WO2022018884A1 - 栄養障害型表皮水疱症の治療薬 - Google Patents

栄養障害型表皮水疱症の治療薬 Download PDF

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WO2022018884A1
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blister
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克人 玉井
康 菊池
智樹 玉越
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    • C12N2740/16043—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector

Definitions

  • the present disclosure relates to a therapeutic agent for nutritionally impaired epidermolysis bullosa.
  • Epidermolysis bullosa is a disease in which the epidermis peels off from the dermis and causes blisters (blisters) and skin ulcers when force is applied to the skin due to the loss or disappearance of the adhesive structural molecules responsible for the adhesion of skin tissue. be.
  • the type in which the epidermis is torn and blisters are formed is simple epidermolysis bullosa
  • the type in which blisters are formed by peeling between the epidermis and the dermis is junctional epidermolysis bullosa, and the part between the epidermis and the dermis is peeled off.
  • the type of disease is called epidermolysis bullosa.
  • Nutritional disorder type epidermolysis bullosa is the most common type of epidermolysis bullosa, accounting for about 50% of all epidermolysis bullosa, and is a hereditary disease caused by a mutation in the COL7A1 gene that encodes type VII collagen.
  • the epidermal basal cells at the bottom of the epidermis are bound to a sheet-like structure called the basement membrane.
  • Type VII collagen forms a fiber called anchoring fibril in the dermis and connects the basement membrane and the dermis.
  • Skin sheets are difficult to manufacture because they require advanced process control and culture technology, and are expensive, so there is a demand for therapeutic agents that are easier to manufacture.
  • the present disclosure is a composition for use in the treatment of dystrophic epidermolysis bullosa, comprising blistering-derived cells of a dystrophic epidermolysis bullosa patient genetically modified to produce type VII collagen. Regarding the composition.
  • the present disclosure provides a therapeutic agent for nutritionally impaired epidermolysis bullosa.
  • FIG. 1 is a photograph showing the appearance of blister-derived cells up to 20 days after the start of culture.
  • FIG. 2 shows the results of FACS analysis of blister-derived cells and human bone marrow-derived mesenchymal stem cells (BM-MSC).
  • BM-MSC bone marrow-derived mesenchymal stem cells
  • FIG. 3 blisters-derived cells and human BM-MSC are cultured under conditions for inducing differentiation into osteoblasts, adipocytes, and chondrocytes, and are stained with alkaline phosphatase (ALP), oil red O, and alcian blue, respectively. The result of the above is shown.
  • FIG. 4 shows the cleavage of genomic DNA by the designed sgRNA (sgAAVS1- # 1 to # 3) and its cleavage efficiency.
  • FIG. 1 is a photograph showing the appearance of blister-derived cells up to 20 days after the start of culture.
  • FIG. 2 shows the results of FACS analysis of blister-derived cells and human bone
  • FIG. 5 is an explanatory diagram of genome editing in which the COL7A1 gene is introduced into the AAVS1 region.
  • HA-R and HA-L indicate the homologous sequence part
  • SA indicates the splice acceptor sequence
  • T2A indicates the T2A sequence encoding the T2A peptide
  • Puro indicates the puromycin resistance gene
  • CAG indicates the CAG promoter sequence.
  • the length from F2 to R2 in the wild-type genome (top) is 1952 bp
  • the length from F1 to R1 in the genome into which the COL7A1 gene is introduced (bottom) is 1246 bp
  • the length from F2 to R2 is 14249 bp. be.
  • FIG. 6 is an explanatory diagram of the production of an epidermolysis bullosa model mouse.
  • the photo on the right shows the formed blisters.
  • FIG. 7 shows a skin tomographic image of an epidermolysis bullosa model mouse in which blister-derived cells are injected into the blister.
  • the photo on the left shows the results of immunostaining for type VII collagen
  • the photo on the right shows the results of immunostaining for DAPI staining and type VII collagen.
  • Control shows the results of mice injected with unmodified blister-derived cells
  • CAG-hCOL7 shows the results of mice injected with COL7A1 gene-introduced blister-derived cells.
  • Dystrophic Epidermolysis Bullosa is a hereditary disease caused by a mutation in the COL7A1 gene that encodes type VII collagen, and type VII collagen is not produced at all or its function is impaired by the mutation. It is known that type VII collagen is produced as its characteristic. Type VII collagen forms a fiber called anchoring fibril in the dermis and connects the basement membrane and the dermis. Type VII collagen contains a first non-collagen region, a collagen region, and a second non-collagen region from the N-terminal, and forms a triple chain at the collagen region portion characterized by a repeating sequence of glycine-XY, forming a triple chain and a C-terminal.
  • Mutations include mutations in which glycine in the collagen region is replaced with other amino acids, stop codon mutations that stop protein translation, and splice site mutations.
  • the mutation may be in one of the alleles or in both.
  • the malnourished epidermolysis bullosa includes a dominant malnutrition type and a recessive malnutrition type, and the recessive malnutrition type includes a severe generalized type and other generalized types with relatively mild symptoms.
  • the malnutrition-type epidermolysis bullosa in the present specification may be any type of malnutrition-type epidermolysis bullosa, and may be caused by a mutation in any COL7A1 gene.
  • the blister-derived cells of a dystrophic epidermolysis bullosa patient refer to adherent cells collected from within the blister of a dystrophic epidermolysis bullosa patient, and in the present disclosure, "DEB patient blister-derived cells” or Also called “blister-derived cells”.
  • the cells can be obtained by culturing the blister contents of a nutritionally impaired epidermolysis bullosa patient on a solid phase.
  • the blister contents can be collected from the blisters of a nutritionally impaired epidermolysis bullosa patient by means such as a syringe.
  • the solid phase means a solid support to which cells can adhere, and includes, for example, a culture vessel made of plastic or glass, such as a culture dish, a flask, or a multi-well plate.
  • the solid phase is a plastic culture vessel.
  • the solid phase may be coated, and examples of the coating substance include collagen I, laminin, vitronectin, fibronectin, poly-L-lysine, and poly-L-ornithine.
  • the solid phase is coated with collagen I. Culturing can be carried out in a general incubator under conditions such as "37 ° C, 5% CO 2 ", "37 ° C, 5% O 2 , 5% CO 2".
  • the culture medium may be any medium that can be used for culturing animal cells, for example, MEM, MEM ⁇ , DMEM, GMEM, RPMI 1640, MesenCult TM (STEMCELL Technologies), Messengerle Stem Cell Growth Medium 2 (PromoCell). , MSCGM Mesenchymal Stem Cell Growth Medium (Lonza), Cellartis MSC Xeno-Free Culture Medium (Takara Bio), and a mixed medium thereof.
  • the culture period may be long enough for the cells to adhere to the solid phase, eg, 1 day to several months (eg, 2, 3 or 4 months), 1 day to 1 month, 1 day. It can be from several weeks (eg, two, three or four weeks), one day to one week.
  • blister-derived cells of DEB patients have one or more characteristics selected from the following 1) -6): 1) Adhesive to the solid phase, 2) One or more surface markers selected from the group consisting of CD73, CD105 and CD90 are positive. 3) One or more surface markers selected from the group consisting of CD45, CD34, CD11b, CD79A, HLA-DR and CD31 are negative, 4) It does not have the ability to differentiate into osteoblasts, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells. 5) It does not have the ability to differentiate into adipocytes, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells.
  • chondrocytes It does not have the ability to differentiate into chondrocytes, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells.
  • a cell "does not have the ability to differentiate" into osteoblasts, fat cells or chondrocytes means osteoblasts, fat cells or or using normal differentiation induction conditions and detection methods (staining, etc.). It means that differentiation into cartilage cells cannot be detected.
  • the DEB patient blister-derived cells are CD73-positive, CD105-positive, and CD90-positive cells.
  • DEB patient blister-derived cells are CD45-negative, CD34-negative, CD11b-negative, CD79A-negative, HLA-DR-negative, and CD31-negative cells.
  • DEB patient blisters are cells that are less capable of differentiating into osteoblasts, adipocytes, and chondrocytes than bone marrow-derived mesenchymal stem cells. be.
  • DEB patient blisters-derived cells have a lower ability to differentiate into osteoblasts and adipocytes than bone marrow-derived mesenchymal stem cells, and have no ability to differentiate into chondrocytes. It is a cell.
  • blister-derived cells of a nutritionally impaired epidermolysis bullosa patient genetically modified to produce type VII collagen are used.
  • “cells genetically modified to produce type VII collagen” means cells genetically modified to produce functional (ie, capable of forming anchoring fibrils) type VII collagen.
  • the gene modification of a cell means both the modification of a gene in the genome of the cell and the modification of the cell to express the gene from an extragenome nucleic acid construct (for example, a vector). That is, the expression “gene-modify to produce type VII collagen” refers to modifying cells to express type VII collagen from the COL7A1 gene in the genome, and to VII from the COL7A1 gene of the extragenomic nucleic acid construct. It involves modifying cells to express type collagen.
  • “cells genetically modified to produce type VII collagen” include cells that express type VII collagen from the COL7A1 gene in the genome and cells that express type VII collagen from the COL7A1 gene, which is a nucleic acid construct outside the genome. And are included.
  • Gene modification of cells can be performed by introducing the COL7A1 gene or by modifying the mutation of the COL7A1 gene in the genome.
  • the introduction of the COL7A1 gene can be performed either by introducing the COL7A1 gene into the cell genome or by allowing a nucleic acid construct containing the COL7A1 gene to be present in the cell so that the COL7A1 gene is expressed from an extragenome nucleic acid construct. Can be done.
  • the COL7A1 gene is introduced into the genome of a cell, it may be introduced at a specific position or may be introduced at random.
  • the COL7A1 gene is introduced into the COL7A1 locus of the genome, or a safe harbor such as the AAVS1 region.
  • DEB patient blister-derived cells are cells of the dystrophic epidermolysis bullosa patient (ie, autologous cells) to which the cells are administered, but are different from those of the patient receiving the cells. It may be a patient's cell (ie, an allogeneic cell).
  • the cells of the epidermolysis bullosa patient with malnutrition include cells that do not produce type VII collagen and cells that produce type VII collagen but whose function is reduced due to mutation.
  • the "cells of a patient with epidermolysis bullosa" may be any of them.
  • the DEB patient blister-derived cells may be cells that can produce type VII collagen in the vicinity of the epidermal basement membrane when administered to the patient.
  • cells are used in the sense of including those grown as needed.
  • Cell proliferation can be performed by culturing the cells.
  • blister-derived cells in patients with dystrophy-type epidermolysis bullosa
  • gene-modified cells are cells obtained by genetic modification. Includes those that have been propagated.
  • genetically modified cells may be grown until the amount required for the genetic modification is obtained. Also, after genetic modification, cells may be grown until the amount required for treatment is obtained.
  • the term "cell” can mean one cell or a plurality of cells depending on the context. Further, the cell may be a cell population consisting of one type of cell, or may be a cell population including a plurality of types of cells.
  • the COL7A1 gene means a nucleic acid sequence encoding type VII collagen, and is used to include cDNA as well as a sequence containing one or more introns (eg, a genomic sequence or a minigene).
  • the representative nucleic acid sequence of the human COL7A1 gene (cDNA) is shown in SEQ ID NO: 1, and the representative amino acid sequence of human type VII collagen is shown in SEQ ID NO: 2.
  • the cDNA sequence of the COL7A1 gene is disclosed in GenBank: NM_000094.3, and the genomic sequence is disclosed in GenBank: AC121252.4.
  • the COL7A1 gene may encode functional type VII collagen (ie, capable of forming anchoring fibrils), and its sequence is not limited.
  • CDNA sequence of human COL7A1 gene (8835 bp) (SEQ ID NO: 1) Amino acid sequence of human type VII collagen (2944 AA) (SEQ ID NO: 2) *
  • the COL7A1 gene is a nucleic acid having 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% or more sequence identity with the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1. Contains or consists of the nucleic acid sequence. In another embodiment, the COL7A1 gene is 1-30, 1-20, 1-10, 1-5, 1-3, 1-2 or 1 in the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1. The base contains or consists of the nucleic acid sequence inserted, deleted, substituted, or added. In a further embodiment, the COL7A1 gene comprises or consists of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1.
  • type VII collagen has 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% or more sequence identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. Contains or consists of the amino acid sequence. In another embodiment, type VII collagen is 1-30, 1-20, 1-10, 1-5, 1-3, 1-2 or 1 in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. Contains or consists of the amino acid sequence of which the amino acid residue of is inserted, deleted, substituted, or added. In a further embodiment, type VII collagen comprises or consists of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.
  • the COL7A1 gene is an amino acid having 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% or more sequence identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. Contains or consists of the nucleic acid sequence encoding the sequence. In another embodiment, the COL7A1 gene is 1-30, 1-20, 1-10, 1-5, 1-3, 1-2 or 1 in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. The amino acid residue comprises or consists of a nucleic acid sequence encoding an inserted, deleted, substituted, or added amino acid sequence.
  • sequence identity with respect to a nucleic acid sequence or amino acid sequence coincides between two sequences that are optimally aligned (maximum match) over the entire region of the sequence to be compared. Means the proportion of base or amino acid residues.
  • sequence to be compared may have insertions, additions or deletions (eg, gaps, etc.) in the optimal alignment of the two sequences.
  • Sequence identity can be calculated using programs such as FASTA, BLAST, and CLUSTAL W provided in public databases (eg, DDBJ (http://www.ddbj.nig.ac.jp)). Alternatively, it can be obtained by using commercially available sequence analysis software (for example, Vector NTI (registered trademark) software, GENETYX (registered trademark) ver. 12).
  • cells are genetically modified by genome editing such as CRISPR systems (eg, CRISPR / Cas9, CRISPR / Cpf1), TALENs, ZFNs.
  • CRISPR systems eg, CRISPR / Cas9, CRISPR / Cpf1
  • TALENs TALENs
  • ZFNs ZFNs.
  • the cell is genetically modified by a viral vector such as a retroviral vector, a lentiviral vector, an adenoviral vector, an adeno-associated virus vector.
  • the cells are genetically modified by CRISPR / Cas9.
  • the cells are genetically modified with a retroviral vector or a lentiviral vector.
  • the sequence can be inserted into the cleavage site of the genome by causing cleavage in the genome and introducing a donor vector containing the target sequence into the cell.
  • the sequence to be inserted into the genome can be the COL7A1 gene, or a sequence for replacement with a site containing a mutation in the COL7A1 gene (eg, a partial sequence of the COL7A1 gene).
  • the donor vector may contain regulatory sequences such as promoters and enhancers that control the expression of the sequence of interest, as well as other elements such as drug resistance genes for cell selection, at both ends of the genome. It may contain homologous sequences at both ends of the insertion site.
  • the donor vector can be introduced at the desired site by non-homologous end binding or homologous recombination.
  • a viral vector such as a plasmid, an adeno-associated virus vector, or an integrase-deficient lentivirus vector can be used.
  • endonucleases such as Cas9 or Cas12 (eg, Cas12a (also known as Cpf1), Cas12b, Cas12e) recognize the PAM sequence, which is a specific base sequence, and the action of the endonuclease double-strands the target DNA. To disconnect. If the endonuclease is Cas9, it cleaves about 3-4 bases upstream of the PAM sequence.
  • endonucleases include S. pyogenes, S. aureus, N. meningitidis, S. thermophilus, or T. denticola Cas9, L. bacterium ND2006 or Acidaminococcus sp. BV3L6 Cpfl.
  • the PAM sequence is endonuclease dependent, for example, the PAM sequence of Cas9 in S. pyogenes is NGG.
  • the gRNA contains a sequence (target sequence) of about 20 bases upstream of the PAM sequence or a sequence complementary thereto on the 5'end side, and plays a role of recruiting endonucleases to the target sequence.
  • the sequence of the portion of the gRNA other than the target sequence (or a sequence complementary thereto) can be appropriately determined by those skilled in the art depending on the endonuclease used.
  • gRNA is a crRNA (CRISPRRNA) that contains a target sequence or a sequence complementary to it and is responsible for the sequence specificity of gRNA, and a tracrRNA (Trans-activating crRNA) that forms a double strand and contributes to the formation of a complex with Cas9. And can be included.
  • crRNA and tracrRNA may exist as different molecules.
  • the endonuclease is Cpf1
  • crRNA alone functions as a gRNA.
  • a gRNA containing an element necessary for the function of the gRNA on a single strand may be particularly referred to as sgRNA.
  • the gRNA sequence can be determined by tools available for target sequence selection and gRNA design, such as CRISPRdirect (https://crispr.dbcls.jp/).
  • a vector containing a nucleic acid sequence encoding a gRNA and a nucleic acid sequence encoding an endonuclease may be introduced and expressed in the cell, or an extracellularly prepared gRNA and an endonuclease protein may be introduced into the cell. ..
  • the endonuclease may include a nuclear localization signal.
  • the nucleic acid sequence encoding the gRNA and the nucleic acid sequence encoding the endonuclease may be present on different vectors.
  • Vectors, gRNAs, and endonucleases can be introduced into cells by lipofection, electroporation, microinjection, calcium phosphate method, DEAE-dextran method, etc., but are not limited to these methods.
  • the gRNA that can be used to introduce the COL7A1 gene into the genome comprises any of the sequences of SEQ ID NOs: 3-5 or a sequence complementary thereto.
  • the COL7A1 gene can be introduced into the cell genome by using a retroviral vector or a lentiviral vector having integrase activity.
  • the retroviral vector and the lentiviral vector may be integrase-deficient. Integrase-deficient vectors lack integrase activity, for example, due to mutations in the integrase gene.
  • an integrase-deficient vector, an adenovirus vector, or an adeno-associated virus vector is used, the sequence integrated into the vector is usually not introduced into the cell genome.
  • type VII collagen is expressed from the COL7A1 gene of the vector existing in the cell (intranuclear).
  • the viral vector contains a sequence encoding the COL7A1 gene, and may contain regulatory sequences such as promoters and enhancers that control the expression of the COL7A1 gene, and other elements such as drug resistance genes for cell selection.
  • the viral vector may be prepared by any method known in the art.
  • retroviral and lentiviral vectors are viral vector plasmids containing LTR sequences (5'LTR and 3'LTR) at both ends, packaging signals, and sequences of interest, viral structures such as Gag, Pol, Env. It can be made by introducing into packaging cells with one or more plasmid vectors expressing the proteins, or by introducing into packaging cells expressing these structural proteins.
  • the packaging cells include, but are not limited to, 293T cells, 293 cells, HeLa cells, COS1 cells, COS7 cells, and the like.
  • the viral vector may be pseudotyped and may express an enveloped protein such as, for example, the vesicular stomatitis virus G protein (VSV-G).
  • VSV-G vesicular stomatitis virus G protein
  • the viral vector is a lentiviral vector.
  • Lentivirus vectors include HIV (human immunodeficiency virus) (for example, HIV-1 and HIV-2), SIV (simian immunodeficiency virus), FIV (feline immunodeficiency virus), MVV (Maedi-Visna virus), EV1 (Maedi-). Visna-like virus), EIAV (equine infectious anemia virus), and CAEV (caprine arthritis encephalitis virus), but are not limited to these.
  • the lentiviral vector is HIV.
  • the lentiviral vector can be produced as follows. First, a viral vector plasmid encoding the viral genome and one or more plasmid vectors expressing Gag, Pol, and Rev (and optionally Tat) and one or more plasmid vectors expressing enveloped proteins such as VSV-G. , Introduced into packaging cells. Viral vector plasmids are LTR sequences at both ends (5'LTR and 3'LTR), packaging signals, and promoters that control the COL7A1 gene and its expression (eg, CMV promoter, CAG promoter, EF1 ⁇ promoter, PGK promoter, or hCEF). Promoter) is included.
  • LTR sequences at both ends 5'LTR and 3'LTR
  • promoters that control the COL7A1 gene and its expression (eg, CMV promoter, CAG promoter, EF1 ⁇ promoter, PGK promoter, or hCEF). Promoter) is included.
  • the 5'LTR functions as a promoter that induces transcription of the viral RNA genome, it may be replaced with another promoter such as the CMV promoter in order to enhance the expression of the RNA genome.
  • the viral RNA genome is transcribed from the vector plasmid and packaged to form the viral core.
  • the virus core is transported to the cell membrane of the packaging cell, encapsulated in the cell membrane, and released as virus particles from the packaging cell.
  • the released virus particles can be recovered from the culture supernatant of the packaging cells.
  • virus particles can be recovered by conventional purification methods such as centrifugation, filter filtration, column purification and the like.
  • lentiviral vectors can be manufactured using kits such as Lentiviral High Titer Packaging Mix, Lenti-X TM Packaging Single Shots (Takara Bio Inc.), and ViraSafe TM Lentivirus Complete Expression System (Cell Biolabs Inc.). can.
  • Adeno-associated virus vectors can be prepared using a kit such as AAVpro (R) Helper Free System (Takara Bio Inc. ).
  • the cells into which the target sequence has been introduced can be confirmed by Southern blotting or PCR.
  • the sequence of interest may be introduced into at least one of the alleles.
  • DEB patient blister-derived cells are the most abundant cells contained in the composition.
  • DEB patient blister-derived cells make up 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98 or 99% or more of the cells contained in the composition.
  • the compositions of the present disclosure are substantially free of cells other than DEB patient blister-derived cells. "Substantially free of cells other than DEB patient blister-derived cells” means that only cells obtained by substantially the same method as the method for obtaining DEB patient blister-derived cells described herein are included. means.
  • the number of cells contained in the composition is an amount required to exert the desired effect (also referred to herein as an effective amount), and those skilled in the art will appreciate the age, weight, and medical condition of the patient, as well as the type of cells. It can be appropriately determined in consideration of factors such as the gene modification method.
  • the number of cells is not limited, but is, for example, 1 cell to 1 ⁇ 10 7 cells, 1 ⁇ 10 cells to 1 ⁇ 10 7 cells, 1 ⁇ 10 2 cells to 1 ⁇ 10 7 cells, 1 ⁇ 10 3 cells to 1 ⁇ .
  • composition may include pharmaceutically acceptable vehicles and / or additives in addition to the cells.
  • Pharmaceutically acceptable vehicles include water, medium, saline, glucose, infusions containing D-sorbitol, D-mannitol and the like, phosphate buffered saline (PBS) and the like.
  • PBS phosphate buffered saline
  • the additive include a solubilizing agent, a stabilizer, a preservative and the like.
  • the dosage form of the composition is not particularly limited, but is a parenteral administration preparation, for example, an injection.
  • Injections include solution injections, suspension injections, emulsion injections, and time-prepared injections.
  • the composition may be frozen or may contain cryoprotectants such as DMSO, glycerol, polyvinylpyrrolidone, polyethylene glycol, dextran, sucrose and the like.
  • compositions of the present disclosure may be administered systemically or topically.
  • the composition is administered to the affected area of a nutritionally impaired epidermolysis bullosa patient.
  • the affected area means a blister or an area in the vicinity thereof.
  • the composition is administered intracutaneously or intrablister of the blister portion.
  • the composition is administered intrablister.
  • administration in the blister means administration in the space under the epidermis of the blister portion. Intrablister administration can reduce patient distress as compared to intradermal or subcutaneous administration, and type VII collagen can be well expressed near the basement membrane.
  • the number of cells administered per site is an amount (effective amount) necessary for exerting the desired effect, and those skilled in the art will be able to determine the patient's age, weight, and medical condition, as well as the cell type and gene modification method. It can be determined as appropriate in consideration of the factors of.
  • the number of cells is not limited, but for example, 1 cell to 1 ⁇ 10 7 cells, 1 ⁇ 10 cells to 1 ⁇ 10 7 cells, 1 ⁇ 10 2 cells to 1 ⁇ 10 7 cells, 1 ⁇ 10 3 cells to 1 ⁇ 10 7 cells, 1 ⁇ 10 4 cells to 1 ⁇ 10 7 cells, 1 ⁇ 10 5 cells to 1 ⁇ 10 7 cells, 1 ⁇ 10 5 cells to 5 ⁇ 10 6 cells, 5 ⁇ 10 5 cells to 1 ⁇ 10 6 cells, or 1 x 10 5 cells to 1 x 10 6 cells.
  • the dose per blister may be a standard blister having a diameter of 7 to 8 mm when the blister is approximately circularly approximated, and the above dose may be adjusted according to the size thereof.
  • a composition for use in the treatment of dystrophic epidermolysis bullosa comprising blister-derived cells of a dystrophic epidermolysis bullosa patient genetically modified to produce type VII collagen.
  • the composition according to 1 above, wherein the blister-derived cells have been genetically modified by introducing the COL7A1 gene.
  • the COL7A1 gene contains a nucleic acid sequence having 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% or more sequence identity with the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 Containing a nucleic acid sequence encoding an amino acid sequence having 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% or more sequence identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.
  • composition according to any one of 1 to 4 above, wherein the blister-derived cells have one or more characteristics selected from the following 1) to 6): 1) Adhesive to the solid phase, 2) One or more surface markers selected from the group consisting of CD73, CD105 and CD90 are positive. 3) One or more surface markers selected from the group consisting of CD45, CD34, CD11b, CD79A, HLA-DR and CD31 are negative, 4) It does not have the ability to differentiate into osteoblasts, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells. 5) It does not have the ability to differentiate into adipocytes, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells.
  • the composition according to any one of 1 to 10 above, wherein the blister-derived cells have been genetically modified by genome editing.
  • composition according to 11 above wherein the genome editing is performed by CRISPR / Cas9.
  • composition according to any one of 1 to 10 above, wherein the blister-derived cells are genetically modified by a viral vector.
  • the viral vector is a retrovirus vector or a lentiviral vector.
  • the viral vector is a lentiviral vector.
  • a method for producing a composition for use in the treatment of nutritionally impaired epidermolysis bullosa comprising genetically modifying a blister-derived cell of a dystrophic epidermolysis bullosa patient to produce type VII collagen, and preparing a composition comprising the genetically modified blister-derived cell.
  • a method for treating dystrophic epidermolysis bullosa wherein a composition containing blister-derived cells of a dystrophic epidermolysis bullosa patient genetically modified to produce type VII collagen is administered to the patient. How to include.
  • [18] 17 The method according to 17 above, wherein the blister-derived cells have been genetically modified by introducing the COL7A1 gene. [19] 18.
  • the method according to 18 above wherein the COL7A1 gene has been introduced into the genome of a blister-derived cell.
  • the COL7A1 gene contains a nucleic acid sequence having 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% or more sequence identity with the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 Containing a nucleic acid sequence encoding an amino acid sequence having 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% or more sequence identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.
  • the method of any of 16 and 26-29 above, wherein the blister-derived cells are genetically modified by genome editing.
  • the viral vector is a lentiviral vector.
  • composition comprising blister-derived cells of a dystrophy-type epidermolysis bullosa patient genetically modified to produce type VII collagen for the manufacture of a pharmaceutical for the treatment of dystrophic epidermolysis bullosa.
  • 41 The use according to 41, wherein the composition is administered intrablister.
  • a gRNA comprising any of the sequences of SEQ ID NOs: 3 to 5 or a sequence complementary thereto.
  • a method for producing cells which comprises a step of culturing the contents of blisters of a patient with epidermolysis bullosa with malnutrition on a solid phase.
  • the cell according to 50 which has one or more characteristics selected from 1) to 6) below: 1) Adhesive to the solid phase, 2) One or more surface markers selected from the group consisting of CD73, CD105 and CD90 are positive.
  • One or more surface markers selected from the group consisting of CD45, CD34, CD11b, CD79A, HLA-DR and CD31 are negative, 4) It does not have the ability to differentiate into osteoblasts, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells. 5) It does not have the ability to differentiate into adipocytes, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells. 6) It does not have the ability to differentiate into chondrocytes, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells.
  • [52] Cell production method including the following steps: 1) The process of culturing the contents of blisters in patients with epidermolysis bullosa with malnutrition on a solid phase, 2) Culture step A step of genetically modifying the cells obtained in 1) to produce type VII collagen.
  • the cell according to 53 or 54 above which has been genetically modified by introducing the COL7A1 gene.
  • the COL7A1 gene contains a nucleic acid sequence having 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% or more sequence identity with the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 Containing a nucleic acid sequence encoding an amino acid sequence having 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% or more sequence identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.
  • the cell according to 56 [58] The cell according to any one of 53 to 57 above, which has been genetically modified by genome editing. [59] The cell according to 58 above, wherein the genome editing was performed by CRISPR / Cas9.
  • One or more surface markers selected from the group consisting of CD45, CD34, CD11b, CD79A, HLA-DR and CD31 are negative, 4) It does not have the ability to differentiate into osteoblasts, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells. 5) It does not have the ability to differentiate into adipocytes, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells. 6) It does not have the ability to differentiate into chondrocytes, or its differentiation ability is lower than that of bone marrow-derived mesenchymal stem cells.
  • the cells obtained by such a method are also referred to as "blister-derived cells” below.
  • the following surface marker analysis and differentiation induction experiments used cells of the 3rd passage, and cells of the 3rd to 4th passages were used for gene transfer.
  • an equal amount mixed medium of Mesenchymal Stem Cell Growth Medium 2 (PromoCell, C-28009) and MSCGM Mesenchymal Stem Cell Growth Medium (Lonza, PT-3001) or Cellartis MSC Xeno-Free Culture It was confirmed that equivalent blisters-derived cells could be obtained even when Medium (Takara Bio Inc., Y50200) was used.
  • Blister-derived cell characterization a) Surface marker analysis (FACS) Regarding the blisters-derived cells obtained in 1. above and human bone marrow-derived mesenchymal stem cells (hereinafter, also referred to as BM-MSC) [purchased from PromoCell (Heidelberg, Germany) or Lonza (Basel, Switzerland)], the following. Surface marker analysis was performed according to the procedure of: Cells were peeled from the plate using Accutase-Solution (PromoCell, C-41310), washed with medium, and then placed in two tubes based on the cell count measurement results. 100,000 cells were separated.
  • FACS Surface marker analysis
  • the cells were washed once with 2 ml of Flow Cytometry Staining Buffer (1X), resuspended in 300 ⁇ l of Flow Cytometry Staining Buffer (1X), and then analyzed with BD FACSAria (BD). FACS analysis was also performed on CD31 according to the following procedure to confirm the presence or absence of expression in blister-derived cells and human BM-MSC: cells were peeled from the plate using Accutase-Solution (PromoCell, C-41310), and the medium was used. After washing with, 100,000 cells were separated into two tubes based on the measurement result of the cell number.
  • BD FACSAria BD FACSAria
  • both blister-derived cells and BM-MSC were positive for CD73, CD105 and CD90, and negative for CD45, CD34, CD11b, CD79A, HLA-DR and CD31 (Fig. 2).
  • Induction of differentiation (osteoblasts, adipocytes and chondrocytes)
  • the blisters-derived cells and BM-MSC obtained in 1. above were induced to differentiate into osteoblasts, adipocytes and chondrocytes under the following conditions.
  • Induction of differentiation into osteoblasts Cells are cultured in medium containing 0.1 ⁇ M Dexamethasone, 0.2 mM Ascorbic acid 2-phosphate, 10 mM Glycerol 2-phosphate (all numerical values are final concentrations) at 37 ° C. and 5% CO 2 for 3 weeks (2 weeks). (Culture exchange) was performed to induce differentiation into osteoblasts.
  • Alkaline phosphatase (ALP) staining was performed using the TRACP & ALP Assay Kit (Takara Bio Inc., MK301) according to the product manual.
  • Induction of differentiation into adipocytes Cells were cultivated in medium containing 1 ⁇ M Dexamethasone, 0.5 mM 3-Isobutyl-1-methylanxthine (IBMX), 10 ⁇ g / mL Insulin, 100 ⁇ M Indomethacin (all numbers are final concentrations) under 37 ° C., 5% CO 2 conditions. Insulin differentiation into adipocytes was induced by culturing for 3 weeks (medium exchange twice a week).
  • the cells were stained with Oil Red O using the Lipit assay kit (Cosmo Bio Co., Ltd., AK09F) according to the product manual.
  • Induction of differentiation into chondrocytes The components of Human Mesenchymal Stem Cell (hMSC) Chondrogenic Differentiation Medium Bullet Kit (tm) (Lonza, PT-3003) were mixed as instructed to prepare a cartilage differentiation-inducing medium (incomplete medium).
  • Recombinant Human TGF-beta 3 Protein R & D Systems, 243-B3 was added to this to a final concentration of 10 ng / ml, and a cartilage differentiation-inducing medium (complete medium) was prepared for each use.
  • the third passage cells were peeled off with Accutase-Solution PromoCell (C-41310), washed with a medium, and then 250,000 cells were separated into 15 ml polypropylene conical tubes based on the cell number measurement results.
  • the cells were washed twice with cartilage differentiation-inducing medium (incomplete medium), the supernatant was removed, and then suspended in 500 ⁇ l of cartilage differentiation-inducing medium (complete medium).
  • Cell pellets were formed by centrifugation at 150 g for 5 minutes, the lid was loosened and placed in a CO 2 incubator (37 ° C, 5% CO 2 ), and then the medium (complete medium) was changed every 2 to 3 days.
  • the pellet was taken out and fixed with 4% paraformaldehyde, frozen sections were prepared, and chondrocyte-derived proteoglycan was stained by Alcian blue staining.
  • chondrocyte-derived proteoglycan was stained by Alcian blue staining.
  • the same differentiation-inducing operation was performed on human bone marrow-derived mesenchymal stem cells.
  • BM-MSC was positive in all of ALP staining, Oil Red O staining, and Alcian blue staining.
  • blistering-derived cells were positive for ALP staining (however, the staining intensity was lower than BM-MSC), positive for Oil Red O staining (however, the staining intensity was lower than that for BM-MSC), and negative for alcyan blue staining. There was (Fig. 3).
  • sgRNAs Three types were prepared in order to select a position in the human genome that has good cleavage efficiency by the CRISPR-Cas9 system in the AAVS1 (Adeno-associated virus integration site 1) region.
  • the AAVS1 region is a safe region (safe harbor) that is not easily affected by gene transfer. Since the CRISPR-Cas9 system recognizes the base sequence of "NGG” and cleaves 3 bases upstream of it, it selects the region where "GG" is located at the end and selects the target sequence of 20 bases upstream of "NGG". Included sgRNAs (sgAAVS1- # 1 to # 3) were designed (Fig. 4, top; Table 1).
  • a plasmid expressing the Cas9 protein and sgRNA was prepared by cloning the oligonucleotide consisting of any of SEQ ID NOs: 3 to 5 and its complementary strand into the Bbs1 site of eSpCas9 (1.1) (Addgene plasmid # 71814). Created (eSpCas9 (1.1)-sgAAVS1- # 1, eSpCas9 (1.1)-sgAAVS1- # 2, eSpCas9 (1.1)-sgAAVS1- # 3, respectively).
  • This plasmid (2.5 ⁇ g) was introduced into HEK293 cells (human fetal kidney cell line) seeded in 6 well dishes by Lipofectamin 3000 (Thermo Fisher Scientific). Forty-eight hours after transfection, genomic DNA was extracted from the cells and the region containing the target site was amplified by PCR. The PCR amplified fragments were single-stranded by heat treatment, annealed by slow cooling, and then treated with a mismatch site-specific endonuclease. This was fractionated by electrophoresis, the degree of insertion or deletion mutation introduced by genome cleavage was measured by the band density, and the genome editing efficiency was calculated by the following formula (in the formula, a is digested). Band concentration that was not present, b and c indicate the band concentration that was cleaved).
  • COL7A1 gene into blister-derived cells
  • a plasmid expressing the COL7A1 gene was designed under the control of the CAG promoter (Fig. 5).
  • the COL7A1 cDNA was obtained from the Flexi ORF sequence-verified clone (Promega, Madison, WI, USA).
  • the COL7A1 cDNA was subcloned into the pENTR1A plasmid (Thermo Fisher Scientific, A10462) to give pENTR1A-COL7A1.
  • COL7A1 cDNA was introduced from pENTR1A-COL7A1 to pAAVS1-P-CAG-DEST (Addgene plasmid # 80490) by Gateway reaction using LR recombinase (Thermo Fisher Scientific) to obtain donor plasmid pAAVS1-P-CAG-COL7A1.
  • the blister-derived cells obtained in 1. above were suspended in a dedicated buffer of the Neon transfection system (Thermo Fisher Scientific), and the Cas9-sgRNA expression plasmid (eSpCas9 (1.1) -sgAAVS1- # 3) and donor plasmid (pAAVS1-P) were suspended.
  • eSpCas9 1.1
  • pAAVS1-P donor plasmid
  • the above plasmid was introduced into blister-derived cells by electroporation under the conditions of 1,200 V, 20 ms, and 2 pulses, and then seeded and cultured on a 6-well plate.
  • As the medium an equal amount mixed medium of Mesenchymal Stem Cell Growth Medium 2 (PromoCell, C-28009) and MSCGM Mesenchymal Stem Cell Growth Medium (Lonza, PT-3001) was used. Puromycin was added to a final concentration of 0.5 ⁇ g / mL 48 hours after transfection, cultured for about 2 weeks, and the selected cells were used in the transplantation experiment into the following mice.
  • the blister-derived cells have a higher expression level and secretion amount of type VII collagen than BM-MSC and fibroblasts. Therefore, blister-derived cells into which the COL7A1 gene has been introduced are expected to exert a higher therapeutic effect than BM-MSC and fibroblasts in gene therapy for dystrophic epidermolysis bullosa.

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Abstract

本開示は、栄養障害型表皮水疱症の治療に用いるための組成物であって、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞を含む組成物などを含む。

Description

栄養障害型表皮水疱症の治療薬
　本出願は、特願２０２０－１２５６２０号について優先権を主張するものであり、ここに参照することによって、その全体が本明細書中へ組み込まれるものとする。
　本開示は、栄養障害型表皮水疱症の治療薬に関する。
　表皮水疱症は、皮膚組織の接着を担っている接着構造分子が欠損または消失していることにより、皮膚に力が加わると、表皮が真皮から剥がれて水ぶくれ（水疱）や皮膚潰瘍を生じる疾患である。このうち、表皮が千切れて水疱ができる病型は単純型表皮水疱症、表皮と基底膜の間が剥がれて水疱ができる病型は接合部型表皮水疱症、基底膜と真皮の間が剥がれる病型は栄養障害型表皮水疱症と称される。
　栄養障害型表皮水疱症は表皮水疱症全体の約５割と最も多い病型であり、VII型コラーゲンをコードするCOL7A1遺伝子の変異を原因とする遺伝性疾患である。皮膚の構造において、表皮の一番下にある表皮基底細胞は、基底膜と称されるシート様の構造体と結合している。VII型コラーゲンは、真皮内でアンカリングフィブリルという線維を形成し基底膜と真皮をつなげている。このため、VII型コラーゲン遺伝子に異常があると基底膜と真皮の接着機能が損なわれ基底膜と真皮の間で水疱ができる栄養障害型表皮水疱症となる。栄養障害型表皮水疱症のなかでも、重症劣性栄養障害型表皮水疱症は、生直後より全身熱傷様皮膚症状が続き、３０歳前後より高率に皮膚有棘細胞癌（瘢痕癌）が多発して死に至る、極めて重篤な遺伝性水疱性皮膚疾患である。
　表皮水疱症に対して、現在有効な治療法はなく、根治的に水疱形成を抑制する遺伝子治療法の開発が求められている。このような遺伝子治療として、患者の皮膚細胞を採取し、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子操作した後、培養して皮膚シートを形成し、患者に移植する治療技術が開示されている（特許文献１参照）。また、VII型コラーゲンの活性が失活している間葉系幹細胞に対してゲノム編集を施し、VII型コラーゲンを産生可能となった間葉系幹細胞をケラチノサイトや線維芽細胞に分化させると共に、培養して皮膚シートを形成し、患者の治療に用いることが提案されている（特許文献２参照）。
国際公開第２０１７/１２０１４７号公報 国際公開第２０１８/１５４４１３号公報
　皮膚シートは、高度な工程管理や培養技術が必要であることから製造の難易度が高く、高コストとなることから、より製造容易な治療薬が求められている。
　ある態様において、本開示は、栄養障害型表皮水疱症の治療に用いるための組成物であって、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞を含む組成物に関する。
　本開示により、栄養障害型表皮水疱症の治療薬が提供される。
図１は、培養開始20日後までの水疱由来細胞の外観を示す写真である。 図２は、水疱由来細胞とヒト骨髄由来間葉系幹細胞（BM-MSC）のFACS解析の結果を示す。 図３は、水疱由来細胞とヒトBM-MSCを、骨芽細胞、脂肪細胞、軟骨細胞への分化誘導条件下で培養し、それぞれアルカリホスファターゼ（ALP）染色、オイルレッドO染色、アルシアンブルー染色を行った結果を示す。 図４は、設計したsgRNA（sgAAVS1-#1～#3）によるゲノムDNAの切断およびその切断効率を示す。 図５は、AAVS1領域にCOL7A1遺伝子を導入するゲノム編集の説明図である。HA-RおよびHA-Lは相同配列部分、SAはスプライスアクセプター配列、T2AはT2AペプチドをコードするT2A配列、Puroはピューロマイシン耐性遺伝子、CAGはCAGプロモーター配列を示す。野生型ゲノム（上）でのF2からR2までの長さは1952bp、COL7A1遺伝子が導入されたゲノム（下）でのF1からR1までの長さは1246bp、F2からR2までの長さは14249bpである。 図６は、表皮水疱症モデルマウスの作製の説明図である。右側の写真は、形成された水疱を示す。 図７は、水疱由来細胞を水疱内に注入した表皮水疱症モデルマウスの皮膚断層画像を示す。左側の写真はVII型コラーゲンに対する免疫染色の結果を示し、右側の写真はDAPI染色とVII型コラーゲンに対する免疫染色の結果を重ねたものである。「Control」は遺伝子改変していない水疱由来細胞を注入したマウス、「CAG-hCOL7」はCOL7A1遺伝子を導入した水疱由来細胞を注入したマウスの結果を示す。
　特に具体的な定めのない限り、本開示で使用される用語は、有機化学、医学、薬学、分子生物学、微生物学等の分野における当業者に一般に理解されるとおりの意味を有する。以下にいくつかの本開示で使用される用語についての定義を記載するが、これらの定義は、本開示において、一般的な理解に優先する。
　栄養障害型表皮水疱症（Dystrophic Epidermolysis Bullosa, DEB）は、VII型コラーゲンをコードするCOL7A1遺伝子の変異を原因とする遺伝性疾患であり、VII型コラーゲンが全く産生されないか、変異により機能の低下したVII型コラーゲンが産生されることが、その特徴として知られている。VII型コラーゲンは、真皮内でアンカリングフィブリルという線維を形成し、基底膜と真皮とをつないでいる。VII型コラーゲンは、N末端から、第一非コラーゲン領域、コラーゲン領域、および第二非コラーゲン領域を含み、グリシン-X-Yの繰り返し配列を特徴とするコラーゲン領域部分で3本鎖を形成し、C末端で2分子が結合し、N末端が基底膜に結合する。変異には、コラーゲン領域のグリシンが他のアミノ酸に置換される変異、タンパク質の翻訳が止まる終始コドン変異、スプライス部位変異などがある。変異は、対立遺伝子の一方にある場合と、両方にある場合がある。栄養障害型表皮水疱症には、優性栄養障害型と劣性栄養障害型とが含まれ、劣性栄養障害型には、重症汎発型と、比較的症状の軽いその他の汎発型が含まれる。本明細書における栄養障害型表皮水疱症は、いずれの病型の栄養障害型表皮水疱症であってもよく、また、如何なるCOL7A1遺伝子の変異を原因とするものであってもよい。
　本開示において、栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞とは、栄養障害型表皮水疱症患者の水疱内から採取される付着性の細胞をいい、本開示において「DEB患者水疱由来細胞」または「水疱由来細胞」とも称される。当該細胞は、栄養障害型表皮水疱症患者の水疱内容物を固相上で培養することによって得ることができる。水疱内容物は、注射器等の手段により、栄養障害型表皮水疱症患者の水疱から採取することができる。本開示において、固相とは、細胞が接着できる固体の支持体を意味し、例えば、プラスチック製またはガラス製の、培養皿、フラスコ、マルチウェルプレートなどの培養容器が含まれる。ある実施形態では、固相は、プラスチック製の培養容器である。固相はコーティングされていてもよく、コーティング用の物質としては、例えば、コラーゲンI、ラミニン、ビトロネクチン、フィブロネクチン、ポリL-リジン、ポリL-オルニチンなどが挙げられる。ある実施形態では、固相はコラーゲンIでコーティングされている。培養は、一般的なインキュベーター内で、「37℃、5％CO2」、「37℃、5％O2、5％CO2」などの条件下で行うことができる。培養用の培地は、動物細胞の培養に用いることができる培地であればよく、例えば、MEM、MEMα、DMEM、GMEM、RPMI 1640、MesenCultTM（STEMCELL Technologies社）、Mesenchymal Stem Cell Growth Medium 2 (PromoCell社)、MSCGM Mesenchymal Stem Cell Growth Medium（Lonza社）、Cellartis MSC Xeno-Free Culture Medium（タカラバイオ社）、およびこれらの混合培地などが挙げられる。培養期間は、細胞が固相に接着するのに十分な期間であればよく、例えば、、1日間～数カ月間（例えば、2、3または4カ月間）、1日間～1カ月間、1日間～数週間（例えば、2、3または4週間）、1日間～1週間でありうる。
　ある実施形態において、DEB患者の水疱由来細胞は、以下の1)～6)から選択される１つ以上の特徴を有する：
　1)固相への接着性を有する、
　2)CD73、CD105およびCD90からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陽性である、
　3)CD45、CD34、CD11b、CD79A、HLA-DRおよびCD31からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陰性である、
　4)骨芽細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
　5)脂肪細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
　6)軟骨細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い。
　本開示において、ある細胞が骨芽細胞、脂肪細胞または軟骨細胞への「分化能を有しない」とは、通常の分化誘導条件および検出方法（染色等）を用いて骨芽細胞、脂肪細胞または軟骨細胞への分化を検出できないことを意味する。
　ある実施形態において、DEB患者水疱由来細胞は、CD73陽性、CD105陽性、且つCD90陽性の細胞である。別の実施形態において、DEB患者水疱由来細胞は、CD45陰性、CD34陰性、CD11b陰性、CD79A陰性、HLA-DR陰性、且つCD31陰性の細胞である。さらなる実施形態において、DEB患者水疱由来細胞は、骨芽細胞への分化能、脂肪細胞への分化能、および軟骨細胞への分化能がいずれも骨髄由来間葉系幹細胞と比較して低い細胞である。さらなる実施形態において、DEB患者水疱由来細胞は、骨芽細胞への分化能および脂肪細胞への分化能が骨髄由来間葉系幹細胞と比較して低く、且つ、軟骨細胞への分化能を有しない細胞である。
　本開示においては、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞が用いられる。本開示における「VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された細胞」とは、機能的な（すなわち、アンカリングフィブリルを形成しうる）VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された細胞を意味する。
　本開示において、細胞の遺伝子改変とは、細胞のゲノムの遺伝子を改変することと、ゲノム外の核酸構築物（例えば、ベクター）から遺伝子を発現するよう細胞を改変することのいずれをも意味する。すなわち、「VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変する」との表現には、ゲノム中のCOL7A1遺伝子からVII型コラーゲンを発現するよう細胞を改変すること、およびゲノム外の核酸構築物のCOL7A1遺伝子からVII型コラーゲンを発現するよう細胞を改変することが含まれる。また、「VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された細胞」には、ゲノム中のCOL7A1遺伝子からVII型コラーゲンを発現する細胞と、ゲノム外の核酸構築物のCOL7A1遺伝子からVII型コラーゲンを発現する細胞とが含まれる。
　細胞の遺伝子改変は、COL7A1遺伝子を導入することにより、またはゲノムのCOL7A1遺伝子の変異を修正することにより、行うことができる。COL7A1遺伝子の導入は、細胞のゲノムにCOL7A1遺伝子を導入することによっても、ゲノム外の核酸構築物からCOL7A1遺伝子を発現するよう、COL7A1遺伝子を含む核酸構築物を細胞内に存在させることによっても、行うことができる。COL7A1遺伝子を細胞のゲノムに導入する場合、特定の位置に導入してもよく、ランダムに導入してもよい。ある実施形態において、COL7A1遺伝子は、ゲノムのCOL7A1遺伝子座、またはAAVS1領域のようなセーフ・ハーバーに導入される。
　DEB患者水疱由来細胞は、その細胞が投与される栄養障害型表皮水疱症患者の細胞（すなわち、自家細胞）であっても、その細胞の投与を受ける患者とは別の栄養障害型表皮水疱症患者の細胞（すなわち、他家細胞）であってよい。栄養障害型表皮水疱症患者の細胞には、VII型コラーゲンを産生しない細胞と、VII型コラーゲンを産生するが変異によりその機能が低下している細胞とがあるが、本開示における「栄養障害型表皮水疱症患者の細胞」は、そのいずれであってもよい。
　DEB患者水疱由来細胞は、患者に投与された場合に表皮基底膜近傍でVII型コラーゲンを産生しうる細胞であればよい。
　本開示において、細胞は、必要に応じて増殖させたものを包含する意味で用いられる。細胞の増殖は、細胞を培養することによって行うことができる。例えば、「（栄養障害型表皮水疱症患者の）水疱由来細胞」は、患者から取得された後に増殖させたものを包含し、「遺伝子改変された細胞」は、遺伝子改変操作により得られた細胞を増殖させたものを包含する。遺伝子改変を行う場合、遺伝子改変に必要な量を得るまで、細胞を増殖させてもよい。また、遺伝子改変後に、治療に必要な量を得るまで、細胞を増殖させてもよい。
　本明細書において、「細胞」とは、文脈に応じて１個の細胞または複数個の細胞を意味しうる。また、細胞は、一種類の細胞からなる細胞集団であってもよく、複数種の細胞を含む細胞集団であってもよい。
　本明細書において、COL7A1遺伝子とは、VII型コラーゲンをコードする核酸配列を意味し、cDNAも、１以上のイントロンを含む配列（例えば、ゲノム配列またはミニジーン）も包含する意味で用いられる。ヒトCOL7A1遺伝子（cDNA）の代表的核酸配列を配列番号１に、ヒトVII型コラーゲンの代表的アミノ酸配列を配列番号２に示す。COL7A1遺伝子のcDNA配列はGenBank: NM_000094.3に、ゲノム配列はGenBank: AC121252.4に開示されている。COL7A1遺伝子は、機能的な（すなわち、アンカリングフィブリルを形成しうる）VII型コラーゲンをコードするものであればよく、その配列は限定されない。

ヒトCOL7A1遺伝子のcDNA配列（8835 bp）（配列番号１）
ATGACGCTGCGGCTTCTGGTGGCCGCGCTCTGCGCCGGGATCCTGGCAGAGGCGCCCCGAGTGCGAGCCCAGCACAGGGAGAGAGTGACCTGCACGCGCCTTTACGCCGCTGACATTGTGTTCTTACTGGATGGCTCCTCATCCATTGGCCGCAGCAATTTCCGCGAGGTCCGCAGCTTTCTCGAAGGGCTGGTGCTGCCTTTCTCTGGAGCAGCCAGTGCACAGGGTGTGCGCTTTGCCACAGTGCAGTACAGCGATGATCCACGGACAGAGTTCGGCCTGGATGCACTTGGCTCTGGGGGTGATGTGATCCGCGCCATCCGTGAGCTTAGCTACAAGGGGGGCAACACTCGCACAGGGGCTGCAATTCTCCATGTGGCTGACCATGTCTTCCTGCCCCAGCTGGCCCGACCTGGTGTCCCCAAGGTCTGCATCCTGATCACAGACGGGAAGTCCCAGGACCTGGTGGACACAGCTGCCCAAAGGCTGAAGGGGCAGGGGGTCAAGCTATTTGCTGTGGGGATCAAGAATGCTGACCCTGAGGAGCTGAAGCGAGTTGCCTCACAGCCCACCAGTGACTTCTTCTTCTTCGTCAATGACTTCAGCATCTTGAGGACACTACTGCCCCTCGTTTCCCGGAGAGTGTGCACGACTGCTGGTGGCGTGCCTGTGACCCGACCTCCGGATGACTCGACCTCTGCTCCACGAGACCTGGTGCTGTCTGAGCCAAGCAGCCAATCCTTGAGAGTACAGTGGACAGCGGCCAGTGGCCCTGTGACTGGCTACAAGGTCCAGTACACTCCTCTGACGGGGCTGGGACAGCCACTGCCGAGTGAGCGGCAGGAGGTGAACGTCCCAGCTGGTGAGACCAGTGTGCGGCTGCGGGGTCTCCGGCCACTGACCGAGTACCAAGTGACTGTGATTGCCCTCTACGCCAACAGCATCGGGGAGGCTGTGAGCGGGACAGCTCGGACCACTGCCCTAGAAGGGCCGGAACTGACCATCCAGAATACCACAGCCCACAGCCTCCTGGTGGCCTGGCGGAGTGTGCCAGGTGCCACTGGCTACCGTGTGACATGGCGGGTCCTCAGTGGTGGGCCCACACAGCAGCAGGAGCTGGGCCCTGGGCAGGGTTCAGTGTTGCTGCGTGACTTGGAGCCTGGCACGGACTATGAGGTGACCGTGAGCACCCTATTTGGCCGCAGTGTGGGGCCCGCCACTTCCCTGATGGCTCGCACTGACGCTTCTGTTGAGCAGACCCTGCGCCCGGTCATCCTGGGCCCCACATCCATCCTCCTTTCCTGGAACTTGGTGCCTGAGGCCCGTGGCTACCGGTTGGAATGGCGGCGTGAGACTGGCTTGGAGCCACCGCAGAAGGTGGTACTGCCCTCTGATGTGACCCGCTACCAGTTGGATGGGCTGCAGCCGGGCACTGAGTACCGCCTCACACTCTACACTCTGCTGGAGGGCCACGAGGTGGCCACCCCTGCAACCGTGGTTCCCACTGGACCAGAGCTGCCTGTGAGCCCTGTAACAGACCTGCAAGCCACCGAGCTGCCCGGGCAGCGGGTGCGAGTGTCCTGGAGCCCAGTCCCTGGTGCCACCCAGTACCGCATCATTGTGCGCAGCACCCAGGGGGTTGAGCGGACCCTGGTGCTTCCTGGGAGTCAGACAGCATTCGACTTGGATGACGTTCAGGCTGGGCTTAGCTACACTGTGCGGGTGTCTGCTCGAGTGGGTCCCCGTGAGGGCAGTGCCAGTGTCCTCACTGTCCGCCGGGAGCCGGAAACTCCACTTGCTGTTCCAGGGCTGCGGGTTGTGGTGTCAGATGCAACGCGAGTGAGGGTGGCCTGGGGACCCGTCCCTGGAGCCAGTGGATTTCGGATTAGCTGGAGCACAGGCAGTGGTCCGGAGTCCAGCCAGACACTGCCCCCAGACTCTACTGCCACAGACATCACAGGGCTGCAGCCTGGAACCACCTACCAGGTGGCTGTGTCGGTACTGCGAGGCAGAGAGGAGGGCCCTGCTGCAGTCATCGTGGCTCGAACGGACCCACTGGGCCCAGTGAGGACGGTCCATGTGACTCAGGCCAGCAGCTCATCTGTCACCATTACCTGGACCAGGGTTCCTGGCGCCACAGGATACAGGGTTTCCTGGCACTCAGCCCACGGCCCAGAGAAATCCCAGTTGGTTTCTGGGGAGGCCACGGTGGCTGAGCTGGATGGACTGGAGCCAGATACTGAGTATACGGTGCATGTGAGGGCCCATGTGGCTGGCGTGGATGGGCCCCCTGCCTCTGTGGTTGTGAGGACTGCCCCTGAGCCTGTGGGTCGTGTGTCGAGGCTGCAGATCCTCAATGCTTCCAGCGACGTTCTACGGATCACCTGGGTAGGGGTCACTGGAGCCACAGCTTACAGACTGGCCTGGGGCCGGAGTGAAGGCGGCCCCATGAGGCACCAGATACTCCCAGGAAACACAGACTCTGCAGAGATCCGGGGTCTCGAAGGTGGAGTCAGCTACTCAGTGCGAGTGACTGCACTTGTCGGGGACCGCGAGGGCACACCTGTCTCCATTGTTGTCACTACGCCGCCTGAGGCTCCGCCAGCCCTGGGGACGCTTCACGTGGTGCAGCGCGGGGAGCACTCGCTGAGGCTGCGCTGGGAGCCGGTGCCCAGAGCGCAGGGCTTCCTTCTGCACTGGCAACCTGAGGGTGGCCAGGAACAGTCCCGGGTCCTGGGGCCCGAGCTCAGCAGCTATCACCTGGACGGGCTGGAGCCAGCGACACAGTACCGCGTGAGGCTGAGTGTCCTAGGGCCAGCTGGAGAAGGGCCCTCTGCAGAGGTGACTGCGCGCACTGAGTCACCTCGTGTTCCAAGCATTGAACTACGTGTGGTGGACACCTCGATCGACTCGGTGACTTTGGCCTGGACTCCAGTGTCCAGGGCATCCAGCTACATCCTATCCTGGCGGCCACTCAGAGGCCCTGGCCAGGAAGTGCCTGGGTCCCCGCAGACACTTCCAGGGATCTCAAGCTCCCAGCGGGTGACAGGGCTAGAGCCTGGCGTCTCTTACATCTTCTCCCTGACGCCTGTCCTGGATGGTGTGCGGGGTCCTGAGGCATCTGTCACACAGACGCCAGTGTGCCCCCGTGGCCTGGCGGATGTGGTGTTCCTACCACATGCCACTCAAGACAATGCTCACCGTGCGGAGGCTACGAGGAGGGTCCTGGAGCGTCTGGTGTTGGCACTTGGGCCTCTTGGGCCACAGGCAGTTCAGGTTGGCCTGCTGTCTTACAGTCATCGGCCCTCCCCACTGTTCCCACTGAATGGCTCCCATGACCTTGGCATTATCTTGCAAAGGATCCGTGACATGCCCTACATGGACCCAAGTGGGAACAACCTGGGCACAGCCGTGGTCACAGCTCACAGATACATGTTGGCACCAGATGCTCCTGGGCGCCGCCAGCACGTACCAGGGGTGATGGTTCTGCTAGTGGATGAACCCTTGAGAGGTGACATATTCAGCCCCATCCGTGAGGCCCAGGCTTCTGGGCTTAATGTGGTGATGTTGGGAATGGCTGGAGCGGACCCAGAGCAGCTGCGTCGCTTGGCGCCGGGTATGGACTCTGTCCAGACCTTCTTCGCCGTGGATGATGGGCCAAGCCTGGACCAGGCAGTCAGTGGTCTGGCCACAGCCCTGTGTCAGGCATCCTTCACTACTCAGCCCCGGCCAGAGCCCTGCCCAGTGTATTGTCCAAAGGGCCAGAAGGGGGAACCTGGAGAGATGGGCCTGAGAGGACAAGTTGGGCCTCCTGGCGACCCTGGCCTCCCGGGCAGGACCGGTGCTCCCGGCCCCCAGGGGCCCCCTGGAAGTGCCACTGCCAAGGGCGAGAGGGGCTTCCCTGGAGCAGATGGGCGTCCAGGCAGCCCTGGCCGCGCCGGGAATCCTGGGACCCCTGGAGCCCCTGGCCTAAAGGGCTCTCCAGGGTTGCCTGGCCCTCGTGGGGACCCGGGAGAGCGAGGACCTCGAGGCCCAAAGGGGGAGCCGGGGGCTCCCGGACAAGTCATCGGAGGTGAAGGACCTGGGCTTCCTGGGCGGAAAGGGGACCCTGGACCATCGGGCCCCCCTGGACCTCGTGGACCACTGGGGGACCCAGGACCCCGTGGCCCCCCAGGGCTTCCTGGAACAGCCATGAAGGGTGACAAAGGCGATCGTGGGGAGCGGGGTCCCCCTGGACCAGGTGAAGGTGGCATTGCTCCTGGGGAGCCTGGGCTGCCGGGTCTTCCCGGAAGCCCTGGACCCCAAGGCCCCGTTGGCCCCCCTGGAAAGAAAGGAGAAAAAGGTGACTCTGAGGATGGAGCTCCAGGCCTCCCAGGACAACCTGGGTCTCCGGGTGAGCAGGGCCCACGGGGACCTCCTGGAGCTATTGGCCCCAAAGGTGACCGGGGCTTTCCAGGGCCCCTGGGTGAGGCTGGAGAGAAGGGCGAACGTGGACCCCCAGGCCCAGCGGGATCCCGGGGGCTGCCAGGGGTTGCTGGACGTCCTGGAGCCAAGGGTCCTGAAGGGCCACCAGGACCCACTGGCCGCCAAGGAGAGAAGGGGGAGCCTGGTCGCCCTGGGGACCCTGCAGTGGTGGGACCTGCTGTTGCTGGACCCAAAGGAGAAAAGGGAGATGTGGGGCCCGCTGGGCCCAGAGGAGCTACCGGAGTCCAAGGGGAACGGGGCCCACCCGGCTTGGTTCTTCCTGGAGACCCTGGCCCCAAGGGAGACCCTGGAGACCGGGGTCCCATTGGCCTTACTGGCAGAGCAGGACCCCCAGGTGACTCAGGGCCTCCTGGAGAGAAGGGAGACCCTGGGCGGCCTGGCCCCCCAGGACCTGTTGGCCCCCGAGGACGAGATGGTGAAGTTGGAGAGAAAGGTGACGAGGGTCCTCCGGGTGACCCGGGTTTGCCTGGAAAAGCAGGCGAGCGTGGCCTTCGGGGGGCACCTGGAGTTCGGGG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ヒトVII型コラーゲンのアミノ酸配列（2944 AA）（配列番号２）
MTLRLLVAALCAGILAEAPRVRAQHRERVTCTRLYAADIVFLLDGSSSIGRSNFREVRSFLEGLVLPFSGAASAQGVRFATVQYSDDPRTEFGLDALGSGGDVIRAIRELSYKGGNTRTGAAILHVADHVFLPQLARPGVPKVCILITDGKSQDLVDTAAQRLKGQGVKLFAVGIKNADPEELKRVASQPTSDFFFFVNDFSILRTLLPLVSRRVCTTAGGVPVTRPPDDSTSAPRDLVLSEPSSQSLRVQWTAASGPVTGYKVQYTPLTGLGQPLPSERQEVNVPAGETSVRLRGLRPLTEYQVTVIALYANSIGEAVSGTARTTALEGPELTIQNTTAHSLLVAWRSVPGATGYRVTWRVLSGGPTQQQELGPGQGSVLLRDLEPGTDYEVTVSTLFGRSVGPATSLMARTDASVEQTLRPVILGPTSILLSWNLVPEARGYRLEWRRETGLEPPQKVVLPSDVTRYQLDGLQPGTEYRLTLYTLLEGHEVATPATVVPTGPELPVSPVTDLQATELPGQRVRVSWSPVPGATQYRIIVRSTQGVERTLVLPGSQTAFDLDDVQAGLSYTVRVSARVGPREGSASVLTVRREPETPLAVPGLRVVVSDATRVRVAWGPVPGASGFRISWSTGSGPESSQTLPPDSTATDITGLQPGTTYQVAVSVLRGREEGPAAVIVARTDPLGPVRTVHVTQASSSSVTITWTRVPGATGYRVSWHSAHGPEKSQLVSGEATVAELDGLEPDTEYTVHVRAHVAGVDGPPASVVVRTAPEPVGRVSRLQILNASSDVLRITWVGVTGATAYRLAWGRSEGGPMRHQILPGNTDSAEIRGLEGGVSYSVRVTALVGDREGTPVSIVVTTPPEAPPALGTLHVVQRGEHSLRLRWEPVPRAQGFLLHWQPEGGQEQSRVLGPELSSYHLDGLEPATQYRVRLSVLGPAGEGPSAEVTARTESPRVPSIELRVVDTSIDSVTLAWTPVSRASSYILSWRPLRGPGQEVPGSPQTLPGISSSQRVTGLEPGVSYIFSLTPVLDGVRGPEASVTQTPVCPRGLADVVFLPHATQDNAHRAEATRRVLERLVLALGPLGPQAVQVGLLSYSHRPSPLFPLNGSHDLGIILQRIRDMPYMDPSGNNLGTAVVTAHRYMLAPDAPGRRQHVPGVMVLLVDEPLRGDIFSPIREAQASGLNVVMLGMAGADPEQLRRLAPGMDSVQTFFAVDDGPSLDQAVSGLATALCQASFTTQPRPEPCPVYCPKGQKGEPGEMGLRGQVGPPGDPGLPGRTGAPGPQGPPGSATAKGERGFPGADGRPGSPGRAGNPGTPGAPGLKGSPGLPGPRGDPGERGPRGPKGEPGAPGQVIGGEGPGLPGRKGDPGPSGPPGPRGPLGDPGPRGPPGLPGTAMKGDKGDRGERGPPGPGEGGIAPGEPGLPGLPGSPGPQGPVGPPGKKGEKGDSEDGAPGLPGQPGSPGEQGPRGPPGAIGPKGDRGFPGPLGEAGEKGERGPPGPAGSRGLPGVAGRPGAKGPEGPPGPTGRQGEKGEPGRPGDPAVVGPAVAGPKGEKGDVGPAGPRGATGVQGERGPPGLVLPGDPGPKGDPGDRGPIGLTGRAGPPGDSGPPGEKGDPGRPGPPGPVGPRGRDGEVGEKGDEGPPGDPGLPGKAGERGLRGAPGVRGPVGEKGDQGDPGEDGRNGSPGSSGPKGDRGEPGPPGPPGRLVDTGPGAREKGEPGDRGQEGPRGPKGDPGLPGAPGERGIEGFRGPPGPQGDPGVRGPAGEKGDRGPPGLDGRSGLDGKPGAAGPSGPNGAAGKAGDPGRDGLPGLRGEQGLPGPSGPPGLPGKPGEDGKPGLNGKNGEPGDPGEDGRKGEKGDSGASGREGRDGPKGERGAPGILGPQGPPGLPGPVGPPGQGFPGVPGGTGPKGDRGETGSKGEQGLPGERGLRGEPGSVPNVDRLLETAGIKASALREIVETWDESSGSFLPVPERRRGPKGDSGEQGPPGKEGPIGFPGERGLKGDRGDPGPQGPPGLALGERGPPGPSGLAGEPGKPGIPGLPGRAGGVGEAGRPGERGERGEKGERGEQGRDGPPGLPGTPGPPGPPGPKVSVDEPGPGLSGEQGPPGLKGAKGEPGSNGDQGPKGDRGVPGIKGDRGEPGPRGQDGNPGLPGERGMAGPEGKPGLQGPRGPPGPVGGHGDPGPPGAPGLAGPAGPQGPSGLKGEPGETGPPGRGLTGPTGAVGLPGPPGPSGLVGPQGSPGLPGQVGETGKPGAPGRDGASGKDGDRGSPGVPGSPGLPGPVGPKGEPGPTGAPGQAVVGLPGAKGEKGAPGGLAGDLVGEPGAKGDRGLPGPRGEKGEAGRAGEPGDPGEDGQKGAPGPKGFKGDPGVGVPGSPGPPGPPGVKGDLGLPGLPGAPGVVGFPGQTGPRGEMGQPGPSGERGLAGPPGREGIPGPLGPPGPPGSVGPPGASGLKGDKGDPGVGLPGPRGERGEPGIRGEDGRPGQEGPRGLTGPPGSRGERGEKGDVGSAGLKGDKGDSAVILGPPGPRGAKGDMGERGPRGLDGDKGPRGDNGDPGDKGSKGEPGDKGSAGLPGLRGLLGPQGQPGAAGIPGDPGSPGKDGVPGIRGEKGDVGFMGPRGLKGERGVKGACGLDGEKGDKGEAGPPGRPGLAGHKGEMGEPGVPGQSGAPGKEGLIGPKGDRGFDGQPGPKGDQGEKGERGTPGIGGFPGPSGNDGSAGPPGPPGSVGPRGPEGLQGQKGERGPPGERVVGAPGVPGAPGERGEQGRPGPAGPRGEKGEAALTEDDIRGFVRQEMSQHCACQGQFIASGSRPLPSYAADTAGSQLHAVPVLRVSHAEEEERVPPEDDEYSEYSEYSVEEYQDPEAPWDSDDPCSLPLDEGSCTAYTLRWYHRAVTGSTEACHPFVYGGCGGNANRFGTREACERRCPPRVVQSQGTGTAQD*
　ある実施形態において、COL7A1遺伝子は、配列番号１の核酸配列と70%、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有する核酸配列を含むか、前記核酸配列からなる。別の実施形態において、COL7A1遺伝子は、配列番号１の核酸配列において1～30個、1～20個、1～10個、1～5個、1～3個、1～2個または1個の塩基が挿入、欠失、置換、または付加された核酸配列を含むか、前記核酸配列からなる。さらなる実施形態において、COL7A1遺伝子は、配列番号１の核酸配列を含むか、配列番号１の核酸配列からなる。
　ある実施形態において、VII型コラーゲンは、配列番号２のアミノ酸配列と70%、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、前記アミノ酸配列からなる。別の実施形態において、VII型コラーゲンは、配列番号２のアミノ酸配列において1～30個、1～20個、1～10個、1～5個、1～3個、1～2個または1個のアミノ酸残基が挿入、欠失、置換、または付加されたアミノ酸配列を含むか、前記アミノ酸配列からなる。さらなる実施形態において、VII型コラーゲンは、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、配列番号２のアミノ酸配列からなる。
　ある実施形態において、COL7A1遺伝子は、配列番号２のアミノ酸配列と70%、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含むか、前記核酸配列からなる。別の実施形態において、COL7A1遺伝子は、配列番号２のアミノ酸配列において1～30個、1～20個、1～10個、1～5個、1～3個、1～2個または1個のアミノ酸残基が挿入、欠失、置換、または付加されたアミノ酸配列をコードする核酸配列を含むか、前記核酸配列からなる。
　本明細書における、核酸配列またはアミノ酸配列に関する「配列同一性」とは、比較対象の配列の全領域にわたって最適な状態に（一致が最大となる状態に）アラインメントされた２つの配列間で一致する塩基またはアミノ酸残基の割合を意味する。ここで、比較対象の配列は、２つの配列の最適なアラインメントにおいて、挿入、付加または欠失（例えばギャップ等）を有していてもよい。配列同一性は、公共のデータベース（例えば、DDBJ（http://www.ddbj.nig.ac.jp））で提供されるFASTA、BLAST、CLUSTAL W等のプログラムを用いて算出することができる。あるいは、市販の配列解析ソフトウェア（例えば、Vector NTI（登録商標）ソフトウェア、GENETYX（登録商標） ver. 12）を用いて求めることもできる。
　細胞を遺伝子改変する方法は、特に限定されない。ある実施形態において、細胞は、CRISPRシステム（例えば、CRISPR/Cas9、CRISPR/Cpf1）、TALEN、ZFNなどのゲノム編集により、遺伝子改変される。別の実施形態において、細胞は、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクターなどのウイルスベクターにより、遺伝子改変される。さらなる実施形態において、細胞は、CRISPR/Cas9により遺伝子改変される。さらなる実施形態において、細胞は、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターにより遺伝子改変される。
　ゲノム編集による場合、ゲノムに切断を生じさせるとともに、目的の配列を含むドナーベクターを細胞に導入することにより、当該配列をゲノムの切断部位に挿入することができる。ゲノムに挿入する配列は、COL7A1遺伝子、またはCOL7A1遺伝子の変異を含む部位と置換するための配列（例えば、COL7A1遺伝子の部分配列）でありうる。ドナーベクターは、目的の配列に加えて、目的の配列の発現を制御するプロモーターやエンハンサーなどの調節配列や細胞選択のための薬剤耐性遺伝子などの他の要素を含んでよく、その両端にゲノムの挿入部位の両端に相同な配列を含んでもよい。ドナーベクターは、非相同性末端結合または相同組み換えにより、所望の部位に導入されうる。ドナーベクターとしては、プラスミドや、アデノ随伴ウイルスベクター、インテグラーゼ欠損型レンチウイルスベクターなどのウイルスベクターを使用することができる。
　CRISPRシステムでは、Cas9またはCas12（例えば、Cas12a（Cpf1ともいう）、Cas12b、Cas12e）などのエンドヌクレアーゼが、特定の塩基配列であるPAM配列を認識し、エンドヌクレアーゼの作用によって標的DNAの二本鎖を切断する。エンドヌクレアーゼがCas9であれば、PAM配列の約3-4塩基上流を切断する。エンドヌクレアーゼとしては、S. pyogenes、S. aureus、N. meningitidis、S. thermophilus、またはT. denticolaのCas9、L. bacterium ND2006またはAcidaminococcus sp. BV3L6のCpflなどが挙げられる。PAM配列はエンドヌクレアーゼに依存し、例えば、S. pyogenesのCas9のPAM配列はNGGである。gRNAは、PAM配列の上流約20塩基の配列（標的配列）またはこれに相補的な配列を5’末端側に含み、標的配列にエンドヌクレアーゼを動員する役割を果たす。gRNAのうち、標的配列（またはこれに相補的な配列）以外の部分の配列は、使用するエンドヌクレアーゼに応じて当業者が適宜決定しうる。gRNAは、標的配列またはそれに相補的な配列を含みgRNAの配列特異性を担うcrRNA（CRISPR RNA）と、二本鎖を形成してCas9との複合体形成に寄与するtracrRNA（Trans-activating crRNA）とを含み得る。crRNAとtracrRNAとは、別の分子として存在してもよい。エンドヌクレアーゼがCpf1の場合、crRNAのみでgRNAとして機能する。本明細書において、gRNAの機能に必要な要素を一本鎖上に含むgRNAを特にsgRNAと記載する場合がある。gRNAの配列は、CRISPRdirect (https://crispr.dbcls.jp/)など、標的配列の選択およびgRNAの設計に利用可能なツールにより決定することができる。
　細胞に、gRNAをコードする核酸配列とエンドヌクレアーゼをコードする核酸配列とを含むベクターを導入し発現させてもよく、細胞外で作製したgRNAとエンドヌクレアーゼのタンパク質とを細胞に導入してもよい。なお、エンドヌクレアーゼは核移行シグナルを備えていてもよい。gRNAをコードする核酸配列とエンドヌクレアーゼをコードする核酸配列とは、別のベクター上に存在してもよい。ベクター、gRNA、およびエンドヌクレアーゼは、リポフェクション、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、リン酸カルシウム法、DEAE-デキストラン法などにより細胞に導入することができるが、これらの方法に限定されない。
　ある実施形態において、COL7A1遺伝子のゲノムへの導入に用いることができるgRNAは、配列番号３～５のいずれかの配列またはこれに相補的な配列を含む。
　ウイルスベクターによる場合、インテグラーゼ活性を有するレトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターを用いると、COL7A1遺伝子を細胞のゲノムに導入することができる。レトロウイルスベクターおよびレンチウイルスベクターは、インテグラーゼ欠損型であってもよい。インテグラーゼ欠損型ベクターは、例えば、インテグラーゼ遺伝子の変異によりインテグラーゼ活性を欠く。インテグラーゼ欠損型ベクターや、アデノウイルスベクターまたはアデノ随伴ウイルスベクターを用いると、通常、ベクターに組み込まれた配列は細胞のゲノムに導入されない。例えば、インテグラーゼ欠損型レンチウイルスベクターや、アデノウイルスベクターにCOL7A1遺伝子を組み込んだ場合は、細胞内(核内)に存在するベクターのCOL7A1遺伝子からVII型コラーゲンが発現される。
　ウイルスベクターは、COL7A1遺伝子をコードする配列を含み、COL7A1遺伝子の発現を制御するプロモーターやエンハンサーなどの調節配列や細胞選択のための薬剤耐性遺伝子などの他の要素を含んでよい。ウイルスベクターは、当業界に知られるいずれの方法で作製してもよい。例えば、レトロウイルスベクターおよびレンチウイルスベクターは、両端のLTR配列（5'LTRおよび3'LTR）、パッケージングシグナル、および目的の配列を含むウイルスベクタープラスミドを、Gag、Pol、Envなどのウイルスの構造タンパク質を発現する1以上のプラスミドベクターとともにパッケージング細胞に導入することにより、またはこれら構造タンパク質を発現するパッケージング細胞に導入することにより、作製することができる。パッケージング細胞としては、293T細胞、293細胞、HeLa細胞、COS1細胞、COS7細胞などが挙げられるが、これらに限定されない。ウイルスベクターは、シュードタイプ化されていてもよく、例えば、水疱性口内炎ウイルスGタンパク質（VSV-G）などのエンベロープタンパク質を発現してもよい。作製されたウイルスベクターを標的細胞に感染させることで、目的の配列を標的細胞に導入することができる。
　ある実施形態において、ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。レンチウイルスベクターとしては、HIV（human immunodeficiency virus）（例えば、HIV-1およびHIV-2)、SIV（simian immunodeficiency virus）、FIV（feline immunodeficiency virus）、MVV（Maedi-Visna virus）、EV1（Maedi-Visna-like virus）、EIAV（equine infectious anemia virus）、およびCAEV（caprine arthritis encephalitis virus）が挙げられるが、これらに限定されない。ある実施形態において、レンチウイルスベクターは、HIVである。
　一例として、レンチウイルスベクターは、下記のように製造することができる。まず、ウイルスゲノムをコードするウイルスベクタープラスミドと、Gag、Pol、およびRev（および場合によりTat）を発現する1以上のプラスミドベクターおよびVSV-Gなどのエンベロープタンパク質を発現する1以上のプラスミドベクターとを、パッケージング細胞に導入する。ウイルスベクタープラスミドは、両端のLTR配列（5'LTRおよび3'LTR）、パッケージングシグナル、並びにCOL7A1遺伝子およびその発現を制御するプロモーター（例えば、CMVプロモーター、CAGプロモーター、EF1αプロモーター、PGKプロモーター、またはhCEFプロモーター）を含む。5'LTRは、ウイルスRNAゲノムの転写を誘導するプロモーターとして機能するが、RNAゲノムの発現を高めるため、CMVプロモーターなどの別のプロモーターに置換されていてもよい。細胞内で、ベクタープラスミドからウイルスRNAゲノムが転写され、パッケージングされて、ウイルスコアが形成される。ウイルスコアは、パッケージング細胞の細胞膜に輸送され、細胞膜に封入されて、パッケージング細胞からウイルス粒子として放出される。放出されたウイルス粒子は、パッケージング細胞の培養上清から回収することができる。例えば、ウイルス粒子は、遠心分離、フィルターろ過、カラム精製などの通常の精製方法により、回収することができる。また、レンチウイルスベクターは、Lentiviral High Titer Packaging Mix、Lenti-XTM Packaging Single Shots （Takara Bio Inc.）、ViraSafeTM レンチウイルスコンプリート発現システム（Cell Biolabs Inc.）などのキットを用いて製造することができる。アデノ随伴ウイルスベクターは、AAVpro（登録商標） Helper Free System （Takara Bio Inc.）などのキットを用いて製造することができる。
　目的の配列が導入された細胞は、サザンブロッティングやPCRにより確認することができる。目的の配列は、対立遺伝子の少なくとも一方に導入されていればよい。
　本開示の組成物のある実施形態では、DEB患者水疱由来細胞が、組成物に含まれる細胞で最も多い細胞である。さらなる実施形態では、DEB患者水疱由来細胞が、組成物に含まれる細胞の、70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98または99％以上を占める。さらなる実施形態において、本開示の組成物は、実質的にDEB患者水疱由来細胞以外の細胞を含まない。「実質的にDEB患者水疱由来細胞以外の細胞を含まない」とは、本明細書に記載されるDEB患者水疱由来細胞の取得方法と実質的に同じ方法により得られた細胞のみを含むことを意味する。
　組成物に含まれる細胞の数は、所望の効果の発揮に必要な量（本明細書において、有効量とも称する）であり、当業者は、患者の年齢、体重、および病状、並びに細胞の種類および遺伝子改変方法などの因子を考慮して、適宜決定することができる。細胞数は、限定されないが、例えば、1細胞～1 × 107細胞、1 × 10細胞～1 × 107細胞、1 × 102細胞～1 × 107細胞、1 × 103細胞～1 × 107細胞、1 × 104細胞～1 × 107細胞、1 × 105細胞～1 × 107細胞、1 × 105細胞～5 × 106細胞、5 × 105細胞～1 × 106細胞、または1 × 105細胞～1 × 106細胞である。組成物は、細胞に加えて、医薬上許容される媒体および/または添加物を含んでもよい。医薬上許容される媒体としては、水、培地、生理食塩水、ブドウ糖、D-ソルビトール、またはD-マンニトールなどを含む輸液、リン酸緩衝生理食塩水（PBS）などが挙げられる。添加物としては、溶解補助剤、安定剤、防腐剤などが挙げられる。組成物の剤形は、特に限定されないが、非経口投与製剤、例えば注射剤である。注射剤には、溶液性注射剤、懸濁性注射剤、乳濁性注射剤、用時調製型注射剤が含まれる。組成物は、凍結されていてもよく、DMSO、グリセロール、ポリビニルピロリドン、ポリエチレングリコール、デキストラン、スクロースなどの凍結保護剤を含んでもよい。
　本開示の組成物は、全身に、または局所的に投与されうる。ある実施形態において、組成物は、栄養障害型表皮水疱症患者の患部に投与される。本明細書において、患部とは、水疱またはその近傍の領域を意味する。さらなる実施形態において、組成物は、水疱部分の皮内または水疱内に投与される。さらなる実施形態において、組成物は、水疱内に投与される。本明細書において、水疱内に投与するとは、水疱部分の表皮下の空間に投与することを意味する。水疱内への投与により、皮内または皮下への投与と比較して、患者の苦痛を軽減することができ、また、VII型コラーゲンを基底膜近傍にて良好に発現させることができる。一箇所あたりに投与される細胞の数は、所望の効果の発揮に必要な量（有効量）であり、当業者は、患者の年齢、体重、および病状、並びに細胞の種類および遺伝子改変方法などの因子を考慮して、適宜決定することができる。細胞数は、限定はされないが、例えば、1細胞～1 × 107細胞、1 × 10細胞～1 × 107細胞、1 × 102細胞～1 × 107細胞、1 × 103細胞～1 × 107細胞、1 × 104細胞～1 × 107細胞、1 × 105細胞～1 × 107細胞、1 × 105細胞～5 × 106細胞、5 × 105細胞～1 × 106細胞、または1 × 105細胞～1 × 106細胞である。ある実施形態では、水疱1つあたり、1細胞～1 × 107細胞、1 × 10細胞～1 × 107細胞、1 × 102細胞～1 × 107細胞、1 × 103細胞～1 × 107細胞、1 × 104細胞～1 × 107細胞、1 × 105細胞～1 × 107細胞、1 × 105細胞～5 × 106細胞、5 × 105細胞～1 × 106細胞、または1 × 105細胞～1 × 106細胞が投与される。水疱1つあたりの投与量は、水疱を円形近似した場合の直径が７～８ｍｍであるものを標準的な水疱とし、上記投与量を、その大きさに応じて調整してもよい。
　本発明の例示的な実施形態を以下に記載する。
［１］
　栄養障害型表皮水疱症の治療に用いるための組成物であって、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞を含む、組成物。
［２］
　水疱由来細胞が、COL7A1遺伝子を導入することにより遺伝子改変されている、前記１に記載の組成物。
［３］
　水疱由来細胞のゲノムにCOL7A1遺伝子が導入されている、前記２に記載の組成物。
［４］
　COL7A1遺伝子が、配列番号１の核酸配列と70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有する核酸配列を含むか、配列番号２のアミノ酸配列と70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、前記２または３に記載の組成物。
［５］
　水疱由来細胞が、以下の1)～6)から選択される１つ以上の特徴を有するものである、前記１～４のいずれかに記載の組成物：
　1)固相への接着性を有する、
　2)CD73、CD105およびCD90からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陽性である、
　3)CD45、CD34、CD11b、CD79A、HLA-DRおよびCD31からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陰性である、
　4)骨芽細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
　5)脂肪細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
　6)軟骨細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い。
［６］
　水疱由来細胞が、組成物に含まれる細胞で最も多い細胞である、前記１～５のいずれかに記載の組成物。
［７］
　水疱由来細胞が、組成物に含まれる細胞の70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98または99％以上を占める、前記１～６のいずれかに記載の組成物。
［８］
　組成物が、実質的に水疱由来細胞以外の細胞を含まない、前記１～７のいずれかに記載の組成物。
［９］
　患部に投与される、前記１～８のいずれかに記載の組成物。
［１０］
　水疱内に投与される、前記１～９のいずれかに記載の組成物。
［１１］
　ゲノム編集により水疱由来細胞が遺伝子改変されている、前記１～１０のいずれかに記載の組成物。
［１２］
　ゲノム編集が、CRISPR/Cas9による、前記１１に記載の組成物。
［１３］
　ウイルスベクターにより水疱由来細胞が遺伝子改変されている、前記１～１０のいずれかに記載の組成物。
［１４］
　ウイルスベクターが、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターである、前記１３に記載の組成物。
［１５］
　ウイルスベクターが、レンチウイルスベクターである、前記１３または１４に記載の組成物。
［１６］
　栄養障害型表皮水疱症の治療に使用するための組成物の製造方法であって、
　VII型コラーゲンを産生するよう栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞を遺伝子改変すること、および
　該遺伝子改変された水疱由来細胞を含む組成物を調製すること
　を含む方法。
［１７］
　栄養障害型表皮水疱症を治療するための方法であって、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞を含む組成物を前記患者に投与することを含む方法。
［１８］
　水疱由来細胞が、COL7A1遺伝子を導入することにより遺伝子改変されている、前記１７に記載の方法。
［１９］
　水疱由来細胞のゲノムにCOL7A1遺伝子が導入されている、前記１８に記載の方法。
［２０］
　COL7A1遺伝子が、配列番号１の核酸配列と70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有する核酸配列を含むか、配列番号２のアミノ酸配列と70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、前記１８または１９に記載の方法。
［２１］
　ゲノム編集により水疱由来細胞が遺伝子改変されている、前記１７～２０のいずれかに記載の方法。
［２２］
　ゲノム編集が、CRISPR/Cas9による、前記２１に記載の方法。
［２３］
　ウイルスベクターにより水疱由来細胞が遺伝子改変されている、前記１７～２０のいずれかに記載の方法。
［２４］
　ウイルスベクターが、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターである、前記２３に記載の方法。
［２５］
　ウイルスベクターが、レンチウイルスベクターである、前記２３または２４に記載の方法。
［２６］
　患者への投与に先立ち、VII型コラーゲンを産生するよう水疱由来細胞を遺伝子改変することをさらに含む、前記１７～２５のいずれかに記載の方法。
［２７］
　COL7A1遺伝子を導入することにより水疱由来細胞を遺伝子改変する、前記１６または２６に記載の方法。
［２８］
　水疱由来細胞のゲノムにCOL7A1遺伝子を導入する、前記２７に記載の方法。
［２９］
　COL7A1遺伝子が、配列番号１の核酸配列と70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有する核酸配列を含むか、配列番号２のアミノ酸配列と70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、前記２７または２８に記載の方法。
［３０］
　ゲノム編集により水疱由来細胞を遺伝子改変する、前記１６および２６～２９のいずれかに記載の方法。
［３１］
　ゲノム編集が、CRISPR/Cas9による、前記３０に記載の方法。
［３２］
　ウイルスベクターにより水疱由来細胞を遺伝子改変する、前記１６および２６～２９のいずれかに記載の方法。
［３３］
　ウイルスベクターが、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターである、前記３２に記載の方法。
［３４］
　ウイルスベクターが、レンチウイルスベクターである、前記３２または３３に記載の方法。
［３５］
　遺伝子改変に先立ち、栄養障害型表皮水疱症患者の水疱から細胞を得ることをさらに含む、前記１６および２６～３４のいずれかに記載の方法。
［３６］
　水疱由来細胞が、組成物に含まれる細胞で最も多い細胞である、前記１６～３５のいずれかに記載の方法。
［３７］
　水疱由来細胞が、組成物に含まれる細胞の70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98または99％以上を占める、前記１６～３６のいずれかに記載の方法。
［３８］
　組成物が、実質的に水疱由来細胞以外の細胞を含まない、前記１６～３７のいずれかに記載の方法。
［３９］
　組成物が、患部に投与される、前記１７～３８のいずれかに記載の方法。
［４０］
　組成物が、水疱内に投与される、前記１７～３９のいずれかに記載の方法。
［４１］
　栄養障害型表皮水疱症を治療するための医薬の製造のための、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞を含む組成物の使用。
［４２］
　組成物が水疱内に投与されるものである、前記４１に記載の使用。
［４３］
　栄養障害型表皮水疱症を治療するための、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞を含む組成物の使用。
［４４］
　組成物が水疱内に投与されるものである、前記４３に記載の使用。
［４５］
　栄養障害型表皮水疱症の治療における使用のための、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞。
［４６］
　水疱内に投与されるものである、前記４５に記載の細胞。
［４７］
　配列番号３～５のいずれかの配列またはこれに相補的な配列を含む、gRNA。
［４８］
　前記４７のgRNAをコードする核酸配列を含むベクター。
［４９］
　栄養障害型表皮水疱症患者の水疱内容物を固相上で培養する工程を含む、細胞の製造方法。
［５０］
　前記４９に記載の方法によって製造される細胞。
［５１］
　以下の1)～6)から選択される１つ以上の特徴を有する、前記５０に記載の細胞：
　1)固相への接着性を有する、
　2)CD73、CD105およびCD90からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陽性である、
　3)CD45、CD34、CD11b、CD79A、HLA-DRおよびCD31からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陰性である、
　4)骨芽細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
　5)脂肪細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
　6)軟骨細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い。
［５２］
　以下の工程を含む、細胞の製造方法：
1)栄養障害型表皮水疱症患者の水疱内容物を固相上で培養する工程、
2)培養工程1)によって得られた細胞を、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変する工程。
［５３］
　前記５２に記載の方法によって製造される細胞。
［５４］
　VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された、栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞。
［５５］
　COL7A1遺伝子を導入することにより遺伝子改変されている、前記５３または５４に記載の細胞。
［５６］
　細胞のゲノムにCOL7A1遺伝子が導入されている、前記５５に記載の細胞。
［５７］
　COL7A1遺伝子が、配列番号１の核酸配列と70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有する核酸配列を含むか、配列番号２のアミノ酸配列と70％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％または99％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、前記５６に記載の細胞。
［５８］
　ゲノム編集により遺伝子改変されている、前記５３～５７のいずれかに記載の細胞。
［５９］
　ゲノム編集が、CRISPR/Cas9による、前記５８に記載の細胞。
［６０］
　ウイルスベクターにより遺伝子改変されている、前記５３～５７のいずれかに記載の細胞。
［６１］
　ウイルスベクターが、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターである、前記６０に記載の細胞。
［６２］
　ウイルスベクターが、レンチウイルスベクターである、前記６０または６１に記載の細胞。
［６３］
　以下の1)～6)から選択される１つ以上の特徴を有する、前記５３～６２のいずれかに記載の細胞：
　1)固相への接着性を有する、
　2)CD73、CD105およびCD90からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陽性である、
　3)CD45、CD34、CD11b、CD79A、HLA-DRおよびCD31からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陰性である、
　4)骨芽細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
　5)脂肪細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
　6)軟骨細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い。
　以下、実施例により本発明をさらに詳細に説明するが、本発明は以下に記載される態様に限定されるものではない。
1. 水疱由来細胞の取得
　栄養障害型表皮水疱症患者の水疱内容液を採取し、300gで 5分遠心した。得られた沈殿を培地（Mesenchymal Stem Cell Growth Medium 2 (PromoCell社、C-28009)にペニシリンおよびストレプトマイシンをそれぞれ終濃度100unit/mLおよび100μg/mLとなるよう添加したもの）で懸濁してコラーゲンIコート 6-well plateに播種し、37℃、5%CO2で培養することにより、付着性の細胞を得た。その後、適宜培地交換と継代を行って所望の細胞数まで増殖させた（培養開始20日後までの培養経過を図１に示す）。かかる方法によって得た細胞を、以下において「水疱由来細胞」とも称する。下記表面マーカー解析と分化誘導の実験には３継代目の細胞、遺伝子導入には３～４継代目の細胞をそれぞれ用いた。また、上記の培地に代えてMesenchymal Stem Cell Growth Medium 2 (PromoCell社、C-28009)とMSCGM Mesenchymal Stem Cell Growth Medium（Lonza社、PT-3001）の等量混合培地や、Cellartis MSC Xeno-Free Culture Medium (タカラバイオ社、Y50200)を用いた場合でも同等の水疱由来細胞が得られることを確認した。
2. 水疱由来細胞の特徴決定
a) 表面マーカー解析（FACS）
　上記1.で得られた水疱由来細胞と、ヒト骨髄由来間葉系幹細胞（以下、BM-MSCとも称する）[PromoCell社 (Heidelberg, Germany) または Lonza社 (Basel, Switzerland)より購入]について、以下の手順で表面マーカー解析を行った：　細胞をAccutase-Solution (PromoCell社、C-41310)を用いてプレートから剥がし、培地で洗浄した後、細胞数の計測結果を基に、2本のチューブに細胞を10万個ずつ分取した。細胞をFlow Cytometry Staining Buffer (1X) (R&D Systems社、FC001)で1回洗浄し、100μlのFlow Cytometry Staining Buffer (1X)に再懸濁した。Fc受容体のブロッキングを行うため、Human TruStain FcXTM (BioLegend社、422301)を5μl加えて、氷上で10分間反応させた。1本のチューブには、Human Mesenchymal Stem Cell Verification Flow Kit (R&D Systems社、FMC020)に含まれるCD73-CFS Mouse IgG2B、CD90-APC Mouse IgG2A、およびNegative Marker Cocktail（CD45-PE Mouse IgG1、CD34-PE Mouse IgG1、CD11b-PE Mouse IgG2B、CD79A-PE Mouse IgG1、HLA-DR-PE Mouse IgG1）をそれぞれ10μlずつ加え、さらにBrilliant Violet 421TM anti-human CD105 Antibody (BioLegend社、323219)を5μl加えて、室温・遮光下で30分間反応させた。もう1本のチューブは陰性コントロールとして使用するため、それぞれのアイソタイプコントロール抗体を同量加えて、室温・遮光下で30分間反応させた。細胞を2mlのFlow Cytometry Staining Buffer (1X)で1回洗浄し、300μlのFlow Cytometry Staining Buffer (1X)に再懸濁した後、BD FACSAria(BD社)で解析した。また、CD31についても以下の手順でFACS解析を行い、水疱由来細胞およびヒトBM-MSCにおける発現有無を確認した：細胞をAccutase-Solution (PromoCell社、C-41310)を用いてプレートから剥がし、培地で洗浄した後、細胞数の計測結果を基に、2本のチューブに細胞を10万個ずつ分取した。細胞を2%FBS含有PBSで洗浄し、100μlの2%FBS含有PBSに再懸濁した。Fc受容体のブロッキングを行うため、Human TruStain FcXTM (BioLegend社, 422301)を5μl加えて、氷上で10分間反応させた。1本のチューブには、APC anti-human CD31 Antibody (BioLegend社, 303116)を5μl(タンパク質量0.4μg)加えて、氷上・遮光下で60分間反応させた。もう1本のチューブは陰性コントロールとして使用するため、APC Mouse IgG1, κ Isotype Ctrl Antibody (BioLegend社, 400120)を2μl(タンパク質量0.4μg)加えて、氷上・遮光下で60分間反応させた。細胞を2mlの2%FBS含有PBSで1回洗浄した後、300μlの2%FBS含有PBSに再懸濁し、BD FACSAria(BD社)で解析した。
　FACS解析の結果、水疱由来細胞とBM-MSCはいずれも、CD73、CD105およびCD90が陽性であり、CD45、CD34、CD11b、CD79A、HLA-DRおよびCD31が陰性であった（図２）。
b) 分化誘導（骨芽細胞、脂肪細胞および軟骨細胞）
　上記1.で得られた水疱由来細胞とBM-MSCについて、下記の条件で骨芽細胞、脂肪細胞および軟骨細胞への分化誘導を行った。

骨芽細胞への分化誘導：
　細胞を、0.1μM Dexamethasone、0.2mM Ascorbic acid 2-phosphate、10mM Glycerol 2-phosphate（数値はいずれも終濃度）を含む培地で、37℃、5%CO2の条件下、3週間培養（週2回培地交換）して骨芽細胞への分化を誘導した。TRACP & ALP Assay Kit (タカラバイオ社, MK301)を製品マニュアル通りに用いて、アルカリホスファターゼ（ALP）染色を行った。

脂肪細胞への分化誘導：
　細胞を、1μM Dexamethasone、0.5mM 3-Isobutyl-1-methylanxthine (IBMX)、10μg/mL Insulin、100μM Indomethacin（数値はいずれも終濃度）を含む培地で、37℃、5%CO2の条件下、3週間培養（週2回培地交換）して脂肪細胞への分化を誘導した。リピットアッセイキット（コスモ・バイオ社、AK09F）を製品マニュアル通りに用いて、細胞のオイルレッドO染色を行った。

軟骨細胞への分化誘導：
　Human Mesenchymal Stem Cell (hMSC) Chondrogenic Differentiation Medium Bullet Kit(tm) (Lonza社, PT-3003)の構成品を指示通りに混合して、軟骨分化誘導培地(不完全培地)を調製した。これにRecombinant Human TGF-beta 3 Protein (R&D Systems社, 243-B3)を、最終濃度10ng/mlになるように添加して、軟骨分化誘導培地(完全培地)を使用毎に調製した。第三継代細胞をAccutase-Solution PromoCell社, C-41310)で剥がし、培地で洗浄した後、細胞数の計測結果を基に、250,000個の細胞を15mlポリプロピレンコニカルチューブに分取した。細胞を軟骨分化誘導培地(不完全培地)で2回洗浄し、上清を除去した後、500μlの軟骨分化誘導培地(完全培地)で懸濁した。150gで5分間遠心して細胞のペレットを形成させ、ふたを緩めてCO2インキュベーターに静置し（37℃、5%CO2）、その後2～3日毎に培地(完全培地)を交換した。3週間経過後にペレットを取り出して4%パラホルムアルデヒドで固定し、凍結切片を作成してアルシアンブルー染色により軟骨細胞由来のプロテオグリカンを染色した。ポジティブコントロールとしてヒト骨髄由来間葉系幹細胞についても同様の分化誘導操作を行った。
　上記分化誘導実験の結果、BM-MSCはALP染色、オイルレッドO染色、およびアルシアンブルー染色の全てにおいて陽性であった。一方、水疱由来細胞は、ALP染色が陽性（但し、BM-MSCより染色強度は低い）、オイルレッドO染色が陽性（但し、BM-MSCより染色強度は低い）、アルシアンブルー染色が陰性であった（図３）。
3. ゲノム編集の設計
　ヒトゲノム内のAAVS1（Adeno-associated virus integration site 1）領域においてCRISPR-Cas9システムによる切断効率が良好な位置を選択するため、３種類のsgRNAを作製した。AAVS1領域は、遺伝子導入による影響を受けにくい安全領域（セーフ・ハーバー／safe harbor）である。CRISPR-Cas9システムは「NGG」の塩基配列を認識し、その３塩基上流を切断することから、末端に「GG」が配置される領域を選択し、「NGG」の上流２０塩基の標的配列を含むsgRNA（sgAAVS1-#1～#3）を設計した（図４、上；表１）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
　配列番号３～５のいずれかの配列からなるオリゴヌクレオチドとその相補鎖をアニーリングした後にeSpCas9(1.1) (Addgene plasmid # 71814)のBbs1サイトにクローニングすることにより、Cas9タンパク質とsgRNAを発現するプラスミドを作成した（それぞれ、eSpCas9(1.1)-sgAAVS1-#1、eSpCas9(1.1)-sgAAVS1-#2、eSpCas9(1.1)-sgAAVS1-#3）。このプラスミド（2.5 μg）を、6ウェルディッシュに播種したHEK293細胞（ヒト胎児腎細胞株）にLipofectamin 3000 (Thermo Fisher Scientific)により導入した。トランスフェクションの48時間後、細胞からゲノムDNAを抽出し、標的部位を含む領域をPCRで増幅した。PCR増幅断片は熱処理により一本鎖にし、ゆっくり冷却することでアニーリングさせた後に、ミスマッチ部位特異的エンドヌクレアーゼで処理した。これを電気泳動で分画し、ゲノム切断によって導入された挿入または欠失変異の程度をバンドの濃さで測定し、以下の計算式によりゲノム編集効率を算出した(式中、aは消化されなかったバンド濃度、b, cは切断されたバンド濃度を示す)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000002
　sgAAVS1-#1～#3のいずれのsgRNAによってもコントロールとは異なる短いDNA断片が生じ、二重鎖切断が生じることが確認された（図４、下）。以下の実験では、最も切断効率の高かったsgAAVS1-#3を使用した。
4. 水疱由来細胞へのCOL7A1遺伝子の導入
　AAVS1領域へのCOL7A1遺伝子の導入のため、CAGプロモーターの制御下にCOL7A1遺伝子を発現するプラスミドを設計した（図５）。COL7A1 cDNAは、Flexi ORF sequence-verified clone (Promega, Madison, WI, USA)より得た。COL7A1 cDNAをpENTR1Aプラスミド（Thermo Fisher Scientific, A10462）にサブクローニングし、pENTR1A-COL7A1を得た。LRリコンビナーゼ (Thermo Fisher Scientific) を用いたGateway反応によってpENTR1A-COL7A1からpAAVS1-P-CAG-DEST (Addgene plasmid # 80490)へCOL7A1 cDNAを導入し、ドナープラスミドpAAVS1-P-CAG-COL7A1を得た。
　上記1.で得られた水疱由来細胞をNeonトランスフェクションシステム（Thermo Fisher Scientific）の専用バッファーで懸濁し、Cas9-sgRNA発現プラスミド（eSpCas9(1.1)-sgAAVS1-#3）およびドナープラスミド（pAAVS1-P-CAG-COL7A1）と以下のように混合した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
　Neonトランスフェクションシステムを用い、1,200 V, 20 ms, 2 pulsesの条件でエレクトロポレーションにより上記プラスミドを水疱由来細胞に導入した後、6-wellプレートに播種して培養した。培地は、Mesenchymal Stem Cell Growth Medium 2 (PromoCell社、C-28009)とMSCGM Mesenchymal Stem Cell Growth Medium（Lonza社、PT-3001）の等量混合培地を使用した。トランスフェクションの48時間後にpuromycinを最終濃度0.5μg/mLになるよう添加し、約2週間培養して選択された細胞を下記マウスへの移植実験に使用した。（なお、CAGプロモーターの代わりにEF1αプロモーターまたはPGKプロモーターを用いたCOL7A1遺伝子ドナープラスミドで水疱由来細胞を遺伝子改変した場合でもVII型コラーゲンを発現および分泌する細胞が得られることを、免疫染色および培養上清のウェスタンブロッティングにより確認している。）
5. 遺伝子改変水疱由来細胞のマウスへの移植
　水疱形成を示すCol7A1遺伝子ノックアウトマウス（Col7a1-/-）の新生児の全層皮膚を切除し、免疫不全マウス（NOD-SCID）の背部に移植した。移植直後に皮膚表面をつまみ、かつ擦ることで水疱を形成させ、直ちに表皮下の空間（水疱内）に上記4.で作成した1.0×106個の遺伝子改変水疱由来細胞を注入し（図６）、フィイルムドレッシング材で密封した（対照群のマウスには、遺伝子改変していない水疱由来細胞を1.0×106個注入した）。4週間後に皮膚を採取し、抗VII型コラーゲン抗体(clone LH7.2; Sigma Aldrich, C6805)を用いた免疫染色により、VII型コラーゲン基底膜への沈着を確認した。その結果、遺伝子改変水疱由来細胞を水疱内に注入したマウスの基底膜近傍にVII型コラーゲンの沈着が認められた（図７）。
　また、本発明者らが行った予備試験の結果、水疱由来細胞は、BM-MSCや線維芽細胞と比較してVII型コラーゲンの発現量および分泌量が多いというデータも得られている。したがって、COL7A1遺伝子を導入した水疱由来細胞は、栄養障害型表皮水疱症の遺伝子治療において、BM-MSCや線維芽細胞よりも高い治療効果を発揮することが期待される。

Claims (15)

  1. 　栄養障害型表皮水疱症の治療に用いるための組成物であって、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞を含む、組成物。
  2. 　水疱由来細胞が、COL7A1遺伝子を導入することにより遺伝子改変されている、請求項１に記載の組成物。
  3. 　COL7A1遺伝子が、配列番号１の核酸配列と90％以上の配列同一性を有する核酸配列を含むか、配列番号２のアミノ酸配列と90％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項２に記載の組成物。
  4. 　水疱由来細胞が、以下の1)～6)から選択される１つ以上の特徴を有するものである、請求項１～３のいずれかに記載の組成物：
    　1)固相への接着性を有する、
    　2)CD73、CD105およびCD90からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陽性である、
    　3)CD45、CD34、CD11b、CD79A、HLA-DRおよびCD31からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陰性である、
    　4)骨芽細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
    　5)脂肪細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
    　6)軟骨細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い。
  5. 　水疱由来細胞が、組成物に含まれる細胞で最も多い細胞である、請求項１～４のいずれかに記載の組成物。
  6. 　水疱内に投与される、請求項１～５のいずれかに記載の組成物。
  7. 　栄養障害型表皮水疱症患者の水疱内容物を固相上で培養する工程を含む、細胞の製造方法。
  8. 　請求項７に記載の方法によって製造される細胞。
  9. 　以下の1)～6)から選択される１つ以上の特徴を有する、請求項８に記載の細胞：
    　1)固相への接着性を有する、
    　2)CD73、CD105およびCD90からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陽性である、
    　3)CD45、CD34、CD11b、CD79A、HLA-DRおよびCD31からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陰性である、
    　4)骨芽細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
    　5)脂肪細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
    　6)軟骨細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い。
  10. 　以下の工程を含む、細胞の製造方法：
    1)栄養障害型表皮水疱症患者の水疱内容物を固相上で培養する工程、
    2)培養工程1)によって得られた細胞を、VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変する工程。
  11. 　請求項１０に記載の方法によって製造される細胞。
  12. 　VII型コラーゲンを産生するよう遺伝子改変された、栄養障害型表皮水疱症患者の水疱由来細胞。
  13. 　COL7A1遺伝子を導入することにより遺伝子改変されている、請求項１１または１２に記載の細胞。
  14. 　COL7A1遺伝子が、配列番号１の核酸配列と90％以上の配列同一性を有する核酸配列を含むか、配列番号２のアミノ酸配列と90％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む、請求項１３に記載の細胞。
  15. 　以下の1)～6)から選択される１つ以上の特徴を有する、請求項１１～１４のいずれかに記載の細胞：
    　1)固相への接着性を有する、
    　2)CD73、CD105およびCD90からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陽性である、
    　3)CD45、CD34、CD11b、CD79A、HLA-DRおよびCD31からなる群より選択される一つ以上の表面マーカーが陰性である、
    　4)骨芽細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
    　5)脂肪細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い、
    　6)軟骨細胞への分化能を有しない、又は骨髄由来間葉系幹細胞と比較して当該分化能が低い。
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