CN105969890A - 一种与香猪产仔数相关的snp分子标记及其应用 - Google Patents

一种与香猪产仔数相关的snp分子标记及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN105969890A
CN105969890A CN201610531708.9A CN201610531708A CN105969890A CN 105969890 A CN105969890 A CN 105969890A CN 201610531708 A CN201610531708 A CN 201610531708A CN 105969890 A CN105969890 A CN 105969890A
Authority
CN
China
Prior art keywords
pig
snp
fragrant
litter size
primer
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201610531708.9A
Other languages
English (en)
Inventor
王嘉福
冉雪琴
牛熙
王洋
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Guizhou University
Original Assignee
Guizhou University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Guizhou University filed Critical Guizhou University
Priority to CN201610531708.9A priority Critical patent/CN105969890A/zh
Publication of CN105969890A publication Critical patent/CN105969890A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/124—Animal traits, i.e. production traits, including athletic performance or the like
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Fats And Perfumes (AREA)

Abstract

本发明公开了一种与香猪产仔数相关的SNP分子标记，其特征在于：SNP标记为位于香猪NCBI猪参考基因组Sscrofa 10.2的chr17:17089983，该SNP位点的两种等位基因为T或C，三种基因型分别命名为CC、TT和CT型，分别对应于chr17:17089983的碱基是纯合的CC、TT，或杂合的CT类型，TT和CT基因型对应于1胎2胎和3胎的产仔数较高。

Description

一种与香猪产仔数相关的SNP分子标记及其应用
技术领域
本发明涉及家畜分子生物学检测领域，具体来说，涉及一种与香猪产仔数相关的SNP标记及其应用技术。
背景技术
产仔数是养猪业重要的经济性状(曹清果，2004)，是猪遗传育种研究的热点和重点。香猪是我国珍贵的小型地方猪种，具基因纯合度高、肌纤维细、脂肪颗粒小、肉质香糯、早熟易繁等特点，适于制作高质量肉品。我们在贵州从江县发现香猪群体中产仔数存在较大的差别，是猪繁殖调控研究和品种选育的良好遗传材料。
猪的产仔数性状是数量性状，调控基因中有几个主效基，更多的是微效基因。基于芯片的全基因组关联分析(Genome-wide associationstudy，GWAS)技术已用于数量性状的基因座(quantitative trait locus，QTL)的筛选研究。全基因组关联分析是指在猪全基因组范围内筛选出SNP位点，经过分群和SNP位点分型，利用统计学的方法，从中筛选出与某些性状相关联的SNP，进而得到控制或者影响猪繁殖性状的QTL。我们的前期研究中应用Illumina Porcine SNP60K基因芯片，对香猪进行了全基因组关联分析，筛选出某些SNP位点具有多态性，与香猪的产仔数显著相关。这些候选位点在较大的香猪群体中是否真实存在、如何影响香猪的产仔数，需要建立一种技术和方法，便于进行群体基因分型研究和应用。本发明描述一个SNP位点基因型的AS-PCR检测方法，目的在于适用于改善香猪产仔数的分子辅助选择技术。
SNP是一种在动物基因组中存在的数目多、分布广泛且相对稳定的遗传标记，主要指基因组核苷酸水平上的变异引起的序列多态性，包括单碱基的转换、颠换，以及单碱基的插入、缺失等(杨昭庆等，2000)。作为第三代分子标记，已广泛应用于生物、农学、医学、生物进化等领域，在分子遗传学、药物遗传学、法医学以及疾病的诊断和治疗等方面发挥着重要作用(唐立群等，2012)。目前SNP检测常用方法有：单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)、等位基因特异性PCR(allele-specific PCR，AS-PCR)、直接测序、DNA芯片等(许家磊等，2015)，其中AS-PCR方法适于群体检测。
AS-PCR方法的原理是，由于Taq DNA聚合酶对位于引物3'末端的单个碱基的错配无法修复，当引物3'末端的碱基与SNP位点的等位基因互补配对时，才能发生扩增反应；当引物3'末端的碱基与SNP位点的等位基因不匹时，则扩增反应不能发生(Suzuki et al.，1991)。每个SNP位点的检测需要设计三条不同的引物，其中一条是通用的引物，另两条是分别对应SNP位点的两个等位基因的特异性引物。以每个个体的基因组DNA为模板进行PCR扩增，PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测，依据电泳条带的有和无确定SNP的基因型。理论上，引物3'末端的碱基与DNA模板发生完全互补配对时，Taq DNA聚合酶才能使扩增反应有效地进行。然而多项研究表明，在某些情况下即使引物3'末端的碱基与DNA模板不是完全的互补配对，延伸反应仍然可以发生(Ugozzoli et al.，1991)。为了解决这一问题，人为地在3'末端倒数第二或第三位引入错配的碱基，能够显著提高引物的特异性，降低假阳性率(Hayashi et al.，2004)。
发明内容
本发明要解决的技术问题是：提供一种与香猪产仔数相关的SNP标记及其应用。
本发明的技术方案是：一种与香猪产仔数相关的SNP标记，位于香猪NCBI猪参考基因组Sscrofa 10.2的chr17:17089983(rs:339042644)，该SNP位点的两种等位基因为T或C，三种基因型分别命名为CC、TT和CT型，分别对应于chr17:17089983的碱基是纯合的CC、TT，或杂合的CT类型。
本发明还提供用于检测香猪产仔数性状的SNP标记的一组引物，所述的引物分别为：末位锚定引物U1(上游引物)：5’-TGGATGTGTGGTAAGGGAGAGAT-3’，末位锚定引物U2(上游引物)：5’-TGGATGTGTGGTAAGGGAGAGAC-3’和下游引物D3：5’-AAAGACTGGTAGGTCAAAGAGTATGC-3’，目的序列分别为SEQID No.1和SEQ ID No.2。
本发明还提供所述SNP标记在不同产仔数香猪群中的检测方法。
该方法包括以下步骤：
(1)提取待测香猪的基因组DNA；
(2)以待测香猪的基因组DNA为模板，分别利用引物U1、U2和D3，进行AS-PCR检测，确定香猪SNP位点chr17:17089983的基因型；
(3)1.5％琼脂糖凝胶电泳检测AS-PCR产物，凝胶成像系统记录条带并判断基因型。如待测个体该位点基因型为CT型或TT型，可将待测个体视为有较高产仔数优势的香猪个体，可选择留作种公猪或种母猪，以提高后代的产仔数；如基因型为CC型，可将待测个体视为产仔数较低的个体，不用于提高后代的产仔数的亲本。
步骤(2)中进行AS-PCR所使用的扩增体系为20μL，计为：2×Taq PCR Master Mix 10μL，10μmol/L引物U1/U20.2μL，10μmol/L引物D30.2μL，ddH2O 8.6μL，10ng/μL基因组DNA 1μL。进行AS-PCR采用的反应条件：1)预变性：94.0℃5min；2)扩增反应：变性：94.0℃30sec，退火：60.0℃-66.0℃30sec，延伸：72.0℃45sec，30个循环；72.0℃10min。
本发明进一步提供所述SNP标记在鉴定产仔数及与香猪产仔数性状相关的分子标记辅助育种中的应用。
前述的应用包括以下步骤：
(1)采用AS-PCR技术检测SNP位点chr17:17089983在群体中的基因型分布情况，筛选出与香猪产仔数性状相关的SNP标记；
(2)应用SPSS v22.0中的Spearman相关系数进行双侧检验，分析该SNP位点的基因型与母猪每胎产仔数的相关性。
(3)根据SNP位点chr17:17089983基因型进行高产仔数优势香猪的选育。
本发明对香猪SNP位点chr17:17089983进行基因型检测，并对该位点的基因型与香猪的产仔数性状进行相关性分析。应用经SPSSv22.0软件的χ2检验分析，得出香猪高产群和低产群该SNP位点基因型的分布频率差异极显著(P<0.001)。将SNP位点chr17:17089983的基因型与各胎次的产仔数进行相关性分析，应用SPSS v22.0中的Spearman相关系数进行双侧检验，得出SNP位点chr17:17089983的基因型与第1胎、第2胎产仔数呈弱相关关系(0.2<ρ<0.4，P<0.001)；与第3胎产仔数呈极弱相关(0.0<ρ<0.2，0.01<P<0.05)。说明不同基因型对香猪各胎次的产仔数存在影响。香猪第1-3胎平均产仔数规律是，TT型香猪的产仔数最高，CC型最低，CT型居中；TT型香猪的第1胎产仔数平均比CC型多1.33头仔数，TT型香猪的第2胎产仔数平均比CC型多1.81头仔数，TT型香猪的第3胎产仔数平均比CC型多2.88头仔数。说明TT基因型的香猪的产仔数高于CC基因型。因此SNP位点chr17:17089983，可作为与产仔数相关的分子标记，为香猪的产仔数性状标记辅助选择提供了科学依据。
本发明的有益效果：(1)本发明提供的分子标记可不受香猪年龄、性别等因素的限制，可用于高产仔数香猪的早期选择，降低香猪的选育成本。
(2)本发明建立的检测香猪SNP位点chr17:17089983基因型的方法准确可靠，操作简便。
(3)香猪SNP位点chr17:17089983基因型的检测，为香猪产仔数的分子标记辅助选择技术奠定理论基础。
附图说明
图1为本发明实施例1中SNP位点chr17:17089983基因型分型结果；
图2为本发明实施例2中SNP位点chr17:17089983在香猪高低产群体间的基因型频率分布。
具体实施方式
以下实例对本发明做进一步的解释，但不限定本发明的范围，若无特别指明，实施例中所用的技术方法和条件均为本领域技术人员所熟知的技术方法和常规实验条件，或按照相关试剂厂商说明书建议的方法和条件。
实施例1香猪产仔数相关的SNP标记的检测技术，步骤如下：
1、基因组DNA提取
本试验采用购自天根生化科技(北京)有限公司的血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒，用于从血液或组织中提取基因组DNA，具体方法如下：
1)处理材料
提取材料为血液时，可直接使用200μL新鲜、冷冻或加入各种抗凝剂的血液，不足200μL可加缓冲液GA补足。
提取材料为组织时，可取50mg组织(脾组织用量应少于10mg)打碎处理为细胞悬浮液，然后10，000rpm(11，200×g)离心1min，倒尽上清，加200μL缓冲液GA，振荡至彻底悬浮。
2)加入20μL蛋白酶K，漩涡混匀，提取血液基因组时，即可继续进行下一步；提取组织基因组时，56.0℃消化2-4h(每隔0.5h混匀一次)至组织块消化完全；
3)加入200μL缓冲液GB，充分颠倒混匀，70.0℃消化10min；
4)加入200μL无水乙醇，漩涡混匀；
5)将消化液倒入吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中)，12000rpm离心30sec，弃废液，将吸附柱CB3放回收集管中；
6)向吸附柱CB3中加入500μL缓冲液GD，12000rpm离心30sec，弃废液，将吸附柱CB3放回收集管中；
7)向吸附柱CB3中加入600μL漂洗液PW，12000rpm离心30sec，弃废液，将吸附柱CB3放回收集管中；
8)重复操作步骤7)一次；
9)将吸附柱CB3放回收集管中12000rpm空离心2min，弃废液，将吸附柱CB3置于室温放置数分钟，以彻底晾干吸附材料中残留的漂洗液成份；
10)将吸附柱转移到干净的2mL离心管中，向吸附柱中部悬空加入50-200μL洗脱液TE，室温放置2-5min,12000rpm离心2min；基因组DNA存在于离心管中TE溶液中，4.0℃备用或-20.0℃保存。
11)为增加基因组DNA的得率，可将离心得到的TE溶液再重复加入吸附柱CB3中，放置2min，12000rpm离心2min；
2、目标序列的扩增
本发明中SNP位点位于chr17:17089983(T/C)，参考NCBIGenbank收录的相应序列，使用Primer Premier 5.0软件设计三条特异性引物，其中U1与U2为末位锚定引物U1：5’-TGGATGTGTGGTAAGGGAGAGAT-3’，U2：5’-TGGATGTGTGGTAAGGGAGAGAC-3’；反向引物D3：5’-AAAGACTGGTAGGTCAAAGAGTATGC-3’。D3分别与U1、U2组合进行AS-PCR检测，每个样本分别进行三次重复检测，目的片段均为361bp，测序后得出目标序列分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2。
AS-PCR所使用的扩增体系为20μL，计为：2×Taq PCR MasterMix 10μL，10μmol/L引物U1或U2取0.2μL，10μmol/L引物D3取0.2μL，ddH2O取8.6μL，10ng/μL基因组DNA取1μL。
进行AS-PCR采用的反应条件：1)预变性：94.0℃5min；2)扩增反应：变性：94.0℃30sec，退火：60.0℃-66.0℃30sec，延伸：72.0℃45sec，30个循环；72.0℃10min。
3、AS-PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测及基因型判断
AS-PCR结束后，取5μLPCR产物经1.5％的琼脂糖电泳检测，0.5μg/mL溴乙锭染色，凝胶成像系统记录条带。
每个样品，以引物D3分别与U1、U2组合进行两个AS-PCR检测。若引物U1/D3，引物U2/D3均扩增出条带，将基因型定义为CT；若引物U1/D3扩增出361bp的条带，引物U2/D3没有条带出现，将基因型定义为CC型；若引物U1/D3检测没有得到条带，引物U2/D3出现一条361bp的条带，将基因型定义为TT型(图1)。
实施例2SNP位点chr17:17089983基因型与产仔数的相关性与检测应用
按照实施例1的方法，以采自贵州从江县香猪高低产群共654头(高产129头，低产525头)为试验材料，以chr17:17089983为候选SNP位点，利用AS-PCR技术检测该SNP位点的基因型在两个群体中的分布情况，应用SPSS v22.0软件中的双侧检验分析该SNP位点的基因型与每胎产仔数的相关性。结果显示，该SNP位点在香猪高产群和低产群中，基因型的分布频率差异极显著(P<0.001)，如表1和图2所示。
表1SNP位点chr17:17089983的基因型及基因频率
备注：香猪高产群的T等位基因频率与香猪低产群的T等位基因频率相比，P<0.01表示差异极显著。
应用SPSS v22.0中的Spearman相关分析，将SNP位点chr17:17089983的基因型与个体的繁殖性状即各胎次产仔数和乳头数进行相关性分析(表2)。结果显示：该SNP位点的基因型与香猪第1胎、第2胎产仔数呈弱相关关系(0.2<ρ<0.4，P<0.01)；与第3胎产仔数呈极弱相关(0.0<ρ<0.2，0.01<P<0.05)。说明不同基因型对香猪各胎次的产仔数存在影响
表2SNP位点chr17:17089983的基因型与产仔数的相关性分析
使用SPSS软件统计出每种基因型对应的各胎次的平均产仔数(表3)，表明，第1-3胎平均产仔数规律是，TT型香猪的产仔数最高，CC型最低，CT型居中；TT型香猪的第1胎产仔数平均比CC型多1.33头仔数，TT型香猪的第2胎产仔数平均比CC型多1.81头仔数，TT型香猪的第3胎产仔数平均比CC型多2.88头仔数。说明TT基因型的香猪的产仔数高于CC基因型。
表3不同基因型各胎次平均产仔数

Claims (5)

1.一种与香猪产仔数相关的SNP分子标记，其特征在于：SNP标记为位于香猪NCBI猪参考基因组Sscrofa 10.2的chr17:17089983，该SNP位点的两种等位基因为T或C，三种基因型分别命名为CC、TT和CT型，分别对应于chr17:17089983的碱基是纯合的CC、TT，或杂合的CT类型。
2.根据权利要求1所述的一种与香猪产仔数相关的SNP分子标记，其特征在于：SNP标记的一组引物，所述的引物分别为：末位锚定引物U1：5’-TGGATGTGTGGTAAGGGAGAGAT-3’，末位锚定引物U2：5’-TGGATGTGTGGTAAGGGAGAGAC-3’和下游引物D3：5’-AAAGACTGGTAGGTCAAAGAGTATGC-3’，目的序列分别为SEQ IDNo.1和SEQ ID No.2。
3.如权利要求1-2之一所述的一种与香猪产仔数相关的SNP分子标记的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：(1)提取待测香猪的基因组DNA；(2)以待测香猪的基因组DNA为模板，分别利用引物U1、U2和D3，进行AS-PCR检测，确定香猪SNP位点chr17:17089983的基因型；(3)1.5％琼脂糖凝胶电泳检测AS-PCR产物，凝胶成像系统记录条带并判断基因型。
4.根据权利要求3所述的一种与香猪产仔数相关的SNP分子标记的检测方法，其特征在于：步骤(2)中进行AS-PCR所使用的扩增体系为20μL，计为：2×Taq PCR Master Mix 10μL，10μmol/L引物U1/U2 0.2μL，10μmol/L引物D3 0.2μL，ddH2O 8.6μL，10ng/μL基因组DNA 1μL；进行AS-PCR采用的反应条件：1)预变性：94.0℃5min；2)扩增反应：变性：94.0℃30sec，退火：60.0℃-66.0℃30sec，延伸：72.0℃45sec，30个循环；72.0℃10min。
5.如权利要求1或2所述的一种与香猪产仔数相关的SNP分子标记在鉴定产仔数及与香猪产仔数性状相关的分子标记辅助育种中的使用方法，其特征在于：包括以下步骤：(1)采用AS-PCR技术检测SNP位点chr17:17089983在群体中的基因型分布情况，筛选出与香猪产仔数性状相关的SNP标记；(2)应用SPSS v22.0中的Spearman相关系数进行双侧检验，分析该SNP位点的基因型与母猪每胎产仔数的相关性；(3)根据SNP位点chr17:17089983基因型进行高产仔数优势香猪的选育。
CN201610531708.9A 2016-07-07 2016-07-07 一种与香猪产仔数相关的snp分子标记及其应用 Pending CN105969890A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610531708.9A CN105969890A (zh) 2016-07-07 2016-07-07 一种与香猪产仔数相关的snp分子标记及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610531708.9A CN105969890A (zh) 2016-07-07 2016-07-07 一种与香猪产仔数相关的snp分子标记及其应用

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN105969890A true CN105969890A (zh) 2016-09-28

Family

ID=56954751

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201610531708.9A Pending CN105969890A (zh) 2016-07-07 2016-07-07 一种与香猪产仔数相关的snp分子标记及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN105969890A (zh)

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107164463A (zh) * 2017-04-27 2017-09-15 江西农业大学 一种用于测定和/或遗传改良猪生长性状的snp标记
CN107287329A (zh) * 2017-07-28 2017-10-24 深圳华大基因研究院 一种预测待测猪的窝产活仔数遗传性能的snp位点组合及方法
CN107365842A (zh) * 2017-07-28 2017-11-21 深圳华大基因研究院 一种预测待测猪的窝产总仔数遗传性能的snp位点组合及方法
CN108841967A (zh) * 2018-06-21 2018-11-20 浙江大学 与猪种繁殖性状相关的fat1基因分子标记及应用

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102181529A (zh) * 2011-03-04 2011-09-14 中国农业大学 一种检测牛瓜氨酸血症有害基因的方法及其专用引物
CN103757009A (zh) * 2013-12-26 2014-04-30 中国科学院昆明动物研究所 猪13号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物
CN105543356A (zh) * 2016-01-04 2016-05-04 中国科学院昆明动物研究所 猪9号染色体上与窝产仔数相关的snp位点
CN105567816A (zh) * 2016-01-04 2016-05-11 中国科学院昆明动物研究所 猪8号染色体上与窝产仔数相关的snp位点

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102181529A (zh) * 2011-03-04 2011-09-14 中国农业大学 一种检测牛瓜氨酸血症有害基因的方法及其专用引物
CN103757009A (zh) * 2013-12-26 2014-04-30 中国科学院昆明动物研究所 猪13号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物
CN105543356A (zh) * 2016-01-04 2016-05-04 中国科学院昆明动物研究所 猪9号染色体上与窝产仔数相关的snp位点
CN105567816A (zh) * 2016-01-04 2016-05-11 中国科学院昆明动物研究所 猪8号染色体上与窝产仔数相关的snp位点

Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107164463A (zh) * 2017-04-27 2017-09-15 江西农业大学 一种用于测定和/或遗传改良猪生长性状的snp标记
CN107164463B (zh) * 2017-04-27 2020-06-26 江西农业大学 一种用于测定和/或遗传改良猪生长性状的snp标记
CN107287329A (zh) * 2017-07-28 2017-10-24 深圳华大基因研究院 一种预测待测猪的窝产活仔数遗传性能的snp位点组合及方法
CN107365842A (zh) * 2017-07-28 2017-11-21 深圳华大基因研究院 一种预测待测猪的窝产总仔数遗传性能的snp位点组合及方法
CN107365842B (zh) * 2017-07-28 2021-01-26 深圳华大生命科学研究院 一种预测待测猪的窝产总仔数遗传性能的snp位点组合及方法
CN107287329B (zh) * 2017-07-28 2021-02-09 深圳华大生命科学研究院 一种预测待测猪的窝产活仔数遗传性能的snp位点组合及方法
CN108841967A (zh) * 2018-06-21 2018-11-20 浙江大学 与猪种繁殖性状相关的fat1基因分子标记及应用

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN106282394B (zh) 高通量检测玉米南方锈病抗性基因分型的方法及其试剂盒
CN106434931A (zh) 一种区分大白猪和中国地方猪品种的结构变异sv177及其检测技术
CN105200160B (zh) 一种与凡纳滨对虾低溶氧耐受性相关的snp标记及其筛选和应用
CN106399523A (zh) 一种区分中国地方猪种和大白猪的分子标记sv193及其应用技术
CN105969890A (zh) 一种与香猪产仔数相关的snp分子标记及其应用
CN116426678B (zh) 与番木瓜果肉果糖含量相关的snp分子标记及应用
CN116837112B (zh) 一种与牦牛生长性状相关的snp分子标记及其应用
CN108753954A (zh) 痴呆相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和用途
WO2023231940A1 (zh) 一种与细毛羊羊毛纤维直径相关的snp位点组合及其应用
CN112662788A (zh) 与中国南方荷斯坦奶牛产奶性状相关的snp标记及其应用
CN112662789A (zh) 与中国南方荷斯坦奶牛初产日龄相关的snp标记及其应用
CN107090450B (zh) 与谷子穗长性状相关的分子标记及其检测引物和应用
CN103757010A (zh) 猪8号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物
CN101899526B (zh) 一种山羊产羔性状的分子标记选择方法
Lemay et al. Bleomycin-induced pulmonary fibrosis susceptibility genes in AcB/BcA recombinant congenic mice
KR101796158B1 (ko) 돼지의 산자수 예측용 nat9 유전자의 snp 마커 및 이를 이용한 돼지 다산 개체 선발 방법
CN105543403B (zh) 水牛泌乳相关基因Leptin作为分子标记的方法及其应用
CN115852033B (zh) 提高稻米品质的gs3基因和gw5基因的分子标记
CN117051127A (zh) 一种与牦牛生长性状相关的snp位点及应用
CN113774154B (zh) 一种筛选牛体高变异相关分子标记的方法及其应用
CN114250305B (zh) 一种基于glrx3基因检测猪产活仔数和仔猪出生窝重的方法及应用
KR102173458B1 (ko) 국내산 소의 신체충실지수 예측용 단일염기다형성 마커 조성물 및 이의 용도
Liu et al. Targeted Genotyping of a Whole-Gene Repertoire by an Ultrahigh-Multiplex and Flexible HD-Marker Approach
CN101921854B (zh) 一种黄牛chemerin基因的单核苷酸多态性检测方法
WO2023001235A1 (zh) 猪生长速率相关基因RPS27L的InDel标记及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination