CN101905024A - 含有血管生成素-样蛋白质3angptl3的组合物及其使用方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及含有血管生成素-样蛋白质3ANGPTL3的组合物及其使用方法。本发明涉及制备和使用Angptl3多肽的方法和工具。本发明具体涉及Angptl3多肽在诱导肝脏再生和血管生成中的用途。其它方法包括Angptl3多肽在诊断和治疗肝脏疾病中的用途。在此还提供了与本发明的多肽结合的抗体。
Description
本申请是申请日为2002年11月13日、申请号为02827192.0(国际申请号为PCT/US02/36865)、发明名称为“含有血管生成素-样蛋白质3ANGPTL3的组合物及其使用方法”的发明申请的分案申请。
发明背景
技术领域
本发明涉及Angptl3多肽以及制备和使用所述蛋白质分子的方法和工具(means),和结合Angptl3多肽的抗体。
相关技术的描述
新血管的生长在胚胎发育和出生后发育的正常生理学过程中是一个必要条件。从已有的毛细血管增生出新血管的过程(称为血管生成),还在实体瘤,糖尿病性视网膜病,牛皮癣,炎症和类风湿性关节炎的病理发展中起关键作用(Ferrara,Recent Prog.Horm.Res.55:15-35(2000),讨论35-6)。
血管生成不仅依赖于生长因子,例如血管内皮生长因子(VEGF)和成纤维细胞生长因子(FGF),而且还受到包括整联蛋白在内的细胞粘附分子(CAMs)的影响。编码特异性粘附受体的各种基因的失活或在动物模型中施加封闭性抗体对内皮细胞的血管生成反应具有显著的影响(Elicieri和Cheresh,Mol.Med.,4:741-50(1998))。
细胞粘附蛋白的整联蛋白家族由15个α和8个β亚基组成,有至少22种不同的αβ异二聚体组合形式(Byzova等,Mol.Cell.,6(4):851-60(2000))。其中,至少6种组合(αvβ3,αvβ5,α5β1,α2β1,αvβ1和α1β1)涉及血管生成(Hynes和Bader,Thromb.Haemost.,78(1):83-7(1997);Hynes等,Braz.J.Med.Biol.Res.,32(5):501-10(1999))。整联蛋白促进细胞粘附并迁移到在细胞间隙和基底膜中发现的细胞外基质蛋白上。
整联蛋白αvβ3是包括玻连蛋白,纤连蛋白,血纤蛋白原,层粘连蛋白,胶原蛋白,冯威勒布兰特(Van Willebrard)因子,骨桥蛋白和MMP2的片断(PEX)等在内的广泛多种细胞外基质蛋白的受体(综述参见Eliceiri和Cheresh,Cancer J.Sci.Am.6 Suppl 3:S245-9(2000))。尽管αvβ3具有混杂的配体结合行为,但是在成年组织中并不广泛表达,仅在一些血管,肠和子宫平滑肌细胞中发现(Brem等,Invest.Ophthalmol.Vis.Sci.,35:3466-74(1994)。该受体也在某些活化的白细胞中表达,在巨噬细胞和破骨细胞中表达,这时它在骨吸收期间起重要作用(McHugh,等,J.Clin.Invest.,105:433-40(2000))。最突出的是,在暴露于低氧和诸如血管内皮生长因子A(VEGF-A)等细胞因子的内皮细胞中,αvβ3出现上调(Suzuma等,Invest Ophthalmol.Vis.Sci.39:1029-35(1998);Walton等,J.Cell.Biochem.78:674-80(2000))。在体内,在肿瘤肉芽组织内的血管细胞上,在伤口愈合,黄斑变性和其它新血管疾病期间观察到αvβ3表达增加。在肿瘤血管生成的各种体外和体内模型中,用单克隆抗体或配体拮抗剂封闭αvβ3导致形成钝头血管(Brooks等,Cell 79:1157-64(1994);Eliceiri和Cheresh,Mol.Med.4:741-50(1998))。
尽管有大量的报道集中在诸如肿瘤生长或心肌局部缺血后侧副管形成等病理情况下与血管生成的调节相关的机理上,但是令人惊奇的是对于肝脏再生期间血管生成过程的作用所知甚少。经部分肝切除术(PH)后,肝细胞和非实质细胞表达血管内皮生长因子(VEGF)mRNA(Mochida等,Biochem.Biophys.Res.Commun.226:176-9 issn:0006-291x(1996)),意味着VEGF借助于诱导血管生成可能在肝脏再生中起作用。然而,抗VEGF的中和抗血清不会改变损伤后的恢复率,而是导致在该模型中增生的内皮细胞和肝细胞减少(Taniguchi等,J.Histochem.Cytochem.49:121-30(2001))。与此一致,加入血管生成抑制剂TNP-470不会损害部分肝切除术后的伤口愈合,表明肝脏再生期间不需要TNP470-敏感型血管生成(Tanaka等,Br.J.Surg.,83(10):1444-7(1996))。
仍然需要鉴定在肝脏再生,且特别是在肝脏再生期间的血管生成过程中涉及的新因子。
发明概述
本发明涉及含有与人Angptl3序列具有序列相同性的氨基酸序列的多肽,或其激动剂(agonist)治疗以Angptl3过量表达为特征的组织损伤的用途。具体地说,本发明涉及Angptl3在治疗(包括预防)或鉴定存在组织损伤危险,优选肝脏或心脏组织损伤危险的人类受试者中的用途。因此,据信Angptl3涉及肝脏再生期间血管生成过程的调节。
本发明涉及治疗以Angptl3过量表达为特征的组织损伤的方法,包括用SEQ ID NO:2所示Angptl3的拮抗剂或其哺乳动物同系物处理组织。在一个实施方案中,该治疗包括预防,更具体地说,预防组织损伤的进展。
在一个优选的实施方案中,该组织优选是人肝脏组织。该拮抗剂优选是SEQ ID NO:2所示Angptl3的拮抗剂。该组织损伤优选与炎症或肝脏肿瘤相关。该炎症优选与选自由肝硬化,肝纤维变性,慢性肝炎,甲、乙、丙、丁、戊和庚型病毒性肝炎,中毒性代谢性肝损伤,脂肪肝,肝脏局部缺血再灌注(ischemia reperfusion)损伤和脓毒病组成的组中的一种慢性肝病相关。肝硬化是酒精性肝硬化或原发胆汁性肝硬化(PBC)。肝炎是选自由慢性自身免疫肝炎,慢性酒精性肝炎和非酒精性脂肪肝炎(NASH)组成的组中。肝脏肿瘤选自由肝细胞癌,胆管癌和肝脏转移癌组成的组中。
在另一实施方案,该组织优选是心脏组织。该组织损伤优选与炎症相关。该组织损伤优选与特征在于Angptl3表达升高的心脏疾病相关。在另一方面,该组织损伤与其发病机理包括炎症反应,或在其形成中炎症是一个危险因素的那些心脏疾病相关。该心脏疾病优选选自由冠状动脉疾病,心肌病,心肌炎,充血性心力衰竭(CHF),和心肌梗塞组成的组中。心肌病优选选自由非特异性肥大和扩张性心肌病组成的组中。
在另一实施方案中,该拮抗剂是抗-Angptl3的抗体,抗-αvβ3的抗体,免疫粘附素或小分子。该抗体优选是单克隆抗体,选自由Fab,Fab′,F(ab′)2和Fv片断组成的组中的抗体片断或单链抗体。该单克隆抗体优选是嵌合的,人源化的或人的。该免疫粘附素至少包含与免疫球蛋白序列融合的αvβ3的配体结合区或至少包含用于免疫球蛋白序列的Angptl3的受体结合区。
在另一方面,本发明包括治疗哺乳动物受试者中的慢性肝脏疾病的方法,包括给需要的哺乳动物受试者施用有效量的具有SEQ ID NO:2的Angptl3的拮抗剂,或其哺乳动物同系物。在一个实施方案中,该哺乳动物受试者是人。该治疗包括预防且更具体地说,预防肝脏疾病的进展。施用的该拮抗剂是具有SEQ ID NO:2的Angptl3的拮抗剂或抗体,特别是抗-Angptl3的抗体或抗-αvβ3的抗体。该慢性肝病特征在于Angptl3的表达升高。该肝脏疾病选自由肝硬化,肝纤维变性,慢性肝炎,甲、乙、丙、丁、戊和庚型病毒性肝炎,中毒性代谢性肝损伤,脂肪肝,肝脏局部缺血再灌注损伤和脓毒病组成的组中。
在另一方面,本发明包括治疗哺乳动物受试者中的心脏疾病的方法,包括给受试者施用有效量的具有SEQ ID NO:2的Angptl3的拮抗剂,或其哺乳动物同系物。在一个实施方案中,该哺乳动物受试者是人。该治疗包括预防且更具体地说,预防心脏疾病的进展。施用的该拮抗剂是具有SEQ IDNO:2的Angptl3的拮抗剂。该心脏疾病选自由冠状动脉疾病,心肌病,心肌炎,充血性心力衰竭(CHF),和心肌梗塞组成的组中。该拮抗剂是抗-Angptl3的抗体或抗-αvβ3的抗体。
在另一方面,本发明包括治疗急性肝脏疾病的方法,包括给需要的哺乳动物受试者施用治疗上有效量的多肽,或其激动剂,该多肽包含与具有SEQ ID NO:2的人Angptl3序列具有至少80%的序列相同性的氨基酸序列。在一个实施方案中,该哺乳动物受试者是人。该治疗包括预防且更具体地说,预防急性肝脏疾病的进展。该多肽包含与具有SEQ ID NO:2的人Angptl3序列具有至少98%相同性的氨基酸序列,或其激动剂。在一个优选的实施方案中,该多肽包含具有SEQ ID NO:2的人Angptl3序列的氨基酸区域281-293(P1,SEQ ID NO:14),442-460(P2,SEQ ID NO:15),和415-430(P3,SEQ ID NO:17)。在另一优选的实施方案中,该多肽包含具有SEQ ID NO:2的人Angptl3序列的血纤蛋白原结构域。在甚至更优选的实施方案中,该方法包括施用另一治疗剂。该另一治疗剂是血管内皮生长因子(VEGF)或成纤维细胞生长因子(FGF)。该激动剂是特异性结合Angptl3或αvβ3的激动剂抗体。
在另一方面,本发明包括在急性肝脏损伤后诱导肝脏再生的方法,包括给需要的哺乳动物受试者施用治疗上有效量的多肽,或其激动剂,该多肽包含与具有SEQ ID NO:2的人Angptl3序列具有至少80%序列相同性的氨基酸序列。该哺乳动物受试者优选是人类。该人类受试者可能被诊断为患有炎症性肝脏疾病,例如慢性,酒精性或病毒性肝炎,脓毒病,原发胆汁性肝硬化(PBC)或原发性或转移性肝癌,肝脏受到化学或机械损伤或者由于诸如慢性肝炎,肝硬化,原发性或转移性肝癌,或胆囊癌等任何原因接受了肝切除术。另外,患者可能暴露于引起肝脏损伤的化学剂或其它环境或其它已知因素,且在所述损伤进展前得到治疗。预防性治疗具体包括在本发明的范围内。
在另一方面,本发明包括在组织中诱导血管生成的方法,包括用有效量的多肽,或其激动剂治疗该组织,该多肽包含与具有SEQ ID NO:2的人Angptl3序列具有至少80%序列相同性的氨基酸序列。在一个实施方案中,该组织是心脏组织或肝脏组织,该肝脏组织可以是由于感染性或自身免疫性病变,机械或化学损伤,或者癌症或转移癌而被损伤的患病肝脏组织。预防性治疗且更具体地说预防该疾病的进展具体包括在本发明的范围内。
在另一方面,本发明包括抑制组织中不需要的血管透性增大的方法,包括施用有效量的具有SEQ ID NO:2的Angptl3的拮抗剂,或其哺乳动物同系物。血管透性增大可以是组织损伤后小血管透性的增大或者可以是在暴露于毒素而引起的血管内皮坏死之后出现。血管透性增大与炎症相关,优选慢性炎症。该组织是肝脏组织或心脏组织。预防性治疗且更具体地说预防该疾病的进展都具体包括在本发明的范围内。
在另一方面,本发明包括鉴定存在心血管疾病危险的人类受试者的方法,优选在发生严重损伤之前。该方法包括测定所述受试者心脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平,相对于所述受试者心脏组织中Angptl3或其表达产物的水平,相对于正常心脏组织中Angptl3或其表达产物的水平,且该受试者心脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平相对于正常心脏组织升高则确定该受试者存在危险。该心脏组织样品可从怀疑存在心血管疾病危险的受试者,优选从人类患者获取,且可进行差别基因表达分析以检测SEQ ID NO:1所示人Angptl3基因的上调,比较存在危险的心脏组织样品中Angptl3的表达与从正常心脏组织获取的第二种心脏样品的表达。差别基因表达分析可通过包括northern印迹,原位杂交,逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)等已知技术,或者通过使用微阵列技术进行。
在另一方面,本发明包括鉴定存在肝脏损伤危险的人类受试者的方法,优选在发生严重损伤之前。该方法包括测定所述受试者肝脏组织中Angptl3mRNA或其表达产物的水平,相对于正常肝脏组织中Angptl3或其表达产物的水平,且该受试者肝脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平相对于正常肝脏组织升高则确定该受试者存在危险。该肝脏组织样品可从怀疑存在肝脏损伤危险的受试者,优选从人类患者获取,且可进行差别基因表达分析以检测SEQ ID NO:1所示人Angptl3基因的上调,比较存在危险的肝脏样品中Angptl3的表达与从正常肝脏组织获取的第二种肝脏样品的表达。差别基因表达分析可通过包括northern印迹,原位杂交,逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)等已知技术,或者通过使用微阵列技术进行。
在所有治疗性应用(包括预防)中,Angptl3多肽,或其激动剂或拮抗剂可与诸如另一血管生成因子,例如血管内皮生长因子(VEGF),或成纤维细胞生长因子(FGF)等另一治疗剂组合给药。
本发明还涉及:
1.一种治疗以Angptl3过量表达为特征的组织损伤的方法,包括用Angptl3的拮抗剂治疗该组织。
2.权利要求1的方法,其中该组织是肝脏组织。
3.权利要求2的方法,其中该组织损伤与炎症相关。
4.权利要求3的方法,其中该组织损伤与慢性肝脏疾病相关。
5.权利要求2的方法,其中该组织损伤与肝脏肿瘤相关。
6.权利要求1的方法,其中该组织是心脏组织。
7.权利要求6的方法,其中该组织损伤与炎症相关。
8.权利要求6的方法,其中该组织损伤与以Angptl3表达升高为特征的心脏疾病相关。
9.权利要求1的方法,其中该拮抗剂是抗-Angptl3抗体或抗-αvβ3抗体。
10.权利要求1的方法,其中该拮抗剂是免疫粘附素。
11.一种治疗哺乳动物受试者的慢性肝脏疾病的方法,包括给需要的哺乳动物受试者施用有效量的Angptl3的拮抗剂。
12.权利要求11的方法,其中该慢性肝脏疾病的特征在于Angptl3的表达升高。
13.权利要求11的方法,其中该拮抗剂是抗-Angptl3或抗-αvβ3的抗体。
14.一种治疗哺乳动物受试者中以Angptl3表达升高为特征的心脏疾病的方法,包括给受试者施用有效量的Angptl3的拮抗剂。
15.权利要求14的方法,其中该拮抗剂是抗-Angptl3的抗体或抗-αvβ3的抗体。
16.一种治疗急性肝脏疾病的方法,包括给需要的哺乳动物受试者施用治疗上有效量的多肽或其激动剂,该多肽包含与SEQ ID NO:2的人Angptl3序列具有至少80%序列相同性的氨基酸序列。
17.权利要求16的方法,其中所述的多肽包含SEQ ID NO:2的人Angptl3序列的氨基酸区域281-293(P1,SEQ ID NO:14),442-460(P2,SEQID NO:15),和415-430(P3,SEQ ID NO:17)。
18.权利要求16的方法,其中所述的多肽包含SEQ ID NO:2的人Angptl3序列的血纤蛋白原结构域。
19.权利要求16的方法,还包括给药另一治疗剂。
20.权利要求16的方法,其中所述的激动剂是特异性结合Angptl3或αvβ3的激动剂抗体。
21.一种诱导急性肝脏损伤后的肝脏再生的方法,包括给需要的哺乳动物受试者施用治疗上有效量的多肽或其激动剂,该多肽包含与SEQ ID NO:2的人Angptl3序列具有至少80%序列相同性的氨基酸序列。
22.一种诱导组织中血管生成的方法,包括用有效量的多肽或其激动剂治疗该组织,该多肽包含与SEQ ID NO:2的人Angptl3序列具有至少80%序列相同性的氨基酸序列。
23.权利要求22的方法,其中该组织是肝脏组织。
24.权利要求22的方法,其中该组织是心脏组织。
25.一种抑制组织中血管透性不需要地增大的方法,包括用有效量的Angptl3的拮抗剂治疗该组织。
26.权利要求25的方法,其中该组织是肝脏组织。
27.权利要求25的方法,其中该组织是心脏组织。
28.一种鉴定存在心血管疾病危险的人类受试者的方法,包括测定所述受试者心脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平相对于正常心脏组织中Angptl3或其表达产物的水平,当该受试者心脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平相对于正常心脏组织升高时,则确定该受试者存在危险。
29.一种鉴定存在肝脏损伤危险的人类受试者的方法,包括测定所述受试者肝脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平相对于正常肝脏组织中Angptl3或其表达产物的水平,当该受试者肝脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平相对于正常肝脏组织升高时,则确定该受试者存在危险。
附图说明
图1是Angptl3的核苷酸序列(SEQ.ID NO:1)(DNA 16451)。
图2A和2B是Angptl3的氨基酸序列(SEQ.ID NO:2)。
图3A是Angptl3(SEQ ID NO:2)和血管生成素(angiopoietin)-1(ANG1)和血管生成素-2(ANG2)的结构域结构的比较。
图3B显示了用含有人ANG2,ARP1,Angptl3的gD-表位标记形式的条件培养基或对照培养基培养的HMVEC细胞的FACS分析结果。
图4显示了用分别编码ANG1,ANG2,ARP1,Angptl3的gD-标记形式和Tie1受体或Tie2受体的质粒共转染293细胞的共免疫沉淀实验的结果。上清用抗Tie1或Tie2的抗体免疫沉淀,通过SDS-PAGE分离并印迹到PVDF膜上的蛋白质用抗gD标记或Tie受体的抗体分别温育。
图5A-C显示了Angptl3的血纤蛋白原结构域的同源性模型。(A)人血纤蛋白原(3FIB)γ-链C末端的X-射线结构(白色),和Angptl3的血纤蛋白原样结构域的模型结构(绿色)的叠置带状图。α螺旋表示为圆筒,β链用箭头指示。标记了在两种结构中有区别的区域。(B)Angptl3的血纤蛋白原样结构域的模型结构(绿色)的带状图。α5β3中包含的P1,P1,和P3区以黄色显示。(C)人血纤蛋白原(3FIB)γ-链C末端(SEQ ID NO:27)与Angptl3的血纤蛋白原样结构域(SEQ ID NO:28)和人血管生成素1(SEQ ID NO:29),2(SEQ ID NO:30)和4(SEQ ID NO:31)的序列对比。亲水和带电的残基以蓝色表示,芳香/疏水残基以橙色表示。共有序列在序列对比下面显示;保守的亲水/带电和芳香/疏水突变分别标记为蓝色和橙色方框。相应于本研究所用的肽的残基在黄色框中表示。编号方式相应于3FIB的x-射线结构。
图6A-C提供了Angptl3是分泌型糖蛋白的证据。(A)免疫亲和纯化的人Angptl3的考马斯染色的SDS-聚丙烯酰胺凝胶。(B)从瞬时转染的CHO细胞免疫亲和纯化的鼠Angptl3经银染的SDS-聚丙烯酰胺凝胶。(C)用(+)或没用(-)PNGase-F处理的重组Angptl3蛋白的分子量比较。gD标记的hAngptl3的预期分子量是60kDa。使用抗-gD抗体进行Western印迹。
图7A-E提供了Angptl3用于内皮细胞结合的结构域的功能性分析并将αvβ3-整联蛋白鉴定为生物学反应的介质。(A)在用200nM MA进行刺激的4小时前,用肽p1,p2和p3的组合(总体100μM或250μM),对照(NL6-PP2-scr,250μM)或RGD或RGE肽(250μM)预培养后测试HMVEC贴壁。存在200nM PMA且没有肽时的贴壁设定为值100%。(B)在用20μg/mlhAngptl3或BSA覆盖的微量滴定板上测试过量表达整联蛋白αIIbβ3,αvβ3,αvβ1,或αvβ5的293细胞的贴壁。在37℃允许细胞贴壁并在4小时后定量。(C)用增大量的hAngptl3覆盖96-孔平板在4℃过夜,用3%BSA在37℃封闭非特异性结合1小时,平板接种HMVEC细胞前用PBS洗涤孔。显示的数据是三个独立实验的平均值和SD。(D)在用200nM PMA进行刺激前,用含有或不含25mg/ml封闭抗体抗-α5β1(JBS5),抗-αvβ3(LM609),或抗-αvβ5(P1F6)预培养HMVEC。作为阴性对照,贴壁在10mM EDTA存在下进行。(E)在含有或不含25μg/ml封闭抗体抗-αvβ3(LM609),或抗-αvβ5(P1F6)的条件下未刺激或hAngptl3刺激(50μg/ml)的HMCECs迁移16小时。
图8A-C显示了Angptl3在发育期间的肝细胞中表达且在患病肝脏中显著上调。(A)使用人多组织印迹(Clontech)进行hAngptl3的Northern印迹分析,揭示了在肝脏和肾中hAngptl3的表达。每个泳道含有来自成人脑(BR),心脏(HT),骨骼肌(SM),结肠(CO),胸腺(TH),脾(SP),肾(KD),肝(LI),小肠(SI),胎盘(PL),肺(LU),和外周血白细胞(PBL)的2μg RNA。(B)在来自肝硬化组织中的和被acetominophen中毒损伤后的肝细胞中hAngptl3的表达显著上调。在肝脏肿瘤样品中未观察到改变。(C)胎鼠肝脏的原位杂交表明在E15和E18的肝细胞中表达mAngptl3,但在红细胞祖细胞,内皮细胞和巨核细胞中不表达。
图9A-E显示了CCLF1对大鼠角膜中体内血管生成的诱导的影响。(A)用缓冲液(对照),(B)鼠Angptl3(500ng),(C)VEGF(100ng),(D)鼠Angptl3(500ng)和VEGF(100ng)处理hydron颗粒,6天后进行移植,所得大鼠角膜的代表性平整-封固的显微照片。(E)针对对照,VEGF(100ng),mAngptl3(500ng),mAngptl3(500ng)和所示组合的体内血管生成反应的总结性数据。数据表示为平均值±SE,n=5只动物/组。与对照相比p<0.005(用于非参数值的Mann-Whitney检验)。
图10A-B显示,根据在第0天用腺病毒感染并在第4天用CC14处理后在第7天的天冬氨酸转移酶(AST)的血清水平,评估鼠Angptl3在CC14诱导的肝脏毒性中的保护效果。图10A显示,在第0天用腺病毒感染并在第4天用CC14处理后,在第7天时所测试的所有构建体的表达水平相等。图10B显示了在第0天用所示病毒载体处理并在第4天用CC14处理后在第7天时小鼠血清中的AST水平。(P<0.0001)。
图11A-B显示,在C57/B16野生型小鼠肝脏中鼠Angptl3延长表达后,血清AST水平增加。图11A显示,在第0天用所示病毒构建体处理并在第4天用CC14处理后,在各时间点,小鼠血清中的AST水平。图11B显示,在腺病毒感染的两周后,RAG2敲除小鼠血清中ALT和AST水平增加。结果以平均值±SEM表示。每组动物数为6(P<0.0001)。
图12A-D显示了K5-Angptl3转基因小鼠或野生型FVB小鼠皮肤中,因皮内施用表达Angptl3的腺病毒载体而导致血管渗漏增加。图12A显示了RNA的实时RT-PCR分析结果,所述RNA是从转基因小鼠和窝型匹配(liter matched)的野生型对照小鼠的各种器官分离的。皮肤中转基因的表达达到在肝脏中检测到的内源性Angptl3表达水平的大约10%。图12B显示了RNA的实时RT-PCR分析结果,所述RNA是在出生后不同时间点从转基因小鼠和窝型匹配的野生型对照小鼠的皮肤活检组织分离的。图12C显示了对11周-龄的转基因小鼠和窝型匹配的野生型对照小鼠进行伊文思蓝试验以测定血管透性水平的结果。转基因小鼠显示出在基础条件下血管透性明显增大(左侧组)而用芥子油攻击时不增大(右侧组)。通过分光光度计在610nm下的吸收测量渗出的伊文思蓝染料的量并表示为每1mg组织湿重的染料含量(下面组)。结果表示为平均值±SEM,每组动物数为6只,P<0.05。图12D显示了用1x109Pfu的所示腺病毒构建体皮肤内注射FVB小鼠,在给药6天后进行的伊文思蓝试验的结果。用Angptl3(p<0.05)或VEGF(p<0.005)处理的小鼠皮肤显示出与对照处理的小鼠(LacZ)相比时在基础条件下血管透性明显增大(左侧组)。用分光光度计在610nm下测量渗出的伊文思蓝染料的量并表示为每1mg组织湿重的染料含量。结果表示为平均值±SEM,且每组动物数为6只,P<0.05。
图13显示了新鲜分离的鼠肝细胞与重组鼠Angptl3(mAngptl3)的结合水平。肝细胞粘着到以所示浓度的重组mAngptl3,纤连蛋白或BSA对照覆盖的培养皿上。用3%BSA在37℃封闭非特异性结合1小时,平板接种细胞前用PBS洗涤孔。所示的数据代表在总共3个独立实验中以一式三份进行的一个代表性实验的平均值±SD。
优选实施方案的详细描述
A.定义
术语“肝脏疾病”在此以最广义使用且是指与任何类型的肝脏损伤相关的任何肝脏疾病,而不论其内在原因。因此,肝脏疾病可以由例如,感染或自身免疫病变,对肝脏的机械或化学损伤,或癌症引起,所有这些情况都包含在“肝脏疾病”的定义内。对肝脏的化学损伤可能由各种毒素引起,例如醇,四氯化碳,三氯乙烯,铁过量,药物过量,药物副作用等。
术语“与炎症相关的组织损伤”及其语法上的变化形式用于指至少部分由炎症引起或者伴随着炎症反应的任何组织损伤。组织可以是例如,肝脏组织或心脏组织,且组织损伤可以例如,与炎症性肝脏疾病,或者心脏疾病相关。
本文使用的术语“炎症性肝脏疾病”是指其病理涉及炎症性细胞活化并募集至肝脏的任何肝脏疾病,而不论其内在原因是感染还是自身免疫病变,对肝脏的化学损伤,或其它。因此,炎症性肝脏疾病包括,但不限于,酒精性肝炎和肝硬化,病毒性肝炎,肝脏的局部缺血再灌注损伤,脓毒病和原发胆汁性肝硬化(PBC)。其综述参见Lawson等,Toxicol Sci 54:509-16(2000)。
本文使用的术语“慢性肝脏疾病”是指以Angptl3过量表达为特征的肝脏疾病,且包括,但不限于肝脏的炎症性疾病和肝脏肿瘤。例如,肝脏的炎症性疾病包括,诸如酒精性肝硬化和原发胆汁性肝硬化(PBC)等肝硬化,肝脏纤维变性,慢性肝炎,即慢性自身免疫性肝炎,慢性酒精性肝炎,非酒精性脂肪肝炎(NASH,也称为脂肪变性),病毒性肝炎甲型,乙型,丙型,丁型,戊型和庚型,中毒代谢性肝脏损伤,脂肪肝,肝脏的局部缺血再灌注损伤,和脓毒病。肝脏肿瘤包括,例如,肝细胞癌,胆管癌,和肝脏的转移癌。
本文使用的术语“急性肝脏疾病”是指短期的肝脏疾病,其病史一般不超过6个月。该定义包括,例如,急性肝炎,即急性自身免疫性肝炎和急性酒精性肝炎,和急性肝衰竭。该定义特别包括不以Angptl3过量表达为特征的任何短期肝脏疾病。
本文使用的术语“心脏疾病”是指其病理包括炎症反应,或者炎症是其形成的一个危险因素的任何心脏疾病。该定义特别包括以Angptl3表达提高为特征的任何心脏疾病。该定义包含的心脏疾病包括,但不限于,冠状动脉疾病,诸如肥大性心肌病,非特异性肥大和扩张性心肌病等心肌病,心肌炎,充血性心力衰竭(CHF),心脏病发作,等。
本文使用的“酒精性肝炎”包括由过量消费酒精引起的急性和慢性肝炎,且包括从仅有实验室试验异常作为疾病征兆的轻度肝炎,到具有诸如黄疸(由胆红素滞留引起的黄皮肤),肝性脑病变(由肝衰竭引起的神经机能障碍),腹水(腹部的液体积累),出血性食管静脉曲张(食管中静脉曲张),异常凝血和昏迷等并发症的严重肝脏机能障碍。
本文使用的术语“病毒性肝炎”是指由甲,乙,丙,丁,戊或庚型肝炎感染引起的肝炎。
甲肝病毒(HAV)是来自小RNA病毒科(Picornaviridae)肠道病毒的一种,通常引起轻度的疾病,该疾病的特征在于突然发热,不适,恶心,食欲不振,和腹部不适,几天后出现黄疸。
乙肝病毒(HBV)是嗜肝DNA病毒科(Hepadnaviridae)主要的双链DNA病毒。HBV引起人类肝炎且该科中的相关病毒引起鸭,松鼠和土拨鼠肝炎。HBV基因组具有4个基因:pol,env,pre-core和X,分别编码病毒DNA聚合酶,包膜蛋白,前核心蛋白(它加工成病毒衣壳)和蛋白质X。蛋白质X的功能还不清楚,但是它可能涉及宿主细胞基因的激活和癌形成。HBV引起急性和慢性肝炎。变成慢性感染的机会取决于年龄。大约90%的受感染新生儿和50%的受感染低龄儿童会变成慢性感染。相反,只有大约5%至10%感染HBV的具有免疫能力的成年人发展成慢性乙肝。
丙肝病毒(HCV)是黄病毒科(Flaviviridae)的正链单链RNA病毒。基因组大约为10,000个核苷酸且编码大约3,000个氨基酸的单个多蛋白。该多蛋白被宿主细胞和病毒蛋白酶加工成三个主要结构蛋白和数个病毒复制所必需的非结构蛋白。已鉴定了数个不同的HCV基因型,它们的基因组序列略有不同,这与预后和对治疗的反应中的差异相关联。被HCV急性感染的个体大约85%变成慢性感染。因此,HCV是慢性(持续超过6个月)肝炎的主要病因。一旦被慢性感染,该病毒不经治疗几乎不能清除。在极少情况下,HCV感染引起临床上的急性疾病,甚至肝衰竭,然而,大多数情况的急性感染是临床上不可检测的。
丁型肝炎病毒(HDV,也称为δ病毒)是小环形RNA病毒。HDV具有复制缺陷,因此在另一病毒不存在时不能繁殖。在人类,HDV感染仅在存在HBV感染时发生。
戊型肝炎病毒(HEV)通常引起与甲肝疾病在临床上不能区分的肝炎。症状包括不适,食欲不振,腹痛,关节痛,和发热。戊肝以流行病和散发性地方病形式发生,通常与饮水污染相关。
庚型肝炎病毒(HGV)是相对新发现的黄病毒,与HCV相关但有区别,可引起急性和慢性肝炎。
当身体一个区域的血流暂时停止(局部缺血)且然后再形成血流(再灌注)时发生局部缺血再灌注损伤。可交换使用的术语“局部缺血再灌注损伤”与“局部缺血性再灌注损伤”是指与细胞缺氧相关的起始损伤和与给细胞再供氧时的炎症反应相关的后续损伤。局部缺血再灌注损伤可在一些手术期间发生,如修复动脉瘤和进行器官移植的手术。该损伤可在供血中断的身体部位发生,或者可在局部缺血期间供血充分的部位发生。例如,肝脏的局部缺血再灌注损伤可由肝脏和胆手术切除术引起,且在临床上表现为包括急性肝细胞损伤和坏死在内的肝脏机能障碍等并发症。
“原发胆汁性肝硬化(PBC)”是以肝脏内小胆管的炎症性破坏为特征的一种疾病。PBC最终导致肝脏硬化。PBC的病原学还不完全了解,但是由于存在自身抗体,一般认为它是一种自身免疫疾病,尽管如此,还不能完全排除诸如传染因素等其它病原学。诊断为PBC的大约90%的病人是妇女,最常见的年龄在40至60岁之间。
“脓毒病”是细菌感染的结果,可在身体任一部位(包括肝脏或胆管)发起。脓毒病可以是威胁生命的情况,特别是在免疫系统减弱的人中。
本文使用的术语“血管生成”是指从已有血管系统形成新血管的过程且需要进行内皮细胞的增殖和迁移。
本文使用的术语“肝硬化”是指在解剖上特征为与纤维变性结合的肝脏扩散型结节的病理性肝脏状况。肝硬化是包括与慢性酒精滥用,慢性病毒性肝炎,代谢性和胆疾病相关的大多数类型慢性肝脏疾病的最终共同方向。
术语“Angptl3多肽”,“Angptl3蛋白”,和“Angptl3”可交换使用,且包含天然序列Angptl3和Angptl3多肽的变异体(在本文中有进一步限定)。Angptl3多肽可从诸如人组织类型或另一来源等各种来源分离,或者通过重组和/或合成方法制备。应注意,Angptl3以前也称为“FLS139”,“NL6”,或“CCFL1”。因此,任何提及的Angptl3也应理解为是指FLS139,NL6和CCFL1多肽。
“天然序列Angptl3”或“天然Angptl3”包含与天然来源的Angptl3分子具有相同氨基酸序列的多肽。该天然序列Angptl3可从天然分离或者可通过重组和/或合成方法产生。术语“天然序列的Angptl3”或“天然Angptl3”特别包含天然存在的截短或分泌形式(例如,胞外结构域序列),天然存在的变异体形式(例如,旁路剪接形式)和Angptl3的天然存在的等位基因变异体。在本发明的一个实施方案中,Angptl3的天然序列是含有SEQ ID NO:2的氨基酸1至460的成熟或全长天然序列Angptl3。尽管表明SEQID NO:2的人Angptl3多肽以本文称为氨基酸位置1的甲硫氨酸残基开始,但是采用位于SEQ ID NO:2的氨基酸位置1上游或下游的另一甲硫氨酸残基作为Angptl3多肽的起始氨基酸残基是可想得到和可能的。另外,术语“天然序列Angptl3”和“天然Angptl3”特别包括无起始甲硫氨酸的多肽。
可交换使用的术语“Angptl3变异体”或“Angptl3变异体多肽”是指如下限定的活性Angptl3多肽,它与(a)SEQ ID NO:2所示Angptl3多肽的残基1至460,或其非人哺乳动物同系物,或者(b)SEQ ID NO:2的氨基酸序列或其非人哺乳动物同系物的另一具体产生的片断的氨基酸序列具有至少大约80%的氨基酸序列相同性。例如,该Angptl3变异体多肽包括这样的Angptl3多肽,其中在SEQ ID NO:2的序列N-和/或C-末端,以及在其一个或多个内部结构域中添加或缺失了一个或多个氨基酸残基。一般来说,Angptl3变异体多肽与SEQ ID NO:2所示Angptl3多肽的残基1至460或其非人哺乳动物同系物具有至少大约80%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约81%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约82%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约83%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约84%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约85%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约86%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约87%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约88%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约89%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约90%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约91%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约92%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约93%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约94%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约95%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约96%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约97%的氨基酸序列相同性,更优选至少大约98%的氨基酸序列相同性且还更优选至少大约99%的氨基酸序列相同性。Angptl3的变异体多肽不包含天然Angptl3多肽序列。一般来说,Angptl3变异体多肽是至少大约10个氨基酸的长度,通常是至少大约20个氨基酸的长度,更常见的是至少大约30个氨基酸的长度,更常见的是至少大约40个氨基酸的长度,更常见的是至少大约50个氨基酸的长度,更常见的是至少大约60个氨基酸的长度,更常见的是至少大约70个氨基酸的长度,更常见的是至少大约80个氨基酸的长度,更常见的是至少大约90个氨基酸的长度,更常见的是至少大约100个氨基酸的长度,更常见的是至少大约150个氨基酸的长度,更常见的是至少大约200个氨基酸的长度,更常见的是至少大约250个氨基酸的长度,更常见的是至少大约300个氨基酸的长度,或更长。特别优选的Angptl3变异体保留了SEQ ID NO:2所示天然人Angptl3序列的氨基酸区域281至193,415至430,和442-460中的至少一个,或非人哺乳动物Angptl3同系物的相应区域,或者在该区域内仅含有保守氨基酸取代。
术语“血纤蛋白原结构域”或“血纤蛋白原样结构域”用于指Angptl3的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)中从大约位置238至大约位置460的氨基酸。
相对于本文鉴定的Angptl3多肽序列的“氨基酸序列相同性百分数(%)”定义为对位排列该序列且按需要导入间隔以达到最大序列相同性百分数后与Angptl3序列中氨基酸残基相同的候选序列氨基酸残基的百分数,且任何保守取代都不作为该序列相同性的一部分。以测定氨基酸序列相同性百分数为目的的序列对比可按本领域技术内的各种方法完成,例如,使用公众可得到的计算机软件,例如BLAST,BLAST-2,ALIGN,ALIGN-2或Megalign(DNASTAR)软件。本领域的技术人员可确定用于测量序列对比的合适参数,包括在所比较的序列全长上达到最大对位排列所需的任何算法。然而,为达到本文目的,氨基酸序列相同性值%可通过使用序列比较计算机程序ALIGN-2按下文所述获得,其中图4A-Q提供了ALIGN-2程序的全部源代码。ALIGN-2序列比较计算机程序由Genentech,Inc.创作且图4A-Q所示的源代码在美国版权局,华盛顿区,20559以用户文件存档,以美国版权登记号TXU510087登记。ALIGN-2程序通过Genentech,Inc.,South San Francisco,California可公开得到或者可从图4A-Q提供的源代码编译。编译ALIGN-2程序应基于UNIX操作系统平台,优选数字UNIX V4.0D。所有序列比较参数由ALIGN-2程序设定且不改变。
为达到本文目的,给定氨基酸序列A与,和,或者对给定氨基酸序列B的氨基酸序列相同性%(任选可表述为具有或者包含与,和,或者对给定氨基酸序列B的某一氨基酸序列相同性%的给定氨基酸序列A)计算如下:
100乘以分数X/Y
其中X是通过序列对比程序ALIGN-2在A和B经该程序进行序列对比中评分为相同性匹配的氨基酸残基数,且其中Y是B中氨基酸残基的总数。可预料到如果氨基酸序列A的长度与氨基酸序列B的长度不相等时,A与B的氨基酸序列相同性%不等于B与A的氨基酸序列相同性%。
除非另有说明,本文使用的所有氨基酸序列相同性%值为使用ALIGN-2序列比较计算机程序按上述获得。然而,氨基酸序列相同性%也可使用序列比较程序NCBI-BLAST2(Altschul等,Nucleic Acids Res.25:3389-3402(1997))测定。NCBI-BLAST2序列比较程序可从网站http://www.ncbi.nlm.nih.gov.下载。NCBI-BLAST2使用了一些检索参数,其中所有这些检索参数设定为默认值,包括,例如,暴露(unmask)=是,链(strand)=全部,预期事件=10,最低复杂性长度=15/5,多途径(multi-pass)e-值=0.01,多途径常数=25,最终有间隔的序列对比减少=25,记分矩阵=BLOSUM62。
在使用NCBI-BLAST2用于氨基酸序列比较的情况下,给定氨基酸序列A与,和,或者对给定氨基酸序列B的氨基酸序列相同性%(任选可表述为具有或者包含与,和,或者对给定氨基酸序列B的某一氨基酸序列相同性%的给定氨基酸序列A)计算如下:
100乘以分数X/Y
其中X是通过序列对比程序ALIGN-2在A和B经该程序进行序列对比中评分为相同性匹配的氨基酸残基数,且其中Y是B中氨基酸残基的总数。可预料到如果氨基酸序列A的长度与氨基酸序列B的长度不相等时,A与B的氨基酸序列相同性%不等于B与A的氨基酸序列相同性%。
“Angptl3变异体核酸序列”是指编码如下定义的活性Angptl3多肽且与(a)编码SEQ ID NO:2所示Angptl3氨基酸序列的残基1至460,或其非人哺乳动物同系物的核酸序列,或者(b)编码SEQ ID NO:2的氨基酸序列或其非人哺乳动物同系物的另一具体产生的片断的核酸序列具有至少大约80%的核酸序列相同性的核酸分子。一般来说,Angptl3变异体多核苷酸与(a)编码SEQ ID NO:2的残基1至460,或者该人类多肽的非人哺乳动物同系物的核酸序列具有至少大约80%的核酸序列相同性,更优选至少大约81%的核酸序列相同性,更优选至少大约82%的核酸序列相同性,更优选至少大约83%的核酸序列相同性,更优选至少大约84%的核酸序列相同性,更优选至少大约85%的核酸序列相同性,更优选至少大约86%的核酸序列相同性,更优选至少大约87%的核酸序列相同性,更优选至少大约88%的核酸序列相同性,更优选至少大约89%的核酸序列相同性,更优选至少大约90%的核酸序列相同性,更优选至少大约91%的核酸序列相同性,更优选至少大约92%的核酸序列相同性,更优选至少大约93%的核酸序列相同性,更优选至少大约94%的核酸序列相同性,更优选至少大约95%的核酸序列相同性,更优选至少大约96%的核酸序列相同性,更优选至少大约97%的核酸序列相同性,更优选至少大约98%的核酸序列相同性且还更优选至少大约99%的核酸序列相同性。
一般来说,Angptl3变异体核酸序列是至少大约30个核苷酸的长度,通常是至少大约60个核苷酸的长度,更常见的是至少大约90个核苷酸的长度,更常见的是至少大约120个核苷酸的长度,更常见的是至少大约150个核苷酸的长度,更常见的是至少大约180个核苷酸的长度,更常见的是至少大约210个核苷酸的长度,更常见的是至少大约240个核苷酸的长度,更常见的是至少大约270个核苷酸的长度,更常见的是至少大约300个核苷酸的长度,更常见的是至少大约450个核苷酸的长度,更常见的是至少大约600个核苷酸的长度,更常见的是至少大约900个核苷酸的长度,或更长。
相对于本文鉴定的编码Angptl3多肽的核酸序列的“核酸序列相同性百分数(%)”定义为对位排列该序列且按需要导入间隔以达到最大序列相同性百分数后与编码Angptl3多肽的核酸序列中的核苷酸相同的候选序列中核苷酸的百分数。以测定核酸序列相同性百分数为目的的序列对比可按本领域技术内的各种方法完成,例如,使用公众可得到的计算机软件,例如BLAST,BLAST-2,ALIGN,ALIGN-2或Megalign(DNASTAR)软件。本领域的技术人员可确定用于测量序列对比的合适参数,包括在所比较的序列全长上达到最大对位排列所需的任何算法。然而,为达到本文目的,核酸序列相同性值%可通过使用序列比较计算机程序ALIGN-2按下文所述获得。ALIGN-2序列比较计算机程序由Genentech,Inc.创作且源代码在美国版权局,华盛顿区,20559以用户文件存档,以美国版权登记号TXU510087登记。ALIGN-2程序通过Genentech,Inc.,South San Francisco可公开得到。编译ALIGN-2程序应基于UNIX操作系统平台,优选数字UNIX V4.0D。所有序列比较参数由ALIGN-2程序设定且不改变。
为达到本文目的,给定核酸序列C与,和,或者对给定核酸序列D的核酸序列相同性%(任选可表述为具有或者包含与,和,或者对给定核酸序列D的某一核酸序列相同性%的给定核酸序列C)计算如下:
100乘以分数W/Z
其中W是通过序列对比程序ALIGN-2在C和D经该程序进行的序列对比中评分为相同性匹配的核苷酸数,且其中Z是D中核苷酸的总数。可预料到如果核酸序列C的长度与核酸序列D的长度不相等时,C与D的核酸序列相同性%不等于D与C的核酸序列相同性%。
除非另有说明,本文使用的所有核酸序列相同性%值为使用ALIGN-2序列比较计算机程序按上述获得。然而,核酸序列相同性%也可使用序列比较程序NCBI-BLAST2(Altschul等,Nucleic Acids Res.25:3389-3402(1997))测定。NCBI-BLAST2序列比较程序可从网站http://www.ncbi.nlm.nih.gov.下载。NCBI-BLAST2使用了一些检索参数,其中所有这些检索参数设定为默认值,包括,例如,暴露(unmask)=是,链(strand)=全部,预期事件=10,最低复杂性长度=15/5,多途径(multi-pass)e-值=0.01,多途径常数=25,最终有间隔的序列对比减少=25,记分矩阵=BLOSUM62。
在使用NCBI-BLAST2用于序列比较的情况下,给定核酸序列C与,和,或者对给定核酸序列D的核酸序列相同性%(任选可表述为具有或者包含与,和,或者对给定核酸序列D的某一核酸序列相同性%的给定核酸序列C)计算如下:
100乘以分数W/Z
其中W是通过序列对比程序ALIGN-2在C和D经该程序进行的序列对比中评分为相同性匹配的核苷酸数,且其中Z是D中核苷酸的总数。可预料到如果核酸序列C的长度与核酸序列D的长度不相等时,C与D的核酸序列相同性%不等于D与C的核酸序列相同性%。
在其它实施方案中,Angptl3变异体多核苷酸是编码活性Angptl3多肽且与编码SEQ ID NO:2所示全长Angptl3多肽的核苷酸序列能够杂交,优选在严格杂交和洗涤条件下杂交的核酸分子。Angptl3变异体多肽可以是由Angptl3变异体多核苷酸编码的那些多肽。
在按上述进行的氨基酸序列相同性比较上下文中使用的术语“正数”不仅包括在比较的序列中相同的氨基酸残基,而且包括具有相似特性的那些氨基酸残基。相对于感兴趣的氨基酸残基评分为正值的氨基酸残基是与感兴趣的氨基酸残基相同或者是感兴趣的氨基酸残基的优选取代的那些氨基酸残基。
为达到本文目的,给定氨基酸序列A与,和,或者对给定氨基酸序列B的正数值%(任选可表述为具有或者包含与,和,或者对给定氨基酸序列B的某一正数值%的给定氨基酸序列A)计算如下:
100乘以分数X/Y
其中X是通过序列对比程序ALIGN-2在A和B经该程序进行的序列对比中评分为上述限定的正值的氨基酸残基数,且其中Y是B中氨基酸残基的总数。可预料到如果氨基酸序列A的长度与氨基酸序列B的长度不相等时,A对B的正值%不等于B对A的正值%。
术语“抗体”以最广义使用且具体包括,例如,单一抗-Angptl3单克隆抗体(包括激动剂,拮抗剂,和中和抗体),具有多表位特异性的抗-Angptl3抗体组合物,单链抗-Angptl3抗体,和抗-Angptl3抗体的片断(见下文)。本文使用的术语“单克隆抗体”是指从基本上同源的抗体群体获得的抗体,即除了少量存在的天然发生的突变外,该群体包含的各个抗体是相同的。
本文使用的术语“单克隆抗体”是指从基本上同源的抗体群体获得的抗体,即除了少量存在的天然发生的突变外,该群体包含的各个抗体是相同的。
“抗体片断”包含完整抗体的一部分,优选完整抗体的抗原结合区或可变区。抗体片断的例子包括Fab,Fab′,F(ab′)2,和Fv片断;二价抗体(diabodies);线性抗体(Zapata等,Protein Eng.,8(10):1057-1062[1995]);单链抗体分子;和从抗体片断形成的多特异性抗体。
木瓜蛋白酶消化抗体产生两个相同的称为“Fab”片断且分别具有单个抗原结合位点的抗原结合片断,和残留的“Fc”片断,Fc片断的名称反映了其容易结晶的能力。胃蛋白酶处理产生F(ab′)2片断,它具有两个抗原结合位点且依然能够交联抗原。
“Fv”是最小的抗体片断,它含有完整的抗原识别和结合位点。该区域由以紧密非共价缔合的一个重链可变区和一个轻链可变区的二聚体组成。在其构型中各可变区的3个CDRs相互作用形成该VH-VL二聚体表面的抗原结合位点。6个CDRs总合可赋予该抗体的抗原结合特异性。然而,即使单个可变区(或仅含有3个抗原特异性CDRs的Fv半分子)也具有识别和结合抗原的能力,尽管比完整结合位点的亲和性要低。
Fab片断还含有轻链恒定区和重链第一恒定区(CH1)。Fab片断与Fab′片断的区别在于在重链CH1结构域的羧基末端增加了几个残基,包括来自抗体铰链区的一个或多个半胱氨酸。那些在其恒定区的半胱氨酸残基携带游离巯基的Fab′在本文中命名为Fab′-SH。F(ab′)2抗体片断最初由Fab′片断配对产生,在其之间具有铰链半胱氨酸。抗体片断的其它化学偶连也是已知的。
来自任一脊椎动物物种的抗体(免疫球蛋白)的“轻链”,根据其恒定区的氨基酸序列,可称为κ和λ这两个明显不同的类型之一。
根据其重链恒定区的氨基酸序列,可将免疫球蛋白分为不同的类型。有5种主要的免疫球蛋白类型:IgA,IgD,IgE,IgG,和IgM,其中的一些可进一步分成亚类(同种型),例如,IgG1,IgG2,IgG3,IgG4,IgA,和IgA2。相应于免疫球蛋白不同类型的重链恒定区分别称为α,δ,ε,γ和μ。不同类型的免疫球蛋白的亚基结构和三维构型是熟知的。
术语“二价抗体(diabodies)”是指具有两个抗原结合位点的小抗体片断,该片断包含在同一肽链(VH-VL)中与轻链可变区(VL)相连的重链可变区(VH)。通过使用短到不允许在同一链上的两个结构域之间配对的接头,可迫使该结构域与另一链上的互补结构域配对并产生两个抗原结合位点。在例如,EP 404,097;WO 93/11161;和Hollinger等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993)中对二价抗体有更充分的描述。
“分离的”抗体是指从其天然环境成份中鉴定和分离和/或回收的抗体。其天然环境的污染成份是可能干扰该抗体的诊断或治疗用途的物质,且可能包括酶,激素,和其它蛋白型或非蛋白型溶质。在优选的实施方案中,该抗体可纯化成(1)按劳里(Lowry)方法测定的抗体重量超过95%,且最优选重量超过99%,(2)其纯化程度足以通过使用转杯式测序仪获得至少15个残基的N-末端或内部氨基酸序列,或(3)在还原型或非还原型条件下进行SDS-PAGE并使用考马斯蓝或者,优选银染测定具有同质性。该分离的抗体包括在重组细胞内的原位抗体,因为该抗体天然环境中的至少一种成份不存在。然而,一般来说,分离的抗体由至少一个纯化步骤制备。
术语“可变的”是指可变区的某些部分在不同抗体之间存在较大序列差异且用于各特定抗体对其特定抗原的结合和特异性。然而,该可变性不是在抗体可变区中平均分布。它集中在轻链和重链可变区两者中称为互补决定区(CDRs)或高变区的三个片断中。可变区保守程度更高的部分称为框架(FR)区。天然重链和轻链的可变区各包含4个FR区,大量采取β-折叠构型,由3个CDRs相连接,形成环形连接,在某些情况下形成β-折叠结构的一部分。各链中的CDRs通过FR区紧密相邻,并与来自另一链的CDRs一起负责形成抗体的抗原结合位点(参见Kabat等,NIH Publ.No.91-3242,第I卷,第647-669页(1991))。恒定区不直接涉及抗体与抗原的结合,但表现出各种效应物功能,例如,使抗体参与抗体依赖性细胞介导的细胞毒性。
本文使用的术语“高变区”是指抗体上负责抗原结合的氨基酸残基。高变区包含来自“互补决定区”或“CDR”的氨基酸残基(即,轻链可变区中的残基24-34(L1),50-56(L2)和89-97(L3)和重链可变区中的31-35(H1),50-65(H2)和95-102(H3);Kabat等,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,Public Health Service,National Institute of Health,Bethesda,MD.[1991])和/或来自“高变环”的那些残基(即,轻链可变区的残基26-32(L1),50-52(L2)和91-96(L3)和重链可变区的26-32(H1),53-55(H2)和96-101(H3);Clothia和Lesk,J.Mol.Biol.,196:901-917[1987])。“框架”或“FR”残基是指除了本文限定的高变区残基以外的那些可变区残基。
非人(例如,鼠)抗体的“人源化”形式是指含有来自非人免疫球蛋白最小序列的嵌合免疫球蛋白,免疫球蛋白链或其片断(例如,Fv,Fab,Fab′,F(ab′)2或抗体的其它抗原结合序列)。大多数情况下,人源化抗体是人免疫球蛋白(受体抗体),其中来自受体CDR的残基被具有所需特异性,亲和性,和能力的来自诸如小鼠,大鼠或兔的非人物种(供体抗体)CDR的残基取代。在某些情况下,人免疫球蛋白的Fv FR残基被相应的非人残基取代。另外,人源化的抗体可包含在受体抗体或引入的CDR或框架序列中均没有发现的残基。可作出这些修饰以进一步优化和最大化抗体效果。一般来说,人源化抗体可包含至少一个,且一般是2个可变区的基本上全部,其中全部或基本上全部的CDR区相应于非人免疫球蛋白的CDR区且全部或基本上全部的FR区是人免疫球蛋白序列的FR区。人源化抗体优选还包含至少部分免疫球蛋白恒定区(Fc),一般是人免疫球蛋白的Fc。对于更详细的情况,参见,Jones等,Nature,321:522-525(1986);Reichmann等,Nature,332:323-329[1988];和Presta,Curr.Op.Struct.Biol.,2:593-596(1992)。人源化抗体包括PRIMATIZEDTM抗体,其中该抗体的抗原结合区来源于用目的抗原免疫猕猴产生的抗体。
本文使用的术语“免疫粘附素”是指结合了异源蛋白质(“粘附素”)的结合特异性与免疫球蛋白恒定区的效应器功能的抗体样分子。在结构上,免疫粘附素包含氨基酸序列与免疫球蛋白恒定区序列的融合,该氨基酸序列具有除抗体的抗原识别和结合位点以外的所需结合特异性(即,是“异源性的”)。免疫粘附素分子的粘附素部分一般是至少含有受体或配体的结合位点的连续氨基酸序列。免疫粘附素中的免疫球蛋白恒定区序列可从诸如IgG-1,IgG-2,IgG-3,或IgG-4亚型,IgA(包括IgA-1和IgA-2),IgE,IgD或IgM等任何免疫球蛋白获得。
杂交反应的“严格性”是本领域的普通技术人员容易测定的,且一般根据探针长度,洗涤温度,和盐浓度凭经验进行计算。一般来说,探针越长需要的合适退火温度越高,而探针越短需要的温度越低。杂交一般依赖于变性DNA在低于其解链温度的环境中存在互补链时重退火的能力。探针与可杂交序列之间所需的同源性程度越高,可使用的相对温度越高。结果,随着相对温度越高则倾向于使得反应条件更严格,而温度越低则严格程度越低。对于杂交反应更详细的情况和解释参见,Ausubel等,Current Protocols in Molecular Biology,Wiley Interscience Publishers,(1995)。
本文定义的“严格条件”或“高度严格条件”可通过下列条件确定:(1)采用低离子强度和高温度洗涤,例如50℃,0.015M氯化钠/0.0015M柠檬酸钠/0.1%十二烷基磺酸钠;(2)杂交期间采用诸如甲酰胺等变性剂,例如,50%(v/v)甲酰胺与0.1%牛血清白蛋白/0.1%Ficoll/0.1%聚乙烯吡咯烷酮/50mM磷酸钠缓冲液,pH 6.5,含750mM氯化钠,75mM柠檬酸钠,42℃,或(3)采用42℃,50%甲酰胺,5x SSC(0.75M NaCl,0.075M柠檬酸钠),50mM磷酸钠(pH 6.8),0.1%焦磷酸钠,5x Denhardt′s溶液,超声处理的鲑精DNA(50μg/ml),0.1%SDS,和10%葡聚糖硫酸酯,在42℃的0.2x SSC(氯化钠/柠檬酸钠)和55℃的50%甲酰胺中洗涤,接着在55℃含有EDTA的0.1x SSC中进行高度严格洗涤。
“中度严格条件”可按Sambrook等,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,New York:Cold Spring Harbor Press,1989所述确定,且包括使用比上文所述严格程度更低的洗涤溶液和杂交条件(例如,温度,离子强度和%SDS)。中度严格条件的例子是在含有:20%甲酰胺,5x SSC(150mM NaCl,15mM柠檬酸三钠),50mM磷酸钠(pH 7.6),5x Denhardt′s溶液,10%葡聚糖硫酸酯,和20mg/ml变性剪切的鲑精DNA中37℃温育过夜,接着在大约37-50℃在1x SSC中洗膜。本领域的技术人员将认识到如何调节温度,离子强度等以适应诸如探针长度等因素的需要。
本文使用的术语“表位标记的”是指含有与“标记多肽”融合的Angptl3多肽的嵌合多肽。标记多肽具有足够的残基以提供可对其产生抗体的表位,而且它足够短使其不能干扰与它融合的多肽的活性。标记多肽还优选是相当特异的,以便其抗体基本上不与其它表位交叉反应。合适的标记多肽一般具有至少6个氨基酸残基且通常在大约8到50个氨基酸残基之间(优选在大约10到20个氨基酸残基之间)。
本文关于Angptl3分子的术语“生物学活性”和“生物学上有活性的”是指分子特异性结合并调节由天然αvβ3整联蛋白受体介导的诸如血管内皮细胞粘着和/或迁移等细胞反应的能力。在本文上下文中,术语“调节”包括促进和抑制,因此,本发明的(天然和变异体)Angptl3分子包括天然αvβ3整联蛋白受体的激动剂和拮抗剂。本文的Angptl3配体的优选生物学活性包括血管形成(血管生成)的促进或抑制,且具体地说,涉及肝脏再生期间的血管形成过程。
术语“激动剂”用于指本发明的天然Angptl3分子的肽和非肽类似物,和特异性结合该天然Angptl3分子的抗体,前提是它们具有通过天然Angptl3受体(αvβ3)传导信号的能力。换句话说,术语“激动剂”在Angptl3受体(αvβ3)的生物学作用上下文中定义。优选的激动剂具有上文限定的天然Angptl3的优选生物学活性,例如促进血管形成(血管生成),例如在肝脏再生期间。
术语“拮抗剂”用于指天然Angptl3分子的肽和非肽类似物,以及抗体,前提是它们具有抑制Angptl3的生物学功能的能力,而不论它们是否具有结合Angptl3或其受体αvβ3的能力。因此,具有结合Angptl3或其受体的能力的拮抗剂包括抗-Angptl3和抗-αvβ3的抗体。优选的拮抗剂是血管内皮细胞粘着和/或迁移的抑制剂,且特别是血管生成,具体来说与恶性肿瘤生长,肝脏的炎症性疾病或心脏病相关的血管生成的抑制剂。
本文使用的“肿瘤”是指不论是恶性还是良性的所有赘生性细胞生长和增殖,以及所有前癌性和癌性的细胞和组织。
术语“癌症”和“癌性”是指或者描述哺乳动物中一般特征在于细胞生长不受调控的生理学状态。癌症的例子包括,但不限于,癌,淋巴瘤,母细胞瘤,肉瘤,和白血病。癌症的更具体的例子包括乳腺癌,前列腺癌,结肠癌,鳞状细胞癌,小细胞肺癌,非小细胞肺癌,胃肠癌,胰腺癌,成胶质细胞瘤,宫颈癌,卵巢癌,肝脏癌症,膀胱癌,肝细胞瘤,结肠直肠癌,子宫内膜癌,唾液腺癌,肾癌,外阴癌,甲状腺癌,肝癌和各种类型的头和颈癌症。
“治疗”是指治疗性处理和预防性或防止性措施,其中的目的是预防或缓解(减轻)目标病理状况或病症。需要治疗的情况包括已经患有该病症以及倾向于患有该病症或者需要预防该病症的情况。在肿瘤(例如,癌症)治疗中,治疗剂可直接减弱肿瘤细胞的病理学,或者导致肿瘤细胞更容易被诸如放射和/或化疗等其它治疗剂治疗。
癌症的“病理学”包括危害患者健康的所有现象。它包括,但不限于,异常或不能控制的细胞生长,转移,干扰相邻细胞的正常功能,以异常水平释放细胞因子或其它分泌产物,抑制或加重炎症反应或免疫反应,等。
“慢性”给药是指与急性方式相对的以连续方式施用药剂,以便在延长的时间期限内维持起始治疗效果(活性)。“间歇性”给药是指不是连续无中断地进行,而是具有周期性特性的治疗。
用于治疗目的的“哺乳动物”是指分类为哺乳动物的任何动物,包括人类,驯养动物和农场动物,以及动物园动物,竞技动物,或宠物动物,例如狗,猫,牛,马,绵羊,猪,山羊,兔等,优选的是,该哺乳动物是人类。
与一种或多种其它治疗剂“组合”的给药包括同时的(同时进行的)和以任何顺序连续的给药。
本文使用的“载体”包括对于以所用剂量和浓度与其接触的细胞或哺乳动物无毒的药用上可接受的载体,赋形剂,或稳定剂。通常生理学上可接受的载体是含水的pH缓冲溶液。生理学上可接受的载体的例子包括诸如磷酸盐,柠檬酸盐,和其它有机酸在内的缓冲液;包括抗坏血酸在内的抗氧化剂;低分子量(不超过10个残基)多肽;诸如血清白蛋白,明胶,或免疫球蛋白等蛋白质;诸如聚乙烯吡咯烷酮等亲水性多聚体;诸如甘氨酸,谷氨酰胺,天冬酰胺,精氨酸或赖氨酸等氨基酸;单糖,二糖,和包括葡萄糖,甘露糖,或糊精等其它糖类;诸如EDTA等螯合剂;诸如甘露醇或山梨醇等糖醇;诸如钠等成盐反离子;和/或诸如TWEENTM,聚乙二醇(PEG),和PLURONICSTM等非离子表面活性剂。
“脂质体”是用于给哺乳动物给药(例如PRO10282多肽或其抗体)的由各种类型的脂类,磷脂和/或表面活性剂组成的小泡。脂质体的成份通常以双层结构排列,类似于生物膜的脂类排列。
“小分子”本文定义为具有低于大约500道尔顿的分子量。
本文公开的Angptl3多肽的“有效量”是能够触发所需生物学反应的量。具体地说,Angptl3多肽或其激动剂的“有效量”优选是能够调节通过αvβ3Angptl3受体介导的,诸如内皮细胞,例如血管内皮细胞的粘着和/或迁移等细胞反应的量。该术语包括能够引起血管生成,特别是与肝脏再生相关的血管生成的量。
例如,当使用天然Angptl3多肽的拮抗剂时,与肿瘤治疗有关的“治疗有效量”是指能够引起一种或多种下列效果的量:(1)一定程度地抑制肿瘤生长,包括延缓和生长完全停止;(2)肿瘤细胞数减少;(3)肿瘤大小减小;(4)抑制(即,减少,延缓或完全停止)肿瘤细胞渗入外周器官;(5)抑制(即,减少,延缓或完全停止)转移;(6)增强抗肿瘤免疫反应,其有可能但不是必需导致肿瘤的消退或排斥;和/或(7)一定程度地缓解与该疾病相关的一种或多种症状。用于肿瘤治疗目的的Angptl3多肽拮抗剂的“治疗有效量”可凭经验并以常规方式测定。
“血管内皮生长因子”或“VEGF”是内皮细胞特异性促分裂原,它显示出受低氧刺激且是肿瘤血管生成所必需的(Senger等,Cancer 46:5629-5632(1986);Kim等,Nature 362:841-844(1993);Schweiki等,Nature359:843-845(1992);Plate等,Nature 359:845-848(1992))。本文使用的该术语包括所有VEGF同种型,包括,但不限于人VEGF121和VEGF165同种型。
B.人Ansptl3的非人哺乳动物同系物
天然人Angptl3的分离在实施例1中描述,且也在PCT公开号WO99/15654中描述。Angptl3 DNA还于1997年9月18日在美国典型培养物保藏中心(ATCC)保藏,命名为FLS139-DNA16451-1078,指定的ATCC保藏号为209283。
为了鉴定其它非人哺乳动物同系物,或剪接体或其它天然存在的变异体,可采用设计用于鉴定目的基因或由其编码的蛋白质的探针(例如抗人Angptl3序列的抗体或至少大约20-80个碱基的寡核苷酸)筛选文库。可使用标准程序,例如按Sambrook等,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(纽约:冷泉港实验室出版,1989)所述用选定的探针筛选cDNA或基因组文库。分离编码其它天然Angptl3多肽的基因的一个可供选择的方法是使用PCR方法(Sambrook等,出处同上;Dieffenbach等,PCR Primer:A Laboratory Manual(冷泉港实验室出版,1995))。
选择作为探针的寡核苷酸序列应当足够长且足够明确使得假阳性最小化。优选标记该寡核苷酸以便在与待筛选文库中的DNA杂交时可检测它。标记的方法是本领域熟知的,且包括使用诸如32P-标记的ATP等放射性标记,生物素标记或酶标记。包括中等严格和高度严格等杂交条件在Sambrook等,出处同上中提供。
在该文库筛选方法中鉴定的序列可与在诸如GenBank的公共数据库或其它私有序列数据库中保存和得到的其它已知序列进行比较和序列对比。使用本领域已知的方法并按本文所述可测定在该分子的限定区域内或在全长序列中的序列相同性(在氨基酸或者核苷酸水平上)。
通过使用本文首次公开的推定氨基酸序列,且如果需要,可使用在Sambrook等,出处同上中描述的用于检测前体的常规引物延长方法,并处理没有被逆转录成cDNA的mRNA中间体,来筛选选定的cDNA或基因组文库,可获得具有蛋白质编码序列的核酸。
C.Angptl3变异体
天然人Angptl3是本领域已知的,且在例如,1999年4月1日公开的PCT公开号WO 99/15654中公开。在天然全长序列Angptl3(SEQID NO:2)中,或在本文所述Angptl3氨基酸序列的各种结构域中的变异可使用例如,任一技术和在例如,美国专利号5,364,934中所述的保守和非保守突变的指导来产生。变异可以是对编码Angptl3多肽的一个或多个密码子进行的取代,缺失或插入,导致Angptl3的氨基酸序列与SEQ ID NO:2的天然序列相比被改变。任选该变异是在天然或变异体Angptl3序列的一个或多个结构域中至少一个氨基酸被任何其它氨基酸取代。通过比较Angptl3序列与同源的已知蛋白质分子的序列,并使高度同源性区域中氨基酸序列改变的数目最小化,可找到关于确定哪一个氨基酸残基可插入,取代或缺失而对所需活性无不利影响的指导。氨基酸取代可以是一个氨基酸被具有相似结构和/或化学特性的另一氨基酸取代,例如亮氨酸被丝氨酸取代,即保守氨基酸取代的结果。插入或缺失可任选是在大约1到5个氨基酸的范围内。通过在序列中系统地产生氨基酸的插入,缺失或取代并检测所得变异体是否具有由全长或成熟天然序列表现出的活性,可测定允许的变异。
因此,本文提供了Angptl3多肽的片断。例如,与全长天然蛋白质相比,该片断可以是在N-末端或C-末端被截短,或者可以是缺失了内部残基。一些片断缺失了对于Angptl3多肽的所需生物学活性不是必需的氨基酸残基。
实施例5中描述的SEQ ID NO:2的天然人Angptl3的血纤蛋白原结构域的同源性模型,以及对Angptl3与内皮细胞结合的结构域的功能性分析,可用于设计本文的Angptl3变异体。根据Angptl3的血纤蛋白原样结构域的模型结构,发现天然人Angptl3(SEQ ID NO:2)的区域P1:氨基酸281-293(SEQ ID NO:14);P2:氨基酸442-460(SEQ ID NO:15);和P3氨基酸415-430(SEQ ID NO:17)与αvβ3结合相关。为了保留受体结合和通过受体激活和传导信号的能力,应基本上保留P1,P2和P3区,或者仅在这些区域进行保守取代。另一方面,为了设计Angptl3拮抗剂,必需在一个或多个这些区域内作出更有意义的氨基酸改变。通过图5B所示的带状图,和图5C所示的序列对比可进一步帮助Angptl3变异体的设计,其中亲水性和带电的残基以蓝色表示,芳香基和疏水性残基以橙色表示。
如上所述,在具体实施方案中,在本发明的Angptl3变异体制备中保守取代是有利的。该保守取代在表1中在优选取代的标题下表示。如果该取代导致生物学活性改变,那么可导入表1中命名为举例性取代的,或在下文有关氨基酸类型中进一步描述的更重大的改变并筛选其产物。
表1
通过选择对于维持(a)取代区中多肽主链的结构,例如折叠和螺旋构象,(b)在靶位点的分子的电荷或疏水性,或(c)侧链的大小,这几方面其效果显著不同的取代,可实现对Angptl3变异体多肽的功能或免疫学相同性的重大修饰。天然存在的残基可根据共有的侧链特性分成几组:
(1)疏水型:正亮氨酸,met,ala,val,leu,ile;
(2)中性亲水型:cys,ser,thr;
(3)酸性:asp,glu;
(4)碱性:asn,gln,his,lys,arg;
(5)影响链方向的残基:gly,pro;和
(6)芳香基:trp,tyr,phe。
非保守取代需要将一种类型中的成员更换成另一种类型。该取代的残基也可导入保守取代位点,或者更优选的是导入剩下的(非保守的)位点。
使用诸如寡核苷酸介导的(定点)诱变,丙氨酸扫描,和PCR诱变等本领域已知的方法可作出该变异。可对克隆的DNA进行定点诱变(Carter等,Nucl.Acids Res.,13:4331(1986);Zoller等,Nucl.Acids Res.,10:6487(1987)),盒式诱变[Wells等,Gene,34:315(1985)],限制性选择诱变(Wells等,Philos. Trans.R.Soc.London SerA,317:415(1986))或其它已知技术,以产生Angptl3变异体DNA。
通过许多常规技术中的任一种可制备Angptl3片断。所需的肽片断可以是化学合成的。一个可供选择的方法包括通过酶消化,例如,通过用已知在由特定氨基酸残基限定的位点裂解蛋白质的酶处理该蛋白质,或者通过用合适的限制性酶消化DNA并分离所需的片断来产生Angptl3片断。还有另一合适的技术包含通过聚合酶链式反应(PCR)分离和扩增编码所需多肽片断的DNA片断。在该PCR中的5’和3’引物可采用限定该DNA片断所需末端的寡核苷酸。优选的是,Angptl3多肽片断与SEQ ID NO:2的天然Angptl3共有至少一种生物学和/或免疫学活性。
也可采用扫描氨基酸分析沿连续序列鉴定一个或多个氨基酸。其中优选的扫描氨基酸是相对较小的中性氨基酸。这类氨基酸包括丙氨酸,甘氨酸,丝氨酸,和半胱氨酸。一般来说丙氨酸是该组中优选的扫描氨基酸,因为它消除了β-碳之外的侧链且改变变异体主链构象的可能性较小(Cunningham和Wells,Science,244:1081-1085(1989))。丙氨酸通常优选的另一原因是它是最常见的氨基酸。另外,在包埋的和暴露的位置都经常发现它(Creighton,The Proteins,(W.H.Freeman & Co.,N.Y.);Chothia,J.Mol. Biol.,150:1(1976))。如果丙氨酸取代不能产生足够量的变异体,可使用同功能(isoteric)的氨基酸。
制备Angptl3变异体,天然和变异体Angptl3多肽的共价修饰,与Angptl3(包括变异体)特异性结合的抗体,和免疫粘附素的更详细的情况在例如,WO 99/15654中提供。
D.Angptl3多肽的用途
如下文实施例中所述,对成人组织中Angptl3的表达分析证实了肝脏特异性表达以及在疾病,肝硬化中或中毒性肝脏损伤后的肝细胞中强烈上调。另外,体内施用Angptl3导致血管透性增加和对肝脏损伤的短期保护效应,但是Angptl3的延长表达与肝脏损伤相关。另外,在体内的大鼠角膜试验中检测时Angptl3诱导血管生成。在后一试验中Angptl3对血管生长的强烈诱导结合在病变肝脏样品中检测到的显著表达,有力地表明该因子在肝脏再生期间血管生成过程的调节中起重要作用。
因此,据信Angptl3和Angptl3激动剂可用于治疗,预防和/或鉴定存在急性肝脏疾病危险的受试者和诱导急性肝脏损伤后的肝脏再生和/或组织中的血管生成。急性肝脏损伤可能与炎症性肝脏疾病相关,该疾病是例如慢性,酒精性或病毒性肝炎,对肝脏的化学或机械损伤,由于慢性肝炎,肝硬化,原发性或转移性肝脏癌症或胆囊癌症引起的肝切除。组织中的血管生成可能与由于感染或自身免疫病变,机械或化学损伤或癌症或转移癌而导致损伤的心脏组织或肝脏组织相关。
因此,据信Angptl3拮抗剂可用于治疗和/或预防以Angptl3过量表达为特征的组织损伤,慢性肝脏疾病,和/或以Angptl3表达升高为特征的心脏疾病。以Angptl3过量表达为特征的组织损伤包括与炎症相关的肝脏组织损伤,不限于与慢性肝脏疾病相关的炎症,其病理涉及激活炎症细胞并募集到肝脏,而不论内在病因是感染或自身免疫性疾病,还是对肝脏的化学损伤,或者其它。因此,以Angptl3过量表达为特征的肝脏组织损伤包括肝硬化,例如酒精性肝硬化和原发胆汁性肝硬化(PBC),肝脏纤维变性,慢性肝炎,例如慢性自身免疫性肝炎,慢性酒精性肝炎,和非酒精性脂肪肝炎(NASH),病毒性肝炎甲,乙,丙,丁,戊和庚型,中毒代谢性肝脏损伤,脂肪肝,肝脏的局部缺血再灌注损伤,和脓毒病,和与肝脏肿瘤相关的肝脏损伤,不限于肝细胞癌,肝外胆管癌,胆管癌和肝脏的转移癌。心脏组织损伤与Angptl3表达升高或心脏疾病相关,其病理包括炎症性反应,或者在其形成中炎症是一种危险因素,且心脏组织损伤与Angptl3的表达升高相关,不限于冠状动脉疾病,心肌病,例如非特异性肥大和扩张性心肌病,心肌炎,充血性心力衰竭(CHF),和心肌梗塞。其综述参见Lawson等,ToxicolSci 54:509-16(2000),出处同上。
另外,据信Angptl3拮抗剂可用于抑制不需要的组织血管透性增大。该组织可以是肝脏或心脏组织。血管透性增大可以是组织损伤后小血管透性的增大且可以在由于接触毒素引起的血管内皮坏死之后出现或者可以是与炎症相关,例如慢性炎症/对以Angptl3过量表达为特征的组织损伤的治疗和/或预防,慢性肝脏疾病,和/或以Angptl3表达升高为特征的心脏疾病。
另外,据信Angptl3拮抗剂可用于预防和/或治疗由过多消费酒精引起的慢性酒精性肝炎。酒精性肝炎可包括从仅有实验室试验异常作为疾病征兆的轻度肝炎,到伴有诸如黄疸(由胆红素滞留引起的黄皮肤),肝性脑病变(由肝衰竭引起的神经机能障碍),腹水(腹部的液体积累),出血性食管静脉曲张(食管中静脉曲张),异常凝血和昏迷等并发症的严重肝脏机能障碍。
本发明还包括影响肝脏的T-细胞介导的疾病。T细胞导致的自身免疫损伤由细胞毒性T细胞直接介导且由T辅助细胞间接介导。本文将要治疗的自身免疫疾病包括,但不限于,自身免疫肝炎和原发胆汁性肝硬化。自身免疫性肝炎(也称为自身免疫性慢性活动性肝炎)是一种慢性疾病,其特征在于持续的肝细胞坏死和炎症,如果不进行治疗,一般发展成肝硬化和最终的肝衰竭。原发胆汁性肝硬化是肝内或胆汁系统的自身免疫疾病,与胆汁分泌受损相关。据信自身免疫抗体和T细胞介导了与该疾病相关的肝脏组织损伤。
Angptl3拮抗剂也可用于治疗肝脏的局部缺血再灌注损伤。如前所述,当身体一个区域的血流暂时停止(局部缺血)且然后再形成血流(再灌注)时一般发生局部缺血再灌注损伤。该损伤可在供血中断的身体部位发生,或者可在局部缺血期间供血充分的部位发生。肝脏的局部缺血再灌注损伤可由例如,肝脏和胆手术切除术等各种内在病因引起,且在临床上表现为包括急性肝细胞损伤和坏死在内的肝脏机能障碍等并发症。
Angptl3拮抗剂包括,但不限于,抑制靶基因产物的表达和/或活性的抗体,小的有机分子和无机分子,肽,磷肽,反义分子和核酶分子,三链螺旋分子,等。
例如,反义RNA和RNA分子通过与被靶向的mRNA杂交而直接阻断mRNA的翻译并阻止蛋白质翻译。当使用反义DNA时,优选来自例如,靶基因核苷酸序列大约-10到+10位置之间的翻译起始位点的寡聚脱氧核糖核苷酸。
核酶是能够催化RNA特异性裂解的酶性RNA分子。核酶通过与互补靶RNA的序列特异性杂交,随后进行核酸内切性裂解而起作用。潜在RNA靶内的特异性核酶裂解位点可通过已知技术鉴定。更详细的情况参见,例如Rossi,Current Biology,4:469-471(1994),和PCT公开号WO97/33551(1997年9月18日公开)。
在三链螺旋形成中用于抑制转录的核酸分子应是单链的且由脱氧核苷酸组成。可设计这些寡核苷酸的碱基组成以便促进通过Hoogsteen碱基配对规律形成三链螺旋,该碱基组成一般需要在双螺旋的一条链上有相当长的嘌呤或嘧啶链。更详细的情况参见,例如,PCT公开号WO 97/33551,出处同上。
当本文的Angptl3多肽(包括其激动剂和拮抗剂)用作治疗剂时,可按照已知方法配制它们以制备药用上有用的组合物,其中Angptl3多肽在混合物中与药用上可接受的载体赋形剂混合。通过将具有所需纯度的活性成份与任选的生理学上可接受的载体,赋形剂或稳定剂(Remington′s Pharmaceutical Sciences,第16版,Osol,A.Ed.(1980))以冻干配制品或水溶液的形式混合,可制备用于贮存的治疗性配制品。可接受的载体,赋形剂,或稳定剂在所用剂量和浓度下对接受者无毒性,且包括诸如磷酸盐,柠檬酸盐和其它有机酸等缓冲液;包括抗坏血酸等抗氧化剂;低分子量(不超过大约10个残基)多肽;诸如血清白蛋白,明胶,或免疫球蛋白等蛋白质;诸如聚乙烯吡咯烷酮等亲水性多聚体;诸如甘氨酸,谷氨酰胺,天冬酰胺,精氨酸或赖氨酸等氨基酸;单糖,二糖,和包括葡萄糖,甘露糖,或糊精在内的其它糖类;诸如EDTA等螯合剂;诸如甘露醇或山梨醇等糖醇;诸如钠等成盐反离子;和/或诸如TWEENTM,PLURONICSTM或PEG等非离子表面活性剂。
用于体内给药的配制品必须是无菌的。在冻干和重建之前或之后通过除菌滤膜过滤可容易地实现无菌。
本文的治疗性组合物一般放入具有无菌入口的容器中,例如具有通过皮下注射针头可刺入的塞子的静脉内用溶液袋或小瓶。
给药途径可按已知的方法,例如通过静脉内,腹膜内,脑内,肌肉内,眼内,动脉内或病灶内途径注射或输注,局部给药,或通过持续释放系统给药。
本发明的药用组合物的剂量和所需药物浓度可根据预想的具体用途变化。确定合适的剂量或给药途径是普通医师技术内熟知的。动物实验可为测定人类治疗的有效量提供可靠的指导。按照Mordenti,J.和Chappell,W.“The use of interspecies scaling in toxicokinetics”,见Toxicokinetics and New Drug Development,Yacobi等,编,Pergamon Press,New York 1989,第42-96页制订的原则可进行有效量的种间比例缩放。
当体内施用Angptl3多肽或其激动剂或拮抗剂时,正常的剂量可根据给药途径从每天大约10ng/kg到高达100mg/kg哺乳动物体重或更多,优选大约1μg/kg/天到10mg/kg/天。关于具体剂量和给药方法的指导在文献中提供,参见,例如,美国专利号4,657,760;5,206,344;或5,225,212。可预期不同的配制品对不同的治疗化合物和不同的疾病有效,例如,针对一种器官或组织的给药必须以不同于另一种器官或组织的方式给药。
例如,在测定治疗任一具体肝脏疾病的有效量之前,通过对病人的常规临床和实验室评估确定该疾病的严重性。通过随后以诸如每周,两周或一个月的定期间隔进行临床和实验室肝功评估来评估治疗效果。
如果在释放特征适合于治疗需要施用Angptl3多肽的任何疾病或病症的配制品中需要Angptl3多肽的持续释放给药时,可考虑使Angptl3多肽微囊化。用人生长激素(rhGH),干扰素-γ(rhIFN-γ),白介素-2,和MN rgp120已经成功地使用于持续释放的重组蛋白微囊化。Johnson等,Nat.Med.,2:795-799(1996);Yasuda,Biomed.Ther.,27:1221-1223(1993);Hora等,Bio/Technology.8:755-758(1990);Cleland,“Design and Production of Single Immunization Vaccines Using Polylactide Polyglycolide Microsphere Systems”,见Vaccine Design:The Subunit and Adjuvant Approach,Powell和Newman编(Plenum Press:New York,1995),第439-462页;WO 97/03692,WO 96/40072,WO 96/07399;和美国专利号5,654,010。
由于聚-乳-共乙醇酸(poly-lactic-coglycolic acid,PLGA)多聚体的生物相容性和广泛的可生物降解特性,已经使用它开发了这些蛋白质的持续释放剂型。PLGA的降解产物,即乳酸和乙醇酸可在人体内迅速清除。另外,可根据该多聚体的分子量和组成将其可降解性从几个月调节到几年。Lewis,“Controlled release of bioactive agents from lactide/glycolide polymer”,参见:M.Chasin和R.Langer(Eds.),Biodegradable Polymers as Drug Delivery Systems(Marcel Dekker:New York,1990),第1-41页。
将Angptl3治疗剂与其它治疗方案结合是可取的。例如,用Angptl3多肽或其激动剂进行的治疗可与诸如血管内皮细胞生长因子(VEGF)或成纤维细胞生长因子(FGF)等其它血管生成因子的给药结合。
E.产品
在本发明的另一实施方案中,提供了含有用于诊断或治疗上述疾病的物质的产品。该产品包含容器和标签。合适的容器包括,例如,瓶子,小瓶,注射器和试管。容器可由诸如玻璃或塑料等各种材料制成。该容器内含有诊断或治疗该症状有效的组合物且可以具有无菌入口(例如,该容器可以是具有通过皮下注射针头可刺入的塞子的静脉内用溶液袋或小瓶)。该组合物中的活性试剂通常是能够干扰本文鉴定的基因产物的活性的抗肿瘤剂,例如抗体。容器上的或者与其相连的标签指示该组合物用于诊断或治疗选定的症状。该产品还可包含第二个容器,该容器中含有药用上可接受的缓冲液,例如磷酸盐缓冲液,林格(Ringer′s)溶液和葡萄糖溶液。它还包含从商业和用户角度需要的其它材料,包括其它缓冲液,稀释剂,过滤器,针头,注射器和含有使用说明的包装插图。
F.诊断用途
由于在炎症性肝脏疾病中Angptl3上调,其相对于正常组织的过量表达可用作该疾病的诊断标记。
基因扩增和/或表达可在样品中直接测量,例如,根据本文提供的序列使用合适标记的探针进行常规Southern印迹,Northern印迹以定量mRNA的转录(Thomas,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:5201-5205(1980)),斑点印迹(DNA分析),或原位杂交。另外,可采用能识别包括DNA双螺旋,RNA双螺旋,和DNA-RNA杂交双螺旋或DNA-蛋白质双螺旋在内的特异性双螺旋的抗体。而抗体可以是标记的,在双螺旋结合到表面上的情况下可进行试验,以便通过在表面形成双螺旋来检测与该双螺旋结合的抗体的存在。
例如,可使用抗体,包括抗体片断定性或定量检测Angptl3蛋白的表达。如上所述,抗体优选携带可检测的标记,例如荧光标记,且可通过光学显微镜检,流式细胞术,荧光测定法,或本领域已知的其它技术监测其结合。如果扩增的基因编码细胞表面蛋白,例如生长因子,那么这些技术特别合适。所述结合试验基本上按上文第5节所述进行。
与Angptl3蛋白质结合的抗体的原位检测可通过例如,免疫荧光法或免疫电子显微镜检来进行。为此目的,可从患者取出组织样品,对其应用标记抗体,优选通过将该抗体覆盖在生物学样品上来应用。该方法还允许测定检查的组织中标记基因产物的分布。对于本领域的技术人员而言显而易见的是用于原位检测的各种组织学方法是容易得到的。
用于定量差异性基因表达的一种最灵敏且最灵活的定量方法是RT-PCR,它可用于比较在不同样品群体,在正常和肿瘤组织,在接受或未接受药物治疗的样品中的mRNA水平,从而鉴定基因表达方式,区分密切相关的mRNAs,和分析RNA结构。
第一步是从靶样品分离mRNA。该起始材料一般是从病变组织和相应的正常组织分别分离的总RNA。因此,可从例如,冷冻的或保存的石蜡包埋的和固定的(例如福尔马林固定的)病变组织样品提取mRNA,用于与相同类型的正常组织进行比较。mRNA的提取方法是本领域熟知的且在包括Ausubel等,Current Protocols of Molecular Biology,John Wiley和Sons(1997)的分子生物学标准教科书中的公开。从石蜡包埋的组织提取RNA的方法在例如,Rupp和Locker,Lab Invest 56:A67(1987),和De Andres等,BioTechniques 18:42044(1995)中公开。具体地说,可使用来自诸如Qiagen等厂商的纯化试剂盒,缓冲液组和蛋白酶按照产品说明书进行RNA的分离。例如,可使用Qiagen Rneasy微型柱从培养物的细胞中分离总RNA。使用RNA Stat-60(Tel-Test)可从组织样品分离总RNA。
由于RNA不能用作PCR的模板,因此通过RT-PCR进行差异性基因表达分析的第一步是将RNA模板逆转录成cDNA,接着在PCR反应中进行其指数扩增。两种最常用的逆转录酶是禽成髓细胞瘤病毒逆转录酶(AMV-RT)和Moloney鼠白血病病毒逆转录酶(MMLV-RT)。逆转录步骤一般根据情况和表达目标的分布使用特异性引物,随机六聚体,或寡聚-dT引物引发。例如,提取的RNA可以使用GeneAmp RNA PCR试剂盒(Perkin Elmer,CA,USA),按照产品说明书进行逆转录。然后产生的cDNA可用作随后的PCR反应的模板。
尽管PCR步骤可使用各种热稳定性DNA-依赖型DNA聚合酶,但是一般采用Taq DNA聚合酶,它具有5’-3’核酸酶活性而缺乏3’-5’核酸内切酶活性。因此,TaqMan PCR一般使用Taq或Tth聚合酶的5’-核酸酶活性水解结合到其靶扩增子上的杂交探针,但是也可使用具有同等5’核酸酶活性的任何酶。可使用两个寡核苷酸引物产生PCR反应典型的扩增子。可以设计第三种寡核苷酸或探针来检测位于两个PCR引物之间的核苷酸序列。该探针不能用Taq DNA聚合酶延伸,且已用报告荧光染料和猝灭荧光染料进行了标记。当两种染料在探针上紧密靠近时,来自报告染料的任何激光诱导的发射都被猝灭染料猝灭。在扩增反应期间,Taq DNA聚合酶以模板依赖型方式裂解该探针。所得的探针片断在溶液中分散,来自释放的报告染料的信号不受第二荧光团的猝灭影响。每合成一个新分子就释放一分子的报告染料,检测未猝灭的报告染料提供了定量解释该数据的基础。
TaqMan RT-PCR可使用商业上可得到的设备,例如,ABI PRIZM 7700TMSequence Detection SystemTM(Perkin-Elmer-Applied Biosystems,Foster City,CA,USA),或Lightcycler(Roche Molecular Biochemicals,Mannheim,Germany)进行。在一个优选的实施方案中,5’核酸酶方法在诸如ABI PRIZM 7700TMSequence Detection SystemTM等实时定量PCR装置上运行。该系统由热循环仪,激光器,电荷偶合装置(charge-coupled device(CCD)),照相机和计算机组成。该系统在热循环仪上以96-孔形式扩增样品。扩增期间,通过所有96孔的光纤电缆实时收集激光诱导的荧光信号,并在CCD中检测。该系统包括运行该仪器和分析该数据的软件。
5’-核酸酶测定数据开始表示为Ct,或临界循环。如上所述,每个循环期间记录荧光值,它代表在扩增反应中到该时间点扩增的产物量。荧光信号首次记录为统计学上显著的时间点是临界循环(Ct)。当比较病变组织的细胞与正常细胞的RNA表达时,用ACt值作为核酸样品中特定靶序列的起始拷贝相对数的度量值。
为了最小化误差和样品与样品间差异的影响,通常使用内部标准进行RT-PCR。理想的内部标准在不同组织间以恒定水平表达,且不受实验处理的影响。最常用于标准化基因表达模型的RNAs是管家基因甘油醛-3-磷酸-脱氢酶(GAPDH)和β-肌动蛋白的mRNAs。
使用微阵列技术也可鉴定或证实差异性基因表达。在该方法中,将目的核苷酸序列涂板,或排列在芯片基质上。然后将排列的序列与来自目的细胞或组织的特异性DNA探针杂交。
在微阵列技术的一个具体实施方案中,将经过PCR扩增的cDNA克隆的插入片断以密集的阵列应用在基片上。优选在基片应用至少10,000个核苷酸序列。每片芯片上固定10,000个单元,所得的微阵列基因适合于在严格条件下杂交。从目的组织提取RNA,通过逆转录掺入含荧光的核苷酸,因此产生荧光标记的cDNA探针。使芯片上的标记cDNA探针与阵列上的各DNA点特异性杂交。严格洗涤去掉非特异性结合的探针后,通过共焦激光显微镜扫描该芯片。定量各阵列单元的杂交以便评估相应的mRNA丰度。通过双色荧光的利用,分别标记的从两种RNA来源产生的cDNA探针与阵列逐对杂交。因此可同时测定相应于各具体基因的两种来源的转录子的相对丰度。微型化的杂交规模允许方便且迅速地评估大量基因的表达模式。已表明这类方法具有检测每个细胞仅表达几个拷贝的那些稀有转录子所需的灵敏度,并且可重复检测在表达水平上至少大约2倍的差异(Schena等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93(20):106-49(1996))。核酸的杂交方法和微阵列技术是本领域熟知的。
下面的实施例仅为了说明性目的而提供,且并不打算以任何方式限制本发明的范围。
本说明书引证的所有专利和参考文献以其整体在此引用以供参考。
实施例
实施例中提及的商业上可得到的试剂均按产品说明书使用,除非另有说明。在下面实施例和整个说明书中以ATCC保藏号鉴定的那些细胞的来源是美国典型培养物保藏中心,Manassas,VA。
实施例1
Angptl3的鉴定
在从Clontech Laboratories,Inc.Palo Alto,CA USA,获得产品目录号为64018-1的人胎儿肝脏mRNA,制备cDNA文库,从中鉴定Angptl3,方法按照“Instruction Manual:SuperscriptLambda System for cDNA Synthesis andλcloning”,产品目录号19643-014,Life Technologies,Gaithersburg,MD,USA中所述。除非另有说明,所有试剂也都从Life Technologies获得。整个方法总结为下列步骤:(1)第一链合成;(2)第二链合成;(3)添加衔接头;(4)酶消化;(5)凝胶分离cDNA;(6)连接进载体;和(7)转化。
第一链合成:
将Not1引物衔接头(Life Tech.,2μl,0.5μg/μl)加入无菌的1.5ml微量离心管中,向管中加入polyA+mRNA(7μl,5μg)。将反应管加热到70℃5分钟或足以使mRNA二级结构变性的时间。然后在冰上冷却反应并加入5X第一链缓冲液(Life Tech.,4μl),0.1M DTT(2μl)和10mM dNTP混合物(Life Tech.,1μl),然后加热到37℃2分钟以平衡温度。然后加入Superscript II逆转录酶(Life Tech.,5μl),充分混合反应管并在37℃温育1小时,并通过放置在冰上来终止反应。反应物的最终浓度如下:50mM Tris-HCl(pH 8.3);75mM KCl;3mMgCl2;10mM DTT;各500μM的dATP,dCTP,dGTP和dTTP;50μg/ml的Not1引物-衔接头;5μg(250μg/ml)mRNA;50,000U/ml Superscript II逆转录酶。
第二链合成:
在冰上时,向来自第一链合成的反应管中加入下列试剂,充分混合反应物并使其在16℃反应2小时,注意不使温度超过16℃:蒸馏水(93μl);5X第二链缓冲液(30μl);dNTP混合物(3μl);10U/μl大肠杆菌DNA连接酶(1μl);10U/μl大肠杆菌DNA聚合酶I(4μl);2U/μl大肠杆菌RNase H(1μl)。加入10U T4 DNA聚合酶(2μl),反应物在16℃继续温育另一个5分钟。反应物的最终浓度如下:25mM Tris-HCl(pH 7.5);100mM KCl;5mM MgCl2;10mM(NH4)2SO4;0.15mM β-NAD+;各250μM的dATP,dCTP,dGTP,dTTP;1.2mM DTT;65U/ml DNA连接酶;250U/ml DNA聚合酶I;13U/mlRnase H。通过在冰上放置和通过加入0.5M EDTA(10μl)来停止反应,然后通过酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1,150μl)提取。取出水相,收集并稀释进5MNaCl(15μl)和无水乙醇(-20℃,400μl)中,以14,000xg离心2分钟。小心分离上清与所得的DNA沉淀,将沉淀重悬于70%乙醇(0.5ml)中并再次以14,000xg离心2分钟。再次去掉上清,将沉淀在真空离心蒸发浓缩器(speedvac)中干燥。
添加衔接头
向来自上述第二链合成的cDNA沉淀中加入下列试剂,轻轻混合反应物并在16℃温育16小时:蒸馏水(25μl);5X T4 DNA连接酶缓冲液(10μl);Sal I衔接头(10μl);T4 DNA连接酶(5μl)。反应物的最终组成如下:50mMTris-HCl(pH 7.6);10mM MgCl2;1mM ATP;5%(w/v)PEG 8000;1mM DTT;200μg/ml Sal 1衔接头;100U/ml T4 DNA连接酶。通过酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1,50μl)提取反应物,取出水相,收集并稀释进5M NaCl(8μl)和无水乙醇(-20℃,250μl)中。然后以14,000xg离心20分钟,弃去上清并将沉淀重悬于0.5ml 70%乙醇中,再次以14,000xg离心2分钟。随后去掉上清且所得的沉淀在真空离心蒸发浓缩器中干燥并继续进入下一步操作。
酶消化:
向来自前一段用Sal 1衔接头制备的cDNA中加入下列试剂且混合物在37℃温育2小时:DEPC-处理的水(41μl);Not 1限制性缓冲液(REACT,Life Tech.,5μl),Not 1(4μl)。该反应物的最终组成如下:50mM Tris-HCl(pH 8.0);10mM MgCl2;100mM MaCl;1,200U/ml Not 1。
cDNA的凝胶分离:
cDNA在5%丙烯酰胺凝胶上通过丙烯酰胺凝胶电泳按大小进行分级分离,从凝胶上切下通过与分子量标记比较测定的大于1Kb的任何片断。然后将cDNA从凝胶上电洗脱进0.1xTBE缓冲液(200μl)中,用酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1,200μl)进行提取。取出水相,收集并以14,000xg离心20分钟。分离上清与DNA沉淀,将该沉淀重悬于70%乙醇(0.5ml)中并再次以14,000xg离心2分钟。再次弃去上清,沉淀在真空离心蒸发浓缩器中干燥并重悬于蒸馏水(15μl)中。
将cDNA连接进pRK5载体:
将下列试剂加在一起并在16℃温育16小时:5X T4连接酶缓冲液(3μl);pRK5,Xhol,Notl消化的载体,0.5μg,1μl);从前一段制备的cDNA(5μl)和蒸馏水(6μl)。随后,再加入蒸馏水(70μl)和10mg/ml tRNA(0.1μl)并通过酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1)提取整个反应物。取出水相,收集并稀释进5M NaCl(10μl)和无水乙醇(-20℃,250μl)中。然后以14,000xg离心20分钟。倾析,将沉淀重悬于70%乙醇(0.5ml)中,再以14,000xg离心2分钟。然后将DNA沉淀在真空离心蒸发浓缩器中干燥并洗脱进蒸馏水(3μl)中用于下一步操作。
将文库连接物转化进细菌:
将前面制备的连接的cDNA/pRK5载体DNA在冰上冷却,向其中加入电感受态的DH10B细菌(Life Tech.,20μl)。然后按厂商建议对细菌载体混合物进行电穿孔。随后加入SOC培养基(1ml),混合物在37℃温育30分钟。然后将转化子平板接种到20个标准150mm的含有氨苄青霉素的LB平板上并培养16小时(37℃)以允许菌落生长。然后刮下阳性菌落并使用标准CsCl-梯度方法从细菌沉淀中分离DNA。例如,Ausubel等,2.3.1。
Angptl3的鉴定
Angptl3可通过本领域已知的任何标准方法,包括Klein R.D.等,(1996),Proc.Natl.Acad.Sci.93,7108-7113和Jacobs(1996年7月16日公开的美国专利号5,563,637)报道的方法,在人胎儿肝脏文库中鉴定。根据Klein等和Jacobs的方法,编码新分泌的和膜结合的哺乳动物蛋白质的cDNAs,可通过检测其分泌前导序列来鉴定,其中使用酵母转化酶基因作为报道系统。转化酶催化蔗糖裂解为葡萄糖和果糖以及棉子糖裂解为蔗糖和蜜二糖。转化酶的分泌形式是酵母(Saccharomyces cerevisiae)的蔗糖利用所必需的,因此不能产生分泌型转化酶的酵母细胞在含有蔗糖作为唯一碳源和能源的培养基上难以生长。Klein R.D.出处同上和Jacobs,出处同上都利用了哺乳动物信号序列能有功能地取代酵母转化酶的天然信号序列的已知能力。将哺乳动物cDNA文库连接到编码非分泌型酵母转化酶的DNA上,分离已连接的DNA,并转化进不含转化酶基因的酵母细胞中。含有连接到哺乳动物信号序列上的非分泌型酵母转化酶基因的重组子,可根据其在仅含有蔗糖或者仅含有棉子糖作为碳源的培养基上生长的能力来鉴定。然后使用鉴定的哺乳动物信号序列,筛选第二个全长cDNA文库,以分离编码相应的分泌蛋白的全长克隆。例如,克隆可通过表达克隆或者通过本领域已知的任何其它技术进行。
用于鉴定Angptl3的引物如下:
OLI114 CCACGTTGGCTTGAAATTGA(SEQ ID NO:3)
OLI115 CCTCCAGAATTGATCAAGACAATTCATGATTTGATTCTCTATCTCCAGAG(SEQID NO:4)
OLI116 TCGTCTAACATAGCAAATC(SEQ ID NO:5)
Angptl3的核苷酸序列在图1(SEQ.ID.NO:1)中显示,而其氨基酸序列在图2A和2B(SEQ.ID.NO:2)中显示。Angptl3含有与TIE-2受体的两个已知的人类配体(h-TE2L1和h-TIE2L2)以及人血管生成素1,2和4(ANG1,ANG2,ANG4,图5C)表现出高度序列同源性的血纤蛋白原样结构域(图3A,和图5A-C)。
Angptl3的一个克隆按布达佩斯条约于1997年9月18日在美国典型培养物保藏中心(ATCC),12301Parklawn Drive,Rockville,Maryland 20852保藏,指定的保藏号为ATCC209281。
实施例2
Angptl3的表达
将人Angptl3克隆进真核表达载体pRK5tkNEO和杆状病毒载体pHIF,即一种从PharMingen,CA购买的pVL1393的衍生物中。将质粒DNA与BaculoGoldTM DNA(PharMingen,CA)用Lipofectin(GIBCO-BRL,MD)共转染进草地夜蛾(Spodoptera frugiperda)(“Sf9”)细胞(ATCC CRL 1711)中。4天后,收获细胞,使用500μl的上清感染2x106个Sf9细胞并扩增杆状病毒。扩增72小时后,收获细胞并使用10ml上清感染7.5x105个H5细胞/ml 40小时。收获并通过0.45μm醋酸纤维素滤膜过滤后,纯化上清。在大规模瞬时转染实验中小鼠Angptl3在中国仓鼠卵巢(CHO)细胞中过量表达。使用免疫亲和色谱法从生长于悬液中并被杆状病毒感染的昆虫细胞上清中纯化人Angptl3。通过将抗-gD Fab偶连到glycophase-CPG(可控制孔径的玻璃)上产生色谱柱。将澄清的(1000xg离心5分钟然后0.2μm过滤)培养基上样并在4℃过夜。用PBS洗涤柱子直到流出液在280nm下的吸光度回到基线,用pH3.0的50mM柠檬酸钠洗脱。洗脱蛋白在1mM HCl中透析(Spectra-pore;MWCO 10,000)并在-70℃冷冻。将含有小鼠Angptl3的瞬时表达的CHO培养物澄清并使用10,000MWCO膜(Amicon)浓缩。将该体积按前面对人Angptl3所述转移到与glycophase-CPG柱偶连的抗-gD Fab上。洗脱合并液用10mM乙酸钠(pH 5.0)稀释成导电率<5mS并上样到S Sepharose Fast Flow(Amersham Pharmacia Biotech,NJ)上。用10mM乙酸钠pH 5.0洗涤柱子,直到流出液在280nm的吸光度回到基线,用在10mM乙酸钠pH 5.0中的20倍柱体积梯度0-0.5M NaCl洗脱。使用反向C-4色谱法(Vydac,CA)进一步纯化含有小鼠Angptl3的在0.45M-0.5M NaCl处洗脱的级分。所述级分用0.1%三氟乙酸梯度酸化。将以67%乙腈洗脱的小鼠mAngptl3冻干并在-70℃贮存。纯化蛋白的鉴定通过N-末端序列分析证实。使用商品试剂盒证实LPS浓度且对于所有人或鼠Angptl3制品测定为<5Eu/ml。
实施例3
制备结合Angptl3的抗体
本实施例说明了可特异性地结合Angptl3的单克隆抗体的制备。
产生单克隆抗体的技术是本领域已知的且在例如,Goding,出处同上中描述。可采用的免疫原包括本发明的纯化的配体同系物,含有该配体同系物的融合蛋白,和在细胞表面表达重组配体同系物的细胞。免疫原的选择可由本领域的技术人员不需过多的实验来作出。
用在完全弗氏佐剂中乳化的免疫原通过以1-100微克的含量皮下或腹膜内注射来免疫诸如Balb/c等小鼠。作为选择,免疫原可在MPL-TDM佐剂(Ribi Immunochemical Research,Hamilton,MT)中乳化并注射进动物后爪垫。然后免疫的小鼠在10到12天后用在选定佐剂中乳化的额外(additional)免疫原加强免疫。此后,在几周内也可用额外的免疫注射对小鼠进行加强免疫。通过眼眶后取血从小鼠定期获得血清样品用于进行ELISA试验以检测该抗体。
检测到合适的抗体滴度后,用给定配体的最终静脉内注射液注射抗体“阳性”的动物。3至4天后,处死小鼠并收获脾细胞。然后将脾细胞与鼠骨髓瘤细胞系,如可从ATCC,No.CRL 1597得到的P3X63AgU.l,融合(使用35%的聚乙二醇)。该融合产生杂交瘤细胞,随后可将其平板接种在含有HAT(次黄嘌呤,氨基蝶呤,和胸腺嘧啶核苷)培养基的96孔组织培养板上以抑制非融合细胞,骨髓瘤杂交体,和脾细胞杂交体的增殖。
可在ELISA中筛选杂交瘤细胞对抗原的反应性。分泌抗本文TIE配体同系物的所需单克隆抗体的“阳性”杂交瘤细胞可通过本领域熟知的技术测定。
可将阳性杂交瘤细胞腹膜内注射进同系Balb/c小鼠中以产生含有抗-TIE-配体的单克隆抗体的腹水。作为选择,杂交瘤细胞可在组织培养瓶或转瓶中生长。产生在腹水中的单克隆抗体可使用硫酸铵沉淀,接着通过凝胶排阻层析来纯化。作为选择,可采用以抗体与蛋白质A或蛋白质G的结合为基础的亲和层析。
实施例4
内皮细胞的结合
血管生成素是分泌型因子,它通过其N-末端的血纤蛋白原(FBN)-样结构域与内皮细胞特异性酪氨酸激酶受体Tie2结合来调节血管生成。发现在该分泌型配体家族中存在的C-末端卷曲螺旋结构域是配体寡聚反应所必需的(Procopio等,J.Biol.Chem.274:30196-201(1999))。
与血管生成素相似,Angptl3是由N-末端信号肽,接着的一个卷曲螺旋结构域和一个C-末端FBN-样结构域组成的分泌型糖蛋白(图3A)。
由于在Angptl3和血管生成素之间存在结构相似性,试验了Angptl3在培养物中与表达Tie2受体的原代内皮细胞结合的能力。人微血管内皮细胞(HMVECs)从Cell System(Kirkland,WA)购买,并按厂商说明书在含有10%胎牛血清和促分裂原的CS-C完全培养基中维持,分别用表达表位(gD)-标记形式的Tie2配体血管生成素1和2(Ang1和Ang2),Angptl3,和血管生成素相关蛋白1(ARP1)的瞬时转染293细胞产生的条件培养基进行培养。ARP1是一种结构上相关的分子,由卷曲螺旋和血纤蛋白原样结构域组成但不能结合Tie2,用作阴性对照。如图3B所示,在没有观察到ARP1结合的条件下Ang2和Angptl3强烈结合HMVEC。这些发现证实了Angptl3与内皮细胞的结合是特异性的且暗示着在内皮细胞上存在介导Angptl3结合的受体。
Tie2是血管生成素1,2和3(Ang1,Ang2,和Ang3)的受体,Tie1是与Tie2具有高度序列同源性的孤独受体,为了试验是Tie2还是Tie1与Angptl3结合,使用分别以表位(gD)-标记形式的Ang1和Ang2,Angptl3,和ARP1的表达载体结合Tie1和Tie2的全长受体构建体瞬时转染的293细胞进行免疫沉淀实验。通过在含有新鲜添加的蛋白酶抑制剂的RIPA缓冲液(1xPBS;1%NP40;0.5%脱氧胆酸钠;0.1%SDS;PMSF,100μg/ml;抑酶肽,30μl/ml;正钒酸钠,1μM)中裂解来制备总细胞提取物。提取物用Tie1或Tie2的特异性抗体(Santa Cruz Biotechnology,San Diego,CA)温育,所得的免疫沉淀通过SDS-PAGE和免疫印迹分析。具体地说,通过SDS-PAGE分离并印迹到PVDF膜上的蛋白质分别用抗gD标记或Tie受体的抗体温育。如图4所示,Tie1和Tie2在允许Tie2与Ang1和Ang2结合的实验条件下不结合Angptl3。这些发现证实了Angptl3既不是Tie2的配体也不是Tie1的配体,且表明在内皮细胞上存在介导细胞结合实验中观察到的强烈结合的其它受体。
感兴趣的是,模拟“肿瘤样”条件而暴露于低氧或VEGF的细胞与Angptl3的结合显著增强(数据未显示)。以前发现这些条件诱导内皮细胞上的整联蛋白表达(Suzuma等,Invest.Ophthalmol.Vis.Sci.39:1028-35(1999)),而发现Tie1和Tie2受体水平不改变(Mandriota和Pepper,Circ.Res.83:852-9(1998)和Oh等,J.Biol.Chem.274:15732-9(1999))。
实施例5
FBN-Angptl3的分子模型
Angptl3的FBN-样结构域与人血纤蛋白原γ链的C末端具有39.6%的序列相同性。为了研究Angptl3与内皮细胞结合的生物学功能和分子机制,使用对FBN结构域的X-射线晶体学研究提供的结构信息和同源性建模技术构建Angptl3的FBN-样结构域模型。FBN结构域具有由三个明确的结构域组成的特有折叠:该三个结构域是:由一个双链反向平行的β-折叠和侧翼的一个短螺旋形成的N端结构域;由具有两个短螺旋的5链反向平行的β-折叠和倚靠其一个面排列的发夹环形成的中央结构域;和主要由环组成的第三个结构域(图5B)。
为了构建FBN-Angptl3模型,通过使用clustalW(Thompson等,Nucleic Acids Res.,22:4673-80(1994))和threading(ProCeryon Biosciences Inc.)在FBN-Angptl3序列和一些FBN结构域结构之间进行序列结构对比。从该序列对比中,选择3FB(PDB代码)作为模板结构用于模型构建。程序PROCHECK(Laskowski等,J.Biomol.NMR 8:477-86(1996))用于评估该模型的几何品质,它与PDB中保存的结构的参考数据库比较时超过平均立体化学品质。最终的FBN-Angptl3模型与模板比较时所有Cα原子的r.m.s.d为1.95。FBN结构域的总体折叠在FBN-Angptl3中保守,在氨基酸位置220-224,289-306,和357-363所示环区域中有一些差异(图5A和B)。
对人血纤蛋白原γ链的研究导致鉴定了与整联蛋白αMP2(即主要在白细胞上表达的整联蛋白)结合相关的两个区域(Ugarova等,J.Biol.Chem.273:22519-27(1998))。在线性氨基酸序列上分开的这两个区域在FBN结构域的三维结构中形成两个相邻的反向平行的β-链(P1,残基190-202;P2,残基377-395)。已发现在血纤蛋白原γ链内的一个不同区域(P3,346-358)和tenasin-C也涉及与整联蛋白αvβ3的结合(Yokoyama等,J.Biol.Chem.275:16891-8(2000))。该FBN-Angptl3模型和人血纤蛋白原γ链的FBN结构域在这些区域(P1:38-50;P2:199-214;P3:346-361)中具有高度的结构相似性(图5A),其中的编号遵循3FIB的编号(PDB代码)。按照Angptl3的氨基酸编号(SEQ ID NO:2),在成熟蛋白质的氨基酸序列中P1相应于氨基酸281-293(SEQ ID NO:14);P2相应于氨基酸442-460(SEQ ID NO:15);且P3相应于氨基酸415-430(SEQ ID NO:17)。
为了验证Angptl3的FBN-样结构域内的区域是否负责结合的假设,设计并合成了一些肽(表2)。P3序列编码在不同结构域之间具有最大结构差异的区域且因此可测定受体特异性。来自相同区域的一些拼凑和颠倒的肽用作对照肽(表2)。带有氨基末端gD表位标记的重组人Angptl3蛋白质按实施例2所述使用杆状病毒表达系统产生(图6A)。
重组Angptl3的糖基化状态按照厂商说明书(New England Biolabs,MA)用PNGase-F处理来测定。纯化的蛋白质(50ng)通过SDS聚丙烯酰胺凝胶(10%Tris-Glycine,Invitrogen,CA)进行电泳并使用标准方法电转移到硝酸纤维素膜(Invitrogen,CA)上。膜在含5%w/v速溶脱脂奶粉的PBS中温育封闭并在4℃用含1μg/ml单克隆抗-gD(克隆5B6.K6)抗体的封闭缓冲液温育过夜。膜用PBS/0.05%Tween 20洗涤且随后用辣根过氧化物酶偶连的驴抗小鼠抗体(Jackson ImmunoResearch Laboratories,PA)在室温下温育1小时。按照厂商的方法(Amersham Pharmacia Biotech,NJ)通过化学发光检测来观察Angptl3蛋白。按以前所述进行免疫沉淀,瞬时转染和FACS分析(Klein等,Nature 387:717-21(1997))。
用PNGase温育时Angptl3带的迁移率下降表明该重组蛋白是糖基化的(图6C)。以前对于血管生成素得到过相似的观察结果。如图7A所示,向贴壁试验中加入所有3种肽,完全阻断了内皮细胞与Angptl3的结合。整联蛋白αvβ3在RGD粘着序列环境中能够识别其一些配体。与我们的观察结果(即Angptl3的血纤蛋白原样结构域不编码该RGD序列)一致,加入RGD肽仅部分消除HMVEC贴壁,而RGE-肽无影响。该结果表明只有部分Angptl3与αvβ3的相互作用以RGD-依赖型方式介导。因此,这些数据表明Angptl3的FBN-样结构域内的所有三个区域都是受体结合位点的一部分。
表2
名称 | 序列 | SEQ ID NO |
NL6_P1* | PWTLIQHRIDGSQ | 14 |
NL6_PP1 | PWTLIQHRIDGSQ | 14 |
NL6_P2* | YSIKSTKMLIHPTDSESFE | 15 |
NL6_PP2 | YSIKSTKMLIHPTDSES | 16 |
NL6_P3* | GKYNKPRAKSKPERRR | 17 |
NL6_PP3 | GKYNKPRAKSKPER | 18 |
NL6_P32 | GKYNKPRAKSKPE | 19 |
对照肽名称 | 序列 | SEQ ID NO |
NL6_PP1_inv | QSGDIRHQILTWP | 20 |
NL6_PP1_src | PQWSTGLDIIQRH | 21 |
NL_PP2_inv | SESDTPHILMKTSKISY | 22 |
NL_PP2_src | YSSEISKDSTTPKHMIL | 23 |
NL6_PP3_inv | REPKSKARPKNYKG | 24 |
NL6_PP3_src | GRKEYPNKKSPKRA | 25 |
FBG_P1 | GWTVFQKRLDGSV | 26 |
FBG_P2 | YSMKKTTMKIIPFNRL | 10 |
FBG_P3 | GVYYQGGTYSKAS | 12 |
实施例6
细胞贴壁试验
A.鉴定整联蛋白介导的Angptl3细胞贴壁
为了鉴定整联蛋白与Angptl3的可能结合,将重组Angptl3蛋白质覆盖到96-孔平底微量滴定板(MaxiSorp,Nunc,Denmark)上于4℃过夜,并用含100μg/ml BSA的PBS在37℃封闭1小时。检测了用包括IIbIIIa(αIIBβ3),αvβ3,αvβ1和αvβ5在内的不同整联蛋白异二聚体稳定转染的各种293细胞系结合Angptl3包被板的能力。收获细胞并在含1%BSA,1mMCaCl2和1mMMgCl2的无血清CS-C培养基中稀释至105个细胞/ml。细胞在含有或不含封闭抗体或肽的条件下37℃预培养15分钟,然后用200nM PMA刺激。将细胞悬液(104个细胞/孔)加入包被孔中,平板在37℃培养选定的时间。通过PBS洗涤去掉非贴壁细胞,并使用Lanndegren的PNAG方法测量细胞贴壁(Landegren,U.,J.Immunol.Methods,67:379-388(1984))。结果以一式三份孔的平均OD405值表示。
在检测的稳定细胞系中,表达αvβ3的细胞相对于其它细胞系细胞表现出与Angptl3的粘着显著增强(图7B)。因此,这些发现证实,重组人Angptl3特异性地结合αvβ3整联蛋白。这与暴露于低氧和VEGF的内皮细胞更有效地结合Angptl3的在先观察结果一致。
B.αvβ3介导Angptl3细胞粘着
已知整联蛋白被其配体激活时诱导诸如细胞粘着和迁移等生物学反应。已设计实验检测了Angptl3是否对原代人内皮细胞发挥该作用,和αvβ3是否足以介导这些反应。当在内皮细胞贴壁试验中检测时,Angptl3在温育后4小时内诱导强烈的剂量依赖型贴壁(图7C)。观察到的水平相当于将细胞平板接种在玻连蛋白,即αvβ3的原著型(prototypic)配体上时获得的水平(数据未显示)。
为了确定αvβ3整联蛋白是否足以介导Angptl3细胞粘着,在细胞贴壁试验中检测了封闭性抗体或抑制性肽抑制贴壁的能力。在用Angptl3-包被的孔进行培养前向内皮细胞中加入功能封闭性抗体。抗α5β1或αvβ5的功能封闭性抗体的存在不减少HMVECs与Angptl3(20μg/ml)包被的培养皿的粘着,然而,αvβ3特异性抗体完全阻断粘着(图7D)。作为通用对照,向结合实验中加入消除整联蛋白与其配体结合的EDTA(10mM)。如图7D所示,干扰整联蛋白对二价阳离子的依赖性完全消除了内皮细胞贴壁。
实施例7
细胞迁移试验
由于针对内皮细胞的整联蛋白活性的另一标志是其对配体刺激的迁移反应,已建立了一种迁移测定法,其允许研究Angptl3对诱导内皮细胞迁移的影响。
在T.V.Byzova等,Exp.Cell Res.,254:299-308(2000)所述的迁移测定法中检测Angptl3。该迁移测定法使用具有8μm孔径的HTS多孔组织培养插件(Becton Dickinson,NJ)。将Angptl3蛋白在PBS中稀释成50ng/μl并用作滤膜表面的内涂层。用3%BSA/PBS预覆盖后,将滤膜放在500μl含1%BSA,1mMCaCl2的无血清CS-C培养基中。用PBS洗涤HMVECs 3次,收获并以105个细胞/ml悬浮于按上述添加的无血清培养基中。在用PMA(200nM)刺激前细胞在含有或不含封闭性抗体(25μg/ml)的条件下37℃预培养15分钟。将细胞悬液(250μl)加入上面室中,允许细胞在5%CO2的湿润培养箱中37℃迁移过夜。培养后,使用棉签去掉上孔中剩余的细胞,用甲醇固定迁移到膜下表面的细胞并用YO-PRO-1碘化物(Molecular Probes)染色。使用Openlab软件(Improvision,MA)将迁移结果定量为细胞平均数/显微镜视野。
内皮细胞接触Angptl3 16至20小时后,观察到与BSA对照处理相比细胞迁移增加2.5倍(图7E)。最重要的是,施加抗αvβ3的拮抗性抗体封闭该迁移,而封闭其它整联蛋白的对照抗体不能。因此,Angptl3潜在地诱导原代人内皮细胞的迁移且两种活性都被抗αvβ3的拮抗性抗体封闭。
实施例8
Angptl3的组织表达
A.原位杂交
原位杂交按以前所述(Lu,Cell Vision 1:169-176(1994))进行。设计PCR引物:
上游:5’T7启动子:GGATTCTAATACGACTCACTAT AGGGC(SEQ IDNO:6)+GGCATTCCTGCTGAATGTACC(hAngptl3特异性序列,SEQ ID NO:7)3’和下游5’T3启动子:CTATGAAATTAACCCTCACTAAAGGGA(SEQ IDNO:8)+ACCACACTCATCATGCCACCA(hAngptl3特异性序列,SEQ ID NO;9)3’用于扩增人Angptl3的506-bp片断和
上游:5’T7启动子:GGATTCTAATACGACTCAC TATAGGGC(SEQ IDNO:6)+5′GATGACCTTCCTGCCGACTG(mAngptl3特异性序列,SEQ IDNO:11)3’和下游:T3启动子:CTATGAAATTAACCCTCACTAAAGGGA(SEQID NO:8)+5’GTCATTCCACCACCAGCCA(mAngptl3特异性序列,SEQ IDNO:13)。引物包含编码27个核苷酸的T7或T3 RNA聚合酶起始位点的延长序列,以允许从扩增产物分别体外转录有义或反义核糖探针。将人组织的5μm厚切片脱蜡,在20μg/ml蛋白酶K中37℃脱蛋白15分钟,在2x SSC中漂洗,通过分级浓度的乙醇脱水并在预杂交缓冲液中温育1-4小时。将小鼠组织在4μg/ml蛋白酶K中37℃消化30分钟并按上述处理。33P-UTP-标记的有义和反义探针与切片在55℃杂交过夜。通过在20mg/ml RNaseA中37℃温育30分钟去掉未结合的探针,接着在55℃以0.1x SSC高度严格洗涤2小时,并通过分级浓度的乙醇脱水。将玻片浸入NBT2核示踪乳液(Eastman Kodak,NY)中,在含有干燥剂的密封塑料玻片盒中4℃曝光4周,显影,并用苏木精和曙红复染。
如图8C所示,在从E15和E18小鼠胚胎的胚胎肝脏切片中观察到肝细胞特异性表达。在分析的胚胎切片内的红细胞祖细胞,内皮细胞或巨核细胞上没有Angptl3表达。
B.Northern印迹
为了研究成人组织中的Angptl3表达,用上述覆盖编码序列5’端的放射性标记探针探测多组织的Northern印迹。与用鼠直向同源Angptl3发现只在肝脏中表达的在先观察结果相反(Conklin等,Genomics 62:477-82(1999)),在成人肝脏和肾中发现人Angptl3的表达,尽管在肾中观察到的信号明显较低(图8A)。除了在骨骼肌组织中有一些微弱信号外,在分析的包括肺和脑在内的任一其它成人组织中没有发现表达。通过对来自人和小鼠标本的各种正常和病变组织进行原位杂交研究了Angptl3 mRNA表达的细胞定位。所述组织包括所有主要器官,骨髓,以及诸如肝硬化,转移性肝脏腺癌等病理肝脏组织和来自acetominophen诱导的肝毒性病例的切片。如图8B所示,在正常成人肝脏中发现了一些本底表达,证实了northern印迹的数据。尽管在分析的肝脏肿瘤样品内表达无变化,但是在与肝硬化等炎症相关的病变肝脏和毒性损伤后的病变肝脏的切片中观察到强烈诱导。如高倍放大插图所示,在正常和病变肝脏组织中都发现肝细胞的特异性表达(图8C)。在病变组织内或周围的基质细胞,淋巴细胞和内皮细胞中没有检测到表达。
总之,这些数据证实了胚胎发育期间Angptl3的肝细胞特异性表达方式以及在与炎症相关的各种病变肝脏病例中强烈的肝细胞特异性上调。
C.基因表达分布
使用代表正常状态和包括癌症和非癌症等疾病状态的人组织的GeneLogic数据库对Angptl3进行基因表达分析。
使用GeneLogic基因表达数据库证实,在通过人肝脏切片的原位杂交鉴定的肝脏疾病状态下,表达增加(图8B)。除了肝脏外,在大多数组织和器官中Angptl3的基础水平较低。在肝脏,心脏和甲状腺中,正常和病理状况之间的Angptl3表达水平存在显著提高。用各种肝脏疾病的患者的样品对Angptl3表达进行更详细的亚类分析,证实了在肝硬化期间Angptl3的表达最强。令人感兴趣的是,GeneLogic数据库分析揭示,不仅在病理学肝脏,而且在诸如冠心病和肥大性心肌病等心脏疾病中强烈诱导Angptl3表达。与Angptl3的表达水平升高相关的疾病形式都共同具有由包括胶原蛋白,纤连蛋白,玻连蛋白和层粘连蛋白在内的各种细胞外基质蛋白组成的纤维变性组织的形成,已知所有这些ECM分子都与特异性整联蛋白形式结合。
实施例9
Angptl3的体内血管生成活性测定
为了检测Angptl3是否能够诱导大鼠角膜的体内血管生成反应,将含有鼠和人Angptl3(500ng)以及人VEGF(100ng)的透明质酸酶药丸(hyaluron pellets)按以前所述分别或联合植入(Xin等,J.Biol.Chem.,274:99116-9121(1999))。将含有赋形剂(对照),鼠或人Angptl3(500ng),VEGF(100ng),或鼠或人Angptl3(500ng)与VEGF(100ng)的组合物的透明质酸酶药丸植入250至300g雄性Sprague-Dawley大鼠的角膜。所有透明质酸酶药丸含有100ng硫糖铝(sucralfate)。在第6天,安乐处死动物并注射荧光素异硫氰酸葡聚糖酯以便观察血管系统。对摘出的眼球进行角膜整体封固并使用计算机辅助图像分析(Image Pro-Plus 2.0,Silver Spring,MD)分析新血管区。与以前在角膜血管生成试验中检测时针对血管生成素1和2的效果的报道相反(Asahara等,Circ.Res.83:233-40(1998)),药丸移植5天后,单独的重组Angptl3有效诱导强烈的血管生成反应。如图9A和B所示,与重组人蛋白相比,鼠Angptl3在诱导血管生成中有效性略高,但是两者的反应都相当于VEGF获得的水平。与VEGF联合处理时,观察到叠加效果但没有协同效应(图9B)。这些发现可能反映了两种配体参与的互相依赖的信号转导途径(Byzova等,Mol.Cell.6:852-60(2000))。
实施例10
Angptl3的体内生物学活性
A.静脉内和真皮内给药Angptl3的瞬时保护效果和长期效果
方法
腺病毒产生:使用AdEasy腺病毒载体系统(Stratagene)基本上按厂商说明书产生腺病毒CMV-gD-mAngptl3,CMV-lacZ和mVEGF164。通过将Angptl3或VEGF的编码区克隆进来自Stratagene的Ad-easy载体构建试剂盒的多接头位点,构建编码鼠Angptl3或VEGF的重组腺病毒载体。将mAngptl3或VEGF的编码区克隆到pShuttleCMV载体的NotI和HindIII位点之间。这些载体与提供的pShuttleCMV-lacZ一起在BJ5183电感受态细菌(Stratagene)中重组,AdEasy载体含有缺失E1和E3区域的Ad5基因组。通过将重组AdEasy质粒瞬时转染进宿主HEK293细胞,制备原代病毒原种。腺病毒原种在HEK293细胞中进一步扩增并使用Virakit腺病毒纯化试剂盒(Virapur)纯化。通过琼脂糖覆盖的噬斑测定法获得腺病毒滴度。
1.短期静脉内给药Angptl3的保护效果
为了对肝脏防止中毒性损伤的保护作用进行短期分析,通过尾静脉注射给12只成年BalbC小鼠施用腺病毒构建体,以便经过1x109Pfu剂量的编码mAngptl3和LacZ的对照病毒,和1x107Pfus的编码VEGF的病毒处理,在早至处理的2天后直到多达3周的期间,在肝脏中可以连续且强烈表达蛋白质。用腺病毒载体处理后5天时,将小鼠再分成两个亚组(n=6),进一步接受载体(橄榄油)或CCl4(四氯化碳)处理,CCl4是一种诱导肝脏损伤的强效肝毒性剂。通过口服管饲法以4ml/kg给予载体和CCl4。48小时后,处死动物,收集血液,收获组织并固定用于分析。在腺病毒感染后7天时通过western印迹分析法分析小鼠中构建体的表达水平(图10A)。
结果
Angptl3对CCl4诱导的肝细胞坏死的保护效应得到如下证实:在用编码Angptl3的腺病毒处理的小鼠血清中,作为肝衰竭指标的天冬氨酸转移酶(AST)的血液水平显著下降2.1倍,而任何对照构建体不下降(p<0.0001)(图10B)。因此,重组Angptl3的瞬时给药对于治疗肝脏损伤有益。
2.Angptl3的静脉内延长表达所诱导的肝脏损伤
为了评估Angptl3水平升高的长期效果,用上述编码Angptl3的腺病毒载体处理的小鼠在病毒转导后两周期限内鉴定。
a.血液化学分析
在腺病毒转导后2周的期限内,从野生型,C57B16小鼠获取血清样品,测量肝脏功能的血液化学水平指标。在Cobas Integra 400上测定血液学Cell-Cyn 13700,和血液化学水平。
如图11A所示,编码Angptl3的腺病毒载体而不是编码LacZ或血管生成素1(Ang1)的对照病毒,可诱导血清ALT和AST水平强烈升高。血清ALT和AST水平的升高相当于用四氯化碳处理观察到的ALT和AST水平。因此,在炎症性肝脏疾病或心脏疾病期间干扰Angptl3活性可能是有效的治疗方法。
为了进一步评定免疫系统的潜在贡献,在免疫受损的缺乏B-和T-细胞的RAG2-敲除小鼠和缺乏B,T和自然杀伤(NK)细胞的SCID小鼠中测量肝脏功能的血液化学水平指标。如图11B所示,编码Angptl3的腺病毒载体诱导RAG2小鼠中的AST和ALT水平,表明发生Angptl3诱导的肝脏功能改变,其与完整免疫系统的存在无关。
b.肝细胞增殖
为了进一步鉴定用表达Angptl3的腺病毒载体处理RAG2-敲除小鼠和SCID小鼠的效果,在用表达Angptl3的腺病毒载体或对照腺病毒载体处理的RAG2-敲除小鼠和SCID小鼠中,对所处理小鼠的各种经福尔马林固定并掺入了BrdU的器官(包括肾,心脏,肝脏,肺和小肠)中的细胞增殖进行定量。从腺病毒给药(IV)后14天的对照小鼠或Angptl3-处理小鼠获取石蜡包埋的切片,进行BrDU染色来测量细胞增殖,以检测细胞周期S期期间的细胞。处死前1小时以100mg/kg的剂量给动物腹膜内施用BrdU。用0.05%胰蛋白酶在37℃处理20分钟,用含95%甲酰胺的0.15M柠檬酸三钠在70℃处理45分钟进行变性后,用1∶1000稀释度的小鼠抗IdU/BrdU抗体(Caltag)4℃染色组织过夜。用生物素标记的马抗小鼠IgG抗体(Vector)作为第二试剂,通过使用Vectastin ABC Standard Elite试剂盒(Vector Laboratories)检测。用小鼠同种型(Zymed)作为阴性对照。然后用苏木精复染切片。计数在40x物镜下随机选择的10个独立视野中带标记细胞核的总数。每个视野覆盖0.063mm2的面积。
如表2所示,在用表达Angptl3的腺病毒载体处理的RAG2-敲除小鼠和SCID小鼠中观察到超过10倍的对肝细胞增殖的诱导。
表2:处理14天后,相对于对照处理,在Angptl3处理的RAG2敲除小鼠或SCID淡棕色小鼠肝脏切片中,BrDU染色增加
RAG2敲除小鼠 | SCID淡棕色小鼠 | |
PBS | 13.0±5.3 | 9.0±6.2 |
Ad-LacZ(1x109PFU) | 3.5±1.3 | 3.3±1.7 |
Ad-Angptl3(1x109PFU) | 81.2±24.9 | 67.2±20.1 |
c.组织学分析
对从腺病毒载体感染14天后的C57/B16收获的肝脏切片进行组织学分析。与从编码LacZ的腺病毒载体处理的对照小鼠分离的肝脏相比,从编码Angptl3的腺病毒载体处理的小鼠分离的肝脏切片中观察到肝细胞和炎性渗润物内作为细胞增殖指标的有丝分裂相增加。Angptl3-处理的动物肝脏比对照处理的动物肝脏也明显更大。
d.FACS分析
尽管通过体外ELISA测定法检测时在免疫细胞上表达的LFA1和Mac-1不与重组Angptl3结合(Camenisch等,2002),但是在免疫细胞上表达的整联蛋白家族的其它成员与Angptl3相关。
为了研究炎症性细胞在表达CCLF1的腺病毒载体所处理的小鼠肝脏中引起观察到的组织损伤的可能性,通过FACS测定外周血细胞的量,所述FACS通过染色细胞类型特异性标记来确定各种谱系的存在。与用表达LacZ或Ang1的对照腺病毒载体处理的小鼠的检测量相比,用表达Angptl3的腺病毒载体处理的小鼠中检测到的祖细胞(Sca1),T-细胞(CD4和CD8),B-细胞(B220),巨噬细胞(Gr1/Mac1)和红细胞系的细胞(Ter119)的量无显著差异。同样,在处理组之间观察到血清甘油酯和胆固醇的量无差异。
e.细胞贴壁分析
为了进一步分析与介导肝脏损伤相关的细胞机制,类似于实施例6中所述的细胞贴壁试验,在Angptl3-包被的组织培养皿上进行肝细胞和内皮细胞的细胞贴壁实验。
用所示浓度的蛋白质在4℃包被96-孔平底板(MaxiSorp,Nunc,Denmark)过夜,用含3%BSA的PBS在37℃封闭1小时。收获原代人皮肤内皮细胞(HMVECs)和使用LeCouter等(LeCouter等,2001)所述的方法从成年C57/B16小鼠肝脏新鲜分离的鼠肝细胞,并在200nM PMA存在的条件下,在含有1%BSA,1mM CaCl2和1mM MgCl2的无血清CS-C培养基中稀释成个105个细胞/ml。不存在PMA时观察到关于细胞结合的定性相似结果。向包被孔中加入细胞悬液(104个细胞/孔)并在37℃将平板培养选定的时间。通过PBS洗涤去掉非贴壁细胞并使用Landegren的PNAG方法(Landegren,1984)测量细胞贴壁。结果表示为一式三份孔中的平均OD405值。
如图13所示,HMVEC对Angptl3-包被板的贴壁相当于观察到的对纤连蛋白包被板贴壁水平的20%到50%。还观察到包被浓度依赖型肝细胞贴壁。因此,肝细胞和内皮细胞可以参与介导在Angptl3处理小鼠的肝脏中观察到的生物学效应。
3.皮内给药Angptl3增大血管透性
为了研究在成年小鼠中瞬时表达Angptl3诱导的血管变化,将腺病毒表达载体(10x10-9PFUs)以10μl总体积施用到麻醉的成年FVB小鼠耳朵表皮层并通过使用伊文思蓝试验进一步分析血管透性变化。简单地说,从开始并且在整个伊文思蓝试验期间麻醉小鼠。麻醉开始后,将100μl伊文思蓝(1%的PBS溶液)通过尾静脉注射方式对小鼠给药。伊文思蓝给药的60分钟后,在120mmHg压力下用pH 3.5的含1%低聚甲醛的柠檬酸盐缓冲液从左心室灌注小鼠。取下耳朵并称重。用1mL甲酰胺从耳朵提取伊文思蓝染料。用分光光度计在610nm下测量渗出的伊文思蓝量并表示为每1mg组织湿重的染料含量。
结果:
在给药的6天后,在静脉内施用表达Angptl3或VEGF的腺病毒载体的小鼠耳朵中,相对于施用表达LacZ的对照腺病毒载体的小鼠而言,通过伊文思蓝试验观察到的血管透性水平增大(图12D)。
B.表达-K5-mAngptl3的转基因小鼠中血管透性增大
在一个可供选择的方法中,通过制备在角质细胞特异性启动子(其在发育期间和成体中组成型表达)控制下表达鼠Angptl3的转基因小鼠,来研究皮肤中Angptl3表达水平升高的发育影响。
1.起始转基因小鼠
按照标准方法(Filvaroff等,2002)使用允许在鼠K5启动子控制下表达Angptl3的构建体K5-gD-mAng5制备起始转基因小鼠。为了产生K5-gD-mAng5构建体,将Angptl3基因切成NotI-NotI并插入pNASSK5βNotI-NotI-SAP中产生K5-gD-mAng5。
总共制备了17个转基因起始株。使用如下引物组通过对小鼠尾DNA进行PCR(QIAGEN,Santa Clarita,CA)测定9日龄小鼠幼仔的基因型:
gD-mAng5.311.F:ATATGCCTTGGCGGATGC(SEQ ID NO:32);和
gD-mAng5.578.R:ATGGACAAAATCTTTAAGTCCATGAC(SEQ ID NO:33)。
在8周龄时,获取包括肌肉,肾,肝脏,脾,皮肤,脑,胸腺和肠在内的一些组织的活检标本,经过实时RT-PCR来测定Angptl3的内源性表达和转基因表达水平。为了进行RT-PCR分析,使用设计成可测量内源性转录子和转基因转录子的下列探针和引物:
MMAng5.1165.FP:FAM-CTCCCAGAGCACACAGACCTGATGTTTT-TAMRA(SEQ ID NO:34)
MMAng5.1144.F:GCTGGCAATATCCCTGGG(SEQ ID NO:35)
MMAng5.1223.R:AGCTGTCCCTTTGCTCTGTGA(SEQ ID NO:36)。
通过Student’s t检验测定在鼠K5启动子下表达Angptl3的转基因小鼠之间的差异的统计学分析,P值<0.05时认为是统计学上显著,P值<0.01时为非常显著。
2.后代转基因小鼠
根据对所有转基因起始小鼠的皮肤活检标本的基因表达分析,鉴定了5个Angptl3-表达最高的起始株并选择用于进一步繁殖C57/B16小鼠。基因型频率分析揭示了该转基因的正常孟德尔频率分布且观察到没有明显的出生后致死性与转基因表达相关。
a.转基因表达
分离所示各种组织的RNA并通过实时RT-PCR评估相对于内源性表达的相对转基因表达水平,特别是在肝脏中的水平。
正如预期,相对于窝型匹配的野生型对照,在转基因皮肤中观察到鼠Angptl3表达水平升高。皮肤中Angptl3的转基因表达水平达到肝脏内源性Angptl3表达水平的大约10%(图12A)。
另外,与野生型小鼠相比,在12周龄转基因小鼠的肺和脑中观察到中等表达。因此,肺和脑中的表达可由这些组织中K5启动子的转录活性增加引起。
与成人肾中通过Northern印迹分析发现的中度Angptl3表达一致(图8A),对小鼠肾RNA的Taqman分析揭示了Angptl3的中度内源性表达水平。
为了监测出生后一个时间段内的转基因表达,用从3,6和11周龄转基因小鼠的皮肤活检标本分离的RNA进行实时RT-PCR分析。如图12B所示,在检测的所有发育阶段,在转基因小鼠皮肤中观察到恒定水平的转基因表达。
b.血管透性
根据转基因表达数据,选择12周龄转基因小鼠和野生型窝型匹配的野生型对照,并使用相似于上文和以前对血管生成分子的血管生成素家族的两个结构上相关的成员Ang1和Ang2所述的伊文思蓝测定法进行血管透性测定(Maisonpierre等,1997;Thurston等,2000;Thurston等,1999)。通过上文所述的伊文思蓝测定法测量血管透性。进行伊文思蓝分析的两个11周龄转基因株与窝型匹配的野生型品系相比基础水平的血管透性明显增大,即增大2到3倍(图12C)。然而,在进行伊文思蓝测定分析前用芥子油攻击小鼠,则转基因小鼠和窝型匹配的野生型小鼠之间血管透性差异较不显著。因此,转基因小鼠相对于其野生型同窝对照而言血管透性增加表明Angptl3在血管透性调节中起作用。
材料的保藏
如前所述,下列材料保藏在美国典型培养物保藏中心,12301 ParklawnDrive,Rockville,MD,USA(ATCC):
按照布达佩斯条约的规定在国际上认可的用于专利程序的微生物保藏机构并按其实施细则(布达佩斯条约)进行这些保藏。这样保证了该保藏物的活培养物从保藏日起维持30年。按布达佩斯条约的条款该保藏物由ATCC使其可获得且按Genentech,Inc.与ATCC之间的协议进行,该协议保证在相关美国专利颁发时或在任何美国或外国专利申请公开提供给公众时,无论哪一个在先,该保藏物的培养物后代可持久和无限制地为公众获得,且保证按照35 USC§122和依据其委员会规定(包括具体参考886 OG 683的37C.F.R.§1.14)对其授权的美国专利和商标委员认定的个人获得该后代。
本申请的受让人同意如果保藏的该材料的培养物在合适条件下培养时如果死亡导致丢失或破坏时,该材料将在通知时用另一相同材料迅速替换。该保藏材料的可获得性不应解释为允许违反任何政府机构按其专利法批准的权利来实施本发明。
本说明书认为足以使得本领域的技术人员能够实施本发明。本发明不限于保藏的构建体限定的范围,因为保藏物的实施方案是用作对本发明某些方面的单一例证且功能上等同的任何构建体都在本发明范围内。本文的材料保藏不构成承认文字形式的描述不足以使得本发明的任一方面,包括其最佳的更多方面能够实施,也不应解释为将权利要求书的范围局限于所提供的具体例证。事实上,除了本文所示和所述之外,对本发明的各种修饰根据前面的描述对本领域的技术人员将是显而易见的且落在所附权利要求书的范围内。
Claims (29)
1.一种治疗以Angptl3过量表达为特征的组织损伤的方法,包括用Angptl3的拮抗剂治疗该组织。
2.权利要求1的方法,其中该组织是肝脏组织。
3.权利要求2的方法,其中该组织损伤与炎症相关。
4.权利要求3的方法,其中该组织损伤与慢性肝脏疾病相关。
5.权利要求2的方法,其中该组织损伤与肝脏肿瘤相关。
6.权利要求1的方法,其中该组织是心脏组织。
7.权利要求6的方法,其中该组织损伤与炎症相关。
8.权利要求6的方法,其中该组织损伤与以Angptl3表达升高为特征的心脏疾病相关。
9.权利要求1的方法,其中该拮抗剂是抗-Angptl3抗体或抗-αvβ3抗体。
10.权利要求1的方法,其中该拮抗剂是免疫粘附素。
11.一种治疗哺乳动物受试者的慢性肝脏疾病的方法,包括给需要的哺乳动物受试者施用有效量的Angptl3的拮抗剂。
12.权利要求11的方法,其中该慢性肝脏疾病的特征在于Angptl3的表达升高。
13.权利要求11的方法,其中该拮抗剂是抗-Angptl3或抗-αvβ3的抗体。
14.一种治疗哺乳动物受试者中以Angptl3表达升高为特征的心脏疾病的方法,包括给受试者施用有效量的Angptl3的拮抗剂。
15.权利要求14的方法,其中该拮抗剂是抗-Angptl3的抗体或抗-αvβ3的抗体。
16.一种治疗急性肝脏疾病的方法,包括给需要的哺乳动物受试者施用治疗上有效量的多肽或其激动剂,该多肽包含与SEQ ID NO:2的人Angptl3序列具有至少80%序列相同性的氨基酸序列。
17.权利要求16的方法,其中所述的多肽包含SEQ ID NO:2的人Angptl3序列的氨基酸区域281-293(P1,SEQ ID NO:14),442-460(P2,SEQID NO:15),和415-430(P3,SEQ ID NO:17)。
18.权利要求16的方法,其中所述的多肽包含SEQ ID NO:2的人Angptl3序列的血纤蛋白原结构域。
19.权利要求16的方法,还包括给药另一治疗剂。
20.权利要求16的方法,其中所述的激动剂是特异性结合Angptl3或αvβ3的激动剂抗体。
21.一种诱导急性肝脏损伤后的肝脏再生的方法,包括给需要的哺乳动物受试者施用治疗上有效量的多肽或其激动剂,该多肽包含与SEQ ID NO:2的人Angptl3序列具有至少80%序列相同性的氨基酸序列。
22.一种诱导组织中血管生成的方法,包括用有效量的多肽或其激动剂治疗该组织,该多肽包含与SEQ ID NO:2的人Angptl3序列具有至少80%序列相同性的氨基酸序列。
23.权利要求22的方法,其中该组织是肝脏组织。
24.权利要求22的方法,其中该组织是心脏组织。
25.一种抑制组织中血管透性不需要地增大的方法,包括用有效量的Angptl3的拮抗剂治疗该组织。
26.权利要求25的方法,其中该组织是肝脏组织。
27.权利要求25的方法,其中该组织是心脏组织。
28.一种鉴定存在心血管疾病危险的人类受试者的方法,包括测定所述受试者心脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平相对于正常心脏组织中Angptl3或其表达产物的水平,当该受试者心脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平相对于正常心脏组织升高时,则确定该受试者存在危险。
29.一种鉴定存在肝脏损伤危险的人类受试者的方法,包括测定所述受试者肝脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平相对于正常肝脏组织中Angptl3或其表达产物的水平,当该受试者肝脏组织中Angptl3 mRNA或其表达产物的水平相对于正常肝脏组织升高时,则确定该受试者存在危险。
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