WO2022071242A1 - 腎がん患者の抗がん剤抵抗性および予後予測方法、抗腎がん物質のスクリーニング方法、ならびに、腎がん治療用医薬組成物 - Google Patents
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Definitions
- the present invention relates to an anticancer drug resistance and prognosis prediction method for renal cancer patients, a screening method for antirenal cancer substances, and a pharmaceutical composition for treating renal cancer.
- Kidney cancer is one of the major cancers in the urinary field, and the number of patients is increasing due to the spread of health examinations and the improvement of the examination system.
- the clinical characteristics of renal cancer include the fact that symptoms such as hematuria and pain are unlikely to occur, that many patients have metastases at the time of diagnosis, and that about 20% of patients have recurrence even if radical resection is performed. Be done. Therefore, the prediction and suppression of postoperative recurrence and the development of treatments for advanced cancer are indispensable for improving the prognosis of life.
- Patent Documents 1 and 2 there have been various reports as factors predicting prognosis including postoperative recurrence (for example, Patent Documents 1 and 2), but most of them are based on gene analysis or complicated analysis models and are clinical. None is used in the field yet.
- molecular-targeted therapeutic agents and new immunotherapeutic agents have appeared as therapeutic agents for advanced renal cancer, and although the prognosis for life has improved, the 5-year survival rate is about 25%, which is not satisfactory at all. Furthermore, the lack of predictors of their antitumor effects has become a problem. Thus, for prolonging the survival prognosis of renal cancer patients, clinically feasible and highly useful postoperative recurrence and survival prognosis, and predictive models for the effects of molecular-targeted therapies and novel immunotherapeutic agents There is a need to develop new therapeutic strategies based on the development and the development of new therapeutic agents with different mechanisms of action.
- Non-Patent Document 1 Largen increases mitochondria and promotes ATP production, Largen activates protein synthesis, and hepatocytes and cardiomyocytes that overexpress Largen are actually contained in mice. It is reported that it will grow in. In addition, the present inventors have found and reported that the onset and progression of lymphoma are delayed in lymphocyte-specific overexpressing mice of the PRR16 gene (Non-Patent Document 2).
- the present invention includes the following inventions in order to solve the above problems.
- a method for predicting anticancer drug resistance and / or prognosis of a renal cancer patient in which a step of evaluating the expression of Largen in the renal cancer tissue of the subject and the kidney of the subject are used.
- a predictive method comprising comparing the expression level of Largen in a kidney tissue with a control.
- a method for predicting anticancer drug resistance and / or prognosis in patients with renal cancer which evaluates the expression of Largen in the metastatic tissue of renal cancer of the subject and the kidney of the subject.
- a predictive method comprising comparing the expression level of Largen in cancer metastatic tissue with a control.
- a method for predicting anticancer drug resistance and / or prognosis in renal cancer patients which is a step of detecting Largen in the body fluid of a subject and the amount of Largen detected in the body fluid of a subject.
- a prediction method that includes a step of comparing the control with the control.
- a screening method comprising the step of selecting a test substance having a reduced expression level.
- a pharmaceutical composition for treating renal cancer which comprises a substance that inhibits the expression of Largen in renal cancer cells as an active ingredient.
- An anticancer drug resistance and / or prognosis prediction kit for renal cancer patients which comprises an anti-Largen antibody or a primer or probe for detecting Largen mRNA.
- a kit for screening an antirenal cancer substance which comprises an anti-Largen antibody or a primer or probe for detecting Largen mRNA.
- anticancer drug resistance of renal cancer patients can be predicted.
- the present invention can predict the prognosis of renal cancer patients.
- the screening method of the present invention can provide a pharmaceutical composition for treating renal cancer having a new mechanism of action.
- Tissue sections of renal cancer tissue removed from renal cancer patients were immunostained with an anti-human Largen antibody and observed under a microscope.
- A is an observation image of a normal kidney part
- B is. It is an observation image of the kidney cancer part. It is a figure which shows the result of having compared the cleaved-Cas3 positive cell rate with respect to the largen high expression patient group (88 persons) and the Largen low expression patient group (120 persons). It is a figure which shows the result of having compared the postoperative overall survival time with respect to the largen high expression patient group (88 persons) and the Largen low expression patient group (120 persons).
- the present invention provides a method for predicting anticancer drug resistance and / or prognosis of a renal cancer patient (hereinafter referred to as "the predictive method of the present invention").
- the first embodiment of the prediction method of the present invention is a step of evaluating the expression of Largen in the renal cancer tissue of a subject and a step of comparing the expression level of Largen in the renal cancer tissue of the subject with a control. It may be any one containing.
- the step of evaluating the expression of Largen in the renal cancer metastatic tissue of the subject and the expression level of Largen in the renal cancer metastatic tissue of the subject are compared with the control. It suffices as long as it includes the steps to be performed.
- the third embodiment of the prediction method of the present invention may include a step of detecting Largen in the body fluid of the subject and a step of comparing the amount of Largen detected in the body fluid of the subject with the control. ..
- the subject in the prediction method of the present invention may be a subject suspected of having renal cancer.
- the subject may be a renal cancer patient who has undergone partial nephrectomy or may be a renal cancer patient who has undergone radical nephrectomy.
- the prediction method of the present invention is useful in that it can predict the prognosis of renal cancer patients who have undergone radical nephrectomy.
- a subject who can provide a renal tissue sample suspected of having renal cancer can apply the first embodiment of the prediction method of the present invention.
- a subject who can provide a tissue sample suspected of metastasis of renal cancer can apply the second embodiment of the prediction method of the present invention.
- All subjects suspected of having renal cancer can apply the third embodiment of the prediction method of the present invention.
- the renal tissue sample or the tissue sample suspected of having renal cancer metastasis may be obtained by biopsy or may be obtained by surgery.
- Tissues suspected of having renal cancer metastasis are not particularly limited, but ovary, uterus, breast, thyroid, brain, esophagus, tongue, lung, pancreas, stomach, small intestine, duodenum, large intestine, bladder, liver, prostate, gallbladder, pharynx. , Muscles, bones, skin, etc.
- Tissue suspected of metastasis of kidney cancer may be lung, brain or bone.
- the body fluid is not particularly limited, but examples thereof include blood, lymph, tissue fluid, body cavity fluid, digestive fluid, runny nose, and urine. It is preferably blood or urine.
- the blood may be serum, plasma or whole blood.
- the body fluid may be the body fluid itself collected from the subject, or may be a body fluid obtained by subjecting the collected body fluid to a treatment such as dilution or concentration that is usually performed.
- the anticancer drug to be predicted for resistance is not particularly limited, but it may be a molecular target drug or an immunotherapeutic drug.
- the molecular target drug include tyrosine kinase inhibitors such as sorafenib, sunitinib, pazopanib, axitinib, and cabosantinib, and mTOR (mammalian rapamycin target protein) inhibitors such as everolimus and temsilonimus.
- immunotherapeutic agent examples include immune checkpoint inhibitors, and examples thereof include anti-PD-1 antibodies such as nibolumab and pembrolizumab, and anti-PD-L1 antibodies such as avelumab, atezolizumab, and durvalumab.
- anti-PD-1 antibodies such as nibolumab and pembrolizumab
- anti-PD-L1 antibodies such as avelumab, atezolizumab, and durvalumab.
- the prognosis is not particularly limited, and examples thereof include survival time, cancer progression, cancer recurrence, and event-free period.
- Cancer recurrence includes cancer recurrence at the site of resection (progression-free survival) and recurrence of once cured cancer (disease-free survival).
- the event-free period includes a period until a new metastasis appears in addition to an existing metastasis, a period until the residual cancer increases, a period until a fracture associated with the cancer occurs, and the like.
- Postoperative event-free period can be predicted.
- a tissue section of the subject's renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue is prepared and an anti-Largen antibody is used. It can be done by immunostaining.
- the evaluation of Largen expression in the renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue of the subject measures, for example, the amount of Largen protein or the amount of Largen mRNA in the renal cancer tissue or the renal cancer metastatic tissue. It can be done by. It is preferable to use immunostaining because of its convenience and widespread use, and because it can eliminate the expression of Largen in cells other than cancer cells.
- PRR16 gene proline rich 16 gene
- the immunostaining method for tissue specimens is not particularly limited, and can be appropriately selected and used from known immunostaining methods.
- anti-Largen antibody anti-PRR16 antibody
- a commercially available antibody can be used.
- protein can be extracted from renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue by a known method and quantified by using a known method for measuring protein amount.
- Known methods for measuring the amount of protein include, for example, Western blotting, EIA method, ELISA method, RIA method, and a method using a protein measuring reagent.
- RNA can be extracted from renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue by a known method and quantified using a known method for measuring mRNA amount.
- Known methods for measuring the amount of mRNA include Northern blotting, RT-PCR, quantitative RT-PCR, RNase protection assay and the like.
- normal renal tissue When evaluating the expression of Largen in the renal cancer tissue of a subject by immunostaining, normal renal tissue can be used as a control, and it is preferable, but not limited to, normal renal tissue collected at the same time. ..
- renal cells collected from a healthy subject may be used as a control, or an organ or tissue other than the kidney known to have a low expression level of Largen may be used as a control.
- the normal tissue corresponding to the metastatic tissue can be used as a control, and it is preferable to use the normal tissue collected at the same time.
- a normal corresponding tissue collected from a healthy person may be used as a control, or an organ or tissue other than the corresponding tissue known to have a low expression level of Largen may be used as a control.
- the expression level of Largen is, for example, the expression intensity of Largen in 4 stages (no expression; 0, mild; 1, moderate; 2, severe; 3) and the expression rate in 4 stages (less than 10%; 0, 10). It can be classified into% or more and less than 25%; 1, 25% or more and less than 50%; 2, 50% or more: 3), and can be expressed as a numerical value obtained by adding both.
- the expression level of the control is compared with the expression level of the renal cancer tissue of the subject to determine whether the expression level of the subject is high or not.
- normal renal tissue When evaluating the expression of Largen in the renal cancer tissue of a subject by the amount of protein or mRNA, normal renal tissue can be used as a control, and it is preferable to use normal renal tissue collected at the same time.
- the corresponding normal tissue When evaluating the expression of Largen in the renal cancer metastatic tissue of a subject by the amount of protein or mRNA, the corresponding normal tissue can be used as a control, and it is preferable to use the corresponding normal tissue collected at the same time.
- a cutoff value based on accumulated data in normal tissue may be used as the measured value of Largen protein or mRNA in the control.
- each sample can be measured a plurality of times and judged by the presence or absence of a statistically significant difference.
- the subject When it is determined in the prediction method of the present invention that the expression level of Largen in the renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue of the subject is higher than that of the control, the subject is resistant to the anticancer drug. It can be predicted to be sex (anticancer drug is difficult to work) and has a poor prognosis (short survival time, rapid cancer progression, high probability of recurrence, short event-free period). Can be predicted. On the other hand, if it is determined that the expression level of Largen in the renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue of the subject is not different from that of the control, the subject is anticancer drug sensitive (anti-cancer drug).
- the prediction method of the present invention can be used to assist the determination of the treatment policy of the subject and the selection of the anticancer drug to be administered.
- the prediction method of the present invention may combine the evaluation of Largen expression in a subject's renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue with the evaluation of necrosis in the subject's renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue.
- the prediction method of the present invention is a step of evaluating the expression of Largen in the renal cancer tissue or the metastatic tissue of the renal cancer of the subject and the Largen in the renal cancer tissue or the metastatic tissue of the renal cancer of the subject.
- the step of evaluating necrosis in the renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue of the subject and the necrosis in the renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue of the subject may include a step of comparing the level with the control.
- a tissue section of the subject's renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue is stained with hematoxylin-eosin (HE staining). It can be done by observation by a pathologist.
- tissue sections of the kidney cancer tissue of the subject were prepared and expressed by the expression of receptor-interacting protein kinase 3 (hereinafter referred to as "RIP3"), which is a representative marker of tissue necrosis. Can be evaluated.
- RIP3 receptor-interacting protein kinase 3
- a tissue section of the subject's renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue is prepared and an anti-RIP3 antibody is used. It can be done by immunostaining.
- an anti-RIP3 antibody a commercially available antibody can be used.
- the evaluation of RIP3 expression in the renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue of the subject measures, for example, the amount of RIP3 protein or the amount of RIP3 mRNA in the renal cancer tissue or the renal cancer metastatic tissue. It can be done by.
- Information on the amino acid sequence of the human RIP3 protein and the base sequence of the gene encoding the same can be obtained from a known database such as NCBI.
- the RefSeq ID of the amino acid sequence of the human RIP3 protein is NP_006862.2, and the RefSeq ID of the base sequence of the gene encoding this is NM_006871.4.
- the immunostaining method, the protein amount measuring method, and the mRNA amount measuring method can be carried out by using the same method as in the case of evaluating the expression of Largen described above.
- necrosis in a subject's renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue with an HE-stained specimen When evaluating necrosis in a subject's renal cancer tissue or renal cancer metastatic tissue with an HE-stained specimen, the same control as when evaluating Largen expression by immunostaining can be used as a control.
- the level of necrosis in HE-stained specimens can be determined by pathologist observation under a microscope and the presence or absence of disruption of cell morphology, cytoplasmic oxidation, and pyknosis or disappearance of nuclei.
- the level of necrosis of the control and the level of necrosis of the kidney cancer tissue or kidney cancer metastatic tissue of the subject are compared based on standard criteria by a pathologist, and the expression level of the subject is high or different. Judge if there is none.
- the expression level of RIP3 is, for example, the expression intensity of RIP3 in 4 stages (no expression; 0, mild; 1, moderate; 2, severe; 3) and the expression rate in 4 stages (less than 10%; 0, 10). It can be classified into% or more and less than 25%; 1, 25% or more and less than 50%; 2, 50% or more: 3), and can be expressed as a numerical value obtained by adding both.
- the expression level of the control is compared with the expression level of the kidney cancer tissue or the metastatic tissue of the kidney cancer of the subject to determine whether the expression level of the subject is high or not.
- the present invention when it is determined that the expression level of Largen in the renal cancer tissue or the metastatic tissue of the renal cancer of the subject is higher than that of the control and the level of necrosis is not different from that of the control, the present invention is concerned.
- Subjects can be predicted with high accuracy to be resistant to anticancer drugs (anticancer drugs are difficult to work) and have a poor prognosis (short survival time, rapid cancer progression, recurrence). (There is a high possibility that the non-event period is short), and it can be predicted with high accuracy.
- the subject is determined to be the subject. It can be predicted with high accuracy that it is sensitive to anticancer drugs (anticancer drugs are effective), and the prognosis is good (long survival time, slow progression of cancer, low possibility of recurrence). It can be predicted with high accuracy (the non-event period is long).
- the method for detecting Largen in body fluid is not particularly limited, and may be an immune reaction method or a non-immune reaction method.
- EIA method EIA method, ELISA method, RIA method, Western blotting method, immunoprecipitation method, latex aggregation method, method using protein measuring reagent, high performance liquid chromatography, gas chromatography, mass spectrometry and the like can be mentioned.
- It is preferably a method capable of performing detection and quantification at the same time.
- detection and quantification can be performed simultaneously by using the sandwich method.
- an anti-Largen antibody is immobilized on a solid-phase carrier, and an appropriately pretreated body fluid is added for reaction, and then an anti-Largen antibody that recognizes another enzyme-labeled epitope is added and reacted. Largen can be detected and quantified at the same time by reacting with the enzyme substrate after washing, developing a color, and measuring the absorbance.
- an unlabeled Largen antibody (primary antibody) is added, and the antibody (secondary antibody) against this unlabeled antibody is enzymatically labeled. It may be a method of further adding.
- the ELISA method is not limited to the sandwich method, and may be a direct method, a competitive method, or the like.
- a detection system may be prepared using a commercially available ELISA production kit (manufactured by MyBioSource, etc.).
- the amount of mRNA in body fluid may be detected and quantified.
- mRNA can be detected and quantified at the same time by the Northern plot method, microarray method, quantitative PCR method, real-time PCR method, digital PCR, next-generation sequencing, and the like.
- the mRNA in the body fluid may be contained in the exosome. In that case, the exosome is separated from the body fluid using an ultracentrifugation method, a commercially available kit (manufactured by Hitachi, Ltd., etc.) filter or a column, and then the mRNA is extracted. It may be quantified after that.
- the corresponding body fluid of a healthy person can be used as a control. It is preferable to detect Largen using the same method as that of the subject, using the corresponding body fluid of a healthy subject.
- a cutoff value based on the Largen detection amount accumulation data in the body fluid of a healthy person may be used.
- the subject when it is determined that the amount of Largen detected in the body fluid of the subject is larger than that of the control, the subject is resistant to the anticancer drug (the anticancer drug is effective). It can be predicted that it is difficult) and that the prognosis is poor (short survival time, rapid cancer progression, high probability of recurrence, short event-free period). On the other hand, if it is determined that the amount of Largen detected in the body fluid of the subject is not different from that of the control, the subject is predicted to be anticancer drug sensitive (the anticancer drug is likely to be effective). It can be predicted that the prognosis is good (long survival, slow cancer progression, low chance of recurrence, long event-free period).
- the present invention provides a method for screening an antirenal cancer substance.
- the screening method of the present invention may include the following steps (1) to (3). (1) A step of in vitro contacting a test substance with a renal cancer cell expressing Largen. (2) The step of measuring the Largen expression level in the renal cancer cells, and (3) the obtained Largen expression level is compared with the Largen expression level of the renal cancer cells not in contact with the test substance. , The step of selecting a test substance that reduces the expression level.
- test substance for example, nucleic acids, peptides, proteins, non-peptide compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, cell culture supernatants, plant extracts, mammalian tissue extracts, plasma and the like are preferably used. be able to. However, it is not limited to these.
- the test substance may be a novel substance or a known substance. These test substances may form salts.
- the salt of the test substance a salt with a physiologically acceptable acid or base is used.
- renal cancer cells expressing Largen use primary cultured cells obtained from cancer tissues of renal cancer patients, renal cancer cell lines expressing Largen, renal cancer cell lines into which a Largen expression vector has been introduced, and the like. Can be done.
- the renal cancer cell line is preferably a human renal cancer cell line.
- the method of bringing the test substance into contact with the renal cancer cells expressing Largen in vitro is not particularly limited, and for example, a method of adding the test substance to the medium in which the renal cancer cells are cultured is used. Can be mentioned. It is preferable to provide a control group that does not come into contact with the test substance.
- the Largen expression level in renal cancer cells contacted with the test substance is measured.
- the largen expression level may be measured by measuring the amount of Largen protein or the amount of Largen mRNA.
- protein can be extracted from renal cancer cells by a known method and quantified by using a known method for measuring protein amount.
- Known methods for measuring the amount of protein include, for example, Western blotting, EIA method, ELISA method, RIA method, and a method using a protein measuring reagent.
- RNA can be extracted from renal cancer cells by a known method and quantified using a known method for measuring the amount of mRNA.
- Known methods for measuring the amount of mRNA include Northern blotting, RT-PCR, quantitative RT-PCR, RNase protection assay and the like.
- step (3) the Largen expression level measured in step (2) is compared with the Largen expression level of the renal cancer cells that are not in contact with the test substance, and a test substance having a reduced expression level is selected.
- the criteria for reducing the expression are not particularly limited, but it is preferable to select a test substance that reduces the expression level to the extent that a significant difference is observed in the statistical analysis. Since the selected test substance reduces the Largen expression level of renal cancer cells, renal cancer patients who receive it are considered to have a better prognosis. In addition, renal cancer patients who received this drug are considered to be more sensitive to anticancer drugs.
- test substance selected by the screening method of the present invention is effective as a renal cancer therapeutic agent capable of enhancing the anticancer effect of the concomitant anticancer agent by concomitant use with other anticancer agents. It is thought that it can be an ingredient.
- the present invention provides a pharmaceutical composition for treating renal cancer.
- the pharmaceutical composition of the present invention may contain a substance that inhibits the expression of Largen in renal cancer cells as an active ingredient.
- the test substance selected by the screening method of the present invention can be preferably used.
- the pharmaceutical composition of the present invention contains a substance that inhibits the expression of Largen in renal cancer cells as an active ingredient, and can be formulated according to conventional means.
- the preparation for oral administration includes solid or liquid dosage forms, specifically tablets (including sugar-coated tablets and film-coated tablets), pills, granules, powders, capsules (including soft capsules), and the like. Examples include syrups, emulsions and suspending agents.
- These formulations are manufactured by known methods and contain carriers, diluents or excipients commonly used in the pharmaceutical field. For example, lactose, starch, sucrose, magnesium stearate and the like are used as carriers and excipients for tablets. For example, injections, suppositories, etc.
- injections include intravenous injections, subcutaneous injections, intradermal injections, intramuscular injections, drip injections, and intra-articular injections. Including dosage forms such as.
- Such injections are prepared according to known methods, for example, by dissolving, suspending or emulsifying the active ingredient in a sterile aqueous or oily solution normally used for injections.
- aqueous solution for injection for example, physiological saline, an isotonic solution containing glucose and other adjuvants are used, and suitable solubilizing agents such as alcohol (eg, ethanol), polyalcohol (eg, eg, ethanol) are used.
- Propylene glycol, polyethylene glycol, etc.), nonionic surfactant for example, polysorbate 80, HCO-50, etc.
- oily liquid for example, sesame oil, soybean oil and the like are used, and benzyl benzoate, benzyl alcohol and the like may be used in combination as a solubilizing agent.
- Suppositories used for rectal administration are prepared by mixing the active ingredient with a conventional suppository base.
- the pharmaceutical product thus obtained is safe and low toxicity, and therefore, for example, orally to humans and mammals (eg, rats, mice, rabbits, sheep, pigs, cows, cats, dogs, monkeys, etc.). Alternatively, it can be administered parenterally.
- the active ingredient of the pharmaceutical composition of the present invention may be a nucleic acid that inhibits the expression of Largen in renal cancer cells.
- nucleic acids that inhibit the expression of Largen include siRNA (short interfering RNA), shRNA (short hairpin RNA), and antisense oligonucleotides of the PRR16 gene.
- the nucleic acid that inhibits the expression of Largen can be designed by a known method based on the base sequence of the PRR16 gene (see RefSeqID shown in Table 1).
- a siRNA is a double-stranded RNA having a length of about 20 bases (for example, about 21 to 23 bases) or less, and by expressing such siRNA in a cell, the gene targeted by the siRNA (book). In the invention, the expression of PRR16 gene) can be suppressed.
- shRNA is a single-stranded RNA containing a partially palindromic base sequence, thereby having a double-stranded structure in the molecule, and about 20 base pairs consisting of a short hairpin structure having a protrusion at the 3'end. Refers to the above molecules.
- shRNA After being introduced into a cell, such shRNA is broken down into a length of about 20 bases (typically, for example, 21 bases, 22 bases, and 23 bases) in the cell and becomes a target like siRNA. Expression of a gene (PRR16 gene in the present invention) can be suppressed.
- the siRNA and shRNA may be in any form as long as they can suppress the expression of Largen.
- the siRNA or shRNA can be designed by a known method based on the base sequence of the target gene.
- siRNA or shRNA can be artificially synthesized.
- Antisense and sense RNA can also be synthesized in vitro from template DNA using, for example, T7 RNA polymerase and T7 promoter.
- the antisense oligonucleotide may be any nucleotide that is complementary to or hybridizes to the consecutive 5 to 100 base sequences in the DNA sequence of the PRR16 gene, and may be either DNA or RNA. Further, it may be modified as long as it does not interfere with the function.
- the antisense oligonucleotide can be synthesized by a conventional method, and can be easily synthesized by, for example, a commercially available DNA synthesizer.
- the active ingredient of the pharmaceutical composition of the present invention is a nucleic acid that inhibits the expression of Largen, it can be administered in the form of a non-viral vector or a viral vector.
- a method of introducing a nucleic acid molecule using a liposome lipocytosis method, HVJ-lipolysis method, cationic liposome method, lipofection method, lipofectamine method, etc.
- microinjection method can be used to transfer nucleic acid molecules into cells together with carriers (metal particles).
- siRNA or shRNA When siRNA or shRNA is administered to a living body using a viral vector, detoxified retrovirus, adenovirus, adeno-associated virus, herpesvirus, vaccinia virus, poxvirus, poliovirus, Sindobis virus, Sendai virus, SV40, etc.
- a gene can be introduced into a cell or tissue by introducing a DNA expressing siRNA or shRNA into the DNA virus or RNA virus of the above and infecting the cell or tissue with the recombinant virus.
- the DNA expressing siRNA or shRNA preferably has a promoter sequence specific to renal cells.
- the siRNA and the target sequence are the same, but as long as RNA interference can be induced, the sequences do not have to be exactly the same. Specifically, as long as the antisense strand sequence of siRNA and the target sequence hybridize, there may be one to several mismatches (for example, 2, 3 or 4). That is, the siRNA may be one in which one to several bases are substituted, added or deleted from the target sequence and can induce RNA interference. Further, the siRNA may have 85% or more, 90% or more, 95% or more, 98% or more sequence identity with the target sequence, and may be capable of inducing RNA interference.
- SiRNA is a DNA obtained by converting all nucleotides of either the sense strand or the antisense strand into DNA (hybrid type) as long as it can induce RNA interference, or DNA of some nucleotides of the sense strand and / or the antisense strand. It may be converted to (chimera type).
- hybrid type include those obtained by converting the nucleotides of the sense strand into DNA.
- chimeric type include those in which a part of the nucleotides on the downstream side (3'end side of the sense strand and 5'end side of the antisense strand) are converted into DNA.
- the nucleotides on the 3'end side of the sense strand and the 5'end side of the antisense strand are both converted into DNA, either on the 3'end side of the sense strand or on the 5'end side of the antisense strand.
- the nucleotide of the above is converted into DNA.
- the nucleotide length to be converted may be an arbitrary length up to a nucleotide corresponding to 1/2 of the RNA molecule.
- the siRNA may be a nucleotide analog in which the nucleotide (ribonucleotide, deoxyribonucleotide) is chemically modified with a sugar, a base and / or a phosphate as long as it can induce RNA interference.
- Base-modified nucleotide analogs include, for example, 5-position modified uridine or cytidine (eg, 5-propynyluridine, 5-propynylcytidine, 5-methylcitidine, 5-methyluridine, 5- (2-amino) propyl.
- 2'-OH of ribonucleotide is H, OR, R, halogen atom, SH, SR, NH 2 , NHR, NR 2 , or CN (here).
- R indicates a 2'-position sugar modification substituted with an alkyl group having 1-6 carbon atoms, an alkenyl group or an alkynyl group), and a 5'end phosphorylation modification in which the 5'end is monophosphorylated.
- Phosphate-modified nucleotide analogs include those in which the phosphoester group that binds adjacent ribonucleotides is replaced with a phosphothioate group.
- the pharmaceutical composition of the present invention can improve the prognosis of administered renal cancer patients.
- the pharmaceutical composition of the present invention can increase the sensitivity of a administered renal cancer patient to an anticancer drug. Therefore, the pharmaceutical composition of the present invention is preferably used in combination with other anticancer agents.
- the present invention provides an anticancer drug resistance and / or prognosis prediction kit for renal cancer patients.
- the present invention also provides a kit for screening an antirenal cancer substance.
- the kit of the present invention may include an anti-Largen antibody or a primer or probe for detecting Largen mRNA.
- the anti-Largen antibody can be used for immunostaining, Western blotting, ELISA and the like.
- Primers for detecting Largen mRNA can be used in RT-PCR method and quantitative RT-PCR.
- the primer may be a primer set for RT-PCR or quantitative RT-PCR.
- Probes for detecting Largen mRNA can be used for Northern blots.
- the composition other than the primer or probe for detecting the anti-Largen antibody or Largen mRNA is not particularly limited, and depending on the purpose of use, an instrument such as a tube or plate for reaction, a necessary reagent, etc. An instruction manual or the like may be included.
- an instrument such as a tube or plate for reaction, a necessary reagent, etc.
- An instruction manual or the like may be included.
- Example 1 Evaluation of Largen expression in cancer tissues of renal cancer patients
- the immunostained specimen was evaluated by scoring the expression intensity and the expression ratio. Specifically, the expression intensity is divided into 4 stages (no expression; 0, mild; 1, moderate; 2, severe; 3), and the expression ratio is divided into 4 stages (less than 10%; 0, 10% or more and less than 25%). It was classified into 1, 25% or more and less than 50%; 2, 50% or more: 3), and each was added. At a magnification of 200 times, 10 or more visual fields were observed and evaluated in the visual field with the highest expression. Since the highest score in normal renal tissue was 3, those with a score of 4 or higher in renal cancer tissue were judged to be patients with high Largen expression, and those with a score of 3 or less were judged to be patients with low Largen expression.
- Results Figure 1 shows typical immunostaining images of renal cancer tissue removed from renal cancer patients.
- A is an observation image of the normal kidney part (magnification 200 times)
- B is an observation image of the kidney cancer part (magnification 400 times in the upper row, magnification 200 times in the lower row). It can be seen that Largen was hardly stained in the normal kidney part of (A), but Largen was strongly stained in the renal cancer part in the upper part of (B).
- the lower part shows that the renal cancer cells in the upper right are strongly stained, and the renal cancer cells in the lower left are lightly stained, indicating that the expression of Largen is low.
- Example 2 Evaluation of cleaved-Cas3 expression in cancer tissues of renal cancer patients
- the expression of cleaved-Cas3 in the renal cancer tissue specimens of 208 renal cancer patients in Example 1 was evaluated by immunostaining, and was performed in the Largen high expression patient group (88 patients) and the Largen low expression patient group (120 patients). The expression of cleaved-Cas3 was compared.
- Example 3 Evaluation of histological necrosis in cancer tissue of renal cancer patient
- Histological necrosis in the renal cancer tissue specimens of 208 renal cancer patients of Example 1 was determined by hematoxylin eosin (HE) staining and immunostaining of the tissue necrosis marker RIP3, and the Largen high expression patient group (88).
- HE hematoxylin eosin
- RIP3 Judgment by RIP3 immunostaining RIP3 is one of the representative markers of tissue necrosis.
- a rabbit polyclonal antibody against human RIP3 manufactured by Abcam was used as the primary antibody, and immunostaining was performed by the same method as in Example 1.
- the expression intensity of RIP3 was in 4 stages (no expression; 0, mild; 1, moderate; 2, severe; 3), and the expression ratio was in 4 stages (less than 10%; 0, 10% or more and less than 25%; 1, It was classified into 25% or more and less than 50%; 2, 50% or more: 3), and each was added.
- 10 or more visual fields were observed and evaluated in the most highly expressed visual field, and when the added score was 4 or more, necrosis was determined.
- Example 4 Evaluation of postoperative survival time of renal cancer patients
- 4-1 Overall postoperative survival time A comparison of postoperative overall survival was performed between a group of patients with high expression of Largen (88 patients) and a group of patients with low expression of Largen (120 patients). The cumulative survival rate was calculated by the Kaplan-Meier method, and the P value was calculated by the log-rank test.
- Progression-free survival is the period during which the cancer remains stable without recurrence or progression after surgery.
- the largen high expression patient group (88 patients) and the Largen low expression patient group (120 patients) were included, and all patients were followed up with necessary imaging tests and treatment regardless of the Largen expression level.
- the cumulative survival rate was calculated by the Kaplan-Meier method, and the P value was calculated by the log-rank test.
- 4-3 Disease-free survival is the period in which cancer does not recur and survives in patients who have undergone radical surgery without any suspicion of metastasis before surgery. To say. Of the 174 patients with renal cancer, 61 had high expression of Largen and 113 had low expression of Largen. The target patients were followed up with necessary imaging tests and treatment for all patients, regardless of Largen expression level. The cumulative survival rate was calculated by the Kaplan-Meier method, and the P value was calculated by the log-rank test.
- Example 5 Therapeutic effect of renal cancer patients on anticancer drugs
- 17 had high expression of Largen and 24 had low expression of Largen.
- sorafenib and pazopanib which are tyrosine kinase inhibitors
- nivolumab which is an immune checkpoint inhibitor
- RECIST Response Evaluation Criteria in Solid Tumors
- Example 6 Detection and quantification of Largen in blood and urine of renal cancer patients
- Blood and urine were collected from healthy subjects and renal cancer patients, respectively, and the amount of Largen protein and mRNA was quantified and compared.
- 11 renal cancer patients whose blood and urine were collected before surgery were included.
- Blood and urine were similarly collected from three healthy subjects with no pathological conditions including malignant tumors and renal dysfunction.
- the sandwich ELISA method was used to quantify the large n protein.
- a Quantitative Sandwich ELISA kit manufactured by MyBioSource was used. Largen mRNA was quantified by RT-PCR.
- FIG. (A) is the result of serum Largen concentration
- Example 7 Relationship between antitumor effect of anticancer drug and Largen expression
- 41 patients were able to analyze the expression of Largen in pretreatment tissues.
- a chi-square test was used for statistical processing.
- CR is an abbreviation for Complete Response, which indicates a state in which the tumor has completely / almost disappeared (therapeutic effect: strong)
- PR is an abbreviation for Partial Response, in which the size of the tumor has decreased (therapeutic effect: present).
- SD is an abbreviation for Stable Disease, which indicates a state in which the size of the tumor does not change
- PD is an abbreviation for Progressive Disease, which indicates a state in which a tumor has increased / a new lesion has appeared (no therapeutic effect).
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Abstract
本発明は、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程を含む、腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法、ならびに、(1)被験物質とLargenを発現する腎がん細胞を接触させる工程、(2)前記腎がん細胞におけるLargenの発現量を測定する工程、および(3)得られたLargen発現量を、被験物質と接触していない前記腎がん細胞のLargen発現量と比較して、発現量を低下させる被験物質を選択する工程を含む、抗腎がん物質のスクリーニング方法を提供する。
Description
本発明は、腎がん患者の抗がん剤抵抗性および予後予測方法、抗腎がん物質のスクリーニング方法、ならびに、腎がん治療用医薬組成物に関するものである。
腎がんは泌尿器領域における主要ながんの1つであり、健康診断の普及や検査制度の向上から患者数は増加傾向にある。腎がんの臨床的特徴として、血尿や疼痛などの症状が出にくいこと、診断時に転移を有する患者が少なくないこと、根治的切除が行われた場合でも約2割が再発することなどが挙げられる。それゆえ、術後再発の予測とその抑制、進行がんに対する治療法の発展が生命予後改善に不可欠である。近年、術後再発を含む予後を予測する因子として様々な報告があるが(例えば、特許文献1、2など)、その多くは遺伝子の解析や複雑な解析モデルに基づいたものであり、臨床の現場で用いられるものは未だに存在しない。
また、進行性腎がんに対する治療薬として分子標的治療薬や新規免疫療法薬が登場し、生命予後は改善したものの、その5年生存率は約25%と決して満足のいくものではない。さらに、それらの抗腫瘍効果に関する予測因子がないことが問題となっている。このように、腎がん患者の生命予後の延長には、臨床的に実施可能で有用性の高い術後再発や生命予後、そして、分子標的治療薬や新規免疫治療薬の効果に関する予測モデルの開発と、従来とは作用機序の異なる新規治療薬の開発に基づいた新たな治療戦略の構築が求められている。
本発明者らは、細胞の大きさを調節する遺伝子を発見し、その遺伝子がコードするタンパク質を「Largen(ラージン)」と名付けた(非特許文献1)。本発明者らは、非特許文献1において、Largenはミトコンドリアを増やしATP産生を促進すること、Largenはタンパク質合成を活性化すること、Largenを過剰発現する肝細胞や心筋細胞は実際にマウスの体内で大きくなることを報告している。また、本発明者らは、PRR16遺伝子のリンパ球特異的過剰発現マウスにおいて、リンパ腫の発症や進行が遅延されることを見出し、報告している(非特許文献2)。さらに、本発明者らは、Largenを定常発現させた肝癌細胞株(HepG2細胞)における増殖能変化を解析したところ、Largen定常発現細胞では細胞増殖の抑制が認められたことを報告している(非特許文献3)。しかし、これら以外のがん細胞において、Largenがどのように関与しているかは未だ明らかにされていない。
Yamamoto K et al., Molecular Cell 53 (6): 904-915, 2014. doi: 10.1016/j.molcel.2014.02.028.
山本一男他、第36回日本分子生物学会本会(2013年12月3日~6日、神戸ポートアイランド)要旨、「翻訳制御を介した細胞サイズ調節と癌の関わり」
山本一男、「細胞サイズ調節遺伝子によるワールブルグ効果の破綻を利用した肝細胞癌抑制の研究」2017年度実施状況報告書、科学研究費助成事業データベース、https://kaken.nii.ac.jp/ja/report/KAKENHI-PROJECT-17K09431/17K094312017hokoku/
本発明は、腎がん患者の抗がん剤抵抗性を予測する方法、腎がん患者の予後を予測する方法を提供することを課題とする。また、本発明は、抗腎がん物質のスクリーニング方法を提供することを課題とする。さらに、本発明は、腎がん治療用医薬組成物、腎がんの予後予測用キットおよび抗腎がん物質のスクリーニング用キットを提供することを課題とする。
本発明は、上記の課題を解決するために以下の各発明を包含する。
[1]腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法であって、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程を含む予測方法。
[2]さらに、被検者の腎がん組織における壊死を評価する工程と、被検者の腎がん組織における壊死レベルを対照と比較する工程を含む、前記[1]に記載の予測方法。
[3]腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法であって、被検者の腎がん転移組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん転移組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程を含む予測方法。
[4]さらに、被検者の腎がん転移組織における壊死を評価する工程と、被検者の腎がん転移組織における壊死レベルを対照と比較する工程を含む、前記[3]に記載の予測方法。
[5]被検者の腎がん組織または腎がん転移組織における受容体相互作用プロテインキナーゼ3の発現により壊死を評価する、前記[2]または[4]に記載の予測方法。
[6]腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法であって、被検者の体液中のLargenを検出する工程と、被検者の体液中のLargen検出量を対照と比較する工程を含む予測方法。
[7]前記体液が尿または血液である、前記[6]に記載の予測方法。
[8]前記被検者が、がん組織の摘出手術を受けた腎がん患者である、前記[1]~[7]のいずれかに記載の予測方法。
[9]抗がん剤が、分子標的薬または免疫療法薬である、前記[1]~[8]のいずれかに記載の予測方法。
[10]腎がん患者の予後が、生存期間、がんの進行、がんの再発および無イベント期間からなる群より選択される1つ以上である、前記[1]~[9]のいずれかに記載の予測方法。
[11]抗腎がん物質のスクリーニング方法であって、
(1)被験物質とLargenを発現する腎がん細胞をインビトロで接触させる工程、
(2)前記腎がん細胞におけるLargenの発現量を測定する工程、および
(3)得られたLargen発現量を、被験物質と接触していない前記腎がん細胞のLargen発現量と比較して、発現量を低下させる被験物質を選択する工程
を含むことを特徴とするスクリーニング方法。
[12]腎がん細胞におけるLargenの発現を阻害する物質を有効成分とする、腎がん治療用医薬組成物。
[13]前記有効成分が、腎がん細胞におけるLargenの発現を阻害する核酸である、前記 [12]に記載の医薬組成物。
[14]抗Largen抗体、または、LargenのmRNAを検出するためのプライマーもしくはプローブを含む、腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後予測用キット。
[15]抗Largen抗体、または、LargenのmRNAを検出するためのプライマーもしくはプローブを含む、抗腎がん物質のスクリーニング用キット。
[1]腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法であって、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程を含む予測方法。
[2]さらに、被検者の腎がん組織における壊死を評価する工程と、被検者の腎がん組織における壊死レベルを対照と比較する工程を含む、前記[1]に記載の予測方法。
[3]腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法であって、被検者の腎がん転移組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん転移組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程を含む予測方法。
[4]さらに、被検者の腎がん転移組織における壊死を評価する工程と、被検者の腎がん転移組織における壊死レベルを対照と比較する工程を含む、前記[3]に記載の予測方法。
[5]被検者の腎がん組織または腎がん転移組織における受容体相互作用プロテインキナーゼ3の発現により壊死を評価する、前記[2]または[4]に記載の予測方法。
[6]腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法であって、被検者の体液中のLargenを検出する工程と、被検者の体液中のLargen検出量を対照と比較する工程を含む予測方法。
[7]前記体液が尿または血液である、前記[6]に記載の予測方法。
[8]前記被検者が、がん組織の摘出手術を受けた腎がん患者である、前記[1]~[7]のいずれかに記載の予測方法。
[9]抗がん剤が、分子標的薬または免疫療法薬である、前記[1]~[8]のいずれかに記載の予測方法。
[10]腎がん患者の予後が、生存期間、がんの進行、がんの再発および無イベント期間からなる群より選択される1つ以上である、前記[1]~[9]のいずれかに記載の予測方法。
[11]抗腎がん物質のスクリーニング方法であって、
(1)被験物質とLargenを発現する腎がん細胞をインビトロで接触させる工程、
(2)前記腎がん細胞におけるLargenの発現量を測定する工程、および
(3)得られたLargen発現量を、被験物質と接触していない前記腎がん細胞のLargen発現量と比較して、発現量を低下させる被験物質を選択する工程
を含むことを特徴とするスクリーニング方法。
[12]腎がん細胞におけるLargenの発現を阻害する物質を有効成分とする、腎がん治療用医薬組成物。
[13]前記有効成分が、腎がん細胞におけるLargenの発現を阻害する核酸である、前記 [12]に記載の医薬組成物。
[14]抗Largen抗体、または、LargenのmRNAを検出するためのプライマーもしくはプローブを含む、腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後予測用キット。
[15]抗Largen抗体、または、LargenのmRNAを検出するためのプライマーもしくはプローブを含む、抗腎がん物質のスクリーニング用キット。
本発明により、腎がん患者の抗がん剤抵抗性を予測することができる。また、本発明により、腎がん患者の予後を予測することができる。また、本発明のスクリーニング方法により、新たな作用機序を持つ腎がん治療用医薬組成物を提供することができる。さらに、本発明により、腎がんの予後予測用キットおよび抗腎がん物質のスクリーニング用キットを提供することができる。
〔腎がん患者の抗がん剤抵抗性予測方法、予後予測方法〕
本発明は、腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法を提供する(以下「本発明の予測方法」と記す)。本発明の予測方法の第一の実施形態は、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程を含むものであればよい。
本発明は、腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法を提供する(以下「本発明の予測方法」と記す)。本発明の予測方法の第一の実施形態は、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程を含むものであればよい。
本発明の予測方法の第二の実施形態は、被検者の腎がん転移組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん転移組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程を含むものであればよい。本発明の予測方法の第三の実施形態は、被検者の体液中のLargenを検出する工程と、被検者の体液中のLargen検出量を対照と比較する工程を含むものであればよい。
本発明の予測方法における被検者は、腎がんが疑われる被検者であればよい。被検者は、腎部分切除術を受けた腎がん患者であってもよく、根治的腎摘除術を受けた腎がん患者であってもよい。本発明の予測方法は、根治的腎摘除術を受けた腎がん患者の予後を予測できる点で有用である。
腎がんが疑われる腎組織サンプルを提供できる被検者は、本発明の予測方法の第一の実施形態を適用することができる。腎がんの転移が疑われる組織サンプルを提供できる被検者は、本発明の予測方法の第二の実施形態を適用することができる。腎がんが疑われる全ての被検者は、本発明の予測方法の第三の実施形態を適用することができる。腎組織サンプルまたは腎がんの転移が疑われる組織サンプルは、生検により得られたものでもよく、手術により得られたものでもよい。
腎がんの転移が疑われる組織は特に限定されないが、卵巣、子宮、乳房、甲状腺、脳、食道、舌、肺、膵臓、胃、小腸、十二指腸、大腸、膀胱、肝臓、前立腺、胆嚢、咽頭、筋肉、骨、皮膚などが挙げられる。腎がんの転移が疑われる組織は肺、脳または骨であってもよい。
体液は特に限定されないが、血液、リンパ液、組織液、体腔液、消化液、鼻水、尿などが挙げられる。好ましくは血液または尿である。血液は、血清、血漿または全血であってもよい。体液は、被検者から採取した体液そのものであってもよく、採取した体液に通常行われる希釈、濃縮等の処理を行ったものであってもよい。
本発明の予測方法において、抵抗性予測の対象となる抗がん剤は特に限定されないが、分子標的薬であってもよく、免疫療法薬であってもよい。分子標的薬としては、例えば、ソラフェニブ、スニチニブ、パゾパニブ、アキシチニブ、カボサンチニブ等のチロシンキナーゼ阻害薬、エベロリムス、テムシロニムス等のmTOR(哺乳類ラパマイシン標的タンパク質)阻害薬などが挙げられる。免疫治療薬としては、免疫チェックポイント阻害薬が挙げられ、例えば、ニボルマブ、ペムブロリズマブ等の抗PD-1抗体、アベルマブ、アテゾリズマブ、デュルバルマブ等の抗PD-L1抗体などが挙げられる。
本発明の予測方法において、予後は特に限定されないが、例えば、生存期間、がんの進行、がんの再発、無イベント期間などが挙げられる。がんの再発には、切除部位におけるがんの再発(無進行生存期間)および一旦根治したがんの再発(無病生存期間)が含まれる。無イベント期間には、既に存在する転移に加えて新たな転移が出現するまでの期間、残存がんが増大するまでの期間、がんに伴う骨折などが起きるまでの期間などが含まれる。本発明の予測方法において、被検者が、がん組織の摘出手術を受けた腎がん患者である場合は、術後生存期間、術後のがんの進行、術後のがんの再発、術後無イベント期間を予想することができる。
被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるLargenの発現の評価は、例えば、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織の組織切片を作製し、抗Largen抗体を用いて免疫染色することにより行うことができる。また、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるLargenの発現の評価は、例えば、腎がん組織中または腎がん転移組織中のLargenタンパク質量またはLargenのmRNA量を測定することにより行うことができる。簡便性および普及度の観点、ならびに、がん細胞以外の細胞におけるLargenの発現を排除できる点で、免疫染色を用いることが好ましい。なお、ヒトLargenのアミノ酸配列およびそれをコードする遺伝子の塩基配列の情報は、NCBI等の公知のデータベースから取得することができる。例えば以下の表1に記載のアミノ酸配列および塩基配列が挙げられるが、これらに限定されない。なお、Largenをコードする遺伝子はPRR16(proline rich 16)遺伝子(以下「PRR16遺伝子」と記す)として知られている。
組織標本の免疫染色方法は特に限定されず、公知の免疫染色方法から適宜選択して用いることができる。抗Largen抗体(抗PRR16抗体)は市販の抗体を用いることができる。タンパク質量を測定する場合は、公知の方法で腎がん組織または腎がん転移組織からタンパク質を抽出し、公知のタンパク質量測定方法を用いて定量することができる。公知のタンパク質量測定方法としては、例えば、ウエスタンブロット法、EIA法、ELISA法、RIA法、タンパク質測定試薬を用いる方法などが挙げられる。mRNA量を測定する場合は、公知の方法で腎がん組織または腎がん転移組織からRNAを抽出し、公知のmRNA量測定方法を用いて定量することができる。公知のmRNA量測定方法としては、ノーザンブロット法、RT-PCR法、定量RT-PCR法、RNaseプロテクションアッセイなどが挙げられる。
被検者の腎がん組織におけるLargenの発現を免疫染色で評価する場合、対照には、正常腎組織を用いることができ、同時に採取した正常腎組織を用いることが好ましいが、これに限定されない。例えば、健常者から採取した腎細胞を対照として用いてもよく、Largenの発現レベルが低いことが知られている腎臓以外の臓器や組織を対照として用いてもよい。被検者の腎がん転移組織におけるLargenの発現を免疫染色で評価する場合、対照には、転移組織に対応する正常組織用いることができ、同時に採取した正常組織を用いることが好ましいが、これに限定されない。例えば、健常者から採取した対応正常組織を対照として用いてもよく、Largenの発現レベルが低いことが知られている対応組織以外の臓器や組織を対照として用いてもよい。
各種臓器、組織におけるLargenの発現情報は、公知のデータベースで調べることができる。Largenの発現レベルは、例えば、Largenの発現強度を4段階(発現なし;0、軽度;1、中等度;2、高度;3)に、発現の割合を4段階(10%未満;0、10%以上25%未満;1、25%以上50%未満;2、50%以上:3)に分類し、両者を加算した数値で表すことができる。対照の発現レベルの数値と被検者の腎がん組織の発現レベルの数値を比較して、被検者の発現レベルが高いか、差がないかを判断する。
被検者の腎がん組織におけるLargenの発現をタンパク質量またはmRNA量で評価する場合、対照には正常腎組織を用いることができ、同時に採取した正常腎組織を用いることが好ましい。被検者の腎がん転移組織におけるLargenの発現をタンパク質量またはmRNA量で評価する場合、対照には、対応する正常組織用いることができ、同時に採取した対応する正常組織を用いることが好ましい。あるいは、対照におけるLargenタンパク質またはmRNAの測定値として、正常組織における蓄積データに基づくカットオフ値を用いてもよい。被検者の腎がん組織または腎がん転移組織のLargenタンパク質またはmRNAの測定値を、対照における測定値と比較して、被検者の発現レベルが高いか、差がないかを判断する。例えば、各サンプルについて複数回の測定を行い、統計的有意差の有無で判断することができる。
本発明の予測方法において、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるLargenの発現レベルが対照と比較して高いと判断された場合、当該被検者は、抗がん剤抵抗性である(抗がん剤が効き難い)と予測することができ、予後不良である(生存期間が短い、がんの進行が速い、再発の可能性が高い、無イベント期間が短い)と予測することができる。一方、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるLargenの発現レベルが対照と差がないと判断された場合、当該被検者は、抗がん剤感受抗性である(抗がん剤が効きやすい)と予測することができ、予後良好である(生存期間が長い、がんの進行が遅い、再発の可能性が低い、無イベント期間が長い)と予測することができる。したがって、本発明の予測方法は、被検者の治療方針の決定や投与する抗がん剤の選択を補助するために用いることができる。
本発明の予測方法は、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるLargenの発現評価と、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織における壊死の評価を組み合わせることが好ましい。すなわち、本発明の予測方法は、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程に加えて、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織における壊死を評価する工程と、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織における壊死レベルを対照と比較する工程を含む方法であってもよい。両者の評価を組み合わせることにより、腎がん患者の抗がん剤抵抗性予測および予後予測の精度を高めることができる。
被検者の腎がん組織または腎がん転移組織における壊死の評価は、例えば、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織の組織切片をヘマトキシリン・エオジン染色(HE染色)し、病理専門医が観察することにより行うことができる。また、被検者の腎がん組織の組織切片を作製し、組織壊死の代表的マーカーである受容体相互作用プロテインキナーゼ3(receptor‐interacting protein kinase 3、以下「RIP3」と記す)の発現により評価することができる。
被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるRIP3の発現の評価は、例えば、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織の組織切片を作製し、抗RIP3抗体を用いて免疫染色することにより行うことができる。抗RIP3抗体は、市販の抗体を用いることができる。また、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるRIP3の発現の評価は、例えば、腎がん組織中または腎がん転移組織中のRIP3タンパク質量またはRIP3のmRNA量を測定することにより行うことができる。なお、ヒトRIP3タンパク質のアミノ酸配列およびそれをコードする遺伝子の塩基配列の情報は、NCBI等の公知のデータベースから取得することができる。ヒトRIP3タンパク質のアミノ酸配列のRefSeq IDはNP_006862.2であり、これをコードする遺伝子の塩基配列のRefSeq IDはNM_006871.4である。免疫染色方法、タンパク質量測定方法、mRNA量測定方法は、上記のLargenの発現を評価する場合と同じ方法を用いて行うことができる。
被検者の腎がん組織または腎がん転移組織における壊死をHE染色標本で評価する場合、対照にはLargenの発現を免疫染色で評価する場合と同じ対照を用いることができる。HE染色標本における壊死レベルは、病理専門医が顕微鏡観察を行い、細胞形態の崩壊、細胞質の好酸化、核の濃縮や消失の有無により判定することができる。対照の壊死レベルと被検者の腎がん組織または腎がん転移組織の壊死レベルを、病理専門医による標準的な基準に基づいて比較して、被検者の発現レベルが高いか、差がないかを判断する。
被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるRIP3の発現を免疫染色で評価する場合、対照にはLargenの発現を免疫染色で評価する場合と同じ対照を用いることができる。RIP3の発現レベルは、例えば、RIP3の発現強度を4段階(発現なし;0、軽度;1、中等度;2、高度;3)に、発現の割合を4段階(10%未満;0、10%以上25%未満;1、25%以上50%未満;2、50%以上:3)に分類し、両者を加算した数値で表すことができる。対照の発現レベルの数値と被検者の腎がん組織または腎がん転移組織の発現レベルの数値を比較して、被検者の発現レベルが高いか、差がないかを判断する。
本発明の予測方法において、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるLargenの発現レベルが対照と比較して高く、壊死のレベルが対照と差がないと判断された場合、当該被検者は、抗がん剤抵抗性である(抗がん剤が効き難い)と高精度に予測することができ、予後不良である(生存期間が短い、がんの進行が速い、再発の可能性が高い、無イベント期間が短い)と高精度に予測することができる。一方、被検者の腎がん組織または腎がん転移組織におけるLargenの発現レベルが対照と差がなく、壊死のレベルが対照と比較して高いと判断された場合、当該被検者は、抗がん剤感受性である(抗がん剤が効きやすい)と高精度に予測することができ、予後良好である(生存期間が長い、がんの進行が遅い、再発の可能性が低い、無イベント期間が長い)と高精度に予測することができる。
体液中のLargenを検出する方法は特に限定されず、免疫反応法であってもよく、非免疫反応法であってもよい。例えば、EIA法、ELISA法、RIA法、ウエスタンブロット法、免疫沈降法、ラテックス凝集法、タンパク質測定試薬を用いる方法、高速液体クロマトグラフィー、ガスクロマトグラフィー、質量分析法などが挙げられる。好ましくは検出と定量を同時に行うことができる方法である。例えば、ELISA法ではサンドイッチ法を用いて検出と定量を同時に行うことができる。具体的には、固相担体に抗Largen抗体を固定化し、適宜前処理した体液を添加して反応させた後、さらに酵素で標識した別のエピトープを認識する抗Largen抗体を添加して反応させ、洗浄後酵素基質と反応、発色させ、吸光度を測定することにより、Largenを検出でき、同時に定量することができる。また、固相担体に固定した抗Largen抗体と生体試料中のLargenを反応させた後、非標識Largen抗体(一次抗体)を添加し、この非標識抗体に対する抗体(二次抗体)を酵素標識してさらに添加する方法であってもよい。ELISA法はサンドイッチ法に限定されず、直接法、競合法等であってもよい。これらは市販のELISA作製キット(MyBioSource社製等)を用いて検出系を作製してもよい。
体液中のLargenを検出、定量する方法として、体液中のmRNA量を検出し定量してもよい。mRNAはノーザンプロット法、マイクロアレイ法、定量PCR法、Real-Time PCR法、デジタルPCR、次世代シーケンシングなどで検出および定量が同時に可能である。体液中のmRNAはエクソソームに含まれることがあり、その場合は超遠心法、市販のキット(日立ケミカル社製等)フィルターあるいはカラム等を使用して体液からエクソソームを分離した後、mRNAを抽出してから定量してもよい。
本発明の予測方法を、被検者の体液におけるLargen検出量の評価で実施する場合(第三の実施形態)、対照には健常者の対応する体液を用いることができる。健常者の対応する体液を用いて、被検者の体液と同じ方法を用いてLargenを検出することが好ましい。あるいは、対照の体液におけるLargen検出量として、健常者の体液におけるLargen検出量蓄積データに基づくカットオフ値を用いてもよい。
本発明の予測方法において、被検者の体液におけるLargen検出量が対照と比較して多いと判断された場合、当該被検者は、抗がん剤抵抗性である(抗がん剤が効き難い)と予測することができ、予後不良である(生存期間が短い、がんの進行が速い、再発の可能性が高い、無イベント期間が短い)と予測することができる。一方、被検者の体液におけるLargen検出量が対照と差がないと判断された場合、当該被検者は、抗がん剤感受抗性である(抗がん剤が効きやすい)と予測することができ、予後良好である(生存期間が長い、がんの進行が遅い、再発の可能性が低い、無イベント期間が長い)と予測することができる。
〔スクリーニング方法〕
本発明は、抗腎がん物質のスクリーニング方法を提供する。本発明のスクリーニング方法は、以下の工程(1)~(3)を含むものであればよい。
(1)被験物質とLargenを発現する腎がん細胞をインビトロで接触させる工程、
(2)前記腎がん細胞におけるLargenの発現量を測定する工程、および
(3)得られたLargen発現量を、被験物質と接触していない前記腎がん細胞のLargen発現量と比較して、発現量を低下させる被験物質を選択する工程。
本発明は、抗腎がん物質のスクリーニング方法を提供する。本発明のスクリーニング方法は、以下の工程(1)~(3)を含むものであればよい。
(1)被験物質とLargenを発現する腎がん細胞をインビトロで接触させる工程、
(2)前記腎がん細胞におけるLargenの発現量を測定する工程、および
(3)得られたLargen発現量を、被験物質と接触していない前記腎がん細胞のLargen発現量と比較して、発現量を低下させる被験物質を選択する工程。
被験物質としては、例えば、核酸、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、細胞培養上清、植物抽出液、哺乳動物の組織抽出液、血漿等を好ましく用いることができる。ただし、これらに限定されない。被験物質は、新規な物質であってもよいし、公知の物質であってもよい。これら被験物質は塩を形成していてもよい。被験物質の塩としては、生理学的に許容される酸や塩基との塩が用いられる。
Largenを発現する腎がん細胞は、腎がん患者のがん組織から取得した初代培養細胞、Largenを発現する腎がん細胞株、Largen発現ベクターを導入した腎がん細胞株などを用いることができる。腎がん細胞株はヒト腎がん細胞株であることが好ましい。
工程(1)において、被験物質とLargenを発現する腎がん細胞をインビトロで接触させる方法は特に限定されず、例えば、腎がん細胞を培養している培地に被験物質を添加する方法などが挙げられる。なお、被験物質を接触させない対照群を設けることが好ましい。
工程(2)では被験物質を接触させた腎がん細胞におけるLargen発現量を測定する。Largen発現量の測定は、Largenのタンパク質量を測定してもよく、LargenのmRNA量を測定してもよい。タンパク質量を測定する場合は、公知の方法で腎がん細胞からタンパク質を抽出し、公知のタンパク質量測定方法を用いて定量することができる。公知のタンパク質量測定方法としては、例えば、ウエスタンブロット法、EIA法、ELISA法、RIA法、タンパク質測定試薬を用いる方法などが挙げられる。mRNA量を測定する場合は、公知の方法で腎がん細胞からRNAを抽出し、公知のmRNA量測定方法を用いて定量することができる。公知のmRNA量測定方法としては、ノーザンブロット法、RT-PCR法、定量RT-PCR法、RNaseプロテクションアッセイなどが挙げられる。
工程(3)では、工程(2)で測定したLargen発現量と、被験物質と接触していない前記腎がん細胞のLargen発現量を比較して、発現量を低下させる被験物質を選択する。発現低下の基準は特に限定されないが、統計解析で有意差が認められる程度に発現量を低下させる被験物質を選択することが好ましい。選択した被験物質は、腎がん細胞のLargen発現量を低下させるので、これを投与された腎がん患者は予後が良好になると考えられる。また、これを投与された腎がん患者は抗がん剤に対する感受性が高くなると考えられる。したがって、本発明のスクリーニング方法で選択された被験物質は、他の抗がん剤と併用することにより、併用する抗がん剤の抗がん効果を高めることができる腎がん治療薬の有効成分になり得ると考えられる。
〔腎がん治療用医薬組成物〕
本発明は、腎がん治療用医薬組成物を提供する。本発明の医薬組成物は、腎がん細胞におけるLargenの発現を阻害する物質を有効成分とするものであればよい。本発明の医薬組成物の有効成分として、上記本発明のスクリーニング方法で選択された被験物質を好適に用いることができる。
本発明は、腎がん治療用医薬組成物を提供する。本発明の医薬組成物は、腎がん細胞におけるLargenの発現を阻害する物質を有効成分とするものであればよい。本発明の医薬組成物の有効成分として、上記本発明のスクリーニング方法で選択された被験物質を好適に用いることができる。
本発明の医薬組成物は、腎がん細胞におけるLargenの発現を阻害する物質を有効成分とし、常套手段に従って製剤化することができる。例えば、経口投与のための製剤としては、固体または液体の剤形、具体的には錠剤(糖衣錠、フィルムコーティング錠を含む)、丸剤、顆粒剤、散剤、カプセル剤(ソフトカプセル剤を含む)、シロップ剤、乳剤、懸濁剤などが挙げられる。これらの製剤は公知の方法によって製造され、製剤分野において通常用いられる担体、希釈剤もしくは賦形剤を含有するものである。例えば、錠剤用の担体、賦形剤としては、乳糖、でんぷん、蔗糖、ステアリン酸マグネシウムなどが用いられる。非経口投与のための製剤としては、例えば、注射剤、坐剤などが用いられ、注射剤は静脈注射剤、皮下注射剤、皮内注射剤、筋肉注射剤、点滴注射剤、関節内注射剤などの剤形を包含する。このような注射剤は、公知の方法に従って、例えば、上記有効成分を通常注射剤に用いられる無菌の水性もしくは油性液に溶解、懸濁または乳化することによって調製される。注射用の水性液としては、例えば、生理食塩水、ブドウ糖やその他の補助薬を含む等張液などが用いられ、適当な溶解補助剤、例えば、アルコール(例えば、エタノール等)、ポリアルコール(例えば、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール等)、非イオン界面活性剤(例えば、ポリソルベート80、HCO-50等)などと併用してもよい。油性液としては、例えば、ゴマ油、大豆油などが用いられ、溶解補助剤として安息香酸ベンジル、ベンジルアルコールなどを併用してもよい。直腸投与に用いられる坐剤は、上記有効成分を通常の坐薬用基剤に混合することによって調製される。このようにして得られる製剤は安全で低毒性であるので、例えば、ヒトや哺乳動物(例えば、ラット、マウス、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して経口的にまたは非経口的に投与することができる。
本発明の医薬組成物の有効成分は、腎がん細胞におけるLargenの発現を阻害する核酸であってもよい。Largenの発現を阻害する核酸としては、PRR16遺伝子のsiRNA(short interfering RNA)、shRNA(short hairpin RNA)、アンチセンスオリゴヌクレオチドなどが挙げられる。Largenの発現を阻害する核酸は、PRR16遺伝子の塩基配列(表1に記載のRefSeq ID参照)に基づいて、公知の方法で設計することができる。
siRNAは、約20塩基(例えば、約21~23塩基)またはそれ未満の長さの二本鎖RNAであり、このようなsiRNAを細胞に発現させることにより、そのsiRNAの標的となる遺伝子(本発明においてはPRR16遺伝子)の発現を抑制することができる。shRNAは、一本鎖RNAで部分的に回文状の塩基配列を含むことにより、分子内で二本鎖構造をとり、3'末端に突出部を有する短いヘアピン構造からからなる約20塩基対以上の分子のことをいう。そのようなshRNAは、細胞内に導入された後、細胞内で約20塩基(代表的には例えば、21塩基、22塩基、23塩基)の長さに分解され、siRNAと同様に標的となる遺伝子(本発明においてはPRR16遺伝子)の発現を抑制することができる。siRNAおよびshRNAは、Largenの発現を抑制できるものであればどのような形態であってもよい。siRNAまたはshRNAは、標的遺伝子の塩基配列に基づいて、公知の方法により設計することができる。siRNAまたはshRNAは、人工的に化学合成することができる。また、例えばT7RNAポリメラーゼおよびT7プロモーターを用いて、鋳型DNAからアンチセンスおよびセンスのRNAをインビトロで合成することができる。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、PRR16遺伝子のDNA配列中の連続する5から100の塩基配列に対して相補的な、またはハイブリダイズするヌクレオチドであればよく、DNAまたはRNAのいずれであってもよい。また、機能に支障がない限り修飾されたものであってもよい。アンチセンスオリゴヌクレオチドは常法によって合成することができ、例えば、市販のDNA合成装置によって容易に合成することができる。
本発明の医薬組成物の有効成分が、Largenの発現を阻害する核酸である場合、非ウイルスベクターまたはウイルスベクターの形態で投与することができる。非ウイルスベクターの形態で投与する場合、リポソームを用いて核酸分子を導入する方法(リポソーム法、HVJ-リポソーム法、カチオニックリポソーム法、リポフェクション法、リポフェクトアミン法など)、マイクロインジェクション法、遺伝子銃(Gene Gun)でキャリア(金属粒子)とともに核酸分子を細胞に移入する方法などを利用することができる。siRNAまたはshRNAをウイルスベクターを用いて生体に投与する場合は、無毒化したレトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス、ワクシニアウイルス、ポックスウイルス、ポリオウイルス、シンドビスウイルス、センダイウイルス、SV40などのDNAウイルスまたはRNAウイルスに、siRNAまたはshRNAを発現するDNAを導入し、細胞または組織にこの組換えウイルスを感染させることにより、細胞または組織内に遺伝子を導入することができる。siRNAまたはshRNAを発現するDNAは、腎細胞特異的なプロモーター配列を有することが好ましい。
siRNAと標的配列は同一であることが望ましいが、RNA干渉を誘導できる限り、完全に同一な配列でなくてもよい。具体的には、siRNAのアンチセンス鎖配列と標的配列がハイブリダイズする限り、1~数個(例えば2、3、4個)のミスマッチがあってもよい。すなわち、siRNAは、標的配列に対して1~数個の塩基が置換、付加もしくは欠失したものであってRNA干渉を誘導できるものであってもよい。また、siRNAは、標的配列と85%以上、90%以上、95%以上、98%以上の配列同一性を有し、かつRNA干渉を誘導できるものであってもよい。
siRNAは、RNA干渉を誘導できる限り、センス鎖またはアンチセンス鎖のいずれか一方のヌクレオチドを全てDNAに変換したもの(ハイブリッド型)や、センス鎖および/またはアンチセンス鎖の一部のヌクレオチドをDNAに変換したもの(キメラ型)であってもよい。ハイブリッド型としては、センス鎖のヌクレオチドをDNAに変換したものが挙げられる。キメラ型としては、下流側(センス鎖の3'末端側、アンチセンス鎖の5'末端側)の一部のヌクレオチドをDNAに変換したものが挙げられる。具体的には、センス鎖の3'末端側およびアンチセンス鎖の5'末端側のヌクレオチドを共にDNAに変換したもの、センス鎖の3'末端側またはアンチセンス鎖の5'末端側の何れかのヌクレオチドをDNAに変換したものが挙げられる。また、変換するヌクレオチド長は、RNA分子の1/2に相当するヌクレオチドまでの任意長であってもよい。
siRNAは、RNA干渉を誘導できる限り、そのヌクレオチド(リボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド)が、糖、塩基および/またはリン酸塩が化学修飾されたヌクレオチド類似体であってもよい。塩基が修飾されたヌクレオチド類似体としては、例えば、5位修飾ウリジンまたはシチジン(例えば、5-プロピニルウリジン、5-プロピニルシチジン、5-メチルシチジン、5-メチルウリジン、5-(2-アミノ)プロピルウリジン、5-ハロシチジン、5-ハロウリジン、5-メチルオキシウリジン等);8位修飾アデノシンまたはグアノシン(例えば、8-ブロモグノシン等);デアザヌクレオチド(例えば7-デアザ-アデノシン等);O-およびN-アルキル化ヌクレオチド(例えば、N6-メチルアデノシン等)等が挙げられる。また、糖が修飾されたヌクレオチド類似体としては、例えば、リボヌクレオチドの2'-OHが、H、OR、R、ハロゲン原子、SH、SR、NH2、NHR、NR2、もしくはCN(ここで、Rは炭素数1-6のアルキル基、アルケニル基またはアルキニル基を示す)等によって置換された2'位糖修飾、5'末端がモノリン酸化された5'末端リン酸化修飾が挙げられる。リン酸塩が修飾されたヌクレオチド類似体としては、隣接するリボヌクレオチドを結合するホスホエステル基を、ホスホチオエート基で置換したものが挙げられる。
本発明の医薬組成物は、投与された腎がん患者の予後を改善するこができる。また、本発明の医薬組成物は、投与された腎がん患者の抗がん剤に対する感受性を高めることができる。したがって、本発明の医薬組成物は、他の抗がん剤と併用することが好ましい。
〔キット〕
本発明は、腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後予測用キットを提供する。また、本発明は、抗腎がん物質のスクリーニング用キットを提供する。本発明のキットは、抗Largen抗体またはLargenのmRNAを検出するためのプライマーもしくはプローブを含むものであればよい。抗Largen抗体は免疫染色、ウエスタンブロット、ELISA等に用いることができる。LargenのmRNAを検出するためのプライマーは、RT-PCR法、定量RT-PCRに用いることができる。プライマーは、RT-PCR法または定量RT-PCR用のプライマーセットであってもよい。LargenのmRNAを検出するためのプローブは、ノーザンブロットに用いることができる。
本発明は、腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後予測用キットを提供する。また、本発明は、抗腎がん物質のスクリーニング用キットを提供する。本発明のキットは、抗Largen抗体またはLargenのmRNAを検出するためのプライマーもしくはプローブを含むものであればよい。抗Largen抗体は免疫染色、ウエスタンブロット、ELISA等に用いることができる。LargenのmRNAを検出するためのプライマーは、RT-PCR法、定量RT-PCRに用いることができる。プライマーは、RT-PCR法または定量RT-PCR用のプライマーセットであってもよい。LargenのmRNAを検出するためのプローブは、ノーザンブロットに用いることができる。
本発明のキットにおいて、抗Largen抗体またはLargenのmRNAを検出するためのプライマーもしくはプローブ以外の構成は特に限定されず、使用目的に応じて、反応用のチューブやプレート等の器具、必要な試薬、取扱説明書等が含まれていてもよい。本発明のキットを用いることにより、上記本発明の予測方法および上記本発明のスクリーニング方法を簡便かつ迅速に実施することができる。
以下、実施例により本発明を詳細に説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
〔実験材料〕
以下の実施例に用いた全ての臨床検体、臨床情報は長崎大学病院臨床研究倫理委員会(12052899号および19081920号)の許可の下、収集され使用された。すなわち、腎がん組織におけるLargenの発現(実施例1)、ならびに、その発現と切断型カスパーゼ3(cleaved-Cas3)の発現との関連(実施例2)、組織学的壊死の発生またはRIP3(receptor‐interacting protein kinase 3)の発現との関連(実施例3)、術後全生存期間との関連(実施例4-1)、無進行生存期間との関連(実施例4-2)については、1993年~2008年の間に長崎大学病院にて外科的に腎がん組織を切除された患者のうち、手術前治療が行われていなかった腎がん患者208名を対象とした。一方、Largenの発現と無病生存期間との関連(実施例4-3)については、上記208名の腎がん患者のうち、術前の画像検査で転移を疑う所見のなかった174名を対象とした。また、Largenと抗がん剤の治療効果との関連(実施例5)については、2017年~2020年の間に長崎大学病院において、外科的に腎がん組織を切除された患者のうち、術後に分子標的薬および免疫療法を行った腎がん患者41名を対象とした。
以下の実施例に用いた全ての臨床検体、臨床情報は長崎大学病院臨床研究倫理委員会(12052899号および19081920号)の許可の下、収集され使用された。すなわち、腎がん組織におけるLargenの発現(実施例1)、ならびに、その発現と切断型カスパーゼ3(cleaved-Cas3)の発現との関連(実施例2)、組織学的壊死の発生またはRIP3(receptor‐interacting protein kinase 3)の発現との関連(実施例3)、術後全生存期間との関連(実施例4-1)、無進行生存期間との関連(実施例4-2)については、1993年~2008年の間に長崎大学病院にて外科的に腎がん組織を切除された患者のうち、手術前治療が行われていなかった腎がん患者208名を対象とした。一方、Largenの発現と無病生存期間との関連(実施例4-3)については、上記208名の腎がん患者のうち、術前の画像検査で転移を疑う所見のなかった174名を対象とした。また、Largenと抗がん剤の治療効果との関連(実施例5)については、2017年~2020年の間に長崎大学病院において、外科的に腎がん組織を切除された患者のうち、術後に分子標的薬および免疫療法を行った腎がん患者41名を対象とした。
〔統計解析〕
統計解析には、SAS社製ソフトウエアJMPを使用した。
統計解析には、SAS社製ソフトウエアJMPを使用した。
〔実施例1:腎がん患者のがん組織におけるLargen発現の評価〕
上記208名の腎がん患者の組織検体を用いて、腎がん組織標本におけるLargenの発現を免疫染色により評価した。
上記208名の腎がん患者の組織検体を用いて、腎がん組織標本におけるLargenの発現を免疫染色により評価した。
(1)免疫染色方法
腎がん組織を10%ホルマリンで固定し、パラフィン包埋した後、厚さ5μmの切片を作製した。Target Retrieval Solution(DAKO社製)を用いて切片の抗原を賦活化した後、一次抗体としてヒトLargenに対するマウスポリクローナル抗体(Abnova社製)を60倍希釈したもので4℃、12時間インキュベーションした。次に、デキストランポリマーに2次抗体とパーオキシダーゼを結合させたEnVision検出システム(DAKO社製)を使用して染色した。
腎がん組織を10%ホルマリンで固定し、パラフィン包埋した後、厚さ5μmの切片を作製した。Target Retrieval Solution(DAKO社製)を用いて切片の抗原を賦活化した後、一次抗体としてヒトLargenに対するマウスポリクローナル抗体(Abnova社製)を60倍希釈したもので4℃、12時間インキュベーションした。次に、デキストランポリマーに2次抗体とパーオキシダーゼを結合させたEnVision検出システム(DAKO社製)を使用して染色した。
(2)発現判定方法
免疫染色した標本を、発現強度と発現の割合をスコアリングして評価した。具体的には、発現強度を4段階(発現なし;0、軽度;1、中等度;2、高度;3)に、発現の割合を4段階(10%未満;0、10%以上25%未満;1、25%以上50%未満;2、50%以上:3)に分類し、それぞれを加算した。倍率200倍で10視野以上を観察して最も高発現している視野で評価した。正常腎組織におけるスコアの最高値が3であったため、腎がん組織においてスコア4以上のものをLargen高発現患者と判定し、スコア3以下のものをLargen低発現患者と判定した。
免疫染色した標本を、発現強度と発現の割合をスコアリングして評価した。具体的には、発現強度を4段階(発現なし;0、軽度;1、中等度;2、高度;3)に、発現の割合を4段階(10%未満;0、10%以上25%未満;1、25%以上50%未満;2、50%以上:3)に分類し、それぞれを加算した。倍率200倍で10視野以上を観察して最も高発現している視野で評価した。正常腎組織におけるスコアの最高値が3であったため、腎がん組織においてスコア4以上のものをLargen高発現患者と判定し、スコア3以下のものをLargen低発現患者と判定した。
(3)結果
図1に、腎がん患者から摘出した腎がん組織における代表的な免疫染色画像を示した。(A)が正常腎部分の観察画像(倍率200倍)、(B)が腎がん部分の観察画像(上段は倍率400倍、下段は倍率200倍)である。(A)の正常腎部分ではLargenはほとんど染色されなかったが、(B)上段の腎がん部分ではLargenが濃く染色されているのがわかる。(B)下段は、右上の腎がん細胞は濃く染色されており、左下の腎がん細胞は染色が薄く、Largenの発現が低いことを示している。すなわち、同一視野の腎がん細胞において、Largenの発現が高い部分とLargenの発現が低い部分が存在することを示している。
対象の208名の腎がん患者のうち、88名がLargen高発現患者と判定され、120名がLargen低発現患者と判定された。
図1に、腎がん患者から摘出した腎がん組織における代表的な免疫染色画像を示した。(A)が正常腎部分の観察画像(倍率200倍)、(B)が腎がん部分の観察画像(上段は倍率400倍、下段は倍率200倍)である。(A)の正常腎部分ではLargenはほとんど染色されなかったが、(B)上段の腎がん部分ではLargenが濃く染色されているのがわかる。(B)下段は、右上の腎がん細胞は濃く染色されており、左下の腎がん細胞は染色が薄く、Largenの発現が低いことを示している。すなわち、同一視野の腎がん細胞において、Largenの発現が高い部分とLargenの発現が低い部分が存在することを示している。
対象の208名の腎がん患者のうち、88名がLargen高発現患者と判定され、120名がLargen低発現患者と判定された。
〔実施例2:腎がん患者のがん組織におけるcleaved-Cas3発現の評価〕
実施例1の208名の腎がん患者の腎がん組織標本におけるcleaved-Cas3の発現を免疫染色により評価し、Largen高発現患者群(88名)とLargen低発現患者群(120名)におけるcleaved-Cas3の発現を比較した。
実施例1の208名の腎がん患者の腎がん組織標本におけるcleaved-Cas3の発現を免疫染色により評価し、Largen高発現患者群(88名)とLargen低発現患者群(120名)におけるcleaved-Cas3の発現を比較した。
(1)免疫染色および陽性率算出方法
実施例1と同様に、厚さ5μmのパラフィン包埋切片を作製した。0.01M(pH6.0)のクエン酸バッファーで抗原賦活化し、cleaved-Cas3(Asp175)の発現を評価した。一次抗体には、ヒトcleaved-Cas3に対するマウスモノクローナル抗体(R&D systems社製)を用い、実施例1と同様の方法で免疫染色を行った。cleaved-Cas3陽性細胞率は、以下の式で算出した。
cleaved-Cas3陽性細胞率(%)=[cleaved-Cas3発現細胞数/全細胞数]×100
実施例1と同様に、厚さ5μmのパラフィン包埋切片を作製した。0.01M(pH6.0)のクエン酸バッファーで抗原賦活化し、cleaved-Cas3(Asp175)の発現を評価した。一次抗体には、ヒトcleaved-Cas3に対するマウスモノクローナル抗体(R&D systems社製)を用い、実施例1と同様の方法で免疫染色を行った。cleaved-Cas3陽性細胞率は、以下の式で算出した。
cleaved-Cas3陽性細胞率(%)=[cleaved-Cas3発現細胞数/全細胞数]×100
(2)結果
結果を図2に示した。Largen高発現患者群で有意にcleaved-Cas3の発現が低いことが示された。この結果から、Largenがアポトーシスの誘導を抑制している可能性が示唆された。
結果を図2に示した。Largen高発現患者群で有意にcleaved-Cas3の発現が低いことが示された。この結果から、Largenがアポトーシスの誘導を抑制している可能性が示唆された。
〔実施例3:腎がん患者のがん組織における組織学的壊死の評価〕
実施例1の208名の腎がん患者の腎がん組織標本における組織学的壊死を、ヘマトキシリン・エオジン(HE)染色および組織壊死マーカーRIP3の免疫染色で判定し、Largen高発現患者群(88名)とLargen低発現患者群(120名)における組織学的壊死の発生を比較した。
実施例1の208名の腎がん患者の腎がん組織標本における組織学的壊死を、ヘマトキシリン・エオジン(HE)染色および組織壊死マーカーRIP3の免疫染色で判定し、Largen高発現患者群(88名)とLargen低発現患者群(120名)における組織学的壊死の発生を比較した。
(1)HE染色による判定
各患者のがん組織のパラフィン包埋切片を作製し、定法に従いHE染色を行った。観察はすべて病理専門医が行い、倍率200倍で10視野以上を観察して、細胞形態の崩壊、細胞質の好酸化、核の濃縮や消失が観察されたものを壊死と判定した。
結果はロジスティック回帰分析により、評価した。
各患者のがん組織のパラフィン包埋切片を作製し、定法に従いHE染色を行った。観察はすべて病理専門医が行い、倍率200倍で10視野以上を観察して、細胞形態の崩壊、細胞質の好酸化、核の濃縮や消失が観察されたものを壊死と判定した。
結果はロジスティック回帰分析により、評価した。
(2)RIP3免疫染色による判定
RIP3は組織壊死の代表的なマーカーの1つである。一次抗体にヒトRIP3に対するウサギポリクローナル抗体(Abcam社製)を用い、実施例1と同様の方法で免疫染色を行った。RIP3の発現強度を4段階(発現なし;0、軽度;1、中等度;2、高度;3)に、発現の割合を4段階(10%未満;0、10%以上25%未満;1、25%以上50%未満;2、50%以上:3)に分類し、それぞれを加算した。倍率200倍で10視野以上を観察して最も高発現している視野で評価し、加算したスコアが4以上の場合に壊死と判定した。
RIP3は組織壊死の代表的なマーカーの1つである。一次抗体にヒトRIP3に対するウサギポリクローナル抗体(Abcam社製)を用い、実施例1と同様の方法で免疫染色を行った。RIP3の発現強度を4段階(発現なし;0、軽度;1、中等度;2、高度;3)に、発現の割合を4段階(10%未満;0、10%以上25%未満;1、25%以上50%未満;2、50%以上:3)に分類し、それぞれを加算した。倍率200倍で10視野以上を観察して最も高発現している視野で評価し、加算したスコアが4以上の場合に壊死と判定した。
(3)結果
ロジスティック回帰分析により評価した。結果を表2に示した。HE染色による判定およびRIP3免疫染色による判定共に、Largen高発現患者群のがん組織において免疫組織学的に壊死を生じていると判定される割合は、Largen低発現患者群のがん組織の半数以下(0.492倍)であり、有意に低値であった。また、病理学的特徴を含む多変量解析においても、同じ結果が確認された。この結果から、Largenが高発現しているがん細胞は、壊死に対して抵抗性を獲得していることが推察された。
ロジスティック回帰分析により評価した。結果を表2に示した。HE染色による判定およびRIP3免疫染色による判定共に、Largen高発現患者群のがん組織において免疫組織学的に壊死を生じていると判定される割合は、Largen低発現患者群のがん組織の半数以下(0.492倍)であり、有意に低値であった。また、病理学的特徴を含む多変量解析においても、同じ結果が確認された。この結果から、Largenが高発現しているがん細胞は、壊死に対して抵抗性を獲得していることが推察された。
〔実施例4:腎がん患者の術後生存期間の評価〕
4-1 術後全生存期間
Largen高発現患者群(88名)とLargen低発現患者群(120名)において、術後全生存期間の比較を行った。カプランマイヤー法により累積生存率を算出し、P値はlog-rank testで算出した。
4-1 術後全生存期間
Largen高発現患者群(88名)とLargen低発現患者群(120名)において、術後全生存期間の比較を行った。カプランマイヤー法により累積生存率を算出し、P値はlog-rank testで算出した。
結果を図3に示した。Largen高発現患者群はLargen低発現患者群と比較して、生存期間が有意に短かった(5年生存期間で91.1% 対 54.5%;P < 0.001)。
4-2 無進行生存期間
無進行生存期間(progression-free survival)は、手術後に、がんが再発または進行せず安定した状態である期間をいう。Largen高発現患者群(88名)とLargen低発現患者群(120名)を対象とし、Largen発現量とは無関係に、すべての患者に対して必要な画像検査および治療を行いながら経過観察した。カプランマイヤー法により累積生存率を算出し、P値はlog-rank testで算出した。
無進行生存期間(progression-free survival)は、手術後に、がんが再発または進行せず安定した状態である期間をいう。Largen高発現患者群(88名)とLargen低発現患者群(120名)を対象とし、Largen発現量とは無関係に、すべての患者に対して必要な画像検査および治療を行いながら経過観察した。カプランマイヤー法により累積生存率を算出し、P値はlog-rank testで算出した。
結果を図4に示した。Largen高発現患者群はLargen低発現患者群と比較して、無進行生存期間が有意に短かった(5年無進行生存期間で、93.4% 対 55.4%;P <0.001)。
4-3 無病生存期間
無病生存期間(DFS: disease-free survival)は、術前に転移を疑う所見がなく、根治的手術を受けた患者において、がんが再発せず生存した状態である期間をいう。対象腎がん患者174名のうち、Largen高発現患者は61名、Largen低発現患者は113名であった。対象患者については、Largen発現量とは無関係に、すべての患者に対して必要な画像検査および治療を行いながら経過観察した。カプランマイヤー法により累積生存率を算出し、P値はlog-rank testで算出した。
無病生存期間(DFS: disease-free survival)は、術前に転移を疑う所見がなく、根治的手術を受けた患者において、がんが再発せず生存した状態である期間をいう。対象腎がん患者174名のうち、Largen高発現患者は61名、Largen低発現患者は113名であった。対象患者については、Largen発現量とは無関係に、すべての患者に対して必要な画像検査および治療を行いながら経過観察した。カプランマイヤー法により累積生存率を算出し、P値はlog-rank testで算出した。
結果を図5に示した。Largen高発現患者群はLargen低発現患者群と比較して、無病生存期間が有意に短かった(5年無病期間で97.6% 対 76.2%;P < 0.001)。この結果から、Largen高発現患者は、根治的術後の無病期間が短い、すなわち再発率が高いことが推察された。
〔実施例5:腎がん患者の抗がん剤に対する治療効果〕
対象腎がん患者41名のうち、Largen高発現患者は17名、Largen低発現患者は24名であった。抗がん剤には、分子標的薬としてチロシンキナーゼ阻害薬であるソラフェニブおよびパゾパニブ、免疫治療薬として免疫チェックポイント阻害剤であるニボルマブが用いられた。抗腫瘍効果については、Response Evaluation Criteria in Solid Tumors(RECIST)に則り、complete response(CR)、partial response(PR)、および、stable disease(SD)が得られた患者を、「抗腫瘍効果あり」と判定した。
対象腎がん患者41名のうち、Largen高発現患者は17名、Largen低発現患者は24名であった。抗がん剤には、分子標的薬としてチロシンキナーゼ阻害薬であるソラフェニブおよびパゾパニブ、免疫治療薬として免疫チェックポイント阻害剤であるニボルマブが用いられた。抗腫瘍効果については、Response Evaluation Criteria in Solid Tumors(RECIST)に則り、complete response(CR)、partial response(PR)、および、stable disease(SD)が得られた患者を、「抗腫瘍効果あり」と判定した。
結果を表3に示した。Largen高発現患者群はLargen低発現患者群と比較して、抗がん剤に対する効果が低かった。この結果から、Largenが高発現しているがん細胞は、抗がん剤に対して抵抗性を獲得していることが推察された。また、RIP3の発現を組み合わせた結果を見ると、腎がん組織においてLargenが高発現しており、かつ、RIP3の発現が低い(壊死率が低い)腎がん患者は、特に抗がん剤に対する感受性が低かった。したがって、Largen高発現/RIP3低発現の腎がん患者は予後が悪いことが推察される。
〔実施例6:腎がん患者の血液および尿中Largenの検出および定量〕
健常者、腎がん患者からそれぞれ血液と尿を採取し、Largenのタンパク質の量およびmRNAの量を定量し、比較した。長崎大学病院において、外科的に腎がん組織を切除された患者のうち、術前に血液および尿の採取を行った腎がん患者11名を対象とした。なお、健常者として、悪性腫瘍や腎機能障害を含め病的状態が認められない3名から、同様に血液と尿を採取した。Largenのタンパク質の定量にはサンドイッチELISA法を用いた。ELISAには、MyBioSource社製のQuantitative Sandwich ELISA法のキットを使用した。LargenのmRNAはRT-PCRで定量した。
健常者、腎がん患者からそれぞれ血液と尿を採取し、Largenのタンパク質の量およびmRNAの量を定量し、比較した。長崎大学病院において、外科的に腎がん組織を切除された患者のうち、術前に血液および尿の採取を行った腎がん患者11名を対象とした。なお、健常者として、悪性腫瘍や腎機能障害を含め病的状態が認められない3名から、同様に血液と尿を採取した。Largenのタンパク質の定量にはサンドイッチELISA法を用いた。ELISAには、MyBioSource社製のQuantitative Sandwich ELISA法のキットを使用した。LargenのmRNAはRT-PCRで定量した。
Largenのタンパク質を測定した結果を図6に示した。(A)が血清Largen濃度、(B)が尿中Largen濃度の結果である。血清および尿のどちらも、健常者(n=3)と比較して腎がん患者(n=11)のLargen濃度が有意に高かった。統計解析にはMann-Whitney U testを使用した。
〔実施例7:抗がん薬による抗腫瘍効果とLargen発現との関連性〕
長崎大学病院において、分子標的治療薬であるスニチニブ(sunitinib)または免疫チェックポイント阻害薬であるニボルマブ(nivolumab)で治療を行った患者のうち、治療前の組織におけるLargenの発現が解析できた41名について、それぞれの治療で得られた腫瘍縮小効果とLargenの発現との関連を解析した。統計処理にはカイ2乗検定を使用した。
長崎大学病院において、分子標的治療薬であるスニチニブ(sunitinib)または免疫チェックポイント阻害薬であるニボルマブ(nivolumab)で治療を行った患者のうち、治療前の組織におけるLargenの発現が解析できた41名について、それぞれの治療で得られた腫瘍縮小効果とLargenの発現との関連を解析した。統計処理にはカイ2乗検定を使用した。
結果を表4-1、表4-2、表4-3に示した。表4-1は全患者(n=41)の結果、表4-2はスニチニブで治療を行った患者(n=26)の結果、表4-3はニボルマブで治療を行った患者(n=15)の結果である。表中、CRはComplete Responseの略で、腫瘍が完全/ほぼ消失した状態(治療効果:強くあり)を示し、PRはPartial Responseの略で、腫瘍の大きさが減少した状態(治療効果:あり)を示し、SDはStable Diseaseの略で、腫瘍の大きさが変化しない状態を示し、PDはProgressive Diseaseの略で、腫瘍が増加/新病変が出現した状態(治療効果なし)を示す。スニチニブ治療とニボルマブ治療の全体(表4-1)、スニチニブ治療(表4-2)およびニボルマブ治療(表4-3)のいずれの場合も、Largen陽性の患者のほうが、治療効果なし(PD)の患者数が有意に多いことが示された。この結果から、Largenを発現している腎がんは、分子標的治療薬および免疫チェックポイント阻害薬に対して抵抗性であり、効果が出にくいことを示している。
なお本発明は上述した各実施形態および実施例に限定されるものではなく、請求項に示した範囲で種々の変更が可能であり、異なる実施形態にそれぞれ開示された技術的手段を適宜組み合わせて得られる実施形態についても本発明の技術的範囲に含まれる。また、本明細書中に記載された学術文献および特許文献の全てが、本明細書中において参考として援用される。
Claims (15)
- 腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法であって、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程を含む予測方法。
- さらに、被検者の腎がん組織における壊死を評価する工程と、被検者の腎がん組織における壊死レベルを対照と比較する工程を含む、請求項1に記載の予測方法。
- 腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法であって、被検者の腎がん転移組織におけるLargenの発現を評価する工程と、被検者の腎がん転移組織におけるLargenの発現レベルを対照と比較する工程を含む予測方法。
- さらに、被検者の腎がん転移組織における壊死を評価する工程と、被検者の腎がん転移組織における壊死レベルを対照と比較する工程を含む、請求項3に記載の予測方法。
- 被検者の腎がん組織または腎がん転移組織における受容体相互作用プロテインキナーゼ3の発現により壊死を評価する、請求項2または4に記載の予測方法。
- 腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後を予測する方法であって、被検者の体液中のLargenを検出する工程と、被検者の体液中のLargen検出量を対照と比較する工程を含む予測方法。
- 前記体液が尿または血液である、請求項6に記載の予測方法。
- 前記被検者が、がん組織の摘出手術を受けた腎がん患者である、請求項1~7のいずれかに記載の予測方法。
- 抗がん剤が、分子標的薬または免疫療法薬である、請求項1~8のいずれかに記載の予測方法。
- 腎がん患者の予後が、生存期間、がんの進行、がんの再発および無イベント期間からなる群より選択される1つ以上である、請求項1~9のいずれかに記載の予測方法。
- 抗腎がん物質のスクリーニング方法であって、
(1)被験物質とLargenを発現する腎がん細胞をインビトロで接触させる工程、
(2)前記腎がん細胞におけるLargenの発現量を測定する工程、および
(3)得られたLargen発現量を、被験物質と接触していない前記腎がん細胞のLargen発現量と比較して、発現量を低下させる被験物質を選択する工程
を含むことを特徴とするスクリーニング方法。 - 腎がん細胞におけるLargenの発現を阻害する物質を有効成分とする、腎がん治療用医薬組成物。
- 前記有効成分が、腎がん細胞におけるLargenの発現を阻害する核酸である、請求項12に記載の医薬組成物。
- 抗Largen抗体、または、LargenのmRNAを検出するためのプライマーもしくはプローブを含む、腎がん患者の抗がん剤抵抗性および/または予後予測用キット。
- 抗Largen抗体、または、LargenのmRNAを検出するためのプライマーもしくはプローブを含む、抗腎がん物質のスクリーニング用キット。
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