BG98989A - Защитни антигени срещу инфекции от еснinососсus grаnulоsus и ваксини,съдържащи такива антигени - Google Patents
Защитни антигени срещу инфекции от еснinососсus grаnulоsus и ваксини,съдържащи такива антигени Download PDFInfo
- Publication number
- BG98989A BG98989A BG98989A BG9898994A BG98989A BG 98989 A BG98989 A BG 98989A BG 98989 A BG98989 A BG 98989A BG 9898994 A BG9898994 A BG 9898994A BG 98989 A BG98989 A BG 98989A
- Authority
- BG
- Bulgaria
- Prior art keywords
- leu
- thr
- vai
- sir
- glu
- Prior art date
Links
- 239000000427 antigen Substances 0.000 title claims abstract description 64
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 title claims abstract description 64
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 title claims abstract description 64
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 title claims abstract description 27
- 208000009366 Echinococcosis Diseases 0.000 title description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 67
- 241000244170 Echinococcus granulosus Species 0.000 claims abstract description 58
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 56
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 56
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 claims abstract description 47
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 claims abstract description 47
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims abstract description 31
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 claims abstract description 24
- 241000244160 Echinococcus Species 0.000 claims abstract description 16
- 244000045947 parasite Species 0.000 claims abstract description 16
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 56
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 41
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 36
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims description 32
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 32
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 27
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 claims description 27
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 25
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 23
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 23
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 17
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 16
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 claims description 15
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 15
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 14
- GADKFYNESXNRLC-WDSKDSINSA-N Asn-Pro Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O GADKFYNESXNRLC-WDSKDSINSA-N 0.000 claims description 12
- CJUKAWUWBZCTDQ-SRVKXCTJSA-N Asp-Leu-Lys Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O CJUKAWUWBZCTDQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 12
- YFGUZQQCSDZRBN-DCAQKATOSA-N Asp-Pro-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O YFGUZQQCSDZRBN-DCAQKATOSA-N 0.000 claims description 12
- TWYSSILQABLLME-HJGDQZAQSA-N Glu-Thr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O TWYSSILQABLLME-HJGDQZAQSA-N 0.000 claims description 12
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 claims description 12
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 claims description 12
- MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N 0.000 claims description 11
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 claims description 11
- ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N Leu-Phe-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N 0.000 claims description 10
- DEGCBBCMYWNJNA-RHYQMDGZSA-N Thr-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O DEGCBBCMYWNJNA-RHYQMDGZSA-N 0.000 claims description 10
- VBMOVTMNHWPZJR-SUSMZKCASA-N Thr-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VBMOVTMNHWPZJR-SUSMZKCASA-N 0.000 claims description 10
- PWIQCLSQVQBOQV-AAEUAGOBSA-N Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 PWIQCLSQVQBOQV-AAEUAGOBSA-N 0.000 claims description 10
- 108010025826 prolyl-leucyl-arginine Proteins 0.000 claims description 10
- ZRHDPZAAWLXXIR-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZRHDPZAAWLXXIR-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 9
- WOAQYWUEUYMVGK-ULQDDVLXSA-N Tyr-Lys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O WOAQYWUEUYMVGK-ULQDDVLXSA-N 0.000 claims description 9
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 claims description 9
- DIIGDGJKTMLQQW-IHRRRGAJSA-N Arg-Lys-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N DIIGDGJKTMLQQW-IHRRRGAJSA-N 0.000 claims description 8
- MFYLRRCYBBJYPI-JYJNAYRXSA-N Glu-Tyr-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O MFYLRRCYBBJYPI-JYJNAYRXSA-N 0.000 claims description 8
- 101710194807 Protective antigen Proteins 0.000 claims description 8
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 8
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 8
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims description 8
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 8
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 8
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 8
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 claims description 7
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 claims description 7
- NVTPVQLIZCOJFK-FOHZUACHSA-N Gly-Thr-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NVTPVQLIZCOJFK-FOHZUACHSA-N 0.000 claims description 7
- MECSIDWUTYRHRJ-KKUMJFAQSA-N Phe-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MECSIDWUTYRHRJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 claims description 7
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 claims description 7
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 7
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 claims description 7
- VCSABYLVNWQYQE-UHFFFAOYSA-N Ala-Lys-Lys Natural products NCCCCC(NC(=O)C(N)C)C(=O)NC(CCCCN)C(O)=O VCSABYLVNWQYQE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 6
- ZUXQFMVPAYGPFJ-JXUBOQSCSA-N Thr-Ala-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZUXQFMVPAYGPFJ-JXUBOQSCSA-N 0.000 claims description 6
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 claims description 6
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 claims description 6
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 claims description 6
- KEVYYIMVELOXCT-KBPBESRZSA-N Leu-Gly-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=CC=C1 KEVYYIMVELOXCT-KBPBESRZSA-N 0.000 claims description 5
- IPSDPDAOSAEWCN-RHYQMDGZSA-N Lys-Met-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IPSDPDAOSAEWCN-RHYQMDGZSA-N 0.000 claims description 5
- KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N Met-Thr Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C([O-])=O KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N 0.000 claims description 5
- IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N Thr-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N 0.000 claims description 5
- 108010051673 leucyl-glycyl-phenylalanine Proteins 0.000 claims description 5
- 108010090333 leucyl-lysyl-proline Proteins 0.000 claims description 5
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 4
- 241000244163 Echinococcus multilocularis Species 0.000 claims description 4
- JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N Glu-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 4
- PPBKJAQJAUHZKX-SRVKXCTJSA-N Leu-Cys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C PPBKJAQJAUHZKX-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 4
- 241000244159 Taenia saginata Species 0.000 claims description 4
- AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N 0.000 claims description 4
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 claims description 4
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 claims description 4
- 241000356560 Taenia multiceps Species 0.000 claims description 3
- 241000244157 Taenia solium Species 0.000 claims description 3
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 3
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 claims description 3
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 claims description 3
- QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N Ala-Gly-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N 0.000 claims description 2
- FHETWELNCBMRMG-HJGDQZAQSA-N Asn-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FHETWELNCBMRMG-HJGDQZAQSA-N 0.000 claims description 2
- KLSUAWUZBMAZCL-RHYQMDGZSA-N Leu-Thr-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O KLSUAWUZBMAZCL-RHYQMDGZSA-N 0.000 claims description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 2
- 229960004854 viral vaccine Drugs 0.000 claims description 2
- JHSRJMUJOGLIHK-GUBZILKMSA-N Glu-Met-Glu Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N JHSRJMUJOGLIHK-GUBZILKMSA-N 0.000 claims 5
- YYPFZVIXAVDHIK-IUCAKERBSA-N Gly-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CN YYPFZVIXAVDHIK-IUCAKERBSA-N 0.000 claims 4
- WSXTWLJHTLRFLW-SRVKXCTJSA-N Lys-Ala-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O WSXTWLJHTLRFLW-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims 4
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 claims 4
- JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N Glu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N 0.000 claims 3
- VEPBEGNDJYANCF-QWRGUYRKSA-N Gly-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCCN VEPBEGNDJYANCF-QWRGUYRKSA-N 0.000 claims 3
- NHDVNAKDACFHPX-GUBZILKMSA-N Pro-Arg-Ala Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O NHDVNAKDACFHPX-GUBZILKMSA-N 0.000 claims 3
- AUXMWYRZQPIXCC-KNIFDHDWSA-N (2s)-2-amino-4-methylpentanoic acid;(2s)-2-aminopropanoic acid Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O.CC(C)C[C@H](N)C(O)=O AUXMWYRZQPIXCC-KNIFDHDWSA-N 0.000 claims 2
- FBHOPGDGELNWRH-DRZSPHRISA-N Ala-Glu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O FBHOPGDGELNWRH-DRZSPHRISA-N 0.000 claims 2
- MEFILNJXAVSUTO-JXUBOQSCSA-N Ala-Leu-Thr Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MEFILNJXAVSUTO-JXUBOQSCSA-N 0.000 claims 2
- HHRODZSXDXMUHS-LURJTMIESA-N Gly-Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](NC(=O)C[NH3+])C(=O)NCC([O-])=O HHRODZSXDXMUHS-LURJTMIESA-N 0.000 claims 2
- HIZYETOZLYFUFF-BQBZGAKWSA-N Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O HIZYETOZLYFUFF-BQBZGAKWSA-N 0.000 claims 2
- ZMMDPRTXLAEMOD-BZSNNMDCSA-N Lys-His-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O ZMMDPRTXLAEMOD-BZSNNMDCSA-N 0.000 claims 2
- YXHYJEPDKSYPSQ-AVGNSLFASA-N Pro-Leu-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 YXHYJEPDKSYPSQ-AVGNSLFASA-N 0.000 claims 2
- IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N 0.000 claims 2
- XOTBWOCSLMBGMF-SUSMZKCASA-N Thr-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XOTBWOCSLMBGMF-SUSMZKCASA-N 0.000 claims 2
- CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N Ala-Gly Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N 0.000 claims 1
- BLIMFWGRQKRCGT-YUMQZZPRSA-N Ala-Gly-Lys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN BLIMFWGRQKRCGT-YUMQZZPRSA-N 0.000 claims 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 claims 1
- VQXAVLQBQJMENB-SRVKXCTJSA-N Lys-Glu-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O VQXAVLQBQJMENB-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims 1
- MUAFDCVOHYAFNG-RCWTZXSCSA-N Thr-Pro-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O MUAFDCVOHYAFNG-RCWTZXSCSA-N 0.000 claims 1
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 claims 1
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 claims 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 claims 1
- 241000244155 Taenia Species 0.000 abstract 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 31
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 22
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 22
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 19
- 235000013601 eggs Nutrition 0.000 description 18
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 16
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 16
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Natural products NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 15
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 12
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 11
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 11
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 11
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 11
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 11
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 11
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 11
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 10
- AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M caesium chloride Chemical compound [Cl-].[Cs+] AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- 208000031513 cyst Diseases 0.000 description 10
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 10
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 9
- 241000283903 Ovis aries Species 0.000 description 9
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 9
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 9
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 9
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 8
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 8
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 8
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 7
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 7
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 7
- 239000000047 product Substances 0.000 description 7
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 7
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 6
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 6
- 201000003808 Cystic echinococcosis Diseases 0.000 description 6
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 235000019687 Lamb Nutrition 0.000 description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 6
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 6
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 6
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241000829100 Macaca mulatta polyomavirus 1 Species 0.000 description 5
- 101000702488 Rattus norvegicus High affinity cationic amino acid transporter 1 Proteins 0.000 description 5
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 5
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 5
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 5
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 5
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 5
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 5
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 5
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 5
- 238000011160 research Methods 0.000 description 5
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 5
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 5
- 102100039217 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal Human genes 0.000 description 4
- 101100153048 Homo sapiens ACAA1 gene Proteins 0.000 description 4
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 4
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 4
- 229960001484 edetic acid Drugs 0.000 description 4
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 4
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 4
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 4
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000242722 Cestoda Species 0.000 description 3
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 3
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 3
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 3
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 3
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 3
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 3
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 3
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 3
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 3
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 3
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 3
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 3
- VCSABYLVNWQYQE-SRVKXCTJSA-N Ala-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O VCSABYLVNWQYQE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- KWKQGHSSNHPGOW-BQBZGAKWSA-N Arg-Ala-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O KWKQGHSSNHPGOW-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- KQBVNNAPIURMPD-PEFMBERDSA-N Asp-Ile-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KQBVNNAPIURMPD-PEFMBERDSA-N 0.000 description 2
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 2
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 2
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N Guanidine Chemical compound NC(N)=N ZRALSGWEFCBTJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MWAJSVTZZOUOBU-IHRRRGAJSA-N His-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MWAJSVTZZOUOBU-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 2
- QOOWRKBDDXQRHC-BQBZGAKWSA-N L-lysyl-L-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QOOWRKBDDXQRHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 description 2
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 description 2
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 2
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 2
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 2
- QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N Thr-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 2
- VTCKHZJKWQENKX-KBPBESRZSA-N Tyr-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O VTCKHZJKWQENKX-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- 101710123661 Venom allergen 5 Proteins 0.000 description 2
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- 238000001261 affinity purification Methods 0.000 description 2
- FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N all-trans-retinol Chemical compound OC\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N 0.000 description 2
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000010805 cDNA synthesis kit Methods 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 239000002532 enzyme inhibitor Substances 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 2
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 2
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 229960003180 glutathione Drugs 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 2
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 2
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 2
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 2
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 2
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 2
- 239000002198 insoluble material Substances 0.000 description 2
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 2
- 230000017074 necrotic cell death Effects 0.000 description 2
- 229960005030 other vaccine in atc Drugs 0.000 description 2
- 238000012856 packing Methods 0.000 description 2
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 2
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 2
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- -1 propylene glycine Chemical compound 0.000 description 2
- 230000009993 protective function Effects 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 description 2
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 description 2
- 235000017709 saponins Nutrition 0.000 description 2
- FSYKKLYZXJSNPZ-UHFFFAOYSA-N sarcosine Chemical compound C[NH2+]CC([O-])=O FSYKKLYZXJSNPZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 235000020183 skimmed milk Nutrition 0.000 description 2
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 2
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 2
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 2
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 2
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 2
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RDEIXVOBVLKYNT-VQBXQJRRSA-N (2r,3r,4r,5r)-2-[(1s,2s,3r,4s,6r)-4,6-diamino-3-[(2r,3r,6s)-3-amino-6-(1-aminoethyl)oxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-5-methyl-4-(methylamino)oxane-3,5-diol;(2r,3r,4r,5r)-2-[(1s,2s,3r,4s,6r)-4,6-diamino-3-[(2r,3r,6s)-3-amino-6-(aminomethyl)oxan-2-yl]o Chemical compound OS(O)(=O)=O.O1C[C@@](O)(C)[C@H](NC)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H](CC[C@@H](CN)O2)N)[C@@H](N)C[C@H]1N.O1C[C@@](O)(C)[C@H](NC)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H](CC[C@H](O2)C(C)N)N)[C@@H](N)C[C@H]1N.O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N RDEIXVOBVLKYNT-VQBXQJRRSA-N 0.000 description 1
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 13-cis retinol Natural products OCC=C(C)C=CC=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NKDFYOWSKOHCCO-YPVLXUMRSA-N 20-hydroxyecdysone Chemical compound C1[C@@H](O)[C@@H](O)C[C@]2(C)[C@@H](CC[C@@]3([C@@H]([C@@](C)(O)[C@H](O)CCC(C)(O)C)CC[C@]33O)C)C3=CC(=O)[C@@H]21 NKDFYOWSKOHCCO-YPVLXUMRSA-N 0.000 description 1
- OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 3-phospho-D-glyceric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- OXEUETBFKVCRNP-UHFFFAOYSA-N 9-ethyl-3-carbazolamine Chemical compound NC1=CC=C2N(CC)C3=CC=CC=C3C2=C1 OXEUETBFKVCRNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010042708 Acetylmuramyl-Alanyl-Isoglutamine Proteins 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- 101710187573 Alcohol dehydrogenase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101710133776 Alcohol dehydrogenase class-3 Proteins 0.000 description 1
- 108010039627 Aprotinin Proteins 0.000 description 1
- BHQQRVARKXWXPP-ACZMJKKPSA-N Asn-Asp-Glu Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N BHQQRVARKXWXPP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 238000009010 Bradford assay Methods 0.000 description 1
- 102000017420 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Human genes 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L Carbonate Chemical compound [O-]C([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 108020004638 Circular DNA Proteins 0.000 description 1
- 206010053567 Coagulopathies Diseases 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 206010011732 Cyst Diseases 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 241000305071 Enterobacterales Species 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241001522878 Escherichia coli B Species 0.000 description 1
- 241001646716 Escherichia coli K-12 Species 0.000 description 1
- 241000701533 Escherichia virus T4 Species 0.000 description 1
- 108010014173 Factor X Proteins 0.000 description 1
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N Gly-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- WNZOCXUOGVYYBJ-CDMKHQONSA-N Gly-Phe-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)CN)O WNZOCXUOGVYYBJ-CDMKHQONSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- XMAUFHMAAVTODF-STQMWFEESA-N His-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 XMAUFHMAAVTODF-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- KYFGGRHWLFZXPU-KKUMJFAQSA-N His-Phe-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N KYFGGRHWLFZXPU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 241000701109 Human adenovirus 2 Species 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 1
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 1
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 description 1
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- RTIRBWJPYJYTLO-MELADBBJSA-N Leu-Lys-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N RTIRBWJPYJYTLO-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- UQRZFMQQXXJTTF-AVGNSLFASA-N Lys-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UQRZFMQQXXJTTF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 241000713869 Moloney murine leukemia virus Species 0.000 description 1
- 102000016943 Muramidase Human genes 0.000 description 1
- 108010014251 Muramidase Proteins 0.000 description 1
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 description 1
- CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N N-methyl-guanidine Natural products CNC(N)=N CHJJGSNFBQVOTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MQUQNUAYKLCRME-INIZCTEOSA-N N-tosyl-L-phenylalanyl chloromethyl ketone Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1S(=O)(=O)N[C@H](C(=O)CCl)CC1=CC=CC=C1 MQUQNUAYKLCRME-INIZCTEOSA-N 0.000 description 1
- 238000011887 Necropsy Methods 0.000 description 1
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000609499 Palicourea Species 0.000 description 1
- 208000030852 Parasitic disease Diseases 0.000 description 1
- IPVPGAADZXRZSH-RNXOBYDBSA-N Phe-Tyr-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O IPVPGAADZXRZSH-RNXOBYDBSA-N 0.000 description 1
- 102000045595 Phosphoprotein Phosphatases Human genes 0.000 description 1
- 108700019535 Phosphoprotein Phosphatases Proteins 0.000 description 1
- 208000000474 Poliomyelitis Diseases 0.000 description 1
- 241000276498 Pollachius virens Species 0.000 description 1
- 108010021757 Polynucleotide 5'-Hydroxyl-Kinase Proteins 0.000 description 1
- 102000008422 Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase Human genes 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- UUHXBJHVTVGSKM-BQBZGAKWSA-N Pro-Gly-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O UUHXBJHVTVGSKM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- MHHQQZIFLWFZGR-DCAQKATOSA-N Pro-Lys-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MHHQQZIFLWFZGR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 102000007327 Protamines Human genes 0.000 description 1
- 108010007568 Protamines Proteins 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 1
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 1
- 108010077895 Sarcosine Proteins 0.000 description 1
- VVKVHAOOUGNDPJ-SRVKXCTJSA-N Ser-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VVKVHAOOUGNDPJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 241001672171 Taenia hydatigena Species 0.000 description 1
- 241000356557 Taenia serialis Species 0.000 description 1
- 239000004809 Teflon Substances 0.000 description 1
- 229920006362 Teflon® Polymers 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N Thr-Pro-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- 229920000392 Zymosan Polymers 0.000 description 1
- VLSOAXRVHARBEQ-UHFFFAOYSA-N [4-fluoro-2-(hydroxymethyl)phenyl]methanol Chemical compound OCC1=CC=C(F)C=C1CO VLSOAXRVHARBEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 239000008186 active pharmaceutical agent Substances 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N 0.000 description 1
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K aluminium phosphate Chemical compound O1[Al]2OP1(=O)O2 ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 230000000507 anthelmentic effect Effects 0.000 description 1
- 229940124339 anthelmintic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000000921 anthelmintic agent Substances 0.000 description 1
- 229960004405 aprotinin Drugs 0.000 description 1
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 108010058966 bacteriophage T7 induced DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 239000013602 bacteriophage vector Substances 0.000 description 1
- 239000000440 bentonite Substances 0.000 description 1
- 229910000278 bentonite Inorganic materials 0.000 description 1
- SVPXDRXYRYOSEX-UHFFFAOYSA-N bentoquatam Chemical compound O.O=[Si]=O.O=[Al]O[Al]=O SVPXDRXYRYOSEX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- 210000000941 bile Anatomy 0.000 description 1
- 239000001045 blue dye Substances 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 239000007975 buffered saline Substances 0.000 description 1
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960001714 calcium phosphate Drugs 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000035602 clotting Effects 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- 230000000593 degrading effect Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- FFYPMLJYZAEMQB-UHFFFAOYSA-N diethyl pyrocarbonate Chemical compound CCOC(=O)OC(=O)OCC FFYPMLJYZAEMQB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N dimethylaminoamidine Natural products CN(C)C(N)=N SWSQBOPZIKWTGO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 230000007515 enzymatic degradation Effects 0.000 description 1
- 238000012869 ethanol precipitation Methods 0.000 description 1
- DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N ethyl mercaptane Natural products CCS DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 1
- 238000010304 firing Methods 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 230000006870 function Effects 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 229960005150 glycerol Drugs 0.000 description 1
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 1
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 239000011544 gradient gel Substances 0.000 description 1
- 229960004198 guanidine Drugs 0.000 description 1
- 229960000789 guanidine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000038280 herbivores Species 0.000 description 1
- 239000012145 high-salt buffer Substances 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N hydroxyacetaldehyde Natural products OCC=O WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000521 hyperimmunizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010324 immunological assay Methods 0.000 description 1
- 229960001438 immunostimulant agent Drugs 0.000 description 1
- 239000003022 immunostimulating agent Substances 0.000 description 1
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 description 1
- 238000005470 impregnation Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- ZPNFWUPYTFPOJU-LPYSRVMUSA-N iniprol Chemical compound C([C@H]1C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@H]2CSSC[C@H]3C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@H](C(N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC(O)=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC(O)=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC=4C=CC=CC=4)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC2=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CC=2C=CC=CC=2)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H]2N(CCC2)C(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N3)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@H](C(=O)N1)C(C)C)[C@@H](C)O)[C@@H](C)CC)=O)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 ZPNFWUPYTFPOJU-LPYSRVMUSA-N 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 229940047124 interferons Drugs 0.000 description 1
- 229940047122 interleukins Drugs 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 239000004325 lysozyme Substances 0.000 description 1
- 229960000274 lysozyme Drugs 0.000 description 1
- 235000010335 lysozyme Nutrition 0.000 description 1
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 229940126619 mouse monoclonal antibody Drugs 0.000 description 1
- BSOQXXWZTUDTEL-ZUYCGGNHSA-N muramyl dipeptide Chemical compound OC(=O)CC[C@H](C(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](C)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H](O)[C@@H]1NC(C)=O BSOQXXWZTUDTEL-ZUYCGGNHSA-N 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- YFCUZWYIPBUQBD-ZOWNYOTGSA-N n-[(3s)-7-amino-1-chloro-2-oxoheptan-3-yl]-4-methylbenzenesulfonamide;hydron;chloride Chemical compound Cl.CC1=CC=C(S(=O)(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)CCl)C=C1 YFCUZWYIPBUQBD-ZOWNYOTGSA-N 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 238000002559 palpation Methods 0.000 description 1
- 230000003071 parasitic effect Effects 0.000 description 1
- 238000009304 pastoral farming Methods 0.000 description 1
- 239000003415 peat Substances 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 229950000964 pepstatin Drugs 0.000 description 1
- 108010091212 pepstatin Proteins 0.000 description 1
- FAXGPCHRFPCXOO-LXTPJMTPSA-N pepstatin A Chemical compound OC(=O)C[C@H](O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C[C@H](O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CC(C)C FAXGPCHRFPCXOO-LXTPJMTPSA-N 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 229920000867 polyelectrolyte Polymers 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 244000062645 predators Species 0.000 description 1
- QQONPFPTGQHPMA-UHFFFAOYSA-N propylene Natural products CC=C QQONPFPTGQHPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940095050 propylene Drugs 0.000 description 1
- 229940048914 protamine Drugs 0.000 description 1
- 235000004252 protein component Nutrition 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000004153 renaturation Methods 0.000 description 1
- 210000001995 reticulocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000011607 retinol Substances 0.000 description 1
- 229960003471 retinol Drugs 0.000 description 1
- 235000020944 retinol Nutrition 0.000 description 1
- 108020004418 ribosomal RNA Proteins 0.000 description 1
- 229940043230 sarcosine Drugs 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 229960002920 sorbitol Drugs 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 238000012549 training Methods 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 101150108727 trpl gene Proteins 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/43504—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates
- C07K14/43536—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates from worms
- C07K14/4355—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates from worms from cestodes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Oncology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Изобретението се отнася до антигенни полипептиди или пептидни фрагменти и техни варианти, които могат да се използват като ваксина за защита от инфекции, причинени от паразити от рода еснinососсus или таеniа, по-специално инфекции с е.grаnulоsus. Антигените се получават чрез експресия на кодиращатаги днк в рекомбинантна клетка гостоприемник.
Description
ОБЛАСТ НА ТЕХНИКАТА
Този патент се отнася до защитни антигени срещу инфекции причинени от Echinococcus granulosus, до ваксини съдържащи такива антигени, както и до методи, предпазващи гостоприемници податливи на паразитни инфекции причинявани от Echinococcus и Taenii.
ПРЕДШЕСТВУВАНИ) СЪСТОЯНИЕ НА ТЕХНИКАТА
Ехинококовите болести се причиняват от заразяване с ларви /метацестоден стадий/ на тении принадлежащи към род Echinococcus. Предаването става в циклите хищник - жертва при бозайници, като това се осъществява между месоядни гостоприемници и тревопасни или всеядни междинни гостоприемници.
От тениите Echinococcus, най-значими са Echinococcus granulosus. Те са причината за цестозната болест /ЦБ/ и се предават между домашни кучета и домашни тревопасни, като овце и крави, като хората също могат да бъдат междинни гостоприемници, но обикновено не допринасят за жизнения им цикъл. В резултат на това, Е. granulosus е много широко разпространен в географски смисъл и неговото разпределение е в тясна връзка с тези области в света, където отглеждането на селскостопански животни е главната стопанска дейност.
Следователно може да се каже, че ЦБ е важна ендемична болест в широки региони на Южна
Америка,
Африка, Австралия,
Централна
Европа,
Централна Азия,
Средиземноморието, включително и Северна Африка
Някои страни сега се опитват да контролират ЦБ чрез обучаване собствениците на кучета и редовно анти хелминтологично третиране на кучетата, като най-значими гостоприемници. Обаче, въпреки че подобни програми са били частично успешни, окончателното решаване на проблема се оказа трудно за постигане.
Един по-добър подход за контрол над ЦБ включва използуването на ваксина, която въздействува върху цистния стадий от жизнения цикъл на
Е.
granulosus в междинния гостоприемник. Този подход има това предимство, че предаването на инфекцията на кучетата чрез консумиране на храна, заразена с цисти, се предотвратява. В резултат на това окончателното премахване на болестта изглежда една реална възможност.
Настоящето изобретение е насочено предимно към подхода, включващ използуване на ваксина.
Обаче, за да се получи комерсионално-достъпна ваксина, е необходимо да се идентифицират специфични защитни антигени срещу Е. granulosus. Въпреки, че досегашните изследвания (Gemmell М A, Immunology Ц 325-335 (1966); Heath et al., J. Parasitol ξ£_ (6) 797-799 (1981)) ясно показаха, че онкосферата на Е. granulosus е потентен източник на такива антигени, не бяха идентифицирани такива, които да имат защитни функции.
Международен патент No. PCT/FR91/00563 /публикуван като W092/01051/ се отнася до имуногенен пептид от Е. granulosus, заедно с ДНК секвенция, кодираща този пептид и методите за диагностициране и лечение на ехинококова инфекция с помощта на този пептид. Обаче, описания антиген от Е. granulosus /известен като антиген 5/ няма отношение към онкосферните антигени изследвани от авторите. Освен това авторите са показали, че присъствието на антитела срещу антиген 5 не предпазва агнета срещу инфекция с яйца от Е. granulosus (Heath et al., Int__Journal of__Parasitology 22. 1017-1021 (1992)).
ТЕХНИЧЕСКА СЪЩНОСТ HA ИЗОБРЕТЕНИЕТО
Целта на настоящето изобретение е да се получи специфичен антиген, който да се използува за ваксина срещу инфекции с Е. granulosus или поне обществото да има един полезен избор.
От една страна настоящето изобретение предлага един антигенен полипептид с молекулно тегло 23-25 кД, изчислено чрез SDS-PAGE, включващ от четвъртата до седемдесет и седмата аминокиселини, съгласно секвенцията от Фиг. 4 и можещ да предизвика защитна имунологична реакция срещу инфекция от Е.
granulosus в даден податлив гостоприемник, или от друга един пептиден фрагмент или негов вариант, който има еквивалентна защитна имунологична активност.
В един по-добър вариант, полипептида включва аминокиселини от 1 до 154 от секвенцията на Фиг. 4.
В един още по-добър вариант, изобретението се състои от пептиден фрагмент имащ част или цялата аминокиселинна секвенция от Фиг. 4.
Полипептида или пептидния фрагмент е продукт на кодираща нуклеотидна секвенция в клетката гостоприемник.
В по-нататъшен аспект изобретението се състои от смес от вещества, способни да предизвикат защитна имунологична реакция срещу инфекция от Е. granulosus в чувствителни гостоприемници и която основно съдържа компонент, подбран от група състояща се от:
/а/ полипептида, описан по-горе /б/ пептиден фрагмент от /а/, който има еквивалентна защитна имунологична активност; и /в/ вариант на /а/ или /б/, който е бил модифициран чрез включване, заместване или премахване на една или повече аминокиселини и който има еквивалентна имунологична активност.
В един допълнителен аспект, изобретението предлага молекула ДНК, която е подбрана от групата ДНК състояща се от:
/а/ нуклеотидна секвенция, кодираща антигенния полипептид, дефиниран по-горе /б/ нуклеотидна секвенция, кодираща пептиден фрагмент от антигенния полипептид от /а/, който фрагмент има еквивалентна защитна имунологична активност с полипептида от /а/; и /в/ нуклеотидна секвенция, кодираща вариант на полипептида от /а/ или пептида от /б/ в която аминокиселинните секвенции са били модифицирани чрез включване, заместване или премахване на една или повече аминокиселини, като варианта има еквивалентна защитна имунологична активност на полипептида от /а/ или на пептидния фрагмент /б/.
В един предпочитан вариант, молекулата ДНК включва поне нуклеотиди 10 до 233 от секвенцията на Фиг. 4, за предпочитане нуклеотиди 3 до 461 от секвенцията на Фиг. 4 и най-добре нуклеотиди от 1 до 461 от секвенцията на Фиг. 4.
В по-нататъшни аспекти, изобретението предлага рекомбинантни експресионни вектори, които съдържат молекула ДНК, както е описано по-горе, клетки гостоприемници, които са трансформирани с тези вектори и са способни да експресират полипептида, пептидния фрагмент или техни варианти, методи за култивиране на клетките гостоприемници, продуциращи антигенните полипептиди, пептидните фрагменти или техните варианти и получаването на експресираните продукти.
В един друг аспект настоящето изобретение предлага ваксина срещу инфекции с Е. granulosus, състояща се от полипептид, пептиден фрагмент или негов вариант, съгласно описанието по-горе, заедно с имунологично подходящ адювант или носител.
В един допълнителен аспект, настоящето изобретение предлага метод за защита на гостоприемника срещу паразити от рода на Echinococcus или Taeniid, включващ въвеждането в гостоприемника на известно количество полипептид, пептиден фрагмент или негов вариант, който е дефиниран по-горе и който има защитна функция срещу тази инфекция.
Полипептида, пептидния фрагмент или неговия вариант се въвежда в гостоприемника под формата на ваксина, както е описано по-горе.
В допълнителен аспект, изобретението предлага антитяло, специфично за антигенния полипептид, пептидния фрагмент или негов вариант, както е дефинирано по-горе.
Други аспекти на изобретението ще станат очевидни от описанието което следва.
ОПИСАНИЕ НА ПРИЛОЖЕНИТЕ ФИГУРИ
Въпреки, че изобретението обширно е описано по-горе, хората които са добре запознати с тази материя ще преценят, че това изобретение не е ограничено в описаните рамки, но включва и редица варианти за които описваме няколко примера по-долу. Особено добро разбиране на това изобретение може да се постигне ако се разгледат следните илюстрации:
Фигура 1 показва IgG^ и IgG2 овчи антитела, получени в отговор на ваксинация с SDS-PAGE фракции от онкосфери. Групи овце бяха ваксинирани с фракции от онкосфери представляващи SDS-PAGE фракции включващи антигени с определени молекулни тегла: Група 1: Всички молекули под 21кД; Група 2: 23 + 25кД ; Група 3: ЗОкД; Група 4: 34кД; Група 5: 40кД двойка; Група 6: 43кД; Група 7: Всички молекули над 43кД; Група 8: Смес от всички молекули; Група 9: Само адювант; Група 10 овце бяха ваксинирани с нетретирани онкосфери или третирани по начин подобен на групи 1 до 9, и Група 21 бяха ваксинирани със замразен и размразен соникат от активирани онкосфери на Е. granulosus. Фигура 1 показва анализа на имунния отговор на овце от всяка от тези групи, в реакция срещу SDS-PAGE фракции получени при разделяне на екстракти от цели онкосфери.
Фигура 2 показва получените антитела IgG^ и IgG2 в резултат на ваксинация с клонирани антигени. Групи: 11. Клон S2; 12. Клон S3; 13. Клон 48; 14. Клон 95; 15. Клон 101; 15. Клон 119; 17. Клон 123; 18. Смес от всички клонове; 19.Клонове 33, 42 и 85; 20. GST-контрола; 21. Смесен серум от
5 овце имунизирани със | замразен и размразен соникат | от | ||
активирани | онкосфери от | Е. gtanulosus. | Процедурата | на |
имунизация | е идентична с | тази проведена | за антигените | от |
групи 11 до | 20. | |||
Фигура | 3 показва | имунния отговор | IgG£ при овце |
ваксинирани с препаративни SDS-PAGE фракции от онкосферни антигени или с клонирани антигени. Групите са същите както описаните по-горе.
Фигура 4 показва нуклеотидните секвенции и аминокиселинните секвенции на пептиден фрагмент от защитния антиген описан в изобретението. Цифрите от ляво показват нуклеотидния номер в посока 5' към 3' . Цифрите от дясно показват броя на аминокиселините. Транслационния стоп кодон е подчертан.
Ш#’·'
ПОДРОБНА ТЕХНИЧЕСКА CWQCI_.HA ИЗОБЕЕТЕНИЕЩ
Както е описано по-горе, в своя първоначален аспект, това изобретение е насочено към получаване на антиген който защитава даден гостоприемник срещу Е. granulosus, без значение дали се касае за самата тения или нейния цистен стадий. Гостоприемниците които са податливи на инфекции с Е. granulosus са предимно бозайниците, включително и човека. Съответно, примери за гостоприемници, върху които може да се приложи това изобретение са овце, говеда, свине, коне, хора и ДР8
В резултат на изследванията авторите са идентифицирали полипептид от Е. granulosus, който може да участвува в защитата на даден гостоприемник срещу Е. granulosus. Този полипептид от Е. granulosus има молекулно тегло 23-25кД.
Настоящето изобретение също включва антигени, получени от нативния полипептид от Е. granulosus за който стана дума, като тези деривати също имат защитна активност. Тези деривати обикновено са пептидни фрагменти от нативния полипептид които включват протективния епитоп, но могат също така да бъдат функционално еквивалентни варианти на нативния полипептид, модифицирани чрез известни техники, като специфична по място мутагенеза (виж Adelman et al., DNA 2 183 (1983)). Например, възможно е чрез такива методи да се заменят аминокиселини в дадена секвенция с еквивалентни аминокиселини. Такива групи аминокиселини за които че са еквивалентни са:
се знае,
(а) | Ala | Ser | Thr | Pro | Gly; | |||
(Ь) | Asn | Asp | Glu | Gin | / | |||
(в) | His | Arg | Lys | |||||
(г) | Met | Leu | He | Vai | ; и | |||
(д) | Phe | Tyr | Trp | • | ||||
В | един | предпаочитан | вариант, | антигена | е пептиден | |||
фрагмент | имащ | част | или | цялата | аминокиселинна | секвенция от | ||
Фиг. 4 | По- | -добре | е | пептидния | фрагмент | да съдържа | ||
аминокиселини | 4-77 | от | Фиг. | 4. | Още | по-добре | е пептидния | |
фрагмент | да съдържа | аминокиселини | : 1-77 | от Фиг. 4 | . Най добре е |
1-153 пептидния фрагмент да от Фиг.4.
съдържа аминокиселини
Защитния антиген от изобретението може да се получи чрез изолиране от нативния онкосферен комплемент на Е.
granulosus, като се използуват известните техники на очистване. Обаче, ясно е че за получаване на антиген за комерсионални нужди, е необходимо получаването му да стане по синтетичен начин. Този начин включва подхода описан от Merryfield ( J Amer Chem Soc Si 2149-2156 (1963)) c използуването на рекомбинантни ДНК технологии. Посоченият начин беше използуван предимно от авторите на изобретението.
В един по-нататъшен аспект, изобретението се отнася към рекомбинантното получаване на антигенния полипептид или пептид описан по-горе.
Най-общо казано, получаването на защитния антиген предложен в изобретението чрез рекомбинантни ДНК технологии, включва трансформирането на един подходящ гостоприемников организъм или клетка чрез експресионен вектор, който съдържа ДНК секвенция кодираща антигена, последвано от култивиране на трансформирания гостоприемник и последващо очистване на експресирания антиген. Такива техники са описани в Sambrook et al., Molecular Cloning, Second Edition, Cold Spring Harbor Press (1987).
Първоначалната стъпка в метода за рекомбинантно получаване на антигена се състои във включването на ДНК секвенцията, кодираща антигена в експресионен вектор, съдържащ промотор, място за свързване с рибозомите в гостоприемниковата клетка, в която трансформиращата секвенция ще бъде трансформирана. Най-често срещаните примери за такива експресионни вектори са плазмидите, които представляват двойноспирални, кръгови молекули ДНК, които се реплицират автономно в клетката гостоприемник. Ще стане ясно по-нататък обаче, че подходящи вектори, които не са плазмиди, могат да се използуват в това изобретение.
За предпочитане е, клетката гостоприемник, в която ДНК секвенцията кодираща полипептида ще се клонира и експресира, да бъде прокариотна, като например Е. coli. Например Е. coli DH5 (Raleigh Е A et al., Nucleic Acid Research Ifj. (4) 15631575 (1988)), E. coli K12 клон 294 (ATCC 31446), E. coli B,E. coli X1776 (ATCC 31537), E. coli клон ST9 или E. coli JM101 могат да бъдат използувани. Други прокариоти също могат да бъдат използувани, като например бацили от типа на Bacillus subtilis и ентеробактерии като например Salmonella tuphimurium, Serrati a marсеsans или модифицирания щам на Bacille Callmete-Guerin (BCG) от Mucobacterium bovis.
Общо взето, когато клетката е прокариот се използуват ......„ експресионни или клониращи вектори, съдържащи контролни секвенции и секвенции отговорни за репликацията, които са получени от видове, сравними с клетката гостоприемник. Векторът също така може да носи маркерни секвенции, които осигуряват фенотипна селекция на трансформираните клетки. Например Е. coli обикновено се трансформира чрез pBR322, плазмид получен от щам на Е. coli (Bolivar et al., Gene 2 95 (1977)). pBR322 съдържа гени за ампицилинова и тетрациклинова резистентност и така осигурява лесен начин за идетифициране на трансформираните клетки.
При използуване за експресиране, плазмида който ще се експресира, съдържа промотор. Промоторите, които се използуват най-често при конструиране на рекомбинантна ДНК за използуване в прокариотни гостоприемници включват беталактамаза /пеницилаза/ и лактозна промоторна система (Chang et al., Nature 275 615 (1978); Itakura et al., Science 198 1056 (1977); Goeddel et al., Nature 281 544(1979) и триптофанова (trp) промоторна система (Goeddel et al., Nucleic Acid Research S 4057 (1980); EPO Publ No. 0036776). Докато тези са най-често използуваните, други микробиални промотори, като например tac-промотора (Amann et al., Gene 25 167-178 (1983) са били конструирани и използувани, като детайлите около тяхното конструиране и използуване са публикувани и всеки квалифициран експериментатор може да ги използува (Siebenlist et al., Cell 20 269 (1980)).
Освен прокариотите, еукариотните микроби могат също да бъдат използувани. Saccharomyces cerevisiae е най-често използувания еукариотен микроорганизъм, но се използуват също така и други щамове. За експресиране в Saccharomyces найчесто се използува плазмида YRp7 (Stinchcomb et al., Nature 282 39 (1979); Kingsman et al., Gene Z 141 (1979); Tschemper et al., Gene 10 157 (1980). Този плазмид вече съдържа trpl гена, който се използува за селекциониране на мутантния щам дрожди, тъй като той не е в състояние да расте в триптофан, например АТСС No 44076 или РЕР4-1 (Jones, Genetics 85 12 (1977)). Наличието на trpl дефект, което е характерно за генома на дрождите гостоприемник, осигурява по-късно ефективна възможност за установяване на трансформацията чрез растеж при липса на триптофан.
Подходящи промоторни секвенции във векторите при дрождите, включват промоторите за 3-фосфоглицерат киназа (Hitzeman et al., J Biol Chem 255 2073 (1980) или други гликолитични ензими (Hess et al., J Adv Enzvme Rea Z 149 (1968); Holland et al., Biochemistry LZ 4900 (1978). Други промотори, които имат допълнително преимущество да контролират транскрипцията чрез условията на растеж са промоторните области на алкохол дехидрогеназа 2, изоцитохром С, кисела фосфатаза, разграждащи ензими свързани с азотния метаболизъм и вече споменатата глицералдехид-3-фосфат дехидрогеназа, както и ензимите отговорни за използуването на малтоза и глюкоза. Подходящ е всеки един плазмиден вектор, който съдържа промотор, съвместим с този на дрождите, начало на репликация и терминиращи секвенции.
Освен микроорганизмите, клетъчни култури, получени от многоклетъчни организми като например бозайници и насекоми, също могат да се използуват като гостоприемници. По принцип, може да се използува всяка една клетъчна култура, без значение дали произхожда от гръбначни или безгръбначни животни.
Все пак по-голям е интереса към клетките на гръбначните животни, като напоследък те се използуват по
масово в експерименталната практика (Tissue Culture. Academic
Press, Kruse and Patterson, editors (1973)). Примери за такива полезни и удобни клетъчни линии са VERO, HeLa и клетки от овариум на китайски хамстер (СНО). Експресионните вектори за подобни клетки обикновено включват /ако е необходимо/ начало на репликация, промотор, локализиран преди гена който ще се експресира, необходимите места за свързване на рибозомите, места за сплайсинг на РНК, места отговорни за полиаденилиране и секвенции отговорни за терминацията на транскрипцията.
При клетките от бозайниците, контролните функции върху експресионния вектор често се поемат от вирусен материал. Например, често използуваните промотори се получават от полиома, Аденовирус 2 и особено често от Simian Virus 40 (SV40). Ранните и късните промотори на SV40 са особено полезни защото и двата се получават лесно от вируса като фрагмент който съдържа и вирусното начало на репликация (Piers et al., Nature 273 113 (1978). По-малки или по-големи фрагменти от SV40 също могат да бъдат използувани, при условие че в тях е включена приблизително 250 н.дв. секвенция разположена от мястото за Hind III до мястото за Bgl I, локализирани във вирусното начало на репликация. Освен това е възможно, а често пъти е и желателно да се използува промотора или контролните секвенции, които нормално са свързани с желаната генна секвенция, при положение че тези нормални генни секвенции са съвместими с клетъчните системи на гостоприемника.
Източник на репликация (ori) може да се получи или чрез конструиране на вектор, включващ екзогенен ori, като например произхождащ от SV40 или друг вирус (напр. Polyoma, Adeno, VSV, BPV) или може да се осигури от хромозомния репликационен механизъм на клетката гостоприемник. Ако векторът се интегрира в хромозомата на клетката гостоприемник, това обикновено е достатъчно.
При трансформиране на клетката гостоприемник с подходящ вектор, антигенния полипептид или пептид може да се продуцира чрез култивиране на клетките гостоприемници.
След получаване на антигенния полипептид или пептид, като хибриден белтък, той се подлага на очистване до необходимата степен. Процедурата на очистване, която ще се приложи зависи от степента на очистване което е необходимо да се достигне. За нуждите на ваксиниране е достатъчно грубо отделяне на хибридния белтък от остатъчните компоненти на клетъчната култура и антигена може да бъде включен във ваксина в сравнително по-груб вид. Обаче, в случаи когато е необходима по-висока степен на чистота, компонента-носител на хибридния белтък, трябва да бъде отделен от антигенния компонент.Както ще се види от специфичните примери и илюстрации, това може лесно да се направи чрез предварително включване на подходящо за ензимно разграждане място между компонента-носител и антигена.
При положение, че се използуват рекомбинантни техники за получаване на антигенния пептид, първата стъпка е да се получи ДНК кодираща желания продукт. Такива ДНК молекули представляват един по-нататъшен аспект на това изобретение.
За предпочитане е ДНК молекулата от настоящето изобретение да включва поне част или цялата нуклеотидна секвенция от Фиг. 4. В един от вариантите, ДНК молекулата включва поне нуклеотиди 3-233 от секвенцията на Фиг.4. Наидобре е молекулата да съдържа поне нуклеотиди 3-461 от секвенцията на Фиг. 4 ако не цялата нуклеотидна секвенция от Фиг. 4.
Молекулата ДНК от изобретението може да бъде получена или като съдържаща се в една ДНК молекула изолирана от подходящ естествен източник или може да бъде продуцирана като свободна от интрони кДНК с конвенционални техники, като тези използувани в специфичното описание на изобретението. Предпочита се кДНК.
Обаче, както вече беше отбелязано, изобретението също така обхваща и варианти на полипептида които се различават от нативните аминокиселинни секвенции чрез добавяне, заместване или премахване на една или повече аминокиселини. Там където такъв вариант е желетелен, се променя съответно и нуклеотидната секвенция на нативната молекула ДНК. Тази промяна може да бъде направена чрез избирателна синтеза на ДНК, като се използува подходящ синтезатор като например Applied Biosystems DNA Synthesizer или чрез модификация на нативната ДНК , например чрез специфична по място или касетна мутагенеза.
След получаването и, ДНК молекулата се обработва така, че да бъде подходяща за включване заедно с избраните регулаторни секвенции в подходящ вектор за клониране или експресиране. Това включва разрязване на молекулата, обработване на получените краища и повторно зашиване в зависимост от необходимостта.
Разрязването се прави чрез третиране с рестриктази в подходящ буфер. Всеки от големия брой от комерсионално достъпни рестрикционни ензими може да бъде използуван при спазване указанията на производителя. След разрязването, нуклеиновата киселина се получава например чрез утаяване с етанол.
Обработването на краищата на молекулата ДНК се извършва чрез използуването на конвенционални техники. Например ако е необходимо получаването на гладки краища, ДНК може да бъде третирана с ДНК полимераза I (Klenow), екстрахирана с фенол и хлороформ и утаена с алкохол.
Повторното зашиване може да бъде извършено чрез смесване на еквимоларни количества от желаните компоненти, чиито краища са предварително така обработени че да осигуряват точно сдвояване и третиране с подходяща лигаза (напр. Т4
ДНК
Освен защитните антигени и метод за получаването им изобретението предлага и ваксина срещу инфекции с
Е.
granulosus. Такава ваксина включва като основен компонент известно количество от полипептида, пептидния фрагмент или негов вариант от Е.
granulosus, който играе роля за защита на гостоприемника, заедно с подходящ адювант или носител.
Пример за подходящи адюванти са сапонините /или техни производни или техни сходни материали/, мурамилдипептид, трехалозо димиколат, пълен адювант на Freund, непълен адювант
на Freund, някои емулсии, декстран, детлиаминоетил-декстран, алуминиев фосфат, алуминиев хидроксид, бентонит, зимозан, полиелектролити, ретинол, калциев фосфат, протамин, саркозин, глицерол, сорбитол, пропилен гликол, фиксирани мазнини и синтетични естери на висшите мастни киселини.За сапонините е установено, че са много ефективни адюванти.
Ведни допълнителни варианти ваксината може да съдържа и някои терапевтични агенти по отношение на гостоприемника. Такива терапевтични агенти могат да бъдат антихелминти или други ваксини, а също така и имуностимуланти като интерферони или интерлевкини.
Такава ваксина може да бъде въвеждана в гостоприемника по всеки един от широко приетите методи. Все пак найпредпочитания начин за въвеждане на тази ваксина е парентералния. Термина парентерален се използува тук в смисъл на: интравенозно, интрамускулно, интрадермално и подкожно инжектиране. Най-удобно е въвеждането в организма да стане с подкожна инжекция.
Количеството ваксина въвеждана в гостоприемника ще зависи от типа, размера и теглото на тялото на гостоприемника, както и от имуногенността на ваксината. Ваксината е приготвена така, че относително малки дози от нея /1-5мл/ да бъдат ефективни за получаване на защитна реакция.
Ваксината може също така да бъде и под формата на жива рекомбинантна вирусна ваксина, включваща нуклеинова киселина кодираща полипептида, пептидния фрагмент или негов вариант. Ваксината се въвежда в гостоприемника под тази форма и след като вече се намира в гостоприемника, експресира кодирания полипептид, пептиден фрагмент или вариант за да индуцира защитна имунна реакция в гостоприемника.
Известни са няколко такива системи от рекомбинантни живи ваксини. Пример за такава система е вирусната система Vaccinia (US Patent 4603112; Brochier et al. , Nature 354 520 (1991)).
В един по-нататъшен аспект, изобретението предлага метод за защита на гостоприемник податлив на инфекция с Е. granulosus и Taeniid. Този метод включва като първоначална стъпка въвеждането в гостоприемника или на антигенния полипептид, пептиден фрагмент или негов вариант per se, или на ваксина както беше описано по-горе.
Докато специфичните примери представени в изобретението описват само използуването на антигените за защите срещу инфектиране с Е. granulosus, опитните експериментатори биха преценили, че може да се получи и кръстосана видова защита, при използуване на антигени от един паразитен вид ( виж например Lighttowlers, Acta_Leidensia__ΪΖ 135-142 (1989)). Следователно ще стане ясно, че антигените от изобретението са кандидат защитни антигени Echinococcus: Е. granulosus, Е. multilocularis, Е. vogelii, Т. ovis, Т. saginata, Т. solium, Т. multiceps и Т. hudatigena.
В един по-нататъшен аспект на изобретението се разглежда използуването на ДНК молекулата, описана по-горе, като сонда. В този смисъл, ДНК молекулата се използува за идентификация чрез хибридизация на ДНК от Echinococcus или Taenid, като например Т. saginata, Т. hudatigena или Е. multilocularis, която кодира един имуногенен антиген от този паразит. По този начин могат да бъдат идентифицирани и други паразитни антигени, които могат да бъдат използувани за ваксина. Метода за използуване на ДНК молекулата, като сонда, в това изобретение ще бъде разбран добре от хората, квалифицирани в тази област. Например техниките, описани в Maniatis et al., Molecular cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor (1982), могат да бъдат използувани.
Алтернативно, техниките за амплификация на ДНК, като например полимеразна верижна реакция (PCR)(Saki et al., Science 239 487 (1988), могат да се използуват за установяване на хомоложна ДНК от други паразити, като праймерите за PCR могат да се разположат върху нуклеотидната секвенция от Фигура 4.
Подобно на използуването на ДНК молекулата от изобретението, за идентификация на ДНК кодираща съответния протективен антиген от други паразити, могат да се използуват антитела специфични за защитните антигени от изобретението, за да скринират антигените, които са експресирани от организмите трансформирани с въпросната ДНК. Локализирането на един положителен клон /такъв, който експресира антиген, разпознат от антитялото/ ще позволи да се идентифицират и защитния антиген и ДНК която го кодира. Такива антитела, които се използуват като сонди могат да бъдат или поликлонални или моноклонални и могат да бъдат получени чрез всяка една от широкоизползуваните техники. Най-вече моноклонални антитела могат да се получат според метода на Kohler и Milstein (Kohler G & Milstein C, Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predifined specificity Nature (London) 256 459-497 (1975)).
Имуногенността на антигенния полипептид от изобретението, както и на пептидни фрагменти от този полипептид ще бъде оценена от следните примери.
ПРИМЕР 1; ТЕСТИРАНЕ НА АНТИГЕНИ ИЗОЛИРАНИ ОТ ОНКОСФЕРИ
НА ECHINOCOCCUS GRANULOSUS ЧРЕЗ ПРЕПАРАТИВНА ПОЛИАКРИЛАМИЛНА ГЕЛ ЕЛЕКТРОФОРЕЗА (SDS/PAGE)
Предишни непубликувани изследвания на авторите доведоха до идентифициране на няколко потенциални защитни антигени от Е. granulosus. Тези потенциални антигени имаха следните молекулни тегла, определени чрез SDS/PAGE:
- 23-25кД
- ЗОкД
- 34кД
- 40кД
Този експеримент беше проведен от авторите за да се идентифицират защитния/те/ антиген/и/ сред посочените по-горе кандидати.
ЕКСПЕРИМЕНТАЛНИ ПРОЦЕДУРИ
Препаративен гел: При използуването на Biorad SDS Preparative Cell, бяха изляти 50мл от 15% полиакриламиден разтвор в 32мм държател, до височина 5,5см. След полимеризацията на повърхността бяха изляти 8мл концентриращ гел, който беше оставен също да полимеризира.
Антиген: Девет милиона излюпен онкосфери бяха приготвени по следния начин: Яйца на Е. granulosus с напълно развити ембриофори бяха преброени и необходимия брой яйца, при очакван добив от 20% от активирани онкосфери, бяха поставени в 15мл пластмасови центрофужни епруветки (Falcon Plastics). Не повече от 500 000 бяха използувани за всяка епруветка. Яйцата бяха центрофугирани на 200д за 2 мин, супернатантата изхвърлена и беше добавена Юмл от изкуствена стомашна течност (AIF), затоплена до 37°С (Heat D D and Smith J D, In vitro cultivation of Echinococcus granulosus, Taenia hydatigena, T. ovis, T. pisiformis and T. serialis from oncosphere to cystic larva, Parasitology 61 329-344 (1970)) предварително филтрувани през 0,2 микронова мембрана. Епруветките бяха рязбърквяни на 37°С за един час.
Яйцата бяха центрофугирани на 200д за 2 мин, супернатантата изтеглена и подменена с Юмл изкуствена стомашна течност (AIF) затоплена до 37°С и филтрирана през 0,2 микронова мембрана. Яйцата бяха разбърквани на 37°С за 30 мин и след това центрофугирани на 1 000д за 2 мин. Супернатантата беше изхвърлена и подменена с 15мл Percoll (Pharmacia, Sweden), разредени стерилно 9:1 (v/v) с 10 път w·· концентриран NCTC135 (GIBCO, NY). Ембриофорните агрегати, активираните и неактивираните онкосфери, от които се състоеше утайката, бяха смесени с Percoll чрез обръщане на епруветките. След това епруветките бяха центрофугирани на 1 000д за 10 мин и всяка супернатанта, съдържаща онкосферите беше прехвърлена в нова стерилна 15мл центрофужна епруветка. След това, половината от супернатантата (7,5мл) беше прехвърлена в друга стерилна центрофужна епруветка и към всяка от двете епруветки бяха добавени по 7,5мл от NCTC135.
«**’ Епруветките бяха разбъркани чрез обръщане и центрофугирани на w
000д за 5 мин. Супернатантите бяха премахнати и утайките съдържащи онкосферите бяха промити два пъти с Юмл NCTC135 и центрофугирани за 2 мин на 1 000д всеки път. Накрая утайките бяха ресуспендирани в NTCT135 до краен обем 10 микролитра в който всъщност се съдържаха между 40 и 200 онкосфери. След това броят на активираните и неактивираните онкосфери беше оценен чрез преброяване на целия обем от 4x10 микролитрови препарати чрез нанасяне от двете страни на две хематоцитометрични камери (Improved Neubauer) при увеличение #*·
200х, позволяващо различаването на неактивираните онкосфери от тези, които нямаха онкосферни мембрани /активирани онкосфери/.
Разделяне на_онкосферни_белтъци; Онкосферите /приблизително 50% неактивирани и 50% активирани/ бяха сварени в SDS препаратен буфер (Laemmli U К, Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4, fiatlAEfi__(London)__211 680-685 (1970))(съдържащ дитиотреитол (DTT), Sigma [10мгр/мл] вместо меркаптоетанол) и нанесени върху колона на Biorad SDS Preparative Cell. Когато фронтът на бромфенолово синьото багрило почти достигна края на колоната, бяха събирано последователни фракции от по 2,5мл в продължение на 24 часа.
Ензимни инхибитори: Всички бяха получени от Sigma. Те бяха разтворени в 20мл Шрис/HCl, рН 8,0 така, че при разрежданията (ν/ν), крайната им концентрация беше:
йодоацетамид - 20мМ, Апротинин - 10мкл/мл, Пепстатин 2мг/мл, N-тозил-Ь-фенилаланин хлор метил кетон /ТРСК/ 50мкг/мл, Ка-р-тозил-Ь-лизин- хлоро метил кетон /TLCK/ 50мкг/мл, Етилен диамин тетра оцетна киселина /EDTA/ - 2мМ, Фенил метил сулфонил флуорид /PMSF/ - 1мМ. Те бяха добавяни към всички фракции. Препарати от всяка фракция бяха разделяни на 5-25% гел при използуване на SDS/PAGE и теловете бяха оцветявани със сребро за идентифициране на молекулните тегла. Избраните фракции бяха концентрирани чрез Amicn UM3 мембрани до Юмл. След това те бяха центрофугирани на 2 200 об/мин за 30 мин на 1°С. Супернатантата беше отделена от наслагванията от SDS и след това всяка беше диализирана срещу 20мМ физиологичен раствор забуфериран с Трис/HCl, рН 7,5, съдържащ ензимни инхибитори в продължение на три дни и четири смени на буфера.
Молекулните тегла, които трябваше да бъдат тестирани бяха избрани според молекулните тегла на фракциите както следва: 1./всички молекули под 21кД/, 2. /23 + 25кД/, 3. /ЗОкД/, 4. /34кД/, 5. /40кД двойка/, 6. /43кД/, 7. /всички молекули над 43кД/, 8. /смес от всички молекули/, 9. /само адювант/, 10. /Препарат от антигена преди нанасянето му на гела. Този препарат също беше обработен чрез студено центрофугиране и интензивна диализа/.
Имунизаиионна процедура: Всеки антиген представляваше Юмл супернатанта. Фсяка фракция представляваше опеделен/и_ вид/ове/ молекула/и/ получени от пет милиона онкосфери, докато сместта от всички молекули беше получена от два милиона онкосфери, както и антигена п<еди нанасянето /група 10/. За първото инжектиране 1мл от антигена беше хомогенизиран с 1мл от STM адювант (Bokhout et al., Veterinary Immunology and Immunopatholoav 2 491-500 (1980)) и половината от този разтвор беше инжектиран подкожно, над левите ребра, докато другата половина беше инжектирана мускулно в задния ляв крак. За второто инжектиране, което беше направено един месец по-късно, беше използуван същият разтвор и същата схема на имунизация с изключение на това, че 2мг от лиофилизирани Micobacterium phlei бяха добавени към всяка инжекция. Инжекциите бяха направени от дясната страна.
Индукция. С Яйца: Един месец след втората инжекция, на всички агнета бяха дадени 1 000 яйца от Е. granulosus орално. Яйцата бяхя съхранявани на 4°С за 6 седмици. Те бяха събрани от тении от експериментално инфектирани кучета по метода на Heath D D and Lawrence S B, Dayly egg production of dogs infected with Echinococcus granulosus, AtchiZAS__de la
Hidatidosis 30 321-328 (1991).
Експериментални животни: Агнетата бяха от Romney и Dorset линии, разпределени равномерно във всички групи. Те бяха отглеждани без инфекции от Е. granulosus и първата имунизация им беше направена на 8 месечна възраст. За получаване на серум, от всяко животно бяха събрани по Юмл кръв по време на първата и втората имунизация и още веднъж, когато беше проведена индукцията. Серумът беше отделен стерилно и пазен на -20°С до тестирането му от in vitro култивирани онкосфери или имуноблотинг.
Некроскопия: Шест месеца след индуциращата инжекция беше взет още един препарат от кръв след което агнетата бяха обезкървени след умъртвяване. Черният дроб и белият дроб на всяко животно бяха нарязани на 2-Змм дебелина и всеки и всеки срез беше внимателно огледан с невъоръжено око. Белите дробове бяха нарязани на дебелина 4мм и срезите бяха внимателно проверени чрез палпиране и оглеждане.
Имуноблотинг: Антигените от онкосфери на Е. granulosus бяха разделени чрез SDS/PAGE според публикуваните методи (Laemmli (1979); Hames В D and Rickwood D, Gel electrophoresis of proteins: a practical approach, IRE. Press, Oxford (1981). Препаратите бяха разтворени чрез сваряване за 3 мин в бОмМ Трис/HCl pH 6,8, 10% глицерол, 2% SDS, 1% DTT и 0,05% бромфенолово синьо. Разделянето беше извършено на градиентен гел (Т=5-25%) при използуване на вертикална система за електрофореза (BioRad Protean 11) според инструкциите на производителя. Разделените антигени бяха прехвърлени електрофоретично (Towbin Н, Staehelin Т and
Gordon J, Electrophoretic transfer of proteins, Proceedings of the National.Academy of Sciences USA,. 76 4350-4354 (1979)) върху нитроцелулозни мембрани (0,45мкм Schleicher & Schull, Dassel Germany) в изстудена камера Transblot с плоски електроди (BioRad, Richmond, USA) при използуване на 50V напрежение за 2 часа в ЮмМ карбонатен буфер pH 9,0, съдържащ 20% метанол (Dunn S D, Effects of modification of transfer buffer composition and the renaturation of proteins in gels on the recognition of proteins on Western blots by monoclonal antibodies, Analytical Biochemistry 157 144-153 (1986)). След прехвърлянето, нитроцелулозните мембрани бяха оцветявани в 0,5% Ponceau S (BDH) в 1% оцетна киселина за 5 мин и след това бяха промивани в дестилирана вода докато белтъчните ивици започнат да се виждат ясно. Маркерите за молекулните (Pharmacia) тегла бяха отбелязвани с молив. Отделни ивици от нитроцелулозните мембрани бяха отрязани и поставени в инкубационни съдове (Schleicher & Schull, Germany). Ивиците бяха блокирани с 5% обезмаслено мляко на прах в 0,1% Tween 20 (BDH), 20мМ Трис/HCL pH 7,5, 0,5% NaCl за 1 час на 37°С. Тестуваните серуми бяха разредени 1:100 с блокиращия буфер. Ивиците бяха инкубирани в разредените серуми за едно денонощие при стайна температура на клатачка. След това ивиците бяха промити четири пъти по 10 мин с 20мМ Трис/HCl pH 7,5 съдържащ 0,5М NaCl и 0,1% Tween 20. Една допълнителна стъпка беше включена в имунологичния тест за установяване на имуноглобулиновите класове IgG^ или IgG2. След първото антитяло, ивиците бяха тестувани с миши моноклонални антитела за овчи IgG-]_ или IgG2, получени от Dr. Ken Beh, CSIRO McMaster Laboratory, Sidney. След това ивиците бяха тестувани с кози анти миши IgG /цяла молекула/ белязани с пероксидаза (Cappel) и разредени 1:1 000 с блокиращия буфер. След това ивиците бяха промити три пъти с блокиращия буфер без мляко или Teen 20. Пероксидазната активност беше визуализирана с 3амино-9 етилкарбазол (Sigma). Развитието на оцветяването при всички ивици беше спряно по едно и също време, така че да могат да се правят сравнения в интензитета на оцветяването, което отразява количеството на специфичния имуноглобулин във всички серуми.
Убиване на онкосферите_in vitro: Сборният серум преди индукцията, получен от десетте групи от овце беше тестуван за способността му да убива онкосферите. За фетален агнешки серумен комплемент, беше взимана кръв със стерилна спринцовка Г от агнешки фетуси близо до термина, като кръвта беше
Ч»' поставяна веднага в 50мл стерилни полипропиленови епруветки (Falcon plastics). След съсирване за два часа при стайна температура, съсиреците бяха отделени от стените на епруветките със стерилни пръчици в стерилен бокс. След това епруветките бяха центрофугирани в охладена центрофуга Beckman при 4°С за 30 мин. Епруветките бяха държани на лед до премахването на серума. Феталният агнешки серум беше съхраняван на порции от по 2мл на -70°С до използуването му за култивиране.
* Културите бяха поставени в 96-кладенчови плоскодънни панички за култивиране (Falcon Microtest III). Към всяко кладенче бяха добавени по 150мкл от тест-серума /инактивиран при 56°С за 30 мин/ и150мкл от NTCT135, съдържащи 50 активирани онкосфери плюс 20мкл фетален агнешки серумен комплемент. Всички култури бяха изследвани в дубликати или в трипликати. Паничките бяха съхранявани във влажен СС>2 инкубатор при 37°С, а резултатите бяха отчитани на 24тия час и на 7мия ден използувайки Leitz Labovert, инвертен микроскоп. Там където NCTC135 беше използуван, той беше допълнен с ЗООмг/л цистеин хидрохлорид (Sigma) и 50 мкг/мл гентамицин сулфат (Schering).
РЕЗУЛТАТИ
Профилите на антитела срещу онкосферния антиген, които бяха получени от всяка група са показани на Фиг. 1. Ясно е, че различните групи продуцираха антитела, които разпознаваха тази област от молекулни тегла с които те са били имунизирани. В някои групи, като например 1 и 5 имаше епитопи от молекулите използувани за имунизация, които бяха същите като при молекули с други молекулни тегла.
Резултатите от некроскопията са показани на Таблица 1, групи 1-10 и те показват, че докато другите кандидат-антигени намаляват броя на цистите в сравнение с контролите, то само молекули с тегла около 23-25кД предизвикват значителна степен на защита (Р = 0,012, F = 10,62, 8DF).
Резултатите от убиването in vitro на онкосфери чрез серумите от групите овце, имунизирани с фракции с различни молекулни тегла, са показани на Таблица 2. Вижда се ясно, че тези резултати подкрепят заключението, че само антигенни молекули с тегла 23-25кД от Е. granulosus, действуват защитно върху гостоприемника.
Таблица 1: Резултати от некроскопия на овце третирани с 1 000 яйца от Е. granulosus след имунизация с нативни антигени, елуирани от полиакриламидни телове /групи 1-8/, контроли с
адювант /група 9/, и третирани с SDS онкосфери /група 10/ | ||||
Група | Имунизационен антиген | Номера на групите овпе | Брой на цистите | Средно |
1 | < 20 | 62,47,12,50,65 | 75,39,19,101,47 | 56,2 |
2 | 23 + 25 | 05,24,67,45,95 | 0,39,10,2,4, | 11 |
3 | 30 | 17,19,13,57,03 | 0,42,17,148,197 | 80,8 |
4 | 34 | 11,37,14,77,43 | 167,9,48,85,126 | 87 |
5 | 40 | 51,39,06,41,82 | 109,86,156,276,97 | 144,8 |
6 | 43 | 08,64,04,88,68 | 57,67,165,3,52 | 68,8 |
7 | > 43 | 86,45,40,72,01 | 84,75,2,17,78 | 51,2 |
8 | Смес | 15,23,92,48,27 | 0,0,104,133,79 | 63,2 |
9 | Контрола | 96,09,38,90,33 | 27,137,170,242,86 | 132,4 |
10 | SDS онк. | 60,30,44,20,18 | 247,49,175,25,54 | 110 |
Таблица 2: Убиване in vitro на онкосфери от Е. granulosus чрез сборни серуми, събрани в деня на индукция с яйца на Е.
granulosus
Номер на групата | Третиране | % Убити | |
it. w | 1 | < 20кД | 0% |
2 | 23 - 25кД | 91% | |
3 | ЗОкД | 0% | |
4 | 34кД | 0% | |
5 | 40кД | 0% | |
6 | 43кД | 0% | |
7 | > 43кД | 0% | |
8 | Смес от вс. мол. | 0% | |
9 | Само адювант | 0% | |
10 | SDS-онкосфери | 0% |
ч»
ПРИМЕР 2; АФИНИТЕТНО ПРЕЧИСТВАНЕ НА ПРОБИ СЬЛЪРЖАШИ АНТИТЕЛА
Афинитетно пречистени антитела от имобилизирани молекули с молекулни тегла 23-25кД бяха получени по следния начин: Агнета 1488 и 1489 бяха имунизирани подкожно и интрамускулно с 100 000 активирани онкосфери от Е. granulosus на четири пъти. Първите две инжекции бяха през 2 седмици, следващата след 1 месец и последната - след 3 месеца. Една седмица след последната инжекция беше взета кръв от агнетата, като от ЗООмл кръв бяхя получени по 150мл стерилен хиперимунен серум. Агнетата бяха третирани с 3 000 прясно събрани яйца от Е. granulosus в деня когато беше взет и серума, като по същият начин бяха третирани и две контролни агнета. При некроскопия, б месеца по-късно, имунизираните агнета имаха нарастващи цисти само на мястото на първото инжектиране, докато контролните - имаха голям брой цисти в белите дробове и черния дроб.
Серумът от агне 1488 беше използуван за афинитетно очистване на антитела, защото имаше по-висок титър на способността да убива онкосферите в сравнение с 1489. Антитела специфични към замразен-размразен и озвучен антиген от Е. granulosus, цял старт от SDS/PAGE от онкосфери или към антигени с относителна подвижност 0-20, 20-25, 25-30, 30-36, 36-67, или към антигени с относителна подвижност от 0-20, 2030, 30-43, 43-67, 67-90, 90-180, и >180кД, бяха афинитетно очистени от нитроцелулозните ивици, съдържащи горните антигени, чрез метода на Beaii J A and Mitchell G F, Identification of a particular antigen from a parasite cDNA library using antibodies affinity purified from selected portions of Western blot, Journal of Immunological Methods £6
217-223 (1986). Белтъка-носител беше 1% фетален агнешси серум. Афинитетно очистените антитела бяха промити и след това концентрирани 10 пъти използувайки Amicon stirred cell и РМ10 мембрана.
ПРИМЕР 3:
КЛОНИРАНЕ НА РЕКОМБИНАНТНА ДНК И ЕКСПРЕСИЯ
НА АНТИГЕНИ ОТ ОНКОСФЕРИ НА ECHINOCOCCUS
GRANULOSUS
1. Изолиране м...идентифициране на иРНК /а/ Приготвяне на реагенти
Всички разтвори използувани при изолиране на иРНК, освен разтворите съдържащи Трие [Трие(хидроксиметил) аминоетан Sigma, St Louis, МО USA],бяха третирани с 0,1% диетилпирокарбонат (DEPC, Sigma) за едно денонощие, след което бяха автоклавирани преди употреба. Цялята стъклария беше изпечена на 200°С или по-висока температура. Концентрираните разтвори на Трие бяха приготвяни с DEPC третирана вода и автоклавирани.
/б/ ОнкосФеюа
Зрели яйца от Е. granulosus бяха получени и активирани
И*' както е описано в пример 1.
£
Приблизително 4x10° онкосфери бяха разтворени в лед в 6М свободен от нуклеази гуанидин хидрохлорид (BRL Ultrapurе,
Bethesda Research
Laboratories,
USA),
0,1М натриев ацетат, pH 5,2, използувайки стъклен/тефлонов тъканен хомогенизатор. Разтворените онкосфери бяха съхранявани на -70°С преди изолирането на РНК.
/в/ Изолиране на РНК
Разтворените онкосфери бяха размразени в лед и неразтворимия материал беше утаен чрез центрофугиране при 10 ОООоб/мин за 30 мин на 4°С в тип 50 Ti ротор и ултрацентрофуга Beckman L8 (Beckman, Palo Alto, CA USA). Супернатантата беше надслоена върху разтвор съдържащ 4,8М цезиев хлорид (CsCl - BRL, Ultrapure, Betesda Research Laboratories, Gaithersburg, MD USA), IOmM EDTA /етилен диамин тетра оцетна киселина, двунатриева сол/, б,5мл гуанидин/ 5,5мл CsCl в полиаломерна епруветка от Beckman SW40. Епруветките бяха центрофугирани на 35 ОООоб/мин за 18 часа на 15°С на ротор SW40, ултрацентрофуга Beckman L8. Супернатантата беше премахната и дъното на епруветките беше промито бързо и внимателно с 200мкл от Τ^θΕ^ (ЮмМ Трие, 1мМ EDTA, pH 8,0). Утаената РНК беше разтворена в 200мкл Τ-^θΕ^ и беше преципитирана чрез добавяне на 1:10 обема ЗМ натриев ацетат и 2,5 обема 100% леден етанол, като беше инкубирана на -20°С за една нощ. Преципитираната РНК беше утаена чрез центрофугиране в микроцентрофуга за 15 мин при 4°С, утайката беше промита със 70% етанол, повторно центрофугирана и изсушена на въздух. Изолираната РНК беше ресуспендирана в 50мкл ТудЕу, като количеството и, измерено по абсорбция при дължина на вълната 2б0нм беше 23мкг тотална РНК. Един микрограм беше изследван в 1,2% формалдехид-агарозен гел (Sambrook J Fritsch Е Maniatis Т, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989) и се оказа, че препарата съдържа интактна рибозомална РНК.
/г/ Очистване на поли А* РНК
Поли А+ информационна РНК беше очистена чрез олиго (dT) целулоза Тип 7 (Pharmacia LKB Biotechnology, Uppsala, Sweden) съгласно инструкциите на производителя и описанието на Aviv Н & Leder Р, Purification of biologically active globin messenger RNA was by chromatography on oligothymidilic acidcellulose, Proc Nat Acad Sci 69 1408-1412 (1972). Елюираната β#**»
поли Α+ иРНК беше преципитирана както вече беше описано и утайката отново беше разтворена в Т^дЕ^.
/Д/ Транслация in vitro
Пет микролитра от иРНК бяха транслирани in vitro използувайки Rabbit Reticulocyte Lysate (Amersham, UK) в тотален обем от 25мкл, съгласно инструкциите на производителя. Продуктите бяха белязани радиоактивно с 37,5 микрокюри 35δ-ΜβτποΗΗΗ (Amersham International, Amersham UK) и бяха изследвани с полиакриламидна гел електрофореза в 10% полиакриламиден гел при редуциращи условия.(laemmli U К, Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriofage T4, Nature (London) 227 680-685 (1970)) и установени c флуорография след импрегниране на гела с Amplify (Amersham, UK). Продуктите от транслацията бяха с хетерогенна големина, включвайки и продукти с молекулна маса повече от 94кД.
2. Синтез и клониране на кДНК /а/ синтез на кДНК
Тридесет и пет микролитра от разтвора на иРНК в Т^дЕ^ беше обратно транскрибирана в присъствие на алфа 32P-dATP (Amersham) използувайки Moloney-Murine Leukemia Virus Reverse Transcriptase, както и реагентите и протокола, съдържащи се в ZAP-cDNA Synthesis Kit (Lot# UC106, Catalog # 200400, Stratagene, La Jolla, USA). След синтеза на втората верига, една проба беше изследвана с гел електрофореза 1% алкална агароза, съгласно инструкциите в ZAP-cDNA Synthesis Kit. Размера на кДНК беше хетерогенен и в сравнение с Lambda Hind
III маркерите (Promega Corporation, Madison, WI, USA), включваше установими транскрипти, по-големи от 2 000 н. дв.
/б/ Клониране на кДНК кДНК беше клонирана в бактериофагния вектор Uni-ZAP XR (ламбда ZAP)(Stratagene) съгласно условията детайлизирани в инструкциите на UNI-ZAP XR Cloning Kit, (Lot #18D, Catalog #237211, Stratagene). кДНК беше лигирана c вектора без някакъв специален подбор на размера на кДНК. Цялото количество кДНК беше свързана с 1мкг векторна ДНК.
/в/ In vitro опаковане на бактеоиоФага
Два | микролитра от кДНК, лигирани | с вектора, бяха | |||
опаковани | в неефективен | фаг, използувайки | единична | реакция на | |
опаковане | Gigapack II | Gold (Lot #1535, | Catalog | # 200216, |
Stratagene) съгласно инструкциите на производителя. Получения фаг беше титруван върху Е. coli PLK-F'. Останалата лигирана кДНК беше опакована след това в две еднакви реакции, като продуктите от трите реакции бяха събрани заедно и титрувани. Получената библиотека от кДНК клонове /кДНК библиотека/ в ламбда ZAP беше титрувана в Е. coli PLK-F' и се оказа, че съдържа приблизително 100 000 първични клона (според методите описани в UNI-ZAP XR Cloning Kit, Stratagene).
3. АмплиФикапия на кДНК библиотеката
Цялата кДНК библиотека беше амплифицирана в клетки на Е. coli PLK-F' при плътност от 5 000 плакови единици (pfu) на агарови панички с диаметър 150мм. Амплифицираните фаги бяха събрани след една нощ в Юмл SM (ЮОмМ NaCl, 8мМ MgSO4, 50мМ Трие pH 7,5, 0,01% w/v желатин). Амплифицираната библиотека беше обединена и титрувана върху Е. coli XLl-Blue cells (Stratagene) в присъствие на изопропилтиогалактозид (IPTG) и 5-бромо-4-хлоро-3-индолил-бета-П-галактозид (Xgal), според инструкциите на UNI-ZAP XR Cloning Kit (Stratagene). Титърът
Q на амплифицираната библиотека беше оценен на 1,7x10’ pfu на милилитър.
4. ИМУНОСКРИНИРАНЕ НА БИБЛИОТЕКАТА ОТ кДНК /а/ Подготовка.на. антит.ела-сонди
Два типа антитела-сонди бяха използувани в имунологичния тест на плаките: серумни и афинитетно пречистени антитела приготвени съгласно пример 2. Серумните проби бяха освободени от фонова реактивност спрямо Е. coli и или бета-галактозидаза по следния начин. Чувствителен гостоприемник Е. coli (обикновено XL-1 Blue, Stratagene) бяха заразени с почти конфлуентни, не-рекомбинантни ламбда gtll или ламбда ZAP. Нитроцелулозни филтри (Schleicher & Schule, Dassel, Germany) бяха импрегнирани с ЮмМ IPTG, изсушени и след инкубация на паничките при 42°С за 4 часа, на повърхността на всяка паничка беше поставен по един филтър. Паничките бяха инкубирани при 37°С за една нощ, след което бяха инкубирани на 4°С за ЗОмин. Филтрите бяха извадени и промити с TNT (150мМ NaCl, 0,05% Tween 20, 20мМ Трие pH 8,0) и инкубирани в 5% обезмаслено мляко на прах/TNT (BLOTTO) за един час. Всички имунологични инкубации бяха проведени при стайна температура на клатачка. Всяка една серумна проба, предназначена за имунологично изследване беше разредена в TNT съдържащ 20% фетален телешки серум (FTNT) и беше инкубирана в петриева паничка, съдържаща 20мл разреден серум плюс два нитроцелулозни филтъра, приготвени както вече беше описано. След инкубация от 2 часа, нитроцелулозните филтри бяха извадени и освободените от фонова реактивност серуми бяха готови за използуване.
Антителата, които бяха получени получени от серум чрез афинитетно очистване /детайлизирано в Пример 2/ не бяха афинитетно пречиствани с не-рекомбинантни ламбда gtll или (supra); накратко: сдвоените олигонуклеотиди бяха третирани с
Т4 полинуклеотид киназа (New England Biolabs, Beyer1у СА,
USA); pGEX ЗХ ДНК беше смляна c EcoR I (New England Biolabs), обработена c фосфатаза и лигирана за киназираните сдвоени олигонуклеотиди. Е.coli JM101 бяха трансформирани с лигирания плазмид използувайки калциев хлорид. Трансформираните с плазмида бактериални клонове бяха селекционирани, плазмидната ДНК беше изолирана и модификацията беше потвърдена чрез секвениране на съответните части от ДНК чрез dideoxy chain%₽* termination метода след субклониране на BamH I/позиция
914/Pst I/позиция 1885/ в М13 бактериофаги. Вектора pGEX ЗЕХ има следната ДНК секвенция и предсказана аминокиселинна секвенция в полилинкерната област:
BamH I pGEX-ЗЕХ CCA AAA TCG GAT CTG ATC GAA GGT CGT GGG АТС
Pro Lys Ser Asp Leu He Glu Glv Ara Gly lie Factor X
Sma.....X.
EcoR......1
CCC GGG AAT TCA TAC TCG AGT /КАТ TCA TCG TGA
Pro Gly Asn Ser Tyr Ser Ser Asn Ser Ser ***
Плазмидна ДНК от pBluescript беше очистена чрез центрофугиране в CsCI (Sambrook et al., supra) и включеното парче кДНК беше изрязано по следния начин. Около 2мкг от pBluescript ДНК от всеки клон беше смляна с по 10 единици EcoR I и Xho I (Amersham, UK) в 20 мкл високо солев буфер. Включената ДНК беше разделена на 1% агароза, ДНК ивиците бяха изрязани и пречистени чрез използуване на Geneclean (ВЮ101 Inc., La Jolla, USA). След околичествяване при абсорбция при 260нм, около ЮОнг от включеното парче ДНК беше лигирано /2 единици Т4 ДНК лигаза Boehringer, Mannheim) към около 50нг цезиево хлоридно пречистена и обработена с фосфатаза pGEX-3EX ДНК, предварително смляна с EcoR I и Xho I.
Лигираната кДНК в pGEX-ЗЕХ /виж по-долу/ беше трансформирана в Е. coli щам ВВ4 (Stratagene Cloning System, La Jolla, California, USA, cat. # 200269) чрез електропориране при използуване на BioRad Gene Pulser, съгласно инструкциите на производителя (BioRad, Richmond, USA).
ПРИМЕР 4: ПРОДУКЦИЯ НА Е. GRANULOSUS ХИБРИДЕН БЕЛТЪК
Селекционираните Е. granulosus онкосферни кДНК клонове бяха субклонирани в експресионния плазмид pGEX-ЗЕХ и трансформирани в Е. coli щам ВВ4, както е описано по-горе.
Експресията доведе до получаване на паразитния белтък, свързан с глутатион S-трансфераза (GST). Такива хибридни белтъци са много често разтворими и могат да бъдат пречистени от лизирани клетки при неденатуриращи условия чрез абсорбция с агарозни зърна, свързани с глутатион.
МАТЕРИАЛИ И МЕТОДИ
GST-хибридните белтъци бяха индуцирани и пречистени както е описано от Smith & Johnson, Gene б7 31-40 (1988) при използуване на специфични стъпки детайлизирани по-долу:
1. Колонии от pGEX трансформирани клетки бяха посяти в 4Х100мл LB/ампицилинова среда и инкубирани за една нощ на 37°С с разклащане.
2. Културите бяха разредени 1:10 със свежа LB/ампицилинова среда и инкубирани за 90мин на 37°С.
3. Експресията беше индуцирана чрез добавяне на ЮОмл IPTG до 0,1мМ.
4. Инкубацията беше продължена за 4,5 часа допълнително.
5. Клетките бяха утаени чрез центрофугиране на 5 000д на 4°С за 10 мин.
6. Утайката от клетки, получена от всеки литър беше ресуспендирана в 15мл изстуден PBS pH 7,2 и пазена на -20°С/70°С до последващо обработване.
7. Утайките бяха размразени и инкубирани за 10 мин на стайна температура с лизозим /0,25мг/мл/.
8. Беше добавен 0,5% Тритон Х-100.
9. Клетъчната суспенсия беше озвучена на лед 3 пъти по 12 сек с 15 секундни интервали.
10. Неразтворимият материал беше премахнат чрез центрофугиране на 10 000д на 4°С за 15 мин.
11. Супернатантата от един литър първоначална култура беше добавен към 15мл 50% глутатионови агарозни зърна и беше размесвана внимателно на стайна температура за 3 часа.
12. Агарозните зърна бяха утаени чрез центрофугиране на 2 000д за 5 мин на стайна температура.
13. Агарозните зърна бяха измити 5 пъти със студен PBS чрез центрофугиране на 2 000д за 5 мин на стайна температура.
14. GST хибридният белтък, закачен за агарозата беше получен.
15. Концентрацията на хибридния белтък върху агарозните зърна беше определена чрез метода на Брадфорд (BioRad).
ПРИМЕР 5:
ДЕМОНСТРАЦИЯ НА ИМУНОГЕННОСТТА НА ХИБРИДЕН
БЕЛТЪК ОТ Е. GRANULOSUS
ИМУНИЗАЦИЯ НА ОВПЕ
Овцете бяха осем месечни по времето на първоначалната ваксинация.Те бяха смес от породи Rommey и Dorset и бяха разделени на 9 групи от по пет третирани овце и една група с осем контроли. Всяко животно получаваше по 50мкг хибриден белтък, свързан с агароза /Приготвен съгласно Примар 4/, в С-’ 1мл физиологичен разтвор смесен с 1мл STM адювант (Bokhout В A, van Gaalen С and Van der Heijen Ph J, A selected water-inoil emulsion: Composition and usefulness as an immunological adjvant, Veterinary Immunology and Immunopatholoav 2 491-500 (1981)). Тоталният обем за инжектиране от 2мл/овца, беше въвеждан наполовина подкожно и наполовина - интрамускулно в лявата страна и беше повторен след 1 месец от дясната страна. Контролите получиха експресираната глутатион S-трансфераза от не-рекомбинантни pGEX. Две седмици след втората инжекция беше взета кръв от овцете и беше приготвен серум за култивиране in vitro и за имуноблотинг срещу онкосферен антиген, както е описано в Пример 1. Същият ден, овцете бяха третирани орално с 1 000 яйца от Е. granulosus, както е описано в Пример 1.
НЕКРОСКОПИЯ
Шест месеца след заразяването, овцете бяха обезкървени и техните бели и черни дробове бяха взети за изследване. Черните дробове бяха нарязани на парчета дебели 2мм и бяха изследвани на око за наличието на цисти. Белите дробове бяха нарязани на парчета дебели по 4мм и бяха внимателно палпирани за установяване наличието на цисти. Всички неясни лезии бяха срязани и отворени за да се установи дали са цисти на Е. granulosus.
Резултатите от некроскопията са показани в Таблица 3, а убиването на онкосферите - на Таблица 4, Една значителна имунна реакция беше стимулирана от клон S2 (97%. Р<0,001. F=24,04, 11DF); клон 48 (83%. Р=0,002. F=16,51, 11DF); клон 95 (96%. Р<0,001. F=23,41, 11DF); клон 119 (83%. Р=0,002. 11DF).
Умъртвяване in vitro беше наблюдавано при серуми, събрани от тези четири клона, както и от смес от всички клонове.
Всички тези клонове продуцираха антитела, които реагираха с нативния 23-25кД белтък, докато два клона /101 и 123/, които не индуцираха статистически значима защитна реакция, реагираха с нативния 34кД белтък. Друг клон, който не индуцира статистически значима защита (S3), реагира с ЗОкД белтък /Фигура 2/.
Клонове S2 и 95 индуцираха силен IgG2 отговор на 23-25кД молекулата в сравнение с по-малко ефективните клонове 48 и 119. Отделни овце в тези групи също потвърдиха хипотезата, че един силен IgG2 отговор е много полезен при индуцирането на защитен имунитет /Фигура 3/. Ниската вариабилност на резултатите от Юте овце, имунизирани с клон S2 или 95, показа че тази секвенция може да бъде разпозната от широк диапазон от генотипове.
Таблица 3 Резултати от некроскопията на овце заразени с яйца от Е. granulosus след имунизация с рекомбинантни антигени.
Група Имунизационен Номера на овцете Брой цисти Средно .антиген
11 | Клон S2 | 28,53,46,29,16 | 2,3,0,16,3 | 4,8 |
12 | Клон S3 | 56,54,36,26,71 | 0,68,72,53,99 | 58,4 |
13 | Клон 48 | 31,49,25,22,66 | 17,58,12,0,46 | 26,6 |
14 | Клон 95 | 76,80,10,42,52 | 13,14,5,0,2 | 6,8 |
15 | Клон 101 | 58,02,93,79,83 | 64,79,30,108,100 | 76,2 |
16 | Клон 119 | 84,73,91,85,55 | 53,29,0,13,40 | 27 |
17 | Клон 123 | 21,07,34,81,63 | 305,8,100,20,40 | 94,6 |
18 | Смес от вс. | 89,61,75,74,70 | 8,74,27,0,105 | 42,8 |
19 | Клон 33,42,86 | 32,87,69,78,59 | 6,130,136,5,200 | 95,4 |
20 | GST- | 94,97,99,00,01 | 70,105,270,180 | 156,6 |
контрола | 02,04,05 | 122,227,108,171 |
Таблица 4. Групов номер | Убиване in от събрани индукциа с | vitro на онкосфери от Е. granulosus групови серуми получени в дена на яйца на Е. granulosus | |
Третиране | % Убити | ||
11 | Клон S2 | 94% | |
12 | Клон S3 | 0% | |
13 | Клон 48 | 97% | |
14 | Клон 95 | 100% | |
15 | Клон 101 | 0% | |
16 | Клон 119 | 89% | |
17 | Клон 123 | 0% | |
18 | Смес от всички | 89% | |
19 | Смес от 33,42,86 | 0% | |
20 | Адювантна контрола | 0% | |
21 | Онкосферна контрола | 0% |
ПРИМЕР 6: ЧАСТИЧНО-СЕКВЕНИРАНЕ НА ДНК ОТ КЛОНОВЕ S2,
48, 95 И 119
Получаване на PBluescript
Phagemid pBluescript беше генериран чрез phagemid rescue от ламбда-ZAP за всяка кДНК, както е описано в инструкциите на производителя към UNI-ZAP XR Cloning Kit (Stratagene). Получаване на едноверижна ДНК
Едноверижна ДНК беше получена от плазмида pBluescript (Stratagene), използувайки техниките описани от Ausubel et ( al., Current Protocols in Molecular Biology, Green
Publishing | Associates | and Wiley | Interscience, | New York | |
(1987). | |||||
Секвениоане | на кДНК | ||||
кДНК беше секвенирана частично | чрез | верижно | терминиращи | ||
инхибитори | (Sanger F, | Nicklen S | and | Coulson | A R, DNA |
sequencing with chain-terminating inhibitors, Proc Natl Acad Sci USA 14 5463 (1977)) използувайки Sequenase, Version 2.0 (Unated States Biochemical). Праймера беше ТЗ (Albert Einstein College of Medicine, Oligonucleotide Synthesis Unit). Продуктите на терминиращите реакции бяха разделени на 6% полиакриламиден гел и визуализирани чрез авторадиография (X-Omat, Kodak).
Резултати
Резултатите са показани на Таблица 5.
Таблица 5:
Име: | 95 | Дължина: | 224 | Проверка: | 708 | Тегло: | 1,00 |
Име: | S2 | Дължина: | 224 | Проверка: | 708 | Тегло: | 1,00 |
Име: | 48 | Дължина: | 224 | Проверка: | 708 | Тегло: | 1,00 |
Име: | 119 | Дължина: | 224 | Проверка: | 708 | Тегло: | 1,00 |
59
95 TCCAGTTAT 82..TCCAGTTAT 48 119 ... | GTCTCATTTT GTTTGCGACT TCAGTTTTGG CTCAGGAATA CAAAGGAATG | |||||
GTCTCATTTT GTCTCATTTT GTCTCATTTT | GTTTGCGACT TCAGTTTTGG CTCAGGAATA CAAAGGAATG GTTTGCGACT TCAGTTTTGG CTCAGGAATA CAAAGGAATG | |||||
GTTTGCGACT TCAGTTTTGG | CTCAGGAATA CAAAGGAATG | |||||
60 | 109 | |||||
95 | GGCGTAGAGA | CAAGGACAAC | AGAGACTCCG | CTCCGTAAAC | ACTTCAATTT | |
S2 | GGCGTAGAGA | CAAGGACAAC | AGAGACTCCG | CTCCGTAAAC | ACTTCAATTT | |
48 | GGCGTAGAGA | CAAGGACAAC | AGAGACTCCG | CTCCGTAAAC | ACTTCAATTT | |
119 | GGCGTAGAGA | CAAGGACAAC | AGAGACTCCG | CTCCGTAAAC | ACTTCAATTT | |
110 | 159 | |||||
95 | GACTCCTGTG | GGTTCTCAGG | GCATTCGCTT | AAGTTGGGAA | GTCCAACACT | |
S2 | GACTCCTGTG | GGTTCTCAGG | GCATTCGCTT | AAGTTGGGAA | GTCCAACACT | |
48 | GACTCCTGTG | GGTTCTCAGG | GCATTCGCTT | AAGTTGGGAA | GTCCAACACT | |
119 | GACTCCTGTG | GGTTCTCAGG | GCATTCGCTT | AAGTTGGGAA | GTCCAACACT | |
160 | 209 | |||||
Уви» | 95 | TGTCTGACCT | CAAAGGAACA | GATATTTCTC | TAAAAGCGGT | GAATCCTTCT |
S2 | TGTCTGACCT | CAAAGGAACA | GATATTTCTC | TAAAAGCGGT | GAATCCTTCT | |
48 | TGTCTGACCT | CAAAGGAACA | GATATTTCTC | TAAAAGCGGT | GAATCCTTCT | |
119 | TGTCTGACCT | CAAAGGAACA | GATATTTCTC | TAAAAGCGGT | GAATCCTTCT | |
210 | 233 | |||||
95 | GACCCGTTAG | TCTACAAAAG | ACAA | |||
S2 | GACCCGTTAG | TCTACAAAAG | ACAA | |||
48 | GACCCGTTAG | TCTACAAAAG | ACAA | |||
119 | GACCCGTTAG | TCTACAAAAG | ACAA |
Както се вижда от Таблица 5, всеки от клоновете експресиращи защитни антигени срещу Е. granulosus включва една идентична 224 н. дв. ДНК молекула /нуклеотиди от 10 до 233/.
ПРИМЕР -2...; | СЕКВЕНИРАНЕ НА ДНК ОТ КЛОН 95 |
кДНК | беше секвенирана използувайки T7Sequencing Kit |
(Pharmacia) със CsCl пречистена плазмидна ДНК и олигонуклеотидни праймери, получени от pGEX секвенцията, приблизително 30
н.дв.
на ляво и на дясно от EcoR I клониращото място. Олигонуклеотидите бяха синтезирани чрез използуването на PCR - MATE 391 DNA Synthesiser (Applied
Biosystems, Foster City, CA, USA) и химикали от Applied Biosystems. Вътрешната секвенция беше получена при използването на прави и обратни олигонуклеотидни праймери съответни на вътрешната кДНК секвенция.
Пълната секвенция на клон 95 и предсказаната аминокиселинна секвенция на транслирания белтък е показана на
Фигура 4. Клон 95 на кДНК съдържа парче от 715 н.дв. / с изключение на нуклеотидите получени като част от клониращата стратегия в ламбда ZAP/. Тази кДНК съдържа отворена рамка за четене от 461 н.дв., кодираща един предсказан белтък с молекулно тегло 16 592 Да.
Следната ДНК секвенция е включена в пълната секвенция на клон 95, като тя произхожда от стратегията , използувана за получаване на кДНК и беше клонирана във вектора ламбда ZAP XR.
На 5' края на кДНК:
5'GAATTCGGCACGAG3' нА 3' края на кДНК:
5'AAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAG3’
Секвенцията от Фигура 4 беше потвърдена независимо използувайки процедурата от Пример 6.
ПРОМИШЛЕНО ПРИЛОЖЕНИЕ
Настоящото изобретение предлага един антигенен полипептид заедно с активни пептидни фрагменти и техни варианти, коитно са ефективни за предизвикване на защитен имунологичен отговор срещу инфекция с Е. granulosus на даден гостоприемник, податлив на такава инфекция. Беше установено, че ваксинирането с този полипептид и/или неговите пептидни фрагменти стимулира почти напълно имунитета срещу заразяване с яйца от Е. granulosus. Изобретението също така предлага рекомбинантен метод за експресия на антигена, чрез който могат да бъдат получени комерсиални количества.
Ясно е, че горното описание се предлага като пример и че опитните експериментатори могат да използуват редица вариации както на материалите, така и на използуваните техники.
ОПИСАНИЕ НА СЕКВЕНЦИИТЕ (1) ОБЩА ИНФОРМАЦИЯ:
/1/ ЗЯВИТЕЛ: NEW ZEALAND PASTORAL AGRICULTURAL INSTITUTE LIMITED, компания включена към Companies Act 1955, съответствуващ на Crwn Research Institutes Act 1992 и имаща регистрирана кантора на Peat Marwick Tower, 85 Alexandra Street, Hamilton New Zealand, THE UNIVERSITY OF MELBOURNE, организация, съобразена със законите на Щата Виктория, Grattan Street, Prkville, Victoria 3052, Australia.
/2/ НАЗВАНИЕ HA ПАТЕНТА: Защитни антигени срещу инфекция среппцу Echinococcus granulosus и ваксини съдържащи такива антигени.
/3/ БРОЙ НА СЕКВЕНЦИИТЕ: 4 /4/ АДРЕС ЗА КОРЕСПОНДЕНЦИЯ:
/А/ Адресант: A J PARK & SON /Б/ Улица: HUDDART PARKER BUILDING, POST OFFICE SQUARE /В/ Град: Ρ Ο BOX 949, WELLINGTON /Г/ Страна:NEW ZEALAND /5/ КОМПЮТЪРНА ФОРМА:
/А/ Вид: 3.5, DS, HD FLOPPY DISK /Б/ Компютър: IBM PC COMPATIBLE /В/ Операционна система: MS-DOS /Г/ Софтуер: WORP PERFECT 5.1 FOR WINDOWS /б/ ТЕКУЩИ ДАННИ:
/А/ Номер на заявката:
/Б/ Дата на попълване: 22. февруари 1993 /В/ Класификация:
/7/ АДВОКАТ/АГЕНТ:
/А/ Име: BENNETT, MICHAEL R.
/8/ТЕЛЕКОМУНИКАЦИОННА ИНФОРМАЦИЯ:
/А/ Телефон: (64 4) 473 8278 /Б/ Телефакс: (64 4) 472 3358
472 3351 (2) ИНФОРМАЦИЯ ЗА СЕКВЕНЦИЯ ID No 1 /1/ СЕКВЕНЦИОННИ ХАРАКТЕРИСТИКИ:
/А/ Дължина: 224 НУКЛЕОТИДНИ ДВОЙКИ /Б/ Вид: НУКЛЕИНОВА КИСЕЛИНА /В/ Верижност: ЕДНОВЕРИЖНА /Г/ Топология: ЛИНЕЙНА /2/ МОЛЕКУЛЕН ВИД: кДНК /3/ ОПИСАНИЕ НА СЕКВЕНЦИЯТА: SEQ ID NO 1
1 | GT СТС Leu | ATT lie | TTG Leu | TTT Phe | GCG Ala | ACT Thr | TCA Ser | GTT Vai | TTG GCT | CAG Gin | GAA Glu | TAC Tyr | AAA Lys | GGA Gly | 47 | |
Leu | Ala | |||||||||||||||
48 | ATG | GGC | GTA | GAG | ACA | AGG | ACA | ACA | GAG | ACT | CCG | CTC | COT | AAA | CAC | 92 |
Met | Gly | Vai | Glu | Thr | Arg | Thr | Thr | Glu | Thr | Pro | Leu | Arg | Lys | His | ||
93 | ТТС | AAT | TTG | ACT | CCT | GTG | GGT | TCT | CAG | GGC | ATT | CGC | TTA | ACT | TGG | 137 |
Phe | Asn | Leu | Thr | Pro | Vai | Gly | Ser | Sin | Gly | lie | Arg | Leu | Ser | Trp | ||
13 | GAA | GTC | CAA | CAC | TTG | TCT | GAC | CTC | AAA | GGA | ACA | GAT | ATT | TCT | CTA | 182 |
G1U | Vai | Gin | His | Leu | Ser | Asp | Leu | Lys | Gly | Thr | Asp | lie | Ser | Leu | ||
18 | AAA | GCG | GTG | AAT | CCT | TCT | GAC | CCG | TTA | GTC | TAC | AAA | AGA | CAA | 224 | |
Lys | Ala | Vai | Asn | Pro | Ser | Asp | Pro | Leu | Vai | Tyr | Lys | Arg | Gin |
(3) ИНФОРМАЦИЯ ЗА SEQ ID No 2:
/1/ СЕКВЕНЦИОННИ ХАРАКТЕРИСТИКИ /А/ Дължина: 74 АМИНО КИСЕЛИНИ /Б/ Вид: АМИНО КИСЕЛИНИ /В/ Топология: ЛИНЕЙНА /2/ МОЛЕКУЛЕН ВИД: БЕЛТЪК /3/ ОПИСАНИЕ НА СЕКВЕНЦИИТЕ: SEQ ID No 2.:
1 | Leu | lie | Leu | Phe | Ala | Thr | Ser | Vai | Leu | Ala | Gin | Glu | Tyr | Lys | Gly | 15 |
16 | Het | Gly | Vai | Glu | Thr | Arg | Thr | Thr | Glu | Thr | Pro | Leu | Arg | Lys | His | 30 |
31 | Pile | Asn | Leu | Thr | Pro | Vai | Gly | Ser | Gin | Gly | Ila | Arg | Leu | Ser | Trp | 45 |
46 | Glu | Vai | Gin | His | Leu | Ser | Asp | Leu | Lys | Gly | Thr | Asp | lie | Ser | Leu | 60 |
61 | Lys | Ala | Vai | Asn | Pro | Ser | Asp | Pro | Leu | Vai | Tyr | Lys | Arg | Gin | 74 |
(4) ИНФОРМАЦИЯ ЗА SEQ ID No 3:
/1/ СЕКВЕНЦИОННИ ХАРАКТЕРИСТИКИ:
/А/ Дължина: 715 НУКЛЕОТИДНИ ДВОЙКИ /В/ Вид: НУКЛЕИНОВА КИСЕЛИНА /В/ Верижност: ЕДНОВЕРИЖНА /Г/ Топология: ЛИНЕЙНА /2/ МОЛЕКУЛЕН ВИД: кДНК /3/ ОПИСАНИЕ НА СЕКВЕНЦИЯТА: SEQ ID No. 3:
1 TC | CAG Gin | TTA Leu | TGT Cye | CTC Leu | ATT lie | TTG Leu | |
4 | TAC | AAA | GGA | ATG | GGC | GTA | |
Tyr | Lys | Gly | Het | Gly | Vai | ||
9 | CGT | AAA | CAC | TTC | AAT | TTG | |
Arg | Lye | His | Phe | Aen | Leu | ||
138 | TTA | AGT | TGG | GAA | GTC | CAA | |
Leu | Ser | Trp | Glu | Vai | Gin | ||
183 | ATT | TCT | CTA | AAA | GCG | GTG | |
( | lie | Ser | Leu | Lys | Ala | Vai | |
228 | AGA | CAA | ACT | GCA | AAA | TTC | |
Arg | Gin | Thr | Ala | Lys | Phe | ||
273 | CTG | AAG | CCC | TCC | ACA | TTA | |
Leu | Lye | Pro | Ser | Thr | Leu | ||
318 | GCG | AAA | AAG | ACC | ATT | TTG | |
Ala | Lys | Lys | Thr | lie | Leu | ||
363 | CGC | GCT | GGC | AAG | AAG | GAA | |
Arg | Ala | Gly | Lys | Lys | Glu | ||
408 | TTA | ACA | TCC | GCA | ATC | GCT | |
Leu | Thr | Ser | Ala | lie | Ala | ||
453 | GTC | CTT | ACT | TGA | ACT | CTC | |
Vai | Leu | Thr | |||||
498 | CTT | CTA | TAC | TGA | GTA | GCA | |
543 | ACT | CTT | CTT | CCA | CAT | CAG | |
588 | TCA | CCA | TTT | ATT | TTC | GCT | |
633 | GTG | GAT | TAC | TCC | CGA | ATG |
TTT | GCG | ACT | TCA | GTT | TTG | GCT | CAG | GAA | 47 |
Phi | Ala | Thr | Ser | Vai | Leu | Ala | Gin | Glu | |
GAG | ACA | AGG | ACA | ACA | GAG | ACT | CCG | CTC | 92 |
Glu | Thr | Arg | Thr | Thr | Glu | Thr | Pro | Leu | |
ACT | CCT | GTG | GGT | TCT | CAG | GGC | ATT | CGC | 137 |
Thr | Pro | Vai | Gly | Ser | Gin | Gly | He | Arg | |
CAC | TTG | TCT | GAC | CTC | AAA | GGA | ACA | GAT | 182 |
His | Leu | Ser | Asp | Leu | Lys | Gly | Thr | Asp | |
AAT | CCT | TCT | GAC | CCG | TTA | GTC | TAC | AAA | 227 |
Asn | Pro | Ser | Asp | Pro | Leu | Vai | Tyr | Lys | |
CCA | GAT | GGA | CAA | CTC | ACT | ATC | GGC | GAA | 272 |
Ser | Asp | Gly | Gin | Leu | Thr | lie | Gly | Glu | |
TAC | AAA | ATG | ACT | GTG | GAA | GCA | GTG | AAA | 317 |
Tyr | Lys | Het | Thr | Vai | Glu | Ala | Vai | Lys | |
GGA | TTC | ACC | GTA | GAC | ATT | GAG | ACA | CCG | 362 |
Gly | Phe | Thr | Vai | Asp | ILe | Glu | Thr | Pro | |
AGC | ACT | GTA | ATG | ACT | AGT | GGA | TCC | GCC | 407 |
Ser | Thr | Vai | Het | Thr | Ser | Gly | Ser | Ala | |
GGT | TTT | GTA | TTC | AGC | TGC | ATA | GTG | GTT | 452 |
Gly | Phe | Vai | Phe | Ser | Cye | lie | Vai | Vai | |
ATG | TAA | GTC | AAT | GCA | AAT | TAT | CCA | CTG | 497 |
CGA | CCC | ATA | ACT | TGC | ATT | TTT | CAA | ATA | 542 |
GCT | TCC | TTG | GTG | CCG | AAG | ATG | CAC | AAA | 587 |
TTA | TTA | ACA | TTT | GTA | TGA | CCT | CTC | ATT | 632 |
ACA | AAT | ACG | GGA | CTT | TGT | CAT | ATT | TGC | 677 |
678
TTC ATT GTT ATC ACC CTT AAT TCC AAT TCA CTG ACT CG
715 (5) ИНФОРМАЦИЯ ЗА SEQ ID No. 4:
/1/ СЕКВЕНЦИОННИ ХАРАКТЕРИСТИКИ:
/А/ Дължина: 153 АМИНО КИСЕЛИНИ /Б/ Вид: АМИНО КИСЕЛИНИ /В/ Топология: ЛИНЕЙНА /2/ МОЛЕКУЛЕН ВИД: БЕЛТЪК /3/ ОПИСАНИЕ НА СЕКВЕНЦИЯТА: SEQ ID No. 4:
1 | Gin | Leu | Cys | Leu | lie | Leu | Phe | Ala | Thr | Ser | Vai | Leu | Ala | Gin | Glu | 15 |
16 | Tyr | Lys | Gly | Met | Gly | Vai | Glu | Thr | Arg | Thr | Thr | Glu | Thr | Pro | Leu | 30 |
31 | Arg | Lye | His | Phe | Asn | Leu | Thr | Pro | Vai | Gly | Ser | Gin | Gly | He | Arg | 45 |
46 | Leu | Ser | Trp | Glu | Vai | Gin | His | Leu | Ser | Asp | Leu | Lys | Gly | Thr | Asp | 60 |
61 | He | Ser | Leu | Lye | Ala | Vai | Asn | Pro | Ser | Asp | Pro | Leu | Vai | Tyr | Lys | 75 |
76 | Arg | Gin | Thr | Ala | Lys | Phe | Ser | Asp | Gly | Gin | Leu | Thr | He | Gly | Glu | 90 |
91 | Leu | Lys | Pro | Ser | Thr | Leu | Tyr | Lys | Met | Thr | Vai | Glu | Ala | Vai | Lys | 105 |
106 | Ala | Lys | Lys | Thr | lie | Leu | Gly | Phe | Thr | Vai | Asp | ILe | Glu | Thr | Pro | 120 |
121 | Arg | Ala | Gly | Lye | Lys | Glu | Ser | Thr | Vai | Met | Thr | Ser | Gly | Ser | Ala | 135 |
136 | leu | Thr | Ser | Ala | He | Ala | Gly | Phe | Vai | Phe | Ser | Cys | lie | Vai | Vai | 150 |
151 Vai Leu Thr 153
Claims (44)
- ПАТЕНТНИ ПРЕТЕНЦИИ1. Пречистен антигенен полипептид, който има молекулно тегло в диапазона 23 до 25кД, изчислено чрез SDS-PAGE и който включва аминокиселинната секвенция:
Leu He Leu Phe Ala Thr Ser Vai Leu Ala Gin Glu Tyr Lys Glu Met Glu Vai Glu Thr Arg Thr Thr Glu Thr Pro Leu Arg Lys His Phe Asn Leu Thr Pro Vai Glu Ser Gin Glu lie Arg Leu Ser Trp Glu Vai Gin His Leu Ser Asp Leu Lys Gly Thr Asp He Ser Leu Lys Ala Vai Asn Pro Ser Asp Pro Leu Vai Tyr Lys Arg Gin и който е в състояние да генерира защитен имунологичен отговор при податлив на инфекция с Е. granulosus гостоприемник; или пептиден фрагмент или негов вариант, които имат еквивалентна защитна имунологична активност. - 2. Пептиден фрагмент, съгласно претенция 1, включващ аминокиселинната секвенция:
Leu He Leu Phe Ala Thr Ser Vai Leu Ala Gin Glu Tyr Lys Glu Met Glu Vai Glu Thr Arg Thr Thr Glu Thr Pro Leu Arg Lys His Phe Asn Leu Thr Pro Vai Glu Ser Gin Glu He Arg Leu Ser Trp Glu Vai Gin His Leu Ser Asp Leu Lys Gly Thr Asp He Ser Leu Lys Ala Vai Asn Pro Ser Asp Pro Leu Vai Tyr Lys Arg Gin - 3. Пептиден фрагмент съгласно претенция 1, състоящ се от аминокиселинната секвенция:
Leu He Leu Phe Ala Thr Ser Vai Leu Ala Gin Glu Tyr Lys Glu Met Glu Vai Glu Thr Arg Thr Thr Glu Thr Pro Leu Arg Lys His Phe Asn Leu Thr Pro Vai Glu Ser Gin Glu lie Arg Leu Ser Trp Glu Vai Gin His Leu Ser Asp Leu Lys Gly Thr Asp He Ser Leu Lys Ala Vai Asn Pro Ser Asp Pro Leu Vai Tyr Lys Arg Gin - 4.Пептиден фрагмент, съгласно претенция 1, състоящ се от аминокиселинната секвенция:
Gin Leu Cys Leu He Leu Phe Ala Thr Ser Vai Leu Ala Gin Glu Tyr Lys Glu Met Glu Vai Glu Thr Arg Thr Thr Glu Thr Pro Leu Arg Lys His Phe Asn Leu Thr Pro Vai Glu Ser Gin Glu He Arg Leu Ser Trp Glu Vai Gin His Leu Ser Asp Leu Lys Gly Thr Asp He Ser Leu Lys Ala Vai Asn Pro Ser Asp Pro Leu Vai Tyr Lys Arg Gin - 5.Полипептид или пептиден фрагмент, съгласно претенция 1, включващ аминокиселинната секвенция:
Gin Leu Cys Leu He Leu Phe Ala Thr Ser Vai Leu Ala Gin Glu Tyr Lys Glu Met Glu Vai Glu Thr Arg Thr Thr Glu Thr Pro Leu Arg Lys His Phe Asn Leu Thr Pro Vai Glu Ser Gin Glu He Arg Leu Ser Trp Glu Vai Gin His Leu Ser Asp Leu Lys Gly Thr Asp He Ser Leu Lys Ala Vai Asn Pro Ser Asp Pro Leu Vai Tyr Lys Arg Gin Thr Ala Lys Phe Ser Asp Gly Gin Leu Thr He Gly Glu Leu Lys Pro Ser Thr Leu Tyr Lys Met Thr Vai Glu Ala Vai Lys Ala Lys Lys Thr He Leu Gly Phe Thr Vai Asp He Glu Thr Pro Arg Ala Gly Lys Lys Glu Ser Thr Vai Met Thr Ser Gly Ser Ala Leu Thr Ser Ala He Ala Glu Phe Vai Phe Ser Cys He Vai Vai Vai Leu Thr - 6. Пептиден фрагмент, съгласно претенция 1, състоящ се от аминокиселинна секвенция:
Gin Leu Cys Leu lie Leu Phe Ala Thr Ser Vai Leu Ala Gin Glu Туг Lys Glu Met Glu Vai Glu Thr Arg Thr Thr Glu Thr Pro Leu Arg Lys His Phe Asn Leu Thr Pro Vai Glu Ser Gin Glu He Arg Leu Ser Trp Glu Vai Gin His Leu Ser Asp Leu Lys Gly Thr Asp He Ser Leu Lys Ala Vai Asn Pro Ser Asp Pro Leu Vai Tyr Lys Arg Gin Thr Ala Lys Phe Ser Asp Gly Gin Leu Thr He Gly Glu Leu Lys Pro Ser Thr Leu Tyr Lys Met Thr Vai Glu Ala Vai Lys Ala Lys Lys Thr He Leu Gly Phe Thr Vai Asp He Glu Thr Pro Arg Ala Gly Lys Lys Glu Ser Thr Vai Met Thr Ser Gly Ser Ala Leu Thr Ser Ala He Ala Glu Phe Vai Phe Ser Cys He Vai Vai Vai Leu Thr - 7. Полипептид или пептиден фрагмент или негов вариант, съгласно претенции 1 до 6, който е продукт от експресирането на нуклеотидна секвенция в клетката гостоприемник.
- 8. Полипептид или пептиден фрагмент или негов вариант, съгласно претенция 7, който се експресира в клетката гостоприемник като хибриден белтък.
- 9. Полипептид или пептид, който съгласно претенция 8 се експресира като хибриден белтък с ензима глутатион sтрансфераза (Е.С 2.5.18).
- 10. Състав, характеризиращ се с това, че е способен да генерира защитна имунологична реакция срещу инфекция с Е. granulosus в даден податлив гостоприемник и основно се състои от компонент подбран от група състояща се от:/а/ полипептидът от претенция 1;/б/ пептиден фрагмент от /а/, които има еквивалентна имунологична активност; и /в/ вариант на /а/ или /б/, който е бил модифициран чрез вмъкване, заместване или премахване на една или повече аминокиселини и който има еквивалентна защитна имунологична активност.
- 11. ДНК молекула, която е подбрана от групата състояща се от:/а/ нуклеотидна секвенция, кодираща антигенния полипептид от претенция 1;/б/ нуклеотидна секвенция, кодираща пептиден фрагмент от антигенния пептид от /а/, който фрагмент има еквивалентна защитна имунологична активност, като полипептида от /а/; и /в/ нуклеотидна секвенция, кодираща вариант на полипептида от /а/ или пептида от /б/ в който аминокиселинната секвенция е била модифицирана чрез вмъкване, заместване или премахване на една или повече аминокиселини, като този вариант има еквивалентна защитна имунологична активност на полипептида от /а/ или пептидния фрагмент от /б/.
- 12. ДНК молекула, която има следната секвенция:Λ ч»»
GT СТС АТТ TTG ТТТ GCG ACT TCA GTT TTG GCT CAG GAA ТАС ААА GGA ATG GGC GTA GAG АСА AGG АСА АСА GAG ACT CCG СТС CGT AAA САС ТТС ААТ TTG ACT ССТ GTG GGT TCT CAG GGC АТТ CGC ТТА AGT TGG GAA GTC CAA CAC TTG ТСТ GAC СТС ААА GGA АСА GAT ATT TCT СТА ААА GCG GTG ААТ ССТ ТСТ GAC CCG TTA GTC ТАС ААА AGA САА - 13. ДНК молекула, която има следната секвенция:
CAG TTA TGT CTC ATT TTG TTT GCG ACT TCA GTT TTG GCT CAG GAA TAC AAA Gin Leu Cys Ley He Leu Phe Ala Thr Ser Vai Leu Ala Gin Glu Tyr Lys GGA ATG GGC GTA GAG ACA AGG ACA ACA GAG ACT CCG CTC CGT AAA CAC TTC Gly Met Gly Vai Glu Thr Arg Thr Thr Glu Thr Pro Leu Arg Lys His Phe ААТ TTG ACT CCT GTG GOT TCT CAG GGC ATT CGC TTA AGT TGG GAA GTC CAA Αβη Leu Thr Pro Vai Gly Ser Gin Gly He Arg Leu Ser Trp Glu Vai Gin CAC TTG TCT GAC CTC AAA GGA ACA GAT ATT TCT CTA AAA GCG GTG AAT CCT His Leu Ser Asp Leu Lys Gly Thr Asp He Ser Leu Lys Ala Vai Asn Pro TCT GAC CCG TTA GTC TAC AAA AGA CAA ACT GCA AAA TTC TCA GAT GGA CAA Ser Asp Pro Leu Vai Tyr Lys Arg Gin Thr Ala Lys Phe Ser Asp Gly Gin СТС ACT ATC GGC GAA CTG AAG CCC TCC ACA TTA TAC AAA ATG ACT GTG GAA Leu Thr He Gly Glu Leu Lys Pro Ser Thr Leu Tyr Lys Met Thr Vai Glu GCA GTG AAA GCG AAA AAG ACC ATT TTG GGA TTC ACC OTA GAC ATT GAG ACA Ala Vai Lys Ala Lys Lys Thr He Leu Gly Phe Thr Vai Asp He Glu Thr CCG CGC GCT GGC AAG AAG GAA AGC ACT OTA ATG ACT AGT GGA TCC GCC TTA Pro Arg Ala Gly Lys Lys Glu Ser Thr Vai Met Thr Ser Gly Ser Ala Leu ACA TCC GCA ATC GCT GOT TTT GTA TTC AGC TGC ATA GTG GTT GTC CTT ACT Thr Ser Ala lie Ala Gly Pho Vai Phe Ser Cys He Vai Vai Vai Leu Thr - 14. ДНК молекула която има следната секвенция:
CAG TTA TGT CTC ATT TTG TTT GCG ACT TCA GTT TTG GCT CAG GAA TAC AAA Gin Leu Cys Ley Ila Leu Phe Ala Thr Ser Vai Leu Ala Gin Glu Tyr Lys GGA ATG GGC GTA GAG ACA AGG ACA ACA GAG ACT CCG CTC CGT AAA CAC TTC Gly Met Gly Vai Glu Thr Arg Thr Thr Glu Thr Pro Leu Arg Lys His Phe AAT TTG ACT CCT GTG GGT TCT CAG GGC ATT CGC TTA AGT TGG GAA GTC CAA Asn Leu Thr Pro Vai Gly Ser Gin Gly lie Arg Leu Ser Trp Glu Vai Gin CAC TTG TCT GAC CTC AAA GGA ACA GAT ATT TCT CTA AAA GCG GTG AAT CCT His Lau Ser Asp Leu Lys Gly Thr Asp lie Ser Leu Lys Ala Vai Asn Pro TCI GAC CCG TTA GTC TAC AAA AGA CAA ACT GCA AAA TTC TCA GAT GGA CAA Sar Asp Pro Leu Vai Tyr Lys Arg Gin Thr Ala Lys Phe Ser Asp Gly Gin CTC ACT ATC GGC GAA CTG AAG CCC TCC ACA TTA TAC AAA ATG ACT GTG GAA Leu Thr He Gly Glu Leu Lys Pro Ser Thr Leu Tyr Lys Met Thr Vai Glu GCA GTG AAA GCG AAA AAG ACC ATT TTG GGA TTC ACC GTA GAC ATT GAG ACA Ala Vai Lys Ala Lys Lys Thr Ila Leu Gly Phe Thr Vai Asp He Glu Thr CCG CGC GCT GGC AAG AAG GAA AGC ACT GTA ATG ACT AGT GGA TCC GCC TTA Pro Arg Ala Gly Lys Lys Glu Ser Thr Vai Met Thr Ser Gly Ser Ala Leu ACA TCC GCA ATC GCT GGT TTT GTA TTC AGC TGC ATA GTG GTT GTC CTT ACT Thr Sar Ala Ila Ala Gly Phe Vai Phi Ser Cys He Vai Vai Vai Leu Thr TGAACTCTCATGTAAGTCAATGCAAATTATCCACTGCTTCTATACTGAGTAGCACGACCCATAACTTGCATTTTTCAAATAACTCTTCTTCCACATCAGGCTTCCTTGGTGCCGAAGATGCACAAATCACCATTTATTTTCGCTTTATTAACATTTGTATGACCTC TCATTGTGGATTACTCCCGAATGACAAATACGGGACTTTGTCATATTTGCTTCATTGTTATCACCCTTAATTCCAATTCACTG ^*·ACTCG - 15. ДНК молекула, съгласно всяка една от претенции 11 до 14, която е била изолирана от естествен източник.
- 16. ДНК молекула, съгласно всяка една от претенции 11 до 14, коята е кДНК.
- 17. Рекомбинантен експресионен вектор, който съдържа ДНК молекула, съгласно всяка една от претенции 11 до 16.
- 18. Клетка гостоприемник, трансформирана с вектор, съгласно претенция 17 и способна да експресира полипептида, пептидния фрагмент или негов вариант, който е кодиран.
- 19. Клетка гостоприемник, съгласно претенция 18, която е прокариот.
- 20. Клетка гостоприемник, съгласно претенция 19, като прокариотния гостоприемник е Е. coli.
- 21. Клетка гостоприемник, съгласно претенция 18, която е еукариот.
- 22. Метод за получаване на антигенен полипептид, пептиден фрагмент или негов вариант, който се състои в култивиране на клетки, съгласно всяка една от претенции 18 до 21 и получаване на експресирания продукт.
- 23. Антигенен полипептид, пептиден фрагмент или негов вариант, получен по метода от претенция 22.
- 24. Ваксина, характеризираща се с това, че съдържаща имунологично-ефективно количество от полипептида, пептидния фрагмент или негов вариант, съгласно всяка една от претенции 1 до 9 и 23 в комбинация с фармацевтично приемлив адювант, носител или разтворител.
- 25. Ваксина съгласно претенция 24, която по-нататък включва едно ефективно количество от един или повече полипептид/и/ от Е. granulosus имащи молекулно тегло, определено 4pe3SDS-PAGE подбрано от ЗОкД, 34кД и 40кД или от един или повече фрагменти или варианти от споменатите полипептиди, имащи еквивалентна имунологична активност.
- 26. Рекомбинантна вирусна ваксина, характеризираща се с това, че включва нуклеинова киселина кодираща антигенен полипептид, пептиден фрагмент или негов вариант, съгласно претенция 1 и която е способна да експресира споменатия кодиран полипептид, пептиден фрагмент или негов вариант.
- 27. Метод за защита на гостоприемник, податлив на инфектиране с паразити от Echinococcus или Taeniid, срещу такава инфекция състоящ се във въвеждане в гостоприемника на имунологично активен полипептид, пептиден фрагмент или вариант, съгласно всяка една от претенции 1 до 8 и 22.
- 28. Метод за защита на гостоприемник, податлив на инфектиране с паразити от Echinococcus или Taeniid, срещу такава инфекция.
- 29. Метод за защита на гостоприемник, податлив на инфектиране с паразити от Echinococcus или Taeniid, срещу такава инфекция, състоящ се от въвеждане в гостоприемника на имунологично ефективно количество ваксина, съгласно всяка една от претенции 24 до 26.
- 30. Метод, съгласно всяка една от претенции 27 до 29, при който споменатия паразит е Е. granulosus.
- 31. Метод, съгласно всяка една от претенции 27 до 29, когато споменатия паразит е Е. multilocularis, Е. vogelii, Т. ovis, Т. saginata, Т. solium, Т. multiceps или Т. hudatigena.
- 32. Очистено антитяло или свързващ -| агмент, специфичен за антигенния полипептид, пептиден фрагмент или вариант, съгласно претенция!.
- 33. Белязана ДНК молекула, съдържаща част или цялата нуклеотидна секвенция от Фигура 4, удобна за използуване като сонда за идентифициране на нуклеиновата киселина, кодираща защитния антиген от Echinococcus или Taeniid, различни от Е. granulosus.
- 34. Използуването на антитяло или свързващ фрагмент, съгласно претенция 32, за идентифициране на защитен антиген от Echinococcus или Taeniid, но не Е. granulosus.
- 35. Използуване на ДНК молекула, съгласно претенция 33, за идентифициране на ДНК кодираща защитен антиген от Echinococcus или Taeniid, но не Е. granulosus.
- 36. Използуване на претенции 34 или 35, когато паразита, който не е Е. granulosus, е Е. multilocularis, Е. vogelii, Т. ovis, Т. saginata, Т. solium, Т. multiceps или Т. hudatigena.
- 37. Метод за идентифициране на защитен антиген от паразитите Echinococcus или Taeniid, но не Е. granulosus, който съдържа и стъпката на идентифициране на ген от споменатия паразит, който има нуклеотидна секвенция, хомоложна на част или на цялата нуклеотидна секвенция от Фигура 4.
- 38. Антигенен полипептид, пептиден фрагмент или вариант, съгласно претенция 1, който е описан подробно тук и има отношение към придружаващите примери и илюстрации.
- 39. ДНК молекула, съгласно претенция 11, която подробно е описана тук и има част или цялата секвенция от Фигура 4.
- 40. Рекомбинантен експресионен вектор, както е дефинирано в претенция 17 и подробно е описан тук.
- 41. Клетка гостоприемник, както е дефинирано в претенция 18 и подробно описано тук.
- 42. Метод за получаване на антигенен полипептид, пептиден фрагмент или вариант, съгласно претенция 22 и подробно описан тук.
- 43. Ваксина, както е дефинирано в претенция 24 и както е описана подробно тук.
- 44. Метод за предпазване на гостоприемник, податлив на заразяване с Echinococcus или Taeniid, срещу такава инфекция съгласно всяка една от претенции 27 до 29 икойто подробно е описан тук с оглед на приложените примери и илюстрации.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
NZ24168892 | 1992-02-21 | ||
PCT/NZ1993/000007 WO1993016722A1 (en) | 1992-02-21 | 1993-02-22 | Antigens protective against echinococcus granulosus infection and vaccines containing such antigens |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
BG98989A true BG98989A (bg) | 1995-07-28 |
BG61754B1 BG61754B1 (bg) | 1998-05-29 |
Family
ID=19923888
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
BG98989A BG61754B1 (bg) | 1992-02-21 | 1994-08-19 | Защитни антигени срещу инфекции от echinococcus granulosus иваксини, които ги съдържат |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0629131B1 (bg) |
JP (1) | JPH07504088A (bg) |
AU (1) | AU676828B2 (bg) |
BG (1) | BG61754B1 (bg) |
BR (1) | BR9305933A (bg) |
DE (1) | DE69330385T2 (bg) |
ES (1) | ES2160594T3 (bg) |
HU (1) | HU220575B1 (bg) |
PT (1) | PT629131E (bg) |
RU (1) | RU2205875C2 (bg) |
UA (1) | UA45946C2 (bg) |
WO (1) | WO1993016722A1 (bg) |
Families Citing this family (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1886936A1 (en) | 2006-08-11 | 2008-02-13 | Graphic Packaging International, Inc. | Construct for heating a rounded food item in a microwave oven and blank therefore |
CN109234410A (zh) * | 2018-11-15 | 2019-01-18 | 海南国际旅行卫生保健中心(海南出入境检验检疫局口岸门诊部) | 一种基于环介导等温扩增技术的检测包虫病的方法 |
CN113214374B (zh) * | 2020-02-06 | 2022-08-26 | 深圳华大基因股份有限公司 | 一种包虫病新抗原Cystatin蛋白 |
CN113214373B (zh) * | 2020-02-06 | 2022-08-30 | 深圳华大基因股份有限公司 | 新包虫病抗原Murinoglobulin-2蛋白 |
CN111796090B (zh) * | 2020-04-21 | 2023-02-07 | 沈阳农业大学 | 牛细粒棘球蚴病时间分辨荧光免疫层析检测试纸条及其制备方法 |
CN112014556A (zh) * | 2020-08-04 | 2020-12-01 | 中国农业科学院兰州兽医研究所 | 一种牛棘球蚴eg95蛋白抗体间接elisa检测试剂盒 |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU642874B2 (en) * | 1989-05-09 | 1993-11-04 | Her Majesty The Queen In Right Of New Zealand Through The Ministry Of Agriculture And Fisheries | Stable forms of antigenic taenia ovis polypeptides |
FR2664613B1 (fr) * | 1990-07-12 | 1994-08-26 | Pasteur Institut | Sequence peptidique immunogene d'echinococcus granulosus, sequence d'adn codant pour cette sequence peptidique et applications diagnostiques et therapeutiques. |
-
1993
- 1993-02-22 JP JP5514723A patent/JPH07504088A/ja active Pending
- 1993-02-22 AU AU36500/93A patent/AU676828B2/en not_active Ceased
- 1993-02-22 RU RU94045154/13A patent/RU2205875C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1993-02-22 DE DE69330385T patent/DE69330385T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1993-02-22 HU HU9402404A patent/HU220575B1/hu not_active IP Right Cessation
- 1993-02-22 EP EP93905659A patent/EP0629131B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1993-02-22 PT PT93905659T patent/PT629131E/pt unknown
- 1993-02-22 BR BR9305933A patent/BR9305933A/pt not_active Application Discontinuation
- 1993-02-22 ES ES93905659T patent/ES2160594T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1993-02-22 WO PCT/NZ1993/000007 patent/WO1993016722A1/en active IP Right Grant
- 1993-02-23 UA UA94085714A patent/UA45946C2/uk unknown
-
1994
- 1994-08-19 BG BG98989A patent/BG61754B1/bg unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU676828B2 (en) | 1997-03-27 |
BG61754B1 (bg) | 1998-05-29 |
PT629131E (pt) | 2001-12-28 |
ES2160594T3 (es) | 2001-11-16 |
HU9402404D0 (en) | 1994-10-28 |
DE69330385D1 (de) | 2001-08-02 |
UA45946C2 (uk) | 2002-05-15 |
BR9305933A (pt) | 1997-08-26 |
WO1993016722A1 (en) | 1993-09-02 |
EP0629131A4 (en) | 1995-11-29 |
EP0629131A1 (en) | 1994-12-21 |
DE69330385T2 (de) | 2002-06-06 |
HU220575B1 (hu) | 2002-03-28 |
HUT69925A (en) | 1995-09-28 |
RU94045154A (ru) | 1996-11-10 |
EP0629131B1 (en) | 2001-06-27 |
JPH07504088A (ja) | 1995-05-11 |
RU2205875C2 (ru) | 2003-06-10 |
AU3650093A (en) | 1993-09-13 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Lightowlers et al. | Vaccination against hydatidosis using a defined recombinant antigen | |
EP0871735B1 (en) | Therapeutic compositions for the treatment of Lawsonia intracellularis infections | |
SK217292A3 (en) | Vaccine containing a pc protein useful in prevention of lyme disease, method of b.burgdorferi protein purification, diagnostic agent detecting b.burgdorferi antigens and method of detecting b.burgdorferi antigenes in humoralis | |
EP0640133A1 (en) | Recombinant dna molecules encoding aminopeptidase enzymes and their use in the preparation of vaccines against helminth infections | |
RU2130072C1 (ru) | Фрагмент днк, кодирующий иммуногенный поверхностный полипептид мерозоитов, иммуногенный полипептид (варианты) и способ его получения, рекомбинантная плазмидная днк и способ ее получения, способ получения рекомбинантного вируса вакцины, способ получения микроорганизма, вакцина против кокцидиоза птицы | |
US6676944B2 (en) | Vaccine containing a peroxiredoxin and/or a β-tubulin | |
BG98989A (bg) | Защитни антигени срещу инфекции от еснinососсus grаnulоsus и ваксини,съдържащи такива антигени | |
JPH025871A (ja) | コクシジウム症ワクチンとして有用な組換え及び天然a、c、f及びh群アイメリア・テネラ免疫原 | |
US7351693B2 (en) | Peptides and nucleic acids of the cathelicidin family, derived from fish, and uses thereof | |
US5525508A (en) | Haemonchus contortus vaccine | |
CZ20012360A3 (cs) | Farmaceutický prostředek, vakcína, protein a způsob prevence nebo léčby | |
JPH05507208A (ja) | 線虫ワクチン | |
HUT56852A (en) | Process for producing anticoagulant and vermicidal proteins | |
EP0540128B1 (en) | Nematode vaccine | |
CA2442346C (en) | Nucleic acids encoding isav polypeptides | |
NZ249600A (en) | Antigenic polypeptides, their production and vaccines containing them, useful against echinococcus (tapeworm) and taenii parasite infections | |
NZ224597A (en) | Taenia ovis antigens and vaccines | |
GB2219590A (en) | Antigenic polypeptides of taena ovis | |
Nicholson | Studies on the immunological role of schistosome tropomyosin in schistosomiasis |