CN101849002A - 在细胞中稳定保持外来基因的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及使外来基因表达来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的方法,该方法包括:在可以表达的状态下插入任意外来基因,以准备在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体的步骤;准备使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失的突变宿主细胞等的步骤;用重组载体转化突变宿主细胞得到转化体的步骤;培养转化体,以制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的步骤。根据本发明,可以提供:在不使用抗生素、且对培养基组成没有限制的情况下能够在宿主细胞中维持重组DNA克隆载体的新手段;和利用该手段来制备外来基因所编码的蛋白或肽的方法。
Description
技术领域
本发明涉及在细胞中稳定保持外来基因的方法。更详细而言,本发明涉及该方法中使用的、包含编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体、用于表达编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的突变宿主细胞、以及表达编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的外来基因来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的方法。需要说明的是,作为相关申请的相互参照,本申请主张2007年7月13日申请的日本特愿2007-1839831号的优先权,其全部内容作为公开而特别引用于此。
背景技术
将重组DNA技术应用于实际中,并尝试着利用所得的转化细胞来生产目标分子时,通常转化细胞内的染色体外基因(即其中所含的目标外来基因)的存在极不稳定,产生非常难以生产目标分子的问题。
实验室中通常所用的克隆和表达载体通常是多拷贝重组载体,通过每个细胞基因组的多个重组载体来确保向其后代稳定遗传。但是,向这些重组载体中导入外来基因会给细胞的增殖循环期间带来各种程度的不稳定性。在工业生产步骤中,有时需要1000L培养物,需要50世代以上的世代交替后的1016个以上的细胞。因此,为了确保细胞中重组载体的存在、进而确保外来基因的表达,人们希望使细胞中的重组载体稳定直至发酵槽内的培养结束。
已知有几种使携带外来基因的重组载体在细胞中稳定的方法。
其中的一种方法包含以下内容:先使抗生素耐性基因包含在重组载体中,之后向培养基中加入适当的抗生素。保持有含抗生素耐性基因的重组载体的细胞被筛选,未保持该重组载体的细胞不被筛选而被排除。
通过插入抗生素耐性基因使重组载体稳定,这通常在实验室中进行,但由于下述理由,在工业规模的生产中并不优选。
(i)使用抗生素耐性菌株有可能给环境带来危险。
(ii)培养中所必需的抗生素量使生产成本显著增加。
(iii)在用于人和动物的物质的生产中应避免使用抗生素。
补充染色体的营养要求突然突变的方法也是已知的重组载体稳定化方法之一(参照Genetics.1989 May;122(1):19~27(以下,有时还称作非专利文献1)和Curr Genet.1989 Sep;16(3):159~63(以下,有时还称作非专利文献2),这些内容作为公开而特别引用于此)。在该方法中,必需严格限制发酵培养基的组成,在不向培养基中加入宿主细菌所必需的营养的情况下进行发酵。而且,通过营养共生,在重组载体消失后细胞仍有可能增殖。
发明内容
发明所要解决的课题
如上所述,上述两种筛选方法依赖于培养基的特殊处理。这样的限制会导致发酵步骤的费用增加、以及为了提高生产率而能够采取的筛选自由度受限。
因此,人们迫切希望开发在不使用抗生素、且对培养基组成没有限制的情况下能够维持重组DNA克隆载体的其他筛选方法。
因此,本发明的目的在于提供:在不使用抗生素、且没有限制的情况下能够维持重组DNA克隆载体的新手段和利用该手段来制备外来基因所编码的蛋白或肽的方法。
解决课题的方法
本发明人等为了解决上述课题进行各种研究,发现根据带有氨酰tRNA合成酶基因的染色体外基因与使该氨酰tRNA合成酶活性产生缺失的染色体突变宿主细胞的互补性,在不使用抗生素、且不限制培养基组成的情况下能够维持重组DNA克隆载体,从而完成了本发明。本发明基于仅确保含有染色体外基因的细胞生存,所述染色体外基因带有氨酰tRNA合成酶基因。
本发明如下。
(1)重组载体,该重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点、且
在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,
上述重组载体在突变宿主中使用,所述突变宿主是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。
(2)(1)所述的重组载体,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
(3)(1)或(2)所述的重组载体,该重组载体具有质粒、噬菌体或逆转录转座子的形态。
(4)突变宿主细胞,该突变宿主细胞是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度,
上述突变宿主细胞经重组载体转化后使用,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点、且
在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因。
(5)(4)所述的突变宿主细胞,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
(6)(4)或(5)所述的突变宿主细胞,其中带有突变的宿主细胞为细菌、酵母、动物细胞或植物细胞。
(7)(4)或(5)所述的突变宿主细胞,其中带有突变的宿主细胞为细菌或酵母。
(8)(6)或(7)所述的突变宿主细胞,其中细菌为芽孢杆菌属细菌。
(9)使编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的外来基因表达来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的方法,该方法包括下述步骤:
准备重组载体的步骤,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点、且在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,在上述重组载体的、在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点插入有期望的外来基因;
准备突变宿主细胞的步骤,所述突变宿主细胞是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度;
用上述重组载体转化上述突变宿主细胞得到转化体的步骤;
培养上述转化体来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的步骤。
(10)在宿主细胞内稳定维持目标重组载体的方法,该方法包括:
使上述宿主细胞中所含的、编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失或者使其降低至宿主细胞无法生长的程度,之后以上述宿主细胞作为突变宿主细胞;
使上述目标重组载体在可以表达的状态下含有编码氨酰tRNA合成酶的基因;
用在可以表达的状态下含有上述编码氨酰tRNA合成酶的基因的目标重组载体转化上述突变宿主细胞。
(11)(10)所述的方法,其中上述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点。
(12)(9)~(11)中任一项所述的方法,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
(13)(9)~(12)中任一项所述的方法,其中带有突变的宿主细胞为细菌、酵母、动物细胞或植物细胞。
(14)(9)~(12)中任一项所述的方法,其中带有突变的宿主细胞为细菌或酵母。
(15)(13)或(14)所述的方法,其中细菌为芽孢杆菌属细菌。
(16)(9)~(15)中任一项所述的方法,其中外来基因编码的蛋白为选自氧化还原酶、转移酶、水解酶、磷酸化酶、裂解酶、异构酶、合成酶或修饰酶的一种酶。
(17)(1)~(3)中任一项所述的重组载体在制备外来基因所编码的蛋白或肽中的应用。
(18)(4)~(8)中任一项所述的突变宿主细胞在制备外来基因所编码的蛋白或肽中的应用。
发明效果
根据本发明,在不使用抗生素、且不限制培养基组成的情况下可以维持重组DNA克隆载体,其结果,在工业生产中也可以使细胞中的重组载体稳定至发酵槽内的培养结束。
附图简述
图1显示质粒回收溶液的电泳结果。
具体实施方式
[重组载体]
本发明涉及重组载体,该重组载体满足下述(1)~(3):(1)在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因;(2)具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点;且(3)在突变宿主中使用,所述突变宿主是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。
(1)在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体。
本发明的重组载体在可以表达的状态下含有编码氨酰tRNA合成酶基因的基因。该重组载体在可以在期望宿主细胞内表达的状态下含有编码氨酰tRNA合成酶基因的基因,用于转化该宿主细胞。因此,本发明的重组载体只要具有能够实现所述宿主细胞的转化的形态即可,例如可以具有质粒、噬菌体、逆转录转座子的形态。
氨酰tRNA合成酶对应于20种氨基酸,有20多种(部分有多种),例如丙氨酸所对应的氨酰tRNA合成酶称作丙氨酰tRNA合成酶(丙氨酰-tRNA合成酶或丙氨酸-tRNA合成酶)。氨酰tRNA合成酶的具体例子有:例如色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
将色氨酸所对应的氨酰tRNA合成酶称为色氨酰tRNA合成酶,色氨酰tRNA合成酶缺失的细胞株由于无法进行含有色氨酸的蛋白的合成,所以无法增殖。
氨酰tRNA合成酶基因包含在原核生物到真核生物的所有生物中。例如,大肠杆菌中包含:丙氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:1)、精氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:2)、天冬酰胺酰-tRNA合成酶(SEQID NO:3)、天冬氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:4)、半胱氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:5)、谷氨酰胺-tRNA合成酶(SEQ ID NO:6)、谷氨酸-tRNA合成酶(SEQ ID NO:7)、甘氨酸-tRNA合成酶(α亚单位)(SEQ ID NO:8)、甘氨酸-tRNA合成酶(β亚单位)(SEQ ID NO:9)、组氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:10)、异亮氨酰-tRNA合成酶(SEQ IDNO:11)、亮氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:12)、赖氨酸-tRNA合成酶(组成型)(SEQ ID NO:13)、赖氨酸-tRNA合成酶(诱导型)(SEQ IDNO:14)、甲硫氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:15)、苯丙氨酸-tRNA合成酶(α亚单位)(SEQ ID NO:16)、苯丙氨酸-tRNA合成酶(β亚单位)(SEQ ID NO:17)、预测赖氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:18)、脯氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:19)、丝氨酰-tRNA合成酶(在硒代半胱氨酰-tRNA上负载丝氨酸)(SEQ ID NO:20)、苏氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:21)、色氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:22)、酪氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:23)、缬氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:24)。
已知枯草杆菌中包含:丙氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:25)、精氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:26)、天冬酰胺酰-tRNA合成酶(SEQID NO:27)、天冬氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:28)、半胱氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:29)、谷氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:30)、谷氨酰-tRNA酰胺转移酶(亚单位a)(SEQ ID NO:31)、甘氨酸tRNA合成酶(α亚单位)(SEQ ID NO:32)、甘氨酸tRNA合成酶(β亚单位)(SEQID NO:33)、组氨酰tRNA合成酶(hisS)(SEQ ID NO:34)、异亮氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:35)、亮氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:36)、赖氨酸tRNA合成酶(组成型)(SEQ ID NO:37)、组氨酰tRNA合成酶(hisZ)(SEQ ID NO:38)、甲硫氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:39)、苯丙氨酸tRNA合成酶(α亚单位)(SEQ ID NO:40)、苯丙氨酸tRNA合成酶(β亚单位)(SEQ ID NO:41)、相似于苯丙氨酰-tRNA合成酶(ytpR)(SEQ ID NO:42)、脯氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:43)、丝氨酰-tRNA合成酶(在硒代半胱氨酰-tRNA上负载丝氨酸)(SEQ IDNO:44)、苏氨酰-tRNA合成酶(主要)(SEQ ID NO:45)、苏氨酰-tRNA合成酶(次要)(SEQ ID NO:46)、色氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:47)、酪氨酰-tRNA合成酶(主要)(SEQ ID NO:48)、酪氨酰-tRNA合成酶(次要)(SEQ ID NO:49)、缬氨酰-tRNA合成酶(SEQ ID NO:50)、谷氨酰-tRNA酰胺转移酶(亚单位b)(SEQ ID NO:51)、谷氨酰-tRNA酰胺转移酶(亚单位c)(SEQ ID NO:52)等。
本发明的重组载体在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因。因此,除氨酰tRNA合成酶基因以外,为了形成可以表达该基因的状态而使用大肠杆菌(Escherichia coli)或枯草杆菌(Bacillus subtilis)等细菌作为宿主时,通常还具有例如启动子、操纵基因区(包含启动子、操纵基因和核糖体结合区(SD区))、起始密码子、编码生产目标蛋白的DNA、终止密码子、终止区和能够复制质粒的单元等。使用酵母等真菌细胞或动物细胞作为宿主细胞时,通常具有启动子、起始密码子、编码信号肽和生产目标蛋白的DNA、以及终止密码子等。本发明的重组载体根据需要可以包含增强子等顺式元件、编码生产目标蛋白的DNA的5’侧或3’侧的非翻译区、剪接接合部、聚腺苷酸化位点、能够复制的单元、同源区域、筛选标记。上述元件只要是用于表达编码生产目标蛋白的基因的宿主所对应的元件即可,没有特别限定,可以根据技术常识来筛选。
需要说明的是,对筛选标记没有特别限定,例如当用于基因表达的宿主为细菌时,可以使用耐药性基因(例如,氨苄青霉素耐性基因、新霉素耐性基因、环己酰亚胺耐性基因、四霉素耐性基因等);当宿主为细菌以外的例如酵母等时,还可以使用以营养要求性基因(例如HIS4、URA3、LEU2、ARG4等)等为代表的公知的各种筛选标记。
(2)本发明的重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点。如下所述,该位点是使用本发明的宿主细胞,在可以表达的状态下能够插入编码欲生产的蛋白的外来基因的位点。
“在可以表达的状态下能够插入基因”是指通常编码蛋白的基因的表达要求用于将其基因信息转录到mRNA上的RNA聚合酶识别位点和用于将mRNA的信息翻译成肽的核糖体结合区存在于编码该蛋白的基因的起始密码子的上游。归纳起来,“在可以表达的状态下具有基因”是指将其基因的起始密码子到终止密码子转录到mRNA中所必需的序列存在于起始密码子的上游,并且用于将其mRNA的信息翻译成肽的序列存在于起始密码子的上游。此处所说的“起始密码子”并不限于原染色体上的该基因的起始密码子序列,只要是发挥起始密码子功能的密码子均可。此处所说的“核糖体结合区”例如只要是不被集中在具有包含原核生物的5’-aaaggagg-3’的共有序列的序列中、且为核糖体能够识别的序列即可,并不限于原染色体上作为该基因的核糖体结合区的序列,只要是核糖体能够识别的序列即可使用。
本发明的重组载体的构建可以按照DNA重组的一般方法、例如文献Molecular Cloning(1989)(Cold Spring Harbor Lab)中记载的方法来进行。该文献内容作为公开特别引用于此。
作为载体,质粒载体的例子有:例如pRS413、pRS415、pRS416、YCp50、pAUR112或pAUR123等YCp型大肠杆菌-酵母穿梭载体;pRS403、pRS404、pRS405、pRS406、pAUR101或pAUR135等YIp型大肠杆菌-酵母穿梭载体;来自大肠杆菌的质粒(例如pBR322、pBR325、pUC18、pUC19、pUC119、pTV118N、pTV119N、pBluescript、pHSG298、pHSG396或pTrc99A等ColE系质粒;pACYC177或pACYC184等p1A系质粒;pMW118、pMW119、pMW218或pMW219等pSC101系质粒等);来自枯草杆菌的质粒(例如pUB110、pTP5等);pHY300PLK等大肠杆菌-枯草杆菌穿梭载体。噬菌体载体的例子有:λ噬菌体(例如Charon 4A、Charon21A、EMBL4、λgt100、gt11、zap)、ψX174、M13mp18、M13mp19等。作为逆转录转座子,例如有Ty因子等。此外,还可以使用以融合蛋白的形式表达的表达载体、例如pGEX系列(ファルマシア制)、pMAL系列(Biolabs社制)。
(3)本发明的重组载体在突变宿主中使用,所述突变宿主是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。有关该突变宿主在后面阐述。
[宿主细胞(突变宿主)]
本发明涉及突变宿主细胞,该突变宿主细胞满足下述(4)~(6):(4)使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度;(5)具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点;且(6)用在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体转化后使用。
(4)本发明的突变宿主细胞,其突变前的宿主细胞例如有:大肠杆菌或枯草杆菌等细菌;酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、粟酒裂殖酵母(Saccharomyces pombe)、毕赤酵母(Pichia pastoris)等酵母;sf9或sf21等昆虫细胞;COS细胞、中国仓鼠卵巢细胞(CHO细胞)等动物细胞;烟草等植物细胞。优选为大肠杆菌或枯草杆菌等细菌和酵母。
通常,细胞为了自身增殖而具有编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因。相对于此,在本发明中,使细胞本来所具有的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失或者使该基因表达降低可以按照以下的方法进行。
[基因缺失(失活)]
“失活”一词包含妨碍染色体基因中一个以上基因的功能表达的方法。失活通过核酸基因序列的缺失、置换(例如突变)、抑制和/或插入等来进行。在几个实施方式中,突变微生物优选包含发生稳定且不可逆的失活的一个以上基因的失活。
(由插入引起的失活)
此处使用的“插入序列”一词是指被导入微生物染色体内的DNA序列。在几个实施方式中,插入序列可以是被转化的细胞的基因组中已经存在或不存在的序列(即、相同或不同的序列)。并且,在另一实施方式中,插入序列有时包含筛选标记。在又一实施方式中,插入序列有时包含两个同源框(homoeobox)。
此处使用的“同源框”是指与微生物染色体的序列同源的核酸序列。更具体而言,根据本发明,“同源框”是指与失活的基因相邻的编码区或与部分基因具有约80~100%序列同源性、约90~100%序列同源性或约95%~100%序列同源性的上游或下游区域。这些序列以置换微生物染色体的一部分为目的。同源框并非用以限定本发明,其包含约1碱基对(bp)~20万碱基(kb)。优选同源框包含:约1bp~10.0kb;1bp~5.0kb;1bp~2.5kb;1bp~1.0kb和0.25kb~2.5kb。同源框包含约10.0kb、5.0kb、2.5kb、2.0kb、1.5kb、1.0kb、0.5kb、0.25kb和0.1kb。在几个实施方式中,筛选标记的5’和3’末端与同源框相邻,其中同源框包含与该基因的编码区近邻的核酸序列。
此处使用的“筛选标记”一词是指能够在宿主细胞中表达的核苷酸序列,通过筛选标记的表达,在对应的筛选因子的存在下、或不存在必须营养素的条件下,包含表达基因的细胞可以生长。此处使用的“可筛选标记”和“筛选标记”是指能够在宿主细胞中表达的核酸(例如基因),包含载体的这些宿主的筛选可以简单地进行。对该筛选标记的例子没有限定,有抗微生物剂等。因此,“筛选标记”是指宿主细胞赋予整合有目的插入DNA或发生了其它反应的记号的基因。通常,筛选标记是指为了能够区别转化时未接受外来序列的细胞与包含外来DNA的细胞而赋予宿主细胞抗菌耐性或代谢优点的基因。筛选标记的例子有:抗微生物耐性标记等(参照例如ampR;phleoR;specR;kanR;eryR;tetR;cmpR;和neoR;例如Guerot-Fleury,Gene,167:335~337[1995];Palmeros等人,Gene 247:255~264[2000];和Trieu-Cuot等人,Gene、23:331~341[1983],这些内容作为公开而特别引用于此)。在几个特别优选的实施方式中,本发明提供氯霉素耐性基因(例如存在于pC194上的基因、以及存在于地衣芽孢杆菌基因组中的耐性基因)。该耐性基因在本发明和与整合在染色体上的表达盒和整合质粒的染色体扩增有关的实施方式中特别有用。
例如,当色氨酰tRNA合成酶基因(trpS)为失活基因时,DNA构建体包含筛选标记作为插入序列,具有抑制其活性的trpS基因。筛选标记插入trpS编码序列部分的内侧。DNA构建体与宿主染色体中的trpS基因本质上具有相同的序列,在双重交叉的情况下,trpS基因由于筛选标记的插入而失活。
(由缺失引起的失活)
在几个优选实施方式中,失活通过缺失来实现。在几个优选实施方式中,基因通过同源重组而缺失。例如,在几个实施方式中,当缺失的基因为trpS时,使用包含插入序列的DNA构建体,所述插入序列具有与同源框的两侧相邻的筛选标记。同源框在染色体trpS基因的核酸侧翼区具有相同的核苷酸序列。DNA构建体与微生物宿主染色体的同源序列一致,在双重交叉的情况下,trpS基因从宿主染色体中被切除。
此处使用的基因的“缺失”一词是指编码序列全体的缺失、一部分编码序列的缺失、或包含侧翼区的编码序列的缺失。只要染色体中残留的序列不发挥缺失前的生物活性即可,缺失可以是部分缺失。编码序列的侧翼区可以在5’和3’末端包含约1bp~约500bp。侧翼区可以大于500bp,但根据本发明优选该区不包含能够失活或缺失的其它基因。最终,缺失基因事实上是没有功能的。简而言之,“缺失”一词以1个以上的核苷酸或氨基酸残基分别被除去(即不存在)的核苷酸或氨基酸序列的变化来定义。
此处使用的“侧翼序列”是指位于对象序列的上游或下游的序列(例如基因A-B-C,基因B位于A和C基因序列的侧翼(位于侧面))。在优选实施方式中,插入序列位于同源框两侧的侧面。在几个实施方式中,侧翼序列仅存在于一方侧(3’侧或5’侧),但在优选实施方式中,其位于序列两侧的侧面。各同源框的序列与微生物染色体中的序列同源。这些序列的目的在于在微生物染色体中整合新的构建体、以及用插入序列置换微生物染色体的一部分。在优选实施方式中,筛选标记的5’和3’末端位于包含一部分失活染色体片段的多核苷酸序列的侧面。
(由突变引起的失活)
在另一实施方式中,通过基因突变而发生失活。基因突变的方法有多种,对其没有限定,可以列举出:位点特异性突变、随机突变发生和gapped-duplex法(例如参照Moring等人、Biotech.2:646[1984];以及Kramer等人、Nucleic Acids Res.,12:9441[1984],这些内容作为公开而特别引用于此)。
在优选实施方式中,在染色体上的至少一个密码子中利用突变诱发来产生突变。在又一实施方式中,突变DNA序列与野生型序列具有40%以上、45%以上、50%以上、55%以上、60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上或98%以上的同源性。在另一实施方式中,使用公知的突变诱发程序、例如UV照射、亚硝基胍等化学突变剂在体内产生突变DNA。
即使在氨酰tRNA合成酶活性发生缺失的染色体突变内,也优选使用氨酰tRNA合成酶基因自身的缺失。但是,只要使用带有对应基因的染色体外基因,调节氨酰tRNA合成酶生合成的其它基因也可使用。当为氨酰tRNA合成酶基因缺失株时,染色体外基因中适合插入的基因对应于该氨酰tRNA合成酶基因。
为了避免具有氨酰tRNA合成酶的染色体外基因与染色体的突变氨酰tRNA合成酶基因之间的同源性重组的可能性,优选使目标氨酰tRNA合成酶基因实质上从染色体上缺失。
(5)和(6)的重组载体与上述(1)和(2)的重组载体相同。
[功能]
使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失的突变宿主细胞、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度的突变宿主细胞由于无法表达编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因,所以保持原样,已经无法增殖。
相对于此,通过包含在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体,可以维持增殖。即,氨酰tRNA合成酶的缺失可以通过向染色体外基因上导入该氨酰tRNA合成酶基因来互补。但是,万一细胞失去了该染色体外基因,则该细胞已经变得无法增殖。
因此,本发明的突变宿主细胞在上述关系的基础上,在培养基中不含抗生素、或者不排除或不限制满足特定营养要求性的营养成分的情况下,能够使插入有外来基因的重组载体稳定,并将其维持在宿主细胞中。因此,本发明的突变宿主细胞具有以下优点、即可以适用于工业规模生产所使用的任意培养基中。
并且,本发明的突变宿主细胞用于表达编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因。本发明的宿主细胞包含在可以表达的状态下在上述突变宿主中具有上述编码氨酰tRNA合成酶的基因的重组载体,并且,该重组载体具有在可以表达的状态下能够插入外来基因的位点,通过在该位点插入期望外来基因,可以使插入有期望外来基因的重组载体稳定,并将其维持在宿主细胞中。并且,使外来基因表达,可以用于生产外来基因所编码的期望蛋白。
[制备蛋白或肽的方法]
本发明涉及使编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的外来基因表达来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的方法。该方法包括以下步骤。
(10)准备重组载体的步骤,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点、并且在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,在上述重组载体的、在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点插入有期望外来基因;
(11)准备突变宿主细胞的步骤,所述突变宿主细胞使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度;
(12)用上述重组载体转化上述突变宿主细胞得到转化体的步骤;
(13)培养上述转化体来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的步骤。
(10)准备重组载体的步骤
在该步骤中准备重组载体,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点、并且在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,在上述重组载体的、在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点插入有期望外来基因。上述重组载体为之前说明的本发明的重组载体。在本发明的制造方法中准备重组载体,其中在该重组载体的、在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点插入有期望外来基因。具体而言,在适当的载体中插入编码氨酰tRNA合成酶的基因和期望外来基因。基因的插入可以按照常规方法进行。所有基因均在可以表达的状态下插入。
“关于插入两个基因的一般说明”
向重组载体中插入氨酰tRNA合成酶基因和任意外来基因,这可以按照DNA重组的一般方法、例如文献Molecular Cloning(1989)(Cold Spring Harbor Lab.)中记载的方法来进行。该文献的全部内容作为公开而特别引用于此。各基因在重组载体中的插入位置只要是不参与重组载体复制的位置即可,基本上可以是任意位置,插入位置根据使用的载体而不同。例如,可使用的重组载体的例子有:来自大肠杆菌的质粒(例如pBR322、pBR325、pUC18、pUC19、pUC119、pTV118N、pTV119N、pBluescript、pHSG298、pHSG396或pTrc99A等ColE系质粒;pACYC177或pACYC184等p1A系质粒;pMW118、pMW119、pMW218或pMW219等pSC101系质粒等);来自枯草杆菌的质粒(例如pUB 110、pTP5等);pHY300PLK等大肠杆菌-枯草杆菌穿梭载体。
例如,以大肠杆菌-枯草杆菌的穿梭载体pHY300PLK质粒为例,可以在多克隆位点、即EcoRI位点插入氨酰tRNA合成酶基因,同样在多克隆位点、即BamHI位点插入任意的外来基因。以下稍详细说明本例。
以具有任意外来基因的生物染色体DNA为模板,采用PCR扩增来扩增包含从启动子位点到终止密码子的该任意外来基因,将其与用限制酶BamHI消化pHY300PLK而得到的DNA片段进行连接反应,使用所得的连接反应混合物来转化大肠杆菌,筛选包含在pHY300PLK的BamHI位点根据目的插入有包含从启动子位点到终止密码子的任意外来基因的质粒的转化体,由该转化体制备质粒。接着将如上制备的质粒用限制酶EcoRI消化,切断该质粒。以枯草杆菌168(Bacillus subtilis 168)株的染色体DNA为模板,利用PCR扩增来扩增包含从启动子位点到终止密码子的氨酰tRNA合成酶基因,之后与来自被EcoRI切断的、已构建好的质粒的DNA片段进行连接反应,使用所得的连接反应混合物来转化大肠杆菌,筛选包含在构建好的质粒的EcoRI位点根据目的插入有氨酰tRNA合成酶基因的质粒的转化体,由该转化体可以制备目的质粒。
(11)准备突变宿主细胞的步骤
在该步骤中准备突变宿主细胞,所述突变宿主细胞是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。该突变宿主细胞是上述说明的本发明的突变宿主细胞。其制备方法如下。
作为突变宿主细胞的制备程序,除了将存在于宿主染色体上的目的基因按计划删除或使之失活的方法以外,还可以列举:赋予随机的基因的删除或失活突变、之后利用适当方法进行基因解析或蛋白生产性评价的方法。
删除目的基因或使之失活时,例如可以使用同源重组的方法。即,将包含一部分目的基因的DNA片段克隆到适当的质粒载体中,将所得的环状重组质粒或直链上的DNA片段整合到宿主细胞内,通过目的基因的一部分区域的同源重组截断亲本微生物基因组上的目的基因,使之失活。或者,采用PCR等方法构建导入有由碱基置换或碱基插入等引起的失活突变的目的基因、或者包含目的基因的外侧区域但不包含目的基因的直链状DNA片段等,之后将其整合到亲本微生物细胞内,使在亲本微生物基因组的目的基因内的突变位置的外侧两个区域、或目的基因外侧的两个区域发生两次交叉同源重组,从而可以与基因组上的删除或失活的目的基因的基因片段进行置换。
(12)得到转化体的步骤
使用步骤(10)中制备的重组载体来转化步骤(11)中制备的突变宿主细胞。利用重组载体进行的宿主细胞的转化也可以按照常规方法来实施。
对向宿主细胞中导入(转化)重组载体的方法没有特别限定,根据导入的宿主细胞的种类或重组载体的形态,可以适当筛选转化法、转染法、感受态细胞法、电穿孔等方法。
此处使用的“宿主细胞”是指具有为新导入的DNA序列发挥宿主或表达媒体作用的能力的细胞。
需要说明的是,对重组载体在宿主细胞内的存在形式没有特别限定,可以是被插入染色体中或者被置换整合,还可以以质粒状态存在。
需要说明的是,重组载体中所含的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因与在突变宿主细胞中缺失的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因、或者表达被降低至宿主细胞无法生长的程度的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因为同种的基因。例如,在突变宿主细胞中,缺失的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因、或者表达被降低至宿主细胞无法生长的程度的编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因为丙氨酰tRNA合成酶基因时,重组载体中所含的也是丙氨酰tRNA合成酶基因。
(13)制备蛋白或肽的步骤
培养步骤(12)中得到的转化体来制备外来基因所编码的蛋白或肽。转化体的培养要根据宿主细胞的种类,使用适当的培养基,在适当的培养条件下实施。作为宿主细胞,只要能够生产外来基因所编码的蛋白或肽即可,可以是野生型宿主细胞,也可以是施行了突变的宿主细胞。具体可以列举:枯草杆菌等芽孢杆菌(Bacillus)属细菌或大肠杆菌(Escherihia)属细菌、梭菌(Clostridium)属细菌、或酵母等,其中优选芽孢杆菌属细菌。从全基因组信息已明确、基因工程学、基因组工程学技术已确立的角度以及具有将蛋白分泌生产到菌体外的能力的角度考虑,特别优选枯草杆菌。
本说明书中所说的“芽孢杆菌属”包含通常已知的芽孢杆菌属所包含的所有种类,对其没有限定,意思是指例如枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、迟缓芽孢杆菌(Bacillus lentus)、嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillus stearothermophilus)、嗜碱芽孢杆菌(Bacillus alkalophilus)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)、蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)、短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)、克劳氏芽孢杆菌(Bacillus clausii)、耐盐芽孢杆菌(Bacillus halodurans)、巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)、凝结芽孢杆菌(Bacillus coagulans)、环状芽孢杆菌(Bacillus circulans)和苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)等。需要说明的是,芽孢杆菌属在分类上接受重新编组,该属还包含重新分类的种。例如有:地芽孢杆菌(Geobacillus)属、耐碱芽孢杆菌(Alkalibacillus)属、双芽孢杆菌(Amphibacillus)属、Amylobacillus属、厌氧芽孢杆菌(Anoxybacillus)属、Goribacillus属、Cerasibacillus属、薄壁芽孢杆菌(Gracilibacillus)属、Halolactibacillus属、Halalkalibacillus属、Filobacillus属、Jeotgalibacillus属、需盐芽孢杆菌(Salibacillus)属、Oceanobacillus属、Marinibacillus属、Lysinibacillus属、Lentibacillus属、解脲芽孢杆菌(Ureibacillus)属、Salinibacillus属、Pontibacillus属、Piscibacillus属、Paraliobacillus属、枝芽孢杆菌(Virgibacillus)属、Salsuginibacillus属、Tenuibacillus属、Thalassobacillus属、Thermalkalibacillus属、Tumebacillus属等,这些菌属也包含在本说明书所说的芽孢杆菌属中。
例如,当宿主细胞为枯草杆菌时,作为培养所使用的培养基的种类,只要是包含适当的氮源、碳源、矿物质、且本发明的枯草杆菌宿主繁殖、可以生产目标蛋白的培养基即可。例如,通过重组枯草杆菌168株来生产外来基因所编码的蛋白或肽时,可以使用混合有葡萄糖或果糖等单糖类;蔗糖、麦芽糖等双糖类或可溶性淀粉等多糖类等作为碳源的培养基;或者混合有蛋白胨类、大豆提取物、酵母提取物、鱼肉提取物、玉米浆(CSL)、金属盐等作为氮源的培养基等。
此外,培养基的pH值只要是所用的重组生物体能够生育的范围的pH值即可,但是,例如为枯草杆菌时,优选调节至pH6.0~8.0,培养条件可以是在15~42℃、优选28~37℃下振荡或通气搅拌培养2~7天。
上述培养后回收目标蛋白或肽。目标蛋白或多肽的回收方法可以按照常规方法进行。回收的目标蛋白或多肽根据需要还可以进一步按照常规方法进行纯化。
按照本发明的制造方法生产的目标蛋白或肽的例子有:例如作为食品用、药品用、化妆品用、洗涤剂用、纤维处理用、医疗检查药用等有用的酶或生理活性因子等蛋白或多肽。
对目标蛋白或肽基因没有特别限定,包含洗剂、食品、纤维、饲料、化学品、医疗、诊断等各种产业用酶或生理活性肽等。除产业用酶的功能以外,还包含氧化还原酶(Oxidoreductase)、转移酶(Transferase)、水解酶(Hydrolase)、磷酸化酶(Phosphorylase)、裂解酶(Lyase)、异构酶(Isomerase)、合成酶(连接酶/合成酶)、修饰酶(Modifyingenzyme)等。可以进一步具体列举:纤维素酶、琼脂分解酶、γ-环糊精合成酶等糖分解酶基因等。
[在宿主细胞内稳定维持重组载体的方法]
本发明涉及在宿主细胞内稳定维持目标重组载体的方法。该方法包括以下(20)~(22)。
(20)使上述宿主细胞中所含的、编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使其表达降低至宿主细胞无法生长的程度,以上述宿主细胞作为突变宿主细胞;
(21)在可以表达的状态下使上述目标重组载体含有编码氨酰tRNA合成酶的基因;
(22)用在可以表达的状态下含有上述编码氨酰tRNA合成酶的基因的目标重组载体转化上述突变宿主细胞。
(20)以宿主细胞作为突变宿主细胞的方法如上述突变宿主细胞的说明中所述。
(21)有关在可以表达的状态下使重组载体含有编码氨酰tRNA合成酶的基因,也如本发明的重组载体的说明中所述。上述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点,这一点也如上所述。
(22)关于突变宿主细胞的转化,也如制备上述蛋白或肽的方法的说明中所述。
本发明包含在宿主细胞内稳定维持目标重组载体的方法,在该方法中使用上述本发明的突变宿主细胞作为宿主细胞。本发明的这种方法是使上述细胞中所含的染色体外基因稳定的方法,例如,使氨酰tRNA合成酶产生缺陷的染色体突变是指该氨酰tRNA合成酶基因的至少一部分的缺失,而染色体外基因是指该氨酰tRNA合成酶基因。
根据本发明,例如在不存在抗生素所带来的筛选压力或不需要施加不含特定氨基酸限制的培养基的情况下,即可得到染色体外基因在完全培养基中稳定的转化细胞株。并且,根据本发明所述的方法,缺失了染色体外基因的细胞无法增殖。因此,本发明还涉及:通过氨酰tRNA合成酶基因和具有确实表达产业上有用的蛋白的要素的染色体外基因转化的细胞。本发明还涉及使用转化细胞来制造产业上有用的蛋白的方法,其特征在于:在完全培养基中培养通过本发明的染色体外基因转化的细胞。该染色体外基因能够进一步带有该蛋白的基因。
此处使用的“蛋白基因”一词是指参与肽链生成的DNA的染色体片段,在编码蛋白的区中可以包含也可以不包含先行或后续的区。
下述实施例是将具有色氨酰tRNA合成酶基因的质粒在氨酰tRNA合成酶之一、即色氨酰tRNA合成酶中具有缺陷的枯草杆菌中的稳定性与相同质粒在色氨酰tRNA合成酶中不具有缺陷的枯草杆菌中的稳定性比较后进行显示。并且,还将具有色氨酰tRNA合成酶基因的质粒在前述氨酰tRNA合成酶之一、即色氨酰tRNA合成酶中具有缺陷的枯草杆菌中的稳定性与不具有色氨酰tRNA合成酶基因的同种质粒在色氨酰tRNA合成酶中不具有缺陷的枯草杆菌中的稳定性比较后进行显示。
并且还展示了:带有色氨酰tRNA合成酶基因的这些重组载体还可用于表达编码同时存在于同一载体上的纤维素酶、琼脂分解酶的基因等的例子。
实施例
以下,通过实施例进一步详细说明本发明。
[实施例1]向枯草杆菌株中导入具有色氨酰tRNA合成酶基因的染色 体外基因
按下述方法构建带有色氨酰tRNA合成酶基因的染色体外基因、即质粒pDATS14。首先,以通用枯草杆菌-大肠杆菌的穿梭质粒、即pHY300PLK(ヤクルト社制)为模板,使用引物A和B进行PCR扩增。所得扩增片段用限制酶XhoI消化后,通过连接两末端形成环状质粒。使用该质粒转化大肠杆菌HB101株。由转化体制备质粒,将其作为pDA2。另一方面,以枯草杆菌ISW1214株的染色体为模板,使用引物C和D得到包含色氨酰tRNA合成酶基因及其邻近区域的DNA片段。用限制酶XhoI消化该DNA片段,并与预先用限制酶XhoI消化的pDA2连接。使用所得连接物转化大肠杆菌HB101株。由所得转化体制备质粒,将该质粒命名为pDATS14。接下来,使用pDATS14,通过原生质体转化法(参照参考文献Mol.Gen.Genet.168:111~115(1979)Chang,S.和Cohen,S.N.、其内容作为公开而特别引用于此)转化来自两种蛋白酶(碱性蛋白酶E、中性蛋白酶E)存在缺陷的枯草杆菌ISW1214株的突变株(参照参考文献Appl.Microbiol.Biotechnol 65:583~592(2004)Hatada,Y.等人、其内容作为公开而特别引用于此),得到在染色体外带有色氨酰tRNA合成酶基因的枯草杆菌转化体。
[实施例2]用于破坏枯草杆菌株染色体上的色氨酰tRNA合成酶基因 的DNA片段的构建
以枯草杆菌ISW1214株的染色体为模板,使用引物E和F,得到包含色氨酰tRNA合成酶基因及其邻近区域的约2.5kb的DNA片段。将其用限制酶EcoRI和SalI消化。之后与预先通过EcoRI和SalI消化的通用性质粒pUC18连接,得到质粒pTSAF。另一方面,以通用性质粒pC194为模板,使用引物G和H,得到包含来自葡萄球菌的氯霉素耐性基因及其邻近区域的约1.6kb的DNA片段。再以pTSAF为模板,使用引物I和J进行PCR反应,得到DNA片段。将该DNA片段和包含氯霉素耐性基因及其邻近区域的约1.6kb的DNA片段用限制酶BamHI和XbaI消化后进行连接,然后用该连接物转化大肠杆菌HB101株。由转化体制备质粒,作为色氨酰tRNA合成酶基因破坏用质粒pINTTS。以pINTTS为模板,使用引物K和L进行PCR反应,得到直链状的色氨酰tRNA合成酶基因破坏用DNA片段。
[实施例3]枯草杆菌株染色体上的色氨酰tRNA合成酶基因的破坏
使用上述色氨酰tRNA合成酶基因破坏用DNA片段,采用感受态细胞法进一步转化上述带有染色体外色氨酰tRNA合成酶基因的转化体,得到获得了氯霉素耐性的转化体。由该转化体制备染色体DNA。使用引物M和N、或O和P,对该染色体DNA进行PCR反应,确认染色体的色氨酰tRNA合成酶基因所编码的区域与来自色氨酰tRNA合成酶基因破坏用DNA片段的氯霉素耐性基因发生了置换,将该菌株作为色氨酰tRNA合成酶基因缺失株、即DTS1451(pDATS14)株。
[实施例4]向DTS1451株中导入具有卡那霉素耐性基因的质粒
以枯草杆菌ISW1214株的染色体为模板,使用引物C和D,得到包含色氨酰tRNA合成酶基因及其邻近区域的DNA片段。用限制酶XhoI消化该DNA片段,之后与预先用限制酶XhoI消化的pDA2连接。使用所得连接物转化大肠杆菌HB101株。由所得转化体制备质粒,将该质粒命名为pDATS13。以通用性质粒pUB110为模板,使用引物Q和R,得到包含卡那霉素耐性基因及其邻近区域的DNA片段。用EcoRI消化该DNA片段,之后以pDATS14为模板,使用引物S和T采用PCR法进行扩增,再与通过EcoRI消化而得到的DNA片段连接。使用所得连接物转化大肠杆菌HB101株。由所得的具有卡那霉素耐性的转化体制备质粒,将质粒命名为pDATSK。使用pDATSK,采用原生质体转化法转化具有pDATS14的DTS1451株,利用包含30μg/mL卡那霉素的再生培养基(组成:琥珀酸钠8%、琼脂1%、酪蛋白氨基酸0.5%、酵母提取物0.5%、磷酸二氢钾0.15%、磷酸氢二钾0.35%、葡萄糖0.5%、硫酸镁0.4%、牛血清白蛋白0.01%、甲硫氨酸0.001%、亮氨酸0.001%)进行筛选。将所得转化体铺在添加有卡那霉素的LB琼脂培养基和含有7.5μg/mL四环素的再生培养基中,将具有卡那霉素耐性且具有四环素感受性的株命名为DTS1451(pDATSK)。
[实施例5]DTS1451株中的纤维素酶的生产
以作为纤维素酶生产菌的Bacillus akibai 1139株(JCM 9157T)(参照J.Gen.Microbiol.1986,132,2329~2335.Fukumori等人、Int J SystEvol Microbiol.(2005)55:2309~15.Nogi,Y.等人,其内容作为公开而特别引用于此)的染色体为模板,使用引物U和V进行PCR反应,得到包含纤维素酶及其邻近区域的DNA片段。将该DNA片段和pDATS13用限制酶BamHI消化后,再将两者连接起来,得到质粒pDATSC1。使用该质粒转化DTS1451(pDATSK),利用添加有四环素的再生培养基进行筛选。将所得转化体铺在添加有卡那霉素的LB琼脂培养基和含有7.5μg/mL四环素的再生培养基中,将显示纤维素酶活性、并且具有卡那霉素感受性且具有四环素耐性的株命名为DTS1451(pDATSC1)。将DTS1451(pDATSC1)在PPS培养基(聚胨S3%、鱼肉提取物0.5%、酵母提取物0.05%、磷酸二氢钾0.1%、麦芽糖4%、硫酸镁0.02%、氯化钙0.05%)中(不含抗生素)、在30℃下以130rpm的转速搅拌培养72小时,测定所得培养上清中所含的纤维素酶活性。其结果,可以确认每1L培养液生产约1g的纤维素酶。
[实施例6]DTS1451株中的质粒pDATSC1的保持
将带有pDATSC1的DTS1451株铺在添加7.5μg/mL四环素或未添加四环素的LB培养基(聚胨1%、酵母提取物0.5%、氯化钠1%)中,在30℃下以130rpm的转速搅拌培养24小时。取10μL该培养液,继续接种在另外的100mL LB培养基中。再培养24小时,取10μL该培养液,继续接种在另外的100mL LB培养基中,同样培养24小时。之后,从培养细胞中回收质粒。其结果,在带有pDATSC1的DTS1451株中,无论四环素添加与否,每一种培养液的质粒含量均未见变化。另一方面,在带有pDATSC1的、氨酰tRNA合成酶基因没有缺失的枯草杆菌ISW1214株突变株中,观察到:在添加四环素的情况下,每种培养液的质粒含量得以维持,但在未添加四环素的情况下,质粒含量极度下降。并且,在将pDATSC1所带有的纤维素酶基因插入pDA2的BamHI识别位点制成质粒pDAC1,进行同样的试验时,在带有pDAC1的枯草杆菌ISW1214株突变株中,观察到:在添加四环素的情况下,每种培养液的质粒含量得以维持,但在未添加的情况下,质粒含量极度下降。为了容易判断这些结果,图1显示出从用未添加抗生素的培养基培养的各细胞中回收的质粒溶液的电泳结果。将电泳操作后的琼脂糖凝胶浸在溴化乙锭中,进行DNA染色。图1的电泳泳道1为质粒上含有氨酰tRNA合成酶基因、染色体上的该氨酰tRNA合成酶基因缺失宿主的转化的组合;电泳泳道2为质粒上含有氨酰tRNA合成酶基因、染色体上的该氨酰tRNA合成酶基因未缺失宿主的转化的组合;电泳泳道3为质粒上不含氨酰tRNA合成酶基因、染色体上的该氨酰tRNA合成酶基因未缺失宿主的转化的组合。
[实施例7]DTS1451株中的琼脂分解酶的生产
以作为琼脂分解酶生产菌的Microbulbifer sp.A94株(参照BiosciBiotechnol Biochem.(2004)68:1073~81.Ohta,Y.等人,其内容作为公开而特别引用于此)的染色体为模板,使用引物W、X进行PCR反应,得到编码琼脂分解酶的DNA片段。另一方面,以上述pDATSC1为模板,使用引物Y、Z进行PCR反应,将所得DNA片段的5’末端磷酸化,之后与编码琼脂分解酶的DNA片段连接。使用所得连接物转化大肠杆菌HB101,在得到的转化体中,将由具有琼脂分解活性的转化体制备的质粒命名为pDATSA1。使用该质粒转化DTS1451(pDATSK),利用含7.5μg/mL四环素的再生培养基进行筛选。将所得转化体铺在添加有卡那霉素的LB琼脂培养基和含有7.5μg/mL四环素的再生培养基中,将显示琼脂分解酶活性、并且显示卡那霉素感受性且显示四环素耐性的株命名为DTS1451(pDATSA1)。将DTS1451(pDATSA1)在PPS培养基中(不含抗生素)、在30℃下以130rpm在转速搅拌培养72小时,测定所得培养上清中所含的琼脂分解酶活性。其结果,确认每1L培养液生产约0.1g的琼脂分解酶。接下来,以pDATSA1为模板,使用引物A1(SEQ ID NO:79)、引物B1(SEQ IDNO:80)进行PCR反应,所得DNA片段用XhoI消化后,通过连接反应形成闭合环。通过该操作形成暂且排除了色氨酰tRNA合成酶基因的质粒。事先用限制酶EcoRI切断该质粒,另一方面,以pDATSC1为模板,使用引物C1(SEQ ID NO:81)与D1(SEQ ID NO:82)、引物E1(SEQ ID NO:83)与F1(SEQ ID NO:84)、引物G1(SEQ ID NO:85)与H1(SEQ ID NO:86)的各个组合,对包含色氨酰tRNA合成酶基因及其邻近区域的DNA片段进行PCR扩增。将各PCR扩增DNA片段用限制酶EcoRI消化,之后与预先用限制酶EcoRI消化的上述质粒连接。分别使用所得连接物转化大肠杆菌HB101,在所得转化体中,将由具有琼脂分解活性的转化体制备的质粒命名为pDATSA2、pDATSA3、pDATSA4。确认pDATSA2、pDATSA3、pDATSA4的核苷酸序列,结果色氨酰tRNA合成酶基因及其周边部分分别为SEQ IDNO:87、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:89所示的序列。接着,使用上述质粒转化DTS1451(pDATSK),利用含7.5μg/mL四环素的再生培养基进行筛选。将转化体铺在添加有卡那霉素的LB琼脂培养基和含有7.5μg/mL四环素的再生培养基中,筛选显示琼脂分解酶活性、并且显示卡那霉素感受性且显示四环素耐性的株。将所得DTS1451(pDATSA2)、DTS1451(pDATSA3)、DTS1451(pDATSA4)在PPS培养基中(不含抗生素)、在30℃下以130rpm的转速搅拌培养72小时,测定所得培养上清中所含的琼脂分解酶活性。其结果,确认到上述三种均为每1L培养液生产约0.1g的琼脂分解酶。
[表1]
引物 | 核苷酸序列 | SEQ ID NO: |
A | GTGCCTCGAGGATTAAGCATTGGTAACTGTC | 53 |
引物 | 核苷酸序列 | SEQ ID NO: |
B | TATTCTCGAGACATTAACCTAGAAAGCACTAAGG | 54 |
C | CTGCCTGTCTCGAGGCTGATAGCAGTTATC | 55 |
D | CAACTCGAGGCTGGTCGGACAAACACCTAG | 56 |
E | TGCGAATTCCGGATGTAAGGAGAACGGCTC | 57 |
F | CTTGTCGACGTACATCAGAAATCGTACATTCG | 58 |
G | GGTGGATCCCCTCGCCGGCAATAGTTACCC | 59 |
H | AATCTAGACTTTCGTTATACAAATTTTAACC | 60 |
I | TGTAGGATCCAATATGGGCAGAAAACACATG | 61 |
J | ATATCTAGATTCCACTCTGTGTACCAGTAGC | 62 |
K | GTTAGCTCCTTCGGTCCTCC | 63 |
L | GTAACTGGCTTCAGCAGAGC | 64 |
M | CTGCCACATCGTCTAGGCTGC | 65 |
N | CAGGAGTCCAAATACCAGAG | 66 |
O | CCCTTGCCTATACTGTGGAC | 67 |
P | GTTACAATAGCGACGGAGAG | 68 |
Q | GTCTGAATTCGAGGAAGGTTTACACCG | 69 |
R | CTGCGAATTCATCTTCATGGTGAACC | 70 |
S | CATTGTCATTAGTTGGCTGG | 71 |
T | GCAAGAATTCAAAATCCATCTTCATCGG | 72 |
U | GTGACTGAGGATCCGCTAGTTCCAGATCG | 73 |
V | CTCTTGGATCCCTTCATCATTCTATCACAC | 74 |
W | GCAGATTGGGATGGAGTTCCCGTAC | 75 |
引物 | 核苷酸序列 | SEQ ID NO: |
X | TTACAGCTTCACAAAGCGGATTTC | 76 |
Y | TGCTGCAAGAGCTGTCGGAAATAAAG | 77 |
Z | AAGAAGAAAAGAAAGAAGCTAAAG | 78 |
。
产业实用性
本发明在培养通过转化细菌等宿主细胞而得到的转化体来制造各种蛋白或肽的领域中有用。
序列表
<110>独立行政法人海洋研究开发机构
<120>在细胞中稳定保持外来基因的方法
<130>A85139H
<160>89
<210>1
<211>2631
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>alaS丙氨酸-tRNA合成酶
<400>1
atgagcaaga gcaccgctga gatccgtcag gcgtttctcg actttttcca tagtaaggga 60
catcaggtag ttgccagcag ctccctggta ccccataacg acccaacttt gttgtttacc 120
aacgccggga tgaaccagtt caaggatgtg ttccttgggc tcgacaagcg taattattcc 180
cgcgctacca cttcccaacg ctgcgtgcgt gcgggtggta aacacaacga cctggaaaac 240
gtcggttaca ccgcgcgtca ccataccttc ttcgaaatgc tgggcaactt cagcttcggc 300
gactatttca aacacgatgc cattcagttt gcatgggaac tgctgaccag cgaaaaatgg 360
tttgccctgc cgaaagagcg tctgtgggtt accgtctatg aaagcgacga cgaagcctac 420
gaaatctggg aaaaagaagt agggatcccg cgcgaacgta ttattcgcat cggcgataac 480
aaaggtgcgc catacgcatc tgacaacttc tggcagatgg gtgacactgg tccgtgcggc 540
ccgtgcaccg aaatcttcta cgatcacggc gaccacattt gggggggccc tccgggaagc 600
ccggaagaag acggcgaccg ctacattgag atctggaaca tcgtcttcat gcagttcaac 660
cgccaggccg atggcacgat ggaaccgctg ccgaagccgt ctgtagatac cggtatgggt 720
ctggagcgta ttgctgcggt gctgcaacac gttaactcta actatgacat cgacctgttc 780
cgcacgctga tccaggcggt agcgaaagtc actggcgcaa ccgatctgag caataaatcg 840
ctgcgcgtaa tcgctgacca cattcgttct tgtgcgttcc tgatcgcgga tggcgtaatg 900
ccgtccaatg aaaaccgtgg ttatgtactg cgtcgtatca ttcgtcgcgc agtgcgtcac 960
ggtaatatgc tcggcgcgaa agaaaccttc ttctacaaac tggttggtcc gctgatcgac 1020
gttatgggct ctgcgggtga agacctgaaa cgccagcagg cgcaggttga gcaggtgctg 1080
aagactgaag aagagcagtt tgctcgtact ctggagcgcg gtctggcgtt gctggatgaa 1140
gagctggcaa aactttctgg tgatacgctg gatggtgaaa ctgctttccg tctgtacgac 1200
acctatggct tcccggttga cctgacggct gatgtttgtc gtgagcgcaa catcaaagtt 1260
gacgaagctg gttttgaagc tgcaatggaa gagcagcgtc gtcgcgcgcg cgaagccagc 1320
ggctttggtg ccgattacaa cgcaatgatc cgtgttgaca gtgcatctga atttaaaggc 1380
tatgaccatc tggaactgaa cggcaaagtg actgcgctgt ttgttgatgg taaagcggtt 1440
gatgccatca atgcaggcca ggaagctgtg gtcgtgctgg atcaaacgcc attctatgcg 1500
gaatccggcg gtcaggttgg cgataaaggc gaactgaaag gcgctaactt ctcctttgcg 1560
gtggaagata cgcagaaata cggccaggcg attggtcaca tcggtaaact tgctgcgggt 1620
tctctgaaag tgggcgacgc ggtgcaggct gatgttgatg aggctcgtcg cgcccgtatt 1680
cgtctgaatc actccgcaac gcacctgatg cacgctgcgc tgcgccaggt tctgggtact 1740
catgtatcgc agaaaggttc actggttaac gacaaggtgc tgcgcttcga cttctcacac 1800
aacgaagcga tgaaaccaga agagattcgt gcggtcgaag acctggtgaa cacacagatt 1860
cgtcgcaatt tgccgatcga aaccaacatc atggatctcg aagcggcgaa agcgaaaggt 1920
gcgatggcgc tgttcggcga gaagtatgat gagcgcgtac gcgtgctgag catgggcgat 1980
ttctctaccg agttgtgtgg cggtactcac gccagccgca ctggtgatat tggtctgttc 2040
cgcatcatct ctgaatcggg tactgctgca ggcgttcgtc gtatcgaagc ggtaaccgga 2100
gaaggtgcta tcgccaccgt tcatgcagac agcgatcgct taagcgaagt cgcgcatctg 2160
ctgaaaggcg atagcaataa tctggctgat aaagtgcgct cagtactgga acgtacgcgt 2220
cagctggaaa aagagttaca acagcttaaa gaacaagctg ccgcacagga gagcgcaaat 2280
ctttccagta aggcaattga tgttaatggt gttaagctgt tggttagcga gcttagcggt 2340
gttgagccga aaatgttgcg taccatggtt gacgatttaa aaaatcagct ggggtcgaca 2400
attatcgtgc tggcaacggt agtcgaaggt aaggtttctc tgattgcagg cgtatctaag 2460
gacgtcacag atcgtgtgaa agcaggggaa ctgattggta tggtcgctca gcaggtgggc 2520
ggcaagggtg gtggacgtcc tgacatggcg caagccggtg gtacggatgc tgcggcctta 2580
cctgcagcgt tagccagtgt gaaaggctgg gtcagcgcga aattgcaata a 2631
<210>2
<211>1734
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>argS精氨酸-tRNA合成酶
<400>2
gtgaatattc aggctcttct ctcagaaaaa gtccgtcagg ccatgattgc ggcaggcgcg 60
cctgcggatt gcgaaccgca ggttcgtcag tcagcaaaag ttcagttcgg cgactatcag 120
gctaacggca tgatggcagt tgctaaaaaa ctgggtatgg caccgcgaca attagcagag 180
caggtgctga ctcatctgga tcttaacggt atcgccagca aagttgagat cgccggtcca 240
ggctttatca acattttcct tgatccggca ttcctggctg aacatgttca gcaggcgctg 300
gcgtccgatc gtctcggtgt tgctacgcca gaaaaacaga ccattgtggt tgactactct 360
gcgccaaacg tggcgaaaga gatgcatgtc ggtcacctgc gctctaccat tattggtgac 420
gcagcagtgc gtactctgga gttcctcggt cacaaagtga ttcgcgcaaa ccacgtcggc 480
gactggggca ctcagttcgg tatgctgatt gcatggctgg aaaagcagca gcaggaaaac 540
gccggtgaaa tggagctggc tgaccttgaa ggtttctacc gcgatgcgaa aaagcattac 600
gatgaagatg aagagttcgc cgagcgcgca cgtaactacg tggtaaaact gcaaagcggt 660
gacgaatatt tccgcgagat gtggcgcaaa ctggtcgaca tcaccatgac gcagaaccag 720
atcacctacg atcgtctcaa cgtgacgctg acccgtgatg acgtgatggg cgaaagcctc 780
tacaacccga tgctgccagg aattgtggcg gatctcaaag ccaaaggtct ggcagtagaa 840
agcgaagggg cgaccgtcgt attccttgat gagtttaaaa acaaggaagg cgaaccgatg 900
ggcgtgatca ttcagaagaa agatggcggc tatctctaca ccaccactga tatcgcctgt 960
gcgaaatatc gttatgaaac actgcatgcc gatcgcgtgc tgtattacat cgactcccgt 1020
cagcatcaac acctgatgca ggcatgggcg atcgtccgta aagcaggcta tgtaccggaa 1080
tccgtaccgc tggaacacca catgttcggc atgatgctgg gtaaagacgg caaaccgttc 1140
aaaacccgcg cgggtggtac agtgaaactg gccgatctgc tggatgaagc cctggaacgt 1200
gcacgccgtc tggtggcaga aaagaacccg gatatgccag ccgacgagct ggaaaaactg 1260
gctaacgcgg ttggtattgg tgcggtgaaa tatgcggatc tctccaaaaa ccgcaccacg 1320
gactacatct tcgactggga caacatgctg gcgtttgagg gtaataccgc gccatacatg 1380
cagtatgcat acacgcgtgt attgtccgtg ttccgtaaag cagaaattga cgaagagcaa 1440
ctggctgcag ctccggttat catccgtgaa gatcgtgaag cgcaactggc agctcgcctg 1500
ctgcagtttg aagaaaccct caccgtggtt gcccgtgaag gcacgccgca tgtaatgtgt 1560
gcttacctgt acgatctggc cggtctgttc tctggcttct acgagcactg cccgatcctc 1620
agcgcagaaa acgaagaagt gcgtaacagc cgtctaaaac tggcacaact gacggcgaag 1680
acgctgaagc tgggtctgga tacgctgggt attgagactg tagagcgtat gtaa 1734
<210>3
<211>1401
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>asnS天冬酰胺-tRNA合成酶
<400>3
atgagcgttg tgcctgtagc cgacgtactc cagggccgtg tagccgttga cagcgaagtc 60
accgtgcgcg gatgggtacg tacccgccga gattcaaaag ctggcatctc cttcctcgcc 120
gtttatgacg gttcctgctt tgatcctgta caggctgtca tcaataattc tctgcccaat 180
tacaatgaag acgtcctgcg tctgaccacc ggctgctcgg tcattgtgac gggtaaagtc 240
gtggcgtcgc cgggccaggg gcaacaattt gaaattcagg ccagcaaggt tgaagttgct 300
ggttgggttg aagatccaga cacttacccg atggcggcaa aacgccacag cattgagtat 360
ctgcgtgaag tcgctcacct gcgtccgcgc acaaacctga ttggtgccgt cgcgcgcgtt 420
cgccatacgc tggcgcaggc gctgcatcgc ttctttaacg agcagggatt cttctgggtt 480
tcaacgccac tgattaccgc atctgatacc gaaggtgcag gcgaaatgtt ccgcgtttct 540
acgctggatc tggaaaacct gccgcgtaac gatcagggca aagtggattt cgacaaagac 600
ttctttggta aagagtcttt cctgaccgta tctggccagt tgaacggcga aacctacgct 660
tgcgcattgt ccaaaattta taccttcggc ccgactttcc gtgctgaaaa ctccaacacc 720
agccgtcacc tggcggaatt ctggatgctg gagccggaag tggcgtttgc taacctgaac 780
gatattgcgg gtctggctga agccatgctg aaatatgtct tcaaagcggt tctcgaagaa 840
cgcgctgacg acatgaaatt cttcgctgaa cgcgtagata aagatgccgt ttcacgtctg 900
gaacgcttca ttgaagccga ttttgcgcag gtggattata ccgacgcagt gaccattctc 960
gaaaactgcg gcaggaagtt tgaaaacccg gtttactggg gagtcgatct ctcttctgag 1020
catgagcgtt atctggcgga agaacacttt aaagcaccgg tagtggttaa aaactatccg 1080
aaagatatta aagcgttcta tatgcgcctt aacgaagacg gtaaaaccgt tgcggctatg 1140
gacgttctgg ctccgggcat cggtgagatc attggtggct cccagcgtga agaacgtctg 1200
gacgtgctgg acgagcgtat gctggaaatg ggcctgaata aagaagatta ctggtggtat 1260
cgcgatctgc gtcgctacgg tactgttccg cattcaggtt tcggtcttgg ttttgaacgt 1320
ctgattgctt acgtaactgg cgtgcaaaac gtacgtgatg tgattccgtt cccacgtact 1380
ccgcgtaacg ccagcttcta a 1401
<210>4
<211>1773
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>aspS天冬氨酸-tRNA合成酶
<400>4
atgcgtacag aatattgtgg acagctccgt ttgtcccacg tggggcagca ggtgactctg 60
tgtggttggg tcaaccgtcg tcgtgatctt ggtagcctga tcttcatcga tatgcgcgac 120
cgcgaaggta tcgtgcaggt atttttcgat ccggatcgtg cggacgcgtt aaagctggcc 180
tctgaactgc gtaatgagtt ctgcattcag gtcacgggca ccgtacgtgc gcgtgacgaa 240
aaaaatatta accgcgatat ggcgaccggc gaaatcgaag tgctggcgtc ctcgctgact 300
atcatcaacc gcgcagatgt tctgccgctt gactctaacc acgtcaacac cgaagaagcg 360
cgtctgaaat accgctacct cgacctgcgt cgtccggaaa tggctcagcg cctgaaaacc 420
cgcgctaaaa tcaccagcct ggtgcgccgt tttatggatg accacggctt cctcgacatc 480
gaaactccga tgctgaccaa agccacgccg gaaggcgcgc gtgactacct ggtgccttct 540
cgtgtgcaca aaggtaaatt ctacgcactg ccgcaatccc cgcagttgtt caaacagctg 600
ctgatgatgt ccggttttga ccgttactat cagatcgtta aatgcttccg tgacgaagac 660
ctgcgtgctg accgtcagcc tgaatttact cagatcgatg tggaaacttc tttcatgacc 720
gcgccgcaag tgcgtgaagt gatggaagcg ctggtgcgtc atctgtggct ggaagtgaag 780
ggtgtggatc tgggcgattt cccggtaatg acctttgcgg aagcagaacg ccgttatggt 840
tctgataaac cggatctgcg taacccgatg gaactgactg acgttgctga tctgctgaaa 900
tctgttgagt ttgctgtatt tgcaggtccg gcgaacgatc cgaaaggtcg cgtagcggct 960
ctgcgcgttc cgggcggcgc atcgctgacc cgtaagcaga tcgacgaata cggtaacttc 1020
gttaaaatct acggcgcgaa aggtctggct tacatcaaag ttaacgaacg cgcgaaaggt 1080
ctggaaggta tcaacagccc ggtagcgaag ttccttaatg cagaaatcat cgaagacatc 1140
ctggatcgta ctgccgcgca agatggcgat atgattttct tcggtgccga caacaagaaa 1200
attgttgccg acgcgatggg tgcactgcgc ctgaaagtgg gtaaagacct tggtctgacc 1260
gacgaaagca aatgggcacc gctgtgggtt atcgacttcc cgatgtttga agacgacggt 1320
gaaggcggcc tgacggcaat gcaccatccg ttcacctcac cgaaagatat gacggctgca 1380
gaactgaaag ctgcaccgga aaatgcggtg gcgaacgctt acgatatggt catcaatggt 1440
tacgaagtgg gcggtggttc agtacgtatc cataatggtg atatgcagca gacggtgttt 1500
ggtattctgg gtatcaacga agaggaacag cgcgagaaat tcggcttcct gctcgacgct 1560
ctgaaatacg gtactccgcc gcacgcaggt ctggcattcg gtcttgaccg tctgaccatg 1620
ctgctgaccg gcaccgacaa tatccgtgac gttatcgcct tcccgaaaac cacggcggca 1680
gcgtgtctga tgactgaagc accgagcttt gctaacccga ctgcactggc tgagctgagc 1740
attcaggttg tgaagaaggc tgagaataac tga 1773
<210>5
<211>1386
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>cysS半胱氨酸-tRNA合成酶
<400>5
atgctaaaaa tcttcaatac tctgacacgc caaaaagagg aatttaagcc tattcacgcc 60
ggggaagtcg gcatgtacgt gtgtggaatc accgtttacg atctctgtca tatcggtcac 120
gggcgtacct ttgttgcttt tgacgtggtt gcgcgctatc tgcgtttcct cggctataaa 180
ctgaagtatg tgcgcaacat taccgatatc gacgacaaaa tcatcaaacg cgccaatgaa 240
aatggcgaaa gctttgtggc gatggtggat cgcatgatcg ccgaaatgca caaagatttt 300
gatgctttga acattctgcg cccggatatg gagccgcgcg cgacgcacca tatcgcagaa 360
attattgaac tcactgaaca actgatcgcc aaaggtcacg cttatgtggc ggacaacggc 420
gacgtgatgt tcgacgtccc gaccgatcca acttatggcg tgctgtcgcg tcaggatctc 480
gaccagctgc aggcaggcgc gcgcgttgac gtggtcgacg acaaacgcaa cccaatggac 540
ttcgttctgt ggaagatgtc gaaagagggc gaaccgagct ggccgtctcc gtggggcgcg 600
ggtcgtcctg gctggcacat tgaatgttcg gcaatgaact gcaagcagct gggtaaccac 660
tttgatatcc acggcggcgg ttcagacctg atgttcccgc accacgaaaa cgaaatcgcg 720
cagtccacct gtgcccatga tggtcagtat gtgaactact ggatgcactc ggggatggtg 780
atggttgacc gcgagaagat gtccaaatcg ctgggtaact tctttaccgt gcgcgatgtg 840
ctgaaatact acgacgcgga aaccgtgcgt tacttcctga tgtcgggcca ctatcgcagc 900
cagttgaact acagcgaaga gaacctgaag caggcgcgtg cggcgctgga gcgtctctac 960
actgcgctgc gcggcacaga taaaaccgtt gcgcctgccg gtggcgaagc gtttgaagcg 1020
cgctttattg aagcgatgga cgacgatttc aacaccccgg aagcctattc cgtactgttt 1080
gatatggcgc gtgaagtaaa ccgtctgaaa gcagaagata tggcagcggc gaatgcaatg 1140
gcatctcacc tgcgtaaact ttccgctgta ttgggcctgc tggagcaaga accggaagcg 1200
ttcctgcaaa gcggcgcgca ggcagacgac agcgaagtgg ctgagattga agcgttaatt 1260
caacagcgtc tggatgcccg taaagcgaaa gactgggcgg cggcggatgc ggcgcgtgat 1320
cgtcttaacg agatggggat cgtgctggaa gatggcccgc aagggaccac ctggcgtcgt 1380
aagtaa 1386
<210>6
<211>1665
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>glnS谷氨酰胺-tRNA合成酶
<400>6
atgagtgagg cagaagcccg cccgactaac tttatccgtc agatcatcga tgaagatctg 60
gccagtggta agcacaccac agtacacacc cgtttcccgc cggagccgaa tggctatctg 120
catattggcc atgcgaaatc tatctgcctg aacttcggga tcgcccagga ctataaaggc 180
cagtgcaacc tgcgtttcga cgacactaac ccggtaaaag aagatatcga gtatgttgag 240
tcgatcaaaa acgacgtaga gtggttaggt tttcactggt ctggtaacgt ccgttactcc 300
tccgattatt ttgatcagct ccacgcctat gcgatcgaac tgatcaataa aggcctggcg 360
tacgttgatg aactgacgcc ggaacagatc cgcgaatacc gcggcaccct gacgcaaccg 420
ggtaaaaaca gcccgtaccg cgaccgcagc gttgaagaga acctggcgct gttcgaaaaa 480
atgcgtgccg gtggttttga agaaggtaaa gcctgcctgc gtgcgaaaat cgacatggct 540
tcaccgttta tcgtgatgcg cgatccggtg ctgtaccgta ttaaatttgc tgaacaccac 600
cagactggca acaagtggtg catctacccg atgtacgact tcacccactg catcagcgat 660
gccctggaag gtattacgca ctctctgtgt acgcttgagt tccaggacaa ccgtcgtctg 720
tacgactggg tactggacaa catcacgatt cctgttcacc cgcgccagta tgagttctcg 780
cgcctgaatc tggaatacac cgtgatgtcc aagcgtaagt tgaacctgct ggtgaccgac 840
aagcacgttg aaggctggga tgacccgcgt atgccgacca tttccggtct gcgtcgtcgt 900
ggttacactg cggcttctat tcgtgagttc tgcaaacgca tcggcgtgac caagcaggac 960
aacaccattg agatggcgtc gctggaatcc tgcatccgtg aagatctcaa cgaaaatgcg 1020
ccgcgcgcaa tggcggttat cgatccggtg aaactggtta tcgaaaacta tcagggcgaa 1080
ggcgaaatgg ttaccatgcc gaaccatccg aacaaaccgg aaatgggcag ccgtcaggtg 1140
ccgtttagcg gtgagatttg gattgatcgc gccgatttcc gcgaagaagc taacaagcag 1200
tacaaacgtc tggtgctggg taaagaagtg cgtctgcgta atgcttatgt gattaaggca 1260
gaacgcgtcg agaaagatgc cgaaggtaat atcaccacca tcttctgtac ttatgacgcc 1320
gataccttaa gcaaagatcc ggcagatggt cgtaaagtca aaggtgttat tcactgggtg 1380
agcgcggcac atgcgctgcc ggttgaaatc cgtttgtatg accgtctgtt cagcgtgcct 1440
aacccaggtg ctgcggatga tttcctgtcg gtgattaacc cggaatcgct ggtgatcaaa 1500
cagggctttg ctgaaccgtc gctgaaagat gcggttgcgg gtaaagcatt ccagtttgag 1560
cgtgaaggtt acttctgcct cgatagccgc cattctacgg cggaaaaacc ggtatttaac 1620
cgcaccgttg ggctgcgtga tacctgggcg aaagtaggcg agtaa 1665
<210>7
<211>1665
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>gltX谷氨酸-tRNA合成酶
<400>7
atgagtgagg cagaagcccg cccgactaac tttatccgtc agatcatcga tgaagatctg 60
gccagtggta agcacaccac agtacacacc cgtttcccgc cggagccgaa tggctatctg 120
catattggcc atgcgaaatc tatctgcctg aacttcggga tcgcccagga ctataaaggc 180
cagtgcaacc tgcgtttcga cgacactaac ccggtaaaag aagatatcga gtatgttgag 240
tcgatcaaaa acgacgtaga gtggttaggt tttcactggt ctggtaacgt ccgttactcc 300
tccgattatt ttgatcagct ccacgcctat gcgatcgaac tgatcaataa aggcctggcg 360
tacgttgatg aactgacgcc ggaacagatc cgcgaatacc gcggcaccct gacgcaaccg 420
ggtaaaaaca gcccgtaccg cgaccgcagc gttgaagaga acctggcgct gttcgaaaaa 480
atgcgtgccg gtggttttga agaaggtaaa gcctgcctgc gtgcgaaaat cgacatggct 540
tcaccgttta tcgtgatgcg cgatccggtg ctgtaccgta ttaaatttgc tgaacaccac 600
cagactggca acaagtggtg catctacccg atgtacgact tcacccactg catcagcgat 660
gccctggaag gtattacgca ctctctgtgt acgcttgagt tccaggacaa ccgtcgtctg 720
tacgactggg tactggacaa catcacgatt cctgttcacc cgcgccagta tgagttctcg 780
cgcctgaatc tggaatacac cgtgatgtcc aagcgtaagt tgaacctgct ggtgaccgac 840
aagcacgttg aaggctggga tgacccgcgt atgccgacca tttccggtct gcgtcgtcgt 900
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aacaccattg agatggcgtc gctggaatcc tgcatccgtg aagatctcaa cgaaaatgcg 1020
ccgcgcgcaa tggcggttat cgatccggtg aaactggtta tcgaaaacta tcagggcgaa 1080
ggcgaaatgg ttaccatgcc gaaccatccg aacaaaccgg aaatgggcag ccgtcaggtg 1140
ccgtttagcg gtgagatttg gattgatcgc gccgatttcc gcgaagaagc taacaagcag 1200
tacaaacgtc tggtgctggg taaagaagtg cgtctgcgta atgcttatgt gattaaggca 1260
gaacgcgtcg agaaagatgc cgaaggtaat atcaccacca tcttctgtac ttatgacgcc 1320
gataccttaa gcaaagatcc ggcagatggt cgtaaagtca aaggtgttat tcactgggtg 1380
agcgcggcac atgcgctgcc ggttgaaatc cgtttgtatg accgtctgtt cagcgtgcct 1440
aacccaggtg ctgcggatga tttcctgtcg gtgattaacc cggaatcgct ggtgatcaaa 1500
cagggctttg ctgaaccgtc gctgaaagat gcggttgcgg gtaaagcatt ccagtttgag 1560
cgtgaaggtt acttctgcct cgatagccgc cattctacgg cggaaaaacc ggtatttaac 1620
cgcaccgttg ggctgcgtga tacctgggcg aaagtaggcg agtaa 1665
<210>8
<211>912
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>glyQ甘氨酸-tRNA合成酶,α-亚单位
<400>8
atgcaaaagt ttgataccag gaccttccag ggcttgatcc tgaccttaca ggattactgg 60
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ccttctcgtc gcccgaccga tggtcgctac ggcgaaaacc ccaaccgttt acagcactac 240
tatcagttcc aggtggtcat taagccatcg ccggacaata ttcaggagct gtacctcggt 300
tctctgaaag agctgggcat ggacccgact attcacgaca tccgtttcgt ggaagataac 360
tgggaaaacc cgacgctggg tgcctgggga ctgggctggg aagtgtggct gaacggcatg 420
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ggcgagatca cctacggtct ggaacgtctg gccatgtaca ttcagggcgt agacagcgtt 540
tacgacctgg tctggagcga cggcccgctg ggtaaaacca cctacggcga cgtgttccat 600
cagaacgaag tggagcagtc cacttacaac ttcgaatacg cggatgtgga cttcctgttc 660
acctgcttcg agcagtacga gaaagaagcg cagcagctgc tggcgctgga aaatccgctg 720
ccgctgccag cctacgagcg tattctgaaa gccgcccaca gcttcaacct gctggatgcg 780
cgtaaagcca tctccgtcac cgagcgtcag cgctacattc tgcgcattcg caccctgacc 840
aaagcagtgg cagaagcata ctacgcttcc cgtgaagccc tcggcttccc gatgtgcaac 900
aaagataagt aa 912
<210>9
<211>2070
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>glyS甘氨酸-tRNA合成酶,β-亚单位
<400>9
atgtctgaga aaacttttct ggtggaaatc ggcactgaag agctgccacc aaaagcactg 60
cgcagcctgg ctgagtcctt tgctgcgaac tttactgcgg agctggataa cgctggcctc 120
gcacacggca ccgttcaatg gtttgctgct ccgcgtcgtc tggcgctgaa agtagctaac 180
ctggcggaag cgcaaccgga tcgtgaaatc gaaaaacgcg gcccggcgat tgcccaggcg 240
ttcgacgctg aaggcaaacc gagcaaagcg gcagaaggtt gggcgcgtgg ttgcggtatt 300
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catgtgaagg gcgaaagcac cgaagcactg ctgccgaata tggttgcgac ttctctggcg 420
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cagtccgatc gcgtgattcg cggccaccgc tttatgggcg agccggaatt caccatcgat 600
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gaacgtaagg cgaagattaa agccgatgcc gaagaagcag cgcgtaagat tggcggtaac 720
gctgacttaa gcgaaagcct gctggaagaa gtggcttcgc tggtggagtg gccggtcgtt 780
ctgaccgcaa aattcgaaga gaaattcctc gcggtgccgg ctgaagcgct ggtttacacc 840
atgaaaggtg accagaaata cttcccggtg tatgcgaacg acggcaaact gctgccgaac 900
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aaagtcgttc gtccgcgtct ggcggatgcc gagttcttct tcaacaccga ccgtaaaaaa 1020
cgtcttgaag ataacctgcc gcgcctgcaa accgtgttgt tccagcaaca gttggggacg 1080
ctgcgcgaca aaactgaccg catccaggcg ctggctggct ggattgctga acagattggc 1140
gctgacgtta accacgctac ccgtgcgggt ctgctgtcta agtgcgacct gatgaccaac 1200
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ggcgaagcgg aagatgtcgc ggtggcgctg aatgagcagt atcagccgcg ttttgctggt 1320
gatgacctgc cgtccaaccc agtagcttgt gcgctggcga ttgctgacaa gatggatacc 1380
ctggcgggta tcttcggtat cggtcagcat ccgaaaggcg acaaagaccc gtttgcgctg 1440
cgtcgtgccg cgcttggcgt gctgcgaatt atcgttgaga agaacctcaa ccttgatctg 1500
caaacgctga ccgaagaagc ggtgcgtctg tatggcgata agctgactaa tgccaacgta 1560
gttgatgatg ttatcgactt tatgctcggt cgcttccgcg cctggtatca ggacgaaggt 1620
tataccgttg acaccatcca ggcggtactg gcgcgtcgtc cgactcgtcc ggctgatttc 1680
gatgcccgta tgaaagcggt atcgcatttc cgtaccctgg atgcagctgc tgcactggcg 1740
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cgcgttgcgg atatttcgct gttgcaataa 2070
<210>10
<211>1275
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>hisS组氨酸-tRNA合成酶
<400>10
gtggcaaaaa acattcaagc cattcgcggc atgaacgatt acctgcctgg cgaaacggcc 60
atctggcagc gcattgaagg cacactgaaa aacgtgctcg gcagctacgg ttacagtgaa 120
atccgcttgc cgattgtaga gcagaccccg ctattcaaac gtgcgattgg tgaagtcacc 180
gacgtggttg aaaaagagat gtacaccttt gaggatcgca atggcgacag cctgactctg 240
cgccctgaag ggacggcggg ctgtgtacgc gccggcatcg agcatggtct tctgtacaat 300
caggaacagc gtctgtggta tatcgggccg atgttccgtc acgagcgtcc gcagaaaggg 360
cgttatcgtc agttccatca gttgggctgc gaagttttcg gtctgcaagg tccggatatc 420
gacgctgaac tgattatgct cactgcccgc tggtggcgcg cgctgggtat ttccgagcac 480
gtaactcttg agctgaactc tatcggttcg ctggaagcac gcgccaatta ccgcgatgcg 540
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tacactaacc cgctgcgcgt gctggattca aaaaatccgg aagtgcaggc gcttctcaac 660
gacgctccgg cattaggtga ctatctggac gaggaatctc gtgagcattt tgccggtctg 720
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gatttgcgct ctggtgagca aacggcagtt gcgcaggata gcgtagccgc gcatttgcgc 1260
acgttactgg gttaa 1275
<210>11
<211>2817
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>ileS异亮氨酸-tRNA合成酶
<400>11
atgagtgact ataaatcaac cctgaatttg ccggaaacag ggttcccgat gcgtggcgat 60
ctcgccaagc gcgaacccgg aatgctggcg cgttggactg atgatgatct gtacggcatc 120
atccgtgcgg ctaaaaaagg caaaaaaacc ttcattctgc atgatggccc tccttatgcg 180
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tccaaagggc tttccggtta tgactcgccg tatgtgcctg gctgggactg ccacggtctg 300
ccgatcgagc tgaaagtcga gcaagaatac ggtaagccgg gtgagaaatt caccgccgcc 360
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gagtattacg acaaaacttc tccgtccatc gacgttgctt tccaggcagt cgatcaggat 660
gcactgaaag caaaatttgc cgtaagcaac gttaacggcc caatctcgct ggtaatctgg 720
accaccacgc cgtggactct gcctgccaac cgcgcaatct ctattgcacc agatttcgac 780
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gtaatgcagc gtatcggcgt gaccgattac accattctcg gcacggtaaa aggtgcggag 900
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gaaggttctg accaacaccg cggctggttc atgtcttccc taatgatctc caccgcgatg 1740
aagggtaaag cgccgtatcg tcaggtactg acccacggct ttaccgtgga tggtcagggc 1800
cgcaagatgt ctaaatccat cggcaatacc gtttcgccgc aggatgtgat gaacaaactg 1860
ggcgcggata ttctgcgtct gtgggtggca tcaaccgact acaccggtga aatggccgtt 1920
tctgacgaga tcctgaaacg tgctgccgat agctatcgtc gtatccgtaa caccgcgcgc 1980
ttcctgctgg caaacctgaa cggttttgat ccagcaaaag atatggtgaa accggaagag 2040
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aaggcgtacg aagcatacga tttccacgaa gtggtacagc gtctgatgcg cttctgctcc 2160
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accttgtatg cagaaccgga actgtcggcg aaactgaccg cgctgggcga tgaattacga 2580
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tgcggccgct gtgtcagcaa cgtcgccggt gacggtgaaa aacgtaagtt tgcctga 2817
<210>12
<211>2583
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>leuS亮氨酸-tRNA合成酶
<400>12
atgcaagagc aataccgccc ggaagagata gaatccaaag tacagcttca ttgggatgag 60
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gcgcgctaca cttgcccgca gtacaaagaa ggtatgctgg attccgaagc ggctaactac 1560
tggctgccgg tggatatcta cattggtggt attgaacacg ccattatgca cctgctctac 1620
ttccgcttct tccacaaact gatgcgtgat gcaggcatgg tgaactctga cgaaccagcg 1680
aaacagttgc tgtgtcaggg tatggtgctg gcagatgcct tctactatgt tggcgaaaac 1740
ggcgaacgta actgggtttc cccggttgat gctatcgttg aacgtgacga gaaaggccgt 1800
atcgtgaaag cgaaagatgc ggcaggccat gaactggttt ataccggcat gagcaaaatg 1860
tccaagtcga agaacaacgg tatcgacccg caggtgatgg ttgaacgtta cggcgcggac 1920
accgttcgtc tgtttatgat gtttgcttct ccggctgata tgactctcga atggcaggaa 1980
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taa 2583
<210>13
<211>1518
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>lysS赖氨酸-tRNA合成酶,组成型
<400>13
atgtctgaac aacacgcaca gggcgctgac gcggtagtcg atcttaacaa tgaactgaaa 60
acgcgtcgtg agaagctggc gaacctgcgc gagcagggga ttgccttccc gaacgatttc 120
cgtcgcgatc atacctctga ccaattgcac gcagaattcg acggcaaaga gaacgaagaa 180
ctggaagcgc tgaacatcga agtcgccgtt gctggccgca tgatgacccg tcgtattatg 240
ggtaaagcgt ctttcgttac cctgcaggac gttggcggtc gcattcagct gtacgttgcc 300
cgtgacgatc tcccggaagg cgtttataac gagcagttca aaaaatggga cctcggcgac 360
atcctcggcg cgaaaggtaa gctgttcaaa accaaaaccg gcgaactgtc tatccactgc 420
accgagttgc gtctgctgac caaagcactg cgtccgctgc cggataaatt ccacggcttg 480
caggatcagg aagcgcgcta tcgtcagcgt tatctcgatc tcatctccaa cgatgaatcc 540
cgcaacacct ttaaagtgcg ctcgcagatc ctctctggta ttcgccagtt catggtgaac 600
cgcggcttta tggaagttga aacgccgatg atgcaggtga tccctggcgg tgccgctgcg 660
cgtccgttta tcacccacca taacgcgctg gatctcgaca tgtacctgcg tatcgcgccg 720
gaactgtacc tcaagcgtct ggtggttggt ggcttcgagc gtgtattcga aatcaaccgt 780
aacttccgta acgaaggtat ttccgtacgt cataacccag agttcaccat gatggaactc 840
tacatggctt acgcagatta caaagatctg atcgagctga ccgaatcgct gttccgtact 900
ctggcacagg atattctcgg taagacggaa gtgacctacg gcgacgtgac gctggacttc 960
ggtaaaccgt tcgaaaaact gaccatgcgt gaagcgatca agaaatatcg cccggaaacc 1020
gacatggcgg atctggacaa cttcgactct gcgaaagcaa ttgctgaatc tatcggcatc 1080
cacgttgaga agagctgggg tctgggccgt atcgttaccg agatcttcga agaagtggca 1140
gaagcacatc tgattcagcc gaccttcatt actgaatatc cggcagaagt ttctccgctg 1200
gcgcgtcgta acgacgttaa cccggaaatc acagaccgct ttgagttctt cattggtggt 1260
cgtgaaatcg gtaacggctt tagcgagctg aatgacgcgg aagatcaggc gcaacgcttc 1320
ctggatcagg ttgccgcgaa agacgcaggt gacgacgaag cgatgttcta cgatgaagat 1380
tacgtcaccg cactggaaca tggcttaccg ccgacagcag gtctgggaat tggtatcgac 1440
cgtatggtaa tgctgttcac caacagccat accatccgcg acgttattct gttcccggcg 1500
atgcgtccgg taaaataa 1518
<210>14
<211>1518
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>lysU赖氨酸-tRNA合成酶,热诱导型
<400>14
atgtctgaac aagaaacacg gggagccaat gaggctattg attttaacga tgaactgaga 60
aatcgccgcg aaaaactggc ggcactacgt cagcaaggtg tggcgtttcc caatgatttt 120
cgccgcgacc atacctctga ccagttgcac gaagagtttg atgcgaagga taaccaggaa 180
ctggaatcct taaacattga agtctcggtt gctggccgaa tgatgacccg tcgtatcatg 240
gggaaagcct cctttgtaac gttgcaggat gtcggtggcc gtattcaact gtacgttgca 300
agagatagcc tgccagaagg tgtttataac gatcagttta aaaaatggga tctgggtgac 360
attatcggtg cccgcggtac gctgtttaag acgcaaacgg gtgagctttc cattcactgt 420
actgagctgc gcctgctgac taaagcacta cgtcctttac cagataaatt ccatggtctg 480
caggatcagg aagtccgtta tcgtcaacgt tatctggacc tcatcgctaa cgataaatcc 540
cgtcaaacgt ttgttgtccg ttcaaaaatt ctggccgcta tccgtcaatt catggtcgcg 600
cgcggcttta tggaagtaga aaccccgatg atgcaggtaa ttccaggtgg ggcatctgct 660
cgcccgttta ttacccatca taatgctctg gatttagata tgtatctgcg tatcgcgccg 720
gagctgtatc tgaaacgtct ggttgtaggc ggttttgaac gggtattcga aatcaaccgt 780
aacttccgta atgaaggtat ttctgttcgc cataatcctg agttcacaat gatggaactc 840
tacatggcgt atgcggatta ccacgatttg attgaactga cagagtcact gttccgcacc 900
ctggcacaag aggttctggg taccactaaa gtcacttatg gcgagcatgt gtttgatttc 960
ggcaaaccgt ttgaaaaact caccatgcgc gaagcaatca aaaaatatcg tccagaaacc 1020
gatatggccg acctggataa ttttgatgct gctaaagcat tagctgaatc tatcggtatt 1080
acggtagaga aaagctgggg gttgggacgt attgtcacag agatctttga tgaagtggca 1140
gaagcacatc tgattcagcc aacctttatt acggaatatc cggcagaagt gtccccgctg 1200
gcacgccgta atgatgttaa cccggaaatc accgaccgtt ttgaattctt catcggtggt 1260
cgtgaaatcg gtaatggttt tagcgaatta aacgacgcag aagatcaggc tgaacgtttc 1320
caggaacagg ttaatgctaa agctgcaggt gacgacgaag ccatgttcta tgacgaagat 1380
tacgtgactg cgctggaata tggtctgccg ccaaccgctg gtctgggtat tggtatcgac 1440
cgaatgatta tgctgtttac taacagccat actattcgcg acgttattct cttcccggcg 1500
atgcgcccac agaaataa 1518
<210>15
<211>2034
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>metG甲硫氨酸-tRNA合成酶
<400>15
atgactcaag tcgcgaagaa aattctggtg acgtgcgcac tgccgtacgc taacggctca 60
atccacctcg gccatatgct ggagcacatc caggctgatg tctgggtccg ttaccagcga 120
atgcgcggcc acgaggtcaa cttcatctgc gccgacgatg cccacggtac accgatcatg 180
ctgaaagctc agcagcttgg tatcaccccg gagcagatga ttggcgaaat gagtcaggag 240
catcagactg atttcgcagg ctttaacatc agctatgaca actatcactc gacgcacagc 300
gaagagaacc gccagttgtc agaacttatc tactctcgcc tgaaagaaaa cggttttatt 360
aaaaaccgca ccatctctca gctgtacgat ccggaaaaag gcatgttcct gccggaccgt 420
tttgtgaaag gcacctgccc gaaatgtaaa tccccggatc aatacggcga taactgcgaa 480
gtctgcggcg cgacctacag cccgactgaa ctgatcgagc cgaaatcggt ggtttctggc 540
gctacgccgg taatgcgtga ttctgaacac ttcttctttg atctgccctc tttcagcgaa 600
atgttgcagg catggacccg cagcggtgcg ttgcaggagc aggtggcaaa taaaatgcag 660
gagtggtttg aatctggcct gcaacagtgg gatatctccc gcgacgcccc ttacttcggt 720
tttgaaattc cgaacgcgcc gggcaaatat ttctacgtct ggctggacgc accgattggc 780
tacatgggtt ctttcaagaa tctgtgcgac aagcgcggcg acagcgtaag cttcgatgaa 840
tactggaaga aagactccac cgccgagctg taccacttca tcggtaaaga tattgtttac 900
ttccacagcc tgttctggcc tgccatgctg gaaggcagca acttccgcaa gccgtccaac 960
ctgtttgttc atggctatgt gacggtgaac ggcgcaaaga tgtccaagtc tcgcggcacc 1020
tttattaaag ccagcacctg gctgaatcat tttgacgcag acagcctgcg ttactactac 1080
actgcgaaac tctcttcgcg cattgatgat atcgatctca acctggaaga tttcgttcag 1140
cgtgtgaatg ccgatatcgt taacaaagtg gttaacctgg cctcccgtaa tgcgggcttt 1200
atcaacaagc gttttgacgg cgtgctggca agcgaactgg ctgacccgca gttgtacaaa 1260
accttcactg atgccgctga agtgattggt gaagcgtggg aaagccgtga atttggtaaa 1320
gccgtgcgcg aaatcatggc gctggctgat ctggctaacc gctatgtcga tgaacaggct 1380
ccgtgggtgg tggcgaaaca ggaaggccgc gatgccgacc tgcaggcaat ttgctcaatg 1440
ggcatcaacc tgttccgcgt gctgatgact tacctgaagc cggtactgcc gaaactgacc 1500
gagcgtgcag aagcattcct caatacggaa ctgacctggg atggtatcca gcaaccgctg 1560
ctgggccaca aagtgaatcc gttcaaggcg ctgtataacc gcatcgatat gaggcaggtt 1620
gaagcactgg tggaagcctc taaagaagaa gtaaaagccg ctgccgcgcc ggtaactggc 1680
ccgctggcag atgatccgat tcaggaaacc atcacctttg acgacttcgc taaagttgac 1740
ctgcgcgtgg cgctgattga aaacgcagag tttgttgaag gttctgacaa actgctgcgc 1800
ctgacgctgg atctcggcgg tgaaaaacgc aatgtcttct ccggtattcg ttctgcttac 1860
ccggatccgc aggcactgat tggtcgtcac accattatgg tggctaacct ggcaccacgt 1920
aaaatgcgct tcggtatctc tgaaggcatg gtgatggctg ccggtcctgg cgggaaagat 1980
attttcctgc taagcccgga tgccggtgct aaaccgggtc atcaggtgaa ataa 2034
<210>16
<211>984
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>pheS苯丙氨酸-tRNA合成酶,α-亚单位
<400>16
atgtcacatc tcgcagaact ggttgccagt gcgaaggcgg ccattagcca ggcgtcagat 60
gttgccgcgt tagataatgt gcgcgtcgaa tatttgggta aaaaagggca cttaaccctt 120
cagatgacga ccctgcgtga gctgccgcca gaagagcgtc cggcagctgg tgcggttatc 180
aacgaagcga aagagcaggt tcagcaggcg ctgaatgcgc gtaaagcgga actggaaagc 240
gctgcactga atgcgcgtct ggcggcggaa acgattgatg tctctctgcc aggtcgtcgc 300
attgaaaacg gcggtctgca tccggttacc cgtaccatcg accgtatcga aagtttcttc 360
ggtgagcttg gctttaccgt ggcaaccggg ccggaaatcg aagacgatta tcataacttc 420
gatgctctga acattcctgg tcaccacccg gcgcgcgctg accacgacac tttctggttt 480
gacactaccc gcctgctgcg tacccagacc tctggcgtac agatccgcac catgaaagcc 540
cagcagccac cgattcgtat catcgcgcct ggccgtgttt atcgtaacga ctacgaccag 600
actcacacgc cgatgttcca tcagatggaa ggtctgattg ttgataccaa catcagcttt 660
accaacctga aaggcacgct gcacgacttc ctgcgtaact tctttgagga agatttgcag 720
attcgcttcc gtccttccta cttcccgttt accgaacctt ctgcagaagt ggacgtcatg 780
ggtaaaaacg gtaaatggct ggaagtgctg ggctgcggga tggtgcatcc gaacgtgttg 840
cgtaacgttg gcatcgaccc ggaagtttac tctggtttcg ccttcgggat ggggatggag 900
cgtctgacta tgttgcgtta cggcgtcacc gacctgcgtt cattcttcga aaacgatctg 960
cgtttcctca aacagtttaa ataa 984
<210>17
<211>2388
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>pheT苯丙氨酸-tRNA合成酶,β-亚单位
<400>17
atgaaattca gtgaactgtg gttacgcgaa tgggtgaacc cggcgattga tagcgatgcg 60
ctggcaaatc aaatcactat ggcgggcctg gaagttgacg gtgtagaacc ggttgccggc 120
agcttccacg gcgtggtcgt tggtgaagtg gttgagtgtg cgcagcatcc gaacgctgac 180
aaactgcgtg tgacaaaagt gaatgtcggc ggcgatcgcc tgctggacat cgtctgcggt 240
gcgccaaact gccgtcaggg cctgcgtgta gcggtagcga ccattggtgc tgttctgccg 300
ggtgatttca aaattaaagc ggcgaaactg cgtggcgaac cgtctgaagg gatgctgtgc 360
tccttctctg aactgggcat ttctgacgat cacagcggca ttatcgaact gcctgcggat 420
gcgccgattg gcaccgatat ccgtgaatac ctgaaacttg atgacaacac catcgaaatc 480
agcgtgacgc caaaccgtgc cgactgctta ggcatcattg gtgttgcgcg tgacgttgcc 540
gtgctgaacc agctgccgct ggttcaaccg gaaatcgttc cggttggtgc gaccatcgac 600
gacacgctgc cgattacagt cgaagcgccg gaagcctgcc cgcgttatct tggccgtgtg 660
gtaaaaggca ttaacgttaa agcgccaact ccgctgtgga tgaaagaaaa actgcgtcgt 720
tgcgggatcc gttctatcga tgcagttgtt gacgtcacca actatgtgct gctcgaactg 780
ggccagccga tgcacgcttt cgataaagat cgcattgaag gcggcattgt ggtgcggatg 840
gcgaaagagg gcgaaacgct ggtgctgctc gacggtactg aagcgaagct gaatgctgac 900
actctggtca tcgccgacca caacaaggcg ctggcgatgg gcggcatctt cggtggcgaa 960
cactctggcg tgaatgacga aacacaaaac gtgctgctgg aatgcgcgtt ctttagcccg 1020
ctgtctatca ccggtcgtgc tcgtcgtcat ggcctgcata ccgatgcgtc tcaccgttat 1080
gagcgtggcg ttgatccggc actgcagcac aaagcgatgg aacgtgcgac ccgtctgctg 1140
atcgacatct gcggtggtga ggctggcccg gtaattgata tcaccaacga agcaacgctg 1200
ccgaagcgtg caaccatcac tctacgtcgt agcaaactgg atcgcctgat cggccatcat 1260
attgcggatg agcaggtaac tgacattctg cgtcgtctcg gctgcgaagt gaccgaaggc 1320
aaagacgaat ggcaggcagt tgcgccgagc tggcgtttcg atatggagat tgaagaagat 1380
ctggttgaag aagtcgcgcg tgtttacggc tacaacaaca tcccggatga gccggtacag 1440
gcaagcctga ttatgggtac tcaccgtgaa gctgacctgt cgctcaagcg cgtgaaaacg 1500
ctgctcaacg acaaaggcta tcaggaagtg atcacctaca gcttcgttga tccgaaagtg 1560
cagcagatga tccatccagg cgttgaagcc ttactgctgc caagcccgat ctctgttgaa 1620
atgtcagcaa tgcgtctttc tctgtggact ggcctgctgg caaccgtggt gtacaaccag 1680
aaccgtcagc agaaccgtgt gcgcattttc gaaagcggtc tgcgtttcgt accagatact 1740
caggcaccgt tgggcattcg tcaggatctg atgttagccg gtgtgatttg cggtaaccgt 1800
tacgaagagc actggaacct ggcaaaagag accgttgatt tctatgattt gaaaggcgat 1860
cttgaatccg ttctcgacct gaccggtaaa ctgaatgagg ttgagttccg tgcagaagcg 1920
aatccggcac tgcatccggg gcaatccgca gcgatttatc tgaaaggtga acgtattggt 1980
tttgttgggg ttgttcatcc tgaactggaa cgtaaactgg atcttaacgg tcgcactctg 2040
gtgttcgaac tggagtggaa caagctcgca gaccgcgtgg tgcctcaggc gcgcgagatt 2100
tctcgcttcc cggcgaaccg tcgtgacatc gcggtggtgg tcgcagaaaa cgttcccgca 2160
gcggatattt tatccgaatg taagaaagtt ggcgtaaatc aggtagttgg cgtaaactta 2220
tttgacgtgt accgcggtaa gggtgttgcg gaggggtata agagcctcgc cataagcctg 2280
atcctgcaag ataccagccg tacactcgaa gaagaggaga ttgccgctac cgtcgccaaa 2340
tgtgtagagg cattaaaaga gcgattccag gcatcattga gggattga 2388
<210>18
<211>978
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>赖氨酰-tRNA合成酶,genX
<400>18
atgagcgaaa cggcatcctg gcagccgagc gcatccattc ctaacttatt aaaacgcgcg 60
gcgattatgg cggagatccg tcgtttcttt gccgatcgtg gagtgctgga ggtggagacg 120
ccttgtatga gccaggcgac ggtaaccgat attcatttgg tcccgtttga gacacgtttc 180
gttggccccg ggcattcgca ggggatgaat ctctggttaa tgaccagccc ggaataccat 240
atgaaacgcc tgctggttgc cggttgtggg ccggtattcc agctgtgccg cagcttccgt 300
aatgaagaga tggggcgtta tcacaaccct gagttcacta tgctggagtg gtatcgaccg 360
cactatgata tgtaccggtt gatgaacgag gtggacgatc tcttacaaca ggtgctggac 420
tgcccggcag cagaaagcct ttcttatcaa caagctttct tgcgttatct ggaaattgac 480
ccgctctctg ccgacaaaac gcaactgcgg gaagtcgcag cgaaactgga tttgagcaat 540
gttgctgata ccgaagaaga ccgcgacacg ctgctacaat tgctgtttac ctttggcgta 600
gagccaaata ttggcaaaga aaaaccgacc tttgtgtacc actttccagc cagccaggca 660
tcactggcgc aaatcagtac cgaagatcat cgggtcgctg aacgctttga ggtttattat 720
aaaggtattg agctggcgaa tggtttccat gaattgacgg atgcccgtga gcagcaacaa 780
cgctttgaac aagataaccg taagcgcgcg gcgcgcggtt tgccgcagca ccccattgac 840
cagaatctga ttgaagcctt gaaagtcggt atgcctgact gttccggcgt ggcattaggt 900
gttgatcgtc tggtgatgtt ggcgctgggc gcggagacac tggctgaagt catcgccttt 960
agcgttgacc gggcataa 978
<210>19
<211>1719
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>proS脯氨酸-tRNA合成酶
<400>19
atgcgtacta gccaatacct gctctccact ctcaaggaga cacctgccga cgccgaggtg 60
atcagccatc agctgatgct gcgcgccggg atgatccgca agctggcctc cgggttatat 120
acctggctgc cgaccggcgt gcgcgttctg aaaaaagtcg aaaacatcgt gcgtgaagag 180
atgaacaacg ccggtgcgat cgaggtgtcg atgccggtgg ttcagccagc cgatttgtgg 240
caagagagtg gtcgttggga acagtacggt ccggaactgc tgcgttttgt tgaccgtggc 300
gagcgtccgt tcgtactcgg cccaactcat gaagaagtta tcactgacct gattcgtaac 360
gagcttagct cttacaaaca gctgccgctg aacttctatc agatccagac caagttccgc 420
gacgaagtgc gtccgcgttt cggcgtcatg cgttcccgcg aattcctgat gaaagatgct 480
tactctttcc atacttctca ggaatccctg caggaaacct acgatgcaat gtatgcggcc 540
tacagcaaaa tcttcagccg catggggctg gatttccgcg ccgtacaagc cgacaccggt 600
tctatcggcg gcagcgcctc tcacgaattc caggtgctgg cgcagagcgg tgaagacgat 660
gtggtcttct ccgacacctc tgactatgca gcgaacattg aactggcaga agctatcgcg 720
ccgaaagaac cgcgcgctgc tgctacccag gaaatgacgc tggttgatac gccgaacgcg 780
aaaaccatcg cggaactggt tgaacagttc aatctgccga ttgagaaaac ggttaagact 840
ctgctggtta aagcggttga aggcagcagc ttcccgcagg ttgcgctgct ggtgcgcggt 900
gatcacgagc tgaacgaagt taaagcagaa aaactgccgc aggttgcaag cccgctgact 960
ttcgcgaccg aagaagaaat tcgtgccgtg gttaaagccg gtccgggttc actgggtccg 1020
gtaaacatgc cgattccggt ggtgattgac cgtaccgttg cggcgatgag tgatttcgct 1080
gctggtgcta acatcgatgg taaacactac ttcggcatca actgggatcg cgatgtcgct 1140
accccggaag ttgcagatat ccgtaacgtg gtggctggcg atccaagccc ggatggccag 1200
ggtaggctgc tgatcaaacg tggtatcgaa gttggtcaca tcttccagct gggtaccaag 1260
tactccgaag cactgaaagc ctccgtacag ggtgaagatg gccgtaacca aatcctgacg 1320
atgggttgct acggtatcgg ggtaacgcgt gtggtagctg cggcgattga gcagaactac 1380
gacgaacgag gcatcgtatg gcctgacgct atcgcgccgt tccaggtggc gattctgccg 1440
atgaacatgc acaaatcctt ccgcgtacaa gagcttgctg agaaactgta cagcgaactg 1500
cgtgcacaag gtatcgaagt gctgctggat gaccgcaaag agcgtccggg cgtgatgttt 1560
gctgatatgg aactgatcgg tattccgcac actattgtgc tgggcgaccg taacctcgac 1620
aacgacgata tcgaatataa atatcgtcgc aacggcgaga aacagttaat taagactggt 1680
gacatcgtcg aatatctggt gaaacagatt aaaggctga 1719
<210>20
<211>1293
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>serS丝氨酸-tRNA合成酶
<400>20
atgctcgatc ccaatctgct gcgtaatgag ccagacgcag tcgctgaaaa actggcacgc 60
cggggcttta agctggatgt agataagctg ggcgctcttg aagagcgtcg taaagtattg 120
caggtcaaaa cggaaaacct gcaagcggag cgtaactccc gatcgaaatc cattggccag 180
gcgaaagcgc gcggggaaga tatcgagcct ttacgtctgg aagtgaacaa actgggcgaa 240
gagctggatg cagcaaaagc cgagctggat gctttacagg ctgaaattcg cgatatcgcg 300
ctgaccatcc ctaacctgcc tgcagatgaa gtgccggtag gtaaagacga aaatgacaac 360
gttgaagtca gccgctgggg taccccgcgt gagtttgact ttgaagttcg tgaccacgtg 420
acgctgggtg aaatgcactc tggcctcgac tttgcagctg cagttaagct gactggttcc 480
cgctttgtgg taatgaaagg gcagattgct cgcatgcacc gcgcactgtc gcagtttatg 540
ctggatctgc ataccgaaca gcatggctac agtgagaact atgttccgta cctggttaac 600
caggacacgc tgtacggtac gggtcaactg ccgaaatttg ctggcgatct gttccatact 660
cgtccgctgg aagaagaagc agacaccagt aactatgcgc tgatcccaac ggcagaagtt 720
ccgctgacta acctggtgcg cggtgaaatc atcgatgaag atgatctgcc aattaagatg 780
accgcccaca ccccatgctt ccgttctgaa gccggttcat atggtcgtga cacccgtggt 840
ctgatccgta tgcaccagtt cgacaaagtt gaaatggtgc agatcgtgcg cccagaagac 900
tcaatggcgg cgctggaaga gatgactggt catgcagaaa aagtcctgca gttgctgggc 960
ctgccgtacc gtaaaatcat cctttgcact ggcgacatgg gctttggcgc ttgcaaaact 1020
tacgacctgg aagtatggat cccggcacag aacacctacc gtgagatctc ttcctgctcc 1080
aacgtttggg atttccaggc acgtcgtatg caggcacgtt gccgcagcaa gtcggacaag 1140
aaaacccgtc tggttcatac cctgaacggt tctggtctgg ctgttggtcg tacgctggtt 1200
gcagtaatgg aaaactatca gcaggctgat ggtcgtattg aagtaccaga agttctgcgt 1260
ccgtatatga acggactgga atatattggc taa 1293
<210>21
<211>1929
<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>thrS苏氨酸-tRNA合成酶,自调节
<400>21
atgcctgtta taactcttcc tgatggcagc caacgccatt acgatcacgc tgtaagcccc 60
atggatgttg cgctggacat tggtccaggt ctggcgaaag cctgtatcgc agggcgcgtt 120
aatggcgaac tggttgatgc ttgcgatctg attgaaaacg acgcacaact gtcgatcatt 180
accgccaaag acgaagaagg tctggagatc attcgtcact cctgtgcgca cctgttaggg 240
cacgcgatta aacaactttg gccgcatacc aaaatggcaa tcggcccggt tattgacaac 300
ggtttttatt acgacgttga tcttgaccgc acgttaaccc aggaagatgt cgaagcactc 360
gagaagcgga tgcatgagct tgctgagaaa aactacgacg tcattaagaa gaaagtcagc 420
tggcacgaag cgcgtgaaac tttcgccaac cgtggggaga gctacaaagt ctccattctt 480
gacgaaaaca tcgcccatga tgacaagcca ggtctgtact tccatgaaga atatgtcgat 540
atgtgccgcg gtccgcacgt accgaacatg cgtttctgcc atcatttcaa actaatgaaa 600
acggcagggg cttactggcg tggcgacagc aacaacaaaa tgttgcaacg tatttacggt 660
acggcgtggg cagacaaaaa agcacttaac gcttacctgc agcgcctgga agaagccgcg 720
aaacgcgacc accgtaaaat cggtaaacag ctcgacctgt accatatgca ggaagaagcg 780
ccgggtatgg tattctggca caacgacggc tggaccatct tccgtgaact ggaagtgttt 840
gttcgttcta aactgaaaga gtaccagtat caggaagtta aaggtccgtt catgatggac 900
cgtgtcctgt gggaaaaaac cggtcactgg gacaactaca aagatgcaat gttcaccaca 960
tcttctgaga accgtgaata ctgcattaag ccgatgaact gcccgggtca cgtacaaatt 1020
ttcaaccagg ggctgaagtc ttatcgcgat ctgccgctgc gtatggccga gtttggtagc 1080
tgccaccgta acgagccgtc aggttcgctg catggcctga tgcgcgtgcg tggatttacc 1140
caggatgacg cgcatatctt ctgtactgaa gaacaaattc gcgatgaagt taacggatgt 1200
atccgtttag tctatgatat gtacagcact tttggcttcg agaagatcgt cgtcaaactc 1260
tccactcgtc ctgaaaaacg tattggcagc gacgaaatgt gggatcgtgc tgaggcggac 1320
ctggcggttg cgctggaaga aaacaacatc ccgtttgaat atcaactggg tgaaggcgct 1380
ttctacggtc cgaaaattga atttaccctg tatgactgcc tcgatcgtgc atggcagtgc 1440
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gacaatgaac gtaaagtacc ggtaatgatt caccgcgcaa ttctggggtc gatggaacgt 1560
ttcatcggta tcctgaccga agagttcgct ggtttcttcc cgacctggct tgcgccggtt 1620
caggttgtta tcatgaatat taccgattca cagtctgaat acgttaacga attgacgcaa 1680
aaactatcaa atgcgggcat tcgtgttaaa gcagacttga gaaatgagaa gattggcttt 1740
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gtggaatcag gcaaagttgc cgttcgcacc cgccgtggta aagacctggg aagcatggac 1860
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gaggaataa 1929
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<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>trpS色氨酸-tRNA合成酶
<400>22
atgactaagc ccatcgtttt tagtggcgca cagccctcag gtgaattgac cattggtaac 60
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gataatcgca ataacgttat cggcctgctg gaagatccga aatcggtagt gaagaaaatc 660
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ctaaaagcgg tgtacgaagc gattggtttt gtggcgaagc cgtaa 1005
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<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>tyrS酪氨酸-tRNA合成酶
<400>23
atggcaagca gtaacttgat taaacaattg caagagcggg ggctggtagc ccaggtgacg 60
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<210>24
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<212>DNA
<213>大肠杆菌
<220>
<223>valS缬氨酸-tRNA合成酶
<400>24
atggaaaaga catataaccc acaagatatc gaacagccgc tttacgagca ctgggaaaag 60
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cgttacaaag atctgattgg caaatatgtc attctgccgc tggttaaccg tcgtattccg 780
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gcgcacgact ttaacgacta tgaagtgggt aaacgtcacg ccctgccgat gatcaacatc 900
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<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>丙氨酰-tRNA合成酶
<400>25
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gacaaagagc ttctctctgt tacggttcat cctgaagatg aagaggcata tgagttttgg 420
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ggtaatgatc cagaagatcc ggagctttac ccaggcgggg aaaacgaccg ttacctggaa 600
gtatggaacc ttgtgttctc agagttcaac cataaccctg acggcacgta cacaccgctt 660
ccaaagaaaa atattgatac aggcatgggt cttgaaagaa tggtgtctgt catccagaat 720
gttccgacaa actttgacac cgatttgttt gttccgatca ttaaagcaac agaatcgatt 780
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catatcagaa cggttgcctt tgctgtcagt gacggtgcgc tgccgtcaaa tgaaggccgc 900
ggctatgtat taagacgctt attacgccgt gccgtgcgtt atgccaaaac gatcaacatc 960
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cctgaagtga aagagaaagc ggatttcatc gcaaaagtca ttaaaaccga ggaagaacgc 1080
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ggcgtcatta aaaaccacac ggcaacgcat ttattgcatc aggctctaaa agatgttctt 1740
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ttgtttaaaa tcgtttctga atccggaatc ggagcaggca caagacggat tgaagctgta 2100
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tctgcggtga tcgtgcttgg tgcggtacaa aacgataaag ttaatatctc tgccggagtc 2460
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<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>精氨酰-tRNA合成酶
<400>26
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<212>DNA
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<223>天冬酰胺酰tRNA合成酶
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gttgaggcag acggagtgaa aggcccgatc gctaaattct ttgatgaaga aaagcagtct 1140
aagctgattg aagcacttga tgctgctgaa ggtgatttgc tgctgttcgg agcggatcaa 1200
ttcgaagttg tggccgcatc actcggcgcc ctgcgcttaa agcttgggaa agaacgcgga 1260
ctgattgacg aaaaattgtt caatttctta tgggtcatcg actggccgct attagagcat 1320
gatccggaag aaggccgttt ttacgcagcg caccatccgt tcacaatgcc tgtccgagaa 1380
gaccttgagc tgattgaaac agcgcctgaa gacatgaaag cgcaagctta tgacctcgtc 1440
ttaaacggct atgagcttgg cggcggttca atccgtattt tcgaaaagga tattcaggaa 1500
aaaatgtttg cgcttctcgg cttctcacca gaagaagcgg ctgaacagtt cggattcctg 1560
ctggaagcat ttgaatacgg cgctcctccg cacggcggaa tcgcactcgg cttagaccgt 1620
ctcgttatgc ttctcgctgg acgtacgaac ctgagagata cgattgcatt cccgaaaacg 1680
gcaagtgcaa gctgcctgat gacagaagcg ccaggcgaag taagcgacgc ccagcttgac 1740
gagcttcatc tttctatcaa gaaaaaagtt aagaac 1776
<210>29
<211>1398
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>半胱氨酰-tRNA合成酶
<400>29
atgacaatca cactttataa tacattgact agacagaagg aaacattcgt tcctcttgaa 60
gagggaaaag tgaaaatgta tgtatgcgga cccacggttt acaattacat tcatatcggg 120
aacgcgcgtc cggcaatcgt ttacgatacg gttcgaaact atttagagta taaaggctat 180
gatgtgcagt atgtctctaa cttcacagac gtagacgata aattaattaa agcggcaaat 240
gaactcggtg aggatgtacc caccatttca gagcgtttta ttaaagcata ctttgaagac 300
gtaggtgcgc tcggctgccg aaaagccgac cttcatccgc gagtaatgga gaacatggat 360
gccattatcg aattcgtaga tcagctcgtg aaaaagggct acgcatatga atcagaaggt 420
gacgtatatt tcaaaaccag agcatttgaa gggtacggaa agctttctca gcaatcaatc 480
gatgaactaa gatcaggtgc acgcatccgg gtcggcgaga aaaaagaaga tgctcttgat 540
ttcgcactgt ggaaagcggc aaaagaagga gaaatctctt gggatagccc ttgggggaaa 600
gggcgtccgg gctggcacat tgaatgctca gcaatggtga aaaagtatct cggtgaccag 660
attgatatcc atgcgggcgg acaggattta acattccctc accatgaaaa cgaaattgcg 720
caatctgagg cgctgacagg caaaacgttt gcgaagtact ggcttcataa tggttatatc 780
aatattgata atgaaaaaat gtcaaaatca ctaggcaact ttgtgcttgt gcatgacatc 840
attaaacagc atgatccgca gcttttgaga ttctttatgc tatctgttca ttatcgccat 900
ccgattaact attcagaaga gcttctggag aatacgaaaa gcgcgttcag ccgtttaaaa 960
acagcgtaca gcaatcttca gcaccgtctg aacagcagta cgaatttaac cgaagatgac 1020
gatcaatggc ttgaaaaggt tgaagaacac cgcaaagcat tcgaagaaga gatggacgat 1080
gattttaata cggcgaatgc catttcagtc ttgtttgact tagcgaaaca cgccaattat 1140
tatcttcaga aagatcatac ggctgatcat gtgattacgg cgtttattga gatgtttgac 1200
cgcattgttt ctgtcctcgg tttttcgttg ggtgagcagg aacttctcga tcaagagatt 1260
gaagacttaa tcgaaaagcg aaatgaagcg cgccggaatc gcgattttgc attgtcagac 1320
cagatccgcg accagctgaa aagcatgaat atcattcttg aagatacggc tcaaggcact 1380
cgctggaaac ggggagaa 1398
<210>30
<211>1449
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>谷氨酰-tRNA合成酶
<400>30
atgggaaacg aagtacgcgt ccgttatgca ccgagtccaa ccggacattt gcatattgga 60
aatgccagaa cggcgctttt taattattta tttgcccgca atcaaggcgg taagtttatc 120
attcgagttg aggatactga taaaaagcgc aatattgagg gcggagaaca aagccagctg 180
aattatctga agtggctagg tattgactgg gatgagagtg tggatgtcgg aggagagtac 240
ggtccatacc gtcagtcaga gcgtaacgat atctataaag tgtactatga agagcttctt 300
gaaaaagggc ttgcttataa atgttactgt acggaagaag agcttgaaaa agagcgtgaa 360
gaacagattg cccgcggaga aatgcctcgt tattccggaa aacacagaga cctgactcag 420
gaagaacagg agaaatttat cgccgaaggc agaaaaccaa gtattcgttt ccgtgtgccg 480
gaaggaaaag tcatcgcctt caacgacatc gtaaaaggcg aaatttcttt tgaatcagat 540
ggcatcggcg acttcgttat tgtgaaaaag gacggaacgc ctacttataa cttcgcggta 600
gctattgatg actacttaat gaaaatgaca cacgtgctgc gcggtgagga tcatatttct 660
aacacaccga aacagattat gatctatcaa gcattcgggt gggatattcc tcagttcgga 720
cacatgacgc tgattgtaaa cgaaagccgt aaaaagctca gcaaacgtga tgaatccatt 780
attcaattca tcgagcagta caaagagctt ggctacctgc cagaagcgct gttcaacttt 840
atcggcttgt taggctggtc accggttgga gaagaagagc ttttcacaaa agagcagttt 900
attgaaattt ttgatgtaaa tcgtttatct aaatcaccag ctttgtttga tatgcataag 960
ctaaaatggg ttaacaacca atatgtgaag aagctggatc ttgatcaggt tgttgaactg 1020
acgcttccgc atttgcaaaa agccggcaaa gttggcactg agctttctgc tgaagaacaa 1080
gaatgggttc gtaaactgat ttccctgtat catgagcaat taagctacgg tgcggaaatt 1140
gttgagctga ctgatttgtt ctttacggat gagatcgagt ataatcaaga agcgaaagct 1200
gttctggaag aagaacaggt tcctgaagtg ctcagcacat tcgcagcgaa gcttgaagag 1260
cttgaggagt tcactccgga taatatcaaa gcatcgatca aagcagtgca gaaagaaact 1320
ggccataaag ggaaaaaact gtttatgccg attcgtgttg ctgtaacagg gcaaactcac 1380
ggtccggaac tgccgcaatc aattgaattg atcggtaaag agactgcaat tcagcgttta 1440
aagaatatc 1449
<210>31
<211>1458
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>谷氨酰-tRNA酰胺转移酶,亚单位a
<400>31
atgtcattat ttgatcataa aatcacagaa ttaaaacagc tcatacataa aaaagagatt 60
aagatttctg atctggttga tgaatcttat aaacgcatcc aagcggttga tgataaggta 120
caagcctttt tggcattaga tgaagaaaga gcgcgcgcat acgcgaagga gcttgatgag 180
gcggttgacg gccgttctga gcacggtctt cttttcggta tgccgatcgg cgtaaaagat 240
aatatcgtaa caaaagggct gcgcacaaca tgctccagca aaattctcga aaactttgat 300
ccgatttacg atgctactgt cgttcagcgc cttcaagacg ctgaagcggt cacaatcgga 360
aaactgaaca tggacgaatt cgccatgggg tcatctacag aaaactcagc ttacaagctg 420
acgaaaaacc cttggaacct ggatacagtt cccggcggtt caagcggcgg atctgcagct 480
gcggttgctg cgggagaagt tccgttttct cttggatctg acacaggcgg ctccatccgt 540
cagccggcat ctttctgcgg cgttgtcgga ttaaaaccta catacggacg tgtatctcgt 600
tacggcctgg tcgcatttgc gtcttcattg gaccaaatcg gaccgattac acgtacggtt 660
gaggataacg cgtttttact tcaagcgatt tccggcgtag acaaaatgga ctctacgagt 720
gcaaatgtgg acgtgcctga ttttctttct tcattaactg gcgacatcaa aggactgaaa 780
atcgccgttc cgaaagaata ccttggtgaa ggtgtcggca aagaagcgag agaatctgtc 840
ttggcagcgc tgaaagtcct tgaaggtctc ggcgctacat gggaagaagt gtctcttccg 900
cacagtaaat acgcgcttgc gacatattac ctgctgtcat cttctgaagc gtcagcgaac 960
cttgcacgct ttgacggcat ccgctacggc taccgcacag acaacgcgga taacctgatc 1020
gacctttaca agcaaacgcg cgctgaaggt ttcggaaatg aagtcaaacg ccgcatcatg 1080
ctcggaacgt ttgctttaag ctcaggctac tacgatgcgt actacaaaaa agcgcaaaaa 1140
gtgcgtacgt tgattaagaa ggatttcgag gacgtatttg aaaaatatga tgttattgtt 1200
ggaccgacta caccgacacc tgcgtttaaa atcggtgaaa acacgaagga tccgctcaca 1260
atgtacgcaa acgatatctt aacgattccg gtcaaccttg ccggcgtacc gggaatcagt 1320
gtgccatgcg gattagcaga cggacttccg ctcggcctgc aaatcatcgg aaaacacttt 1380
gatgaaagca ctgtataccg cgttgctcat gcatttgaac aagcaacaga ccatcataaa 1440
gcaaaacctg aactgtaa 1458
<210>32
<211>885
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>甘氨酸tRNA合成酶,α亚单位
<400>32
atgaatattc aagacatgat tctaaccttg caaaagcatt ggtccagtca gggctgtgtg 60
cttatgcagg cttacgatgt agaaaaagga gccggcacga tgagcccgta tacatttttg 120
cgcagtatcg gtcctgagcc gtggaaagtg gcttatgtag agccttccag acgtccggca 180
gacggccgct acggggagaa cccgaacaga ctgtatcagc atcatcagtt ccaggtcatt 240
attaaaccgt cacctgataa cattcaagag ctgtatttgg attccttgcg tgctcttgga 300
attgatccgc ttgagcacga tattcgcttt gttgaagaca actgggagaa tccgtcttta 360
ggctgcgcgg gtctaggctg ggaagtttgg cttgacggaa tggaaataac acaatttacg 420
tatttccagc aggtcggggg attagagtgt aaacccgttt ctgtagagat tacgtatgga 480
attgagcgtc tcgcgtctta tatccaggat aaagaaaacg tgtttgactt ggaatggacg 540
tcagggttta cagtaaaaga tttattcatg atggctgaat atgagcattc tgtttatacg 600
tttgaaacat cagacgtcga tatgctgttc caattgttca gcacatatga aaaagaagcg 660
atcaagcaaa tggacaacgg acttgttcat ccagcatatg actatgtgct gaaatgctcg 720
cacactttca acctgcttga tgccaaaggt gcgatctctg ttaccgagcg gacgggctat 780
atcgcaagag tgcggaattt agctagaaaa gtagcaaaaa cctactatga ggaacgagaa 840
aaactagggt tcccaatgct taaaggggag ggttcttctc atgag 885
<210>33
<211>2037
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>甘氨酸tRNA合成酶,β亚单位
<400>33
atgagtaaac aggatttact tttagagatc ggattagagg aaatgccggc gcgctttttg 60
aatgaaagca tggttcagct tggcgacaag ctgacaggct ggcttaaaga aaaaaatatt 120
actcacggtg aagtgaaact cttcaataca ccgagacgtc ttgctgtgtt cgttaaggat 180
gtcgcagaaa agcaggatga tataaaagaa gaagcaaaag ggcctgcgaa aaaaattgcc 240
cttgatgcgg acgggaactg gacaaaagcg gcaatcggct tttcaaaagg ccaaggcgca 300
aatgtggaag acctgtacat caaagaagta aaaggcatag agtatgtatt cgtgcaaaaa 360
ttccaagccg gccaagaaac gaagtcgctt ctgccagaat tgagcggttt aattacaagc 420
ttgcatttcc cgaaaaacat gcgctgggga aatgaagatt tgcgttatat ccgaccgatc 480
aaatggattg tcgcattatt tggacaggat gtcattccat tttcgatcac aaacgttgag 540
tctggacgga caacacaggg acaccgtttc ctcggacatg aagtgtcaat tgaatcacct 600
tcagcttatg aagagcagct caaaggacag catgttattg ctgatcctag cgtccgaaag 660
caaatgattc aatctcagct ggaaacaatg gctgctgaaa acaattggag cattccagtt 720
gacgaagacc ttcttgatga agtgaatcat ttagtagaat acccgacagc tctttacggt 780
tcatttgaat ccgagtttct gtcaattcct gaagaagtgc ttgtcacgac aatgaaagag 840
catcagcgct acttccctgt caaagacaaa aacggtgacc tgctgcctca ctttatcaca 900
gtccgaaacg gcaacagcca cgcgattgaa aatgtggccc gaggcaatga aaaagtgctg 960
cgcgcacgtt tatctgatgc ttcattcttc tacaaagaag atcagaaact aaacattgat 1020
gcaaatgtga agaagcttga aaatatcgtt ttccatgaag agcttggttc tcttgctgat 1080
aaggttagga gagtcacatc aatcgcagag aaacttgccg ttcgtcttca ggctgatgaa 1140
gatacattaa aacatgtgaa gcgggctgct gaaatttcta aattcgacct tgtgacgcat 1200
atgatatatg aattccctga acttcaagga attatgggcg aaaagtatgc gagaatgctt 1260
ggcgaagatg aagctgtggc tgcggcagtt aatgaacatt atatgcctag atcagcgggc 1320
ggagaaacgc cttctacttt caccggagct gttgtagcaa tggcggataa gcttgacaca 1380
atcgcttcat tcttctctat cggcgtaatt ccgaccggtt cccaggaccc ttacggactg 1440
ccccgccaag caagcggtat tgttgcgatt ctccttgacc gcaactgggg aatttcattt 1500
gaagagctgc ttactttcgt tcaaaccgat aaagaaaatg aactgctgga tttcttcact 1560
cagcgcttga aatatgtctt gaatgctgaa caaatcagac atgatgtcat tgacgccgtg 1620
ctggaaagct ctgagcttga gccgtactct gcgctgcata aagcacaagt actggagcaa 1680
aagcttggtg cacctggctt taaggaaaca gccgaagcgt taggccgagt gatctctatc 1740
agcaaaaaag gagtccgcgg agacattcag cctgatctgt ttgaaaatga atacgaagca 1800
aaactgtttg atgcctacca aacagcgaag gaaaatctgc aggaaaactt cagcaaaaaa 1860
gattatgagg cggcgcttgc ttcacttgca gccttaaaag aaccgatcga tgcttacttc 1920
gatcatacaa tggttatagc ggataatgag tcattaaagg caaatcgttt agcgcaaatg 1980
gtaagcttgg cggatgagat caagtccttt gcgaatatga atgcccttat tgtaaaa 2037
<210>34
<211>1272
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>组氨酰tRNA合成酶
<400>34
atgggatata acattccgag aggaacacag gatattctgc ctggagaatc agatcgctgg 60
cagtttgttg aacaaattat gagagacact tgccgcactt atcaatataa agaaatccgc 120
acaccgattt ttgagcatac agaactgttt gccagaggcg tcggagaatc aacggatatc 180
gtacaaaaag aaatgtatac cttcgaggac cgcaaaggca gaagcctgac gcttcgtccg 240
gagggaacag ctgctgcggt tcgcgctttt aatgaaaaca agctgttcgc aaatcctgta 300
cagccgacaa agctttatta tgtcgggccg atgttccgtt atgaacgtcc tcagacgggc 360
cgttaccgcc agttttatca gtttggaatt gaagcgattg gttcgaaaga ccctgcaatc 420
gacgctgaag taatggcgct tgcgatgagt atttatgaaa aagcaggttt agaaaacgtt 480
aagcttgtca taaacagtct cggcgatcaa gatagccgca aaagctacag agaagcgctc 540
gtgaaacact tcgagcctcg catcgaagaa ttttgttcag actgccagtc ccggctgcac 600
acgaacccgc ttagaatttt ggactgcaaa aaagaccgtg atcatgagct gatgaaatcg 660
gcaccttcga ttttgacata tttaaatgaa gaatcagccg cttattttga aaaagtgaaa 720
caatacttaa atgatcttgg catttcgtat gaaatcgatc cgaaccttgt gagagggctg 780
gattattaca accacaccgc atttgaaatt atgagcaatg cggagggctt tggcgcgatt 840
acgacacttg ccggcggcgg acgctacgac gggcttgtcg aacagatcgg cggacctgaa 900
gcaccgggca tcggatttgc gatgagcatc gaacgcttgc ttgccgcaat tgatgctgaa 960
aaaagagagc tgcctgttga taagggaatc gactgctata tcgtcacact cggcgaaaaa 1020
gcaaaggatt attctgtttc attggtgtac aaactgagag aagcaggcat ttccagtgaa 1080
atcgattatg aaaataagaa aatgaaaggc cagtttaaaa cagctgatcg cttaaaggcc 1140
agatttattg cgattttggg tgaagatgag cttgcccaaa acaaaatcaa tgtaaaggat 1200
gcacagacgg gcgaacagat tgaagtggca cttgatgaat ttatacatgt gatgaaggca 1260
aaccaaaagg ga 1272
<210>35
<211>2763
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>异亮氨酰-tRNA合成酶
<400>35
atggatttta aagacacgct cttaatgccg aaaacagatt tcccgatgcg tggaaatttg 60
ccaaaccgtg agcctgacat tcaaaaaaaa tgggaggaag aagatatcta ccgtcttgtt 120
caggaacgga cgaaagaccg cccgaaattt gttttacatg acggacctcc gtatgcaaac 180
ggcgacatcc atatgggcca tgcacttaac aagattttga aagacttcat tgtccgctat 240
aaatcaatga gcggctacaa cgcaccgtat gtgccgggct gggatacaca cggattgcca 300
attgaaacag ctctgacaaa aaacaaaaag gtcaaccgca aagaaatgtc agtagcggaa 360
ttccgcaaac tatgcgaaga gtacgcttgg aagcaaatcg agggacagcg tgagcaattc 420
aaacgtcttg gtgtccgcgg tgactgggaa aacccatatg tgacattaaa accggaatac 480
gaagcgcagc aaatccgcgt atttggtgaa atggcaaaac gaggctacat ttacaaaggc 540
cttaaaccgg ttaactggtc accttcaagt gagtctgctc tggctgaagc cgagatcgaa 600
tatcaagata aacgttcagc atctatttac gtcgcttttg gtgtaaaaga cggaaaaggc 660
gttcttgaaa acggcgagcg catcatcatt tggacaacaa cgccgtggac aattccggcg 720
aacctcggaa tctcagtgca ccctgatctt gagtacagcg tgattgcagt aggtgaagac 780
cgctttgttg tagcaagtgc cttagtcgaa aatgttgcat cggcatgcgg atttgatcag 840
tatgaagtga caagaacggt caaagggaaa gaccttgaga acattatcgc tgaacacccg 900
ctatatggca gagactctct cgttatgctt ggtgaacacg taacaactga tgccggaaca 960
ggctgtgttc atacagcgcc tggacatggg gaagatgact ttatcatcgg ccaaaaatac 1020
ggtttagatg tgctttgccc ggtcgatgaa aaaggtgtaa tgacaagcga agctcctggc 1080
tttgaaggca tgttctatga tgatgcaaac aaagcgatca cacagcagct tgatgaaaaa 1140
ggcgcacttg tgaagcttga attcattact cattcttatc cgcatgattg gagaacaaaa 1200
aaaccaacca ttttcagagc aacagcgcaa tggtttgcgt ctattaaaga tttcagatca 1260
gacctgctgg atgccattaa agaaaccaaa tgggttcctg aatggggcga gcagcgtttg 1320
cacaacatgg ttcgggaccg cggagactgg tgtatttcca gacagcgtgc gtggggtgtg 1380
ccgattccgg tattttacgc tgaaaacgga gaaccggtta ttacagatga aaccattgaa 1440
catgtttctg aattgttcag acagcatgga tcaaacattt ggtttgaaaa agaagcaaag 1500
gatcttcttc cggaaggctt tacgcatcct ggcagcccga acggcacatt tacaaaagaa 1560
caggatatca tggatgtttg gtttgattca ggctcttcac atcaagcagt gcttgaagaa 1620
cgtgatgacc tcgttcgccc ggctgatcta tacctagagg gatctgacca atatcgcggc 1680
tggtttaact cttctctttc tacagcagta gccgtaacag ggaaagcgcc gtataaaggt 1740
gtgctcagcc atgggttcgc actggatgga gaaggacgta agatgagtaa atcaatcggt 1800
aacgttgttg ttccggctaa agtcatgaaa cagcttggtg ccgacatctt aagattatgg 1860
gtatcttcag tggattatca ggcggacgtt cgcgtgtctg acgccattct gaagcaggtt 1920
gcggaagtat atcgtaaaat ccgcaacacg ttccgtttcc ttcacggcaa ccttttcgat 1980
tttgatccaa aaacaaatgc ggtggctgtc gaagatcttc gcgaagtgga tcagtatatg 2040
ctgattaagc tgaacaagct gattgataaa gtgaaaaaag cgtatgatga gtacgaattt 2100
gcggttgtgt atcacagcat tcataatttc tgcacaatcg aattgagctc attctacctt 2160
gattttgcaa aagatattgt ctacatcgag catgcggatc atccggatag acgcagcatg 2220
cagacagtat cctacgaaac gcttcttgca ttagtgaagc tttcagcgcc tatccttcca 2280
catacggcag acgaattgtg gtctcattta acatttgttg aagagcagag cgttcagttg 2340
accgatatgc cggaaacaat cacggttcca aacagtgaag cgactgaaga aaaatttgac 2400
cgctttatgg ctcttcgtga tgacgtgtta aaagcattag aaactgcgcg aaatgaaaaa 2460
attatcggta aatctttgga agcaaacctg aaattgtatc caaacaaaga aaacaaggag 2520
ctcttggctt ccataaaaga aaacctttct cagctgttta ttgtgtctga actgacaatc 2580
agcgaagaaa atgaagcgcc gaacgatgcg caaagctttg cgacgggtaa aatcgctgtc 2640
gagaaagcgg aaggcgaaat gtgtgagaga tctcgtgtga tttcaaaaga tgtaggggca 2700
aatccgaaat atcctacact ttcattacgc aacgctgaaa tcgttgaaaa atactatcaa 2760
aaa 2763
<210>36
<211>2412
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>亮氨酸-tRNA合成酶
<400>36
ttgagttttc agcacaaaga gatagaaaag aaatggcaga catattggct tgaaaacaaa 60
acatttgcca ctcttgataa taatgaaaaa caaaaatttt acgcgctgga catgtttcct 120
tatccgtctg gagctgggtt gcacgtcggc catcctgaag gatacacagc tacggatatt 180
ctgtcccgca tgaagcgcat gcagggctat gatgtccttc atccaatggg ctgggacgca 240
ttcggcctgc cagctgaaca gtacgcgctt gacacaggga acgaccccgc tgtgtttacg 300
aagcagaata ttgataactt ccgccgccaa attcaagcgc ttggcttctc atatgactgg 360
gatcgcgaaa tcaatacgac tgaccctgaa tactataaat ggacgcaatg gattttctta 420
aagctatacg aaaaaggcct tgcttacgtt gacgaagtgc ctgtaaactg gtgccctgcg 480
ctcggtactg ttcttgccaa cgaagaagtc attgacggca agagcgaacg cggcggccat 540
ccggtagaga gacgcccaat gaagcagtgg atgctgaaaa tcaccgctta tgcggacagg 600
ctccttgagg acttggaaga gcttgattgg ccggaaagca ttaaagatat gcagcgcaac 660
tggatcggcc gttcggaagg cgctcacgtt cattttgcta tagatggaca tgatgattcc 720
tttacagtgt ttacaacaag accagatacg ctgtttggcg ctacatacac tgtccttgcc 780
ccggaacacg cattggtgga aaacatcaca acggcagagc aaaaagaagc tgttgaagct 840
tatatcaaag aaattcaatc aaagagtgac ctagaacgca cagatcttgc gaaaacaaag 900
acaggcgtat ttacaggagc gtatgcgatc aatcctgtaa acggagaaaa actgccgatt 960
tggattgcgg attatgttct tgcatcatac ggaacaggtg ctgtcatggc agttccagga 1020
cacgatgagc gtgattttga attcgccaaa acattcggcc ttccggtgaa ggaagtcgta 1080
aaaggcggga acgttgagga agcagcctat actggcgacg gcgagcacgt gaactctgat 1140
ttcctgaacg gccttcacaa acaggaagcg attgaaaaag tgatcgcttg gctggaagaa 1200
acgaaaaacg gtgagaagaa agtgacgtac cgtcttcgtg actggctctt cagccgccag 1260
cgttattggg gcgagccgat tccggtcatt cattgggaag acggaacgtc aacagctgtc 1320
ccggaagagg agctgccgct gattttgcca aaaacggatg aaatcaaacc gagcggaacg 1380
ggcgaatcac cgcttgcgaa cattaaagag tgggtggaag tcacagaccc tgagacaggg 1440
aaaaaaggaa gaagagaaac gaatacaatg ccgcaatggg cgggaagctg ctggtatttc 1500
ttgcgctata ttgatccgca caatccggat cagctggcat caccagaaaa attggaaaaa 1560
tggcttccgg tcgatatgta tatcggcggt gcagaacatg ccgtgcttca ccttctgtat 1620
gcccgcttct ggcataagtt cctttatgat atcggcgtag tgccgacgaa agaaccgttc 1680
caaaagctgt acaaccaagg aatgattctc ggcgaaaaca acgaaaaaat gagtaaatct 1740
aaagggaacg ttgtcaatcc tgacgaaatc gtggcctctc acggtgctga tacgctgaga 1800
ttgtacgaaa tgttcatggg acctcttgat gcttcaatcg cctggtctga atcaggatta 1860
gacggtgcgc gccgtttcct tgaccgtgta tggcgcctat ttattgaaga cagcggtgag 1920
cttaatggaa aaatcgttga aggcgcgggt gaaacattgg agcgcgtcta tcatgaaacg 1980
gtcatgaaag tcacagacca ttatgaaggc cttcgtttca acacgggtat ttcccagctg 2040
atggtcttta ttaatgaagc ttataaagca acagaactgc cgaaagaata tatggaaggc 2100
ttcgtgaagc ttctttctcc tgtcgcgcca cacttagcgg aagagctatg ggagaagctt 2160
ggccattccg gcacaattgc ctacgaagct tggcctgtat atgatgaaac aaaacttgtg 2220
gatgatgaag ttgaaatcgt tgttcagctg aacggaaaag taaaagcgaa attacaggtt 2280
cctgccgatg caacgaaaga acagctggaa cagcttgctc aagcagatga aaaggtcaaa 2340
gagcagcttg aaggcaaaac gattcggaaa atcatcgcgg tgcctgggaa gcttgtcaat 2400
attgtggcaa ac 2412
<210>37
<211>1497
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>赖氨酸tRNA合成酶
<400>37
atgagtcaag aagagcataa ccatgaagaa ttgaatgatc agctgcaagt cagacgcgat 60
aaaatgaatc agctgagaga taacggcatc gatccattcg gcgcacgttt tgaaagaact 120
catcagtctc aagaagttat ttcggcatat caagatctaa ccaaagaaga gttagaagaa 180
aaagcgattg aagttacaat cgcaggccgc atgatgacaa aacgcggcaa aggaaaagcc 240
ggctttgccc atcttcagga tttagaaggc caaatccaaa tctacgtaag aaaagacagt 300
gtcggtgacg accaatatga aatcttcaag tcttctgacc tcggtgatct tatcggcgta 360
accggaaaag tcttcaaaac aaatgtaggc gaattgtctg ttaaagcaac ttcctttgaa 420
ttgctgacaa aagcgcttcg tccgcttcct gacaaatacc atggtttaaa agacgttgag 480
cagcgctacc gtcagcgcta tctggatctt atcgtaaacc cagacagcaa acatacgttc 540
attacacgaa gcaagatcat tcaagctatg agaaggtacc ttgatgatca tggatactta 600
gaagtagaaa cacctacaat gcacagcatt cctgggggag cttctgcacg tccgtttatc 660
actcaccaca acgcgttaga cattccactc tatatgcgta ttgctatcga actgcaccta 720
aaacgtctaa ttgtcggcgg tttagaaaaa gtatatgaaa tcggccgtgt tttccgtaac 780
gaaggtgtct ctacacgcca taaccctgaa tttacaatga ttgagttata tgaagcatat 840
gcggactata aagatatcat gagcttaact gaaaaccttg tcgctcatat cgcccaagaa 900
gtgcttggca caactacgat tcaatacggg gaagagcaaa tcgaccttaa accggagtgg 960
aaaagaatcc atatggttga cgcagtcaaa gaagcgaccg gcgttgattt ctgggaagag 1020
gttactgttg agcaggcgcg tgaatatgca aaagaacatg aagtagaaat taaagactct 1080
atgacagtag gccatatcat caacgaattc ttcgaacaaa aaattgaaga aacgcttatt 1140
cagccaacgt ttatttacgg gcatcctgta gaaatttctc ctcttgctaa gaaaaaccct 1200
gaggacccgc gttttacaga ccgttttgag ctgtttatcg ttggccgtga acatgccaac 1260
gcgtttacag agctgaatga tcctattgat caaagagaac gctttgaagc gcaattaaaa 1320
gagcgtgaag ccggtaatga tgaagctcat ttaatggatg aagactttgt tgaagctctg 1380
gaatacggta tgccgccaac aggaggttta ggcatcggta tcgaccgtct ggttatgctg 1440
ctgacgaatg ccccttctat tcgcgatgtg ctgttattcc cgcaaatgag acaacgc 1497
<210>38
<211>1176
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>组氨酰-tRNA合成酶,hisZ
<400>38
atgtttatgt ttgaaaaacc gcacggcatg agagatacac tgcccggttt atacgaaacg 60
aaaaaaaagg tgagacgatc gttaaccgat ttgattgata aatggggata tcaatttatg 120
gaaacgccga cactggagtt ttacgatacc gttggcgtcc agtcagcaat tgaagagcag 180
cagctgttta agctacttga tcaggacggc aagacattgg tgcttcgccc ggatatgacg 240
gggccgattg caagggtggc ggcatcgaag cttctgaaac acggtcatcc gctaagagtc 300
ggctatgcgg caaatgtatt cagggctcag gagcgtgaag gcggacgtcc ggctgagttc 360
gagcaggtcg gagtggagtt aatcggtgac ggcacgacga gcgcggatgc ggaggtcatt 420
gctttagtcg tcggggcatt aaaaaacgct gggctggcat cctttaaaat tgcaattggc 480
catgccggca ttgcggatgc tttgtttgtt gaggtgctcg gaaacgttga acgagctgat 540
gtgctgcgga ggttcttata tgaaaagaac tacgtcggct acagagagca tgtcaagtct 600
ctcccgcttt cctccattga taaaagcagg ctgcttgagc tccttgaact gcggggcggt 660
atagaagtat gcggacgtgc cgaggaaatc gtcgattctg cgcaaggaaa aagcgtggtt 720
gatgagctga aggcgctgtg ggacattctt gaggattacg gatgtacgga aaatgtccgc 780
ctggatctga atatggtcag ccacatgagc tattacacag ggattttatt tgaagtgtac 840
gccgagaatg tcggttttgt cattggaagc ggcggccgtt acaacaagct gctgggccat 900
tttgattcac ctgcaccggc aacaggcttc gggcttcgga tcgaccggct gattgaagcc 960
cttcatatga aggacgaacc ttgtgaaata gacgctgtta ttttcagcaa agagcagcgg 1020
gcgcaagcca tcgcttatgc gaatgaagaa cgcatgaaag ggaacaaagt ggttcttcaa 1080
gatttatcgg gaatagaaaa tatcgaccag atgacaaaat cttttgcaaa cgtcacttat 1140
tttatcggtg ccagaaagga agagcaaaat gggtaa 1176
<210>39
<211>1992
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>甲硫氨酰-tRNA合成酶
<400>39
atgccgcaag aaaacaatac attttacatt acaacaccga tttattatcc gagcggaaaa 60
ttacatatcg gccatgcata tacgacagtc gcaggagatg caatggcacg ttacaaaaga 120
ttaaaagggt tcgatgttcg ctatttaacg ggaacggacg agcatggaca aaagatccag 180
caaaaagctg aacaggaaaa cattacacct caggagtatg tggatcgcgc agcggcagat 240
attcaaaaac tgtggaagca gcttgaaatc tcaaacgacg actttatccg cacgacagaa 300
aaacggcata aagttgtcat tgaaaaagtg tttcaaaagc ttcttgataa cggggacatc 360
tatcttgatg agtatgaagg ctggtacagc atccctgatg aaacgttcta cacggaaact 420
cagctcgttg atattgagcg gaatgaaaag ggagaggtca tcggcggaaa aagccctgac 480
agcggtcacc cagttgaatt gatcaaagag gaatcttatt tcttccgcat ggggaaatac 540
gcggatcgtc ttctgaaata ctatgaagaa aacccgacat tcattcagcc agaatcacgc 600
aaaaacgaaa tgattaataa ctttatcaaa cctggacttg aggatttggc agtatcacgt 660
accacttttg attggggcgt gaaggtgccg gaaaatccaa agcatgttgt atatgtttgg 720
attgacgcac tatttaacta tttaacggca ctcggttatg atacagaaaa tgatgagctt 780
tatcaaaaat attggcctgc cgatgttcat ttagtcggta aggagattgt acgattccat 840
actatttact ggccaattat gctgatggcg ctggatcttc cgctgccaaa gcaagtattc 900
gcgcatggct ggcttttgat gaaagacgga aaaatgtcga aatcaaaagg aaacgttgta 960
gatccggtta cattaattga acgctatggt ttagacgaac ttcgctatta cttgcttcgc 1020
gaagtgccgt tcggatcaga cggtgttttc acgccggaag gatttgttga gcgaatcaac 1080
tatgatttag cgaatgattt aggaaatcta ttgaatcgta ctgttgcgat gattaataag 1140
tattttgacg gacaaatcgg ttcttacaaa ggtgctgtta cggaatttga ccatacgctc 1200
acttctgttg ctgaagaaac agtgaaagct tatgagaaag caatggaaaa tatggagttc 1260
tcggtagcac tttcgacttt atggcagctc atcagccgca caaacaaata cattgatgag 1320
acagctccat gggtgcttgc gaaagatccg gcaaaagaag aagaattgcg atcagttatg 1380
tatcatctcg ctgaatcatt gcgtatttca gcggtactgc ttcagccatt cttaacaaaa 1440
acacctgaaa aaatgttcga gcagctgggc attactgatg aatctttaaa agcttgggac 1500
agcattacag ctttcggcca gctgaaagat acaaaagtac aaaaaggcga gccattgttc 1560
cctcgtttag aggcagaaga agaaattgct tacatcaaag ggaaaatgca aggttcagca 1620
ccagcgaaag aagaaacaaa agaagaagag cctcaagagg tcgatcgttt acctgaaatt 1680
acgattgatc aatttatgga tgtagagctt cgcgtagctg aggtcattga ggcagagcca 1740
gtgaaaaaag cagaccgttt attgaagctg cagcttgatc ttggttttga aaagcgccaa 1800
gtggtatccg gcattgcgaa gcattatacg cctgaagagc ttgttggaaa aaaactcgtt 1860
tgtgtaacaa atctaaaacc ggttaaactc agaggagagc tttctcaagg tatgatcctt 1920
gcaggagaag cagacggcgt tttaaaggtc gtatctatcg atcagtcgtt accaaaaggc 1980
acaagaatta aa 1992
<210>40
<211>1032
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>苯丙氨酰-tRNA合成酶α亚单位
<400>40
atggaagaaa agctaaaaca gctggaacaa gaagctttag aacaagtaga agcggcaagc 60
tcattgaagg ttgtcaatga tattcgggtg caatatctcg gaaaaaaagg gccgattaca 120
gaagtgctgc gcggaatggg caagctttct gctgaggaac gtccaaaaat gggggcgctc 180
gcgaacgaag taagggagcg tattgccaat gcgattgctg acaaaaacga gaagcttgaa 240
gaagaggaaa tgaaacagaa gcttgcagga cagacaattg acgtcacgct gccggggaac 300
cctgttgcag tcggcggccg ccatccgctc actgttgtca ttgaagaaat tgaagattta 360
tttatcggta tgggctacac agtcgaggaa gggccagagg ttgaaacgga ttactacaac 420
ttcgaatcgc tcaatcttcc gaaagaacac ccagcgcgcg atatgcagga cagcttttac 480
atcacagagg aaactttgat gagaacgcaa acttctcctg tccaaacacg tacgatggaa 540
aagcatgaag gcaaaggtcc cgttaaaatc atttgcccgg gtaaagtata tcgccgtgat 600
aacgatgatg cgacgcactc tcaccaattt atgcaaattg aagggcttgt cgttgacaaa 660
aacatcagca tgagtgattt aaaaggaacg cttgaacttg ttgcgaaaaa aatgttcggg 720
caagaccgtg aaatcagact ccgcccaagc ttcttcccgt ttactgagcc ttcagtagaa 780
gtggatgtga catgctttaa atgcggtggg aacggctgct cagtatgtaa aggaacaggc 840
tggattgaaa tcctcggtgc cggaatggtt cacccgaacg tgcttaaaat ggctggcttt 900
gatccgaagg aatatcaggg cttcgcattc ggaatgggtg ttgagcgcat cgcgatgctg 960
aaatatggca ttgatgatat ccgccacttc tatacaaacg atgtcagatt tatttcgcag 1020
tttaaacagg cg 1032
<210>41
<211>2412
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>苯丙氨酸tRNA合成酶,β亚单位
<400>41
atgtttgttt cttataaatg gttagaggat tatgttgatt taaaaggcat ggacccggct 60
gttcttgctg aaaaaattac aagagccggt attgaggttg aaggaattga atacaaagga 120
gaaggcatca aaggcgttgt catcggccat gtgctggagc gcgagcagca cccgaatgct 180
gataagctga ataagtgcct tgtggatatc ggagctgaag cccctgtaca aatcatttgc 240
ggcgcgccga atgtggataa gggacaaaaa gtcgcagttg caacagtcgg agcggtgctg 300
ccgggcaatt tcaaaatcaa aaaagccaag cttcgcggtg aagaatcaaa cggcatgatc 360
tgttccttac aggagcttgg tatcgaaagc aaacttgtgg cgaaggagta tgcagaaggc 420
attttcgtat tcccgaatga cgctgaaaca ggaagcgatg ccttagcggc tttacagctt 480
gacgatgcga ttcttgagct gggtttaacg ccaaaccgcg cggatgccat gaacatgctt 540
ggtgttgctt acgaggttgc ggcgatttta gacactgagg taaagcttcc ccaaacggat 600
tacccggctg cttcagaaca agcgtctgat tacatttcag tcaaaattga agatcaagaa 660
gcgaacccgc tgtacactgc aaaaatcatt aaaaatgtca cgattgctcc gtcaccgctt 720
tggatgcaga caaagctgat gaatgcaggc attcgtccgc acaacaacgt cgttgacatc 780
acaaattttg tcctgttgga atacggacag ccgcttcatg cgtttgatta tgacagattt 840
ggctctaagg aagtcgtagt aagaaaagca gctgagaatg aaatgatcgt aacacttgat 900
gatcaagaac gtaagctgtc tgccgatcac cttgtcatta caaacggaac gaaagcgcag 960
gccgttgccg gtgtcatggg aggagcagag tcagaggttc aggaagatac gaaaaccatt 1020
ttgcttgagg ctgcgtattt caacgggcag aaggttcgca aggcttccaa agaccttggt 1080
ttgagaagtg aatcaagcgt aagatttgaa aaaggaattg atccggcacg cgtacgtctt 1140
gcagcagaac gggctgcgca gctgatccat ctgtatgccg gcggtgaggt gcttgctgga 1200
acggttgagg aagatcacct gacaatcgaa gcaaataaca ttcacgtatc tgctgacaaa 1260
gtgagcagcg ttctaggcct gacgatcagt aaagaagaac tgatcagcat ttataaacgt 1320
ctcggtttta cggtcggtga agcggatgat cttctcgttg tgactgtccc atcacggcgc 1380
ggtgacatta caatagaaga ggatttaatc gaagaagcgg caagactgta cggctacgat 1440
aacattccgt ctacgcttcc tgagacagcg ggaactacag gcggattaac gccatatcag 1500
gcaaaacgcc gtaaagtcag acgcttcctt gaaggcgcag gcttatcaca agccatcact 1560
tactcactga caaacgagaa gaaagcgaca gcgtttgcga ttgaaaaatc actgaatact 1620
gtgcttgcgc ttccaatgag tgaagaaaga agcattctca gacacagtct tgttccaaat 1680
ctgcttgatt ctgtttctta caatcttgcg aggcagactg actcagttgc actgtacgaa 1740
gttggctccg ttttcctaac gaaggaagag gacacaaaac ctgttgaaac agaacgcgta 1800
gcaggagctg ttaccggatt atggcgcaag cagctatggc agggtgaaaa gaaaccagtt 1860
gatttctttg ttgtcaaagg aattgtggaa gggctgttag acaaactcaa cgtcctagac 1920
agcattgaat ttgtacagtc tgaacgcaaa cagctgcatc cgggcagaac agcgaacatt 1980
ttattgaatg gttctctgat cggcttcatc ggccaagtcc atccttcatt ggaaaaagaa 2040
ctggatataa aggaaacata cgtatttgag ctcgatcttc atgcgttgct cgcagcagaa 2100
acagcaccgc ttgtttacac ggcgattcca aaatatccgt ctgtgacacg tgatatcgct 2160
cttgtaacag ataaaaccgt cacaagcgga cagctcgaga gcgtcattaa agaggccggg 2220
ggcaagcttc tgaaagaggt aaccgtattt gacgtatacg aaggagagca tatggaggaa 2280
ggcaagaagt cagtcgcttt ctcactccag tatgtcaatc ctgaacaaac actgactgaa 2340
gaagaagtga caaaggcgca cagcaaagtg ctgaaagcgt tagaagacac atatcaagct 2400
gttttaagag gc 2412
<210>42
<211>606
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>相似于苯丙氨酰-tRNA合成酶,ytpR
<400>42
atgaacgctt tttataataa agaaggtgtg ggagacacgc tcctgatctc tcttcaagat 60
gtgacacgcg aacaattagg ctatgaaaaa cacggcgacg tcgtcaaaat tttcaataac 120
gaaacaaaag aaacaacggg cttcaacatt ttcaatgcgt cttcttactt gaccattgat 180
gaaaacggcc ctgttgcgct ctcagaaaca ttcgtgcaag atgtgaatga gattttaaac 240
agaaacggcg ttgaagaaac attagtcgtt gatttatctc cgaagtttgt tgtgggttat 300
gtagaatcaa aagaaaaaca tccgaatgcg gataaattaa gcgtatgtaa agtcaacgta 360
ggagaagaaa cgcttcagat cgtctgcggc gcgcctaacg ttgaccaagg ccaaaaagtt 420
gtcgttgcca aagtcggtgc tgtgatgcct agcggacttg tcattaagga tgcagagctt 480
cgtggcgttc cgtcaagcgg gatgatctgc tcagcgaaag agcttgattt gccggatgcc 540
cctgctgaaa aaggaatcct tgtgttagaa ggagactatg aggcgggaga cgcatttcag 600
ttttag 606
<210>43
<211>1692
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>脯氨酰-tRNA合成酶
<400>43
atgagacaaa gcttgacgct tattcctacg ctccgtgaag ttccagctga tgccgaagca 60
aaaagtcatc agcttcttct gagagcagga tttatcagac agaatacgag cggggtatac 120
agctatatgc ctcttgcgta taaggtgatt caaaacattc agcagattgt tcgagaggaa 180
atggagaaaa ttgatgccgt agaaatgctc atgcccgcat tgcagcaggc agagacatgg 240
caggaatcag gcagatggta tacgtatggt cccgaactga tgagactaaa agaccgtcat 300
ggccgtgaat ttgctttagg ggcaacgcat gaagaggtta tcacttcgct tgttcgcgat 360
gaggttaaat cttataagcg tctccctctg actctttatc aaattcagtc taagttcaga 420
gatgaaaaac gtcctcgctt cggtttgtta agaggccgcg aatttattat gaaggatgcg 480
tactctttcc atgcatctgc agagagcctg gatgaaacgt atcaaaaaat gtacgaggcc 540
tattctaata tttttgcccg ctgcggcatt aatgtaagac ctgttatcgc tgattcaggc 600
gcaatgggag gaaaggatac gcacgaattt atggcacttt ctgcgatcgg agaggatacg 660
attgcgtatt ctgatgaatc acagtacgcg gctaatatcg agatggctga agttcttcac 720
caggaagttc cttcagatga agagcctaaa gctctagaga aggttcatac gcctaacgtg 780
aaaacaatcg aagaactgac tgcgttctta caggtttcgg ctgaagcgtg cattaagtca 840
gtattgttta aagctgatga ccgttttgtc ttagtgcttg taagagggga tcatgaagtt 900
aacgatatta aagtgaaaaa cttgcttcat gcagaagttg tagagcttgc tacacatgaa 960
gaggtcattc agcagctcgg aacagagcca ggctttgtag gccctgtcgg tattcatcag 1020
gatgtggaag tatatgccga tcaagctgtg aaagcaatgg ttaatgctgt tgccggggca 1080
aatgaaggag atcatcatta taaaaatgtc aatgtgaatc gtgacgcgca aattaaagaa 1140
tttgctgatc ttcgttttat taaagaaggt gatccttcac cagacggcaa gggaacgatc 1200
cgttttgctg agggaatcga agtcggacaa gtctttaagc tcggaacacg ctattcagaa 1260
gcgatgaatg cgacatattt agatgaaaac ggacgcgcgc agccaatgct gatgggctgt 1320
tacggaatcg gtgtgtcaag aacgctttct gctattgctg aacagcatca cgacgaaaaa 1380
ggcttaatat ggccaaaaag cgttgcgccg tacgatcttc atattcttgc tttgaacatg 1440
aaaaacgatg ggcaaagaga gcttgctgaa aagctgtatg ccgatttaaa agcggaaggc 1500
tatgaagtgc tctatgatga ccgtgctgag cgtgccggcg taaaattcgc tgattcagat 1560
ttaatcggcc ttccaatccg catcactgtc ggaaaacgag ctgacgaagg aatcgtcgaa 1620
gtgaaaattc gtcaaactgg tgagtcaact gagatttcag tagacgaatt atctgcgttt 1680
atcagcaagc ag 1692
<210>44
<211>1275
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>丝氨酰-tRNA合成酶,
<400>44
atgcttgata cgaaaatgct gagagcaaat tttcaagaaa ttaaagcaaa gcttgtacac 60
aaaggcgaag acttaactga ttttgataag tttgaggcgc tggatgatag acgaagagag 120
cttatcggca aggttgaaga gttaaaagga aaacgaaatg aagtttctca gcaggttgct 180
gtgctgaagc gtgagaaaaa agacgcggat cacattatta aagaaatgcg tgaagtcggc 240
gaggaaatta aaaagctcga tgaagaatta cggacagtgg aagctgagct tgatacaatc 300
ctgctctcaa tcccgaatat tccgcatgag tctgtacctg tcggtgaaac agaagacgac 360
aacgtagaag tgcgtaaatg gggtgaaaag ccttcatttg cttatgagcc gaagccgcac 420
tgggatattg cggatgagct gggtattctg gattttgaac gtgctgccaa agtaacagga 480
agccgtttcg tgttctataa aggcttaggt gctcgtctgg agcgtgcgct ttataacttt 540
atgcttgatc tgcatgtgga tgagtataac tacactgaag tgatcccgcc atatatggta 600
aaccgcgcaa gcatgacggg aacggggcag cttcctaaat ttgaagagga tgcatttaaa 660
atcagagaag aagattattt cttaattcca acggcggaag tgccgattac aaacatgcat 720
cgcgatgaaa tcctttcagg tgacagcctg ccgatcaact atgcggcatt cagtgcttgc 780
ttccgttctg aagctggttc agcaggacgt gacacacgcg gattaattcg tcagcaccaa 840
tttaataaag ttgagcttgt aaagtttgtg aagcctgaag attcttatga agaattagag 900
aaacttacaa accaagcaga acgggttctt cagctgcttg agcttccata ccgtgtcatg 960
agcatgtgta cgggtgactt aggctttacg gctgcgaaaa aatacgatat cgaagtttgg 1020
attccaagcc aagacacata tcgagaaatc tcttcttgca gcaacttcga agcgttccag 1080
gcgagacgtg cgaatattcg tttcagacgt gaagcgaaag gcaagcctga gcatgtacac 1140
acactgaacg gctcaggact ggcggttgga agaacagttg ctgctatctt agaaaattat 1200
cagcaggaag acggaagcgt tgtgattccg aaagtgcttc gtccttatat ggggaataga 1260
gaagtaatga aaccg 1275
<210>45
<211>1929
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>苏氨酰-tRNA合成酶,主要
<400>45
atgtcagata tggtaaaaat cacatttcct gatggagcag tcaaggagtt tgcgaaagga 60
acaacaacag aagatatcgc ggcatccatc agtccgggat taaagaaaaa gtcattagcc 120
ggaaaactga acggaaaaga aatcgatttg agaacgccga tcaatgaaga cggtacagtg 180
gaaatcatta cagaaggctc agaagaaggt cttcaaatta tgcgccacag tgcggctcac 240
ctgctggctc aagcgattaa acgcatctac aaggatgtta aattcggcgt cggtccggtt 300
atcgaaaacg gtttttacta cgatgtagaa atggacgaag cgattacacc ggaggatctg 360
ccgaaaatcg agaaagaaat gaaaaaaatc gttaatgcga accttccgat cgttcgaaaa 420
gaagtcagcc gtgaagaagc gaaagcccgt tttgcggaaa tcggcgacga cctgaagctt 480
gaactattgg atgcgattcc tgaaggagaa accgtttcga tctatgagca aggcgaattc 540
tttgacctgt gccgcggcgt ccatgttcct tcaaccggaa aaatcaaaga atttaagctg 600
ttaagccttg caggcgcata ctggcgcggt gacagcaaaa accaaatgct tcagcgcgta 660
tatggtacag ctttcttcaa aaaagctgat cttgaagagc atcttcgtat gctagaagaa 720
gcgaaagaac gcgaccacag aaagcttggc aaagaattaa agctgttcgc gaactctcaa 780
aaagtcggac aaggcctgcc gctttggctg ccaaaaggcg caacaatccg ccgcgtcatc 840
gagcgctaca ttgtcgataa agaaatcagc ctcggctatg agcacgtata cacacctgtg 900
ctaggcagca aagagctgta tgaaacatca ggacactggg atcattatca ggaaggcatg 960
ttccctccga tggaaatgga caatgaaaca cttgtattgc gtccgatgaa ctgtccgcac 1020
catatgatga tttacaaaca agacattcac agttaccgcg agcttccgat tcgtattgca 1080
gagcttggaa cgatgcaccg ctatgaaatg tcaggtgcgc tgtcaggact tcaacgggta 1140
cgcggaatga cgttaaatga tgcacacatc tttgtgcgcc cggatcaaat taaggatgag 1200
tttatccgta cagtccgttt aatccaggat gtttatgaag acttcggttt aagtgattac 1260
acattccgtc tgtcttaccg cgatccggaa gatacagaga aatattttga tgacgatgaa 1320
atgtggaaca aagcgcaatc catgctgaaa gaggcaatgg atgaaatcgg ccacgactat 1380
tacgaagcag aaggtgaagc ggcattctac ggacctaaac ttgatgttca ggtgaaaact 1440
gcgatcggaa aagaagaaac actgtctacg gttcagcttg atttcttatt gccggaacgt 1500
ttcgacctga catacatcgg tgaggacggc aagcagcacc gtccggttgt cattcacaga 1560
ggtgtcgttt caacaatgga acgctttgtt gctttcttaa tcgaagaaca caaaggcgcg 1620
ctgccgacat ggcttgcacc ggttcagttc caagtcatcc cggtttctcc ggctgtgcat 1680
ttagactacg cgaaaaaagt gcaggaacgc ctgcaatgtg aaggcctgcg tgttgaagtc 1740
gacagccgcg atgaaaaaat cggctacaaa atccgtgaag cgcaaatgca aaaaatcccg 1800
tacatgctgg tggtcggtga ccaagaagca gaaaacggag cggtaaacgt gcgtaaatac 1860
ggagaacaga actctgaaac catttcactt gatgagtttg tgaaaaaggc agtagctgaa 1920
gcgaaaaaa 1929
<210>46
<211>1914
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>苏氨酰-tRNA合成酶,次要
<400>46
atgagcaaac atgtacacat tcagcttccg gacggacaga tccaggaata tccgaaaggc 60
atcacaatca aagaagcggc tggttcgatc agttccagtc tgcaaaagaa ggcggccgca 120
ggtcaggtca acggcaagct tgttgatctc agtttcaagc tggaggagga tgctgagctt 180
tcgattgtca cactcgattc acaagaaggc ttgcaggtcg ttcgccacac aacagcgcac 240
gtgctggccc aagcagtaaa acggctgtac ggcgaagtgt cattgggggt agggcctgtg 300
attttagacg gcttctacta tgacatgaag ctggggaaaa gcttggcatc aggagactta 360
gaggccatcg aaaaagaaat gaaaaacata ataaatgaga accttgaaat caaacgtata 420
gaggtttctt acgaagaagc tgaagagctg tttgcacaaa aagacgagcg gctcaagctt 480
gagattttaa aggatattcc gcgcggggag gatatcacac tgtaccagca aggggaattc 540
gttgacctgt gccgagggcc gcatcttcct tctacaggga tgatcaaggc gttcaaactg 600
acaagagtat caggcgctta ttggcgcgga gacagcaaaa atgaagtcct gcagcgggtg 660
tacggggttg cgtttcaaaa gaaaaaagat ttggatgcgc acctgcatat gctagaagaa 720
gcggcaaaac gagaccatcg caagctcggc aaacagttag ggctgtttat gttttctgaa 780
gaagcgccgg ggatgccgtt ttatttgccg aaagggcaga ttgtccgcaa tgagctggag 840
cgcttctcgc gtgagctgca aacaaatgcc ggctacgatg aggtgcgtac gccgtttatg 900
atgaatcagc ggttatggga gcagtcaggc cattgggacc attatcgcga caatatgtac 960
ttttcagaag tggatgatac aagattcgca atgaagccga tgaattgccc cggccacatg 1020
ctcatcttta aaaacagcct gtattcttat cgggatctgc cgattcgcat ggcggaattc 1080
ggacaggtgc accgccatga atacagcggc gctttaaacg gaatgcttcg cgttcggacg 1140
ttctgtcagg atgacgccca tattttcgtt cgggaggatc agattgagag tgagatcaaa 1200
gaagcgattc ggctgattga tgaggtatat cggacatttg gtttcgagta ttctgttgag 1260
ctttcgactc gcccggagga ttcattaggc gatgacagcc tttgggaagc gtcggaacgt 1320
gccttagcac gcgtccttga ggagcttggc ctctcttatg agatcaatga aggcgatggg 1380
gcgttttacg ggccgaaaat tgatttccat ataaaagatg ccctgaaacg gagccaccaa 1440
tgcgcgacaa ttcagcttga ttttcaaatg ccggaaaaat ttgatttaac atatatcaac 1500
gaactcaatg agaaggttcg tcccgttgtc atccacagag cggttttcgg ctcaatcgac 1560
cgtttcttcg gcattttgat cgagcattac ggtggggctt ttccagtctg gctcgcaccg 1620
atccaggttc aaatcatacc ggtttcgcac gttcacttag actattgcag aaaagtgcag 1680
gcggagctga agcaggcggg gataagagcc ggcattgatg agcgcaatga gaagctcggc 1740
tataaaatca gagaatcgca ggtgcaaaaa attccgtacg tgctggtgct tggagatcat 1800
gaggagcagg agaatgcggt aaacgtccgc cgattcggac atcagcagaa tgaacacgtt 1860
cctttccaaa cttttaaaga taaacttgtg aaacaggtgg aaaatcgagg catg 1914
<210>47
<211>990
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>色氨酰-tRNA合成酶
<400>47
atgaaacaaa cgattttttc aggcattcag ccaagcggct cagtgacgct cggcaactat 60
atcggtgcaa tgaagcagtt tgtcgaactg cagcatgatt ataacagcta tttttgcatc 120
gtcgatcagc atgcgataac tgttcctcaa gaccggcttg agcttagaaa gaatatccgc 180
aatctcgcgg cgctttactt agctgtcgga cttgatccag aaaaagcaac attgtttatt 240
cagtcagagg tccccgcaca tgcgcaggcc ggatggatga tgcagtgtgt cgcctatatc 300
ggcgagcttg agcggatgac tcaatttaag gacaaatcca aaggcaatga agctgtcgtc 360
tccggcctgt taacatatcc gccgctgatg gccgctgata ttctgctgta cggaacggat 420
cttgtacctg tcggcgagga tcaaaagcag caccttgagc tgacgcggaa tcttgcagaa 480
cgcttcaaca aaaaatacaa cgacatcttt acgattccgg aagtgaaaat tccaaaagtc 540
ggtgcacgta tcatgtctct gaatgatccg ctgaagaaaa tgagcaaatc tgatccgaat 600
cagaaagctt atattacatt gctggatgag ccgaagcagc ttgaaaagaa aatcaaaagc 660
gcagtaacgg attctgaagg cattgtcaaa tttgataagg aaaacaaacc gggcgtttcc 720
aaccttctta caatttattc aatcctcggc aatacgacaa ttgaagagct tgaagcaaag 780
tacgaaggaa aaggctacgg cgagtttaaa ggtgatttgg cagaagtcgt agtgaacgca 840
ttaaaaccga tccaggaccg ctattacgag ctgatagaat ctgaagaatt agaccggatt 900
cttgatgaag gcgcggaacg agcgaatcgg acagcaaaca aaatgctgaa aaaaatggag 960
aatgccatgg gtcttggaag aaaaagacgc 990
<210>48
<211>1266
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>酪氨酰-tRNA合成酶,主要
<400>48
atgactaact tacttgaaga cttatccttc cgcggattga ttcagcaaat gacagatgaa 60
gaagggttaa ataaacagct gaatgaagaa aaaatccgct tgtactcagg ctttgaccct 120
acagcagaca gcttgcatat cggacacctg ctgcctattt taacacttcg ccgttttcag 180
cttgcagggc atcatccgat tgcgcttgtg ggcggcgcga cgggcctcat cggtgatcca 240
agcggaaaaa aagcagagcg tacattaaac actgctgaca tcgtatccga atggtcccaa 300
aaaatcaaaa accagctgtc cagatttcta gattttgaag cagcagaaaa cccagctgtc 360
atcgcgaaca actttgactg gatcggcaaa atgaatgtga tcgatttcct tcgtgacgtt 420
ggtaaaaatt tcggcatcaa ttacatgctg gcaaaagata cggtcagctc aagaattgaa 480
tccggcatct cgtacacgga attcagctac atgattcttc aatcttatga tttcttaaat 540
ctttacagag acaaaaactg taaactgcaa atcggcggaa gcgatcagtg gggcaacatc 600
acagcgggtc ttgaactgat cagaaaatca gaagaagaag gagcaaaagc gtttggccta 660
acgattccgc ttgtcacaaa agcagacggc acgaagttcg gaaaaacgga aggcggcgcg 720
atctggcttg ataaagaaaa aacatcgcca tatgaattct atcaattctg gatcaacaca 780
gacgaccgtg acgttgtcaa atacttgaaa tacttcacgt tcctttcaaa agaggaaatt 840
gaagcatacg ctgaaaaaac agaaacggcg ccagaaaaac gtgaagcgca aaaacgcctg 900
gcagaagaag tgacatcact tgttcacgga cgcgaggcgc tggagcaagc catcaacatc 960
tcccaagcgc tgttcagcgg caatattaaa gagctttctg ctcaagacgt aaaagtaggc 1020
tttaaagatg ttccttctat ggaagttgac agcacccaag agctttcact tgtagatgtg 1080
ttggtgcaat ctaaattatc tccttctaaa cgccaagcgc gtgaagacat ccaaaacgga 1140
gctgtttaca ttaacggtga acgccagacg gaaataaatt ataccctatc aggtgaagac 1200
cgcatcgaaa accaatttac tgttctgcgc cgcgggaaga aaaaatactt ccttgtgacg 1260
tataaa 1266
<210>49
<211>1239
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>酪氨酰-tRNA合成酶,次要
<400>49
atgatgagaa catttgagca gctcacagcg tcacaacaaa aagaggtaga aagacagctt 60
cagctataca tgacaggcgc ccacgaagtc ataccgccgg aggaattaaa ggcaaagctc 120
gtgaaatcaa tttccacggg cacgccgctt aaaattaagc tcggattaga tccgtctgca 180
ccggatgtac atttgggcca tacggttgtg ttaaataagc ttcgccaatt tcaagaaaac 240
ggccacattg tccagctgtt aattggggat ttcacaggaa aaattggtga tccgaccgga 300
aaatcggcag ccagaaagca actgactgat gaagaagttc agcacaatgc caaaacctac 360
tttgagcaat tcggaaaagt gcttgatcca gaaaaagtcg agcttcacta taactcaaaa 420
tggctgaaaa cattgaatct agaagatgtc attgaattag cagggaaaat aacggtagcc 480
cgcctgatgg agcgcgacga ctttgaagaa cgcatcgcca tgcaaaaacc aatctcactg 540
catgaattct tttacccatt gatgcagggc tatgattctg tcgttctcga aagtgatatt 600
gaattaggcg gaacggatca gcatttcaat gtcctcatgg gacggcattt ccaagaacga 660
tacaacaaag aaaaacaagt cgtcatcctt atgccgctct tggaaggctt ggatggcgtc 720
gagaaaatgt cgaagtcgaa acacaactac attggcatta acgaacatcc aaacgacatg 780
tacggaaaaa cgatgtcact gcccgacagc ctgatgaaaa agtacatcca cttggcgaca 840
gacttagagc ttgaagagaa aaaacagctc gtaaaagact tagaaaccgg cgccgttcat 900
ccgcgtgatg ccaaaatgct tttagccaga acaatcgtcc gaatgtatca cggagagaaa 960
gcagcagaag ctgccgaaca ctcgtttaaa acagtctttc aggaaaacag cctgccggaa 1020
gatataccgg ccgtaaactg gaaaggcgaa aaaacgatag cgatgattga tctgctcgtc 1080
aagctaaagc tcctctcttc gaagagcgag gcgcgccgca tgattcaaaa cggaggtgta 1140
cgcatcgacg gagagaaagt aacagatgtt cacgccaaag cagagataag agagaatatg 1200
atcatccaag tcggcaaacg caagttttta aagctccaa 1239
<210>50
<211>2640
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>缬氨酰-tRNA合成酶
<400>50
atggaaacga atgaacaaac aatgccgacg aaatatgatc cggcagcggt tgaaaaagac 60
cgatatgatt tttggctaaa aggcaaattt tttgaagcgg gcagtgacca gacaaaagag 120
ccatactctg ttgtcatccc gccgccaaac gtaacaggga gacttcacct tggccacgca 180
tgggacacaa cgctgcaaga cattgtaaca agaatgaaac gcatgcaggg ctatgatgtg 240
ctgtggcttc ctggcatgga ccacgccggc atcgcgacac aggctaaagt ggaggcgaaa 300
cttcgtgaag aaggcaaatc ccgctacgat ttaggccgtg aaaaattcct cgaagaaacg 360
tggaagtgga aggaagaata tgctgacttt attcgcagcc agtgggcgaa attaggtctt 420
ggcctagatt attcccgtga acgttttacg ctggatgaag gcttgagcaa agcggtaagg 480
gaagtattcg ttaagcttta tgaaaaaggc ctgatctaca gaggcgaata tattattaac 540
tgggacccag cgacaaaaac agccctatcc gacattgagg tgatttacaa ggatgttcaa 600
ggcgcattct atcatatgag ctatccgctt gctgacggtt caggctcaat tgaaattgcg 660
acgacacgtc ctgaaacaat gctcggtgat acagctgttg ccgttcaccc tgaagacgag 720
cgctataaac accttatcgg aaaaacggtg atcctgccga ttgtaaatcg tgaaattccg 780
attgtcggtg atgactatgt tgatatggaa tttggttcag gtgccgtgaa aattacgcct 840
gctcatgatc cgaacgactt cgagcttggc aaccgccaca atttagaacg catccttgtc 900
atgaatgaag atggcacgat gaatgaaaat gcgctccaat atcaaggtat ggatcgtttt 960
gaatgccgca aaaagctcgt gaaagattta caggaggcgg gagttctctt caagatcgag 1020
gatcatatgc actctgtcgg ccatagtgaa cgaagcgggg ctgttgtgga gccttatctt 1080
tctacacaat ggtttgtgcg catgcagccg cttgctgatg cagcgattga gctcgaaaaa 1140
aaagaagaaa aggtcaactt tgtgcctgac cgtttcgaaa aaacgtattt acactggatg 1200
gaaaatatcc gcgactggtg tatctcccgt caattgtggt ggggccatcg tattcctgcc 1260
tggtatcata aagaaacagg cgagctatat gtcggacttg aagcgccgga agacagcgaa 1320
aattgggaac aggatacaga cgtactggat acatggttca gttctgcgct atggcctttc 1380
tccacaatgg gctggcctga tgtaacggct gaagacttta aacgctacta tccgacagat 1440
gttctcgtga cagggtacga tatcattttc ttctgggtat cacgcatgat tttccaaggc 1500
attgaattta caggcgagcg cccgttcaaa gatgttttaa tccacggctt aatccgtgac 1560
gagcaaggcc ggaaaatgag taaatctctt ggcaacggtg tcgacccgat ggatgtgatt 1620
gacaagtacg gagccgattc tctgcgttat ttccttgcga ctggaagctc tcctggccag 1680
gatctgcgct tcagctatga aaaagtggaa tcgacctgga attttgccaa taaaatttgg 1740
aacgcctccc gttttgcatt aatgaatatg gatggcatga cgtacgatga gcttgatctg 1800
tcaggtgaaa agtcagtcgc tgacaagtgg attttaacgc gattaaatga aacgatcgag 1860
cacgtgaccc agcttgctga ccgatatgaa tttggtgaag taggacgcca tttatataac 1920
tttatttggg atgatttctg tgattggtat attgaaatgg cgaagcttcc gctttatgga 1980
gaagacgaag cggctaagaa aactacccgt tccatccttg cttacgtact tgatcaaacg 2040
atgcgtctgc tccatccgtt tatgccattc ttaacggagg aaatttggca gcaccttcct 2100
caccaagggg aatcgattac agtaagtcaa tggcctgcag tagtgccgga gcataccgat 2160
actgaagcgg cagctgacat gaagcttctt gttgagctga tccgttctgt gcgcaatatc 2220
cgcagtgaag tcaatacgcc aatgagcaag caggttgaac tgtacattaa aacaagcaca 2280
gacgaaatag cgtcccgcct cgaagcgaac cgttcatatg ttgaacgctt tacgaatccg 2340
agcgtgctta aaatcggcac cgatattgag gctgttgata aggcgatgac ggccgttgtc 2400
tcaggagcag aggttattct tccgcttgaa ggcttaatca atattgatga agaaattgcc 2460
cgtctgcaaa aagaatttga taaactgaca aaagaagttg agcgtgtcca aaagaaactt 2520
ggaaatgaag gatttatgaa aaaagcgcct gcacacgtaa ttgatgaaga acgtgaaaaa 2580
gaaaaagatt atgtggcgaa gcgtgacgct gttcaaaaac gaatggctga gctgaagggt 2640
<210>51
<211>1431
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>谷氨酰-tRNA酰胺转移酶,亚单位B
<400>51
ttgaactttg aaacggtaat cggacttgaa gtccacgttg agttaaaaac aaaatcaaaa 60
attttctcaa gctctccaac gccattcggc gcggaggcga atacgcagac aagcgttatt 120
gacctcggat atccgggcgt cctgcctgtt ctgaacaaag aagccgttga attcgcaatg 180
aaagccgcta tggcgctcaa ctgtgagatc gcaacggata cgaagtttga ccgcaaaaac 240
tatttctatc ctgacaaccc gaaagcgtat cagatttctc aatttgataa gccaatcggc 300
gaaaacggct ggatcgaaat tgaagtcggc ggcaaaacaa aacgcatcgg catcacgcgc 360
cttcatcttg aagaggatgc cggaaaactg acgcatacgg gcgacggcta ttctcttgtt 420
gacttcaacc gtcaaggaac gccgcttgtt gagatcgtat cagagccgga catccgcacg 480
ccggaagaag cgtacgcata tcttgaaaag ctgaaatcca tcatccaata tacaggcgtt 540
tctgactgta aaatggaaga aggctcactt cgctgtgacg ccaatatctc tcttcgtccg 600
atcggccaag aggaattcgg cacaaaaaca gaattgaaaa acttgaactc ctttgcgttt 660
gttcaaaaag gccttgagca tgaagaaaaa cgccaggagc aggttcttct ttccggcggc 720
gtcatccagc aagaaactcg ccgttatgat gaagcaacga agaaaaccat tcttatgcgt 780
gtcaaagagg gatctgacga ctaccgttac ttcccagagc cagatctagt cgagctctac 840
attgatgatg aatggaagga acgcgtaaaa gcaagcattc ctgagcttcc ggatgagcgc 900
cgcaagcgtt atatcgaaga gcttggcttg cctgcatatg acgcaatggt tctgacgctg 960
acaaaagaaa tggctgattt cttcgaagaa accgttcaaa aaggcgctga agctaaacaa 1020
gcgtctaact ggctgatggg tgaagtgtca gcttacctaa acgcagaaca aaaagagctt 1080
gccgatgttg ccctgacacc tgaaggcctt gccggcatga tcaaattgat tgaaaaagga 1140
accatttctt ctaagatcgc gaagaaagtg tttaaagaat tgattgaaaa aggcggcgac 1200
gctgagaaga ttgtgaaaga gaaaggcctt gttcagattt ctgacgaagg cgtgcttctg 1260
aagcttgtca ctgaggcgct tgacaacaat cctcaatcaa tcgaagactt taaaaacgga 1320
aaagaccgcg cgatcggctt cctagtcgga cagattatga aagcgtccaa aggacaagcc 1380
aacccgccga tggtcaacaa aattctgctt gaagaaatta aaaaacgcta a 1431
<210>52
<211>291
<212>DNA
<213>枯草杆菌
<220>
<223>谷氨酰-tRNA酰胺转移酶,亚单位C
<400>52
atgtcacgaa tttcaataga agaagtaaag cacgttgcgc accttgcaag acttgcgatt 60
actgaagaag aagcaaaaat gttcactgaa cagctcgaca gtatcatttc atttgccgag 120
gagcttaatg aggttaacac agacaatgtg gagcctacaa ctcacgtgct gaaaatgaaa 180
aatgtcatga gagaagatga agcgggtaaa ggtcttccgg ttgaggatgt catgaaaaat 240
gcgcctgacc ataaagacgg ctatattcgt gtgccatcaa ttctggacta a 291
<210>53
<211>31
<212>DNA
<213>人工序列
<400>53
gtgcctcgag gattaagcat tggtaactgt c 31
<210>54
<211>34
<212>DNA
<213>人工序列
<400>54
tattctcgag acattaacct agaaagcact aagg 34
<210>55
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>55
ctgcctgtct cgaggctgat agcagttatc 30
<210>56
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>56
caactcgagg ctggtcggac aaacacctag 30
<210>57
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>57
tgcgaattcc ggatgtaagg agaacggctc 30
<210>58
<211>32
<212>DNA
<213>人工序列
<400>58
cttgtcgacg tacatcagaa atcgtacatt cg 32
<210>59
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>59
ggtggatccc ctcgccggca atagttaccc 30
<210>60
<211>31
<212>DNA
<213>人工序列
<400>60
aatctagact ttcgttatac aaattttaac c 31
<210>61
<211>31
<212>DNA
<213>人工序列
<400>61
tgtaggatcc aatatgggca gaaaacacat g 31
<210>62
<211>31
<212>DNA
<213>人工序列
<400>62
atatctagat tccactctgt gtaccagtag c 31
<210>63
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>63
gttagctcct tcggtcctcc 20
<210>64
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>64
gtaactggct tcagcagagc 20
<210>65
<211>21
<212>DNA
<213>人工序列
<400>65
ctgccacatc gtctaggctg c 21
<210>66
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>66
caggagtcca aataccagag 20
<210>67
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>67
cccttgcc tatactgtggac 20
<210>68
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>68
gttacaatag cgacggagag 20
<210>69
<211>27
<212>DNA
<213>人工序列
<400>69
gtctgaattc gaggaaggtt tacaccg 27
<210>70
<211>26
<212>DNA
<213>人工序列
<400>70
ctgcgaattc atcttcatgg tgaacc 26
<210>71
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>71
cattgtcatt agttggctgg 20
<210>72
<211>28
<212>DNA
<213>人工序列
<400>72
gcaagaattc aaaatccatc ttcatcgg 28
<210>73
<211>29
<212>DNA
<213>人工序列
<400>73
gtgactgagg atccgctagt tccagatcg 29
<210>74
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<400>74
ctcttggatc ccttcatcat tctatcacac 30
<210>75
<211>25
<212>DNA
<213>人工序列
<400>75
gcagattggg atggagttcc cgtac 25
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<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<400>76
ttacagcttc acaaagcgga tttc 24
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<211>26
<212>DNA
<213>人工序列
<400>77
tgctgcaaga gctgtcggaa ataaag 26
<210>78
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<400>78
aagaagaaaa gaaagaagct aaag 24
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<211>31
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<220>
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gtgcctcgag gattaagcat tggtaactgt c 31
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tattctcgag acattaacct agaaagcact aagg 34
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<220>
<223>引物
<400>82
ctgaattctg gtcggacaaa cacctagc 28
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<213>人工序列
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<400>83
cggagaattc tccgttacaa acgtcagag 29
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<211>29
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<213>人工序列
<220>
<223>引物
<400>84
actgaattct ggtcggacaa acacctagc 29
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<211>30
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<220>
<223>引物
<400>85
ctcgaggctg aattcagtta tcatttaagg 30
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<211>1394
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<213>人工序列
<220>
<223>DNA序列
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gaattcgagt agtacacgtt tcacctgttt gaagagagtc tgcggtgctg ggagcagata 60
acgggcaatg tggaatggac ttcggagcag ctgaccgaac tggaaaaaag taggctcagc 120
cggagcagtc tccgttacaa acgtcagagt gattccattt taatggaata atcagggtgg 180
taccacggtt cattcgtccc ttttttacag gggaagaatg agcctttttt attatgtttt 240
aagaaatggg gttgatgttt tcttgaaaca aacgattttt tcaggcattc agccaagcgg 300
ctcagtgacg ctcggcaact atatcggtgc aatgaagcag tttgtcgaac tgcagcatga 360
ttataacagc tatttttgca tcgtcgatca gcatgcgata actgttcctc aagaccggct 420
tgagcttaga aagaatatcc gcaatctcgc ggcgctttac ttagctgtcg gacttgatcc 480
agaaaaagca acattgttta ttcagtcaga ggtccccgca catgcgcagg ccggatggat 540
gatgcagtgt gtcgcctata tcggcgagct tgagcggatg actcaattta aggacaaatc 600
caaaggcaat gaagctgtcg tctccggcct gttaacatat ccgccgctga tggccgctga 660
tattctgctg tacggaacgg atcttgtacc tgtcggcgag gatcaaaagc agcaccttga 720
gctgacgcgg aatcttgcag aacgcttcaa caaaaaatac aacgacatct ttacgattcc 780
ggaagtgaaa attccaaaag tcggtgcacg tatcatgtct ctgaatgatc cgctgaagaa 840
aatgagcaaa tctgatccga atcagaaagc ttatattaca ttgctggatg agccgaagca 900
gcttgaaaag aaaatcaaaa gcgcagtaac ggattctgaa ggcattgtca aatttgataa 960
ggaaaacaaa ccgggcgttt ccaaccttct tacaatttat tcaatcctcg gcaatacgac 1020
aattgaagag cttgaagcaa agtacgaagg aaaaggctac ggcgagttta aaggtgattt 1080
ggcagaagtc gtagtgaacg cattaaaacc gatccaggac cgctattacg agctgataga 1140
atctgaagaa ttagaccgga ttcttgatga aggcgcggaa cgagcgaatc ggacagcaaa 1200
caaaatgctg aaaaaaatgg agaatgccat gggtcttgga agaaaaagac gctaatcaaa 1260
aaaccgctct ttgcaaagag cggttttttt cagttgacct ttgattcgtt ttccatttcc 1320
caaagctttt cgaaaaaagg ctgtcctttt attaggtttt cgcaaaaagc taggtgtttg 1380
tccgaccaga attc 1394
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<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>DNA序列
<400>88
gaattctccg ttacaaacgt cagagtgatt ccattttaat ggaataatca gggtggtacc 60
acggttcatt cgtccctttt ttacagggga agaatgagcc ttttttatta tgttttaaga 120
aatggggttg atgttttcgt gaaacaaacg attttttcag gcattcagcc aagcggctca 180
gtgacgctcg gcaactatat cggtgcaatg aagcagtttg tcgaactgca gcatgattat 240
aacagctatt tttgcatcgt cgatcagcat gcgataactg ttcctcaaga ccggcttgag 300
cttagaaaga atatccgcaa tctcgcggcg ctttacttag ctgtcggact tgatccagaa 360
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cagtgtgtcg cctatatcgg cgagcttgag cggatgactc aatttaagga caaatccaaa 480
ggcaatgaag ctgtcgtctc cggcctgtta acatatccgc cgctgatggc cgctgatatt 540
ctgctgtacg gaacggatct tgtacctgtc ggcgaggatc aaaagcagca ccttgagctg 600
acgcggaatc ttgcagaacg cttcaacaaa aaatacaacg acatctttac gattccggaa 660
gtgaaaattc caaaagtcgg tgcacgtatc atgtctctga atgatccgct gaagaaaatg 720
agcaaatctg atccgaatca gaaagcttat attacattgc tggatgagcc gaagcagctt 780
gaaaagaaaa tcaaaagcgc agtaacggat tctgaaggca ttgtcaaatt tgataaggaa 840
aacaaaccgg gcgtttccaa ccttcttaca atttattcaa tcctcggcaa tacgacaatt 900
gaagagcttg aagcaaagta cgaaggaaaa ggctacggcg agtttaaagg tgatttggca 960
gaagtcgtag tgaacgcatt aaaaccgatc caggaccgct attacgagct gatagaatct 1020
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accagaattc 1270
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gaattcagtt atcatttaag gattttacag cactcgtgtt atttatatta ttacaatttt 60
actggaaaaa agaatgtttt ttcatgatga caattggtta taattgattt ataatggagc 120
aatcaaaaga aaagcttgct atgaaaaaga gtagtacacg tttcacctgt ttgaagagag 180
tctgcggtgc tgggagcaga taacgggcaa tgtggaatgg acttcggagc agccgaccga 240
actggaaaaa agtaggctca gccggagcgg tctccgttac aaacgtcaga gtgattccat 300
tttaatggaa taatcagggt ggtaccacgg ttcattcgtc ccttttttac aggggaagaa 360
tgagcctttt ttattatgtt ttaagaaatg gggttgatgt tttcatgaaa caaacgattt 420
tttcaggcat tcagccaagc ggctcagtga cgctcggcaa ctatatcggt gcaatgaagc 480
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aggatcaaaa gcagcacctt gagctgacgc ggaatcttgc agaacgcttc aacaaaaaat 900
acaacgacat ctttacgatt ccggaagtga aaattccaaa agtcggtgca cgtatcatgt 960
ctctgaatga tccgctgaag aaaatgagca aatctgatcc gaatcagaaa gcttatatta 1020
cattgctgga tgagccgaag cagcttgaag agaaaatcaa gagcgcagta acggattctg 1080
aaggcattgt caaatttgat aaggaaaaca aaccgggcgt ttccaacctt cttacaattt 1140
attcaatcct cggcaatacg acaattgaag agcttgaagc aaagtacgaa ggaaaaggct 1200
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accgctatta cgagctgata gaatctgaag aattagaccg gattcttgat gaaggcgcgg 1320
aacgagcgaa tcggacagca aacaaaatgc tgaaaaaaat ggagaacgcc atgggtcttg 1380
gaagaaaaag acgctaatcg aaaaaccgct ctttgcaaag ggcggttttt ttcagttgac 1440
ctttgattcg ttttccatct cccaaagctt ttcgaaaaaa ggctgtcctt ttattaggtt 1500
ctcgcaaaaa gctaggtgtt tgtccgaatt c 1531
Claims (16)
1.重组载体,该重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点、且
在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,
上述重组载体在突变宿主中使用,所述突变宿主是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度。
2.权利要求1所述的重组载体,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
3.权利要求1或2所述的重组载体,该重组载体具有质粒、噬菌体或逆转录转座子的形态。
4.突变宿主细胞,该突变宿主细胞是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度,
上述突变宿主细胞经重组载体转化后使用,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点、且
在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因。
5.权利要求4所述的突变宿主细胞,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
6.权利要求4或5所述的突变宿主细胞,其中带有突变的宿主细胞为细菌、酵母、动物细胞或植物细胞。
7.权利要求4或5所述的突变宿主细胞,其中带有突变的宿主细胞为细菌或酵母。
8.权利要求6或7所述的突变宿主细胞,其中细菌为芽孢杆菌属细菌。
9.使编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的外来基因表达来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的方法,该方法包括下述步骤:
准备重组载体的步骤,所述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点、且在可以表达的状态下具有编码氨酰tRNA合成酶的基因,在上述重组载体的、在可以表达的状态下能够插入任意外来基因的位点插入有期望的外来基因;
准备突变宿主细胞的步骤,所述突变宿主细胞是使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失、或者使编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因的表达降低至宿主细胞无法生长的程度;
用上述重组载体转化上述突变宿主细胞得到转化体的步骤;
培养上述转化体来制备上述外来基因所编码的蛋白或肽的步骤。
10.在宿主细胞内稳定维持目标重组载体的方法,该方法包括:
使上述宿主细胞中所含的、编码氨酰tRNA合成酶的染色体基因缺失或者使其表达降低至宿主细胞无法生长的程度,之后以上述宿主细胞作为突变宿主细胞;
使上述目标重组载体在可以表达的状态下含有编码氨酰tRNA合成酶的基因;
用在可以表达的状态下含有上述编码氨酰tRNA合成酶的基因的目标重组载体转化上述突变宿主细胞。
11.权利要求10所述的方法,其中上述重组载体具有在可以表达的状态下能够插入编码氨酰tRNA合成酶的基因以外的任意外来基因的位点。
12.权利要求9~11中任一项所述的方法,其中氨酰tRNA合成酶为:色氨酰tRNA合成酶、丙氨酰tRNA合成酶、精氨酰tRNA合成酶、天冬酰胺酰tRNA合成酶、天冬氨酰tRNA合成酶、半胱氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺tRNA合成酶、谷氨酸tRNA合成酶、甘氨酸tRNA合成酶、组氨酰tRNA合成酶、异亮氨酰tRNA合成酶、亮氨酰tRNA合成酶、赖氨酸tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA合成酶、苯丙氨酸tRNA合成酶、脯氨酰tRNA合成酶、丝氨酰tRNA合成酶、苏氨酰tRNA合成酶、酪氨酰tRNA合成酶或缬氨酰tRNA合成酶。
13.权利要求9~12中任一项所述的方法,其中带有突变的宿主细胞为细菌、酵母、动物细胞或植物细胞。
14.权利要求9~12中任一项所述的方法,其中带有突变的宿主细胞为细菌或酵母。
15.权利要求13或14所述的方法,其中细菌为芽孢杆菌属细菌。
16.权利要求9~15中任一项所述的方法,其中外来基因所编码的蛋白为选自氧化还原酶、转移酶、水解酶、磷酸化酶、裂解酶、异构酶、合成酶或修饰酶的一种酶。
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