CN109161598B - 前列腺癌早期诊断或预后评估标志物lncRNA malat1及其应用 - Google Patents

前列腺癌早期诊断或预后评估标志物lncRNA malat1及其应用 Download PDF

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Abstract

本发明涉及前列腺癌早期诊断或预后评估标志物lncRNA malat1及其应用。本发明所述标志物为外泌体源性长链非编码RNA（lncRNA）malat1，其在前列腺癌的早期诊断方面具有良好的指示作用，能够实现前列腺癌的无创检测，且与常规的前列腺癌无创检测方法相比，其具有更高的灵敏度和特异性，从而在临床上避免对前列腺癌可疑患者进行不必要的穿刺活检。另外，本发明所述标志物还对前列腺癌的预后具有良好的预测效果，有利于指导患者的复发监控和临床早期干预。

Description

前列腺癌早期诊断或预后评估标志物lncRNA malat1及其 应用
技术领域
本发明涉及医学诊断领域，具体而言，涉及前列腺癌早期诊断或预后评估标志物lncRNA malat1及其应用。
背景技术
前列腺癌是一种严重威胁男性健康的恶性肿瘤，其发病及死亡率高峰在70岁左右，占全球男性肿瘤发病率第2位、死亡率第5位。我国前列腺癌的发病率近年来一直处于显著的上升趋势。据最新报道，我国前列腺癌的发病率和死亡率年增长率分别高达7.2%和5.5%，成为我国肿瘤发病率和死亡率增长最快的肿瘤。
早期前列腺癌局限于包膜内，但当肿瘤扩散到包膜外或远处转移时，肿瘤的治疗就显得相当困难且预后很差。因此，前列腺癌的早期诊断就显得尤为重要。前列腺特异性抗原（PSA）作为目前诊断前列腺癌最为公认、应用最为广泛的分子诊断标记物，在目前前列腺癌的诊断方面起着极为重要的作用，但它在明显提高肿瘤诊断率的同时也有着很大的局限性。例如，PSA处于正常范围（<4.0 ng/ml），前列腺穿刺阳性率为15.2%；在PSA的诊断灰区（4-10 ng/ml），前列腺穿刺及反复穿刺阴性率为78% 和90%。美国一项临床随机对照试验表明，PSA作为前列腺癌的诊断标记物不能降低癌死亡率，与此同时，欧洲的一项类似研究表明PSA能降低癌死亡率但医疗花费巨大。这些研究表明，PSA作为前列腺癌的诊断标记物敏感性高，但特异性低，因此临床上亟需找到前列腺癌特异性更高的分子诊断标记物。
最新的研究表明，肿瘤细胞分泌的外泌体在肿瘤的发生和发展过程中发挥着重要作用。外泌体是由细胞主动分泌的，由脂质双分子层构成，直径在30-150nm的包裹有蛋白质、RNA等重要遗传物质的细胞外囊泡，这在形态结构上决定了其生物学的稳定性。在功能上，外泌体通过其表面的小分子靶向特定的受体细胞，通过受体-配体反应、细胞内吞或者直接与受体细胞膜融合，来传递其遗传物质，最终对受体细胞的生理或病理状态进行调控。基于外泌体这些独有的特点，使其成为了目前肿瘤标志物研究的一大热点，也是液体活检有望突破稳定性“瓶颈”的重大发现。可遗憾的是，截止到目前，仍未见血清外泌体lncRNA或mRNA应用于前列腺癌早期诊断或预后评估的报道或专利。
血清外泌体RNA可采取无创方式加以检测，因此，与病理组织活检相比，以外泌体RNA作为疾病诊断标志物具有显著优势。同时，开发新的前列腺癌分子标志物有助于临床上减少过度穿刺及重复穿刺给病人带来的精神和经济负担，有着重要的社会和经济效应。但目前针对前列腺癌早期诊断和或预后评估仍缺乏行之有效的外泌体标志物。
lncRNA malat1是新发现的一个前列腺癌相关分子。CN103146688A公开了特定核苷酸序列的血清lncRNA能够诊断前列腺癌，但并未揭示其他来源、其他核苷酸序列的lncRNA片段与前列腺癌的关系，更未露其与前列腺癌早期诊断的关联。
有鉴于此，特提出本发明。
发明内容
本发明的目的在于提供一种前列腺癌早期诊断和/或预后评估的标志物、所述标志物的检测试剂在制备前列腺癌早期诊断和/或预后评估的试剂和/或试剂盒中应用、根据所述应用制备而成的早期诊断和/或预后评估的试剂和/或试剂盒，以及相应的系统，从而通过外泌体源性malat1指示受试者是否罹患前列腺癌和/或评估受试者的预后情况，实现前列腺癌早期诊断和/或预后评的无创检测，提高前列腺癌早期诊断的灵敏度和特异性和/或准确地实现前列腺癌受试者的预后评估。
为实现本发明的上述目的，特采用以下技术方案：
一种前列腺癌早期诊断和/或预后评估的标志物，所述前列腺癌诊断标志物为外泌体源性长链非编码RNA（lncRNA）malat1，所述lncRNA malat1的核苷酸序列如SEQ ID NO：13所示。
在一些具体的实施方式中，所述诊断包括区分早期前列腺癌受试者与其他受试者。
在一些具体的实施方式中，所述其他受试者包括健康受试者、慢性前列腺炎受试者、急性前列腺炎受试者、前列腺增生受试者或其他前列腺癌可疑的受试者；优选地，所述其他前列腺癌可疑的受试者为其它临床体征、临床检验、临床检查提示前列腺癌可疑的受试者，更优选地，所述临床体征包括直肠指诊触及可疑结节等；所述临床检验包括血清总PSA、游离PSA或游离PSA与总PSA的比值不在正常范围内；所述临床检查包括B超可见可颖回声，CT或MRI检查可见可疑病灶，或其它检查提示前列腺内可疑病灶。
所述预后评估包括预测受试者的临床进展，优选地，所述临床进展为治疗后的复发或转移，例如术后复发或术后转移，优选地，所述复发为生化复发，更优选地，所述预后评估包括预测受试者术后生化复发的时间早晚。
在一些具体的实施方式中，所述外泌体为血液、血清或血浆外泌体，优选为血清外泌体。
本发明还涉及：前述标志物的检测试剂在制备前列腺癌早期诊断和/或预后评估的试剂和/或试剂盒中的应用。
在一些具体的实施方式中，所述检测试剂包括外泌体提取试剂和lncRNA malat1的检测试剂。
在一些具体的实施方式中，所述lncRNA malat1的检测试剂包括用于PCR的上、下游引物和检测探针；
在一些具体的实施方式中，所述检测探针的5’端标记荧光基团（可选地，FAM荧光基团），3’端标记MGB修饰基团；
在一些具体的实施方式中，所述上、下游引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO：1-2所示，所述检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：14所示。
本发明还涉及：根据前述应用制备而成的用于前列腺癌早期诊断和/或预后评估的试剂和/或试剂盒。
在一些具体的实施方式中，所述试剂盒还包括以下一种或多种：DNA聚合酶、PCR缓冲液、阳性对照品和阴性对照品；更优选地，所述阳性对照品为核酸标准品，所述核酸标准品的核苷酸序列如SEQ ID NO：15所示，所述阴性对照品为DNase-free和RNase-free的纯水。
本发明还涉及：一种用于前列腺癌的早期诊断和/或预后评估系统，所述系统包括受试者信息获取模块，所述系统还包括诊断模块和/或预后评估模块，其中：
所述受试者信息获取模块，用于获取前述标志物的检测信息；
所述早期诊断和/或预后评估模块，用于根据所述标志物的检测信息诊断所述受试者是否为前列腺癌患者，或用于根据所述标志物的检测预测所述受试者的预后情况，优选地，所述预后评估包括评估受试者的复发情况，更优选地，所述复发是指生化复发，最优选地，所述预后评估包括预测受试者发生生化复发的时间的早晚。
在一些具体的实施方式中，如果所述标志物的检测信息超过阈值，则判定所述受试者罹患前列腺癌，否则则判定所述受试者未罹患前列腺癌。
在一些具体的实施方式中，所述阈值为21.35拷贝/微升血清。
在一些具体的实施方式中，所述预后评估包括：如果所述标志物的检测信息超过阈值，则判定所述受试者的预后不佳，否则则判定所述受试者的预后佳，优选地，所述预后不佳为发生复发的时间早，所述预后佳是指发生复发的时间晚；更优选的，所述阈值为20拷贝数/μL血清样本。
在一些具体的实施方式中，所述系统还包括检测模块和/或显示模块。
在一些具体的实施方式中，所述检测模块用于检测前述标志物，优选的，所述检测模块使用前述试剂和/或试剂盒检测前述标志物。
在一些具体的实施方式中，所述显示模块用于展示早期诊断和/或预后评估结果，优选的，所述早期诊断和/或预后评估结果通过显示器、打印或播报的方式展示。
术语定义
本发明所述早期前列腺癌是指无转移、淋巴结阴性的局限前列腺癌。
有益效果
与现有技术相比，本发明的有益效果为：（1）本发明独创性地发现外泌体源性malat1能够明显区分早期前列腺癌与非癌患者，在前列腺癌的早期诊断方面具有良好的指示作用，能够实现前列腺癌的无创检测；（2）且与常规的前列腺癌无创检测相比，本发明所述外泌体源性malat1具备更高的灵敏度和特异性；（3）本发明独创性地发现外泌体源性malat1对前列腺癌的预后具有良好的指示作用，高表达血清外泌体malat1与生化复发显著相关，这就提示，血清外泌体malat1对生化复发有着预测作用。
附图说明
为了更清楚地说明本发明具体实施方式或现有技术中的技术方案，下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图是本发明的一些实施方式，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为实施例1的电泳结果图，其中M表示Marker，L1~L6分别表示泳道1~泳道6；
图2为实施例2所述PCR的反应程序；
图3为实施例3所述ROC图，其中1为血清外泌体源性malat1浓度，2为血浆MD-miniRNA拷贝数，3为参考线；
图4为外泌体源性malat1的表达量与前列腺癌受试者生化复发的关系图，其中，横坐标为检测外泌体源性malat1后受试者发生生化复发的时间，纵坐标为受试者未发生生化复发的概率，1为高表达外泌体源性malat1，2为低表达外泌体源性malat1。
具体实施方式
下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述，但是本领域技术人员将会理解，下列实施例仅用于说明本发明，而不应视为限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件者，按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市购买获得的常规产品。
实施例1
本实施例的主要目的在于检测血清外泌体源性malat1的各malat1片段的含量，具体包括：
1. 用外泌体提取试剂盒(QIAGEN公司：exoEasy Maxi Kit或者miRCURY ExosomeKits；Thermofisher公司：Total Exosome Isolation Reagent from serum)，将血清中的总外泌体提取出来。将提取的外泌体，利用核糖核酸抽提试剂盒(QIAGEN公司：miRNeasyMicro Kit)，将外泌体中全部的核糖核酸进行提取。提取后的核糖核酸，用反转录试剂盒(Takara公司：PrimeScript™ II 1st Strand cDNA Synthesis Kit)，将核糖核酸转化成cDNA。
2. 针对malat1的核苷酸序列设计用于扩增malat1上不同片段的引物，具体引物信息如表1所示。利用表1所示引物和对所述cDNA进行PCR反应和琼脂糖凝胶电泳（电泳结果参见图1）。图1中的L1~L6分别对应用针对malat1-1、malat1-2、malat1-3、malat-4、malat-5和malat-6的引物对的扩增结果，其中，L1泳道的条带最亮，且片段大小相符，L2~L3、L5~L6泳道的条带暗淡，L4泳道的条带较亮，但片段大小不符。由此可见，malat1-1片段在外泌体中的含量最高，被选为候选对象。
表1 引物信息
实施例2
本实施例的主要目的在于建立一种针对外泌体malat1-1片段进行定量检测的方法，所述方法包括：
1. 提取血清总外泌体与核糖核酸，并将所述核糖核酸反转录为cDNA（具体方法参见实施例2）。
2. 根据malat1-1序列设计用于与malat1-1的上、下游引物配合使用的探针：其中，所述malat1-1的核苷酸序列为：
TAGGGGATTTCAGGATTGAGAAATTTTTCCATCGAGCCTTTTTAAAATTGTAGGACTTGT（SEQ IDNO：13）
所述探针的核苷酸序列为：TCCATCGAGCCTTTT（SEQ ID NO：14），该探针5’端标记FAM荧光基团，3’端标记MGB修饰基团。
3. 人工合成malat1的一段核酸片段作为核酸标准品，依次稀释至浓度为5pg/μL，1pg/μL，0.5pg/μL，0.2pg/μL，0.1pg/μL，所述人工合成malat1片段的核苷酸序列如下所示：
5’-CCTGACCCCTTCCCTAGGGGATTTCAGGATTGAGAAATTTTTCCATCGAGCCTTTTTAAAATTGTAGGACTTGTTCCTGTGGGCTTCAGTGATGG-3’（SEQ ID NO：15）。
4. 在荧光PCR的96孔反应板上，前15个孔用于加入上述五个浓度的核酸标准品，每个浓度用3个孔检测。从第16个孔开始，检测提取的cDNA。每管反应液中加入2μL的cDNA或2μL标准品(5个浓度操作相同)。将混合好的反应液放入荧光PCR仪器(Thermofisher公司：AB7500荧光PCR仪)上，设置反应程序如下图2所示并完成反应。将反应完成后的前15个孔做成标准曲线，得到CT值与模板浓度的换算关系，后读取加入cDNA的反应孔的CT值，将其换算成cDNA的浓度。
实施例3
本实施例的主要目的在于评估血清外泌体源性malat1-1对早期前列腺癌的诊断效果，主要包括：
1. 召集299名临床诊断结果已确定的受试者，具体信息参见表2。
2. 分别检测299名受试者的血清外泌体源性malat1（检测方法参见实施例2）以及血浆MD-miniRNA（检测方法参见中国发明专利CN103146688B）。
3. 根据受试者的诊断结果以及血清外泌体源性malat1的拷贝数、血浆MD-miniRNA浓度，通过SPSS13.0软件分别绘制所述外泌体源性malat1、MD-miniRNA的ROC曲线（参见图3）。
4. 结论：根据图3所示结果可知，血清外泌体源性malat1的ROC曲线的AUC面积（0.881）、灵敏度和特异性均高于现有的标志物MD-miniRNA（AUC面积为0.756），表明本发明所述标志物对早期前列腺癌具有良好的指示作用，且其诊断效果显著优于现有的前列腺癌诊断标志物MD-miniRNA。根据图3所示malat1的ROC曲线获得用于区分早期前列腺癌与其他非前列腺癌患者的cutoff值（即，阈值），为21.35拷贝/微升血清，此处的灵敏度为82.5%，特异性为88.2%。
表2 受试者信息
编号 诊断结果
1 前列腺良性增生伴局部慢性炎症
2 早期前列腺腺癌
3 早期前列腺腺癌
4 早期前列腺腺癌
5 良性增生
6 良性前列腺增生
7 早期前列腺腺癌
8 良性前列腺增生伴慢性炎
9 良性前列腺增生伴慢性炎
10 良性前列腺增生
11 良性前列腺增生伴慢性炎
12 良性前列腺增生伴慢性炎
13 早期前列腺腺癌
14 良性前列腺增生
15 良性前列腺增生
16 良性前列腺增生
17 早期前列腺腺癌
18 早期前列腺腺癌
19 良性前列腺增生
20 早期前列腺腺癌
21 良性前列腺增生伴慢性炎
22 良性前列腺增生
23 良性前列腺增生伴慢性炎
24 良性前列腺增生伴慢性炎
25 良性前列腺增生伴慢性炎
26 早期前列腺腺癌
27 良性前列腺增生
28 良性前列腺增生
29 早期前列腺腺癌
30 良性前列腺增生
31 良性前列腺增生
32 早期前列腺腺癌
33 早期前列腺腺癌
34 早期前列腺腺癌
35 早期前列腺腺癌
36 早期前列腺腺癌
37 良性前列腺增生
38 良性前列腺增生伴慢性炎
39 良性前列腺增生
40 良性前列腺增生伴慢性炎
41 良性前列腺增生伴慢性炎
42 良性前列腺增生
43 早期前列腺腺癌
44 早期前列腺腺癌
45 早期前列腺腺癌
46 良性前列腺增生伴慢性炎
47 良性前列腺增生伴慢性炎
48 早期前列腺腺癌
49 良性前列腺增生
50 早期前列腺腺癌
51 早期前列腺腺癌
52 早期前列腺腺癌
53 良性前列腺增生
54 早期前列腺腺癌
55 良性前列腺增生
56 早期前列腺腺癌
57 早期前列腺腺癌
58 早期前列腺腺癌
59 早期前列腺腺癌
60 前列腺导管腺癌
61 早期前列腺腺癌
62 良性前列腺增生
63 早期前列腺腺癌
64 良性前列腺增生
65 早期前列腺腺癌
66 早期前列腺腺癌
67 早期前列腺腺癌
68 良性前列腺增生
69 良性前列腺增生
70 早期前列腺腺癌
71 良性前列腺增生伴慢性炎
72 早期前列腺腺癌
73 早期前列腺腺癌
74 良性前列腺增生
75 早期前列腺腺癌
76 早期前列腺腺癌
77 良性前列腺增生
78 良性前列腺增生
79 良性前列腺增生伴慢性炎
80 良性前列腺增生
81 早期前列腺腺癌
82 早期前列腺腺癌
83 早期前列腺腺癌
84 良性前列腺增生伴慢性炎
85 早期前列腺腺癌
86 良性前列腺增生伴慢性炎
87 早期前列腺腺癌
88 早期前列腺腺癌
89 良性前列腺增生
90 良性前列腺增生
91 良性前列腺增生
92 早期前列腺腺癌
93 良性前列腺增生
94 早期前列腺腺癌
95 良性前列腺增生
96 早期前列腺腺癌
97 良性前列腺增生
98 良性前列腺增生
99 良性前列腺增生
100 良性前列腺增生
101 良性前列腺增生
102 早期前列腺腺癌
103 良性前列腺增生
104 早期前列腺腺癌
105 早期前列腺腺癌
106 早期前列腺腺癌
107 早期前列腺腺癌
108 良性前列腺增生
109 早期前列腺腺癌
110 良性前列腺增生
111 早期前列腺腺癌
112 早期前列腺腺癌
113 早期前列腺腺癌
114 慢性炎症
115 良性前列腺增生
116 早期前列腺腺癌
117 早期前列腺腺癌
118 早期前列腺腺癌
119 早期前列腺腺癌
120 早期前列腺腺癌
121 良性前列腺增生
122 早期前列腺腺癌
123 早期前列腺腺癌
124 早期前列腺腺癌
125 早期前列腺腺癌
126 早期前列腺腺癌
127 早期前列腺腺癌
128 早期前列腺腺癌
129 早期前列腺腺癌
130 非典型腺瘤样增生
131 良性前列腺增生
132 早期前列腺腺癌
133 早期前列腺腺癌
134 早期前列腺腺癌
135 良性前列腺增生
136 良性前列腺增生伴慢性炎
137 早期前列腺腺癌
138 良性前列腺增生
139 早期前列腺腺癌
140 良性前列腺增生
141 良性前列腺增生
142 早期前列腺腺癌
143 良性前列腺增生
144 早期前列腺腺癌
145 良性前列腺增生
146 早期前列腺腺癌
147 早期前列腺腺癌
148 早期前列腺腺癌
149 早期前列腺腺癌
150 良性前列腺增生
151 良性前列腺增生伴慢性炎
152 早期前列腺腺癌
153 早期前列腺腺癌
154 良性前列腺增生伴慢性炎
155 良性前列腺增生
156 良性前列腺增生
157 良性前列腺增生
158 早期前列腺腺癌
159 良性前列腺增生伴慢性炎
160 良性前列腺增生伴慢性炎
161 良性前列腺增生
162 早期前列腺腺癌
163 良性前列腺增生
164 良性前列腺增生
165 早期前列腺腺癌
166 良性前列腺增生伴慢性炎
167 良性前列腺增生
168 良性前列腺增生伴慢性炎
169 早期前列腺腺癌
170 早期前列腺腺癌
171 早期前列腺腺癌
172 早期前列腺腺癌
173 早期前列腺腺癌
174 良性前列腺增生伴慢性炎
175 早期前列腺腺癌
176 早期前列腺腺癌
177 早期前列腺腺癌
178 良性前列腺增生伴慢性炎
179 早期前列腺腺癌
180 良性前列腺增生
181 良性前列腺增生伴慢性炎
182 良性前列腺增生
183 早期前列腺腺癌
184 早期前列腺腺癌
185 良性前列腺增生伴间质慢性炎
186 早期前列腺腺癌
187 良性前列腺增生
188 早期前列腺腺癌
189 良性前列腺增生
190 良性前列腺增生
191 早期前列腺腺癌
192 良性前列腺增生
193 早期前列腺腺癌
194 早期前列腺腺癌
195 良性前列腺增生伴慢性炎
196 良性前列腺增生
197 早期前列腺腺癌
198 早期前列腺腺癌
199 早期前列腺腺癌
200 良性前列腺增生伴慢性炎
201 良性前列腺增生
202 良性前列腺增生
203 良性前列腺增生伴慢性炎
204 早期前列腺腺癌
205 良性前列腺增生伴间质慢性炎
206 良性前列腺增生
207 良性前列腺增生
208 早期前列腺腺癌
209 良性前列腺增生
210 良性前列腺增生
211 良性前列腺增生
212 良性前列腺增生
213 良性前列腺增生
214 良性前列腺增生
215 早期前列腺腺癌
216 良性前列腺增生
217 良性前列腺增生
218 早期前列腺腺癌
219 早期前列腺腺癌
220 良性前列腺增生伴灶性慢性炎
221 良性前列腺增生
222 良性前列腺增生
223 良性前列腺增生伴慢性炎
224 早期前列腺腺癌
225 早期前列腺腺癌
226 早期前列腺腺癌
227 良性前列腺增生
228 良性前列腺增生伴间质慢性炎
229 良性前列腺增生
230 早期前列腺腺癌
231 良性前列腺增生
232 良性前列腺增生
233 良性前列腺增生
234 早期前列腺腺癌
235 良性前列腺增生
236 良性前列腺增生伴慢性炎
237 良性前列腺增生
238 良性前列腺增生
239 良性前列腺增生
240 良性前列腺增生
241 良性前列腺增生
242 良性前列腺增生伴慢性炎
243 良性前列腺增生
244 早期前列腺腺癌
245 良性前列腺增生
246 良性前列腺增生伴间质慢性炎
247 良性前列腺增生
248 早期前列腺腺癌
249 良性前列腺增生伴间质慢性炎
250 早期前列腺腺癌
251 良性前列腺增生
252 早期前列腺腺癌
253 早期前列腺腺癌
254 早期前列腺腺癌
255 早期前列腺腺癌
256 良性前列腺增生
257 良性前列腺增生
258 良性前列腺增生伴间质慢性炎
259 早期前列腺腺癌
260 早期前列腺腺癌
261 良性前列腺增生
262 良性前列腺增生
263 早期前列腺腺癌
264 良性前列腺增生伴局部慢性炎
265 早期前列腺腺癌
266 早期前列腺腺癌
267 良性前列腺增生
268 良性前列腺增生
269 良性前列腺增生
270 弥漫性大B细胞淋巴瘤
271 早期前列腺腺癌
272 良性前列腺增生
273 良性前列腺增生伴间质慢性炎
274 良性前列腺增生伴间质慢性炎
275 早期前列腺腺癌
276 良性前列腺增生伴间质慢性炎
277 良性前列腺增生伴间质慢性炎
278 早期前列腺腺癌
279 早期前列腺腺癌
280 早期前列腺腺癌
281 良性前列腺增生
282 早期前列腺腺癌
283 早期前列腺腺癌
284 早期前列腺腺癌
285 良性前列腺增生
286 良性前列腺增生
287 良性前列腺增生
288 良性前列腺增生
289 良性前列腺增生
290 良性前列腺增生
291 良性前列腺增生伴间质慢性炎
292 良性前列腺增生伴间质慢性炎
293 早期前列腺腺癌
294 早期前列腺腺癌
295 良性前列腺增生
296 良性前列腺增生
297 早期前列腺腺癌
298 良性前列腺增生
299 良性前列腺增生
实施例4
本实施例的主要目的在于考察外泌体源性malat1对前列腺癌预后的评估效果：
（1）召集108名接受手术的前列腺癌受试者，检测受试者血清样本中外泌体源性malat1的含量，具体检测方法参见实施例2，并统计受试者在生化复发方面的信息，包括malat1检测的时间点受试者是否发生生化复发以及受试者在检测后发生生化复发的时间，具体信息参见表3。
（2）根据表3的信息，绘制高表达量外泌体源性malat1（表达量高于20拷贝数/μL血清）和低表达外泌体源性malat1（表达量在20拷贝数/μL血清以下）与生化复发之间的关系（参见图4）。
图4所示结果表明，外泌体源性malat1在血清中的拷贝数能够预测前列腺癌的生化复发指导预后与治疗策略：在前列腺癌术后患者中检测malat1的表达水平能够指导预后。当malat1在每μL血清中拷贝在20以下时，前列腺癌患者出现生化复发的时间更晚，发生生化复发的概率低，当malat1在每μL血清中拷贝高于20时，前列腺癌患者更早的出现生化复发，发生生化复发的概率高，需要提早的临床干预。
表3 受试者malat1检测信息及生化复发信息
样本 malat1 拷贝数/μL 血清 检测时是否出现生化复发 生化复发的发生时间(月)
1 504437.33 No 24
2 571.10 No 31
3 119.16 No 0
4 76.00 No 24
5 73.69 Yes 4
6 73.28 Yes 7
7 62.47 No 25
8 47.29 Yes 16
9 46.62 No 19
10 44.88 No 31
11 42.90 Yes 2
12 42.76 No 34
13 40.86 No 0
14 33.39 Yes 24
15 33.26 Yes 1
16 31.73 Yes 7
17 30.83 Yes 12
18 30.32 No 30
19 25.35 No 1
20 24.15 Yes 3
21 23.85 Yes 2
22 21.67 No 36
23 21.55 Yes 3
24 21.15 No 21
25 20.96 No 25
26 18.94 No 23
27 18.86 No 0
28 18.83 Yes 1
29 18.63 No 0
30 17.56 No 24
31 16.99 No 24
32 16.28 No 29
33 15.99 No 2
34 15.56 No 23
35 15.28 No 28
36 15.26 Yes 10
37 15.13 No 30
38 14.81 Yes 0
39 14.21 No 28
40 13.49 No 20
41 13.41 No 21
42 12.46 Yes 28
43 10.81 No 11
44 9.53 No 20
45 9.42 No 34
46 9.08 No 17
47 8.99 No 38
48 8.99 Yes 43
49 8.77 No 1
50 8.47 No 30
51 8.46 Yes 3
52 8.38 Yes 0
53 8.37 No 24
54 8.29 No 1
55 8.26 Yes 33
56 8.21 No 6
57 8.04 Yes 9
58 7.87 No 19
59 7.78 No 0
60 7.73 No 38
61 7.71 Yes 22
62 7.27 No 31
63 7.00 No 24
64 7.00 Yes 27
65 6.50 No 38
66 6.23 No 0
67 5.98 Yes 13
68 5.94 No 20
69 5.88 No 25
70 5.65 No 29
71 5.50 Yes 0
72 5.30 No 39
73 5.23 Yes 3
74 5.13 No 27
75 4.94 No 24
76 4.54 No 23
77 4.31 No 23
78 4.23 No 33
79 4.16 Yes 1
80 4.06 No 21
81 3.91 Yes 10
82 3.75 No 0
83 3.53 Yes 28
84 3.50 No 21
85 3.44 No 0
86 3.42 No 21
87 3.35 No 24
88 3.06 No 24
89 2.99 No 42
90 2.92 No 24
91 2.76 No 13
92 2.75 No 36
93 2.62 No 23
94 2.57 No 15
95 2.55 No 35
96 2.42 Yes 14
97 2.29 No 23
98 1.99 No 24
99 1.93 Yes 9
100 1.90 No 35
101 1.88 No 24
102 1.84 Yes 38
103 1.69 No 21
104 1.60 No 18
105 1.35 No 20
106 1.20 Yes 16
107 0.89 No 32
108 0.79 No 22
最后应说明的是：以上各实施例仅用以说明本发明的技术方案，而非对其限制；尽管参照前述各实施例对本发明进行了详细的说明，但本领域的普通技术人员应当理解：其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改，或者对其中部分或者全部技术特征进行等同替换；而这些修改或者替换，并不使相应技术方案的本质脱离本发明各实施例技术方案的范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 上海晟燃生物科技有限公司
<120> 前列腺癌早期诊断或预后评估标志物lncRNA malat1及其应用
<160> 15
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
taggggattt caggattg 18
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
acaggaacaa gtcctacaat 20
<210> 3
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
ggtaggcatt gaggcagc 18
<210> 4
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
tctgcggttt cctcaagc 18
<210> 5
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
caggagccag tgcgattt 18
<210> 6
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
tcctagcttc accaccaa 18
<210> 7
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
aagttggcaa gtaactcc 18
<210> 8
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
tacacccagt ggctcata 18
<210> 9
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
aagaagccga aataaatgag 20
<210> 10
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
tctgaggcaa acgaaaca 18
<210> 11
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 11
aaattaaact ggcaagtgg 19
<210> 12
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 12
gaattaagac caagggag 18
<210> 13
<211> 60
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
taggggattt caggattgag aaatttttcc atcgagcctt tttaaaattg taggacttgt 60
<210> 14
<211> 15
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 14
tccatcgagc ctttt 15
<210> 15
<211> 95
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 15
cctgacccct tccctagggg atttcaggat tgagaaattt ttccatcgag cctttttaaa 60
attgtaggac ttgttcctgt gggcttcagt gatgg 95

Claims (28)

1.前列腺癌早期诊断和/或预后评估的标志物的检测试剂在制备前列腺癌早期诊断和/或预后评估的试剂和/或试剂盒中的应用，其特征在于，所述标志物为外泌体源性长链非编码RNA（lncRNA）malat1，所述lncRNA malat1的核苷酸序列如SEQ ID NO：13所示。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述前列腺癌早期诊断包括区分早期前列腺癌受试者与其他受试者。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述其他受试者包括健康受试者、慢性前列腺炎受试者、急性前列腺炎受试者、前列腺增生受试者或其他前列腺癌可疑的受试者。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述其他前列腺癌可疑的受试者为其它临床体征、临床检验、临床检查提示前列腺癌可疑的受试者。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述临床体征包括直肠指诊触及可疑结节；所述临床检验包括血清总PSA、游离PSA或游离PSA与总PSA的比值不在正常范围内；所述临床检查包括B超可见可颖回声，CT或MRI检查可见可疑病灶，或其它检查提示前列腺内可疑病灶。
6.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述预后评估包括预测受试者的临床进展。
7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述临床进展为治疗后的复发或转移。
8.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述临床进展为术后复发或术后转移。
9.根据权利要求7或8所述的应用，其特征在于，所述复发为生化复发。
10.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述预后评估包括预测受试者术后生化复发的时间早晚。
11.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述外泌体为血液、血清或血浆外泌体。
12.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述检测试剂包括外泌体提取试剂和lncRNA malat1的检测试剂。
13.根据权利要求12所述的应用，其特征在于，所述lncRNA malat1的检测试剂包括用于PCR的上、下游引物和检测探针。
14.根据权利要求13所述的应用，其特征在于，所述检测探针的5’端标记荧光基团，3’端标记MGB修饰基团。
15.根据权利要求14所述的应用，其特征在于，所述荧光基团为FAM荧光基团。
16.根据权利要求13所述的应用，其特征在于，所述上、下游引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO：1-2所示，所述检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO：14所示。
17.根据权利要求1~16任一项所述应用制备而成的用于前列腺癌早期诊断和/或预后评估的试剂和/或试剂盒。
18.根据权利要求17所述的试剂和/或试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括以下一种或多种：DNA聚合酶、PCR缓冲液、阳性对照品和阴性对照品。
19.根据权利要求18所述的试剂和/或试剂盒，其特征在于，所述阳性对照品为核酸标准品，所述核酸标准品的核苷酸序列如SEQ ID NO：15所示，所述阴性对照品为DNase-free和RNase-free的纯水。
20.一种用于前列腺癌的早期诊断和/或预后评估系统，其特征在于，所述系统包括受试者信息获取模块，所述系统还包括早期诊断模块和/或预后评估模块，其中：
所述受试者信息获取模块，用于获取权利要求1~11任一项所述标志物的检测信息；
所述早期诊断和/或预后评估模块，用于根据所述标志物的检测信息诊断所述受试者是否为前列腺癌患者，或用于根据所述标志物的检测预测所述受试者的预后情况；
其中，所述诊断包括：如果所述标志物的检测信息超过阈值，则判定所述受试者罹患前列腺癌，否则则判定所述受试者未罹患前列腺癌，所述阈值为21.35拷贝数/μL血清样本；
所述预后评估包括：如果所述标志物的检测信息超过阈值，则判定所述受试者的预后不佳，否则则判定所述受试者的预后佳，所述阈值为20拷贝数/μL血清样本。
21.根据权利要求20所述的系统，其特征在于，所述预后评估包括评估受试者的复发情况。
22.根据权利要求21所述的系统，其特征在于，所述复发是指生化复发。
23.根据权利要求22所述的系统，其特征在于，所述预后评估包括预测受试者发生生化复发的时间的早晚。
24.根据权利要求20所述的系统，其特征在于，所述预后不佳为发生复发的时间早，所述预后佳是指发生复发的时间晚。
25.根据权利要求20~24任一项所述的系统，其特征在于，所述系统还包括检测模块和/或显示模块，其中，所述检测模块用于检测权利要求1~11任一项所述标志物。
26.根据权利要求25所述的系统，其特征在于，所述检测模块使用权利要求17~19任一项所述试剂和/或试剂盒检测权利要求1~11任一项所述标志物。
27.根据权利要求26所述的系统，其特征在于，所述显示模块用于展示早期诊断和/或预后评估结果。
28.根据权利要求27所述的系统，其特征在于，所述早期诊断和/或预后评估的结果通过显示器、打印或播报的方式展示。
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