BR112015019425A2 - Métodos e kits para identificar e ajustar desvio no sequenciamento de amostras de polinucleotídeos - Google Patents

Métodos e kits para identificar e ajustar desvio no sequenciamento de amostras de polinucleotídeos

Info

Publication number
BR112015019425A2
BR112015019425A2 BR112015019425A BR112015019425A BR112015019425A2 BR 112015019425 A2 BR112015019425 A2 BR 112015019425A2 BR 112015019425 A BR112015019425 A BR 112015019425A BR 112015019425 A BR112015019425 A BR 112015019425A BR 112015019425 A2 BR112015019425 A2 BR 112015019425A2
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
methods
kits
identify
polynucleotide
adjust
Prior art date
Application number
BR112015019425A
Other languages
English (en)
Inventor
Van Criekinge Wim
Original Assignee
Mdxhealth Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Mdxhealth Inc filed Critical Mdxhealth Inc
Publication of BR112015019425A2 publication Critical patent/BR112015019425A2/pt

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869Methods for sequencing
    • C12Q1/6874Methods for sequencing involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869Methods for sequencing
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/154Methylation markers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers

Abstract

MÉTODOS E KITS PARA IDENTIFICAR E AJUSTAR DESVIO NO SEQUENCIAMENTO DE AMOSTRAS DE POLINUCLEOTÍDEOS. Métodos para a determinação de um ou mais nucleotídeos em uma ou mais posições de nucleotídeos de uma amostra de polinucleotídeo são revelados, a amostra de polinucleotídeo compreendendo polinucleotídeos heterogêneos possuindo diferentes nucleotídeos nas posições de nucleotídeos. Os métodos descritos podem ser empregados para controlar o desvio de sequenciamento durante o sequenciamento da amostra de polinucleotídeo. Amostras adequadas podem incluir amostras de pacientes para o uso no diagnóstico, prognóstico e tratamento do paciente
BR112015019425A 2013-02-12 2014-02-12 Métodos e kits para identificar e ajustar desvio no sequenciamento de amostras de polinucleotídeos BR112015019425A2 (pt)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201361763771P 2013-02-12 2013-02-12
PCT/IB2014/058942 WO2014125421A1 (en) 2013-02-12 2014-02-12 Methods and kits for identifying and adjusting for bias in sequencing of polynucleotide samples

Publications (1)

Publication Number Publication Date
BR112015019425A2 true BR112015019425A2 (pt) 2017-08-22

Family

ID=50239704

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BR112015019425A BR112015019425A2 (pt) 2013-02-12 2014-02-12 Métodos e kits para identificar e ajustar desvio no sequenciamento de amostras de polinucleotídeos

Country Status (10)

Country Link
US (1) US10119166B2 (pt)
EP (1) EP2956553B1 (pt)
JP (1) JP2016506755A (pt)
KR (1) KR20160002705A (pt)
CN (1) CN105473734A (pt)
AU (1) AU2014217518A1 (pt)
BR (1) BR112015019425A2 (pt)
CA (1) CA2901120C (pt)
IL (1) IL240535A0 (pt)
WO (1) WO2014125421A1 (pt)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10036316B2 (en) * 2012-10-02 2018-07-31 United Technologies Corporation Geared turbofan engine with high compressor exit temperature
CN105893788B (zh) * 2016-04-26 2018-04-17 哈尔滨工程大学 利用参考基因组信息的半导体测序平台的测序数据校正方法
EP3452618A4 (en) 2016-05-06 2019-12-11 Regents of the University of Minnesota ANALYTICAL STANDARDS AND METHOD FOR USE THEREOF
EP3596236B1 (en) * 2017-03-17 2021-06-02 MDxHealth SA Mgmt epigenetic deep-sequencing assay

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2002539849A (ja) * 1999-03-26 2002-11-26 ホワイトヘッド インスチチュート フォアー バイオメディカル リサーチ ユニバーサルアレイ
US20060275782A1 (en) 1999-04-20 2006-12-07 Illumina, Inc. Detection of nucleic acid reactions on bead arrays
US20100035249A1 (en) * 2008-08-05 2010-02-11 Kabushiki Kaisha Dnaform Rna sequencing and analysis using solid support

Also Published As

Publication number Publication date
IL240535A0 (en) 2015-10-29
AU2014217518A1 (en) 2015-09-03
EP2956553A1 (en) 2015-12-23
EP2956553B1 (en) 2020-01-08
CN105473734A (zh) 2016-04-06
US10119166B2 (en) 2018-11-06
CA2901120A1 (en) 2014-08-21
KR20160002705A (ko) 2016-01-08
US20160017415A1 (en) 2016-01-21
CA2901120C (en) 2021-05-04
JP2016506755A (ja) 2016-03-07
WO2014125421A1 (en) 2014-08-21

Similar Documents

Publication Publication Date Title
BR112018069849A2 (pt) kit, dispositivo e método para a detecção de câncer pancreático precoce ou de lesão precursora do câncer pancreático
BR112015023120A2 (pt) método para identificar um indivíduo com uma doença ou disfunção, método para prever a responsividade de um indivíduo com uma doença ou disfunção, método para determinar a probabilidade de que um indivíduo com uma doença ou disfunção exibirá benefício do tratamento, método para selecionar uma terapia, usos de um antagonista de ligação do eixo pd-l1, ensaio para identificar um indivíduo com uma doença, kit de diagnóstico, método para avaliar uma resposta ao tratamento e método para monitorar a resposta de um indivíduo tratado
BR112016001457A2 (pt) Inibidores de fatores de transcrição e usos dos mesmos
BR112017025254A2 (pt) ?métodos para detecção de pelo menos uma mutação em uma pluralidade de genes relacionados ao câncer, selecionar um indivíduo para tratamento e prever a probabilidade de capacidade de resposta ao tratamento?
MX2017010836A (es) Panel biomarcador para la deteccion de cancer.
BR112015001052B8 (pt) Métodos para distinguir um polinucleotídeo alvo,sensor para distinguir um polinucleotídeo alvo, e, uso de um construto
EP4303314A3 (en) Polypeptide tagged nucleotides and use thereof in nucleic acid sequencing by nanopore detection
BR112016029583A2 (pt) ?kit ou dispositivo para a detecção de câncer esofágico e método de detecção?
BR112013003391A2 (pt) biomarcadores de câncer pancreático e usos dos mesmos
EP3744859A3 (en) Microrna biomarker for the diagnosis of gastric cancer
BR112016017986A2 (pt) anticorpos isolados, ácido nucleico isolado, célula hospedeira, métodos de produção de um anticorpo, de tratamento do câncer, de tratamento de uma doença e de detecção de jagged1 humana em uma amostra biológica, imunoconjugado, formulação farmacêutica e uso do anticorpo
BR112016018044A2 (pt) teste de diagnóstico molecular para prever resposta às drogas antiangiogênicas e prognóstico de câncer
MY198081A (en) Urinalysis device and dry reagent for quantitative urinalysis
SG10201903822XA (en) Method for the enrichment of circulating tumor dna
BR112018013430A2 (pt) ?métodos para detectar pelo menos uma mutação em uma pluralidade de genes relacionados a câncer de tireoide, para selecionar um sujeito que tem nódulos na tireoide e para prognosticar risco de malignidade, e, kit?
EA201400117A1 (ru) Способы и нуклеиновые кислоты для определения прогноза у больных раком
BR112014006432A2 (pt) biomarcadores do câncer de pulmão e seus usos
BR112017016808A2 (pt) biomarcadores para câncer pancreático
BR112016016249A2 (pt) Métodos de análise imunocromatográfica, dispositivo de análise imunocromatográfica e kit
TR201909951T4 (tr) Kanser olduğundan şüphelenilen bir hastanın aflibersept ile tedavisinin sonucunun öngörülmesine yönelik yöntem.
EA201790769A1 (ru) Определение уровней гликозаминогликанов методом масс-спектрометрии
BR112016019740A2 (pt) monitoramento do estado de inflamação
BR112015019425A2 (pt) Métodos e kits para identificar e ajustar desvio no sequenciamento de amostras de polinucleotídeos
BR112017008218A2 (pt) métodos e composições para diagnóstico e prognóstico de lesão renal e insuficiência renal
BR112018008799A2 (pt) método de prognóstico

Legal Events

Date Code Title Description
B08F Application dismissed because of non-payment of annual fees [chapter 8.6 patent gazette]
B08K Patent lapsed as no evidence of payment of the annual fee has been furnished to inpi [chapter 8.11 patent gazette]