CN103276054A - 用于辅助检测大豆百粒重的引物和检测方法 - Google Patents

用于辅助检测大豆百粒重的引物和检测方法 Download PDF

Info

Publication number
CN103276054A
CN103276054A CN2013100790369A CN201310079036A CN103276054A CN 103276054 A CN103276054 A CN 103276054A CN 2013100790369 A CN2013100790369 A CN 2013100790369A CN 201310079036 A CN201310079036 A CN 201310079036A CN 103276054 A CN103276054 A CN 103276054A
Authority
CN
China
Prior art keywords
soybean
primer
grain
grain weight
detecting
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN2013100790369A
Other languages
English (en)
Other versions
CN103276054B (zh
Inventor
王晓波
邱丽娟
李英慧
司红起
常成
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Anhui Agricultural University AHAU
Original Assignee
Anhui Agricultural University AHAU
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Anhui Agricultural University AHAU filed Critical Anhui Agricultural University AHAU
Priority to CN201310079036.9A priority Critical patent/CN103276054B/zh
Publication of CN103276054A publication Critical patent/CN103276054A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN103276054B publication Critical patent/CN103276054B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种用于辅助检测大豆百粒重的引物，包括如下一对引物：F：CGCCTTACTCTGTATCTTCT；R：CACCTCTTCCTCACTCCT。本发明还提供了一种检测大豆百粒重的方法，包括以下步骤：以待测大豆基因组DNA 为模板，将上述引物对上述DNA模板进行PCR 扩增；PCR扩增产物进行酶切，检测酶切产物中是否有238bp和181bp两条带，若酶切产物中有238bp和181bp两条带，上述待测大豆为大籽粒，若扩增产物中无238bp和181bp两条带，上述待测大豆为小籽粒。本发明的优点在于，可以通过对育种材料进行筛选，淘汰无238bp和181bp目标条带的亲本或育种中间材料，极大的提高了育种过程中选择高百粒重大豆品种的效率，对于高产大豆品种的培育效果显著。

Description

用于辅助检测大豆百粒重的引物和检测方法
技术领域
本发明涉及一种用于辅助检测大豆百粒重的引物和检测方法。
背景技术
大豆是我国主要农作物之一，已成为世界上最丰富、物美价廉的蛋白质与油脂资源，是具有高经济与营养性的农作物，在国际市场上的需求日益增多。百粒重是大豆产量构成的重要因素，与产量呈正相关，是大豆育种中重要的育种目标。大豆百粒重既是一个遗传力较高的性状，也是一个对外界环境比较敏感的性状，由多个因素共同作用的结果。大豆在进化过程中籽粒大小发生了显著改变，百粒重从野生豆的3-4g进化到地方品种12-15g再到目前主要育成品种的18-20g，增加约6-7倍，是大豆在进化过程中受到人工驯化的典型性状之一(Liu etal., 2007)。由于控制大豆籽粒大小的基因（QTLs）数目众多，近20年来已经报道了65个大豆百粒重QTLs，(Liu et al., 2007; Xuet al., 2011; Han et al., 2012; Sun et al., 2012)，大豆群体遗传学研究进展缓慢，以及大豆特殊生理特征（严格自花授粉、花期分散等）决定了通过正向遗传学克隆控制大豆籽粒大小功能基因相对困难，单纯利用传统方法遗传改良效率不高，利用分子标记方法进行关键基因型的辅助选择不仅不受环境和育种世代的影响，而且大大提高了育种选择的目的性和针对性，有助于提高大豆百粒重的育种效率。但目前报道的多为与目标性状连锁的SSR标记，受遗传背景影响较大，并且操作复杂，实际利用程度不高，功能基因的缺乏导致难以在育种实践中有效开展分子标记辅助选育。
发明内容
本发明要解决的技术问题之一是提供一种用于辅助检测大豆百粒重的引物。
本发明是通过以下技术方案来实现的。
一种用于辅助检测大豆百粒重的引物，包括如下一对引物：
F：CGCCTTACTCTGTATCTTCT；
R：CACCTCTTCCTCACTCCT。
本发明要解决的技术问题之二是提供一种用于辅助检测大豆百粒重的方法。
一种检测大豆百粒重的方法，包括以下步骤：
（1）以待测大豆基因组DNA 为模板，将上述引物对上述DNA模板进行PCR 扩增；
（2）PCR扩增产物进行酶切，检测酶切产物中是否有238bp和181bp两条带，若酶切产物中有238bp和181bp两条带，上述待测大豆为大籽粒，若扩增产物中无238bp和181bp两条带，上述待测大豆为小籽粒。
进一步地，上述步骤（2）中，PCR扩增产物用Sau3A I 内切酶进行酶切。
本发明的有益效果：
可以通过对育种材料进行筛选，淘汰无238bp和181bp目标条带的亲本或育种中间材料，极大的提高了育种过程中选择高百粒重大豆品种的效率，对于高产大豆品种的培育效果显著。
附图说明
图1为实施案例2琼脂糖凝胶电泳的示意图。
具体实施方式
下面根据实施例对本发明作进一步详细说明。
实施案例1：
本发明，一种用于辅助检测大豆百粒重的引物，包括如下一对引物：
F：CGCCTTACTCTGTATCTTCT；
R：CACCTCTTCCTCACTCCT。
实施案例2：
一种检测大豆百粒重的方法，包括以下步骤：
（1）以待测大豆基因组DNA 为模板，将上述引物对上述DNA模板进行PCR 扩增；
其中，20μL PCR 扩增反应体系的组成为:1×ex-Taq PCR 缓冲液、dNTP 各0.2mM、ex-Taq DNA 聚合酶1U、上下游引物各10pM 、模板DNA 50ng; 反应条件为:首先95℃变性5min; 然后95℃变性45s，退火40s ，72℃延伸50s，共循环30次;最后72℃延伸8min;所述退火的温度，在第一个循环中是62℃，以后每循环降低0.3℃。
（2）PCR扩增产物用Sau3A I 内切酶进行酶切，检测酶切产物中是否有238bp和181bp两条带，是以酶切产物通过1.5%的琼脂糖凝胶电泳进行检测，若酶切产物中有238bp和181bp两条带，上述待测大豆为大籽粒，若扩增产物中无238bp和181bp两条带，上述待测大豆为小籽粒。
其中，20ul酶切反应体系的组成为：1×H Buffer，PCR产物800ng，5U Sau3A I 内切酶，37℃酶切3小时。
参照图1，M：marker
1-5：野1、野2、野3、野4、东山69
6-10：早熟18、绥农14号、铁丰18、绥农20、冀豆12
Figure BDA0000291137361
注：野表示野生大豆
上述实施例只为说明本发明的技术构思及特点，其目的在于让熟悉此领域技术的人士能够了解本发明内容并加以实施，并不能以此限制本发明的保护范围。凡根据本发明精神实质所作的等效变化或修饰，都应涵盖在本发明的保护范围内。
Figure IDA00003499702300011

Claims (3)

1.一种用于辅助检测大豆百粒重的引物，其特征在于，包括如下一对引物：
F：CGCCTTACTCTGTATCTTCT；
R：CACCTCTTCCTCACTCCT。
2.一种检测大豆百粒重的方法，其特征在于，包括以下步骤：
（1）以待测大豆基因组DNA 为模板，将上述引物对上述DNA模板进行PCR 扩增；
（2）PCR扩增产物进行酶切，检测酶切产物中是否有238bp和181bp两条带，若酶切产物中有238bp和181bp两条带，上述待测大豆为大籽粒，若扩增产物中无238bp和181bp两条带，上述待测大豆为小籽粒。
3.根据权利要求2所述的检测大豆百粒重的方法，所述步骤（2）中，PCR扩增产物用Sau3A I 内切酶进行酶切。
CN201310079036.9A 2013-03-13 2013-03-13 用于辅助检测大豆百粒重的引物和检测方法 Expired - Fee Related CN103276054B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201310079036.9A CN103276054B (zh) 2013-03-13 2013-03-13 用于辅助检测大豆百粒重的引物和检测方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201310079036.9A CN103276054B (zh) 2013-03-13 2013-03-13 用于辅助检测大豆百粒重的引物和检测方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN103276054A true CN103276054A (zh) 2013-09-04
CN103276054B CN103276054B (zh) 2014-08-20

Family

ID=49058670

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201310079036.9A Expired - Fee Related CN103276054B (zh) 2013-03-13 2013-03-13 用于辅助检测大豆百粒重的引物和检测方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN103276054B (zh)

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104894123A (zh) * 2015-06-18 2015-09-09 中国农业科学院作物科学研究所 辅助鉴定大豆结荚习性的方法及其专用引物
CN105087757A (zh) * 2014-05-05 2015-11-25 河北省农林科学院粮油作物研究所 鉴定大豆百粒重高低的分子标记及其应用
CN105543222A (zh) * 2016-02-29 2016-05-04 南京农业大学 大豆百粒重主效QTL的分子标记InDeL_33及其应用
CN107988414A (zh) * 2017-12-29 2018-05-04 安徽农业大学 一种辅助检测大豆百粒重的dCAPS标记及其应用
CN116397042A (zh) * 2022-12-16 2023-07-07 安徽农业大学 与大豆百粒重相关的snp标记及其应用

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7655840B2 (en) * 2001-06-05 2010-02-02 E. I. Du Pont De Nemours And Company Alteration of embryo/endosperm size during seed development
CN102534026A (zh) * 2012-02-13 2012-07-04 中国科学院遗传与发育生物学研究所 辅助鉴定大豆百粒重相关位点的一种方法及其专用引物

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7655840B2 (en) * 2001-06-05 2010-02-02 E. I. Du Pont De Nemours And Company Alteration of embryo/endosperm size during seed development
CN102534026A (zh) * 2012-02-13 2012-07-04 中国科学院遗传与发育生物学研究所 辅助鉴定大豆百粒重相关位点的一种方法及其专用引物

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
GENBANK: "NC_016092.1", 《GENBANK》 *
WENJUAN FANG ET AL.: "Maternal control of seed size by EOD3/CYP78A6 in Arabidopsis thaliana", 《THE PLANT JOURNAL》 *

Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105087757A (zh) * 2014-05-05 2015-11-25 河北省农林科学院粮油作物研究所 鉴定大豆百粒重高低的分子标记及其应用
CN104894123A (zh) * 2015-06-18 2015-09-09 中国农业科学院作物科学研究所 辅助鉴定大豆结荚习性的方法及其专用引物
CN105543222A (zh) * 2016-02-29 2016-05-04 南京农业大学 大豆百粒重主效QTL的分子标记InDeL_33及其应用
CN105543222B (zh) * 2016-02-29 2019-05-07 南京农业大学 大豆百粒重主效QTL的分子标记InDeL_33及其应用
CN107988414A (zh) * 2017-12-29 2018-05-04 安徽农业大学 一种辅助检测大豆百粒重的dCAPS标记及其应用
CN107988414B (zh) * 2017-12-29 2021-07-23 安徽农业大学 一种辅助检测大豆百粒重的dCAPS标记及其应用
CN116397042A (zh) * 2022-12-16 2023-07-07 安徽农业大学 与大豆百粒重相关的snp标记及其应用
CN116397042B (zh) * 2022-12-16 2023-12-08 安徽农业大学 与大豆百粒重相关的snp标记及其应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN103276054B (zh) 2014-08-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Gao et al. Diversity analysis in Cannabis sativa based on large-scale development of expressed sequence tag-derived simple sequence repeat markers
CN102162011B (zh) 一个水稻抗稻瘟病基因的分子标记方法
Xiong et al. Start codon targeted polymorphism for evaluation of functional genetic variation and relationships in cultivated peanut (Arachis hypogaea L.) genotypes
CN103276054B (zh) 用于辅助检测大豆百粒重的引物和检测方法
Abid et al. Genetic relationship and diversity analysis of faba bean (Vicia faba L. var. Minor) genetic resources using morphological and microsatellite molecular markers
CN104152450B (zh) 与黄瓜白粉病抗性主效基因共分离的InDel分子标记
Abedi-Tizaki et al. Morphological and molecular identification of'Fusarium'head blight isolates from wheat in north of Iran
CN105647920A (zh) 基于番茄黄化曲叶病毒病抗性基因Ty-3的InDel分子标记
CN107177667B (zh) 小麦穗密度qtl连锁的hrm分子标记及其应用
CN104774922B (zh) 小麦旗叶宽基因TaFLW1的分子标记WGRB125及其应用
CN104805081B (zh) 一种小麦粒重分子标记及其应用
CN106755465B (zh) 与小麦旗叶长QTL QFll.sicau-2D紧密连锁的分子标记及应用
Siva et al. Genetic diversity study of important Indian rice genotypes using biochemical and molecular markers
CN106701751A (zh) 与小麦旗叶长QTL　QFll．sicau‑4D紧密连锁的分子标记及应用
CN103088109B (zh) 一种辅助鉴定玉米单倍体诱导系的方法及其专用引物
Jangra et al. Promising versions of a commercial pearl millet hybrid for terminal drought tolerance identified through MAS
CN104762299B (zh) 一种水稻苗期耐盐基因qST2及其分子标记方法
US10954555B2 (en) Anthranilate synthase allele fragments for increasing rice yield and uses thereof
CN103409414B (zh) 甘蔗基因组内标基因乙酰乳酸合酶基因pcr引物序列及扩增方法
CN108315463B (zh) 用于检测玉米1768基因的引物组及其应用
Zahid et al. Utilization of SSR markers to identify slow rusting genes in spring wheat (Triticum aestivum L.)
CN105671053A (zh) 一种普通小麦高千粒重基因及其应用
de Pinho Benemann et al. Estimation of genetic variability of a Gerbera Brazilian collection based on morphological traits and EST-SSR markers
CN105087802B (zh) 鉴定番茄抗晚疫病性状的方法及其所用分子标记和引物
CN106834485B (zh) 一种水稻抗瘟病基因Pi9的分子标记及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20140820

Termination date: 20150313

EXPY Termination of patent right or utility model