CN101736007A - 哲罗鲑线粒体全基因组序列及其扩增引物 - Google Patents

Abstract

哲罗鲑线粒体全基因组序列及其扩增引物，它涉及一种线粒体全基因组序列及其扩增引物。本发明确定哲罗鲑线粒体全基因组序列，为哲罗鲑的保护遗传学、进化遗传学及优良养殖品种的分子标记辅助选择提供物质基础。哲罗鲑线粒体全基因组序列如SEQ ID NO：1所示。哲罗鲑线粒体全基因组序列的扩增引物为33对。本发明为哲罗鲑的保护遗传学、进化遗传学及优良养殖品种的分子标记辅助选择提供物质基础。

Description

哲罗鲑线粒体全基因组序列及其扩增引物

技术领域

本发明涉及一种线粒体全基因组序列及其扩增引物。

背景技术

线粒体是细胞内一个重要的细胞器，它具有自身的一套基因组，在鱼类中线粒体基因组由于其母系遗传的特点，复制过程中缺乏修复机制导致序列的累积变异速率远远大于核基因组的变异速率等特点，使其作为保护生物学和进化生物学研究的一种非常有效的工具。同时由于线粒体在细胞内起到产能及能量传递的重要作用，其基因组中的碱基突变或缺失能造成重大线粒体疾病(如人类的线粒体肌肉病及线粒体脑肌肉病等)，且其基因组的多态性与物种的经济性状相关，因此对线粒体基因组的研究十分重要。目前鲑科鱼类中已有13个物种对线粒体基因组进行了测序，而哲罗鲑(Hucho taimen)的线粒体基因组序列到目前为止仍未测定。哲罗鲑是我国土著的珍稀名贵的鱼类，是鲑科鱼类中体型最大。由于环境恶化及过度捕捞等因素，其目前的资源量已十分稀少、濒临灭绝；因此，1998年哲罗鲑被列入《中国濒危动物红皮书(鱼类)》，2004年被列入《中国物种红色名录》。哲罗鲑同时也是一种优良的冷水性养殖鱼类，其具有生长快速、抗逆性强的特点，目前已成功进行了野生哲罗鲑的人工驯养，并在此基础上成功开展了规模化繁殖和养殖。但由于其自残严重、不耐高温、不耐低氧及在北方地区低温季节(如冬春季水文在10℃以下季节)生长缓慢等特性影响了生产的成本和产量。因此，确定哲罗鲑线粒体全基因组序列可以在哲罗鲑的保护遗传学、进化遗传学及优良养殖品种的分子标记辅助选择上起到重要作用。

发明内容

本发明的目的是确定哲罗鲑线粒体全基因组序列，为哲罗鲑的保护遗传学、进化遗传学及优良养殖品种的分子标记辅助选择提供物质基础。

哲罗鲑线粒体全基因组序列如SEQ ID NO：1所示。

哲罗鲑线粒体全基因组序列的扩增引物为33对；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第1对的正向引物为5’-AGAGCGCCGGTCTTGTAATC-3’，反向引物为5’-GCTAGCGGGACTTTCTAGGGTC-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第2对的正向引物为5’-TGAATTCCAGAGAACCCATGT-3’，反向引物为5’-TAAAACAAGGGGTGGTGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第3对的正向引物为5’-CAAAGGCTTGGTCCTGACTT-3’，反向引物为5’-TAAAACAAGGGGTGGTGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第4对的正向引物为5’-TGATATCCGCCAGGGAACTA-3’，反向引物为5’-CCCTTGCGGTACTTTTTCTG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第5对的正向引物为5’-GGGTCACCCTGAGCTGACTA-3’，反向引物为5’-GTGCAGGTGGCTGCTCTTAG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第6对的正向引物为5’-AAACCAGGAGAGTTAGTCAAAGGA-3’，反向引物为5’-CCCTCGTGATGCCATTCAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第7对的正向引物为5’-AACACAAGCCTCGCCTGTT-3’，反向引物为5’-CGTTGAACAAACGAACCCTTA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第8对的正向引物为5’-CTCTCCCAGAGTCCCTATCG-3’，反向引物为5’-GCGAGAAATAGAAAGGGTGAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第9对的正向引物为5’TGCTTTCCTCACCCTACTTGA-3’，反向引物为5’-GTGGGATGCGCCTAAAAATA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第10对的正向引物为5’-CCCTTTGACCTCACAGAAGG-3’，反向引物为5’-CTGGCAAAGGTGAGGACTGT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第11对的正向引物为5’-TTGGTGCTTCCACTACACCA-3’，反向引物为5’-GTGTGAGAGAGGGTGCGAAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第12对的正向引物为5’-TTGGTGCTTCCACTACACCA-3’，反向引物为5’-TGTGGGATAAAGTCCTGCAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第13对的正向引物为5’-CACCAGCTGTGACTGCGATA-3’，反向引物为5’-TCAGGGGCTCCGATTATTAG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第14对的正向引物为5’-CCCATGCCTTCGTTATGATT-3’，反向引物为5’-TGGGCTCAAACGATAAATCC-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第15对的正向引物为5’-TGGCAGCAGGCATTACTATG-3’，反向引物为5’-CCTGCGAGGCCTAGGAAAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第16对的正向引物为5’-TTACGTAGTTGCTCATTTCCACT-3’，反向引物为5’-GGATAACTGCTGGGAGGACA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第17对的正向引物为5’-AATGGCACATCCCTCACAAC-3’，反向引物为5’-CAGATCTCAGAACATTGTCCGTA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第18对的正向引物为5’-GACGTCCTTCACTCCTGAGC-3’，反向引物为5’-TGCTGGGTAAATCGGTTGAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第19对的正向引物为5’-CCTCCCATGAATTCTTTTCC-3’，反向引物为5’-CATTAAACGTTTTCTTGTAAATAGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第20对的正向引物为5’-CCTCCCATGAATTCTTTTCC-3’，反向引物为5’-GATTGTAAATGGGGCTTCGT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第21对的正向引物为5’-CCCTTTGAGGTACCCCTTCT-3’，反向引物为5’-TCTAAGCCTCCTTGGGTTCA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第22对的正向引物为5’-GCCCTTCTCCTTACGCTTCT-3’，反向引物为5’-TGGAAAAAGCATGAGTGTGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第23对的正向引物为5’-GCCCTTCTCCTTACGCTTCT-3’，反向引物为5’-GAAGGTGTAGGGGTTGCGTA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第24对的正向引物为5’-ACATCTCCCTCCTGGTCTCC-3’，反向引物为5’-TCCTATTAGGTTGGGGAGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第25对的正向引物为5’-GCAATTATTCTCATAATCGCACA-3’，反向引物为5’-TCCTTTAGAAGCACGAGTGAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第26对的正向引物为5’-CTCTTATCCACCGAGAGAAATC-3’，反向引物为5’-CAGCCGATAAATAGTTGGAACA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第27对的正向引物为5’-AACCTTAGCTTTAAATTTGACCAC-3’，反向引物为5’-TGGATGTAGAGAATGCGACAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第28对的正向引物为5’-GCGATAGAGGGTCCTACGC-3’，反向引物为5’-AACCTCATGGGTAGCAGTGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第29对的正向引物为5’-GCCATTTATAGCCTCCGAGT-3’，反向引物为5’-GATACAAGTGGGGTGGCATT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第30对的正向引物为5’-CCTCACCCTATTTTTCCTTTCA-3’，反向引物为5’-GGTTGGCCATTAGGTTCTTG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第31对的正向引物为5’-CACAAGATAAGTCATAATTCCTGCTC-3’，反向引物为5’-GGAGAAGCCCCCTCAAAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第32对的正向引物为5’-ATTCTGAGGGGCCACTGTAA-3’，反向引物为5’-CCGATTCAGGTGAGGATGAG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第33对的正向引物为5’-CATGGTTGTCCCCATCCTAC-3’，反向引物为5’-AACCTTGGATTTGTGCTGATG-3’。

本发明确定了哲罗鲑线粒体全基因组序列，为哲罗鲑的保护遗传学、进化遗传学及优良养殖品种的分子标记辅助选择提供物质基础。哲罗鲑线粒体全基因组序列共16797bp，含有22个tRNA基因，1个12S rRNA基因，1个16S rRNA基因和13个蛋白编码基因。

本发明所设计引物的扩增产物应覆盖整个线粒体全基因组，每对引物的扩增产物长度在500～1300bp，且相邻两对引物获得的序列重叠100～300bp。

附图说明

图1是具体实施方式三提取的哲罗鲑线粒体基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳图，图2是具体实施方式三哲罗鲑线粒体基因组DNA的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳图。

具体实施方式

本发明技术方案不局限于以下所列举具体实施方式，还包括各具体实施方式间的任意组合。

具体实施方式一：本实施方式哲罗鲑线粒体全基因组序列如SEQ ID NO：1所示。

哲罗鲑线粒体全基因组序列共16797bp，含有22个tRNA基因，1个12SrRNA基因，1个16S rRNA基因和13个蛋白编码基因，哲罗鲑线粒体中的基因及其他结构相应序列位置如表1所示。

表1

基因/部件	序列位置bp	序列大小	编码链	起始密码子	终止密码子
						tRNA-Phe基因	1～68	68bp

基因/部件	序列位置bp	序列大小	编码链	起始密码子	终止密码子
						12S rRNA基因	69～1015	947bp
tRNA-Val基因	1016～1087	72bp
						16S rRNA基因	1088～2768	1681bp
tRNA-Leu(TTA)基因	2769～2843	75bp
						ND1基因	2844～3815	972bp		ATG	TAA
tRNA-Ile基因	3824～3895	72bp
						tRNA-Gln基因	3893～3963	71bp	L
tRNA-Met基因	3963～4031	69bp
						ND2基因	4032～5081	1050bp		ATG	TAA
tRNA-Trp基因	5080～5150	71bp
						tRNA-Ala基因	5153～5222	70bp	L
tRNA-Asn基因	5224～5296	73bp	L
						轻链复制起始区OL	5297～5331	35bp
tRNA-Cys基因	5332～5398	67bp	L
						tRNA-Tyr基因	5399～5469	71bp	L
COX1基因	5471～7021	1551bp		GTG	TAA
						tRNA-Ser(TCA)基因	7022～7092	71bp	L
tRNA-Asp基因	7097～7170	74bp
						COX2基因	7185～7883	699bp		ATG	AGA
tRNA-Lys基因	7876～7949	74bp
						ATP8基因	7951～8118	168bp		ATG	TAA
ATP6基因	8109～8792	684bp		ATG	TAA

基因/部件	序列位置bp	序列大小	编码链	起始密码子	终止密码子
						COX3基因	8792～9577	786bp		ATG	TAA
tRNA-Gly基因	9577～9646	70bp
						ND3基因	9647～9997	351bp		ATG	TAG
tRNA-Arg基因	9996～10065	70bp
						ND4L基因	10066～10362	297bp		ATG	TAA
ND4基因	10356～11741	1386bp		ATG	AGA
						tRNA-His基因	11737～11805	69bp
tRNA-Ser(AGY)基因	11806～11874	69bp
						tRNA-Leu(CTA)基因	11876～11948	73bp
ND5基因	11949～13787	1839bp		ATG	TAA
						ND6基因	13784～14305	522bp	L	ATG	TAG
tRNA-Glu基因	14306～14374	69bp	L
						Cytb基因	14378～15574	1197bp		ATG	TAA
tRNA-Thr基因	15519～15590	72bp
						tRNA-Pro基因	15590～15659	70bp	L
控制区CR	15560～16797	1238bp

具体实施方式二：本实施方式哲罗鲑线粒体全基因组序列的扩增引物为33对；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第1对的正向引物为5’-AGAGCGCCGGTCTTGTAATC-3’，反向引物为5’-GCTAGCGGGACTTTCTAGGGTC-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第2对的正向引物为5’-TGAATTCCAGAGAACCCATGT-3’，反向引物为5’-TAAAACAAGGGGTGGTGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第3对的正向引物为5’-CAAAGGCTTGGTCCTGACTT-3’，反向引物为5’-TAAAACAAGGGGTGGTGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第4对的正向引物为5’-TGATATCCGCCAGGGAACTA-3’，反向引物为5’-CCCTTGCGGTACTTTTTCTG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第5对的正向引物为5’-GGGTCACCCTGAGCTGACTA-3’，反向引物为5’-GTGCAGGTGGCTGCTCTTAG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第6对的正向引物为5’-AAACCAGGAGAGTTAGTCAAAGGA-3’，反向引物为5’-CCCTCGTGATGCCATTCAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第7对的正向引物为5’-AACACAAGCCTCGCCTGTT-3’，反向引物为5’-CGTTGAACAAACGAACCCTTA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第8对的正向引物为5’-CTCTCCCAGAGTCCCTATCG-3’，反向引物为5’-GCGAGAAATAGAAAGGGTGAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第9对的正向引物为5’-TGCTTTCCTCACCCTACTTGA-3’，反向引物为5’GTGGGATGCGCCTAAAAATA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第10对的正向引物为5’-CCCTTTGACCTCACAGAAGG-3’，反向引物为5’-CTGGCAAAGGTGAGGACTGT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第11对的正向引物为5’-TTGGTGCTTCCACTACACCA-3’，反向引物为5’-GTGTGAGAGAGGGTGCGAAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第12对的正向引物为5’-TTGGTGCTTCCACTACACCA-3’，反向引物为5’-TGTGGGATAAAGTCCTGCAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第13对的正向引物为5’-CACCAGCTGTGACTGCGATA-3’，反向引物为5’-TCAGGGGCTCCGATTATTAG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第14对的正向引物为5’CCCATGCCTTCGTTATGATT-3’，反向引物为5’-TGGGCTCAAACGATAAATCC-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第15对的正向引物为5’-TGGCAGCAGGCATTACTATG-3’，反向引物为5’-CCTGCGAGGCCTAGGAAAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第16对的正向引物为5’-TTACGTAGTTGCTCATTTCCACT-3’，反向引物为5’-GGATAACTGCTGGGAGGACA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第17对的正向引物为5’-AATGGCACATCCCTCACAAC-3’，反向引物为5’-CAGATCTCAGAACATTGTCCGTA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第18对的正向引物为5’-GACGTCCTTCACTCCTGAGC-3’，反向引物为5’-TGCTGGGTAAATCGGTTGAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第19对的正向引物为5’-CCTCCCATGAATTCTTTTCC-3’，反向引物为5’-CATTAAACGTTTTCTTGTAAATAGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第20对的正向引物为5’-CCTCCCATGAATTCTTTTCC-3’，反向引物为5’-GATTGTAAATGGGGCTTCGT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第21对的正向引物为5’-CCCTTTGAGGTACCCCTTCT-3’，反向引物为5’-TCTAAGCCTCCTTGGGTTCA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第22对的正向引物为5’-GCCCTTCTCCTTACGCTTCT-3’，反向引物为5’-TGGAAAAAGCATGAGTGTGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第23对的正向引物为5’-GCCCTTCTCCTTACGCTTCT-3’，反向引物为5’-GAAGGTGTAGGGGTTGCGTA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第24对的正向引物为5’-ACATCTCCCTCCTGGTCTCC-3’，反向引物为5’-TCCTATTAGGTTGGGGAGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第25对的正向引物为5’-GCAATTATTCTCATAATCGCACA-3’，反向引物为5’-TCCTTTAGAAGCACGAGTGAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第26对的正向引物为5’-CTCTTATCCACCGAGAGAAATC-3’，反向引物为5’-CAGCCGATAAATAGTTGGAACA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第27对的正向引物为5’-AACCTTAGCTTTAAATTTGACCAC-3’，反向引物为5’-TGGATGTAGAGAATGCGACAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第28对的正向引物为5’-GCGATAGAGGGTCCTACGC-3’，反向引物为5’-AACCTCATGGGTAGCAGTGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第29对的正向引物为5’-GCCATTTATAGCCTCCGAGT-3’，反向引物为5’-GATACAAGTGGGGTGGCATT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第30对的正向引物为5’-CCTCACCCTATTTTTCCTTTCA-3’，反向引物为5’-GGTTGGCCATTAGGTTCTTG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第31对的正向引物为5’-CACAAGATAAGTCATAATTCCTGCTC-3’，反向引物为5’-GGAGAAGCCCCCTCAAAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第32对的正向引物为5’-ATTCTGAGGGGCCACTGTAA-3’，反向引物为5’-CCGATTCAGGTGAGGATGAG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第33对的正向引物为5’-CATGGTTGTCCCCATCCTAC-3’，反向引物为5’-AACCTTGGATTTGTGCTGATG-3’。

本实施方式所设计引物的扩增产物应覆盖整个线粒体全基因组，每对引物的扩增产物长度在500～1300bp，且相邻两对引物获得的序列重叠100～300bp。

具体实施方式三：本实施方式利用具体实施方式二中的33对引物按以下步骤扩增获得哲罗鲑线粒体全基因组序列：

一、提取哲罗鲑的线粒体基因组DNA

A、取200mg新鲜或-20℃保存的哲罗鲑的肌肉、肝脏用无菌水洗净研磨，然后提取线粒体(线粒体提取操作步骤及参数参见商业化线粒体提取试剂盒使用操作手册)；B、向含线粒体悬浮液的离心管中加入质量浓度为20％的SDS，使SDS的终浓度达到0.8％，再37℃水浴15min；C、在离心管中加入与离心管中液体等体积的酚氯仿抽提，轻轻摇匀至乳白色，冰上静止10min；D、在4℃条件下10000g离心10min，取上清液移至另一离心管中；E、重复步骤C和D 1～2次(去除蛋白质)，加入离心管中液体总体积0.2倍的醋酸钠(浓度为1mol/L)，再加入原离心管中液体总体积2倍的温度为-20℃的无水乙醇，置于-20℃环境中放置4h；F、在4℃条件下15000g离心30min，弃去上清液，用上清液2倍体积的体积浓度为75％乙醇洗涤两次；G、加入50μL 0.1×TE溶液溶解线粒体DNA；

二、用具体实施方式二中的33对引物对哲罗鲑线粒体基因组DNA进行PCR扩增

33对引物PCR扩增反应体系都为25μL，均由3.5μL浓度为20ng/μL的哲罗鲑线粒体基因组DNA、2.5μL高保真Taq DNA聚合酶商业包装中的10×Buffer、1.5μL浓度为25mmol/L的MgCl₂、2μL浓度为2.5mmol/L的dNTP、1.6μL浓度为10pmol/μL正向引物、1.6μL浓度为10pmol/μL反向引物、0.3μL浓度为5U/μL高保真Taq DNA聚合酶和余量无菌去离子水组成；扩增反应程序为：94℃预变性5min，循环设置为94℃变性30s、退火30s、72℃延伸30s～60s，72℃延伸10min；

其中哲罗鲑线粒体全基因组序列第1对扩增引物的退火温度为56℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第2对扩增引物的退火温度为54℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第3对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第4对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第5对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第6对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第7对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第8对扩增引物的退火温度为54℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第9对扩增引物的退火温度为50℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第10对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第11对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第12对扩增引物的退火温度为50℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第13对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第14对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第15对扩增引物的退火温度为50℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第16对扩增引物的退火温度为50℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第17对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第18对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第19对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第20对扩增引物的退火温度为54℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第21对扩增引物的退火温度为50℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第22对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第23对扩增引物的退火温度为50℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第24对扩增引物的退火温度为50℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第25对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第26对扩增引物的退火温度为53℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第27对扩增引物的退火温度为50℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第28对扩增引物的退火温度为50℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第29对扩增引物的退火温度为50℃，循环38次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第30对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第31对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第32对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；哲罗鲑线粒体全基因组序列第33对扩增引物的退火温度为53℃，循环35次；

三、对获得的PCR扩增产物进行纯化回收，并进行序列测定

PCR扩增产物的纯化回收和测序交由上海生物工程技术有限公司进行商业操作，PCR扩增产物序列测定的测序引物为步骤二中PCR扩增的正向引物或反向引物：

其中第1对引物的扩增产物用第1对中的正向引物测序；第2对引物的扩增产物用第2对中的正向引物测序；第3对引物的扩增产物用第3对中的正向引物测序；第4对引物的扩增产物用第4对中的正向引物测序；第5对引物的扩增产物用第5对中的正向引物测序；第6对引物的扩增产物用第6对中的正向引物测序；第7对引物的扩增产物用第7对中的正向引物测序；第8对引物的扩增产物用第8对中的正向引物测序；第9对引物的扩增产物用第9对中的正向引物测序；第10对引物的扩增产物用第10对中的正向引物测序；第11对引物的扩增产物用第11对中的正向引物测序；第12对引物的扩增产物用第12对中的反向引物测序；第13对引物的扩增产物用第13对中的正向引物测序；第14对引物的扩增产物用第14对中的正向引物测序；第15对引物的扩增产物用第15对中的正向引物测序；第16对引物的扩增产物用第16对中的正向引物测序；第17对引物的扩增产物用第17对中的正向引物测序；第18对引物的扩增产物用第18对中的正向引物测序；第19对引物的扩增产物用第19对中的正向引物测序；第20对引物的扩增产物用第20对中的反向引物测序；第21对引物的扩增产物用第21对中的正向引物测序；第22对引物的扩增产物用第22对中的正向引物测序；第23对引物的扩增产物用第23对中的反向引物测序；第24对引物的扩增产物用第24对中的正向引物测序；第25对引物的扩增产物用第25对中的正向引物测序；第26对引物的扩增产物用第26对中的正向引物测序；第27对引物的扩增产物用第27对中的正向引物测序；第28对引物的扩增产物用第28对中的正向引物测序；第29对引物的扩增产物用第29对中的正向引物测序；第30对引物的扩增产物用第30对中的正向引物测序；第31对引物的扩增产物用第31对中的正向引物测序；第32对引物的扩增产物用第32对中的正向引物测序；第33对引物的扩增产物用第33对中的正向引物测序；

四、采用序列拼接软件对获得的序列进行质量控制，并根据各条序列中的重叠部分进行全基因组序列拼接

获得的PCR产物序列用序列拼接软件Staden进行测序峰的读取及质量控制，并进行全基因组序列拼接；在读取测序峰和序列拼接时采用置信度控制序列质量，去除平均置信度小于15以下的序列；

五、采用序列分析软件对获得的全基因组序列进行结构、功能分析，并对序列进行注释

采用tRNAScan-SE软件确定哲罗鲑线粒体全基因组序列的21个tRNA基因，第22个tRNA基因tRNA-Ser(AGY)采用Blast软件与其他鲑科鱼类线粒体全基因序列比对确定；采用ORFFinder、GetORF和Sequin软件确定哲罗鲑线粒体全基因组序列的13个蛋白质编码基因；采用Blast软件与其他鲑科鱼类线粒体全基因序列比对确定12S rRNA、16S rRNA基因、线粒体基因组复制转录控制区CR(Control Region)和线粒体基因组轻链复制起始区OL(Origin ofReplication)。

本实施方式提取的哲罗鲑线粒体基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳图如图1所示，其中图1中“M”泳道标样为Marker，第二泳道标样为基因组DNA，“mt”泳道标样为哲罗鲑线粒体基因组DNA。

本实施方式哲罗鲑线粒体基因组DNA的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳图如图2所示，其中图2中“M”泳道标样为Marker，第“3～13”泳道标样为第3对至第13对哲罗鲑线粒体基因组扩增引物，每对引物扩增用两个哲罗鲑样品，第一个样本H表示哲罗鲑红花尔基群体野生样品，BH表示哲罗鲑北洪群体野生样品。

序列表

<110>中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

<120>哲罗鲑线粒体全基因组序列及其扩增引物

<160>67

<210>1

<211>16797

<212>DNA

<213>哲罗鲑(Hucho taimen)

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列。

<400>1

GCTAGCGTAG CTTAACTAAA GCATAACACT GAAGCTGTTA AGATGGACCC TAGAAAGTCC 60

CGAAGGCACA AAGGCTTGGT CCTGACTTTA CCATCAGCTT TAACTGAACT TACACATGCA 120

AGTCTCCGCA TTCCTGTGAG GATGCCCTTA ATCCCCTGCC CGGGGACGAG GAGCCGGCAT 180

CAGGCACGCC CCGGCAGCCC AAGACGCCTT GCTAAGCCAC ACCCCCAAGG AAACTCAGCA 240

GTGATAGACA TTAAGCCATA AGCGAAAGCT TGACTTAGTT AAGGTTAAGA GGGCCGGTAA 300

AACTCGTGCC AGCCACCGCG GTTATACGAG AGGCCCTAGT TGATGGTTAC CGGCGTAAAG 360

AGTGGTTATG AAAAAGTATT TAATAAAGCC GAACACCCCC TTAGCCGTCA TACGCACCTG 420

GGGGCACGAA GACCTACTGC GAAAGCAGCT TTAATTATAC CTGAACCCAC GACAGCTACG 480

ACACAAACTG GGATTAGATA CCCCACTATG CCTAGCCGTA AACTTTGATA AAAACATACA 540

ACTGATATCC GCCAGGGAAC TACAAGCGCC AGCTTAAAAC CCAAAGGACT TGGCGGTGCC 600

TCAGACCCAC CTAGAGGAGC CTGTTCTAGA ACCGATAACC CCCGTTCAAC CTCACCACCT 660

CTTGTTTTCC CCGCCTATAT ACCACCGTCG TCAGCTTACC CTGTGAAGGC CTTATAGTAA 720

GCAAAATGGG CAAAACCCAA AACGTCAGGT CGAGGTGTAG CGCATGGGGT GGGAAGAAAT 780

GGGCTACATT CTCTAAATTA GAGCACTACG AACCACGCTG TGAAACCAGC GTCCGAAGGT 840

GGATTTAGCA GTAAACAGAA AACAGAGAGT TCTCTTGAAA CTGGCTCTGA GGCGCGCACA 900

CACCGCCCGT CACTCTCCCC GAGTTCAATT TATCCTTCTA ACTAAGAAGT TAACCGAACA 960

AAGGGGAGGC AAGTCGTAAC ATGGTAAGTG TACCGGAAGG TGCACTTGGA ATAACCAGAG 1020

TGTAGCTAAG ATAGAAAAGC ACCTCCCTTA CACCGAGAAG ACATCCGTGC AATTCGGGTC 1080

ACCCTGAGCT GACTAGCTAG CCCACACCTT GGTCTAACAC CACAACATAC ATACCCCTAA 1140

AAGACTTAGA ACTAAGTTAA CAAACCATTT TTCCACCTTA GTACGGGCGA CGGAAAAGGA 1200

GATAATCGAG CAACAGAGAA AGTACCGCAA GGGAAAGCTG AAAGAGAACT GAAACAACCC 1260

ATTTAAGCCT AGAAAAGCAG AGATTAAATC TCGTACCTTT TGCATCATGA TTTAGCCAGC 1320

AAACCTGGGC AAAGAGAACT TTAGTTCAGG CCCCCGAAAC TAGACGAGCT ACTCCGGGAC 1380

AGCCTATTAT AGGGCCAACC CGTCTCTGTG GCAAAAGAGT GGGACGAGCC CCGAGTAGAG 1440

GTGATAAACC TATCGAGCCT AGTTATAGCT GGTTGCTTAG GAAATGAATA GAAGTTCAGC 1500

CCCCTGGCCT TCTTAGGACC TCAAGGTAAA ACTAACCTTG TCCCAAAGAA ACCAAGGGAG 1560

TTAGTCAAAG GAGGTACAGC TCCTTTGAAC AAGGACACAA CCTTAACAGG CGGCTAAGGA 1620

TCATAATTAC TAAGGTAACC TGTTACAGTG GGCCTAAGAG CAGCCACCTG CATAGAAAGC 1680

GTTAAAGCTC AGACAGATAT AAGCCTCTTA TCCTGATAAG AAATCCTACC CCCTAACCGT 1740

ACTAAGCCAT TCCATGCCCC CATGGAAGAG ATTATGCTAG AATGAGTAAT AAGAGGGAAT 1800

AACCCTCTCC CAGCACATGT GTAAGTCGGA CCGGACCCCC CGCCGACAAA TAACGAACCC 1860

AAGCCAAGAG GGAACTGTAG GCCAGAATAA ACACCAAGAA GAACCTACAC CAATAAATCG 1920

TTAACCCCAC ACAGGAGTGC CCACAGGGAA AGACCCAAAG GAAGAGAAGG AACTCGGCAA 1980

ACACAAGCCT CGCCTGTTTA CCAAAAACAT CGCCTCTTGC AAATCAAAGC ATAAGAGGTC 2040

CCGCCTGCCC TGTGACTATG GGTTTAACGG CCGCGGTATT TTGACCGTGC GAAGGTAGCG 2100

CAATCACTTG TCTTTTAAAT GAAGACCTGT ATGAATGGCA TCACGAGGGC TTAGCTGTCT 2160

CCTCTTCCAA GTCAATGAAA TTGATCTGCC CGTGCAGAAG CGGACATAAG CACATAAGAC 2220

GAGAAGACCC TATGGAGCTT TAGACACCAG GCAGATCACG TCAAGCAACC TTGAACTAAC 2280

AAGTAAAAAC GCAGTGACCC CTAGCCCATA TGTCTTTGGT TGGGGCGACC GCGGGGGAAA 2340

ACAAAGCCCC CATGTGGACT GGGGGCACTG CCCCCCACAG CCAAGAGCTA CAACTCTAAG 2400

CACCAGAATT TCTGACCAAA AATGATCCGG CGAACGCCGA TCAACGGACC GAGTTACCCT 2460

AGGGATAACA GCGCAATCCT CTCCCAGAGT CCCTATCGAC GAGGGGGTTT ACGACCTCGA 2520

TGTTGGATCA GGACATCCTA ATGGTGCAGC CGCTATTAAG GGTTCGTTTG TTCAACGATT 2580

AAAGTCCTAC GTGATCTGAG TTCAGACCGG AGTAATCCAG GTCAGTTTCT ATCTATGAAG 2640

TGATGTTTCC TAGTACGAAA GGACCGGAAA GAAGGGGCCC ATGCTTTAGG CACGCCCCAC 2700

CCCCACCTGA TGAAGGCAAC TAAAACAGAC AAGGGGGCAC ACCAAGATTG TGCCTAAAAG 2760

AACGGCGCGC TAAGGTGGCA GAGCCCGGTA ATTGCGAGAG GCCTAAGCCC TCTTTTTCAG 2820

AGGTTCAAGT CCTCTCCTTA GCTATGACTA CCCTTATTAC CCATGTTATT AACCCACTCG 2880

TATACATTGT GCCTGTTCTC CTAGCAGTTG CTTTCCTCAC CCTCCTCGAA CGAAAAGTTC 2940

TCGGGTACAT GCAACTTCGA AAGGGACCTA ATATTGTTGG TCCATATGGA TTACTTCAAC 3000

CCATTGCAGA CGGCCTTAAG CTATTTATTA AAGAACCAGT TCGACCATCC ACCTCTTCCC 3060

CCTTTCTATT TCTCGCCACA CCAATACTTG CCTTAACACT TGCACTCACC TTATGAGCCC 3120

CAATACCAAT CCCCTACCCC GTCACAGACC TCAACCTAGG AATACTATTT ATTCTAGCAC 3180

TATCAAGCCT CGCGGTATAC TCAATCCTAG GGTCAGGATG AGCATCAAAT TCCAAATATG 3240

CATTAATCGG AGCCCTACGA GCAGTAGCCC AAACTATTTC CTATGAAGTC AGCCTAGGAC 3300

TAATCCTACT AAGCGTGATT ATCTTCACAG GAGGATACAC ACTACAAACA TTTAACATCA 3360

CCCAAGAAAG TATCTGACTA CTCATACCAG CCTGACCCCT TGCCGCCATA TGATACATCT 3420

CAACCCTAGC TGAGACAAAC CGTGCACCAT TCGACCTAAC AGAAGGAGAA TCAGAACTGG 3480

TATCCGGCTT TAATGTAGAA TATGCTGGAG GACCCTTCGC CCTTTTTTTC TTAGCCGAAT 3540

ACGCTAATAT CCTTCTAATA AATACACTCT CAGCCATCCT ATTCCTAGGC GCATCCCATA 3600

TCCCAGCTCT CCCTGAACTA ACAGCCCTTA ATCTCATAAC AAAAGCTGCC CTACTCTCCG 3660

TTGTATTCTT ATGAGTACGA GCATCCTACC CCCGATTTCG GTACGACCAA CTTATACACT 3720

TAGTTTGAAA AAGCTTCCTA CCTCTAACTT TAGCCCTTGT CCTATGACAC CTTGCACTCC 3780

CTATTGCTAT AGCAGGCCTC CCTCCCCAAC TTTAATTTCA CAAGGAATTG TGCCTGAATG 3840

CTTAAGGACC ACCTTGATAG CGTGGCTGAT AGGGGTTCAA GTCCCCTCAA TTCTAGAGAG 3900

AAGGGGCTCG AACCCATCCT CAAGAGATCA AAACTCTTGG TGCTTCCACT ACACCACTTT 3960

CTAGTAAAGT CAGCTAATTA AGCTTTTGGG CCCATACCCC AAATATGTTG GTTAAAATCC 4020

TTCCTTTACT AATGAACCCC TATGTACTCA CTATTTTACT TTCCAGCCTA GGTCTAGGCA 4080

CAGTCCTCAC CTTTGCCAGC TCCCACTGAC TTCTTGCATG AATAGGCCTA GAAATTAATA 4140

CCCTTGCTAT TATTCCAATC ATAGCACGAC AGCACCACCC CCGAGCAATT GAAGCTACAA 4200

CCAAGTACTT TTTAACACAA GCAACTGCCG CAGCAATGAT CCTCTTTGCC AGCACTACCA 4260

ATGCTTGACT GGTTGGGGAA TGAGAAATCC ACCAACTATC CCACCCCTTA GCAACTACAA 4320

CTGTAATACT GGCCTTAGCA CTTAAGCTCG GGCTAGCCCC CGTTCATTTC TGATTACCAG 4380

AAGTCCTTCA AGGGATTGAA CTCACCACAG GGTTAATCCT TTCAACCTGA CAAAAACTCG 4440

CACCCTTTGC ACTTATAATT CAAGTAGCCC CAACTATCAA CTCTTCTCTA CTTATTACAC 4500

TAGGTCTTCT ATCAACTCTA GTGGGGGGTT GAGGAGGACT TAACCAAACC CAGCTACGTA 4560

AAATTTTAGC ATACTCTTCA ATTGCCCACC TGGGATGAAT AGTGTTAATC TTACAATTTG 4620

CACCCTCCCT GACACTCCTC AGCCTTCTCC TTTATATCAT CATAACCTCT TCAGCATTCC 4680

TTGCACTAAA AACCAACAAT TCCCTAACTA TCAACACCCT TGCAACCTCA TGAACGAAAG 4740

CCCCCACTCT CGCCGCACTA ACTACTCTTG TTCTCCTCTC TCTAGGAGGT CTCCCACCTC 4801

TCTCAGGCTT TATACCCAAA TGACTTATTC TGCAAGAACT AACAAAACAA GGACTTCCAC 4860

TATCTGCCAC ACTAGCTGCT ATAGCAGCCC TCCTTAGCCT CTACTTTTAT CTGCGCCTCT 4920

GTTACGCCAT AGCACTCACT ATTTACCCCA ACACCCTAAC TGCCACCGCC CCCTGACGCC 4980

TCAACTTCAC TCACCTTACC CTGCCCCTCT CAATTGTTAC TATCTTAGCC TTAGGCTTAC 5040

TCCCCCTCAC CCCAGCTGTG ACTGCAGTAT TAACCTTATA AGGGCTTAGG ATAACACTAG 5100

ACCAAGAGCC TTCAAAGCTC TAAGCGGGAG TGAAAATCTC CCAGCCCTTG TTTAAGACTT 5160

GCAGGACTTT TATCCCACAT CTTCTGAATG CAACCCAGAC ACTTTAATTA AGCTAAAGCC 5220

TTTCTAGGTG GGAAGGCCTC GATCCTACAA ACTCTTAGTT AACAGCTAAG CGCTCTATCC 5280

AGCGAGCATC CATCTACTTT CCCCCGCCAC CAGGGGCGGC GAGGCGGGGG AAAGCCCCGG 5340

TAGGCTGTTA GCCTACTTCT TTAGATTTGC AATCTAACAT GTGGTACACC ACAGGGCTTG 5400

ATAAGGAGAG GATTTAAACC TCTGTTTATG GAGCTACAAT CCACCGCTTA AGCTCTCAGC 5460

CACCCTACCT GTGGCAATCA CACGATGATT TTTCTCAACC AACCACAAAG ACATTGGCAC 5520

CCTCTATTTA GTATTTGGTG CCTGAGCCGG AATAGTCGGC ACAGCCCTAA GTCTCTTGAT 5580

CCGAGCAGAA CTAAGTCAAC CCGGAGCTCT TCTAGGGGAT GACCAAATCT ATAACGTAAT 5640

CGTCACAGCC CATGCCTTCG TTATAATTTT CTTTATAGTC ATGCCAATCA TAATTGGGGG 5700

CTTTGGAAAC TGATTGATCC CACTAATAAT TGGAGCCCCT GACATAGCAT TCCCTCGAAT 5760

AAATAACATA AGCTTCTGGC TCCTCCCTCC ATCCTTTCTC CTCCTTCTAG CTTCGTCTGG 5820

GGTTGAAGCC GGCGCCGGCA CAGGGTGAAC AGTTTATCCC CCTCTAGCCG GAAACCTAGC 5880

CCACGCAGGG GCTTCCGTTG ATTTAACTAT CTTCTCCCTC CACTTGGCTG GTATTTCCTC 5940

AATTTTAGGG GCTATTAATT TTATTACAAC CATTATTAAT ATAAAACCCC CAGCCATTTC 6000

TCAGTATCAA ACCCCACTTT TTGTTTGAGC TGTTTTAGTC ACTGCCGTTC TCTTACTACT 6060

TTCCCTCCCC GTCTTAGCAG GGGGCATCAC TATACTACTC ACAGACCGAA ATCTAAATAC 6120

CACTTTCTTT GACCCAGCCG GCGGAGGAGA CCCAATCCTG TACCAGCACC TCTTTTGATT 6180

CTTCGGCCAT CCGGAAGTCT ATATTCTTAT TCTCCCAGGC TTTGGTATAA TTTCTCACAT 6240

CGTTGCCTAT TATTCAGGTA AAAAAGAACC TTTCGGGTAT ATGGGGATAG TCTGAGCTAT 6300

GATAGCCATC GGACTCTTGG GGTTCATCGT TTGAGCCCAC CACATATTTA CTGTTGGTAT 6360

GGACGTAGAC ACTCGTGCTT ACTTTACATC CGCCACCATA ATTATTGCCA TCCCCACAGG 6420

AGTAAAAGTA TTTAGCTGAT TAGCTACATT ACATGGCGGC TCAATCAAAT GAGAAACGCC 6480

ACTTCTCTGA GCCCTAGGGT TTATTTTCCT ATTTACGGTG GGGGGACTCA CGGGCATTGT 6540

TCTTGCTAAT TCCTCATTAG ACATCGTCCT CCACGACACT TATTATGTGG TCGCTCATTT 6600

CCACTATGTA TTATCTATGG GAGCTGTCTT TGCCATCATG GGCGCTTTCG TACACTGATT 6660

CCCACTATTT ACAGGGTACA CCCTTCACAG CACATGAACC AAAATCCATT TTGGAATTAT 6720

ATTCATCGGC GTAAATTTAA CCTTTTTCCC CCAGCACTTC CTCGGCCTTG CAGGGATACC 6780

ACGGCGATAC TCTGATTACC CAGACGCCTA CACATTATGA AACACAGTAT CCTCAATTGG 6840

GTCTCTTATC TCCTTAGTTG CTGTAATTAT ATTCCTGTTT ATTCTCTGAG AAGCCTTTGC 6900

TGCCAAACGA GAAGTAGCAT CAATTGAATT AACTTCAACA AACGTAGAAT GACTACATGG 6960

ATGTCCTCCA CCTTACCACA CATTTGAAGA GCCAGCATTT GTTCGAGTAC AGGCAAACTA 7020

ACGAGAAAGG GAGGAATTGA ACCCCCATGT GCTGGTTTCA AGCCAACCGC ATAACCACTC 7080

TGCCACTTTC TTCCATAAGA CACTAGTAAA ACTAGTCTAT TATACTGCCT TGTCAAGGCA 7140

AAATTGTGGG TTAAAATCCC GCGTGTCTTA AGCATTTAGC TAAAATGGCA CATCCCTCAC 7200

AACTAGGATT CCAAGACGCG GCCTCCCCTG TAATAGAAGA ACTTCTTCAC TTCCACGACC 7260

ACGCTCTTAT GATTGTTCTT CTTATCAGCA CACTAGTGCT TTATATCATC GTAGCAATAG 7320

TCTCTACTAA ACTCACTAAC AAATATATCC TTGATTCTCA AGAAATTGAA ATCGTTTGAA 7380

CCGTCCTCCC AGCGGTTATC CTTATTCTTA TTGCCCTCCC CTCCCTCCGA ATTCTCTACC 7440

TCATAGATGA AATTAATGAC CCCCACCTCA CTATCAAAGC AATGGGTCAT CAATGATACT 7500

GAAGCTACGA ATACACCGAC TACGAAGATT TAGGCTTTGA CTCTTACATA GTCCCCACCC 7560

AAGATTTGGT ACCCGGTCAA TTTCGCCTTC TAGAAACAGA TCATCGAATA GTTGTCCCTG 7620

TAGAATCCCC AATCCGAGTT CTTGTCTCGG CTGAAGACGT CCTACACTCC TGAGCTGTCC 7680

CTTCTCTAGG TGTAAAAATA GACGCAGTGC CAGGACGATT AAACCAAACA GCCTTTATTG 7740

CCTCTCGACC TGGAGTATTC TACGGACAAT GTTCTGAAAT CTGCGGGGCC AACCACAGCT 7800

TCATACCCAT CGTTGTCGAA GCAGTACCCC TAGAACACTT CGAGAAATGA TCCACTATAA 7860

TACTTGAAGA TGCCTCACTA AGAAGCTAAA TCGGGAATAG CGTTAGCCTT TTAAGCTAAA 7920

GACTGGTGAC CCCCAATCAC CCTTAGTGAC ATGCCCCAAC TCAACCCCGC CCCCTGATTT 7980

GCCATCTTGG TATTCTCATG ACTGGTTTTT CTAACTGTTA TTCCCCCAAA AGTCCTAGGC 8040

CACACTTTTA CAAATGAGCC TACTTCACAA AGCACTGAAA AAGCTAAACC TGAACCCTGA 8100

AACTGACCAT GACACTAAGC TTCTTTGACC AATTTATGAG CCCCACATAC CTAGGTATTC 8160

CACTTATTGC TTTAGCACTA ACCCTACCAT GAATTCTTTT CCCCACCCCC TCCACCCGGT 8220

GACTAAATAA CCGCCTTATC ACCCTTCAAG GATGGTTCAT CAACCGATTT ACTCAACAAC 8280

TTCTTCTACC CCTTAACTTA GGGGGCCACA AATGAGCAGT TCTATTGACT TCTTTAATAT 8340

TATTCCTTAT TACCCTAAAT ATACTAGGCC TCCTCCCATA CACATTTACC CCTACTACAC 8400

AACTCTCTTT AAATATAGGC CTCGCAGTCC CACTATGACT TGCAACAGTA ATCATTGGAA 8460

TACGAAACCA GCCCACCGCT GCCCTCGGAC ACCTCTTGCC TGAAGGAACT CCTGTCCCAC 8520

TAATCCCAGT TCTCATTATT ATCGAAACAA TTAGCCTTTT TATCCGCCCC CTCGCCCTAG 8580

GTGTACGACT TACAGCCAAT CTCACAGCAG GCCATCTTCT AATTCAACTA ATTGCCACAG 8640

CAGCCTTTGT TCTTCTGCCT ATAATACCCA CAGTGGCAAT CCTGACTTCT ATTGTTCTTT 8700

TCCTATTAAC CCTCCTTGAA ATTGCCGTTG CCATAATCCA AGCCTATGTA TTTGTTCTTC 8760

TCCTAAGCCT CTATTTACAA GAAAACGTCT AATGGCACAC CAAGCACACG CATACCATAT 8820

GGTTGACCCA AGCCCCTGAC CTCTAACCGG CGCAATTGCC GCCCTCTTAC TTACATCAGG 8880

CACTGCAGTC TGATTCCACT TTCATTCACT AACACTACTA ACCATAGGGA ATATTCTACT 8940

GCTTCTCACC ATATACCAGT GATGACGGGA TATTATCCGA GAAGGTACCT TTCAAGGACA 9000

CCACACACCC CCAGTCCAAA AAGGATTACG CTACGGTATA ATCTTATTTA TCACCTCCGA 9060

AGTATTCTTT TTCTTAGGTT TCTTCTGAGC TTTCTACCAT TCTAGTCTCG CCCCCACGCC 9120

TGAGTTAGGA GGCTGCTGAC CCCCCACAGG CATTATCACT CTTGATCCCT TTGAAGTCCC 9180

ACTTCTTAAC ACCGCAGTCC TTCTAGCATC TGGTGTCACC GTTACATGAG CCCACCACAG 9240

CATTATGGAA GGAGAACGGA AACAAGCCAT TCAATCTCTT ACCCTTACCA TCTTACTAGG 9300

ATTTTACTTC ACTTTCCTCC AAGGCATAGA ATACTACGAA GCCCCATTCA CAATCGCCGA 9360

CGGTGTATAC GGCTCCACTT TCTTTGTCGC CACAGGATTC CACGGCTTGC ATGTAATTAT 9420

CGGCTCTACC TTTCTAGCCG TCTGCCTATT ACGACAAGTT CAATACCATT TTACATCCGA 9480

ACATCACTTT GGCTTTGAAG CTGCCGCCTG ATATTGACAT TTTGTGGACG TCGTATGACT 9540

CTTCCTGTAC GTCTCTATTT ATTGATGAGG CTCATAATCT TTCTAGTATT AATACGTATA 9600

AGTGACTTCC AATCACCCGG TCTTGGTTAA AGTCCAAGGA AAGATAATGA ATTTAATTAC 9660

AACAATTATT ACTATCACCA TCACACTATC CGCAGTACTG GCCACCATTT CTTTCTGACT 9720

ACCACAAATT TCGCCCGACG CAGAAAAGCT ATCCCCCTAT GAGTGCGGAT TTGATCCCCT 9780

AGGATCTGCC CGCTTACCCT TCTCCTTACG CTTCTTTCTA ATCGCCATCC TTTTTCTTCT 9840

ATTTGATCTA GAAATTGCCC TTCTCCTTCC CCTTCCCTGA GGAGATCAGC TCATCACCCC 9900

CACTCTAACA CTTGCCTGAT CGGCCGCCGT CCTCGCTCTT CTTACTCTCG GCTTAATCTA 9960

TGAATGAACC CAAGGAGGCT TAGAATGAGC TGAATAGGCA GTTAGTCCAA AACAAGACCC 10020

TTGATTTCGG CTCAAAAAAC CATGGTTTAA GTCCATGACC GCCTTATGAC ACCAGTACAC 10080

TTCAGCTTTA CCTCAGCCTT TATCCTAGGG CTAATAGGAC TTGCATTCCA TCGCACCCAT 10140

CTTCTCTCAG CCCTTCTATG CCTAGAAGGA ATAATACTCT CCCTATTTAT TGCCCTCTCC 10200

CTCTGAGCCC TCCAAATGGA GGCAACTGGC TACTCAGTGG CTCCCATACT TCTTCTAGCA 10260

TTTTCAGCCT GCGAAGCCAG CGCAGGTCTA GCCCTCCTGG TTGCAACTGC ACGAACACAC 10320

GGTACAGACC GCCTTCAAAG CCTAAACCTC CTCCAATGTT AAAAATCCTA ATCCCAACAC 10380

TCATGCTTTT CCCAACAATC TGGCTAAGCC CTGCGAAATG ACTTTGAACA ACATCGATTG 10440

CCCAAAGTTT AATCATTGCC TTGGCAAGTT TATCATGACT TAAATGATCA TCAGAGACCG 10500

GATGATCCTC CTCCAACCTT TATTTAGCAA CTGATCCTCT ATCAACACCC TTACTAGTAT 10560

TAACCTGCTG ATTACTACCC CTTATAATTC TTGCCAGCCA AAACCACATC TCCCCTGAAC 10620

CCTTAAACCG CCAACGAACT TACATCTCCC TTTTGGTCTC CCTCCAAACA TTTTTAATTT 10680

TAGCATTTGG AGCTACGGAA ATCATCATGT TCTACATCAT ATTTGAAGCC ACTCTGCTCC 10740

CAACCCTGAT CATCATCACA CGATGAGGAA ATCAAACAGA ACGCCTTAAT GCCGGCACTT 10800

ATTTCTTATT CTACACCTTA GCCGGCTCCC TACCCCTCCT CGTAGCCTTA CTACTTTTAC 10860

AAAATGACAA TGGTACCCTA TCCATACTTA CCCTGCAATA CACGCAACCT CTACACCTTT 10920

TAACATGGGG TGATAAGCTA TGATGAGCTG CCTGCCTCTT AGCCTTTCTT GTAAAAATAC 10980

CGCTATACGG CGTCCACCTT TGACTTCCTA AAGCCCATGT AGAAGCCCCA ATCGCAGGAT 11040

CCATAATTCT GGCAGCTGTT CTTCTTAAAC TTGGAGGATA TGGTATAATA CGCATGATAG 11100

TTATACTAGA CCCATTAACC AAAGAACTAG CCTACCCCTT CATTATTTTG GCCTTGTGAG 11160

GTATTATTAT GACCGGGTCA ATCTGCCTAC GTCAAACAGA CCTAAAATCA CTAATTGCAT 11220

ACTCTTCAGT AGGCCATATA GGATTAGTTG CAGGGGGCAT TCTCATTCAA ACGCCCTGAG 11280

GATTCACTGG TGCAATTATC CTTATAATTG CACACGGTCT TGCCTCCTCA GCACTCTTCT 11340

GCCTGGCTAA CACTAGCTAC GAGCGCACAC ATAGCCGAAC TATACTCTTA GCTCGAGGAA 11400

TACAAATGGT TCTCCCCCTT ATAACCACCT GATGATTCGT AGCTAGTTTA GCCAATCTCG 11460

CCCTACCTCC CCTCCCCAAC CTAATAGGAG AACTGATAAT CATCACTTCC ATATTTAACT 11520

GATCATACTG AACTCTCCTT CTTACAGGAA TCGGCACATT AATTACAGCA AGCTACTCTC 11580

TCTATCTATT TTTAATAACC CAACGAGGAC CCCTACCCTC CCACATCATT GCTCTTGAAC 11640

CCACCCACAC TCGCGAACAC CTACTCATCA CTTTACACCT TATTCCTATC ATCCTCCTGA 11700

TCCTAAAACC TGAGCTCATC TGAGGCTGAT GTTTCTGTAG ATATAGTTTA ACCAAAACAT 11760

TAGATTGTGA CTCTAAAGAC AGAGGTTAGA GTCCTCTTAT CCACCGAGAG AAATCTGTTG 11820

ATAGTAGAGA CTGCTAATCT TCTACCCCCT TGGTTAAATT CCGTGGTTCA CTCGCGCTTT 11880

TAAAGGATAA TAGCCCATCC ATTGGTCTTA GGAACCAAAA ACTCTTGGTG CAAATCCAAG 11940

TAAAAGCTAT GCACCCGACT ACCCTTATCT TAAGTTCAGC TCTTTTAATG ATCTTCGCAC 12000

TCCTCCTTTA CCCCCTTATT ACTACCCTCA GCCCCACCCC CCGACAAGAA GACTGAGCCC 12060

TCACTCACGT GAAAACCGCT ATCAAAATAG CTTTTCTAGT AAGCCTCCTA CCCCTCTTTG 12120

TTTTTCTTGA CCAAGGCACC GAAACAATTG TTACCAATTG ACAATGAATA AACACCTTAA 12180

CTTTTGATAT CAATCTCAGT TTTAAATTTG ACCACTATTC CATTATTTTC ACCCCCATTG 12240

CCCTTTATGT CACTTGATCT ATTCTCGAAT TTGCATCCTG ATATATGCAC GCTGACCCTA 12300

ATATAAACCG ATTTTTTAAA TACCTTCTCC TCTTCCTAAT TGCAATAATC ATTCTAGTAA 12360

CCGCCAACAA CATATTTCAA CTATTTATTG GCTGGGAGGG AGTTGGCATT ATATCATTCC 12420

TCCTCATTGG ATGGTGATAC GGCCGAGCCG ATGCTAACAC GGCTGCCATA CAAGCTGTAA 12480

TTTATAACCG AGTCGGAGAC ATCGGACTTA TCCTAAGCAT AGCATGATTC GCAACAAACC 12540

TTAACTCATG AGAGATTCAA CAAATATTCG CCTCCTCAAA AGAACTAGAC CTCACATTCC 12600

CCCTCCTTGG CCTCATTTTA GCCGCCACCG GTAAATCAGC ACAATTTGGA CTTCATCCGT 12660

GACTTCCTTC CGCGATAGAG GGCCCTACGC CGGTATCTGC CCTACTTCAC TCTAGCACCA 12720

TGGTCGTCGC GGGCATCTTC CTATTGATTC GACTCCACCC CCTTATAGAA AACAACCAAA 12780

CAGCCCTAAC CACCTGCCTA TGTTTAGGAG CCCTAACTAC GCTATTTACC GCCACCTGTG 12840

CCCTAACACA AAACGATATC AAAAAGATTG TCGCATTCTC TACATCAAGC CAACTAGGCC 12900

TGATAATAGT GACTATTGGA CTCAATCAAC CACAACTAGC CTTTCTCCAC ATCTGCACCC 12960

ACGCATTCTT CAAAGCCATA CTCTTCCTTT GCTCCGGCTC AATTATTCAT AGCTTAAATG 13020

ATGAACAGGA TATTCGAAAA ATGGGAGGAA TACACAATCT TACCCCCTTT ACCTCCTCCT 13080

GCCTCACAAT CGGAAGCCTA GCACTTACTG GCACTCCATT TTTAGCAGGA TTCTTTTCCA 13140

AAGATGCTAT TATTGAGGCC TTAAATACCT CTCACCTTAA CGCCTGAGCC CTCACACTTA 13200

CTCTCCTAGC TACCTCCTTC ACTGCCGTTT ACAGCCTCCG AGTTGTCTTT TTCGTCTCCA 13260

TGGGACACCC CCGCTTTACA GCCATTGCCC CCATTAACGA AAATAACCCC TCCGTTATTA 13320

ACCCAATCAA ACGATTGGCC TGAGGAAGCA TTATTGCAGG ACTTTTAATT ACCTCAAACT 13380

TTCTTCCCTC TAAAACCCCT GTAATAACCA TACCCCTTCC GTTGAAATTA GCCGCTCTCC 13440

TAGTTACTAT CTTAGGCCTC CTTATCGCAC TAGAACTTGC ATCACTAACC AACAAGCAAT 13500

TTAAAGCTGT ACCCAACCTC ATCCCCCACA ACTTCTCTAA CATACTAGGA TTCTTCCCTG 13560

CCGTTATCCA CCGACTAGCC CCCAAGCTAA ACTTAACTCT AGGACAAACC ATCGCCAGCC 13620

AGATAGTAGA TCAAACATGA TTTGAAAAGA TCGGCCCAAA AGGAATTATC TCCGCTCACC 13680

TGCCCATAGT TACAACAACA AGTAATATTC AACAAGGCAT AATTAAAACA TACCTCACTC 13740

TATTTTTCCT CTCAACAACC CTAGCCGTCC TACTTACACT AACCTAAACT GCTCGAAGAG 13800

CCCCCCGACT CAACCCCCGT GTTAATTCTA ACACTACAAA AAGTGTTAAT AAAAGCACCC 13860

ACGCACACGC AATTAGCATC CCACCTCCAC AGGAGTATAT TAAAGCTACC CCGCTCGTGT 13920

CACCTCGCAG TACAGAAAAC TCCTTAAATT CATCCACCGC TACCCATGAA GTTTCATACC 13980

ACCCACCCCA GAATCAACCT GCCACCAAAG CCACCCCCAC CGTATACACC ACCACATACC 14040

CCAAGACCGA ACGATCCCCC CAAGATTCTG GAAAGGGTTC AGCAGCCAAA GCTGCTGAAT 14100

AAGCAAATAC TACTAATATT CCCCCTAAAT AAATCAGAAA CAGTACCAAA GACAAAAAAG 14160

ACCCCCCATG GCCCACCAAA ACCCCACAAC CCACACCTGC TGCTACAACC AACCCCAAGG 14220

CAGCAAAATA AGGAGCAGGA TTAGATGCAA CAGCCACAAG CCCTAAAACC AACCCTAAAA 14280

GAAATAAAGA CACAAGATAA GTCATAATTC CTGCTCGGAC TTTAACCGAA ACTAATGACT 14340

TGAAAAACCA CCGTTGTTAT TCAACTACAA GAACCTAATG GCTAACCTCC GAAAAACCCA 14400

CCCCCTCCTA AAAATTGCTA ATGACGCACT AGTTGACCTT CCAGCACCCT CTAATATCTC 14460

AGTTTGATGA AATTTTGGGT CTCTCCTAGG CTTATGTCTA GCCACCCAAA TTCTCACCGG 14520

ACTTTTCCTA GCCATACATT ACACCTCTGA CATTTCAACA GCCTTTTCCT CCGTCTGCCA 14580

TATCTGCCGG GATGTTAGTT ACGGCTGACT AATTCGTAAT ATCCACGCTA ACGGAGCATC 14640

TTTCTTCTTT ATCTGTATTT ATATACATAT CGCCCGAGGA CTTTACTACG GGTCCTACTT 14700

ATATAAGGAG ACTTGAAATA TTGGAGTAGT ACTATTACTT CTCACCATGA TAACTGCCTT 14760

TGTAGGCTAT GTCCTTCCAT GAGGACAAAT ATCCTTCTGA GGAGCCACTG TAATCACCAA 14820

CCTCCTATCC GCTGTCCCCT ATGTTGGGGG CGCCCTAGTA CAGTGAATTT GAGGCGGATT 14880

CTCTGTAGAC AATGCTACTC TAACACGATT TTTCGCCTTC CACTTCCTAT TCCCGTTTGT 14940

TATCGCAGCT GCTACAGTCC TCCACCTTCT ATTTTTACAC GAAACCGGGT CAAACAATCC 15000

AGCAGGAATT AACTCCGACG CTGATAAAAT CTCATTTCAC CCCTACTTCT CATATAAAGA 15060

CCTGCTCGGG TTTGTGGCCA TACTATTAGG CCTAACATCT CTAGCTCTTT TTGCACCCAA 15120

TCTCCTTGGA GATCCAGACA ATTTTACACC CGCCAACCCG CTAGTTACCC CACCTCACAT 15180

TAAACCCGAG TGGTACTTCT TGTTTGCCTA TGCAATTCTA CGCTCTATCC CCAATAAACT 15240

GGGTGGAGTA CTCGCCCTCT TGTTCTCCAT CCTCGTCCTT ATAGTTGTCC CCATCCTCCA 15300

CACCTCTAAA CAACGTGGAC TAACCTTCCG ACCACTGACC CAATTCTTAT TCTGAACCCT 15360

AGTAGCAGAC ATACTGATCC TCACCTGGAT TGGAGGTATA CCTGTAGAAC ACCCATTTAT 15420

TATCATTGGC CAAGTCGCCT CCGTAATTTA CTTCGCCATC TTCCTAGTCC TCGCCCCCCT 15480

AGCCGGCTGG GCCGAGAATA AAGCCCTTGA ATGAGCCTGC CCTAGTAGCT CAGCGCCAGA 15540

GCGCCGGTCT TGTAATCCGG AGGCCGGAGG TTAAAACCCT CCCTAGTGCT CAGAGAAAGG 15600

AGATTTTAAC TCCTACCCTT AACTCCCAAA GCTAAGATTC TAAATTAAAC TACCCTCTGA 15660

CCGCCGATGT ACAATAATAA ATGTTATATC TTACAAGTCA GTACGATATA ACACTTATGT 15720

ATTATATTAC ACACTATGTA TTTACCCATG TACAATATTG CGCATGAGTA GTACATTATA 15780

TGTATTATCA ACATAAGTGG TTTTAACCCC TCATACATCA GCACAAATCC AAGGTTTACA 15840

TTAAGCAAAA CACGGATAAC CACCAACTAA GATGTTTTAA CCCGATTAAT TGCTACACCA 15900

CAAACCTTCA GCTAACACGA GCTCCGTCTT TACCCACCAA CTTTCAGCAT CAGTCCTGCT 15960

TCATGTAGTA AGAACCGACC AACGATTTAT CAGTAGGCAT ACTCTTATTG ATGGTCAGGG 16020

GCAGAAATCG TATTAGGTAG CATCTCGTGA ATTATTCCTG GCATTTGGTT CCTATATCAA 16080

GGGCTATCCT TAAGAAACCA GCCCCTGAAA GCCGAATGTA ATGCATCTGG TTAATGGTGT 16140

CAATCTTATT GCCCGTTACC CACCAAGCCG GGCGTTCTCT TATATGCATA GGGTTCTCTT 16200

TTTTTTTTTT TCCGGGGTTC CGAAACTAGA TCTTGAATTC CCGAGGACTA ATGTATCATT 16260

ATAGAATGAT ATTTTATAAA GAATCACATA CTTGGATATC AAGTGCATAA GGTCCAATTC 16320

CATCCTCACA GATATCTAAT AGATCCCCGG CTTCTGCGCG ACAAACCCCC CTACCCCCCT 16380

ACGCTGAACG ATCCTTGTGT TCCTGTCAAA CCCCTAAACC AGGAAGTCTC AACAGCGCTA 16440

ATTTTTGTTA AAGTATACAT TAATAAACTT TTTAACACAC TTTATGACAT TTGGCACCGA 16500

CAACACTGTC ATCGGACCCC CTTTCATAAT TAAAGTATAC ATTAATAAAC TTTTTAACAC 16560

ACTTTATGAC ATTTGGCACC GACAACACTG TCATCGGACC CCCTTTCATA ATTAAAGTAT 16621

ACATTAATAA ACTTTTTAAC ACACTTTATG ACATTTGGCA CCGACAACACT GTCATCGGA 16680

CCCCCTTTCA TAATTAAAGT ATACATTAAT AAACTTTTTA ACACACTTTA TGACATTTGG 16740

CACCGACAAC ACTGTCATCG GACCCCCTTT CGTAATTAAA TGTATTCAAG ACCCATT 16797

<210>2

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第1对的正向引物序列。

<400>2

AGAGCGCCGG TCTTGTAATC 20

<210>3

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第1对的反向引物序列。

<400>3

GCTAGCGGGA CTTTCTAGGG TC 22

<210>4

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第2对的正向引物序列。

<400>4

TGAATTCCAG AGAACCCATG T 21

<210>5

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第2对的反向引物序列。

<400>5

TAAAACAAGG GGTGGTGAGG 20

<210>6

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第3对的正向引物序列。

<400>6

CAAAGGCTTG GTCCTGACTT 20

<210>7

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第3对的反向引物序列。

<400>7

TAAAACAAGG GGTGGTGAGG 20

<210>8

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第4对的正向引物序列。

<400>8

TGATATCCGC CAGGGAACTA 20

<210>9

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第4对的反向引物序列。

<400>9

CCCTTGCGGT ACTTTTTCTG 20

<210>10

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第5对的正向引物序列。

<400>10

GGGTCACCCT GAGCTGACTA 20

<210>11

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第5对的反向引物序列。

<400>11

GTGCAGGTGG CTGCTCTTAG 20

<210>12

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第6对的正向引物序列。

<400>12

AAACCAGGAG AGTTAGTCAA AGGA 24

<210>13

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第6对的反向引物序列。

<400>13

CCCTCGTGAT GCCATTCAT 19

<210>14

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第7对的正向引物序列。

<400>14

AACACAAGCC TCGCCTGTT 19

<210>15

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第7对的反向引物序列。

<400>15

CGTTGAACAA ACGAACCCTT A 21

<210>16

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第8对的正向引物序列。

<400>16

CTCTCCCAGA GTCCCTATCG 20

<210>17

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第8对的反向引物序列。

<400>17

GCGAGAAATA GAAAGGGTGA A 21

<210>18

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第9对的正向引物序列。

<400>18

TGCTTTCCTC ACCCTACTTG A 21

<210>19

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第9对的反向引物序列。

<400>19

GTGGGATGCG CCTAAAAATA 20

<210>20

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第10对的正向引物序列。

<400>20

CCCTTTGACC TCACAGAAGG 20

<210>21

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第10对的反向引物序列。

<400>21

CTGGCAAAGG TGAGGACTGT 20

<210>22

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第11对的正向引物序列。

<400>22

TTGGTGCTTC CACTACACCA 20

<210>23

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第11对的反向引物序列。

<400>23

GTGTGAGAGA GGGTGCGAAT 20

<210>24

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第12对的正向引物序列。

<400>24

TTGGTGCTTC CACTACACCA 20

<210>25

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第12对的反向引物序列。

<400>25

TGTGGGATAA AGTCCTGCAA 20

<210>26

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第13对的正向引物序列。

<400>26

CACCAGCTGT GACTGCGATA 20

<210>27

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第13对的反向引物序列。

<400>27

TCAGGGGCTC CGATTATTAG 20

<210>28

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第14对的正向引物序列。

<400>28

CCCATGCCTT CGTTATGATT 20

<210>29

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第14对的反向引物序列。

<400>29

TGGGCTCAAA CGATAAATCC 20

<210>30

<211>20

<212>DNA    

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第15对的正向引物序列。

<400>30

TGGCAGCAGG CATTACTATG 20

<210>31

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第15对的反向引物序列。

<400>31

CCTGCGAGGC CTAGGAAAT  19

<210>32

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第16对的正向引物序列。

<400>32

TTACGTAGTT GCTCATTTCC ACT 23

<210>33

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第16对的反向引物序列。

<400>33

GGATAACTGC TGGGAGGACA 20

<210>34

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第17对的正向引物序列。

<400>34

AATGGCACAT CCCTCACAAC 20

<210>35

<211>23

<212>DNA    

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第17对的反向引物序列。

<400>35

CAGATCTCAG AACATTGTCC GTA 23

<210>36

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第18对的正向引物序列。

<400>36

GACGTCCTTC ACTCCTGAGC 20

<210>37

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第18对的反向引物序列。

<400>37

TGCTGGGTAA ATCGGTTGAT 20

<210>38

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第19对的正向引物序列。

<400>38

CCTCCCATGA ATTCTTTTCC 20

<210>39

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第19对的反向引物序列。

<400>39

CATTAAACGT TTTCTTGTAA ATAGAGG 27

<210>40

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第20对的正向引物序列。

<400>40

CCTCCCATGA ATTCTTTTCC 20

<210>41

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第20对的反向引物序列。

<400>41

GATTGTAAAT GGGGCTTCGT 20

<210>42

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第21对的正向引物序列。

<400>42

CCCTTTGAGG TACCCCTTCT 20

<210>43

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第21对的反向引物序列。

<400>43

TCTAAGCCTC CTTGGGTTCA 20

<210>44

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第22对的正向引物序列。

<400>44

GCCCTTCTCC TTACGCTTCT 20

<210>45

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第22对的反向引物序列。

<400>45

TGGAAAAAGC ATGAGTGTGG 20

<210>46

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第23对的正向引物序列。

<400>46

GCCCTTCTCC TTACGCTTCT 20

<210>47

<211>20

<212>DNA    

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第23对的反向引物序列。

<400>47

GAAGGTGTAG GGGTTGCGTA 20

<210>48

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第24对的正向引物序列。

<400>48

ACATCTCCCT CCTGGTCTCC 20

<210>49

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第24对的反向引物序列。

<400>49

TCCTATTAGG TTGGGGAGAG G 21

<210>50

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第25对的正向引物序列。

<400>50

GCAATTATTC TCATAATCGC ACA 23

<210>51

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第25对的反向引物序列。

<400>51

TCCTTTAGAA GCACGAGTGA A 21

<210>52

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第26对的正向引物序列。

<400>52

CTCTTATCCA CCGAGAGAAA TC 22

<210>53

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第26对的反向引物序列。

<400>53

CAGCCGATAA ATAGTTGGAA CA 22

<210>54

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第27对的正向引物序列。

<400>54

AACCTTAGCT TTAAATTTGA CCAC 24

<210>55

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第27对的反向引物序列。

<400>55

TGGATGTAGA GAATGCGACA A 21

<210>56

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第28对的正向引物序列。

<400>56

GCGATAGAGG GTCCTACGC  19

<210>57

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第28对的反向引物序列。

<400>57

AACCTCATGG GTAGCAGTGG 20

<210>58

<211>20

<212>DNA    

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第29对的正向引物序列。

<400>58

GCCATTTATA GCCTCCGAGT 20

<210>59

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第29对的反向引物序列。

<400>59

GATACAAGTG GGGTGGCATT 20

<210>60

<211>22

<212>DNA    

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第30对的正向引物序列。

<400>60

CCTCACCCTA TTTTTCCTTT CA 22

<210>61

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第30对的反向引物序列。

<400>61

GGTTGGCCAT TAGGTTCTTG 20

<210>62

<211>26

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第31对的正向引物序列。

<400>62

CACAAGATAA GTCATAATTC CTGCTC 26

<210>63

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第31对的反向引物序列。

<400>63

GGAGAAGCCC CCTCAAAT 18

<210>64

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第32对的正向引物序列。

<400>64

ATTCTGAGGG GCCACTGTAA 20

<210>65

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第32对的反向引物序列。

<400>65

CCGATTCAGG TGAGGATGAG 20

<210>66

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第33对的正向引物序列。

<400>66

CATGGTTGTC CCCATCCTAC 20

<210>67

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第33对的反向引物序列。

<400>67

AACCTTGGAT TTGTGCTGAT G 21

Claims (2)

1.哲罗鲑线粒体全基因组序列，其特征在于哲罗鲑线粒体全基因组序列如SEQ ID NO：1所示。

2.哲罗鲑线粒体全基因组序列的扩增引物，其特征在于哲罗鲑线粒体全基因组序列的扩增引物为33对；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第1对的正向引物为5’-AGAGCGCCGGTCTTGTAATC-3’，反向引物为5’-GCTAGCGGGACTTTCTAGGGTC-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第2对的正向引物为5’-TGAATTCCAGAGAACCCATGT-3’，反向引物为5’-TAAAACAAGGGGTGGTGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第3对的正向引物为5’-CAAAGGCTTGGTCCTGACTT-3’，反向引物为5’-TAAAACAAGGGGTGGTGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第4对的正向引物为5’-TGATATCCGCCAGGGAACTA-3’，反向引物为5’-CCCTTGCGGTACTTTTTCTG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第5对的正向引物为5’-GGGTCACCCTGAGCTGACTA-3’，反向引物为5’-GTGCAGGTGGCTGCTCTTAG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第6对的正向引物为5’-AAACCAGGAGAGTTAGTCAAAGGA-3’，反向引物为5’-CCCTCGTGATGCCATTCAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第7对的正向引物为5’-AACACAAGCCTCGCCTGTT-3’，反向引物为5’-CGTTGAACAAACGAACCCTTA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第8对的正向引物为5’-CTCTCCCAGAGTCCCTATCG-3’，反向引物为5’-GCGAGAAATAGAAAGGGTGAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第9对的正向引物为5’-TGCTTTCCTCACCCTACTTGA-3’，反向引物为5’-GTGGGATGCGCCTAAAAATA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第10对的正向引物为5’-CCCTTTGACCTCACAGAAGG-3’，反向引物为5’-CTGGCAAAGGTGAGGACTGT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第11对的正向引物为5’-TTGGTGCTTCCACTACACCA-3’，反向引物为5’-GTGTGAGAGAGGGTGCGAAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第12对的正向引物为5’-TTGGTGCTTCCACTACACCA-3’，反向引物为5’-TGTGGGATAAAGTCCTGCAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第13对的正向引物为5’-CACCAGCTGTGACTGCGATA-3’，反向引物为5’-TCAGGGGCTCCGATTATTAG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第14对的正向引物为5’-CCCATGCCTTCGTTATGATT-3’，反向引物为5’-TGGGCTCAAACGATAAATCC-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第15对的正向引物为5’-TGGCAGCAGGCATTACTATG-3’，反向引物为5’-CCTGCGAGGCCTAGGAAAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第16对的正向引物为5’-TTACGTAGTTGCTCATTTCCACT-3’，反向引物为5’-GGATAACTGCTGGGAGGACA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第17对的正向引物为5’-AATGGCACATCCCTCACAAC-3’，反向引物为5’-CAGATCTCAGAACATTGTCCGTA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第18对的正向引物为5’-GACGTCCTTCACTCCTGAGC-3’，反向引物为5’-TGCIGGGTAAATCGGTTGAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第19对的正向引物为5’-CCTCCCATGAATTCTTTTCC-3’，反向引物为5’-CATTAAACGTTTTCTTGTAAATAGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第20对的正向引物为5’-CCTCCCATGAATTCTTTTCC-3’，反向引物为5’-GATTGTAAATGGGGCTTCGT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第21对的正向引物为5’-CCCTTTGAGGTACCCCTTCT-3’，反向引物为5’-TCTAAGCCTCCTTGGGTTCA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第22对的正向引物为5’-GCCCTTCTCCTTACGCTTCT-3’，反向引物为5’-TGGAAAAAGCATGAGTGTGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第23对的正向引物为5’-GCCCTTCTCCTTACGCTTCT-3’，反向引物为5’-GAAGGTGTAGGGGTTGCGTA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第24对的正向引物为5’-ACATCTCCCTCCTGGTCTCC-3’，反向引物为5’-TCCTATTAGGTTGGGGAGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第25对的正向引物为5’-GCAATTATTCTCATAATCGCACA-3’，反向引物为5’-TCCTTTAGAAGCACGAGTGAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第26对的正向引物为5’-CTCTTATCCACCGAGAGAAATC-3’，反向引物为5’-CAGCCGATAAATAGTTGGAACA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第27对的正向引物为5’-AACCTTAGCTTTAAATTTGACCAC-3’，反向引物为5’-TGGATGTAGAGAATGCGACAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第28对的正向引物为5’-GCGATAGAGGGTCCTACGC-3’，反向引物为5’-AACCTCATGGGTAGCAGTGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第29对的正向引物为5’-GCCATTTATAGCCTCCGAGT-3’，反向引物为5’-GATACAAGTGGGGTGGCATT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第30对的正向引物为5’-CCTCACCCTATTTTTCCTTTCA-3’，反向引物为5’-GGTTGGCCATTAGGTTCTTG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第31对的正向引物为5’-CACAAGATAAGTCATAATTCCTGCTC-3’，反向引物为5’-GGAGAAGCCCCCTCAAAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第32对的正向引物为5’-ATTCTGAGGGGCCACTGTAA-3’，反向引物为5’-CCGATTCAGGTGAGGATGAG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第33对的正向引物为5’-CATGGTTGTCCCCATCCTAC-3’，反向引物为5’-AACCTTGGATTTGTGCTGATG-3’。