CN104726586A - 用于检测人类红细胞Kell血型基因分型的引物组及试剂盒 - Google Patents
用于检测人类红细胞Kell血型基因分型的引物组及试剂盒 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开了一种用于检测人类红细胞Kell血型基因的引物组及试剂盒。用于Kell血型基因测定的引物组包括K1引物对,K2引物对及内参引物对。本发明的试剂盒克服了血清学方法鉴定Kell血型的种种限制、是正确判定血型不可缺少的辅助手段,具有广泛的应用前景和临床参考价值。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,特别涉及一种用于检测人类红细胞Kell血型基因分型的试剂盒(PCR-SSP法)。
背景技术
在欧美Kell和ABO、Rh 被并列为3大血型系统,在输血中具有较重要的意义,抗-K、抗-k都会引起溶血性输血反应。我国汉族人Kell血型系统虽大多数为kk,但产生抗K的可能 性仍然存在。一项运用抗-K、抗-k血型研究668例北京地区汉族人群的调查发现,K(+)个体3例,基因频率为0.0022。
Kell血型系统以往采用血清学技术分型,至今无国产抗-K、-k血清供应,进口血清价格昂贵,较难普及,而采用DNA分型技术则一是可以降低成本,适合国内大多数实验室使用;二是标本可长期保存,便于复查及各实验室相互比较结果;三是实验结果易于判定。
Kell血型是使用抗人球蛋白试验方法(又称为Coombs试验)检出的第1个血型,相应抗体是在一位姓Kell的产妇血清中发现的,故被称为抗-Kell, 后来又检出了抗-K的对偶抗体抗-k。K和k抗原均表现为显性遗传,因此具有KK、Kk、kk、和K-k-4种表型。由于Kell抗原的抗原性较强,所以 在输血中有较重要的意义。到目前为止,我国已有关于Kell血型系统的血清学分型研究报道,但尚未见采用基因分型技术分型报告。
发明内容
本发明的目的是:克服血清学检测试剂的价格昂贵,试剂不好购买等不足,提供一种免疫学方法能够简单方便的检测人类红细胞Kell血型基因的引物组;
本发明的第二个目的是提供一种具有灵敏、特异、经济、简便、快速的用于检测人类红细胞Kell血型基因的试剂盒。
一种用于检测人类红细胞Kell血型基因的引物组,其特征是包括K1引物对,K2引物对及内参引物对。
所述K1的上下游引物位于Kell的DNA参考序列的Intron5 168-188和EXON6 578-598位置,上、下游引物分别是序列表中SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。
所述K2的上下游引物位于Kell的DNA参考序列的Intron5 168-188和EXON6 578-598位置,上、下游引物分别是序列表中SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。
一种用于检测人类红细胞Kell血型基因的试剂盒,其特征是包括包被有K1引物对,K2引物对及内参引物对的引物板和浓缩dNTP-Buffer。
所述K1的上下游引物位于Kell的DNA参考序列的Intron5 168-188和EXON6 578-598位置,上、下游引物分别是序列表中SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。
所述K2的上下游引物位于Kell的DNA参考序列的Intron5 168-188和EXON6 578-598位置,上、下游引物分别是序列表中SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。
附图说明
图 1为人类红细胞Kell血型基因特异引物孔位图。
图 2为实验结果阴阳性判读图。
图 3为人类红细胞Kell血型基因测定结果分型读板纸。
图 4为人类红细胞Kell血型基因测定试剂盒电泳结果胶图。
具体实施方案
下面结合具体实施例对本发明做进一步说明。
实施例1。
依据美国国立生物技术信息中心基因库(NCBI Gene Bank)公开的Kell等位基因序列,设计出用于检测人类红细胞Kell血型基因的引物组,该引物组包括K1引物对,K2引物对及内参引物对。
实施例2。
一种用于检测人类红细胞Kell血型基因的试剂盒,包括包被有K1引物对,K2引物对及内参引物对的引物板和浓缩dNTP-Buffer。
用于检测人类红细胞Kell血型基因的试剂盒的制备方法是:
(1) 依据人类红细胞Kell血型基因特异引物孔位图(见图1),分别将K1引物对,K2引物对及内参引物对包被至引物板的相应位置上,干燥处理;
(2) 依据配220mM dNTP、3.5mM Mg2+、500mM KCL、100mM Tris-HCL、1% TritonX-100制备出440μl 浓缩dNTP-Buffer;
(3) 将包被有引物对的引物板每人份检测包括2孔特异性引物孔,浓缩dNTP-Buffer组成一种用于检测人类红细胞Kell血型基因的试剂盒。
实施例3。
使用操作流程。
一、2.5%琼脂糖凝胶的准备。
(1) 将加入2.5g琼脂糖加入100ml 1×TBE 溶液(Tris-硼酸盐-EDTA溶液),加热直到形成均匀的凝胶溶液。再加入适量电泳染色剂,混合均匀。
(2) 将凝胶槽置于水平位置,向凝胶槽中加入适量凝胶溶液,插入电泳梳。前后水平移动凝胶槽,确保凝胶溶液覆盖均匀。
(3)待凝胶完全凝固后,竖直拔出电泳梳。
二、PCR循环参数见表1。
表1 扩增参数特征表。
1 | 96℃/2 min | 1 cycle |
2 | 96℃/20 sec, 68℃/60 sec | 5 cycles |
3 | 96℃/20 sec, 65℃/45 sec, 72℃/30 sec | 10 cycles |
4 | 96℃/20 sec, 62℃/45 sec, 72℃/30 sec | 15 cycles |
5 | 72℃/3 min | 1 cycle |
6 | 4℃保存 |
三、必须满足的试验条件。
(1)从冷冻室取出Taq聚合酶,放置冰上备用。
(2)根据实验所需数量,将包被引物的干燥冷冻保存的引物板取出,放置室温解冻,备用。
(3)根据实验所需数量,将冷冻的DNA样本、浓缩dNTP-Buffer取出,彻底融化,混匀离心。
四、实验过程中的注意事项。
(1)PCR扩增前后使用的加样器具要分开,不得混用。
(2)所有血液制品均应按照潜在的传染物处理。
(3)当观察和拍摄胶凝体时,要戴防紫外光的保护镜,不要直视紫外光源。
(4)试剂和样本应加样到微孔板的底部。
(5)为避免交叉污染,在不同样本和试剂之间要更换加样枪头。
(6)在检测前应准备好所有试剂和样本,一旦开始试验,为确保得到可靠结果不可中断操作。
(7)Taq聚合酶粘性很大,在分装过程中必须小心操作确保准确。
(8)严格按照指定的顺序操作。
五、操作步骤。
(1) 选用实施例2制备的一种用于检测人类红细胞Kell血型基因的试剂盒,配制dNTP-Buffer工作液:
440μl浓缩dNTP-Buffer + 560μl无菌水=1000μl dNTP-Buffer工作液。
(2) 配制Buffer-酶混合液:
每人份用量:20μl dNTP-Buffer工作液 + 0.3μl Taq酶(5 units/μl)+2μl DNA = 22.3μl 。
(3) 漩涡混匀Buffer-酶混合液,并瞬时离心,,使液体位于管底。
(4) 分别向每个引物孔加入10μl上述混合液。
(5) 每孔再分别加入15-20μl石蜡油,用密封膜封好PCR反应板(引物板)。
(6) 将引物板放入设置好循环参数的PCR仪内,配合使用适当的板架适配器。PCR循环参数见上文。
(7) 反应板顶部置PCR密封压力垫,以防止液体蒸发,关上PCR仪,启动程序直至循环结束。
(8) 启动PCR程序,直到循环结束。
(9) 取出引物板,轻轻地撕掉密封膜,防止样品溅出。或者如果不立即电泳,置于4℃可保存48小时。
(10) 按照引物孔位图的顺序,将每个PCR反应产物(5-10μl)转移到2.5%琼脂糖凝胶孔中。
(11) 140-150V电泳15-20分钟,内参带和阳性带清晰分开即可停止电泳。
(12) 紫外光下观察结果并拍摄成像。
(13) 根据提供的读板纸解释分型结果。
六、质量控制程序:
内参质控带(缓慢迁移的)作为成功扩增的质控手段,在阴性孔应该总是可见的;阳性孔的内参质控带可能会很弱或者不存在,这是因为特异性引物扩增过程中与内参引物竞争Taq酶等反应原料的结果。
七、实验结果的判读。
人类红细胞Kell血型基因检测试剂盒电泳结果胶图(见图4)。
实验结果阴阳性判读图(见图2)。
人类红细胞Kell血型基因测定结果分型读板纸(见图3)。
预期结果:
阳性孔:有两条带,一条是内参带,另一条是特异性扩增带。
阴性孔:只有一条带,是内参带,无特异性扩增带。
产物大小和孔位:见人类红细胞Kell血型基因特异引物孔位图(见图1)。
根据人类红细胞Kell血型基因特异引物孔位图(见图1)或该试剂配套软件进行分型结果的判定。
该实验为定性试验,特异性扩增带强弱将不影响结果判读;扩增产物大小请参见人类红细胞Kell血型基因特异引物孔位图(见图1) ;并符合人类基因座位规则。
以上各实验涉及到的引物对如下:
所述K1的上下游引物位于Kell的DNA参考序列的Intron5 168-188和EXON6 578-598位置,上、下游引物分别是序列表中SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列;
所述K2的上下游引物位于Kell的DNA参考序列的Intron5 168-188和EXON6 578-598位置,上、下游引物分别是序列表中SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。
序列表
<110>天津市秀鹏生物技术开发有限公司
<120>人类红细胞Kell血型基因测定试剂盒(PCR-SSP法)
<160>17
<210>1
<211>22
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<221>mutation
<222> (1)……(22)
<400> 1
gaccttgggagaaggcacataa 22
<210>2
<211>23
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<221>mutation
<222> (1)……(23)
<400> 2
ctgactcatcagaagtcccagca 23
<210>3
<211>23
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<221>mutation
<222> (1)……(23)
<400> 3
ctgactcatcagaagtcccagcg 23
Claims (2)
1.一种用于检测人类红细胞Kell血型基因的引物组,其特征是包括K1引物对,K2引物对及内参引物对;
所述K1的上下游引物位于Kell的DNA参考序列的Intron5 168-188和EXON6 578-598位置,上、下游引物分别是序列表中SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列;
所述K2的上下游引物位于Kell的DNA参考序列的Intron5 168-188和EXON6 578-598位置,上、下游引物分别是序列表中SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。
2.一种用于检测人类红细胞Kell血型基因的试剂盒,其特征是包括包被有K1引物对,K2引物对及内参引物对的引物板和浓缩dNTP-Buffer;
所述K1的上下游引物位于Kell的DNA参考序列的Intron5 168-188和EXON6 578-598位置,上、下游引物分别是序列表中SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列;
所述K2的上下游引物位于Kell的DNA参考序列的Intron5 168-188和EXON6 578-598位置,上、下游引物分别是序列表中SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。
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CN108588068A (zh) * | 2018-05-11 | 2018-09-28 | 金晖 | 急性红白血病kel基因及其转录出的环状rna分子标记物 |
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---|---|---|---|---|
CN101065499A (zh) * | 2004-09-22 | 2007-10-31 | 英国西英格兰大学,布里斯托尔 | 通过多重pcr进行rhd和abo基因分型 |
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