该申请于2005年9月13日作为PCT国际专利申请提交,申请人为美国国有公司Pharmasset,Inc.,Byoung-Kwon Chun(韩国公民)、Peiyuan Wang(中国公民),该申请要求于2004年9月14日提交的美国临时专利申请第60/609,783号、于2004年9月15日提交的美国临时专利申请第60/610,035号、于2005年3月29日提交的美国临时专利申请第60/666,230号的优先权,这些专利申请全文参考结合于本文。
发明领域
本发明提供(i)制备2-脱氧-2-氟-2-甲基-D-核糖酸内酯(ribonolactone)衍生物的方法,(ii)将中间体内酯转化为具有潜在抗HCV活性的核苷和其类似物,和(iii)由预形成的,优选是天然生成的核苷制备含2′-脱氧-2′-氟-2′-C-甲基-β-D-呋喃核糖基核苷的抗HCV核苷的方法。
发明背景
HCV感染已经在世界范围内流行,受感染病患承受巨大的痛苦。目前,还没有普遍有效地治疗该感染的措施,仅有的用于治疗慢性丙型肝炎的药物是各种形式的α干扰素(IFN-α),它们单独使用或与病毒唑组合使用。但是,这些治疗措施的治疗价值由于副作用而被大大减低,因此迫切需要开发其它用于治疗的供选择方案。
HCV是黄病毒科(Flaviviridae)的一种小的、有包膜的病毒,其在核衣壳中具有约9.6kb的阳性单链RNA基因组。该基因组含有一个编码刚大于3,000个氨基酸的多蛋白的可读框(ORF),切割该多蛋白可得到成熟的结构与非结构病毒蛋白质。ORF的侧翼是对RNA翻译和复制重要的长度为几百个核苷酸的5’和3’非翻译区(NTR)。翻译的多蛋白在N末端含有结构核心(C)与包膜蛋白(E1、E2、p7),其后是非结构蛋白(NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A、NS5B)。利用宿主信号肽酶切割得到成熟的结构蛋白。NS2/NS3蛋白酶自催化切割NS2 与NS3之间的连接处,而与NS4A形成复合体的NS3的N-末端丝氨酸蛋白酶结构域切割其余四个连接处。NS3蛋白也具有能在复制期间使双螺旋RNA解旋的NTP依赖性的解旋酶活性。NS5B蛋白具有对病毒复制关键的RNA依赖性的RNA聚合酶(RDRP)活性。与HBV或HIV不同,本文强调的是HCV的复制不涉及DNA。
美国专利公开(US 2005/0009737A1)揭示了1-(2-脱氧-2-氟-2-C-甲基-β-D-呋喃核糖基)胞嘧啶(14)是有效的且选择性的抗HCV剂。该化合物最初的合成步骤(方案1-3)的效率非常低,总产率也很低,不能适应大规模生产。
方案1
方案2
方案3
从D-木糖、胞苷或尿苷制备(2’R)-2’-脱氧-2’-氟-2’-C-甲基核苷和其类似物的现有公知的方法是使用DAST或
用于关键的氟化反应。但是, DAST和
对于工业合成而言都很贵且存在危险,经常提供不可靠的结果。因此,这些三氟化烷基氨基硫(alkylaminosulfur trifluoride)不适用于工业生产。
作为寻找更好的氟化条件所做出的努力的一部分,已经发现用非-三氟化烷基氨基硫的氟化剂使环硫酸酯开环是合成抗HCV核苷,即(2’R)-2’-脱氧-2’-氟-2’-C-甲基胞苷的较好方法。此外,发现这种新颖的合成路线也适合于其它核苷,包括抗HCV核苷、D-2-脱氧-2-氟-胞苷(Devos等,美国专利第6,660,721号)、抗HBV核苷、D和L-2’,3’-二脱氢-2’,3’-二脱氧-2’-氟-核苷(Schinazi等,美国专利6,348,587)(图3的I和II)以及其它2’-取代的核苷,如D-和L-FMAU(Su等,J Med.Chem,1986,29,151-154;Chu,等,美国专利第6,512,107号)。
需要一种新颖且廉价的合成具有抗HCV活性的2’-C-烷基-2’-脱氧-2’-取代-D-吡喃核糖基核苷的方法。
发明概述
本文中揭示的本发明涉及用于制备下面通式[I]和[II]表示的化合物的各种中间体和合成方法,
式中
X是卤素(F、Cl、Br),
Y是N或CH,
Z是卤素、OH、OR’、SH、SR’、NH2、NHR’或R’,
R2’是C1-C3烷基、乙烯基或乙炔基;
R3’和R5’可以相同或不同,是H、烷基、芳烷基、酰基、环状缩醛,如2’,3’-O-异亚丙基或2’,3-O-亚苄基或2’,3’-环状碳酸酯。
R2、R4和R5独立地是H、卤素(包括F、Cl、Br、I)、OH、OR’、SH、SR’、N3、NH2、NHR’、NR’2、NHC(O)O R′、C1-C6低级烷基、卤化(F、Cl、Br、I)的C1-C6低级烷基(如CF3和CH2CH2F)、C2-C6低级烯基(如CH=CH2)、卤化(F、Cl、Br、I)的C2-C6低级烯基(如CH=CHCl,CH=CHBr和CH=CHI)、C2-C6低级炔基(如C≡CH)、卤化(F、Cl、Br、I)的C2-C6低级炔基、C1-C6低级烷氧基(如CH2OH和CH2CH2OH)、卤化(F、Cl、Br,I)的C1-C6低级烷氧基、CO2H、CO2R’、CONH2、CONHR’、CONR’2、CH=CHCO2H、CH=CHCO2R’;
R’是任选取代的C1-C12烷基或酰基(特别是当烷基是氨基酸的残基时)、环烷基、任选取代的C2-C6炔基、任选取代的C2-C6低级烯基或任选取代的酰基。
发明详述
目前没有抵抗黄病毒(包括丙型肝炎病毒(HCV)、登革热病毒(DENV)、西尼罗病毒(WNV)或黄热病病毒(YFV))感染的方法。唯一被认可的治疗方法是单独使用α干扰素或使用α干扰素和核苷病毒唑的组合来治疗HCV感染,但是这些治疗措施的治疗价值由于副作用而大大降低。最近发现一类核苷,包括2′-脱氧-2′-氟代-2′-C-甲基胞苷,对抵抗复制子体系中复制HCV表现出有效且有选择的活性。但是,这类核苷以及类似核苷化合物合成的难度阻碍了开发治疗黄病毒感染的临床药物所必需进行的生物物理、生物化学、药理学评估。
本发明提供一种有效地制备含2-脱氧-2-氟-2-C-甲基-D-呋喃核糖基部分的核苷和中间体的方法。
定义
文中所用的术语“独立地”是指独立应用的变量可以根据应用的不同而独立地变化。因此,在如RaXYRa之类的化合物中,其中Ra“独立地是碳或氮”,则两个Ra都可以是碳,两个Ra都可以是氮,或者一个Ra可以是碳而另一个Ra是氮。
文中所用的术语“对映(异构)体纯的”或“富含对映(异构)体的”是指一种核苷组合物,该组合物中所述核苷的一种对映体的含量至少约为95%,优选约为97%、98%、99%或100%。
文中所用的术语“基本上不含”或“基本上不存在”是指一种核苷组合物,该组合物中所述核苷的指定对映体的含量至少为85重量%或90重量%,优选 为95-98重量%,甚至更优选为99-100重量%。在一个优选的实施方式中,在本发明的方法和化合物中,所述化合物基本上不含有多种对映体。
除非另有指示,文中所用的术语“烷基”是指通常为C1-C10的饱和直链或支链的烃链,具体包括:甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、叔丁基、戊基、异戊基、新戊基、己基、异己基、环己基、环己基甲基、3-甲基戊基、2,2-二甲基丁基和2,3-二甲基丁基等。该术语包括取代和未取代的烷基。烷基可任选被一个或多个选自以下的部分取代:羟基、氨基、烷基氨基、芳基氨基、烷氧基、芳氧基、硝基、氰基、磺酸、硫酸酯、膦酸、磷酸酯或膦酸酯。连接在烷基碳原子上的一个或多个氢原子可以被一个或多个卤素原子(例如,氟或氯,或氟和氯同时)替代,如三氟甲基、二氟甲基、氟氯甲基等。烃链还可以被如N、O或S之类的杂原子中断。
除非另有指示,文中所用的术语“低级烷基”是指C1-C4饱和直链或支链烷基,包括如上所定义的取代和未取代形式。除非在本申请中另有具体说明,当烷基是合适部分时,优选低级烷基。同样,当烷基或低级烷基是合适部分时,优选未取代的烷基或低级烷基。
除非另有指示,文中所用的术语“环烷基”是指具有3-8个、优选3-6个碳原子的饱和烃环,如环丙基、环丁基、环戊基和环己基。环烷基的环上原子也可以被烷基如环丙基甲基等取代。
术语“烷基氨基”或“芳基氨基”分别指具有一个或两个烷基或芳基取代基的氨基。
除非另有指示,文中所用的术语“保护的”是指添加到氧、氮或磷原子上以防止该原子进一步反应或出于其它目的的基团。有机合成领域的技术人员已经知道了许多氧和氮保护基团。非限制性的例子包括:C(O)-烷基、C(O)Ph、C(O)芳基、CH3、CH2-烷基、CH2-烯基、CH2Ph、CH2-芳基、CH2O-烷基、CH2O-芳基、SO2-烷基、SO2-芳基、叔丁基二甲基甲硅烷基、叔丁基二苯基甲硅烷基和1,3-(1,1,3,3-四异丙基亚甲硅醚基(disiloxanylidene))。
除非另有指示,文中所用的术语“芳基”指苯基、联苯基或萘基,优选的是苯基。该术语包括取代和未取代的部分。芳基可以被一个或多个取代基取代,所述取代基包括但不限于:羟基、卤代、氨基、烷基氨基、芳基氨基、烷氧基、芳氧基、硝基、氰基、磺酸、硫酸酯、膦酸、磷酸酯或膦酸酯,这些取 代基可以是未保护的,或者根据需要用本领域技术人员已知方法进行保护,例如参见T.W.Greene和P.G.M.Wuts在″Protective Groups in Organic Synthesis,″第三版,John Wiley&Sons,1999中所述。
术语“烷芳基”或“烷基芳基”指具有芳基取代基的烷基。术语“芳烷基”或“芳基烷基”指具有烷基取代基的芳基,例如,苄基。
文中所用的术语“卤代”包括氯代、溴代、碘代和氟代。
术语“酰基酯”或“O-连接的酯”指通式为C(O)R′的羧酸酯,其中酯基的非羰基部分R′是直链或支链烷基或环烷基或低级烷基;烷氧基烷基包括甲氧基甲基;芳烷基包括苄基;芳氧基烷基如苯氧基甲基;芳基包括苯基,可任选地被卤素(F、Cl、Br、I)、C1-C4烷基或C1-C4烷氧基取代;磺酸酯,诸如烷基或芳烷基磺酰基,包括甲磺酰基;单磷酸酯、二磷酸酯或三磷酸酯;三苯甲基或一甲氧基三苯甲基;取代苄基;三烷基甲硅烷基(例如二甲基叔丁基甲硅烷基)或二苯基甲基甲硅烷基。酯基中的芳基最好包括苯基。
术语“酰基”指通式为R″C(O)-的基团,其中R″是直链或支链烷基或环烷基;氨基酸;芳基,包括苯基;烷基芳基;芳烷基,包括苄基;烷氧基烷基,包括甲氧基甲基;芳氧基烷基,诸如苯氧基甲基;或任选地被氯、溴、氟、碘、C
1-C
4烷基或C
1-C
4烷氧基取代的烷基(包括低级烷基)、芳基(包括苯基);磺酸酯,诸如烷基或芳烷基磺酰基,包括甲磺酰基;单磷酸酯、二磷酸酯或三磷酸酯;三苯甲基或一甲氧基三苯甲基;取代苄基;烷芳基;芳烷基,包括苄基;烷氧基烷基,包括甲氧基甲基;芳氧基烷基,诸如苯氧基甲基。酯中的芳基最好包括苯基。具体地,酰基包括乙酰基、三氟乙酰基、甲基乙酰基、环丙基乙酰基、环丙基羧基、丙酰基、丁酰基、异丁酰基、己酰基、庚酰基、辛酰基、新庚酰基、苯基乙酰基、2-乙酰氧基-2-苯基乙酰基、二苯基乙酰基、α-甲氧基-α-三氟甲基-苯基乙酰基、溴乙酰基、2-硝基-苯乙酰基、4-氯-苯乙酰基、2-氯-2,2-二苯基乙酰基、2-氯-2-苯基乙酰基、三甲基乙酰基、氯代二氟乙酰基、全氟乙酰基、氟乙酰基、溴代二氟乙酰基、甲氧基乙酰基、2-噻吩乙酰基、氯磺酰基乙酰基、3-甲氧基苯基乙酰基、苯氧基乙酰基、叔丁基乙酰基、三氯乙酰基、一氯乙酰基、二氯乙酰基、7H-十二氟庚酰基、全氟庚酰基、7H-十二氟庚酰基、7-氯-十二氟庚酰基、7-氯-十二氟庚酰基、7H-十二氟庚酰基、7H-十二氟庚酰基、九氟-3,6-二氧杂庚酰基、九氟-3,6-二氧杂庚酰基、全氟庚酰基、甲氧基苯甲酰基、甲基3-氨基-5-苯基噻吩-2-羧基、3,6-二氯-2-甲氧基-苯甲酰基、 4-(1,1,2,2-四氟-乙氧基)-苯甲酰基、2-溴-丙酰基、ω-氨基辛酰基(capryl)、癸酰基、正十五烷酰基、硬脂酰基、3-环戊基-丙酰基、1-苯-羧基、O-乙酰基扁桃基(mandelyl)、新戊酰基乙酰基、1-金刚烷-羧基、环己烷-羧基、2,6-吡啶二羧基、环丙烷-羧基、环丁烷-羧基、全氟环己基羧基、4-甲基苯甲酰基、氯甲基异
唑基羰基、全氟环己基羧基、巴豆酰基、1-甲基-1H-吲唑-3-羰基、2-丙烯基、异戊酰基、1-吡咯烷羰基、4-苯基苯甲酰基。当使用术语酰基时,具体指乙酰基、三氟乙酰基、甲基乙酰基、环丙基乙酰基、丙酰基、丁酰基、异丁酰基、己酰基、庚酰基、辛酰基、新庚酰基、苯基乙酰基、二苯基乙酰基、ct-三氟甲基-苯基乙酰基、溴乙酰基、4-氯-苯乙酰基、2-氯-2,2-二苯基乙酰基、2-氯-2-苯基乙酰基、三甲基乙酰基、氯代二氟乙酰基、全氟乙酰基、氟乙酰基、溴代二氟乙酰基、2-噻吩乙酰基、叔丁基乙酰基、三氯乙酰基、一氯乙酰基、二氯乙酰基、甲氧基苯甲酰基、2-溴-丙酰基、癸酰基、正十五烷酰基、硬酯酰基、3-环戊基-丙酰基、1-苯-羧基、新戊酰基乙酰基、1-金刚烷-羧基、环己烷-羧基、2,6-吡啶二羧基、环丙烷-羧基、环丁烷-羧基、4-甲基苯甲酰基、巴豆酰基、1-甲基-1H-吲唑-3-羰基、2-丙烯基、异戊酰基、4-苯基苯甲酰基。
术语“低级酰基”指其中如上所定义的R″是低级烷基的酰基。
术语“天然核碱(nucleic base)”和“改性的核碱”指按照下面定义的“嘌呤”或“嘧啶”碱。
术语“嘌呤”或“嘧啶”碱包括但不限于:腺嘌呤、N6-烷基嘌呤、Nb-酰基嘌呤(其中,酰基是C(O)(烷基、芳基、烷基芳基或芳基烷基)、N6-苄基嘌呤、N6-卤代嘌呤、N6-乙烯基嘌呤、N6-炔属嘌呤、N6-酰基嘌呤、N6-羟基烷基嘌呤、N6-烯丙基氨基嘌呤、N6-硫代烯丙基嘌呤、N2-烷基嘌呤、N2-烷基-6-硫代嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶、5-氟胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、6-氮杂嘧啶(包括6-氮杂胞嘧啶)、2-和/或4-巯基嘧啶、尿嘧啶、5-卤代尿嘧啶(包括5-氟尿嘧啶)、C5-烷基嘧啶、C5-苄基嘧啶、C5-卤代嘧啶、C5-乙烯基嘧啶、C5-炔属嘧啶、C5-酰基嘧啶、N4-乙酰基胞嘧啶、N4-苯甲酰基胞嘧啶、N4烷基嘧啶、C5-羟基烷基嘌呤、C5-酰氨基嘧啶、C5-氰基嘧啶、C5-碘嘧啶、C6-碘-嘧啶、C5-Br-乙烯基嘧啶、C6-Br-乙烯基嘧啶、C5-硝基嘧啶、C5-氨基-嘧啶、N2-烷基嘌呤、N2-烷基-6-硫代嘌呤、5-氮杂胞苷基(azacytidinyl)、5-氮杂尿嘧啶基、三唑并吡啶基(triazolopyridinyl)、咪唑并吡啶基、吡咯并嘧啶基(pyrrolopyrimidinyl)和吡唑并嘧啶基。嘌呤碱包括但不限于:鸟嘌呤、腺嘌呤、次黄嘌呤、2,6-二氨基嘌呤 和6-氯嘌呤。这类碱上的官能氧和氮基团可根据需要或要求得到保护。合适的保护基为本领域技术人员熟知,包括:三甲基甲硅烷基、二甲基己基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基和叔丁基二苯基甲硅烷基、三苯甲基、烷基和酰基,如乙酰基和丙酰基、甲磺酰基和p-甲苯磺酰基。
术语“氨基酸”包括天然形成和合成的α、β、γ或δ氨基酸,包括但不限于:蛋白质中发现的氨基酸,即甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸、苯基丙氨酸、色氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、天冬氨酸盐、谷氨酸盐、赖氨酸、精氨酸和组氨酸。在一个优选的实施方式中,氨基酸是L-构型。或者,氨基酸可以是以下物质的衍生物:丙氨酰、缬氨酰、亮氨酰、异亮氨酰、脯氨酰、苯基丙氨酰、色氨酰、甲硫氨酰、甘氨酰、丝氨酰、苏氨酰、半胱氨酰、酪氨酰、天冬酰胺酰、谷氨酰胺酰、天冬氨二酰、戊二酸单酰(glutaroyl)、赖氨酰、精氨酰、组氨酰、β-丙氨酰、β-缬氨酰、β-亮氨酰、β-异亮氨酰、β-脯氨酰、β-苯基丙氨酰、β-色氨酰、β-甲硫氨酰、β-甘氨酰、β-丝氨酰、β-苏氨酰、β-半胱氨酰、β-酪氨酰、β-天冬酰胺酰、β-谷氨酰胺酰、β-天冬氨二酰、β-戊二酸单酰、β-赖氨酰、β-精氨酰或β-组氨酰。当使用术语氨基酸时,认为该术语具体独立地指D和L-构型的α、β、γ或δ甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸、苯基丙氨酸、色氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、天冬氨酸盐、谷氨酸盐、赖氨酸、精氨酸和组氨酸的酯。
在说明书中通篇使用的术语“药学上可接受的盐或药物前体”来描述在对病患给药后提供活性化合物的化合物的任何药学上可接受的形式(例如,酯、磷酸酯、酯或相关基团的盐)。药学上可接受的盐包括衍生自药学上可接受的无机或有机的碱和酸的物质。合适的盐包括衍生自碱金属(诸如钾和钠)、碱土金属(诸如钙和镁)以及药学领域中众所周知的许多其它酸的盐。当形成包含氮原子时,药学上可接受的盐还可以是酸加成盐。这类盐还可以衍生自药学上可接受的无机酸或有机酸,如盐酸、硫酸、磷酸、乙酸、柠檬酸、酒石酸等。药学上可接受的药物前体指能在寄主中发生代谢变化(例如水解或氧化)形成本发明化合物的化合物。药物前体的典型例子包括在活性化合物的官能部分具有生物学上易变的保护基团的化合物。药物前体包括能够氧化、还原、氨化、脱氨化、羟基化、脱羟基化、水解、脱水、烷基化、脱烷基化、酰化、脱酰化、磷酸化、脱磷酸化,从而产生活性化合物的化合物。
申请人开发了一种合成2-C-烷基-2-脱氧-2-取代的-D-呋喃核糖衍生物的新颖的能有效实施的方法,该化合物是在使用手性催化剂或者不使用手性催化剂条件下制备14(方案1)及其衍生物和类似物的关键中间体。合成14的关键步骤是使用手性催化剂将41不对称转化为42(方案4)。前面揭示的合成42的方法需要Sharpless AD催化剂,如二氢奎尼定(DHQD)及其衍生物。文中揭示的本发明涉及使用锇、锇酸盐或高锰酸盐但没有手性催化剂下由41立构有择(stereoselective)制备42。本发明的申请人还开发了以高度有规立构和区域选择的方式利用环硫酸酯50的亲核开环,由42合成49的有效可实施的方法(方案6)。在方案4、5和6中所示的方法是目前选择用于预备合成14和相关衍生物的方法。
方案4
方案5
方案6
(i)应为甲硅烷基化碱/Vorbruggen条件。
I.化合物的制备
(i)合成环亚硫酸酯(IIIa)和环硫酸酯(IIIb)
本发明涉及按照高度有规立构和区域选择的方式,采用通过结构式IV内酯,使结构式III的环亚硫酸酯IIIa(X=SO)、环硫酸酯IIIb(X=SO2)亲核开环,制备通式IB和IB-L-表示的2’-F-核苷和其它2’-取代的核苷。
式中,结构式IB、IB-L、III、IV具有以下含义:
R1独立地是(C1-C6)低级烷基,包括但不限于:甲基、乙基、任选取代的苯基、任选取代的苄基;或者R1是环亚烷基的一部分,包括形成环戊基或环己基(cyclic hexanyl)的亚乙基(-CH2CH2-)或三亚甲基(-CH2CH2CH2-);
R2、R3独立地是氢,(C1-C6)低级烷基,包括但不限于甲基、羟基甲基、甲氧基甲基、卤代甲基(包括但不限于氟甲基)、乙基、丙基,任选取代的乙烯基,包括但不限于乙烯基、卤代乙烯基(F-CH=C),任选取代的乙炔基,包括但不限于卤代乙炔基(F-C≡C),任选取代的烯丙基,包括但不限于卤代烯丙基(FHC=CH-CH2-);
R4独立地是氢,芳基(包括但不限于苯基),芳基烷基(包括但不限于苄基),低级烷基,包括但限于甲基、乙基、丙基。Nu是卤素(F、Cl、Br),N3,CN,NO3,CF3、OR或NR,其中R是酰基,包括但不限于乙酰基、苯甲酰基,芳基烷基(包括但不限于苄基),低级烷基,包括但不限于甲基、乙基、丙基、CH2R,其中R是氢、低级烷基(包括但不限于甲基、乙基、丙基);
X是SO2、SO或CO;
B是天然或改性的核碱。
在一个实施方式中,结构式IB如下:
式中,
R2,R3独立地是氢,(C1-C6)低级烷基,包括但不限于甲基、羟基甲基、甲氧基甲基、卤代甲基(包括但不限于氟甲基)、乙基、丙基,任选取代的乙烯基,包括但不限于乙烯基、卤代乙烯基(F-CH=C),任选取代的乙炔基,包括但不限于卤代乙炔基(F-C≡C),任选取代的烯丙基,包括但不限于卤代烯丙基(FHC=CH-CH2-);
B是天然或改性的核碱。
文中揭示的本发明涉及合成下面通式42B表示的2-烷基-4,5-二-O-保护的-2,3-二羟基-戊酸酯的化合物的方法,该化合物是合成通式[I]和[II](下面)抗HCV核苷的重要中间体。
式中,R′,R”=异亚丙基、亚苄基或亚环己基或类似基团,或是环状基团的一部分,包括分别形成环戊基或环己基(cyclohexanyl)的亚乙基(-CH2CH2-)或三亚甲基(-CH2CH2CH2-);R′和R”可独立地是C1-C6低级烷基或C6-C20芳基、苄基和其它任选取代的苄基、三烷基甲硅烷基、叔丁基-二烷基甲硅烷基、叔丁基二苯基甲硅烷基、TIPDS、THP、MOM、MEM和其它任选的醚保护基;或H、乙酰基、苯甲酰基和其它任选取代的酰基(R′和R”是-C(O)-R,其中R可以是C1-C6低级烷基或C6-C20芳基、苄基或其它任选取代的苄基);
R1、R2独立地是氢,(C6-C20)芳基和(C1-C6)低级烷基,包括甲基、羟基甲基、甲氧基甲基、卤代甲基(包括氟甲基)、乙基、丙基,任选取代的乙烯基,包括乙烯基、卤代乙烯基(F-CH=C),任选取代的乙炔基,包括卤代乙炔基(F-C≡C),任选取代的烯丙基,包括卤代烯丙基(FHC=CH-CH2-);和
R3独立地是氢,芳基(包括苯基),芳基烷基(包括但不限于苄基),(C1-6)低级烷基,包括甲基、乙基或丙基。
文中揭示的本发明还涉及以下通式49B表示的化合物的制备方法,该化合物由通式[42B]表示的2-烷基-4,5-二-O-保护的-2,3-二羟基-戊酸酯衍生物制备。
式中,R3和R5可以独立地是H、CH3、Ac、Bz、新戊酰基(pivaloyl)或4-硝基苯甲酰基、3-硝基苯甲酰基、2-硝基苯甲酰基、4-氯苯甲酰基、3-氯苯甲酰基、2-氯苯甲酰基、4-甲基苯甲酰基、3-甲基苯甲酰基、2-甲基苯甲酰基、对苯基苯甲酰基和其它任选取代的酰基(R3和R5是-C(O)-R,R可以独立地是C1-C6低级烷基或C6-C20芳基、苄基、4-甲氧基苄基和其它任选取代的苄基(R3和R5可以独立地是C6-C20芳基)、三苯甲基、三烷基甲硅烷基、叔丁基-二烷基甲硅烷基、叔丁基二苯基甲硅烷基、TIPDS、THP、MOM、MEM和其它任选醚保护基(R3和R5可以独立地是C1-C10烷基,或者,R3和R5通过-SiR2-O-SiR2-或-SiR2-相连,其中R是低级烷基,如Me、Et、n-Pr或i-Pr。
式中,
X是卤素(F、Cl、Br),
Y是N或CH,
Z是卤素、OH、OR′、SH、SR′、NH2、NHR′或R′,
R2′是C1-C3烷基、乙烯基或乙炔基,
R3′和R5′可以相同或不同,是H、烷基、芳烷基、酰基、环状缩醛,如2′,3′-O-异亚丙基或2′,3-O-亚苄基,或2′,3′-环碳酸酯。
R2、R4、R5和R6独立地是H,卤素,包括F、Cl、Br、I,OH,OR′,SH,SR′,N3,NH2,NHR′,NR”,NHC(O)OR′,C1-C6低级烷基,卤化(F、Cl、Br、I)C1-C6低级烷基,如CF3和CH2CH2F,C2-C6低级烯基,如CH=CH2,卤化(F、Cl、Br、I)C2-C6低级烯基,如CH=CHCl、CH=CHBr和CH=CHI,C2-C6低级炔基,如C≡CH,卤化(F、Cl、Br、I)C2-C6低级炔基,C1-C6低级烷氧基,如CH2OH和CH2CH2OH,卤化(F、Cl、Br、I)C1-C6低级烷氧基,CO2H,CO2R′,CONH2,CONHR′,CONR′2,CH=CHCO2H,CH=CHCO2R′;和
R′和R”是相同或不同,是任选取代的C1-C12烷基(特别当所述烷基是氨基酸的残基时)、环烷基、任选取代的C2-C6炔基,任选取代的C2-C6低级烯基或任选取代的酰基。
环硫酸酯50(方案6)与氟化四乙铵或氟化四甲铵51(方案6)以高度有规立构和区域选择的方式反应,定量产生氟化硫酸酯。酸催化的环化反应后,高产率形成2-氟-2-C-甲基-γ-核糖酸内酯53。
本发明是基于这种发现,并提供采用本文所述反应制备2’-脱氧-2’-取代的核苷I和II的方法。
(2S,3R,4R)-4,5-O-亚烷基-2-二甲基-2,3,4,5-四羟基-2-甲基-戊酸乙酯(42B)可以通过在使用手性催化剂或不使用手性催化剂条件下对维悌希产物41的不对称二羟基化(AD)或立构有择二羟基化来制备。而维悌希产物41能容易地由保护的(R)甘油醛制备(方案7,8),其中的R1独立地是(C1-C6)低级烷基,包括但不限于甲基、乙基,任选取代的苯基,任选取代的苄基。或者R1是环状基团的一部分,包括分别形成环戊基或环己基(cyclohexanyl)的亚乙基(-CH2CH2-)或三亚甲基(-CH2CH2CH2-)。R2、R3独立地是氢,(C1-C6)低级烷基,包括但不限于甲基、羟基甲基、甲氧基甲基、卤代甲基(包括但不限于氟甲基)、乙基、丙基,任选取代的乙烯基,包括但不限于乙烯基、卤代乙烯基(F-CH=C),任选取代的乙炔基,包括但不限于卤代乙炔基(F-C≡C),任选取代的烯丙基,包括但不限于卤代烯丙基(FHC=CH-CH2-);R4是酰基,包括但不限于乙酰基、苯甲酰基,芳基烷基,包括但不限于苄基、(C1-10)低级烷基,包括但不限于甲基、乙基、丙基、CH2R,其中R是氢、(C1-10)低级烷基,包括但不限于甲基、乙基、丙基。
方案7
二醇(42B)通过以下方式可转化为环亚硫酸酯(IIIa),即在烷基胺如三乙胺、二异丙基乙胺或吡啶存在下用亚硫酰氯(SOCl2)处理,然后用氧化剂进行氧化,所述氧化剂选自RuCl3、KMnO4和TEMPO的第一组或者所述第一组与由NaIO4、KIO4、HIO4、mCPBA、NaOCl和过硫酸氢钾制剂组成的第二组中的一种的组合。该步骤的溶剂选自以下的一种或多种:氯仿、二氯甲烷、1,2-二氯乙烷、二乙醚、四氢呋喃、苯和甲苯,这些溶剂可以单独或与水组合使用。(GaoY等,J.Am.Chem.Soc.1988,110,7538-7539,Berridge et al J.Org.Chem.1990,55,1211-1217)。还可以通过用硫酰氯或硫酰二咪唑处理将二醇直接转化为环硫酸酯(Vb)。另一方面,二醇42B可以通过羰基二咪唑(carbonyl diimidazole)或羰基二甲醇盐(carbonyl dimethoxide)处理转化为环碳酸酯(IIIc)(方案8)(Chang等,Tetrahedron Lett.1996,37,3219-3222)。
方案8
(ii)合成取代的2-脱氧-D-核糖酸-γ-内酯,53B
环硫酸酯(IIIb,方案8)通过以下方式,以高产率和高区域选择性和有规立构转化为式51B的氟化硫酸酯(方案9),即用氟化四烷基铵在质子极性溶剂中 进行处理,氟化四烷基铵包括但不限于氟化四甲铵(TMAF)、氟化四乙铵(TEAF)或氟化四丁铵(TBAF)或(三甲基甲硅烷基)二氟化三(二甲基氨基)硫(TAS-F)(Fuentes J等,Tetrahedron lett.1998,39,7149-7152),所述质子极性溶剂是如丙酮、四氢呋喃、N,N-二甲基甲酰胺或乙腈(方案9)。金属氟化物如氟化银(AgF)、氟化钾(KF)、氟化铯(CsF)或氟化铷(RbF),这些溶剂可以单独使用,或者与催化量的氟化四烷基铵、冠醚、二甘醇二甲醚或聚乙二醇或其它相转移催化剂一起使用。
环硫酸酯(IIIb)可以通过用NaBH4、氯化四烷基铵、溴化四烷基铵、NaN3或LiN3、NH4OR、NH4SCN、CF3I-四(二甲基氨基)-乙烯(TDAE)和硝酸四烷基铵(Gao等,J.Am.Chem.Soc.1988,110,7538-7539)、KCN、LiCu(R)2处理,转化为结构式51B表示的其它2-取代的硫酸酯,其中R是甲基、乙基、乙烯基或乙炔基。类似地,环亚硫酸酯(IIIa)可以转化为取代的酯52B(Chang等,Tetrahedron Lett.1996,37,3219-3222)。结构式51B和52B的化合物通过用酸在含H2O的有机溶剂如甲醇、乙醇或乙腈中处理,可转化为结构式53B的取代的内酯。
在结构式53B中,R2、R3独立地是氢,(C1-C6)低级烷基,包括但不限于甲基、羟基甲基、甲氧基甲基、卤代甲基(包括但不限于氟甲基)、乙基、丙基,任选取代的乙烯基,包括但不限于乙烯基、卤代乙烯基(F-CH=C),任选取代的乙炔基,包括但不限于卤代乙炔基(F-C≡C),任选取代的烯丙基,包括但不限于卤代烯丙基(FHC=CH-CH2-)。Nu是卤素(F、Cl、Br),N3,CN,NO3,CF3,SCN、OR或NR2,其中R是酰基,包括但不限于乙酰基、苯甲酰基,芳基烷基,包括但不限于苄基,(C1-10)低级烷基,包括但不限于甲基、乙基、丙基、CH2R,其中R是氢、(C1-10)低级烷基,包括但不限于甲基、乙基、丙基。
方案9
(iii)D-核糖酸-γ-内酯(53B)的保护
53B可以在合适溶剂中用合适的碱,用合适的保护剂进行选择保护,得到结构式53C的5-保护的内酯。这些保护基包括但不限于以下基团:三苯甲基、叔丁基二甲基甲硅烷基、叔丁基二苯基甲硅烷基、苄氧基甲基、苯甲酰基、甲苯酰基、4-苯基苯甲酰基、2-、3-或4-硝基苯甲酰基、2-、3-或4-氯苯甲酰基、其它取代的苯甲酰基。所述碱包括但不限于以下的碱:咪唑、吡啶、4-(二甲基氨基)吡啶、三乙胺、二异丙基乙胺、1,4-二氮杂双环[2,2,2]-辛烷。溶剂包括但不限于以下的溶剂:吡啶、二氯甲烷、氯仿、1,2-二氯乙烷、四氢呋喃。
方案10
或者,内酯53B可以在合适溶剂中,用合适的碱,用合适的保护剂完全保护。保护基(R5,R6)包括但不限于以下基团:甲氧基甲基、甲氧基乙基、苄氧基甲基、乙氧基甲基、三苯甲基、三乙基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基、叔丁基二苯基甲硅烷基、酰基,包括乙酰基、新戊酰基、苯甲酰基、甲苯酰基、4-苯基苯甲酰基、2-、3-或4-硝基苯甲酰基、2-、3-或4-氯苯甲酰基,或其它取代的苯甲酰基。所述碱包括但不限于以下的碱:咪唑、吡啶、4-(二甲基氨基)吡啶、三乙胺、二异丙基乙胺、1,4-二氮杂双环[2,2,2]辛烷。溶剂包括但不限于:吡啶、二氯甲烷、氯仿、1,2-二氯乙烷、四氢呋喃(方案10)。
(iv)络合定向的β-糖基化
方案10a
2-脱氧-2-氟-2-C-甲基-呋喃核糖苷(54:Nu=F,R3=Me,R5=R6=新戊酰基)与甲硅烷基化N4-苯甲酰基胞嘧啶在三甲基甲硅烷基三氟甲磺酸酯(TMSOTf)存在下在CHCl3中发生偶联,以获得α-异构体占优的2/1比值的α/β-端基异构体的混合物。但是,在类似条件下,在SnCl4催化的同样反应中,β-端基异构体为主要产物(α/β=1/4.9)。在方案10A中提出了可能的机理(R5和R6是O-保护基,可以是有C1-20的酰基或甲硅烷基或烷基或芳烷基)。54在TMSOTf存在下在CHCl3中用甲硅烷基化的N4-苯甲酰基胞嘧啶进行处理,形成氧鎓中间体54-i。甲硅烷基化碱可以从上侧攻击54-1,产生β-端基异构体55B,或者从底侧攻击提供α-端基异构体55B-α。由于2-甲基在上侧造成的空间位阻(stereohinderance),甲硅烷基化碱主要从底侧(空间位阻较小侧)攻击中间体54-i,形成α-端基异构体占优的比值为2/1的α/β-端基异构体的混合物。而54在SnCl4存在下用甲硅烷基化N4-苯甲酰基胞嘧啶处理,形成的是络合物54-ii而非氧鎓54-i。甲硅烷基化的N4-苯甲酰基胞嘧啶从空间位阻较小的上侧攻击54-ii,形成β-端基异构体占优的比值为1/5的α/β-端基异构体混合物。
化合物54可以由结构式49B表示的保护的内酯形成,49B可以用DIBAL-H或氢化三叔丁氧基铝锂(1ithium tri-tert-butoxyaluminum hydride)和其它氢化物还原剂还原为内半缩醛,然后,在合适碱存在下,在合适溶剂内,通过用酰卤 或酰基酐(acyl anhydride)进行酰化,内半缩醛转化为酰基化物(acylate)。酰卤或酰基酐包括但不限于以下:乙酰氯(acetic chloride)、任选取代的苯甲酰氯、乙酸酐、任选取代的苯甲酰酐。这些碱包括但不限于以下:咪唑、吡啶、4-(二甲基氨基)吡啶、三乙胺、二异丙基乙胺、1,4-二氮杂双环[2,2,2]辛烷。所述溶剂包括但不限于以下:吡啶、二氯甲烷、氯仿、1,2-二氯乙烷、四氢呋喃。
(v)合成L-核苷,IB-L
对结构式I和II的D-系列的方法可用于从(S)-甘油醛制备结构式IB-L的L-核苷(方案11)。
方案11
(vi)合成2-烷基-4,5-二-O-保护的-2,3-二羟基-戊酸
目前,合成通式I和II的核苷的最优选的方法是按照方案4、方案5和方案6所示,通过以下步骤制备I和II中2-脱氧-2-氟-2-C-甲基-D-呋喃核糖基部分的衍生物,(i)合成中间体,通式I的2-烷基-4,5-二-O-保护的-2,3-二羟基-戊酸酯的衍生物,(ii)将42B转化为通式49B的3,5-保护的2-脱氧-2-氟-2-C-甲基-D-核糖酸-γ-内酯,(iii)将49B转化为通式I和II的嘌呤和嘧啶核苷。方案4中的关键步骤是烯烃中间体41在昂贵的Sharpless AD催化剂存在下进行立构有择锇催化的二羟基化,转化为42。如果使用其它手性化合物如L-奎纳定替代Sharpless催化剂,反应也可以平缓进行,获得所需的42。Kishi等已提出,在烯丙基醇衍生物(酯、醚、缩醛或缩酮)的OsO4二羟基化中,反应主要过程发生在与预先存在的羟基或烷氧基相对的烯键面上(Tetrahedron Lett,1983,24,3943)。某些例子示于方案12(Tetrahedron Lett,1983,24,3947)中。在每一种情况下,主要产物由从与仲碳相邻的氧的反侧添加OsO4而产生。但是,空间选择性并没有高到足以进行制备合成。
方案12
Kishi规则提出立体化学阐述为由在预先存在的羟基或烷氧基面相对的烯键面上发生四氧化锇优先接近而引起,受Kishi规则的鼓励,在原始条件但没有任何手性催化剂包括Sharpless AD催化剂下进行41的二羟基化。使用Ke3Fe(CN)6/K2OsO2(OH)4/K2CO3体系但没有手性催化剂使41进行二羟基化,所得产物的产率为77%,所述产物是5∶1的异构体混合物,主要的异构体是所需化合物42。使用N-甲基吗啉N-氧化物(NMO)作为氧化剂,在没有手性催化剂条件下使烯烃41与OsO4反应,获得42与其异构体的5∶1的混合物,其产率为79%。最令人惊奇的是,当使用叔丁基过氧化氢(TBHP)作为氧化剂时,在催化量的OsO4存在下,在丙酮和乙酸铵为缓冲剂中(该试剂组合被Masamune和Sharpless用于合成醛醇(J.Org.Chem,1982,47,1373)),分离的晶体产物是实际上纯的所需42。这种方法远优于OsO4/NMO和Fe(CN)6 3-法。在10毫摩尔(mmolar)量级,排他地形成所需的二醇42,分离后产率为87%。通过剧烈的1H NMR分析,没有检测到该产物被其它异构体污染。
众所周知,在OsO4氧化中,中间体是环锇酸盐V(下面)(Criegee,Liebigs Ann.Chem.,1936,522,75)。用高锰酸钾在碱介质中进行烯烃的顺式二羟基化已经为人 们所知相当一段时间(Robinson and Robinson,J.Chem.Soc.,1925,127,1628),该反应看来要通过环酯VI来进行。因此,已经进行了高锰酸盐二羟基化的尝试。
前面的报道表明,烯烃在酸或中性条件下进行高锰酸盐二羟基化,会引起最初的二醇产物过氧化,伴随生成酮和羧酸酯。只有在碱性条件下才能使二醇产物的进一步氧化减速。由于化合物41是羧酸酯,反应不能在含水碱中进行。Hazra等(J.Chem.Soc.Perkin Trans.I,1994,1667)描述了使用高锰酸十四烷基三甲基铵(TDTAP),在t-BuOH、二氯甲烷和水的混合物中,在0.1当量KOH存在下,将高度取代的烯烃成功地二羟基化为相应的二醇。将这种方法应用于化合物41的二羟基化,导致快速形成(室温下10分钟内)化合物42与其非对映体的混合物(比值为8∶1),分离的产率为71%。在类似的反应中,没有KOH条件下更快速地发生氧化,但是化合物42的产率并未提高。
Mukaiyama等(Chem.Lett.,1983,173)揭示烯烃用KMnO4和18-冠-6-醚在二氯甲烷中于-40℃进行二羟基化。在Mukaiyama条件下,但在不同温度下尝试进行化合物41的二羟基化,在-40℃,形成6∶1的化合物42和其非对映体的混合物,产率为50%,在-10℃,形成同样的混合物,但产率为94%。
令人惊奇的是,现有技术揭示,双键被KMnO4氧化是经由二醇进行的,其中产生的二醇在没有碱存在的条件下被进一步迅速氧化。与现有技术不同,发现当相应的41用KMnO4处理但没有加入碱和冠醚时,二醇42可被隔离。在纯的叔丁基醇中,即使在室温下放置2天氧化反应也不会进行。在混合物中添加水能促进反应。据发现,在反应介质中的水越多,反应进行得越快,形成42的选择性越差;在反应介质中的水越少,反应进行得越慢,但形成42的选择性提高。在任何情况下,由于进一步氧化产率相当差。
最令人惊奇的是,与现有技术相矛盾的是,发现化合物41用KMnO4在丙酮中处理能以一定产率获得10∶1混合物,所需的42是主要组分。据发现,在丙酮和吡啶的混合物中进行反应可以提高立构有择性。
下面列出的实施例有助于理解本发明。这一部分并未意图也不应被解释为以任何方式对下面权利要求书提出的本发明构成限制。
实施例
实施例1
(2S,3R,4R)-4,5-O-异亚丙基-2,3-O-磺酰基-2,3,4,5-四羟基-2-甲基-戊酸乙酯(IIIb,R1=CH3,R2=H,R3=CH3)
于0℃向(2S,3R,4R)-4,5-O-异亚丙基-2,3,4,5-四羟基-2-甲基-戊酸乙酯(R1=CH3,R2=H,R3=CH3)(2.0g,8.06mmol)在无水二氯甲烷(40mL)中且含三乙胺(3.4mL)的溶液中滴加亚硫酰氯(0.88mL,12.08mmol),持续10分钟。形成的反应混合物于0℃搅拌10分钟,用冷乙醚(100mL)稀释,用水(50mL×2)和盐水(50mL×2)洗涤,用硫酸钠干燥,浓缩后获得残余物(IIIa,R1=CH3,R2=H,R3=CH3),将该残余物溶解在乙腈-四氯甲烷(10∶10mL)中。随后于室温向所获溶液中加入高碘酸钠(2.58g,12.06mmol)、三氯化钌(16mg,0.077mmol)和水(14mL)。室温搅拌形成的反应混合物10分钟,用乙醚稀释(100mL),用水(50mL×2)、饱和碳酸氢钠溶液(50mL×2)和盐水(50mL×2)洗涤,用硫酸钠干燥,浓缩,与甲苯(30mL×3)共蒸发为糖浆状残余物,该硫酸酯IIIb(2.23g,89%)用于下一反应,不必再进行纯化。1H NMR(CDCl3)δ(ppm)5.04(d,1H,J=9.6Hz,H-3)4.37(m,1H,H-4),4.29(q,2H,J=7.6Hz,CH 2CH3),4.17(dd,1H,J=5.6,9.6Hz,H-5),4.05(dd,1H,J=3.2,9.6Hz,H-5’),1.8(s,3H,CH3-2),1.38(s,3H,(CH 3)2C),1.32(t,3H,J=6.8Hz,CH2CH 3),1.31(s,3H,(CH 3)2C)。
实施例2
(2R,3S,4R)-2-氟-4,5-O-异亚丙基-2-甲基-3-磺氧基(sulfooxy)-3,4,5-三羟基戊酸乙酯的四丁基铵盐(51B,R1=CH3,R2=H,R3=CH3,Nu=F,M+=四丁基铵)
方法1:于0℃向来自实施例1的硫酸酯IIIb(628mg,2.02mmo1)在无水四氢呋喃的溶液中滴加氟化四丁基铵(1M的四氢呋喃溶液,用
分子筛干燥),持续5分钟。形成的反应混合物于0℃搅拌20分钟,再加入2mL氟化四丁基铵(1M的四氢呋喃溶液,用
分子筛干燥,3mL),然后于0℃搅拌该反应混合物2小时,然后浓缩,通过硅胶柱层析(EtOAc)纯化,获得氟化的硫酸酯,糖 浆状物(350mg,38%)。
1H NMR(CDCl
3)δ(ppm)4.66(dd,1H,J=9.6,25.6Hz,H-3),4.48(dd,1H,J=5.2,8.8Hz,H-4),4.20,4.07(2m,4H,H-5,OC
H 2CH
3),3.21(m,8H,N(C
H 2CH
2CH
2CH
3)
4),1.69(d,3H,J=22.4Hz,CH
3-2),1.59(m,8H,N(CH
2C
H 2CH
2CH
3)
4),1.39(m,8H,CH
2CH
2C
H 2CH
3)
4),1.27-1.25(m,9H,OCH
2C
H 3,(C
H 3)
2C),0.96(t,12H,J=6.8Hz,CH
2CH
2CH
2C
H 3)
4.
方法2:于0℃向环硫酸酯IIIb(480mg,1.55mmol)在无水四氢呋喃的溶液中滴加氟化四丁基铵(1M的四氢呋喃,用HF-吡啶中和,3.1mL),持续5分钟。搅拌形成的反应混合物39小时,浓缩,通过硅胶柱层析(CH2Cl2∶MeOH=10∶1)纯化,得氟化的硫酸酯,为糖浆状物(280mg,39%)。
实施例3
2-脱氧-2-氟-2-C-甲基-D-核糖酸-γ-内酯(53B,R2=H,R3=CH3,Nu=F)
将实施例2的产物(170mg,0.370mmol)、三氟乙酸(0.8mL)和水(2mL)在乙腈(10mL)中的混合物于80℃加热1.5小时,用乙酸乙酯(15mL)稀释,用水(10mL)和饱和碳酸氢钠溶液(10mL)洗涤。含水层被NaCl饱和,并用乙酸乙酯(10mL)萃取。合并的有机层用硫酸钠干燥,过滤和浓缩,产生残余物,该残余物通过硅胶柱层析纯化(己烷∶乙酸乙酯=1∶1至CH2Cl2∶MeOH=20∶1),制得为白色固体的所需化合物,(60mg,100%)。1H NMR(CDCl3)δ(ppm)6.06(d,1H,J=6.8Hz,HO-3),5.16(t,1H,J=4.8Hz,HO-5),4.26(m,1H,H-4),3.98(ddd,1H,J=7.2,8.0,23.2Hz,H-3),3.78(ddd,1H,J=2.0,5.2,12.8Hz,H-5),3.55(ddd,1H,J=4.4,5.6,12.4Hz,H-5’),1.48(d,3H,J=24Hz,CH3-2);13C NMR(CDCl3)δ(ppm)171.2(d,J=21.2Hz,C-1),92.5(d,J=177.5Hz,C-2),83.37(C-4),70.2(d,J=15.9Hz,C-3),59.0(C-5),17.1(d,J=25.0Hz,CH3-C-2).
实施例4
3,5-二-O-苯甲酰基-2-脱氧-2-氟-2-C-甲基-D-核糖酸-γ-内酯(49B,R2=H,R3=CH3,R5=Bz,R6=Bz,Nu=F)
将实施例3的化合物(60mg,0.16mmol)溶解在无水吡啶(1mL)中,并加入苯甲酰氯(0.3mL)。室温,搅拌形成的反应混合物20分钟,加入水(1mL),搅拌20分钟,用乙酸乙酯(5mL)稀释,用水(2mL)和1M HCl(2mL×3)洗涤,用 硫酸钠干燥。过滤和浓缩后,残余物通过硅胶柱层析(己烷∶乙酸乙酯=10∶1)纯化,制得3,5-二-O-苯甲酰基-2-脱氧-2-氟-D-核糖酸-γ-内酯,为白色固体(118mg,87%)。1H NMR(CDCl3)δ(ppm)8.08(m,2H,芳族),7.99(m,2H,芳族),7.63(m,1H,芳族),7.58(m,1H,芳族),7.49(m,2H,芳族),7.43(m,2H,芳族),5.51(dd,1H,J=7.2,17.6Hz,H-3),5.00(m,1H,H-4),4.78(dd,1H,J=3.6,12.8Hz,H-5),4.59(dd,1H,J=5.2,12.8Hz,H-5’),1.75(d,3H,J=23.6Hz,CH3-2)
实施例5
(2R,3S,4R)-4,5-二羟基-2-氟-4,5-O-异亚丙基-2-甲基-3-磺氧基(sulfooxy)-戊酸乙酯的四乙基铵盐(51B,R1=CH3,R2=H,R3=CH3,Nu=F,M+=四乙基铵)
方法1:0℃,向硫酸酯IIIb(方案9)(1.96g,6.32mmol)在无水N,N-二甲基甲酰胺(20mL)的溶液中一批加入水合氟化四乙铵(1.39g,9.13mmol)。搅拌形成的反应混合物30分钟,浓缩,与甲苯共蒸发,获得一种半固体物(51b)(3.35g,粗产物,质子NMR显示实际是一种产物)。1H NMR(CDCl3)δ(ppm)4.61(dd,1H,J=9.2,25.6Hz,H-3),4.51(dd,1H,J=5.2,9.2Hz,H-4),4.23-4.05(m,4H,H-5,OCH 2CH3),3.32(q,8H,J=7.2Hz,N(CH 2CH3)4),1.69(d,3H,J=23.2Hz,CH3-2),1.31-1.24(m,21H,OCH2CH 3,(CH 3)2C,N(CH2CH 3)4。
方法2:0℃,向硫酸酯IIIb(148mg,0.477mmol)在无水乙腈(2mL)的溶液中一批加入水合氟化四乙铵(107mg,0.717mmol)。搅拌形成的反应混合物24小时,浓缩,与甲苯共蒸发,获得一种半固体物(257mg,粗产物,质子NMR显示实际是一种产物)。
实施例6
制备1-(2-脱氧-2-氟-2-甲基-3,5-O-3,5-二新戊酰基-呋喃核糖基)-N4-苯甲酰基胞嘧啶(11b,R5=R6=新戊酰基、R2=H,R3=Me)
于-20℃至-10℃,向49B(方案6)(Nu=F,R2=H,R3=Me,R5=R6=新戊酰基、3.44g,10.36mmol)在THF(70mL)的溶液中加入LiAl(t-BuO)3H(13.47mmol,1M的THF溶液,13.47mL),-10℃至-15℃搅拌形成的溶液2小时。在该溶液中加入另一些LiAl(t-BuO)3H(1.35mL,1.35mmol),于-10℃搅拌该溶液1小时。加入冰水(50mL)。混合物用EtOAc(200mL)萃取,有机层用水、盐水洗涤,用 (Na2SO4)干燥。除去溶剂后获得粗内半缩醛(lactol),将该内半缩醛溶解于CH2Cl2(50mL)中。向该溶液加入Et3N(31.08mmol,4.24mL)、4-二甲基氨基吡啶(1mmol,122mg)和三甲基乙酰氯(20.7mmol,2.55mL),室温搅拌混合物16小时。加入水(20mL),室温搅拌形成的混合物10分钟。加入EtOAc(200mL),有机溶液用水、盐水洗涤,用(Na2SO4)干燥。除去溶剂后,残余物与甲苯(2×20mL)共蒸发制得粗中间体(5,6.74g),不需纯化就可供下一偶联反应使用。
N4-苯甲酰基胞嘧啶(6.06mmol,1.30g)和(NH4)2SO4(30mmg)在HMDS(16.7mL)中的悬浮液回流5小时,清液在减压下浓缩至干。将残余物溶于1,2-二氯乙烷(50mL)中。室温,向该溶液加入粗制的54(1.96g,方案6)和SnCl4(1.42mL,12.12mmol)。溶液回流24小时后冷却至0℃。向该溶液中加入NaHCO3(6.11g,72.72mmol)和EtOAc(50mL)。在混合物中缓慢加入H2O(2mL),室温搅拌形成的混合物20分钟。过滤除去固体。有机溶液用水、盐水洗涤,用(Na2SO4)干燥。除去溶剂后,获得糖浆状物质,它是4/1比值的β/α-端基异构体的粗混合物,其中β-异构体占优。粗产物于50℃溶解于MeOH(1mL)。在该溶液中加入己烷(10mL)。混合物于室温静置1小时,然后于0℃静置2小时。过滤收集结晶,用己烷洗涤,获得产物55,方案6(323mg,20.3%来自49)。母液浓缩至干,并通过柱层析纯化(20-50%EtOAc在己烷中),获得第二批产物55。H-NMR(CDCl3):δ8.82(br s,1H,NH),8.10,7.89,7.62,7.52(m,7H,H-5,H-6,5Ph-H),6.41(d,J=18.4Hz,1H,H-1’),5.10(m,1H,H-3’),4.45(d,J=9.6Hz,1H,H-4’),4.36(t,J=2.8Hz,2H,H-5’),1.35(d,J=22.0Hz,3H,Me),1.29,1.23[ss,18H,C(Me)3]。
实施例7
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
4-甲基吗啉N-氧化物作为氧化剂,有锇催化剂。
在氩气下,向化合物41(214mg,0.1mmol)在t-BuOH的搅拌溶液中加入4-甲基吗啉N-氧化物(0.47mL,50重量%水溶液)和水(0.2mL)的溶液。加入2.5重量%的四氧化锇在叔丁醇(0.51mL)的溶液,室温,在水浴中搅拌该混合物5小时。混合物真空蒸发为糖浆状物,该糖浆状物与H2O(3×10mL)共沸,以除去4-甲基吗啉。残余物通过加入并蒸发EtOH(2×10mL)来干燥,获得残余物,该残余物通过用20 %EtOAc的己烷溶液的硅胶柱层析纯化,获得为固体的所需产物和其异构体(196mg,79%)。质子NMR表明所需产物与其异构体的比例约为5∶1。混合物从己烷/乙酸乙酯混合物中重结晶后获得纯产物(91mg,37.4%来自起始原料),为结晶固体。 1H NMR(DMSO-d6)δ1.18(t,J=7.2Hz,3H,-OCH2 CH 3 ),1.24(s,3H,CH3),1.25(s,3H,CH3),1.28(s,3H,2-CH3),3.67(t,J=7.2Hz,1H),3.85,4.06和4.12(m,4H),4.97(s,1H,2-OH,D2O可交换的),5.14(d,J=7.6Hz,2-OH,D2O可交换的)。
实施例8
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
铁氰化钾为氧化剂,有锇催化剂。
在一个配备有磁力搅拌器的100mL圆底烧瓶中投入5mL叔丁醇、5mL水以及K3Fe(CN)6(0.98g)、K2CO3(0.41g)和K2OsO2(OH)4(3.2mg)的混合物。室温搅拌形成的两个清楚的相;下层水相为亮黄色。此时加入甲磺酰胺(95mg)。混合物冷却至0℃,期间一部分盐沉淀,立刻加入214mg(1mmol)化合物41,0℃剧烈搅拌该均质浆料24小时。0℃,搅拌下在该混合物中加入固体亚硫酸钠(1.5g),然后,使混合物温热至室温,搅拌30-60分钟。加入乙酸乙酯(10mL),层分离后,水相进一步用EtOAc萃取。有机层用Na2SO4干燥并浓缩至干。残余物通过用20%EtOAc的己烷溶液在硅胶柱层析纯化,提供固体产物(190mg,77%)。质子NMR表明所需产物与其异构体的比值约为5∶1。混合物用己烷/乙酸乙酯重结晶后获得为结晶固体的纯二醇产物(102mg,41%来自起始原料)。该产物的1H NMR谱与可信样品的谱图相同。
实施例9
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
氢过氧化叔丁基为氧化物,室温下有锇催化剂。
在一个50mL配备磁力搅拌器的烧瓶中投入2mL丙酮、214mg(1mmol)化合物41、65mg Et4NOAc·4H2O和0.3mL氢过氧化叔丁基(5~6M,癸烷中)。室温下搅拌,直到获得Et4NOAc的清澈溶液,形成的溶液在冰浴中冷却,一批加入5mL OsO4(2.5重量%在t-BuOH中)。该溶液立刻成为褐紫色。1小时后除去冰浴,使反应混合物温热至室温并搅拌14小时。其余的反应步骤与上面所 述完全相同。快速柱层析后,获得178mg(72%)固体产物。在扩展的1H NMR中,在δ1.26观察到微小凸起,表明产物中存在小于4%的异构体。
实施例10
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
氢过氧化叔丁基为氧化剂,在0℃,用锇催化剂。
在一个250mL配备磁力搅拌器的烧瓶中投入20mL丙酮、2.14g(10mmol)化合物41、650mg Et4NOAc·4H2O和3mL氢过氧化叔丁基(5~6M在癸烷中溶液)。室温下搅拌,直到Et4NOAc已经溶解,形成的溶液在冰浴中冷却,一批加入5mL OsO4(2.5重量%在t-BuOH中)。溶液立刻成为褐紫色。0℃搅拌反应混合物6.5小时(用TLC监控,己烷∶乙酸乙酯=4∶1,Rf=0.18)。0℃,加入乙醚(40mL),形成的混合物用5mL新配制的10%NaHSO3溶液一次处理。除去冰浴,继续搅拌1小时。在混合物中加入EtOAc(100mL)和H2O(50mL)。层分离后,水相再用EtOAc萃取。有机层用盐水洗涤,用(MgSO4)干燥后浓缩。残余物通过用20%EtOAc的己烷溶液的快速柱层析进行纯化,获得固体产物(2.16g,87%)。用剧烈1H NMR分析,在该产物中未检测到异构体的污染。
实施例11
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
高锰酸十四烷基三甲基铵(TDTAP)为氧化剂。
室温,向化合物41(214mg,1mmol)在t-BuOH(10mL)和CH2Cl2(2mL)的搅拌溶液中加入KOH(6mg,0.1mmol)溶于水的溶液,然后在5分钟时间分小批量多次加入TDTAP(0.420g,1.12mmol)。5分钟后,TLC显示反应完成。溶液用10mL饱和亚硫酸氢钠猝灭。反应混合物真空浓缩。残余物用乙酸乙酯(3×15mL)萃取,用(Na2SO4)干燥,蒸发后获得白色固体,将该固体再溶解于5mLCH2Cl2,使该溶液通过顶端有硅藻土的硅胶柱,用乙酸乙酯(50ml)洗涤。滤液真空干燥,获得粘性油状物(174mg,产率71%),为8∶1的混合物,其中主要的异构体是标题化合物。
实施例12
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
高锰酸钾为氧化剂,与18-冠-6-醚-A(于-40℃)。
于-40℃,向化合物41(214mg,1mmol)在CH2Cl2(10mL)和18-冠-6-醚(37.5mg,0.1mmol)的溶液中分多次加入KMnO4(158mg,1mmol),同样温度下搅拌混合物2小时。在此期间,反应混合物变为深棕色。反应完成后,混合物用饱和亚硫酸氢钠溶液(10mL)猝灭。形成的无色混合物通过玻璃料过滤,滤液用乙酸乙酯(2×25ml)萃取,用(Na2SO4)干燥后浓缩,获得粘性油状物,该油状物包含10-20%未反应的烯烃起始原料与所需的二醇及其异构体(二醇与其异构体的比值为6∶1)(1H NMR)。从使用5%乙酸乙酯∶己烷的硅胶小垫通过后除去了烯烃起始原料。所需二醇的6∶1的混合物用20%乙酸乙酯/己烷从该柱洗脱,蒸发溶剂后,获得白色固体(200mg~80%)。
实施例13
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
高锰酸钾为氧化剂,有18-冠-6-醚-B(于-10℃)。
向化合物41(214mg,1mmol)在CH2Cl2(10ml)的溶液中加入37.5mg(0.1mmol)18-冠-6-醚,混合物冷却至-10℃。分多批加入KMnO4(237mg,1.5mmo1),于-10℃搅拌混合物2小时。在此期间反应混合物变成深棕色,混合物用饱和亚硫酸氢钠(10mL)溶液处理。形成的混合物通过玻璃料过滤,滤液用乙酸乙酯(2×25ml)萃取,用(Na2SO4)干燥,蒸发后获得白色固体(240mg,94.4%),该固体包含所需产物和其异构体,所需产物与其异构体的比值为6∶1。
实施例14
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
高锰酸钾为氧化剂,在1∶9的H2O/t-BuOH中。
于0℃,向化合物41(214mg,1mmol)在t-BuOH(9mL)和H2O(1mL)的溶液中分多批加入KMnO4(237mg,1.5mmol),在同样温度下搅拌该混合物2小 时。再加入(79mg,0.5mmol)的KMnO4,再搅拌混合物30分钟。如上所述进行操作后,获得128mg(50%)为白色固体的异构体混合物,异构体的比值为8∶1,其中的主要组分是所需产物。
实施例15
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
高锰酸钾为氧化剂,在9∶1的H2O/t-BuOH中。
于0℃,向化合物41(214mg,1mmol)在H2O(9mL)和t-BuOH(1mL)的溶液中分多批加入KMnO4(237mg,1.5mmol),在同样温度下搅拌混合物30分钟。在此期间,混合物变为深棕色。在混合物中加入饱和亚硫酸氢钠溶液(10mL),混合物过滤,滤液用乙酸乙酯(3×25ml)萃取,用(Na2SO4)干燥,浓缩后获得为白色固体的4∶1的二醇异构体的混合物(128mg,50%),混合物中主要组分是标题化合物。
实施例16
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
高锰酸钾为氧化剂,0℃在H2O中。
将KMnO4(158mg,1.0mmol)在H2O(10mL)中的溶液加入化合物41(214mg,1mmol)中,然后于0℃搅拌混合物1小时。该反应混合物用饱和亚硫酸氢钠溶液(10mL)猝灭,并如上所述对混合物进行操作。获得的白色固体(80mg,32%)是4∶1的二醇异构体的混合物,其中的主要组分是标题化合物。
实施例17
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
高锰酸钾为氧化剂,在丙酮中。
向化合物41(214mg,1mmol)在丙酮(10mL)的溶液中加入_(37.5mg、0.1mmol),将反应混合物冷却至0℃。在该冷溶液中分多批加入KMnO4(237mg,1.5mmol),在同样温度搅拌反应混合物2小时。在此期间,反应混合物变为深棕 色。反应混合物用饱和亚硫酸氢钠溶液(10ml)猝灭,此时溶液成为无色。反应混合物用乙酸乙酯(3×25ml)萃取,混合物干燥和蒸发后,获得白色固体(245mg,96.4%),比值为10∶1。
实施例18
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42)
高锰酸钾为氧化剂,在丙酮和吡啶的混合物中。
于0℃,向化合物41(214mg,1mmol)在丙酮(9mL)和吡啶(1mL)的混合物中的溶液加入KMnO4(158mg,1.0mmol),在同样温度下搅拌1小时。如上所述对反应混合物进行操作后,获得实际为纯产物的白色固体164mg(67%)。剧烈 1H NMR分析表明该粗制的白色固体含有约6%的标题化合物的非对映体。
实施例19
(2S,3R)-3-[(4R)-2,2-二甲基-[1,3]二氧戊环-4-基]-2,3-二羟基-2-甲基-丙酸乙酯(42),在RuCl3/CeCl3/NaIO4体系中
在一个50mL配备磁力搅拌棒的圆底烧瓶中,搅拌NaIO4(321mg,1.5mmol)和CeCl3·7H2O(37mg,0.1mmol)在0.45mL水中的混合物,并温和加热,直到形成亮黄色的悬浮液。冷却至0℃后,加入EtOAc(1.25mL)和乙腈(1.5mL),搅拌悬浮液2分钟。加入0.1M RuCl3(25μL)的水溶液,搅拌混合物2分钟。一批加入化合物41(214mg,1mmol)在EtOAc(0.25mL)的溶液,形成的浆料于0℃搅拌1小时。加入固体Na2SO4(0.5g),然后加入EtOAc(3mL)。滤出固体,滤饼用EtOAc洗涤数次。滤液用饱和Na2SO3溶液洗涤,有机层用(Na2SO4)干燥,浓缩至干。残余物通过用20%EtOAc的己烷溶液的硅胶柱层析纯化,获得一糖浆状物(150mg,60%)。1H NMR表明,所需产物与其异构体的比值约为1.6∶1。
实施例20
化合物49的还原和酰化
于-20℃至-10℃,向3,5-二苯甲酰基-2-氟-2-脱氧-2-甲基-D-核糖酸-内酯(49,23g,61.77mmol,方案6)在无水THF(400ml)的溶液中加入LiAl(t-OBu)3H(75mL 1M在THF的溶液,75.0mmol),持续15分钟,在同样温度下搅拌形成的溶 液,直到所有起始原料被消耗。5小时后,留下约10-20%的起始原料,因此,当TLC表明所有起始原料被消耗时,在同样温度下再加入10mLLiAl(t-OBu)3H(10mmol)并搅拌1小时。在该反应混合物中加入DMAP(7.5g)和Ac2O(58.2g,616mmol),于-10℃搅拌溶液约2-3小时。反应完成后(由TLC表示),反应混合物用乙酸乙酯(400ml)和200ml水稀释。分离有机层,含水层用乙酸乙酯(2×100ml)洗涤。合并的有机层用水(3×150ml)、盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥。减压下除去溶剂,并与甲苯(2×100mL)共蒸发后,获得为清澈的棕色油状物的粗制乙酸酯。该油状物通过一硅胶柱(50g),用20%乙酸乙酯/己烷洗涤,直到回收全部的乙酸酯。溶剂减压下蒸发,获得为无色油状物的所需乙酸酯(54,32g)。
实施例21
1-(2-脱氧-2-氟-2-甲基-3-5-O-二苯甲酰基-β-D-呋喃核糖基)-N4-苯甲酰基胞嘧啶(55)
向N4-苯甲酰基胞嘧啶(20.39g,94.74mmol)在400ml HMDS的悬浮液中加入(NH4)2SO4(250mg),并回流下加热4小时。减压下除去过量的HMDS。将油状残余物溶解在氯苯(1L)中。向该溶液中加入乙酸酯(25g)在氯苯(250mL)的溶液和SnCl4(190.4mmol,49g),室温搅拌混合物2小时,然后于约65℃加热16小时。将反应混合物冷却至0℃,在其中加入NaHCO3(96g,1.14mol)和乙酸乙酯(500ml),然后小心加入水(20ml)。室温搅拌该混合物30分钟。混合物真空过滤,残余物用乙酸乙酯洗涤。有机层用水、盐水(2×250mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥。减压下除去溶剂,获得淡黄色-棕色固体。将该固体溶解在MeOH(250mL)中,回流下加热30分钟,冷却至室温,过滤,获得所需产物(55,8.0g),为灰白色固体。
实施例22
1-(2-脱氧-2-氟-2-C-甲基-β-D-呋喃核糖基)胞嘧啶(14)
将实施例21的化合物55(16.7g,30.8mmol,方案6)的悬浮液用甲醇氨(750mL,7M的MeOH溶液)处理,室温搅拌12小时,减压下浓缩至干,获得淡黄色固体。在该固体中加入THF(400mL),回流下加热30分钟,冷却至室温。过滤收集形成的固体,并用THF洗涤,获得为灰白色粉末的化合物14(6.7g,88%)。