CN101509044A - 日本沼虾呼肠孤病毒基因诊断试剂盒 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种日本沼虾呼肠孤病毒基因诊断试剂盒,涉及一种病毒基因诊断试剂盒。本试剂盒由以下试剂组成:试剂A是组织匀浆缓冲液,为Tris-NaCl-EDTA缓冲液;试剂B是RNA提取液,为Trizol液;试剂C是日本沼虾呼肠孤病毒RNA反转录反应液,其中含有特定引物MnRV-325R;试剂D是PCR反应液,其中含有特定引物MnRV 325R及MnRV 325F;试剂E液是阳性对照,为MnRV阳性DNA模板。本发明能快速、灵敏、准确地检测出日本沼虾苗种、虾、成虾及亲虾是否携带日本沼虾呼肠孤病毒。
Description
技术领域
本发明涉及一种病毒基因诊断试剂盒,尤其涉及一种日本沼虾呼肠孤病毒基因诊断试剂盒。
背景技术
河虾(Macrobrachium nipponensede Haan),又名青虾,学名为日本沼虾,为日本和我国所特有淡水虾类。它营养丰富,肉嫩味美,是一种深受人们喜爱的名贵水产品。在研究河虾病害的过程中,从湖北省某养殖场分离到一株呼肠孤病毒(命名为MnRV,Macrobrachium nipponensede Reovirus)。目前对病毒病尚无治疗办法。因此,建立灵敏准确的早期检测技术对于预防疾病,减少经济损失具有重要意义。目前没有关于此种病毒检测技术的专利和报道。
发明内容
本发明的目的是填补现有技术的空白,提供一种日本沼虾呼肠孤病毒基因诊断试剂盒。
本发明的目的是这样实现的:
根据日本沼虾呼肠孤病毒的基因组序列设计一对特异性引物,采用RT-PCR的方法,可以对日本沼虾是否感染呼肠孤病毒进行检测。
1、一种日本沼虾呼肠孤病毒基因诊断试剂盒(简称本试剂盒)
试剂A:组织匀浆缓冲液,为Tris-NaCl-EDTA缓冲液;
试剂B:RNA提取液,为Trizol液;
试剂C:日本沼虾呼肠孤病毒RNA反转录反应液,其中含有特定引物MnRV-325R,其序列为:5′-TCGTAAGGTGTAGGTTGTGAT-3′;
试剂D:PCR反应液,其中含有特定引物MnRV 325R及MnRV 325F,其序列为:
MnRV-325R 5′-TCGTAAGGTGTAGGTTGTGAT-3′;
MnRV-325F 5′-CAAACGAATTAAATGATGATG-3′;
试剂E液:阳性对照,为MnRV阳性DNA模板。
2、本试剂盒的获得方法
本试剂盒的所有试剂均购自商业化公司。
3、本试剂盒的用途
本试剂盒的用途就在于能检测出日本沼虾苗种、虾、成虾及亲虾是否携带日本沼虾呼肠孤病毒。
本发明具有下列优点和积极效果:
1、本发明能快速、灵敏、准确地检测出日本沼虾苗种、虾、成虾及亲虾是否携带日本沼虾呼肠孤病毒;
2、本发明适用于检测日本沼虾呼肠孤病毒。
附图说明
图1是PGR产物电泳结果图。
具体实施方式
一、本试剂盒的几种试剂的组成
1、试剂A液、试剂B液为常用试剂。
2、试剂C液
试剂C液是含有日本沼虾呼肠孤病毒RNA反转录反应液,每管组成为:
4μl 5×RNA反转录缓冲液,
2μl 10mM MgCl2,
8μl RNase Free H2O,
1μl 10mM dNTP Mixture,
1μl 1u RNsin,
1μl 1u M-MLV ReverseTranscriptase,
1μl 10pM MnRV-325R。
3、试剂D液
试剂D液是PCR反应液,每管组成为:
2mM MgCl2,
5μl 10×PCR缓冲液,
41μl ddH2O,
2U Taq酶,
10pM MnRV-325R及MnRV-325F。
二、本试剂盒的使用方法如下:
①日本沼虾组织的匀浆
待检日本沼虾组织100-200mg加入100μl试剂A在冰上混匀,捣碎匀浆;冰上静置15分钟。
②日本沼虾呼肠孤病毒RNA的提取
在4℃以12000g离心5分钟;将水相(上层)转至一个新的1.5ml离心管中;加入1ml试剂B,混匀,冰上静置15分钟;加入200μl氯仿,振摇15秒,静置10分钟;在4℃以12000g离心15分钟;将水相(上层)转至一个新的1.5ml离心管中。
加入500μl异丙醇后-20℃沉淀30分钟。12000g离心10分钟;用75%乙醇淋洗RNA沉淀然后离心5分钟,晾干;用10μl无RNA酶的水溶解,得到日本沼虾呼肠孤病毒RNA溶液。
③日本沼虾呼肠孤病毒RNA反转录
取2μl病毒RNA溶液95℃变性3分钟;加入含试剂C的反应管,在PCR仪或者恒温水浴锅中进行以下反应:
42℃ 60分钟;
80℃ 5分钟;
0℃ 5分钟。
④PCR反应
在以上反应管中取4μl加入试剂D,混匀后在PCR仪中进行以下反应:
94℃ 4分钟
55℃ 45秒;循环30次
72℃ 2分钟;
72℃ 7分钟;
15℃ 停止。
反应结束后取10μl加2μl 6×DNA加样缓冲液(含溴酚蓝)混匀后在1%琼脂糖凝胶进行电泳,确定扩增产物。如出现约325bp的反应产物,说明待检样品携带日本沼虾呼肠孤病毒。
三、试验结果
已经用本发明对日本沼虾是否被病毒感染进行检测,得出有效、可靠的检测结果。
如图1,PCR产物电泳结果是:
右200bp ladder DNA分子量Marker;
中阴性对照;
左PCR产物。
序列表
<110>中国科学院武汉病毒研究所
<120>日本沼虾呼肠孤病毒基因诊断试剂盒
<140>
<141>
<160>1
<210>1
<211>111
<212>DNA
<213>日本沼虾呼肠孤病毒(MnRV,Macrobrachiumni pponensede Reovirus)
<400>
Claims (3)
1、一种日本沼虾呼肠孤病毒基因诊断试剂盒,其特征在于由以下试剂组成:
试剂A:组织匀浆缓冲液,为Tris-NaCl-EDTA缓冲液;
试剂B:RNA提取液,为Trizol液;
试剂C:日本沼虾呼肠孤病毒RNA反转录反应液,其中含有特定引物MnRV-325R,其序列为:5′-TCGTAAGGTGTAGGTTGTGAT-3′;
试剂D:PCR反应液,其中含有特定引物MnRV 325R及MnRV 325F,其序列为:
MnRV-325R 5′-TCGTAAGGTGTAGGTTGTGAT-3′;
MnRV-325F 5′-CAAACGAATTAAATGATGATG-3′;
试剂E液:阳性对照,为MnRV阳性DNA模板。
2、根据权利要求1所述的一种日本沼虾呼肠孤病毒基因诊断试剂盒,其特征在于所述的试剂C:其中含有日本沼虾呼肠孤病毒RNA反转录反应液,每管组成为:
4μl 5×RNA反转录缓冲液,
2μl 10mM MgCl2,
8μl RNase Free H2O,
1μl 10mM dNTP Mixture,
1μl 1u RNsin,
1μl 1u M-MLV ReverseTranscriptase,
1μl 10pM MnRV-325R。
3、根据权利要求1所述的一种日本沼虾呼肠孤病毒基因诊断试剂盒,其特征在于所述的试剂D:PCR反应液,每管组成为:
2mM MgCl2,
5μl 10×PCR缓冲液,
41μl ddH20,
2U Taq酶,
10pM MnRV-325R及MnRV-325F。
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