BR112018071376A2 - método para modificar um sítio alvejado de um dna de cadeia dupla, complexo enzimático modificador de ácido nucleico, e, ácido nucleico - Google Patents

método para modificar um sítio alvejado de um dna de cadeia dupla, complexo enzimático modificador de ácido nucleico, e, ácido nucleico

Info

Publication number
BR112018071376A2
BR112018071376A2 BR112018071376-7A BR112018071376A BR112018071376A2 BR 112018071376 A2 BR112018071376 A2 BR 112018071376A2 BR 112018071376 A BR112018071376 A BR 112018071376A BR 112018071376 A2 BR112018071376 A2 BR 112018071376A2
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
nucleic acid
modifying
stranded dna
double stranded
target site
Prior art date
Application number
BR112018071376-7A
Other languages
English (en)
Inventor
Nishida Keiji
Kondo Akihiko
Arazoe Takayuki
Shimatani Zenpei
Original Assignee
National University Corporation Kobe University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by National University Corporation Kobe University filed Critical National University Corporation Kobe University
Publication of BR112018071376A2 publication Critical patent/BR112018071376A2/pt

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/78—Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPRs]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y305/00—Hydrolases acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds (3.5)
    • C12Y305/04—Hydrolases acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds (3.5) in cyclic amidines (3.5.4)
    • C12Y305/04005—Cytidine deaminase (3.5.4.5)

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

é provido um método para modificar um sítio alvejado de um dna de cadeia dupla, o dito método compreendendo uma etapa para introduzir um complexo, em que um módulo de reconhecimento de sequência de ácidos nucleicos capaz de se ligar especificamente a uma sequência de nucleotídeos alvo no dna de cadeia dupla e pmcda1 são ligados, em células com o dna de cadeia dupla e depois cultivar as células pelo menos temporariamente a uma baixa temperatura para assim converter o sítio alvejado, isto é, a sequência de nucleotídeos alvo e nucleotídeo(s) na proximidade da mesma em outros nucleotídeos, ou deletar os mesmos, ou inserir nucleotídeo(s) no sítio.
BR112018071376-7A 2016-04-21 2017-04-21 método para modificar um sítio alvejado de um dna de cadeia dupla, complexo enzimático modificador de ácido nucleico, e, ácido nucleico BR112018071376A2 (pt)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2016-085631 2016-04-21
JP2016085631 2016-04-21
PCT/JP2017/016105 WO2017183724A1 (ja) 2016-04-21 2017-04-21 ゲノム配列改変技術における変異導入効率の向上方法、及びそれに用いる分子複合体

Publications (1)

Publication Number Publication Date
BR112018071376A2 true BR112018071376A2 (pt) 2019-04-24

Family

ID=60116870

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BR112018071376-7A BR112018071376A2 (pt) 2016-04-21 2017-04-21 método para modificar um sítio alvejado de um dna de cadeia dupla, complexo enzimático modificador de ácido nucleico, e, ácido nucleico

Country Status (11)

Country Link
US (1) US20200377910A1 (pt)
EP (1) EP3447139B1 (pt)
JP (1) JP7001272B2 (pt)
KR (1) KR102116200B1 (pt)
CN (2) CN117925730A (pt)
BR (1) BR112018071376A2 (pt)
CA (1) CA3021281C (pt)
DK (1) DK3447139T3 (pt)
ES (1) ES2919961T3 (pt)
SG (1) SG11201809242VA (pt)
WO (1) WO2017183724A1 (pt)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108495932B (zh) 2015-11-27 2022-08-09 国立大学法人神户大学 用于特异性转换靶向dna序列的核酸碱基的单子叶植物的基因组序列的转换方法、及其使用的分子复合体
KR20200103769A (ko) * 2018-01-23 2020-09-02 기초과학연구원 연장된 단일 가이드 rna 및 그 용도
CN110607320B (zh) * 2018-11-23 2023-05-12 电子科技大学 一种植物基因组定向碱基编辑骨架载体及其应用
WO2020241869A1 (ja) * 2019-05-30 2020-12-03 国立大学法人東京大学 ２種の核酸塩基変換酵素が融合されたＣａｓタンパク質を利用したゲノム編集システム
US20220333133A1 (en) 2019-09-03 2022-10-20 Voyager Therapeutics, Inc. Vectorized editing of nucleic acids to correct overt mutations

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003087341A2 (en) 2002-01-23 2003-10-23 The University Of Utah Research Foundation Targeted chromosomal mutagenesis using zinc finger nucleases
JP2013128413A (ja) 2010-03-11 2013-07-04 Kyushu Univ Ｐｐｒモチーフを利用したｒｎａ結合性蛋白質の改変方法
EP3613854A1 (en) 2014-03-05 2020-02-26 National University Corporation Kobe University Genomic sequence modification method for specifically converting nucleic acid bases of targeted dna sequence, and molecular complex for use in same
PT3216867T (pt) * 2014-11-04 2020-07-16 Univ Kobe Nat Univ Corp Método para modificar a sequência de genoma para introduzir mutação específica a sequência de adn alvo por reação de remoção de bases, e complexo molecular nele utilizado
WO2017009073A1 (de) * 2015-07-13 2017-01-19 Huf Hülsbeck & Fürst Gmbh & Co. Kg Türaussengriff für ein fahrzeug
WO2017043656A1 (ja) * 2015-09-09 2017-03-16 国立大学法人神戸大学 標的化したｄｎａ配列の核酸塩基を特異的に変換する、グラム陽性菌のゲノム配列の変換方法、及びそれに用いる分子複合体
SG11201801809VA (en) * 2015-09-09 2018-04-27 Univ Kobe Nat Univ Corp Method for modifying genome sequence that specifically converts nucleobase of targeted dna sequence, and molecular complex used in said method
IL310721A (en) * 2015-10-23 2024-04-01 Harvard College Nucleobase editors and their uses
CN108495932B (zh) * 2015-11-27 2022-08-09 国立大学法人神户大学 用于特异性转换靶向dna序列的核酸碱基的单子叶植物的基因组序列的转换方法、及其使用的分子复合体

Also Published As

Publication number Publication date
DK3447139T3 (da) 2022-07-04
CN109312329A (zh) 2019-02-05
CA3021281C (en) 2021-07-27
KR102116200B1 (ko) 2020-05-27
JP7001272B2 (ja) 2022-01-19
CN117925730A (zh) 2024-04-26
EP3447139A1 (en) 2019-02-27
KR20180132862A (ko) 2018-12-12
EP3447139A4 (en) 2019-10-02
WO2017183724A1 (ja) 2017-10-26
SG11201809242VA (en) 2018-11-29
CN109312329B (zh) 2023-11-21
ES2919961T3 (es) 2022-07-29
US20200377910A1 (en) 2020-12-03
JPWO2017183724A1 (ja) 2019-02-28
EP3447139B1 (en) 2022-06-08
CA3021281A1 (en) 2017-10-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
BR112018071376A2 (pt) método para modificar um sítio alvejado de um dna de cadeia dupla, complexo enzimático modificador de ácido nucleico, e, ácido nucleico
BR112015031639A2 (pt) integração alvo
BR112012019396A2 (pt) método e kit para amplificar um ácido nucleico.
BR112019006388A2 (pt) enzimas modificadoras de ácido nucleico guiadas por rna e métodos de uso das mesmas
BR112018004636A2 (pt) método para modificação de um sítio alvejado em um dna de fita dupla de uma bactéria gram-positiva, complexo de enzima modificadora de ácido nucleico, e, ácido nucleico
BRPI0510811A (pt) nano-pcr: métodos e dispositivos para amplificação e detecção de ácido nucléico
WO2014186585A3 (en) Methods and compositions for treatment of a genetic condition
BR112018007177A2 (pt) edição de genoma multiplexado
BR112019006384A2 (pt) enzimas modificadoras de ácido nucleico guiadas por rna e métodos de uso das mesmas
EP4257596A3 (en) Coumarin compounds and their uses as fluorescent labels
CA2884084C (en) Fad2 performance loci and corresponding target site specific binding proteins capable of inducing targeted breaks
BR112012017267A2 (pt) ácidos graxos de cadeia ramificada dispersos e produção biológica dos mesmos
BR122022007092B8 (pt) Método para construir um perfil de dna, método para construir uma biblioteca de ácido nucléico, biblioteca de ácido nucléico, pluralidade de iniciadores e kit
WO2015157555A3 (en) Import of unnatural or modified nucleoside triphosphates into cells via nucleic acid triphosphate transporters
BR112014029441A2 (pt) rna tendo como alvo dna; polinucleotídeo de dna; vetor de expressão recombinante; célula hospedeira geneticamente modificada in vitro; polipeptídeo de modificação dirigido a sítio variante; polipeptídeo de modificação dirigido a sítio quimérico; polinucleotídeo de rna; célula modificada geneticamente; organismo não humano transgênico cujo genoma compreende um transgene; composição; método de modificação específica de sítio de um dna de alvo; método de modulação de transcrição específica de sítio dentro de um dna de alvo; método de modificação específica de sítio em dna de alvo; método de promover clivagem e modificação específica de sítio de um dna de alvo em uma célula; método de produzir uma célula modificada geneticamente em um sujeito; método de modificar dna de alvo em uma célula modificada geneticamente; kit; kit para direcionar dna de alvo; método de modular seletivamente transcrição de um dna de alvo em uma célula hospedeira; ácido nucleico isolado; célula hospedeira modificada geneticamente; e biblioteca de ácidos nucleicos
WO2014022702A3 (en) Methods and compositions for controlling gene expression by rna processing
BR112015030491A8 (pt) método de modular a expressão de um ácido nucleico alvo em uma célula, bem como método de alterar um ácido nucleico de dna alvo em uma célula
BR112015006255A2 (pt) Métodos para a produção de produtos químicos e derivados dos mesmos
NZ705745A (en) Fad3 performance loci and corresponding target site specific binding proteins capable of inducing targeted breaks
WO2014145296A3 (en) Nuclei acid amplification
BR112017025785A2 (pt) ?biossensor, enzima de glicose desidrogenase, enzima oxirredutase, polipeptídeo, composição ou kit, método de detecção de uma molécula alvo, método de diagnóstico de uma doença ou condição em um organismo, dispositivo de detecção, ácido nucleico isolado, construção gênica, célula hospedeira e método para produzir um biossensor?
BR112018011902A2 (pt) método de fermentação, levedura geneticamente modificada, construto de ácido nucleico, vetor, célula hospedeira, meio de fermentação e utilização da levedura geneticamente modificada
BR112012029355A2 (pt) sistema à base de ácido nucleico para propagar informações e método para melhorar sistema de computação molecular à base de ácido nucleico
BR112017009223A2 (pt) módulo de biorreator eletroquímico melhorado e uso do mesmo
MX2017000391A (es) Tecnologia de amplificacion de adn.

Legal Events

Date Code Title Description
B350 Update of information on the portal [chapter 15.35 patent gazette]
B06W Patent application suspended after preliminary examination (for patents with searches from other patent authorities) chapter 6.23 patent gazette]