WO2023128722A1 - Cda 억제제를 포함하는 alk 저해제 내성 비소세포폐암 치료용 조성물 - Google Patents

Cda 억제제를 포함하는 alk 저해제 내성 비소세포폐암 치료용 조성물 Download PDF

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WO2023128722A1
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cda
inhibitor
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lung cancer
protein
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김미랑
허해정
함기옥
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한국생명공학연구원
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Definitions

  • the present invention relates to a composition for treating ALK inhibitor-resistant non-small cell lung cancer containing a CDA (cytidine deaminase) inhibitor, and more particularly, to inhibit the expression or activity of CDA to inhibit proliferation, migration, and invasion of ALK inhibitor-resistant non-small cell lung cancer. It relates to a composition for treating ALK inhibitor-resistant non-small cell lung cancer, which inhibits and exhibits anticancer activity.
  • CDA cytidine deaminase
  • ALK is a tyrosine kinase receptor, which includes the Ras/Raf/MEK/ERK1/2 pathway, JAK (Janus kinase)/STAT (signal transducers and activators of transcription) pathway, Pl3K (Phosphatidylinositol It plays an important role in cell proliferation, growth and survival through the 3-kinase)/Akt pathway.
  • overexpression of ALK results in abnormal proliferation and growth of cancer cells.
  • EML4 echinoderm microtubule-associated protein-like 4
  • ALK inhibitors such as crizotinib and ceritinib have been used as target therapeutics for ALK, but when continued use, they show resistance to therapeutic effects or show measurable responses. There is an invisible problem. In fact, only about 10% of non-small cell lung cancer patients respond to these drugs (Transl Cancer Res 2017;6(Suppl 2):S239-S245).
  • the present inventors have repeatedly conducted extensive research to develop a new therapeutic agent for the treatment of non-small cell lung cancer that has acquired resistance to ALK inhibitors.
  • the present invention was completed by finding that the activity of inhibiting proliferation, migration and invasion of cell lung cancer was very excellent.
  • an object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition for the prevention or treatment of non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor comprising a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor as an active ingredient.
  • CDA cysteine deaminase
  • Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition for preventing or treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor comprising a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor.
  • CDA cysteine deaminase
  • an object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition for preventing or treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor consisting essentially of a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor.
  • CDA cysteine deaminase
  • Another object of the present invention is (a) processing a test substance to cells expressing CDA protein or mRNA; (b) measuring the expression level of CDA protein or mRNA in the cells and control cells not treated with the test substance; and (c) screening for a non-small cell lung cancer drug resistant to an ALK inhibitor comprising the step of selecting a test substance that reduces the expression level of CDA protein or mRNA compared to control cells as a candidate substance that acquires resistance to the ALK inhibitor. is to provide a way
  • An object of the present invention is to provide a use of a CDA (cysteine deaminase) expression or activity inhibitor for preparing a composition for treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor.
  • CDA cyste deaminase
  • An object of the present invention is to provide a method for treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to ALK inhibitors, comprising administering an effective amount of a composition containing a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor as an active ingredient to a subject in need thereof will be.
  • CDA cysteine deaminase
  • the present invention provides a pharmaceutical composition for preventing or treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor comprising a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor as an active ingredient.
  • CDA cysteine deaminase
  • the present invention provides a pharmaceutical composition for preventing or treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor comprising a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor.
  • an ALK inhibitor comprising a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor.
  • the present invention provides a pharmaceutical composition for preventing or treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor consisting essentially of an inhibitor of expression or activity of CDA (cysteine deaminase).
  • the present invention comprises the steps of (a) treating a test substance to cells expressing CDA protein or mRNA; (b) measuring the expression level of CDA protein or mRNA in the cells and control cells not treated with the test substance; and (c) screening for a non-small cell lung cancer drug resistant to an ALK inhibitor comprising the step of selecting a test substance that reduces the expression level of CDA protein or mRNA compared to control cells as a candidate substance that acquires resistance to the ALK inhibitor.
  • the present invention provides the use of a CDA (cysteine deaminase) expression or activity inhibitor for preparing a composition for treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor.
  • CDA cyste deaminase
  • the present invention acquires resistance to ALK inhibitors, which includes administering an effective amount of a composition containing a CDA (cysteine deaminase) expression or activity inhibitor as an active ingredient to a subject in need thereof
  • a method for treating non-small cell lung cancer is provided.
  • the present invention provides a pharmaceutical composition for preventing or treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor, including a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor as an active ingredient.
  • an ALK inhibitor including a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor as an active ingredient.
  • CDA cysteine deaminase
  • the pharmaceutical composition of the present invention may be a composition containing a CDA expression or activity inhibitor as an active ingredient, or a composition composed of a CDA expression or activity inhibitor as an active ingredient, or a CDA expression or activity inhibitor as an active ingredient. It may also be a composition consisting essentially of an active inhibitor.
  • the term 'comprising' is used in the same meaning as 'including' or 'characterized by', and in the composition or method according to the present invention, specifically Additional components or method steps not mentioned are not excluded. Also, the term 'consisting of' means excluding additional elements, steps or components not separately described. The term 'essentially consisting of' means that in the scope of a composition or method, in addition to the described materials or steps, materials or steps that do not substantially affect the basic characteristics thereof may be included.
  • 'treatment' means inhibition of occurrence or recurrence of a disease, alleviation of symptoms, reduction of direct or indirect pathological consequences of a disease, reduction of the rate of disease progression, improvement of a disease state, amelioration, alleviation, or improved prognosis. do.
  • the term 'prevention' refers to any action that suppresses the onset or delays the progression of a disease.
  • 'Protein' is used interchangeably with 'polypeptide' or 'peptide' and refers to a polymer of amino acid residues, eg as commonly found in proteins in nature.
  • a 'fragment' of a CDA protein refers to a peptide of a portion of a CDA protein.
  • 'mRNA messenger RNA or messenger RNA
  • RNA that serves as a blueprint for polypeptide synthesis (protein translation) by transferring the genetic information of the nucleotide sequence of a specific gene to ribosome during protein synthesis.
  • protein translation protein translation
  • the "ALK inhibitor” refers to a drug that exhibits a therapeutic effect on patients with EML4-ALK-positive non-small cell lung cancer and inhibits the kinase activity of EML4-ALK.
  • the acquisition of resistance to the ALK inhibitor is determined by comparing the initial drug response to the administration of the drug for a certain period of time when the ALK inhibitor is administered to a non-small cell lung cancer patient for a certain period of time for the treatment of non-small cell lung cancer. ALK inhibitor It can be said that non-dependent tolerance has been acquired for .
  • an increase in the expression level of the CDA gene or protein or a decrease in methylation of the CDA gene can be said to be an important factor in inducing resistance.
  • Progression of the non-small cell lung cancer can be confirmed by any means that can confirm the development of cancer by imaging, such as computed tomography (CT), magnetic resonance imaging (MRI), ultrasound, X-ray imaging, mammography, PET scan, radiographic
  • CT computed tomography
  • MRI magnetic resonance imaging
  • ultrasound ultrasound
  • X-ray imaging X-ray imaging
  • mammography mammography
  • PET scan radiographic
  • the method is not particularly limited as long as it can be confirmed through an imaging technique such as a nuclide scan or a bone scan.
  • the ALK inhibitor may be selected from the group consisting of crizotinib, ceritinib, alectinib, brigatinib, and entrectinib. It is not limited.
  • the term 'expression' refers to the production of proteins or nucleic acids in cells.
  • the CDA means an enzyme having an activity that converts cytidine (or deoxycytidine) into uridine (or deoxyuridine), CDA (cytidine deaminase; EC number 3.5.4.5; eg, CDD): GenBank Accession Nos. Sequences such as NP_001776.1 (Gene: NM_001785.2), CAA06460.1 (Gene: AJ005261.1), NP_416648.1 (Gene: NC_000913.3) can be referenced.
  • the CDA protein may consist of the following amino acid sequence and the CDA gene may consist of the following nucleotide sequence.
  • plgicaerta iqkavsegyk dfraiaiasd mqddfispcg acrqvmrefg tnwpvymtkp
  • the ALK inhibitor-resistant non-small cell lung cancer patient is preferably an "EML4-ALK-positive non-small cell lung cancer patient", which may mean a patient who is resistant to an ALK inhibitor.
  • the EML4-ALK-positive non-small cell lung cancer patient refers to a non-small cell lung cancer patient with a mutation in the ALK gene. Mutation of the ALK gene may be formed from fusion of EML4 and ALK genes. The fused gene induces cancer by expressing EML4-ALK.
  • the substance that inhibits the expression of CDA may be a substance that inhibits translation of the CDA mRNA, and may be a low-molecular-weight compound, antisense nucleic acid sequence prepared, or RNA using RNAi technology, siRNA, or shRNA.
  • the substance that inhibits the expression of CDA may be an antisense oligonucleotide, siRNA, shRNA, miRNA, ribozyme, DNAzyme, and protein nucleic acid (PNA) that complementarily bind to CDA mRNA.
  • the material for suppressing the expression of the CDA gene may be a promoter, an enhancer, or a protein or compound that binds to a transcriptional regulator known to regulate the transcription of the CDA gene.
  • substances that inhibit the expression of CDA include antisense nucleotides that complementarily bind to the CDA gene or its mRNA, short interfering RNA, short hairpin RNA, and double strand RNA.
  • miRNA micro RNA
  • nucleotide molecules that are antisense to nucleic acids specifically encoding the CDA protein can be used as inhibitors.
  • An 'antisense' nucleic acid may comprise a nucleic acid sequence that is complementary to a 'sense' nucleic acid encoding a CDA, for example complementary to the coding strand of a double-stranded cDNA molecule or complementary to an mRNA sequence.
  • the antisense nucleic acid may be complementary to the entire CDA coding strand or only a portion thereof (eg, a coding region).
  • the material may be shRNA, miRNA or siRNA specifically targeting mRNA of the CDA gene.
  • the CDA activity inhibitor may be selected from the group consisting of compounds, peptides, peptide mimetics, aptamers, antibodies, and natural extracts that specifically bind to or competitively inhibit the activity of CDA protein.
  • the CDA activity inhibitor may be selected from the group consisting of tetrahydrouridine, cedazuridine, and pharmaceutically acceptable salts thereof.
  • the term "pharmaceutically acceptable” means that it does not interfere with the biological activity or properties of a compound and is relatively non-toxic, that is, a substance has an undesirable biological effect or any component of a composition it contains. Refers to a substance, such as a carrier or diluent, that can be administered to an individual without interacting in a detrimental way with the component.
  • the term "pharmaceutically acceptable salt” refers to a salt of a compound to be administered prepared from non-toxic acids including pharmaceutically acceptable inorganic acids, organic acids, solvates, hydrates or clathrates thereof. indicate As the pharmaceutically acceptable salt of apigenin, an acid addition salt formed from a pharmaceutically acceptable free acid may be useful. Acid addition salts are formed with inorganic acids such as hydrochloric acid, nitric acid, phosphoric acid, sulfuric acid, hydrobromic acid, hydroiodic acid, nitrous acid or phosphorous acid and aliphatic mono- and dicarboxylates, phenyl-substituted alkanoates, hydroxy alkanoates and alkanedios.
  • non-toxic organic acids such as oxalates, aromatic acids, aliphatic and aromatic sulfonic acids.
  • These pharmaceutically non-toxic salts include sulfate, pyrosulfate, bisulphate, sulphite, bisulfite, nitrate, phosphate, monohydrogen phosphate, dihydrogen phosphate, metaphosphate, pyrophosphate chloride, bromide, ioda Id, fluoride, acetate, propionate, decanoate, caprylate, acrylate, formate, isobutyrate, caprate, heptanoate, propiolate, oxalate, malonate, succinate, suberate , sebacate, fumarate, maleate, butyne-1,4-dioate, hexane-1,6-dioate, benzoate, chlorobenzoate, methylbenzoate, dinitro benzoate, hydroxybenzoate, Toxybenzo
  • the pharmaceutical composition of the present invention may further include a pharmaceutically acceptable carrier.
  • a pharmaceutically acceptable carrier may further include, for example, a carrier for oral administration or a carrier for parenteral administration.
  • Carriers for oral administration may include lactose, starch, cellulose derivatives, magnesium stearate, stearic acid and the like.
  • carriers for parenteral administration may include water, suitable oil, saline, aqueous glucose and glycol, and the like.
  • a stabilizer and a preservative may be further included. Suitable stabilizers include antioxidants such as sodium bisulfite, sodium sulfite or ascorbic acid.
  • Suitable preservatives include benzalkonium chloride, methyl- or propyl-paraben and chlorobutanol.
  • the pharmaceutical composition of the present invention can be administered to mammals including humans by any method.
  • it can be administered orally or parenterally, and parenteral administration methods include, but are not limited to, intravenous, intramuscular, intraarterial, intramedullary, intrathecal, intracardiac, transdermal, subcutaneous, intraperitoneal , intranasal, enteral, topical, sublingual or rectal administration.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may be formulated into a preparation for oral administration or parenteral administration according to the administration route as described above.
  • one or more buffers eg saline or PBS
  • antioxidants e.g saline or PBS
  • bacteriostats e.g EDTA or glutathione
  • fillers e.g. EDTA or glutathione
  • bulking agents e.g. EDTA or glutathione
  • binders eg aluminum hydroxyl side
  • suspending agents eg aluminum hydroxyl
  • Solid preparations for oral administration include tablets, pills, powders, granules, liquids, gels, syrups, slurries, suspensions or capsules, etc. These solid preparations contain at least one excipient in the pharmaceutical composition of the present invention.
  • starch including corn starch, wheat starch, rice starch, potato starch, etc.
  • calcium carbonate sucrose, lactose, dextrose, sorbitol, mannitol (mannitol), xylitol, erythritol maltitol, cellulose, methyl celulose, sodium carboxymethyl cellulose and hydroxypropyl methyl-cellulose or gelatin It can be prepared by mixing etc.
  • Tablets or sugar tablets may be obtained, for example, by combining the active ingredient with a solid excipient, grinding it, and processing it into a mixture of granules after adding suitable auxiliaries.
  • Liquid preparations for oral use include suspensions, solutions for oral use, emulsions, or syrups.
  • various excipients such as wetting agents, sweeteners, aromatics, or preservatives may be included. .
  • cross-linked polyvinylpyrrolidone, agar, alginic acid, or sodium alginate may be added as a disintegrant, and may further include anti-agglomerating agents, lubricants, wetting agents, flavoring agents, emulsifiers, and preservatives. .
  • the pharmaceutical composition of the present invention may be formulated according to a method known in the art in the form of injection, transdermal administration, and nasal inhalation with a suitable parenteral carrier.
  • a suitable parenteral carrier In the case of the injection, it must be sterilized and must be protected from contamination by microorganisms such as bacteria and fungi.
  • suitable carriers for injections include, but are not limited to, water, ethanol, polyols (eg, glycerol, propylene glycol, liquid polyethylene glycol, etc.), mixtures thereof, and/or solvents or dispersion media containing vegetable oils.
  • suitable carriers include Hanks' solution, Ringer's solution, phosphate buffered saline (PBS) containing triethanolamine or sterile water for injection, 10% ethanol, 40% propylene glycol and 5% dextrose.
  • An isotonic solution such as can be used.
  • various antibacterial and antifungal agents such as paraben, chlorobutanol, phenol, sorbic acid, thimerosal, etc. may be further included.
  • the injection may further include an isotonic agent such as sugar or sodium chloride.
  • Transdermal preparations include ointments, creams, lotions, gels, external solutions, pastas, liniments, air rolls, and the like.
  • 'transdermal administration' means that an effective amount of the active ingredient contained in the pharmaceutical composition is delivered into the skin by applying the pharmaceutical composition topically to the skin.
  • an inhibitor of the expression or activity of CDA of the present invention is pressurized using a suitable propellant, e.g., dichlorofluoromethane, trichlorofluoromethane, dichlorotetrafluoroethane, carbon dioxide, or other suitable gas. It can be conveniently delivered in the form of an aerosol spray from a pack or nebulizer. In the case of pressurized aerosols, dosage units may be determined by providing a valve that delivers a metered amount.
  • gelatin capsules and cartridges for use in inhalers or insufflators may be formulated to contain a powder mixture of the compound and a suitable powder base such as lactose or starch. Formulations for parenteral administration are described in prescriptions generally known to all pharmaceutical chemists.
  • the pharmaceutical composition of the present invention can provide desirable disease prevention and treatment effects when it contains an effective amount of a CDA expression or activity inhibitor.
  • the term 'effective amount' refers to an amount that exhibits a higher response than that of the negative control group, and preferably refers to an amount sufficient to alleviate the symptoms of non-small cell lung cancer.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may contain 0.01 to 99.99% of CDA expression or activity inhibitors, and the remaining amount may be occupied by a pharmaceutically acceptable carrier.
  • the effective amount of the expression or activity inhibitor of CDA included in the pharmaceutical composition of the present invention will vary depending on the form in which the composition is commercialized.
  • the total effective amount of the pharmaceutical composition of the present invention may be administered to the patient in a single dose, or may be administered by a fractionated treatment protocol in which multiple doses are administered over a long period of time.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may vary the content of the active ingredient according to the severity of the disease. In case of parenteral administration, it is preferably administered in an amount of 0.01 to 50 mg, more preferably 0.1 to 30 mg per 1 kg of body weight per day based on the inhibitor of CDA expression or activity, and in case of oral administration, the amount of CDA protein Based on the expression or activity inhibitor, preferably 0.01 to 100 mg, more preferably 0.01 to 10 mg per 1 kg of body weight per day may be administered in one to several divided doses.
  • the dose of the expression or activity inhibitor of the CDA protein is determined by the patient in consideration of various factors such as age, weight, health condition, sex, severity of disease, diet and excretion rate of the patient as well as the route of administration of the pharmaceutical composition and the number of treatments. Since the effective dose is determined, considering this point, those with ordinary knowledge in the art can use an inhibitor of the expression or activity of the CDA protein at an appropriate effective dose according to specific uses for the prevention and treatment of non-small cell lung cancer. will be able to determine
  • the pharmaceutical composition according to the present invention is not particularly limited in its formulation, administration route and administration method as long as it exhibits the effects of the present invention.
  • composition of the present invention can be used alone or in combination with methods using surgery, radiation therapy, hormone therapy, chemotherapy or biological response modifiers.
  • composition of the present invention may also be provided in the form of an external preparation containing a CDA expression or activity inhibitor as an active ingredient.
  • the pharmaceutical composition of the present invention when used as an external skin preparation, it may additionally contain a fatty substance, an organic solvent, a solubilizing agent, a thickening agent and a gelling agent, a softening agent, an antioxidant, a suspending agent, a stabilizer, a foaming agent, a fragrance, and an interface agent.
  • Active agents water, ionic emulsifiers, non-ionic emulsifiers, fillers, sequestering agents, chelating agents, preservatives, vitamins, blocking agents, humectants, essential oils, dyes, pigments, hydrophilic actives, lipophilic actives or lipid vesicles, etc.
  • Skin may contain adjuvants commonly used in the field of dermatology, such as any other ingredients commonly used in external preparations.
  • the components may be introduced in an amount generally used in the field of skin science.
  • the pharmaceutical composition of the present invention when provided as an external skin preparation, it may be formulated as an ointment, patch, gel, cream or spray, but is not limited thereto.
  • the composition may be administered in combination with an ALK inhibitor.
  • compositions When the composition of the present invention is administered in combination with an ALK inhibitor, the compositions may be administered individually in the form of a single composition or simultaneously administered in the form of a combination drug. That is, the composition and the ALK inhibitor may be administered simultaneously (simultaneously), separately (separately) or sequentially (sequentially), and there is no particular limitation on the order of administration when administered sequentially.
  • the present invention also provides a food composition for preventing or improving non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor, including a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor as an active ingredient.
  • an ALK inhibitor including a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor as an active ingredient.
  • CDA cysteine deaminase
  • the food composition according to the present invention can be used to prevent or improve non-small cell lung cancer that has acquired resistance to ALK inhibitors.
  • the food composition of the present invention includes all types of functional food, nutritional supplements, health food, food additives, etc., and is intended for consumption by humans or animals including livestock.
  • Food compositions of this type can be prepared in various forms according to conventional methods known in the art.
  • Food compositions of this type can be prepared in various forms according to conventional methods known in the art.
  • General foods include, but are not limited to, beverages (including alcoholic beverages), fruits and their processed foods (e.g. canned fruits, bottled products, jams, marmalades, etc.), fish, meat and their processed foods (e.g. ham, sausages) Corned beef, etc.), breads and noodles (e.g. udon, buckwheat noodles, ramen, spagate, macaroni, etc.), fruit juice, various drinks, cookies, taffy, dairy products (e.g.
  • CDA expression or activity inhibitor itself is prepared in the form of tea, juice, and drink, so that it can be consumed (healthy beverage), liquefied, granulated, encapsulated, and powdered It can be digested and consumed.
  • the CDA expression or activity inhibitor in the form of a food additive, it can be prepared and used in the form of a powder or concentrate. In addition, it may be prepared in the form of a composition by mixing a CDA expression or activity inhibitor and a known active ingredient known to have cancer prevention or improvement effects.
  • the health beverage composition may contain various flavoring agents or natural carbohydrates as additional components, like conventional beverages.
  • the aforementioned natural carbohydrates include monosaccharides such as glucose and fructose; disaccharides such as maltose and sucrose; polysaccharides such as dextrin and cyclodextrin; It may be a sugar alcohol such as xylitol, sorbitol, or erythritol.
  • Sweeteners include natural sweeteners such as thaumatin and stevia extract; Synthetic sweeteners such as saccharin and aspartame may be used.
  • the proportion of the natural carbohydrate is generally about 0.01 to 0.04 g, preferably about 0.02 to 0.03 g per 100 mL of the composition of the present invention.
  • the amount is specifically limited to an amount effective to achieve symptomatic improvement. However, it is preferably 0.01 to 100% by weight based on the total weight of the total composition.
  • the food composition of the present invention can be prepared by mixing the CDA expression or activity inhibitor together with other active ingredients known to have an effect of improving non-small cell lung cancer that has acquired resistance to ALK inhibitors.
  • the food composition of the present invention when used as a health food, various nutrients, vitamins, electrolytes, flavors, colorants, pectic acid, salts of pectic acid, alginic acid, salts of alginic acid, organic acids, protective colloidal thickeners, pH It may contain regulators, stabilizers, preservatives, glycerin, alcohols or carbonating agents, and the like.
  • the health food of the present invention may contain fruit flesh for the production of natural fruit juice, fruit juice beverage or vegetable beverage. These components may be used independently or in combination. The ratio of these additives is not very important, but is generally selected in the range of 0.01 to 0.1 parts by weight per 100 parts by weight of the composition of the present invention.
  • the present invention also comprises the steps of (a) treating a test substance to cells expressing CDA protein or mRNA; (b) measuring the expression level of CDA protein or mRNA in the cells and control cells not treated with the test substance; and (c) screening for a non-small cell lung cancer drug resistant to an ALK inhibitor comprising the step of selecting a test substance that reduces the expression level of CDA protein or mRNA compared to control cells as a candidate substance that acquires resistance to the ALK inhibitor.
  • the step (a) is a step of contacting cells expressing the CDA protein or mRNA in order to determine whether the test substance to be analyzed has an activity of inhibiting the expression of the CDA protein or mRNA.
  • 'contacting' or 'treatment' is a general meaning, and combines two or more agents (eg, two peptides), or an agent and a cell (eg, refers to the binding of proteins to cells).
  • Contacting can occur in vitro. For example, combining two or more agents in a test tube or other container, or combining a test agent with a cell or a cell lysate and a test agent. Contact may also occur in cells or in situ.
  • two polypeptides are brought into contact in a cell or cell lysate by co-expression in a cell of a recombinant polynucleotide encoding the two polypeptides.
  • a protein chip or a protein array in which proteins to be tested are arranged on the surface of a stationary phase may be used.
  • test substance' can be used interchangeably with a test agent or agent, and is any substance, molecule, element, compound ( compound), entity, or a combination thereof. Examples include proteins, polypeptides, small organic molecules, polysaccharides, polynucleotides, and the like. It may also be a natural product, a synthetic compound or a chemical compound or a combination of two or more substances.
  • test agents that can be screened by the method of the present invention are polypeptides, beta-turn mimetics, polysaccharides, phospholipids, hormones, prostaglandins, steroids, aromatic compounds, heterocyclic compounds, benzodiazepines ), oligomeric N-substituted glycines, oligocarbamates, saccharides, fatty acids, purines, pyrimidines or derivatives thereof, structural analogs or combinations thereof.
  • Test agents may be synthetic or natural.
  • the test agents can be obtained from a wide variety of sources including libraries of synthetic or natural compounds. Combinatorial libraries can be produced with several types of compounds that can be synthesized in a step-by-step manner.
  • ESL encoded synthetic libraries
  • Peptide libraries can be prepared by phage display methods (WO91/18980).
  • Libraries of natural compounds in the form of bacterial, fungal, plant and animal extracts can be obtained from commercial sources or collected in the field.
  • Known pharmacological agents can be subjected to direct or random chemical modifications such as acylation, alkylation, esterification, amidification, etc. to produce structural analogs.
  • 'expression' refers to the production of a protein or nucleic acid in a cell.
  • the CDA-expressing cell may be a cell endogenously expressing CDA or a cell transformed with a recombinant expression vector containing a polynucleotide encoding CDA to overexpress CDA.
  • the cell expressing the CDA gene may be an ALK inhibitor-resistant non-small cell lung cancer cell line.
  • Step (b) is a step of measuring the gene expression level of CDA in CDA-expressing cells contacted with the test substance and CDA-expressing cells not contacted with the test substance.
  • RNA sequencing For measurement of CDA mRNA expression, conventional expression level confirmation methods in the art can be used without limitation.
  • analysis methods include reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and competitive RT-PCR (competitive RT-PCR).
  • PCR reverse transcription polymerase chain reaction
  • RPA RNase protection assay
  • northern blotting DNA microarray chip
  • RNA sequencing RNA sequencing
  • a method for measuring the expression level of CDA protein methods known in the art can be used without limitation, such as western blotting, dot blotting, enzyme-linked immunosorbent assay ), radioimmunoassay (RIA), radioimmunoassay, octeroni immunodiffusion, rocket immunoelectrophoresis, immunohistochemical staining, immunoprecipitation, complement fixation assay, flow cytometry (FACS) or protein chip method and the like, but is not limited thereto.
  • RIA radioimmunoassay
  • FACS flow cytometry
  • Step (c) is a step of selecting a test substance that reduces the expression level of CDA protein or mRNA compared to control cells as an ALK inhibitor-resistant non-small cell lung cancer treatment candidate.
  • inhibiting the activity of CDA inhibits the growth and metastasis of ALK inhibitor-resistant non-small cell lung cancer cells and improves the survival rate. It can be clearly understood that there is a possibility of being used as a therapeutic agent for ALK inhibitor-resistant non-small cell lung cancer as it exerts an effect of inhibiting the activity.
  • the ALK inhibitor-resistant non-small cell lung cancer therapeutic agent may preferably be a substance that exhibits an effect of inhibiting the activity of CDA by decreasing the expression of CDA protein or mRNA.
  • the present invention provides a use of a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor for preparing a composition for treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor.
  • CDA cysteine deaminase
  • the present invention provides a method for treating non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor, comprising administering an effective amount of a composition containing a cysteine deaminase (CDA) expression or activity inhibitor as an active ingredient to a subject in need thereof.
  • CDA cysteine deaminase
  • the 'effective amount' of the present invention refers to an amount that exhibits an effect of improving, treating, detecting, diagnosing, or suppressing or reducing non-small cell lung cancer that has acquired resistance to an ALK inhibitor when administered to an individual, wherein the 'subject ' may be an animal, preferably a mammal, especially an animal including a human, and may also be a cell, tissue, organ, etc. derived from an animal. The subject may be a patient in need of the effect.
  • the 'treatment' of the present invention comprehensively refers to ameliorating non-small cell lung cancer or non-small cell lung cancer symptoms that have acquired resistance to an ALK inhibitor, which cures, substantially prevents, or improves the condition of the disease. It may include alleviating, including, but not limited to, alleviating, curing or preventing one or most of the symptoms resulting from the disease.
  • Substances capable of inhibiting the expression or activity of CDA inhibit the proliferation, migration, and invasion of non-small cell lung cancer resistant to ALK inhibitors, making it very useful for the development of prevention or treatment for non-small cell lung cancer resistant to ALK inhibitors. It can be.
  • 1a to 1g are results of evaluating the anticancer activity of suppressing CDA expression or activity on ALK inhibitor-resistant cells (LR).
  • 2a to 2e are results of evaluating the gene expression level profile of cells depleted of CDA expression in lung cancer cell line H3122, ALK inhibitor resistant cells (LR) and resistant cells, and the anticancer activity of inhibiting CDA expression or activity.
  • LR ALK inhibitor resistant cells
  • RNA-seq Gene expression level of lung cancer cell line H3122 and ALK inhibitor-resistant LR cell line by RNA-seq and gene expression analysis of CDA-depleted LR cells by RNA-seq.
  • a lung cancer cell line, H3122 was cultured in 1% antibiotics (Gibco, Cat# 15240062 Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA) and 10% fetal bovine serum (HyClone, UT, USA). They were cultured in RPMI-1640 medium (WELGENE, Cat No. LM 011-01, Korea) supplemented with Ceritinib (LDK378).
  • LR cells an ALK inhibitor-resistant lung cancer cell line, were formed according to a previously reported method. Briefly, H3122 cells were cultured with increasing concentrations of ceritinib starting with an IC 30 , and resistant cells were induced after approximately 6 months of culture under continuous 1 ⁇ M ceritinib treatment conditions. All cells were maintained at 37° C. in a humidified atmosphere containing 5% CO 2 .
  • Example 2 Inhibition of proliferation and migration of ALK inhibitor-resistant lung cancer cell lines through inhibition of CDA (cytidine deaminase) expression or activity
  • CDA depletion in LR cell lines by siRNA increased the expression of the epithelial marker E-Cadherin and decreased the expression of the mesenchymal markers N-Cadherin and Vimentin (Fig. 1e).
  • CDA depletion can inhibit migration and metastasis of cancer cells by reducing wound healing (Fig. 1f) and cell migration and invasion (Fig. 1g).
  • Example 3 LR cell line and CDA (cytidine deaminase) suppression of proliferation of resistant lung cancer cell line through inhibition of gene expression level profile and expression or activity of CDA (cytidine deaminase) suppressed cell
  • RNA-seq analysis of gene expression in the lung cancer cell line H3122 and the ALK inhibitor-resistant LR cell line it was confirmed that the CDA expression level increased in the resistant cells.
  • RNA-seq analysis of gene expression in cells depleted of CDA expression in LR cells using CDA siRNA showed that genes up-regulated in LR cells were down-regulated in CDA-depleted cells (Fig. 2a). It was confirmed that downregulated CDA in CDA-depleted cells was associated with proliferation, migration and invasion (FIG. 2B).
  • Substances capable of inhibiting the expression or activity of CDA inhibit the proliferation, migration, and invasion of non-small cell lung cancer resistant to ALK inhibitors, making it very useful for the development of prevention or treatment for non-small cell lung cancer resistant to ALK inhibitors. It has high industrial applicability.

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Abstract

본 발명은 CDA(cysteine deaminase) 억제제를 포함하는 ALK 저해제 내성 비소세포폐암 치료용 조성물에 관한 것으로, 보다 상세하게는 CDA의 발현 또는 활성을 억제하여 ALK 저해제 내성 비소세포폐암의 증식, 이주 및 침습을 억제하여 항암활성을 나타내는 ALK 저해제 내성 비소세포폐암 치료용 조성물에 관한 것이다.

Description

CDA 억제제를 포함하는 ALK 저해제 내성 비소세포폐암 치료용 조성물
본 출원은 2022년 1월 3일에 출원된 대한민국 특허출원 제10-2022-0000569호를 우선권으로 주장하고, 상기 명세서 전체는 본 출원의 참고문헌이다.
본 발명은 CDA(cytidine deaminase) 억제제를 포함하는 ALK 저해제 내성 비소세포폐암 치료용 조성물에 관한 것으로, 보다 상세하게는 CDA의 발현 또는 활성을 억제하여 ALK 저해제 내성 비소세포폐암의 증식, 이주 및 침습을 억제하여 항암활성을 나타내는 ALK 저해제 내성 비소세포폐암 치료용 조성물에 관한 것이다.
ALK(Anaplastic Lymphoma kinase)는 티로신 키나아제 수용체(tyrosine kinase receptor)로서 Ras/Raf/MEK/ERK1/2 경로(pathway), JAK(Janus kinase)/STAT(signal transducers and activators of transcription) 경로, Pl3K(Phosphatidylinositol 3-kinase)/Akt 경로를 통해 세포의 증식, 생장 및 생존에 중요한 역할을 한다. 그러나 ALK의 과다 발현은 암세포의 비정상적인 증식과 생장을 초래한다.
한편, 비소세포폐암(Non-small cell lung cancer)에서 ALK의 EML4(echinoderm microtubule-associated protein-like 4)-ALK 돌연변이(mutation)는 암세포의 비정상적인 증식에 중요한 역할을 한다고 알려져 있어 ALK를 표적으로 하는 항암 치료에 대한 연구와 관심이 커지고 있다.
이러한 ALK의 표적 치료제로는 크리조티닙(crizotinib)과 세리티닙(ceritinib) 등의 ALK 저해제(inhibitor)가 사용되어 왔으나, 계속 사용시 치료효과들에 대하여 내성을 나타내거나, 측정가능한 정도의 반응을 보이지 않는 문제가 있다. 실제, 비소세포폐암 환자들의 약 10% 정도만이 이들 약물에 반응성을 보이고 있다(Transl Cancer Res 2017;6(Suppl 2):S239-S245).
따라서, EML4-ALK 양성 비소세포폐암의 환자군에서 ALK 저해제를 사용할 것인지를 정확하게 판단하기 위한 효율적인 방법과 함께, ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암을 치료하기 위한 새로운 치료제 개발이 필요한 실정이다.
이에, 본 발명자는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암을 치료하기 위한 새로운 치료제를 개발하기 위해 예의 연구를 거듭한 결과, CDA의 발현 또는 활성을 저해하는 물질이 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암의 증식, 이주 및 침습을 억제하는 활성이 매우 뛰어나다는 것을 발견하고 본 발명을 완성하였다.
따라서, 본 발명의 목적은 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다.
또한, 본 발명의 목적은 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제로 이루어지는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다.
또한, 본 발명의 목적은 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제로 필수적으로 이루어지는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 (a) CDA 단백질 또는 mRNA를 발현하는 세포에 시험물질을 처리하는 단계; (b) 상기 세포와 시험물질을 처리하지 않은 대조군 세포에서 CDA 단백질 또는 mRNA의 발현 수준을 측정하는 단계; 및 (c) 대조군 세포와 비교하여 CDA 단백질 또는 mRNA의 발현 수준을 감소시키는 시험 물질을 ALK 저해제에 내성을 획득한 후보물질로 선별하는 단계를 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료제 스크리닝 방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 목적은 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료용 조성물을 제조하기 위한 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제의 용도를 제공하는 것이다.
본 발명의 목적은 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 조성물의 유효량을 이를 필요로 하는 개체에 투여하는 것을 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료 방법을 제공하는 것이다.
전술한 본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제로 이루어지는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제로 필수적으로 이루어지는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 (a) CDA 단백질 또는 mRNA를 발현하는 세포에 시험물질을 처리하는 단계; (b) 상기 세포와 시험물질을 처리하지 않은 대조군 세포에서 CDA 단백질 또는 mRNA의 발현 수준을 측정하는 단계; 및 (c) 대조군 세포와 비교하여 CDA 단백질 또는 mRNA의 발현 수준을 감소시키는 시험 물질을 ALK 저해제에 내성을 획득한 후보물질로 선별하는 단계를 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료제 스크리닝 방법을 제공한다.
본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료용 조성물을 제조하기 위한 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제의 용도를 제공한다.
본 발명의 다른 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 조성물의 유효량을 이를 필요로 하는 개체에 투여하는 것을 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료 방법을 제공한다.
이하, 본 발명에 대해 상세히 설명한다.
본 발명은 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명의 상기 약학적 조성물은 CDA의 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 조성물일 수도 있고, 유효성분으로서 CDA의 발현 또는 활성 억제제로 구성되는 조성물일 수도 있으며, 또는 유효성분으로서 CDA의 발현 또는 활성 억제제로 필수적으로 구성되는 조성물일 수도 있다.
본 명세서에서 용어 '~을 포함하는(comprising)'이란 '함유하는(including)'또는 '특징으로 하는(characterized by)'과 동일한 의미로 사용되며, 본 발명에 따른 조성물 또는 방법에 있어서, 구체적으로 언급되지 않은 추가적인 구성 성분 또는 방법의 단계 등을 배제하지 않는다. 또한 용어 '로 이루어지는(consisting of)'이란 별도로 기재되지 않은 추가적인 요소, 단계 또는 성분 등을 제외하는 것을 의미한다. 용어 '필수적으로 이루어지는(essentially consisting of)'이란, 조성물 또는 방법의 범위에 있어서, 기재된 물질 또는 단계와 더불어 이의 기본적인 특성에 실질적으로 영향을 미치지 않는 물질 또는 단계 등을 포함할 수 있는 것을 의미한다.
본 명세서에서 '치료'는 질환의 발생 또는 재발 억제, 증상의 완화, 질병의 직접 또는 간접적인 병리학적 결과의 감소, 질병 진행 속도의 감소, 질병 상태의 개선, 호전, 완화 또는 개선된 예후를 의미한다. 본 발명에서 사용되는 용어 '예방'은 질환의 발병을 억제시키거나 진행을 지연시키는 모든 행위를 의미한다.
‘단백질’은 '폴리펩타이드(polypeptide)' 또는 '펩타이드(peptide)'와 호환성 있게 사용되며, 예컨대, 자연 상태의 단백질에서 일반적으로 발견되는 바와 같이 아미노산 잔기의 중합체를 말한다. CDA 단백질의 '단편(fragment)'은 CDA 단백질의 일부분의 펩타이드를 말한다.
한편, 'mRNA(messenger RNA 또는 전령 RNA)'는 단백질 합성 과정에서 특정 유전자의 염기서열의 유전 정보를 리보솜(ribosome)으로 전달하여 폴리펩티드 합성(단백질 번역, translation)의 청사진 역할을 하는 RNA이다. 유전자를 주형(template)으로 하여 단일 가닥의 mRNA가 전사(transcription) 과정을 통하여 합성된다.
본 발명에서, 상기 "ALK 저해제"는 EML4-ALK 양성 비소세포폐암 환자에 치료 효과를 나타내는 약물로, EML4-ALK의 카이네이즈 활성을 억제시키는 약물을 의미한다. 본 발명에 있어서, ALK 저해제에 대한 내성 획득 여부는 비소세포폐암 환자에게 비소세포폐암의 치료를 위해 ALK 저해제를 일정 기간 투여하였을 때, 약물이 투여된 초기의 약물 반응과 비교하여 일정 기간 약물을 투여한 후에 ALK 저해제에 대해 극히 낮은 감수성을 나타내어 암의 증세가 호전, 완화, 경감 또는 치료 증상을 나타내지 않거나, 2차적 ALK 돌연변이가 없고, 다른 ALK 저해제를 투여한 후에도 암이 진행성을 나타내었을 때 ALK 저해제에 대해 비의존적 내성을 획득했다고 말할 수 있다. 특히 상기와 같이 ALK 저해제에 내성을 획득한 경우, CDA 유전자 또는 단백질의 발현 수준 증가, 또는 CDA 유전자 메틸화의 감소는 내성 유발에 중요한 인자라 말할 수 있다. 상기 비소세포폐암의 진행은 암의 발생을 이미징하여 확인할 수 있는 모든 수단, 예를 들어 컴퓨터 단층촬영(CT), 자기공명영상(MRI), 초음파, X-선 영상, 유방조영술, PET 스캔, 방사성 핵종 스캔, 뼈 스캔 등의 영상화 기법을 통해 확인할 수 있는 것이라면 그 수단이 특별히 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 ALK 저해제는 크리조티닙(crizotinib), 세리티닙(ceritinib), 알렉티닙(alectinib), 브리가티닙(brigatinib) 및 엔트렉티닙(entrectinib)으로 이루어진 군에서 선택될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 용어 '발현(expression)'은 세포에서 단백질 또는 핵산이 생성되는 것을 의미한다.
상기 CDA는 cytidine(혹은 deoxycytidine)을 uridine (혹은 deoxyuridine)으로 변환시키는 활성을 갖는 효소를 의미하는 것으로, CDA (cytidine deaminase; EC number 3.5.4.5; 예컨대, CDD): GenBank Accession Nos. NP_001776.1 (유전자: NM_001785.2), CAA06460.1 (유전자: AJ005261.1), NP_416648.1 (유전자: NC_000913.3) 등의 서열을 참고할 수 있다.
바람직하게는, 본 발명에서 상기 CDA 단백질은 아래 아미노산 서열 및 상기 CDA 유전자는 아래의 염기서열로 이루어진 것일 수 있다.
[CDA 단백질 아미노산 서열] (서열번호 4)
maqkrpactl kpecvqqllv csqeakksay cpyshfpvga alltqegrif kgcnienacy
plgicaerta iqkavsegyk dfraiaiasd mqddfispcg acrqvmrefg tnwpvymtkp
dgtyivmtvq ellpssfgpe dlqktq
[CDA 유전자 염기 서열] (서열번호 5)
a tggcccagaa gcgtcctgcc tgcaccctga agcctgagtg tgtccagcag ctgctggttt
gctcccagga ggccaagaag tcagcctact gcccctacag tcactttcct gtgggggctg
ccctgctcac ccaggagggg agaatcttca aagggtgcaa catagaaaat gcctgctacc
cgctgggcat ctgtgctgaa cggaccgcta tccagaaggc cgtctcagaa gggtacaagg
atttcagggc aattgctatc gccagtgaca tgcaagatga ttttatctct ccatgtgggg
cctgcaggca agtcatgaga gagtttggca ccaactggcc cgtgtacatg accaagccgg
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본 발명에서 상기 ALK 저해제 내성 비소세포폐암 환자는 바람직하게는 "EML4-ALK 양성 비소세포폐암 환자"로서 ALK 저해제에 내성을 나타내는 환자를 의미하는 것일 수 있다. 상기 EML4-ALK 양성 비소세포폐암 환자는 비소세포폐암 환자 중 ALK 유전자의 변이가 발생한 환자를 말한다. 상기 ALK 유전자의 변이는 EML4와 ALK 유전자가 융합되는 것으로부터 형성될 수 있다. 융합이 일어난 유전자는 EML4-ALK을 발현함으로써 암을 유발시킨다.
상기 CDA의 발현을 억제하는 물질은 상기 CDA mRNA의 번역을 억제하는 물질로서 저분자 화합물, 안티센스 핵산 서열의 제조나 RNAi 테크닉을 이용한 RNA, siRNA 또는 shRNA 등을 이용하는 것일 수 있다. 예를 들어, 상기 CDA의 발현을 억제하는 물질은 CDA mRNA에 상보적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드(antisense oligonucleotide), siRNA, shRNA, miRNA, ribozyme, DNAzyme 및 PNA(protein nucleic acid)일 수 있다. 또한, 상기 CDA 유전자의 발현을 억제시키는 물질은 상기 CDA 유전자의 전사를 조절한다고 알려져 있는 프로모터, 인핸서(enhancer), 또는 전사조절인자에 결합하는 단백질 또는 화합물을 이용하는 것일 수 있다.
구체적으로, CDA의 발현을 억제하는 물질은 CDA 유전자 또는 그의 mRNA에 상보적으로 결합하는 안티센스 뉴클레오티드, 작은 간섭 RNA(short interfering RNA), 짧은 헤어핀 RNA(short hairpin RNA), 두 가닥 RNA (double strand RNA) 및 마이크로 RNA(miRNA)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상일 수 있다. 또한, 구체적으로 CDA 단백질을 코딩하는 핵산에 대해 안티센스인 뉴클레오티드 분자를 저해제로 사용할 수 있다. '안티센스' 핵산은 CDA를 코딩하는 '센스' 핵산에 상보적인, 예를 들면 두 가닥 사슬 cDNA 분자의 코딩 가닥에 상보적이거나 mRNA 서열에 상보적인 핵산 서열을 포함할 수 있다. 상기 안티센스 핵산은 전체 CDA 코딩 가닥 또는 단지 그들의 일부(예: 코딩영역)에 상보적일 수 있다. 또한 상기 물질은 구체적으로 CDA 유전자의 mRNA를 타겟으로 하는 shRNA, miRNA 또는 siRNA일 수 있다.
본 발명에서 상기 CDA 활성 억제제는 CDA 단백질에 특이적으로 결합하거나 이의 활성을 경쟁적으로 억제하는 화합물, 펩티드, 펩티드 유사체(mimetics), 앱타머, 항체 및 천연추출물로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
본 발명의 바람직한 일 양태에서, 상기 CDA 활성 억제제는 테트라하이드로유리딘(tetrahydrouridine), 세다쥬리딘(Cedazuridine) 및 이의 약학적으로 허용가능한 염으로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
본 발명에서 사용되는 용어, "약학적으로 허용가능한" 이란, 화합물의 생물학적 활성 또는 특성을 저해하지 않고, 상대적으로 무독성인, 즉, 물질이 원하지 않는 생물학적 효과 또는 그것이 함유하고 있는 조성물의 임의의 구성성분과 해로운 방법으로 상호작용 없이 개체에게 투여될 수 있는 담체 또는 희석액과 같은 물질을 나타낸다.
본 발명에서 사용되는 용어, "약학적으로 허용가능한 염"이란, 약학적으로 허용가능한 무기산, 유기산, 용매 화합물, 수화물 또는 그것의 포접 화합물을 포함하는 무독성의 산으로부터 제조된 투여되는 화합물의 염을 나타낸다. 상기 아피제닌의 약학적으로 허용 가능한 염으로는, 약학적으로 허용 가능한 유리산(free acid)에 의해 형성된 산 부가염이 유용할 수 있다. 산 부가염은 염산, 질산, 인산, 황산, 브롬화수소산, 요오드화수소산, 아질산 또는 아인산과 같은 무기산류와 지방족 모노 및 디카르복실레이트, 페닐-치환된 알카노에이트, 하이드록시 알카노에이트 및 알칸디오에이트, 방향족 산류, 지방족 및 방향족 설폰산류와 같은 무독성 유기산으로부터 얻는다. 이러한 약학적으로 무독한 염류로는 설페이트, 피로설페이트, 바이설페이트, 설파이트, 바이설파이트, 니트레이트, 포스페이트, 모노하이드로겐 포스페이트, 디하이드로겐 포스페이트, 메타포스페이트, 피로포스페이트 클로라이드, 브로마이드, 아이오다이드, 플루오라이드, 아세테이트, 프로피오네이트, 데카노에이트, 카프릴레이트, 아크릴레이트, 포메이트, 이소부티레이트, 카프레이트, 헵타노에이트, 프로피올레이트, 옥살레이트, 말로네이트, 석시네이트, 수베레이트, 세바케이트, 푸마레이트, 말리에이트, 부틴-1,4-디오에이트, 헥산-1,6-디오에이트, 벤조에이트, 클로로벤조에이트, 메틸벤조에이트, 디니트로 벤조에이트, 하이드록시벤조에이트, 메톡시벤조에이트, 프탈레이트, 테레프탈레이트, 벤젠설포네이트, 톨루엔설포네이트, 클로로벤젠설포네이트, 크실렌설포네이트, 페닐아세테이트, 페닐프로피오네이트, 페닐부티레이트, 시트레이트, 락테이트, β-하이드록시부티레이트, 글리콜레이트, 말레이트, 타트레이트, 메탄설포네이트, 프로판설포네이트, 나프탈렌-1-설포네이트, 나프탈렌-2-설포네이트 또는 만델레이트를 사용할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 약학적 조성물은 약학적으로 허용 가능한 담체를 더 포함할 수 있다.
약학적으로 허용되는 담체로는 예컨대, 경구 투여용 담체 또는 비경구 투여용 담체를 추가로 포함할 수 있다. 경구 투여용 담체는 락토스, 전분, 셀룰로스 유도체, 마그네슘 스테아레이트, 스테아르산 등을 포함할 수 있다. 또한 비경구 투여용 담체는 물, 적합한 오일, 식염수, 수성 글루코스 및 글리콜 등을 포함할 수 있다. 또한, 안정화제 및 보존제를 추가로 포함할 수 있다. 적합한 안정화제로는 아황산수소나트륨, 아황산나트륨 또는 아스코르브산과 같은 항산화제가 있다. 적합한 보존제로는 벤즈알코늄 클로라이드, 메틸- 또는 프로필-파라벤 및 클로로부탄올이 있다. 그 밖의 약학적으로 허용되는 담체로는 당업계에 공지되어 있는 것을 참고로 할 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 인간을 비롯한 포유동물에 어떠한 방법으로도 투여할 수 있다. 예를 들어, 경구 또는 비경구로 투여할 수 있으며, 비경구적인 투여방법으로는 이에 제한되는 것은 아니나, 정맥내, 근육내, 동맥내, 골수내, 경막내, 심장내, 경피, 피하, 복강내, 비강내, 장관, 국소, 설하 또는 직장내 투여일 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 상술한 바와 같은 투여 경로에 따라 경구 투여용 또는 비경구 투여용 제제로 제형화 할 수 있다. 제형화할 경우에는 하나 이상의 완충제(예를 들어, 식염수 또는 PBS), 항산화제, 정균제, 킬레이트화제(예를 들어, EDTA 또는 글루타치온), 충진제, 증량제, 결합제, 아쥬반트(예를 들어, 알루미늄 하이드록사이드), 현탁제, 농후제 습윤제, 붕해제 또는 계면활성제, 희석제 또는 부형제를 사용하여 조제될 수 있다.
경구투여를 위한 고형제제에는 정제, 환제, 산제, 과립제, 액제, 겔제, 시럽제, 슬러리제, 현탁액 또는 캡슐제 등이 포함되며, 이러한 고형제제는 본 발명의 약학적 조성물에 적어도 하나 이상의 부형제 예를 들면, 전분(옥수수 전분, 밀 전분, 쌀 전분, 감자 전분 등 포함), 칼슘카보네이트(calcium carbonate), 수크로스(sucrose), 락토오스(lactose), 덱스트로오스(dextrose), 솔비톨(sorbitol), 만니톨(mannitol), 자일리톨(xylitol), 에리스리톨 말티톨(Erythritol maltitol), 셀룰로즈(celulose), 메틸 셀룰로즈(methyl celulose), 나트륨 카르복시메틸셀룰로오스(sodium carboxymethyl cellulose) 및 하이드록시프로필메틸-셀룰로스(Hydroxypropyl methylCellulose) 또는 젤라틴 등을 섞어 조제될 수 있다. 예컨대, 활성성분을 고체 부형제와 배합한 다음 이를 분쇄하고 적합한 보조제를 첨가한 후 과립 혼합물로 가공함으로써 정제 또는 당의 정제를 수득할 수 있다.
단순한 부형제 이외에 마그네슘 스티레이트 탈크 같은 윤활제들도 사용된다. 경구를 위한 액상 제제로는 현탁제, 내용액제, 유제 또는 시럽제 등이 해당되는데 흔히 사용되는 단순 희석제인 물 또는 리퀴드 파라핀 이외에 여러 가지 부형제, 예를 들면 습윤제, 감미제, 방향제 또는 보존제 등이 포함될 수 있다.
또한, 경우에 따라 가교결합 폴리비닐피롤리돈, 한천, 알긴산 또는 나트륨 알기네이트 등을 붕해제로 첨가할 수 있으며, 항응집제, 윤활제, 습윤제, 향료, 유화제 및 방부제 등을 추가로 포함할 수 있다.
비경구적으로 투여하는 경우 본 발명의 약학적 조성물은 적합한 비경구용 담체와 함께 주사제, 경피 투여제 및 비강 흡입제의 형태로 당업계에 공지된 방법에 따라 제형화될 수 있다. 상기 주사제의 경우에는 반드시 멸균되어야 하며 박테리아 및 진균과 같은 미생물의 오염으로부터 보호되어야 한다. 주사제의 경우 적합한 담체의 예로는 이에 한정되지는 않으나, 물, 에탄올, 폴리올(예를 들어, 글리세롤, 프로필렌 글리콜 및 액체 폴리에틸렌 글리콜 등), 이들의 혼합물 및/또는 식물유를 포함하는 용매 또는 분산매질일 수 있다. 보다 바람직하게는, 적합한 담체로는 행크스 용액, 링거 용액, 트리에탄올 아민이 함유된 PBS(phosphate buffered saline) 또는 주사용 멸균수, 10% 에탄올, 40% 프로필렌 글리콜(propylene glycol) 및 5% 덱스트로오스와 같은 등장 용액 등을 사용할 수 있다. 상기 주사제를 미생물 오염으로부터 보호하기 위해서는 파라벤(paraben), 클로로부탄올(Chlorobutanol), 페놀(phenol), 소르빈산(Sorbic acid), 티메로살(thimerosal) 등과 같은 다양한 항균제 및 항진균제를 추가로 포함할 수 있다. 또한, 상기 주사제는 대부분의 경우 당 또는 나트륨 클로라이드와 같은 등장화제를 추가로 포함할 수 있다.
경피 투여제의 경우 연고제, 크림제, 로션제, 겔제, 외용액제, 파스타제, 리니멘트제, 에어롤제 등의 형태가 포함된다. 상기에서 '경피 투여'는 약학적 조성물을 국소적으로 피부에 도포하여 약학적 조성물에 함유된 유효한 양의 활성성분이 피부 내로 전달되는 것을 의미한다.
흡입 투여제의 경우, 본 발명의 CDA의 발현 또는 활성 억제제를 적합한 추진제, 예를 들면, 디클로로플루오로메탄, 트리클로로플루오로메탄, 디클로로테트라플루오로에탄, 이산화탄소 또는 다른 적합한 기체를 사용하여, 가압 팩 또는 연무기로부터 에어로졸 스프레이 형태로 편리하게 전달할 수 있다. 가압 에어로졸의 경우, 투약 단위는 계량된 양을 전달하는 밸브를 제공하여 결정할 수 있다. 예를 들면, 흡입기 또는 취입기에 사용되는 젤라틴 캡슐 및 카트리지는 화합물, 및 락토오스(lactose) 또는 전분과 같은 적합한 분말 기제의 분말 혼합물을 함유하도록 제형화할 수 있다. 비경구 투여용 제형은 모든 제약 화학에 일반적으로 공지된 처방서에 기재되어 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 CDA의 발현 또는 활성 억제제를 유효량으로 포함할 때 바람직한 질환 예방 및 치료 효과를 제공할 수 있다. 본 명세서에서, '유효량'이라 함은 음성 대조군에 비해 그 이상의 반응을 나타내는 양을 말하며 바람직하게는 비소세포폐암의 증상 완화에 충분한 양을 말한다. 본 발명의 약학적 조성물에 CDA의 발현 또는 활성 억제제가 0.01 내지 99.99% 포함될 수 있으며, 잔량은 약학적으로 허용 가능한 담체가 차지할 수 있다. 본 발명의 약학적 조성물에 포함되는 CDA의 발현 또는 활성 억제제의 유효량은 조성물이 제품화되는 형태 등에 따라 달라질 것이다.
본 발명의 약학적 조성물의 총 유효량은 단일 투여량(single dose)으로 환자에게 투여될 수 있으며, 다중 투여량(multiple dose)으로 장기간 투여되는 분할 치료 방법(fractionated treatment protocol)에 의해 투여될 수 있다. 본 발명의 약학적 조성물은 질환의 정도에 따라 유효성분의 함량을 달리할 수 있다. 비경구 투여시는 CDA의 발현 또는 활성 억제제를 기준으로 하루에 체중 1 kg당 바람직하게 0.01 내지 50 mg, 더 바람직하게는 0.1 내지 30 mg의 양으로 투여되도록, 그리고 경구 투여시는 CDA의 단백질의 발현 또는 활성 억제제를 기준으로 하루에 체중 1 kg당 바람직하게 0.01 내지 100 mg, 더 바람직하게는 0.01 내지 10 mg의 양으로 투여되도록 1 내지 수회에 나누어 투여할 수 있다. 그러나 상기 CDA의 단백질의 발현 또는 활성 억제제의 용량은 약학적 조성물의 투여 경로 및 치료 횟수뿐만 아니라 환자의 연령, 체중, 건강 상태, 성별, 질환의 중증도, 식이 및 배설율 등 다양한 요인들을 고려하여 환자에 대한 유효 투여량이 결정되는 것이므로, 이러한 점을 고려할 때 당 분야의 통상적인 지식을 가진 자라면 상기 CDA의 단백질의 발현 또는 활성 억제제를 비소세포폐암 예방 및 치료를 위한 특정한 용도에 따른 적절한 유효 투여량을 결정할 수 있을 것이다. 본 발명에 따른 약학적 조성물은 본 발명의 효과를 보이는 한 그 제형, 투여 경로 및 투여 방법에 특별히 제한되지 아니한다.
본 발명의 약학적 조성물은 단독으로 또는 수술, 방사선 치료, 호르몬 치료, 화학 치료 또는 생물학적 반응조절제를 사용하는 방법들과 병용하여 사용할 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 또한 CDA의 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 외용제의 제형으로 제공할 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물을 피부외용제로 사용하는 경우, 추가로 지방 물질, 유기 용매, 용해제, 농축제 및 겔화제, 연화제, 항산화제, 현탁화제, 안정화제, 발포제(foaming agent), 방향제, 계면활성제, 물, 이온형 유화제, 비이온형 유화제, 충전제, 금속이온봉쇄제, 킬레이트화제, 보존제, 비타민, 차단제, 습윤화제, 필수 오일, 염료, 안료, 친수성 활성제, 친유성 활성제 또는 지질 소낭 등 피부 외용제에 통상적으로 사용되는 임의의 다른 성분과 같은 피부 과학 분야에서 통상적으로 사용되는 보조제를 함유할 수 있다. 또한 상기 성분들은 피부 과학 분야에서 일반적으로 사용되는 양으로 도입될 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물이 피부 외용제로 제공될 경우, 이에 제한되는 것은 아니나, 연고, 패취, 겔, 크림 또는 분무제 등의 제형일 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 조성물은 ALK 저해제와 병용하여 투여되는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 상기 조성물이 ALK 저해제와 병용하여 투여될 때, 상기 조성물은 단일 조성물의 형태로 각각 투여되거나 또는 복합제의 형태로 동시에 투여될 수 있다. 즉, 상기 조성물은 ALK 저해제와 동시에(simultaneous), 별도로(separate) 또는 순차적(sequential)으로 투여될 수 있으며, 순차적으로 투여될 때 투여순서에 특별한 제한은 없다.
본 발명은 또한 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 개선용 식품 조성물을 제공한다.
본 발명에 따른 식품 조성물은 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암의 예방 또는 개선에 사용될 수 있다.
본 발명의 식품 조성물은 기능성 식품(functional food), 영양 보조제(nutritional supplement), 건강식품(health food), 식품 첨가제(food additives) 등의 모든 형태를 포함하며, 인간 또는 가축을 비롯한 동물을 취식대상으로 한다. 상기 유형의 식품 조성물은 당업계에 공지된 통상적인 방법에 따라 다양한 형태로 제조할 수 있다.
상기 유형의 식품 조성물은 당업계에 공지된 통상적인 방법에 따라 다양한 형태로 제조할 수 있다. 일반 식품으로는 이에 한정되지 않지만 음료(알콜성 음료 포함), 과실 및 그의 가공식품(예: 과일통조림, 병조림, 잼, 마아말레이드 등), 어류, 육류 및 그 가공식품(예: 햄, 소시지 콘비이프 등), 빵류 및 면류(예: 우동, 메밀국수, 라면, 스파게이트, 마카로니 등), 과즙, 각종 드링크, 쿠키, 엿, 유제품(예: 버터, 치이즈 등), 식용식물 유지, 마아가린, 식물성 단백질, 레토르트 식품, 냉동식품, 각종 조미료(예: 된장, 간장, 소스 등) 등에 상기 CDA의 발현 또는 활성 억제제를 첨가하여 제조할 수 있다. 또한, 영양보조제로는 이에 한정되지 않지만 캡슐, 타블렛, 환 등에 CDA의 발현 또는 활성 억제제를 첨가하여 제조할 수 있다. 또한, 건강기능식품으로는 이에 한정되지 않지만 예를 들면, 상기 CDA의 발현 또는 활성 억제제 자체를 차, 쥬스 및 드링크의 형태로 제조하여 음용(건강음료)할 수 있도록 액상화, 과립화, 캡슐화 및 분말화하여 섭취할 수 있다. 또한, 상기 CDA의 발현 또는 활성 억제제를 식품 첨가제의 형태로 사용하기 위해서는 분말 또는 농축액 형태로 제조하여 사용할 수 있다. 또한, CDA의 발현 또는 활성 억제제와 암 예방 또는 개선 효과가 있다고 알려진 공지의 활성 성분과 함께 혼합하여 조성물의 형태로 제조할 수 있다.
본 발명의 식품 조성물이 건강음료 조성물로 이용되는 경우, 상기 건강음료 조성물은 통상의 음료와 같이 여러 가지 향미제 또는 천연 탄수화물 등을 추가 성분으로 함유할 수 있다. 상술한 천연 탄수화물은 포도당, 과당과 같은 모노사카라이드(monosaccharide); 말토스, 수크로스와 같은 디사카라이드(disaccharide); 덱스트린(dextrin), 사이클로덱스트린(cyclodextrin)과 같은 폴리사카라이드(polysaccharide); 자일리톨, 소르비톨, 에리트리톨 등의 당알콜일 수 있다. 감미제는 타우마틴(thaumatin), 스테비아(stevia) 추출물과 같은 천연 감미제; 사카린, 아스파르탐(aspartame)과 같은 합성 감미제 등을 사용할 수 있다. 상기 천연 탄수화물의 비율은 본 발명의 조성물 100 mL 당 일반적으로 약 0.01~0.04g, 바람직하게는 약 0.02~0.03g이다.
본 발명에 따른 CDA의 발현 또는 활성 억제제가 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 개선용 식품 조성물의 유효성분으로 함유될 때, 그 양은 증상 개선 작용을 달성하기에 유효한 양으로 특별히 한정되는 것은 아니나, 전체 조성물 총 중량에 대하여 0.01 내지 100 중량%인 것이 바람직하다. 본 발명의 식품 조성물은 CDA의 발현 또는 활성 억제제와 함께 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암의 개선 효과가 있는 것으로 알려진 다른 활성 성분과 함께 혼합하여 제조될 수 있다.
상기 외에 본 발명의 식품 조성물이 건강식품으로 이용되는 경우, 여러 가지 영양제, 비타민, 전해질, 풍미제, 착색제, 펙트산, 펙트산의 염, 알긴산, 알긴산의 염, 유기산, 보호성 콜로이드 증점제, pH 조절제, 안정화제, 방부제, 글리세린, 알코올 또는 탄산화제 등을 함유할 수 있다. 그 밖에 본 발명의 건강식품은 천연 과일주스, 과일주스 음료 또는 야채 음료의 제조를 위한 과육을 함유할 수 있다. 이러한 성분은 독립적으로 또는 혼합하여 사용할 수 있다. 이러한 첨가제의 비율은 크게 중요하진 않지만 본 발명의 조성물 100 중량부당 0.01 ~ 0.1 중량부의 범위에서 선택되는 것이 일반적이다.
본 발명은 또한 (a) CDA 단백질 또는 mRNA를 발현하는 세포에 시험물질을 처리하는 단계; (b) 상기 세포와 시험물질을 처리하지 않은 대조군 세포에서 CDA 단백질 또는 mRNA의 발현 수준을 측정하는 단계; 및 (c) 대조군 세포와 비교하여 CDA 단백질 또는 mRNA의 발현 수준을 감소시키는 시험 물질을 ALK 저해제에 내성을 획득한 후보물질로 선별하는 단계를 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료제 스크리닝 방법을 제공한다.
상기 (a) 단계는 분석의 대상인 시험 물질이 CDA 단백질 또는 mRNA의 발현을 억제하는 활성이 있는지 확인하기 위하여 CDA 단백질 또는 mRNA를 발현하는 세포에 접촉시키는 단계이다.
본 발명의 방법에서 '접촉(contacting)' 또는 '처리(treatment)'는 일반적인 의미이며, 2개 이상의 제제(예를 들어, 2개의 리펩티드)를 결합시키거나, 제제와 세포(예를 들어, 단백질과 세포)를 결합시키는 것을 말한다. 접촉은 시험 관 내(in vitro)에서 일어날 수 있다. 예컨대, 시험관(test tube) 또는 다른 컨테이너(container)에서 2개 이상의 제제를 결합시키거나 시험 제제와 세포 또는 세포 용해물과 시험 제제를 결합시키는 것이다. 또한 접촉은세포 또는 인 시투(in situ)에서 일어날 수도 있다. 예컨대, 2개의 폴리펩티드를 암호화하는 재조합 폴리뉴클레오티드를 세포 내에서 공동발현(coexpression)시킴으로써 세포 또는 세포 용해물에서 2개의 폴리펩티드를 접촉시키는 것이다. 또한 테스트하고자 하는 단백질이 고정상의 표면에 배열된 단백질 칩(protein chip)이나 단백질 어레이(protein array)를 이용할 수도 있다.
또한 본 발명의 방법에서 '시험 물질'은 시험 제제(test agent) 또는 제제(agent)와 호환가능하게 사용할 수 있는 것으로, 임의의 물질(substance), 분자(molecule), 원소(element), 화합물(compound), 실재물(entity) 또는 이들의 조합을 포함한다. 예를 들어 단백질, 폴리펩티드, 저분자 유기화합물(small organic molecule), 다당류(polysaccharide), 폴리뉴클레오티드 등을 포함한다. 또한 자연 산물(natural product), 합성 화합물 또는 화학 화합물 또는 2개 이상의 물질의 조합일 수도 있다.
보다 구체적으로 본 발명의 방법으로 스크리닝할 수 있는 시험 제제는, 폴리펩티드, 베타-턴 유도체(beta-turn mimetics), 다당류, 인지질, 호르몬, 프로스타글란딘, 스테로이드, 방향족 화합물, 헤테로사이클릭 화합물, 벤조디아제핀(benzodiazepines), 올리고머릭 N-치환 글리신(oligomeric N-substituted glycines), 올리고카르바메이트(oligocarbamates), 당류(saccharides), 지방산, 퓨린, 피리미딘 또는 이들의 유도체, 구조적 아날로그 또는 이들의 조합을 포함한다. 시험 제제는 합성 물질 또는 천연물질일 수 있다. 상기 시험 제제는 합성 또는 자연 화합물의 라이브러리를 포함하는 광범위하고 다양한 출처로부터 얻어질 수 있다. 조합(combinatorial) 라이브러리는 스텝-바이-스텝 방식으로 합성될 수 있는 여러 종류의 화합물로 생산될 수 있다. 다수의 조합 라이브러리의 화합물들은 ESL(encoded synthetic libraries) 방법(WO 95/12608, WO93/06121, WO 94/08051, WO95/395503 및 WO 95/30642)에 의해 제조될 수 있다. 펩티드 라이브러리는 파지 디스플레이 방법(WO91/18980)에 의해 제조될 수 있다. 박테리아, 곰팡이, 식물 및 동물 추출물 형태의 자연 화합물의 라이브러리는 상업적인 출처로부터 얻거나 또는 필드(field)에서 수집될 수 있다. 공지된 약리학적(pharmacological) 제제가 구조적 아날로그를 제조하기 위하여 아실화, 알킬화, 에스테르화 반응(esterification), 아미드화 반응(amidification)과 같이 지시되거나(direct) 무작위한 화학적 수식에 적용될 수 있다.
본 명세서에서 '발현(expression)'이라 함은 세포에서 단백질 또는 핵산이 생성되는 것을 의미한다. 상기 CDA를 발현하는 세포는 CDA를 내재적으로 발현하는 세포일 수도 있고, CDA를 암호화하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 재조합 발현 벡터로 형질전환되어 CDA를 과발현하는 세포일 수도 있다. 바람직하게는 상기 CDA 유전자를 발현하는 세포는 ALK 저해제 내성 비소세포폐암 세포주일 수 있다.
상기 (b) 단계는 시험 물질을 접촉시킨 CDA를 발현하는 세포와 시험 물질을 접촉시키지 않은 CDA를 발현하는 세포에서 CDA의 유전자 발현 수준을 측정하는 단계이다.
CDA mRNA 발현의 측정은 당업계에서 통상적인 발현 수준 확인 방법을 제한 없이 사용할 수 있으며, 분석 방법의 예로 역전사중합체연쇄반응(reverse transcription polymerase chain reaction, RT-PCR), 경쟁적 RT-PCR(competitive RT-PCR), 실시간 RT-PCR(real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection assay, RPA), 노던 블랏팅(northern blotting), DNA 마이크로어레이 칩(microarray chip), RNA 염기서열분석(RNA sequencing) 등이 있으나, 이들에 한정되는 것은 아니다.
또한 CDA 단백질의 발현 수준 측정 방법은 당업계에서 공지되어 있는 방법은 제한 없이 사용할 수 있으며, 그 예로 웨스턴 블랏팅(western blotting), 닷 블랏팅(dot blotting), 효소면역분석법(enzyme-linked immunosorbent assay), 방사능 면역분석법(RIA), 방사면역확산법, 오우크테로니 면역 확산법, 로케트 면역 전기영동, 면역조직화학염색, 면역침전법(immunoprecipitation), 보체 고정 분석법, 유세포 분석법(FACS) 또는 단백질 칩 방법 등이 있으나, 이들에 한정되는 것은 아니다.
상기 (c) 단계는 대조군 세포와 비교하여 CDA 단백질 또는 mRNA의 발현 수준을 감소시키는 시험 물질을 ALK 저해제 내성 비소세포폐암 치료제 후보물질로 선별하는 단계이다.
본 발명자가 규명한 바와 같이, CDA의 활성을 저해하면 ALK 저해제 내성 비소세포폐암 세포의 성장 및 전이가 억제되고, 생존율이 향상되는 바와 같이, CDA의 단백질 또는 mRNA의 발현을 저해하는 물질 또한 CDA의 활성을 저해시키는 효과를 발휘하는 바 ALK 저해제 내성 비소세포폐암의 치료제로서 활용될 가능성이 있다는 것이 자명하게 이해될 수 있다.
따라서, 본원발명의 상기 스크리닝 방법에서 ALK 저해제 내성 비소세포폐암 치료제란 바람직하게는 CDA의 단백질 또는 mRNA의 발현을 저하시킴으로써 결과적으로 CDA의 활성을 저해하는 효과를 나타내는 물질일 수 있다.
본 발명은 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료용 조성물을 제조하기 위한 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제의 용도를 제공한다.
본 발명은 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 조성물의 유효량을 이를 필요로 하는 개체에 투여하는 것을 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료 방법을 제공한다.
본 발명의 상기 '유효량'이란 개체에게 투여하였을 때, ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암의 개선, 치료, 검출, 진단 또는 비소세포폐암의 억제 또는 감소 효과를 나타내는 양을 말하며, 상기 '개체'란 동물, 바람직하게는 포유동물, 특히 인간을 포함하는 동물일 수 있으며, 동물에서 유래한 세포, 조직, 기관 등일 수도 있다. 상기 개체는 상기 효과가 필요한 환자(patient) 일 수 있다.
본 발명의 상기 '치료'는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 또는 비소세포폐암으로 인한 증상을 개선시키는 것을 포괄적으로 지칭하고, 이는 상기 질환을 치유하거나, 실질적으로 예방하거나, 또는 상태를 개선시키는 것을 포함할 수 있으며, 상기 질환으로부터 비롯된 한 가지 증상 또는 대부분의 증상을 완화시키거나, 치유하거나 예방하는 것을 포함하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
CDA의 발현 또는 활성을 저해할 수 있는 물질은 ALK 저해제에 내성을 나타내는 비소세포폐암의 증식, 이주 및 침습을 억제하여, ALK 저해제에 내성을 나타내는 비소세포폐암의 예방 또는 치료제 개발에 매우 유용하게 활용될 수 있다.
도 1a 내지 1g는 ALK 저해제 내성 세포(LR)에 대한 CDA 발현 또는 활성 억제의 항암활성을 평가한 결과이다.
1a: H3122 및 LR 세포 용해물에서 CDA의 웨스턴 블롯 분석.
1b, 1c: qRT-PCR(B) 및 웨스턴 블로팅(C)에 의해 평가된 siRNA의 녹다운(knock-down) 효율.
1d: 표시된 시간 동안 siRNA로 형질감염된 LR 세포의 증식.
1e: CDA 녹다운 후 EMT 관련 단백질의 발현.
1f: 세포 표면이 긁힌 후 0시간과 15시간 후 CDA가 고갈된 LR 세포의 상처 치유 분석.
1g: 세포 시딩 후 48시간 후에 CDA가 고갈된 LR 세포가 이주하고 침습하는 정도를 관찰한 현미경 이미지.
도 2a 내지 2e는 폐암 세포주 H3122, ALK 저해제 내성 세포(LR) 와 내성세포에서 CDA의 발현을 고갈시킨 세포의 유전자 발현량 프로파일과 CDA 발현 또는 활성 억제의 항암활성을 평가한 결과이다.
2a: RNA-seq에 의한 폐암 세포주 H3122와 ALK 저해제 내성 LR 세포주의 유전자 발현량과 RNA-seq에 의한 CDA의 발현이 고갈된 LR 세포의 유전자 발현 분석.
2b: CDA가 고갈된 LR 세포에서 상향 또는 하향 조절된 유전자의 기능
2c: 표시된 시간 동안 테트라히드로우리딘(0-20 μM)으로 처리된 H3122 및 LR 세포의 증식.
2d: 표시된 시간 동안 세다쥬리딘(0-30 μM)으로 처리된 H3122 및 LR 세포의 증식.
2e: 세리티닙(Ceritinib) 민감도 증가에 따른 LR 세포증식 억제 효과
이하, 본 발명을 하기 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐, 본 발명이 이들에 의해 제한되는 것은 아니다.
실시예 1: ALK 저해제 내성 폐암 세포주의 형성
폐암 세포주, H3122를 1% 항생제 (Gibco, Cat 번호 15240062 Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA) 및 10% 태아 소 혈청 (HyClone, UT, USA). Ceritinib (LDK378)이 보충된 RPMI-1640 배지 (WELGENE, Cat 번호 LM 011-01, 한국)에서 배양했다. ALK 저해제 내성 폐암 세포주인 LR 세포는 이전 보고된 방법에 따라 형성하였다. 간략하게, H3122 세포에 세리티닙(ceritinib)을 IC30으로 시작하여 점차 농도를 증가시켜 배양하고, 연속적인 1μM 세리티닙 처리 조건에서 대략 6 개월의 배양 후 내성 세포를 유도하였다. 모든 세포를 5% CO2를 함유한 가습 대기에서 37℃로 유지시켰다.
실시예 2: CDA(cytidine deaminase) 발현 또는 활성 억제를 통한 ALK 저해제 내성 폐암 세포주의 증식 및 이주 억제
폐암 세포주 H3122와 ALK 저해제 내성 LR 세포주의 단백질 발현을 Western blotting으로 분석해 본 결과, CDA 발현 수준이 내성 세포에서 증가했음이 확인되었다(도 1a).
본 발명자는 세 가지 다른 CDA siRNA를 사용하여 LR 세포에서 CDA의 발현을 고갈시켰다(표 1). 세 가지 siRNA 모두 CDA mRNA와 단백질의 수준을 감소시켰다(도 1b 및 2c). 그 결과, siRNA에 의한 CDA 고갈은 LR 세포 증식을 감소시켰다(도 1d).
Figure PCTKR2023000031-appb-img-000001
그 다음으로, siRNA에 의한 LR 세포주에서의 CDA 고갈은 상피 마커 E-Cadherin의 발현을 증가시키고 중간엽 마커 N-Cadherin 및 Vimentin의 발현을 감소시켰다(도 1e). 또한, CDA 고갈은 상처 치유(도 1f)와 세포 이동 및 침습(도 1g)을 감소시켜 암 세포의 이주 및 전이를 억제할 수 있음이 확인되었다.
실시예 3: LR 세포주와 CDA(cytidine deaminase) 발현억제 세포의 유전자 발현량 프로파일과 CDA 발현 또는 활성 억제를 통한 내성 폐암 세포주의 증식 억제
폐암 세포주 H3122와 ALK 저해제 내성 LR 세포주의 유전자 발현을 RNA-seq으로 분석해 본 결과, CDA 발현 수준이 내성 세포에서 증가했음이 확인되었다. 그리고 CDA siRNA를 사용하여 LR세포에서 CDA의 발현을 고갈시킨 세포의 유전자 발현을 RNA-seq으로 분석해 본 결과, LR세포에서 상향 조절된 유전자는 CDA 고갈 세포에서 하향 조절되었다(도 2a). CDA 고갈 세포에서 하향 조절된 CDA는 증식, 이주 및 침습과 관련되어 있음이 확인되었다 (도 2b).
CDA의 경쟁적 억제제인 테트라하이드로유리딘(tetrahydrouridine)과 세다쥬리딘(Cedazuridine)의 처리는 H3122의 증식에는 아무런 영향을 미치지 않았으나, LR 세포주의 증식에 대한 용량 의존적 억제 효과를 나타내었다(도 2c, 2d). 또한, LR 세포주의 CDA의 발현 억제는 세리티닙(Ceritinib)의 민감도를 증가시키는 효과를 나타내었고, 세리티닙(Ceritinib) 단독처리보다 테트라하이드로유리딘(tetrahydrouridine) 혹은 세다쥬리딘(Cedazuridine)과의 병용 처리시 더 효과적으로 LR 세포의 증식을 억제함을 확인하였다 (도 2e).
CDA의 발현 또는 활성을 저해할 수 있는 물질은 ALK 저해제에 내성을 나타내는 비소세포폐암의 증식, 이주 및 침습을 억제하여, ALK 저해제에 내성을 나타내는 비소세포폐암의 예방 또는 치료제 개발에 매우 유용하게 활용될 수 있어 산업상 이용가능성이 높다.

Claims (17)

  1. CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 치료용 약학적 조성물.
  2. 제1항에 있어서, 상기 CDA 발현 억제제는 CDA mRNA에 상보적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드(antisense oligonucleotide), siRNA, shRNA, miRNA, ribozyme, DNAzyme 및 PNA(protein nucleic acid)로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
  3. 제2항에 있어서, 상기 CDA 발현 억제제는 서열번호 1 내지 3으로 이루어진 군에서 선택된 siRNA인 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
  4. 제1항에 있어서, 상기 CDA 활성 억제제는 CDA 단백질에 특이적으로 결합하거나 이의 활성을 경쟁적으로 억제하는 화합물, 펩티드, 펩티드 유사체(mimetics), 앱타머, 항체 및 천연추출물로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
  5. 제4항에 있어서, 상기 CDA 활성 억제제는 테트라하이드로유리딘(tetrahydrouridine), 세다쥬리딘(Cedazuridine) 및 이들의 약학적으로 허용가능한 염으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
  6. 제1항에 있어서, 상기 조성물은 ALK 저해제와 병용 투여되는 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
  7. 제6항에 있어서, 상기 조성물과 ALK 저해제를 병용 투여 시 단일 약물로 순차적으로 또는 별도로 투여되거나, 또는 복합제의 형태로 동시에 투여되는 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
  8. CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 예방 또는 개선용 식품 조성물.
  9. (a) CDA 단백질 또는 mRNA를 발현하는 세포에 시험물질을 처리하는 단계;
    (b) 상기 세포와 시험물질을 처리하지 않은 대조군 세포에서 CDA 단백질 또는 mRNA의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
    (c) 대조군 세포와 비교하여 CDA 단백질 또는 mRNA의 발현 수준을 감소시키는 시험 물질을 ALK 저해제에 내성을 획득한 후보물질로 선별하는 단계를 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료제 스크리닝 방법.
  10. 제9항에 있어서, 상기 CDA의 mRNA 발현 수준은 RT-PCR, 정량적 또는 반정량적 RT-PCR(Quentitative or semi-Quentitative RT-PCR), 정량적 또는 반정량적 리얼 타임 RT-PCR(Quentitative or semi-Quentitative real-time RT-PCR), 노던 블롯(northern blot), DNA 칩(chip) 및 RNA 칩으로 이루어지는군에서 선택된 어느 하나의 방법을 이용하여 측정되는 것을 특징으로 하는 스크리닝 방법.
  11. 제9항에 있어서, CDA의 단백질 발현 수준은 웨스턴 블롯, ELISA, 방사선면역분석법, 방사면역확산법, 오우크레로니(Ouchterlony) 면역확산법, 로케트 면역전기영동, 면역조직화학염색, 면역침전분석, 보체고정분석, FACS 및 단백질 칩으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나의 방법을 이용하여 측정되는 것을 특징으로 하는 스크리닝 방법.
  12. ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료용 조성물을 제조하기 위한 CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제의 용도.
  13. 제12항에 있어서, 상기 CDA 발현 억제제는 CDA mRNA에 상보적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드(antisense oligonucleotide), siRNA, shRNA, miRNA, ribozyme, DNAzyme 및 PNA(protein nucleic acid)로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 용도.
  14. 제12항에 있어서, 상기 CDA 활성 억제제는 CDA 단백질에 특이적으로 결합하거나 이의 활성을 경쟁적으로 억제하는 화합물, 펩티드, 펩티드 유사체(mimetics), 앱타머, 항체 및 천연추출물로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 용도.
  15. CDA(cysteine deaminase) 발현 또는 활성 억제제를 유효성분으로 포함하는 조성물의 유효량을 이를 필요로 하는 개체에 투여하는 것을 포함하는 ALK 저해제에 내성을 획득한 비소세포폐암 치료 방법.
  16. 제15항에 있어서, 상기 CDA 발현 억제제는 CDA mRNA에 상보적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드(antisense oligonucleotide), siRNA, shRNA, miRNA, ribozyme, DNAzyme 및 PNA(protein nucleic acid)로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 방법.
  17. 제15항에 있어서, 상기 CDA 활성 억제제는 CDA 단백질에 특이적으로 결합하거나 이의 활성을 경쟁적으로 억제하는 화합물, 펩티드, 펩티드 유사체(mimetics), 앱타머, 항체 및 천연추출물로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 방법.
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