CN101849002A - 在细胞中稳定保持外来基因的方法 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及使外来基因表达来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的方法,该方法包括:在可以表达的状态下插入任意外来基因,以准备在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体的步骤;准备使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失的突变宿主细胞等的步骤;用重组载体转化突变宿主细胞得到转化体的步骤;培养转化体,以制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的步骤。根据本发明,可以提供:在不使用抗生素、且对培养基组成没有限制的情况下能够在宿主细胞中维持重组DNA克隆载体的新手段;和利用该手段来制备外来基因所编码的蛋白或肽的方法。

Description

在细胞中稳定保持外来基因的方法
技术领域
本发明涉及在细胞中稳定保持外来基因的方法。更详细而言,本发明涉及该方法中使用的、包含编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体、用于表达编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的突变宿主细胞、以及表达编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的外来基因来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的方法。需要说明的是,作为相关申请的相互参照,本申请主张2007年7月13日申请的日本特愿2007-1839831号的优先权,其全部内容作为公开而特别引用于此。
背景技术
将重组DNA技术应用于实际中,并尝试着利用所得的转化细胞来生产目标分子时,通常转化细胞内的染色体外基因(即其中所含的目标外来基因)的存在极不稳定,产生非常难以生产目标分子的问题。
实验室中通常所用的克隆和表达载体通常是多拷贝重组载体,通过每个细胞基因组的多个重组载体来确保向其后代稳定遗传。但是,向这些重组载体中导入外来基因会给细胞的增殖循环期间带来各种程度的不稳定性。在工业生产步骤中,有时需要1000L培养物,需要50世代以上的世代交替后的1016个以上的细胞。因此,为了确保细胞中重组载体的存在、进而确保外来基因的表达,人们希望使细胞中的重组载体稳定直至发酵槽内的培养结束。
已知有几种使携带外来基因的重组载体在细胞中稳定的方法。
其中的一种方法包含以下内容:先使抗生素耐性基因包含在重组载体中,之后向培养基中加入适当的抗生素。保持有含抗生素耐性基因的重组载体的细胞被筛选,未保持该重组载体的细胞不被筛选而被排除。
通过插入抗生素耐性基因使重组载体稳定,这通常在实验室中进行,但由于下述理由,在工业规模的生产中并不优选。
(i)使用抗生素耐性菌株有可能给环境带来危险。
(ii)培养中所必需的抗生素量使生产成本显著增加。
(iii)在用于人和动物的物质的生产中应避免使用抗生素。
补充染色体的营养要求突然突变的方法也是已知的重组载体稳定化方法之一(参照Genetics.1989 May;122(1):19~27(以下,有时还称作非专利文献1)和Curr Genet.1989 Sep;16(3):159~63(以下,有时还称作非专利文献2),这些内容作为公开而特别引用于此)。在该方法中,必需严格限制发酵培养基的组成,在不向培养基中加入宿主细菌所必需的营养的情况下进行发酵。而且,通过营养共生,在重组载体消失后细胞仍有可能增殖。
发明内容
发明所要解决的课题
如上所述,上述两种筛选方法依赖于培养基的特殊处理。这样的限制会导致发酵步骤的费用增加、以及为了提高生产率而能够采取的筛选自由度受限。
因此,人们迫切希望开发在不使用抗生素、且对培养基组成没有限制的情况下能够维持重组DNA克隆载体的其他筛选方法。
因此,本发明的目的在于提供:在不使用抗生素、且没有限制的情况下能够维持重组DNA克隆载体的新手段和利用该手段来制备外来基因所编码的蛋白或肽的方法。
解决课题的方法
本发明人等为了解决上述课题进行各种研究,发现根据带有氨酰tRNA合成酶基因的染色体外基因与使该氨酰tRNA合成酶活性产生缺失的染色体突变宿主细胞的互补性,在不使用抗生素、且不限制培养基组成的情况下能够维持重组DNA克隆载体,从而完成了本发明。本发明基于仅确保含有染色体外基因的细胞生存,所述染色体外基因带有氨酰tRNA合成酶基因。
本发明如下。
(1)重组载体,该重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点、且
在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,
上述重组载体在突变宿主中使用,所述突变宿主是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。
(2)(1)所述的重组载体,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
(3)(1)或(2)所述的重组载体,该重组载体具有质粒、噬菌体或逆转录转座子的形态。
(4)突变宿主细胞,该突变宿主细胞是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度,
上述突变宿主细胞经重组载体转化后使用,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点、且
在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因。
(5)(4)所述的突变宿主细胞,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
(6)(4)或(5)所述的突变宿主细胞,其中带有突变的宿主细胞为细菌、酵母、动物细胞或植物细胞。
(7)(4)或(5)所述的突变宿主细胞,其中带有突变的宿主细胞为细菌或酵母。
(8)(6)或(7)所述的突变宿主细胞,其中细菌为芽孢杆菌属细菌。
(9)使编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的外来基因表达来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的方法,该方法包括下述步骤:
准备重组载体的步骤,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点、且在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,在上述重组载体的、在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点插入有期望的外来基因;
准备突变宿主细胞的步骤,所述突变宿主细胞是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度;
用上述重组载体转化上述突变宿主细胞得到转化体的步骤;
培养上述转化体来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的步骤。
(10)在宿主细胞内稳定维持目标重组载体的方法,该方法包括:
使上述宿主细胞中所含的、编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失或者使其降低至宿主细胞无法生长的程度,之后以上述宿主细胞作为突变宿主细胞;
使上述目标重组载体在可以表达的状态下含有编码氨酰tRNA合成酶的基因;
用在可以表达的状态下含有上述编码氨酰tRNA合成酶的基因的目标重组载体转化上述突变宿主细胞。
(11)(10)所述的方法,其中上述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点。
(12)(9)~(11)中任一项所述的方法,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
(13)(9)~(12)中任一项所述的方法,其中带有突变的宿主细胞为细菌、酵母、动物细胞或植物细胞。
(14)(9)~(12)中任一项所述的方法,其中带有突变的宿主细胞为细菌或酵母。
(15)(13)或(14)所述的方法,其中细菌为芽孢杆菌属细菌。
(16)(9)~(15)中任一项所述的方法,其中外来基因编码的蛋白为选自氧化还原酶、转移酶、水解酶、磷酸化酶、裂解酶、异构酶、合成酶或修饰酶的一种酶。
(17)(1)~(3)中任一项所述的重组载体在制备外来基因所编码的蛋白或肽中的应用。
(18)(4)~(8)中任一项所述的突变宿主细胞在制备外来基因所编码的蛋白或肽中的应用。
发明效果
根据本发明,在不使用抗生素、且不限制培养基组成的情况下可以维持重组DNA克隆载体,其结果,在工业生产中也可以使细胞中的重组载体稳定至发酵槽内的培养结束。
附图简述
图1显示质粒回收溶液的电泳结果。
具体实施方式
[重组载体]
本发明涉及重组载体,该重组载体满足下述(1)~(3):(1)在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因;(2)具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点;且(3)在突变宿主中使用,所述突变宿主是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。
(1)在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体。
本发明的重组载体在可以表达的状态下含有编码氨酰tRNA合成酶基因的基因。该重组载体在可以在期望宿主细胞内表达的状态下含有编码氨酰tRNA合成酶基因的基因,用于转化该宿主细胞。因此,本发明的重组载体只要具有能够实现所述宿主细胞的转化的形态即可,例如可以具有质粒、噬菌体、逆转录转座子的形态。
氨酰tRNA合成酶对应于20种氨基酸,有20多种(部分有多种),例如丙氨酸所对应的氨酰tRNA合成酶称作丙氨酰tRNA合成酶(丙氨酰-tRNA合成酶或丙氨酸-tRNA合成酶)。氨酰tRNA合成酶的具体例子有:例如色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
将色氨酸所对应的氨酰tRNA合成酶称为色氨酰tRNA合成酶,色氨酰tRNA合成酶缺失的细胞株由于无法进行含有色氨酸的蛋白的合成,所以无法增殖。
氨酰tRNA合成酶基因包含在原核生物到真核生物的所有生物中。例如,大肠杆菌中包含:丙氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:1)、精氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:2)、天冬酰胺酰-tRNA合成酶(SEQID NO:3)、天冬氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:4)、半胱氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:5)、谷氨酰胺-tRNA合成酶(SEQ ID NO:6)、谷氨酸-tRNA合成酶(SEQ ID NO:7)、甘氨酸-tRNA合成酶(α亚单位)(SEQ ID NO:8)、甘氨酸-tRNA合成酶(β亚单位)(SEQ ID NO:9)、组氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:10)、异亮氨酰-tRNA合成酶(SEQ IDNO:11)、亮氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:12)、赖氨酸-tRNA合成酶(组成型)(SEQ ID NO:13)、赖氨酸-tRNA合成酶(诱导型)(SEQ IDNO:14)、甲硫氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:15)、苯丙氨酸-tRNA合成酶(α亚单位)(SEQ ID NO:16)、苯丙氨酸-tRNA合成酶(β亚单位)(SEQ ID NO:17)、预测赖氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:18)、脯氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:19)、丝氨酰-tRNA合成酶(在硒代半胱氨酰-tRNA上负载丝氨酸)(SEQ ID NO:20)、苏氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:21)、色氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:22)、酪氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:23)、缬氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:24)。
已知枯草杆菌中包含:丙氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:25)、精氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:26)、天冬酰胺酰-tRNA合成酶(SEQID NO:27)、天冬氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:28)、半胱氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:29)、谷氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:30)、谷氨酰-tRNA酰胺转移酶(亚单位a)(SEQ ID NO:31)、甘氨酸tRNA合成酶(α亚单位)(SEQ ID NO:32)、甘氨酸tRNA合成酶(β亚单位)(SEQID NO:33)、组氨酰tRNA合成酶(hisS)(SEQ ID NO:34)、异亮氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:35)、亮氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:36)、赖氨酸tRNA合成酶(组成型)(SEQ ID NO:37)、组氨酰tRNA合成酶(hisZ)(SEQ ID NO:38)、甲硫氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:39)、苯丙氨酸tRNA合成酶(α亚单位)(SEQ ID NO:40)、苯丙氨酸tRNA合成酶(β亚单位)(SEQ ID NO:41)、相似于苯丙氨酰-tRNA合成酶(ytpR)(SEQ ID NO:42)、脯氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:43)、丝氨酰-tRNA合成酶(在硒代半胱氨酰-tRNA上负载丝氨酸)(SEQ IDNO:44)、苏氨酰-tRNA合成酶(主要)(SEQ ID NO:45)、苏氨酰-tRNA合成酶(次要)(SEQ ID NO:46)、色氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:47)、酪氨酰-tRNA合成酶(主要)(SEQ ID NO:48)、酪氨酰-tRNA合成酶(次要)(SEQ ID NO:49)、缬氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:50)、谷氨酰-tRNA酰胺转移酶(亚单位b)(SEQ ID NO:51)、谷氨酰-tRNA酰胺转移酶(亚单位c)(SEQ ID NO:52)等。
本发明的重组载体在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因。因此,除氨酰tRNA合成酶基因以外,为了形成可以表达该基因的状态而使用大肠杆菌(Escherichia coli)或枯草杆菌(Bacillus subtilis)等细菌作为宿主时,通常还具有例如启动子、操纵基因区(包含启动子、操纵基因和核糖体结合区(SD区))、起始密码子、编码生产目标蛋白的DNA、终止密码子、终止区和能够复制质粒的单元等。使用酵母等真菌细胞或动物细胞作为宿主细胞时,通常具有启动子、起始密码子、编码信号肽和生产目标蛋白的DNA、以及终止密码子等。本发明的重组载体根据需要可以包含增强子等顺式元件、编码生产目标蛋白的DNA的5’侧或3’侧的非翻译区、剪接接合部、聚腺苷酸化位点、能够复制的单元、同源区域、筛选标记。上述元件只要是用于表达编码生产目标蛋白的基因的宿主所对应的元件即可,没有特别限定,可以根据技术常识来筛选。
需要说明的是,对筛选标记没有特别限定,例如当用于基因表达的宿主为细菌时,可以使用耐药性基因(例如,氨苄青霉素耐性基因、新霉素耐性基因、环己酰亚胺耐性基因、四霉素耐性基因等);当宿主为细菌以外的例如酵母等时,还可以使用以营养要求性基因(例如HIS4、URA3、LEU2、ARG4等)等为代表的公知的各种筛选标记。
(2)本发明的重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点。如下所述,该位点是使用本发明的宿主细胞,在可以表达的状态下能够插入编码欲生产的蛋白的外来基因的位点。
“在可以表达的状态下能够插入基因”是指通常编码蛋白的基因的表达要求用于将其基因信息转录到mRNA上的RNA聚合酶识别位点和用于将mRNA的信息翻译成肽的核糖体结合区存在于编码该蛋白的基因的起始密码子的上游。归纳起来,“在可以表达的状态下具有基因”是指将其基因的起始密码子到终止密码子转录到mRNA中所必需的序列存在于起始密码子的上游,并且用于将其mRNA的信息翻译成肽的序列存在于起始密码子的上游。此处所说的“起始密码子”并不限于原染色体上的该基因的起始密码子序列,只要是发挥起始密码子功能的密码子均可。此处所说的“核糖体结合区”例如只要是不被集中在具有包含原核生物的5’-aaaggagg-3’的共有序列的序列中、且为核糖体能够识别的序列即可,并不限于原染色体上作为该基因的核糖体结合区的序列,只要是核糖体能够识别的序列即可使用。
本发明的重组载体的构建可以按照DNA重组的一般方法、例如文献Molecular Cloning(1989)(Cold Spring Harbor Lab)中记载的方法来进行。该文献内容作为公开特别引用于此。
作为载体,质粒载体的例子有:例如pRS413、pRS415、pRS416、YCp50、pAUR112或pAUR123等YCp型大肠杆菌-酵母穿梭载体;pRS403、pRS404、pRS405、pRS406、pAUR101或pAUR135等YIp型大肠杆菌-酵母穿梭载体;来自大肠杆菌的质粒(例如pBR322、pBR325、pUC18、pUC19、pUC119、pTV118N、pTV119N、pBluescript、pHSG298、pHSG396或pTrc99A等ColE系质粒;pACYC177或pACYC184等p1A系质粒;pMW118、pMW119、pMW218或pMW219等pSC101系质粒等);来自枯草杆菌的质粒(例如pUB110、pTP5等);pHY300PLK等大肠杆菌-枯草杆菌穿梭载体。噬菌体载体的例子有:λ噬菌体(例如Charon 4A、Charon21A、EMBL4、λgt100、gt11、zap)、ψX174、M13mp18、M13mp19等。作为逆转录转座子,例如有Ty因子等。此外,还可以使用以融合蛋白的形式表达的表达载体、例如pGEX系列(ファルマシア制)、pMAL系列(Biolabs社制)。
(3)本发明的重组载体在突变宿主中使用,所述突变宿主是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。有关该突变宿主在后面阐述。
[宿主细胞(突变宿主)]
本发明涉及突变宿主细胞,该突变宿主细胞满足下述(4)~(6):(4)使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度;(5)具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点;且(6)用在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体转化后使用。
(4)本发明的突变宿主细胞,其突变前的宿主细胞例如有:大肠杆菌或枯草杆菌等细菌;酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、粟酒裂殖酵母(Saccharomyces pombe)、毕赤酵母(Pichia pastoris)等酵母;sf9或sf21等昆虫细胞;COS细胞、中国仓鼠卵巢细胞(CHO细胞)等动物细胞;烟草等植物细胞。优选为大肠杆菌或枯草杆菌等细菌和酵母。
通常,细胞为了自身增殖而具有编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因。相对于此,在本发明中,使细胞本来所具有的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失或者使该基因表达降低可以按照以下的方法进行。
[基因缺失(失活)]
“失活”一词包含妨碍染色体基因中一个以上基因的功能表达的方法。失活通过核酸基因序列的缺失、置换(例如突变)、抑制和/或插入等来进行。在几个实施方式中,突变微生物优选包含发生稳定且不可逆的失活的一个以上基因的失活。
(由插入引起的失活)
此处使用的“插入序列”一词是指被导入微生物染色体内的DNA序列。在几个实施方式中,插入序列可以是被转化的细胞的基因组中已经存在或不存在的序列(即、相同或不同的序列)。并且,在另一实施方式中,插入序列有时包含筛选标记。在又一实施方式中,插入序列有时包含两个同源框(homoeobox)。
此处使用的“同源框”是指与微生物染色体的序列同源的核酸序列。更具体而言,根据本发明,“同源框”是指与失活的基因相邻的编码区或与部分基因具有约80~100%序列同源性、约90~100%序列同源性或约95%~100%序列同源性的上游或下游区域。这些序列以置换微生物染色体的一部分为目的。同源框并非用以限定本发明,其包含约1碱基对(bp)~20万碱基(kb)。优选同源框包含:约1bp~10.0kb;1bp~5.0kb;1bp~2.5kb;1bp~1.0kb和0.25kb~2.5kb。同源框包含约10.0kb、5.0kb、2.5kb、2.0kb、1.5kb、1.0kb、0.5kb、0.25kb和0.1kb。在几个实施方式中,筛选标记的5’和3’末端与同源框相邻,其中同源框包含与该基因的编码区近邻的核酸序列。
此处使用的“筛选标记”一词是指能够在宿主细胞中表达的核苷酸序列,通过筛选标记的表达,在对应的筛选因子的存在下、或不存在必须营养素的条件下,包含表达基因的细胞可以生长。此处使用的“可筛选标记”和“筛选标记”是指能够在宿主细胞中表达的核酸(例如基因),包含载体的这些宿主的筛选可以简单地进行。对该筛选标记的例子没有限定,有抗微生物剂等。因此,“筛选标记”是指宿主细胞赋予整合有目的插入DNA或发生了其它反应的记号的基因。通常,筛选标记是指为了能够区别转化时未接受外来序列的细胞与包含外来DNA的细胞而赋予宿主细胞抗菌耐性或代谢优点的基因。筛选标记的例子有:抗微生物耐性标记等(参照例如ampR;phleoR;specR;kanR;eryR;tetR;cmpR;和neoR;例如Guerot-Fleury,Gene,167:335~337[1995];Palmeros等人,Gene 247:255~264[2000];和Trieu-Cuot等人,Gene、23:331~341[1983],这些内容作为公开而特别引用于此)。在几个特别优选的实施方式中,本发明提供氯霉素耐性基因(例如存在于pC194上的基因、以及存在于地衣芽孢杆菌基因组中的耐性基因)。该耐性基因在本发明和与整合在染色体上的表达盒和整合质粒的染色体扩增有关的实施方式中特别有用。
例如,当色氨酰tRNA合成酶基因(trpS)为失活基因时,DNA构建体包含筛选标记作为插入序列,具有抑制其活性的trpS基因。筛选标记插入trpS编码序列部分的内侧。DNA构建体与宿主染色体中的trpS基因本质上具有相同的序列,在双重交叉的情况下,trpS基因由于筛选标记的插入而失活。
(由缺失引起的失活)
在几个优选实施方式中,失活通过缺失来实现。在几个优选实施方式中,基因通过同源重组而缺失。例如,在几个实施方式中,当缺失的基因为trpS时,使用包含插入序列的DNA构建体,所述插入序列具有与同源框的两侧相邻的筛选标记。同源框在染色体trpS基因的核酸侧翼区具有相同的核苷酸序列。DNA构建体与微生物宿主染色体的同源序列一致,在双重交叉的情况下,trpS基因从宿主染色体中被切除。
此处使用的基因的“缺失”一词是指编码序列全体的缺失、一部分编码序列的缺失、或包含侧翼区的编码序列的缺失。只要染色体中残留的序列不发挥缺失前的生物活性即可,缺失可以是部分缺失。编码序列的侧翼区可以在5’和3’末端包含约1bp~约500bp。侧翼区可以大于500bp,但根据本发明优选该区不包含能够失活或缺失的其它基因。最终,缺失基因事实上是没有功能的。简而言之,“缺失”一词以1个以上的核苷酸或氨基酸残基分别被除去(即不存在)的核苷酸或氨基酸序列的变化来定义。
此处使用的“侧翼序列”是指位于对象序列的上游或下游的序列(例如基因A-B-C,基因B位于A和C基因序列的侧翼(位于侧面))。在优选实施方式中,插入序列位于同源框两侧的侧面。在几个实施方式中,侧翼序列仅存在于一方侧(3’侧或5’侧),但在优选实施方式中,其位于序列两侧的侧面。各同源框的序列与微生物染色体中的序列同源。这些序列的目的在于在微生物染色体中整合新的构建体、以及用插入序列置换微生物染色体的一部分。在优选实施方式中,筛选标记的5’和3’末端位于包含一部分失活染色体片段的多核苷酸序列的侧面。
(由突变引起的失活)
在另一实施方式中,通过基因突变而发生失活。基因突变的方法有多种,对其没有限定,可以列举出:位点特异性突变、随机突变发生和gapped-duplex法(例如参照Moring等人、Biotech.2:646[1984];以及Kramer等人、Nucleic Acids Res.,12:9441[1984],这些内容作为公开而特别引用于此)。
在优选实施方式中,在染色体上的至少一个密码子中利用突变诱发来产生突变。在又一实施方式中,突变DNA序列与野生型序列具有40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上或98%以上的同源性。在另一实施方式中,使用公知的突变诱发程序、例如UV照射、亚硝基胍等化学突变剂在体内产生突变DNA。
即使在氨酰tRNA合成酶活性发生缺失的染色体突变内,也优选使用氨酰tRNA合成酶基因自身的缺失。但是,只要使用带有对应基因的染色体外基因,调节氨酰tRNA合成酶生合成的其它基因也可使用。当为氨酰tRNA合成酶基因缺失株时,染色体外基因中适合插入的基因对应于该氨酰tRNA合成酶基因。
为了避免具有氨酰tRNA合成酶的染色体外基因与染色体的突变氨酰tRNA合成酶基因之间的同源性重组的可能性,优选使目标氨酰tRNA合成酶基因实质上从染色体上缺失。
(5)和(6)的重组载体与上述(1)和(2)的重组载体相同。
[功能]
使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失的突变宿主细胞、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度的突变宿主细胞由于无法表达编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因,所以保持原样,已经无法增殖。
相对于此,通过包含在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体,可以维持增殖。即,氨酰tRNA合成酶的缺失可以通过向染色体外基因上导入该氨酰tRNA合成酶基因来互补。但是,万一细胞失去了该染色体外基因,则该细胞已经变得无法增殖。
因此,本发明的突变宿主细胞在上述关系的基础上,在培养基中不含抗生素、或者不排除或不限制满足特定营养要求性的营养成分的情况下,能够使插入有外来基因的重组载体稳定,并将其维持在宿主细胞中。因此,本发明的突变宿主细胞具有以下优点、即可以适用于工业规模生产所使用的任意培养基中。
并且,本发明的突变宿主细胞用于表达编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因。本发明的宿主细胞包含在可以表达的状态下在上述突变宿主中具有上述编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体,并且,该重组载体具有在可以表达的状态下能够插入外来基因的位点,通过在该位点插入期望外来基因,可以使插入有期望外来基因的重组载体稳定,并将其维持在宿主细胞中。并且,使外来基因表达,可以用于生产外来基因所编码的期望蛋白。
[制备蛋白或肽的方法]
本发明涉及使编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的外来基因表达来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的方法。该方法包括以下步骤。
(10)准备重组载体的步骤,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点、并且在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,在上述重组载体的、在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点插入有期望外来基因;
(11)准备突变宿主细胞的步骤,所述突变宿主细胞使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度;
(12)用上述重组载体转化上述突变宿主细胞得到转化体的步骤;
(13)培养上述转化体来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的步骤。
(10)准备重组载体的步骤
在该步骤中准备重组载体,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点、并且在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,在上述重组载体的、在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点插入有期望外来基因。上述重组载体为之前说明的本发明的重组载体。在本发明的制造方法中准备重组载体,其中在该重组载体的、在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点插入有期望外来基因。具体而言,在适当的载体中插入编码氨酰tRNA合成酶的基因和期望外来基因。基因的插入可以按照常规方法进行。所有基因均在可以表达的状态下插入。
“关于插入两个基因的一般说明”
向重组载体中插入氨酰tRNA合成酶基因和任意外来基因,这可以按照DNA重组的一般方法、例如文献Molecular Cloning(1989)(Cold Spring Harbor Lab.)中记载的方法来进行。该文献的全部内容作为公开而特别引用于此。各基因在重组载体中的插入位置只要是不参与重组载体复制的位置即可,基本上可以是任意位置,插入位置根据使用的载体而不同。例如,可使用的重组载体的例子有:来自大肠杆菌的质粒(例如pBR322、pBR325、pUC18、pUC19、pUC119、pTV118N、pTV119N、pBluescript、pHSG298、pHSG396或pTrc99A等ColE系质粒;pACYC177或pACYC184等p1A系质粒;pMW118、pMW119、pMW218或pMW219等pSC101系质粒等);来自枯草杆菌的质粒(例如pUB 110、pTP5等);pHY300PLK等大肠杆菌-枯草杆菌穿梭载体。
例如,以大肠杆菌-枯草杆菌的穿梭载体pHY300PLK质粒为例,可以在多克隆位点、即EcoRI位点插入氨酰tRNA合成酶基因,同样在多克隆位点、即BamHI位点插入任意的外来基因。以下稍详细说明本例。
以具有任意外来基因的生物染色体DNA为模板,采用PCR扩增来扩增包含从启动子位点到终止密码子的该任意外来基因,将其与用限制酶BamHI消化pHY300PLK而得到的DNA片段进行连接反应,使用所得的连接反应混合物来转化大肠杆菌,筛选包含在pHY300PLK的BamHI位点根据目的插入有包含从启动子位点到终止密码子的任意外来基因的质粒的转化体,由该转化体制备质粒。接着将如上制备的质粒用限制酶EcoRI消化,切断该质粒。以枯草杆菌168(Bacillus subtilis 168)株的染色体DNA为模板,利用PCR扩增来扩增包含从启动子位点到终止密码子的氨酰tRNA合成酶基因,之后与来自被EcoRI切断的、已构建好的质粒的DNA片段进行连接反应,使用所得的连接反应混合物来转化大肠杆菌,筛选包含在构建好的质粒的EcoRI位点根据目的插入有氨酰tRNA合成酶基因的质粒的转化体,由该转化体可以制备目的质粒。
(11)准备突变宿主细胞的步骤
在该步骤中准备突变宿主细胞,所述突变宿主细胞是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。该突变宿主细胞是上述说明的本发明的突变宿主细胞。其制备方法如下。
作为突变宿主细胞的制备程序,除了将存在于宿主染色体上的目的基因按计划删除或使之失活的方法以外,还可以列举:赋予随机的基因的删除或失活突变、之后利用适当方法进行基因解析或蛋白生产性评价的方法。
删除目的基因或使之失活时,例如可以使用同源重组的方法。即,将包含一部分目的基因的DNA片段克隆到适当的质粒载体中,将所得的环状重组质粒或直链上的DNA片段整合到宿主细胞内,通过目的基因的一部分区域的同源重组截断亲本微生物基因组上的目的基因,使之失活。或者,采用PCR等方法构建导入有由碱基置换或碱基插入等引起的失活突变的目的基因、或者包含目的基因的外侧区域但不包含目的基因的直链状DNA片段等,之后将其整合到亲本微生物细胞内,使在亲本微生物基因组的目的基因内的突变位置的外侧两个区域、或目的基因外侧的两个区域发生两次交叉同源重组,从而可以与基因组上的删除或失活的目的基因的基因片段进行置换。
(12)得到转化体的步骤
使用步骤(10)中制备的重组载体来转化步骤(11)中制备的突变宿主细胞。利用重组载体进行的宿主细胞的转化也可以按照常规方法来实施。
对向宿主细胞中导入(转化)重组载体的方法没有特别限定,根据导入的宿主细胞的种类或重组载体的形态,可以适当筛选转化法、转染法、感受态细胞法、电穿孔等方法。
此处使用的“宿主细胞”是指具有为新导入的DNA序列发挥宿主或表达媒体作用的能力的细胞。
需要说明的是,对重组载体在宿主细胞内的存在形式没有特别限定,可以是被插入染色体中或者被置换整合,还可以以质粒状态存在。
需要说明的是,重组载体中所含的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因与在突变宿主细胞中缺失的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因、或者表达被降低至宿主细胞无法生长的程度的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因为同种的基因。例如,在突变宿主细胞中,缺失的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因、或者表达被降低至宿主细胞无法生长的程度的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因为丙氨酰tRNA合成酶基因时,重组载体中所含的也是丙氨酰tRNA合成酶基因。
(13)制备蛋白或肽的步骤
培养步骤(12)中得到的转化体来制备外来基因所编码的蛋白或肽。转化体的培养要根据宿主细胞的种类,使用适当的培养基,在适当的培养条件下实施。作为宿主细胞,只要能够生产外来基因所编码的蛋白或肽即可,可以是野生型宿主细胞,也可以是施行了突变的宿主细胞。具体可以列举:枯草杆菌等芽孢杆菌(Bacillus)属细菌或大肠杆菌(Escherihia)属细菌、梭菌(Clostridium)属细菌、或酵母等,其中优选芽孢杆菌属细菌。从全基因组信息已明确、基因工程学、基因组工程学技术已确立的角度以及具有将蛋白分泌生产到菌体外的能力的角度考虑,特别优选枯草杆菌。
本说明书中所说的“芽孢杆菌属”包含通常已知的芽孢杆菌属所包含的所有种类,对其没有限定,意思是指例如枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、迟缓芽孢杆菌(Bacillus lentus)、嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillus stearothermophilus)、嗜碱芽孢杆菌(Bacillus alkalophilus)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)、蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)、短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)、克劳氏芽孢杆菌(Bacillus clausii)、耐盐芽孢杆菌(Bacillus halodurans)、巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)、凝结芽孢杆菌(Bacillus coagulans)、环状芽孢杆菌(Bacillus circulans)和苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)等。需要说明的是,芽孢杆菌属在分类上接受重新编组,该属还包含重新分类的种。例如有:地芽孢杆菌(Geobacillus)属、耐碱芽孢杆菌(Alkalibacillus)属、双芽孢杆菌(Amphibacillus)属、Amylobacillus属、厌氧芽孢杆菌(Anoxybacillus)属、Goribacillus属、Cerasibacillus属、薄壁芽孢杆菌(Gracilibacillus)属、Halolactibacillus属、Halalkalibacillus属、Filobacillus属、Jeotgalibacillus属、需盐芽孢杆菌(Salibacillus)属、Oceanobacillus属、Marinibacillus属、Lysinibacillus属、Lentibacillus属、解脲芽孢杆菌(Ureibacillus)属、Salinibacillus属、Pontibacillus属、Piscibacillus属、Paraliobacillus属、枝芽孢杆菌(Virgibacillus)属、Salsuginibacillus属、Tenuibacillus属、Thalassobacillus属、Thermalkalibacillus属、Tumebacillus属等,这些菌属也包含在本说明书所说的芽孢杆菌属中。
例如,当宿主细胞为枯草杆菌时,作为培养所使用的培养基的种类,只要是包含适当的氮源、碳源、矿物质、且本发明的枯草杆菌宿主繁殖、可以生产目标蛋白的培养基即可。例如,通过重组枯草杆菌168株来生产外来基因所编码的蛋白或肽时,可以使用混合有葡萄糖或果糖等单糖类;蔗糖、麦芽糖等双糖类或可溶性淀粉等多糖类等作为碳源的培养基;或者混合有蛋白胨类、大豆提取物、酵母提取物、鱼肉提取物、玉米浆(CSL)、金属盐等作为氮源的培养基等。
此外,培养基的pH值只要是所用的重组生物体能够生育的范围的pH值即可,但是,例如为枯草杆菌时,优选调节至pH6.0~8.0,培养条件可以是在15~42℃、优选28~37℃下振荡或通气搅拌培养2~7天。
上述培养后回收目标蛋白或肽。目标蛋白或多肽的回收方法可以按照常规方法进行。回收的目标蛋白或多肽根据需要还可以进一步按照常规方法进行纯化。
按照本发明的制造方法生产的目标蛋白或肽的例子有:例如作为食品用、药品用、化妆品用、洗涤剂用、纤维处理用、医疗检查药用等有用的酶或生理活性因子等蛋白或多肽。
对目标蛋白或肽基因没有特别限定,包含洗剂、食品、纤维、饲料、化学品、医疗、诊断等各种产业用酶或生理活性肽等。除产业用酶的功能以外,还包含氧化还原酶(Oxidoreductase)、转移酶(Transferase)、水解酶(Hydrolase)、磷酸化酶(Phosphorylase)、裂解酶(Lyase)、异构酶(Isomerase)、合成酶(连接酶/合成酶)、修饰酶(Modifyingenzyme)等。可以进一步具体列举:纤维素酶、琼脂分解酶、γ-环糊精合成酶等糖分解酶基因等。
[在宿主细胞内稳定维持重组载体的方法]
本发明涉及在宿主细胞内稳定维持目标重组载体的方法。该方法包括以下(20)~(22)。
(20)使上述宿主细胞中所含的、编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使其表达降低至宿主细胞无法生长的程度,以上述宿主细胞作为突变宿主细胞;
(21)在可以表达的状态下使上述目标重组载体含有编码氨酰tRNA合成酶的基因;
(22)用在可以表达的状态下含有上述编码氨酰tRNA合成酶的基因的目标重组载体转化上述突变宿主细胞。
(20)以宿主细胞作为突变宿主细胞的方法如上述突变宿主细胞的说明中所述。
(21)有关在可以表达的状态下使重组载体含有编码氨酰tRNA合成酶的基因,也如本发明的重组载体的说明中所述。上述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点,这一点也如上所述。
(22)关于突变宿主细胞的转化,也如制备上述蛋白或肽的方法的说明中所述。
本发明包含在宿主细胞内稳定维持目标重组载体的方法,在该方法中使用上述本发明的突变宿主细胞作为宿主细胞。本发明的这种方法是使上述细胞中所含的染色体外基因稳定的方法,例如,使氨酰tRNA合成酶产生缺陷的染色体突变是指该氨酰tRNA合成酶基因的至少一部分的缺失,而染色体外基因是指该氨酰tRNA合成酶基因。
根据本发明,例如在不存在抗生素所带来的筛选压力或不需要施加不含特定氨基酸限制的培养基的情况下,即可得到染色体外基因在完全培养基中稳定的转化细胞株。并且,根据本发明所述的方法,缺失了染色体外基因的细胞无法增殖。因此,本发明还涉及:通过氨酰tRNA合成酶基因和具有确实表达产业上有用的蛋白的要素的染色体外基因转化的细胞。本发明还涉及使用转化细胞来制造产业上有用的蛋白的方法,其特征在于:在完全培养基中培养通过本发明的染色体外基因转化的细胞。该染色体外基因能够进一步带有该蛋白的基因。
此处使用的“蛋白基因”一词是指参与肽链生成的DNA的染色体片段,在编码蛋白的区中可以包含也可以不包含先行或后续的区。
下述实施例是将具有色氨酰tRNA合成酶基因的质粒在氨酰tRNA合成酶之一、即色氨酰tRNA合成酶中具有缺陷的枯草杆菌中的稳定性与相同质粒在色氨酰tRNA合成酶中不具有缺陷的枯草杆菌中的稳定性比较后进行显示。并且,还将具有色氨酰tRNA合成酶基因的质粒在前述氨酰tRNA合成酶之一、即色氨酰tRNA合成酶中具有缺陷的枯草杆菌中的稳定性与不具有色氨酰tRNA合成酶基因的同种质粒在色氨酰tRNA合成酶中不具有缺陷的枯草杆菌中的稳定性比较后进行显示。
并且还展示了:带有色氨酰tRNA合成酶基因的这些重组载体还可用于表达编码同时存在于同一载体上的纤维素酶、琼脂分解酶的基因等的例子。
实施例
以下,通过实施例进一步详细说明本发明。
[实施例1]向枯草杆菌株中导入具有色氨酰tRNA合成酶基因的染色 体外基因
按下述方法构建带有色氨酰tRNA合成酶基因的染色体外基因、即质粒pDATS14。首先,以通用枯草杆菌-大肠杆菌的穿梭质粒、即pHY300PLK(ヤクルト社制)为模板,使用引物A和B进行PCR扩增。所得扩增片段用限制酶XhoI消化后,通过连接两末端形成环状质粒。使用该质粒转化大肠杆菌HB101株。由转化体制备质粒,将其作为pDA2。另一方面,以枯草杆菌ISW1214株的染色体为模板,使用引物C和D得到包含色氨酰tRNA合成酶基因及其邻近区域的DNA片段。用限制酶XhoI消化该DNA片段,并与预先用限制酶XhoI消化的pDA2连接。使用所得连接物转化大肠杆菌HB101株。由所得转化体制备质粒,将该质粒命名为pDATS14。接下来,使用pDATS14,通过原生质体转化法(参照参考文献Mol.Gen.Genet.168:111~115(1979)Chang,S.和Cohen,S.N.、其内容作为公开而特别引用于此)转化来自两种蛋白酶(碱性蛋白酶E、中性蛋白酶E)存在缺陷的枯草杆菌ISW1214株的突变株(参照参考文献Appl.Microbiol.Biotechnol 65:583~592(2004)Hatada,Y.等人、其内容作为公开而特别引用于此),得到在染色体外带有色氨酰tRNA合成酶基因的枯草杆菌转化体。
[实施例2]用于破坏枯草杆菌株染色体上的色氨酰tRNA合成酶基因 的DNA片段的构建
以枯草杆菌ISW1214株的染色体为模板,使用引物E和F,得到包含色氨酰tRNA合成酶基因及其邻近区域的约2.5kb的DNA片段。将其用限制酶EcoRISalI消化。之后与预先通过EcoRISalI消化的通用性质粒pUC18连接,得到质粒pTSAF。另一方面,以通用性质粒pC194为模板,使用引物G和H,得到包含来自葡萄球菌的氯霉素耐性基因及其邻近区域的约1.6kb的DNA片段。再以pTSAF为模板,使用引物I和J进行PCR反应,得到DNA片段。将该DNA片段和包含氯霉素耐性基因及其邻近区域的约1.6kb的DNA片段用限制酶BamHIXbaI消化后进行连接,然后用该连接物转化大肠杆菌HB101株。由转化体制备质粒,作为色氨酰tRNA合成酶基因破坏用质粒pINTTS。以pINTTS为模板,使用引物K和L进行PCR反应,得到直链状的色氨酰tRNA合成酶基因破坏用DNA片段。
[实施例3]枯草杆菌株染色体上的色氨酰tRNA合成酶基因的破坏
使用上述色氨酰tRNA合成酶基因破坏用DNA片段,采用感受态细胞法进一步转化上述带有染色体外色氨酰tRNA合成酶基因的转化体,得到获得了氯霉素耐性的转化体。由该转化体制备染色体DNA。使用引物M和N、或O和P,对该染色体DNA进行PCR反应,确认染色体的色氨酰tRNA合成酶基因所编码的区域与来自色氨酰tRNA合成酶基因破坏用DNA片段的氯霉素耐性基因发生了置换,将该菌株作为色氨酰tRNA合成酶基因缺失株、即DTS1451(pDATS14)株。
[实施例4]向DTS1451株中导入具有卡那霉素耐性基因的质粒
以枯草杆菌ISW1214株的染色体为模板,使用引物C和D,得到包含色氨酰tRNA合成酶基因及其邻近区域的DNA片段。用限制酶XhoI消化该DNA片段,之后与预先用限制酶XhoI消化的pDA2连接。使用所得连接物转化大肠杆菌HB101株。由所得转化体制备质粒,将该质粒命名为pDATS13。以通用性质粒pUB110为模板,使用引物Q和R,得到包含卡那霉素耐性基因及其邻近区域的DNA片段。用EcoRI消化该DNA片段,之后以pDATS14为模板,使用引物S和T采用PCR法进行扩增,再与通过EcoRI消化而得到的DNA片段连接。使用所得连接物转化大肠杆菌HB101株。由所得的具有卡那霉素耐性的转化体制备质粒,将质粒命名为pDATSK。使用pDATSK,采用原生质体转化法转化具有pDATS14的DTS1451株,利用包含30μg/mL卡那霉素的再生培养基(组成:琥珀酸钠8%、琼脂1%、酪蛋白氨基酸0.5%、酵母提取物0.5%、磷酸二氢钾0.15%、磷酸氢二钾0.35%、葡萄糖0.5%、硫酸镁0.4%、牛血清白蛋白0.01%、甲硫氨酸0.001%、亮氨酸0.001%)进行筛选。将所得转化体铺在添加有卡那霉素的LB琼脂培养基和含有7.5μg/mL四环素的再生培养基中,将具有卡那霉素耐性且具有四环素感受性的株命名为DTS1451(pDATSK)。
[实施例5]DTS1451株中的纤维素酶的生产
以作为纤维素酶生产菌的Bacillus akibai 1139株(JCM 9157T)(参照J.Gen.Microbiol.1986,132,2329~2335.Fukumori等人、Int J SystEvol Microbiol.(2005)55:2309~15.Nogi,Y.等人,其内容作为公开而特别引用于此)的染色体为模板,使用引物U和V进行PCR反应,得到包含纤维素酶及其邻近区域的DNA片段。将该DNA片段和pDATS13用限制酶BamHI消化后,再将两者连接起来,得到质粒pDATSC1。使用该质粒转化DTS1451(pDATSK),利用添加有四环素的再生培养基进行筛选。将所得转化体铺在添加有卡那霉素的LB琼脂培养基和含有7.5μg/mL四环素的再生培养基中,将显示纤维素酶活性、并且具有卡那霉素感受性且具有四环素耐性的株命名为DTS1451(pDATSC1)。将DTS1451(pDATSC1)在PPS培养基(聚胨S3%、鱼肉提取物0.5%、酵母提取物0.05%、磷酸二氢钾0.1%、麦芽糖4%、硫酸镁0.02%、氯化钙0.05%)中(不含抗生素)、在30℃下以130rpm的转速搅拌培养72小时,测定所得培养上清中所含的纤维素酶活性。其结果,可以确认每1L培养液生产约1g的纤维素酶。
[实施例6]DTS1451株中的质粒pDATSC1的保持
将带有pDATSC1的DTS1451株铺在添加7.5μg/mL四环素或未添加四环素的LB培养基(聚胨1%、酵母提取物0.5%、氯化钠1%)中,在30℃下以130rpm的转速搅拌培养24小时。取10μL该培养液,继续接种在另外的100mL LB培养基中。再培养24小时,取10μL该培养液,继续接种在另外的100mL LB培养基中,同样培养24小时。之后,从培养细胞中回收质粒。其结果,在带有pDATSC1的DTS1451株中,无论四环素添加与否,每一种培养液的质粒含量均未见变化。另一方面,在带有pDATSC1的、氨酰tRNA合成酶基因没有缺失的枯草杆菌ISW1214株突变株中,观察到:在添加四环素的情况下,每种培养液的质粒含量得以维持,但在未添加四环素的情况下,质粒含量极度下降。并且,在将pDATSC1所带有的纤维素酶基因插入pDA2的BamHI识别位点制成质粒pDAC1,进行同样的试验时,在带有pDAC1的枯草杆菌ISW1214株突变株中,观察到:在添加四环素的情况下,每种培养液的质粒含量得以维持,但在未添加的情况下,质粒含量极度下降。为了容易判断这些结果,图1显示出从用未添加抗生素的培养基培养的各细胞中回收的质粒溶液的电泳结果。将电泳操作后的琼脂糖凝胶浸在溴化乙锭中,进行DNA染色。图1的电泳泳道1为质粒上含有氨酰tRNA合成酶基因、染色体上的该氨酰tRNA合成酶基因缺失宿主的转化的组合;电泳泳道2为质粒上含有氨酰tRNA合成酶基因、染色体上的该氨酰tRNA合成酶基因未缺失宿主的转化的组合;电泳泳道3为质粒上不含氨酰tRNA合成酶基因、染色体上的该氨酰tRNA合成酶基因未缺失宿主的转化的组合。
[实施例7]DTS1451株中的琼脂分解酶的生产
以作为琼脂分解酶生产菌的Microbulbifer sp.A94株(参照BiosciBiotechnol Biochem.(2004)68:1073~81.Ohta,Y.等人,其内容作为公开而特别引用于此)的染色体为模板,使用引物W、X进行PCR反应,得到编码琼脂分解酶的DNA片段。另一方面,以上述pDATSC1为模板,使用引物Y、Z进行PCR反应,将所得DNA片段的5’末端磷酸化,之后与编码琼脂分解酶的DNA片段连接。使用所得连接物转化大肠杆菌HB101,在得到的转化体中,将由具有琼脂分解活性的转化体制备的质粒命名为pDATSA1。使用该质粒转化DTS1451(pDATSK),利用含7.5μg/mL四环素的再生培养基进行筛选。将所得转化体铺在添加有卡那霉素的LB琼脂培养基和含有7.5μg/mL四环素的再生培养基中,将显示琼脂分解酶活性、并且显示卡那霉素感受性且显示四环素耐性的株命名为DTS1451(pDATSA1)。将DTS1451(pDATSA1)在PPS培养基中(不含抗生素)、在30℃下以130rpm在转速搅拌培养72小时,测定所得培养上清中所含的琼脂分解酶活性。其结果,确认每1L培养液生产约0.1g的琼脂分解酶。接下来,以pDATSA1为模板,使用引物A1(SEQ ID NO:79)、引物B1(SEQ IDNO:80)进行PCR反应,所得DNA片段用XhoI消化后,通过连接反应形成闭合环。通过该操作形成暂且排除了色氨酰tRNA合成酶基因的质粒。事先用限制酶EcoRI切断该质粒,另一方面,以pDATSC1为模板,使用引物C1(SEQ ID NO:81)与D1(SEQ ID NO:82)、引物E1(SEQ ID NO:83)与F1(SEQ ID NO:84)、引物G1(SEQ ID NO:85)与H1(SEQ ID NO:86)的各个组合,对包含色氨酰tRNA合成酶基因及其邻近区域的DNA片段进行PCR扩增。将各PCR扩增DNA片段用限制酶EcoRI消化,之后与预先用限制酶EcoRI消化的上述质粒连接。分别使用所得连接物转化大肠杆菌HB101,在所得转化体中,将由具有琼脂分解活性的转化体制备的质粒命名为pDATSA2、pDATSA3、pDATSA4。确认pDATSA2、pDATSA3、pDATSA4的核苷酸序列,结果色氨酰tRNA合成酶基因及其周边部分分别为SEQ IDNO:87、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:89所示的序列。接着,使用上述质粒转化DTS1451(pDATSK),利用含7.5μg/mL四环素的再生培养基进行筛选。将转化体铺在添加有卡那霉素的LB琼脂培养基和含有7.5μg/mL四环素的再生培养基中,筛选显示琼脂分解酶活性、并且显示卡那霉素感受性且显示四环素耐性的株。将所得DTS1451(pDATSA2)、DTS1451(pDATSA3)、DTS1451(pDATSA4)在PPS培养基中(不含抗生素)、在30℃下以130rpm的转速搅拌培养72小时,测定所得培养上清中所含的琼脂分解酶活性。其结果,确认到上述三种均为每1L培养液生产约0.1g的琼脂分解酶。
[表1]
  引物   核苷酸序列  SEQ ID NO:
  A   GTGCCTCGAGGATTAAGCATTGGTAACTGTC  53
  引物   核苷酸序列  SEQ ID NO:
  B   TATTCTCGAGACATTAACCTAGAAAGCACTAAGG  54
  C   CTGCCTGTCTCGAGGCTGATAGCAGTTATC  55
  D   CAACTCGAGGCTGGTCGGACAAACACCTAG  56
  E   TGCGAATTCCGGATGTAAGGAGAACGGCTC  57
  F   CTTGTCGACGTACATCAGAAATCGTACATTCG  58
  G   GGTGGATCCCCTCGCCGGCAATAGTTACCC   59
  H   AATCTAGACTTTCGTTATACAAATTTTAACC   60
  I   TGTAGGATCCAATATGGGCAGAAAACACATG   61
  J   ATATCTAGATTCCACTCTGTGTACCAGTAGC   62
  K   GTTAGCTCCTTCGGTCCTCC   63
  L   GTAACTGGCTTCAGCAGAGC   64
  M   CTGCCACATCGTCTAGGCTGC   65
  N   CAGGAGTCCAAATACCAGAG   66
  O   CCCTTGCCTATACTGTGGAC   67
  P   GTTACAATAGCGACGGAGAG   68
  Q   GTCTGAATTCGAGGAAGGTTTACACCG   69
  R   CTGCGAATTCATCTTCATGGTGAACC   70
  S   CATTGTCATTAGTTGGCTGG   71
  T   GCAAGAATTCAAAATCCATCTTCATCGG   72
  U   GTGACTGAGGATCCGCTAGTTCCAGATCG   73
  V   CTCTTGGATCCCTTCATCATTCTATCACAC   74
  W   GCAGATTGGGATGGAGTTCCCGTAC   75
  引物   核苷酸序列  SEQ ID NO:
  X   TTACAGCTTCACAAAGCGGATTTC   76
  Y   TGCTGCAAGAGCTGTCGGAAATAAAG   77
  Z   AAGAAGAAAAGAAAGAAGCTAAAG   78
                                           。
产业实用性
本发明在培养通过转化细菌等宿主细胞而得到的转化体来制造各种蛋白或肽的领域中有用。
序列表
<110>独立行政法人海洋研究开发机构
<120>在细胞中稳定保持外来基因的方法
<130>A85139H
<160>89
 
<210>1
<211>2631
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>alaS丙氨酸-tRNA合成酶
 
<400>1
atgagcaaga gcaccgctga gatccgtcag gcgtttctcg actttttcca tagtaaggga    60
catcaggtag ttgccagcag ctccctggta ccccataacg acccaacttt gttgtttacc    120
aacgccggga tgaaccagtt caaggatgtg ttccttgggc tcgacaagcg taattattcc    180
cgcgctacca cttcccaacg ctgcgtgcgt gcgggtggta aacacaacga cctggaaaac    240
gtcggttaca ccgcgcgtca ccataccttc ttcgaaatgc tgggcaactt cagcttcggc    300
gactatttca aacacgatgc cattcagttt gcatgggaac tgctgaccag cgaaaaatgg    360
tttgccctgc cgaaagagcg tctgtgggtt accgtctatg aaagcgacga cgaagcctac    420
gaaatctggg aaaaagaagt agggatcccg cgcgaacgta ttattcgcat cggcgataac    480
aaaggtgcgc catacgcatc tgacaacttc tggcagatgg gtgacactgg tccgtgcggc    540
ccgtgcaccg aaatcttcta cgatcacggc gaccacattt gggggggccc tccgggaagc    600
ccggaagaag acggcgaccg ctacattgag atctggaaca tcgtcttcat gcagttcaac    660
cgccaggccg atggcacgat ggaaccgctg ccgaagccgt ctgtagatac cggtatgggt    720
ctggagcgta ttgctgcggt gctgcaacac gttaactcta actatgacat cgacctgttc    780
cgcacgctga tccaggcggt agcgaaagtc actggcgcaa ccgatctgag caataaatcg    840
ctgcgcgtaa tcgctgacca cattcgttct tgtgcgttcc tgatcgcgga tggcgtaatg    900
ccgtccaatg aaaaccgtgg ttatgtactg cgtcgtatca ttcgtcgcgc agtgcgtcac    960
ggtaatatgc tcggcgcgaa agaaaccttc ttctacaaac tggttggtcc gctgatcgac    1020
gttatgggct ctgcgggtga agacctgaaa cgccagcagg cgcaggttga gcaggtgctg  1080
aagactgaag aagagcagtt tgctcgtact ctggagcgcg gtctggcgtt gctggatgaa  1140
gagctggcaa aactttctgg tgatacgctg gatggtgaaa ctgctttccg tctgtacgac  1200
acctatggct tcccggttga cctgacggct gatgtttgtc gtgagcgcaa catcaaagtt  1260
gacgaagctg gttttgaagc tgcaatggaa gagcagcgtc gtcgcgcgcg cgaagccagc  1320
ggctttggtg ccgattacaa cgcaatgatc cgtgttgaca gtgcatctga atttaaaggc  1380
tatgaccatc tggaactgaa cggcaaagtg actgcgctgt ttgttgatgg taaagcggtt  1440
gatgccatca atgcaggcca ggaagctgtg gtcgtgctgg atcaaacgcc attctatgcg  1500
gaatccggcg gtcaggttgg cgataaaggc gaactgaaag gcgctaactt ctcctttgcg  1560
gtggaagata cgcagaaata cggccaggcg attggtcaca tcggtaaact tgctgcgggt  1620
tctctgaaag tgggcgacgc ggtgcaggct gatgttgatg aggctcgtcg cgcccgtatt  1680
cgtctgaatc actccgcaac gcacctgatg cacgctgcgc tgcgccaggt tctgggtact  1740
catgtatcgc agaaaggttc actggttaac gacaaggtgc tgcgcttcga cttctcacac  1800
aacgaagcga tgaaaccaga agagattcgt gcggtcgaag acctggtgaa cacacagatt  1860
cgtcgcaatt tgccgatcga aaccaacatc atggatctcg aagcggcgaa agcgaaaggt  1920
gcgatggcgc tgttcggcga gaagtatgat gagcgcgtac gcgtgctgag catgggcgat  1980
ttctctaccg agttgtgtgg cggtactcac gccagccgca ctggtgatat tggtctgttc  2040
cgcatcatct ctgaatcggg tactgctgca ggcgttcgtc gtatcgaagc ggtaaccgga  2100
gaaggtgcta tcgccaccgt tcatgcagac agcgatcgct taagcgaagt cgcgcatctg  2160
ctgaaaggcg atagcaataa tctggctgat aaagtgcgct cagtactgga acgtacgcgt  2220
cagctggaaa aagagttaca acagcttaaa gaacaagctg ccgcacagga gagcgcaaat  2280
ctttccagta aggcaattga tgttaatggt gttaagctgt tggttagcga gcttagcggt  2340
gttgagccga aaatgttgcg taccatggtt gacgatttaa aaaatcagct ggggtcgaca  2400
attatcgtgc tggcaacggt agtcgaaggt aaggtttctc tgattgcagg cgtatctaag  2460
gacgtcacag atcgtgtgaa agcaggggaa ctgattggta tggtcgctca gcaggtgggc  2520
ggcaagggtg gtggacgtcc tgacatggcg caagccggtg gtacggatgc tgcggcctta  2580
cctgcagcgt tagccagtgt gaaaggctgg gtcagcgcga aattgcaata a           2631
 
<210>2
<211>1734
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>argS精氨酸-tRNA合成酶
 
<400>2
gtgaatattc aggctcttct ctcagaaaaa gtccgtcagg ccatgattgc ggcaggcgcg    60
cctgcggatt gcgaaccgca ggttcgtcag tcagcaaaag ttcagttcgg cgactatcag    120
gctaacggca tgatggcagt tgctaaaaaa ctgggtatgg caccgcgaca attagcagag    180
caggtgctga ctcatctgga tcttaacggt atcgccagca aagttgagat cgccggtcca    240
ggctttatca acattttcct tgatccggca ttcctggctg aacatgttca gcaggcgctg    300
gcgtccgatc gtctcggtgt tgctacgcca gaaaaacaga ccattgtggt tgactactct    360
gcgccaaacg tggcgaaaga gatgcatgtc ggtcacctgc gctctaccat tattggtgac    420
gcagcagtgc gtactctgga gttcctcggt cacaaagtga ttcgcgcaaa ccacgtcggc    480
gactggggca ctcagttcgg tatgctgatt gcatggctgg aaaagcagca gcaggaaaac    540
gccggtgaaa tggagctggc tgaccttgaa ggtttctacc gcgatgcgaa aaagcattac    600
gatgaagatg aagagttcgc cgagcgcgca cgtaactacg tggtaaaact gcaaagcggt    660
gacgaatatt tccgcgagat gtggcgcaaa ctggtcgaca tcaccatgac gcagaaccag    720
atcacctacg atcgtctcaa cgtgacgctg acccgtgatg acgtgatggg cgaaagcctc    780
tacaacccga tgctgccagg aattgtggcg gatctcaaag ccaaaggtct ggcagtagaa    840
agcgaagggg cgaccgtcgt attccttgat gagtttaaaa acaaggaagg cgaaccgatg    900
ggcgtgatca ttcagaagaa agatggcggc tatctctaca ccaccactga tatcgcctgt    960
gcgaaatatc gttatgaaac actgcatgcc gatcgcgtgc tgtattacat cgactcccgt    1020
cagcatcaac acctgatgca ggcatgggcg atcgtccgta aagcaggcta tgtaccggaa    1080
tccgtaccgc tggaacacca catgttcggc atgatgctgg gtaaagacgg caaaccgttc    1140
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acgctgaagc tgggtctgga tacgctgggt attgagactg tagagcgtat gtaa          1734
<210>3
<211>1401
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>asnS天冬酰胺-tRNA合成酶
 
<400>3
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accgtgcgcg gatgggtacg tacccgccga gattcaaaag ctggcatctc cttcctcgcc    120
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tacaatgaag acgtcctgcg tctgaccacc ggctgctcgg tcattgtgac gggtaaagtc    240
gtggcgtcgc cgggccaggg gcaacaattt gaaattcagg ccagcaaggt tgaagttgct    300
ggttgggttg aagatccaga cacttacccg atggcggcaa aacgccacag cattgagtat    360
ctgcgtgaag tcgctcacct gcgtccgcgc acaaacctga ttggtgccgt cgcgcgcgtt    420
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acgctggatc tggaaaacct gccgcgtaac gatcagggca aagtggattt cgacaaagac    600
ttctttggta aagagtcttt cctgaccgta tctggccagt tgaacggcga aacctacgct    660
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<210>4
<211>1773
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>aspS天冬氨酸-tRNA合成酶
 
<400>4
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ctgcgtgctg accgtcagcc tgaatttact cagatcgatg tggaaacttc tttcatgacc    720
gcgccgcaag tgcgtgaagt gatggaagcg ctggtgcgtc atctgtggct ggaagtgaag    780
ggtgtggatc tgggcgattt cccggtaatg acctttgcgg aagcagaacg ccgttatggt    840
tctgataaac cggatctgcg taacccgatg gaactgactg acgttgctga tctgctgaaa    900
tctgttgagt ttgctgtatt tgcaggtccg gcgaacgatc cgaaaggtcg cgtagcggct    960
ctgcgcgttc cgggcggcgc atcgctgacc cgtaagcaga tcgacgaata cggtaacttc    1020
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attcaggttg tgaagaaggc tgagaataac tga                               1773
 
<210>5
<211>1386
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>cysS半胱氨酸-tRNA合成酶
 
<400>5
atgctaaaaa tcttcaatac tctgacacgc caaaaagagg aatttaagcc tattcacgcc    60
ggggaagtcg gcatgtacgt gtgtggaatc accgtttacg atctctgtca tatcggtcac    120
gggcgtacct ttgttgcttt tgacgtggtt gcgcgctatc tgcgtttcct cggctataaa    180
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aatggcgaaa gctttgtggc gatggtggat cgcatgatcg ccgaaatgca caaagatttt    300
gatgctttga acattctgcg cccggatatg gagccgcgcg cgacgcacca tatcgcagaa    360
attattgaac tcactgaaca actgatcgcc aaaggtcacg cttatgtggc ggacaacggc    420
gacgtgatgt tcgacgtccc gaccgatcca acttatggcg tgctgtcgcg tcaggatctc    480
gaccagctgc aggcaggcgc gcgcgttgac gtggtcgacg acaaacgcaa cccaatggac    540
ttcgttctgt ggaagatgtc gaaagagggc gaaccgagct ggccgtctcc gtggggcgcg    600
ggtcgtcctg gctggcacat tgaatgttcg gcaatgaact gcaagcagct gggtaaccac    660
tttgatatcc acggcggcgg ttcagacctg atgttcccgc accacgaaaa cgaaatcgcg    720
cagtccacct gtgcccatga tggtcagtat gtgaactact ggatgcactc ggggatggtg    780
atggttgacc gcgagaagat gtccaaatcg ctgggtaact tctttaccgt gcgcgatgtg    840
ctgaaatact acgacgcgga aaccgtgcgt tacttcctga tgtcgggcca ctatcgcagc    900
cagttgaact acagcgaaga gaacctgaag caggcgcgtg cggcgctgga gcgtctctac    960
actgcgctgc gcggcacaga taaaaccgtt gcgcctgccg gtggcgaagc gtttgaagcg    1020
cgctttattg aagcgatgga cgacgatttc aacaccccgg aagcctattc cgtactgttt    1080
gatatggcgc gtgaagtaaa ccgtctgaaa gcagaagata tggcagcggc gaatgcaatg    1140
gcatctcacc tgcgtaaact ttccgctgta ttgggcctgc tggagcaaga accggaagcg  1200
ttcctgcaaa gcggcgcgca ggcagacgac agcgaagtgg ctgagattga agcgttaatt  1260
caacagcgtc tggatgcccg taaagcgaaa gactgggcgg cggcggatgc ggcgcgtgat  1320
cgtcttaacg agatggggat cgtgctggaa gatggcccgc aagggaccac ctggcgtcgt  1380
aagtaa                                                             1386
 
<210>6
<211>1665
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>glnS谷氨酰胺-tRNA合成酶
 
<400>6
atgagtgagg cagaagcccg cccgactaac tttatccgtc agatcatcga tgaagatctg    60
gccagtggta agcacaccac agtacacacc cgtttcccgc cggagccgaa tggctatctg    120
catattggcc atgcgaaatc tatctgcctg aacttcggga tcgcccagga ctataaaggc    180
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tcgatcaaaa acgacgtaga gtggttaggt tttcactggt ctggtaacgt ccgttactcc    300
tccgattatt ttgatcagct ccacgcctat gcgatcgaac tgatcaataa aggcctggcg    360
tacgttgatg aactgacgcc ggaacagatc cgcgaatacc gcggcaccct gacgcaaccg    420
ggtaaaaaca gcccgtaccg cgaccgcagc gttgaagaga acctggcgct gttcgaaaaa    480
atgcgtgccg gtggttttga agaaggtaaa gcctgcctgc gtgcgaaaat cgacatggct    540
tcaccgttta tcgtgatgcg cgatccggtg ctgtaccgta ttaaatttgc tgaacaccac    600
cagactggca acaagtggtg catctacccg atgtacgact tcacccactg catcagcgat    660
gccctggaag gtattacgca ctctctgtgt acgcttgagt tccaggacaa ccgtcgtctg    720
tacgactggg tactggacaa catcacgatt cctgttcacc cgcgccagta tgagttctcg    780
cgcctgaatc tggaatacac cgtgatgtcc aagcgtaagt tgaacctgct ggtgaccgac    840
aagcacgttg aaggctggga tgacccgcgt atgccgacca tttccggtct gcgtcgtcgt    900
ggttacactg cggcttctat tcgtgagttc tgcaaacgca tcggcgtgac caagcaggac    960
aacaccattg agatggcgtc gctggaatcc tgcatccgtg aagatctcaa cgaaaatgcg    1020
ccgcgcgcaa tggcggttat cgatccggtg aaactggtta tcgaaaacta tcagggcgaa    1080
ggcgaaatgg ttaccatgcc gaaccatccg aacaaaccgg aaatgggcag ccgtcaggtg    1140
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tacaaacgtc tggtgctggg taaagaagtg cgtctgcgta atgcttatgt gattaaggca    1260
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cgcaccgttg ggctgcgtga tacctgggcg aaagtaggcg agtaa                    1665
 
<210>7
<211>1665
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>gltX谷氨酸-tRNA合成酶
 
<400>7
atgagtgagg cagaagcccg cccgactaac tttatccgtc agatcatcga tgaagatctg    60
gccagtggta agcacaccac agtacacacc cgtttcccgc cggagccgaa tggctatctg    120
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tccgattatt ttgatcagct ccacgcctat gcgatcgaac tgatcaataa aggcctggcg    360
tacgttgatg aactgacgcc ggaacagatc cgcgaatacc gcggcaccct gacgcaaccg    420
ggtaaaaaca gcccgtaccg cgaccgcagc gttgaagaga acctggcgct gttcgaaaaa    480
atgcgtgccg gtggttttga agaaggtaaa gcctgcctgc gtgcgaaaat cgacatggct    540
tcaccgttta tcgtgatgcg cgatccggtg ctgtaccgta ttaaatttgc tgaacaccac    600
cagactggca acaagtggtg catctacccg atgtacgact tcacccactg catcagcgat    660
gccctggaag gtattacgca ctctctgtgt acgcttgagt tccaggacaa ccgtcgtctg    720
tacgactggg tactggacaa catcacgatt cctgttcacc cgcgccagta tgagttctcg    780
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ccgcgcgcaa tggcggttat cgatccggtg aaactggtta tcgaaaacta tcagggcgaa  1080
ggcgaaatgg ttaccatgcc gaaccatccg aacaaaccgg aaatgggcag ccgtcaggtg  1140
ccgtttagcg gtgagatttg gattgatcgc gccgatttcc gcgaagaagc taacaagcag  1200
tacaaacgtc tggtgctggg taaagaagtg cgtctgcgta atgcttatgt gattaaggca  1260
gaacgcgtcg agaaagatgc cgaaggtaat atcaccacca tcttctgtac ttatgacgcc  1320
gataccttaa gcaaagatcc ggcagatggt cgtaaagtca aaggtgttat tcactgggtg  1380
agcgcggcac atgcgctgcc ggttgaaatc cgtttgtatg accgtctgtt cagcgtgcct  1440
aacccaggtg ctgcggatga tttcctgtcg gtgattaacc cggaatcgct ggtgatcaaa  1500
cagggctttg ctgaaccgtc gctgaaagat gcggttgcgg gtaaagcatt ccagtttgag  1560
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cgcaccgttg ggctgcgtga tacctgggcg aaagtaggcg agtaa                  1665
 
<210>8
<211>912
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>glyQ甘氨酸-tRNA合成酶,α-亚单位
 
<400>8
atgcaaaagt ttgataccag gaccttccag ggcttgatcc tgaccttaca ggattactgg    60
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cacccaatga cctgtctgcg cgagctgggg ccagaaccga tggcggctgc ttatgttcag    180
ccttctcgtc gcccgaccga tggtcgctac ggcgaaaacc ccaaccgttt acagcactac    240
tatcagttcc aggtggtcat taagccatcg ccggacaata ttcaggagct gtacctcggt    300
tctctgaaag agctgggcat ggacccgact attcacgaca tccgtttcgt ggaagataac    360
tgggaaaacc cgacgctggg tgcctgggga ctgggctggg aagtgtggct gaacggcatg    420
gaagtgacgc agttcactta cttccagcag gttggtggtc tggagtgtaa accggttacc    480
ggcgagatca cctacggtct ggaacgtctg gccatgtaca ttcagggcgt agacagcgtt    540
tacgacctgg tctggagcga cggcccgctg ggtaaaacca cctacggcga cgtgttccat    600
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acctgcttcg agcagtacga gaaagaagcg cagcagctgc tggcgctgga aaatccgctg    720
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aaagcagtgg cagaagcata ctacgcttcc cgtgaagccc tcggcttccc gatgtgcaac    900
aaagataagt aa                                                        912
 
<210>9
<211>2070
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>glyS甘氨酸-tRNA合成酶,β-亚单位
 
<400>9
atgtctgaga aaacttttct ggtggaaatc ggcactgaag agctgccacc aaaagcactg    60
cgcagcctgg ctgagtcctt tgctgcgaac tttactgcgg agctggataa cgctggcctc    120
gcacacggca ccgttcaatg gtttgctgct ccgcgtcgtc tggcgctgaa agtagctaac    180
ctggcggaag cgcaaccgga tcgtgaaatc gaaaaacgcg gcccggcgat tgcccaggcg    240
ttcgacgctg aaggcaaacc gagcaaagcg gcagaaggtt gggcgcgtgg ttgcggtatt    300
accgttgacc aggctgagcg tctgactacc gataaaggcg aatggctgct gtatcgcgcc    360
catgtgaagg gcgaaagcac cgaagcactg ctgccgaata tggttgcgac ttctctggcg    420
aaactgccga tcccgaaact gatgcgttgg ggcgcaagcg acgtgcactt cgtgcgtccg    480
gtgcacaccg tgaccctgct gctgggcgac aaagtcattc cggcaaccat tctgggcatt    540
cagtccgatc gcgtgattcg cggccaccgc tttatgggcg agccggaatt caccatcgat    600
aacgccgatc agtatccgga aattctgcgt gagcgtggga aagtcatcgc cgattacgaa    660
gaacgtaagg cgaagattaa agccgatgcc gaagaagcag cgcgtaagat tggcggtaac    720
gctgacttaa gcgaaagcct gctggaagaa gtggcttcgc tggtggagtg gccggtcgtt    780
ctgaccgcaa aattcgaaga gaaattcctc gcggtgccgg ctgaagcgct ggtttacacc    840
atgaaaggtg accagaaata cttcccggtg tatgcgaacg acggcaaact gctgccgaac    900
tttatcttcg ttgccaacat cgaatcgaaa gatccgcagc agattatctc cggtaacgag    960
aaagtcgttc gtccgcgtct ggcggatgcc gagttcttct tcaacaccga ccgtaaaaaa    1020
cgtcttgaag ataacctgcc gcgcctgcaa accgtgttgt tccagcaaca gttggggacg    1080
ctgcgcgaca aaactgaccg catccaggcg ctggctggct ggattgctga acagattggc    1140
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cgcgttgcgg atatttcgct gttgcaataa                                   2070
 
<210>10
<211>1275
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>hisS组氨酸-tRNA合成酶
 
<400>10
gtggcaaaaa acattcaagc cattcgcggc atgaacgatt acctgcctgg cgaaacggcc    60
atctggcagc gcattgaagg cacactgaaa aacgtgctcg gcagctacgg ttacagtgaa    120
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caggaacagc gtctgtggta tatcgggccg atgttccgtc acgagcgtcc gcagaaaggg    360
cgttatcgtc agttccatca gttgggctgc gaagttttcg gtctgcaagg tccggatatc    420
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gtaactcttg agctgaactc tatcggttcg ctggaagcac gcgccaatta ccgcgatgcg    540
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tacactaacc cgctgcgcgt gctggattca aaaaatccgg aagtgcaggc gcttctcaac    660
gacgctccgg cattaggtga ctatctggac gaggaatctc gtgagcattt tgccggtctg    720
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caatctgcgg ctatggcatt agctgagcgt ctgcgtgatg aattaccggg cgtgaaattg    1080
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gcccgcgttg ctgtggtgct gggtgagtct gaagtggcta acggcacagc agtagtgaag    1200
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acgttactgg gttaa                                                     1275
 
<210>11
<211>2817
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>ileS异亮氨酸-tRNA合成酶
 
<400>11
atgagtgact ataaatcaac cctgaatttg ccggaaacag ggttcccgat gcgtggcgat    60
ctcgccaagc gcgaacccgg aatgctggcg cgttggactg atgatgatct gtacggcatc    120
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gcactgaaag caaaatttgc cgtaagcaac gttaacggcc caatctcgct ggtaatctgg    720
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tggttcgtca gcatggatca gaaaggtctg cgtgcgcagt cactgaaaga gatcaaaggc    1320
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gacacggaag agctgcatcc gcgtaccctt gaactgatgg aagaagtggc aaaacgcgtt    1500
gaagtcgatg gcatccaggc gtggtgggat ctcgatgcga aagagatcct cggcgacgaa    1560
gctgatcagt acgtgaaagt gccggacaca ttggatgtat ggtttgactc cggatctacc    1620
cactcttctg ttgttgacgt gcgtccggaa tttgccggtc acgcagcgga catgtatctg    1680
gaaggttctg accaacaccg cggctggttc atgtcttccc taatgatctc caccgcgatg    1740
aagggtaaag cgccgtatcg tcaggtactg acccacggct ttaccgtgga tggtcagggc    1800
cgcaagatgt ctaaatccat cggcaatacc gtttcgccgc aggatgtgat gaacaaactg    1860
ggcgcggata ttctgcgtct gtgggtggca tcaaccgact acaccggtga aatggccgtt    1920
tctgacgaga tcctgaaacg tgctgccgat agctatcgtc gtatccgtaa caccgcgcgc    1980
ttcctgctgg caaacctgaa cggttttgat ccagcaaaag atatggtgaa accggaagag    2040
atggtggtac tggatcgctg ggccgtaggt tgtgcgaaag cggcacagga agacatcctc    2100
aaggcgtacg aagcatacga tttccacgaa gtggtacagc gtctgatgcg cttctgctcc    2160
gttgagatgg gttccttcta cctcgacatc atcaaagacc gtcagtacac cgccaaagcg    2220
gacagtgtgg cgcgtcgtag ctgccagact gcgctatatc acatcgcaga agcgctggtg    2280
cgctggatgg caccaatcct ctccttcacc gctgatgaag tgtggggcta cctgccgggc    2340
gaacgtgaaa aatacgtctt caccggtgag tggtacgaag gcctgtttgg cctggcagac    2400
agtgaagcga tgaacgatgc gttctgggac gagctgttga aagtgcgtgg cgaagtgaac    2460
aaagtcattg agcaagcgcg tgccgacaag aaagtgggtg gctcgctgga agcggcagta    2520
accttgtatg cagaaccgga actgtcggcg aaactgaccg cgctgggcga tgaattacga    2580
tttgtcctgt tgacctccgg cgctaccgtt gcagactata acgacgcacc tgctgatgct  2640
cagcagagcg aagtactcaa agggctgaaa gtcgcgttga gtaaagccga aggtgagaag  2700
tgcccacgct gctggcacta cacccaggat gtcggcaagg tggcggaaca cgcagaaatc  2760
tgcggccgct gtgtcagcaa cgtcgccggt gacggtgaaa aacgtaagtt tgcctga     2817
 
<210>12
<211>2583
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>leuS亮氨酸-tRNA合成酶
 
<400>12
atgcaagagc aataccgccc ggaagagata gaatccaaag tacagcttca ttgggatgag    60
aagcgcacat ttgaagtaac cgaagacgag agcaaagaga agtattactg cctgtctatg    120
cttccctatc cttctggtcg actacacatg ggccacgtac gtaactacac catcggtgac    180
gtgatcgccc gctaccagcg tatgctgggc aaaaacgtcc tgcagccgat cggctgggac    240
gcgtttggtc tgcctgcgga aggcgcggcg gtgaaaaaca acaccgctcc ggcaccgtgg    300
acgtacgaca acatcgcgta tatgaaaaac cagctcaaaa tgctgggctt tggttatgac    360
tggagccgcg agctggcaac ctgtacgccg gaatactacc gttgggaaca gaaattcttc    420
accgagctgt ataaaaaagg cctggtatat aagaagactt ctgcggtcaa ctggtgcccg    480
aacgaccaga ccgtactggc gaacgaacaa gttatcgacg gctgctgctg gcgctgcgat    540
accaaagttg aacgtaaaga gatcccgcag tggtttatca aaatcactgc ttacgctgac    600
gagctgctca acgatctgga taaactggat cactggccag acaccgttaa aaccatgcag    660
cgtaactgga tcggtcgttc cgaaggcgtg gagatcacct tcaacgttaa cgactatgac    720
aacacgctga ccgtttacac tacccgcccg gacaccttta tgggttgtac ctacctggcg    780
gtagctgcgg gtcatccgct ggcgcagaaa gcggcggaaa ataatcctga actggcggcc    840
tttattgacg aatgccgtaa caccaaagtt gccgaagctg aaatggcgac gatggagaaa    900
aaaggcgtcg atactggctt taaagcggtt cacccattaa cgggcgaaga aattcccgtt    960
tgggcagcaa acttcgtatt gatggagtac ggcacgggcg cagttatggc ggtaccgggg    1020
cacgaccagc gcgactacga gtttgcctct aaatacggcc tgaacatcaa accggttatc    1080
ctggcagctg acggctctga gccagatctt tctcagcaag ccctgactga aaaaggcgtg    1140
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ggtgtttccc gtcagcgtta ctggggcgcg ccgattccga tggtgacgct ggaagacggt  1320
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gacggcatta ccagcccgat taaagcagat ccggagtggg cgaaaactac cgttaacggt  1440
atgccagcac tgcgtgaaac cgacactttc gacaccttta tggagtcctc ctggtactat  1500
gcgcgctaca cttgcccgca gtacaaagaa ggtatgctgg attccgaagc ggctaactac  1560
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ttccgcttct tccacaaact gatgcgtgat gcaggcatgg tgaactctga cgaaccagcg  1680
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ggcgaacgta actgggtttc cccggttgat gctatcgttg aacgtgacga gaaaggccgt  1800
atcgtgaaag cgaaagatgc ggcaggccat gaactggttt ataccggcat gagcaaaatg  1860
tccaagtcga agaacaacgg tatcgacccg caggtgatgg ttgaacgtta cggcgcggac  1920
accgttcgtc tgtttatgat gtttgcttct ccggctgata tgactctcga atggcaggaa  1980
tccggtgtgg aaggggctaa ccgcttcctg aaacgtgtct ggaaactggt ttacgagcac  2040
acagcaaaag gtgatgttgc ggcactgaac gttgatgcgc tgactgaaaa tcagaaagcg  2100
ctgcgtcgcg atgtgcataa aacgatcgct aaagtgaccg atgatatcgg ccgtcgtcag  2160
accttcaaca ccgcaattgc ggcgattatg gagctgatga acaaactggc gaaagcacca  2220
accgatggcg agcaggatcg cgctctgatg caggaagcac tgctggccgt tgtccgtatg  2280
cttaacccgt tcaccccgca catctgcttc acgctgtggc aggaactgaa aggcgaaggc  2340
gatatcgaca acgcgccgtg gccggttgct gacgaaaaag cgatggtgga agactccacg  2400
ctggtcgtgg tgcaggttaa cggtaaagtc cgtgccaaaa tcaccgttcc ggtggacgca  2460
acggaagaac aggttcgcga acgtgctggc caggaacatc tggtagcaaa atatcttgat  2520
ggcgttactg tacgtaaagt gatttacgta ccaggtaaac tcctcaatct ggtcgttggc  2580
taa                                                                2583
 
<210>13
<211>1518
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>lysS赖氨酸-tRNA合成酶,组成型
 
<400>13
atgtctgaac aacacgcaca gggcgctgac gcggtagtcg atcttaacaa tgaactgaaa    60
acgcgtcgtg agaagctggc gaacctgcgc gagcagggga ttgccttccc gaacgatttc    120
cgtcgcgatc atacctctga ccaattgcac gcagaattcg acggcaaaga gaacgaagaa    180
ctggaagcgc tgaacatcga agtcgccgtt gctggccgca tgatgacccg tcgtattatg    240
ggtaaagcgt ctttcgttac cctgcaggac gttggcggtc gcattcagct gtacgttgcc    300
cgtgacgatc tcccggaagg cgtttataac gagcagttca aaaaatggga cctcggcgac    360
atcctcggcg cgaaaggtaa gctgttcaaa accaaaaccg gcgaactgtc tatccactgc    420
accgagttgc gtctgctgac caaagcactg cgtccgctgc cggataaatt ccacggcttg    480
caggatcagg aagcgcgcta tcgtcagcgt tatctcgatc tcatctccaa cgatgaatcc    540
cgcaacacct ttaaagtgcg ctcgcagatc ctctctggta ttcgccagtt catggtgaac    600
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cgtccgttta tcacccacca taacgcgctg gatctcgaca tgtacctgcg tatcgcgccg    720
gaactgtacc tcaagcgtct ggtggttggt ggcttcgagc gtgtattcga aatcaaccgt    780
aacttccgta acgaaggtat ttccgtacgt cataacccag agttcaccat gatggaactc    840
tacatggctt acgcagatta caaagatctg atcgagctga ccgaatcgct gttccgtact    900
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cacgttgaga agagctgggg tctgggccgt atcgttaccg agatcttcga agaagtggca    1140
gaagcacatc tgattcagcc gaccttcatt actgaatatc cggcagaagt ttctccgctg    1200
gcgcgtcgta acgacgttaa cccggaaatc acagaccgct ttgagttctt cattggtggt    1260
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cgtatggtaa tgctgttcac caacagccat accatccgcg acgttattct gttcccggcg    1500
atgcgtccgg taaaataa                                                  1518
 
<210>14
<211>1518
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>lysU赖氨酸-tRNA合成酶,热诱导型
<400>14
atgtctgaac aagaaacacg gggagccaat gaggctattg attttaacga tgaactgaga    60
aatcgccgcg aaaaactggc ggcactacgt cagcaaggtg tggcgtttcc caatgatttt    120
cgccgcgacc atacctctga ccagttgcac gaagagtttg atgcgaagga taaccaggaa    180
ctggaatcct taaacattga agtctcggtt gctggccgaa tgatgacccg tcgtatcatg    240
gggaaagcct cctttgtaac gttgcaggat gtcggtggcc gtattcaact gtacgttgca    300
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attatcggtg cccgcggtac gctgtttaag acgcaaacgg gtgagctttc cattcactgt    420
actgagctgc gcctgctgac taaagcacta cgtcctttac cagataaatt ccatggtctg    480
caggatcagg aagtccgtta tcgtcaacgt tatctggacc tcatcgctaa cgataaatcc    540
cgtcaaacgt ttgttgtccg ttcaaaaatt ctggccgcta tccgtcaatt catggtcgcg    600
cgcggcttta tggaagtaga aaccccgatg atgcaggtaa ttccaggtgg ggcatctgct    660
cgcccgttta ttacccatca taatgctctg gatttagata tgtatctgcg tatcgcgccg    720
gagctgtatc tgaaacgtct ggttgtaggc ggttttgaac gggtattcga aatcaaccgt    780
aacttccgta atgaaggtat ttctgttcgc cataatcctg agttcacaat gatggaactc    840
tacatggcgt atgcggatta ccacgatttg attgaactga cagagtcact gttccgcacc    900
ctggcacaag aggttctggg taccactaaa gtcacttatg gcgagcatgt gtttgatttc    960
ggcaaaccgt ttgaaaaact caccatgcgc gaagcaatca aaaaatatcg tccagaaacc    1020
gatatggccg acctggataa ttttgatgct gctaaagcat tagctgaatc tatcggtatt    1080
acggtagaga aaagctgggg gttgggacgt attgtcacag agatctttga tgaagtggca    1140
gaagcacatc tgattcagcc aacctttatt acggaatatc cggcagaagt gtccccgctg    1200
gcacgccgta atgatgttaa cccggaaatc accgaccgtt ttgaattctt catcggtggt    1260
cgtgaaatcg gtaatggttt tagcgaatta aacgacgcag aagatcaggc tgaacgtttc    1320
caggaacagg ttaatgctaa agctgcaggt gacgacgaag ccatgttcta tgacgaagat    1380
tacgtgactg cgctggaata tggtctgccg ccaaccgctg gtctgggtat tggtatcgac    1440
cgaatgatta tgctgtttac taacagccat actattcgcg acgttattct cttcccggcg    1500
atgcgcccac agaaataa                                                  1518
 
<210>15
<211>2034
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>metG甲硫氨酸-tRNA合成酶
 
<400>15
atgactcaag tcgcgaagaa aattctggtg acgtgcgcac tgccgtacgc taacggctca    60
atccacctcg gccatatgct ggagcacatc caggctgatg tctgggtccg ttaccagcga    120
atgcgcggcc acgaggtcaa cttcatctgc gccgacgatg cccacggtac accgatcatg    180
ctgaaagctc agcagcttgg tatcaccccg gagcagatga ttggcgaaat gagtcaggag    240
catcagactg atttcgcagg ctttaacatc agctatgaca actatcactc gacgcacagc    300
gaagagaacc gccagttgtc agaacttatc tactctcgcc tgaaagaaaa cggttttatt    360
aaaaaccgca ccatctctca gctgtacgat ccggaaaaag gcatgttcct gccggaccgt    420
tttgtgaaag gcacctgccc gaaatgtaaa tccccggatc aatacggcga taactgcgaa    480
gtctgcggcg cgacctacag cccgactgaa ctgatcgagc cgaaatcggt ggtttctggc    540
gctacgccgg taatgcgtga ttctgaacac ttcttctttg atctgccctc tttcagcgaa    600
atgttgcagg catggacccg cagcggtgcg ttgcaggagc aggtggcaaa taaaatgcag    660
gagtggtttg aatctggcct gcaacagtgg gatatctccc gcgacgcccc ttacttcggt    720
tttgaaattc cgaacgcgcc gggcaaatat ttctacgtct ggctggacgc accgattggc    780
tacatgggtt ctttcaagaa tctgtgcgac aagcgcggcg acagcgtaag cttcgatgaa    840
tactggaaga aagactccac cgccgagctg taccacttca tcggtaaaga tattgtttac    900
ttccacagcc tgttctggcc tgccatgctg gaaggcagca acttccgcaa gccgtccaac    960
ctgtttgttc atggctatgt gacggtgaac ggcgcaaaga tgtccaagtc tcgcggcacc    1020
tttattaaag ccagcacctg gctgaatcat tttgacgcag acagcctgcg ttactactac    1080
actgcgaaac tctcttcgcg cattgatgat atcgatctca acctggaaga tttcgttcag    1140
cgtgtgaatg ccgatatcgt taacaaagtg gttaacctgg cctcccgtaa tgcgggcttt    1200
atcaacaagc gttttgacgg cgtgctggca agcgaactgg ctgacccgca gttgtacaaa    1260
accttcactg atgccgctga agtgattggt gaagcgtggg aaagccgtga atttggtaaa    1320
gccgtgcgcg aaatcatggc gctggctgat ctggctaacc gctatgtcga tgaacaggct    1380
ccgtgggtgg tggcgaaaca ggaaggccgc gatgccgacc tgcaggcaat ttgctcaatg    1440
ggcatcaacc tgttccgcgt gctgatgact tacctgaagc cggtactgcc gaaactgacc    1500
gagcgtgcag aagcattcct caatacggaa ctgacctggg atggtatcca gcaaccgctg    1560
ctgggccaca aagtgaatcc gttcaaggcg ctgtataacc gcatcgatat gaggcaggtt    1620
gaagcactgg tggaagcctc taaagaagaa gtaaaagccg ctgccgcgcc ggtaactggc    1680
ccgctggcag atgatccgat tcaggaaacc atcacctttg acgacttcgc taaagttgac    1740
ctgcgcgtgg cgctgattga aaacgcagag tttgttgaag gttctgacaa actgctgcgc    1800
ctgacgctgg atctcggcgg tgaaaaacgc aatgtcttct ccggtattcg ttctgcttac    1860
ccggatccgc aggcactgat tggtcgtcac accattatgg tggctaacct ggcaccacgt    1920
aaaatgcgct tcggtatctc tgaaggcatg gtgatggctg ccggtcctgg cgggaaagat    1980
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<210>16
<211>984
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>pheS苯丙氨酸-tRNA合成酶,α-亚单位
 
<400>16
atgtcacatc tcgcagaact ggttgccagt gcgaaggcgg ccattagcca ggcgtcagat    60
gttgccgcgt tagataatgt gcgcgtcgaa tatttgggta aaaaagggca cttaaccctt    120
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aacgaagcga aagagcaggt tcagcaggcg ctgaatgcgc gtaaagcgga actggaaagc    240
gctgcactga atgcgcgtct ggcggcggaa acgattgatg tctctctgcc aggtcgtcgc    300
attgaaaacg gcggtctgca tccggttacc cgtaccatcg accgtatcga aagtttcttc    360
ggtgagcttg gctttaccgt ggcaaccggg ccggaaatcg aagacgatta tcataacttc    420
gatgctctga acattcctgg tcaccacccg gcgcgcgctg accacgacac tttctggttt    480
gacactaccc gcctgctgcg tacccagacc tctggcgtac agatccgcac catgaaagcc    540
cagcagccac cgattcgtat catcgcgcct ggccgtgttt atcgtaacga ctacgaccag    600
actcacacgc cgatgttcca tcagatggaa ggtctgattg ttgataccaa catcagcttt    660
accaacctga aaggcacgct gcacgacttc ctgcgtaact tctttgagga agatttgcag    720
attcgcttcc gtccttccta cttcccgttt accgaacctt ctgcagaagt ggacgtcatg    780
ggtaaaaacg gtaaatggct ggaagtgctg ggctgcggga tggtgcatcc gaacgtgttg    840
cgtaacgttg gcatcgaccc ggaagtttac tctggtttcg ccttcgggat ggggatggag    900
cgtctgacta tgttgcgtta cggcgtcacc gacctgcgtt cattcttcga aaacgatctg    960
cgtttcctca aacagtttaa ataa                                           984
 
<210>17
<211>2388
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>pheT苯丙氨酸-tRNA合成酶,β-亚单位
 
<400>17
atgaaattca gtgaactgtg gttacgcgaa tgggtgaacc cggcgattga tagcgatgcg    60
ctggcaaatc aaatcactat ggcgggcctg gaagttgacg gtgtagaacc ggttgccggc    120
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tccttctctg aactgggcat ttctgacgat cacagcggca ttatcgaact gcctgcggat    420
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gacacgctgc cgattacagt cgaagcgccg gaagcctgcc cgcgttatct tggccgtgtg    660
gtaaaaggca ttaacgttaa agcgccaact ccgctgtgga tgaaagaaaa actgcgtcgt    720
tgcgggatcc gttctatcga tgcagttgtt gacgtcacca actatgtgct gctcgaactg    780
ggccagccga tgcacgcttt cgataaagat cgcattgaag gcggcattgt ggtgcggatg    840
gcgaaagagg gcgaaacgct ggtgctgctc gacggtactg aagcgaagct gaatgctgac    900
actctggtca tcgccgacca caacaaggcg ctggcgatgg gcggcatctt cggtggcgaa    960
cactctggcg tgaatgacga aacacaaaac gtgctgctgg aatgcgcgtt ctttagcccg    1020
ctgtctatca ccggtcgtgc tcgtcgtcat ggcctgcata ccgatgcgtc tcaccgttat    1080
gagcgtggcg ttgatccggc actgcagcac aaagcgatgg aacgtgcgac ccgtctgctg    1140
atcgacatct gcggtggtga ggctggcccg gtaattgata tcaccaacga agcaacgctg    1200
ccgaagcgtg caaccatcac tctacgtcgt agcaaactgg atcgcctgat cggccatcat    1260
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caggcaccgt tgggcattcg tcaggatctg atgttagccg gtgtgatttg cggtaaccgt    1800
tacgaagagc actggaacct ggcaaaagag accgttgatt tctatgattt gaaaggcgat    1860
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gcggatattt tatccgaatg taagaaagtt ggcgtaaatc aggtagttgg cgtaaactta    2220
tttgacgtgt accgcggtaa gggtgttgcg gaggggtata agagcctcgc cataagcctg    2280
atcctgcaag ataccagccg tacactcgaa gaagaggaga ttgccgctac cgtcgccaaa    2340
tgtgtagagg cattaaaaga gcgattccag gcatcattga gggattga                 2388
 
<210>18
<211>978
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>赖氨酰-tRNA合成酶,genX
 
<400>18
atgagcgaaa cggcatcctg gcagccgagc gcatccattc ctaacttatt aaaacgcgcg    60
gcgattatgg cggagatccg tcgtttcttt gccgatcgtg gagtgctgga ggtggagacg    120
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atgaaacgcc tgctggttgc cggttgtggg ccggtattcc agctgtgccg cagcttccgt    300
aatgaagaga tggggcgtta tcacaaccct gagttcacta tgctggagtg gtatcgaccg    360
cactatgata tgtaccggtt gatgaacgag gtggacgatc tcttacaaca ggtgctggac    420
tgcccggcag cagaaagcct ttcttatcaa caagctttct tgcgttatct ggaaattgac    480
ccgctctctg ccgacaaaac gcaactgcgg gaagtcgcag cgaaactgga tttgagcaat    540
gttgctgata ccgaagaaga ccgcgacacg ctgctacaat tgctgtttac ctttggcgta    600
gagccaaata ttggcaaaga aaaaccgacc tttgtgtacc actttccagc cagccaggca    660
tcactggcgc aaatcagtac cgaagatcat cgggtcgctg aacgctttga ggtttattat    720
aaaggtattg agctggcgaa tggtttccat gaattgacgg atgcccgtga gcagcaacaa    780
cgctttgaac aagataaccg taagcgcgcg gcgcgcggtt tgccgcagca ccccattgac    840
cagaatctga ttgaagcctt gaaagtcggt atgcctgact gttccggcgt ggcattaggt    900
gttgatcgtc tggtgatgtt ggcgctgggc gcggagacac tggctgaagt catcgccttt    960
agcgttgacc gggcataa                                                  978
 
<210>19
<211>1719
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>proS脯氨酸-tRNA合成酶
 
<400>19
atgcgtacta gccaatacct gctctccact ctcaaggaga cacctgccga cgccgaggtg    60
atcagccatc agctgatgct gcgcgccggg atgatccgca agctggcctc cgggttatat    120
acctggctgc cgaccggcgt gcgcgttctg aaaaaagtcg aaaacatcgt gcgtgaagag    180
atgaacaacg ccggtgcgat cgaggtgtcg atgccggtgg ttcagccagc cgatttgtgg    240
caagagagtg gtcgttggga acagtacggt ccggaactgc tgcgttttgt tgaccgtggc    300
gagcgtccgt tcgtactcgg cccaactcat gaagaagtta tcactgacct gattcgtaac    360
gagcttagct cttacaaaca gctgccgctg aacttctatc agatccagac caagttccgc    420
gacgaagtgc gtccgcgttt cggcgtcatg cgttcccgcg aattcctgat gaaagatgct    480
tactctttcc atacttctca ggaatccctg caggaaacct acgatgcaat gtatgcggcc    540
tacagcaaaa tcttcagccg catggggctg gatttccgcg ccgtacaagc cgacaccggt    600
tctatcggcg gcagcgcctc tcacgaattc caggtgctgg cgcagagcgg tgaagacgat    660
gtggtcttct ccgacacctc tgactatgca gcgaacattg aactggcaga agctatcgcg    720
ccgaaagaac cgcgcgctgc tgctacccag gaaatgacgc tggttgatac gccgaacgcg    780
aaaaccatcg cggaactggt tgaacagttc aatctgccga ttgagaaaac ggttaagact    840
ctgctggtta aagcggttga aggcagcagc ttcccgcagg ttgcgctgct ggtgcgcggt    900
gatcacgagc tgaacgaagt taaagcagaa aaactgccgc aggttgcaag cccgctgact    960
ttcgcgaccg aagaagaaat tcgtgccgtg gttaaagccg gtccgggttc actgggtccg    1020
gtaaacatgc cgattccggt ggtgattgac cgtaccgttg cggcgatgag tgatttcgct    1080
gctggtgcta acatcgatgg taaacactac ttcggcatca actgggatcg cgatgtcgct    1140
accccggaag ttgcagatat ccgtaacgtg gtggctggcg atccaagccc ggatggccag    1200
ggtaggctgc tgatcaaacg tggtatcgaa gttggtcaca tcttccagct gggtaccaag    1260
tactccgaag cactgaaagc ctccgtacag ggtgaagatg gccgtaacca aatcctgacg    1320
atgggttgct acggtatcgg ggtaacgcgt gtggtagctg cggcgattga gcagaactac    1380
gacgaacgag gcatcgtatg gcctgacgct atcgcgccgt tccaggtggc gattctgccg    1440
atgaacatgc acaaatcctt ccgcgtacaa gagcttgctg agaaactgta cagcgaactg    1500
cgtgcacaag gtatcgaagt gctgctggat gaccgcaaag agcgtccggg cgtgatgttt    1560
gctgatatgg aactgatcgg tattccgcac actattgtgc tgggcgaccg taacctcgac    1620
aacgacgata tcgaatataa atatcgtcgc aacggcgaga aacagttaat taagactggt    1680
gacatcgtcg aatatctggt gaaacagatt aaaggctga                           1719
 
<210>20
<211>1293
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>serS丝氨酸-tRNA合成酶
 
<400>20
atgctcgatc ccaatctgct gcgtaatgag ccagacgcag tcgctgaaaa actggcacgc    60
cggggcttta agctggatgt agataagctg ggcgctcttg aagagcgtcg taaagtattg    120
caggtcaaaa cggaaaacct gcaagcggag cgtaactccc gatcgaaatc cattggccag    180
gcgaaagcgc gcggggaaga tatcgagcct ttacgtctgg aagtgaacaa actgggcgaa    240
gagctggatg cagcaaaagc cgagctggat gctttacagg ctgaaattcg cgatatcgcg    300
ctgaccatcc ctaacctgcc tgcagatgaa gtgccggtag gtaaagacga aaatgacaac    360
gttgaagtca gccgctgggg taccccgcgt gagtttgact ttgaagttcg tgaccacgtg    420
acgctgggtg aaatgcactc tggcctcgac tttgcagctg cagttaagct gactggttcc    480
cgctttgtgg taatgaaagg gcagattgct cgcatgcacc gcgcactgtc gcagtttatg    540
ctggatctgc ataccgaaca gcatggctac agtgagaact atgttccgta cctggttaac    600
caggacacgc tgtacggtac gggtcaactg ccgaaatttg ctggcgatct gttccatact    660
cgtccgctgg aagaagaagc agacaccagt aactatgcgc tgatcccaac ggcagaagtt    720
ccgctgacta acctggtgcg cggtgaaatc atcgatgaag atgatctgcc aattaagatg    780
accgcccaca ccccatgctt ccgttctgaa gccggttcat atggtcgtga cacccgtggt    840
ctgatccgta tgcaccagtt cgacaaagtt gaaatggtgc agatcgtgcg cccagaagac    900
tcaatggcgg cgctggaaga gatgactggt catgcagaaa aagtcctgca gttgctgggc    960
ctgccgtacc gtaaaatcat cctttgcact ggcgacatgg gctttggcgc ttgcaaaact    1020
tacgacctgg aagtatggat cccggcacag aacacctacc gtgagatctc ttcctgctcc    1080
aacgtttggg atttccaggc acgtcgtatg caggcacgtt gccgcagcaa gtcggacaag    1140
aaaacccgtc tggttcatac cctgaacggt tctggtctgg ctgttggtcg tacgctggtt    1200
gcagtaatgg aaaactatca gcaggctgat ggtcgtattg aagtaccaga agttctgcgt    1260
ccgtatatga acggactgga atatattggc taa                                 1293
 
<210>21
<211>1929
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>thrS苏氨酸-tRNA合成酶,自调节
 
<400>21
atgcctgtta taactcttcc tgatggcagc caacgccatt acgatcacgc tgtaagcccc    60
atggatgttg cgctggacat tggtccaggt ctggcgaaag cctgtatcgc agggcgcgtt    120
aatggcgaac tggttgatgc ttgcgatctg attgaaaacg acgcacaact gtcgatcatt    180
accgccaaag acgaagaagg tctggagatc attcgtcact cctgtgcgca cctgttaggg    240
cacgcgatta aacaactttg gccgcatacc aaaatggcaa tcggcccggt tattgacaac    300
ggtttttatt acgacgttga tcttgaccgc acgttaaccc aggaagatgt cgaagcactc    360
gagaagcgga tgcatgagct tgctgagaaa aactacgacg tcattaagaa gaaagtcagc    420
tggcacgaag cgcgtgaaac tttcgccaac cgtggggaga gctacaaagt ctccattctt    480
gacgaaaaca tcgcccatga tgacaagcca ggtctgtact tccatgaaga atatgtcgat    540
atgtgccgcg gtccgcacgt accgaacatg cgtttctgcc atcatttcaa actaatgaaa    600
acggcagggg cttactggcg tggcgacagc aacaacaaaa tgttgcaacg tatttacggt    660
acggcgtggg cagacaaaaa agcacttaac gcttacctgc agcgcctgga agaagccgcg    720
aaacgcgacc accgtaaaat cggtaaacag ctcgacctgt accatatgca ggaagaagcg    780
ccgggtatgg tattctggca caacgacggc tggaccatct tccgtgaact ggaagtgttt    840
gttcgttcta aactgaaaga gtaccagtat caggaagtta aaggtccgtt catgatggac    900
cgtgtcctgt gggaaaaaac cggtcactgg gacaactaca aagatgcaat gttcaccaca    960
tcttctgaga accgtgaata ctgcattaag ccgatgaact gcccgggtca cgtacaaatt    1020
ttcaaccagg ggctgaagtc ttatcgcgat ctgccgctgc gtatggccga gtttggtagc    1080
tgccaccgta acgagccgtc aggttcgctg catggcctga tgcgcgtgcg tggatttacc    1140
caggatgacg cgcatatctt ctgtactgaa gaacaaattc gcgatgaagt taacggatgt    1200
atccgtttag tctatgatat gtacagcact tttggcttcg agaagatcgt cgtcaaactc    1260
tccactcgtc ctgaaaaacg tattggcagc gacgaaatgt gggatcgtgc tgaggcggac    1320
ctggcggttg cgctggaaga aaacaacatc ccgtttgaat atcaactggg tgaaggcgct    1380
ttctacggtc cgaaaattga atttaccctg tatgactgcc tcgatcgtgc atggcagtgc    1440
ggtacagtac agctggactt ctctttgccg tctcgtctga gcgcttctta tgtaggcgaa    1500
gacaatgaac gtaaagtacc ggtaatgatt caccgcgcaa ttctggggtc gatggaacgt    1560
ttcatcggta tcctgaccga agagttcgct ggtttcttcc cgacctggct tgcgccggtt    1620
caggttgtta tcatgaatat taccgattca cagtctgaat acgttaacga attgacgcaa    1680
aaactatcaa atgcgggcat tcgtgttaaa gcagacttga gaaatgagaa gattggcttt    1740
aaaatccgcg agcacacttt gcgtcgcgtc ccatatatgc tggtctgtgg tgataaagag    1800
gtggaatcag gcaaagttgc cgttcgcacc cgccgtggta aagacctggg aagcatggac    1860
gtaaatgaag tgatcgagaa gctgcaacaa gagattcgca gccgcagtct taaacaattg    1920
gaggaataa                                                            1929
 
<210>22
<211>1005
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>trpS色氨酸-tRNA合成酶
 
<400>22
atgactaagc ccatcgtttt tagtggcgca cagccctcag gtgaattgac cattggtaac    60
tacatgggtg cgctgcgtca gtgggtaaac atgcaggatg actaccattg catttactgt    120
atcgttgacc aacacgcgat caccgtgcgc caggatgcac agaagctgcg taaagcgacg    180
ctggatacgc tggccttgta tctggcttgt ggtatcgatc ctgagaaaag caccattttt    240
gttcagtccc acgtgccgga acatgcacag ttaggctggg cactgaactg ctatacctac    300
ttcggcgaac tgagtcgcat gacgcagttt aaagataaat ctgcgcgtta tgccgagaac    360
atcaacgctg gtctgtttga ctatccggtg ctgatggcag cggacatcct gctgtatcaa    420
actaatctgg taccggtggg tgaagaccag aaacagcacc tcgaactgag ccgcgatatt    480
gcccagcgtt tcaacgcgct gtatggcgag atctttaagg tgccggagcc gtttattccg    540
aaatctggcg cgcgcgtaat gtcgctgctg gagccgacca agaagatgtc caagtctgac    600
gataatcgca ataacgttat cggcctgctg gaagatccga aatcggtagt gaagaaaatc    660
aaacgtgcgg tcactgactc cgacgagccg ccggtagttc gctacgatgt gcagaacaaa    720
gcgggcgttt ccaacctgtt ggatatcctt tcagcggtaa cgggccagag catcccagaa    780
ctggaaaaac agttcgaagg caagatgtat ggtcatctga aaggtgaagt ggctgatgcc    840
gtttccggta tgctgactga attgcaggaa cgctatcacc gtttccgcaa cgatgaagcc    900
ttcctgcaac aggtgatgaa agatggcgcg gaaaaagcca gcgcgcacgc ttcccgtacg    960
ctaaaagcgg tgtacgaagc gattggtttt gtggcgaagc cgtaa                    1005
 
<210>23
<211>1275
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>tyrS酪氨酸-tRNA合成酶
 
<400>23
atggcaagca gtaacttgat taaacaattg caagagcggg ggctggtagc ccaggtgacg    60
gacgaggaag cgttagcaga gcgactggcg caaggcccga tcgcgctcta ttgcggcttc    120
gatcctaccg ctgacagctt gcatttgggg catcttgttc cattgttatg cctgaaacgc    180
ttccagcagg cgggccacaa gccggttgcg ctggtaggcg gcgcgacggg tctgattggc    240
gacccgagct tcaaagctgc cgagcgtaag ctgaacaccg aagaaactgt tcaggagtgg    300
gtggacaaaa tccgtaagca ggttgccccg ttcctcgatt tcgactgtgg agaaaactct    360
gctatcgcgg cgaacaacta tgactggttc ggcaatatga atgtgctgac cttcctgcgc    420
gatattggca aacacttctc cgttaaccag atgatcaaca aagaagcggt taagcagcgt    480
ctcaaccgtg aagatcaggg gatttcgttc actgagtttt cctacaacct gttgcagggt    540
tatgacttcg cctgtctgaa caaacagtac ggtgtggtgc tgcaaattgg tggttctgac    600
cagtggggta acatcacttc tggtatcgac ctgacccgtc gtctgcatca gaatcaggtg    660
tttggcctga ccgttccgct gatcactaaa gcagatggca ccaaatttgg taaaactgaa    720
ggcggcgcag tctggttgga tccgaagaaa accagcccgt acaaattcta ccagttctgg  780
atcaacactg cggatgccga cgtttaccgc ttcctgaagt tcttcacctt tatgagcatt  840
gaagagatca acgccctgga agaagaagat aaaaacagcg gtaaagcacc gcgcgcccag  900
tatgtactgg cggagcaggt gactcgtctg gttcacggtg aagaaggttt acaggcggca  960
aaacgtatta ccgaatgcct gttcagcggt tctttgagtg cgctgagtga agcggacttc  1020
gaacagctgg cgcaggacgg cgtaccgatg gttgagatgg aaaagggcgc agacctgatg  1080
caggcactgg tcgattctga actgcaacct tcccgtggtc aggcacgtaa aactatcgcc  1140
tccaatgcca tcaccattaa cggtgaaaaa cagtccgatc ctgaatactt ctttaaagaa  1200
gaagatcgtc tgtttggtcg ttttacctta ctgcgtcgcg gtaaaaagaa ttactgtctg  1260
atttgctgga aataa                                                   1275
 
<210>24
<211>2856
<212>DNA
<213>大肠杆菌
 
<220>
<223>valS缬氨酸-tRNA合成酶
 
<400>24
atggaaaaga catataaccc acaagatatc gaacagccgc tttacgagca ctgggaaaag    60
cagggctact ttaagcctaa tggcgatgaa agccaggaaa gtttctgcat catgatcccg    120
ccgccgaacg tcaccggcag tttgcatatg ggtcacgcct tccagcaaac catcatggat    180
accatgatcc gctatcagcg catgcagggc aaaaacaccc tgtggcaggt cggtactgac    240
cacgccggga tcgctaccca gatggtcgtt gagcgcaaga ttgccgcaga agaaggtaaa    300
acccgtcacg actacggccg cgaagctttc atcgacaaaa tctgggaatg gaaagcggaa    360
tctggcggca ccattacccg tcagatgcgc cgtctcggca actccgtcga ctgggagcgt    420
gaacgcttca ccatggacga aggcctgtcc aatgcggtga aagaagtttt cgttcgtctg    480
tataaagaag acctgattta ccgtggcaaa cgcctggtaa actgggatcc gaaactgcgc    540
accgctatct ctgacctgga agtcgaaaac cgcgaatcga aaggttcgat gtggcacatc    600
cgctatccgc tggctgacgg tgcgaaaacc gcagacggta aagattatct ggtggtcgcg    660
actacccgtc cagaaaccct gctgggcgat actggcgtag ccgttaaccc ggaagatccg    720
cgttacaaag atctgattgg caaatatgtc attctgccgc tggttaaccg tcgtattccg    780
atcgttggcg acgaacacgc cgacatggaa aaaggcaccg gctgcgtgaa aatcactccg    840
gcgcacgact ttaacgacta tgaagtgggt aaacgtcacg ccctgccgat gatcaacatc    900
ctgacctttg acggcgatat ccgtgaaagc gcccaggtgt tcgataccaa aggtaacgaa    960
tctgacgttt attccagcga aatccctgca gagttccaga aactggagcg ttttgctgca    1020
cgtaaagcag tcgttgccgc agttgacgcg cttggcctgc tggaagaaat taaaccgcac    1080
gacctgaccg ttccttacgg cgaccgtggc ggcgtagtta tcgaaccaat gctgaccgac    1140
cagtggtacg tgcgtgccga tgtcctggcg aaaccggcgg ttgaagcggt tgagaacggc    1200
gacattcagt tcgtaccgaa gcagtacgaa aacatgtact tctcctggat gcgcgatatt    1260
caggactggt gtatctctcg tcagttgtgg tggggtcacc gtatcccggc atggtatgac    1320
gaagcgggta acgtttatgt tggccgcaac gaagacgaag tgcgtaaaga aaataacctc    1380
ggtgctgatg ttgtcctgcg tcaggacgaa gacgttctcg atacctggtt ctcttctgcg    1440
ctgtggacct tctctaccct tggctggccg gaaaataccg acgccctgcg tcagttccac    1500
ccaaccagcg tgatggtatc tggtttcgac atcattttct tctggattgc ccgcatgatc    1560
atgatgacca tgcacttcat caaagatgaa aatggcaaac cgcaggtgcc gttccacacc    1620
gtttacatga ccggcctgat tcgtgatgac gaaggccaga agatgtccaa atccaagggt    1680
aacgttatcg acccactgga tatggttgac ggtatttcgc tgccagaact gctggaaaaa    1740
cgtaccggca atatgatgca gccgcagctg gcggacaaaa tccgtaagcg caccgagaag    1800
cagttcccga acggtattga gccgcacggt actgacgcgc tgcgcttcac cctggcggcg    1860
ctggcgtcta ccggtcgtga catcaactgg gatatgaagc gtctggaagg ttaccgtaac    1920
ttctgtaaca agctgtggaa cgccagccgc tttgtgctga tgaacacaga aggtcaggat    1980
tgcggcttca acggcggcga aatgacgctg tcgctggcgg accgctggat tctggcggag    2040
ttcaaccaga ccatcaaagc gtaccgcgaa gcgctggaca gcttccgctt cgatatcgcc    2100
gcaggcattc tgtatgagtt cacctggaac cagttctgtg actggtatct cgagctgacc    2160
aagccggtaa tgaacggtgg caccgaagca gaactgcgcg gtactcgcca tacgctggtg    2220
actgtactgg aaggtctgct gcgcctcgcg catccgatca ttccgttcat caccgaaacc    2280
atctggcagc gtgtgaaagt actttgcggt atcactgccg acaccatcat gctgcagccg    2340
ttcccgcagt acgatgcatc tcaggttgat gaagccgcac tggccgacac cgaatggctg    2400
aaacaggcga tcgttgcggt acgtaacatc cgtgcagaaa tgaacatcgc gccgggcaaa    2460
ccgctggagc tgctgctgcg tggttgcagc gcggatgcag aacgtcgcgt aaatgaaaac    2520
cgtggcttcc tgcaaaccct ggcgcgtctg gaaagtatca ccgtgctgcc tgccgatgac    2580
aaaggtccgg tttccgttac gaagatcatc gacggtgcag agctgctgat cccgatggct    2640
ggcctcatca acaaagaaga tgagctggcg cgtctggcga aagaagtggc gaagattgaa    2700
ggtgaaatca gccgtatcga gaacaaactg gcgaacgaag gctttgtcgc ccgcgcaccg    2760
gaagcggtca tcgcgaaaga gcgtgagaag ctggaaggct atgcggaagc gaaagcgaaa    2820
ctgattgaac agcaggctgt tatcgccgcg ctgtaa                               2856
 
<210>25
<211>2634
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>丙氨酰-tRNA合成酶
 
<400>25
atgaaacact taacttctgc ggaagtgcgt caaatgtttt tggatttctt taaagaaaaa    60
ggacatgcgg tagagccaag cgcgtcatta gtgcctcatg aggatccttc actgctttgg    120
atcaacagcg gtgttgcgac gctgaaaaaa tattttgacg gccgtgtcgt gccggaaaat    180
ccaagaatcg taaacgctca aaaagcgatc agaacaaacg atatagaaaa tgtaggtaaa    240
actgcgcgcc atcacacttt ctttgaaatg ctcggaaact tttccatcgg cgattatttc    300
aaagaagaag ccattacatg ggcttgggag tttttaacga gcgacaagtg gattggcttc    360
gacaaagagc ttctctctgt tacggttcat cctgaagatg aagaggcata tgagttttgg    420
gcgaaaaaaa tcggtattcc tgaagaaaga attatccgtc tggaagggaa cttctgggat    480
atcggtgaag ggccgagcgg accgaatacg gaaatctttt acgaccgcgg tgaagcatac    540
ggtaatgatc cagaagatcc ggagctttac ccaggcgggg aaaacgaccg ttacctggaa    600
gtatggaacc ttgtgttctc agagttcaac cataaccctg acggcacgta cacaccgctt    660
ccaaagaaaa atattgatac aggcatgggt cttgaaagaa tggtgtctgt catccagaat    720
gttccgacaa actttgacac cgatttgttt gttccgatca ttaaagcaac agaatcgatt    780
tctggtgaaa catatggcaa agacaatgtg aaagacactg cgtttaaagt gattgctgac    840
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catcgtccgt tcatgtttga tttagtgccg gttgtcgcag aaatcatggc tgatttctat    1020
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gaaaaattag aagaagcttt ggcttctgta gaagattggg tgaaatccgt ttta          2634
 
<210>26
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<213>枯草杆菌
 
<220>
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<212>DNA
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<220>
<223>天冬氨酰-tRNA合成酶
 
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<220>
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<211>1458
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
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caagcctttt tggcattaga tgaagaaaga gcgcgcgcat acgcgaagga gcttgatgag    180
gcggttgacg gccgttctga gcacggtctt cttttcggta tgccgatcgg cgtaaaagat    240
aatatcgtaa caaaagggct gcgcacaaca tgctccagca aaattctcga aaactttgat    300
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gcaaaacctg aactgtaa                                                  1458
 
<210>32
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<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>甘氨酸tRNA合成酶,α亚单位
 
<400>32
atgaatattc aagacatgat tctaaccttg caaaagcatt ggtccagtca gggctgtgtg    60
cttatgcagg cttacgatgt agaaaaagga gccggcacga tgagcccgta tacatttttg    120
cgcagtatcg gtcctgagcc gtggaaagtg gcttatgtag agccttccag acgtccggca    180
gacggccgct acggggagaa cccgaacaga ctgtatcagc atcatcagtt ccaggtcatt    240
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agcggtcacc cagttgaatt gatcaaagag gaatcttatt tcttccgcat ggggaaatac    540
gcggatcgtc ttctgaaata ctatgaagaa aacccgacat tcattcagcc agaatcacgc    600
aaaaacgaaa tgattaataa ctttatcaaa cctggacttg aggatttggc agtatcacgt    660
accacttttg attggggcgt gaaggtgccg gaaaatccaa agcatgttgt atatgtttgg    720
attgacgcac tatttaacta tttaacggca ctcggttatg atacagaaaa tgatgagctt    780
tatcaaaaat attggcctgc cgatgttcat ttagtcggta aggagattgt acgattccat    840
actatttact ggccaattat gctgatggcg ctggatcttc cgctgccaaa gcaagtattc    900
gcgcatggct ggcttttgat gaaagacgga aaaatgtcga aatcaaaagg aaacgttgta    960
gatccggtta cattaattga acgctatggt ttagacgaac ttcgctatta cttgcttcgc    1020
gaagtgccgt tcggatcaga cggtgttttc acgccggaag gatttgttga gcgaatcaac    1080
tatgatttag cgaatgattt aggaaatcta ttgaatcgta ctgttgcgat gattaataag    1140
tattttgacg gacaaatcgg ttcttacaaa ggtgctgtta cggaatttga ccatacgctc    1200
acttctgttg ctgaagaaac agtgaaagct tatgagaaag caatggaaaa tatggagttc    1260
tcggtagcac tttcgacttt atggcagctc atcagccgca caaacaaata cattgatgag    1320
acagctccat gggtgcttgc gaaagatccg gcaaaagaag aagaattgcg atcagttatg    1380
tatcatctcg ctgaatcatt gcgtatttca gcggtactgc ttcagccatt cttaacaaaa    1440
acacctgaaa aaatgttcga gcagctgggc attactgatg aatctttaaa agcttgggac    1500
agcattacag ctttcggcca gctgaaagat acaaaagtac aaaaaggcga gccattgttc    1560
cctcgtttag aggcagaaga agaaattgct tacatcaaag ggaaaatgca aggttcagca    1620
ccagcgaaag aagaaacaaa agaagaagag cctcaagagg tcgatcgttt acctgaaatt    1680
acgattgatc aatttatgga tgtagagctt cgcgtagctg aggtcattga ggcagagcca    1740
gtgaaaaaag cagaccgttt attgaagctg cagcttgatc ttggttttga aaagcgccaa    1800
gtggtatccg gcattgcgaa gcattatacg cctgaagagc ttgttggaaa aaaactcgtt    1860
tgtgtaacaa atctaaaacc ggttaaactc agaggagagc tttctcaagg tatgatcctt    1920
gcaggagaag cagacggcgt tttaaaggtc gtatctatcg atcagtcgtt accaaaaggc    1980
acaagaatta aa                                                        1992
 
<210>40
<211>1032
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>苯丙氨酰-tRNA合成酶α亚单位
 
<400>40
atggaagaaa agctaaaaca gctggaacaa gaagctttag aacaagtaga agcggcaagc    60
tcattgaagg ttgtcaatga tattcgggtg caatatctcg gaaaaaaagg gccgattaca    120
gaagtgctgc gcggaatggg caagctttct gctgaggaac gtccaaaaat gggggcgctc    180
gcgaacgaag taagggagcg tattgccaat gcgattgctg acaaaaacga gaagcttgaa    240
gaagaggaaa tgaaacagaa gcttgcagga cagacaattg acgtcacgct gccggggaac    300
cctgttgcag tcggcggccg ccatccgctc actgttgtca ttgaagaaat tgaagattta    360
tttatcggta tgggctacac agtcgaggaa gggccagagg ttgaaacgga ttactacaac    420
ttcgaatcgc tcaatcttcc gaaagaacac ccagcgcgcg atatgcagga cagcttttac    480
atcacagagg aaactttgat gagaacgcaa acttctcctg tccaaacacg tacgatggaa    540
aagcatgaag gcaaaggtcc cgttaaaatc atttgcccgg gtaaagtata tcgccgtgat    600
aacgatgatg cgacgcactc tcaccaattt atgcaaattg aagggcttgt cgttgacaaa    660
aacatcagca tgagtgattt aaaaggaacg cttgaacttg ttgcgaaaaa aatgttcggg    720
caagaccgtg aaatcagact ccgcccaagc ttcttcccgt ttactgagcc ttcagtagaa    780
gtggatgtga catgctttaa atgcggtggg aacggctgct cagtatgtaa aggaacaggc    840
tggattgaaa tcctcggtgc cggaatggtt cacccgaacg tgcttaaaat ggctggcttt    900
gatccgaagg aatatcaggg cttcgcattc ggaatgggtg ttgagcgcat cgcgatgctg    960
aaatatggca ttgatgatat ccgccacttc tatacaaacg atgtcagatt tatttcgcag    1020
tttaaacagg cg                                                        1032
 
<210>41
<211>2412
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>苯丙氨酸tRNA合成酶,β亚单位
 
<400>41
atgtttgttt cttataaatg gttagaggat tatgttgatt taaaaggcat ggacccggct    60
gttcttgctg aaaaaattac aagagccggt attgaggttg aaggaattga atacaaagga    120
gaaggcatca aaggcgttgt catcggccat gtgctggagc gcgagcagca cccgaatgct    180
gataagctga ataagtgcct tgtggatatc ggagctgaag cccctgtaca aatcatttgc    240
ggcgcgccga atgtggataa gggacaaaaa gtcgcagttg caacagtcgg agcggtgctg    300
ccgggcaatt tcaaaatcaa aaaagccaag cttcgcggtg aagaatcaaa cggcatgatc    360
tgttccttac aggagcttgg tatcgaaagc aaacttgtgg cgaaggagta tgcagaaggc    420
attttcgtat tcccgaatga cgctgaaaca ggaagcgatg ccttagcggc tttacagctt    480
gacgatgcga ttcttgagct gggtttaacg ccaaaccgcg cggatgccat gaacatgctt    540
ggtgttgctt acgaggttgc ggcgatttta gacactgagg taaagcttcc ccaaacggat    600
tacccggctg cttcagaaca agcgtctgat tacatttcag tcaaaattga agatcaagaa    660
gcgaacccgc tgtacactgc aaaaatcatt aaaaatgtca cgattgctcc gtcaccgctt    720
tggatgcaga caaagctgat gaatgcaggc attcgtccgc acaacaacgt cgttgacatc    780
acaaattttg tcctgttgga atacggacag ccgcttcatg cgtttgatta tgacagattt    840
ggctctaagg aagtcgtagt aagaaaagca gctgagaatg aaatgatcgt aacacttgat    900
gatcaagaac gtaagctgtc tgccgatcac cttgtcatta caaacggaac gaaagcgcag    960
gccgttgccg gtgtcatggg aggagcagag tcagaggttc aggaagatac gaaaaccatt    1020
ttgcttgagg ctgcgtattt caacgggcag aaggttcgca aggcttccaa agaccttggt    1080
ttgagaagtg aatcaagcgt aagatttgaa aaaggaattg atccggcacg cgtacgtctt    1140
gcagcagaac gggctgcgca gctgatccat ctgtatgccg gcggtgaggt gcttgctgga    1200
acggttgagg aagatcacct gacaatcgaa gcaaataaca ttcacgtatc tgctgacaaa    1260
gtgagcagcg ttctaggcct gacgatcagt aaagaagaac tgatcagcat ttataaacgt    1320
ctcggtttta cggtcggtga agcggatgat cttctcgttg tgactgtccc atcacggcgc    1380
ggtgacatta caatagaaga ggatttaatc gaagaagcgg caagactgta cggctacgat    1440
aacattccgt ctacgcttcc tgagacagcg ggaactacag gcggattaac gccatatcag    1500
gcaaaacgcc gtaaagtcag acgcttcctt gaaggcgcag gcttatcaca agccatcact    1560
tactcactga caaacgagaa gaaagcgaca gcgtttgcga ttgaaaaatc actgaatact    1620
gtgcttgcgc ttccaatgag tgaagaaaga agcattctca gacacagtct tgttccaaat    1680
ctgcttgatt ctgtttctta caatcttgcg aggcagactg actcagttgc actgtacgaa    1740
gttggctccg ttttcctaac gaaggaagag gacacaaaac ctgttgaaac agaacgcgta    1800
gcaggagctg ttaccggatt atggcgcaag cagctatggc agggtgaaaa gaaaccagtt    1860
gatttctttg ttgtcaaagg aattgtggaa gggctgttag acaaactcaa cgtcctagac    1920
agcattgaat ttgtacagtc tgaacgcaaa cagctgcatc cgggcagaac agcgaacatt    1980
ttattgaatg gttctctgat cggcttcatc ggccaagtcc atccttcatt ggaaaaagaa    2040
ctggatataa aggaaacata cgtatttgag ctcgatcttc atgcgttgct cgcagcagaa    2100
acagcaccgc ttgtttacac ggcgattcca aaatatccgt ctgtgacacg tgatatcgct  2160
cttgtaacag ataaaaccgt cacaagcgga cagctcgaga gcgtcattaa agaggccggg  2220
ggcaagcttc tgaaagaggt aaccgtattt gacgtatacg aaggagagca tatggaggaa  2280
ggcaagaagt cagtcgcttt ctcactccag tatgtcaatc ctgaacaaac actgactgaa  2340
gaagaagtga caaaggcgca cagcaaagtg ctgaaagcgt tagaagacac atatcaagct  2400
gttttaagag gc                                                      2412
 
<210>42
<211>606
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>相似于苯丙氨酰-tRNA合成酶,ytpR
 
<400>42
atgaacgctt tttataataa agaaggtgtg ggagacacgc tcctgatctc tcttcaagat    60
gtgacacgcg aacaattagg ctatgaaaaa cacggcgacg tcgtcaaaat tttcaataac    120
gaaacaaaag aaacaacggg cttcaacatt ttcaatgcgt cttcttactt gaccattgat    180
gaaaacggcc ctgttgcgct ctcagaaaca ttcgtgcaag atgtgaatga gattttaaac    240
agaaacggcg ttgaagaaac attagtcgtt gatttatctc cgaagtttgt tgtgggttat    300
gtagaatcaa aagaaaaaca tccgaatgcg gataaattaa gcgtatgtaa agtcaacgta    360
ggagaagaaa cgcttcagat cgtctgcggc gcgcctaacg ttgaccaagg ccaaaaagtt    420
gtcgttgcca aagtcggtgc tgtgatgcct agcggacttg tcattaagga tgcagagctt    480
cgtggcgttc cgtcaagcgg gatgatctgc tcagcgaaag agcttgattt gccggatgcc    540
cctgctgaaa aaggaatcct tgtgttagaa ggagactatg aggcgggaga cgcatttcag    600
ttttag                                                               606
 
<210>43
<211>1692
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>脯氨酰-tRNA合成酶
<400>43
atgagacaaa gcttgacgct tattcctacg ctccgtgaag ttccagctga tgccgaagca    60
aaaagtcatc agcttcttct gagagcagga tttatcagac agaatacgag cggggtatac    120
agctatatgc ctcttgcgta taaggtgatt caaaacattc agcagattgt tcgagaggaa    180
atggagaaaa ttgatgccgt agaaatgctc atgcccgcat tgcagcaggc agagacatgg    240
caggaatcag gcagatggta tacgtatggt cccgaactga tgagactaaa agaccgtcat    300
ggccgtgaat ttgctttagg ggcaacgcat gaagaggtta tcacttcgct tgttcgcgat    360
gaggttaaat cttataagcg tctccctctg actctttatc aaattcagtc taagttcaga    420
gatgaaaaac gtcctcgctt cggtttgtta agaggccgcg aatttattat gaaggatgcg    480
tactctttcc atgcatctgc agagagcctg gatgaaacgt atcaaaaaat gtacgaggcc    540
tattctaata tttttgcccg ctgcggcatt aatgtaagac ctgttatcgc tgattcaggc    600
gcaatgggag gaaaggatac gcacgaattt atggcacttt ctgcgatcgg agaggatacg    660
attgcgtatt ctgatgaatc acagtacgcg gctaatatcg agatggctga agttcttcac    720
caggaagttc cttcagatga agagcctaaa gctctagaga aggttcatac gcctaacgtg    780
aaaacaatcg aagaactgac tgcgttctta caggtttcgg ctgaagcgtg cattaagtca    840
gtattgttta aagctgatga ccgttttgtc ttagtgcttg taagagggga tcatgaagtt    900
aacgatatta aagtgaaaaa cttgcttcat gcagaagttg tagagcttgc tacacatgaa    960
gaggtcattc agcagctcgg aacagagcca ggctttgtag gccctgtcgg tattcatcag    1020
gatgtggaag tatatgccga tcaagctgtg aaagcaatgg ttaatgctgt tgccggggca    1080
aatgaaggag atcatcatta taaaaatgtc aatgtgaatc gtgacgcgca aattaaagaa    1140
tttgctgatc ttcgttttat taaagaaggt gatccttcac cagacggcaa gggaacgatc    1200
cgttttgctg agggaatcga agtcggacaa gtctttaagc tcggaacacg ctattcagaa    1260
gcgatgaatg cgacatattt agatgaaaac ggacgcgcgc agccaatgct gatgggctgt    1320
tacggaatcg gtgtgtcaag aacgctttct gctattgctg aacagcatca cgacgaaaaa    1380
ggcttaatat ggccaaaaag cgttgcgccg tacgatcttc atattcttgc tttgaacatg    1440
aaaaacgatg ggcaaagaga gcttgctgaa aagctgtatg ccgatttaaa agcggaaggc    1500
tatgaagtgc tctatgatga ccgtgctgag cgtgccggcg taaaattcgc tgattcagat    1560
ttaatcggcc ttccaatccg catcactgtc ggaaaacgag ctgacgaagg aatcgtcgaa    1620
gtgaaaattc gtcaaactgg tgagtcaact gagatttcag tagacgaatt atctgcgttt    1680
atcagcaagc ag                                                        1692
 
<210>44
<211>1275
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>丝氨酰-tRNA合成酶,
 
<400>44
atgcttgata cgaaaatgct gagagcaaat tttcaagaaa ttaaagcaaa gcttgtacac    60
aaaggcgaag acttaactga ttttgataag tttgaggcgc tggatgatag acgaagagag    120
cttatcggca aggttgaaga gttaaaagga aaacgaaatg aagtttctca gcaggttgct    180
gtgctgaagc gtgagaaaaa agacgcggat cacattatta aagaaatgcg tgaagtcggc    240
gaggaaatta aaaagctcga tgaagaatta cggacagtgg aagctgagct tgatacaatc    300
ctgctctcaa tcccgaatat tccgcatgag tctgtacctg tcggtgaaac agaagacgac    360
aacgtagaag tgcgtaaatg gggtgaaaag ccttcatttg cttatgagcc gaagccgcac    420
tgggatattg cggatgagct gggtattctg gattttgaac gtgctgccaa agtaacagga    480
agccgtttcg tgttctataa aggcttaggt gctcgtctgg agcgtgcgct ttataacttt    540
atgcttgatc tgcatgtgga tgagtataac tacactgaag tgatcccgcc atatatggta    600
aaccgcgcaa gcatgacggg aacggggcag cttcctaaat ttgaagagga tgcatttaaa    660
atcagagaag aagattattt cttaattcca acggcggaag tgccgattac aaacatgcat    720
cgcgatgaaa tcctttcagg tgacagcctg ccgatcaact atgcggcatt cagtgcttgc    780
ttccgttctg aagctggttc agcaggacgt gacacacgcg gattaattcg tcagcaccaa    840
tttaataaag ttgagcttgt aaagtttgtg aagcctgaag attcttatga agaattagag    900
aaacttacaa accaagcaga acgggttctt cagctgcttg agcttccata ccgtgtcatg    960
agcatgtgta cgggtgactt aggctttacg gctgcgaaaa aatacgatat cgaagtttgg    1020
attccaagcc aagacacata tcgagaaatc tcttcttgca gcaacttcga agcgttccag    1080
gcgagacgtg cgaatattcg tttcagacgt gaagcgaaag gcaagcctga gcatgtacac    1140
acactgaacg gctcaggact ggcggttgga agaacagttg ctgctatctt agaaaattat    1200
cagcaggaag acggaagcgt tgtgattccg aaagtgcttc gtccttatat ggggaataga    1260
gaagtaatga aaccg                                                     1275
 
<210>45
<211>1929
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>苏氨酰-tRNA合成酶,主要
 
<400>45
atgtcagata tggtaaaaat cacatttcct gatggagcag tcaaggagtt tgcgaaagga    60
acaacaacag aagatatcgc ggcatccatc agtccgggat taaagaaaaa gtcattagcc    120
ggaaaactga acggaaaaga aatcgatttg agaacgccga tcaatgaaga cggtacagtg    180
gaaatcatta cagaaggctc agaagaaggt cttcaaatta tgcgccacag tgcggctcac    240
ctgctggctc aagcgattaa acgcatctac aaggatgtta aattcggcgt cggtccggtt    300
atcgaaaacg gtttttacta cgatgtagaa atggacgaag cgattacacc ggaggatctg    360
ccgaaaatcg agaaagaaat gaaaaaaatc gttaatgcga accttccgat cgttcgaaaa    420
gaagtcagcc gtgaagaagc gaaagcccgt tttgcggaaa tcggcgacga cctgaagctt    480
gaactattgg atgcgattcc tgaaggagaa accgtttcga tctatgagca aggcgaattc    540
tttgacctgt gccgcggcgt ccatgttcct tcaaccggaa aaatcaaaga atttaagctg    600
ttaagccttg caggcgcata ctggcgcggt gacagcaaaa accaaatgct tcagcgcgta    660
tatggtacag ctttcttcaa aaaagctgat cttgaagagc atcttcgtat gctagaagaa    720
gcgaaagaac gcgaccacag aaagcttggc aaagaattaa agctgttcgc gaactctcaa    780
aaagtcggac aaggcctgcc gctttggctg ccaaaaggcg caacaatccg ccgcgtcatc    840
gagcgctaca ttgtcgataa agaaatcagc ctcggctatg agcacgtata cacacctgtg    900
ctaggcagca aagagctgta tgaaacatca ggacactggg atcattatca ggaaggcatg    960
ttccctccga tggaaatgga caatgaaaca cttgtattgc gtccgatgaa ctgtccgcac    1020
catatgatga tttacaaaca agacattcac agttaccgcg agcttccgat tcgtattgca    1080
gagcttggaa cgatgcaccg ctatgaaatg tcaggtgcgc tgtcaggact tcaacgggta    1140
cgcggaatga cgttaaatga tgcacacatc tttgtgcgcc cggatcaaat taaggatgag    1200
tttatccgta cagtccgttt aatccaggat gtttatgaag acttcggttt aagtgattac    1260
acattccgtc tgtcttaccg cgatccggaa gatacagaga aatattttga tgacgatgaa    1320
atgtggaaca aagcgcaatc catgctgaaa gaggcaatgg atgaaatcgg ccacgactat    1380
tacgaagcag aaggtgaagc ggcattctac ggacctaaac ttgatgttca ggtgaaaact    1440
gcgatcggaa aagaagaaac actgtctacg gttcagcttg atttcttatt gccggaacgt    1500
ttcgacctga catacatcgg tgaggacggc aagcagcacc gtccggttgt cattcacaga    1560
ggtgtcgttt caacaatgga acgctttgtt gctttcttaa tcgaagaaca caaaggcgcg    1620
ctgccgacat ggcttgcacc ggttcagttc caagtcatcc cggtttctcc ggctgtgcat    1680
ttagactacg cgaaaaaagt gcaggaacgc ctgcaatgtg aaggcctgcg tgttgaagtc    1740
gacagccgcg atgaaaaaat cggctacaaa atccgtgaag cgcaaatgca aaaaatcccg    1800
tacatgctgg tggtcggtga ccaagaagca gaaaacggag cggtaaacgt gcgtaaatac    1860
ggagaacaga actctgaaac catttcactt gatgagtttg tgaaaaaggc agtagctgaa    1920
gcgaaaaaa                                                            1929
 
<210>46
<211>1914
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>苏氨酰-tRNA合成酶,次要
 
<400>46
atgagcaaac atgtacacat tcagcttccg gacggacaga tccaggaata tccgaaaggc    60
atcacaatca aagaagcggc tggttcgatc agttccagtc tgcaaaagaa ggcggccgca    120
ggtcaggtca acggcaagct tgttgatctc agtttcaagc tggaggagga tgctgagctt    180
tcgattgtca cactcgattc acaagaaggc ttgcaggtcg ttcgccacac aacagcgcac    240
gtgctggccc aagcagtaaa acggctgtac ggcgaagtgt cattgggggt agggcctgtg    300
attttagacg gcttctacta tgacatgaag ctggggaaaa gcttggcatc aggagactta    360
gaggccatcg aaaaagaaat gaaaaacata ataaatgaga accttgaaat caaacgtata    420
gaggtttctt acgaagaagc tgaagagctg tttgcacaaa aagacgagcg gctcaagctt    480
gagattttaa aggatattcc gcgcggggag gatatcacac tgtaccagca aggggaattc    540
gttgacctgt gccgagggcc gcatcttcct tctacaggga tgatcaaggc gttcaaactg    600
acaagagtat caggcgctta ttggcgcgga gacagcaaaa atgaagtcct gcagcgggtg    660
tacggggttg cgtttcaaaa gaaaaaagat ttggatgcgc acctgcatat gctagaagaa    720
gcggcaaaac gagaccatcg caagctcggc aaacagttag ggctgtttat gttttctgaa    780
gaagcgccgg ggatgccgtt ttatttgccg aaagggcaga ttgtccgcaa tgagctggag    840
cgcttctcgc gtgagctgca aacaaatgcc ggctacgatg aggtgcgtac gccgtttatg    900
atgaatcagc ggttatggga gcagtcaggc cattgggacc attatcgcga caatatgtac    960
ttttcagaag tggatgatac aagattcgca atgaagccga tgaattgccc cggccacatg    1020
ctcatcttta aaaacagcct gtattcttat cgggatctgc cgattcgcat ggcggaattc    1080
ggacaggtgc accgccatga atacagcggc gctttaaacg gaatgcttcg cgttcggacg    1140
ttctgtcagg atgacgccca tattttcgtt cgggaggatc agattgagag tgagatcaaa    1200
gaagcgattc ggctgattga tgaggtatat cggacatttg gtttcgagta ttctgttgag    1260
ctttcgactc gcccggagga ttcattaggc gatgacagcc tttgggaagc gtcggaacgt    1320
gccttagcac gcgtccttga ggagcttggc ctctcttatg agatcaatga aggcgatggg    1380
gcgttttacg ggccgaaaat tgatttccat ataaaagatg ccctgaaacg gagccaccaa    1440
tgcgcgacaa ttcagcttga ttttcaaatg ccggaaaaat ttgatttaac atatatcaac    1500
gaactcaatg agaaggttcg tcccgttgtc atccacagag cggttttcgg ctcaatcgac    1560
cgtttcttcg gcattttgat cgagcattac ggtggggctt ttccagtctg gctcgcaccg    1620
atccaggttc aaatcatacc ggtttcgcac gttcacttag actattgcag aaaagtgcag    1680
gcggagctga agcaggcggg gataagagcc ggcattgatg agcgcaatga gaagctcggc    1740
tataaaatca gagaatcgca ggtgcaaaaa attccgtacg tgctggtgct tggagatcat    1800
gaggagcagg agaatgcggt aaacgtccgc cgattcggac atcagcagaa tgaacacgtt    1860
cctttccaaa cttttaaaga taaacttgtg aaacaggtgg aaaatcgagg catg          1914
 
<210>47
<211>990
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>色氨酰-tRNA合成酶
 
<400>47
atgaaacaaa cgattttttc aggcattcag ccaagcggct cagtgacgct cggcaactat    60
atcggtgcaa tgaagcagtt tgtcgaactg cagcatgatt ataacagcta tttttgcatc    120
gtcgatcagc atgcgataac tgttcctcaa gaccggcttg agcttagaaa gaatatccgc    180
aatctcgcgg cgctttactt agctgtcgga cttgatccag aaaaagcaac attgtttatt    240
cagtcagagg tccccgcaca tgcgcaggcc ggatggatga tgcagtgtgt cgcctatatc    300
ggcgagcttg agcggatgac tcaatttaag gacaaatcca aaggcaatga agctgtcgtc    360
tccggcctgt taacatatcc gccgctgatg gccgctgata ttctgctgta cggaacggat    420
cttgtacctg tcggcgagga tcaaaagcag caccttgagc tgacgcggaa tcttgcagaa    480
cgcttcaaca aaaaatacaa cgacatcttt acgattccgg aagtgaaaat tccaaaagtc    540
ggtgcacgta tcatgtctct gaatgatccg ctgaagaaaa tgagcaaatc tgatccgaat    600
cagaaagctt atattacatt gctggatgag ccgaagcagc ttgaaaagaa aatcaaaagc    660
gcagtaacgg attctgaagg cattgtcaaa tttgataagg aaaacaaacc gggcgtttcc    720
aaccttctta caatttattc aatcctcggc aatacgacaa ttgaagagct tgaagcaaag    780
tacgaaggaa aaggctacgg cgagtttaaa ggtgatttgg cagaagtcgt agtgaacgca    840
ttaaaaccga tccaggaccg ctattacgag ctgatagaat ctgaagaatt agaccggatt    900
cttgatgaag gcgcggaacg agcgaatcgg acagcaaaca aaatgctgaa aaaaatggag    960
aatgccatgg gtcttggaag aaaaagacgc                                     990
 
<210>48
<211>1266
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>酪氨酰-tRNA合成酶,主要
 
<400>48
atgactaact tacttgaaga cttatccttc cgcggattga ttcagcaaat gacagatgaa    60
gaagggttaa ataaacagct gaatgaagaa aaaatccgct tgtactcagg ctttgaccct    120
acagcagaca gcttgcatat cggacacctg ctgcctattt taacacttcg ccgttttcag    180
cttgcagggc atcatccgat tgcgcttgtg ggcggcgcga cgggcctcat cggtgatcca    240
agcggaaaaa aagcagagcg tacattaaac actgctgaca tcgtatccga atggtcccaa    300
aaaatcaaaa accagctgtc cagatttcta gattttgaag cagcagaaaa cccagctgtc    360
atcgcgaaca actttgactg gatcggcaaa atgaatgtga tcgatttcct tcgtgacgtt    420
ggtaaaaatt tcggcatcaa ttacatgctg gcaaaagata cggtcagctc aagaattgaa    480
tccggcatct cgtacacgga attcagctac atgattcttc aatcttatga tttcttaaat    540
ctttacagag acaaaaactg taaactgcaa atcggcggaa gcgatcagtg gggcaacatc    600
acagcgggtc ttgaactgat cagaaaatca gaagaagaag gagcaaaagc gtttggccta    660
acgattccgc ttgtcacaaa agcagacggc acgaagttcg gaaaaacgga aggcggcgcg    720
atctggcttg ataaagaaaa aacatcgcca tatgaattct atcaattctg gatcaacaca    780
gacgaccgtg acgttgtcaa atacttgaaa tacttcacgt tcctttcaaa agaggaaatt    840
gaagcatacg ctgaaaaaac agaaacggcg ccagaaaaac gtgaagcgca aaaacgcctg    900
gcagaagaag tgacatcact tgttcacgga cgcgaggcgc tggagcaagc catcaacatc    960
tcccaagcgc tgttcagcgg caatattaaa gagctttctg ctcaagacgt aaaagtaggc    1020
tttaaagatg ttccttctat ggaagttgac agcacccaag agctttcact tgtagatgtg    1080
ttggtgcaat ctaaattatc tccttctaaa cgccaagcgc gtgaagacat ccaaaacgga    1140
gctgtttaca ttaacggtga acgccagacg gaaataaatt ataccctatc aggtgaagac  1200
cgcatcgaaa accaatttac tgttctgcgc cgcgggaaga aaaaatactt ccttgtgacg  1260
tataaa                                                             1266
 
<210>49
<211>1239
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>酪氨酰-tRNA合成酶,次要
 
<400>49
atgatgagaa catttgagca gctcacagcg tcacaacaaa aagaggtaga aagacagctt    60
cagctataca tgacaggcgc ccacgaagtc ataccgccgg aggaattaaa ggcaaagctc    120
gtgaaatcaa tttccacggg cacgccgctt aaaattaagc tcggattaga tccgtctgca    180
ccggatgtac atttgggcca tacggttgtg ttaaataagc ttcgccaatt tcaagaaaac    240
ggccacattg tccagctgtt aattggggat ttcacaggaa aaattggtga tccgaccgga    300
aaatcggcag ccagaaagca actgactgat gaagaagttc agcacaatgc caaaacctac    360
tttgagcaat tcggaaaagt gcttgatcca gaaaaagtcg agcttcacta taactcaaaa    420
tggctgaaaa cattgaatct agaagatgtc attgaattag cagggaaaat aacggtagcc    480
cgcctgatgg agcgcgacga ctttgaagaa cgcatcgcca tgcaaaaacc aatctcactg    540
catgaattct tttacccatt gatgcagggc tatgattctg tcgttctcga aagtgatatt    600
gaattaggcg gaacggatca gcatttcaat gtcctcatgg gacggcattt ccaagaacga    660
tacaacaaag aaaaacaagt cgtcatcctt atgccgctct tggaaggctt ggatggcgtc    720
gagaaaatgt cgaagtcgaa acacaactac attggcatta acgaacatcc aaacgacatg    780
tacggaaaaa cgatgtcact gcccgacagc ctgatgaaaa agtacatcca cttggcgaca    840
gacttagagc ttgaagagaa aaaacagctc gtaaaagact tagaaaccgg cgccgttcat    900
ccgcgtgatg ccaaaatgct tttagccaga acaatcgtcc gaatgtatca cggagagaaa    960
gcagcagaag ctgccgaaca ctcgtttaaa acagtctttc aggaaaacag cctgccggaa    1020
gatataccgg ccgtaaactg gaaaggcgaa aaaacgatag cgatgattga tctgctcgtc    1080
aagctaaagc tcctctcttc gaagagcgag gcgcgccgca tgattcaaaa cggaggtgta    1140
cgcatcgacg gagagaaagt aacagatgtt cacgccaaag cagagataag agagaatatg    1200
atcatccaag tcggcaaacg caagttttta aagctccaa                           1239
<210>50
<211>2640
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>缬氨酰-tRNA合成酶
 
<400>50
atggaaacga atgaacaaac aatgccgacg aaatatgatc cggcagcggt tgaaaaagac    60
cgatatgatt tttggctaaa aggcaaattt tttgaagcgg gcagtgacca gacaaaagag    120
ccatactctg ttgtcatccc gccgccaaac gtaacaggga gacttcacct tggccacgca    180
tgggacacaa cgctgcaaga cattgtaaca agaatgaaac gcatgcaggg ctatgatgtg    240
ctgtggcttc ctggcatgga ccacgccggc atcgcgacac aggctaaagt ggaggcgaaa    300
cttcgtgaag aaggcaaatc ccgctacgat ttaggccgtg aaaaattcct cgaagaaacg    360
tggaagtgga aggaagaata tgctgacttt attcgcagcc agtgggcgaa attaggtctt    420
ggcctagatt attcccgtga acgttttacg ctggatgaag gcttgagcaa agcggtaagg    480
gaagtattcg ttaagcttta tgaaaaaggc ctgatctaca gaggcgaata tattattaac    540
tgggacccag cgacaaaaac agccctatcc gacattgagg tgatttacaa ggatgttcaa    600
ggcgcattct atcatatgag ctatccgctt gctgacggtt caggctcaat tgaaattgcg    660
acgacacgtc ctgaaacaat gctcggtgat acagctgttg ccgttcaccc tgaagacgag    720
cgctataaac accttatcgg aaaaacggtg atcctgccga ttgtaaatcg tgaaattccg    780
attgtcggtg atgactatgt tgatatggaa tttggttcag gtgccgtgaa aattacgcct    840
gctcatgatc cgaacgactt cgagcttggc aaccgccaca atttagaacg catccttgtc    900
atgaatgaag atggcacgat gaatgaaaat gcgctccaat atcaaggtat ggatcgtttt    960
gaatgccgca aaaagctcgt gaaagattta caggaggcgg gagttctctt caagatcgag    1020
gatcatatgc actctgtcgg ccatagtgaa cgaagcgggg ctgttgtgga gccttatctt    1080
tctacacaat ggtttgtgcg catgcagccg cttgctgatg cagcgattga gctcgaaaaa    1140
aaagaagaaa aggtcaactt tgtgcctgac cgtttcgaaa aaacgtattt acactggatg    1200
gaaaatatcc gcgactggtg tatctcccgt caattgtggt ggggccatcg tattcctgcc    1260
tggtatcata aagaaacagg cgagctatat gtcggacttg aagcgccgga agacagcgaa    1320
aattgggaac aggatacaga cgtactggat acatggttca gttctgcgct atggcctttc    1380
tccacaatgg gctggcctga tgtaacggct gaagacttta aacgctacta tccgacagat    1440
gttctcgtga cagggtacga tatcattttc ttctgggtat cacgcatgat tttccaaggc    1500
attgaattta caggcgagcg cccgttcaaa gatgttttaa tccacggctt aatccgtgac    1560
gagcaaggcc ggaaaatgag taaatctctt ggcaacggtg tcgacccgat ggatgtgatt    1620
gacaagtacg gagccgattc tctgcgttat ttccttgcga ctggaagctc tcctggccag    1680
gatctgcgct tcagctatga aaaagtggaa tcgacctgga attttgccaa taaaatttgg    1740
aacgcctccc gttttgcatt aatgaatatg gatggcatga cgtacgatga gcttgatctg    1800
tcaggtgaaa agtcagtcgc tgacaagtgg attttaacgc gattaaatga aacgatcgag    1860
cacgtgaccc agcttgctga ccgatatgaa tttggtgaag taggacgcca tttatataac    1920
tttatttggg atgatttctg tgattggtat attgaaatgg cgaagcttcc gctttatgga    1980
gaagacgaag cggctaagaa aactacccgt tccatccttg cttacgtact tgatcaaacg    2040
atgcgtctgc tccatccgtt tatgccattc ttaacggagg aaatttggca gcaccttcct    2100
caccaagggg aatcgattac agtaagtcaa tggcctgcag tagtgccgga gcataccgat    2160
actgaagcgg cagctgacat gaagcttctt gttgagctga tccgttctgt gcgcaatatc    2220
cgcagtgaag tcaatacgcc aatgagcaag caggttgaac tgtacattaa aacaagcaca    2280
gacgaaatag cgtcccgcct cgaagcgaac cgttcatatg ttgaacgctt tacgaatccg    2340
agcgtgctta aaatcggcac cgatattgag gctgttgata aggcgatgac ggccgttgtc    2400
tcaggagcag aggttattct tccgcttgaa ggcttaatca atattgatga agaaattgcc    2460
cgtctgcaaa aagaatttga taaactgaca aaagaagttg agcgtgtcca aaagaaactt    2520
ggaaatgaag gatttatgaa aaaagcgcct gcacacgtaa ttgatgaaga acgtgaaaaa    2580
gaaaaagatt atgtggcgaa gcgtgacgct gttcaaaaac gaatggctga gctgaagggt    2640
 
<210>51
<211>1431
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>谷氨酰-tRNA酰胺转移酶,亚单位B
 
<400>51
ttgaactttg aaacggtaat cggacttgaa gtccacgttg agttaaaaac aaaatcaaaa    60
attttctcaa gctctccaac gccattcggc gcggaggcga atacgcagac aagcgttatt    120
gacctcggat atccgggcgt cctgcctgtt ctgaacaaag aagccgttga attcgcaatg    180
aaagccgcta tggcgctcaa ctgtgagatc gcaacggata cgaagtttga ccgcaaaaac    240
tatttctatc ctgacaaccc gaaagcgtat cagatttctc aatttgataa gccaatcggc    300
gaaaacggct ggatcgaaat tgaagtcggc ggcaaaacaa aacgcatcgg catcacgcgc    360
cttcatcttg aagaggatgc cggaaaactg acgcatacgg gcgacggcta ttctcttgtt    420
gacttcaacc gtcaaggaac gccgcttgtt gagatcgtat cagagccgga catccgcacg    480
ccggaagaag cgtacgcata tcttgaaaag ctgaaatcca tcatccaata tacaggcgtt    540
tctgactgta aaatggaaga aggctcactt cgctgtgacg ccaatatctc tcttcgtccg    600
atcggccaag aggaattcgg cacaaaaaca gaattgaaaa acttgaactc ctttgcgttt    660
gttcaaaaag gccttgagca tgaagaaaaa cgccaggagc aggttcttct ttccggcggc    720
gtcatccagc aagaaactcg ccgttatgat gaagcaacga agaaaaccat tcttatgcgt    780
gtcaaagagg gatctgacga ctaccgttac ttcccagagc cagatctagt cgagctctac    840
attgatgatg aatggaagga acgcgtaaaa gcaagcattc ctgagcttcc ggatgagcgc    900
cgcaagcgtt atatcgaaga gcttggcttg cctgcatatg acgcaatggt tctgacgctg    960
acaaaagaaa tggctgattt cttcgaagaa accgttcaaa aaggcgctga agctaaacaa    1020
gcgtctaact ggctgatggg tgaagtgtca gcttacctaa acgcagaaca aaaagagctt    1080
gccgatgttg ccctgacacc tgaaggcctt gccggcatga tcaaattgat tgaaaaagga    1140
accatttctt ctaagatcgc gaagaaagtg tttaaagaat tgattgaaaa aggcggcgac    1200
gctgagaaga ttgtgaaaga gaaaggcctt gttcagattt ctgacgaagg cgtgcttctg    1260
aagcttgtca ctgaggcgct tgacaacaat cctcaatcaa tcgaagactt taaaaacgga    1320
aaagaccgcg cgatcggctt cctagtcgga cagattatga aagcgtccaa aggacaagcc    1380
aacccgccga tggtcaacaa aattctgctt gaagaaatta aaaaacgcta a             1431
 
<210>52
<211>291
<212>DNA
<213>枯草杆菌
 
<220>
<223>谷氨酰-tRNA酰胺转移酶,亚单位C
 
<400>52
atgtcacgaa tttcaataga agaagtaaag cacgttgcgc accttgcaag acttgcgatt    60
actgaagaag aagcaaaaat gttcactgaa cagctcgaca gtatcatttc atttgccgag    120
gagcttaatg aggttaacac agacaatgtg gagcctacaa ctcacgtgct gaaaatgaaa    180
aatgtcatga gagaagatga agcgggtaaa ggtcttccgg ttgaggatgt catgaaaaat    240
gcgcctgacc ataaagacgg ctatattcgt gtgccatcaa ttctggacta a             291
 
<210>53
<211>31
<212>DNA
<213>人工序列
<400>53
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<210>54
<211>34
<212>DNA
<213>人工序列
<400>54
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<210>55
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>55
ctgcctgtct cgaggctgat agcagttatc      30
 
<210>56
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>56
caactcgagg ctggtcggac aaacacctag      30
 
<210>57
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>57
tgcgaattcc ggatgtaagg agaacggctc      30
 
<210>58
<211>32
<212>DNA
<213>人工序列
<400>58
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<210>59
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>59
ggtggatccc ctcgccggca atagttaccc     30
 
<210>60
<211>31
<212>DNA
<213>人工序列
<400>60
aatctagact ttcgttatac aaattttaac c   31
 
<210>61
<211>31
<212>DNA
<213>人工序列
<400>61
tgtaggatcc aatatgggca gaaaacacat g   31
 
<210>62
<211>31
<212>DNA
<213>人工序列
<400>62
atatctagat tccactctgt gtaccagtag c   31
 
<210>63
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>63
gttagctcct tcggtcctcc  20
 
<210>64
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>64
gtaactggct tcagcagagc  20
 
<210>65
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<400>65
ctgccacatc gtctaggctg c 21
 
<210>66
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>66
caggagtcca aataccagag   20
 
<210>67
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>67
cccttgcc tatactgtggac   20
 
<210>68
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>68
gttacaatag cgacggagag   20
<210>69
<211>27
<212>DNA
<213>人工序列
<400>69
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<210>70
<211>26
<212>DNA
<213>人工序列
<400>70
ctgcgaattc atcttcatgg tgaacc   26
 
<210>71
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
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cattgtcatt agttggctgg          20
 
<210>72
<211>28
<212>DNA
<213>人工序列
<400>72
gcaagaattc aaaatccatc ttcatcgg 28
 
<210>73
<211>29
<212>DNA
<213>人工序列
<400>73
gtgactgagg atccgctagt tccagatcg 29
 
<210>74
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>74
ctcttggatc ccttcatcat tctatcacac 30
 
<210>75
<211>25
<212>DNA
<213>人工序列
<400>75
gcagattggg atggagttcc cgtac      25
 
<210>76
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<400>76
ttacagcttc acaaagcgga tttc       24
 
<210>77
<211>26
<212>DNA
<213>人工序列
<400>77
tgctgcaaga gctgtcggaa ataaag     26
 
<210>78
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<400>78
aagaagaaaa gaaagaagct aaag       24
 
<210>79
<211>31
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>引物
<400>79
gtgcctcgag gattaagcat tggtaactgt c      31
 
<210>80
<211>34
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>引物
<400>80
tattctcgag acattaacct agaaagcact aagg    34
 
<210>81
<211>32
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>引物
<400>81
ctgctatgaa ttcgagtagt acacgtttca cc      32
 
<210>82
<211>28
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>引物
<400>82
ctgaattctg gtcggacaaa cacctagc           28
 
<210>83
<211>29
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>引物
<400>83
cggagaattc tccgttacaa acgtcagag    29
 
<210>84
<211>29
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>引物
<400>84
actgaattct ggtcggacaa acacctagc    29
 
<210>85
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>引物
<400>85
ctcgaggctg aattcagtta tcatttaagg    30
 
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<211>31
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<220>
<223>引物
<400>86
gggaattcgg acaaacacct agctttttgc g   31
 
<210>87
<211>1394
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>DNA序列
<400>87
gaattcgagt agtacacgtt tcacctgttt gaagagagtc tgcggtgctg ggagcagata  60
acgggcaatg tggaatggac ttcggagcag ctgaccgaac tggaaaaaag taggctcagc  120
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gctgacgcgg aatcttgcag aacgcttcaa caaaaaatac aacgacatct ttacgattcc  780
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<211>1270
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<213>人工序列
<220>
<223>DNA序列
<400>88
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acggttcatt cgtccctttt ttacagggga agaatgagcc ttttttatta tgttttaaga  120
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accagaattc                                                         1270
 
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<211>1531
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<213>人工序列
<220>
<223>DNA序列
<400>89
gaattcagtt atcatttaag gattttacag cactcgtgtt atttatatta ttacaatttt  60
actggaaaaa agaatgtttt ttcatgatga caattggtta taattgattt ataatggagc  120
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attcaatcct cggcaatacg acaattgaag agcttgaagc aaagtacgaa ggaaaaggct    1200
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ctcgcaaaaa gctaggtgtt tgtccgaatt c                                   1531

Claims (16)

1.重组载体,该重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点、且
在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,
上述重组载体在突变宿主中使用,所述突变宿主是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。
2.权利要求1所述的重组载体,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
3.权利要求1或2所述的重组载体,该重组载体具有质粒、噬菌体或逆转录转座子的形态。
4.突变宿主细胞,该突变宿主细胞是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度,
上述突变宿主细胞经重组载体转化后使用,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点、且
在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因。
5.权利要求4所述的突变宿主细胞,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
6.权利要求4或5所述的突变宿主细胞,其中带有突变的宿主细胞为细菌、酵母、动物细胞或植物细胞。
7.权利要求4或5所述的突变宿主细胞,其中带有突变的宿主细胞为细菌或酵母。
8.权利要求6或7所述的突变宿主细胞,其中细菌为芽孢杆菌属细菌。
9.使编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的外来基因表达来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的方法,该方法包括下述步骤:
准备重组载体的步骤,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点、且在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,在上述重组载体的、在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点插入有期望的外来基因;
准备突变宿主细胞的步骤,所述突变宿主细胞是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度;
用上述重组载体转化上述突变宿主细胞得到转化体的步骤;
培养上述转化体来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的步骤。
10.在宿主细胞内稳定维持目标重组载体的方法,该方法包括:
使上述宿主细胞中所含的、编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失或者使其表达降低至宿主细胞无法生长的程度,之后以上述宿主细胞作为突变宿主细胞;
使上述目标重组载体在可以表达的状态下含有编码氨酰tRNA合成酶的基因;
用在可以表达的状态下含有上述编码氨酰tRNA合成酶的基因的目标重组载体转化上述突变宿主细胞。
11.权利要求10所述的方法,其中上述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点。
12.权利要求9~11中任一项所述的方法,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
13.权利要求9~12中任一项所述的方法,其中带有突变的宿主细胞为细菌、酵母、动物细胞或植物细胞。
14.权利要求9~12中任一项所述的方法,其中带有突变的宿主细胞为细菌或酵母。
15.权利要求13或14所述的方法,其中细菌为芽孢杆菌属细菌。
16.权利要求9~15中任一项所述的方法,其中外来基因所编码的蛋白为选自氧化还原酶、转移酶、水解酶、磷酸化酶、裂解酶、异构酶、合成酶或修饰酶的一种酶。
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