WO2018179302A1 - 抗ポドプラニン抗体 - Google Patents
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- C07K2317/76—Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding
Definitions
- the present invention relates to a novel anti-podoplanin antibody and the like.
- Podoplanin is a mucin-type glycoprotein known as a platelet aggregation factor and a metastasis promoting factor, and is a type I transmembrane protein having a transmembrane site at the C-terminus.
- Podoplanin is a brain tumor, mesothelioma, testicular tumor, ovarian cancer, and various squamous cell carcinomas (oral cancer, pharyngeal cancer, laryngeal cancer, esophageal cancer, lung cancer, skin cancer, cervical cancer). It is known that it is highly expressed.
- the anti-podoplanin antibody is expected to exhibit an anticancer action (antitumor activity) in a cancer (tumor) in which podoplanin is highly expressed. Therefore, an antibody having higher specificity and affinity for podoplanin, a novel antibody that recognizes podoplanin, and the like are required.
- Non-Patent Documents 1-3 a monoclonal antibody production technique
- Non-Patent Documents 3-4 Cancer cell-specific antibodies against podoplanin are highly reactive to cancer cells such as lung cancer, esophageal cancer, brain tumor, and malignant mesothelioma that express cancer podoplanin, but normal podoplanin is highly expressed. It does not react at all to lymphatic endothelial cells, alveolar epithelial cells, or renal epithelial cells. Monoclonal antibodies developed so far by the CasMab method have strong ADCC / CDC activity and high anti-tumor effects in mouse cancer graft models. The possibility of
- the problem to be solved by the present invention is to provide a novel anti-podopranin antibody useful as a medicine, a diagnostic agent and a reagent.
- the PMab-117 antibody and its modified antibody established by the present invention were found to contain an O-type sugar chain (including sialic acid) added to Thr85 of human podoplanin as an epitope. Further, the PMab-117 antibody and its modified antibody were strongly positive for cancer cells expressing human podoplanin, but were found to be cancer cell-specific antibodies because of low reactivity with normal cells. Since no sugar chain has been proved to be added to Thr85 of human podoplanin, and no antibody containing Thr85 to which an O-type sugar chain is added as an epitope has been established, PMab-117 It is a cancer cell-specific anti-podoplanin antibody having a novel epitope. That is, the present invention is as follows.
- a cancer cell-specific anti-podoplanin antibody or antigen binding thereof having an epitope in a region containing Thr85 in the amino acid sequence of human podoplanin represented by SEQ ID NO: 1, to which a sialic acid-containing O-type sugar chain is added Fragment.
- N-type sugar chains are bound to the Fc region, and fucose is not bound to N-acetylglucosamine at the reducing end of the N-type sugar chain, according to any one of [1] to [4-2] A cancer cell-specific anti-podopranin antibody or an antigen-binding fragment thereof.
- a nucleic acid encoding any one of the amino acid sequences according to [3] or [4].
- An expression vector comprising the nucleic acid according to [6].
- a transformant comprising the expression vector according to [7].
- a pharmaceutical composition comprising the cancer cell-specific anti-podopranin antibody or antigen-binding fragment thereof according to any one of [1] to [5] as an active ingredient.
- a pharmaceutical composition comprising, as an active ingredient, the cancer cell-specific anti-podoplanin antibody or antigen-binding fragment thereof according to any one of [1] to [5] to which a substance having anticancer activity is bound.
- the pharmaceutical composition according to [9] or [10] which is a preventive or therapeutic agent for tumors.
- Human podoplanin having an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, and having a sialic acid-containing O-type sugar chain added to Thr85. [13] It has the following amino acid sequence: IRIEDLPT (SEQ ID NO: 12) A glycopeptide in which a sialic acid-containing O-type sugar chain is added to Thr.
- the anticancer activity can be exhibited specifically in the cancer cell, so that a medicine with reduced side effects can be obtained. It is also useful for delivery of drugs targeting cancer cells, and is highly useful as a diagnostic agent or reagent.
- ADVANTAGE OF THE INVENTION According to this invention, a novel anti- podoplanin antibody useful as a pharmaceutical, a diagnostic agent, and a reagent can be provided.
- 1 shows the amino acid sequence of human podoplanin (SEQ ID NO: 1). The result of having measured the fluorescence intensity in flow cytometry using PMab-117 and NZ-1 by EC800 (Sony) is shown. This shows the heavy chain DNA sequence of chPMab-117 (SEQ ID NO: 13). 1 shows the light chain DNA sequence of chPMab-117 (SEQ ID NO: 14). This shows the heavy chain amino acid sequence of chPMab-117 (SEQ ID NO: 8). This shows the light chain amino acid sequence of chPMab-117 (SEQ ID NO: 9). The result of having measured the fluorescence intensity in flow cytometry using chPMab-117 with EC800 (Sony) is shown.
- 1 shows the light chain DNA sequence of chPMab117-mG2a (SEQ ID NO: 16).
- This shows the light chain amino acid sequence of chPMab117-mG2a (SEQ ID NO: 11).
- the result of having measured the fluorescence intensity in flow cytometry using chPMab117-mG2a with EC800 (Sony) is shown.
- the fluorescence intensity in the flow cytometry using PMab-117, chPMab-117, and NZ-1 in all Ser / Thr alanine-substituted human podoplanins after the 75th is shown by EC800 (Sony).
- the fluorescence intensity in flow cytometry using PMab-117, chPMab-117 and NZ-1 in alanine-substituted human podoplanin of all amino acids 77 to 89 is shown by EC800 (Sony).
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention has an epitope in a region containing Thr85 in the amino acid sequence of human podoplanin represented by SEQ ID NO: 1, and Thr85 has a sialic acid-containing O-type sugar chain added thereto.
- O-type sugar chains are also referred to as O-linked sugar chains.
- the “antibody” has a structure in which two heavy chains (H chains) stabilized by a pair of disulfide bonds and two light chains (L chains) are associated.
- the heavy chain consists of a heavy chain variable region VH, a heavy chain constant region CH1, CH2, CH3, and a hinge region located between CH1 and CH2, and the light chain comprises a light chain variable region VL and a light chain constant region CL. Consists of.
- a variable region fragment (Fv) composed of VH and VL is a region that directly participates in antigen binding and gives diversity to antibodies.
- an antigen-binding region composed of VL, CL, VH, and CH1 is referred to as a Fab region, and a region composed of a hinge region, CH2, and CH3 is referred to as an Fc region.
- the region that directly contacts the antigen has a particularly large change and is called a complementarity-determining region (CDR).
- CDR complementarity-determining region
- the part with relatively few mutations other than CDR is called a framework region (FR).
- FR framework region
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention may be a monoclonal antibody or a polyclonal antibody. Further, the anti-podoplanin antibody of the present invention may be any isotype of IgG, IgM, IgA, IgD, and IgE.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention may be prepared by immunizing non-human animals such as mice, rats, hamsters, guinea pigs, rabbits, chickens, etc., or may be a recombinant antibody or a chimeric type. It may be an antibody (chimeric antibody), humanized antibody, fully humanized antibody or the like.
- a chimeric antibody refers to an antibody in which fragments of antibodies derived from different species are linked.
- “Humanized antibody” means an antibody in which the corresponding position of a human antibody is substituted with an amino acid sequence characteristic of a non-human-derived antibody.
- the heavy chain of an antibody produced by immunizing a mouse or rat Examples include antibodies having CDR1-3 and light chain CDR1-3, and all other regions including four framework regions (FR) of heavy chain and light chain, respectively, derived from human antibodies. Such antibodies are sometimes referred to as CDR-grafted antibodies.
- the term “humanized antibody” may include human chimeric antibodies.
- the “antigen-binding fragment” of an anti-podoplanin antibody refers to a fragment of an anti-podoplanin antibody that binds to podoplanin.
- Fab consisting of VL, VH, CL, and CH1 regions; F (ab ′) 2 in which two Fabs are linked by a disulfide bond at the hinge region; Fv consisting of VL and VH;
- scFv which is a single chain antibody linked by a polypeptide linker
- bispecific antibodies such as diabody type, scDb type, tandem scFv type, leucine zipper type, and the like are included, but are not limited thereto.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention is a region from the 78th to the 85th in the amino acid sequence of human podoplanin represented by SEQ ID NO: 1 ( 78- IRIELDPT- 85 ), which is a sialic acid-containing O-type at the 85th position. It is preferable to have an epitope in the glycopeptide part of human podoplanin to which a sugar chain is added.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention having an epitope in the region from the 78th to the 85th in the amino acid sequence of human podoplanin ( 78- IRIELPLT- 85 ) is an antibody that recognizes both peptides and sugar chains as epitopes.
- the amino acid sequence represented by 78- IRIEDLPT- 85 corresponds to the 78th to 85th amino acids in human podoplanin represented by SEQ ID NO: 1.
- T corresponds to threonine at position 85 (Thr85) in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
- the present invention also provides a glycopeptide represented by IRIEDLPT (SEQ ID NO: 12) in which a sialic acid-containing O-type sugar chain is added to Thr, which is an epitope of an anti-podoplanin antibody.
- the present invention also provides a human podoplanin having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 and having a sialic acid-containing O-type sugar chain added to Thr85.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention may have at least one of the following six CDRs. These CDRs are the CDR sequences of PMab-117. Heavy chain CDR1: GFTFSNAAMY (SEQ ID NO: 2) Heavy chain CDR2: RIRSKPNNYATYYTDSVKG (SEQ ID NO: 3) Heavy chain CDR3: TVGGNNNYAAY (SEQ ID NO: 4) Light chain CDR1: RSSQSLVSNGNTYLE (SEQ ID NO: 5) Light chain CDR2: KVSNRFS (SEQ ID NO: 6) Light chain CDR3: FQVTHDPFT (SEQ ID NO: 7) The anti-podoplanin antibody according to the present invention has an epitope in a region containing Thr85 in the amino acid sequence of human podoplanin represented by SEQ ID NO: 1, and Thr85 has a sialic acid-containing O-type sugar chain added thereto.
- the anti-podoplanin antibody is a region from the 78th to the 85th in the amino acid sequence of human podoplanin represented by SEQ ID NO: 1 ( 78 -IRIELPLT- 85 ), and a sialic acid-containing O-type sugar chain at threonine at position 85 It is more preferable to have an epitope in the glycopeptide part of human podoplanin to which is added.
- the anti-podopranin antibody according to the present invention may be any antibody as long as it contains at least one of the six CDRs, and may contain a plurality of CDRs out of the six CDRs. As mentioned above, 5 or more or 6 can be included.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention contains 6 CDRs
- the anti-podoplanin antibody comprises a heavy chain CDR1 to 3 represented by SEQ ID NOs: 2 to 4 and a light chain represented by SEQ ID NOs: 5 to 7 Has CDR1-3.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention includes any one of the heavy chain CDR1 to 3 represented by SEQ ID NOs: 2 to 4 and the light chain CDR1 to 3 represented by SEQ ID NOs: 5 to 7, At least one of them may contain an amino acid sequence having one to several amino acid additions, substitutions or deletions.
- amino acid is used in its broadest sense, and includes artificial amino acid variants and derivatives in addition to natural amino acids. Amino acids may be shown in conventional one-letter code or three-letter code. Examples of the “amino acid” in the present specification include natural proteinaceous L-amino acids, unnatural amino acids, chemically synthesized compounds having properties known in the art that are characteristic of amino acids, and the like.
- non-natural amino acids include ⁇ , ⁇ -disubstituted amino acids ( ⁇ -methylalanine, etc.), N-alkyl- ⁇ -amino acids, D-amino acids, ⁇ -amino acids, ⁇ -Hydroxy acids, amino acids whose side chain structure is different from the natural type (norleucine, homohistidine, etc.), amino acids with extra methylene in the side chain ("homo" amino acids, homophenylalanine, homohistidine, etc.), and in the side chain
- An amino acid (such as cysteic acid) in which the carboxylic acid functional group is substituted with a sulfonic acid group, is not limited thereto.
- “having 1 to several amino acid additions, substitutions or deletions” refers to the number of amino acids added, substituted or deleted so that the resulting polypeptide retains its function as a CDR. Although it does not specifically limit as long as it does, For example, it can be 1, 2, 3, or 4. It may have “addition, substitution or deletion of 1 amino acid”, may have “addition, substitution or deletion of 1 to 2 amino acids”, and may have “1 to 3 It may have “addition, substitution or deletion of amino acids”, or may have “addition, substitution or deletion of 1 to 4 amino acids”. The position of the amino acid deletion, substitution or addition may be anywhere in the CDR sequence where the amino acid is deleted, substituted or added as long as the function as CDR is retained.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention includes any one of the heavy chain CDR1 to 3 represented by SEQ ID NOs: 2 to 4 and the light chain CDR1 to 3 represented by SEQ ID NOs: 5 to 7, At least one of them has 80% or more identity with the corresponding amino acid sequence of heavy chain CDRs 1 to 3 represented by SEQ ID NOs: 2 to 4 and light chain CDRs 1 to 3 represented by SEQ ID NOs: 5 to 7 An amino acid sequence may be included.
- “having 80% or more identity” means that when alignment is performed so that the amino acid sequence match of a polypeptide having an amino acid sequence before mutation and a sequence mutated from the amino acid sequence is maximized, It means that the number of common amino acid residues is 80% or more of the number of amino acids in the amino acid sequence before mutation.
- the identity is 80% or more, and is not particularly limited as long as it retains the function as a CDR. For example, it can be 85% or more, 90% or more, 95% or more, 98% or more, 99% or more.
- the amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 2 to 7 and “having 80% or more identity” means the amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 2 to 7
- the number of common amino acid residues is represented by any one of SEQ ID NOs: 2 to 7 It means 80% or more of the number of amino acids in the sequence.
- CDRs composed of amino acid sequences obtained by adding, substituting, or deleting amino acids to the amino acid sequences of heavy chain CDR1 to 3 and light chain CDR1 to 3, and the amino acid sequences of heavy chain CDR1 to 3 and light chain CDR1 to 3 CDRs having the above identity can be prepared using known methods such as site-specific mutagenesis, random mutagenesis, chain shuffling, and CDR walking. According to these methods, CDRs with more affinity can be obtained by displaying antibodies or antibody fragments having various mutations in CDRs by the phage display method and screening using antigens.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention is A heavy chain comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 8 or 10; A heavy chain comprising an amino acid sequence comprising an addition, substitution, or deletion of one to several amino acids in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 8 or 10; or It preferably contains a heavy chain comprising an amino acid sequence having 80% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 8 or 10.
- the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 8 is the heavy chain amino acid sequence of the chPMab-117 chimeric antibody
- the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 10 is the chPMab-117-mG2a chimeric antibody.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention is A light chain comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 or 11; A light chain comprising an amino acid sequence comprising an addition, substitution, or deletion of one to several amino acids in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 or 11; or It preferably contains a light chain comprising an amino acid sequence having 80% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 or 11.
- the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 is the amino acid sequence of the light chain of the chPMab-117 chimeric antibody, and the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 11 is the chPMab-117-mG2a chimeric antibody. Amino acid sequence of the light chain.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention is More preferably, it comprises: a heavy chain comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 8; and a light chain comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9; A heavy chain comprising an amino acid sequence comprising an addition, substitution or deletion of one to several amino acids in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 8; and from 1 to in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 A light chain comprising an amino acid sequence comprising several amino acid additions, substitutions or deletions; A heavy chain comprising an amino acid sequence having 80% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 8; and an amino acid sequence having 80% or more identity to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 A light chain.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention is More preferably, it comprises: a heavy chain comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 10; and a light chain comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 11; A heavy chain comprising an amino acid sequence comprising an addition, substitution or deletion of one to several amino acids in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 10; and from 1 to in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 11 A light chain comprising an amino acid sequence comprising several amino acid additions, substitutions or deletions; A heavy chain comprising an amino acid sequence having 80% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 10; and an amino acid sequence having 80% or more identity to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 11 A light chain.
- the number of added, substituted, or deleted amino acids is, for example, It can be 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, or 10. Other terms are as described above.
- amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 8 to 11 and “having 80% or more identity” means the amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 8 to 11.
- amino acid sequences of polypeptides having mutated sequences are compared and aligned so as to maximize the match, the number of common amino acid residues is represented by any one of SEQ ID NOs: 8 to 11 It means 80% or more of the number of amino acids in the sequence.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention may be an antibody in which one or more N-type sugar chains are bound to the Fc region and fucose is not bound to N-acetylglucosamine at the reducing end of the N-type sugar chain.
- N-type sugar chains are also referred to as N-linked sugar chains.
- the N-type sugar chain refers to a sugar chain that binds to Asn in the Asn-X-Ser / Thr sequence, and has a common structure Man 3 GlcNAc 2 (-Asn) bound to Asn.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention may be used by binding a substance having anticancer activity.
- the “substance having anticancer activity” refers to a decrease in tumor size (delayed or stopped), inhibition of tumor metastasis, inhibition of tumor growth (delayed or stopped), and one associated with cancer.
- toxin having anticancer activity examples include Pseudomonas aeruginosa exotoxin (PE) or a cytotoxic fragment thereof (eg, PE38), diphtheria toxin, ricin A and the like.
- PE Pseudomonas aeruginosa exotoxin
- cytotoxic fragment thereof eg, PE38
- diphtheria toxin ricin A
- ricin A examples of the toxin having anticancer activity include Pseudomonas aeruginosa exotoxin (PE) or a cytotoxic fragment thereof (eg, PE38), diphtheria toxin, ricin A and the like.
- Toxins with anti-cancer activity are toxic only to cells in which the toxin is taken together with the anti-podoplanin antibody, i.e., cancer cells expressing podoplanin, so that they do not adversely affect the surrounding cells and are specifically effective. There is an advantage that
- Anticancer agents include, for example, adriamycin, daunomycin, mitomycin, cisplatin, vincristine, epirubicin, methotrexate, 5-fluorouracil, aclacinomycin, nitrogen mustard, cyclophosphamide, bleomycin, daunorubicin, doxorubicin, vincristine, vinblastine Low molecular weight compounds such as vindesine, tamoxifen, dexamethasone, and cytokines that activate immunocompetent cells (eg, human interleukin 2, human granulocyte macrophage colony stimulating factor, human macrophage colony stimulating factor, human interleukin 12), etc. Examples include proteins.
- radioisotopes having anticancer activity examples include 32 P, 14 C, 125 I, 3 H, 131 I, 211 At, and 90 Y. Radioisotopes are also toxic to cells around which the anti-podoplanin antibody binds, ie, cells that express podoplanin. In general, tumor cells are not uniform and not all tumor cells express podoplanin, so radioisotopes are useful for killing surrounding podoplanin negative tumor cells. In the case of binding a radioisotope, the anti-podoplanin antibody may be a low molecular antibody such as Fab or scFv.
- a substance having anticancer activity can be directly bound to an anti-podoplanin antibody by a known method. Further, for example, a substance having anticancer activity may be encapsulated in a carrier such as a liposome whose surface is modified with an anti-podoplanin antibody.
- the substance having anticancer activity is a protein or polypeptide
- a nucleic acid (described later) encoding the anti-podoplanin antibody according to the present invention and a DNA encoding the substance having anticancer activity are linked, and an appropriate expression vector May be expressed as a fusion protein of a substance having anticancer activity and an anti-podoplanin antibody.
- the present invention also includes a nucleic acid encoding the anti-podoplanin antibody according to the present invention.
- the nucleic acid may be a natural nucleic acid or an artificial nucleic acid, and examples thereof include, but are not limited to, DNA, RNA, and a chimera of DNA and RNA.
- the nucleotide sequence of the nucleic acid encoding the anti-podopranin antibody can be determined by a person skilled in the art according to a known method or a method analogous thereto, and can be prepared by a known method or a method analogous thereto.
- the nucleic acid according to the present invention comprises Amino acid sequences of the following 6 CDRs, An amino acid sequence comprising one to several amino acid additions, substitutions or deletions in the amino acid sequences of the following six CDRs: Amino acid sequence having 80% identity or more with the following 6 CDR amino acid sequences Heavy chain CDR1: GTFFSNAAMY (SEQ ID NO: 2) Heavy chain CDR2: RIRSKPNNYATYYTDSVKG (SEQ ID NO: 3) Heavy chain CDR3: TVGGNNNYAAY (SEQ ID NO: 4) Light chain CDR1: RSSQSLVSNGNTYLE (SEQ ID NO: 5) Light chain CDR2: KVSNRFS (SEQ ID NO: 6) Light chain CDR3: FQVTHDPFT (SEQ ID NO: 7) Amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 8 or 10 Amino acid sequence comprising one to several amino acid additions, substitutions or deletions in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 8 or 10 Am
- nucleic acid encoding the anti-podoplanin antibody examples include a DNA encoding the chPMab-117 heavy chain represented by SEQ ID NO: 13, and the chPMab-117 light chain represented by SEQ ID NO: 14.
- Nucleic acids encoding each of chPMab-117 and chPMab117-mG2a CDRs are included in the DNA sequence represented by any of SEQ ID NOs: 13-16.
- the present invention also includes an expression vector comprising the nucleic acid according to the present invention.
- the expression vector can be appropriately selected according to the host cell to be used.
- a plant such as a plasmid, a retrovirus vector, an adenovirus vector, an adeno-associated virus (AAV) vector, a cauliflower mosaic virus vector, or a tobacco mosaic virus vector.
- AAV adeno-associated virus
- Examples include viral vectors, cosmids, YACs, EBV-derived episomes, and the like.
- the nucleic acid according to the present invention can be inserted into these expression vectors by a known method (eg, a method using a restriction enzyme).
- the expression vector according to the present invention includes, in addition to the nucleic acid according to the present invention, for example, the nucleic acid encoding the anti-podoplanin antibody according to the present invention, a promoter that regulates the expression of the antibody gene, a replication origin, a selection marker gene, and the like. be able to.
- the promoter and origin of replication can be appropriately selected depending on the type of host cell and vector.
- the present invention includes a transformant comprising the vector according to the present invention.
- a transformant can be obtained by transfecting a vector according to the present invention into an appropriate host cell.
- host cells include eukaryotic cells such as mammalian cells (CHO cells, COS cells, myeloma cells, HeLa cells, Vero cells, etc.), insect cells, plant cells, fungal cells (eg, Saccharomyces genus, Aspergillus genus), and Escherichia coli. (E. coli), prokaryotic cells such as Bacillus subtilis, and the like can be used.
- the method for producing the anti-podoplanin antibody according to the present invention is not limited.
- the anti-podoplanin monoclonal antibody is obtained by isolating an antibody-producing cell from a non-human mammal immunized with podoplanin or a fragment thereof and treating it with a myeloma cell or the like. To produce a hybridoma, and the antibody produced by the hybridoma can be purified.
- Anti-podoplanin polyclonal antibodies can also be obtained from the sera of animals immunized with podoplanin or fragments thereof.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention may use podoplanin to which a sugar chain other than the sugar chain that binds to Thr85 is added when immunizing a non-human animal.
- the podoplanin or fragment thereof used in the method for producing an anti-podoplanin antibody according to the present invention has a region containing Thr85 in the amino acid sequence of human podoplanin represented by SEQ ID NO: 1, and Thr85 is a sialic acid-containing O-type sugar chain. It has been added.
- it has a region from the 78th to the 85th in the amino acid sequence of human podoplanin represented by SEQ ID NO: 1 (IRIEDLPT), and Thr85 is added with a sialic acid-containing O-type sugar chain.
- IRIEDLPT amino acid sequence of human podoplanin represented by SEQ ID NO: 1
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention is produced by a gene recombination method, for example, an appropriate host is transformed with an expression vector containing a nucleic acid encoding the anti-podoplanin antibody according to the present invention, and The antibody may be expressed by culturing under conditions and isolated and purified according to a known method. Examples of isolation and purification methods include affinity columns using protein A and the like, other chromatography columns, filters, ultrafiltration, salting out, dialysis, and the like, and these can be combined as appropriate.
- An antibody that binds to a predetermined epitope sequence can be prepared by a method known to those skilled in the art or a method analogous thereto.
- an antibody that specifically binds to the same epitope can be obtained by immobilizing a peptide containing the epitope sequence on a solid phase carrier and detecting the binding between the peptide and a plurality of antibodies.
- the “plurality of antibodies” those obtained by immunizing an animal with an antigen protein or a partial peptide thereof may be used, or an antibody library or antibody fragment library prepared by a phage display method may be used. Good.
- an antibody that specifically binds to the same epitope can be obtained by immobilizing a peptide containing the epitope sequence on a solid phase carrier and repeating panning.
- a human chimeric antibody and a human CDR-grafted antibody are prepared by cloning an antibody gene from mRNA of a hybridoma that produces an antibody of a non-human animal and ligating it with a part of the human antibody gene by a gene recombination technique. be able to.
- cDNA is synthesized by reverse transcriptase from mRNA of a hybridoma producing a mouse antibody, and the sequence is analyzed by cloning the heavy chain variable region (VH) and light chain variable region (LH) by PCR. .
- a 5 ′ primer containing a leader sequence is prepared from the antibody base sequence having a high concordance rate, and PCR is performed from the cDNA to the 3 ′ end of the variable region from the above cDNA using the 5 ′ primer and the variable region 3 ′ primer.
- Cloning On the other hand, the heavy and light chain constant regions of human IgG1 were cloned, and the mouse antibody-derived variable region and the human antibody-derived constant region were linked by PCR using the Overwrapping Hanging method for amplification. To do.
- the obtained DNA can be inserted into a suitable vector and transformed to obtain a human chimeric antibody.
- the human antibody variable region having the highest homology with the mouse antibody variable region to be used is selected and cloned, and the nucleotide sequence of the CDR is modified by site-directed mutagenesis using the megaprimer method. To do. If the amino acid sequence constituting the framework region cannot be specifically bound to the antigen when humanized, it is possible to convert some amino acids of the framework from human to rat.
- a CDR comprising an amino acid sequence having a deletion, substitution or addition of one or two amino acids, or a CDR comprising an amino acid sequence having 80% or more identity to the original sequence is a site-specific mutation.
- the Adrib method for obtaining an antibody-producing strain from a DT40 cell line derived from trichostatin A-treated chicken B cells (Seo, H. et al., Nat. Biotechnol., 6: 731-736, 2002) , A method for producing a human antibody by immunizing a KM mouse, which is a mouse into which a mouse antibody gene has been disrupted and a human antibody gene has been introduced (Itoh, K. et al., Jpn. J. Cancer Res., 92: 1313- 1321, 2001; Koide, A. et al., J. Mol. Biol., 284: 1141-11151, 1998), and the like, can also be applied to the production of the antibody according to the present invention.
- the antigen-binding fragment of the anti-podoplanin antibody according to the present invention may be expressed by the above-described method using DNA encoding the fragment, or treated with an enzyme such as papain or pepsin after obtaining a full-length antibody. And may be fragmented.
- the amino acid sequence, molecular weight, isoelectric point, presence / absence of sugar chain, form, and the like of the anti-podoplanin antibody according to the present invention may vary depending on the production method and purification method. However, as long as the obtained antibody has a function equivalent to that of the anti-podoplanin antibody according to the present invention, it is included in the present invention.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention when expressed in prokaryotic cells such as Escherichia coli, a methionine residue is added to the N-terminus of the original antibody amino acid sequence.
- the invention also encompasses such antibodies.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention is an antibody having an N-type sugar chain in which fucose is not bound to N-acetylglucosamine at the reducing end
- an antibody can be produced according to a known method or a method analogous thereto.
- Such antibody production methods are described, for example, in International Publication No. WO 2002/031140 and JP 2009-225781, the disclosure of which is incorporated herein by reference in its entirety.
- the activity of an enzyme involved in the synthesis of GDP-fucose or the activity of ⁇ -1,6-fucosyltransferase is reduced using a vector containing a DNA encoding the anti-podoplanin antibody according to the present invention.
- the deleted cells can be obtained by transforming the deleted cells, culturing the obtained transformant, and then purifying the target anti-podopranin antibody.
- the enzyme involved in the synthesis of GDP-fucose include GDP-mannose 4,6-dehydratase (GMP), GDP-keto-6-deoxymannose 3,5-epimerase, 4-reductase (Fx), and GDP-beta- L-fucose pyrophosphorylase (GFPP) can be mentioned.
- the cells are not particularly limited, but mammalian cells are preferable.
- mammalian cells are preferable.
- CHO cells in which the enzyme activity is reduced or deleted can be used.
- the antibody composition obtained by the above method may contain an antibody in which fucose is bound to N-acetylglucosamine at the reducing end, but the ratio of the antibody to which fucose is bound is 20% by weight or less of the whole antibody. , Preferably 10% by weight or less, more preferably 5% by weight or less, and most preferably 3% by weight or less.
- An antibody having an N-type sugar chain in which fucose is not bound to N-acetylglucosamine at the reducing end is introduced into a insect egg by introducing a vector containing a DNA encoding the anti-podoplanin antibody according to the present invention into an insect And can be obtained by extracting an anti-podopranin antibody from the transgenic insect or its secretion.
- Silkworms can be used as insects, in which case antibodies can be extracted from the cocoons.
- the antibody composition obtained by this method may also contain an antibody in which fucose is bound to N-acetylglucosamine at the reducing end, but the ratio of the antibody to which fucose is bound is 20% by weight or less of the whole antibody. , Preferably 10% by weight or less, more preferably 5% by weight or less, and most preferably 3% by weight or less.
- the medicinal mechanism of the antibody drug is based on two biological activities of the antibody.
- One is a target antigen-specific binding activity, which is an activity to neutralize the function of the target antigen molecule by binding. Neutralization of the function of the target antigen molecule is exerted through the Fab region.
- the other is the biological activity of the antibody called effector activity.
- the effector activity is such as antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC), complement-dependent cytotoxicity (CDC), direct induction of apoptosis, etc. via the Fc region of the antibody. Demonstrated in an embodiment.
- the activity of the anti-podoplanin antibody according to the present invention can be measured by the following method.
- Binding activity The binding activity of an antibody is determined by a known method such as ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay), EIA (enzyme immunoassay), RIA (radioimmunoassay), fluorescent antibody method, FACS method, etc. Can be measured.
- ELISA enzyme-linked immunosorbent assay
- EIA enzyme immunoassay
- RIA radioimmunoassay
- fluorescent antibody method FACS method, etc. Can be measured.
- ADCC activity means that when an anti-podoplanin antibody according to the present invention binds to a cell surface antigen of a target cell, an Fc ⁇ receptor-bearing cell (effector cell) binds to the Fc portion via the Fc ⁇ receptor. And an activity that damages a target cell.
- ADCC activity can be known by mixing target cells expressing podoplanin, effector cells, and the anti-podoplanin antibody according to the present invention, and measuring the degree of ADCC.
- effector cells for example, mouse spleen cells, monocyte nuclei isolated from human peripheral blood or bone marrow can be used.
- target cells for example, podoplanin-positive mesothelioma cells or podoplanin-positive glioblastoma cells can be used.
- the target cells are labeled with 51 Cr in advance, and the anti-podoplanin antibody according to the present invention is added to the target cells for incubation, and then the effector cells in an appropriate ratio to the target cells are added for incubation. After incubation, the supernatant can be collected and measured by counting the label in the supernatant.
- CDC activity CDC activity means cytotoxic activity by the complement system. CDC activity can be measured by using complement in place of effector cells in a test for ADCC activity.
- Tumor growth inhibitory activity can be measured using a tumor model animal. For example, a tumor is transplanted subcutaneously in a mouse, and the anti-podoplanin antibody according to the present invention is administered. By comparing the volume of the tumor tissue in the non-administered group and the administered group, the tumor growth inhibitory effect can be measured. Note that the tumor growth inhibitory activity may be the result of suppressing the growth of individual cells or the result of inducing cell death.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention may be used for prevention or treatment of a tumor that expresses podoplanin.
- the pharmaceutical composition according to the present invention contains the anti-podoplanin antibody or antigen-binding fragment thereof according to the present invention as an active ingredient, and further includes a pharmaceutically acceptable carrier and additive.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention may be used for delivery of a drug targeting tumor cells.
- the pharmaceutical composition according to the present invention may contain an anti-podoplanin antibody or an antigen-binding fragment thereof bound with a substance having anticancer activity as an active ingredient, and further contains a pharmaceutically acceptable carrier or additive. You may go out.
- carriers and additives include pharmaceutically acceptable organic solvents such as water, saline, phosphate buffer, dextrose, glycerol, ethanol, collagen, polyvinyl alcohol, polyvinyl pyrrolidone, carboxyvinyl polymer, carboxymethylcellulose sodium , Sodium polyacrylate, sodium alginate, water-soluble dextran, sodium carboxymethyl starch, pectin, methylcellulose, ethylcellulose, xanthan gum, gum arabic, casein, agar, polyethylene glycol, diglycerin, glycerin, propylene glycol, petrolatum, paraffin, stearyl Examples include alcohol, stearic acid, human serum albumin, mannitol, sorbitol, lactose, and surfactants. But it is not limited to, et al.
- the pharmaceutical composition according to the present invention can be in various forms such as a liquid (for example, injection), a dispersion, a suspension, a tablet, a pill, a powder, a suppository, and the like.
- a preferred embodiment is an injection, which is preferably administered parenterally (for example, intravenously, transdermally, intraperitoneally, intramuscularly).
- the pharmaceutical composition according to the present invention is effective in treating diseases associated with podoplanin, such as tumors, thrombosis, arteriosclerosis and the like.
- Tumors associated with podoplanin include brain tumors, mesothelioma, testicular tumors, ovarian cancer, and squamous cell carcinoma.
- the squamous cell cancer includes, but is not limited to, oral cancer, pharyngeal cancer, laryngeal cancer, esophageal cancer, lung cancer, skin cancer, and cervical cancer.
- the present invention also includes a method for treating a disease associated with podoplanin, comprising administering a therapeutically effective amount of the anti-podoplanin antibody according to the present invention.
- a therapeutically effective amount refers to the amount of an agent by which one or more symptoms of the disease being treated are alleviated to some extent.
- anti-cancer drugs at least: reduction of tumor size; inhibition of tumor metastasis (delay or cessation); inhibition of tumor growth (delay or cessation), and relief of one or more symptoms associated with cancer An amount indicating one.
- the dose of the anti-podoplanin antibody according to the present invention is, for example, 0.025 to 50 mg / kg, preferably 0.1 to 50 mg / kg, more preferably 0.1 to 25 mg / kg, More preferably, it can be 0.1 to 10 mg / kg or 0.1 to 3 mg / kg, but is not limited thereto.
- the anti-podoplanin antibody according to the present invention is used for cancer, particularly brain tumor, mesothelioma, testicular tumor, ovarian cancer, and various squamous cell carcinomas (oral cancer, pharyngeal cancer, laryngeal cancer, esophageal cancer, lung cancer). , Skin cancer, cervical cancer, etc.) and is useful for diagnosis of cancers that highly express podoplanin. Since the anti-podoplanin antibody according to the present invention binds specifically to tumor cells, it is particularly useful for diagnosis.
- the present invention relates to a diagnostic agent for cancer comprising the anti-podoplanin antibody according to the present invention, the use of the anti-podoplanin antibody according to the present invention for diagnosing cancer, and a method for diagnosing cancer using the anti-podoplanin antibody according to the present invention. Is also included.
- Rats with anti-podoplanin antibodies against novel glycopeptide epitopes were immunized 4 times (once every 10 days) with 1 ⁇ 10 8 LN229 / hPDPN cells.
- Antibodies that react with recombinant proteins purified from cancer cell lines were screened by ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay).
- the selected cancer cell specific anti-podopranin antibody was named PMab-117 (rat IgM, kappa).
- Recombinant protein was purified as follows. LN229 / hPDPN cells are statically cultured and a total of 10 g is recovered. 10 mL of 0.5% Triton / PBS solution was added, and the cells were solubilized by pipetting on ice. The solubilized solution was centrifuged at 15,000 rpm for 30 minutes. The supernatant was added to 1 mL of an anti-FLAG antibody (M2) affinity column (Sigma Aldrich) and reacted at 4 ° C. for 18 hours.
- M2 anti-FLAG antibody
- the ELISA method was performed as follows. Purified podoplanin 1 mg / mL was solidified on a 96-well plate (Nunc MaxiSorp; Thermo Fisher) for 30 minutes at 37 ° C and blocked with SuperBlock / PBST (Thermo Fisher) for 30 minutes at 37 ° C. . Similarly, the culture supernatant derived from mouse hybridoma and anti-rat IgG-HRP (Dako) were reacted sequentially at 37 ° C. for 30 minutes, and developed with TMB-Ultra (Thermo Fisher). Absorbance was measured (OD 655 nm) using a microplate reader (Bio-Rad).
- PMab-117 was highly responsive to podoplanin on cancer cells such as glioblastoma (LN319) and lung cancer (PC-10), but not to renal epithelial cells (HEK-293T) at all.
- the anti-podoplanin antibody NZ-1 antibody showed high reactivity not only with LN319 and PC-10 but also with HEK-293T. From this result, it was shown that PMab-117 is cancer cell specific.
- DNA encoding the VH region of PMab-117 is amplified by PCR, and DNA encoding the CH1, hinge region, CH2, and CH3 regions of human IgG1 is retained. It was integrated in the pCAG vector (pCAG-CHhG1 / PMab-117HVH (G418)).
- DNA encoding the VL region of PMab-117 was amplified by PCR and incorporated into a pCAG vector retaining DNA encoding the CK region of the human kappa chain (pCAG-hIgCKb / PMab-117LVL (zeocin)).
- InF.HindIII-P117L CGGTATCGATAAGCTTAAAATGAAAGTGCCTGTTAG (SEQ ID NO: 19)
- InFr.chP117LVL-BamHI ATGGTGCAGCGGATCCCCGTTTTATTTCCAACTTC (SEQ ID NO: 20)
- QIAGEN HotStar HiFidelity Polymerase Kit Qiagen was used for the PCR reaction. The temperature conditions were 95 ° C for 5 minutes first, then 94 ° C for 15 seconds, 50 ° C for 1 minute, 72 ° C for 1 minute for 35 cycles, and finally 72 ° C for 10 minutes.
- the amplified PCR product was purified with the QIAGEN PCR purification kit, and the nucleotide sequence was determined from the vector primer.
- the amino acid sequence was predicted from the base sequence.
- the heavy chain DNA sequence, light chain DNA sequence, heavy chain amino acid sequence, and light chain amino acid sequence of chPMab-117 are shown in FIGS. 3 to 6 as SEQ ID NOs: 13, 14, 8, and 9.
- ⁇ CDR of PMab-117> The amino acid sequences of PMab-117 heavy chain CDR1-3 and light chain CDR1-3 were as shown in SEQ ID NOs: 2-7.
- Heavy chain CDR1 GFTFSNAAMY (SEQ ID NO: 2) Heavy chain CDR2: RIRSKPNNYATYYTDSVKG (SEQ ID NO: 3) Heavy chain CDR3: TVGGNNYAAAY (SEQ ID NO: 4) Light chain CDR1: RSSQSLVHSNGNTYLE (SEQ ID NO: 5) Light chain CDR2: KVSNRFS (SEQ ID NO: 6) Light chain CDR3: FQVTHDPFT (SEQ ID NO: 7);
- chPMab-117 was highly responsive to podoplanin on cancer cells such as glioblastoma (LN319) and lung cancer (PC-10), but it was completely different from renal epithelial cells (HEK-293T) that strongly expressed podoplanin. It did not react. Similar to the results of PMab-117 (FIG. 2), it was shown that chPMab-117 is a cancer-specific antibody.
- mice chimeric PMab-117 (chPMab117-mG2a)
- the variable regions of PMab-117 H chain and L chain were incorporated into mouse IgG2a constant region into pCAG vector (In vivogen), and mouse chimeric PMab-117 ( An expression plasmid for chPMab117-mG2a) was prepared.
- the following primers were used for H chain amplification. InF.
- HindIII-chP117H CGGTATCGAT AAGCTTAGTA TGTTGGTGCT GCAG (SEQ ID NO: 17)
- InFr.P117HVH-mG2a GGCTGTTGTT TTGGCTGAAG AGACAGTGAC CAGA (SEQ ID NO: 21)
- the following primers were used for L chain amplification.
- InF.HindIII-P117L CGGTATCGATAAGCTTAAAATGAAAGTGCCTGTTAG (SEQ ID NO: 19)
- InF.mIgCKter-NotI TCTAGAGTCG CGGCCGCCTA ACACTCATTC CTGT (SEQ ID NO: 22)
- the heavy chain DNA sequence, light chain DNA sequence, heavy chain amino acid sequence, and light chain amino acid sequence of chPMab117-mG2a are shown as SEQ ID NOs: 15, 16, 10, and 11 in FIGS.
- ChPMab117-mG2a flow cytometry ChPMab117-mG2a H chain and L chain plasmids were introduced into the ExpiCHO cell line (Thermo Fisher) by the lipofection method, and chPMab117-mG2a recombinant antibody was expressed in the culture supernatant.
- the culture supernatant was collected 2 days after gene transfer, reacted with LN319 cells at 4 ° C. for 30 minutes, and further reacted with anti-mouse IgG-FITC antibody (Thermo Fisher) at 4 ° C. for 30 minutes.
- As a negative control only the secondary antibody was used.
- the fluorescence intensity was measured with Cell Analyzer EC800 (Sony). The results are shown in FIG. chPMab117-mG2a showed high reactivity to the podoplanin of glioblastoma cells (LN319), similar to chPMab117.
- dN23 Full-length podoplanin with the 23rd amino acid at the N-terminus dN37: deletion mutant of the 37th amino acid at the N-terminus dN46: deletion mutant of the 46th amino acid at the N-terminus dN55: deletion mutant of the 55th amino acid at the N-terminus dN65: deletion mutant of the 65th amino acid at the N-end dN75: deletion mutant of the 75th amino acid at the N-terminus dN85: deletion mutant of the 85th amino acid at the N-terminus dN95: deletion mutant of the 95th amino acid at the N-end
- These deletion mutants were allowed to react with PMab-117 (culture supernatant) and chPMab-117 (10 ⁇ g / mL) at 4 ° C for 30 minutes, and then anti-rat IgG-Oregon Green antibody (Thermo Fisher), anti-human IgG -FITC antibody (Thermo Fisher) was reacted at 4 ° C for
- the PMab-117 epitope contains an O-type sugar chain containing sialic acid
- the human podoplanin Thr85 is contained in the PMab-117 epitope. It was shown that Thr85 to which an O-type sugar chain containing sialic acid was added was essential for 117 epitopes. Furthermore, amino acids around Thr85 were substituted with alanine, and the reactivity of PMab-117, chPMab-117, and NZ-12 was examined. FIG. 17 revealed that five amino acids Ile78, Ile80, Glu81, Asp82, and Thr85 are particularly important as epitopes of PMab-117. From the above, it was found that a glycopeptide containing Thr85 of human podoplanin is an important target showing cancer specificity.
- the anti-podoplanin antibody and the antigen-binding fragment thereof according to the present invention are useful as medicines, diagnostic agents and reagents, and have industrial applicability.
- SEQ ID NO: 1 This shows the amino acid sequence of human podoplanin.
- SEQ ID NO: 2 This shows the amino acid sequence of heavy chain CDR1 of PMab-117.
- SEQ ID NO: 3 This shows the amino acid sequence of heavy chain CDR2 of PMab-117.
- SEQ ID NO: 4 This shows the amino acid sequence of heavy chain CDR3 of PMab-117.
- SEQ ID NO: 5 This shows the amino acid sequence of light chain CDR1 of PMab-117.
- SEQ ID NO: 6 This shows the amino acid sequence of light chain CDR2 of PMab-117.
- SEQ ID NO: 7 This shows the amino acid sequence of light chain CDR3 of PMab-117.
- SEQ ID NO: 8 This shows the heavy chain amino acid sequence of chPMab-117.
- SEQ ID NO: 9 This shows the light chain amino acid sequence of chPMab-117.
- SEQ ID NO: 10 This shows the heavy chain amino acid sequence of chPMab117-mG2a.
- SEQ ID NO: 11 This shows the light chain amino acid sequence of chPMab117-mG2a.
- SEQ ID NO: 12 This shows the amino acid sequence corresponding to the 78th to 85th region of the amino acid sequence of human podoplanin represented by SEQ ID NO: 1.
- SEQ ID NO: 13 This shows the heavy chain DNA sequence of chPMab-117.
- SEQ ID NO: 14 This shows the light chain DNA sequence of chPMab-117.
- SEQ ID NO: 15 This shows the heavy chain DNA sequence of chPMab117-mG2a.
- SEQ ID NO: 16 This shows the light chain DNA sequence of chPMab117-mG2a.
- SEQ ID NO: 17 Primer InF. Used for amplification of heavy chain HindIII-chP117H is shown.
- SEQ ID NO: 18 Primer used for amplification of heavy chain InFr.
- chP117HVH-BamHI is shown.
- SEQ ID NO: 19 Primer used for amplification of L chain HindIII-P117L is shown. Sequence number: Primer InFr. Used for amplification of 20 L chain Shown is chP117LVL-BamHI.
- SEQ ID NO: 21 primer InFr. Used for amplification of heavy chain P117HVH-mG2a is shown.
- SEQ ID NO: 22 Primer InF. Used for amplification of L chain mIgCKter-NotI is shown.
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Abstract
本発明は、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列におけるThr85を含む領域にエピトープを有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメントを提供する。
Description
本発明は、新規な抗ポドプラニン抗体などに関する。
ポドプラニンは、血小板凝集因子及び転移促進因子として知られるムチン型糖タンパク質であり、C末端に膜貫通部位を有するI型膜貫通型タンパク質である。
ポドプラニンは、脳腫瘍、中皮腫、精巣腫瘍、卵巣がん、及び各種扁平上皮がん(口腔がん、咽頭がん、喉頭がん、食道がん、肺がん、皮膚がん、子宮頸がん)などに高発現していることが知られている。したがって、抗ポドプラニン抗体は、ポドプラニンが高発現しているがん(腫瘍)において抗がん作用(抗腫瘍活性)を示すことが期待される。そのため、ポドプラニンに対する特異性や親和性がより高い抗体や、ポドプラニンを認識する新規抗体などが求められている。
ポドプラニンは、脳腫瘍、中皮腫、精巣腫瘍、卵巣がん、及び各種扁平上皮がん(口腔がん、咽頭がん、喉頭がん、食道がん、肺がん、皮膚がん、子宮頸がん)などに高発現していることが知られている。したがって、抗ポドプラニン抗体は、ポドプラニンが高発現しているがん(腫瘍)において抗がん作用(抗腫瘍活性)を示すことが期待される。そのため、ポドプラニンに対する特異性や親和性がより高い抗体や、ポドプラニンを認識する新規抗体などが求められている。
我々は近年、がん細胞に特異的な反応性を示すモノクローナル抗体作製技術(CasMab法)を開発した。CasMab法により、がん細胞と正常細胞に同一のアミノ酸配列の膜タンパク質が発現している場合、糖鎖などの翻訳後修飾の違いを利用し、がん細胞のみを攻撃する抗体医薬品を作製することが可能となった(非特許文献1-3)。
これまで、ポドプラニンに対し、複数のがん細胞特異的抗体を作製した(特許文献1、非特許文献3-4)。ポドプラニンに対するがん細胞特異的抗体は、がん型ポドプラニンが高発現する肺がん、食道がん、脳腫瘍、悪性中皮腫などのがん細胞に高反応性を示すが、正常型ポドプラニンが高発現するリンパ管内皮細胞、肺胞上皮細胞、腎上皮細胞には全く反応しない。CasMab法によりこれまでに開発したモノクローナル抗体は、強いADCC/CDC活性を持ち、マウスのがん移植片モデルにおいて高い抗腫瘍効果を示したことから、がんに対する特異性のみならず、抗体医薬としての可能性を示している。
Kato Y, Ogasawara S, Oki H, Goichberg P, Honma R, Fujii Y, Kaneko MK. LpMab-12 Established by CasMab Technology Specifically Detects Sialylated O-glycan on Thr52 of Platelet Aggregation-stimulating Domain of Human Podoplanin. PLoS One, 11(3), e0152912, 2016
Kato Y, Kunita A, Abe S, Ogasawara S, Fujii Y, Oki H, Fukayama M, Nishioka Y, and Kaneko MK. The chimeric antibody chLpMab-7 targeting human podoplanin suppresses pulmonary metastasis via ADCC and CDC rather than via its neutralizing activity. Oncotarget, 36003-36018, 2015
Kato Y and Kaneko MK. A Cancer-specific Monoclonal Antibody Recognizes the Aberrantly Glycosylated Podoplanin. Sci Rep., 4, 5924, 2014
Kaneko MK, Yamada S, Nakamura T, Abe S, Nishioka Y, Kunita A, Fukayama M, Fujii Y, Ogasawara S, Kato Y*. Antitumor activity of chLpMab-2, a human-mouse chimeric cancer-specific antihuman podoplanin antibody, via antibody-dependent cellular cytotoxicity. Cancer Med., DOI: 10.1002/cam4.1049
本発明が解決しようとする課題は、医薬、診断薬及び試薬として有用な、新規な抗ポドプラニン抗体を提供することである。
本発明により樹立されたPMab-117抗体及びその改変抗体は、ヒトポドプラニンのThr85に付加されたO型糖鎖(シアル酸を含む)をエピトープに含んでいることが分かった。また、PMab-117抗体及びその改変抗体は、ヒトポドプラニンが発現するがん細胞には強陽性であるが、正常細胞には反応性が低いため、がん細胞特異的抗体であることが分かった。ヒトポドプラニンのThr85に糖鎖が付加されていることはこれまで一切証明されておらず、またO型糖鎖が付加されたThr85をエピトープに含む抗体も全く樹立されていないことから、PMab-117は新規のエピトープを持つがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体である。
即ち、本発明は、以下のとおりである。
〔1〕
配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列におけるThr85を含む領域にエピトープを有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔2〕
配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列における78番目から85番目の領域(IRIEDLPT)にエピトープを有する、〔1〕に記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔3-1〕
以下の6つのCDRのアミノ酸配列を少なくとも1つ有するか、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列において1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を少なくとも1つ有するか、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を少なくとも1つ有する、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント:
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7)。
〔3-2〕
以下の6つのCDRのアミノ酸配列を少なくとも1つ有するか、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列において1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を少なくとも1つ有するか、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を少なくとも1つ有する、〔1〕又は〔2〕に記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント:
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7)。
〔4-1〕
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、
を含む、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔4-2〕
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、
を含む、〔1〕から〔3-2〕のいずれかにがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔5〕
Fc領域に1以上のN型糖鎖が結合し、該N型糖鎖の還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合していない、〔1〕から〔4-2〕のいずれかに記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔6〕
〔3〕又は〔4〕に記載のアミノ酸配列のいずれか1つをコードする核酸。
〔7〕
〔6〕に記載の核酸を含む発現ベクター。
〔8〕
〔7〕に記載の発現ベクターを含む形質転換体。
〔9〕
〔1〕から〔5〕のいずれかに記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含む医薬組成物。
〔10〕
抗がん活性を有する物質を結合させた〔1〕から〔5〕のいずれかに記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含む医薬組成物。
〔11〕
腫瘍の予防又は治療剤である、〔9〕又は〔10〕に記載の医薬組成物。
〔12〕
配列番号:1で表されるアミノ酸配列を有し、Thr85にシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、ヒトポドプラニン。
〔13〕
以下のアミノ酸配列を有し、
IRIEDLPT(配列番号:12)
Thrにシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、糖ペプチド。
即ち、本発明は、以下のとおりである。
〔1〕
配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列におけるThr85を含む領域にエピトープを有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔2〕
配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列における78番目から85番目の領域(IRIEDLPT)にエピトープを有する、〔1〕に記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔3-1〕
以下の6つのCDRのアミノ酸配列を少なくとも1つ有するか、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列において1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を少なくとも1つ有するか、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を少なくとも1つ有する、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント:
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7)。
〔3-2〕
以下の6つのCDRのアミノ酸配列を少なくとも1つ有するか、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列において1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を少なくとも1つ有するか、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を少なくとも1つ有する、〔1〕又は〔2〕に記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント:
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7)。
〔4-1〕
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、
を含む、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔4-2〕
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、
を含む、〔1〕から〔3-2〕のいずれかにがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔5〕
Fc領域に1以上のN型糖鎖が結合し、該N型糖鎖の還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合していない、〔1〕から〔4-2〕のいずれかに記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
〔6〕
〔3〕又は〔4〕に記載のアミノ酸配列のいずれか1つをコードする核酸。
〔7〕
〔6〕に記載の核酸を含む発現ベクター。
〔8〕
〔7〕に記載の発現ベクターを含む形質転換体。
〔9〕
〔1〕から〔5〕のいずれかに記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含む医薬組成物。
〔10〕
抗がん活性を有する物質を結合させた〔1〕から〔5〕のいずれかに記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含む医薬組成物。
〔11〕
腫瘍の予防又は治療剤である、〔9〕又は〔10〕に記載の医薬組成物。
〔12〕
配列番号:1で表されるアミノ酸配列を有し、Thr85にシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、ヒトポドプラニン。
〔13〕
以下のアミノ酸配列を有し、
IRIEDLPT(配列番号:12)
Thrにシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、糖ペプチド。
がん細胞特異的抗体によれば、抗がん活性をがん細胞特異的に発揮することができるので、副作用が極限まで低減された医薬を得ることができる。また、がん細胞を標的とする薬剤の送達にも有用であり、診断薬や試薬としての有用性も高い。
本発明によれば、医薬、診断薬及び試薬として有用な、新規な抗ポドプラニン抗体を提供することができる。
本発明によれば、医薬、診断薬及び試薬として有用な、新規な抗ポドプラニン抗体を提供することができる。
(抗ポドプラニン抗体)
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列におけるThr85を含む領域にエピトープを有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体である。O型糖鎖は、O-結合型糖鎖ともいう。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列におけるThr85を含む領域にエピトープを有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体である。O型糖鎖は、O-結合型糖鎖ともいう。
本明細書において「抗体」とは、一対のジスルフィド結合で安定化された2本の重鎖(H鎖)と2本の軽鎖(L鎖)が会合した構造をとる。重鎖は、重鎖可変領域VH、重鎖定常領域CH1、CH2、CH3、及びCH1とCH2の間に位置するヒンジ領域からなり、軽鎖は、軽鎖可変領域VLと軽鎖定常領域CLとからなる。この中で、VHとVLからなる可変領域断片(Fv)が、抗原結合に直接関与し、抗体に多様性を与える領域である。また、VL、CL、VH、CH1からなる抗原結合領域をFab領域と呼び、ヒンジ領域、CH2、CH3からなる領域をFc領域と呼ぶ。
可変領域のうち、直接抗原と接触する領域は特に変化が大きく、相補性決定領域(complementarity-determining region:CDR)と呼ばれる。CDR以外の比較的変異の少ない部分をフレームワーク(framework region:FR)と呼ぶ。軽鎖と重鎖の可変領域には、それぞれ3つのCDR(重鎖CDR1~3、及び軽鎖CDR1~3)が存在する。
可変領域のうち、直接抗原と接触する領域は特に変化が大きく、相補性決定領域(complementarity-determining region:CDR)と呼ばれる。CDR以外の比較的変異の少ない部分をフレームワーク(framework region:FR)と呼ぶ。軽鎖と重鎖の可変領域には、それぞれ3つのCDR(重鎖CDR1~3、及び軽鎖CDR1~3)が存在する。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、モノクローナル抗体であっても、ポリクローナル抗体であってもよい。また、本発明の抗ポドプラニン抗体は、IgG、IgM、IgA、IgD、IgEのいずれのアイソタイプであってもよい。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、ウサギ、ニワトリなどの非ヒト動物を免疫して作製したものであってもよいし、組換え抗体であってもよく、キメラ型抗体(キメラ抗体)、ヒト化抗体、完全ヒト化抗体などであってもよい。キメラ型抗体(キメラ抗体)とは、異なる種に由来する抗体の断片が連結された抗体をいう。
「ヒト化抗体」とは、非ヒト由来の抗体に特徴的なアミノ酸配列で、ヒト抗体の対応する位置を置換した抗体を意味し、例えば、マウス又はラットを免疫して作製した抗体の重鎖CDR1~3及び軽鎖CDR1~3を有し、重鎖及び軽鎖のそれぞれ4つのフレームワーク領域(FR)を含むその他のすべての領域がヒト抗体に由来する抗体などが挙げられる。かかる抗体は、CDR移植抗体と呼ばれる場合もある。用語「ヒト化抗体」は、ヒト型キメラ抗体を含む場合もある。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、ウサギ、ニワトリなどの非ヒト動物を免疫して作製したものであってもよいし、組換え抗体であってもよく、キメラ型抗体(キメラ抗体)、ヒト化抗体、完全ヒト化抗体などであってもよい。キメラ型抗体(キメラ抗体)とは、異なる種に由来する抗体の断片が連結された抗体をいう。
「ヒト化抗体」とは、非ヒト由来の抗体に特徴的なアミノ酸配列で、ヒト抗体の対応する位置を置換した抗体を意味し、例えば、マウス又はラットを免疫して作製した抗体の重鎖CDR1~3及び軽鎖CDR1~3を有し、重鎖及び軽鎖のそれぞれ4つのフレームワーク領域(FR)を含むその他のすべての領域がヒト抗体に由来する抗体などが挙げられる。かかる抗体は、CDR移植抗体と呼ばれる場合もある。用語「ヒト化抗体」は、ヒト型キメラ抗体を含む場合もある。
本明細書において、抗ポドプラニン抗体の「抗原結合フラグメント」とは、抗ポドプラニン抗体のフラグメントであって、ポドプラニンに結合するフラグメントをいう。具体的には、VL、VH、CL及びCH1領域からなるFab;2つのFabがヒンジ領域でジスルフィド結合によって連結されているF(ab’)2;VL及びVHからなるFv;VL及びVHを人工のポリペプチドリンカーで連結した一本鎖抗体であるscFvのほか、diabody型、scDb型、tandem scFv型、ロイシンジッパー型等の二重特異性抗体などが挙げられるが、これらに限定されない。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列における78番目から85番目の領域(78-IRIEDLPT-85)であって、85位のスレオニンにシアル酸含有O型糖鎖が付加されているヒトポドプラニンの糖ペプチド部分にエピトープを有することが好ましい。
ヒトポドプラニンのアミノ酸配列における78番目から85番目の領域(78-IRIEDLPT-85)にエピトープを有する本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、ペプチドと糖鎖の両方をエピトープに含んで認識する抗体である。
78-IRIEDLPT-85で表されるアミノ酸配列は、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンにおける78番目から85番目のアミノ酸に相当する。そして、Tは、配列番号:1のアミノ酸配列における85位のスレオニン(Thr85)に相当する。
本発明においては、抗ポドプラニン抗体のエピトープである、Thrにシアル酸含有O型糖鎖が付加されているIRIEDLPT(配列番号:12)で表される糖ペプチドも提供する。また、本発明は、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を有し、Thr85にシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、ヒトポドプラニンを提供する。
ヒトポドプラニンのアミノ酸配列における78番目から85番目の領域(78-IRIEDLPT-85)にエピトープを有する本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、ペプチドと糖鎖の両方をエピトープに含んで認識する抗体である。
78-IRIEDLPT-85で表されるアミノ酸配列は、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンにおける78番目から85番目のアミノ酸に相当する。そして、Tは、配列番号:1のアミノ酸配列における85位のスレオニン(Thr85)に相当する。
本発明においては、抗ポドプラニン抗体のエピトープである、Thrにシアル酸含有O型糖鎖が付加されているIRIEDLPT(配列番号:12)で表される糖ペプチドも提供する。また、本発明は、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を有し、Thr85にシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、ヒトポドプラニンを提供する。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、以下の6つのCDRの少なくとも1つを有していてもよい。これらのCDRは、PMab-117のCDR配列である。
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7)
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列におけるThr85を含む領域にエピトープを有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体であって、上記6つのCFRの少なくとも1つを有することが好ましい。当該抗ポドプラニン抗体は、、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列における78番目から85番目の領域(78-IRIEDLPT-85)であって、85位のスレオニンにシアル酸含有O型糖鎖が付加されているヒトポドプラニンの糖ペプチド部分にエピトープを有することがより好ましい。
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7)
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列におけるThr85を含む領域にエピトープを有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体であって、上記6つのCFRの少なくとも1つを有することが好ましい。当該抗ポドプラニン抗体は、、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列における78番目から85番目の領域(78-IRIEDLPT-85)であって、85位のスレオニンにシアル酸含有O型糖鎖が付加されているヒトポドプラニンの糖ペプチド部分にエピトープを有することがより好ましい。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、6つのCDRのうち少なくとも1つを含むものであればよいが、6つのCDRのうち複数のCDRを含んでいてもよく、例えば、2以上、3以上、4以上、5以上、又は6つ含むものとすることができる。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体が、6つのCDRを含む場合、当該抗ポドプラニン抗体は、配列番号:2~4で表される重鎖CDR1~3及び配列番号:5~7で表される軽鎖CDR1~3を有する。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体が、6つのCDRを含む場合、当該抗ポドプラニン抗体は、配列番号:2~4で表される重鎖CDR1~3及び配列番号:5~7で表される軽鎖CDR1~3を有する。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体が、配列番号:2~4で表される重鎖CDR1~3及び配列番号:5~7で表される軽鎖CDR1~3のいずれか1つを含む場合において、その少なくとも1つに、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を有するアミノ酸配列を含んでいてもよい。
本明細書において「アミノ酸」は、その最も広い意味で用いられ、天然アミノ酸に加え、人工のアミノ酸変異体や誘導体を含む。アミノ酸は慣用的な一文字表記又は三文字表記で示される場合もある。本明細書における「アミノ酸」としては、天然タンパク質性L-アミノ酸、非天然アミノ酸、アミノ酸の特徴である当業界で公知の特性を有する化学的に合成された化合物などが挙げられる。
非天然アミノ酸としては、例えば、主鎖の構造が天然型と異なる、α,α-二置換アミノ酸(α-メチルアラニン等)、N-アルキル-α-アミノ酸、D-アミノ酸、β-アミノ酸、α-ヒドロキシ酸や、側鎖の構造が天然型と異なるアミノ酸(ノルロイシン、ホモヒスチジン等)、側鎖に余分のメチレンを有するアミノ酸(「ホモ」アミノ酸、ホモフェニルアラニン、ホモヒスチジン等)、及び側鎖中のカルボン酸官能基がスルホン酸基で置換されるアミノ酸(システイン酸等)などが挙げられるが、これらに限定されない。
非天然アミノ酸としては、例えば、主鎖の構造が天然型と異なる、α,α-二置換アミノ酸(α-メチルアラニン等)、N-アルキル-α-アミノ酸、D-アミノ酸、β-アミノ酸、α-ヒドロキシ酸や、側鎖の構造が天然型と異なるアミノ酸(ノルロイシン、ホモヒスチジン等)、側鎖に余分のメチレンを有するアミノ酸(「ホモ」アミノ酸、ホモフェニルアラニン、ホモヒスチジン等)、及び側鎖中のカルボン酸官能基がスルホン酸基で置換されるアミノ酸(システイン酸等)などが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書において「1から数個のアミノ酸の付加、置換又は欠失を有する」という場合、付加、置換又は欠失されるアミノ酸の個数は、結果として得られるポリペプチドがCDRとしての機能を保持する限り特に限定されないが、例えば、1個、2個、3個又は4個とすることができる。「1個のアミノ酸の付加、置換又は欠失を有」していてもよく、「1~2個のアミノ酸の付加、置換又は欠失を有」していてもよく、「1~3個のアミノ酸の付加、置換又は欠失を有」していてもよく、「1~4個のアミノ酸の付加、置換又は欠失を有」していてもよい。
アミノ酸の欠失、置換又は付加の位置は、CDRとしての機能が保持される限り、アミノ酸が欠失、置換又は付加されるCDR配列のどこであってもよい。
アミノ酸の欠失、置換又は付加の位置は、CDRとしての機能が保持される限り、アミノ酸が欠失、置換又は付加されるCDR配列のどこであってもよい。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体が、配列番号:2~4で表される重鎖CDR1~3及び配列番号:5~7で表される軽鎖CDR1~3のいずれか1つを含む場合において、その少なくとも1つが、配列番号:2~4で表される重鎖CDR1~3及び配列番号:5~7で表される軽鎖CDR1~3の対応するアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含んでいてもよい。
本明細書において、「80%以上の同一性を有する」とは、変異前のアミノ酸配列と当該アミノ酸配列から変異した配列を有するポリペプチドのアミノ酸配列一致が最大になるようにアライメントしたときに、共通するアミノ酸残基の数が、変異前のアミノ酸配列のアミノ酸数の80%以上であることを意味する。
同一性は80%以上であって、CDRとしての機能を保持する限り特に限定されないが、例えば85%以上、90%以上、95%以上、98%以上、99%以上とすることができる。
本明細書において、配列番号:2~7のいずれかで表されるアミノ酸配列と「80%以上の同一性を有する」とは、配列番号:2~7のいずれかで表されるアミノ酸配列と変異した配列を有するポリペプチドのアミノ酸配列を比較して、一致が最大になるようにアライメントしたときに、共通するアミノ酸残基の数が、配列番号:2~7のいずれかで表されるアミノ酸配列のアミノ酸数の80%以上であることを意味する。
同一性は80%以上であって、CDRとしての機能を保持する限り特に限定されないが、例えば85%以上、90%以上、95%以上、98%以上、99%以上とすることができる。
本明細書において、配列番号:2~7のいずれかで表されるアミノ酸配列と「80%以上の同一性を有する」とは、配列番号:2~7のいずれかで表されるアミノ酸配列と変異した配列を有するポリペプチドのアミノ酸配列を比較して、一致が最大になるようにアライメントしたときに、共通するアミノ酸残基の数が、配列番号:2~7のいずれかで表されるアミノ酸配列のアミノ酸数の80%以上であることを意味する。
重鎖CDR1~3及び軽鎖CDR1~3のアミノ酸配列にアミノ酸を付加、置換、又は欠失させたアミノ酸配列からなるCDRや、重鎖CDR1~3及び軽鎖CDR1~3のアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するCDRは、部位特異的変異導入法、ランダム変異導入法、チェーンシャフリング法、CDRウォーキング法などの公知の方法を用いて作製され得る。これらの方法によれば、ファージディスプレイ法によってCDRに種々の変異を有する抗体又は抗体断片をファージ表面に提示させ、抗原を使用してスクリーニングすることにより、より親和性が成熟したCDRを得られることが当業者によく知られている(例えば、Wu et al.,PNAS,95:6037-6042(1998);Schier,R. et al.,J.Mol.Bio.263:551-567(1996);Schier,R. et al.,J.Mol.Biol.255:28-43(1996);Yang,W.P. et al.,J.Mol.Biol.,254:392-403(1995)。)。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
を含むことが好ましい。
配列番号:8で表されるアミノ酸配列は、chPMab-117のキメラ型抗体の重鎖のアミノ酸配列であり、配列番号:10で表されるアミノ酸配列は、chPMab-117-mG2aのキメラ型抗体の重鎖のアミノ酸配列である。
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;又は、
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖
を含むことが好ましい。
配列番号:8で表されるアミノ酸配列は、chPMab-117のキメラ型抗体の重鎖のアミノ酸配列であり、配列番号:10で表されるアミノ酸配列は、chPMab-117-mG2aのキメラ型抗体の重鎖のアミノ酸配列である。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含むことが好ましい。
配列番号:9で表されるアミノ酸配列は、chPMab-117のキメラ型抗体の軽鎖のアミノ酸配列であり、配列番号:11で表されるアミノ酸配列は、chPMab-117-mG2aのキメラ型抗体の軽鎖のアミノ酸配列である。
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖
を含むことが好ましい。
配列番号:9で表されるアミノ酸配列は、chPMab-117のキメラ型抗体の軽鎖のアミノ酸配列であり、配列番号:11で表されるアミノ酸配列は、chPMab-117-mG2aのキメラ型抗体の軽鎖のアミノ酸配列である。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、
配列番号:8で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:9で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;を含むことがより好ましく、
配列番号:8で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:9で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;を含んでいてもよく、
配列番号:8で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:9で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖;を含んでいてもよい。
配列番号:8で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:9で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;を含むことがより好ましく、
配列番号:8で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:9で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;を含んでいてもよく、
配列番号:8で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:9で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖;を含んでいてもよい。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、
配列番号:10で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:11で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;を含むことがより好ましく、
配列番号:10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;を含んでいてもよく、
配列番号:10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖;を含んでいてもよい。
配列番号:10で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:11で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;を含むことがより好ましく、
配列番号:10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;を含んでいてもよく、
配列番号:10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖;及び
配列番号:11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖;を含んでいてもよい。
本明細書において、重鎖又は軽鎖のアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失という場合、付加、置換、又は欠失するアミノ酸の数は、例えば、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、又は10個とすることができる。その他の用語は、上述したとおりである。
本明細書において、配列番号:8~11のいずれかで表されるアミノ酸配列と「80%以上の同一性を有する」とは、配列番号:8~11のいずれかで表されるアミノ酸配列と変異した配列を有するポリペプチドのアミノ酸配列を比較して、一致が最大になるようにアライメントしたときに、共通するアミノ酸残基の数が、配列番号:8~11のいずれかで表されるアミノ酸配列のアミノ酸数の80%以上であることを意味する。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、Fc領域に1以上のN型糖鎖が結合し、該N型糖鎖の還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合していない抗体であってもよい。N型糖鎖は、N-結合型糖鎖ともいう。
例えばIgG抗体のFc領域には、N型糖鎖の結合部位が2ヶ所存在し、この部位に複合型糖鎖が結合している。N型糖鎖とは、Asn-X-Ser/Thr配列のAsnに結合する糖鎖をいい、Asnに結合した共通した構造Man3GlcNAc2(-Asn)を有する。非還元末端の2つのマンノース(Man)に結合する糖鎖の種類により、高マンノース型、混成型、及び複合型などに分類される。
N型糖鎖の還元末端のN-アセチルグルコサミン(GlcNAc)にはフコースが結合し得るが、フコースが結合していない場合、結合している場合に比較してADCC活性が著しく上昇することが知られている。このことは例えば、国際公開第2002/031140号に記載されており、その開示は全体として参照により本明細書に組み込まれる。
ADCC活性が著しく向上することにより、抗体を医薬として用いる場合に投与量を少なくすることができるので、副作用を軽減させることが可能であると共に、治療費も低減させることができる。
例えばIgG抗体のFc領域には、N型糖鎖の結合部位が2ヶ所存在し、この部位に複合型糖鎖が結合している。N型糖鎖とは、Asn-X-Ser/Thr配列のAsnに結合する糖鎖をいい、Asnに結合した共通した構造Man3GlcNAc2(-Asn)を有する。非還元末端の2つのマンノース(Man)に結合する糖鎖の種類により、高マンノース型、混成型、及び複合型などに分類される。
N型糖鎖の還元末端のN-アセチルグルコサミン(GlcNAc)にはフコースが結合し得るが、フコースが結合していない場合、結合している場合に比較してADCC活性が著しく上昇することが知られている。このことは例えば、国際公開第2002/031140号に記載されており、その開示は全体として参照により本明細書に組み込まれる。
ADCC活性が著しく向上することにより、抗体を医薬として用いる場合に投与量を少なくすることができるので、副作用を軽減させることが可能であると共に、治療費も低減させることができる。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、抗がん活性を有する物質を結合させて用いてもよい。
本明細書において、「抗がん活性を有する物質」とは、腫瘍サイズの低下(遅延又は停止)、腫瘍の転移の阻害、腫瘍増殖の阻害(遅延又は停止)、及びがんと関連する一つ又は複数の症状の緩和、の少なくとも1つを生じさせる物質を意味する。具体的には、毒素、抗がん剤、ラジオアイソトープなどが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書において、「抗がん活性を有する物質」とは、腫瘍サイズの低下(遅延又は停止)、腫瘍の転移の阻害、腫瘍増殖の阻害(遅延又は停止)、及びがんと関連する一つ又は複数の症状の緩和、の少なくとも1つを生じさせる物質を意味する。具体的には、毒素、抗がん剤、ラジオアイソトープなどが挙げられるが、これらに限定されない。
抗がん活性を有する毒素としては、例えば、緑膿菌外毒素(PE)又はその細胞障害性フラグメント(例えばPE38)、ジフテリア毒素、リシンAなどが挙げられる。抗がん活性を有する毒素は、抗ポドプラニン抗体と共に毒素が取り込まれる細胞、即ちポドプラニンを発現しているがん細胞のみに毒性を発揮するので、周囲の細胞に悪影響を与えず、特異的に効果を得られるという利点がある。本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、腫瘍細胞に発現する抗ポドプラニンに特異的に結合するので、有用である。
抗がん剤としては、例えば、アドリアマイシン、ダウノマイシン、マイトマイシン、シスプラチン、ビンクリスチン、エピルビシン、メトトレキセート、5-フルオロウラシル、アクラシノマイシン、ナイトロジェン・マスタード、サイクロフォスファミド、ブレオマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビンデシン、タモキシフェン、デキサメタゾン等の低分子化合物や、免疫担当細胞を活性化するサイトカイン(例えば、ヒトインターロイキン2、ヒト顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、ヒトマクロファージコロニー刺激因子、ヒトインターロイキン12)等のタンパク質などが挙げられる。
抗がん活性を有するラジオアイソトープとしては、32P、14C、125I、3H、131I、211At、90Yなどが挙げられる。ラジオアイソトープは、抗ポドプラニン抗体が結合する細胞、即ちポドプラニンを発現している細胞の周囲の細胞にも毒性を発揮する。一般に、腫瘍細胞は均一ではなく、すべての腫瘍細胞がポドプラニンを発現しているわけではないので、周囲のポドプラニン陰性の腫瘍細胞を殺すためにラジオアイソトープは有用である。なお、ラジオアイソトープを結合させる場合、抗ポドプラニン抗体はFabやscFvなどの低分子抗体としてもよい。
抗がん活性を有する物質は、公知の方法によって抗ポドプラニン抗体に直接結合させることができる。また、例えば、抗ポドプラニン抗体を表面に修飾させたリポソームなどの担体に抗がん活性を有する物質を封入してもよい。
抗がん活性を有する物質が蛋白質やポリペプチドの場合は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体をコードする核酸(後述)と抗がん活性を有する物質をコードするDNAを連結し、適当な発現ベクターに挿入することにより、抗がん活性を有する物質と抗ポドプラニン抗体との融合タンパク質として発現させてもよい。
(核酸)
本発明は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体をコードする核酸も包含する。核酸は、天然の核酸であっても人工の核酸であってもよく、例えば、DNA、RNA、DNAとRNAのキメラが挙げられるが、これらに限定されない。抗ポドプラニン抗体をコードする核酸の塩基配列は、当業者が公知の方法又はそれに準ずる方法に従って決定することができ、公知の方法又はそれに準ずる方法で調製することができる。
本発明は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体をコードする核酸も包含する。核酸は、天然の核酸であっても人工の核酸であってもよく、例えば、DNA、RNA、DNAとRNAのキメラが挙げられるが、これらに限定されない。抗ポドプラニン抗体をコードする核酸の塩基配列は、当業者が公知の方法又はそれに準ずる方法に従って決定することができ、公知の方法又はそれに準ずる方法で調製することができる。
本発明に係る核酸は、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列において1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7)
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列、又は、
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸であってよい。
以下の6つのCDRのアミノ酸配列、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列において1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7)
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列、又は、
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸であってよい。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体をコードする核酸としては、例えば、配列番号:13で表されるchPMab-117の重鎖をコードするDNA、配列番号:14で表されるchPMab-117の軽鎖をコードするDNA、配列番号:15で表されるchPMab117-mG2aの重鎖をコードするDNA、配列番号:16で表されるchPMab117-mG2aの軽鎖をコードするDNAなどが挙げられるが、これらに限定されない。
chPMab-117及びchPMab117-mG2aのCDRのそれぞれをコードする核酸は、配列番号:13~16のいずれかで表されるDNA配列に含まれている。
chPMab-117及びchPMab117-mG2aのCDRのそれぞれをコードする核酸は、配列番号:13~16のいずれかで表されるDNA配列に含まれている。
(発現ベクター)
本発明は、本発明に係る核酸を含む発現ベクターも包含する。発現ベクターは、使用する宿主細胞にあわせて適宜選択することができ、例えば、プラスミド、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター、カリフラワーモザイクウイルスベクターやタバコモザイクウイルスベクター等の植物ウイルスベクター、コスミド、YAC、EBV由来エピソームなどが挙げられる。これらの発現ベクターには、公知の方法(制限酵素を利用する方法など)で、本発明に係る核酸を挿入することができる。
本発明は、本発明に係る核酸を含む発現ベクターも包含する。発現ベクターは、使用する宿主細胞にあわせて適宜選択することができ、例えば、プラスミド、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター、カリフラワーモザイクウイルスベクターやタバコモザイクウイルスベクター等の植物ウイルスベクター、コスミド、YAC、EBV由来エピソームなどが挙げられる。これらの発現ベクターには、公知の方法(制限酵素を利用する方法など)で、本発明に係る核酸を挿入することができる。
本発明に係る発現ベクターは、本発明に係る核酸、例えば、本発明に係る抗ポドプラニン抗体をコードする核酸に加え、さらに、抗体遺伝子の発現を調節するプロモーター、複製起点、選択マーカー遺伝子などを含むことができる。プロモーター及び複製起点は、宿主細胞とベクターの種類によって適宜選択することができる。
(形質転換体)
本発明は、本発明に係るベクターを含む形質転換体を包含する。形質転換体は、本発明に係るベクターを適切な宿主細胞にトランスフェクトすることによって得ることができる。宿主細胞としては、例えば、哺乳類細胞(CHO細胞、COS細胞、ミエローマ細胞、HeLa細胞、Vero細胞等)、昆虫細胞、植物細胞、真菌細胞(サッカロミセス属、アスペルギルス属等)といった真核細胞や、大腸菌(E.Coli)、枯草菌等の原核細胞などを用いることができる。
本発明は、本発明に係るベクターを含む形質転換体を包含する。形質転換体は、本発明に係るベクターを適切な宿主細胞にトランスフェクトすることによって得ることができる。宿主細胞としては、例えば、哺乳類細胞(CHO細胞、COS細胞、ミエローマ細胞、HeLa細胞、Vero細胞等)、昆虫細胞、植物細胞、真菌細胞(サッカロミセス属、アスペルギルス属等)といった真核細胞や、大腸菌(E.Coli)、枯草菌等の原核細胞などを用いることができる。
(抗ポドプラニン抗体の製造方法)
本発明に係る抗ポドプラニン抗体の製造方法は限定されないが、例えば、抗ポドプラニンモノクローナル抗体は、ポドプラニン又はその断片で免疫した非ヒト哺乳動物から抗体産生細胞を単離し、これを骨髄腫細胞などと融合させてハイブリドーマを作製し、このハイブリドーマが産生した抗体を精製することによって得ることができる。また、抗ポドプラニンポリクローナル抗体は、ポドプラニン又はその断片で免疫した動物の血清から得ることができる。また、本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、非ヒト動物を免疫する際、Thr85に結合する糖鎖以外の糖鎖を付加したポドプラニンを用いてもよい。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体の製造方法において用いられるポドプラニン又はその断片は、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列におけるThr85を含む領域を有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている。好ましくは、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列における78番目から85番目の領域(IRIEDLPT)を有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体の製造方法は限定されないが、例えば、抗ポドプラニンモノクローナル抗体は、ポドプラニン又はその断片で免疫した非ヒト哺乳動物から抗体産生細胞を単離し、これを骨髄腫細胞などと融合させてハイブリドーマを作製し、このハイブリドーマが産生した抗体を精製することによって得ることができる。また、抗ポドプラニンポリクローナル抗体は、ポドプラニン又はその断片で免疫した動物の血清から得ることができる。また、本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、非ヒト動物を免疫する際、Thr85に結合する糖鎖以外の糖鎖を付加したポドプラニンを用いてもよい。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体の製造方法において用いられるポドプラニン又はその断片は、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列におけるThr85を含む領域を有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている。好ましくは、配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列における78番目から85番目の領域(IRIEDLPT)を有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体を遺伝子組換え法で作製する場合、例えば、本発明に係る抗ポドプラニン抗体をコードする核酸を含む発現ベクターで適当な宿主を形質転換し、この形質転換体を適当な条件で培養して抗体を発現させ、公知の方法に従って単離精製すればよい。
単離精製方法としては、例えば、プロテインA等を用いたアフィニティーカラム、その他のクロマトグラフィーカラム、フィルター、限外濾過、塩析、透析などが挙げられ、これらを適宜組み合わせることができる。
単離精製方法としては、例えば、プロテインA等を用いたアフィニティーカラム、その他のクロマトグラフィーカラム、フィルター、限外濾過、塩析、透析などが挙げられ、これらを適宜組み合わせることができる。
所定のエピトープの配列に結合する抗体は、当業者が公知の方法又はそれに準ずる方法で作製することができる。例えば、エピトープ配列を含むペプチドを固相担体に固定し、当該ペプチドと複数の抗体の結合を検出することにより、同エピトープに特異的に結合する抗体を得ることができる。
ここで、「複数の抗体」としては、動物を抗原タンパク質又はその部分ペプチドで免疫することによって得たものを用いてもよいし、ファージディスプレイ法によって作製した抗体ライブラリ又は抗体フラグメントライブラリを用いてもよい。ファージディスプレイ法によるライブラリを用いる場合、エピトープ配列を含むペプチドを固相担体に固定しパニングを繰り返すことによって、同エピトープに特異的に結合する抗体を得ることもできる。
ここで、「複数の抗体」としては、動物を抗原タンパク質又はその部分ペプチドで免疫することによって得たものを用いてもよいし、ファージディスプレイ法によって作製した抗体ライブラリ又は抗体フラグメントライブラリを用いてもよい。ファージディスプレイ法によるライブラリを用いる場合、エピトープ配列を含むペプチドを固相担体に固定しパニングを繰り返すことによって、同エピトープに特異的に結合する抗体を得ることもできる。
ヒト型キメラ抗体及びヒトCDR移植抗体は、ヒト以外の動物の抗体を産生するハイブリドーマのmRNAから抗体遺伝子をクローン化し、これをヒト抗体遺伝子の一部と遺伝子組換え技術で連結することによって作製することができる。
ヒト型キメラ抗体の場合、マウス抗体を産生するハイブリドーマのmRNAから逆転写酵素によりcDNAを合成し、重鎖可変領域(VH)及び軽鎖可変領域(LH)をPCRでクローニングして配列を解析する。次に、一致率の高い抗体塩基配列から、リーダー配列を含む5’プライマーを作製し、5’プライマーと可変部3’プライマーによって上記cDNAから、シグナル配列から可変領域の3’末端までをPCRでクローニングする。一方で、ヒトIgG1の重鎖及び軽鎖の定常領域をクローニングし、重鎖と軽鎖それぞれについて、マウス抗体由来可変領域と、ヒト抗体由来定常領域とをPCRによるOverlapping Hanging法で連結し、増幅する。得られたDNAを適当なベクターに挿入し、これを形質転換して、ヒト型キメラ抗体を得ることができる。
ヒト型キメラ抗体の場合、マウス抗体を産生するハイブリドーマのmRNAから逆転写酵素によりcDNAを合成し、重鎖可変領域(VH)及び軽鎖可変領域(LH)をPCRでクローニングして配列を解析する。次に、一致率の高い抗体塩基配列から、リーダー配列を含む5’プライマーを作製し、5’プライマーと可変部3’プライマーによって上記cDNAから、シグナル配列から可変領域の3’末端までをPCRでクローニングする。一方で、ヒトIgG1の重鎖及び軽鎖の定常領域をクローニングし、重鎖と軽鎖それぞれについて、マウス抗体由来可変領域と、ヒト抗体由来定常領域とをPCRによるOverlapping Hanging法で連結し、増幅する。得られたDNAを適当なベクターに挿入し、これを形質転換して、ヒト型キメラ抗体を得ることができる。
ヒトCDR移植抗体の場合、使用するマウス抗体可変部と最も相同性の高いヒト抗体可変部を選択してクローン化し、メガプライマー法を用いた部位選択的突然変異導入により、CDRの塩基配列を改変する。フレームワーク領域を構成するアミノ酸配列をヒト化すると抗原との特異的な結合ができなくなる場合には、フレームワークの一部のアミノ酸をヒト型からラット型に変換してもよい。
元の配列において、1又は2個のアミノ酸の欠失、置換又は付加を有するアミノ酸配列からなるCDRや、元の配列に80%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるCDRは、部位特異的変異導入法、ランダム変異導入法、チェーンシャフリング法、CDRウォーキング法などの公知の方法を用いて作製され得る。
これらの方法により、ファージディスプレイ法によってCDRに種々の変異を有する抗体又は抗体断片をファージ表面に提示させ、抗原を使用してスクリーニングすることにより、より親和性が成熟したCDRを得られることが当業者によく知られている(例えば、Wu et al.,PNAS,95:6037-6042(1998);Schier,R. et al.,J.Mol.Bio.263:551-567(1996);Schier,R. et al.,J.Mol.Biol.255:28-43(1996);Yang,W.P. et al.,J.Mol.Biol.,254:392-403(1995)。)。本発明は、このような方法で成熟させたCDRを含む抗体も包含する。
元の配列において、1又は2個のアミノ酸の欠失、置換又は付加を有するアミノ酸配列からなるCDRや、元の配列に80%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるCDRは、部位特異的変異導入法、ランダム変異導入法、チェーンシャフリング法、CDRウォーキング法などの公知の方法を用いて作製され得る。
これらの方法により、ファージディスプレイ法によってCDRに種々の変異を有する抗体又は抗体断片をファージ表面に提示させ、抗原を使用してスクリーニングすることにより、より親和性が成熟したCDRを得られることが当業者によく知られている(例えば、Wu et al.,PNAS,95:6037-6042(1998);Schier,R. et al.,J.Mol.Bio.263:551-567(1996);Schier,R. et al.,J.Mol.Biol.255:28-43(1996);Yang,W.P. et al.,J.Mol.Biol.,254:392-403(1995)。)。本発明は、このような方法で成熟させたCDRを含む抗体も包含する。
その他の抗体の製造方法として、トリコスタチンA処理ニワトリB細胞由来DT40細胞株から抗体産生株を取得するAdlib法(Seo,H. et al.,Nat.Biotechnol.,6:731-736,2002)、マウス抗体遺伝子が破壊されヒト抗体遺伝子が導入されたマウスであるKMマウスを免疫してヒト抗体を作製する方法(Itoh,K. et al.,Jpn.J.Cancer Res.,92:1313-1321,2001;Koide,A. et al.,J.Mol.Biol.,284:1141-1151,1998)などがあり、これらも本発明に係る抗体の産生に応用することができる。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体の抗原結合フラグメントは、当該フラグメントをコードするDNAを用いて上述の方法で発現させてもよいし、また、全長の抗体を得てからパパイン、ペプシンなどの酵素で処理して断片化してもよい。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、作製方法や精製方法により、アミノ酸配列、分子量、等電点、糖鎖の有無、形態などが異なり得る。しかしながら、得られた抗体が、本発明に係る抗ポドプラニン抗体と同等の機能を有している限り、本発明に含まれる。例えば、本発明に係る抗ポドプラニン抗体を、大腸菌などの原核細胞で発現させた場合、本来の抗体のアミノ酸配列のN末端にメチオニン残基が付加される。本発明は、かかる抗体も包含する。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体が、還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合していないN型糖鎖を有する抗体である場合、かかる抗体は公知の方法又はそれに準ずる方法に従って製造することができる。かかる抗体の製造方法は、例えば、国際公開第2002/031140号、特開2009-225781号公報に記載されており、その開示は全体として参照により本明細書に組み込まれる。
具体的には、例えば、本発明に係る抗ポドプラニン抗体をコードするDNAを含むベクターを用いて、GDP-フコースの合成に関与する酵素の活性、又はα-1,6-フコシルトランスフェラーゼの活性が低下又は欠失した細胞を形質転換し、得られた形質転換体を培養した後、目的とする抗ポドプラニン抗体を精製することによって得ることができる。
GDP-フコースの合成に関与する酵素としては、例えば、GDP-mannose 4,6-dehydratase(GMP)、GDP-keto-6-deoxymannose 3,5-epimerase,4-reductase(Fx)、GDP-beta-L-fucose pyrophosphorylase(GFPP)が挙げられる。
ここで、細胞は特に限定されないが、哺乳動物細胞が好ましく、例えば上記酵素活性を低下又は欠失されたCHO細胞を用いることができる。
上記方法によって得られる抗体組成物は、還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合している抗体を含む場合もあるが、フコースが結合している抗体の割合は、抗体全体の20重量%以下、好ましくは10重量%以下、さらに好ましくは5重量%以下、最も好ましくは3重量%以下である。
具体的には、例えば、本発明に係る抗ポドプラニン抗体をコードするDNAを含むベクターを用いて、GDP-フコースの合成に関与する酵素の活性、又はα-1,6-フコシルトランスフェラーゼの活性が低下又は欠失した細胞を形質転換し、得られた形質転換体を培養した後、目的とする抗ポドプラニン抗体を精製することによって得ることができる。
GDP-フコースの合成に関与する酵素としては、例えば、GDP-mannose 4,6-dehydratase(GMP)、GDP-keto-6-deoxymannose 3,5-epimerase,4-reductase(Fx)、GDP-beta-L-fucose pyrophosphorylase(GFPP)が挙げられる。
ここで、細胞は特に限定されないが、哺乳動物細胞が好ましく、例えば上記酵素活性を低下又は欠失されたCHO細胞を用いることができる。
上記方法によって得られる抗体組成物は、還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合している抗体を含む場合もあるが、フコースが結合している抗体の割合は、抗体全体の20重量%以下、好ましくは10重量%以下、さらに好ましくは5重量%以下、最も好ましくは3重量%以下である。
また、還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合していないN型糖鎖を有する抗体は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体をコードするDNAを含むベクターを昆虫卵に導入し、孵化させて昆虫を成長させ、必要に応じて交配を行ってトランスジェニック昆虫を作製し、当該トランスジェニック昆虫又はその分泌物から抗ポドプラニン抗体を抽出することによっても得ることができる。昆虫としてはカイコを用いることができ、その場合、繭から抗体を抽出することができる。
この方法によって得られる抗体組成物も、還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合している抗体を含む場合もあるが、フコースが結合している抗体の割合は、抗体全体の20重量%以下、好ましくは10重量%以下、さらに好ましくは5重量%以下、最も好ましくは3重量%以下である。
この方法によって得られる抗体組成物も、還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合している抗体を含む場合もあるが、フコースが結合している抗体の割合は、抗体全体の20重量%以下、好ましくは10重量%以下、さらに好ましくは5重量%以下、最も好ましくは3重量%以下である。
(本発明に係る抗ポドプラニン抗体の活性)
抗体医薬の薬効メカニズムは、抗体が有する2つの生物活性に基づいている。1つは標的抗原特異的な結合活性であり、結合することによって標的抗原分子の機能を中和する活性である。標的抗原分子の機能の中和はFab領域を介して発揮される。
抗体医薬の薬効メカニズムは、抗体が有する2つの生物活性に基づいている。1つは標的抗原特異的な結合活性であり、結合することによって標的抗原分子の機能を中和する活性である。標的抗原分子の機能の中和はFab領域を介して発揮される。
もう1つは、エフェクター活性と呼ばれる抗体の生物活性である。エフェクター活性は、抗体のFc領域を介して、抗体依存性細胞障害活性(antibody-dependent cellular cytotoxicity;ADCC)、補体依存性細胞障害活性(complement-dependent cytotoxicity;CDC)、アポトーシスの直接誘導などの態様で発揮される。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体の活性は、以下の方法で測定することができる。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体の活性は、以下の方法で測定することができる。
(1)結合活性
抗体の結合活性は公知の方法、例えば、ELISA(酵素結合免疫吸着検定法)、EIA(酵素免疫測定法)、RIA(放射免疫測定法)、蛍光抗体法、FACS法などで、測定することができる。
抗体の結合活性は公知の方法、例えば、ELISA(酵素結合免疫吸着検定法)、EIA(酵素免疫測定法)、RIA(放射免疫測定法)、蛍光抗体法、FACS法などで、測定することができる。
(2)ADCC活性
ADCC活性とは、標的細胞の細胞表面抗原に本発明に係る抗ポドプラニン抗体が結合した際、そのFc部分にFcγ受容体保有細胞(エフェクター細胞)がFcγ受容体を介して結合し、標的細胞に障害を与える活性を意味する。
ADCC活性は、ポドプラニンを発現している標的細胞とエフェクター細胞と本発明に係る抗ポドプラニン抗体を混合し、ADCCの程度を測定することによって知ることができる。エフェクター細胞としては、例えば、マウス脾細胞、ヒト末梢血や骨髄から分離した単球核を利用することができる。標的細胞としては、例えばポドプラニン陽性中皮腫細胞やポドプラニン陽性膠芽腫細胞を用いることができる。標的細胞をあらかじめ51Crなどで標識し、これに本発明に係る抗ポドプラニン抗体を加えてインキュベーションし、その後標的細胞に対して適切な比のエフェクター細胞を加えてインキュベーションを行う。インキュベーション後、上清を採取し、上清中の上記標識をカウントすることにより、測定することが可能である。
ADCC活性とは、標的細胞の細胞表面抗原に本発明に係る抗ポドプラニン抗体が結合した際、そのFc部分にFcγ受容体保有細胞(エフェクター細胞)がFcγ受容体を介して結合し、標的細胞に障害を与える活性を意味する。
ADCC活性は、ポドプラニンを発現している標的細胞とエフェクター細胞と本発明に係る抗ポドプラニン抗体を混合し、ADCCの程度を測定することによって知ることができる。エフェクター細胞としては、例えば、マウス脾細胞、ヒト末梢血や骨髄から分離した単球核を利用することができる。標的細胞としては、例えばポドプラニン陽性中皮腫細胞やポドプラニン陽性膠芽腫細胞を用いることができる。標的細胞をあらかじめ51Crなどで標識し、これに本発明に係る抗ポドプラニン抗体を加えてインキュベーションし、その後標的細胞に対して適切な比のエフェクター細胞を加えてインキュベーションを行う。インキュベーション後、上清を採取し、上清中の上記標識をカウントすることにより、測定することが可能である。
(3)CDC活性
CDC活性とは、補体系による細胞障害活性を意味する。
CDC活性は、ADCC活性の試験において、エフェクター細胞に代えて補体を用いることにより測定することができる。
CDC活性とは、補体系による細胞障害活性を意味する。
CDC活性は、ADCC活性の試験において、エフェクター細胞に代えて補体を用いることにより測定することができる。
(4)腫瘍増殖抑制活性
腫瘍増殖抑制活性は、腫瘍モデル動物を利用して測定することができる。例えば、マウスの皮下に腫瘍を移植し、本発明に係る抗ポドプラニン抗体を投与する。非投与群と投与群における腫瘍組織の体積を比較することにより、腫瘍増殖抑制効果を測定することができる。
なお、腫瘍増殖抑制活性は、個々の細胞の増殖を抑制する結果生じるものであっても、細胞死を誘導する結果生じるものであってもよい。
腫瘍増殖抑制活性は、腫瘍モデル動物を利用して測定することができる。例えば、マウスの皮下に腫瘍を移植し、本発明に係る抗ポドプラニン抗体を投与する。非投与群と投与群における腫瘍組織の体積を比較することにより、腫瘍増殖抑制効果を測定することができる。
なお、腫瘍増殖抑制活性は、個々の細胞の増殖を抑制する結果生じるものであっても、細胞死を誘導する結果生じるものであってもよい。
(医薬組成物)
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、ポドプラニンを発現する腫瘍の予防又は治療に用いてもよい。本発明に係る医薬組成物は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含み、さらに薬学的に許容できる担体や添加物を含む。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、ポドプラニンを発現する腫瘍の予防又は治療に用いてもよい。本発明に係る医薬組成物は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含み、さらに薬学的に許容できる担体や添加物を含む。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、腫瘍細胞を標的とする薬物の送達に用いてもよい。本発明に係る医薬組成物は、抗がん活性を有する物質を結合させた抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含んでいてもよく、さらに薬学的に許容できる担体や添加物を含んでいてもよい。
担体及び添加物の例としては、水、食塩水、リン酸緩衝液、デキストロース、グリセロール、エタノール等の薬学的に許容される有機溶剤、コラーゲン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、カルボキシビニルポリマー、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ポリアクリル酸ナトリウム、アルギン酸ナトリウム、水溶性デキストラン、カルボキシメチルスターチナトリウム、ぺクチン、メチルセルロース、エチルセルロース、キサンタンガム、アラビアゴム、カゼイン、寒天、ポリエチレングリコール、ジグリセリン、グリセリン、プロピレングリコール、ワセリン、パラフィン、ステアリルアルコール、ステアリン酸、ヒト血清アルブミン、マンニトール、ソルビトール、ラクトース、界面活性剤などが挙げられるが、これらに限定されない。
本発明に係る医薬組成物は、様々な形態、例えば、液剤(例えば注射剤)、分散剤、懸濁剤、錠剤、丸剤、粉末剤、坐剤などとすることができる。好ましい態様は、注射剤であり、非経口(例えば、静脈内、経皮、腹腔内、筋内)で投与することが好ましい。
本発明に係る医薬組成物は、ポドプラニンが関連する疾患、例えば、腫瘍、血栓症、動脈硬化症などの治療に有効である。
ポドプラニンが関連する腫瘍としては、脳腫瘍、中皮腫、精巣腫瘍、卵巣がん、及び扁平上皮がんなどが挙げられる。ここで、扁平上皮がんには、口腔がん、咽頭がん、喉頭がん、食道がん、肺がん、皮膚がん、子宮頸がんが含まれるがこれらに限定されない。
ポドプラニンが関連する腫瘍としては、脳腫瘍、中皮腫、精巣腫瘍、卵巣がん、及び扁平上皮がんなどが挙げられる。ここで、扁平上皮がんには、口腔がん、咽頭がん、喉頭がん、食道がん、肺がん、皮膚がん、子宮頸がんが含まれるがこれらに限定されない。
本発明は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体を治療有効量投与することを含むポドプラニンが関連する疾患の治療方法も包含する。
本明細書において、治療有効量とは、治療する疾患の一つ又は複数の症状が、それによりある程度緩和される作用物質の量を意味する。抗がん剤の場合、腫瘍サイズの低下;腫瘍の転移の阻害(遅延又は停止);腫瘍増殖の阻害(遅延又は停止)、及びがんと関連する一つ又は複数の症状の緩和、の少なくとも1つを示す量を意味する。
具体的には、本発明に係る抗ポドプラニン抗体の投与量は、例えば、0.025~50mg/kg、好ましくは0.1~50mg/kgであり、より好ましくは0.1~25mg/kg、さらに好ましくは0.1~10mg/kg又は0.1~3mg/kgとすることができるが、これに限定されない。
本明細書において、治療有効量とは、治療する疾患の一つ又は複数の症状が、それによりある程度緩和される作用物質の量を意味する。抗がん剤の場合、腫瘍サイズの低下;腫瘍の転移の阻害(遅延又は停止);腫瘍増殖の阻害(遅延又は停止)、及びがんと関連する一つ又は複数の症状の緩和、の少なくとも1つを示す量を意味する。
具体的には、本発明に係る抗ポドプラニン抗体の投与量は、例えば、0.025~50mg/kg、好ましくは0.1~50mg/kgであり、より好ましくは0.1~25mg/kg、さらに好ましくは0.1~10mg/kg又は0.1~3mg/kgとすることができるが、これに限定されない。
(マーカー、診断薬)
ポドプラニンは特定の腫瘍細胞において高発現している。本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、がん、特に脳腫瘍、中皮腫、精巣腫瘍、卵巣がん、及び各種扁平上皮がん(口腔がん、咽頭がん、喉頭がん、食道がん、肺がん、皮膚がん、子宮頸がん)などポドプラニンが高発現するがんの診断に有用である。本発明に係る抗ポドプラニン抗体が腫瘍細胞特異的に結合するので、診断に特に有用である。
本発明は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体を含むがんの診断薬、がんの診断のための本発明に係る抗ポドプラニン抗体の使用、本発明に係る抗ポドプラニン抗体を用いるがんの診断方法をも包含する。
ポドプラニンは特定の腫瘍細胞において高発現している。本発明に係る抗ポドプラニン抗体は、がん、特に脳腫瘍、中皮腫、精巣腫瘍、卵巣がん、及び各種扁平上皮がん(口腔がん、咽頭がん、喉頭がん、食道がん、肺がん、皮膚がん、子宮頸がん)などポドプラニンが高発現するがんの診断に有用である。本発明に係る抗ポドプラニン抗体が腫瘍細胞特異的に結合するので、診断に特に有用である。
本発明は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体を含むがんの診断薬、がんの診断のための本発明に係る抗ポドプラニン抗体の使用、本発明に係る抗ポドプラニン抗体を用いるがんの診断方法をも包含する。
本明細書において引用されるすべての特許文献及び非特許文献の開示は、全体として本明細書に参照により組み込まれる。
また、本明細書において、本発明に係る抗ポドプラニン抗体として記載している内容は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体を本発明に係る抗ポドプラニン抗体の抗原結合フラグメントと読み換えて理解することができる。
また、本明細書において、本発明に係る抗ポドプラニン抗体として記載している内容は、本発明に係る抗ポドプラニン抗体を本発明に係る抗ポドプラニン抗体の抗原結合フラグメントと読み換えて理解することができる。
以下、本発明を実施例及び比較例に基づいて具体的に説明するが、本発明は実施例に限定されるものではない。当業者は、本発明の意義を逸脱することなく様々な態様に本発明を変更することができ、かかる変更も本発明の範囲に含まれる。
1.新規の糖ペプチドエピトープに対する抗ポドプラニン抗体の樹立
ラットに合計4回(10日間に1回)、LN229/hPDPN細胞を1x108個ずつ免疫した。ELISA(Enzyme-linked immunosorbent assay)法により、がん細胞株から精製したリコンビナントタンパク質に反応する抗体をスクリーニングした。
選択されたがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体を、PMab-117(rat IgM, kappa)と名付けた。
ラットに合計4回(10日間に1回)、LN229/hPDPN細胞を1x108個ずつ免疫した。ELISA(Enzyme-linked immunosorbent assay)法により、がん細胞株から精製したリコンビナントタンパク質に反応する抗体をスクリーニングした。
選択されたがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体を、PMab-117(rat IgM, kappa)と名付けた。
リコンビナントタンパク質は、以下のようにして精製した。
LN229/hPDPN細胞を静置培養し、合計10 g回収する。0.5% Triton/PBS溶液を10 mL添加し、氷上で細胞をピペッティングにより可溶化した。可溶化した溶液を15,000 rpm, 30分遠心した。上清をanti-FLAG抗体(M2)のアフィニティーカラム(シグマアルドリッチ社)1 mLに加え、4℃で18時間反応させた。10 mLのPBSで3回洗浄し、0.1 mg/mLのFLAG peptide(シグマアルドリッチ社)を1 mLずつ添加し、カラムに吸着したリコンビナントタンパク質を溶出させた。OD280で吸光度を測定し、溶出したフラクションを濃縮し、最終濃度を0.1 mg/mLに調整した。
LN229/hPDPN細胞を静置培養し、合計10 g回収する。0.5% Triton/PBS溶液を10 mL添加し、氷上で細胞をピペッティングにより可溶化した。可溶化した溶液を15,000 rpm, 30分遠心した。上清をanti-FLAG抗体(M2)のアフィニティーカラム(シグマアルドリッチ社)1 mLに加え、4℃で18時間反応させた。10 mLのPBSで3回洗浄し、0.1 mg/mLのFLAG peptide(シグマアルドリッチ社)を1 mLずつ添加し、カラムに吸着したリコンビナントタンパク質を溶出させた。OD280で吸光度を測定し、溶出したフラクションを濃縮し、最終濃度を0.1 mg/mLに調整した。
ELISA法は、以下のように行った。
精製したポドプラニン1 mg/mLを96 well plate(Nunc MaxiSorp; サーモフィッシャー社)に37℃で30分固相化し、SuperBlock/PBST(サーモフィッシャー社)を用いて、37℃で30分ブロッキングを行った。同様に、マウスハイブリドーマ由来の培養上清、anti-rat IgG-HRP (ダコ社)を37℃30分の条件で順次反応させ、TMB-Ultra(サーモフィッシャー社)で発色させた。マイクロプレートリーダー(バイオラッド社)を用いて、吸光度の測定(OD655nm)を行った。
精製したポドプラニン1 mg/mLを96 well plate(Nunc MaxiSorp; サーモフィッシャー社)に37℃で30分固相化し、SuperBlock/PBST(サーモフィッシャー社)を用いて、37℃で30分ブロッキングを行った。同様に、マウスハイブリドーマ由来の培養上清、anti-rat IgG-HRP (ダコ社)を37℃30分の条件で順次反応させ、TMB-Ultra(サーモフィッシャー社)で発色させた。マイクロプレートリーダー(バイオラッド社)を用いて、吸光度の測定(OD655nm)を行った。
2.PMab-117を用いたフローサイトメトリー
抗ポドプラニン抗体(PMab-117;rat IgM, kappa)のポドプラニン発現株に対する反応性をフローサイトメトリーにて調べた。まず、ヒトポドプラニンを発現した各種細胞株に、PMab-117(培養上清)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)を4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみを用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図2に示す。
PMab-117は、膠芽腫(LN319)や肺がん(PC-10)などのがん細胞上のポドプラニンに高反応性を示したが、腎上皮細胞(HEK-293T)には全く反応しなかった。一方、抗ポドプラニン抗体のNZ-1抗体は、LN319やPC-10だけでなく、HEK-293Tにも高い反応性を示した。この結果から、PMab-117はがん細胞特異的であることが示された。
抗ポドプラニン抗体(PMab-117;rat IgM, kappa)のポドプラニン発現株に対する反応性をフローサイトメトリーにて調べた。まず、ヒトポドプラニンを発現した各種細胞株に、PMab-117(培養上清)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)を4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみを用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図2に示す。
PMab-117は、膠芽腫(LN319)や肺がん(PC-10)などのがん細胞上のポドプラニンに高反応性を示したが、腎上皮細胞(HEK-293T)には全く反応しなかった。一方、抗ポドプラニン抗体のNZ-1抗体は、LN319やPC-10だけでなく、HEK-293Tにも高い反応性を示した。この結果から、PMab-117はがん細胞特異的であることが示された。
3.ヒトキメラ型PMab-117(chPMab-117)の作製と、アミノ酸配列及び抗体遺伝子の塩基配列の決定
抗ポドプラニン抗体(PMab-117;rat IgM, kappa)のハイブリドーマ細胞1×106個からQIAGEN RNeasy mini kit(キアゲン社)を使用してトータルRNAを抽出した。トータルRNA 1μgからSuperScript III First-Strand Syntheses kit(サーモフィッシャー社)を使用してcDNA合成を行った。以下の実験では、cDNAを鋳型として使用した。
ヒトキメラ型PMab-117(chPMab-117)を作製するために、PMab-117のVH領域をコードするDNAをPCRで増幅し、ヒトIgG1のCH1、ヒンジ領域、CH2、CH3領域をコードするDNAを保持したpCAGベクターに組み込んだ(pCAG-CHhG1/PMab-117HVH(G418))。また、PMab-117のVL領域をコードするDNAをPCRで増幅し、ヒトkappa鎖のCK領域をコードするDNAを保持したpCAGベクターに組み込んだ(pCAG-hIgCKb/PMab-117LVL(zeocin))。
H鎖の増幅に以下のプライマーを使用した。
InF.HindIII-chP117H:CGGTATCGAT AAGCTTAGTA TGTTGGTGCT GCAG(配列番号:17)
InFr.chP117HVH-BamHI:GGCCCTTGGT GGATCCTGAA GAGACAGTGA CCAG(配列番号:18)
L鎖の増幅に以下のプライマーを使用した。
InF.HindIII-P117L:CGGTATCGATAAGCTTAAAATGAAAGTGCCTGTTAG(配列番号:19)
InFr.chP117LVL-BamHI:ATGGTGCAGCGGATCCCCGTTTTATTTCCAACTTC(配列番号:20)
PCR反応にはQIAGEN HotStar HiFidelity Polymerase Kit(キアゲン社)を使用した。温度条件は、最初に95℃5分、次に94℃15秒、50℃1分、72℃1分を35サイクル、最後に72℃10分とした。増幅したPCR産物はQIAGEN PCR purification kitにて精製し、ベクタープライマーから塩基配列の決定を行った。
塩基配列からアミノ酸配列を予測した。chPMab-117の重鎖DNA配列、軽鎖DNA配列、重鎖アミノ酸配列及び軽鎖アミノ酸配列、を、配列番号:13、14、8及び9として、図3~図6に示す。
<PMab-117のCDR>
PMab-117の重鎖CDR1~3及び軽鎖CDR1~3のアミノ酸配列は、配列番号:2~7のとおりであった。
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7);
抗ポドプラニン抗体(PMab-117;rat IgM, kappa)のハイブリドーマ細胞1×106個からQIAGEN RNeasy mini kit(キアゲン社)を使用してトータルRNAを抽出した。トータルRNA 1μgからSuperScript III First-Strand Syntheses kit(サーモフィッシャー社)を使用してcDNA合成を行った。以下の実験では、cDNAを鋳型として使用した。
ヒトキメラ型PMab-117(chPMab-117)を作製するために、PMab-117のVH領域をコードするDNAをPCRで増幅し、ヒトIgG1のCH1、ヒンジ領域、CH2、CH3領域をコードするDNAを保持したpCAGベクターに組み込んだ(pCAG-CHhG1/PMab-117HVH(G418))。また、PMab-117のVL領域をコードするDNAをPCRで増幅し、ヒトkappa鎖のCK領域をコードするDNAを保持したpCAGベクターに組み込んだ(pCAG-hIgCKb/PMab-117LVL(zeocin))。
H鎖の増幅に以下のプライマーを使用した。
InF.HindIII-chP117H:CGGTATCGAT AAGCTTAGTA TGTTGGTGCT GCAG(配列番号:17)
InFr.chP117HVH-BamHI:GGCCCTTGGT GGATCCTGAA GAGACAGTGA CCAG(配列番号:18)
L鎖の増幅に以下のプライマーを使用した。
InF.HindIII-P117L:CGGTATCGATAAGCTTAAAATGAAAGTGCCTGTTAG(配列番号:19)
InFr.chP117LVL-BamHI:ATGGTGCAGCGGATCCCCGTTTTATTTCCAACTTC(配列番号:20)
PCR反応にはQIAGEN HotStar HiFidelity Polymerase Kit(キアゲン社)を使用した。温度条件は、最初に95℃5分、次に94℃15秒、50℃1分、72℃1分を35サイクル、最後に72℃10分とした。増幅したPCR産物はQIAGEN PCR purification kitにて精製し、ベクタープライマーから塩基配列の決定を行った。
塩基配列からアミノ酸配列を予測した。chPMab-117の重鎖DNA配列、軽鎖DNA配列、重鎖アミノ酸配列及び軽鎖アミノ酸配列、を、配列番号:13、14、8及び9として、図3~図6に示す。
<PMab-117のCDR>
PMab-117の重鎖CDR1~3及び軽鎖CDR1~3のアミノ酸配列は、配列番号:2~7のとおりであった。
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7);
4.chPMab-117によるフローサイトメトリー
ヒトキメラ型PMab-117(chPMab-117)のポドプラニン発現株に対する反応性をフローサイトメトリーにて調べた。まず、ヒトポドプラニンを発現した各種細胞株に、chPMab-117(10 μg/mL)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)、抗human IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)をそれぞれ4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみを用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図7に示す。
chPMab-117は、膠芽腫(LN319)や肺がん(PC-10)などのがん細胞上のポドプラニンに高反応性を示したが、ポドプラニン強発現の腎上皮細胞(HEK-293T)には全く反応しなかった。PMab-117の結果(図2)と同様に、chPMab-117ががん特異的抗体であることが示された。
ヒトキメラ型PMab-117(chPMab-117)のポドプラニン発現株に対する反応性をフローサイトメトリーにて調べた。まず、ヒトポドプラニンを発現した各種細胞株に、chPMab-117(10 μg/mL)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)、抗human IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)をそれぞれ4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみを用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図7に示す。
chPMab-117は、膠芽腫(LN319)や肺がん(PC-10)などのがん細胞上のポドプラニンに高反応性を示したが、ポドプラニン強発現の腎上皮細胞(HEK-293T)には全く反応しなかった。PMab-117の結果(図2)と同様に、chPMab-117ががん特異的抗体であることが示された。
5.マウスキメラ型PMab-117(chPMab117-mG2a)の作製
PMab-117のH鎖とL鎖の可変領域をマウスIgG2aの定常領域をpCAGベクター(インビボージェン社)に組み込み、マウスキメラ型PMab-117(chPMab117-mG2a)の発現プラスミドを作製した。
H鎖の増幅に以下のプライマーを使用した。
InF.HindIII-chP117H:CGGTATCGAT AAGCTTAGTA TGTTGGTGCT GCAG(配列番号:17)
InFr.P117HVH-mG2a:GGCTGTTGTT TTGGCTGAAG AGACAGTGAC CAGA(配列番号:21)
L鎖の増幅に以下のプライマーを使用した。
InF.HindIII-P117L:CGGTATCGATAAGCTTAAAATGAAAGTGCCTGTTAG(配列番号:19)
InF.mIgCKter-NotI:TCTAGAGTCG CGGCCGCCTA ACACTCATTC CTGT(配列番号:22)
PMab-117のH鎖とL鎖の可変領域をマウスIgG2aの定常領域をpCAGベクター(インビボージェン社)に組み込み、マウスキメラ型PMab-117(chPMab117-mG2a)の発現プラスミドを作製した。
H鎖の増幅に以下のプライマーを使用した。
InF.HindIII-chP117H:CGGTATCGAT AAGCTTAGTA TGTTGGTGCT GCAG(配列番号:17)
InFr.P117HVH-mG2a:GGCTGTTGTT TTGGCTGAAG AGACAGTGAC CAGA(配列番号:21)
L鎖の増幅に以下のプライマーを使用した。
InF.HindIII-P117L:CGGTATCGATAAGCTTAAAATGAAAGTGCCTGTTAG(配列番号:19)
InF.mIgCKter-NotI:TCTAGAGTCG CGGCCGCCTA ACACTCATTC CTGT(配列番号:22)
chPMab117-mG2aの重鎖DNA配列、軽鎖DNA配列、重鎖アミノ酸配列及び軽鎖アミノ酸配列を、配列番号:15、16、10及び11として、図8~図11に示す。
6.chPMab117-mG2aによるフローサイトメトリー
ExpiCHO細胞株(サーモフィッシャー社)にリポフェクション法によりchPMab117-mG2aのH鎖、L鎖のプラスミドを導入し、培養上清中にchPMab117-mG2aのリコンビナント抗体を発現させた。培養上清を遺伝子導入から2日後に回収し、4℃で30分、LN319細胞と反応させ、さらに抗mouse IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)を4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして、二次抗体のみを用いた。
蛍光強度をCell Analyzer EC800(Sony社)で測定した。結果を図12に示す。
chPMab117-mG2aは、chPMab117と同様に、膠芽腫細胞(LN319)のポドプラニンに高反応性を示した。
ExpiCHO細胞株(サーモフィッシャー社)にリポフェクション法によりchPMab117-mG2aのH鎖、L鎖のプラスミドを導入し、培養上清中にchPMab117-mG2aのリコンビナント抗体を発現させた。培養上清を遺伝子導入から2日後に回収し、4℃で30分、LN319細胞と反応させ、さらに抗mouse IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)を4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして、二次抗体のみを用いた。
蛍光強度をCell Analyzer EC800(Sony社)で測定した。結果を図12に示す。
chPMab117-mG2aは、chPMab117と同様に、膠芽腫細胞(LN319)のポドプラニンに高反応性を示した。
7.PMab-117のエピトープ解析?1
PMab-117はがん特異的抗体(CasMab)であることが分かったため、その認識配列(エピトープ)の解析を行った。
ヒトポドプラニンのN末deletion mutantは以下の通りである。
dN23:N末が23番目のアミノ酸の完全長のポドプラニン
dN37:N末が37番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN46:N末が46番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN55:N末が55番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN65:N末が65番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN75:N末が75番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN85:N末が85番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN95:N末が95番目のアミノ酸のdeletion mutant
これらのdeletion mutantに、PMab-117(培養上清)、chPMab-117(10 μg/mL)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)、抗human IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)をそれぞれ4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみを用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図13及び図14に示す。
dN85(N末が85番目のアミノ酸のdeletion mutant)で反応性が消失したことから、PMab-117のエピトープのN末が、75番目~85番目の間から開始することが分かった。
PMab-117はがん特異的抗体(CasMab)であることが分かったため、その認識配列(エピトープ)の解析を行った。
ヒトポドプラニンのN末deletion mutantは以下の通りである。
dN23:N末が23番目のアミノ酸の完全長のポドプラニン
dN37:N末が37番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN46:N末が46番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN55:N末が55番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN65:N末が65番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN75:N末が75番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN85:N末が85番目のアミノ酸のdeletion mutant
dN95:N末が95番目のアミノ酸のdeletion mutant
これらのdeletion mutantに、PMab-117(培養上清)、chPMab-117(10 μg/mL)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)、抗human IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)をそれぞれ4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみを用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図13及び図14に示す。
dN85(N末が85番目のアミノ酸のdeletion mutant)で反応性が消失したことから、PMab-117のエピトープのN末が、75番目~85番目の間から開始することが分かった。
8.PMab-117のエピトープ解析?2
ヒトポドプラニンの各種糖鎖不全株に、PMab-117(培養上清)、chPMab-117(10 μg/mL)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)、抗human IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)をそれぞれ4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみを用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図15に示す。
ヒトポドプラニンのシアル酸欠損株やガラクトース欠損株に対する反応が消失したことから、PMab-117のエピトープには、O型糖鎖に付加したシアル酸が含まれることが分かった。
ヒトポドプラニンの各種糖鎖不全株に、PMab-117(培養上清)、chPMab-117(10 μg/mL)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)、抗human IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)をそれぞれ4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみを用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図15に示す。
ヒトポドプラニンのシアル酸欠損株やガラクトース欠損株に対する反応が消失したことから、PMab-117のエピトープには、O型糖鎖に付加したシアル酸が含まれることが分かった。
9.PMab-117のエピトープ解析?3
75番目以降のすべてのSer/Thrのアラニン置換のヒトポドプラニンに、PMab-117(培養上清)、chPMab-117(10μg/ml)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)、抗human IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)をそれぞれ4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみ、ポジティブコントロールとしてNZ-12を用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図16に示す。
T85Aに対し、PMab-117の反応性が消失した。よって、PMab-117のエピトープには、Thr85が含まれていることが示された。
75番目以降のすべてのSer/Thrのアラニン置換のヒトポドプラニンに、PMab-117(培養上清)、chPMab-117(10μg/ml)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)、抗human IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)をそれぞれ4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみ、ポジティブコントロールとしてNZ-12を用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図16に示す。
T85Aに対し、PMab-117の反応性が消失した。よって、PMab-117のエピトープには、Thr85が含まれていることが示された。
10.PMab-117のエピトープ解析?4
77番目から89番目のすべてのアミノ酸のアラニン置換のヒトポドプラニンに、PMab-117(10 μg/mL)、chPMab-117(10 μg/mL)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)、抗human IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)をそれぞれ4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみ、ポジティブコントロールとしてNZ-12を用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図17に示す。
I78A, I80A, D82A, T85Aに対し、PMab-117の反応性が消失し、E81Aに対しPMab-117の反応性が減弱した。また、I78A, I80A, E81A, D82A, T85Aに対し、chPMab-117の反応性が消失した。よって、PMab-117のエピトープには、Ile78, Ile80, Glu81, Asp82, Thr85の5つのアミノ酸が含まれていることが示された。
77番目から89番目のすべてのアミノ酸のアラニン置換のヒトポドプラニンに、PMab-117(10 μg/mL)、chPMab-117(10 μg/mL)を4℃で30分反応させ、さらに抗rat IgG-Oregon Green抗体(サーモフィッシャー社)、抗human IgG-FITC抗体(サーモフィッシャー社)をそれぞれ4℃で30分反応させた。ネガティブコントロールとして二次抗体のみ、ポジティブコントロールとしてNZ-12を用いた。
蛍光強度をEC800(Sony社)で測定した。結果を図17に示す。
I78A, I80A, D82A, T85Aに対し、PMab-117の反応性が消失し、E81Aに対しPMab-117の反応性が減弱した。また、I78A, I80A, E81A, D82A, T85Aに対し、chPMab-117の反応性が消失した。よって、PMab-117のエピトープには、Ile78, Ile80, Glu81, Asp82, Thr85の5つのアミノ酸が含まれていることが示された。
図15により、PMab-117のエピトープにはシアル酸を含むO型糖鎖が含まれており、さらに、図16により、ヒトポドプラニンのThr85がPMab-117のエピトープに含まれていることから、PMab-117のエピトープにはシアル酸を含むO型糖鎖が付加されたThr85が必須であることが示された。さらに、Thr85周辺のアミノ酸をアラニンに置換し、PMab-117, chPMab-117, NZ-12の反応性を調べた。図17により、Ile78, Ile80, Glu81, Asp82, Thr85の5つのアミノ酸が、PMab-117のエピトープとして特に重要であることが判明した。
以上より、ヒトポドプラニンのThr85を含む糖ペプチドが、がん特異性を示す重要な標的であることが分かった。
以上より、ヒトポドプラニンのThr85を含む糖ペプチドが、がん特異性を示す重要な標的であることが分かった。
本発明に係る抗ポドプラニン抗体及びその抗原結合フラグメントは、医薬、診断薬及び試薬として有用であり、産業上の利用可能性を有する。
配列番号:1 ヒトポドプラニンのアミノ酸配列を示す。
配列番号:2 PMab-117の重鎖CDR1のアミノ酸配列を示す。
配列番号:3 PMab-117の重鎖CDR2のアミノ酸配列を示す。
配列番号:4 PMab-117の重鎖CDR3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:5 PMab-117の軽鎖CDR1のアミノ酸配列を示す。
配列番号:6 PMab-117の軽鎖CDR2のアミノ酸配列を示す。
配列番号:7 PMab-117の軽鎖CDR3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:8 chPMab-117の重鎖アミノ酸配列を示す。
配列番号:9 chPMab-117の軽鎖アミノ酸配列を示す。
配列番号:10 chPMab117-mG2aの重鎖アミノ酸配列を示す。
配列番号:11 chPMab117-mG2aの軽鎖アミノ酸配列を示す。
配列番号:12 配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列の78番目から85番目の領域に相当するアミノ酸配列を示す。
配列番号:13 chPMab-117の重鎖DNA配列を示す。
配列番号:14 chPMab-117の軽鎖DNA配列を示す。
配列番号:15 chPMab117-mG2aの重鎖DNA配列を示す。
配列番号:16 chPMab117-mG2aの軽鎖DNA配列を示す。
配列番号:17 H鎖の増幅に使用したプライマーInF.HindIII-chP117Hを示す。
配列番号:18 H鎖の増幅に使用したプライマーInFr.chP117HVH-BamHIを示す。
配列番号:19 L鎖の増幅に使用したプライマーInF.HindIII-P117Lを示す。
配列場号:20 L鎖の増幅に使用したプライマーInFr.chP117LVL-BamHIを示す。
配列番号:21 H鎖の増幅に使用したプライマーInFr.P117HVH-mG2aを示す。
配列番号:22 L鎖の増幅に使用したプライマーInF.mIgCKter-NotIを示す。
配列番号:2 PMab-117の重鎖CDR1のアミノ酸配列を示す。
配列番号:3 PMab-117の重鎖CDR2のアミノ酸配列を示す。
配列番号:4 PMab-117の重鎖CDR3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:5 PMab-117の軽鎖CDR1のアミノ酸配列を示す。
配列番号:6 PMab-117の軽鎖CDR2のアミノ酸配列を示す。
配列番号:7 PMab-117の軽鎖CDR3のアミノ酸配列を示す。
配列番号:8 chPMab-117の重鎖アミノ酸配列を示す。
配列番号:9 chPMab-117の軽鎖アミノ酸配列を示す。
配列番号:10 chPMab117-mG2aの重鎖アミノ酸配列を示す。
配列番号:11 chPMab117-mG2aの軽鎖アミノ酸配列を示す。
配列番号:12 配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列の78番目から85番目の領域に相当するアミノ酸配列を示す。
配列番号:13 chPMab-117の重鎖DNA配列を示す。
配列番号:14 chPMab-117の軽鎖DNA配列を示す。
配列番号:15 chPMab117-mG2aの重鎖DNA配列を示す。
配列番号:16 chPMab117-mG2aの軽鎖DNA配列を示す。
配列番号:17 H鎖の増幅に使用したプライマーInF.HindIII-chP117Hを示す。
配列番号:18 H鎖の増幅に使用したプライマーInFr.chP117HVH-BamHIを示す。
配列番号:19 L鎖の増幅に使用したプライマーInF.HindIII-P117Lを示す。
配列場号:20 L鎖の増幅に使用したプライマーInFr.chP117LVL-BamHIを示す。
配列番号:21 H鎖の増幅に使用したプライマーInFr.P117HVH-mG2aを示す。
配列番号:22 L鎖の増幅に使用したプライマーInF.mIgCKter-NotIを示す。
Claims (13)
- 配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列におけるThr85を含む領域にエピトープを有し、Thr85はシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
- 配列番号:1で表されるヒトポドプラニンのアミノ酸配列における78番目から85番目の領域(IRIEDLPT)にエピトープを有する、請求項1に記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
- 以下の6つのCDRのアミノ酸配列を少なくとも1つ有するか、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列において1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を少なくとも1つ有するか、
以下の6つのCDRのアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を少なくとも1つ有する、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント:
重鎖CDR1:GFTFSNAAMY(配列番号:2)
重鎖CDR2:RIRSKPNNYATYYTDSVKG(配列番号:3)
重鎖CDR3:TVGGNNYAAAY(配列番号:4)
軽鎖CDR1:RSSQSLVHSNGNTYLE(配列番号:5)
軽鎖CDR2:KVSNRFS(配列番号:6)
軽鎖CDR3:FQVTHDPFT(配列番号:7)。 - 配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:8又は10で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列を含む軽鎖;
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸の付加、置換、又は欠失を含むアミノ酸配列を含む軽鎖;又は、
配列番号:9又は11で表されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖、
を含む、がん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。 - Fc領域に1以上のN型糖鎖が結合し、該N型糖鎖の還元末端のN-アセチルグルコサミンにフコースが結合していない、請求項1から4のいずれか1項に記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメント。
- 請求項3又は4に記載のアミノ酸配列のいずれか1つをコードする核酸。
- 請求項6に記載の核酸を含む発現ベクター。
- 請求項7に記載の発現ベクターを含む形質転換体。
- 請求項1から5のいずれか1項に記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含む医薬組成物。
- 抗がん活性を有する物質を結合させた請求項1から5のいずれか1項に記載のがん細胞特異的抗ポドプラニン抗体又はその抗原結合フラグメントを有効成分として含む医薬組成物。
- 腫瘍の予防又は治療剤である、請求項9又は10に記載の医薬組成物。
- 配列番号:1で表されるアミノ酸配列を有し、Thr85にシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、ヒトポドプラニン。
- 以下のアミノ酸配列を有し、
IRIEDLPT
Thrにシアル酸含有O型糖鎖が付加されている、糖ペプチド。
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