CN105754981A - 一种碱性果胶酶及其编码基因和它们的应用 - Google Patents

一种碱性果胶酶及其编码基因和它们的应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种(a)或(b)所示的碱性果胶酶:(a)由SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列组成的碱性果胶酶;(b)SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列经过取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且酶活性不变的由(a)衍生的蛋白质,或者,在SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:3的氨基末端和/或羧基末端连接有标签的氨基酸序列所示的蛋白质。本发明还公开了能够编码所述碱性果胶酶的基因、含有所述基因的重组载体、含有所述重组载体的重组菌株以及它们的应用。此外,本发明还公开了制备碱性果胶酶的方法和用于降解果胶的组合物。本发明的碱性果胶酶同时具有水解活性和裂解活性,活性高且稳定性强。

Description

一种碱性果胶酶及其编码基因和它们的应用
技术领域
本发明涉及基因工程领域,具体地,涉及一种具有双功能的碱性果胶酶及其编码基因和它们的应用。
背景技术
果胶是一种广泛存在于植物细胞初生壁和细胞中间层的一组多糖类物质,为内部细胞的支撑物质,其存在有利于维持植物的特定外形结构,但却增加了对植物进行深加工的难度。果胶酶是一类能够分解果胶质的酶的总称,普遍存在于微生物和植物中。根据分解糖苷键的反应性质和降解底物的性质可以分为果胶水解酶、果胶裂解酶、果胶酯酶和原果胶酶。其中水解酶以水解方式切断组成果胶的聚半乳糖醛酸链中D-半乳糖醛酸的α-1,4-糖苷键,而裂解酶是通过反式消除反应促使D-半乳糖醛酸的α-1,4-糖苷键的裂解,目前已报道的果胶酶多数采用这两种方式降解果胶。
碱性果胶酶是一类在碱性条件下具有较高活性的果胶酶,一般以裂解方式降解果胶产生不饱和的寡聚半乳糖醛酸,是一类非常重要的工业酶,在植物药提取、咖啡和茶业发酵、油料提取、纺织和植物纤维处理、造纸、含有果胶物质工业废水处理等生物技术领域具有重要应用价值。尤其在纺织工业的麻类脱胶、棉织品精炼等领域,使用碱性果胶酶可以减少或替代传统的高碱、高温处理,不仅可有效去除果胶质,对天然纤维损伤小,而且节能减排,绿色高效。
目前虽已有多个碱性果胶酶报道,但其广泛应用仍然受到酶学特性和生产成本的制约。已报道的碱性果胶酶均以单一的裂解或水解方式降级果胶,酶的活性和稳定性还不足以适应工业应用环境。而国内已筛选获得的碱性果胶酶产酶菌株生产水平参差不齐,其生产能力距离工业应用需求还很远。因此筛选高活性和稳定性高的碱性果胶酶,并构建双功能高产工程菌株是促进碱性果胶酶工业应用的重点。
发明内容
本发明的目的是克服现有技术的不足,提供一种活性高稳定性强的双功能碱性果胶酶及其编码基因和它们的应用。
为了实现上述目的,第一方面,本发明提供了一种(a)或(b)所示的碱性果胶酶:
(a)由SEQIDNO:1或SEQIDNO:3所示的氨基酸序列组成的碱性果胶酶;
(b)SEQIDNO:1或SEQIDNO:3所示的氨基酸序列经过取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且酶活性不变的由(a)衍生的蛋白质,或者,在SEQIDNO:1或SEQIDNO:3的氨基末端和/或羧基末端连接有标签的氨基酸序列所示的蛋白质。
第二方面,本发明提供了一种能够编码第一方面所述的碱性果胶酶的基因。
第三方面,本发明提供了一种含有第二方面所述的基因的重组载体。
第四方面,本发明提供了一种含有第三方面所述的重组载体的重组菌株。
第五方面,本发明提供了一种制备碱性果胶酶的方法,该方法包括:(1)培养第四方面所述的重组菌株,诱导编码碱性果胶酶的基因的表达;(2)分离提纯所表达的碱性果胶酶。
第六方面,本发明提供了一种用于降解果胶的组合物,该组合物含有第一方面所述的碱性果胶酶作为活性成分,以所述组合物的总重量为基准,所述碱性果胶酶的含量为10-90重量%。
第七方面,本发明提供了一种第一方面所述的碱性果胶酶、第二方面所述的基因、第三方面所述的重组载体、第四方面所述的重组菌株以及第六方面所述的组合物在降解果胶中的应用。
本发明的碱性果胶酶的最适反应pH值为10.5,最适温度高达70℃,在较宽的温度和pH条件下均能表现出较高的活性,稳定性强;对果胶(多聚半乳糖醛酸)的降解同时具有水解和裂解两种方式(具有双功能),对多聚半乳糖醛酸的最高水解比活力为4100U/mg,而最高裂解比活力为910U/mg,对不同程度酯化的果胶也有一定降解活性,活性高。本发明提供的碱性果胶酶可作为一种新型的酶制剂,在纺织、咖啡和茶业发酵、油料提取、纺织和植物纤维处理、造纸、含有果胶物质工业废水处理等领域都有应用价值。
本发明的其它特征和优点将在随后的具体实施方式部分予以详细说明。
附图说明
附图是用来提供对本发明的进一步理解,并且构成说明书的一部分,与下面的具体实施方式一起用于解释本发明,但并不构成对本发明的限制。在附图中:
图1为重组大肠杆菌中表达的碱性果胶酶的SDS-PAGE电泳图;
图2为本发明碱性果胶酶的最适pH曲线;
图3为本发明碱性果胶酶的pH稳定曲线;
图4为本发明碱性果胶酶的最适温度曲线;
图5为本发明碱性果胶酶在不同温度下保温30分钟的热稳定曲线。
具体实施方式
以下对本发明的具体实施方式进行详细说明。应当理解的是,此处所描述的具体实施方式仅用于说明和解释本发明,并不用于限制本发明。
在本发明中,在未作相反说明的情况下,使用的术语“酶活力”的大小即酶含量的多少,用酶活力单位表示,即酶单位(U),本发明中酶单位的定义是:在pH10.5和70℃的条件下,每分钟水解或裂解聚半乳糖醛酸产生1μmol对应的半乳糖醛酸或不饱和聚半乳糖醛酸的酶量为一个酶活力单位,即1U=1μmol/min;“酶的比活力”代表每单位质量蛋白质的催化能力,能够反应酶活性大小,其值越大,表明酶活性越高,比活力的计算公式为:比活力(U/mg)=总酶活力单位数/mg总蛋白。
本发明提供的碱性果胶酶为(a)或(b):
(a)由SEQIDNO:1或SEQIDNO:3所示的氨基酸序列组成的碱性果胶酶;
(b)SEQIDNO:1或SEQIDNO:3所示的氨基酸序列经过取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且酶活性不变的由(a)衍生的蛋白质,或者,在SEQIDNO:1或SEQIDNO:3的氨基末端和/或羧基末端连接有标签的氨基酸序列所示的蛋白质。其中,酶活性不变是指在相同的测定条件下,由(a)衍生的蛋白质的酶活力与(a)的酶活力之间的百分比(相对活性)不低于95%(或96%,或97%,或98%,或99%,或100%)。
组成蛋白质的20种氨基酸残基,按照侧链极性可以分成四类:1、非极性的氨基酸:丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)、亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(Ile)、甲硫氨酸(Met)、苯丙氨酸(Phe)、色氨酸(Trp)和脯氨酸(Pro);2、极性不带电荷的氨基酸:甘氨酸(Gly)、丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、半胱氨酸(Cys)、天冬氨酸(Asn)、谷氨酰胺(Gln)和酪氨酸(Tyr);3、带正电荷的氨基酸:精氨酸(Arg)、赖氨酸(Lys)和组氨酸(His);4、带负电荷的氨基酸:天冬氨酸(Asp)和谷氨酸(Glu)(参见“生物化学”(第二版)上册,沈同、王镜岩,第82-83页,高等教育出版社,1990年12月)。蛋白质中如果发生同属一个类别的氨基酸残基取代,例如由Arg取代Lys或由Leu取代Ile,所述残基在蛋白质结构域中所起的作用(比如提供正电荷或形成疏水囊袋结构的作用)没有改变,因此对蛋白质的立体结构并不会产生影响,因此仍然可以实现蛋白的功能。所述同属一个类别的氨基酸残基取代可以发生在上述碱性果胶酶的任意一个氨基酸残基位置上。
如前所述,本发明提供的碱性果胶酶还可以进行修饰或突变,得到衍生的蛋白质。本发明所述“衍生的蛋白质”指与具有上述氨基酸序列的碱性果胶酶具有氨基酸序列上的差异,也可以有不影响序列的修饰形式上的差异,或者兼而有之。这些蛋白包括天然或诱导的遗传变异体。所述诱导变异体可以通过各种技术得到,如辐射或诱变剂等产生的随机突变,也可以通过如定点突变法或其他已知分子生物学的技术。所述“衍生的蛋白质”还包括具有天然L型氨基酸的残基的类似物(如D型氨基酸),以及具有非天然存在的或合成的氨基酸(如β-氨基酸、γ-氨基酸等)的类似物。
修饰(通常不改变一级结构,即不改变氨基酸序列)形式包括:体内或体外的蛋白的化学衍生形式如乙酰化或羧基化。修饰还包括糖基化,如那些在蛋白的合成和加工中或进一步加工步骤中进行糖基化修饰而产生的蛋白。这种修饰可以通过将蛋白暴露于进行糖基化的酶(如哺乳动物的糖基化酶或去糖基化酶)而完成。修饰形式还包括具有磷酸化氨基酸残基(如磷酸酪氨酸,磷酸丝氨酸,磷酸苏氨酸)的序列。还包括被修饰从而提高了其抗蛋白水解性能或优化了溶解性能的蛋白。
为了方便纯化,还可以采用本领域常见的标签对(a)进行添加修饰,举例来说,(b)可以通过在(a)的氨基末端和/或羧基末端连接下表1所示的标签(如Poly-Arg、Poly-His、FLAG、Strep-tagⅡ和c-myc中的至少一种)而获得。所述标签不会影响本发明的碱性果胶酶的活性,在实际应用过程中,可以根据需求选择是否添加标签。
表1
标签 残基数 氨基酸序列
Poly-Arg 5-6(通常为5个) RRRRR(SEQ ID NO:5)
Poly-His 2-10(通常为6个) HHHHHH(SEQ ID NO:6)
FLAG 8 DYKDDDDK(SEQ ID NO:7)
Strep-tag Ⅱ 8 WSHPQFEK(SEQ ID NO:8)
c-myc 10 EQKLISEEDL(SEQ ID NO:9)
上述碱性果胶酶可以通过人工合成得到,也可以先合成其编码基因,再通过生物表达获得。
本发明还提供了能够编码上述碱性果胶酶的基因。相应地,所述基因可以为如下的(1)或(2):
(1)核苷酸序列如SEQIDNO:2或SEQIDNO:4所示的DNA分子;
(2)在严格条件下与(1)限定的DNA序列杂交且编码的碱性果胶酶的酶活性不变的DNA分子。其中,所述严格条件可以为:在6×SCC,0.5%SDS的溶液中,在65℃下杂交,然后用2×SCC,0.1%SDS和1×SCC,0.1%SDS各洗膜一次。酶活性不变是指在相同的测定条件下,由(2)编码的蛋白质的酶活力与(1)编码的蛋白质的酶活力之间的百分比(相对活性)不低于95%(或96%,或97%,或98%,或99%,或100%)。
本领域公知,组成蛋白质的20种不同的氨基酸中,除Met(ATG)或Trp(TGG)分别为单一密码子编码外,其他18种氨基酸分别由2-6个密码子编码(Sambrook等,分子克隆,冷泉港实验室出版社,纽约,美国,第二版,1989,见950页附录D)。即由于遗传密码子的简并性,决定一个氨基酸的密码子大多不止一个,三联体密码子中第三个核苷酸的置换,往往不会改变氨基酸的组成,因此编码相同蛋白的基因的核苷酸序列可以不同。本领域人员根据公知的密码子表,从本发明公开的氨基酸序列,以及由所述氨基酸序列得到的碱性果胶酶活性不变的氨基酸序列,完全可以推导出能够编码它们的基因的核苷酸序列,通过生物学方法(如PCR方法、突变方法)或化学合成方法得到所述核苷酸序列,因此该部分核苷酸序列都应该包括在本发明范围内。相反,利用本文公开的DNA序列,也可以通过本领域公知的方法,例如Sambrook等的方法(分子克隆,冷泉港实验室出版社,纽约,美国,第二版,1989)进行,通过修改本发明提供的核酸序列,得到与本发明所述碱性果胶酶活性一致的氨基酸序列。
优选地,所述基因的核苷酸序列如SEQIDNO:2或SEQIDNO:4所示。
如上所述,相应地,核苷酸序列的5'端和/或3'端还可以连接有上表1所示的标签的编码序列。
本发明提供的核苷酸序列通常可以用聚合酶链式反应(PCR)扩增法、重组法、或人工合成的方法获得。例如,本领域技术人员根据本发明所提供的核苷酸序列,可以很容易得到模板和引物,利用PCR进行扩增获得有关序列。
一旦获得了有关核苷酸序列,就可以用重组法大批量的获得有关氨基酸序列。通常将所得核苷酸序列克隆入载体,再转入基因工程菌中,然后通过常规的方法从增殖后的宿主细胞分离得到有关核苷酸序列。
此外,还可用公知的人工化学合成的方法来合成有关核苷酸序列。
本发明提供的重组载体含有本发明提供的基因。
所述重组载体优选为重组质粒pET28a-BacPelB。重组载体中使用的“载体”可选用本领域已知的各种载体,如市售的各种质粒、粘粒、噬菌体及反转录病毒等,本发明优选pET28a质粒。重组载体构建可采用能够在载体多克隆位点具有切割位点的各种核酸内切酶(如对于pUC18,可用SalⅠ、BamHⅠ、EcoRⅠ等;对于pET28a,可用NdeⅠ、NheⅠ、EcoRⅠ、BamH、HindⅢ等)进行酶切获得线性质粒,与采用相同核酸内切酶切割的基因片段连接,获得重组质粒。本发明优选采用NdeⅠ和HindⅢ双酶切pET28a及与其连接的基因片段,经连接酶连接,构建得到重组载体pET28a-BacPelB。
本发明提供的重组菌株含有本发明提供的重组载体。
可以通过本领域常规的方法将所述重组载体转化、转导或者转染到宿主细胞(菌株)中,如氯化钙法化学转化、高压电击转化,优选电击转化。所述宿主细胞可以为原核细胞或真核细胞,优选为杆状菌(如大肠杆菌(Escherichiacoli)或枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis))或酵母菌(如巴斯德毕赤酵母(Pichiapastoris)或酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)),更优选地,所述宿主细胞为大肠杆菌(如大肠杆菌BL21(DE3)或大肠杆菌DH5α)。
本发明提供的制备碱性果胶酶的方法包括:培养本发明提供的重组菌株,诱导编码碱性果胶酶的基因的表达;分离提纯所表达的碱性果胶酶。所述培养条件为常规的培养条件,如使用LB培养基(溶剂为水,溶质及其终浓度分别为:Tryptone10g/L,酵母提取物5g/L,NaCl10g/L),在35-37℃下培养至OD600为0.6。由于本发明提供的重组菌株中含有编码碱性果胶酶的基因,其可以高效地表达碱性果胶酶。培养后经过分离提纯,即可得到高纯度的碱性果胶酶。可以采用本领域技术人员公知的方法进行分离提纯(如,往培养液中加入异丙基-β-d-硫代半乳糖苷(IPTG)至终浓度为0.8mM,37℃继续振荡培养5小时后收集菌体,用20mM的pH7.9的Tris-HCl缓冲液悬浮并超声破碎细胞,再经过纯化即可得到碱性果胶酶),在此不再赘述。
本发明提供的用于降解果胶的组合物含有本发明的碱性果胶酶作为活性成分,以所述组合物的总重量为基准,所述碱性果胶酶的含量为10-90重量%。所述组合物中还可以含有本领域技术人员公知的溶剂(如甘油、糖类和蛋白酶抑制剂等蛋白保护剂)、激动剂(如氯化钙)等。
本发明还提供了本发明的上述碱性果胶酶、基因、重组载体、重组菌株以及组合物在降解果胶中的应用。
以下将通过实施例对本发明进行详细描述。
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
实施例中蛋白质含量(BacPelB酶液浓度)测定所用试剂盒为伯乐蛋白测定试剂盒(QuickStartBradfordProteinAssayKit),产品目录编号为500-0201;所用多聚半乳糖醛酸(即果胶类底物)购自Sigma,产品目录编号为Cat.No81325。
实施例1
碱性果胶酶及其编码基因等的获得
(1)碱性果胶酶(BacPelB)编码基因的克隆
取分离自内蒙古碱性热泉样品的克劳氏芽孢杆菌(Bacillusclausii)S10,利用基因组提取试剂盒提取克劳氏芽孢杆菌S10的总DNA,紫外分光光度计测定DNA的纯度结果为:A260/A280=1.96,A260/A230=2.15。取总DNA溶液10μl(约50μgDNA),用限制性内切酶Sau3AI进行部分酶切,经琼脂糖凝胶电泳,回收2-8kb的DNA片段。然后进行连接反应,4℃连接反应16小时,连接体系如下(20μl):
用连接反应产物转化感受态大肠杆菌DH5α,然后涂于含60μg/ml氨苄青霉素(Amp)、20μg/mlIPTG、40μg/ml半乳糖苷(X-gal)以及0.5%果胶的pH8.0的固体LB培养基上,37℃培养16-18小时,菌落周围有透明圈的即为阳性克隆。将阳性克隆在Amp-LB液体培养基中37℃培养16小时后,经活性测试具有碱性果胶酶活性。
对阳性克隆中的重组质粒进行了测序,结果显示重组质粒中,在pUC118DNA骨架中插入了一个DNA片段,该DNA片段含有一个长984bp的开放阅读框(ORF),其对应的核苷酸序列如SEQIDNO:4所示,其编码的氨基酸序列如SEQIDNO:3所示的氨基酸序列,将氨基酸序列如SEQIDNO:3所示的蛋白质命名为BacPelB-S。
通过信号肽在线预测软件SignalP4.1Server分析得出:SEQIDNO:3中第1至23位为信号肽序列,因此成熟的碱性果胶酶共304个氨基酸,命名为BacPelB,序列如SEQIDNO:1所示,其编码基因的核苷酸序列如SEQIDNO:2所示。
(2)BacPelB的表达载体和重组菌株的构建
根据SEQIDNO:2所示的核苷酸序列,设计引物对如下:
正向引物:5’-CTAGCTAGCGCCAATGTGAATTTCTCAATGC-3’(SEQIDNO:10),下划线部分为NheI酶切位点;反向引物:5’-CCCAAGCTTTTAAGGAGAAATAACCCCAAC-3’(SEQIDNO:11),下划线部分为HindIII酶切位点。
以克劳氏芽孢杆菌S10的总DNA为模板,用设计的引物对进行PCR扩增,PCR反应体系如下(50μl):
PCR扩增条件为:94℃预变性4min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,30个循环;最后72℃延伸10min。PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳检测产量和特异性,并用DNA纯化试剂盒(超薄离心柱型,天根公司生产)纯化。将纯化的PCR产物进行测序,检测是否为SEQIDNO:2所示的基因片段。将测序正确的PCR产物和质粒pET28a(购自Novogen)均经NheI和HindIII双酶切并经琼脂糖电泳回收,然后将两个酶切产物进行连接反应,得到重组质粒,连接条件为4℃下16小时,连接反应体系如下(10μl):
将测序验证正确的重组质粒命名为pET28a-BacPelB,并用其转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞后涂布于含有50μg/ml卡那霉素的LB固体平板上,37℃过夜培养得到含有pET28a-BacPelB的重组工程菌。
(3)BacPelB的制备和纯化
将得到的重组工程菌接种于含有50μg/ml卡那霉素的LB培养基中,37℃过夜培养活化得到种子液,然后将种子液按1%的量接种于100ml新鲜的LB培养基中(含50μg/ml卡那霉素),37℃培养约3小时至OD600=0.6,加入IPTG至终浓度为0.8mM,37℃继续诱导培养5小时。将培养液6000g离心10min收集菌体,悬浮于10ml溶液A(20mMTris-HCl,pH7.9,0.5MNaCl,5mM咪唑)中,于冰浴中超声破碎(60w,15min;超声3s,停止3s),之后12000g离心5min除去细胞碎片。然后于60℃水浴热处理15min,之后再15000g离心10min去除热不稳定的杂蛋白,上清过Ni-IDAHis·BindSuperflow纯化柱(Novogen),用5ml溶液A洗涤,再用10ml溶液B(20mMTris-HCl,pH7.9,0.5MNaCl,60mM咪唑)漂洗,然后用2ml溶液C(20mMTris-HCl,pH7.9,0.5MNaCl,1M咪唑)洗脱,收集洗脱液。将洗脱液用脱盐缓冲液(20mMTris-HCl,pH7.9)在AKTAFPLC(快速蛋白液相层析)系统上进行脱盐,获得纯化的BacPelB。SDS-PAGE电泳显示纯化的BacPelB的分子量约为35kDa(见图1,其中M道为Marker,1道为空载体诱导表达后的蛋白,2为诱导表达的BliPelB,3为纯化后的BacPelB),基本符合理论值(36kDa,含His-Tag纯化标签)。
(4)BacPelB-S的制备和纯化
根据SEQIDNO:4所示的核苷酸序列,参照与步骤(2)和(3)相同的方法获得BacPelB-S。
实施例2
碱性果胶酶(BacPelB)的酶学性质的检测
(1)标准酶活力测定方法
水解酶活力测定:取10μl实施例1获得的BacPelB酶液(稀释至0.3μg/ml)与190μL含0.2%多聚半乳糖醛酸(PGA)和0.1mMCaCl2的pH值为10.5的甘氨酸-NaOH缓冲液混匀后,在70℃下反应10min,加入200μL二硝基水杨酸溶液(DNS)终止反应(张龙翔等主编,《生化实验方法和技术》,高等教育出版社,1996),然后于沸水浴中反应5min后测定在540nm处的吸光值。
裂解酶活力测定:取10μl实施例1获得的BacPelB酶液(稀释至0.6μg/ml)与190μL含0.2%的PGA和0.1mMCaCl2的pH值为10.5的甘氨酸-NaOH缓冲液混匀后,在70℃下反应10min,加入0.03M的磷酸溶液终止反应,然后测定在235nm处的吸光值。以无活性的酶液作为对照,不饱和聚半乳糖醛酸在235nm处的摩尔消光系数为4600M-1·cm-1
(2)BacPelB最适pH值和pH稳定性的测定
在70℃下,将BacPelB酶液在不同pH值(pH7.5-11.5)的缓冲液中进行酶促反应以测定其最适pH值,其余条件同(1)水解酶活力测定,所用缓冲液为pH7.5-8.5的50mM的Tris-HCl缓冲液、pH8.5-10.5的50mM甘氨酸-NaOH缓冲液和pH10.5-11.5的KCl-NaOH缓冲液。结果如图2所示,BacPelB的最适pH值为10.5。
将酶液在不同pH(pH4.0-12.0)的缓冲液中于30℃下处理6小时,再测定酶活性以研究酶的pH稳定性,其他具体条件同(1)水解酶活力测定,所用缓冲液为pH4.0-7.5的Na2HPO4-柠檬酸缓冲液、pH7.5-8.5的50mM的Tris-HCl缓冲液、pH8.5-10.5的50mM甘氨酸-NaOH缓冲液和pH10.5-12.0的KCl-NaOH缓冲液。结果如图3所示,BacPelB在pH6.5-11.5间很稳定,保持了80%以上的酶活力。
相似地,BacPelB裂解酶活力测定的结果显示其最适pH也为10.5,在pH6.5-11.5之间稳定,与水解酶活力测定结果一致。
(3)BacPelB最适温度和热稳定性的测定
在pH10.5的50mM甘氨酸-NaOH缓冲液体系(含0.2%PGA和0.1mM的CaCl2)及不同的温度(50-85℃)下进行酶促反应以测定BacPelB的最适温度,其余条件同(1)水解酶活力测定。酶最适温度测定结果(见图4)显示,BacPelB的最适温度为70℃。
将BacPelB分别用pH7.5的20mM的Tris-HCl缓冲液和pH9.0的50mM甘氨酸-NaOH缓冲液稀释至1μg/ml的浓度,然后在不同温度(55-80℃)下保温30分钟后测定残余的酶活力,其他具体测定条件同(1)水解酶活力测定,绘制酶的热稳定性曲线。结果(见图5)显示,BacPelB在两种不同pH的缓冲液中,在高温处理后酶活有一定的提高,同时在偏中性的Tris-HCl缓冲液中的热稳定性更好,在75℃处理半小时酶活力不仅没有降低反而有约40%的提高;即使在pH9.0的碱性缓冲液中,在70℃处理半小时仍有约80%的酶活力,因此BacPelB具有较好的热碱稳定性。
相似地,BacPelB裂解酶活力测定的结果显示其最适温度为70℃,在中性缓冲液中,75℃及以下温度处理半小时酶活力有约30-40%的提高,而在pH9.0的碱性缓冲液中在70℃及以下的温度酶活力比较稳定,与水解酶活力测定结果基本一致。
(4)Ca2+浓度对BacPelB酶活性的影响
一般Ca2+浓度对果胶酶的活性具有激活作用,采用不同浓度的CaCl2溶液参照(1)中方法测定Ca2+浓度对BacPelB的酶活性的影响,结果显示BacPelB的活性在Ca2+浓度为0.1mM时达到最高。
(5)BacPelB对不同果胶的酶活性
在最适的反应条件下(70℃,pH10.5,0.1mM的CaCl2),以多聚半乳糖醛酸为底物,其余条件同(1),BacPelB的水解比活力为4100U/mg,而裂解比活力也达到910U/mg。
BacPelB对不同程度酯化的果胶也具有很好的降解作用,以对多聚半乳糖醛酸的酶活性为100%,对于两种来源的果胶(Pectin)的相对活性分别为60.7%(柑橘类果胶,购自Sigma,Cat.NoP9135)和114.7%(苹果果胶,购自Sigma,Cat.No76282),而对三种具有不同酯化度的果胶的相对活性分别为30.2%(柑橘类果胶,购自Sigma,酯化度为20-34%,Cat.NoP9311)、80.6%(柑橘类果胶,购自Sigma,酯化度为55-70%,Cat.NoP9436)和138.6%(柑橘类果胶,购自Sigma,酯化度≥85%,Cat.NoP9561)。
实施例3
按照与实施例2相同的方法检测BacPelB-S的酶学性质,结果显示,BacPelB-S与BacPelB的酶学性质基本相同。
从以上实施例可以看出,本发明的碱性果胶酶同时具有水解活性和裂解活性,且酶活性高、稳定性强。
以上详细描述了本发明的优选实施方式,但是,本发明并不限于上述实施方式中的具体细节,在本发明的技术构思范围内,可以对本发明的技术方案进行多种简单变型,这些简单变型均属于本发明的保护范围。
另外需要说明的是,在上述具体实施方式中所描述的各个具体技术特征,在不矛盾的情况下,可以通过任何合适的方式进行组合,为了避免不必要的重复,本发明对各种可能的组合方式不再另行说明。
此外,本发明的各种不同的实施方式之间也可以进行任意组合,只要其不违背本发明的思想,其同样应当视为本发明所公开的内容。

Claims (10)

1.一种碱性果胶酶,其特征在于,所述碱性果胶酶为(a)或(b):
(a)由SEQIDNO:1或SEQIDNO:3所示的氨基酸序列组成的碱性果胶酶;
(b)SEQIDNO:1或SEQIDNO:3所示的氨基酸序列经过取代、缺失或添加一个或几个氨基酸且酶活性不变的由(a)衍生的蛋白质,或者,在SEQIDNO:1或SEQIDNO:3的氨基末端和/或羧基末端连接有标签的氨基酸序列所示的蛋白质。
2.一种能够编码权利要求1所述的碱性果胶酶的基因。
3.根据权利要求2所述的基因,其中,所述基因的核苷酸序列如SEQIDNO:2或SEQIDNO:4所示。
4.一种重组载体,其特征在于,所述重组载体含有权利要求2或3所述的基因。
5.一种重组菌株,其特征在于,所述重组菌株含有权利要求4所述的重组载体。
6.根据权利要求5所述的重组菌株,其中,所述菌株为杆状菌或酵母菌。
7.根据权利要求5或6所述的重组菌株,其中,所述菌株为大肠杆菌(Escherichiacoli)、枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)、巴斯德毕赤酵母(Pichiapastoris)或酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)。
8.一种制备碱性果胶酶的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
(1)培养权利要求5-7中任意一项所述的重组菌株,诱导编码碱性果胶酶的基因的表达;
(2)分离提纯所表达的碱性果胶酶。
9.一种用于降解果胶的组合物,其特征在于,该组合物含有权利要求1所述的碱性果胶酶作为活性成分,以所述组合物的总重量为基准,所述碱性果胶酶的含量为10-90重量%。
10.权利要求1所述的碱性果胶酶、权利要求2或3所述的基因、权利要求4所述的重组载体、权利要求5-7中任意一项所述的重组菌株以及权利要求9所述的组合物在降解果胶中的应用。
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Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106399337A (zh) * 2016-10-18 2017-02-15 江南大学 一种产碱性果胶酶的重组菌及其应用
CN107164353A (zh) * 2017-06-27 2017-09-15 湖北大学 一种低温碱性果胶裂解酶及其编码基因和应用
CN111217935A (zh) * 2018-11-25 2020-06-02 中国科学院大连化学物理研究所 一种小分子柑橘果胶及制备方法

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102021157A (zh) * 2009-09-23 2011-04-20 中国科学院微生物研究所 一种果胶酶及其编码基因
CN103589675A (zh) * 2013-10-18 2014-02-19 齐鲁工业大学 碱性果胶酶基因工程菌及其构建方法
CN103966194A (zh) * 2014-05-07 2014-08-06 江南大学 一种分泌性能提高的碱性果胶酶突变体
CN103981167A (zh) * 2014-05-07 2014-08-13 江南大学 一种热稳定性提高的碱性果胶酶突变体

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102021157A (zh) * 2009-09-23 2011-04-20 中国科学院微生物研究所 一种果胶酶及其编码基因
CN103589675A (zh) * 2013-10-18 2014-02-19 齐鲁工业大学 碱性果胶酶基因工程菌及其构建方法
CN103966194A (zh) * 2014-05-07 2014-08-06 江南大学 一种分泌性能提高的碱性果胶酶突变体
CN103981167A (zh) * 2014-05-07 2014-08-13 江南大学 一种热稳定性提高的碱性果胶酶突变体

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
C ZHOU ET AL.: "Cloning,evaluation,and high-level expression of a thermoalkaline pectate lyase from alkaliphilic Bacillus clausii with potential in ramie degumming", 《APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY》 *
NCBI: "ACCESSION NO.WP_011244927.1", 《GENBANK》 *
ZHOU ,C.: "ACCESSION NO.ALK03050.1", 《GENBANK》 *
陈丽娜 等: "细菌碱性果胶酶的酶学特性及其应用研究", 《中国生物工程杂志》 *

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106399337A (zh) * 2016-10-18 2017-02-15 江南大学 一种产碱性果胶酶的重组菌及其应用
CN107164353A (zh) * 2017-06-27 2017-09-15 湖北大学 一种低温碱性果胶裂解酶及其编码基因和应用
CN107164353B (zh) * 2017-06-27 2020-03-31 湖北大学 一种低温碱性果胶裂解酶及其编码基因和应用
CN111217935A (zh) * 2018-11-25 2020-06-02 中国科学院大连化学物理研究所 一种小分子柑橘果胶及制备方法

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