WO2019239879A1 - アミドの製造方法 - Google Patents
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Definitions
- Non-Patent Documents 1 and 2 disclose a method for synthesizing an amide using a symmetric acid anhydride as an active species of carboxylic acid.
- the symmetric acid anhydride method disclosed in Non-Patent Documents 1 and 2 is A first step of producing a symmetric anhydride by a condensation reaction between carboxylic acids; A second step of performing a coupling reaction between the symmetric anhydride and an amine; It can be said that the method comprises
- Non-Patent Document 3 discloses a method for synthesizing amides using a mixed acid anhydride as an active species of carboxylic acid.
- carboxylic acid and isopropyl chloroformate are mixed with a first micromixer to synthesize a mixed acid anhydride in a short time, and then, immediately, the synthesized mixed acid anhydride is not racemized. It is described that a solution containing a mixed acid anhydride, an amine and a catalyst (base) are mixed with a second micromixer to perform amidation.
- the mixed acid anhydride method disclosed in Non-Patent Document 3 is: A first step of reacting a carboxylic acid with a chloroformate to obtain a mixed acid anhydride; A second step of adding a base to the mixed anhydride to obtain an acylpyridinium species; Performing a coupling reaction of the acylpyridinium species with an amine to obtain an amide; It can be said that the method comprises
- this invention has the following aspects.
- a method for producing an amide comprising dehydrating condensation of carboxylic acids, followed by reacting with a base and reacting with an amine.
- a method for producing an amide comprising mixing a product obtained by reacting a mixture obtained by mixing a first carboxylic acid and a second carboxylic acid, a base, and an amine.
- FIG. 1 is a schematic diagram showing a schematic configuration of a flow system reaction apparatus 1.
- the manufacturing method of the amide of embodiment includes making it react with a base after making dehydration condensation of carboxylic acids, and making it react with an amine.
- the method for producing an amide according to the embodiment is a method including mixing a product obtained by reacting a mixture obtained by mixing a first carboxylic acid and a second carboxylic acid, a base, and an amine. May be.
- the method for producing an amide according to an embodiment is a product obtained by reacting a mixture obtained by mixing a first carboxylic acid, a second carboxylic acid and phosgene or a phosgene equivalent that decomposes in a reaction system to produce phosgene.
- R 1 is a hydrogen atom or a monovalent organic group.
- the carboxylic acid may be deprotonated to become a carboxylate ion and can be represented by the following general formula (1i).
- R 1 is a hydrogen atom or a monovalent organic group.
- the deprotonation of the carboxylic acid can be achieved by placing the carboxylic acid in the presence of a low nucleophilic base such as N, N-diisopropylethylamine (DIEA) in the reaction system.
- a low nucleophilic base such as N, N-diisopropylethylamine (DIEA)
- DIEA diisopropylethylamine
- the presence of a base means, for example, in a solvent to which a base has been added.
- the kind of the base is not particularly limited as long as it enables deprotonation of the carboxylic acid in the reaction system.
- Step 1 of the method for producing an amide according to the embodiment comprises dehydration condensation of a carboxylic acid represented by the following general formula (1) and a carboxylic acid represented by the following general formula (1) ′ to form the following general formula ( An acid anhydride represented by 2) is obtained.
- the acid anhydride can be obtained, for example, by reacting a carboxylic acid with phosgene or a phosgene equivalent that decomposes in a reaction system to produce phosgene.
- R 1 and R 2 are each independently a hydrogen atom or a monovalent organic group.
- the phosgene equivalent is one that decomposes in the reaction system to produce phosgene, and can be used as a substance substantially equivalent to phosgene in the synthesis reaction.
- Examples of phosgene equivalents include diphosgene and triphosgene.
- R 1 and R 2 in the formulas (1) and (1) ′ may be the same or different from each other.
- the acid anhydride represented by the general formula (2) is a symmetric acid anhydride.
- the counter anion of the cationic active species generated in Step 2 described later is the same as the carboxylate ion before activation.
- the counter anion may self-react with the cationic active species, but if the counter anion is the same as the carboxylate ion before activation, the product is activated to the cationic active species even if self-reacting. It is the same as the symmetric acid anhydride before. Therefore, when R 1 and R 2 are the same, there is an advantage that the type of amide obtained in the reaction system is homogenized and the planned acquisition of the desired type of reaction product is easy. is there.
- the amino acids may be 20 types of amino acids that constitute peptides or proteins in vivo and are encoded as genetic information. These amino acids include alanine, arginine, asparagine, aspartic acid, cysteine, glutamine, glutamic acid, glycine, histidine, isoleucine, leucine, lysine, methionine, phenylalanine, proline, serine, threonine, tryptophan, tyrosine, valine. Further, the amino acid may be a kind of amino acid that is not encoded as genetic information such as cystine.
- R 0 in the formula (1-1) is “—CH 3 ” when the amino acid is alanine, “—H” when the amino acid is glycine, and “ ⁇ ” when valine is used. CH (CH 3 ) 2 ”, and in the case of isoleucine,“ —CH (CH 3 ) CH 2 CH 3 ”.
- —R 1 and —R 2 may each be —CH (R 0 ) NH 2 .
- the amino acid may not be an ⁇ -amino acid.
- it may be a ⁇ -amino acid such as ⁇ -alanine.
- the carboxylic acid may be an amino acid derivative.
- An amino acid derivative may be a compound having substantially the same properties as an amino acid, may be a naturally occurring natural type, and is different from the natural type, such as modifications, additions, functional group substitutions, etc. Etc. may be included. As an example of the case where it has substantially the same properties as an amino acid, it can be incorporated into an enzyme using an amino acid as a substrate or can bind to a molecule that binds to an amino acid.
- Examples of amino acid derivatives include amino acids in which one or more hydrogen atoms or groups are substituted with other groups (substituents).
- An example of an amino acid derivative is a protected amino acid having a functional group protected with a protecting group.
- the protecting group has a function of inactivating a reactive functional group. It is also possible to deprotect the protecting group and return the protected functional group to its pre-protected state.
- that the functional group is protected means that an atom constituting the functional group is substituted with a protective group.
- Examples of the site protected by the protecting group include one or more sites selected from the group consisting of an amino group, a carboxyl group, and a side chain.
- the functional group contained in the side chain may be protected at one site or two or more sites with a protecting group. In the said process 1, it is preferable that the functional group of an amino group and / or a side chain is protected so that reaction of reactive functional groups other than a carboxyl group may be prevented.
- the kind of the protecting group is not particularly limited and can be appropriately selected depending on the kind of the functional group to be protected.
- the protecting group for amino group includes, but is not limited to, carbamate-based, sulfonamide-based, acyl-based, and alkyl-based protecting groups.
- the carbamate-based protecting group includes a 2-benzyloxycarbonyl group (sometimes abbreviated as -Z or -Cbz), a tert-butoxycarbonyl group (sometimes abbreviated as -Boc), allyloxy.
- a carbonyl group (sometimes abbreviated as -Alloc), a 2,2,2-trichloroethoxycarbonyl group (sometimes abbreviated as -Troc), a 2- (trimethylsilyl) ethoxycarbonyl group (-Teoc and 9-fluorenylmethyloxycarbonyl group (may be abbreviated as -Fmoc), p-nitrobenzyloxycarbonyl group (-Z (NO 2 )) And p-biphenylisopropyloxycarbonyl group (sometimes abbreviated as -Bpoc).
- sulfonamide-based protecting group examples include a p-toluenesulfonyl group (sometimes abbreviated as -Ts or -Tos), a 2-nitrobenzenesulfonyl group (sometimes abbreviated as -Ns), 2 , 2,4,6,7-pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfonyl (sometimes abbreviated as -Pbf), 2,2,5,7,8-pentamethylchroman-6-sulfonyl (-Pmc) And 1,2-dimethylindole-3-sulfonyl (sometimes abbreviated as -MIS).
- a p-toluenesulfonyl group sometimes abbreviated as -Ts or -Tos
- 2-nitrobenzenesulfonyl group sometimes abbreviated as -Ns
- 2 2,4,6,7-pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfony
- the base in Step 2 reacts with the acid anhydride to generate a cationic active species, and preferably has a high nucleophilicity, such as pyridine, pyridine derivative, imidazole, imidazole derivative and 1,4-diazabicyclo. More preferably, it is one or more selected from the group consisting of [2,2,2] octane.
- the pyridine derivative is not particularly limited as long as one or more hydrogen atoms of pyridine are substituted with other groups and has basic properties, but pyridine and pyridine derivatives are as follows.
- a compound represented by the general formula (3-1) is preferable.
- X 1 represents a hydrogen atom or any group selected from the group represented by the following formulas (a) to (c)).
- R 31 , R 32 , R 33 and R 34 each independently represents an alkyl group.
- R 33 and R 34 may be bonded to each other to form a ring, , One methylene group not directly bonded to R 33 or R 34 may be substituted with an oxygen atom.
- X 1 represents the same meaning as X 1 in formula (3-1)).
- acylpyridinium species are characterized by high electrophilicity. Therefore, even with a reaction with an amine having a low nucleophilicity, which will be described later, the reaction can proceed at a very high rate, and the generation of side reaction products can be significantly reduced.
- the imidazole derivative is not particularly limited as long as one or more hydrogen atoms of imidazole may be substituted with other groups and has a basic property.
- a compound represented by the general formula (3-2) is preferable.
- R 35 and R 36 are each independently a hydrogen atom or an alkyl group.
- pyridine derivatives in addition to pyridine, pyridine derivatives, imidazole, and imidazole derivatives, 1,4-diazabicyclo [2,2,2] octane (DABCO) can be exemplified as a preferable example.
- DABCO 1,4-diazabicyclo [2,2,2] octane
- Step 3 is a step of producing an amide by reacting the cationic active species obtained in Step 2 with an amine.
- Step 3 of the method for producing an amide according to the embodiment comprises reacting a cationic active species represented by the following general formula (4) with an amine represented by the following general formula (6) to produce the following general formula ( The amide represented by 7) is obtained.
- R 1 , R 2 , R 3 and R 4 are each independently a hydrogen atom or a monovalent organic group.
- the amine is preferably an amino acid or an amino acid derivative.
- amino acids and amino acid derivatives include those exemplified for the carboxylic acid.
- —R 3 and —R 4 may be, for example, —H and —CH (R 0 ) COOH.
- An example of an amino acid derivative is a protected amino acid having a functional group protected with a protecting group.
- the site protected by the protecting group include one or more sites selected from the group consisting of an amino group, a carboxyl group, and a side chain.
- the functional group contained in the side chain may be protected at one site or two or more sites with a protecting group.
- it is preferable that the carboxyl group and / or the side chain functional group is protected so as to prevent the reaction of a reactive functional group other than the amino group.
- the type of the protecting group is not particularly limited and can be appropriately selected according to the type of the functional group to be protected.
- the carboxyl group may be protected by neutralization to form a salt form, but is usually protected in the form of an ester.
- the esters include, but are not limited to, alkyl esters such as methyl and ethyl, benzyl esters (sometimes abbreviated as Bn or BZl), and the like.
- the method for producing an amide according to the embodiment in Step 3, the cationic active species is reacted with an amine.
- the method for producing an amide of the embodiment has an advantage that the reaction rate does not depend on the nucleophilicity of the amine because the cationic active species has high electrophilicity. Therefore, the method for producing an amide according to the embodiment is suitable for a reaction with an amine having low nucleophilicity.
- an amine having a low nucleophilicity is an amine having a lower nucleophilicity than 18 amino acids obtained by removing valine and isoleucine from 20 amino acids constituting a protein and encoded as genetic information.
- valine, isoleucine, N-alkylated amino acids, or derivatives thereof can be exemplified.
- An N-alkylated amino acid is an amino group in which one or two hydrogen atoms of an amino group bonded to the ⁇ -carbon are substituted with an alkyl group, and one hydrogen atom is substituted with a methyl group.
- -Methyl amino acids are preferred.
- the nucleophilicity of the amine here is, for example, by performing the acid anhydride method under the conditions shown in Example 1, and reacting the acid anhydride produced in Example 1 with the amine for which nucleophilicity is desired. , From the degree of reaction efficiency.
- the amount of each compound used in the reactions of Steps 1 to 3 may be appropriately adjusted according to the target reaction in consideration of the types of these compounds.
- the molar equivalent ratio of activated carboxylic acid to amine in the reaction system (activated carboxylic acid: amine) may be 10: 1 to 1/10: 1, and 5: 1 to 1/5: 1 or 3: 1 to 1/3: 1.
- the activated carboxylic acid is, for example, a compound represented by the general formula (4). According to the method for producing an amide of the embodiment, an amide can be produced with high efficiency even when a relatively small amount of amine close to an equivalent amount is reacted with the activated carboxylic acid.
- the reaction time of each step may be appropriately adjusted according to other conditions such as reaction temperature.
- the reaction time in Step 1 may be 0.05 seconds to 30 minutes, 0.1 seconds to 5 minutes, or 0.5 seconds to 30 seconds.
- the reaction time of step 2 and step 3 may be 1 second to 60 minutes, 5 seconds to 30 minutes, 1 minute to 10 minutes, Also good.
- the temperature (reaction temperature) at the time of the reaction in Steps 1 to 3 may be appropriately adjusted according to the type of compound used in Steps 1 to 3.
- the reaction temperature is preferably in the range of 0 to 100 ° C., more preferably in the range of 20 to 50 ° C.
- the reaction of Step 1 to Step 3 may be performed in the presence of a solvent.
- the solvent is not particularly limited, but a solvent that does not interfere with the reaction of the compound is preferable, and a solvent having high solubility of the raw material used in the reaction is preferable.
- N, N-dimethylformamide (DMF), tetrahydrofuran (THF), 1,4-dioxane and the like can be mentioned.
- reaction of Step 1 to Step 3 may further include other compounds not corresponding to the compounds exemplified above in the reaction system as long as the amide formation can be achieved.
- the reactions in Step 1 to Step 3 may be performed separately or simultaneously. From the viewpoint of more effectively suppressing the formation of side reaction products, it is preferable to perform Step 2 and Step 3 simultaneously.
- the amide can be produced with very high efficiency. Even the acid anhydride obtained in step 1 is in a state of accepting a nucleophilic species (amine) as an active species.
- a cationic active species is further formed in step 2, and an amine is reacted for the first time. Since the cationic active species produced here are significantly more active than acid anhydrides, the reaction can proceed at a very high rate, and by-products can also be produced compared to conventional methods. It can be dramatically suppressed. Furthermore, the reaction can easily proceed even with a low-reactivity amine that was difficult to react in the conventional method.
- the carboxylic acid includes a polypeptide
- the amino acid or amino acid derivative (carboxylic acid) according to the embodiment includes an amino acid or amino acid derivative (carboxylic acid) located at the C-terminal as a structural unit of the polypeptide.
- the amide production method of the embodiment is suitable as a peptide or protein production method.
- the manufacturing method of the amide of embodiment can be implemented using a flow-type reaction apparatus.
- the flow system reaction apparatus include a flow path for transporting a fluid containing a raw material or an intermediate used in the reaction in the method for producing an amide according to the embodiment, and a mixer for mixing the fluid.
- the reaction with the amine at least in the step 3 may be performed in the flow system reactor, and the base is reacted with the amine in the steps 2 and 3 to be reacted with the amine.
- the tank 13 is connected to the pump 23, and by the operation of the pump 23, the liquid stored in the tank 13 moves in the flow path f3 and flows into the mixer 32, and is mixed with the first mixed liquid.
- a second mixed liquid and sent to the flow path f5.
- the acid anhydride obtained in Step 1 and 4-morpholinopyridine contained in the third liquid react to form a cationic active species (Step 2 of the amide production method),
- the cationic active species obtained in this way reacts with the amine contained in the third liquid to obtain an amide (Step 3 of the amide production method).
- the second mixed liquid containing the produced amide is stored in the tank 14.
- the five types of compounds to be reacted are stored in three tanks. For example, each of them is stored in five separate tanks and mixed sequentially. Also good.
- the third liquid in the above embodiment it is preferable that 4-morpholinopyridine (base) and the amine are present in the same liquid in advance. That is, step 2 and step 3 may be performed at the same time, which makes it easy to react the highly reactive cationic active species generated in step 2 with the target amine immediately, and the cationic active species are active. It is possible to shorten the time in the crystallization state, and to effectively suppress the formation of unwanted side reaction products.
- R h represents a histidine side chain (in this example, protected by a protecting group MBom).
- a coupling reaction between the amino acid used as the carboxylic acid and the amino acid used as the amine was performed.
- a flow reaction system constituted by a PTFE tube (inner diameter 0.8 mm, outer diameter 1.59 mm) and a T-shaped mixer was used.
- the solution before the reaction was prepared by dividing it into three.
- the first solution was obtained by dissolving Fmoc-His (MBom) -OH, N-methylmorpholine, and DIEA used as carboxylic acid in DMF.
- the second solution was obtained by dissolving isopropyl chloroformate in THF.
- the first solution and the second solution are mixed with a T-shaped mixer and reacted for 20 seconds in the flow system reactor to perform mixed acid anhydride.
- the reaction solution containing the mixed acid anhydride and the third solution were mixed using a new T-shaped mixer, and the mixture was allowed to react for 30 seconds in a flow reactor and about 5 minutes after dispensing into a test tube. . All of these reactions were carried out at 30 ° C., and 20 seconds was set as the time for heat exchange before the solution before each reaction reached the mixer.
- Various solutions flowed out using a syringe pump. The flow rate of each pump was 1.2 mL / min for the first solution, 2.0 mL / min for the second solution, and 2.0 mL / min for the third solution.
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Abstract
Description
本願は、2018年6月15日に日本に出願された特願2018-114577に基づく優先権を主張し、その内容をここに援用する。
高活性な活性化剤を使って前記カルボキシル基を活性化させる方法として、酸塩化物法や酸無水物法がある。これら酸塩化物法や、酸無水物法は、活性化度の弱い縮合剤を使った活性法と比較して、活性化剤の構造が簡単であるため、単価が安く、更には活性化剤由来の副生成物の生成が少ない等の利点がある。
非特許文献1~2で開示される対称酸無水物法は、
カルボン酸同士の縮合反応による対称酸無水物の生成の第1のステップと、
前記対称酸無水物とアミンとのカップリング反応を行う第2のステップと、
を備える方法ということができる。
非特許文献3には、カルボン酸とクロロギ酸イソプロピルを第1のマイクロミキサーで混合し、混合酸無水物を短時間で合成し、続いて、合成した混合酸無水物がラセミ化しないよう、すぐさま混合酸無水物を含む溶液とアミンおよび触媒(塩基)を第二のマイクロミキサーで混合しアミド化を行うことが記載されている。
非特許文献3で開示される混合酸無水物法は、
カルボン酸とクロロギ酸エステルとを反応させて混合酸無水物を得る第1のステップと、
前記混合酸無水物に塩基を添加してアシルピリジニウム種を得る第2のステップと、
前記アシルピリジニウム種とアミンとのカップリング反応を行い、アミドを得る第3のステップと、
を備える方法ということができる。
(1)カルボン酸同士を脱水縮合させた後に、塩基と反応させ、アミンと反応させることを含む、アミドの製造方法。
(2)第一のカルボン酸及び第二のカルボン酸を混合して得られた混合物を反応させた生成物と、塩基と、アミンとを混合させることを含む、アミドの製造方法。
(3)ホスゲン、又は反応系内で分解してホスゲンを生成するホスゲン等価体を反応させて、前記カルボン酸同士を脱水縮合させる、前記(1)又は(2)に記載のアミドの製造方法。
(4)同じ種類のカルボン酸同士を脱水縮合させる、前記(1)~(3)のいずれか一つに記載のアミドの製造方法。
(5)前記カルボン酸が、アミノ酸又はアミノ酸誘導体である、前記(1)~(4)のいずれか一つに記載のアミドの製造方法。
(6)前記塩基が、ピリジン、ピリジン誘導体、イミダゾール、イミダゾール誘導体及び1,4-ジアザビシクロ[2,2,2]オクタンからなる群より選択されるいずれか一種以上である、前記(1)~(5)のいずれか一つに記載のアミドの製造方法。
(7)前記塩基が、4-モルホリノピリジン、N,N-ジメチル-4-アミノピリジン、4-ピロリジノピリジン、ピリジン、4-メトキシピリジン、イミダゾール、N-メチルイミダゾール及び1,4-ジアザビシクロ[2,2,2]オクタンからなる群より選択されるいずれか一種以上である前記(1)~(6)のいずれか一つに記載のアミドの製造方法。
(8)前記アミンが、アミノ酸又はアミノ酸誘導体である、前記(1)~(7)のいずれか一つに記載のアミドの製造方法。
(9)前記アミンの求核性が、タンパク質を構成し遺伝情報としてコードされる20種のアミノ酸からバリン及びイソロイシンを除いた18種のアミノ酸の求核性よりも低い、前記(1)~(8)のいずれか一つに記載のアミドの製造方法。
(10)前記アミンが、バリン、イソロイシン若しくはN-アルキル化されたアミノ酸、又はそれらの誘導体である、前記(8)又は(9)に記載のアミドの製造方法。
(11)前記アミンと反応させることを、流通系反応装置で行う、前記(1)~(10)のいずれか一つに記載のアミドの製造方法。
(12)さらに、前記カルボン酸同士を脱水縮合させた後に、前記塩基と反応させることを、流通系反応装置で行う、前記(11)に記載のアミドの製造方法。
実施形態のアミドの製造方法は、カルボン酸同士を脱水縮合させた後に、塩基と反応させ、アミンと反応させることを含むものである。
実施形態のアミドの製造方法は、第一のカルボン酸及び第二のカルボン酸を混合して得られた混合物を反応させた生成物と、塩基と、アミンとを混合させることを含む方法であってもよい。実施形態のアミドの製造方法は、第一のカルボン酸、第二のカルボン酸及びホスゲン又は反応系内で分解してホスゲンを生成するホスゲン等価体を混合して得られた混合物を反応させた生成物と、塩基と、アミンとを混合させることを含む方法であってもよい。ここで、第一のカルボン酸及び第二のカルボン酸を混合して得られた混合物を反応させた生成物は、第一のカルボン酸及び第二のカルボン酸を脱水縮合させた酸無水物を含むことができる。
なお、当該塩基は、カチオン性活性種を生成させるものであってよく、塩基(ただし、当該アミンを除く)であってよい。
なお、ここでいう混合とは、反応系に原料等の物質を添加する動作を指すものであり、反応系内でこれらが混合されたときには、原料等が添加前とは別の物質に変化していてもよい。
当該製造方法は、以下の工程1~3を含んでいてもよい。
工程1:カルボン酸同士を脱水縮合させて、酸無水物を得る工程。
工程2:前記工程1で得られた前記酸無水物と、塩基と、を反応させてカチオン性活性種を得る工程。
工程3:前記工程2で得られた前記カチオン性活性種と、アミンと、を反応させてアミドを製造する工程。
以下、上記の各工程について説明する。なお、本発明に係るアミドの製造方法の反応は、下記の各工程に例示される反応に限定されるものではない。
工程1は、カルボン酸同士を脱水縮合させて、酸無水物を得る工程である。
カルボン酸は、分子の末端にカルボキシル基を有するものであればよく、下記一般式(1)で表すことができる。
塩基の存在下とは、例えば、塩基を添加した溶媒中のことを意味する。当該塩基の種類は、反応系内でカルボン酸の脱プロトン化を可能とするものであれば、特に限定されない。
したがって、R1とR2とが同一である場合には、反応系中に得られるアミドの種類が均一化され、目的とする種類の反応生成物の計画的な取得が容易であるという利点がある。
例えば、前記式(1-1)中のR0は、前記アミノ酸がアラニンの場合には「-CH3」であり、グリシンの場合には「-H」であり、バリンの場合には「-CH(CH3)2」であり、イソロイシンの場合には「-CH(CH3)CH2CH3」である。他のアミノ酸についても同様である。
前記式(1)及び(1)’がアミノ酸である場合、-R1及び-R2は、それぞれ、-CH(R0)NH2であってよい。
アミノ酸と実質的に同等の性質を有する場合の一例として、アミノ酸を基質とする酵素に取り込まれ得る、又はアミノ酸と結合する分子と結合し得る場合が挙げられる。
アミノ酸誘導体としては、アミノ酸において、1個以上の水素原子又は基が、それ以外の基(置換基)で置換されたものが挙げられる。アミノ酸誘導体の一例として、官能基が保護基で保護された、保護アミノ酸が挙げられる。保護基は、反応性の官能基を不活性化する作用を有する。保護基を脱保護して、保護された官能基を保護される前の状態に戻すことも可能である。ここで官能基が保護されたとは、前記官能基を構成する原子が、保護基で置換されていることをいう。保護基で保護される部位としては、アミノ基、カルボキシル基、及び側鎖からなる群から選択されるいずれか一種以上の部位が挙げられる。側鎖に含まれる官能基は1箇所又は2箇所以上が保護基で保護されていてもよい。当該工程1においては、カルボキシル基以外の反応性の官能基の反応を防止するよう、アミノ基及び/又は側鎖の官能基が保護されていることが好ましい。
カルバメート系の保護基としては、2-ベンジルオキシカルボニル基(-Z又は-Cbzと略されることがある。)、tert-ブトキシカルボニル基(-Bocと略されることがある。)、アリルオキシカルボニル基(-Allocと略されることがある。)、2,2,2-トリクロロエトキシカルボニル基(-Trocと略されることがある。)、2-(トリメチルシリル)エトキシカルボニル基(-Teocと略されることがある。)、9-フルオレニルメチルオキシカルボニル基(-Fmocと略されることがある。)、p-ニトロベンジルオキシカルボニル基(-Z(NO2)と略されることがある。)、p-ビフェニルイソプロピルオキシカルボニル基(-Bpocと略されることがある。)等が挙げられる。
スルホンアミド系の保護基としては、p-トルエンスルホニル基(-Ts又は-Tosと略されることがある。)や、2-ニトロベンゼンスルホニル基(-Nsと略されることがある。)、2,2,4,6,7-ペンタメチルジヒドロベンゾフラン-5-スルホニル(-Pbfと略されることがある。)、2,2,5,7,8-ペンタメチルクロマン-6-スルホニル(-Pmcと略されることがある。)、1,2-ジメチルインドール-3-スルホニル(-MISと略されることがある。)等が挙げられる。
工程2は、前記工程1で得られた前記酸無水物と、塩基と、を反応させてカチオン性活性種を得る工程である。
実施形態に係るアミドの製造方法の工程2は、下記一般式(2)で表される酸無水物と、Bで表される塩基と、を反応させて下記一般式(4)で表されるカチオン性活性種を得るものである。なお、当該反応においては、カチオン性活性種のカウンターアニオンとして、下記一般式(5)で表される化合物が生成される。
工程3は、前記工程2で得られた前記カチオン性活性種と、アミンと、を反応させてアミドを製造する工程である。
実施形態に係るアミドの製造方法の工程3は、下記一般式(4)で表されるカチオン性活性種と、下記一般式(6)で表されるアミンと、を反応させて下記一般式(7)で表されるアミドを得るものである。
アミノ酸及びアミノ酸誘導体としては、前記カルボン酸において例示したものが挙げられる。
前記式(6)がアミノ酸である場合、-R3と-R4は、例えば、-Hと-CH(R0)COOHであってよい。
アミノ酸誘導体の一例として、官能基が保護基で保護された、保護アミノ酸が挙げられる。保護基で保護される部位としては、アミノ基、カルボキシル基、及び側鎖からなる群から選択されるいずれか一種以上の部位が挙げられる。側鎖に含まれる官能基は1箇所又は2箇所以上が保護基で保護されていてもよい。当該工程3においては、アミノ基以外の反応性の官能基の反応を防止するよう、カルボキシル基及び/又は側鎖の官能基が保護されていることが好ましい。
したがって、実施形態のアミドの製造方法は、求核性の低いアミンとの反応に好適である。求核性の低いアミンとは、具体的には、タンパク質を構成し遺伝情報としてコードされる20種のアミノ酸からバリン及びイソロイシンを除いた18種のアミノ酸の求核性よりも低いアミンであってもよく、より具体的には、バリン、イソロイシン若しくはN-アルキル化されたアミノ酸、又はそれらの誘導体を例示できる。N-アルキル化されたアミノ酸とは、α炭素に結合したアミノ基の1又は2つの水素原子がアルキル基に置換されているものであってよく、1つの水素原子がメチル基に置換されたN-メチルアミノ酸が好ましい。これらの求核性の低いアミンは、従来、酸無水物法で合成に用いることが困難であった。しかし、実施形態のアミドの製造方法によれば、従来、酸無水物法で合成に用いることの困難であった求核性の低いアミンであっても使用することができ、係る点においても実施形態のアミドの製造方法は画期的である。
活性化したカルボン酸とアミンとの、反応系内のモル当量比(活性化したカルボン酸:アミン)は、10:1~1/10:1であってよく、5:1~1/5:1であってよく、3:1~1/3:1であってよい。活性化したカルボン酸とは、例えば前記一般式(4)で表される化合物である。実施形態のアミドの製造方法によれば、活性化したカルボン酸に対して、等当量に近い比較的少量のアミンを反応させた場合であっても、高効率でアミドを製造可能である。
実施形態のアミドの製造方法は、前記カルボン酸が、アミノ酸又はアミノ酸誘導体であり、且つ、前記アミンが、アミノ酸又はアミノ酸誘導体である場合、ペプチド又はタンパク質を合成できる。ペプチド又はタンパク質の製造方法は、アミドの製造方法に包含される。
上記工程3で得られたアミドを、工程1におけるカルボン酸として用い、工程1~3の後に、さらに工程1~3を繰り返すことで、ポリペプチド鎖を伸長させることができる。
即ち、前記カルボン酸としてはポリペプチドも含まれ、実施形態に係るアミノ酸又はアミノ酸誘導体(カルボン酸)として、ポリペプチドの構成単位としてC末端に位置するアミノ酸又はアミノ酸誘導体(カルボン酸)も含まれる。このように、実施形態のアミドの製造方法は、ペプチド又はタンパク質の製造方法として好適である。
実施形態のアミドの製造方法は、流通系反応装置を使用して実施することができる。流通系反応装置は、実施形態のアミドの製造方法における反応に用いられる原料又は中間体を含む流体を輸送する流路と、該流体を混合するための混合機と、を備えるものを例示できる。流通系反応装置の使用について、例えば、少なくとも前記工程3における、アミンとの反応を流通系反応装置で行うのであってもよく、前記工程2及び工程3における、塩基と反応させ、アミンと反応させる反応を流通系反応装置で行うのであってもよく、前記工程1~3における、カルボン酸同士を脱水縮合させた後に、塩基と反応させ、アミンと反応させる反応を流通系反応装置で行うのであってもよい。なお、実施形態のアミドの製造方法は、流通系反応装置を使用して実施するものに限定されない。例えば、容積が小さく高速な攪拌速度が得られるバッチ容器を用いてもよい。バッチ容器の混合部の体積は、1~100mLであってもよく、5~50mLであってもよい。
図1は、流通系反応装置1の概略的な構成を示す模式図である。流通系反応装置1は、第1の液を収容するタンク11と、第2の液を収容するタンク12と、第3の液を収容するタンク13とを備える。
一例として、第1の液は第一のカルボン酸及び第二のカルボン酸を含み、第2の液はホスゲン又は反応系内で分解してホスゲンを生成するホスゲン等価体を含み、第3の液は塩基及びアミンを含む。より具体的な一例としては、図1に示すように、第1の液はカルボン酸及びDIEAを含み、第2の液はトリホスゲンを含み、第3の液は4-モルホリノピリジン及びアミンを含む。
流通系反応装置の使用について、例えば、少なくとも第1の液と第2の液との混合物と、第3の液との混合を流通系反応装置で行うのであってもよく、更には、第1の液と第2の液との混合を流通系反応装置で行うのであってもよい。
上記の流路の内径とは、流路の長さ方向と直角に交わる方向での流路断面における、流路内部分(流体が通る部分)の直径とすることができる。流路内部分の形状が真円形でない場合には、上記の流路の内径とは、上記流路内部分の形状を面積基準で真円換算したときの直径とすることができる。
タンク11,12,13,14、混合機31,32及び流路f1,f2,f3,f4,f5は、一例として、プラスチックやエラストマー等の樹脂や、ガラス材、金属、セラミックなどで形成されている。
実施形態に係る流通系反応装置1によれば、流路を通じて液を連続的に流通させることで化合物の衝突の機会が向上し、より高効率に反応を進めることができ、副反応の抑制も容易となる。例えば、工程1で生じた酸無水物を、すぐさま4-モルホリノピリジン(塩基)と反応させることが可能となるので、酸無水物が活性化状態でいる時間を短くでき、異性化等の副反応が生じる確率を低減できる。
しかし、上記実施形態の第3の液として示したように、4-モルホリノピリジン(塩基)とアミンとは、あらかじめ同じ液中に存在させることが好ましい。即ち、工程2及び工程3は同時に行ってもよく、これにより、工程2で生じた反応性の高いカチオン性活性種を、すぐさま目的のアミンと反応させることが容易となり、カチオン性活性種が活性化状態でいる時間を短くでき、望まない副反応物の生成を効果的に抑制できる。
〔原料〕
カルボン酸として用いたアミノ酸には、アミノ基がFmoc基によって保護され、ヒスチジン側鎖のπ位が4-メトキシベンジルオキシメチル(MBom)基で保護されたヒスチジンである、Fmoc-His(MBom)-OH(市販品)を用いた。アミンとして用いたアミノ酸には、カルボキシル基がメチル基で保護され、かつアミノ基がメチル化されたフェニルアラニンである、H-MePhe-OMe(市販品)を用いた。
カルボン酸として用いたアミノ酸と、アミンとして用いたアミノ酸とのカップリング反応を行った。カップリング反応は、PTFE製チューブ(内径0.8mm,外径1.59mm)とT字型ミキサーで構成された流通系反応装置を用いた。反応前の溶液は3つに分けて調整した。第1の溶液は、カルボン酸として用いたFmoc-His(MBom)-OHと、DIEAとをDMFに溶解して得た。第2の溶液は、トリホスゲンをTHFに溶解して得た。第3の溶液は、アミンとして用いたH-MePhe-OMeと、4-モルホリノピリジンとをTHFに溶解して得た。流通系反応装置中でのそれぞれのモル濃度の比は、H-MePhe-OMeが1.0に対して、4-モルホリノピリジンが0.010、トリホスゲンが0.40、DIEAが3.0、Fmoc-His(MBom)-OHが2.5とした。
目的物の単離にはGPCを用い、400MHzのH1-NMRにて同定した。
サンプルの調整は以下のように行った。得られたジペプチドの保護基を外した後、ペプチド/アミノ酸誘導体を重水素塩酸中で加水分解し、メチルアルコール中の重水素化物で試料をエステル化し、試薬を蒸発させた後、残留物をトリフルオロ酢酸無水物またはペンタフルオロプロピオン酸無水物を用いてアシル化した。
得られたジペプチドのNMRデータを以下に示す。
1H NMR (400 MHz, CDCl3, major rotamer): δ 7.78-6.85 (m, 20H), 5.33-5.22 (m, 3H), 4.79-4.74 (m, 1H), 4.44-4.30 (m, 4H), 4.15 (t, J = 6.8 Hz, 1H), 3.79 (s, 3H),3.72 (s, 3H), 3.33 (dd, J = 5.5, 14.5 Hz, 1H), 3.03 (dd, J = 6.8, 14.5 Hz, 1H),2.95-2.85 (m, 2H), 2.67 (s, 3H).
〔原料〕
カルボン酸として用いたアミノ酸には、アミノ基がFmoc基によって保護され、側鎖のπ位が4-メトキシベンジルオキシメチル(MBom)基で保護されたヒスチジンである、Fmoc-His(MBom)-OHを用いた。アミンとして用いたアミノ酸には、カルボキシル基がメチル基で保護され、かつアミノ基がメチル化されたフェニルアラニンである、H-MePhe-OMeを用いた。
カルボン酸として用いたアミノ酸と、アミンとして用いたアミノ酸とのカップリング反応を行った。カップリング反応は、PTFE製チューブ(内径0.8mm,外径1.59mm)とT字型ミキサーで構成された流通系反応装置を用いた。反応前の溶液は3つに分けて調整した。第1の溶液は、カルボン酸として用いたFmoc-His(MBom)-OHと、N-メチルモルホリンと、DIEAとをDMFに溶解して得た。第2の溶液は、クロロギ酸イソプロピルをTHFに溶解して得た。第3の溶液はアミンとして用いたH-MePhe-OMeと、4-モルホリノピリジンとをTHFに溶解して得た。流通系反応装置中でのそれぞれのモル濃度の比はH-MePhe-OMeが1.0に対して、4-モルホリノピリジンが0.010、その他Fmoc-His(MBom)-OH、N-メチルモルホリン、DIEA、及びクロロギ酸イソプロピルは1.0とした。
実施例1と同様の方法により行った。
なお、エステル及び目的物の単離は、目的物とエステルが同程度の極性であったため、GPCを用いてエステルと目的物とを単離し、400MHzのH1-NMRにて同定した。エステルおよび目的物の収率は、混合物の単離収量とNMRで得られたエステルと目的物のピーク面積の比率から算出した。
反応後の生成物を分析した結果、目的物であるジペプチドは、カップリング収率が26.4%であった。原料カルボン酸のうち33.5%は、副反応であるエステル化によって消費された。
Claims (12)
- カルボン酸同士を脱水縮合させた後に、塩基と反応させ、アミンと反応させることを含む、アミドの製造方法。
- 第一のカルボン酸及び第二のカルボン酸を混合して得られた混合物を反応させた生成物と、塩基と、アミンとを混合させることを含む、アミドの製造方法。
- ホスゲン、又は反応系内で分解してホスゲンを生成するホスゲン等価体を反応させて、前記カルボン酸同士を脱水縮合させる、請求項1又は2に記載のアミドの製造方法。
- 同じ種類のカルボン酸同士を脱水縮合させる、請求項1~3のいずれか一項に記載のアミドの製造方法。
- 前記カルボン酸が、アミノ酸又はアミノ酸誘導体である、請求項1~4のいずれか一項に記載のアミドの製造方法。
- 前記塩基が、ピリジン、ピリジン誘導体、イミダゾール、イミダゾール誘導体及び1,4-ジアザビシクロ[2,2,2]オクタンからなる群より選択されるいずれか一種以上である、請求項1~5のいずれか一項に記載のアミドの製造方法。
- 前記塩基が、4-モルホリノピリジン、N,N-ジメチル-4-アミノピリジン、4-ピロリジノピリジン、ピリジン、4-メトキシピリジン、イミダゾール、N-メチルイミダゾール及び1,4-ジアザビシクロ[2,2,2]オクタンからなる群より選択されるいずれか一種以上である請求項1~6のいずれか一項に記載のアミドの製造方法。
- 前記アミンが、アミノ酸又はアミノ酸誘導体である、請求項1~6のいずれか一項に記載のアミドの製造方法。
- 前記アミンの求核性が、タンパク質を構成し遺伝情報としてコードされる20種のアミノ酸からバリン及びイソロイシンを除いた18種のアミノ酸の求核性よりも低い、請求項1~8のいずれか一項に記載のアミドの製造方法。
- 前記アミンが、バリン、イソロイシン若しくはN-アルキル化されたアミノ酸、又はそれらの誘導体である、請求項8又は9に記載のアミドの製造方法。
- 前記アミンと反応させることを、流通系反応装置で行う、請求項1~10のいずれか一項に記載のアミドの製造方法。
- さらに、前記カルボン酸同士を脱水縮合させた後に、前記塩基と反応させることを、流通系反応装置で行う、請求項11に記載のアミドの製造方法。
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