WO2022211129A1 - Atn1のアンチセンスオリゴヌクレオチド誘導体 - Google Patents

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信嗣 橋本
秋 内藤
智子 太田
光助 長島
貴宣 山田
友輔 入山
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株式会社三和化学研究所
日産化学株式会社
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Definitions

  • the present invention relates to antisense oligonucleotide derivatives of ATN1.
  • DRPLA Dentate red nucleus pallidus Louis body atrophy
  • Substances that inhibit the expression of the ATN1 gene include RNaseH-independent antisense oligonucleotides for CAG repeats (see, for example, Non-Patent Document 2) and ss-siRNA (see, for example, Patent Document 1 and Non-Patent Document 3), etc. have been reported, showing that the repeat selectively inhibits the aberrantly expanded allele. It has also been reported that morpholino nucleic acids or RNaseH-dependent LNA gapmers inhibit the expression of the ATN1 gene, but the sequence and degree of inhibition have not been described (see, for example, Non-Patent Document 4).
  • An object of the present invention is to provide novel antisense oligonucleotide derivatives that inhibit the expression of the ATN1 gene.
  • the present inventors have made extensive studies to discover compounds having an antisense effect on ATN1, and have found that the compounds of the present invention have an excellent ATN1 gene expression inhibitory effect, leading to the completion of the present invention. That is, the present invention is characterized by the following.
  • a single-stranded oligonucleotide in which the first oligonucleotide and the second oligonucleotide are linked by a third oligonucleotide the first oligonucleotide comprises a sequence that allows it to hybridize with Atrophin1 mRNA or pre-mRNA; consisting of 8 to 30 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides; comprising at least one sugar-modified nucleoside;
  • the second oligonucleotide comprises a sequence that allows it to hybridize with at least a portion of the first oligonucleotide; consisting of 8 to 30 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides;
  • the third oligonucleotide consists of 1-20 nucleosides independently selected from deoxyribon
  • the nucleosides contained in the third oligonucleotide are linked together by phosphodiester bonds,1. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the third oligonucleotide is DNA or RNA;1. or 2. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the 3' end of the third oligonucleotide is bound to the 5' end of the first oligonucleotide;
  • the 5' end of the third oligonucleotide is linked to the 3' end of the second oligonucleotide,1. to 3. or a pharmaceutically acceptable salt thereof. 5.
  • the first oligonucleotide has a nucleobase sequence comprising at least 8 contiguous nucleobases of the nucleobase sequence of any one of SEQ ID NOs: 3-716 and 718-770; to 4. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • 6. 1. the first oligonucleotide has a nucleobase sequence comprising the nucleobase sequence of any one of SEQ ID NOs: 3-716 and 718-770; to 5. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • 7. 1. the first oligonucleotide has the nucleobase sequence of any one of SEQ ID NOs: 3-716 and 718-770; to 6. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the first oligonucleotide comprises nucleobase positions 59 to 104, 109 to 133, 173 to 192, 207 to 272, 300 to 319, 353 to 372, 419 to 434, 458 to 509, 523-559, 561-618, 626-685, 766-785, 787-819, 838-855, 880-922, 924-943, 970-989, 994-1039, 1055-1074, 1079-1098, 1157-1176, 1196-1223, 1310-1329, 1339-1399, 1423-1442, 1614-1633, 1650-1670, 1806-1833, 1844-1865, 1896-1915, 1924-1992, 2023-2042, 2058- 2081, 2103-2124, 2398-2417, 2480-2520, 2526-2562, 2568-2587, 2853-2872, 2876-2923, 2931-2950, 2972-3016, 3072-3099, 3109-3128, 3192-3211, Nucleic acid base sequence
  • the first oligonucleotide is at least part of the nucleobase sequence selected from the group consisting of the nucleobase sequences represented by position numbers 3451 to 3475 and 3490 to 3505 of the Atrophin1 mRNA represented by SEQ ID NO: 1. 7. consists of 8-30 complementary nucleosides and is at least 80% complementary to a portion within said selected nucleobase sequence of SEQ ID NO:1; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the first oligonucleotide comprises nucleobase positions 383-398, 986-1001, 1004-1019, 1378-1393, 1398-1413, 1853-1868, 1971-1986 of the Atrophin1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO: 2, 2189-2204, 2522-2537, 2562-2577, 3662-3677, 3987-4002, 4217-4232, 4266-4281, 4335-4350, 4360-4375, 4477-4492, 4562-4577, 4636-4651, 4687- 4702,4734-4749,4840-4855,5536-5563,5568-5592,5632-5651,5666-5715,5906-5925,5959-5978,6176-6191,6215-6266,6963-6978,7248-7284, 7286-7343, 7351-7410, 7491-7510, 7512-7544, 7563-7580, 7605-7647, 7649-7668, 7695-
  • the first oligonucleotide has at least one nucleobase sequence selected from the group consisting of the nucleobase sequences represented by position numbers 12574 to 12598 and 12613 to 12628 of the Atrophin1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO: 2. 10. consists of 8-30 nucleosides complementary to a portion and is at least 80% complementary to a portion within said selected nucleobase sequence of SEQ ID NO:2; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the first oligonucleotide has SEQ ID NOs: 3, 4, 9, 10, 12, 13, 18, 19, 20, 21, 26, 29, 34, 37, 38, 39, 40, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 52, 55, 59, 60, 61, 62, 63, 66, 67, 68, 69, 70, 72, 74, 75, 78, 79, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 91, 92, 94, 95, 97, 99, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 126, 127, 128, 131, 132, 133, 137, 138, 139, 148, 151, 152, 153, 154, 156, 157, 158
  • the first oligonucleotide consists of 16 to 20 nucleosides having a nucleobase sequence comprising any one nucleobase sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 209, 215, 216, 221, and 715; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the first oligonucleotide consists of 16-20 nucleosides having a nucleobase sequence containing any one nucleobase sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 47, 105, 174, 214, 240, 585 and 586. , 12. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • 15. 1 The first oligonucleotide contains at least one phosphorothioate linkage; to 14.
  • the first oligonucleotide comprises at least one nucleoside selected from the group consisting of 2'-modified nucleosides and 2'-4'-bridged nucleosides; to 15. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the 2'-4'-bridged nucleoside is at least one selected from the group consisting of LNA, ENA, cEt, AmNA, scpBNA and GuNA;
  • the 2' modified nucleoside is at least one selected from the group consisting of 2'-O-MCE nucleoside, 2'-O-MOE nucleoside, 2'-O-NMA nucleoside, and 2'-O-Me nucleoside Yes, 16.
  • the 2'-4'-bridged nucleoside is LNA; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the 2'-modified nucleoside is at least one selected from the group consisting of 2'-O-MCE nucleoside and 2'-O-MOE nucleoside; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the first oligonucleotide comprises a gap segment, a 5' wing segment and a 3' wing segment;
  • the gap segment comprises at least two deoxyribonucleosides, the 5′ and 3′ ends of the gap segment being deoxyribonucleosides;
  • the nucleoside at the 3' end of the 5' wing segment is a sugar modified nucleoside and is linked to the 5' end of the gap segment; 1.
  • the nucleoside at the 5' end of the 3' wing segment is a sugar modified nucleoside and is linked to the 3' end of the gap segment; to 19. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • said gap segment consists of 5 to 16 deoxyribonucleosides
  • the 5′ wing segment and the 3′ wing segment are each independently selected from 1 to 7 independently selected from the group consisting of LNA, 2′-O-MCE nucleosides and 2′-O-MOE nucleosides. consisting of sugar-modified nucleosides, each wing segment comprises at least one phosphorothioate linkage; 20. each cytosine of the gap segment and each wing segment is replaced with a 5-methylcytosine; or a pharmaceutically acceptable salt thereof. 22.
  • said gap segment consists of 8-12 deoxyribonucleosides
  • the 5′ wing segment and the 3′ wing segment each independently consist of 2-5 sugar modified nucleosides independently selected from the group consisting of LNA and 2′-O-MCE nucleosides; containing two 2'-O-MCE nucleosides, 21.
  • the gap segment contains at least one phosphorothioate bond; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • said gap segment consists of 8-12 deoxyribonucleosides, said 5′ wing segment and said 3′ wing segment each independently have 3 to 6 sugar modifications independently selected from the group consisting of 2′-O-MOE nucleosides and 2′-O-MCE nucleosides; made up of nucleosides, 21.
  • the gap segment contains at least one phosphorothioate bond; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the 5' wing segment and the 3' wing segment each independently consist of five 2'-O-MOE nucleosides; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the 5' wing segment and the 3' wing segment each independently consist of five 2'-O-MCE nucleosides; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the arrangement of the sugar-modified nucleosides in the 5′ wing segment and the 3′ wing segment are each independently VLL, LVL, LLV, LVV, VLV, VVL, LLL, VVLL, VLVL, VLLV, LVLV, LLVV, LVVL, 21. selected from the group consisting of VLLL, LVLL, LLVL, LLLV, LVVV, VLVV, VVLV and VVVL, wherein L represents LNA and V represents a 2'-O-MCE nucleoside; or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the first oligonucleotide is an antisense oligonucleotide; to 26.
  • the second oligonucleotide comprises at least one ribonucleoside; to 27. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the second oligonucleotide comprises at least four consecutive ribonucleosides; to 28. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the second oligonucleotide is RNA;1. to 29. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the second oligonucleotide is DNA;1. to 27. or a pharmaceutically acceptable salt thereof. 32. 1.
  • the second oligonucleotide contains one or more sugar-modified nucleosides on at least one of the 5'-terminal side and the 3'-terminal side of the second oligonucleotide. to 29. or a pharmaceutically acceptable salt thereof. 33.
  • the nucleosides contained in the second oligonucleotide are linked together by phosphodiester bonds,1. to 32. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • 34. 1 contains one or more phosphorothioate linkages on at least one of the 5'-terminal side and the 3'-terminal side of the second oligonucleotide; to 32. or a pharmaceutically acceptable salt thereof. 35. 1.
  • the single-stranded oligonucleotide has a nucleobase sequence containing any one nucleobase sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs:772 to 776; to 34. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • the single-stranded oligonucleotide has a nucleobase sequence comprising any one nucleobase sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOS: 797-801, 803-808 and 810; to 34. or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • a double-stranded oligonucleotide complex comprising a first oligonucleotide and a second oligonucleotide
  • the first oligonucleotide comprises a sequence that allows it to hybridize with Atrophin1 mRNA or pre-mRNA; consisting of 8 to 30 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides; comprising at least one sugar-modified nucleoside
  • the second oligonucleotide comprises a sequence that allows it to hybridize with at least a portion of the first oligonucleotide; consisting of 8 to 30 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides
  • a medicament comprising the single-stranded oligonucleotide or double-stranded oligonucleotide complex according to any one of , or a medically acceptable salt thereof as an active ingredient.
  • a disease or condition in which the ATN1 gene expression inhibitory action is effective comprising the single-stranded oligonucleotide or double-stranded oligonucleotide complex according to any one of or a medically acceptable salt thereof as an active ingredient A therapeutic, preventive and/or ameliorative agent. 43. 1. to 40.
  • ATN1 gene expression inhibitor comprising the single-stranded oligonucleotide or double-stranded oligonucleotide complex according to any one of or a medically acceptable salt thereof as an active ingredient.
  • 44. 1. to 40. The single-stranded oligonucleotide or double-stranded oligonucleotide complex according to any one of, or a medically acceptable salt thereof, as an active ingredient, of dentate nucleus pallidus Louis body atrophy A therapeutic, prophylactic, and/or ameliorative agent.
  • a medicament comprising the oligonucleotide described in 1. or a pharmaceutically acceptable salt thereof as an active ingredient. 47. 45. 3. A therapeutic, preventive and/or ameliorating agent for diseases or conditions for which ATN1 gene expression inhibitory action is effective, comprising the oligonucleotide according to 1. or a medically acceptable salt thereof as an active ingredient. 48. 45. 3. An ATN1 gene expression inhibitor comprising the oligonucleotide according to 1. or a medically acceptable salt thereof as an active ingredient. 49. 45. 3. A therapeutic, preventive and/or ameliorating agent for dentate nucleus pallidus louis body atrophy comprising the oligonucleotide according to 1. or a medically acceptable salt thereof as an active ingredient.
  • the present invention provides a novel antisense oligonucleotide derivative that has an excellent ATN1 gene expression inhibitory activity and is particularly useful for the treatment, amelioration and/or prevention of dentate nucleus pallidus louis body atrophy. can do.
  • 1 is a graph showing the results of administering single-stranded oligonucleotides according to the present embodiment to DRPLA model mice and evaluating their effects on motor function improvement.
  • 1 is a graph showing the results of administering single-stranded oligonucleotides according to the present embodiment to DRPLA model mice and evaluating their effects on motor function improvement.
  • 1 is a graph showing the results of administering single-stranded oligonucleotides according to the present embodiment to DRPLA model mice and evaluating their effects on motor function improvement.
  • 1 is a graph showing the results of administering single-stranded oligonucleotides according to the present embodiment to DRPLA model mice and evaluating their effects on motor function improvement.
  • 1 is a graph showing the results of administering single-stranded oligonucleotides according to the present embodiment to DRPLA model mice and evaluating their effects on motor function improvement.
  • an antisense oligonucleotide derivative is an oligonucleotide in which a first oligonucleotide and a second oligonucleotide are linked by a third oligonucleotide (hereinafter referred to as a single-stranded oligonucleotide).
  • the first oligonucleotide comprises a sequence that allows it to hybridize with Atrophin1 mRNA or pre-mRNA, and consists of 8-30 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides, and at least comprising one sugar-modified nucleoside
  • the second oligonucleotide comprises a sequence capable of hybridizing with at least a portion of the first oligonucleotide and consists of 8-30 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleo
  • the third oligonucleotide consists of 1-20 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides; A first oligonucleotide and a second oligonucleotide hybridize.
  • the first oligonucleotide comprises a sequence that allows it to hybridize with Atrophin1 mRNA or pre-mRNA, and consists of 8-30 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides, and at least comprising one sugar-modified nucleoside
  • the second oligonucleotide comprises a sequence capable of hybridizing with at least a portion of the first oligonucleotide and consists of 8-30 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar modified nucleosides.
  • a first oligonucleotide and a second oligonucleotide are hybridized.
  • Nucleic acids in nature are most basically composed of adenosine (A), thymidine (T) (or uridine (U)), cytidine (C) and guanosine (G).
  • Their basic nucleic acids are often referred to as AT(U)GC and the like. Therefore, in this specification, when a sequence is indicated by "nucleobase sequence” or “sequence number" with respect to, for example, the ATN1 gene sequence, it is basically a sequence of A, T, G, C and U.
  • the nucleic acids constituting the ASO derivatives of the present invention include basic nucleic acids (AT(U)CG) as well as structurally modified versions thereof.
  • Modifications are detailed below and include modifications to sugar moieties, internucleoside linkages, and/or nucleobases. Therefore, herein, for example, in the description of "compounds” or “compounds given compound numbers (M-number and L-number)", or “nucleobase sequences indicated by SEQ No. ”, the ASO derivative of the present invention, and the first oligonucleotide, second oligonucleotide, third oligonucleotide, etc. constituting the derivative have a nucleic acid base sequence of A, T, G, C and U. When given, A, T, G, C and U also include those that have undergone structural modifications.
  • Optionally substituted means unsubstituted or substituted.
  • nucleoside is a term well known to those skilled in the art, and is generally understood to be a molecule in which a sugar and a nucleobase are bound, and which can be a unit constituting a nucleic acid. As used herein, nucleoside is a broader concept and includes deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides described below. The nucleobases may be modified.
  • Deoxyribonucleoside means a molecule having a nucleobase at the 1-position carbon atom of 2-deoxyribose.
  • Deoxyribonucleosides in the present invention may be naturally occurring deoxyribonucleosides or deoxyribonucleosides obtained by modifying the nucleobase portion of naturally occurring deoxyribonucleosides.
  • a naturally occurring deoxyribonucleoside is a deoxyribonucleoside having a naturally occurring nucleobase.
  • a single deoxyribonucleoside may be modified in combination of multiple types.
  • the modified deoxyribonucleosides are, for example, Journal of Medicinal Chemistry, 2016, 59, pp 9645-9667, Medicinal Chemistry Communication, 2014, 5, pp 1454-1471, Future Medicinal Chemistry, 2011, 3, pp 339-365, It is described in International Publication No. 2018/155450 and the like.
  • “Ribonucleoside” means a molecule having a nucleobase at the carbon atom at position 1 of ribose.
  • a ribonucleoside in the present invention may be a naturally occurring ribonucleoside or a ribonucleoside in which the nucleobase portion of a naturally occurring ribonucleoside is modified.
  • a naturally occurring ribonucleoside is a ribonucleoside having a naturally occurring nucleobase.
  • a single ribonucleoside may be modified in combination of multiple types.
  • modified ribonucleosides are, for example, Journal of Medicinal Chemistry, 2016, 59, pp 9645-9667, Medicinal Chemistry Communication, 2014, 5, pp 1454-1471, Future Medicinal Chemistry, 2011, 3, pp 339-365, It is described in International Publication No. 2018/155450 and the like.
  • a "modified sugar” is (Z1) molecules in which the ribose or 2-deoxyribose is partially substituted by one or more substituents, (Z2) a molecule in which ribose or 2-deoxyribose is replaced by a penta- or hexose (e.g., hexitol, threose, etc.) different from ribose and 2-deoxyribose; (Z3) the entirety of ribose or 2-deoxyribose, or the tetrahydrofuran ring thereof, binds to a 5- to 7-membered saturated or unsaturated ring (e.g., cyclohexane, cyclohexene, morpholine, etc.), or a 5- to 7-membered ring via hydrogen bonding; molecules that have been replaced by substructures that can form (e.g., peptide structures), or (Z4) refers to molecules in which ribos
  • Modified sugars include "2-modified sugars” and "2-4 bridged sugars” described below.
  • modified sugars and sugar-modified nucleosides described later include, for example, JP-A-10-304889, WO-2005/021570, JP-A-10-195098, JP-A-2002-521310, and WO-2007. / 143315, International Publication No. 2008/043753, International Publication No. 2008/029619, International Publication No. 2008/049085 and International Publication No. 2017/142054 (hereinafter, these documents are referred to as "documents related to antisense method") et al., sugars and sugar-modified nucleosides disclosed as being suitable for use in the antisense method.
  • modified sugars partially substituted with one substituent include ribose or 2-deoxyribose substituted with (i) or (ii) below at any position of the sugar moiety.
  • a C 1-6 alkyl group (ii) a halogen atom, a C 1-6 alkoxy group, a haloC 1-6 alkoxy group, a mono- or di-C 1-6 alkylamino group, a 5-10 membered heterocyclic group, a carboxy group, a carbamoyl group, or N - a C 1-6 alkyl group substituted with at least one selected from the group consisting of substituted carbamoyl groups;
  • the N-substituted carbamoyl group includes an N-methyl-carbamoyl group and an N-ethyl-carbamoyl group, where the methyl group and the ethyl group of the N-methyl-carbamoyl group and N-ethyl-car
  • N-substituted carbamoyl groups include N-methylcarbamoyl group, N-ethylcarbamoyl group, N-dimethylaminoethyl-carbamoyl group, N-morpholinoethylcarbamoyl group, N-(2-pyridylethyl)carbamoyl group, N-((benzimidazol-1-yl)ethyl)carbamoyl group and the like.
  • “Sugar-modified nucleoside” means a molecule having the aforementioned "modified sugar” in place of the sugar moiety of a deoxyribonucleoside or ribonucleoside. Examples include “2'-modified nucleosides” and “2'-4'-bridged nucleosides” described below. When the modified sugar is (Z3) as defined above, sugar-modified nucleosides also include molecules in which the modified sugar and a nucleobase are linked via a methylene chain or the like.
  • 2-modified sugar means a non-bridged sugar in which the oxygen atom or carbon atom at the 2-position of ribose is modified, such as "2-O-Me”, “2-O-MOE”, “2-O -MCE”, “2-O-NMA”, “2-O-AP”, “2-F”, “2-DMAECE”, “2-MorECE”, “2-PyECE” and “2-BimECE” contain.
  • “2'-modified nucleoside” means a molecule having a nucleobase at position 1 of said two modified sugars, e.g., "2'-O-Me nucleoside”, “2'-O-MOE nucleoside”, “2' -O-MCE nucleoside”, “2'-O-NMA nucleoside”, “2'-O-AP nucleoside”, “2'-F nucleoside”, “2'-DMAECE nucleoside”, “2'-MorECE nucleoside” , “2′-PyECE nucleoside” and “2′-BimECE nucleoside”.
  • 2-O-Me also called 2-O-methyl
  • 2-O-Me nucleoside also called 2'-O-methyl nucleoside
  • 2-O-MOE also called 2-O-methoxyethyl
  • 2-O-methoxyethyl means a sugar in which the hydroxy group at position 2 of ribose has been replaced with a 2-methoxyethyloxy group.
  • 2-O-MOE nucleoside also referred to as 2'-O-methoxyethyl nucleoside
  • 2-O-MCE also called 2-O-methylcarbamoylethyl
  • 2-O-methylcarbamoylethyl means a sugar in which the hydroxy group at position 2 of ribose has been replaced with a methylcarbamoylethyloxy group.
  • 2'-O-MCE nucleoside also referred to as 2'-O-methylcarbamoylethyl nucleoside
  • 2-O-NMA means a sugar in which the hydroxy group at position 2 of ribose has been replaced with a 2-[(methylamino)-2-oxoethyl]oxy group.
  • 2-O-NMA nucleoside means a molecule having the nucleobase at position 1 of "2-O-NMA”.
  • 2-O-AP means a sugar in which the hydroxy group at position 2 of ribose has been replaced with a 3-aminopropyloxy group.
  • 2'-O-AP nucleoside means a molecule having the nucleobase at position 1 of "2-O-AP”.
  • 2-F means a sugar in which the hydroxy group at the 2-position of ribose is replaced with a fluorine atom.
  • 2'-F nucleoside means a molecule with a nucleobase at position 1 of "2-F”.
  • 2-DMAECE 2-MorECE
  • 2-PyECE 2-PyECE
  • 2-BimECE are structures in which the hydroxy group at the 2-position of ribose is represented by DMAECE, MorECE, PyECE, and BimECE, respectively. is a modified sugar replaced with In the structure below, the wavy line indicates the bonding position with the carbon atom to which the hydroxy group at the 2-position of ribose is bonded.
  • a "2-4 bridged sugar” means a sugar in which the bridging unit has been substituted by two substitutions at positions 2 and 4 on ribose.
  • the bridging unit include a C 2-6 alkylene group (the alkylene group is unsubstituted or substituted with one or more substituents selected from the group consisting of a halogen atom, an oxo group and a thioxo group.
  • alkylene group and one or two methylene groups of said alkylene group are either unsubstituted or independently —O—, —NR 1 — (R 1 is a hydrogen atom, a C 1-6 alkyl group or haloC 1 -6 alkyl group) and replaced with a group selected from the group consisting of -S-).
  • a "2'-4'-bridged nucleoside"(2',4'-BNA) refers to a molecule having a nucleobase at position 1 of said 2-4 bridged sugar.
  • ⁇ -D-methyleneoxy (4′-CH 2 -O-2′) BNA also called LNA (Locked Nucleic Acid®)
  • ⁇ -L-methyleneoxy (4′ —CH 2 —O-2′)BNA ethyleneoxy (4′-(CH 2 ) 2 —O-2′)BNA also called ENA
  • ⁇ -D-thio(4′-CH 2 —S-2 ') BNA also called aminooxy(4'- CH2 -ON(R11)-2')BNA ( R11 is H or CH3 )
  • 2 ',4'-BNA NC oxyamino(4′-CH 2 —N(R 12 )-O-2′)BNA R 12 is H or CH 3
  • 2′,4′-BNA COC 3′-a
  • the bond between the carbon atom at position 1' and the nucleobase is an ⁇ -glycosidic bond and A ⁇ -glycosidic bond is included, but usually a ⁇ -glycosidic bond. Therefore, ⁇ -D-methyleneoxy BNA is usually used as LNA.
  • n- means normal, "s-” means secondary, and "t-" means tertiary.
  • Halogen atom means a fluorine atom, a chlorine atom, a bromine atom or an iodine atom.
  • C 1-6 alkyl group means a linear or branched saturated hydrocarbon group having 1 to 6 carbon atoms, such as methyl group, ethyl group, n-propyl group, isopropyl group, n -butyl group, isobutyl group, s-butyl group, t-butyl group, n-pentyl group, isopentyl group, neopentyl group, n-hexyl group and isohexyl group.
  • halo C 1-6 alkyl group means a group in which a hydrogen atom at any position in the above “C 1-6 alkyl group” is substituted with one or more above-mentioned “halogen atoms”.
  • C 2-6 alkylene group means a divalent group obtained by removing one hydrogen atom at any position from a linear or branched saturated hydrocarbon group having 2 to 6 carbon atoms, for example Examples include ethylene (ethanediyl) group, propane-1,3-diyl (trimethylene) group, propane-2,2-diyl group, 2,2-dimethyl-propane-1,3-diyl group, hexane-1,6 -diyl (hexamethylene) group and 3-methylbutane-1,2-diyl group.
  • the “C 1-20 alkylene group” means a divalent group obtained by removing one hydrogen atom at an arbitrary position from a linear or branched saturated hydrocarbon group having 1 to 20 carbon atoms.
  • C 2-20 alkenylene group refers to a linear or branched unsaturated hydrocarbon group containing at least one double bond having 2 to 20 carbon atoms and one hydrogen atom at any position It means a removed divalent group.
  • C 1-6 alkoxy group means a group in which the above “C 1-6 alkyl group” is bonded to an oxy group.
  • halo C 1-6 alkoxy group means a group in which a hydrogen atom at an arbitrary position in the above “C 1-6 alkoxy group” is substituted with one or more above-mentioned “halogen atoms”.
  • “Mono- or di-C 1-6 alkylamino group” means a group in which one hydrogen atom of an amino group is replaced with one "C 1-6 alkyl group", or two hydrogen atoms of an amino group are means a group replaced by two identical or different "C 1-6 alkyl groups", for example, methylamino group, ethylamino group, propylamino group, isopropylamino group, butylamino group, dimethylamino group, diethylamino group , dipropylamino group, dibutylamino group, and N-ethyl-N-methylamino group.
  • 5- to 10-membered heterocyclic group is a 5- to 10-membered monocyclic or condensed ring system containing 1 to 4 heteroatoms selected from nitrogen atoms, sulfur atoms and oxygen atoms in addition to carbon atoms as ring-constituting atoms It means a polycyclic aromatic or non-aromatic heterocyclic group.
  • the "5- to 10-membered heterocyclic group” include a thienyl group, a furyl group, a pyrrolyl group, an imidazolyl group, a pyrazolyl group, a thiazolyl group, an isothiazolyl group, an oxazolyl group, an isoxazolyl group, a pyridyl group, a pyrazinyl group, pyrimidinyl group, pyridazinyl group, triazolyl group, tetrazolyl group, triazinyl group, benzothiophenyl group, benzofuranyl group, benzimidazolyl group, benzoxazolyl group, benzoisoxazolyl group, benzothiazolyl group, benzoisothiazolyl group, benzotria solyl group, imidazopyridinyl group, thienopyridinyl group, pyrrolopyridin
  • nucleobase is a purine base or a pyrimidine base, and may be a naturally occurring nucleobase or a modified naturally occurring nucleobase.
  • Naturally occurring nucleobases include adenine (A), guanine (G), thymine (T), cytosine (C) and uracil (U).
  • the “nucleobase” includes naturally occurring nucleobases and "modified nucleobases" described later.
  • nucleobase modifications in "modified nucleobases” include halogenation, methylation, ethylation, n-propylation, isopropylation, cyclopropylation, n-butylation, isobutylation, s-butylation, t -butylation, cyclobutylation, hydroxylation, amination, thiolation and demethylation.
  • the nucleobase in the nucleoside is preferably at least one selected from the group consisting of adenine, guanine, thymine, cytosine, uracil and 5-methylcytosine.
  • 5-methylcytosine means cytosine having a methyl group at the 5-position.
  • Nucleobase sequence means the sequence from the 5' side to the 3' side of the nucleobase of each nucleoside contained in the oligonucleotide.
  • Contiguous nucleobase means a sequence from the 5' side to the 3' side of a part of consecutive nucleobases in the above-mentioned “nucleobase sequence”.
  • Internucleoside linkage means a group or bond that forms a covalent bond between adjacent nucleosides in an oligonucleotide.
  • Internucleoside linkages include phosphodiester linkages and "modified internucleoside linkages” described below.
  • Modified internucleoside linkage means a modified phosphodiester linkage, e.g., phosphorothioate linkage, methylphosphonate linkage (including chiral-methylphosphonate linkage), methylthiophosphonate linkage, phosphorodithioate linkage, phosphoramidate bond, phosphorodiamidate bond, phosphoramidothioate bond, boranophosphate bond and the like. Also, Journal of Medicinal Chemistry, 2016, 59, pp 9645-9667, Medicinal Chemistry Communication, 2014, 5, pp 1454-1471, Future Medicinal Chemistry, 2011, 3, pp 339-365, etc. Examples are disclosed and can be used for modified phosphodiester linkages.
  • Modified nucleoside means a nucleoside having a modified sugar and/or a modified nucleobase.
  • Oligodeoxyribonucleotide has a structure in which two or more identical or different “nucleosides” are linked by the independently selected “internucleoside linkage” (e.g., phosphodiester linkage or modified phosphodiester linkage). means molecules.
  • An “oligodeoxyribonucleotide” means a polynucleotide or oligonucleotide in which two or more of the same or different “deoxyribonucleosides” are linked by the “internucleoside linkages” selected independently of each other.
  • “Oligoribonucleotide” means a polynucleotide or oligonucleotide in which two or more of the same or different “ribonucleosides” are linked by the “internucleoside linkage” independently selected from each other.
  • DNA means a polynucleotide or oligonucleotide in which two or more naturally occurring "deoxyribonucleosides” are linked by phosphodiester bonds. Natural deoxyribonucleosides that constitute DNA may be the same or different.
  • RNA means a polynucleotide or oligonucleotide in which two or more naturally occurring "ribonucleosides” are linked by phosphodiester bonds. The natural ribonucleosides that make up RNA may be the same or different.
  • oligonucleotide complex is a complex in which a plurality of the “oligonucleotides” (molecules) that are not covalently linked to each other are hybridized intermolecularly so that the plurality of oligonucleotides are integrated. means.
  • antisense effect means that the function of the target RNA is controlled by hybridizing the target RNA selected corresponding to the target gene and, for example, an oligonucleotide having a sequence complementary to its partial sequence.
  • hybridization inhibits the translation of the target RNA, a splicing function conversion effect such as exon skipping, and the target RNA is degraded by recognition of the hybridized portion. etc.
  • the target RNA is "ATN1 mRNA" and/or "ATN1 pre-mRNA".
  • an "antisense oligonucleotide” is an oligonucleotide that produces the antisense effect. Examples include, but are not limited to, DNA, oligodeoxyribonucleotides, gapmers, and mixmers. RNA, oligoribonucleotides, or oligonucleotides designed to normally produce an antisense effect may be used.
  • Hybridize refers to the act of forming a duplex between oligonucleotides containing complementary sequences or portions thereof, and oligonucleotides containing complementary sequences or portions thereof forming duplexes means phenomenon.
  • “Complementary” means that two nucleobases can form Watson-Crick base pairs (natural base pairs) or non-Watson-Crick base pairs (Hoogsteen base pairs, etc.) through hydrogen bonding.
  • Two oligonucleotides or portions thereof can "hybridize” if their sequences are complementary. Although it is not necessary for two oligonucleotides or portions thereof to hybridize they must be perfectly complementary, the complementarity for two oligonucleotides or portions thereof to hybridize is preferably 70%. or more, more preferably 80% or more, and still more preferably 90% or more (for example, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% or more).
  • Sequence complementarity is determined by utilizing computer programs that automatically identify subsequences of oligonucleotides.
  • OligoAnalyzer is one such software and is provided by Integrated DNA Technologies. The program is also available on the website.
  • One skilled in the art can determine that two oligonucleotides hybridize when the two oligonucleotides have the preferred complementarity described above.
  • Gapmer means an oligonucleotide containing a "gap segment", a "5' wing segment” and a “3' wing segment” described below.
  • a “gap segment” is a region containing "at least four consecutive nucleosides recognized by RNase H", and is not particularly limited as long as it contains four or more consecutive nucleosides and is recognized by RNase H, but said consecutive Nucleosides are preferably independently selected from deoxyribonucleosides and sugar-modified nucleosides and comprise at least two deoxyribonucleosides.
  • the 5' and 3' terminal nucleosides of the gap segment are preferably deoxyribonucleosides.
  • a “5' wing segment” is a region that is linked to the 5' side of the gap segment and contains "at least one nucleoside” without the "at least four consecutive nucleosides recognized by RNase H". where the 3'-terminal nucleoside sugar moiety of the 5' wing segment is different from the 5'-terminal nucleoside sugar moiety of the gap segment. Differences in sugar moieties confirm the boundaries of the 5' wing and gap segments. In one embodiment of the present invention, the difference in sugar moieties is preferably determined by the presence or absence of modification at the 2-position of the corresponding sugar.
  • the "2-modified sugar” is a non-crosslinked sugar in which the oxygen atom or carbon atom at the 2-position of ribose is modified
  • the "2-4 bridged sugar” is defined as 2 Both are modified at the 2-position because they are sugars in which the bridging unit is substituted by two substitutions at the position and the 4-position.
  • the nucleosides at the 5' end of the gap segment are deoxyribonucleosides and the nucleosides at the 3' end of the 5' wing segment are sugar-modified nucleosides.
  • the sugar-modified nucleosides are 2'-4'-bridged nucleosides.
  • the nucleoside at the 3' end of the 5' wing segment is generally a sugar modified nucleoside.
  • the 5′ wing segment is not particularly limited as long as it satisfies the above definition, but said at least one nucleoside is preferably independently selected from deoxyribonucleosides and sugar-modified nucleosides and includes at least one sugar-modified nucleoside.
  • a "3' wing segment” is a region that is linked to the 3' side of the gap segment and contains "at least one nucleoside" without the "at least four consecutive nucleosides recognized by RNase H".
  • the difference in sugar moieties identify the boundary between the 3' wing segment and the gap segment.
  • the difference in sugar moieties is preferably determined by the presence or absence of modification at the 2-position of the corresponding sugar.
  • the nucleosides at the 3' end of the gap segment are deoxyribonucleosides and the nucleosides at the 5' end of the 3' wing segment are sugar-modified nucleosides.
  • the sugar-modified nucleosides are 2'-4'-bridged nucleosides.
  • the 5' terminal nucleoside of the 3' wing segment is generally a sugar modified nucleoside.
  • the 3′ wing segment is not particularly limited as long as it satisfies the above definition, but said at least one nucleoside is preferably independently selected from deoxyribonucleosides and sugar-modified nucleosides and includes at least one sugar-modified nucleoside.
  • the portion where the 2'-modified nucleoside or the 2'-4'-bridged nucleoside continues from the 5'-end is the 5'-wing segment, and the nucleoside at the 3'-end of the 5'-wing segment is 2'-modified.
  • the boundary connecting nucleosides or other nucleosides (deoxyribonucleosides, ribonucleosides, etc.) except 2'-4'-bridged nucleosides is the boundary between the 5' wing segment and the gap segment.
  • the portion where the 2'-modified nucleoside or the 2'-4'-bridged nucleoside continues from the 3'-end is the 3'-wing segment, and the nucleoside at the 5'-end of the 3'-wing segment is 2'-modified.
  • the boundary connecting nucleosides or other nucleosides (deoxyribonucleosides, ribonucleosides, etc.) other than 2'-4'-bridged nucleosides is the boundary between the 3' wing segment and the gap segment.
  • RNase H is generally known as a ribonuclease that recognizes a double strand in which DNA and RNA hybridize in vivo and cleaves the RNA to generate single-stranded DNA.
  • RNase H recognizes not only double strands in which DNA and RNA hybridize, but also double strands in which at least one of the nucleobase moiety, phosphodiester linkage moiety and sugar moiety of at least one of DNA and RNA is modified. obtain. For example, it can also recognize duplexes in which DNA modified with phosphorothioate linkages and RNA are hybridized. It can also recognize double strands in which oligodeoxyribonucleotides and oligoribonucleotides are hybridized.
  • DNA can be recognized by RNaseH when hybridized with RNA.
  • RNA can also be cleaved by RNase H when hybridized with DNA.
  • RNase H when hybridized with DNA.
  • typical examples include oligonucleotides in which the phosphodiester binding portion of DNA is modified with phosphorothioate.
  • RNase H is preferably mammalian RNase H, more preferably human RNase H, and particularly preferably human RNase H1.
  • At least 4 consecutive nucleosides recognized by RNaseH includes 4 or more consecutive nucleosides, and is not particularly limited as long as it is recognized by RNaseH, for example, “at least 4 consecutive deoxyribonucleosides", etc. are mentioned.
  • the number of nucleosides constituting "at least four consecutive nucleosides recognized by RNaseH” is, for example, 5 to 30, preferably 5 to 15, more preferably 8 to 12, particularly preferably 10. Whether a given at least four consecutive nucleosides are "at least four consecutive nucleosides recognized by RNase H" can be determined by those skilled in the art from the structure of the sugar portion of the consecutive nucleosides.
  • Oligonucleotides that contain multiple sugar-modified nucleosides and produce an antisense effect without the gap segment. Oligonucleotides in which nucleosides consisting of three deoxyribonucleosides or oligonucleotides are alternately linked, oligonucleotides consisting of only sugar-modified nucleosides as nucleosides, and the like.
  • ATN1 (Atrophin1) means any protein of Atrophin1.
  • ATN1 mRNA means mRNA encoding ATN1 protein
  • ATN1 pre-mRNA means pre-mRNA encoding ATN1 protein.
  • ATN1 nucleic acid means any nucleic acid encoding ATN1, including, for example, “ATN1 mRNA” and "ATN1 pre-mRNA”.
  • ATN1 mRNA is represented, for example, by SEQ ID NO: 1
  • ATN1 pre-mRNA is represented, for example, by SEQ ID NO: 2 or 717. Both "ATN1 mRNA” and “ATN1 pre-mRNA” have nucleosides linked together by phosphodiester bonds, and thymine is usually replaced with uracil. "ATN1 mRNA” and “ATN1 pre-mRNA” do not otherwise have modified sugars, modified nucleobases, or modified internucleoside linkages.
  • Gene expression refers to the conversion of gene code information into structures or functions in cells. Such structures include, but are not limited to, transcription and translation products (mRNA, pre-mRNA, proteins, etc.).
  • DRPLA Dentate-rubropallid-louis-body atrophy
  • CAG repeats are present in many genes other than ATN1 and thus may have off-target effects.
  • the ASO derivatives of the present invention are complementary to ATN1 mRNA and/or ATN1 pre-mRNA and do not target the CAG repeat of the ATN1 gene. That is, since it has complementarity with other than the CAG repeat sequence, it is expected that the variation in efficacy is small and the off-target effect is small.
  • a “CAG repeat sequence” is a sequence in which three base units of cytosine (C), adenine (A), and guanine (G) are repeated in this order. Those skilled in the art can determine from the base sequence of ASO that the CAG repeat sequence is not the target.
  • the first oligonucleotide targets the ATN1 mRNA or pre-mRNA.
  • the first oligonucleotide contains a sequence that allows it to hybridize with the ATN1 mRNA or pre-mRNA.
  • the first oligonucleotide need not hybridize with the entire ATN1 mRNA or pre-mRNA, but usually hybridizes with at least a portion.
  • an oligonucleotide having a sequence complementary to a partial sequence of ATN1 mRNA or pre-mRNA (such as a gapmer or an oligonucleotide generally designed to produce an antisense effect) and an ATN1 mRNA or pre-mRNA
  • the expression of the ATN1 gene is controlled by hybridizing a part. Also, the entire first oligonucleotide need not be hybridized, and a portion thereof may not be hybridized.
  • the complementarity between the nucleic acid base sequence of the first oligonucleotide and the partial sequence of ATN1 mRNA or pre-mRNA is preferably 70% or more, more preferably 80% or more, still more preferably 90% or more (e.g., 95% , 96%, 97%, 98% or 99% or more).
  • their sequences need not be completely complementary, but must be completely complementary. is even more preferred.
  • the first oligonucleotide consists of 8-30 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides and includes at least one sugar-modified nucleoside.
  • the number of nucleosides contained in the first oligonucleotide is 8 to 30, preferably 8 to 25, more preferably 13 to 23, still more preferably 15 to 21, still more Preferably 16 to 20, particularly preferably 16 or 20.
  • Nucleosides comprised in the first oligonucleotide are preferably independently selected from deoxyribonucleosides and sugar-modified nucleosides.
  • the first oligonucleotide has a gap segment, a 5' wing segment and a 3' wing segment.
  • the gap segment consists of at least five nucleosides independently selected from the group consisting of deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides, and includes at least two deoxyribonucleosides, the 3' and 5' ends of which are respectively Independently, it is a deoxyribonucleoside.
  • a gap segment preferably comprises "at least 4 consecutive deoxyribonucleosides".
  • the number of nucleosides contained in the gap segment is preferably 5-28, more preferably 5-16, even more preferably 8-12, still more preferably 9 or 10. .
  • the gap segment is composed of deoxyribonucleosides.
  • the internucleoside linkages contained in the gap segment are preferably independently selected from phosphodiester linkages and modified phosphodiester linkages. and more preferably at least one independently selected from a phosphodiester bond and a phosphorothioate bond.
  • the internucleoside linkages contained in the gap segment preferably contain at least one phosphorothioate linkage, more preferably 50% or more are phosphorothioate linkages, more preferably 75% or more are phosphorothioate linkages, and 80% More preferably, the above are phosphorothioate bonds, even more preferably 90% or more are phosphorothioate bonds, and most preferably all are phosphorothioate bonds.
  • the 5' wing segment consists of at least one nucleoside independently selected from the group consisting of deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides, provided that its 3' end attached to the gap segment is sugar-modified is a nucleoside and does not contain "at least 4 consecutive nucleosides recognized by RNase H".
  • the 3' wing segment consists of at least one nucleoside independently selected from the group consisting of deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides, provided that its 5' end attached to the gap segment is sugar-modified is a nucleoside and does not contain "at least 4 consecutive nucleosides recognized by RNase H".
  • the 5' and 3' wing segments preferably do not contain "at least 4 consecutive deoxyribonucleosides”.
  • wing segments the properties common to the 5′ wing segment and the 3′ wing segment are referred to as wing segments.
  • the number of nucleosides contained in the wing segment is respectively 1 to 15, preferably 1 to 10, more preferably 1 to 7, still more preferably 2 to 6, still more preferably 2 to 5, more preferably 3 to 5, and particularly preferably 3 or 4.
  • the sugar-modified nucleoside contained in the wing segment is preferably a nucleoside with increased affinity for the partial sequence of ATN1 mRNA and/or ATN1 pre-mRNA or a nucleoside with increased resistance to nucleolytic enzymes due to substitution or the like. More preferably, they are independently selected from 2' modified nucleosides and 2',4'-BNAs.
  • 2′-modified nucleosides contained in the wing segment are preferably 2′-O-Me nucleosides, 2′-O-MOE nucleosides, 2′-O-AP nucleosides, 2′-F nucleosides, 2′-O-NMA at least one independently selected from the group consisting of nucleosides, 2′-O-MCE nucleosides, 2′-DMAECE nucleosides, 2′-MorECE nucleosides, 2′-PyECE nucleosides and 2′-BimECE nucleosides, and more Preferably at least one independently selected from the group consisting of 2'-O-Me nucleosides, 2'-O-MOE nucleosides, 2'-O-NMA nucleosides and 2'-O-MCE nucleosides, and further More preferably, it is at least one independently selected from 2'-O-MOE nucleosides and 2'-O
  • 2',4'-BNA contained in the wing segment is preferably at least one independently selected from the group consisting of LNA, cEt, ENA, BNA NC , AmNA, GuNA and scpBNA, more preferably It is an LNA.
  • the sugar-modified nucleosides contained in the wing segment are more preferably at least one independently selected from 2'-O-MOE nucleosides, LNA and 2'-O-MCE nucleosides, and more preferably 2' -O-MOE nucleosides, 2'-O-MCE nucleosides, or combinations of LNA and 2'-O-MCE nucleosides, even more preferably 2'-O-MOE nucleosides , or a combination of LNA and 2'-O-MCE nucleosides, particularly preferably a combination of LNA and 2'-O-MCE nucleosides.
  • Each wing segment preferably consists of 1-10 nucleosides independently selected from the group consisting of sugar-modified nucleosides and deoxyribonucleosides and includes at least one sugar-modified nucleoside. More preferably, it consists of 2 to 6 nucleosides independently selected from the group consisting of sugar-modified nucleosides and deoxyribonucleosides, and contains at least two sugar-modified nucleosides.
  • each wing segment is more specifically 1 to 10, preferably 1 to 7, more preferably independently selected from LNA, 2'-O-MCE nucleosides and 2'-O-MOE nucleosides.
  • Each wing segment even more preferably consists of two LNAs and one or two 2'-O-MCE nucleosides, particularly preferably two LNAs and one 2'-O-MCE nucleoside.
  • each wing segment more preferably consists of 3 to 6, particularly preferably 5, 2'-O-MOE nucleosides. In still another aspect, it is more preferably composed of 3 to 6, particularly preferably 5, 2'-O-MCE nucleosides.
  • each wing segment consists of 2-5 nucleosides independently selected from the group consisting of 2',4'-BNA and deoxyribonucleosides, and at least two 2',4' -An oligonucleotide containing BNA, such an oligonucleotide can be referred to WO 2016/127002 and the like.
  • a preferred LNA contained in each wing segment is ⁇ -D-methyleneoxy BNA.
  • the 5' and 3' wing segments each independently comprise 3, 4, 5, or 6 sugar modified nucleosides and the gap segment comprises 8, 9, 10 , 11, 12, 13, or 14 deoxyribonucleosides.
  • the number of nucleosides of such gapmers can be expressed as [the number of nucleosides in the 5' wing segment - the number of nucleosides in the gap segment - the number of nucleosides in the 3' wing segment], for example, 5-10-5, 5- 11-4, 4-11-5, 4-12-4, 3-14-3, 6-8-6, 3-12-3, 3-10-3, 4-10-4, 3-10- 4, 4-10-3, 3-9-3, 4-9-4, 3-9-4, 4-9-3, 3-8-3, 3-8-4, 4-8-3 and It is represented by 4-8-4.
  • the first oligonucleotide has at least 11, 12, 13, 14 or 15 consecutive nucleosides and the gap segment has at least 5, 6, 7, 8, or 9 consecutive nucleosides, and the 5′ wing segment and the 3′ wing segment are any of (i) to (iv) below.
  • the 5' and 3' wing segments each independently contain 3, 4, 5 or 6 2'-O-MOE nucleosides;
  • the 5' and 3' wing segments each independently contain 3, 4, 5 or 6 2'-O-MCE nucleosides;
  • the 5' and 3' wing segments each independently comprise 2, 3, 4, 5 or 6 LNAs;
  • the 5' wing segment and the 3' wing segment each independently comprise 3 or 4 selected from 2'-O-MCE nucleosides and LNAs, and at least one 2'-O-MCE nucleoside; and at least one LNA.
  • the arrangement of sugar-modified nucleosides in the 5′ wing segment and the 3′ wing segment is preferably VLL, LVL, LLV, LVV, VLV, VVL, LLL, VVLL, VLVL, VLLV, LVLV, LLVV, LVVL , VLLL, LVLL, LLVL, LLLV, LVVV, VLVV, VVLV, and VVVL.
  • the placement of the sugar modified nucleosides in the 5' wing segment is selected from the group consisting of LLL, VLL, LVL, VVL, LLV, VLVL, LVLV, LLVV and VLLV
  • the placement of the sugar modified nucleosides in the 3' wing segment is selected from the group consisting of LLL, LLV, LVL, LVV, VLL, LVLV, VLVL, VVLL and VLLV.
  • the sugar-modified nucleoside placement in the 5' wing segment is selected from the group consisting of LLL, VLL, LVL, VVL, LLV, VLVL, LVLV, LLVV and VLLV
  • the sugar-modified nucleoside placement in the 3' wing segment is selected from the group consisting of LLL, LLV, LVL, LVV, VLL, LVLV and VLLV.
  • the placement of the sugar-modified nucleosides in the 5' wing segment is selected from the group consisting of VLL, LVL, VVL, LLV, VLVL and VLLV, and the placement of the sugar-modified nucleosides in the 3' wing segment is LLV, It is selected from the group consisting of LVL, LVV, VLL, LVLV and VLLV.
  • L and V in the 5' wing segment and 3' wing segment are sugar-modified nucleosides having different modified sugars, and the left side indicates the 5' side and the right side indicates the 3' side.
  • L represents a 2'-4'-bridged nucleoside and V represents a 2' modified nucleoside.
  • L denotes LNA and V denotes a 2'-O-MCE nucleoside.
  • the internucleoside linkages contained in the 5' wing segment is preferably at least one independently selected from a phosphodiester bond and a modified phosphodiester bond, more preferably at least one independently selected from a phosphodiester bond and a phosphorothioate bond. Seeds.
  • the internucleoside linkages contained in the 5' wing segment preferably comprise at least one phosphorothioate linkage, preferably 50% or more are phosphorothioate linkages, more preferably 60% or more are phosphorothioate linkages, 75 % or more are phosphorothioate linkages, even more preferably 80% or more are phosphorothioate linkages, even more preferably 90% or more are phosphorothioate linkages, and particularly preferably all are phosphorothioate linkages. .
  • the 3' wing segment is similar to the 5' wing segment.
  • the internucleoside linkages contained in the wing segment may be all phosphodiester linkages from the viewpoint of reducing toxicity, but are preferably partially phosphodiester linkages.
  • the 5' terminal internucleoside linkages contained in the 5' wing segment are preferably phosphorothioate linkages.
  • the 3' terminal internucleoside linkages contained in the 3' wing segment are preferably phosphorothioate linkages.
  • Other internucleoside linkages of the 5' wing segment, except for the 5' terminal internucleoside linkage included in the 5' wing segment may be phosphodiester linkages or phosphorothioate linkages, but 50% or more are phosphodiester linkages.
  • the other internucleoside linkages of the 3' wing segment may be phosphodiester linkages or phosphorothioate linkages, but may be 50% or more phosphodiester linkages.
  • the internucleoside bond located closest to the gap segment is preferably a phosphodiester bond.
  • the 5′ terminal internucleoside bond is preferably a phosphorothioate bond
  • the gap segment side internucleoside bond is preferably a phosphodiester bond.
  • the internucleoside linkage at the 5' end is preferably a phosphorothioate bond
  • the other two internucleoside linkages contained in the 5' wing segment are independent. is preferably a phosphodiester bond or a phosphorothioate bond, and particularly preferably a phosphodiester bond.
  • the 5′ terminal internucleoside bond is preferably a phosphorothioate bond, and the other three internucleoside bonds contained in the 5′ wing segment are independent.
  • a phosphodiester bond or a phosphorothioate bond is preferred, and a phosphodiester bond is particularly preferred.
  • the 3′ wing segment contains two internucleoside bonds
  • the 3′ terminal internucleoside bond is preferably a phosphorothioate bond
  • the gap segment side internucleoside bond is preferably a phosphodiester bond.
  • the internucleoside bond at the 3′ end is preferably a phosphorothioate bond, and the other two internucleoside bonds contained in the 3′ wing segment are independent. is preferably a phosphodiester bond or a phosphorothioate bond, and particularly preferably a phosphodiester bond.
  • the internucleoside linkage at the 3' end is preferably a phosphorothioate linkage, and the other three internucleoside linkages contained in the 3' wing segment are independent.
  • a phosphodiester bond or a phosphorothioate bond is preferred, and a phosphodiester bond is particularly preferred.
  • the 5' wing segment contains one nucleoside
  • the 5' wing segment contains 0 internucleoside bonds.
  • the 3' wing segment contains one nucleoside
  • the 3' The wing segment contains 0 internucleoside linkages.
  • the 3' end of the 5' wing segment and the 5' end of the gap segment are linked by forming a phosphodiester bond or a modified phosphodiester bond, and the 5' end of the 3' wing segment
  • the 'end and the 3' end of the gap segment are linked by forming a phosphodiester bond or a modified phosphodiester bond.
  • the 3' end of the 5' wing segment and the 5' end of the gap segment are linked by forming a modified phosphodiester bond, and the 5' end of the 3' wing segment and the 3' end of the gap segment are linked.
  • the ends are ligated forming a modified phosphodiester bond.
  • the 3' end of the 5' wing segment and the 5' end of the gap segment are linked by forming a phosphorothioate bond, and the 5' end of the 3' wing segment and the 3' end of the gap segment are linked by phosphorothioate linked by forming a bond.
  • the 3' end of the 5' wing segment and the 5' end of the gap segment are linked by forming a phosphodiester bond, and the 5' end of the 3' wing segment The 'end and the 3' end of the gap segment are linked by forming a phosphorothioate bond.
  • the 3' end of the 5' wing segment and the 5' end of the gap segment are linked by forming a phosphorothioate bond, and the 5' end of the 3' wing segment and the 3' end of the gap segment are , may be linked by forming a phosphodiester bond, the 3′ end of the 5′ wing segment and the 5′ end of the gap segment are linked by forming a phosphodiester bond, and the 5′ end of the 3′ wing segment The 'end and the 3' end of the gap segment may be linked by forming a phosphodiester bond.
  • the first oligonucleotide preferably comprises positions 59 to 104, 109 to 133, 173 to 192, 207 to 272, 300 to 319, 353 to 372, 419 to 434, 458-509, 523-559, 561-618, 626-685, 766-785, 787-819, 838-855, 880-922, 924-943, 970-989, 994-1039, 1055-1074, 1079-1098, 1157-1176, 1196-1223, 1310-1329, 1339-1399, 1423-1442, 1614-1633, 1650-1670, 1806-1833, 1844-1865, 1896-1915, 1924-1992, 2023- 2042, 2058-2081, 2103-2124, 2398-2417, 2480-2520, 2526-2562, 2568-2587, 2853-2872, 2876-2923, 2931-2950, 2972-3016, 3072-3099, 3109-3128, 3192-3211, 3267-3290, 3333-33
  • the first oligonucleotide is more preferably located at position numbers 238-272, 537-559, 585-618, 664-683, 787-819, 838-855, 924 of the nucleobase of ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO: 1 ⁇ 943, 972 ⁇ 987, 994 ⁇ 1029, 1055 ⁇ 1074, 1080 ⁇ 1095, 1204 ⁇ 1219, 1310 ⁇ 1329, 1362 ⁇ 1397, 1650 ⁇ 1670, 1806 ⁇ 1833, 1844 ⁇ 1865, 1896 ⁇ 1915, 1955 ⁇ 1992 . -3926, 4022-4062, 4118-4137, 4218-4236, and 4266-4281.
  • the first oligonucleotide is more preferably complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by position numbers 3419-3557 of the ATN1 mRNA nucleobase represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is more preferably complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by position numbers 3449-3557 of the ATN1 mRNA nucleobase represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is more preferably complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by position numbers 3451-3520 of the ATN1 mRNA nucleobase represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is even more preferably a nucleobase sequence selected from the group consisting of the nucleobase sequences represented by position numbers 3451 to 3484 and 3487 to 3520 of the ATN1 mRNA nucleobase represented by SEQ ID NO: 1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of The first oligonucleotide is even more preferably a nucleobase sequence selected from the group consisting of the nucleobase sequences represented by position numbers 3451 to 3475 and 3490 to 3505 of the ATN1 mRNA nucleobase represented by SEQ ID NO: 1. is complementary to at least a portion of
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3451-3468 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by position numbers 3452-3467 of the ATN1 mRNA nucleobase represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3453-3468 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3457-3476 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3458-3477 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3459-3474 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3459-3476 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3460-3475 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3461-3476 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3465-3484 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3487-3502 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3488-3503 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 3490-3505 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by position numbers 3501-3520 of the ATN1 mRNA nucleobase represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 538-553 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 587-602 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 666-681 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 1363-1378 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 1975-1990 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 2888-2903 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 2979-2994 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by position numbers 3520-3535 of the ATN1 mRNA nucleobase represented by SEQ ID NO:1.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 4221-4236 of the ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1.
  • the complementarity between the first oligonucleotide and the corresponding portion of ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO: 1 is at least 80% or more, preferably 85% or more, more preferably 90% or more, Even more preferably, it is 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more.
  • the first oligonucleotide preferably consists of 8-30 nucleosides complementary to at least a portion of each of the above target regions of ATN1 mRNA represented by SEQ ID NO:1. More preferably 10 to 25, more preferably 16 to 20, particularly preferably 16 or 20 nucleosides.
  • the first oligonucleotide preferably comprises nucleobase positions 383-398, 986-1001, 1004-1019, 1378-1393, 1398-1413, 1853-1868 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO: 2, 1971-1986, 2189-2204, 2522-2537, 2562-2577, 3662-3677, 3987-4002, 4217-4232, 4266-4281, 4335-4350, 4360-4375, 4477-4492, 4562-4577, 4636- 4651, 4687-4702, 4734-4749, 4840-4855, 5536-5563, 5568-5592, 5632-5651, 5666-5715, 5906-5925, 5959-5978, 6176-6191, 6215-6266, 6963-6978, 7248-7284, 7286-7343, 7351-7410, 7491-7510, 7512-7544, 7563-7580, 7605-7647, 7649-7668,
  • the first oligonucleotide is more preferably the position numbers 986 to 1001, 1004 to 1019, 1378 to 1393, 1398 to 1413, 4217 to 4232, 4335 to 4350 of the nucleobases of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO: 2 ,4360-4375,4477-4492,4562-4577,4636-4651,4687-4702,4734-4749,4840-4855,5697-5715,6963-6978,7262-7284,7310-7343,7389-7408,7512 ⁇ 7544, 7563 ⁇ 7580, 7649 ⁇ 7668, 7697 ⁇ 7712, 7719 ⁇ 7754, 7780 ⁇ 7799, 7805 ⁇ 7820, 7929 ⁇ 7944, 8035 ⁇ 8054, 8087 ⁇ 8122, 8375 ⁇ 8395, 8531 ⁇ 8558, 8569 ⁇ 8590 .
  • 13931-13946 is complementary to at least a portion within the nucleobase sequence that is identified.
  • the first oligonucleotide is more preferably complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 12508-12680 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is even more preferably complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 12572-12680 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is more preferably complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 12574-12643 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is more preferably a nucleobase selected from the group consisting of the nucleobase sequences represented by position numbers 12574 to 12607 and 12610 to 12643 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO: 2. It is complementary to at least part of the sequence.
  • the first oligonucleotide is even more preferably a nucleic acid selected from the group consisting of the nucleobase sequences represented by nucleobase position numbers 12574 to 12598 and 12613 to 12628 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO: 2. It is complementary to at least part of the base sequence.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 12574-12591 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 12575-12590 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 12576-12591 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 12580-12599 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 12581-12600 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 12582-12597 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 12582-12599 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 12583-12598 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 12584-12599 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 12588-12607 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 12610-12625 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 12611-12626 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 12613-12628 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 12624-12643 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 4335-4350 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 4360-4375 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 7263-7278 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 7312-7327 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 7391-7406 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 8088-8103 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 10309-10324 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least part of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 10400-10415 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase positions 12643-12658 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • the first oligonucleotide is complementary to at least a portion of the nucleobase sequence represented by nucleobase position numbers 13886-13901 of the ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2.
  • Complementarity between the first oligonucleotide and the corresponding portion of ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO: 2 is at least 80% or more, preferably 85% or more, more preferably 90% Above, and more preferably above 95%, 96%, 97%, 98%, 99%.
  • the first oligonucleotide preferably consists of 8 to 30 nucleosides complementary to at least a portion of each of the above target regions of ATN1 pre-mRNA represented by SEQ ID NO:2. More preferably 10 to 25, more preferably 16 to 20, particularly preferably 16 or 20 nucleosides.
  • the nucleobase sequence of the first oligonucleotide is preferably at least 8, more preferably 8, 9, 10, 11, 12, 13 of any of SEQ ID NOS: 3-716 and 718-770. , 14 or 15 contiguous nucleobases.
  • the nucleobase sequence of the first oligonucleotide more preferably includes any one of the nucleobase sequences of SEQ ID NOs: 3-716 and 718-770.
  • the nucleobase sequence of the first oligonucleotide is preferably at least 8 nucleobase sequences in any one of nucleobase sequence group A, more preferably 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 or It has a nucleobase sequence containing 15 contiguous nucleobases, and more preferably contains any one nucleobase sequence of nucleobase sequence group A.
  • the nucleobase sequence of the first oligonucleotide is more preferably at least 8 nucleobase sequences in any one of nucleobase sequence group B, more preferably 8, 9, 10, 11, It has a nucleobase sequence containing 12, 13, 14 or 15 contiguous nucleobases, and more preferably contains any one nucleobase sequence of nucleobase sequence group B.
  • the nucleobase sequence of the first oligonucleotide is more preferably at least 8 nucleobase sequences of any one of nucleobase sequence group C, still more preferably 8, 9, 10, 11 , 12, 13, 14 or 15 contiguous nucleobases, particularly preferably any one of nucleobase sequence group C.
  • Nucleic acid base sequence group A SEQ. 52, 55, 59, 60, 61, 62, 63, 66, 67, 68, 69, 70, 72, 74, 75, 78, 79, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 91, 92, 94, 95, 97, 99, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 126, 127, 128, 131, 132, 133, 137, 138, 139, 148, 151, 152, 153, 154, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174
  • Nucleic acid base sequence group B SEQ. 103, 104, 105, 106, 107, 109, 111, 112, 113, 114, 117, 120, 121, 122, 124, 128, 138, 151, 152, 153, 154, 156, 157, 159, 160, 161, 163, 168, 169, 171, 174, 180, 181, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 192, 194, 195, 196, 197, 198, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 238, 239, 240, 241, 298, 299,
  • Nucleic acid base sequence group C The group consisting of SEQ. Preferred sequence numbers among the sequence numbers listed in the nucleobase sequence group C are listed below. SEQ ID NO:209, SEQ ID NO:215, SEQ ID NO:216, SEQ ID NO:221, SEQ ID NO:715. Among the SEQ ID NOs listed in the nucleobase sequence group C, particularly preferred SEQ ID NOs are listed below in addition to the above. SEQ ID NO:47, SEQ ID NO:105, SEQ ID NO:174, SEQ ID NO:214, SEQ ID NO:240, SEQ ID NO:585, SEQ ID NO:586.
  • the nucleobase sequence of the first oligonucleotide is preferably at least 8, more preferably 8, 9, 10 or 11, of any one of nucleobase sequence groups D1 and D3. , 12, 13, 14 or 15 contiguous nucleobases, more preferably any one of nucleobase sequence groups D1 and D3.
  • the number of first oligonucleotides is preferably 8-30, more preferably 12-25, even more preferably 12-22, even more preferably 16-20, even more preferably 16-18. , particularly preferably consisting of 16 nucleosides.
  • the nucleobase sequence of the first oligonucleotide is preferably at least 8, more preferably 8, 9, 10, 11, 12 nucleobase sequences of any one of the nucleobase sequence group D2. , 13, 14 or 15 contiguous nucleobases, more preferably any one of the nucleobase sequence group D3.
  • the first oligonucleotide preferably comprises 8 to 30, more preferably 12 to 25, even more preferably 12 to 22, even more preferably 16 to 20, particularly preferably 18 nucleosides. Become.
  • the nucleobase sequence of the first oligonucleotide is more preferably at least 8, more preferably 8, 9, 10 or 11, of any one of the nucleobase sequences of nucleobase sequence group E. , 12, 13, 14 or 15 contiguous nucleobases, more preferably any one of nucleobase sequence group E.
  • the first oligonucleotide preferably comprises 8 to 30, more preferably 16 to 25, even more preferably 16 to 22, even more preferably 16 to 20, particularly preferably 20 nucleosides. Become.
  • Nucleic acid base sequence group D1 SEQ. 52, 55, 59, 60, 61, 62, 63, 66, 67, 68, 69, 70, 72, 74, 75, 78, 79, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 91, 92, 94, 95, 97, 99, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 126, 127, 128, 131, 132, 133, 137, 138, 139, 148, 151, 152, 153, 154, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173,
  • SEQ ID NO:208 SEQ ID NO:215, SEQ ID NO:220, SEQ ID NO:221, SEQ ID NO:222.
  • SEQ ID NO: 222 SEQ ID NO: 221, SEQ ID NO:222.
  • SEQ ID NO: 47 SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 174, SEQ ID NO: 214, SEQ ID NO: 240, SEQ ID NO: 585, SEQ ID NO: 586.
  • Nucleic acid base sequence group D2 the group consisting of: .
  • Nucleic acid base sequence group D3 SEQ. The group consisting of 750, 751, 752, 753, 754, 755, 756, 757, 758, 759, 760, 761, 762, 763, 764, 765, 766, 767, 768, 769 and 770.
  • Nucleic acid base sequence group E SEQ. 294, 296, 297, 298, 299, 300, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 309, 310, 311, 313, 314, 315, 316, 317, 319, 320, 321, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 335, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 355, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 369, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 382, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 409, 410, 411, 412
  • the first oligonucleotide having a nucleobase sequence comprising at least 8 contiguous nucleobases of any one of the nucleobase sequences of nucleobase sequence group D1 preferably has at least one LNA and at least have one 2'-O-MCE nucleoside, preferably 1 or 2 LNA and 1 or 2 2'-O-MCE nucleoside, more preferably 2 LNA and one 2'-O-MCE nucleoside, or one LNA and two 2'-O-MCE nucleosides. It may have two LNAs and two 2'-O-MCE nucleosides. Particularly preferred are two LNAs and one 2'-O-MCE nucleoside.
  • the first oligonucleotide having a nucleobase sequence comprising at least 8 contiguous nucleobases of any one of the nucleobase sequences of the nucleobase sequence group D2 preferably has at least one LNA and at least It has one 2'-O-MCE nucleoside, preferably 1 or 2 LNA and 1 or 2 2'-O-MCE nucleoside, particularly preferably 2 LNA and two 2'-O-MCE nucleosides.
  • the first oligonucleotide having a nucleobase sequence comprising at least 8 contiguous nucleobases of any one of the nucleobase sequences of nucleobase sequence group D3 preferably has at least one LNA in each wing segment. However, it preferably has 1 to 3 LNAs, particularly preferably 3 LNAs.
  • a first oligonucleotide having a nucleobase sequence comprising at least 8 contiguous nucleobases of any one of the nucleobase sequences of nucleobase sequence group E is attached to each wing segment, particularly preferably at least one 2′- O-MOE nucleosides or at least one 2'-O-MCE nucleoside, preferably 5 2'-O-MOE nucleosides or 5 2'-O-MCE nucleosides, more particularly It preferably has five 2'-O-MOE nucleosides.
  • the second oligonucleotide consists of 8-30 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides. It includes a sequence that allows it to hybridize with at least a portion of the first oligonucleotide.
  • the number of nucleosides contained in the second oligonucleotide is 8 to 30, preferably 8 to 25, more preferably 13 to 23, still more preferably 15 to 21, and further More preferably 16 to 20, particularly preferably 16 or 20.
  • the number of nucleosides contained in the second oligonucleotide may be the same as or different from the number of nucleosides contained in the first oligonucleotide. The difference is preferably 3 or less, more preferably 1 or less, and particularly preferably the same.
  • the second oligonucleotide hybridizes intramolecularly or intermolecularly with at least a portion of the first oligonucleotide.
  • the first and second oligonucleotides in the single-stranded oligonucleotide may hybridize intramolecularly or intermolecularly, but preferably hybridize intramolecularly.
  • the first oligonucleotide and the second oligonucleotide in the single-stranded oligonucleotide are preferably intramolecularly hybridized.
  • the first and second oligonucleotides in the double-stranded oligonucleotide complex are intermolecularly hybridized.
  • the complementarity is preferably 70% or more, more preferably 80% or more, and even more preferably. is 90% or more (eg, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more).
  • the first oligonucleotide and the second oligonucleotide may be fully complementary.
  • nucleic acid base sequence of the second oligonucleotide is highly complementary to the nucleic acid base sequence of the first oligonucleotide, it can be designed based on the nucleic acid base sequence of the first oligonucleotide.
  • the nucleic acid base sequence of the second oligonucleotide is preferably complementary to the nucleic acid base sequence of any one of SEQ ID NOs: 3-716 and 718-770, more preferably a nucleic acid selected from nucleic acid base sequence group A Complementary to the base sequence, more preferably complementary to a nucleobase sequence selected from nucleobase sequence group B, still more preferably complementary to a nucleobase sequence selected from nucleobase sequence group C is.
  • the nucleobase sequence of the second oligonucleotide may be complementary to a nucleobase sequence selected from nucleobase sequence group D (preferably D1), or a nucleobase sequence selected from nucleobase sequence group E may be complementary
  • nucleobase sequences possessed by the second oligonucleotide are listed below, and a nucleobase sequence complementary to the nucleobase sequence possessed by the first oligonucleotide is selected.
  • CCUCGGUGCACCCUCUCA SEQ ID NO: 782
  • CUCGGUGCACCCUCUC SEQ ID NO: 783
  • UCGGUGCACCCUCUCA SEQ ID NO: 784
  • UGCACCCUCUCAUUGACCCC SEQ ID NO: 785
  • GCACCCUCUCAUUGACCCCCC SEQ ID NO: 786
  • CACCCUCUCAUUGACC SEQ ID NO: 787
  • CACCCUCUCAUUGACCCC SEQ ID NO: 788
  • ACCCUCUCAUUGACCC SEQ ID NO: 789
  • CCCUCUCAUUGACCCC SEQ ID NO: 790
  • CUCAUUGACCCCCUGGCCUC SEQ ID NO: 791
  • GGUCUCACCUUACCCG SEQ ID NO: 7
  • GGAUAUUUUGAGUCUU SEQ ID NO: 811
  • UGGUACAUCUGUGUUG SEQ ID NO: 812
  • GAACUCUCCCUAACCC SEQ ID NO: 813
  • CCAGCCUCUGCCCUCGG SEQ ID NO: 814
  • GGUUACAAUGUCCCCGG SEQ ID NO: 815
  • CCGAUCUGGAAUAGCUU SEQ ID NO: 816
  • GACUCAUCUUCUGGCC SEQ ID NO: 817
  • CAGUGAAUAUGCCCCG SEQ ID NO: 818
  • CGACCCUAGGGAUUC SEQ ID NO: 819
  • CCUACCCAUGUUCACA SEQ ID NO: 820
  • AUGUAUGCCCCUUGCC SEQ ID NO: 821
  • CUAGUAGUAGCUCUGC SEQ ID NO: 822).
  • the second oligonucleotide is preferably cleaved by RNase H and thus preferably contains at least one ribonucleoside, more preferably at least 4 contiguous ribonucleosides, more preferably 4 to 25 contiguous ribonucleosides. More preferably it contains a nucleoside.
  • the number of nucleosides in the continuous ribonucleoside is preferably 13 to 23, more preferably 15 to 21, even more preferably 16 to 20, particularly preferably 16 or 20. be. Each consecutive nucleoside may be the same or different.
  • the second oligonucleotide is preferably an oligoribonucleotide, more preferably RNA.
  • the nucleobase of the ribonucleoside contained in the oligoribonucleotide in the second oligonucleotide is preferably at least one selected from the group consisting of adenine, guanine, thymine, cytosine and uracil, more preferably adenine and guanine , cytosine and uracil.
  • the ribonucleosides contained in the oligoribonucleotides in the second oligonucleotide are preferably linked by phosphodiester bonds.
  • the second oligonucleotide preferably contains at least one deoxyribonucleoside, more preferably contains at least 4 consecutive deoxyribonucleosides, and preferably contains 4 to 25 consecutive deoxyribonucleosides. more preferred. Each consecutive nucleoside may be the same or different.
  • the second oligonucleotide is preferably an oligodeoxyribonucleotide, more preferably DNA.
  • the deoxyribonucleoside nucleobase contained in the oligodeoxyribonucleotide in the second oligonucleotide is preferably at least one selected from the group consisting of adenine, guanine, thymine, cytosine and uracil, more preferably adenine and guanine , thymine and cytosine.
  • the deoxyribonucleosides contained in the oligodeoxyribonucleotides in the second oligonucleotide are preferably linked by phosphodiester bonds.
  • the second oligonucleotide preferably contains one or more sugar-modified nucleosides on at least one of the 5′-terminal side and the 3′-terminal side of the second oligonucleotide, and the 5′-terminal side and 3′-terminal side of the second oligonucleotide. More preferably, at least one of the 'terminal side contains 1 to 7 sugar-modified nucleosides, and at least one of the 5'-terminal and 3'-terminal sides further preferably contains 2 to 5 sugar-modified nucleosides, Even more preferably, at least one of the 5'-end and 3'-end contains 2 to 3 sugar-modified nucleosides.
  • the nucleoside at the 5'-terminal of the second oligonucleotide is a sugar-modified nucleoside.
  • the nucleosides at the 3'-end of the second oligonucleotide are sugar-modified nucleosides.
  • the second oligonucleotide When the 5' end of the second oligonucleotide is attached to the third oligonucleotide, the second oligonucleotide preferably contains one or more sugar-modified nucleosides at the 3' end of the second oligonucleotide. When the 3' end of the second oligonucleotide is attached to the third oligonucleotide, the second oligonucleotide preferably contains one or more sugar-modified nucleosides at the 5' end of the second oligonucleotide.
  • the second oligonucleotide may or may not contain one or more deoxyribonucleosides or ribonucleosides or both between the plurality of sugar-modified nucleosides on at least one of the 5'-terminal side and the 3'-terminal side. may be included, but preferably not. That is, one or more nucleosides counted from the 5'-end and/or 3'-end of the second oligonucleotide are preferably sugar-modified nucleosides.
  • the internucleoside linkages included in the second oligonucleotide are preferably at least one independently selected from phosphodiester linkages and modified phosphodiester linkages, more preferably independently from phosphodiester linkages and phosphorothioate linkages. At least one selected.
  • the internucleoside linkage contained in the second oligonucleotide preferably contains at least one phosphodiester bond, more preferably 50% or more is a phosphodiester bond, and 75% or more is a phosphodiester bond. More preferably, 80% or more are phosphodiester bonds, even more preferably 90% or more are phosphodiester bonds, and most preferably all are phosphodiester bonds.
  • the second oligonucleotide preferably contains one or more phosphorothioate bonds on at least one of the 5' end side and the 3' end side of the second oligonucleotide, and 1 to 7 phosphorothioate More preferably it contains linkages, more preferably 2-5 phosphorothioate linkages, even more preferably 2-3 phosphorothioate linkages.
  • the second oligonucleotide preferably contains one or more phosphorothioate linkages at the 3' end.
  • the second oligonucleotide When the 3' end of the second oligonucleotide is attached to the third oligonucleotide, the second oligonucleotide preferably contains one or more phosphorothioate linkages at the 5' end.
  • the internucleoside linkage at the 5' end of the second oligonucleotide is a phosphorothioate linkage when the second oligonucleotide contains one or more phosphorothioate linkages at the 5' end of the second oligonucleotide.
  • one or more internucleoside linkages counted from the 5' end of the second oligonucleotide are preferably phosphorothioate linkages.
  • the internucleoside linkage at the 3' end of the second oligonucleotide is a phosphorothioate linkage when the second oligonucleotide contains one or more phosphorothioate linkages at the 3' end of the second oligonucleotide. Furthermore, one or more internucleoside linkages counted from the 3' end of the second oligonucleotide are preferably phosphorothioate linkages.
  • the first and second oligonucleotides may or may not be linked by a third oligonucleotide consisting of 1 to 20 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides. , preferably linked.
  • the third oligonucleotide is a linker that connects the above-mentioned first and second oligonucleotides.
  • the third oligonucleotide links the above-mentioned first oligonucleotide and second oligonucleotide in the order of first oligonucleotide - third oligonucleotide - second oligonucleotide.
  • the third oligonucleotide and the first oligonucleotide are linked by a covalent bond, for example, the terminal nucleosides of the third oligonucleotide and the first oligonucleotide are preferably linked by a phosphodiester bond.
  • the third oligonucleotide and the second oligonucleotide are linked by a covalent bond, for example, the terminal nucleosides of each of the third oligonucleotide and the second oligonucleotide are linked by a phosphodiester bond.
  • the 3'-terminal nucleoside of the oligonucleotide and the 5'-terminal nucleoside of the third oligonucleotide are linked, and the 5'-terminal nucleoside of the second oligonucleotide and the 3'-terminal nucleoside of the third oligonucleotide are linked.
  • the 5'-terminal nucleoside of the first oligonucleotide and the 3'-terminal nucleoside of the third oligonucleotide are linked, and the 3'-terminal nucleoside of the second oligonucleotide and the 5'-terminal nucleoside of the third oligonucleotide are linked.
  • the third oligonucleotide consists of 1-20 nucleosides independently selected from deoxyribonucleosides, ribonucleosides and sugar-modified nucleosides.
  • the nucleosides comprised in the third oligonucleotide are preferably independently selected from deoxyribonucleosides and ribonucleosides, more preferably independently selected from ribonucleosides.
  • the number of nucleosides contained in the third oligonucleotide is 1 to 20, preferably 2 to 15, more preferably 3 to 10, still more preferably 3 to 7, and further The number is more preferably 4 or 5, and particularly preferably 4.
  • the third oligonucleotide is preferably an oligonucleotide linked by phosphodiester bonds.
  • the third oligonucleotide is, for example, an oligodeoxyribonucleotide or oligoribonucleotide, more preferably DNA or RNA, even more preferably RNA.
  • the deoxyribonucleoside nucleobase contained in the oligodeoxyribonucleotide in the third oligonucleotide is preferably at least one selected from the group consisting of adenine, guanine, thymine, cytosine and uracil, more preferably adenine, At least one selected from the group consisting of guanine, thymine and cytosine.
  • the deoxyribonucleosides contained in the oligodeoxyribonucleotides in the third oligonucleotide are preferably linked by phosphodiester bonds.
  • the nucleobase of the ribonucleoside contained in the oligoribonucleotide in the third oligonucleotide is preferably at least one selected from the group consisting of adenine, guanine, thymine, cytosine and uracil, more preferably adenine, At least one selected from the group consisting of guanine, cytosine and uracil.
  • the ribonucleosides contained in the oligodeoxyribonucleotides in the third oligonucleotide are preferably linked by phosphodiester bonds.
  • the third oligonucleotide may or may not contain a partially self-complementary sequence within the third oligonucleotide, but the third oligonucleotide contains It preferably does not contain partially self-complementary sequences.
  • examples of such oligonucleotides include (N)n (where N is independently adenosine, uridine, cytidine, guanosine, 2'-deoxyadenosine, thymidine, 2'-deoxycytidine, or 2′-deoxyguanosine, and n is an integer (repeating number) of 1 to 20.).
  • n is preferably 2 to 15, more preferably 3 to 10, still more preferably 3 to 7, still more preferably 4 or 5, particularly preferably 4 is.
  • N is more preferably each independently adenosine, uridine, cytidine or guanosine, particularly preferably adenosine.
  • the single-stranded oligonucleotides of the invention wherein the first and second oligonucleotides are linked by a third oligonucleotide, are preferably , 779, 780, 781.
  • Single-stranded oligonucleotides of the invention more preferably comprise at least 30 contiguous nucleobases of any one nucleobase sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 772, 773, 774, 775, 776. has an array.
  • the single-stranded oligonucleotide of the present invention more preferably has a nucleobase sequence containing any one nucleobase sequence selected from the group consisting of 772, 773, 774, 775, and 776, and even more preferably , 772, 773, 774, 775, and 776.
  • Single-stranded oligonucleotides of the present invention particularly preferably have any one nucleobase sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs:772, 773, 774, 775, and 776.
  • nucleobase sequence represented by any of SEQ ID NOs: 771 to 775 the 1st to 16th nucleobases counted from the 5′ end side correspond to the nucleobases of the second oligonucleotide, and the 17th to 20th nucleobases
  • the nucleobases correspond to the nucleobases of the third oligonucleotide, of which nucleobases 21-36 correspond to the nucleobases of the first oligonucleotide.
  • nucleobase sequence represented by SEQ ID NO: 776 or 777 the 1st to 18th nucleobases counted from the 5' end side correspond to the nucleobases of the second oligonucleotide, and the 19th to 22nd nucleobases are , correspond to the nucleobases of the third oligonucleotide, and nucleobases 23-40 thereof correspond to the nucleobases of the first oligonucleotide.
  • nucleobase sequences represented by SEQ ID NOS: 778-781 the 1st to 20th nucleobases counted from the 5' end side correspond to the nucleobases of the second oligonucleotide, and the 21st to 24th nucleobases are , correspond to the nucleobases of the third oligonucleotide, and nucleobases 25-44 thereof correspond to the nucleobases of the first oligonucleotide.
  • a functional molecule may be bound directly or indirectly to the first oligonucleotide or second oligonucleotide that constitutes the ASO derivative of the present invention.
  • the binding between the functional molecule and the first oligonucleotide or the second oligonucleotide may be direct or indirect via another substance. is preferably bound. From the viewpoint of high stability of the bond, it is more preferable to bond directly by covalent bond or to bond by covalent bond via a linker (linking group).
  • the functional molecule When the functional molecule is covalently bound to the first oligonucleotide or the second oligonucleotide, the functional molecule is attached directly to the 3′ end or 5′ end of the first oligonucleotide or the second oligonucleotide. or indirectly, more preferably directly or indirectly to the 3' or 5' end of the second oligonucleotide.
  • the binding between the linker or functional molecule and the terminal nucleoside of the first oligonucleotide or the second oligonucleotide is selected according to the functional molecule.
  • the linker or functional molecule and the terminal nucleoside of the first oligonucleotide or the second oligonucleotide are preferably linked by a phosphodiester bond or a modified phosphodiester bond, and are linked by a phosphodiester bond. is more preferable.
  • the linker or functional molecule is directly linked to the 3′-position oxygen atom of the 3′-terminal nucleoside of the first oligonucleotide or the second oligonucleotide or the 5′-position oxygen atom of the 5′-terminal nucleoside.
  • the structure of the "functional molecule” is not particularly limited, and by binding it to the oligonucleotide, the ASO derivative can have the desired function. Desired functions include labeling functions, purification functions and delivery functions to target sites. Examples of molecules that impart a labeling function include compounds such as fluorescent proteins and luciferase. Examples of molecules that confer a purification function include compounds such as biotin, avidin, His-tag peptides, GST-tag peptides, FLAG-tag peptides.
  • functional molecules include: It is preferred that a molecule having the function of delivering the ASO derivative to the target site is bound. Molecules having the delivery function are described, for example, in European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics, 2016, 107, pp 321-340, Advanced Drug Delivery Reviews, 2016, 104, pp 78-92, Expert Opinion on Drug Delivery, 2014, 11, See pp 791-822, etc. For example, functional molecules that can efficiently deliver the ASO derivative of the present invention to the brain, spinal cord, etc.
  • Lipids include cholesterol; fat-soluble vitamins such as vitamin E (tocopherols and tocotrienols), vitamin A, vitamin D, and vitamin K; fatty acids; intermediate metabolites such as acylcarnitine and acyl CoA; derivatives and the like.
  • a sugar derivative that interacts with an asialoglycoprotein receptor may be used as a functional molecule capable of delivering an ASO derivative to the liver with high specificity.
  • the "asialoglycoprotein receptor” exists on the surface of liver cells, and has the action of recognizing the galactose residue of asialoglycoprotein and taking that molecule into the cell and degrading it.
  • the "sugar derivative that interacts with the asialoglycoprotein receptor” is preferably a compound that has a structure similar to that of a galactose residue and is taken up into cells by interacting with the asialoglycoprotein receptor. acetylgalactosamine) derivatives, galactose derivatives and lactose derivatives.
  • Functional molecules capable of highly specific and efficient delivery of ASO derivatives to the organ by interacting with various proteins on the cell surface of each organ include receptor ligands, antibodies, and peptides or proteins of fragments thereof. is mentioned. Even if the ASO derivative is partially degraded before the functional molecule-bound ASO derivative is delivered to an organ such as the liver or to the target site, the oligonucleotide or oligonucleotide complex containing the first oligonucleotide is It is sufficient if the expression of the ATN1 gene can be effectively controlled by delivering it to an organ such as the liver or a target site.
  • the linker via the bond between the functional molecule and the oligonucleotide that constitutes the ASO derivative is sufficient if the ASO and the functional molecule contained in the oligonucleotide can exhibit their respective functions. is not particularly limited as long as it is a linker that stably binds.
  • the linker include a group derived from an oligonucleotide having 1 to 20 nucleosides, a group derived from a polypeptide having 1 to 20 amino acids, a C 1-20 alkylene group, a C 2-20 alkenylene group, and the like. mentioned.
  • the group derived from an oligonucleotide having 1 to 20 nucleosides is a hydrogen atom from the 3' end and 5' end of an oligonucleotide having 1 to 20 nucleosides (a nucleoside when the number of nucleosides is 1), It is a divalent group from which a hydroxy group or the like has been removed.
  • groups derived from oligonucleotides having 1 to 20 nucleosides see, for example, International Publication No. 2017/053995.
  • International Publication No. 2017/053995 describes, for example, a 3-base linker with a TCA motif, a 1-5 base linker without a TCA motif, and the like.
  • the group derived from a polypeptide having 1 to 20 amino acids is selected from polypeptides having 1 to 20 amino acids (amino acids when the number of amino acids is 1), hydroxy, hydrogen atoms, amino, etc. 2 It is a divalent group with one group removed.
  • the ASO derivatives of the invention may have a prodrug moiety.
  • a prodrug is a derivative of a pharmaceutical compound having groups that are chemically or metabolically degradable, and which, upon solvolysis or in vivo degradation under physiological conditions, render the pharmacologically active pharmaceutical compound is a compound that induces Methods for selecting and manufacturing suitable prodrug derivatives are described, for example, in Design of Prodrugs (Elsevier, Amsterdam, 1985).
  • a prodrug moiety such as an acyloxy derivative prepared by reacting the hydroxy group of ASO (or a compound containing ASO) with a suitable acyl halide, a suitable acid anhydride or a suitable halogenated alkyloxycarbonyl compound.
  • the ASO derivatives of the present invention in addition to existing via their tautomerism and geometric isomerism, also include those existing as mixtures thereof or mixtures of their respective isomers.
  • an asymmetric center exists, or when an asymmetric center is generated as a result of isomerization, it also includes those existing as respective optical isomers and mixtures of arbitrary ratios.
  • diastereomers due to each optical isomerism also exist.
  • the present invention also includes all these types in any proportion. Optically active forms can also be obtained by well-known methods for this purpose.
  • the ASO derivative of the present invention contains a modified phosphodiester bond (e.g., a phosphorothioate bond) and the phosphorus atom becomes an asymmetric atom, then the stereochemistry of the oligonucleotide and the stereochemistry of the phosphorus atom can be controlled. Any form of oligonucleotide in which the is not controlled is included within the scope of the invention.
  • the ASO derivative of the present invention or a medically acceptable salt thereof can exist as any crystal form depending on the production conditions, and can exist as any hydrate. and mixtures thereof are also included within the scope of the present invention. It may also exist as solvates with organic solvents such as acetone, ethanol, 1-propanol, 2-propanol, etc., and all of these forms are included within the scope of the present invention.
  • the ASO derivatives of the present invention can be converted into pharmaceutically acceptable salts or liberated from salts formed, if desired.
  • pharmacologically acceptable salts of compounds containing the ASO derivative of the present invention include alkali metals (lithium, sodium, potassium, etc.), alkaline earth metals (calcium, etc.), magnesium, ammonium, organic bases (triethylamine, trimethylamine, etc.), amino acids (glycine, lysine, glutamic acid, etc.), inorganic acids (hydrochloric acid, hydrobromic acid, phosphoric acid, sulfuric acid, etc.), or organic acids (acetic acid, citric acid, maleic acid, fumaric acid, tartaric acid, benzenesulfonic acid , methanesulfonic acid, p-toluenesulfonic acid, etc.).
  • a particularly preferred pharmaceutically acceptable salt is the sodium salt.
  • the ASO derivative of the present invention can be prepared by a person skilled in the art by appropriately selecting a known method.
  • a person skilled in the art can design the nucleoside sequence of ASO based on the nucleoside sequence information of the target RNA, and use a commercially available automatic nucleic acid synthesizer (manufactured by Applied Biosystems, Beckman, Genedesign, etc.). can be synthesized by Alternatively, it can be synthesized by a reaction using an enzyme.
  • the enzymes include, but are not limited to, polymerases, ligases, restriction enzymes, and the like.
  • the method for producing a single-stranded oligonucleotide or a double-stranded oligonucleotide complex can include a step of extending the nucleoside chain at the 3' end or the 5' end.
  • the ASO derivative of the present invention can be prepared by purifying the obtained oligonucleotide by reversed-phase column chromatography or the like.
  • the double-stranded oligonucleotide complex of the present invention can be prepared by synthesizing the first oligonucleotide and the second oligonucleotide separately according to the above, mixing equal amounts, and intermolecularly hybridizing. Intermolecular hybridization of the double-stranded oligonucleotide complex can be performed by adjusting the concentration, heating and/or cooling, and/or adding salt, as necessary.
  • the single-stranded oligonucleotide of the present invention can be prepared by spontaneous intramolecular hybridization when synthesized according to the above.
  • Single-stranded oligonucleotides of the present invention can hybridize intramolecularly or intermolecularly by adjusting the concentration, heating and/or cooling, and/or adding salt as necessary.
  • the ASO derivatives (single-stranded oligonucleotides and double-stranded oligonucleotide complexes) of the present invention or medically acceptable salts thereof can effectively inhibit the expression of the ATN1 gene.
  • Diseases that can be treated, prevented, or ameliorated by nucleic acid pharmaceuticals using the ASO derivative of the present invention or a medically acceptable salt thereof are not particularly limited as long as the ATN1 gene expression inhibitory action is effective. dentate nucleus pallidus louis body atrophy.
  • the present invention can provide a composition containing the ASO derivative as an active ingredient, for example, for inhibiting ATN1 gene expression by antisense effect.
  • the ASO derivative (single-stranded oligonucleotide and double-stranded oligonucleotide complex) of the present invention is effective for inhibiting ATN1 gene expression in dentate nucleus pallidus Louis body atrophy, which contains the ASO derivative (single-stranded oligonucleotide and double-stranded oligonucleotide complex) as an active ingredient.
  • Pharmaceutical compositions for treating, preventing, and/or ameliorating disease can also be provided.
  • a pharmaceutical composition containing the ASO derivative of the present invention or a medically acceptable salt thereof can be formulated by a known pharmaceutical method.
  • Turbidities, elixirs, emulsions, liniments, ointments, plasters, poultices, transdermal preparations, lotions, inhalants, aerosols, suppositories, etc. can be administered enterally (orally, etc.) or non- It can be used enterally.
  • pharmacologically acceptable carriers specifically sterile water, physiological saline, vegetable oils, solvents, bases, emulsifiers, suspending agents, surfactants, pH adjusters , stabilizers, flavoring agents, fragrances, excipients, vehicles, preservatives, binders, diluents, tonicity agents, soothing agents, bulking agents, disintegrants, buffers, coating agents, lubricants, Coloring agents, sweetening agents, thickening agents, flavoring agents, solubilizing agents, other additives, and the like can be appropriately combined.
  • the dosage form of the composition containing the ASO derivative of the present invention or a medically acceptable salt thereof is not particularly limited, and includes enteral (oral, etc.) or parenteral administration. More preferably, intravenous administration, intraarterial administration, intraperitoneal administration, subcutaneous administration, intradermal administration, intratracheal administration, rectal administration, intramuscular administration, intrathecal administration, intracerebroventricular administration, intranasal administration and intravitreal administration. Intrathecal administration, intracerebroventricular administration, and intranasal administration are more preferred, and intrathecal administration is particularly preferred.
  • a formulation that contains the ASO derivative of the present invention or a medically acceptable salt thereof and enables intrathecal administration can be produced by a known conventional method.
  • the ASO derivative of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof and additives such as a buffer and a tonicity agent are completely dissolved in water for injection, and then filtered and sterilized.
  • a pre-filled syringe formulation is obtained by filling a sterilized syringe with the preparation solution, a preparation for injection is obtained by filling a sterilized vial, and a ready-to-use preparation is obtained by filling a sterilized vial and freeze-drying it. can be manufactured.
  • Final sterilization such as autoclaving or gamma irradiation may be performed instead of filtration sterilization.
  • compositions containing the ASO derivatives of the present invention or pharmaceutically acceptable salts thereof can be treated, prevented and/or ameliorated by compositions containing the ASO derivatives of the present invention or pharmaceutically acceptable salts thereof.
  • ASO derivatives of the present invention or pharmaceutically acceptable salts thereof.
  • mammals for example, but not limited to, humans, cows, sheep, goats, horses, dogs, cats, guinea pigs, rats, rabbits, chimpanzees or other bovines.
  • ovine, equine, canine, feline, mouse and other rodent species is particularly preferably human.
  • the dosage or ingestion is preferably an effective amount.
  • Effective amount means an amount of a compound sufficient to produce the desired pharmacological effect in an individual in need of the drug, and to treat, prevent and/or ameliorate the disease, age, weight, symptoms, health status of the individual. , varies depending on the formulation of the composition, etc., and is selected as appropriate.
  • the dosage or intake is preferably 0.0001 mg/kg/day to 100 mg/kg/day in terms of ASO.
  • a method for regulating ATN1 gene expression comprising the step of contacting a cell with the ASO derivative of the present invention or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • a method for regulating ATN1 gene expression in a mammal comprising the step of administering to said mammal a pharmaceutical composition comprising the ASO derivative of the present invention or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
  • Antisense oligonucleotides (compounds represented by chemical structures corresponding to compound numbers) listed in Tables 1 to 19 were synthesized using an automatic nucleic acid synthesizer nS-8II (manufactured by Genedesign) or 3900 DNA Synthesizer (manufactured by Applied Biosystems). ) was prepared using Note that the title lines of Tables 2 to 19 are the same as those of Table 1, so they may be omitted.
  • SEQ1 START means "SEQ ID NO: 1 start site"
  • SEQ ID NO: 1 start site the most 5' site targeted by an antisense oligonucleotide in the human ATN1 mRNA sequence (SEQ ID NO: 1).
  • the position numbers of the side nucleosides are indicated.
  • SEQ1 END means "SEQ ID NO: 1 end site” and indicates the position number of the 3'-most nucleoside targeted by the antisense oligonucleotide in the human ATN1 mRNA sequence (SEQ ID NO: 1).
  • SEQ2 START means "SEQ ID NO: 2 start site", the position number of the 5'-most nucleoside targeted by the antisense oligonucleotide in the sequence of human ATN1 pre-mRNA (SEQ ID NO: 2) indicates "SEQ2 END” means "SEQ ID NO: 2 termination site” and indicates the position number of the 3'-most nucleoside targeted by the antisense oligonucleotide in the human ATN1 pre-mRNA sequence (SEQ ID NO: 2). show.
  • Each antisense oligonucleotide targets either the human ATN1 mRNA, designated herein as SEQ ID NO:1, and/or the human ATN1 pre-mRNA, designated herein as SEQ ID NO:2 or SEQ ID NO:717.
  • a "-" indicates that the antisense oligonucleotide does not target that mRNA or pre-mRNA sequence with 100% complementarity.
  • SEQ No indicates the sequence number
  • BASE SEQUENCE indicates the nucleic acid base sequence of the antisense oligonucleotide. Note that the title lines of Tables 21 to 38 are the same as those of Table 20, so they may be omitted.
  • SEQ717 START means “SEQ ID NO: 717 start site”
  • SEQ ID NO: 717 indicates
  • SEQ717 END means "SEQ ID NO: 717 end site” and refers to the position number of the 3'-most nucleoside targeted by the antisense oligonucleotide in the human ATN1 pre-mRNA sequence (SEQ ID NO: 717).
  • SEQ ID NO:2 corresponds to position numbers 4451 to 18401 of the nucleobase of SEQ ID NO:717.
  • Antisense Suppression of Human ATN1 in GM13716 Cells [DRPLA Patient-Derived Cells] The effect of antisense oligonucleotides targeting the ATN1 nucleic acid, which is the causative gene of DRPLA, on ATN1 RNA transcripts was tested in vitro. .
  • Antisense oligonucleotides (ASO Production Example 1) were added to GM13716 cells cultured at a density of 7,500 cells/well using Lipofectamin (registered trademark) RNAiMAX Transfection Reagent (Thermo Fisher Scientific) to a final concentration of 100 nM. ) was added.
  • ASO derivative production example 1 Single-stranded oligonucleotides (compounds represented by chemical structures corresponding to compound numbers) listed in Table 50 were prepared using an automatic nucleic acid synthesizer nS-8II (manufactured by Genedesign). Intramolecular hybridization of each single-stranded oligonucleotide was also confirmed by non-denaturing polyacridamide gel electrophoresis.
  • a single-stranded DNA size marker (manufactured by Gene Design) containing single-stranded DNA having 15, 20, 30, 40, 50, 60 and 80 nucleotides as a marker , 17, 21, 25 and 29 base pairs of double-stranded RNA size markers (Genedesign) were used to confirm a single band for each single-stranded oligonucleotide.
  • each single-stranded oligonucleotide shown in Table 50 the compound number of the antisense oligonucleotide contained in the first oligonucleotide, and the first oligonucleotide, the second oligonucleotide and the third that constitute the single-stranded oligonucleotide
  • the nucleoside positions of the oligonucleotides are shown in Table 51.
  • Table 52 shows the sequence number and nucleic acid base sequence corresponding to each single-stranded oligonucleotide shown in Table 50.
  • DRPLA model (Q129 transgenic) mouse (4 weeks old, Sato T, et al. Human Molecular Genetics, 2009, 18, 723-736, Niigata University Brain Research Institute, Department of Molecular Neurological Disease Resource Analysis Taisuke Kato The fertilized eggs were obtained from Associate Professor Nim).
  • the Q129 transgenic mouse has integrated the human ATN1 gene, which carries 129 CAG repeats.
  • Results are presented in Table 53 as percent expression of human ATN1 relative to saline (vehicle)-treated animals.
  • dose indicates dosage
  • Cerebrum indicates dosage
  • Cerebellum indicates dosage
  • Pons indicates Medulla
  • Spinal cord indicates cerebrum, cerebellum, pons, medulla oblongata and spinal cord, respectively.
  • administration tests of L-0561 in Table 53 8-week-old Q129 transgenic mice were used.
  • ASO derivative production example 2 Single-stranded oligonucleotides (compounds represented by chemical structures corresponding to compound numbers) listed in Table 54 were prepared using an automatic nucleic acid synthesizer nS-8II (manufactured by Genedesign). Intramolecular hybridization of each single-stranded oligonucleotide was also confirmed by non-denaturing polyacridamide gel electrophoresis.
  • a single-stranded DNA size marker (manufactured by Gene Design) containing single-stranded DNA having 15, 20, 30, 40, 50, 60 and 80 nucleotides as a marker , 17, 21, 25 and 29 base pairs of double-stranded RNA size markers (Genedesign) were used to confirm a single band for each single-stranded oligonucleotide.
  • each single-stranded oligonucleotide shown in Table 54 the compound number of the antisense oligonucleotide contained in the first oligonucleotide, and the first oligonucleotide, the second oligonucleotide and the third that constitute the single-stranded oligonucleotide
  • the nucleoside positions of the oligonucleotides are shown in Table 55.
  • Table 56 shows the sequence number and nucleic acid base sequence corresponding to each single-stranded oligonucleotide shown in Table 54.
  • Antisense oligonucleotides (compounds represented by chemical structures corresponding to compound numbers) listed in Table 57 were prepared using an automatic nucleic acid synthesizer nS-8II (manufactured by Genedesign) or 3900 DNA Synthesizer (manufactured by Applied Biosystems). prepared using
  • Table 58 shows the position targeted by each antisense oligonucleotide shown in Table 57 in the sequence of human ATN1 mRNA or pre-mRNA, and the SEQ ID NO and nucleobase sequence corresponding to each antisense oligonucleotide.
  • the meaning of each column in the sequence notation of Table 58 is the same as in Tables 20-38.
  • a single-stranded DNA size marker (manufactured by Gene Design) containing single-stranded DNA having 15, 20, 30, 40, 50, 60 and 80 nucleotides as a marker , 17, 21, 25 and 29 base pairs of double-stranded RNA size markers (Genedesign) were used to confirm a single band for each single-stranded oligonucleotide.
  • each single-stranded oligonucleotide shown in Table 60 the compound number of the antisense oligonucleotide contained in the first oligonucleotide, and the first oligonucleotide, the second oligonucleotide and the third that constitute the single-stranded oligonucleotide
  • the nucleoside positions of the oligonucleotides are shown in Table 61.
  • Table 62 shows the sequence number and nucleic acid base sequence corresponding to each single-stranded oligonucleotide shown in Table 60.
  • ASO derivative production example 4 The single-stranded oligonucleotides (compounds represented by the chemical structures corresponding to the compound numbers) listed in Table 64 were prepared using an automatic nucleic acid synthesizer nS-8II (Gene Design Inc.) in the same manner as in ASO Derivative Production Examples 1-3. can be prepared using Moreover, intramolecular hybridization of each single-stranded oligonucleotide can be confirmed by non-denaturing polyacridamide gel electrophoresis.
  • a single-stranded DNA size marker (manufactured by Gene Design) containing single-stranded DNA having 15, 20, 30, 40, 50, 60 and 80 nucleotides as a marker
  • double-stranded RNA size markers with 17, 21, 25 and 29 base pairs (manufactured by Genedesign)
  • each single-stranded oligonucleotide shown in Table 64 the compound number of the antisense oligonucleotide contained in the first oligonucleotide, and the first oligonucleotide, the second oligonucleotide and the third that constitute the single-stranded oligonucleotide
  • the nucleoside positions of the oligonucleotides are shown in Table 65.
  • Table 66 shows the sequence number and nucleic acid base sequence corresponding to each single-stranded oligonucleotide shown in Table 64.
  • ASO derivatives of the present invention are preferred.
  • the ASO derivative of the present invention was intracerebroventricularly administered once at a dose of 10 to 63 ⁇ g/body to 2-day-old male DRPLA model (Q129 transgenic) mice.
  • the mice were trained from the day before the measurement start date (3 weeks old) in order to acclimatize the mice to the test.
  • the rotation speed of Rota-Rod is accelerated from 3.5 rpm to 35 rpm over 300 seconds, and the time (seconds) until the mouse falls off the Rota-Rod or hangs on the Rota-Rod and completely rotates is measured. did.
  • a cutoff of 600 seconds was used, and the longest walking time among the three times was evaluated. The walking stick recorded the time required to reach the goal.
  • the cut-off time was set to 90 seconds, and the fastest time to reach the goal among the three times was evaluated.
  • the results are presented in Figures 1-5.
  • “Latency to fall” means the time measured using the Rota-Rod
  • “Time to traverse” is the earliest time to reach the goal evaluated using a walking stick.
  • the safety of the ASO derivative of the present invention can be evaluated by the methods of Evaluation Examples 10 and 11. ASO derivatives with high safety are preferred.
  • a microarray was performed at this concentration, and genes whose expression was suppressed by a factor of two or more in the ASO derivative of the present invention were extracted. From the obtained in silico analysis results and comprehensive gene expression analysis results, off-target genes were extracted and risk assessment was performed. ASO derivatives with a small number of off-target genes extracted in this test and which did not alter toxicity-related genes can be evaluated as highly safe.
  • the ASO derivative of the present invention inhibits the expression of the ATN1 gene, it is useful for the treatment, prevention, and/or amelioration of diseases for which inhibition of the ATN1 gene expression is effective, particularly dentate nucleus pallidus louis body atrophy. is.

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Abstract

ATN1の遺伝子発現を制御し、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症を治療できるアンチセンスオリゴヌクレオチド誘導体として、 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとが、第三オリゴヌクレオチドよって連結されている一本鎖オリゴヌクレオチドであって、 第一オリゴヌクレオチド及び第二オリゴヌクレオチドは、それぞれ独立してデオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、 第一オリゴヌクレオチドは、Atrophin1 mRNA若しくはpre-mRNAとのハイブリダイズを可能にする配列を含み、少なくとも1つの糖修飾ヌクレオシドを含み、 第二オリゴヌクレオチドは、第一オリゴヌクレオチドの少なくとも一部とのハイブリダイズを可能とする配列を含み、 第三オリゴヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される1~20個のヌクレオシドからなり、 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドがハイブリダイズする一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩 を提供する。

Description

ATN1のアンチセンスオリゴヌクレオチド誘導体
 本発明は、ATN1のアンチセンスオリゴヌクレオチド誘導体に関する。
 歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症(DRPLA)は、小脳歯状核、赤核、淡蒼球、ルイ体に病変を有する常染色体顕性遺伝性の脊髄小脳変性症で、ATN1遺伝子のCAGリピートの異常伸長が原因である。DRPLAは、小児では運動失調、ミオクローヌス、てんかん、進行性の知能低下を、成人では運動失調、舞踏アテトーゼ、認知症や性格変化をきたす進行性の疾患である。発症年齢は1歳未満から70代まで幅広く、その平均発症年齢は31.5歳である。臨床症状の重篤度はCAGリピート数と相関することが知られている(例えば、非特許文献1参照)。
 ATN1遺伝子の発現を阻害する物質としては、CAGリピートに対するRNaseH非依存のアンチセンスオリゴヌクレオチド(例えば、非特許文献2参照)及び、ss-siRNA(例えば、特許文献1、非特許文献3参照)等が報告されており、リピートが異常伸長したアレルを選択的に阻害することが示されている。また、モルホリノ核酸あるいはRNaseH依存のLNAギャップマーが、ATN1遺伝子の発現を阻害することが報告されているが、その配列や阻害の程度は記載されていない(例えば、非特許文献4参照)。
 また、アンチセンスオリゴヌクレオチドの機能を高めるための改良技術として、アンチセンスオリゴヌクレオチドと相補のRNA鎖等を含むヘテロ二本鎖核酸複合体や(例えば、特許文献2参照)、その一本鎖化核酸が報告されている(例えば、特許文献3参照)。
国際公開第2015/017675号 国際公開第2013/089283号 国際公開第2017/131124号
Movement Disorders, 2010 Aug 15, 25(11), pp 1694-700 PLoS One, 2011, 6(9), e24308. Biochemistry, 2014 Jul 22, 53(28), pp 4510-8 第38回日本神経科学学会 2015 2P107
 本発明は、ATN1遺伝子の発現を阻害する新規なアンチセンスオリゴヌクレオチド誘導体を提供することを目的とする。
 本発明者らは、ATN1へのアンチセンス効果を有する化合物を見出すべく鋭意検討したところ、本発明化合物が優れたATN1遺伝子の発現阻害作用を有することを見出し、本発明を完成するに至った。
 すなわち本発明は以下を特徴とするものである。
1.
 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとが、第三オリゴヌクレオチドによって連結されている一本鎖オリゴヌクレオチドであって、
 第一オリゴヌクレオチドは、Atrophin1 mRNA若しくはpre-mRNAとのハイブリダイズを可能にする配列を含み、
 デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、
 少なくとも1つの糖修飾ヌクレオシドを含み、
 第二オリゴヌクレオチドは、第一オリゴヌクレオチドの少なくとも一部とのハイブリダイズを可能とする配列を含み、
 デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、
 第三オリゴヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される1~20個のヌクレオシドからなり、
 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドがハイブリダイズする一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
2.
 第三オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシドが、ホスホジエステル結合で互いに連結されている、1.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
3.
 第三オリゴヌクレオチドは、DNA又はRNAである、1.又は2.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
4.
 第三オリゴヌクレオチドの3’末端は、第一オリゴヌクレオチドの5’末端と結合し、
 第三オリゴヌクレオチドの5’末端は、第二オリゴヌクレオチドの3’末端と結合している、1.から3.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
5.
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号3~716及び718~770のいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、1.から4.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
6.
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号3~716及び718~770のいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する、1.から5.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
7.
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号3~716及び718~770のいずれか1つの核酸塩基配列を有する、1.から6.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
8.
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表わされるAtrophin1 mRNAの核酸塩基の位置番号59~104、109~133、173~192、207~272、300~319、353~372、419~434、458~509、523~559、561~618、626~685、766~785、787~819、838~855、880~922、924~943、970~989、994~1039、1055~1074、1079~1098、1157~1176、1196~1223、1310~1329、1339~1399、1423~1442、1614~1633、1650~1670、1806~1833、1844~1865、1896~1915、1924~1992、2023~2042、2058~2081、2103~2124、2398~2417、2480~2520、2526~2562、2568~2587、2853~2872、2876~2923、2931~2950、2972~3016、3072~3099、3109~3128、3192~3211、3267~3290、3333~3379、3419~3557、3765~3784、3789~3853、3888~3926、4022~4062、4118~4139、4141~4156、4218~4236、及び4266~4281で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的な8~30個のヌクレオシドからなり、配列番号1の前記選択された核酸塩基配列内の一部と少なくとも80%相補的である、1.から4.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
9.
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表わされるAtrophin1 mRNAの核酸塩基の位置番号3451~3475、及び3490~3505で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的な8~30個のヌクレオシドからなり、配列番号1の前記選択された核酸塩基配列内の一部と少なくとも80%相補的である、8.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
10.
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表わされるAtrophin1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号383~398、986~1001、1004~1019、1378~1393、1398~1413、1853~1868、1971~1986、2189~2204、2522~2537、2562~2577、3662~3677、3987~4002、4217~4232、4266~4281、4335~4350、4360~4375、4477~4492、4562~4577、4636~4651、4687~4702、4734~4749、4840~4855、5536~5563、5568~5592、5632~5651、5666~5715、5906~5925、5959~5978、6176~6191、6215~6266、6963~6978、7248~7284、7286~7343、7351-7410、7491~7510、7512~7544、7563~7580、7605~7647、7649~7668、7695~7714、7719~7764、7780~7799、7804~7823、7882~7901、7921~7948、8035~8054、8064~8124、8148~8167、8339~8358、8375~8395、8531~8558、8569~8590、8621~8640、8649~8717、8748~8767、8783~8806、8828~8849、9123~9142、9205~9245、9336~9351、9534~9570、9576~9595、9923~9938、10001~10016、10056~10071、10274~10293、10297~10344、10352~10371、10393~10437、10493~10520、10530~10549、10613~10632、10688~10711、10754~10800、10840~10865、12508~12680、12723~12738、13454~13518、13553~13591、13687~13727、13783~13804、13806~13821、13883~13901、及び13931~13946で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的な8~30個のヌクレオシドからなり、配列番号2の前記選択された核酸塩基配列内の一部と少なくとも80%相補的である、1.から4.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
11.
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表わされるAtrophin1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12574~12598、及び12613~12628で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的な8~30個のヌクレオシドからなり、配列番号2の前記選択された核酸塩基配列内の一部と少なくとも80%相補的である、10.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
12.
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号3、4、9、10、12、13、18、19、20、21、26、29、34、37、38、39、40、44、45、46、47、48、49、50、52、55、59、60、61、62、63、66、67、68、69、70、72、74、75、78、79、82、83、84、85、86、87、88、89、91、92、94、95、97、99、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、126、127、128、131、132、133、137、138、139、148、151、152、153、154、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、238、239、240、241、242、247、248、253、254、255、256、258、259、263、264、274、276、277、278、280、281、283、286、287、288、291、292、293、294、296、297、298、299、300、302、303、304、305、306、307、309、310、311、313、314、315、316、317、319、320、321、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、335、337、338、339、340、341、342、344、345、346、347、348、349、350、355、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、369、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、382、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、494、513、515、533、534、544、551、552、554、566、574、582、585、586、589、592、593、595、596、638、639、642、644、661、662、663、664、665、666、667、668、669,670、671、672、673、674、675、676、677、696、697、699、706、713、715、716、722、723、724、727、728、729、730、731、732、733、734、735、736、737、738、739、740、741、742、743、744、745、746,748、750、751、752、753、754、755、756、757、758、759、760、761、762、763、764、765、766、767、768、769及び770からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する12~30個のヌクレオシドからなる、1.から4.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
13.
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号209、215、216、221、及び715からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16~20個のヌクレオシドからなる、12.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
14.
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号47、105、174、214、240、585及び586からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16~20個のヌクレオシドからなる、12.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
15.
 第一オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含む、1.から14.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
16.
 第一オリゴヌクレオチドは、2’修飾ヌクレオシド及び2’-4’-架橋ヌクレオシドからなる群から選択される少なくとも1つのヌクレオシドを含む、1.から15.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
17.
 前記2’-4’-架橋ヌクレオシドは、LNA、ENA、cEt、AmNA、scpBNA及びGuNAからなる群から選択される少なくとも1つであり、
 前記2’修飾ヌクレオシドは、2’-O-MCEヌクレオシド、2’-O-MOEヌクレオシド、2’-O-NMAヌクレオシド、及び2’-O-Meヌクレオシドからなる群から選択される少なくとも1つである、16.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
18.
 前記2’-4’-架橋ヌクレオシドは、LNAである、17.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
19.
 前記2’修飾ヌクレオシドは、2’-O-MCEヌクレオシド及び2’-O-MOEヌクレオシドからなる群から選択される少なくとも1つである、17.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
20.
 第一オリゴヌクレオチドは、ギャップセグメント、5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントを含み、
 前記ギャップセグメントは、少なくとも2つのデオキシリボヌクレオシドを含み、ギャップセグメントの5’末端及び3’末端は、デオキシリボヌクレオシドであり、
 前記5’ウィングセグメントの3’末端のヌクレオシドは、糖修飾ヌクレオシドであり、かつ前記ギャップセグメントの5’末端と連結し、
 前記3’ウィングセグメントの5’末端のヌクレオシドは、糖修飾ヌクレオシドであり、かつ前記ギャップセグメントの3’末端と連結している、1.から19.のいずれか一つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
21.
 前記ギャップセグメントは、5~16個のデオキシリボヌクレオシドからなり、
 前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して、LNA、2’-O-MCEヌクレオシド及び2’-O-MOEヌクレオシドからなる群から独立して選択される1~7個の糖修飾ヌクレオシドからなり、
 それぞれのウィングセグメントは、少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含み、
 ギャップセグメント及びそれぞれのウィングセグメントのそれぞれのシトシンは、5-メチルシトシンへ置き換えられている、20.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
22.
 前記ギャップセグメントは、8~12個のデオキシリボヌクレオシドからなり、
 前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して、LNA及び2’-O-MCEヌクレオシドからなる群から独立して選択される2~5個の糖修飾ヌクレオシドからなり、少なくとも1つの2’-O-MCEヌクレオシドを含み、
 ギャップセグメントは、少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含む、21.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
23.
 前記ギャップセグメントは、8~12個のデオキシリボヌクレオシドからなり、
 前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して、2’-O-MOEヌクレオシド及び2’-O-MCEヌクレオシドからなる群から独立して選択される3~6個の糖修飾ヌクレオシドからなり、
 ギャップセグメントは、少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含む、21.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
24.
 前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して、5個の2’-O-MOEヌクレオシドからなる、23.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
25.
 前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して、5個の2’-O-MCEヌクレオシドからなる、23.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
26.
 前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントにおける糖修飾ヌクレオシドの配置は、それぞれ独立して、VLL、LVL、LLV、LVV、VLV、VVL、LLL、VVLL、VLVL、VLLV、LVLV、LLVV、LVVL、VLLL、LVLL、LLVL、LLLV、LVVV、VLVV、VVLV、及びVVVLからなる群から選ばれ、ここで、LはLNAを示し、Vは2’-O-MCEヌクレオシドを示す、21.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
27.
 第一オリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、1.から26.のいずれか一つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
28.
 第二オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つのリボヌクレオシドを含む、1.から27.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
29.
 第二オリゴヌクレオチドは、少なくとも4つの連続するリボヌクレオシドを含む、1.から28.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
30.
 第二オリゴヌクレオチドは、RNAである、1.から29.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
31.
 第二オリゴヌクレオチドは、DNAである、1.から27.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
32.
 第二オリゴヌクレオチドは、第二オリゴヌクレオチドの5’末端側及び3’末端側の少なくとも一方に、1又は複数の糖修飾ヌクレオシドを含む、1.から29.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
33.
 第二オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシドが、ホスホジエステル結合で互いに連結されている、1.から32.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
34.
 第二オリゴヌクレオチドは、第二オリゴヌクレオチドの5’末端側及び3’末端側の少なくとも一方に、1又は複数のホスホロチオエート結合を含む、1.から32.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
35.
 前記一本鎖オリゴヌクレオチドは、配列番号772~776からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する、1.から34.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
36.
 前記一本鎖オリゴヌクレオチドは、配列番号797~801、803~808及び810からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する、1.から34.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
37.
 標識機能、精製機能及び標的部位への送達機能からなる群から選択される少なくとも1つを有する機能性分子をさらに含む、1.から36.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
38.
 前記機能性分子は、脂質及び糖から選択される、37.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
39.
 CUCACCUUACCCGGAUAAAAA(V)^T(L)^5(L)^5(x)^g^g^g^t^a^a^g^g^t^G(L)^A(L)^G(V)、
CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)^G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)^A(L)^G(V)、
ACCCUCUCAUUGACCCAAAAG(V)^G(L)^G(L)^t^5(x)^a^a^t^g^a^g^a^g^G(L)^G(L)^T(V)、
UCGGUGCACCCUCUCAAAAAT(L)^G(V)^A(L)^g^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(L)^G(V)^A(L)、
CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(V)^G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)^A(L)^G(V)、
CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)^G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)^A(V)^G(V)、
CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(L)^A(V)^G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)^A(V)^G(L)、
CCUCGGUGCACCCUCUCAAAAAT(V)^G(L)^A(V)^G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)^A(V)^G(L)^G(V) 、
CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(L)^A(L)^G(V)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(V)^A(L)^G(L)、
CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)A(L)^G(V)、
CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)G(L)a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)A(L)^G(V)、
CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)G(L)A(V)^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)A(L)^G(V)、
CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)G(L)a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(V)G(L)A(L)^G(V)、
ACCCUCUCAUUGACCCAAAAG(V)^G(L)^G(L)^t^5(x)^a^a^t^g^a^g^a^g^G(L)^G(V)^T(V) 、
GGAUAUUUUGAGUCUUAAAAA(V)^A(L)^G(L)^a^5(x)^t^5(x)^a^a^a^a^t^a^T(L)^5(L)^5(V) 、
UGGUACAUCUGUGUUGAAAA5(V)^A(L)^A(L)^5(x)^a^5(x)^a^g^a^t^g^t^a^5(L)^5(L)^A(V) 、
GAACUCUCCCUAACCCAAAAG(V)^G(L)^G(L)^t^t^a^g^g^g^a^g^a^g^T(L)^T(L)^5(V) 、
CCAGCCUCUGCCUCGGAAAA5(L)^5(L)^G(L)^a^g^g^5(x)^a^g^a^g^g^5(x)^T(L)^G(L)^G(L) 、
GGUUACAAUGUCCCGGAAAA5(V)^5(L)^G(L)^g^g^a^5(x)^a^t^t^g^t^a^A(L)^5(L)^5(V) 、
CCGAUCUGGAUAGCUUAAAAA(V)^A(L)^G(L)^5(x)^t^a^t^5(x)^5(x)^a^g^a^t^5(L)^G(L)^G(V) 、
GACUCAUCUUCUGGCCAAAAG(V)^G(L)^5(L)^5(x)^a^g^a^a^g^a^t^g^a^G(L)^T(L)^5(V) 、
CAGUGAAUAUGCCCGGAAAA5(V)^5(L)^G(L)^g^g^5(x)^a^t^a^t^t^5(x)^a^5(L)^T(L)^G(V) 、
CGACCCUAGGGAUAUCAAAAG(V)^A(L)^T(L)^a^t^5(x)^5(x)^5(x)^t^a^g^g^g^T(L)^5(L)^G(V) 、
CCUACCCAUGUUCACAAAAAT(V)^G(L)^T(L)^g^a^a^5(x)^a^t^g^g^g^t^A(L)^G(L)^G(V) 、
AUGUAUGCCCCUUGCCAAAAG(V)^G(L)^5(L)^a^a^g^g^g^g^5(x)^a^t^a^5(L)^A(L)^T(V) 及び
CUAGUAGUAGCUCUGCAAAAG(V)^5(L)^A(L)^g^a^g^5(x)^t^a^5(x)^t^a^5(x)^T(L)^A(L)^G(V)
からなる群から選択され、
ここで、(L)はLNA(β-D-メチレンオキシBNA)を意味し、(V)は2’-O-MCEヌクレオシドを意味し、小文字のアルファベットはデオキシリボヌクレオシドを意味し、大文字のアルファベット(前記(L)における「L」、及び(V)における「V」を除く)はリボヌクレオシドを意味し、^はホスホロチオエート結合を意味し、5(x)は、そのデオキシリボヌクレオシドの核酸塩基が5-メチルシトシンであることを意味し、
「5(V)」及び「5(L)」における「5」は、そのヌクレオシドの核酸塩基が5-メチルシトシンであることを意味し、
隣り合う2つのヌクレオシドの間に、^が記載されていないとき、その2つのヌクレオシドの間のヌクレオシド間結合はホスホジエステル結合である、1.に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
40.
 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとを含む二本鎖オリゴヌクレオチド複合体であって、
 第一オリゴヌクレオチドは、Atrophin1 mRNA若しくはpre-mRNAとのハイブリダイズを可能にする配列を含み、
 デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、
 少なくとも1つの糖修飾ヌクレオシドを含み、
 第二オリゴヌクレオチドは、第一オリゴヌクレオチドの少なくとも一部とのハイブリダイズを可能とする配列を含み、
 デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、
 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドがハイブリダイズしている、二本鎖オリゴヌクレオチド複合体、又はその医学的に許容され得る塩。
41.
 1.から40.のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又は二本鎖オリゴヌクレオチド複合体、又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む医薬。
42.
 1.から40.のいずれか一つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又は二本鎖オリゴヌクレオチド複合体、又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む、ATN1遺伝子の発現阻害作用が有効な疾患若しくは状態の治療、予防及び/又は改善薬。
43.
 1.から40.のいずれか一つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又は二本鎖オリゴヌクレオチド複合体、又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む、ATN1遺伝子の発現阻害剤。
44.
 1.から40.のいずれか一つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又は二本鎖オリゴヌクレオチド複合体、又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症の治療、予防、及び/又は改善薬。
45.
5(V)^5(L)^G(L)^a^g^g^5(x)^a^g^a^g^g^5(x)^T(L)^G(L)^G(V) 、
5(L)^5(L)G(L)a^g^g^5(x)^a^g^a^g^g^5(x)^T(L)G(L)^G(L) 、
5(V)^5(L)G(L)a^g^g^5(x)^a^g^a^g^g^5(x)^T(L)G(L)^G(V) 、
5(V)^5(L)G(L)A(V)g^g^5(x)^a^g^a^g^g^5(x)^T(L)G(L)^G(V) 、
5(L)^5(L)G(L)g^g^a^5(x)^a^t^t^g^t^a^A(L)5(L)^5(L) 、
5(V)^5(L)G(L)g^g^a^5(x)^a^t^t^g^t^a^A(L)5(L)^5(V) 、
5(V)^5(L)G(L)G(V)g^a^5(x)^a^t^t^g^t^a^A(L)5(L)^5(V) 、
G(V)^T(L)^5(L)^a^5(x)^5(x)^a^g^a^a^g^g^5(x)^A(L)^G(L)^G(V) 、
G(L)^T(L)5(L)a^5(x)^5(x)^a^g^a^a^g^g^5(x)^A(L)G(L)^G(L) 、
G(V)^T(L)5(L)a^5(x)^5(x)^a^g^a^a^g^g^5(x)^A(L)G(L)^G(V) 、
G(V)^T(L)5(L)A(V)5(x)^5(x)^a^g^a^a^g^g^5(x)^A(L)G(L)^G(V) 、
A(L)^A(L)G(L)5(x)^t^a^t^5(x)^5(x)^a^g^a^t^5(L)G(L)^G(L) 、
A(V)^A(L)G(L)5(x)^t^a^t^5(x)^5(x)^a^g^a^t^5(L)G(L)^G(V) 、
A(V)^A(L)G(L)5(V)t^a^t^5(x)^5(x)^a^g^a^t^5(L)G(L)^G(V) 、
G(L)^G(L)5(L)5(x)^a^g^a^a^g^a^t^g^a^G(L)T(L)^5(L) 、
G(V)^G(L)5(L)5(x)^a^g^a^a^g^a^t^g^a^G(L)T(L)^5(V) 、
G(V)^G(L)5(L)5(V)a^g^a^a^g^a^t^g^a^G(L)T(L)^5(V) 、
5(L)^5(L)G(L)g^g^5(x)^a^t^a^t^t^5(x)^a^5(L)T(L)^G(L) 、
5(V)^5(L)G(L)g^g^5(x)^a^t^a^t^t^5(x)^a^5(L)T(L)^G(V) 、
5(V)^5(L)G(L)G(V)g^5(x)^a^t^a^t^t^5(x)^a^5(L)T(L)^G(V) 、
G(L)^A(L)T(L)a^t^5(x)^5(x)^5(x)^t^a^g^g^g^T(L)5(L)^G(L) 、
G(V)^A(L)T(L)a^t^5(x)^5(x)^5(x)^t^a^g^g^g^T(L)5(L)^G(V) 、
G(V)^A(L)T(L)A(V)t^5(x)^5(x)^5(x)^t^a^g^g^g^T(L)5(L)^G(V) 、
T(L)^G(L)T(L)g^a^a^5(x)^a^t^g^g^g^t^A(L)G(L)^G(L) 、
T(V)^G(L)T(L)g^a^a^5(x)^a^t^g^g^g^t^A(L)G(L)^G(V) 、
T(V)^G(L)T(L)G(V)a^a^5(x)^a^t^g^g^g^t^A(L)G(L)^G(V) 、
G(L)^G(L)5(L)a^a^g^g^g^g^5(x)^a^t^a^5(L)A(L)^T(L) 、
G(V)^G(L)5(L)a^a^g^g^g^g^5(x)^a^t^a^5(L)A(L)^T(V) 、
G(V)^G(L)5(L)A(V)a^g^g^g^g^5(x)^a^t^a^5(L)A(L)^T(V) 、
A(L)^A(L)A(L)t^g^g^g^a^g^t^a^g^t^G(L)G(L)^G(L) 、
A(V)^A(L)A(L)t^g^g^g^a^g^t^a^g^t^G(L)G(L)^G(V) 、
A(V)^A(L)A(L)T(V)g^g^g^a^g^t^a^g^t^G(L)G(L)^G(V) 、
5(L)^A(L)A(L)5(x)^a^5(x)^a^g^a^t^g^t^a^5(L)5(L)^A(L) 、
5(V)^A(L)A(L)5(x)^a^5(x)^a^g^a^t^g^t^a^5(L)5(L)^A(V) 、
5(V)^A(L)A(L)5(V)a^5(x)^a^g^a^t^g^t^a^5(L)5(L)^A(V) 、
A(L)^A(L)G(L)a^5(x)^t^5(x)^a^a^a^a^t^a^T(L)5(L)^5(L) 、
A(V)^A(L)G(L)a^5(x)^t^5(x)^a^a^a^a^t^a^T(L)5(L)^5(V) 、
A(V)^A(L)G(L)A(V)5(x)^t^5(x)^a^a^a^a^t^a^T(L)5(L)^5(V) 、
G(L)^5(L)A(L)g^a^g^5(x)^t^a^5(x)^t^a^5(x)^T(L)A(L)^G(L) 、
G(V)^5(L)A(L)g^a^g^5(x)^t^a^5(x)^t^a^5(x)^T(L)A(L)^G(V) 、
G(V)^5(L)A(L)G(V)a^g^5(x)^t^a^5(x)^t^a^5(x)^T(L)A(L)^G(V) 、
G(L)^G(L)G(L)t^t^a^g^g^g^a^g^a^g^T(L)T(L)^5(L) 、
G(V)^G(L)G(L)t^t^a^g^g^g^a^g^a^g^T(L)T(L)^5(V) 及び
G(V)^G(L)G(L)T(V)t^a^g^g^g^a^g^a^g^T(L)T(L)^5(V) 
からなる群から選択され、
ここで、(L)はLNA(β-D-メチレンオキシBNA)を意味し、(V)は2’-O-MCEヌクレオシドを意味し、小文字のアルファベットはデオキシリボヌクレオシドを意味し、大文字のアルファベット(前記(L)における「L」、及び(V)における「V」を除く)はリボヌクレオシドを意味し、^はホスホロチオエート結合を意味し、5(x)は、そのデオキシリボヌクレオシドの核酸塩基が5-メチルシトシンであることを意味し、
「5(V)」及び「5(L)」における「5」は、そのヌクレオシドの核酸塩基が5-メチルシトシンであることを意味し、
隣り合う2つのヌクレオシドの間に、^が記載されていないとき、その2つのヌクレオシドの間のヌクレオシド間結合はホスホジエステル結合である、オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
46.
 45.に記載オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む医薬。
47.
 45.に記載のオリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む、ATN1遺伝子の発現阻害作用が有効な疾患若しくは状態の治療、予防及び/又は改善薬。
48.
 45.に記載のオリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む、ATN1遺伝子の発現阻害剤。
49.
 45.に記載のオリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症の治療、予防、及び/又は改善薬。
 本発明により、優れたATN1遺伝子の発現阻害作用を有し、特に歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症の治療、改善及び/又は予防に有用な、新規なアンチセンスオリゴヌクレオチド誘導体を提供することができる。
本実施形態に係る一本鎖オリゴヌクレオチドをDRPLAモデルマウスに投与し、運動機能改善への影響を評価したグラフである。 本実施形態に係る一本鎖オリゴヌクレオチドをDRPLAモデルマウスに投与し、運動機能改善への影響を評価したグラフである。 本実施形態に係る一本鎖オリゴヌクレオチドをDRPLAモデルマウスに投与し、運動機能改善への影響を評価したグラフである。 本実施形態に係る一本鎖オリゴヌクレオチドをDRPLAモデルマウスに投与し、運動機能改善への影響を評価したグラフである。 本実施形態に係る一本鎖オリゴヌクレオチドをDRPLAモデルマウスに投与し、運動機能改善への影響を評価したグラフである。
 上記の概要及び以下の詳細な説明の両方は、例示的及び説明的なものにすぎず、特許請求される本発明を限定するものではないことが理解される。本明細書において、単数形の使用は、別途具体的に記述されない限り、複数形を含む。
 また本説明において、アンチセンスオリゴヌクレオチド誘導体は「ASO誘導体」と記載することがある。
 本明細書中、アンチセンスオリゴヌクレオチド誘導体(ASO誘導体)は、第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとが、第三オリゴヌクレオチドよって連結されているオリゴヌクレオチド(以下、一本鎖オリゴヌクレオチドと称する)又はその医学的に許容され得る塩を包含し、また、第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとを含むオリゴヌクレオチド複合体(以下、二本鎖オリゴヌクレオチド複合体と称する)又はその医学的に許容され得る塩を包含する。
 該一本鎖オリゴヌクレオチドにおいて、
 第一オリゴヌクレオチドは、Atrophin1 mRNA若しくはpre-mRNAとのハイブリダイズを可能にする配列を含み、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、少なくとも1つの糖修飾ヌクレオシドを含み、
 第二オリゴヌクレオチドは、第一オリゴヌクレオチドの少なくとも一部とのハイブリダイズを可能とする配列を含み、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、
 第三オリゴヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される1~20個のヌクレオシドからなり、
 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドがハイブリダイズする。
 該二本鎖オリゴヌクレオチド複合体において、
 第一オリゴヌクレオチドは、Atrophin1 mRNA若しくはpre-mRNAとのハイブリダイズを可能にする配列を含み、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、少なくとも1つの糖修飾ヌクレオシドを含み、
 第二オリゴヌクレオチドは、第一オリゴヌクレオチドの少なくとも一部とのハイブリダイズを可能とする配列を含み、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、
 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドがハイブリダイズしている。
 自然界における核酸は、もっとも基本的には、アデノシン(A)、チミジン(T)(又はウリジン(U))、シチジン(C)、グアノシン(G)で構成される。それらの基本的な核酸はしばしばAT(U)GC等と言及される。したがって、本明細書において、例えばATN1遺伝子の配列等に関し、「核酸塩基配列」や「配列番号」で配列を示す場合、それらは基本的にA、T、G、C及びUによる配列である。
 一方、本発明のASO誘導体を構成する核酸は、基本的な核酸(AT(U)CG)のほか、それらが構造修飾を受けたものも含む。修飾の詳細については後述されるが、糖部分、ヌクレオシド間結合、及び/又は核酸塩基への修飾等が含まれる。
 したがって、本明細書において、例えば、「化合物」又は「化合物番号(M-番号及びL-番号)が付与された化合物」の説明において、あるいは「配列番号(SEQ No)で示された核酸塩基配列」の説明において、本発明のASO誘導体、ならびに該誘導体を構成する第一オリゴヌクレオチド、第二オリゴヌクレオチド、及び第三オリゴヌクレオチド等が、A、T、G、C及びUにより核酸塩基配列が記載された場合、A、T、G、C及びUは、それらが構造修飾を受けたものも包含する。
 以下、さらに詳細に本発明を説明する。
 別途示されない限り、以下の用語は、以下の意味を有する。
 「置換されていてもよい」とは、無置換であるか、又は置換されていることを意味する。
 「ヌクレオシド」は、当業者に周知の用語であり、一般的に、糖及び核酸塩基が結合した分子であって、核酸を構成する単位となりうる分子と理解される。本明細書において、ヌクレオシドは、より広義の概念であり、後述のデオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドを包含する。前記核酸塩基は、修飾されていてもよい。
 「デオキシリボヌクレオシド」は、2-デオキシリボースの1位の炭素原子に核酸塩基を有する分子を意味する。本発明におけるデオキシリボヌクレオシドは、天然に存在するデオキシリボヌクレオシドであっても、天然に存在するデオキシリボヌクレオシドの核酸塩基部分が修飾されたデオキシリボヌクレオシドであってもよい。天然に存在するデオキシリボヌクレオシドとは、天然に存在する核酸塩基を有するデオキシリボヌクレオシドである。修飾は1つのデオキシリボヌクレオシドに対して、複数種組み合わせて施されていてもよい。前記修飾されたデオキシリボヌクレオシドは、例えば、Journal of Medicinal Chemistry, 2016, 59, pp 9645-9667、Medicinal Chemistry Communication, 2014, 5, pp 1454-1471、Future Medicinal Chemistry, 2011, 3, pp 339-365、国際公開第2018/155450号等に記載されている。
 「リボヌクレオシド」は、リボースの1位の炭素原子に核酸塩基を有する分子を意味する。本発明におけるリボヌクレオシドは、天然に存在するリボヌクレオシドであっても、天然に存在するリボヌクレオシドの核酸塩基部分が修飾されたリボヌクレオシドであってもよい。天然に存在するリボヌクレオシドは、天然に存在する核酸塩基を有するリボヌクレオシドである。修飾は1つのリボヌクレオシドに対して、複数種組み合わせて施されてもよい。前記修飾されたリボヌクレオシドは、例えば、Journal of Medicinal Chemistry, 2016, 59, pp 9645-9667、Medicinal Chemistry Communication, 2014, 5, pp 1454-1471、Future Medicinal Chemistry, 2011, 3, pp 339-365、国際公開第2018/155450号等に記載されている。
 「修飾糖」は、
(Z1)リボース又は2-デオキシリボースが、部分的に1つ以上の置換基によって置換されている分子、
(Z2)リボース又は2-デオキシリボースが、リボース及び2-デオキシリボースとは異なる五単糖又は六単糖(例えば、ヘキシトール、トレオース等)によって置換されている分子、
(Z3)リボース又は2-デオキシリボース全体、又はこれらのテトラヒドロフラン環が、5から7員の飽和若しくは不飽和環(例えば、シクロヘキサン、シクロヘキセン、モルホリン等)、又は5から7員の環を水素結合によって形成し得る部分構造(例えば、ペプチド構造)へ置き換えられた分子、
又は
(Z4)リボース又は2-デオキシリボースが、C2-6アルキレングリコール(例えば、エチレングリコール、プロピレングリコール等)へ置き換えられた分子
を意味する。
 修飾糖は、後述の「2修飾糖」及び「2-4架橋糖」を含む。
 修飾糖及び、後述の糖修飾ヌクレオシドとしては、例えば、特開平10-304889号公報、国際公開第2005/021570号、特開平10-195098号公報、特表2002-521310号公報、国際公開第2007/143315号、国際公開第2008/043753号、国際公開第2008/029619号、国際公開第2008/049085号及び国際公開2017/142054号(以下、これら文献を「アンチセンス法に関する文献」と称する)等において、アンチセンス法に好適に用いられるとして開示されている糖及び糖修飾ヌクレオシド等が挙げられる。また、Journal of Medicinal Chemistry, 2016, 59, pp 9645-9667、Medicinal Chemistry Communication, 2014, 5, pp 1454-1471、Future Medicinal Chemistry, 2011, 3, pp 339-365、国際公開第2018/155450号等にも、修飾糖及び糖修飾ヌクレオシドが開示されている。
 部分的に1つの置換基によって置換されている修飾糖の例としては、糖部分の任意の位置が、以下の(i)又は(ii)で置換されたリボース若しくは2-デオキシリボースが挙げられる。
(i)C1-6アルキル基。
(ii)ハロゲン原子、C1-6アルコキシ基、ハロC1-6アルコキシ基、モノ-又はジ-C1-6アルキルアミノ基、5-10員複素環基、カルボキシ基、カルバモイル基、又はN-置換カルバモイル基からなる群から選択される少なくとも1つで置換されたC1-6アルキル基。
 ここで、前記N-置換カルバモイル基としては、N-メチル-カルバモイル基及びN-エチル-カルバモイル基が挙げられ、ここで、N-メチル-カルバモイル基及びN-エチル-カルバモイル基のメチル基及びエチル基は、5-10員複素環基又はモノ-又はジ-C1-6アルキルアミノ基で置換されていてもよい。N-置換カルバモイル基の具体例としては、N-メチルカルバモイル基、N-エチルカルバモイル基、N-ジメチルアミノエチル-カルバモイル基、N-モルホリノエチルカルバモイル基、N-(2-ピリジルエチル)カルバモイル基、N-((ベンズイミダゾール-1-イル)エチル)カルバモイル基等が挙げられる。
 「糖修飾ヌクレオシド」は、デオキシリボヌクレオシド又はリボヌクレオシドの糖部分の代わりに、前記「修飾糖」を有する分子を意味する。例えば、後述の「2’修飾ヌクレオシド」及び「2’-4’-架橋ヌクレオシド」を包含する。修飾糖が、前記定義の(Z3)である場合、糖修飾ヌクレオシドは、修飾糖と核酸塩基とが、メチレン鎖等を介して結合した分子も含む。
 「2修飾糖」は、リボースの2位の酸素原子又は炭素原子が修飾された、非架橋の糖を意味し、「2-O-Me」、「2-O-MOE」、「2-O-MCE」、「2-O-NMA」、「2-O-AP」、「2-F」、「2-DMAECE」、「2-MоrECE」、「2-PyECE」及び「2-BimECE」を包含する。
 「2’修飾ヌクレオシド」は、前記2修飾糖の1位に核酸塩基を有する分子を意味し、例えば、「2’-O-Meヌクレオシド」、「2’-O-MOEヌクレオシド」、「2’-O-MCEヌクレオシド」、「2’-O-NMAヌクレオシド」、「2’-O-APヌクレオシド」、「2’-Fヌクレオシド」、「2’-DMAECEヌクレオシド」、「2’-MоrECEヌクレオシド」、「2’-PyECEヌクレオシド」及び「2’-BimECEヌクレオシド」等が挙げられる。
 「2-O-Me」(2-O-メチルとも称される)は、リボースの2位のヒドロキシ基が、メトキシ基に置き換えられた糖を意味する。
 「2’-O-Meヌクレオシド」(2’-O-メチルヌクレオシドとも称される)は、「2-O-Me」の1位に核酸塩基を有する分子を意味する。
 「2-O-MOE」(2-O-メトキシエチルとも称される)は、リボースの2位のヒドロキシ基が、2-メトキシエチルオキシ基に置き換えられた糖を意味する。
 「2’-O-MOEヌクレオシド」(2’-O-メトキシエチルヌクレオシドとも称される)は、「2-O-MOE」の1位に核酸塩基を有する分子を意味する。
 「2-O-MCE」(2-O-メチルカルバモイルエチルとも称される)は、リボースの2位のヒドロキシ基が、メチルカルバモイルエチルオキシ基に置き換えられた糖を意味する。
 「2’-O-MCEヌクレオシド」(2’-O-メチルカルバモイルエチルヌクレオシドとも称される)は、「2-O-MCE」の1位に核酸塩基を有する分子を意味する。
 「2-O-NMA」は、リボースの2位のヒドロキシ基が、2-[(メチルアミノ)-2-オキソエチル]オキシ基に置き換えられた糖を意味する。
 「2’-O-NMAヌクレオシド」は、「2-O-NMA」の1位に核酸塩基を有する分子を意味する。
 「2-O-AP」は、リボースの2位のヒドロキシ基が、3-アミノプロピルオキシ基に置き換えられた糖を意味する。
 「2’-O-APヌクレオシド」は、「2-O-AP」の1位に核酸塩基を有する分子を意味する。
 「2-F」は、リボースの2位のヒドロキシ基が、フッ素原子に置き換えられた糖を意味する。
 「2’-Fヌクレオシド」は、「2-F」の1位に核酸塩基を有する分子を意味する。
 「2-DMAECE」、「2-MоrECE」、「2-PyECE」、及び「2-BimECE」は、リボースの2位のヒドロキシ基が、それぞれ、以下、DMAECE、MоrECE、PyECE、BimECEで示される構造に置き換えられた修飾糖である。以下構造中、波線は、リボースの2位のヒドロキシ基が結合する炭素原子との結合位置を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000001
 「2’-DMAECEヌクレオシド」、「2’-MоrECEヌクレオシド」、「2’-PyECEヌクレオシド」及び「2’-BimECEヌクレオシド」は、それぞれ「2-DMAECE」、「2-MоrECE」、「2-PyECE」及び「2-BimECE」の1位に核酸塩基を有する分子を意味する。
 「2-4架橋糖」は、リボースにおける2位及び4位の2箇所の置換によって架橋ユニットが置換された糖を意味する。架橋ユニットとしては、例えば、C2-6アルキレン基(前記アルキレン基は無置換であるか、又はハロゲン原子、オキソ基及びチオキソ基からなる群から選択される1個以上の置換基で置換されており、かつ前記アルキレン基の1若しくは2つのメチレン基は、置き換えられていないか、又は独立して-O-、-NR-(Rは水素原子、C1-6アルキル基又はハロC1-6アルキル基を示す)及び-S-からなる群から選択される基で置き換えられている)が挙げられる。
 「2’-4’-架橋ヌクレオシド」(2’,4’-BNA)は、前記2-4架橋糖の1位に核酸塩基を有する分子を意味する。例えば、後述のLNA(ロックド核酸;Locked Nucleic Acid(登録商標))とも称されるβ-D-メチレンオキシ(4’-CH-O-2’)BNA又はα-L-メチレンオキシ(4’-CH-O-2’)BNA、ENAとも称されるエチレンオキシ(4’-(CH-O-2’)BNA、β-D-チオ(4’-CH-S-2’)BNA、アミノオキシ(4’-CH-O-N(R11)-2’)BNA(R11は、H又はCHである)、2’,4’-BNANCとも称されるオキシアミノ(4’-CH-N(R12)-O-2’)BNA(R12は、H又はCHである)、2’,4’-BNACOC、3’-アミノ-2’,4’-BNA、5’-メチルBNA、cEtとも称される(4’-CH(CH)-O-2’)BNA、cMOE-BNAとも称される(4’-CH(CHOCH)-O-2’)BNA、AmNAとも称されるアミド型BNA(4’-C(=O)-N(R13)-2’)BNA(R13は、H又はCHである)、scpBNAとも称される(4’-C(スピロ-シクロプロピル)-O-2’)BNA、GuNAとも称される(4’-CH-N(R14)-2’)BNA(R14は、C(=NH +)NHR15であり、R15は、H又はCHである)、及び当業者に知られた他のBNA等が挙げられる。
 前記「デオキシリボヌクレオシド」、「リボヌクレオシド」、「2’修飾ヌクレオシド」及び「2’-4’-架橋ヌクレオシド」等において、1’位の炭素原子と核酸塩基との結合は、α-グリコシド結合及びβ-グリコシド結合が挙げられるが、通常は、β-グリコシド結合である。したがって、LNAとして、通常β-D-メチレンオキシBNAが用いられる。
 「n-」はノルマル、「s-」はセカンダリー、「t-」はターシャリーを意味する。
 「ハロゲン原子」とは、フッ素原子、塩素原子、臭素原子又はヨウ素原子を意味する。
 「C1-6アルキル基」とは、炭素数が1から6の直鎖又は分枝状の飽和炭化水素基を意味し、例えば、メチル基、エチル基、n-プロピル基、イソプロピル基、n-ブチル基、イソブチル基、s-ブチル基、t-ブチル基、n-ペンチル基、イソペンチル基、ネオペンチル基、n-ヘキシル基及びイソヘキシル基等が挙げられる。
 「ハロC1-6アルキル基」とは、前記「C1-6アルキル基」の任意の位置の水素原子が、1個以上の前記「ハロゲン原子」で置換された基を意味する。
 「C2-6アルキレン基」とは、炭素数が2から6の直鎖又は分枝状の飽和炭化水素基から任意の位置の水素原子を1個取り除いた2価の基を意味し、例としては、エチレン(エタンジイル)基、プロパン-1,3-ジイル(トリメチレン)基、プロパン-2,2-ジイル基、2,2-ジメチル-プロパン-1,3-ジイル基、ヘキサン-1,6-ジイル(ヘキサメチレン)基及び3-メチルブタン-1,2-ジイル基等が挙げられる。
 「C1-20アルキレン基」とは、炭素数が1から20の直鎖又は分枝状の飽和炭化水素基から任意の位置の水素原子を1個取り除いた2価の基を意味する。
 「C2-20アルケニレン基」とは、炭素数が2から20の、少なくとも1個の二重結合を含む直鎖又は分枝状の不飽和炭化水素基から任意の位置の水素原子を1個取り除いた2価の基を意味する。
 「C1-6アルコキシ基」とは、前記「C1-6アルキル基」がオキシ基に結合した基を意味する。
 「ハロC1-6アルコキシ基」とは、前記「C1-6アルコキシ基」の任意の位置の水素原子が、1個以上の前記「ハロゲン原子」で置換された基を意味する。
 「モノ-又はジ-C1-6アルキルアミノ基」とは、アミノ基の1つの水素原子が1つの「C1-6アルキル基」に置き換えられた基、又はアミノ基の2つの水素原子が同一又は異なる2つの「C1-6アルキル基」に置き換えられた基を意味し、例えば、メチルアミノ基、エチルアミノ基、プロピルアミノ基、イソプロピルアミノ基、ブチルアミノ基、ジメチルアミノ基、ジエチルアミノ基、ジプロピルアミノ基、ジブチルアミノ基、及びN-エチル-N-メチルアミノ基等が挙げられる。
 「5-10員複素環基」は、環構成原子として炭素原子以外に窒素原子、硫黄原子及び酸素原子から選ばれる1から4個のヘテロ原子を含有する5から10員の単環系又は縮合多環系の芳香族又は非芳香族の複素環基を意味する。
 前記「5-10員複素環基」の好適な例としては、チエニル基、フリル基、ピロリル基、イミダゾリル基、ピラゾリル基、チアゾリル基、イソチアゾリル基、オキサゾリル基、イソオキサゾリル基、ピリジル基、ピラジニル基、ピリミジニル基、ピリダジニル基、トリアゾリル基、テトラゾリル基、トリアジニル基、ベンゾチオフェニル基、ベンゾフラニル基、ベンゾイミダゾリル基、ベンゾオキサゾリル基、ベンゾイソオキサゾリル基、ベンゾチアゾリル基、ベンゾイソチアゾリル基、ベンゾトリアゾリル基、イミダゾピリジニル基、チエノピリジニル基、ピロロピリジニル基、ピラゾロピリジニル基、オキサゾロピリジニル基、チアゾロピリジニル基、イミダゾピラジニル基、イミダゾピリミジニル基、アジリジニル基、オキシラニル基、アゼチジニル基、オキセタニル基、チエタニル基、テトラヒドロチエニル基、テトラヒドロフラニル基、ピロリニル基、ピロリジニル基、オキソピロリジニル基、イミダゾリニル基、オキソイミダゾリニル基、イミダゾリジニル基、オキサゾリニル基、オキサゾリジニル基、ピラゾリニル基、ピラゾリジニル基、チアゾリニル基、チアゾリジニル基、テトラヒドロイソチアゾリル基、テトラヒドロオキサゾリル基、テトラヒドロイソオキサゾリル基、ピペリジニル基、ピペラジニル基、テトラヒドロピリジニル基、ジヒドロピリジニル基、テトラヒドロピリダジニル基、ジヒドロピラニル基、テトラヒドロピラニル基、テトラヒドロチオピラニル基、モルホリニル基、及びチオモルホリニル基等が挙げられる。
 「オキソ基」とは、酸素原子が二重結合を介して置換した基(=O)を示す。オキソ基が炭素原子に置換した場合は当該炭素原子と一緒となってカルボニル基を形成する。
 「チオキソ基」とは、硫黄原子が二重結合を介して置換した基(=S)を示す。チオキソ基が炭素原子に置換した場合は当該炭素原子と一緒となってチオカルボニル基を形成する。
 「核酸塩基」は、プリン塩基又はピリミジン塩基であり、天然に存在する核酸塩基であっても、天然に存在する核酸塩基が修飾されたものであってもよい。天然に存在する核酸塩基としては、アデニン(A)、グアニン(G)、チミン(T)、シトシン(C)及びウラシル(U)が挙げられる。前記「核酸塩基」は、天然に存在する核酸塩基及び、後述の「修飾核酸塩基」を含む。
 「修飾核酸塩基」における核酸塩基の修飾の例としては、ハロゲン化、メチル化、エチル化、n-プロピル化、イソプロピル化、シクロプロピル化、n-ブチル化、イソブチル化、s-ブチル化、t-ブチル化、シクロブチル化、水酸化、アミノ化、チオ化及びデメチル化等が挙げられる。より具体的には、シトシンの5-メチル化、5-フルオロ化、5-ブロモ化、5-ヨード化及びN4-メチル化;チミンの2-チオ化、5-デメチル化、5-フルオロ化、5-ブロモ化及び5-ヨード化;ウラシルの2-チオ化、5-フルオロ化、5-ブロモ化及び5-ヨード化;アデニンのN6-メチル化及び8-ブロモ化;グアニンのN2-メチル化及び8-ブロモ化等が挙げられる。また、Journal of Medicinal Chemistry, 2016, 59, pp 9645-9667、Medicinal Chemistry Communication, 2014, 5, pp 1454-1471、Future Medicinal Chemistry, 2011, 3, pp 339-365、国際公開第2018/155450号等に、ヌクレオシドにおける核酸塩基部分の修飾の例が開示されている。
 ヌクレオシドにおける核酸塩基は、好ましくは、アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル及び5-メチルシトシンからなる群から選ばれる少なくとも1種である。
 「5-メチルシトシン」は、5位にメチル基を有するシトシンを意味する。
 「核酸塩基配列」は、オリゴヌクレオチドに含有される各ヌクレオシドが有する核酸塩基の5’側から3’側への配列を意味する。
 「連続核酸塩基」は、前記「核酸塩基配列」において連続する一部分の核酸塩基の5’側から3’側への配列を意味する。
 「ヌクレオシド間結合」は、オリゴヌクレオチド中の隣接ヌクレオシド間の共有結合を形成する基又は結合を意味する。「ヌクレオシド間結合」は、ホスホジエステル結合及び後述の「修飾ヌクレオシド間結合」を含む。
 「修飾ヌクレオシド間結合」は、修飾されたホスホジエステル結合を意味し、例えば、ホスホロチオエート結合、メチルホスホネート結合(キラル-メチルホスホネート結合を含む)、メチルチオホスホネート結合、ホスホロジチオエート結合、ホスホロアミデート結合、ホスホロジアミデート結合、ホスホロアミドチオエート結合及びボラノホスフェート結合等が挙げられる。また、Journal of Medicinal Chemistry, 2016, 59, pp 9645-9667、Medicinal Chemistry Communication, 2014, 5, pp 1454-1471、Future Medicinal Chemistry, 2011, 3, pp 339-365等に、ホスホジエステル結合の修飾の例が開示されており、修飾されたホスホジエステル結合に用いることができる。
 「修飾ヌクレオシド」は、修飾糖及び/又は修飾核酸塩基を有するヌクレオシドを意味する。
 「オリゴヌクレオチド」は、同一又は異なる2以上の「ヌクレオシド」が、互いに独立して選択される前記「ヌクレオシド間結合」(例えば、ホスホジエステル結合又は修飾されたホスホジエステル結合)で連結した構造を有する分子を意味する。
 「オリゴデオキシリボヌクレオチド」は、同一又は異なる2以上の前記「デオキシリボヌクレオシド」が、互いに独立して選択される前記「ヌクレオシド間結合」によって、連結したポリヌクレオチド又はオリゴヌクレオチドを意味する。
 「オリゴリボヌクレオチド」は、同一又は異なる2以上の前記「リボヌクレオシド」が、互いに独立して選択される前記「ヌクレオシド間結合」によって、連結したポリヌクレオチド又はオリゴヌクレオチドを意味する。
 「DNA」は、天然に存在する2以上の前記「デオキシリボヌクレオシド」が、ホスホジエステル結合によって、連結したポリヌクレオチド又はオリゴヌクレオチドを意味する。DNAを構成する天然のデオキシリボヌクレオシドは、それぞれ同一であっても異なっていてもよい。
 「RNA」は、天然に存在する2以上の前記「リボヌクレオシド」が、ホスホジエステル結合によって、連結したポリヌクレオチド又はオリゴヌクレオチドを意味する。RNAを構成する天然のリボヌクレオシドは、それぞれ同一であっても異なっていてもよい。
 「オリゴヌクレオチド複合体」は、互いに共有結合で連結されていない複数の前記「オリゴヌクレオチド」(分子)が、分子間でハイブリダイズすることにより、該複数のオリゴヌクレオチドが一体となった複合体を意味する。
 「アンチセンス効果」とは、標的遺伝子に対応して選択される標的RNAと、例えば、その部分配列に相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドとがハイブリダイズすることによって、標的RNAの機能が制御されることを意味する。例えば、標的RNAがmRNAの場合、ハイブリダイゼーションにより前記標的RNAの翻訳が阻害されること、エキソンスキッピング等のスプライシング機能変換効果、ハイブリダイズした部分が認識されることにより前記標的RNAが分解されること等を意味する。
 本発明において、標的RNAは、「ATN1 mRNA」及び/又は「ATN1 pre-mRNA」である。
 「アンチセンスオリゴヌクレオチド」(ASO)は、前記アンチセンス効果が生じるオリゴヌクレオチドである。例えば、DNA、オリゴデオキシリボヌクレオチド、ギャップマー、及びミックスマー等が挙げられるが、これらに限定されず、RNA、オリゴリボヌクレオチド又はアンチセンス効果が通常生じるように設計されたオリゴヌクレオチド等でもよい。
 「ハイブリダイズ」とは、相補的な配列を含むオリゴヌクレオチド又はその一部同士で二重鎖を形成させる行為、及び相補的な配列を含むオリゴヌクレオチド又はその一部同士が二重鎖を形成する現象を意味する。
 「相補的」とは、2つの核酸塩基が、水素結合を介して、ワトソン-クリック型塩基対(天然型塩基対)又は非ワトソン-クリック型塩基対(フーグスティーン型塩基対等)を形成できることを意味する。2つのオリゴヌクレオチド又はその一部は、それらの配列が相補的である場合に「ハイブリダイズ」し得る。2つのオリゴヌクレオチド又はその一部がハイブリダイズするために、それらが完全に相補的である必要はないが、2つのオリゴヌクレオチド又はその一部がハイブリダイズするための相補性は、好ましくは70%以上であり、より好ましくは80%以上であり、さらに好ましくは90%以上(例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%以上)である。配列の相補性は、オリゴヌクレオチドの部分配列を自動的に同定するコンピュータープログラムを利用することにより決定される。例えば、OligoAnalyzerは、そのようなソフトウエアの1つであり、Integrated DNA Technologies社が提供している。このプログラムは、ウェブサイトでも利用することができる。2つのオリゴヌクレオチドが上記好ましい相補性を有するとき、当業者は、2つのオリゴヌクレオチドがハイブリダイズすると判断することができる。
 「ギャップマー」は、後述する「ギャップセグメント」、「5’ウィングセグメント」及び「3’ウィングセグメント」を含むオリゴヌクレオチドを意味する。
 「ギャップセグメント」は、「RNaseHによって認識される少なくとも4個の連続するヌクレオシド」を含む領域であり、4個以上の連続するヌクレオシドを含み、RNaseHによって認識される限り特に限定されないが、前記連続するヌクレオシドは、好ましくはデオキシリボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選ばれ、少なくとも2つのデオキシリボヌクレオシドを含む。ギャップセグメントの5’末端及び3’末端のヌクレオシドは、好ましくはデオキシリボヌクレオシドである。
 「5’ウィングセグメント」は、ギャップセグメントの5’側に連結しており、前記「RNaseHによって認識される少なくとも4個の連続するヌクレオシド」を含まずに「少なくとも1個のヌクレオシド」を含む領域であり、ここで、5’ウィングセグメントの3’末端のヌクレオシドの糖部分は、ギャップセグメントの5’末端のヌクレオシドの糖部分と異なっている。糖部分の違いにより、5’ウィングセグメントとギャップセグメントの境界が確認される。本発明において、一態様として好ましくは、前記糖部分の違いは、対応する糖の2位の修飾の有無により判断される。なお、「2修飾糖」は前記定義のとおり、リボースの2位の酸素原子又は炭素原子が修飾された非架橋の糖であり、「2-4架橋糖」は、上述の定義においてリボースにおける2位及び4位の2箇所の置換によって架橋ユニットが置換された糖であるため、いずれも2位は修飾されている。(例えば、ギャップセグメントの5’末端のヌクレオシドは、デオキシリボヌクレオシドであり、5’ウィングセグメントの3’末端のヌクレオシドは、糖修飾ヌクレオシドである。この糖修飾ヌクレオシドは、2’-4’-架橋ヌクレオシドまたは2’修飾ヌクレオシドである。)5’ウィングセグメントの3’末端のヌクレオシドは、一般的に、糖修飾ヌクレオシドである。5’ウィングセグメントは、上記定義を満たす限り特に限定されないが、前記少なくとも1個のヌクレオシドは、好ましくはデオキシリボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選ばれ、少なくとも1個の糖修飾ヌクレオシドを含む。
 「3’ウィングセグメント」は、ギャップセグメントの3’側に連結しており、前記「RNaseHによって認識される少なくとも4個の連続するヌクレオシド」を含まずに「少なくとも1個のヌクレオシド」を含む領域であり、ここで、3’ウィングセグメントの5’末端のヌクレオシドの糖部分は、ギャップセグメントの3’末端のヌクレオシドの糖部分と異なっている。糖部分の違いにより、3’ウィングセグメントとギャップセグメントの境界が確認される。本発明において、一態様として好ましくは、前記糖部分の違いは、対応する糖の2位の修飾の有無により判断される。(例えば、ギャップセグメントの3’末端のヌクレオシドは、デオキシリボヌクレオシドであり、3’ウィングセグメントの5’末端のヌクレオシドは、糖修飾ヌクレオシドである。この糖修飾ヌクレオシドは、2’-4’-架橋ヌクレオシドまたは2’修飾ヌクレオシドである。)3’ウィングセグメントの5’末端のヌクレオシドは、一般的に、糖修飾ヌクレオシドである。3’ウィングセグメントは、上記定義を満たす限り特に限定されないが、前記少なくとも1個のヌクレオシドは、好ましくはデオキシリボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選ばれ、少なくとも1個の糖修飾ヌクレオシドを含む。
 一つの典型としては、5’末端から2’修飾ヌクレオシドまたは2’-4’-架橋ヌクレオシドが連続する部分が5’ウィングセグメントであり、5’ウィングセグメントの3’末端のヌクレオシドが、2’修飾ヌクレオシドまたは2’-4’-架橋ヌクレオシドを除く他のヌクレオシド(デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシドなど)に繋がる境目が、5’ウィングセグメントとギャップセグメントの境界である。
 一つの典型としては、3’末端から2’修飾ヌクレオシドまたは2’-4’-架橋ヌクレオシドが連続する部分が3’ウィングセグメントであり、3’ウィングセグメントの5’末端のヌクレオシドが、2’修飾ヌクレオシドまたは2’-4’-架橋ヌクレオシドを除く他のヌクレオシド(デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシドなど)に繋がる境目が、3’ウィングセグメントとギャップセグメントの境界である。
 「RNaseH」は、一般的には、生体内のDNAとRNAとがハイブリダイズした二重鎖を認識して、そのRNAを切断し一本鎖DNAを生じさせるリボヌクレアーゼとして知られている。RNaseHは、DNAとRNAがハイブリダイズした二重鎖に限らず、DNA及びRNAの少なくとも一方の、核酸塩基部分、ホスホジエステル結合部分及び糖部分の少なくとも1つが修飾された二重鎖をも認識し得る。例えば、ホスホロチオエート結合で修飾されたDNAと、RNAとがハイブリダイズした二重鎖をも認識し得る。また、オリゴデオキシリボヌクレオチドとオリゴリボヌクレオチドがハイブリダイズした二重鎖をも認識し得る。
 よって、DNAは、RNAとハイブリダイズした際に、RNaseHによって認識され得る。また、RNAは、DNAとハイブリダイズした際に、RNaseHによって切断され得る。DNA及びRNAの少なくとも一方において、核酸塩基部分、ホスホジエステル結合部分及び糖部分の少なくとも1つが修飾された場合も、同様である。例えば、代表的なものとして、DNAのホスホジエステル結合部分が、ホスホロチオエートに修飾されたオリゴヌクレオチド等が挙げられる。
 RNaseHによって認識され得るDNA及び/又はRNAの修飾例は、例えば、Nucleic Acids Research, 2014, 42, pp 5378-5389、Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2008, 18, pp 2296-2300、Molecular BioSystems, 2009, 5, pp 838-843、Nucleic Acid Therapeutics, 2015, 25, pp 266-274、The Journal of Biological Chemistry, 2004, 279, pp 36317-36326等に記載されている。
 本発明において、RNaseHは、好ましくは哺乳動物のRNaseHであり、より好ましくはヒトのRNaseHであり、特に好ましくはヒトRNaseH1である。
 「RNaseHによって認識される少なくとも4個の連続するヌクレオシド」は、4個以上の連続するヌクレオシドを含み、RNaseHによって認識される限り特に限定されないが、例えば、「少なくとも4個の連続するデオキシリボヌクレオシド」等が挙げられる。「RNaseHによって認識される少なくとも4個の連続するヌクレオシド」を構成するヌクレオシドの数は、例えば、5~30であり、好ましくは5~15であり、より好ましくは8~12であり、特に好ましくは10である。
 ある少なくとも4個の連続するヌクレオシドが、「RNaseHによって認識される少なくとも4個の連続するヌクレオシド」であるかどうか、当業者は、その連続するヌクレオシドの糖部分の構造により、判断できる。
 ミックスマーは、複数の糖修飾ヌクレオシドを含み、かつ前記ギャップセグメントを有さずにアンチセンス効果を生じるオリゴヌクレオチドであり、例えば、1~3個の糖修飾ヌクレオシドからなるヌクレオシド又はオリゴヌクレオチドと1~3個のデオキシリボヌクレオシドからなるヌクレオシド又はオリゴヌクレオチドとが交互に連結されたオリゴヌクレオチド、ヌクレオシドとして糖修飾ヌクレオシドのみから構成されるオリゴヌクレオチドなどが挙げられる。
 「ATN1」(Atrophin1)は、Atrophin1の任意のタンパク質を意味する。「ATN1 mRNA」は、ATN1タンパク質をコードするmRNAを、「ATN1 pre-mRNA」は、ATN1タンパク質をコードするpre-mRNAを意味する。「ATN1核酸」は、ATN1をコードする任意の核酸を意味し、例えば、「ATN1 mRNA」及び「ATN1 pre-mRNA」を含む。
 「ATN1 mRNA」は、例えば配列番号1で表され、「ATN1 pre-mRNA」は、例えば配列番号2又は717で表される。「ATN1 mRNA」及び「ATN1 pre-mRNA」のいずれも、互いにホスホジエステル結合で連結されたヌクレオシドを有し、通常チミンは、ウラシルに置き換えられている。「ATN1 mRNA」及び「ATN1 pre-mRNA」は、その他に、修飾糖、修飾核酸塩基、修飾ヌクレオシド間結合のいずれも有さない。
 「遺伝子の発現」は、遺伝子のコード情報が、細胞中における構造又はその機能に変換されることをいう。このような構造としては、限定されるものではないが、転写及び翻訳の産物(mRNA、pre-mRNA、タンパク質等)が挙げられる。
 歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症(DRPLA)は、小脳歯状核、赤核、淡蒼球及び/又はルイ体に病変を有する常染色体顕性遺伝性の脊髄小脳変性症である。DRPLAの原因は、ATN1遺伝子のCAGリピートの異常伸長であることが明らかにされている。健常人では、7~23回のCAGリピート配列を有するが、DRPLA患者は、例えば、49回以上のCAGリピート配列を有する。
 DRPLA患者のATN1遺伝子におけるCAGリピートの長さは、患者ごとに異なるため、CAGリピート配列を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド及びss-siRNAは、その有効性のばらつきが大きい可能性がある。また、CAGリピートは、ATN1以外の多くの遺伝子に存在するため、オフターゲット効果を生ずる可能性がある。本発明のASO誘導体は、ATN1 mRNA及び/又はATN1 pre-mRNAと相補性を有し、かつATN1遺伝子のCAGリピートを標的としていない。すなわちCAGリピート配列以外と相補性を有するものであるため、有効性のばらつきが小さく、かつオフターゲット効果が小さいことが期待される。
 「CAGリピート配列」は、シトシン(C)、アデニン(A)、グアニン(G)の3塩基単位が、この順で反復した配列である。当業者は、CAGリピート配列が標的でないことを、ASOの塩基配列より判断することができる。
 次に、第一オリゴヌクレオチドの好適な形態について説明する。
 第一オリゴヌクレオチドは、ATN1のmRNA又はpre-mRNAを標的とする。第一オリゴヌクレオチドは、ATN1のmRNA若しくはpre-mRNAとのハイブリダイズを可能にする配列を含む。第一オリゴヌクレオチドは、ATN1のmRNA又はpre-mRNAの全体とハイブリダイズする必要はなく、通常は、少なくとも一部とハイブリダイズする。例えば、ATN1のmRNA又はpre-mRNAの部分配列に相補的な配列を有するオリゴヌクレオチド(ギャップマー又は通常アンチセンス効果が生じるように設計されたオリゴヌクレオチド等)と、ATN1のmRNA又はpre-mRNAの一部がハイブリダイズすることによって、ATN1遺伝子の発現が制御される。また、第一オリゴヌクレオチドの全体がハイブリダイズする必要はなく、一部がハイブリダイズしなくてもよい。
 第一オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列と、ATN1のmRNA又はpre-mRNAの部分配列との相補性は、好ましくは70%以上、より好ましくは80%以上、さらに好ましくは90%以上(例えば、95%、96%、97%、98%又は99%以上)である。第一オリゴヌクレオチドと、ATN1のmRNA又はpre-mRNAの部分配列の少なくとも一部とがハイブリダイズするために、それらの配列が完全に相補的である必要はないが、完全に相補的であることがさらにより好ましい。
 第一オリゴヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、少なくとも1つの糖修飾ヌクレオシドを含む。
 第一オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシド数は、8~30個であり、好ましくは、8~25個であり、より好ましくは13~23個であり、さらに好ましくは15~21個であり、さらにより好ましくは、16~20個であり、特に好ましくは、16又は20個である。第一オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシドは、好ましくは、デオキシリボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される。
 第一オリゴヌクレオチドは、ギャップセグメント、5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントを有する。
 ギャップセグメントは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドからなる群より独立して選択される少なくとも5個のヌクレオシドからなり、少なくとも2つのデオキシリボヌクレオシドを含み、その3’末端及び5’末端が、それぞれ独立して、デオキシリボヌクレオシドである。ギャップセグメントは、好ましくは、「少なくとも4個の連続するデオキシリボヌクレオシド」を含む。
 ギャップセグメントに含まれるヌクレオシドの数は、好ましくは、5~28であり、より好ましくは5~16であり、さらに好ましくは8~12であり、さらにより好ましくは、9であるか又は10である。
 ある実施態様において、ギャップセグメントは、デオキシリボヌクレオシドから構成される。
 ギャップセグメントに含まれるヌクレオシド間結合(ウィングセグメントとギャップセグメントとの間のヌクレオシド間結合は含まれない。以下同じ。)は、好ましくはホスホジエステル結合及び修飾されたホスホジエステル結合から独立して選択される少なくとも1種であり、より好ましくは、ホスホジエステル結合及びホスホロチオエート結合から独立して選択される少なくとも1種である。ギャップセグメントに含まれるヌクレオシド間結合は、少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含むことが好ましく、50%以上がホスホロチオエート結合であることがより好ましく、75%以上がホスホロチオエート結合であることがより好ましく、80%以上がホスホロチオエート結合であることがさらに好ましく、90%以上がホスホロチオエート結合であることがさらにより好ましく、全てがホスホロチオエート結合であることが特に好ましい。
 5’ウィングセグメントは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドからなる群から独立して選択される少なくとも1個のヌクレオシドからなり、但し、ギャップセグメントに結合しているその3’末端は、糖修飾ヌクレオシドであり、そして「RNaseHによって認識される少なくとも4個の連続するヌクレオシド」を含まない。
 3’ウィングセグメントは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドからなる群から独立して選択される少なくとも1個のヌクレオシドからなり、但し、ギャップセグメントに結合しているその5’末端は、糖修飾ヌクレオシドであり、そして「RNaseHによって認識される少なくとも4個の連続するヌクレオシド」を含まない。
 5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントは、好ましくは、「少なくとも4個の連続するデオキシリボヌクレオシド」を含まない。
 以下、5’ウィングセグメントと3’ウィングセグメントに共通する性質について、ウィングセグメントとして言及する。
 ウィングセグメントに含まれるヌクレオシドの数は、それぞれ、1~15であり、好ましくは1~10であり、より好ましくは1~7であり、さらに好ましくは2~6であり、さらにより好ましくは2~5であり、さらに好ましくは3~5であり、特に好ましくは、3又は4である。
 ウィングセグメントに含まれる糖修飾ヌクレオシドは、置換等により、ATN1 mRNA及び/又はATN1 pre-mRNAの部分配列に対する親和性が増大したヌクレオシド又は核酸分解酵素に対する耐性が増大したヌクレオシドが好ましい。より好ましくは、2’修飾ヌクレオシド及び2’,4’-BNAから独立して選択される。
 ウィングセグメントに含まれる2’修飾ヌクレオシドは、好ましくは、2’-O-Meヌクレオシド、2’-O-MOEヌクレオシド、2’-O-APヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、2’-O-NMAヌクレオシド、2’-O-MCEヌクレオシド、2’-DMAECEヌクレオシド、2’-MоrECEヌクレオシド、2’-PyECEヌクレオシド及び2’-BimECEヌクレオシドからなる群から独立して選択される少なくとも1つであり、より好ましくは2’-O-Meヌクレオシド、2’-O-MOEヌクレオシド、2’-O-NMAヌクレオシド及び2’-O-MCEヌクレオシドからなる群から独立して選択される少なくとも1つであり、さらにより好ましくは、2’-O-MOEヌクレオシド及び2’-O-MCEヌクレオシドから独立して選択される少なくとも1つである。
 ウィングセグメントに含まれる2’,4’-BNAは、好ましくは、LNA、cEt、ENA、BNANC、AmNA、GuNA及びscpBNAからなる群から独立して選択される少なくとも1つであり、より好ましくはLNAである。
 ウィングセグメントに含まれる糖修飾ヌクレオシドは、より好ましくは、2’-O-MOEヌクレオシド、LNA及び2’-O-MCEヌクレオシドから独立して選択される少なくとも1つであり、さらに好ましくは、2’-O-MOEヌクレオシドであるか、2’-O-MCEヌクレオシドであるか、又はLNA及び2’-O-MCEヌクレオシドの組合せであり、さらにより好ましくは、2’-O-MOEヌクレオシドであるか、又はLNA及び2’-O-MCEヌクレオシドの組合せであり、特に好ましくはLNA及び2’-O-MCEヌクレオシドの組合せである。
 それぞれのウィングセグメントは、好ましくは、糖修飾ヌクレオシド及びデオキシリボヌクレオシドからなる群から独立して選択される1~10個のヌクレオシドからなり、糖修飾ヌクレオシドを少なくとも1個含む。より好ましくは、糖修飾ヌクレオシド及びデオキシリボヌクレオシドからなる群から独立して選択される2~6個のヌクレオシドからなり、糖修飾ヌクレオシドを少なくとも2個含む。さらに好ましくは、2’修飾ヌクレオシド及び2’,4’-BNAからなる群から独立して選択される2~6個のヌクレオシドからなり、さらに好ましくは、2’修飾ヌクレオシド及び2’,4’-BNAからなる群から独立して選択される3~5個のヌクレオシドからなる。
 それぞれのウィングセグメントは、より具体的にはLNA、2’-O-MCEヌクレオシド及び2’-O-MOEヌクレオシドから独立して選択される1~10個、好ましくは1~7個、より好ましくは2~6個、さらに好ましくは2~5個、さらにより好ましくは3~5個のヌクレオシドからなり、さらに好ましくは、LNA及び2’-O-MCEヌクレオシドから独立して選択される2~5個、より好ましくは3~5個のヌクレオシドからなり、その中でもさらに好ましくは、少なくとも1個の2’-O-MCEヌクレオシドを含み、さらに好ましくは、少なくとも1個のLNA及び少なくとも1個の2’-O-MCEヌクレオシドを含む。それぞれのウィングセグメントは、さらにより好ましくは、2個のLNA及び1又は2個の2’-O-MCEヌクレオシドからなり、特に好ましくは、2個のLNA及び1個の2’-O-MCEヌクレオシドからなる。別の態様として、それぞれのウィングセグメントは、より好ましくは、3~6個、特に好ましくは5個の2’-O-MOEヌクレオシドからなる。さらに別の態様として、より好ましくは、3~6個、特に好ましくは5個の2’-O-MCEヌクレオシドからなる。
 別の好ましい態様として、それぞれのウィングセグメントは、2’,4’-BNA及びデオキシリボヌクレオシドからなる群から独立して選択される2~5個のヌクレオシドからなり、少なくとも2個の2’,4’-BNAを含むオリゴヌクレオチドであり、そのようなオリゴヌクレオチドは国際公開第2016/127002号等を参考にできる。
 それぞれのウィングセグメントに含まれる好ましいLNAは、β-D-メチレンオキシBNAである。
 本発明のいくつかの実施形態では、5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して3、4、5、又は6個の糖修飾ヌクレオシドを含み、ギャップセグメントは、8、9、10、11、12、13、又は14個のデオキシリボヌクレオシドからなる。そのようなギャップマーのヌクレオシドの数は、[5’ウィングセグメントのヌクレオシド数-ギャップセグメントのヌクレオシド数-3’ウィングセグメントのヌクレオシド数]で表すことができ、例えば、5-10-5、5-11-4、4-11-5、4-12-4、3-14-3、6-8-6、3-12-3、3-10-3、4-10-4、3-10-4、4-10-3、3-9-3、4-9-4、3-9-4、4-9-3、3-8-3、3-8-4、4-8-3及び4-8-4個で表される。
 本発明のいくつかの実施形態では、第一オリゴヌクレオチドは、少なくとも11、12、13、14又は15個の連続するヌクレオシドを有し、ギャップセグメントは、少なくとも5、6、7、8、又は9個の連続するヌクレオシドを含み、5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントは、下記(i)から(iv)のいずれかである。
(i)5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントが、それぞれ独立して、3、4、5又は6個の2’-O-MOEヌクレオシドを含む。
(ii)5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントが、それぞれ独立して、3、4、5又は6個の2’-O-MCEヌクレオシドを含む。
(iii)5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントが、それぞれ独立して、2、3、4、5又は6個のLNAを含む。
(iv)5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントが、それぞれ独立して、2’-O-MCEヌクレオシド及びLNAから選択される3又は4個を含み、少なくとも1個の2’-O-MCEヌクレオシド及び少なくとも1個のLNAを含む。
 本発明において、5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントにおける糖修飾ヌクレオシドの配置は、それぞれ好ましくは、VLL、LVL、LLV、LVV、VLV、VVL、LLL、VVLL、VLVL、VLLV、LVLV、LLVV、LVVL、VLLL、LVLL、LLVL、LLLV、LVVV、VLVV、VVLV、及びVVVLからなる群から独立して選択される。
 より好ましくは、5’ウィングセグメントにおける糖修飾ヌクレオシドの配置は、LLL、VLL、LVL、VVL、LLV、VLVL、LVLV、LLVV及びVLLVからなる群から選択され、3’ウィングセグメントにおける糖修飾ヌクレオシドの配置は、LLL、LLV、LVL、LVV、VLL、LVLV、VLVL、VVLL及びVLLVからなる群から選択される。
 さらに好ましくは、5’ウィングセグメントにおける糖修飾ヌクレオシドの配置は、LLL、VLL、LVL、VVL、LLV、VLVL、LVLV、LLVV及びVLLVからなる群から選択され、3’ウィングセグメントにおける糖修飾ヌクレオシドの配置は、LLL、LLV、LVL、LVV、VLL、LVLV及びVLLVからなる群から選択される。
 さらにより好ましくは、5’ウィングセグメントにおける糖修飾ヌクレオシドの配置は、VLL、LVL、VVL、LLV、VLVL、及びVLLVからなる群から選択され、3’ウィングセグメントにおける糖修飾ヌクレオシドの配置は、LLV、LVL、LVV、VLL、LVLV及びVLLVからなる群から選択される。
 ここで、前記5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントにおけるL及びVは、それぞれ異なる修飾糖を有する糖修飾ヌクレオシドであり、左側が5’側を示し右側が3’側を示す。好ましくは、Lは2’-4’-架橋ヌクレオシドを示し、Vは2’修飾ヌクレオシドを示す。特に好ましくは、LはLNAを示し、Vは2’-O-MCEヌクレオシドを示す。
 5’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシドが2個以上(例えば2~10個)のとき、5’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合(ウィングセグメントとギャップセグメントとの間のヌクレオシド間結合は含まれない。以下同じ。)は、好ましくはホスホジエステル結合及び修飾されたホスホジエステル結合から独立して選択される少なくとも1種であり、より好ましくは、ホスホジエステル結合及びホスホロチオエート結合から独立して選択される少なくとも1種である。5’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合は、少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含むことが好ましく、50%以上がホスホロチオエート結合であることが好ましく、60%以上がホスホロチオエート結合であることがより好ましく、75%以上がホスホロチオエート結合であることがさらに好ましく、80%以上がホスホロチオエート結合であることがさらにより好ましく、90%以上がホスホロチオエート結合であることがさらにより好ましく、全てがホスホロチオエート結合であることが特に好ましい。
 3’ウィングセグメントは、5’ウィングセグメントと同様である。
 別の態様として、ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合は、毒性を低減できるという観点から、全てがホスホジエステル結合であってもよいが、一部がホスホジエステル結合であることが好ましい。
 5’ウィングセグメントに含まれる5’末端のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合が好ましい。3’ウィングセグメントに含まれる3’末端のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合が好ましい。5’ウィングセグメントの含まれる5’末端のヌクレオシド間結合を除く5’ウィングセグメントの他のヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合であってもホスホロチオエート結合であってもよいが、50%以上がホスホジエステル結合であることが好ましく、60%以上がホスホジエステル結合であることがより好ましく、75%以上がホスホジエステル結合であることがさらに好ましく、80%以上がホスホジエステル結合であることがさらにより好ましく、90%以上がホスホジエステル結合であることがさらにより好ましく、全てがホスホジエステル結合であることが特に好ましい。3’ウィングセグメントの3’末端のヌクレオシド間結合を除く3’ウィングセグメントの他のヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合であってもホスホロチオエート結合であってもよいが、50%以上がホスホジエステル結合であることが好ましく、60%以上がホスホジエステル結合であることがより好ましく、75%以上がホスホジエステル結合であることがさらに好ましく、80%以上がホスホジエステル結合であることがさらにより好ましく、90%以上がホスホジエステル結合であることがさらにより好ましく、全てがホスホジエステル結合であることが特に好ましい。各ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合のうち、ギャップセグメントに最も近くに位置するヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合が好ましい。
 例えば、5’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合が2個であるとき、5’末端のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合が好ましく、ギャップセグメント側のヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合が好ましい。
 5’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合が3個であるとき、5’末端のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合が好ましく、5’ウィングセグメントに含まれる他の2個のヌクレオシド間結合は、独立してホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合であることが好ましく、ホスホジエステル結合であることが特に好ましい。
 5’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合が4個であるとき、5’末端のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合が好ましく、5’ウィングセグメントに含まれる他の3個のヌクレオシド間結合は、独立してホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合が好ましく、ホスホジエステル結合であることが特に好ましい。
 3’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合が2個であるとき、3’末端のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合が好ましく、ギャップセグメント側のヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合が好ましい。
 3’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合が3個であるとき、3’末端のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合が好ましく、3’ウィングセグメントに含まれる他の2個のヌクレオシド間結合は、独立してホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合であることが好ましく、ホスホジエステル結合であることが特に好ましい。
 3’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合が4個であるとき、3’末端のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合が好ましく、3’ウィングセグメントに含まれる他の3個のヌクレオシド間結合は、独立してホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合が好ましく、ホスホジエステル結合であることが特に好ましい。
 なお、5’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシドが1個のとき、その5’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合は0個であり、3’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシドが1個のとき、その3’ウィングセグメントに含まれるヌクレオシド間結合は0個である。
 第一オリゴヌクレオチドにおいて、好ましくは5’ウィングセグメントの3’末端とギャップセグメントの5’末端が、ホスホジエステル結合若しくは修飾されたホスホジエステル結合を形成して連結されており、3’ウィングセグメントの5’末端とギャップセグメントの3’末端が、ホスホジエステル結合若しくは修飾されたホスホジエステル結合を形成して連結されている。より好ましくは、5’ウィングセグメントの3’末端とギャップセグメントの5’末端が、修飾されたホスホジエステル結合を形成して連結されており、3’ウィングセグメントの5’末端とギャップセグメントの3’末端が、修飾されたホスホジエステル結合を形成して連結されている。さらに好ましくは、5’ウィングセグメントの3’末端とギャップセグメントの5’末端が、ホスホロチオエート結合を形成して連結されており、3’ウィングセグメントの5’末端とギャップセグメントの3’末端が、ホスホロチオエート結合を形成して連結されている。
 第一オリゴヌクレオチドの別の実施形態においては、好ましくは、5’ウィングセグメントの3’末端とギャップセグメントの5’末端が、ホスホジエステル結合を形成して連結されており、3’ウィングセグメントの5’末端とギャップセグメントの3’末端が、ホスホロチオエート結合を形成して連結されている。
 第一オリゴヌクレオチドにおいて、5’ウィングセグメントの3’末端とギャップセグメントの5’末端が、ホスホロチオエート結合を形成して連結されており、3’ウィングセグメントの5’末端とギャップセグメントの3’末端が、ホスホジエステル結合を形成して連結されていてもよく、5’ウィングセグメントの3’末端とギャップセグメントの5’末端が、ホスホジエステル結合を形成して連結されており、3’ウィングセグメントの5’末端とギャップセグメントの3’末端が、ホスホジエステル結合を形成して連結されていてもよい。
 第一オリゴヌクレオチドは、好ましくは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号59~104、109~133、173~192、207~272、300~319、353~372、419~434、458~509、523~559、561~618、626~685、766~785、787~819、838~855、880~922、924~943、970~989、994~1039、1055~1074、1079~1098、1157~1176、1196~1223、1310~1329、1339~1399、1423~1442、1614~1633、1650~1670、1806~1833、1844~1865、1896~1915、1924~1992、2023~2042、2058~2081、2103~2124、2398~2417、2480~2520、2526~2562、2568~2587、2853~2872、2876~2923、2931~2950、2972~3016、3072~3099、3109~3128、3192~3211、3267~3290、3333~3379、3419~3557、3765~3784、3789~3853、3888~3926、4022~4062、4118~4139、4141~4156、4218~4236、及び4266~4281で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、より好ましくは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号238~272、537~559、585~618、664~683、787~819、838~855、924~943、972~987、994~1029、1055~1074、1080~1095、1204~1219、1310~1329、1362~1397、1650~1670、1806~1833、1844~1865、1896~1915、1955~1992、2058~2081、2103~2124、2480~2503、2876~2923、2931~2946、2979~3016、3109~3128、3192~3211、3267~3290、3333~3379、3419~3557、3812~3833、3888~3926、4022~4062、4118~4137、4218~4236、及び4266~4281で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、より好ましくは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3419~3557で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、より好ましくは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3449~3557で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、より好ましくは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3451~3520で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、さらにより好ましくは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3451~3484、及び3487~3520で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、さらにより好ましくは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3451~3475、及び3490~3505で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的である。
 特に好ましいATN1 mRNAへの相補的な位置は、以下に挙げられる。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3451~3468で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3452~3467で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3453~3468で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3457~3476で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3458~3477で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3459~3474で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3459~3476で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3460~3475で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3461~3476で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3465~3484で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3487~3502で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3488~3503で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3490~3505で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3501~3520で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 上記のほか、特に好ましいATN1 mRNAへの相補的な位置は、以下に挙げられる。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号538~553で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号587~602で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号666~681で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号1363~1378で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号1975~1990で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号2888~2903で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号2979~2994で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号3520~3535で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表されるATN1 mRNAの核酸塩基の位置番号4221~4236で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドと配列番号1で表されるATN1 mRNA(例えば、上述の各標的領域)の該当部分との相補性は、少なくとも80%以上、好ましくは85%以上、より好ましくは90%以上、さらにより好ましくは、95%、96%、97%、98%、99%以上である。
 第一オリゴヌクレオチドは、好ましくは配列番号1で表されるATN1 mRNAの上述の各標的領域の少なくとも一部と相補的な8~30個のヌクレオシドからなる。さらに好ましくは10~25個、さらに好ましくは16~20個、特に好ましくは16個又は20個のヌクレオシドからなる。
 第一オリゴヌクレオチドは、好ましくは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号383~398、986~1001、1004~1019、1378~1393、1398~1413、1853~1868、1971~1986、2189~2204、2522~2537、2562~2577、3662~3677、3987~4002、4217~4232、4266~4281、4335~4350、4360~4375、4477~4492、4562~4577、4636~4651、4687~4702、4734~4749、4840~4855、5536~5563、5568~5592、5632~5651、5666~5715、5906~5925、5959~5978、6176~6191、6215~6266、6963~6978、7248~7284、7286~7343、7351-7410、7491~7510、7512~7544、7563~7580、7605~7647、7649~7668、7695~7714、7719~7764、7780~7799、7804~7823、7882~7901、7921~7948、8035~8054、8064~8124、8148~8167、8339~8358、8375~8395、8531~8558、8569~8590、8621~8640、8649~8717、8748~8767、8783~8806、8828~8849、9123~9142、9205~9245、9336~9351、9534~9570、9576~9595、9923~9938、10001~10016、10056~10071、10274~10293、10297~10344、10352~10371、10393~10437、10493~10520、10530~10549、10613~10632、10688~10711、10754~10800、10840~10865、12508~12680、12723~12738、13454~13518、13553~13591、13687~13727、13783~13804、13806~13821、13883~13901、及び13931~13946で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、より好ましくは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号986~1001、1004~1019、1378~1393、1398~1413、4217~4232、4335~4350、4360~4375、4477~4492、4562~4577、4636~4651、4687~4702、4734~4749、4840~4855、5697~5715、6963~6978、7262~7284、7310~7343、7389~7408、7512~7544、7563~7580、7649~7668、7697~7712、7719~7754、7780~7799、7805~7820、7929~7944、8035~8054、8087~8122、8375~8395、8531~8558、8569~8590、8621~8640、8680~8717、8783~8806、8828~8849、9205~9228、10297~10344、10352~10367、10400~10437、10530~10549、10613~10632、10688~10711、10754~10800、10840~10865、12508~12523、12572~12680、12723~12738、13477~13498、13553~13591、13687~13727、13783~13802、13883~13901、及び13931~13946で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、さらに好ましくは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12508~12680で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、さらにより好ましくは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12572~12680で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、さらに好ましくは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12574~12643で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、さらに好ましくは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12574~12607、及び12610~12643で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、さらにより好ましくは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12574~12598、及び12613~12628で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的である。
 特に好ましいATN1 pre-mRNAへの相補的な位置は、以下に挙げられる。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12574~12591で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12575~12590で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12576~12591で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12580~12599で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12581~12600で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12582~12597で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12582~12599で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12583~12598で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12584~12599で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12588~12607で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12610~12625で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12611~12626で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12613~12628で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12624~12643で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 上記のほか、特に好ましいATN1 pre-mRNAへの相補的な位置は、以下に挙げられる。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号4335~4350で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号4360~4375で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号7263~7278で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号7312~7327で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号7391~7406で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号8088~8103で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号10309~10324で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号10400~10415で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12643~12658で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号13886~13901で示される核酸塩基配列の少なくとも一部と相補的である。
 第一オリゴヌクレオチドと配列番号2で表されるATN1 pre-mRNA(例えば、上述の各標的領域)の該当部分との相補性は、少なくとも80%以上、好ましくは85%以上、より好ましくは90%以上、さらにより好ましくは、95%、96%、97%、98%、99%以上である。
 第一オリゴヌクレオチドは、好ましくは配列番号2で表されるATN1 pre-mRNAの上述の各標的領域の少なくとも一部と相補的な8~30個のヌクレオシドからなる。さらに好ましくは10~25個、さらに好ましくは16~20個、特に好ましくは16個又は20個のヌクレオシドからなる。
 第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、好ましくは、配列番号3~716及び718~770のいずれかの核酸塩基配列の少なくとも8個、より好ましくは、8、9、10、11、12、13、14又は15個の連続核酸塩基を含む。
 第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、より好ましくは、配列番号3~716及び718~770の核酸塩基配列のいずれかを含む。
 第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、好ましくは、核酸塩基配列群Aのいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個、より好ましくは、8、9、10、11、12、13、14又は15個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有し、さらに好ましくは核酸塩基配列群Aのいずれか1つの核酸塩基配列を含む。
 その他の態様として、第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、より好ましくは、核酸塩基配列群Bのいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個、より好ましくは、8、9、10、11、12、13、14又は15個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有し、さらに好ましくは核酸塩基配列群Bのいずれか1つの核酸塩基配列を含む。
 その他の態様として、第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、さらに好ましくは、核酸塩基配列群Cのいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個、さらにより好ましくは、8、9、10、11、12、13、14又は15個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有し、特に好ましくは核酸塩基配列群Cのいずれか1つの核酸塩基配列を含む。
核酸塩基配列群A:
配列番号3、4、9、10、12、13、18、19、20、21、26、29、34、37、38、39、40、44、45、46、47、48、49、50、52、55、59、60、61、62、63、66、67、68、69、70、72、74、75、78、79、82、83、84、85、86、87、88、89、91、92、94、95、97、99、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、126、127、128、131、132、133、137、138、139、148、151、152、153、154、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、238、239、240、241、242、247、248、253、254、255、256、258、259、263、264、274、276、277、278、280、281、283、286、287、288、291、292、293、294、296、297、298、299、300、302、303、304、305、306、307、309、310、311、313、314、315、316、317、319、320、321、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、335、337、338、339、340、341、342、344、345、346、347、348、349、350、355、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、369、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、382、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、494、513、515、533、534、544、551、552、554、566、574、582、585、586、589、592、593、595、596、638、639、642、644、661、662、663、664、665、666、667、668、669,670、671、672、673、674、675、676、677、696、697、699、706、713、715、716、722、723、724、727、728、729、730、731、732、733、734、735、736、737、738、739、740、741、742、743、744、745、746,748、750、751、752、753、754、755、756、757、758、759、760、761、762、763、764、765、766、767、768、769及び770からなる群。
核酸塩基配列群B:
配列番号19、37、38、47、55、59、61、62、67、68、70、72、75、78、82、83、84、85、86、88、89、91、101、102、103、104、105、106、107、109、111、112、113、114、117、120、121、122、124、128、138、151、152、153、154、156、157、159、160、161、163、168、169、171、174、180、181、184、185、186、187、188、189、190、192、194、195、196、197、198、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、238、239、240、241、298、299、302、310、316、320、326、327、328、332、333、337、345、346、350、355、357、358、361、362、363、364、365、366、367、372、375、376、377、378、379、382、394、395、397、398、400、401、403、404、407、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、477、478、479、480、482、483、484、485、486、488、489、490、491、492、513、515、533、534、585、586、589、592、593、595、596、661、662、663、664、665、666、667、668、669,670、671、672、673、674、675、676、677、697、699、706、713、715、716、722、723、724、727、728、729、730、731、732、733、734、735、736、737、738、739、740、741、742、743、744、745、746,748、750、751、752、753、754、755、756、757、758、759、760、761、762、763、764、765、766、767、768、769及び770からなる群。
核酸塩基配列群C:
配列番号47、105、174、207、209、214、215、216、221、240、424、425、432、464、585、586、715及び716からなる群。
 核酸塩基配列群Cに列挙された配列番号のうち、好ましい配列番号は、以下に挙げられる。
 配列番号209、配列番号215、配列番号216、配列番号221、配列番号715。
 核酸塩基配列群Cに列挙された配列番号のうち、特に好ましい配列番号は、上記のほか、以下に挙げられる。
 配列番号47、配列番号105、配列番号174、配列番号214、配列番号240、配列番号585、配列番号586。
 別の態様では、第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、好ましくは、核酸塩基配列群D1及びD3のいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個、より好ましくは、8、9、10、11、12、13、14又は15個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有し、さらに好ましくは核酸塩基配列群D1及びD3のいずれか1つの核酸塩基配列を含む。かかる態様において、第一オリゴヌクレオチドは、好ましくは8~30個、より好ましくは12~25個、さらに好ましくは12~22個、さらにより好ましくは16~20個、さらにより好ましくは16~18個、特に好ましくは16個のヌクレオシドからなる。
 別の態様では、第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、好ましくは、核酸塩基配列群D2のいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個、より好ましくは、8、9、10、11、12、13、14又は15個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有し、さらに好ましくは核酸塩基配列群D3のいずれか1つの核酸塩基配列を含む。かかる態様において、第一オリゴヌクレオチドは、好ましくは8~30個、より好ましくは12~25個、さらに好ましくは12~22個、さらにより好ましくは16~20個、特に好ましくは18個のヌクレオシドからなる。
 さらに別の態様として、第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、より好ましくは、核酸塩基配列群Eのいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個、より好ましくは、8、9、10、11、12、13、14又は15個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有し、さらに好ましくは核酸塩基配列群Eのいずれか1つの核酸塩基配列を含む。かかる態様において、第一オリゴヌクレオチドは、好ましくは8~30個、より好ましくは16~25個、さらに好ましくは16~22個、さらにより好ましくは16~20個、特に好ましくは20個のヌクレオシドからなる。
 核酸塩基配列群D1:
配列番号3、4、9、10、12、13、18、19、20、21、26、29、34、37、38、39、40、44、45、46、47、48、49、50、52、55、59、60、61、62、63、66、67、68、69、70、72、74、75、78、79、82、83、84、85、86、87、88、89、91、92、94、95、97、99、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、126、127、128、131、132、133、137、138、139、148、151、152、153、154、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、238、239、240、241、494、513、515、533、534、544、551、552、554、566、574、582、585、586、589、592、593、595、596、638、639、642、644、661、696、697、699、706及び713からなる群。
 核酸塩基配列群D1に列挙された配列番号のうち、特に好ましい配列番号は、以下に挙げられる。
 配列番号208、配列番号215、配列番号220、配列番号221、配列番号222。
 核酸塩基配列群D1に列挙された配列番号のうち、特に好ましい配列番号は、上記のほか、以下に挙げられる。
 配列番号47、配列番号105、配列番号174、配列番号214、配列番号240、配列番号585、配列番号586。
 核酸塩基配列群D2:
配列番号488、489、490、491、492、662、663、664、665、666、667、668、669,670、671、672、673、674、675、676、677、715及び716からなる群。
 核酸塩基配列群D3:
配列番号722、723、724、727、728、729、730、731、732、733、734、735、736、737、738、739、740、741、742、743、744、745、746,748、750、751、752、753、754、755、756、757、758、759、760、761、762、763、764、765、766、767、768、769及び770からなる群。
 核酸塩基配列群E:
配列番号242、247、248、253、254、255、256、258、259、263、264、274、276、277、278、280、281、283、286、287、288、291、292、293、294、296、297、298、299、300、302、303、304、305、306、307、309、310、311、313、314、315、316、317、319、320、321、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、335、337、338、339、340、341、342、344、345、346、347、348、349、350、355、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、369、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、382、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486及び487からなる群。
 核酸塩基配列群D1のいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する第一オリゴヌクレオチドは、好ましくは、それぞれのウィングセグメントに、少なくとも1個のLNA及び少なくとも1個の2’-O-MCEヌクレオシドを有し、中でも好ましくは、1又は2個のLNAと1又は2個の2’-O-MCEヌクレオシドとを有し、さらに好ましくは、2個のLNAと1個の2’-O-MCEヌクレオシドとを、あるいは1個のLNAと2個の2’-O-MCEヌクレオシドとを有する。2個のLNAと2個の2’-O-MCEヌクレオシドとを有してもよい。特に好ましくは、2個のLNA及び1個の2’-O-MCEヌクレオシドを有する。
 核酸塩基配列群D2のいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する第一オリゴヌクレオチドは、好ましくは、それぞれのウィングセグメントに、少なくとも1個のLNA及び少なくとも1個の2’-O-MCEヌクレオシドを有し、中でも好ましくは、1又は2個のLNAと1又は2個の2’-O-MCEヌクレオシドとを有し、特に好ましくは、2個のLNA及び2個の2’-O-MCEヌクレオシドを有する。
 核酸塩基配列群D3のいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する第一オリゴヌクレオチドは、好ましくは、それぞれのウィングセグメントに、少なくとも1個のLNAを有し、中でも好ましくは、1から3個のLNAを有し、特に好ましくは、3個のLNAを有する。
 核酸塩基配列群Eのいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する第一オリゴヌクレオチドは、それぞれのウィングセグメントに、特に好ましくは少なくとも1個の2’-O-MOEヌクレオシド又は少なくとも1個の2’-O-MCEヌクレオシドを有し、中でも好ましくは5個の2’-O-MOEヌクレオシド又は5個の2’-O-MCEヌクレオシドを有し、さらに特に好ましくは5個の2’-O-MOEヌクレオシドを有する。
 次に、第二オリゴヌクレオチドの好適な形態について説明する。
 第二オリゴヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなる。第一オリゴヌクレオチドの少なくとも一部とのハイブリダイズを可能とする配列を含む。
 第二オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシドの数は、8~30個であり、好ましくは、8~25個であり、より好ましくは13~23個であり、さらに好ましくは15~21個であり、さらにより好ましくは、16~20個であり、特に好ましくは、16又は20個である。
 第二オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシドの数は、第一オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシドの数と同一であってもよく、異なっていてもよい。その差は、3個以内であることが好ましく、1個以内であることがより好ましく、同一であることが特に好ましい。
 第二オリゴヌクレオチドは、第一オリゴヌクレオチドの少なくとも一部と、分子内あるいは分子間でハイブリダイズする。
 一本鎖オリゴヌクレオチドにおける第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとは、分子内でハイブリダイズしても分子間でハイブリダイズしてもよいが、好ましくは分子内でハイブリダイズする。また、一本鎖オリゴヌクレオチドにおける第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとは、分子内でハイブリダイズしていることが好ましい。
 二本鎖オリゴヌクレオチド複合体における第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとは、分子間でハイブリダイズしている。
 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとがハイブリダイズするために完全に相補的である必要はないが、相補性は、好ましくは70%以上であり、より好ましくは80%以上であり、さらに好ましくは90%以上(例えば、95%、96%、97%、98%、99%以上)である。第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとは、完全に相補的であってもよい。
 第二オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列と相補性が高い配列であるため、第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列を基に設計できる。
 第二オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、好ましくは、配列番号3~716及び718~770のいずれかの核酸塩基配列と相補的であり、より好ましくは、核酸塩基配列群Aから選択される核酸塩基配列と相補的であり、さらに好ましくは、核酸塩基配列群Bから選択される核酸塩基配列と相補的であり、さらにより好ましくは、核酸塩基配列群Cから選択される核酸塩基配列と相補的である。
 第二オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列は、核酸塩基配列群D(好ましくはD1)から選択される核酸塩基配列と相補的であってもよく、または核酸塩基配列群Eから選択される核酸塩基配列と相補的であってもよい。
 第二オリゴヌクレオチドが有する特に好ましい核酸塩基配列は、以下に挙げられ、第一オリゴヌクレオチドが有する核酸塩基配列と相補的な核酸塩基配列が選ばれる。
CCUCGGUGCACCCUCUCA (配列番号782)、
CUCGGUGCACCCUCUC (配列番号783)、
UCGGUGCACCCUCUCA (配列番号784)、
UGCACCCUCUCAUUGACCCC (配列番号785)、
GCACCCUCUCAUUGACCCCC (配列番号786)、
CACCCUCUCAUUGACC (配列番号787)、
CACCCUCUCAUUGACCCC (配列番号788)、
ACCCUCUCAUUGACCC (配列番号789)、
CCCUCUCAUUGACCCC (配列番号790)、
CUCAUUGACCCCCUGGCCUC (配列番号791)、
GGUCUCACCUUACCCG (配列番号792)、
GUCUCACCUUACCCGG (配列番号793)、
CUCACCUUACCCGGAU (配列番号794)、
CGGAUCCCCUACCCAGCUGG (配列番号795)。
GGAUAUUUUGAGUCUU (配列番号811)、
UGGUACAUCUGUGUUG (配列番号812)、
GAACUCUCCCUAACCC (配列番号813)、
CCAGCCUCUGCCUCGG (配列番号814)、
GGUUACAAUGUCCCGG (配列番号815)、
CCGAUCUGGAUAGCUU (配列番号816)、
GACUCAUCUUCUGGCC (配列番号817)、
CAGUGAAUAUGCCCGG (配列番号818)、
CGACCCUAGGGAUAUC (配列番号819)、
CCUACCCAUGUUCACA (配列番号820)、
AUGUAUGCCCCUUGCC (配列番号821)、
CUAGUAGUAGCUCUGC (配列番号822)。
 第二オリゴヌクレオチドは、RNaseHによって切断されることが好ましいため、少なくとも1つのリボヌクレオシドを含むことが好ましく、少なくとも4個の連続するリボヌクレオシドを含むことがより好ましく、4~25個の連続するリボヌクレオシドを含むことがより好ましい。該連続するリボヌクレオシドのヌクレオシドの個数は、好ましくは13~23個であり、より好ましくは15~21個であり、さらに好ましくは、16~20個であり、特に好ましくは、16又は20個である。この連続するヌクレオシドは、それぞれ同一であっても、異なっていてもよい。第二オリゴヌクレオチドは、オリゴリボヌクレオチドであることが好ましく、RNAであることがより好ましい。第二オリゴヌクレオチドにおけるオリゴリボヌクレオチドに含まれるリボヌクレオシドの核酸塩基は、好ましくは、アデニン、グアニン、チミン、シトシン及びウラシルからなる群から選択される少なくとも1つであり、より好ましくは、アデニン、グアニン、シトシン及びウラシルからなる群から選択される少なくとも1つである。第二オリゴヌクレオチドにおけるオリゴリボヌクレオチドに含まれるリボヌクレオシドは、好ましくは、ホスホジエステル結合で連結されている。
 別の態様として、第二オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つのデオキシリボヌクレオシドを含むことが好ましく、少なくとも4個の連続するデオキシリボヌクレオシドを含むことがより好ましく、4~25個の連続するデオキシリボヌクレオシドを含むことがより好ましい。この連続するヌクレオシドは、それぞれ同一であっても、異なっていてもよい。第二オリゴヌクレオチドは、オリゴデオキシリボヌクレオチドであることが好ましく、DNAであることがより好ましい。第二オリゴヌクレオチドにおけるオリゴデオキシリボヌクレオチドに含まれるデオキシリボヌクレオシドの核酸塩基は、好ましくは、アデニン、グアニン、チミン、シトシン及びウラシルからなる群から選択される少なくとも1つであり、より好ましくは、アデニン、グアニン、チミン及びシトシンからなる群から選択される少なくとも1つである。第二オリゴヌクレオチドにおけるオリゴデオキシリボヌクレオチドに含まれるデオキシリボヌクレオシドは、好ましくは、ホスホジエステル結合で連結されている。
 さらに別の態様として、第二オリゴヌクレオチドは、第二オリゴヌクレオチドの5’末端側及び3’末端側の少なくとも一方に、1又は複数の糖修飾ヌクレオシドを含むことが好ましく、5’末端側及び3’末端側の少なくとも一方に1~7個の糖修飾ヌクレオシドを含むことがより好ましく、5’末端側及び3’末端側の少なくとも一方に2~5個の糖修飾ヌクレオシドを含むことがさらに好ましく、5’末端側及び3’末端側の少なくとも一方に2~3個の糖修飾ヌクレオシドを含むことがさらにより好ましい。ここで、第二オリゴヌクレオチドが、第二オリゴヌクレオチドの5’末端側に、1又は複数の糖修飾ヌクレオシドを含むとき、第二オリゴヌクレオチドの5’末端のヌクレオシドは、糖修飾ヌクレオシドである。同様に、第二オリゴヌクレオチドが、第二オリゴヌクレオチドの3’末端側に、1又は複数の糖修飾ヌクレオシドを含むとき、第二オリゴヌクレオチドの3’末端のヌクレオシドは、糖修飾ヌクレオシドである。
 第二オリゴヌクレオチドの5’末端が第三オリゴヌクレオチドに結合しているとき、第二オリゴヌクレオチドは、第二オリゴヌクレオチドの3’末端側に、1又は複数の糖修飾ヌクレオシドを含むことが好ましい。第二オリゴヌクレオチドの3’末端が第三オリゴヌクレオチドに結合しているとき、第二オリゴヌクレオチドは、第二オリゴヌクレオチドの5’末端側に、1又は複数の糖修飾ヌクレオシドを含むことが好ましい。ここで、第二オリゴヌクレオチドは、5’末端側及び3’末端側の少なくとも一方における複数の糖修飾ヌクレオシドの間に、1又は複数のデオキシリボヌクレオシド若しくはリボヌクレオシド又はその両方を含んでも、含まなくてもよいが、含まないことが好ましい。すなわち、第二オリゴヌクレオチドの5’末端及び/又は3’末端から数えて1又は複数のヌクレオシドが糖修飾ヌクレオシドであることが好ましい。
 第二オリゴヌクレオチドが含むヌクレオシド間結合は、好ましくはホスホジエステル結合及び修飾されたホスホジエステル結合から独立して選択される少なくとも1種であり、より好ましくは、ホスホジエステル結合及びホスホロチオエート結合から独立して選択される少なくとも1種である。第二オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシド間結合は、少なくとも1個のホスホジエステル結合を含むことが好ましく、50%以上がホスホジエステル結合であることがより好ましく、75%以上がホスホジエステル結合であることがより好ましく、80%以上がホスホジエステル結合であることがさらに好ましく、90%以上がホスホジエステル結合であることがさらにより好ましく、全てがホスホジエステル結合であることが特に好ましい。
 別の態様として、第二オリゴヌクレオチドは、第二オリゴヌクレオチドの5’側末端側及び3’側末端側の少なくとも一方に、1又は複数のホスホロチオエート結合を含むことが好ましく、1~7個のホスホロチオエート結合を含むことがより好ましく、2~5個のホスホロチオエート結合を含むことがさらに好ましく、2~3個のホスホロチオエート結合を含むことがさらにより好ましい。
 第二オリゴヌクレオチドの5’末端が第三オリゴヌクレオチドに結合しているとき、第二オリゴヌクレオチドは、3’末端側に1又は複数のホスホロチオエート結合を含むことが好ましい。第二オリゴヌクレオチドの3’末端が第三オリゴヌクレオチドに結合しているとき、第二オリゴヌクレオチドは、5’末端側に1又は複数のホスホロチオエート結合を含むことが好ましい。
 第二オリゴヌクレオチドが、第二オリゴヌクレオチドの5’末端側に、1又は複数のホスホロチオエート結合を含むとき、第二オリゴヌクレオチドの5’末端のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合である。さらに、第二オリゴヌクレオチドの5’末端から数えて1又は複数のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であることが好ましい。
 第二オリゴヌクレオチドが、第二オリゴヌクレオチドの3’末端側に、1又は複数のホスホロチオエート結合を含むとき、第二オリゴヌクレオチドの3’末端のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合である。さらに、第二オリゴヌクレオチドの3’末端から数えて1又は複数のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合であることが好ましい。
 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される1~20個のヌクレオシドからなる第三オリゴヌクレオチドによって連結されていてもいなくてもよいが、好ましくは連結されている。
 次に、第三オリゴヌクレオチドの好適な形態について説明する。
 第三オリゴヌクレオチドは、前述の第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドを連結しているリンカーである。第三オリゴヌクレオチドは前述の第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとを、第一オリゴヌクレオチド-第三オリゴヌクレオチド-第二オリゴヌクレオチドの順に連結している。
 第三オリゴヌクレオチドと第一オリゴヌクレオチドとは共有結合で連結され、例えば、第三オリゴヌクレオチドと第一オリゴヌクレオチドのそれぞれの末端ヌクレオシドがホスホジエステル結合で連結されていることが好ましい。第三オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとは共有結合で連結され、例えば、第三オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドのそれぞれの末端ヌクレオシドがホスホジエステル結合で連結されていることが好ましい。
 第一オリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオシドと第三オリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオシドで連結し、第二オリゴヌクレオチド3’末端ヌクレオシドと第三オリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオシドで連結しているか、又は第一オリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオシドと第三オリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオシドで連結し、第二オリゴヌクレオチド5’末端ヌクレオシドと第三オリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオシドで連結していることが好ましい。第一オリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオシドと第三オリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオシドで連結し、第二オリゴヌクレオチド3’末端ヌクレオシドと第三オリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオシドで連結していることがより好ましい。
 第三オリゴヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される1~20個のヌクレオシドからなる。第三オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシドは、好ましくは、デオキシリボヌクレオシド及びリボヌクレオシドから独立して選択され、より好ましくはリボヌクレオシドから独立して選択される。
 第三オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシドの数は、1~20個であり、好ましくは、2~15個であり、より好ましくは3~10個であり、さらに好ましくは3~7個であり、さらにより好ましくは、4又は5個であり、特に好ましくは、4個である。
 第三オリゴヌクレオチドは、好ましくはホスホジエステル結合で連結されたオリゴヌクレオチドである。
 第三オリゴヌクレオチドは、例えばオリゴデオキシリボヌクレオチド又はオリゴリボヌクレオチドであり、より好ましくはDNA又はRNAであり、さらにより好ましくはRNAである。
 第三オリゴヌクレオチドにおける前記オリゴデオキシリボヌクレオチドに含まれるデオキシリボヌクレオシドの核酸塩基は、好ましくは、アデニン、グアニン、チミン、シトシン及びウラシルからなる群から選択される少なくとも1つであり、より好ましくは、アデニン、グアニン、チミン及びシトシンからなる群から選択される少なくとも1つである。第三オリゴヌクレオチドにおけるオリゴデオキシリボヌクレオチドに含まれるデオキシリボヌクレオシドは、好ましくは、ホスホジエステル結合で連結されている。
 第三オリゴヌクレオチドにおける前記オリゴリボヌクレオチドに含まれるリボヌクレオシドの核酸塩基は、好ましくは、アデニン、グアニン、チミン、シトシン及びウラシルからなる群から選択される少なくとも1つであり、より好ましくは、アデニン、グアニン、シトシン及びウラシルからなる群から選択される少なくとも1つである。第三オリゴヌクレオチドにおけるオリゴデオキシリボヌクレオチドに含まれるリボヌクレオシドは、好ましくは、ホスホジエステル結合で連結されている。
 第三オリゴヌクレオチドは、第三オリゴヌクレオチドの内において部分的に自己相補的な配列を含んでいてもよく、含んでいなくてもよいが、第三オリゴヌクレオチドは、第三オリゴヌクレオチドの内において部分的に自己相補的な配列を含んでいないことが好ましい。そのようなオリゴヌクレオチドの例として、ホスホジエステル結合で連結された(N)n(Nは、それぞれ独立してアデノシン、ウリジン、シチジン、グアノシン、2’-デオキシアデノシン、チミジン、2’-デオキシシチジン、又は2’-デオキシグアノシンであり、nは1~20個の整数(繰り返し数)である。)を挙げることができる。中でも、nは好ましくは2~15個であり、より好ましくは3~10個であり、さらに好ましくは3~7個であり、さらにより好ましくは、4又は5個であり、特に好ましくは4個である。Nは、より好ましくは、それぞれ独立してアデノシン、ウリジン、シチジン又はグアノシンであり、特に好ましくは、アデノシンである。
 第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとが第三オリゴヌクレオチドによって連結されている、本発明の一本鎖オリゴヌクレオチドは、好ましくは配列番号771、772、773、774、775、776、777、778、779、780、781からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも30個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
 本発明の一本鎖オリゴヌクレオチドは、より好ましくは配列番号772、773、774、775、776からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも30個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
 本発明の一本鎖オリゴヌクレオチドは、さらに好ましくは、772、773、774、775、776からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有し、さらにより好ましくは、772、773、774、775、776からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する。
 本発明の一本鎖オリゴヌクレオチドは、特に好ましくは配列番号772、773、774、775、776からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列有する。
 配列番号771~775のいずれかで示される核酸塩基配列において、5’末端側から数えてその1~16番目の核酸塩基は、第二オリゴヌクレオチドの核酸塩基に対応し、その17~20番目の核酸塩基は、第三オリゴヌクレオチドの核酸塩基に対応し、その21~36番目の核酸塩基は、第一オリゴヌクレオチドの核酸塩基に対応する。
 配列番号776又は777で示される核酸塩基配列において、5’末端側から数えてその1~18番目の核酸塩基は、第二オリゴヌクレオチドの核酸塩基に対応し、その19~22番目の核酸塩基は、第三オリゴヌクレオチドの核酸塩基に対応し、その23~40番目の核酸塩基は、第一オリゴヌクレオチドの核酸塩基に対応する。
 配列番号778~781で示される核酸塩基配列において、5’末端側から数えてその1~20番目の核酸塩基は、第二オリゴヌクレオチドの核酸塩基に対応し、その21~24番目の核酸塩基は、第三オリゴヌクレオチドの核酸塩基に対応し、その25~44番目の核酸塩基は、第一オリゴヌクレオチドの核酸塩基に対応する。
 本発明のASO誘導体を構成する第一オリゴヌクレオチド又は第二オリゴヌクレオチドには、直接的に又は間接的に機能性分子が結合していてもよい。機能性分子と第一オリゴヌクレオチド又は第二オリゴヌクレオチドとの結合は、直接的でも、他の物質を介して間接的でもよいが、共有結合、イオン結合又は水素結合でオリゴヌクレオチドと機能性分子とが結合していることが好ましい。その結合の安定性が高いという観点から、共有結合で直接的に結合していること、又は共有結合でリンカー(連結基)を介して結合していることがより好ましい。
 前記機能性分子が、共有結合で第一オリゴヌクレオチド又は第二オリゴヌクレオチドに結合する場合、前記機能性分子は、第一オリゴヌクレオチド又は第二オリゴヌクレオチドの3’末端又は5’末端に、直接的に又は間接的に結合していることが好ましく、第二オリゴヌクレオチドの3’末端又は5’末端に、直接的に又は間接的に結合していることがより好ましい。前記リンカー又は機能性分子と、第一オリゴヌクレオチド又は第二オリゴヌクレオチドの末端ヌクレオシドとの結合は、機能性分子に応じて選択される。
 前記リンカー又は機能性分子と、第一オリゴヌクレオチド又は第二オリゴヌクレオチドの末端ヌクレオシドとは、ホスホジエステル結合又は修飾されたホスホジエステル結合で連結されていることが好ましく、ホスホジエステル結合で連結されていることがより好ましい。
 前記リンカー又は機能性分子は、第一オリゴヌクレオチド又は第二オリゴヌクレオチドの3’末端のヌクレオシドが有する3’位の酸素原子又は5’末端のヌクレオシドが有する5’位の酸素原子に直接連結されていてもよい。
 「機能性分子」(コンジュゲート)の構造は、特に制限はなく、それがオリゴヌクレオチドに結合することで、ASO誘導体は所望の機能を有することが可能である。所望の機能としては、標識機能、精製機能及び標的部位への送達機能が挙げられる。標識機能を付与する分子の例としては、蛍光タンパク質、ルシフェラーゼ等の化合物が挙げられる。精製機能を付与する分子の例としては、ビオチン、アビジン、Hisタグペプチド、GSTタグペプチド、FLAGタグペプチド等の化合物が挙げられる。
 また、ASO誘導体を特異性高く効率的に標的部位(例えば、脳、脊髄)に送達し、かつ該ASO誘導体によってATN1遺伝子の発現を非常に効果的に制御するという観点から、機能性分子として、ASO誘導体を標的部位に送達させる機能を有する分子が結合していることが好ましい。前記送達機能を有する分子は、例えば、European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics, 2016, 107, pp 321-340、Advanced Drug Delivery Reviews, 2016, 104, pp 78-92、Expert Opinion on Drug Delivery, 2014, 11, pp 791-822等を参照できる。
 例えば、脳、脊髄等に特異性高く効率的に本発明のASO誘導体を送達できる機能性分子としては、脂質、糖(例えば、グルコース、スクロース等)が挙げられる。脂質としては、コレステロール;ビタミンE(トコフェロール類、トコトリエノール類)、ビタミンA、ビタミンD、ビタミンK等の脂溶性ビタミン;脂肪酸;アシルカルニチン、アシルCoA等の中間代謝物;糖脂質;グリセリド;それらの誘導体等が挙げられる。
 肝臓に特異性高くASO誘導体を送達できる機能性分子として、アシアロ糖タンパク質受容体と相互作用を有する糖誘導体を用いてもよい。
 「アシアロ糖タンパク質受容体」は肝臓細胞表面に存在し、アシアロ糖タンパク質のガラクトース残基を認識して、その分子を細胞内に取り込み分解する作用を持つ。「アシアロ糖タンパク質受容体と相互作用する糖誘導体」は、ガラクトース残基と類似した構造を持ち、アシアロ糖タンパク質受容体との相互作用により細胞内に取り込まれる化合物が好ましく、例えば、GalNAc(N-アセチルガラクトサミン)誘導体、ガラクトース誘導体及びラクトース誘導体が挙げられる。
 各臓器の細胞表面にある各種タンパク質に相互作用することにより、当該臓器に特異性高く効率的にASO誘導体を送達できる機能性分子としては、受容体のリガンド、抗体、それらの断片のペプチド又はタンパク質が挙げられる。
 機能性分子が結合したASO誘導体が肝臓などの臓器や標的部位まで送達する前に、ASO誘導体が部分的に分解する場合であっても、第一オリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド又はオリゴヌクレオチド複合体が、肝臓などの臓器や標的部位まで送達することで、ATN1遺伝子の発現を効果的に制御できればよい。
 機能性分子と、ASO誘導体を構成するオリゴヌクレオチドとの結合を介するリンカーは、当該オリゴヌクレオチドに含まれるASOと機能性分子がそれぞれの機能を発揮できればよいため、前記機能性分子と前記オリゴヌクレオチドとを、安定して結合させるリンカーであれば特に限定されない。前記リンカーとしては、例えば、ヌクレオシド数が1~20のオリゴヌクレオチドに由来する基、アミノ酸数が1~20のポリペプチドに由来する基、C1-20アルキレン基及びC2-20アルケニレン基等が挙げられる。前記ヌクレオシド数が1~20のオリゴヌクレオチドに由来する基は、ヌクレオシド数が1~20のオリゴヌクレオチド(ヌクレオシド数が1の場合は、ヌクレオシド)の3’末端及び5’末端から、それぞれ水素原子、ヒドロキシ基等を取り除いた2価の基である。前記ヌクレオシド数が1~20のオリゴヌクレオチドに由来する基は、例えば国際公開第2017/053995号が参照できる。国際公開第2017/053995号には、例えば、TCAモチーフを有する3塩基のリンカー、TCAモチーフを有さない1~5塩基のリンカー等が記載されている。前記アミノ酸数が1~20のポリペプチドに由来する基は、アミノ酸数が1~20のポリペプチド(アミノ酸数が1の場合は、アミノ酸)から、ヒドロキシ、水素原子及びアミノ等から選択される2つの基を取り除いた2価の基である。
 本発明のASO誘導体は、プロドラッグ部分を有していてもよい。
 プロドラッグとは、化学的又は代謝的に分解できる基を有する医薬品化合物の誘導体であり、加溶媒分解又は生理的条件下のインビボ(in vivo)での分解により、薬理学的に活性な医薬品化合物へと誘導される化合物である。適切なプロドラッグ誘導体を選択する方法及び製造する方法は、例えばDesign of Prodrugs(Elsevier, Amsterdam, 1985)に記載されている。例えば、ASO(又はASOを含む化合物)のヒドロキシ基を適切なアシルハライド、適切な酸無水物又は適切なハロゲン化アルキルオキシカルボニル化合物と反応させることによって製造されるアシルオキシ誘導体のようなプロドラッグ部分として、-O-C(=O)C、-O-C(=O)(t-Bu)、-O-C(=O)C1531、-O-C(=O)-(m-CONa-Ph)、-O-C(=O)CHCHCONa、-OC(=O)CH(NH)CH、-O-C(=O)CHN(CH又は-O-CHOC(=O)CH等が挙げられる。
 本発明のASO誘導体は、それらの互変異性、幾何異性を経由して存在することに加えて、その混合物あるいはそれぞれの異性体の混合物として存在するものも含む。また不斉中心が存在する場合、あるいは異性化の結果、不斉中心が生じる場合は、それぞれの光学異性体及び任意の比率の混合物として存在するものも含む。また、不斉中心を2個以上持つ化合物の場合には、さらにそれぞれの光学異性によるジアステレオマーも存在する。本発明は、これらすべての型を、任意の割合で含んだものも含む。また、光学活性体はこの目的のためによく知られた方法によって得ることができる。
 例えば、本発明のASO誘導体が、修飾されたホスホジエステル結合(例えば、ホスホロチオエート結合)を含み、且つリン原子が不斉原子となる場合、リン原子の立体が制御されたオリゴヌクレオチド及びリン原子の立体が制御されていないオリゴヌクレオチドのいずれの形態も、本発明の範囲に含有される。
 本発明のASO誘導体又はそれらの医学的に許容され得る塩は、製造条件により任意の結晶形として存在することができ、任意の水和物として存在することができるが、これら結晶形や水和物及びそれらの混合物も本発明の範囲に含有される。またアセトン、エタノール、1-プロパノール、2-プロパノール等の有機溶媒を含む溶媒和物として存在することもあるが、これらの形態はいずれも本発明の範囲に含有される。
 本発明のASO誘導体は、必要に応じて医学的に許容され得る塩に変換することも、又は生成した塩から遊離させることもできる。本発明のASO誘導体を含む化合物の薬理学上許容される塩としては、例えば、アルカリ金属(リチウム、ナトリウム、カリウム等)、アルカリ土類金属(カルシウム等)、マグネシウム、アンモニウム、有機塩基(トリエチルアミン、トリメチルアミン等)、アミノ酸(グリシン、リシン、グルタミン酸等)、無機酸(塩酸、臭化水素酸、リン酸、硫酸等)又は有機酸(酢酸、クエン酸、マレイン酸、フマル酸、酒石酸、ベンゼンスルホン酸、メタンスルホン酸、p-トルエンスルホン酸等)との塩が挙げられる。
 特に、-P(=O)(OH)-で表される部分構造が、-P(=O)(O)-で表されるアニオン性の部分構造へ変換されて、アルカリ金属(リチウム、ナトリウム、カリウム等)、アルカリ土類金属(カルシウム等)、マグネシウム又はアンモニウム等と塩を形成してもよい。また、ホスホロチオエート結合を形成する、-P(=O)(SH)-で表される部分構造が、-P(=O)(S)-で表されるアニオン性の部分構造へ変換されて、同様に、アルカリ金属、アルカリ土類金属又はアンモニウム等と塩を形成してもよい。その他の修飾されたホスホジエステル結合についても同様である。
 医学的に許容され得る塩は、特に好ましくはナトリウム塩である。
 本発明のASO誘導体は、当業者であれば公知の方法を適宜選択することにより調製することができる。例えば、当業者は、標的RNAのヌクレオシド配列の情報に基づいて、ASOのヌクレオシド配列を設計し、市販の核酸自動合成機(アプライドバイオシステムズ社製、ベックマン社製、ジーンデザイン社製等)を用いて合成することができる。また、酵素を用いた反応によって合成することもできる。前記酵素としては、ポリメラーゼ、ライゲース及び制限酵素等が挙げられるが、これらに限定されない。すなわち、本実施形態に係る一本鎖オリゴヌクレオチド又は二本鎖オリゴヌクレオチド複合体の製造方法は、3’末端又は5’末端でヌクレオシド鎖を伸長する工程を含むことができる。
 機能性分子とオリゴヌクレオチドとを結合させるための多くの方法は、当該分野においてよく知られており、例えば、European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics, 2016, 107, pp 321-340、Advanced Drug Delivery Reviews, 2016, 104, pp 78-92、Expert Opinion on Drug Delivery, 2014, 11, pp 791-822等を参照できる。例えば、機能性分子とリンカーとを公知の方法により結合させた後に、それをアミダイト化試薬によりアミダイト体へ、又はH-ホスホネート試薬によりH-ホスホネート体へと誘導し、オリゴヌクレオチドと結合させることができる。
 得られるオリゴヌクレオチドを逆相カラムクロマトグラフィー等により精製することにより、本発明のASO誘導体を調製することができる。
 本発明の二本鎖オリゴヌクレオチド複合体は、第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドを上記に従いそれぞれ別に合成し、等量を混合し分子間ハイブリダイズすることで、調製できる。二本鎖オリゴヌクレオチド複合体の分子間ハイブリダイズは、必要に応じて、濃度調整、加熱及び/又は冷却、及び/又は、塩の添加により、実施することができる。
 本発明の一本鎖オリゴヌクレオチドは、上記に従いに合成すれば、自発的に分子内でハイブリダイズし、調製できる。必要に応じて、濃度調整、加熱及び/又は冷却、及び/又は、塩の添加を実施することで、本発明の一本鎖オリゴヌクレオチドは分子内又は分子間でハイブリダイズすることができる。
 本発明のASO誘導体(一本鎖オリゴヌクレオチド及び二本鎖オリゴヌクレオチド複合体)又はその医学的に許容され得る塩は、ATN1遺伝子の発現を効果的に阻害することができる。本発明のASO誘導体又はその医学的に許容され得る塩を利用した核酸医薬品が治療、予防、改善できる疾患は、ATN1遺伝子の発現阻害作用が有効な疾患であれば、特に制限されないが、例えば、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症が挙げられる。
 本発明は、前記ASO誘導体を有効成分として含有する、例えば、ATN1遺伝子の発現をアンチセンス効果によって阻害するための組成物を、提供することができる。特に、本発明のASO誘導体(一本鎖オリゴヌクレオチド及び二本鎖オリゴヌクレオチド複合体)を有効成分として含有する、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症といったATN1遺伝子の発現阻害が有効な疾患を治療、予防、及び/又は改善するための医薬組成物も、提供することができる。
 本発明のASO誘導体又はその医学的に許容され得る塩を含む医薬組成物は、公知の製剤学的方法により製剤化することができる。例えば、注射剤、カプセル剤、錠剤、丸剤、液剤、散剤、顆粒剤、細粒剤、フィルムコーティング剤、ペレット剤、トローチ剤、舌下剤、咀嚼剤、バッカル剤、ペースト剤、シロップ剤、懸濁剤、エリキシル剤、乳剤、塗布剤、軟膏剤、硬膏剤、パップ剤、経皮吸収型製剤、ローション剤、吸引剤、エアゾール剤、坐剤等として、経腸管的(経口的等)又は非経腸管的に使用することができる。
 これら製剤化においては、薬理学上若しくは飲食品として許容される担体、具体的には、滅菌水や生理食塩水、植物油、溶剤、基剤、乳化剤、懸濁剤、界面活性剤、pH調節剤、安定剤、香味剤、芳香剤、賦形剤、ベヒクル、防腐剤、結合剤、希釈剤、等張化剤、無痛化剤、増量剤、崩壊剤、緩衝剤、コーティング剤、滑沢剤、着色剤、甘味剤、粘稠剤、矯味矯臭剤、溶解補助剤あるいはその他の添加剤等と適宜組み合わせることができる。
 本発明のASO誘導体又はその医学的に許容され得る塩を含む組成物の投与形態としては特に制限はなく、経腸管的(経口的等)又は非経腸管的投与が挙げられる。より好ましくは、静脈内投与、動脈内投与、腹腔内投与、皮下投与、皮内投与、気道内投与、直腸投与、筋肉内投与、髄腔内投与、脳室内投与、経鼻投与及び硝子体内投与等及び輸液による投与が挙げられ、さらに好ましくは、髄腔内投与、脳室内投与及び経鼻投与が挙げられ、特に好ましくは、髄腔内投与が挙げられる。
 本発明ASO誘導体又はその医学的に許容され得る塩を含み、髄腔内投与を可能にする製剤の製造は、公知の慣用法により実施可能である。例えば、本発明のASO誘導体又はその薬理学上許容される塩に、緩衝剤、等張化剤等の添加剤を加えた調製物を注射用水に完全に溶解した後、ろ過滅菌する。前記調製液を、滅菌済のシリンジに充填すればプレフィルドシリンジ製剤が、滅菌済のバイアルに充填すれば注射用製剤が、滅菌済のバイアルに充填後に凍結乾燥すれば用時調製用製剤が、それぞれ製造できる。ろ過滅菌に替えて、オートクレーブ、ガンマ線照射等の最終滅菌を行ってもよい。
 様々な哺乳動物の疾患を、本発明のASO誘導体又はその医学的に許容され得る塩を含む組成物により治療、予防及び/又は改善することができる。例えば、それだけに限らないが、ヒト、ウシ(cow)、ヒツジ(sheep)、ヤギ、ウマ(horse)、イヌ(dog)、ネコ(cat)、テンジクネズミ、ラット、ウサギ、チンパンジー又は他のウシ(bovine)、ヒツジ(ovine)、ウマ(equine)、イヌ(canine)、ネコ(feline)、マウス等の齧歯類の種を含めた哺乳動物の疾患を治療、予防及び/又は改善することができる。哺乳動物は特に好ましくはヒトである。
 本発明のASO誘導体又はその医学的に許容され得る塩を含む組成物を、ヒトを含む哺乳動物に投与又は摂取する場合、その投与量又は摂取量は、有効量が好ましい。有効量は、薬剤が必要とされる個体における所望の薬理学的効果もたらすために十分な化合物の量を意味し、疾患を治療、予防及び/又は改善する個体の年齢、体重、症状、健康状態、組成物の配合等に応じて変動し、適宜選択される。投与量又は摂取量は、ASO換算で0.0001mg/kg/日~100mg/kg/日が好ましい。
 本発明のASO誘導体(一本鎖オリゴヌクレオチド及び二本鎖オリゴヌクレオチド複合体)を使用する好ましい方法としては以下に示すものが挙げられる。
 本発明のASO誘導体又はその医学的に許容され得る塩と細胞を接触させる工程を含む、ATN1遺伝子の発現を制御する方法。
 本発明のASO誘導体又はその医学的に許容され得る塩を含む医薬組成物を、哺乳動物に投与する工程を含む、前記哺乳動物におけるATN1遺伝子の発現を制御する方法。
 哺乳動物において、ATN1遺伝子の発現を制御するための、本発明のASO誘導体又はその医学的に許容され得る塩の使用。
 哺乳動物において、ATN1遺伝子の発現を制御するための薬剤を製造するための、本発明のASO誘導体又はその医学的に許容され得る塩の使用。
 以下、実施例に基づいて本発明をより具体的に説明するが、本発明の実施形態は以下の実施例に限定されるものではない。
 実施例中の表(1から66)において、「Cmpd No」は化合物番号を意味する。
 実施例中の配列の化学構造表記(表1から19、50、54、57、60及び64の化学構造)において、特に記載がない限り、「(L)」はLNA(β-D-メチレンオキシBNA)を、「(V)」は2’-O-MCEヌクレオシドを、「(m)」は2’-O-MOEヌクレオシドを、小文字のアルファベット(前記(m)における「m」を除く)はデオキシリボヌクレオシドを、大文字のアルファベット(前記(L)における「L」、及び(V)における「V」を除く)はリボヌクレオシドを、「^」はホスホロチオエート結合を、「5(x)」は、そのデオキシリボヌクレオシドの核酸塩基が5-メチルシトシンであることを、「5(m)」、「5(V)」及び「5(L)」における「5」は、そのヌクレオシドの核酸塩基が5-メチルシトシンであることを意味する。
 なお、実施例中の化学構造の表記(表1から19、50、54、57、60及び64)において、隣り合う2つのヌクレオシドの間に、「^」が記載されていないとき、その2つのヌクレオシドの間のヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合である。例えば、「A(L)G(L)」との表記では、AとGとの間のヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合であり、「G(L)a」との表記では、Gとaの間のヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合である。
(ASO製造例1)
 表1から19に記載されたアンチセンスオリゴヌクレオチド(化合物番号に対応する化学構造で表される化合物)を、核酸自動合成機nS-8II(ジーンデザイン社製)又は3900 DNA Synthesizer(Applied Biosystems社製)を使用して調製した。なお、表2から19のタイトル行は、表1と同じであるため、省略した場合がある。
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 表1から19に示された各アンチセンスオリゴヌクレオチドがヒトATN1のmRNA又はpre-mRNAの配列中で標的とする位置、各アンチセンスオリゴヌクレオチドに対応する配列番号及び核酸塩基配列を、表20から38に示す。
 表20から38の配列表記において、「SEQ1 START」は、「配列番号1 開始部位」を意味し、ヒトATN1のmRNA配列(配列番号1)中でアンチセンスオリゴヌクレオチドにより標的化される最も5’側のヌクレオシドの位置番号を示す。「SEQ1 END」は、「配列番号1 終止部位」を意味し、ヒトATN1のmRNA配列(配列番号1)中でアンチセンスオリゴヌクレオチドにより標的化される最も3’側のヌクレオシドの位置番号を示す。
 「SEQ2 START」は、「配列番号2 開始部位」を意味し、ヒトATN1のpre-mRNAの配列(配列番号2)中でアンチセンスオリゴヌクレオチドにより標的化される最も5’側のヌクレオシドの位置番号を示す。「SEQ2 END」は、「配列番号2 終止部位」を意味し、ヒトATN1のpre-mRNA配列(配列番号2)中でアンチセンスオリゴヌクレオチドにより標的化される最も3’側のヌクレオシドの位置番号を示す。
 各アンチセンスオリゴヌクレオチドは、本明細書において配列番号1と指定されるヒトATN1 mRNA、及び/又は本明細書において配列番号2又は配列番号717と指定されるヒトATN1 pre-mRNAのいずれかに標的化される。
 「-」(ハイフン)は、アンチセンスオリゴヌクレオチドがそのmRNA又はpre-mRNAの配列を100%の相補性で標的化しないことを示す。
 「SEQ No」は、配列番号を、「BASE SEQUENCE」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列を示す。
 なお、表21から38のタイトル行は、表20と同じであるため、省略した場合がある。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000021
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000022
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000023
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Figure JPOXMLDOC01-appb-T000039
 L-0498~0515がヒトATN1のpre-mRNAの配列中で標的とする位置、各アンチセンスオリゴヌクレオチドに対応する配列番号及び核酸塩基配列を、表39に示す。
 「SEQ717 START」は、「配列番号717 開始部位」を意味し、ヒトATN1のpre-mRNAの配列(配列番号717)中でアンチセンスオリゴヌクレオチドにより標的化される最も5’側のヌクレオシドの位置番号を示す。「SEQ717 END」は、「配列番号717 終止部位」を意味し、ヒトATN1のpre-mRNA配列(配列番号717)中でアンチセンスオリゴヌクレオチドにより標的化される最も3’側のヌクレオシドの位置番号を示す。その他、表39中の表記は、表20から38と同様である。
 なお、配列番号2は、配列番号717の核酸塩基の位置番号4451~18401に相当する。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000040
[評価例1]SH-SY5Y細胞中のヒトATN1のアンチセンス抑制
 DRPLAの原因遺伝子であるATN1核酸を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドのATN1 RNA転写物に与える効果をインビトロで試験した。12,000細胞/ウェルの密度で96 wellプレートに播種したSH-SY5Y細胞に、約24時間後、Lipofectamin(登録商標) RNAiMAX Transfection Reagent(Thermo Fisher Scientific)を用いて、300nMアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO製造例1で製造)を形質移入(その最終濃度が300nMとなるようにASOを添加)した。約48時間後、RNeasy Micro Kit(QIAGEN)を用いて、RNAを細胞から単離した後に、High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit(Thermo Fisher Scientific)により逆転写してcDNAを作成した。作成したcDNAを用いて、TaqMan(登録商標) Gene Expression Assays(Thermo Fisher Scientific)による定量リアルタイムPCRでATN1遺伝子発現レベルを測定した。結果を未処理対照細胞に対する、ATN1のパーセント発現として表40~46に表した。なお、表41から46のタイトル行は、表40と同じであるため、省略した場合がある。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000041
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000042
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000043
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000044
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000045
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000046
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000047
[評価例2]SH-SY5Y細胞中のヒトATN1の用量依存性アンチセンス抑制
 評価例1でSH-SY5Y細胞中のATN1の抑制を示したアンチセンスオリゴヌクレオチドを種々の用量で試験した。12,000細胞/ウェルの密度で96 wellプレートに播種したSH-SY5Y細胞に、約24時間後、Lipofectamin(登録商標) RNAiMAX Transfection Reagent(Thermo Fisher Scientific)を用いて、0.003nM、0.03nM、0.3nM、3nM、30nM及び300nMの濃度の各アンチセンスオリゴヌクレオチドを形質移入(その最終濃度が前記濃度となるようにASOを添加)した。約48時間後、RNeasy Micro Kit(QIAGEN)を用いて、RNAを細胞から単離した後に、High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit(Thermo Fisher Scientific)により逆転写してcDNAを作成した。作成したcDNAを用いて、TaqMan(登録商標) Gene Expression Assays(Thermo Fisher Scientific)による定量リアルタイムPCRでATN1遺伝子発現レベルを測定した。結果を未処理対照細胞に対してRNA転写物レベルが50%となる濃度(IC50値)として算出し、表47に表した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000048
[評価例3]GM13716細胞[DRPLA患者由来細胞]中のヒトATN1のアンチセンス抑制
 DRPLAの原因遺伝子であるATN1核酸を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドのATN1 RNA転写物に与える効果をインビトロで試験した。7,500細胞/ウェルの密度で培養したGM13716細胞に、Lipofectamin(登録商標) RNAiMAX Transfection Reagent(Thermo Fisher Scientific)を用いて、その最終濃度が100nMとなるようにアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO製造例1で製造)を添加した。約48時間後、RNeasy Micro Kit(QIAGEN)を用いて、RNAを細胞から単離した後に、High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit(Thermo Fisher Scientific)により逆転写してcDNAを作成した。TaqMan(登録商標) Gene Expression Assays(Thermo Fisher Scientific)による定量リアルタイムPCRでATN1 RNA転写物レベルを測定した。結果を未処理対照細胞に対する、ATN1のパーセント発現として表48に表した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000049
[評価例4]GM13716細胞[DRPLA患者由来細胞]中のヒトATN1のアンチセンス抑制(Free-Uptake)
 DRPLAの原因遺伝子であるATN1核酸を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドのATN1 RNA転写物に与える効果をインビトロで試験した。7,500細胞/ウェルの密度で培養したGM13716細胞に、その最終濃度が100nMとなるようにアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO製造例1で製造)を添加した(Free-Uptake)。約48時間後、RNeasy Micro Kit(QIAGEN)を用いて、RNAを細胞から単離した後に、High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit(Thermo Fisher Scientific)により逆転写してcDNAを作成した。TaqMan(登録商標) Gene Expression Assays(Thermo Fisher Scientific)による定量リアルタイムPCRでATN1 RNA転写物レベルを測定した。結果を未処理対照細胞に対する、ATN1のパーセント発現として表49に表した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000050
(ASO誘導体製造例1)
 表50に記載された、一本鎖オリゴヌクレオチド(化合物番号に対応する化学構造で表される化合物)を、核酸自動合成機nS-8II(ジーンデザイン社製)を使用して調製した。また、各一本鎖オリゴヌクレオチドが分子内でハイブリダイズしていることを、非変性ポリアクリドアミドゲル電気泳動により確認した。非変性ポリアクリドアミドゲル電気泳動では、マーカーとしてヌクレオチド数が15、20、30、40、50、60及び80の一本鎖のDNAを含む一本鎖DNAサイズマーカー(ジーンデザイン社製)と、塩基対の数が17、21、25及び29の二本鎖のRNAサイズマーカー(ジーンデザイン社製)を用い、各一本鎖オリゴヌクレオチドについて単一のバンドが確認された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000051
 表50に示された各一本鎖オリゴヌクレオチドにおいて、第一オリゴヌクレオチドに含まれるアンチセンスオリゴヌクレオチドの化合物番号、及び一本鎖オリゴヌクレオチドを構成する第一オリゴヌクレオチド、第二オリゴヌクレオチド及び第三オリゴヌクレオチドのヌクレオシド位置(各一本鎖オリゴヌクレオチドの5’末端から数えた位置番号)を表51に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000052
 表50に示された各一本鎖オリゴヌクレオチドに対応する配列番号及び核酸塩基配列を、表52に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000053
 [評価例5]DRPLAモデルマウスにおける、ヒトATN1のアンチセンス抑制
DRPLAの原因遺伝子であるATN1核酸を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド(表50に示された一本鎖オリゴヌクレオチド)のATN1 RNA転写物に与える効果をDRPLAモデル(Q129トランスジェニック)マウス(4週齢、Sato T, et al. Human Molecular Genetics, 2009, 18, 723-736、新潟大学脳研究所 分子神経疾患資源解析学分野 加藤泰介特任准教授より受精卵を入手)を用いて試験した。Q129トランスジェニックマウスはヒトATN1遺伝子が組み込まれており、それには129個のCAGリピートを保有する。各アンチセンスオリゴヌクレオチドを表53に記載の用量で単回脳室内投与し、投与2週間後に脳の各部位(大脳、小脳、橋、延髄)及び脊髄を採取した。RNeasy Mini Kit(QIAGEN)を用いて、RNAを組織から単離した後に、High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit(Thermo Fisher Scientific)により逆転写してcDNAを作成した。作成したcDNAを用いて、TaqMan(登録商標) Gene Expression Assays(Thermo Fisher Scientific)による定量リアルタイムPCRでヒトATN1遺伝子発現レベルを測定した。結果を生理食塩水(溶媒)投与動物に対する、ヒトATN1のパーセント発現として表53に表した。表53中、「dose」は、投与量を示し、「Cerebrum」、「Cerebellum」、「Pons」、「Medulla」及び「Spinal cord」は、それぞれ、大脳、小脳、橋、延髄及び脊髄を示す。なお、表53のL-0561の6.3及び21μg投与試験においては、8週齢のQ129トランスジェニックマウスを使用した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000054
(ASO誘導体製造例2)
 表54に記載された、一本鎖オリゴヌクレオチド(化合物番号に対応する化学構造で表される化合物)を、核酸自動合成機nS-8II(ジーンデザイン社製)を使用して調製した。また、各一本鎖オリゴヌクレオチドが分子内でハイブリダイズしていることを、非変性ポリアクリドアミドゲル電気泳動により確認した。非変性ポリアクリドアミドゲル電気泳動では、マーカーとしてヌクレオチド数が15、20、30、40、50、60及び80の一本鎖のDNAを含む一本鎖DNAサイズマーカー(ジーンデザイン社製)と、塩基対の数が17、21、25及び29の二本鎖のRNAサイズマーカー(ジーンデザイン社製)を用い、各一本鎖オリゴヌクレオチドについて単一のバンドが確認された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000055
 表54に示された各一本鎖オリゴヌクレオチドにおいて、第一オリゴヌクレオチドに含まれるアンチセンスオリゴヌクレオチドの化合物番号、及び一本鎖オリゴヌクレオチドを構成する第一オリゴヌクレオチド、第二オリゴヌクレオチド及び第三オリゴヌクレオチドのヌクレオシド位置(各一本鎖オリゴヌクレオチドの5’末端から数えた位置番号)を表55に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000056
 表54に示された各一本鎖オリゴヌクレオチドに対応する配列番号及び核酸塩基配列を、表56に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000057
(ASO製造例2)
 表57に記載されたアンチセンスオリゴヌクレオチド(化合物番号に対応する化学構造で表される化合物)を、核酸自動合成機nS-8II(ジーンデザイン社製)又は3900 DNA Synthesizer(Applied Biosystems社製)を使用して調製した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000058
 表57に示された各アンチセンスオリゴヌクレオチドがヒトATN1のmRNA又はpre-mRNAの配列中で標的とする位置、各アンチセンスオリゴヌクレオチドに対応する配列番号及び核酸塩基配列を、表58に示す。表58の配列表記における各カラムの意味は、表20から38と同様である。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000059
[評価例6]GM13716細胞[DRPLA患者由来細胞]中のヒトATN1のアンチセンス抑制
 DRPLAの原因遺伝子であるATN1核酸を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオ
チドのATN1 RNA転写物に与える効果をインビトロで試験した。7,500細胞/ウェルの密度で96 wellプレートに播種したGM13716細胞に、約24時間後、Lipofectamin(登録商標) RNAiMAX Transfection Reagent(Thermo Fisher Scientific)を用いて、100nMの濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO製造例1、2で製造)を形質移入(その最終濃度が前記濃度となるようにASOを添加)した。約48時間後、RNeasy Micro Kit(QIAGEN)を用いて、RNAを細胞から単離した後に、High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit(Thermo Fisher Scientific)により逆転写してcDNAを作成した。作成したcDNAを用いて、TaqMan(登録商標) Gene Expression Assays(Thermo Fisher Scientific)による定量リアルタイムPCRでATN1遺伝子発現レベルを測定した。結果を未処理対照細胞に対する、ATN1のパーセント発現として表59に表した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000060
(ASO誘導体製造例3)
 表60に記載された、一本鎖オリゴヌクレオチド(化合物番号に対応する化学構造で表される化合物)を、核酸自動合成機nS-8II(ジーンデザイン社製)を使用して調製した。また、各一本鎖オリゴヌクレオチドが分子内でハイブリダイズしていることを、非変性ポリアクリドアミドゲル電気泳動により確認した。非変性ポリアクリドアミドゲル電気泳動では、マーカーとしてヌクレオチド数が15、20、30、40、50、60及び80の一本鎖のDNAを含む一本鎖DNAサイズマーカー(ジーンデザイン社製)と、塩基対の数が17、21、25及び29の二本鎖のRNAサイズマーカー(ジーンデザイン社製)を用い、各一本鎖オリゴヌクレオチドについて単一のバンドが確認された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000061
 表60に示された各一本鎖オリゴヌクレオチドにおいて、第一オリゴヌクレオチドに含まれるアンチセンスオリゴヌクレオチドの化合物番号、及び一本鎖オリゴヌクレオチドを構成する第一オリゴヌクレオチド、第二オリゴヌクレオチド及び第三オリゴヌクレオチドのヌクレオシド位置(各一本鎖オリゴヌクレオチドの5’末端から数えた位置番号)を表61に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000062
 表60に示された各一本鎖オリゴヌクレオチドに対応する配列番号及び核酸塩基配列を、表62に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000063
[評価例7]DRPLAモデルマウスにおける、ヒトATN1のアンチセンス抑制
表60に示された一本鎖オリゴヌクレオチドのATN1 RNA転写物に与える効果を4週齢のDRPLAモデル(Q129トランスジェニック)マウスを用いて試験した。各アンチセンスオリゴヌクレオチドを表63に記載の用量で単回脳室内投与し、投与2週間後に脳を採取した。RNeasy Mini Kit(QIAGEN)を用いて、RNAを組織から単離した後に、High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit(Thermo Fisher Scientific)により逆転写してcDNAを作成した。作成したcDNAを用いて、TaqMan(登録商標) Gene Expression Assays(Thermo Fisher Scientific)による定量リアルタイムPCRでヒトATN1遺伝子発現レベルを測定した。結果を生理食塩水(溶媒)投与動物に対する、ヒトATN1のパーセント発現として表63に表した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000064
(ASO誘導体製造例4)
 表64に記載された、一本鎖オリゴヌクレオチド(化合物番号に対応する化学構造で表される化合物)は、ASO誘導体製造例1~3と同様に、核酸自動合成機nS-8II(ジーンデザイン社製)を使用して調製できる。また、各一本鎖オリゴヌクレオチドが分子内でハイブリダイズしていることは、非変性ポリアクリドアミドゲル電気泳動により確認できる。非変性ポリアクリドアミドゲル電気泳動では、マーカーとしてヌクレオチド数が15、20、30、40、50、60及び80の一本鎖のDNAを含む一本鎖DNAサイズマーカー(ジーンデザイン社製)と、塩基対の数が17、21、25及び29の二本鎖のRNAサイズマーカー(ジーンデザイン社製)を用い、各一本鎖オリゴヌクレオチドについて単一のバンドが確認できる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000065
 表64に示された各一本鎖オリゴヌクレオチドにおいて、第一オリゴヌクレオチドに含まれるアンチセンスオリゴヌクレオチドの化合物番号、及び一本鎖オリゴヌクレオチドを構成する第一オリゴヌクレオチド、第二オリゴヌクレオチド及び第三オリゴヌクレオチドのヌクレオシド位置(各一本鎖オリゴヌクレオチドの5’末端から数えた位置番号)を表65に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000066
 表64に示された各一本鎖オリゴヌクレオチドに対応する配列番号及び核酸塩基配列を、表66に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000067
 本発明のASO誘導体の生存期間に対する影響及び運動機能に対する影響は、評価例6及び7の方法により評価することができる。生存期間を延長させるASO誘導体、及び/又は運動機能を改善するASO誘導体が好ましい。
 [評価例8]生存期間に対する影響
 生後2日の雄性DRPLAモデル(Q129トランスジェニック)マウスに本発明のASO誘導体を0.3~30μg/bodyの用量で単回脳室内投与した。マウスの死亡日(エンドポイント)は、持続的な横たわりやうずくまり、極度の衰弱状態を確認した時点とした。
 [評価例9]運動機能の改善
 一本鎖オリゴヌクレオチドであるL-0556、L-0557、L-0664、L-0665、L-0666のATN1 RNA転写物に与える効果をDRPLAモデル(Q129トランスジェニック)マウスを用いて試験した。各アンチセンスオリゴヌクレオチドを図1~5に記載の用量で生後2日目に単回脳室内投与し、4週齢時に運動機能及び体重を評価した。運動機能は、Rota-Rod(室町機械株式会社)及び歩行棒(小原医科産業株式会社)を用いて評価した。本発明のASO誘導体を、生後2日の雄性DRPLAモデル(Q129トランスジェニック)マウスに10~63μg/bodyの用量で単回脳室内投与した。何れの評価もマウスを試験に慣れさせるために、測定開始日の前日(3週齢)より訓練させた。Rota-Rodの回転速度は、3.5rpmから300秒かけて35rpmまで加速し、マウスがRota-Rodから落下するまで、もしくは、Rota-Rodにぶら下がり完全に回りきるまでの時間(秒)を測定した。カットオフを600秒とし、3回のうち最も長く歩行した時間を評価した。歩行棒は、ゴールに到達するまでの所要時間を記録した。所要時間は、カットオフを90秒とし、3回のうち最も早くゴールに到達した時間を評価した。結果を図1~5に表した。
図1~5中、「Latency to fall」は、Rota-Rodを用いて測定された前記時間を意味し、「Time to traverse」は、歩行棒を用いて評価された最も早くゴールに到達した時間を意味する。
 本発明のASO誘導体の安全性は、評価例10及び11の方法により評価することができる。安全性の高いASO誘導体が好ましい。
 [評価例10]安全性(マウス単回脳室内投与毒性試験)
 本発明のASO誘導体の脳室内投与による中枢神経系を含む毒性の評価を行った。本発明のASO誘導体を、2~5%イソフルラン麻酔下にて6週齢の雄性マウス(Crl:CD1(ICR))に630μg/bodyで単回脳室内投与した。投与後0.5、1、2、4及び24時間で中枢神経系を含む一般状態の観察を行った。また、投与後24時間及び2週間で剖検し、血液生化学的検査及び病理学的解析(臓器重量測定・病理組織学的検査・免疫染色)を実施した。免疫染色は、Iba-1及びGFAPの抗原に対して行った。
 [評価例11]安全性(オフターゲット遺伝子の抽出・リスク評価)
 本発明のASO誘導体に対して相補性を持つ遺伝子をin silico解析にて抽出するため、超絶高速ゲノム配列検索(GGGenome)を使用し、第一オリゴヌクレオチド配列と相補的なRNA配列を検索(Human pre-spliced RNA, RefSeq curated on hg38.p12, D3G 20.03 (Mar, 2020))した。さらに、SH-SY5Y細胞を用いた網羅的遺伝子発現解析を実施するため、本発明のASO誘導体の評価濃度を活性、細胞毒性及びインターフェロン応答関連遺伝子の発現量から設定した。該濃度にてマイクロアレイを実施し、本発明のASO誘導体において発現抑制が2倍以上認められた遺伝子を抽出した。得られたin silico解析結果並びに網羅的遺伝子発現解析結果から、オフターゲット遺伝子を抽出してリスク評価を行った。
 本試験において抽出されたオフターゲット遺伝子の数が少なく、毒性関連遺伝子を変動させなかったASO誘導体を、安全性が高いものと評価することができる。
 本明細書で引用した全ての刊行物又はその一部、特許及び特許出願をそのまま参考として本明細書にとり入れるものとする。
 本発明のASO誘導体は、ATN1遺伝子の発現を阻害するため、ATN1遺伝子の発現阻害が有効な疾患、特に歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症の治療、予防、及び/又は改善に有用である。

Claims (44)

  1.  第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとが、第三オリゴヌクレオチドによって連結されている一本鎖オリゴヌクレオチドであって、
     第一オリゴヌクレオチドは、Atrophin1 mRNA若しくはpre-mRNAとのハイブリダイズを可能にする配列を含み、
     デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、
     少なくとも1つの糖修飾ヌクレオシドを含み、
     第二オリゴヌクレオチドは、第一オリゴヌクレオチドの少なくとも一部とのハイブリダイズを可能とする配列を含み、
     デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、
     第三オリゴヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される1~20個のヌクレオシドからなり、
     第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドがハイブリダイズする一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  2.  第三オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシドが、ホスホジエステル結合で互いに連結されている、請求項1に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  3.  第三オリゴヌクレオチドは、DNA又はRNAである、請求項1又は2に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  4.  第三オリゴヌクレオチドの3’末端は、第一オリゴヌクレオチドの5’末端と結合し、
     第三オリゴヌクレオチドの5’末端は、第二オリゴヌクレオチドの3’末端と結合している、請求項1から3のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  5.  第一オリゴヌクレオチドは、配列番号3~716及び718~770のいずれか1つの核酸塩基配列の少なくとも8個の連続核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、請求項1から4のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  6.  第一オリゴヌクレオチドは、配列番号3~716及び718~770のいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する、請求項1から5のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  7.  第一オリゴヌクレオチドは、配列番号3~716及び718~770のいずれか1つの核酸塩基配列を有する、請求項1から6のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  8.  第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表わされるAtrophin1 mRNAの核酸塩基の位置番号59~104、109~133、173~192、207~272、300~319、353~372、419~434、458~509、523~559、561~618、626~685、766~785、787~819、838~855、880~922、924~943、970~989、994~1039、1055~1074、1079~1098、1157~1176、1196~1223、1310~1329、1339~1399、1423~1442、1614~1633、1650~1670、1806~1833、1844~1865、1896~1915、1924~1992、2023~2042、2058~2081、2103~2124、2398~2417、2480~2520、2526~2562、2568~2587、2853~2872、2876~2923、2931~2950、2972~3016、3072~3099、3109~3128、3192~3211、3267~3290、3333~3379、3419~3557、3765~3784、3789~3853、3888~3926、4022~4062、4118~4139、4141~4156、4218~4236、及び4266~4281で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的な8~30個のヌクレオシドからなり、配列番号1の前記選択された核酸塩基配列内の一部と少なくとも80%相補的である、請求項1から4のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  9.  第一オリゴヌクレオチドは、配列番号1で表わされるAtrophin1 mRNAの核酸塩基の位置番号3451~3475、及び3490~3505で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的な8~30個のヌクレオシドからなり、配列番号1の前記選択された核酸塩基配列内の一部と少なくとも80%相補的である、請求項8に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  10.  第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表わされるAtrophin1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号383~398、986~1001、1004~1019、1378~1393、1398~1413、1853~1868、1971~1986、2189~2204、2522~2537、2562~2577、3662~3677、3987~4002、4217~4232、4266~4281、4335~4350、4360~4375、4477~4492、4562~4577、4636~4651、4687~4702、4734~4749、4840~4855、5536~5563、5568~5592、5632~5651、5666~5715、5906~5925、5959~5978、6176~6191、6215~6266、6963~6978、7248~7284、7286~7343、7351-7410、7491~7510、7512~7544、7563~7580、7605~7647、7649~7668、7695~7714、7719~7764、7780~7799、7804~7823、7882~7901、7921~7948、8035~8054、8064~8124、8148~8167、8339~8358、8375~8395、8531~8558、8569~8590、8621~8640、8649~8717、8748~8767、8783~8806、8828~8849、9123~9142、9205~9245、9336~9351、9534~9570、9576~9595、9923~9938、10001~10016、10056~10071、10274~10293、10297~10344、10352~10371、10393~10437、10493~10520、10530~10549、10613~10632、10688~10711、10754~10800、10840~10865、12508~12680、12723~12738、13454~13518、13553~13591、13687~13727、13783~13804、13806~13821、13883~13901、及び13931~13946で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的な8~30個のヌクレオシドからなり、配列番号2の前記選択された核酸塩基配列内の一部と少なくとも80%相補的である、請求項1から4のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  11.  第一オリゴヌクレオチドは、配列番号2で表わされるAtrophin1 pre-mRNAの核酸塩基の位置番号12574~12598、及び12613~12628で示される核酸塩基配列からなる群から選択される核酸塩基配列内の少なくとも一部と相補的な8~30個のヌクレオシドからなり、配列番号2の前記選択された核酸塩基配列内の一部と少なくとも80%相補的である、請求項10に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  12.  第一オリゴヌクレオチドは、配列番号3、4、9、10、12、13、18、19、20、21、26、29、34、37、38、39、40、44、45、46、47、48、49、50、52、55、59、60、61、62、63、66、67、68、69、70、72、74、75、78、79、82、83、84、85、86、87、88、89、91、92、94、95、97、99、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、126、127、128、131、132、133、137、138、139、148、151、152、153、154、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、238、239、240、241、242、247、248、253、254、255、256、258、259、263、264、274、276、277、278、280、281、283、286、287、288、291、292、293、294、296、297、298、299、300、302、303、304、305、306、307、309、310、311、313、314、315、316、317、319、320、321、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、335、337、338、339、340、341、342、344、345、346、347、348、349、350、355、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、369、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、382、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、494、513、515、533、534、544、551、552、554、566、574、582、585、586、589、592、593、595、596、638、639、642、644、661、662、663、664、665、666、667、668、669,670、671、672、673、674、675、676、677、696、697、699、706、713、715、716、722、723、724、727、728、729、730、731、732、733、734、735、736、737、738、739、740、741、742、743、744、745、746,748、750、751、752、753、754、755、756、757、758、759、760、761、762、763、764、765、766、767、768、769及び770からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する12~30個のヌクレオシドからなる、請求項1から4のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  13.  第一オリゴヌクレオチドは、配列番号209、215、216、221、及び715からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16~20個のヌクレオシドからなる、請求項12に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  14.  第一オリゴヌクレオチドは、配列番号47、105、174、214、240、585及び586からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する16~20個のヌクレオシドからなる、請求項12に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  15.  第一オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含む、請求項1から14のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  16.  第一オリゴヌクレオチドは、2’修飾ヌクレオシド及び2’-4’-架橋ヌクレオシドからなる群から選択される少なくとも1つのヌクレオシドを含む、請求項1から15のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  17.  前記2’-4’-架橋ヌクレオシドは、LNA、ENA、cEt、AmNA、scpBNA及びGuNAからなる群から選択される少なくとも1つであり、
    前記2’修飾ヌクレオシドは、2’-O-MCEヌクレオシド、2’-O-MOEヌクレオシド、2’-O-NMAヌクレオシド、及び2’-O-Meヌクレオシドからなる群から選択される少なくとも1つである、請求項16に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  18.  前記2’-4’-架橋ヌクレオシドは、LNAである、請求項17に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  19.  前記2’修飾ヌクレオシドは、2’-O-MCEヌクレオシド及び2’-O-MOEヌクレオシドからなる群から選択される少なくとも1つである、請求項17に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  20.  第一オリゴヌクレオチドは、ギャップセグメント、5’ウィングセグメント及び3’ウィングセグメントを含み、
     前記ギャップセグメントは、少なくとも2つのデオキシリボヌクレオシドを含み、ギャップセグメントの5’末端及び3’末端は、デオキシリボヌクレオシドであり、
     前記5’ウィングセグメントの3’末端のヌクレオシドは、糖修飾ヌクレオシドであり、かつ前記ギャップセグメントの5’末端と連結し、
     前記3’ウィングセグメントの5’末端のヌクレオシドは、糖修飾ヌクレオシドであり、かつ前記ギャップセグメントの3’末端と連結している、請求項1から19のいずれか一つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  21.  前記ギャップセグメントは、5~16個のデオキシリボヌクレオシドからなり、
     前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して、LNA、2’-O-MCEヌクレオシド及び2’-O-MOEヌクレオシドからなる群から独立して選択される1~7個の糖修飾ヌクレオシドからなり、
     それぞれのウィングセグメントは、少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含み、
     ギャップセグメント及びそれぞれのウィングセグメントのそれぞれのシトシンは、5-メチルシトシンへ置き換えられている、請求項20に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  22.  前記ギャップセグメントは、8~12個のデオキシリボヌクレオシドからなり、
     前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して、LNA及び2’-O-MCEヌクレオシドからなる群から独立して選択される2~5個の糖修飾ヌクレオシドからなり、少なくとも1つの2’-O-MCEヌクレオシドを含み、
     ギャップセグメントは、少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含む、請求項21に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  23.  前記ギャップセグメントは、8~12個のデオキシリボヌクレオシドからなり、
     前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して、2’-O-MOEヌクレオシド及び2’-O-MCEヌクレオシドからなる群から独立して選択される3~6個の糖修飾ヌクレオシドからなり、
     ギャップセグメントは、少なくとも1つのホスホロチオエート結合を含む、請求項21に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  24.  前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して、5個の2’-O-MOEヌクレオシドからなる、請求項23に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  25.  前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントは、それぞれ独立して、5個の2’-O-MCEヌクレオシドからなる、請求項23に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  26.  前記5’ウィングセグメント及び前記3’ウィングセグメントにおける糖修飾ヌクレオシドの配置は、それぞれ独立して、VLL、LVL、LLV、LVV、VLV、VVL、LLL、VVLL、VLVL、VLLV、LVLV、LLVV、LVVL、VLLL、LVLL、LLVL、LLLV、LVVV、VLVV、VVLV、及びVVVLからなる群から選ばれ、ここで、LはLNAを示し、Vは2’-O-MCEヌクレオシドを示す、請求項21に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  27.  第一オリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項1から26のいずれか一つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  28.  第二オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つのリボヌクレオシドを含む、請求項1から27のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  29.  第二オリゴヌクレオチドは、少なくとも4つの連続するリボヌクレオシドを含む、請求項1から28のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  30.  第二オリゴヌクレオチドは、RNAである、請求項1から29のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  31.  第二オリゴヌクレオチドは、DNAである、請求項1から27のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  32.  第二オリゴヌクレオチドは、第二オリゴヌクレオチドの5’末端側及び3’末端側の少なくとも一方に、1又は複数の糖修飾ヌクレオシドを含む、請求項1から29のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  33.  第二オリゴヌクレオチドに含まれるヌクレオシドが、ホスホジエステル結合で互いに連結されている、請求項1から32のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  34.  第二オリゴヌクレオチドは、第二オリゴヌクレオチドの5’末端側及び3’末端側の少なくとも一方に、1又は複数のホスホロチオエート結合を含む、請求項1から32のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  35.  前記一本鎖オリゴヌクレオチドは、配列番号772~776からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する、請求項1から34のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  36.  前記一本鎖オリゴヌクレオチドは、配列番号797~801、803~808及び810からなる群から選択されるいずれか1つの核酸塩基配列を含む核酸塩基配列を有する、請求項1から34のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  37.  標識機能、精製機能及び標的部位への送達機能からなる群から選択される少なくとも1つを有する機能性分子をさらに含む、請求項1から36のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  38.  前記機能性分子は、脂質及び糖から選択される、請求項37に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  39.  CUCACCUUACCCGGAUAAAAA(V)^T(L)^5(L)^5(x)^g^g^g^t^a^a^g^g^t^G(L)^A(L)^G(V)、
    CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)^G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)^A(L)^G(V)、
    ACCCUCUCAUUGACCCAAAAG(V)^G(L)^G(L)^t^5(x)^a^a^t^g^a^g^a^g^G(L)^G(L)^T(V)、
    UCGGUGCACCCUCUCAAAAAT(L)^G(V)^A(L)^g^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(L)^G(V)^A(L)、
    CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(V)^G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)^A(L)^G(V)、
    CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)^G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)^A(V)^G(V)、
    CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(L)^A(V)^G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)^A(V)^G(L)、
    CCUCGGUGCACCCUCUCAAAAAT(V)^G(L)^A(V)^G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)^A(V)^G(L)^G(V)、
    CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(L)^A(L)^G(V)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(V)^A(L)^G(L)、
    CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)G(L)^a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)A(L)^G(V)、
    CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)G(L)a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)A(L)^G(V)、
    CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)G(L)A(V)^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(x)^G(L)A(L)^G(V)、
    CUCGGUGCACCCUCUCAAAAG(V)^A(L)G(L)a^g^g^g^t^g^5(x)^a^5(x)^5(V)G(L)A(L)^G(V)、
    ACCCUCUCAUUGACCCAAAAG(V)^G(L)^G(L)^t^5(x)^a^a^t^g^a^g^a^g^G(L)^G(V)^T(V)、
    GGAUAUUUUGAGUCUUAAAAA(V)^A(L)^G(L)^a^5(x)^t^5(x)^a^a^a^a^t^a^T(L)^5(L)^5(V) 、
    UGGUACAUCUGUGUUGAAAA5(V)^A(L)^A(L)^5(x)^a^5(x)^a^g^a^t^g^t^a^5(L)^5(L)^A(V) 、
    GAACUCUCCCUAACCCAAAAG(V)^G(L)^G(L)^t^t^a^g^g^g^a^g^a^g^T(L)^T(L)^5(V) 、
    CCAGCCUCUGCCUCGGAAAA5(L)^5(L)^G(L)^a^g^g^5(x)^a^g^a^g^g^5(x)^T(L)^G(L)^G(L) 、
    GGUUACAAUGUCCCGGAAAA5(V)^5(L)^G(L)^g^g^a^5(x)^a^t^t^g^t^a^A(L)^5(L)^5(V) 、
    CCGAUCUGGAUAGCUUAAAAA(V)^A(L)^G(L)^5(x)^t^a^t^5(x)^5(x)^a^g^a^t^5(L)^G(L)^G(V) 、
    GACUCAUCUUCUGGCCAAAAG(V)^G(L)^5(L)^5(x)^a^g^a^a^g^a^t^g^a^G(L)^T(L)^5(V) 、
    CAGUGAAUAUGCCCGGAAAA5(V)^5(L)^G(L)^g^g^5(x)^a^t^a^t^t^5(x)^a^5(L)^T(L)^G(V) 、
    CGACCCUAGGGAUAUCAAAAG(V)^A(L)^T(L)^a^t^5(x)^5(x)^5(x)^t^a^g^g^g^T(L)^5(L)^G(V) 、
    CCUACCCAUGUUCACAAAAAT(V)^G(L)^T(L)^g^a^a^5(x)^a^t^g^g^g^t^A(L)^G(L)^G(V) 、
    AUGUAUGCCCCUUGCCAAAAG(V)^G(L)^5(L)^a^a^g^g^g^g^5(x)^a^t^a^5(L)^A(L)^T(V) 及び
    CUAGUAGUAGCUCUGCAAAAG(V)^5(L)^A(L)^g^a^g^5(x)^t^a^5(x)^t^a^5(x)^T(L)^A(L)^G(V)
    からなる群から選択され、
    ここで、(L)はLNA(β-D-メチレンオキシBNA)を意味し、(V)は2’-O-MCEヌクレオシドを意味し、小文字のアルファベットはデオキシリボヌクレオシドを意味し、大文字のアルファベット(前記(L)における「L」、及び(V)における「V」を除く)はリボヌクレオシドを意味し、^はホスホロチオエート結合を意味し、5(x)は、そのデオキシリボヌクレオシドの核酸塩基が5-メチルシトシンであることを意味し、
    「5(V)」及び「5(L)」における「5」は、そのヌクレオシドの核酸塩基が5-メチルシトシンであることを意味し、
    隣り合う2つのヌクレオシドの間に、^が記載されていないとき、その2つのヌクレオシドの間のヌクレオシド間結合はホスホジエステル結合である、請求項1に記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又はその医学的に許容され得る塩。
  40.  第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドとを含む二本鎖オリゴヌクレオチド複合体であって、
     第一オリゴヌクレオチドは、Atrophin1 mRNA若しくはpre-mRNAとのハイブリダイズを可能にする配列を含み、
     デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、
     少なくとも1つの糖修飾ヌクレオシドを含み、
     第二オリゴヌクレオチドは、第一オリゴヌクレオチドの少なくとも一部とのハイブリダイズを可能とする配列を含み、
     デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド及び糖修飾ヌクレオシドから独立して選択される8~30個のヌクレオシドからなり、
     第一オリゴヌクレオチドと第二オリゴヌクレオチドがハイブリダイズしている、二本鎖オリゴヌクレオチド複合体、又はその医学的に許容され得る塩。
  41.  請求項1から40のいずれか1つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又は二本鎖オリゴヌクレオチド複合体、又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む医薬。
  42.  請求項1から40のいずれか一つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又は二本鎖オリゴヌクレオチド複合体、又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む、ATN1遺伝子の発現阻害作用が有効な疾患若しくは状態の治療、予防及び/又は改善薬。
  43.  請求項1から40のいずれか一つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又は二本鎖オリゴヌクレオチド複合体、又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む、ATN1遺伝子の発現阻害剤。
  44.  請求項1から40のいずれか一つに記載の一本鎖オリゴヌクレオチド又は二本鎖オリゴヌクレオチド複合体、又はその医学的に許容され得る塩を有効成分として含む、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症の治療、予防、及び/又は改善薬。
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