CN105349705B - 水产品常见病毒检测试剂盒 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及水产品检测用品领域内的一种水产品常见病毒检测试剂盒,主要由引物组合和膜芯片组成,引物组合为7重聚合酶链式反应引物组合,其中,反向引物的5’端接上Tag序列,引物组合中还含有一条5’端带生物素标志的Tag引物,膜芯片为顺序固定在支持膜表面的7组探针序列、1组阳性对照探针序列和1组阴性对照探针序列。本发明克服了现有水产品病毒检测技术费时费力成本高的缺陷,提供的水产品常见病毒检测试剂盒操作简单,快速灵敏,检测通量大,检测结果可视化,成本低廉。
Description
所属技术领域
本发明涉及水产品检测用品领域,具体为水产品常见病毒检测试剂盒。
背景技术
水产品是营养丰富的食品,尤其是鱼类的蛋白质高、脂肪低、胆固醇少,为人们所喜食。然而,近年来,各类病毒严重威胁着水产品的健康可持续发展,水产品质量也因此受到严重影响。更为重要的是,部分水产品病毒,如甲肝病毒、诺瓦克病毒及类诺瓦克病毒会引起水产品相关疾病。水产品质量安全问题不仅关系到水产业的健康发展,也与人民群众健康息息相关,加强水产品质量安全管理体系研究具有重大而深远的意义。
核酸检测技术作为分子生物学检测技术的核心,在水产品病毒检测中发挥着巨大作用。目前市面上水产品病毒核酸检测方法主要为常规定性聚合酶链式反应(PCR),实时荧光PCR及基因芯片技术等。常规定性PCR操作简单,但过程繁琐,需通过琼脂糖凝胶电泳检测结果,检测灵敏度低,且检测过程中使用高致癌染料,对环境及人体危害非常大。实时荧光PCR检测灵敏度高,但其设备昂贵、对操作人员专业素质、引物及模板质量要求高,且不同品牌间产品重复性及重现性不佳。使用常规定性PCR及实时荧光PCR法每次只能筛检一种病毒指标,无法满足同时针对水产品中多种病毒进行筛检的需求。而基因芯片法利用核酸杂交原理,将待测病毒特异性探针固定于固相/液相芯片上,可同时检测多种病毒指标,但其配套设备昂贵,通常用于科研工作中。
发明内容
本发明的目的是为了克服现有水产品病毒检测技术费时费力成本高的缺陷,提供一种操作简单,快速灵敏,检测通量大,检测结果可视化,成本低廉的水产品常见病毒检测试剂盒。
本发明的目的是通过以下技术方案实现的:
本发明的水产品常见病毒检测试剂盒,主要由引物组合和膜芯片组成,其特征在于引物组合为7重聚合酶链式反应(PCR)引物组合,各对引物的碱基序列5’-3’如下:
外参基因: 正向引物: GATTTGGACCTGCGAGC
反向引物: GGTTGGCCAGGCGCGAAG;
甲肝病毒: 正向引物: ACAACTGTAAATGGAACCCC
反向引物: AGCAACATGGATGCCCAA;
星状病毒: 正向引物: GAATTTCCTCTCCGCCTGAC
反向引物: CGGTTGTTCTCATCAGAGTCC;
诺瓦克病毒: 正向引物: ACCTAACCACCAGAACCCCTT
反向引物: CTCAGCATCCATTGTTCCAAAGCG;
轮状病毒: 正向引物: CTTTTCCATCCGAAATTAACAC
反向引物: AATATAAGGCAACCACGGTA;
脊灰病毒: 正向引物: AGGAGAAAATTATCCCACAAGC
反向引物: AAACATACTGGTTCAATACGGTG;
柯萨奇病毒: 正向引物: AAAACGTGGCAGCTAATGGA
反向引物: GCCACTCACCATAAGCAACA;
其中,反向引物的5’端接上Tag序列,该Tag序列为
5’-AGTCCATGTCCCGAAACGTATACCGCAGTATGGCT-3’;
引物组合中还含有一条5’端带生物素标志(biotin)的Tag引物,其碱基顺序如下所示:
Tag引物:biotin-5’-AGTCCATGTCCCGAAACGTATACCGCAGTATGG
CT-3’;
膜芯片为顺序固定在支持膜表面的7组探针序列、1组阳性对照(Positive)探针序列和1组阴性对照(Negative)探针序列,7组探针序列、阳性对照探针序列和阴性对照探针序列的碱基序列5’-3’如下:
外参基因探针: CTGACCTGAAGGCTCT;
甲肝病毒探针: TCCAGGAAGACCTTCGCCTT;
星状病毒探针: CTGTCCGCTTCATCGTCTTCGT;
诺瓦克病毒探针: CCCAACTAATGGCCCTGCTCGGT;
轮状病毒探针: CAAATTTACTTCCACCGTACACA;
脊灰病毒探针: TTCCTGACTAGGGCATGATTGGT;
柯萨奇病毒探针: ACGGTCACTGTAACCACATGCTTC;
Positive探针: GCATCCAGATCAGAAGCAATAATGAGCAGTGCGA
GAAGAACGAGTGTCCAAAGTACCAG;
Negative探针: GGTTCCTTGAGAAATGTTTTACGGGATTACTTCC
ATGTTTGTTGGATGATCCTATTTTC。
上述方案中,所述试剂盒主要由引物组合、膜芯片和辅料组成,辅料为dNTPs、EX-Taq聚合酶(Polymerase)及5’端带生物素标志的阳性寡核苷酸单链DNA,该单链的碱基序列为:
biotin-5'-CTGGTACTTTGGACACTCGTTCTTC
TCGCACTGCTCATTATTGCTTCTGATCTGGATGC-3’。
上述方案中,所述试剂盒由引物组合、膜芯片、辅料和配液组成,配液为10×PCR缓冲液、预杂交液、杂交液、洗液、封闭液、链酶亲和素标记辣根过氧化物酶和四甲基联苯胺(TMB)显色液。
上述方案中,所述预杂交液为5×SSC,0.1%重量百分比十二烷基磺酸钠(SDS)和10×Denhardt’s液,其中,SSC为0.75M 氯化钠和0.075M 柠檬酸钠,Denhardt’s液为1%Ficoll聚蔗糖,1%聚乙烯吡咯烷酮(polyvinylpyrrolidone),1% 牛血清白蛋白(BSA);杂交液为5×SSC,0.1% 重量百分比SDS,5×Denhardt’s,50%重量百分比去离子甲酰胺和100ug/ml 酵母tRNA;洗液分别为洗液1、洗液2、洗液3和洗液4,其中,洗液1:2×SSC和0.1% 重量百分比SDS,洗液2:0.5×SSC和0.1%重量百分比 SDS,洗液3:100 mM (毫摩尔/升)Tris-HCl,pH7.5,150 mM NaCl,洗液4:100 mM Tris-HCl,pH9.5,100 mM NaCl和100 mM MgCl2;封闭液为3%重量百分比牛血清白蛋白(BSA),100 mM Tris-HCl,pH7.5,150 mM NaCl;四甲基联苯胺显色液由四甲基联苯胺显色液A液和四甲基联苯胺显色液B液使用前等量混合配成,其中,四甲基联苯胺显色液A液:pH5.4的200mM柠檬酸钠和0.2mg/ml四甲基联苯胺,四甲基联苯胺显色液B液: 3%重量百分比的H2O2用800体积的双蒸水稀释液。
上述方案中,所述支持膜为硝酸纤维素膜、尼龙膜或其他有三维孔径结构的支持物。
本发明采用多重PCR扩增的方法扩增目标序列。多重PCR扩增技术原理是将多对引物放到同一个反应管中进行PCR扩增,达到同时扩增2种或两种以上目标DNA序列的目的。本发明采用了7重PCR扩增体系扩增目标序列,包括6种常见、常检的水产品病毒检测指标:甲肝病毒、星状病毒、诺瓦克病毒、轮状病毒、脊灰病毒、柯萨奇病毒和外参基因。
本发明采用单引物扩增获得大量单链DNA技术用以提高检测灵敏度。单引物扩增技术原理是在PCR扩增过程中采用的反向引物的5’端接上Tag序列,同时引入一条5’端带生物素标志(biotin)的Tag引物(二者TAG序列相同),使得PCR扩增后产生大量的单链DNA,该单链DNA可以有效的和固定在支持膜上的探针杂交,从而提高检测灵敏度。
本发明在多重PCR扩增同时进行单引物扩增获得大量单链DNA,采用的技术方案是在多重PCR反向引物的5’端添加Tag序列,同时在PCR反应体系中引入5’端带生物素标志的Tag引物,带生物素标志的Tag引物的碱基序列与多重PCR反向引物的Tag序列的碱基序列相同,带生物素标志的Tag引物Tm值(解链温度)比多重PCR正向引物Tm值高10~15℃,带生物素标志的Tag引物和反向引物上的Tag接头的互补序列配对后,通过调节退火温度进行单引物扩增制备出单链DNA。在整个PCR扩增过程中,首先采用低退火温度(55~60℃)进行多重PCR反应,其扩增产物主要是双链DNA,之后提高退火温度(65~68℃),使正向引物不能结合到模板上,只有Tag引物可以结合到模板上并延伸扩增,从而产生大量5’端带生物素标志的单链DNA,该单链DNA用于接下来的膜芯片杂交检测。
本发明采用基于反向斑点杂交的可视化膜芯片技术进行水产品中常见病毒的分子杂交检测,其工作原理是首先将针对各个病毒特异性序列的单链探针按顺序排列固定于支持膜表面的特定区域,再将待测的多重PCR产物与其杂交,这样PCR产物中的病毒特异性序列单链DNA就会和支持膜上的探针杂交,经洗涤去除未结合的DNA样品,由于待测PCR产物的DNA上带有生物素标志,结合了待测DNA的探针点就偶联上了生物素标志物,再经过相应的显色反应就能读取对应的杂交信号,这样一张膜芯片上就可以同时检测多个水产品病毒检测指标。本发明的检测探针顺序排列于支持膜表面的特殊区域,形成低密度探针阵列。膜芯片同待测样本杂交后经底物显色可形成肉眼可视化的检测结果。
本发明的有益效果是:
1)操作简单,经过一次样本前处理,单管PCR扩增,单芯片杂交就可以同步筛检水产品样本中多种病毒指标,具有平行分析和多重判断的特点;
2)检验对象完备,包含了当前市面上常见、常检的的水产品病毒指标,并且可以很方便的加入新的检测指标;
3)系统在多重PCR扩增过程同时进行了单链扩增获得大量单链DNA,提高了系统的灵敏度和准确性;
4)试剂盒采用了可视化膜芯片的检测方式,提高了系统的检测通量,并且检测结果可以直接用肉眼判断,方便,快捷;
5)试剂盒操作简单,经济,无需特殊的昂贵仪器,适用于水产品病毒的检测和大规模筛查。
因此,本发明克服了现有水产品病毒检测技术费时费力成本高的缺陷,提供的水产品常见病毒检测试剂盒操作简单,快速灵敏,检测通量大,检测结果可视化,成本低廉。
附图说明
图1为本发明用于检测水产品扇贝的杂交结果图,其中图1A为芯片结果模式图,图1B为水产品扇贝的检测结果图。
图2为本发明用于检测水产品对虾的杂交结果图,其中图2A为芯片结果模式图,图2B为水产品对虾的检测结果图。
图3为本发明用于检测水产品鲢鱼的杂交结果图,其中图3A为芯片结果模式图,图3B为水产品鲢鱼的检测结果图。
图4为本发明用于检测水产品鲫鱼的杂交结果图,其中图4A为芯片结果模式图,图4B为水产品鲫鱼的检测结果图。
附图中,外参基因为人RPS30基因 ;Positive为阳性对照;Negative为阴性对照。
具体实施例
下面结合附图及实施例进一步详述本发明,但本发明不仅限于所述实施例。
实施例一
本例的水产品常见病毒检测试剂盒,由引物组合和膜芯片组成,引物组合为7重PCR引物组合,各对引物的碱基序列5’-3’如下:
甲肝病毒:正向引物:ACAACTGTAAATGGAACCCC
反向引物:AGCAACATGGATGCCCAA;
星状病毒:正向引物:GAATTTCCTCTCCGCCTGAC
反向引物:CGGTTGTTCTCATCAGAGTCC;
诺瓦克病毒:正向引物:ACCTAACCACCAGAACCCCTT
反向引物:CTCAGCATCCATTGTTCCAAAGCG;
轮状病毒:正向引物:CTTTTCCATCCGAAATTAACAC
反向引物:AATATAAGGCAACCACGGTA;
脊灰病毒:正向引物:AGGAGAAAATTATCCCACAAGC
反向引物:AAACATACTGGTTCAATACGGTG;
柯萨奇病毒:正向引物:AAAACGTGGCAGCTAATGGA
反向引物:GCCACTCACCATAAGCAACA;
外参基因:正向引物:GATTTGGACCTGCGAGC
反向引物:GGTTGGCCAGGCGCGAAG。
本例的引物组合中反向引物的5’端接上Tag序列,该Tag序列为5’-AGTCCATGTCCCGAAACGTATACCGCAGTATGGCT-3’,同时PCR体系中还含有一条5’端带生物素标志(biotin)的Tag引物,其碱基顺序如下所示:
Tag引物:biotin-5’-AGTCCATGTCCCGAAACGTATACCGCAGTAT
GGCT-3’。该Tag引物和反向引物上接上的Tag接头的互补序列配对后,通过调节退火温度进行单引物扩增制备出大量单链DNA。,
膜芯片为顺序固定在支持膜表面的7组探针序列、1组阳性对照(Positive)探针序列和1组阴性对照(Negative)探针序列,7组探针序列、阳性对照探针序列和阴性对照探针序列的碱基序列5’-3’如下:
甲肝病毒探针: TCCAGGAAGACCTTCGCCTT;
星状病毒探针: CTGTCCGCTTCATCGTCTTCGT;
诺瓦克病毒探针: CCCAACTAATGGCCCTGCTCGGT;
轮状病毒探针: CAAATTTACTTCCACCGTACACA;
脊灰病毒探针: TTCCTGACTAGGGCATGATTGGT;
柯萨奇病毒探针:ACGGTCACTGTAACCACATGCTTC;
外参基因探针:CTGACCTGAAGGCTCT;
Positive探针: GCATCCAGATCAGAAGCAATAATGAGCAGTGCGAG
AAGAACGAGTGTCCAAAGTACCAG;
Negative探针:GGTTCCTTGAGAAATGTTTTACGGGATTACTTCCA
TGTTTGTTGGATGATCCTATTTTC。
支持膜为硝酸纤维素膜、尼龙膜或其他有三维孔径结构的支持物。
通过相应的多重PCR引物设计,采用固相亚磷酰胺三酯法合成得到上述7重PCR组合引物和Tag引物。根据多重PCR扩增产物设计检测探针,采用固相亚磷酰胺三酯法合成探针,探针合成时同时合成阳性探针(positive probe)、阴性探针(negative probe)和与阳性探针对应的5’端带生物素标志的阳性寡核苷酸(positive oligo)单链DNA,该单链的碱基序列为:biotin-5'-CTGGTACTTTGGACACTCGTTCTTCT
CGCACTGCTCATTATTGCTTCTGATCTGGATGC-3’。
将支持膜裁成1.2cm×1.8cm的膜条,裁好的膜于双蒸水中浸泡15min,再用15×SSC浸泡15min,取出,置于滤纸上,60℃烘1.5 hour,膜条降温到室温后,将探针(5uM)顺序点在膜上,每个探针重复点样两次,以验证检测结果的可重复性,点样样式见附图,膜条晾干后80℃烘2小时以固定探针,处理好的膜芯片室温保存。
按照北京康为世纪生物科技有限公司病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒(VirusGenPurification Kit,CW0548)的说明提取水产品扇贝内病毒基因组DNA/RNA,取50g样品按照试剂盒说明抽提后用50ul ddH2O(双蒸水)溶解基因组DNA/RNA,并用紫外分光光度计将DNA/RNA溶液稀释至同一质量浓度(50ng/ul)。
PCR扩增的反应体系如下所示:
ddH2O: 加至总体积50ul
10×PCR Buffer: 5ul
dNTP (2.5mM each): 5ul
PCR引物(20μM): 0.5ul each
Tag primer (20μM): 3.5ul
EX-Taq Polymerase (Takara, 5U/ul): 0.5ul
提取的产品扇贝中病毒基因组DNA/RNA (约50ng/ul): 2ul
对上述反应体系进行PCR循环扩增,PCR循环条件如下所示,反应过程由预变性、多重PCR循环1和单链PCR循环2组成,条件分别为:
预变性:温度95℃,时间10分钟。
多重PCR循环1:30个循环组成:
变性:温度95℃,时间45秒。
退火:温度55℃,时间30秒。
延伸:温度72℃,时间30秒。
单链PCR循环2:25个循环组成:
变性:温度95℃,时间45秒。
退火:温度65℃,时间30秒。
延伸:温度72℃,时间30秒。
最后延伸:温度72℃,时间10分钟。
然后进行膜芯片斑点杂交检测,膜条于42℃预杂交液(5×SSC,0.1% SDS,10×Denhardt’s)中预杂交1小时,之后将膜条放于2ml杂交液(5×SSC,0.1% SDS,5×Denhardt’s,50%去离子甲酰胺,100ug/ml 酵母tRNA)中42℃,1小时。取40ul多重PCR产物加入1ul阳性寡核苷酸单链DNA(10uM),100℃水浴变性5分钟后置于冰上,之后加入2ml杂交液中,42℃杂交16小时。洗液1(2×SSC,0.1% SDS)、洗液2(0.5×SSC,0.1% SDS)42℃各洗膜条两次,每次10分钟。将膜条置于封闭液(3%BSA,100 mM Tris-HCl,PH7.5,150 mM NaCl)中37℃封闭30分钟,之后将膜条放到酶联液(用封闭液1:5000稀释链酶亲和素标记辣根过氧化物酶)中37℃,30分钟。用洗液3(100 mM Tris-HCl,PH7.5,150 mM NaCl)、洗液4(100 mM Tris-HCl,PH9.5,100 mM NaCl,100 mM MgCl2)各漂洗膜条3次,每次5分钟,之后将膜条放入 TMB显色液(100mM柠檬酸钠PH5.4,0.1mg/ml四甲基联苯胺TMB,1:1600体积比的H2O2(3%))中,避光显色10~15分钟,依照杂交点的显色情况判定结果。
本例中所用辅料和配液为外购或自配,百分比为重量百分比。
本例中水产品扇贝经检测含星状病毒、轮状病毒,检测结果如图1B所示。
实施例二
本例的水产品常见病毒检测试剂盒,由引物组合、膜芯片和辅料组成,辅料为脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)、EX-Taq聚合酶(Polymerase)、5’端带生物素标志的阳性寡核苷酸单链DNA,该单链的碱基序列如下:biotin-5'-CTGGTACTTTGGACAC
TCGTTCTTCTCGCACTGCTCATTATTGCTTCTGATCTGGATGC-3’。
本例中水产品对虾经检测含诺瓦克病毒、脊灰病毒,检测结果如图2B所示。
其余同实施例一。
实施例三
本例的水产品常见病毒检测试剂盒,由引物组合、膜芯片、辅料和配液组成,配液为10×PCR缓冲液、预杂交液、杂交液、洗液、封闭液、链酶亲和素标记辣根过氧化物酶和四甲基联苯胺(TMB)显色液,其中,预杂交液为5×SSC,0.1% SDS和10×Denhardt’s;杂交液为5×SSC,0.1% SDS,5×Denhardt’s,50%去离子甲酰胺和100ug/ml 酵母tRNA;洗液分别为洗液1:2×SSC和0.1% SDS,洗液2:0.5×SSC和0.1% SDS,洗液3:100 mM Tris-HCl,PH7.5,150mM NaCl,洗液4:100 mM Tris-HCl,PH9.5,100 mM NaCl和100 mM MgCl2;封闭液为3% BSA,100 mM Tris-HCl,PH7.5,150 mM NaCl;四甲基联苯胺显色液分别为四甲基联苯胺显色液A液:200mM柠檬酸钠PH5.4,0.2mg/ml四甲基联苯胺,四甲基联苯胺显色液B液: 3% H2O2用800体积的双蒸水稀释液,使用前A液B液等量混合配成四甲基联苯胺显色液。
本例水产品鲢鱼经检测含甲肝病毒、诺瓦克病毒及柯萨奇病毒,检测结果如图3B所示。
其余同实施例二。
实施例四
本例的水产品常见病毒检测试剂盒,由引物组合、膜芯片、辅料和配液组成,其中,多重PCR扩增试剂一管600ul,每48ul试剂可检测一个DNA样本,每48ul扩增体系构成如下:10×PCR Buffer(Takara) 5ul,dNTP (2.5mM each) 5ul,7对多重PCR引物(20μM) 0.5uleach, Tag primer(20μM) 3.5ul,EX-Taq Polymerase (Takara,5U/ul) 0.5ul,ddH2O加至48ul。每一样本检测需要吸取48ul扩增试剂,加入2ul待检测病毒基因组DNA/RNA (约50ng/ul)。
阳性寡核苷酸单链DNA(10uM)一管15ul。
预杂交液(5×SSC,0.1% SDS,10×Denhardt’s)一瓶30ml。杂交液(5×SSC,0.1%SDS,5×Denhardt’s,50%去离子甲酰胺,100ug/ml 酵母tRNA)一瓶30ml。
洗液1(2×SSC,0.1% SDS)10倍浓缩液一瓶12ml,使用前加108ml ddH2O。洗液2(0.5×SSC,0.1% SDS)10倍浓缩液一瓶12ml,使用前加108ml ddH2O。洗液3(100 mM Tris-HCl,PH7.5,150 mM NaCl)10倍浓缩液一瓶18ml,使用前加162ml ddH2O。洗液4(100 mMTris-HCl,PH9.5,100 mM NaCl,100 mM MgCl2)10倍浓缩液一瓶18ml,使用前加162mlddH2O。
封闭液/酶联液(3%BSA,100 mM Tris-HCl,PH7.5,150 mMNaCl)一瓶60ml。链酶亲和素标记辣根过氧化物酶(1mg/ml)一管5ul,使用前用封闭液1:5000稀释成酶联液。
TMB显色液A液(200mM柠檬酸钠PH5.4,0.2mg/ml四甲基联苯胺TMB)一瓶15m l。TMB显色液B液(1:800体积比的H2O2(3%))一瓶15ml。使用前A液B液等量混合配成TMB显色液。
本例水产品鲫鱼经检测不含本试剂盒所检测的6种水产品病毒,检测结果如图4B所示。
其余同实施例三。
Claims (4)
1.一种水产品常见病毒检测试剂盒,包括引物组合、膜芯片和辅料,其特征在于引物组合为7重聚合酶链式反应引物组合,各对引物的碱基序列5’-3’如下:
外参基因:正向引物:GATTTGGACCTGCGAGC
反向引物:GGTTGGCCAGGCGCGAAG;
甲肝病毒:正向引物:ACAACTGTAAATGGAACCCC
反向引物:AGCAACATGGATGCCCAA;
星状病毒:正向引物:GAATTTCCTCTCCGCCTGAC
反向引物:CGGTTGTTCTCATCAGAGTCC;
诺瓦克病毒:正向引物:ACCTAACCACCAGAACCCCTT
反向引物:CTCAGCATCCATTGTTCCAAAGCG;
轮状病毒:正向引物:CTTTTCCATCCGAAATTAACAC
反向引物:AATATAAGGCAACCACGGTA;
脊灰病毒:正向引物:AGGAGAAAATTATCCCACAAGC
反向引物:AAACATACTGGTTCAATACGGTG;
柯萨奇病毒:正向引物:AAAACGTGGCAGCTAATGGA
反向引物:GCCACTCACCATAAGCAACA;
其中,反向引物的5’端接上Tag序列,该Tag序列为
5’-AGTCCATGTCCCGAAACGTATACCGCAGTATGGCT-3’;
引物组合中还含有一条5’端带生物素标志的Tag引物,其碱基顺序如下所示:
Tag引物:biotin-5’-AGTCCATGTCCCGAAACGTATACCGCAGTATGGCT-3’;
膜芯片为顺序固定在支持膜表面的7组探针序列、1组阳性对照探针序列和1组阴性对照探针序列,7组探针序列、阳性对照探针序列和阴性对照探针序列的碱基序列5’-3’如下:
外参基因探针:CTGACCTGAAGGCTCT;
甲肝病毒探针:TCCAGGAAGACCTTCGCCTT;
星状病毒探针:CTGTCCGCTTCATCGTCTTCGT;
诺瓦克病毒探针:CCCAACTAATGGCCCTGCTCGGT;
轮状病毒探针:CAAATTTACTTCCACCGTACACA;
脊灰病毒探针:TTCCTGACTAGGGCATGATTGGT;
柯萨奇病毒探针:ACGGTCACTGTAACCACATGCTTC;
Positive探针:GCATCCAGATCAGAAGCAATAATGAGCAGTGCGAGAAGAACGAGTGTCCAAAGTACCAG;
Negative探针:GGTTCCTTGAGAAATGTTTTACGGGATTACTTCCATGTTTGTTGGATGATCCTATTTTC;
辅料为dNTPs、EX-Taq聚合酶及5’端带生物素标志的阳性寡核苷酸单链DNA,该单链的碱基序列为:
biotin-5'-CTGGTACTTTGGACACTCGTTCTTCTCGCACTGCTCATTATTGCTTCTGATCTGGATGC-3’。
2.根据权利要求1所述的水产品常见病毒检测试剂盒,其特征在于所述试剂盒由引物组合、膜芯片、辅料和配液组成,配液为10×PCR缓冲液、预杂交液、杂交液、洗液、封闭液、链酶亲和素标记辣根过氧化物酶和四甲基联苯胺显色液。
3.根据权利要求2所述的水产品常见病毒检测试剂盒,其特征在于所述预杂交液为5×SSC,0.1%重量百分比十二烷基磺酸钠和10×Denhardt’s液,其中,SSC为0.75M氯化钠和0.075M柠檬酸钠,Denhardt’s液为1%Ficoll聚蔗糖,1%聚乙烯吡咯烷酮,1%牛血清白蛋白;杂交液为5×SSC,0.1%重量百分比十二烷基磺酸钠,5×Denhardt’s,50%重量百分比去离子甲酰胺和100ug/ml酵母tRNA;洗液分别为洗液1、洗液2、洗液3和洗液4,其中,洗液1:2×SSC和0.1%重量百分比十二烷基磺酸钠,洗液2:0.5×SSC和0.1%重量百分比十二烷基磺酸钠,洗液3:100mM Tris-HCl,pH7.5,150mM NaCl,洗液4:100mM Tris-HCl,pH9.5,100mMNaCl和100mM MgCl2;封闭液为3%重量百分比牛血清白蛋白,100mM Tris-HCl,pH7.5,150mM NaCl;四甲基联苯胺显色液由四甲基联苯胺显色液A液和四甲基联苯胺显色液B液使用前等量混合配成,其中,四甲基联苯胺显色液A液:pH5.4的200mM柠檬酸钠和0.2mg/ml四甲基联苯胺,四甲基联苯胺显色液B液:3%重量百分比的H2O2用800体积的双蒸水稀释。
4.根据权利要求1所述的水产品常见病毒检测试剂盒,其特征在于所述支持膜为硝酸纤维素膜或尼龙膜。
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