CN101472470B - miR155转基因小鼠中前B细胞增殖和淋巴母细胞性白血病/高度淋巴瘤 - Google Patents

miR155转基因小鼠中前B细胞增殖和淋巴母细胞性白血病/高度淋巴瘤 Download PDF

Info

Publication number
CN101472470B
CN101472470B CN2007800230938A CN200780023093A CN101472470B CN 101472470 B CN101472470 B CN 101472470B CN 2007800230938 A CN2007800230938 A CN 2007800230938A CN 200780023093 A CN200780023093 A CN 200780023093A CN 101472470 B CN101472470 B CN 101472470B
Authority
CN
China
Prior art keywords
gene
animal
cell
mir155
transgenic
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
CN2007800230938A
Other languages
English (en)
Other versions
CN101472470A (zh
Inventor
C·M·克劳斯
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Ohio State University Research Foundation
Original Assignee
Ohio State University Research Foundation
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ohio State University Research Foundation filed Critical Ohio State University Research Foundation
Publication of CN101472470A publication Critical patent/CN101472470A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN101472470B publication Critical patent/CN101472470B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K49/00Preparations for testing in vivo
    • A61K49/0004Screening or testing of compounds for diagnosis of disorders, assessment of conditions, e.g. renal clearance, gastric emptying, testing for diabetes, allergy, rheuma, pancreas functions
    • A61K49/0008Screening agents using (non-human) animal models or transgenic animal models or chimeric hosts, e.g. Alzheimer disease animal model, transgenic model for heart failure
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; CARE OF BIRDS, FISHES, INSECTS; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K67/00Rearing or breeding animals, not otherwise provided for; New breeds of animals
    • A01K67/027New breeds of vertebrates
    • A01K67/0275Genetically modified vertebrates, e.g. transgenic
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/8509Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells for producing genetically modified animals, e.g. transgenic
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; CARE OF BIRDS, FISHES, INSECTS; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2207/00Modified animals
    • A01K2207/05Animals modified by non-integrating nucleic acids, e.g. antisense, RNAi, morpholino, episomal vector, for non-therapeutic purpose
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; CARE OF BIRDS, FISHES, INSECTS; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2217/00Genetically modified animals
    • A01K2217/05Animals comprising random inserted nucleic acids (transgenic)
    • A01K2217/054Animals comprising random inserted nucleic acids (transgenic) inducing loss of function
    • A01K2217/058Animals comprising random inserted nucleic acids (transgenic) inducing loss of function due to expression of inhibitory nucleic acid, e.g. siRNA, antisense
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; CARE OF BIRDS, FISHES, INSECTS; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2227/00Animals characterised by species
    • A01K2227/10Mammal
    • A01K2227/105Murine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; CARE OF BIRDS, FISHES, INSECTS; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00Animals characterised by purpose
    • A01K2267/03Animal model, e.g. for test or diseases
    • A01K2267/0331Animal model for proliferative diseases

Abstract

一种转基因非人动物,如小鼠,具有包括一个核酸构建体的基因组,该核酸构建体具有能指导在动物的B细胞中表达的至少一个转录调节序列,其中该转录调节序列与编码miR155基因产物的核酸可操作连接。一种测试试剂在治疗或预防淋巴组织增生疾病中的治疗功效的方法包括评估该试剂对转基因非人动物的影响。

Description

miR155转基因小鼠中前B细胞增殖和淋巴母细胞性白血病/高度淋巴瘤
政府支持
本发明完全或者部分得到美国政府财政补贴的支持。政府享有本发明的某些权利。
发明背景
急性白血病是一种骨髓和血液的快速进行性恶性疾病,其导致未成熟的,无功能的细胞,所谓的胚细胞,在髓和血液中的累积。胚细胞在髓中的累积可阻断正常血细胞的发育。结果,没有产生足够数量的红细胞,白细胞和血小板。当疾病是由于髓淋巴细胞祖细胞而引起的时,它导致急性淋巴母细胞性白血病(ALL),而当疾病是由于髓细胞样祖细胞引起的时,它导致急性髓性白血病(AML)。
ALL是一种快速进行性癌症,其开始于髓淋巴细胞的恶变。ALL是最常见的儿童期白血病类型,而且在所有的年龄组中每年有3,000例新病例。转化的,目前恶性的,细胞增殖并在髓中累积为白血病淋巴母细胞。淋巴母细胞阻断髓中正常血细胞的形成,其导致不足的红细胞,白细胞和血小板产生。
高度淋巴瘤,也称为侵袭性淋巴瘤,包括淋巴瘤的几个亚型,其如果不治疗就会相对快速地进展。这些亚型包括,例如,AIDS相关的淋巴瘤,退行性变化的大细胞淋巴瘤,伯基特氏淋巴瘤,弥散性大细胞淋巴瘤,免疫母细胞淋巴瘤,淋巴母细胞性淋巴瘤和小的未裂解细胞淋巴瘤。相较于弥散性大B细胞淋巴瘤,高度淋巴瘤表现更具侵袭性,需要更强烈的化疗,而且更常发生于儿童中。因为快速分裂的细胞对抗癌剂更敏感,而且由于年轻患者通常没有其他的健康问题,所以这些淋巴瘤中的一些显示对治疗的显著应答。急性淋巴母细胞性白血病和高度淋巴瘤是儿童中最常见的白血病和淋巴瘤。这些疾病,绝大部分,是多克隆的,这表明仅仅少数遗传变化就足以诱导恶性肿瘤。
微小RNA(miRNA)表示一类新的丰富的小RNA,其按照与靶的互补程度,通过结合靶向的mRNA,和阻断它们的翻译或者启动它们的降解,在转录后水平上发挥重要的调节作用。自从它们1993年在Caenorhabditis elegans中的发现(Lee,R.等,Cell 75:843-854(1993)),许多报道表明,在大的蛋白阵列的转录后调节中这些微小的分子具有非常不同的作用,从细胞增殖和分化到脂类代谢(Nairz,K.,等,Dev.Biol.291:314-324(2006);Chen,J.F.,等,Nat.Genet.38:228-233(2006);Naguibneva,I.,等,Nat.Cell Biol.8:278-284(2006);Esau,C.,等,Cell Metab.3:87-98(2006);和Gauthier,B.R.,等,Nat.Med.12:36-18(2006))。
人和小鼠中造血系的miRNA分布图显示miRNA在造血发育过程中差异表达,这表明在造血分化中可能的作用(Chen,C.Z.,等,Science 303:83-86(2004);Chen,C.Z.,等,Semin.Immunol.77:155-165(2005);和Ramkissoon,S.H.,等,Leuk.Res.30:643-647(2006))。我们已经证实了miR-15a和miR-16-1在68%的慢性淋巴细胞性白血病(CLL)病例中缺失或下调(Calin,G.A.,等,Proc.Natl Acad Sci.USA 99:15524-15529(2002);和Calin,G.A.,等,Proc.Natl Acad.Sci.USA 101:1155-11760(2004)),而且miRNA基因经常位于与癌症相关的脆性位点和基因组区域(Calin,G.A.,等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:2999-3004(2004))。miR155和BIC(它的宿主基因)转录物已经显示在人B细胞淋巴瘤,特别是弥散性大B细胞淋巴瘤(Eis,P.S.,等,Proc.Natl Acad.Sci.USA102:3627-3632(2005)),霍奇金淋巴瘤(Kluvier,J.,等,J.Pathol 207:243-249(2006)),和某些类型的伯基特淋巴瘤(潜伏类型III埃-巴二氏病毒阳性伯基特淋巴瘤)(Kluvier,J.,等,Genes Chromosomes Cancer 45:147-153(2006))中累积。
目前,急需产生动物模型,其可用于筛选和鉴定候选试剂,该候选试剂具有治疗淋巴组织增生疾病,如B细胞恶性肿瘤(例如,B细胞白血病,B细胞淋巴瘤)的治疗潜能。
发明概述
本发明是基于携带miR155转基因的转基因小鼠,其表达靶向B细胞(例如,使用Ig重链-Eμ增强子),最初显示白血病前期前B细胞增殖,在脾和骨髓中显著,而且以后逐渐形成B细胞恶性肿瘤的发现。过表达miR155的转基因小鼠逐渐形成与人淋巴组织增生疾病类似的淋巴组织增生疾病,从而这强烈暗示miR155涉及这些疾病的起始和/或进展。Eμ-mmu-miR155转基因小鼠可用于设计新的治疗方法来治疗人中的不同形式的淋巴组织增生疾病,如B细胞恶性肿瘤(例如,急性淋巴母细胞性白血病,高度淋巴瘤)。
因此,在一个方面,这里提供了用于淋巴组织增生疾病的新的动物模型。具体地,根据一个方面,提供了用于B细胞恶性肿瘤(例如,白血病(如,急性淋巴母细胞性白血病),淋巴瘤(例如,高度淋巴瘤),和赘生物的动物模型。
在一个实施方案中,这里提供了一种转基因的非人动物(例如,小鼠),其基因组包括含有至少一个转录调节序列的核酸构建体,该转录调节序列能指导在动物的B细胞中的表达,并与编码miR155基因产物的核酸可操作连接。在一个特定的实施方案中,miR155基因产物包括与SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2具有至少90%序列同一性的核苷酸序列。在另一个实施方案中,miR155基因产物包括SEQ ID NO:1的核苷酸序列。仍然在另一个实施方案中,miR155基因产物包括SEQ IDNO:2的核苷酸序列。
根据一个实施方案,所述的至少一个转录调节序列可以是能指导在动物的B细胞中表达的任何序列。在一个实施方案中,该转录调节序列包括VH启动子(例如,来源于小鼠的VH启动子)。在另一个实施方案中,该转录调节序列包括Ig重链-Eμ增强子(例如,来源于小鼠的Ig重链-Eμ增强子)。在一个相关的实施方案中,该核酸构建体包括β-球蛋白基因(例如,来源于人或其他哺乳动物物种的β-球蛋白基因)的3’UTR和聚腺苷酸序列。
这里还提供了转基因的非人动物,其基因组包括含有VH启动子和Ig重链-Eμ增强子的核酸构建体,该VH启动子和Ig重链-Eμ增强子与编码含有SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2的miR155基因产物的核酸可操作连接。在一个特定的实施方案中,转基因非人动物的基因组包括含有VH启动子和Ig重链-Eμ增强子的核酸构建体,该VH启动子和Ig重链-Eμ增强子与编码含有与SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2具有至少90%序列同一性的核苷酸序列的miR155基因产物的核酸可操作连接。
在一个特定的实施方案中,相对于合适对照动物中的该群体,转基因非人动物在脾,骨髓或脾和骨髓二者中具有扩大的B2201ow/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43--淋巴样细胞群体。在一个相关的实施方案中,转基因非人动物显示淋巴组织增生疾病。在某个实施方案中,淋巴组织增生疾病是B细胞恶性肿瘤(例如,B细胞白血病,比如,急性淋巴母细胞性白血病;B细胞淋巴瘤,B细胞赘生物)。在一个另外的实施方案中,B细胞恶性肿瘤显示人急性淋巴母细胞性白血病,人淋巴母细胞性淋巴瘤或其组合的特征。在又一个实施方案中,淋巴组织增生疾病是白血病前期状况(例如,前B细胞增殖)。在另外的实施方案中,转基因非人动物显示增大的腹部,脾肿大,骨髓取代,淋巴细胞减少,或其组合。
这里还提供了测试试剂在治疗或预防受试者中的淋巴组织增生疾病的治疗功效的方法。根据一个实施方案,该方法包括施用试剂给转基因的非人动物(例如,小鼠),其基因组包括含有至少一个转录调节序列(例如,VH启动子,Ig重链-Eμ增强子,其组合)的核酸构建体,该转录调节序列能指导在动物的B细胞中的表达,其中该转录调节序列与编码含有与SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2具有至少90%序列同一性的核苷酸序列的miR155基因产物的核酸可操作连接。在一个特定的实施方案中,miR155基因产物包括SEQ ID NO:1的核苷酸序列。在另一个实施方案中,miR155基因产物包括SEQ ID NO:2的核苷酸序列。
试剂已经施用给转基因动物以后,将转基因动物中淋巴组织增生疾病的一种或多种症状和/或征象与没有施用该试剂的相同基因型的对照动物进行比较。如果相对于对照动物,该试剂抑制,阻止和/或减轻已经施用该试剂的转基因动物中淋巴组织增生疾病的一种或多种症状和/或征象,那么认为该试剂在治疗或预防淋巴组织增生疾病中具有治疗功效。在某个实施方案中,所述的淋巴组织增生疾病的一种或多种症状和/或征象选自:扩大的B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-淋巴样细胞群体,增大的腹部,脾肿大,骨髓取代,淋巴细胞减少和其组合。
在另一个实施方案中,这里提供了一种确定试剂是否影响受试者中的淋巴组织增生疾病的方法(例如,影响一种或多种症状和/或征象的可检测性和/或出现率的差异)。该方法包括施用试剂给这里描述的转基因非人动物,并将转基因动物中淋巴组织增生疾病的一种或多种症状和/或征象与相同基因型的对照动物的进行比较,其中对照动物没有施用该试剂。相对于对照动物,检测转基因动物中淋巴组织增生疾病的一种或多种症状和/或征象的可检测性和/或出现率的差异是该试剂影响淋巴组织增生疾病的指示。
在一个实施方案中,淋巴组织增生疾病是B细胞恶性肿瘤。在一个特定的实施方案中,B细胞恶性肿瘤选自急性淋巴母细胞性白血病,B细胞淋巴瘤(例如,高度淋巴瘤),B细胞赘生物和其组合。B细胞恶性肿瘤可显示人急性淋巴母细胞性白血病,人淋巴母细胞性淋巴瘤或两者的特性。在另一个实施方案中,淋巴组织增生疾病是白血病前期状况,如特征为前B细胞增殖的状况。
本发明的这些以及其他的重要方面从下列详细说明中将变得更显而易见。
附图简述
本专利或申请文件包含至少一幅以颜色制作的附图。带有颜色附图的本专利或专利申请出版物的拷贝经请求并支付必要的费用由专利局提供。
图1的示意图描述了注射到怀孕的C57/B6和FVB/N雌性小鼠的卵细胞的雄原核中的miR155转基因构建体。通过将mmu-miR155基因插入到VH启动子Eμ增强子下游的EcoRV与SalI位点之间,来制备miR155转基因构建体。
图2A的Southern印迹描述了具有C57BL/6背景的7个miR155转基因(1,3,5,6,7,10与14道)和8个野生型(2,4,8,9,11,12,13与15道)小鼠的基因型。
图2B的Southern印迹描述了具有FVB/N背景的8个miR155转基因(1,3,5,7,9,11,13与15道)和7个野生型(2,4,6,8,10,12与14道)小鼠的基因型。
图3的对总RNA的Northern印迹描述了使用mmu-miR155成熟序列作为探针,胸腺依赖性细胞中成熟miR155的表达,该胸腺依赖性细胞分离自15个转基因系中的6个系的3周龄小鼠的脾。脾细胞中成熟miR155最高表达水平的5个转基因系(1,2,5,8和9),选作进一步培养和分析。一个转基因系不表达转基因(3道)。野生型对照缺乏转基因表达(4,6与7道)。
图4A的图片显示了相对于野生型小鼠,在6月龄时,由于临床上明显的脾肿大,而具有显著增大的腹部的转基因小鼠(左边)。
图4B的图片描述了图4A中所示的小鼠的脾。转基因小鼠的脾(左边),由于白血病/淋巴瘤细胞的膨胀而增大。
图5A的显微照片描述了以200X放大倍数,3周龄转基因小鼠脾的苏木精/曙红(H & E)染色切片(小鼠50;建立者10)。切片显示非典型的淋巴增殖压缩了白髓。
图5B的显微照片描述了以100X放大倍数,来自6月龄的转基因小鼠的脾的H & E-染色切片。脾的总体结构正在被非典型的淋巴样增殖取代。只有少数胚的淋巴滤泡保留,其由于增殖而大小极大地缩小和压缩。
图5C的显微照片描述了以200X放大倍数,来自6月龄的转基因小鼠的脾的H & E-染色切片。由于成淋巴细胞的增殖,脾结构已经几乎被完全磨灭。2个小的压缩淋巴滤泡的残余物是可见的。
图5D的显微照片描述了以400X放大倍数,来自6月龄转基因小鼠(建立者8)的骨髓的H & E-染色切片,其显示了骨髓中成淋巴细胞的增殖,其导致造血中心的取代。
图5E的显微照片描述了以200X放大倍数,正常脾的H & E-染色切片。
图5F的显微照片描述了以200X放大倍数,来自3周龄转基因小鼠(72号小鼠)的脾的切片。切片已经用Ki67染色,并显示脾中增加的淋巴样增殖。
图6的显微照片以400X放大倍数,描述了3周龄转基因小鼠(50号小鼠)的脾切片中非典型的淋巴样增殖,其已经用IgM进行免疫组织化学染色。IgM存在于增殖的胸腺依赖性细胞的细胞质(cIgM)中,作为转基因小鼠中的褐色核周晕,而野生型胸腺依赖性细胞是强褐色,但是由于sIgM与cIgM的存在,没有明显的细胞核。
图7A的流式细胞术分析分布图描述了来自两个不同的建立者系(建立者8与10)的转基因小鼠的脾中,胸腺依赖性细胞的B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-群体的膨胀。显示了3周龄(74号转基因小鼠,建立者8(74TG;左上方)和68号野生型小鼠(68WT;右上方))和7周龄(156号转基因小鼠,建立者10(156TG;左下方)和157号野生型小鼠(157WT;右下方))的两个转基因小鼠与两个野生型小鼠的门控脾细胞。比较左上四分之一的图片,选通B220+IgM群体,显示了相对于野生型,转基因脾中前体B细胞数目的增加。
图7B的流式细胞术分析分布图描述了来自建立者8的转基因小鼠的骨髓中,胸腺依赖性细胞的B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-群体的膨胀。显示了6月龄的一个转基因和一个野生型小鼠(8号转基因小鼠,(8TG;左边)和24号野生型小鼠(24WT;右边)的门控骨髓白细胞。比较两个图的右上四分之一,表明相对于野生型小鼠,转基因小鼠骨髓的B200+IgM+门控成熟B细胞群体的减少。
图8A的图描述了B220-PE表达,如通过流式细胞术分析,对7周龄野生型小鼠no.223(223WT)的B220+-门控脾细胞所评估的。
图8B的图描述了CD10-FITC表达,如通过流式细胞术分析,对7周龄野生型小鼠no.223(223WT)的B220+-门控脾细胞所评估的。
图8C的图描述了B220-PE表达,如通过流式细胞术分析,对7周龄转基因小鼠no.222(222TG)的B220+-门控脾细胞所评估的,其表明相对于野生型小鼠,转基因小鼠中B220low群体的显著增加(介于B220-与B220+的两个峰值之间)。
图8D的图描述了CD10-FITC表达,如通过流式细胞术分析,对7周龄转基因小鼠no.222(222TG)的B220+-门控脾细胞所评估的,表明相对于野生型小鼠,仅仅在转基因小鼠中的B220+-门控群体中CD10+群体的百分比增加,这证明B220low增生,至少部分地,是由于CD10+群体的增加。
图8E的图描述了B220-PE表达,如通过流式细胞术分析,对7周龄转基因小鼠no.221(221TG)的B220+-门控脾细胞所评估的,其表明相对于野生型小鼠,转基因小鼠中B220low群体的显著增加(介于B220-与B220+的两个峰值之间)。
图8F的图描述了CD10-FITC表达,如通过流式细胞术分析,对7周龄转基因小鼠no.221(221TG)的B220+-门控脾细胞所评估的,表明相对于野生型小鼠,仅仅在转基因小鼠中的B220+-门控群体中CD10+群体的百分比增加,这证明B220low增生,至少部分地,是由于CD10+群体的增加。
图9是分离自转基因脾的淋巴样细胞的染色体组型,分析其染色体的缺失,易位和倒位,以及中期的数目。箭头表示9号染色体中的异常,其通过粗的额外条带的存在而鉴定。
图10是对从3到6周龄之间的5只转基因(TG)与4只野生型(WT)小鼠的脾细胞提取的DNA进行的Southern印迹。使用JH4探针和不同的消化酶进行了Southern印迹杂交,如在道顶部所标明的(StuI,BglII,BamHI,与HindIII)。高分子量的粗条带对应于种系。相对于野生型,转基因动物中没有重排的条带。
发明详述
下面是本发明的特定实施方案的描述。
如这里例示和描述的,过表达微小RNA,即miR155的转基因小鼠,逐渐形成淋巴组织增生疾病,其类似于人类中急性淋巴母细胞性白血病和高度淋巴瘤。这里提供的结果强烈地表明miR155和/或其他基因(例如,在癌症中激活的基因(例如,信号转导基因))的致癌表达涉及B细胞恶性肿瘤的起始和/或进展。因此,这里提供了一种动物模型,其可用于研究B细胞恶性肿瘤和其他淋巴组织增生疾病的起始和进展的机制。这种动物模型也可用于鉴定,开发和测试可用于治疗或预防淋巴组织增生疾病的新的治疗剂。
在一个实施方案中,这里提供了一种转基因动物,其基因组包括含有至少一个转录调节序列的核酸构建体或转基因,该转录调节序列能指导在B细胞中的表达,其中该转录调节序列与编码miR155基因产物的核酸序列可操作连接。术语“转基因”指通过人为干预,如通过这里描述的方法,引入到非人动物的一个或多个细胞中的核酸序列。引入的遗传信息可以是受体所属的动物物种外源的,仅仅是特定的单独受体外源的,或者是受体已经具有的遗传信息。在后面的情况中,相较于天然的内源基因,引入的遗传信息可以差异表达。
转基因非人动物具有包括核酸构建体/转基因的基因组,其能表达miR155基因产物。因为miR基因产物,(这里也称为微小RNA,miR和miRNA)没有翻译成蛋白,所以术语“miR基因产物”不包括蛋白。未处理的miR基因转录物也称为“miR前体”,而且一般包括长度大约为70-100个核苷酸的RNA转录物。可通过天然的处理途径(例如,使用完整细胞或细胞裂解物),或通过合成处理途径(例如,使用分离的处理酶,如分离的切酶,Argonaut或RNA酶III(如大肠杆菌RNA酶III)),将miR前体加工成活性的19-25个核苷酸的RNA分子。这种活性的19-25个核苷酸的RNA分子也称为“加工的”miR基因转录物或“成熟”miRNA。当这里通过名称提及微小RNA时,该名称相应于前体和成熟形式,除非另有说明。
如这里使用的,“miR155基因产物”指来自miR155基因的未加工的(例如,前体)或加工的(例如,成熟)RNA转录物,如,但是不局限于,来自小鼠(小家鼠)的miR155基因。来自小鼠的前体miR155基因产物通过下面的核苷酸序列表示:5'-CUGUUAAUGCUAAUUGUGAUAGGGGUUUUGGCCUCUGACUGACUCCUACCUGUUAGCAUUAACAG-3'(SEQ IDNO:1),而加工的,或成熟的,小鼠miR155基因产物通过下面的核苷酸序列表示:5'-UUAAUGCUAAUUGUGAUAGGGG-3'(SEQ ID NO:2;GenBank登录号AJ459767)。
在某些实施方案中,miR155基因产物包括与SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2的核苷酸序列具有至少70%,至少75%,至少80%,至少85%,至少90%,至少95%,至少99%,或100%的序列同一性的核苷酸序列。在一个特定的实施方案中,miR155基因产物包括SEQ ID NO:1的核苷酸序列具有100%同一性的核苷酸序列。在另一个实施方案中,miR155基因产物包括与SEQ ID NO:2的核苷酸序列具有100%同一性的核苷酸序列。
可以通过公知的方法,例如,使用数学算法,来进行两个序列的实际比较。Karlin等中描述了这种数学算法的一个优选的,非限制性的例子(Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:5873-5877(1993))。这种算法被并入如Schaffer等(Nucleic Acids Res.,29:2994-3005(2001))所述的BLASTN和BLASTX程序(2.2版本)中。当利用BLAST和Gapped BLAST程序时,可以使用各个程序的缺省参数(例如,BLASTN;可获自NCBI的因特网站点)。在一个实施方案中,检索的数据库是非冗余(NR)数据库,并且序列比较的参数可以设置为:无筛选程序;期望值为10;字长为3;矩阵是BLOSUM62;和缺口值具有11的存在(Existence)和1的延伸(Extension)。
用于序列比较的数学算法的另一个非限制性例子是Myers和Miller,CABIOS(1989)的算法。这种算法结合到ALIGN程序(2.0版本)中,其是GCG(Accelrys,San Diego,California)序列比对软件包的部分。当利用ALIGN程序用于比较氨基酸序列时,可以使用PAM120权残基表,缺口长度罚分12,和缺口罚分4。用于序列分析的另外的算法是本领域已知的,而且包括Torellis和Robotti(Comput.Appl.Biosci.,10:3-5,1994)中描述的ADVANCE和ADAM;和Pearson和Lipman中描述的FASTA(Proc.Natl.Acad.Sci.USA,85:2444-2448,1988)。
在另一个实施方案中,可使用GCG软件包中的GAP程序(Accelrys,San Diego,California),使用Blossom 63矩阵或PAM250矩阵,和缺口权12,10,8,6或4,以及长度权2,3,或4,得到两个氨基酸序列之间的同一性百分数。在又一个实施方案中,可使用GCG软件包中的GAP程序(Accelrys,San Diego,California),使用缺口权50和长度权3,得到两个核酸序列之间的同一性百分数。
根据一个方面,转基因非人动物具有包括一种核酸构建体的基因组,该核酸构建体中编码miR155基因产物的核酸序列与能指导在动物的B细胞中表达的至少一个转录调节序列可操作连接。术语“转录调节序列”根据它的本领域公认的含义使用。它意图指任何DNA序列,依靠它的序列,其能导致连接的基因在特定的细胞中被上调或者下调。在启动子的情况中,启动子一般邻近编码区。然而,在增强子的情况中,增强子可以在离编码区一定距离处发挥功能,以便在增强子与编码区之间存在干预DNA序列。为了指导遗传信息的表达,其可包括编码特定蛋白的DNA序列(或“编码区”),目标编码区可以功能性方式与至少一个转录调节序列连接。转录调节序列可用于增强,降低,调节基因表达,或指定基因表达于某些组织或某些发育阶段。该转录调节序列不必是天然存在的序列。
因此,在这里描述的一个实施方案中,编码miR155的序列与指导在B细胞中表达的转录调节序列可操作连接,以产生重组构建体或转基因。该转录调节序列可以是能指导在B细胞中表达的任何序列。适合的转录调节序列的例子包括,但不限于,VH启动子,Ig重链-Eμ增强子及其组合。在一个特定的实施方案中,转录调节序列是小鼠的转录调节序列或来源于小鼠的转录调节序列。
如果核酸分子包括含有转录调节信息的核苷酸序列,而且这样的序列与编码微小RNA的核苷酸序列可操作连接,则该核酸分子被认为是“能表达”微小RNA或“能指导微小RNA的表达”。可操作连接是这样的连接,其中试图表达的调节核酸序列与核酸序列以容许基因表达的方式连接。
一般来说,基因表达所需的调节区包括,但不限于,转录调节序列(例如,启动子区域,增强子区域),以及当转录成RNA时,有助于基因转录物稳定的DNA序列。
术语“启动子”根据它本领域公认的含义使用。它意图指通常基因或操纵子的编码序列上游的DNA区域,其结合RNA聚合酶并指导该酶以正确转录起始位点。如果启动子能影响DNA序列的转录,则该启动子区域与DNA序列可操作连接。
术语“增强子”根据它本领域公认的含义使用。它意图指在真核生物和某些真核病毒中发现的序列,当位于离研究的基因高达几千个碱基处时(以任一方向),其能增强基因的转录。当位于所讨论的基因的5’侧(上游)时,这些序列通常充当增强子。然而,当位于基因的3’侧(下游)时,一些增强子是活性的。有时,没有(已知的)启动子时,增强子元件能激活从基因的转录。
所述的核酸构建体还可包括促进构建体和/或从该构建体表达的基因产物的表达和/或稳定性的序列。在一个特定的实施方案中,该核酸构建体包括β-球蛋白基因(例如,小鼠β-球蛋白基因)的3’UTR和聚腺苷酸序列。促进构建体和/或从该构建体表达的基因产物的表达和/或稳定性的其他序列是本领域已知的,而且包含于这里。
术语“转基因非人动物”这里用于包括所有的脊椎动物,除了人之外。在一个实施方案中,转基因的非人动物是哺乳动物类。这种转基因的非人动物包括,例如,转基因猪,转基因老鼠,转基因兔,转基因牛,转基因山羊,及其他转基因动物种类,特别是哺乳动物。另外,啮齿类动物家族的其他成员,例如,老鼠,和豚鼠,以及非人类的灵长类动物,如黑猩猩,可用于实施这里描述的实施方案。在一个特定的实施方案中,转基因非人动物是小鼠。这里描述的转基因非人动物包括处于所有发育阶段的受试者动物,包括胚胎和胎儿阶段。
“转基因动物”是包含一个或多个带有遗传信息的细胞的动物,该遗传信息直接或间接地通过考虑的遗传操作在亚细胞水平接受,如通过显微注射或用重组病毒感染。引入的核酸分子可以掺入到染色体内,或者它可以是染色体外复制DNA。这里描述的适合的转基因动物包括,但不限于,其中引入遗传信息到生殖系细胞中,从而赋予传递该信息给后代的能力的那些动物。如果这种后代实际上具有一些或者全部该信息,那么它们也是转基因动物。
为了产生转基因动物,本领域已知的用于引入重组构建体或转基因到胚胎中的任何方法,如,例如,显微注射,使用细胞枪,转染,脂质体融合,电穿孔,等等,可以使用。在一个特定的实施方案中,用于生产转基因动物的方法是显微注射,其包括注射DNA分子到受精卵的雄原核中(参见,例如,美国专利4,870,009;5,550,316;4,736,866;和4,873,191)。最初在小鼠中开发用于引入重组构建体/转基因到哺乳动物和它们的生殖细胞中方法。这种方法随后用于较大的动物,包括家畜类(参见,例如,PCT公开号WO 88/00239,WO90/05188和WO 92/11757)。显微注射DNA到接合子的细胞质中也可用于产生转基因动物。
用于评估引入的转基因以及它的表达存在的方法是很容易获得的,而且是本领域公知的。这种方法包括,但不限于,DNA(Southern)杂交以检测外源DNA,聚合酶链反应(PCR),聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和印迹以检测DNA,RNA或蛋白。
本实施方案不局限于任何一种动物,而是提供用于任何合适的非人脊椎动物。例如,如这里描述和例示的,可以产生转基因小鼠。其他非限制性的例子包括,例如,这里描述的其他非人哺乳动物,如豚鼠,兔,猪,绵羊,等等。通过显微注射产生转基因动物的成功率在小鼠中是最高的,其中大约25%的受精小鼠卵,该受精小鼠卵中已经注射DNA,而且其已经被移植到雌性中,将发育成转基因小鼠。用兔,猪,绵羊和牛获得了较低的成功率。
在一个特定的实施方案中,相对于合适对照动物中的该群体,这里描述的转基因非人动物在脾,骨髓或脾和骨髓二者中显示扩大的B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-淋巴样细胞群体。如这里使用的,术语“扩大的B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-细胞群体”或“B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-细胞的增加”,指相较于对照动物,相对于其他的淋巴样细胞亚型,显示B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-细胞的数目和/或B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-细胞的比例增加的淋巴样细胞群体。
在另一个实施方案中,这里描述的转基因非人动物显示淋巴组织增生疾病。“淋巴组织增生”指其属于,或特征在于,淋巴网状内皮细胞系统细胞的增生;该术语一般用于指一群恶性赘生物。“淋巴网状内皮细胞”指淋巴样和网状内皮系统的细胞或组织。“淋巴组织增生不适”(或“淋巴组织增生疾病”或“淋巴组织增生障碍”)指由与共同的会分化成几种细胞的任何一种的,原始淋巴网状内皮细胞相关的细胞引起的一群恶性赘生物之一,该淋巴组织增生疾病包括,尤其是,淋巴细胞,组织细胞,和单核细胞性白血病,多发性骨髓瘤,浆细胞瘤,淋巴肉芽肿病,所有的淋巴细胞性淋巴瘤,和与单株丙种球蛋白病相关的免疫分泌疾病。如这里使用的,“淋巴组织增生疾病”,“淋巴组织增生障碍”或“淋巴组织增生不适”也可指一种生理状态,其中相对于正常或对照动物,淋巴网状内皮细胞系统的增生,倍增和/或累积改变,但是受影响的动物却不必然地显示如上所述的赘生物之一的症状。如这里使用的,“白血病前期”状况指在白血病的明显症状发展之前的这种淋巴组织增生疾病。
在某个实施方案中,淋巴组织增生疾病是B细胞恶性肿瘤(例如,B细胞白血病(比如,急性淋巴母细胞性白血病);B细胞淋巴瘤(例如,高级的淋巴瘤),B细胞赘生物)。在一个另外的实施方案中,B细胞恶性肿瘤显示人急性淋巴母细胞性白血病,人淋巴母细胞性淋巴瘤或其组合的特征。在又一个实施方案中,淋巴组织增生疾病是白血病前期状况(例如,前B细胞增殖)。在另外的实施方案中,转基因非人动物显示增大的腹部,脾肿大,骨髓取代,淋巴细胞减少,或其组合。
在另一个实施方案中,存在这里描述的一种方法,其将转基因非人动物用作实验模型,用于研究淋巴组织增生疾病(例如,B细胞恶性肿瘤(如,白血病(例如,急性淋巴母细胞性白血病),淋巴瘤(如,高度淋巴瘤),和赘生物)),和测试可能的致癌剂和治疗剂。
在另一个方面,这里描述了一种测试试剂在治疗或预防受试者中的淋巴组织增生疾病的治疗功效的方法。根据一个实施方案,该方法包括施用该试剂给这里描述的转基因非人动物(例如,小鼠)。在一个实施方案中,转基因非人动物具有包括一个核酸构建体的基因组,该核酸构建体含有能指导在动物的B细胞中表达的至少一个转录调节序列(例如,VH启动子,Ig重链-Eμ增强子,其组合),其中该转录调节序列与编码miR155基因产物的核酸可操作连接。在一个特定的实施方案中,该转录调节序列与这样的核苷酸序列可操作连接,该核苷酸序列与SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2具有至少90%序列同一性。在另一个实施方案中,miR155基因产物包括SEQ ID NO:1的核苷酸序列。在另一个实施方案中,miR155基因产物包括SEQ ID NO:2的核苷酸序列。
试剂已经施用给转基因动物以后,将转基因动物中淋巴组织增生疾病的一种或多种症状和/或征象与没有施用该试剂的相同基因型的对照动物进行比较。如果相对于对照动物,该试剂抑制,阻止和/或减轻已经施用该试剂的转基因动物中淋巴组织增生疾病的一种或多种症状和/或征象,那么认为该试剂在治疗或预防淋巴组织增生疾病中具有治疗功效。在某个实施方案中,淋巴组织增生疾病的一种或多种症状和/或征象选自:扩大的B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-淋巴样细胞群体,增大的腹部,脾肿大,骨髓取代,淋巴细胞减少和其组合。
适于测试试剂的治疗功效的淋巴组织增生疾病包括,例如,这里描述的那些疾病。在一个实施方案中,淋巴组织增生疾病是B细胞恶性肿瘤。在一个特定的实施方案中,B细胞恶性肿瘤选自急性淋巴母细胞性白血病,B细胞淋巴瘤(例如,高度淋巴瘤),B细胞赘生物和其组合。B细胞恶性肿瘤可显示人急性淋巴母细胞性白血病,人淋巴母细胞性淋巴瘤或两者的特性。在另一个实施方案中,淋巴组织增生疾病是白血病前期状况,如特征为前B细胞增殖的状况。
如这里描述的,这里提供了在B细胞中表达miR155的转基因非人动物。在一个实施方案中,提供了一种转基因动物,其基因组包括含有至少一个转录调节序列的核酸构建体或转基因,该转录调节序列能指导在B细胞中的表达,其中该转录调节序列与编码miR155的核酸序列可操作连接。在一个特定的实施方案中,转基因包括编码miR155的DNA序列,其已经置于VH启动子和/或Ig重链-Eμ增强子的转录调控下。在这种动物中,mir155的表达针对未成熟的和成熟的B细胞。在一个实施方案中,转基因动物是小鼠,其发展扩大的B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-淋巴样细胞群体。
在另一个实施方案中,来自显示淋巴组织增生的转基因动物的白血球,可以转移到第二种动物(其可以是非转基因动物),从而在第二种“受体”动物中诱导淋巴组织增生疾病的快速发病。
根据另一个实施方案,可根据这里描述的一个或多个方面,通过测定动物中这种药征的抗淋巴组织增生活性来测试用于预防和/或治疗淋巴组织增生疾病的可能的治疗药征或试剂。可通过测定抑制,预防,和/或破坏根据一个实施方案产生的转基因动物显示的和/或根据另一个实施方案产生的“受体”动物中淋巴组织增生疾病的一种或多种症状或征象的可能的治疗药征能力来评估这种活性。
可以测试各种治疗药征或试剂,如蛋白(例如,抗体),肽,肽模拟物,小的有机分子,核酸等等,预防和/或治疗淋巴组织增生疾病。根据这里描述的方法,可以逐一地筛选试剂,或者同时测试一种或多种试剂。在测试化合物的混合物时,通过这里描述的处理选择的化合物,可以使用适合的方法分离(视情况而定)和鉴定(例如,测序,色谱法)。也可以根据这些方法确定测试样品中一种或多种化合物的存在。
可以例如,通过筛选分子文库或集合,如,国家癌症研究所的化学药品贮藏处,在测定抑制和/或预防这里描述的转基因动物显示的淋巴组织增生疾病的一种或多种症状或征象的分析中,鉴定预防和/或治疗淋巴组织增生疾病的试剂。可以测试文库,如通过组合的化学合成或其他方法生产的化合物(例如,有机化合物,重组或合成肽,“类肽”,核酸)的组合文库(参见,例如,Zuckerman,R.N.等,J.Med.Chem.,37:2678-2685(1994)和其中引用的参考文献;也参见,Ohlmeyer,M.H.J.等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:10922-10926(1993)和De Witt,S.H.等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA90:6909-6913(1993),relating to tagged compounds;Rutter,W.J.等U.S.Patent No.5,010,175;Huebner,V.D.等,U.S.Patent No.5,182,366;和Geysen,H.M.,美国专利号4,833,092)。其中通过层析法,从携带独特标签的文库筛选化合物,鉴定单个化合物是可能的。
可以根据已知的方法另外配制鉴定的治疗药征,以产生药学上可接受的组合物。治疗药征或包含这种治疗药征的组合物可以各种标准方式施用给受试者(例如,转基因动物)。例如,试剂可以使用各种途径给药,包括,例如,口服,饮食,局部,经皮肤,直肠,肠胃外(例如,静脉内,动脉内,肌内,皮下,皮内注射),和吸入(例如,支气管内,鼻内,口服吸入,鼻内滴剂)。给药可以是如表明的局部的或全身的。给药的优选模式可以根据待施用的抗体或抗原结合片段,和被治疗的特定不适(例如,疾病)而改变,但是,口服或肠胃外给药一般是优选的。
试剂可以肠胃外给药如,例如,通过静脉内,肌内,鞘内或皮下注射。肠胃外给药可以通过将试剂掺入到溶液或悬浮液中来实现。这种溶液或混悬液也可包括无菌稀释剂,如注射用水,盐溶液,抑菌盐水(包含大约0.9%mg/ml苯甲醇的盐水),磷酸缓冲盐溶液(这里称为PBS),Hank's溶液,Ringer's-乳酸盐,固定油类,聚乙二醇,甘油,丙二醇,及其他合成的溶剂。肠胃外制剂还可包括抗菌剂(例如,苯甲醇,对羟基苯甲酸甲酯),抗氧化剂(例如,抗坏血酸,亚硫酸氢钠),和螯合剂(例如,EDTA)。缓冲液如醋酸盐,柠檬酸盐和磷酸盐和用于调节张力的试剂如氯化钠和葡萄糖,也可添加。肠胃外制剂可以封装到安瓿,一次性注射器,或由玻璃或塑料制成的多次剂量小瓶中。
实施例
实施例1:产生Eμ-mmu-miR155转基因小鼠
材料和方法
转基因小鼠:
通过PCR,从129SvJ小鼠(The Jackson Laboratory),扩增包含miR155的前体序列的318-bp片段,并克隆到pBSVE6BK(pEμ)质粒的EcoRV和SalT位点,该质粒包含用于Ig重链的Eμ增强子,VH启动子,和人β-球蛋白基因的3’UTR和聚腺苷酸(图1),而且以前已经用于在Eμ-TCL1转基因小鼠中逐渐形成慢性淋巴细胞性白血病(Bichi,R.,等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 99:6955-6960(2002))。转基因,其通过用BssHII和PvuI切割该构建体分离,注射到怀孕的FVB/N和C57/B6小鼠的受精卵细胞的雄原核中。通过Southern印迹分析,其对用BamHI消化的尾部提取的DNA进行,使用设计用于靶向Eμ增强子序列的探针(图2A,2B)来筛选幼鼠中转基因的存在。鉴定转基因建立者,并饲养成年龄相当的野生型小鼠。转基因半合子小鼠出生,进行研究,并与它们的野生型对应物相比较。通过对尾部提取的DNA进行的PCR,对小鼠进行基因分型(数据未显示)。
Northern印迹分析:
脾离解在两个磨砂显微镜载玻片之间,并在磷酸盐缓冲盐水(PBS)中洗涤裂解物,通过用氯化铵(NH4Cl)低渗裂解使红细胞耗竭,离心,并在PBS中重悬。用TRIzol试剂(GIBCO,Invitrogen)提取总RNA,在SDS/PAGE中点样和变性,并在Hybond N+膜(Amersham Pharmacia)中印迹。该膜与包含成熟的mmu-miR155序列的反义物的γ-32P放射性探针杂交,孵育过夜,洗涤,并暴露于感光成像仪筛选(MolecularDynamics)。使用Typhoon图像处理系统(Amersham Biosciences)对图像进行处理(图3)。
结果
产生转基因小鼠,其中mmu-miR155(小鼠miR155)表达在VH启动子-Ig重链Eμ增强子调控下,其在B细胞发育的晚期前B细胞阶段变得有活性。通过Southern印迹杂交鉴定了15只转基因建立者(图2A,2B),C57BL/B6背景上7只(指定为F1-F7),FVB/N背景上8只(指定为F8-F15)。将这些建立者饲养成相同品系的野生型小鼠,以产生15个独立的转基因系。
对从转基因和野生型脾提取的总RNA进行实时PCR(数据未显示)和Northern印迹分析(图3),显示在5个转基因小鼠的建立者系中高水平的miR155表达。1个转基因系完全缺乏表达,而所有其他的建立者系都表达转基因。如以前报道的,野生型小鼠在脾细胞中不表达成熟的miR155(Monticelli,S.,等,Genome Biol.6:R71(2005))。
实施例2:Eμ-mmu-miR 155转基因小鼠的表型表征揭示了脾和骨髓中前B细胞的增生,其导致B细胞恶性肿瘤
材料和方法
体测定:
杀死以后对小鼠称重,解剖它们的脾,测量和称重。
白细胞(WBC)和涂布标本:
从小鼠的眼球后血管抽取血液,涂布到磨砂显微镜载玻片上并用Giemsa染色或者离心,在PBS中洗涤,并用氯化铵处理。细胞用细胞-脉冲室计数。
流式细胞术分析:
通过低渗裂解(0.165M NH4Cl)除去脾细胞或骨髓细胞的单细胞混悬液的成熟红细胞,并用下列配合抗体染色:抗-B220-PE,抗-IgM-FITC,抗-TCR-PE cy5,抗-CD5-PE,和抗-CD-43-FITC。所有的抗体都获自BD PharMingen。在Becton Dickinson FACSCa libur上进行流式细胞术,使用Mac软件的Becton Dickinson FACS CONVERT 1.0对数据进行分析。
组织学和免疫组织化学:
从宰后检验的小鼠分离脾,股骨和胸骨,并固定于10%缓冲的福尔马林中,包埋于石蜡中,然后切成4微米的切片。切片用苏木精/曙红按照标准方案染色。对于脱蜡步骤,切片于55℃加热1小时,通过分级乙醇系列和蒸馏水再水化,浸于PBS中,然后37℃用溶于Tris缓冲液中的0.1%胰蛋白酶溶液处理30分钟。用10%正常血清阻断内源过氧化物酶。将CD43,B220,和VpreB1(CD179a)抗体(BD PharMingen)用作第一抗体。第二抗体和二氨基联苯胺按照制造商的指导添加。
结果
相对于野生型小鼠的脾,转基因小鼠的身体和脾都增大了(图4A,4B),而且转基因小鼠的脾重量/体重比例比野生型小鼠的比例大3到4倍(表1)。有趣地,该比例没有随着年龄改变很多。
表1.转基因和野生型小鼠的脾和身体测量。
 
小鼠 系(建立者) 年龄,周 BW,*gr SW,**mg WI,***mg/gr
72tg 8 3 22.68 210 9.25
69wt 8 8 23.90 90 3.76
74tg 8 3 23.98 270 11.25
68wt 8 3 24.54 60 2.44
8gt 8 24 38.3 380 9.92
24wt N/A 24 26.5 100 3.77
50tg 10 3 21.7 200 9.21
49wt 10 3 20.4 80 3.92
148wt 8 6 26.97 240 8.89
149wt 8 6 25.9 100 3.86
156tg 10 6 23.44 280 11.94
157wt 10 6 23.91 100 4.18
220wt 8 7 23.13 120 5.2
221tg 8 7 22.37 260 11.6
222tg 8 7 21.67 250 11.5
223wt 8 7 22.44 120 5.2
*BW,以克(gr)计体重;**SW,以毫克(mg)计的脾重量;***WI,以毫克每克(mg/g)计的重量指数(转基因与野生型重量的比例);tg,转基因小鼠;wt,野生型小鼠。
3月龄转基因小鼠的白血球计数(WBC)是每ml外周血10 X 106±1 X 106,相较于正常的,年龄相当的小鼠为每ml外周血40 X 106±1.5 X 106。相较于野生型年龄相当的小鼠,值没有变化,其为每ml外周血40 X 106±1.5 X 106,6月龄转基因小鼠的WBC甚至更低,其值为每ml外周血6 X 106±0.5 X 106
3周龄转基因小鼠的脾的组织病理学(苏木精/伊红染液),特征为侵入和扩大红髓的一致的非典型淋巴样群体。胚滤泡不受影响,而且存在许多次级造血中心(图5A)。组织学地,6月龄小鼠存在大大增加的恶性淋巴样群体,其具有显著的非典型和再结晶形态,红髓的血管通道增加,而且逐渐取代白髓。胚滤泡数目减少,而且脾的总体结构被淋巴样增生破坏(图5B)。组织学类似的淋巴样群体存在于6月龄小鼠的骨髓中。增生抗原,Ki67的表达,显示转基因小鼠中显著的淋巴样增生(图5D),其在野生型小鼠中没有观察到。
转基因脾中淋巴样增生的免疫组织化学分析,显示非典型扩大的胸腺依赖性细胞是B220和VpreB1(CD179a)低阳性的,不过CD43是阴性的(数据未显示)。转基因小鼠脾的石蜡包埋切片的IgM染色,显示增殖胸腺依赖性细胞的细胞质中μ链的存在(图6)。相反,流式细胞术分析没有鉴定到这些细胞表面上IgM的表达,其表明扩大的淋巴样细胞表达细胞质的μ链,但是不表达表面IgM。
对来自3,6,或7周龄或6龄的转基因和野生型小鼠的脾和骨髓的WBC的单细胞混悬液,进行的流式细胞术分析,显示相较于它们的野生型对应物,转基因小鼠中脾和骨髓中B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-淋巴样细胞的数目都增加。这种表型与在人急性淋巴母细胞性白血病或淋巴母细胞性淋巴瘤中观察到的增殖胸腺依赖性细胞的表型类似。这些发现表明,相较于在野生型小鼠的脾中仅仅1.65%,3周龄转基因小鼠的脾中B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-淋巴样群体,是总的门控淋巴样群体的9%(对1只转基因小鼠和1只野生型小鼠进行评价)。6周龄时,这些百分数在转基因小鼠的脾中变成6.6±1.4%,7周龄小鼠为4.7±0.3%,而在野生型脾中保持没有变化(分析的两种转基因小鼠来自两个不同的建立者系和两个野生型小鼠)。
在6月龄转基因小鼠的骨髓中,我们发现相较于野生型,如通过B220low/IgM-表达限定的前B细胞群体增加(图7和8)。B220low/IgM-细胞群体的正向散射分析显示,这些细胞将大的海蕾细胞(数据未显示)。
根据流式细胞术,组织学和免疫组织化学分析,推断前B细胞增殖,限定为B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-,存在于转基因小鼠的脾和骨髓中,而且在3周龄是已经是可检测的。这种增生最终导致脾肿大,骨髓取代,和显著的淋巴细胞减少,常常与高级B细胞恶性肿瘤相关的特征。相较于野生型对照,其全部都是健康的(11只野生型小鼠中的11只),与该特征一致,所有的转基因小鼠在6月龄都发展高级B细胞赘生物(7只转基因小鼠的7只)。显著地,没有过表达miR155的转基因小鼠系也是正常的。
实施例3:Eμ-mmu-miR155转基因小鼠的细胞遗传学分析
材料和方法
细胞遗传学:
股骨骨髓用RPMI培养基1640/20% FBS冲洗,并收集到带有1%肝素的5ml RPMI培养基1640/20% FBS中。细胞生长,并使用标准的细胞学技术,评价染色体的缺失,移位,倒位和中期的数目。
Ig重链重排:
使用下列寡核苷酸引物,通过扩增小鼠基因组DNA的Ig重链区域的JH4片段中序列,设计探针:正向,5'-TGAAGGATCTGCCAGAACTGAA-3'(SEQ ID NO:3),和反向,5'-TGCAATGCTCAGAAAACTCCAT-3'(SEQ ID NO:4)。
转基因和野生型小鼠的脾离解到处于PBS中的磨砂显微镜载玻片之间,用氯化铵处理以裂解红血球,离心,并重悬于PBS中。从脾的白血球提取DNA,并用EcoRI,StuI,BglII,BamHI和HindIII消化。消化的DNA印迹到Hybond N+膜上,用JH4探针杂交,该探针用γ-32p放射性标记,然后暴露于感光图像仪筛选,并使用Typhoon扫描仪进行处理。
结果
相较于来自正常同窝仔畜的脾,脾细胞的染色体组型的细胞遗传研究,没有鉴定到来自转基因小鼠的脾中一致的染色体异常。但是,偶然观察到一些基因组的改变(图9;参见箭头)。这些结果表明,扩大的前B细胞群体是二倍体和细胞遗传学拟似正常的。
为了检测克隆性,使用多酶消化酶,对来自3到6周龄之间的小鼠的脾细胞DNA进行Southern印迹分析,以评价V(D)J重排。相对于野生型小鼠,没有检测到转基因小鼠中重排条带的存在(图10),除了1只转基因小鼠外,其在用每种不同的限制性内切酶进行Southern印迹上具有一致的重排条带(数据未显示)。这些数据表明,该龄的小鼠中B细胞群体大部分是多克隆的,至少直到6周龄。因为大部分恶性肿瘤是多克隆的,这种发现表明miR155可能是癌症中激活的信号转导途径的下游靶。
有趣地,已经在实体瘤中观察到miR155的过表达,如乳房和结肠癌,以及肺癌,其中miR155的过表达是差的预后的指示(Volinia,S.,等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 103:2257-2261(2006))。
实施例4:微阵列表达分布图揭示了VpreB1 mRNA和其他靶的上调
材料和方法
RNA分离:
根据制造商的指导,用TRIzol试剂(Invitrogen)进行总的RNA分离。
miRNA表达分布图:
如所述的在miRNA微阵列芯片上进行RNA标记和杂交(Liu,C.G.,等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101:9740-9744)。简要地,使用5’生物素末端标记的随机八聚物寡核苷酸引物,通过逆转录,用生物素对来自每种样品的5μg总RNA进行标记。在miRNA微阵列芯片(OhioState University,Ver.2.0)上进行生物素标记的cDNA的杂交,该芯片含有800个miRNA探针,包括245个人和200个小鼠miRNA基因,一式四份。使用Axon扫描仪4000B(Axon Instruments,Union City,CA),通过结合链霉亲和素-Alexa647缀合物与生物素,检测杂交信号。通过GENEPIX 6.0软件(Axon Instruments)对图像进行定量。
mRNA表达分布图:
使用GeneChip小鼠基因组4302.0阵列(Affymetrix),其包含用于超过45,000个表征的基因和表达的序列标签的探针组。根据Affymetrix方案,进行样本标记和处理,GeneChip杂交,以及扫描。简要地,使用SuperScript Choice System(Invitrogen),其添加T7 RNA聚合酶启动子位点到3’-末端(Genset,La Jolla,CA),从总RNA合成双链cDNA。使用BioArray T7 RNA聚合酶标记试剂盒(EnzoDiagnostics),从cDNA体外产生生物素化的cRNA并扩增。使用RNeasy微型试剂盒(Qiagen,Hilden,德国),纯化cRNA以后,20μg的cRNA于94℃破碎35min。大约12.5μg的破碎cRNA用于250μl杂交混合物中,该混合物含有鲱鱼-精子DNA(0.1mg/ml;Promega),加上细菌和噬菌体cRNA对照(1.5pM BioB,5pM BioC,25pM BioD,和100pM Cre)用作杂交效率的内部对照。混合物的等分试样(200μ1),在GeneChip杂交烘箱640(Affymetrix)中,于45℃与阵列杂交18小时。洗涤每个阵列,并用链霉亲和素-藻红蛋白(Invitrogen)染色,用生物素化的抗链霉亲和素抗体(Vector Laboratories),在GeneChip Fluidics Station 450(Affymetrix)上扩增。阵列用GeneArray G7扫描仪(Affymetrix)扫描,以获得图像和信号强度。
结果
对从5只转基因小鼠的脾的白血球提取的总RNA,进行微阵列分析,其包括不表达miR155转基因的1只小鼠,和6只野生型同窝仔畜对应物的白血球。分析显示,相对于野生型同窝对照小鼠(数据未显示),在过表达miR155的转基因小鼠中,miR155,miR194,miR224,miR217和miR151的表达增加10到20倍(表3),miR146和miR138的表达减少2到3倍。使用Affymetrix微阵列芯片,研究相同组的转基因小鼠中mRNA的差异表达,并与同窝仔畜对照中的mRNA表达进行比较。Affymetrix微阵列数据的统计分析显示,在miR155过表达小鼠中,200个增生相关的基因上调,而50个基因下调(表3)。显著地,VpreB1 mRNA是上调的,当前B细胞增殖发生时,期望其存在。这些数据补充了来自流式细胞术分析和免疫组织化学的数据。
表2.根据微阵列的预测分析(PAM),miR155转基因/野生型小鼠分类的Affymetrix微阵列数据。
 
名称 探针组ID 基因称谓 mir155分数 Wt分数
1456609_at 1456609_at RIKEN cDNA 1810006K23基因 0.8041* -0.5744
1452324_at 1452324_at 浆细胞瘤变体易位1 0.4468* -0.3192
1449452_a_at 1449452_a_at 糖蛋白2(酶原颗粒膜) 0.3377* -0.2412
1459923_at 1459923_at 脑表达的,X-连锁的6 0.319* -0.2279
1449222_at 1449222_at EB病毒诱导的基因3 0.31* -0.2214
1424437_s_at 1424437_s_at ATP-结合表达盒,亚家族G(WHITE),成员4 0.2723* -0.1945
1425784_a_at 1425784_a_at 嗅介蛋白1 0.2717* -0.1941
1436827_at 1436827_at 基因模型944,(NCBI) 0.2537* -0.1812
1425677_a_at 1425677_a_at 锚蛋白1,红色的 0.2513* -0.1795
1417636_at 1417636_at 溶质载体家族6(神经递质转运蛋白,甘氨酸)成员9 0.2476* -0.1769
1441054_at 1441054_at 载脂蛋白L,2 0.233* -0.1664
1458642_at 1458642_at 杀伤细胞凝集素样受体家族E,成员1 0.2307* -0.1648
1448558_a_at 1448558_a_at 磷酯酶A2,IVA组,(细胞溶质的,钙依赖的) 0.2157* -0.154
1418601_at 1418601_at 醛脱氢酶家族1,亚家族A7 0.2136* -0.1526
1458667_at 1458667_at RIKEN cDNA4930519N13基因 0.2084* -0.1488
1436443_a_at 1436443_a_at 含KDEL(Lys-Aso-Glu-Leu)的1 0.2073* -0.1481
1416740_at 1416740_at 前胶原,类型V,α1 0.2025* -0.1447
1422663_at 1422663_at 起点识别复合体,亚基1-样(酿酒酵母) 0.2019* -0.1442
1433892_at 1433892_at 精子相关抗原5 0.1988* -0.142
1435660_at 1435660_at 类似于RIKEN cDNA 5830484A20 0.1979* -0.1413
1454622_at 1454622_at 溶质载体家族38,成员5 0.1847* -0.132
1426802_at 1426802_at 隔蛋白8 0.1821* -0.13
1449869_at 1449869_at 前B淋巴细胞基团1(V perB1) 0.1798* -0.1284
1426015_s_at 1426015_s_at 天冬氨酸-β-羟化酶 0.1768* -0.1263
1418710_at 1418710_at CD59a抗原 0.1697* -0.1212
1437244_at 1437244_at 生长停止特异性2样3 0.1662* -0.1187
1429830_a_at 1429830_a_at CD59a抗原 0.1651* -0.118
1422524_at 1422524_at ATP-结合表达盒,亚家族B(MDR/TAP),成员6 0.1604* -0.1145
1435287_at 1435287_at 内收蛋白2(β) 0.158* -0.1129
1436984_at 1436984_at abl-相互作用物2 0.1554* -0.111
1453226_at 1453226_at RIKEN cDNA 3000004C01基因 0.1467* -0.1048
1429146_at 1429146_at RIKEN cDNA 6620401M08基因 0.139* -0.0993
 
1454630_at 1454630_at cDNA序列BC034054 0.1385* -0.099
1429089_s_at 1429089_s_at RIKEN cDNA 2900026A02基因 0.138* -0.0986
1455980_a_at 1455980_a_at 生长停滞特异性2样3 0.1375* -0.0982
1427677_a_at 1427677_a_at 含SRY-框的基因6 0.1363* -0.0974
1419031_at 1419031_at 脂肪酸去饱和酶2 0.1338* -0.0956
1422016_a_at 1422016_a_at 着丝粒自身抗原H 0.1309* -0.0935
1420176_x_at 1420176_x_at 免疫球蛋白λ样多肽1 0.13.05* -0.0932
1434501_at 1434501_at --- 0.1246* -0.089
1419665_a_at 1419665_a_at 核内蛋白1 0.123* -0.0878
1446391_at 1446391_at 突触核蛋白,α 0.1203* -0.0859
1419421_at 1419421_at 锚蛋白1,类红细胞 0.1181* -0.0844
1452458_s_at 1452458_s_at 肽基脯氨酰异构酶(亲环蛋白)样5 0.1163* -0.0831
1417939_at 1417939_at RAD51相关蛋白1 0.1149* -0.0821
1436725_at 1436725_at RIKEN cDNA E130306D19基因 0.1104* -0.0789
1437187_at 1437187_at E2F转录因子7 0.1103* -0.0788
1453004_at 1453004_at RIKEN cDNA 3110004L20基因 0.1062* -0.0758
1428105_at 1428105_at TPX2,微管相关蛋白同系物(光滑爪蟾) 0.1049* -0.0749
1448926_at 1448926_at 同源异型框A5 0.1047* -0.0748
1437370_at 1437370_at Shugoshin样2(裂殖酵母) 0.1046* -0.0747
1430999_a_at 1430999_a_at 短卷曲螺旋蛋白 0.1038* -0.0742.
1454757_s_at 1454757_s_at DNA区段,Chr12,ERATO Doi647,表达的 0.1018* -0.0727
1418026_at 1418026_at 核酸外切酶1 0.1016* -0.0726
1435148_at 1435148_at ATP酶,Na+/K+转运,β2多肽 0.1012* -0.0723
1434553_at 1434553_at RIKEN cDNA 4930577M16基因 0.1009* -0.0721
1422967_a_at 1422967_a_at 转铁蛋白受体 0.1008* -0.072
1434479_at 1434479_at 表达的序列AI413331 0.1001* -0.0715
1431893_a_at 1431893_a_at 反-异戊烯转移酶 0.0994* -0.071
1447655_x_at 1447655_x_at 含SRY-框的基因6 0.0959*
Figure G2007800230891D0013121424QIETU
-0.0685
1434789_at 1434789_at 含DEP域1B 0.095* -0.0678
1421957_a_at 1421957_a_at 磷酸胞苷酰转移酶1,胆碱,α同工型 0.0946* -0.0676
1455228_at 1455228_at Wolf-Hirschhorn综合征候选物1(人) 0.0937* -0.0669
1435663_at 1435663_at 雌激素受体1(α) 0.093* -0.0664
1429058_at 1429058_at RIKEN cDNA 1110004B13基因 0.0925* -0.0661
1424229_at 1424229_at 双特异性酪氨酸-(Y)-磷酸化调节激酶3 0.0919* -0.0657
1422930_at 1422930_at 细胞间粘附分子4,Landsteiner-Wiener血型 0.0917* -0.0655
1452591_a_at 1452591_a_at RIKEN cDNA 2410018G20基因 0.0905* -0.0646
1453416_at 1453416_at 生长停滞特异性2样3 0.0886* -0.0633
1433908_a_at 1433908_a_at 皮层肌动蛋白 0.0874* -0.0624
 
1419595_a_at 1419595_a_at γ-谷氨酰水解酶 0.0872* -0.0623
1421654_a_at 1421654_a_at 核纤层蛋白A 0.0867* -0.062
1417323_at 1417323_at RIKEN cDNA 5430413I02基因 0.085* -0.0607
1450992_a_at 1450992_a_at 髓细胞样嗜亲性病毒整合位点1 0.0832* -0.0594
1435773_at 1435773_at RIKEN cDNA 4930547N16基因 0.0829* -0.0592
1438711_at 1438711_at --- 0.0829* -0.0592
1429701_at 1429701_at RIKEN cDNA 2410003J06基因 0.0827* -0.0591
1433582_at 1433582_at RIKEN cDNA 1190002N15基因 0.0823* -0.0588
1460192_at 1460192_at 氧固醇结合蛋白样1A 0.0817* -0.0584
1443870_at 1443870_at ATP结合盒,亚家族C(CFTR/MRP),成员4 0.0814* -0.0581
1456020_at 1456020_at SH3域和tetratricopeptide重复2 0.???0813* -0.0581
1451664_x_at 1451664_x_at 杀伤细胞凝集素样受体亚家族A,成员12///杀伤细胞凝集素样受体亚家族A,成员4///杀伤细胞凝集素样受体亚家族A,成员7///杀伤细胞凝集素样受体亚家族A,成员20///杀伤细胞凝集素样受体亚家族A,成员18 0.0812* -0.058
1421975_a_at 1421975_a_at 内收蛋白2(β) 0.0805* -0.0575
1423124_x_at 1423124_x_at RAD54样(酿酒酵母) 0.0789* -0.0563
1417749_a_at 1417749_a_at 紧密连接蛋白1 0.0779* -0.0557
1425145_at 1425145_at 白细胞介素1受体样1 0.0768* -0.0549
1424722_at 1424722_at RIKEN cDNA 1300017J02基因 0.0762* -0.0544
1455409_at 1455409_at 螺旋体同源物1(果蝇) 0.0739* -0.0528
1453067_at 1453067_at RIKEN cDNA 2610040C18基因 0.0734* -0.0524
1430839_at 1430839_at RIKEN cDNA 9430076G02基因 0.0713* -0.0509
1434577_at 1434577_at cDNA序列BC052040 0.0704*
Figure 2007800230938100002G2007800230891D0013121424QIETU
-0.0503
1457306_at 1457306_at 聚合酶(DNA指导的),ε3(p17亚基) 0.0699* -0.0499
1429734_at 1429734_at RIKEN cDNA 4632434I11基因 0.0695* -0.0496
1449060_at 1449060_at 驱动蛋白家族成员2C 0.0684* -0.0489
1424223_at 1424223_at RIKEN cDNA 1700020C11基因 0.0676* -0.0483
1428372_at 1428372_at 肿瘤发生抑制5 0.0667* -0.0476
1436124_at 1436124_at 磷酸盐胞苷酰转移酶1,胆碱,β同工型 0.0663* -0.0474
1417656_at 1417656_at 成髓细胞血症致癌基因样2 0.0661* -0.0472
1436922_at 1436922_at --- 0.0657* -0.047
1455009_at 1455009_at 羧肽酶D 0.065* -0.0464
1434826_at 1434826_at 表达的序列AI256775 0.064* -0.0457
1455746_at 1455746_at 驱动蛋白家族成员13A 0.0628* -0.0449
1419087_s_at 1419087_s_at 剪接因子3a,亚基1 0.0616* -0.044
1418919_at 1418919_at shugoshin样1(裂殖酵母) 0.0611* -0.0436
 
1433596_at 1433596_at DnaJ(Hsp40)同源物,亚家族C,成员6 0.061* -0.0436
1430538_at 1430538_at RIKEN cDNA 2210013O21基因 0.0605* -0.0432
1454193_at 1454193_at RIKEN cDNA 5430401H09基因 0.0605* -0.0432
1450380_at 1450380_at 室管膜素相关蛋白2(斑马鱼) 0.06* -0.0428
1434322_at 1434322_at RIKEN cDNA A930021H16基因 0.0596* -0.0426
1438650_x_at 1438650_x_at 间隙连接膜通道蛋白α1 0.0593* -0.0424
1451914_a_at 1451914_a_at 内收蛋白2(β) 0.0574* -0.041
1436584_at 1436584_at Sprouty同源物2(果蝇) 0.0555* -0.0396
1455012_s_at 1455012_s_at 三联基序蛋白37 0.0551* -0.0394
1452026_a_at 1452026_a_at 磷酯酶A2,XIIA类 0.0524* -0.0374
1451257_at 1451257_at 酰基辅酶A合成酶长链家族成员6 0.0521* -0.0372
1435792_at 1435792_at Sp100-rs的组分 0.0513* -0.0366
1435029_at 1435029_at RIKEN cDNA B230120H23基因 0.0492* -0.0351
1434630_at 1434630_at 锚蛋白重复结构域28 0.0491* -0.0351
1426801_at 1426801_at 隔蛋白8 0.0483* -0.0345
1436936_s_at 1436936_s_at 灭活的X特异性转录物 0.0458* -0.0327
1418069_at 1418069_at 载脂蛋白C-II 0.0456* -0.0326
1425837_a_at 1425837_a_at CCR4碳分解代谢物阻抑4样(酿酒酵母) 0.0456* -0.0326
1441757_at 1441757_at RIKEN cDNA 1190002F15基因 0.0454* -0.0325
1422906_at 1422906_at ATP结合盒,亚家族G(WHITE),成员2 0.045* -0.0322
1454858_x_at 1454858_x_at RIKEN cDNA 3300001H21基因 0.045* -0.0321
1443673_x_at 1443673_x_at --- 0.0449* -0.032
1417587_at 1417587_at 永久同源物(果蝇) 0.0447* -0.0319
1456022_at 1456022_at 同源结构域相互作用蛋白激酶2 0.0445* -0.0318
1438202_at 1438202_at RIKEN cDNA C920005C14基因 0.0439* -0.0314
1453836_a_at 1453836_a_at 单酸甘油酯脂肪酶 0.0434* -0.031
1422966_a_at 1422966_a_at 转铁蛋白受体 0.0431* -0.0308
1439208_at 1439208_at 限制点激酶1同源物,(裂殖酵母) 0.0423* -0.0302
1422944_a_at 1422944_a_at 透明同源物3(果蝇) 0.0417* -0.0298
1419412_at 1419412_at 趋化因子(C基序)配体1 0.0414* -0.0296
1435378_at 1435378_at RIKEN cDNA 2210020M01基因 0.0414* -0.0296
1422788_at 1422788_at 溶质载体家族43,成员3 0.0413* -0.0295
1452763_at 1452763_at Prader-Willi/Angelman综合征1中非印迹同源物(人) 0.0413* -0.0295
1428369_s_at 1428369_s_at Rho GTP酶激活蛋白21 0.0409* -0.0292
1453107_s_at 1453107_s_at 果蝇forkhead框M1///脑磷酯结合蛋白///RIKEN cDNA 0.0404* -0.0288
 
4933413G19基因
1418219_at 1418219_at 白细胞介素15 0.0379* -0.027
1448834_at 1448834_at 果蝇forkhead框M1 0.0372* -0.0266
1435054_at 1435054_at 必需减数分裂核酸内切酶同源物1(裂殖酵母) 0.0371* -0.0265
1434586_a_at 1434586_a_at 磷脂酰丝氨酸合成酶2 0.0367* -0.0262
1418929_at 1418929_at 雌激素相关受体β样1 0.0366* -0.0261
1451469_at 1451469_at RIKEN cDNA B430108F07基因 0.0363* -0.0259
1428104_at 1428104_at TPX2,微管相关蛋白同源物(光滑爪蟾) 0.0339* -0.0242
1427262_at 1427262_at 灭活的X特异性转录物 0.0337* -0.0241
1431012_a_at 1431012_a_at 过氧化物酶体Δ3,Δ2-烯酰辅酶A异构酶 0.0336* -0.024
1434850_at 1434850_at 假设蛋白D030034H08 0.033* -0.0236
1441520_at 1441520_at 钙调蛋白结合蛋白1 0.0329* -0.0235
1423344_at 1423344_at 促红细胞生成素受体 0.0328* -0.0234
1434557_at 1434557_at 亨廷顿蛋白相互作用蛋白1 0.0325* -0.0232
1424863_a_at 1424863_a_at 同源结构域相互作用蛋白激酶2 0.0321* -0.0229
1457670_s_at 1457670_s_at 核纤层蛋白A 0.0316* -0.0226
1451417_at 1451417_at 乳房癌1 0.0305* -0.0218
1428952_at 1428952_at 蛋白质二硫键异构酶相关2 0.0303* -0.0217
1449514_at 1449514_at G蛋白偶联受体激酶5 0.0296* -0.0211
1416273_at 1416273_at 肿瘤坏死因子,α-诱导的蛋白2 0.0292* -0.0209
1460223_a_at 1460223_a_at 红细胞蛋白带4.9 0.0292* -0.0208
1423902_s_at 1423902_s_at Rho鸟嘌呤核苷交换因子(GEF)12 0.0291* -0.0208
1417404_at 1417404_at ELOVL家族成员6,长链脂肪酸的延伸(酵母) 0.0289* -0.0206
1420712_a_at 1420712_a_at hepsin 0.0273* -0.0195
1452924_at 1452924_at RIKEN cDNA 2310007D09基因 0.0273* -0.0195
1429059_s_at 1429059_s_at RIKEN cDNA 1110004B13基因 0.0272* -0.0194
1435784_at 1435784_at 自噬相关9样1(酵母) 0.0264* -0.0189
1449648_s_at 1449648_s_at RNA聚合酶1-1 0.0264* -0.0188
1460551_at 1460551_at RAN,癌基因家族成员RAS 0.0259* -0.0185
1439091_at 1439091_at 范科尼贫血,互补群D2 0.0249* -0.0178
1457851_at 1457851_at --- 0.0245* -0.0175
1416575_at 1416575_at 细胞分裂周期45同源物(酿酒酵母)样 0.0234* -0.0167
1422922_at 1422922_at RecQ蛋白样4 0.0234* -0.0167
1456510_x_at 1456510_x_at UbiE-YGHL1融合蛋白 0.0231* -0.0165
1448871_at 1448871_at 促分裂原激活蛋白激酶13 0.0226* -0.0161
1450495_a_at 1450495_a_at 杀伤细胞凝集素样受体亚家族K,成员1 0.0225* -0.0161
 
                                                                                                    
1442000_at       1442000_at       类似于新蛋白                           0.0222*     -0.0158   
1452098_at       1452098_at         CTF18,染色体传递保真因子18同源物(酿酒酵母) 0.0219*      -0.0156     
1453049_at      1453049_at         RTKEN cDNA 662040IM08基因             0.0217*    -0.0155   
1434864_at       1434864_at         Prader-Willi/Angelman综合征1中非印迹同源物(人) 0.0212*      -0.0152     
1460495_s_at   1460495_s_at     蛋白酶,丝氨酸,25                     0.021*    -0.015    
1453181_x_at   1453181_x_at    磷脂scramblasel                        0.0209*    -0.0149   
1420330_at       1420330_at         C-型凝集素结构域家族4,成员e 0.0208*      -0.0149     
1438011_at       1438011_at         磷酸胞苷酰转移酶1,胆碱,α同工型 0.0205*      -0.0146     
1450344_a_at     1450344_a_at       前列腺E受体3(EP3亚型) 0.0204*      -0.0146     
1424895_at       1424895_at         G-蛋白信号调制器2(AGS3-样,线虫)                        0.0201*      -0.0144     
1426543_x_at 1426543_x_at   RIKEN cDNA 2310067E08基因;           0.0193*     -0.0138   
1423878_at      1423878_at        血型糖蛋白C                            0.0186*   -0.0133   
1427263_at    1427263_at     灭活的X特异性转录物                    0.0186*     -0.0133   
1434150_a_at     1434150_a_at       RIKBN cDNA 3300001H21基因:///UbiE-YGHL1融合蛋白                     0.0185*      -0.0132     
1453681_at     1453681_at        ATP酶抑制因子1                       0.0181*     -0.013    
1450556_at    1450556_at        膜收缩蛋白β1                          0.0175*   -0.0125  
1434554_at      1434554_at        三联基序蛋白37                         0.0174*   -0.0124    
1448529_at      1448S29_at        血栓调节蛋白                           0.0173*    -0.0123   
1429404_at    1429404_at       RIKEN cDNA 2010317E24基因             0.0168*     -0.012    
1432886_at      1432886_at        RIKEN cDNA 5730488B01基因             0.0162*     -0.0116   
1435325_at      1435325_at        泛素特异性蛋白酶46                     0.016*     -0.0114   
1434587_x_at 1434587_x_at      磷脂酰丝氨酸合成酶2                    0.0157*    -0.0112   
1418003_at     1418003_at        RIKEN cDNA  1190002H23基因         0.0156*     -0.0111   
1434310_at       1434310_at         骨形态发生蛋白受体,II型(丝氨酸/苏氨酸激酶)                    0.0147*      -0.0105     
1435035_at       1435035_at         含RNA(鸟嘌呤-9-)甲基转移酶结构域的2                              0.0144*      -0.0103     
1424413_at     1424413_at        阿片样物质生长因子受体样1              0.014*     -0.01      
1436872_at       1436872 _at        转化,含酸性卷曲螺旋蛋白3 0.0133*      -0.0095     
1417878_at      1417878_at       E2F转录因子1                           0.013*     -0.0093   
1428433_at       1428433_at         同源结构域相互作用蛋白激酶2 0.0125*      -0.0089     
1429642_at       1429642_at         ANl,泛素样,同源物(光滑爪蟾) 0.0122*      -0.0087     
1435786_at      1435786_at        Kelch样12(果蝇)                0.0119*    -0.0085   
1428391_at       1428391_at         RAB3A相互作用蛋白(Rab结合蛋白3)样1                                    0.0118*      -0.0085     
 
1451596_a_at 1451596_a_at 鞘氨醇激酶1 0.0117* -0.0084
1422619_at 1422619_at 磷脂酸磷酸酶2a 0.0111* -0.0079
1449708_s_at 1449708_s_at 限制点激酶1同源物(裂殖酵母) 0.0106* -0.0076
1429294_at 1429294_at 甲状腺激素受体相互作用物13 0.0105* -0.0075
1450862_at 1450862_at RAD54样(酿酒酵母) 0.0103* ·0.0074
1433695_at 1433695_at RIKEN cDNA 1500041B16基因 0.0097* -0.0069
1451083_s_at 1451083_s_at 丙氨酰-tRNA合成酶 0.0097* -0.0069
1422620_s_at 1422620_s_at 磷脂酸磷酸酶2a 0.0094* -0.0067
1457722_at 1457722_at RIKEN cDNA A630024B12基因 0.0091* -0.0065
1455405_at 1455405_at 脯氨酸-丝氨酸-苏氨酸磷酸酶相互作用蛋白2 0.009* -0.0064
1460010_a_at 1460010_a_at 磷脂酰丝氨酸合成酶2 0.0089* -0.0063
1424412_at 1424412_at 阿片样物质生长因子受体样1 0.0083* -0.0059
1456475_s_at 1456475_s_at 蛋白激酶,cAMP依赖性调节,IIβ型 0.0082* -0.0058
1449714_at 1449714_at RIKEN cDNA 5730472N09基因 0.0077* -0.0055
1434645_at 1434645_at RIKEN cDNA C530008M17基因 0.0069* -0.005
1425157_x_at 1425157_x_at RIKEN cDNA 1300010A20基因 0.0067* -0.0048
1432273_a_at 1432273_a_at 达菲血型 0.0063* -0.0045
1417037_at 1417037_at 起点识别复合体亚基6样(酿酒酵每) 0.0062* -0.0044
1428402_at 1428402_at 锌指,含CCHC结构域的3 0.0062* -0.0044
1416130_at 1416130_at 朊病毒蛋白 0.0061* -0.0043
1455218_at 1455218_at RIKEN cDNA 6330503K22基因 0.0056* -0.004
1452166_a_at 1452166_a_at 角蛋白复合物,酸性基团10 0.0049* -0.0035
1437992_x_at 1437992_x_at 间隙连接膜通道蛋白α1 0.0037* -0.0026
1449015_at 1449015_at 抵抗素样α 0.0033* -0.0023
1428713_s_at 1428713_s_at RIKEN cDNA 4833427B12基因 0.0032* -0.0023
1427105_at 1427105_at RIKEN cDNA 2610510J17基因 0.0031* -0.0022
1426541_a_at 1426541_a_at RIKEN cDNA 2310067E08基因 0.0028* -0.002
1424293_s_at 1424293_s_at RIKEN cDNA 2610319K07基因 0.0024* -0.0017
1423724_at 1423724_at ZW10相互作用物 0.002* -0.0014
1451609_at 1451609_at RIKEN cDNA 1300010A20基因 0.0018* -0.0013
1417902_at 1417902_at 溶质载体家族19(硫胺转运蛋白),成员2 0.0016* -0.0012
1424292_at 1424292_at 含DEP结构域的1a 0.0015* -0.0011
1455983_at 1455983_at 细胞分裂周期相关2 0.0015* -0.0011
1448211_at 1448211_at ATP酶,H+转运,溶酶体的,V0亚基E同工型2 0.0013* -9.00E-04
1453769_at 1453769_at RIKEN cDNA 2610318C08基因 0.0012* -9.00E-04
1417892_a_at 1417892_a_at Sirtuin3(沉默交配型信息调节2,同源物3(酿酒酵母) 6.00E-04* -4.00E-04
 
1428195_at 1428195_at RIKEN cDNA 4631427C17基因 -1.00E-04# 1.00E-04
1450932_s_at 1450932_s_at 胞质分裂9的奉献者 -3.00E-04# 2.00E-04
1417652_a_at 1417652_a_at 微管蛋白辅因子a -4.00E-04# 3.00E-04
1455210_at 1455210_at 锌指和同源异型框蛋白2 -0.0014# 0.001
1419103_a_at 1419103_a_at 含自水解酶结构域的6 -0.0015# 0.001
1441975_at 1441975_at 酸性磷酸酶,前列腺 -0.0017# 0.0012
1419119_at 1419119_at 造血细胞信号传感器 -0.0019# 0.0013
1449508_at 1449508_at 白介素27受体α -0.0025# 0.0018
1445711_at 1445711_at 表达的序列BB163080 -0.0029# 0.002
1426044_a_at 1426044_a_at 蛋白激酶C,θ -0.0036# 0.0026
1424903_at 1424903_at Jumonji,富含AT的相互作用结构域ID(Rbp2样) -0.0037# 0.0027
1416035_at 1416035_at --- -0.0045# 0.0032
1460260_s_at 1460260_s_at 亲核蛋白(核转运蛋白)α1 -0.0046# 0.0033
1439956_at 1439956_at 成人雄性主动脉和静脉cDNA,RIKEN全长富集文库,克隆:A530049N04产物:未知EST,全部插入序列 -0.0048# 0.0034
1416406_at 1416406_at 星形细胞中富含的磷蛋白15 -0.0051# 0.0036
1419548_at 1419548_at 亲核蛋白(核转运蛋白)α1 -0.0054# 0.0039
1437756_at 1437756_at GTP酶,IMAP家族成员9 -0.0056# 0.004
1436067_at 1436067_at 含锌指和BTB结构域的10 -0.0058# 0.0042
1450710_at 1450710_at jumonji,富含AT相互作用结构域2 -0.0061# 0.0044
1433955_at 1433955_at 含布罗莫结构域和WD重复结构域的1 -0.0067# 0.0048
1439343_at 1439343_at 3天婴儿胸腺cDNA,RIKEN全长富集文库,克隆:A630050A01产物:未分类,全部插入序列 -0.0073# 0.0052
1426771_at 1426771_at 表达的序列AI316828 -0.0079# 0.0057
1419722_at 1419722_at 蛋白酶,丝氨酸19(neuropsin) -0.0085# 0.0061
1419810_x_at 1419810_x_at Rho GTP酶活化蛋白9 -0.0099# 0.0071
1452322_a_at 1452322_a_at 含布罗莫结构域和WD重复结构域的1 -0.0106# 0.0076
1446835_at 1446835_at --- -0.011# 0.0078
1417371_at 1417371_at pellino 1 -0.0111# 0.0079
1436353_at 1436353_at RIKEN cDNA A230046K03基因 -0.0114# 0.0082
1420685_at 1420685_at GRB2相关的接头蛋白2 -0.0115# 0.0082
 
1456440_s_at 1456440_s_at 转录座位 -0.0117# 0.0084
1454742_at 1454742_at RasGEF域家族,成员1B -0.0122# 0.0087
1450024_at 1450024_at 融合同源物的阻抑基因(果蝇) -0.0125# 0.009
1433953_at 1433953_at 锌指蛋白277 -0.0135# 0.0096
1417210_at 1417210_at 真核翻译起始因子2,亚基3,结构基因Y连锁的 -0.0137# 0.0098
1444828_at 1444828_at 蛋白质磷酸酶2,调节亚基B(B56),γ同工型 -0.0139# 0.0099
1447502_at 1447502_at --- -0.014# 0.01
1422445_at 1422445_at 整联蛋白的α6 -0.0148# 0.0106
1453244_at 1453244_at RIKEN cDNA 5830416P10基因 -0.0157# 0.0112
1426725_s_at 1426725_s_at E26鸟类白血病致癌基因1,5'结构域 -0.0175# 0.0125
1438577_at 1438577_at 转录座位 -0.018# 0.0129
1452077_at 1452077_at DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)框多肽3,Y-连锁的 -0.02# 0.0143
1416007_at 1416007_at 富含特定AT序列结合蛋白1 -0.0203# 0.0145
1426438_at 1426438_at DEAD,(Asp-Glu-Ala-Asp)框多肽3,Y-连锁的 -0.021# 0.015
1422122_at 1422122_at Fc受体,IgE,低亲和力II,α多肽 -0.0213# 0.0152
1434260_at 1434260_at FCH和双SH3结构域2 -0.0215# 0.0153
1417816_s_at 1417816_s_at 肿瘤差异表达1 -0.0222# 0.0158
1427532_at 1427532_at T细胞受体相关跨膜接头1 -0.0222# 0.0159
1454947_a_at 1454947_a_at cDNA序列BC002236 -0.0224# 0.016
1418235_at 1418235_at 自噬相关5样(酵母) -0.0243# 0.0173
1418353_at 1418353_at CD5抗原 -0.0258# 0.0184
1450262_at 1450262_at Car样细胞因子1 -0.026# 0.0186
1455165_at 1455165_at 转录座位 -0.0268# 0.0191
1439595_at 1439595_at T细胞受体α链 -0.0272# 0.0194
1426620_at 1426620_at 碳水化合物磺基转移酶10 -0.0278# 0.0198
1454745_at 1454745_at Rho GTP酶活化蛋白29 -0.029# 0.0207
1439719_at 1439719_at RIKEN cDNA E430004N04基因 -0.0292# 0.0208
1435374_at 1435374_at 转录座位 -0.0302# 0.0216
1456678_at 1456678_at RIKEN cDNA 1700091G21基因 -0.0306# 0.0218
1423176_at 1423176_at ErbB-2.1的传感器 -0.0348# 0.0249
1424374_at 1424374_at GTP酶,IMAP家族成员4 -0.0355# 0.0253
1446614_at 1446614_at 二酰基甘油激酶ζ -0.0359# 0.0257
1448862_at 1448862_at 细胞间粘附分子2 -0.0365# 0.0261
1439036_a_at 1439036_a_at ATP酶,Na+/K+转运,β1多肽 -0.0375# 0.0268
1442023_at 1442023_at RIKEN cDNA A530030E21基因 -0.0376# 0.0269
1436182_at 1436182_at 富含特定AT序列结合蛋白1 -0.0385# 0.0275
 
1443703_at 1443703_at 转录座位 -0.0385# 0.0275
1422562_at 1422562_at 与糖尿病相关的Ras -0.0396# 0.0283
1454893_at 1454893_at RIKEN cDNA 1110013L07基因 -0.0402# 0.0287
1427831_s_at 1427831_s_at 锌指蛋白260 -0.0404# 0.0289
1452163_at 1452163_at E26鸟白血病致癌基因1,5'结构域 -0.0417# 0.0298
1421570_at 1421570_at 白介素9受体 -0.0431# 0.0308
1442998_at 1442998_at 胞嘧啶核苷5'-三磷酸合成酶2 -0.0437# 0.0312
1426452_a_at 1426452_a_at RAB30,RAS致癌基因家族成员 -0.0473# 0.0338
1431980_a_at 1431980_a_at 砷(+3氧化态)甲基转移酶 -0.0478# 0.0341
1456205_x_at 1456205_x_at 微管蛋白辅因子a -0.048# 0.0343
1441041_at 1441041_at RIKEN cDNA 2810407L07基因 -0.0491# 0.0351
1427418_a_at 1427418_a_at 低氧可诱导因子1,α亚基 -0.0492# 0.0351
1456502_at 1456502_at 双特异性酪氨酸-(Y)-磷酸化调节激酶2 -0.0502# 0.0358
1432229_a_at 1432229_a_at 染色体结构域蛋白,Y染色体样2 -0.0516# 0.0368
1453726_s_at 1453726_s_at RIKEN cDNA 2810407CO2基因 -0.0517# 0.0369
1440343_at 1440343_at 核糖体蛋白S6激酶,多肽5 -0.0519# 0.037
1435584_at 1435584_at 表达的序列AI662791 -0.0522# 0.0373
1419481_at 1419481_at 选择蛋白,淋巴细胞 -0.0524# 0.0374
1437907_a_a_at 1437907_a_at 微管蛋白辅因子a -0.0532# 0.038
1419192_at 1419192_at 白介素4诱导的1 -0.0554# 0.0395
1424936_a_at 1424936_a_at 动力蛋白,纤毛轴,重链8 -0.0562# 0.0402
1448931_at 1448931_at 组织凝血活酶II(凝血酶)受体样2 -0.0571# 0.0408
1423890_x_at 1423890_x_at ATP酶,Na+/k+转运,β1多肽 -0.0582# 0.0415
1458432_at 1458432_at 酪氨酸激酶接头蛋白的2-非催化区域 -0.0588# 0.042
1440217_at 1440217_at 类似于假定蛋白FLJ39743 -0.0593# 0.0424
1440647_at 1440647_at 信号诱导的增生相关1样1 -0.0596# 0.0426
1440284_at 1440284_at 转录座位 -0.0598# 0.0427
145769I_at 1457691_at 转录座位 -0.0614# 0.0439
1455256_at 1455256_at TRAF2和NCK相互作用激酶 -0.0625# 0.0447
1421628_at 1421628_at 白介素18受体1 -0.0635# 0.0454
1442045_at 1442045_at 16天婴儿胸腺cDNA,RIKEN全长富集文库,克隆:A130046K23产物:未知EST,全部插入序列 -0.0635# 0.0453
 
1452737_at 1452737_at RIKEN cDNA 2810008M24基因 -0.0673# 0.0481
1419480_at 1419480_at 选择蛋白,淋巴细胞 -0.0683# 0.0488
1459632_at 1459632_at 富含半胱氨酸的运动神经元 -0.0722# 0.0516
1427359_at 1427359_at RIKEN cDNA A630082K20基因 -0.0757# 0.0541
1426640_s_at 1426640_s_at tribbles同源物2(果蝇) -0.0783# 0.0559
1435754_at 1435754_at DNA片段,Chr6,Brigham&Women’sGenetics 1452表达的 -0.0791# 0.0565
1460204_at 1460204_at 细胞质酪氨酸激酶Dscr28C相关的(果蝇) -0.0803# 0.0574
1454897_at 1454897_at RIKEN cDNA 6330509M05基因 -0.0804# 0.0574
1449520_at 1449520_at 表达序列AI428795 -0.0813# 0.058
1421622_a_at 1421622_a_at Rap鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)4 -0.0841# 0.0601
1425245_a_t 1425245_a_at G蛋白信号的调节子11 -0.0842# 0.0602
1416008_at 1416008_at 富含特定AT序列结合蛋白1 -0.0847# 0.0605
1452009_at 1452009_at RIKEN cDNA 9130422G05基因 -0.0861# 0.0615
1445141_at 1445141_at κB激酶β的抑制子 -0.0875# 0.0625
1431169_at 1431169_at RIKEN cDNA D230012E17基因 -0.0878# 0.0627
1443192_at 1443192_at RIKEN cDNA E430004N04基因 -0.0882# 0.063
1428834_at 1428834_at 双特异性磷酸酶4 -0.091# 0.065
1423989_at 1423989_at RIKEN cDNA 2210010N04基因 -0.0914# 0.0653
1443573_at 1443573_at 聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成员1 -0.0916# 0.0654
1450061_at 1450061_at 外胚层神经皮层1 -0.0959# 0.0685
1452503_a_at 1452503_a_at 含布罗莫结构域和WD重复结构域的1 -0.0969# 0.0692
1451313_a_at 1451313_a_at RIKEN cDNA 1110067D22基因 -0.1008# 0.072
1437253_at 1437253_at RIKEN cDNA A630054L15基因 -0.1009# 0.072
1428726_at 1428726_at 含THUMP结构域的2 -0.1017# 0.0727
1451622_at 1451622_at 含LMBR1结合域的1 -0.103# 0.0736
1435456_at 1435456_at 表达的序列AI428795 -0.1035# 0.0739
1444181_at 1444181_at GTP酶,IMAP家族成员5 -0.1036# 0.074
1418762_at 1418762_at 衰变加速因子1 -0.1059# 0.0757
1423297_at 1423297_at 内收蛋白3(γ) -0.1071# 0.0765
1425518_at 1425518_at Rap鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)4 -0.1071# 0.0765
1427322_at 1427322_at 含布罗莫结构域和WD重复结构域的1 -0.1084# 0.0775
1426158_at 1426158_at T细胞受体,变体13 -0.1126# 0.0804
1416129_at 1416129_at RIKEN cDNA 1300002F13基因 -0.1139# 0.0814
1426550_at 1426550_at SID1跨膜家族成员1 -0.1143# 0.0817
1428510_at 1428510_at latrophilin 1 -0.1187# 0.0848
1456520_at 1456520_at RIKEN cDNA 9530033F24基因 -0.1202# 0.0859
1419212_at 1419212_at Icos配体 -0.126# 0.09
1437540_at 1437540_at --- -0.1261# 0.0901
 
1429969_at 1429969_at RIKEN cDNA 4833403J16基因 -0.13# 0.0929
1459722_at 1459722_at 含锌指、SWIM结构域的6 -0.13# 0.0928
1449642_at 1449642at EB病毒诱导基因2 -0.1319# 0.0942
1444283_at 1444283_at GTP酶,IMAP家族成员7 -0.1324# 0.0945
1434333_a_at 1434333_a_at 蛋白激酶D2 -0.1329# 0.0949
1453119_at 1453119_at 含OUT结合域的1 -0.1339# 0.0957
1421852_at 1421852_at 钾通道亚家族K成员5 -0.1385# 0.099
1425186_at 1425186_at 含LMBR1结构域的1 -0.1443# 0.103
1433977_at 1433977_at 硫酸类肝素(葡萄糖胺)3-O-磺基转移酶3B1 -0.1462# 0.1044
1436491_at 1436491_at RIKEN cDNA 5830431A10基因 -0.1518# 0.1084
1460242_at 1460242_at 衰变加速因子1 -0.1524# 0.1088
1445277_at 1445277_at 16天婴儿胸腺cDNA,RIKEN全长富集文库,克隆:A130006J10产物:未知EST,全部插入序列 -0.1527# 0.1091
1418497_at 1418497_at 成纤维细胞生长因子13 -0.1588# 0.1134
1455425_at 1455425_at 表达序列BB001228 -0.1632# 0.1166
1418998_at 1418998_at 犬尿氨酸3-单加氢酶(犬尿氨酸3-羟化酶) -0.1673# 0.1195
1452167_at 1452167_at RIKEN cDNA 2810407C02基因 -0.1698# 0.1213
1442266_at 1442266_at 表达序列AI662175 -0.1713# 0.1223
1439843_at 1439843_at 钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶IV -0.1732# 0.1237
1427752_a_at 1427752_a_at T细胞受体β,变体13///类似于TCRBV7S1///类似于TCRBV7S1 -0.1805# 0.1289
1451253_at 1451253_at 包含PX结构域的丝氨酸/苏氨酸激酶 -0.1819# 0.1299
1428669_at 1428669_at 脑表达的髓细胞组织增生致癌基因 -0.1862# 0.133
1434967_at 1434967_at 含锌指,SWIM结构域的6 -0.1869# 0.1335
1422231_a_at 1422231_a_at 肿瘤坏死因子受体超家族,成员25 -0.1906# 0.1361
1428914_at 1428914_at RIKEN cDNA 2310014D11基因 -0.1917# 0.1369
1434175_s_at 1434175_s_at RIKEN cDNA 2210010N04基因 -0.2013# 0.1438
1416268_at 1416268_at E26鸟白血病致癌基因2,3'域 -0.203# 0.145
1436851_at 1436851_at 蛋白激酶N1 -0.2037# 0.1455
1438862_at 1438862_at RIKEN cDNA A630005104基因 -0.2078# 0.1484
1448107_x_at 1448107_x_at 激肽释放酶6 -0.2085# 0.149
1424062_at 1424062_at 泛素缀合酶E2D,UBC4/5同源物(酵母) -0.2114# 0.151
1444003_at 1444003_at 肺可诱导的中和相关的C3HC4 RING域蛋白 -0.2133# 0.1524
 
1428267_at 1428267_at DEAH(Asp-Glu-Ala-His)框多肽40 -0.2217# 0.1584
1443906_at 1443906_at 衰变加速因子1 -0.2229# 0.1592
1420583_a_at 1420583_a_at RAR相关的孤儿基因受体 -0.2261# 0.1615
1420965_a_at 1420965_a_at 外胚层神经皮层1 -0.2282# 0.163
1446244_at 1446244_at DNA区段Chr 6,Brigham &Women's Genetics 1452表达的 -0.2305# 0.1647
1440900_at 1440900_at 成人胸腺cDNA,RIKEN全长富集文库,克隆:5830404C02产物:未知EST,全部插入序列 -0.2324# 0.166
1416958_at 1416958_at 核受体亚家族1,D组,成员2 -0.2348# 0.1677
1425832_a_at 1425832_a_at 趋化因子(C-X-C基序)受体6 -0.2391# 0.1708
1447792_x_at 1447792_x_at 成人胸腺cDNA,RIKEN全长富集文库,克隆:5830404C02产物:未知EST,全部插入序列 -0.2451# 0.1751
1429443_at 1429443_at copine IV ·0.2472# 0.1766
1455555_at 1455555_at 表达序列AV071699 -0.251# 0.1793
1415837_at 1415837_at 激肽释放酶6 -0.2687# 0.1919
1453568_at 1453568_at RIKEN cDNA 2310032F03基因 -0.2765# 0.1975
1452815_at 1452815_at 嘌呤能受体P2Y G蛋白偶联的10 -0.2789# 0.1992
1446412_at 1446412_at 含WW结构域的氧化还原酶 -0.2819# 0.2014
1448575_at 1448575_at 白介素7受体 -0.2862# 0.2044
1431050_at 1431050_at 核糖体蛋白S6激酶多肽5 -0.291# 0.2078
1448576_at 1448576_at 白介素7受体 -0.3125# 0.2232
1422812_at 1422812_at 趋化因子(C-X-C基序)受体6 -0.314# 0.2243
1437356_at 1437356_at EB病毒诱导基因2 -0.322# 0.23
1448613_at 1448613_at 脑外基质蛋白1 -0.3377# 0.2412
1433779_at 1433779_at 癌症易感候选者4 -0.4293# 0.3066
mir155mRNA标记:*表明在小鼠mir155中过表达的基因,#表明下表达的基因。分数是PAM分数(Tibshirani,R.J.,Hastie,T.J.,Narasimhan,B.,和Chu,G.(2002),"Diagnosis of multiplecancer types by shrunken centroids of gene expression,"Proceedings of the National Academy of Sciences,99,6567-6572)。“nearest shrunken centroids”的PAM方法,鉴定了最好表征mir155转基因的基因的亚类。PAM分数不是倍数变化。
表3.根据微阵列预测分析的(PAM)分类,Affymetrix微阵列数据描述了在mir155转基因小鼠中显著过表达的微小RNA的标记(5只转基因小鼠和6只野生型小鼠)。
名称                           miR155分数         wt分数
mmu-mir-151-prec               3.9218*            -2.2411
mmu-mir-217-precNo2            3.1565*            -1.8037
mmu-mir-224-precformer175No1   1.9286*            -1.1021
mmu-mir-194-prec               1.6021*            -0.9155
mmu-mir-201-prec               1.5653*            -0.8945
mmu-mir-155-prec               1.4967*            -0.8553
mmu-mir-218-2-precNo2          0.939*             -0.5365
mmu-mir-182-prec               0.4886*            -0.2792
mir155微小RNA标记:*表明在Eμ-mmu-miR155转基因小鼠中显著过表达的微小RNA。
这里引用的所有出版物的相关教导,其没有明确地引入作为参考,都以其全部内容引入这里作为参考。同时本发明尤其参考其优选实施方案说明和描述,本领域的普通技术人员应当理解,可以对本发明进行形式和细节的各种改变,而不背离附加的权利要求所包含的本发明的范围。

Claims (11)

1.一种生产转基因非人哺乳动物的方法,该方法包括将含有能指导在动物的B细胞中表达的至少一个转录调节序列的核酸构建体引入所述动物中,其中所述的转录调节序列包含VH启动子,并且与编码miR155基因产物的核酸可操作连接,该miR155基因产物是SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列,并且其中所述至少一个转录调节序列还包括Ig重链-Eμ增强子,其中所述动物是小鼠。 
2.权利要求1的方法,其中所述VH启动子来源于小鼠。 
3.权利要求1的方法,其中所述I g重链-Eμ增强子来源于小鼠。 
4.权利要求1-3中任一项的方法,其中相对于适合的对照,该动物的脾、骨髓或两者中具有扩大的B220low/CD19low/CD10low/IgM-/TCR-/CD43-淋巴样细胞群体。 
5.权利要求1-3中任一项的方法,其中所述动物显示淋巴组织增生疾病。 
6.权利要求5的方法,其中所述淋巴组织增生疾病是B细胞恶性肿瘤。 
7.权利要求6的方法,其中所述B细胞恶性肿瘤是白血病,淋巴瘤或赘生物。 
8.权利要求5的方法,其中所述淋巴组织增生疾病是白血病前期状况。 
9.权利要求1-3中任一项的方法,其中该动物显示扩大的B2201ow/CD191ow/CD101ow/IgM-/TCR-/CD43-淋巴样细胞群体、增大的腹部、脾肿大、骨髓取代、淋巴细胞减少和其组合。 
10.权利要求1的方法,其中所述核酸构建体包括β球蛋白基因的3’UTR和聚腺苷酸序列。 
11.权利要求6的方法,其中所述B细胞恶性肿瘤显示人急性淋巴母细胞性白血病,人淋巴母细胞性淋巴瘤或其组合的特征。 
CN2007800230938A 2006-04-24 2007-04-24 miR155转基因小鼠中前B细胞增殖和淋巴母细胞性白血病/高度淋巴瘤 Expired - Fee Related CN101472470B (zh)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US74545406P 2006-04-24 2006-04-24
US60/745,454 2006-04-24
PCT/US2007/009910 WO2007127190A2 (en) 2006-04-24 2007-04-24 Pre-b cell proliferation and lymphoblastic leukemia/high-grade lymphoma in mir155 transgenic mice

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN101472470A CN101472470A (zh) 2009-07-01
CN101472470B true CN101472470B (zh) 2013-07-24

Family

ID=38656133

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN2007800230938A Expired - Fee Related CN101472470B (zh) 2006-04-24 2007-04-24 miR155转基因小鼠中前B细胞增殖和淋巴母细胞性白血病/高度淋巴瘤

Country Status (7)

Country Link
US (1) US7667090B2 (zh)
EP (1) EP2023944A4 (zh)
JP (1) JP5127821B2 (zh)
CN (1) CN101472470B (zh)
AU (1) AU2007243475B2 (zh)
CA (1) CA2650026C (zh)
WO (1) WO2007127190A2 (zh)

Families Citing this family (43)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103866017B (zh) 2005-08-01 2016-05-25 俄亥俄州立大学研究基金会 用于乳腺癌的诊断、预后和治疗的基于MicroRNA的方法和组合物
US8481505B2 (en) 2005-09-12 2013-07-09 The Ohio State University Research Foundation Compositions and methods for the diagnosis and therapy of BCL2-associated cancers
US20090270484A1 (en) * 2005-10-05 2009-10-29 The Ohio State University Research Foundation WWOX Vectors and Uses in Treatment of Cancer
US7943318B2 (en) 2006-01-05 2011-05-17 The Ohio State University Research Foundation Microrna-based methods and compositions for the diagnosis, prognosis and treatment of lung cancer
EP1968622B1 (en) 2006-01-05 2014-08-27 The Ohio State University Research Foundation Microrna expression abnormalities in pancreatic endocrine and acinar tumors
ES2545118T3 (es) 2006-01-05 2015-09-08 The Ohio State University Research Foundation Métodos basados en microARN y composiciones para el diagnóstico y tratamiento de cánceres sólidos
ES2446362T3 (es) 2006-03-20 2014-03-07 The Ohio State University Research Foundation Huellas de microARN durante megacariocipoyesis humana
EP2436785B1 (en) 2006-07-13 2013-09-11 The Ohio State University Research Foundation MIR-29a for diagnosing poor survival prognosis colon adenocarcinoma.
ES2374446T3 (es) 2006-09-19 2012-02-16 The Ohio State University Research Foundation Expresión de tcl1 en la leucemia linfocítica crónica (llc) regulada por mir-29 y mir-181.
JP5501766B2 (ja) 2006-11-01 2014-05-28 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイション 肝細胞癌における生存および転移を予測するためのマイクロrna発現サイン
EP2109687B1 (en) 2007-01-31 2014-06-04 The Ohio State University Research Foundation Micro-rna-based methods for the treatment of acute myeloid leukemia
EP2142659A4 (en) * 2007-04-30 2010-06-09 Univ Ohio State Res Found METHOD FOR THE DISTINCTION OF PANCREATIC CANCER OF NORMAL IMMERSION SPECTRUM FUNCTIONS AND CHRONIC IMMERSION IMAGING IGNITION
AU2008262252B2 (en) 2007-06-08 2013-09-12 The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Methods for determining hepatocellular carcinoma subtype and detecting hepatic cancer stem cells
EP2167521A4 (en) 2007-06-15 2011-11-23 Univ Ohio State Res Found ALL-1 ONCOGEN FUSION PROTEINS TO TARGE TREATMENT OF MICRO-RNA REGULATED BY DROSHA
EP2808398A1 (en) 2007-07-31 2014-12-03 The Ohio State University Research Foundation Methods for reverting methylation by targeting DNMT3A and DNMT3B
AU2008283997B2 (en) 2007-08-03 2014-04-10 The Ohio State University Research Foundation Ultraconserved regions encoding ncRNAs
CN101836112A (zh) 2007-08-22 2010-09-15 俄亥俄州立大学研究基金会 用于在人急性白血病中诱导epha7和erk磷酸化的脱调节的方法和组合物
AU2008296022B2 (en) * 2007-09-06 2014-01-23 The Ohio State University Research Foundation MicroRNA signatures in human ovarian cancer
WO2009049129A1 (en) * 2007-10-11 2009-04-16 The Ohio State University Research Foundation Methods and compositions for the diagnosis and treatment of esphageal adenocarcinomas
CN102137927B (zh) 2007-10-26 2014-03-12 俄亥俄州立大学研究基金会 鉴定脆性组氨酸三联体(Fhit)相互作用的方法及其用途
JP2011505143A (ja) * 2007-11-30 2011-02-24 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイション マイクロrna発現プロファイリング及び肺癌における末梢血ターゲティング
CN104031984A (zh) * 2008-02-28 2014-09-10 俄亥俄州立大学研究基金会 用于前列腺相关病症的诊断、预后和治疗的基于微rna的方法和组合物
AU2009219193A1 (en) * 2008-02-28 2009-09-03 The Ohio State University Research Foundation MicroRNA signatures associated with human chronic lymphocytic leukemia (CCL) and uses thereof
WO2009152300A1 (en) 2008-06-11 2009-12-17 The Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Use of mir-26 family as a predictive marker of hepatocellular carcinoma and responsiveness to therapy
WO2011063382A1 (en) 2009-11-23 2011-05-26 The Ohio State University Materials and methods useful for affecting tumor cell growth, migration and invasion
JP5931050B2 (ja) * 2010-03-26 2016-06-08 ジ・オハイオ・ステート・ユニバーシティ miR−155によるミスマッチ修復およびゲノム安定性の調節に関連する材料および方法
JP2013534824A (ja) * 2010-06-24 2013-09-09 ジ・オハイオ・ステート・ユニバーシティ 標的化されたmiR−29発現によりマウスにおいてモデル化された慢性リンパ性白血病
AU2011326032B2 (en) 2010-11-12 2016-10-06 The Ohio State University Research Foundation Materials and methods related to microRNA-21, mismatch repair, and colorectal cancer
CN103313706A (zh) 2010-11-15 2013-09-18 俄亥俄州立大学研究基金会 控制释放粘膜粘合系统
KR101382219B1 (ko) * 2010-12-23 2014-04-08 경희대학교 산학협력단 미토콘드리아 기능 저하에 기인한 질환 동물 모델로서의 마이크로 알엔에이―24를 과발현한 형질전환 생쥐
CN102120038A (zh) * 2011-02-12 2011-07-13 华侨大学 一种可抑制转基因产物所致免疫反应的基因治疗药物及其制备方法
AU2012225506B2 (en) 2011-03-07 2016-11-17 The Ohio State University Mutator activity induced by microRNA-155 (miR-155) links inflammation and cancer
CA2852066A1 (en) 2011-10-14 2013-04-18 The Ohio State University Methods and materials related to ovarian cancer
AU2012352265B2 (en) 2011-12-13 2017-02-16 Ohio State Innovation Foundation Methods and compositions related to miR-21 and miR-29a, exosome inhibition, and cancer metastasis
EP2802207A4 (en) * 2012-01-13 2015-11-25 Advanced Genomic Technology Llc TRANSGENIC NON-HUMAN ANIMAL MODEL FOR ACCELERATED AGING AND / OR AGE-RELATED SYMPTOMS AND USE THEREOF
AU2013209477B2 (en) 2012-01-20 2016-12-08 The Ohio State University Breast cancer biomarker signatures for invasiveness and prognosis
WO2016085876A1 (en) 2014-11-25 2016-06-02 The Broad Institute Inc. Clonal haematopoiesis
WO2016086197A1 (en) 2014-11-25 2016-06-02 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Method of identifying and treating a person having a predisposition to or afflicted with a cardiometabolic disease
WO2016164558A1 (en) * 2015-04-07 2016-10-13 Children's Medical Center Corporation Methods and compositions relating to an embryonic stem cell-based tumor model
CN106754699B (zh) * 2016-12-22 2020-01-31 朗姿赛尔生物科技(广州)有限公司 miRNA-155及其抑制剂在DC-CIK细胞培养方面的应用
CN107760765A (zh) * 2017-11-29 2018-03-06 河南农业大学 一种检测猪add2基因表达量的方法及应用
CN112574994B (zh) * 2020-12-17 2023-10-24 河南牧业经济学院 一种筛选猪miR-155基因启动子活性区域及转录调控元件的方法
WO2024047115A1 (en) 2022-09-02 2024-03-07 Leibniz-Institut Für Immuntherapie (Lit) THERAPEUTIC USE OF THE miR155 SNP rs377265631

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
P.Mathijs Voorhoeve et al.A Genetic Screen Implicates miRNA-372 and miRNA-373 As Oncogenes in Testicular Germ Cell Tumors.《CELL》.2006,第124卷1169-1181. *
Robertra Bichi et al.Human chronic lymphocytic leukemia modeled in mouse by targeted TCL1 expression.《PNAS》.2002,第99卷(第10期),6955-6960. *

Also Published As

Publication number Publication date
EP2023944A2 (en) 2009-02-18
US7667090B2 (en) 2010-02-23
WO2007127190A3 (en) 2008-04-17
CA2650026A1 (en) 2007-11-08
WO2007127190A2 (en) 2007-11-08
AU2007243475B2 (en) 2013-02-07
JP5127821B2 (ja) 2013-01-23
CN101472470A (zh) 2009-07-01
US20090222934A1 (en) 2009-09-03
AU2007243475A1 (en) 2007-11-08
EP2023944A4 (en) 2011-10-05
JP2009534051A (ja) 2009-09-24
CA2650026C (en) 2013-01-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN101472470B (zh) miR155转基因小鼠中前B细胞增殖和淋巴母细胞性白血病/高度淋巴瘤
Kaya et al. Lysophosphatidic acid-mediated GPR35 signaling in CX3CR1+ macrophages regulates intestinal homeostasis
Hartman et al. The role of the Birt–Hogg–Dubé protein in mTOR activation and renal tumorigenesis
Gwack et al. Hair loss and defective T-and B-cell function in mice lacking ORAI1
Gimeno et al. Targeted deletion of fatty acid transport protein-4 results in early embryonic lethality
CN104039960B (zh) 用于治疗和诊断与五羟色胺‑、肾上腺素‑、去甲肾上腺素‑、谷氨酸‑和促肾上腺皮质素释放激素相关的病症的微rna和包含微rna的组合物
CN1354657A (zh) 用egf-r拮抗剂防止气道粘液的过量产生
CN1653080A (zh) 淋巴管和血管的内皮细胞基因
Bartkowska et al. Adult neurogenesis in the hedgehog (Erinaceus concolor) and mole (Talpa europaea)
CN102282162A (zh) 用于增强dna修复的物质和组合物及使用方法
WO2006095559A1 (ja) 造血因子としてのFgf21の使用
Karimi et al. Detection of selection signatures for response to Aleutian mink disease virus infection in American mink
Bird et al. cAMP response element binding protein is required for differentiation of respiratory epithelium during murine development
Cheng et al. Aquaporin 9 represents a novel target of chronic liver injury that may antagonize its progression by reducing lipotoxicity
Zhang et al. Hepcidin gene silencing ameliorated inflammation and insulin resistance in adipose tissue of db/db mice via inhibiting METs formation
Smith et al. Expression of pregnancy-specific genes in preneoplastic mouse mammary tissues from virgin mice
Han et al. Loss of RNA-binding protein HuR leads to defective ependymal cells and hydrocephalus
CN101466410A (zh) 新型治疗和诊断产品及方法
Buggiotti et al. Comparison of the transcriptome in circulating leukocytes in early lactation between primiparous and multiparous cows provides evidence for age-related changes
Cui et al. A functional polymorphism of inhibin alpha subunit at miR-181b-1-3p-binding site regulates proliferation and apoptosis of chicken ovarian granular cells
Jia et al. Peroxisome proliferator-activated receptor-binding protein null mutation results in defective mammary gland development
US20180023087A1 (en) Screening Method For Compound Having Obesity Preventive Or Therapeutic Activity
WO2021134842A1 (zh) Zc3h12b基因或蛋白的用途及一种肝脏疾病动物模型的建立方法
Etayo et al. The thymus and T-cell ontogeny in ballan wrasse (Labrus bergylta) is nutritionally modelled
KR102199911B1 (ko) 태반 기능 평가용 바이오마커, 동물모델 및 이를 이용한 태반 기능 평가 방법

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20130724

Termination date: 20200424

CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee