CN102584998A - 犬胸腺基质淋巴细胞生成素蛋白及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种犬TSLP蛋白和编码该蛋白的核酸。本发明也公开了该蛋白的包含犬TSLP蛋白特异性表位的肽片段。犬TSLP蛋白和相关肽片段可用作免疫分析的抗原,也可用作诱导抗TSLP抗体的疫苗。本发明进一步公开了制备和使用犬TSLP基因、犬TSLP蛋白、以及相关肽片段的方法。
Description
本申请是申请号为“200780051269.0”,发明名称为“犬胸腺基质淋巴细胞生成素蛋白及其应用”的发明专利申请的分案申请。
相关申请的交叉参考
本申请为非临时申请,要求2006年12月14日根据美国法典第35篇第119条e款提交的系列号为60/875,135的美国临时专利申请的优先权,并将该申请的全部内容合并到本文中作为参考。
发明领域
本发明涉及犬胸腺基质淋巴细胞生成素蛋白(犬“TSLP”)、编码犬TSLP的核酸分子、载体和宿主细胞,以及制备和使用犬TSLP的方法。
发明背景
患有反应素介导的疾病,例如特应性疾病的动物,包括人,具有产生涉及免疫球蛋白E(IgE)抗体的速发变态反应的遗传倾向。由此得到的这些动物的这种表型的表达是由多个遗传因子促成的。特应性疾病的速发过敏性是由于暴露于特定的过敏原,例如室内尘螨(Dermatophagoidespteronyssinus)、花粉、霉菌、以及毛屑。不出人意料的是,患有特应性疾病的个体更容易患哮喘、遗传过敏性皮炎、以及与内部IgE释放有关的其它疾病。
特应性疾病如过敏性皮炎、哮喘等等,也发生于犬类,包括家犬。这些犬一般在1到3岁之间开始出现特异反应性的征兆。尽管我们知道其它种类的犬,包括杂交品种,也会出现特异反应性,但由于该病的遗传特性,许多品种,包括金毛猎犬、许多小猎犬、爱尔兰长毛猎犬、拉萨狮子犬、斑点犬、斗牛犬、以及英国古老牧养犬,有更大的倾向出现特异反应性。至少一种特定类型的特异反应性,即遗传过敏性皮炎的发病率在人和犬中都显著提高。
特异反应性犬通常会摩擦、舔、啃、咬、或抓自己的脚、鼻口部、耳朵、腋窝或腹股沟区域,导致毛发脱落、皮肤变红、增厚。在某些情况下,多种皮肤病共同作用导致动物发痒,而单独一种过敏症不会导致如此之痒。这些恶化的问题可能是由于空气传播的过敏原(花粉等)、食物中的过敏原、以及来自寄生虫(跳蚤等)的过敏原。皮肤的细菌和/或真菌感染也能加重痒的感觉。
一种减轻特异反应性的恼人症状的简单方法是避免刺激性的过敏原。遗憾的是,这种避免通常是不现实的。迄今为止,兽医师已经通过下列方法治疗了犬遗传过敏性皮炎:口服抗组胺药、口服或外用皮质类固醇消炎剂、其它免疫系统抑制剂如环孢霉素或他克莫司(tacrolimus)、脂肪酸增补剂、以及过敏原特异性免疫疗法(需要注射确定的抗原)。然而,上述疗法没有一种能适用全部病例。此外,这些疗法花费昂贵和/或产生显著的副作用。因此,长期以来需要更安全、更有效、并且更经济的方法来治疗或抑制犬遗传过敏性皮炎的症状。
哺乳动物的免疫应答基于一系列复杂的细胞相互作用,称为“免疫网络”。大多数免疫应答涉及淋巴细胞、巨噬细胞、粒细胞、以及其它细胞的网络状相互作用,其中被称为细胞因子的可溶性蛋白在介导/控制/调节这些细胞相互作用中起关键作用。因此,细胞因子和免疫细胞介导导致各种炎症的特定生理机制或通路。
过敏性炎症是由于复杂的免疫级联造成的,其导致T细胞产生源于失调的2型T辅助淋巴细胞(TH2)的细胞因子,例如白细胞介素4(IL-4)、白细胞介素5(IL-5)、以及白细胞介素13(IL-13)。这些细胞因子依次触发了支气管过度反应、IgE生成、嗜酸性粒细胞增多、以及黏液的产生。(参见Busse and Lemanske,Jr.(2001)N.Enggl.J.Med.344:350-62;Holgate(2000)Br.Med.J.320:231-234;以及Renauld(2001)J.Clin.Pathol.54:577-589)。
胸腺基质淋巴细胞生成素蛋白(TSLP)是一种类似白细胞介素7(IL-7)的细胞因子,其最初在小鼠中被鉴定为一种因子支持:(i)膜表面具有免疫球蛋白M(IgM)的B细胞的体外发育,(ii)B细胞与T细胞的增殖(Friend等人,1994,Exp Hematology 22:321-328,Levin等人,1999,J.Immunol 162:677-683)。现在已知TSLP结合于一种细胞受体,其包含IL-7R-α亚单位和一种称为TSLP-R的独有受体亚单位。这种相互作用可在造血细胞,例如骨髓谱系细胞如单核细胞,或树突细胞中触发信号传导,其经由转录活化因子(STAT)的激活或胸腺和激活可调节趋化因子(TARC)的表达来实现(参见例如共有的美国专利第6,890,734号,合并到本文中作为参考)。
TSLP在小鼠的过敏性疾病如遗传过敏性皮炎和哮喘的发病机理中也可能起重要作用。举例来说,在皮肤中特别诱导TSLP基因表达的转基因小鼠表现出遗传过敏性皮炎的免疫学和临床特征,例如湿疹性损伤,其包括炎性皮肤细胞浸润、表达皮肤归巢受体的Th2 CD4+T细胞显著增多、以及IgE血清水平的升高。此外,表达肺特异性TSLP基因的小鼠的肺部表现出哮喘的免疫学和临床特征,其包括大量白细胞浸润、杯状细胞增生、上皮下纤维化、2型T辅助细胞因子的增多,以及IgE水平的升高。
Sims等用表达克隆得到了鼠TSLP的cDNA序列,但是用基于鼠TSLP的杂交探针不能克隆人的同源体(Sims等人,2000,J exp Med,192:671-680)。其后,通过详细的表达序列标签(EST)分析,人的同源体被鉴定出来。已发现人TSLP的核苷酸序列与对应的小鼠序列只有43%的同源性。
因此,需要提供新的且更实用的方法来治疗犬特应性疾病,包括遗传过敏性皮炎及其相关临床表现。此外,需要分离出导致犬特应性疾病的免疫级联所涉及的因子,其可能引发上述疗法的发展。
本文对任何参考文献的引用不应解释为承认该参考文献可作为本申请的“现有技术”。
发明概要
本发明提供了新的且更实用的方法来治疗犬特应性疾病,包括遗传过敏性皮炎及其相关临床表现。相应地,本发明提供了新的分离的和/或重组的胸腺基质淋巴细胞生成素蛋白(TSLP),其涉及导致特应性疾病的免疫级联。本发明进一步提供了这些TSLP蛋白的抗原片段。在本发明的某一具体方面,TSLP蛋白为一种犬TSLP蛋白。
因此本发明提供了一种TSLP蛋白,其包含一段氨基酸序列,该序列与SEQ ID NO:2的氨基酸序列有80%或更高的同一性,且不包括其28个氨基酸残基的信号序列,当该蛋白作为疫苗施用于实验犬时,从接种疫苗的实验犬取样的犬血清中可检测到抗体,该抗体与包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的犬TSLP蛋白结合。在一相关实施方式中,所述TSLP蛋白包含一段氨基酸序列,该序列与SEQ ID NO:2的氨基酸序列有80%或更高的同一性,且不包括其28个氨基酸残基的信号序列;并且可与包含SEQ ID NO:2中氨基酸的犬TSLP的抗体交叉反应。
本发明进一步提供了一种TSLP蛋白,其包含一段氨基酸序列,该序列与SEQ ID NO:2的氨基酸序列有80%或更高的同一性(不包括其28个氨基酸残基的信号序列),该蛋白与一种表位特异性的犬TSLP单克隆抗体结合。
在一更具体的实施方式中,TSLP蛋白包含一段氨基酸序列,该序列与SEQ ID NO:2的氨基酸序列有90%或更高的同一性,不包括其28个氨基酸残基的信号序列。在另一实施方式中,TSLP蛋白包含一段氨基酸序列,该序列与SEQ ID NO:2的氨基酸序列有95%或更高的同一性,不包括其28个氨基酸残基的信号序列。
在本发明的一特定实施方式中,TSLP蛋白为犬TSLP蛋白,其包含SEQID NO:2的氨基酸序列。在另一实施方式中,TSLP蛋白为成年犬TSLP蛋白,其包含SEQ ID NO:2中的氨基酸残基29-155。
本文还提供了本发明的TSLP蛋白的抗原片段。这些抗原片段包括含一个或多个表位的那些片段,所述表位分别由氨基酸序列SEQ ID NOs:8-101定义。在一种具体的实施方式中,本发明的一种抗原片段包含一个或多个表位,其包含一段氨基酸序列,该序列来自SEQ ID NOs:30、31、32和/或34。在另一实施方式中,抗原片段可有一段氨基酸序列,该序列包含在氨基酸序列SEQ ID NOs:30、31、32、和/或34的重叠区内,即NPPDCLARIERLTLHRIRGCAS(SEQ ID NO:118)。在一种具体的实施方式中,犬TSLP蛋白的一种抗原片段能够与抗人TSLP的单克隆抗体结合。氨基酸序列NPPDCLARIERLTLHRIRGCAS(SEQ ID NO:118)的抗原片段的大小在约5个到约21个氨基酸残基之间。
本文还提供了疫苗,这些疫苗可包含有效量的下列各项:本发明的任何TSLP蛋白、其一种或多种抗原片段、或者上述全长蛋白与一种或多种上述片段的组合。在一实施方式中,TSLP蛋白为一种犬TSLP蛋白,其包含SEQID NO:2的氨基酸序列。在一具体的实施方式中,一种疫苗包含犬TSLP蛋白的一种或多种抗原片段,该蛋白包含SEQ ID NO:2的氨基酸残基71-92(本文鉴定为SEQ ID NO:118)中第5到22位邻接的氨基酸。在此公开了包括表位的上述抗原片段的实例,其包含SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、或SEQ ID NO:34的氨基酸序列。本发明的所有疫苗可进一步包含药学上可接受的佐剂。
本发明的疫苗可用于诱导抗犬TSLP抗体的方法。一种这样的方法包括用有效量的疫苗免疫哺乳动物。该方法任选包括一种下调犬体内TSLP活性的方法,和/或一种治疗或预防特异反应性犬的过敏症状的方法,其包括用有效量的疫苗免疫犬。被改善的过敏症状可包括过敏性皮炎、哮喘等等。
本发明的疫苗可通过以下途径施用:肌肉注射、皮下注射、静脉注射、皮内注射、口服、鼻腔给药、划痕法、以及上述方法的组合。
本发明进一步提供了一种核酸分子,其编码本发明的一种TSLP蛋白或者该蛋白的一种抗原片段。在一这样的实施方式中,所述核酸分子编码SEQID NO:2的氨基酸序列。在一具体的此类实施方式中,所述核酸分子包含SEQ ID NO:1的核苷酸序列。SEQ ID NO:1的核苷酸序列的下列片段也是本发明的一部分:约18个连续核苷酸的片段、约24个连续核苷酸的片段、约36个连续核苷酸的片段、约45个连续核苷酸的片段、约66个连续核苷酸的片段、或更大的片段。本发明了还提供了下列核酸:约18个核苷酸、约24个核苷酸、约36个核苷酸、约45个核苷酸、约66个核苷酸、或更大的核酸,包括编码全长TSLP蛋白的核酸,其在严格的杂交条件下与SEQ IDNO:1杂交。本发明的所有核酸分子及其片段可进一步包含异源核苷酸序列。
本发明还提供表达载体,其包括前面所述的核酸分子和/或其片段。另外,本发明提供包含这种表达载体的宿主细胞。宿主细胞可任选为原核或真核宿主细胞。在一实施方式中,原核宿主细胞为大肠杆菌。在一具体的此类实施方式中,所述宿主细胞为包含T7 RNA聚合酶基因的E.coli BL21(DE3)/pLysS,该基因受异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导的lacUV5启动子调控。
本发明进一步提供重组病毒载体和/或裸DNA载体,其包含上述编码犬TSLP的核酸分子中的一种,例如SEQ ID NO:1和/或该其片段。这些载体可用于,举例来说,适合施用于患有遗传过敏性皮炎的犬的疫苗。
本发明还提供了生产本发明的TSLP蛋白的方法。这样的方法包括在合适的培养基中培养本发明的宿主细胞。该方法可进一步包括从培养的宿主细胞或培养基中分离和/或提纯TSLP蛋白的步骤。分离和/或提纯所得到的蛋白也是本发明的一部分。
由本发明的疫苗在杂交瘤体系中诱导产生的抗TSLP抗体也是本发明的一部分。在一此类实施方式中应用哺乳动物杂交瘤体系。在一具体的实施方式中,抗体被分离和/或提纯。所述抗体可以是多克隆或单克隆的。根据本发明,在非犬物种中诱导产生的单克隆抗体可任选进行犬源化改造,从而在给实验犬注射时尽量降低抗原性。在某些优选实施方式中,本发明的任何抗体的结合区可任选转换为(例如通过裂解)比原抗体小的结合片段,和/或成为一种重组Fv、Fab、以及F(ab′)2结合蛋白。本发明还包括源于抗体的治疗用蛋白,其包含天然重链抗体(例如)所独有的结构和功能特性。另外,本发明还包括具有TSLP高亲和性和低免疫原性的抗体替代物(例如从TSLP受体的结合区制备的高亲合性多聚体)。这些新的抗犬TSLP抗体及高亲合性多聚体可方便地用于治疗特异反应性犬的过敏症状的方法,该方法通过施用有效量的抗犬TSLP抗体进行治疗。
本发明还提供疫苗,其包含有效量的非TSLP免疫原,该免疫原与有效量的下列各项组合:本发明的TSLP蛋白、该蛋白的一个或多个抗原片段、或者全长蛋白与一个或多个上述片段的组合。在一具体的此类实施方式中,TSLP蛋白为一种犬TSLP蛋白。在一更具体的实施方式中,犬TSLP蛋白包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列。
本发明另外提供诊断方法,这些方法应用新的犬TSLP蛋白、该蛋白的片段、和/或犬TSLP及其片段诱导产生的抗体。在一实施方式中,本发明提供诊断犬遗传过敏性皮炎的方法,其包括犬表皮样品的取样,以及在表皮样品中检测犬TSLP蛋白的存在。
通过参考以下附图和详述部分,可以更好地了解本发明的上述方面和其它方面。
附图简述
图1所示为十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析,所分析蛋白来源于表达犬TSLP蛋白的无真核细胞的蛋白合成系统。第1道:蛋白分子量标准;第2道:全蛋白;第3道:可溶性蛋白;第4道:不可溶蛋白。TSLP蛋白条带以箭头标示。
图2A所示为蛋白质印迹(Western blot)分析,所分析蛋白来源于表达犬TSLP蛋白的无真核细胞的蛋白合成系统。该蛋白与购自Invitrogen公司的Anti-His(C Term)/AP Ab反应。第1道:蛋白质分子量标准;第2道:全蛋白;第3道:可溶性蛋白;第4道:不可溶蛋白。犬TSLP蛋白在全蛋白和不可溶蛋白中检出(如箭头所示)。
图2B所示为蛋白质印迹(Western blot)分析,所分析蛋白来源于表达犬TSLP蛋白的无真核细胞的蛋白合成系统。该蛋白与人TSLP特异性的大鼠单克隆抗体反应。第1道:蛋白质分子量标准;第2道:全蛋白;第3道:可溶性蛋白;第4道:不可溶蛋白。犬TSLP蛋白在全蛋白和不可溶蛋白中检出(如箭头所示)。
图3A所示为来源于大肠杆菌(E.coli)宿主细胞的TSLP的表达与纯化,并且显示了存在于可溶性E.coli馏分的一个61kd条带,这表示犬TSLP与谷胱甘肽S转移酶(GST)融合蛋白以及一个6组氨酸标签的融合。“M”表示蛋白质分子量标准(在图3A-3D中相同)。第1道和第2道为包含质粒1265-93B的E.coli B121(DE3)pLysS的可溶性馏分,分别没有进行和进行了IPTG诱导。箭头标示了GST-TSLP-His融合蛋白条带(在图3A-3D中相同)。
图3B显示GST-TSLP-His标签融合蛋白可用谷胱甘肽琼脂糖4B树脂纯化。第1到3道表示谷胱甘肽琼脂糖4B树脂的不同洗脱馏分。
图3C显示B道的融合蛋白可用镍-次氨基三乙酸(Ni-NTA)树脂进一步纯化。本图所示为谷胱甘肽琼脂糖4B树脂纯化后的GST-TSLP-His融合蛋白用Ni-NTA树脂的再次纯化。第1道为流穿液,第2道为Ni-NTA树脂的洗脱液。
图3D所示为GST-TSLP-His融合蛋白的蛋白质印迹(Western blot),证实了该融合蛋白可被一种抗GST抗体(GE Health Care公司商品编号27457701)识别。
图4所示为损伤皮肤组织的石蜡包埋块切片的异硫氰酸荧光素(FITC)染色,样品取自被诊断为遗传过敏性皮炎的10197号犬。所述切片与兔抗人TSLP多克隆抗体反应,该反应用链霉亲和素-FITC(异硫氰酸荧光素)显影。荧光强度(照亮区)显示组织中出现兔抗人TSLP多克隆抗体与TSLP的结合。
图5A所示为损伤皮肤组织的石蜡包埋块切片的免疫过氧化物酶染色,样品取自一只被诊断为遗传过敏性皮炎的犬。在此切片中,皮肤标本的表皮层有一大鼠抗人TSLP单克隆抗体导致的弥漫染色(暗区)。
图5B所示为一对照切片。该切片来源于损伤皮肤组织的石蜡包埋块,样品取自一只被诊断为遗传过敏性皮炎的犬,只用磷酸缓冲液对照处理过。
图6所示为犬TSLP蛋白与大鼠抗人TSLP单克隆抗体的表位图。需特别注意的峰来自第22-26号表位(SEQ ID NOs 29-33)。表位22-26还进行了N端修饰(55号及以上各峰),以证实结合表位不需要N端氨基酸残基。
图7所示为犬TSLP表位25(SEQ ID NO:32)与人的同源体(SEQ ID NO:3)的多肽序列比较。
图8A所示为犬TSLP基因的DNA序列(SEQ ID NO:1)。
图8B所示为预测的由图8A所示DNA序列表达的TSLP多肽(SEQ ID NO:2)。星号标注了起始信号序列(氨基酸残基1-28)的N末端,下划线标注的氨基酸残基71-92(SEQ ID NO:118)表示一个域,从该域中确定了表2中相互重叠的表位22-26。
发明详述
遗传过敏性皮炎(“AD”)是一种Th2介导的过敏性炎性疾病。该病在病人和病犬中显示出很多类似的临床特征。考虑到涉及皮肤损伤的细胞类型和细胞因子,犬AD的免疫发病机理很可能与人AD类似。
TARC配体(CCL22)与Th2淋巴细胞上选择性表达的CC趋化因子受体4(CCR4)的结合可诱导这些细胞向过敏性损伤选择性迁移。已有报道TARC及其受体CCR4在犬AD皮肤损伤中上调。既然TSLP是人TARC的强力诱导剂,我们假设TSLP可能在犬AD损伤中存在。因此在AD病犬的损伤皮肤上测试了抗人TSLP抗体。如图4所示,这些皮肤样品的免疫组织化学证实了损伤中存在与抗人TSLP抗体反应的抗原。然而,鼠和人TSLP基因的犬直向同源基因的鉴定工作特别困难,其原因如本文所公开的,在于哺乳动物中各物种的TSLP的核酸及氨基酸序列有高度差异。
用本发明的一种TSLP和/或其一种或多种抗原片段免疫家犬,可降低内源TSLP的活性水平,并因此减轻、消除、和/或预防被免疫犬的一种或多种特应性症状,例如哮喘和/或遗传过敏性皮炎出现的症状。另外,犬TSLP蛋白可用作诱发抗犬TSLP抗体的抗原,这些抗体可用作家犬或其它哺乳动物的研究和/或诊断试剂。或者,在特定情况下,犬TSLP蛋白和/或编码犬TSLP的核酸可上调免疫损伤犬的免疫系统因子,例如通过造血细胞中STAT的活化或TARC的表达。
为了更全面地了解本发明,提供以下定义。
为描述方便而使用的单数术语绝非有意如此限制。因此,举例来说,提及一种组合物包含“一种多肽”,包括提及一种或多种这样的多肽。本文中使用的术语“大概”可与术语“大约”互换使用,表示数值与所述数值相差百分之二十以内,即一种包含“大概”50个氨基酸残基的多肽可包含40到60个氨基酸残基。
术语“结合组合物”系指与犬TSLP特异性结合的分子,例如在抗体-抗原反应中。特异性的内涵可大可小,例如仅限于一具体的实施方式、或限于相关的一组实施方式,例如犬TSLP和/或犬抗体。
本文中使用的“犬”一词包括所有家犬,拉丁名Canis lupus familiaris或Canis familiaris,除非另有说明。
本文中使用的术语“多肽”可与术语“蛋白”和“肽”互换使用,系指包含2个或多个氨基酸由肽键连接而成的聚合体。本文中使用的“多肽”一词包括一种重要的片段或部分,并包含一段延长的氨基酸残基,其包含至少约8个氨基酸,通常至少约12个氨基酸,一般至少约16个氨基酸,优选至少约20个氨基酸,在特别优选的实施方式中,至少约30个氨基酸,例如35、40、45、50个等等。这种片段可在几乎所有位置上有开始和/或结束的末端,例如开始于氨基酸残基1、2、3等等,结束于155、154、153等等,包括所有实用的组合。
多肽可任选缺少由基因或mRNA编码的某些氨基酸残基。举例来说,基因或mRNA可编码多肽N端的氨基酸残基序列(即信号序列),该序列被切除掉,因此不是最终蛋白的一部分。
本文中如果一段氨基酸序列与另一段氨基酸序列完全相同,则这两段氨基酸序列100%“同源”,和/或仅因下文定义的中性或保守替换而不同。因此,如果一段氨基酸序列与另一端氨基酸序列约80%相同,则这两段氨基酸序列约80%“同源”,和/或仅因中性或保守替换而不同。
序列中的氨基酸残基通常可被功能相同的氨基酸残基替换,导致保守的氨基酸替换。这种改变定义了本文中使用的术语“保守替换”。举例来说,序列中的一个或多个氨基酸残基可被另一个具有同样极性、相同功能的氨基酸替换,导致沉默改变。序列中氨基酸的替换者可选自该氨基酸所属种类中的其它成员。举例来说,非极性(疏水)氨基酸包括丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、和甲硫氨酸。含有芳香环结构的氨基酸有苯丙氨酸、色氨酸、和酪氨酸。中性极性的氨基酸包括甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、天冬酰胺、和谷氨酰胺。带正电荷(碱性)的氨基酸包括精氨酸、赖氨酸、和组氨酸。带负电荷(酸性)的氨基酸包括天冬氨酸和谷氨酸。这种改变不会影响聚丙烯酰胺凝胶电泳测定的表观分子量或者等电点。
特别优选的保守替换有:赖氨酸替换精氨酸及相反,如此可保留一个正电荷;谷氨酸替换天冬氨酸及相反,如此可保留一个负电荷;丝氨酸替换苏氨酸,如此可保留一个自由羟基;以及谷氨酰胺替换天冬酰胺,如此可保留一个自由氨基。氨基酸也可分为下述类似组:(1)脯氨酸、丙氨酸、甘氨酸、丝氨酸、和苏氨酸;(2)谷氨酰胺、天冬酰胺、谷氨酸、天冬氨酸;(3)组氨酸、赖氨酸、和精氨酸;(4)半胱氨酸;(5)缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸;以及(6)苯丙氨酸、酪氨酸、和色氨酸。
在一相关的实施方式中,两种高度同源的DNA序列可通过其自身同源性或其所编码氨基酸的同源性进行鉴定。这种序列比较可用序列数据库的标准软件进行。在一具体的实施方式中,两种高度同源的DNA序列编码的氨基酸序列有约80%的同一性,优选有约90%的同一性,更优选有约95%的同一性。更具体地所,两种高度同源的氨基酸序列有约80%的同一性,优选约90%的同一性,更优选约95%的同一性。
如本文中使用的,确定蛋白和DNA序列的同一性百分比可使用软件鉴定,例如Accelrys公司(Burlington,Massachusetts)出售的MacVector v9,和Clustal W算法,应用默认的排列参数和默认的同一性参数。参见Thompson,等人.1994.Nucleic Acids Res.22:4673-4680。用于Dos、Macintosh、和Unix平台的ClustalW可从例如欧洲分子生物学实验室(EMBLI)、欧洲生物信息学研究所免费下载。本下载链接位于http://www.ebi.ac.uk/clustalw/。这些和其它可用的程序还可以使用相同的或相似的默认参数来确定序列相似性。
“多核苷酸”或“核酸分子”系指包含核苷酸的分子,其包括但不限于RNA、cDNA、基因组DNA、甚至人工DNA序列。包括任何本领域已知的DNA和RNA的碱基类似物的核酸分子也可包含在上述术语中。
本发明提供了可与编码本发明的TSLP蛋白的核苷酸序列杂交的核酸。当在合适的温度和溶液离子强度条件下,该核酸分子的单链形式可与另一核酸分子退火,一核酸分子“可杂交”于另一核酸分子,例如cDNA、基因组DNA、或RNA,[参见Sambrook and Russell,Molecular Cloning,Alaboratory Manual,第3版,Cold Spring Harbor Laboratory Press,ColdSpring Harbor L.I.(2000)]。
高度严格的杂交条件对应于最高的Tm,例如50%甲酰胺、5X或6X SSC。杂交需要包含互补序列的两种核酸,虽然依赖于杂交的严格性,碱基错配仍然可能。合适的核酸杂交严格性依赖于核酸的长度和互补的程度,本领域熟知的变量。两种核苷酸序列的相似度或同源性越高,包含这些序列的核酸的杂交体的Tm值越高。核酸杂交的相对稳定性(相当于较高的Tm)以下述顺序递减:RNA:RNA,DNA:RNA,DNA:DNA。对于长度超过100个核苷酸的杂交体,已经得到计算Tm的公式(equations for calculating Tm havebeen derived strength)[参见Sambrook and Russell,Molecular Cloning,Alaboratory Manual,第3版,Cold Spring Harbor Laboratory Press,ColdSpring Harbor L.I.(2000)]。对于较短核酸即寡核苷酸的杂交,错配的位置更为重要,而寡核苷酸的长度决定了其特异性。
可杂交的核酸的最小长度优选为至少约12个核苷酸;更优选至少约18个核苷酸;甚至更优选长度为至少约24个核苷酸;最优选至少约36个核苷酸。在一特定的实施方式中,“标准杂交条件”一词系指Tm 55℃,并应用上述条件。在另一特定的实施方式中,严格的条件系指杂交和洗涤条件中分别为Tm 65℃。
DNA“编码序列”或者某具体蛋白或多肽的“编码序列”,系指在合适的调控因子控制下,可在体内或体外转录并翻译生成多肽的DNA序列。
编码序列的范围由位于5’端的起始密码子和位于3’端的翻译终止密码子确定。编码序列可以包括但不限于原核序列、真核mRNA的cDNA、真核(例如哺乳动物)DNA的基因组DNA序列、甚至合成DNA序列。转录终止序列通常位于编码序列的3’端。
“可操作的连接”系指多因子的排列,其中各组分被配置以执行其正常功能。因此,可操作地与编码序列连接的调控因子能够影响编码序列的表达。调控因子并不需要与编码序列相连续,只要它们起指示其表达的功能。因此,举例来说,未翻译的已转录序列可以存在于启动子和编码序列之间,此时启动子仍可被认为与编码序列“可操作地连接”。
本文中使用的“异源核苷酸序列”系指一种核苷酸序列,其通过重组方法添加至本发明的核苷酸序列,从而形成非自然界天然形成的核酸。这种核酸可编码融合(例如嵌合)蛋白。因此异源核苷酸序列可编码包含调控和/或结构特性的多肽和或/蛋白。在另一此类实施方式中,所述异源核苷酸序列可编码蛋白或多肽,其可作为在重组核酸表达后可检测本发明的核苷酸序列编码的蛋白或多肽的工具。在另一实施方式中,所述异源核苷酸序列可作为检测本发明的核苷酸序列的工具。异源核苷酸序列可包含非编码序列,其包括限制性酶切位点、调控位点、启动子等等。
本文中使用的术语“融合蛋白”和“融合肽”可互换使用并包含下列各词:“嵌合蛋白和/或嵌合肽”、以及融合“内含肽蛋白/肽”。融合蛋白包含本发明的一种犬TSLP蛋白的至少一部分,其通过肽键与另一蛋白的至少一部分连接,例如非犬TSLP蛋白的至少一部分,和/或包含犬TSLP蛋白的两个或多个非连续部分的组合,例如表位,其在犬TSLP多肽中并不天然地处于相邻位置(例如,一种10个氨基酸残基的融合肽,其包含由肽键连接的SEQ ID NO:2的氨基酸残基71-75和101-105)。在优选的实施方式中,犬TSLP蛋白的各部分是有功能的,例如保持抗原性。融合蛋白还可包含标记蛋白、或有助于本发明的犬TSLP蛋白的分离和/或纯化的蛋白(例如FLAG标签,参见下述实施例)、和/或抗原性。非犬TSLP序列可以氨基端或羧基端与犬TSLP序列连接。
编码本发明的融合蛋白的重组DNA分子,举例来说,可包含编码非犬TSLP蛋白的至少一部分的一段序列,其插入犬TSLP编码序列中,并可进一步编码特定的蛋白酶,例如凝血酶或Xa因子的酶切位点,该位点优选位于或接近于犬TSLP序列和非犬TSLP序列的结合部。在一特定的实施方式中,融合蛋白在原核细胞中表达。通过使用与犬TSLP融合的蛋白和/或标签特异性的亲和柱,这种融合蛋白可用于分离本发明的犬TSLP(参见下述实施例)。纯化的犬TSLP,举例来说,可通过使用蛋白水解酶或上述酶切位点从融合蛋白中释放出来。
“载体”或“复制载体”为一种复制子,例如质粒、病毒、噬菌体、或粘粒,另一DNA片段可附加或整合其中,以进行附加片段的复制。所述术语还包括一种复制子,其包括所整合或附加的感兴趣DNA片段。
本发明中可使用的载体包括细菌质粒、病毒、噬菌体、可整合的DNA片段、以及其它可帮助核酸分子整合进宿主基因组的载体。质粒是最普遍使用的载体,但是所有其它具有同等功能的或本领域已知的载体都适用于本发明。[参见例如Pouwels等人,Cloning Vectors:A Laboratory Manual,1985及其补充,Elsevier,N.Y.,以及Rodriguez等人(eds.),Vectors:A Survey of Molecular CloningVectors and Their Uses,1988,Buttersworth,Boston,MA.]
当DNA和载体末端都包含合适的限制性酶切位点时,编码新的犬TSLP蛋白的DNA可以容易地插入载体。如果不能做到,可能需要修饰DNA和/或载体的末端,方法为消化掉限制性内切酶裂解产生的单链DNA突出端以产生钝末端,或者用合适的DNA聚合酶填补单链末端以达到同样的结果。或者,例如通过在末端上连接核苷酸序列(连接子)来产生所需位点。这种连接子可包含特定的确定所需限制性酶切位点的寡核苷酸序列。限制性酶切位点还可通过聚合酶链反应(PCR)产生。参见,例如Saiki等人,Science 239:487(1988)。如果需要,裂解过的载体和DNA片段也可用同聚物加尾修饰。
本发明中使用的重组表达载体一般为自我复制的DNA或RNA结构,其包含编码本发明的犬TSLP蛋白和/或其抗原片段的核酸,该核酸通常可操作地与合适的基因调控因子连接,这些因子能在合适的宿主细胞中调控核酸的表达。基因调控因子可包括原核启动子系统或真核启动子表达控制系统,一般包括转录启动子、可选的控制转录开始的操纵子、提高mRNA表达水平的转录增强子、编码合适的核糖体结合位点的序列、以及终止转录和翻译的序列。表达载体还可包含复制起点,其允许载体独立于宿主细胞进行复制。
编码新的犬TSLP蛋白的核酸表达可通过常规方法在原核或真核细胞中进行。
“宿主细胞”系指临时性或永久性包含或能够包含、并表达外源核酸分子的细胞。当这种外源DNA已被引入细胞膜内,则该细胞已被外源DNA“转化”。外源DNA可整合或不整合(共价结合)入构成细胞基因组的染色体DNA。举例来说,在原核生物和酵母中,所述外源DNA可保持在游离因子上,例如质粒。对真核细胞来说,稳定的转化细胞是其中外源DNA整合到染色体中,因此可以通过染色体复制遗传到子细胞中的细胞。这种稳定性表现在真核细胞可以建立细胞系或克隆的能力,其包含一群含有外源DNA的子细胞。
原核生物包括革兰氏阴性和阳性生物,例如E.coli和枯草杆菌(B.subtilis)。真核细胞包括来源于动物细胞的已建立的组织培养细胞系,可来自非哺乳动物如昆虫细胞和鸟类,和来自哺乳动物如人、灵长动物、以及啮齿动物。
原核宿主-载体系统包括用于很多不同物种的多种载体。用于扩增DNA的载体包括pBR322及其多种衍生物,或pET42b(+)表达载体(Novagen)。
通常使用的原核表达调控序列包含启动子,其包括源自β-内酰胺酶(β-lactamase)和乳糖启动子系统的启动子[Chang等人,Nature,198:1056(1977)],例如pUC系列,源自色氨酸(trp)启动子系统的启动子[Goeddel等人,Nucleic Acids Res.8:4057(1980)],例如pBR322-trp,源自lambda PL启动子系统的启动子[Shimatake等人,Nature,292:128(1981)],lam bda-pP或pR启动子(pOTS),阿拉伯糖诱导的启动子(InVitrogen),tac启动子[De Boer等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 292:128(1983)],Ipp启动子(pIN系列);或者杂交启动子,例如ptac(pDR540)。许多包含这种调控序列的其它表达载体是本领域已知的,并有商业出售。[也参见Brosius等人,″Expression Vectors Employing Lambda-,trp-,lac-,and Ipp-derivedPromoters″,in Rodriguez and Denhardt(eds.)Vectors:A Survey ofMolecular Cloning Vectors and Their Uses,1988,Buttersworth,Boston,pp.205-236]。
适用于E.coli的等效的载体,其可用于其它原核生物,也可用来表达本发明的TSLP蛋白。
酵母以及高等真核组织培养细胞也能用作重组生产的宿主,用来生产新的犬TSLP蛋白、和/或抗犬TSLP抗体、和/或这些抗体的片段。虽然可以使用任何高等真核组织培养细胞系,包括昆虫杆状病毒表达系统,但哺乳动物细胞是优选的。此类细胞的转化或转染以及增殖已经成为常规例行程序。有用的细胞系实例包括人子宫颈癌传代细胞(HeLa细胞)、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞系、幼大鼠肾(BRK)细胞系、昆虫细胞系(例如SF9),鸟类细胞系(例如DF-11)、Madin-darby牛肾(MDBK)细胞、Madin-Darby犬肾(MDCK)细胞系、非洲绿猴肾异倍体细胞(Vero细胞)、HEK-293细胞系以及猴(COS)细胞系。
用于此类细胞系的表达载体通常包括,举例来说,复制起点、启动子、翻译起始点、RNA剪切位点(如果使用基因组DNA)、多腺苷酸位点、以及转录终止点。这些载体通常还包含选择基因或扩增基因。合适的表达载体可以是包含启动子的质粒、病毒、或逆转录病毒,其启动子来源于,例如腺病毒、SV40、细小病毒、牛痘病毒、或巨细胞病毒。合适的表达载体的典型实例包括pCDNA1、pCD[Okayama等人,Mol.Cell Biol.5:1136(1985)]、pMC1neo Poly-A[Thomas等人,Cell 51:503(1987)]、pUC19、pREP8、pSVSPORT及其衍生物、以及杆状病毒载体,例如pAC 373或pAC 610。
表达以后,新的犬TSLP可根据本领域的标准程序进行纯化,包括硫酸铵沉淀、亲和柱、柱色谱等等(参见R.Scopes,Protein Purification,Springer--Verlag,N.Y.(1982))。药用中优选的是至少约90%到95%同质化的几乎完全纯的组合物,最优选的是98%到99%或更高的同质化。纯化可以是部分的,或直至所需的同质化。如果犬TSLP用于治疗,该蛋白几乎完全不能含有内毒素。用结合抗TSLP抗体的纯化柱或结合TSLP受体的纯化柱选择性纯化表达的TSLP,是获取高纯度犬TSLP蛋白的可用策略。
纯化的方法本领域熟知。举例来说,纯化核酸可用沉淀、色谱、超速离心以及其它方法。纯化蛋白和多肽以及肽可用多种方法,其包括但不限于,制备圆盘凝胶电泳、等电子聚焦、高效液相色谱(HPLC)、反向HPLC、凝胶过滤、离子交换与分配色谱、沉淀与盐析色谱、提取与反流分布。在某些方面,优选在重组系统中生产多肽,使蛋白包含有助于纯化的额外序列标签,例如但不限于,多组氨酸序列、或特异性与抗体结合的序列,例如和GST。如此则多肽可在合适的固相基质上用色谱从宿主细胞的粗裂解液中纯化。或者,多肽的抗体或其结合片段可用作纯化试剂。
溶剂和电解质通常为用来保持生物活性的生物相容缓冲液,并通常近似于生理水溶剂。通常溶剂的pH为中性,通常在5到10之间,优选约7.5。某些情况下,要加入一种或多种去污剂,通常是温和的不导致变性的,例如CHS(胆甾醇半琥珀酸酯)或CHAPS(3-[(3-胆固醇氨丙基)二甲基氨基]-1-丙磺酸),或者浓度足够低以免严重影响所述蛋白的结构或生理特性。在其它情况下,强烈的表面活性剂可用来进行强烈变性。
另一选择是,来源于E.coli或其它细菌的异源功能蛋白可通过强变性剂增溶和随后重新折叠的方法从包涵体中分离。本领域已知的变性剂包括,简单举例来说,尿素、硫氰酸钾、盐酸胍(“GuHCl”)、碘酸钾、和/或碘化钠,以及这些试剂的组合。优选GuHCl被用作还原剂,例如浓度约6到8M,在碱性条件下,例如约pH8。或者使用另一种还原剂,二硫苏糖醇(“DTT”),可以单独使用或与GuHCl组合使用。如果使用DTT,其浓度范围,简单举例来说,从约50mM到约0.5mM DTT。本领域已熟知,在增溶步骤中必须有还原剂来切断或变性二硫键。一种典型的还原缓冲液为:0.1M Tris(三羟甲基氨基甲烷)pH8.0,6M胍,2mM EDTA(乙二胺四乙酸),和0.3M DTE(二硫赤藓醇)。
通常在氧化剂存在下将变性与还原的蛋白稀释(例如100倍)到重新折叠缓冲液可完成复性。可以使用任何合适的本领域已知的氧化剂,只要其允许理想产量的正确折叠。举例来说,还原和氧化形式的低分子量硫醇试剂可以进行氧化和重新折叠,如Saxena,等人,1970,Biochemistry 9:5015-5021中所述,该文合并到本文中作为参考,并特别如Buchner,等人(引文同上)所述。通常将变性与还原的蛋白稀释(例如100倍)到重新折叠缓冲液可完成复性。一种典型的重新折叠缓冲液为:Tris HCl 100mM,pH 10.0,25mMEDTA,NaCl 0.1M,GSSG 551mg/L,0.5M精氨酸。GSSG为氧化形式的谷胱甘肽。
多肽的大小和结构通常应处于相当稳定的状态,并且通常不处于变性的状态。多肽可与其它多肽在四级结构中结合,例如可增加溶解度,或与脂类或去污剂结合。
几乎完全纯,例如描述蛋白的上下文中,通常表示该蛋白不含其它污染的蛋白、核酸、或其它源于有机物来源的其它生物制品。纯度可通过标准方法测定,通常依据重量,普通的至少约40%纯,一般至少约50%纯,经常至少60%纯,通常至少80%纯,优选至少90%纯,在最优选的实施方式中至少95%纯。通常添加载体或赋形剂。纯度可通过下列方法评估:色谱、凝胶电泳、免疫测定、成分分析、生物测定、以及其它本领域已知的方法。从功能方面看,根据本发明的分离的犬TSLP蛋白与其它物质充分分离,包括前体犬TSLP蛋白和/或成熟的犬TSLP蛋白,因此能够诱发犬TSLP蛋白特异性的免疫应答。
多肽或片段的可溶性取决于环境和多肽本身。很多参数影响多肽可溶性,包括温度、电解质环境、多肽大小和分子特性、以及溶剂的性质。通常所用多肽的温度在约4℃到约65℃之间。一般温度高于约18℃。进行诊断时,温度一般为室温或更高,但是低于方法中各成分的变性温度。进行治疗时,温度一般为体温,通常约36℃到40℃(例如狗约39℃),在某些情况下温度可能在原位或体外升高或降低。
本文中使用的一种具体蛋白的“抗原片段”一词,系指该蛋白的一种片段(包括仅比全长蛋白少一个氨基酸的大片段),其具有抗原性,即能够特异性地与免疫系统的抗原识别分子反应,例如免疫球蛋白(抗体)或T细胞抗原受体。举例来说,本发明的犬TSLP的抗原片段是犬TSLP的具有抗原性的片段。只要这种片段与用于免疫的载体分子结合后能用来产生TSLP蛋白的抗体,其不须具有自身免疫原性,即在没有载体的情况下诱发免疫应答。
在一具体的实施方式中,犬TSLP的抗原片段包含5到150个氨基酸残基。在一具体的实施方式中,犬TSLP的抗原片段包含多于120个氨基酸残基。在另一实施方式中,犬TSLP的抗原片段包含10到120个氨基酸残基。在另一实施方式中,犬TSLP的抗原片段包含20到100个氨基酸残基。在另一实施方式中,犬TSLP的抗原片段包含25到75个氨基酸残基。
犬TSLP的抗原片段可从重组来源、天然来源中分离的蛋白、或化学合成得到。此外,抗原片段可从下列途径得到:犬TSLP或其片段的水解消化、重组表达、或者从头产生,例如通过肽合成。
疫苗
本发明进一步提供了疫苗,这些疫苗包含有效量的下列各项:本发明的TSLP蛋白、该蛋白的一种或多种抗原片段、或者上述全长蛋白与一种或多种上述片段的组合。举例来说,犬TSLP蛋白和/或其片段,如下述表2中所列举,可整合进任何蛋白或肽相容的疫苗组合物。此类疫苗组合物是本领域熟知的,可以但并不必须包括,例如生理上适合的缓冲液和生理盐水等等,以及药学上可接受的佐剂,例如或
必要时,疫苗组合物可用来在实验犬体内诱导内源性抗TSLP抗体,例如为了治疗与实验犬体内TSLP活性下调有关的疾病或病症的临床症状。另外,或与之相关的,本发明的疫苗也可用来诱发筛选和/或鉴定犬TSLP的抗血清,例如作为鉴定过量表达TSLP犬的试剂盒的成分。
如下述表2中公开的TSLP肽及其变体可用作免疫原,可单独或以多种组合使用。此类肽可通过化学或重组DNA技术任选互相连接和/或与作为载体的大蛋白连接。载体可增强作为免疫应答目标的宿主动物对多肽的识别,并增加TSLP多肽的免疫原性。很多载体是本领域已知的,包括破伤风类毒素或无毒的破伤风毒素C片段、白喉类毒素、PhoP蛋白、钥孔虫戚血蓝蛋白(KLH)、β牛乳糖、源于1型牛疱疹病毒(BHV-1)的gD蛋白、源于狂犬病毒的G蛋白、源于犬瘟热病毒的F蛋白、以及合成载体,例如用已知的“通用”T细胞表位聚合而成的载体。
使用已知的算法,可用作免疫原的TSLP多肽可从下述表2中的多肽及其变体中选择出来,这些算法评估如下特性:天然TSLP蛋白的表面可达性、亲水性、原子迁移率、以及抗原性。表2中多肽及其变体的表位也可基于其与下列抗体的反应活性进行选择:与天然TSLP蛋白反应的抗体、特别是能够中和TSLP生物活性的抗体。此类抗原可包括用标准肽合成技术从本文所公开的序列中制备的合成肽,和/或或者从重组或天然TSLP蛋白得到的片段。
本发明的药学上可接受的佐剂可从多种来源获得,其包括天然来源、重组来源和/或化学合成等等。作为佐剂的化合物实例包括但不限于,铝化合物、可代谢和不可代谢的油、嵌段共聚物、ISCOM’s(免疫刺激复合物)、维生素和矿物质(包括但不限于:维生素E、维生素A、硒、以及维生素B12)、和Quil A(皂苷)、弗氏完全佐剂、以商标出售的丙烯酸与聚烯基醚或二乙烯基乙二醇交联的聚合物(例如941)、以及在水乳胶中均匀分散的微米级油滴(例如以商标出售的)。另外一些佐剂的实施例有时候特指免疫刺激物,其包括细菌或真菌细胞壁成分(例如脂多糖、脂蛋白、糖蛋白、胞壁肽、β-1,3/1,6-葡聚糖)、源于植物的多种复合糖(例如多聚糖、乙酰化甘露聚糖)、源于动物的多种蛋白和多肽(例如激素、细胞因子、共刺激因子)、以及源于病毒和其它来源的新核酸分子(例如双链RNA、CpG)。另外,上述各项的各种组合可提供佐剂作用,因此可构成本发明的佐剂。
本发明的疫苗可通过以下任何途径施用:肌肉注射、皮下注射、静脉注射、皮内注射、口服、鼻腔给药、以及上述方法的组合。
抗体
本发明还包括与新的犬TSLP蛋白特异性结合的多克隆和单克隆(mAb)抗体。如本文中使用的,“抗体”一词系指免疫球蛋白和/或其片段。天然存在的免疫球蛋白包含实质上由免疫球蛋白基因编码的一个或多个多肽。已知的免疫球蛋白基因包括kappa、lambda、alpha、gamma、delta、epsilon和mu恒定区基因,以及大量免疫球蛋白可变区基因。根据本发明的抗体也包含抗体片段,即抗原结合片段,例如Fv、Fa、和F(ab′)2,改造的单链结合蛋白,参考Huston等人,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,85,5879-5883(1988)和Bird等人,Science,242,423-426(1988)(合并到本文中作为参考),以及双功能杂交抗体(参考Lanzavecchia等人,Eur.J.Immunol.17,105(1987))。参见Hood等人,Immunology,Benjamin,N.Y.,2nd ed.(1984),Harlow and Lane,Antibodies.A Laboratory Manual,Cold SpringHarbor Laboratory(1988)和Hunkapiller and Hood,Nature,323,15-16(1986),全部合并到本文中作为参考。
举例来说,以标准方法用新的犬TSLP蛋白免疫的动物中产生的血清可直接使用,也可用标准方法从血清中分离出IgG组分,例如用血浆去除术或采用IgG特异性吸附剂的吸附色谱,例如固定化蛋白A或蛋白G。或者,可制备单克隆抗体,和任选源于此类单抗的抗原结合片段或重组结合蛋白。此类单抗或其片段可用本领域已知的方法或者直接修饰来分别进行人源化或犬源化。
如本文中使用的,一种“表位特异性的”犬TSLP抗体是一种抗犬TSLP的一种片段的抗体,该抗体包含一种表位,其包含一个或多个下列5氨基酸序列:SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33和SEQID NO:34;该抗体进一步结合一种蛋白,其包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列,和/或一种蛋白,其包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列,但不包括28个氨基酸残基的信号序列。在一具体的实施方式中,表位特异性的犬TSLP抗体是一种单克隆抗体。
选择性结合本发明的犬TSLP蛋白的产自杂交瘤的单抗是用熟知的技术生产的。通常所述过程涉及永久细胞系与生产所需抗体的B淋巴细胞的融合。或者,也可使用产生永久抗体生产细胞系的非融合技术,例如病毒诱导转化[Casali等,Science 234:476(1986)]。永久细胞系通常转化哺乳动物细胞,尤其是啮齿类、牛、和人源的骨髓瘤细胞。出于方便和可用性考虑,最经常使用的是大鼠和小鼠的骨髓瘤细胞。
从注射抗原的哺乳动物中获得生产抗体的淋巴细胞的技术是熟知的。如果使用人源细胞通常使用外周血淋巴细胞(PBLs),或者使用非人哺乳动物来源的脾或淋巴结细胞。宿主动物被注射多剂量的纯化的抗原(人细胞在体外致敏),则该动物可产生所需的生产抗体细胞,以供收获用于与永久细胞系的融合。融合技术也是在本领域熟知的,通常涉及将细胞与融合剂混合,例如聚乙二醇。
杂交瘤用标准程序选择,例如HAT(次黄嘌呤-氨喋呤-胸腺嘧啶脱氧核苷)选择。分泌所需抗体的杂交瘤用标准免疫分析选择,例如蛋白印迹法、ELISA(酶联免疫吸附法)、RIA(放射性免疫分析)等等。抗体用标准蛋白纯化技术从培养基中回收[Tijssen,Practice and Theory of Enzyme Immunoassays(Elsevier,Amsterdam,1985)]。
很多参考文献可对应用上述技术提供指导[Kohler等人,HybridomaTechniques(Cold Spring Harbor Laboratory,New York,1980);Tijssen,Practice and Theory of Enzyme Immunoassays(Elsevier,Amsterdam,1985);Campbell,Monoclonal Antibody Technology(Elsevier,Amsterdam,1984);Hurrell,Monoclonal Hybridoma Antibodies:Techniques and Applications(CRCPress,Boca Raton,FL,1982)]。单克隆抗体还可用熟知的噬菌体文库系统生产。[参见Huse,等人,Science 246:1275(1989);Ward,等人,Nature,341:544(1989)]。
如此生产的抗体,无论多克隆还是单克隆,可被用于,例如用熟知的方法以固定形式结合于固体载体,通过免疫亲和色谱纯化犬TSLP蛋白。
未标记的或用标准方法标记的抗犬TSLP蛋白的抗体也可用作定性或定量检测犬TSLP蛋白的免疫分析的基础。具体使用的标记物取决于免疫分析的类型。可使用标记物的实例包括但不限于,放射性同位素标记,例如32P、125I、3H、和14C;荧光标记,例如荧光素以及衍生物、若丹明及其衍生物、丹酰和伞形酮;化学发光剂,例如虫荧光素和邻苯二甲酰肼;以及酶,例如辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、溶菌酶、和6-磷酸葡萄糖脱氢酶。
抗体可用上述标记物通过已知方法标记。举例来说,用荧光剂、化学发光剂、或酶标记抗体时可使用偶联剂,例如乙醛、碳二亚胺、双马来酰亚胺、亚氨酸酯、琥珀酰亚胺、双重氮化联苯胺等等。涉及的常规方法本领域熟知,如下所述,考例如Immunoassay:A Practical Guide,1987,Chan(Ed.),AcademicPress,Inc.,Orlando,FL.。此类免疫分析可在,例如,受体纯化所得馏分中应用。
本发明的抗体还可用于鉴定在表达克隆系统中表达犬TSLP蛋白的特定cDNA克隆。受体配基结合位点特异性的中和抗体还可用作阻断或下调犬TSLP蛋白功能的拮抗剂(抑制剂)。此类中和抗体可通过常规实验容易地鉴定。
犬TSLP蛋白活性的拮抗可用完整的抗体分子、或熟知的抗原结合片段如Fab、Fc、F(ab)2、和Fv片段完成。此类片段的定义如上文所述,或参考例如Klein,Immunology(John Wiley,New York,1982);Parham,Chapter 14,inWeir,ed.Immunochemistry,第4版.(Blackwell Scientific Publishers,Oxford,1986)。抗体片段的使用和生产在下列文献描述:例如Fab片段[Tijssen,Practiceand Theory of Enzyme Immunoassays(Elsevier,Amsterdam,1985)],Fv片段[Hochman等人,Biochemistry 12:1130(1973);Sharon等人,Biochemistry15:1591(1976);Ehrlich等人,美国专利第4,355,023号],以及抗体半分子(Auditore-Hargreaves,美国专利第4,470,925号)。进一步描述基于已知的抗体重链和轻链可变区序列制备重组Fv片段的方法,例如Moore等人(U.S.PatentNo.4,642,334)和Plückthun[Bio/Technology 9:545(1991)]。或者,也可用标准方法化学合成。
本发明还包含多克隆和单克隆抗独特型抗体,其用上述抗体作为抗原来生产。这些抗体的作用在于其可以模拟配基的结构。
产自非犬哺乳动物或非犬杂交瘤系统的抗体可任选进行改造,以使其在注射给犬时几乎无抗原性,即其可犬源化。改造产自动物的单克隆抗体以使其在治疗施用给人时降低免疫原性(人源化)的方法已被积极探索,并在很多文献中描述[例如Antibody Engineering:A practical Guide.Carl A.K.Borrebaeck ed.W.H.Freeman and Company,1992;Reichman,L.等人,″Reshaping human antibodies for therapy″,Nature 332:323-327(1988)]。或者,产自非犬哺乳动物的单克隆抗体,例如小鼠单克隆抗体,可与犬抗体或其序列产生嵌合抗体,其对受体宿主来说,比标准鼠单克隆抗体的免疫原性降低。参见例如,美国专利第5,593,861号,“犬-小鼠异源杂交瘤和编码犬免疫球蛋白恒定区的基因片段”,合并到本文中作为参考。
另外,Wasserman和Capra[Biochem.16:3160(1977)]确定了犬lgM和犬IgA重链可变区的氨基酸序列。他们进一步确定了犬IgA kappa轻链的氨基酸序列[Wasserman and Capra,Immunochem.15:303(1978)]。McCumber和Capra[Mol.Immunol.16:565(1979)]公开了犬mu链的氨基酸全序列。Tang等人[Vet.Immunology Immunopathology 80:259(2001)]公开了一种犬IgG-A gamma链cDNA和4种犬IgG-A gamma链蛋白序列。Tang等人(引文同上)进一步描述了犬脾cDNA文库的PCR扩增,其使用了根据人、小鼠、猪、和牛IgG保守区设计的变性寡核苷酸引物。此外,Krah等人(美国专利公开号20040181039,公开于2004年9月16日,合并到本文中作为参考)详细描述了非犬抗体犬源化的一种过程。
犬TSLP基因的分离
A.初步尝试
鉴定犬TSLP的初步尝试基于克隆的人和小鼠cDNA序列与大鼠、黑猩猩、和恒河猴cDNA序列的序列比较,这些序列从BLAT(公共基因组数据库,加利福尼亚大学圣克鲁兹分校)收集。黑猩猩TSLP与人TSLP在氨基酸水平上100%相同,而恒河猴TSLP在成熟蛋白上与人TSLP超过90%同源性(12/151氨基酸残基差异)。然而,人和非人灵长类动物TSLP蛋白和cDNA序列与鼠TSLP序列有很大差异。人和小鼠TSLP cDNA序列只有43%同源性,不能通过这些物种之间的低严格性跨种杂交进行克隆。此外,与小鼠TSLP比较,大鼠TSLP序列在成熟蛋白的氨基酸序列中有39/121差异,提示甚至在近缘的鼠类物种之间,TSLP序列也有显著差异。
遗憾的是,如本文所公开的,犬TSLP序列也与所有这些不同的鼠类和相似的灵长类序列有差异。因此,通过低严格性跨种杂交获得犬TSLP是不成功的。实际上,根据人、小鼠、大鼠、和猴序列信息设计的尝试用巢式PCR策略克隆犬TSLP直向同源基因的引物没能确定甚至一条与犬TSLP对应的条带。
B.成功分离犬TSLP基因
用人TSLP序列搜索可供收集的犬基因组数据库(源于全基因组鸟枪测序;由加利福尼亚大学圣克鲁兹分校提供给公众)部分确定了犬TSLP外显子1和4。简单地说,在此初步搜索中确定了多个显著序列同源性的搜索结果(参加下述“搜索结果”1-6)。其序列被集中并用作查询条件来延伸和组装犬TSLP基因的部分电子序列。
搜索结果1
评分=60.8字节(146),期望值=1e-08
同一性=33/58(56%),阳性=39/58(67%),缺口=1/58(1%)
Query:7 LYVLSVS-FRKIFILQLVGLVLTYDFTNCDFEKIKAAYLSTISKDLITYMSGTKSTEF 63
L+SVS FRKIF+LQLVGLVLTY+F +CDFEKI+ Y I+L YM G F
Sbjct:26 LIICSVSVFRKIFVLQLVGLVLTYNFIDCDFEKIRWKYQEVIYQALEKYMDGVSE*TF 199
SEQ ID NO:102:人TSLP
SEQ ID NO:103>gi|36323560|gb|AACN010632090.1|家犬
ctg19866851299046,全基因组鸟枪序列长度=1007
搜索结果2
评分=59.7字节(143),期望值=3e-08
同一性=30/42(71%),阳性=33/42(78%)
框=-1
Query:117 QINATQAMKKRRKRKVTTNKCLEQVSQLQGLWRRFNRPLLKQ 158(SEQ ID NO:104)
QIN TQA KKR+KR VTTNKC EQV +L GLWRRF+R KQ
Sbjct:588 QINNTQAKKKRKKRGVTTNKCREQVAHLIGLWRRFSRIS*KQ 463(SEQ ID NO:105)
SEQ ID NO:104:人TSLP
SEQ ID NO:105>gi|36314527|gb|AACN010674832.1家犬
ctg19866851282529,全基因组鸟枪序列长度=963
搜索结果3
评分=42.0字节(97),期望值=0.006
同一性=21/44(47%),阳性=27/44(61%)
框=-2
Query:76 LTEIQSLTFNPTAGCASLAKEMFAMKTKAALAIWCPGYSETQIN 119(SEQ ID NO:106)
L I+LT+GCAS A+E FA T AALA CPGY+ ++
Sbjct:369 LARIERLTLHRIRGCASGAREAFAEGTVAALAAECPGYAAAPVS 238(SEQ ID NO:107)
SEQ ID NO:106:人TSLP
SEQ ID NO:107>gi|36442813|gb|AACN011084208.1|家犬
ctg19866851499233,全基因组鸟枪序列长度=370
搜索结果4
评分=38.9字节(89),期望值=0.047
同一性=15/32(46%),阳性=22/32(68%)
阅读框=+1
Query:87 TAGCASLAKEMFAMKTKAALAIWCPGYSETQI 118(SEQ ID NO:108)
T GC AKE A+ AL++WCPG+++TQ+
Sbjct:178 TPGCGICAKEAAALGWFCALSVWCPGWAQTQV 273(SEQ ID NO:109)
SEQ ID NO:108:人TSLP
SEQ ID NO:109>gi|36211043|gb|AACN010354273.1|家犬
ctg19866851087147,全基因组鸟枪序列长度=1369
搜索结果5
评分=42.0字节(97),期望值=0.006
同一性=21/44(47%),阳性=27/44(61%)
阅读框=-2
Query:76 LTEIQSLTFNPTAGCASLAKEMFAMKTKAALAIWCPGYSETQIN 119(SEQ ID NO:110)
L I+ LT+ GCAS A+E FA T AALA CPGY+ ++
Sbjct:369 LARIERLTLHRIRGCASGAREAEAEGTVAALAAECPGYAAAPVS 238(SEQ ID NO:111)
SEQ ID NO:110:人TSLP
SEQ ID NO:111>gi|36211043|gb|AACN010354273.1|家犬
ctg19866851087147,全基因组鸟枪序列长度=1369
搜索结果6
评分=38.9字节(89),期望值=0.047
同一性=15/32(46%),阳性=22/32(68%)
框=+1
Query:87 TAGCASLAKEMFAMKTKAALAIWCPGYSETQI 118(SEQ ID NO:112)
T GC AKE A+ AL++WCPG+++TQ+
Sbjct:178 TPGCGICAKEAAALGWFCALSVWCPGWAQTQV 273(SEQ ID NO:113)
SEQ ID NO:112:人TSLP
SEQ ID NO:113>gi|36211043|gb|AACN010354273.1|家犬
ctg19866851087147,全基因组鸟枪序列长度=1369
这个电子构建的序列与人、猴、大鼠、和小鼠TSLP的比较显示保守的内含子/外显子边界和基本的序列同一性,确定此序列为犬TSLP直向同源基因的一部分。基于此发现随后设计PCR引物并用于扩增该基因的缺失部分。通过双重巢式PCR从犬活化的外周血单核细胞(PBMC)cDNA文库中获得2个部分重叠的克隆。通过巢式PCR获得完整犬TSLP cDNA的进一步尝试或向5’或3’端延伸序列的尝试都没有成功。然而,用这些克隆中的延伸序列信息在犬全基因组鸟枪序列数据(加利福尼亚大学圣克鲁兹分校)中进行反复的数据库搜索,结合从此数据库中人工组装原始DNA序列,得到电子组装的全长犬TSLP cDNA。在体外用DNA合成仪合成此cDNA序列的实际克隆。
综上所述,用现有的和最新的分子克隆技术不可能直接从人、小鼠、大鼠、或猴序列中得到犬TSLP序列。只有用收集的人、小鼠、大鼠、和非人灵长类(NHP)TSLP基因进行复杂的反复的数据库搜索,利用基因组数据库中的内含子/外显子边界分配和序列同一性,结合分子PCR克隆技术,才能确定编码犬TSLP的基因。
一旦得到,所述犬TSLP与成熟的人TSLP蛋白的氨基酸序列相比较有58/132的差异(61%同一性),与成熟的小鼠TSLP蛋白的氨基酸序列相比较有83/129的差异(33%同一性)(参见下述)。
家犬与人TSLP成熟蛋白序列比较
TSLP_CF(家犬) 长度 141 (1..141)
TSLP_H(人) 长度 145 (1..145)
评分=167字节(423),期望值=1e-40
同一性=85/139(61%),阳性=101/139(72%)
Query:1 RKIFVLQLVGLVLTYNFIDCDFEKIRWKYQEVIYQALEKYMDGTRSTEFSHPVYCANPPD 60
RKIF+LQLVGLVLTY+F +CDFEKI+ Y I+L YM GT+STEF++ V C+N P
Sbjct:1 RKIFILQLVGLVLTYDFTNCDFEKIKAAYLSTISKDLITYMSGTKSTEFNNTVSCSNRPH 60
Query:61 CLARIERLTLHRIRGCASGAREAFAEGTVAALAAECPGYAAAPINNTQAKKKRKKRGVTT 120
CL I+ LT+ GCAS A+E FA T AALA CPGY+ IN TQA KKR+KR VTT
Sbjct:61 CLTEIQSLTFNPTAGCASLAKEMFAMKTKAALAIWCPGYSETQINATQAMKKRRKRKVTT 120
Query:121 NKCREQVAHLIGLWRRFSR 139(SEQ ID NO:114)
NKC EQV+ L GLWRRF+R
Sbjct:121 NKCLEQVSQLQGLWRRFNR 139(SEQ ID NO:115)
SEQ ID NO:114:家犬TSLP
SEQ ID NO:115:人TSLP
家犬与鼠TSLP成熟蛋白序列比较
TSLP_CF(家犬) 长度 141 (1..141)
TSLP_M(鼠) 长度 136 (1..136)
评分=72.0字节(175),期望值=7e-12
同一性=46/138(33%),阳性=67/138(48%),缺口=8/138(5%)
Query:1 RKIFVLQ-LVGLVLTYNFIDCDFEKIRWKYQEVIYQALEKYMDGTRSTEFSHPVYCANPP 59
R +F+LQ LV + LTYNF +C+F I Y +I+ L +G+ + C+P
Sbjct:1 RSLFILQVLVRMGLTYNFSNCNFTSITKIYCNIIFHDLTGDLKGAKFEQIED---
CESKP 57
Query:60 DCLARIERLTLHRIRGCASGAREAFAEGTVAALAAECPGYAAAPINNTQAKKKRKKRGVT 119
CL +IE TL+ I GC S +FA T AL CPGY N+ + ++
Sbjct:58 ACLLKIEYYTLNPIPGCPSLPDKTFARRTREALNDHCPGYPETERNDGTQEMAQE----V 113
Query:120 TNKCREQVAHLIGLWRRF 137(SEQ ID NO:116)
N C Q + ++LW F
Sbjct:114 QNICLNQTSQILRLWYSF 131(SEQ ID NO:117)
SEQ ID NO:116:家犬TSLP
SEQ ID NO:117:鼠TSLP
因此,通过克服前述困难,本发明现在提供编码犬TSLP的DNA序列及其编码的犬TSLP蛋白。犬TSLP蛋白及其某些片段可作为有用的抗原,例如免疫原,用于产生针对该蛋白的多种表位的抗体,包括直链的和构象的表位。编码犬TSLP的DNA有助于提供载体和宿主细胞,其生产用于免疫和/或用作研究试剂的TSLP蛋白,还有助于提供用于产生抗TSLP抗体的基于DNA的疫苗,可以是适于在被免疫动物的细胞中表达TSLP的“裸”DNA或质粒形式或动物病毒载体。
如此得到的犬TSLP基因序列如图8A(SEQ ID NO:1)所示,预测的表达的TSLP蛋白如图8B(SEQ ID NO:2)所示。氨基酸残基1-28表示信号序列,氨基酸残基29-155表示成熟蛋白。
鉴定同源TSLP蛋白的测定方法
本发明还提供了TSLP蛋白,其包含一段氨基酸序列,该序列与SEQ IDNO:2的氨基酸序列有80%或更高的同一性,不包括其28个氨基酸残基的信号序列,而当该蛋白作为疫苗施用于犬时,可产生与犬TSLP蛋白结合的抗体,其中犬TSLP蛋白包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列。本发明还提供了此类TSLP蛋白的抗原片段。
实际上,证明假定的TSLP蛋白是本发明的TSLP的一种方法是测试该假定蛋白能否产生与犬TSLP结合的抗体,其中犬TSLP包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列。一种此类方法是用不同剂量(5-500μg)的假定TSLP-GST抗原接种(例如注射)犬。此类抗原可在基于氢氧化铝的佐剂中配制,例如吸附凝胶。然后对所述犬肌肉注射3次:第0天、第21天、和第42天。在第0、21、42、和63天采集接种犬和对照(未免疫)犬的血清样品。
抗原接种过的犬体内的抗体诱导可通过下述ELISA测定方法评估:将包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的犬TSLP蛋白在包被缓冲液(碳酸氢钠pH 9.0)中稀释到5μg/ml,在96孔板(Pierce)中每孔加入100μl。4℃孵育过夜。然后用含有0.05%吐温-20(Tween-20)的磷酸缓冲液(PBST)洗板3次。每孔加入200μl封闭液(PBST中2%脱脂牛奶),室温孵育60分钟。用PBST洗板3次。然后,在最上排合适的孔中每孔加入100μl 1∶100稀释的测试犬抗血清。血清样品稀释10倍加入板上合适的位置。室温孵育60分钟后,用PBST洗板3次。
然后,每孔加入100μl 1∶20,000稀释的辣根过氧化物酶结合的羊抗犬IgG(Bethyl Laboratories)。室温孵育60分钟。然后用PBST洗板3次,每孔加入100μl TMB底物(3,3’,5,5’四甲基苯胺,Sigma Chemical公司,St.Louis,MO)。用10-20分钟在室温下进行颜色反应,其后每孔加入50μl0.18M硫酸终止。
用ELISA酶标仪(Thermo Max;Molecular Devices,Sunnyvale,CA)在450nm波长测定了所有孔的光密度(O.D.)。取自注射了假定TSLP抗原的犬的血清样品被认为是可检测的,因此,如果其产生的O.D.值等于或大于取自免疫之前的犬血清样品产生的本底值的3倍,该抗原可鉴定为本发明的TSLP蛋白。类似地,相关抗体对TSLP抗原的效价可基于最高血清稀释倍数来确定,在此稀释倍数下,其产生的O.D.值等于或大于取自免疫之前的犬血清样品产生的本底值的3倍。
犬TSLP蛋白特异性表位的抗体
抗体可针对天然形式和重组形式的犬TSLP蛋白及其片段的多种表位产生,包括物种、多态性、或等位基因变异。另外,抗体可针对犬TSLP的活化形式或非活化形式,包括天然或变性形式产生。抗独特型抗体也在预期之中。
抗原预定片段的抗体,包括结合片段和单链形式,可通过用犬TSLP和/或其片段,和本领域标准的佐剂,和/或与免疫原性蛋白结合免疫动物产生。如此免疫的动物可以是为下调犬TSLP活性而免疫的犬。
合适的宿主,例如纯系小鼠如Balb/c,可用所选蛋白免疫,通常使用标准佐剂和标准小鼠免疫程序(参见Harlow and Lane,引文同上)。对目标动物施用佐剂可在施用疫苗之前、同时、或之后。
或者,源于本文公开的序列的合成肽,并与载体蛋白结合也可用作免疫原。采集多克隆血清并通过免疫分析测定其对免疫原蛋白的效价,例如利用固定于固体载体的免疫原的固相免疫分析。选择效价为1x 104或更高的多克隆抗血清并测试其与其它IL-7家族成员例如啮齿类IL-7的交叉反应活性,测试方法为竞争性结合免疫分析,例如Harlow and Lane,引文同上,第570-573页中所述的方法。优选至少一种其它IL-7家族成员与例如灵长类IL-7在此测定中共同使用。使用本文所述的标准分子生物学和蛋白化学技术,所述IL-7家族成员可生产为重组蛋白并分离。
竞争性结合免疫分析可用于交叉反应活性测定。举例来说,SEQ ID NO:2的蛋白可固定于固体载体。分析中加入的蛋白与抗血清-固定抗原结合相竞争。上述蛋白与抗血清-固定蛋白结合的竞争能力与包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的蛋白相比较。上述蛋白的交叉反应活性百分比可用标准算法计算。选择并汇集与上列各蛋白的交叉反应活性均小于10%的抗血清。交叉反应抗体通过与上列蛋白的免疫吸附从汇集的抗血清中分离出来。
免疫吸附的且汇集的抗血清可用于上述的竞争性结合免疫分析中,进行另一蛋白与免疫原蛋白的比较(例如类似IL-7的SEQ ID NO:2蛋白)。为进行此比较,两种蛋白用宽范围浓度进行分析,测定了各蛋白抑制50%抗血清-固定蛋白结合所需的量。如果另一蛋白所需的量少于所选蛋白所需的量的2倍,另一蛋白可认为与免疫原生成的抗体特异性结合。
本发明的抗体也可用于诊断应用。作为捕获或非中和抗体,可筛选其在不抑制与受体结合的情况下与抗原结合的能力。作为中和抗体,其可用于竞争性结合分析。其还可用于定性或定量检测犬TSLP蛋白或其受体。[参见例如Chan(ed.1987)Immunology:A Practical Guide,Academic Press,Orlando,Fla.;Price and Newman(eds.1991)Principles and Practice of Immunoassay,Stockton Press,N.Y.;和Ngo(ed.1988)Nonisotopic Immunoassay,Plenum Press,N.Y.]。交叉吸附、去除、或其它方法可提供确定选择性的制剂,例如独有的或共有的物种特异性。这可作为鉴定多组抗原的测试的基础。
另外,本发明的抗体,包括抗原结合片段,可作为强力拮抗剂,其与抗原结合并抑制可能诱发生物应答的功能性结合,例如与受体的结合。另外,上述抗体可直接或通过连接剂间接与药物或其它治疗剂结合,并可能影响药物靶向。
源于本文公开的序列的合成肽与载体蛋白结合可用作免疫原。在任何情况下,抗原片段可与其它物质结合,特别是多肽,成为融合的或共价结合的多肽可用作免疫原。抗原及其片段可融合或与多种免疫原共价结合,例如钥孔虫戚血蓝蛋白、牛血清白蛋白、破伤风类毒素等等。制备多克隆抗血清的方法参见Microbiology,Hoeber Medical Division,Harper and Row,1969;Landsteiner(1962)Specificity of Serological Reactions,Dover Publications,New York;Williams,等人(1967)Methods in Immunology and Immunochemistry,第1卷,Academic Press,New York;和Harlow and Lane(1988)Antibodies:A Laboratory Manual,CSH Press,NY。
在某些情况下,需要从多种哺乳动物宿主,例如小鼠、啮齿类、灵长类、人等,制备单克隆抗体。制备此类单克隆抗体的技术描述可在下列文献中发现,例如Stites,等人(编辑)Basic and Clinical Immunology(第4版),Lange Medical Publications,Los Altos,Calif.及其所引用的文献;Harlow and Lane(1988)Antibodies:A Laboratory Manual,CSH Press;Goding(1986)Monoclonal Antibodies:Principles and Practice(第2版),Academic Press,New York;特别是Kohler and Milstein(1975),Nature 256:495-497,其讨论了一种生产单克隆抗体的方法。
其它适合的技术涉及淋巴细胞在体外接触抗原性多肽或者噬菌体或其它类似载体中抗体文库的一部分。[参见Huse,等人(1989)“Generation of aLarge Combinatorial Library of the Immunoglobulin Repertoire in PhageLambda,”Science 246:1275-1281;和Ward,等人(1989)Nature341:544-546.]。本发明的多肽和抗体可直接使用或修饰后使用,包括嵌合、犬源化、和/或人源化抗体。
通常本发明的多肽和抗体通过连接提供可检测信号的其它物质进行标记。可通过共价或非共价结合完成这种连接。大量标记物和结合技术已经熟知并在科学和专利文献中被广泛报道。合适的标记物包括放射性核素、酶、底物、辅因子、抑制剂、荧光基、化学发光基、磁性粒子等等。指导使用此类标记物的专利包括美国专利第3,817,837、3,850,752、3,939,350、3,996,345、4,277,437、4,275,149、和4,366,241号。还有,重组或嵌合免疫球蛋白可以生产,参见Cabilly,美国专利第4,816,567号;Moore,等人,美国专利第4,642,334号;和Queen,等人(1989)Proc.Nat′l Acad.Sci.USA86:10029-10033;或在转基因小鼠中产生,参见Mendez,等人(1997)NatureGenetics 15:146-156。上述文献合并到本文中作为参考。
本发明的抗体也可用于分离蛋白的亲和色谱。将抗体连接到固体载体上以制备色谱柱(参见例如Wilchek等人(1984)Meth.Enzymol.104:3-55)。或者,与固体载体结合的抗原可用于纯化相应的抗体。
各种犬TSLP的抗体也可用于产生抗独特型抗体。这将有助于检测或诊断与各个抗原表达有关的多种免疫疾病。
RNA抑制
在生产犬TSLP的细胞中干扰编码犬TSLP的RNA是另一种抑制TSLP生物活性的方法,可治疗很多与TSLP相关的疾病,例如遗传过敏性皮炎。为此目的,化学合成的或在合适的运输载体,例如质粒或病毒载体中克隆的双链RNA分子可被引入活跃生产TSLP mRNA的细胞,其目的是降低编码TSLP的内源mRNA水平。上述RNA分子进入之后(在外源进入的分子或者质粒或病毒载体进入细胞之后的RNA转录的情况下),被3型核糖核酸酶蛋白的裂解活性处理成短核苷酸片段,称为小分子干扰核糖核酸(siRNA)。上述siRNA片段被整合进包含核酸酶的多蛋白复合物,称为RISC(RNA诱导的沉默复合物),其活化是由于siRNA双螺旋被RNA螺旋酶的活性解旋。此时单链的siRNA引导RISC复合物到其靶mRNA,然后该mRNA被裂解并随后被RISC的核酸内切活性降解。
更具体地,包含TSLP基因或其片段的质粒被克隆进任何一种商业出售的真核质粒,其中TSLP基因或其片段的转录由合适的启动子驱动,例如CMV或SV40启动子。纯化的质粒DNA(1-100ug)被注射到皮肤损伤处或遗传过敏性皮炎特有的环绕皮肤损伤的区域。质粒DNA的注射可重复多次,其频率应足以引起TSLP mRNA显著减少。这种减少可通过以下途径评估:注射区域的皮肤活体组织检查、和测定TSLP mRNA水平,例如定量PCR方法。
下列本发明的实施例提供了本发明的进一步了解,绝非意图限制本发明的有效范围。
实施例
实施例1
犬TSLP DNA和蛋白序列
通过在电子数据库中反复的数据挖掘和分子生物学方法鉴定了一种表达犬TSLP的犬基因,如上详述。
结果
犬TSLP基因序列如图8A(SEQ ID NO:1)所示,表达TSLP蛋白的预测蛋白如图8B(SEQ ID NO:2)所示。图8B(SEQ ID NO:2)中标注星号的氨基酸残基1-28表示信号序列,氨基酸残基29-155表示成熟蛋白。
实施例2
犬TSLP的克隆与表达
编码犬TSLP的DNA如本文所述鉴定,并用本领域的标准方法克隆进一种供体载体pDONR221(Invitrogen Gateway System)。在合作研究机构DNA 2.0中进行基因组装并克隆进供体载体,从而构建一种质粒,称为pDONR221.G03276,其包含已鉴定的基因组犬TSLP基因。使用2种引物从pDONR221.G03276中PCR扩增编码成熟(即不含信号序列)犬TSLP蛋白的DNA,其中引物分别含有Nco I和EcoR V位点:
引物
#1:5’AATAATCCATGGCATACAATTTCATTGACTGTGAC-3’(SEQ IDNO:4);和
#2:5’-AAAATAGATATCTGAAATGCGACTGAAACGACG-3’(SEQ ID NO:5).
Nco I和EcoR V消化后,PCR产物插入到载体pIVEX 1.3 WG(RocheApplied Sciences,商品编号3728803)的Nco I和Sma I位点。由此产生了一种质粒,其包含编码C端融合6个组氨酸残基(6组氨酸标签)的成熟犬TSLP的基因。包含正确插入序列的质粒命名为1265-93.D质粒。1265-93.D质粒用于表达TSLP,使用的设备为RTS Proteomaster Instrument(Roche AppliedSciences,商品编号3064859),根据制造商的建议操作。如图1所示,在第2道和第4道有明显的16kDa条带(箭头所示)。蛋白质印迹实验(图2A和图2B)显示此条带与抗组氨酸标签抗体(图2A)和特异性抗人TSLP的大鼠单克隆抗体(图2B)特异性反应。
实施例3
从宿主细胞中生产犬TSLP
为在E.coli中表达重组TSLP蛋白,PCR扩增了编码cTSLP的核苷酸序列(即缺少编码信号序列的核苷酸),其中模板为质粒1265-66C,正向引物和反向引物分别含有NcoI和Hind III位点:
正向引物
5’-AATAATCCATGGCATACAATTTCATTGACTGTGAC-3’(SEQ IDNO:6)
反向引物
5’-ACATAAAAGCTTTGAAATGCGACTGAAACGACG-3’(SEQ ID NO:7)
NcoI和Hind III消化后,PCR产物插入到pET42b(+)表达载体(Novagen)的NcoI/HindIII位点。此过程产生一种质粒,其编码N端融合GST标签和C端融合6组氨酸标签的成熟cTSLP。包含正确插入序列的质粒命名为1265-93B。GST-TSLP-His融合蛋白的表达在E.coli BL21(DE3)/pLysS中进行,其包含T7RNA聚合酶基因,该基因受异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导的lacUV5启动子调控。含有质粒1265-93B的E.coli细胞在30℃生长,直到O.D.600达到0.6,再加入0.5mM IPTG诱导蛋白表达,并进一步30℃孵育2小时。SDS-PAGE显示在可溶性E.coli馏分中有正确大小(约61kDa)的蛋白条带(箭头所示)(图3A)。蛋白质印迹显示表达的蛋白与抗GST抗体反应(图3D)。GST-TSLP-His蛋白可用谷胱甘肽琼脂糖4B树脂纯化(图3B)。用Ni-NTA树脂再次纯化后,大部分GST-TSLP蛋白包含在纯化柱流穿液中(图3C)。
实施例4
犬TSLP的免疫荧光检测
使用抗人TSLP蛋白的兔多克隆抗体,通过免疫组织化学(“IHC”)测定了犬TSLP蛋白在犬皮肤和扁桃体组织中的表达。免疫组织化学在石蜡包埋组织块上进行,样品取自注射盐水的正常犬皮肤,以及经诊断患有多种皮肤病的患犬皮肤,所患皮肤病包括遗传过敏性皮炎、皮肤红斑狼疮、多形红斑、和交界型大疱性表皮松解症。另外,在两只犬的冷冻扁桃体组织中测定了TSLP蛋白表达。通过IHC测定TSLP表达的程序如下所述:
I.制备切片:
1.包埋皮肤样品的石蜡块切片成5-7微米厚度并置于载玻片上,载玻片已用多聚L-赖氨酸处理以促进粘合。
2.切片用二甲苯去除石蜡,用一系列乙醇溶液再水化。
3.抗体恢复在柠檬酸盐缓冲液中进行[10mM柠檬酸钠,其中含有0.5ml/升Tween-20,用实验室微波炉处理25分钟,达到99-100℃]。此为恢复组织切片在石蜡包埋过程中被掩盖的抗原性的过程。
II.免疫染色
1.切片在磷酸缓冲液(PBS)稀释的10%正常驴血清中室温孵育1小时以降低抗体的非特异性结合。
2.小心去除多余血清,切片用PBS稀释的兔抗体(1∶100)覆盖,在潮湿箱中室温孵育1小时或4℃孵育过夜。
3.切片在PBS中漂洗2次,每次5分钟,其间小心摇动。
4.小心去除多余PBS,切片用PBS 1∶5000稀释的生物素标记的驴抗兔IgG抗体覆盖,在潮湿箱中室温处理30分钟。
5.切片在PBS中漂洗2次,每次5分钟,其间小心摇动。
6.去除多余的PBS,切片在5微克/ml链霉亲和素-异硫氰酸荧光素(链霉亲和素-FITC)结合的PBS中室温孵育30分钟。
7.切片在PBS中漂洗2次,每次5分钟,小心摇动。
8.切片用苏木精复染色2-3分钟。
9.在荧光显微镜下检查切片。
10.拍照合适的图像。
11.实验对照包括不加一级抗TSLP抗体、或用普通兔抗体替换一级抗TSLP抗体。
以下表1总结了IHC实验结果
表1
兔抗人TSLP的免疫组织化学
实施于石蜡包埋皮肤组织块,样品取自多种皮肤病的患犬
TSLP表达在80%AD患犬皮肤组织中检出,但仅在20%注射盐水的正常皮肤组织中检出。TSLP还分别在66%多形红斑患犬和100%遗传性皮肤病交界型大疱性表皮松解症患犬皮肤组织中检出。在皮肤红斑狼疮患犬皮肤组织中无TSLP蛋白表达。在石蜡包埋的皮肤组织中,TSLP表达在汗腺中检出。冷冻犬扁桃体组织中的TSLP表达在复层扁平上皮及其关联的唾液腺中检出。图4显示了犬皮肤样品阳性IHC染色的一个实例,其代表取自诊断为遗传过敏性皮炎患犬的石蜡包埋皮肤组织样品。
实施例6
犬TSLP免疫过氧化物酶检测
使用免疫过氧化物酶染色作为检测方法,通过免疫组织化学测定犬TSLP蛋白在由诊断为遗传过敏性皮炎患犬皮肤制备的石蜡包埋组织块中的表达。在此方法中,表位特异性的大鼠抗人TSLP蛋白单克隆抗体被用作一级抗体。通过免疫过氧化物酶染色测定TSLP表达的程序如下所述:
特殊试剂
普通新生牛血清:#N-4762 Sigma
石蜡包埋皮肤组织
一级抗体:大鼠抗人TSLP mAB大鼠IgG2a
二级抗体:兔抗大鼠IgG(生物素标记):BA-4000 Vector Lab.Burlingame,CA
检测试剂:链霉亲和素-辣根过氧化物酶:#43-8323 Zymed Labs.SanFrancisco,CA
3-氨基-9-乙基卡巴唑(AEC)底物试剂盒:Biogenex #HK129-5K SanRamon,CA
1.样品切片4-6um。
2.室温风干10分钟。
3.丙酮固定10分钟。
4.PBS(0.01磷酸缓冲液)漂洗3分钟。
5.在含有0.1%叠氮钠的0.3%过氧化氢中淬灭7-10分钟。
6.PBS漂洗5分钟。
7.在保湿箱中用1%普通新生牛血清封闭切片20分钟。
8.沥干载玻片,加入1∶100稀释的一级抗体,室温2小时。
9.漂洗5分钟。
10.加入二级抗体(1∶400稀释的兔抗大鼠IgG),在保湿箱中室温30分钟。
11.漂洗5分钟。
12.沥干,加入检测试剂(1∶400稀释的链霉亲和素-辣根过氧化物酶),室温30分钟。
13.漂洗2次,每次5分钟。
14.加入AEC,2.5分钟。根据所需染色深度和背景调整。
15.苏木精复染色并制作标本。
使用表位特异性的犬TSLP抗体,通过IHC检测一组AD患犬的犬皮肤组织。图5所示结果提示此抗体可与和人TSLP具有相同表位的分子反应。犬AD皮肤样品在表皮增厚的慢性炎症区域染色强烈。这种表现与已知的人AD皮肤损伤中的TSLP表达位置一致,进一步表明在犬皮肤AD损伤中识别的分子是犬TSLP。使用PBS或不同蛋白(淋巴细胞蛋白)特异性的不同大鼠单克隆抗体不能观察到染色。
实施例7
犬TSLP的表位作图
为鉴定可在能够中和TSLP活性的疫苗中包含的犬TSLP表位,合成一组基于犬TSLP蛋白序列的相互重叠的肽,并测试其与抗人TSLP单克隆中和抗体反应的能力。为此目的,在MIMOTOPES(Minneapolis,MN)的针上合成一组相互重叠的肽,各长15个氨基酸,相互错开2个氨基酸。上述肽的序列在表2中列出。合成的肽1-57带有酰胺化末端,结构为NH2-PEPTIDE-PIN。合成的肽58-94(母肽1-37的重复)带有乙酰化末端,结构为ACETYL-PEPTIDE-PIN。
根据制造商推荐的程序(Mimotopes,Minneapolis,MN),通过ELISA分析检测含表2中所列的肽的针(The pins carrying the peptide listed in Table2)。如图6所示,25号多肽(表位25),其氨基酸序列为NH2-ARIERLTLHRIRGCA(SEQ ID NO:32),具有最高的抗PAB100单克隆抗体的反应活性。图7所示为该多肽序列与对应的假定人TSLP多肽序列的比较。
表2
用于表位作图的犬TSLP多肽
本发明的范围不受本文所述的具体实施方式的限制。实际上,根据前面所述,对本领域的技术人员而言,除本文所述之外的对本发明的多种改型是显而易见的。此类改型理应列入所附权利要求书的范围内。
应进一步了解,为核酸或多肽给出的所有碱基大小或氨基酸大小、以及所有分子量或分子量数值都是近似的,仅为描述所用。
本文引用了很多文献,其公开的全部内容结合到本文中作为参考。
Claims (12)
1.抗犬胸腺基质淋巴细胞生成素蛋白(TSLP)抗体,其在哺乳动物或哺乳动物杂交瘤体系中被组合物诱导产生,所述组合物包含TSLP或其抗原片段,其中所述TSLP蛋白包含一段氨基酸序列,该序列与SEQ ID NO:2的氨基酸序列有90%或更高的同一性,不包括其28个氨基酸残基信号。
2.根据权利要求1所述的抗犬TSLP抗体,其中所述抗体是单克隆抗体。
3.根据权利要求2所述的抗犬TSLP抗体,其中所述单克隆抗体是犬源化的。
4.抗犬胸腺基质淋巴细胞生成素蛋白(TSLP)抗体,其在哺乳动物或哺乳动物杂交瘤体系中被组合物诱导产生,所述组合物包含融合蛋白;
其中所述融合蛋白包含TSLP或其抗原片段;并且
其中所述TSLP蛋白包含一段氨基酸序列,该序列与SEQ ID NO:2的氨基酸序列有90%或更高的同一性,不包括其28个氨基酸残基信号。
5.根据权利要求4所述的抗犬TSLP抗体,其中所述抗体是单克隆抗体。
6.根据权利要求5所述的抗犬TSLP抗体,其中所述单克隆抗体是犬源化的。
7.根据权利要求1所述的抗犬TSLP抗体在制备用于治疗特异反应性犬的过敏症状的药物中的应用。
8.根据权利要求2所述的抗犬TSLP抗体在制备用于治疗特异反应性犬的过敏症状的药物中的应用。
9.根据权利要求3所述的抗犬TSLP抗体在制备用于治疗特异反应性犬的过敏症状的药物中的应用。
10.根据权利要求4所述的抗犬TSLP抗体在制备用于治疗特异反应性犬的过敏症状的药物中的应用。
11.根据权利要求5所述的抗犬TSLP抗体在制备用于治疗特异反应性犬的过敏症状的药物中的应用。
12.根据权利要求6所述的抗犬TSLP抗体在制备用于治疗特异反应性犬的过敏症状的药物中的应用。
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