前列腺癌尿液检测试剂盒及其应用
技术领域
本发明属于检测领域,具体涉及前列腺癌尿液检测试剂盒,还涉及该试剂盒的应用。
背景技术
前列腺癌为发生于男性前列腺组织中的恶性肿瘤,是前列腺腺泡细胞异常无序生长的结果。前列腺癌的发病率具有明显的地理和种族差异。在欧美等发达国家和地区,它是男性最常见的恶性肿瘤,其死亡率居各种癌症的第二位,仅次于肺癌;在亚洲,其发病率低于西方国家,但近年来呈迅速上升趋势。前列腺癌一般50岁以后发病,95%发生于60岁以上的老年男性,发生率随年龄增长而增加。我国每年有7万~8万名前列腺癌新病人。而隐匿未被发现的病人数则更多。因此,凡是50岁至70岁的男性都应该定期接受前列腺癌的专科筛查;而直系亲属中有前列腺癌患者的男性,则应将筛查的时间提前到40岁。
前列腺癌在转移发生之前,早发现、及时合理治疗可有效降低该病的死亡率。前列腺癌常规筛查手段有直肠指检、血清前列腺特异抗原(PSA)测定和经直肠超声检查三种,其中,经直肠指检、血清前列腺特异抗原(PSA)测定是最基本的两项检查,一般每年检查一次;发现异常时,再行经直肠超声波检查和超声引导下的前列腺穿刺活检。
PSA(Prostate Specific Antigen)为前列腺组织特异性抗原,由前列腺的解剖结构可知PSA通过前列腺导管进入血液和尿液中,一些病例或生理情况下PSA会进入血液中去,如前列腺炎症、尿潴留、前列腺感染、前列腺增生和前列腺癌等,因此通过检测血清PSA水平来预测前列腺癌具有一定的假阳性率。从1991年开始,检测血清中PSA含量用于预测前列腺癌,含量高于4ng/mL认为是前列腺癌阳性,灵敏度79%,特异性20%-59%,平均灵敏度约33%,在浓度4-10ng/mL灰区部分,特异性是最低的,这时往往需要通过侵入性的穿刺活检进行确定。PSA在血液中有两种存在形式,一种与ACT结合,一种是游离状态。研究发现与良性前列腺病变相比,前列腺癌患者血清中与ACT结合的PSA含量更高一些。当检测出患者血清中PSA含量在4-10ng/mL灰区部分时,可用游离PSA(fPSA)比总PSA(tPSA)来增加检测的特异性,可提高检测特异性约20%。
近年来发现的前列腺癌新的标记物PCA3(Prostate cancer antigen3),在前列腺癌中高表达,可反应前列腺癌进展情况。PCA3位于9号染色体,含有4个外显子,为非编码的mRNA,通过选择性剪切和多聚腺苷酸化产生至少四种不同的转录产物。RT-PCR分析显示PCA3仅在前列腺组织中表达,在其他组织中不表达。Northern blot检测分析50例患者中47例PCA3高表达,而前列腺良性病变组织中不表达或低度表达(Cancer Reserch,1999,Dec,1;59(23):5975-9)。文献(cancer res.,2002,May1;62(9):2695-8)报道比较端粒酶RNA和PCA3RNA作为前列腺癌的标记物,PCA3指示作用更优。PCA3为到目前为止针对前列腺癌特异性最优的标志物,含有4个外显子,三个内含子,Gandini et al2003等文献报道,与其它外显子相比,PCA3外显子4用于前列腺癌检测特异性最优。
Gen-probe公司开发的基于PCA3/PSA的尿液检测试剂盒,应用转录介导的扩增(TMA)方法给出PCA3/PSA在尿液中的浓度(copy/mL),然后二者相比后乘以1000即为前列腺癌风险评估值。该方法操作流程繁琐,耗时长,质控及结果判读复杂,复检率较高15.2%,跟临床常规PCR仪器不兼容,需另外购置设备。更重要的是该检测过程中需反复开盖加入试剂,易污染检测环境,导致后续检测结果出现假阳性。
基于以上几点考虑,本发明给出了一种基于PCR方法的PCA3/PSA尿液检测试剂盒,操作流程简便,耗时短,质控方法简便、结果重复性好,复检率低,模板加入后PCR反应全程闭管,避免了污染导致的假阳性现象。且使用该试剂盒用于前列腺癌预示诊断、疗效评估、复发监控准确性好,与临床评价指标符合率高。
发明内容
有鉴于此,本发明的目的之一在于提供前列腺癌尿液检测试剂盒,本发明的目的之二在于提供前列腺癌尿液检测试剂盒的应用。
为实现上述发明目的,提供如下技术方案:
前列腺癌尿液检测试剂盒,所述试剂盒含有一步法RT-PCR扩增试剂,所述一步法RT-PCR扩增试剂含有检测PCA3和PSA的特异引物和探针,检测PCA3的特异引物如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示,探针如SEQ ID NO.5所示;检测PSA的特异引物如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示,探针如SEQ ID NO.6所示。
优选的,所述一步法RT-PCR扩增试剂还包括10×Buffer,2.5Mm dNTP,25Mm MgCl2,DMSO分析纯;100mMDTT;UDG,逆转录酶和RNA酶抑制剂和水。各组分的用量为10×Buffer2~10μL,2.5Mm dNTP5~8μL,25Mm MgCl21~5μL,DMSO分析纯1~6μL;100mMDTT1~4μL,Roche HS TAQ(货号12032953001),0.1~1μL;UDG(购自NEB,货号EN0362),0.1~1μL;0.1~1.5μL逆转录酶和0.1~2μL RNA酶抑制剂(使用Thermo逆转录试剂盒,货号K1622);引物混合物1~5μL(10μm),探针(10μm)0.5-2.5μL灭菌纯化水补足50μL,更优选的,10×Buffer5μL,2.5Mm dNTP7μL,25Mm MgCl24μL,引物混合物(10μm)2.5μL,探针(10μm)1.25μL,DMSO分析纯5μL;100mMDTT2.5μLRoche HS TAQ(货号12032953001),0.5μL;UDG(购自NEB,货号EN0362),0.25μL;0.25μL逆转录酶和0.3μLRNA酶抑制剂(其成分使用Thermo逆转录试剂盒,货号K1622),灭菌纯化水16.5μL。
一步法RT-PCR扩增条件为:37~42℃,2-5分钟;50~60℃,15~30分钟;94~95℃,10~30秒,60~65℃,10~30秒,40~50个循环,最后50度冷却30秒,最优的是37℃,5分钟;50℃,15分钟;扩增94℃,10秒,60℃,30秒,45个循环,50度,30秒冷却。
优选的,所述试剂盒还包括样本运输保存液、磁珠法提取试剂、标准品、阳性质控品和阴性质控品。
更优选的,所述样本运输保存液的组分如下,质量分数1%~5%十二烷基硫酸锂,10~20mMNaH2PO4,10~20mM Na2HPO4,0.5~2mM乙二胺四乙酸和0.5~2mM乙二醇二乙醚二胺四乙酸。最优的是质量分数为3%十二烷基硫酸锂,15mM NaH2PO4,15mM Na2HPO4,1mM乙二胺四乙酸(EDTA),1mM乙二醇二乙醚二胺四乙酸(EGTA),pH6.7;使用时样本运输保存液和直肠指检(DRE)后的尿液样本体积比可以是1:1;1:2;1:3;1:4;1:5;2:1;3:1;4:1;5:1,最优的是1:2。
更优选的,所述磁珠法提取试剂包括捕获液和洗液,所述捕获液的组分如下:所述磁珠法提取试剂包括捕获液和洗液,所述捕获液的组分如下:100~400mM HEPES,0.5~3M LiCl,100~500mM LiOH,50~150mM EDTA和50~400μg/mL超顺磁性的共价结合(dT)14的磁珠,所述洗液的组分如下:5~20mM HEPES,100~200mM NaCl,4~10mM NaOH,0.5~2mMEDTA,0.1~0.5%(v/v)乙醇,0.01~0.02%(w/v)对羟基苯甲酸甲酯,0.01~0.05%(w/v)尼泊金丙酯,和0.05~0.3%(w/v)月桂醇硫酸酯钠盐。最优的,捕获液的组分如下:浓度为250mM HEPES,1.88M LiCl,310mM LiOH,100mM EDTA,pH6.4和250μg/mL超顺磁性的共价结合(dT)14的磁珠;洗液的组分如下:10mM HEPES,150mM NaCl,6.5mM NaOH,1mM EDTA,0.3%(v/v)乙醇,0.02%(w/v)对羟基苯甲酸甲酯,0.01%(w/v)尼泊金丙酯,and0.1%(w/v)月桂醇硫酸酯钠盐,pH7.5。
磁珠法提取样本RNA:100μL~1000μL经样本运输保存液处理的尿液样本,加入1~5倍体积或1/2~1/5倍体积的捕获液,涡旋混匀1-5分钟,42~75℃反应10~60分钟,将反应液置于磁场中静置2~10分钟,吸弃液体,然后向含磁珠的EP管中加入200μL~2mL洗液,涡旋10-60秒后置于磁场中静置2~10分钟,吸弃液体,加入10~100μL的无RNase的水溶解RNA,在磁场中静置2~10分钟,将液体转移至新的EP管中,稀释0~5倍后取5μL检测。优选的,200μL经样本运输保存液处理的尿液样本加入400μL捕获液,涡旋混匀1分钟,60℃反应30分钟,将反应液置于磁场中静置2分钟,吸弃液体,然后向含磁珠的EP管中加入500μL洗液,涡旋20秒后置于磁场中静置2分钟,吸弃液体,加入50μL的无RNase的水溶解RNA,在磁场中静置2分钟,将液体转移至新的EP管中,稀释5倍后取5μL检测。
优选的,所述标准品为含PCA3和PSA基因片段的重组质粒。
优选的,所述阳性质控品为前列腺癌细胞株LNcap总RNA逆转录后的cDNA。
更优选的,所述阴性质控品为正常前列腺上皮细胞株RWPE-1总RNA逆转录后的cDNA。
2.所述前列腺癌尿液检测试剂盒在评估前列腺癌患病风险、治疗效果和复发监控中的应用。
本发明的有益效果在于:本发明公开了基于一步PCR方法的PCA3/PSA尿液检测试剂盒,该试剂盒操作流程简便,耗时短,质控方法简便、结果判读简单,重复性好,复检率低,模板加入后PCR反应全程闭管,避免了污染导致的假阳性现象。且使用该试剂盒用于前列腺癌预示诊断、疗效评估、复发监控准确性好,与临床评价指标符合率高。
附图说明
为了使本发明的目的、技术方案和有益效果更加清楚,本发明提供如下附图:
图1为前列腺癌尿液检测试剂盒下限检测散点图。
图2为前列腺癌尿液检测试剂盒下限检测ROC曲线。
图3为前列腺癌尿液检测试剂盒上限检测散点图。
图4为前列腺癌尿液检测试剂盒下限检测ROC曲线。
图5为PCA3标准曲线。
图6为PSA标准曲线。
图7为前列腺癌尿液检测试剂盒检测散点图。
图8为前列腺癌尿液检测试剂盒检测ROC曲线。
具体实施方式
下面将结合附图,对本发明的优选实施例进行详细的描述。实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,例如分子克隆实验指南(第三版,J.萨姆布鲁克等著)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实施例1试剂盒检测试剂、检测条件下限检测能力
1.前列腺癌尿液检测试剂盒:包括样本运输保存液、磁珠法提取试剂、一步法RT-PCR扩增试剂、标准品、阳性质控品、阴性质控品。
样本运输保存液:成分为质量分数为1%十二烷基硫酸锂,10mM NaH2PO4,10mMNa2HPO4,0.5mM乙二胺四乙酸(EDTA),0.5mM乙二醇二乙醚二胺四乙酸(EGTA),pH6.7;
磁珠法提取试剂:
(1)捕获液:浓度为100mM HEPES,0.5M LiCl,100mM LiOH,50mM EDTA和50μg/mL超顺磁性的共价结合(dT)14的磁珠(0.7~1.05μMparticles,Sera-MagTM),pH6.4;
(2)洗液:5mM HEPES,100mM NaCl,4mM NaOH,0.5mM EDTA,0.1%(v/v)乙醇,0.01%(w/v)对羟基苯甲酸甲酯,0.01%(w/v)尼泊金丙酯和0.05%(w/v)月桂醇硫酸酯钠盐,pH7.5。
磁珠法提取样本RNA:100μL经样本运输保存液处理的尿液样本加入20μL捕获液,涡旋混匀1分钟,42℃反应10分钟,将反应液置于磁场中静置2分钟,吸弃液体,然后向含磁珠的EP管中加入200μL洗液,涡旋10秒后置于磁场中静置2分钟,吸弃液体,加入10μL的无RNase的水溶解RNA,在磁场中静置2分钟,将液体转移至新的EP管中,取5μL检测。
一步法RT-PCR扩增试剂,包括2μL10×Buffer,5μL2.5Mm dNTP,1μL25Mm MgCl2,1μL PCA3和PSA引物混合物(引物浓度分别为10μm,具体序列如下:PCA3上游引物5’-ccaggaagatctgcatggtggg-3’(SEQ ID NO.1);PCA3下游引物5’-gatgacccaagatggcggc-3’(SEQID NO.2);PSA上游引物5’-cctgctcgggtgattctg-3’(SEQ ID NO.3);PSA下游引物5’-gccacgatggtgtccttgat-3’(SEQ ID NO.4)),0.5μL浓度为10μm的探针混合物(PCA3探针:5’-gcacagagatccctgggagaaatgcc-3’(SEQ ID NO.5);PSA探针:5’-gggcccacttgtctgtaatggtgtgc-3’(SEQ ID NO.6),DMSO分析纯1μL;100mMDTT,1μL;0.1μLRoche HS TAQ(货号12032953001),0.1μL UDG(购自NEB公司,货号EN0362);0.1μL逆转录酶和0.1μL RNA酶抑制剂(其成分使用Thermo逆转录试剂盒,货号K1622),灭菌纯化水34.3μL。
一步法RT-PCR反应条件:37℃,5分钟;50℃,15分钟;94℃,5分钟;扩增94℃,10秒,60℃,30秒,45个循环,最后50℃冷却30秒。
标准品:以前列腺癌细胞株LNcap 1μg总RNA逆转录后的cDNA为模板,分别以SEQ ID NO.7与SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.9与SEQ ID NO.10为引物进行PCR扩增,分别获得670bp的PCA3和589bp的PSA,然后将PCR产物装入T载体(使用Thermo Scientific InsTAclone PCRCloning Kit,货号k1213),测序验证后得到PCA3/PSA重组质粒。
质控品:阳性质控品为前列腺癌细胞株LNcap(购自上海细胞所)1μg总RNA逆转录后的cDNA;阴性质控品为正常前列腺上皮细胞株RWPE-1(购自上海细胞所)1μg总RNA逆转录后的cDNA。
结果判读:患者的PCA3score为尿液样本中PCA3浓度比上PSA浓度乘以1000,即
2.应用本实施例中的检测试剂盒和检测方法,检测来自北京协和医院泌尿科(99例)和上海中山医院泌尿科(45例)的直肠指检后尿液样本,结果如图1所示。检测显示,共有前列腺癌样本60例(北京协和医院泌尿科43例,上海中山医院泌尿科17例),前列腺良性病变84例(北京协和医院泌尿科56例,上海中山医院泌尿科28例),与穿刺活检结果一致,然后将检测的PCA3浓度比上PSA浓度乘以1000计算每例患者PCA3评分,并经ROC曲线分析(图2)。分析结果显示,曲线下面积0.65,cutoff值取38.3045时,诊断灵敏度60.9%,特异性60.9%。
实施例2试剂盒检测试剂、检测条件上限检测能力
1.前列腺癌尿液检测试剂盒:包括样本运输保存液、磁珠法提取试剂、一步法RT-PCR扩增试剂、标准品、阳性质控品、阴性质控品。
样本运输保存液:成分为质量分数为5%十二烷基硫酸锂,20mM NaH2PO4,20mM Na2HPO4,2mM乙二胺四乙酸(EDTA),2mM乙二醇二乙醚二胺四乙酸(EGTA),pH6.7;
磁珠法提取试剂:
(1)捕获液:浓度为400mM HEPES,3M LiCl,500mM LiOH,150mM EDTA和400μg/mL超顺磁性的共价结合(dT)14的磁珠(0.7~1.05μMparticles,Sera-MagTM),pH6.4;
(2)洗液:20mM HEPES,200mM NaCl,10mM NaOH,2mM EDTA,0.5%(v/v)乙醇,0.02%(w/v)对羟基苯甲酸甲酯,0.05%(w/v)尼泊金丙酯和0.3%(w/v)月桂醇硫酸酯钠盐,pH7.5。
磁珠法提取样本RNA:1000μL经样本运输保存液处理的尿液样本加入5000μL捕获液,涡旋混匀5分钟,75℃反应60分钟,将反应液置于磁场中静置10分钟,吸弃液体,然后向含磁珠的EP管中加入2000μL洗液,涡旋60秒后置于磁场中静置10分钟,吸弃液体,加入100μL的无RNase的水溶解RNA,在磁场中静置10分钟,将液体转移至新的EP管中,稀释5倍后取5μL检测。
一步法RT-PCR扩增试剂,包括10μL10×Buffer,8μL2.5Mm dNTP,5μL25Mm MgCl2,5μL PCA3和PSA引物混合物(引物浓度分别为10μm,具体序列如下:PCA3上游引物5’-ccaggaagatctgcatggtggg-3’(SEQ ID NO.1);PCA3下游引物5’-gatgacccaagatggcggc-3’(SEQID NO.2);PSA上游引物5’-cctgctcgggtgattctg-3’(SEQ ID NO.3);PSA下游引物5’-gccacgatggtgtccttgat-3’(SEQ ID NO.4)),5μL浓度为10μm的探针(PCA3探针:5’-gcacagagatccctgggagaaatgcc-3’(SEQ ID NO.5);PSA探针:5’-gggcccacttgtctgtaatggtgtgc-3’(SEQ ID NO.6),DMSO分析纯6μL;100mMDTT4μL;1μL Roche HS TAQ(货号12032953001),1μL UDG(购自NEB公司,货号EN0362);1.5μL逆转录酶和2μL RNA酶抑制剂(其成分使用Thermo逆转录试剂盒,货号K1622),灭菌纯化水0μL。
一步法RT-PCR反应条件:37℃,5分钟;50℃,15分钟;94℃,5分钟;扩增94℃,10秒,60℃,30秒,45个循环,最后50℃冷却30秒。
标准品:以前列腺癌细胞株LNcap1μg总RNA逆转录后的cDNA为模板,分别以SEQ IDNO.7与SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.9与SEQ ID NO.10为引物进行PCR扩增,分别获得670bp的PCA3和589bp的PSA,然后将PCR产物装入T载体(使用Thermo Scientific InsTAclone PCRCloning Kit,货号k1213),测序验证后得到PCA3/PSA重组质粒。
质控品:阳性质控品为前列腺癌细胞株LNcap(购自上海细胞所)1μg总RNA逆转录后的cDNA;阴性质控品为正常前列腺上皮细胞株RWPE-1(购自上海细胞所)1μg总RNA逆转录后的cDNA。
结果判读:患者的PCA3score为尿液样本中PCA3浓度比上PSA浓度乘以1000,即
2.应用本实施例中的检测试剂盒和检测方法,检测来自北京协和医院泌尿科(99例)和上海中山医院泌尿科(45例)的直肠指检后尿液样本,结果如图3所示。检测显示,共有前列腺癌样本60例(北京协和医院泌尿科43例,上海中山医院泌尿科17例),前列腺良性病变84例(北京协和医院泌尿科56例,上海中山医院泌尿科28例),与穿刺活检结果一致,然后将检测的PCA3浓度比上PSA浓度乘以1000计算每例患者PCA3评分,并经ROC曲线分析(图4)。分析结果显示,曲线下面积0.623,cutoff值取37.9374时,诊断灵敏度60.9%,特异性56.5%。
实施例3
1.前列腺癌尿液检测试剂盒:包括样本运输保存液、磁珠法提取试剂、一步法RT-PCR扩增试剂、标准品、阳性质控品、阴性质控品。
样本运输保存液:成分为质量分数为3%十二烷基硫酸锂,15mM NaH2PO4,15mMNa2HPO4,1mM乙二胺四乙酸(EDTA),1mM乙二醇二乙醚二胺四乙酸(EGTA),pH6.7;
磁珠法提取试剂:
(1)捕获液:浓度为250mM HEPES,1.88M LiCl,310mM LiOH,100mM EDTA和250μg/mL超顺磁性的共价结合(dT)14的磁珠(0.7~1.05μMparticles,Sera-MagTM),pH6.4;
(2)洗液:10mM HEPES,150mM NaCl,6.5mM NaOH,1mM EDTA,0.3%(v/v)乙醇,0.02%(w/v)对羟基苯甲酸甲酯,0.01%(w/v)尼泊金丙酯和0.1%(w/v)月桂醇硫酸酯钠盐,pH7.5。
磁珠法提取样本RNA:200μL经样本运输保存液处理的尿液样本加入400μL捕获液,涡旋混匀1分钟,60℃反应30分钟,将反应液置于磁场中静置2分钟,吸弃液体,然后向含磁珠的EP管中加入500μL洗液,涡旋20秒后置于磁场中静置2分钟,吸弃液体,加入50μL的无RNase的水溶解RNA,在磁场中静置2分钟,将液体转移至新的EP管中,稀释5倍后取5μL检测。
一步法RT-PCR扩增试剂,包括5μL10×Buffer,7μL2.5Mm dNTP,4μL25Mm MgCl2,2.5μL PCA3和PSA引物混合物(引物浓度分别为10μm,具体序列如下:PCA3上游引物5’-ccaggaagatctgcatggtggg-3’(SEQ ID NO.1);PCA3下游引物5’-gatgacccaagatggcggc-3’(SEQ ID NO.2);PSA上游引物5’-cctgctcgggtgattctg-3’(SEQ ID NO.3);PSA下游引物5’-gccacgatggtgtccttgat-3’(SEQ ID NO.4)),1.25μL浓度为10μm的探针(PCA3探针:5’-gcacagagatccctgggagaaatgcc-3’(SEQ ID NO.5);PSA探针:5’-gggcccacttgtctgtaatggtgtgc-3’(SEQ ID NO.6),DMSO分析纯5μL;100mMDTT2.5μL(Roche HS TAQ,货号12032953001),0.5μL UDG(购自NEB公司,货号EN0362);0.25μL逆转录酶和0.3μL RNA酶抑制剂(其成分使用Thermo逆转录试剂盒,货号K1622),灭菌纯化水16.5μL。
一步法RT-PCR条件:37℃,5分钟;50℃,15分钟;扩增94℃,10秒,60℃,30秒,45个循环,最后50℃冷却30秒。
标准品:以前列腺癌细胞株LNcap1μg总RNA逆转录后的cDNA为模板,分别以SEQID NO.7与SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.9与SEQ ID NO.10为引物进行PCR扩增,分别获得670bp的PCA3和589bp的PSA,然后将PCR产物装入T载体(使用Thermo ScientificInsTAclone PCR Cloning Kit,货号k1213),测序验证后得到PCA3/PSA重组质粒。提取重组质粒,并将浓度调至100ng/μL,换算为copy/mL,具体如表1所示。
表1.标准品浓度
编号 |
PCA3(copy/ml) |
PSA(copy/ml) |
Std1 |
105 |
106 |
Std2 |
104 |
105 |
Std3 |
103 |
104 |
Std4 |
102 |
103 |
阳性质控品:为前列腺癌细胞株LNcap(购自上海细胞所)1μg总RNA逆转录后的cDNA,取5μL检测,参考值以PCA3浓度比上PSA浓度乘以1000计算,其范围为56.4~60.3。
阴性质控品:为正常前列腺上皮细胞株RWPE-1(购自上海细胞所)1μg总RNA逆转录后的cDNA,参考值以PCA3浓度比上PSA浓度乘以1000计算,其范围为18.5~22.6。
2.试剂盒检测方法:
取样本运输保存液与直肠指检(DRE)后的尿液样本按照1:2体积比进行混合后为处理后的尿液样本,-20度可保存11个月,最多反复冻融5次;然后向200μL经样本运输保存液处理的尿液样本中加入400μL捕获液,涡旋混匀1分钟,60℃反应30分钟,将反应液置于磁场中静置2分钟,吸弃液体,然后向含磁珠的EP管中加入500μL洗液,涡旋20秒后置于磁场中静置2分钟,吸弃液体,加入50μL的无RNase的水溶解RNA,在磁场中静置2分钟,将液体转移至新的EP管中,稀释5倍后取5μL检测。
PCA3标准曲线:以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示核苷酸序列为引物,以PCA3标准品按表3稀释后的溶液为模板,以实施例1中的热循环条件进行扩增,然后根据扩增曲线的Ct值绘制标准曲线,如图5所示。结果表明PCA3扩增效率为90.1%,扩增曲线斜率为-3.584。
PSA标准曲线:以SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示核苷酸序列为引物,以PSA标准品按表3稀释后的溶液为模板,以实施例1中的热循环条件进行扩增,然后根据扩增曲线的Ct值绘制标准曲线,如图6所示,结果表明PSA扩增效率为103.9%,扩增曲线斜率为-3.231。
结果判读:患者的PCA3score为尿液样本中PCA3浓度比上PSA浓度乘以1000,即
应用本实施例中的试剂盒和检测方法,检验检测的重复性。重复检测PCA3Score三个临床样本10次,结果如表2所示,样本收集自北京协和医院:
表2.试剂盒重复性检验结果
重复次数 |
PCA3Score |
PCA3Score |
PCA3Score |
1 |
112 |
56 |
15 |
2 |
113 |
55 |
16 |
3 |
114 |
54 |
17 |
4 |
111 |
57 |
18 |
5 |
110 |
58 |
14 |
6 |
109 |
53 |
15 |
7 |
115 |
59 |
16 |
8 |
108 |
54 |
17 |
9 |
114 |
56 |
18 |
10 |
111 |
57 |
14 |
平均值 |
111.7 |
55.9 |
16 |
标准差 |
2.311805451 |
1.91195072 |
1.490711985 |
CV% |
0.020696557 |
0.034203054 |
0.093169499 |
由上述结果可知,本发明建立的检测试剂盒和检测方法具有较好的重复性。
临床样本复检率:从北京协和医院泌尿科取43例前列腺癌患者尿液,56例前列腺良性病变患者尿液,从上海中山医院泌尿科取17例前列腺癌患者尿液,28例前列腺良性病变患者尿液,共144例样本,检测后只有2例样本进行了复检,而2例复检样本的PCA3浓度低于PCA3线性范围下限,其原因可能是尿液样本收集操作不规范,尿液样本中DRE后前列腺液未进入尿液中,安排重复收集样本,检测结果在PCA3/PSA线性范围内。因此使用本发明的试剂盒的复检率为1.4%,远低于Gen-probe产品复检率15.2%,差异有统计学意义,P<0.01。
实施例4
应用实施例3中的检测试剂盒和检测方法,检测来自北京协和医院泌尿科(99例)和上海中山医院泌尿科(45例)的直肠指检后尿液样本,结果如图7所示。检测显示,共有前列腺癌样本60例(北京协和医院泌尿科43例,上海中山医院泌尿科17例),前列腺良性病变84例(北京协和医院泌尿科56例,上海中山医院泌尿科28例),与穿刺活检结果一致,然后将检测的PCA3浓度比上PSA浓度乘以1000计算每例患者PCA3评分,并经ROC曲线分析(图8)。分析结果显示,曲线下面积0.807,cutoff值取36.99时,诊断灵敏度72.5%,特异性78.3%。
(1)评估前列腺癌患病风险
应用上述给出的PCA3评分cutoff值,双盲评估60例患者前列腺癌患病风险,样本收集自北京协和医院泌尿科,四格表卡方检验见表3。
表3.四格表卡方检验结果
χ2检验P<0.01,因此两种检测方法相关性较好;KAPPA值为89.8%,表明两种检测方法具有较好的一致性。并且诊断灵敏度92.3%(24/26),特异性97%(33/34),阳性预测值96%(24/25),阴性预测值94.3%(33/35),误诊率(假阳性率)2.9%(1/34),漏诊率(假阴性率)7.7%(2/26),可满足临床检验要求。
(2)评估前列腺癌患者治疗效果
治疗前检测10例上海中山医院前列腺癌患者PCA3score,疗程结束后再检测PCA3score,然后判断治疗效果。判定根据计算公式P=治疗后PCA3score/PCA3score,P≥1判断为治疗无效;0.6<P<1判断为病情改善;P≤0.6判断为治疗效果显著,其判定结果如表4所示,同时进行临床评价,结果如表4所示。其判定结果与临床判断结果对比,符合率达90%。
表4.前列腺癌患者治疗效果评估结果
患者编号 |
治疗前后浓度比值 |
临床评价 |
01 |
2.234 |
无效 |
02 |
0.128 |
疗效显著 |
03 |
0.609 |
无效 |
04 |
0.633 |
改善 |
05 |
1.833 |
无效 |
06 |
3.368 |
无效 |
07 |
1.675 |
无效 |
08 |
0.221 |
疗效显著 |
09 |
0.814 |
改善 |
10 |
1.998 |
无效 |
由表4可知,检前列腺癌患者治疗效果测结果与临床判断结果对比,符合率达90%。
(3)对前列腺癌患者进行复发监控
对6例上海中山医院早期前列腺癌患者化疗疗程结束后PCA3score,然后对患者进行跟踪随访,治疗后六周首次检测PCA3score,以后每三个月检测一次,跟踪九个月,检测四次。然后计算跟踪随访PCA3score与化疗后PCA3score比值P,P>1判断为转移复发,P≤1判断为无进展生存,其结果如表5所示。同时对患者进行临床评价,结果如表5所示。
表5.对前列腺癌患者复发监控结果
患者编号 |
6周 |
3个月 |
6个月 |
9个月 |
临床评价 |
01 |
0.834 |
0.973 |
1.031 |
1.467 |
转移复发 |
02 |
0.148 |
0.219 |
0.235 |
0.369 |
无进展生存 |
03 |
0.023 |
0.085 |
0.113 |
0.416 |
无进展生存 |
04 |
1.313 |
1.564 |
1.912 |
1.541 |
无进展生存 |
05 |
0.684 |
1.461 |
1.498 |
1.694 |
转移复发 |
06 |
0.084 |
0.144 |
0.545 |
0.494 |
无进展生存 |
由表5可知,通过PCA3score变化计算其P值,可早于临床症状和体征发现前列腺癌患者复发转移,医生可提前进行干预。
最后说明的是,以上优选实施例仅用以说明本发明的技术方案而非限制,尽管通过上述优选实施例已经对本发明进行了详细的描述,但本领域技术人员应当理解,可以在形式上和细节上对其作出各种各样的改变,而不偏离本发明权利要求书所限定的范围。