CN105408341A - 取代的核苷、核苷酸及其类似物 - Google Patents

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Abstract

本文公开了核苷、核苷酸及其类似物,包含一种或多种核苷、核苷酸及其类似物的药物组合物,以及合成上述项的方法。本文还公开了用核苷、核苷酸及其类似物减轻和/或治疗副粘病毒的病毒感染的方法。

Description

取代的核苷、核苷酸及其类似物
通过引用并入任何优先权申请
根据37CFR1.57,以及细则4.18和20.6,将例如与本申请一起提交的申请数据表或请求中已被确认的外国或国内优先权要求的任何和所有申请通过引用并入本文。
序列表的引用
将本申请与电子版的序列表一起提交。序列表以于2014年6月23日创建的,标题为ALIOS076.txt的文件(其大小大约为4kb)的形式提供。将电子版序列表的信息通过引用整体并入本文。
发明领域
本申请涉及化学、生物化学和医学领域。更具体地,本文公开了核苷、核苷酸及其类似物,包含一种或多种核苷、核苷酸及其类似物的药物组合物,以及合成上述项的方法。本文还公开用一种或多种核苷、核苷酸及其类似物减轻和/或治疗副粘病毒的病毒感染的方法。
发明背景
呼吸道病毒感染(infections)(其包括上呼吸道和下呼吸道病毒感染)感染(infect)且是每年数百万人死亡的主要原因。上呼吸道病毒感染涉及鼻、鼻窦、咽和/或喉。下呼吸道病毒感染涉及声带下的呼吸系统,其包括气管、主支气管和肺。
核苷类似物为已显示在体外和体内均发挥抗病毒活性的一类化合物,并且因此已成为用于病毒感染治疗的广泛研究主题。核苷类似物通常为医疗上不活泼的化合物,其被宿主或病毒的酶转化为它们各自有活性的抗代谢物,其反过来可抑制涉及病毒或细胞扩增的聚合酶。通过多种机制发生活化作用,如加入一种或多种磷酸基团和/或与其他代谢过程结合。
发明概述
本文公开的某些实施方案涉及式(I)化合物或其药学上可接受的盐。
本文公开的某些实施方案涉及减轻和/或治疗副粘病毒的病毒感染的方法,其包括对患有副粘病毒的病毒感染的对象施用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的包含式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物。本文所述的其他实施方案涉及使用式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐制备用于减轻和/或治疗副粘病毒的病毒感染的药物。本文所述的其他实施方案涉及可被用于减轻和/或治疗副粘病毒的病毒感染的式(I)化合物或其药学上可接受的盐。而本文公开的其他实施方案涉及减轻和/或治疗副粘病毒的病毒感染的方法,其可包括使感染有副粘病毒的细胞与有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的包含式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物接触。本文公开的某些实施方案涉及抑制副粘病毒的复制的方法,其包括使感染有副粘病毒的细胞与有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的包含式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物接触。
本文公开的某些实施方案涉及减轻和/或治疗副粘病毒的病毒感染的方法,其包括与本文所描述的一种或多种药剂(agent)联用,对患有病毒感染的对象施用有效量的本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐(例如,式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐),或者有效量的包含本文所描述的一种或多种化合物的药物组合物。本文公开的某些实施方案涉及减轻和/或治疗副粘病毒的病毒感染的方法,其可包括与本文所描述的一种或多种药剂联用,使感染有病毒的细胞与有效量的本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐(例如,式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐),或者有效量的包含本文所描述的一种或多种化合物的药物组合物接触。
附图简述
图1显示抗RSV药剂的实例。
发明详述
副粘病毒(Paramyxoviridae)家族是单链RNA病毒的家族。副粘病毒家族的一些属包括呼吸道病毒属、腮腺炎病毒属、肺炎病毒属和偏肺病毒属。通过与被污染的呼吸小滴或污染物直接或亲密接触,这些病毒可在人与人之间传递。
人呼吸道合胞体病毒(RSV)是肺炎病毒的种类,并且为负义单链RNA病毒。RSV可引起呼吸道感染,并且可能与毛细支气管炎和肺炎有关。RSV感染的症状包括咳嗽、打喷嚏、流鼻涕、发烧、食欲下降、喉咙痛、头痛和气喘。RSV是世界上一岁以下儿童的毛细支气管炎和肺炎的最常见原因,并且可为更大的儿童和成人的气管支气管炎的原因。在美国,每年75,000至125,000的婴儿因RSV住院。超过65岁的老年人中,估计14,000例的死亡和177,000例的住院治疗归因于RSV。
当前,对感染有RSV的病人的治疗选择有限。抗生素(通常为治疗细菌感染的处方药)和非处方药在治疗RSV中是没有效果的,并且可能仅帮助减轻某些症状。在严重的情况下,雾状的支气管扩张剂(如舒喘宁)可为减轻某些症状(如气喘)的处方药。(RSV-IGIV,MedImmune,批准用于小于24个月的高风险儿童)和(帕利珠单抗,MedImmune,批准用于小于24个月的高风险儿童)已被批准用于针对RSV的预防药使用,并且(气溶胶的病毒唑,ICN药物)已被批准用于RSV的治疗。
副流感病毒为典型的负义RNA病毒。呼吸道病毒的种类包括人副流感病毒1和3;以及腮腺炎病毒的种类包括人副流感病毒2和4。人副流感病毒包括四种血清型类型(HPIV-1、HPIV-2、HPIV-3和HPIV-4),并且人副流感病毒4(HPIV-4)包括两种抗原亚组,A和B。人副流感病毒可引起上呼吸道和下呼吸道感染。人副流感病毒1(HPIV-1)和人副流感病毒2(HPIV-2)可与哮吼有关;人副流感病毒3(HPIV-3)可能与毛细支气管炎和肺炎有关。根据疾病控制和预防中心(CDC),不存在针对人副流感病毒的疫苗。
偏肺病毒的种类为人偏肺病毒属。人偏肺病毒为负义单链RNA病毒。人偏肺病毒可引起呼吸道感染,如人(例如幼童)的上呼吸道和下呼吸道感染。
呼吸道感染包括感冒、哮吼、肺炎、支气管炎和毛细支气管炎。症状可包括咳嗽、流鼻涕、鼻塞、喉咙痛、发烧、呼吸困难、不正常的急促呼吸、气喘呕吐、腹泻和耳朵感染。
定义
除非另有说明,本文使用的所有技术和科学术语与本领域普通技术人员通常理解的含义相同。除非另有规定,将本文提及的所有专利、申请、被公布的申请和其他出版物通过引用整体并入。在本文的术语存在多种定义的事件中,除非另有规定,以在该部分中的定义为准。
如本文所用,任何“R”基团,如但不限于:R1A、R2A、R3A、R4A、R5A、R6A R7A、R8A、R9A、R10A、R11A、R12A、R13A、R14A、R15A、R16A、R17A、R18A、R19A、R20A、R21A、R22A、R23A、R24A、R25A、R26A、R27A、R28A、R29A、R30A、R31A、R32A、R33A、R34A、R35A、R36A、R37A和R38A,表示可被连接到指定原子的取代基。R基团可为取代的或未被取代的。如果两个“R”基团被描述为“一起(takentogether)”,那么R基团和其所连接至的原子可形成环烷基、环烯基、芳基、杂芳基或杂环基。例如,但不限于,如果NRaRb基团的Ra和Rb被指示为“一起”,那么其意指它们彼此共价地连接以形成环:
此外,如果两个“R”基团被描述为与它们所连接至的原子“一起”形成环作为备选,那么R基团不限于之前所定义的变量或取代基。
每当基团被描述为“任选取代的”时,该基团可为未被取代的或被指定的取代基中的一种或多种取代。同样地,当基团被描述为“未被取代的或被取代的”时,如果被取代,那么取代基可选自指定取代基中的一种或多种。如果没有取代基被指定,其意指指定的“任选取代的”或“被取代的”基团可被分别地且独立地选自以下的一种或多种基团取代:烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)、杂环基(烷基)、羟基、烷氧基、酰基、氰基、卤素、硫代羰基、O-氨甲酰基、N-氨甲酰基、O-硫代氨甲酰基、N-硫代氨甲酰基、C-氨基、N-氨基、S-磺酰氨基、N-磺酰氨基、C-羧基、O-羧基、异氰酸基、硫氰基、异硫氰基、叠氮基、硝基、甲硅烷基、亚氧硫基、亚磺酰基、磺酰基、卤烷基、卤烷氧基、三卤甲烷磺酰基、三卤甲烷磺酰氨基、氨基、单取代的氨基基团和二取代的氨基基团。
如本文所用,“Ca至Cb”中的“a”和“b”为整数且指烷基、烯基或炔基基团中的碳原子数,或者环烷基、环烯基、芳基、杂芳基或杂脂环基基团的环中的碳原子数。即,烷基、烯基、炔基、环烷基的环、环烯基的环、芳基的环、杂芳基的环或杂环基的环可含有包括a和b在内的“a”至“b”个碳原子。因此,例如,“C1至C4烷基”基团指具有1至4个碳的所有烷基基团,即CH3-、CH3CH2-、CH3CH2CH2-、(CH3)2CH-、CH3CH2CH2CH2-、CH3CH2CH(CH3)-和(CH3)3C-。如果关于烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基或杂环基团的“a”和“b”没有被指定,那么这些定义中所述的最大范围将被接受。
如本文所用,“烷基”指包含完全饱和(无双键或三键)的烃基的直链或支链的烃链。烷基基团可具有1至20个碳原子(每当其在本文出现时,数值范围如“1至20”指给定范围中的各个整数;例如,“1至20个碳原子”意指烷基基团可由1个碳原子、2个碳原子、3个碳原子等,至多且包括20个碳原子组成,尽管本定义也涵盖了没有数值范围被指定的术语“烷基”的事件)。烷基基团也可为具有1至10个碳原子的中间大小的烷基。烷基基团也可为具有1至6个碳原子的低级烷基。化合物的烷基基团可被指定为“C1-C4烷基”,或类似的指定。仅通过实例的方式,“C1-C4烷基”表示在烷基链中存在一至四个碳原子,即,烷基链选自:甲基、乙基、丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基和叔丁基。通常的烷基基团包括但不限于:甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、叔丁基、戊烷基和己基。烷基基团可为取代的或未被取代的。
如本文所用,“烯基”指在直链或支链的烃链上含有一个或多个双键的烃基基团。烯基基团的实例包括:丙二烯基、乙烯甲基和乙烯基。烯基基团可为未被取代的或取代的。
如本文所用,“炔基”指在直链或支链的烃链上含有一个或多个三键的烃基基团。炔基的实例包括乙炔基和丙炔基。炔基基团可为未被取代的或取代的。
如本文所用,“环烷基”指完全饱和(无双键或三键)的单环或多环烃环系。当环烷基由两个或更多个环构成时,所述环可以以稠合的形式连接在一起。环烷基基团在环中可含有3至10个原子,或在环中含有3至8个原子。环烷基基团可为未被取代的或取代的。通常的环烷基基团包括但绝不限于:环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基和环辛基。
如本文所用,“环烯基”指在至少一个环上含有一个或多个双键的单环或多环烃环系;尽管,如果存在多于一个双键,所述双键不能形成遍及所有环的完全离域的π电子体系(否则所述基团将为本文所定义的“芳基”)。当环烯基由两个或更多个环构成时,所述环可以以稠合形式连接在一起。环烯基在环中可含有3至10个原子,或在环中含有3至8个原子。环烯基基团可为未被取代的或取代的。
如本文所用,“芳基”指具有遍及所有环的完全离域π电子体系的碳环(所有碳)的单环或多环芳香环系(其包括其中两个碳环共有化学键的稠合环系)。芳基基团中的碳原子数可变化。例如,芳基基团可为C6-C14芳基基团、C6-C10芳基基团或C6芳基基团。芳基基团的实例包括但不限于:苯、萘和薁。芳基基团可为取代的或未被取代的。
如本文所用,“杂芳基”指含有一个或多个杂原子(例如,1至5个杂原子)的单环或多环芳香环系(具有完全离域π电子体系的环系),所述杂原子为除碳以外的元素,其包括但不限于氮、氧和硫。杂芳基基团环中的原子数可变化。例如,杂芳基基团在环中可含有4至14个原子、在环中含有5至10原子或在环中含有5至6原子。此外,术语“杂芳基”包括其中两个环(如至少一个芳基环和至少一个杂芳环,或至少两个杂芳环)共有至少一个化学键的稠合环系。杂芳环的实例包括但不限于:呋喃、呋咱、噻吩、苯并噻吩、酞嗪、吡咯、噁唑、苯并噁唑、1,2,3-噁二唑、1,2,4-噁二唑、噻唑、1,2,3-噻二唑、1,2,4-噻二唑、苯并噻唑、咪唑、苯并咪唑、吲哚、吲唑、吡唑、苯并吡唑、异噁唑、苯并异噁唑、异噻唑、三唑、苯并三唑、噻二唑、四唑、吡啶、哒嗪、嘧啶、吡嗪、嘌呤、蝶啶、喹啉、异喹啉、喹唑啉、喹喔啉、噌啉和三嗪。杂芳基基团可为取代的或未被取代的。
如本文所用,“杂环基”或“杂脂环基”指3-、4-、5-、6-、7-、8-、9-、10-、至多18-元的单环,二环和三环环系,其中碳原子与1至5个杂原子一起组成所述的环系。杂环可任选地含有一个或多个不饱和键,然而所述不饱和键以使得不发生遍及所有环的完全离域π电子体系的方式存在。杂原子为除碳以外的元素,其包括但不限于氧、硫和氮。杂环还可含有一个或多个羰基或硫代羰基官能团,以使得所述定义包括氧代系和硫代系,如内酰胺、内酯、环酰亚胺、环硫代酰亚胺和环氨基甲酸酯。当杂环基由两个或更多个环组成时,所述环可以以稠合的形式连接在一起。此外,杂环基或杂脂环基中的任何氮可被季铵化(quaternized)。杂环基或杂脂环基团可为未被取代的或取代的。这样的“杂环基”或“杂脂环基”基团的实例包括但不限于:1,3-二噁英、1,3-二氧六环、1,4-二氧六环、1,2-二氧戊环、1,3-二氧戊环、1,4-二氧戊环、1,3-氧硫杂环己烷、1,4-氧硫杂环己二烯、1,3-氧硫杂环戊烷、1,3-二硫杂环戊二烯、1,3-二硫戊环、1,4-氧硫杂环己烷、四氢-1,4-噻嗪、2H-1,2-噁嗪、马来酰亚胺、琥珀酰亚胺、巴比土酸、硫代巴比土酸、二氧代哌嗪、乙内酰脲、二氢尿嘧啶、三氧杂环已烷、六氢化-1,3,5-三嗪、咪唑啉、咪唑烷、异噁唑啉、异噁唑烷、噁唑啉、噁唑烷、噁唑烷酮、噻唑啉、噻唑烷、吗啉、环氧乙烷、哌啶N-氧化物、哌啶、哌嗪、吡咯烷、吡咯烷酮、吡咯烷酮、4-哌啶酮、吡唑啉、吡唑烷、2-吡咯酮、四氢吡喃、4H-吡喃、四氢噻喃、硫代吗啉、硫代吗啉亚砜、硫代吗啉砜及其苯并稠合类似物(例如,苯并咪唑烷酮、四氢喹啉和3,4-亚甲二氧基苯基)。
如本文所用,“芳烷基”和“芳基(烷基)”指经低级亚烷基基团(作为取代基)连接的芳基基团。芳烷基的低级亚烷基和芳基基团可为取代的或未被取代的。实例包括但不限于:苄基、2-苯基(烷基)、3-苯基(烷基)和萘基(烷基)。
如本文所用,“杂芳烷基”和“杂芳基(烷基)”指经低级亚烷基基团(作为取代基)连接的杂芳基基团。杂芳烷基的低级亚烷基和杂芳基基团可为取代的或未被取代的。实例包括但不限于:2-噻吩基(烷基)、3-噻吩基(烷基)、呋喃基(烷基)、噻吩基(烷基)、吡咯基(烷基)、吡啶基(烷基)、异噁唑基(烷基)、咪唑基(烷基)及其苯并稠合类似物。
“杂脂环基(烷基)”和“杂环基(烷基)”指经低级亚烷基基团(作为取代基)连接的杂环或杂脂环基团。杂脂环基(烷基)的低级亚烷基和杂环基可为取代的或未被取代的。实例包括但不限于:四氢-2H-吡喃-4-基(甲基)、哌啶-4-基(乙基)、哌啶-4-基(丙基)、四氢-2H-噻喃-4-基(甲基)和1,3-噻嗪-4-基(甲基)。
“低级亚烷基基团”为直链的-CH2-系基团,其通过它们的末端碳原子形成连接分子片段的键。实例包括但不限于:亚甲基(-CH2-)、亚乙基(-CH2CH2-)、亚丙基(-CH2CH2CH2-)和亚丁基(-CH2CH2CH2CH2-)。低级亚烃基基团可被取代,通过用“被取代的”定义下所列的取代基代替低级亚烃基基团的一个或多个氢。
如本文所用,“烷氧基”指式–OR,其中R为本文所定义的烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。烷氧基的非限制性实例为:甲氧基、乙氧基、正丙氧基、1-甲基乙氧基(异丙氧基)、正丁氧基、异丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基、苯氧基和苯甲酰氧基。烷氧基可为取代的或未被取代的。
如本文所用,“酰基”指经羰基基团(作为取代基)连接的氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。实例包括:甲酰基、乙酰基、丙酰基、苯甲酰基和丙烯酰基。酰基可为取代的或未被取代的。
如本文所用,“羟烷基”指其中一个或多个氢原子被羟基基团代替的烷基基团。示例性羟烷基基团包括但不限于:2-羟乙基、3-羟丙基、2-羟丙基和2,2-二羟乙基。羟烷基可为取代的或未被取代的。
如本文所用,“卤烷基”指其中一个或多个氢原子被卤素代替的烷基基团(例如,单卤烷基、二卤烷基和三卤烷基)。这样的基团包括但不限于:氯甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、1-氯-2-氟甲基和2-氟异丁基。卤烷基可为取代的或未被取代的。
如本文所用,“卤烷氧基”指其中一个或多个氢原子被卤素代替的烷氧基基团(例如,单卤烷氧基、二卤烷氧基和三卤烷氧基)。这样的基团包括但不限于:氯甲氧基、氟甲氧基、二氟甲氧基、三氟甲氧基、1-氯-2-氟甲氧基和2-氟异丁氧基。卤烷氧基可为取代的或未被取代的。
“亚氧硫基(sulfenyl)”基团指“-SR”基团,其中R可为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。亚氧硫基可为取代的或未被取代的。
“亚磺酰基”基团指“-S(=O)-R”基团,其中R可与亚氧硫基所定义的相同。亚磺酰基可为取代的或未被取代的。
“磺酰基”基团指“SO2R”基团,其中R可与亚氧硫基所定义的相同。磺酰基可为取代的或未被取代的。
“O-羧基”基团指“RC(=O)O-”基团,其中R可为本文所定义的氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。O-羧基可为取代的或未被取代的。
术语“酯”和“C-羧基”指“-C(=O)OR”基团,其中R可与O-羧基所定义的相同。酯和C-羧基可为取代的或未被取代的。
“硫代羰基”基团指“-C(=S)R”基团,其中R可与O-羧基所定义的相同。硫代羰基可为取代的或未被取代的。
“三卤甲烷磺酰基”基团指“X3CSO2-”基团,其中各个X为卤素。
“三卤甲烷磺酰氨基”基团指“X3CS(O)2N(RA)-”基团,其中各个X为卤素,以及RA为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。
如本文所用,术语“氨基”指–NH2基团。
如本文所用,术语“羟基”指–OH基团。
“氰基”基团指“-CN”基团。
如本文所用,术语“叠氮基”指–N3基团。
“异氰酸基”基团指“-NCO”基团。
“硫氰基”基团指“-CNS”基团。
“异硫氰基”基团指“–NCS”基团。
“羰基”基团指C=O基团。
“S-磺酰氨基”基团指“-SO2N(RARB)”基团,其中RA和RB可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。S-磺酰氨基可为取代的或未被取代的。
“N-磺酰氨基”基团指“RSO2N(RA)-”基团,其中R和RA可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。N-磺酰氨基可为取代的或未被取代的。
“O-氨甲酰基”基团指“-OC(=O)N(RARB)”基团,其中RA和RB可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。O-氨甲酰基可为取代的或未被取代的。
“N-氨甲酰基”基团指“ROC(=O)N(RA)-”基团,其中R和RA可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。N-氨甲酰基可为取代的或未被取代的。
“O-硫代氨甲酰基”基团指“-OC(=S)-N(RARB)”基团,其中RA和RB可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。O-硫代氨甲酰基可为取代的或未被取代的。
“N-硫代氨甲酰基”基团指“ROC(=S)N(RA)-”基团,其中R和RA可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。N-硫代氨甲酰基可为取代的或未被取代的。
“C-氨基”基团指“-C(=O)N(RARB)”基团,其中RA和RB可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。C-氨基可为取代的或未被取代的。
“N-氨基”基团指“RC(=O)N(RA)-”基团,其中R和RA可独立地为氢、烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基(烷基)、杂芳基(烷基)或杂环基(烷基)。N-氨基可为取代的或未被取代的。
如本文所用,术语“卤素原子”或“卤素”意指元素周期表第7列的放射稳定原子中的任一种,如氟、氯、溴和碘。
当未规定取代基的数目时(例如卤烷基),可能有一个或多个取代基的存在。例如“卤烷基”可包括一个或多个相同或不同的卤素。作为另一个实例,“C1-C3烷氧苯基”可包括一个或多个相同或不同的烷氧基基团,所述烷氧基基团含有一个、两个或三个碳原子。
除非另有说明,如本文所用,任何保护基、氨基酸和其他化合物的缩写与它们常见的使用、公认的缩写或IUPAC-IUB委员会生化命名法一致(参见,生物化学11:942-944(1972))。
如本文所用,术语“核苷”为本领域技术人员所理解的普通意义,并且指由任选取代的戊糖部分或修饰的戊糖部分经N-糖苷键连接到杂环碱基或其互补异构体而组成的化合物,如经嘌呤碱基的位置9或嘧啶碱基的位置1连接。实例包括但不限于:含有核糖部分的核糖核苷和含有脱氧核糖部分的脱氧核苷。修饰的戊糖部分为其中氧原子被碳代替和/或碳被硫或氧原子代替的戊糖部分。“核苷”为单体,其可具有被取代的碱基和/或糖的部分。此外,核苷可被并入较大的DNA和/或RNA聚合体和寡聚物。在某些实例中,核苷可为核苷类似物药物。
如本文所用,术语“核苷酸”为本领域技术人员所理解的普通意义,并且指具有连接戊糖部分(例如,在5’-位置)的磷酸酯的核苷。
如本文所用,术语“杂环碱基”指任选取代的含氮杂环基,其可被连接至任选取代的戊糖部分或被修饰的戊糖部分。在某些实施方案中,杂环碱基可选自:任选取代的嘌呤碱基、任选取代的嘧啶碱基和任选取代的三唑碱基(例如,1,2,4-三唑)。如本文所用,术语“嘌呤碱基”为本领域技术人员所理解的普通意义,并且包括其互变异构体。类似地,如本文所用,术语“嘧啶碱基”为本领域技术人员所理解的普通意义,并且包括其互变异构体。任选取代的嘌呤碱基的非限制实例包括:嘌呤、腺嘌呤、鸟嘌呤、次黄嘌呤、黄嘌呤、别黄嘌呤、7-烷基鸟嘌呤(例如,7-甲基鸟嘌呤)、可可碱、咖啡因、尿酸和异鸟嘌呤。嘧啶碱基的实例包括但不限于:胞嘧啶、胸腺嘧啶、尿嘧啶、5,6-二氢尿嘧啶和5-烷基胞嘧啶(例如,5-甲基胞嘧啶)。任选取代的三唑碱基的实例为1,2,4-三唑-3-甲酰胺。杂环碱基的非限制性的实例包括二氨基嘌呤、8-氧代-N6-烷基腺嘌呤(例如,8-氧代-N6-甲基腺嘌呤)、7-脱氮黄嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、7-脱氮腺嘌呤、N4,N4-桥亚乙基(ethano)胞嘧啶,N6,N6-桥亚乙基-2,6-二氨基嘌呤、5-卤尿嘧啶(例如,5-氟尿嘧啶和5-溴尿嘧啶)、假异胞嘧啶、异胞嘧啶、异鸟嘌呤以及美国专利第5,432,272号和7,125,855号中所描述的其他杂环碱基,为了公开其他杂环碱基的有限目的,将上述美国专利通过引用并入本文。在某些实施方案中,杂环碱基可被胺或烯醇保护基任选地取代。
术语“–N–连接的氨基酸”指经主链氨基或单取代的氨基基团连接到指定部分上的氨基酸。当氨基酸以–N–连接的氨基酸的形式被连接时,主链氨基或单取代的氨基基团部分的一个氢不存在,并且氨基酸经氮连接。N连接的氨基酸可为取代的或未被取代的。
术语“–N–连接的氨基酸酯衍生物”指其中主链羧酸基团被转化为酯基团的氨基酸。在某些实施方案中,酯基团具有选自以下的化学式:烷基-O-C(=O)-、环烷基-O-C(=O)-、芳基-O-C(=O)-和芳基(烷基)-O-C(=O)-。酯基团的非限制实例包括以下基团的被取代的或未被取代的形式:甲基-O-C(=O)-、乙基-O-C(=O)-、正丙基-O-C(=O)-、异丙基-O-C(=O)-、正丁基-O-C(=O)-、异丁基-O-C(=O)-、叔丁基-O-C(=O)-、新戊基-O-C(=O)-、环丙基-O-C(=O)-、环丁基-O-C(=O)-、环戊基-O-C(=O)-、环己基-O-C(=O)-、苯基-O-C(=O)-、苄基-O-C(=O)-和萘基-O-C(=O)-。N连接的氨基酸酯衍生物可为取代的或未被取代的。
术语“–O–连接的氨基酸”指经来自主链羧酸基团的羟基被连接至指定部分的氨基酸。当氨基酸以–O–连接的氨基酸形式被连接时,来自主链羧酸基团的羟基部分的氢不存在,并且氨基酸经氧连接。O连接的氨基酸可为取代的或未被取代的。
如本文所用,术语“氨基酸”指任何氨基酸(标准和非标准的氨基酸),其包括但不限于:α-氨基酸、β-氨基酸、γ-氨基酸和δ-氨基酸。合适的氨基酸的实例包括但不限于:丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯基丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。合适的氨基酸的其他实例包括但不限于:鸟氨酸、高赖氨酸、2-氨基异丁酸、脱氢丙氨酸、γ-氨基丁酸、瓜氨酸、β-丙氨酸、α-乙基-甘氨酸、α-丙基-甘氨酸和正亮氨酸。
术语“硫代磷酸酯(phosphorothioate/phosphothioate)”指通式的化合物、其质子化形式(例如,)和其互变异构体(如)。
如本文所用,术语“磷酸盐”为本领域技术人员所理解的普通意义,并且包括其质子化形式(例如,)。如本文所用,术语“单磷酸”、“二磷酸”和“三磷酸”为本领域技术人员所理解的普通意义,并且包括其质子化形式。
如本文所用,术语“保护基(protectinggroup/protectinggroups)”指为了防止分子中的现有基团遭受不必要的化学反应而被加入至该分子中的任何原子或原子的基团。保护基部分的实例描述于T.W.GreeneandP.G.M.Wuts,ProtectiveGroupsinOrganicSynthesis,3.Ed.JohnWiley&Sons,1999和J.F.W.McOmie,ProtectiveGroupsinOrganicChemistryPlenumPress,1973,为了公开合适的保护基的有限目的,通过引用将其并入本文。可按以下方式选择保护基部分:它们在某些反应条件下稳定,并且在适当的阶段使用本领域已知的方法很容易地去除。保护基的非限制实例包括:苄基;被取代的苄基;烷羰基和烷氧羰基(例如,叔丁氧羰基(BOC)、乙酰基或异丁酰基);芳烷基羰基和芳烷氧羰基(例如,苄氧羰基);被取代的甲醚(例如,甲氧基甲醚);被取代的乙醚;被取代的二苄醚;四氢吡喃醚;甲硅烷基(例如,三甲基甲硅烷基,三乙基甲硅烷基,三异丙基甲硅烷基,叔丁基二甲基甲硅烷基,三异丙基甲硅烷基氧甲基,[2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基]甲基,或叔丁基二苯基甲硅烷基);酯(例如,苯甲酸酯);碳酸盐(例如,碳酸甲氧基甲酯);磺酸盐(例如,甲苯磺酸盐或甲磺酸盐);非环的缩酮(例如,二甲基乙缩醛);环缩酮(例如,1,3-二氧六环、1,3-二氧戊环,以及本文所描述的环缩酮);非环的缩醛;环缩醛(例如,本文所描述的环缩醛);非环的半缩醛;环半缩醛;环二硫代缩酮(例如,1,3-二噻烷或1,3-二硫戊环);原酸酯(例如,本文所描述的原酸酯)和三芳基甲基基团(例如,三苯甲基;单甲氧三苯甲基(MMTr);4,4'-二甲氧三苯甲基(DMTr);4,4',4"-三甲氧三苯甲基(TMTr);以及本文所描述的三芳基甲基基团)。
术语“药学上可接受的盐”指对施用它的生物体不引起明显刺激并且不废除化合物的生物学活性和特性的该化合物的盐。在某些实施方案中,盐为化合物的酸加成盐。可通过将化合物与无机酸(如氢卤酸(例如,氢氯酸或氢溴酸)、硫酸、硝酸和磷酸)反应获得药用盐。也可通过将化合物与有机酸(如脂肪族或芳香族羧基酸或磺酸,例如甲酸、醋酸、琥珀酸、乳酸、苹果酸、酒石酸、柠檬酸、抗坏血酸、烟碱酸、甲基磺酸、乙基磺酸、对甲苯磺酸、水杨酸或萘磺酸)反应获得药用盐。也可通过将化合物与碱反应形成盐来获得药用盐,如铵盐,碱金属盐(如钠盐或钾盐),碱土金属盐(如钙盐或镁盐),有机碱盐(如二环己胺、N-甲基-D-葡糖胺、三(羟甲基)甲胺、C1-C7烷基胺、环己胺、三乙醇胺、乙二胺)和具有氨基酸如精氨酸和赖氨酸的盐。
除非另有明确规定,在本申请尤其是在所附权利要求中使用的术语和短语及其变体,应当被解释为与限制相反的开放式的。作为上述的实例,术语‘包括’应当被读为意指‘包括不限于’‘其包括但不限于’等等;本文使用的术语‘包含’与‘包括’、‘含有’、‘以…为特点’同义,并且为包含式的或开放式的,并且不排除其他未列举的元素或方法步骤;术语‘具有’应当被解释为‘具有至少’;术语‘包括’应当被解释为‘包括但不限于’;术语‘实例’被用来提供讨论项的示例性实例,而非其详尽的或限制性列举;以及术语如‘优选地’、‘优选的’、‘预期的’或‘期望的’以及类似意思的词语的使用,不应当被理解为隐含某种特征是关键的、必要的或甚至对结构或功能是重要的,但相反仅仅意图强调可被或可不被用于具体的实施方案中的可选的或另外的特征。此外,术语“包含”被解释为与短语“具有至少”或“包括至少”同义。在方法的语境中使用时,术语“包含”意指所述方法至少包含列举的步骤,但可包括另外的步骤。当在化合物、组合物或装置的语境中使用时,术语“包含”意指化合物、组合物或装置至少包含所列举的特征或组分,但也可包括另外的特征或组分。同样地,除非另有明确规定,与连接词‘和’连接的项的组不应当被读为要求这些项中的各个和每一个都存在于分组中,而应当被读为‘和/或’。类似地,除非另有明确规定,与连接词‘或’连接的项的组不应被读为要求组间的相互排他性,而应被读为‘和/或’。
关于本文的基本上任何复数和/或单数术语的使用,根据上下文和/或应用,本领域技术人员可将复数转化为单数和/或将单数转化为复数。为了清楚起见,多种单数/复数置换在本文被清楚地陈述。不定冠词“a”或“an”不排除复数。单处理或其他单位可实现权利要求中所列的数项功能。相互不同的从属权利要求中所列某些措施的仅有事实,并不表示这些措施的组合不能用来产生益处。权利要求中的任何参考标志不应被解释为限制范围。
应理解,在本文所描述的具有一个或多个手性中心的任何化合物中,如果没有明确地指示绝对立体化学,那么各个中心可独立地为R-构型或S-构型或其混合物。因此,本文提供的化合物可为对映体纯的、富含对映体的、外消旋混合物、非对映体纯的、富含非对映体的或立体异构混合物。此外,应理解,在本文所描述的具有产生几何异构体的一个或多个双键(可被定义为E或Z)的任何化合物中,各个双键可独立地为E或Z或其混合物。
同样地,应理解,在所描述的任何化合物中,也意图包括所有的互变异构形式。例如意图包括磷酸盐和硫代磷酸酯基团的所有互变异构体。硫代磷酸酯的互变异构体的实例包括以下:此外,意图包括本领域已知的杂环碱基的所有互变异构体,其包括天然的和非天然的嘌呤碱基和嘧啶碱基的互变异构体。
应被理解,其中本文公开的化合物具有未填满的化合价,然后所述化合价将被氢或其同位素填满,例如,氢-1(氕)和氢-2(氘)。
应理解,本文所描述的化合物可为同位素标记的。同位素(如氘)的取代可提供由较大的代谢稳定性导致的某些治疗优势,例如,增加的体内半衰期或降低的剂量要求。化合物结构中所示的各个化学元素可包括所述元素的任何同位素。例如,在化合物结构中,明确地公开或理解氢原子存在于化合物中。在可存在氢原子的化合物的任何位置上,氢原子可为氢的任何同位素,其包括但不限于氢-1(氕)和氢-2(氘)。因此,除非上下文中另有明确地规定,本文提及的化合物涵盖所有潜在的同位素形式。
应理解,本文所描述的方法和组合包括晶体形式(也被称为多晶型,其包括化合物的相同元素组成的不同晶体组合排列)、非晶相、盐、溶剂化物和水合物。在某些实施方案中,本文所描述的化合物与药学上可接受的溶剂(如水、乙醇等等)一起以溶剂化的形式存在。在其他实施方案中,本文所描述的化合物以非溶剂化的形式存在。溶剂化物含有化学计算量或非化学计算量的溶剂量,并且可在与药学上可接受溶剂(如水、乙醇等等)的结晶化过程期间形成。溶剂为水时形成水合物,或溶剂为乙醇时形成醇化物。此外,本文提供的化合物可以以非溶剂化的以及溶剂化的形式存在。大体上,为了本文提供的化合物和方法的目的,溶剂化形式被认为与非溶剂化形式等同。
当提供值的范围时,应理解,所述范围的上限值和下限值,以及上限和下限之间的各个中间值被涵盖在实施方案内。
化合物
本文公开的某些实施方案涉及式(I)化合物或上述项的药学上可接受的盐:
其中:B1A可为任选取代的杂环碱基,或具有被保护的氨基基团的任选取代的杂环碱基;RA可为氢或氘;R1A可选自:氢、任选取代的酰基、任选取代的O连接的氨基酸、Ra1和Ra2可独立地为氢或氘;R2A可为C1-6叠氮烷基或C1-6氨烷基;R3A可选自:OH、–OC(=O)R”A和任选取代的O连接的氨基酸;R4A可为卤素;R5A可为氢或卤素;R6A、R7A和R8A可独立地选自:不存在、氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的C3-24烯基、任选取代的C3-24炔基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C3-6环烯基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的芳基(C1-6烷基)、任选取代的*–(CR15AR16A)p–O–C1-24烷基、任选取代的*–(CR17AR18A)q–O–C1-24烯基、 或者R6A可为并且R7A可不存在或为氢;或者R6A和R7A可一起形成选自以下的部分:任选取代的和任选取代的其中与R6A和R7A连接的氧、磷和所述部分形成六元至十元的环系;R9A可独立地选自:任选取代的C1-24烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C3-6环烯基、NR30AR31A、任选取代的N连接的氨基酸和任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物;R10A和R11A可独立地为任选取代的N连接的氨基酸,或任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物;R12A、R13A和R14A可独立地不存在或为氢;各个R15A,各个R16A,各个R17A和各个R18A可独立地为氢、任选取代的C1-24烷基或烷氧基;R19A、R20A、R22A和R23A可独立地选自:氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基;R21A和R24A可独立地选自:氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的芳基、任选取代的–O–C1-24烷基、任选取代的–O–芳基、任选取代的–O–杂芳基、任选取代的–O–单环杂环和R25A和R29A可独立地选自:氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基;R26A和R27A可独立地为-C≡N,或选自以下的任选取代的取代基:C2-8有机羰基、C2-8烷氧羰基和C2-8有机氨羰基;R28A可选自:氢、任选取代的C1-24-烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基和任选取代的C3-6环烯基;R30A和R31A可独立地选自:氢、任选取代的C1-24-烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基和任选取代的C3-6环烯基;R”A可为任选取代的C1-24-烷基;m和t可独立地为0或1;p和q可独立地选自1、2和3;r可为1或2;s可为0、1、2或3;u可为1或2;以及Z1A、Z2A、Z3A和Z4A可独立地为O或S。
在某些实施方案中,R1A可为在某些实施方案中,R6A和R7A均可为氢。在其他实施方案中,R6A和R7A均可不存在。在其他实施方案中,R6A和R7A中至少一项可不存在。而在其他实施方案中,R6A和R7A中至少一项可为氢。本领域技术人员理解,R6A和/或R7A不存在时,相连的氧将具有负电荷。例如,R6A不存在时,与R6A相连的氧将具有负电荷。在某些实施方案中,Z1A可为O(氧)。在其他实施方案中,Z1A可为S(硫)。在某些实施方案中,R1A可为单磷酸。在其他实施方案中,R1A可为单硫代磷酸。
在某些实施方案中,R1A时,R6A和R7A中的一项可为氢,并且R6A和R7A中的另一项可选自:任选取代的C1-24烷基、任选取代的C3-24烯基、任选取代的C3-24炔基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C3-6环烯基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基)。在某些实施方案中,R6A和R7A中的一项可为氢,并且R6A和R7A中的另一项可为任选取代的C1-24烷基。在其他实施方案中,R6A和R7A可独立地选自:任选取代的C1-24烷基、任选取代的C3-24烯基、任选取代的C3-24炔基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C3-6环烯基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基)。在某些实施方案中,R6A和R7A可为任选取代的C1-24烷基。在其他实施方案中,R6A和R7A均可为任选取代的C3-24烯基。在某些实施方案中,R6A和R7A可独立地为以下的任选取代的形式:肉豆蔻烯醇基(myristoley)、肉豆蔻基、棕榈油酰基(palmitoleyl)、棕榈基、萨宾基(sapienyl)、油烯基、十八碳烯醇基(elaidyl)、异油基(vaccenyl)、亚油基(linoleyl)、α-亚麻基(linolenyl)、花生四酰基(arachidonyl)、二十碳五烯基(eicosapentaenyl)、二十二碳烯基(erucyl)、二十二碳六烯基、辛酰基、癸酰基、十二烷基、硬脂酰基、二十烷醇基(arachidyl)、二十二烷醇基、木蜡基和二十六烷醇基。
在某些实施方案中,R6A和R7A中至少一项可为*–(CR15AR16A)p–O–C1-24烷基。在其他实施方案中,R6A和R7A均可为*–(CR15AR16A)p–O–C1-24烷基。在某些实施方案中,每个R15A和每个R16A可为氢。在其他实施方案中,R15A和R16A中至少一项可为任选取代的C1-24烷基。在其他实施方案中,R15A和R16A中至少一项可为烷氧基(例如,苯甲酰氧基)。在某些实施方案中,p可为1。在其他实施方案中,p可为2。在其他实施方案中,p可为3。
在某些实施方案中,R6A和R7A中至少一项可为*–(CR17AR18A)q–O–C2-24烯基。在其他实施方案中,R6A和R7A均可为*–(CR17AR18A)q–O–C2-24烯基。在某些实施方案中,每个R17A和每个R18A可为氢。在其他实施方案中,R17A和R18A中至少一项可为任选取代的C1-24烷基。在某些实施方案中,q可为1。在其他实施方案中,q可为2。在其他实施方案中,q可为3。R6A和R7A中至少一项为*–(CR15AR16A)p–O–C1-24烷基或*–(CR17AR18A)q–O–C2-24烯基时,C1-24烷基可选自:辛酰基、癸酰基、十二烷基、肉豆蔻基、棕榈基、硬脂酰基、二十烷醇基、二十二烷醇基、木蜡基和二十六烷醇基,以及C2-24烯基可选自:肉豆蔻烯醇基、棕榈油酰基、萨宾基(sapienyl)、油烯基、十八碳烯醇基、异油基、亚油基、α-亚麻基、花生四酰基、二十碳五烯基、二十二碳烯基和二十二碳六烯基。
在某些实施方案中,当R1A时,R6A和R7A中至少一项可选自并且R6A和R7A中另一项可选自:不存在、氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C3-6环烯基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基)。
在某些实施方案中,R6A和R7A中至少一项可为 在某些实施方案中,R6A和R7A均可为当R6A和R7A中一项或两项均为时,R19A和R20A可独立地选自:氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基;以及R21A可选自:氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的芳基、任选取代的–O–C1-24烷基、任选取代的–O–芳基、任选取代的–O–杂芳基、任选取代的–O–单环杂环和在某些实施方案中,R19A和R20A可为氢。在其他实施方案中,R19A和R20A中至少一项可为任选取代的C1-24烷基,或任选取代的芳基。在某些实施方案中,R21A可为任选取代的C1-24烷基。在其他实施方案中,R21A可为任选取代的芳基。在其他实施方案中,R21A可为任选取代的–O–C1-24烷基,或任选取代的–O–芳基。在某些实施方案中,R21A可为任选取代的–O–C1-24烷基、任选取代的–O–芳基、任选取代的–O–杂芳基或任选取代的–O–单环杂环。
在某些实施方案中,R6A和R7A均可为R6A和R7A中一项或两项均为时,R22A和R23A可独立地选自:氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基;R24A可独立地选自氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的芳基、任选取代的–O–C1-24烷基、任选取代的–O–芳基、任选取代的–O–杂芳基、任选取代的–O–单环杂环和以及Z4A可独立地为O(氧)或S(硫)。在某些实施方案中,R22A和R23A可为氢。在其他实施方案中,R22A和R23A中至少一项可为任选取代的C1-24烷基,或任选取代的芳基。在某些实施方案中,R24A可为任选取代的C1-24烷基。在其他实施方案中,R24A可为任选取代的芳基。在其他实施方案中,R24A可为任选取代的–O–C1-24烷基,或任选取代的–O–芳基。在某些实施方案中,Z4A可为O(氧)。在其他实施方案中,Z4A可为或S(硫)。在某些实施方案中,s可为0。在其他实施方案中,s可为1。在其他实施方案中,s可为2。而在其他实施方案中,s可为3。在某些实施方案中,s可为0,并且R24A可为在某些实施方案中,u可为1。在其他实施方案中,u可为2。在某些实施方案中,R6A和R7A中一项或两项均可为异丙基氧羰基氧甲基(POC)。在某些实施方案中,R6A和R7A中一项或两项均可为特戊酰氧基甲基(POM)。在某些实施方案中,R6A和R7A均可为异丙基氧羰基氧甲基基团,并形成双(异丙基氧羰基氧甲基)(双(POC))前药。在某些实施方案中,R6A和R7A均可为特戊酰氧基甲基基团,并形成双(特戊酰氧基甲基)(双(POM))前药。
在某些实施方案中,R6A和R7A均可为其中R26A和R27A可独立地为-C≡N,或选自以下的任选取代的取代基:C2-8有机羰基、C2-8烷氧羰基和C2-8有机氨羰基;R28A可选自:氢、任选取代的C1-24-烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基和任选取代的C3-6环烯基;以及r可为1或2。
在某些实施方案中,R6A和R7A均可为任选取代的芳基。在某些实施方案中,R6A和R7A中至少一项可为任选取代的芳基。例如,R6A和R7A均可为任选取代的苯基,或任选取代的萘基。当被取代时,取代的芳基可被1、2、3或多于3个取代基取代。当多于两个取代基存在时,取代基可相同或不同。在某些实施方案中,当R6A和R7A中至少一项为被取代的苯基时,取代苯基可为对位-、邻位-或间位-取代的苯基。
在某些实施方案中,R6A和R7A均可为任选取代的芳基(C1-6烷基)。在某些实施方案中,R6A和R7A中至少一项可为任选取代的芳基(C1-6烷基)。例如,R6A和R7A均可为任选取代的苄基。当被取代时,取代苄基基团可被1、2、3或多于3个取代基取代。当多于两个取代基存在时,取代基可相同或不同。在某些实施方案中,芳基(C1-6烷基)的芳基基团可为对位-、邻位-或间位-取代的苯基。
在某些实施方案中,R6A和R7A均可为在某些实施方案中,R6A和R7A中至少一项可为在某些实施方案中,R25A可为氢。在其他实施方案中,R25A可为任选取代的C1-24烷基。在其他实施方案中,R25A可为任选取代的芳基。在某些实施方案中,R25A可为C1-6烷基,例如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊烷基(支链和直链的)和己基(支链和直链的)。在某些实施方案中,t可为0。在其他实施方案中,t可为1。在某些实施方案中,R6A和R7A中一项或两项均可为S-酰基硫代乙基(SATE)。
在某些实施方案中,R6A和R7A均可为在某些实施方案中,R6A和R7A中至少一项可为在某些实施方案中,R29A可为氢。在其他实施方案中,R29A可为任选取代的C1-24烷基。在某些实施方案中,R29A可为C1-4烷基,如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在其他实施方案中,R29A可为任选取代的芳基,如任选取代的苯基,或任选取代的萘基。在某些实施方案中,R6A和R7A均可为二氧杂环戊烯酮(dioxolenone)基团,并形成二氧杂环戊烯酮前药。
在某些实施方案中,R1A可为R6A可为R7A可不存在或为氢;R12A、R13A和R14A可独立地不存在或为氢;以及m可为0或1。在某些实施方案中,m可为0,并且R7A、R12A和R13A可独立地不存在或为氢。在其他实施方案中,m可为1,并且R7A、R12A、R13A和R14A可独立地不存在或为氢。本领域技术人员理解,m为0时,R6A可为二磷酸,这时Z1A为氧,或者R6A可为α-硫代二磷酸,这时Z1A为硫。同样地,本领域技术人员理解,m为1时,R6A可为三磷酸,这时Z1A为氧,或者R6A可为α-硫代三磷酸,这时Z1A为硫。
在某些实施方案中,R6A和R7A可一起形成任选取代的例如,R1A可为任选取代的当被取代时,环可被1次、2次、3次或者3次或更多次取代。当被多个取代基取代时,取代基可相同或不同。在某些实施方案中,当R1A时,环可被任选取代的芳基基团和/或任选取代的杂芳基取代。合适的杂芳基的实例为吡啶基。在某些实施方案中,R6A和R7A可一起形成任选取代的其中R32A可为:任选取代的芳基、任选取代的杂芳基,或任选取代的杂环基。在某些实施方案中,R6A和R7A可一起形成环1-芳基-1,3-丙烯酯(HepDirect)前药部分。
在某些实施方案中,R6A和R7A可一起形成任选取代的其中与R6A和R7A连接的氧、磷和所述部分形成六元至十元环系。任选取代的的实例包括: 在某些实施方案中,R6A和R7A可形成甲基异丙基环己烯酮(cyclosaligenyl)(cycloSal)前药。
在某些实施方案中,R6A和R7A可相同。在某些实施方案中,R6A和R7A可不同。
在某些实施方案中,Z1A可为氧。在其他实施方案中,Z1A可为硫。
在某些实施方案中,R1A可为在某些实施方案中,R8A可选自:不存在、氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基和任选取代的C3-6环烯基;以及R9A可独立地选自:任选取代的C1-24烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基和任选取代的C3-6环烯基。
在某些实施方案中,R8A可为氢,以及R9A可为任选取代的C1-6烷基。合适的C1-6烷基的实例包括:甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊烷基(支链和直链的)己基(支链和直链的)。在其他实施方案中,R8A可为氢,以及R9A可为NR30AR31A,其中R30和R31可独立地选自:氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基和任选取代的C3-6环烯基。
在某些实施方案中,R8A可不存在或为氢;以及R9A可为任选取代的N连接的氨基酸,或任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物。在其他实施方案中,R8A可为任选取代的芳基;以及R9A可为任选取代的N连接的氨基酸,或任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物。在其他实施方案中,R8A可为任选取代的杂芳基;以及R9A可为任选取代的N连接的氨基酸,或任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物。在某些实施方案中,R9A可选自:丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯基丙氨酸、苏氨酸、色氨酸、缬氨酸和其酯衍生物。任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物的实例包括以下的任选取代的形式:丙氨酸异丙酯、丙氨酸环己酯、丙氨酸新戊酯、缬氨酸异丙酯和亮氨酸异丙酯。在某些实施方案中,R9A可具有结构其中R33A可选自:氢、任选取代的C1-6-烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的芳基、任选取代的芳基(C1-6烷基)和任选取代的卤烷基;R34A可选自:氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C1-6卤烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基);以及R35A可为氢,或任选取代的C1-4-烷基;或R34A和R35A可一起形成任选取代的C3-6环烷基。
当R34A被取代时,R34A可被选自以下的一个或多个取代基取代:N-氨基、巯基、烷硫基、任选取代的芳基、羟基、任选取代的杂芳基、O-羧基和氨基。在某些实施方案中,R34A可为未被取代的C1-6-烷基,如本文所述的C1-6-烷基。在某些实施方案中,R34A可为氢。在其他实施方案中,R34A可为甲基。在某些实施方案中,R33A可为任选取代的C1-6烷基。任选取代C1-6-烷基的实例包括以下的任选取代的变体:甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊烷基(支链和直链的)和己基(支链和直链的)。在某些实施方案中,R33A可为甲基或异丙基。在某些实施方案中,R33A可为乙基或新戊基。在其他实施方案中,R33A可为任选取代的C3-6环烷基。任选取代C3-6环烷基的实例包括以下的任选取代的变体:环丙基、环丁基、环戊基和环己基。在一个实施方案中,R33A可为任选取代的环己基。在其他实施方案中,R33A可为任选取代的芳基,如苯基和萘基。而在其他实施方案中,R33A可为任选取代的芳基(C1-6烷基)。在某些实施方案中,R33A可为任选取代的苄基。在某些实施方案中,R33A可为任选取代的C1-6卤烷基,例如CF3。在某些实施方案中,R35A可为氢。在其他实施方案中,R35A可为任选取代的C1-4-烷基,如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在一个实施方案中,R35A可为甲基。在某些实施方案中,R34A和R35A可一起形成任选取代的C3-6环烷基。任选取代C3-6环烷基的实例包括以下的任选取代的变体:环丙基、环丁基、环戊基和环己基。根据所选的用于R34A和R35A的基团,R34A和R35A与之连接的碳可为手性中心。在某些实施方案中,R34A和R35A与之连接的碳可为(R)-手性中心。在其他实施方案中,R34A和R35A与之连接的碳可为(S)-手性中心。
在某些实施方案中,当R1A时,Z2A可为O(氧)。在其他实施方案中,当R1A时,Z2A可为S(硫)。在某些实施方案中,当R1A时,式(I)化合物可为氨基磷酸酯的前药,如芳基氨基磷酸酯前药。
在某些实施方案中,R1A可为在某些实施方案中,R10A和R11A均可为任选取代的N连接的氨基酸,或任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物。在某些实施方案中,R10A和R11A可独立地选自:丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯基丙氨酸、苏氨酸、色氨酸、缬氨酸和其酯衍生物。在某些实施方案中,R10A和R11A可为以下的任选取代的形式:丙氨酸异丙酯,丙氨酸环己酯,丙氨酸新戊酯,缬氨酸异丙酯和亮氨酸异丙酯。在某些实施方案中,R10A和R11A可独立地具有结构其中R36A可选自:氢、任选取代的C1-6-烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的芳基、任选取代的芳基(C1-6烷基)和任选取代的卤烷基;R37A可选自:氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C1-6卤烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基);以及R38A可为氢,或任选取代的C1-4-烷基;或者R37A和R38A可一起形成任选取代的C3-6环烷基。
当R37A被取代时,R37A可被选自以下的一个或多个取代基取代:N-氨基、巯基、烷硫基、任选取代的芳基、羟基、任选取代的杂芳基、O-羧基和氨基。在某些实施方案中,R37A可为未被取代的C1-6-烷基,如本文所述的C1-6-烷基。在某些实施方案中,R37A可为氢。在其他实施方案中,R37A可为甲基。在某些实施方案中,R36A可为任选取代的C1-6烷基。任选取代C1-6-烷基的实例包括以下的任选取代的变体:甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、戊烷基(支链和直链的)和己基(支链和直链的)。在某些实施方案中,R36A可为甲基或异丙基。在某些实施方案中,R36A可为乙基或新戊基。在其他实施方案中,R36A可为任选取代的C3-6环烷基。任选取代C3-6环烷基的实例包括以下的任选取代的变体:环丙基、环丁基、环戊基和环己基。在一个实施方案中,R36A可为任选取代的环己基。在其他实施方案中,R36A可为任选取代的芳基,如苯基和萘基。而在其他实施方案中,R36A可为任选取代的芳基(C1-6烷基)。在某些实施方案中,R36A可为任选取代的苄基。在某些实施方案中,R36A可为任选取代的C1-6卤烷基,例如CF3。在某些实施方案中,R38A可为氢。在其他实施方案中,R38A可为任选取代的C1-4-烷基,如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在一个实施方案中,R38A可为甲基。在某些实施方案中,R37A和R38A可一起形成任选取代的C3-6环烷基。任选取代C3-6环烷基的实例包括以下的任选取代的变体:环丙基、环丁基、环戊基和环己基。根据所选的用于R37A和R38A的基团,R37A和R38A与之连接的碳可为手性中心。在某些实施方案中,R37A和R38A与之连接的碳可为(R)-手性中心。在其他实施方案中,R37A和R38A与之连接的碳可为(S)-手性中心。
合适的基团的实例包括以下:
在某些实施方案中,R10A和R11A可相同。在某些实施方案中,R10A和R11A可不同。
在某些实施方案中,Z3A可为O(氧)。在其他实施方案中,Z3A可为S(硫)。在某些实施方案中,R1A时,式(I)化合物可为联氨磷酸酯(phosphonicdiamide)的前药。
在某些实施方案中,R1A可为氢。在某些实施方案中,R1A可为任选取代的酰基。在其他实施方案中,R1A可为–C(=O)R39A,其中R39A可选自:任选取代的C1-12烷基、任选取代的C2-12烯基、任选取代的C2-12炔基、任选取代的C3-8环烷基、任选取代的C5-8环烯基、任选取代的C6-10芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基(C1-6烷基)、任选取代的杂芳基(C1-6烷基)和任选取代的杂环基(C1-6烷基)。在某些实施方案中,R39A可为被取代的C1-12烷基。在其他实施方案中,R39A可为未被取代的C1-12烷基。
在其他实施方案中,R1A可为任选取代的O连接的氨基酸。合适的O连接的氨基酸的实例包括:丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯基丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。合适的氨基酸的其他实例包括但不限于:鸟氨酸、高赖氨酸、2-氨基异丁酸、脱氢丙氨酸、γ-氨基丁酸、瓜氨酸、β-丙氨酸、α-乙基-甘氨酸、α-丙基-甘氨酸和正亮氨酸。在某些实施方案中,O连接的氨基酸可具有结构其中R40A可选自:氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C1-6卤烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基);以及R41A可为氢,或任选取代的C1-4-烷基;或者R40A和R41A可一起形成任选取代的C3-6环烷基。本领域技术人员理解,当R1A为任选取代的O连接的氨基酸时,式(I)的R1AO-中的氧为任选取代的O连接的氨基酸的部分。例如,当R1A时,用“*”指示的氧为式(I)的R1AO-的氧。
当R40A被取代时,R40A可被选自以下的一个或多个取代基取代:N-氨基、巯基、烷硫基、任选取代的芳基、羟基、任选取代的杂芳基、O-羧基和氨基。在某些实施方案中,R40A可为未被取代的C1-6-烷基,如本文所述的C1-6-烷基。在某些实施方案中,R40A可为氢。在其他实施方案中,R40A可为甲基。在某些实施方案中,R41A可为氢。在其他实施方案中,R41A可为任选取代的C1-4-烷基,如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在一个实施方案中,R41A可为甲基。根据所选的用于R40A和R41A的基团,R40A和R41A与之连接的碳可为手性中心。在某些实施方案中,R40A和R41A与之连接的碳可为(R)-手性中心。在其他实施方案中,R40A和R41A与之连接的碳可为(S)-手性中心。
合适的的实例包括以下:
如本文所述,在某些实施方案中,R2A可为C1-6叠氮烷基。例如,R2A可为叠氮甲基、叠氮乙基、叠氮丙基、叠氮丁基、叠氮戊烷基或叠氮己基。在其他实施方案中,R2A可为C1-6氨烷基,如氨甲基、氨乙基、氨丙基、氨丁基、氨戊烷基或氨己基。
连接至戊糖环的3’-位置上的基团可变化。在某些实施方案中,R3A可为OH。在其他实施方案中,R3A可为任选取代的O连接的氨基酸。合适的O连接的氨基酸的实例包括:丙氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、脯氨酸、丝氨酸、酪氨酸、精氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯基丙氨酸、苏氨酸、色氨酸和缬氨酸。合适的氨基酸的其他实例包括但不限于:鸟氨酸、高赖氨酸、2-氨基异丁酸、脱氢丙氨酸、γ-氨基丁酸、瓜氨酸、β-丙氨酸、α-乙基-甘氨酸、α-丙基-甘氨酸和正亮氨酸。在某些实施方案中,O连接的氨基酸可具有结构其中R42A可选自:氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C1-6卤烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基);以及R43A可为氢或任选取代的C1-4-烷基;或者R42A和R43A可一起形成任选取代的C3-6环烷基。
当R42A被取代时,R42A可被选自以下的一个或多个取代基取代:N-氨基、巯基、烷硫基、任选取代的芳基、羟基、任选取代的杂芳基、O-羧基和氨基。在某些实施方案中,R42A可为未被取代的C1-6-烷基,如本文所述的C1-6-烷基。在某些实施方案中,R42A可为氢。在其他实施方案中,R42A可为甲基。在某些实施方案中,R43A可为氢。在其他实施方案中,R43A可为任选取代的C1-4-烷基,如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基。在一个实施方案中,R43A可为甲基。根据所选的用于R42A和R43A的基团,R42A和R43A与之连接的碳可为手性中心。在某些实施方案中,R42A和R43A与之连接的碳可为(R)-手性中心。在其他实施方案中,R42A和R43A与之连接的碳可为(S)-手性中心。
合适的的实例包括以下:
在其他实施方案中,R3A可为-OC(=O)R”A,其中R”A可为任选取代的C1-24烷基。在某些实施方案中,R”A可为被取代的C1-8烷基。在其他实施方案中,R”A可为未被取代的C1-8烷基。在其他实施方案中,R3A可为任选取代的-O-酰基。而在其他实施方案中,R3A可为–OC(=O)R44A,其中R44A可选自:任选取代的C1-12烷基、任选取代的C2-12烯基、任选取代的C2-12炔基、任选取代的C3-8环烷基、任选取代的C5-8环烯基、任选取代的C6-10芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的杂环基、任选取代的芳基(C1-6烷基)、任选取代的杂芳基(C1-6烷基)和任选取代的杂环基(C1-6烷基)。在某些实施方案中,R44A可为被取代的C1-12烷基。在其他实施方案中,R44A可为未被取代的C1-12烷基。
在戊糖环的2’-位置可存在多种取代基。在某些实施方案中,R5A可为氢。在其他实施方案中,R5A可为卤素,例如氟或氯。在某些实施方案中,R4A可为卤素,如氟或氯。在某些实施方案中,R5A可为氢,且R4A可为卤素。在某些实施方案中,R5A可为氢,且R4A可为氟。在其他实施方案中,R5A可为氢且R4A可为氯。在其他实施方案中,R4A和R5A均可为卤素。
在戊糖环的5’-位置也可存在多种取代基。在某些实施方案中,Ra1和Ra2均可为氢。在其他实施方案中,Ra1可为氢,且Ra2可为氘。在其他实施方案中,Ra1和Ra2均可为氘。对于1’-位置,在某些实施方案中,RA可为氢。在其他实施方案中,RA可为氘。
在某些实施方案中,B1A不能为被取代的或未被取代的胸腺嘧啶。在其他实施方案中,B1A不能为未被取代的尿嘧啶。在其他实施方案中,B1A不能为胞嘧啶。在某些实施方案中,R1A不能为H。在某些实施方案中,当B1A为任选取代的胞嘧啶或任选取代的胸腺嘧啶时,R1A不能为H。在某些实施方案中,Z1A不能为在某些实施方案中,当R2A为叠氮甲基,R3A为羟基,R4A为卤素(例如氟),R5A为氢,RA为氢且B1A为尿嘧啶时,R1A不能为氢。在某些实施方案中,当R2A为H2N-甲基,R3A为羟基,R4A为卤素(例如氟),R5A为氢,RA为氢且B1A为尿嘧啶时,R1A不能为氢。在某些实施方案中,当R2A为叠氮甲基,R3A为羟基,R4A为卤素(例如氟),R5A为氢且RA为氢时,那么B1A不能为尿嘧啶。在某些实施方案中,当R2A为H2N-甲基,R3A为羟基,R4A为卤素(例如氟),R5A为氢且RA为氢时,那么B1A不能为尿嘧啶。在某些实施方案中,式(I)化合物或药学上可接受的盐不能为在某些实施方案中,式(I)化合物或药学上可接受的盐不能为
多种任选取代的杂环碱基可被连接至戊糖环。在某些实施方案中,一个或多个胺和/或氨基基团可被合适的保护基保护。例如,可通过将胺和/或氨基基团转化为酰胺或氨基甲酸酯来保护氨基基团。在某些实施方案中,任选取代的杂环碱基,或具有一个或多个被保护的氨基基团的任选取代的杂环碱基可具有以下结构的任一种:
其中:RA2可选自:氢、卤素和NHRJ2,其中RJ2可选自:氢、-C(=O)RK2和–C(=O)ORL2;RB2可为卤素或NHRW2,其中RW2可选自:氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C3-8环烷基、-C(=O)RM2和–C(=O)ORN2;RC2可为氢或NHRO2,其中RO2可选自:氢、-C(=O)RP2和–C(=O)ORQ2;RD2可选自:氢、氘、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基;RE2可选自:氢、羟基、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C3-8环烷基、-C(=O)RR2和–C(=O)ORS2;RF2可选自:氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基;Y2和Y3可独立地为N(氮)或CRI2,其中RI2可选自:氢、卤素、任选取代的C1-6-烷基、任选取代的C2-6-烯基和任选取代的C2-6-炔基;RG2可为任选取代的C1-6烷基;RH2可为氢或NHRT2,其中RT2可独立地选自:氢、-C(=O)RU2和–C(=O)ORV2;以及RK2、RL2、RM2、RN2、RP2、RQ2、RR2、RS2、RU2和RV2可独立地选自:C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、C3-6环烯基、C6-10芳基、杂芳基、杂环基、芳基(C1-6烷基)、杂芳基(C1-6烷基)和杂环基(C1-6烷基)。在某些实施方案中,通过用选自“被取代的”的定义所提供的取代基实例中的取代基来代替一个或多个氢,以上所述结构可被修饰。
在某些实施方案中,B1A可为在其他实施方案中,B1A可为在其他实施方案中,B1A可为而在其他实施方案中,B1A可为例如,在某些实施方案中,RD2可为氢。在其他实施方案中,B1A可为在某些实施方案中,RB2可为NH2。在其他实施方案中,RB2可为NHRW2,其中RW2可为-C(=O)RM2或–C(=O)ORN2。在其他实施方案中,B1A可为在某些实施方案中,B1A可为
在某些实施方案中,式(I)化合物可具有结构: 或者上述项的药学上可接受的盐。在其他实施方案中,式(I)化合物可具有结构:或上述项的药学上可接受的盐。在该段落的某些实施方案中,B1A可为任选取代的嘌呤碱基。在该段落的其他实施方案中,B1A可为任选取代的嘧啶碱基。在该段落的某些实施方案中,B1A可为鸟嘌呤。在该段落的其他实施方案中,B1A可为胸腺嘧啶。在该段落的其他实施方案中,B1A可为胞嘧啶。而在该段落的其他实施方案中,B1A可为尿嘧啶。在该段落的某些实施方案中,B1A可为腺嘌呤。在该段落的某些实施方案中,R1A可为氢。在该段落的其他实施方案中,R1A可为任选取代的酰基。在该段落的其他实施方案中,R1A可为单磷酸、二磷酸或三磷酸。而在该段落的其他实施方案中,R1A可为氨基磷酸酯的前药,如芳基氨基磷酸酯的前药。在该段落的某些实施方案中,R1A可为酰氧基烷基磷酸酯的前药。在该段落的其他实施方案中,R1A可为S-酰基硫代乙基(SATE)的前药。在其他实施方案中,R1A可为联氨磷酸酯的前药。而在该段落的其他实施方案中,R1A可为环1-芳基-1,3-丙酰酯(HepDirect)的前药部分。在该段落的某些实施方案中,R1A为甲基异丙基环己烯酮(cyclosaligenyl)(环萨耳,cycloSal)的前药。
合适的式(I)化合物的实例包括但不限于以下:
或上述项的药学上可接受的盐。
合适的式(I)化合物的其他实例包括但不限于以下:
或上述项的药学上可接受的盐。
式(I)化合物的另外实例包括以下:
或上述项的药学上可接受的盐。
式(I)化合物的实例包括以下:
或上述项的药学上可接受的盐。
式(I)化合物的其他实例包括但不限于以下:
或上述项的药学上可接受的盐。
合成
可用多种方式制备式(I)化合物和本文所描述的化合物。某些式(I)化合物可商业获得和/或利用已知的合成方法制备。本文显示和描述了针对式(I)化合物的通用合成路线和被用来合成式(I)化合物的原材料的某些实例。本文所示和所述的路线仅为示例性的,并且无论如何不意图、也不被解释为以任何方式限制权利要求的范围。本领域技术人员将能够认识到所公开的合成的修饰,且能够基于本文的公开设计可选的路线;所有这样的修饰和可选的路线在权利要求的范围内。
方案1
其中R2A为C1-6叠氮烷基的式(I)化合物可制备自核苷,例如式(A)的核苷。在方案1中,Ra、R3a、R4a、R5a和B1a可与本文所描述的式(I)的RA、R3A、R4A、R5A和B1A相同,PG1可为合适的保护基,以及LG1可为合适的离去基团。可使用本领域技术人员已知的方法将核苷的5’-位置氧化为醛。合适的氧化条件包括但不限于:Moffatt氧化、Swern氧化和Corey-Kim氧化;以及合适的氧化剂包括但不限于:Dess-Martin高价碘化物、IBX(2-碘酰基苯甲酸)、TPAP/NMO(四丙基过钌酸铵/N-甲基吗啉N-氧化物)、Swern氧化试剂、PCC(氯铬酸吡啶鎓)、PDC(重铬酸吡啶鎓)、高碘酸钠、Collin’s试剂、硝酸铈铵CAN、水中的Na2Cr2O7、硅藻土上的Ag2CO3、水性甘醇二甲醚中的热HNO3、O2-吡啶CuCl、Pb(OAc)4-吡啶和过氧化苯甲酰-NiBr2。随着醛还原为醇,可将羟甲基基团添加至戊糖环的4’-位置。可使用甲醛和碱(如氢氧化钠),经缩合反应将羟甲基基团加入。羟甲基基团加入后,可使用还原试剂进行具有4’-羟甲基基团的中间化合物的还原。合适的还原剂的实例包括但不限于NaBH4和LiAlH4。合适的离去基团(如三氟甲磺酸酯)可通过代替连接至4’-位置的羟甲基基团的氢形成,以及连接至5’-位置的氧可被合适的保护基保护(例如,通过与碱基、B1a或单独的保护基的环化作用)。可使用叠氮化金属试剂,例如叠氮化钠,使离去基团被叠氮基基团代替。
方案2
方案3
可使用本领域技术人员已知的多种方法,制备具有连接至戊糖环5’-位置的含磷基团的式(I)化合物。方法的实例如方案2和3所示。在方案2和3中,Ra、R2a、R3a、R4a、R5a和B1a可与本文所描述的式(I)的RA、R2A、R3A、R4A、R5A和B1A相同。含磷前体可被偶联至核苷,例如,式(B)的化合物。如方案2所示,含磷前体的偶联后,可在合适的条件下(如水解)切割任何离去基团。可使用本领域技术人员已知的方法,例如使用焦磷酸盐将其他含磷基团加入。
在某些实施方案中,可使用有机金属试剂(如格氏试剂),从式(C)的化合物产生醇盐。醇盐可被偶联至含磷前体。合适的格氏试剂为本领域技术人员已知,并且包括但不限于:烷基氯化镁和烷基溴化镁。在某些实施方案中,可使用适当的碱。合适的碱的实例包括但不限于:胺碱,如烷基胺(其包括单烷基胺、二烷基胺和三烷基胺(例如三乙胺)),任选取代的吡啶(例如可力丁)和任选取代的咪唑(例如N-甲基咪唑))。或者,可将含磷前体加入至核苷并形成亚磷酸盐。可使用本领域技术人员已知的条件,将亚磷酸盐氧化为磷酸盐。合适的条件包括但不限于:间-氯过氧苯甲酸(MCPBA),以及作为氧化剂的碘和作为氧供体的水。
可将4’-位置上的C1-6叠氮烷基还原为C1-6氨烷基。可使用本领域技术人员已知的多种还原剂/条件。例如,叠氮基基团经氢化作用(例如,H2-Pd/C或HCO2NH4-Pd/C)、Staudinger反应、NaBH4/CoCl2·6H2O、Fe/NH4Cl或Zn/NH4Cl可被还原为氨基基团。
当式(I)化合物具有为硫的Z1A、Z2A或Z3A时,硫可以以本领域技术人员已知的多种方式加入。在某些实施方案中,硫可为含磷前体的部分,例如,或者,可使用硫化试剂将硫加入。合适的硫化剂是本领域技术人员已知的,并且包括但不限于:元素硫、劳氏试剂、环辛硫、3H-1,2-苯并二硫杂环戊二烯-3-酮-1,1-二氧化物(Beaucage’s试剂)、3-((N,N-二甲基氨亚甲基)氨基)-3H-1,2,4-二噻唑-5-硫酮(DDTT)和二(3-三乙氧基甲硅烷基)丙基-四硫化物(TEST)。
合适的含磷前体可商业获得,或通过本领域技术人员已知的合成方法制备。含磷前体的通用结构实例如方案2和3所示。
在本文所描述的化合物任一种的合成期间,如果需要,连接至戊糖环上的任何羟基基团和B1a上存在的任何–NH和/或NH2基团,可用一个或多个合适的保护基保护。本文描述了合适的保护基。例如,当R3a为羟基基团时,R3a可用三芳基甲基基团或甲硅烷基基团保护。同样地,B1a上存在的任何–NH和/或NH2基团,可用如三芳基甲基和甲硅烷基基团保护。三芳基甲基基团的实例包括但不限于:三苯甲基、单甲氧三苯甲基(MMTr)、4,4'-二甲氧三苯甲基(DMTr)、4,4',4"-三甲氧三苯甲基(TMTr)、4,4',4"-三-(苯甲酰氧基)三苯甲基(TBTr)、4,4',4"-三(4,5-二氯苯二甲酰亚氨基)三苯甲基(CPTr)、4,4',4"-三(乙酰丙酸基氧基(levulinyloxy))三苯甲基(TLTr)、p-茴香基-1-萘基苯基甲基、二-o-茴香基-1-萘甲基、p-甲苯二苯甲基、3-(咪唑甲基)-4,4'-二甲氧三苯甲基、9-苯基氧杂蒽-9-基(Pixyl)、9-(p-甲氧苯基)氧杂蒽-9-基(Mox)、4-癸氧基三苯甲基、4-十六烷氧基三苯甲基、4,4'-双十八烷基三苯甲基、9-(4-十八烷氧基苯基)氧杂蒽-9-基、1,1'-二-(4-甲氧苯基)-1'-芘甲基、4,4',4"-三-(叔丁基苯基)甲基(TTTr)和4,4'-二-3,5-六双烯氧基(hexadienoxy)三苯甲基。甲硅烷基基团的实例包括但不限于:三甲基甲硅烷基(TMS)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBDMS)、三异丙基甲硅烷基(TIPS)、叔丁基二苯基甲硅烷基(TBDPS)、三-异丙基甲硅烷氧基甲基和[2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基]甲基。本领域技术人员将了解,连接至戊糖环的基团和B1a上存在的任何–NH和/或NH2基团可用多种保护基保护,并且存在的任何保护基可被交换为其他保护基。保护基的选择和交换在本领域普通技术人员的技能内。任何保护基可通过本领域已知的方法去除,例如,用酸(例如无机酸或有机酸)、碱或氟化物来源。
药物组合物
本文所描述的某些实施方案涉及药物组合物,其可包含有效量的本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)以及药学上可接受的载体、稀释剂、赋形剂或其组合。
术语“药物组合物”指本文公开的一个或多个化合物与其他化学组分(如稀释或载体)的混合物。药物组合物有利于将所述化合物施用于生物体。也通过将化合物与无机酸或有机酸(如氢氯酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸、甲磺酸、乙磺酸、对甲苯磺酸和水杨酸)反应获得药物组合物。药物组合物通常针对施用的具体预期途径调整。
术语“生理上可接受的”限定了不废除所述化合物的生物学活性和特性的载体、稀释剂或赋形剂。
如本文所用,“载体”指促进化合物并入细胞或组织的化合物。例如但不限于二甲亚砜(DMSO),其为促进许多有机化合物吸收进个体的细胞或组织的常用载体。
如本文所用,“稀释剂”指药物组合物中的成分,其缺乏药理活性但可为药学上必需的或需要的。例如,稀释剂可被用来增加强效药物(其质量对于制备和/或施用来说太少)的体积。其也可为用于溶解通过注射、咽下或吸入来施用的药物的液体。本领域稀释剂的常规形式为缓冲水性溶液,例如但不限于,模拟人血液组分的磷酸缓冲盐。
如本文所用,“赋形剂”指被加入至药物组合物为所述组合物提供不限于体积、一致性、稳定性、结合能力、润滑作用、崩解能力等等的惰性物质。“稀释剂”是赋形剂的类型。
可将本文所描述的药物组合物本身施用于的人患者,或者在药物组合物中混合有其他活性成分(如在联合治疗中)、或载体、稀释剂、赋形剂或其组合。适当的配方取决于所选的施用途径。配方的技术和本文所描述的化合物施用是本领域技术人员已知的。
本文公开的药物组合物可以以自身已知的方式制备,例如,通过以下手段:常规混合、溶解、造粒、制作糖衣丸、磨细、乳化、包封、截留或制锭的方法。此外,以能有效实现其预期目的量含有活性成分。本文公开的药物组合中使用的许多化合物,可被提供为具有药学上可兼容的抗衡离子的盐。
本领域存在施用化合物的多种技术,包括但不限于:口服、经肠、外用、气溶胶、注射和肠胃外递送,其包括肌内、皮下、静脉内、髓内注射、囊内、直接的心室内、腹膜内、鼻内和眼内注射。
也可以以局部而不是全身的方式施用所述化合物,例如,通常以储库或缓释剂型的方式将化合物直接地注射进感染区域。此外,可以以靶向药物递送系统的形式施用化合物,例如,以包被有组织特异性抗体的脂质体的形式。脂质体将被靶向至器官并被其选择性地吸收。
如果需要,组合物可以以包装或分配器装置的形式存在,所述包装或分配器装置可包含一个或多个含有活性成分的单位剂型。例如,包装可包含金属或塑料箔,如泡罩包装。包装或分配器装置可附有施用说明书。包装或分配器也可附有与管控药物的制造、使用或销售的政府机关所规定的形式的容器有关的注意事项,该注意事项反应了所述机关对用于人或兽医施用的药物形式的批准。这样的注意事项,例如,可为美国食品和药物管理局针对处方药所批准的标签,或被批准的产品夹带的说明书。也可制造包含在可兼容药物载体中配制的本文所描述的化合物的组合物,并放置在适当的容器中,且标注了用于治疗指定的病况。
使用方法:
本文所描述的某些实施方案涉及减轻、治疗和/或预防副粘病毒的病毒感染的方法,其可包括对个体施用有效量的本文所描述的一种或多种化合物,或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物。在某些实施方案中,所述个体被鉴定为患有副粘病毒的病毒感染。
本文所描述的其他实施方案涉及抑制副粘病毒的病毒复制的方法,其可包括使感染有病毒的细胞与有效量的式(I)化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物接触。例如,式(I)化合物或药学上可接受的盐可作为链终止剂,并且抑制病毒的复制。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻副粘病毒的病毒感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,预防副粘病毒的病毒感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,抑制副粘病毒的复制。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,抑制副粘病毒的聚合酶复合体。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻由副粘病毒的病毒感染引起的上呼吸道病毒感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻由副粘病毒的病毒感染引起的下呼吸道病毒感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻由副粘病毒的病毒感染引起的一种或多种感染症状(如本文所描述的症状)。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻归因于副粘病毒的病毒感染的毛细支气管炎和/或气管支气管炎。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻归因于副粘病毒的病毒感染的肺炎。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻归因于副粘病毒的病毒感染的哮吼。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻呼吸道合胞体病毒(RSV)感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,预防呼吸道合胞体病毒感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,抑制呼吸道合胞体病毒的复制。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,抑制RSV聚合酶复合体。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻由RSV感染引起的上呼吸道病毒感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻由RSV感染引起的下呼吸道病毒感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻由RSV感染引起的一种或多种感染症状(如本文所描述的症状)。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻归因于RSV感染的毛细支气管炎和/或气管支气管炎。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻归因于RSV感染的肺炎。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻归因于RSV感染的哮吼。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻HPIV-1感染和/或HPIV-3感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,预防HPIV-1感染和/或HPIV-3感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,抑制HPIV-1和/或HPIV-3的复制。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,抑制HPIV-1聚合酶复合体和/或HPIV-3聚合酶复合体。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻HPIV-2感染和/或HPIV-4感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,预防HPIV-2感染和/或HPIV-4感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,抑制HPIV-2和/或HPIV-4的复制。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,抑制HPIV-2聚合酶复合体和/或HPIV-4聚合酶复合体。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻偏肺病毒感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,预防偏肺病毒感染。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,抑制偏肺病毒的复制。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,抑制偏肺病毒聚合酶复合体。在某些实施方案(包括该段落的实施方案)中,偏肺病毒可为人偏肺病毒。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻由选自以下的病毒引起的上呼吸道病毒感染:RSV病毒、副流感病毒和偏肺病毒。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻由选自以下的病毒引起的下呼吸道病毒感染:RSV病毒、副流感病毒和偏肺病毒。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻由选自以下的病毒引起的一种或多种感染症状(如本文所描述的症状):RSV病毒、副流感病毒和偏肺病毒。
在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻归因于RSV病毒感染、副流感病毒感染和偏肺病毒感染的毛细支气管炎和/或气管支气管炎。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻归因于RSV病毒感染、副流感病毒感染和偏肺病毒属感染的肺炎。在某些实施方案中,可使用有效量的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐,和/或有效量包含本文所描述的一种或多种化合物(例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐)的药物组合物,治疗和/或减轻归因于RSV病毒感染、副流感病毒感染和偏肺病毒属感染的哮吼。
可被用来治疗、减轻和/或预防副粘病毒的病毒感染的式(I)的一种或多种化合物或其药学上可接受的盐可为段落[0083]-[0130]中所描述的任何实施方案中提供的式(I)化合物或其药学上可接受的盐。
如本文所用,术语“预防(prevent/preventing)”意指与没有接受所述化合物的个体相比,较大程度地降低了接受该化合物的个体中病毒复制的功效和/或抑制了病毒复制。预防形式的实例包括对已暴露于或可能暴露于感染原(如副粘病毒(例如,RSV))的个体的预防施用。
如本文所用,术语“治疗(treat/treating/treatment)”、“治疗的(therapeutic)”和“疗法(therapy)”不一定意味着疾病或病况的完全治愈或消除。对疾病或病况的任何不想要的病征或症状任意减轻至任何程度,可被认为是治疗和/或疗法。此外,治疗可包括使个体的良好状态或外观的整体感觉恶化的行为。
可使用术语“治疗有效量”和“有效量”表示活性化合物或药物剂的量,其引起指示的生物学或医学应答。例如,化合物的有效量可为预防、减轻或改善疾病症状或者延长受治疗患者的存活所需的量。该应答可发生于组织、系统、动物或人,并且包括受治疗疾病的病征或症状的减轻。根据本文提供的公开,有效量的测定是在本领域技术人员的能力内。作为剂量所需的本文公开的化合物的治疗有效量,将取决于考虑的施用途径、受治疗动物(包括人)的类型、具体动物的身体特点。可调整剂量以实现预期效果,但取决于诸如体重、饮食、同时用药这样的因素,以及医学领域技术人员公认的其他因素。
确定用于治疗副粘病毒的病毒感染方法的有效性的多种指标是本领域技术人员已知的。合适的指标的实例包括但不限于:病毒负载的降低、病毒复制的降低、血清转化时间的降低(患者血清中病毒检测不到)、临床结果中发病率或死亡率的降低和/或疾病应答的其他指标。
在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐的有效量为,有效降低病毒滴度至不可检测水平的量,例如,约1000至约5000、约500至约1000,或约100至约500个基因组拷贝/mL血清。在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐的有效量为,与施用式(I)化合物或其药学上可接受的盐之前的病毒负载相比,有效降低病毒负载的量。例如,其中在施用式(I)化合物或其药学上可接受的盐之前,测定病毒负载,并且在使用式(I)化合物或其药学上可接受的盐的治疗方案完成后(例如完成后1周),再次测定病毒负载。在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐的有效量可为,有效降低病毒负载至低于约100个基因组拷贝/mL血清的量。在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐的有效量为,与施用式(I)化合物或其药学上可接受的盐之前的病毒负载相比,有效实现个体血清中病毒滴度的降低范围为约1.5-log至约2.5-log降低、约3-log至约4-log降低,或大于约5-log降低的量。例如,其中在施用式(I)化合物或其药学上可接受的盐之前,测定病毒负载,并且在使用式(I)化合物或其药学上可接受的盐的治疗方案完成后(例如,完成后1周),再次测定病毒负载。
在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐可导致副粘病毒复制相对于个体的预处理水平至少1、2、3、4、5、10、15、20、25、50、75、100倍或更多倍的降低,如治疗方案完成后(例如,完成后1周)所测定。在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐可导致副粘病毒的复制相对于预处理水平的降低范围为约2至约5倍、约10至约20倍、约15至约40倍,或约50至约100倍。在某些实施方案中,与病毒唑实现的副粘病毒复制的降低相比,式(I)化合物或其药学上可接受的盐可导致副粘病毒复制的降低范围为1至1.5log、1.5log至2log、2log至2.5log、2.5至3log、3log至3.5log,或3.5至4log,或更多的副粘病毒复制的降低,或者与病毒唑疗法六个月后所实现的降低相比,可在较短的时期内(例如一周、两周、一个月、两个月或三个月内)实现与病毒唑疗法相同的降低。
在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐的有效量为,有效实现持久病毒应答的量,例如,疗法停止后至少约一周、两周、一个月、至少约两个月、至少约三个月、至少约四个月、至少约五个月,或至少约六个月的时期内,在个体的血清中发现未检出或基本上未检出副粘病毒RNA(例如,每毫升血清小于约500、小于约400、小于约200或小于约100个基因组拷贝)。
一段时期后,感染原可对一种或多种治疗剂产生抗性。如本文所用,术语“抗性”指病毒株对治疗剂呈现出延迟的、减少的和/或零应答。例如,用抗病毒剂治疗后,与感染有非抗性毒株的个体所显示出的病毒负载降低的量相比,感染有抗性病毒株的个体的病毒负载可降低更少的程度。在某些实施方案中,可将式(I)化合物或其药学上可接受的盐施用于感染有RSV且对一种或多种不同的抗RSV剂(例如病毒唑)有抗性的个体,以改善和/或治疗RSV感染。在某些实施方案中,用式(I)化合物或其药学上可接受的盐治疗个体时,与对其他抗RSV剂有抗性的一种或多种RSV毒株的发展相比,可延迟一种或多种抗性RSV毒株的发展。
在某些实施方案中,与用病毒唑治疗且经历并发症的个体的百分比相比,式(I)化合物或其药学上可接受的盐,可降低经历来自RSV病毒感染的并发症的个体的百分比。例如,与用病毒唑治疗的个体相比,用式(I)化合物或其药学上可接受的盐治疗且经历并发症的个体的百分比可减少10%、25%、40%、50%、60%、70%、80%和90%。
在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐,或者包含本文所描述的化合物的药物组合物,可被用于与一种或多种其他药剂联用。在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐可与当前用于治疗RSV的一种或多种药剂联用。例如,其他药剂可为病毒唑、帕利珠单抗和RSV-IGIV。针对RSV的治疗,其他药剂包括但不限于:ALN-RSV01(于2008年12月15日提交的美国公开第2009/0238772号,具有正义链序列(5'至3')GGCUCUUAGCAAAGUCAAGdTdT(SEQIDNO.1)和反义链序列(5'至3')CUUGACUUUGCUAAGAGCCdTdT(SEQIDNO.2)的siRNA药剂;Alnylam制药公司)、BMS-433771(1-环丙基-3-[[1-(4-羟丁基)苯并咪唑基-2-基]甲基]咪唑[4,5-c]吡啶-2-酮)、RFI-641(4,4"-双-{4,6-双-[3-(双-氨甲酰甲基-氨磺酰基)-苯基氨基]-(1,3,5)三嗪-2-基氨基}-二苯基-2,2"-二磺酸)、RSV604((S)-1-(2-氟苯基)-3-(2-氧代-5-苯基-2,3-二氢-1H-苯并[e][1,4]二氮杂卓-3-基)尿素)、MDT-637(5,5′-双[1-(((5-氨基-1H-四唑基)亚氨基)甲基)]2,2′,4″-次甲三苯酚)、BTA9881((R)-9b-(4-氯苯基)-1-(4-氟苯甲酰基)-2,3-二氢-1H-咪唑[1',2':1,2]吡咯[3,4-c]吡啶-5(9bH)-酮)、TMC-353121(2-[[6-[[[2-(3-羟丙基)-5-甲苯基]氨基]甲基]-2-[[3-(吗啉-4-基)丙基]氨基]苯并咪唑-1-基]甲基]-6-甲基吡啶-3-醇)(Tibotec)、MBX-300([2,2-双(二十二酰基-甲氧基)丙基-5-乙酰氨基-3,5-二脱氧-4,7,8,9-四-O-(钠-氧基磺酰基)-D-丙三氧基-D-半乳-2-吡喃神经氨酸(nonulopyranosid)]酮酸酯)、YM-53403(6-{4-[(二苯基-2-羰基)氨基]苯甲酰基}-N-环丙基-5,6-二氢-4H-噻吩并[3,2-d][1]苯并氮杂卓-2-氨甲酰)、莫维珠单抗(Medi-524,MedImmune)、Medi-559(重组的RSVA2cp248/404/1030/ΔSH)、Medi-534(载体疫苗候选物重组的牛/人副流感病毒类型3(PIV3)/RSVF2)、Medi-557、RV568和RSV-F颗粒疫苗(Novavax)。
在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐,可与一种或多种其他药剂在单药物组合物中一起施用。在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐,可与一种或多种其他药剂作为两种或更多种分开的药物组合物施用。例如,式(I)化合物或其药学上可接受的盐,可在一种药物组合物中施用,并且其他药剂中的至少一种可在第二药物组合物中施用。如果存在至少两种其他药剂,其他药剂中的至少一种或多种,可在包含式(I)化合物或其药学上可接受的盐的第一药物组合物中,并且另外的其他药剂中的至少一种可在第二药物组合物中。
式(I)化合物或其药学上可接受的盐与一种或多种其他药剂的施用顺序可变化。在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐,可在所有其他药剂之前施用。在其他实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐,可在至少一种其他药剂之前施用。在其他实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐,可与一种或多种其他药剂同时施用。而在其他实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐,可在至少一种其他药剂的施用后施用。在某些实施方案中,式(I)化合物或其药学上可接受的盐,可在所有其他药剂的施用后施用。
利用式(I)化合物或其药学上可接受的盐与段落[173]所述的一种或多种其他药剂(包括其药学上可接受的盐和前药)联用的可能优点可为:该段落中所述的一种或多种化合物(包括其药学上可接受的盐和前药)有效治疗本文公开的疾病病况(例如,RSV)的所需量,与在没有式(I)化合物或其药学上可接受的盐的情况下施用该段落中所述的一种或多种化合物(包括其药学上可接受的盐和前药)时实现相同治疗结果所需的量相比有降低。例如,该段落中所述的化合物(包括其药学上可接受的盐和前药)的量,相比以单药治疗方式施用时实现相同的病毒负载降低所需的该段落中所述的化合物(包括其药学上可接受的盐和前药)的量更少。利用式(I)化合物或其药学上可接受的盐与该段落中所述的一种或多种其他药剂(包括其药学上可接受的盐和前药)联用的另一可能的优点为:与化合物以单药治疗形式施用时对抗性病毒毒株发展产生的障碍相比,具有不同作用机制的两种或更多种化合物的使用能产生更高的所述障碍。
利用式(I)化合物或其药学上可接受的盐与段落[173]所述的一种或多种其他药剂(包括其药学上可接受的盐和前药)联用的另一优点可包括:式(I)化合物或其药学上可接受的盐和该段落中所述的一种或多种其他药剂(包括其药学上可接受的盐和前药)之间几乎没有交叉抗性;去除式(I)化合物或其药学上可接受的盐以及该段落中所述的一种或多种其他药剂(包括药学上可接受的盐和其前药)采用不同途径;式(I)化合物或其药学上可接受的盐和该段落中所述的一种或多种其他药剂(包括其药学上可接受的盐和前药)之间几乎没有重叠的毒性;对细胞色素P450几乎没有明显影响;和/或式(I)化合物或其药学上可接受的盐和该段落中所述的一种或多种其他药剂(包括其药学上可接受的盐和前药)之间几乎没有药物代谢动力学的相互作用。
对本领域技术人员很显而易见的是,将根据年龄、体重、痛苦的严重性、以及被治疗的哺乳动物种类、采用的具体化合物、以及这些化合物的具体用途,来改变所施用的有效体内剂量和具体施用模式。本领域技术人员使用常规的方法(例如人临床试验和体外研究)可完成有效剂量水平(即实现预期结果所需的剂量水平)的测定。
根据预期效果和治疗适应证,剂量可存在大的范围。如本领域技术人员所理解的,可选的剂量可基于并根据患者的表面面积计算。尽管精确的剂量可根据每个药物来逐一测定,但在大多数情况下,可做出关于剂量的某些概括。成人患者的每日剂量方案可为:例如,口服剂量为0.01-3000mg每种活性成分,更优选1-700mg,例如5-200mg。根据患者的需要,在一天或多天的疗程中,剂量可为单种或连续的两种或更多种指定剂量。在某些实施方案中,化合物将被施用于连续的治疗周期内,例如一周或数周,或者数月或数年。
在针对至少某种条件已被建立的用于人的化合物剂量的实例中,可使用相同的剂量,或者为已建立的人剂量的约0.1%至500%,更优选约25%至250%的剂量。当未建立人的剂量时,新发现的药物组合物为该情况,从对动物的毒性研究和功效研究获得的源自体外或体内研究的ED50或ID50值,或者其他适当的值可推测出合适的人的剂量。
在施用药学上可接受的盐的情况下,剂量可被计算为游离的碱。如本领域技术人员所理解的,在某些情形下,为了有效地且积极地治疗特别具有侵袭性的疾病或感染,可能必须以超过或甚至远远超过上述规定的优选剂量范围的量施用本文公开的化合物。
可分别地调整剂量用量和剂量间隔,以提供足以维持调节效果或最低有效浓度(MEC)的活性部分的血浆水平。对于每种化合物,MEC将不同,但可从体外数据估算出。实现MEC所需的剂量将取决于个体的性质和施用途径。然而,可使用HPLC检测或生物检测来测定血浆浓度。使用MEC值也可确定剂量间隔。应当使用在10-90%的时间,优选30-90%的时间,以及最优选50-90%的时间内,维持血浆水平超过MEC的方案施用组合物。在局部施用或选择性吸收的情况下,药物的有效局部浓度可不与血浆浓度相关。
应当注意,由于毒性或器官机能障碍,主治医师知道如何且何时终止、中断或调整施用。相反地,如果临床应答不足,主治医师也知道将治疗调整至较高水平(排除毒性)。在目标病症的管控中施用的剂量的量级,将随着被治疗病况的严重性和施用途径而变化。例如可通过标准的预后评估方法,在某种程度上评估病况的严重性。而且,剂量和可能的剂量频率,将根据个体患者的年龄、体重和应答而变化。与上述讨论的程序相当的程序可被用于兽医医学中。
可使用已知的方法评估本文公开的化合物的功效和毒性。例如,可通过测定针对细胞系(如哺乳动物,以及优选人的细胞系)的体外毒性,建立具体化合物或化合物的子集(共享某种化学基团)的毒理学。这样的研究结果通常预测对动物(如哺乳动物或更具体地,人)的毒性。或者,可使用已知的方法测定具体的化合物对动物模型(如小鼠、大鼠、兔或猴)的毒性。可使用多种公认的方法(如体外方法、动物模型或人的临床试验)确立具体化合物的功效。当选择用于确定功效的模型时,可通过本领域的现有技术来指导技术人员选择适当的模型、剂量、施用途径和/或方案。
实施例
其他实施方案在下面的实施例中进一步详细地公开,其不以任何方式意图限制权利要求的范围。
实施例1
化合物1A的制备
(1-2)的制备:向1-1(50g,203mmol)在无水吡啶(200mL)中的溶液加入TBDPS-Cl(83.7g,304mmol)。允许反应在室温下过夜进行。在低压下将溶液浓缩以得到残余物,其在乙酸乙酯和水之间分配。将有机层分离,用盐水洗涤,用硫酸镁干燥且减压浓缩,得到白色泡沫的5'-OTBDPS乙醚(94g)。
向5'-OTBDPS乙醚(94.0g,194.2mmol)在无水DCM(300mL)中的溶液加入硝酸银(66.03g,388.4mmol)和可力丁(235mL,1.94mol)。在室温下,搅拌混合物。15分钟后,将混合物冷却至0℃,并且加入单甲氧基氯化三苯甲烷(239.3g,776.8mmol),作为单部分。室温过夜搅拌后,将混合物通过硅藻土过滤,并且滤液用TBME稀释。将溶液依次用1M柠檬酸、稀盐水和5%碳酸氢钠洗涤。有机溶液用硫酸钠干燥,并且在真空下浓缩,得到黄色泡沫的完全被保护的中间物。
将该完全被保护的中间物溶解在甲苯(100mL)中,并且将溶液减压浓缩。将残留物溶解在无水THF(250mL)中,并且用TBAF(60g,233mmol)处理。在室温下,将混合物搅拌2小时,并且将溶剂减压去除。将残留物溶解于乙酸乙酯,并且将溶液首先用饱和的碳酸氢钠,然后用盐水洗涤。用硫酸镁干燥后,在真空下去除溶剂,并且将残留物通过柱色谱(PE中50%EA)纯化,得到白色泡沫的1-2(91g,86.4%)。
(1-3)的制备:向1-2(13.5g,26mmol)在DCM(100mL)中的溶液加入吡啶(6.17mL,78mmol)。将溶液冷却至0℃,并且加入Dess-Martin高价碘化物(33.8g,78mmol),作为单部分。在室温下,将反应混合物搅拌4小时,并且通过加入Na2S2O3溶液(4%)和碳酸氢钠水溶液(4%)(调整溶液至pH6,~150mL)猝灭。将混合物搅拌15分钟。将有机层分离,用稀盐水洗涤,并且减压浓缩。将残留物溶解在二氧六环(100mL)中,并且将溶液用37%甲醛水溶液(21.2g,10当量)和2N氢氧化钠水溶液(10当量)处理。在室温下,将反应混合物过夜搅拌。室温下搅拌0.5小时后,用饱和的NH4Cl(~150mL)去除过量的氢氧化钠水溶液。将混合物减压浓缩,并且残留物在乙酸乙酯和5%碳酸氢钠之间分配。将有机相分离,用盐水洗涤,用硫酸镁干燥并浓缩。将残留物通过柱色谱(DCM中2%MeOH)纯化,得到白色泡沫的二醇1-3(9.2g,83.6%)。
(1-4)的制备:将化合物1-3(23g,42.0mmol)与甲苯共蒸发两次。将残留物溶解在无水DCM(250mL)和吡啶(20mL)中。将溶液冷却至0℃,并且在10分钟内逐滴加入三氟甲磺酸酐(24.9g,88.1mmol)。在该温度下,将反应物搅拌40分钟。通过TLC(PE:EA=2:1和DCM:MeOH=15:1)监测反应。完成后,在0℃下,将反应混合物用水(50mL)猝灭。将混合物搅拌30分钟,并且用EA萃取。有机相用Na2SO4干燥,并且通过硅胶垫过滤。将滤液减压浓缩,并且将残留物通过柱色谱(PE中50%EA)纯化,以得到棕色泡沫的1-4(30.0g,88.3%)。
(1-5)的制备:在0℃、氮气气氛下,向1-4(4.4g,5.42mmol)在无水DMF(50mL)中的搅拌下溶液加入NaH(260mg,6.5mmol)。在室温下,将溶液搅拌1.5小时。将溶液在无任何其他后处理的情况下用于下一步。
(1-6)的制备:在0℃、氮气气氛下,向搅拌下溶液加入NaN3(1.5g,21.68mmol),并且将得到的溶液在室温下搅拌1.5小时。将反应用水猝灭,用EA萃取,用盐水洗涤,并且用MgSO4干燥。将浓缩的有机相在不进一步纯化的情况下用于下一步。
(1-7)的制备:在室温下,向1-6(3.0g,5.4mmol)在无水1,4-二氧六环(18mL)中的溶液加入NaOH(5.4mL,在水中2M)。在室温下,将反应将混合物搅拌3小时。将反应物用EA稀释,用盐水洗涤,并且用MgSO4干燥。将浓缩的有机相在硅胶柱(PE中30%EA)上纯化,得到白色泡沫的1-7(2.9g,93%)。
(1A)的制备:在室温下,将化合物1-7(520mg,0.90mmol)溶解在80%HCOOH(20mL)中。将混合物搅拌3小时,并且通过TLC监测。将溶剂去除,并且残留物用MeOH和甲苯处理3次。加入NH3/MeOH,并且在室温下将反应混合物搅拌5分钟。将溶剂浓缩至干燥,并且将残留物通过柱色谱纯化,以得到白色固体的1A(120mg,44.4%)。ESI-LCMS:m/z302.0[M+H]+,324.0[M+Na]+
实施例2
化合物2A的制备
(2-1)的制备:在25℃、N2气氛下,向1-7(1.1g,2.88mmol)在无水DCM(10mL)中的搅拌下溶液加入MMTrCl(1.77g,5.76mmol)、AgNO3(1.47g,8.64mmol)和可力丁(1.05g,8.64mmol)。将反应物回流12小时。加入MeOH(20mL),并且将溶剂去除至干燥。将残留物在硅胶柱(PE中20%EA)上纯化,得到白色泡沫的2-1(1.6g,85.1%)。
(2-2)的制备:在室温下,向2-1(800mg,0.947mmol)在无水MeCN(10mL)中的搅拌下溶液加入TPSCl(570mg,1.89mmol)、DMAP(230mg,1.89mmol)和TEA(190mg,1.89mmol)。将混合物搅拌12小时。加入NH4OH(25mL),并且将混合物搅拌2小时。去除溶剂,并且将残留物在硅胶柱上纯化为黄色泡沫。通过预TLC的进一步纯化,得到白色固体的2-2(700mg,87.1%)。
(2A)的制备:在室温下,将化合物2-2(300mg,0.355mmol)溶解在80%HCOOH(5mL)中。将混合物搅拌3小时,并且通过TLC监测。然后将溶剂去除,并且将残留物用MeOH和甲苯处理(3次)。加入NH3/MeOH,并且在室温下将混合物搅拌5分钟。去除溶剂,并且将残留物通过柱色谱纯化,得到白色固体的2A(124mg,82.6%)。ESI-LCMS:m/z301.0[M+H]+,601.0[2M+H]+
实施例3
化合物14A的制备
(AA-2)的制备:在室温(18℃)下,将AA-1(2.20g,3.84mmol)溶解在80%HCOOH(40mL)中。在室温下,将混合物搅拌12小时。将溶剂在低压下去除。将残留物通过柱色谱(使用己烷中50%EA)纯化,得到白色固体的AA-2(1.05g,91.3%)。
(AA-3)的制备:在室温(16℃)、N2气氛下,向AA-2(1g,3.32mmol)在无水吡啶(20mL)中的搅拌下溶液加入TBSCl(747mg,4.98mmol)和咪唑(451mg,6.64mmol)。在室温下,将混合物搅拌4小时。将得到的溶液减压浓缩至干燥,并且将残留物溶解在EA(100mL)中。将溶液用饱和的NaHCO3溶液和盐水洗涤,并且用无水MgSO4干燥。将溶液浓缩至干燥,并且将残留物在硅胶柱上(使用己烷中20%EA)纯化,得到白色固体的AA-3(1.4g,79.5%)。
(AA-4)的制备:在室温(15℃)下,向AA-3(1.50g,2.83mmol,1.00当量)在无水CH3CN(28mL)中的搅拌下溶液加入TPSCl(1.71g,5.80mmol,2.05当量)、DMAP(691.70mg,5.66mmol,2.00当量)和TEA(573.00mg,5.66mmol,2.00当量)。将混合物搅拌2小时。加入NH3.H2O(20mL),并且将混合物搅拌3小时。将混合物用EA萃取(3×60mL)。将有机相用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物在硅胶柱(PE中30%EA)上纯化,得到黄色泡沫的AA-4(2.3g,粗的)。
(AA-5)的制备:在室温(15℃)、N2气氛下,向AA-4(1.90g,2.34mmol)在无水DCM(20mL)中的搅拌下溶液加入DMTrCl(1.82g,3.49mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(1.00g,8.25mmol)。在室温下,将混合物搅拌12小时。加入MeOH(20mL)。将混合物过滤,并且将滤液浓缩至干燥。将残留物溶解在EA(80mL)中。将溶液用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物在硅胶柱(DCM中5%MeOH)上纯化,得到白色固体的AA-5(1.4g,粗品)。
(AA)的制备:将AA-5(2.40g,2.60mmol)溶解在TBAF(10mL,在THF中1M)中。在室温(15℃)下将混合物搅拌30分钟。将混合物浓缩至干燥,并且将残留物溶解在EA(60mL)中。将溶液用盐水洗涤,用MgSO4干燥,并且减压浓缩。将残留物在硅胶柱(DCM中5%MeOH)上纯化,得到白色固体的AA(1.50g,95.8%)。ESI-MS:m/z625.3[M+Na]+
(14-1)的制备:在室温(15℃)、N2气氛下,向AA(60.0mg,99.57μmol,1.00当量)在吡啶(1mL)中的溶液加入1份异丁酸酐(31.50mg,199.13μmol,2.00当量)。在室温下,将混合物搅拌12小时。将混合物浓缩,并且将残留物在EA和水之间分配。将合并的有机相用水和盐水洗涤,并且用无水Na2SO4干燥。将混合物过滤,并且将滤液浓缩至干燥。将残留物通过硅胶色谱(PE中30%EA)纯化,提供白色固体的14-1(59.00mg,79.77%)。
(14A)的制备:将14-1(57.00mg,76.74μmol,1.00当量)溶解在80%CH3COOH(8mL)中。在室温(15℃)下将溶液搅拌12小时。将混合物浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中2.5%MeOH)上纯化,得到白色泡沫的14A(23.00mg,68.05%)。ESI-MS:m/z441.2[M+H]+,463.2[M+Na]+
实施例4
化合物15A的制备
(15-1)的制备:以与14-1相似的方式,使用在吡啶(1mL)中的AA(60.00mg,99.57μmol,1.00当量)和丙酸酐(25.92mg,199.13μmol,2.00当量)制备15-1。15-1(白色固体,56.00mg,78.69%)。
(15A)的制备:以与14A相似的方式,使用15-1(54.00mg,75.55μmol,1.00当量)制备化合物15A。15A(白色泡沫,18.00mg,57.78%)。ESI-MS:m/z413.1[M+H]+
实施例5
化合物16A的制备
(16-1)的制备:以与14-1相似的方式,使用在吡啶(1mL)中的AA(62.00mg,102.89μmol,1.00当量)和戊酸酐(38.32mg,205.77μmol,2.00当量)制备16-1。16-1(白色固体,60.00mg,75.65%)。
(16A)的制备:以与14A相似的方式,使用16-1(75.00mg,97.30μmol,1.00当量)制备化合物16A。16A(白色泡沫,28.00mg,61.43%)。ESI-MS:m/z469.2[M+H]+
实施例6
化合物24A的制备
(24-1)的制备:在室温(17℃)、N2气氛下,向AA-1(300.0mg,497.83μmol)在无水吡啶(0.5mL)中的搅拌下溶液加入DMTrCl(337.36mg,995.66μmol)。在50℃~60℃下将溶液搅拌12小时。将混合物减压浓缩至干燥,并且将残留物溶解在EA(40mL)中。将溶液用盐水洗涤,用无水MgSO4干燥,并且在低压下浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(使用PE中20%EA)上纯化,得到白色固体的24-1(300mg,66.59%)。
(24-2)的制备:在室温(18℃)、N2气氛下,向24-1(100.00mg,110.50μmol)在无水吡啶(0.5mL)中的搅拌下溶液加入DMAP(6.75mg,55.25μmol)、DCC(22.80mg,110.50μmol)和正辛酸(31.87mg,221.00μmol)。在室温下将溶液搅拌12小时。将溶液减压浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(使用PE中15%EA)上纯化,得到白色泡沫的24-2(98.00mg,86.0%)。
(24A)的制备:在室温(16℃)下,将24-2(90.00mg,87.28μmol)溶解在80%CH3COOH(20mL)中。在室温下,将混合物搅拌12小时。将反应用MeOH猝灭,并且将混合物浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中5%MeOH)上纯化,得到白色固体的24A(33.00mg,88.7%)。ESI-MS:m/z427.2[M+H]+
实施例7
化合物25A的制备
(BB-2)的制备:在20℃、N2下,向BB-1(500.00mg,0.87mmol)在无水吡啶(1mL)中的搅拌下溶液加入TBSCl(236.5mg,1.57mmol)。在50℃~60℃下将溶液搅拌12小时。将溶液减压浓缩至干燥。将残留物溶解在EA(50mL)中。将溶液用饱和的NaHCO3溶液和盐水洗涤,并且用无水MgSO4干燥。将溶液过滤,并且将滤液浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱上纯化,得到白色固体的BB-2(510.00mg,85.06%)。
(BB-3)的制备:在室温下,向BB-2(430.00mg,625.15mmol)在无水MeCN(6mL)中的搅拌下溶液加入TPSCl(368.65mg,1.25mmol)、DMAP(152.75mg,1.25mmol)和TEA(126.52mg,1.25mmol)。将混合物搅拌2小时。加入NH4OH(8mL),并且将混合物搅拌3小时。将混合物用EA萃取(3×40mL)。将有机相用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物在硅胶柱(PE中25%EA)上纯化,得到黄色泡沫的BB-3(500mg粗品)。
(BB-4)的制备:在室温(15℃)、N2气氛下,向BB-3(500mg粗品,0.72mmol)在无水DCM(7mL)中的搅拌下溶液加入DMTrCl(365mg,1.0mmol)、可力丁(305mg,2.5mmol)和AgNO3(184mg,1.08mmol)。在室温下将混合物搅拌12小时。加入MeOH(5mL)。将混合物过滤,并且将滤液浓缩至干燥。将残留物溶解在EA(50mL)中。将溶液用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物在硅胶柱(DCM中5%MeOH)上纯化,得到白色固体的BB-4(500mg,70.3%)。
(BB)的制备:将BB-4(1.00g,1.01mmol)溶解在TBAF(5mL,THF中1M)中。并且在室温下搅拌30分钟。将混合物用EA(100mL)稀释。将混合物用水和盐水洗涤,并且用无水MgSO4干燥。将有机相浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(PE中30%EA)上纯化,得到白色固体的BB(0.80g,91.5%)。ESI-MS:m/z873.7[M+1]+
(25-1)的制备:在室温(18℃)、N2气氛下,向BB(100.00mg,114.29μmol)在无水吡啶(1.5mL)中的溶液加入DMAP(2.79mg,22.86μmol)、DCC(70.75mg,342.88μmol)和正辛酸(49.45mg,342.88μmol)。在室温下将溶液搅拌12小时。将溶液减压浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(使用PE中15%EA)纯化,得到白色泡沫的25-1(95.00mg,83.03%)。
(25A)的制备:在室温(15℃)下,将25-1(110.00mg,109.87μmol)溶解在80%CH3COOH(25mL)中。将混合物搅拌12小时。将反应用MeOH猝灭,并且将溶液浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中5%MeOH)上纯化,得到白色固体的25A(30.00mg,64.03%)。ESI-MS:m/z427.2[M+H]+
实施例8
化合物26A的制备
(26-1)的制备:向N-Boc-L-缬氨酸(620.78mg,2.86mmol)和TEA(144.57mg,1.43mmol)在无水THF(2.5mL)中的溶液加入BB(250.00mg,285.73μmol)。将混合物与吡啶和甲苯共同蒸发以去除水。将残留物溶解在THF(2.5mL)中。在室温(18℃)下,加入DIPEA(369.28mg,2.86mmol),随后加入BOP-Cl(363.68mg,1.43mmol)和3-硝基-1H-1,2,4-三唑(162.95mg,1.43mmol)。在室温下将混合物搅拌12小时,并且然后用EA(40mL)稀释。将溶液用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(PE中30%EA)上纯化,得到白色泡沫的26-1(220mg,粗品)。
(26-2)的制备:将26-1(250.0mg,232.73μmol)溶解在80%CH3COOH(30mL)中。将溶液加热至50℃,并且搅拌12小时。将反应用MeOH猝灭,并且将溶液浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中5%MeOH)上纯化,得到白色泡沫的26-2(80.00mg,68.82%)。
(26A)的制备:在室温(19℃)下将26-2(78.00mg,156.16μmol)溶解在HCl/二氧六环(1.5mL)和EA(1.5mL)中。在室温下将混合物搅拌30分钟。将溶液在低压下浓缩至干燥。将残留物通过prep-HPLC纯化,得到白色固体的26A(23mg,31.25%)。ESI-MS:m/z400.20[M+H]+,799.36[2M+H]+
实施例9
化合物27A的制备
(27-1)的制备:以与26-1相似的方式,使用BB(250.0mg,276.25μmol)、(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酸(360.11mg,1.66mmol)和TEA(83.86mg,828.75μmol)制备27-1。27-1(白色泡沫,220.0mg,72.12%)。
(27-2)的制备:以与26-2相似的方式,使用27-1(230.00mg,208.29μmol,1.00当量)制备27-2。27-2(白色泡沫,80.00mg,77.66%)。
(27A)的制备:以与26相似的方式,使用27-2(100.00mg,200.20μmol,1.00当量)制备27A。27A(白色固体,56mg,59.57%)。ESI-MS:m/z400.0[M+H]+,422.1[M+Na]+;799.1[2M+H]+,821.2[2M+Na]+
实施例10
化合物13A的制备
(13-1)的制备:在室温下,向2A(200mg,0.67mmol)在无水吡啶(5mL)中的溶液加入TBSCl(120mg,0.8mmol)。将混合物搅拌过夜,并且将反应混合物用EA稀释。将混合物用NaHCO3水溶液和盐水洗涤。将有机层干燥、过滤并浓缩,得到残留物,将其通过硅胶柱色谱(DCM中5%MeOH至DCM中25%MeOH)纯化,得到白色固体的13-1(153mg,55%)。
(13-2)的制备:在室温下,向13-1(54mg,0.13mmol)在无水DCM(2mL)中的溶液加入可力丁(95μL,0.78mmol)、DMTrCl(262mg,0.78mmol)和AgNO3(66mg,0.39mmol)。将混合物搅拌过夜,并且然后用DCM(5mL)稀释。将混合物通过预包装的硅藻土漏斗过滤,并且将滤液用NaHCO3水溶液、1.0M柠檬酸溶液和盐水洗涤。将有机层用Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩,得到残留物。将残留物通过硅胶柱色谱(PE中25%EA至100%EA)纯化,得到13-2(83.5mg,63.6%)。
(13-3)的制备:在冰浴温度下,向13-2(83mg,0.081mmol)在THF(1mL)中的溶液加入1MTBAF在THF(0.122mL,0.122mmol)中的溶液。将混合物搅拌1.5小时。将混合物用EA稀释,并且用水和盐水洗涤。将有机层干燥并浓缩,得到粗品,将其通过硅胶柱色谱(DCM至DCM中5%MeOH)纯化,得到白色泡沫的13-3(66.6mg,91%)。
(13-4)的制备:将13-3(66.6mg,0.074mmol)与甲苯和THF(3×)共同蒸发。加入双(POC)磷酸(33mg,0.96mmol),并且然后与甲苯(3×)共同蒸发。然后将混合物溶解在无水THF(1.5mL)中,并且在冰浴中冷却(0℃至5℃)。依次加入3-硝基-1,2,4-三唑(13mg,0.11mmol)、二异丙基乙胺(54μL,0.3mmol)和BOP-Cl(28mg,0.11mmol)。在0℃至5℃下,将混合物搅拌2小时,用EtOAc稀释,用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤,并且用Na2SO4干燥。将残留物在硅石(10g柱)上用CH2Cl2:异丙醇(4-10%梯度)纯化,得到白色固体的13-4(68mg,76%)。
(13A)的制备:将13-4(68mg,0.07mmol)溶解在80%HCOOH中。在室温下将混合物搅拌2小时。在室温下将溶剂蒸发,并且与甲苯(3×)共同蒸发。将残留物溶解在50%CH3CN/H2O中,在反相HPLC(C18)上使用CH3CN和H2O纯化。将产物冻干,得到白色泡沫的13A(4.8mg,14%)。ESI-LCMS:m/z=613.1[M+H]+,1225.2[2M+H]+
实施例11
化合物17A的制备
(17-1)的制备:以与13-4相似的方式,从1-7(50mg,0.087mmol)和双(异丙氧羰基氧甲基)磷酸(58mg,0.175mmol)与在THF(0.4mL)中的DIPEA(75μL,0.52mmol)、BOP-Cl(66.2mg,0.26mmol)和3-硝基-1,2,4-三唑(30mg,0.26mmol)以相同的方式制备17-1(40.7mg,53%)。
(17A)的制备:将17-1(40mg,0.045mmol)溶解在无水CH3CN(0.5mL)中,并且在0℃至5℃下,加入在二氧六环(34μL,0.135mmol)中的4NHCl。在室温下将混合物搅拌3小时。加入无水EtOH(200μL)。在室温下将溶剂蒸发,并且与甲苯(3×)共同蒸发。将残留物在硅石(10g柱)上用MeOH/CH2Cl2(5-7%梯度)纯化,并且冻干,得到白色泡沫的17A(15.4mg,76%)。ESI-LCMS:m/z=614.15[M+H]+,1227.2[2M+H]+
实施例12
化合物18A的制备
(18-1)的制备:在0℃(冰/水浴)下,向1-7(80mg,0.14mmol)在无水CH3CN(2.0mL)中的搅拌下溶液加入N-甲基咪唑(0.092mL,1.12mmol)。然后加入苯基(异丙氧基-L-丙氨基)磷酰氯(128mg,0.42mmol,溶解于CH3CN(0.5mL))的溶液(根据McGuigan等,J.Med.Chem.(2008)51:5807-5812中所述的通用方法制备)。将溶液在0℃至5℃下搅拌数小时,并且然后在室温下搅拌16小时。将混合物冷却至0℃至5℃,用EA稀释,随后加入水(5mL)。将溶液用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤,并且用MgSO4干燥。将残留物在硅石(10g柱)上用EA/己烷(25-100%梯度)纯化,得到泡沫的18-1(57.3mg,49%)。
(18A)的制备:将18-1(57.3mg,0.07mmol)溶解在无水CH3CN(0.5mL)中,并且在0℃至5℃下加入在二氧六环(68μL,0.27mmol)中的4NHCl。在室温下将混合物搅拌2小时,并且加入无水EtOH(100μL)。在室温下将溶剂蒸发,并且与甲苯(3×)共同蒸发。将残留物在硅石(10g柱)上用MeOH/CH2Cl2(1-7%梯度)纯化,并且冻干,得到白色泡沫的18A(27.8mg,72%)。ESI-LCMS:m/z=571.1[M+H]+,1141.2[2M+H]+
实施例13
化合物28A的制备
(28-1)的制备:以与13-4相同的方式,从1-7(100mg,0.174mmol)和双(叔丁氧羰基氧甲基)磷酸(126mg,0.35mmol)与在THF(1.5mL)中的DIPEA(192μL,1.04mmol)、BOP-Cl(133mg,0.52mmol)和3-硝基-1,2,4-三唑(59mg,0.52mmol)制备28-1(68.4mg,44.7%)。
(28A)的制备:以与17A相同的方式,从28-1(68mg,0.077mmol)制备28A(31.4mg,67%)。ESI-LCMS:m/z=627.15[M+Na]+,1219.25[2M+H]+
实施例14
化合物19A的制备
(19-1)的制备:向1-7(100mg,0.175mmol)在无水CH3CN(2mL)中的溶液加入在CH3CN中的5-乙硫基-1H-四唑(0.25M;0.84mL,0.21mmol)。在0℃至5℃下,逐滴加入在CH3CN(1mL)中的双-SATE-氨基磷酸酯(95mg,0.21mmol)。在0℃至5℃、Ar下,将混合物搅拌2小时。加入在DCM(1mL)中的77%m-CPBA(78mg,0.35mmol)溶液,并且在0℃至5℃、Ar下,将混合物搅拌2小时。将混合物用EtOAc(50mL)稀释,用1.0M柠檬酸、饱和的NaHCO3和盐水洗涤,并且用MgSO4干燥。将混合物过滤,并且在真空下将溶剂蒸发。将残留物在硅石(10g柱)上用EA/己烷(20-100%梯度)纯化,得到白色泡沫的19-1(105mg,63.6%)。
(19A)的制备:将19-1(105mg,0.112mmol)溶解在无水CH3CN(0.8mL)中,并且在0℃至5℃下加入在二氧六环(84μL,0.334mmol)中的4NHCl。在室温下将混合物搅拌2小时。加入无水EtOH(100μL)。在室温下将溶剂蒸发,并且与甲苯(3×)共同蒸发。将残留物在硅石(10g柱)上用MeOH/CH2Cl2(1-7%梯度)纯化,并且冻干,得到白色泡沫的19A(42.7mg,57%)。ESI-LCMS:m/z=692.15[M+Na]+,1339.30[2M+H]+
实施例15
化合物20A的制备
(20-2)的制备:将1-7(100mg,0.174mmol)与无水吡啶(3×)、甲苯(3×)和CH3CN(3×)共同蒸发,并且在高真空下干燥过夜。将1-7溶解在CH3CN(2mL)中。在0℃至5℃下,加入1,8-双二甲氨基萘(112mg,0.52mmol)、POCl3(49μL,0.52mmol)。在0℃至5℃下,将混合物搅拌3小时,得到中间体20-1。向该溶液加入L-丙氨酸异丙基酯盐酸盐(146mg,0.87mmol)和TEA(114μL,1.74mmol)。在0℃至5℃下,将混合物搅拌4小时。在0℃至5℃下,将混合物搅拌2小时,然后用EtOAc稀释。将混合物用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤,并且用Na2SO4干燥。将残留物在硅石(10g柱)上用CH2Cl2/MeOH(0-7%梯度)纯化,得到白色固体的20-2(67mg,43.7%)。
(20A)的制备:将20-2(65mg,0.074mmol)溶解在无水CH3CN(0.5mL)中,并且在0℃至5℃下,加入在二氧六环(55μL,0.22mmol)中的4NHCl。在室温下将混合物搅拌1.5小时。加入第二部分的在二氧六环(15μL)中的4NHCl,并且在室温下将混合物搅拌2小时。加入无水EtOH(300μL)。在室温下将溶剂蒸发,并且与甲苯(3×)共同蒸发。将残留物溶解在50%CH3CN/H2O中,在反相HPLC(C18)上用CH3CN和水纯化,并且冻干,得到白色泡沫的20A(9mg,20%)。ESI-LCMS:m/z=608.15[M+H]+,1215.3[2M+H]+
实施例16
化合物23A的制备
(23-2)的制备:在0℃(冰/水浴)下,向1-7(100mg,0.175mmol)在无水CH3CN(2.0mL)中的搅拌下溶液加入N-甲基咪唑(0.14mL,1.4mmol)。加入23-1的溶液((220mg,0.53mmol,溶解在0.5mLCH3CN中),根据Bondada,L.等,ACSMedicinalChemistryLetters,(2013)4(8):747-751中所述的通用方法制备)。在0℃至5℃下,将溶液搅拌1小时,并且然后在室温下搅拌16小时。将混合物冷却至0℃至5℃,用EA稀释,随后加入水(5mL)。将溶液用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤,并且用MgSO4干燥。将残留物在硅石(10g柱)上用EA/己烷(25-100%梯度)纯化,得到白色泡沫的23-2(56.4mg,33.7%)。
(23A)的制备:将23-2(56mg,0.0585mmol)溶解在无水CH3CN(0.7mL)中,并且在0℃至5℃下加入在二氧六环(44μL,0.176mmol)中的4NHCl。在室温下将混合物搅拌2小时。加入在二氧六环(20μL)中的4NHCl。在室温下将混合物搅拌2小时。加入无水EtOH(100μL)。在室温下将溶剂蒸发,并且与甲苯(3×)共同蒸发。将残留物在硅石(10g柱)上用MeOH/CH2Cl2(1-7%梯度)纯化,并且冻干,得到白色泡沫的23A(27.6mg,69%)。ESI-LCMS:m/z=685.2[M+H]+
实施例17
化合物29A的制备
(29-1)的制备:在0℃至5℃下,向BB(100mg,0.114mmol)在无水CH3CN(2mL)中的溶液逐滴加入双-SATE-氨基磷酸酯(62.2mg,0.14mmol)在CH3CN(1mL)中的溶液,随后逐滴加入在CH3CN中的5-乙硫基-1H-四唑(0.25M;0.56mL,0.14mmol)。在0℃至5℃、Ar下,将混合物搅拌2小时。加入在DCM(1mL)中的77%m-CPBA(49mg,0.22mmol)溶液,并且在0℃至5℃、Ar下,将混合物搅拌2小时。将混合物用EtOAc(50mL)稀释,用1.0M柠檬酸、饱和NaHCO3和盐水洗涤,并且用MgSO4干燥。将混合物过滤,并且将溶剂在真空下蒸发。将残留物在硅石(10g柱)用EA/己烷(10-100%梯度)纯化,得到白色固体的29-1(72mg,50.8%)。
(29A)的制备:将29-1(72mg,0.056mmol)溶解在无水CH3CN(1.0mL)中,并且在0℃至5℃下加入在二氧六环(87μL,0.35mmol)中的4NHCl。在室温下将混合物搅拌2小时。通过LCMS观察到中间体29-2。在室温下将溶剂蒸发,并且与甲苯(3×)共同蒸发。将获得的残留物复溶在80%HCOOH(2mL)中。在室温下,将混合物搅拌4.5小时。在室温下将溶剂蒸发,并且与甲苯(3×)共同蒸发。加入无水EtOH(3×5mL)。将残留物溶解在50%CH3CN/H2O中,在反相HPLC(C18)上使用CH3CN和H2O纯化,并且冻干,得到白色泡沫的29A(19.2mg)。ESI-LCMS:m/z=669.2[M+H]+,1337.25[2M+H]+
实施例18
化合物30A的制备
(30-1)的制备:以与13-4相同的方式,从BB(100mg,0.114mmol)和双(叔丁氧羰基氧甲基)磷酸(83mg,0.35mmol)与在THF(1.5mL)中的DIPEA(126μL,0.69mmol)、BOP-Cl(87mg,0.34mmol)和3-硝基-1,2,4-三唑(39mg,0.34mmol)以相同的方式制备30-1(98mg,72.6%)。
(30A)的制备:以与17A相同的方式,从30-1(98mg,0.083mmol)制备30A(30.2mg,60%)。ESI-LCMS:m/z=609.15[M+H]+,1217.3[2M+H]+
实施例19
化合物21A的制备
(21-3)的制备:在-75℃下,1小时内,将21-1(4.7g,11.2mmol;根据Villard等,Bioorg.Med.Chem.(2008)16:7321-7329的步骤制备)和Et3N(3.4mL,24.2mmol)在THF(25mL)中的溶液,逐滴加入N,N-二异丙基二氯亚磷酸(1.0mL,5.5mmol)在THF(35mL)中的搅拌下溶液。在室温下将混合物搅拌4小时。将混合物过滤,并且将滤液浓缩。将油质残留物在硅胶柱上用EtOAc/己烷(2-20%梯度)纯化,得到21-3(1.4g,26%)。
(21-4)的制备:向21-2(50mg,0.08mmol)和21-3(110mg,0.11mmol)在CH3CN(1.0mL)中的溶液加入5-(乙硫基)四唑(0.75mL,0.16mmol;CH3CN中0.25M)。在室温下将混合物搅拌1小时。使混合物冷却至-40℃,并且加入3-氯过氧苯甲酸(37mg,0.16mmol)在CH2Cl2(0.3mL)中的溶液。在1小时内,使混合物升温至室温。将反应用饱和NaHCO3水溶液中的7%Na2S2O3溶液猝灭。将混合物用EtOAc稀释,并且将层分离。有机层用盐水冲洗,并且用Na2SO4干燥。将溶剂蒸发,并且将残留物在硅胶柱上用EtOAc/己烷(30-100%梯度)纯化,得到21-4(52mg,45%)。
(21A)的制备:在室温下,将21-4(52mg,0.036mmol)在MeCN(0.5mL)和HCl(45μL;二氧六环中4N)中的溶液搅拌20小时,将反应用MeOH猝灭,并且将溶剂蒸发。将残留物与甲苯共同蒸发,并且在硅胶柱上用MeOH/CH2Cl2(4-10%梯度)纯化,得到21A(14mg,51%)。ESI-LCMS:m/z=702[M+H]+
实施例20
化合物22A的制备
(22-2)的制备:通过与吡啶蒸发使得22-1(0.14g,0.24mmol;根据于2007年12月28提交的WO2008/082601中所述的步骤制备)和21-2(120mg,0.2mmol)的混合物脱水,并且然后溶解在吡啶(3mL)中。在-15℃下,逐滴加入特戊酰氯(48μL)。在-15℃下将混合物搅拌2小时。将反应用饱和NH4Cl水溶液猝灭,并且用CH2Cl2稀释。将有机层用盐水洗涤,并且用Na2SO4干燥。将溶剂蒸发,并且将残留物在硅胶柱上用EtOAc/己烷(30-100%梯度)纯化,得到22-2(50mg,24%)。
(22-3)的制备:在室温下,将在CCl4(0.8mL)中的22-2(43mg;0.04mmol)、L-缬氨酸异丙酯盐酸盐(20mg,0.12mmol)和Et3N(33μL,0.24mmol)的混合物搅拌2小时。将混合物用EtOAc稀释。将混合物用饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤,并且用Na2SO4干燥。将溶剂蒸发,并且将残留物在硅胶柱上用异丙醇/CH2Cl2(2-10%梯度)纯化,得到22-3(35mg,75%)。
(22A)的制备:在室温下,将在MeCN(0.4mL)中的22-3(35mg,0.03mmol)和HCl(40μL;二氧六环中4N)的溶液搅拌4小时。加入MeOH,将反应猝灭,并且将溶剂蒸发。将残留物与甲苯共同蒸发,并且在硅胶柱上用MeOH/CH2Cl2(4-10%梯度)纯化,得到23A(11mg,56%)。ESI-LCMS:m/z=655[M+H]+
实施例21
化合物7A的制备
(7-2)的制备:在25℃下,向7-1(20.0g,70.1mmol)在无水吡啶(230mL)中的溶液加入咪唑(19.1g,280.7mmol)和TBSCl(42.1g,280.7mmol)。在25℃下将溶液搅拌15小时。将混合物减压浓缩至干燥,并且将残留物溶解在EA中。获得白色固体并过滤。将滤饼浓缩至干燥,得到白色固体的7-2(30.1g,83%)。
(7-3)的制备:将7-2(30.1g,58.7mmol)溶解在THF(120mL)和H2O(80mL)中。加入HOAc(260mL),并且然后在80℃下搅拌13小时。将混合物冷却至室温,并且减压浓缩至干燥。将残留物溶解在EA中并且过滤。将滤饼浓缩至干燥,得到白色固体的7-3(20.1g,86%)。
(7-4)的制备:将7-3(20.1g,50.4mmol)溶解在无水吡啶(200mL)中。加入Ac2O(7.7g,75.5mmol),并且在25℃下搅拌18小时。加入MMTrCl(46.5g,151.1mmol)和AgNO3(25.5g,151.1mmol)。在25℃下,将溶液搅拌15小时。将反应用水猝灭。将混合物减压浓缩至干燥,并且将残留物溶解在EA中。将溶液用盐水洗涤。将有机层用Na2SO4干燥并且过滤。将滤液在真空下浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中2%MeOH)上纯化,得到白色泡沫的7-4(21.5g,60%)。
(7-5)的制备:将7-4(4.3g,6.0mmol)溶解在NH3/MeOH(40mL)中。在25℃下,将混合物搅拌20小时。将溶液蒸发至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中2%MeOH)上纯化,得到黄色固体的7-5(3.1g,76.5%)。
(7-6)的制备:在0℃下,向7-5(3.1g,4.6mmol)在无水DCM(50mL)中的溶液加入Dess-Martin试剂(3.5g,8.2mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,并且然后在室温下搅拌2小时。将反应用饱和的NaHCO3和Na2S2O3溶液猝灭。将有机层用盐水(2×)洗涤,并且用无水Na2SO4干燥。将溶剂蒸发,得到黄色泡沫的粗品7-6(2.8g)。
(7-7)的制备:向7-6(2.8g,4.2mmol)在1,4-二氧六环(40mL)中的溶液加入37%HCHO(2.7g,33.5mmol)和2.0NNaOH水溶液(3.0mL,6.0mmol)。在25℃下将混合物搅拌12小时。将混合物用EtOH(20mL)和NaBH4(2.5g,66.9mmol)处理,并且搅拌30分钟。将反应用饱和NH4Cl水溶液猝灭,并且用EA(50mL)萃取。将有机层用Na2SO4干燥。将浓缩的有机相在硅胶柱(DCM中2%MeOH)上纯化,得到黄色固体的7-7(2.1g,72.4%)。
(7-8)的制备:在0℃下,向7-7(2.1g,3.0mmol)在DCM(20mL)中的溶液加入吡啶(5mL)和DMTrCl(1.0g,3.0mmol)。在25℃下将溶液搅拌1小时。将混合物用MeOH(8mL)处理,并且减压浓缩。将残留物在硅胶柱(DCM中2%MeOH)上纯化,得到黄色固体的7-8(1.1g,36.7%)。
(7-9)的制备:向7-8(1.1g,1.1mmol)在无水吡啶(10mL)中的溶液加入TBDPSCl(0.9g,3.3mmol)和AgNO3(0.6g,3.3mmol)。在25℃下将混合物搅拌15小时。通过过滤去除固体,并且在低压下浓缩滤液。使残留物溶解在EA中。将得到的溶液用盐水洗涤。将有机层用Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物通过柱色谱(DCM中2%MeOH)纯化,得到白色泡沫的7-9(1.2g,88.2%)。
(7-10)的制备:在-78℃下,向7-9(1.2g,1.0mmol)在无水DCM(15mL)中的溶液加入Cl2CHCOOH(0.6mL)。在-20℃下,将混合物搅拌1小时。将反应用饱和NaHCO3水溶液猝灭,并且用DCM萃取。将有机层用Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物在硅胶柱(DCM中2%MeOH)上纯化,得到白色泡沫的7-10(693mg,76.3%)。
(7-11)的制备:在0℃下,向无水DCM(25mL)中的7-10(693mg,0.74mmol)和吡啶(291mg,3.70mmol)溶液逐滴加入在DCM(1mL)中的Tf2O(312mg,1.1mmol)。在0℃下,将混合物搅拌15分钟。将反应用冰水猝灭。将有机层分离,并且用盐水洗涤。将有机层用无水Na2SO4干燥并且蒸发,得到黄色泡沫的7-11(442mg,粗品)。
(7-12)的制备:向7-11(442mg,0.41mmol)在无水DMF(5mL)中的溶液加入NaN3(134mg,2.1mmol)。在室温下将混合物搅拌12小时。将反应用水猝灭,并且用EA(20mL,2×)萃取。将有机层用盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物在硅胶柱(DCM中1%MeOH)上纯化,得到白色泡沫的纯7-12(313mg,78.6%)。
(7-13)的制备:在80℃下将7-12(313mg,0.32mmol)和NH4F(240mg,6.5mmol)在MeOH(10mL)中的混合物搅拌12小时。将混合物冷却降至室温。通过过滤去除固体。将溶剂减压去除,并且将残留物在硅胶柱(DCM中5%MeOH)上纯化,得到白色泡沫的7-13(102mg,52%)。
(7A)的制备:将7-13(102mg,0.17mmol)溶解在CH3COOH(80%)中。在60℃下将混合物搅拌2小时,并且然后冷却至室温。将混合物减压浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中5%至10%MeOH)上纯化,得到粗制品(67mg)。将粗制品通过prep-HPLC(水和CH3CN中,0.1%NH4HCO3)纯化,得到白色固体的7A(37.5mg,66%)。MS:m/z341[M+H]+
实施例22
化合物31A的制备
(31-2)的制备:在0℃下,向7-7(1.92g,27.3mmol)、PPh3(1.43g,54.7mmol)、EtOH(0.25g,54.7mmol)在无水二氧六环(20mL)中的搅拌下溶液逐滴加入DIAD(1.11g,54.7mmol)。在25℃下将溶液搅拌15小时。将反应用水猝灭,并且用EA萃取。将混合物用水和盐水洗涤。将有机层用Na2SO4干燥并且过滤。将滤液在真空下浓缩至干燥,并且将残留物在硅胶柱(DCM中2%至5%MeOH)上纯化,得到白色泡沫的31-1(1.43g,71%)。
(31-2)的制备:在0℃下,向31-1(1.43g,19.6mmol)在DMF(15mL)中的搅拌下溶液加入TEA(0.59g,58.8mmol)和DMTrCl(0.99g,29.4mmol)。在25℃下将溶液搅拌12小时。将混合物用MeOH(1mL)处理,并且用EA稀释。将溶液用水和盐水洗涤。将有机层用无水NaSO4干燥,并且浓缩至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中2%MeOH)上纯化,得到黄色固体的31-2(1.13g,56%)。
(31-3)的制备:向31-2(1.13g,1.1mmol)在无水吡啶(10mL)中的搅拌下溶液加入TBDPSCl(0.91g,3.3mmol)和AgNO3(0.61g,3.3mmol)。在25℃下将混合物搅拌15小时。将固体通过过滤去除,并且将滤液用EA(50mL)稀释。将溶液用盐水洗涤。将有机层用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物在硅胶柱(DCM中2%MeOH)上纯化,得到白色泡沫的31-3(1.22g,88%)。
(31-4)的制备:在-78℃下,向31-3(1.22g,1.0mmol)在无水DCM(15mL)中的搅拌下溶液加入Cl2CHCOOH(0.6mL)。在-20℃下将混合物搅拌1小时。将反应用饱和NaHCO3水溶液猝灭,并且用DCM萃取。将有机层用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物通过柱色谱(DCM中2%MeOH)纯化,得到白色泡沫的31-4(0.52g,56%)。
(31-5)的制备:在0℃下,向在无水DCM(15mL)中的31-4(0.52g,0.5mmol)和吡啶(0.21g,2.5mmol)的搅拌下溶液逐滴加入在DCM(1mL)中的Tf2O(0.30g,1.0mmol)。在0℃下将混合物搅拌15分钟。将反应用冰水猝灭。将有机层分离并且用水洗涤。将有机层用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩,得到黄色泡沫的31-5(442mg粗品)。
(31-6)的制备:向31-5(442mg,0.4mmol)在无水DMF(5mL)中的搅拌下溶液加入NaN3(131mg,2.0mmol)。在室温下将混合物搅拌12小时。将反应用水猝灭,并且通过EA(20mL,2×)萃取。将有机层用水洗涤,并且用Na2SO4干燥。将有机相减压蒸发至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中1%MeOH)上纯化,得到白色泡沫的31-6(352mg,88%)。
(31-7)的制备:在80℃下,将31-6(352mg,0.35mmol)和NH4F(392mg,10.6mmol)在MeOH(10mL)中的混合物搅拌12小时。将混合物冷却至室温。将固体通过过滤去除。将溶剂减压浓缩。将残留物在硅胶柱(DCM中2%至5%MeOH)上纯化,得到粗品31-7(151mg)。将所述粗品通过prep-HPLC(水和CH3CN中,0.1%NH4HCO3)纯化,得到白色固体的31-7(71.5mg,32%)。MS:m/z641[M+H]+
(31-8)的制备:通过与甲苯蒸发,使脱水后的31-7(64mg,0.1mmol)和双(特戊酸甲基)磷酸盐的混合物溶解在CH3CN(1mL)中,并且冷却至0℃。加入BopCl(40mg,0.15mmol)和NMI(40μL,0.5mmol)。在0℃下将混合物搅拌2小时。加入EtOAc,并且将混合物用0.5N柠檬酸水溶液、饱和NaHCO3水溶液和盐水洗涤,并且然后用Na2SO4干燥。将溶剂去除,并且将残留物在硅胶柱上用在CH2Cl2中的3%异丙醇纯化,得到31-8(38mg,40%)。
(31A)的制备:在室温下,将在CH3CN(0.3mL)中的31-8(30mg,0.03mmol)和HCl(30μL;4N二氧六环)的溶液搅拌100分钟。将反应用EtOH猝灭,并且将混合物蒸发。将粗品残留物在硅胶柱上用异丙醇/CH2Cl2(3-10%梯度)纯化,产生31A(10mg,50%)。ESI-LCMS:m/z=681[M+H]+
实施例23
化合物32A的制备
在正常压力下,使2A(30mg,0.1mmol)在MeOH中通过10%Pd/C氢化。将催化剂过滤掉,并且将滤液在Synergy4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RPHPLC纯化。将在50mM三乙基乙酸铵缓冲液(pH7.5)中0-20%MeOH的线性梯度用于洗脱。将相应的级分合并、浓缩并冻干(3×)以去除过量的缓冲液,产生32A(17mg,63%)。ESI-LCMS:m/z=275.2[M+H]+,297.1[M+Na]+
实施例24
化合物8A的制备
(8-2)的制备:在25℃、N2气氛下,向8-1(3.0g,11.15mmol)在无水吡啶(90mL)中的溶液加入咪唑(3.03g,44.59mmol)和TBSCl(6.69g,44.59mmol)。在25℃下将溶液搅拌15小时。将溶液减压浓缩至干燥。将残留物溶解在EA中。将溶液用饱和的NaHCO3和盐水洗涤,并且用无水MgSO4干燥。将溶剂在低压下去除,得到白色固体的粗品8-2(4.49g,90%)。
(8-3)的制备:在0℃下,向8-2(3.5g,7.04mmol)在EA和EtOH(1:1,55mL)的混合物中的搅拌下溶液加入TsOH(10.7g,56.34mmol)。在30℃下将混合物搅拌8小时。加入水(30mL),并且将溶液去除至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中10%MeOH)上纯化,得到白色泡沫的8-3(1.75g,65%)。
(8-4)的制备:在25℃、N2下,向8-3(3.4g,8.88mmol)在无水吡啶(17mL)中的溶液加入可力丁(4.3g,35.51mmol)、AgNO3(5.50g,35.51mmol)和MMTrCl(8.02g,26.63mmol)。在25℃下将混合物搅拌12小时。加入MeOH(20mL),并且将溶剂在低压下去除至干燥。将残留物在硅胶柱(PE中10%EA)上纯化,得到白色泡沫的8-4(5.76g,70%)。
(8-5)的制备:在-78℃下,向8-4(2.0g,2.16mmol)在无水DCM(10mL)中的溶液逐滴加入Cl2CHCOOH(2.8g,21.57mmol)。使混合物升温至-10℃,并且在该温度下搅拌20分钟。在-10℃下,将反应用饱和的NaHCO3猝灭。将混合物用DCM萃取,用盐水洗涤,并且用无水MgSO4干燥。将溶液在低压下浓缩。将残留物在硅胶柱(PE中10%EA)上纯化,得到白色泡沫的8-5(0.99g,70%)。
(8-6)的制备:向8-5(3.5g,5.34mmol)在无水DMSO(35mL)中的搅拌下溶液加入DCC(3.30g,16.03mmol)和Py·TFA(1.03g,5.34mmol)。在30℃下将混合物搅拌1小时。将反应用0℃的冷水猝灭,并且用EA(3×60mL)萃取。将沉淀过滤。将有机层用盐水(3×)洗涤,并且用无水MgSO4干燥。将有机相在低压下浓缩,得到黄色油状粗品8-6(3.5g)。
(8-7)的制备:向8-6(3.5g,5.34mmol)在MeCN(35mL)中的搅拌下溶液加入37%HCHO(11.1mL)和TEA(4.33g,42.7mmol)。在25℃下将混合物搅拌12小时。将混合物用EtOH(26mL)和NaBH4(3.25g,85.5mmol)处理,并且然后搅拌30分钟。将反应用饱和NH4Cl水溶液猝灭,并且用EA(3×60mL)萃取。将有机层用无水MgSO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物通过柱色谱(从PE中10%EA至PE中50%DCM)纯化,得到白色固体的8-7(1.46g,40%)。
(8-8)的制备:在-35℃、N2气氛下,向吡啶(24mL)中的8-7(1.85g,2.7mmol)和DCM(9.6mL)的搅拌下溶液加入DMTrCl(1.3g,3.9mmol)。在25℃下将溶液搅拌16小时。将混合物用MeOH(15mL)处理,并且在低压下浓缩。将残留物通过柱色谱(PE中10%至30%的EA)纯化,得到白色固体的8-8(1.60g,60%)。
(8-9)的制备:向8-8(1.07g,1.08mmol)在无水吡啶(5mL)中的溶液加入AgNO3(0.65g,3.79mmol)和TBDPSCl(1.04g,3.79mmol)。在25℃下将混合物搅拌16小时。将溶剂减压去除。将残留物溶解在EA(50mL)中。将得到的溶液用盐水洗涤。将有机层用无水MgSO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物在硅胶柱(PE中10%EA)上纯化,得到白色泡沫的8-9(0.93g,70%)。
(8-10)的制备:在-78℃下,向8-9(1g,0.82mmol)在无水DCM(13.43mL)中的搅拌下溶液加入Cl2CHCOOH(2.69mL)。在-10℃下将混合物搅拌20分钟。将反应用饱和NaHCO3水溶液猝灭,并且用DCM萃取。将有机层用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将有机相通过柱色谱(DCM中0.5%至2%的MeOH)纯化,得到固体的8-10(0.48g,65%)。
(8-11)的制备:在-35℃下,向8-10(0.4g,0。433mmol)在无水DCM(2.7mL)中的冰冷溶液逐滴加入吡啶(171mg,2.17mmol)和Tf2O(183mg,0.65mmol)。在-10℃下将混合物搅拌20分钟。将反应用冰水猝灭,并且搅拌30分钟。将混合物用DCM(3×20mL)萃取。将有机相用盐水(100mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩,得到粗品8-11(0.46g),将其在不进一步纯化的情况下用于下一步。
(8-12)的制备:向8-11(0.46g,0.43mmol)在无水DMF(2.5mL)中的溶液加入NaN3(42mg,0.65mmol)。在30℃下将混合物搅拌16小时。将溶液用水稀释,并且用EA(3×30mL)萃取。将合并的有机层用无水Na2SO4干燥,并且在低压下浓缩。将残留物在硅胶柱(PE中5%至15%的EA)上纯化,得到固体的8-12(0.31g,70%)。
(8-13)的制备:在70℃下,向8-12(0.31g,0.33mmol)在MeOH(5mL)中的溶液加入NH4F(0.36g,9.81mmol)。在该温度下将混合物搅拌24小时。将混合物蒸发至干燥。将残留物在硅胶柱(DCM中0.5%至2.5%的MeOH)上纯化,得到白色固体的8-13(117mg,60%)。
(8A)的制备:将8-13(300mg,0.50mmol)溶解在80%HOAc(20mL)中。在55℃下将混合物搅拌1小时。将反应用MeOH猝灭,并且在低压下浓缩。将残留物通过prep-HPLC纯化,得到白色固体的8A(100mg,61.3%)。ESI-LCMS:m/z325.1[M+H]+
实施例25
化合物33A的制备
根据上述提供的方案制备化合物33-3。可使用本领域技术人员已知的方法获得化合物33A,所述方法包括于2011年9月19日提交的美国专利申请公开第2012/0071434号中所述的方法。
实施例26
三磷酸化合物的制备
化合物3A、4A、9A和11A:将干核苷(0.05mmol)溶解在PO(OMe)3(0.7mL)和吡啶(0.3mL)的混合物中。在水浴温度42℃下将混合物在真空下蒸发15分钟,然后冷却降至室温。加入N-甲基咪唑(0.009mL,0.11mmol),随后加入POCl3(9μL,0.11mmol),并且将混合物在室温下保持40分钟。通过LCMS控制反应,并且通过相应的核苷5’-单磷酸的出现监测反应。实现超过50%的转换后,加入焦磷酸酯(150mg)的四丁铵盐,随后加入DMF(0.5mL)得到均匀的溶液。在周围环境温度下1.5小时后,将反应用水(10mL)稀释,并且加载至具有Q琼脂糖高性能的柱HiLoad16/10上。在50mMTris-缓冲液(pH7.5)中0至1NNaCl的线性梯度下进行分离。于75-80%B中洗脱三磷酸盐。将相应的级分浓缩。在Synergy4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RPHPLC实现脱盐。将50mM三乙基乙酸铵缓冲液(pH7.5)中0-30%乙醇的线性梯度用于洗脱。将相应的级分合并,浓缩并冻干三次,以去除过量的缓冲液。
化合物5A、6A、10A和12A:将具有4’-叠氮烷基基团的核苷5’-三磷酸溶解在水(0.1mL)中,加入甲醇(3mL),随后加入10%Pd/C(3mg)。氢气在整个溶液中冒泡2小时。将催化剂过滤掉,并且将滤液在Synergy4微米Hydro-RP柱(Phenominex)上通过RPHPLC纯化。将50mM三乙基乙酸铵缓冲液(pH7.5)中0-20%甲醇的线性梯度用于洗脱。将相应的级分合并、浓缩并且冻干三次,以去除过量的缓冲液。
表1–获自实施例25的三磷酸酯
实施例27
其他化合物
上述合成是示例性的,并且可被用作制备大量其他化合物的起点。下面提供式(I)化合物的实例,其可以以多种方式制备,包括本文所示和所述的合成方案。本领域技术人员能够认识到对所公开的合成的修饰,并且基于本文的公开设计路线;所有这样的修饰和可选的路线在本权利要求的范围内。
实施例28
RSV检测
RSV亚基因组复制子395HeLa获得(纽约市,布鲁克林区)Apath的许可,并且最初由俄亥俄州哥伦布市的全国儿童医院研究所的疫苗&免疫中心的MarkMeeples医生研发。为了生成亚基因组RSV复制子,将来自全长重组的GFP-表达(rg)的RSV反基因组cDNA的SH、G和F的三个糖蛋白基因缺失。在它们的位置上,插入杀稻瘟素S脱氨酶(bsd)基因。通过多个步骤,在HeLa细胞中建立RSV复制子。在含有4500mg/LD-葡萄糖、L-谷氨酰胺和110mg/L丙酮酸钠(Invitrogen,Cat.#11995-040)的达尔伯克改良伊格尔培养基(DMEM)中培养395HeLa细胞。所述培养基还补充有10%(v/v)胎牛血清(FBS)(Mediatech,Cat.#35-010-CV)、1%(v/v)青霉素/链霉素(Mediatech,Cat.#30-002-CI)和10μg/mL杀稻瘟素(BSD)(Invivogen,Cat.codeant-bl-1)。将细胞维持在37℃、潮湿的5%CO2气氛下。
50%抑制浓度(EC50)的测定,通过以下方法测定RSV复制子细胞的90%抑制浓度(EC90)和50%细胞毒素浓度(CC50)。在第一天,以每孔5000个RSV复制子细胞放入96孔板中。在接下来的时期,使待测试的化合物溶解在100%DMSO中至100X预期的最终测试浓度。将每种化合物连续稀释(1:3)至多9个不同的浓度。通过用细胞培养基1:10稀释,将100%DMSO中的化合物降低至10%(v/v)DMSO。用细胞培养基稀释至10%(v/v)DMSO的10μL样品化合物,被用来处理96孔板中的RSV复制子细胞。最终的DMSO浓度为1%(v/v)。在37℃、5%CO2气氛下,将细胞与化合物孵育7天。在每个检测中包括阳性对照,其事先在RSV复制子分析中被表征。
使用海肾荧光素酶分析系统(Promega,Cat.#E2820)来测定抗RSV复制子活性。按照上述陈述设置检测板。使用珀金埃尔默多标计数仪Victor3V记录发光。使用MicrosoftExcel预测功能,从针对药物浓度的光学密度(OD)值的百分比减少的曲线图计算EC50(相对于未处理的细胞对照值,减少50%的RSV复制子RNA所需的药物浓度)。
395HeLa细胞增殖检测(Promega;CellTiter-Glo发光法细胞活力检测,Cat.#G7572)被用来测定细胞活力。发光法细胞活力检测是基于对ATP存在的定量来测定培养基中活细胞数目的一种同类方法,ATP存在为新陈代谢活力细胞存在的信号。以与上面陈述的用于复制子检测的相同方式设置检测板。将CellTiter-Glo试剂(100μL)加入至每孔,并且在室温下孵育8分钟。使用珀金埃尔默多标计数仪Victor3V记录发光。使用MicrosoftExcel预测功能,从针对药物浓度的发光值百分比减少的曲线图来计算CC50(相对于未处理的细胞对照值,减少50%的活细胞所需的药物浓度)。
表A1包括EC50值小于1μM的化合物。表A2包括EC50值等于或大于1μM且小于50μM的化合物。本文公开的其他测试化合物具有50μM或更高的EC50值。
表A1
表A2
在反应缓冲液中3μL感染RSV的细胞的提取物存在下,进行标准的RSV聚合酶检测,所述反应缓冲液含有50mMtris-醋酸盐pH8、120mMK-醋酸盐、4.5mMMgCl2、5%丙三醇、2mMEDTA、50μg/mLBSA和3mMDTT。在30℃下,使用不同浓度的测试化合物来起始120分钟的RNA合成,并且放射性33PGTP(15uCi)被用作示踪物。通过加入50mMEDTA停止反应,并且将RNA样品通过G-50尺寸排阻旋转柱和酚-氯仿抽提来纯化。将放射性标记的RNA产物在6%聚丙烯酰酰胺TBE凝胶上通过电泳分辨,并且在磷相仪屏幕上曝光后显相并定量。在渐增浓度的测试化合物存在下,以相同的方式进行聚合酶抑制实验(IC50)。
表A3包括针对聚合酶IC50值小于1μM的化合物。表A4包括针对聚合酶IC50值等于或大于1μM且小于50μM的化合物。本文公开的其他测试化合物,针对聚合酶具有50μM或更高的IC50值。
表A3
表A4
实施例29
副流感病毒-3(PIV-3)空斑检测
在补充有10%胎牛血清和抗生素(C-EMEM)的最低必需培养基(MEM)存在下,将MA-104细胞在24孔板中培养至90%的汇合度。然后将细胞用非完全的最低必需培养基(NC-EMEM)冲洗两次。将测试样品溶解在DMSO中至储存浓度为10mM。
然后将0.5mL不同浓度的测试样品的等份接种在三个平行的孔中,并且为了使测试样品扩散进MA-104细胞,在37℃、5%CO2下孵育60分钟。孵育期后,将人PIV3型的冻存品解冻,并用NC-EMEM稀释以获得104pfu/mL的病毒浓度。然后将0.1mL的等份接种在除了阴性对照孔和测试样品毒性对照孔之外的所有孔中。一旦感染,将板在37℃、5%CO2下孵育72小时。孵育后,在显微镜下检查板,记录细胞毒性。使用标准的空斑检测,将MA-104细胞作为指示剂细胞,对所收集的上清进行病毒定量。
为了进行空斑检测,在24-孔板上培养MA-104细胞至汇合。用无血清的培养基冲洗所述细胞,然后用连续的10倍稀释的上清样品接种重复的孔。37℃下孵育1小时后,将样品吸出,并且向每孔加入1.0mL甲基纤维素覆盖培养基。培养6天后,将所述细胞固定,并且用1%戊二醛中的0.06%结晶紫染色,并且对病毒空斑计数。用Prism软件分析数据,EC50被定义为相对于病毒对照(VC),病毒负载减少50%的药物浓度。表B1提供对PIV-3有活性且EC50<20μM的式(I)化合物的实例。
表B1
编号
2A
14A
15A
16A
17A
18A
19A
28A
实施例30
人偏肺病毒(hMPV)TCID 50 分析
在补充有10%胎牛血清和抗生素的最低必需培养基(MEM)(C-EMEM)存在下,将LLC-MK2细胞在24-孔板上培养至90%的汇合度。然后细胞用非完全最低必需培养基(NC-EMEM)冲洗两次。将测试样品溶解在DMSO中至储存浓度为10mM。
然后将0.5mL不同浓度的测试样品的等份接种在三个平行的孔中,并且为了使测试样品扩散进LLC-MK2细胞,在37℃、5%CO2下孵育60分钟。孵育期后,将人偏肺病毒的冻存品解冻,并且用NC-EMEM稀释以获得104pfu/mL的病毒浓度。然后将0.1mL的等份接种在除阴性对照孔和测试样品毒性对照孔之外的所有孔中。一旦感染,将板在37℃、5%CO2下孵育7天。孵育后,在显微镜下检查板,记录细胞毒性。使用标准的TCID50分析,将LLC-MK2细胞作为指示剂细胞,对收集的上清进行病毒定量。用Prism软件分析数据,EC50被定义为相对于病毒对照(VC),病毒负载减少50%的药物浓度。表C1提供对人偏肺病毒有活性且EC50<20μM的式(I)化合物的实例。
表C1
编号.
2A
7A
8A
13A
14A
15A
16A
17A
18A
19A
28A
尽管为了清楚和理解的目的,上述内容通过示例和实施例的方式被相当详细地描述,但本领域技术人员应理解的是,在不脱离本公开的情况下可做出大量且不同的改进。因此,应该清楚地理解,本文公开的形式仅为示例性的且不意图限制本公开的范围,而是也涵盖了源自本发明的真实范围和精神的所有改进和替换。

Claims (85)

1.式(I)化合物或其药学上可接受的盐,
其中:
B1A为任选取代的杂环碱基或具有被保护的氨基基团的任选取代的杂环碱基;
RA为氢或氘;
R1A选自:氢、任选取代的酰基、任选取代的O连接的氨基酸、
Ra1和Ra2独立地为氢或氘;
R2A为C1-6叠氮烷基或C1-6氨烷基;
R3A选自:OH、–OC(=O)R”A和任选取代的O连接的氨基酸;
R4A为卤素;
R5A为氢或卤素;
R6A、R7A和R8A独立地选自:不存在、氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的C3-24烯基、任选取代的C3-24炔基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C3-6环烯基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的芳基(C1-6烷基)、任选取代的*–(CR15AR16A)p–O–C1-24烷基、任选取代的*–(CR17AR18A)q–O–C1-24烯基、
或者
R6A并且R7A不存在或为氢;或者
R6A和R7A一起形成选自以下的部分:任选取代的和任选取代的其中与R6A和R7A连接的氧、磷和所述部分形成六元至十元环系;
R9A独立地选自:任选取代的C1-24烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C3-6环烯基、NR30AR31A、任选取代的N连接的氨基酸和任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物;
R10A和R11A独立地为任选取代的N连接的氨基酸或任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物;
R12A、R13A和R14A独立地不存在或为氢;
每个R15A、每个R16A、每个R17A和每个R18A独立地为氢、任选取代的C1-24烷基或烷氧基;
R19A、R20A、R22A和R23A独立地选自:氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基;
R21A和R24A独立地选自:氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的芳基、任选取代的–O–C1-24烷基、任选取代的–O–芳基、任选取代的–O–杂芳基、任选取代的–O–单环杂环和
R25A和R29A独立地选自:氢、任选取代的C1-24烷基和任选取代的芳基;
R26A和R27A独立地为-C≡N或选自以下的任选取代的取代基:C2-8有机羰基、C2-8烷氧羰基和C2-8有机氨羰基;
R28A选自:氢、任选取代的C1-24-烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基和任选取代的C3-6环烯基;
R30A和R31A独立地选自:氢、任选取代的C1-24-烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基和任选取代的C3-6环烯基;
R”A为任选取代的C1-24-烷基;
m和t独立地为0或1;
p和q独立地选自1、2和3;
r为1或2;
s为0、1、2或3;
u为1或2;以及
Z1A、Z2A、Z3A和Z4A独立地为O或S。
2.如权利要求1所述的化合物,其中R2A为叠氮甲基。
3.如权利要求1所述的化合物,其中R2A为氨甲基。
4.如权利要求1-3中任一项所述的化合物,其中R1A
5.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为氢。
6.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均不存在。
7.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均独立地选自:任选取代的C1-24烷基、任选取代的C3-24烯基、任选取代的C3-24炔基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C3-6环烯基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基)。
8.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为任选取代的C1-24烷基。
9.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为任选取代的C3-24烯基。
10.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为*–(CR15AR16A)p–O–C1-24烷基。
11.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为*–(CR17AR18A)q–O–C2-24烯基。
12.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为任选取代的芳基。
13.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为任选取代的芳基(C1-6烷基)。
14.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为
15.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为
16.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为
17.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为
18.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A均为
19.如权利要求4所述的化合物,其中R6A和R7A可一起形成选自以下的部分:任选取代的和任选取代的其中与R6A和R7A连接的氧、磷和所述部分形成六元至十元环系。
20.如权利要求1至19中任一项所述的化合物,其中Z1A为O。
21.如权利要求1至19中任一项所述的化合物,其中Z1A为S。
22.如权利要求1所述的化合物,其中R1A
23.如权利要求22所述的化合物,其中R8A为氢,并且R9A为NR30AR31A,其中R30和R31独立地选自:氢、任选取代的C1-24烷基、任选取代的C2-24烯基、任选取代的C2-24炔基、任选取代的C3-6环烷基和任选取代的C3-6环烯基。
24.如权利要求22所述的化合物,其中R8A为任选取代的芳基;并且R9A为任选取代的N连接的氨基酸或任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物。
25.如权利要求22所述的化合物,其中R8A为任选取代的芳基;并且R9A具有结构其中R33A选自:氢、任选取代的C1-6-烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的芳基、任选取代的芳基(C1-6烷基)和任选取代的卤烷基;R34A选自:氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C1-6卤烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基);以及R35A为氢或任选取代的C1-4-烷基;或者R34A和R35A一起形成任选取代的C3-6环烷基。
26.如权利要求22至25中任一项所述的化合物,其中Z2A为O。
27.如权利要求22至25中任一项所述的化合物,其中Z2A为S。
28.如权利要求1所述的化合物,其中R1A
29.如权利要求28所述的化合物,其中R10A和R11A均为任选取代的N连接的氨基酸或任选取代的N连接的氨基酸酯衍生物。
30.如权利要求28所述的化合物,其中R10A和R11A独立地具有结构其中R36A选自:氢、任选取代的C1-6-烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的芳基、任选取代的芳基(C1-6烷基)和任选取代的卤烷基;R37A选自:氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C1-6卤烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基);以及R38A为氢或任选取代的C1-4-烷基;或者R37A和R38A一起形成任选取代的C3-6环烷基。
31.如权利要求28至30中任一项所述的化合物,其中Z3A为O。
32.如权利要求28至30中任一项所述的化合物,其中Z3A为S。
33.如权利要求1所述的化合物,其中R1A
34.如权利要求33所述的化合物,其中m为0,并且R12A和R13A独立地不存在或为氢。
35.如权利要求33所述的化合物,其中m为1,并且R12A、R13A和R14A独立地不存在或为氢。
36.如权利要求1所述的化合物,其中R1A为H。
37.如权利要求1所述的化合物,其中R1A为任选取代的酰基。
38.如权利要求1所述的化合物,其中R1A为任选取代的O连接的氨基酸。
39.如权利要求1所述的化合物,其中R1A其中R40A选自:氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C1-6卤烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基);以及R41A为氢或任选取代的C1-4-烷基;或者R40A和R41A一起形成任选取代的C3-6环烷基。
40.如权利要求1至39中任一项所述的化合物,其中B1A选自:
其中:
RA2选自:氢、卤素和NHRJ2,其中RJ2选自:氢、-C(=O)RK2和–C(=O)ORL2
RB2为卤素或NHRW2,其中RW2选自:氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基、任选取代的C3-8环烷基、-C(=O)RM2和–C(=O)ORN2
RC2为氢或NHRO2,其中RO2选自:氢、-C(=O)RP2和–C(=O)ORQ2
RD2选自:氢、氘、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基;
RE2选自:氢、羟基、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C3-8环烷基、-C(=O)RR2和–C(=O)ORS2
RF2选自:氢、卤素、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C2-6烯基和任选取代的C2-6炔基;
Y2和Y3独立地为N或CRI2,其中RI2选自氢、卤素、任选取代的C1-6-烷基、任选取代的C2-6-烯基和任选取代的C2-6-炔基;
RG2为任选取代的C1-6烷基;
RH2为氢或NHRT2,其中RT2独立地选自:氢、-C(=O)RU2和–C(=O)ORV2;以及
RK2、RL2、RM2、RN2、RP2、RQ2、RR2、RS2、RU2和RV2独立地选自:C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、C3-6环烯基、C6-10芳基、杂芳基、杂环、芳基(C1-6烷基)、杂芳基(C1-6烷基)和杂环(C1-6烷基)。
41.如权利要求40所述的化合物,其中B1A
42.如权利要求40所述的化合物,其中B1A
43.如权利要求40所述的化合物,其中B1A
44.如权利要求40所述的化合物,其中B1A
45.如权利要求40所述的化合物,其中B1A
46.如权利要求40所述的化合物,其中B1A
47.如权利要求1至46中任一项所述的化合物,其中R3A为OH。
48.如权利要求1至46中任一项所述的化合物,其中R3A为–OC(=O)R”A
49.如权利要求1至46中任一项所述的化合物,其中R3A为O连接的氨基酸。
50.如权利要求1至46中任一项所述的化合物,其中R3A其中R42A选自:氢、任选取代的C1-6烷基、任选取代的C1-6卤烷基、任选取代的C3-6环烷基、任选取代的C6芳基、任选取代的C10芳基和任选取代的芳基(C1-6烷基);以及R43A为氢或任选取代的C1-4-烷基;或者R42A或R43A一起形成任选取代的C3-6环烷基。
51.如权利要求1至50中任一项所述的化合物,其中R5A为氢。
52.如权利要求1至50中任一项所述的化合物,其中R5A为卤素。
53.如权利要求52所述的化合物,其中R5A为氟或氯。
54.如权利要求1至53中任一项所述的化合物,其中R4A为氟。
55.如权利要求1至53中任一项所述的化合物,其中R4A为氯。
56.如权利要求1至55中任一项所述的化合物,其中Ra1和Ra2均为氢。
57.如权利要求1至55中任一项所述的化合物,其中Ra1和Ra2均为氘。
58.如权利要求1至57中任一项所述的化合物,其中RA为氢。
59.如权利要求1至57中任一项所述的化合物,其中RA为氘。
60.如权利要求1所述的化合物,其中所述式(I)化合物为:或其药学上可接受的盐。
61.如权利要求1所述的化合物,其中所述式(I)化合物为:或其药学上可接受的盐。
62.如权利要求1所述的化合物,其中所述式(I)化合物选自:
或上述项的药学上可接受的盐。
63.如权利要求1所述的化合物,其中所述式(I)化合物选自:
或上述项的药学上可接受的盐。
64.如权利要求1所述的化合物,其中所述式(I)化合物选自:
或上述项的药学上可接受的盐。
65.如权利要求1所述的化合物,其中所述式(I)化合物选自:
或上述项的药学上可接受的盐。
66.如权利要求1所述的化合物,其中所述式(I)化合物选自:
或上述项的药学上可接受的盐。
67.药物组合物,其包含有效量的权利要求1至66中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐;以及药学上可接受的载体、稀释剂、赋形剂或其组合。
68.减轻或治疗副粘病毒的病毒感染的方法,其包括对被鉴定为患有副粘病毒的病毒感染的对象施用有效量的权利要求1至66中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的权利要求67所述的药物组合物。
69.抑制副粘病毒复制的方法,其包括使感染有副粘病毒的细胞与有效量的权利要求1至66中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的权利要求67所述的药物组合物接触。
70.减轻或治疗副粘病毒的病毒感染的方法,其包括使被鉴定为患有所述病毒感染的对象中感染有副粘病毒的细胞与有效量的权利要求1至66中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的权利要求67所述的药物组合物接触。
71.与一种或多种药剂联用以减轻或治疗副粘病毒的病毒感染的方法,其包括将有效量的权利要求1至66中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的权利要求67所述的药物组合物施用于被鉴定为患有副粘病毒的病毒感染的对象或者与所述对象的细胞接触。
72.如权利要求68至71中任一项所述的方法,其中所述副粘病毒的病毒感染为人呼吸道合胞体病毒感染。
73.如权利要求68至71中任一项所述的方法,其中所述副粘病毒的病毒感染为人呼吸道合胞体病毒感染;并且其中所述一种或多种药剂选自:病毒唑、帕利珠单抗、RSV-IGIV、ALN-RSV01、BMS-433771、RFI-641、RSV604、MDT-637、BTA9881、TMC-353121、MBX-300、YM-53403、RV568和RSV-F颗粒疫苗。
74.如权利要求68至71中任一项所述的方法,其中所述副粘病毒的病毒感染为人副流感病毒感染。
75.如权利要求74所述的方法,其中人副流感病毒感染为人副流感病毒3感染。
76.如权利要求68至71中任一项所述的方法,其中所述副粘病毒的病毒感染为人偏肺病毒感染。
77.有效量的权利要求1至66中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的权利要求67所述的药物组合物在制备用于减轻或治疗被鉴定为患有副粘病毒的病毒感染的对象的副粘病毒的病毒感染的药物中的用途。
78.有效量的权利要求1至66中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的权利要求67所述的药物组合物在制备用于抑制副粘病毒复制的药物中的用途。
79.有效量的权利要求1至66中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的权利要求67所述的药物组合物在制备用于接触感染有副粘病毒的细胞的药物中的用途。
80.有效量的权利要求1至66中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的权利要求67所述的药物组合物在制备用于与一种或多种药剂联用以减轻或治疗副粘病毒的病毒感染的药物中的用途,其包括将有效量的权利要求1至66中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,或者有效量的权利要求67所述的药物组合物施用于被鉴定为患有副粘病毒的病毒感染的对象或与所述对象的细胞接触。
81.如权利要求77至80中任一项所述的用途,其中所述副粘病毒的病毒感染为人呼吸道合胞体病毒感染。
82.如权利要求77至80中任一项所述的用途,其中所述副粘病毒的病毒感染为人呼吸道合胞体病毒感染;并且其中所述一种或多种药剂选自:病毒唑、帕利珠单抗、RSV-IGIV、ALN-RSV01、BMS-433771、RFI-641、RSV604、MDT-637、BTA9881、TMC-353121、MBX-300、YM-53403、RV568和RSV-F颗粒疫苗。
83.如权利要求77至80中任一项所述的用途,其中所述副粘病毒的病毒感染为人副流感病毒感染。
84.如权利要求83所述的用途,其中人副流感病毒感染为人副流感病毒3感染。
85.如权利要求77至80中任一项所述的用途,其中所述副粘病毒的病毒感染为人偏肺病毒感染。
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