WO2021140693A1 - 新規微生物およびエルゴチオネインの生産方法 - Google Patents

新規微生物およびエルゴチオネインの生産方法 Download PDF

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竜行 越山
睦 金子
幸弘 東山
佐藤　俊
友岳 森田
あずさ 雜賀
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株式会社クレハ
国立研究開発法人産業技術総合研究所
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    • C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/645—Fungi ; Processes using fungi

Definitions

  • the present invention relates to a novel microorganism and a method for producing ergothioneine by culturing the novel microorganism to obtain ergothioneine.
  • Ergothioneine is a type of sulfur-containing amino acid. Ergothioneine has an antioxidant effect superior to that of vitamin E, and is attracting attention as a compound having high utility value in fields such as health and cosmetology.
  • Patent Document 1 and Non-Patent Document 1 describe transformed filamentous fungi with enhanced ergothioneine-producing ability.
  • Non-Patent Document 2 describes a transformed microorganism of the genus Methylobacrium with enhanced ergothioneine-producing ability.
  • Non-Patent Document 2 describes that microorganisms of the genus Aureobasidium and the genus Rhodotorula have the ability to produce ergothioneine.
  • Non-Patent Document 3 describes that a microorganism belonging to the genus Pleurotus has an ability to produce ergothioneine.
  • ergothioneine is not biosynthesized in the human body, but is biosynthesized by some microorganisms. Therefore, as described in the above-mentioned prior art document, research and development such as search for microorganisms producing ergothioneine and modification of microorganisms for enhancing ergothioneine production are underway. However, it is desired to search for and develop microorganisms described in the prior art documents in which the production amount of ergothioneine is low and the production amount of ergothioneine is high.
  • microorganisms can be modified to enhance the production of ergothioneine.
  • ergothioneine produced by the microorganism cannot be used in the food industry or the like. Therefore, it is strongly desired to search for a microorganism having a high ergothioneine production amount, which has not been genetically modified and has not been modified.
  • the present invention has been made in view of the above problems, and an object of the present invention is to provide a novel microorganism having a high production amount of ergothioneine.
  • the present inventors have found a novel microorganism that produces a higher amount of ergothioneine than the conventional microorganism, and have completed the present invention.
  • the microorganisms according to the present invention include microorganisms belonging to Dirkmeia chulashimaensis (NITE BP-03054), microorganisms belonging to Papillion diaeresis flavescens (NITE BP-0351), and microorganisms belonging to Papillion diaeresis flavescens (NITE BP-03052). , Or a microorganism belonging to Apiotricum porosum (NITE BP-03053).
  • the microorganism of the present embodiment is a microorganism belonging to the genus Dirkmeia having the ability to produce ergothioneine, a microorganism belonging to the genus Papilliontrema having the ability to produce ergothioneine, or a microorganism belonging to the genus Apiotricum having the ability to produce ergothioneine. is there.
  • the microorganism of this embodiment has a high production amount of ergothioneine.
  • Ergothioneine is a type of sulfur-containing amino acid and has an excellent antioxidant effect. Further, since the microorganism of the present embodiment has not been modified by gene recombination technology or the like, it can also be used in the food industry.
  • Dirkmeia Chulashimaensis S111 Dirkmeia churashimaensis S111 (hereinafter sometimes abbreviated as "yeast S111") is the first microorganism isolated from the leaves (young leaves) collected in Tsukuba City, Ibaraki Prefecture. ..
  • the nucleotide sequences of the D1 / D2 region and the ITS region of 26SrDNA of the ribosomal RNA gene were determined. Then, a BLAST homologous search was performed on the TechnoSuruga Laboratory, Japan database DB-FU 10.0 and the international nucleotide sequence database (DDBJ / ENA (EMBL) / GenBank). As a result, yeast S111 was assigned to Dirkmeia chulashimaensis. In addition, as shown in the examples, erythritol and succinate as a carbon source and nitrate as a nitrogen source were different from each other in terms of assimilation and growth at 37 ° C. It shows almost similar physiological and biochemical properties.
  • Yeast S111 is a patented microorganism deposit center (hereinafter abbreviated as "NITE") of the National Institute of Technology and Evaluation, Room 122, 2-5-8 Kazusakamatari, Kisarazu City, Chiba Prefecture. Deposited with NPMD) (Original deposit date: October 25, 2019, deposit number: NITE BP-03504).
  • NITE microorganism deposit center
  • the culturing method of yeast S111 may be carried out according to a general culturing method performed on microorganisms of the genus Dirkmeia.
  • the culture form is batch culture using a liquid medium or fed-batch culture in which a carbon source and / or an organic nitrogen source is continuously added to the culture system, and it is desirable to aerate and stir.
  • a medium containing a necessary nutrient source such as a carbon source, a nitrogen source, or an inorganic salt that can be assimilated by a microorganism belonging to the genus Dirkmeia may be used.
  • the culture pH is preferably 3 to 8
  • the culture temperature is preferably 20 ° C. to 37 ° C.
  • the culture time is preferably 2 to 14 days.
  • Papiliotrema flavescens EA071 (hereinafter, may be abbreviated as "yeast EA071”) is the first microorganism isolated from the leaves of Miscanthus sinensis collected around Lake Motosu.
  • the nucleotide sequences of the D1 / D2 region and the ITS region of 26SrDNA of the ribosomal RNA gene were determined. Then, a BLAST homologous search was performed on the TechnoSuruga Laboratory, Japan database DB-FU 10.0 and the international nucleotide sequence database (DDBJ / ENA (EMBL) / GenBank). As a result, yeast EA071 was assigned to papillotrema flavessens. In addition, as shown in the examples, the physiological and biochemical properties are almost similar to those of papillotrema flavescens, except that inulin as a carbon source and water-soluble starch are different.
  • Yeast EA071 was deposited at Room 122, 2-5-8 Kazusakamatari, Kisarazu City, Chiba Prefecture, at the Patent Microorganisms Depositary Center (NPMD) of the National Institute of Technology and Evaluation (NITE) (Original deposit date: October 2019). 25th, accession number: NITE BP-0351).
  • the yeast EA071 culturing method may be carried out according to a general culturing method performed on microorganisms of the genus Papillion diaeresis.
  • the culture form is batch culture using a liquid medium or fed-batch culture in which a carbon source and / or an organic nitrogen source is continuously added to the culture system, and it is desirable to aerate and stir.
  • a medium containing a necessary nutrient source such as a carbon source, a nitrogen source, or an inorganic salt that can be assimilated by a microorganism belonging to the genus Papillion Trema may be used.
  • the culture pH is preferably 3 to 8
  • the culture temperature is preferably 20 ° C. to 30 ° C.
  • the culture time is preferably 2 to 14 days.
  • Papiliotrema flavescens EA361 (hereinafter sometimes abbreviated as "yeast EA361") is the first microorganism isolated from the bark of a tree collected around Lake Suwa.
  • the nucleotide sequences of the D1 / D2 region and the ITS region of 26SrDNA of the ribosomal RNA gene were determined. Then, a BLAST homologous search was performed on the TechnoSuruga Laboratory, Japan database DB-FU 10.0 and the international nucleotide sequence database (DDBJ / ENA (EMBL) / GenBank). As a result, yeast EA361 was assigned to papillotrema flavessens. In addition, as shown in the examples, the physiological and biochemical properties are almost similar to those of papillotrema flavescens, except that inulin as a carbon source and water-soluble starch are different.
  • Yeast EA361 was deposited at Room 122, 2-5-8 Kazusakamatari, Kisarazu City, Chiba Prefecture, at the Patent Microorganisms Depositary Center (NPMD) of the National Institute of Technology and Evaluation (NITE) (Original deposit date: October 2019). 25th, accession number: NITE BP-0352).
  • the yeast EA361 culturing method may be carried out according to a general culturing method performed on microorganisms of the genus Papillion diaeresis.
  • the culture form is batch culture using a liquid medium or fed-batch culture in which a carbon source and / or an organic nitrogen source is continuously added to the culture system, and it is desirable to aerate and stir.
  • a medium containing a necessary nutrient source such as a carbon source, a nitrogen source, or an inorganic salt that can be assimilated by a microorganism belonging to the genus Papillion Trema may be used.
  • the culture pH is preferably 3 to 8
  • the culture temperature is preferably 20 ° C. to 30 ° C.
  • the culture time is preferably 2 to 14 days.
  • Apiotrichum porosum EA702 (hereinafter sometimes abbreviated as "yeast EA702") is the first microorganism isolated from the soil collected in Iwaki City.
  • the nucleotide sequences of the D1 / D2 region and the ITS region of 26SrDNA of the ribosomal RNA gene were determined. Then, a BLAST homologous search was performed on the TechnoSuruga Laboratory, Japan database DB-FU 10.0 and the international nucleotide sequence database (DDBJ / ENA (EMBL) / GenBank). As a result, yeast EA702 was assigned to Apiotricum porosum. In addition, as shown in the examples, the physiological and biochemical properties are almost similar to those of papillotrema flavescens, except that inulin as a carbon source and 50% D-glucose in the resistance test are different.
  • Yeast EA702 was deposited at Room 122, 2-5-8 Kazusakamatari, Kisarazu City, Chiba Prefecture, at the Patent Microorganisms Depositary Center (NPMD) of the National Institute of Technology and Evaluation (NITE) (Original deposit date: October 2019). 25th, accession number: NITE BP-0353).
  • the method of culturing yeast EA702 may be carried out according to a general culturing method performed on microorganisms of the genus Apiotricum.
  • the culture form is batch culture using a liquid medium or fed-batch culture in which a carbon source and / or an organic nitrogen source is continuously added to the culture system, and it is desirable to aerate and stir.
  • a medium containing a necessary nutrient source such as a carbon source, a nitrogen source, or an inorganic salt that can be assimilated by a microorganism belonging to the genus Apiotricum may be used.
  • the culture pH is preferably 3 to 8
  • the culture temperature is preferably 20 ° C. to 27 ° C.
  • the culture time is preferably 2 to 14 days.
  • the method for producing ergothioneine of the present embodiment includes a step of culturing the above-mentioned microorganism to obtain a culture containing ergothioneine.
  • Recovery of ergothioneine from a culture containing ergothioneine may be carried out by, for example, a method of recovering and purifying ergothioneine from a normal microbial culture.
  • the culture includes a culture supernatant, cultured cells, crushed cultured cells, and the like. For example, the cells are collected by centrifuging the culture.
  • An extract containing ergothioneine is obtained by subjecting the recovered cells to hot water extraction or the like. Then, by purifying the extract, ergothioneine can be recovered.
  • the amount of ergothioneine produced by the microorganism can be quantified, for example, by measuring the obtained extract with a high performance liquid chromatography device and a quality analyzer such as LCMS.
  • the microorganisms according to the present embodiment include microorganisms belonging to Dirkmeia chulashimaensis (NITE BP-03054), microorganisms belonging to Papillion diaeresis flavescens (NITE BP-0351), and microorganisms belonging to Papillion diaeresis flavescens (NITE BP-03052). ), Or a microorganism belonging to Apiotricum porosum (NITE BP-03053).
  • the method for producing ergothioneine according to the present embodiment includes a step of culturing the above-mentioned microorganism to obtain a culture containing ergothioneine.
  • the collected samples were immersed in 15 mL plastic tubes containing 2 mL of the screening medium, and cultured at 200 rpm at 25 ° C. for 3 to 5 days.
  • the screening medium YM medium containing antibiotics was used. Specifically, a medium containing 1% glucose, 0.5% peptone, 0.3% yeast extract, 0.3% malt extract, 0.01% streptomycin sulfate, and 0.005% chloramphenicol is used. did.
  • the number of colonies grown on YM agar were counted number of grown colonies on H 2 O 2 containing YM agar. Then, it was selected sample of 83 colonies were grown both in YM agar and H 2 O 2 containing YM agar.
  • LCMS-2020 manufactured by Shimadzu Corporation was used for LCMS analysis.
  • As the LC column an Asahipak NH2P-40 2D + guard column manufactured by SHODEX was used.
  • FIGS. 1 and 2 are graphs showing the amount of ergothioneine produced by the microbial samples collected in the first and second microbial samples, respectively.
  • the horizontal axis of FIGS. 1 and 2 shows the value obtained by measuring the culture solution obtained after culturing in (3) above with OD600.
  • the vertical axis indicates the amount of ergothioneine (mg / L (culture solution)) in the culture solution obtained after culturing in (3) above.
  • the amount of ergothioneine is the value obtained by LCMS analysis.
  • the colonies circled are 14 colonies selected.
  • the culture solution on the 3rd to 7th days of culture was appropriately collected.
  • the cells were centrifuged and washed, and then the extract was recovered by hot water extraction.
  • the obtained extract was analyzed by LCMS in the same manner as in (4) above, and 5 strains (S111, EA071, EA361, EA701, EA702) having a high production amount of ergothioneine were selected.
  • the bar graph on the left of each strain shows the amount of ergothioneine produced on the third day of culture.
  • the bar graph on the right of each strain shows the production of ergothioneine on the 5th day of culture.
  • the attribution classification group of the selected 5 strains was estimated by analyzing the nucleotide sequences of the D1 / D2 region and the ITS region of the 26S rDNA of the ribosomal RNA gene.
  • Table 1 shows the production volume and production rate of the selected 5 strains of ergothioneine (EGT).
  • Table 2 shows the production amount and production rate of known microorganisms. Unless otherwise specified, in Tables 1 and 2, the unit of ergothioneine (EGT) production is mg / L, and the EGT production rate is mg / L / d (daily production of ergothioneine). The amount of EGT produced in Table 1 shows the amount of ergothioneine produced on the 5th day of culturing.
  • the S111 strain showed the same molecular phylogenetic position as a plurality of nucleotide sequences of Dirkmeia chulashimaensis.
  • the S111 strain was cultured on a YM agar plate medium at 27 ° C. for 7 days, and the formed colonies were observed.
  • the shape of the periphery of the colony was all edges, and the raised state was flat and wrinkled.
  • the shape of the surface of the colony was smooth.
  • the colonies were dull and buttery, pale orange to cream.
  • the S111 strain was also cultured on a YM agar plate medium at 27 ° C. for 7 days, and then the cell morphology was also observed.
  • the vegetative cells were oval to oval, and proliferation was found to be due to budding. No formation of sexual reproductive organs was observed on the flat plate 4 weeks or more after the start of culture.
  • the morphological properties of the above S111 strain were almost consistent with the characteristics of Dirkmeia chulashimaensis assigned by DNA sequence analysis of the D1 / D2 region and the ITS region.
  • the physiological properties of the S111 strain are shown in Table 3.
  • the S111 strain was determined to be a novel microorganism belonging to Dirkmeia chulashimaensis.
  • the EA071 strain was included in the phylogenetic group composed of the genus Papillion Trema. And it showed the same molecular phylogenetic position as Cryptococcus flavesense (current name Papillion Trema flavesense) CBS942 T.
  • the EA071 strain was cultured on a YM agar plate medium at 27 ° C. for 7 days, and the formed colonies were observed.
  • the shape of the periphery of the colony was all edges, and the raised state was cushion-shaped.
  • the shape of the surface of the colony was smooth.
  • the colonies were brilliant and viscous and cream-colored.
  • the EA071 strain was also cultured on a YM agar plate medium at 27 ° C. for 7 days, and then the cell morphological properties were also observed.
  • the vegetative cells were subspherical to elliptical, and the proliferation was found to be due to budding. No formation of sexual reproductive organs was observed on the flat plate 4 weeks or more after the start of culture.
  • the morphological properties of the above EA071 strain were almost consistent with the characteristics of papillotrema flavessens assigned by DNA sequence analysis of the D1 / D2 region and the ITS region.
  • the physiological properties of the EA071 strain are shown in Table 4.
  • the EA071 strain was judged to be a novel microorganism belonging to papillotrema flavessens.
  • the EA361 strain was included in the phylogenetic group composed of the genus Papillion Trema. And it showed the same molecular phylogenetic position as Cryptococcus flavesense (current name Papillion Trema flavesense) CBS942 T.
  • the EA361 strain was cultured on a YM agar plate medium at 27 ° C. for 7 days, and the formed colonies were observed.
  • the shape of the periphery of the colony was all edges, and the raised state was cushion-shaped.
  • the shape of the surface of the colony was smooth.
  • the colonies were brilliant and viscous and cream-colored.
  • the EA361 strain was also cultured on a YM agar plate medium at 27 ° C. for 7 days, and then the cell morphological properties were also observed.
  • the vegetative cells were subspherical to elliptical, and the proliferation was found to be due to budding. No formation of sexual reproductive organs was observed on the flat plate 4 weeks or more after the start of culture.
  • the morphological properties of the above EA361 strain were almost consistent with the characteristics of papillotrema flavessens assigned by DNA sequence analysis of the D1 / D2 region and the ITS region.
  • the physiological properties of the EA071 strain are shown in Table 5.
  • the EA361 strain was judged to be a novel microorganism belonging to papillotrema flavessens.
  • the EA702 strain was included in the phylogenetic group composed of the genus Trichosporon (Apiotricum). It showed the same molecular phylogenetic position as Trichosporon porosam (current name Apiotricum porosam) CBS2040 T.
  • the EA702 strain was cultured on a YM agar plate medium at 27 ° C. for 7 days, and the formed colonies were observed.
  • the shape of the periphery of the colony was hyphal.
  • the raised state of the colony was flat at the periphery and raised at the center.
  • the surface shape of the colony was wrinkled.
  • the colony was dull.
  • the colonies were moist to slightly dry and white to white cream in color.
  • the EA702 strain was also cultured on a YM agar plate medium at 27 ° C. for 7 days, and then the cell morphological properties were also observed.
  • the vegetative cells were oval to oval, and proliferation was found to be due to budding. In addition, it proliferated laterally as the hyphae grew. No formation of sexual reproductive organs was observed on the flat plate 4 weeks or more after the start of culture.
  • the morphological properties of the above EA702 strain were almost consistent with the characteristics of apiotricum porosum assigned by DNA sequence analysis of the D1 / D2 region and the ITS region.
  • the physiological properties of the EA702 strain are shown in Table 6.
  • the EA702 strain was judged to be a novel microorganism belonging to papillotrema flavessens.
  • the microorganism of the present invention has a high production amount of ergothioneine and can be used in fields such as health and beauty.

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Abstract

本発明の微生物は、ディルクメイア・チュラシマエンシス（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５４）、パピリオトレマ・フラベセンス（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５１）、パピリオトレマ・フラベセンス（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５２）、または、アピオトリカム・ポロサム（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５３）である。

Description

新規微生物およびエルゴチオネインの生産方法
　本発明は、新規微生物、および、当該新規微生物を培養してエルゴチオネインを得るエルゴチオネインの生産方法に関する。
　エルゴチオネインは含硫アミノ酸の一種である。エルゴチオネインは、ビタミンＥの抗酸化作用よりも優れた抗酸化作用を有し、健康および美容等の分野において、利用価値の高い化合物として注目されている。
　例えば、特許文献１および非特許文献１には、エルゴチオネイン生産能が増強された形質転換糸状菌が記載されている。
　また、非特許文献２には、エルゴチオネイン生産能が増強された、形質転換したMethylobacrium属の微生物が記載されている。非特許文献２には、Aureobasidium属およびRhodotorula属の微生物がエルゴチオネイン生産能を有することが記載されている。
　また、非特許文献３には、Pleurotus属の微生物がエルゴチオネイン生産能を有することが記載されている。
国際公開第２０１６／１２１２８５号
S. Takusagawa, Biosci. Biotechnol. Biochem., 83, 181-184 (2019) Y. Fujitani et al., J. Biosci. Bioeng., 126, 715-722 (2018) SY. Lin, Int. J. Med. Mushrooms, 17, 749-761 (2015)
　エルゴチオネインは、ヒトの体内では生合成されず、一部の微生物で生合成されることが知られている。よって、上述の先行技術文献に記載されるように、エルゴチオネインを産生する微生物の探索、および、エルゴチオネインの生産が増強させるための微生物の改変等の研究開発が進められている。しかしながら、先行技術文献に記載される微生物は、エルゴチオネインの生産量が低く、エルゴチオネインの生産量が高い微生物の探索および開発が望まれる。
　遺伝子組換え技術により、エルゴチオネインの生産を増強させるように微生物を改変することができる。しかしながら、当該微生物により生産されたエルゴチオネインは食品産業等では利用できない。したがって、遺伝子組換えが行われておらず未改変である、エルゴチオネイン生産量が高い微生物の探索が強く望まれている。
　本発明は、上記課題に鑑みてなされたものであり、エルゴチオネインの生産量が高い新規微生物を提供することを目的とする。
　本発明者らは、スクリーニングの結果、従来の微生物よりもエルゴチオネインの生産量が高い新規微生物を見出し、本発明を完成するに至った。
　本発明に係る微生物は、ディルクメイア・チュラシマエンシスに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５４）、パピリオトレマ・フラベセンスに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５１）、パピリオトレマ・フラベセンスに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５２）、または、アピオトリカム・ポロサムに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５３）である。
　本発明の一態様によれば、エルゴチオネインの生産量が高い微生物を提供することができる。
１回目のスクリーニング結果を示すグラフである。 ２回目のスクリーニング結果を示すグラフである。 新規微生物５株のエルゴチオネイン生産量の評価結果を示すグラフである。
　本実施形態の微生物は、エルゴチオネインを生産する能力を有するディルクメイア属に属する微生物、エルゴチオネインを生産する能力を有するパピリオトレマ属に属する微生物、または、エルゴチオネインを生産する能力を有するアピオトリカム属に属する微生物である。
　本実施形態の微生物は、エルゴチオネインの生産量が高い。エルゴチオネインは、含硫アミノ酸の一種であり、優れた抗酸化作用を有する。また、本実施形態の微生物は遺伝子組換え技術等による改変が行われていないため、食品産業でも使用することができる。
　以下、本実施形態の微生物について詳細に説明する。
　〔１．ディルクメイア・チュラシマエンシスＳ１１１〕
　ディルクメイア・チュラシマエンシス（Dirkmeia churashimaensis）Ｓ１１１（以下、「酵母Ｓ１１１」と略記する場合がある）は、茨城県つくば市内で収集した木の葉（若葉）を分離源として初めて分離された微生物である。
　リボソームＲＮＡ遺伝子の２６ＳｒＤＮＡのＤ１／Ｄ２領域およびＩＴＳ領域の塩基配列を決定した。そして、テクノスルガラボ微生物同定システム（TechnoSuruga Laboratory, Japan）データベースDB-FU10.0および国際塩基配列データベース（DDBJ/ENA(EMBL)/GenBank）に対するBLAST相同検索を行った。その結果、酵母Ｓ１１１はディルクメイア・チュラシマエンシスに帰属された。また、実施例に示す通り、炭素源としてのエリスリトールおよびコハク酸塩ならびに窒素源としての硝酸塩の資化性、３７℃での生育性について相違が認められた以外は、ディルクメイア・チュラシマエンシスとほぼ類似した生理・生化学的性状を示す。
　酵母Ｓ１１１は、千葉県木更津市かずさ鎌足２－５－８　１２２号室、独立行政法人製品評価技術基盤機構（Natural Institute of Technology and Evaluation；以下、「ＮＩＴＥ」と略記する）の特許微生物寄託センター（ＮＰＭＤ）に寄託した（原寄託日：２０１９年１０月２５日、受託番号：ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５４）。
　酵母Ｓ１１１の培養方法は、ディルクメイア属の微生物に対して行われる一般的な培養方法に準じて行えばよい。培養形態は液体培地を用いた回分培養あるいは培養系に炭素源および／または有機窒素源を連続添加する流加培養であり、通気攪拌することが望ましい。培地としては、ディルクメイア属に属する微生物が資化可能な炭素源、窒素源、または無機塩類などの必要な栄養源を含有する培地を使用してもよい。培養ｐＨは３～８が好ましく、培養温度は２０℃～３７℃が好ましく、培養時間は２～１４日が好ましい。
　〔２．パピリオトレマ・フラベセンスＥＡ０７１〕
　パピリオトレマ・フラベセンス（Papiliotrema flavescens）ＥＡ０７１（以下、「酵母ＥＡ０７１」と略記する場合がある）は、本栖湖周辺で収集したススキの葉を分離源として初めて分離された微生物である。
　リボソームＲＮＡ遺伝子の２６ＳｒＤＮＡのＤ１／Ｄ２領域およびＩＴＳ領域の塩基配列を決定した。そして、テクノスルガラボ微生物同定システム（TechnoSuruga Laboratory, Japan）データベースDB-FU10.0および国際塩基配列データベース（DDBJ/ENA(EMBL)/GenBank）に対するBLAST相同検索を行った。その結果、酵母ＥＡ０７１はパピリオトレマ・フラベセンスに帰属された。また、実施例に示す通り、炭素源としてのイヌリンおよび水溶性デンプンについて相違が認められた以外は、パピリオトレマ・フラベセンスとほぼ類似した生理・生化学的性状を示す。
　酵母ＥＡ０７１は、千葉県木更津市かずさ鎌足２－５－８　１２２号室、独立行政法人製品評価技術基盤機構（ＮＩＴＥ）の特許微生物寄託センター（ＮＰＭＤ）に寄託した（原寄託日：２０１９年１０月２５日、受託番号：ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５１）。
　酵母ＥＡ０７１の培養方法は、パピリオトレマ属の微生物に対して行われる一般的な培養方法に準じて行えばよい。培養形態は液体培地を用いた回分培養あるいは培養系に炭素源および／または有機窒素源を連続添加する流加培養であり、通気攪拌することが望ましい。培地としては、パピリオトレマ属に属する微生物が資化可能な炭素源、窒素源、または無機塩類などの必要な栄養源を含有する培地を使用してもよい。培養ｐＨは３～８が好ましく、培養温度は２０℃～３０℃が好ましく、培養時間は２～１４日が好ましい。
　〔３．パピリオトレマ・フラベセンスＥＡ３６１〕
　パピリオトレマ・フラベセンス（Papiliotrema flavescens）ＥＡ３６１（以下、「酵母ＥＡ３６１」と略記する場合がある）は、諏訪湖周辺で収集した木の皮を分離源として初めて分離された微生物である。
　リボソームＲＮＡ遺伝子の２６ＳｒＤＮＡのＤ１／Ｄ２領域およびＩＴＳ領域の塩基配列を決定した。そして、テクノスルガラボ微生物同定システム（TechnoSuruga Laboratory, Japan）データベースDB-FU10.0および国際塩基配列データベース（DDBJ/ENA(EMBL)/GenBank）に対するBLAST相同検索を行った。その結果、酵母ＥＡ３６１はパピリオトレマ・フラベセンスに帰属された。また、実施例に示す通り、炭素源としてのイヌリンおよび水溶性デンプンについて相違が認められた以外は、パピリオトレマ・フラベセンスとほぼ類似した生理・生化学的性状を示す。
　酵母ＥＡ３６１は、千葉県木更津市かずさ鎌足２－５－８　１２２号室、独立行政法人製品評価技術基盤機構（ＮＩＴＥ）の特許微生物寄託センター（ＮＰＭＤ）に寄託した（原寄託日：２０１９年１０月２５日、受託番号：ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５２）。
　酵母ＥＡ３６１の培養方法は、パピリオトレマ属の微生物に対して行われる一般的な培養方法に準じて行えばよい。培養形態は液体培地を用いた回分培養あるいは培養系に炭素源および／または有機窒素源を連続添加する流加培養であり、通気攪拌することが望ましい。培地としては、パピリオトレマ属に属する微生物が資化可能な炭素源、窒素源、または無機塩類などの必要な栄養源を含有する培地を使用してもよい。培養ｐＨは３～８が好ましく、培養温度は２０℃～３０℃が好ましく、培養時間は２～１４日が好ましい。
　〔４．アピオトリカム・ポロサムＥＡ７０２〕
　アピオトリカム・ポロサム（Apiotrichum porosum）ＥＡ７０２（以下、「酵母ＥＡ７０２」と略記する場合がある）は、いわき市で収集した土壌を分離源として初めて分離された微生物である。
　リボソームＲＮＡ遺伝子の２６ＳｒＤＮＡのＤ１／Ｄ２領域およびＩＴＳ領域の塩基配列を決定した。そして、テクノスルガラボ微生物同定システム（TechnoSuruga Laboratory, Japan）データベースDB-FU10.0および国際塩基配列データベース（DDBJ/ENA(EMBL)/GenBank）に対するBLAST相同検索を行った。その結果、酵母ＥＡ７０２はアピオトリカム・ポロサムに帰属された。また、実施例に示す通り、炭素源としてのイヌリンおよび耐性試験における５０％Ｄ－グルコースについて相違が認められた以外は、パピリオトレマ・フラベセンスとほぼ類似した生理・生化学的性状を示す。
　酵母ＥＡ７０２は、千葉県木更津市かずさ鎌足２－５－８　１２２号室、独立行政法人製品評価技術基盤機構（ＮＩＴＥ）の特許微生物寄託センター（ＮＰＭＤ）に寄託した（原寄託日：２０１９年１０月２５日、受託番号：ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５３）。
　酵母ＥＡ７０２の培養方法は、アピオトリカム属の微生物に対して行われる一般的な培養方法に準じて行えばよい。培養形態は液体培地を用いた回分培養あるいは培養系に炭素源および／または有機窒素源を連続添加する流加培養であり、通気攪拌することが望ましい。培地としては、アピオトリカム属に属する微生物が資化可能な炭素源、窒素源、または無機塩類などの必要な栄養源を含有する培地を使用してもよい。培養ｐＨは３～８が好ましく、培養温度は２０℃～２７℃が好ましく、培養時間は２～１４日が好ましい。
　〔エルゴチオネインの生産方法〕
　本実施形態のエルゴチオネインの生産方法は、上記微生物を培養し、エルゴチオネインを含む培養物を得る工程を含む。
　エルゴチオネインを含む培養物からのエルゴチオネインの回収は、例えば、通常の微生物培養物からエルゴチオネインを回収し精製する方法で行えばよい。培養物には、培養上清、培養菌体、培養菌体破砕物等が含まれる。例えば、培養物を遠心分離等して菌体を回収する。回収した菌体を熱水抽出に供する等により、エルゴチオネインを含む抽出液を得る。そして、当該抽出液を精製することによって、エルゴチオネインを回収することができる。微生物のエルゴチオネインの生産量は、例えば、得られた抽出液を、高速液体クロマトグラフィー装置およびＬＣＭＳ等の質料分析装置によって測定することによって、定量することができる。
　〔まとめ〕
　本実施形態に係る微生物は、ディルクメイア・チュラシマエンシスに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５４）、パピリオトレマ・フラベセンスに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５１）、パピリオトレマ・フラベセンスに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５２）、または、アピオトリカム・ポロサムに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５３）である。
　また、本実施形態に係るエルゴチオネインの生産方法は、上記微生物を培養し、エルゴチオネインを含む培養物を得る工程を含む。
　以下に実施例を示し、本発明の実施の形態についてさらに詳しく説明する。もちろん、本発明の以下の実施例に限定されるものではなく、細部については様々な態様が可能であることはいうまでもない。さらに、本発明は上述した実施形態に限定されるものではなく、請求項に示した範囲で種々の変更が可能であり、それぞれ開示された技術的手段を適宜組み合わせて得られる実施形態についても本発明の技術的範囲に含まれる。また、本明細書中に記載された文献の全てが参考として援用される。
　以下の実施例中、特に記載がない限り、％は質量％を表す。
　（１）環境から採取した分離源での集積培養
　まず、植物および土壌等の環境からの微生物サンプル採取を２回に分けて行った。その結果、合計１１３のサンプル（１回目３０、２回目８３）を採取した。
　次に、スクリーニング培地２ｍＬを含む１５ｍＬのプラスチックチューブに採取したサンプルをそれぞれ浸漬し、２００ｒｐｍにおいて、３～５日間２５℃にて培養した。スクリーニング培地は抗生物質を含むＹＭ培地を使用した。具体的には、１％グルコース、０．５％ペプトン、０．３％酵母エキス、０．３％麦芽エキス、０．０１％ストレプトマイシン硫酸塩、０．００５％クロラムフェニコールを含む培地を使用した。
　そして、目視により培地が濁った（微生物が増殖した）、１１１のサンプル（１回目３０、２回目８１）を選抜した。
　（２）酸化ストレス負荷によるサンプルの選抜
　上記（１）で選抜した１１１のサンプルの培養液を、ＹＭ培地で１００倍または１０００００倍に希釈した。そして、ＹＭ寒天培地、および、３ｍＭのＨ２Ｏ２が添加されたＹＭ寒天培地（以下、Ｈ２Ｏ２含有ＹＭ寒天培地と略記する。）に希釈した培養液を塗布し、２５℃において２～５日間培養した。
　ＹＭ寒天培地上に生育したコロニーの数と、Ｈ２Ｏ２含有ＹＭ寒天培地上に生育したコロニーの数をカウントした。そして、ＹＭ寒天培地およびＨ２Ｏ２含有ＹＭ寒天培地の両方においてコロニーが生育した８３のサンプルを選抜した。
　さらに、選抜した８３のサンプルの寒天培地上で生育したコロニーについて、目視で形態および色を観察し、種類が異なる酵母様のコロニー１６４個（１回目５１個、２回目１１３個）を選抜した。
　（３）選抜コロニーの９６ウェルにおける培養
　上記（２）で選抜したコロニー１６４個を、１ｍＬのＹＭ培地を含む９６ウェルプレートに植菌し、１６００ｒｐｍにおいて、３～４日間２５℃にて培養した。培養後、回収した培養液を２０００ｒｐｍにおいて、１０分間４℃にて遠心分離させた。遠心分離により得られた菌体ペレットを純粋１ｍＬで洗浄し、再度遠心分離に供した。
　遠心分離により得られた菌体ペレットに０．１ｍＬの純水を加えて懸濁した。得られた懸濁液を９６℃において１０分間加熱して、菌体内成分を抽出した。そして、抽出した菌体内成分を遠心分離に供して菌体残渣を取り除き、抽出液が得られた。
　（４）ＬＣＭＳによる抽出液中のエルゴチオネインの定量分析
　上記（３）で得られた抽出液０．１５ｍＬとアセトニトリル０．３５ｍＬとを混合した溶液を０．４５μｍのＰＶＤＦフィルターで濾過した。得られた濾液をＬＣＭＳ測定のサンプルとして使用した。
　ＬＣＭＳ分析には、島津製作所社製ＬＣＭＳ－２０２０を用いた。また、ＬＣのカラムには、ＳＨＯＤＥＸ社製Asahipak NH2P-40 2D+ガードカラムを使用した。ＬＣの移動相として、１０ｍＭギ酸アンモニウムとアセトニトリルとの混合液（１０ｍＭギ酸アンモニウム／アセトニトリル＝３０／７０（ｖ／ｖ））を使用した。また、流速は０．１ｍＬ／ｍｉｎとし、２５℃において分析を行った。
　ＭＳ検出においては、ＥＳＩイオン化とＡＰＣＩイオン化とを同時に行うＤＵＩＳモードでイオン化させた。また、エルゴチオネインを検出可能なｍ／ｚ＝２３０（＋）のＳＩＭモードで検出を行った。
　上記（２）で選抜したコロニー１６４個の抽出液を分析した結果、エルゴチオネインの生産量が高かった１４個のコロニー（１回目５個、２回目９個）を選抜した。
　また、図１および２はそれぞれ、微生物サンプル採取１回目および２回目で採取した微生物サンプルが生産するエルゴチオネインの量を示すグラフである。図１および２の横軸は、上記（３）において培養後に得られた培養液をＯＤ６００にて測定して得られた値を示す。縦軸は、上記（３）において培養後に得られた培養液中のエルゴチオネインの量（ｍｇ／Ｌ（培養液））を示す。エルゴチオネインの量は、ＬＣＭＳ分析によって得られた値である。図１および２中、丸で囲ったコロニーが選抜した１４個のコロニーである。
　（５）エルゴチオネイン生産微生物のフラスコにおけるスケールアップ培養
　上記（４）で選抜した１４個のコロニーを、５０ｍＬのＹＭ培地を含む３００ｍＬフラスコに植菌し、２００ｒｐｍにおいて、７日間２５℃にて培養した（ｎ＝１）。
　培養３～７日目の培養液を適宜採取した。上記（３）と同様に、菌体を遠心分離および洗浄後、熱水抽出により抽出液を回収した。
　得られた抽出液を、上記（４）と同様に、ＬＣＭＳにより分析を行い、エルゴチオネインの生産量が高かった５株（Ｓ１１１、ＥＡ０７１、ＥＡ３６１、ＥＡ７０１、ＥＡ７０２）を選抜した。
　選抜した５株のコロニーを、５０ｍＬのＹＭ培地を含む３００ｍＬフラスコに植菌し、２００ｒｐｍにおいて、５日間２５℃にて培養した（ｎ＝３）。そして、培養３日目および５日目のエルゴチオネインの生産量を、ＬＣＭＳにより測定した。選抜した５株のコロニーのエルゴチオネインの生産量を図３に示す。
　図３中、各株の左の棒グラフは、培養３日目のエルゴチオネインの生産量を示す。各株の右の棒グラフは、培養５日目のエルゴチオネインの生産量を示す。
　（７）選抜した５株の同定
　選抜した５株の帰属分類群の推定は、リボソームＲＮＡ遺伝子の２６Ｓ　ｒＤＮＡのＤ１／Ｄ２領域およびＩＴＳ領域の塩基配列の解析により行った。
　塩基配列の解析の結果、Ｓ１１１株はディルクメイア・チュラシマエンシス、ＥＡ０７１株およびＥＡ３６１株はパピリオトレマ・フラベセンス、ＥＡ７０１株およびＥＡ７０２株はアピオトリカム・ポロサムに属すると推定された。
　表１は選抜した５株のエルゴチオネイン（ＥＧＴ）の生産量と生産速度を示す。表２は、公知の微生物の生産量と生産速度を示す。表１および２中、特に記載がない限り、エルゴチオネイン（ＥＧＴ）の生産量の単位はｍｇ／Ｌであり、ＥＧＴの生産速度はｍｇ／Ｌ／ｄ（１日当たりのエルゴチオネインの生産量）である。また、表１のＥＧＴの生産量は、培養５日目のエルゴチオネインの生産量を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
　表１および２より、選抜した５株のエルゴチオネインの生産量は、既知のエルゴチオネイン生産微生物のエルゴチオネインの生産量の同等以上だったことが分かった。また、選抜した５株のエルゴチオネインの生産速度も、既知のエルゴチオネイン生産微生物の生産速度の同等以上であったことが分かった。
　（８）Ｓ１１１株の分子系統学的位置および生理学的性質
　Ｓ１１１株の２６Ｓ　ｒＤＮＡのＤ１／Ｄ２領域塩基配列およびＩＴＳ－５．８　ｒＤＮＡ塩基配列について、国際塩基配列データベースに対するＢＬＡＳＴ相同検索を行った。その結果、担子菌系酵母の一種であるディルクメイア・チュラシマエンシスの複数の塩基配列に対して、相同率９８．４～１００％の相同性を示した。また、得られた塩基配列をもとに解析した分子系統樹において、Ｓ１１１株はディルクメイア・チュラシマエンシスの複数の塩基配列と同一の分子系統学的位置を示した。
　Ｓ１１１株を、ＹＭ寒天平板培地上で２７℃７日間培養し、形成されたコロニーを観察した。コロニーの周縁の形状は全縁であり、隆起状態は平坦、シワ状だった。また、コロニーの表面の形状は平滑であった。さらに、コロニーは鈍光性およびバター様を有し、薄橙色～クリーム色であった。
　また、Ｓ１１１株を、ＹＭ寒天平板培地上で２７℃７日間培養後、細胞形態性状についても観察した。栄養細胞は楕円形～卵形であり、増殖は出芽によることが認められた。培養開始４週間以上経過した平板で有性生殖器官の形成は認められなかった。
　上記のＳ１１１株の形態学的性質は、Ｄ１／Ｄ２領域およびＩＴＳ領域のＤＮＡ配列解析で帰属されたディルクメイア・チュラシマエンシスの特徴にほぼ一致していた。Ｓ１１１株の生理学的性質を表３に示す。
　表３中、「＋」は陽性を示す。「－」は陰性を示す。「Ｗ」は弱い陽性を示す。「Ｄ」は試験開始後１週間以上の時間をかけて徐々に陽性になったことを示す、「Ｌ」は試験開始後２週間以降に急速に陽性になったことを示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
　分子系統学的位置および生理学的性質ならびにエルゴチオネインの生産量の測定より、Ｓ１１１株はディルクメイア・チュラシマエンシスに帰属される新規微生物と判断した。
　（９）ＥＡ０７１株の分子系統学的位置および生理学的性質
　ＥＡ０７１株の２６Ｓ　ｒＤＮＡのＤ１／Ｄ２領域塩基配列およびＩＴＳ－５．８　ｒＤＮＡ塩基配列について、国際塩基配列データベースに対するＢＬＡＳＴ相同検索を行った。その結果、担子菌系酵母の一種であるクリプトコッカス・フラベセンス（Cryptococcus flavescens、現行名パピリオトレマ・フラベセンス）の複数の塩基配列に対して、相同率９９．４～１００％の相同性を示した。また、得られた塩基配列をもとに解析した分子系統樹において、ＥＡ０７１株はパピリオトレマ属で構成される系統群に含まれた。そして、クリプトコッカス・フラベセンス（現行名パピリオトレマ・フラベセンス）CBS942Tと同一の分子系統学的位置を示した。
　ＥＡ０７１株を、ＹＭ寒天平板培地上で２７℃７日間培養し、形成されたコロニーを観察した。コロニーの周縁の形状は全縁であり、隆起状態はクッション形だった。また、コロニーの表面の形状は平滑であった。さらに、コロニーは輝光性および粘稠性を有し、クリーム色であった。
　また、ＥＡ０７１株を、ＹＭ寒天平板培地上で２７℃７日間培養後、細胞形態性状についても観察した。栄養細胞は亜球形～楕円形であり、増殖は出芽によることが認められた。培養開始４週間以上経過した平板で有性生殖器官の形成は認められなかった。
　上記のＥＡ０７１株の形態学的性質は、Ｄ１／Ｄ２領域およびＩＴＳ領域のＤＮＡ配列解析で帰属されたパピリオトレマ・フラベセンスの特徴にほぼ一致していた。ＥＡ０７１株の生理学的性質を表４に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000004
　分子系統学的位置および生理学的性質ならびにエルゴチオネインの生産量の測定より、ＥＡ０７１株はパピリオトレマ・フラベセンスに帰属される新規微生物と判断した。
　（１０）ＥＡ３６１株の分子系統学的位置および生理学的性質
　ＥＡ３６１株の２６Ｓ　ｒＤＮＡのＤ１／Ｄ２領域塩基配列およびＩＴＳ－５．８　ｒＤＮＡ塩基配列について、国際塩基配列データベースに対するＢＬＡＳＴ相同検索を行った。その結果、担子菌系酵母の一種であるクリプトコッカス・フラベセンス（現行名パピリオトレマ・フラベセンス）の複数の塩基配列に対して、相同率９９．４～１００％の相同性を示した。また、得られた塩基配列をもとに解析した分子系統樹において、ＥＡ３６１株はパピリオトレマ属で構成される系統群に含まれた。そして、クリプトコッカス・フラベセンス（現行名パピリオトレマ・フラベセンス）CBS942Tと同一の分子系統学的位置を示した。
　ＥＡ３６１株を、ＹＭ寒天平板培地上で２７℃７日間培養し、形成されたコロニーを観察した。コロニーの周縁の形状は全縁であり、隆起状態はクッション形だった。また、コロニーの表面の形状は平滑であった。さらに、コロニーは輝光性および粘稠性を有し、クリーム色であった。
　また、ＥＡ３６１株を、ＹＭ寒天平板培地上で２７℃７日間培養後、細胞形態性状についても観察した。栄養細胞は亜球形～楕円形であり、増殖は出芽によることが認められた。培養開始４週間以上経過した平板で有性生殖器官の形成は認められなかった。
　上記のＥＡ３６１株の形態学的性質は、Ｄ１／Ｄ２領域およびＩＴＳ領域のＤＮＡ配列解析で帰属されたパピリオトレマ・フラベセンスの特徴にほぼ一致していた。ＥＡ０７１株の生理学的性質を表５に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000005
　分子系統学的位置および生理学的性質ならびにエルゴチオネインの生産量の測定より、ＥＡ３６１株はパピリオトレマ・フラベセンスに帰属される新規微生物と判断した。
　（１１）ＥＡ７０２株の分子系統学的位置および生理学的性質
　ＥＡ７０２株の２６Ｓ　ｒＤＮＡのＤ１／Ｄ２領域塩基配列およびＩＴＳ－５．８　ｒＤＮＡ塩基配列について、国際塩基配列データベースに対するＢＬＡＳＴ相同検索を行った。その結果、担子菌系酵母の一種であるトリコスポロン・ポロサム（現行名アピオトリカム・ポロサム）の複数の塩基配列に対して、相同率９９．３～１００％の相同性を示した。また、得られた塩基配列をもとに解析した分子系統樹において、ＥＡ７０２株はトリコスポロン（アピオトリカム）属で構成される系統群に含まれた。そして、トリコスポロン・ポロサム（現行名アピオトリカム・ポロサム）CBS2040Tと同一の分子系統学的位置を示した。
　ＥＡ７０２株を、ＹＭ寒天平板培地上で２７℃７日間培養し、形成されたコロニーを観察した。コロニーの周縁の形状は菌糸状であった。コロニーの隆起状態は、周縁部が扁平であり、中央部が隆起だった。また、コロニーの表面の形状はシワ状であった。コロニーは鈍光性を有していた。さらに、コロニーは湿性～やや乾燥状であり、色が白色～白クリーム色であった。
　また、ＥＡ７０２株を、ＹＭ寒天平板培地上で２７℃７日間培養後、細胞形態性状についても観察した。栄養細胞は楕円形～卵形であり、増殖は出芽によることが認められた。また、菌糸伸長に伴い、側出芽的に増殖した。培養開始４週間以上経過した平板で有性生殖器官の形成は認められなかった。
　上記のＥＡ７０２株の形態学的性質は、Ｄ１／Ｄ２領域およびＩＴＳ領域のＤＮＡ配列解析で帰属されたアピオトリカム・ポロサムの特徴にほぼ一致していた。ＥＡ７０２株の生理学的性質を表６に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
　分子系統学的位置および生理学的性質ならびにエルゴチオネインの生産量の測定より、ＥＡ７０２株はパピリオトレマ・フラベセンスに帰属される新規微生物と判断した。
　本発明の微生物は、エルゴチオネインの生産量が高く、健康および美容等の分野において利用可能である。
　ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５１
　ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５２
　ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５３
　ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５４

Claims (2)

  1. 　ディルクメイア・チュラシマエンシスに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５４）、パピリオトレマ・フラベセンスに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５１）、パピリオトレマ・フラベセンスに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５２）、または、アピオトリカム・ポロサムに属する微生物（ＮＩＴＥ　ＢＰ－０３０５３）。
  2. 　請求項１に記載の微生物を培養し、エルゴチオネインを含む培養物を得る工程を含む、エルゴチオネインの生産方法。
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