚胺、三氟化锰、三氟甲基三甲基硅烷、三氟甲磺酸N-吡啶鎓、二乙胺基三氟化硫、二水合铋酸钠、双三氟甲基磺酰亚胺、叔丁基过氧化氢、四丁基氟化铵、戴斯-马丁氧化剂、氧气、碘、碘苯二乙酸、过氧化氢、过硫酸钠、间氯过氧苯甲酸、Selectfluor、TEMPO等。
在本发明的一些具体示例中,可以使用直接市场购买的产品作为氧化剂。
上述方法中,所述溶剂可选自下列溶剂中的至少一种:水、甲醇、乙醇、异丙醇、正丁醇、丙酮、丁酮、四氢呋喃、二甲基亚砜、二甲基甲酰胺、乙腈等。
上述方法中,所述光敏剂的添加量为反应原料的1~40%(摩尔比),优选可为5~10%,具体可为10%;所述氧化剂的添加量为反应原料的1~100倍(摩尔比),优选可为2~10倍,具体可为2.2倍。
所述光照为波长200nm~700nm波段的光源照射,优选为305~620nm波段的光照,具体可为303nm波长紫外线照射、470nm波长蓝光照射、620nm波长红光照射或365nm波长紫外光照射。
所述反应的反应温度为室温至50℃,优选为37℃;反应时间为12~48小时,优选为24小时。
本发明的有益效果是:
1)针对过氧化氢等其他氧化手段在N6-甲基腺嘌呤的脱甲基化反应中效率较低、条件苛刻等问题,本发明提出了一种通过光反应对N6-甲基腺嘌呤进行化学转化的方法。该方法不仅可以高效地完成N6-甲基腺嘌呤的脱甲基化反应,而且还可以推广到RNA链上进行,为实现对全转录组基因序列的表观遗传学研究提供了支持。
2)本发明提供的光反应体系,只需要催化量的光敏剂,同时采用的光波长的选择范围较广,具有精确可控的调节优点,特别适合化学生物学中发展选择性的生物正交光学反应。
附图说明
图1为N6-甲基腺嘌呤核糖核苷、N6-甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基反应混合物以及腺嘌呤核糖核苷标准品的高效液相色谱图。
图2为N6-甲基腺嘌呤核糖核苷经过脱甲基反应得到的腺嘌呤核糖核苷及其标准品的核磁氢谱、碳谱。
具体实施方式
下面通过具体实施例对本发明进行说明,但本发明并不局限于此。
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法;下述实施例中所用的试剂、材料等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
实施例1
用维生素B2为光敏剂在470nm波长蓝光下和Selectfluor使N6-甲基腺嘌呤脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤(0.2mmol,29.8mg),Selectfluor(0.44mmol,155.8mg),维生素B2(0.02mmol,7.5mg),氮气保护下加入4毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,470nm波长蓝光下光照,搅拌3小时,加入适量碳酸氢钠至反应液pH为7,旋干液体,柱层析(n-BuOH/H2O/MeOH=4/1/1)分离得腺嘌呤19mg,产率为71%。1H NMR(DMSO-d6,300MHz)δ12.8(s,1H),8.1(d,J=5.4Hz,2H),7.1(s,2H)。
实施例2
用维生素B2为光敏剂在470nm波长蓝光下和Selectfluor使N6-甲基腺嘌呤脱氧核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤脱氧核糖核苷(0.1mmol,26.5mg),Selectfluor(0.22mmol,78mg),维生素B2(0.01mmol,3.8mg),氮气保护下加入2毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,470nm波长蓝光下光照,搅拌3小时,加入适量碳酸氢钠至反应液pH为7,旋干液体,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤脱氧核糖核苷15mg,产率为60%。1H NMR(DMSO-d6,300MHz)δ8.33(s,1H),8.13(s,1H),7.31(s,2H),6.36-6.31(m,1H),5.31(d,J=4.2Hz,1H),5.26-5.22(m,1H),4.42-4.38(m,1H),3.89-3.86(m,1H),3.65-3.60(m,1H),3.58-3.48(m,1H)。
实施例3
用1,4-二氰基苯为光敏剂在303nm波长紫外线下和Selectfluor使N6-甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤核糖核苷(0.1mmol,28.1mg),Selectfluor(0.22mmol,77.9mg),1,4-二氰基苯(0.01mmol,1.3mg),氮气保护下加入2毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,303nm波长紫外线下光照,搅拌8小时,加入适量碳酸氢钠至反应液pH为7,旋干反应液,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤核糖核苷25mg,产率为95%。1HNMR(DMSO-d6,500MHz)δ8.35(s,1H),8.14(s,1H),7.34(s,2H),5.88(d,J=6.0Hz,1H),5.46-5.41(m,2H),5.20(d,J=4.5Hz,1H),4.63-4.60(m,1H),4.16-4.14(m,1H),3.98-3.96(m,1H),3.69-3.65(m,1H),3.58-3.53(m,1H).13C NMR(DMSO-d6,125MHz)δ156.6,152.8,149.5,140.4,119.8,88.4,86.3,73.9,71.1,62.3.
实施例4
用硫酸原黄素为光敏剂在470nm波长蓝光下和Selectfluor使N6-甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤核糖核苷(0.1mmol,28.1mg),Selectfluor(0.22mmol,77.9mg),硫酸原黄素(0.01mmol,5.2mg),氮气保护下加入2毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,470nm波长蓝光下光照,搅拌10小时,加入适量碳酸氢钠至反应液pH为7,旋干液体,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤核糖核苷23mg,产率为86%。
实施例5
用[Ru(bpy)3]2Cl2为光敏剂在470nm波长蓝光下和Selectfluor使N6-甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤核糖核苷(0.1mmol,28.1mg),Selectfluor(0.22mmol,77.9mg),[Ru(bpy)3]2Cl2(0.01mmol,7.5mg),氮气保护下加入2毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,470nm波长蓝光下光照,搅拌10小时,加入适量碳酸氢钠至反应液pH为7,旋干液体,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤核糖核苷19mg,产率为71%。
实施例6
用亚甲基蓝为光敏剂在620nm波长红光下和Selectfluor使N6-甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤核糖核苷(0.1mmol,28.1mg),Selectfluor(0.22mmol,77.9mg),亚甲基蓝(0.01mmol,3.2mg),氮气保护下加入2毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,620nm波长红光下光照,搅拌22小时,加入适量碳酸氢钠至反应液pH为7,旋干液体,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤核糖核苷19mg,产率为71%。
实施例7
用1,2,4,5-四氰基苯为光敏剂在303nm波长紫外光下和Selectfluor使N6-甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤核糖核苷(0.1mmol,28.1mg),Selectfluor(0.22mmol,77.9mg),1,2,4,5-四氰基苯(0.01mmol,1.8mg),氮气保护下加入2毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,303nm波长紫外光下光照,搅拌5小时,加入适量碳酸氢钠至反应液pH为7,旋干液体,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤核糖核苷14mg,产率为52%。
实施例8
用1,2,4,5-四氰基苯为光敏剂在303nm波长紫外光下和过硫酸钠使N6-甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤核糖核苷(0.1mmol,28.1mg),过硫酸钠(0.22mmol,52.4mg),1,2,4,5-四氰基苯(0.01mmol,1.8mg),氮气保护下加入2毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,303nm波长紫外光下光照,搅拌16小时,旋干液体,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤核糖核苷16mg,产率为60%。
实施例9
用1,2,4,5-四氰基苯为光敏剂在303nm波长紫外光下和双三氟甲烷磺酰亚胺使N6-甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤核糖核苷(0.1mmol,28.1mg),双三氟甲烷磺酰亚胺(CF3SO2)2NH(0.22mmol,61.9mg),1,2,4,5-四氰基苯(0.01mmol,1.8mg),氮气保护下加入2毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,303nm波长紫外光下光照,搅拌17小时,旋干液体,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤核糖核苷17mg,产率为64%。
实施例10
用二苯甲酮为光敏剂在365nm波长紫外光下和Selectfluor使N6-甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤核糖核苷(0.1mmol,28.1mg),Selectfluor(0.22mmol,77.9mg),二苯甲酮(0.01mmol,1.8mg),氮气保护下加入2毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,365nm波长紫外光下光照,搅拌5小时,加入适量碳酸氢钠至反应液pH为7,旋干液体,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤核糖核苷26mg,产率为97%。
实施例11
用硫酸原黄素为光敏剂在470nm波长蓝光下和Selectfluor使N6-甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6-甲基腺嘌呤核糖核苷(0.1mmol,28.1mg),Selectfluor(0.22mmol,77.9mg),硫酸原黄素(0.01mmol,5.2mg),氮气保护下加入2毫升H2O,470nm波长蓝光下光照,搅拌12小时,加入适量碳酸氢钠至反应液pH为7,旋干液体,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤核糖核苷16mg,产率为60%。
实施例12
用维生素B2为光敏剂在470nm波长蓝光下和Selectfluor使N6,N’6-二甲基腺嘌呤核糖核苷脱甲基化:依次往反应管中加入N6,N’6-二甲基腺嘌呤核糖核苷(0.1mmol,29.5mg),Selectfluor(0.22mmol,78mg),维生素B2(0.01mmol,3.8mg),氮气保护下加入2毫升H2O/CH3CN(1/1)溶液,470nm波长蓝光下光照,搅拌7小时,加入适量碳酸氢钠至反应液pH为7,旋干液体,柱层析(CH2Cl2/MeOH=12/1)分离得腺嘌呤核糖核苷22mg,产率为78%。

Claims (7)

1.N6-甲基腺嘌呤及其衍生物的光化学脱甲基方法,包括如下步骤:
在溶剂存在下,在光照条件下使式I所示N6-甲基腺嘌呤或其衍生物与光敏剂和氧化剂反应,得到式II所示的脱甲基化产物,即实现脱甲基化;
上述式I中,R为H,R’为H时,式I所示化合物为N6-甲基腺嘌呤;
R为H,R’为甲基时,式I所示化合物为N6,N6-二甲基腺嘌呤;
R非H,R’为H时,式I所示化合物为N6-甲基腺嘌呤1号位氢原子取代衍生物;
R非H,R’为甲基时,式I所示化合物为N6,N6-甲基腺嘌呤1号位氢原子取代衍生物;
所述N6-甲基腺嘌呤1号位氢原子取代衍生物选自核苷或脱氧核苷、核苷酸或脱氧核苷酸、核糖核酸或脱氧核糖核酸中以糖苷键与N6-甲基腺嘌呤1号位键合的相关小分子化合物或聚合大分子化合物,分别构成N6-甲基腺嘌呤核糖核苷或N6-甲基腺嘌呤脱氧核糖核苷、N6-甲基腺嘌呤核糖核苷酸或N6-甲基腺嘌呤脱氧核糖核苷酸、含N6-甲基腺嘌呤碱基的RNA或含N6-甲基腺嘌呤碱基的DNA;
除上述含核糖基或脱氧核糖基的衍生物外,N6-甲基腺嘌呤1号位取代衍生物的取代基R也可代表烃基、或带-OH、-NH2、-CHO和/或-COOH功能性取代基团的烃基,其中,所述烃基为烷基、环烷基、烯基或炔基;
N6,N6-甲基腺嘌呤1号位氢原子取代衍生物选自核苷或脱氧核苷、核苷酸或脱氧核苷酸、核糖核酸或脱氧核糖核酸中以糖苷键与N6,N6-甲基腺嘌呤1号位键合的相关小分子化合物或聚合大分子化合物,分别构成N6,N6-甲基腺嘌呤核糖核苷或N6,N6-甲基腺嘌呤脱氧核糖核苷、N6,N6-甲基腺嘌呤核糖核苷酸或N6,N6-甲基腺嘌呤脱氧核糖核苷酸、含N6,N6-甲基腺嘌呤碱基的RNA或含N6,N6-甲基腺嘌呤碱基的DNA;
除上述含核糖基或脱氧核糖基的衍生物外,N6,N6-甲基腺嘌呤1号位取代衍生物的取代基R也可代表烃基、或带-OH、-NH2、-CHO和/或-COOH等功能性取代基团的烃基,其中,所述烃基为烷基、环烷基、烯基或炔基;
式II所示产物中取代基R不受影响,其可选范围与原料相同。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述光敏剂选自:1-羟基环己基苯甲酮、N-乙烯基咔唑、二异丙基噻唑酮、二苯乙二酮、二苯乙醇酮、二苯甲酮、吩噻嗪、苯甲酰、蒽、1,2,4,5-四氰基苯、1,4-二氰基苯、10-(2-hydroxyethyl)benzo[g]pteridine-2,4-dione、2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌、2,4,6-三苯基吡喃鎓高氯酸盐、2,5-dioctyl-3,6-diphenyl-pyrrolo[3,4-c]pyrrole-1,4-dione、2,7-dipropy-1,2,3,6,7,8-hexahydrobenzo-[lmn][3,8]phenanthroline、4,4’-二(N,N-二甲氨基)二苯甲酮、5-ethyl-1,3-dimethyl-8-(trifluoromethyl)alloxazinium perchlorate、9,10-二氰基蒽、9-均三甲苯基-2,7,10-三甲基吖啶高氯酸盐、N,N’-Dihexyl-3,4,9,10-perylenedicarboximide、二苯甲酮、亚甲兰、四苯基卟啉、曙红、硫酸原黄素、维生素B2、罗丹明B、蒽醌、血卟啉二盐酸盐、酸性红94、三(2,2’-联吡啶)二氯化钌和安息香二甲醚中的一种或多种。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:所述氧化剂选自:N-氟代双苯磺酰胺、N-氯代丁二酰亚胺、N-溴代丁二酰亚胺、N-碘代丁二酰亚胺、三氟化锰、三氟甲基三甲基硅烷、三氟甲磺酸N-吡啶鎓、二乙胺基三氟化硫、二水合铋酸钠、双三氟甲基磺酰亚胺、叔丁基过氧化氢、四丁基氟化铵、戴斯-马丁氧化剂、氧气、碘、碘苯二乙酸、过氧化氢、过硫酸钠、间氯过氧苯甲酸、Selectfluor和TEMPO中的一种或多种。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其特征在于:所述溶剂选自下列溶剂中的至少一种:水、甲醇、乙醇、异丙醇、正丁醇、丙酮、丁酮、四氢呋喃、二甲基亚砜、二甲基甲酰胺和乙腈。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法,其特征在于:按摩尔比计,所述光敏剂的添加量为反应原料的1~40%;所述氧化剂的添加量为反应原料的1~100倍。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法,其特征在于:所述光照为波长200nm~700nm波段的光源照射。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法,其特征在于:所述反应的反应温度为室温至50℃,优选为37℃;反应时间为12~48小时,优选为24小时。
CN201710320303.5A 2017-05-09 2017-05-09 N6-甲基腺嘌呤的光化学脱甲基方法 Expired - Fee Related CN106967068B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201710320303.5A CN106967068B (zh) 2017-05-09 2017-05-09 N6-甲基腺嘌呤的光化学脱甲基方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201710320303.5A CN106967068B (zh) 2017-05-09 2017-05-09 N6-甲基腺嘌呤的光化学脱甲基方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN106967068A true CN106967068A (zh) 2017-07-21
CN106967068B CN106967068B (zh) 2019-01-11

Family

ID=59331524

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201710320303.5A Expired - Fee Related CN106967068B (zh) 2017-05-09 2017-05-09 N6-甲基腺嘌呤的光化学脱甲基方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN106967068B (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110106231A (zh) * 2019-04-22 2019-08-09 武汉大学 一种利用dUTP或dTTP检测核酸中腺嘌呤N6或N1位发生甲基化修饰的方法

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101896487A (zh) * 2007-12-17 2010-11-24 马林克罗特公司 N-甲基吗啡喃的n-脱甲基化
CN104262434A (zh) * 2014-10-28 2015-01-07 武汉大学 Rna中n6-甲基腺苷的化学脱甲基方法
WO2017040477A1 (en) * 2015-08-31 2017-03-09 The University Of Chicago Composition and methods for detecting adenosine modifications

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101896487A (zh) * 2007-12-17 2010-11-24 马林克罗特公司 N-甲基吗啡喃的n-脱甲基化
CN104262434A (zh) * 2014-10-28 2015-01-07 武汉大学 Rna中n6-甲基腺苷的化学脱甲基方法
WO2017040477A1 (en) * 2015-08-31 2017-03-09 The University Of Chicago Composition and methods for detecting adenosine modifications

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110106231A (zh) * 2019-04-22 2019-08-09 武汉大学 一种利用dUTP或dTTP检测核酸中腺嘌呤N6或N1位发生甲基化修饰的方法
CN110106231B (zh) * 2019-04-22 2021-08-17 武汉大学 一种利用dUTP或dTTP检测核酸中腺嘌呤N6或N1位发生甲基化修饰的方法

Also Published As

Publication number Publication date
CN106967068B (zh) 2019-01-11

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR101404374B1 (ko) 핵산의 복제방법 및 신규한 인공 염기쌍
Shen et al. Continuous flow photocatalysis enhanced using an aluminum mirror: rapid and selective synthesis of 2′-deoxy and 2′, 3′-dideoxynucleosides
US4826967A (en) Psoralen-nucleoside adducts and method for their preparation
Onizuka et al. Pin-point chemical modification of RNA with diverse molecules through the functionality transfer reaction and the copper-catalyzed azide–alkyne cycloaddition reaction
CN110845428A (zh) 一种3-酰基喹喔啉酮化合物的光催化制备方法
Sato et al. p-Quinobis (benzo-1, 3-dithiole)
Richel et al. Microwave-assisted synthesis of D-glucuronic acid derivatives using cost-effective solid acid catalysts
CN106967068B (zh) N6-甲基腺嘌呤的光化学脱甲基方法
Wang et al. To seek an approach toward the chemical conversion of C19-diterpenoid alkaloids to taxoids
Chambers et al. An approach to the synthesis of α-(1-6)-C-disaccharides by tandem Tebbe methylenation and Claisen rearrangement
Nemoto et al. A three-step preparation of MAC reagents from malononitrile
Sato et al. Efficient synthesis of analogs of safflower yellow B, carthamin, and its precursor: two yellow and one red dimeric pigments in safflower petals
CN111334070B (zh) 一类532nm激发的罗丹明类荧光染料及其制备方法
Wada et al. First asymmetric photochemistry with nucleosides and DNA: enantiodifferentiating Z–E photoisomerization of cyclooctene
CN110655506B (zh) 一种替加氟的制备方法
CN115093372B (zh) 一种咪唑衍生物的合成方法
Pasternak et al. Photoligation of self-assembled DNA constructs containing anthracene-functionalized 2′-amino-LNA monomers
da Silva et al. Synthesis and antitumor evaluation of hybrids of 5, 8-dioxo-5, 8-dihydroisoquinoline-4-carboxylates and carbohydrates
CN108715875A (zh) 酶化学法合成结构明确的硫酸肝素寡糖的方法
JPH10505353A (ja) オリゴヌクレオチド複合体、構成成分及びリボ核酸の分解方法
CN105985290B (zh) 一种醚类化合物与异喹啉类衍生物交叉偶联的方法
EP3788116B1 (en) Chemiluminescent imidazopyrazinone-based photosensitizers with available singlet and triplet excited states
Malinowska et al. Design and application of mini‐libraries of miRNA probes for an efficient and versatile miRNA‐mRNA cross‐linking
Scribner et al. Deamination of 1-methylcytosine by the carcinogen N-acetoxy-4-acetamidostilbene: implications for hydrocarbon carcinogenesis
Huang et al. Total Synthesis of Complex Peptidyl Nucleoside Antibiotics: Asymmetric De Novo Syntheses of Miharamycin B and Its Biosynthetic Precursor

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20190111

CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee