CN103333912B - 在Pichia pastoris中组成型表达菌丝霉素衍生物MP1102的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种利用GAP启动子在毕赤酵母中组成型表达菌丝霉素衍生物MP1102的方法。本发明利用GAP启动子替换载体pPICMP1102中的AOX启动子,构建组成型重组表达载体pGAPMP1102并转化毕赤酵母X-33,获得的重组酵母经发酵培养,能够分泌产生MP1102。本发明首次实现菌丝霉素衍生物MP1102在毕赤酵母中组成型表达,经120小时培养后发酵液中总蛋白浓度达到387.6mg/L;发酵液上清经G25脱盐和SP离子交换层析后能够得到目标产物纯品,产量为105.84mg/L;经Genetools分析其纯度为95.13%。抑菌实验表明MP1102对金黄色葡萄球菌ATCC标准菌株有很强抑制作用,MP1102的MIC介于0.0028-0.11μM。本发明所述方法获得的MP1102可应用于抗菌药物、食品添加剂、化妆品、饲料添加剂等领域,具有广阔的应用价值和市场前景。
Description
技术领域
本发明涉及基因工程领域,具体地说,涉及利用组成型启动子PGAP在重组毕赤酵母中高效表达菌丝霉素衍生物MP1102的方法。
背景技术
菌丝霉素Plectasin是Mygind研究组利用从欧洲北部松林中分离出的腐生子囊类真菌Pseudoplectania nigrella构建cDNA文库,通过BLASTX和SSEARCHp序列相似性搜索程序,筛查到的具有高效抗G+菌活性抗菌肽。Plectasin基因编码含有95个氨基酸残基的多肽序列,其1-23是信号肽序列,24-55位为前导肽序列,56-95位为成熟肽(Plectasin)序列。Plectasin理论分子量为4407.9Da,具有六个组氨酸(His)和五个赖氨酸(Lys),在不同pH环境中,由于组氨酸解离状态不同,Plectasin的净电荷数在+1到+3之间变化(Mygind 等,Plectasin is a peptide antibiotic with therapeutic potential from a saprophytic fungus.Nature,2005,437(7061):975-980)。
Plectasin对革兰氏阳性细菌具有强烈杀伤作用。Mygind等研究了Plectasin对130余株不同来源肺炎链球菌的抑制作用,发现对于青霉素敏感或抗性菌株,最小杀菌浓度(MIC)均在0.028-1.818μM之间,MIC50为0.227μM。Gottlieb等(2008)研究Plectasin对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)杀菌能力,MIC值介于0.227和7.273μM,MIC50为1.82μM(Gottlieb等,Antimicrobial peptides effectively kill a broad spectrum of Listeria monocytogenes and Staphylococcus aureus strains independently of origin,sub-type,or virulence factor expression.BMC Microbiol,2008,8(1):205-214)。此外,Novozymes以Plectasin为母体,经易错PCR构建突变文库,从274个突变体中筛选到抗菌性 能大幅提高的突变体NZ2114,对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)临床分离菌株平均MIC仅为0.227μM,并且对耐万古霉素肠球菌(VRSA)也具有很强的抑制作用,MIC值仅为0.455-0.91μM。此外,杀菌动力学实验证明,Plectasin具有高效杀菌能力,5×MIC Plectasin在5h内能够杀灭99.9%供试病原菌。小鼠腹腔感染模型显示,10mg/kg Plectasin5h内杀菌效率相当于70mg/kg万古霉素,腹腔中病原菌数量减少3个数量级(相当于99.9%杀菌效率)。7天后对照组小鼠全部死亡,按10mg/kg Plectasin给药的小鼠存活率依给药频度不同介于80-100%。NZ2114在兔心内膜炎感染模型中的治疗效果也得到相似结论,10mg/kg NZ2114即可大于或等于15mg/kg万古霉素或12mg/kg达托霉素疗效,3天后相关脏器(肾脏,脾脏)中病原菌的数量减少99%以上(Xiong等,Efficacy of NZ2114,a novel plectasin-derived cationic antimicrobial peptide antibiotic,in experimental endocarditis due to methicillin-resistant Staphylococcus aureus.Antimicrobial Agents and Chemotherapy,2011,55(11):5325-5330)。
MP1102是中国农业科学院饲料研究所基因工程室设计的具有高效抗菌活性的Plectasin衍生肽,对G+菌,尤其是金黄色葡萄球菌具有很强的杀菌活性,而对G-菌没有抗菌活性。重组MP1102(rMP1102)对金黄色葡萄球菌ATCC25923MIC值为0.028μM,是Plectasin的3.7倍,rMP1102对金黄葡萄球菌ATCC43300(MRSA)也具有很强杀菌活性,MIC值仅为0.06μM,是万古霉素的47倍。经研究发现,rMP1102具有比NZ2114更强抗菌活性,对金黄葡萄球菌ATCC43300(MRSA)MIC值是rNZ2114的15倍(0.9μM/0.06μM),对金黄葡萄球菌ATCC29213MIC值是rNZ2114的2倍(0.11μM/0.06μM)。此外,rMP1102不具有溶血性,即便在浓度高达128μg/mL时对人红细胞的溶血活性仍低于0.1%。因此,MP1102能够作为安全的治疗金黄色葡萄球菌感染静脉注射药物,在医药及畜牧领域均有广泛的应用前景。
毕赤酵母表达系统因具有分泌表达、易于培养、拥有真核生物蛋白修饰系统等优势成为目前使用广泛的异源蛋白表达系统(Li等,Expression of recombinant proteins in Pichia pastoris.Applied Biochemistry and Biotechnology,2007,142(2):105-124)。但是,目前常用的甲醇脱氢酶启动子(PAOX)在表达目标产物时需添加具有生物安全性争议性的甲醇。3-磷酸甘油醛脱氢酶启动子(PGAP)是一种组成型启动子,文献报道异源蛋白分泌效率与AOX启动子相当(Waterham等,Isolation of the Pichia pastoris glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene and regulation and use of its promoter.Gene,1997,186(1):37-44),具有目的基因伴随细胞生长表达,不需进行诱导(Tang等,Pichia pastoris fermentation for phytase production using crude glycerol from biodiesel production as the sole carbon source.Biochemical Engineering Journal,2009,43(2):157-162);表达过程中不存在碳源阻遏效应(Cos等,Operational strategies,monitoring and control of heterologous protein production in the methylotrophic yeast Pichia pastoris under different promoters:A review.Microbial Cell Factories,2006,517-37);适合进行连续发酵生产(Potvin等,Bioprocess engineering aspects of heterologous protein production in Pichia pastoris:A review.Biochemical Engineering Journal,2012,64(0):91-105)等特点。
MP1102是具有理想抗菌活性的菌丝霉素衍生物,尚未见到利用毕赤酵母GAP启动子组成型表达MP1102的报道。
发明内容
本发明的目的是提供一种利用GAP启动子组成型表达菌丝霉素衍生物MP1102的方法。
为实现本发明目的,本发明提供了一种表达载体,其含有毕赤酵母组成型启动子GAP、位于启动子下游的编码信号肽的核苷酸序 列、编码菌丝霉素衍生物MP1102的基因序列和TAA,TAG终止子序列,所述编码MP1102的DNA序列5’端具有酵母Kex2切割识别序列AAGAGA。
所述菌丝霉素衍生物MP1102的氨基酸序列如SEQ IDNo.1所示。
优选地,所述编码菌丝霉素衍生物MP1102的基因序列按照酵母密码子偏爱性进行优化,具有如SEQ IDNo.2所示的核苷酸序列。
毕赤酵母组成型启动子GAP的核苷酸序列如SEQ IDNo.3所示。
前述表达载体中,在编码信号肽的核苷酸序列的3’端连接有XhoI酶切位点;在编码MP1102的DNA序列的3’端连接有XbaI酶切位点。
前述表达载体中,载体所用信号肽为α-因子分泌信号肽(α-MF),酿酒酵母转化酶信号肽(SUC2),毕赤酵母碱性磷酸酶信号肽(PHO1)或所需表达基因自身信号肽序列。
前述表达载体中,载体所用Kex2切割位点氨基酸信息为KR,或在Kex2切割位点N/C-端添加EAEA及其相似序列。
优选地,所述载体为重组表达载体pGAPMP1102,其构建方法包括如下步骤:
(1)设计并合成如下基因片段:在甘油醛3’-磷酸脱氢酶启动子(GAP启动子)序列5’端添加酶切位点BglII,在3’端依次添加α-因子分泌信号肽序列和XhoI酶切位点;
(2)用限制性内切酶BglII和XhoI分别对合成的基因片段和载体pUC57进行双酶切,回收pUC57载体片段和GAP启动子+α-因子分泌信号肽片段,连接,得到载体pUCGAP;
(3)用限制性内切酶XhoI和XbaI分别对MP1102基因片段(SEQ IDNo.2)和载体pPICZαA进行双酶切,回收pPICZαA载体片段和MP1102基因片段,连接,得到载体pPICMP1102;
(4)用限制性内切酶BglII和XhoI分别对载体pUCGAP和pPICMP1102进行双酶切,回收pPICMP1102载体片段和GAP启动子+α-因子分泌信号肽片段,连接,得到含有GAP启动子+α-因子分泌信号肽序列的MP1102重组表达载体pGAPMP1102。
步骤(1)中,合成的基因片段,其核苷酸序列如SEQ IDNo.4所示。
本发明还提供了含有上述重组表达载体的宿主细胞。
优选地,所述宿主细胞为酵母属细胞;进一步优选地,所述宿主细胞为毕赤酵母基因工程菌;最优选地,所述宿主细胞为毕赤酵母X-33基因工程菌。
其中,所述宿主细胞含有分泌通路因子(如Bip,PDI,Sec63,YDJ1p,Ssa1p等)共表达系统。
本发明还提供了重组毕赤酵母X-33基因工程菌Pichia pastorisX-33/GAPMP02,其通过如下方法构建:将重组表达载体pGAPMP1102用限制性内切酶AvrII作线性化处理,然后转化毕赤酵母X-33,获得重组毕赤酵母X-33基因工程菌。
本发明进一步提供了一种在重组毕赤酵母中表达菌丝霉素衍生物MP1102的方法,其是将获得的重组毕赤酵母Pichia pastorisX-33/GAPMP02发酵培养,分泌产生菌丝霉素衍生物MP1102。
所述发酵培养的方法为转化子摇瓶水平组成型表达培养或转化子发酵罐高密度组成型表达培养。
其中,转化子摇瓶水平组成型表达培养的方法如下:
挑取阳性转化子(重组毕赤酵母Pichia pastorisX-33/GAPMP02),接种至YPD液体培养基,30℃,250rpm振荡培养18-20h;0.5-1%接种量转接至50mL YPD液体培养基,30℃,250rpm振荡培养1d后以4层灭菌纱布替换玻璃纸封口膜包裹摇瓶口,30℃, 250rpm振荡培养3-5d至发酵结束。
其中,转化子发酵罐高密度组成型表达培养的方法如下:
(1)种子液的制备及接种上罐
挑取阳性转化子(重组毕赤酵母Pichia pastorisX-33/GAPMP02),接种至含100μg/mL Zeocin的YPD液体培养基,30℃,250rpm振荡培养18-20h;0.5-1%接种量转接至YPD液体培养基,30℃,250rpm振荡培养至OD600为4-6,火焰保护下接种至SARTORIUS发酵罐中(含基础盐培养基,其中PMT1终浓度为4.8‰);维持发酵罐转速800rpm,pH5.0,通气量8L/min,溶氧维持于20%以上,培养温度29℃;
(2)菌体的补料生长和产物的组成型表达
观测溶氧值缓慢下降(18-20h)后突然上升,调整发酵液pH值为5.5,转速为1000rpm并开始补加含有12‰PMT1的50%葡萄糖,补加过程由0h的1mL L-1h-1线性增加到6h的3-3.5mL L-1h-1,直至5天后发酵结束。
其中,步骤(1)中使用的基础盐培养基配方为:45g/L葡萄糖、50g/L NH4H2PO4、20g/L K2SO4、15g/L MgSO47H2O、6g/L KH2PO4、0.4g/L CaSO4和1.5g/L KOH。
本发明还提供了由上述基因工程菌分泌的菌丝霉素衍生物MP1102的纯化方法,其包括对发酵液进行脱盐、冷冻干燥、复溶、离子交换层析等步骤。
具体地,菌丝霉素衍生物MP1102的纯化方法包括如下步骤:
(1)G25除盐
收集发酵上清液,冻干后去离子水复溶,Bradford法测定蛋白浓度,4℃,13000rpm离心5min后取上清;在AKTA上用脱盐柱Sephadex G-25进行除盐,上样量4mL,流速8mL/min,除盐后冻干;
(2)阳离子交换层析纯化
Bradford法测定蛋白浓度,4℃,13000rpm离心5min后取上清;将HiTrap SP FF阳离子交换柱利用磷酸盐缓冲液A液平衡5-10个柱体积后上样,上样量为500μL;进样完毕后,利用含有1M NaCl的50mM,pH5.7的磷酸盐洗脱缓冲液B液进行梯度洗脱;
洗脱步骤为:70%A液,30%B液,洗脱5个柱体积;40%A液,60%B液,洗脱5个柱体积;100%B液,洗脱5个柱体积;利用UV215nm监测洗脱情况并收集洗脱峰。
本发明还提供了由所述方法纯化获得的菌丝霉素衍生物MP1102在制备抗菌药物、食品添加剂、化妆品、饲料添加剂中的应用。
本发明还提供了一种利用GAP启动子在毕赤酵母中组成型表达菌丝霉素衍生物MP1102的方法。本发明利用GAP启动子替换载体pPICMP1102中的AOX启动子,构建组成型重组表达载体pGAPMP1102并转化毕赤酵母X-33,获得的重组酵母经发酵培养,能够分泌产生MP1102。
本发明首次实现菌丝霉素衍生物MP1102在毕赤酵母中组成型表达,产物随菌体生长而积累,经120小时培养后发酵液中总蛋白浓度达到387.6mg/L,可实现规模化生产;发酵液上清经G25脱盐和SP离子交换层析后能够得到目标产物纯品,产量为105.84mg/L;经Genetools分析其纯度为95.13%。抑菌实验表明MP1102对金黄色葡萄球菌ATCC标准菌株有很强抑制作用。MP1102的MIC介于0.0028-0.11μM。本发明所述方法获得菌丝霉素衍生物MP1102可应用于抗菌药物、食品添加剂、化妆品、饲料添加剂等领域,具有广阔的应用价值和市场前景。
附图说明
图1为本发明实施例1中重组表达载体pGAPMP1102示意图。
图2为本发明实施例1中含有pGAPMP1102的大肠杆菌DH5α重组子菌落PCR电泳图,其中,M:DNA分子量Marker;1-5:含有pGAPMP1102的大肠杆菌重组子。
图3为本发明实施例2中线性化重组载体电泳图,其中,M:DNA marker;1-3:pGAPMP1102线性化产物。
图4为本发明实施例2中基因组中整合有pGAPMP1102重组酵母菌落PCR电泳图,其中,M:DNA Marker,1-5:含有pGAPMP1102的毕赤酵母X-33重组子。
图5为本发明实施例3中MP1102摇瓶水平组成型表达Tricine-SDS-PAGE电泳图,其中,M:超低分子量蛋白Marker;1-5:不同阳性转化子诱导96小时发酵液上清;6:空载体诱导96小时发酵液上清。
图6为本发明实施例4中发酵罐水平组成型表达MP1102的Tricine-SDS-PAGE检测,M:超低分子量蛋白Marker;1-6:10μL培养0,24,48,72,96,120小时的发酵液上清。
图7为本发明实施例4中发酵罐水平组成型表达MP1102的抑菌活性检测,1-11:30μL培养0,12,24,36,48,60,72,84,96,108,120小时的发酵液上清;供试菌株为金黄色葡萄球菌ATCC25923。
图8为本发明实施例4中发酵罐水平组成型表达MP1102菌体湿重和发酵液上清总蛋白浓度曲线。
图9为本发明实施例5中MP1102的分离纯化,M:超低分子量蛋白Marker;1、2:10μL纯化后MP1102。
图10为本发明实施例5中MP1102纯化后的MALDI-TOF MS分析。
具体实施方式
以下实施例用于说明本发明,但不用来限制本发明的范围。在 不背离本发明精神和实质的情况下,对本发明方法、步骤或条件所作的修改或替换,均属于本发明的范围。
若未特别指明,本发明实施例中所用的实验材料、试剂和仪器等均可市售获得,若未具体指明,实施例中所用的技术手段均为本领域技术人员所熟知的常规手段。
下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,如Sambrook等分子克隆实验手册(New York:Gold Spring Harbor Laboratory Press,1989)。
以下实施例中使用的酶和试剂:限制性内切酶、pfuDNA聚合酶、T4DNA连接酶等分别购自Biolabs、Invitrogen和Promega公司。四种dNTP购自Promega公司。DNA和蛋白质分子量标准为Biolabs产品。其它常规试剂采用进口分装或国产分析纯。
以下实施例中涉及的培养基和缓冲液配方:
LB培养基:胰蛋白胨10g/L,酵母浸提取物5g/L,NaCl10g/L;固体LB培养基则加入2%的琼脂糖。
低盐LB培养基:胰蛋白胨10g/L,酵母浸提取物5g/L,NaCl5g/L;固体低盐LB培养基则加入2%的琼脂粉。
MH培养基:酪蛋白水解物17.5g/L,牛肉浸粉5g/L,淀粉1.5g/L。
MHA培养基:MH培养基中加入2%的琼脂粉。
YPD培养基:蛋白胨20g/L,酵母浸提取物10g/L,葡萄糖20g/L;固体YPD培养基则加入2%琼脂粉。
YPDS培养基:蛋白胨20g/L,酵母浸提取物10g/L,山梨醇182.2g/L,葡萄糖20g/L,琼脂粉20g/L。
有关LB培养基、低盐LB、MH、YPD、YPDS等培养基的使用参照Invitrogen毕赤酵母操作手册。
20mM磷酸盐缓冲液(A液):0.465g Na2HPO4,2.917g NaH2PO4,加去离子水至950mL,置于磁力搅拌器至完全溶解后调pH5.7,定容至1000mL。
1M NaCl20mM磷酸盐缓冲液(B液):0.465g Na2HPO4,2.917g NaH2PO4,58.44g NaCl,加去离子水至950mL,置于磁力搅拌器至完全溶解后调pH5.7,定容至1000mL。
以下实施例中涉及的基因扩增及转化子鉴定方法为PCR法及DNA测序法。
以下实施例中涉及的蛋白检测方法为Tricine-SDS-PAGE,参照(H.Tricine–SDS-PAGE.Nat protoc,2006,1(1):16-22)。
以下实施例中涉及的蛋白质浓度测定方法为考马斯亮蓝法。
以下实施例中涉及的蛋白分子量的确定方法为MALDI-TOF MS法。
以下实施例中涉及的蛋白纯化的方法为基于离子层析法。
以下实施例中涉及的发酵方法为高密度发酵法。
以下实施例中涉及的菌种和质粒概述于表1:
表1供试菌种和质粒
实施例1毕赤酵母组成型表达载体pGAPMP1102的构建
(1)设计并合成如下基因片段:依据Invitrogen公司提供的甘油醛3’-磷酸脱氢酶启动子(GAP)序列,分别在序列5’端添加酶切位点BglII,在3’端依次添加α-因子分泌信号肽序列和XhoI酶切位点,将设计的基因序列送交上海生工生物工程有限公司合成,合成的基因片段的核苷酸序列如SEQ IDNo.4所示,GAP启动子序列的核苷酸序列如SEQ IDNo.3所示;
(2)用限制性内切酶BglII和XhoI分别对合成的基因片段和载体pUC57进行双酶切,回收pUC57载体片段和GAP启动子+α-因子分泌信号肽片段,连接,得到载体pUCGAP;
(3)用限制性内切酶XhoI和XbaI分别对MP1102基因片段(SEQ IDNo.2)和载体pPICZαA进行双酶切,回收pPICZαA载体片段和MP1102基因片段,连接,得到载体pPICMP1102;
(4)用限制性内切酶BglII和XhoI分别对载体pUCGAP和pPICMP1102进行双酶切,回收pPICMP1102载体片段和GAP启动子+α-因子分泌信号肽片段,连接,得到含有GAP启动子+α-因子分泌信号肽序列的MP1102重组表达载体pGAPMP1102,载体主要信息如图1所示。
载体pGAPMP1102详细构建过程:利用限制性内切酶BglII和XhoI分别对pUCGAP和pGAPMP1102进行双酶切,酶切体系和条件如下:
以上酶切体系加样完毕后于37℃反应3个小时,2%琼脂糖凝胶电泳检测,电泳条件:120V,30min。电泳完毕在紫外灯下利用手术刀分别切割pPICMP1102载体片段与GAP启动子+α-因子分泌信号肽片段对应的电泳条带并利用天根生物技术有限公司胶回收试剂盒进行DNA片段回收,按试剂盒提供说明书的相关细节进行操作。
利用琼脂糖凝胶电泳检测回收片段并使用定量软件(GeneTools)进行初步定量,按照片段/载体(3:1)的摩尔比例使用T4DNA连接酶进行连接,体系和条件如下:
以上连接体系加样完毕后于金属浴22℃反应2小时,转化E.coli DH5α。转化操作细节如下:
1)连接产物加入100μL E.coli DH5α感受态细胞,冰浴30min
2)42℃热激90s,立即冰浴2-3min
3)加入900μL37℃预热的LB低盐培养基,37℃,80-100rpm恢复培养1h
4)5000rpm离心2min,吸去700μL上清
5)重悬菌体后取100-200μL涂布含有25μg/mL Zeocin的LB低盐固体培养基
6)37℃倒置培养12-16h。
挑取阳性转化子,根据GAP启动子和MP1102序列设计引物,进行菌液PCR验证转化子正确性,引物序列、PCR体系、条件如下:
引物序列:GAPF: AGATCTTTTTTGTAGAAATGTCTTG(SEQ IDNo.5)
GAPR: GCGGCCGCCTATTAGTAACACTTAC(SEQ IDNo.6)
PCR体系:
PCR条件:
2 %琼脂糖凝胶电泳检测阳性转化子菌液PCR产物,电泳条件:120V,30min。15%甘油管保存含有重组表达载体的E.coli并提取质粒为线性化电转P. pastoris准备,相关实验细节按照质粒提取试剂盒(购自天根生物科技有限公司)说明书操作。
PCR扩增结果显示在700-900 bp左右处出现目的条带(图2),与理论大小(879 bp)相符合。挑取阳性转化子进一步测序验证,将 序列信息与设计相符的重组载体命名为pGAPMP1102。
实施例2含pGAPMP1102重组酵母菌株的构建
2.1重组载体pGAPMP1102的线性化
利用AvrII对组成型重组表达载体pGAPMP1102进行酶切,酶切体系和反应条件如下:
以上酶切体系加样完毕后于37℃反应3个小时,2 %琼脂糖凝胶电泳检测,电泳条件:120 V,30 min。电泳完毕检测重组表达载体正确线性化后利用DNA回收试剂盒回收线性化的重组表达载体pGAPMP1102。
电泳结果显示,重组载体线性化效果好(图3),几乎不存在未切割载体和星号活性,大小在5000 bp与3000 bp之间,与理论大小(3186 bp)相符。
2.2线性化载体的毕赤酵母电转化与鉴定
1)挑取YPD平板上的X-33单菌落,接种至10 mLYPD液体培养基,30℃,250 rpm,过夜培养;
2)取50 μL过夜培养液接种至100 mLYPD液体培养基,30℃,250 rpm,培养至OD600吸光值为1.2左右;
3)50 mL培养物,4℃,4000 rpm,5 min离心后加入50 mL无菌水重悬;
4)4℃,4000 rpm,5 min离心后加入25 mL无菌水重悬;
5)4℃,4000rpm,5min离心后加入2mL1M山梨醇重悬;
6)4℃,4000rpm,5min离心后加入100μL1M山梨醇重悬后即为X-33感受态细胞(以上6步操作须在冰上操作,动作轻柔);
7)预混80 μL X-33感受态细胞和5-10 μg线性化载体,转移至冰上预冷的0.2 cm电转杯中,冰上放置5 min后电转仪操作(1200 V,25 μF,400 Ω);
8)立即加入1mL 1M山梨醇,混匀;
9)30℃温育1-2 h;
10)取100 μL温育后的X-33细胞涂布含有100 μg/mL Zeocin的YPDS平板,30℃倒置培养2-4天。
挑取YPDS平板上的单菌落接种至100 μg/mL Zeocin的YPD液体培养基中,30℃,250 rpm,过夜培养。取1 mL过夜培养物4℃,12000 rpm,5 min离心后PBS重悬,沸水浴10 min,快速放置于-70℃30 min,立即再次沸水浴10 min,4℃,12000 rpm,5 min离心后取上清作为模板进行PCR验证阳性转化子,PCR体系与条件如下:
PCR体系:
PCR条件:
2%琼脂糖凝胶电泳检测阳性转化子菌液PCR产物,电泳条件:120V,30min。将大小正确的阳性转化子一一对应转移至含有100μg/mL Zeocin的YPD平板上以备进一步表达。
结果显示,转化子阳性克隆率高,重组酵母PCR条带大小在700-900bp(图4),均与理论大小(879bp)相符,表明目的基因已整合到酵母基因组中,获得重组酵母Pichia pastorisX-33/GAPMP02。实施例3摇瓶水平组成型表达MP1102重组酵母菌株筛选
3.1转化子摇瓶水平组成型表达
挑取阳性转化子,接种至YPD液体培养基,30℃,250rpm振荡培养18-20h,0.5-1%接种量转接至50mL YPD液体培养基,30℃,250rpm振荡培养1天后,以4层灭菌纱布替换玻璃纸封口膜包裹摇瓶口,30℃,250rpm振荡培养3-5天至发酵结束。
3.2重组酵母发酵液抗菌活性检测
抑菌圈实验分析(Zhang等,Expression of plectasin in Pichia pastoris and its characterization as a new antimicrobial peptide against Staphyloccocus and Streptococcus.Protein Expression and Purification,2011,78(2):189-196)被用来检测重组酵母发酵液抗金黄色葡萄球菌活性。S.aureus ATCC25923作为受试菌。挑取S.aureus ATCC25923单菌落接种于10mL MH培养基中,37℃,250rpm培养OD600nm=0.4,1%接种量转移至50mL MH培养基中,混匀,迅速倒19cm×19cm的方形培养皿中,待凝固后,在培养基表面小心放置牛津杯,分别加入50μL发酵液上清。
3.3重组酵母发酵液抗菌效价检测
二倍稀释法,将样品用无菌水进行二倍梯度稀释,每个稀释梯度取10μL点至已接种S.aureus ATCC25923的MHA平板,能够形成明显抑菌圈的最高稀释度的倒数为一个rAgP效价单位,样品的rAgP效价为:稀释度×100,单位为AU/mL(O’Keeffe等,Characterization and heterologous expression of the genes encoding enterocin a production,immunity,and regulation inenterococcus faecium DPC1146.Applied and Environmental Microbiology,1999,65(4):1506-1515;Liu等,Controlling Listeria monocytogenes in Cottage cheese through heterologous production of enterocin A by Lactococcus lactis.Journal of Applied Microbiology,2008,104(4):1059-1066)。
3.4重组酵母分泌蛋白水平Tricine-SDS-PAGE检测
对所获得的高活性重组酵母菌株进一步采用Tricine-SDS-PAGE分析重组MP1102表达水平,电泳方法参照(,2006)。
电泳结果显示,培养重组酵母Pichia pastorisX-33/GAPMP02能够组成型分泌表达目标蛋白,条带大小在4.6Da左右,与理论大小(4.38kDa)相符,空载体对照在此处未发现条带(图5),发酵液中最高总蛋白浓度为134.8mg/L,效价为7200AU/mL。
实施例4发酵罐水平高密度发酵表达重组MP1102
1)种子液的制备及接种上罐
挑取阳性转化子,接种至含100μg/mL Zeocin的YPD液体培养基,30℃,250rpm振荡培养18-20h,0.5-1%接种量转接至YPD液体培养基,30℃,250rpm振荡培养至OD600为4-6,火焰保护下接种至SARTORIUS发酵罐中(含基础盐培养基,PMT1终浓度为4.8‰)。维持发酵罐转速800rpm,pH5.0,通气量8L/min,溶氧维持于20%以上,培养温度29℃。
基础盐培养基配方为:45g/L葡萄糖、50g/L NH4H2PO4、20g/L K2SO4、15g/L MgSO47H2O、6g/L KH2PO4、0.4g/L CaSO4和1.5g/LKOH。
2)菌体的补料生长和产物的组成型表达
观测溶氧值缓慢下降(约18-20h)后突然上升,调整发酵液pH值为5.5,转速为1000rpm并开始补加含有12‰PMT1的50%葡萄糖,补加过程由0h的1mL L-1h-1线性增加到6h的3-3.5mL L-1h-1,直至5天后发酵结束。发酵液上清抗菌活性、抗菌效价和重组蛋白分泌水平检测按实施方式3.2、3.3和3.4操作。
从接种开始,每隔12h取样,检测菌体湿重和蛋白表达情况分析,及抗菌活性分析。图6为5L发酵罐水平组成型表达MP1102的Tricine-SDS-PAGE检测。图7为5L发酵罐水平组成型表达MP1102的抑菌活性检测。图8为5L发酵罐水平组成型表达MP1102菌体湿重和发酵液上清总蛋白浓度曲线。结果显示随着菌体持续生长(108h达到最大值279.25g/L),发酵液上清抑菌能力逐步增强(图7),抑菌效价在120小时达到最大值32000AU/mL。目的蛋白MP1102持续大量表达并积累(图6箭头所示),发酵液中总蛋白浓度也持续上升,96h达到最大值387.61mg/L(图8)。
实施例5重组MP1102的纯化
1)G25除盐
收集发酵上清液,冻干后去离子水复溶,Bradford法测定蛋白浓度,4℃,13000rpm离心5min后取上清。在AKTA上用脱盐柱Sephadex G-25(Bed volume,53ml;GE Healthcare)进行除盐,上样量4mL,流速8mL/min,除盐后冻干。
2)阳离子交换层析纯化
Bradford法测定蛋白浓度,4℃,13000rpm离心5min后取上清。将HiTrap SP FF阳离子交换柱(长度25mm,内径7mm,GE Healthcare)利用A液平衡5-10个柱体积后上样,上样量为500μL。 进样完毕后,利用含有1M NaCl的50mM,pH5.7的磷酸盐洗脱缓冲液(B液)进行梯度洗脱。洗脱步骤为:70%A液,30%B液,洗脱5个柱体积;40%A液,60%B液,洗脱5个柱体积;100%B液,洗脱5个柱体积。利用UV215nm监测洗脱情况并收集洗脱峰,Tricine-SDS-PAGE和抑菌圈实验检测rAgP纯化情况。
如图9所示,经G25脱盐和SP阳离子纯化后,能够得到具有单一条带的MP1102纯品,产量为105.84mg/L。经Genetools分析纯度为95.13%。
图10为MALDI-TOF MS分析纯化后MP1102分子量。如图10所示,MP1102组成型表达发酵液上清纯化后的质谱鉴定分子量为4382.9Da,与理论分子量(4383.0Da)相符。
实施例6重组MP1102抗金黄色葡萄球菌活性检测
6.1MIC实验
重组MP1102和万古霉素对病原菌的最小抑菌浓度(MIC)参照Tian等(Tian等,Expression of antimicrobial peptide LH multimers in Escherichia coli C43(DE3).Applied Microbiology and Biotechnology,2009,83(1):143-149)建立的微量肉汤稀释法,根据具有情况略有改动,操作细节如下:
1)挑取供试菌株(S.aures ATCC25923,S.aures ATCC6538,S.aures ATCC29213,S.aures ATCC43300)单克隆至MH培养基,37℃,250rpm,振荡过夜培养;
2)将抗菌药物(MP1102和万古霉素)按2倍梯度系列稀释至1.5mL无菌离心管中,浓度分别是终浓度的10倍;
3)以1%的接种量分别将供试菌株转接至MH液体培养基中37℃,250rpm振荡培养至0.5个麦氏标准比浊;
4)稀释供试菌培养液1000倍(最终菌体浓度为105CFU/mL左右),转移至无菌细胞培养板中,每孔含稀释后菌液90μL;
5)加入稀释后的药物10μL,每个浓度3个平行样,并预留无药物阴性对照孔。加无菌培养板板盖,封口膜封闭后37℃静止培养至阴性对照空出现肉眼可见的明显浑浊菌液。将细胞培养板取出,观测结果,MIC值是能够明显抑制受试菌株生长的最小浓度。如出现跳孔或平行样间结果不一致情况,则重新测试。
6.2MBC实验:
在MIC及前后各3个浓度梯度和阴性对应孔内取培养液10μL,稀释合适倍数后涂布MHA平板,37℃静止培养16-18个小时后取出计算菌落数,将菌落数低于对照菌液99.9%的对应浓度定义为最小杀菌浓度(MBC)。测定结果如表2所示。
表2MP1102对金黄色葡萄球菌活性检测结果
结果显示,MP1102对金黄色葡萄球菌有较强抑制作用。MP1102对金黄色葡萄球菌的MIC介于0.0028-0.11μM。MP1102抑菌能力均强于万古霉素,同时,MP1102对病原菌MBC是MIC值的1-2倍,因此可推断MP1102对临床分离MRSA的作用是直接杀灭而非简单抑制病原菌生长(Gottlieb等,ntimicrobial peptides effectively kill a broad spectrum of Listeria monocytogenes and Staphylococcus aureus strains independently of origin,sub-type,or virulence factor expression.BMC Microbiol,2008,8(1):205-214)。
虽然,上文中已经用一般性说明、具体实施方式及试验,对本发明作了详尽的描述,但在本发明基础上,可以对之作一些修改或改进,这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此,在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进,均属于本发明要求保护的范围。
Claims (11)
1.一种表达载体,其特征在于,含有毕赤酵母组成型启动子GAP、位于启动子下游的编码信号肽的核苷酸序列、编码菌丝霉素衍生物MP1102的基因序列和TAA,TAG终止子序列;
所述菌丝霉素衍生物MP1102的氨基酸序列如SEQ IDNo.1所示;所述编码菌丝霉素衍生物MP1102的核苷酸序列如SEQ IDNo.2所示。
2.根据权利要求1所述的载体,其特征在于,载体所用信号肽为α-因子分泌信号肽α-MF,酿酒酵母转化酶信号肽SUC2,毕赤酵母碱性磷酸酶信号肽PHO1。
3.根据权利要求1所述的载体,其特征在于,所述载体在编码信号肽的核苷酸序列的3’端连接有XhoI酶切位点;在编码MP1102的DNA序列的3’端连接有XbaI酶切位点。
4.根据权利要求1-3任一项所述的载体,其特征在于,所述载体为重组表达载体pGAPMP1102,其构建方法包括如下步骤:
(1)设计并合成如下基因片段:在甘油醛3’-磷酸脱氢酶启动子GAP序列5’端添加酶切位点BglII,在3’端依次添加α-因子分泌信号肽序列和XhoI酶切位点;
(2)用限制性内切酶BglII和XhoI分别对合成的基因片段和载体pUC57进行双酶切,回收pUC57载体片段和GAP启动子+α-因子分泌信号肽片段,连接,得到载体pUCGAP;
(3)用限制性内切酶XhoI和XbaI分别对MP1102基因片段和载体pPICZαA进行双酶切,回收pPICZαA载体片段和MP1102基因片段,连接,得到载体pPICMP1102;
(4)用限制性内切酶BglII和XhoI分别对载体pUCGAP和pPICMP1102进行双酶切,回收pPICMP1102载体片段和GAP启动子+α-因子分泌信号肽片段,连接,得到重组表达载体pGAPMP1102。
5.含有权利要求1-4任一项所述表达载体的宿主细胞。
6.根据权利要求5所述的宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞为酵母属细胞。
7.根据权利要求6所述的宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞为毕赤酵母基因工程菌。
8.根据权利要求7所述的宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞为毕赤酵母X-33基因工程菌。
9.根据权利要求5所述的宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞含有分泌通路因子Bip、PDI、Sec63、YDJ1p或Ssa1p共表达系统。
10.根据权利要求5所述的宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞为重组毕赤酵母X-33基因工程菌Pichia pastorisX-33/GAPMP02,其构建方法为将权利要求5所述的重组表达载体pGAPMP1102用限制性内切酶AvrII作线性化处理,然后转化毕赤酵母X-33,获得重组毕赤酵母X-33基因工程菌。
11.一种在重组毕赤酵母中表达菌丝霉素衍生物MP1102的方法,其特征在于,将权利要求10所述的重组毕赤酵母PichiapastorisX-33/GAPMP02发酵培养,分泌产生菌丝霉素衍生物MP1102。
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