WO2017204274A1 - 検体処理測定システム - Google Patents

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WO2017204274A1
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田島 秀二
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ユニバーサル・バイオ・リサーチ株式会社
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Definitions

  • the present invention relates to a specimen processing measurement system for continuously processing and measuring samples (specimens) of a plurality of types of biological substances.
  • a sample of a biological substance such as a gene is subjected to measurement processing such as detection or quantification after predetermined pretreatment.
  • measurement processing such as detection or quantification after predetermined pretreatment.
  • physical processing such as sample capture, purification, separation, and washing, gene amplification, chemical reaction treatment, and the like are performed.
  • measurement process chemiluminescence, fluorescence, absorbance, and the like are measured.
  • plastic parts and consumables such as dispensing tips for dispensing multiple reagents and reaction solutions are selected according to the purpose of the treatment, and these are used in sequence. Therefore, it is necessary to execute an appropriate pretreatment process.
  • Patent Document 1 a magnetization technique using magnetic particles. Furthermore, the present inventor, in addition to the magnet technology, controls the dispensing of the solution at the same time with the cartridge multi-row alignment and the plurality of dispensing nozzles as proposed in Patent Document 2, and separates the magnetic material. The dispense control used enables multi-sample batch processing.
  • the multiple sample batch method is a method of batch processing a plurality of samples in parallel.
  • Examples of the multi-sample / batch-type products include “geneLEAD XII” provided by Precision System Science Co., Ltd.
  • Examples of multi-sample batch products include the “cobas” series provided by Roche Diagnostics Inc.
  • the one-sample random access method reads information one by one for each sample and sequentially executes different physical processes and reaction processes based on the information.
  • the advantage of the multiple sample / batch method is that the equipment can be reduced in size and simplified by batch processing multiple functional samples for each sample using the “fixed system configuration”. is there.
  • the disadvantage of the multiple sample / batch method is that it is difficult to cope with samples that require a plurality of different processes and to cope with different samples that are continuously introduced. Specifically, as shown in FIG. 1, when a plurality of samples S A1 , S A2 , S A2 , S A3 , S A4 , S A5 , S A6 , S AB1 , S BC1 are processed in a multiple sample batch method. Is assumed.
  • Samples S A1 , S A2 , S A2 , S A3 , S A4 , S A5 , S A6 need to be pre-processed for item A, and pre-processing for items B and C is not necessary.
  • the sample S AB1 needs to perform the preprocessing of the item A and the item B in order, and the preprocessing of the item C is unnecessary.
  • Sample S BC1 it is necessary to perform pretreatment item B and item C in order, pretreatment of item A is not required. As described above, it is difficult to simultaneously process a plurality of samples having different necessary items by a plurality of sample batch processing.
  • the advantage of the one-sample random access method is that different processing items can be continuously processed with consistency for a sample that requires a plurality of process processes (items).
  • the disadvantage of the 1-sample random access method is that, as shown in Fig. 2, the sample must be transferred from the functional unit designated for processing to the functional unit, and different processing steps must be performed. It is. Accordingly, the difference in processing steps for each sample complicates the hardware and software for controlling the processing steps. As a result, there arises a problem that a necessary system or apparatus has to be very complicated, expensive and large (5 to 10 m). For example, as shown in FIG.
  • samples S A1 , S AB1 , and S BC1 are processed by a one-sample random access method.
  • the sample S A1 is transferred to the sample recovery unit.
  • the sample S AB1 is transferred to the item A processing function unit to execute the processing process of the item A
  • the sample S AB1 is transferred to the item B processing function unit to execute the processing process of the item B
  • the sample S AB1 Is transferred to the sample collection section.
  • the sample S BC1 is transferred to the item B processing function unit to execute the item B processing step
  • the sample S BC1 is transferred to the item C processing function unit to execute the item C processing step.
  • SBC1 is transferred to the sample recovery unit.
  • the 1-sample random access method is a process for each sample, there is also a problem that it takes a lot of time to process a plurality of samples.
  • the object of the present invention is to provide a novel sample processing measurement system capable of executing processing and measurement efficiently and continuously when processing a plurality of samples.
  • a sample processing measurement system that performs in parallel a process comprising extraction of a nucleic acid contained in each of a plurality of specimens, amplification of the extracted nucleic acid, and measurement of the amplified nucleic acid
  • a sample processing unit comprising a cartridge storage unit for storing one type or a plurality of types of cartridges for use in the processing corresponding to a plurality of samples, and a plurality of processing lanes for executing the processing in parallel.
  • a sample processing unit that mounts the cartridge in each of the plurality of processing lanes, a sample storage unit that stores each of the plurality of samples, and a cartridge transfer unit that transfers the cartridge to each of the plurality of processing lanes
  • a sample transfer unit for transferring the plurality of samples to the plurality of processing lanes, and the cartridge transfer unit.
  • a controller that controls the transfer of the plurality of samples by the sample transfer unit, and the control unit uses the cartridge transfer unit to respond to each of the plurality of samples.
  • a sample is transferred to each of the plurality of lanes using the cartridge transfer unit, and the control unit further transfers the plurality of samples to the plurality of processing lanes using the sample transfer unit. Processing measurement system.
  • Aspect 2 The sample processing measurement system according to Aspect 1, wherein the processing and / or the measurement is batch processing performed simultaneously on the plurality of samples.
  • Aspect 3 The sample processing measurement system according to aspect 1 or 2, comprising a sample processing preparation unit in which the cartridge transfer unit and the sample transfer unit are integrated.
  • Aspect 4 In the specimen processing measurement system according to any one of aspects 1 to 3, at least a part of the cartridge includes a prefilled well in which a reagent and / or a solution necessary for the processing are sealed in advance. Sample processing measurement system.
  • Aspect 5 In the specimen processing measurement system according to any one of aspects 1 to 4, the plurality of specimens are classified into a plurality of groups capable of common processing operations, and the control unit includes the plurality of specimens.
  • a sample processing measurement system that selects a plurality of samples included in the same group from the samples and executes the processing in parallel.
  • the plurality of samples are processed randomly and continuously as a whole by executing the processing of the plurality of samples in parallel for each group. Specimen processing measurement system.
  • the cartridge transfer mechanism includes a cartridge picker elevating mechanism for elevating and lowering the cartridge picker.
  • the sample processing measurement system includes a consumable storage unit that stores consumables used in the plurality of lanes, The cartridge transfer mechanism includes a consumable item picker that takes out the consumable item from the consumable item storage unit.
  • Aspect 13 The specimen processing measurement system according to Aspect 12, wherein the cartridge transfer mechanism includes a consumable picker lifting mechanism for lifting and lowering the consumable picker.
  • the cartridge includes a cartridge information recording unit that records cartridge information, and the cartridge transfer mechanism is connected to the cartridge information storage unit.
  • a sample processing measurement system comprising an information reading unit for reading the cartridge information.
  • a first cartridge and a second cartridge are mounted on each of the plurality of processing lanes, and the control unit includes: A sample processing measurement system that removes the second cartridge, which has finished processing the sample, from the plurality of processing lanes using the cartridge transfer mechanism while the sample is being processed by the first cartridge.
  • the specimen container includes a specimen information recording unit that records specimen information and / or reagent information used for processing the specimen.
  • the sample transport unit or the sample storage unit includes an information reading unit that reads the sample information and / or the reagent information from the sample information storage unit.
  • the specimen storage unit includes a specimen transport mechanism that transports the plurality of specimens in an annular shape, and the specimen from the specimen transport mechanism.
  • a sample processing measurement system comprising a sample extraction position for extraction.
  • a sample processing measurement system comprising a cartridge fixing mechanism for fixing the cartridge to the sample processing unit.
  • Aspect 20 The specimen processing measurement system according to any one of aspects 1 to 19, wherein the cartridge fixing mechanism includes a first claw and a second claw for pressing both ends of the cartridge.
  • a sample processing measurement system comprising a processing execution unit having a plurality of dispensing nozzles.
  • a sample processing measurement system comprising a measurement unit for performing the measurement on the plurality of specimens.
  • a sample processing measurement system that performs in parallel a process comprising extraction of a nucleic acid contained in each of a plurality of specimens, amplification of the extracted nucleic acid, and measurement of the amplified nucleic acid
  • the sample processing measurement system includes a processing preparation subsystem, a processing execution subsystem, a plurality of stage racks, and a stage rack transfer mechanism that transfers the plurality of stage racks between the processing preparation subsystem and the processing execution subsystem.
  • the processing preparation subsystem stores a cartridge supply unit that supplies at least one cartridge, a cartridge picker that picks up the cartridge, and consumables
  • Each of the plurality of stage racks includes a plurality of processing lanes for performing the processing in parallel, and each of the plurality of processing lanes.
  • the cartridge, the consumables, and the sample container are mounted in a predetermined arrangement
  • the processing execution subsystem includes a plurality of processing execution units, and a plurality of stage rack mounting units that mount the plurality of stage racks.
  • a stage rack mounting mechanism that transports and mounts the stage rack to the stage rack mounting section, and each of the plurality of processing execution units includes the plurality of the stage racks mounted on the stage rack mounting section.
  • a sample processing measurement system that performs the processing on each of the samples.
  • the sample processing measurement system according to Aspect 23 a plurality of samples to which a common protocol capable of executing the processes in parallel is applied are arranged in one stage rack and the process execution unit performs the process.
  • the plurality of processing lanes include an extraction function unit for extracting nucleic acid from the sample, an amplification function unit for amplifying the extracted nucleic acid, A sample processing measurement system, wherein the measurement function units for measuring the amplified nucleic acid are arranged in a line.
  • the stage rack includes a reagent container for storing various reagents used in the processing, the cartridge, the consumable, and the sample.
  • a sample processing measurement system in which a sample container to be accommodated is mounted on each processing lane, and all or at least a part thereof is replaced or discarded after the processing to reduce contamination of the sample.
  • the cartridge picker adsorbs both ends of the cartridge.
  • a specimen processing measurement system comprising a transport mechanism for transporting to a processing execution subsystem.
  • Aspect 28 The specimen processing measurement system according to Aspect 27, wherein the transport mechanism is composed of a slide rack that houses the reagent or the specimen and a slide mechanism that slides the slide rack.
  • Aspect 29 The specimen processing measurement system according to Aspect 26 or 27, wherein the processing preparation subsystem further includes a storage unit for adjusting the temperature of the reagent or specimen for storage.
  • the cartridge supply unit pushes the lowermost cartridge out of the cartridge supply unit with respect to the plurality of stacked cartridges.
  • a specimen processing measurement system comprising a cartridge push-out mechanism.
  • the processing execution subsystem further brings a heat block into close contact with the stage rack mounted on the stage rack mounting portion A sample processing measurement system including a close-contact mechanism.
  • the processing execution subsystem includes a consumables disposal unit that discards the consumables, and during or after the processing, The sample processing measurement system, wherein the dispensing nozzle of the processing execution unit takes out the consumable from the stage rack and discards it in the consumable disposal unit.
  • the processing execution subsystem includes a waste liquid tank for discarding a waste liquid containing the specimen, and the processing execution unit includes a waste liquid tank that is disposed during or after the processing.
  • a sample processing measurement system in which a dispensing nozzle sucks the waste liquid from the stage rack and discards it in the waste liquid tank.
  • the processing preparation subsystem includes a cartridge disposal unit that discards the cartridge, and the cartridge picker is connected to the processing preparation subsystem after the measurement is completed.
  • a sample processing measurement system that picks up the cartridge from the transferred stage rack and discards the cartridge in the cartridge disposal unit.
  • Aspect 35 The specimen processing measurement system according to any one of aspects 1 to 34, wherein the consumable includes at least one of a well, a tube, a dispensing tip, a piercing tip, and a well cap. Measuring system.
  • At least a part of the cartridge includes at least a nucleic acid extraction reagent and / or a nucleic acid amplification reagent sealed in advance. An analyte processing measurement system comprising one prefilled well.
  • At least a part of the cartridge includes an extraction reagent prefilled cartridge in which the nucleic acid extraction reagent is sealed in advance, and the nucleic acid
  • a sample processing measurement system including a prefilled cartridge for amplification reagent in which the amplification reagent is sealed in advance.
  • a sample processing measurement system comprising at least one or more of a holding unit and a dispensing tip holding unit for holding a dispensing tip.
  • the processing lane includes a tube containing a microparticle for nucleic acid detection, and each of the tubes is different from a different specimen.
  • a plurality of microparticles fixed with a substance capable of binding to each other are arranged at known positions, and the sample processing measurement system includes a detection unit that detects a signal emitted from the microparticles in the tube. Measuring system.
  • the processing lane includes an electrophoresis chip for performing electrophoresis of the specimen
  • the specimen processing measurement system includes the electrophoresis A sample processing measurement system comprising a detection unit for detecting a band separated from the sample in a chip.
  • the specimen processing measurement system according to any one of aspects 1 to 40 further comprising a biochemical examination apparatus that performs a biochemical examination of the specimen.
  • the sample processing measurement system of the present invention can efficiently perform continuous processing when processing a plurality of samples that require different processing steps.
  • FIG. 5 is a top view of the sample processing measurement system of FIG. 4. It is a perspective view of the chain conveyor of the sample processing measurement system of FIG. It is a top view of the chain conveyor of FIG.
  • FIG. 5 is an upper perspective view of a pickup unit mounted on the sample processing measurement system of FIG. 4. It is a downward perspective view of the pickup unit of FIG. It is a side view of the pickup unit of FIG.
  • FIG. 3 is an upper perspective view of the cartridge according to the first embodiment of the present invention.
  • FIG. 12 is a perspective view of a state where the cartridge of FIG. 11 is installed on a stage. It is a perspective view of the non-fixed state of the cartridge fixing mechanism which concerns on the 1st Embodiment of this invention. It is a perspective view of the fixed state of the cartridge fixing mechanism which concerns on the 1st Embodiment of this invention.
  • 1 is a perspective view of a cartridge fixing mechanism and a partition wall according to a first embodiment of the present invention. It is a perspective view of the cartridge storage unit which concerns on the 1st Embodiment of this invention.
  • FIG. 17 is a front view of the cartridge storage unit of FIG. 16.
  • FIG. 18 is a side view of the cartridge storage unit of FIG. 17.
  • FIG. 3 is a flowchart according to the first embodiment of the present invention. It is a front view of the sample processing measurement system which concerns on the 2nd Embodiment of this invention.
  • FIG. 21 is a top view of the sample processing measurement system of FIG. 20. It is (a) top view, (b) front view, (c) side view of a stage rack according to a second embodiment of the present invention. It is a perspective view of the stage rack of FIG. It is a perspective view of the stage rack and stage rack mounting mechanism used for the 2nd Embodiment of this invention.
  • FIG. 25 is a plan view showing transfer of the stage rack to the stage rack mounting mechanism of FIG. 24. It is a top view which shows mounting
  • FIG. 30 is a perspective view showing a fixing mechanism of the cartridge of FIG. 29.
  • FIG. 31 is a side view showing the operation of the cartridge fixing mechanism of FIG. 30.
  • each embodiment of the present invention provides a sample processing measurement system of a random batch access method combining a conventional multiple sample batch method and a one sample random access method.
  • processing includes extraction, purification, and amplification of a sample containing nucleic acid
  • measurement refers to measurement of a pretreated sample (nucleic acid), such as real-time PCR or Includes measurement of bands by gel electrophoresis. In the case of real-time PCR, amplification and measurement are performed simultaneously.
  • the sample processing measurement system 1000 includes a stage 100 that holds consumables and the like and executes each processing step, a frame 200 to which the stage 100 and each unit, etc. are attached, and an x direction 210A and a y direction 300A with respect to the frame 200.
  • a pick-up unit (picker unit) 300 movably mounted on the stage 100, a processing execution unit 400 provided on the stage 100 so as to be movable in the x direction 400A, a sample storage unit 600, and a plurality of types of cartridges used for processing.
  • a cartridge storage unit 700 that stores the cartridges in a removable manner, a disposal box 800 provided below the stage 100, and a control unit (not shown) that controls the operation of each unit and the like are provided.
  • the processing execution unit 400 includes a plurality of dispensing nozzles (nozzle portions) that move up and down integrally to correspond to a plurality of processing lanes.
  • stage 100 of the sample processing measurement system 1000 will be described with reference to the top view of FIG.
  • a processing unit 110 having a plurality of processing lanes
  • a consumable storage unit 120 for storing consumables such as dispensing tips, sample tubes and caps
  • consumables connected to a disposal box 800
  • a waste outlet 130 and an extract storage rack 140 for storing the extract and its residual liquid are provided.
  • a sample storage unit 600 is disposed beside the stage 100, and the sample storage unit 600 includes a chain conveyor 602 for transporting a plurality of sample tubes. A part of the chain conveyor 602 extends from the sample storage unit 600 to the stage 100 side.
  • a measurement unit 900 that measures the amplified sample is provided behind the processing execution unit 400.
  • Each processing lane of the processing unit 110 includes a nucleic acid extraction cartridge (first processing cartridge) 112, a nucleic acid amplification and measurement cartridge (second processing cartridge) 114, and a dispensing chip used in each processing step. And a consumable item storage unit 116 for storing consumable items such as caps and caps.
  • the cartridges 112 and 114 and the consumable storage unit 116 are linearly arranged.
  • Each processing lane of the processing unit 110 can include at least one cartridge. While the processing execution unit 400 moves along the processing lane above the processing unit 110, using the dispenser (dispensing nozzle) of the moving unit 400, the reagent or the solution is added to the sample in the well of the cartridge.
  • the cartridges 112 and 114 preferably comprise a plurality of wells (containers) arranged in a straight line. Note that the well may not be integrated with the cartridge, and at least one well may be disposed in the processing unit 110 together with the cartridges 112 and 114.
  • the chain conveyor 602 of the sample storage unit 600 will be described with reference to the perspective view of FIG. 6 and the top view of FIG. 6 and 7, the housing of the sample storage unit 600 and the drive mechanism of the chain conveyor 602 are not shown.
  • a plurality of tube holders 604 are arranged on the chain conveyor 602, and a sample tube (parent sample container) 606 containing a sample is held in the tube holder (parent sample tray) 604.
  • an information storage unit 608 that stores sample information and / or information on a reagent to be used may be provided on the surface facing the outside or the upper side of the tube holder 604 or the sample tube 606.
  • the information storage unit 608 can be a QR code (registered trademark), a barcode, an IC tag, or the like.
  • An information reading unit 610 is provided at a position facing the information storage unit 608. Information in the information storage unit 608 may be read by the information reading unit 350 (FIG. 9) instead of the information reading unit 610.
  • the chain conveyor 602 is rotationally driven by a drive mechanism (not shown).
  • the sample storage unit 600 can preferably include a temperature adjustment mechanism for preventing denaturation or deterioration of the sample in the sample tube 606. For example, if the sample is whole blood, the temperature adjustment mechanism maintains the sample tube 606 at 2 to 6 ° C.
  • the sample tube 604 moves on an annular track of a chain conveyor (sample transport mechanism) 602. With the sample tube 604 moved to the extraction position 612 on the stage 100 side, the specimen in the sample tube 604 can be taken out (aspirated) by the dispensing nozzle of the preparation moving unit 300.
  • the information reading unit 610 can be provided at a position facing the extraction position 612. Thus, information can be read when the sample is taken out from the sample tube 604.
  • the sample tubes 604 are preferably arranged randomly on the chain conveyor 602 by opening the upper lid (not shown) of the chain conveyor 602. Even if the sample tubes are arranged at random, the information reading unit 610 or 350 reads out information from the information storage unit 608 of each sample tube 606, so that a plurality of samples that can be processed in parallel can be continuously taken out.
  • the control unit of the sample processing measurement system 1000 according to the first embodiment may preferably include a priority sample interruption function for priority sample testing that needs to be urgently tested. For example, when a priority sample that requires urgent processing or inspection occurs, the priority sample interruption function can be executed. For example, when the priority sample interrupt function is executed, based on the information read by the information reading unit 610 or 350, the chain conveyor 602 is driven to move the priority sample tube 604 to the extraction position 612 before other samples. It can be taken out and processed.
  • the pickup unit 300 will be described with reference to FIGS. As shown in FIG. 8, the pickup unit 300 is provided so as to be movable above the stage 100. The pickup unit 300 is arranged to be movable in the y direction 300A on the first rail 210 by the first motor 340. The first rail 210 is disposed on the second rail 220 by the second motor 212 so as to be movable in the x direction 210A. The second rail 220 is integrated with the frame 200, and a pair of second rails 220 are provided at positions corresponding to both ends of the first rail 210 as shown in FIG.
  • the pickup unit 300 will be described with reference to the lower perspective view of FIG.
  • a cartridge picker (cartridge removal tool) 310 that conveys the cartridges 112 and 114, a nozzle portion (dispensing nozzle) 320 to which a dispensing tip is connected, a dispensing tip, a tube,
  • a consumable item picker (consumable item picking tool) 330 for taking out consumable items such as a cap, and an information reading unit 350 for reading cartridge information from an information storage unit of a cartridge to be described later are provided.
  • the nozzle part 320 can be moved up and down by a nozzle part lifting motor 322 mounted on the pickup unit 300.
  • the nozzle part 320 can suck and discharge the liquid to the dispensing tip by a vacuum pump (not shown) with the dispensing tip attached.
  • the consumable item picker 330 can be moved up and down by a consumable item picker lifting / lowering motor 332 mounted on the pickup unit 300.
  • the consumable picker 330 includes a plurality of coupling ends (four in FIG. 10B), and the coupling ends are coupled (inserted) into openings such as dispensing tips, tubes, caps, and the like. These can be taken out. As shown in FIG.
  • the cartridge picker 310 can be raised and lowered by a cartridge picker raising / lowering motor 314 mounted on the pickup unit 300. Further, the cartridge picker 310 includes a pair of adsorbing portions (convex portions) 312 that adsorb both ends of the cartridge 112 (114) in a movable manner.
  • the adsorbing part 312 protrudes in a conical shape and is provided with an opening at its tip. The opening of the suction unit 312 is connected to a vacuum pump (not shown).
  • the structure of the cartridge 112 will be described with reference to FIG.
  • the cartridge 112 has an elongated shape, a plurality of wells 112a arranged linearly, a pair of attracted portions (recessed portions) 112b provided on the upper surfaces of both ends of the cartridge 112, and an information recording unit provided on the upper surface of the cartridge 112c, a pair of stacking plates 112d extending downward from both ends of the cartridge 112, and a pair of slits 112e provided at both ends of the cartridge 112. Furthermore, a pair of protruding pieces 112d1 are provided at the lower end of the stacking plate 112d.
  • the cartridges 112 When the cartridges 112 are stacked and stored, the protruding pieces 112d1 of the stacking plate 112d of the upper cartridge 112 are detachably engaged with the slits 112e of the lower cartridge 112, whereby the plurality of cartridges 112 are moved in the vertical direction. Can be stacked in a row.
  • 11 describes the cartridge 112
  • the cartridge 114 also has the same structure as the cartridge 112 except for the arrangement and shape of the well 112a, that is, a pair of attracted portions, an information storage portion, a pair of stacking plates, A pair of slits and a pair of protruding pieces can be provided.
  • At least some of the cartridges 112 and 114 can be prefilled cartridges.
  • the prefilled cartridge can include a plurality of prefilled wells in which reagents and solutions necessary for processing steps are sealed in advance.
  • the pickup unit 300 moves from the state of FIG. 4, and the pickup unit 300 stops above the outlet 710 on the upper surface of the cartridge storage unit 700. With the pickup unit 300 stopped above the outlet 710, the cartridge picker 310 is lowered and the suction portion 312 of the cartridge picker 310 is inserted into the suction portion 112b of the cartridge 112 (114). After the suction portion 312 is inserted into the suction target portion 112b, the cartridge 112 (114) is sucked to the cartridge picker 310 by reducing the pressure from the opening of the tip of the suction portion 312 by a vacuum pump (not shown).
  • the cartridge picker 310 After the cartridge 112 (114) is attracted by the adsorption unit 312 of the cartridge picker 310, the cartridge picker 310 is raised to the moving position, and then the pickup unit 300 is moved above the processing unit 110. After the pickup unit 300 moves above the processing unit 110, the cartridge picker 310 is lowered to place the cartridge 112 (114) at a position in a predetermined processing lane in the processing unit 110, and the vacuum of the suction unit 312. The pump decompression is stopped, the cartridge 112 (114) is separated from the cartridge picker 312, and the cartridge 112 (114) is installed in the processing lane of the processing unit 110.
  • the information storage unit 112c can be, for example, a QR code (registered trademark), a barcode, an IC tag, or the like.
  • the information reading unit 350 reads information when the cartridge is stored in the sample storage unit 600 and / or when the cartridge is removed from the sample storage unit 600.
  • the information storage unit of each cartridge stores processing steps in which the cartridge can be used, cartridge lot, expiration date, and the like.
  • the cartridge whose expiration date has passed can be automatically transferred to the consumables disposal port 130 and discarded using a cartridge picker.
  • the pickup unit 300 has been described as an integrated cartridge transfer unit that transfers a cartridge and a sample transfer unit that transfers a sample (sample). However, the cartridge transfer unit and the sample transfer unit are independent of each other. It can also be provided to be movable.
  • cartridge fixing mechanism 500 will be described with reference to FIGS. As shown in FIG. 13, cartridges 112 and 114 are arranged in a non-fixed state by the cartridge fixing mechanism 500 in the plurality of processing lanes of the processing unit 110, respectively.
  • the non-fixed state is a state before and after the process execution.
  • the cartridge fixing mechanism 500 includes a motor 502, a gear mechanism 504 including a plurality of gears driven by the motor 502, a pair of first rotating shafts 506 disposed near both ends of the cartridge 112 and rotated by the gear mechanism 504, A plurality of first claws 506 that rotate integrally with the first rotating shaft 506, a pair of second rotating shafts 510 that are arranged near both ends of the cartridge 114 and rotated by the gear mechanism 504, and the second rotating shaft 510 are integrated with each other. And a plurality of second claws 512 that rotate.
  • FIG. 14 shows a fixed state during processing. To release the fixed state, the motor may be rotated in the reverse direction.
  • the gear mechanism 504 can rotate the first claw 508 and the second claw 512 by combining a pinion gear and a rack gear.
  • the cartridge fixing mechanism 500 shown in FIGS. 13 and 14 fixes both the cartridges 112 and 114 at the same time.
  • the first cartridge fixing mechanism that fixes the cartridge 112 and the second cartridge that fixes the cartridge 114 are used.
  • a fixing mechanism can also be provided. In this case, while the processing is being performed while the cartridge 112 is being fixed by the first cartridge fixing mechanism, the cartridge 114 that has been processed is released and the cartridge 114 is transferred and discarded using the cartridge picker 310. can do.
  • a partition wall 118 is provided between the lanes of the processing unit 110. The partition wall 118 facilitates the alignment of the cartridge to each lane and prevents contamination between the lanes.
  • a cartridge storage unit (cartridge magazine rack unit) 700 will be described with reference to FIGS.
  • the cartridge storage unit 700 stores a plurality of cartridges 112 and 114 in a stacked state.
  • a cartridge outlet 710 is formed on the upper surface of the cartridge storage unit 700, and a plurality of cartridges 112 and 114 are exposed at the cartridge outlet 710.
  • a door 720 is provided on the side surface of the cartridge storage unit 700.
  • a plurality of cartridges 112 and 114 are stacked and biased upward. When the uppermost cartridge is taken out by the cartridge picker 310, the cartridge immediately below rises to the take-out position. Thus, the top cartridge is always maintained at the same height.
  • a flowchart of the sample processing measurement system 1000 according to the first embodiment of the present invention will be described with reference to FIG.
  • the flowchart of FIG. 19 is not limited, but assumes operation in a large-scale hospital.
  • a genetic test such as DNA / RNA, an immunological test, a biochemical test, an infectious disease test, and the like can be performed.
  • a patient's blood whole blood
  • the blood is inspected by each inspection system including the sample processing measurement system 1000.
  • the vacuum blood collection tube can be removed and provided as a sample tube to the automatic inspection system of the present invention.
  • the automatic inspection system according to the first embodiment of the present invention is preferably a cartridge (information management) including a prefilled reagent and a solution, an autoloading system for the cartridge, and geneLEAD (Precision System Science Co., Ltd.). Or a multi-item detection mechanism such as a biochemical inspection unit. This makes it possible to construct a completely new concept system that takes advantage of the multiple sample batch method and the one sample random access method.
  • step S1 sample information is read from the sample tube.
  • the sample information is stored in an information storage unit 608 (FIG. 7) such as a barcode or an IC chip attached to the tube holder 604 or the sample tube 606, and the information reading unit 610 (FIG. 7) or the information reading unit 350 (FIG. 9). ).
  • step S2 the sample tube 606 is transferred to the removal position (suction position) 612 (FIG. 7) using the chain conveyor 602 of the sample storage unit 600.
  • step S ⁇ b> 3 the nozzle unit 320 of the preparation moving unit 300 sucks the sample and dispenses the sample to the processing tube of the processing unit 110.
  • step S 4 the cartridge, the dispensing tip, etc. suitable for the processing item are transferred to each lane of the processing unit 110 of the stage 100 using the cartridge picker 310 (loading arm) or the consumables picker 330 of the preparation moving unit 300. And align.
  • step S5 the first processing step (extraction step) is performed.
  • the first processing step is, for example, DNA / RNA extraction using a magnetic substance and an extraction reagent, and is executed by the extraction cartridge 112 (extraction function unit). All processing steps can be automated.
  • the DNA extraction process is executed by performing suction and discharge on each well of the cartridge 114 using the dispensing nozzle of the processing execution unit 400.
  • cells are lysed, DNA is exposed from the cells (used as a lysis buffer solution), and heated.
  • the magnet is mixed with the magnetic particle solution, and the magnet is detached from the container / dispensing tip (see FIG. 3 of Patent Document 1 and Non-Patent Document 1).
  • DNA bonded to the magnetic particles is separated from the solution by a magnet, and capture, stirring, suction, and discharge are executed using a dispensing nozzle and a well.
  • the DNA is separated from the magnetic material (as a DNA extraction buffer solution), and the magnet is detached from the container / dispensing chip.
  • a DNA purification solution is obtained and the first processing step is completed.
  • the DNA purification solution is transferred to the cartridge 114 (amplification and measurement function unit) in the second processing step (amplification step).
  • step S6 the second processing step is executed.
  • the second processing step is executed by performing suction and discharge on each well of the second cartridge 114 using a plurality of dispensing nozzles (nozzle portions) of the processing execution unit 400.
  • the amplification and measurement (real-time PCR) of purified DNA is performed as follows. First, in order to dispense and mix the DNA purification solution and PCR reagents, stirring / aspiration / discharge control is performed. PCR reagents are dNTPs (DNA amplification containers), Primers, buffers, and the like. Second, the PCR container is capped or sealed using the dispensing nozzle of the process execution unit 400. Third, the heating and cooling process by the thermal cycler is repeated, PCR is performed, and DNA is amplified.
  • step S7 using the measurement unit 900, a detection process of a sample in the second processing process or a sample that has been amplified is executed.
  • steps S6 and S7 are executed simultaneously.
  • the measurement unit 900 performs real-time measurement of the amplified DNA and analyzes the fluorescence amount / fluorescence curve. Specifically, the fluorescent light is received by performing excitation light irradiation of the six-color fluorescent material and wavelength filtering by the optical unit of the measurement unit 900.
  • detection information (diagnostic information etc.) is acquired and transmitted to a host server such as a hospital.
  • step S9 each used consumable is discarded from the stage to the consumable disposal port 130, and the process ends.
  • each cartridge can be provided with information storage units 608 and 112c such as a QR code (registered trademark), a bar code, or an IC chip in order to facilitate management.
  • information storage units 608 and 112c such as a QR code (registered trademark), a bar code, or an IC chip in order to facilitate management.
  • the information reading unit 350 or 610 includes an information storage unit 608 provided with sample information (QR code (registered trademark), bar code, IC chip, etc.) that is sent at random from a sample tube.
  • sample information QR code (registered trademark), bar code, IC chip, etc.
  • random access processing can be performed based on the read information.
  • a plurality of samples are arranged and arranged in a batch batch processable array, and the plurality of samples are batch processed, that is, batch processing is executed by the multiple dispensing nozzles of the processing execution unit 400.
  • a highly rational test system could be constructed by combining batch processing and random access processing of samples.
  • a pickup unit 300 (FIGS. 4, 8, and 9) including a moving mechanism that can move three-dimensionally above the stage is provided. With the cartridge picker 310 of the pickup unit 300, multiple alignment of cartridges and up-and-down transfer (FIG. 12) can be realized.
  • An automatic loading mechanism (cartridge picker 310 of the pickup unit 300) that automatically transfers and places consumables such as prefilled cartridges 112 and 114 and dispensing tips to the processing unit 110 that performs batch processing.
  • the auto loading mechanism is realized by a vacuum suction type cartridge picker 310 (FIGS. 9 and 11) that does not require a complicated configuration.
  • a dispensing mechanism (nozzle portion 320 of the pickup unit 300) that performs sample dispensing and dispensing to the cartridges 112 and 114 is provided.
  • An information system (information storage units 608 and 112c and information reading units 350 and 610) that reads reagent / sample information is provided.
  • the cartridges 112 and 114 mounted on the processing unit 110 can execute the processing steps without moving from the region of the processing unit 110.
  • a plurality of dispensing nozzles of the processing execution unit 400 perform the same suction / discharge operation (protocol) for multiple rows of processing lanes provided in the processing unit 110 during processing.
  • a plurality of samples (12 samples in the first embodiment) can be processed simultaneously or in parallel. Thereby, a batch processing method can be realized.
  • a certain kind of sample (which requires different processing) can be simultaneously treated in parallel with the same operation by devising a reagent.
  • the reagents are different for serum samples and whole blood samples, they can be processed with the same protocol (operation of dispensing nozzle suction, discharge, and movement).
  • a plurality of basic protocols are prepared and classified into a plurality of groups including only those that can be processed by the same protocol.
  • the necessary reagents can be used in the same protocol. This allows continuous and endless processing, and improves the throughput or operating rate of the sample processing measurement system.
  • the single nozzle (nozzle portion 320) of the pickup unit 300 can be attached with a rubber plug (rubber lid) piercing needle (piercing tip).
  • the sample tube 606 can be used as a vacuum blood collection tube (sample tube) provided with a rubber plug, and the rubber plug can be pierced (perforated) with a needle attached to the nozzle portion 320 to suck the sample from the sample tube 606.
  • an extract such as DNA obtained from the pretreatment step is transferred and stored in a tube of the extract storage rack 140 using the nozzle unit 320 of the pickup unit 300 as required. Is possible.
  • consumables such as used cartridges, dispensing tips, sample tubes and the like can be disposed of separately.
  • the consumables disposal port 130 is set as a plurality of sorting waste ports, and the sorting waste bags are disposed in the sorting waste ports. Can be connected. As a result, the consumables can be separated and discarded.
  • the sample processing measurement system 2000 includes a processing preparation subsystem 2100, a processing execution subsystem 2200, a plurality of movable stage racks (moving stages) 2300, a processing preparation subsystem 2100, and A stage rack transfer mechanism 2400 for transferring a plurality of stage racks 2300 between the processing execution subsystems 2200; On the processing preparation subsystem 2100 side, consumables and the like are arranged or mounted on the stage rack 2300.
  • the stage rack 2300 on which the consumables and the like are arranged is transferred to the process execution subsystem 2200 side and mounted on a plurality of process execution units 400 incorporated in the process execution subsystem 2200.
  • the processing execution unit 400 executes processing (extraction, amplification, and measurement) along a plurality of processing lines provided on the stage rack 2300 with respect to a plurality of samples stored in the sample containers of the stage rack 2300. .
  • the processing preparation subsystem 2100 includes a processing preparation stage 2110 that stores various consumables and the like, and a cartridge supply unit 2120 that supplies the cartridge to the processing preparation stage 2110.
  • the processing preparation stage 2110 includes a pickup unit 2130 and a cartridge picker (air tweezers) 2132 that can be moved three-dimensionally.
  • the processing preparation stage 2110 includes a consumables storage unit 2140 that stores consumables such as dispensing tips and piercing chips, a container storage unit 2150 that stores various reagent containers such as PCR reagents and / or child sample containers, and a PCR.
  • a reagent storage unit 2152 for storing various reagents such as reagents and a parent sample storage unit 2160 for storing a parent sample are provided.
  • the consumable storage unit 2140 accommodates any consumable such as, for example, a large-capacity dispensing tip, a small-capacity dispensing tip, a piercing tip that perforates an aluminum seal of a sealed container, and a PCR well sealing lid.
  • the parent sample storage unit 2160 and / or the reagent storage unit 2152 can preferably include a temperature adjustment mechanism (cooling mechanism) that adjusts (cools) the temperature of the parent sample and / or reagent.
  • the cartridge supply unit 2120 is disposed adjacent to the processing preparation stage 2110 and extends upward from the processing preparation stage 2110.
  • the cartridge supply unit 2120 supplies the extraction cartridge 112, the PCR cartridge 114, the integrated cartridge 113 (FIG. 29), and the like toward the processing preparation stage 2110.
  • the cartridge supply unit 2120 includes cartridges stacked, and includes a cartridge push-out mechanism 2122 (FIG. 21) that pushes a plurality of cartridges at the lowest stage from the cartridge supply port 2121 (FIG. 20) toward the processing preparation stage 2110.
  • the cartridge push-out mechanism 2122 can include a plurality of push-out pins 2122a that are expanded and contracted by an actuator such as a solenoid or a hydraulic cylinder.
  • the operation of the cartridge push-out mechanism 2122 is driven by a control unit (not shown).
  • the cartridge extruding mechanism 2122 includes one extruding pin 2122a for each cartridge, but may include an extruding plate 2122b that extrudes a plurality of cartridges at once.
  • the pickup unit 2130 can include one or a plurality of (for example, four) consumable item pickers 2130a and at least one dispensing nozzle 2130b.
  • the cartridge picker 2132 includes a pair of suction portions (convex portions) 2132a that movably sucks both ends of the cartridge 112 (114) or 113.
  • the adsorbing portion 2132a protrudes in a conical shape and has an opening at its tip.
  • the opening of the suction part 2132a is connected to a vacuum pump (not shown).
  • Each of the pickup unit 2130 and the cartridge picker 2132 includes an x-direction moving motor, and can move independently in the x direction along the first rail 2134.
  • the first rail 2134 can be moved in the y direction on the second rail 2136 by a y-direction moving motor.
  • Each of the consumable picker 2130a and the dispensing nozzle 2130b of the pickup unit 2130 includes a z-direction raising / lowering motor, and can be raised and lowered independently in the z-direction. Accordingly, the pick-up unit 2130 and / or the cartridge picker 2132 can arrange the consumables and the like at predetermined positions on the stage rack 2140 from the consumables storage unit 2140.
  • the processing preparation subsystem 2100 may include a pickup unit 300 (FIGS. 8 to 10) in which the pickup unit 2130 and the cartridge picker 2132 are integrated instead of the pickup unit 2130 and the cartridge picker 2132.
  • the parent specimen storage unit 2160 stores a plurality of parent specimens (for example, vacuum blood collection tubes).
  • the parent sample is loaded onto the parent sample tray 2160b and loaded from the sample loading unit 2160a.
  • the parent sample tray (elongated rack) 2160b preferably contains 12 parent sample containers. Since the parent sample storage unit 2160 stores eight parent sample trays 2160b, it can store a total of 96 parent samples.
  • Each parent sample container is provided with an information storage unit such as a barcode.
  • the sample information is read from the information storage unit by the information reading device 2160c provided in the parent sample storage unit 2160.
  • sample information such as sample number, sample collection date, collection location (ward name), doctor in charge, information on the patient who provided the sample, whether it is an emergency sample, infectious disease to be tested, etc. It is recorded.
  • the stage rack transfer mechanism 2400 can transfer the stage rack 2300 along the rail 2410 in the x direction using an x direction transfer motor.
  • the process preparation stage 2110 can preferably comprise a slide rack (transport container) 2162 comprising a plurality of wells or containers.
  • the slide rack 2162 can move between the process preparation subsystem 2100 and the process execution subsystem 2200 along the slide rail 2164.
  • the slide rail 2164 extends in the x direction between the processing preparation subsystem 2100 and the processing execution subsystem 2200, and the slide rack 2162 is moved by a slider and a slider motor (sliding mechanism).
  • the processing preparation subsystem 2100 further includes a cartridge disposal box 2170.
  • the cartridge disposal box 2170 is arranged at a lower position adjacent to the stage rack 2300 moved to the consumable mounting position. Used cartridges are discarded into the cartridge disposal box 2170 using the cartridge picker 2132.
  • the process execution subsystem 2200 mounts a process execution stage 2240, a plurality of process execution units 400 installed in the process execution stage 2240, and a plurality of stage racks 2300 on the process execution stage 2240, respectively.
  • the stage rack mounting mechanism 2220 is movable three-dimensionally above the processing execution stage 2240.
  • the stage rack mounting mechanism 2220 is attached to a rail 2222 that extends in the x direction, and is movable in the x direction by an x direction moving motor.
  • the rail 2222 is movable in the y direction along the rail 2224 extending in the y direction.
  • the stage rack mounting mechanism 2220 includes a pair of openable arms (not shown) that hold the stage rack 2300, and the arms can be moved up and down in the z direction by a z direction lifting motor.
  • the stage rack mounting unit 2210 includes a lifting and lowering contact mechanism (not shown) that lifts and lowers the stage rack 2300 in a state where the stage rack 2300 is mounted.
  • stage rack 2300 After the stage rack 2300 is mounted on the stage rack mounting portion 2210, the stage rack 2300 is lowered by the lifting and lowering contact mechanism, and a PCR heat block is placed in the PCR well of the PCR cartridge 114 or the integrated cartridge 113 disposed on the stage rack 2300. Adhere.
  • the process execution subsystem 2200 includes a consumables disposal box 2230 and a waste liquid tank 2232 below the area where the stage rack 2300 moves in the x direction, before the process execution stage 2240.
  • Consumables that can be attached to and detached from the dispensing nozzle (used dispensing tips, etc.) move to above the consumables disposal box 2230 with the consumables mounted on the dispensing nozzle provided in the processing execution unit 400. Is done. After that, the consumables are removed from the dispensing nozzle by the consumables removal mechanism provided in the dispensing nozzle (disengaged) and discarded in the consumables disposal box 2230. Similarly, the waste liquid is moved to above the waste liquid tank 2232 while being sucked by the dispensing nozzle provided in the processing execution unit 400. Thereafter, the waste liquid is discharged from the dispensing tip and discarded into the waste liquid tank 2232.
  • the stage rack (moving stage) 2300 has a substantially flat plate shape, and includes a plurality of processing lanes 2310 arranged in parallel to each other, and a long and thin tube accommodating portion 2318 corresponding to each processing lane. ing. On each processing lane, an extraction process (extraction function) and an amplification measurement process (amplification measurement function) are performed independently for each specimen. On the processing lane 2130, the positions of the extraction function unit that executes the processing step and the amplification measurement function unit that executes the amplification measurement step are fixed.
  • the tube accommodating portion 2318 accommodates a child specimen and / or reagent tube 119 (FIG. 26).
  • the partition wall 2312 which protrudes upwards in parallel with each processing lane 2130 is provided.
  • a partition wall 2313 that protrudes upward in parallel with the tube housing portion 2318 is provided between the tube housing portions 2318. The partition walls 2312 and 2313 can prevent contamination of the sample processed in each processing lane.
  • the stage rack 2300 further includes a plurality of transfer connection holes 2314 and a plurality of mounting connection holes 2316.
  • a plurality of transfer protrusions 2402 (FIGS. 24 and 27) of a stage rack transfer mechanism 2400 described later are inserted into the plurality of transfer connection holes 2314.
  • a plurality of mounting projections 2252 (FIGS. 24 and 27) of a stage rack mounting mechanism 2250, which will be described later, are inserted into the plurality of mounting connection holes 2316.
  • four transfer connection holes 2314 and four attachment connection holes 2316 can be provided, but the number is not limited to four and may be at least two.
  • a child sample tube 119, an extraction cartridge 112, a PCR cartridge 114, an integrated cartridge 113, and the like are arranged in each processing lane 2310.
  • the stage rack 2300 includes a cartridge fixing mechanism (concave groove and pin) for fixing the extraction cartridge 112, the PCR cartridge 114, or the integrated cartridge 113.
  • a cartridge fixing mechanism concave groove and pin
  • the extraction cartridge 112 and the PCR cartridge 114 can be similarly provided with a concave groove part.
  • the integrated cartridge 113 is integrated with an extraction cartridge and a PCR cartridge, and as shown in FIG. 29, is composed of a DNA extraction unit 133A and a PCR reaction unit 113B.
  • the integrated cartridge 113 is provided with one concave groove (pin insertion portion) 113f in the vicinity of the center thereof so as to intersect the longitudinal direction of the cartridge.
  • the fixing mechanism includes a pin 113g that is inserted into and removed from the groove 113f from the side surface direction of the cartridge 113, and a pin support 113h that supports the pin 113g so as to be movable.
  • FIG. 29 and FIG. 31 (c) show a state where the pin 113g is inserted into the concave groove 113f. As shown in FIG.
  • the cartridge 113 (112, 114) is lowered from above toward the processing lane 2310 of the stage rack 2300 by the cartridge picker 2132 (FIG. 20), as shown in FIG. 31 (b).
  • the pin 113g is inserted into the concave groove 113f, and the cartridge 113 is fixed.
  • the pin 113g and the pin support 113h are disposed below the adjacent cartridge, and the pin support 113h is slid by an actuator provided in the stage rack 2300 or the like.
  • the cartridge fixing mechanism (concave groove portion 113f, pin 113g, and pin support body 113h) can be configured such that a pair of concave groove portions are provided in the cartridge at both ends in the longitudinal direction of the cartridge, and the pin is inserted and removed from the side. .
  • the stage rack 2300 can be mounted with the cartridge fixing mechanism 500 (FIGS. 13 to 15) of the first embodiment.
  • the cartridge fixing mechanism (concave groove 113f and pin 113g) of FIG. 31 can be provided.
  • one stage rack 2300 can preferably include eight processing lanes 2310 and eight tube storage units 2318 in order to process eight different child samples at the same time.
  • one process execution unit 400 is provided with eight dispensing nozzles that move simultaneously along each process lane and tube receptacle and run with substantially the same protocol. Processing and measurement processing can be performed.
  • the number of processing lanes 2310 and tube storage portions 2318 provided in the stage rack 2300 is not limited to eight, and any number of processing lanes such as 4, 10, 12, 16 can be provided.
  • the number of dispensing nozzles provided in the processing execution unit 400 is not limited to eight, and any number of dispensing nozzles such as 4, 10, 12, 16, etc., corresponding to the number of lanes provided in the stage rack. Can be provided.
  • the stage rack transfer mechanism 2400 includes a substantially U-shaped stage rack transfer arm 2401 as shown in FIG.
  • the stage rack transfer arm 2401 can be reciprocated by a moving motor and a slider along a rail 2410 extending between the processing preparation subsystem 2100 and the processing execution subsystem 2200.
  • At least one transfer protrusion 2402 (FIGS. 24 and 28) is provided on the upper surface of each stage rack transfer arm 2401.
  • the stage rack 2300 is fixed and integrated with the stage rack transfer mechanism 2400.
  • the stage rack 2300 can move along the rail 2410 while being held by the stage rack transfer arm 2401.
  • the stage rack transfer mechanism 2400 can be moved up and down on the rail 2410 by an elevating mechanism (not shown) in order to insert or remove the transfer protrusion 2402 with respect to the transfer connection hole 2314.
  • stage rack mounting mechanism 2250 shown in FIG. 24 can be provided instead of the stage rack mounting mechanism 2220 shown in FIG.
  • the stage rack mounting mechanism 2250 is provided in the process execution stage 2240 for each process execution unit 400.
  • the stage rack mounting mechanism 2250 is provided on the processing execution stage 2240 and is movable in the y direction.
  • the stage rack mounting mechanism 2250 includes a pair of stage rack mounting arms 2251, at least one protrusion 2252 provided on each of the stage rack mounting arms 2251, and a pair of first racks extending downward from one end of each of the stage rack mounting arms 2251.
  • the second column 2253b extends downward from the end, and the second slider 2256b provided at the lower end of each of the second columns 2253b.
  • a pair of rails 2255 are provided on the stage 2240 to slide the first slider 2256a and the second slider 2256b in the y direction.
  • the stage rack mounting mechanism 2250 is provided with a moving motor (not shown) so that the stage rack mounting mechanism 2250 can be automatically moved.
  • stage rack 2300 is mounted on each processing lane in a state where the stage rack 2300 is held on the pair of stage rack transfer arms 2401 of the stage rack transfer mechanism 2400 at the consumable supply position of the processing preparation subsystem 2100. . Thereafter, the stage rack 2300 moves from the processing preparation subsystem 2100 to the processing execution subsystem 2200 as shown in FIG. Further, when the stage rack 2300 is transferred to the upper part between the rails 2255 of the processing execution subsystem 2200 and the stage rack mounting mechanism 2250 is moved below the stage rack 2300, the state shown in FIG.
  • FIG. 27 is a side view of the top view of FIG. 26 viewed from the x direction.
  • the stage rack transfer mechanism 2400 holding the stage rack 2300 is positioned above the stage rack mounting mechanism 2250.
  • the stage rack transfer mechanism 2400 is moved downward from the stage rack mounting arm 2251 by the lifting mechanism (not shown) from the state of FIG. 27A, the state of FIG. 27B is obtained.
  • the transfer projection 2402 of the stage rack transfer arm 2401 is detached from the transfer connection hole 2314 of the stage rack 2300, and the stage rack installation arm 2251 of the stage rack installation mechanism 2250 is attached to the connection hole for installation of the stage rack 2300. 2316 is inserted.
  • the stage rack 2300 is transferred from the stage rack transfer mechanism 2400 to the stage rack mounting mechanism 2250.
  • the width W 1 between the outer surfaces of the pair of stage rack transfer arms 2401 is smaller than the width W 2 between the inner surfaces of the pair of stage rack mounting arms 2251.
  • the stage rack 2300 and the stage rack transfer arm 2401 do not interfere with each other.
  • the sample processing measurement system 2000 operates as follows in order to improve the efficiency of the preprocessing process and realize high throughput.
  • the preparation operation in the processing preparation subsystem 2100 will be described.
  • the cartridges 112 and 114 are pushed out onto the processing preparation stage 2110 using a cartridge pushing mechanism 2122.
  • the extruded cartridges 112 and 114 are mounted on the stage rack 2300 using the cartridge picker 2132.
  • Consumables such as dispensing tips and piercing tips stored in the consumable storage unit 2140 are picked up by the four consumable pickers 2130a (FIG. 20) of the pickup unit 2130 and mounted on the stage rack 2300.
  • the Consumables such as reagent containers and / or child sample containers stored in the container storage unit 2150 are also picked up by the four consumable pickers 2130a of the pickup unit 2130 and mounted on the stage rack 2300 or the slide rack 2162. Is done.
  • reagents such as PCR reagents stored in the reagent storage unit 2152 are dispensed into reagent containers mounted on the stage rack 2300 by the dispensing nozzle 2130b of the pickup unit 2130.
  • the parent sample stored in the parent sample tray 2160b of the parent sample storage unit 2160 is dispensed into the child sample container 2320 mounted on the stage rack 2300 or the child sample container of the slide rack 2162 by the dispensing nozzle 2130b of the pickup unit 2130. Is done.
  • the consumables such as the cartridges 114 and 116 are fixed on the stage rack 2300 by the cartridge fixing mechanism. With the cartridge fixed, the stage rack 2300 is transferred to the processing execution subsystem 2200 by the stage rack transfer mechanism 2400.
  • the stage rack 2300 transferred to the processing execution subsystem is gripped by the pair of openable arms of the stage rack mounting mechanism 2220 and mounted on the stage rack mounting unit 2210. With the stage rack mounting unit 2210 mounted, the stage rack 2300 is lowered by the elevating mechanism, and the PCR cartridge of the stage rack 2300 is brought into close contact with the heat block provided in the stage rack mounting unit 2210 to perform the mounting operation. Complete.
  • the process is executed by the process execution unit 400, or after the child sample and / or PCR reagent is mounted using the slide rack, the process is executed by the process execution unit 400. Executed.
  • steps S5 to S9 shown in the flowchart of FIG. 19 of the first embodiment can be executed.
  • the slide rack 2162 is transferred to the processing execution unit 400 immediately before use, such as a child sample and / or a PCR reagent.
  • the child sample is dispensed from the parent sample container stored at a low temperature in the parent sample storage unit 2160 to the well or tube (container) of the slide rack 2162 using the dispensing nozzle 2130b.
  • the PCR reagent taken out from the PCR reagent container stored at low temperature is dispensed into the wells or tubes (containers) of the slide rack 2162 using the dispensing nozzle 2130b.
  • the slide rack 2162 is immediately transferred to the front (near) the processing execution unit 400.
  • the child sample or the PCR reagent transferred by the slide rack 2162 is sucked by the dispensing nozzle of the processing execution unit 400 and dispensed in a timely manner to the wells or containers of the stage rack 2300 mounted on the stage rack mounting unit 2210.
  • reagents such as PCR reagents and specimens are not left on the stage rack that is not cooled for a long time, so that deterioration of the reagents and specimens can be prevented.
  • the sample processing measurement system 2000 of the second embodiment includes a plurality of processing execution units 400, even if one processing execution unit 400 is operating, the other processing execution units 400 perform preprocessing in parallel. Can be executed.
  • processing extraction, amplification, and measurement
  • the stage rack mounting mechanism 2220 removes the stage rack 2300 from the stage rack mounting portion 2210, moves to the stage rack moving mechanism 2400, discards the consumables, and then again the consumables such as the next cartridge. Is repeatedly processed.
  • each processing execution unit 400 is not limited, and for example, any of processing lines 4, 6, 8, and 12 may be included. Furthermore, in the second embodiment, three process execution units 400 are provided, but the number of process execution units 400 is not limited, and for example, five process execution units 400 may be provided.
  • the first group (three units) can be used for processing the first to third common protocols
  • the second group (two units) can be used for individual protocols or emergency processing. As a result, a wide variety of specimens can be randomly and continuously processed as a whole system.
  • the types of specimens that can be processed in the first and second embodiments are, for example, whole blood, serum, plasma, urine, and the like.
  • Examples of pathogens that are diagnosed as infectious diseases by genes after pretreatment include HIV, hepatitis C virus, Mycobacterium tuberculosis, and chlamydia.
  • the protocol of the process executed by the process execution unit 400 differs depending on the test conditions such as the type or test item of the specimen or pathogen. Therefore, in the second embodiment, a plurality of common protocols corresponding to the types of specimens or pathogens are prepared. Samples that can be processed by the same common protocol can be arranged in the same stage rack 2300 and processed by the same processing stage 400 according to the common protocol.
  • the samples that can be processed by the first common protocol are collected in the first processing execution unit 400 and the processing is executed, and the samples that can be processed by the second common protocol are collected in the second processing execution unit 400.
  • processing can be executed.
  • specimens having the same protocol can be collected and preprocessed by recognizing preset examination conditions.
  • the examination conditions can be read in a non-contact manner from an information storage unit such as a barcode provided in each parent sample container using an information reading unit 2160c provided in the parent sample storage unit 2160.
  • the operation for discarding consumables on the stage rack 2300 will be described. Since the specimen to be processed may contain a pathogen, care must be taken when discarding the consumables that have contacted the specimen from the stage rack 2300 after the processing is completed. Therefore, in order to discard the consumables after use without touching the user, the consumables other than the cartridge are automatically picked up from the stage rack 2300 by using the dispensing nozzle of the processing execution unit 400. Discard in the disposal box 2230. Further, the waste liquid containing the specimen (sample) is sucked by the dispensing tip attached to the dispensing nozzle of the processing execution unit 400 on the stage rack 2300, and the dispensing nozzle of the processing execution unit 400 is used as the waste liquid tank 2232.
  • the liquid is discharged from the dispensing nozzle to the waste liquid tank 2232.
  • the process execution unit 400 used in the first and second embodiments “geneLEAD” provided by Precision System Science Co., Ltd. can be preferably used.
  • the first and second embodiments enable batch processing from DNA extraction to real-time PCR analysis.
  • the sample processing measurement system 2000 according to the second embodiment performs high-throughput processing by combining a plurality of processing execution units 400 with sample dispensing, reagent dispensing, and consumable setting (loading) functions. Can be executed automatically.
  • batch management can be automatically performed from parent sample to child sample dispensing, reagent dispensing, and pre-processing completion.
  • the sample processing measurement system 2000 includes a combination of a processing execution unit 400 including a plurality of dispensing nozzles (nozzle units) arranged in parallel and a plurality of stage racks 2300, and as a whole, a random batch. Access processing is possible, and 96 samples can be pre-processed per day.
  • the stage rack 2300 mounted on the stage rack mounting unit 2210 does not move in the y direction, and the multiple dispensing nozzles of the processing execution unit 400 move in the y direction.
  • pre-processing was performed, it is not limited to this.
  • the processing may be executed by moving the stage rack 2300 in the x direction without moving the multiple dispensing nozzles of the processing execution unit 400 in the y direction.
  • the stage rack 2300 includes a DNA extraction function unit for extracting and / or purifying DNA and a DNA amplification function unit for amplifying DNA at designated positions on each processing lane.
  • a plurality of consumables such as containers, cartridges, dispensing tips, piercing tips, and / or sealing caps used in the respective functional units are provided in each functional unit on each lane of the stage rack 2300. Pre-arranged at the position.
  • the placement or mounting of each consumable item on the stage rack 2300 can be performed automatically.
  • the processing execution unit 400 can DNA extraction, DNA amplification, and measurement of amplified DNA can be performed automatically. Furthermore, after these processes are executed, the consumables used from the stage rack 2300 can be automatically discarded and the stage rack can be reused.
  • the DNA extraction function section the DNA adsorbed on the magnetic particles in the solution held on the dispensing chip by desorption of the magnet from the dispensing chip of the processing execution unit 400 (magnetization technique). Extraction can be performed automatically.
  • the sample processing measurement system according to the second embodiment includes a plurality of processing execution units 400, even if processing is performed by one processing execution unit 400, a stage rack is added to another available processing execution unit 400.
  • the 2300 can be mounted at an arbitrary timing and the processing can be executed continuously. Thereby, the sample processing measurement system of the second embodiment can realize a random batch access method as a whole.
  • the consumable item may include at least one of a well, a tube, a dispensing tip, a piercing tip, and a well cap.
  • at least a part of the cartridge includes at least one prefilled well in which a nucleic acid extraction reagent and / or a nucleic acid amplification reagent is pre-sealed. Can do.
  • the cartridge is pre-filled with an extraction reagent pre-filled cartridge in which a nucleic acid extraction reagent is sealed in advance and a nucleic acid amplification reagent is sealed in advance. And a prefilled cartridge for an amplification reagent.
  • the cartridge includes a reagent well, a nucleic acid extraction well, a nucleic acid amplification well, a cap holding unit that holds a well cap, It can be provided with at least one or a plurality of dispensing tip holding portions for holding the dispensing tips.
  • each processing lane includes a tube containing a microparticle for nucleic acid detection, and each tube specifically binds to a different sample.
  • a plurality of microparticles to which a substance capable of being immobilized is arranged at a known position, and the sample processing measurement system can include a detection unit that detects a signal emitted from the microparticles in the tube.
  • each processing lane is provided with an electrophoresis chip for performing electrophoresis of the sample
  • the sample processing measurement system includes the electrophoresis chip from the sample in the electrophoresis chip.
  • a detector for detecting the separated band can be provided.
  • a biochemical test apparatus that performs one or a plurality of biochemical tests on a plurality of samples can be provided.
  • the biochemical test can include at least one of canine CRP (inflammatory marker), serum amyloid protein (SAA), total bile acid (TBA), fibrin degradation product (FDP), lipase, and D dimer.
  • Sample processing measurement system 100 Stage 110 Pre-processing unit 112 Cartridge 114 Cartridge 200 Frame 300 Pickup unit (cartridge transfer unit and sample transfer unit) 310 Cartridge picker 330 Consumable picker 400 Processing execution unit (parallel processing unit) 500 Cartridge fixing mechanism 600 Sample storage unit 700 Cartridge storage unit 800 Disposal box 900 Measurement unit 2000 Sample processing measurement system 2100 Processing preparation subsystem 2130 Pickup unit 2132 Cartridge picker 2200 Processing execution subsystem 2210 Stage rack mounting unit 2220 Stage rack mounting mechanism 2300 Stage rack 2400 Stage rack transfer mechanism

Abstract

本発明の検体処理測定システム1000は、複数の検体を並行処理を実行するための複数のレーンを備え、複数のレーンのそれぞれにカートリッジ112を搭載する処理部110と、複数の検体に対応した異なる処理に用いるための、複数種類のカートリッジを保管するカートリッジ保管ユニット700と、複数の検体を収容したサンプルチューブを保管及び搬送するサンプル保管ユニット600と、複数種類のカートリッジ112を各レーンにそれぞれ移送すると共に、複数のレーンのそれぞれに対してサンプルチューブから複数の検体のそれぞれを移送するピックアップユニット300と、ピックアップユニット300による複数種類のカートリッジの移送、及び複数の検体の移送を制御する制御部とを備える。

Description

検体処理測定システム
 本発明は、複数種類の生体関連物質のサンプル(検体)について、連続的に処理及び測定を実行するための検体処理測定システムに関する。
 遺伝子等の生体関連物質のサンプルは、所定の前処理を行った上で、検出または定量といった測定処理が行われる。所定の前処理として、サンプルの捕獲・精製・分離・洗浄等の物理的処理や、遺伝子の増幅や化学的反応処理等が行われる。測定処理としては、化学発光、蛍光、吸光光度等の測定が行われる。このような前処理や測定を行うためには、複数の試薬・反応溶液等を分注するための分注チップ等のプラスチック部材・消耗品をその処理目的に合わせて選抜し、これらを順次用いて適切な前処理工程を実行する必要がある。
 本発明者は、磁性体粒子を利用したマグトレーション技術(特許文献1)を提案している。さらに、本発明者は、マグトレーション技術に加えて、特許文献2にて提案したような、カートリッジ多列整列、複数分注ノズルにて、同時に溶液の分注を制御、磁性体の分離を用いた分注制御により、多検体一括バッチ処理を可能としている。
 前処理の自動化としては、複数サンプル・バッチ方式、及び1サンプル・ランダム・アクセス方式の2つが提案されている。複数サンプル・バッチ方式は、複数サンプルを並行して一括処理するものである。複数サンプル・バッチ方式の製品としては、プレシジョン・システム・サイエンス株式会社が提供する「geneLEAD XII」が挙げられる。複数サンプル・バッチ方式の製品としては、ロシュ・ダイアグノスティックス・インクが提供する「cobas」シリーズが挙げられる。1サンプルランダム・アクセス方式は、1サンプル毎に情報を逐一読取り、情報に基づき異なった物理的処理および反応処理を順次実行するものである。
特許第3682302号(図3) 国際公開第2010/074265号(図38)
 複数サンプル・バッチ方式のメリットは、複数サンプルに対し、「処理のための各機能部」を「固定化したシステム構成」にて、一括して処理することにより、装置を小型・簡素化できることである。しかしながら、複数サンプル・バッチ方式のデメリットは、異なった工程を複数要求されるサンプルへの対応や、連続的に導入される異なったサンプルへの対応が困難となることである。具体的には、図1に示すように、複数サンプルSA1,SA2,SA2,SA3,SA4,SA5,SA6,SAB1,SBC1を複数サンプル・バッチ方式で処理する場合を想定する。サンプルSA1,SA2,SA2,SA3,SA4,SA5,SA6は、項目Aの前処理を行う必要があり、項目B及びCの前処理は不要である。サンプルSAB1は、項目A及び項目Bの前処理を順に行う必要があり、項目Cの前処理は不要である。サンプルSBC1は、項目B及び項目Cの前処理を順に行う必要があり、項目Aの前処理は不要である。このように必要な項目が異なる複数サンプルを複数サンプル・バッチ処理で同時に並行処理を行うことは困難である。
 これに対して、1サンプル・ランダム・アクセス方式のメリットは、複数の工程処理(項目)が要求されるサンプルに対し、異なる処理項目を一貫性を持って連続的に処理できることである。しかしながら、1サンプル・ランダム・アクセス方式のデメリットは、図2に示すように、処理のために指定された機能部から機能部へ、サンプルを移送し、異なる処理工程をそれぞれ実行しなければならないことである。したがって、サンプル毎に処理工程が相違することにより、処理工程を制御するハードウェアおよびソフトウェアが複雑になる。その結果、必要なシステムまたは装置が、非常に複雑で高価、大型(5m~10m)にならざるを得ないという問題が生じている。例えば、図2に示すように、サンプルSA1,SAB1,SBC1を1サンプル・ランダム・アクセス方式で処理する場合を想定する。初めに、サンプルSA1を項目A処理機能部に移送して項目Aの処理工程を実行した後、サンプルSA1をサンプル回収部に移送する。次に、サンプルSAB1を項目A処理機能部に移送して項目Aの処理工程を実行し、サンプルSAB1を項目B処理機能部に移送して項目Bの処理工程を実行し、サンプルSAB1をサンプル回収部に移送する。最後に、サンプルSBC1を項目B処理機能部に移送して項目Bの処理工程を実行し、次にサンプルSBC1を項目C処理機能部に移送して項目Cの処理工程を実行し、サンプルSBC1をサンプル回収部に移送する。さらに、1サンプル・ランダム・アクセス方式は、1サンプルずつの処理となるため、複数サンプルを処理する場合、多くの時間を要するという問題も生じている。
 複数サンプルの前処理工程の自動化システムにおける要求は次の通りである。必要とされる検査項目が数十種類に及ぶため、試薬類や消耗品を間違えることなく、正確にバーコードやICタグによる選抜を行う情報管理方式が必要である。また、試薬やサンプルが微量でも混じることのないコンタミネーション防止対策、出来るだけ大量のサンプル処理を連続して行うための試薬や、消耗品類の大量収納・供給・廃棄を実現するステージレイアウト・移送方法を検討する必要がある。他にも、多数サンプルの連続処理と緊急検査のための優先検体の割り込み機能、操作者が容易に対応出来るユーザーフレンドリーなインターフェイス、装置本体の小型化、安価な価格、確実な安全性を保障できる構造が課題となる。
 本発明は、複数の検体を処理する場合に、効率よく連続的に処理及び測定を実行することができる、新規な検体処理測定システムの提供を目的とする。
 本発明の各態様は次の通りである。
(態様1)複数の検体のそれぞれに含まれる核酸の抽出、及び抽出された核酸の増幅、及び増幅された核酸の測定からなる処理を、並行して実行する検体処理測定システムであって、前記複数の検体に対応した前記処理に用いるための、1種類または複数種類のカートリッジを保管するカートリッジ保管ユニットと、前記処理を並行して実行するための複数の処理レーンを備える検体処理部であって、前記複数の処理レーンのそれぞれに前記カートリッジを搭載する、検体処理部と、前記複数の検体のそれぞれを保管する検体保管ユニットと、前記カートリッジを前記複数の処理レーンのそれぞれに移送するカートリッジ移送ユニットと、前記複数の処理レーンに前記複数の検体を移送する検体移送ユニットと、前記カートリッジ移送ユニットによる前記カートリッジの移送、及び前記検体移送ユニットによる前記複数の検体の移送を制御する制御部とを備え、前記制御部は、前記カートリッジ移送ユニットを用いて、前記複数の検体のそれぞれに応じた前記カートリッジを、前記カートリッジ移送ユニットを用いて前記複数のレーンのそれぞれに移送し、前記制御部は、さらに、前記検体移送ユニットを用いて、前記複数の検体を前記複数の処理レーンに移送する、検体処理測定システム。
(態様2)態様1に記載の検体処理測定システムにおいて、前記処理及び/または前記測定は、前記複数の検体について同時に行うバッチ処理である、検体処理測定システム。(態様3)態様1または2に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジ移送ユニット及び前記検体移送ユニットを一体化した検体処理準備ユニットを備える、検体処理測定システム。(態様4)態様1~3のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジの少なくとも一部が、前記処理に必要な試薬及び/または溶液が予め密封されたプレフィルドウェルを含む、検体処理測定システム。(態様5)態様1~4のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記複数の検体は、処理動作の共通化が可能な複数のグループに分類され、前記制御部は、前記複数の検体から同じグループに含まれる複数の検体を選択して前記処理を並行して実行する、検体処理測定システム。(態様6)態様5に記載の検体処理測定システムにおいて、前記グループ毎にまとめて前記複数の検体の前記処理を並行して実行することにより、前記複数の検体を全体としてランダムかつ連続的に処理する、検体処理測定システム。
(態様7)態様1~6のいずれか1項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジ移送機構は、前記少なくとも1つのカートリッジを吸着するカートリッジピッカーを備える、検体処理測定システム。(態様8)態様7に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジピッカーは、前記カートリッジを真空吸引する、検体処理測定システム。(態様9)態様7または8に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジピッカーは凸部を備え、前記カートリッジは前記凸部が挿入される凹部を備える、検体処理測定システム。(態様10)態様7~9のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジピッカーは前記カートリッジの両端を吸着する、検体処理測定システム。(態様11)態様7~10のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジ移送機構は、前記カートリッジピッカーを昇降するカートリッジピッカー昇降機構を備える、検体処理測定システム。(態様12)態様7~11のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記検体処理測定システムは、前記複数のレーンで使用される消耗品を保管する消耗品保管ユニットを備え、前記カートリッジ移送機構は、前記消耗品保管ユニットから前記消耗品を取り出す消耗品ピッカーを備える、検体処理測定システム。
(態様13)態様12に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジ移送機構は、前記消耗品ピッカーを昇降する消耗品ピッカー昇降機構を備える、検体処理測定システム。(態様14)態様7~13のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジは、カートリッジ情報を記録したカートリッジ情報記録部を備え、前記カートリッジ移送機構は、前記カートリッジ情報記憶部から前記カートリッジ情報を読み出す情報読出し部を備える、検体処理測定システム。(態様15)態様1~14のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記複数の処理レーンのそれぞれには、第1のカートリッジと第2のカートリッジが搭載され、前記制御部は、前記第1のカートリッジで前記検体を処理している間に、前記検体の処理が終了した前記第2のカートリッジを前記カートリッジ移送機構を用いて前記複数の処理レーンから除去する、検体処理測定システム。(態様16)態様1~15のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記検体容器は、検体情報、及び/または、前記検体の処理に用いる試薬情報を記録した検体情報記録部を有し、前記検体移送ユニットまたは前記検体保管ユニットは、前記検体情報記憶部から前記検体情報及び/または前記試薬情報を読み出す情報読出し部を備える、検体処理測定システム。
(態様17)態様1~16のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記検体保管ユニットは、前記複数の検体を環状に搬送する検体搬送機構と、前記検体搬送機構から前記検体を取り出すための検体取出位置とを備える、検体処理測定システム。(態様18)態様1~17のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記検体保管ユニットは、前記複数の検体の変性または劣化を防止するための温度調整機構を備える、検体処理測定システム。(態様19)態様1~18のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
 前記カートリッジを前記検体処理部に固定するカートリッジ固定機構を備える、検体処理測定システム。(態様20)態様1~19のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジ固定機構は、前記カートリッジの両端を押える第1爪及び第2爪を備える、検体処理測定システム。(態様21)態様1~20のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記複数の処理レーンのそれぞれに搭載された前記カートリッジに対して、前記処理を並行して実行するために、複数の分注ノズルを有する処理実行ユニットを備える、検体処理測定システム。(態様22)態様1~21のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記複数の検体に対して、前記測定を実行ための測定ユニットを備える、検体処理測定システム。
(態様23)複数の検体のそれぞれに含まれる核酸の抽出、及び抽出された核酸の増幅、及び増幅された核酸の測定からなる処理を、並行して実行する検体処理測定システムであって、前記検体処理測定システムは、処理準備サブシステムと、処理実行サブシステムと、複数のステージラックと、前記処理準備サブシステム及び前記処理実行サブシステムの間で前記複数のステージラックを移送するステージラック移送機構と、前記検体処理測定システムの動作を制御する制御部とを備え、前記処理準備サブシステムは、少なくとも1つのカートリッジを供給するカートリッジ供給ユニットと、前記カートリッジをピックアップするカートリッジピッカーと、消耗品を保管する消耗品保管ユニットと、前記消耗品をピックアップするピックアップユニットと、前記複数の検体を保管する検体保管部とを備え、前記複数のステージラックのそれぞれが、前記処理を並行して実行するために複数の処理レーンを備え、前記複数の処理レーンのそれぞれに、前記カートリッジ、前記消耗品、及び前記検体容器が所定の配置で搭載され、前記処理実行サブシステムは、複数の処理実行ユニットと、前記複数のステージラックを装着する複数のステージラック装着部と、前記ステージラックを前記ステージラック装着部まで移送して装着するステージラック装着機構とを備え、前記複数の処理実行ユニットのそれぞれが、前記ステージラック装着部に装着された前記ステージラック中の前記複数の検体のそれぞれに対して前記処理を実行する、検体処理測定システム。
(態様24)態様23に記載の検体処理測定システムにおいて、前記処理を並行して実行可能な共通プロトコールが適用される複数の検体を、1つのステージラックに配置して1つの処理実行ユニットで前記処理を実行する、検体処理測定システム。(態様25)態様23または24に記載の検体処理測定システムにおいて、前記複数の処理レーンには、前記検体から核酸を抽出する抽出機能部と、前記抽出された核酸を増幅する増幅機能部と、前記増幅された核酸の測定を行う測定機能部とが一列にそれぞれ配置される、検体処理測定システム。(態様26)態様23~25のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記ステージラックは、前記処理に用いる各種試薬を収容する試薬容器、前記カートリッジ、前記消耗品、及び前記検体を収容する検体容器を各処理レーンに搭載し、これらの全部または少なくとも一部を、前記処理後に取り換えるまたは廃棄することにより、前記検体のコンタミネーションを低減可能とする、検体処理測定システム。(態様25)態様23または24に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジピッカーは、前記カートリッジを真空吸引する、検体処理測定システム。(態様26)態様23~25のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジピッカーは前記カートリッジの両端を吸着する、検体処理測定システム。(態様27)態様23~26のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記処理に使用する試薬及び/または検体を、前記処理実行ユニットでの使用時に、前記処理準備サブシステムから前記処理実行サブシステムに輸送する輸送機構を備える、検体処理測定システム。
(態様28)態様27に記載の検体処理測定システムにおいて、前記輸送機構は、前記試薬または検体を収容するスライドラックと、前記スライドラックをスライドするスライド機構とから構成される、検体処理測定システム。(態様29)態様26または27に記載の検体処理測定システムにおいて、前記処理準備サブシステムは、さらに前記試薬または検体を温度調整して保管する保管部を備える、検体処理測定システム。(態様30)態様23~29のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジ供給ユニットは、積み重ねられた複数のカートリッジに対し、最下段のカートリッジを前記カートリッジ供給ユニットの外に押し出すカートリッジ押出し機構を備える、検体処理測定システム。(態様31)態様23~30のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記処理実行サブシステムは、さらに前記ステージラック装着部に装着された前記ステージラックに対してヒートブロックを密着させる密着機構を備える、検体処理測定システム。(態様32)態様23~31のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記処理実行サブシステムは、前記消耗品を廃棄する消耗品廃棄部を備え、前記処理中または前記処理後に、前記処理実行ユニットの分注ノズルが、前記ステージラックから前記消耗品を取り出して前記消耗品廃棄部に廃棄する、検体処理測定システム。
(態様33)態様23~32に記載の検体処理測定システムにおいて、前記処理実行サブシステムは、前記検体を含む廃液を廃棄する廃液槽を備え、前記処理中または前記処理後に、前記処理実行ユニットの分注ノズルが、前記ステージラックから前記廃液を吸引して前記廃液槽に廃棄する、検体処理測定システム。(態様34)態様23~33に記載の検体処理測定システムにおいて、前記処理準備サブシステムは、前記カートリッジを廃棄するカートリッジ廃棄部を備え、測定完了後に、前記カートリッジピッカーが、前記処理準備サブシステムに移送された前記ステージラックから前記カートリッジをピックアップして、前記カートリッジ廃棄部に廃棄する、検体処理測定システム。(態様35)態様1~34のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記消耗品は、ウェル、チューブ、分注チップ、ピアシングチップ、ウェルのキャップの少なくとも1つを含む、検体処理測定システム。(態様36)態様1~35のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジの少なくとも一部が、前記核酸の抽出試薬、及び/または前記核酸の増幅試薬が予め密封された少なくとも1つのプレフィルドウェルを含む、検体処理測定システム。
(態様37)態様1~35のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジの少なくとも一部が、前記核酸の抽出試薬が予め密封された抽出試薬用プレフィルドカートリッジと、前記核酸の増幅試薬が予め密封された増幅試薬用プレフィルドカートリッジとを含む、検体処理測定システム。(態様38)態様1~35のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記カートリッジが、試薬用ウェルと、核酸抽出用ウェルと、核酸増幅用ウェルと、ウェルのキャップを保持するキャップ保持部と、分注チップを保持する分注チップ保持部との少なくとも一つまたは複数を備える、検体処理測定システム。(態様39)態様1~38のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記処理レーンは、核酸検出用のマイクロ粒子を収容するチューブを備え、前記チューブには、異なる検体とそれぞれ特異的に結合することができる物質が固定された複数のマイクロ粒子が既知の位置に配置され、前記検体処理測定システムは、前記チューブ内のマイクロ粒子が発するシグナルを検出する検出部を備える、検体処理測定システム。(態様40)態様1~39のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記処理レーンに、前記検体の電気泳動を行う電気泳動チップを備え、前記検体処理測定システムは、前記電気泳動チップ内で前記検体から分離されたバンドを検出する検出部を備える、検体処理測定システム。(態様41)態様1~40のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、前記検体の生化学検査を行う生化学検査装置を備える、検体処理測定システム。
 本発明の検体処理測定システムは、異なる処理工程を必要とする複数の検体を処理する場合に、効率よく連続処理を実行することができる。
複数サンプル・バッチ方式を説明する模式図である。 1サンプル・ランダム・アクセス方式を説明する模式図である。 本発明のランダムバッチアクセス方式に関するベン図である。 本発明の第1の実施形態に係る検体処理測定システムの斜視図である。 図4の検体処理測定システムの上面図である。 図5の検体処理測定システムのチェーンコンベアの斜視図である。 図6のチェーンコンベアの上面図である。 図4の検体処理測定システムに搭載されたピックアップユニットの上方斜視図である。 図8のピックアップユニットの下方斜視図である。 図8のピックアップユニットの側面図である。 本発明の第1の実施形態に係るカートリッジの上方斜視図である。 図11のカートリッジをステージに設置する状態の斜視図である。 本発明の第1の実施形態に係るカートリッジ固定機構の非固定状態の斜視図である。 本発明の第1の実施形態に係るカートリッジ固定機構の固定状態の斜視図である。 本発明の第1の実施形態に係るカートリッジ固定機構及び仕切壁の斜視図である。 本発明の第1の実施形態に係るカートリッジ保管ユニットの斜視図である。 図16のカートリッジ保管ユニットの正面図である。 図17のカートリッジ保管ユニットの側面図である。 本発明の第1の実施形態に係るフローチャートである。 本発明の第2の実施形態に係る検体処理測定システムの正面図である。 図20の検体処理測定システムの上面図である。 本発明の第2の実施形態に係るステージラックの、(a)上面図、(b)正面図、(c)側面図である。 図22のステージラックの斜視図である。 本発明の第2の実施形態に用いる、ステージラック及びステージラック装着機構の斜視図である。 図24のステージラック装着機構へのステージラックの移送を示す平面図である。 図24のステージラック装着機構へのステージラックの装着を示す平面図である。 図26のステージラック装着機構へのステージラックの装着を示す側面図である。 図26のステージラック装着機構に装着されたステージラックの移動を示す平面図である。 本発明の第2の実施形態に用いるカートリッジの斜視図である。 図29のカートリッジの固定機構を示す斜視図である。 図30のカートリッジの固定機構の動作を示す側面図である。
 本発明の各実施形態に係る検体処理測定システムを図面を参照して説明する。各図において同一部分には同一符号を付して説明する。本発明の各実施形態は、図3に示すように、従来の複数サンプル・バッチ方式と1サンプル・ランダム・アクセス方式を組み合わせたランダム・バッチ・アクセス方式の検体処理測定システムを提供する。本発明の各実施形態において、「処理」とは、核酸を含む検体の、抽出、精製、及び増幅を含み、「測定」とは、前処理された検体(核酸)の測定、例えばリアルタイムPCRまたはゲル電気泳動によるバンドの測定を含む。なお、リアルタイムPCRの場合には、増幅と測定が同時に行われる。
(第1の実施形態)
〔検体処理測定システムの概要〕
 第1の実施形態に係る検体処理測定システム1000の概略を図4を用いて説明する。検体処理測定システム1000は、消耗品等を保持すると共に各処理工程を実行するステージ100と、ステージ100及び各ユニット等が取り付けられるフレーム200と、フレーム200に対して、x方向210A及びy方向300Aに移動可能に取り付けられたピックアップユニット(ピッカーユニット)300と、ステージ100上でx方向400Aに移動可能に設けられた処理実行ユニット400と、サンプル保管ユニット600と、処理に用いる複数種類のカートリッジを取出し可能に保管するカートリッジ保管ユニット700と、ステージ100の下方に設けられた廃棄ボックス800と、各ユニット等の動作を制御する不図示の制御部とを備える。処理等実行ユニット400は、複数の処理レーンに対応し一体となって昇降する複数の分注ノズル(ノズル部)を備える。
〔ステージ〕
 検体処理測定システム1000のステージ100を図5の上面図を用いて説明する。ステージ100上には、複数の処理レーンを備えた処理部110と、分注用チップ、サンプルチューブ、キャップ等の消耗品を保管する消耗品保管ユニット120と、廃棄ボックス800に接続される消耗品廃棄口130と、抽出物やその残液等を保管する抽出物等保管ラック140とを備える。さらに、ステージ100の横にはサンプル保管ユニット600が配置されており、サンプル保管ユニット600は、複数のサンプルチューブを搬送するサンプルチューブ搬送用のチェーンコンベア602を備える。チェーンコンベア602の一部は、サンプル保管ユニット600からステージ100側に延長される。処理等実行ユニット400の後方には、増幅されたサンプルを測定する測定ユニット900が設けられている。
 処理部110の各処理レーンは、核酸抽出用のカートリッジ(第1の処理カートリッジ)112と、核酸増幅及び測定用のカートリッジ(第2の処理カートリッジ)114と、各処理工程で使用する分注チップやキャップ等の消耗品を収容する消耗品収容部116とから構成される。各処理レーンにおいて、好ましくは、カートリッジ112、114、及び消耗品収容部116は、直線状に配置される。処理部110の各処理レーンは、少なくとも1つのカートリッジを備えることができる。処理部110の上方を処理レーンに沿って処理等実行ユニット400が移動しながら、移動ユニット400の分注器(分注ノズル)を用いて、カートリッジのウェル中のサンプルに対して試薬や溶液の吸引/吐出を行い処理を実行する。カートリッジ112及び114は、好ましくは直線的に配置された複数のウェル(容器)を備える。なお、ウェルをカートリッジと一体化せず、少なくとも1つのウェルをカートリッジ112、114と共に処理部110に配置してもよい。
〔チェーンコンベア(サンプル搬送機構)〕
 サンプル保管ユニット600のチェーンコンベア602を、図6の斜視図及び図7の上面図を用いて説明する。図6及び7において、サンプル保管ユニット600のハウジング及びチェーンコンベア602の駆動機構は、図示を省略している。チェーンコンベア602には、複数のチューブホルダ604が配置されており、チューブホルダ(親検体トレー)604にはサンプルを収容したサンプルチューブ(親検体容器)606が保持されている。好ましくは、チューブホルダ604またはサンプルチューブ606の外側または上側を向く面には、サンプルの情報、及び/または使用する試薬に関する情報記憶した情報記憶部608を備えてもよい。情報記憶部608は、QRコード(登録商標)、バーコード、ICタグ等とすることができる。情報記憶部608と対向する位置に、情報読取り部610を備える。なお、情報記憶部608の情報は、情報読取り部610に換えて、情報読取り部350(図9)で読み取ってもよい。チェーンコンベア602は、不図示の駆動機構によって回転駆動される。さらに、サンプル保管ユニット600には、好ましくは、サンプルチューブ606内のサンプルの変性または劣化を防止するための温度調整機構を備えることができる。温度調整機構は、例えばサンプルが全血であればサンプルチューブ606を2~6℃に維持する。
 サンプルチューブ604は、チェーンコンベア(サンプル搬送機構)602の環状軌道上を移動する。サンプルチューブ604がステージ100側の取出位置612に移動した状態で、サンプルチューブ604内の検体が、準備用移動ユニット300の分注ノズルにより取り出し(吸引)可能となる。情報読取り部610は、取出位置612に対向する位置に設けることができる。これによって、サンプルをサンプルチューブ604から取り出す際に、情報を読み出すことができる。
 サンプルチューブ604は、好ましくは、チェーンコンベア602の上方蓋(図示省略)を開放して、チェーンコンベア602にランダムに並べることができる。サンプルチューブをランダムに並べたとしても、情報読取り部610または350が各サンプルチューブ606の情報記憶部608から情報を読み出すことにより、並行処理が可能な複数のサンプルを連続して取り出すことができる。第1の実施形態の検体処理測定システム1000の制御部は、好ましくは、緊急に検査する必要がある優先サンプル検査のために、優先サンプルの割り込み機能を備えることができる。例えば、緊急に処理や検査が必要な優先サンプルが生じた場合は、優先サンプルの割り込み機能を実行することができる。例えば、優先サンプルの割り込み機能の実行時には、情報読取り部610または350が読み取った情報に基づき、チェーンコンベア602を駆動して優先サンプルのサンプルチューブ604を他のサンプルより先に取出位置612に移動し取り出し、処理を実行することができる。
〔ピックアップユニット〕
 ピックアップユニット300を図8~10を用いて説明する。ピックアップユニット300は、図8に示すように、ステージ100の上方で移動可能に設けられている。ピックアップユニット300は、第1モータ340によって第1レール210上をy方向300Aに移動可能に配置される。第1レール210は、第2モータ212によって第2レール220上をx方向210Aに移動可能に配置される。なお、第2レール220はフレーム200と一体化されており、図4に示したように、第1レール210の両端に対応する位置に、一対の第2レール220が設けられる。
 ピックアップユニット300を図9の下方斜視図を用いて説明する。ピックアップユニット300の下部には、カートリッジ112、114を搬送するカートリッジピッカー(カートリッジ取出し具)310と、分注用チップが接続されるノズル部(分注ノズル)320と、分注用チップ、チューブ、キャップ等の消耗品を取り出す消耗品ピッカー(消耗品取出し具)330と、後述するカートリッジの情報記憶部からカートリッジ情報を読み取る情報読取り部350とを備える。
 図10(a)に示すように、ノズル部320は、ピックアップユニット300に搭載されたノズル部昇降用モータ322によって昇降可能である。なお、ノズル部320は分注チップを取り付けた状態で、不図示の真空ポンプによって液体を分注チップに対して吸引吐出可能である。図10(b)に示すように、消耗品ピッカー330は、ピックアップユニット300に搭載された消耗品ピッカー昇降用モータ332によって昇降可能である。さらに、消耗品ピッカー330は、複数の結合端部(図10(b)では4個)を備え、結合端部を分注用チップ、チューブ、キャップ等の開口部に結合(挿入)することにより、これらを取り出すことができる。図10(c)に示すように、カートリッジピッカー310は、ピックアップユニット300に搭載されたカートリッジピッカー昇降用モータ314によって昇降可能である。さらに、カートリッジピッカー310は、カートリッジ112(114)の両端を移動可能に吸着する一対の吸着部(凸部)312を備える。吸着部312は、円錐状に突出しその先端には開口が設けられている。吸着部312の開口は、不図示の真空ポンプに接続される。
 図11を用いてカートリッジ112の構造を説明する。カートリッジ112は細長い形状であり、直線的に配置された複数のウェル112aと、カートリッジ112の両端上面に設けられた一対の被吸着部(凹部)112bと、カートリッジの上面に設けられた情報記録部112cと、カートリッジ112の両端から下方に延びる一対の積重ね用板112dと、カートリッジ112の両端に設けられた一対のスリット112eとを備える。さらに、積重ね用板112dの下端には、一対の突出片112d1が設けられる。カートリッジ112を積み重ねて保管する際に、上側のカートリッジ112の積重ね用板112dの突出片112d1が、下側のカートリッジ112のスリット112eに着脱可能に係合することにより、複数のカートリッジ112を上下方向に整列して積み重ねることができる。なお、図11はカートリッジ112について説明したが、カートリッジ114も、ウェル112aの配置や形状以外は、カートリッジ112と同様の構造、即ち、一対の被吸着部、情報記憶部、一対の積重ね用板、一対のスリット、及び一対の突出片を備えることができる。カートリッジ112、114は、少なくともその一部をプレフィルドカートリッジとすることができる。プレフィルドカートリッジには、処理工程に必要な試薬、溶液が予め密封された複数のプレフィルドウェルを備えることができる。
 図12を用いてカートリッジピッカー310によるカートリッジ112の取出し及び移送を説明する。図4の状態からピックアップユニット300が移動し、カートリッジ保管ユニット700の上面の取出口710の上方でピックアップユニット300が停止する。取出口710の上方にピックアップユニット300が停止した状態で、カートリッジピッカー310の下降させ、カートリッジピッカー310の吸着部312をカートリッジ112(114)の被吸着部112bに挿入する。吸着部312を被吸着部112bに挿入した後、不図示の真空ポンプにより吸着部312の先端開口から減圧することにより、カートリッジ112(114)がカートリッジピッカー310に吸着される。カートリッジ112(114)がカートリッジピッカー310の吸着部312で吸着された状態でカートリッジピッカー310を移動位置に上昇させた後、ピックアップユニット300を処理部110の上方に移動させる。ピックアップユニット300が処理部110の上方に移動した後、カートリッジピッカー310を下降させて、カートリッジ112(114)を処理部110内の予め定めた処理レーン内の位置に配置し、吸着部312の真空ポンプの減圧を停止し、カートリッジ112(114)をカートリッジピッカー312から分離し、カートリッジ112(114)を処理部110の処理レーンに設置する。
 なお、情報記憶部112cは、例えば、QRコード(登録商標)、バーコード、ICタグ等とすることができる。好ましくは、情報読取り部350によって、サンプル保管ユニット600へのカートリッジの収納時、及び/または、サンプル保管ユニット600からカートリッジの取り出し時に、情報が読み出される。各カートリッジの情報記憶部には、カートリッジが使用可能な処理工程、カートリッジのロット、使用期限等が記憶されている。使用期限が経過したカートリッジは、好ましくは、カートリッジピッカーを用いて自動的に消耗品廃棄口130に移送し廃棄することができる。情報記憶部により、多種類の検査を行う際に適切なサンプル及び/またはカートリッジを取り出すことができるとともに、これらの取り違え等も防止できる。ピックアップユニット300は、カートリッジの移送を行うカートリッジ移送ユニットと、検体(サンプル)の移送を行う検体移送ユニットを一体化したものとして説明したが、カートリッジ移送ユニットと、検体移送ユニットとをそれぞれ独立して移動可能に設けることもできる。
〔カートリッジ固定機構〕
 カートリッジ固定機構500を図13~15を用いて説明する。図13に示すように、処理部110の複数の処理レーンには、それぞれカートリッジ112、114がカートリッジ固定機構500によって非固定状態で配置されている。非固定状態は、処理実行前後の状態である。カートリッジ固定機構500は、モータ502と、モータ502によって駆動する複数のギヤから構成されるギヤ機構504と、カートリッジ112の両端近傍に配置されギヤ機構504によって回転する一対の第1回転シャフト506と、第1回転シャフト506と一体となって回転する複数の第1爪506と、カートリッジ114の両端近傍に配置されギヤ機構504によって回転する一対の第2回転シャフト510と、第2回転シャフト510と一体となって回転する複数の第2爪512とから構成される。
 図13の状態で、第1爪508及び第2爪512の先端は上方を向いており、カートリッジ112及び114を押えていない。この状態でモータ502を回転してギヤ機構504を駆動すると、第1爪508及び第2爪512が回転してカートリッジ112、114のそれぞれの両端を押えて固定した固定状態となる。図14が処理実行中の固定状態を示している。固定状態を解除するには、モータを逆方向に回転すればよい。なお、ギヤ機構504は、ピニオンギヤ、ラックギヤを組み合わせることにより第1爪508及び第2爪512を回転できる。図13及び14に示したカートリッジ固定機構500は、カートリッジ112及び114の両方を同時に固定するものとしたが、カートリッジ112を固定する第1のカートリッジ固定機構と、カートリッジ114を固定する第2のカートリッジ固定機構を設けることもできる。この場合には、第1のカートリッジ固定機構によりカートリッジ112を固定しながら処理を実行している間に、処理が完了したカートリッジ114の固定を解除してカートリッジ114をカートリッジピッカー310を用いて移送廃棄することができる。なお、図15に示すように、処理部110の各レーンの間には仕切り壁118が設けられる。仕切り壁118により、各レーンへのカートリッジの整列が容易となると共に、各レーンの間におけるコンタミネーションも防止できる。
〔カートリッジ保管ユニット〕
 カートリッジ保管ユニット(カートリッジマガジンラックユニット)700を図16~18を用いて説明する。カートリッジ保管ユニット700は、複数のカートリッジ112、114を積み重ねた状態で保管する。カートリッジ保管ユニット700の上面には、カートリッジ取出口710が形成され、カートリッジ取出口710に複数のカートリッジ112、114が露出している。カートリッジ保管ユニット700の側面には、扉720が設けられている。複数のカートリッジ112、114を積み重ねた状態で、上方に付勢されており、最上部のカートリッジをカートリッジピッカー310で取り出すと直下のカートリッジが取り出し位置まで上昇する。したがって、最上部のカートリッジは常に同じ高さに維持される。
〔フローチャート〕
 本発明の第1の実施形態の検体処理測定システム1000のフローチャートを図19を用いて説明する。図19のフローチャートは、限定するものではないが、大規模病院における運用を想定している。本発明の第1の実施形態の検体処理測定システム1000において、好ましくは、DNA/RNA等の遺伝子検査、免疫検査、生化学検査、感染症検査等が実行可能である。まず、病院では、患者の血液(全血)を真空採血管で採取し、血液が検体処理測定システム1000を含む各検査システムで検査される。この検査の際、真空採血管の脱ゴム栓を行い、サンプルチューブとして、本発明の自動検査システムに提供することができる。また、脱ゴム栓を行わずに、ピックアップユニット300のノズル部320に取り付けたニードルで真空採血管から血液を吸引することもできる。本発明の第1の実施形態に係る自動検査システムは、好ましくは、プレフィルド試薬及び溶液等を備えたカートリッジ(情報管理)と、カートリッジのオートローディングシステムと、geneLEAD(プレシジョン・システム・サイエンス株式会社)や、生化学検査ユニット等の、多項目検出機構と結合することができる。これによって、複数サンプル・バッチ方式と1サンプル・ランダム・アクセス方式の利点を生かした、全く新しい概念のシステムが構築可能となる。
 図19のフローチャートは次の通りである。ステップS1では、サンプルチューブからサンプル情報を読み取る。サンプル情報は、チューブホルダ604またはサンプルチューブ606に取り付けられたバーコードまたはICチップ等の情報記憶部608(図7)に記憶され、情報読取り部610(図7)または情報読取り部350(図9)により読み取られる。ステップS2では、サンプル保管ユニット600のチェーンコンベア602を用いてサンプルチューブ606を取出位置(吸引位置)612(図7)へ移送する。ステップS3では、準備用移動ユニット300のノズル部320がサンプルを吸引し、処理部110の処理用チューブへサンプルを分注する。ステップS4では、準備用移動ユニット300の、カートリッジピッカー310(ローディングアーム)または消耗品ピッカー330を用いて、処理項目に適合するカートリッジ及び分注チップ等をステージ100の処理部110の各レーンへ移送して整列させる。
 ステップS5では、第1の処理工程(抽出工程)を実行する。第1の処理工程は、例えば磁性体及び抽出試薬を用いたDNA/RNA抽出であり、抽出カートリッジ112(抽出機能部)で実行される。全ての処理工程は、その作業工程を自動化することができる。DNAの抽出工程は、処理実行ユニット400の分注ノズルを用いて、カートリッジ114の各ウェルに対して、吸引吐出等を行うことにより実行される。DNAの抽出工程は、第1に、細胞を溶解、細胞からDNAを暴露し(溶解バッファ液とし)加熱する。第2に、磁性体粒子溶液と混合し、磁石を容器・分注チップに対し脱着する(特許文献1の図3、及び非特許文献1参照)。第3に、磁性体粒子と結合したDNAを磁石により溶液から分離して、分注ノズル及びウェルを用いて捕獲・攪拌・吸引・吐出を実行する。第4に、DNAを磁性体から分離し(DNA抽出バッファ液とし)、磁石を容器・分注チップに対して脱着する。最後にDNA精製溶液を得て、第1の処理工程は完了する。DNA精製溶液は第2の処理工程(増幅工程)のカートリッジ114(増幅及び測定機能部)に移送される。
 ステップS6では、第2の処理工程を実行する。第2の処理工程は、処理実行ユニット400の複数の分注ノズル(ノズル部)を用いて、第2のカートリッジ114の各ウェルに対して、吸引吐出等を行うことにより実行される。具体的には、精製されたDNAの増幅及び測定(リアルタイムPCR)を次の通り実行する。第1に、DNA精製溶液、PCR試薬類を分注・混合するために、攪拌/吸引・吐出制御を行う。PCR試薬は、dNTP(DNA増幅容器)、Primier、バッファー等である。第2に、処理実行ユニット400の分注ノズルを用いてPCR容器をキャッピングまたはシーリングする。第3に、サーマルサイクラーによる加熱冷却処理を繰り返して、PCRを実行しDNAを増幅する。
 ステップS7では、測定ユニット900を用いて、第2の処理工程中のサンプル、または増幅が完了したサンプルの検出工程を実行する。なお、リアルタイムPCRでは、ステップS6とS7が同時に実行される。測定ユニット900は、増幅されているDNAのリアルタイム測定を行い、蛍光量・蛍光曲線を解析する。詳細には、測定ユニット900のオプティカルユニットによる6色蛍光物質の励起光照射、及び波長のフィルタリングを行って蛍光を受光する。ステップS8では、検出情報(診断情報等)を取得し、病院等のホストサーバに送信する。最後に、ステップS9では、使用済み各消耗品をステージから消耗品廃棄口130に廃棄し終了する。
 図3に示したように、複数サンプル・バッチ方式と1サンプルランダム・アクセス方式を組み合わせる際に、多種類の検査を行うための大きな問題、即ち、多種類の試薬ボトルが必要となるだけでなく、複数の試薬を分注する工程が複雑になるという問題が生じる。そこで、本発明の第1の実施形態においては、多種類の試薬及び/または溶液を「複数ウェルを備えたカートリッジ」に予め分注・プレパックし密閉したプレフィルドカートリッジを用いることにより、複雑な分注工程、試薬ボトルの準備を不要とすることができた。さらに、その一つ一つのカートリッジには、管理を容易にするために、QRコード(登録商標)、バーコードまたはICチップ等の情報記憶部608、112cを設けることができる。
 そして、複数のカートリッジ112、114を処理部110の複数のレーンに整列させる。検体処理測定システム1000は、ランダムに送られてくる検体の情報(QRコード(登録商標)、バーコード、またはICチップ等)をサンプルチューブに設けた情報記憶部608から情報読取り部350または610が読み取り、読み取った情報に基づき、全体としてランダムアクセス処理が可能となる。このサンプル情報を基に、複数サンプルを一括バッチ処理可能な配列に区分して配置し、処理実行ユニット400の多連分注ノズルにより複数サンプルを一括処理、即ち、バッチ処理を実行する。本発明の第1の実施形態においては、バッチ処理と検体のランダムアクセス処理を合体することで、合理性の高い検査システムを構築することができた。
 本発明の第1の実施形態の特徴は、次の通りである。
・ステージ上方を三次元的に移動可能な移動機構を備えたピックアップユニット300(図4及び図8、図9)を備える。ピックアップユニット300のカートリッジピッカー310により、カートリッジの多重整列、昇降移送(図12)が実現できた。
・バッチ処理を行う処理部110に対して、プレフィルドされたカートリッジ112、114、分注チップ等の消耗品を自動的に移送及び配置するオートローディング機構(ピックアップユニット300のカートリッジピッカー310)を備える。オートローディング機構は、複雑な構成を必要としない真空吸着式のカートリッジピッカー310(図9及び11)により実現される。
・検体分注とカートリッジ112、114への分注を行う分注機構(ピックアップユニット300のノズル部320)を備える。
・試薬・検体の情報を読み取る情報システム(情報記憶部608、112c及び情報読取り部350、610)を備える。
 本発明の第1の実施形態に係る検体処理測定システムによって、保管機能部(カートリッジ保管ユニット700)から各処理機能部(処理部110の各処理レーン)へのカートリッジ移送、検体情報のランダム・バッチ処理による一貫多項目検査対応、従来のバッチ処理システムには困難な連続アクセス処理が可能となった。さらに、反応機能部(カートリッジ)を固定単純化(プレフィルドしたカートリッジの使用)による、検査結果の安定性向上、低コスト化、省スペース化、操作容易性を確立することができた。
 本発明の第1の実施形態において、好ましくは、処理部110に搭載されたカートリッジ112、114は、処理部110の領域から移動することなく、処理工程を実行することができる。本発明の第1の実施形態において、好ましくは、処理時に処理部110に設けられた多列の処理レーンに対して、処理実行ユニット400の複数の分注ノズルが同じ吸引吐出動作(プロトコール)をするだけで、複数のサンプル(第1の実施形態では12サンプル)を同時にまたは並行して処理できる。これによって、バッチ処理方式が実現できる。本発明の第1の実施形態において、好ましくは、ランダムな(異なる処理が必要な)ある種のサンプルに対しては、試薬の工夫で同じ動作で同時に平行して処置可能とすることもできる。例えば、血清サンプル、全血サンプルに対して、試薬は異なるのものの、同じプロトコール(分注ノズルの吸引、吐出、移動の動作)で処理することができる。本発明の第1の実施形態において、好ましくは、基本プロトコール(共通プロトコール)を複数用意して、同じプロトコールで処理できるもののみを含む複数のグループに分類する。そして、1回の前処理に1つのグループを用いることにより、1回の処理動作を均等化して並行処理することができる。この場合には、必要な試薬を同じプロトコールで使うことができる。これによって、コンティニュアス、エンドレスで処理可能となり、検体処理測定システムのスループットまたは稼働率が向上する。
 本発明の第1の実施形態において、好ましくは、ピックアップユニット300のシングルノズル(ノズル部320)は、ゴム栓(ゴム蓋)ピアシング用ニードル(ピアシングチップ)を取り付けることも可能である。サンプルチューブ606をゴム栓を備えた真空採血管(サンプルチューブ)として、ノズル部320に取り付けたニードルでゴム栓をピアシング(穿孔)し、サンプルチューブ606からサンプルを吸引することもできる。本発明の第1の実施形態において、好ましくは、前処理工程から得られたDNA等の抽出液は、要求によりピックアップユニット300のノズル部320を用いて抽出物等保管ラック140のチューブに移送保存が可能である。
 本発明の第1の実施形態において、好ましくは、使用済みのカートリッジ、分注チップ、サンプルチューブ等の消耗品は、分別廃棄することができる。例えば、処理工程の終了後にピックアップユニット300の各ピッカー310、330を用いて消耗品を廃棄する際、消耗品廃棄口130を複数の分別用廃棄口とし、各分別用廃棄口に分別用廃棄袋を接続することができる。これによって、消耗品の分別廃棄が可能となる。
(第2の実施形態)
〔検体処理測定システムの概要〕
 本発明の第2の実施形態に係る検体処理測定システム2000を説明する。図20及び21に示すように、検体処理測定システム2000は、処理準備サブシステム2100と、処理実行サブシステム2200と、移動可能な複数のステージラック(移動ステージ)2300と、処理準備サブシステム2100及び処理実行サブシステム2200の間で複数のステージラック2300を移送するステージラック移送機構2400とを備える。処理準備サブシステム2100側で、消耗品等は、ステージラック2300に配置または搭載される。消耗品等が配置されたステージラック2300は、処理実行サブシステム2200側に移送され、処理実行サブシステム2200に組み込まれた複数の処理実行ユニット400に装着される。処理実行ユニット400は、ステージラック2300の検体容器に収容された複数の検体に対して、ステージラック2300上に設けられた複数の処理ラインにそって処理(抽出、増幅、及び測定)を実行する。
〔処理準備サブシステム〕
 処理準備サブシステム2100は、図21に示すように、各種消耗品等を保管する処理準備ステージ2110と、処理準備ステージ2110にカートリッジを供給するカートリッジ供給ユニット2120とを備える。また、処理準備ステージ2110は、その上方に、ピックアップユニット2130、及びカートリッジピッカー(エアピンセット)2132を、3次元的に移動可能に備えている。さらに、処理準備ステージ2110は、分注チップやピアシングチップ等の消耗品を保管する消耗品保管ユニット2140と、PCR試薬等の各種試薬容器及び/または子検体容器を保管する容器保管部2150、PCR試薬等の各種試薬を保管する試薬保管部2152と、親検体を保管する親検体保管部2160とを備える。消耗品保管ユニット2140は、例えば、大容量用分注チップ、小容量用分注チップ、密閉容器のアルミシールを穿孔するピアシングチップ、PCRウェル密閉蓋等のいずれかの消耗品を収容している。親検体保管部2160及び/または試薬保管部2152は、好ましくは、親検体及び/または試薬を温度調整(冷却)する温度調整機構(冷却機構)を備えることができる。
 カートリッジ供給ユニット2120は、処理準備ステージ2110に隣接配置され、処理準備ステージ2110より上方に延びている。カートリッジ供給ユニット2120は、処理準備ステージ2110に向けて抽出カートリッジ112、PCRカートリッジ114、一体型カートリッジ113(図29)等を供給する。カートリッジ供給ユニット2120には、カートリッジが積み重ねられており、最下段の複数のカートリッジをカートリッジ供給口2121(図20)から処理準備ステージ2110に向けて押出すカートリッジ押出機構2122(図21)を備える。カートリッジ押出機構2122は、ソレノイド、液圧シリンダ等のアクチュエータにより伸縮する複数の押出しピン2122aを備えることができる。カートリッジ押出機構2122の動作は不図示の制御部によって駆動される。カートリッジ押出機構2122は、1つのカートリッジ毎に1つの押出しピン2122aを備えるものとしたが、複数のカートリッジを一度に押出す押出し板2122bを備えることもできる。
 ピックアップユニット2130は、図20に示すように、1つまたは複数(例えば4連)の消耗品ピッカー2130aと、少なくとも1つの分注ノズル2130bとを備えることができる。カートリッジピッカー2132は、カートリッジ112(114)または113の両端を移動可能に吸着する一対の吸着部(凸部)2132aを備える。吸着部2132aは、円錐状に突出しその先端には開口が設けられている。吸着部2132aの開口は、不図示の真空ポンプに接続される。ピックアップユニット2130及びカートリッジピッカー2132は、それぞれx方向移動用モータを備え、第1レール2134にそってx方向に独立して移動可能である。第1レール2134は、y方向移動用モータによって第2レール2136上をy方向に移動可能である。ピックアップユニット2130の消耗品ピッカー2130a及び分注ノズル2130bは、それぞれz方向昇降用モータを備え、z方向に独立して昇降可能である。これによって、ピックアップユニット2130及び/またはカートリッジピッカー2132は、消耗品等を消耗品保管ユニット2140からステージラック2140上の所定の位置に配置することができる。なお、処理準備サブシステム2100は、ピックアップユニット2130及びカートリッジピッカー2132に替えて、これらを一体化したピックアップユニット300(図8~10)を備えることもできる。
 親検体保管部2160には、複数の親検体(例えば真空採血管)が保管されている。親検体は、親検体トレー2160bに乗せられて検体搬入部2160aから搬入される。親検体トレー(細長いラック)2160bは、好ましくは12本の親検体容器を収容している。親検体保管部2160は、親検体トレー2160bを8個収容するので、合計96個の親検体を収容することができる。また、個々の親検体容器には、バーコード等の情報記憶部が設けられている。親検体保管部2160に設けた情報読み取り装置2160cによって、情報記憶部から検体情報が読み出される。情報記憶部には、検体情報として、検体番号、検体採取日、採取場所(病棟名)、担当医師、検体を提供した患者の情報、緊急検体か否か、検査対象感染症等のいずれかが記録されている。
 ステージラック移送機構2400は、x方向移送用モータを用いて、ステージラック2300をレール2410にそってx方向に移送可能である。処理準備ステージ2110は、好ましくは、複数のウェルまたは容器を備えるスライドラック(輸送容器)2162を備えることができる。スライドラック2162は、スライドレール2164にそって、処理準備サブシステム2100と処理実行サブシステム2200との間を移動可能である。スライドレール2164は、処理準備サブシステム2100及び処理実行サブシステム2200の間をx方向に延びており、スライドラック2162は、スライダー及びスライダー用モータ(スライド機構)によって移動される。
 処理準備サブシステム2100は、さらにカートリッジ廃棄ボックス2170を備える。カートリッジ廃棄ボックス2170は、消耗品搭載位置に移動したステージラック2300に隣接しかつより低い位置に配置される。使用済みのカートリッジは、カートリッジピッカー2132を用いてカートリッジ廃棄ボックス2170内に廃棄される。
〔処理実行サブシステム〕
 処理実行サブシステム2200は、図21に示すように、処理実行ステージ2240と、処理実行ステージ2240に設置された複数の処理実行ユニット400と、処理実行ステージ2240に複数のステージラック2300をそれぞれ装着する複数のステージラック装着部2210と、処理実行サブシステム2200側でステージラック2300をステージラック装着部2210に移送して装着するステージラック装着機構2220とを備える。
 ステージラック装着機構2220は、処理実行ステージ2240の上方で3次元的に移動可能である。ステージラック装着機構2220は、x方向に延びるレール2222に取り付けられており、x方向移動用モータによってx方向に移動可能である。レール2222は、y方向に延びるレール2224にそってy方向に移動可能である。ステージラック装着機構2220は、ステージラック2300を抱える一対の開閉式アーム(不図示)を備えており、アームはz方向昇降用モータによってz方向に昇降可能である。ステージラック装着部2210は、ステージラック2300を装着した状態で、ステージラック2300を昇降する昇降密着機構(不図示)を備える。ステージラック2300をステージラック装着部2210に装着した後、昇降密着機構によりステージラック2300を降下させて、ステージラック2300に配置されたPCRカートリッジ114または一体型カートリッジ113のPCRウェルにPCR用のヒートブロックを密着させる。
 処理実行サブシステム2200は、処理実行ステージ2240の手前の、ステージラック2300がx方向に移動する領域の下方に、消耗品廃棄ボックス2230、及び廃液槽2232を備えている。分注ノズルに対して着脱可能な消耗品(使用済みの分注チップ等)は、処理実行ユニット400に設けられた分注ノズルに消耗品を装着した状態で消耗品廃棄ボックス2230の上方まで移動される。その後、消耗品は、分注ノズルに設けられた消耗品取外機構により、分注ノズルから取り外され(押し外され)、消耗品廃棄ボックス2230内に廃棄される。同様に、廃液は、処理実行ユニット400に設けられた分注ノズルで吸引された状態で、廃液槽2232の上方まで移動される。その後、廃液は、分注チップから吐出され廃液槽2232に廃棄される。
〔ステージラック〕
 ステージラック(移動ステージ)2300は、図22に示すように、概略平板状であり、互いに並行に配置された複数の処理レーン2310と、各処理レーンに対応した長細いチューブ収容部2318とを備えている。各処理レーン上で、個々の検体について、独立して抽出工程(抽出機能)、及び増幅測定工程(増幅測定機能)が実行される。処理レーン2130上で処理工程を実行する抽出機能部、及び増幅測定工程を実行する増幅測定機能部の位置は固定されている。チューブ収容部2318には、子検体及び/または試薬用のチューブ119(図26)が収容される。各処理レーン2130の間には、各処理レーン2130に並行に上方に突出する仕切壁2312が設けられている。チューブ収容部2318の間には、チューブ収容部2318に並行に上方に突出する仕切壁2313が設けられている。仕切壁2312、2313によって、各処理レーンで処理される検体のコンタミネーションを防止することができる。
 ステージラック2300は、さらに、複数の移送用接続孔2314と、複数の装着用接続孔2316とを備える。複数の移送用接続孔2314には、後述するステージラック移送機構2400の複数の移送用突起2402(図24及び図27)が挿入される。複数の装着用接続孔2316には、後述するステージラック装着機構2250の複数の装着用突起2252(図24及び図27)が挿入される。移送用接続孔2314、装着用接続孔2316は、好ましくは、それぞれ4つ設けることができるが、4つに限定されず、少なくとも2つ以上であればよい。なお、各処理レーン2310には、図26等に示すように、子検体チューブ119、抽出カートリッジ112、PCRカートリッジ114、一体型カートリッジ113等が配置される。
(カートリッジ固定機構)
 ステージラック2300は、抽出カートリッジ112、PCRカートリッジ114、または一体型カートリッジ113を固定するためにカートリッジ固定機構(凹溝部及びピン)を備える。以下、一体型カートリッジ113に凹溝部を設けた場合を説明するが、抽出カートリッジ112、PCRカートリッジ114にも同様に凹溝部を設けることができる。一体型カートリッジ113は、抽出カートリッジとPCRカートリッジと一体化したものであり、図29に示すように、DNA抽出部133AとPCR反応部113Bとから構成される。
 図29及び図30に示すように、一体型カートリッジ113は、その中央部近辺にカートリッジの長手方向と交差するように1つの凹溝部(ピン挿入部)113fを備える。図30~31に示すように、固定機構は、カートリッジ113の側面方向から凹溝部113fに挿脱するピン113gと、ピン113gを移動可能に支持するピン支持体113hとを備える。図29及び図31(c)は、凹溝部113fにピン113gが挿入された状態である。図31(a)に示すようにカートリッジ113(112、114)は、カートリッジピッカー2132(図20)によって上方からステージラック2300の処理レーン2310に向かって下降して、図31(b)に示すように処理レーン2310上の定位置に搭載される。その後、図31(c)及び図29に示すようにピン113gが凹溝部113fに挿入されて、カートリッジ113が固定される。図31(c)及び図29のカートリッジ113を固定することによって、ステージラック2300の移送及び装着時に、カートリッジ113の浮き上がり、脱落が防止される。ピン113g及びピン支持体113hは、隣接するカートリッジの下方に配置されており、ピン支持体113hはステージラック2300等に設けたアクチュエータによりスライドされる。このカートリッジ固定機構(凹溝部113f、ピン113g、及びピン支持体113h)は、カートリッジの長手方向の両端にカートリッジに一対の凹溝部を設け、横からピンを挿脱するように構成することもできる。ステージラック2300には、第1の実施形態のカートリッジ固定機構500(図13~図15)を搭載することもできる。逆に、第1の実施形態において、カートリッジ固定機構500に替えて、図31のカートリッジ固定機構(凹溝部113f及びピン113g)を設けることもできる。
 1つのステージラック2300は、図22に示すように、8つの異なる子検体を同時に処理するために、好ましくは、8つの処理レーン2310、及び8つのチューブ収容部2318を備えることができる。これに対応して、1つの処理実行ユニット400は、8つの分注ノズルを備え、8つの分注ノズルは、各処理レーン及びチューブ収容部にそって同時に移動して実質的に同じプロトコールで前処理及び測定処理を行うことができる。なお、ステージラック2300に設ける処理レーン2310及びチューブ収容部2318の数は、8つに限らず、4、10、12、16等、任意の複数の処理レーンを設けることができる。同様に、処理実行ユニット400に設ける分注ノズルの数も、8つに限らず、ステージラックに設けるレーンの数に対応して、4、10、12、16等、任意の複数の分注ノズルを設けることができる。
〔ステージラック移送機構〕
 ステージラック移送機構2400は、図21に示すように、概略U字形のステージラック移送アーム2401を有する。ステージラック移送アーム2401は、処理準備サブシステム2100と処理実行サブシステム2200との間を延びるレール2410にそって、移動用モータ及びスライダによって往復移動可能である。ステージラック移送アーム2401のそれぞれの上面には、少なくとも1つの移送用突起2402(図24及び図28)が設けられる。移送用突起2403が、ステージラック2300の移送用接続孔2314に挿入されると、ステージラック移送機構2400にステージラック2300が固定されて一体化される。これによって、ステージラック2300は、ステージラック移送アーム2401に保持された状態で、レール2410にそって移動可能となる。また、ステージラック移送機構2400は、移送用突起2402を移送用接続孔2314に対して挿入または離脱するために、不図示の昇降機構によって、レール2410上で昇降可能である。
〔ステージラック装着機構の変形形態〕
 本変形形態においては、図21に示したステージラック装着機構2220に替えて、図24に示すステージラック装着機構2250を備えることができる。ステージラック装着機構2250は、処理実行ユニット400毎に、処理実行ステージ2240に設けられている。ステージラック装着機構2250は、処理実行ステージ2240に設けられy方向に移動可能である。ステージラック装着機構2250は、一対のステージラック装着アーム2251と、ステージラック装着アーム2251のそれぞれに少なくとも1つ設けられた突起2252と、ステージラック装着アーム2251のそれぞれの一端から下方に延びる一対の第1の柱2253aと、一対の第1の柱2253aの下端を接続する接続アーム2254と、接続アーム2254の両端に設けられた一対の第1のスライダー2256aと、ステージラック装着アーム2251のそれぞれの他端から下方に延びる第2の柱2253bと、第2の柱2253bのそれぞれの下端に設けられた第2のスライダー2256bとから構成される。ステージ2240上には、第1のスライダー2256a及び第2のスライダー2256bをy方向にスライドするために一対のレール2255が設けられる。さらに、ステージラック装着機構2250には、ステージラック装着機構2250を自動的に移動可能とするために不図示の移動用モータが設けられる。
 次に、図25~28を用いて、ステージラック移送機構2400及びステージラック装着機構2220を用いたステージラック2300の移送及び装着を説明する。ステージラック2300は、処理準備サブシステム2100の消耗品搭載位置で、ステージラック移送機構2400の一対のステージラック移送アーム2401の上で保持された状態で、消耗品等が各処理レーンに搭載される。その後、ステージラック2300は、図25に示すように、処理準備サブシステム2100から処理実行サブシステム2200に移動する。さらに、ステージラック2300が、処理実行サブシステム2200のレール2255の間の上方まで移送され、ステージラック装着機構2250がステージラック2300の下方に移動されると、図26に示す状態となる。
 図27は、図26の上面図をx方向から見た側面図である。図27(a)の状態では、ステージラック2300を保持したステージラック移送機構2400がステージラック装着機構2250の上方に位置している。図27(a)の状態から、ステージラック移送機構2400が、不図示の昇降機構によってステージラック装着アーム2251より下方移動すると、図27(b)の状態となる。この下方移動によって、ステージラック移送アーム2401の移送用突起2402がステージラック2300の移送用接続孔2314から外れるとともに、ステージラック装着機構2250のステージラック装着アーム2251が、ステージラック2300の装着用接続孔2316に挿入される。これによって、ステージラック2300が、ステージラック移送機構2400からステージラック装着機構2250に受け渡される。図26に示すように、一対のステージラック移送アーム2401の外側面の間の幅Wは、一対のステージラック装着アーム2251の内側面の間の幅Wより小さいため、この下方移動の際、ステージラック2300及びステージラック移送アーム2401が互いに干渉することはない。図27(b)の状態となった後、ステージラック2300を保持したステージラック装着機構2250は、レール2255にそってy方向に移動し、図28に示すように、処理実行ユニット400の手前のステージラック装着部(装着位置)で停止し、処理が可能な配置となる。
〔検体処理測定システムの動作〕
 第2の実施形態の検体処理測定システム2000は、前処理工程の効率化をはかり、ハイスループットを実現するために、次の通り動作する。始めに、処理準備サブシステム2100における準備動作を説明する。図21に示すように、カートリッジ112、114は、カートリッジ押出し機構2122を用いて処理準備ステージ2110上に押し出される。押し出されたカートリッジ112、114は、カートリッジピッカー2132を用いてステージラック2300に搭載される。
 消耗品保管ユニット2140に保管された分注チップやピアシングチップ等の消耗品は、ピックアップユニット2130の4連の消耗品ピッカー2130a(図20)によって、4個毎にピックアップされステージラック2300に搭載される。容器保管部2150に保管された試薬容器及び/または子検体容器等の消耗品も、ピックアップユニット2130の4連の消耗品ピッカー2130aによって、4個毎にピックアップされステージラック2300またはスライドラック2162に搭載される。
 試薬保管部2152に保管されたPCR試薬等の各種試薬は、ピックアップユニット2130の分注ノズル2130bによって、ステージラック2300に搭載された試薬容器に分注される。親検体保管部2160の親検体トレー2160bに保管された親検体は、ピックアップユニット2130の分注ノズル2130bによって、ステージラック2300に搭載された子検体容器2320またはスライドラック2162の子検体容器に分注される。各種消耗品等がステージラック2300に配置された後、カートリッジ114、116等の消耗品はカートリッジ固定機構によってステージラック2300上で固定される。カートリッジを固定した状態で、ステージラック2300は、ステージラック移送機構2400によって処理実行サブシステム2200に移送される。
 処理実行サブシステムに移送されたステージラック2300は、ステージラック装着機構2220の一対の開閉式アームで把持され、ステージラック装着部2210に装着される。ステージラック装着部2210に装着された状態で、ステージラック2300は昇降機構により下降して、ステージラック2300のPCRカートリッジが、ステージラック装着部2210に設けられたヒートブロックに密着されて、装着動作が完了する。ステージラック2300の装着動作が完了すると、処理実行ユニット400で処理が実行されるか、またはスライドラックを用いて、子検体及び/またはPCR試薬等が搭載された後、処理実行ユニット400で処理が実行される。第2の実施形態の処理工程では、第1の実施形態の図19のフローチャートに示したステップS5~S9を実行することができる。
 スライドラック2162を用いる場合の動作を説明する。スライドラック2162は、子検体及び/またはPCR試薬等を使用直前に、処理実行ユニット400に移送される。その使用直前に、親検体保管部2160で低温保管されている親検体容器から子検体が、分注ノズル2130bを用いてスライドラック2162のウェルまたはチューブ(容器)に分注される。または、低温保管されているPCR試薬容器から取り出されたPCR試薬は、分注ノズル2130bを用いてスライドラック2162のウェルまたはチューブ(容器)に分注される。
 スライドラック2162は、直ちに処理実行ユニット400の手前(近傍)まで移送される。スライドラック2162で移送された子検体またはPCR試薬は、処理実行ユニット400の分注ノズルで吸引して、ステージラック装着部2210に装着されたステージラック2300のウェルまたは容器に適時分注される。スライドラック2162を用いることにより、PCR試薬等の試薬や検体は、冷却されていないステージラック上に長時間放置されることがなくなるため、試薬や検体の劣化を防ぐことができる。
 第2の実施形態の検体処理測定システム2000は、複数の処理実行ユニット400を備えるため、1つの処理実行ユニット400が動作中であっても、他の処理実行ユニット400で並行して前処理を実行できる。1つの処理実行ユニット400において、複数(8列)の処理ラインで同時に処理(抽出、増幅、及び測定)が実行される。処理が終わると、ステージラック装着機構2220がステージラック2300をステージラック装着部2210から取り外して、ステージラック移動機構2400へ移動し、消耗品等を廃棄した後、改めて次のカートリッジ等の消耗品等を装着して繰り返し処理される。
 第2の実施形態において、各処理実行ユニット400が備える処理ラインの数は、限定されず、例えば、4、6、8、12のいずれかの処理ラインを備えることもできる。さらに、第2の実施形態では、3台の処理実行ユニット400を備えたが、処理実行ユニット400の数は限定されず、例えば5台備えることもできる。この場合、第1グループ(3台)は第1~第3の共通プロトコールを処理するために用い、第2グループ(2台)は個別プロトコール用または緊急処理用とすることができる。これによって、システム全体として、多種多様な検体を、ランダムにかつコンティニュアスに処理可能となる。
 第1及び第2の実施形態における処理可能な検体の種類としては、例えば、全血、血清、血漿、尿等である。前処理後に遺伝子による感染症診断がされる病原体としては、例えば、HIV、C型肝炎ウイルス、結核菌、クラミジア等とすることができる。検体または病原体の種類もしくは検査項目等の検査条件により、処理実行ユニット400で実行される処理のプロトコールが相違する。そこで、第2の実施形態では、検体または病原体の種類に対応した複数の共通プロトコールを準備する。同一の共通プロトコールで処理可能な検体を同一のステージラック2300に並べて同一の処理ステージ400で共通プロトコールにしたがって処理することができる。例えば、第1の処理実行ユニット400に、第1の共通プロトコールで処理可能な検体を集約して処理を実行し、第2の処理実行ユニット400に第2の共通プロトコールで処理可能な検体を集約して処理を実行することができる。このように、第2の実施形態では、予め設定した検査条件を認識してプロトコールが同じ検体を集めて前処理することができる。検査条件は、親検体容器のそれぞれに設けられたバーコード等の情報記憶部から、親検体保管部2160に設けた情報読取り部2160cを用いて非接触で読み取ることができる。
 ステージラック2300上の消耗品等を廃棄するための動作を説明する。処理される検体は病原体を含む可能性があるため、処理が完了した後のステージラック2300から、検体に接触した消耗品を廃棄する際、注意が必要である。そこで、使用後の消耗品等を使用者が触れずに廃棄するために、処理実行ユニット400の分注ノズルを用いてステージラック2300からカートリッジ以外の消耗品を自動的にピックアップして、消耗品廃棄ボックス2230に廃棄する。また、検体(サンプル)を含む廃液は、ステージラック2300上で処理実行ユニット400の分注ノズルに装着した分注チップにより吸引された状態で、処理実行ユニット400の分注ノズルを、廃液槽2232の上方に移動させた後、分注ノズルから廃液槽2232に廃液される。なお、ステージラックに搭載されたカートリッジ114、116は、1つの分注ノズルを用いて移動することは困難である。そこで、処理が完了した後のステージラック2300を、ステージラック装着機構2220、ステージラック移送機構2400を用いて、処理準備サブシステム2100の消耗品搭載位置に移送し、カートリッジ固定機構の固定を解除する。その後、カートリッジピッカー2132を用いて、ステージラック2300からカートリッジを取り出して、カートリッジ廃棄ボックス2170に廃棄する。これによって、ステージラック2300から全ての消耗品等が取り外された空状態となる。この空状態のステージラック2300に対して、次の処理に備えて、ピックアップユニット2130、及びカートリッジピッカー2132を用いて、必要な消耗品等がステージラック2300上に搭載される。
 第1及び第2の実施形態で用いた処理実行ユニット400としては、好ましくは株式会社プレシジョン・システム・サイエンスが提供する「geneLEAD」を用いることができる。第1及び第2の実施形態は、DNA抽出からリアルタイムPCR解析までの一括処理を可能としたものである。特に、第2の実施形態の検体処理測定システム2000は、複数の処理実行ユニット400に、検体分注と試薬分注、消耗品のセッティング(ローディング)機能を組み合わせることにより、ハイスループットで処理を全自動で実行することができる。また、親検体から子検体の分注、試薬の分注、前処理完了まで自動的に一括管理することができる。第2の実施形態の検体処理測定システム2000は、並列配置された複数の分注ノズル(ノズルユニット)を備える処理実行ユニット400と、複数のステージラック2300との組み合わせにより、全体としてランダム・バッチ・アクセス処理が可能となり、1日に96検体の前処理が可能となる。第2の実施形態(図21)では、ステージラック装着部2210に装着されたステージラック2300はy方向に移動せず、処理実行ユニット400の多連分注ノズルがy方向に移動することにより、前処理を行っていたが、これに限定されない。例えば、処理実行ユニット400の多連分注ノズルをy方向に移動させず、ステージラック2300をx方向に移動させることにより、処理を実行してもよい。
 第2の実施形態の検体処理測定システム2000を、DNAの処理システムとした場合を説明する。この場合、ステージラック2300は、DNAを抽出及び/または精製するDNA抽出等機能部と、DNAを増幅するDNA増幅機能部と、を各処理レーン上の指定位置に備える。処理準備サブシステム2100において、各機能部にて使用する容器、カートリッジ、分注チップ、ピアシングチップ、及び/または密閉キャップ等の複数の消耗品が、ステージラック2300の各レーン上の各機能部の位置に予め配置される。
 第2の実施形態において、各消耗品のステージラック2300への配置または搭載は、自動的に行うことができ、ステージラック2300をステージラック装着部2210に装着した状態で、処理実行ユニット400により、DNA抽出、DNA増幅、及び増幅されたDNAの測定を自動的に実行することができる。さらに、これらの処理実行後、ステージラック2300から使用した消耗品を自動的に廃棄し、ステージラックを再利用することができる。なお、DNA抽出機能部においては、処理実行ユニット400の分注チップに対して磁石の脱着(マグトレーション技術)によって、分注チップに保持された溶液中で、磁性粒子に吸着されたDNAの抽出を自動的に実行することができる。
 第2の実施形態の検体処理測定システムは、複数の処理実行ユニット400を備えるため、1つの処理実行ユニット400で処理が実施されていても、空いている他の処理実行ユニット400に、ステージラック2300を任意のタイミングで装着して、連続的に処理を実行することができる。これによって、第2の実施形態の検体処理測定システムは、全体として、ランダム・バッチ・アクセス方式を実現することができる。
 第1または第2の実施形態の検体処理測定システムにおいて、好ましくは、消耗品は、ウェル、チューブ、分注チップ、ピアシングチップ、ウェルのキャップの少なくとも1つを含むことができる。第1または第2の実施形態の検体処理測定システムにおいて、好ましくは、カートリッジの少なくとも一部が、核酸の抽出試薬、及び/または核酸の増幅試薬が予め密封された少なくとも1つのプレフィルドウェルを含むことができる。第1または第2の実施形態の検体処理測定システムにおいて、好ましくは、カートリッジの少なくとも一部が、核酸の抽出試薬が予め密封された抽出試薬用プレフィルドカートリッジと、核酸の増幅試薬が予め密封された増幅試薬用プレフィルドカートリッジとを含むことができる。
 第1または第2の実施形態の検体処理測定システムにおいて、好ましくは、カートリッジが、試薬用ウェルと、核酸抽出用ウェルと、核酸増幅用ウェルと、ウェルのキャップを保持するキャップ保持部と、分注チップを保持する分注チップ保持部との少なくとも一つまたは複数を備えることができる。第1または第2の実施形態の検体処理測定システムにおいて、好ましくは、各処理レーンは、核酸検出用のマイクロ粒子を収容するチューブを備え、前記チューブには、異なる検体とそれぞれ特異的に結合することができる物質が固定された複数のマイクロ粒子が既知の位置に配置され、検体処理測定システムは、前記チューブ内のマイクロ粒子が発するシグナルを検出する検出部を備えることができる。
 第1または第2の実施形態の検体処理測定システムにおいて、好ましくは、各処理レーンに、検体の電気泳動を行う電気泳動チップを備え、検体処理測定システムは、前記電気泳動チップ内で前記検体から分離されたバンドを検出する検出部を備えることができる。第1または第2の実施形態の検体処理測定システムにおいて、好ましくは、複数の検体について、1つまたは複数の生化学検査を行う生化学検査装置を備えることができる。生化学検査としては、イヌCRP(炎症マーカー)、血清アミロイドタンパク(SAA)、総胆汁酸(TBA)、フィルブリン分解産物(FDP)、リパーゼ、Dダイマーの少なくとも1つを含むことができる。
1000 検体処理測定システム
 100 ステージ
 110 前処理部
 112 カートリッジ
 114 カートリッジ
 200 フレーム
 300 ピックアップユニット(カートリッジ移送ユニット及び検体移送ユニット)
 310 カートリッジピッカー
 330 消耗品ピッカー
 400 処理実行ユニット(並列処理ユニット)
 500 カートリッジ固定機構
 600 サンプル保管ユニット
 700 カートリッジ保管ユニット
 800 廃棄ボックス
 900 測定ユニット
2000 検体処理測定システム
2100 処理準備サブシステム
2130 ピックアップユニット
2132 カートリッジピッカー
2200 処理実行サブシステム
2210 ステージラック装着部
2220 ステージラック装着機構
2300 ステージラック
2400 ステージラック移送機構

Claims (40)

  1.  複数の検体のそれぞれに含まれる核酸の抽出、及び抽出された核酸の増幅、及び増幅された核酸の測定からなる処理を、並行して実行する検体処理測定システムであって、
     前記複数の検体に対応した前記処理に用いるための、1種類または複数種類のカートリッジを保管するカートリッジ保管ユニットと、
     前記処理を並行して実行するための複数の処理レーンを備える検体処理部であって、前記複数の処理レーンのそれぞれに前記カートリッジを搭載する、検体処理部と、
     前記複数の検体のそれぞれを保管する検体保管ユニットと、
     前記カートリッジを前記複数の処理レーンのそれぞれに移送するカートリッジ移送ユニットと、
     前記複数の処理レーンに前記複数の検体を移送する検体移送ユニットと、
     前記カートリッジ移送ユニットによる前記カートリッジの移送、及び前記検体移送ユニットによる前記複数の検体の移送を制御する制御部とを備え、
     前記制御部は、前記カートリッジ移送ユニットを用いて、前記複数の検体のそれぞれに応じた前記カートリッジを前記複数のレーンのそれぞれに移送し、
     前記制御部は、さらに、前記検体移送ユニットを用いて、前記複数の検体を前記複数の処理レーンに移送する、検体処理測定システム。
  2.  請求項1に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記処理及び/または前記測定は、前記複数の検体について同時に行うバッチ処理である、検体処理測定システム。
  3.  請求項1または2に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジ移送ユニット及び前記検体移送ユニットを一体化した検体処理準備ユニットを備える、検体処理測定システム。
  4.  請求項1~3のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジの少なくとも一部が、前記処理に必要な試薬及び/または溶液が予め密封されたプレフィルドウェルを含む、検体処理測定システム。
  5.  請求項1~4のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記複数の検体は、処理動作の共通化が可能な複数のグループに分類され、前記制御部は、前記複数の検体から同じグループに含まれる複数の検体を選択して前記処理を並行して実行する、検体処理測定システム。
  6.  請求項5に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記グループ毎にまとめて前記複数の検体の前記処理を並行して実行することにより、前記複数の検体を全体としてランダムかつ連続的に処理する、検体処理測定システム。
  7.  請求項1~6のいずれか1項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジ移送機構は、前記少なくとも1つのカートリッジを吸着するカートリッジピッカーを備える、検体処理測定システム。
  8.  請求項7に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジピッカーは、前記カートリッジを真空吸引する、検体処理測定システム。
  9.  請求項7または8に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジピッカーは凸部を備え、前記カートリッジは前記凸部が挿入される凹部を備える、検体処理測定システム。
  10.  請求項7~9のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジピッカーは前記カートリッジの両端を吸着する、検体処理測定システム。
  11.  請求項7~10のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジ移送機構は、前記カートリッジピッカーを昇降するカートリッジピッカー昇降機構を備える、検体処理測定システム。
  12.  請求項7~11のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記検体処理測定システムは、前記複数のレーンで使用される消耗品を保管する消耗品保管ユニットを備え、
     前記カートリッジ移送機構は、前記消耗品保管ユニットから前記消耗品を取り出す消耗品ピッカーを備える、検体処理測定システム。
  13.  請求項12に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジ移送機構は、前記消耗品ピッカーを昇降する消耗品ピッカー昇降機構を備える、検体処理測定システム。
  14.  請求項7~13のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジは、カートリッジ情報を記録したカートリッジ情報記録部を備え、
     前記カートリッジ移送機構は、前記カートリッジ情報記憶部から前記カートリッジ情報を読み出す情報読出し部を備える、検体処理測定システム。
  15.  請求項1~14のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記複数の処理レーンのそれぞれには、第1のカートリッジと第2のカートリッジが搭載され、
     前記制御部は、前記第1のカートリッジで前記検体を処理している間に、前記検体の処理が終了した前記第2のカートリッジを前記カートリッジ移送機構を用いて前記複数の処理レーンから除去する、検体処理測定システム。
  16.  請求項1~15のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記検体容器は、検体情報、及び/または、前記検体の処理に用いる試薬情報を記録した検体情報記録部を有し、
     前記検体移送ユニットまたは前記検体保管ユニットは、前記検体情報記憶部から前記検体情報及び/または前記試薬情報を読み出す情報読出し部を備える、検体処理測定システム。
  17.  請求項1~16のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記検体保管ユニットは、前記複数の検体を環状に搬送する検体搬送機構と、前記検体搬送機構から前記検体を取り出すための検体取出位置とを備える、検体処理測定システム。
  18.  請求項1~17のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記検体保管ユニットは、前記複数の検体の変性または劣化を防止するための温度調整機構を備える、検体処理測定システム。
  19.  請求項1~18のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジを前記検体処理部に固定するカートリッジ固定機構を備える、検体処理測定システム。
  20.  請求項1~19のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジ固定機構は、前記カートリッジの両端を押える第1爪及び第2爪を備える、検体処理測定システム。
  21.  請求項1~20のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
    前記複数の処理レーンのそれぞれに搭載された前記カートリッジに対して、前記処理を並行して実行するために、複数の分注ノズルを有する処理実行ユニットを備える、検体処理測定システム。
  22.  請求項1~21のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記複数の検体に対して、前記測定を実行ための測定ユニットを備える、検体処理測定システム。
  23.  複数の検体のそれぞれに含まれる核酸の抽出、及び抽出された核酸の増幅、及び増幅された核酸の測定からなる処理を、並行して実行する検体処理測定システムであって、
     前記検体処理測定システムは、処理準備サブシステムと、処理実行サブシステムと、複数のステージラックと、前記処理準備サブシステム及び前記処理実行サブシステムの間で前記複数のステージラックを移送するステージラック移送機構と、前記検体処理測定システムの動作を制御する制御部とを備え、
     前記処理準備サブシステムは、少なくとも1つのカートリッジを供給するカートリッジ供給ユニットと、前記カートリッジをピックアップするカートリッジピッカーと、消耗品を保管する消耗品保管ユニットと、前記消耗品をピックアップするピックアップユニットと、前記複数の検体を保管する検体保管部とを備え、
     前記複数のステージラックのそれぞれが、前記処理を並行して実行するために複数の処理レーンを備え、前記複数の処理レーンのそれぞれに、前記カートリッジ、前記消耗品、及び前記検体容器が所定の配置で搭載され、
     前記処理実行サブシステムは、複数の処理実行ユニットと、前記複数のステージラックを装着する複数のステージラック装着部と、前記ステージラックを前記ステージラック装着部まで移送して装着するステージラック装着機構とを備え、前記複数の処理実行ユニットのそれぞれが、前記ステージラック装着部に装着された前記ステージラック中の前記複数の検体のそれぞれに対して前記処理を実行する、検体処理測定システム。
  24.  請求項23に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記処理を並行して実行可能な共通プロトコールが適用される複数の検体を、1つのステージラックに配置して1つの処理実行ユニットで前記処理を実行する、検体処理測定システム。
  25.  請求項23または24に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記複数の処理レーンには、前記検体から核酸を抽出する抽出機能部と、前記抽出された核酸を増幅する増幅機能部と、前記増幅された核酸の測定を行う測定機能部とが一列にそれぞれ配置される、検体処理測定システム。
  26.  請求項23~25のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記ステージラックは、前記処理に用いる各種試薬を収容する試薬容器、前記カートリッジ、前記消耗品、及び前記検体を収容する検体容器を各処理レーンに搭載し、これらの全部または少なくとも一部を、前記処理後に取り換えるまたは廃棄することにより、前記検体のコンタミネーションを低減可能とする、検体処理測定システム。
  27.  請求項23~26のいずれか1項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジピッカーは、前記カートリッジを真空吸引する、検体処理測定システム。
  28.  請求項23~27のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジピッカーは前記カートリッジの両端を吸着する、検体処理測定システム。
  29.  請求項23~28のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記処理に使用する試薬及び/または検体を、前記処理実行ユニットでの使用時に、前記処理準備サブシステムから前記処理実行サブシステムに輸送する輸送機構を備える、検体処理測定システム。
  30.  請求項29に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記輸送機構は、前記試薬または検体を収容するスライドラックと、前記スライドラックをスライドするスライド機構とから構成される、検体処理測定システム。
  31.  請求項29または30に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記処理準備サブシステムは、さらに前記試薬または検体を温度調整して保管する保管部を備える、検体処理測定システム。
  32.  請求項23~31のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジ供給ユニットは、積み重ねられた複数のカートリッジに対し、最下段のカートリッジを前記カートリッジ供給ユニットの外に押し出すカートリッジ押出し機構を備える、検体処理測定システム。
  33.  請求項23~32のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記処理実行サブシステムは、さらに前記ステージラック装着部に装着された前記ステージラックに対してヒートブロックを密着させる密着機構を備える、検体処理測定システム。
  34.  請求項23~33のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記処理実行サブシステムは、前記消耗品を廃棄する消耗品廃棄部を備え、
     前記処理中または前記処理後に、前記処理実行ユニットの分注ノズルが、前記ステージラックから前記消耗品を取り出して前記消耗品廃棄部に廃棄する、検体処理測定システム。
  35.  請求項23~34に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記処理実行サブシステムは、前記検体を含む廃液を廃棄する廃液槽を備え、
     前記処理中または前記処理後に、前記処理実行ユニットの分注ノズルが、前記ステージラックから前記廃液を吸引して前記廃液槽に廃棄する、検体処理測定システム。
  36.  請求項23~35に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記処理準備サブシステムは、前記カートリッジを廃棄するカートリッジ廃棄部を備え、
     測定完了後に、前記カートリッジピッカーが、前記処理準備サブシステムに移送された前記ステージラックから前記カートリッジをピックアップして、前記カートリッジ廃棄部に廃棄する、検体処理測定システム。
  37.  請求項1~36のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記消耗品は、ウェル、チューブ、分注チップ、ピアシングチップ、ウェルのキャップの少なくとも1つを含む、検体処理測定システム。
  38.  請求項1~37のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジの少なくとも一部が、前記核酸の抽出試薬、及び/または前記核酸の増幅試薬が予め密封された少なくとも1つのプレフィルドウェルを含む、検体処理測定システム。
  39.  請求項1~38のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジの少なくとも一部が、前記核酸の抽出試薬が予め密封された抽出試薬用プレフィルドカートリッジと、前記核酸の増幅試薬が予め密封された増幅試薬用プレフィルドカートリッジとを含む、検体処理測定システム。
  40.  請求項1~39のいずれか一項に記載の検体処理測定システムにおいて、
     前記カートリッジが、試薬用ウェルと、核酸抽出用ウェルと、核酸増幅用ウェルと、ウェルのキャップを保持するキャップ保持部と、分注チップを保持する分注チップ保持部との少なくとも一つまたは複数を備える、検体処理測定システム。
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