CN106754505A - 高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法 - Google Patents

高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法 Download PDF

Info

Publication number
CN106754505A
CN106754505A CN201611183770.XA CN201611183770A CN106754505A CN 106754505 A CN106754505 A CN 106754505A CN 201611183770 A CN201611183770 A CN 201611183770A CN 106754505 A CN106754505 A CN 106754505A
Authority
CN
China
Prior art keywords
glms
bacillus subtilis
gene
high yield
acetylglucosamine
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201611183770.XA
Other languages
English (en)
Inventor
刘龙
陈坚
堵国成
李江华
牛腾飞
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Jiangnan University
Original Assignee
Jiangnan University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Jiangnan University filed Critical Jiangnan University
Priority to CN201611183770.XA priority Critical patent/CN106754505A/zh
Priority to US15/390,490 priority patent/US10093936B2/en
Publication of CN106754505A publication Critical patent/CN106754505A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/74Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
    • C12N15/75Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora for Bacillus
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102Mutagenizing nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1025Acyltransferases (2.3)
    • C12N9/1029Acyltransferases (2.3) transferring groups other than amino-acyl groups (2.3.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/26Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/12Type of nucleic acid catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00Nucleic acids vectors
    • C12N2800/10Plasmid DNA
    • C12N2800/101Plasmid DNA for bacteria

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)

Abstract

本发明涉及一种高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌,通过敲除枯草芽孢杆菌中调控氨基葡萄糖合成酶表达的glmS核酶,并插入终止子和启动子序列而得到。本发明还公开了一种高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌的构建方法,包括以下步骤:构建glmS核酶编码基因敲除框,所述敲除框依次包括glmS核酶编码基因上游同源臂、终止子、抗性基因、组成型启动子和glmS核酶编码基因下游同源臂序列;将得到的glmS核酶编码基因敲除框转化枯草芽孢杆菌,得到重组枯草芽孢杆菌。通过同源重组敲除氨基葡萄糖合成酶基因(glmS)核酶,阻断了宿主菌胞内6‑磷酸氨基葡萄糖反馈抑制氨基葡萄糖合成酶基因(glmS)的表达,促进乙酰氨基葡萄糖积累。

Description

高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法
技术领域
本发明涉及遗传工程领域,尤其涉及一种高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法。
背景技术
乙酰氨基葡萄糖是生物体内的一种单糖,广泛存在于细菌、酵母、霉菌、植物以及动物体内。在人体中,乙酰氨基葡萄糖是糖胺聚糖二糖单元的合成前体,其对修复和维持软骨及关节组织功能具有重要作用。
枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)是一种被广泛用作食品酶制剂及重要营养化学品的生产宿主,其产品被FDA认证为“generally regarded as safe”(GRAS)安全级别。因此,运用代谢工程手段构建重组枯草芽孢杆菌是生产食品安全级乙酰氨基葡萄糖的有效途径。现有公开技术中(Metab.Eng.2014,23:42-52),构建的重组枯草芽孢杆菌(BSGN6-PxylA-glmS-P43-GNA1)在基本培养基中生长缓慢,并且乙酰氨基葡萄糖产量相比于在复合培养基中显著降低。
已有研究表明,6-磷酸果糖在GlmS的催化作用下生成6-磷酸氨基葡萄糖(GlcN6P)的过程受到由glmS核酶开关介导的严格反馈控制,该步是GlcNAc合成途径中的重要限速反应,具体调控过程如下:当胞内GlcN6P积累时,其能够与glmS核酶开关结合,激活核酶开关对glmS基因转录产物进行自切割;3’端mRNA切割部分因切割形成的5’-OH端被RNA酶J1特异性识别,在RNA酶J1作用下mRNA被进一步降解,造成glmS基因的mRNA无法翻译,降低glmS基因的表达;而当GlcN6P浓度较低时,glmS基因转录产物可正常翻译。因此,要想过量合成GlcNAc,必须解除glmS核酶对GlcNAc合成关键酶glmS在转录水平的抑制调控。
发明内容
为解决上述技术问题,本发明的目的是提供一种高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法,通过同源重组敲除氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶,阻断了宿主菌胞内6-磷酸氨基葡萄糖反馈抑制氨基葡萄糖合成酶基因glmS的表达,促进乙酰氨基葡萄糖积累。
为解决上述技术问题,本发明采用以下技术方案:
在一方面,本发明提供了一种高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌,通过敲除枯草芽孢杆菌中调控氨基葡萄糖合成酶表达的glmS核酶,并插入终止子和组成型启动子序列而得到。
进一步地,枯草芽孢杆菌为BSGN6-PxylA-glmS-P43-GNA1,是通过以B.subtilis 168ΔnagPΔgamPΔgamAΔnagAΔnagBΔldhΔpta::lox72为宿主,分别以启动子PxylA、P43控制glmS、GNA1的重组表达得到。其构建方法可参阅文献“Modular pathway engineering ofBacillus subtilis for improved N-acetylglucosamine production(MetabolicEngineering,23(2014)p42-52)”,在此不作进一步描述。
进一步地,glmS核酶的编码基因如NCBI-Gene ID:8302932所示。
进一步地,终止子为trp终止子、ybc终止子或T7终止子。
进一步地,组成型启动子为P43启动子、PsrfA启动子或PaprE启动子。
在另一方面,本发明还提供了一种高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌的构建方法,包括以下步骤:
(1)构建glmS核酶编码基因敲除框,所述敲除框依次包括glmS核酶编码基因上游同源臂、终止子、抗性基因、组成型启动子和glmS核酶编码基因下游同源臂序列;
(2)将步骤(1)得到的glmS核酶编码基因敲除框转化枯草芽孢杆菌,通过筛选、PCR验证并筛选出抗性消除菌株后得到重组枯草芽孢杆菌。
进一步地,在步骤(1)中,glmS核酶编码基因敲除框中还包括glmS核酶的编码基因的上、下游同源臂引物序列。
进一步地,在步骤(1)中,抗性基因为壮观霉素抗性基因spc、博来霉素抗性基因zeo、卡那霉素抗性基因kan或氨苄青霉素抗性基因amp。
进一步地,在步骤(1)中,终止子为trp终止子、ybc终止子或T7终止子。
进一步地,在步骤(1)中,glmS核酶的编码基因如NCBI-Gene ID:8302932所示。
进一步地,在步骤(1)中,组成型启动子为P43启动子、PsrfA启动子或PaprE启动子。
进一步地,在步骤(2)中,枯草芽孢杆菌为BSGN6-PxylA-glmS-P43-GNA1(以下实施例中简称为BSGN),是通过以B.subtilis 168ΔnagPΔgamPΔgamAΔnagAΔnagBΔldhΔpta::lox72为宿主,分别以启动子PxylA、P43控制glmS、GNA1的重组表达得到。其构建方法可参阅文献“Modular pathway engineering of Bacillus subtilis for improved N-acetylglucosamine production(Metabolic Engineering,23(2014)p42-52)”,在此不作进一步描述。
进一步地,本发明的重组枯草芽孢杆菌在发酵生产乙酰氨基葡萄糖中的应用。
进一步地,发酵使用的发酵培养基包括以下成分:葡萄糖、Na2HPO4、KH2PO4、(NH4)2SO4、MgSO4、FeSO4·7H2O、MnSO4·4H2O、胸腺嘧啶以及色氨酸。
在一具体实施例中,发酵培养基以其重量为基准,包括以下成分:葡萄糖2.0g/L、Na2HPO4 7.1g/L、KH2PO4 1.35g/L、(NH4)2SO4 2g/L、MgSO4 0.25g/L、FeSO4·7H2O 1.0g/L、MnSO4·4H2O 0.1g/L、胸腺嘧啶0.01g/L以及色氨酸0.01g/L。
借由上述方案,本发明至少具有以下优点:
本发明是以枯草芽孢杆菌(BSGN6-PxylA-glmS-P43-GNA1)作为出发菌株,通过同源重组敲除氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶,阻断了宿主菌胞内6-磷酸氨基葡萄糖反馈抑制氨基葡萄糖合成酶基因glmS的表达,促进乙酰氨基葡萄糖积累;本发明提供的重组枯草芽孢杆菌可提高使用基本培养基时乙酰氨基葡萄糖的产量,其比生长速率和乙酰氨基葡萄糖的产量能够分别达到0.84h-1和321.3mg/L,分别是敲除前菌株的2.09倍和2.57倍,为进一步代谢工程改造枯草芽孢杆菌生产氨基葡萄糖奠定了基础;本发明提供的重组枯草芽孢杆菌构建方法简单,便于使用,具有很好地应用前景。
说明书附图
图1图示了本发明敲除了glmS核酶对细胞生长和乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)产生的影响结果。
具体实施方式
下面结合实施例,对本发明的具体实施方式作进一步详细描述。以下实施例用于说明本发明,但不用来限制本发明的范围。
实施例1
根据NCBI上公布的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis 168,购自美国典型微生物保藏中心,ATCC No.27370)氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶编码基因上下游序列,设计敲除框扩增引物:
扩增上游同源臂引物为GlmS-F TCTGCTATTATGCTGATGAACAC,如SEQ ID No.1所示;GlmS-1R GGAATACTCAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGCCTTTTTCCGGGCGCTTAGTT,如SEQ IDNo.2所示。
扩增筛选标记表达盒引物为GlmS-2F GGAAAAAGGCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTTGAGTATTCCAAACTGGACACATGG,如SEQ ID No.3所示;GlmS-2R ATCAAACTAAGCGCCCGGAAAAAGGCAGCCCGCCAGTGTTTCCACCATTTTTTCAATTT,如SEQ ID No.4所示。
扩增P43启动子引物为GlmS-3F GAAACACTGGCGGGCTGCCTTTTTCCGGGCGCTTAGTTTGATAGGTGGTATGTTTTCGC,如SEQ ID No.5所示;GlmS-3RCGTCCCCTCCTACATGTTTTTATAATGGTACCGCTATCAC,如SEQ ID No.6所示。
扩增下游同源臂引物为GlmS-4F GTGATAGCGGTACCATTATAAAAACATGTAGGAGGGGACG,如SEQ ID No.7所示;GlmS-R TTCTGTCTCAAGTCCTCCATTGACG,如SEQ ID No.8所示。
运用上述引物从枯草芽孢杆菌基因组中扩增上游同源臂、P43启动子和下游同源臂,并从载体PDGREF中扩增含有壮观霉素抗性基因的筛选标记表达盒。其中,引物GlmS-2F中插入trp终止子序列(AGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTT),如SEQ ID No.27所示。再利用融合PCR技术将上游同源臂、筛选标记、P43启动子、下游同源臂序列进行融合,得到氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶编码基因敲除框。利用引物GlmS-F/GlmS-R扩增敲除框,将得到的敲除框转化枯草芽孢杆菌BSGN,该枯草芽孢杆菌是通过以B.subtilis 168ΔnagPΔgamPΔgamAΔnagAΔnagBΔldhΔpta::lox72为宿主,分别以启动子PxylA、P43控制glmS、GNA1的重组表达得到。利用PCR验证筛选并确定正确转化子,再进行诱导表达mazF,筛选出抗性消除菌株,确认氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶编码基因敲除成功,得到重组枯草芽孢杆菌BSGNR。
本实施例中,扩增条件如下:
98℃,预变性3min;(98℃,变性10s,55℃,退火5s;68℃,延伸1.2min)*34个循环;68℃,延伸5min。
实施例2
根据NCBI上公布的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis 168,购自美国典型微生物保藏中心,ATCC No.27370)氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶编码基因上下游序列,设计敲除框扩增引物:
扩增上游同源臂引物为GlmS-F TCTGCTATTATGCTGATGAACAC,如SEQ ID No.1所示;GlmS-1R GGAATACTCAAAAAACCCCTCAAGACCCGTTTAGAGGCCCCAAGGGGTTATGCTAGCCTTTTTCCGGGCGCTTAGTT,如SEQ ID No.9所示。
扩增筛选标记表达盒引物为GlmS-2F GGAAAAAGGCTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAAC GGGTCTTGAGGGGTTTTTTGAGTATTCCAAACTGGACACATGG,如SEQ ID No.10所示;GlmS-2RATCAAACTAAGCGCCCGGAAAAAGGCAGCCCGCCAGTGTTTCCACCATTTTTTCAATTT,如SEQ ID No.11所示。
扩增P43片段引物为GlmS-3F GAAACACTGGCGGGCTGCCTTTTTCCGGGCGCTTAGTTTGATAGGTGGTATGTTTTCGC,如SEQ ID No.12所示;GlmS-3R CGTCCCCTCCTACATGTTTTTATAATGGTACCGCTATCAC,如SEQ ID No.13所示。
扩增下游同源臂引物GlmS-4F GTGATAGCGGTACCATTATAAAAACATGTAGGAGGGGACG,如SEQ ID No.14所示;GlmS-R TTCTGTCTCAAGTCCTCCATTGACG,如SEQ ID No.8所示。
运用上述引物从枯草芽孢杆菌基因组中扩增上游同源臂、P43启动子和下游同源臂,并从载体PDGREF中扩增含有壮观霉素抗性基因的筛选标记表达盒。其中,引物GlmS-2F(SEQ ID No.10)中插入T7终止子序列(TAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTT),如SEQ ID No.28所示。再利用融合PCR技术将上游同源臂、筛选标记、P43启动子、下游同源臂序列进行融合,得到氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶编码基因敲除框。利用引物GlmS-F/GlmS-R扩增敲除框,将得到的敲除框转化枯草芽孢杆菌BSGN,利用PCR验证筛选并确定正确转化子,再进行诱导表达mazF,筛选出抗性消除菌株,即得glmS核酶敲除菌株。
本实施例中,扩增条件如下:
98℃,预变性3min;(98℃,变性10s,55℃,退火5s;68℃,延伸1.2min)*34个循环;68℃,延伸5min。
实施例3
根据NCBI上公布的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis 168,购自美国典型微生物保藏中心,ATCC No.27370)氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶编码基因上下游序列,设计敲除框扩增引物:
扩增上游同源臂引物为GlmS-F TCTGCTATTATGCTGATGAACAC,如SEQ ID No.1所示;GlmS-1R GGAATACTCAAAAAAAACACCCGCTTGTATAACGAGCGGATGGCCTTTTTCCGGGCGCTTAGTT,如SEQ ID No.15所示。
扩增筛选标记表达盒引物为GlmS-2F GGAAAAAGGCCATCCGCTCGTTATACAAGCGGGTGTT TTTTTTGAGTATTCCAAACTGGACACATGG,如SEQ ID No.16所示;GlmS-2RTGACTATGTGTACCGCGCAAAAACCAGTGTTTCCACCATTTTTTCAATTT,如SEQ ID No.17所示。
扩增PsrfA启动子片段引物为Psrf-F AAATTGAAAAAATGGTGGAAACACTGGTTTTTGCGCGGTACACATAGTCA,如SEQ ID No.18所示;Psrf-R CGTCCCCTCCTACATGTTTTCCCCTAATCTTTATAAGCAGTGAAC,如SEQ ID No.19所示。
扩增下游同源臂引物GlmS-4F GTTCACTGCTTATAAAGATTAGGGGAAAACATGTAGGAGGGGACG,如SEQ ID No.20所示;GlmS-R TTCTGTCTCAAGTCCTCCATTGACG,如SEQ ID No.8所示。
运用上述引物从枯草芽孢杆菌基因组中扩增上游同源臂、PsrfA启动子和下游同源臂,并从载体PDGREF中扩增含有壮观霉素抗性基因的筛选标记表达盒。其中,引物GlmS-2F(SEQ ID No.16)中插入ybc终止子序列(CATCCGCTCGTTATACAAGCGGGTGTTTTTTTT),如SEQID No.29所示。再利用融合PCR技术将上游同源臂、筛选标记、PsrfA启动子、下游同源臂序列进行融合,得到氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶编码基因敲除框。利用引物GlmS-F/GlmS-R扩增敲除框,将得到的敲除框转化枯草芽孢杆菌BSGN,利用PCR验证筛选并确定正确转化子,再进行诱导表达mazF,筛选出抗性消除菌株,即得glmS核酶敲除菌株。
本实施例中,扩增条件如下:
98℃,预变性3min;(98℃,变性10s,55℃,退火5s;68℃,延伸1.2min)*34个循环;68℃,延伸5min。
实施例4
根据NCBI上公布的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis 168,购自美国典型微生物保藏中心,ATCC No.27370)氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶编码基因上下游序列,设计敲除框扩增引物:
扩增上游同源臂引物为GlmS-F TCTGCTATTATGCTGATGAACAC,如SEQ ID No.1所示;GlmS-1R GGAATACTCAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGCCTTTTTCCGGGCGCTTAGTT,如SEQ IDNo.21所示。
扩增筛选标记表达盒引物为GlmS-2F GGAAAAAGGCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTTGAGATTCTACCGTTCGTATAGC,如SEQ ID No.22所示;GlmS-2R GCGAAAACATACCACCTATCACTACCGTTCGTATAATGTATGC,如SEQ ID No.23所示。
扩增P43启动子引物为GlmS-3F GCATACATTATACGAACGGTAGTGATAGGTGGTATGTTTTCGC,如SEQ ID No.24所示;GlmS-3R CGTCCCCTCCTACATGTTTTTATAATGGTACCGCTATCAC,如SEQID No.25所示。
扩增下游同源臂引物为GlmS-4F GTGATAGCGGTACCATTATAAAAACATGTAGGAGGGGACG,如SEQ ID No.26所示;GlmS-R TTCTGTCTCAAGTCCTCCATTGACG,如SEQ ID No.8所示。
运用上述引物从枯草芽孢杆菌基因组中扩增上游同源臂、P43启动子和下游同源臂,并从载体P7Z6中扩增含博来霉素抗性基因的筛选标记表达盒。其中,引物GlmS-2F(SEQID No.22)中插入trp终止子序列(AGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTT),如SEQ ID No.27所示。再利用融合PCR技术将上游同源臂、筛选标记、P43启动子、下游同源臂序列进行融合,得到氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶编码基因敲除框。利用引物GlmS-F/GlmS-R扩增敲除框,将得到的敲除框转化枯草芽孢杆菌BSGN,利用PCR验证筛选并确定正确转化子,再进行诱导表达mazF,筛选出抗性消除菌株,即得glmS核酶敲除菌株。
本实施例中,扩增条件如下:
98℃,预变性3min;(98℃,变性10s,55℃,退火5s;68℃,延伸1.2min)*34个循环;68℃,延伸5min。
以上实施例使用的出发菌株BSGN,其构建方法可参阅文献“Modular pathwayengineering of Bacillus subtilis for improved N-acetylglucosamine production(Metabolic Engineering,23(2014)p42-52)”,在此不作进一步描述。
实施例5
在37℃、200rpm下,培养实施例1构建的重组枯草芽孢杆菌BSGNR 12h,所使用的种子培养基包括以下重量的各组分:胰蛋白胨10g/L,酵母粉5g/L,NaCl 10g/L。然后以5%的接种量转入发酵培养基,于37℃、200rpm条件下发酵30h。发酵培养基以其重量为基准,包括以下成分:葡萄糖2.0g/L、Na2HPO4 7.1g/L、KH2PO4 1.35g/L、(NH4)2SO4 2g/L、MgSO4 0.25g/L、FeSO4·7H2O 1.0g/L、MnSO4·4H2O 0.1g/L、胸腺嘧啶0.01g/L以及色氨酸0.01g/L。测定发酵上清液中乙酰氨基葡萄糖的含量,乙酰氨基葡萄糖的测定方法如下:
高效液相色谱(HPLC)检测法:Agilent 1200,RID检测器,NH2柱(250×4.6mm,5μm),流动相:70%乙腈,流速0.75mL/min,柱温30℃,进样体积为10μL。
图1图示了本发明敲除了glmS核酶对细胞生长和GlcNAc产生的影响结果。其中图1a为以葡萄糖作为单一碳源的基本培养基中,对比菌株BSGN和本发明的glmS核酶敲除菌株BSGNR的细胞生长的比较结果,图1b为以葡萄糖作为单一碳源的基本培养基中,在摇瓶发酵系统中对比菌株BSGN和本发明的glmS核酶敲除菌株BSGNR的GlcNAc滴度的比较结果,图1c为以葡萄糖作为单一碳源的基本培养基中,摇瓶发酵系统中BSGN和BSGNR的特异性细胞生长速率和GlcNAc生产力的比较。从图中可以看出,本发明重组枯草芽孢杆菌BSGNR的比生长速率达到0.84h-1,其发酵上清液中乙酰氨基葡萄糖含量达到321.3mg/L,分别是敲除前菌株的2.09倍和2.57倍。BSGNR的乙酰氨基葡萄糖产率为10.04mg/L/h,说明本发明通过敲除氨基葡萄糖合成酶基因glmS核酶编码基因,实现了乙酰氨基葡萄糖在重组枯草芽孢杆菌胞外产量的提高。
以上所述仅是本发明的优选实施方式,并不用于限制本发明,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明技术原理的前提下,还可以做出若干改进和变型,这些改进和变型也应视为本发明的保护范围。
序列表
<110> 江南大学
<120> 高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法
<160> 29
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 23
<212> DNA
<213> 上游同源臂引物 GlmS-F
<400> 1
TCTGCTATTA TGCTGATGAA CAC 23
<210> 2
<211> 57
<212> DNA
<213> 上游同源臂引物 GlmS-1R
<400> 2
GGAATACTCA AAAAAGCCCG CTCATTAGGC GGGCTGCCTT TTTCCGGGCG CTTAGTT 57
<210> 3
<211> 57
<212> DNA
<213> 筛选标记表达盒引物GlmS-2F
<400> 3
GGAATACTCA AAAAAGCCCG CTCATTAGGC GGGCTGCCTT TTTCCGGGCG CTTAGTT 57
<210> 4
<211> 59
<212> DNA
<213> 筛选标记表达盒引物GlmS-2R
<400> 4
ATCAAACTAA GCGCCCGGAA AAAGGCAGCC CGCCAGTGTT TCCACCATTT TTTCAATTT 59
<210> 5
<211> 59
<212> DNA
<213> P43启动子引物GlmS-3F
<400> 5
GAAACACTGG CGGGCTGCCT TTTTCCGGGC GCTTAGTTTG ATAGGTGGTA TGTTTTCGC 59
<210> 6
<211> 40
<212> DNA
<213> P43启动子引物GlmS-3R
<400> 6
CGTCCCCTCC TACATGTTTT TATAATGGTA CCGCTATCAC 40
<210> 7
<211> 40
<212> DNA
<213> 下游同源臂引物GlmS-4F
<400> 7
GTGATAGCGG TACCATTATA AAAACATGTA GGAGGGGACG 40
<210> 8
<211> 25
<212> DNA
<213> 下游同源臂引物GlmS-R
<400> 8
TTCTGTCTCA AGTCCTCCAT TGACG 25
<210> 9
<211> 77
<212> DNA
<213> 上游同源臂引物GlmS-1R
<400> 9
GGAATACTCA AAAAACCCCT CAAGACCCGT TTAGAGGCCC CAAGGGGTTA TGCTAGCCTT 60
TTTCCGGGCG CTTAGTT 77
<210> 10
<211> 80
<212> DNA
<213> 筛选标记表达盒引物GlmS-2F
<400> 10
GGAAAAAGGC TAGCATAACC CCTTGGGGCC TCTAAACGGG TCTTGAGGGG TTTTTTGAGT 60
ATTCCAAACT GGACACATGG 80
<210> 11
<211> 59
<212> DNA
<213> 筛选标记表达盒引物GlmS-2R
<400> 11
ATCAAACTAA GCGCCCGGAA AAAGGCAGCC CGCCAGTGTT TCCACCATTT TTTCAATTT 59
<210> 12
<211> 59
<212> DNA
<213> P43片段引物GlmS-3F
<400> 12
GAAACACTGG CGGGCTGCCT TTTTCCGGGC GCTTAGTTTG ATAGGTGGTA TGTTTTCGC 59
<210> 13
<211> 40
<212> DNA
<213> P43片段引物为GlmS-3R
<400> 13
CGTCCCCTCC TACATGTTTT TATAATGGTA CCGCTATCAC 40
<210> 14
<211> 40
<212> DNA
<213> 下游同源臂引物GlmS-4F
<400> 14
GTGATAGCGG TACCATTATA AAAACATGTA GGAGGGGACG 40
<210> 15
<211> 64
<212> DNA
<213> 上游同源臂引物GlmS-1R
<400> 15
GGAATACTCA AAAAAAACAC CCGCTTGTAT AACGAGCGGA TGGCCTTTTT CCGGGCGCTT 60
AGTT 64
<210> 16
<211> 67
<212> DNA
<213> 筛选标记表达盒引物GlmS-2F
<400> 16
GGAAAAAGGC CATCCGCTCG TTATACAAGC GGGTGTTTTT TTTGAGTATT CCAAACTGGA 60
CACATGG 67
<210> 17
<211> 50
<212> DNA
<213> 筛选标记表达盒引物GlmS-2R
<400> 17
TGACTATGTG TACCGCGCAA AAACCAGTGT TTCCACCATT TTTTCAATTT 50
<210> 18
<211> 50
<212> DNA
<213> PsrfA启动子片段引物Psrf-F
<400> 18
AAATTGAAAA AATGGTGGAA ACACTGGTTT TTGCGCGGTA CACATAGTCA 50
<210> 19
<211> 45
<212> DNA
<213> PsrfA启动子片段引物Psrf-R
<400> 19
CGTCCCCTCC TACATGTTTT CCCCTAATCT TTATAAGCAG TGAAC 45
<210> 20
<211> 45
<212> DNA
<213> 下游同源臂引物GlmS-4F
<400> 20
GTTCACTGCT TATAAAGATT AGGGGAAAAC ATGTAGGAGG GGACG 45
<210> 21
<211> 57
<212> DNA
<213> 上游同源臂引物GlmS-1R
<400> 21
GGAATACTCA AAAAAGCCCG CTCATTAGGC GGGCTGCCTT TTTCCGGGCG CTTAGTT 57
<210> 22
<211> 58
<212> DNA
<213> 筛选标记表达盒引物GlmS-2F
<400> 22
GGAAAAAGGC AGCCCGCCTA ATGAGCGGGC TTTTTTGAGA TTCTACCGTT CGTATAGC 58
<210> 23
<211> 43
<212> DNA
<213> 筛选标记表达盒引物GlmS-2R
<400> 23
GCGAAAACAT ACCACCTATC ACTACCGTTC GTATAATGTA TGC 43
<210> 24
<211> 43
<212> DNA
<213> P43启动子引物GlmS-3F
<400> 24
GCATACATTA TACGAACGGT AGTGATAGGT GGTATGTTTT CGC 43
<210> 25
<211> 40
<212> DNA
<213> P43启动子引物GlmS-3R
<400> 25
CGTCCCCTCC TACATGTTTT TATAATGGTA CCGCTATCAC 40
<210> 26
<211> 40
<212> DNA
<213> 下游同源臂引物GlmS-4F
<400> 26
GTGATAGCGG TACCATTATA AAAACATGTA GGAGGGGACG 40
<210> 27
<211> 26
<212> DNA
<213> trp终止子
<400> 27
AGCCCGCCTA ATGAGCGGGC TTTTTT 26
<210> 28
<211> 46
<212> DNA
<213> T7终止子
<400> 28
TAGCATAACC CCTTGGGGCC TCTAAACGGG TCTTGAGGGG TTTTTT 46
<210> 29
<211> 33
<212> DNA
<213> ybc终止子
<400> 29
CATCCGCTCG TTATACAAGC GGGTGTTTTT TTT 33

Claims (11)

1.一种高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌,其特征在于:通过敲除枯草芽孢杆菌中调控氨基葡萄糖合成酶表达的glmS核酶,并插入终止子和组成型启动子序列而得到。
2.根据权利要求1所述的高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌,其特征在于:所述枯草芽孢杆菌通过以B.subtilis 168Δ nagPΔ gamPΔ gamAΔ nagAΔ nagBΔ ldhΔpta::lox72为宿主,分别以启动子PxylA、P43控制glmS、GNA1的重组表达得到。
3.根据权利要求1或2所述的高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌,其特征在于:所述glmS核酶的编码基因如NCBI-Gene ID:8302932所示。
4.根据权利要求1或2所述的高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌,其特征在于:所述终止子为trp终止子、ybc终止子或T7终止子。
5.根据权利要求1或2所述的高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌,其特征在于:所述组成型启动子为P43启动子、PsrfA启动子或PaprE启动子。
6.一种高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)构建glmS核酶编码基因敲除框,所述敲除框依次包括glmS核酶编码基因上游同源臂、终止子、抗性基因、组成型启动子和glmS核酶编码基因下游同源臂序列;
(2)将步骤(1)得到的所述glmS核酶编码基因敲除框转化枯草芽孢杆菌,得到重组枯草芽孢杆菌。
7.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于:在步骤(1)中,所述抗性基因为壮观霉素抗性基因spc、博来霉素抗性基因zeo、卡那霉素抗性基因kan或氨苄青霉素抗性基因amp。
8.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于:在步骤(1)中,所述终止子为trp终止子、ybc终止子或T7终止子。
9.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于:在步骤(1)中,所述glmS核酶的编码基因如NCBI-Gene ID:8302932所示。
10.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于:在步骤(1)中,所述组成型启动子为P43启动子、PsrfA启动子或PaprE启动子。
11.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于:在步骤(2)中,所述枯草芽孢杆菌通过以B.subtilis 168Δ nagPΔ gamPΔ gamAΔ nagAΔ nagBΔ ldhΔ pta::lox72为宿主,分别以启动子PxylA、P43控制glmS、GNA1的重组表达得到。
CN201611183770.XA 2016-12-20 2016-12-20 高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法 Pending CN106754505A (zh)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201611183770.XA CN106754505A (zh) 2016-12-20 2016-12-20 高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法
US15/390,490 US10093936B2 (en) 2016-12-20 2016-12-24 Recombinant Bacillus subtilis for producing acetylglucosamine and construction method thereof

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201611183770.XA CN106754505A (zh) 2016-12-20 2016-12-20 高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN106754505A true CN106754505A (zh) 2017-05-31

Family

ID=58895796

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201611183770.XA Pending CN106754505A (zh) 2016-12-20 2016-12-20 高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法

Country Status (2)

Country Link
US (1) US10093936B2 (zh)
CN (1) CN106754505A (zh)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107760643A (zh) * 2017-11-15 2018-03-06 江南大学 一种提高枯草芽孢杆菌乙酰氨基葡萄糖产量的方法
WO2019191855A1 (zh) * 2018-04-02 2019-10-10 山东润德生物科技有限公司 重组枯草芽孢杆菌及应用
CN113637623A (zh) * 2021-08-23 2021-11-12 光明乳业股份有限公司 一种提高2′-岩藻糖基乳糖产量的枯草芽孢杆菌及其构建方法与应用

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104928333A (zh) * 2015-07-07 2015-09-23 江南大学 一种敲除glcK促进枯草芽孢杆菌合成乙酰氨基葡萄糖的方法
CN105176879A (zh) * 2015-10-14 2015-12-23 江南大学 一种敲除argCJBD提高重组枯草芽孢杆菌乙酰氨基葡萄糖产量的方法

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105039464A (zh) * 2002-07-01 2015-11-11 阿基昂生命科学公司,以生物技术资源部的名义经营 用于生产葡糖胺和n-乙酰氨基葡糖的方法和物质
EP2848691B1 (en) * 2013-09-11 2017-04-12 Westfälische Wilhelms-Universität Münster Broad host range expression vector for diverse prokaryotes

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104928333A (zh) * 2015-07-07 2015-09-23 江南大学 一种敲除glcK促进枯草芽孢杆菌合成乙酰氨基葡萄糖的方法
CN105176879A (zh) * 2015-10-14 2015-12-23 江南大学 一种敲除argCJBD提高重组枯草芽孢杆菌乙酰氨基葡萄糖产量的方法

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
NCBI: ""GenBank ID:8302932"", 《GENBANK》 *
YANFENG LIU ET AL.,: ""Modular pathway engineering of Bacillus subtilis for improved N-acetylglucosamine production"", 《METABOLIC ENGINEERING》 *
刘延峰: ""代谢工程改造枯草芽孢杆菌高效合成N-乙酰氨基葡萄糖"", 《中国博士学位论文全文数据库 工程科技I辑》 *

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107760643A (zh) * 2017-11-15 2018-03-06 江南大学 一种提高枯草芽孢杆菌乙酰氨基葡萄糖产量的方法
CN107760643B (zh) * 2017-11-15 2020-10-09 江南大学 一种提高枯草芽孢杆菌乙酰氨基葡萄糖产量的方法
WO2019191855A1 (zh) * 2018-04-02 2019-10-10 山东润德生物科技有限公司 重组枯草芽孢杆菌及应用
CN113637623A (zh) * 2021-08-23 2021-11-12 光明乳业股份有限公司 一种提高2′-岩藻糖基乳糖产量的枯草芽孢杆菌及其构建方法与应用
CN113637623B (zh) * 2021-08-23 2023-09-05 光明乳业股份有限公司 一种提高2′-岩藻糖基乳糖产量的枯草芽孢杆菌及其构建方法与应用

Also Published As

Publication number Publication date
US10093936B2 (en) 2018-10-09
US20180171343A1 (en) 2018-06-21

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN104928333B (zh) 一种敲除glcK促进枯草芽孢杆菌合成乙酰氨基葡萄糖的方法
CN107075496A (zh) 抗反馈乙酰羟酸合酶变体和使用其生产l‑缬氨酸的方法
CN106929462A (zh) 一种积累n‑乙酰神经氨酸重组枯草芽孢杆菌及其应用
CN108753669B (zh) 一种腺嘌呤生产菌株及其构建方法和应用
CN101880696B (zh) 发酵生产l-乳酸的方法及该方法所用的菌株
CN106929461A (zh) 一种提高n‑乙酰神经氨酸产量的重组枯草芽孢杆菌
CN109666620B (zh) 一种生产塔格糖的工程菌株,其构建方法及应用
CN106191077B (zh) 一种米尔贝霉素正调控基因milR及其过表达基因工程菌、制备方法和应用
CN106754505A (zh) 高产乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法
CN106479945A (zh) 一种高效合成乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌
CN108034667B (zh) 一种红色红曲霉α-淀粉酶基因、其制备方法及应用
CN108330095A (zh) 一种积累n-乙酰神经氨酸的重组谷氨酸棒杆菌及其应用
CN109679887A (zh) 一种利用高效分泌表达的双酶融合酶耦合发酵生产海藻糖的方法
JP5496356B2 (ja) アラビノース代謝経路が導入されたキシリトール生産菌株及びそれを用いたキシリトール生産方法
CN113755413A (zh) 生产β-烟酰胺单核苷酸的重组微生物及其生产NMN的方法
KR20090081374A (ko) 에탄올 생산을 위한 호열성 미생물
CN117363553A (zh) 一种生产2’-脱氧腺苷的基因工程菌及其构建方法与应用
CN105039374A (zh) 一种淀粉诱导型重组枯草芽孢杆菌及其制备方法与应用
CN114480465A (zh) 一种产生2’-岩藻糖基乳糖的枯草芽孢杆菌及其应用
CN111041013B (zh) 一种褐藻胶裂解酶或果胶酶及其在协同降解褐藻方面的应用
KR20230004466A (ko) 황산화된 다당류의 제조 방법 및 paps의 제조 방법
Dai et al. Bioconversion of inulin to 2, 3-butanediol by a newly isolated Klebsiella pneumoniae producing inulinase
CN113755411A (zh) 高产β-烟酰胺单核苷酸的重组微生物及其生产β-烟酰胺单核苷酸的方法
CN103429731A (zh) 具有生产n-乙酰葡糖胺能力的棒状杆菌属微生物及用其生产n-乙酰葡糖胺或葡糖胺的方法
Khattab et al. A novel production method for high-fructose glucose syrup from sucrose-containing biomass by a newly isolated strain of osmotolerant Meyerozyma guilliermondii

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
RJ01 Rejection of invention patent application after publication
RJ01 Rejection of invention patent application after publication

Application publication date: 20170531