WO2018043546A1 - 変異型酵素の製造方法及び変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ - Google Patents
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- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/62—Carboxylic acid esters
Definitions
- the present invention relates to a method for producing a mutant enzyme and a mutant alcohol acyltransferase. More specifically, the present invention relates to a method for obtaining an enzyme such as alcohol acyltransferase as a highly active soluble recombinant protein.
- the protein After the protein is translated in the cell, the protein is folded into a unique three-dimensional structure and has a function.
- a heterologous protein is expressed using a transformant (recombinant)
- normal folding of the protein is not performed in the host cell, and an inclusion body may be formed.
- the protein in the inclusion body becomes an inactive protein in which the original activity is lost, and is insolubilized in some cases.
- the formation of inclusion bodies is thought to be due to the fact that the protein does not normally fold in the intracellular environment of the host, which is different from the intracellular environment (temperature, transcription rate, translation rate, etc.) of the protein-derived species. Yes.
- Non-patent Document 1 an enzyme whose solubility has been greatly improved by introduction of mutations has been obtained.
- Patent Documents 1 to 3 propose a method for producing isobutyric acid ester or methacrylic acid ester from isobutyryl-CoA or methacrylyl-CoA produced from biomass using alcohol acyltransferase (AAT).
- Carboxylic acid esters are used as raw materials for various industrial chemicals, fragrances, pharmaceuticals and the like.
- isobutyric acid ester is an ester compound that is important as a raw material mainly for fragrance esters, pharmaceuticals, peroxides and the like.
- Methacrylic acid esters are mainly used as raw materials for acrylic resins, and are in great demand as comonomers in fields such as paints, adhesives and resin modifiers.
- esters such as isobutyric acid ester and methacrylic acid ester from biomass using AAT
- a gene group for synthesizing CoA compounds such as isobutyryl-CoA and methacrylyl-CoA from biomass, and from CoA compounds to esters Fermentative production using a recombinant microorganism introduced with an AAT gene that catalyzes the reaction is conceivable.
- Non-patent Document 2 Plant-derived AAT is known to be expressed as an inactive insoluble protein in the majority when expressed using Escherichia coli as a host (Non-patent Document 2).
- Non-patent Documents 3 and 4 when apple-derived AAT is expressed in an E. coli recombinant, it is obtained as a soluble protein only when a specific strain (C43 (DE3)) is used, and a general strain (BL21 ( It has been reported that DE3) derivative strain) was not obtained as a soluble protein.
- C43 specific strain
- BL21 It has been reported that DE3 derivative strain
- the main object of the present invention is to provide an efficient method for expressing the target protein as an active soluble recombinant protein in the recombinant.
- the present invention provides the following [1] to [25].
- [1] A step of expressing a variant having an amino acid sequence in which two or more cysteines are substituted with other amino acid residues in the amino acid sequence of the reference product, A method for producing an enzyme having improved activity per recombinant as compared to a standard.
- [2] The method for producing an enzyme according to [1], comprising the following steps; (1) creating a recombinant that expresses a mutant having an amino acid sequence in which one or more cysteines are substituted with other amino acid residues in the amino acid sequence of the reference compound; (2) a step of selecting a plurality of mutants exhibiting an activity per recombinant of 50% or more compared to 100% of the activity of the reference body, (3) A step of expressing a variant in which corresponding amino acid residues are substituted at two or more sites among the sites in which the amino acid residues of each variant selected in step (2) are substituted. . [3] The method for producing an enzyme according to [1] or [2], wherein the enzyme is an alcohol acyltransferase.
- a mutant alcohol acyltransferase having improved activity compared to a reference substance A mutant alcohol acyltransferase having an amino acid sequence in which one or more cysteines are substituted with other amino acid residues in the reference amino acid sequence.
- mutant alcohol acyltransferase of [6] having one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2; (1) Substitution of the 48th cysteine to another amino acid residue, (2) substitution of the 150th cysteine to another amino acid residue, (3) substitution of the 167th cysteine to another amino acid residue, (4) substitution of the 270th cysteine with another amino acid residue, (5) substitution of 274th cysteine with another amino acid residue, (6) Substitution of 447th cysteine to another amino acid residue.
- mutant alcohol acyltransferase of [6] having one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 64 or 66; (1) substitution of the 206th cysteine with another amino acid residue, (2) substitution of the 209th cysteine with another amino acid residue, (3) substitution of the 256th cysteine to another amino acid residue, (4) substitution of the 269th cysteine to another amino acid residue, (5) Substitution of 322nd cysteine to another amino acid residue.
- [14] The mutant alcohol acyltransferase of [6] having one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 65; (1) substitution of the 115th cysteine to another amino acid residue, (2) substitution of the 167th cysteine with another amino acid residue, (3) substitution of the 179th cysteine to another amino acid residue, (4) substitution of the 325th cysteine to another amino acid residue, (5) Substitution of 356th cysteine to another amino acid residue.
- the mutant alcohol acyltransferase of [12] comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4 or 7.
- the mutant alcohol acyltransferase according to [17] comprising the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 5, 6, 8 to 11, 13.
- a mutant alcohol acyltransferase comprising an amino acid sequence having 70% or more sequence identity with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2,
- a mutant alcohol acyltransferase having one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions; (1) substitution of the amino acid residue corresponding to the 64th alanine with valine, isoleucine or threonine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2; (2) substitution of the amino acid corresponding to the 117th lysine with glutamine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2; (3) substitution of the amino acid corresponding to the 248th valine with alanine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2; (4) Substitution of the amino acid corresponding to the 363th glutamine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2 with lysine, proline, adenine, arginine, gly
- the present invention also provides the following [1] to [24].
- [1] A method for producing an enzyme having improved activity per recombinant as compared to a standard, comprising the following steps. (1) A step of creating a recombinant that expresses a mutant having an amino acid sequence in which one or more cysteines are substituted with other amino acid residues in the amino acid sequence of the reference body. (2) A step of selecting a mutant having an activity per recombinant of 50% or more compared to a reference body. (3) A step of expressing a mutant introduced with the corresponding amino acid substitution at two or more sites among the sites introduced with the amino acid substitutions of the respective variants selected in step (2).
- [2] The production method of [1], wherein the enzyme is an alcohol acyltransferase.
- [5] A step of expressing a mutant having an amino acid sequence in which one or more cysteines are substituted with other amino acid residues in the amino acid sequence of the reference body, And a method for producing an enzyme having improved activity per recombinant as compared to a standard.
- the production method of [6], wherein the amino acid sequence of the reference is an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 3.
- [8] The method according to any one of [5] to [7], wherein the other amino acid residue is alanine or arginine.
- a mutant alcohol acyltransferase comprising an amino acid sequence having 80% or more sequence identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
- a mutant alcohol acyltransferase having one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions: (1) Substitution of the cysteine corresponding to the 48th cysteine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 with another amino acid residue. (2) Substitution of the cysteine corresponding to the 150th cysteine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 with another amino acid residue. (3) Substitution of the cysteine corresponding to the 167th cysteine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 with another amino acid residue.
- Substitution of the 48th cysteine to another amino acid residue. Substitution of the 150th cysteine to another amino acid residue.
- Substitution of the 167th cysteine with another amino acid residue. (4) Substitution of 270th cysteine to another amino acid residue.
- the mutant alcohol acyltransferase according to [11] wherein the other amino acid residue is alanine or arginine.
- a mutant alcohol acyltransferase comprising an amino acid sequence having 80% or more sequence identity with the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1,
- a mutant alcohol acyltransferase having one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions: (1) Substitution of the amino acid residue corresponding to the 64th alanine with valine, isoleucine or threonine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1. (2) Substitution of the amino acid corresponding to the 248th valine with alanine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1.
- a method for producing a plant-derived enzyme having improved activity per recombinant as compared to a reference body (1) creating a non-plant cell recombinant that expresses a mutant having an amino acid sequence in which one or two or more cysteines are substituted with other amino acid residues in the amino acid sequence of the reference body; (2) measuring the enzyme activity per recombinant of the mutant; (3) selecting a mutant that exhibits 50% or more activity per recombinant as compared to the reference; (4) Expressing, in the non-plant cell, a mutant in which the corresponding amino acid substitution is introduced in two or more sites among the sites in which the amino acid substitutions of the respective variants selected in step (3) are introduced
- a manufacturing method comprising: [22] The production method of [21], wherein the enzyme is an apple-derived alcohol acyltransferase.
- the “reference substance” means an enzyme to which substitution of one or more cysteines into other amino acid residues is introduced.
- the amino acid sequence of the mutant enzyme obtained by the production method according to the present invention is different from the amino acid sequence of the reference substance only in that one or more cysteines are substituted with other amino acid residues.
- the reference body is not limited to a natural type (wild type) enzyme, and may be a mutant type enzyme in which one or more amino acid substitutions are introduced into the amino acid sequence of the wild type enzyme.
- the reference body is an amino acid sequence in which one or more amino acids are inserted or added to the amino acid sequence of the wild type enzyme, or a mutant type having an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted from the amino acid sequence of the wild type enzyme. It may be an enzyme. By using these mutant enzymes as reference substances and further introducing substitution of one or more cysteines into other amino acid residues, mutant enzymes with improved activity can be obtained.
- the present invention provides an efficient method for expressing a target protein as an active soluble recombinant protein in a recombinant.
- FIG. 65 shows alignment of the amino acid sequence of AAT derived from SEQ ID NO: 65 (strawberry), SEQ ID NO: 71 (Chile strawberry), SEQ ID NO: 72 (Ezosnake strawberry), and SEQ ID NO: 73 (Humanus).
- FIG. 65 shows alignment of the amino acid sequence of AAT derived from SEQ ID NO: 65 (strawberry), SEQ ID NO: 71 (Chile strawberry), SEQ ID NO: 72 (Ezosnake strawberry), and SEQ ID NO: 73 (Humanus).
- FIG. 65 shows alignment of the amino acid sequence of AAT derived from SEQ ID NO: 65 (strawberry), SEQ ID NO: 71 (Chile strawberry), SEQ ID NO: 72 (Ezosnake strawberry), and SEQ ID NO: 73 (Humanus).
- FIG. 65 shows alignment of the amino acid sequence of AAT derived from SEQ ID NO: 65 (strawberry), SEQ ID NO: 71 (Chile strawberry), SEQ ID NO:
- the upper row shows a mutant (pAAT021) in which a quadruple mutation is introduced into apple wild-type AAT, a mutant in which cysteine 6 substitution is introduced (pAAT024), a mutant in which quadruple mutation and cysteine 6 substitution are introduced (pAAT025), 4 About the recombinant which expresses the mutant (pAAT155) which introduced the double mutation and Cys150Arg introduction (pAAT155), the quadruple mutation and cysteine 6 substitution (of which Cys150Arg is the 150th place), AAT activity per cell weight It is a graph which shows the measurement result.
- the vertical axis shows AAT activity as a relative value with the activity of a recombinant expressing a reference (pAAT116) having no quadruple mutation and cysteine substitution as 1.
- the lower part of the figure is an SDS-polyacrylamide gel electrophoresis image of the soluble fraction and the insoluble fraction of the cell extract containing the mutant.
- the upper part of the figure shows a mutant (pAAT021) in which a quadruple mutation is introduced into apple wild-type AAT (pAAT021), a mutant in which a quadruple mutation and cysteine 6 substitution are introduced (pAAT025), and a mutant in which a quadruple mutation and cysteine 5 substitution are introduced ( (pAAT151)
- the vertical axis shows AAT activity as a relative value with the activity of a recombinant expressing a reference (pAAT116) having no quadruple mutation and cysteine substitution as 1.
- the lower part of the figure is an SDS-polyacrylamide gel electrophoresis image of the soluble fraction and the insoluble fraction of the cell extract containing the mutant.
- the upper part of the figure shows a recombinant that expresses 8 types of mutants prepared by substituting 8 cysteines of tomato AAT one by one with alanine, and a mutant in which cysteine 5 substitution is introduced into tomato wild-type AAT (pAAT164). It is a graph which shows the result of having measured AAT activity per cell weight about the recombinant which expresses.
- the vertical axis shows the AAT activity as a relative value with the activity of the recombinant expressing the reference body (pAAT032) as 1.
- the lower part of the figure is an SDS-polyacrylamide gel electrophoresis image of the soluble fraction and the insoluble fraction of the cell extract containing the mutant.
- the upper row shows a recombinant that expresses nine types of mutants prepared by substituting nine cysteines of strawberry AAT one by one with alanine, and a mutant in which cysteine 5 substitution is introduced into strawberry wild type AAT (pAAT037). It is a graph which shows the result of having measured AAT activity per cell weight about the recombinant which expresses.
- the vertical axis shows AAT activity as a relative value with the activity of the recombinant expressing the reference body (pAAT033) as 1.
- the lower part of the figure is an SDS-polyacrylamide gel electrophoresis image of the soluble fraction and the insoluble fraction of the cell extract containing the mutant.
- the present invention includes a step of expressing a mutant having an amino acid sequence in which two or more cysteines are substituted with other amino acid residues in the amino acid sequence of the reference body, as compared with the reference body.
- the present invention relates to a method for producing an enzyme having improved activity per recombinant.
- the method for producing a mutant enzyme according to the present invention includes the following steps (1) to (3).
- (1) A step of creating a recombinant that expresses a mutant having an amino acid sequence in which one or more cysteines are substituted with other amino acid residues in the amino acid sequence of the reference body.
- (2) A step of selecting a plurality of mutants exhibiting an activity per recombinant of 50% or more as compared with 100% of the activity of the reference body.
- the enzyme targeted by the method for producing a mutant enzyme according to the present invention forms an inclusion body in a transformant (recombinant) when a reference body is expressed in a host different from the species from which the enzyme is derived. It is preferably an enzyme.
- the enzyme targeted by the method for producing a mutant enzyme according to the present invention is, for example, a plant-derived enzyme, and an inclusion body in a recombinant cell when a reference body is expressed in a non-plant cell such as Escherichia coli. It may be an enzyme that forms
- enzymes include, but are not limited to, transferases such as alcohol acyltransferase (AAT); oxidoreductases such as dehydrogenase, oxidase, and oxygenase; hydrolases such as esterase, nitrilase, and amidase; racemase, epimerase, and mutase Examples include isomerases; ligases such as acyl CoA synthetase and DNA ligase; and lyases such as nitrile hydratase, hydroxynitrile lyase, and ammonia lyase.
- transferases such as alcohol acyltransferase (AAT); oxidoreductases such as dehydrogenase, oxidase, and oxygenase; hydrolases such as esterase, nitrilase, and amidase; racemase, epimerase, and mutase
- transferases such as alcohol acyltransfera
- Examples of the origin of the enzyme include animals, plants, filamentous fungi, yeasts, archaea and eubacteria, and are not particularly limited as long as they have the above characteristics.
- the origin of the AAT of the present invention includes, for example, Zingiberales, Rosales, Azaleas (Ericales), Cucurbites, Brassicales, Laureles, Rice ( Poales, Alesales, Asparagales, Saxifragales, Caryophyllese, Vitales, Alpidae, Malphiales , Sapindales, Mallows, Myrtales, Buttercups (Ranunculales), Solanales (Solanales), lamiales (Lamiales), those belonging to one of the eye selected from the group consisting of gentianales (Gentianales) and calycerales (Asterales).
- Zingiberales Rosales, Azaleas, Ericales, Cucurbitales, Brassicales and Laurales
- Musaceae and Zingiberaceae as for belonging to Rosaceae, for Rosaceae and Moraceae, as for belonging to Azalea (Ericaceae) , Actinidaceae, Ebenaceae and Theaceae, Cucurbitaceae as belonging to the order of Cucurbitaceae, Papaceae (Caricaceae) and Rasaceae as belonging to the order of Brassicaceae As for the family belonging to the order of the camphoraceae, Lauraceae, as for the order of the rice, the pineapple family (Bromeliaceae) e) and Gramineae (Poaceae), as for those belonging to the order of coconuts (Arecaceae), as belonging to the order of Cryptoniaceae (Orchidaceae), for the family of Iridaceae, and as for those belonging to the order of Cryptoniaceae (Grossulariaceae), those belonging to the order of Nadesicoaceae (Cary
- the genus Musa belongs to the genus Musacea
- the genus Zingiberaceae belongs to the genus Zingiber
- the genus Rosaceae belongs to the genus Fragaria, the apple (Malus) ), Prunus, Pyrus, Eriobotrya, Chaenomeles, Rubus and Rose, Moraceae (Ficus), belonging to the genus Azalea, belonging to the genus Vaccinium, belonging to the family Matabidae, belonging to the genus Actinidia, belonging to the oyster family, Diospyros
- camellia family camellia (Camellia) genus, as for belonging to the Cucurbitaceae family, the genus Cucumis and the watermelon (Citullulus) genus, as belonging to the family of papaya family, the genus Papaya (Carica) and Vasconcellea (Vasconcellea) ), Belonging to
- Genus belonging to the genus Phyllidae, belonging to the genus Gypsophila, belonging to the vine family, belonging to the genus Gratis (Vitis), belonging to the family Quintranoaceae, belonging to the genus Malpighia, As for those belonging to the genus Passiflora, belonging to Euphorbiaceae, belonging to the genus Ricinus, as belonging to the willow family, as belonging to the genus Populus, as belonging to the family Oxalis, to the genus Averrhoa, legume As belonging to the genus Medagogo, the genus Lupinus, the genus soybean (Glycine) and the genus Clitoria, as belonging to the citrus family, the genus Citrus and Aegle, As belonging to the genus Litchi, belonging to the urushi family, genus Mangofera, belonging to the mallow family, genus Durian and cocoa (Theobroma), pome
- the plant belonging to the genus (Rauvolfia), the genus Catharanthus, and the family Asteraceae is preferably a plant of the genus Chamaemelum.
- a plant belonging to the genus Bacho, Dutch strawberry, Apple, Sakura, Pear, Sunoki, Matabi, Cucumber, Papaya or Alligator is more preferable.
- plants belonging to the genus Bacho, apple genus, pear genus, loquat genus, oyster mushroom genus, matabavi genus, cucumber genus, papaya genus or crocodile genus are particularly preferred.
- those belonging to the genus Basho include bananas (Musa xadparadisiaca), Basho (Musa basjoo), Himebasho (Musa coccinea), Malayamabasho (Musa acuminata), and ginger (Zing) as belonging to the genus Ginger.
- bananas Musa xadparadisiaca
- Basho Musa basjoo
- Himebasho Moccinea
- Malayamabasho Malayamabasho
- Zing ginger
- officinale and the Dutch strawberry genus are the Dutch strawberry (Fragaria x ananassa) (hereinafter sometimes simply referred to as “strawberry”), Virginia strawberry (Fragaria virginiana), Chile strawberry (Fragaria chiloensis) and Ezo snake strawberry.
- Enzymes targeted by the method for producing a mutant enzyme according to the present invention are particularly derived from plants such as apples, tomatoes, strawberries, pears, loquats, oysters, melons, bananas, papayas, salamanders, grapes, kiwi and roman chamomile.
- AAT derived from apple, tomato, strawberry, pear, loquat and oyster is preferable.
- SEQ ID NOs: 1 to 3 examples of amino acid sequences of enzymes that can be used as “reference substances” in the method for producing a mutant enzyme according to the present invention are shown in SEQ ID NOs: 1 to 3.
- SEQ ID NO: 1 shows the amino acid sequence of wild type AAT. Wild type apple AAT has 15 cysteines in the amino acid sequence.
- SEQ ID NO: 2 is the amino acid sequence of mutant AAT (M2K type AAT) in which the second methionine is substituted with lysine in the amino acid sequence of wild type AAT.
- SEQ ID NO: 3 is a mutant AAT in which the 64th alanine is replaced with valine, the 248th valine with alanine, the 363rd glutamine with lysine, and the 117th lysine with glutamine in the amino acid sequence of wild-type AAT (This mutant AAT is highly active compared to wild-type AAT).
- SEQ ID NOs: 64 and 66 show examples of amino acid sequences of enzymes that can serve as “reference substances” in the method for producing a mutant enzyme according to the present invention.
- SEQ ID NO: 66 shows the amino acid sequence of tomato (wild-type) wild-type AAT.
- SEQ ID NO: 64 is the amino acid sequence of mutant AAT (A2K type AAT) in which the second alanine is substituted with lysine in the amino acid sequence of wild type AAT.
- A2K type AAT mutant AAT
- SEQ ID NO: 65 amino acid sequence of an enzyme that can be a “reference substance” in the method for producing a mutant enzyme according to the present invention is shown in SEQ ID NO: 65.
- SEQ ID NO: 65 is the amino acid sequence of wild type AAT.
- Step (1) This step is a step of preparing a recombinant that expresses a mutant having an amino acid sequence in which one or more cysteines are substituted with other amino acid residues in the amino acid sequence of the reference body.
- a plurality of recombinants are produced that express a variant having an amino acid sequence in which one or more cysteines are replaced with other amino acid residues in the amino acid sequence of the reference body.
- N cysteines are present in the amino acid sequence of the standard
- N types of mutants in which each cysteine is substituted with an amino acid other than cysteine can be prepared.
- N cysteines are present in the amino acid sequence of the standard
- N (N-1) / 2 types of mutants in which any two cysteines are substituted with amino acids other than cysteine can be prepared.
- the number of cysteines to be substituted in one mutant may be 1 or 2 or more, and is at most less than the total number of cysteines present in the amino acid sequence of the reference body.
- the number of cysteines substituted in one variant is preferably 1.
- the number of substituted cysteines among the plurality of mutants to be created may be different or the same.
- the amino acid substituted from cysteine is not particularly limited as long as it is an amino acid other than cysteine, and can be, for example, alanine or arginine.
- the DNA encoding the amino acid sequence of the mutant can be prepared by introducing a mutation into the DNA encoding the amino acid sequence of the reference body by a conventionally known genetic engineering technique.
- a DNA encoding the amino acid sequence of the created mutant is conventionally incorporated into a general-purpose expression vector.
- the expression of the mutant may be performed by introducing an expression vector into the host cell by a conventionally known technique.
- Host cells are not particularly limited, and bacteria include E. coli, Rhodococcus genus, Pseudomonas genus, Corynebacterium genus, Bacillus genus, Streptococcus genus, Streptomyces genus, etc.
- yeast Saccharomyces genus
- Candida Examples of filamentous fungi include the genus Aspergillus. Among these, it is particularly convenient to use E. coli, because it is simple and efficient.
- the enzyme activity per recombinant of the mutant prepared in step (1) may be measured.
- the enzyme activity per recombinant of the mutant is measured by preparing a cell extract or cell disruption solution containing the mutant from a certain amount of the recombinant into which an expression vector containing DNA encoding the amino acid sequence of the mutant has been introduced. Then, it may be carried out by measuring the enzyme activity in the cell extract or the like.
- the enzyme activity can be measured by mixing the substrate of the enzyme reaction with a cell extract and the like, and detecting the amount of the reaction product produced using a known means such as chromatography.
- Step (2) This step is a step of selecting a plurality of mutants that exhibit 50% or more activity per recombinant as compared to 100% of the activity of the reference body.
- the activity per recombinant of the mutant is 50% or more compared to 100% of the activity of the reference body” means that the reaction product catalyzed by the mutant expressed from a certain amount of the recombinant. It means that the amount is 50% or more of the amount of the reaction product catalyzed by the reference compound expressed from the same amount of the recombinant under the same conditions due to the high activity and solubility of the mutant.
- step (1) when 10 cysteines are present in the amino acid sequence of the reference substance, and each of the cysteines is replaced with an amino acid other than cysteine and 10 variants are prepared, the activity of the reference substance is 100%. When five types of mutants exhibiting activity per recombinant of 50% or more are present, those five types of mutants are selected.
- cysteines present in the amino acid sequence of the reference body, cysteines that maintain a certain enzymatic activity even when this is replaced with other amino acids in the mutant have a small contribution to the normal protein folding of the reference body. Rather, it is believed that when the reference is expressed in a host cell different from the source species, it may interfere with normal protein folding by forming excess disulfide bonds.
- the criterion for selecting a mutant is to show 50% or more of the activity per recombinant as compared with 100% of the activity of the standard, but higher activity than 100% of the activity of the standard.
- a reference substance that shows an activity per recombinant of 60% or more, preferably 70% or more, more preferably 80% or more, further preferably 90% or more, and most preferably 100% or more.
- Step (3) This step is a step of expressing a variant in which corresponding amino acid residues are substituted at two or more sites among the sites in which the amino acid residues of each variant selected in step (2) are substituted. .
- cysteines are present in the amino acid sequence of the above-mentioned standard
- cysteines that maintain a certain enzyme activity even when they are substituted with other amino acids in the mutant are different from the reference species. When expressed in host cells, it may interfere with normal protein folding. Mutants in which all of these cysteines are substituted with other amino acids are normally or nearly normal folded when expressed in a host cell different from the source species, and are thus expressed in the host cell. It is considered that it becomes highly active and highly soluble as compared to the reference standard.
- the amino acid substituted from cysteine in the variant in this step is preferably the same as the amino acid substituted from cysteine in the variant selected in step (2), but may be different.
- the activity of the recombinant can be further improved by variously changing the type of amino acid substituted from cysteine.
- the DNA encoding the amino acid sequence of the mutant in this step can also be prepared by introducing a mutation into the DNA encoding the amino acid sequence of the reference body by a conventionally known genetic engineering technique.
- the DNA encoding the produced mutant is incorporated into a conventional general-purpose expression vector, and is transfected into a host cell and expressed in the same manner as in step (1).
- Mutant alcohol acyltransferase I The present invention also provides a mutant AAT obtained by the aforementioned method for producing a mutant enzyme.
- the mutant AAT according to the present invention is a mutant alcohol acyltransferase having an improved activity compared to a reference substance, wherein one or more cysteines are substituted with other amino acid residues in the reference substance amino acid sequence A mutant alcohol acyltransferase having a sequence.
- the mutant AAT according to the present invention has one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions in the reference amino acid sequence.
- Reference bodies are wild type apple AAT (SEQ ID NO: 1), mutant type AAT in which the second methionine is substituted with lysine in the amino acid sequence of wild type apple AAT (SEQ ID NO: 2, apple M2K type), or wild type apple AAT
- the mutated AAT (SEQ ID NO: 3) in which the 64th alanine is replaced with valine, the 248th valine with alanine, the 363rd glutamine with lysine, and the 117th lysine with glutamine in the amino acid sequence of .
- the 48th, 150th, 167th, 270th, 274th and 447th cysteines are preferably substituted in combination of two or more, and are substituted in combination of three or more. More preferably, 4 or more combined and substituted are more preferable, 5 or more combined and substituted are particularly preferable, and all combined and substituted are most preferable.
- the amino acid substituted from cysteine is not particularly limited as long as it is an amino acid other than cysteine, and can be, for example, alanine or arginine.
- the activity of mutant AAT can be further improved by substituting arginine for the 150th cysteine.
- mutant AAT examples include a mutant AAT having an amino acid sequence described in SEQ ID NO: 4 or 7, which is prepared using apple M2K type AAT (SEQ ID NO: 2) as a reference substance.
- the mutant AAT having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4 is obtained by substituting all cysteines at the 48th, 150th, 167th, 270th, 274th and 447th of apple M2K type AAT (SEQ ID NO: 2) with alanine. is there.
- the mutant AAT having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 is obtained by substituting the cysteines at the 48th, 167th, 270th, 274th and 447th positions with alanine and the cysteine at the 150th position with arginine.
- mutant AAT from the amino acid sequence according to any one of SEQ ID NOs: 5, 6, 8 to 11, 13 prepared using the mutant AAT (SEQ ID NO: 3) as a reference substance
- the mutant AAT is also mentioned.
- the introduction positions of mutations and cysteine substitutions in the amino acid sequences of SEQ ID NOS: 5, 6, 8 to 11, 13 are shown in “Table 1”.
- the 64th alanine may be isoleucine or threonine.
- the 363rd glutamine may be proline, adenine, arginine, glycine or tryptophan. Also in these cases, it is possible to obtain a highly active mutant AAT.
- the mutant AAT according to the present invention is characterized in that it has one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions in the amino acid sequence of the standard.
- Reference bodies were tomato (wild type) wild type AAT (SEQ ID NO: 66), mutant AAT (SEQ ID NO: 64, tomato (wild type) in which the second alanine was substituted with lysine in the amino acid sequence of tomato (wild type) wild type AAT. Wild type) A2K type).
- cysteines are preferably substituted in combination of two or more, and may be substituted in combination of three or more. More preferably, four or more combined and substituted are more preferable, and all combined and substituted are most preferable.
- the amino acid substituted from cysteine is not particularly limited as long as it is an amino acid other than cysteine, and can be, for example, alanine or arginine.
- mutant AAT according to the present invention has one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions in the reference amino acid sequence.
- the reference body may be a wild-type strawberry AAT consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 65.
- the 115th, 167th, 179th, 325th and 356th cysteines are preferably substituted in combination of two or more, and may be substituted in combination of three or more. More preferably, four or more combined and substituted are more preferable, and all combined and substituted are most preferable.
- the amino acid substituted from cysteine is not particularly limited as long as it is an amino acid other than cysteine, and can be, for example, alanine or arginine.
- the amino acid sequence of apple wild type AAT of SEQ ID NO: 1 or apple M2K type AAT of SEQ ID NO: 2 is 70% or more, preferably 80 or more, more preferably 90% or more, particularly preferably 95% or more.
- a variant AAT comprising an amino acid sequence having sequence identity, the variant AAT having one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions. (1) Substitution of cysteine corresponding to the 48th cysteine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2 with another amino acid residue. (2) Substitution of a cysteine corresponding to the 150th cysteine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2 with another amino acid residue.
- the 48th, 150th, 167th, 270th, 274th and 447th cysteines are preferably substituted in combination of two or more, and are substituted in combination of three or more. More preferably, 4 or more combined and substituted are more preferable, 5 or more combined and substituted are particularly preferable, and all combined and substituted are most preferable.
- the amino acid substituted from cysteine is not particularly limited as long as it is an amino acid other than cysteine, and can be, for example, alanine or arginine.
- the activity of mutant AAT can be further improved by substituting arginine for the 150th cysteine.
- the amino acid sequence of the tomato (wild type) AAT of SEQ ID NO: 66 or the tomato (wild type) A2K type AAT of SEQ ID NO: 64 is 70% or more, preferably 80 or more, more preferably 90% or more.
- a variant AAT comprising an amino acid sequence having a sequence identity of 95% or more, wherein the variant AAT has one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions.
- cysteines are preferably substituted in combination of two or more, and may be substituted in combination of three or more. More preferably, four or more combined and substituted are more preferable, and all combined and substituted may be most preferable.
- the amino acid substituted from cysteine is not particularly limited as long as it is an amino acid other than cysteine, and can be, for example, alanine or arginine.
- the amino acid sequence having the sequence identity of 70% or more, preferably 80 or more, more preferably 90% or more, particularly preferably 95% or more with the amino acid sequence of strawberry wild type AAT of SEQ ID NO: 65 Also provided is a mutant AAT comprising one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions: (1) substitution of the cysteine corresponding to the 115th cysteine with another amino acid residue in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 65; (2) substitution of the cysteine corresponding to the 167th cysteine with another amino acid residue in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 65; (3) substitution of the cysteine corresponding to the 179th cysteine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 65 with another amino acid residue; (4) substitution of the cysteine corresponding to the 325th cysteine with another amino acid residue in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 65; (5) Substitution of cysteine corresponding to the 3
- the 115th, 167th, 179th, 325th and 356th cysteines are preferably substituted in combination of two or more, and may be substituted in combination of three or more. More preferably, four or more combined and substituted are more preferable, and all combined and substituted may be most preferable.
- the amino acid substituted from cysteine is not particularly limited as long as it is an amino acid other than cysteine, and can be, for example, alanine or arginine.
- the amino acid sequence of AAT to be substituted for cysteine is the amino acid sequence of apple wild type AAT of SEQ ID NO: 1 or apple M2K type AAT of SEQ ID NO: 2, tomato (wild type) wild type AAT of SEQ ID NO: 66 or sequence
- the amino acid sequence of SEQ ID No. 1, 2, 64, 65 or 66 And 50% or more, 60% or more, 70% or more, preferably 80 or more, more preferably 90% or more, and particularly preferably 95% or more.
- Alignment is performed by aligning both sequences so that the amino acid residues of the two sequences to be compared match as much as possible. When aligning, a gap is appropriately inserted in one or both of the two sequences to be compared, if necessary.
- Such alignment of sequences can be performed using a known program such as BLAST, FASTA, CLUSTALW, and the like.
- sequence identity between the amino acid sequence of AAT to which cysteine substitution is introduced and the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 1, 2, 64, 65, 66 is aligned, and the number of matched amino acids is calculated as the total number of amino acids. Obtained by dividing by a number. When gaps are inserted, the total number of amino acids is the number of residues obtained by counting one gap as one amino acid residue. If the total number of amino acids counted in this way differs between the two sequences being compared, identity (%) is calculated by dividing the total number of amino acids in the longer sequence by the number of matched amino acids.
- an AAT comprising an amino acid sequence having a high sequence identity with the amino acid sequence of apple wild type AAT of SEQ ID NO: 1 or apple M2K type AAT of SEQ ID NO: 2, apple wild type AAT of SEQ ID NO: 1 or apple M2K type of SEQ ID NO: 2
- apple wild type AAT of SEQ ID NO: 1 or apple M2K type of SEQ ID NO: 2 It is highly possible that the 48th, 150th, 167th, 270th, 274th and 447th cysteines found in the amino acid sequence of AAT are conserved. By substituting these cysteines with other amino acids, It is considered that a highly active mutant can be obtained also in AAT (preferably various AATs derived from plants).
- apple AAT consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 12 derived from a different subspecies of the genus Apple.
- cysteines found in the amino acid sequence of apple wild-type AAT of SEQ ID NO: 1
- the 48th, 150th, 167th, 270th, 274th and 447th cysteines are all conserved in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 12.
- pear AAT consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 61.
- cysteines found in the amino acid sequence of apple wild-type AAT of SEQ ID NO: 1 the 48th, 150th, 167th, 270th and 274th cysteines are all conserved in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 61. . Furthermore, as an AAT showing 91% sequence identity with the apple wild-type AAT of SEQ ID NO: 1, there is a loquat AAT consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 62.
- cysteines at the 48th, 150th, 167th, 270th, 274th and 447th cysteines are any of the amino acid sequences shown in SEQ ID NO: 62.
- the tomato (wild type) wild type AAT of SEQ ID NO: 66 or the tomato (wild type) A2K type AAT of SEQ ID NO: 64 the tomato (wild type) wild The 206th, 209th, 256th, 269th and 322nd cysteines found in the amino acid sequence of type AAT or tomato (wild type) A2K type AAT are likely to be conserved. It is considered that a highly active mutant can be obtained in various AATs (preferably various plant-derived AATs).
- an AAT having 93% sequence identity with the tomato (wild type) wild type AAT of SEQ ID NO: 66 there is a tomato AAT consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 67 derived from tomato (cultivated species).
- cysteines found in the amino acid sequence of tomato (wild type) wild type AAT the 209th, 256th, 269th and 322nd cysteines are all conserved in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 67.
- an AAT having 84% sequence identity with the tomato (wild-type) wild-type AAT of SEQ ID NO: 66 there is a potato AAT consisting of the amino acid sequence shown by SEQ ID NO: 68.
- cysteines found in the amino acid sequence of tomato (wild type) wild type AAT are all conserved in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 68. .
- cysteines at 206, 209, 256, 269 and 322 are all conserved in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 68.
- capsicum AAT consisting of the amino acid sequence shown by SEQ ID NO: 69.
- cysteines found in the amino acid sequence of tomato (wild type) wild type AAT the 206th, 209th, 269th and 322nd cysteines are all conserved in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 69.
- tobacco AAT consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 70 as an AAT showing 74% sequence identity with the tomato (wild-type) wild-type AAT of SEQ ID NO: 66.
- cysteines found in the amino acid sequence of tomato (wild-type) wild-type AAT, the 206th, 209th and 322nd cysteines are all conserved in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 70.
- An alignment of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 66-70 is shown in FIG.
- the AAT consisting of an amino acid sequence having high sequence identity with the amino acid sequence of strawberry wild type AAT of SEQ ID NO: 65
- the 115th, 167th, 179th, 325th and 356 found in the amino acid sequence of strawberry wild type AAT
- the second cysteine is conserved, and it is possible to obtain highly active mutants in various AATs (preferably various AATs derived from plants) by substituting these cysteines with other amino acids.
- cysteines found in the amino acid sequence of strawberry wild-type AAT are all conserved in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 71.
- an AAT showing 91% sequence identity with the strawberry wild-type AAT of SEQ ID NO: 65 there is a snake strawberry AAT consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 72.
- the 115th, 167th, 179th, 325th and 356th cysteines are all conserved in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 71.
- AAT showing 67% sequence identity with the strawberry wild-type AAT of SEQ ID NO: 65 there is a humanus AAT consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 73.
- cysteines found in the amino acid sequence of strawberry wild type AAT the 167th, 325th and 356th cysteines are all conserved in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 73.
- the alignment of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 65, 71 to 73 is shown in FIG.
- Mutant alcohol acyltransferase II The present invention also provides a mutant AAT in which the 64th alanine, 248th valine, 363th glutamine, and 117th lysine are substituted in the amino acid sequence of apple wild type AAT or apple M2K type AAT. This mutant AAT exhibits higher activity and solubility than wild-type AAT.
- the mutant AAT according to the present invention has one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2.
- the 64th alanine, the 117th lysine, the 248th valine and the 363th glutamine are preferably substituted in combination of 2 or more, and are substituted in combination of 3 or more. More preferably, all are combined and most preferably substituted.
- mutant AAT include mutant alcohol acyltransferases comprising the amino acid sequences set forth in any of SEQ ID NOs: 3, 5, 6, 8 to 13 (see Table 1).
- High activation by mutation introduction in the above-mentioned apple mutant AAT is a variety of AATs comprising amino acid sequences having high sequence identity with the amino acid sequence of apple wild type AAT of SEQ ID NO: 1 or apple M2K type AAT of SEQ ID NO: 2 (preferably Is considered to be applicable to various plant-derived AAT).
- the amino acid sequence of apple wild-type AAT of SEQ ID NO: 1 or apple M2K-type AAT of SEQ ID NO: 2 is 70% or more, preferably 80 or more, more preferably 90% or more, particularly preferably 95%.
- a variant AAT comprising one or more amino acid substitutions selected from the following amino acid substitutions, which is an AAT comprising an amino acid sequence having the above sequence identity, is provided. (1) Replacement of the amino acid residue corresponding to the 64th alanine with valine, isoleucine or threonine in the alignment with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2.
- an amino acid residue corresponding to the 64th alanine, an amino acid residue corresponding to the 117th lysine, an amino acid residue corresponding to the 248th valine, an amino acid corresponding to the 363th glutamine are preferably substituted in combination of two or more, more preferably substituted in combination of three or more, and most preferably substituted in combination.
- the 117th lysine, 248th valine and 363th glutamine found in the amino acid sequence of apple wild type AAT of SEQ ID NO: 1 or apple M2K type AAT of SEQ ID NO: 2 are shown in SEQ ID NOs: 12, 61, 62 and 63. Any amino acid sequence is conserved. Therefore, by substituting these amino acids with isoleucine or threonine; glutamine; alanine; lysine, proline, adenine, arginine, glycine or tryptophan, various AATs (preferably plant-derived AAT, particularly preferably apple-derived plants) It is considered possible to obtain a highly active mutant also in (AAT).
- AAT preferably plant-derived AAT, particularly preferably apple-derived plants
- the amino acid sequence of AAT into which amino acid substitutions are to be introduced is aligned with the amino acid sequence of apple wild type AAT of SEQ ID NO: 1 or apple M2K type AAT of SEQ ID NO: 2, It preferably consists of an amino acid sequence having 50% or more, 60% or more, 70% or more, preferably 80 or more, more preferably 90% or more, particularly preferably 95% or more.
- Vector / transformant The expression vector into which the mutant AAT and the DNA encoding the mutant AAT according to the present invention are inserted can be prepared using a conventionally known genetic engineering technique.
- the vector is not limited as long as it can replicate autonomously in the host cell, and a vector suitable for the host cell can be used.
- the insertion of the mutant AAT gene into the vector can be performed using a gene recombination technique known to those skilled in the art. For example, a method using a restriction enzyme cleavage and ligation kit, a method using topoisomerase, an In Fusion kit (Takara Bio) or the like can be used.
- the gene inserted into the vector is inserted linked to the downstream of a promoter capable of controlling transcription and translation of the protein encoded by each gene in the host cell. Further, if necessary at the time of insertion, an appropriate linker may be added.
- a terminator sequence an enhancer sequence, a splicing signal sequence, a poly
- a ribosome binding sequence such as an SD sequence or a Kozak sequence
- a selectable marker gene etc. that can be used in the host organism into which the gene is to be introduced, if necessary.
- selectable marker genes include drug resistance genes such as ampicillin resistance gene, tetracycline resistance gene, neomycin resistance gene, kanamycin resistance gene, chloramphenicol resistance gene, and intracellular biosynthesis of nutrients such as amino acids and nucleic acids.
- examples include genes involved or genes encoding fluorescent proteins such as luciferase. A part of the amino acid sequence encoded by the DNA may be replaced with the insertion.
- a vector is introduced into a host cell by a method known to those skilled in the art, and used to produce a transformant.
- the method for introducing the vector into the host cell is not particularly limited as long as it is a method suitable for the host cell, and examples thereof include an electroporation method, a spheroplast method, a lithium acetate method, and a junction transfer method. It is done.
- Host cells are not particularly limited, and bacteria include E. coli, Rhodococcus genus, Pseudomonas genus, Corynebacterium genus, Bacillus genus, Streptococcus genus, Streptomyces genus, etc.
- yeast Saccharomyces genus
- Candida Examples of filamentous fungi include the genus Aspergillus. Among these, it is particularly convenient to use E. coli, because it is simple and efficient.
- a wild-type apple AAT gene (SEQ ID NO: 14) optimized for E. coli codon was synthesized (consigned to DNA2.0).
- the AAT gene was inserted into an expression vector (pJexpress404) and named pAAT012.
- the AAT gene was transferred from an expression vector having a T7 promoter (pJexpress404) to an expression vector having a trc promoter (pTrc99A) by the following method.
- PCR reaction was performed using primers MMA-156 and MMA-163 with pAAT012 as a template to amplify a fragment containing the AAT gene.
- primers MMA-156 and MMA-163 with pAAT012 as a template to amplify a fragment containing the AAT gene.
- the second codon ATG (Met) of the AAT gene was converted to GTG (Val).
- Primer MMA-156 (SEQ ID NO: 15): CACAGGAAACAGACCATGGTGAGCTTTTCTGTACTCCAAGTCAAACG
- Primer MMA-163 (SEQ ID NO: 16): GCCAAGCTTGCATGCCTGCAGGTTACTGGCTGGTGCTACGCAG
- the amplified product was purified using Gel / PCR Purification Kit (manufactured by FAVORGEN) and used as an insert fragment.
- the vector pTrc99A previously cut with restriction enzymes NcoI and Sse8387I was mixed with the inserted fragment, and ligated using In-Fusion HD Cloning Kit.
- the reaction solution was incubated at 50 ° C. for 15 minutes, then cooled on ice and used for transformation of E. coli JM109 strain.
- the Escherichia coli transformant was subjected to liquid culture in an LB medium (LBAmp medium) containing 100 mg / L of ampicillin, and the target plasmid pAAT115 was prepared using Mini prep Kit (QIAGEN).
- the second amino acid residue of the gene product of the apple AAT gene inserted into pAAT115 is valine, but it is known that the amount of protein expression is improved by substituting the second amino acid residue with lysine, arginine or the like. (Japanese Patent Laid-Open No. 2008-61547). Therefore, the second codon of the AAT gene was converted as follows.
- pAAT115 was cleaved with NcoI and SmaI to prepare a fragment containing a vector region of about 5.1 kb.
- a PCR reaction was performed using primers MMA-166 and MMA-169 and pAAT115 as a template to amplify a fragment containing the AAT gene (about 400 bp) and purified by the above-mentioned method to obtain an inserted fragment.
- Primer MMA-166 (SEQ ID NO: 17): CACAGGAAACAGACCATGAAAAGCTTTTCTGTACTCCAAGTC Primer MMA-169 (SEQ ID NO: 18): CGATGATACCATCGCTGCCCGGGAAGTTGTACAG
- E. coli transformant (recombinant) was cultured in liquid to prepare the desired plasmid pAAT116.
- pAAT116 the second codon GTG (Val) of the AAT gene was replaced with AAA (Lys).
- Example 1 Production of highly active apple AAT
- the protein encoded by the apple AAT gene in the plasmid pAAT116 prepared in Reference Example 1 has 15 cysteines. . Fifteen plasmids in which each cysteine was replaced with alanine were commissioned (Genscript) (Table 2).
- Escherichia coli JM109 strain was transformed with 16 kinds of plasmids shown in “Table 2”.
- the Escherichia coli transformant was inoculated in LB (1% bactotryptone, 0.5% bacto yeast extract, 1% NaCl) medium containing ampicillin, and precultured at 37 ° C. for 7 hours.
- 0.1 ml of the culture solution was taken, added to 100 ml of the same medium (containing 1 mM IPTG), and cultured with shaking at 37 ° C. for 15 hours.
- the cells were collected from the culture, washed with 50 mM phosphate-sodium buffer (pH 7.0), and suspended in the same buffer.
- mutants were obtained that showed AAT activity per recombinant of 50% or more compared to 100% activity of the standard expressed from pAAT116.
- pAAT116C48A, pAAT116C150A, pAAT116C167A, pAAT116C270A, pAAT116C274A and pAAT116C447A were obtained.
- the expressed mutant showed 70% or more AAT activity per recombinant compared to 100% of the activity of the standard expressed from pAAT116. Therefore, mutants were prepared in which all of the amino acid substitutions C48A, C150A, C167A, C270A, C274A and C447A possessed by these six mutants were introduced.
- AAT activity means an activity that catalyzes the formation of an ester from a CoA compound.
- the AAT activity per recombinant of the mutant is 50% or more compared to 100% of the activity of the standard” means that the production of an ester catalyzed by the mutant expressed from a certain amount of E. coli recombinant It means that the amount is 50% or more of the amount of ester produced by the catalyst of the standard expressed from the recombinant E. coli under the same conditions due to the high activity and solubility of the mutant.
- the cell extract containing the mutant was prepared by the method described above, and the AAT activity of the cell extract was measured. Furthermore, the cell extract (soluble fraction) and the insoluble fraction (bacteria and membrane fraction) separated from the cell extract by centrifugation were separated by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, and recombinant AAT was separated. A protein band was detected.
- the results are shown in FIG.
- the vertical axis of the graph shows the AAT activity per cell weight, with the AAT activity of the reference body expressed from pAAT116 as 1.
- the AAT activity per recombinant of the mutant expressed from pAAT024 was about 5 times that of the standard.
- the mutant expressed from pAAT024 was present more in the soluble fraction than in the reference. This result revealed that the substitution of cysteine at positions 48, 150, 167, 270, 274, and 447 with alanine can enhance the solubility of AAT and improve the activity per recombinant. .
- the amplified fragment is treated with restriction enzymes BspHI and SpeI, separated by agarose gel electrophoresis, extracted from a gel using Gel / PCR Purification Kit (FAVORGEN), and this is a random mutant gene library (mutant AAT ( M2K) gene library).
- MMA-152 (SEQ ID NO: 21): GCCCCCGTTTTCACGATGGGCAAATAT
- Reverse primer MMA-153 (SEQ ID NO: 22): ATATTTGCCCATCGTGAAAACGGGGGC
- a plasmid was prepared from the E. coli transformant and designated pSTV28N.
- Primer MMA-156 (SEQ ID NO: 23): CACAGGAAACAGACCATGGTGAGCTTTTCTGTACTCCAAGTCAAACG
- Primer MMA-157 (SEQ ID NO: 24): GTGATTTTTTTCTCCGCACTAGTCTACTGGCTGGTGCTACGCAG
- the CAT gene fragment was amplified by PCR using pSTV28N as a template and primers MMA-159 and 160, followed by purification.
- Primer MMA-159 (SEQ ID NO: 25): CTGCGTAGCACCAGCCAGTAGACTAGTGCGGAGAAAAAAATCAC Primer MMA-160 (SEQ ID NO: 26): GCCAAGCTTGCATGCCTGCAGGTTACGCCCCGCCCTGCCACTCATCG
- the AAT gene fragment and the CAT gene fragment were mixed with the vector pTrc99A previously cut with NcoI and Sse8387I, and the three fragments were ligated using In-Fusion HD Cloning Kit. Escherichia coli JM109 strain was transformed with the reaction solution. A plasmid was prepared from the E. coli transformant and designated pAAT113. The second amino acid of the AAT gene in pAAT113 is valine.
- the Escherichia coli transformant was cultured on an LBAmp agar medium, and about 12,000 colonies were collected to prepare a cell suspension. A part of the cell suspension was taken and a plasmid was prepared using Mini prep Kit (QIAGEN) to obtain a mutant AAT (M2K) -CAT fusion gene plasmid library.
- PCR was performed using pAAT116 as a template and the primer sets shown in Table 4 below. 1 ⁇ l of DpnI was added to the reaction solution and incubated at 37 ° C. for 1 hour. Escherichia coli JM109 strain was transformed with DpnI treatment solution. A plasmid containing a mutant AAT gene was prepared from an E. coli transformant.
- E. coli JM109 strain was transformed with the plasmid shown in “Table 4”, and the AAT activity of the cell disruption solution of the E. coli transformant was measured by the method described in Example 1. The results are shown in “Table 5”. In the table, the activity value is shown as a relative value with the activity of the reference body expressed from pAAT116 as 1.
- AAT activity was observed by introducing mutations of A64V, V248A and Q363K.
- the mutation of K117Q also showed a slight improvement in activity.
- glutamine at position 363 is replaced with proline, adenine, arginine, glycine or tryptophan, An activity of 120% or more compared to the activity was confirmed.
- the quadruple mutant was about 6 times more active than the standard expressed from pAAT116.
- Example 2 Preparation and activity evaluation of cysteine 6-substituted quadruple mutants
- E. coli strain JM109 was transformed with rasmid pAAT025, and the AAT activity of the cell lysate of the E. coli transformant was measured by the method described in Example 1.
- the results are shown in FIG.
- the cysteine 6-substituted quadruple mutant showed about 2.8 times the activity per recombinant compared to the reference body (4-fold mutant) expressed from pAAT021.
- Example 3 Preparation of cysteine 6-substituted quadruple mutant recombinant and activity evaluation 2] Plasmids pAAT155 and pAAT025 (cysteine 6-substituted quadruple mutants) in which cysteine at position 150 of AAT is replaced with arginine in plasmid pAAT021 (quadruple mutant) Plasmids in which cysteine at position 150 in AAT is replaced with arginine pAAT154 was created.
- Plasmid pAAT155 contains a mutant AAT gene in which the cysteine at position 150 of AAT is replaced with arginine and has a quadruple mutation of A64V, K117Q, V248A, and Q363K.
- Plasmid pAAT154 is a 4-fold A64V, K117Q, V248A and Q363K in which cysteines at positions 48, 167, 270, 274 and 447 of AAT are all substituted with alanine, cysteine at position 150 is substituted with arginine.
- a mutant AAT gene having a mutation is included.
- the amino acid substitution was performed following the preparation of pAAT116 from pAAT115 in Reference Example 1.
- the PCR reaction was performed using primers MMA-380 and MMA-381 and the template as pAAT021 or pAAT025.
- Primer MMA-380 (SEQ ID NO: 59): CTGATTCAAGTCACTCGTCTGACGTGTGGTGG
- Primer MMA-381 (SEQ ID NO: 60): CCACCACACGTCAGACGAGTGACTTGAATCAG
- Escherichia coli JM109 strain was transformed with plasmids pAAT155 and pAAT154, and the AAT activity of the cell lysate of the E. coli transformant was measured by the method described in Example 1.
- the cell extract (soluble fraction) and the insoluble fraction (bacteria and membrane fraction) separated from the cell extract by centrifugation were separated by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, and recombinant AAT was separated. A protein band was detected.
- the results are shown in FIG.
- the recombinants expressed from pAAT155 and pAAT154 exhibited AAT activity per recombinant of about 3.7 times and about 5 times that of the reference body (quadruple mutant) expressed from pAAT021, respectively.
- AAT activity per recombinant of about 3.7 times and about 5 times that of the reference body (quadruple mutant) expressed from pAAT021, respectively.
- more protein was present in the soluble fraction than in the recombinant expressing the reference body. From this result, it has been clarified that by substituting cysteine at position 150 with arginine in particular, the solubility of the reference substance can be further increased and the activity can be further improved.
- Example 4 Preparation and activity evaluation of cysteine 4-5 substituted quadruple mutants
- Five or four of the six cysteines at positions 48, 150, 167, 270, 274 and 447 of AAT are substituted with alanine, and four mutations of A64V, K117Q, V248A and Q363K are performed.
- the AAT gene possessed was commissioned (Genscript) and inserted into the vector pTrc99A to obtain the plasmids shown in Table 6.
- E. coli JM109 strain was transformed with each plasmid, and the AAT activity of the E. coli transformant cell disruption solution was measured by the method described in Example 1.
- the results are shown in FIG.
- the vertical axis of the graph shows the AAT activity per cell weight, with 1 representing the activity of the reference body expressed from pAAT116.
- Both the cysteine 5-substituted quadruple mutant and the cysteine 4-substituted quadruple mutant showed higher solubility and activity per recombinant than the reference body expressed from pAAT021 (4-fold mutant).
- Example 5 Production of highly active tomato AAT
- pAAT032 expressing a tomato AAT (SpAAT) gene was commissioned and synthesized (Genscript, the same applies hereinafter).
- pAAT032 includes tomato (wild type) A2K type AAT (SEQ ID NO: 64) in which the second amino acid of tomato (wild type) wild type AAT (SEQ ID NO: 66) is substituted from alanine to lysine.
- SEQ ID NO: 64 tomato (wild type) A2K type AAT
- SEQ ID NO: 66 the second amino acid of tomato (wild type) wild type AAT
- Escherichia coli JM109 strain was transformed with nine kinds of plasmids shown in “Table 7”.
- Example 6 Production of highly active strawberry AAT
- SAAT033 expressing a strawberry AAT (SAAT) gene (SEQ ID NO: 65) was commissioned and synthesized. There are 9 cysteines in the protein encoded by this gene. Nine types of plasmids in which each cysteine was replaced with alanine were commissioned and synthesized (Table 8).
- Escherichia coli JM109 strain was transformed with 10 kinds of plasmids shown in “Table 8”.
- Sequence number 1 Apple wild type AAT (Mp-AAT1_apple)
- Sequence number 2 Apple M2K type AAT SEQ ID NO: 3: AAT in which quadruple mutation has been introduced into apple M2K type
- Sequence number 4 AAT which introduce
- SEQ ID NO: 5 AAT in which quadruple mutation and cysteine 6 substitution are introduced into apple M2K type
- SEQ ID NO: 7 AAT in which quadruple mutation and cysteine 6 substitution (of which Cys150Arg at position 150) is introduced into apple M2K type
- SEQ ID NO: 9 AAT in which quadruple mutation and cysteine 4 substitution have been introduced into apple M2K type SEQ ID NO
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Abstract
Description
〔1〕 基準体のアミノ酸配列において2以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する変異体を発現させる工程、
を含む、基準体に比して、組換体あたりの活性が向上した酵素の製造方法。
〔2〕 以下の工程を含む、〔1〕の酵素の製造方法;
(1)基準体のアミノ酸配列において1以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する変異体を発現する組換体を作成する工程、
(2)基準体の活性100%に比して50%以上の組換体あたりの活性を示す複数の変異体を選択する工程、
(3)工程(2)において選択されたそれぞれの変異体が有するアミノ酸残基が置換された部位のうち、2以上の部位において、それぞれ対応するアミノ酸残基が置換された変異体を発現させる工程。
〔3〕 前記酵素がアルコールアシルトランスフェラーゼである〔1〕又は〔2〕の酵素の製造方法。
〔4〕 前記基準体のアミノ酸配列が、配列番号1、2、3、64、65及び66のいずれかに示されるアミノ酸配列である、〔3〕の酵素の製造方法。
〔5〕 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである〔1〕~〔4〕のいずれかの酵素の製造方法。
基準体のアミノ酸配列において1以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する、変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
〔7〕 配列番号1又は2に示すアミノ酸配列と70%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなる〔6〕の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼであって、
以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて48番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて150番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて167番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて270番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて274番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(6)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて447番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
〔8〕 配列番号64又は66に示すアミノ酸配列と70%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなる〔6〕の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼであって、
以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて206番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて209番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて256番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて269番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて322番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
〔9〕 配列番号65に示すアミノ酸配列と70%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなる〔6〕の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼであって、
以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて115番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて167番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて179番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて325番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて356番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
〔10〕 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである〔6〕~〔9〕のいずれかの変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
〔11〕 植物由来である〔7〕~〔10〕のいずれかの変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
〔12〕 配列番号1又は2に示すアミノ酸配列において以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する〔6〕の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)48番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)150番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)167番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)270番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)274番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(6)447番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
〔13〕 配列番号64又は66に示すアミノ酸配列において以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する〔6〕の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)206番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)209番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)256番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)269番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)322番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
〔14〕 配列番号65に示すアミノ酸配列において以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する〔6〕の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)115番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)167番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)179番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)325番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)356番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
〔15〕 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである〔12〕~〔14〕のいずれか一項に記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
〔16〕 配列番号4又は7に記載のアミノ酸配列からなる〔12〕の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
〔17〕 さらに以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する〔7〕又は〔12〕記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)64番目のアラニンのバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換、
(2)117番目のリジンのグルタミンへの置換、
(3)248番目のバリンのアラニンへの置換、
(4)363番目のグルタミンのリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。
〔18〕 配列番号5,6,8~11,13のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる〔17〕の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて64番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換、
(2)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて117番目のリジンに相当するアミノ酸のグルタミンへの置換、
(3)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて248番目のバリンに相当するアミノ酸のアラニンへの置換、
(4)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて363番目のグルタミンに相当するアミノ酸のリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。
〔20〕 植物由来である〔19〕のいずれかの変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
〔21〕 配列番号1又は2に示すアミノ酸配列において以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)64番目のアラニンのバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換、
(2)117番目のリジンのグルタミンへの置換、
(3)248番目のバリンのアラニンへの置換、
(4)363番目のグルタミンのリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。
〔22〕 配列番号3,5,6,8~11,13のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる〔21〕の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
〔23〕 〔6〕~〔20〕のいずれかのアルコールアシルトランスフェラーゼを発現するベクター。
〔24〕 〔23〕のベクターが導入された形質転換体。
[1] 以下の工程を含む、基準体に比して、組換体あたりの活性が向上した酵素を製造する方法。
(1)基準体のアミノ酸配列において1以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する変異体を発現する組換体を作成する工程。
(2)基準体に比して50%以上の組換体あたりの活性を示す変異体を選択する工程。
(3)工程(2)において選択されたそれぞれの変異体が有するアミノ酸置換が導入された部位のうち2以上の部位においてそれぞれ対応するアミノ酸置換が導入された変異体を発現させる工程。
[2] 前記酵素がアルコールアシルトランスフェラーゼである[1]の製造方法。
[3] 前記基準体のアミノ酸配列が、配列番号1、配列番号2又は配列番号3に示されるアミノ酸配列である、[2]の製造方法。
[4] 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである[1]~[3]のいずれかの製造方法。
を含む、基準体に比して組換体あたりの活性が向上した酵素の製造方法。
[6] 前記酵素がアルコールアシルトランスフェラーゼである[5]の製造方法。
[7] 前記基準体のアミノ酸配列が、配列番号1、配列番号2又は配列番号3に示されるアミノ酸配列である、[6]の製造方法。
[8] 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである[5]~[7]のいずれかの製造方法。
以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
(1)配列番号1に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて48番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(2)配列番号1に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて150番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(3)配列番号1に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて167番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(4)配列番号1に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて270番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(5)配列番号1に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて274番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(6)配列番号1に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて447番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
[10] 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである[9]の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
[11] 配列番号1に示すアミノ酸配列において以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
(1)48番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(2)150番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(3)167番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(4)270番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(5)274番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(6)447番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
[12] 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである[11]の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
[13] 配列番号4又は7に記載のアミノ酸配列からなる[11]の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
[14] さらに以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する[11]の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
(1)64番目のアラニンのバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換。
(2)117番目のリジンのグルタミンへの置換。
(3)248番目のバリンのアラニンへの置換。
(4)363番目のグルタミンのリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。
[15] 配列番号5,6,8~11,13のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる[14]の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
(1)配列番号1に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて64番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換。
(2)配列番号1に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて248番目のバリンに相当するアミノ酸のアラニンへの置換。
(3)配列番号1に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて363番目のグルタミンに相当するアミノ酸のリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。
(4)配列番号1に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて117番目のリジンに相当するアミノ酸のグルタミンへの置換。
[17] 配列番号1に示すアミノ酸配列において以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
(1)64番目のアラニンのバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換。
(2)117番目のリジンのグルタミンへの置換。
(3)248番目のバリンのアラニンへの置換。
(4)363番目のグルタミンのリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。
[18] 配列番号3,5,6,8~11,13のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる[17]の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
[20] [19]のベクターが導入された形質転換体。
(1)基準体のアミノ酸配列において1又は2以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する変異体を発現する非植物細胞組換体を作成する工程と、
(2)前記変異体の組換体あたりの酵素活性を測定する工程と、
(3)基準体に比して50%以上の組換体あたりの活性を示す変異体を選択する工程と、
(4)工程(3)において選択されたそれぞれの変異体が有するアミノ酸置換が導入された部位のうち2以上の部位においてそれぞれ対応するアミノ酸置換が導入された変異体を前記非植物細胞中で発現させる工程と、を含む製造方法。
[22] 前記酵素がリンゴ由来のアルコールアシルトランスフェラーゼである[21]の製造方法。
[23] 前記非植物細胞が大腸菌細胞である[21]又は[22]の製造方法。
[24] 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである[21]~[23]のいずれかの製造方法。
本発明は、基準体のアミノ酸配列において2以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する変異体を発現させる工程、を含む、基準体に比して組換体あたりの活性が向上した酵素の製造方法に関する。
具体的には、本発明に係る変異型酵素の製造方法は、以下の工程(1)~(3)を含むことを特徴とする。
(1)基準体のアミノ酸配列において1以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する変異体を発現する組換体を作成する工程。
(2)基準体の活性100%に比して50%以上の組換体あたりの活性を示す複数の変異体を選択する工程。
(3)工程(2)において選択されたそれぞれの変異体が有するアミノ酸残基が置換された部位のうち2以上の部位においてそれぞれ対応するアミノ酸残基が置換された変異体を発現させる工程。
本発明に係る変異型酵素の製造方法が対象とする酵素は、当該酵素の由来種とは異なる宿主で基準体を発現させた場合に、形質転換体(組換体)中で封入体を形成する酵素であることが好ましい。本発明に係る変異型酵素の製造方法が対象とする酵素は、例えば、植物由来の酵素であって、大腸菌等の非植物細胞で基準体を発現させた場合に、組換体細胞中で封入体を形成する酵素であってよい。
さらにその中でも、バショウ属、リンゴ属、ナシ属、ビワ属、カキノキ属、マタタビ属、キュウリ属、パパイア属又はワニナシ属に属する植物が特に好ましい。
トマトAATに関し、本発明に係る変異型酵素の製造方法において「基準体」となり得る酵素のアミノ酸配列の例を、配列番号64,66に示す。配列番号66は、トマト(野生種)野生型AATのアミノ酸配列を示す。配列番号64は、野生型AATのアミノ酸配列において2番目のアラニンがリジンに置換された変異型AAT(A2K型AAT)のアミノ酸配列である。
イチゴAATに関し、本発明に係る変異型酵素の製造方法において「基準体」となり得る酵素のアミノ酸配列の例を、配列番号65に示す。配列番号65は、野生型AATのアミノ酸配列である。
本工程は、基準体のアミノ酸配列において1以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する変異体を発現する組換体を作成する工程である。
本工程は、基準体の活性100%に比して50%以上の組換体あたりの活性を示す複数の変異体を選択する工程である。ここで、「変異体の組換体あたりの活性が基準体の活性100%に比して50%以上である」とは、一定量の組換体から発現した変異体によって触媒される反応生成物の量が、当該変異体の高い活性と可溶性に起因して、同一条件下において同一量の組換体から発現させた基準体の触媒による反応生成物の量の50%以上となることを意味する。
本工程は、工程(2)で選択したそれぞれの変異体が有するアミノ酸残基が置換された部位のうち2以上の部位においてそれぞれ対応するアミノ酸残基が置換された変異体を発現させる工程である。
本発明は、上述の変異型酵素の製造方法により得られる変異型AATをも提供する。
本発明に係る変異型AATは、基準体のアミノ酸配列において、以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有することを特徴とする。基準体は、野生型リンゴAAT(配列番号1)、野生型リンゴAATのアミノ酸配列において2番目のメチオニンがリジンに置換された変異型AAT(配列番号2、リンゴM2K型)、又は野生型リンゴAATのアミノ酸配列において64番目のアラニンがバリンに、248番目のバリンがアラニンに、363番目のグルタミンがリジンに、117番目のリジンがグルタミンに置換された変異型AAT(配列番号3)であってよい。
(2)150番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(3)167番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(4)270番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(5)274番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(6)447番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(2)209番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)256番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)269番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)322番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(2)167番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)179番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)325番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)356番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(1)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて48番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(2)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて150番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(3)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて167番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(4)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて270番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(5)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて274番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
(6)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて447番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
本発明に係る変異型AATにおいて、48番目、150番目、167番目、270番目、274番目及び447番目の各システインは、2以上組み合わされて置換されることが好ましく、3以上組み合わされて置換されることがより好ましく、4以上組み合わされて置換されることがさらに好ましく、5以上組み合わされて置換されることが特に好ましく、全て組み合わされて置換されることが最も好ましい。システインから置換されるアミノ酸は、システイン以外のアミノ酸であればよく、特に限定されないが、例えばアラニン又はアルギニンとすることができる。特に150番目のシステインをアルギニンに置換することで、変異型AATの活性をさらに向上させることができる。
(1)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて206番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて209番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて256番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて269番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて322番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
本発明に係る変異型AATにおいて、206番目、209番目、256番目、269番目及び322番目の各システインは、2以上組み合わされて置換されることが好ましく、3以上組み合わされて置換されることがより好ましく、4以上組み合わされて置換されることがさらに好ましく、全て組み合わされて置換されることが最も好ましいていてよい。システインから置換されるアミノ酸は、システイン以外のアミノ酸であればよく、特に限定されないが、例えばアラニン又はアルギニンとすることができる。
(1)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて115番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて167番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて179番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて325番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて356番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。
本発明に係る変異型AATにおいて、115番目、167番目、179番目、325番目及び356番目の各システインは、2以上組み合わされて置換されることが好ましく、3以上組み合わされて置換されることがより好ましく、4以上組み合わされて置換されることがさらに好ましく、全て組み合わされて置換されることが最も好ましいていてよい。システインから置換されるアミノ酸は、システイン以外のアミノ酸であればよく、特に限定されないが、例えばアラニン又はアルギニンとすることができる。
例えば、配列番号1のリンゴ野生型AATと88%の配列同一性を示すAATとして、リンゴ属の異なる亜種に由来する配列番号12に示すアミノ酸配列からなるリンゴAATがある。配列番号1のリンゴ野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、48番目、150番目、167番目、270番目、274番目及び447番目のシステインは、配列番号12に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
また、配列番号1のリンゴ野生型AATと91%の配列同一性を示すAATとして、配列番号61に示すアミノ酸配列からなるナシAATがある。配列番号1のリンゴ野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、48番目、150番目、167番目、270番目及び274番目のシステインは、配列番号61に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
さらに、配列番号1のリンゴ野生型AATと91%の配列同一性を示すAATとして、配列番号62に示すアミノ酸配列からなるビワAATがある。配列番号1のリンゴ野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、48番目、150番目、167番目、270番目、274番目及び447番目のシステインのシステインは、配列番号62に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
加えて、配列番号1のリンゴ野生型AATと90%の配列同一性を示すAATとして、配列番号63に示すアミノ酸配列からなるカキAATがある。配列番号1のリンゴ野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、150番目、167番目、270番目、274番目及び447番目のシステインのシステインは、配列番号63に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
配列番号1,12,61~63のアミノ酸配列のアラインメントを図1に示す。
例えば、配列番号66のトマト(野生種)野生型AATと93%の配列同一性を示すAATとして、トマト(栽培種)に由来する配列番号67に示すアミノ酸配列からなるトマトAATがある。トマト(野生種)野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、209番目、256番目、269番目及び322番目のシステインは、配列番号67に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
また、配列番号66のトマト(野生種)野生型AATと84%の配列同一性を示すAATとして、配列番号68示すアミノ酸配列からなるバレイショAATがある。トマト(野生種)野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、206番目、209番目、256番目、269番目及び322番目のシステインは、配列番号68に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
さらに、配列番号66のトマト(野生種)野生型AATと78%の配列同一性を示すAATとして、配列番号69示すアミノ酸配列からなるトウガラシAATがある。トマト(野生種)野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、206番目、209番目、269番目及び322番目のシステインは、配列番号69に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
加えて、配列番号66のトマト(野生種)野生型AATと74%の配列同一性を示すAATとして、配列番号70に示すアミノ酸配列からなるタバコAATがある。トマト(野生種)野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、206番目、209番目及び322番目のシステインは、配列番号70に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
配列番号66~70のアミノ酸配列のアラインメントを図2に示す。
例えば、配列番号65のイチゴ野生型AATと94%の配列同一性を示すAATとして、配列番号71に示すアミノ酸配列からなるチリイチゴAATがある。イチゴ野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、115番目、167番目、179番目、325番目及び356番目のシステインは、配列番号71に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
例えば、配列番号65のイチゴ野生型AATと91%の配列同一性を示すAATとして、配列番号72示すアミノ酸配列からなるエゾヘビイチゴAATがある。イチゴ野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、115番目、167番目、179番目、325番目及び356番目のシステインは、配列番号71に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
例えば、配列番号65のイチゴ野生型AATと67%の配列同一性を示すAATとして、配列番号73に示すアミノ酸配列からなるハマナスAATがある。イチゴ野生型AATのアミノ酸配列にみられるシステインのうち、167番目、325番目及び356番目のシステインは、配列番号73に示すアミノ酸配列においていずれも保存されている。
配列番号65,71~73のアミノ酸配列のアラインメントを図3に示す。
また、本発明は、リンゴ野生型AAT又はリンゴM2K型AATのアミノ酸配列において64番目のアラニン、248番目のバリン、363番目のグルタミン、117番目のリジンが置換された変異型AATをも提供する。この変異型AATは、野生型AATに比して高い活性と可溶性を示す。
(1)64番目のアラニンのバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換。
(2)117番目のリジンのグルタミンへの置換。
(3)248番目のバリンのアラニンへの置換。
(4)363番目のグルタミンのリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。
本発明に係る変異型AATにおいて、64番目のアラニン、117番目のリジン、248番目のバリン、363番目のグルタミンは、2以上組み合わされて置換されることが好ましく、3以上組み合わされて置換されることがより好ましく、全て組み合わされて置換されることが最も好ましい。
(1)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて64番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換。
(2)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて117番目のリジンに相当するアミノ酸のグルタミンへの置換。
(3)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて248番目のバリンに相当するアミノ酸のアラニンへの置換。
(4)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて363番目のグルタミンに相当するアミノ酸のリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。
本発明に係る変異型AATにおいて、64番目のアラニンに相当するアミノ酸残基、117番目のリジンに相当するアミノ酸残基、248番目のバリンに相当するアミノ酸残基、363番目のグルタミンに相当するアミノ酸残基は、2以上組み合わされて置換されることが好ましく、3以上組み合わされて置換されることがより好ましく、全て組み合わされて置換されることが最も好ましい。
本発明に係る変異型AAT及び変異型AATをコードするDNAを挿入した発現ベクターは、従来公知の遺伝子工学的手法を用いて作成できる。
リンゴAAT(MpAAT1)遺伝子を発現するプラスミドを3種類作成した。
プラスミドpAAT012は、野生型リンゴAAT(配列番号1)を含む。
プラスミドpAAT115は、野生型リンゴAATの2番目のアミノ酸がメチオニンからバリンに置換された改変リンゴAATを含む。
プラスミドpAAT116は、野生型リンゴAATの2番目のアミノ酸がメチオニンからリジンに置換された改変リンゴAAT(配列番号2)を含む。
CACAGGAAACAGACCATGGTGAGCTTTTCTGTACTCCAAGTCAAACG
プライマーMMA-163(配列番号16):
GCCAAGCTTGCATGCCTGCAGGTTACTGGCTGGTGCTACGCAG
CACAGGAAACAGACCATGAAAAGCTTTTCTGTACTCCAAGTC
プライマーMMA-169(配列番号18):
CGATGATACCATCGCTGCCCGGGAAGTTGTACAG
(1)システイン残基がアラニン残基に置換された変異体を発現する組換体の作成
参考例1で作製したプラスミドpAAT116中のリンゴAAT遺伝子がコードするタンパク質には、15個のシステインが存在する。それぞれのシステインがアラニンに置換された15種のプラスミドを委託合成(Genscript社)した(表2)。
得られた菌体懸濁液をOD630が10となるように調整した。超音波処理により細胞を破砕し、遠心分離により菌体及び膜画分を除き、細胞抽出液を調製した。
メタクリリル-CoA 1mMとn-ブタノール 40mMを含む反応液0.8mlに0.2mlの細胞抽出液を添加し、ブチリル酸エステルの生成反応を開始した。反応は、10ml容量のセプタム付サンプル瓶(GC用)中で行った。サンプル瓶を30℃で1~2時間インキュベートして反応を進行させた。反応終了後、サンプル瓶中の反応液に1mlのアセトニトリルを添加し混和した。その後、シリンジフィルターDISMIC(穴径0.45μm、ADVANTEC社製)を用いて濾過後、HPLC分析に供した。
装置:Waters 2695
カラム:Shiseido CAPCELL PAK C18 UG120 5μm
移動相:65%MeOH、0.2%リン酸
流量:0.25ml/min
カラム温度:35℃
検出:UV210nm
注入量:10μL
48位、150位、167位、270位、274位及び447位のシステインが全てアラニンに置換されたAAT遺伝子を委託合成(Genscript社)し、ベクターpTrc99Aへ挿入してプラスミドpAAT024を取得した。
リンゴAATの高可溶性変異体の取得のために、まず、AAT遺伝子のランダム変異ライブラリーを作製した。次に、変異型AAT遺伝子にクロラムフェニコール(CAT)耐性遺伝子を連結させた変異AAT-CAT融合遺伝子を含む発現プラスミドライブラリーを作製し、これらにより形質転換された大腸菌形質転換体から、クロラムフェニコール耐性を指標にして高可溶性AATのスクリーニングを行った。AATタンパク質の可溶性が向上すれば、AAT-クロラムフェニコール融合タンパク質の可溶性も向上し、結果として大腸菌形質転換体のクロラムフェニコール耐性が向上する。具体的には、以下の手順で行った。
GeneMorph II Random Mutagenesis Kit(STRATAGENE社)とプライマーMMA-185、MMA-157を用いて、pAAT116を鋳型としたPCRを行い、増幅断片(1.4Kb)を得た。
プライマーMMA-185(配列番号19):
GGATCATGAAAAGCTTTTCTGTACTCCAAGTC
プライマーMMA-157(配列番号20):
GTGATTTTTTTCTCCGCACTAGTCTACTGGCTGGTGCTACGCAG
プラスミドベクターpSTV28Nの作製
CAT遺伝子には、プラスミドベクターpSTV28(タカラバイオ)由来のものを用いた。本CAT遺伝子内にはNcoI制限酵素部位が存在するが、後のライブラリーの作製において不都合が生じるため、NcoI部位である配列をNcoIにより切断されない配列に変換した。変換は、プラスミドpSTV28を鋳型としたPCR反応により以下のようにして行った。
GCCCCCGTTTTCACGATGGGCAAATAT
リバースプライマーMMA-153(配列番号22):
ATATTTGCCCATCGTGAAAACGGGGGC
参考例1に記載のプラスミドpAAT012を鋳型として、プライマーMMA-156、157を用いて、PCRによりAAT遺伝子断片を増幅した後、精製を行った。
CACAGGAAACAGACCATGGTGAGCTTTTCTGTACTCCAAGTCAAACG
プライマーMMA-157(配列番号24):
GTGATTTTTTTCTCCGCACTAGTCTACTGGCTGGTGCTACGCAG
CTGCGTAGCACCAGCCAGTAGACTAGTGCGGAGAAAAAAATCAC
プライマーMMA-160(配列番号26):
GCCAAGCTTGCATGCCTGCAGGTTACGCCCCGCCCTGCCACTCATCG
pAAT113中のAAT遺伝子の2番目のアミノ酸をバリンからリジンに変換し、プラスミドpAAT117を作製した。アミノ酸の置換は、参考例1におけるpAAT115からのpAAT116の作製にならって行った。
pAAT113をNcoIとSpeIにより切断後、SAP(Shrimp Alkaline Phosphatase)処理を行った。アガロースゲル電気泳動とGel/PCR Purification Kit(FAVORGEN社)によりDNA断片を精製した。DNA断片と上記(1)で得られたランダム変異遺伝子ライブラリーをDNA ligation kit ver.2(タカラバイオ)を用いて連結した。反応液を用いて大腸菌JM109株を形質転換した。
上記(3)で得られた変異AAT(M2K)-CAT融合遺伝子プラスミドライブラリーを用いて大腸菌JM109株を形質転換した。大腸菌形質転換体の培養液を、30mg/l クロラムフェニコールと0.4mM IPTGを含むLB寒天培地に塗布し、37℃で一晩培養した。得られたコロニーを液体培養し、プラスミドを調製した。プラスミド中のAAT遺伝子配列を解析し、変異箇所を同定した(表3)。
「表3」に示す変異を導入した変異体を発現するプラスミドを作製した(表4)。
A64V、K117Q、V248A及びQ363Kの4箇所の変異を有するAAT遺伝子を委託合成(Genscript社)し、ベクターpTrc99Aへ挿入してプラスミドpAAT021を取得した。プラスミドpAAT021により大腸菌JM109株を形質転換し、大腸菌形質転換体の細胞破砕液のAAT活性を、実施例1に記載の方法により測定した。
AATの48位、150位、167位、270位、274位及び447位のシステインが全てアラニンに置換され、かつ、A64V、K117Q、V248A及びQ363Kの4箇所の変異を有するAAT遺伝子を委託合成(Genscript社)し、ベクターpTrc99Aへ挿入してプラスミドpAAT025を取得した。ラスミドpAAT025により大腸菌JM109株を形質転換し、大腸菌形質転換体の細胞破砕液のAAT活性を、実施例1に記載の方法により測定した。
プラスミドpAAT021(4重変異体)において、AATの150位のシステインがアルギニンに置換されたプラスミドpAAT155、pAAT025(システイン6置換4重変異体)において、AATの150位のシステインがアルギニンに置換されたプラスミドpAAT154を作成した。
プラスミドpAAT154は、AATの48位、167位、270位、274位及び447位のシステインが全てアラニンに置換され、150位のシステインがアルギニンに置換され、かつA64V、K117Q、V248A及びQ363Kの4重変異を有する変異型AAT遺伝子を含む。
CTGATTCAAGTCACTCGTCTGACGTGTGGTGG
プライマーMMA-381(配列番号60):
CCACCACACGTCAGACGAGTGACTTGAATCAG
AATの48位、150位、167位、270位、274位及び447位の6つのシステインのうち5つ又は4つがアラニンに置換され、かつ、A64V、K117Q、V248A及びQ363Kの4箇所の変異を有するAAT遺伝子を委託合成(Genscript社)し、ベクターpTrc99Aへ挿入して「表6」に示すプラスミドを取得した。各プラスミドにより大腸菌JM109株を形質転換し、大腸菌形質転換体の細胞破砕液のAAT活性を、実施例1に記載の方法により測定した。
(1)システイン残基がアラニン残基に置換された変異体を発現する組換体の作成
トマトAAT(SpAAT)遺伝子を発現するプラスミドpAAT032を委託合成した(Genscript社、以下同じ)。pAAT032は、トマト(野生種)野生型AAT(配列番号66)の2番目のアミノ酸がアラニンからリジンに置換されたトマト(野生種)A2K型AAT(配列番号64)を含む。本遺伝子がコードするタンパク質には、8個のシステインが存在する。それぞれのシステインがアラニンに置換された8種のプラスミドを委託合成した(表7)。
実施例1と同様にして大腸菌形質転回体を培養し、菌体を回収して、細胞抽出液を調製し、AAT活性を測定した。結果を図7に示す。
pAAT032から発現する基準体の活性100%に比して50%以上の組換体あたりのAAT活性を示した変異体は5つ得られた(pATM104、pATM105、pATM106、pATM107、pATM108から発現する変異体)。
そこでこれら5つの変異体が有する全てのアミノ酸置換C206A、C209A、C256A、C269A及びC322Aが導入された変異体を含むプラスミドpAAT164を委託合成した。AAT活性を測定した結果を図7に示す。
pAAT164から発現する変異体の組換体あたりのAAT活性は、基準体の活性に比して約3倍を示した。また、pAAT164から発現する変異体は、基準体に比べて、可能性画分により多く存在していた。この結果により、206位、209位、256位、269位及び322位のシステインのアラニンへの置換によってAATの可溶性を高め、組換体あたりの活性を向上させられることが明らかとなった。
(1)システイン残基がアラニン残基に置換された変異体を発現する組換体の作成
イチゴAAT(SAAT)遺伝子(配列番号65)を発現するプラスミドpAAT033を委託合成した。本遺伝子がコードされたタンパク質には、9個のシステインが存在する。それぞれのシステインがアラニンに置換された9種のプラスミドを委託合成した(表8)。
実施例1と同様にして大腸菌形質転回体を培養し、菌体を回収して、細胞抽出液を調製し、AAT活性を測定した。結果を図8に示す。
pAAT033から発現する基準体の活性100%に比して50%以上の組換体あたりのAAT活性を示した変異体は7つ得られた(pATM202、pATM203、pATM204、pATM205、pATM206、pATM207、pATM208から発現する変異体)。
上記7つの変異体が有するアミノ酸置換のうち、C115A、C167A、C179A、C325A及びC356Aが導入された変異体を含むプラスミドpAAT037を委託合成した。AAT活性を測定した結果を図8に示す。
pAAT037から発現する変異体の組換体あたりのAAT活性は、基準体の活性に比して約1.7倍を示した。この結果により、115位、167位、179位、325位及び356位のシステインのアラニンへの置換によって組換体あたりの活性を向上させられることが明らかとなった。
配列番号2:リンゴM2K型AAT
配列番号3:リンゴM2K型に4重変異を導入したAAT
配列番号4:リンゴM2K型にシステイン6置換を導入したAAT
配列番号5:リンゴM2K型に4重変異とシステイン6置換を導入したAAT
配列番号6:リンゴM2K型に4重変異とCys150Argを導入したAAT
配列番号7:リンゴM2K型に4重変異とシステイン6置換(うち150位はCys150Arg)を導入したAAT
配列番号8:リンゴM2K型に4重変異とシステイン5置換を導入したAAT
配列番号9:リンゴM2K型に4重変異とシステイン4置換を導入したAAT
配列番号10:リンゴM2K型に4重変異とシステイン4置換を導入したAAT
配列番号11:リンゴM2K型に4重変異とシステイン4置換を導入したAAT
配列番号12:リンゴ由来AATのアミノ酸配列(Md-AAT2_apple)
配列番号13:リンゴM2K型に4重変異とシステイン4置換を導入したAAT
配列番号14:大腸菌コドンに最適化した野生型リンゴAAT遺伝子
配列番号15:プライマーMMA-156
配列番号16:プライマーMMA-163
配列番号17:プライマーMMA-166
配列番号18:プライマーMMA-169
配列番号19:プライマーMMA-185
配列番号20:プライマーMMA-157
配列番号21:プライマーMMA-152
配列番号22:プライマーMMA-153
配列番号23:プライマーMMA-156
配列番号24:プライマーMMA-157
配列番号25:プライマーMMA-159
配列番号26:プライマーMMA-160
配列番号27:プライマーMMA-207
配列番号28:プライマーMMA-208
配列番号29:プライマーMMA-215
配列番号30:プライマーMMA-216
配列番号31:プライマーMMA-217
配列番号32:プライマーMMA-218
配列番号33:プライマーMMA-219
配列番号34:プライマーMMA-220
配列番号35:プライマーMMA-221
配列番号36:プライマーMMA-222
配列番号37:プライマーMMA-223
配列番号38:プライマーMMA-224
配列番号39:プライマーMMA-225
配列番号40:プライマーMMA-226
配列番号41:プライマーMMA-241
配列番号42:プライマーMMA-242
配列番号43:プライマーMMA-243
配列番号44:プライマーMMA-244
配列番号45:プライマーMMA-229
配列番号46:プライマーMMA-230
配列番号47:プライマーMMA-231
配列番号48:プライマーMMA-232
配列番号49:プライマーMMA-245
配列番号50:プライマーMMA-246
配列番号51:プライマーMMA-233
配列番号52:プライマーMMA-234
配列番号53:プライマーMMA-239
配列番号54:プライマーMMA-240
配列番号55:プライマーMMA-237
配列番号56:プライマーMMA-238
配列番号57:プライマーMMA-235
配列番号58:プライマーMMA-236
配列番号59:プライマーMMA-380
配列番号60:プライマーMMA-381
配列番号61:ナシ由来AATのアミノ酸配列
配列番号62:ビワ由来AATのアミノ酸配列
配列番号63:カキ由来AATのアミノ酸配列
配列番号64:トマト(野生種)A2K型AAT
配列番号65:イチゴ野生型AATのアミノ酸配列
配列番号66:トマト(野生種)野生型AATのアミノ酸配列
配列番号67:トマト(栽培種)由来AATのアミノ酸配列
配列番号68:バレイショ由来AATのアミノ酸配列
配列番号69:トウガラシ由来AATのアミノ酸配列
配列番号70:タバコ由来AATのアミノ酸配列
配列番号71:チリイチゴ由来AATのアミノ酸配列
配列番号72:エゾヘビイチゴ由来AATのアミノ酸配列
配列番号73:ハマナス由来AATのアミノ酸配列
Claims (22)
- 基準体のアミノ酸配列において2以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する変異体を発現させる工程、
を含む、基準体に比して、組換体あたりの活性が向上した酵素の製造方法。 - 以下の工程を含む、請求項1に記載の酵素の製造方法;
(1)基準体のアミノ酸配列において1以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する変異体を発現する組換体を作成する工程、
(2)基準体の活性100%に比して50%以上の組換体あたりの活性を示す複数の変異体を選択する工程、
(3)工程(2)において選択されたそれぞれの変異体が有するアミノ酸残基が置換された部位のうち、2以上の部位において、それぞれ対応するアミノ酸残基が置換された変異体を発現させる工程。 - 前記酵素がアルコールアシルトランスフェラーゼである請求項1又は2に記載の酵素の製造方法。
- 前記基準体のアミノ酸配列が、配列番号1、2、3、64、65及び66のいずれかに示されるアミノ酸配列である、請求項3記載の酵素の製造方法。
- 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである請求項1~4のいずれか一項に記載の酵素の製造方法。
- 基準体に比して活性が向上した、変異型アルコールアシルトランスフェラーゼであって、
基準体のアミノ酸配列において1以上のシステインが他のアミノ酸残基に置換されたアミノ酸配列を有する、変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。 - 配列番号1又は2に示すアミノ酸配列と70%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなる請求項6に記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼであって、
以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて48番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて150番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて167番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて270番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて274番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(6)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて447番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。 - 配列番号64又は66に示すアミノ酸配列と70%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなる請求項6に記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼであって、
以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて206番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて209番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて256番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて269番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)配列番号64又は66に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて322番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。 - 配列番号65に示すアミノ酸配列と70%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなる請求項6に記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼであって、
以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて115番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて167番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて179番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて325番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)配列番号65に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて356番目のシステインに相当するシステインの他のアミノ酸残基への置換。 - 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである請求項6~9のいずれか一項に記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
- 配列番号1又は2に示すアミノ酸配列において以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する請求項6に記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)48番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)150番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)167番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)270番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)274番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(6)447番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。 - 配列番号64又は66に示すアミノ酸配列において以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する請求項6に記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)206番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)209番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)256番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)269番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)322番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。 - 配列番号65に示すアミノ酸配列において以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する請求項6に記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)115番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(2)167番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(3)179番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(4)325番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換、
(5)356番目のシステインの他のアミノ酸残基への置換。 - 前記他のアミノ酸残基が、アラニン又はアルギニンである請求項11~13のいずれか一項に記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
- 配列番号4又は7に記載のアミノ酸配列からなる請求項11記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
- さらに以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する請求項7又は11記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)64番目のアラニンのバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換、
(2)117番目のリジンのグルタミンへの置換、
(3)248番目のバリンのアラニンへの置換、
(4)363番目のグルタミンのリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。 - 配列番号5,6,8~11,13のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる請求項16記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
- 配列番号1又は2に示すアミノ酸配列と70%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなる変異型アルコールアシルトランスフェラーゼであって、
以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて64番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換、
(2)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて117番目のリジンに相当するアミノ酸のグルタミンへの置換、
(3)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて248番目のバリンに相当するアミノ酸のアラニンへの置換、
(4)配列番号1又は2に示すアミノ酸配列とのアラインメントにおいて363番目のグルタミンに相当するアミノ酸のリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。 - 配列番号1又は2に示すアミノ酸配列において以下のアミノ酸置換から選択される一以上のアミノ酸置換を有する変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ;
(1)64番目のアラニンのバリン、イソロイシン又はスレオニンへの置換、
(2)117番目のリジンのグルタミンへの置換、
(3)248番目のバリンのアラニンへの置換、
(4)363番目のグルタミンのリジン、プロリン、アデニン、アルギニン、グリシン又はトリプトファンへの置換。 - 配列番号3,5,6,8~11,13のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる請求項19記載の変異型アルコールアシルトランスフェラーゼ。
- 請求項6~20のいずれか一項に記載のアルコールアシルトランスフェラーゼを発現するベクター。
- 請求項21記載のベクターが導入された形質転換体。
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