CN103874428A - 解木聚糖拟杆菌物种微生物 - Google Patents

解木聚糖拟杆菌物种微生物 Download PDF

Info

Publication number
CN103874428A
CN103874428A CN201280040687.0A CN201280040687A CN103874428A CN 103874428 A CN103874428 A CN 103874428A CN 201280040687 A CN201280040687 A CN 201280040687A CN 103874428 A CN103874428 A CN 103874428A
Authority
CN
China
Prior art keywords
microorganism
bacteroides
food
ctc1
species
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201280040687.0A
Other languages
English (en)
Other versions
CN103874428B (zh
Inventor
S·格勒茨
P·乌尔瑟默
K·陶陶尼安
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Tibus Co., Ltd
Original Assignee
Glycotope GmbH
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Glycotope GmbH filed Critical Glycotope GmbH
Publication of CN103874428A publication Critical patent/CN103874428A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN103874428B publication Critical patent/CN103874428B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23CDAIRY PRODUCTS, e.g. MILK, BUTTER OR CHEESE; MILK OR CHEESE SUBSTITUTES; MAKING THEREOF
    • A23C9/00Milk preparations; Milk powder or milk powder preparations
    • A23C9/12Fermented milk preparations; Treatment using microorganisms or enzymes
    • A23C9/1203Addition of, or treatment with, enzymes or microorganisms other than lactobacteriaceae
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23LFOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L29/00Foods or foodstuffs containing additives; Preparation or treatment thereof
    • A23L29/065Microorganisms
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23LFOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L33/00Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof
    • A23L33/10Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof using additives
    • A23L33/135Bacteria or derivatives thereof, e.g. probiotics
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20Bacteria; Culture media therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20Bacteria; Culture media therefor
    • C12N1/205Bacterial isolates
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23VINDEXING SCHEME RELATING TO FOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES AND LACTIC OR PROPIONIC ACID BACTERIA USED IN FOODSTUFFS OR FOOD PREPARATION
    • A23V2002/00Food compositions, function of food ingredients or processes for food or foodstuffs
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12RINDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/01Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Coloring Foods And Improving Nutritive Qualities (AREA)
  • General Preparation And Processing Of Foods (AREA)
  • Preparation Of Fruits And Vegetables (AREA)
  • Dairy Products (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明涉及包含解木聚糖拟杆菌物种微生物的食品,尤其发酵食品和益生食品。这些微生物特别地特征为对于人类消费具有十分低的致病性和高度安全性。另外,提供了用于产生、尤其通过发酵产生所述食品的方法,以及合适的解木聚糖拟杆菌细菌菌株。

Description

解木聚糖拟杆菌物种微生物
发明领域
本发明涉及包含微生物的食品。具体而言,提供包含解木聚糖拟杆菌(Bacteroides xylanisolvens)物种微生物的食品。另外,本发明提供这些微生物在发酵中的用途。
发明背景
含有细菌作为有机组成部分或生产助剂的食品是本领域长久已知的。具体而言,酸性发酵的发酵食品,例如酸奶,干酪,生香肠和蔬菜,是我们营养的有机组成部分。多种方法用于产生发酵食品,其中例如利用自发性发酵使用或专门添加微生物添加至食品原料。当前的发酵方法特别地基于添加起子培养物至相应的食品原料(例如乳,以产生酸奶或干酪)。与传统的生产过程对比,起子培养物提供多种益处。例如,经济损失因缺陷性生产更少和缩短生产过程而防止。另外,原料通常可以反应得更好。还由于可以利用各种起子培养物的混合物,所以就味道、安全性和均质性而言,结果经常更好。可以产生在生产过程中不定向干预情况下否则将是不可能的产品。
开发和改善已知发酵过程的一个基本目标是形成并选择用于发酵过程的适宜微生物,因为它们决定性地影响发酵过程。所用微生物的代谢活性决定了例如成品的香味、酸化程度和/或颜色。另外,当积极地影响健康状况或代谢时,微生物对营养领域具有巨大的潜力。积极影响顾客健康的发酵食品的一个已知例子涉及益生食品。益生菌是以足够量消费时对顾客具有促进健康影响的活微生物制备物。益生性乳酸细菌使用得最长久,不过也使用酵母和其他物种。
如今使用的大部分益生菌株属于乳杆菌属(Lactobacillus)或双歧杆菌属(Bifidobacterium),仅少数属于其他属如肠球菌属(Enterococcus)、埃希氏菌属(Escherichia)或链球菌属(Streptococcus)。主要原因在于乳杆菌属(Lactobacillus)和双歧杆菌属(Bifidobacterium)常存在于发酵食品中并因此通常视为对人类安全。在人类中使用非传统物种的建议总体上激起关于潜在不利作用的更大忧虑。因此,当前的益生菌株主要因而其主流接受性而选择--一个排除健康特性好得多的潜在菌株的选择过程。
例如,占据人结肠小生物群20%到至多40%的拟杆菌属微生物通常不用于发酵或用作益生菌株。这是令人惊讶的,因为已知某些拟杆菌属物种(Bacteroides sp.)拥有有益于人类健康的许多功能。拟杆菌拥有参与糖发酵、含氮物质利用和胆酸和其他类固醇生物转化的独特代谢活性。另外,已经显示拟杆菌含有具备免疫调节作用并强烈参与宿主免疫系统发育及维持其对抗病原体和疾病的能力的某些多糖抗原。
然而,一些拟杆菌菌株可能参与在特定条件下严重肠外感染的形成。因此,一些菌株被划归为条件致病菌并且可以遭致一些安全顾虑。例如,卵形拟杆菌(Bacteroides ovartus)微生物未被划入最低安全性微生物类别中并且因此具有潜在致病风险。
鉴于此,本发明的一个目的是包含满足高度安全标准的微生物并且因此可以安全用于人类消费的食品。具体而言,一个目的是涉及益生食品。
发明简述
本发明人已经发现可以有利地使用解木聚糖拟杆菌物种微生物作为食品、尤其发酵食品和益生食品中的食品添加剂或食品成分。含有解木聚糖拟杆菌物种微生物的食品具有以有活力形式或以无活力形式使用的所述微生物提供的多种有利特性。具体而言,这些微生物具有十分低的致病性并且因此对于人类消费是高度安全的,并且产生有利的短链脂肪酸。
解木聚糖拟杆菌是由Chassard等人首次描述的拟杆菌属新物种(“Bacteroides xylanisolvens sp.Nov.,a xylan-degrading bacterium isolatedfrom human faeces”;International Journal of Systematic andEvolutionary Microbiology(2008);58,1008-1013)。其是降解木聚糖的革兰氏阴性杆状细菌,该细菌可以从人粪便分离并因此是人共生性微生物。解木聚糖拟杆菌作为DSM18836保藏在德意志微生物和细胞培养物保藏中心(Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und ZellkulturenGmbH)(DSMZ),Inhoffenstraβe7B,38124Braunschweig(DE)并且是从此处可公开获得的。然而,其在食品中的用途不是本领域已知或提出过的。
可以显示解木聚糖拟杆菌物种微生物不具有致病性并且因此可以在没有造成不良副作用的高风险情况下消费,尤其由人消费时。另外,因致病性低,所以不存在法定规定对制造、分销和销售解木聚糖拟杆菌物种微生物通的严重限制,这因此可以在很少努力情况下就得以满足。具体而言,根据欧盟指令2000/54/EC和德国“生物材料规定”(“Biostoffverordnung”),将解木聚糖拟杆菌微生物划归为第1风险组的生物因子。第1风险组是4个风险组的最低者并且涉及不可能造成人类疾病的生物因子。将许多其他微生物(还包括其他拟杆菌属物种微生物)划分在更高的风险组(例如卵形拟杆菌是第2风险组的生物因子)。
因此,在第一方面,本发明提供包含解木聚糖拟杆菌物种微生物的食品。
在第二方面,本发明提供一种用于产生发酵食品的方法,其中食品原料与用于发酵的起子培养物组合,特征在于添加解木聚糖拟杆菌物种微生物。另外,提供了通过所述方法可获得的包含解木聚糖拟杆菌物种微生物的发酵食品。
在第三方面,本发明提供一种作为DSM23964保藏的菌株CTC1、由其衍生的微生物或CTC1同源物的微生物。
如实施例中展示,本发明的微生物尤其对于质粒DNA物质、最重要的毒力因子和大部分相关胞外酶和致病因子呈阴性,并且不附着于人结肠的上皮细胞。另外,本发明的微生物在小鼠内的毒理学研究中不显示副作用并且在服用每日剂量高达8.5*1011CTC1持续3周的人类中不显示任何性质的副作用。因此,本发明的微生物满足极高安全性标准并可以由人消费,而没有不想要的副作用的风险。另外,本发明的微生物优选地对各种抗生素敏感,因此,如果需要,可以容易地和有效地消除。
另外,可以展示本发明的微生物显示稳定和均质的细胞表面,尤其显示可以用作产品品质标记的稳定和均质的表面碳水化合物结构表达。表面特征和尤其其碳水化合物结构可以用作含有本发明微生物的微生物培养物的均匀性的标记物,和/或可以用作培养物中本发明微生物的量的标记物。
另外,本发明人已经发现本发明的微生物能够产生短链脂肪酸(SCFA)。作为微生物碳水化合物发酵的终产物产生的短链脂肪酸(SCFA)可以具有促进健康的特性。作为例子,丙酸盐据报道具有潜在的降低胆固醇作用和抗脂质生成作用。其还可以刺激饱满感并且与乙酸盐和丁酸盐一起提供抗致癌作用。
在第四方面,本发明提供一种用于产生根据本发明第一方面的食品的方法,包括步骤:将解木聚糖拟杆菌物种微生物添加至包含至少一种食品原料的组合物或添加至加工的食品物料。另外,提供了解木聚糖拟杆菌物种微生物产生食品、尤其作为用于发酵的起子培养物的用途。
本发明的其他目的、特征、优势和方面将因以下描述和所附权利要求书而对本领域技术人员变得清楚。然而,应当理解以下描述、所附权利要求书和表示本申请的优选实施方案的具体实施例仅以说明方式给出。处于所公开发明的精神和范围内的多种改变和修改将因阅读以下内容而对本领域技术人员变得容易显见。
发明详述
本发明人已经发现解木聚糖拟杆菌物种微生物适用于在食品中,尤其适用于人类消费。因此,在第一方面,本发明涉及包含解木聚糖拟杆菌物种微生物的食品。
根据本发明,解木聚糖拟杆菌物种微生物尤其涉及属于拟杆菌属并优选具有以下一个或多个特征的微生物:
a)在DNA-DNA杂交测定法中,其与作为DSM18836或DSM23964保藏的解木聚糖拟杆菌显示至少30%、优选地至少50%、至少70%、至少80%、至少90%或至少95%、更优选地至少98%或至少99%的DNA-DNA亲缘关系;
b)其与作为DSM18836或DSM23964保藏的解木聚糖拟杆菌显示至少95%、优选地至少97%、至少98%或至少99%、更优选地至少99.5%的16S rRNA基因序列相似性水平;
c)其具有以下一个或多个特征:
i)作为保藏为DSM18836的解木聚糖拟杆菌,其不能够降解淀粉;
ii)其具有利用和/或代谢甘露醇、尤其D-甘露醇、松三糖和/或山梨醇、尤其D-山梨醇和/或从丙三醇产生酸的能力;
iii)其表现谷氨酰谷氨酸芳基酰胺酶活性;
iv)其不能产生吲哚;
v)其不显示过氧化氢酶活性;
d)其具有以下一个或多个特征:
i)其是厌氧微生物;
ii)其不形成孢子;
iii)其是非-能动的;并且
iv)其是革兰氏阴性的。
优选地,满足以上定义的标准a)至d)的至少两个或至少三个并且更优选地全部标准。
术语“DNA-DNA亲缘关系”尤其指两种微生物的基因组或整个DNA的相似性百分数,如根据De Ley等人,(1970)Eur.J.Biochem.12,133-142或Huβ等人,(1983)Syst.Appl.Microbiol.4,184-192的DNA-DNA杂交/复性测定法所测量。具体而言,DNA-DNA杂交测定法优选地由DSMZ(德意志微生物和细胞培养物保藏中心(Deutsche Sammlung vonMikroorganismen und Zellkulturen GmbH),布伦瑞克,德国)鉴定服务机构进行。在一个实施方案中,DNA-DNA杂交测定法如下文实施例1.3中所述进行。
术语“16S rRNA基因序列相似性”尤其指在第一微生物16S核糖体RNA(rRNA)基因的核酸序列的一个区域和第二微生物16S rRNA基因的核酸序列的相应区域之间相同核苷酸的百分数。优选地,该区域包含至少100个连续核苷酸,更优选地至少200个连续核苷酸,至少300个连续核苷酸或至少400个连续核苷酸,最优选地约480个连续核苷酸。在一个实施方案中,16S rRNA基因的核酸序列的区域分别旁侧分布有SEQ ID NO:1和2的序列或它们的互补序列。
在优选的实施方案中,解木聚糖拟杆菌物种微生物稳定和/或均质地表达至少一种表面碳水化合物结构。稳定表达表面碳水化合物结构的微生物尤其指一组微生物,其中至少50%、优选地至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%、至少99%或约100%的微生物表达该表面碳水化合物结构。稳定表达表面碳水化合物结构的微生物尤其指一组微生物,其中至少50%、优选地至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%、至少99%或约100%的微生物以这样的表达水平表达表面碳水化合物结构,所述表达水平与平均表达水平相距不多于50%、优选地不多于40%、不多于30%、不多于25%、不多于20%、不多于15%或不多于10%。表达表面碳水化合物结构的微生物尤其涉及以通过如本领域已知合适方法可检测的量包含该表面碳水化合物结构的微生物。
解木聚糖拟杆菌微生物优选地能够产生短链脂肪酸(SCFA)。作为微生物糖发酵的终产物产生的短链脂肪酸(SCFA)可以具有促进健康的特性。作为例子,丙酸据报道具有潜在的降低胆固醇作用和抗脂质生成作用。其还可以刺激饱满感并且与乙酸和丁酸一起提供抗致癌作用。在优选的实施方案中,本发明的微生物能够产生选自丙酸、乙酸、琥珀酸、甲酸和乳酸的一种或多种SCFA。优选地,其能够产生丙酸和/或乙酸。在优选的实施方案中,这些SCFA还存在于含有该微生物的本发明食品中。在其中本发明食品包含处于活性形式的解木聚糖拟杆菌物种微生物的某些实施方案中,所述微生物仍能够在消费食品后在顾客的身体内部产生所述SCFA。
在优选的实施方案中,解木聚糖拟杆菌微生物在摄入后能够存活于胃中条件,尤其经过胃,并且优选地还存活于至少人类肠道的至少一部分中的条件,尤其经过所述部分。具体而言,存活于人类胃中的条件指在包含解木聚糖拟杆菌微生物的组合物中、尤其在本发明的食品中至少50%、优选地至少60%、至少70%、至少80%或至少85%该微生物在胃液中存活至少180分钟。另外,存活于人类肠道中的条件指在包含解木聚糖拟杆菌微生物的组合物中、尤其在本发明的食品中至少50%、优选地至少60%、至少70%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%该微生物在肠液中存活至少240分钟。
在优选的实施方案中,解木聚糖拟杆菌微生物具有以下一个或多个安全特征:
(i)其对抗生素甲硝唑、美罗培南和/或克林霉素敏感;
(ii)其不含质粒RP4(DSM3876)和/或质粒pSC101(DSM6202);
(iii)其不含β-内酰胺酶基因cfiA和/或cfxA;
(iv)其不含毒力因子脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)多糖A和/或脆弱拟杆菌肠毒素Bft和/或由基因ompW编码的“Ton B连接的外膜蛋白”;
(v)其不显示任何胞外DNA酶活性、胞外软骨素酶活性、胞外透明质酸酶活性和/或胞外神经氨酸酶活性;和
(vi)其不附着于人结肠的上皮细胞。
在一个优选实施方案中,所述解木聚糖拟杆菌微生物是
a)CTC1,其由Glycotope GmbH,Robert-
Figure BDA0000468002870000071
-Str.10,13125柏林(DE)根据布达佩斯条约要求,在2010年9月1日以登录号DSM23964保藏于德意志微生物和细胞培养物保藏中心(Deutsche Sammlung vonMikroorganismen und Zellkulturen GmbH)(DSMZ),Inhoffenstraβe7B,38124布伦瑞克(DE)(DSM23964),
b)衍生自CTC1的微生物,或
c)CTC1同源物。
CTC1(DSM23964)属于解木聚糖拟杆菌物种。优选地,CTC1是严格厌氧、不形成孢子、非-能动和革兰氏阴性的杆状细菌,宽0.4-0.5μm,长通常1-2μm,其在Wilkins-Chalgren琼脂上长成菌落,所述菌落在18小时后具有2-3mm直径,圆形、乳状、升高和凸出的表面。
衍生自CTC1的微生物和/或CTC1同源物优选地具有以下一个或多个特征:
a)其属于如上文定义的解木聚糖拟杆菌物种;
b)在DNA-DNA杂交测定法中,其与作为DSM23964保藏的CTC1的解木聚糖拟杆菌显示至少30%、优选地至少50%、至少70%、至少80%、至少90%或至少95%、更优选地至少98%或至少99%的DNA-DNA亲缘关系;
c)其与作为DSM23964保藏的CTC1显示至少95%、优选地至少97%、至少98%、或至少99%、更优选地至少99.5%、和最优选地约100%的16S rRNA基因序列相似性水平;
d)其能够产生短链脂肪酸;
e)其具有上文公开的一个或多个安全特征:
f)其存活于人类胃和/或肠中的条件。
优选地,满足以上定义的标准a)至f)的至少两个,更优选地至少三个,至少四个或至少五个和最优选地全部标准。
如本文所用的术语“微生物”可以仅指一个单细胞生物以及指众多的单一单细胞生物。例如,术语“解木聚糖拟杆菌物种微生物”可以指解木聚糖拟杆菌物种的一个单一解木聚糖拟杆菌细菌细胞以及解木聚糖拟杆菌物种的多个细菌细胞。术语“解木聚糖拟杆菌物种微生物”和“解木聚糖拟杆菌微生物”在本文中以同义地方式使用。通常而言,术语“微生物”指众多细胞。具体而言,该术语指至少103个细胞,优选地至少104个细胞,至少105或至少106个细胞。
根据本发明,术语“食品”指任何可食用产品,尤其可以用于营养人类和/或动物,优选地用于人类营养的任何产品。食品可以是从分离的养分、膳食补充剂和特定膳食至基因修饰的食品、草药产品和加工食品如发酵食品、谷物食品、汤和饮料。术语“食品”尤其指可以由人类或动物经口取得的任何养分、养分组合物或制剂,如但不限于养分、营养添加物、食品添加剂、膳食补充剂、临床食品、肠胃外食品,肠内食品、特殊膳食用途食品、指定健康用途的食品或功能性食品,它们可以经口以不同形式,如但不限于胶囊、片、乳液、粉末、液体应用以及以任何食品或饮料形式或作为其部分应用。在特定的情况下,食品可以按肠胃外方式给予(肠胃外食品)。食品可以按原样或与至少一种其他成分混合给予。食品本身或其与至少一种其他成分的混合物可以按原样给予或混入食品或饮料中。术语“食品”还意指任何食品,尤其发酵食品、饮料、胶囊、片、乳液、粉末或液体。在某些实施方案中,食品提供一般健康益处。具体而言,食品可以是益生的。
本发明的食品优选地以产生用于顾客的每日剂量约106至约1013个微生物的量或浓度包含解木聚糖拟杆菌物种微生物。优选地,每日剂量不超过2.8*1012个微生物,优选地2.3*1012个微生物,和/或是至少108个微生物,优选地至少109个微生物。具体而言,每日剂量处于约1010至约1012个微生物范围内。食品优选地处于单一单位剂量的形式,所述单位剂量各自包含如上文所述的解木聚糖拟杆菌物种微生物的每日剂量。
本发明的食品可以含有处于有活力、非增殖、无活力或裂解形式的解木聚糖拟杆菌物种微生物。优选地,所述微生物以非致病形式、非增殖、无活力或裂解形式使用。
在第二方面,本发明涉及一种用于产生发酵食品的方法,其中食品原料与用于发酵的起子培养物组合,特征在于添加解木聚糖拟杆菌物种微生物。
本发明的“发酵食品”尤其指借助微生物的作用产生或保存的食品。具体而言,包括涉及使用细菌的发酵过程。通过本发明方法可产生的产品的非限制示例性名单包括发酵奶制品,如酸乳清、凝乳/酸乳、明胶、奶油干酪、软干酪、切片干酪、硬干酪、加工干酪、奶豆腐、来自凝乳的干酪、烹煮干酪、牛奶酒(kefir)、衣梅尔(ymer)、avran、糖蜜、酸奶、果味酸奶、甜乳清、乳清黄油、新鲜干酪、莫兹瑞拉、菲达干酪、乳清粉、酸奶油、法式酸奶油(crème fraiche)、马斯卡朋(mascarpone)、斯美塔那酸奶油(smetana)、酸奶油、酸奶油黄油、黄油、酥油(butter oil)、半脂黄油、微酸黄油、生香肠,如萨啦咪或咸肉、可可、咖啡、酸面包和酸菜,如德国酸菜(sauerkraut)。根据待生产的发酵食品选择食品原料。
在用于产生发酵食品的本发明方法中,解木聚糖拟杆菌物种微生物可以单独或与适于发酵的另一个微生物组合地用作起子培养物。另外,可以将解木聚糖拟杆菌物种微生物在发酵期间添加至食品原料或在发酵后添加至发酵食品。如果不使用解木聚糖拟杆菌物种微生物作为起子培养物,则优选地添加非增殖、无活力或裂解形式的解木聚糖拟杆菌物种微生物。如果解木聚糖拟杆菌物种微生物以活性形式添加,则可以使它们不能够在最终的发酵食品中繁殖。这可以例如通过照射微生物或加热来实现。优选地,将微生物杀死。
用于产生发酵食品的本发明方法优选地包括至少一种以下方法步骤:
-将食品原料用任选地含有解木聚糖拟杆菌物种微生物的起子培养物接种;
-添加至少一种糖,优选地葡萄糖;并且
-温育含有用于发酵的起子培养物的食品原料,优选地在无氧条件下。
在用于产生发酵食品的本发明方法中,优选地添加如上文所述的解木聚糖拟杆菌物种微生物。另外,相对于本申请的食品,产生的发酵食品优选地具有上文描述的一个或多个特征。参照解木聚糖拟杆菌物种微生物和包含其的食品的以上公开内容、特征和实施方案。将解木聚糖拟杆菌物种微生物优选地以至少106个细胞/毫升原料的量、优选地以约109至约1010个细胞/毫升原料的量、更优选地以约1*109至约7*109个细胞/毫升原料的量添加。
另外,本发明提供通过产生发酵食品的本发明方法可获得的发酵食品。
在第三方面,本发明提供一种作为DSM23964保藏的菌株CTC1、由其衍生的微生物或CTC1同源物的微生物。相对于解木聚糖拟杆菌物种微生物,菌株CTC1的微生物优选地具有上文描述的一个或多个特征。
具体而言,本发明的微生物是解木聚糖拟杆菌物种微生物。在优选的实施方案中,其与作为DSM18836或DSM23964保藏的CTC1在DNA-DNA杂交测定法中显示至少70%、优选地至少90%、至少95%、更优选地至少98%、最优选地至少99%的DNA-DNA亲缘关系。另外,其优选地与作为DSM18836或DSM23964保藏的CTC1显示至少98%、优选地至少99%或至少99.5%、更优选地100%的16S rRNA基因序列相似性水平。
在优选的实施方案中,本发明的微生物具有以下一个或多个特征:
i)作为保藏为DSM18836的解木聚糖拟杆菌,其不能够降解淀粉;
ii)其具有利用和/或代谢甘露醇、尤其D-甘露醇、松三糖和/或山梨醇、尤其D-山梨醇和/或从丙三醇产生酸的能力;
iii)其表现谷氨酰谷氨酸芳基酰胺酶活性;
iv)其不能产生吲哚;
v)其不显示过氧化氢酶活性。
另外,本发明的微生物优选地是不形成孢子和非-能动的革兰氏阴性厌氧微生物。其优选地能够产生短链脂肪酸,尤其如上文所述,和/或能够在摄入后存活于胃中和任选地人类肠道中的条件,尤其如上文所述。
在优选的实施方案中,本发明的微生物具有以下一个或多个安全特征:
(i)其对抗生素甲硝唑、美罗培南和/或克林霉素敏感;
(ii)其不含质粒RP4(DSM3876)和/或质粒pSC101(DSM6202);
(iii)其不含β-内酰胺酶基因cfiA和/或cfxA;
(iv)其不含毒力因子脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)多糖A和/或脆弱拟杆菌肠毒素Bft和/或由基因ompW编码的“Ton B连接的外膜蛋白”;
(v)其不显示任何胞外DNA酶活性、胞外软骨素酶活性、胞外透明质酸酶活性和/或胞外神经氨酸酶活性;和
(vi)其不附着于人结肠的上皮细胞。
本发明的微生物尤其是优选地在其天然环境中不存在的分离的微生物。具体而言,微生物不存在于人体中,优选地其不存在于人体或动物体中。根据一个实施方案,本发明的微生物已经从包含不属于解木聚糖拟杆菌物种的微生物的组合物分离。根据一个实施方案,本发明的微生物存在于包含至少70%、至少80%、至少90%、优选地至少95%、97%、99%、最优选约100%本发明微生物的培养物中或从其中获得。
另外,本发明提供一种包含本发明微生物的组合物。就本发明微生物的特征而言,参考上文的发明公开。优选地,组合物中80%或更多、更优选地85%或更多、90%或更多、95%或更多、98%或更多或99%或更多和最优选地约100%的微生物是本发明的微生物。根据一个实施方案,组合物中的微生物以有活力、非增殖、无活力或裂解形式存在。根据一个实施方案,所述组合物是细胞培养物。
优选地,该组合物包含至少103个本发明的微生物、更优选地至少104个、至少105个或至少106个本发明的微生物。
在第四方面,本发明提供一种用于产生食品、尤其根据本发明第一方面的食品的方法,包括步骤:将解木聚糖拟杆菌物种微生物添加至包含至少一种食品原料的组合物或添加至加工的食品物料。另外,提供了解木聚糖拟杆菌物种微生物产生食品、尤其作为用于发酵的起子培养物的用途。就解木聚糖拟杆菌物种微生物的特征而言,参考以上公开内容。
如本文所用,表述“包含”,除了其字面含义外还包括并且特别地指表述“基本上由……组成”和“由……组成”。因而,表述“包含”指其中“包含”具体所列出元素的主题物不包含其他要素的实施方案,以及其中“包含”具体所列出元素的主题物可以和/或实际上的确涵盖其他要素的实施方案。同样,表述“具有”应理解为表述“包含”,还包括并且特别地指表述“基本上由……组成”和“由……组成”。
附图说明
图1显示本发明微生物CTC1和不同参考微生物的限制性分析。这些结果支持CTC1是解木聚糖拟杆菌物种。
图2显示质粒和β内酰胺酶基因cfiA、cfxA和cepA的确定。(A)质粒:加载20μg每种分离的质粒DNA。泳道:1,1kb DNA梯;2,大肠杆菌DSM3876;3,大肠杆菌DSM6202;4,解木聚糖拟杆菌DSM23964。(B)cfiA基因:泳道:1,100bp DNA梯;2,脆弱拟杆菌TAL3636;3,解木聚糖拟杆菌DSM23964;4,阴性对照。(C)cfxA基因:泳道:1和6,1kbDNA梯;2,卵形拟杆菌MN7;3,卵形拟杆菌MN23;4,解木聚糖拟杆菌DSM23964;5,阴性对照。(D)cepA基因:泳道:1和6,100bp DNA梯;2,脆弱拟杆菌DSM1396;3,卵形拟杆菌MN23;4,解木聚糖拟杆菌DSM23964;泳道5,阴性对照。
图3显示毒力编码基因bft、wcfR、wcfS和omp W的确定。(A)bft基因:泳道:1,100bp DNA梯;2,解木聚糖拟杆菌DSM23964;3,脆弱拟杆菌ATCC43858;4,阴性对照。(B)wcfR基因:泳道:1,1kb DNA梯;2,脆弱拟杆菌DSM1396;3,脆弱拟杆菌ATCC43858;4,脆弱拟杆菌DSM2151;5,解木聚糖拟杆菌DSM23964;6,脆弱拟杆菌TAL3636;7,阴性对照。(C)wcfS基因:泳道:泳道:1,1kb DNA梯;2,脆弱拟杆菌DSM1396;3,脆弱拟杆菌ATCC43858;4,脆弱拟杆菌DSM2151;5,解木聚糖拟杆菌DSM23964;6,脆弱拟杆菌TAL3636;7,阴性对照。(D)ompW基因:泳道:1,100bp DNA梯;2,解木聚糖拟杆菌DSM23964;3,粪拟杆菌(Bacteroides caccae)DSM19024;4,阴性对照。
图4显示菌株DSM23964与Caco-2细胞结合的分子分析。(A)GAPDH和蔗糖异麦芽糖酶。泳道:1,100bp DNA梯(Bioline);2,第1日;3,第3日;4,第6日;5,第8日;6,第10日;7,第13日;8,第14日,9,第阴性对照。(B)菌株DSM23964和脆弱拟杆菌DSM1396的检测。泳道:1,100bp DNA梯;2,第一洗涤步骤后的菌株DSM23964;3,第六洗涤步骤后的菌株DSM23964;4,菌株DSM23964+Caco-2细胞;5,第一洗涤步骤后的脆弱拟杆菌DSM1396;6,第六洗涤步骤后的脆弱拟杆菌DSM1396;7,脆弱拟杆菌DSM1396+Caco-2细胞;8,Caco-2细胞;9,菌株DSM23964;10,脆弱拟杆菌DSM1396;11,阴性对照。(C)嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)的检测。泳道:1,第一洗涤步骤后的嗜酸乳杆菌DSM9126;2,第六洗涤步骤后的嗜酸乳杆菌DSM9126;3,嗜酸乳杆菌DSM9126+Caco-2细胞;4,Caco-2细胞;5,嗜酸乳杆菌DSM9126;6,阴性对照;7,100bp DNA梯。
图5显示90天口服毒性研究期间小鼠的体重和食物消耗量。(A)雄性对照的体重:NMRI小鼠。(B)雌性对照的体重:NMRI小鼠。(C)雄性对照的食物消耗量:NMRI小鼠。(D)雌性对照的食物消耗量:NMRI小鼠。每组均值:组1(0)、组2(1×106)、组3(1×107)、组4(1×108)CFU的解木聚糖拟杆菌DSM23964和组5(1×1011)解木聚糖拟杆菌DSM23964巴氏消毒/动物/日。统计显著性由P≤0.01指示。值根据Dunnett检验。
图6显示通过物种特异性多重PCR检测到所注射溶液中的污染。泳道:1,阳性对照(解木聚糖拟杆菌DSM23964);2,溶液2(1×109个脆弱拟杆菌RMA6791/ml);3,溶液3(1×109个解木聚糖拟杆菌DSM23964/ml);4,溶液4(1.5×108个脆弱拟杆菌RMA6791/ml);5,溶液5(1.5×108个解木聚糖拟杆菌DSM23964/ml);6,溶液6(5×106个脆弱拟杆菌RMA6791/ml);7,溶液7(5×106个解木聚糖拟杆菌DSM23964/ml),8,阳性对照(脆弱拟杆菌RMA6791);9,溶液1(对照组)。污染对照:泳道10,90%脆弱拟杆菌RMA6791和10%解木聚糖拟杆菌DSM23964的混合物;泳道11,10%脆弱拟杆菌RMA6791和90%解木聚糖拟杆菌DSM23964的混合物。泳道12,1kb DNA梯(Fermentas)。
图7显示来自穿刺脓肿的分离DNA的物种特异性PCR。(A)在用解木聚糖拟杆菌DSM23964注射的动物的脓肿中检出解木聚糖拟杆菌。泳道:1,100bp DNA梯(Fermentas);2-3,组3(4.6×109个解木聚糖拟杆菌DSM23964/kg bw);4-5,组5(6.9×108个解木聚糖拟杆菌DSM23964/kg bw);6-7,组7(2.3×107个解木聚糖拟杆菌DSM23964/kg bw);8,阳性对照(解木聚糖拟杆菌DSM23964);9,阴性对照(水)。(B)在用脆弱拟杆菌RMA6791注射的动物的脓肿中检出脆弱拟杆菌。泳道:1,100bp DNA梯(Fermentas);2-3,组2(4.6×109个脆弱拟杆菌RMA6791/kg bw);4-5,组4(6.9×108个脆弱拟杆菌RMA6791/kg bw);6-7,组6(2.3×107个脆弱拟杆菌RMA6791/kgbw),8,阳性对照(脆弱拟杆菌RMA6791);9,阴性对照(水);10,1kb DNA梯(fermentas)。
实施例
实施例1:本发明的微生物是解木聚糖拟杆菌物种的独特菌株。
1.1分类学分析1:16S rRNA序列相似性
使用通用引物27f(5'-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3'(SEQ IDNO:1))和519r(5'-GWATTACCGCGGCKGCTG-3'(SEQ ID NO:2)),通过PCR扩增菌株CTC1的16S rRNA基因序列(480个碱基)。通过使用高纯PCR产物纯化试剂盒(Roche,印第安纳波利斯,USA)纯化PCR产物并且通过使用低DNA质量梯(Invitrogen,Carlsbad,USA)估计DNA浓度和产物大小。使用DYEnamicTM ET染料终止循环测序试剂盒(AmershamBioscience)和ABI PRISM3100毛细管测序仪(Applied Biosystems)根据制造商的说明书,对PCR产物测序。起初通过BLAST程序(Altschul等人,,1997)和megaBLAST(Zhang等人,2000)程序针对具有合格发表的原核名称的模式菌株的数据库(Chun等人,2007)实施系统进化邻居的鉴定。随后选择具有最高评分的50个序列以便使用总体比对算法计算配对序列相似性,这在EzTaxon服务器处实施(http://www.eztaxon.org/;Chun等人,2007)。通过使用程序MEGA第5版(Tamura,2007)去除比对空位和模糊碱基,手工修正所产生的多重序列比对结果,并且根据邻接法(Saitou和Nei,1987)采用程序MEGA第5版(Tamura,2007),构建进化系统树。
菌株CTC1的16S rRNA序列分析显示这个菌株与解木聚糖拟杆菌DSM18836聚类(100%16S rRNA序列相似性)、与卵形拟杆菌ATCC8483聚类(97.5%)、与多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)ATCC29148聚类(94.2%)并与Bacteroides finegoldii DSM17565聚类(92.2%)。通常认为16S rRNA基因序列趋异性方面≥97%的相似值对于物种划定是显著的(Stackebrandt和Goebel,1994)。然而,Stackebrandt和Ebers(2006)已经推荐这种值可以增加至98.7-99%,同时不牺牲“物种”描述的品质和精度,并且作为分类学家的辅助。
1.2分类学分析2:全基因组DNA-DNA杂交
认为DNA-DNA杂交是分类学中的金标准。使CTC1菌株的全基因组与解木聚糖拟杆菌DSM18836、卵形拟杆菌DSM1896、多形拟杆菌DSM2079和Bacteroides finegoldii DSM17565的全基因组杂交(这些分析在DMSZ(德国微生物和细胞培养物保藏中心)处并由该机构进行)。简而言之,将3g待比较的每个菌株的生物材料用于DNA制备。分析分离的DNA的纯度并且使用弗氏压碎器剪切DNA并使其在高温变性(100℃,10分钟)。将DNA优选地剪切成大小在200和600kDa之间的片段,主要部分为约450+/-100kDa。以分光光度方式使用在260nm处的吸光度测量每个菌株的DNA以及相等浓度的两个菌株的DNA的混合物(样品中的DNA终浓度是基本上相同的并且优选地位于约20和100μg/ml之间,尤其约30μg/ml)的复性。通过迅速冷却该溶液至DNA解链温度以下25℃的温度启动复性,并且测量进行30分钟。从单个细菌菌株的各自DNA和两个菌株的DNA混合物的复性曲线的不同斜率计算DNA亲缘关系。具体而言,将复性速率v'确定为吸光度/分钟(ΔA/t)的下降,并且根据De Ley等人给出的公式(见上文)结合程度(D),即DNA亲缘关系:
D = 4 v ′ m - ( v ′ A + v ′ B ) 2 v ′ A v ′ B 100
其中D是结合程度(%),v'm是混合物的复性速率,v'A是第一菌株的DNA复性速率,和v'B是第二菌株的DNA复性速率。
表1中显示全基因组杂交的结果:
表1
Figure BDA0000468002870000162
1.3分类学分析3:微生物学表征和生物化学表征
可以鉴定菌株DSM23964是严格厌氧、不形成孢子、非-能动和是革兰氏阴性的。短杆或杆状细胞宽0.4-0.5μm并且长度不定;通常在1-2μm范围内。18小时后Wilkins-Chalgren琼脂(Oxoid)上的培育菌落具有2-3mm直径,圆形、乳状、升高和凸出的表面。初步生物化学分析显示与卵形拟杆菌物种的91%相似性(Databank BioMérieux)。与卵形拟杆菌相反,菌株DSM23964不能利用淀粉以产生吲哚,并且其不显示过氧化氢酶活性。据制造商的说明,通过使用快速ID32A和API20A生物化学试剂盒(Biomérieux,Marcy l'Etoile,法国),进行已分离的细菌及其组成型酶和底物利用谱的生物化学鉴定。表2中汇总化学分类学分析解木聚糖拟杆菌CTC1、解木聚糖拟杆菌DSM18836、Bacteroides finegoldii DSM17565、卵形拟杆菌DSM1896、多形拟杆菌DSM2079和脆弱拟杆菌DSM1396菌株的结果。两个菌株解木聚糖拟杆菌CTC1和解木聚糖拟杆菌DSM18836具有相同的生物化学谱。解木聚糖拟杆菌CTC1可以因利用丙三醇、D-山梨醇、D-甘露醇和D-松三糖与卵形拟杆菌DSM1896区分。此外,与卵形拟杆菌DSM1896的结果相反,解木聚糖拟杆菌CTC1显示谷氨酰谷氨酸芳基酰胺酶活性。在另一方面,卵形拟杆菌DSM1896能够表现亮氨酸芳基酰胺酶活性,而解木聚糖拟杆菌CTC1则没有。因此,解木聚糖拟杆菌CTC1可以区别于Bacteroides finegoldii DSM17565、多形拟杆菌DSM2079和脆弱拟杆菌DSM1396(表2)。与解木聚糖拟杆菌CTC1和解木聚糖拟杆菌DSM18836的结果相反,多形拟杆菌DSM2079在酶活性检验中显示众多阳性结果。
表2
Figure BDA0000468002870000171
菌株:1:解木聚糖拟杆菌CTC1;2:解木聚糖拟杆菌DSM18836;3:Bacteroides finegoldii DSM17565;4:卵形拟杆菌DSM1896;5:多形拟杆菌DSM2079;6:脆弱拟杆菌DSM1396。将特征评定为:'+':阳性反应;'-':阴性反应。
1.4随机扩增多态性DNA(RAPD)样式和基因型分析
为检验CTC1是否为解木聚糖拟杆菌物种的不同菌株,进行RAPD测定法。4种不同随机引物在各自的反应中(每种反应中仅使用一种引物)用于扩增模板DNA。PCR反应混合物(50μl)含有:Taq缓冲液(16mM(NH4)2SO4,67mM Tris HCl),2.5mM MgCl2,0.25mM每种dNTP,1μM引物,2.5单位Taq DNA聚合酶和2μl模板DNA。PCR程序是:95℃5分钟,35个循环:95℃1分钟,50℃1分钟和72℃1分钟,并最终72℃6分钟。全部引物的条带样式均在1%琼脂糖凝胶上分析。因而,对于每种模板DNA,获得4种不同的条带样式(每种引物,一种样式)。
使CTC1经历RAPD分析并且将结果与解木聚糖拟杆菌物种(DSM18836)、Baceroides finegoldii(DSM17565)和卵形拟杆菌(DSM1896)的参考细菌的结果比较(对于一个示例性引物,见图1)。结果显示CTC1是与已知解木聚糖拟杆菌菌株DSM18836不相同的独特菌株。
1.5总结
16S rRNA序列相似性、全基因组DNA-DNA杂交和生物化学表征的结果显示,分离的微生物CTC1是解木聚糖拟杆菌物种。另外,RAPD分析显示,CTC1是与已知解木聚糖拟杆菌菌株不同的特殊和独特的解木聚糖拟杆菌菌株。
实施例2:模拟胃液和肠液的影响
为了模拟穿过胃肠道,使CTC1细菌经历模拟胃液和肠液作用。CTC1菌株在胃液中180分钟后的存活率高于90%并且在暴露于肠液240分钟后高于96%。
实施例3:毒力因子的分析
3.1CTC1的抗生素抗性
几种抗生素的最小抑制浓度(MIC)的分析揭示解木聚糖拟杆菌CTC1菌株耐受β-内酰胺药物,如青霉素G、氨苄青霉素和美洛西林(meziocillin)。然而,其对常用抗生素药物如甲硝唑、美罗培南和克林霉素敏感,并且添加β内酰胺酶抑制剂恢复对β-内酰胺药物的敏感性。
3.2检测CTC1中的质粒
为研究CTC1菌株中质粒的可能存在,分别从CTC1和从含有低拷贝质粒RP4(60kb)和pSC101(9.4kb)的两个对照菌株大肠杆菌DSM3876和大肠杆菌DSM6202分离质粒DNA物质。在260nm测量质粒DNA浓度表明CTC1的质粒制备物中不存在DNA。在琼脂糖凝胶上运行质粒制备物证实分离到来自对照菌株的两种低拷贝质粒和不存在来自解木聚糖拟杆菌CTC1的可检测的质粒物质(图2A)。
3.3CTC1基因组中β内酰胺酶基因cfxA、cepA和cfiA的鉴定
为了表征CTC1菌株的β内酰胺酶活性,对拟杆菌属已知的β内酰胺酶基因cfiA、cfxA和cepA的每一个进行特异性PCR分析。结果表明菌株CTC1仅含有cepA基因(图2B-D)。
3.4拟杆菌属中编码毒力因子的基因
脆弱拟杆菌多糖A(PS A)和脆弱拟杆菌肠毒素Bft是最重要的拟杆菌属毒力因子。为了研究肠毒素Bft的存在,对bft基因进行特异性PCR。在PS A的情况下,设计了针对位于PS A生物合成基因上游的高度保守的可读框upaY、upaZ和针对最重要基因-编码氨基转移酶的wcfR和编码糖基转移酶的wcfS的特异性PCR。与脆弱拟杆菌ATCC43858相反,CTC1菌株不拥有bft基因。也不能检测到基因wcfR、wcfS和两个可读框upaY和upaZ(图3A-C)。
另外,分析了编码毒力因子“Ton B连接的外膜蛋白”的基因ompW的存在,所述外膜蛋白可能参与IBD的形成。不能在CTC1菌株中检测到ompW编码基因(图3D)。
3.5CTC1胞外酶和致病因子的测定
除了神经氨酸酶外,拟杆菌属的几个菌株据描述产生不想要的外切酶,包括胶原蛋白酶、DNA酶和可能参与感染过程的一些蛋白酶。借助PCR(神经氨酸酶)或酶测定法分析最相关的外切酶活性。CTC1菌株不显示DNA酶、软骨素酶、透明质酸酶和神经氨酸酶活性,仅显示弱的β-溶血活性和胶原蛋白酶活性。
3.6CTC1对Caco-2细胞的粘附
培育Caco-2细胞并且诱导分化。结果显示GAPDH的表达水平在分化期间恒定,而蔗糖酶-异麦芽糖酶的水平在分化期间增加。显微镜观察结果证实在14日后,Caco-2细胞良好分化为单层。借助物种特异性PCR分析无氧条件下共温育3小时后细菌与分化的Caco-2细胞的结合,所述物种特异性PCR对连续洗涤步骤的上清液进行并且最终对刮取的Caco-2细胞进行。与阳性对照相反,当然可以在第一洗涤步骤的上清液中检测到的CTC1细胞不再能够在稍后的上清液中或在刮取的Caco-2细胞上检测到,这表明CTC1细胞不附着于人结肠的上皮细胞(图4)。
实施例4:毒理学研究
4.1生存力测定法
在几个独立实验中分析冻干和再水化后的解木聚糖拟杆菌CTC1(DSM23964)的生存力。鉴定的最低存活率指示4×109CFU/g活细菌的最小浓度。接受这种浓度作为“可用浓度”。
4.2体外诱变性研究(Ames试验)
进行这个试验以检测CTC1或其发酵产物的任何毒性或致突变作用。在两个独立实验中使用了范围从0.28至28.5mg细菌/平板的五个剂量的活细菌或59mg巴氏消毒细菌/平板的一个剂量,每个实验在进行或不进行代谢活化的情况下实施。没有细胞毒性迹象并且与对照相比,对于任何浓度的5种测试菌株,在进行或不进行代谢活化的情况下并且另外分别在两种试验模式-平板掺入和预温育模式下均未观察到回复体菌落数增加。
4.3致畸变活性的体外评估(体外染色体畸变测定法)
本研究中使用的CTC1最高浓度是2.8mg活细菌/ml培养基和5.9mg巴氏消毒细菌/ml培养基,认为所述浓度是最大合理浓度。在代谢活化不存在的情况下,阴性对照中观察到的染色体畸变(不包括缺口)平均发生率在4小时暴露和24小时暴露后分别是1.0%或0.5%。在4小时暴露和24小时暴露后,任何浓度的有活力或巴氏消毒的CTC1均不导致变异细胞的任何统计显著增加(0.5%至2.5%)。相比之下,在4小时暴露和24小时暴露后,阳性对照导致变异细胞分别增加10.5%和17.5%。在代谢活化存在的情况下,阴性对照中观察到的染色体畸变(不包括缺口)平均发生率在4小时暴露后是0.5%。再一次,任何浓度的有活力或巴氏消毒的CTC1均不导致变异细胞的任何统计显著增加,在两个独立实验中分别导致0.0%和1.5%的变异细胞著增加。阳性对照在两个实验中在4小时后分别导致13.5%和16.5%变异细胞。对于测试的全部CTC1浓度,在进行或不进行代谢活化的实验中项相关的多倍体或核内再复制不是明显的。另外,证实前述结果时,在进行或不进行代谢活化的实验中,在任何测试的CTC1浓度上细胞毒性迹象均不明显。
4.4小鼠中90天口服毒性研究
这项研究的目的是确定口服摄入CTC1是否将产生任何毒理学效应。对照:将NMRI小鼠(50只雄小鼠和50只雌小鼠)分配至5个试验组(每组10只雄小鼠和10只雌小鼠)并且借助管饲经口施用每日剂量的细菌持续90天。我们每天对每只动物测试1×106至1×108CFU或1×1011个巴氏消毒CTC1的作用。在图5中显示结果。在90个测试日期间,如对照组中那样,在用活CTC1或巴氏消毒CTC1处理的任何组中没有明显死亡。处理或未处理的小鼠均未显示其行为或外部外观的任何改变。另外,功能观察没有揭示任何试验项相关的影响:运动性、粪便均匀性和水消耗量,并且体重增加和食物消耗量在处理组之间和相对于对照组在整个实验期间始终没有表现出显著差异。血液学检验在活CTC1和巴氏消毒CTC1的任何测试剂量水平上均没有显示试验项相关的影响,并且没有在对照组和处理小鼠组之间观察到统计显著的差异。临床生物化学值和眼科检查没有揭示任何组中活CTC1和巴氏消毒CTC1的任何剂量水平上的试验项相关变化。另外,死后大体分析未揭示出试验项相关的损害或畸形。最后,对全部器官的广泛和详细的组织病理学分析揭示治疗组与对照组之间无差异。
4.5CTC1的体内致病性(脓肿形成)
体内腹膜内脓肿形成模型是充分认可的研究机会致病菌菌株致病特性的模型(McConville等人,1981;Onderdonk等人,1984;Thadepalli等人,2001)。使用脆弱拟杆菌RMA6971或解木聚糖拟杆菌DSM23964(CTC1)的新鲜过夜细菌培养物。将含有2.3×107至4.6×109CFU/kg体重、50%(w/w)高压灭菌大鼠粪便和10%(w/v)硫酸钡的混合物腹内注射至小鼠中。注射后对剩余材料回顾性确定每个项目的生存力、细菌浓度和纯度。为了鉴定脆弱拟杆菌和/或解木聚糖拟杆菌的存在,建立如Liu等人(2003)所述的物种特异性多重PCR。这种多重PCR还允许在其中一个物种将在数量上严重不足的污染情况下鉴定两个物种。我们证实每种单一检测项含有想要的细菌菌株并且未遭受其它物种污染(见图6)。通过将每检测项涂布在适宜的琼脂上并在有氧条件下温育它,分析其他潜在的污染。在48小时温育后不能检出单菌落。在两个独立实验中,以高剂量CTC1注射的小鼠不诱导更多或更大的脓肿形成,如阴性对照(硫酸钡+无菌大鼠粪便)那样。相比之下,高浓度的脆弱拟杆菌RMA6971引起更多和更大脓肿的形成。在7日后,在无菌条件下每只动物取得2个脓肿,穿刺内容物并进行DNA提取。我们借助物种特异性PCR评价脓肿中CTC1或脆弱拟杆菌RMA6791的存在(图7)。可以在分别以2.3×107至4.6×109个脆弱拟杆菌/kg体重注射的组2、4和6分离的全部脓肿中检测到脆弱拟杆菌RMA6971。相比之下,与注射的细菌浓度无关,不能在任何被分析的脓肿中检出CTC1。用CTC1注射的小鼠的这些结果清晰地表明,该菌株不诱导脓肿形成,并且表明腹膜内注射后,其实际上由免疫系统迅速和彻底地根除。
Figure IDA0000468002940000011
PCT/RO/134表
Figure 00011

Claims (18)

1.一种食品,其包含解木聚糖拟杆菌(Bacteroides xylanisolvens)物种的微生物。
2.根据权利要求1所述的食品,其中所述解木聚糖拟杆菌物种微生物是作为DSM23964保藏的CTC1、由其衍生的微生物或CTC1同源物。
3.根据权利要求1或2所述的食品,其中所述解木聚糖拟杆菌物种微生物具有以下一个或多个特征:
a)在DNA-DNA杂交测定法中,其与作为DSM23964保藏的CTC1显示至少70%、优选地至少90%、至少95%、更优选地至少98%、最优选地至少99%的DNA-DNA亲缘关系;
b)其与作为DSM23964保藏的CTC1显示至少98%、优选地至少99%或至少99.5%、更优选地100%的16S rRNA基因序列相似性水平;和/或
c)其能够产生短链脂肪酸;和/或
d)其能够在摄入后存活于胃中和任选地人类肠道中的条件;和/或
e)其具有以下一个或多个安全特征:
(i)其对抗生素甲硝唑、美罗培南和/或克林霉素敏感;
(ii)其不含质粒RP4(DSM3876)和/或质粒pSC101(DSM6202);
(iii)其不含β-内酰胺酶基因cfiA和/或cfxA;
(iv)其不含毒力因子脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)多糖A和/或脆弱拟杆菌肠毒素和/或由基因ompW编码的“Ton B连接的外膜蛋白”;
(v)其不显示任何胞外DNA酶活性、胞外软骨素酶活性、胞外透明质酸酶活性和/或胞外神经氨酸酶活性;和
(vi)其不附着于人结肠的上皮细胞;和/或
f)其稳定和/或均质地表达表面碳水化合物结构。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的食品,以产生用于顾客的每日剂量约106至约1013个微生物的量或浓度包含解木聚糖拟杆菌物种微生物。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的食品,包含处于有活力、非增殖型、无活力或裂解形式的解木聚糖拟杆菌物种微生物。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的食品,所述食品选自发酵食品、益生食品、功能性食品、膳食补充剂和食品添加剂。
7.一种用于产生发酵食品的方法,其中食品原料与用于发酵的起子培养物组合,特征在于添加解木聚糖拟杆菌物种微生物。
8.根据权利要求7所述的方法,具有以下一个或多个特征:
a)使用所述解木聚糖拟杆菌物种微生物单独或与另一种起子培养物组合作为起子培养物;
b)将所述解木聚糖拟杆菌物种微生物在发酵期间或之后添加至发酵食品;和/或
c)所述解木聚糖拟杆菌物种微生物以有活力、非增殖、无活力或裂解形式使用;
d)将所述解木聚糖拟杆菌物种微生物以至少106个细胞/毫升原料的量、优选地以约109至1010个细胞/毫升原料的量添加。
9.根据权利要求7或8所述的方法,包括至少一个以下方法步骤:
-将食品原料用任选地含有解木聚糖拟杆菌物种微生物的起子培养物接种;
-添加至少一种糖,优选地葡萄糖;并且
-温育含有用于发酵的起子培养物的食品原料,优选地在无氧条件下。
10.根据权利要求7至9中任一项所述的方法,其中所述解木聚糖拟杆菌物种微生物具有以下一个或多个特征:
a)其是CTC1(DSM23964)、由其衍生的微生物或CTC1同源物;
b)在DNA-DNA杂交测定法中,其与作为DSM23964保藏的CTC1显示至少70%、优选地至少90%、至少95%、更优选地至少98%、最优选地至少99%的DNA-DNA亲缘关系;
c)其与作为DSM23964保藏的CTC1显示至少98%、优选地至少99%或至少99.5%、更优选地100%的16S rRNA基因序列相似性水平;和/或
d)其能够产生短链脂肪酸;和/或
e)其能够在摄入后存活于胃中和任选地人类肠道中的条件;和/或
f)其具有以下一个或多个安全特征:
(i)其对抗生素甲硝唑、美罗培南和/或克林霉素敏感;
(ii)其不含质粒RP4(DSM3876)和/或质粒pSC101(DSM6202);
(iii)其不含β-内酰胺酶基因cfiA和/或cfxA;
(iv)其不含毒力因子脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)多糖A和/或脆弱拟杆菌肠毒素和/或由基因ompW编码的“Ton B连接的外膜蛋白”;
(v)其不显示任何胞外DNA酶活性、胞外软骨素酶活性、胞外透明质酸酶活性和/或胞外神经氨酸酶活性;和
(vi)其不附着于人结肠的上皮细胞。
11.发酵食品,通过根据权利要求7至10中任一项所述的方法可获得。
12.作为DSM23964保藏的菌株CTC1、由其衍生的微生物或CTC1同源物的微生物。
13.根据权利要求12所述的微生物,其中从CTC1或CTC1同源物衍生的微生物具有以下一个或多个特征:
a)其是解木聚糖拟杆菌物种微生物;
b)在DNA-DNA杂交测定法中,其与作为DSM23964保藏的CTC1显示至少70%、优选地至少90%、至少95%、更优选地至少98%、最优选地至少99%的DNA-DNA亲缘关系;
c)其与作为DSM23964保藏的CTC1显示至少98%、优选地至少99%或至少99.5%、更优选地100%的16S rRNA基因序列相似性水平;和/或
d)其能够产生短链脂肪酸;和/或
e)其能够在摄入后存活于胃中和任选地人类肠道中的条件;和/或
f)其具有以下一个或多个安全特征:
(i)其对抗生素甲硝唑、美罗培南和/或克林霉素敏感;
(ii)其不含质粒RP4(DSM3876)和/或质粒pSC101(DSM6202);
(iii)其不含β-内酰胺酶基因cfiA和/或cfxA;
(iv)其不含毒力因子脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)多糖A和/或脆弱拟杆菌肠毒素和/或由基因ompW编码的“Ton B连接的外膜蛋白”;
(v)其不显示任何胞外DNA酶活性、胞外软骨素酶活性、胞外透明质酸酶活性和/或胞外神经氨酸酶活性;和
(vi)其不附着于人结肠的上皮细胞。
14.组合物,其包含根据权利要求12或13所述的微生物。
15.用于产生根据权利要求1至6中任一项所述的食品的方法,包括步骤:将解木聚糖拟杆菌物种微生物添加至包含至少一种食品原料的组合物或添加至加工的食品物料。
16.根据权利要求15所述的方法,其中解木聚糖拟杆菌物种微生物是根据权利要求12或13所述的微生物。
17.解木聚糖拟杆菌物种微生物用于产生食品、尤其作为用于发酵的起子培养物的用途。
18.根据权利要求17所述的用途,其中解木聚糖拟杆菌物种微生物是根据权利要求12或13所述的微生物。
CN201280040687.0A 2011-08-22 2012-08-22 解木聚糖拟杆菌物种微生物 Active CN103874428B (zh)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201161526009P 2011-08-22 2011-08-22
EP11178319 2011-08-22
US61/526,009 2011-08-22
EP11178319.7 2011-08-22
PCT/EP2012/066359 WO2013026886A2 (en) 2011-08-22 2012-08-22 Microorganisms of the species bacteroides xylanisolvens

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN103874428A true CN103874428A (zh) 2014-06-18
CN103874428B CN103874428B (zh) 2017-06-13

Family

ID=47746935

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201280040687.0A Active CN103874428B (zh) 2011-08-22 2012-08-22 解木聚糖拟杆菌物种微生物

Country Status (12)

Country Link
US (1) US20150118354A1 (zh)
EP (1) EP2747585B1 (zh)
JP (1) JP2014524260A (zh)
CN (1) CN103874428B (zh)
AU (1) AU2012298495B2 (zh)
BR (1) BR112014004123A2 (zh)
CA (1) CA2844542A1 (zh)
ES (1) ES2893170T3 (zh)
IL (1) IL231064A0 (zh)
IN (1) IN2014CN02038A (zh)
RU (1) RU2014111049A (zh)
WO (1) WO2013026886A2 (zh)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106852938A (zh) * 2015-12-09 2017-06-16 深圳华大基因研究院 拟杆菌(Bacteroides)在治疗和预防肥胖相关疾病中的应用
CN114806962A (zh) * 2022-05-20 2022-07-29 中国海洋大学 一株解木聚糖拟杆菌ay11-1及其在制备治疗炎症性肠病的药物及保健食品中的应用
CN114933993A (zh) * 2022-06-02 2022-08-23 南昌大学 一种解木聚糖拟杆菌及其复合制剂在缓解溃疡性结肠炎中的应用

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108531399B (zh) * 2018-04-12 2020-12-01 江南大学 一种Bacteroides xylanisolvens的筛选培养基及其应用

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101165162A (zh) * 2007-09-30 2008-04-23 苏国权 一种益生菌活性制剂
CN101560488A (zh) * 2009-05-27 2009-10-21 中国农业大学 分解木质纤维素的酶与菌剂
CN101600454A (zh) * 2006-11-10 2009-12-09 葛莱高托普有限公司 诱导碳水化合物特异性细胞免疫性的微生物及其片段
US20110076356A1 (en) * 2009-09-29 2011-03-31 Ziemer Cherie J Novel Fibro-Biotic Bacterium Isolate
US20110129570A1 (en) * 2008-05-13 2011-06-02 Steffen Goletz Fermentation process

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AUPP816899A0 (en) * 1999-01-14 1999-02-11 Food Technology Innovations Pty Limited Improved microbial products
US20040115177A1 (en) * 2001-10-12 2004-06-17 Harris Delbert L. Probiotic compositions and methods against bacterial infection in livestock animals
EP1920781B1 (en) * 2006-11-10 2015-03-04 Glycotope GmbH Compositions comprising a core-1 positive microorganism and their use for the treatment or prophylaxis of tumors

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101600454A (zh) * 2006-11-10 2009-12-09 葛莱高托普有限公司 诱导碳水化合物特异性细胞免疫性的微生物及其片段
CN101165162A (zh) * 2007-09-30 2008-04-23 苏国权 一种益生菌活性制剂
US20110129570A1 (en) * 2008-05-13 2011-06-02 Steffen Goletz Fermentation process
CN101560488A (zh) * 2009-05-27 2009-10-21 中国农业大学 分解木质纤维素的酶与菌剂
US20110076356A1 (en) * 2009-09-29 2011-03-31 Ziemer Cherie J Novel Fibro-Biotic Bacterium Isolate

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
C. MIRANDE, E. KADLECIKOVA, M. MATULOVA, ET.AL: "Dietary fibre degradation and fermentation by two xylanolytic bacteria Bacteroides xylanisolvens XB1AT and Roseburia intestinalis XB6B4 from the human intestine", 《JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY》, vol. 109, 31 December 2010 (2010-12-31), pages 451 - 460 *
CHASSARD C, DELMAS E, LAWSON P A, ET AL: "Bacteroides xylanisolvens sp. nov., a xylan-degrading bacterium isolated from human faeces", 《INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY》, vol. 58, no. 4, 31 December 2008 (2008-12-31), pages 1008 - 1013 *
ULSEMER P, TOUTOUNIAN K, SCHMIDT J, ET AL: "Safety assessment of the commensal strain Bacteroides xylanisolvens DSM 23964", 《REGULATORY TOXICOLOGY AND PHARMACOLOGY》, vol. 62, 6 November 2011 (2011-11-06), pages 336 - 346, XP055092924, DOI: 10.1016/j.yrtph.2011.10.014 *
ZITOMERSKY N L, COYNE M J, COMSTOCK L E: "Longitudinal analysis of the prevalence, maintenance, and IgA response to species of the order Bacteroidales in the human gut", 《INFECTION AND IMMUNITY》, vol. 79, no. 5, 31 May 2011 (2011-05-31), pages 2012 - 2020, XP055092947, DOI: 10.1128/IAI.01348-10 *

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106852938A (zh) * 2015-12-09 2017-06-16 深圳华大基因研究院 拟杆菌(Bacteroides)在治疗和预防肥胖相关疾病中的应用
CN114806962A (zh) * 2022-05-20 2022-07-29 中国海洋大学 一株解木聚糖拟杆菌ay11-1及其在制备治疗炎症性肠病的药物及保健食品中的应用
CN114806962B (zh) * 2022-05-20 2023-07-25 中国海洋大学 一株解木聚糖拟杆菌ay11-1及其在制备治疗炎症性肠病的药物及保健食品中的应用
CN114933993A (zh) * 2022-06-02 2022-08-23 南昌大学 一种解木聚糖拟杆菌及其复合制剂在缓解溃疡性结肠炎中的应用
CN114933993B (zh) * 2022-06-02 2023-12-12 南昌大学 一种解木聚糖拟杆菌及其复合制剂在缓解溃疡性结肠炎中的应用

Also Published As

Publication number Publication date
RU2014111049A (ru) 2015-09-27
IL231064A0 (en) 2014-03-31
AU2012298495A1 (en) 2014-04-17
CN103874428B (zh) 2017-06-13
IN2014CN02038A (zh) 2015-05-29
AU2012298495B2 (en) 2016-05-19
EP2747585A2 (en) 2014-07-02
BR112014004123A2 (pt) 2017-03-01
US20150118354A1 (en) 2015-04-30
WO2013026886A3 (en) 2014-03-20
ES2893170T3 (es) 2022-02-08
CA2844542A1 (en) 2013-02-28
JP2014524260A (ja) 2014-09-22
WO2013026886A2 (en) 2013-02-28
EP2747585B1 (en) 2021-09-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Angmo et al. Probiotic characterization of lactic acid bacteria isolated from fermented foods and beverage of Ladakh
CN105579574B (zh) 新型乳酸菌、以及含有新型乳酸菌的药品、饮食品和饲料
Rahayu et al. MOLECULAR CHARACTERISTICS OF INDIGENOUS PROBIOTIC STRAINS FROM INDONESIA.
Lee et al. Functional properties of Lactobacillus strains isolated from kimchi
Golowczyc et al. Characterization of homofermentative lactobacilli isolated from kefir grains: potential use as probiotic
Blaiotta et al. Production of probiotic bovine salami using Lactobacillus plantarum 299v as adjunct
CN102686112A (zh) 制造益生菌制剂的乳酸细菌的新颖菌株和其组合
Ramasamy et al. Probiotic potential of lactic acid bacteria from fermented Malaysian food or milk products
Ayivi et al. Lactic acid bacteria: an essential probiotic and starter culture for the production of yoghurt
Singh et al. Traditional fermented fish harbors bacteria with potent probiotic and anticancer properties
Holzapfel Introduction to prebiotics and probiotics
Purwandhani et al. Isolation, characterization and screening of folate-producing bacteria from traditional fermented food (dadih)
Yadav et al. Probiotic potential of Weissella paramesenteroides MYPS5. 1 isolated from customary dairy products and its therapeutic application
CN103874428B (zh) 解木聚糖拟杆菌物种微生物
Partovi et al. Microbiological and Chemical Properties of S iahmazgi Cheese, an I ranian Artisanal Cheese: Isolation and Identification of Dominant Lactic Acid Bacteria
Metrouh et al. Technological properties and probiotic potential of Lactiplantibacillus plantarum SJ14 isolated from Algerian traditional cheese “Jben”
Rayavarapu et al. Evaluation of potential probiotic characters of Lactobacillus fermentum
Kabir et al. Isolation, identification, molecular characterization and screening of probiotic activities of Lactobacillus species from poultry sources at live bird markets in Mymensingh, Bangladesh
TWI784326B (zh) 發酵乳桿菌tci275、其組合物及其用途
Abedi et al. Isolation and Identification of Lactobacillus strains from dairy products and evaluation of carbon sources effects on bacterial growth and phytase activity: supplement for fish feed
Nnawuihe et al. Characterization and probiotic potentials of lactic acid bacteria isolated from ingesta of selected ruminants
Akther et al. Optimizing the fermentation condition of low salted squid jeotgal by lactic acid bacteria with enhanced antioxidant activity
Ekwi Damian et al. Isolation, Molecular Identification and Phylogenetic Analysis of Bacteriocinogenic Lactic Acid Bacteria from Traditionally Fermented Foods from four Major Cities in Cameroon against Salmonella enterica pathogens
Temirova Antibiotic resistance and probiotic properties of lactic acid bacteria isolated from camel milk and shubat
Khanmohammadi Otaghsara et al. Evaluation of probiotic properties and the antibacterial activity of lactic acid bacteria isolated from Rutilus kutum intestine

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant
TR01 Transfer of patent right

Effective date of registration: 20200205

Address after: Han Guozhongqingbeidao

Patentee after: Tibus Co., Ltd

Address before: Berlin

Patentee before: GLYCOTOPE GmbH

TR01 Transfer of patent right