TWI724393B - 抗糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(gitr)的小型化抗體、其聚合物及應用 - Google Patents

抗糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(gitr)的小型化抗體、其聚合物及應用 Download PDF

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Abstract

本發明提供特異性結合糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(GITR)的抗體、抗體片段及其聚合物,以及含有該抗體或抗體片段的綴合物和融合物。本發明還提供編碼這些抗體、抗體片段、聚合物、綴合物和融合物的核酸;載體和表達該核酸的宿主細胞。此外,本發明還提供一種包含這些抗體及其抗體片段、聚合物、綴合物或融合物的組合物,及其在治療和診斷中的用途。

Description

抗糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(GITR)的小型化抗體、其聚合物及應用 相關申請的交叉引用
本申請要求於2018年3月26日遞交的中國專利申請第201810255332.2號優先權,在此全文引用上述中國專利申請公開的內容以作為本申請的一部分。
本發明涉及抗體領域。本發明尤其涉及特異性結合糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(GITR)的抗體(包括小型化抗體)、抗體片段及其聚合物,以及含有該抗體或抗體片段的綴合物和融合物。本發明還涉及編碼這些抗體、抗體片段、聚合物、綴合物和融合物的核酸;載體和表達該核酸的宿主細胞。此外,本發明也涉及包含這些抗體及其抗體片段、聚合物、免疫綴合物或融合物的產品,及在治療和診斷中的應用。
糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(glucocorticoid induced tumor necrosis factor receptor,GITR,亦稱作TNFRSF18、活化誘導型腫瘤壞死因子受體(TNFR)家族成員(AITR)、CD357及GITR-D),是腫瘤壞死因子受體(tumor necrosis factor receptor,TNFR)超家族的第18個成員。GITR由其同源配體,GITR配體(GITRL)活化,可結合NFkB二聚體,激活下游的NFkB信號通路。
GITR在應答靜息T細胞中低水平表達;當T細胞活化後,其表達水平顯著上調。GITR在調節性T細胞(Treg,如CD4+CD25+或CD8+CD25+細胞)中高水平組成型表達,並且當這些細胞被活化時,表達水平進一步上調(Nocentini和Riccardi(2005)E.J.Immunol.35:1016-1022)。GITR表達不限於T細胞,已報導,GITR在NK細胞、巨噬細胞、B細胞、樹突狀細胞、肥大細胞及單核細胞上也表達(Nocentini和Riccardi(2005)E.J.Immunol.35:1016-1022)。
GITR配體(GITRL)主要在抗原遞呈細胞(APC,包括巨噬細胞、B細胞、樹突狀細胞及內皮細胞)上表達。APC上的GITRL與應答T細胞上GITR的結合觸發GITR信號傳導,共刺激應答T細胞並抑制Treg細胞的抑制活性。由此,GITR對效應T細胞和調節性T細胞具有若干作用,包括:共刺激和活化效應T細胞,使T細胞對抑制更具抗性、抑制調節性T細胞、降低效應T細胞對由調節性T細胞引起的抑制的敏感性等(Nocentini等(2007)Eur.J.Immunol.37:1165-1169)。
這些作用意味著GITR活化可以導致免疫應答的增強,增加對腫瘤和病毒感染等的抗性。因此,能夠活化GITR的物質可以增強需要的免疫反應(例如,抗腫瘤、治療病毒感染),誘導或增強個體中的免疫應答,治療免疫障礙和增生性障礙(例如腫瘤和癌症)等。
目前,現有技術中能夠活化GITR的物質主要是標準結構的抗GITR抗體(參見CN103951753A、CN105829343A、CN106459203A、WO2016196792A1、WO2017068186A9等)。這樣的抗體是GITR的激動劑(即,是激活型抗體),可誘導或增強GITR信號傳導,在治療需要增強免疫應答的多種GITR相關疾病或病症中是有效的。由於這樣的抗GITR抗體是激活型抗體,故相對於其與抗原的結合親和力,其激活活性的高低是其發揮活性(例如。免疫增強活性)更為關鍵的指標。
但是,上述標準結構的抗GITR抗體具有標準結構抗體的一些固有缺陷:生產成本高、製備週期長、製備工序複雜、體積大(組織滲透性差)、穩定性差、不同批次之間差異較大等,大大限制了其應用範圍。
同時,包括單鏈抗體(single-chain variable fragment,scFv)、單域抗體(single-domain antibody,sdAd)、重鏈抗體(heavy-chain antibody,hcAb)、奈米抗體(nanobody,Nb或variable domain of heavy chain of heavy-chain antibody,VHH)、小型的類抗體支架蛋白(如Affibody、DARPins等)等小型化抗體由於克服了標準結構抗體的一些固有缺陷,其研發已引起生物技術應用領域的廣泛關注,近年得以快速發展。
這類小型化抗體中的單域抗體和重鏈抗體沒有輕鏈,具有的單一重鏈可變區保留了完整的抗原結合活性,具有分子小、穩定性高、體內組織滲透性好、可溶性好、熔解溫度高、易表達等的特性。
例如,這類小型化抗體中的奈米抗體具有如下優點:
1. 由於具有獨特的結構,由此具有有益的抗原結合特性:奈米抗體較長的CDR3(互補決定區3),可形成穩定暴露的凸環結構(凸環中具有穩定結構的二硫鍵),能夠深入抗原內部,從而更好地結合抗原,提高其抗原特異性和親和力。而傳統抗體Fab片段及單鏈抗體scFv的抗原結合表 面常形成凹形拓撲結構,通常只能識別位於抗原表面的位點。因此,奈米抗體具有更有益的抗原結合性能,甚至當抗原蛋白緊密包裹,隱藏了普通抗體無法識別的表位時,奈米抗體也可以識別這樣的表位。
2. 當單獨表達標準結構抗體的VH結構域時,表達出的VH結構域通常形成包涵體,或者暴露的疏水域相互黏附。而奈米抗體由於其FR2區域中的疏水殘基被親水殘基所取代,使得奈米抗體的可溶性非常好,聚合性減少,在普通緩衝液中可輕易被濃縮到10mg/mL而不出現積聚。並且由於奈米抗體具有可逆重折疊性質,在高溫(80~92℃)和高濃度變性劑作用下仍保持抗原結合活性,即使以包涵體形式表達,也很容易複性,使奈米抗體在層析或無菌處理時的短暫變性中,或在污染或有機溶劑等不良環境中,仍能出色地長期維持生物學活性,大大提高奈米抗體作為藥物的利用率。
3. 因為分子量小、結構簡單,且由單一的基因編碼,奈米抗體很容易在微生物中合成,能在價格低廉的噬菌體、酵母等微生物中大量表達,進行大規模生產。據報道,可藉由酵母反應器將奈米抗體的產量提高至1克/升的產量。
同時,由於奈米抗體僅僅具有一個重鏈可變區,不存在配對問題,由此其篩選過程更為簡便,常常僅僅需要文庫即可。
4. 奈米抗體由於分子很小,組織滲透性強,可以穿透或轉移進入血腦屏障,也可以快速經腎臟濾過(腎臟截留值約60kDa),血液中半壽期約2小時,表位靶向唯一,是優異的治療載體。
5. 與sdAb、scFv等相比,奈米抗體也具有如下突出優點:結構更簡單,易與受體結合、可以識別嵌入配體溝槽或夾在兩個亞基之間的隱藏抗原表位,而且相對分子量更小,免疫原性更低、積聚沉澱趨勢更低、生物 分散性更好,更易表達(原核或真核系統中高表達)、可溶性更好、穩定性更強,在極端pH、高濃度變性劑或高溫等不利理化環境條件下更穩定,保質期長,可以口服或呼吸道給藥等;同時不易如單鏈抗體(scFv)那樣容易相互粘連,甚至聚集成塊。
由奈米抗體製成的檢測試劑盒甚至可以直接儲存在室溫下,不用冷藏保存,減少巨大的冷藏費用。
結合上述能夠活化GITR的物質的諸多作用和優點,本領域存在製備能夠活化GITR的小型化抗體的需要,例如能夠活化GITR的奈米抗體的需要,以便更好地誘導或增強個體中的免疫應答,治療免疫障礙和增生性障礙(例如腫瘤和癌症)。
如上所述,標準結構的抗GITR抗體具有如篩選流程複雜、組織滲透性差、生產成本高等不足之處,故開發抗GITR的小型化抗體可以很好地彌補這些不足,具有諸多其他優點,同時還能實現抗GITR抗體的性能。
然而,並不是簡單地將已知標準結構抗體的重鏈可變區分離,就可以獲得相應的VHH。因為如上所述,VHH中CDR1-3的胺基酸序列和長度,特別是CDR3的胺基酸選擇和長度與標準結構抗體中對應的HCDR1-3(例如HCDR3)不同,結構也不同,需要進行精心地設計和大量的篩選工作才能獲得。
本發明的目的是提供一種分離的特異性結合糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(GITR)的抗體或其抗原結合片段(簡稱“本發明的抗體或其抗原結合片段”),其具有以下一種或多種特性:(i)以高親和力與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合;(ii)以低解離常數與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合;(iii)與細胞表面的抗原高親和力結合;(iv)高效激活GITR下游的NFkB信號通路;(v)與GITRL交叉競爭結合至GITR;(vi)可以內化到人CD4細胞中;(vii)抑制調節性T細胞的抑制作用;(viii)活化效應T細胞;(ix)減少循環調節性T細胞;(x)能夠結合Fcγ受體(FcγR);和(xi)在人血清中具有至少6、7、9或12天的半衰期。
本發明的另一目的是提供一種奈米抗體(簡稱“本發明的奈米抗體”),其中的HCDR3(重鏈互補決定區3)包含本發明的抗體或其抗原結合片段的HCDR3。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR1(重鏈互補決定區1)和HCDR2(重鏈互補決定區2)分別包含本發明的抗體或其抗原結合片段的HCDR1和HCDR2。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR1、HCDR2和HCDR3分別包含本發明的抗體或其抗原結合片段的HCDR1、HCDR2和HCDR3。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體僅包含如SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列或其變體,或本發明的奈米抗體僅由SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列或其變體組成。
本發明的另一目的是提供一種重鏈抗體(簡稱“本發明的重鏈抗體”),包含本發明的奈米抗體和IgG抗體的Fc片段。
本發明的另一目的是提供一種人源化重鏈抗體(簡稱“本發明的人源化重鏈抗體”),其改造自本發明的重鏈抗體。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體是全人源重鏈抗體。
本發明的另一目的是提供一種多聚物形式的抗體(簡稱“本發明的多聚物形式的抗體”),是本發明的奈米抗體、本發明的重鏈抗體的重鏈可變區或本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區的多聚物形式。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體是本發明的奈米抗體、本發明的重鏈抗體的重鏈可變區或本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區的四聚化形式或六聚化形式,較佳是本發明的奈米抗體、本發明的重鏈抗體的重鏈可變區或本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區的四聚化形式。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體由本發明的奈米抗體、本發明的重鏈抗體的重鏈可變區或本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區連接到本發明的重鏈抗體(較佳連接到本發明的人源化重鏈抗體)形成的新的結構聚合而成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體由本發明的奈米抗體、本發明的重鏈抗體的重鏈可變區或本發明的人源化重鏈抗體的 重鏈可變區連接到本發明的重鏈抗體的C末端形成的新的結構聚合而成;或者由本發明的奈米抗體、本發明的重鏈抗體的重鏈可變區或本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區連接到本發明的重鏈抗體(較佳連接到本發明的人源化重鏈抗體)的N末端形成的新的結構聚合而成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體中,本發明奈米抗體、本發明的重鏈抗體的重鏈可變區或本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區藉由連接肽連接到本發明的重鏈抗體(較佳連接到本發明的人源化重鏈抗體)。
本發明的另一目的是提供一種包含本發明的抗體的融合蛋白、免疫綴合物、組合物或試劑盒。
本發明的另一目的是提供一種編碼本發明的抗體的分離的核酸;包含該核酸的載體;包含該載體的宿主細胞;包含這些核酸、載體或宿主細胞中的一個或多個的藥物組合物。
本發明的另一目的是提供一種製備本發明的抗體或其抗原結合片段、本發明的融合蛋白、本發明的免疫綴合物或組合物(包括藥物組合物)的方法。
本發明的另一目的是提供一種檢測樣品中GITR的存在的方法,包括使用本發明的抗體或其抗原結合片段。
本發明的另一目的是提供一種治療癌症,誘導或增強個體中的免疫應答,和/或刺激抗原特異性T細胞應答的方法,其特徵在於包括向所需個體施用有效量的本發明的抗體或其抗原結合片段、本發明的融合蛋白或本發明的免疫綴合物。
與現有技術中已有的標準結構抗GITR抗體相比,本發明的抗體不但具有篩選流程簡便、組織滲透性好、生產成本低等優點;且相對 於直接獲自標準結構抗GITR抗體的單鏈抗體、單域抗體、重鏈抗體等,不再具有容易形成包涵體或者容易相互黏附的缺點。進一步,本發明的發明人令人驚訝地發現,本發明的抗體對GITR是高度特異性的,且不會干擾其他受體的活性,能夠以相對低劑量刺激GITR信號傳遞;同時,本發明的抗體能夠高效激活GITR下游的NFkB信號通路,產生有益的抗免疫疾病/障礙和抗增生性疾病/障礙的效果。
在下面的圖式和具體實施方案中進一步說明本發明。然而,這些圖式和具體實施方案不應被認為限制本發明的範圍,並且本領域技術人員容易想到的改變將包括在本發明的精神和所附申請專利範圍的保護範圍內。
第1圖為奈米抗體噬菌體文庫構建流程示意圖。
第2圖為SEC檢測純化後的hcIgG的純度結果圖。
第3圖為hcIgG和細胞表面GITR蛋白的結合情況檢測結果圖。
第4圖為hcIgG引起的ADCC作用圖。
第5圖為HzhcIgG和細胞表面GITR蛋白的結合情況檢測結果圖。
第6圖為人源化後的hcIgG對GITR下游的NFkB信號通路的激活作用圖。
第7圖為4xNb-IgG的結構示意圖。
第8圖為SEC檢測純化後的4xNb-IgG的純度結果圖。
第9圖為4xNb-IgG對GITR下游的NFkB信號通路的激活作用圖。
第10圖為抗GITR抗體(4xNb-IgG)本身,或與抗PD-1抗體聯合使用在MC38移植瘤模型中對腫瘤的抑制作用圖。
以下結合實施例對本發明進行詳細描述。所用的所有實驗試劑和儀器設備,如無特別說明均為普通市售試劑和設備。
1. 定義
除非本文中另外定義,否則本文中所用的所有術語均具有本領域普通技術人員通常理解的含義。此外,除非上下文另外要求,否則單數術語將包括複數術語且複數術語將包括單數術語。為了更好地解釋和理解本發明,下面具體定義一些本文中使用的術語。
如本文所用,術語“約”在與數字數值聯合使用時,意為涵蓋比指定數字數值小5%的下限和比指定數字數值大5%的上限的範圍內的數字數值。
如本文所用,術語“和/或”意指可選項中的任一項或可選項的兩項。
如本文所用,術語“包含”或“包括”意指包括所述的要素、整數或步驟,但是不排除任意其他要素、整數或步驟。在本文中,當使用術語“包含”或“包括”時,除非另有指明,否則也涵蓋由所述及的要素、整數或步驟組合的情形。例如,當提及“包含”某個具體序列的抗體可變區時,也旨在涵蓋由該具體序列組成的抗體可變區。
如本文所用,術語“GITR”是指“糖皮質激素誘導的TNF相關基因和/或多肽”,在本領域中也稱為TNF受體超家族18(TNFRSF18)。人和鼠形式的GITR的胺基酸和核酸序列描述於WO98/06842中,其以引用的方式併入本文。也參見GenBank登記號Q9Y5U5(人胺基酸序列)和AF109216(鼠核酸和胺基酸序列)。一個特定成熟人GITR多肽的胺基酸序列陳述於SEQ ID NO:123中。如本文所用的術語GITR也包括其天然存在的等位基因或變體。
如本文所用,術語“抗原結合分子”、“抗原結合蛋白”與“抗體”在本文中可以互換使用,均指包含能夠與靶抗原結合的抗原結合區或抗原結合部分的分子,例如蛋白質或多肽。在本發明中,當靶抗原是糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(GITR)時,結合GITR的抗原結合分子也稱作GITR結合分子、GITR抗體或抗GITR抗體。抗原結合分子包括例如抗體及其抗原結合片段、單鏈抗體(scFv)、單域抗體(sdAd)、重鏈抗體(hcAb)、奈米抗體(Nb或VHH);或這些抗體的多聚物形式、基於這些抗體的各種融合物和綴合物、免疫綴合物、抗體藥物偶聯物(ADC)、多/雙特異性抗體、嵌合抗原受體(CAR)等。如本領域技術人員所知,抗體的抗原結合部分通常包含來自“互補決定區”或“CDR”的胺基酸殘基。因此,在本發明中術語“GITR結合分子”與“本發明的抗體”、“GITR抗體”或“抗GITR抗體”中的任一個可以互換使用。
如本文所用,術語“抗體”是指至少包含輕鏈或重鏈免疫球蛋白可變區的多肽(免疫球蛋白),其特異性識別並結合抗原。該術語涵蓋各種抗體結構,包括但不限於單株抗體;多特異性抗體;Fab片段、Fab’片段、F(ab’)2片段或Fv片段;雙抗體、單鏈抗體(scFv)、單域抗體(sdAd)、重鏈抗體(hcAb)、奈米抗體(Nb或VHH)或這些抗體的多聚物形式;人抗 體、人源化抗體或嵌合抗體;或經標記的抗體,只要它們呈現期望的抗原結合活性即可。
如本文所用,術語“全抗體”、“全長抗體”、“完全抗體”和“完整抗體”在本文中可互換使用,均指具有基本上與天然抗體結構相似的結構,包含至少兩條重鏈(H)和兩條輕鏈(L)。每條重鏈由重鏈可變區(本文中縮寫為VH)和重鏈恆定區(本文中縮寫為CH)組成。重鏈恆定區由3個結構域CH1、CH2和CH3組成。每條輕鏈由輕鏈可變區(本文中縮寫為VL)和輕鏈恆定區(本文中縮寫為CL)組成。輕鏈恆定區由一個結構域CL組成。恆定區不直接參與抗體與抗原的結合,但是顯示出多種效應子功能。
如本文所用,術語“可變區(V區,Fv)”和“可變結構域”在本文中可以互換使用,均指參與抗體與抗原結合的抗體重鏈或輕鏈的結構域。天然抗體的重鏈可變結構域(VH)和輕鏈可變結構域(VL)通常具有相似的結構,其中每個結構域包含四個保守的框架區(FR)和三個互補決定區(CDR,參見,例如,Kindt等Kuby Immunology,第六版,W.H.Freeman and Co.,91頁(2007))。單個VH或VL結構域可足以給予抗原結合特異性。輕鏈可變區和重鏈可變區從N-末端到C-末端通常包含結構域FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3和FR4。
在一個給定的VH或VL胺基酸序列中,各CDR的精確胺基酸序列邊界可以使用許多公知的抗體CDR指派系統的任一種或其組合確定,所述指派系統包括例如:基於抗體的三維結構和CDR環的拓撲學的Chothia(Chothia等人.(1989)Nature 342:877-883,Al-Lazikani等人,“Standard conformations for the canonical structures of immunoglobulins”,Journal of Molecular Biology,273,927-948(1997))基於抗體序列可變性的Kabat(Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第4版,U.S.Department of Health and Human Services,National Institutes of Health(1987)),AbM(University of Bath),Contact(University College London),國際ImMunoGeneTics database(IMGT)(在萬維網上imgt.cines.fr/上),以及基於利用大量晶體結構的近鄰傳播聚類(affinity propagation clustering)的North CDR定義。本發明抗體的CDR可以根據本領域的任何方案或其組合及人為評估確定邊界。
抗體的輕鏈可以基於其恆定結構域的胺基酸序列分為兩種類型kappa(κ)和lambda(λ)。抗體的重鏈可以取決於其重鏈恆定區的胺基酸序列而分為主要5種不同的類型:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,並且這些類型中的幾種可以進一步劃分成亞類,如,IgG1、IgG2、IgG3和IgG4、IgA1以及IgA2。對應於不同抗體類型的重鏈恆定區分別稱作α、δ、ε、γ和μ。參見例如Fundamental Immunology,Ch.7(Paul,W.編輯,第二版,Raven Press,N.Y.(1989))(其為所有目的以其整體在此引作參考)。
如本文所用,術語“抗體片段”和“(抗體的)抗原結合片段”在本文中可互換使用,均指並非完整抗體的分子,其包含完整抗體中用於結合該完整抗體所結合的抗原的部分,能結合抗原或與完整抗體(即與抗原結合片段所來源的完整抗體)競爭結合抗原。可以藉由重組DNA技術、或藉由酶或化學切割完整的抗體,來製備抗原結合片段。抗原結合片段包括但不限於Fab、scFab、Fab’、F(ab’)2、Fab’-SH、可變區抗體片段(Fragment of variable,Fv)、單鏈Fv、雙鏈抗體(diabody)、三鏈抗體(triabody)、四鏈抗體(tetrabody)、微抗體(minibody)、單結構域抗體(單域抗體,sdAb);以及從抗體片段形成的多特異性抗體。Fab片段是一種由VL、VH、CL和CH1結構域組成的單價片段,例如,藉由木瓜蛋白酶消化完全抗體能夠獲 得Fab片段。可以借助接頭將Fab的輕鏈(L鏈)和重鏈(H鏈)融合構建成單一多肽鏈,即單鏈Fab(scFab)(參見例如US20070274985A1)。此外,藉由胃蛋白酶在鉸鏈區的二硫鍵下面消化完全抗體可以產生F(ab’)2,其為Fab’的二聚體,是二價的抗體片段。F(ab’)2可以在中性條件下藉由破壞鉸鏈區中的二硫鍵而被還原,從F(ab’)2二聚體轉化為Fab’單體。Fab’單體基本上是具有鉸鏈區的Fab片段。Fv片段由抗體單臂的VL和VH結構域組成。
如本文所用,術語“雙鏈抗體”是具有兩個抗原結合位點的抗體片段,該片段在同一多肽鏈中包含藉由短接頭連接的VL和VH。在雙鏈抗體中,由於接頭過短,同一鏈上的VH和VL兩個結構域之間無法配對,而被迫與另一鏈上的互補結構域配對並且產生兩個抗原結合位點。雙鏈抗體可以是二價的或雙特異性的。雙鏈抗體的更詳細描可以參見例如,EP 404,097;WO 1993/01161;Hudson等,Nat.Med.9:129-134(2003);以及Hollinger等,PNAS USA 90:6444-6448(1993)。
三鏈抗體和四鏈抗體和微抗體也描述於Hudson等,Nat.Med.9:129-134(2003),和邵榮光等(編輯),抗體藥物研究與應用,人民衛生出版社(2013)。
如本文所用,術語“單鏈抗體(single-chain variable fragment,scFv)”又稱為“單鏈可變區抗體片段”,是指其中重鏈和輕鏈可變區藉由(柔性)接頭或(柔性)連接肽連接形成的單多肽鏈。例如,藉由使用重組方法,將獨立編碼Fv片段的兩個結構域VL和VH的基因,藉由編碼連接肽(接頭)的核酸序列連接在一起,重組表達而形成。該單多肽鏈形成抗原結合區。單鏈抗體詳述於國際專利申請公佈號WO88/01649及美國專利號4,946,778和5,260,203中。
術語“(柔性)接頭”和術語“(柔性)連接肽”在本文中可以互換使用,是指由胺基酸組成的短肽(肽接頭)。藉由這樣的肽接頭可以連接本發明的抗體中的各個可變結構域,例如VH和VL區。肽接頭通常富含表現柔性的甘胺酸以及表現溶解性的絲胺酸或蘇胺酸。例如可以單獨或組合使用甘胺酸和/或絲胺酸殘基。柔性連接肽或肽接頭的非限定性例子公開於Shen等,Anal.Chem.80(6):1910-1917(2008)、WO2012/138475和WO2014/087010,將其內容全文併入作為參考。如本領域已知的,在scFv的構建中,接頭將利於促使VH和VL配對,且不干擾VH和VL對形成功能有效的抗原結合位點。
如本文所用,術語“單域抗體(single-domain antibody,sdAb)”是指僅包含單個可變結構域(例如,重鏈可變結構域(VH)或輕鏈可變結構域(VL),就可以結合抗原的抗體,即其不需要與另一可變結構域相互作用即以識別靶抗原。單域抗體可以衍生自駱駝科重鏈抗體的重鏈可變結構域、衍生自魚類IgNAR的VH樣單結構域(v-NAR)等。
如本文所用,術語“奈米抗體(nanobody,Nb或variable domain of heavy chain of heavy-chain antibody,VHH)”是指僅由一個重鏈可變區組成,具有與抗原結合的活性的抗體,即從C端到N端僅包含一條鏈:FR4-HCDR3-FR3-HCDR2-FR2-HCDR1-FR1的抗體,可由駱駝天然產生或由基因工程技術產生。奈米抗體是目前已知的可結合目標抗原的最小單位。
如本文所用,術語“重鏈抗體(heavy-chain antibody,hcAb)”是指不具有輕鏈的抗體,從N段到C段可以包含VH-CH2-CH3,或包含VH-CH1-CH2-CH3;可以構成同型二聚體,例如不具有輕鏈的重鏈二聚體抗體。本發明的重鏈抗體中可以包含來自標準抗體的VH或者來自小型化抗體的VH。例如,本發明的重鏈抗體中的VH可以就是奈米抗體。
如本文所用,術語“單株抗體”表示得自基本上同質的抗體群體的抗體,即,除了通常以很少量存在的可能變體抗體(例如,含有天然突變或在單株抗體製品的生產過程中產生的變體抗體)以外,構成所述群體的各個抗體是相同的和/或結合相同表位。單株抗體可以藉由多種技術來製備,該技術包括、但不限於雜交瘤方法、重組DNA方法、酵母展示方法,和使用包含人免疫球蛋白基因座的全部或部分的轉基因動物的方法。
如本文所用,術語“人抗體”或“全人源抗體”在本文中可以互換使用,指包括其中構架區和CDR區二者均源自人種系免疫球蛋白序列的可變區的抗體。而且,如果抗體含有恆定區,恆定區也源自人種系免疫球蛋白序列。本發明的人抗體可包括不由人種系免疫球蛋白序列編碼的胺基酸序列(例如,包含藉由體外隨機或點特異誘變或體內體細胞突變引入的突變),例如在CDR--尤其在CDR3中。然而,術語“人抗體”不意欲包括其中的CDR序列衍生自其他哺乳動物物種(如,小鼠)的種系而移植入人構架序列的抗體。
如本文所用,術語“人源化抗體”是指將源自其他哺乳動物物種例如小鼠種系的CDR序列接到人構架序列上的抗體。可以在人構架序列內進行額外的構架區修飾。
如本文所用,術語“嵌合抗體”是指可變區序列源自一物種、恆定區序列源自另一物種的抗體,例如,其中可變區序列源自小鼠抗體、恆定區序列源自人抗體的抗體。
如本文所用,術語“分離的”抗體是這樣的抗體,其已經與其天然環境的組分分離。在一些實施方案中,將抗體純化至超過95%或99% 純度,如藉由例如電泳(例如,SDS-PAGE,等電聚焦(IEF),毛細管電泳)或層析(例如,離子交換或反相HPLC)確定的純度。對於用於評估抗體純度的方法的綜述參見,例如,Flatman等,J.Chromatogr.B848:79-87(2007)。
如本文所用,術語“表位”是指抗體所結合的抗原區域。表位可以由連續的胺基酸形成或者藉由蛋白的三級折疊而由非連續胺基酸形成。
如本文所用,術語“特異性結合”表示抗體選擇性地或優先結合抗原。當GITR抗體基本不結合非GITR分子時,認為該抗體“特異性地結合”GITR。然而,特異性結合GITR的抗體可與來自不同物種的GITR多肽交叉反應。如果在生物光干涉測量中,抗體以約5×10-7M或更低、約1×10-7M或更低、約5×10-8M或更低、約1×10-8M或更低、約5×10-9M或更低的KD與人GITR結合,則該抗體是“與人GITR特異性結合”的抗體。
如本文所用,“親和力”或“結合親和力”指反映結合的成員之間相互作用的固有結合力。分子X對其配偶物Y的親和力可以通常由平衡解離常數(KD)代表,平衡解離常數是解離速率常數和結合速率常數(分別是kdis和kon)的比值。親和力可以由本領域已知的常見方法測量。用於測量親和力的一個具體方法是本文中的ForteBio動力學結合測定法。
與結合例如GITR抗原的參考抗體“競爭結合的抗體”是指在競爭檢驗中阻斷參考抗體與抗原(例如GITR)結合50%或更多的抗體。示例性競爭檢驗描述於:“Antibodies”,Harlow and Lane(Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,NY)。競爭結合的抗體可以與參考抗體結合相同的表位區,例如相同表位、相鄰表位或重疊表位。
如本文所用,術語“Fc區”用於定義含有至少一部分的恆定區的免疫球蛋白重鏈的C-末端區域。該術語包括天然序列Fc-區和變體Fc-區。在一個實施方案中,人IgG重鏈Fc-區從重鏈的Cys226或從Pro230延伸至羧基端。然而,Fc-區的C-端賴胺酸(Lys447)可以存在或可以不存在。除非本文中另外指出,Fc-區或恆定區中的胺基酸殘基的編號根據EU編號系統,也稱為EU索引,如Kabat,E.A.等,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991),NIH Publication 91-3242中所述。
與抗體相關的術語“變體”在本文中是指包含已經藉由至少1個,例如1-30,或1-20或1-10個,例如1或2或3或4或5個胺基酸取代、缺失和/或插入而具有胺基酸改變的目標抗體區域(例如重鏈可變區或輕鏈可變區或重鏈CDR區或輕鏈CDR區)的抗體,其中變體基本上保持改變之前的抗體分子的生物學特性。
在本文中,“序列同一性”是指在比較窗中以逐個核苷酸或逐個胺基酸為基礎的序列相同的程度。可以藉由以下方式計算“序列同一性百分比”:將兩條最佳比對的序列在比較窗中進行比較,確定兩條序列中存在相同核酸堿基(例如,A、T、C、G、I)或相同胺基酸殘基(例如,Ala、Pro、Ser、Thr、Gly、Val、Leu、Ile、Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg、His、Asp、Glu、Asn、Gln、Cys和Met)的位置的數目以得到匹配位置的數目,將匹配位置的數目除以比較窗中的總位置數(即,窗大小),並且將結果乘以100,以產生序列同一性百分比。為了確定序列同一性百分數而進行的最佳比對,可以按本領域已知的多種方式實現,例如,使用可公開獲得的計算機軟體如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)軟體。本 領域技術人員可以確定用於比對序列的適宜參數,包括為實現正在比較的全長序列範圍內或目標序列區域內最大比對所需要的任何算法。
在本發明中,就抗體序列而言,胺基酸序列同一性百分數藉由將候選抗體序列與參考抗體序列最佳比對後,在一個較佳方案中按照Kabat編號規則進行最佳比對後,予以確定。比對後,將目標抗體區域(例如,重鏈或輕鏈的整個可變區、或其部分例如一個或多個CDR區)與參考抗體的相同區域進行比較。目標抗體區域和參考抗體區域之間的序列同一性百分數為:在目標和參考抗體區域兩者中被相同胺基酸佔據的位置的數目除以兩個區域的比對位置總數(空位不計入)並乘以100得到的百分數。在本文中,在不指定目標抗體區域的情況下,將適用於在參考抗體序列的全長上進行比對。在一些實施方案中,就抗體而言,序列同一性可以分佈在整個重鏈可變區和/或整個輕鏈可變區上,或序列百分數同一性可以僅限定於構架區,而對應CDR區的序列保持100%相同。
在本文中,“保守性取代”是指導致某個胺基酸置換為化學上相似的胺基酸的胺基酸改變。提供功能上相似胺基酸的保守取代表是本領域熟知的。在本發明任一實施方案中,在一個較佳的方面,保守取代殘基來自以下的保守替代表A,較佳地為表A中所示的較佳取代殘基。
Figure 108110498-A0101-12-0020-1
在本文中,術語“個體”或“受試者”可互換使用,是指哺乳動物。哺乳動物包括但不限於馴化動物(例如,奶牛、綿羊、貓、犬和馬)、靈長類(例如,人和非人靈長類如猴)、兔和齧齒類(例如,小鼠和大鼠)。特別地,受試者是人。
在本文中,術語“治療”指意欲改變正在接受治療的個體中疾病的天然過程的臨床介入。想要的治療效果包括但不限於防止疾病出現或復發、減輕症狀、減小疾病的任何直接或間接病理學後果、防止轉移、降低病情進展速率、改善或緩和疾病狀態,以及緩解或改善預後。
在本文中,術語“癌症”、“腫瘤”、“癌性的”和“惡性的”是指或描述哺乳動物中特徵通常為細胞生長不受調節的生理狀況。癌症的實例包括但不限於:癌,包括腺癌、淋巴瘤、母細胞瘤、黑素瘤、肉瘤和白血病。此類癌症的更具體實例包括:鱗狀細胞癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、胃腸癌、何傑金氏和非何傑金氏淋巴瘤、胰腺癌、膠質母細胞瘤、神經膠質瘤、宮頸癌、卵巢癌、肝癌諸如肝的癌和肝細胞瘤、膀胱癌、乳癌、結腸癌、結腸直腸癌、子宮內膜癌、骨髓瘤(諸如多發性骨髓瘤)、唾液腺癌、腎癌諸如腎細胞癌和威爾曼瘤、基底細胞癌、黑素瘤、前列腺癌、外陰癌、甲狀腺癌、睾丸癌、食管癌、及各種類型的頭頸癌。
隨著癌性細胞生長和倍增,它們形成癌性組織塊,這就是腫瘤,其侵入和破壞正常的鄰近組織。惡性腫瘤是癌症。惡性腫瘤經常可以切除,但是它們可能再生。來自惡性腫瘤的細胞可以侵入和破壞附近的組織和器官。另外,癌細胞可以脫離惡性腫瘤,並進入血流或淋巴系統,這是癌細胞從原發腫瘤(即,最初的癌)擴散以在其他器官中形成新腫瘤的途徑。癌症在體內的擴散被稱作轉移(What You Need to Know About Cancer-an Overview,NIH公開號00-1566;2000年9月26日公佈,2002年9月16日更新(2002))。
2. 詳細描述
除非明確指明相反,否則本發明的實施將採用本領域內的常規化學、生物化學、有機化學、分子生物學、微生物學、重組DNA技術、遺傳學、免疫學和細胞生物學的方法。這些方法的描述可以參見,例如,Sambrook等,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(第3版,2001);Sambrook等,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(第2版,1989);Maniatis等,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(1982);Ausubel等,Current Protocols in Molecular Biology(John Wiley和Sons,2008年7月更新);Short Protocols in Molecular Biology:A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology,Greene Pub.Associates和Wiley-Interscience;Glover,DNA Cloning:A Practical Approach,vol.I&II(IRL Press,Oxford,1985);Anand,Techniques for the Analysis of Complex Genomes,(Academic Press,New York,1992);Transcription and Translation(B.Hames&S.Higgins編著,1984);Perbal,A Practical Guide to Molecular Cloning(1984);Harlow和Lane,Antibodies,(Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,,N.Y.,1998)Current Protocols in Immunology Q.E.Coligan,A.M.Kruisbeek,D.H.Margulies,E.M.Shevach和W.Strober編著,1991);Annual Review of Immunology;以及期刊專著如Advances in Immunology。
一方面,本發明提供了一種可以高效激活GITR下游的NFkB信號通路的抗體或其抗原結合片段(即,本發明的抗體或其抗原結合片段),其特異性結合糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(GITR)。
在一些實施方案中,本發明的抗體是單株抗體或多特異性抗體(包括雙抗體);和/或是IgG1、IgG2、IgG3或IgG4型;和/或是抗原結合片段,例如是Fab片段、Fab’片段、F(ab’)2片段或Fv片段;和/或是人抗體、人源化抗體或嵌合抗體;和/或是經標記的抗體。
在一些實施方案中,本發明的抗體是特異性結合GITR的小型化抗體,例如特異性結合GITR的單鏈抗體(scFv)、單域抗體(sdAd)、重鏈抗體(hcAb)、奈米抗體(Nb或VHH);或這些抗體的多聚物形式。這些小型化抗體較佳包含本發明抗體重鏈可變區的HCDR3(重鏈互補決定區3);更佳還包含本發明抗體重鏈可變區的HCDR1(重鏈互補決定區1)和HCDR2(重鏈互補決定區2)。
本發明涵蓋在本文中所述及的任何抗體的變體。在一個實施方案中,抗體變體保持改變前抗體的至少60%、70%、80%、90%或100%的生物學活性(例如抗原結合能力)。在一些實施方案中,該改變不導致抗體變體喪失對抗原的結合,但視需要地可以賦予諸如提高的抗原親和力和不同的效應子功能等性質。可以理解的,抗體的重鏈可變區或輕鏈可變區,或各CDR區可以單獨改變或組合改變。在一些實施方案中,在一個或多個或全部三個重鏈CDR中的胺基酸改變不超過1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個或10個。較佳地,所述胺基酸改變為胺基酸取代,較佳保守取代。在一些實施方案中,在一個或多個或全部三個重鏈CDR中的胺基酸改變不超過1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個或10個。較佳地,所述胺基酸改變為胺基酸取代,較佳保守取代。在 一些實施方案中,抗體變體與親本抗體在目的抗體序列區域上具有至少80%、85%、90%或95%或99%或更高的胺基酸同一性。在一個實施方案中,本發明抗體與表B所列任一抗體相比,在重鏈可變區上具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%或更高的序列同一性。
例如,本發明的抗體包含與表B所列任一抗體的對應CDR相同的至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個CDR,或其變體。在一些實施方案中,本發明的抗體包含與表B所列任一抗體的對應重鏈CDR相同的至少一個、兩個、或三個HCDR,或其變體。在本文中,“對應CDR”是指在可變區胺基酸序列中位於基本相似位置上的CDR。在本文中,CDR變體是已經藉由至少一個,例如1或2或3個胺基酸取代、缺失和/或插入而修飾的CDR,其中包含CDR變體的抗體分子基本上保持包含未修飾CDR的抗體分子的生物學特性,例如,保持至少60%、70%、80%、90%或100%的生物學活性(例如抗原結合能力)。可以理解,各CDR可以單獨修飾或組合修飾。較佳地,胺基酸修飾為胺基酸取代,尤其是保守胺基酸取代,例如表A中列出的較佳保守胺基酸置換。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段以高特異性和高親合性結合GITR。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段以高親和力與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合,例如以小於約50nM、小於約30nM、小於約10-25nM或小於約20nM的高親和力,較佳以小於約10nM的親和力與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合。
例如,本發明的抗體或其抗原結合片段以約1-50nM、約5-50nM、約10-50nM、約1-30nM、約5-30nM、約10-30nM、約1-25nM、約5-25nM、約10-25nM、約1-20nM、約5-20nM、約10-20nM、約0.1-10nM、約1-10nM、約5-10nM、約10nM的親和力與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段以高親和力與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合,例如以大於約0.01×104/Ms、大於約0.1×104/Ms、大於約1×104/Ms或大於約3×104/Ms的結合常數,較佳以大於約5 x 104/Ms的結合常數與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段以低解離常數與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合,例如與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合的解離常數(Kd)小於約2×10-2s-1、小於約1.5×10-2s-1、小於約8×10-3s-1或小於約5×10-3s-1;較佳與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合的解離常數為約1-3×10-3s-1
例如,本發明的抗體或其抗原結合片段與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合的解離常數(Kd)為約1×10-4s-1至2×10-2s-1、約1×10-3s-1至2×10-2s-1、約3×10-3s-1至2×10-2s-1、約1×10-4s-1至1.5×10-2s-1、約1×10-3s-1至1.5×10-2s-1、約3×10-3s-1至1.5×10-2s-1、約1×10-4s-1至8×10-2s-1、約1×10-3s-1至8×10-2s-1、約3×10-3s-1至1.5×10-2s-1、約1×10-4s-1至5×10-2s-1、約1×10-3s-1至5×10-2s-1、約3×10-3s-1至1.5×10-2s-1、1×10-3s-1至2×10-250nM、約3×10-3s-1至1.5×10-2s-1
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段與細胞表面的抗原高親和力結合,例如以小於約50nM、小於約30nM、小於約25nM或小於約20nM的親和力,較佳以小於約10nM的親和力與人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)結合。
例如,本發明的抗體或其抗原結合片段以約1nM-50nM、約5nM-50nM、約10nM-50nM、約1nM-30nM、約5nM-30nM、約10nM-30nM、約1nM-25nM、約5nM-25nM、約10nM-25nM、約1nM-20nM、約5nM-20nM、約10nM-20nM、約0.1-10nM、約1-10nM、約5-10nM、約10nM的親和力與細胞表面的抗原。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段高效激活GITR下游的NFkB信號通路,例如激活NFkB信號通路的EC50值小於約50nM、小於約30nM、小於約25nM或小於約5nM,較佳小於約1nM。
例如,本發明的抗體或其抗原結合片段激活NFkB信號通路的EC50值為約1nM-50nM、約5nM-50nM、約10nM-50nM、約1nM-30nM、約5nM-30nM、約10nM-30nM、約1nM-25nM、約5nM-25nM、約10nM-25nM、約1nM-20nM、約5nM-20nM、約10nM-20nM、約0.1-10nM、約1-10nM、約5-10nM或約10nM。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段與GITRL交叉競爭結合至GITR,較佳與GITRL交叉競爭結合至人GITR(如SEQ ID NO:123或127的多肽)。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段可以內化到人CD4細胞中。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段抑制調節性T細胞的抑制作用。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段活化效應T細胞。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段減少循環調節性T細胞。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段能夠結合Fcγ受體(FcγR)。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段在人血清中具有至少約6、約7、約9或約12天的半衰期。
另一方面,本發明提供了一種特異性結合GITR,並高效激活GITR下游的NFkB信號通路的奈米抗體(即,本發明的奈米抗體),該奈米抗體的HCDR3包含本發明抗體或抗原結合片段的HCDR3。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR3包含SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列所含的HCDR3,或本發明的奈米抗體的HCDR3由SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列所含的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR3包含與如SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列所含的HCDR3,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的奈米抗體的HCDR3由這樣的重鏈可變區序列中所含的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR3包含在如SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保 守取代)的重鏈可變區序列中所含的HCDR3,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的奈米抗體的HCDR3由這樣的重鏈可變區序列中所含的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR3包含如SEQ ID NO:45-63中任一序列所示的HCDR3,或本發明的奈米抗體的HCDR3由如SEQ ID NO:45-63中任一序列所示的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR3包含在如SEQ ID NO:45-63中任一序列所示的HCDR3中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的HCDR3,或本發明的奈米抗體的HCDR3由這樣的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR1(重鏈互補決定區1)和HCDR2(重鏈互補決定區2)包含如SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2,或本發明的奈米抗體的HCDR1和HCDR2由如SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR1和HCDR2包含在如SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列中所含的HCDR1和HCDR2,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的奈米抗體的HCDR1和HCDR2由這樣的重鏈可變區序列中所含的HCDR1和HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR1包含如SEQ ID NO:1-22中任一序列所示的HCDR1,或本發明的奈米抗體的HCDR1由如SEQ ID NO:1-22中任一序列所示的HCDR1組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR1包含在如SEQ ID NO:1-22中任一序列所示的HCDR1中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的HCDR1,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的奈米抗體的HCDR1由這樣的HCDR1組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR2包含如SEQ ID NO:23-44中任一序列所示的HCDR2,或本發明的奈米抗體的HCDR2由如SEQ ID NO:23-44中任一序列所示的HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體的HCDR2包含在如SEQ ID NO:23-44中任一序列所示的HCDR2中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的HCDR2,或本發明的奈米抗體的HCDR2由這樣的HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:1所示的HCDR1、如SEQ ID NO:23所示的HCDR2和如SEQ ID NO:45所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:2所示的HCDR1、如SEQ ID NO:24所示的HCDR2和如SEQ ID NO:46所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:3所示的HCDR1、如SEQ ID NO:25所示的HCDR2和如SEQ ID NO:47所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:4所示的HCDR1、如SEQ ID NO:26所示的HCDR2和如SEQ ID NO:48所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:5所示的HCDR1、如SEQ ID NO:27所示的HCDR2和如SEQ ID NO:49所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:6所示的HCDR1、如SEQ ID NO:28所示的HCDR2和如SEQ ID NO:50所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:7所示的HCDR1、如SEQ ID NO:29所示的HCDR2和如SEQ ID NO:51所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:8所示的HCDR1、如SEQ ID NO:30所示的HCDR2和如SEQ ID NO:52所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:9所示的HCDR1、如SEQ ID NO:31所示的HCDR2和如SEQ ID NO:53所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:10所示的HCDR1、如SEQ ID NO:32所示的HCDR2和如SEQ ID NO:51所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:11所示的HCDR1、如SEQ ID NO:33所示的HCDR2和如SEQ ID NO:48所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:12所示的HCDR1、如SEQ ID NO:34所示的HCDR2和如SEQ ID NO:46所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:13所示的HCDR1、如SEQ ID NO:35所示的HCDR2和如SEQ ID NO:54所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:14所示的HCDR1、如SEQ ID NO:36所示的HCDR2和如SEQ ID NO:55所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:15所示的HCDR1、如SEQ ID NO:37所示的HCDR2和如SEQ ID NO:56所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:16所示的HCDR1、如SEQ ID NO:38所示的HCDR2和如SEQ ID NO:57所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:17所示的HCDR1、如SEQ ID NO:39所示的HCDR2和如SEQ ID NO:58所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:18所示的HCDR1、如SEQ ID NO:40所示的HCDR2和如SEQ ID NO:59所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:19所示的HCDR1、如SEQ ID NO:41所示的HCDR2和如SEQ ID NO:60所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:20所示的HCDR1、如SEQ ID NO:42所示的HCDR2和如SEQ ID NO:61所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:21所示的HCDR1、如SEQ ID NO:43所示的HCDR2和如SEQ ID NO:62所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:22所示的HCDR1、如SEQ ID NO:44所示的HCDR2和如SEQ ID NO:63所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含如SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列,或由如SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列組成,較佳僅由一條這樣的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含與如SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的奈米抗體由這樣的重鏈可變區序列組成,較佳僅由一條這樣的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的奈米抗體包含在如SEQ ID NO:64-85中任一序列所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的奈米抗體由這樣的重鏈可變區序列組成,較佳僅由一條這樣的重鏈可變區序列組成。
另一方面,本發明提供了一種特異性結合GITR,並高效激活GITR下游的NFkB信號通路的重鏈抗體(即,本發明的重鏈抗體),該重鏈抗體的HCDR3包含本發明抗體或抗原結合片段的HCDR3,或由本發明抗體或抗原結合片段的HCDR3組成;該重鏈抗體的HCDR3較佳包含上述本發明奈米抗體的HCDR3或由上述本發明奈米抗體的HCDR3組成;更佳該重鏈抗體的HCDR1-2較佳分別包含上述本發明奈米抗體的HCDR1-2或分別由上述本發明奈米抗體的HCDR1-2組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體是人源化重鏈抗體,較佳是全人源重鏈抗體(人抗體)。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR3包含如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列所含的HCDR3,或本發明的重鏈抗體的HCDR3由如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列所含的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR3包含與如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列所含的HCDR3,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的重鏈抗體的HCDR3由這樣的重鏈可變區序列所含的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR3包含在如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列中所含的 HCDR3,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的重鏈抗體的HCDR3由這樣的重鏈可變區序列所含的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR3包含如SEQ ID NO:46、47、48、51、53、57和61中任一序列所示的HCDR3,或本發明的重鏈抗體的HCDR3由如SEQ ID NO:46、47、48、51、53、57和61中任一序列所示的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR3包含在如SEQ ID NO:46、47、48、51、53、57和61中任一序列所示的HCDR3中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的HCDR3,或本發明的重鏈抗體的HCDR3由這樣的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR1和HCDR2包含如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2,或本發明的重鏈抗體的HCDR1和HCDR2由這樣的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR1和HCDR2包含與如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的重鏈抗體的HCDR1和HCDR2由這樣的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR1和HCDR2包含在如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列中所含的HCDR1和HCDR2,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的重鏈抗體的HCDR1和HCDR2由這樣的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR1包含如SEQ ID NO:2、3、4、7、9、10、16、20中任一序列所示的HCDR1,或本發明的重鏈抗體的HCDR1由如SEQ ID NO:2、3、4、7、9、10、16、20中任一序列所示的HCDR1組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR1包含在如SEQ ID NO:2、3、4、7、9、10、16、20中任一序列所示的HCDR1中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更較佳保守取代)的HCDR1,或本發明的重鏈抗體的HCDR1由這樣的HCDR1組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR2包含如SEQ ID NO:24、25、26、29、31、32、38、42中任一序列所示的HCDR2,或本發明的重鏈抗體的HCDR2由如SEQ ID NO:24、25、26、29、31、32、38、42中任一序列所示的HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的HCDR2包含在如SEQ ID NO:24、25、26、29、31、32、38、42中任一序列所示的HCDR2中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較 佳取代、更佳保守取代)的HCDR2,或本發明的重鏈抗體的HCDR2由這樣的HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含如SEQ ID NO:2所示的HCDR1、如SEQ ID NO:24所示的HCDR2和如SEQ ID NO:46所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含如SEQ ID NO:3所示的HCDR1、如SEQ ID NO:25所示的HCDR2和如SEQ ID NO:47所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含如SEQ ID NO:4所示的HCDR1、如SEQ ID NO:26所示的HCDR2和如SEQ ID NO:48所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含如SEQ ID NO:7所示的HCDR1、如SEQ ID NO:29所示的HCDR2和如SEQ ID NO:51所示的HCDR3。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含如SEQ ID NO:9所示的HCDR1、如SEQ ID NO:31所示的HCDR2和如SEQ ID NO:53所示的HCDR3。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含如SEQ ID NO:10所示的HCDR1、如SEQ ID NO:32所示的HCDR2和如SEQ ID NO:51所示的HCDR3。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含如SEQ ID NO:16所示的HCDR1、如SEQ ID NO:38所示的HCDR2和如SEQ ID NO:57所示的HCDR3。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含如SEQ ID NO:20所示的HCDR1、如SEQ ID NO:42所示的HCDR2和如SEQ ID NO:61所示的HCDR3。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的重鏈可變區序列包含如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列,或本發明的重鏈抗體的重鏈可變區序列由如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的重鏈可變區序列包含與如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的重鏈抗體的重鏈可變區序列由這樣的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體的重鏈可變區序列包含在如SEQ ID NO:65、66、67、70、72、73、79和83中任一序列所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的重鏈抗體的重鏈可變區序列由這樣的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含如SEQ ID NO:108-115中任一序列所示的重鏈抗體序列,或本發明的重鏈抗體由一條、兩條或多條如SEQ ID NO:108-115中任一序列所示的重鏈抗體序列組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含與如SEQ ID NO:108-115中任一序列所示的重鏈抗體序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈抗體序列,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的重鏈抗體由一條、兩條或多條這樣的重鏈抗體序列組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體包含在如SEQ ID NO:108-115中任一序列所示的重鏈抗體序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈抗體序列,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的重鏈抗體由一條、兩條或多條這樣的重鏈抗體序列組成。
另一方面,本發明提供了一種特異性結合GITR,並高效激活GITR下游的NFkB信號通路的人源化重鏈抗體(即,本發明的人源化重鏈抗體),該人源化重鏈抗體的HCDR3包含本發明抗體或抗原結合片段的HCDR3,或由本發明抗體或抗原結合片段的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體的HCDR3包含上述本發明奈米抗體或重鏈抗體的HCDR3,或由上述本發明奈米抗體或重鏈抗體的HCDR3組成;更佳本發明人源化重鏈抗體的HCDR1-2較佳分別包含上述本發明奈米抗體或重鏈抗體的HCDR1-2,或分別由上述本發明奈米抗體或重鏈抗體的HCDR1-2組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR3包含如SEQ ID NO:124或125所示的重鏈可變區序列所含的HCDR3,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR3由如SEQ ID NO:124或125所示的重鏈可變區序列所含的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR3包含與如SEQ ID NO:124或125所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列所含的HCDR3,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR3由這樣的重鏈可變區序列所含的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR3包含在如SEQ ID NO:124或125所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列中所含的HCDR3,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR3由這樣的重鏈可變區序列所含的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR3包含選自SEQ ID NO:51或61的HCDR3,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR3由選自SEQ ID NO:51或61的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR3包含在選自SEQ ID NO:51或61的HCDR3中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的HCDR3,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR3由這樣的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR1和HCDR2包含選自SEQ ID NO:124或125的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR1和HCDR2 由選自SEQ ID NO:124或125的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR1和HCDR2包含與如SEQ ID NO:124或125所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR1和HCDR2由這樣的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR1和HCDR2包含在如SEQ ID NO:124或125所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列中所含的HCDR1和HCDR2,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR1和HCDR2由這樣的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR1包含如SEQ ID NO:7或20所示的HCDR1,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR1由如SEQ ID NO:7或20所示的HCDR1組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR1包含在如SEQ ID NO:7或20所示的HCDR1中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的HCDR1,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR1由這樣的HCDR1組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR2包含如SEQ ID NO:29或42所示的HCDR2,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR2由如SEQ ID NO:29或42所示的HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR2包含在如SEQ ID NO:29或42所示的HCDR2中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的HCDR2,或本發明的人源化重鏈抗體中的HCDR2由這樣的HCDR2組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體包含如SEQ ID NO:7所示的HCDR1、如SEQ ID NO:29所示的HCDR2和如SEQ ID NO:51所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體包含如SEQ ID NO:20所示的HCDR1、如SEQ ID NO:42所示的HCDR2和如SEQ ID NO:61所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區序列包含如SEQ ID NO:124或125所示的重鏈可變區序列,或本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區序列由如SEQ ID NO:124或125所示的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區序列包含與如SEQ ID NO:124或125所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區序列由這樣的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區序列包含在如SEQ ID NO:124或125所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的人源化重鏈抗體的重鏈可變區序列由這樣的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體包含如SEQ ID NO:116或117所示的人源化重鏈抗體序列,或本發明的人源化重鏈抗體由一條、兩條或多條如SEQ ID NO:116或117所示的人源化重鏈抗體序列組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體包含與如SEQ ID NO:116或117所示的人源化重鏈抗體序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的人源化重鏈抗體序列,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的人源化重鏈抗體由一條、兩條或多條這樣的人源化重鏈抗體序列組成。
在一些實施方案中,本發明的人源化重鏈抗體包含在如SEQ ID NO:116或117所示的人源化重鏈抗體序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的人源化重鏈抗體序列,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的人源化重鏈抗體由一條、兩條或多條這樣的人源化重鏈抗體序列組成。
在一些實施方案中,本發明的重鏈抗體或人源化重鏈抗體包含上述任一種重鏈可變區和Fc片段,較佳該Fc片段包含下述序列(a)-(d)之一或由下述序列(a)-(d)之一組成: (a)人IgG1的Fc片段;(b)如SEQ ID NO:121所示的Fc片段;或(c)與如SEQ ID NO:121所示的Fc片段具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的Fc片段;或(d)在如SEQ ID NO:121所示的Fc片段中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的Fc片段。
在較佳的實施方案中,本發明的重鏈抗體或人源化重鏈抗體包含兩條選自上述序列(a)-(d)中的Fc序列。
在更較佳的實施方案中,同一個本發明的重鏈抗體或人源化重鏈抗體的兩條Fc序列(a)-(d)之間存在鏈間二硫鍵。
最較佳的實施方案中,同一個本發明的重鏈抗體或人源化重鏈抗體的兩條Fc序列(a)-(d)之間存在兩個鏈間二硫鍵,該鏈間二硫鍵是本發明的重鏈抗體或人源化重鏈抗體中包含的CPPC序列中,胺基酸殘基C之間形成的兩個鏈間二硫鍵,該CPPC序列是本發明的重鏈抗體或人源化重鏈抗體中的奈米抗體與Fc之間連接的序列。
另一方面,本發明提供了一種特異性結合GITR,並高效激活GITR下游的NFkB信號通路的多聚物形式的抗體(即,本發明的多聚物形式的抗體),該多聚物形式的抗體的HCDR3包含本發明抗體或抗原結合片段的HCDR3,或由本發明抗體或抗原結合片段的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的HCDR3包含上述本發明奈米抗體、重鏈抗體或人源化重鏈抗體的HCDR3,或由上述本發明奈米抗體、重鏈抗體或人源化重鏈抗體的HCDR3組成;更佳 本發明多聚物形式的抗體的HCDR1-2較佳分別包含上述本發明奈米抗體、重鏈抗體或人源化重鏈抗體的HCDR1-2,或分別由上述本發明奈米抗體、重鏈抗體或人源化重鏈抗體的HCDR1-2組成。
在較佳的實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體是本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區的多聚物形式,較佳是本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區的四聚化形式或六聚化形式,最佳是本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區的四聚化形式。
藉由形成將本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區形成多聚物形式的抗體,可以更有效地激活GITR下游的NFkB信號通路,同時可以適當延長本發明的奈米抗體、重鏈抗體、人源化重鏈抗體在活體內的半衰期。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR3包含如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列所含的HCDR3序列,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR3由如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列所含的HCDR3組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR3包含與如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列所含的HCDR3序列,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR3由這樣的HCDR3序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR3包含在如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列中的一 處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列中所含的HCDR3,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR3由這樣的HCDR3序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR3包含所示SEQ ID NO:61所示的HCDR3序列,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR3由所示SEQ ID NO:61所示的HCDR3序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR3包含在SEQ ID NO:61的HCDR3中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的HCDR3序列,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR3由這樣的HCDR3序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR1和HCDR2包含如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2序列,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR1和HCDR2由如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR1和HCDR2包含與如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列所含的HCDR1和HCDR2,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR1和HCDR2由這樣的HCDR1和HCDR2序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR1和HCDR2包含在如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列中所含的HCDR1和HCDR2,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR1和HCDR2由這樣的HCDR1和HCDR2序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR1包含如SEQ ID NO:20所示的HCDR1序列,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR1由如SEQ ID NO:20所示的HCDR1序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR1包含在SEQ ID NO:20的HCDR1中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的HCDR1序列,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR1由這樣的HCDR1序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR2包含如SEQ ID NO:42所示的HCDR2序列,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR2由如SEQ ID NO:42所示的HCDR2序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR2包含在SEQ ID NO:42的HCDR2中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守 取代)的HCDR2序列,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區中的HCDR2由這樣的HCDR2序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區包含如SEQ ID NO:20所示的HCDR1、如SEQ ID NO:42所示的HCDR2和如SEQ ID NO:61所示的HCDR3的組合。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區包含如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區由如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區包含與如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的重鏈可變區序列,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區由這樣的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區包含在如SEQ ID NO:125所示的重鏈可變區序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的重鏈可變區序列,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的多聚物形式的抗體的重鏈可變區由這樣的重鏈可變區序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體包含選自SEQ ID NO:118-120的任一序列,或本發明的多聚物形式的抗體由相同的兩條、三條或多條選自SEQ ID NO:118-120的序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體包含與如SEQ ID NO:118-120中任一序列所示的序列具有至少90%、91%、92%、 93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多序列同一性的序列,其中較佳序列差異不存在於CDR區域中,或本發明的多聚物形式的抗體由相同的兩條、三條或多條這樣的序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體包含在如SEQ ID NO:118-120中任一序列所示的序列中的一處或多處(較佳1-10個,更佳1-5個,最佳1-3個)具有胺基酸改變(較佳取代、更佳保守取代)的序列,其中較佳所述胺基酸改變不發生在CDR區域中,或本發明的多聚物形式的抗體由相同的兩條、三條或多條這樣的序列組成。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體中的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區(簡稱“本發明的抗體的重鏈可變區”)連接到本發明的人源化重鏈抗體。
在較佳的實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體中的本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區連接到本發明的人源化重鏈抗體的C末端;或者本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區連接到本發明的人源化重鏈抗體的N末端。
在更佳的實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體包含兩條相同的本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區,該兩條相同的本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區分別連接到兩條相同的本發明的人源化重鏈抗體的C末端;或者該兩條相同的本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區分別連接到兩條相同的本發明的人源化重鏈抗體的N末端。
在最佳的實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體是四聚體(包含四個相同的本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區),其包含兩條相同的鏈,每條鏈包含一個奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區,和一個本發明的人源化重鏈抗體。即,本發明的多聚物形式的抗體包含兩條完全相同的鏈(完全相同的第一鏈和第二鏈),每條鏈均只包含一個額外的本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區和一個本發明的人源化重鏈抗體,其中第一鏈包含的本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區和第二鏈包含的本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區相同;第一鏈包含的人源化重鏈抗體和第二鏈包含的人源化重鏈抗體相同。這兩條相同的鏈之間還可以存在鏈間二硫鍵,該鏈間二硫鍵是每條鏈的人源化重鏈抗體中連接其中的重鏈可變區與Fc的序列(例如,CPPC序列)中,胺基酸殘基C之間形成的兩個鏈間二硫鍵。即,第一鏈的人源化重鏈抗體中的重鏈可變區與Fc之間的序列中的胺基酸殘基C和第二鏈的人源化重鏈抗體中的重鏈可變區與Fc之間的序列中的胺基酸殘基C之間形成鏈間二硫鍵。
在一些實施方案中,本發明的多聚物形式的抗體中的本發明的奈米抗體、重鏈抗體的重鏈可變區、人源化重鏈抗體的重鏈可變區藉由連接肽連接到本發明的人源化重鏈抗體,該連接肽較佳是柔性連接肽,更佳是胺基酸序列為(G4S)n(n為0-7整數)的連接肽。
本發明提供了如實施例中分離並表徵的特異性結合GITR(例如人GITR)的奈米抗體、重鏈抗體、人源化重鏈抗體和四聚體形式的抗體。下表B中列出了本發明這些示例性抗體的胺基酸序列和核苷酸 序列。其中,抗體的胺基酸序列中,從N端至C端以加粗斜體示出的序列分別是示例性CDR序列(藉由本領域已知的各種確定CDR的精確胺基酸序列邊界的方法中的任一種或其組合確定,例如可以按照本文上述介紹的方法,並參考其他因素,例如保守性,確定如下示例性CDR序列)。
Figure 108110498-A0101-12-0050-2
Figure 108110498-A0101-12-0051-3
Figure 108110498-A0101-12-0052-4
Figure 108110498-A0101-12-0053-7
Figure 108110498-A0101-12-0054-8
Figure 108110498-A0101-12-0055-9
Figure 108110498-A0101-12-0056-10
Figure 108110498-A0101-12-0057-11
Figure 108110498-A0101-12-0058-12
下表C中給出本發明示例的序列對應的SEQ ID NO序號。
表C本發明示例的序列的SEQ ID NO序號
Figure 108110498-A0101-12-0059-14
Figure 108110498-A0101-12-0060-15
另一方面,本發明提供了一種融合蛋白或免疫綴合物(簡稱本發明的融合蛋白或免疫綴合物),其中本發明的抗體與一個或多個異源分子(第二分子)融合或綴合,其中該異源分子包括但不限於蛋白/多肽、標記物、藥物或細胞毒性劑。
蛋白質、多肽或肽與抗體融合或綴合的方法是本領域已知的。參見,例如,美國專利號5,336,603、5,622,929和EP 367,166。
在一些實施方案中,本發明的融合蛋白或免疫綴合物中藥物是抗腫瘤藥物。
另一方面,本發明提供了一種組合物或試劑盒(簡稱本發明的組合物或試劑盒),其包含本發明的抗體。
在一些實施方案中,本發明的組合物或試劑盒包括載體和/或說明書。
在一些實施方案中,本發明的組合物或試劑盒中的抗體與診斷劑或可檢測試劑綴合。
另一方面,本發明提供了一種分離的核酸(簡稱本發明的分離的核酸或本發明的核酸(分子)),其編碼本發明的抗體或其片段(包括抗原結合片段)、本發明的融合蛋白或本發明的免疫綴合物。
在一些實施方案中,本發明的核酸分子是基本上純化的核酸分子。
在一些實施方案中,本發明的核酸分子包含編碼表B所示任一抗體的重鏈可變區或其變體的核苷酸序列。在一個具體實施方案中,核酸分子是表B中列出的奈米抗體的核苷酸序列。本發明的核酸分子包含編碼表B所示任一抗體的重鏈至少一個CDR區和通常全部三個CDR區,或其變體的核苷酸序列。
本發明的一些其他核酸分子與表B中所示的胺基酸序列的編碼核酸分子的核苷酸序列基本上相同(例如,至少65%、80%、95%、或99%同一性)。在適宜的表達載體表達時,由這些多核苷酸編碼的多肽能夠顯示GITR抗原結合能力。
如本領域技術人員所知的,因為密碼子簡並性,每一個抗體或多肽胺基酸序列可以由多種核酸序列編碼。
在一些實施方案中,本發明的核酸序列編碼本發明的上述任何奈米抗體。在一些實施方案中,編碼奈米抗體的本發明核酸序列包含SEQ ID NO:86-107的核苷酸序列或與其基本相同的序列。在一些實施方案中,編碼奈米抗體的本發明核酸序列由SEQ ID NO:86-107的核苷酸序列或與其基本相同的序列組成。
“基本相同”的核苷酸序列是指與參考核苷酸序列在序列上具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%,、98%或99%或更高同一性的序列。核苷酸序列的同一性可以使用本領域公知的各種序列比對方法確定。例如可以從NCBI(National Center for Biotechnology Information,Bethesda,MD)的網站上獲得BLAST序列比對檢索工具。一般而言,百分比同一性採用NCBI Blast的默認參數進行。
可以藉由從頭固相DNA合成或藉由PCR誘變編碼GITR抗體或其結合片段的現有序列(例如,表B和2中所示的序列),產生GITR抗體或其結合片段的多核苷酸序列。核酸的直接化學合成可以藉由本領域已知的方法完成,如Narang等,1979,Meth.Enzymol.68:90的磷酸三酯法;Brown等,Meth.Enzymol.68:109,1979的磷酸二酯法;Beaucage等,Tetra.Lett.,22:1859,1981的二乙基磷醯亞胺法;和美國專利號4,458,066的固相支持法。藉由PCR向多核苷酸序列引入突變可以如同例如PCR Technology:Principles and Applications for DNA Amplification,H.A.Erlich(編著),Freeman Press,NY,NY,1992;PCR Protocols:A Guide to Methods and Applications,Innis等(編著),Academic Press,San Diego,CA,1990;Mattila等,Nucleic Acids Res.19:967,1991;and Eckert等,PCR Methods and Applications 1:17,1991中所述那樣進行。
另一方面,本發明提供包含本發明的核酸的載體(簡稱本發明的載體)。
在一些實施方案中,本發明的載體是表達載體,即可以用來表達編碼結合GITR的抗體鏈(例如本發明的任何抗體)或多肽(例如本發明的任何融合物和綴合物)的多核苷酸。
基於病毒的表達載體和非病毒表達載體都可用於在哺乳動物宿主細胞中產生抗體。非病毒載體和系統包含質粒、游離型載體和人工染色體,一般含有用於表達蛋白質或RNA的表達盒(參見,例如,Harrington等,Nat Genet 15:345,1997)。有用的病毒載體包括基於逆轉錄病毒、腺病毒、腺伴隨病毒、皰疹病毒的載體,基於SV40、乳頭瘤病毒、HBP EB病毒、痘苗病毒載體和Semliki Forest病毒(SFV)的載體。參見,Smith,Annu.Rev.Microbiol.49:807,1995;和Rosenfeld等,Cell 68:143,1992。
另一方面,本發明提供包含本發明的載體的宿主細胞(簡稱本發明的宿主細胞)。
在一些實施方案中,本發明的宿主細胞是適合本發明載體的純株或表達的任何宿主細胞,包括原核或真核細胞。
在一些實施方案中,本發明的宿主細胞是細菌、酵母細胞、哺乳動物細胞或免疫效應細胞(如T細胞)。
例如,當不需要糖基化和Fc效應子功能時,抗體可以在細菌中生產。對於抗體片段和多肽在細菌中的表達,參見例如US 5,648,237、US 5,789,199和US 5,840,523。除了原核生物外,真核微生物例如絲狀真菌或酵母是用於抗體編碼載體的合適純株或表達宿主,包括糖基化途徑已被“人源化”的真菌和酵母菌株,這導致具有部分或完全人糖基化模式的抗體的生產。參見Gerngross,Nat.Biotech.22(2004)1409-1414;和Li,H.等,Nat.Biotech(2006)24:210-215。用於糖基化抗體表達的合適宿主 細胞也可以源自多細胞生物(無脊椎動物和脊椎動物)。無脊椎動物細胞的實例包括植物和昆蟲細胞。已經鑒定了眾多杆狀病毒株,其可以與昆蟲細胞結合使用,特別用於草地貪夜蛾(Spodoptera frugiperda)細胞的轉染。植物細胞培養物也可以用作宿主。參見,例如,US 5,959,177、US 6,040,498、US 6,420,548、US 7,125,978和US 6,417,429(描述用於在轉基因植物中生產抗體的PLANTIBODIESTM技術)。可以用作宿主的脊椎動物細胞包括,例如,懸浮生長適應化的哺乳動物細胞系可以是有用的。有用的哺乳動物宿主細胞系的其他實例是SV40轉化的猴腎CV1系(COS-7);人胚腎系(HEK293或例如Graham,F.L.等,J.Gen Virol.36(1997)59中描述的HEK293細胞);幼倉鼠腎細胞(BHK);小鼠塞爾托利細胞(例如Mather,J.P.,Biol.Reprod.23(1980)243-251中描述的TM4細胞);猴腎細胞(CV1);非洲綠猴腎細胞(VERO-76);人宮頸癌細胞(HELA);犬腎細胞(MDCK);Buffalo大鼠肝細胞(BRL 3A);人肺細胞(W138);人肝細胞(Hep G2);小鼠乳房腫瘤(MMT 060562);TRI細胞,例如Mather,J.P.等,Annals N.Y.Acad.Sci.383(1982)44-68中描述的;MRC 5細胞;FS4細胞。其他有用的哺乳動物宿主細胞系包括中國倉鼠卵巢(CHO)細胞,包括DHFR-CHO細胞(Urlaub,G.等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77(1980)4216-4220);和骨髓瘤細胞系,如Y0、NS0和Sp2/0。對於適合於抗體生產的一些哺乳動物宿主細胞系的綜述,參見,例如,Yazaki,P.和Wu,A.M.,Methods in Molecular Biology,Vol.248,Lo.B.K.C.(編輯),Humana Press,Totowa,NJ(2004)pp.255-268。
在一些較佳的實施方案中,大腸桿菌細胞(TG1細胞)、人胚腎系(293細胞)或人宮頸癌細胞(HELA)可以用來表達並產生結合GITR的本發明抗體。
另一方面,本發明提供一種包含製備本發明的抗體或其抗原結合片段、本發明的融合蛋白或本發明的免疫綴合物的方法(簡稱本發明的製備方法或本發明的方法),包括:在適於表達本發明的抗體或其抗原結合片段、融合蛋白或免疫綴合物的條件下,培養本發明的宿主細胞。
在一些實施方案中,本發明的方法中還包括採用有利於本發明的抗體或其抗原結合片段、融合蛋白或免疫綴合物表達和純化的任何表達手段,例如採用分泌信號序列、表達增強元件、高效的啟動子等本領域技術人員已知的任何表達、調節元件。
另一方面,本發明提供一種藥物組合物(簡稱本發明的藥物組合物),其包含本發明的抗體或其抗原結合片段、本發明的融合蛋白或本發明的免疫綴合物,以及視需要地藥用載體。
在一些實施方案中,本發明的藥物組合物進一步包含其他成分,例如免疫治療劑、抗血管生成劑及化療劑。
在一些實施方案中,本發明的藥物組合物中的免疫治療劑可以誘導或增強免疫應答,包括例如:1)樹突細胞活化劑;2)疫苗佐劑;3)T細胞刺激物;4)免疫檢查點抑制劑,以及5)抑制性細胞、細胞因子和/或酶的抑制劑。
在一些實施方案中,本發明的藥物組合物可包括用於治療癌症的其他化合物、藥物及/或藥劑,包括但不限於刺激針對給定癌症的免疫應答的化學療法藥物、小分子藥物或抗體。在一些情況下,治療組合物可包括:抗CTLA-4抗體、抗PD-1抗體、抗PDL-1抗體、抗OX40(亦稱作 CD134、TNFRSF4、ACT35及/或TXGP1L)抗體、抗CD137抗體或抗LAG-3抗體。
另一方面,本發明提供本發明GITR結合分子(抗體)在診斷和/或檢測中的用途(簡稱本發明的用途,或本發明的診斷和/或檢測用途)及其中使用的組合物。本文中提供的任何抗GITR抗體均可以用於檢測(定量或定性檢測)生物樣品中GITR的存在。例如藉由免疫組織化學、免疫細胞化學、流式細胞術(例如,FACS)、抗體分子複合的磁珠、ELISA測定法、PCR-技術(例如,RT-PCR)等檢測生物樣品中GITR的存在。在一些實施方案中,生物樣品包括體液、細胞或組織。在某些實施方案中,生物樣品是血、血清或生物來源的其他液體樣品。
在一個實施方案中,提供了抗GITR抗體用於診斷或檢測方法。在進一步的方面中,提供了檢測生物樣品中GITR存在的方法。在一些實施方案中,該方法包括將生物樣品在允許抗GITR抗體與GITR結合的條件下接觸本文中所述的抗GITR抗體,並且檢測抗GITR抗體和GITR之間是否形成了複合物。這樣的方法可以是體外或體內方法。
在一個實施方案中,將抗GITR抗體用於選擇適宜使用抗GITR抗體治療的受試者,例如,當GITR是用於患者選擇的生物標誌物時。可以使用本發明的抗體診斷的示例性病症包括免疫障礙或再生性障礙。在一些實施方案中,提供了用本發明的抗體對免疫障礙或再生性障礙患者進行分層的方法。在一些實施方案中,抗GITR抗體是與診斷劑或可檢測劑綴合的前述本發明任何免疫綴合物。在一些實施方案中,本發明提供用於診斷或檢測的試劑盒,其包含本發明的GITR結合分子,例如本發明的任何抗GITR抗體。
在一個實施方案中,本發明提供一種檢測樣品中GITR的存在的方法,包括:(a)將所述樣品與本發明的分離的抗體或其抗原結合片段、本發明的融合蛋白或本發明的免疫綴合物接觸;和(b)檢測所述抗體或其抗原結合片段、或融合蛋白或免疫綴合物和GITR蛋白之間複合物的形成。
另一方面,本發明提供本發明抗體的篩選、鑒定和表徵方法。可以藉由本領域已知的各種試驗,針對其物理/化學特性和/或生物活性,篩選、鑒定、或表徵本文中提供的抗GITR抗體。
可以從噬菌體/噬菌粒展示奈米抗體文庫中選擇與所關注的目標抗原以高親合力結合的噬菌體/噬菌粒。已有多種在噬菌體/噬菌粒表面呈遞或展示抗體或抗體片段以及篩選文庫的方法。
對於抗體的鑒定,可以就其抗原結合活性,例如藉由已知方法,如ELISA、αLISA、蛋白質印跡、抗體或反相陣列等、以及實施例中所述的方法,鑒定或表徵本發明的抗體。
例如,可以採用ForteBio測定法檢測抗體。ForteBio親和力測定可以按照現有的方法(Estep,P等,High throughput solution Based measurement of antibody-antigen affinity and epitope binning.MAbs,2013.5(2):第270-8頁)進行。例如,可以將AHQ傳感器在分析緩衝液中線下平衡30分鐘,然後線上檢測60秒建立基線。之後,將在線加載了經純化的抗體的AHQ傳感器,暴露於100nM抗原作用5分鐘,將傳感器轉移至分析緩衝液進行5分鐘的線下測量。使用1:1結合模型進行動力學分析。
另一方面,本發明提供一種治療癌性病症、誘導或增強個體中的免疫應答,和/或刺激抗原特異性T細胞應答的方法,其特徵在於包括向所述個體施用有效量的本發明的分離的抗體或其抗原結合片段、本發明的融合蛋白或本發明的免疫綴合物。
在一些實施方案中,免疫應答針對腫瘤抗原產生或針對感染性因子產生。
在一些實施方案中,本發明的上述方法可以治療或預防“免疫病症”,例如包括病理性炎症、炎性病症和自身免疫性病症或疾病,也包括感染、持續感染和增生性病症,例如癌症、腫瘤和血管發生,包括抗免疫系統根除的感染、腫瘤和癌症。
在一些實施方案中,本發明的上述方法可以治療或預防“免疫障礙”,其中免疫障礙指哺乳動物中由哺乳動物免疫系統成分引起、介導、或以其他方式促成發病的疾病;或刺激或干預免疫應答對疾病發展具有改善作用的疾病。“免疫障礙”包括自身免疫病、免疫介導的炎性疾病、非免疫介導的炎性疾病、傳染病和免疫缺陷病。
可使用本發明抗體治療的這些免疫相關疾病和炎性疾病的實例(其中有些是免疫或T細胞介導的)包括:系統性紅斑狼瘡、類風濕性關節炎、幼年型慢性關節炎、脊椎關節病、系統性硬化病(硬皮病)、特發性炎性肌病(皮肌炎、多肌炎)、乾燥綜合症、系統性血管炎、結節病、自身免疫性溶血性貧血(免疫性全血細胞減少症、陣發性夜間血紅蛋白尿)、自身免疫性血小板減少症(特發性血小板減少性紫癜、免疫介導的血小板減少症)、甲狀腺炎(格雷夫斯氏病、橋本甲狀腺炎、幼年型淋巴細胞性甲狀腺炎、萎縮性甲狀腺炎)、糖尿病、免疫介導的腎病(腎小球腎炎、腎小管間質性腎炎)、中樞和周圍神經系統的脫髓鞘病諸如多發性硬化病、特發性 脫髓鞘多神經病或格-巴二氏(Guillain-Barre)綜合症、和慢性炎性脫髓鞘多神經病、肝膽病諸如傳染性肝炎(甲型、乙型、丙型、丁型、戊型和其他非嗜肝病毒肝炎)、自身免疫性慢性活動性肝炎、原發性膽汁性肝硬化、肉芽腫性肝炎、和硬化性膽管炎、炎性和纖維化肺病諸如炎性腸病(潰瘍性結腸炎:克羅恩病)、麩膠敏感性腸病、和惠普爾氏(Whipple)病、自身免疫性或免疫介導的皮膚病包括大皰性皮膚病、多形紅斑和接觸性皮炎、銀屑病、變應性疾病諸如哮喘、變應性鼻炎、特應性皮炎、食物超敏反應和蕁麻疹、肺的免疫學疾病諸如嗜曙紅細胞性肺炎、特發性肺纖維化和超敏感性肺炎、移植相關疾病包括移植物排斥和移植物抗宿主疾病。傳染病包括AIDS(HIV感染)、甲型、乙型、丙型、丁型和戊型肝炎、細菌感染、真菌感染、原生動物感染和寄生蟲感染。
在一些實施方案中,本發明的上述方法可以治療或預防“癌性病症”,包括例如癌症、癌細胞、腫瘤、血管發生和癌變前病症,例如發育異常。
在一些實施方案中,癌症是轉移性癌症、難治性癌症或復發性癌症,更較佳是實體癌或血液癌;最較佳是黑色素瘤、肺癌、頭頸癌、結腸直腸癌、非小細胞肺癌、頭頸部的鱗狀細胞癌、膀胱癌、乳腺癌、子宮/子宮頸癌、卵巢癌、前列腺癌、睾丸癌、食道癌、胃腸癌、胰腺癌、結腸癌、腎癌、胃癌、生殖細胞癌、骨癌、肝癌、甲狀腺癌、皮膚癌、中樞神經系統的新生物、淋巴瘤、白血病、骨髓瘤、肉瘤或病毒相關癌症。
在一些實施方案中,本發明抗體的有效量是在個體中實現以下一項或多項的量:a)減輕效應T細胞活性的調節性T細胞抑制;b)降低循環調節性T細胞的水平;c)活化效應T細胞;d)誘導或增強效應T 細胞增殖;e)抑制腫瘤生長;f)誘導腫瘤消退;以及g)增加表達GITR的T細胞中的IL-2及/或IFN-γ產生、增加T細胞增殖。
在一些實施方案中,本發明的上述方法進一步包括以:a)施用化療;b)施用放射療法;和/或c)施用一種或多種另外的治療劑,較佳是免疫刺激劑。
在一些實施方案中,本發明的上述方法中的免疫刺激劑選自T-VEC、PD1拮抗劑、PDL1拮抗劑、CTLA-4拮抗劑及BiTE。
在一些實施方案中,本發明的上述方法中的化療、放射療法或治療劑是在所述抗體或其抗原結合片段之前、同時或之後施用。
描述以下實施例以輔助對本發明的理解。不意在且不應當以任何方式將實施例解釋成限制本發明的保護範圍。
實施例
實施例1.抗GITR奈米抗體的篩選
1. 駱駝免疫
將1mg抗原GITR-His(Acro biosystems)與弗氏佐劑(Sigma)等體積混合後平分於兩個管子中,免疫兩隻新疆雙峰駝。如此每週免疫一次,共免疫7次,刺激B淋巴細胞表達抗原特異性的奈米抗體。免疫七次之後,新疆雙峰駝中產生的GITR-His奈米抗體的血清滴度可達到1:1000以上,由此確定駱駝中產生期望的奈米抗體。
2. 噬菌體展示奈米抗體文庫的構建
(1)7次免疫結束後,提取100ml駱駝血液,分離外周血淋巴細胞,提取總RNA; (2)利用RT-PCR將步驟(1)中得到的總RNA反轉錄為cDNA,然後利用巢式PCR(兩次PCR)擴增得到VHH,其擴增原理如第1圖所示;(3)按照製造商的使用說明書,利用限制性內切酶PstI(NEB)及NotI(NEB)酶切20μg噬菌體展示載體及10μg VHH片段,然後利用T4連接酶(NEB)連接雙酶切得到的兩個片段;(4)將連接產物電轉化至感受態大腸桿菌細胞TG1中,構建奈米抗體文庫。
3. 抗GITR奈米抗體的篩選
(1)將溶解在100mM NaHCO3(pH8.2)中的抗原蛋白GITR-His(Acro biosystems)偶聯在酶標板(Nunc)上,4℃放置過夜;(2)第二天加入100μl封閉液(5% BSA(Jackson)),室溫封閉2小時;(3)2小時後,加入100μl噬菌體(5×1011PFU(plaque forming unit,噬菌體形成單位)上述構建的噬菌體展示奈米抗體文庫),室溫下作用1小時;(4)用PBST(PBS+0.05% Tween-20(Bio Basic Inc.,BBI))洗滌5次,以洗掉非結合的噬菌體;(5)用100mM TEA(Sigma)洗脫液將與抗原蛋白GITR-His特異性結合的噬菌體解離下來,之後感染處於對數期生長的大腸桿菌TG1細胞。37℃培養1小時,擴大培養噬菌體用於下一輪的篩選;(6)步驟(1)至(5)的篩選過程重複3輪,得到富集的與抗原蛋白GITR-His特異性結合的噬菌體。
4. PE-ELISA鑒定陽性純株
(1)從含有上述3輪篩選後得到的噬菌體的細胞培養皿中,隨機挑選1000個單菌落並接種於含有胺苄青黴屬(Amresco)的TB培養基(2%胰蛋白腖、2.4%酵母提取物、72mM K2HPO4、17mM KH2PO4、0.4%甘油)中。菌落生長至對數期後,加入IPTG(Sigma)至終濃度為1mM,28℃培養過夜;(2)利用常規滲透衝擊法獲得粗提抗體,並將粗提抗體轉移到已過夜包被抗原GITR-His的酶標板(Nunc)中,在室溫下孵育1小時;(3)用PBST洗去未結合的抗體,加入小鼠抗-HA tag抗體(SinoBiological),在室溫下放置1小時;(4)用PBST洗去未結合的抗體,加入山羊抗小鼠鹼性磷酸酶標記抗體(Millipore),在室溫下放置1小時;(5)用PBST洗去未結合的抗體,加入鹼性磷酸酶顯色液(新賽美M30100),於ELISA儀(Thermo(MULTISCAN FC))上,在405nm波長讀取吸收值;當樣品孔OD值大於對照孔OD值(Ratio:+/-)3倍以上時,判為陽性純株孔;(6)PE-ELISA(Post-Enrichment Enzyme-linked Immunosorbent Assay,富集後)結果共出現486顆陽性純株,其比值(Ratio:+/-)在3-30之間,隨後,將所有陽性純株轉至LB培養基中培養過夜,提取質粒並進行測序。
5. 測序結果分析
根據序列比對軟體Vector NTI分析各個純株的基因序列,將CDR1、CDR2、CDR3序列相同的株視為同一純株,而其序列不同的株視為不同純株。最終獲得22株序列不同的奈米抗體,其ELISA結果如表1所示。
Figure 108110498-A0101-12-0073-16
實施例2.重鏈抗體的構建及表達、純化
1. 構建重鏈抗體(hcIgG):
(1)PCR擴增奈米抗體Nb-02、Nb-03、Nb-04、Nb-07、Nb-09、Nb-10、Nb-16、Nb-20的cDNA。
(2)膠回收獲得各條PCR片段,藉由同源重組的方法(Vazyme,C112-01/02)構建入HEK293表達載體pTT5(Biotechnology Research Institute;Montreal,Canada)中,其中已包含DNA序列如下的IgG1 Fc片段:
Figure 108110498-A0101-12-0074-17
Figure 108110498-A0101-12-0074-18
(SEQ ID NO:126)。
(3)藉由測序(金唯智公司)驗證載體構建的正確性。
2. hcIgG蛋白的表達
(1)根據所需轉染體積傳代HEK293細胞(Invitrogen),轉染前一天將細胞密度調整至1×106/ml。轉染當天細胞密度約為2×106/ml;(2)取終體積1/10的F17(Gibco,A13835-01)培養基作為轉染緩衝液,每毫升轉染緩衝液加入10ug構建的HEK293表達載體pTT5,混勻;(3)每毫升轉染緩衝液加入30ug PEI(聚乙烯亞胺,Polysciences,23966)到質粒中,混勻後室溫孵育10分鐘。將混合物輕柔倒入HEK293細胞,36.5℃,8% CO2培養;(4)過夜後各補加轉染體積1/50的200g/L的FEED(Sigma,H6784-100G)和200g/L的葡萄糖母溶液,20小時後加VPA(丙戊酸Gibco,11140-050)至2mM/L;(5)連續培養至第7天時,離心收集細胞上清用以純化。
3. hcIgG蛋白純化
藉由HiTrapTM MabSelect SuReTM 5ml(GE Healthcare)純化目的hcIgG蛋白。具體過程如下:
(1)用0.1M NaOH將AKTA蛋白純化系統除去內毒(過夜)。收樣當天將上述細胞上清7500轉/分鐘離心30分鐘,使用SARTOPORE(Sartorius,5441307H4)過濾。純化前用5倍柱體積的結合緩衝液(Tris 20mM,NaCl 150mM,pH 7.2)清洗系統以及平衡柱子。將上述離心後得到的細胞上清藉由柱。用5~10倍柱體積結合緩衝液再平衡,至基線平衡。用洗脫緩衝液(檸檬酸+檸檬酸鈉100mM,pH3.5)洗 脫抗體,根據紫外吸收值來收集樣品。每1ml的收集液加80μl的中和緩衝液(Tris-HCl 2M)中和備用。
(2)純化後的蛋白利用SECC-HPLC(分子排阻高效液相色譜法)檢測純度,結果如第2圖所示,所有hcIgG經一步親和純化後純度均>97%。
得到重鏈抗體hcIgG-02、hcIgG-03、hcIgG-04、hcIgG-07、hcIgG-09、hcIgG-10、hcIgG-16和hcIgG-20,其具體序列示於表B中。
實施例3.重鏈抗體的性質鑒定
1. FortiBio KD測定
本實驗使用Fortebio方法(Estep,P等,High throughput solution Based measurement of antibody-antigen affinity and epitope binning.MAbs,2013.5(2):第270-278頁)測定抗原-抗體結合動力學及親和力,GITR Inc.的抗GITR抗體作為陽性對照(在本申請中稱為TRX518,根據US20130183321A1提供的序列進行選殖,輕鏈和重鏈的序列分別為US20130183321A1中的SEQ ID NO:44,和SEQ ID NO:54,瞬時轉染HEK293細胞進行表達獲得)。具體測定方法如下:
(1)準備傳感器:實驗開始前半個小時,將AHQ傳感器(Pall,1506091)浸泡於SD緩衝液(PBS 1×,BSA 0.1%,Tween-20 0.05%)中;
(2)實驗過程:取100μl的SD buffer、抗體(hcIgG-02、hcIgG-03、hcIgG-04、hcIgG-07、hcIgG-09、hcIgG-10、hcIgG-16和hcIgG-20,對照抗體)、GITR-His(Acro biosystems)分別加入到96孔黑色聚苯乙烯半量微孔板中。根據樣品位置布板,選擇傳感器位置,設置運行步驟及時間:Baseline、Loading~1nm、Baseline、Association和 Dissociation時間取決於樣品結合、解離速度,轉速為400轉/分鐘,溫度為30℃。
(3)使用1:1結合模型進行動力學分析,發現本發明抗體(hcIgG-02、hcIgG-03、hcIgG-04、hcIgG-07、hcIgG-09、hcIgG-10、hcIgG-16和hcIgG-20)均具有比對照抗體TRX518更高的親和力,結果如表2所示。
Figure 108110498-A0101-12-0077-19
2. 檢測hcIgG和細胞表面的抗原結合情況
(1)細胞準備:將攜帶純株至多選殖位點MCS的人GITR cDNA的pCHO1.0載體(Invitrogen)轉染至中國倉鼠卵巢癌細胞(CHO)(Invitrogen),產生過量表達人GITR的CHO細胞(CHO-GITR),將 由此構建的表面過表達人GITR的CHO細胞(CHO-GITR)計數,並稀釋至1×106個細胞/ml,向U型底96孔板中加入100μl/孔;
(1)檢測步驟:400g離心5分鐘,去除細胞培養基。將梯度稀釋的樣品加入U型板並重懸細胞,每孔加100μl,冰上靜置30分鐘。400g 5分鐘去除上清,PBS洗細胞1遍。400g離心5分鐘,去除PBS,每孔加入100μl 1:200稀釋的PE-抗人Fc抗體(Jackson Immuno Research)。冰上避光孵育30分鐘。400g離心5分鐘去除上清,PBS洗細胞1遍。用100μl PBS重懸細胞。
(3)FACS檢測。檢測結果如第3圖所示,所有測定的hcIgG(hcIgG-02、hcIgG-03、hcIgG-04、hcIgG-07、hcIgG-09、hcIgG-10、hcIgG-16和hcIgG-20)均可以和細胞表面表達的抗原相結合。
3. 差示掃描螢光檢測抗體Tm
差示掃描螢光法(DSF)可根據圖譜中的螢光變化過程提供有關結構穩定性的信息,檢測蛋白的構型變化。螢光曲線絕對值最大時對應的溫度為該蛋白的Tm。本研究利用DSF法,測定了抗GITR hcIgG的Tm值,用PBS稀釋抗體(hcIgG-02、hcIgG-03、hcIgG-04、hcIgG-07、hcIgG-09、hcIgG-10、hcIgG-16和hcIgG-20)樣品至1mg/ml。用PBS將SYPRO Orange protein gel stain(GIBCO)稀釋50倍,即4μl SYPRO Orange protein gel stain母液加196μl PBS。在96孔PCR板中加樣,50μl稀釋後抗體樣品+10μl SYPRO Orange protein gel stain稀釋液+40μl水。置於7500 real time PCR system進行檢測,結果如表3所示。
Figure 108110498-A0101-12-0079-20
檢測hcIgG介導的ADCC作用
本實驗利用Promega公司的ADCC Report Bioassay試劑盒對hcIgG介導的抗體依賴的(細胞介導的)細胞毒性作用(ADCC)作用進行了檢測。所用的效應細胞為穩定轉染NFAT-Luciferase報告基因的Jurkat細胞,靶細胞為過表達GITR的CHO細胞(CHO-GITR)。具體實驗過程如下:用ADCC Assay Buffer將靶細胞稀釋至2.5×105個/ml,每孔加入50μl靶細胞; 加入25μl梯度稀釋的抗體hcIgG-02、hcIgG-03、hcIgG-04、hcIgG-07、hcIgG-09、hcIgG-10、hcIgG-16和hcIgG-20(每種抗體的終濃度為3.33μg/ml、1.11μg/ml、0.37μg/ml、0.12μg/ml、0.041μg/ml、0.013μg/ml、0.0046μg/ml、0.0015μg/ml);用ADCC Assay Buffer將效應細胞稀釋至1.5×106個/ml,每孔加入25μl;37℃反應6小時;之後每孔加入等體積的室溫Bio-Glo Luciferase Reagent(Promega),室溫孵育10分鐘。
GloMax Multi+Plate Reader讀數。結果如第4圖所示。從圖中曲線趨勢可以看出,本發明的hcIgG(hcIgG-02、hcIgG-03、hcIgG-04、hcIgG-07、hcIgG-09、hcIgG-10、hcIgG-16和hcIgG-20)均能夠引起ADCC作用。
實施例4.抗GITR的重鏈抗體的人源化
1. hcIgG人源化改造
選擇hcIgG-07和hcIgG-20進行人源化改造,人源化過程按照已有方法(Ce'cile Vincke等,General Strategy to Humanize a Camelid Single-domain Antibody and Identification of a Universal Humanized Nanobody Scaffold.JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,2009.5(284):第3273-3284頁)進行,得到人源化抗體HzhcIgG-07和HzhcIgG-20(具體序列參見表B)。
2. FortiBio KD測定
本實驗使用Fortebio方法測定人源化之前的抗體hcIgG-20和人源化之後的抗體HzhcIgG-20的結合動力學及親和力,方法 同實施例3。ForteBio結果如表4。hcIgG-20和HzhcIgG-20維持了和GITR的結合能力,且親和力高於對照抗體TRX518。
Figure 108110498-A0101-12-0081-21
3. 檢測hcIgG和細胞表面的抗原結合情況
檢測方法同實施例4。流式細胞儀檢測細胞結合結果如第5圖。hcIgG-20和HzhcIgG-20均保持了細胞結合活性(EC50從1.631nM到1.873nM)。
4. 檢測hcIgG對GITR介導的信號通路的激活作用
野生型Hela細胞藉由工程改造後,表面過表達GITR蛋白。同時將表達NFkB結合位點和螢光報告素酶(Luciferase)表達基因的質粒轉入Hela-GITR細胞中獲得穩定的、同時表達GITR及NFkB螢光報告素酶基因的檢測用細胞株Hela-GITR-NFkB-Luc-Rep。本實驗利用該細胞檢測了hcIgG-20和HzhcIgG-20對GITR下游的NFkB信號通路的激活作用。具體實驗過程如下:將表面過表達Hela-GITR-NFkB-Luc-Rep細胞調節細胞密度至1×106個/ml,第一孔加入150μl細胞懸液,其他孔100μl,第一孔加入抗體,終濃度500nM,吸取50μl細胞懸液入下一孔,混勻,以此類推 (抗體稀釋終濃度為500nM、166.67nM、55.56nM、18.52nM、6.17nM、2.06nM、0.69nM、0.23nM、0.08nM、0.025nM),置於二氧化碳培養箱,過夜孵育。
室溫放置10分鐘後,每孔加入80μl的室溫Bio-Glo Luciferase Reagent(Promega),室溫孵育5分鐘。
GloMax Multi+Plate Reader讀數。流式細胞儀檢測細胞結合結果如第6圖。HzhcIgG-20對NFkB信號通路有激活作用,hcIgG-20、HzhcIgG-20及對照抗體TRX518的激活EC50分別為0.6894nM、0.6632nM和2.097nM,hcIgG-20、HzhcIgG-20均具有比對照抗體更優的NFkB通路激活能力。
實施例5.抗GITR 4xNb-IgG的構建及活性檢測
1. 構建4xNb-IgG分子
天然存在的單株抗體可以作為多聚體結構如IgM存在,其增加對固定表面上的其靶抗原的親合性。因為TNFR的激動作用需要受體聚集,所以四價或六價單株抗體可以提供增加的聚集和受體激動作用。本發明的多聚物形式的抗體包含四個相同的奈米抗體區域,其具體構建方法如下:4xNb-IgG-I:HzhcIgG-20的VHH部分(即HzhcIgG-20中的重鏈可變區VH)藉由GGGGS的柔性連接肽連接到HzhcIgG-20的C末端(如第7A圖);4xNb-IgG-II:HzhcIgG-20的VHH部分藉由GGGGS的柔性連接肽連接到HzhcIgG-20的N末端(如第7B圖);4xNb-IgG-III:HzhcIgG-20的VHH部分直接連接到HzhcIgG-20的N末端(如第7C圖)。
其中4xNb-IgG-I、4xNb-IgG-II和4xNb-IgG-III的具體序列參見表B。
將構建體藉由常規方法選殖到HEK293細胞的表達載體pTT5.1的XhoI/NotI多選殖位點中。將構建好的質粒轉染HEK293細胞,篩選表達和分泌的4xNb-IgG分子,並選擇正確的分子用於進一步的實驗。
2. 4xNb-IgG蛋白的表達及純化
4xNb-IgG的表達及純化方法同實施例2。純化後的蛋白利用SEC檢測純度,結果如第8圖所示,4xNb-IgG-I、4xNb-IgG-II和4xNb-IgG-III經一步親和純化後純度分別為97.5%、96.86%和97.21%。
3. FortiBio KD測定
本實驗使用Fortebio方法測定抗原-抗體結合動力學及親和力,方法同實施例4。ForteBio結果如表5所示。
Figure 108110498-A0101-12-0083-22
4. 檢測4xNb-IgG對GITR介導的信號通路的激活作用
檢測方法和實施例4基本類似,但是進行了優化,將抗體濃度降低,增加檢測的靈敏度。
實驗過程如下:將表面過表達Hela-GITR-NFkB-Luc-Rep細胞調節細胞密度至5×105個/ml,第一孔加入200μl細胞懸液,其他孔100μl,第一孔加入抗體,終濃度10nM,吸取100μl細胞懸液入下一孔,以此類推(抗體稀釋終濃度為10nM、5.00nM、2.50nM、1.25nM、0.63nM、0.31nM、0.16nM、0.08nM、0.04nM、0.02nM、0.01nM),置於二氧化碳培養箱,孵育7h。
室溫放置10分鐘,每孔加入80μl的室溫Bio-Glo Luciferase Reagent(Promega),室溫孵育5分鐘。
GloMax Multi+Plate Reader讀數。結果如第9圖所示,4xNb-IgG-I、4xNb-IgG-II和4xNb-IgG-III均顯示出比陽性對照更強的激活活性。
5. 本發明抗GITR抗體的抗腫瘤活性
利用MC38移植瘤小鼠模型研究了抗人GITR抗體4xNb-IgG-III單獨使用,或與抗鼠PD-1抗體“Antibody C”(WO2017/133540)聯合使用的抗腫瘤活性。
小鼠:雄性人GITR轉基因小鼠(約8週大)購自百奧賽圖基因生物技術有限公司。小鼠在到達後馴化7天,隨後開始研究。
細胞:小鼠結腸癌細胞MC38(ATCC)購自ATCC,並嚴格按照ATCC要求進行常規傳代培養用於後續體內實驗。離心收集細胞,在無菌PBS中重懸細胞並調整細胞密度為5×106個/ml。在第0天取0.2ml細胞懸液皮下接種至人GITR轉基因小鼠右側腹部區域中來建立荷瘤小鼠模型。
給藥:將小鼠分為四組(每組8隻小鼠),每組皮下注射如下劑量的抗體:(1)小鼠IgG對照(equitech-Bio),10mg/kg;(2)PD-1(Antibody C),1mg/kg;(3)4xNb-IgG-III,10mg/kg;(4)4xNb-IgG-III,10mg/kg PBS+PD-1(Antibody C),1mg/kg。
試劑注射:接種後第8天,將符合實驗要求的小鼠隨機分組,每組6隻。分別用如上四組試劑在第8天、第11天、第14天和第17天為每組小鼠按如上劑量給藥。
分析:在整個研究期間每週測量兩次腫瘤和體重,當腫瘤達到端點時或當小鼠具有>20%體重減輕時,使小鼠安樂死。採用遊標卡尺測定腫瘤的最大長軸(L)和最大寬軸(W),腫瘤體積按如下公式計算:V=L×W2/2。將來自每組的小鼠的腫瘤尺寸與時間作圖。使用方差分析(ANOVA)來確定統計顯著性。P<0.05的值被視為在所有分析中具有統計顯著性。
實驗結果見第10圖,可見:- 本發明的抗GITR抗體4xNb-IgG-III與IgG對照(equitech-Bio)相比,能顯著抑制腫瘤的生長;- 本發明的抗GITR抗體4xNb-IgG-III和抗PD-1單株抗體“Antibody C”聯合使用與IgG及這兩個抗體分別使用相比,能顯著抑制腫瘤的生長。
<110> 信達生物製藥(蘇州)有限公司
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<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 64
Figure 108110498-A0101-12-0098-88
Figure 108110498-A0101-12-0099-89
<210> 65
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 65
Figure 108110498-A0101-12-0099-90
<210> 66
<211> 126
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 66
Figure 108110498-A0101-12-0099-91
Figure 108110498-A0101-12-0100-92
<210> 67
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 67
Figure 108110498-A0101-12-0100-93
Figure 108110498-A0101-12-0101-94
<210> 68
<211> 116
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 68
Figure 108110498-A0101-12-0101-95
<210> 69
<211> 126
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 69
Figure 108110498-A0101-12-0101-96
Figure 108110498-A0101-12-0102-97
<210> 70
<211> 116
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 70
Figure 108110498-A0101-12-0102-98
Figure 108110498-A0101-12-0103-99
<210> 71
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 71
Figure 108110498-A0101-12-0103-100
<210> 72
<211> 122
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 72
Figure 108110498-A0101-12-0103-101
Figure 108110498-A0101-12-0104-102
<210> 73
<211> 116
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 73
Figure 108110498-A0101-12-0104-103
<210> 74
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 74
Figure 108110498-A0101-12-0105-104
<210> 75
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 75
Figure 108110498-A0101-12-0105-105
Figure 108110498-A0101-12-0106-107
<210> 76
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 76
Figure 108110498-A0101-12-0106-108
<210> 77
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 77
Figure 108110498-A0101-12-0107-109
<210> 78
<211> 129
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 78
Figure 108110498-A0101-12-0107-110
Figure 108110498-A0101-12-0108-111
<210> 79
<211> 128
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 79
Figure 108110498-A0101-12-0108-112
<210> 80
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 80
Figure 108110498-A0101-12-0109-113
<210> 81
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 81
Figure 108110498-A0101-12-0109-114
Figure 108110498-A0101-12-0110-115
<210> 82
<211> 126
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 82
Figure 108110498-A0101-12-0110-116
<210> 83
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 83
Figure 108110498-A0101-12-0111-117
<210> 84
<211> 129
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 84
Figure 108110498-A0101-12-0111-118
Figure 108110498-A0101-12-0112-119
<210> 85
<211> 128
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 85
Figure 108110498-A0101-12-0112-120
<210> 86
<211> 393
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 86
Figure 108110498-A0101-12-0113-121
<210> 87
<211> 375
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 87
Figure 108110498-A0101-12-0113-122
<210> 88
<211> 378
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 88
Figure 108110498-A0101-12-0113-123
<210> 89
<211> 375
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 89
Figure 108110498-A0101-12-0114-124
<210> 90
<211> 348
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 90
Figure 108110498-A0101-12-0114-125
<210> 91
<211> 378
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 91
Figure 108110498-A0101-12-0114-126
<210> 92
<211> 348
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 92
Figure 108110498-A0101-12-0115-127
<210> 93
<211> 375
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 93
Figure 108110498-A0101-12-0115-128
<210> 94
<211> 366
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 94
Figure 108110498-A0101-12-0115-129
<210> 95
<211> 348
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 95
Figure 108110498-A0101-12-0116-130
<210> 96
<211> 375
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 96
Figure 108110498-A0101-12-0116-131
<210> 97
<211> 375
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 97
Figure 108110498-A0101-12-0116-132
Figure 108110498-A0101-12-0117-134
<210> 98
<211> 363
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 98
Figure 108110498-A0101-12-0117-135
<210> 99
<211> 372
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 99
Figure 108110498-A0101-12-0117-136
<210> 100
<211> 387
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 100
Figure 108110498-A0101-12-0117-137
Figure 108110498-A0101-12-0118-138
<210> 101
<211> 384
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 101
Figure 108110498-A0101-12-0118-139
<210> 102
<211> 375
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 102
Figure 108110498-A0101-12-0118-140
<210> 103
<211> 375
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 103
Figure 108110498-A0101-12-0118-141
Figure 108110498-A0101-12-0119-142
<210> 104
<211> 378
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 104
Figure 108110498-A0101-12-0119-143
<210> 105
<211> 372
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 105
Figure 108110498-A0101-12-0119-144
<210> 106
<211> 387
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 106
Figure 108110498-A0101-12-0119-145
Figure 108110498-A0101-12-0120-146
<210> 107
<211> 384
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 107
Figure 108110498-A0101-12-0120-147
<210> 108
<211> 352
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 108
Figure 108110498-A0101-12-0120-148
Figure 108110498-A0101-12-0121-149
Figure 108110498-A0101-12-0122-150
<210> 109
<211> 353
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 109
Figure 108110498-A0101-12-0122-151
Figure 108110498-A0101-12-0123-152
<210> 110
<211> 352
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 110
Figure 108110498-A0101-12-0123-153
Figure 108110498-A0101-12-0124-154
Figure 108110498-A0101-12-0125-155
<210> 111
<211> 343
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 111
Figure 108110498-A0101-12-0125-156
Figure 108110498-A0101-12-0126-157
<210> 112
<211> 349
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 112
Figure 108110498-A0101-12-0127-158
Figure 108110498-A0101-12-0128-159
<210> 113
<211> 343
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 113
Figure 108110498-A0101-12-0128-160
Figure 108110498-A0101-12-0129-161
Figure 108110498-A0101-12-0130-162
<210> 114
<211> 355
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 114
Figure 108110498-A0101-12-0130-163
Figure 108110498-A0101-12-0131-164
<210> 115
<211> 351
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 115
Figure 108110498-A0101-12-0131-165
Figure 108110498-A0101-12-0132-166
Figure 108110498-A0101-12-0133-167
<210> 116
<211> 343
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 116
Figure 108110498-A0101-12-0133-168
Figure 108110498-A0101-12-0134-169
<210> 117
<211> 351
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 117
Figure 108110498-A0101-12-0135-170
Figure 108110498-A0101-12-0136-171
<210> 118
<211> 480
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 118
Figure 108110498-A0101-12-0136-172
Figure 108110498-A0101-12-0137-173
Figure 108110498-A0101-12-0138-174
<210> 119
<211> 480
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 119
Figure 108110498-A0101-12-0138-175
Figure 108110498-A0101-12-0139-176
Figure 108110498-A0101-12-0140-177
<210> 120
<211> 475
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 120
Figure 108110498-A0101-12-0140-178
Figure 108110498-A0101-12-0141-179
Figure 108110498-A0101-12-0142-180
<210> 121
<211> 227
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 121
Figure 108110498-A0101-12-0143-181
Figure 108110498-A0101-12-0144-182
<210> 122
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 122
Figure 108110498-A0101-12-0144-183
<210> 123
<211> 136
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 123
Figure 108110498-A0101-12-0144-184
<210> 124
<211> 116
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 124
Figure 108110498-A0101-12-0145-185
<210> 125
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 125
Figure 108110498-A0101-12-0145-186
Figure 108110498-A0101-12-0146-187
<210> 126
<211> 684
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 126
Figure 108110498-A0101-12-0146-188
<210> 127
<211> 142
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 127
Figure 108110498-A0101-12-0146-189
Figure 108110498-A0101-12-0147-190

Claims (24)

  1. 一種特異性結合糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(GITR)的奈米抗體,其特徵在於其從C端到N端包含FR4-HCDR3-FR3-HCDR2-FR2-HCDR1-FR1,其中的HCDR1、HCDR2和HCDR3的序列分別為:(1)SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:29和SEQ ID NO:51;(2)SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:32和SEQ ID NO:51;或(3)SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:42和SEQ ID NO:61。
  2. 如申請專利範圍第1項所述的奈米抗體,其包含或由以下組成:如SEQ ID NO:70、73、83和125中任一序列所示的重鏈可變區序列。
  3. 一種特異性結合糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(GITR)的重鏈抗體,其特徵在於所述重鏈抗體中的HCDR1、HCDR2和HCDR3的序列分別為:(1)SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:29和SEQ ID NO:51;(2)SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:32和SEQ ID NO:51;或(3)SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:42和SEQ ID NO:61。
  4. 如申請專利範圍第3項所述的的重鏈抗體,其重鏈可變區包含或由以下組成:如SEQ ID NO:70、73、83和125中任一序列所示的重鏈可變區序列。
  5. 如申請專利範圍第3項所述的的重鏈抗體,其包含重鏈可變區和Fc片段,所述Fc片段包含下述序列(a)-(c)之一或由下述序列(a)-(c)之一組成:(a)人IgG1的Fc片段;或(b)如SEQ ID NO:121所示的Fc片段;或(c)如SEQ ID NO:126所示核酸序列所編碼的Fc片段。
  6. 如申請專利範圍第3至5項中任一項所述的重鏈抗體,其中所述抗體是人源化重鏈抗體或是全人源重鏈抗體。
  7. 一種如申請專利範圍第1至5項中任一項所述的抗體的多聚物形式的抗體。
  8. 如申請專利範圍第7項所述的多聚物形式的抗體,其中所述重鏈抗體為人源化重鏈抗體。
  9. 如申請專利範圍第7項所述的多聚物形式的抗體,其為奈米抗體或重鏈抗體的四聚化或六聚化形式。
  10. 如申請專利範圍第7項所述的多聚物形式的抗體,其包含選自SEQ ID NO:118-120的任一序列。
  11. 如申請專利範圍第7項所述的多聚物形式的抗體,其由下述組成相同的兩條、三條或多條選自SEQ ID NO:118-120的序列組成。
  12. 一種融合蛋白,其包含如申請專利範圍第1至11項中任一項所述的抗體,和第二分子,其中所述第二分子選自蛋白/多肽、標記物、藥物或細胞毒性劑。
  13. 一種免疫綴合物,其包含如申請專利範圍第1至11項中任一項所述的抗體。
  14. 一種組合物,其包含如申請專利範圍第1至11項中任一項所述的抗體。
  15. 一種試劑盒,其包含如申請專利範圍第1至11項中任一項所述的抗體。
  16. 一種分離的核酸,其編碼如申請專利範圍第1至11項中任一項所述的抗體、如申請專利範圍第12項所述的融合蛋白或如申請專利範圍第13項所述的免疫綴合物。
  17. 一種包含如申請專利範圍第16項所述的核酸的表達載體。
  18. 一種包含如申請專利範圍第17項所述的載體的宿主細胞。
  19. 一種製備如申請專利範圍第1至11項中任一項所述的抗體、如申請專利範圍第12項所述的融合蛋白或如申請專利範圍第13項所述的免疫綴合物的方法,包括在適於表達所述抗體或所述抗體的抗原結合片段、融合蛋白或免疫綴合物的條件下,培養如申請專利範圍第18項所述的宿主細胞。
  20. 一種藥物組合物,其包含如申請專利範圍第1至11項中任一項所述的抗體、如申請專利範圍第12項所述的融合蛋白或如申請專利範圍第13項所述的免疫綴合物。
  21. 如申請專利範圍第20項所述的藥物組合物,其還包括藥用載體。
  22. 一種檢測樣品中GITR的存在的方法,包括:(a)將所述樣品與如申請專利範圍第1至11項中任一項所述的抗體、如申請專利範圍第12項所述的融合蛋白或如申請專利範圍第13項所述的免疫綴合物接觸;和 (b)檢測所述抗體或其抗原結合片段、或融合蛋白或免疫綴合物和GITR蛋白之間複合物的形成。
  23. 一種如申請專利範圍第1至11項中任一項所述的抗體、如申請專利範圍第12項所述的融合蛋白或如申請專利範圍第13項所述的免疫綴合物在製備用於治療癌症、誘導或增強個體中的免疫應答和/或刺激抗原特異性T細胞應答的藥物中的用途。
  24. 如申請專利範圍第1至11項中任一項所述的抗體,其中所述抗體具有以下一種或多種特性:(i)以小於10nM的親和力與人GITR結合;(ii)以大於0.1×104/Ms的結合常數與人GITR結合;(iii)以小於1.5×10-3s-1的低解離常數與人GITR結合;(iv)與細胞表面的抗原高親和力結合,即以小於50nM的高親和力與人GITR結合;(v)高效激活GITR下游的NFkB信號通路,即激活NFkB信號通路的EC50值小於1nM。
TW108110498A 2018-03-26 2019-03-26 抗糖皮質激素誘導的腫瘤壞死因子受體(gitr)的小型化抗體、其聚合物及應用 TWI724393B (zh)

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