WO2020230780A1 - Ras阻害ペプチド - Google Patents

Ras阻害ペプチド Download PDF

Info

Publication number
WO2020230780A1
WO2020230780A1 PCT/JP2020/018956 JP2020018956W WO2020230780A1 WO 2020230780 A1 WO2020230780 A1 WO 2020230780A1 JP 2020018956 W JP2020018956 W JP 2020018956W WO 2020230780 A1 WO2020230780 A1 WO 2020230780A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
group
pro
cys
amino acid
peptide
Prior art date
Application number
PCT/JP2020/018956
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
孝太郎 坂元
Original Assignee
一丸ファルコス株式会社
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 一丸ファルコス株式会社 filed Critical 一丸ファルコス株式会社
Priority to JP2021519437A priority Critical patent/JPWO2020230780A1/ja
Priority to EP20805621.8A priority patent/EP3970801A4/en
Priority to US17/609,784 priority patent/US20220227813A1/en
Priority to CN202080030445.8A priority patent/CN113727991A/zh
Publication of WO2020230780A1 publication Critical patent/WO2020230780A1/ja

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K7/00Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K7/64Cyclic peptides containing only normal peptide links
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Definitions

  • the present invention relates to a peptide or the like that inhibits the activity of Ras, and more particularly to a cyclic peptide or the like having a specific amino acid sequence and a cyclic structure.
  • the Ras protein (meaning the Ras subfamily, hereinafter abbreviated as Ras) is a GTPase expressed in cells, and by binding to GDP or GTP, cell proliferation signal transduction is turned off (inactivated) / on (active). It functions as a molecular switch that controls the transformation.
  • the GDP-bound type is in the off state and the GTP-bound type is in the on state.
  • a guanine nucleotide exchange factor (GEF) induced by a signal from a cell surface receptor converts Ras from GDP-bound to GTP-bound, and GTP-bound Ras interacts with downstream proteins such as RAF and PI3K. By doing so, the signal is further transmitted.
  • Ras-bound GTP is hydrolyzed from GTP to GDP with the help of Ras' own enzymatic activity and GTPase-activating protein (GAP).
  • GAP GTPase-activating protein
  • Ras consists of 188 to 189 amino acid sequences, and any amino acid mutation greatly suppresses its own GTPase activity and the resolution of GTP to be hydrolyzed by GAP, and is biased toward the GTP-bound type. As a result, the cell proliferation signal is prolonged.
  • Non-Patent Document 1 Approximately 30% of human tumors express mutant Ras with amino acid mutations, which is used as a driver for tumor growth.
  • K-Ras, N-Ras, and H-Ras are examples of members who are attracting attention as drug discovery targets.
  • amino acid mutations of K-Ras are known to occur at the highest frequency of about 20% of human tumors (Non-Patent Document 1).
  • Non-Patent Document 2 It has been reported that most of the amino acid mutation positions in K-Ras are position 12 glycine, followed by position 13 glycine, position 61 glutamine, and other positions. The most common mutations in position 12 glycine are aspartic acid (about 30%), followed by valine (about 20%), cysteine (about 10%), alanine (about 5%), and serine (about 5%). About 5%), arginine (about 3%), and other amino acids (Non-Patent Document 2).
  • K-Ras which is K-Ras in which glycine at position 12 is mutated to aspartic acid
  • G12D K-Ras in which glycine at position 12 is mutated to aspartic acid
  • the present inventor selectively bound K-Ras (G12D) over wild-type K-Ras in cell-free tests, and GDP-bound K-Ras (G12D) became GTP-bound K-Ras ( Cyclic peptide KRpep-2d that inhibits conversion to G12D): Ac-Arg-Arg-Arg-Arg-c (Cys-Pro-Leu-Tyr-Ile-Ser-Tyr-Asp-Pro-Val-Cys) It was reported that -Arg-Arg-Arg-Arg-Arg-NH 2 (SEQ ID NO: 22) was found (Non-Patent Document 3).
  • KRpep-2d was shown in cell studies to significantly and selectively suppress the proliferation of A427 cells expressing K-Ras (G12D).
  • the present inventor has analyzed the crystal structure of the complex of KRpep-2d and K-Ras (G12D) and reported the mechanism of its binding (Non-Patent Document 4).
  • KRpep-2d which is composed only of natural amino acids, has low resistance to protease degradation.
  • Cys cysteines
  • the present inventor has shown that in a cell-free test under reducing conditions containing dithiothreitol (DTT), the inhibitory activity of KRpep-2d on the exchange reaction of K-Ras (G12D) from GDP-bound to GTP-bound.
  • DTT dithiothreitol
  • the inhibitory activity is attenuated by 50 times or more as compared with the inhibitory activity under non-reducing conditions (Non-Patent Documents 3 and 5).
  • the significant growth inhibitory activity of KRpep-2d in a cell test is several to several tens of ⁇ M (Non-Patent Documents 3 and 5), and it can be used as a drug, a diagnostic agent, and / or a research reagent. There is room for improvement.
  • the present invention has been made in view of such a problem, the object of which is to improve at least one of the above problems for using a Ras inhibitor peptide as a drug, a diagnostic agent, and / or a research reagent.
  • the purpose is to provide a novel Ras inhibitory peptide.
  • the present inventor has found a novel group of Ras-inhibiting peptides in conducting an optimization study of KRpep-2d.
  • Ras binding activity and protease degradation resistance of KRpep-2d are based on the structural information of the complex of KRpep-2d and K-Ras (G12D) described in Non-Patent Document 4.
  • Amino acid substitution was predicted to improve functions such as cell growth inhibitory activity.
  • KRpep-2d is (1) circularized by a disulfide bond between the side chains of 5-position Cys and 15-position Cys, and (2) the amino acids at positions 6 to 14 are used as pharmacophore with K-Ras (G12D).
  • the predominantly interacting amino acids (3) at positions 1 to 4 and 16 to 19 mainly contribute to the intracellular translocation of peptides, but when deleted, they bind to Ras and inhibit them. Since the activity is significantly attenuated (Non-Patent Documents 4 and 5), it also contributes to the control of the three-dimensional structure of the peptide. Therefore, (1) a binding form in which the disulfide bond between the side chains of 5-position Cys and 15-position Cys is not easily cleaved even under reducing conditions so that Ras binding activity can be maintained even under reducing intracellular conditions. , (2) Introducing an unnatural amino acid structure at positions 6 to 14 to enhance interaction with Ras, (3) Positions 1 to 4 and 16 for the purpose of reducing molecular weight.
  • X 3, X 5 and X 7 is an amino acid residue having a respective amino acid residue having a hydrocarbon group which may have a substituent independently optionally substituted aromatic carbocyclic group , An amino acid residue having an aromatic heterocyclic group which may have a substituent, or a derivative thereof.
  • X 8 is an aspartic acid residue or a derivative thereof, and X 2 , X 6 , X 9 , and X 10 are arbitrary amino acid residues.
  • X 1 and X 11 and X 4 and X 11 independently form an indirect covalent bond between them, either directly or via a linker, whereby the peptide of formula (1) is intramolecular.
  • the covalent bond between X 1 and X 11 is any of their main chain-main chain, main chain-side chain, side chain-main chain, or side chain-side chain.
  • may, also, covalent bond between X 4 and X 11 are their side chains - between the main chain, or side chain - can be any bond between side chains.
  • a novel cyclic peptide useful for using the Ras inhibitory peptide as a drug, a diagnostic agent, and / or a research reagent.
  • FIG. 1 shows amino acid sequences involved in functions such as Ras binding activity (pharmacophore) of KRpep-2d, cyclic structure regulation (SS binding), and cell-penetrating peptide (CPP). Moreover, the outline of the structure of the peptide of this invention which modified KRpep-2d is shown.
  • FIG. 2 shows an example of amino acids used in the amino acid residue substitution study at each amino acid position of KRpep-2d.
  • FIG. 3 outlines a competitive binding test by ELISA used to compare the binding activity of a peptide substituted with an amino acid residue to that of K-Ras (G12D) with that of KRpep-2d.
  • FIG. 4 shows the peptide concentration-dependent binding activity of N-terminal biotin-modified KRpep-2d (Biotin-KRpep-2d) to K-Ras (G12D).
  • FIG. 5 shows wild-type K-Ras, K-Ras (G12D), K-Ras (G12V), K-Ras (G12C), K-Ras (G13D), and wild-type biomodified products of the peptides of the present invention.
  • FIG. 6 shows the results of mixing KRpep-2d and a representative example of the peptide of the present invention with rat plasma and comparing the resistance to protease degradation.
  • FIG. 7A shows the results of evaluation of the growth inhibitory activity on A427 cells expressing K-Ras (G12D) by quantification of ATP with respect to KRpep-2d and a representative example of the peptide of the present invention.
  • FIG. 7B shows the results of evaluating the growth inhibitory activity of the peptide of sequence 17 on PANC-1 cells expressing K-Ras (G12D) by quantification of ATP.
  • FIG. 8 shows the results of evaluating the anticancer activity of a representative example of the peptide of the present invention by administering it to subcutaneous cancer-bearing mice by tail vein.
  • FIG. 9 shows the results of evaluating the anticancer activity of a representative example of the peptide of the present invention by administering it to an orthotopic transplant model mouse by tail vein.
  • FIG. 10 shows a structural formula of a representative example of the peptide of the present invention used in the examples.
  • a peptide refers to a peptide in which two or more amino acids are bound by an amide bond (peptide bond), and for example, 2 to 20 amino acids may be bound by an amide bond.
  • the left end is the N-terminal (amino terminal) and the right end is the C-terminal (carboxy-terminal) according to the convention of peptide marking.
  • the first carbon atom adjacent to the carbonyl group forming the peptide bond is referred to as C ⁇ carbon.
  • arbitrary amino acid or a derivative thereof is used in the broadest sense, and in addition to a natural amino acid, an artificial amino acid having an unnatural structure and a property known in the art which is a characteristic of the amino acid. It also contains chemically synthesized compounds as well as carboxylic acids having functional groups.
  • unnatural amino acids are D-amino acids, ⁇ / ⁇ -disubstituted amino acids with different main chain structures (such as ⁇ -methylated amino acids such as 2-aminoisobutyric acid), and N-alkyl-amino acids (N-methyl).
  • the hydrocarbon group which may have a substituent is, for example, methyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, sec-butyl, tert-butyl, pentyl, isopentyl, neopentyl, 1-.
  • C 1-10 alkyl groups such as ethylpropyl, hexyl, isohexyl, 1,1-dimethylbutyl, 2,2-dimethylbutyl, 3,3-dimethylbutyl, 2-ethylbutyl, ethenyl, 1-propenyl, 2-propenyl, 2-Methyl-1-propenyl, 1-butenyl, 2-butenyl, 3-butenyl, 3-methyl-2-butenyl, 1-pentenyl, 2-pentenyl, 3-pentenyl, 4-pentenyl, 4-methyl-3- C 2-10 alkenyl groups such as pentenyl, 1-hexenyl, 3-hexenyl, 5-hexenyl, ethynyl, 1-propynyl, 2-propynyl, 1-butynyl, 2-butynyl, 3-butynyl, 1-pentynyl, 2- C 2-10 alkynyl groups such as
  • 5- to 6-membered monocyclic aromatic heterocycles such as 1,2,4-oxadiazolyl, 1,3,4-oxadiazolyl, 1,2,4-thiadiazolyl, 1,3,4-thiadiazolyl, triazolyl, tetrazolyl, triazinyl, etc.
  • Ras means all wild-type proteins and amino acid mutant proteins of the Ras subfamily such as K-Ras, N-Ras, and H-Ras of mammals such as mice, rats, dogs, monkeys, and humans. , Both GDP-bound and GTP-bound.
  • the peptide of the present invention (1) inhibits the binding of the previously reported Ras inhibitory peptide KRpep-2d to the Ras protein of a biotin-labeled product. That, (2) binding to Ras protein in a concentration-dependent manner, (3) inhibiting the phosphorylation of Erk in Ras-expressing cells, (4) suppressing the proliferation of Ras-expressing cells, etc. Meaning, when any one of these effects is shown, it is said to have "Ras inhibitory activity”.
  • the presence or absence of Ras inhibitory activity can be confirmed according to a method known to those skilled in the art.
  • Examples of the method for confirming the inhibitory activity include a method for evaluating the reaction in which GDP on the Ras protein is exchanged for GTP (Non-Patent Document 3), a method for co-culturing Ras-expressing cells and a peptide, and a signal downstream of Ras.
  • a method for examining the presence or absence of phosphorylation of a certain Erk (Non-Patent Document 3), a method for co-culturing Ras-expressing cells and a peptide and examining the presence or absence and rate of proliferation of the cells (Non-Patent Document 3), a cancer-bearing mouse, etc. Examples include, but are not limited to, a method of administering a peptide to a disease model animal of the above and examining the presence or absence and rate of growth of cancer cells.
  • FIG. 1 shows characteristics related to Ras-binding activity of KRpep-2d (pharmacophore), cyclic structure regulation (SS binding), intracellular transferability (Cell Penetrating Peptide: CPP), etc., which were the basis of cyclic peptide design.
  • KRpep-2d the 6th to 14th amino acid residues forming the Ras binding site correspond to the 2nd to 10th amino acid residues in the cyclic peptide of this embodiment.
  • the cyclization between the 5th and 15th cysteine residues in KRpep-2d is the binding A between the 1st and 11th amino acid residues and the 4th and 11th amino acid residues in the cyclic peptide of this embodiment. It is more stabilized as a two cyclic structure with bond B between amino acid residues. Then, an example of the amino acid subjected to the substitution of the amino acid residue at each amino acid position of KRpep-2d is shown in FIG.
  • the cyclic peptide in one preferred embodiment of the present invention can be represented by the following formula (1).
  • c [X 1- X 2- X 3- c (X 4- X 5- X 6- X 7- X 8- X 9- X 10- X 11 )]
  • each amino acid residue of X 1 to X 11 is as follows.
  • X 1 , X 4 and X 11 independently represent an amino acid residue having an amino group, a carboxy group, a thiol group, an allyl group, an alkynyl group, an azido group, or a halogen atom, or a derivative thereof.
  • X 3, X 5 and X 7 is an amino acid residue having a respective amino acid residue having a hydrocarbon group which may have a substituent independently optionally substituted aromatic carbocyclic group , Or an amino acid residue having an aromatic heterocyclic group which may have a substituent, or a derivative thereof.
  • X 8 is an aspartic acid residue or a derivative thereof, and X 2 , X 6 , X 9 , and X 10 are arbitrary amino acid residues.
  • the amino group and the carboxy group in the "amino acid residue having an amino group or a carboxy group" may be a group forming an amide bond in the main chain.
  • X 1 and X 11 and X 4 and X 11 independently form an indirect covalent bond between them, either directly or via a linker, whereby the peptide of formula (1) is intramolecular.
  • the covalent bond between X 1 and X 11 is any of their main chain-main chain, main chain-side chain, side chain-main chain, or side chain-side chain.
  • may, also, covalent bond between X 4 and X 11 are their side chains - between the main chain, or side chain - can be any bond between side chains.
  • X represents CH 2- S—CH 2
  • examples thereof include a thioether bond formed by a thiol-ene reaction between the main chain allyl group of 3-butenoic acid and the side chain thiol group of 11-position cysteine.
  • CH CH
  • Y represents S-CH 2 -S
  • X 4 and X 11 are both cysteine, between side chain thiol group of 4-position of the side chain thiol group and diiodomethane (DIM) Linker and 11 of -S-CH 2 -S-bonds formed in.
  • DIM diiodomethane
  • Y represents S- (CH 2 ) 3- S, for example, between the side chain thiol group of 4-position cysteine, the 1,3-diiodopropane (DIP) linker and the side chain thiol group of 11-position cysteine. Examples include the formed -S- (CH 2 ) 3 -S-bond.
  • Y triazole
  • a triazole-mediated bond formed by a click reaction between the side chains of 4-position butenyl-L-glycine and 11-position ⁇ -azido-L-alanine.
  • X 3 and X 5 are amino acid residues independently represented by any of the following formulas (4) to (7).
  • the amino acid residue of formula (4) is (In the formula, the wavy line represents the attachment point with the carbonyl group or the nitrogen atom forming the amide bond of the main chain, and R 1 , R 2 and R 6 each independently represent the hydrogen atom or the methyl group, and R 3 , R 4 and R 5 each independently represent a hydrogen atom, a methyl group, or a halogen atom (F, Cl, Br, I), and n represents an integer of 0 to 10). ..
  • leucine, norleucine, isoleucine, valine, 2-aminoheptanoic acid, 2-aminooctanoic acid, 2-aminononanoic acid, 2-aminodecanoic acid, ⁇ -methyl-leucine and 5,5'-dimethylnorleucine, etc. preferable.
  • the amino acid residue of formula (5) is (In the formula, Z represents C or N, R 6 represents a hydrogen atom or a methyl group, and n represents an integer of 1 to 6).
  • Z represents C or N
  • R 6 represents a hydrogen atom or a methyl group
  • n represents an integer of 1 to 6.
  • cyclobutylglycine, cyclopentylglycine, cyclohexylglycine and the like are preferable.
  • the amino acid residue of the following formula (6) is (In the formula, R 7 , R 8 , R 9 , R 10 and R 11 independently represent a hydrogen atom or a halogen atom (F, Cl, Br, I), and R 6 is a hydrogen atom or a methyl group. Represents).
  • R 7 , R 8 , R 9 , R 10 and R 11 independently represent a hydrogen atom or a halogen atom (F, Cl, Br, I)
  • R 6 is a hydrogen atom or a methyl group.
  • phenylglycine, 3-chlorophenylglycine, 2-chlorophenylglycine, 4-chlorophenylglycine, 3-fluorophenylglycine, 2-fluorophenylglycine, 4-fluorophenylglycine and the like are preferable.
  • the amino acid residue of formula (7) is (In the formula, R 12 is a 2-thienyl group, a 3-thienyl group, a 2-pyridyl group, a 3-pyridyl group, a 4-pyridyl group, a 2-thiazolyl group, a 4-thiazolyl group, a 2-oxazolyl group, 4-. oxazolyl group, 1-pyrazolyl group, 1-imidazolyl group, a 1,2,3-triazol-1-yl group, or 1,2,4-triazol-1-yl group, R 6 is a hydrogen atom, or Represents a methyl group).
  • the amino acid residue represented by any of these formulas (4) to (7) may be a derivative thereof.
  • X 7 is an amino residue represented by any of the following formulas (8) to (11).
  • the amino acid residue of formula (8) is (In the formula, the wavy line represents the attachment point with the carbonyl group or nitrogen atom forming the amide bond of the main chain, and R 7 , R 8 , R 9 , R 10 , and R 11 are independent hydrogen atoms and hydroxy groups, respectively.
  • R 6 represents a hydrogen atom or a methyl group). ..
  • 4-fluorophenylalanine, 4-methylphenylalanine, 4-chlorophenylalanine, 4-trifluoromethyl-phenylalanine, 4-bromophenylalanine, 4-iodophenylalanine and the like are preferable.
  • the amino acid residue of formula (9) is (In the formula, R 13 , R 14 , R 15 and R 16 are independently hydrogen atoms, hydroxy groups, methoxy groups, methyl groups, tert-butyl groups, methyl halide groups, or halogen atoms (F, Cl, It represents Br, I), and R 6 is represented by a hydrogen atom or a methyl group).
  • R 13 , R 14 , R 15 and R 16 are independently hydrogen atoms, hydroxy groups, methoxy groups, methyl groups, tert-butyl groups, methyl halide groups, or halogen atoms (F, Cl, It represents Br, I)
  • R 6 is represented by a hydrogen atom or a methyl group.
  • tryptophan, 6-chlorotryptophan, 5-chlorotryptophan and the like are preferable.
  • the amino acid residue of formula (10) is (In the formula, the wavy line represents the bond site with the carbonyl group or nitrogen atom forming the amide bond of the main chain, Z represents C or N, R 6 represents a hydrogen atom or a methyl group, and n represents a hydrogen atom or a methyl group. It represents an integer of 1 to 6). Among these, cyclohexylalanine and the like are preferable.
  • R 17 is a 2-thienyl group, a 3-thienyl group, a 2-pyridyl group, a 3-pyridyl group, a 4-pyridyl group, a 2-thiazolyl group, a 4-thiazolyl group, a 2-oxazolyl group, 4-.
  • X 6 is an amino acid residue represented by the following formula (12):
  • the wavy line represents the attachment point with the carbonyl group or nitrogen atom forming the amide bond of the main chain
  • R 18 , R 19 , and R 20 are independently hydrogen atom, hydroxy group, methoxy group, amino group, respectively.
  • 6 represents a hydrogen or a methyl group
  • n represents 0 or 1.
  • valine, leucine, serine, threonine and 2,3-diaminopropanoic acid are preferable.
  • X 2 and X 9 are amino acids having a hydrocarbon group which may independently have a substituent, N-methylated glycine, 2-azetidine-2-carboxylic acid, proline, thioproline, 3, Represents 4-dehydroproline, pipecholinic acid, or derivatives thereof.
  • X 10 is valine, norvaline, leucine, norleucine, isoleucine, methionine, cyclopropylglycine, cyclobutylglycine, phenylalanine, 4-fluoro-phenylalanine, 2-thienylalanine, 3-thienylalanine, 2-pyridylalanine, 3-Pyridylalanine, 4-Pyridylalanine, 2-thiazolylalanine, 4-thiazolylalanine, 2-oxazolylalanine, 4-oxazolylalanine, 1-pyrazolylalanine, 1-imidazolylalanine, 3- (1,2,3-triazole-1-yl) -alanine, 3- (1,2,4-triazole-1-yl) -alanine, 3- (1H-benzoimidazole-1-yl) -alanine, 3 -(1H-Benzoimidazole-2-yl) -alanine, 3- (1,3
  • the cyclic peptide in one embodiment of the present invention has the following formula (13): c [X 1 -Pro-X 3- c (Cys-X 5- Ser-4fF-Asp-Pro-X 10- X 11 )] Consists of the amino acid sequence represented by (13).
  • X 1 represents ⁇ -alanine or ⁇ -aminobutyric acid residue
  • X 3 is leucine, norleucine, cyclohexylglycine, phenylglycine, 2-aminoheptanoic acid, 2-aminooctanoic acid
  • 2 - represents aminononanoic acid or 2 aminodecane residue
  • X 5 is isoleucine, norleucine, cyclohexylglycine, phenylglycine, 2-amino-heptanoic acid, 2-amino octanoic acid, 2-aminononanoic acid or 2 aminodecane acid residue
  • X 10 represents valine, phenylalanine, tryptophan, 1-naphthylalanine or their N-methylated amino acid residues
  • X 11 represents D-form or L-form cysteine residues.
  • X 1 and X 11 form an amide bond between the amino group and the carboxyl group of the main chain
  • X 4 and X 11 form a methylene group and an ethylene group between the respective side chains and SH groups.
  • a covalent bond is formed via a linker of a propylene group or a butylene group, whereby the peptide of formula (13) has two cyclic structures in the molecule.
  • a cyclic peptide of a more preferable embodiment is described in the following formula (14): c [ ⁇ Ala-Pro-X 3- c (Cys-X 5- Ser-4fF-Asp-Pro-Trp- D Cys)] It consists of the amino acid sequence represented by (14).
  • X 3 represents leucine, norleucine, cyclohexylglycine, phenylglycine, 2-aminoheptanoic acid, 2-aminooctanoic acid, 2-aminononanoic acid or 2-aminodecanoic acid residue
  • X 5 is Represents isoleucine, norleucine, cyclohexylglycine, phenylglycine, 2-aminoheptanoic acid, 2-aminooctanoic acid, 2-aminononanoic acid or 2-aminodecanoic acid residue.
  • residues at the 1st and 11th positions form an amide bond between the amino group and the carboxyl group of the main chain
  • the two cysteine residues at the 4th and 11th positions are the side chain-SH groups, respectively.
  • a covalent bond is formed between the peptides via a linker of a propylene group, whereby the peptide of formula (14) has two cyclic structures in the molecule.
  • Examples of the individual cyclic peptides contained in the above formula (13) or formula (14) include the following examples. c [ ⁇ Ala-Pro-Nle-c (Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Val-Cys)] (SEQ ID NOs: 1-3) c [ ⁇ Ala-Pro-Nle-c (Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Val- D Cys)] (SEQ ID NOs: 4-6) c [ ⁇ Aba-Pro-Nle-c (Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Val-Cys)] (SEQ ID NOs: 7-9) c [ ⁇ Aba-Pro-Nle-c (Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Val- D Cys)] (SEQ ID NOs: 10-12) c [ ⁇ Ala-Pro-Nle-c (Cys-Phg-Ser-4fF
  • the peptide according to the present invention is a peptide having homology in which one to several amino acids are deleted, added, and / or substituted in the amino acid sequence represented by the above [1] to [10]. Even if there is, those having a binding activity to Ras are included.
  • the number of those amino acids is not particularly limited as long as the peptide has Ras-binding activity. However, the number is preferably 1 to 5, and more preferably 1 or 2.
  • the sites of deletion, addition, and / or substitution may be at the end of the peptide, in the middle, at one place, or at two or more places.
  • amino acid sequence in which one to several amino acids are deleted, added, and / or substituted in the above amino acid sequence the amino acid sequence and BLAST (Basic Local Alginment Search Tool at the National Center for Biological Information (USA)). At least 50% or more, preferably 70% or more, more preferably 80, when calculated using (eg, using default or default parameters), etc. (eg, the National Center for Biological Information, Basic Local Alignment Search Tool). % Or more, particularly preferably 90% or more.
  • peptides and protein domains that have highly similar three-dimensional structures even if they have low primary structural homology. Therefore, a peptide having at least 50% or more, preferably 70% or more, more preferably 80% or more, particularly preferably 90% or more of three-dimensional structural homology with the above amino acid sequence, and having Ras-binding activity is also present. Included in embodiments.
  • the homology of the three-dimensional structures of such peptides can be predicted as follows from the amino acid sequence of the peptide having an unknown three-dimensional structure by using a homology modeling method or the like.
  • target sequence having a sequence similar to that of the cyclic peptide (reference peptide) of the present embodiment
  • an alignment sequence juxtaposition
  • the target sequence and the reference sequence are given. ..
  • the correspondence relationship between the target sequence and the reference sequence for each amino acid is determined. Based on this relationship, each amino acid on the target sequence is determined from the three-dimensional coordinates of the reference peptide. Create 3D coordinates of. In the construction of three-dimensional coordinates, structurally inappropriate gaps, collisions, and distortions may occur between amino acid residues, and these structural distortions are eliminated by energy minimization calculation.
  • the modeling software in order to smoothly eliminate this structural distortion, it may be performed step by step instead of simultaneously for all the atoms of the peptide. That is, it is first performed on the ⁇ carbon atom forming the skeleton of the peptide, then on the main chain atom containing the ⁇ carbon atom, and finally on the entire peptide containing the side chain atom. If the alignment with respect to the target sequence is obtained in this way, the three-dimensional structure can be predicted and constructed.
  • the index of three-dimensional structure homology can be compared using RMSD (Root Mean Square Deviation) or the like, which is the difference in XYZ coordinates when optimally superposed.
  • the peptides of the invention also include various derivatives and / or modifications thereof, as long as they solve the problems of the present invention.
  • Such derivatives include those in which the saturated fatty chain of the peptide is replaced with an unsaturated fatty chain, those in which some of the atoms of the peptide are replaced with other atoms including radioactive or non-radioactive isotope atoms, and peptides.
  • the amide bond of the peptide is N-alkylated, and some of the functional groups of the peptide are halogenated, cyanated, nitrated, oxoylated, hydroxyated, aminated, deaminoated, dehydrolated, amidated, and acetylated. , Prenylated, prenylated, alkylated, etc. (for example, some amino groups of the peptide are acetylated, alkylated or deaminoized, some of the carboxy groups of the peptide are amides.
  • peptide is multimerized via a chemical linker
  • peptide is Biotin-labeled
  • peptides fluorescently labeled peptides luminescent labeled
  • alkyl chains polyethylene glycols
  • antibodies, lectins, sugar chains enzymes, membrane-permeable peptides , Low molecular weight compounds, and those obtained by fusing a peptide with a molecule that induces ubiquitination of a protein, etc., but are not limited thereto.
  • the peptide of the present invention also includes a salt of the peptide.
  • a salt with a physiologically acceptable base or acid is used.
  • an additional salt of an inorganic acid hydroochloride, hydrobromic acid, hydroiodic acid, sulfuric acid, phosphoric acid, etc.
  • an organic Addition salts of acids p-toluene sulfonic acid, methane sulfonic acid, oxalic acid, p-bromophenyl sulfonic acid, carboxylic acid, succinic acid, citric acid, benzoic acid, acetic acid, etc.
  • inorganic bases ammonium hydroxide or alkali
  • Alkaline earth metal hydroxides carbonates, bicarbonates, etc.
  • the peptide of the present invention may be a prodrug.
  • a prodrug is a compound that is converted to the peptide of the present invention by a reaction with an enzyme or gastric acid under physiological conditions in vivo, that is, a compound that enzymatically undergoes oxidation, reduction, hydrolysis, etc. to change to the peptide of the present invention.
  • Examples of the prodrug of the peptide of the present invention include compounds in which the amino group of the peptide of the present invention is acylated, alkylated or phosphorylated (for example, the amino group of the peptide of the present invention is echosanoylated, alanylated or pentylaminocarbonylated.
  • Alkylation, alanylation, or dimethylaminomethylcarbonylated compounds compounds in which the hydroxy or carboxy groups of the peptides of the invention are esterified or amidated (eg, hydroxy or carboxy groups of the peptides of the invention) C 1-6 Alkylation, phenyl esterification, carboxymethyl esterification, dimethylaminomethyl esterification, pivaloyloxymethyl esterification, ethoxycarbonyloxyethyl esterification, phthalidyl esterification, (5-methyl-2- Examples include, but are not limited to, oxo-1,3-dioxolen-4-yl) methyl esterified, cyclohexyloxycarbonylethyl esterified, or methylamided compounds). These compounds can be produced from the peptides of the invention by methods known per se.
  • the prodrug of the peptide of the present invention may be changed to the peptide of the present invention under physiological conditions as described in "Drug Development", Vol. 7, Molecular Design, pp. 163 to 198 of Hirokawa Shoten, 1990. Good.
  • the prodrug may form a salt
  • examples of the salt include those exemplified as the salt of the peptide of the present invention.
  • the peptide of the present invention may be a crystal, and is included in the peptide of the present invention regardless of whether it has a single crystal form or a mixture of crystalline forms. Crystals can be produced by crystallization by applying a crystallization method known per se.
  • the peptide of the present invention may be a pharmaceutically acceptable co-crystal or co-crystal salt.
  • the co-crystal or co-crystal salt is two or more kinds at room temperature, each having different physical properties (for example, structure, melting point, heat of fusion, hygroscopicity, solubility and stability). It means a crystalline substance composed of a unique solid.
  • the co-crystal or co-crystal salt can be produced according to a co-crystallization method known per se.
  • Sequence 17, Sequence 20 (LO2) and Sequence 21 (LO3) which are representative examples of the amino acid sequence group represented by this embodiment, have resistance to protease degradation and K-Ras (G12D).
  • LO2 Sequence 17, Sequence 20
  • LO3 Sequence 21
  • G12D K-Ras
  • KRpep-2d binds not only to K-Ras (G12D) but also to K-Ras (G12C) and wild-type K-Ras, and its binding activity is to both GDP-binding Ras and GTP-binding Ras. It has been confirmed that they are almost equivalent (Non-Patent Document 3 and Non-Patent Document 4). And the amino acid sequence of Ras is highly conserved regardless of the presence or absence of mutation.
  • the biotin modified product (Biotin-BC-1) of the representative example of the amino acid sequence group represented by this embodiment is wild type K-Ras, K-Ras (G12D), K- Ras (G12V), K-Ras (G12C), K-Ras (G13D), wild N-Ras, N-Ras (Q61K), wild H-Ras, H-Ras (G12V), and H-Ras ( It binds to Q61L).
  • the amino acid sequence group represented by the present embodiment has an amino acid sequence and three-dimensional structural features similar to those of KRpep-2d pharmacophore and Biotin-BC-1, mutant K-Ras and mutant N.
  • -It binds to all Ras such as Ras and mutant H-Ras, and its binding activity is for both GDP-bound Ras and GTP-bound Ras, and it is highly possible that the binding inhibits the function of Ras in general. it is conceivable that.
  • Biotin-BC-1's K-Ras (G12D) binding activity and sequences 1-21 to K-Ras (G12D) -expressing cells show the following.
  • (1) the covalent bond between the 1st and 11th positions has a wide range of shapes, from a flexible structure such as an SS bond to a relatively rigid structure having flatness such as an amide bond. Accepts the structure of.
  • the target binding activity of a cyclic peptide generally draws a bell-shaped shape with the optimum cyclic size as the apex, and thus is shared between the 4-11 positions of the dicyclic peptide of the present invention.
  • Bonds are highly likely to be accepted if the number of atoms between C ⁇ carbons peaks at 4 to 8 and further increases by about 1 to 2 atoms. That is, the covalent bond between the 4- and 11-positions is considered to accept a wide range of atoms between C ⁇ carbons from 4 to 10.
  • the covalent bond between the 4-11 positions contributes to the regulation of the bicyclic structure of the peptide, but does not directly contribute to the Ras bond.
  • the amino acid sequence of Ras in general is highly conserved in mammals, the peptide group consisting of the amino acid sequence represented by this embodiment is a mutant K- of mammals other than humans such as mice, rats, dogs, and monkeys. It is highly likely that it also binds to Ras, mutant N-Ras, and / or mutant H-Ras and inhibits its function.
  • the peptide of the present embodiment can be produced by a known peptide production method such as a liquid phase method, a solid phase method, or a chemical synthesis method such as a hybrid method combining a liquid phase method and a solid phase method.
  • a commercially available automatic synthesizer can be used for the solid phase method.
  • the hydroxyl group of a resin having a hydroxyl group and the carboxy group of the first amino acid (usually the C-terminal amino acid of the target peptide) in which the ⁇ -amino group is protected by a protecting group such as Fmoc group are subjected to an esterification reaction.
  • known dehydration condensing agents such as 1-mesitylenesulfonyl-3-nitro-1,2,4-triazole (MSNT), dicyclohexylcarbodiimide (DCC), and diisopropylcarbodiimide (DIPCDI) can be used.
  • the protective group of the ⁇ -amino group of the first amino acid is eliminated, and the second amino acid in which all functional groups other than the carboxy group of the main chain are protected is added to activate the carboxy group.
  • the first and second amino acids are bound.
  • the ⁇ -amino group of the second amino acid is deprotected, and a third amino acid in which all functional groups other than the carboxy group of the main chain are protected is added to activate the carboxy group to activate the second and second amino acids. Bind the third amino acid.
  • This is repeated to synthesize a peptide of the desired length.
  • the linear peptide is cleaved from the resin, purified, and then the functional groups for cyclizing the peptide are deprotected and the peptide is cyclized according to a conventional method.
  • Resins for solid phase synthesis include Merrifield resin, MBHA resin, Cl-Trt resin, SASRIN resin, Wang resin, Link amide resin, HMFS resin, Amino-PEGA resin (Merck), HMPA-PEG, etc. Can be mentioned. These resins may be used after washing with a solvent (dimethylformamide (DMF), 2-propanol, methylene chloride, etc.).
  • a solvent dimethylformamide (DMF), 2-propanol, methylene chloride, etc.
  • the protective group for the ⁇ -position amino group includes a benzyloxycarbonyl (Cbz) group, a tert-butoxycarbonyl (Boc) group, a fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) group, a benzyl group, an allyl group, and an allyloxycarbonyl (Allloc) group. And so on.
  • the Cbz group can be deprotected by hydrofluoric acid, hydrogenation, etc.
  • the Boc group can be deprotected by trifluoroacetic acid (TFA)
  • the Fmoc group can be deprotected by treatment with piperidine.
  • methyl ester, ethyl ester, benzyl ester, tert-butyl ester, cyclohexyl ester and the like can be used.
  • hydroxy groups such as serine and threonine can be protected with benzyl or tert-butyl groups, and hydroxy groups such as tyrosine can be protected with 2-bromobenzyloxycarbonyl or tert-butyl groups.
  • Side chain amino groups such as lysine and carboxy groups such as glutamic acid and aspartic acid can be protected in the same manner as ⁇ -position amino groups and ⁇ -position carboxy groups.
  • Activation of the carboxy group can be performed using a condensing agent.
  • the condensing agent include dicyclohexylcarbodiimide (DCC), diisopropylcarbodiimide (DIPCDI), 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide (EDC or WSC), and (1H-benzotriazole-1-yloxy) tris.
  • DCC dicyclohexylcarbodiimide
  • DIPCDI diisopropylcarbodiimide
  • EDC or WSC 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide
  • (1H-benzotriazole-1-yloxy) tris examples thereof include (dimethylamino) phosphonium hexafluorophosphate (BOP), 1- [bis (dimethylamino) methyl] -1H-benzotriazolium-3-oxide hexaflu
  • cyclization means that two or more amino acids separated by one or more amino acids are covalently bonded directly or indirectly via a linker in one peptide, and one or more cyclizations in the molecule. It means to make a structure.
  • the cyclization can be carried out according to the methods described in Non-Patent Document 3, Non-Patent Document 6, and Non-Patent Document 7.
  • cysteine having a thiol group D-form cysteine, homocysteine, and D-form homocysteine are independently designated as amino acids 1 and 2, and are formed between the thiol groups.
  • Amino acids eg, 3-chloroalanine
  • a halogen atom chloro, bromo, or iodine
  • a nucleophilic group or a halogen atom (chloro, bromo, or iodine)
  • a halogen atom chloro, bromo, or iodine
  • a carboxylic acid having (for example, 3-chloropropanoic acid) can be used as amino acid 1, and a thioether bond formed with amino acid 2 having a thiol group can be used.
  • a linker having a halogen atom (chloro, bromo, or iodine) as a nucleophilic group for example, diiodomethane (DIM), 1,2-diiodoethane (DIE), 1,3-diiodopropane (DIP), 1,4- A thioether bond formed between diiodobutane (DIB), hexafluorobenzene, etc.
  • DIB diiodobutane
  • ⁇ -azidoalanine having an azido group is amino acid 1, 2-amino-5-hexic acid having an alkynyl group.
  • Amino acid 2 can be used, and a covalent bond via a triazole formed by a click reaction between them can be used.
  • Amino acid having an allyl group for example, allylglycine, D-form allylglycine, homoallylglycine, D-form homo
  • a thioether bond formed by a thiol-ene reaction between amino acid 1 and amino acid 2 having a thiol group can be used, using allylglycine or the like or a carboxylic acid having an allyl group (for example, 3-butenoic acid).
  • amino acid 2 having a carboxy group aspartic acid, glutamate, their D-amino acids, etc.
  • C-terminal carboxy group Use amide bond (9)
  • An amide bond between an amino acid having an N-terminal amino group and a carboxy group or a C-terminal carboxy group can be used. Either amino acid 1 or amino acid 2 may come to the N-terminal side.
  • the pharmaceutical composition according to the present invention contains a peptide consisting of the above-mentioned amino acid sequence as an active ingredient, and the peptide binds to Ras and inhibits its activity, thereby suppressing the growth of malignant tumors and the like. ..
  • the administration form of the above-mentioned pharmaceutical composition is not particularly limited, and may be administered orally or parenterally.
  • Parenteral administration includes, for example, injection administration such as intramuscular injection, intravenous injection, subcutaneous injection, transdermal administration, and transmucosal administration (nasal, oral cavity, eye, lung, vaginal, or rectal administration).
  • Etc. can be mentioned.
  • sustained-release bases include biodegradable polymerized compounds such as polylactic acid / glycol (PLGA), porous hydroxyapatite, liposomes, surface-modified liposomes, emulsions prepared with unsaturated fatty acids, nanoparticles, and nanospheres. It may be used as an inclusion of a peptide.
  • PLGA polylactic acid / glycol
  • a weak electric current can be passed through the skin surface to permeate the stratum corneum (iontophoresis method).
  • the above-mentioned pharmaceutical composition may use the active ingredient as it is, or may be formulated by adding a pharmaceutically acceptable carrier, excipient, additive or the like.
  • Dosage forms include, for example, liquids (injections, etc.), dispersants, suspensions, tablets, pills, powders, suppositories, powders, fine granules, granules, capsules, syrups, troches, etc. Examples thereof include inhalants, ointments, eye drops, nasal drops, ear drops, and poultices.
  • These preparations may be release control preparations (such as sustained-release microcapsules) such as immediate-release preparations or sustained-release preparations.
  • Formulations include, for example, excipients, binders, disintegrants, lubricants, solubilizers, solubilizers, colorants, flavoring agents, stabilizers, emulsifiers, absorption promoters, surfactants, pH adjusters. It can be carried out by a conventional method by appropriately using an agent, a preservative, an antioxidant and the like.
  • ingredients used in the formulation include purified water, saline solution, phosphate buffer, dextrose, glycerol, ethanol and other pharmaceutically acceptable organic solvents, animal and vegetable oils, lactose, mannitol, glucose, sorbitol, crystals.
  • surfactants such as polyoxyethylene lauryl ethers, sodium lauryl sulfate, and saponin are used as absorption enhancers to improve the absorption of poorly absorbable drugs; glycocholic acid, deoxycholic acid, etc.
  • Bile acids such as taurocholic acid; chelating agents such as EDTA and salicylic acids; fatty acids such as caproic acid, capric acid, lauric acid, oleic acid, linoleic acid and mixed micelles; enamine derivatives, N-acylcollagen peptides, N- Acyl amino acids, cyclodextrins, chitosans, nitrogen monoxide donors and the like may be used.
  • Pills or tablets can also be coated with sugar-coated, gastric-soluble, enteric-soluble substances.
  • the injection may contain distilled water for injection, physiological saline, propylene glycol, polyethylene glycol, vegetable oil, alcohols and the like. Further, wetting agents, emulsifiers, dispersants, stabilizers, solubilizers, solubilizing agents, preservatives and the like can be added. If necessary, an appropriate amount of additives such as ordinary preservatives, antioxidants, colorants, sweeteners, adsorbents, and wetting agents can also be used.
  • pancreatic cancer eg, pancreatic duct cancer, etc.
  • colon cancer eg, familial colon cancer, hereditary nonpolyposis colon cancer, gastrointestinal stromal tumor, etc.
  • small bowel cancer eg, non-hodgkin lymphoma, gastrointestinal stromal tumor, etc.
  • breast cancer eg, invasive ductal carcinoma, non-invasive ductal carcinoma, inflammatory breast cancer, etc.
  • prostate cancer eg, hormone-dependent prostate cancer, hormone-independent prostate cancer, etc.
  • gastric cancer eg, hormone-dependent prostate cancer, etc.
  • lung cancer eg, non-small cell lung cancer, small cell lung cancer, malignant mesoderma, etc.
  • lung cancer eg, non-small cell lung cancer, small cell lung cancer, malignant mesoderma, etc.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may be administered in combination with other pharmaceuticals or therapeutic methods useful for the above-mentioned diseases.
  • malignant tumors may be combined with various types of chemotherapy, surgical treatment, and radiation therapy.
  • the dosage may be determined by symptoms, patient age, sex, etc. It depends on the body weight, sensitivity difference, administration method, administration interval, type of active ingredient, type of preparation, and is not particularly limited, but for example, 30 ⁇ g to 1000 mg, 100 ⁇ g to 500 mg, 100 ⁇ g to 100 mg are divided into one or several times. Can be administered.
  • K-Ras V-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma virtual oncogene homolog
  • N-Ras Neuroblastoma ras oncogene homolog
  • H-Ras Harvery rat sarcoma virus oncogene homolog GDP: Guanoncine diphophosphate
  • GTP Guanosine triphosphate
  • GEF Guanine nucleotide exchange factor
  • GAP GTPase accelerating protein
  • BSA Bovine serum albumin
  • RP-HPLC Reverse-phase high performance limit chromatography
  • HRP Horseradish peroxidase SA: Streptavidin DTT: Dithiothreitol
  • PBS Phosphate buffered saline
  • ELISA Enzyme-linked immunosorbent assay ATP: Adenosine triphosphate Ac: Acetyl Arg: L-Arginine Cys: L-Cysteine
  • Gly Glycine Al
  • HATU 1- [bis (dimethylamino) methylene] -1H-1,2,3-triazolo [4,5-b] pyridinium 3-oxide hexafluorophosphate
  • HFIP hexafluoro-2-propanol
  • DCM dichloromethane
  • Non-Patent Document 3 Non-Patent Document 6 and Non-Patent Document 7 were referred to.
  • LO3 the cyclization of sequence 21 (LO3) is shown below.
  • a linear side chain protective peptide was dissolved in DCM, 1-hydroxybenzotriazole (HOAt) dissolved in dimethylformamide (DMF) and ethyl (dimethylaminopropyl) carbodiimide (EDC) hydrochloride were added, and a C-terminal carboxy group was added. Was activated.
  • HOAt 1-hydroxybenzotriazole
  • DMF dimethylformamide
  • EDC ethyl (dimethylaminopropyl) carbodiimide
  • the reaction was further carried out overnight at room temperature, and the side chain protective peptide was cyclized by the amide bond between the N-terminal amino group and the C-terminal carboxy group.
  • the cells were washed 3 times with distilled water, the DCM was distilled off and dried, and then the side chain protecting groups were deprotected and a monocyclic peptide was obtained by ether precipitation.
  • the monocyclic peptide was purified by RT-HPLC using a SunFire C18 column (10 ⁇ 150 mm) (manufactured by Waters) and then lyophilized.
  • the molecular weight of the finally obtained peptide was measured using microflex (Bruker) to identify the desired product.
  • Table 2 shows the theoretical molecular weight, the measured molecular weight, the purity, the cyclization type, and the amino acid sequence of the peptides synthesized in this example. Further, among these, the structural formulas of Biotin-BC-1 and sequences 1 to 21 (Seq-1 to 21) are shown in FIG. In Table 2, amino acid residues without D-form notation indicate L-form.
  • Biotin-KRpep-2d to Ras competes with the binding of amino acid-substituted peptide or KRpep-2d to Ras coexisting in solution, and thus is inhibited depending on the concentration of the amino acid-substituted peptide or KRpep-2d. That is, the binding activity of the amino acid-substituted peptide or KRpep-2d to Ras is detected as a competitive inhibitory activity to the binding of Biotin-KRpep-2d.
  • the binding value of Biotin-KRpep-2d to the wells not coated with Ras is defined as 100% inhibitory activity, and the binding value of Biotin-KRpep-2d to the wells not supplemented with the amino acid-substituted peptide or KRpep-2d is defined as 0% inhibitory activity.
  • Amino acid-substituted peptides and KRpep-2d 50% inhibitory activity values were calculated. Subsequently, the relative value of the inhibitory activity value of the amino acid-substituted peptide was calculated with the 50% inhibitory activity value of KRpep-2d as 1.
  • FIG. 4 shows the peptide concentration-dependent binding of Biotin-KRpep-2d to K-Ras (G12D) (Catalog No. 12259-H07E1-200, manufactured by Sino Biological) used in this competitive test.
  • the absorbance obtained when Biotin-KRpep-2d was added to the wells coated with K-Ras (G12D) was subtracted from the absorbance obtained when Biotin-KRpep-2d was added to the wells blocked only by BSA. , The specific binding activity was estimated.
  • Biotin-KRpep-2d showed a concentration-dependent binding of the peptide to K-Ras (G12D). On the other hand, it did not show binding activity to negative control proteins.
  • Biotin which is a typical example of the peptide of the present invention, is a representative example of the peptide of the present invention in which an unnatural amino acid is introduced into KRpep-2d, a continuous arginine sequence is removed, and bicyclization is performed by a covalent bond between the 1-position-11 position and the 4-position-11 position.
  • the biotin-modified peptide bicyclized by the covalent bond between the 1-position-11-position and the 4-position-11-position binds to any Ras in a concentration-dependent manner. showed that. On the other hand, it did not show binding activity to negative control proteins.
  • the biotin-modified peptide in which the covalent bond between the 4-position and the 11-position was cleaved by the reducing conditions and became a monocycle only by the covalent bond between the 1-position and the 11-position has a binding activity for any Ras. It was greatly weakened.
  • FIGS. 7 (A) and 7 (B) The results are shown in FIGS. 7 (A) and 7 (B).
  • the peptides (sequences 1 to 21) synthesized in the examples suppressed the proliferation of A427 cells.
  • the growth inhibitory activity of the monocyclic peptides MC1 to 12 on A427 cells was significantly attenuated as compared with the bicyclized peptide.
  • the peptide of sequence 17 suppressed the proliferation of not only A427 cells but also PANC-1 cells expressing K-Ras (G12D).
  • K-Ras PANC-1 cells expressing (G12D) (Cat No. CRL-1469, ATCC Co.) at 1 ⁇ 10 7 cells
  • Crlj SHO-Prkdc scid Hr hr mouse (female, 7 weeks old) (Japan It was implanted subcutaneously in the left inguinal region of Charles River), and when the tumor volume reached about 50 mm 3 , it was subjected to the test.
  • the tumor volume was obtained by measuring the major axis (mm) of the tumor mass and the minor axis (mm) orthogonal to the major axis (mm) from the skin surface with a nogis, and calculating the tumor volume by the formula of major axis ⁇ minor axis 2 ⁇ 0.5, and the unit was mm 3 .
  • the Vehicle group is a group in which cancer cells are transplanted and physiological saline (10% DMSO) is administered.
  • mice to which the representative example of the peptide of the present invention (sequence 17) was administered the increase in tumor volume due to the proliferation of PANC-1 cells was significantly suppressed, and the p value calculated by Student's t-test was 0.005 or less. Met. On the other hand, no weight loss was observed in the mice.
  • the Sham group is a group in which a transplantation procedure is performed in a cell medium containing no cancer cells and physiological saline (10% DMSO) is administered
  • the Vehicle group is a group in which cancer cells are transplanted and physiological saline (10% DMSO) is administered. It is a group to which 10% DMSO) was administered.
  • the body weight of the mice and the weight of the organs (pancreas, liver, kidney) 4 weeks after the start of administration were measured.
  • the peptide according to the present invention has protease degradation resistance, and by binding the peptide to Ras, it inhibits the off / on cycle of the molecular switch function of Ras, and the growth of cancer cells using Ras as a growth driver. Suppress. Therefore, the peptide according to the present invention is considered to be useful for the prevention and treatment of diseases involving cancer cells expressing Ras, such as colon cancer, pancreatic cancer, and lung cancer.
  • the peptide according to the present invention can be used not only as an anticancer agent itself, but also as a medicinal molecule to be combined with a delivery molecule to a cancer tissue such as an antibody, a lectin, a sugar chain, a liposome, or a nanoparticle. It can also be used as a functional molecule that selectively degrades intracellular Ras by combining it with a molecule that ubiquitinates a protein and induces degradation.
  • the peptide according to the present invention can more strongly suppress the growth of cancer cells when used in combination with a drug or therapy having another mechanism of action such as an immune checkpoint inhibitor or neutron supplementation therapy.

Abstract

【課題】Ras阻害ペプチドを医薬品、診断薬、及び/又は研究試薬として使用するためにプロテアーゼによる分解性、および立体構造の安定性を改善する。 【解決手段】下記式(1): c[X-X-X-c(X-X-X-X-X-X-X10-X11)] (1) で表されるアミノ酸配列からなる環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。ここで、上記式中、X、X及びX11は、それぞれ独立にアミノ基、カルボキシ基、チオール基、アリル基、アルキニル基、アジド基、若しくはハロゲン原子を有するアミノ酸残基、又はそれらの誘導体を表す。X、X及びXは、それぞれ独立に置換基を有していてもよい炭化水素基を有するアミノ酸残基、置換基を有していてもよい芳香族炭素環基を有するアミノ酸残基、若しくは置換基を有していてもよい芳香族複素環基を有するアミノ酸残基、又はそれらの誘導体である。Xは、アスパラギン酸残基、又はその誘導体であり、X、X、X、X10は、任意のアミノ酸残基である。

Description

Ras阻害ペプチド クロスリファレンス
 本出願は、日本国において、2019年5月14日に出願された特願2019-091419号に基づく優先権を主張するものであり、当該出願に記載された内容は全て、参照によりそのまま本明細書に援用される。また、本願において引用した全ての特許、特許出願及び文献に記載された内容は全て、参照によりそのまま本明細書に援用される。
 本発明は、Rasの活性を阻害するペプチド等に関し、詳細には特定のアミノ酸配列と環状構造を有する環状ペプチド等に関する。
 Rasタンパク質(Rasサブファミリーを意味し、以下Rasと略す)は、細胞内に発現するGTPaseであり、GDPまたはGTPと結合することで、細胞増殖シグナル伝達のオフ(不活性化)/オン(活性化)を司る分子スイッチとして機能する。GDP結合型は、オフの状態であり、GTP結合型は、オンの状態である。細胞表面受容体からのシグナルによって誘導されたグアニンヌクレオチド交換因子(GEF)がRasをGDP結合型からGTP結合型に変換し、GTP結合型Rasが下流のタンパク質であるRAFやPI3Kなどと相互作用することで、シグナルをさらに伝達していく。Rasに結合したGTPは、Ras自身の酵素活性及びGTPase活性化タンパク質(GAP)の助けを借りて、GTPからGDPに加水分解される。
 Rasは、188~189個のアミノ酸配列からなっており、任意のアミノ酸変異によって、自身のGTPase活性とGAPによるGTPの加水分解能が大きく抑制され、GTP結合型に偏重する。この結果、細胞増殖シグナルが延長される。
 ヒト腫瘍の約30%がアミノ酸変異を生じた変異型Rasを発現しており、腫瘍増殖のドライバーとしている(非特許文献1)。Rasの中で、創薬ターゲットとして注目されているメンバーにK-Ras、N-Ras、H-Rasが挙げられる。その中でもK-Rasのアミノ酸変異は、ヒト腫瘍の約20%という最も高い頻度で発生することが知られている(非特許文献1)。
 K-Rasにおけるアミノ酸変異の位置の大部分が12位グリシンであり、続いて13位グリシン、61位グルタミン、そしてその他の位置であることが報告されている。12位グリシンの変異の内容で最も高頻度にみられるのが、アスパラギン酸(約30%)、続いてバリン(約20%)、システイン(約10%)、アラニン(約5%)、セリン(約5%)、アルギニン(約3%)、そしてその他のアミノ酸である(非特許文献2)。
 これらのことから、12位グリシンがアスパラギン酸に変異しているK-RasであるK-Ras(G12D)は、癌治療における最も重要な創薬ターゲットであることがわかる。2017年、本発明者は、無細胞試験において、野生型K-RasよりもK-Ras(G12D)に選択的に結合し、GDP結合型K-Ras(G12D)がGTP結合型K-Ras(G12D)に変換されることを阻害する環状ペプチドKRpep-2d:Ac-Arg-Arg-Arg-Arg-c(Cys-Pro-Leu-Tyr-Ile-Ser-Tyr-Asp-Pro-Val-Cys)-Arg-Arg-Arg-Arg-NH(配列番号22)を見出したことを報告した(非特許文献3)。KRpep-2dは、細胞試験においてK-Ras(G12D)を発現するA427細胞の増殖を有意かつ選択的に抑制することが示された。また、本発明者は、KRpep-2dとK-Ras(G12D)の複合体の結晶構造を解析し、その結合のメカニズムを報告している(非特許文献4)。
Takashima A and Faller DV. Expert Opin Ther Targets. 2013, 17(5):507-531. Pender A, Garcia-Murillas I, Rana S, Cutts RJ, Kelly G, Fenwick K, Kozarewa I, Gonzalez de Castro D, Bhosle J, O’Brien M, Turner NC, Popat S, and Downward J. PLoS One. 2015, 10(9):e0139074. Sakamoto K, Kamada Y, Sameshima T, Yaguchi M, Niid, Sasaki S, Miwa M, Ohkubo S, Sakamoto JI, Kamaura M, Cho N, and Tani A. Biochem Biophys Res Commun. 2017, 484(3):605-611. Sogabe S, Kamada Y, Miwa M, Niid, Sameshima T, Kamaura M, Yonemori K, Sasaki S, Sakamoto JI, and Sakamoto K. ACS Med Chem Lett. 2017, 8(7):732-736. Niida A, Sasaki S, Yonemori K, Sameshima T, Yaguchi M, Asami T, Sakamoto K, and Kamaura M. Bioorg Med Chem Lett. 2017, 27(12):2757-2761. Fairlie DP and Dantas de Araujo. Biopolymers 2016, 106(6):843-852. Lau YH, de Andrade P, Wu Y, and Spring DR. Chem Soc Rev. 2015, 44(1)91-102.
 本発明者の分析によれば、KRpep-2dを医薬品、診断薬、及び/又は研究試薬として使用するには、以下に示すようないくつかの課題がある。(1)天然アミノ酸のみから構成されるKRpep-2dは、プロテアーゼ分解に対する耐性が低いことが懸念される。(2)配列に含まれる二つのシステイン(Cys)の側鎖間のジスルフィド結合で環状化しているため、細胞内の還元的な条件下ではジスルフィド結合が開裂し、ペプチドの環状構造を維持することができず、Rasに対する結合活性及び阻害活性が減弱することが懸念される。実際に本発明者は、ジチオスレイトール(DTT)を含む還元的条件下における無細胞試験では、K-Ras(G12D)のGDP結合型からGTP結合型への交換反応に対するKRpep-2dの阻害活性が、非還元的条件下の阻害活性と比較して50倍以上減弱することを見出している(非特許文献3及び非特許文献5)。(3)KRpep-2dの細胞試験における有意な増殖抑制活性は数~数十μMであり(非特許文献3及び非特許文献5)、医薬品、診断薬、及び/又は研究試薬として使用するには改善の余地がある。
 本発明は、かかる課題に鑑みてなされたものであって、その目的とするところはRas阻害ペプチドを医薬品、診断薬、及び/又は研究試薬として使用するための少なくとも1つの上記課題を改善しうる新規なRas阻害ペプチドを提供することにある。
 本発明者は、KRpep-2dの最適化研究を実施する中で、新規のRas阻害ペプチド群を見出した。KRpep-2dの課題を解決するために、非特許文献4に記載のKRpep-2dとK-Ras(G12D)の複合体の構造情報を基にして、KRpep-2dのRas結合活性やプロテアーゼ分解耐性や細胞増殖抑制活性といった機能を向上させるアミノ酸置換を予想した。KRpep-2dは、(1)5位Cysと15位Cysの側鎖間のジスルフィド結合によって環状化している、(2)6位から14位のアミノ酸がファーマコフォアとしてK-Ras(G12D)と主に相互作用している、(3)1位から4位および16位から19位のアミノ酸はペプチドの細胞内移行性に主に寄与しているが、欠失させるとRasに対する結合活性および阻害活性が大幅に減弱することから(非特許文献4および非特許文献5)、ペプチドの立体構造制御にも寄与している、という特徴を有している。そこで、(1)細胞内の還元的な条件下でもRas結合活性を維持できるように、5位Cysと15位Cysの側鎖間のジスルフィド結合を還元的条件下においても容易に開裂しない結合形態に置換すること、(2)Rasとの相互作用を増強するために、6位から14位に非天然アミノ酸構造を導入すること、(3)分子量の低減を目的に1位から4位及び16位から19位のアミノ酸を欠失させてもRas結合活性を有する分子構造の設計を試みた。このようなKRpep-2dの最適化研究を実施する中で、Ras結合活性、プロテアーゼ分解耐性、そして細胞増殖抑制活性を有する新規のRas阻害ペプチドの配列群を見出し、本発明を完成するに至った。
 即ち、本発明の一態様は、
 下記式(1):
c[X-X-X-c(X-X-X-X-X-X-X10-X11)]   (1)
で表されるアミノ酸配列からなる環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩である。ここで、上記式中、X、X及びX11は、それぞれ独立にアミノ基、カルボキシ基、チオール基、アリル基、アルキニル基、アジド基、若しくはハロゲン原子を有するアミノ酸残基、又はそれらの誘導体を表す。X、X及びXは、それぞれ独立に置換基を有していてもよい炭化水素基を有するアミノ酸残基、置換基を有していてもよい芳香族炭素環基を有するアミノ酸残基、置換基を有していてもよい芳香族複素環基を有するアミノ酸残基、又はそれらの誘導体である。Xは、アスパラギン酸残基、又はその誘導体であり、X、X、X、X10は、任意のアミノ酸残基である。
 そして、XとX11及びXとX11は、それぞれの間で独立に、直接的な又はリンカーを介した間接的な共有結合を形成し、それによって式(1)のペプチドは分子内に2つの環状構造を有する。XとX11との間の共有結合は、それらの主鎖-主鎖間、主鎖-側鎖間、側鎖-主鎖間、又は側鎖-側鎖間のいずれの結合であってもよく、また、XとX11の間の共有結合は、それらの側鎖-主鎖間、又は側鎖-側鎖間のいずれの結合であってもよい。
 上記式(1)のペプチドにおけるXからX11の各アミノ酸残基の好ましい態様は、以下の実施形態において詳細に説明するが、それぞれの好ましい実施形態は相互に独立して任意に組み合わせることができるものとする。
 本発明によれば、Ras阻害ペプチドを医薬品、診断薬、及び/又は研究試薬として使用するために有用な新規な環状ペプチドが提供される。
図1は、KRpep-2dのRas結合活性(ファーマコフォア)、環状構造規制(S-S結合)、細胞内移行性(Cell Penetrating Peptide:CPP)といった機能に関わるアミノ酸配列を示している。また、KRpep-2dを改変した本発明ペプチドの構造の概要を示す。 図2は、KRpep-2dの各アミノ酸ポジションにおけるアミノ酸残基の置換研究に供したアミノ酸の例を示す。 図3は、アミノ酸残基を置換したペプチドのK-Ras(G12D)に対する結合活性をKRpep-2dのそれと比較するために用いたELISA法による競合結合試験の概要を示す。図中、SAはストレプトアビジン、Bはビオチン、HRPは西洋わさびペルオキシダーゼを示す。 図4は、N末端ビオチン修飾KRpep-2d(Biotin-KRpep-2d)のK-Ras(G12D)に対するペプチド濃度依存的な結合活性を示す。 図5は、本発明ペプチドの代表例のビオチン修飾体の野生型K-Ras、K-Ras(G12D)、K-Ras(G12V)、K-Ras(G12C)、K-Ras(G13D)、野生型N-Ras、N-Ras(Q61K)、野生型H-Ras、H-Ras(G12V)及びH-Ras(Q61L)に対するペプチド濃度依存的な結合活性を示す。 図6は、KRpep-2dと本発明ペプチドの代表例について、ラット血漿と混合し、プロテアーゼ分解に対する耐性を比較した結果を示す。 図7Aは、KRpep-2dと本発明ペプチドの代表例について、K-Ras(G12D)を発現するA427細胞に対する増殖抑制活性をATPの定量によって評価した結果を示す。 図7Bは、配列17のペプチドについて、K-Ras(G12D)を発現するPANC-1細胞に対する増殖抑制活性をATPの定量によって評価した結果を示す。 図8は、本発明ペプチドの代表例について、皮下担癌マウスに尾静脈投与し、抗癌活性を評価した結果を示す。 図9は、本発明ペプチドの代表例について、同所性移植モデルマウスに尾静脈投与し、抗癌活性を評価した結果を示す。 図10は、実施例で用いた本発明ペプチドの代表例の構造式を示す。
 次に、本発明の好適な実施形態について、図面を参照して説明する。なお、以下に説明する実施形態は、特許請求の範囲に係る発明を限定するものではなく、また、実施形態の中で説明されている諸要素及びその組み合わせのすべてが本発明の解決手段に必須であるとは限らない。また、本明細書において引用されるすべての特許文献及び非特許文献の開示は、全体として本明細書に参照として組み込まれる。
(定義)
 本明細書においてペプチドは、2つ以上のアミノ酸がアミド結合(ペプチド結合)で結合しているものを指し、例えば2~20アミノ酸がアミド結合したものとすることができる。また、ペプチド標記の慣例に従って左端がN末端(アミノ末端)、右端がC末端(カルボキシ末端)である。ペプチド結合を形成するカルボニル基に隣接する1番目の炭素原子をCα炭素と称する。
 本明細書において「任意のアミノ酸、又はその誘導体」は、その最も広い意味で用いられ、天然アミノ酸に加え、非天然構造を有する人工のアミノ酸、アミノ酸の特徴である当業界で公知の特性を有する化学的に合成された化合物、さらに官能基を有するカルボン酸も含む。非天然アミノ酸の例として、D体アミノ酸、主鎖の構造が天然型と異なるα/α-二置換アミノ酸(2-アミノイソ酪酸といったα-メチル化アミノ酸など)、N-アルキル-アミノ酸(N-メチル化アミノ酸など)、N-置換グリシン(ペプトイド)、主鎖が伸長しているアミノ酸(βホモアミノ酸やγホモアミノ酸)、側鎖の構造が天然型と異なるアミノ酸(シクロヘキシルアラニンやアリルグリシンや2-(2-ピリジル)-グリシンや3-(1H-ベンゾイミダゾール-2-イル)-アラニンなど)、側鎖の一部が置換されているアミノ酸(ノルロイシンやジアミノプロパン酸や3-(2-ピリジル)-アラニンなど)、側鎖に余分の官能基を有するアミノ酸;側鎖に余分のCやアルキル基やメチル基を有するアミノ酸(ホモノルロイシンやγ-メチルロイシンなど)、側鎖にハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を有するアミノ酸(3-クロロ-アラニンなど)、側鎖にハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を有するカルボン酸(3-クロロプロパン酸など)、側鎖に官能基を有するカルボン酸(3-ブテン酸など)、側鎖に余分のNやアミノ基を有するアミノ酸(β-アジドアラニンやオルニチンなど)、側鎖に余分のOやメトキシ基を有するアミノ酸(O-メチル-セリンやO-メチル-スレオニンなど)、側鎖に余分のヒドロキシ基を有するアミノ酸(3-ヒドロキシ-フェニルアラニンなど)、側鎖に余分のカルボキシ基(-COOH)を有するアミノ酸(3-カルボキシ-フェニルアラニンなど)、側鎖に余分のSを有するアミノ酸(エチオニンなど)、側鎖中のカルボン酸官能基がエステルで保護されているアミノ酸(アスパラギン酸-4-メチルエステルなど)、側鎖のチオ基(-S-)が酸化されてスルフィニル基(-S(=O)-)やスルホニル基(-S(=O)-)に変換されているアミノ酸(メチオニンスルホキシド)などが挙げられるが、これらに限定されない。
 本明細書において、置換基を有していてもよい炭化水素基とは、例えば、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、1-エチルプロピル、ヘキシル、イソヘキシル、1,1-ジメチルブチル、2,2-ジメチルブチル、3,3-ジメチルブチル、2-エチルブチルなどのC1-10アルキル基、エテニル、1-プロペニル、2-プロペニル、2-メチル-1-プロペニル、1-ブテニル、2-ブテニル、3-ブテニル、3-メチル-2-ブテニル、1-ペンテニル、2-ペンテニル、3-ペンテニル、4-ペンテニル、4-メチル-3-ペンテニル、1-ヘキセニル、3-ヘキセニル、5-ヘキセニルなどのC2-10アルケニル基、エチニル、1-プロピニル、2-プロピニル、1-ブチニル、2-ブチニル、3-ブチニル、1-ペンチニル、2-ペンチニル、3-ペンチニル、4-ペンチニル、1-ヘキシニル、2-ヘキシニル、3-ヘキシニル、4-ヘキシニル、5-ヘキシニル、4-メチル-2-ペンチニルなどC2-10アルキニル基、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、ビシクロ[2.2.1]ヘプチル、ビシクロ[2.2.2]オクチル、ビシクロ[3.2.1]オクチル、アダマンチルなどのC3-10シクロアルキル基、シクロプロペニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘキセニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニルなどのC3-10シクロアルケニル基を指し、置換基を有していてもよい芳香族炭素環基とは、例えば、フェニル基やナフチル基などを指し、置換基を有していてもよい芳香族複素環基とは、例えば、ピリジル、チエニル、フリル、ピロリル、イミダゾリル、ピラゾリル、チアゾリル、イソチアゾリル、オキサゾリル、イソオキサゾリル、ピラジニル、ピリミジニル、ピリダジニル、1,2,4-オキサジアゾリル、1,3,4-オキサジアゾリル、1,2,4-チアジアゾリル、1,3,4-チアジアゾリル、トリアゾリル、テトラゾリル、トリアジニルなどの5ないし6員単環式芳香族複素環基、さらにはベンゾフラニル、ベンゾチエニル、ベンゾイミダゾリル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾイソオキサゾリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾイソチアゾリル、ベンゾトリアゾリル、イミダゾピリジニル、チエノピリジニル、フロピリジニル、ピロロピリジニル、ピラゾロピリジニル、オキサゾロピリジニル、チアゾロピリジニル、イミダゾピラジニル、イミダゾピリミジニル、チエノピリミジニル、フロピリミジニル、ピロロピリミジニル、ピラゾロピリミジニル、オキサゾロピリミジニル、チアゾロピリミジニル、ピラゾロトリアジニル、ナフト[2,3-b]チエニル、フェノキサチイニル、インドリル、イソインドリル、1H-インダゾリル、プリニル、イソキノリル、キノリル、フタラジニル、ナフチリジニル、キノキサリニル、キナゾリニル、シンノリニル、カルバゾリル、β-カルボリニル、フェナントリジニル、アクリジニル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサジニルなどの8ないし14員縮合多環式(好ましくは2または3環式)芳香族複素環基を指すが、これらに限定されない。
 本明細書において、「Ras」はマウス、ラット、イヌ、サル、ヒトなどの哺乳類のK-Ras、N-Ras、H-RasといったRasサブファミリーの野生型タンパク質及びアミノ酸変異型タンパク質全般を意味し、GDP結合型とGTP結合型のいずれも包含する。
 本明細書において、「Ras阻害活性を有する」という場合、インビトロ試験において、本発明のペプチドが、(1)既報告のRas阻害ペプチドKRpep-2dのビオチン標識化体のRasタンパク質に対する結合を阻害すること、(2)Rasタンパク質に対して濃度依存的に結合すること、(3)Ras発現細胞内のErkのリン酸化を阻害すること、(4)Ras発現細胞の増殖を抑制すること、などを意味し、これらの効果のうちいずれか一つでも示す場合には、「Ras阻害活性を有する」という。Ras阻害活性の有無は、当業者が公知の方法に従って確認することができる。阻害活性を確認する方法としては、例えば、Rasタンパク質上のGDPがGTPに交換される反応を評価する方法(非特許文献3)、Ras発現細胞とペプチドを共培養して、Ras下流のシグナルであるErkのリン酸化の有無を調べる方法(非特許文献3)、Ras発現細胞とペプチドを共培養して、その細胞の増殖の有無や速度を調べる方法(非特許文献3)、担癌マウスなどの疾病モデル動物にペプチドを投与して、癌細胞の増殖の有無や速度を調べる方法などが挙げられるが、これらに限定されない。
(環状ペプチド)
 本発明の一実施形態にかかる環状ペプチドの構造を図1に基づき説明する。図1は、環状ペプチド設計の基礎としたKRpep-2dのRas結合活性にかかわる特徴(ファーマコフォア)、環状構造規制(S-S結合)、細胞内移行性(Cell Penetrating Peptide:CPP)などの機能に関わる構造と、これを改変した本実施形態の環状ペプチドとの関係を模式的に示したものである。KRpep-2dにおいて、Ras結合部位を形成する6~14番目のアミノ酸残基は、本実施形態の環状ペプチドでは2~10番目のアミノ酸残基に対応する。また、KRpep-2dにおける5番目と15番目のシステイン残基間での環状化は、本実施形態の環状ペプチドでは1番目と11番目のアミノ酸残基間における結合Aと、4番目と11番目のアミノ酸残基間における結合Bとの2つの環状構造としてより安定化されている。そして、KRpep-2dの各アミノ酸ポジションにおけるアミノ酸残基の置換に供したアミノ酸の例を図2に示した。
 したがって、本発明の1つの好ましい実施形態における環状ペプチドは、下記式(1)のように表すことができる。
c[X-X-X-c(X-X-X-X-X-X-X10-X11)]   (1)
ここで、XからX11の各アミノ酸残基は以下のとおりである。
[1]X、X及びX11は、それぞれ独立にアミノ基、カルボキシ基、チオール基、アリル基、アルキニル基、アジド基、若しくはハロゲン原子を有するアミノ酸残基、又はそれらの誘導体を表す。X、X及びXは、それぞれ独立に置換基を有していてもよい炭化水素基を有するアミノ酸残基、置換基を有していてもよい芳香族炭素環基を有するアミノ酸残基、若しくは置換基を有していてもよい芳香族複素環基を有するアミノ酸残基、又はそれらの誘導体である。Xは、アスパラギン酸残基、又はその誘導体であり、X、X、X、X10は、任意のアミノ酸残基である。「アミノ基又はカルボキシ基を有するアミノ酸残基」におけるアミノ基及びカルボキシ基とは、主鎖のアミド結合を形成する基であってもよい。
 そして、XとX11及びXとX11は、それぞれの間で独立に、直接的な又はリンカーを介した間接的な共有結合を形成し、それによって式(1)のペプチドは分子内に2つの環状構造を有する。XとX11との間の共有結合は、それらの主鎖-主鎖間、主鎖-側鎖間、側鎖-主鎖間、又は側鎖-側鎖間のいずれの結合であってもよく、また、XとX11の間の共有結合は、それらの側鎖-主鎖間、又は側鎖-側鎖間のいずれの結合であってもよい。
[2]XとX11のCα炭素原子間の結合が下記式(2):
Cα-(CH-X-(CH-Cα11   (2)
で表される構造を含む。ここで、上記式中、AとBは、それぞれ独立に0~2のいずれかの整数を表し、AとBの総和は、1~4のいずれかの整数であり、Xは、S-S、CH-CH、S-CH、CH-S、O-CH、CH-O、CH=CH、NH-C(=O)、N(CH)-C(=O)、NH-C(=S)、N(CH)-C(=S)、O-C(=O)、C(=O)-NH、C(=O)-N(CH)、C(=S)-NH、C(=S)-N(CH)、C(=O)-O、CH-CH-CH、S-CH-CH、CH-CH-S、CH-S-CH、O-CH-CH、CH-CH-O、CH-O-CH、S-CH-S、S-C(=CH)-S、S-(CH-S、S-(CH-S、S-(CH-S、S-CH-CH=CH-CH-S、S-CH-C-CH-S(フェニレン環へのメチレン基の結合部位は、オルト、メタ及びパラの何れであってもよい)、S-CH-C(=O)-CH-S、又はS-CH-C(=CH)-CH-Sを表す。
 これらの中でも、Xが、NH-C(=O)、CH-S-CH、CH=CH、CH-CHを表すことが好ましく、さらに好ましくは、XがNH-C(=O)を表す場合である。XがNH-C(=O)を表す場合とは、例えば、XのN末端アミノ基とX11のC末端カルボキシ基との間で形成されるアミド結合がある。XがCH-S-CHを表す場合とは、例えば、1位の3-クロロプロパン酸の主鎖クロロ基と11位システインの側鎖チオール基間で形成されるチオエーテル結合や、1位の3-ブテン酸の主鎖アリル基と11位システインの側鎖チオール基間のチオール‐エン反応で形成されるチオエーテル結合が挙げられる。また、XがCH=CHを表す場合とは、例えば、1位の3-ブテン酸の主鎖アリル基と11位のβ-ホモ-L-アリルグリシンの側鎖アリル基間のオレフィンメタセシス反応により形成されるCH=CH結合が挙げられる。このCH=CH結合が還元された場合は、XがCH-CHを表す。
[3]XとX11のCα炭素原子間の結合が下記式(3):
Cα-(CH-Y-(CH-Cα11   (3)
で表される構造を含む。ここで、式中、AとBは、それぞれ独立に0~4のいずれかの整数を表し、AとBの総和は、2~4のいずれかの整数であり、Yは、S-S、CH-CH、S-CH、CH-S、O-CH、CH-O、CH=CH、NH-C(=O)、N(CH)-C(=O)、NH-C(=S)、N(CH)-C(=S)、O-C(=O)、C(=O)-NH、C(=O)-N(CH)、C(=S)-NH、C(=S)-N(CH)、C(=O)-O、CH-CH-CH、S-CH-CH、CH-CH-S、CH-S-CH、O-CH-CH、CH-CH-O、CH-O-CH、S-CH-S、S-C(=CH)-S、S-(CH-S、S-(CH-S、S-(CH-S、S-CH-CH=CH-CH-S、S-CH-C-CH-S(フェニレン環へのメチレン基の結合部位は、オルト、メタ及びパラの何れであってもよい)、S-CH-C(=O)-CH-S、S-CH-C(=CH)-CH-S、トリアゾール、又はジチオテトラフルオロベンゼンを表す。
 これらの中でも、Yが、S-S、S-CH-S、S-C(=CH)-S、S-(CH-S、S-(CH-S、S-CH-C(=CH)-CH-S、S-(CH-S、S-CH-CH=CH-CH-S、NH-C(=O)を表すことが好ましく、さらに好ましくは、YがS-CH-S、S-(CH-S、S-(CH-S、又はS-(CH-Sを表す場合である。YがS-CH-Sを表す場合とは、例えば、X及びX11が共にシステインであるとき、4位の側鎖チオール基とジヨードメタン(DIM)リンカーと11位の側鎖チオール基間に形成される-S-CH-S-結合が挙げられる。YがS-(CH-Sを表す場合とは、例えば、4位システインの側鎖チオール基と1,3-ジヨードプロパン(DIP)リンカーと11位システインの側鎖チオール基間に形成される-S-(CH-S-結合が挙げられる。Yがトリアゾールを表す場合とは、例えば、4位ブテニル-L-グリシンと11位β-アジド-L-アラニンの側鎖間でクリック反応によって形成されるトリアゾールを介した結合が挙げられる。また、4位アリルグリシンと11位ホモシステイン間のチオール‐エン反応によるチオエーテル結合や、4位アリルグリシンと11位βホモアリルグリシン間のオレフィンメタセシス反応によるCH=CH結合であってもよい。このCH=CH結合が還元された場合は、YがCH-CHを表す。
[4]XとXは、それぞれ独立に下記式(4)~(7)のいずれかで表されるアミノ酸残基である。式(4)のアミノ酸残基は、
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000010
(式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、R、R及びRは、それぞれ独立に水素原子、又はメチル基を表し、R、R、Rは、それぞれ独立に水素原子、メチル基、又はハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を表し、nは、0~10のいずれかの整数を表す)で表される。これらの中でも、ロイシン、ノルロイシン、イソロイシン、バリン、2-アミノヘプタン酸、2-アミノオクタン酸、2-アミノノナン酸、2-アミノデカン酸、γ-メチル-ロイシン及び5,5‘-ジメチルノルロイシンなどが好ましい。
 式(5)のアミノ酸残基は、
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000011
(式中、Zは、C又はNを表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表し、nは、1~6のいずれかの整数を表す)で表される。これらの中でも、シクロブチルグリシン、シクロペンチルグリシン及びシクロヘキシルグリシンなどが好ましい。
 下記式(6)のアミノ酸残基は、
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000012
(式中、R、R、R、R10及びR11は、それぞれ独立に水素原子又はハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表す)で表される。これらの中でも、フェニルグリシン、3-クロロフェニルグリシン、2-クロロフェニルグリシン、4-クロロフェニルグリシン、3-フルオロフェニルグリシン、2-フルオロフェニルグリシン及び4-フルオロフェニルグリシンなどが好ましい。
 式(7)のアミノ酸残基は、
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000013
(式中、R12は、2-チエニル基、3-チエニル基、2-ピリジル基、3-ピリジル基、4-ピリジル基、2-チアゾリル基、4-チアゾリル基、2-オキサゾリル基、4-オキサゾリル基、1-ピラゾリル基、1-イミダゾリル基、1,2,3-トリアゾール-1-イル基、又は1,2,4-トリアゾール-1-イル基を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表す)で表される。これらの式(4)~(7)のいずれかで表されるアミノ酸残基はその誘導体であってもよい。
[5]Xは、下記式(8)~(11)のいずれかで表されるアミノ残基である。式(8)のアミノ酸残基は、
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000014
(式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、R、R、R、R10、R11は、それぞれ独立に水素原子、ヒドロキシ基、メトキシ基、メチル基、tert-ブチル基、ハロゲン化メチル基、又はハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表す。)で表される。これらの中でも、4-フルオロフェニルアラニン、4-メチルフェニルアラニン、4-クロロフェニルアラニン、4-トリフルオロメチル-フェニルアラニン、4-ブロモフェニルアラニン及び4-ヨードフェニルアラニンなどが好ましい。
 式(9)のアミノ酸残基は、
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000015
(式中、R13、R14、R15、R16は、それぞれ独立に水素原子、ヒドロキシ基、メトキシ基、メチル基、tert-ブチル基、ハロゲン化メチル基、又はハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表す。)で表される。これらの中でも、トリプトファン、6-クロロトリプトファン及び5-クロロトリプトファンなどが好ましい。
式(10)のアミノ酸残基は、
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000016
(式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との結合部位を表し、Zは、C又はNを表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表し、nは、1~6のいずれかの整数を表す。)で表される。これらの中でもシクロヘキシルアラニンなどが好ましい。
 式(11)のアミノ酸残基は、
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000017
(式中、R17は、2-チエニル基、3-チエニル基、2-ピリジル基、3-ピリジル基、4-ピリジル基、2-チアゾリル基、4-チアゾリル基、2-オキサゾリル基、4-オキサゾリル基、1-ピラゾリル基、1-イミダゾリル基、1,2,3-トリアゾール-1-イル基、1,2,4-トリアゾール-1-イル基、1H-ベンゾイミダゾール-1-イル基、1H-ベンゾイミダゾール-2-イル基、1,3-ベンゾチアゾール-2-イル基、1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル基、2-キノイル基、8-キノイル基、1-ナフチル基、又は2-ナフチル基を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表す。)で表される。これらの中でも、2-ナフチルアラニンなどが好ましい。
[6]Xは、下記式(12)で表されるアミノ酸残基である:
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000018
 式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、R18、R19、R20は、それぞれ独立に水素原子、ヒドロキシ基、メトキシ基、アミノ基、モノメチル化アミノ基、ジメチル化アミノ基、トリメチル化アミノ基、メチル基、エチル基、イソプロピル基、tert-ブチル基、ハロゲン化メチル基、又はハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を表し、Rは、水素、又はメチル基を表し、nは、0又は1を表す。これらの中でも、バリン、ロイシン、セリン、スレオニン及び2,3-ジアミノプロパン酸などが好ましい。
[7]XとXは、それぞれ独立に置換基を有していてもよい炭化水素基を有するアミノ酸、N-メチル化グリシン、2-アゼチジン-2-カルボン酸、プロリン、チオプロリン、3,4-デヒドロプロリン、ピペコリン酸、又はそれらの誘導体を表す。
[8]X10は、バリン、ノルバリン、ロイシン、ノルロイシン、イソロイシン、メチオニン、シクロプロピルグリシン、シクロブチルグリシン、フェニルアラニン、4-フルオロ-フェニルアラニン、2-チエニルアラニン、3-チエニルアラニン、2‐ピリジルアラニン、3‐ピリジルアラニン、4‐ピリジルアラニン、2-チアゾリルアラニン、4-チアゾリルアラニン、2-オキサゾリルアラニン、4-オキサゾリルアラニン、1-ピラゾリルアラニン、1-イミダゾリルアラニン、3-(1,2,3-トリアゾール-1-イル)-アラニン、3-(1,2,4-トリアゾール-1-イル)-アラニン、3-(1H-ベンゾイミダゾール-1-イル)-アラニン、3-(1H-ベンゾイミダゾール-2-イル)-アラニン、3-(1,3-ベンゾチアゾール-2-イル)-アラニン、3-(1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル)-アラニン、2-キノイルアラニン、8‐キノイルアラニン、トリプトファン、1-ナフチルアラニン、2-ナフチルアラニン、若しくはそれらのN-メチル化アミノ酸残基、又はそれらの誘導体を表す。
[9]本発明の1つの実施形態における環状ペプチドは、下記式(13):
c[X-Pro-X-c(Cys-X-Ser-4fF-Asp-Pro-X10-X11)]   (13)で表されるアミノ酸配列からなる。
式(13)において、Xは、β-アラニン又はγ-アミノ酪酸残基を表し、Xは、ロイシン、ノルロイシン、シクロヘキシルグリシン、フェニルグリシン、2-アミノヘプタン酸、2-アミノオクタン酸、2-アミノノナン酸又は2-アミノデカン酸残基を表し、Xは、イソロイシン、ノルロイシン、シクロヘキシルグリシン、フェニルグリシン、2-アミノヘプタン酸、2-アミノオクタン酸、2-アミノノナン酸又は2-アミノデカン酸残基を表し、X10は、バリン、フェニルアラニン、トリプトファン、1-ナフチルアラニン又はそれらのN-メチル化アミノ酸残基を表し、X11は、D体又はL体のシステイン残基を表わす。また、XとX11は、主鎖のアミノ基とカルボキシル基との間でアミド結合を形成し、XとX11は、それぞれの側鎖-SH基の間で、メチレン基、エチレン基、プロピレン基又はブチレン基のリンカーを介して共有結合を形成し、それによって式(13)のペプチドは分子内に2つの環状構造を有する。
[10]さらに好ましい実施形態の環状ペプチドは、下記式(14):
c[βAla-Pro-X-c(Cys-X-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]   (14)で表されるアミノ酸配列からなる。
式(14)において、Xは、ロイシン、ノルロイシン、シクロヘキシルグリシン、フェニルグリシン、2-アミノヘプタン酸、2-アミノオクタン酸、2-アミノノナン酸又は2-アミノデカン酸残基を表し、Xは、イソロイシン、ノルロイシン、シクロヘキシルグリシン、フェニルグリシン、2-アミノヘプタン酸、2-アミノオクタン酸、2-アミノノナン酸又は2-アミノデカン酸残基を表わす。また、1位と11位の残基は、主鎖のアミノ基とカルボキシル基との間でアミド結合を形成し、4位と11位の2つのシステイン残基は、それぞれの側鎖-SH基の間で、プロピレン基のリンカーを介して共有結合を形成し、それによって式(14)のペプチドは分子内に2つの環状構造を有する。
 上記式(13)又は式(14)に含まれる個々の環状ペプチドとしては、例えば、以下のような例を挙げることができる。
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Val-Cys)](配列番号1~3)
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Val-Cys)](配列番号4~6)
c[γAba-Pro-Nle-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Val-Cys)](配列番号7~9)
c[γAba-Pro-Nle-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Val-Cys)](配列番号10~12)
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Val-Cys)](配列番号13)
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Val-Cys)](配列番号14)
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Val-Cys)](配列番号15)
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Phe-Cys)](配列番号16)
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)](配列番号17)
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-1NaphA-Cys)](配列番号18)
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)](配列番号19)
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Val-Cys)](配列番号20~21)
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Leu-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Nle-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Chg-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Phg-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Ahep-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Aoc-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Anon-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Ile-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Nle-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Chg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Phg-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Ahep-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Aoc-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Anon-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
c[βAla-Pro-Adec-c(Cys-Adec-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]
[11]本発明に係るペプチドは、上記[1]~[10]で表されるアミノ酸配列において、1~数個のアミノ酸が欠失、付加、及び/又は置換された相同性を有するペプチドであっても、Rasに対する結合活性を有するものは包含する。本明細書において、「1~数個のアミノ酸が欠失、付加、及び/又は置換されているペプチド」という場合、それらのアミノ酸の個数は、そのペプチドがRas結合活性を有する限りは特に限定されないが、好ましくは1~5個、さらに好ましくは1個若しくは2個である。欠失、付加、及び/又は置換されている場所は、ペプチドの末端であっても、中間であってもよく、1ヶ所であっても2ヶ所以上であってもよい。
 このような上記アミノ酸配列において1~数個のアミノ酸が欠失、付加、及び/又は置換されたアミノ酸配列として、前記アミノ酸配列と、BLAST(Basic Local Alignment Search Tool at the National Center for Biological Information(米国国立生物学情報センターの基本ローカルアラインメント検索ツール))等(例えば、デフォルトすなわち初期設定のパラメータを用いて)を用いて計算したときに、少なくとも50%以上、好ましくは70%以上、さらに好ましくは80%以上、特に好ましくは90%以上の同一性を有しているものが挙げられる。
 また、一次構造上の相同性が低くても、立体構造が高度に類似しているペプチドやタンパク質ドメインも存在することが知られている。したがって、上記アミノ酸配列と少なくとも50%以上、好ましくは70%以上、さらに好ましくは80%以上、特に好ましくは90%以上の立体構造相同性を有するペプチドであって、Ras結合活性を有するペプチドも本実施形態に含まれる。このようなペプチド同士の立体構造の相同性は、ホモロジーモデリング法などを用いて、立体構造未知のペプチドのアミノ酸配列から、その立体構造を以下のように予測して行うことができる。例えば、本実施形態の環状ペプチド(参照ペプチド)と類似の配列を有する任意のアミノ酸配列(目的配列)が与えられたとき、目的配列と参照配列の間のアライメント(配列を並置したもの)を与える。FASTA、PSI-BLAST、LIBRAなどにより算出したアライメントを用いれば、目的配列と参照配列間のアミノ酸ごとの対応関係が決まるので、この関係に基づき、参照ペプチドの3次元座標から目的配列上のアミノ酸ごとの3次元座標を作成する。3次元座標の構築では、アミノ酸残基間に構造的に不適切な隙間や衝突や歪みが生じることがあるので、エネルギー極小化計算により、これらの構造的な歪みを解消する。モデリングソフトによっては、この構造的な歪みの解消をスムーズに行うため、ペプチドの全原子に対して同時に行うのではなく、段階的に行うものもある。即ち、まずペプチドの骨格を形成するα炭素原子について行い、次いでα炭素原子を含む主鎖原子について行い、最後に側鎖原子を含むペプチド全体について行うものである。このようにして目的配列に対するアライメントが得られれば、その立体構造を予測構築することができる。立体構造相同性の指標は、最適に重ね合わせたときのXYZ座標の差であるRMSD(Root Mean Square Deviation)などを用いて比較することができる。
 本発明のペプチドは、本発明の課題を解決するものである限り、その種々の誘導体、及び/又は修飾体も包含する。係る誘導体としては、ペプチドの飽和脂肪鎖が不飽和脂肪鎖に置換されているもの、ペプチドの原子の一部が放射性または非放射性の同位体原子を含む他の原子に置換されているもの、ペプチドのアミド結合がチオアミド結合(-NH-C(=S)-)に置換されているもの、ペプチドのアミド結合がアルケン(-C=C-)に置換されているもの、ペプチドのアミド結合がアルキル(-C-C-)に置換されているもの、ペプチドのアミド結合がヒドロキシエチレン(-C(-OH)-C-)に置換されているもの、ペプチドのアミド結合がエステル(-O-C(=O)-)に置換されているもの、ペプチドのアミド結合がアルケン(-C=C-)に置換されているもの、ペプチドのアミド結合が(-C-NH-)に置換されているもの、又はペプチドのアミド結合が(-C(=O)-C-)に置換されているものなどが挙げられ、係る修飾体としては、ペプチドのα位炭素が二置換されているもの、ペプチドのアミド結合がN-アルキル化されているもの、ペプチドの官能基の一部がハロゲン化、シアノ化、ニトロ化、オキソ化、ヒドロキシ化、アミノ化、デアミノ化、デヒドロ化、アミド化、アセチル化、メトキシ化、プレニル化、アルキル化などの修飾を受けているもの(例えば、ペプチドのアミノ基の一部がアセチル化やアルキル化やデアミノ化されているもの、ペプチドのカルボキシ基の一部がアミドやエステルになっているものなど)、ペプチドのSがスルホキシドS(=O)又はスルホンS(=O)になっているもの、ペプチドがケミカルリンカーを介して多量体化しているもの、ペプチドがビオチン標識化されているもの、ペプチドが蛍光標識化されているもの、ペプチドが発光標識化されているもの、さらにはアルキル鎖、ポリエチレングリコール、抗体、レクチン類、糖鎖、酵素、膜透過性ペプチド、低分子化合物、又はタンパク質のユビキチン化を誘導する分子などとペプチドを融合させたもの等が挙げられるが、これらに限定されない。
 本発明のペプチドは、ペプチドの塩も包含する。ペプチドの塩としては、生理学的に許容される塩基や酸との塩が用いられ、例えば、無機酸(塩酸、臭化水素酸、ヨウ化水素酸、硫酸、リン酸等)の付加塩、有機酸(p-トルエンスルホン酸、メタンスルホン酸、シュウ酸、p-ブロモフェニルスルホン酸、カルボン酸、コハク酸、クエン酸、安息香酸、酢酸等)の付加塩、無機塩基(水酸化アンモニウム、又はアルカリ、若しくはアルカリ土類金属水酸化物、炭酸塩、重炭酸塩等)、アミノ酸の付加塩等が挙げられる。
 本発明のペプチドは、プロドラッグであってもよい。プロドラッグは、生体内における生理条件下で酵素や胃酸などによる反応によって本発明のペプチドに変換される化合物、すなわち酵素的に酸化、還元、加水分解などを起こして本発明のペプチドに変化する化合物、胃酸などにより加水分解などを起こして本発明のペプチドに変化する化合物をいう。
 本発明のペプチドのプロドラッグとしては、本発明のペプチドのアミノ基がアシル化、アルキル化またはリン酸化された化合物(例えば、本発明のペプチドのアミノ基がエイコサノイル化、アラニル化、ペンチルアミノカルボニル化、(5-メチル-2-オキソ-1,3-ジオキソレン-4-イル)メトキシカルボニル化、テトラヒドロフラニル化、ピロリジルメチル化、ピバロイルオキシメチル化、又はtert-ブチル化された化合物)、本発明のペプチドのヒドロキシ基がアシル化、アルキル化、リン酸化、又はホウ酸化された化合物(例えば、本発明のペプチドのヒドロキシ基がアセチル化、パルミトイル化、プロパノイル化、ピバロイル化、スクシニル化、フマリル化、アラニル化、又はジメチルアミノメチルカルボニル化された化合物)、本発明のペプチドのヒドロキシ基やカルボキシ基がエステル化、又はアミド化された化合物(例えば、本発明のペプチドのヒドロキシ基やカルボキシ基がC1-6アルキルエステル化、フェニルエステル化、カルボキシメチルエステル化、ジメチルアミノメチルエステル化、ピバロイルオキシメチルエステル化、エトキシカルボニルオキシエチルエステル化、フタリジルエステル化、(5-メチル-2-オキソ-1,3-ジオキソレン-4-イル)メチルエステル化、シクロヘキシルオキシカルボニルエチルエステル化、又はメチルアミド化された化合物)などが挙げられるが、これらに限定されない。これらの化合物は自体公知の方法によって本発明のペプチドから製造することができる。
 本発明のペプチドのプロドラッグは、広川書店1990年刊「医薬品の開発」第7巻分子設計163~198頁に記載されているような生理的条件で本発明のペプチドに変化するものであってもよい。
 本明細書において、プロドラッグは塩を形成していてもよく、係る塩としては、本発明のペプチドの塩として例示したものが挙げられる。
 本発明のペプチドは、結晶であってもよく、結晶形が単一であっても結晶形混合物であっても本発明のペプチドに包含される。結晶は、自体公知の結晶化法を適用して、結晶化することによって製造することができる。
 本発明のペプチドは、薬学的に許容され得る共結晶や共結晶塩であってもよい。ここで共結晶、又は共結晶塩とは、各々が異なる物理的特性(例えば、構造、融点、融解熱、吸湿性、溶解性及び安定性等)を持つ、室温で二種、又はそれ以上の独特な固体から構成される結晶性物質を意味する。共結晶、又は共結晶塩は、自体公知の共結晶化法に従い製造することができる。
(環状ペプチドの作用効果)
 後述する実施例に示される通り、本実施形態で表されるアミノ酸配列群の代表例である配列17、配列20(LO2)及び配列21(LO3)は、プロテアーゼ分解に対する耐性とK-Ras(G12D)発現細胞に対する増殖抑制活性を有している。本実施形態で表されるアミノ酸配列群は、これらの代表例と類似のアミノ酸配列及び立体構造的特徴を有することから、それらもプロテアーゼ分解に対する耐性と細胞増殖抑制活性を有している可能性が極めて高いと考えられる。
 KRpep-2dは、K-Ras(G12D)のみならずK-Ras(G12C)や野生型K-Rasにも結合し、その結合活性はGDP結合型RasとGTP結合型Rasのいずれに対してもほぼ同等であることが確認されている(非特許文献3及び非特許文献4)。そして、Rasのアミノ酸配列は、変異の有無に関わらず高度に保存されている。後述する実施例に示される通り、本実施形態で表されるアミノ酸配列群の代表例のビオチン修飾体(Biotin-BC-1)は、野生型K-Ras、K-Ras(G12D)、K-Ras(G12V)、K-Ras(G12C)、K-Ras(G13D)、野生型N-Ras、N-Ras(Q61K)、野生型H-Ras、H-Ras(G12V)、そしてH-Ras(Q61L)に対して結合する。本実施形態で表されるアミノ酸配列群は、KRpep-2dのファーマコフォア、そしてBiotin-BC-1と類似のアミノ酸配列及び立体構造的特徴を有することから、変異型K-Ras、変異型N-Ras、変異型H-RasといったRas全般に結合し、その結合活性はGDP結合型RasとGTP結合型Rasのいずれに対してもあり、結合によってRas全般の機能を阻害する可能性が極めて高いと考えられる。
 非特許文献5に記載されているKRpep-2d改変ペプチドのK-Ras(G12D)阻害活性、そして後述する実施例に示される2d-5/15-Dap/AspのK-Ras(G12D)結合活性、Biotin-BC-1のK-Ras(G12D)結合活性、配列1~21のK-Ras(G12D)発現細胞に対する増殖抑制活性は、以下のことを示している。本発明の二環ペプチドにおいて、(1)1位-11位間の共有結合はS-S結合のような柔軟な構造から、アミド結合のような平面性を有する比較的堅い構造まで、幅広い形状の構造を受容する。(2)1位-11位間の共有結合は、Cα炭素間の原子数が3~7までの幅広い距離を受容する、(3)4位-11位間の共有結合は、Cα炭素間の原子数が4~8までの幅広い距離を受容する。
 非特許文献5にも示される通り、一般的に環状ペプチドの標的結合活性は、最適な環状サイズを頂点としてベルシェイプ型を描くことから、本発明の二環ペプチドの4-11位間の共有結合は、Cα炭素間の原子数が4~8を頂点として、さらに1~2原子数程度の増加であれば受容する可能性が極めて高い。すなわち4位-11位間の共有結合は、Cα炭素間の原子数が4~10までの幅広い距離を受容すると考えられる。また、4-11位間の共有結合は、ペプチドの二環構造規制に寄与するが、Ras結合には直接寄与していないため、アミド結合、ジスルフィド結合、チオエーテル結合、C=C結合、C-C結合、トリアゾールを介した結合、ジチオテトラフルオロベンゼンを介した結合などの幅広い形状の構造を受容すると考えられる。
 Ras全般のアミノ酸配列は、哺乳類で高度に保存されているため、本実施形態で表されるアミノ酸配列からなるペプチド群は、マウス、ラット、イヌ、サルなどのヒト以外の哺乳類の変異型K-Ras、変異型N-Ras、及び/又は変異型H-Rasに対しても結合して、その機能を阻害する可能性が極めて高いと考えられる。
(環状ペプチドの製造方法)
 本実施形態のペプチドは、液相法、固相法、又は液相法と固相法を組み合わせたハイブリッド法等の化学合成法等、公知のペプチドの製造方法などによって製造することができる。
 固相法には、市販の自動合成機を用いることができる。例えば、水酸基を有するレジンの水酸基と、α位アミノ基がFmoc基といった保護基で保護された第一のアミノ酸(通常、目的とするペプチドのC末端アミノ酸)のカルボキシ基をエステル化反応させる。エステル化触媒としては、1-メシチレンスルホニル-3-ニトロ-1、2、4-トリアゾール(MSNT)、ジシクロヘキシルカルボジイミド(DCC)、ジイソプロピルカルボジイミド(DIPCDI)等の公知の脱水縮合剤を用いることができる。次に、第一アミノ酸のα位アミノ基の保護基を脱離させるとともに、主鎖のカルボキシ基以外のすべての官能基が保護された第二のアミノ酸を加え、当該カルボキシ基を活性化させて、第一及び第二のアミノ酸を結合させる。さらに、第二のアミノ酸のα位アミノ基を脱保護し、主鎖のカルボキシ基以外のすべての官能基が保護された第三のアミノ酸を加え、当該カルボキシ基を活性化させて、第二及び第三のアミノ酸を結合させる。これを繰り返して、目的とする長さのペプチドを合成する。直鎖ペプチドをレジンから切断し、精製後、ペプチドを環状化するための官能基を脱保護し、定法にしたがって、ペプチドを環状化する。
 固相合成のレジンとしては、Merrifield resin、MBHA resin、Cl-Trt resin、SASRIN resin、Wang resin、Rink amide resin、HMFS resin、Amino-PEGA resin(メルク社)、HMPA-PEGA resin(メルク社)等が挙げられる。これらのレジンは、溶剤(ジメチルホルムアミド(DMF)、2-プロパノール、塩化メチレン等)で洗浄してから用いてもよい。α位アミノ基の保護基としては、ベンジルオキシカルボニル(Cbz)基、tert-ブトキシカルボニル(Boc)基、フルオレニルメトキシカルボニル(Fmoc)基、ベンジル基、アリル基、アリルオキシカルボニル(Alloc)基等が挙げられる。Cbz基はフッ化水素酸、水素化等によって脱保護でき、Boc基はトリフルオロ酢酸(TFA)により脱保護でき、Fmoc基はピペリジンによる処理で脱保護できる。α位カルボキシ基の保護は、メチルエステル、エチルエステル、ベンジルエステル、tert-ブチルエステル、シクロヘキシルエステル等を用いることができる。アミノ酸のその他の官能基として、セリンやスレオニンなどのヒドロキシ基はベンジル基やtert-ブチル基で保護することができ、チロシンなどのヒドロキシ基は2-ブロモベンジルオキシカルボニル基やtert-ブチル基で保護できる。リジンなどの側鎖のアミノ基、グルタミン酸やアスパラギン酸などのカルボキシ基は、α位アミノ基、α位カルボキシ基と同様に保護することができる。
 カルボキシ基の活性化は、縮合剤を用いて行うことができる。縮合剤としては、例えば、ジシクロヘキシルカルボジイミド(DCC)、ジイソプロピルカルボジイミド(DIPCDI)、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(EDCあるいはWSC)、(1H-ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリス(ジメチルアミノ)ホスホニウムヘキサフルオロホスファート(BOP)、1-[ビス(ジメチルアミノ)メチル]-1H-ベンゾトリアゾリウム-3-オキシドヘキサフルオロホスファート(HBTU)等が挙げられる。レジンからのペプチド鎖の切断は、TFA、フッ化水素(HF)等の酸で処理することによって行うことができる。
 本実施形態のペプチドは、一態様として環状化されている。本明細書において環状化とは、1つのペプチド内において、1アミノ酸以上離れた2つ以上のアミノ酸が直接的に、又はリンカーを介して間接的に共有結合し、分子内に1つ以上の環状構造を作ることを意味する。環状化は、非特許文献3や非特許文献6や非特許文献7に記載の手法に則って、実施することができる。例えば、アミノ基とカルボキシ基間のアミド結合、チオール基とチオール基間のジスルフィド結合、チオール基とハロゲン基間のチオエーテル結合、チオール基とアリル基間のチオール‐エン反応によるチオエーテル結合、アリル基とアリル基間のオレフィンメタセシス反応によるC=C結合(当該C=C結合は還元反応によって、C-C結合に変換されていてもよい)、アルキニル基とアジド基間のクリック反応によるトリアゾールを介した結合、ハロゲン基を有するリンカーと二つのチオール基間のチオエーテル結合などによることができるが、これらに限定されない。環状化のための直接的な又はリンカーを介した間接的な共有結合は、主鎖-主鎖間、主鎖-側鎖間、側鎖-主鎖間、側鎖-側鎖間のいずれであってもよい。
 本発明のペプチドの環状化には、例えば、(1)チオール基を有するシステイン、D体システイン、ホモシステイン、D体ホモシステインをそれぞれ独立にアミノ酸1及びアミノ酸2とし、それらのチオール基間で形成されるジスルフィド結合を用いることができる、(2)求核基であるハロゲン原子(クロロ、ブロモ、又はヨード)を有するアミノ酸(例えば3-クロロアラニン)、又はハロゲン原子(クロロ、ブロモ、又はヨード)を有するカルボン酸(例えば3-クロロプロパン酸)をアミノ酸1とし、チオール基を有するアミノ酸2との間で形成されるチオエーテル結合を用いることができる、(3)チオール基を有するアミノ酸1及びアミノ酸2、そして求核基であるハロゲン原子(クロロ、ブロモ、又はヨード)を有するリンカー(例えばジヨードメタン(DIM)、1,2-ジヨードエタン(DIE)、1,3-ジヨードプロパン(DIP)、1,4-ジヨードブタン(DIB)、ヘキサフルオロベンゼンなど)の間で形成されるチオエーテル結合を用いることができる、(4)アジド基を有するβアジドアラニンをアミノ酸1、アルキニル基を有する2-アミノ-5-ヘキシン酸をアミノ酸2とし、その間のクリック反応によって形成されるトリアゾールを介した共有結合を用いることができる、(5)アリル基を有するアミノ酸(例えばアリルグリシン、D体アリルグリシン、ホモアリルグリシン、D体ホモアリルグリシンなど)、又はアリル基を有するカルボン酸(例えば3-ブテン酸)をアミノ酸1とし、チオール基を有するアミノ酸2との間のチオール‐エン反応によって形成されるチオエーテル結合を用いることができる、(6)アリル基を有するアミノ酸、又はアリル基を有するカルボン酸をそれぞれ独立にアミノ酸1及びアミノ酸2とし、それらのアリル基間のオレフィンメタセシス反応によって形成されるC=C結合を用いることができる、(7)オレフィンメタセシス反応によって形成されたC=C結合を還元することで形成されるC-Cを用いることができる、(8)アミノ基を有するアミノ酸1(例えば2,3-ジアミノプロパン酸、2,4-ジアミノブタン酸、オルニチン、リジン、それらのD体アミノ酸、βアラニンなど)とカルボキシ基を有するアミノ酸2(アスパラギン酸、グルタミン酸、それらのD体アミノ酸など)又はC末端カルボキシ基の間のアミド結合を用いることができる、(9)N末端アミノ基とカルボキシ基を有するアミノ酸又はC末端カルボキシ基の間のアミド結合を用いることができる。アミノ酸1とアミノ酸2は、どちらがN末端側にきてもよい。
(環状ペプチドを含む医薬、診断薬、研究用試薬)
 本発明に係る医薬組成物は、上述したアミノ酸配列からなるペプチドを有効成分として含み、ペプチドがRasに結合し、その活性を阻害することを通じて、悪性腫瘍などの増殖を抑制することが可能である。上記の医薬組成物の投与形態は特に限定されず、経口的投与でも非経口的投与でもよい。非経口投与としては、例えば、筋肉内注射、静脈内注射、皮下注射等の注射投与、経皮投与、経粘膜投与(経鼻、経口腔、経眼、経肺、経膣、又は経直腸投与)等が挙げられる。医薬組成物中のペプチドは、代謝及び排泄されやすい性質に鑑みて、各種の修飾を行うことができる。例えば、ペプチドにアルキル鎖、ポリエチレングリコール、又は糖鎖などを付加することで、血中滞留時間を長くする、抗原性を低下させることができる。また、ポリ乳酸・グリコール(PLGA)などの生体内分解性の高分子化合、多孔性ヒドロキシアパタイト、リポソーム、表面修飾リポソーム、不飽和脂肪酸で調製したエマルジョン、ナノパーティクル、ナノスフェア等を徐放化基剤として用い、これにペプチドを内包させてもよい。経皮投与する場合、弱い電流を皮膚表面に流して角質層を透過させることもできる(イオントフォレシス法)。
 上記の医薬組成物は、有効成分をそのまま用いてもよいし、薬学的に許容できる担体、賦形剤、添加剤等を加えて製剤化してもよい。剤形としては、例えば、液剤(注射剤など)、分散剤、懸濁剤、錠剤、丸剤、粉末剤、坐剤、散剤、細粒剤、顆粒剤、カプセル剤、シロップ剤、トローチ剤、吸入剤、軟膏剤、点眼剤、点鼻剤、点耳剤、パップ剤等が挙げられる。これらの製剤は、速放性製剤又は徐放性製剤等の放出制御製剤(徐放性マイクロカプセルなど)であってもよい。製剤化は、例えば、賦形剤、結合剤、崩壊剤、滑沢剤、溶解剤、溶解補助剤、着色剤、矯味矯臭剤、安定化剤、乳化剤、吸収促進剤、界面活性剤、pH調整剤、防腐剤、抗酸化剤などを適宜使用し、常法により行うことができる。製剤化に用いられる成分の例としては、精製水、食塩水、リン酸緩衝液、デキストロース、グリセロール、エタノール等の薬学的に許容される有機溶剤、動植物油、乳糖、マンニトール、ブドウ糖、ソルビトール、結晶セルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、デンプン、コーンスターチ、無水ケイ酸、ケイ酸アルミニウムマグネシウム、コラーゲン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、カルボキシビニルポリマー、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ポリアクリル酸ナトリウム、アルギン酸ナトリウム、水溶性デキストラン、カルボキシメチルスターチナトリウム、ぺクチン、メチルセルロース、エチルセルロース、キサンタンガム、アラビアゴム、トラガント、カゼイン、寒天、ポリエチレングリコール、ジグリセリン、グリセリン、プロピレングリコール、ワセリン、パラフィン、ミリスチン酸オクチルドデシル、ミリスチン酸イソプロピル、高級アルコール、ステアリルアルコール、ステアリン酸、ヒト血清アルブミン等が挙げられるが、これらに限定されない。ペプチドが経粘膜吸収されにくい場合は、難吸収性薬物の吸収を改善する吸収促進剤として、ポリオキシエチレンラウリルエーテル類、ラウリル硫酸ナトリウム、サポニン等の界面活性剤;グリココール酸、デオキシコール酸、タウロコール酸等の胆汁酸塩;EDTA、サリチル酸類等のキレート剤;カプロン酸、カプリン酸、ラウリン酸、オレイン酸、リノール酸、混合ミセル等の脂肪酸類;エナミン誘導体、N-アシルコラーゲンペプチド、N-アシルアミノ酸、シクロデキストリン類、キトサン類、一酸化窒素供与体等を用いてもよい。
 丸剤又は錠剤は、糖衣、胃溶性、腸溶性物質で被覆することもできる。注射剤は、注射用蒸留水、生理食塩水、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、植物油、アルコール類等を含むことができる。さらに、湿潤剤、乳化剤、分散剤、安定化剤、溶解剤、溶解補助剤、防腐剤等を加えることができる。必要に応じ、通常の防腐剤、抗酸化剤、着色剤、甘味剤、吸着剤、湿潤剤等の添加物を適宜、適量用いることもできる。
 本発明の医薬組成物は、Rasの機能阻害を通じて、Rasを発現する悪性腫瘍が関与するとされる種々の疾患の治療又は予防に有効である。例えば、膵癌(例えば、膵管癌等)、大腸癌(例えば、家族性大腸癌、遺伝性非ポリポーシス大腸癌、消化管間質腫瘍等)、小腸癌(例えば、非ホジキンリンパ腫、消化管間質腫瘍等)、乳癌(例えば、浸潤性乳管癌、非浸潤性乳管癌、炎症性乳癌等)、前立腺癌(例えば、ホルモン依存性前立腺癌、ホルモン非依存性前立腺癌等)、胃癌(例えば、乳頭腺癌、粘液性腺癌、腺扁平上皮癌等)、肺癌(例えば、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、悪性中皮腫等)、結腸癌(例えば、消化管間質腫瘍等)、直腸癌(例えば、消化管間質腫瘍等)、食道癌、十二指腸癌、舌癌、咽頭癌(例えば、上咽頭癌、中咽頭癌、下咽頭癌等)、唾液腺癌、脳腫瘍(例えば、松果体星細胞腫瘍、毛様細胞性星細胞腫、びまん性星細胞腫、退形成性星細胞腫等)、神経鞘腫、肝臓癌(例えば、原発性肝癌、肝外胆管癌等)、腎臓癌(例えば、腎細胞癌、腎盂と尿管の移行上皮癌等)、胆管癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、卵巣癌(例えば、上皮性卵巣癌、性腺外胚細胞腫瘍、卵巣性胚細胞腫瘍、卵巣低悪性度腫瘍等)、膀胱癌、尿道癌、皮膚癌(例えば、眼内(眼)黒色腫、メルケル細胞癌等)、血管腫、悪性リンパ腫、悪性黒色腫、甲状腺癌(例えば、甲状腺髄様癌等)、副甲状腺癌、鼻腔癌、副鼻腔癌、骨腫瘍(例えば、骨肉腫、ユーイング腫瘍、子宮肉腫、軟部組織肉腫等)、血管線維腫、網膜肉腫、陰茎癌、精巣腫瘍、小児固形癌(例えば、ウィルムス腫瘍、小児腎腫瘍等)、カポジ肉腫、AIDSに起因するカポジ肉腫、上顎洞腫瘍、線維性組織球腫、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、白血病(例えば、急性骨髄性白血病、急性リンパ芽球性白血病等)などが挙げられるが、これらに限定されない。
 本発明の医薬組成物は、上記疾患に有用な他の医薬や治療法と併用投与してもよい。例えば悪性腫瘍であれば、各種の化学療法、外科的治療、放射線療法と組み合わせてもよい。
 本発明の医薬組成物を哺乳類(例えば、ヒト、マウス、ラット、モルモット、ウサギ、イヌ、ウマ、サル、ブタ等)、特にヒトに投与する場合の投与量は、症状、患者の年齢、性別、体重、感受性差、投与方法、投与間隔、有効成分の種類、製剤の種類によって異なり、特に限定されないが、例えば、30μg~1000mg、100μg~500mg、100μg~100mgを1回、又は数回に分けて投与することができる。
 以下に示す実施例は、単なる例示であって、上述した実施形態と共に本発明を詳細に説明することのみを意図しており、本発明を限定するものではない。当業者は、本発明の意義を逸脱することなく様々な態様に本発明を変更することができ、係る変更も本発明の範囲に含まれる。
 本明細書中で用いられている略号は下記の意味を表す。
K-Ras:V-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog
N-Ras:Neuroblastoma ras oncogene homolog
H-Ras:Harvery rat sarcoma viral oncogene homolog
GDP:Guanonsine diphosphate
GTP:Guanonsine triphosphate
GEF:Guanine nucleotide exchange factor
GAP:GTPase accelerating protein
BSA:Bovine serum albumin
RP-HPLC:Reverse-phase high performance liquid chromatography
HRP:Horseradish peroxidase
SA:Streptavidin
DTT:Dithiothreitol
PBS:Phosphate buffered saline
ELISA:Enzyme-linked immunosorbent assay
ATP:Adecnosine triphosphate
Ac:Acetyl
Arg:L-Arginine
Cys:L-Cysteine
Gly:Glycine
Ala:L-Alanine
βAla:beta-Alanine (beta-homo-Glycine)
γAba:gamma―aminobutyric acid
Aze:L-Azetidine carboxylic acid
Pro:L-Proline
t4fP:Trans-4-fluoro-L-Proline
Pip:L-Pipecolic acid
Val:L-Valine
Leu:L-Leucine
Ile:L-Isoleucine
γmL:gamma-methyl-L-Leucine (3-tert-butyl-L-Alanine)
Nle:L-Norleucine
dmNl:5,5-dimethyl-L-Norleucine
Ahep:(S)-2-Aminoheptanonic acid
Aoc:(S)-2-Aminooctanonic acid
Anon:(S)-2-Aminononanonic acid
Adec:(S)-2-Aminodecanoic acid
Cprg:L-Cyclopropylglycine
Cbug:L-Cyclobutylglycine
Cpeng:L-Cyclopentylglycine
Chg:L-Cyclohexylglycine
Cha:L-Cyclohexylalanine
Phg:L-Phenylglycine
Phe:L-Phenylalanine
3cPg:3-chloro-L-Phenylglycine
2cPg:2-chloro-L-Phenylglycine
4fPg:4-fluoro-L-Phenylglycine
Tyr:L-Tyrosine
3hF:3-hydroxy-L-Phenylalanine
Trp:L-Tryptophan
5hW:5-hydroxy-L-Tryptophan
6cW:6-chloro-L-Tryptophan
1NaphA:L-1-Naphthylalanine
2NaphA:L-2-Naphthylalanine
Dap:(S)-2,3-Diaminopropanonic acid
Lys:L-Lysine
S(Ome):O-methyl-L-Serine
hmS(Ome):O-methyl-L-homoserine
Thr:L-Threonine
Asp:L-Aspartic acid
4fF:4-fluoro-L-Phenylalanine
4mF:4-methyl-L-Phenylalanine
4cF:4-chloro-L-Phenylalanine
4tfmF:4-trifluoromethyl-L-Phenylalanine
4bF:4-bromo-L-Phenylalanine
4iF:4-iodo-L-Phenylalanine
2PyrdA:3-(2-Pyridyl)-L-Alanine
Tic:(S)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxylic acid
DIE:1,2-Diiodoethane
DIP:1,3-Diiodopropane
DIB:1,4-Diiodobutane
X:N-methylated amino acid X
X:D-amino acid X
c[XY],c(XY):Cyclization between amino acid X to amino acid Y
(ペプチド合成)
 本実施例に使用した全てのペプチドの化学合成は、株式会社スクラム(東京、日本)に委託し、9-フルオレニルメトキシカルボニル基(Fmoc基)をαアミノ基の保護基として用いる標準的な固相合成法を自動合成機SyroII(Biotage社製)で実施した。C末端に位置する側鎖保護アミノ酸-レジンを合成カラムに入れて、装置をセットした。続いて、Fmoc基で保護した次アミノ酸に1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロフォスフェート(HATU)/ジイソプロピルエチルアミン(DIEA)を加えて活性化し、カラムに入れて反応させた。反応終了後に洗浄し、20%ピペリジンを用いて、Fmoc基を脱保護した。本工程を繰り返すことで、ペプチド鎖を伸長し、最終アミノ酸のFmoc基を脱保護した後、装置からペプチドレジンを取り出した。ペプチドレジンに30%ヘキサフルオロ-2-プロパノール(HFIP)/ジクロロメタン(DCM)を加えて、レジンから直鎖の側鎖保護ペプチドを切り出し、エーテル沈殿によって側鎖保護ペプチドを回収した。SunFire C18カラム(10×150mm)(Waters社製)を用いたRT-HPLCによって、側鎖保護ペプチドを精製した後、凍結乾燥した。
 ペプチドの環状化は、非特許文献3や非特許文献6や非特許文献7に記載の手法を参考とした。例として、配列21(LO3)の環状化を以下に示す。直鎖の側鎖保護ペプチドをDCMに溶解し、ジメチルホルムアミド(DMF)に溶解した1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOAt)とエチル(ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(EDC)塩酸塩を添加し、C末端カルボキシ基を活性化させた。氷上で1時間反応後、さらに室温で一晩反応させ、N末端アミノ基とC末端カルボキシ基間のアミド結合によって、側鎖保護ペプチドを環状化した。蒸留水で3回洗浄し、DCMを留去して乾燥後、側鎖保護基を脱保護し、エーテル沈殿によって、単環ペプチドを得た。SunFire C18カラム(10×150mm)(Waters社製)を用いたRT-HPLCによって、単環ペプチドを精製した後、凍結乾燥した。単環ペプチドをジメチルスルホキシド(DMSO)に溶解し、DMFに溶解した1,4-ジヨードブタン(DIB)、10mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン(TCEP)を含む0.1MのNaHCOとアセトニトリルの混液に加え、80℃で反応させることで、チオール基とハロゲン化アルキルリンカーの間のチオエーテル結合によって、ペプチドを環状化した。SunFire C18カラム(10×150mm)(Waters社製)を用いたRT-HPLCによって、二環ペプチドLO3を精製した後、凍結乾燥した。最終的に得られたペプチドの分子量は、microflex(Bruker社)を用いて測定し、目的物を同定した。本実施例で合成したペプチドの理論分子量、実測分子量、純度、環状化タイプ、アミノ酸配列を表2に示す。また、これらの中でBiotin-BC-1、配列1~21(Seq-1~21)の構造式を図10に示す。なお、表2において、D体表記のないアミノ酸残基はL体を示す。
(ELISA法による競合結合試験の構築)
 アミノ酸置換したペプチドのRasに対する結合活性をKRpep-2dのそれと比較するため、図3に示したELISA法による競合結合試験を構築した。以下、本ELISA法を簡単に説明する。まず、Rasの組み換えタンパク質を10mMのMgCl/10μMのGDP/PBSを用いて、12.5ng/50μL/ウェルで96穴マキシソーププレート(カタログNo.439454、Nunc社製)に添加し、4℃で一晩コートした後、0.1%BSA/10mMのMgCl/10μMのGDP/PBSをさらに300μL/ウェルで添加し、室温で30分間ブロックした。0.1%Tween20/PBSでプレートを洗浄後、0.025%BSA/0.05%Tween20/10mMのMgCl/10μMのGDP/PBSを用いて、Biotin-KRpep-2d(100nM)と任意の濃度のアミノ酸置換ペプチド又は比較対象であるKRpep-2dとの混合液を調製し、50μL/ウェルで添加した。室温で30分間反応後、0.1%Tween20/PBSでプレートを洗浄した。プレートにコートされたRasに結合したBiotin-KRpep-2dをSA-HRP(カタログNo.ab7403、アブカム社製)で検出した。HRPの定量には、TMB-ELISA Substrate Solution(カタログNo.34028、サーモフィッシャー社製)を用いて、吸光度450nmを測定した。Biotin-KRpep-2dのRasに対する結合は、溶液中に共存するアミノ酸置換ペプチドやKRpep-2dのRasに対する結合と競合するため、アミノ酸置換ペプチドやKRpep-2dの濃度依存的に阻害される。すなわち、アミノ酸置換ペプチドやKRpep-2dのRasに対する結合活性は、Biotin-KRpep-2dの結合に対する競合的な阻害活性として検出される。Rasをコートしていないウェルに対するBiotin-KRpep-2dの結合値を阻害活性100%、アミノ酸置換ペプチドやKRpep-2dを添加していないウェルに対するBiotin-KRpep-2dの結合値を阻害活性0%として、アミノ酸置換ペプチド及びKRpep-2dの50%阻害活性値を算出した。続いて、KRpep-2dの50%阻害活性値を1として、アミノ酸置換ペプチドの阻害活性値の相対値を算出した。
 本競合試験に用いたBiotin-KRpep-2dのK-Ras(G12D)(カタログNo.12259-H07E1-200、Sino Biological社製)に対するペプチド濃度依存的な結合を図4に示す。K-Ras(G12D)をコートしたウェルにBiotin-KRpep-2dを添加した場合に得られた吸光度から、BSAでブロッキングのみしたウェルにBiotin-KRpep-2dを添加した場合に得られた吸光度を差し引き、特異的な結合活性を見積もった。この結果、Biotin-KRpep-2dは、K-Ras(G12D)に対してペプチドの添加濃度依存的な結合を示した。一方、ネガティブコントロールのタンパク質に対しては、結合活性を示さなかった。
(アミノ酸置換ペプチドのK-Ras(G12D)に対する結合活性の評価)
 K-Ras(G12D)に対する競合結合試験をN=4で実施した結果を表1に示す。KRpep-2dに対して1アミノ酸置換もしくは2アミノ酸置換を導入したペプチド配列のほとんどが、KRpep-2dと同等の結合活性又はKRpep-2dより強い結合活性を示したことから、これらのアミノ酸置換がK-Ras(G12D)に対するペプチドの結合活性の向上に有効であることが示された。
 5位Cysと15位CysをそれぞれDapとAspに置換し、アミド結合によって環化した2d-5/15-Dap/Aspは、KRpep-2dの0.6倍とやや減弱したもののK-Ras(G12D)結合活性を示した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000019
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000020
(本発明ペプチドのRasに対する結合活性の評価)
 KRpep-2dに非天然アミノ酸を導入し、さらに連続するアルギニン配列を除去し、1位-11位間と4位-11位間の共有結合によって二環化した本発明ペプチドの代表例であるビオチン修飾体Biotin-BC-1の野生型K-Ras、K-Ras(G12D)、K-Ras(G12V)、K-Ras(G12C)、K-Ras(G13D)、野生型N-Ras、N-Ras(Q61K)、野生型H-Ras、H-Ras(G12V)、及びH-Ras(Q61L)に対するペプチド濃度依存的な結合を図5に示す。RasをコートしたウェルにBiotin-BC-1を添加した場合に得られた吸光度から、BSAでブロッキングのみしたウェルにBiotin-BC-1を添加した場合に得られた吸光度を差し引き、特異的な結合活性を見積もった。
 図5に示したように、1位-11位間と4位-11位間の共有結合によって二環化しているビオチン修飾ペプチドは、いずれのRasに対してもペプチドの添加濃度依存的な結合を示した。一方、ネガティブコントロールのタンパク質に対しては、結合活性を示さなかった。還元条件によって、4位-11位間の共有結合が切断され、1位-11位間の共有結合のみで単環となったビオチン修飾ペプチドは、いずれのRasに対しても、その結合活性が大幅に減弱した。
(本発明ペプチドのプロテアーゼ分解に対する耐性の評価)
 本発明ペプチドがKRpep-2dと比較して、プロテアーゼ分解に対する耐性を有していることを確認するため、ラット血漿中にKRpep-2d又は本実施例で合成したペプチド(配列17、配列20(LO2)及び配列21(LO3))を混合し、一定時間の培養後にペプチドの残存をRP-HPLCのピークの有無で評価した。各10mMのペプチド1μLに対して、ラット血漿を20μL添加し、37℃にて任意の時間(0又は24時間)培養した。その後、KRpep-2dに対しては80%メタノールを200μL添加し、合成ペプチド(配列17、配列20、配列21)に対してはアセトニトリルを200μL添加し、よく混合した後、氷上で10分間静置し、4℃下、15,000rpmの速度で10分間遠心することで、血漿タンパク質を除去した。上清を回収し、SunFire C18カラム(5μm 4.6×150mm)を用いたRP-HPLC(A液:0.1%TFA/水、B液:0.1%TFA/アセトニトリル、1mL/minにて80%A液→10%A液を20minグラジエント)でペプチドの残量を検出した。
 その結果を図6に示す。図6に示される通り、KRpep-2d由来のピークは、24時間の培養後には消失しており、配列中のいずれかの部分がプロテアーゼ分解を受けたことが示唆された。一方、合成ペプチド(配列17、配列20、配列21)由来のピークは、24時間後でも培養時間0時間と比較して、ほぼ同等を維持しており、プロテアーゼ分解に対する耐性を有していることが示された。
(本発明ペプチドの変異型K-Ras発現細胞に対する増殖抑制活性の評価)
 本発明ペプチドが細胞内のRasのシグナル伝達を抑制し、その結果として細胞増殖を抑制することを確認するため、細胞増殖試験をN=4で行った。以下、細胞増殖試験を簡単に説明するが、非特許文献3に従って行ってもよい。K-Ras(G12D)を発現するA427細胞(カタログNo.HTB-53、ATCC社製)又はPANC-1細胞(カタログNo.CRL-1469、ATCC社製)を1×10細胞/ウェルで96穴プレートに撒きこみ、CO培養機内で37℃にて、一晩培養した。血清培地で希釈したペプチド(終濃度30μM)をウェルに添加し、24時間培養後、培地を全て除去し、続いて、新たに血清培地で希釈したペプチド(終濃度30μM)をウェルに添加し、24時間培養した。培地の除去とペプチドを添加する工程を計3回実施した後、ウェル中の細胞数をCellTiter-Glo(カタログNo.G7570、プロメガ社製)で定量した。ペプチド添加前の細胞数を増殖抑制率100%、全工程を経たペプチド非添加ウェル内の細胞数を増殖抑制率0%として、任意の濃度のペプチドの増殖抑制活性を算出した。
 その結果を図7(A)及び図7(B)に示す。図7(A)に示される通り、実施例で合成したペプチド(配列1~21)は、A427細胞の増殖を抑制した。一方、単環ペプチドであるMC1~12の、A427細胞に対する増殖抑制活性は、二環化ペプチドと比較して、大きく減弱した。また、図7(B)に示したように、配列17のペプチドは、A427細胞だけでなく、K-Ras(G12D)を発現するPANC-1細胞の増殖も抑制した。
(本発明ペプチドの皮下担癌マウスにおける抗癌活性の評価)
 本発明ペプチドがin vivoで抗癌活性を示すかを評価した。K-Ras(G12D)を発現するPANC-1細胞(カタログNo.CRL-1469、ATCC社製)を1×10細胞でCrlj:SHO-PrkdcscidHrhrマウス(雌、7週齢)(日本チャールス・リバー)の左鼠径部皮下に移植し、腫瘍体積が約50mmに達した時点で、試験に供した。腫瘍体積は、皮膚表面から、腫瘍塊の長径(mm)及びそれに直交する短径(mm)をノギスで測り、長径×短径×0.5の式で求め、単位はmmとした。本発明ペプチドの代表例(配列17)をDMSOに溶解後、生理食塩水で10倍に希釈し、40mg/kgで二日に一回、尾静脈から投与し、経日的にマウスの体重と腫瘍体積を測定した(ペプチド投与群:N=10、Vehicle群:N=4)。なお、Vehicle群とは、癌細胞の移植ありで生理食塩水(10%DMSO)を投与した群である。
 結果を図8に示す。本発明ペプチドの代表例(配列17)を投与したマウスでは、PANC-1細胞の増殖に由来する腫瘍体積の増大が有意に抑制され、スチューデントのt検定によって算出されたp値は0.005以下であった。一方、マウスの体重の減少はみられなかった。
(本発明ペプチドの同所性移植モデルマウスにおける抗癌活性の評価)
 本発明ペプチドがin vivoで抗癌活性を示すかを評価した。K-Ras(G12D)を発現するPANC-1細胞(カタログNo.CRL-1469、ATCC社製)を2.5×10細胞でBALB/cAJcl-nu/nuマウス(雄、8週齢)(日本クレア株式会社)の膵臓尾部被膜下に移植し、1週間後、試験に供した。本実施例で合成したペプチド(配列17)をDMSOに溶解後、生理食塩水で10倍に希釈し、40mg/kgで二日に一回、尾静脈から投与した(Sham群、ペプチド投与群、Vehicle群:各N=7)。なお、Sham群とは、癌細胞を含まない細胞培地で移植手技を実施し生理食塩水(10%DMSO)を投与した群であり、Vehicle群とは、癌細胞の移植ありで生理食塩水(10%DMSO)を投与した群である。投与開始から4週間後のマウスの体重と臓器(膵臓、肝臓、腎臓)の重量を測定した。
 その結果を図9に示す。本発明ペプチドの代表例(配列17)を投与したマウスでは、PANC-1細胞の増殖に由来する膵臓の重量の増加が有意に抑制され、スチューデントのt検定によって算出されたp値は0.05以下であった。一方、肝臓や腎臓の重量には有意な差はみられなかった。また、マウスの体重の減少はみられなかった。

 
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000021
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000022
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000023
 本発明に係るペプチドは、プロテアーゼ分解耐性を有しており、Rasにペプチドが結合することで、Rasの分子スイッチ機能のオフ/オンのサイクルを阻害し、Rasを増殖ドライバーとする癌細胞の増殖を抑制する。従って、本発明に係るペプチドは、Rasを発現する癌細胞が関与する疾患、例えば、大腸癌、膵臓癌、肺癌などの予防や治療に有用であると考えられる。
 本発明に係るペプチドは、そのものを抗癌剤として使用できるだけでなく、抗体、レクチン、糖鎖、リポソーム、ナノパーティクルなどといった癌組織へのデリバリー分子と組み合わせる薬効分子として使用することも可能である。また、タンパク質をユビキチン化し、分解へと誘導する分子と組み合わせることで、細胞内のRasを選択的に分解する機能性分子として使用することも可能である。
 さらに本発明に係るペプチドは、免疫チェックポイント阻害剤や中性子補足療法など、他の作用機序を有する医薬品や療法と併用すれば、癌細胞の増殖をより強力に抑制できると考えられる。

Claims (14)

  1.  下記式(1):
    c[X-X-X-c(X-X-X-X-X-X-X10-X11)]   (1)
    (式中、X、X及びX11は、それぞれ独立にアミノ基、カルボキシ基、チオール基、アリル基、アルキニル基、アジド基、若しくはハロゲン原子を有するアミノ酸残基、又はそれらの誘導体を表し、
     X、X及びXは、それぞれ独立に置換基を有していてもよい炭化水素基を有するアミノ酸残基、置換基を有していてもよい芳香族炭素環基を有するアミノ酸残基、若しくは置換基を有していてもよい芳香族複素環基を有するアミノ酸残基、又はそれらの誘導体を表し、
     Xは、アスパラギン酸残基、又はその誘導体を表し、
     X、X、X、X10は、任意のアミノ酸残基を表し、
     XとX11及びXとX11は、それぞれの間で独立に、直接的な又はリンカーを介した間接的な共有結合を形成し、それによって式(1)のペプチドは分子内に2つの環状構造を有し、
     XとX11との間の前記共有結合は、それらの主鎖-主鎖間、主鎖-側鎖間、側鎖-主鎖間、又は側鎖-側鎖間のいずれの結合であってもよく、
     XとX11の間の前記共有結合は、それらの側鎖-主鎖間、又は側鎖-側鎖間のいずれの結合であってもよい。)
     で表されるアミノ酸配列からなる環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  2.  XとX11のCα炭素原子間の結合が下記式(2):
    Cα-(CH-X-(CH-Cα11   (2)
    (式中、AとBは、それぞれ独立に0~2のいずれかの整数を表し、
     AとBの総和は、1~4のいずれかの整数であり、
     Xは、S-S、CH-CH、S-CH、CH-S、O-CH、CH-O、CH=CH、NH-C(=O)、N(CH)-C(=O)、NH-C(=S)、N(CH)-C(=S)、O-C(=O)、C(=O)-NH、C(=O)-N(CH)、C(=S)-NH、C(=S)-N(CH)、C(=O)-O、CH-CH-CH、S-CH-CH、CH-CH-S、CH-S-CH、O-CH-CH、CH-CH-O、CH-O-CH、S-CH-S、S-C(=CH)-S、S-(CH-S、S-(CH-S、S-(CH-S、S-CH-CH=CH-CH-S、S-CH-C(=O)-NH、NH-C(=O)-CH-S、S-CH-C-CH-S、S-CH-C(=O)-CH-S、又はS-CH-C(=CH)-CH-Sを表す。)
     で表される構造を含む請求項1に記載の環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  3.  XとX11のCα炭素原子間の結合が下記式(3):
    Cα-(CH-Y-(CH-Cα11   (3)
    (式中、AとBは、それぞれ独立に0~4のいずれかの整数を表し、
     AとBの総和は、2~4のいずれかの整数であり、
     Yは、S-S、CH-CH、S-CH、CH-S、O-CH、CH-O、CH=CH、NH-C(=O)、N(CH)-C(=O)、NH-C(=S)、N(CH)-C(=S)、O-C(=O)、C(=O)-NH、C(=O)-N(CH)、C(=S)-NH、C(=S)-N(CH)、C(=O)-O、CH-CH-CH、S-CH-CH、CH-CH-S、CH-S-CH、O-CH-CH、CH-CH-O、CH-O-CH、S-CH-S、S-C(=CH)-S、S-(CH-S、S-(CH-S、S-(CH-S、S-CH-CH=CH-CH-S、S-CH-C(=O)-NH、NH-C(=O)-CH-S、S-CH-C-CH-S、S-CH-C(=O)-CH-S、S-CH-C(=CH)-CH-S、トリアゾール、又はジチオテトラフルオロベンゼンを表す。)
     で表される構造を含む請求項1又は2に記載の環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  4.  XとXがそれぞれ独立に下記式(4):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000001
    (式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、R、R及びRは、それぞれ独立に水素原子、又はメチル基を表し、R、R、Rは、それぞれ独立に水素原子、メチル基、又はハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を表し、nは、0~10のいずれかの整数を表す。);又は
     下記式(5):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000002
    (式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、Zは、C又はNを表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表し、nは、1~6のいずれかの整数を表す。);又は
     下記式(6):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000003
    (式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、R、R、R、R10及びR11は、それぞれ独立に水素原子又はハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表す。);又は
     下記式(7):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000004
    (式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、R12は、2-チエニル基、3-チエニル基、2-ピリジル基、3-ピリジル基、4-ピリジル基、2-チアゾリル基、4-チアゾリル基、2-オキサゾリル基、4-オキサゾリル基、1-ピラゾリル基、1-イミダゾリル基、1,2,3-トリアゾール-1-イル基、又は1,2,4-トリアゾール-1-イル基を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表す。)
     で表されるアミノ酸残基であるか、又はそれらの誘導体である、請求項1~3のいずれか1項に記載の環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  5.  Xが下記式(8):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000005
    (式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、R、R、R、R10及びR11は、それぞれ独立に水素原子、ヒドロキシ基、メトキシ基、メチル基、tert-ブチル基、ハロゲン化メチル基、又はハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表す。);
     下記式(9):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000006
    (式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、R13、R14、R15及びR16は、それぞれ独立に水素原子、ヒドロキシ基、メトキシ基、メチル基、tert-ブチル基、ハロゲン化メチル基、又はハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表す。);
    下記式(10):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000007
    (式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、Zは、C又はNを表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表し、nは、1~6のいずれかの整数を表す。);又は
     下記式(11):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000008
    (式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、R17は、2-チエニル基、3-チエニル基、2-ピリジル基、3-ピリジル基、4-ピリジル基、2-チアゾリル基、4-チアゾリル基、2-オキサゾリル基、4-オキサゾリル基、1-ピラゾリル基、1-イミダゾリル基、1,2,3-トリアゾール-1-イル基、1,2,4-トリアゾール-1-イル基、1H-ベンゾイミダゾール-1-イル基、1H-ベンゾイミダゾール-2-イル基、1,3-ベンゾチアゾール-2-イル基、1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル基、2-キノイル基、8-キノイル基、1-ナフチル基、又は2-ナフチル基を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表す。);
     で表されるアミノ酸残基であるか、又はそれらの誘導体である、請求項1~4のいずれか1項に記載の環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  6.  Xが下記式(12):
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000009
    (式中、波線は主鎖のアミド結合を形成するカルボニル基又は窒素原子との付着点を表し、R18、R19、R20は、それぞれ独立に水素原子、ヒドロキシ基、メトキシ基、アミノ基、モノメチル化アミノ基、ジメチル化アミノ基、トリメチル化アミノ基、メチル基、エチル基、イソプロピル基、tert-ブチル基、ハロゲン化メチル基、又はハロゲン原子(F、Cl、Br、I)を表し、Rは、水素原子、又はメチル基を表し、nは、0又は1を表す。)
     で表されるアミノ酸残基であるか、又はそれらの誘導体である、請求項1~5のいずれか1項に記載の環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  7.  XとXが、それぞれ独立に置換基を有していてもよい炭化水素基を有するアミノ酸、N-メチル化グリシン、2-アゼチジン-2-カルボン酸、プロリン、チオプロリン、3,4-デヒドロプロリン、ピペコリン酸又はそれらの誘導体を表す、請求項1~6いずれか1項に記載の環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  8.  X10が、バリン、ノルバリン、ロイシン、ノルロイシン、イソロイシン、メチオニン、シクロプロピルグリシン、シクロブチルグリシン、フェニルアラニン、4-フルオロ-フェニルアラニン、2-チエニルアラニン、3-チエニルアラニン、2‐ピリジルアラニン、3‐ピリジルアラニン、4‐ピリジルアラニン、2-チアゾリルアラニン、4-チアゾリルアラニン、2-オキサゾリルアラニン、4-オキサゾリルアラニン、1-ピラゾリルアラニン、1-イミダゾリルアラニン、3-(1,2,3-トリアゾール-1-イル)-アラニン、3-(1,2,4-トリアゾール-1-イル)-アラニン、3-(1H-ベンゾイミダゾール-1-イル)-アラニン、3-(1H-ベンゾイミダゾール-2-イル)-アラニン、3-(1,3-ベンゾチアゾール-2-イル)-アラニン、3-(1,3-ベンゾオキサゾール-2-イル)-アラニン、2-キノイルアラニン、8‐キノイルアラニン、トリプトファン、1-ナフチルアラニン、2-ナフチルアラニン、若しくはそれらのN-メチル化アミノ酸残基又はそれらの誘導体を表す、請求項1~7のいずれか1項に記載の環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  9.  下記式(13):
    c[X-Pro-X-c(Cys-X-Ser-4fF-Asp-Pro-X10-X11)]   (13)
    (式中、Xは、β-アラニン又はγ-アミノ酪酸残基を表し、
     Xは、ロイシン、ノルロイシン、シクロヘキシルグリシン、フェニルグリシン、2-アミノヘプタン酸、2-アミノオクタン酸、2-アミノノナン酸又は2-アミノデカン酸残基を表し、
     Xは、イソロイシン、ノルロイシン、シクロヘキシルグリシン、フェニルグリシン、2-アミノヘプタン酸、2-アミノオクタン酸、2-アミノノナン酸又は2-アミノデカン酸残基を表し、
     X10は、バリン、フェニルアラニン、トリプトファン、1-ナフチルアラニン又はそれらのN-メチル化アミノ酸残基を表し、
     X11は、D体又はL体のシステイン残基を表し、
     XとX11は、主鎖のアミノ基とカルボキシル基との間でアミド結合を形成し、XとX11は、それぞれの側鎖-SH基の間で、メチレン基、エチレン基、プロピレン基又はブチレン基のリンカーを介して共有結合を形成し、それによって式(13)のペプチドは分子内に2つの環状構造を有する。)で表されるアミノ酸配列からなる環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  10.  下記式(14):
    c[βAla-Pro-X-c(Cys-X-Ser-4fF-Asp-Pro-Trp-Cys)]   (14)
    (式中、Xは、ロイシン、ノルロイシン、シクロヘキシルグリシン、フェニルグリシン、2-アミノヘプタン酸、2-アミノオクタン酸、2-アミノノナン酸又は2-アミノデカン酸残基を表し、
     Xは、イソロイシン、ノルロイシン、シクロヘキシルグリシン、フェニルグリシン、2-アミノヘプタン酸、2-アミノオクタン酸、2-アミノノナン酸又は2-アミノデカン酸残基を表し、
     1位と11位の残基は、主鎖のアミノ基とカルボキシル基との間でアミド結合を形成し、4位と11位の2つのシステイン残基は、それぞれの側鎖-SH基の間で、プロピレン基のリンカーを介して共有結合を形成し、それによって式(14)のペプチドは分子内に2つの環状構造を有する。)で表されるアミノ酸配列からなる環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  11.  請求項1~10のいずれか1項に記載のペプチドのアミノ酸配列において、1~数個のアミノ酸が欠失、付加、及び/又は置換されているか若しくは前記アミノ酸配列と少なくとも50%以上の配列相同性を有するか、及び/又は請求項1~8のいずれか1項に記載のペプチドと少なくとも50%以上の立体構造相同性を有するペプチドであって、Ras阻害活性を有する環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  12.  配列番号1~21のいずれかに記載のアミノ酸配列を有する環状ペプチド、若しくは配列番号1~21のいずれかに記載のアミノ酸配列において1又は数個のアミノ酸が欠失、付加、及び/又は置換したアミノ酸配列を含み、Ras阻害活性を有する環状ペプチド又はその薬理学的に許容される塩。
  13.  請求項1~12のいずれか1項に記載のペプチドの誘導体、及び/又は修飾体。
  14.  請求項1~13のいずれか1項に記載のペプチドを含む医薬、診断薬、及び/又は研究試薬。

     
PCT/JP2020/018956 2019-05-14 2020-05-12 Ras阻害ペプチド WO2020230780A1 (ja)

Priority Applications (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2021519437A JPWO2020230780A1 (ja) 2019-05-14 2020-05-12
EP20805621.8A EP3970801A4 (en) 2019-05-14 2020-05-12 RAS INHIBITOR PEPTIDE
US17/609,784 US20220227813A1 (en) 2019-05-14 2020-05-12 Ras INHIBITORY PEPTIDE
CN202080030445.8A CN113727991A (zh) 2019-05-14 2020-05-12 Ras抑制肽

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2019091419 2019-05-14
JP2019-091419 2019-05-14

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2020230780A1 true WO2020230780A1 (ja) 2020-11-19

Family

ID=73289428

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/JP2020/018956 WO2020230780A1 (ja) 2019-05-14 2020-05-12 Ras阻害ペプチド

Country Status (5)

Country Link
US (1) US20220227813A1 (ja)
EP (1) EP3970801A4 (ja)
JP (1) JPWO2020230780A1 (ja)
CN (1) CN113727991A (ja)
WO (1) WO2020230780A1 (ja)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2022234639A1 (ja) * 2021-05-07 2022-11-10 中外製薬株式会社 変異型ras(g12d)に対する選択的結合性を示す結合分子

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH03504496A (ja) * 1988-04-08 1991-10-03 スクリプス クリニック アンド リサーチ ファウンデーション 水素結合の共有結合置換により安定化されたポリペプチド
JPH10504802A (ja) * 1994-06-08 1998-05-12 ペプター リミテッド コンホメーション的に固定された主鎖環化ペプチド類似体
JP2003531835A (ja) * 2000-04-12 2003-10-28 アメルシャム ヘルス アクスイェ セルスカプ ペプチドベースの化合物
JP2013507927A (ja) * 2009-10-14 2013-03-07 エルロン・セラピューティクス・インコーポレイテッド 改善されたペプチド模倣大環状分子
JP2017502921A (ja) * 2013-10-28 2017-01-26 バイサイクル・セラピューティクス・リミテッド 新規なポリペプチド

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2705068T3 (es) * 2013-05-23 2019-03-21 Ohio State Innovation Foundation Síntesis química y cribado de bibliotecas de péptidos bicíclicos
CN111620940A (zh) * 2014-05-21 2020-09-04 哈佛大学的校长及成员们 Ras抑制肽和其用途

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH03504496A (ja) * 1988-04-08 1991-10-03 スクリプス クリニック アンド リサーチ ファウンデーション 水素結合の共有結合置換により安定化されたポリペプチド
JPH10504802A (ja) * 1994-06-08 1998-05-12 ペプター リミテッド コンホメーション的に固定された主鎖環化ペプチド類似体
JP2003531835A (ja) * 2000-04-12 2003-10-28 アメルシャム ヘルス アクスイェ セルスカプ ペプチドベースの化合物
JP2013507927A (ja) * 2009-10-14 2013-03-07 エルロン・セラピューティクス・インコーポレイテッド 改善されたペプチド模倣大環状分子
JP2017502921A (ja) * 2013-10-28 2017-01-26 バイサイクル・セラピューティクス・リミテッド 新規なポリペプチド

Non-Patent Citations (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
"Molecular Design", vol. 7, 1990, HIROKAWA SHOTEN, article "Development of Medicines", pages: 163 - 198
AYUMU NIIDA, SHIGEKAZU SASAKI, KAZUKO YONEMORI, TOMOYA SAMESHIMA, MASAHIRO YAGUCHI, TAIJI ASAMI, KOTARO SAKAMOTO, MASAHIRO KAMAURA: "Investigation of the structural requirements of K-Ras(G12D) selective inhibitory peptide KRpep-2d using alanine scans and cysteine bridging", BIORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS, ELSEVIER, AMSTERDAM , NL, vol. 27, no. 12, 1 June 2017 (2017-06-01), Amsterdam , NL, pages 2757 - 2761, XP055760728, ISSN: 0960-894X, DOI: 10.1016/j.bmcl.2017.04.063 *
FAIRLIE DPDANTAS DE ARAUJO, BIOPOLYMERS, vol. 106, no. 6, 2016, pages 843 - 852
LAU YHDE ANDRADE PWU YSPRING DR, CHEM SOC REV, vol. 44, no. 1, 2015, pages 91 - 102
NIIDA ASASAKI SYONEMORI KSAMESHIMA TYAGUCHI MASAMI TSAKAMOTO KKAMAURA M, BIOORG MED CHEM LETT, vol. 27, no. 12, 2017, pages 2757 - 2761
PENDER AGARCIA-MURILLAS IRANA SCUTTS RJKELLY GFENWICK KKOZAREWA IGONZALEZ DE CASTRO DBHOSLE J, O'BRIEN MTURNER NC, PLOS ONE, vol. 10, no. 9, 2015, pages e0139074
SAKAMOTO KKAMADA YSAMESHIMA TYAGUCHI MNIID, SASAKI SMIWA MOHKUBO SSAKAMOTO JIKAMAURA MCHO N, BIOCHEM BIOPHYS RES COMMUN, vol. 484, no. 3, 2017, pages 605 - 611
See also references of EP3970801A4
SOGABE SKAMADA YMIWA MNIID, SAMESHIMA TKAMAURA MYONEMORI KSASAKI SSAKAMOTO JISAKAMOTO K., ACS MED CHEM LETT, vol. 8, no. 7, 2017, pages 732 - 736
TAKASHIMA AFALLER DV, EXPERT OPIN THER TARGETS, vol. 17, no. 5, 2013, pages 507 - 531
TRINH THI B. ET AL.: "Discovery of a Direct Ras Inhibitor by Screening a Combinatorial Library of Cell -Permeable Bicyclic Peptides", ACS COMBINATORIAL SCIENCE, vol. 18, no. 1, 2016, pages 75 - 85, XP055431276, DOI: 10.1021/acscombsci.5b00164 *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2022234639A1 (ja) * 2021-05-07 2022-11-10 中外製薬株式会社 変異型ras(g12d)に対する選択的結合性を示す結合分子
WO2022234851A1 (ja) * 2021-05-07 2022-11-10 中外製薬株式会社 変異型ras(g12d)に対する選択的結合性を示す結合分子

Also Published As

Publication number Publication date
EP3970801A1 (en) 2022-03-23
CN113727991A (zh) 2021-11-30
JPWO2020230780A1 (ja) 2020-11-19
EP3970801A4 (en) 2022-11-02
US20220227813A1 (en) 2022-07-21

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7116217B2 (ja) Mt1-mmpに特異的な二環性ペプチドリガンド
JP4653840B2 (ja) メタスチン誘導体およびその用途
JP4346650B2 (ja) メタスチン誘導体およびその用途
JP5686825B2 (ja) メタスチン誘導体およびその用途
EP3185880A1 (en) Improved peptidyl calcineurin inhibitors
JP7100639B2 (ja) Cxcr4アンタゴニストおよび使用方法
WO2021200259A1 (ja) Vipr2アンタゴニストペプチド
WO2020230780A1 (ja) Ras阻害ペプチド
US20190247457A1 (en) Plexin Binding Regulator
EP2723761B1 (en) Compound and method for modulating opioid receptor activity
AU2011264416A1 (en) Nociceptin mimetics
JP2001518515A (ja) リウマチ性関節炎の治療組成物および治療方法
JP2023544223A (ja) 標的化pet/spect撮像のための放射性標識リガンド及びそれらの使用方法
EP3269727B1 (en) Anti-hepatitis b virus x protein polypeptide pharmaceutical
JP2018525399A (ja) Cck2r−薬物コンジュゲート
JP2005082489A (ja) 新規な摂食促進ペプチド、新規な成長ホルモン分泌促進ペプチド
JP2005082489A6 (ja) 新規な摂食促進ペプチド、新規な成長ホルモン分泌促進ペプチド
WO2024043249A1 (ja) 環状ペプチドまたはその塩、およびmdmx阻害剤
US9815867B2 (en) Peptide for inhibiting vascular endothelial growth factor receptor
WO2024043250A1 (ja) 環状ペプチドまたはその塩、およびmdmx阻害剤
WO2024029242A1 (ja) 新規lrp1結合ペプチド
WO2023088236A1 (zh) Mt1-mmp的双环肽配体及其缀合物
RU2454425C2 (ru) Производные метастина и их применение
JP2004107333A (ja) Cxcr4拮抗薬およびその用途
WO2011088462A2 (en) Alpha-fetoprotein 'ring and tail' peptides

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 20805621

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 2021519437

Country of ref document: JP

Kind code of ref document: A

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 2020805621

Country of ref document: EP

Effective date: 20211214