WO2005077965A1 - 糖鎖リガンド複合体、およびそのリガンド複合体を用いたタンパク質の分析方法 - Google Patents

糖鎖リガンド複合体、およびそのリガンド複合体を用いたタンパク質の分析方法 Download PDF

Info

Publication number
WO2005077965A1
WO2005077965A1 PCT/JP2005/003220 JP2005003220W WO2005077965A1 WO 2005077965 A1 WO2005077965 A1 WO 2005077965A1 JP 2005003220 W JP2005003220 W JP 2005003220W WO 2005077965 A1 WO2005077965 A1 WO 2005077965A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
compound
ligand
formula
general formula
integer
Prior art date
Application number
PCT/JP2005/003220
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
Yasuo Suda
Original Assignee
Japan Science And Technology Agency
National University Corporation Kagoshima University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Japan Science And Technology Agency, National University Corporation Kagoshima University filed Critical Japan Science And Technology Agency
Priority to EP05710751A priority Critical patent/EP1726596A4/en
Priority to CA2556406A priority patent/CA2556406C/en
Priority to CN2005800051869A priority patent/CN1930179B/zh
Priority to US10/590,045 priority patent/US8765384B2/en
Priority to JP2005518081A priority patent/JP4800771B2/ja
Publication of WO2005077965A1 publication Critical patent/WO2005077965A1/ja
Priority to IL177526A priority patent/IL177526A0/en
Priority to US14/274,521 priority patent/US20140295566A1/en

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/52Use of compounds or compositions for colorimetric, spectrophotometric or fluorometric investigation, e.g. use of reagent paper and including single- and multilayer analytical elements
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H15/00Compounds containing hydrocarbon or substituted hydrocarbon radicals directly attached to hetero atoms of saccharide radicals
    • C07H15/02Acyclic radicals, not substituted by cyclic structures
    • C07H15/04Acyclic radicals, not substituted by cyclic structures attached to an oxygen atom of the saccharide radical
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/531Production of immunochemical test materials
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2400/00Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving carbohydrates

Definitions

  • the present invention relates to a sugar chain ligand complex and a method for analyzing a protein using the ligand complex.
  • the present invention provides a novel ligand complex in which a sugar chain having a reducing end is introduced into a linker compound, and the ligand complex is assembled and fixed on a chip whose surface is coated with a metal such as gold, silver, or copper.
  • the present invention relates to a modified ligand carrier. Furthermore, the present invention relates to a method for analyzing a protein using the above-mentioned ligand complex.
  • SPR -Surface plasmon resonance
  • oligosaccharides since the activity of oligosaccharides is not so high with only one molecule, it is necessary to assemble the oligosaccharides on a sensor chip when evaluating the biological activity of the oligosaccharides. In other words, it is possible to evaluate the biological activity of the oligosaccharide by analyzing the interaction with the protein using the assembled oligosaccharide.
  • the present inventors have obtained a linker compound having a site capable of being immobilized on the sensor chip surface and a site capable of introducing an oligosaccharide in the molecule, and 1 or 2 units of the linker compound have been obtained.
  • a linker compound having a site capable of being immobilized on the sensor chip surface and a site capable of introducing an oligosaccharide in the molecule, and 1 or 2 units of the linker compound have been obtained.
  • a ligand conjugate by introducing oligosaccharides. They have found that oligosaccharides can be assembled and introduced onto a sensor chip by using this ligand complex (for example, see Patent Document 1, Non-Patent Document 1, etc.).
  • Patent Document 1 Japanese Patent Application Laid-Open No. 2003-83939 (published March 19, 2003)
  • Non-Patent Document 1 ⁇ Preliminary Proceedings of the Chemical Society of Japan, The 79th Annual Spring Meeting IIJ, The Chemical Society of Japan, March 15, 2001, p. 1 0 4 2
  • the introduced sugar chains are limited to sulfated sugars synthesized by the inventors, and commercially available reducing ends may be added. It is not clear whether or not oligosaccharides such as maltose and ratatose can be introduced and made into chips. Further, a method of using a sensor chip obtained by immobilizing a ligand complex described in the above-mentioned literature, which is used for measurement using SPR, and then used for identifying a protein bound to a sugar chain on the chip, Conventional or Although there was no proposal that was satisfactory in terms of data.
  • the present invention has been made in view of the above-mentioned problems, and provides a novel ligand complex obtained by introducing a commercially available sugar having a reducing end, and a ligand carrier that can be used for identification of a protein. It is intended to provide. Disclosure of the invention
  • the inventor of the present application has conducted intensive studies in order to solve the above-mentioned problems.
  • Linker compounds described in 571 08 (published date: June 3, 2004) and unpublished as of the priority date of the present application (February 18, 2004) All of them were found by the inventors of the present application) and reacted with commercially available maltose or lactose to synthesize a ligand complex having ⁇ -dalcoviranose or 3galactopyranose at the terminals, respectively.
  • the inventor of the present application produced a sugar chip (ligand carrier) in which these ligand complexes were immobilized on a gold-coated chip.
  • the ligand conjugate of the present invention has the general formula (1)
  • X has an aromatic amino group at the terminal and a carbon-nitrogen bond in the main chain.
  • a structure comprising one, two or three chains of a hydrocarbon-derived chain which may be possessed; wherein the above-mentioned Y is provided with a sulfur atom or a hydrocarbon structure containing a sulfur atom;
  • a linker compound having a linear structure having a carbon bond or a carbon-oxygen bond and a saccharide having a reducing end have a structure in which the sugar is bonded via the aromatic amino group.
  • the hydrocarbon-derived chain refers to a hydrocarbon chain composed of carbon and hydrogen, in which some carbon or hydrogen may be replaced by another atom or substituent. That is, the hydrocarbon-derived chain has an aromatic amino group at a terminal, and a part of a carbon-carbon bond (C—C bond), which is a main chain structure of the hydrocarbon chain, has a carbon-nitrogen bond ( It refers to those that may be replaced by C—N bonds, carbon-oxygen bonds (C-O bonds), or amide bonds (CO—NH bonds).
  • hydrocarbon structure containing a sulfur atom means a hydrocarbon structure composed of carbon and hydrogen, in which a part of carbon is replaced by sulfur.
  • the hydrocarbon structure containing a sulfur atom may be linear (including both straight-chain and branched-chain) or cyclic, and may have both a chain structure and a cyclic structure. The structure may be included.
  • the linker compound is In addition, it may have a hydrocarbon structure containing an S—S bond or an SH group. That is, a disulfide bond (SS bond) or a thiol group (SH group) may be contained in the hydrocarbon structure containing a sulfur atom.
  • SS bond disulfide bond
  • SH group thiol group
  • X is represented by the following general formula (2):
  • R ′ is hydrogen (H) or R.), wherein R is derived from a sugar chain. It may be a compound.
  • R ′ is water Prime (H) or R.
  • R may be a compound derived from a sugar chain.
  • X is a compound represented by the following general formula (4):
  • R and R have a structure represented by hydrogen (H) or R), and R may be a compound derived from a sugar chain.
  • Z is the formula (5) ⁇ or the formula (6)
  • n 2 are each an integer of 1 or more and 6 or less.
  • the method for producing a ligand conjugate according to the present invention is represented by the general formula ( 7 ):
  • n 1 is a linker compound having a structure represented by the following formula
  • n 1 and q are each independently an integer of 0 or more and 6 or less), or a general formula (10) 03220
  • the ligand carrier according to the present invention is characterized in that any one of the above ligand complexes is immobilized on a support having a metal on the surface.
  • the ligand carrier may be used for protein analysis.
  • a ligand carrier in which the ligand complex is immobilized on the support is prepared by contacting any of the ligand complexes with a support.
  • a step of identifying a bound protein is obtained by contacting any of the ligand complexes with a support.
  • FIG. 1 is a schematic diagram showing the procedure of a protein analysis method using the ligand complex of the present invention. .
  • FIG. 2 (a) is a graph showing the results of measuring the binding behavior of ConA using a sensor chip on which a ligand conjugate having two molecules of dalcoviranose was immobilized.
  • FIG. 2 () is a graph showing the results of measuring the binding behavior of PSA using a sensor chip on which a ligand complex having two molecules of a-dalcoviranose was immobilized.
  • FIG. 2 (c) is a graph showing the results of measuring the binding behavior of LCA using a sensor chip on which a ligand conjugate having two molecules of darcopyranose was immobilized.
  • FIG. 3 (a) is a graph showing the results of measuring the binding behavior of C ⁇ using a sensor chip on which a ligand conjugate having three molecules of darcoviranose is immobilized.
  • FIG. 3 (b) is a graph showing the results of measuring the binding behavior of PS ⁇ using a sensor chip in which a ligand complex having three ⁇ -dalcoviranoses is immobilized.
  • FIG. 3 (C) ′ is a graph showing the results of measuring the binding behavior of LC ⁇ using a sensor chip on which a ligand conjugate having three ⁇ -dalcoviranoses is immobilized.
  • FIG. 4 (a) is a graph showing the results of measuring the binding behavior of RCA using a sensor chip on which a ligand conjugate having two]] -galactopyranose molecules was immobilized.
  • Figure 4 (b) shows the ligand complex containing two molecules of / 3-galactopyranose.
  • 4 is a graph showing the results of measuring the binding behavior of PNA using a sensor chip with a fixed body.
  • FIG. 5 (a) is a graph showing the results of measuring the binding behavior of RC R using a sensor chip on which a ligand complex having three ⁇ -galactopyranose molecules is immobilized.
  • FIG. 5 (b) is a graph showing the results of measuring the binding behavior of ⁇ using a sensor chip on which a ligand complex having three ⁇ -galactopyranose molecules is immobilized.
  • Fig. 6. is a chart showing the results of mass spectrometry of ConA bound to the sensor chip.
  • FIG. 6 (b) is a chart showing the results of mass spectrometry of PNA bound to the sensor chip.
  • FIG. 7 is a chart of 1 H-NMR spectrum measurement of the ligand conjugate (Compound 30). .
  • FIG. 8 is a 1 H-NMR spectrum measurement chart of the ligand complex (formula (36)).
  • FIG. 9 is a 1 H-NMR spectrum measurement chart of the ligand conjugate (Formula (37)).
  • FIG. 10 is a 1 H-NMR spectrum measurement chart of “ligand complex (formula (38))”.
  • FIG. 11 is a chart of 1 H-NMR spectrum measurement of the ligand complex (formula (39)).
  • FIG. 12 is a 1 H-NMR spectrum measurement chart of the ligand conjugate (Formula (40)).
  • Figure 13 shows the 1 H-NMR spectrum of the ligand complex (Formula (41)). Measurement chart 0
  • Fig. 14 shows the —NMR spectrum measurement chart of the ligand complex (Equation (42)).
  • FIG. 16 is a chart of the ! H—NMR spectrum measurement of the ligand complex (Formula (44)).
  • Figure 1 8 is ⁇ ligand conjugate (Formula (4 6); the J H one NMR spectrum measurement tea one Bok a is o
  • FIG. 19 shows a chart of the NMR complex measurement of the ligand complex (formula (47)).
  • FIG. 21 is a single NMR spectrum measurement chart of the ligand conjugate (Formula (49) :).
  • FIG. 23 is a NMR spectrum measurement chart of the ligand complex (Formula (51),). ⁇ Best mode for carrying out the invention
  • the ligand complex of the present invention is a surface plasmon resonance (SPR) sensor.
  • SPR differential chromatography is to identify and separate substances such as proteins that specifically interact with sugar molecules. Therefore, it is necessary that the ligand complex does not non-specifically interact with a substance such as a protein.
  • the ligand complex of the present invention has a linker part (linker compound) having a structure represented by the general formula (1).
  • a sulfur atom (S) is contained, and this sulfur atom (S) is, for example, a metal (for example, Au) coated on the surface of a support for protein analysis. And form a metal-sulfur bond (for example, Au-S bond), and can be firmly bonded to the support.
  • X in the above general formula (1) represents a hydrocarbon derivative chain which may have an aromatic amino group at the terminal and may have a carbon-nitrogen bond in the main chain. It has a structure comprising a chain or two or three chains.
  • the linker compound is capable of assembling and arranging sugar molecules on the surface of a support for protein analysis, and having a aromatic amino group at a terminal thereof, and Can be easily introduced.
  • the linker compound has a straight-chain structure having a carbon-carbon bond or a carbon-oxygen bond as Z in the general formula (1). More specifically, it is preferable that Z has a structure represented by the above formula (5) or (6), since the production of the compound is easy.
  • the above general formula In (1) p and q are not limited as long as they are each independently an integer of 0 or more and 6 or less. Further, n 1 in the above formula (5) and n 2 in the formula (6) are not limited as long as they are each an integer of 1 or more and 6 or less.
  • linker compound in the general formula (1), p is 4, q is 1, and Y is a cyclic hydrocarbon structure having an S—S bond. And Z has a structure represented by the above formula (5).
  • linker compound for example, a compound represented by the general formula (12)
  • This linker compound can be synthesized using lactic acid as a raw material.
  • linker compound in the above-mentioned general formula (1), P is 4, q is 1, Y has a cyclic hydrocarbon structure having an S—S bond, and Z is the above-mentioned formula. (6) Those having the following structure can be listed.
  • the linker compound include, for example, a compound represented by the general formula (13).
  • This linker compound can be synthesized using thioctic acid as a raw material. Further, in the above linker compound, in the above general formula (1), is 0, q is 0, Y has a sulfur atom (S), and Z is the above formula. (5) Or those in which the structure represented by the above formula (6) forms a dimer. As the above linker compound, for example, the general formula (14)
  • the linker compounds represented by the above general formulas (12), (13) and (14) contain a disulfide bond (S—S bond).
  • S—S bond Sulfur (S) in the S bond forms a metal-sulfur bond (for example, Au—S bond) with a metal (for example, Au) coated on the surface of a support for protein analysis. Can be firmly bonded.
  • the above Y is not limited to those represented by the general formula (12), the general formula (13) or the general formula (14), but a metal-sulfur bond (Au—S
  • the bond is preferably a hydrocarbon structure containing an S—S bond or an SH group from the viewpoint that a bond can be easily formed.
  • the ligand conjugate of the present invention is prepared by introducing a bran chain having a reducing end into an aromatic amino group of the above linker compound.
  • the ligand conjugate of the present invention has a structure in which the above-mentioned linker compound and a sugar having a reducing end are bonded via an aromatic amino group.
  • This sugar can be introduced, for example, by a reductive amination reaction between the amino group (one NH 2 group) of the aromatic amino group of the linker compound and the sugar.
  • an aldehyde group (one CHO group) produced by equilibrium in sugar 5 is a reaction between a ketone group (one CRO group, R is a hydrocarbon group) and an amino group of the linker compound. Then, by successively reducing the Schiff base formed by this reaction, sugar can be easily introduced into the aromatic amino group.
  • the sugar having a reducing end is not a sulfated sugar synthesized by the inventors as described in the above-mentioned prior application, but a commercially available one or a commercially available polysaccharide prepared by decomposition. Use what was done.
  • the “sugar having a reducing end” is a monosaccharide or an oligosaccharide in which the anomeric carbon atom is not substituted. That is, the sugar having a reducing end is a reducing sugar (? ⁇ ⁇ ⁇ .
  • the sugars having a reducing end include maltose, lactose, panose, cellobiose, meliviose, mannooligosaccharide, chitooligosaccharide, laminariooligosaccharide, and the like. It is not limited.
  • the ligand conjugate having an oligosaccharide such as maltose or ratatose has an advantage that it has a wider application range for protein measurement than the conventional ligand conjugate having a sulfated saccharide. are doing.
  • the ligand conjugate of the present invention has the general formula (7)
  • n 1 and q are each independently an integer of 0 or more and 6 or less
  • n 2 is an integer of 1 to 6
  • n 1 is an integer of 1 or more and 6 or less.
  • the above-mentioned ligand complex is subjected to a reduction amination reaction using, for example, a linker compound having a structure represented by any one of the general formulas (7) to (11) and a saccharide having a reducing end. It can be manufactured by
  • the linker compound having the structure represented by the general formula (7) is a compound having three hydrocarbon-derived chains, ie, a three-chain hydrocarbon-derived compound having an aromatic amino group at its terminal.
  • the chains are linked to one carbon (C) to form a branched structure.
  • m 1 , m 2 , and m 3 are not limited as long as they are integers of 0 to 6
  • n 1 is not limited as long as they are integers of 1 to 6. May be different integers
  • the linker compound having the structure represented by the general formula (8) is a compound having two hydrocarbon-derived chains, and a two-chain carbon having an aromatic amino group at the terminal.
  • the hydrogen-derived chain forms a branched structure by bonding to one nitrogen (N).
  • m 4 and m 5 are not limited as long as they are integers of 0 or more and 6 or less, and 11 1 is not limited as long as they are integers of 1 or more and 6 or less.
  • the above m 4 and m 5 are preferably the same integer, and particularly preferably 2, from the viewpoint of simplicity at the time of production.
  • the linker compound having the structure represented by the general formula (9) has one hydrocarbon-derived chain.
  • n 1 and q are not limited as long as they are integers of 0 or more and 6 or less, and may be mutually different integers or the same integer.
  • the linker compound having a structure represented by the general formula (10) has one hydrocarbon-derived chain.
  • n 2 is not limited as long as it is an integer of 1 or more and 6 or less.
  • the linker compound having the structure represented by the general formula (11) is a compound having one hydrocarbon-derived chain formed into a dimer.
  • n 1 is not limited as long as it is an integer of 1 to 6 ′.
  • the X is a multi-branch that forms a branched structure by bonding a plurality of the hydrocarbon-derived chains with an atom such as carbon-nitrogen. What has the structure which is a type
  • mold part may be sufficient.
  • X includes a plurality of hydrocarbon-derived chains, it is preferable that all are the same, but if they have an aromatic amino group at the terminal, they have different structures.
  • the linker compound contained in the ligand conjugate of the present invention comprises a sulfur atom capable of binding to a support for protein analysis and an amino group capable of binding to a sugar molecule such as an oligosaccharide chain.
  • the linker compound is immobilized on the support for protein analysis by a metal-sulfur bond such as an Au—S bond, so that the linker compound is immobilized on the support via the linker compound.
  • a sugar molecule can be firmly and easily bound.
  • the linker compound may have a multi-branched site, and in this case, each terminal of the multi-branched site has an aromatic amino group. Therefore, by using the ligand complex of the present invention in which a sugar having a reducing end has been introduced into the linker compound, sugar molecules can be more efficiently aggregated on the surface of the support.
  • the above linker compound can almost ignore the influence of non-specific interaction with proteins. Therefore, by using the ligand complex of the present invention having the linker compound, it is possible to evaluate the interaction between the sugar and the protein with good reproducibility.
  • the linker compound is produced, for example, by the following production method. That is, the ringer compound represented by the above general formula (7), (8), (9) or (10) is composed of a carboxylic acid and an amine compound whose aromatic amino group terminal is protected by a protective group. By subjecting the aromatic amino group to a deprotection reaction.
  • the linker compound represented by the general formula (11) is a dimer of ⁇ -mercaptobutyric acid and an amine compound in which two aromatic amino group terminals are protected by a protective group. By performing a condensation reaction to deprotect the protecting group at the terminal of the aromatic amino group.
  • the above carboxylic acid has the following general formula (15) Is provided.
  • the amine compound is not particularly limited as long as it has an aromatic amino group terminal protected by a protecting group.
  • the protecting group is a substituent introduced so that the amino group of the aromatic amino group does not react by the above condensation reaction.
  • Examples of the amine compound include the following general formula (16)
  • n 1 is an integer of 1 or more and 6 'or less.
  • a secondary amine compound having a structure represented by the following formula m 4 and m 5 are each independently an integer of 0 or more and 6 or less, and n 1 is an integer of 1 or more and 6 or less. It can be obtained by a condensation reaction of the amine compound represented by the general formula (17) 'with thioctic acid, and by subsequent deprotection of the protecting group at the terminal of the aromatic amino group.
  • the linker compound is a linker compound represented by the general formula (8). The methods for synthesizing these amine compounds will be described in detail in Examples below.
  • the ligand complex of the present invention is obtained by introducing an oligosaccharide such as maltose-lactose having a reducing end into the linker compound prepared as described above.
  • an oligosaccharide such as maltose-lactose having a reducing end
  • Specific examples of the ligand complex of the present invention include the following.
  • the first ligand complex has the structure represented by the general formula (2) as the X in the structure represented by the general formula (12), and R ′ is Hydrogen (H), and R is the following formula (18)
  • the maltose having the structure represented by is introduced.
  • the second ligand conjugate has the structure represented by the general formula (2) as the X in the structure represented by the general formula (12), and R ′ is hydrogen ( H), and R is the following formula (19) ..
  • Lactose having the structure shown here is introduced.
  • the first and second ligand complexes since one oligosaccharide is introduced into each of the linker compounds having three hydrocarbon-derived chains, three units of oligo bran are added at the end. Have.
  • the first ligand complex has 3 units of ⁇ -dalcoviranose at the end
  • the second ligand complex has 3 units of j8-galactovirose at the end. have.
  • the general formula (2),! !! 1 ⁇ ! !!! 3 is not limited as long as it is an integer of 0 or more and 6 or less, and may be mutually different integers, or some or all may be the same integer.
  • n 1 is not particularly limited as long as it is an integer of 1 or more and 6 or less.
  • the third ligand conjugate has the structure represented by the general formula (3) as the X in the structure represented by the general formula (12), and R ′ is hydrogen (H) And maltose having a structure represented by the above formula (18) is introduced into R.
  • the fourth ligand complex has the structure represented by the general formula (3) as the X in the structure represented by the general formula (12), and R ′ is hydrogen ( H), wherein lactose having a structure represented by the above formula (19) is introduced into R.
  • n 1 is not particularly limited as long as it is 1 or more and 6 or less.
  • the fifth ligand conjugate has the structure represented by the above general formula (4) in the structure represented by the above general formula (13), wherein R is hydrogen ( H), which is obtained by introducing glucose into R.
  • R is hydrogen ( H)
  • n 2 is not particularly limited as long as it is an integer of 1 or more and 6 or less.
  • the sixth ligand conjugate has the structure represented by the general formula (4) as the X in the structure represented by the general formula (13), and R ′ is hydrogen (H) And R is made by introducing maltose.
  • n 2 is not particularly limited as long as it is an integer of 1 or more and 6 or less.
  • the seventh ligand conjugate has the structure represented by the general formula (4) as the X in the structure represented by the general formula (14), and R ′ is hydrogen (H) And glucose is introduced into R.
  • n 1 is not particularly limited as long as it is an integer of 1 to 6.
  • the eighth Ligand complex has the structure represented by the general formula (4) as the X in the structure represented by the general formula (14), and R ′ is Hydrogen (H), which is formed by introducing maltose into R.
  • R ′ is Hydrogen (H), which is formed by introducing maltose into R.
  • n 1 is not particularly limited as long as it is an integer of 1 to 6.
  • linker compound having a structure represented by the above general formula (9) includes the following group (20)
  • the 17 types of ligand conjugates into which 17 types of sugar chains are introduced, respectively, are given as examples of the ligand complex of the present invention. Since all of the above ligand complexes contain a linker compound and a sugar molecule, the metal on the support surface for protein analysis and the metal on the S—S bond in the linker compound It can be linked by a sulfur (S) bond, eg, a gold-sulfur (Au-S) bond. This makes it possible to provide a ligand carrier in which sugar molecules are assembled and immobilized on the surface of the support via the Au—S bond. As the metal on the surface of the support, other than Au, metals such as Cu, Ag, and Pt can be used, but it is particularly preferable to use Au.
  • S sulfur
  • Au-S gold-sulfur
  • the oligosaccharide introduced into the ligand conjugate of the present invention may be a single oligosaccharide composed of the same monosaccharide molecule, or a complex composed of various monosaccharide molecules or derivatives thereof. It may be a carbohydrate.
  • any of the above-mentioned oligosaccharides may be various natural sugars obtained by isolation and purification from the natural world, or may be artificially synthesized sugars. Further, the oligosaccharide may be obtained by decomposing a polysaccharide.
  • the present invention also includes a ligand carrier obtained by immobilizing the above-described ligand complex of the present invention on a support having a metal on its surface via a metal-sulfur bond.
  • This ligand carrier is not limited to use in protein analysis, and can also be used for analysis of substances other than protein in order to examine interaction with bran molecules.
  • the above-mentioned ligand carrier is obtained by bringing a ligand complex solution containing the ligand complex into contact with a support having a metal film on the surface thereof, whereby each S atom of the S—S bond of the ligand complex is formed on the surface of the support. Metal-to-metal-sulfur bond
  • the ligand complex is introduced onto the surface of the support. Specifically, a support for protein analysis is immersed in the ligand complex solution for a predetermined time, or a ligand complex solution is injected into the support (flow of the ligand complex solution over the support surface).
  • the S—S bond of the ligand complex (linker compound contained in the ligand complex) is converted into an Au—S bond with gold or the like on the support surface, and the S—S bond is placed on the support surface.
  • the ligand complex can be immobilized.
  • the solvent used for the ligand complex solution is not particularly limited, but examples include methanol, water, dimethylacetamide (DMAc), and a mixed solvent thereof.
  • the immersion time may be about 0.5 to 12 hours, and the injection concentration may be about 1 ⁇ 1 to 1 ⁇ .
  • the ligand conjugate of the present invention since the ligand conjugate of the present invention has an SS bond, it can be easily immobilized on the surface of a support for protein analysis, and a sugar molecule is placed on the support. It can be easily introduced.
  • the ligand carrier of the present invention can be used for analyzing the interaction between a sugar molecule and another substance such as a protein. Specifically, the above ligand carrier can be applied to SPR measurement, affinity chromatography, and the like.
  • the following may be performed. That is, using a ligand carrier obtained by immobilizing the ligand complex of the present invention on a support on which a metal thin film such as a gold thin film is vapor-deposited, contacting the ligand carrier with the protein, and using a conventional method, surface plasmon If the resonance angle is measured using a resonance device, the binding behavior between the ligand carrier and the protein can be observed. Note that it is used for SPR measurement.
  • the support for example, glass, plastic, or the like can be used, and glass is particularly preferably used.
  • the contact between the ligand carrier and the protein may be carried out, for example, by flowing a solution of the protein dissolved in a running buffer onto the surface of the ligand carrier. Examples of the running buffer include a phosphate buffer solution and the like.
  • the ligand carrier of the present invention has been confirmed to exhibit a different interaction with each protein, and thus can be used for protein identification.
  • the ligand carrier of the present invention by analyzing an unknown protein using the ligand carrier of the present invention, it is possible to easily determine whether or not the protein is a sugar-binding protein and what kind of protein the protein is. Can be determined. It should be noted that, if a chip set including at least two of the above-described ligand complexes on which the ligand complexes are immobilized as one set is prepared, proteins (particularly, sugar chains) are more easily prepared. It is useful because it is possible to identify (binding protein).
  • the ligand carrier of the present invention can be used as a sensor chip for measurement of intermolecular interaction (for example, SPR measurement as described below) '. That is, a first sensor chip in which the first ligand complex is immobilized on the surface of the support, and a second ligand complex different in type from the first ligand complex are immobilized on the surface of the support. Using the second sensor chip, the detection result of the SPR measurement obtained using the first sensor chip and the detection result of the SPR measurement obtained using the second sensor chip are used. By detecting the difference, the interaction of sugar molecules can be observed.
  • SPR measurement for example, SPR measurement as described below
  • These sensor chips include ligand complexes with different immobilized sugar molecules or ligand complexes with the same immobilized sugar molecules but different linker compounds. It may be used.
  • Examples of this kind of different ligand conjugates include the above-described ligand conjugates.
  • the linker compound portion has the same structure but the oligosaccharide portion has a different structure (for example, the first ligand complex and the second ligand complex have the same structure)
  • the measurement conditions are kept constant, the SPR measurement is applied to the two sensor chips, and the resonance angle of the two is observed. .
  • the specific interaction between the bran molecule and the protein can be measured.
  • substances that observe interactions with sugar molecules are not limited to proteins.
  • two types of sensor chips were measured simultaneously.
  • the present invention is not limited to this, and two or more types of sensor chips may be measured or may not be measured simultaneously.
  • at least one sensor chip in which a sugar molecule is not introduced may be used.
  • an immobilized linker compound alone may be used.
  • the measurement can be performed using at least two sensor chips having a ligand complex having the same structure except for the bran molecule. This difference is observed as being due to sugar molecules. Therefore, if the above measurement method is used, However, it is possible to reduce a non-specific interaction between a portion other than a sugar molecule and another substance and observe a specific interaction between the sugar molecule and another substance.
  • the above-described SPR measurement may be performed using a 2′-type sensor chip on which a ligand complex having the same sugar molecule but a different linker-compound portion structure is immobilized.
  • the binding behavior of the protein due to the difference in the degree of aggregation of the bran molecules on the sensor chip can be measured.
  • An example of such a set of sensor chips is a set of the first ligand complex and the third ligand complex.
  • the ligand-supported substance with the protein used for the SPR measurement is directly subjected to mass spectrometry, the sensor may be used.
  • the proteins bound to the chip can be identified.
  • the mass spectrometry described above can be performed using a conventionally known mass spectrometer such as a matrix-assisted laser desorption Z-time-of-flight mass spectrometer (MALDI-TOF / MS) according to a conventionally known method. Good.
  • MALDI-TOF / MS matrix-assisted laser desorption Z-time-of-flight mass spectrometer
  • the method for analyzing a protein of the present invention comprises the step of bringing the above-mentioned ligand complex of the present invention into contact with a support having a metal on the surface thereof, thereby allowing the ligand complex to be immobilized on the support.
  • the protein complex can be analyzed using two or more types of ligand carriers, and the results can be compared and analyzed to analyze the properties of each protein.
  • n 1 is 1 and X has a structure represented by the general formula (2)
  • R ′ is hydrogen (H)
  • maltose represented by the above formula (18) is introduced into R
  • a ligand complex compound 1 having a structure in which m 1 , m 2 , and m 3 are 2 ) was synthesized by the following procedure.
  • nitromethane (compound 5) was converted to dimethoxethane at 65 ° C to 70 ° C in the presence of benzyltrimethylammonium hydroxide.
  • 3 units of t-butyl acrylate (Compound 6) were added by Michael to give Compound 7 in a yield of 91%.
  • Raney was added in ethanol at 50 ° C under a hydrogen atmosphere (ekg Z cm 2 ).
  • the compound 8 is obtained by first preparing nitromethane (12. 2 g, 200) according to the method described in the literature (GR Newkome'b, 0PPI BRIEFS, vol. 28, p. 495, 1996). (mol) was dissolved in 50 mL of 1,2-dimethoxetane, heated to 65-70 ° C, and added with 40% benzyltrimethylammonium-monoxide-methanol solution (2 mL) to give nitrite. Then, the temperature of this nitromethane solution was raised to 75 ° C, and t-butyl acrylate (90.8 mL, 62 mm0) was slowly added dropwise.
  • Z-glycine (1.26 g, 6.62 mo 1), HOAt (0 ' ⁇ 90 g, 662 mmo 1), ED C. HC 1 (1.27 g, 6.62 mm o 1) and Z-glycine solution in anhydrous dichloromethane (28 mL) were added to Compound 8 (2.50 g, 6.02 mmo 1) in anhydrous dichloromethane (2 mL), add a solution of the compound 8 and stir at room temperature for 36 hours under an argon atmosphere to obtain a Z-glycine Z compound 8 reaction solution.
  • Dichloromethane is added to the reaction solution of Z-daricin compound 8 by adding dichloromethane and a 10% aqueous solution of citric acid.
  • the compound 9 was prepared using trifluoroacetic acid (hereinafter referred to as TFA) in a mixed solvent of CHsClazZHsO-lOZ1.
  • TFA trifluoroacetic acid
  • the t-butoxycarbonyl group (—COOC (CH 3 ) 3 group; tBu in the formula (22)) was deprotected to obtain a compound 10 in a yield of 95%.
  • the compound 13 was found to have an m / z of 875.5 [(M + H) + ] by ESI-MS (positive) measurement. Also, - NMR (4 0 0 MH z, CDC 1 3) was subjected to measurement, S 9.00 (3H, s, NHC0 2 tBu), 7.57 (2 ⁇ , s, Hs), 7.35 (1H, bs, Gly- NH), 7.14-7.00 (15H, m, aromatic, CH 2 C0NH), 3.21 (2H, s, Gly- (3 ⁇ 4), 2.26 (6H, m, (3 ⁇ 4CH 2 C0), 2.04 (6H, m, 1.5 (27H, s, t-butyl). From these, the structure of Compound 13 was confirmed. The molecular weight of the compound 13 is 877.4.46.
  • compound 14 (23.6 mg, 114 mo 1) and HO Bt (15.4 mg, 114 mmo 1) were combined with anhydrous dichloromethane to obtain the compound 15. (2.3 mL).
  • Compound 0 (2.50 mg, 6.02 mmol) was added at 0 ° C and the mixture was shielded from light under an argon atmosphere. After stirring at room temperature for 36 hours, 10% aqueous solution of citric acid was added. Then, the mixture was extracted with chloroform, the organic layer was washed with a saturated aqueous solution of sodium hydrogen carbonate, and dried using anhydrous sodium sulfate as a drying agent.
  • the compound 15 was subjected to ESI-MS (positive) measurement, and found to have m / z 1088.5 [(M + H) + ]. Further, 1 H- NMR (4 0 0 MH z, CD 3 C 1) was subjected to measurement, S 9.01 (3H, bs, NHC0 2 tBu), 7. 67 (3H ,.
  • n 1 is 1
  • X is represented by the general formula (2).
  • a ligand conjugate (compound 1) having a structure in which m 1 , m 2 and m 3 are 2 was synthesized by the procedure of the following formula (24).
  • Compound 1 was obtained as a ligand conjugate comprising the units.
  • Compound 1 was identified by MA LDI-TOF / MS and NMR.
  • n 1 is 1 and X has a structure represented by the general formula (2)
  • R ′ is hydrogen (H)
  • a ratatoose represented by the above formula (19) is introduced into R
  • a ligand complex compound having a structure in which m 1 , m 2 , and m 3 are 2)
  • the linker Compound A was synthesized according to the same procedure described above for the synthesis of the first ligand conjugate.
  • n 1 is 1
  • X is a structure represented by the general formula (2).
  • R ′ is hydrogen (H)
  • Ratose represented by the above formula (19) is introduced into R, and m 1 , m 2 , and m 3 are 2 in a ligand complex ( Compound 2) was synthesized by the procedure of the following formula (25).
  • the amino benzoic acid derivative (B-2) in which the amino group of amino benzoic acid (B-1) is protected with a Boc group and diethylenetriamine (B-3) are converted into HOBt and EDO Condensation was performed using HC1, to obtain a diamide form (B-14) with a yield of 79%.
  • the diamide (B-4) is reacted with glycine (Z-G1y) in which an amino group is protected by a Z group, and (B-5) was obtained in a yield of 75%.
  • the compound B-2 is obtained by dissolving 4-aminobenzoic acid (B-1) (2.00 g, 14.6 mmol) in 140 mL of methanol, and adding (Boc) 20 (6.7 mL). , 29.1 rtimol) and triethylamine (3.06 mL, 21.9 m) mol) was added and the mixture was stirred at room temperature for 16 hours.
  • the reaction solution was concentrated under reduced pressure, hexane and a saturated aqueous solution of sodium hydrogencarbonate (50 mL) were added to the residue, and the aqueous layer was extracted.
  • thiobutyric acid (B-7) (41.0 mg, 0.200 mmol), HOBt (35.0 mg, 0.200 mmol) and EDCHC1 (42.1 g, 0.200 mmol) were added to dimethylformamide (3 mL). After dissolving, the mixture was stirred at 0 ° C for 1.5 hours under a nitrogen atmosphere and protected from light. Next, the above compound B-6 (0.1 g, 0.167 mmo 1) was dissolved in dimethylformamide (2 mL), added dropwise to the dimethylformamide solution, and stirred at room temperature for 19 hours.
  • n 1 is 1 and X has a structure represented by the general formula (3)
  • R ′ is hydrogen (H)
  • a ratatoose represented by the above formula (19) is introduced into R
  • a ligand complex (compound 4) having a structure in which m 4 and m 5 are 2 is represented by the following formula. Synthesized according to the following procedure.
  • a linker compound B having two branched chains in which the terminal of the aromatic amino group was protected by a protecting group was synthesized as described above. Subsequently, using the obtained linker compound B, in the structure represented by the general formula (12), n 1 is 1, and X is represented by the general formula (3).
  • a ligand complex (compound 4) having a structure wherein R ′ is hydrogen (H), lactose represented by the above formula (19) is introduced into R, and m 4 and m 5 are 2. ) was synthesized according to the following equation (28).
  • Example 2 Protein analysis by SPR measurement and mass spectrometry
  • FIG. 1 shows the procedure of protein analysis in this example as steps 1 to 12.
  • each ligand complex (compound 14) is immobilized on a gold (Au) -coated support surface to prepare a ligand carrier (senchip). It is a process.
  • the step performed after the step 8 of bringing the ligand carrier into contact with a solution containing the protein to be analyzed is a step of performing SPR measurement.
  • the step performed after the step of washing the surface of the support with water 10 is a step of identifying the protein by mass spectrometry (MS).
  • MS mass spectrometry
  • the SPR measurement was performed using SPR-8B manufactured by Japan Laser Electronics Co., Ltd.
  • the mass spectrometry was performed using a Voyager RP-DE, a matrix-assisted laser desorption / time-of-flight mass spectrometer (MALDI-TOF / MS) manufactured by Applied Bio.
  • MALDI-TOF / MS matrix-assisted laser desorption / time-of-flight mass spectrometer
  • the proteins used for the analysis were koncanav a1 in A (abbreviated as ConA) as dalcoviranose-binding lectin protein,
  • PSA serum albumin
  • step 1 to 7 shown in FIG. 1 based on steps 1 to 7 shown in FIG. 1, four types of ligand carriers on which the above compounds 1 to 4 were respectively immobilized were produced. Subsequently, the above five lectin proteins and BSA were each dissolved in PBS buffer to prepare a protein solution. Thereafter, step 8 shown in FIG. 1 was performed, and each ligand carrier and each protein solution were brought into contact with each other to cause an interaction. Subsequently, SPR measurement was performed to measure the binding between the ligand carrier and the protein.
  • FIGS. 2, 3 and Table 1 The results of the binding behavior of the lectin protein using the ligand carrier (sensor chip) on which a-dalcopyranose was immobilized are shown in FIGS. 2, 3 and Table 1.
  • Figure 2 shows the results of a sensor chip in which the ligand complex of compound 3 (Di-valent type) was immobilized.
  • Figure 3 shows the sensor in which the ligand complex of compound 1 (Tri-valent type) was immobilized. The chip results are shown.
  • Figure ) Is the result of the binding behavior of C on A, and (b).
  • Table 1 summarizes the binding behavior of each protein. Specific binding was observed with the ⁇ -glucose-binding lectin protein, and the 'binding' constant could be calculated.
  • the dissociation constant (K D ) was calculated to be equal or smaller when using the Trivalent ligand conjugate than when using the Divalent ligand conjugate. It is clear that increasing the number of sugar chains increases the binding activity.
  • FIGS. 4, 5 and Table 2 The results of the binding behavior of the lectin protein using the ligand carrier (sensor chip) on which ⁇ -galactobiranose was immobilized are shown in FIGS. 4, 5 and Table 2.
  • Fig. 4 shows the results of a sensor chip on which a ligand complex of compound 4 (.Di-valent type) was immobilized
  • Fig. 5 shows a sensor chip on which a ligand complex of compound 2 (Tri-valent type) was immobilized. The result was shown. 4 and 5, (a) shows the results of the binding behavior of RCA, and (b) shows the results of the binding behavior of PNA.
  • Table 2 summarizes the binding behavior of each protein. jS gas Specific binding was observed with the lactose-binding lectin protein, and the binding constant could be calculated.
  • Con A non-specific binding behavior independent of protein concentration was observed in the chip prepared using compound 3.
  • the dissociation constant (K D ) was calculated to be equal or smaller when using the Tri-valent ligand conjugate than when using the Di-valent ligand conjugate, and the sugar chain per ligand complex was calculated. It became clear that the binding activity increased with the increase in the number of.
  • Step 11 After confirming the binding behavior between the ligand carrier and the protein in the series of steps described above, dissociate the bond between the ligand carrier and the protein in step 11 and then wash with PBS buffer in step 12 Was done. Thereafter, using another protein solution, Steps 8 to 10 were repeated again, and SPR measurement and mass spectrometry were performed. This operation was repeated for each ligand carrier and each protein.
  • FIG. 6 The results of mass spectrometry are shown in FIG. 6 and Table 3.
  • Figure 6 (a) shows C on A
  • Fig. 6 (b) shows the results of analysis of PNA.
  • Table 3 also summarizes the results of other lectin proteins.
  • An ion peak close to the monovalent or bivalent molecular mass of each lectin protein subunit was observed. However, since the molecular mass of RCA was as large as 30,000 daltons or more, the ion peak could not be detected by the mass spectrometer used. Detection would be possible with a more sophisticated MALDI-TOF / MS instrument.
  • the protein analysis method of the present invention can also be used for analyzing the relationship between the degree of aggregation of sugar chains and the binding activity of the protein. Such an analysis of the relationship between the degree of aggregation of sugar chains and the binding activity of a protein cannot be determined by an existing method, and thus can be said to further enhance the utility of the present invention.
  • ligand complexes classified into the fifth and sixth ligand complexes described in the embodiment were synthesized. That is, in the structure represented by the general formula (13), which is the fifth ligand complex, n 2 is 4, and the X has the structure represented by the general formula (4).
  • R and R are hydrogen (H), and a ligand complex (compound 21) having a structure in which glucose is introduced into R, and the above-mentioned general formula (13) which is the sixth ligand complex
  • n 2 is 4
  • the above has the structure represented by the general formula (4)
  • R ′ is hydrogen (H)
  • the ligand complex has a structure in which maltose is introduced into (Compound 22) was synthesized by the following procedure.
  • compound 16 of the formula (29) was synthesized by the following procedure. '. Bis dissolved in [2- (2-arsenate Dorokishie butoxy) Echiru] ether (14.57 ml, 80 mmo 1) and BF 3 ⁇ Et 2 0 (252 ml ,. 2 mmol) in anhydrous dichloromethane 50 ml, 0 ° After adding ethyl diacetate (1.8 ml, 17.35 mmol) dropwise at C, the mixture was stirred at room temperature for 70 minutes.
  • ligand complexes classified into the seventh and eighth ligand complexes described in the embodiment were synthesized. That is, in the structure represented by the above general formula (14), which is one of the fifth ligand complexes, which is one of the seventh ligand complexes, ⁇ 1 is 3, and X is generally A ligand complex having a structure represented by the formula (4), wherein R ′ is hydrogen (R), and glucose is introduced into R (compound 26)
  • ⁇ 1 is 3 in the structure represented by the general formula (14), which is one of the eighth ligand complexes, and X is the structure represented by the general formula (4).
  • a ligand complex (compound 26) having a structure in which R ′ is hydrogen ( ⁇ ) and maltose was introduced into R was synthesized by the following procedure.
  • the measurement method, reagents, and the like are the same as those described in Example 3 above.
  • ⁇ -mercaptobutyric acid dimer (Compound.23) (344 mg, 1.44 mmol) was dissolved in anhydrous dichloromethane (25 ml), and HOBt (359 mg, 2.64 mmol), EDC HC1 (508 mg, 2..64 mmol) and N-Boc-phenylenediamine (Compound 11) (502 mg, 2.4 mmol) were sequentially added at 0 ° C., and the mixture was stirred under light shielding for 17 hours. The reaction solution was concentrated under reduced pressure, and the concentrated residue obtained was extracted with chloroform. The organic layer was washed once with 10% aqueous citric acid and saturated aqueous sodium hydrogen carbonate, and used as a desiccant.
  • n 1 and q were 0, and a ligand conjugate introduced with the sugar chain represented by the group (20) was synthesized.
  • the measurement method, reagents, and the like are the same as in Example 4 above.
  • the compound 30 was subjected to 1 H-NMR spectrum (600 MHz, D 20 ) measurement. The chart shown in FIG. 7 was obtained. MALDI-TOF-MS measurement showed that the m / z was 977.5 [(M + Na) + ]. These confirmed the structure of Compound 30. In addition, the molecular mass of this compound 30 is 95.4.34.
  • the ligand conjugate represented by the formula (36) was synthesized in the same procedure as in the above (1).
  • the ligand conjugate represented by the formula (38) was synthesized in the same procedure as in the above (1).
  • the ligand conjugate represented by the formula (39) was synthesized in the same procedure as in the above (1).
  • the ligand conjugate represented by the formula (40) ' was synthesized in the same procedure as in the above (1).
  • the ligand conjugate represented by the formula (42) was synthesized according to the same procedure as in the above (1).
  • the ligand conjugate represented by the formula (45) was synthesized in the same procedure as in the above (1).
  • the ligand conjugate represented by the formula (48) was synthesized in the same procedure as in the above (1).
  • the ligand conjugate represented by the formula (49) was synthesized in the same procedure as in the above (1).
  • the ligand conjugate represented by the formula (50) was synthesized by the same procedure as in the above (1).
  • the ligand complex represented by the formula (51) is
  • the ligand conjugate according to the present invention can introduce a plurality of sugar molecules into one ligand conjugate.
  • sugar molecules can be assembled.
  • the linker compound of the present invention the interaction between the sugar molecule and the protein can be evaluated with good reproducibility. Will be possible.
  • the ligand carrier according to the present invention has an effect that it can be used for identification of an unknown protein. Furthermore, according to the protein analysis method of the present invention, unknown proteins can be identified.
  • the present invention provides novel ligand complexes and ligand carriers that can be effectively used for protein function analysis. Is provided. If the ligand carrier (chip) on which oligosaccharides are immobilized develops as a tool for understanding the functions of bran chains and proteins, it will not only contribute to the elucidation of life phenomena involving oligosaccharides, but also to pharmaceuticals It is expected to be an important technology in development. Therefore, the utility of the present invention is considered to be high.

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
  • Heterocyclic Compounds Containing Sulfur Atoms (AREA)
  • Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

本発明は、タンパク質の機能解析に有効利用することのできる新規なリガンド複合体、リガンド担持体、および、タンパク質の分析方法を提供する。 リガンド複合体は、下記一般式(1)【化1】(式中、n,pは0以上6以下の整数)にて表される構造を備え、上記Xとして、末端に芳香族アミノ基を有するとともに、主鎖に炭素−窒素結合を有していてもよい炭化水素誘導鎖を、1鎖又は2鎖又は3鎖含んでなる構造を備え、上記Yとして、硫黄原子を含む炭化水素構造を備え、上記Zとして、炭素−炭素結合又は炭素−酸素結合を持つ直鎖構造を備えているリンカー化合物と、還元末端を有する糖とが、上記芳香族アミノ基を介して結合している構造である。

Description

5 003220
1
明 細 書 発明の名称
糖鎖リガンド複合体、 およびそのリガンド複合体を用いたタンパク質の 分析方法 技術分野
本発明は、 リ ンカー化合物に還元末端を有する糖鎖が導入された新規 リガンド複合体、 および、 このリガンド複合体を金や銀、 銅などの金属 で表面をコートしたチップ上に集合化させ固定化したリガンド担持体に 関するものである。 さらに、 本発明は上記リガンド複合体を用いたタン パク質の分析方法に関するものである。 背景技術
生体内に存在する種々の糖は、 生物の活動や生命を維持するためのメ 力二ズムの中で重要な役割を果たしている。 このよ うな糖の機能を精密' に解明するためには、 糠の複雑な構造に基づいてそれらの機能を解析す る必要がある'。 糖の機能解析には、 構造が解明されている糖鎖を用いて 、 糖の構造を一部ずつ再現し、 これによつて糖全体の構造と機能との関 係を明らかにする手法が用いられる。
- 上記糖の機能解析の手法としては、 例えば、 表面プラズモン共鳴 (以 下、 S P Rと記載する) が知られている。 すなわち、 糖の一部を模擬し たオリ ゴ糖を含んでなるリガンド複合体をセンサチップ表面上に導入し 、 このリガンド複合体が導入されてなるセンサチップを用いて、 オリ ゴ 糖と特異的に相互作用するタンパク質等の物質を特定する。 これにより 、 ォリ ゴ糖の構造に基づく生物活性の正しい評価を行う ことができる。
ところが、 オリ ゴ糖は、 1分子だけでは活性がそれほど高くないため 、 オリ ゴ糖の生物活性を評価する場合には、 オリ ゴ糖をセンサチップ上 に集合化させることが必要となる。 つまり、 集合化したオリ ゴ糖を用い て、 タンパク質との相互作用を解析することにより、 オリ ゴ糖の生物活 性の評価を行うことが可能になる。
そこで、 本発明者らは、 これまでに、 センサチップ表面に固定可能な 部位及びオリ ゴ糖を導入可能な部位を分子内に有するリ ンカー化合物を 得、 このリ ンカー化合物に 1単位又は 2単位のオリ ゴ糖を導入してなる リガンド複合体を得ている。 そして、 このリガンド複合体を用いること によって、 センサチップ上に、 オリ ゴ糖を集合化して導入することがで きることを見出している (例えば、 特許文献 1、 非特許文献 1等を参照
) o .
〔特許文献 1〕 特開 2 0 0 3— 8 3 9 6 9号公報 ( 2 0 0 3年 3月 1 9 日公開)
〔非特許文献 1〕 「日本化学会第 7 9回春季年会一講演予稿集 IIJ 、 社団法人日本化学会、 2 0 0 1年 3·月 1 5 日、 p . 1 0 4 2
しかしながら、 上記の各文献に記載されたリガンド複合体においては 、 導入される糖鎖 (オリ ゴ糖鎖) は、 発明者らによって合成された硫酸 化糖に限られており、 市販の還元末端を有するマルトース、 ラタ トース などのオリ ゴ糖を導入しチップ化できるかどうかについては明らカ こさ れていない。 また、 上記の文献に記載のリガンド複合体を固定化して得 られたセンサチップを S P Rを用いた測定に使用した後に、 チップ上の 糖鎖と結合したタンパク質の同定に使用するという利用方法は、 従来か ら提唱されてはいたが、 データ的に満足できるものは存在し.なかった。 本発明は上述の問題点に鑑みてなされたものであって、 市販の還元末 端を有する糖を導入してなる新規リガンド複合体、 および、 タンパク質 の同定に使用することのできるリガンド担持体を提供することを目的と するものである。 発明の開示
本願発明者は、 上記課題を解決するために鋭意検討を行った結果、 先 出願 (出願番号 : 特願 2 0 0 3— 1 9 0 5 6 8、 公開番号 : 特開 2 0 0 4 - 1 5 7 1 0 8 (公開日 : 2 0 0 4年 6月 3 日) 、 本願の優先日 ( 2 0 0 4年 2月 1 8 日) の時点で未公開) に記載のリ ンカ一化合物 (何れ も本願発明者らによって見出されたもの) に市販のマルトースまたはラ ク トースを反応させ、 それぞれ末端に αダルコビラノースまたは ]3ガラ ク トピラノースを有するリガンド複合体を合成した。 さらに、 本願発明 者はこれらのリガンド複合体を金コーティングチップに固定化させたシ ュガーチップ (リガンド担持体) を作製した。 そして、 これらのシュガ 一チップを用いてタンパク質との相互作用を検討するために、 S P R測 定で相互作用を確認後、 当該シュガーチップをそのまま MA LD I - Τ O F/M Sに供した.ところ、 各シュガーチップに結合するタンパク質を 同定することができること見出し本発明を完成させるに至った。
すなわち、 本発明のリガンド複合体は、 一般式 ( 1 )
Figure imgf000006_0001
(式中、 p , qはそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数) にて表される 構造を備え、 上記 Xとして、 末端に芳香族アミノ基を有するとともに、 主鎖に炭素—窒素結合を有していてもよい炭化水素誘導鎖を、 1鎖又は 2鎖又は 3鎖含んでなる構造を備え、 上記 Yとして、 硫黄原子又は硫黄 原子を含む炭化水素構造を備え、 上記 Zとして、 炭素一炭素結合又は炭 素一酸素結合を持つ直鎖構造を備えているリ ンカー化合物と、 還元末端 を有する糖とが、 上記芳香族アミノ基を介して結合している構造を有し ていることを特徴としている。
上記炭化水素誘導鎖とは、 炭素及び水素からなる炭化水素鎖にて、 一 部の炭素や水素が他の原子や置換基に置き換わっていてもよいものを指 すものとする。 すなわち、 上記炭化水素誘導鎖とは、 末端に芳香族アミ ノ基を有し、 炭化水素鎖の主鎖構造である炭素—炭素結合 (C— C結合 ) の一部が、 炭素一窒素結合 (C— N結合) 、 炭素—酸素結合 (C一 O 結合) 、 アミ ド結合 (C O— N H結合) に置き換わっていてもよいもの を指す。
また、 上記硫黄原子を含む炭化水素構造とは、 炭素及び水素からなる 炭化水素構造にて、 一部の炭素が硫黄に置き換わっているものを意味す る。 また、 この硫黄原子を含む炭化水素構造は、 鎖状 (直鎖、 枝分かれ 鎖の両方を含む) であっても、 環状であってもよく、 また、 鎖状構造お ょぴ環状構造の両方の構造を含んでいてもよいものとする。
本発明のリガンド複合体において、 上記リ ンカ一化合物は、 上記 Yと して、 S— S結合または S H基を含む炭化水素構造を備えているもので あってもよい。 つまり、 上記硫黄原子を含む炭化水素構造中に、 ジスル フィ ド結合 ( S— S結合) またはチオール基 ( S H基) が含まれていて もよい。
本発明のリガンド複合体において、 上記 Xは、 一般式 ( 2 )
Figure imgf000007_0001
(式中、 m1, m23はそれぞれ独立して 0以上 6以下の.整数。 R' は水素 (H) または R。 ) にて表される構造を備え、 上記 Rは糖鎖由来 化合物であるものであってもよい。
本発明のリガンド複合体において、 上記 は、 一般式 ( 3 )
Figure imgf000007_0002
(式中、 m4, m5はそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数。 R' は水 素 (H) または R。 ) にて表される構造を備え、 上記 Rは糖鎖由来化合 物であるものであってもよい。
本発明のリガンド複合体において、 上記 Xは、 一般式 (4 )
Figure imgf000008_0001
(式中、 R, は水素 (H) または R) にて表される構造を備え、 上記 R は糖鎖由来化合物であるものであってもよい。
'本発明のリガンド複合体において、 上記 Zは、 式 ( 5 )·または式 ( 6
)
Figure imgf000008_0002
(式 '中、 II 1, n 2はそれぞれ 1以上 6以下の整数) にて表される構造 を備えているものであってもよい。
また、 本発明にかかるリガンド複合体の製造方法は、 一般式 ( 7 )
Figure imgf000009_0001
(式中、 m1, m2, m3はそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数、 n 1 は 1以上 6以下の整数) にて表される構造を備えているリ ンカー化合物 、 または、. 一般式 ( 8 )
Figure imgf000009_0002
(式中、 m4, m5はそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数、 n 1は 0以 上 6以下の整数) にて表される構造を備えているリ ンカ一化合物、 また は、 一般式 ( 9 )
Figure imgf000009_0003
(式中、 n 1, qはそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数) にて表され る構造を備えているリ ンカー化合物、 または、 一般式 ( 1 0 ) 03220
8
Figure imgf000010_0001
(式中、 n は 1以上 6以下の整数) にて表される構造を備えている リ ンカー化合物、 または、 一般式 ( 1 1 )
Figure imgf000010_0002
(11) j (式中、 n 1は 1以上 6以下の整数) にて表される構造を備えているリ ^カー化合物と、 還元末端を有する糖とを用いて還元アミノ化反応を行 うことを特徴としている。
i また、 本発明にかかるリガンド担持体は、 上記の何れかのリガンド複 合体を、 表面に金属を有する支持体上に固定化させてなることを特徴と するものである。 そして、 上記リガンド担持体は、 タンパク質の分析に 使用してもよい。
また、 本発明にかかるタンパク質の分析方法は、 上記の何れかのリガ ンド複合体を、 支持体と接触させることによって、 当該リガンド複合体 を支持体上に固定化させたリガンド担持体を作成する工程と、 上記リガ ンド担持体を、 タンパク質溶液と接触させた後、 分子間相互作用の測定 を行う工程と、 上記分子間相互作用の測定の後に質量分析を行って、 上 記リガンド担持体に結合しているタンパク質を同定する工程と、 からな ることを特徴と している。 図面の簡単な説明
図 1は、 本発明のリガンド複合体を用いたタンパク質分析方法の手順 を示す模式図である。 .
図 2 ( a ) は、 一ダルコビラノースを 2分子有するリガンド複合体 を固定化したセンサチップを用いて C o n Aの結合挙動を測定した結果 を示すグラフである。
図 2 ( ) は、 a —ダルコビラノースを 2分子有するリガンド複合体 を固定化したセンサチップを用いて P S Aの結合挙動を測定した結果を 示すダラフである。
図 2 ( c ) は、 ひ 一ダルコピラノースを 2分子有するリガンド複合体 を固定化したセンサチップを用いて L C Aの結合挙動を測定した結果を 示すグラフである。
図 3 ( a ) は、 ひ一ダルコビラノースを 3分子有するリガンド複合体 を固定化したセンサチップを用いて C ο η Αの結合挙動を測定した結果 を示すグラフである。
図 3 ( b ) は、 α—ダルコビラノースを 3分子有するリガンド複合体 を固定化したセンサチップを用いて P S Αの結合挙動を測定した結果を 示すダラフである。
図 3 ( C ) 'は、 α —ダルコビラノースを 3分子有するリガンド複合体 を固定化したセンサチップを用いて L C Αの結合挙動を測定した結果を 示すグラフである。
. 図 4 ( a ) は、 ]3—ガラク トピラノースを 2分子有するリガンド複合 体を固定化したセンサチップを用いて R C Aの結合挙動を測定した結果 を示すグラフである。
図 4 ( b ) は、 /3—ガラク トピラノースを 2分子有するリガンド複合 体を固定化したセンサチップを用いて P N Aの結合挙動を測定した結果 を示すグラフである。
図 5 ( a ) は、 β —ガラ ク トピラノースを 3分子有するリガンド複合 体を固定化したセンサチップを用.いて R C Αの結合挙動を測定した結果 を示すグラフである。
図 5 ( b ) は、 β —ガラ ク トピラノースを 3分子有するリガンド複合 体を固定化したセンサチップを用いて Ρ Ν Αの結合挙動を測定した結果 を示すグラフである。
図 6 .( a ) は、 センサチップに結合した C o n Aを質量分析した結果 を示すチャートである。
図 6 ( b ) は、 センサチップに結合した P N Aを質量分析した結果を 示すチヤ一トである。
図 7は、 リガンド複合体 (化合物 3 0 ) の1 H— NMRスペク トル測 定チヤー トである。 .
図 8は、 リガンド複合体 (式 ( 3 6 ) ) の1 H— NMRスペク トル測 定チャー トである。
図 9は、 リガンド複合体 (式 ( 3 7 ) ) の1 H— NMRスぺタ トル測 定チャートである。
図 1 0は、 "リガンド複合体 (式 ( 3 8 ) ) の1 H— NMRスペク トル 測定チャートである。
図 1 1は、 リガンド複合体 (式 ( 3 9 ) ) の1 H— NMRスペク トル 測定チヤ一トである。
図 1 2は、 リガンド複合体 (式 (4 0 ) ) の1 H— NMRスペク トル 測定チャートである。
図 1 3は、 リガンド複合体 (式 (4 1 ) ) の1 H— NMRスペク トル 測定チャ 卜である 0
図 1 4は 、 リ ガン ド複合体 (式 (4 2) ) の — NMRスぺク トル 測定チャ一卜である 0
図 1 5は 、 リガン ド複合体 (式 (4 3 ) 〕 の JH — NMRスぺク トル 測定チャ一卜である 0
図 1 6は 、 リガンド複合体 (式 (4 4 ) ) の !H — NMRスぺク トル 測定チャ 卜である o
図 1 7は 、 リガン ド複合体 (式 (4 5 ) 〕 の JH — NMRスぺク トル 測定チャ一卜である 0
図 1 8はゝ リガンド複合体 (式 (4 6 ) ; の JH一 NMRスぺク トル 測定チャ一卜である o
図 1 9は 、 リガン ド複合体 (式 (4 7 ) 、' の 'Η一 NMRスぺク トル 測定チャ一卜である o
図 2 0は 、 リガンド複合体 (式 (4 8 ) : の lH一 NMRスぺク トル 測定チャ一卜である o
図 2 1は 、 リガンド複合体 (式 (4 9 ) : ) の Ή一 NMRスぺク トル 測定チャ 卜である o
図 2 2は リガンド複合体 (式 ( 5 0 ) : ) の JH一 NMRスぺク トル 測定チャ一 である 0
図 2 3は 、 リガン ド複合体 (式 ( 5 1 ) 、 ) の 一 NMRスぺク トル 測定チャ 卜である □ 発明を実施するための最良の形態
以下、 本発明について詳細に説明する。
本発明のリガン ド複合体は、 表面プラズモン共鳴 ( S P R) のセンサ チップやァフィ二ティクロマトグラフィーの担持体等のタンパク質分析 用の支持体に固定化されて用いられるものであり、 支持体表面と結合す ることのできるリ ンカー化合物と、 分析対象となるタンパク質などと特 異的に相互作用することのできる糖鎖とから構成されている。 上記 S P Rゃァフイエティクロマ トグラフィーでは、 糖分子と特異的に相互作用 するタンパク質などの物質を特定することや分離することを目的として いる。 そのため、 上記リガンド複合体は、 タンパク質等の物質と非特異 的に相互作用を起こさないものであることが必要と される。
そこで、 本発明のリガン'ド複合体は、 上記一般式 ( 1 ) で表される構 造を備えたリ ンカ一部分 (リンカ一化合物) を有している。 この構造中 の Yで示す構造中には、 硫黄原子 ( S ) が含まれており、 この硫黄原子 ( S ) は、 例えば、 タンパク質分析用の支持体表面にコートされた金属 (例えば A u ) と、 金属一硫黄結合 (例えば A u— S結合) を形成し、 支持体に強固に結合することができる。
また、 上記リ ンカ一化合物は、 上記一般式 ( 1 ) の Xとして、 末端に 芳香族アミノ基を有すると ともに主鎖に炭素一窒素結合を有していても よい炭化水素誘導鎖を、 1鎖又は 2鎖又は 3鎖含んでなる構造を備えて いる。 これによつて、 上記リンカ一化合物は、 タンパク質分析用の支持 体表面に糖分子を集合化して配列することができると ともに、 末端に芳 香族アミノ基を有していることによって、 糠分子を簡便に導入すること ができる。
. また、 上記リ ンカ一化合物は、 上記一般式 ( 1 ) の Zとして、 炭素一 炭素結合又は炭素一酸素結合を持つ直鎖構造を備えている。 より具体的 には、 化合物の製造が容易であることから、 Zは、 上記式 ( 5 ) または 式 ( 6 ) にて表される構造を有することが好ましい。 なお、 上記一般式 ( 1 ) において、 p, qはそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数であれ ば限定されない。 また、 上記式 ( 5 ) の n 1および式 ( 6 ) の n 2はそ れぞれ 1以上 6以下の整数であれば限定されない。
さらに、 上記リ ンカ一化合物と して、 上記一般式 ( 1 ) において、 p が 4であり、 qが 1であり.、 Yと して、 S — S結合を有する環状炭化水 素構造を備えており、 Zが上記式 ( 5 ) である構造を有しているものを 挙げることができる。 上記リ ンカ一化合物としては、 例えば一般式 ( 1 2 )
Figure imgf000015_0001
にて表される構造を備えるものであってもよい。 このリ ンカー化合物は 、 チォク ト酸を原料として合成することが可能である。
また、 上記リンカ一化合物として、 上記一般式 ( 1 ) において、 Pが 4であり、 qが 1であり、 Yとして、 S — S結合を有する環状炭化水素 構造を備えており、 Zが上記式 ( 6 ) である構造を有しているものを挙 げることができる。 上記リ ンカ一化合物としては、 例えば一般式 ( 1 3 ) . ,
Figure imgf000015_0002
にて表される構造を備えるものであってもよレ、。 このリ ンカー化合物は. 、 チォク ト酸を原料として合成することが可能である。 また、 上記リ ンカ一化合物どして、 上記一般式 ( 1 ) において、 が 0であり、 qが 0であり、 Yと して、 硫黄原子 ( S) を有しており、 Z が上記式 ( 5 ) または上記式 ( 6 ) である構造が 2量体を形成している ものを挙げることができる。 上記リ ンカー化合物としては、 例えば一般 式 ( 1 4) · · · ( 14)
Figure imgf000016_0001
にて表される構造を備えるものであってもよい。
上記一般式 ( 1 2 ) 、 一般式 ( 1 3 ) および一般式 ( 1 4 ) にて表さ れるリ ンカ一化合物は、 ジスルフイ ド結合 (S— S結合) が含まれてお り、 この S— S結合中の硫黄 ( S) は、 例えば、 タンパク質分析用の支 持体表面にコートされた金属 (例えば Au) と、 金属—硫黄結合 (例え ば Au— S結合) を形成し、 支持体に強固に結合することができる。 な お、 上記 Yとしては、 一般式 ( 1 2) 、 一般式 ( 1 3 ) または一般式 ( 1 4) で示されるものに限定されることはないが、 金属一硫黄結合 (A u— S結合) を容易に形成することができるという点で、 S— S結合ま たは S H基が含まれている炭化水素構造であることが好ましい。
そして、 本,発明のリガンド複合体は、 上記リ.ンカー化合物の芳香族ァ ミノ基に、 還元末端を有する糠鎖が導入され調製される。 言い換えれば 、 本発明のリガンド複合体は、 上記リ ンカ一化'合物と、 還元末端を有す る糖とが、 芳香族アミノ基を介して結合している構造を有している。 こ の糖の導入は、 例えば、 上記リ ンカ一化合物の芳香族ァミノ基のアミノ 基 (一 NH2基) と糖との還元アミノ化反応によって行うことができる 。 つまり、 糖中の平衡によって生 Dるアルデヒ ド基 (一 CHO基) また 5 はケトン基 (一 C R O基、 Rは炭化水素基) と、 上記リ ンカ一化合物が 有するアミノ基とが反応する。 そして、 この反応によって形成されたシ ッフ塩基を引き続き還元するこ とによって、 芳香族ァミ ノ基に容易に糖 を導入することができる。
本発明では、 特に上記還元末端を有する糖と して、 上記先出願に記載 のような発明者らによって合成された硫酸化糖ではなく、 市販のもの、 あるいは、 市販の多糖を分解して調製したものを用いる。 なお、 上記「 還元末端を有する糖」とは、 ァノマー炭素原子が置換を受けていない単 糖またはオリ ゴ糖である。 つま り、 上記還元末端を有する糖とは、 還元 糖(?ぁ ·ο。
上記還元末端を有する糖としてより具体的には、 マルトース、 ラク ト ース、 パノース、 セロ ビオース、 メ リ ビオース、 マンノオリ ゴ糖、 キ ト オリ ゴ糖、 ラミナリオリ ゴ糖などが挙げられるが、 これに限定されるこ とはない。 このように、 マルトース.やラタ トースなどのオリ ゴ糖を有す るリガンド複合体は、 従来の硫酸化糖を有するリガンド複合体と比較し て、 タンパク質測定に関して応用範囲が広いと言う利点を有している。 本発明のリガンド複合体として具体的には、 一般式 ( 7 )
Figure imgf000018_0001
(式中、 m1, m2, m3はそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数、 n 1 は 1以上 6以下の整数) にて表される構造を有するリ ンカ一化合物、 ま たは、 一般式 ( 8 )
Figure imgf000018_0002
(式中.、 m4, m5はそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数、 n 1は 1以 上 6以下の整数) にて表される構造を有す.るリ ンカ一化合物、 または、 一般式 ( 9 )
Figure imgf000018_0003
(式中、 n 1, qはそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数) にて表され る構造を有するリ ンカー化合物、 または、 一般式 ( 1 0 )
Figure imgf000019_0001
(式中、 n 2は 1以上 6以下の整数) にて表される構造を有するリ ンカ 一化合物、 または、 一般式 ( 1 1 )
Figure imgf000019_0002
(式中、 n 1は 1以上 6以下の整数) にて表される構造を有するリ ンカ 一化合物の芳香族ァミノ基に、 還元末端を有する糖が導入された構造を 有するものが挙げられる。
: 上記のリガンド複合体は、 例えば、 一般式 ( 7 ) 〜 ( 1 1 ) にて表さ れる構造を有するリ ンカー化合物と、 還元末端を有する糖とを用いて還 元アミノ化反応を行うことによつて製造することができる。
上記一般式 ( 7 ) にて表される構造を有するリ ンカ一化合物とは、 つ まり、 炭化水素誘導鎖を 3鎖有するものであり、 末端に芳香族ァミノ基 を有する 3鎖の炭化水素誘導鎖が、 1つの炭素 (C) に結合することに よって分岐構造を形成している。 なお、 上記一般式 ( 7 ) において、 m 1 , m2, m3は、 0以上 6以下の整数であれば限定されず、 n 1は 1以 上 6以下の整数であれば限定されず、 互いに異なる整数であってもよく
、 一部あるいは全てが同じ整数であってもよい。 このうち、 上記!!!1〜 m3は、 製造時の簡便さの点から互いに同じ整数であることが好ましく 、 特に 2であることが好ましい。 上記一般式 ( 8 ) にて表される構造を有するリ ンカ一化合物とは、 つ まり、 炭化水素誘導鎖を 2鎖有するものであり、 末端に芳香族ァミ ノ基 を有する 2鎖の炭化水素誘導鎖が、 1つの窒素 (N) に結合することに よって分岐構造を形成している。 なお、 上記一般式 ( 8 ) において、 m 4, m5は、 0以上 6以下の整数であれば限定されず、 11 1は 1以上 6以 下の整数であれば限定されず、 互いに異なる整数であってもよく、 一部 あるいは全てが同じ整数であってもよい。 このうち、 上記 m4, m5は 、 製造時の簡便さの点から互いに同じ整数であることが好ましく、 特に 2であることが好ましい。
上記一般式 ( 9 ) にて表される構造を有するリ ンカ一化合物は、 炭化 水素誘導鎖を 1鎖有するものである。 なお、 上記一般式 ( 9 ) において 、 n 1, qは、 0以上 6以下の整数であれば限定されず、 互いに異なる 整数であってもよく、 同じ整数であってもよい。
上記一般式 ( 1 0 ) にて表される構造を有するリ ンカー化合物は、 炭 化水素誘導鎖を 1鎖有するものである。 なお、 上記一般式 ( 9 ) におい て、 n 2は、 1以上 6以下の整数であれば限定されない。
上記一般式 ( 1 1 ) にて表される構造を有するリ ンカー化合物は、 炭 化水素誘導鎖を 1鎖有するものが 2量体を形成したものである。 なお、 上記一般式 C1 1 ) において、 n 1は、 1以上 6以'下の整数であれば限 定されない。 '
上記一般式 ( 7 ). または一般式 ( 8 ) のように、 上記 Xは、 炭素ゃ窒 素等の原子にて、 上記炭化水素誘導鎖を複数結合して分岐構造を形成し ている多分岐型部位である構造を備えているものでもよい。 なお、 上記 Xに複数の炭化水素誘導鎖が含まれる場合は、 すべて同じであることが 好ましいが、 末端に芳香族アミノ基を有していれば、 互いに異なる構造 0
1 9 であってもよい。
以上のように、 本発明のリガンド複合体に含まれる リ ンカ一化合物は 、 タンパク質分析用の支持体に結合可能な硫黄原子と、 オリ ゴ糖鎖等の 糖分子に結合可能なァミノ基とを有している。 従って、 例えば A u— S 結合などの金属—硫黄結合により上記リ ンカ一化合物が、 タンパク質分 析用の支持体上に固定されるので、 上記リ ンカ一化合物を介して、 上記 支持体上に糖分子を強固にかつ簡単に結合させることができる。
また、 上記リ ンカ一化合物は、 多分岐型部位を有していてもよく、 こ の場合該多分岐型部位の各末端に芳香族ァミノ基を有している。 そのた め、 上記リ ンカ一化合物に還元末端を有する糖が導入された本発明のリ ガンド複合体を用いることにより、 上記支持体表面によ り効率よく糖分 子を集合化させることができる。
さらに、 上記リ ンカ一化合物は、 タンパク質との非特異的な相互作用 の影響をほぼ無視することができる。 それゆえ、 上記リ ンカ一化合物を 有する本発明のリガンド複合体を用いることによって、 '上記糖とタンパ ク質との相互作用を再現性よく評価することが可能になる。
上記リ ンカー化合物は、 例えば以下に示す製造方法によって製造され る。 つまり、 上記一般式 ( 7 ) 、 ( 8 ) 、 ( 9 ) または ( 1 0 ) にて表 されるリンガー化合物は、 チォク ト酸と、 芳香族アミノ基末端が保護基 によって保護されたァミン化合物との縮合反応を行い、 上記芳香族アミ ノ基末端の保護基を脱保護することによって製造される。 また、 上記一 般式 ( 1 1 ) にて表されるリ ンカ一化合物は、 γ—メルカプト酪酸の 2 量体と、 2分子の芳香族アミノ基末端が保護基によって保護されたアミ ン化合物との縮合反応を行い、 上記芳香族ァミノ基末端の保護基を脱保 護することによって製造される。 · 上記チォク ト酸は、 下記一般式 ( 1 5 )
Figure imgf000022_0001
にて表される構造を備えている。
また、 上記アミン化合物は、 保護基によって保護された芳香族ァミノ 基末端を有するものであれば特に限定さ.れるものではない。
上記保護基とは、 芳香族アミノ基のアミノ基が'上記縮合反応によって 反応しないように導入される置換基である。 このような保護基は、 特に 限定されるものではないが、 例えば、 t—ブトキシカルポュル基 (一 C O O C (CH3) 3基 ; B o c基と記載する) 、 ベンジル基、 ァリルカ ルバメート基 (一 CO O CH2CH= CH2、 A 1 1 o c基) 等を挙げ ることができる。
上記ァミン化合物としては、 例えば、 下記一般式 ( 1 6 )
Figure imgf000022_0002
) にて表される構造を備えている第 1級アミン化合物を挙げることができ る。 なお、 上記一般式 ( 1 6 ) 中の!!!1〜 XII 3は、 それぞれ独立して、 2
0以上 6以下の整数であり、 n 1は 1以上 6'以下の整数である。 この一 般式 ( 1 6 ) にて表されるァミン化合物と、 チォク ト酸との縮合反応、 および、 その後に行われる芳香族ァミノ基末端の保護基を脱保護によつ て得られるリ ンカ一化合物は、 上記一般式 ( 7 ) にて表されるリ ンカ一 化合物である。
! また、 上記アミン化合物の他の例と しては、 例えば、 下記一般式 ( 1 7
— (CH2)n1— ΝΗ2 ·'··(17)
Figure imgf000023_0001
にて表される構造を備えている第 2級ァミン化合物を挙げることができ る。 なお、 上記一般式 ( 1 7) 中の m4, m5は、 それぞれ独立して、 0以上 6以下の整数であり、 n 1は 1以上 6以下の整数である。 この一 般式 ( 1 7 )' にて表されるァミン化合物と、 チォク ト酸との縮合反応、. および、 その後に行われる芳香族ァミノ基末端の保護基を脱保護によつ て得られるリ ンカ一化合物は、 上記一般式 ( 8 ) にて表されるリンカ一 化合物である。 これらのァミン化合物の合成方法については、 後の実施 例にて詳述する。
上記チォク ト酸または γ —メルカプト酪酸とァミ ン化合物との縮合反 応によ り、 チォタ ト酸またはツ ーメルカプト酪酸のカルボキシル基 (一 C O OH基) と、 ァミン化合物のアミノ基 (一 NH2基) とが縮合して 、 アミ ド結合が形成される。 その後、 芳香族ァミノ基末端の保護基を脱 保護して、 保護基を取り外し、 芳香族ァミノ基にすることによって、 上 記したリ ンカー化合物を得ることができる。
本発明のリガンド複合体は、 上述のようにして作製されたリ ンカー化 合物に、 還元末端を有するマルトースゃラク トースなどのオリ ゴ糖が導 入されたものである。 本発明のリガンド複合体として具体的には、 以下 に示すものを拳げることができる。
1番 '目のリガンド複合体は、 上記一般式 ( 1 2) にて表される構造に おいて、 上記 Xと して上記一般式 ( 2 ) にて表される構造を備え、 R' が水素 (H) であり、 Rに下記式 ( 1 8 )
Figure imgf000024_0001
にて表される構造を有するマル トースを導入してなるものである。
2番目のリガンド複合体は、 上記一般式 ( 1 2) にて表される構造に おいて、 上記 Xと して上記一般式 ( 2 ) にて表される構造を備え、 R' が水素 (H) であり、 Rに下記式 ( 1 9 ) ..
Figure imgf000024_0002
こて表される構造を有するラク トースを導入してなるものである この 1, 2番目のリガンド複合体は、 3鎖の炭化水素誘導鎖を有して いるリ ンカー化合物にオリ ゴ糖がそれぞれ 1個導入されているので、 末 端に 3単位のオリ ゴ糠を有している。 言い方を換えれば、 上記 1番目の リガンド複合体は、 末端に 3単位の α—ダルコビラノースを有しており 、 上記 2番目のリガンド複合体は、 末端に 3単位の j8—ガラク トビラノ ースを有している。 なお、 上記一般式 ( 2 ) において、 !!!1〜!!!3は、 0 以上 6以下の整数であれば限定されず、 互いに異なる整数であってもよ く、 一部あるいは全てが同じ整数であってもよい。 また、 上記一般式 (
1 2 ) において、 n 1は 1以上 6以下の整数であれば特に限定されない 。
また、 3番目のリガンド複合体は、 上記一般式 ( 1 2 ) にて表される 構造において、 上記 Xとして上記一般式 ( 3 ) にて表される構造を備え 、 R'が水素 (H) であり、 Rに上記式 ( 1 8 ) にて表される構造を有 するマルトースを導入してなるものである。
4番目のリガンド複合体は、 上記一般式 ( 1 2 ) にて表される構造に おいて、 上記 Xと して上記一般式 ( 3 ) にて表される構造を備え、 R' が水素 (H) であり、 Rに上記式 ( 1 9 ) にて表される構造を有するラ ク トースを導入してなるものである。
この 3 , 4'番目のリガンド複合体は、 2鎖の炭化水素誘導鎖を有して いるリンカ一化合物にオリ ゴ糖がそれぞれ 1個導入されているので、 末 端に 2単位のオリ ゴ糖を有している。 言い方を換えれば、 上記 3番目の .リガンド複合体は、 末端に 2単位の α—ダルコビラノースを有しており 、 上記 4番目のリガンド複合体は、 末端に 2単位の β —ガラク トビラノ ースを有している。 なお、 上記一般式 ( 3 ) において、 m4, m5は、 0以上 6以下の整数であれば限定されず、 互いに異なる整数であっても よく、 一部あるいは全てが同じ整数であってもよい。 また、 上記一般式 ( 1 2) において、 n 1は 1以上 6以下の整薮であれば特に限定されな レヽ o
5番目のリガンド複合体は、'上記一般式 ( 1 3 ) にて表される構造に おいて、 上記 Xとして上記一般式 ( 4 ) にて表される構造を備え、 R'. が水素 (H) であり、 Rにグルコースを導入してなるものである。 なお 、 上記一般式 ( 1 3 ) において、 n 2は 1以上 6以下の整数であれば特 に限定されない。
6番目のリガンド複合体は、 上記一般式 ( 1 3 ) にて表される構造に おいて、 上記 Xとして上記一般式 (4) にて表される構造を備え、 R' が水素 (H) であり、 Rにマルトースを導入してなるものである。 なお 、 上記一般式 ( 1 3 ) において、 n 2は 1以上 6以下の整数であれば特 に限定されない。
7番目のリガンド複合体は、 上記一般式 ( 1 4 ) にて表される構造に おいて、 上記 Xとして上記一般式 (4) にて表される構造を備え、 R' が水素 (H) であり、 Rにグルコースを導入してなるものである。 なお 、 上記一般式 ( 1 4) において、 n 1は 1以上 6以下の整数であれば特 に限定されない。
8番目のリ'ガンド複合体は、 上記一般式 ( 1 4 ) にて表される構造に おいて、 上記 Xと して上記一般式 ( 4 ) にて表される構造を備え、 R' が水素 (H) であり、 Rにマルトースを導入してなるものである。 なお 、 上記一般式 ( 1 4) において、 n 1は 1以上 6以下の整数であれば特 に限定されない。
さらに、 上記一般式 ( 9 ) にて表される構造を備えているリ ンカ一化 合物に、 下記群 ( 2 0 )
Figure imgf000027_0001
Figure imgf000027_0002
に示される 1 7種類の糖鎖をそれぞれ導入した 1 7種類のリガンド複合 体が、 本発明のリガンド複合体の^ r体例に挙げられる。 上記のリガンド複合体は、 いずれもリンカー化合物と糖分子とを含ん でなつているので、 リ ンカ一化合物内の S— S結合にて、 タンパク質分 析用の支持体表面の金属と、 金属一硫黄 (S ) 結合、 .例えば金一硫黄 ( A u - S ) 結合により結合する'ことができる。 これにより、 この A u— S結合を介して、 上記支持体表面に糖分子を集合化して固定化されてな るリガンド担持体を提供することができる。 上記支持体表面の金属と し ては、 上記 A uの他、 C u、 A g、 P t等の金属を用いることができる が、 特に A uを用いることが好ましい。
また、.上記各リガンド複合体は、 後述の実施例に示されるよ うに、 タ ンパク質と異なる相互作用を示すことが確認された。 それゆえ、 未知タ ンパク質の同定に有効に利用することができると考えられる。
なお、 本発明のリガンド複合体に導入されている上記オリ ゴ糖は、 同 一の単糖分子からなる単一オリ ゴ糖であってもよいし、 種々の単糖分子 やその誘導体からなる複合糖質であってもよい。 また、 上記オリ ゴ糖は 、 いずれも、 自然界から単離 ' 精製して得られる種々の天然の糖であつ てもよく、 人工的に合成された糖であってもよい。 また、 上記オリ ゴ糖 は、 多糖を分解して得られたものであってもよい。
また、 上述のような本発明のリガンド複合体を、 表面に金属を有する 支持体に金属一硫黄結合を介して固定化させてなるリガン.ド担持体も本 発明に含まれる。 このリガンド担持体はタンパク質分析の用途に限定さ れず、 糠分子との相互作用を調べるために、 タンパク質以外の物質の分 析用と して用いることもできる。
上記リガンド担持体は、 該リガンド複合体を含むリガンド複合体溶液 と表面に金属膜を有する支持体とを接触させることにより、 リガンド複 合体の S— S結合の各 S原子が、 支持体表面の金属と金属—硫黄結合に よって結合して、 支持体表面に上記リガンド複合体が導入される。 具体 的には、 上記リガンド複合体溶液に、 タンパク質分析用の支持体を所定 時間浸漬する、 あるいは、 上記支持体にリガンド複合体溶液を注入する (支持体表面にリガンド複合体溶液を流す) ことによって、 上記リガン ド複合体 (リガンド複合体に含まれるリ ンカ一化合物) の S— S結合を 、 上記支持体表面の金等との A u— S結合に変換して、 支持体表面に上 記リガンド複合体を固定することができる。
リガンド複合体溶液に用いる溶媒と しては、 特に限定されるものでは ないが、 例えば、 メタノール、 水、 ジメチルァセ トアミ ド ( D M A c ) や、 これらの混合溶媒等を挙げることができる。 また、 浸漬時間は、 0 . 5時間〜 1 2時間程度であればよく、 注入濃度は、 1 μ Μ〜 1 πι Μ程 度であればよい。
このように、 本発明のリガンド複合体は、 S— S結合を有しているの で、 タンパク質分析用の支持体表面に簡単に固定化することができ、 上 記支持体上に糖分子を簡単に導入することができる。
本発明のリガンド担持体は、 糖分子と、 例えばタンパク質等の他の物 質との相互作用の分析に、 利用可能である。 具体的には、 上記リガンド 担持体は、 S P R測定、 ァフィ二ティクロマ トグラフィー等に適用する ことができる。
例えば、 タンパク質分析と して、 S P R測定を行うには、 以下のよ う にすればよい。 すなわち、 金薄膜等の金属薄膜を蒸着した支持体に、 本 発明のリガンド複合体を固定化してなるリガンド担持体を用い、 該リガ ンド担持体とタンパク質とを接触させ、 常法に従って、 表面プラズモン 共鳴装置を用いて共鳴角度を測定すれば、 該リガンド担持体とタンパク 質との結合挙動を観測することができる。 なお、 S P R測定に用いる上 記支持体 (センサチップ) としては、 例えば、 .ガラス、 プラスチック等 を用いることができ、 特にガラスが好適に用いられる。 また、 リガンド 担持体とタンパク質の接触は、 例えば、'タンパク質をランニングバッフ ァ一に溶解した溶液を、 該リガンド担持体の表面に流入することにより 行えばよい。 このランニングバッファ一としては、 例えば、 リ ン酸緩衝 溶液等を挙げることができる。
また、 本発明のリガンド担持体は、 後述の実施例に示されるように、 各々のタンパク質と異なる相互作用を示すことが確認されているため、 タンパク質の同定に利用することができる。 つまり、 本発明のリガンド 担持体を用いて未知タンパク質の分析を行うことによって、 そのタンパ ク質が糖結合性タンパク質であるか否か、 また、 そのタンパク質がどの 種のタンパク質であるかを容易に判定することができる。 なお、 上記の リガンド複合体をそれぞれ固定化したリガンド担持体のうち、 少なく と も 2種類を一組のセッ トと して含むチップセッ トを作製すれば、 より簡 便にタンパク質 (特に、 糖鎖結合性のタンパク質). の同定を行う ことが できるため有用である。
• ここで、 本発明のリガンド担持体の利用方法について説明する。 本発 明のリガンド担持体は、 分子間相互作用の測定 (例えば、 以下のよ うな S P R測定)'にセンサチップとして使用することができる。 すなわち、 第 1のリガンド複合体が支持体表面に固定化されてなる第 1 のセンサチ ップと、 上記第 1のリガンド複合体とは種類の異なる第 2のリガンド複 合体が支持体表面に固定化されてなる第 2のセンサチップとを用いて、 第 1のセンサチップを用いて得られた S P R測定の検出結果と、 第 2の センサチップを用いて得られた S P R測定の検出結果との差を検出し、 糖分子の相互作用を観測することができる。 これらのセンサチップには、 固定化される糖分子が異なっているリガ ンド複合体、 あるいは、 固定化されている糖分子は同じであるがリ ンカ 一化合物の部分が異なっているリガンド複合体を用いればよい。 この種 類の異なるリガンド複合体と しては、 例えば上述の各リガンド複合体を 挙げることができる。 そして、 上記のリガンド複合体のうちから、 リ ン カー化合物部分は同じ構造を有しているが、 オリ ゴ糖の部分が異なる構 造を有するもの (例えば、 上記 1番目のリガンド複合体と 2番目のリガ ンド複合体のセッ ト、 あるいは、 上記 3番目のリガンド複合体と 4番目 のリガンド複合体とのセッ ト) を選択することが好ましい。
上記 S P R測定では、 第 1のセンサチップの糖分子に特異的に作用す るタンパク質等を用いて、 測定条件を一定にして、 上記 2つのセンサチ ップに作用させ、 両者の共鳴角度を観測する。 この両者の共鳴角度の差 を検出することで、 糠分子とタンパク質等との特異的な相互作用と して 測定することができる。
また、 糖分子との相互作用を観測する物質は、 タンパク質に限定はさ れない。
上記では、 2つの種類のセンサチップを同時に測定したが、 これに限 定されることはなく、 2種類以上のセンサチップを測定してもかまわな いし、 同時に測定しなくてもかまわない。 また、 少なく とも 1つのセン サチップに糖分子を導入していないものを用いてもよい。 例えば、 リ ン カー化合物のみを固定化したものを用いてもよい。
. 上記のような S P R測定を行う と、 糠分子以外は同じ構造のリガンド 複合体を有する少なく とも 2つのセンサチップを用いて、 測定をするこ とができるため、 少なく とも 2つのセンサチップ相互作用の差は、 糖分 子に起因したものと して観測される。 従って、 上記測定方法を用いれば 、 糖分子以外の部分と、 他の物質との非特異的な相互作用を低減させ、 糖分子と他の物質との特異的な相互作用を観測することができる。
また、 糖分子は同じであって、 リ ンカ一化合物部分の構造が異なるリ ガンド複合体が固定化された 2'種類のセンサチップを用いて上記のよう な S P R測定を行ってもよい。 この場合は、 センサチップ上の糠分子の 集合化度の違いによるタンパク質の結合挙動を測定することができる。 このようなセンサチップのセッ トの例と しては、 上記 1番目のリガンド 複合体と 3番目のリガンド複合体とのセッ トを挙げることができる。
さらに、 上述の S P R測定によつて糖分子と他の物質との特異的な相 互作用を確認した後に、 S P R測定に使用したタンパク質の結合したリ ガンド担持体をそのまま質量分析にかければ、 センサチップと結合した タンパク質を同定することができる。 上記質量分析は、 マ ト リ ックス支 援型レーザ脱離 Z飛行時間型質量分析計 (M A L D I - T O F /M S ) などの従来公知の質量分析計を使用し、 従来公知の方法に従って実施す ればよい。
上述したような手順を用いれば、 本発明のリガンド複合体を用いてタ ンパク質の分析を行うことができる。 つまり、 本発明のタンパク質の分 析方法は、 上記の本発明のリガンド複合体を、 表面に金属を有する支持 体と接触させることによって、 当該リガンド複合体を支持体上に固定化 させたリガンド担持体を作成する工程と、 上記リガンド担持体を分析対 象となるタンパク質を含む溶液と接触させて相互作用させた後、 例えば .S P Rのような分子間相互作用の測定を行う工程と、 上記分子間相互作 用測定の後に質量分析を行って、 上記リガンド担持体に結合しているタ ンパク質を同定する工程とからなるものである。
このタンパク質の分析方法においては、 上述したよ うに、 種類の異な るリガンド複合体が固定化された 2.種類以上のリガンド担持体を用いて それぞれタンパク質の分析を行って、 それぞれの結果を比較検討し各タ ンパク質の特性を解析することができる。
ぐ実施例 >
以下、 本発明のリガンド複合体の合成についてより詳細に説明する。 また、 本実施例では、 合成したリガンド複合体を用いて S P R測定と質 量分析を行い、 タンパク質の分析を行った。 それについても併せて説明 する。
. 〔実施例 1 : リガンド複合体 (化合物 1〜 4 ) の合成〕
本実施例では、 実施の形態において説明した 1〜 4番目のリガンド複 合体にそれぞれ分類される 4個のリガンド複合体を合成した。
( 1 ) 1番目のリガンド複合体 (化合物 1 ) の合成
上記 1番目のリガンド複合体の一つである、 上記一般式 ( 1 2 ) にて 表される構造において、 n 1が 1であり、 Xが一般式 ( 2 ) にて表され る構造を備え、 R'が水素 (H) であり、 Rに上記式 ( 1 8 ) で表され るマルトースが導入され、 m1, m2, m3が 2である構造を有するリガ ンド複合体 (化合物 1 ) を以下の手順で合成した。
上記リガンド複合体 (化合物 1 ) の合成の前段階と して、 まず、 芳香 族アミノ基末端が保護基によって保護された分岐鎖を 3鎖有するリ ンカ —化合物 Aの合成を行った。
先ず、 下記式 ( 2 1 ) に示すように、 6 5 °C— 7 0 °Cのジメ トキシェ タン中、 水酸化べンジルトリメチルアンモニゥムの存在下にて、 ニトロ メタン (化合物 5 ) に対し、 3単位の t—ブチルァク リ レート (化合物 6 ) をマイケル付加させ、 9 1 %の収率にて化合物 7を得た。 次いで、 水素雰囲気下 ( e k g Z c m2) 、 5 0 °Cのエタノール中にて、 ラネー P2005/003220
32 ニッケル (Raney Ni) を用いて、 上記化合物 7のニ トロ基を還元して'、 9 8 °/。の収率.にて化合物 8を得た。
その後、 CH2C 12中、 1. 1当量の 1—ヒ ドロキシ一 7—ァザペン ゾトリアゾール (式中、 HOA t ) 、 1. 1 当量の水溶性カルポジイ ミ ド塩酸塩 (式中、 ED C . HC 1 ) の存在下にて、 上記化合物 8に 1. 1当量の Z—グリシンを縮合させ、 8 5 %の収率にて Z—グリシン体 ( 化合物 9 ) を得た。
Figure imgf000034_0001
•(21)
より具体的に説明すれば、 上記化合物 8は、 文献 (G. R. Newkome'b 、 0PPI BRIEFS, 28卷, p.495, 1996) の方法に従って、 まず ニトロメ タン ( 1 2." 2 g, 2 0 0 mm o l ) を 1, 2—ジメ トキシェタン 5 0 mLに溶解して、 6 5— 7 0 °0に加熱し、 4 0 %水酸化ベンジルトリメ チルアンモニゥム一メタノール溶液 ( 2 mL) を加えて、 ニ ト ロメタン 溶液と した。 次いで、 このニトロメタン溶液の温度を 7 5 °Cまで上昇さ せ、 t 一ブチルアタ リ レー ト ( 9 0. 8 m L , 6 2 0 mm o 1 ) をゆつ く り滴下した後、 溶液温度を 7 0— 7 5 °Cに保ちながら、 4 0 %水酸化 ベンジノレトリメチルァンモニゥム一メタノール溶液を 1 m Lずつ 4回に 分けて加えて 2. 5時間攪拌し、 ニ トロメタン/ tーブチルァク リ レー ト反応溶液を得た。 このニ トロメタン/ t一プチルァク リ レート反応溶 液中の不溶物をデカンテーシヨ ンにより'取り除いて濃縮し、 得られた残 渣をジェチルエーテルに溶かして、 氷冷した 1 0 %塩酸水溶液、 飽和炭 酸水素ナト リ ゥム水溶液、 及び水で 2回ずつ洗浄して残渣溶液を得た。 その後、 乾燥剤と して無水硫酸ナト リ ウムを用いて、 該残渣溶液を乾燥 させ、 セライ トを用いて該乾燥剤を除去して、 減圧濃縮した後、 濃縮残 渣をエタノールに溶解して再結晶を行い、 化合物 7 ( 8 1. 8 g , 9 1
%) を白色針状結晶として得た。
続いて、 ィ匕合物 7の結晶 ( 1 0 g , 2 2. 4 mm o 1 ) と T— 1 ラネ 一ニッケル ( 6. 0 g ) とを無水エタノール 5 0 m Lに加え、 6 k g Z c m2の水素雰囲気下、 5 0°Cで 2 3時間攪拌した後、 セライ トを用い て T一 1 ラネーニッケルを濾去することによつて得られた化合物 7反応 溶液を減圧濃縮した。 この化合物 7反応溶液の減圧濃縮によって得られ た濃縮残渣を、 シリカゲルクロマトグラフィー (溶媒 : クロ口ホルム/ メタノール = 2 0 / 1 ) で精製し、 化合物 8 (収量 9. 2 g、 収率 9 8 %) を白色固体と して得た。
よ り具体的には、 Z—グリシン ( 1. 2 6 g , 6. 6 2 m o 1 ) と、 HOA t ( 0'· 9 0 g , 6 6 2 mm o 1 ) と、 ED C . HC 1 . ( 1. 2 7 g , 6. 6 2 mm o 1 ) とを無水ジクロロメタン ( 2 8 mL) に溶 かした Z—グリシン溶液に、 0 °Cの温度条件下、 化合物 8 ( 2. 5 0 g , 6. 0 2 mm o 1 ) を無水ジクロロメタン ( 2 mL) に溶かした化合 物 8溶液を加えて、 アルゴン雰囲気下、 室温で 3 6時間攪拌して、 Z— グリ シン Z化合物 8反応溶液を得た。 この Z—ダリシン 化合物 8反応 溶液に、 ジクロロメタンと 1 0 %クェン酸水溶液とを加えてジク ロロメ タンで抽出し、 有機層を水、 飽和炭酸水素ナトリ ウム水溶液、 および水 で 1回ずつ洗浄し、 乾燥剤と して無水硫酸ナト リ ゥムを用いて乾燥させ た後、 該乾燥剤を濾去して減圧濃縮を行 た。 この減圧濃縮によって得 られた濃縮残渣をシリ力ゲルクロマ トグラフィー (溶媒 : ク口口ホルム ) で精製し、 化合物 9 (収量 3. 0 9 g、 収率 8 5 %) を白色固体と し て得た。
得られた上記化合物 9の E S I — M S (positive) 測定 (飛行時間型 質量分析計測定) を行ったところ、 mZ z (質量/電荷比) 6 2 9. 4 [(M+Na).+]であった。 また、 核磁気共鳴 H— NMR、 4 0 0 MH z , C D C 1 a ) 測 を行ったところ、 S 7.37— 7.26 (5H, m, Ph) , 6.43 (1
H, bs, CONHC) , 5.38 (1H, bs, Gly-NH), 5.13 (2H, s, CH2Ph) , 3.78 (2H, d, J = 7.7 Hz, Gly-Ct^), 2.20 (6H, t, J = 7.7 Hz, C(¾CH2) ,
I.96 (6H, t, J = 7.7 Hz, CCH2(¾) , 1.44 (27H, s, CH3)であった。 こ れにより、 化合物 9の構造を確認することができた。 なお、 化合物 9の 分子質量は 6 0 6. 3 5である。
次に、 下記式 ( 2 2 ) にて示すように、 CH s C l aZHs O - l O Z 1 の混合溶媒中にて、 トリフルォロ酢酸 (以下、 T F Aと記載する) を 用いて、 上記化合物 9の t—プトキシカルボニル基 (― C O O C ( C H 3) 3基 ; 式 '( 2 2 ) 中、 t B u ) を脱保護して、 収率 9 5 %にて化合 物 1 0を得た。
その後、 4. 5 当量のペンタフノレオロフェニノレジフエニルホスフエ一 小 (式中、 F D P P) 、 1 1 当量のジイ ソプロピルェチルァミ ン (式中 、 D I P E A) 、 N, N—ジメチルホルムアミ ド (DMF) の存在下に て、 上記化合物 1 0 と B o c基によってアミノ基が保護された m—フエ 二レンジァミ ン誘導体 (化合物 1 1 、 1 0当量) とを縮合させ、 収率 9 9 %にて N— B o cァミ ン誘導体 (化合物 1 2 ) を得た。 続いて、 メ タ ノール (式中、 M e OH) 中、 P d /C (活性炭担持パラジウム) の存 在下にて接触水素還元を行い、 化合物 1 2に縮合した上記 Z—ダリ シン のべンジルォキシカルボニル基 (式中、 Z基) を脱保護して、 収率 7 9 %にて化合物 1 3を得た。
Figure imgf000037_0001
すなわち、 化合物 1 0を得るために、 化合物 9 ( 2. 9 8 g , 4. 9 0 mm 0 1 ) をジク ロ ロメ タン ( 1 5 m L ) に溶かし、 一 1 0 °Cで T F TJP2005/003220
36
A ( 1 5 m L) と水 ( 1. 5 mL) とを加えた後、 室温で 1. 5時間攪 拌して化合物 9反応溶液を得た。 該化合物 9反応溶液を減圧濃縮した後 、 氷浴中で濃縮残渣に p Hが 5になるまで 1 0 %水酸化ナト リ ウム水溶 液を加え、 さらに p Hが 2になるまで濃塩酸を加えて、 白色固体を析出 させた。 得られた白色固体を水で洗浄し、 化合物 1 0 (収量 2. 0 4 g 、 収率 9 5 %) を白色固体と して得た。
得られた上記化合物 1 0の E S I — M S (negative) 測定を行ったと ころ、 m/ z 4 3 7. 1 [(M- H)-]であった。 また、 核磁気共鳴 — NMR、. 4 0 0 MH z , d 6— D M S O ) 測定を行ったところ、 δ 7.34 - 7.30 (6H, m, Ph, CONHC) , 7.15 (1H, s, Gly-NH) , 5.01 (2H, s, (¾P h), 3.55 (2H, d, J = 5.9 Hz, Gly-CIL), 3.33 (3H, brs, C02H) , 2.1 1 (6H, m, CCH2CH2) , 1.81 (6H, m,
Figure imgf000038_0001
であった。 これらにより、 化合物 1 0の構造を確認することができた。 なお、 化合物 1 0の分子質 量は 4 3 8. 1 6である。
また、 化合物 1 1 を得るために、 m—フエ二レンジァミン ( 0. 5 0 g , 4. 6 2 mm o 1 ) をメタノール ( 3 5 mL) に溶かし、 0 °Cで ( B o c ) 2O ( 1. 0 6 m L , 4. 6 2 m m o 1 ) と ト リエチルァミン
( 0. 6 5 m L , 4. 6 5 mm o 1 ) とを加えた後、 室温で 24時間攪 拌して、 減圧'濃縮を行った。 該減圧濃縮によって得られた濃縮残渣をシ リカゲルクロマ トグラフィー (溶媒 : クロ口ホルム Zアセ トン = 1 0 Z 1 ) で精製し、 化合物 1 1 (収量6 6 5 111 §、 収率 6 8 %) を白色固体 と して得た。
上記化合物 1 1の. E S I — M S (positive) 測定を行ったところ、 m / z 2 3 1. 2〔(M+Na)+]であった。 また、 ifi— NMR (4 0 0 MH z , C D C 13) 測定を行ったところ、 S 7.02 (1H, t, J = 8.0 Hz, arom atic), 6.95 (1H, bs, aromatic), 6.54 (1H, dd, J = 2.0 Hz, J = 8. 0 Hz, aromatic), 6.41 (1H, bs, CONH) , 6.35 (1H, dd, J = 2.2 Hz, J = 7.9 Hz, aromatic), 3.66 (2H, bs, Ni^) , 1.50 (9H, s, t - butyl) であった。 これらにより、 化合物 1 1の構造を確認することができた。 なお、 化合物 1 1 の分子質量は 2 0 8. 1 2である。
また、 化合物 1 2を得るために、 上記化合物 1 0 ( l O O m g , 2 2 8 μ m 0 1 ) 、 上記化合物 1 1 (4 7 5 m g , 2. 2 8 mm o 1 ) 、 F D P P ( 3 9 4 m g , 1. O 3 mm o l ) 、 及びジイ ソプロピルェチル ァミ ン .( 4 4 7 L, 2. 5 7 mm o l ) を無水ジメチルホルムアミ ド ( 2 m L ) に溶かし、 アルゴン雰囲気下で、 室温で 2 9時間攪拌した後 、 酢酸ェチル及び水を加えて酢酸ェチルで抽出し、 有機層を 0. 5 N塩 酸、 水、 飽和炭酸水素ナトリ ウム水溶液、 及び飽和食塩水で 1回ずつ洗 浄して、 乾燥剤として無水硫酸ナト リ ウムを用いて乾燥させて、 乾燥反 応溶液を得た。 得られた乾燥反応溶液から、 乾燥剤を濾去して減圧濃縮 し、 濃縮残渣をシリカゲルクロマ トグラフィー (溶媒 : クロ口ホルム Z アセ トン = 3 / 1 ) で精製し、 化合物 1 2 (収量 2 2 8 m g、 収率 9 9 %) を白色固体と して得た。
上記化合物 1 2の E S I — M S (positive) 測定を行ったところ z 1 0 0 9ノ 5 [ (M+H) +]であった。 また、 1H— NMR ( 4 0 0 MH z , C D C 13) 測定を行ったところ、 δ 8.75 (3Η, s, NHC02tBu) , 7.67 (3Η, s, CONHPh) , 7.30-6.95 (15H, m, aromatic, CH2C0NH) , 6.52 (1H , bs, Gly-NH), 5.04 (2H, s, Cl^Ph) , 3.71 (2H, d, J = 5.0 Hz, Gl y-CH2) , 2.23 (6H, m, Ci^C^CO) , 1.97 (6H, m, Cl^C^CO), 1.47 (27H , s, t - butyl)であった。 これらにより、 化合物 1 2の構造を確認する ことができた。 なお、 化合物 1 2の分子質量は 1 0 0 8. 5 0である。 また、 化合物 1 3は、 具体的には次のようにして得た。 すなわち、 化 合物 1 2 ( 2 0 0 m g , 1 9 8 μ m o 1 ) をメタノール ( 3 m L ) に溶 解し、 1 0 % P d / C ( 6 2 . 3 m g ) を加え、 水素雰囲気下、 室温で 1 5時間攪拌した後、 上記 P d'Z Cを濾去して、 減圧濃縮を行った。 該 減圧濃縮によって得られた濃縮残渣をシリ カゲルクロマ トグラフィー ( 溶媒 : クロ口ホルム/メタノール = 8 / 1 ) で精製して、 化合物 1 3 ( 収量 1 3 6 m g、 収率 7 8 %) を白色固体と して得た。
上記化合物 1 3 の E S I — M S (positive) 測定を行ったところ、 m / z 8 7 5 . 5【(M+H)+]であった。 また、 — NMR ( 4 0 0 MH z , C D C 1 3) 測定を行ったところ、 S 9.00 (3H, s, NHC02tBu) , 7.57 (2Η, s, Hs) , 7.35 (1H, bs, Gly-NH) , 7. 14-7.00 (15H, m, aromatic , CH2C0NH) , 3.21 (2H, s, Gly-(¾), 2.26 (6H, m, (¾CH2C0), 2.04 ( 6H, m,
Figure imgf000040_0001
1. 5 (27H, s, t— butyl)であった。 これらにより、 化合物 1 3 の構造を確認することができた。 なお、 化合物 1 3 の分子質 量は 8 7 4 . 4 6である。
さらに、 下記式 ( 2 3 ) にて示すように、 1 . 0当量の E D C ' H C 1、 1 . 0当量の 1 —ヒ ドロキシベンゾトリアゾール (式 ( 2 3 ) 中、 H O B t ) 、 C H 2 C 1 2中、 上記化合物 1 3を、 1 . 0当量のチォク ト酸 (化合物' 1 4 ) と縮合させ、 収率 7 5 %にてチォタ ト酸誘導体 (化 合物 1 5 ) を得た。
上記にて得られた化合物 1 5を、 C H 2 C 1 2中、 トリメチルシリル クロリ ド (式中、 TM S C 1 ) 、 フエノール (P h O H) の存在する酸 性条件下にて、 上記 B o c基を脱保護し、 芳香族ァミ ノ基を有する炭化 水素誘導鎖を 3鎖含んでなる リ ンカ一化合物と して、 化合物 Aを得た ( 収率 3 2 %) 。
Figure imgf000041_0001
Figure imgf000041_0002
具体的に、 化合物 1 5および化合物 Aを得るために以下の操作を行つ た。
すなわち、 ィヒ合物 1 5を得るために、 化合物 1 4 ( 2 3. 6 m g , 1 1 4 m o 1 ) と HO B t ( 1 5. 4 m g , 1 1 4 m m o 1 ) を無水ジク ロロメタン ( 2. 3 m L).に溶解し、 0 °Cの温度条件下、 化合物 1 3 ( 2. 5 0 m g , 6. 0 2 mm o l ) を加えて、 アルゴン雰囲気下で、 遮 光して室温で' 3 6時間攪拌した後、 1 0 %クェン酸水溶液とを加えてか らクロロホルムで抽出し、 有機層を飽和炭酸水素ナト リ ゥム水溶液で洗 浄し、 乾燥剤として無水硫酸ナトリ ウムを用いて乾燥させた。 その後、 該乾燥剤を濾去して減圧濃縮し、 濃縮残渣をシリ力ゲルク口マ トグラフ ィ一 (溶媒 : クロ口ホルム/メタノール = 4 O Z 1 ) で精製して、 ィ匕合 物 1 5 (収量 9 1 . O m g、 収率 7 5 %) を白色固体と して得た。
上記化合物 1 5の E S I — MS (positive) 測定を行ったところ、 m / z 1 0 8 5. 5 〔(M+H)+]であった。 また、 1H— NMR (4 0 0 MH z , C D3C 1 ) 測定を行ったところ、 S 9.01 (3H, bs, NHC02tBu) , 7. 67 (3H,. s, CONHPh), 7.31 (1H, bs, CONHCH,) , 7.27-7.00 (12H, m, a romatic), 3.71 (2H, bs, Gly - (¾), 3.64-3.39 (1H, m, SSCH) , 3.12- 2.99 (2H, m, (¾SS) , 2.33 (1H, m, Cj^CH2SS), 2.32 (6H, m, CCH^CH, CO), 2.20 (2H, m, (¾C0NHCH2), 2.04 (6H, m, CCHsCH^O) , 1.82-1.73 (1H, m, CH2CH2SS), 1.62-1.47 (4H, m, Ci^ (CH2) 2C0NH, (CH2) ^i^CH^O NH), 1. 7 (27H, s, t— butyl), 1.39—1.25 (2H, ra, CH2C^ (CH2) 2C0NH) であった。 これらにより、 化合物 1 5の構造を確認することができた。 なお、 化合物 1 5の分子質量は 1 0 6 2. 4 9である。
また、 化合物 Aを得るために、 ト リメチルシリルクロリ ド ( 0. 2 5 m L , 2. 6 4 mm o 1 ) をジクロロメタン ( 0. 4 9 m L) に溶角?し 、 フエノーノレ' ( 5 4 9 m g, 5. 8 3 mm o 1 ) をジクロロメタン ( 1 - 4 6 Hi L ) に溶解したフエノール溶液を加えて攪拌した後、 さらに、 化合物 1 5 ( 3 4. 7 m g , 3 2. 6 m o 1 ) を加え、 室温で、 遮光 下 1. 5時間攪拌して、 化合物 1 5反応溶液を得た。 続いて、 該化合物 1 5反応溶液にクロ口ホルムを加え、 有機層を飽和炭酸水素ナトリ ウム 水溶液で洗浄して、 黄色固体を析出させた。 析出した黄色固体を酢酸に 溶解して 4 °Cまで冷却し、 凝集した固体を濾別して、 化合物 A (収量 7 . 9 m g、 収率 3 2 %) を白色固体と して得た。
上記化合物 Aの E S I — M S (positive) 測定を行ったところ、 πιΖ z 7 6 3. 6 〔(M+H)+]であった。 また、 ェ:¾一 NMR (4 0 0 MH ζ , C D C 1 a ) 測定を行ったところ、 59.57 (3H, m, CONHPh) , 7.97 (1Η , m, C0NHCH2) , 6.87 (6H, m, aromatic) , 6.67 (3H, d, J = 7.7 Hz, a romatic) , 6.21 (3H, d, J = 7.7 Hz, aromatic) , 4.98 (6H, bs, NH2) , 3.67 (2H, d, J = 5.1 Hz, Gly - (¾), 3.56 (1H, m, SSCH), 3.16-3. 04 (2H, m, C SS) , 2.36 (1H, m, CH2CH2SS), 2.25 (6H, m, CCH2CH2C0 ), 2.19-2.07 (2H, m,
Figure imgf000043_0001
, 1.93 (6H, m, C(¾CH2C0), 1.8 3 (1H, m,
Figure imgf000043_0002
, 1.33 (2H, m, < ( (CH2) 2C0NH)であった。 これらによ り、 化合物 Aの 構造を確認することができた。 なお、 化合物 Aの分子質量は 7 6 2. 3 3である。
続いて、 このよ うに得られたリ ンカ一化合物 Aを用いて、 上記一般式 ( 1 2 ) にて表される構造において、 n 1が 1であり、 Xが一般式 ( 2 ) にて表され、 m1, m2, m3が 2である構造を有するリガンド複合体 (化合物 1 ) を下記式 ( 2 4) の手順にて合成した。
Figure imgf000044_0001
ALDI-TOF/MS Exact Mass: 1740.70
m/z; 1764.41IM+Na]+ 式 ( 24) に示すように、 得られたリンカ一化合物 Aと、 上記式 ( 1 8 ) にて表されるオリ ゴ糖である市販のマルトース水和物 (4. 5当量 ) とを、 H20/ジメチルァセトアミ ド '(式中、 D.MA c ) Z酢酸 ( A c OH) = 1 / 1 / 0. 1の混合溶媒に溶解し、 ρ Η 4〜4 · 5、 3 7 °Cにて、 シッフ塩基を形成させた後、'溶媒に A c OHを加え、 1 0当量 の 9 5 %N a BH3CNを加えて、 p H 3 ~4. 5、 3 7 °Cにて、 還元 アミノ化反応を行った。 その後、 得られた化合物を Sephadex G - 50 (ァ マーシャム イォシステムズ社製) を用いて、 ゲル濾過クロマトグラフ ィ一により精製し、 さらに脱塩処理を行って、 末端にひ一ダルコピラノ ースを 3単位含んでなるリガンド複合体と して化合物 1を得た。 上記化 合物 1の同定は、 MA L D I — T O F/M Sおよび NMRによって行つ た。
M A L D I — T O F /M Sの結果は、 mZ z ; 1764.41 [ (M+Na) +]であ つた。 また1 H— NMRスペク トル ( 6 0 0 M H z、 D 2 O) 測定を行ったと ころ、 S 7.01 (3H, dd, J = 8.2, 8.2 Hz, aromatic) , 6.70 (3H, s, a romatic), 6.58 (3H, d, J = 8.2 Hz, aromatic) , 6.44 (3H, d, J = 8 .2 Hz, aromatic), 4.90 (3H, d, J = 3.4 Hz, H - X3), 3.79-3.73 (6H, m, H - 2X3, H - 5X3), 3.71— 3.66 (6H, m, H-3X3, H- 5, X3), 3.64 (3H, dd, J = 2.1, 12.4 Hz, H - 6a, X3), 3.59 (3H, dd, J = 4. 8, 12.4 Hz, H - 6b' X 3), 3.59— 3.52 (3H, m, H- 6aX3), 3.54—3.51 (6H, m, H - 4X3, H - 3, X3), 3.43 (3H, dd, J = 6.9, 12.4 Hz, H - 6b X 3), 3.39— 3.34 (1H, m, CH2CH(CH2-) (S-) ) , 3.37 (3H, dd, J = 3.4 , 9.6 Hz, H-2' X3), 3.25 (3H, dd, J = 9.6, 9.6 Hz, H- 4, X 3) , 3 .11 (3H, dd, J = 4.8, 13.7 Hz, H— laX3), 3.01 (3H, dd, J = 7.7, 13.7 Hz, H-lbX3), 2.98- 2.86 (2H, m, -SCl^-) , 2.27— 2.23 (6H, m , -CH,CH9C0-X3) , 2.19-2.14 (1H, m, - SCH,CH9 (1H) -), 2.10 (2H, ΐ, J = 7.6 Hz, -NHC0CH?CH,-) , 1.98- 1.94 (6H, m, -CH CH,C0- X 3) , 1. 72- 1.65 (1H, m, -SCH.CH, (1H) -) , 1.43— 1.36 (2H, m, - COCH9CH。CH。C H2 -), 1.39— 1.29 (2H, m, -COCH2CH2CH2CH2-) , 1.19—1.13 (2H, m, -C 0CH2CH2ei2CH2- )であった。 これらの結果から化合物 1の構造を確認する ことができた。 なお、 この化合物 1の分子質量は 1 7 4 0. 7 0である
( 2 ) 2番目のリガンド複合体 (化合物 2 ) の合成
上記 2番目のリガンド複合体の一つである、 上記一般式 ( 1 2 ) にて 表される構造において、 n 1が 1であり、 Xが一般式 ( 2 ) にて表され る構造を備え、 R'が水素 (H) であり、 Rに上記式 ( 1 9 ) で表され るラタ トースが導入され、 m1 , m2, m3が 2である構造を有するリガ ンド複合体 (化合物 2 ) を以下の手順で合成した。
上記リガンド複合体 (化合物 2 ) の合成においては、 まず、 リ ンカ一 化合物 Aを、 上述の 1番目のリガンド複合体の合成における手順と同じ 手順で合成した。
続いて、 得られたリ ンカー化合物 Aを用いて、 上記一般式 ( 1 2 ) に て表される構造において、 n 1が 1であり、 Xが一般式 ( 2 ) にて表さ れる構造を備え、 R'が水素 (H) であり、 Rに上記式 ( 1 9 ) で表さ れるラタ トースが導入され、 m 1 , m2, m3が 2である構造を有するリ ガンド複合体 (化合物 2) を下記式 ( 2 5 ) の手順にて合成した。
Figure imgf000046_0001
MALDI-TOF/MS Exact Mass: 1740.70
mfe; 176B.92[M+Na]+ " 式 ( 2 5 )"に示すように、 上記の方法で得られたリ ンカー化合物 Aと 、 上記式 ( 1 9 ) にて表されるオリ ゴ糖である市販のラタ トース水和物
(4. 5当 *) とを、 H2〇ノジメチルァセ トアミ ド (式中、 DMA c ) Z酢酸 (A c OH) = 1 / 1 / 0. 1の混合溶媒に溶解し、 p H 4〜 4. 5、 3 7°Cにて、 シッフ塩基を形成させた後、 溶媒に A c OHを加 え、 1 0当量の 9 5 %N a B H3C Nを加えて、 p H 3〜4. 5、 3 7 °Cにて、 還元アミノ化反応を行った。 その後、 得られた化合物を Sephad ex G-50 (アマ一シャムバイオシステムズ社製) を用いて、 ゲル濾過ク 口マ トグラフィ一により精製し、 さらに脱塩処理を行って、 末端に /3 — ガラク トピラノースを 3単位含んでなるリガンド複合体と して化合物 2 を得た。 上記化合物 2の同定は、 M A L D I — T O F ZM Sおよび NM Rによって行った。
M A L D I - T O F/M Sの結果は、 m / z 1766.92 [ (M+Na) +]であつ た。 また NMRスベク トル ( 6 0 0 M H z、 D 2 O) 測定を行ったとこ ろ、 δ 6.99 (3Η, dd, J = 7.9, 8, 2 Hz, aromatic), 6.70 (s, 3H, aro matic),- 6.61 (3H, d, J = 7.9 Hz, aromatic), 6.43 (3H, d, J = 8.2 Hz, aromatic), 4.27 (3H, d, J = 7.6 Hz, Η- X3), 3.90— 3.85 ( 3H, m, H - 2 X 3), 3.74- 3.70 (3H, m, H- 5, X 3), 3.69- 3.66 (3H, m, H - 4X3), 3.68- 3.62 (3H, m, H- 6a, X 3), 3.65- 3.62 (3H, m, H- 3 X3) , 3.57 (3H, br, H - 4, X3), 3.53 (3H, dd, J = 5.8, 11.7 Hz, H- 6b, X 3), 3.47- 3.43 (6H, m, H - 6X3), 3.41 (3H, m, J = 3.1, 10 .0 Hz, H-3' X3), 3.38 (3H, brt, J = 5.8 Hz, H— 5X3), 3.35 (3H, dd, J = 7.6, 10.0 Hz, H - 2' X 3), 3.36— 3.29 (1H, m, CH2CH(CH2-) ( S— )), 3.12 (3H, brd, J = 10.7 Hz, H— laX3), 2.91 (3H, dd, J = 7. 6, 12.0 Hz, H— lbX3), 2.90- 2.83 (2H, m, -SCH2~) , 2.23-2.16 (6H , m, — ^Cl^CO- X3), 2.18— 2.10 (1H, m, -SCH^ (1H) -) , 2.06 (2H, t, J = 5.8 Hz,
Figure imgf000047_0001
, 1.95— 1.89 (6H, m, - CH?CHク CO - X 3), 1.68- 1.59 (1H, m, -SCH^ (1H) -) , 1.41—1.30 (2H, m, -C0CH2CH2C H2CH2- ), 1.32— 1.22 (2H, m, - C0CH2CH2CH2^ -) , 1.15- 1.08 (2H, m, -COCf^CH^^CHs -)であった。 これらの結果から化合物 2の構造を確認 することができた。 なお、 この化合物 2の分子質量は 1 7 4 0 . 7 0で ある。 ( 3 ) 3番目のリガンド複合体 (化合物 3 ) の合成
上記 3番目のリガンド複合体の一つである、 上記一般式 ( 1 2 ) にて 表される構.造において、 n 1が 1であり、 Xが一般式 ( 3 ) にて表され る構造を備え、 R'が水素 (H) であり、 Rに上記式 ( 1 8 ) で表され るマルトースが導入され、 m4, m5が 2である構造を有するリガンド 複合体 (化合物 3 ) を以下の手順で合成した。
上記リガンド複合体 .(化合物 3 ) の合成の前段階と して、 まず、 芳香 族アミノ基末端が保護基によって保護された分岐鎖を 2鎖有するリ ンカ 一化合物 Bの合成を行った。
下記式 ( 2 6 ) にて示すように、 ァミノ安息香酸 (B— 1 ) のァミノ 基を Boc基で保護したァミノ安息香酸誘導体 (B— 2 ) とジエチレント リアミン (B— 3 ) を HOBtと EDO HC1を用いて縮合し、 ジアミ ド体 (B 一 4 ) を 7 9 %の収率で得た。 DMF中、 縮合剤と して FDPPを用いて、 ジ アミ ド体 (B— 4 ) とアミノ基を Z基で保護したグリ シン ( Z— G 1 y ) とを反応させ、 (B— 5 ) を 7 5 %の収率で得た。 Z基を接触水素還 元により除去して (B— 6 ) と した後、 チォタ ト酸 (B— 7 ) と縮合さ せ、 (B— 8 ) を 9 7 %の収率で得た。 最後に、 TFAによって Boc基を除 去し、 芳香族ァミノ基を 2単位有するリ ンカー化合物 Bを 9 5 %の収率 で得た。 ' B-3
H
(Boc)2Of Et3N HOBt, EDC-HCI
H2N- VCOOH BocH - -COOH
eOH CH2CI2
B-l B-2
BocHN- —薦
O 5% Pd/C 儿ひ
BocHN- -NH MsO¾rt
Figure imgf000049_0001
B-5
B-
Figure imgf000049_0002
B-6
Figure imgf000049_0003
B-8
Figure imgf000049_0004
B より具体的に説明すれば、 上記化合物 B— 2は、 4ーァミノ安息香酸 ( B - 1 ) (2.00 g, 14.6 mmol) をメタノール 1 4 0 m Lに溶解させ (Boc)20 (6.7 mL, 29.1 rtimol)と ト リェチルァミ ン (3.06 mL、 21.9 m mol) を加えて室温で 1 6時間撹拌した。 反応溶液を減圧濃縮し、 残渣 にへキサンと飽和炭酸水素ナトリ ウム水溶液 ( 5 0 m L ) を加え、 水層 を抽出した。 この水層に 1 0 %タエン酸ナトリ ゥム水溶液を p H = 4に なるまで加え、 白色の固体を析出させた。 得られた固体を酢酸ェチルに 溶解させ、 水で洗浄した後、 減圧濃縮した。 残査を酢酸ェチルー へキサ ンで再結晶して化合物 B — 2 (3.25 g, 収率 : 91.3 % ) を無色結晶と して得た。
得られた上記化合物 B — 2の 1 H— NMR ( 2 7 0 MH z , C DsO D ) 測定を行ったところ、 δ 9· 24 (1H, s, NH) , 7.96 (2H, d, J = 8.9 H , aromatic) , 7. 55 (2H, d, J = 8.6 Hz, aromatic) , 1.56 (9H, s, t- butyl)であった。 また、 上記化合物 B — 2の E S I — M S (negative ) 測定を行ったところ、 m/z 236.20 [ (M - H) ]であった。 これによつて 化合物 B — 2の構造を確認することができた。 なお、 この化合物 B — 2 の分子質量は 2 3 7 . 2 5である。
続いて、 上記化合物 B — 2 (1.30 g、 5.46 mmol ) 、 H O B t (0.73
8 g、 5.46 mmol ) および EDC · HC1 (1.05 g, 5.46 mmol) を無水ジク ロロメタン (30mL) に溶解させ、.アルゴン雰囲気下に 0 °Cで 5 0分間攪 拌した。 この溶液にジエチレントリアミン (B — 3 ) (0.283mL, 2.60 mmol ) を加 、 遮光下に室温で終夜攪拌し、 白色結晶を得た。 この白 色結晶を濾取した後、 メタノールから再結晶して、 化合物 B — 4 (1.23 g, 収率 : 87.4 % ) を白色結晶として得た。
. 得られた上記化合物 B — 4の 1 H— NMR ( 4 0 0 MH z , C D3O D ) 測定を行ったところ、 δ 7.77 - 7.74 (4Η, d, J = 8.67 Hz, aromatic) , 7. 50-7.48 (4H, d, J = 8.57 Hz, aromatic), 3.70-3.66 (4H, ra, J = 5. 19 Hz, NCH2CH2NHC0) , 3.34-3; 28 (4H, m, J = 5.61 Hz, NCH2CH2NH CO), 1.53 (18H, s, t- butyl)であった。 また、 上記化合物 B— 4の E S I — MS (positive) 測定を行ったところ、 m/z 542.64 [ (M+H) +]で あった。 これによつて化合物 B— 4の構造を確認することができた。 な お、 この化合物 B— 4の分子質量は 5 4 1. 6 0である。
続いて、 上記化合物 B— 4 (1.03 g, 1.85 mmol) 、 Z—グリシン (0
. 30 g, 2.04 mmol) および F D P P (l.07 mg, 2.78 mmol ) を無水ジ メチルホルムアミ ド (8 mL) に溶解した後、 ジイソプロピルェチルアミ ン (0.36 mL, 2.78 mmol ) を加え、 アルゴン雰囲気下に室温で 2 0時 間攪拌した。 この反応溶液を減圧濃縮して得られた残渣をク口 口ホルム に溶解し、 有機層を 1 0 %クェン酸、 飽和炭酸水素ナト リ ゥム水溶液で 順に洗浄した後、 無水硫酸ナトリ ウムを用いて乾燥させ、 乾燥剤を濾去 して減圧濃縮を行った。 濃縮残渣をシリカゲルクロマ トグラフィー (50 g, クロ口ホルム : アセ トン = 1 : 2 ) で精製して、 化合物 B— 5 (1. 02 g, 収率 : 75.0 % ) を白色固体と して得た。
得られた上記化合物 B— 5の 1 H— NMR ( 4 0 0 MH z , C D C 13
) 測定を行ったところ、 δ 7.88 (1H, bs, NHCOPh) , 7.73-7.66 (10Η, m , NHCOPh, aromatic), 7.56 (1H, bs, NHCOPh) , 7.38 (4H, d, J = 8.4 Hz, COPhNH) , 7.34-7.29 (8H, m, aromatic), 5.37 (1H, bs, Gly-NH) , 5.00 (2H, s, PhC¾), 3.64 (4H, m, NCH2CH2NH, NC¾CH2腿 ), 3.49, . 3.47 (4H, m, NCH2CH2NH ), 3.43, 3.27, 3.17 (6H, bt, bt, bt, NC¾ CH2NH ), 1.50, 1.49 (36H, s, s, t- butyl)であった。 また、 上記化合 物 B— 5の E S I — MS (positive) 測定を行ったところ、 m/z 755.36 〔(M+Na)+]であった。 これによつて化合物 B— 5の構造を確認すること ができた。 なお、 この化合物 B— 5の分子質量は 7 3 2. 3 2である。 続いて、 上記化合物 B— 5 (0.193 g, 0.264 mmol ) をメタノール ( 3 mL) に溶解し、 l O o/o P d/C (120 mg ) を加え、 水素雰囲気下、 室温で 3時間攪拌した後、 P ci/Cを濾去して減圧濃縮し、 化合物 B— 6 (0.230 g, 収率 : 94.4% ) を白色固体として得た。
得られた上記化合物 B— 6の 1 H— NMR ( 4 0 0 MH z, d 6 - D MS O) 測定を行ったところ、 59.54 (4H, d, J = 9.5 Hz, COPhNH) , 8.58, 8.53, 8.46 (4H, bs, bs, bs, NHCOPh) , 8.10 (2H, bs, NH2) , 7 .56 (1H, bs, NHCOPh) , 7.76-7.73 (8H, m, aromatic), 7.53-7.48 (8H , m, aromatic), 4.39, 4.24 (4H, bs, bs, CONCH^) , 3.80 (2H, bs, C NH2), 3.42-3.33 (16H, ra, NCH2(¾NH, N(¾CH2NH ), 1.46, 1.45 (36H , s, s, t- butyl)であった。 また、 上記化合物 B— 6'の E S I — M S ( positive) 測定を行ったところ、 m/z 599.33 [ (M+H) +]であった。 これ によって化合物 B— 6の構造を確認することができた。 なお、 この化合 物 B— 6の分子質量は 5 9 8. 3 9である。
続いて、 チォク ト酸 (B— 7 ) (41.0 mg, 0.200 mmol ) 、 HO B t (35.0 mg, 0.200 mmol ) および EDC · HC1 (42.1 g, 0.200 mmol) を ジメチルホルムアミ ド (3 mL) に溶解し、 窒素雰囲気下に遮光して 0 °C で 1. 5時間攪拌した。 次いで、 上記化合物 B— 6 (0.1 g, 0.167 mmo 1 ) をジメチルホルムアミ ド (2 mL) に溶解して、 上記のジメチルホル ムアミ ド溶液に滴下した後、 室温で 1 9時間攪拌じた。 反応溶液にクロ 口ホルムを加え、 有機層を抽出し、 この有機層を 1 0 %クェン酸水溶液 と飽和炭酸水素ナ ト リ ゥム水溶液とで洗浄し、 無水硫酸ナト リ ゥムで乾 燥させた後、 乾燥剤を濾去して減圧濃縮を行った。 濃縮残渣をシリカゲ ノレクロマ トグラフィー (50 g, クロロ ホノレム : メタノーノレ = 7 : 1 ) で 精製して、 化合物 B― 8 (0.128 g, 収率 : 97.0 % ) を白色固体として 得た。 得られた上記化合物 B— 8の 1 H— NMR ( 4 0 0 MH z , C D C 1 3 ) 測定を行ったところ、 δ 7.76- 7.69 (11H, m, NHCOPh, aromatic), 7. 55 (1H, bs, NHCOPh) , 7.45-7.35 (9H, m, aromatic, COPhNH) , 7.13, 7.00, 6.97 (3H, bs, bs, bs, COPhNH) , 5.83 (1H, bs, Gly-NH), 4.04 (2H, bs, Gly- CH2) , 3.73-3.66 (4H, m, CONCI^ ), 3.54-3.46 (11H, m, NCH2CH2NH, NCH^CH^H, SSCHCH2) , 3.41, 3.29, 3.22 (6H, bs, bs, bs, N(¾CH2NH), 3.16-3.03 (2H, ra, CH2SSCH) , 2.39 (1H, m, CH2CH2SS ), 2.02 (2H, t, J = 6.9 Hz, CH2CH2CH2C0NH) , 1.84 (1H, m, CHCH2SS) , 1.58-1.52 (4H, m, CH^H^CH^ONH, Ci^C^C^CONH ), 1.51, 1.49 (18 H, s, s, t- butyl), 1.35 (2H, m, Cj^CH^H^i^CONH)であった。 また、 上記化合物 B— 8の E S I — M S (positive) 測定を行ったところ、 m/ z 809.33 [(M+Na)+]であった。 これによつて化合物 B— 8の構造を確認 することができた。 なお、 この化合物 B— 8の分子質量は 7 8 7. 3 0 である。
上記化合物 B— 8 (0.128 g, 0.16 mmol) をジクロロメタン (1 mL) に溶解し、 T F A (2 mL) を加えて、 遮光下 0 °Cで 1 . 5時間攪拌した 後、 減圧濃縮を行い、 得られた残渣をメタノールに溶解して、 Dowex Ma rathon A (OH" form) のカラムに通して中和し、 減圧濃縮し、 化合物 B (89.3 mg, 収率 : 95.2 % ) を黄色固体と して得た。
得られた上記化合物 Bの 1 H— NMR ( 4 0 0 MH z , d 6 - DM S
O) 測定を行ったところ、 S 8.20, 8.07 (2H, ra, NHCOPh) , 7.83 (1Η, t, J = 5.5 Hz, Gly-NH) , 6.51-6.48 (8H, m, aromatic) , 5.57 (8H, d , J = 14.3 Hz, PhNHg), 4.34, 4.12 (4H, bs, bs, C0NCH2) , 3.82 (2H , bs, Gly- CH2), 3.64-3.55 (1H, m, SSCHCH2) , 3.50-3.32 (16H, ban d, NCHaCI^NH, NCH2CH2NH) , 3.18-3: 04 (2H, m, CH2SSCH) , 2.38 (1H, m ,
Figure imgf000054_0001
, 2.02 (2H, t, J = 7.1 Hz, CH2CH2CH2C0NH) , 1.85 (1H, m , CH^SS), 1.57-1.47 (4H, m, 〇Η2(¾〇Η2〇0ΝΗ, CH^CH^HaCH^ONH) , 1. 35 (2H, m, Cl2CH2CH2C0NH)であった。 また、 上記化合物 Bの E S I — M S (positive) 測定を行ったところ、 m/z 587.24 [ Οί+Η) +]であった。 これによつて化合物 Βの構造を確認することができた。 なお、 この化合 物 Βの分子質量は 5 8 6. 2 4である。
続いて、 得られたリンカー化合物 Βを用いて、 上記一般式 ( 1 2 ) に て表される構造において、 η 1が 1であり、 Xが一般式 ( 3 ) にて表さ れる構造を備え、 R'が水素 (Η) であり、 Rに上記式 ( 1 8 ) で表さ れるマルトースが導入され、 m4, m 5が 2である構造を有するリガン ド複合体 (化合物 3 ) を下記式 ( 2 7 ) の手順にて合成した。
Figure imgf000054_0002
MALDI-TOF/MS Exact Mass: 1238.48 --. (27)
Mol, Wt; 1239.36 式 ( 2 7 ) に示すように、 上記の方法で得られたリ ンカー化合物 Bと 、 上記式 ( 1 8 ) にて表されるオリ ゴ糖である市販のマルトース水和物
( 4. 5当量) とを、 H20ノジメチルァセ トアミ ド (式中、 DMA c ) Z酢酸 (A c O H) = 1 / 1 / 0. 1の混合溶媒に溶解し、 p H 4〜 4. 5、 3 7 °Cにて、 シッフ塩基を形成させた後、 溶媒に A c OHを加 え、 1 0当量の 9 5 %N a BH3CNを加えて、 p H 3〜4. 5、 3 7 °Cにて、 還元アミノ化反応を行った。 その後、 得られた化合物を Sephad ex G-50 (アマ一シャムバイオシステムズ社製) を用いて、 ゲル濾過ク 口マトグラフィ一により精製し、 さらに脱塩処理を行って、 末端にひ一 ダルコビラノースを 2単位含んでなるリガンド複合体と して化合物 3を 得た。 上記化合物 3の同定は、 MA L D I — T O Fノ M Sおよび NMR によって行った。
MA L D I — T O F_ M Sの結果は、 m/ z 1239.36 [ (M+H) +]であつ た。 また1 H— NMRスペク トル ( 6 0 0 MH z、 D 2〇) 測定を行っ とこ ろ、 57.39 (2H, d, J = 8.2 Hz, aromatic), 7.38 (2H, d, J = 8.2 H z, aromatic), 6.56 (2H, d, J = 8.2 Hz, aromatic) , 6.55 (2H, d, J = 8.2 Hz, aromatic), 4.91 (2H, d, J = 3.4 Hz, H - Γ X2), 3.84 ( 2H, s, -NHC0CH9NH-) , 3.83- 3.78 (2H, m, H - 2X2), 3.75 (2H, dd, J = 4.1, 6.9 Hz, H - 5 X 2) , 3.72 (2H, dd, J = 2.7, 4.8 Hz, H - 3 X 2), 3.69 (2H, dd, J = 4.1, 4.8 Hz, H - 4X2), 3.69— 3.66 (2H, m, H - 5 X2), 3.64 (2H, dd, J = 2.1, 12.4 Hz, H - 6a, X2), 3.58 (2H, dd, J = 4.8, 12.4 Hz, H - 6b, X2), 3.55—3.51 (2H, m, H - 6aX2), 3.53 (2H, dd, J = 8.9. 9.6 Hz, H-3, X2), 3.47— 3.40 (8H, m, -C0NHCH, CH2N- X 2) , 3.44-3.41 (2H, m, H- 6bX2), 3.37 (2H, dd, J = 3.4, 9 .6 Hz, H-2' X2), 3.37— 3.30 (1H, m, CH2CH(CH2-) (S -)), 3.23 (2H, • dd, J = 8.9, 10.3 Hz, H-4' X 2), 3.20 (3H, dd, J = 4.8, 13.7 Hz , H - laX2) , 3.12 (2H, dd, J = 8.2, 13.7 Hz, H - lbX2), 3.00-2.89 (2H, m, -SCH2-), 2.22—2.15 (1H, m, -SCH2CH2 (1H) -) , 1.98 (2H, t, J = 6.9 Hz, - NHC0CH— 2CH2 -), 1.72- 1.64 (1H, m, -SCH2CH2 (1H) -) , 1. 45— 1.37 (1H, m, - C0CH2CH2CH (1H) -), 1.35— 1.23 (3H, m, - C0CH2 CH2CH2CH2-; -C0CH2CH2CH2CH2(1H)-) , 1.09— 1.02 (2H, m, - COCH CH9CH9C H2 -)であった。 これらから結果から化合物 3の構造を確認することがで きた。 なお、 この化合物 3の分子質量は 1 2 3 8. 4 8である。
(4 ) 4番目のリガンド複合体 (化合物 4 ) の合成
上記 4番目のリガンド複合体の一つである、 上記一般式 ( 1 2 ) にて 表される構造において、 n 1が 1であり、 Xが一般式 ( 3 ) にて表され る構造を備え、 R'が水素 (H) であり、 Rに上記式 ( 1 9 ) で表され るラタ トースが導入され、 m4, m5が 2である構造を有するリガンド 複合体 (化合物 4 ) を以下の手順で合成した。
上記リガンド複合体 (化合物 4 ) の合成の前段階として、 まず、 芳香 族ァミノ基末端が保護基によって保護された分岐鎖を 2鎖有するリ ンカ 一化合物 Bの合成を上記のように行った。 続いて、 得られたリンカ一化 合物 Bを用いて、 上記一般式 ( 1 2 ) にて表される構造において、 n 1 が 1であり、 Xが一般式 ( 3 ) にて表される構造を備え、 R'が水素 ( H) であり、 Rに上記式 ( 1 9 ) で表されるラク トースが導入され、 m 4, m5が 2である構造を有するリガンド複合体 (化合物 4 ) を下記式 ( 2 8 ) 手順にて合成した。
Figure imgf000057_0001
Figure imgf000057_0002
4
ALDI-TOF/MS Exact Mass: 1238.48
m/z = 1261,15【M+Na] 式 ( 2 8) に示すように、 上記の方法で得られたリ ンカー化合物 Bと 、 上記式 ( 1 9 ) にて表されるオリ ゴ糖である市販のラク トース水和物
(4. 5当量) とを、 H2O/ジメチルァセトアミ ド (式中、 DMA c ) ノ酢酸 (A c OH) = 1 / 1 / 0. 1の混合溶媒に溶解し、 p H 4〜 4. 5、 3 7 °Cにて、 シッフ塩基を形成させた後、 溶媒に A c OHを加 え、 1 0当量の 9 5 %N a BH3CNを加えて、 p H 3〜4. 5、 3 7 °Cにて、 還元アミノ化反応を行った。 その後、 得られた化合物を Sephad ex G-50 (アマ一シャムバイオシステムズ社製) を用いて、 ゲル濾過ク 口マトダラライ一により精製し、 さらに脱塩処理を行って、 .末端に) 3— ガラク トピラノースを 2単位含んでなる リガンド複合体として化合物 4 を得た。 上記化合物 4の同定は、 MAL D.I — T O F/MSおよび NM Rによって行った。
MA L D I — T O F /M Sの結果は、 m/ z 1261.15 [ (M+Na) +]であ つた。 また1 H— NMRスペク トル ( 6 0 0 MH z、 D 20) 測定を行ったと ころ、 δ 7.40 (2H, d, J = 8.9 Hz, aromatic) , 7.39 (2H, d, J = 8.9 Hz, aromatic) , 6.59 (2H, d J = 8.9 Hz, aromatic) , 6.58 (2H, d J = 8.9 Hz, aromatic), 4.30 (d 1H, J = 7.6 Hz, H - 1' ) , 4.29 (1 H, d, J = 7.6 Hz, Η-Ϊ" ) , 3.93— 3.89 (2H, m H - 2X2), 3.84 (2H, s, - CONHCH NH -) , 3.74—3.71 (2H, m, H - 5 X2), 3.71— 3.69 (4H m H - 4X2 H- 4 X2), 3.69- 3.66 (2H, m, H - 3X2), 3.65 (2H, dd J = 3.0 11.7 Hz, H-6a' X 2) , 3.53 (2H, dd, J = 5.5, 11.7 Hz, H - 6 b X2), 3.48- 3.42 (12H, m, H - 5X2 H - 3 X2 -CONHCH9CH9N- X 2) , 3.41-3.39 (4H m, H-6X2), 3.37— 3.32 (1H m, CH2CH(CH2-) (S-)) 3.35 (2H, dd, J = 7.6, 8.9 Hz, H - 2 X2), 3.23 (2H dd, J = 4. 1, 13.7 Hz, H-laX2), 3.04 (2H, dd, J = 7.6 13.7 Hz, H - lbX2), 3.01-2.90 (2H m, -SCH?-), 2.23— 2.16 (1H, m - SCH^L (1H) -), 1. 99 (2H, t J = 6.9 Hz, -NHC0CH9CH -) , 1.73— 1.66 (1H, m, -SCH9CH9 (1H) -), 1.46— 1.39 (1H m, - C0CH CH CH CH9 (1H) -) , 1.35— 1.30 (1H, m, -C0CH,CH9CH9CH,(1H)-) , 1.32- 1.26 (2H m, -COCH^CH^H^) , 1 .11-1.04 (2H m - COCH2CH2ei2CH2-)であった。 これらの結果から化合 物 4の構造を確認することができた。 なお、 この化合物 4の分子質量は 1 2 3 8. .4 8である。
〔実施例 2 S P R測定と質量分析によるタンパク質の分析〕 実施例 2では、 実施例 1にて作製した各リガンド複合体 (化合物 1 4 ) を用いて、 タンパク質の糖鎖との結合特性について、 S P R測定お よび質量分析によつて解析した。 その手順について以下に説明する。 • 図 1には、 本実施例におけるタンパク質の分析の手順を工程 1〜工程 1 2 と して示す。 図 1において、 工程 1〜工程 7は、 各リガンド複合体 (化合物 1 4 ) を、 金 (A u ) でコーティングされた支持体表面に固 定化させてリガンド担持体 (セン チップ) を作製する工程である。 そ して、 上記リガンド担持体を、 分析対象となるタンパク質を含む溶液と 接触させる工程 8 の後に実施される工程が、 S P R測定を行う工程であ る。 さらに、 支持体表面を水で洗う工程 1 0の後に実施される工程が、 質量分析 (M S ) によってタンパク質を同定する工程である。
本実施例において、 S P R測定は日本レーザ電子社製の S P R— 8 B を用いて行った。 また、 質量分析はアプライ ドバイォ社製のマ ト リ ック ス支援型レーザ脱離/飛行時間型質量分析計 (MA L D I 一 T O F /M S ) である Voyager RP—DEを用レヽて行った。
分析に用いたタンパク質は、 ダルコビラノース結合性のレクチンタン パク質と して C o n c a n a v a 1 i n A ( C o n Aと略記する ) 、
P S A、 L C A、 および、 ガラク トピラノース結合性のレクチンタンパ ク質と して R C A、 P NAの 5種類であった。 そして、 ネガティブコン トロールと してゥシ血清アルブミン (B S A) を用いた。
まず、 図 1に示す工程 1〜工程 7に基づいて、 上記化合物 1〜 4をそ れぞれ固定化した 4種類のリガンド担持体を作製した。 続いて、 上記の 5種のレクチンタンパク質および B S Aを、 それぞれ P B Sバッファー に溶解してタンパク質溶液を調製した。 その後、 図 1に示す工程 8を行 い、 各リガンド担持体と各タンパク質溶液とをそれぞれ接触させて相互 作用させた。 続いて、 S P R測定を行い、 リガンド担持体とタンパク質 との結合測定を行った。
a—ダルコピラノースを固定化したリガンド担持体 (センサチップ) を用いたレクチンタンパク質の結合挙動の結果を図 2、 図 3および表 1 に示した。 図 2には化合物 3 (Di-valent type) のリガンド複合体を固 定化したセンサチップの結果を示し、 図 3には化合物 1 (Tri- valent t ype) のリガンド複合体を固定化したセンサチップの結果を示した。 図 ) は C o n Aの結合挙動結果、 (b ) . は
は L C Aの結合拳動結果を示している。
Figure imgf000060_0001
KD :解離常数 M)
ka:結合速度常数(wrV1xio4)
:解離速度常数(3-1 101) 図 2および図 3から明らかなように、 C o n Aおよび P S Aについて は、 リガンド複合体のリンカ一部分の構造の違いによらず同様の結合挙. 動を示した。 しかし、 L C Aについては、 3単位の糖分子を有するリガ ンド複合体である化合物 1 とは結合することが示された 、 2単位の糖 分子を有するリガンド複合体化合物 3 とは結合しないことが示された。 図には示していないが、 ネガティプコントロールである B S Aは化合物 1または 3 固定化したチップには結合しないことが分った。
また、.表 1には、 それぞれのタンパク質の結合拳動をまとめた。 αグ ルコース結合性のレクチンタンパク質に、 特異的結合が観測され、' 結合 '定数の算出も可能であった。 Di- valentリガンド結合体を用いた場合よ り も、 Tri- val entリガンド結合体を用いた場合の方が解離定数 (K D ) が同等または小さく算出されており、 1つのリガンド複合体当たりの糖 鎖の数が増えることによって、 結合活性が上昇していることが明らかと TJP2005/003220
59 なつた'。
β —ガラク トビラノースを固定化したリガンド担持体 (センサチップ ) を用いたレクチンタンパク質の結合挙動の結果を図 4、 図 5および表 2に示した。 図 4には化合物 4 (.Di-valent type) のリガンド複合体を 固定化したセンサチップの結果を示し、 図 5には化合物 2 (Tri-valent type) のリガンド複合体を固定化したセンサチップの結果を示した。 図 4およぴ図 5 とも、 ( a ) は R CAの結合挙動結果、 (b ) は P NA の結合挙動結果を示している。
Figure imgf000061_0001
KD:解離常数(/zM)
'結合速度常数( 3-1 104)
:解離速度常数(3-1 101)
*1:蛋白質濃度に依存しない
非特異的吸着が観測された 図 4および図 5から明らかなように、 R C Aおよび P N Aはリガンド 複合体のリ ンカ一部分の構造の違いによらず同様の結合挙動を示した。 図には示していないが、 ネガティブコ トロールである B S Aは化合物 2または 4を固定化したチップには結合しないことが分った。
また、 表 2には、 それぞれのタンパク質の結合挙動をまとめた。 jSガ ラク トース結合性のレクチンタンパク質に、 特異的結合が観測され、 結 合定数の算出も可能であった。 なお、 C o n Aについては化合物 3を用 いて作成したチップにおいて、 タンパク質の濃度に依存しない非特異的 な結合挙動が観測された。 Di- valentリガンド結合体を用いた場合より も、 Tri- valentリガンド結合体を用いた場合の方が解離定数 (K D ) が 同等または小さく算出されており、 1つのリガンド複合体当たりの糖鎖 の数が増えることによって、 結合活性が上昇していることが明らかとな つた。
以上の結果から、 糖鎖の集合化度によってタンパク質の糖鎖に対する 結合活性が異なる場合があることが明らかとなり、 レクチンタンパク質 の糖鎖結合特性もこの系によって測定することが出来ることが示された さらに、 この S P R測定に供したリガンド担持体のうち、 タンパク質 との結合が確認されたものについては、 工程 9および工程 1 0を行った 後、 質量分析計に供することで、 リガンド担持体に結合しているタンパ ク質の同定を行った。 なお、 質量分析を行う際には、 結合測定を行った 部分にマ ト リ ックス溶液 (飽和 a C H C Aまたはシナピン酸) を乗せ、 乾燥させてから質量分析計に供し、 分子質量の測定を行った。
上記の一連の工程で、 リガンド担持体とタンパク質との結合拳動を確 認した後、 工程 1 1においてリガンド担持体とタンパク質との結合を解 離させた後、 工程 1 2において P B Sバッファーで洗浄を行った。 その 後、 別のタンパク質溶液を用いて、 再度工程 8〜工程 1 0までを繰り返 し、 S P R測定および質量分析を行った。 この作業を各リガンド担持体 および各タンパク質について繰り返し実施した。
質量分析の結果を図 6およぴ表 3に示した。 図 6 ( a ) には C o n A の分析結果を示し、 図 6 ( b ) には P N Aの分析結果を示した。
Figure imgf000063_0001
図 6 ( a ) およぴ図 6 (b ) から明らかなように、 それぞれのタンパ ク質を構成するサブュニッ トの分子貧量に相当する 1価と 2価のイオン ピークが観測された。
また、 表 3には他のレクチンタンパク質の結果も合わせてまとめた。 各々のレクチンタンパク質のサブユニッ トの 1価または 2価の分子質量 に近いイオンピークが観測された。 ただし、 R C Aについてはサブ ニ ッ トの分子質量が 3万ダルトン以上と大きいために、 用いた質量分析計 ではそのイオンピークを検出することは出来なかった。 より高性能な M AL D I — TO F/MS機器を用いれば検出は可能であろう。
この質量分析の結果、 R CAを除いて、 結合した各々のレクチンタン パク質に相当する分子量が観測され、 .レクチンタンパク質の同定に成功 した。
以上のように、 本実施例の結果から、 本発明にかかるリガンド複合体 を用いて S P R測定および質量分析を行ってタンパク質の分析を行えば 、 タンパク質を正確に同定することができることが確認された。 また、 本実施例の結果から、 末端に同じ糖鎖を有しているリガンド担持体であ つても、 糖鎖の集合化度の差によってタンパク質との結合活性が異なる ことが確認された。 つまり、 本発明のタンパク質の分析方法は、 糖鎖の 集合化度とタンパク質の結合活性との関係の解析にも利用することがで きると考えられる。 このよ うな糖鎖の集合化度とタンパク質の結合活性 との関係の解析は、 既存の方法では判別不可能であるため、 本発明の有 用性をより高めるものと言える。
〔実施例 3 : リガンド複合体 (化合物 2 1、 2 2 ) の合成〕
本実施例では、 実施の形態において説明した 5番目および 6番目のリ ガンド複合体に分類されるリ ガンド複合体を合成した。 すなわち、 5番 目のリガンド複合体である上記一般式 ( 1 3 ) にて表される構造におい て n 2が 4であり、 上記 Xが一般式 (4) にて表される構造を備え、 R ,が水素 (H) であり、 Rにグルコースが導入された構造を有するリガ ンド複合体 (化合物 2 1 ) 、 および、 6番目のリガンド複合体である上 記一般式 ( 1 3 ) にて表される構造において n 2が 4であり、 上記 が 一般式 (4 ) にて表される構造を備え、 R'が水素 (H) であり、 に マルトースが導入された構造を有するリガンド複合体 (化合物 2 2 ) を 以下の手順で合成した。
〔測定方法、 試薬等〕
1 H - NMR トルの測定には、 JE0L-Delta600 Spectrometerを 用いた。 化学シフ トは、 CDC13 の場合はテ トラメチルシラン (0.00 ppm 2005/003220
63
) を基準物質にして δ値で表した。 D20の場合は DH0 (4.65 ppm)- を基準 物質にして δ値で表した。 質量分析は PerSeptive Biosystem Mariner™ Biospectrometry Workstationを用レヽて則定した。 シリカゲノレカラムク 口マ トグラフィ一は、 Silicagel 60 (Merck, 0.040-0.063 mm) を用い て行つた。 薄層クロマ トグラフィ一は Precoated Silicagel 60 F254 (M erckN 0.5 mm) を使用した。 全ての試薬、 脱水溶媒は関東化学株式会社 製のものを購入して使用した。
( 1 ) 化合物 1 6の合成
以下、 式 ( 2 9 ) にしたがって説明する。
Figure imgf000065_0001
16 17
thiociicacid
Figure imgf000065_0002
18
Figure imgf000065_0003
まず、 式 ( 2 9 ) の化合物 1 6を以下の手順で合成した。 ' . ビス [2- (2-ヒ ドロキシエ トキシ)ェチル]エーテル (14.57 ml, 80 mmo 1) と BF3 · Et20 (252 ml,. 2 mmol) を無水ジクロロメタン 50 ml に溶解 し、 0 °Cでジァゾ酢酸ェチル (1.8 ml, 17.35 mmol) を滴下した後、 室 温で 70 分間攪拌した。 反応溶液に飽和塩化アンモニゥム水溶液 20 ml を加え、 ジクロロメタンで抽出し、 無水硫酸マグネシウムで乾燥した。 乾燥剤を濾去して減圧濃縮し、 濃縮残渣をクロマ トグラフィー (600 g 、 へキサン : 酢酸ェチル = 1 : 3 ) で精製してェチル化体化合物(2. 26 g, 収率 : 47%) を無色液体として得た。
上記のェチル体化合物(2. 15 g, 7. 66 mmol ) と DMAP (41. 7 mg, 337 mmo l) を無水ピリ ジン 8ml に溶解した。 この溶液に 0 °Cで p-トルエン スルホン酸クロ リ ド (1. 75 g, 9. 19mmol) を無水ジクロロメタン 8 ml に溶解した溶液を滴下し、 室温で 3時間攪拌した。 反応溶液にジクロロ メタンと氷水を加えてジクロロメタンに抽出した。 有機層を飽和炭酸水 素ナトリ ウム水溶液、 水、 飽和食塩水で 1回ずつ洗浄し、 無水硫酸マグ ネシゥムで乾燥した。。乾燥剤を濾去して減圧濃縮し、 濃縮残渣をクロマ トグラフィー (100 g 、 クロ口ホル Λ : アセ トン = 4 : 1 ) で精製し て トシル体化合物(2. 59 g, 収率 : 78%)を黄色液体と して得た。
上記の トシル体化合物(1. 01 g, 2. 31 mmol) とアジ化ナトリ ウム (1. 53 g, 2. 31 mmol) を無水ジメチルホルムアミ ド 50 ml に溶解し、 遮光 して 1 2 0 °Cで窒素雰囲気下 1 0時間攪拌した。 反応溶液をクロロホル ムで抽出し、 水、 飽和食塩水で有機層を 1回ずつ洗浄し、 無水硫酸マグ ネシゥムで乾燥した。 乾燥剤を濾去して減圧濃縮し、 濃縮残渣をクロマ トグラフィー (10 g 、 クロ口ホルム : アセ トン = 2 : 1 ) で精製し てアジド体化合物(638 mg, 収率 : 90°/。) を黄色液体と して得た。
上記のアジド体化合物(614 mg, 2. 01 mmol) をメタノール 24 ml に溶 解し、 遮光下 0 °Cで IN NaOH 4. 3 ml を加えた後、 室温で 2 1時間攪拌 した。 反応溶液を減圧濃縮し、 濃縮残渣にクロ口ホルムを加えた後、 1 N HC1 を pH = 2 になるまで加え、 クロ口ホルムで抽出した。 有機層を 飽和食塩水で 1回洗浄し、 無水硫酸マグネシウムで乾燥した。 乾燥剤を 濾去して減圧濃縮し、 化合物 1 6 (549 mg, 収率 : 90%) を無色液体と し 5003220
て得た。
この化合物 1 6について 1 H— NMR ( 4 0 0 MH z , C D C 1 3) 測定を行ったところ、 56.19 (1H, bs, C02H) , 4.16 (2H, s, OCl^CO^) , 3.75-3.64 (12H, m, OC^C^O) , 3.68 (2H, m, N3CH2CH2) , 3.41 (2H, t, J = 5.1 Hz, Ν32)であった。 また、 上記化合物 6の E S I — M S (negative) 測定を行ったところ、 m/z 328.14 [ (M+Na) +]であった。 こ れによって化合物 6の構造を確認することができた。 なお、 この化合物 1 6の分子質量は 2 7 7. 1 3である。
( 2 )· 化合物 1 7の合成
化合物 1 6 (228 mg, 0.823 mmol)を無水ジクロロメタン (4 ml') に溶 解し、 室温、 画 t (135 mg, 0.987mmol) 、 EDC - HC1 (192 mg, 0.987 mmol) 、 化合物 1 1 (205 mg, 0.987 mmol)を 0 。 Cで順に加え、 遮光下 2 0時間攪拌した。 この反応溶液を減圧濃縮して得られた濃縮残渣をク口 口ホルムで抽出し、 有機層を 10% クェン酸、 飽和炭酸水素ナトリ ウム水 溶液で 1回ずつ洗浄して、 乾燥剤として無水硫酸マグネシウムを用いて 乾燥させた後、 乾燥剤を濾去して減圧濃縮を行った。 減圧濃縮によって 得られた濃縮残渣をシリカゲルクロマトグラフィー (80 g, クロ口ホル ム : メタノール = 10 : 1) で精製して、 化合物 1 7 (367 mg, 収率 : 95 %) を黄色オイル状物質と して得た。 この化合物 1 7の E S I — M S (p ositive) 測定を行ったところ、 m/z 490.24 [ (M+Na) +]であった。 これ によって化合物 3の構造を確認することができた。 なお、 この化合物 1 '7の分子質量は 4 6 7. 2 4である。
( 3 ) 化合物 1 8の合成
化合物 1 7 (29 rag, 0.062 mmol) をメタノール (3 ml) に溶解し、 1 0% Pd/C (5.0 mg) を加え、 水素雰囲気下、 室温で 9時間攪拌した。 上 05003220
66 . 記 Pd/Cを濾去して濾液を減圧濃縮した。 得られた濃縮残渣をシリ力ゲル ク ロマ トグラフィー (1.5 g, ク ロ 口ホルム : メ タノール = 7 : 1) で 精製して、 化合物 1 8 (22 mg, 収率 : 82%) を黄色オイル状物質と して 得た。 この化合物 1 8の E S I — M S (positive) 測定を行ったところ 、 m/z 442.27 [ (M+H) +]であった。 これによつて化合物 1 8の構造を確 認することができた。 なお、 この化合物 1 8の分子質量は C21H35N307 : 4 4 1 . 2 5である。
( 4 ) 化合物 1 9の合成
チォク ト酸 (12.6 mg, 0.061 mmol) を無水ジメチルホルムアミ ド (2 ml) に溶解し、 アルゴン雰囲気下、 HOBt (8.3 mg, 0.061 mmol) 、 EDC • HC1 (11.8 mg, 0.061 mmol) を順に加え、 遮光下室温に戻して 2時間 攪拌した。 化合物 1 8 (22.4 mg、 0.051 mmol) を無水ジメチルホルム アミ ド (2 ml) に溶解して加え、 室温で遮光下 1 日撹拌した。 反応液に トルエンを加えて、 濃縮し、 有機層を 1 0 %クェン酸、 飽和炭酸水素ナ ト リ ウム水溶液で順次洗浄し、 無水硫酸マグネシウムを用いて乾燥させ た後、 乾燥剤を濾去して減圧濃縮を行った。 得られた濃縮残渣をシリカ ゲノレカラムクロマトグラフィー ( 3 g、 クロロホノレム : メタノーノレ = 10 : 1) で精製し、 化合物 1 9を黄色の油状物として得た。 収量は 27 mg ( 84%) であった。 この化合物 1 9の E S I — M S (positive) 測定を行 つたところ、 m/z 652.28 [ (M+Na) +]であった。 これによつて化合物 1 9 の構造を確認することができた。 なお、 この化合物 1.9の分子質量は 6 •2 9 · 2 8である。
( 5 ) 化合物 2 0の合成
化合物 1 9 (31 mg, 0.050 mmol) をジクロロメタ ン (2 ml) に溶解 し、 0°Cで TFA (147 μ 1) を加え、 '同温で 3時間攪拌した。 反応溶液を濃 05003220
67 縮後、 トルエンで共沸した。 得られた濃縮残渣をジクロ口メタ.ンに溶解 し、 ト リェチルァミン水溶液を加えて、 水相の pHを 8 と した後、 有機相 を無水硫酸マグネシウムを用いて乾燥させた後、 乾燥剤を濾去して減圧 濃縮を行った。 得られた濃縮残渣をシリ力ゲルカラムクロマ トグラフィ 一 (10g、 クロ口ホルム : メタノール = 5 : 1) で精製し、 ィ匕合物 2 0を 黄色の油状物として得た。 収量は 26.1 mg (59%) であった。 この化合 物 2 0について1 H—NMRスぺク トル (600 MHz, CDC13) 測定を行ったとこ ろ、 δ 7.17 (s, 1H, aromatic), 7.1 (dd, 1H, J = 8.6, 8.3 Hz aroma tic), 6.91 (d, 1H, J = 8.2 Hz aromatic) 6.45 (d, 1H, J = 8.2 Hz aromatic) 4.1 (s, 2H, -0CH2C0NH-) , 3.78- 3.49 (m, 15H, ethylene glycol chain, CH2CH(CH2-) (S-)), 3.41 (q, 2H, J = 5.5 Hz, -CONHCH^ CH20— ), 3.16 (m, 1H, - S^ lH)— ), 3.08 (m, 1H, -SCH (1H)-), 2.46 — 2.44 (m, 1H, -SCH^ (1H) -) , 2.13—2.10 (t, 2H, J = 7.6 Hz, — N HCOCH^CH^) , 1.92— 1.88 (m, 1H, -SCH2CH2 (1H) -) , 1.43- 1.40 (m 4H, -C0CH9CH9CH CH9-) , 1.26— 1.24 (m, 2H, -C0CH,,CH,CH9CH9-)であった。 また、 化合物 2 0の E S I -MS (positive) 測定を行ったところ、 m/ z 552.31 〔(M+Na)+]であった。 以上から化合物 2 0の構造を確認するこ とができた。 なお、 この化合物 2 0の分子質量は 5 2 9. 2 3である。
( 6 ) ·リガンド複合体 (化合物 2 1 ) の合成
以下、 式 ( 3 0 ) にしたがって説明する。
Figure imgf000070_0001
21 (30) 化合物 2 0 (15.5 mg, 29.3 μ mol) とグルコース (5.8 mg, 32.2 μ mol) を DMAc/水 (1:1, 1 ml) に溶解し、 酢酸 (200 μ 1) を加え、 37°C で 2日放置した。 反応液にシァノ水素化ホウ素ナトリ ウム (5.5 mg, 87. 9 μ mol) を加え、 37°Cでさらに 6日間放置した。 反応液を濃縮した。 得 'ちれた残渣は、 0DSカラムクロマトグラフィー (Chromatorex 0DS, 30g, メタノール/水 = 50/50) によって精製した。 化合物 2 1は白色の固体 として得られた。 収量は 4.54 mg (22%) であった。
この化合物 2 1について1 H-NMRスぺク トル (600 MHz, D20) 測定を行 つたところ、 δ 7.17 (s, 1H, aromatic), 7.1 (dd, 1H, J = 8.6, 8.3 Hz aromatic), 6.91 (d, 1H, J = 8.2 Hz aromatic) 6.45 (d, 1H, J =
8.2 Hz aromatic) 4.1 (s, 2H, -OCH^CONH-) , 3.80- 3.76 (m, 1H, H - 2), 3.68- 3.35 (m, 19H, ethylene glycol chain, H - 3, H- 6a, H - 5, H - 4, H - 6b), 3.20,-3.10 (m, 2H, H - 1 - a, CH2CH(CH2-) (S-)), 3.05 - 2.94 (m, 1H ,Ή-lb, -SC^), 2.28- 2.23 (m, 1H, -SCH2CH2 (1H) -) , 2.13-2.10 (t, 2 H, J = 7.6 , 6.9Hz, -NHC0CH?CH?-), 1.78— 1.69 (m, 1H, -SCH,CH?(1H )- ), 1.53- 1.36 (m 4H, -C0CH,CH7CH?CH9-) , 1.20- 1.10 (m, 2H, -C0CH 2CH2^2CH2 -)であった。 MALDト T0F - MS測定を行ったところ、 m/z 694.66 ' 〔(M+H)+]であった。 これらによって化合物 2 1 の構造を確認することが できた。 なお、 この化合物 2 1の分子質量は 6 9 3. 3 0である。 2005/003220
69 リガンド複合体 (化合物 2 2 ) の合成
式 ( 3 1 ) にしたがって説明する。
Figure imgf000071_0001
22 (31). ィ匕合物 2 0 (9.0 mg, 17.0 μ mol) とマルトース (5.8 mg, 17.0 μ m ol) をメタノール/水 (1:1, 1 ml) に溶解し、 酢酸 (50 μ 1) を加え、 37°Cで 24時間放置した。 反応液に酢酸 (450 μ 1) とシァノ水素化ホゥ 素ナトリ ウム (3.2 mg, 51.0 mol) を加え、 37°Cでさらに 120時間放 置した。 反応液を濃縮した。 得られた残渣は、 0DSカラムクロマトグラ フィー (Chromatorex 0DS, 30g, メタノール/水 = 50/50) によって精 製した。 化合物 2 2は白色の固体として得られた。 収暈は 2.36 mg (16 %) であった。
• この化合物 2 2について1 H-薩 Rスぺク トル (600 MHz、 D20) 測定を行 つたところ、 5 7.07—7.04 (t, 1H, J = 8.2', Hz, aromatic), 6.76 (s,
1H, aromatic) , 6.63 (d, 1H, J = 8.2 Hz, aromatic), 6.48 (dd, 1H , J = 2.1, 6.2 Hz, aromatic), 4.91 (d, 1H, J = 4.1 Hz, H— 1), 4.1
(s, 2H, -OCHpCONH-) , 3.82- 3.78 (m, 1H, H - 2), 3.75 - 3· 34 (m, 24H, e •thylene glycol chain H - 2, , H - 5, , H - 5, H - 6' a, H - 6, b, H - 6a, H - 6b, H-3, H— 3, , H-4' ) 3.25 (m, 1H, CH2CH(CH2-) (S-)), 3.18-3.11 (m , 3H, HI' b,
Figure imgf000071_0002
, 2.29- 2.20 (m, 1H, -SGH2CH2(1H)-), 2.05— 1.96 (t, 2H, J = 7.6, 6, 9 Hz, -NHC0CH2CH2-) , 1.76— 1.69 (m, 1H - SCH^ (1H) -), 1.52—1.31 (m 4H -C0CH CH9CH?CH?-) , 1.18—1.10 (m 2H, - COCH CH9CH CH9 -)であつ た。 MALDI- TOF- MS測定を行ったところ、 m/z 878.39 [ (M+Na) +]であった 。 これらによって化合物 2 2の構造を確認することができた。 なお、 こ の化合物 2 2の分子質量は 8 5 5. 3 5である。
〔実施例 4 : リガンド複合体 (化合物 2 6 2 7 ) の合成〕
本実施例では、 実施の形態において説明した 7番目および 8番目のリ ガンド複合体に分類されるリガンド複合体を合成した。 すなわち、 7番 目のリガンド複合体の一つである 5番目のリガンド複合体の一つである 上記一般式 ( 1 4 ) にて表される構造において η 1が 3であり、 上記 X が一般式 (4 ) にて表される構造を備え、 R'が水素 (Η) であり、 R にグルコースが導入された構造を有するリガンド複合体 (化合物 2 6 )
、 および、 8番目のリガンド複合体の一つである上記一般式 ( 1 4 ) に て表される構造において η 1が 3であり、 上記 Xが一般式 (4 ) にて表 される構造を備え、 R'が水素 (Η) であり、 Rにマルトースが導入さ れた構造を有するリガンド複合体 (化合物 2 6 ) を以下の手順で合成し た。
なお、 測定方法、 試薬等については、 上記実施例 3に記載のものと同 じである。
( 1 ) 化合物 2 4の合成
以下、 式 ( 3 2 ) にしたがって説明する。 7
Figure imgf000073_0001
γ —メルカプト酪酸の 2量体 (化合物.2 3 ) (344 mg, 1.44 mmol) を無水ジクロロメタン (25 ml) に溶解し、 室温、 アルゴン雰囲気下で H OBt (359 mg, 2.64 mmol) 、 EDC · HC1 (508 mg, 2..64 mmol) 、 N - Boc - フエ二レンジァミン (化合物 1 1 ) (502 mg, 2.4 mmol) を 0 ° Cで順 に加え、 遮光下 17時間攪拌した。 この反応溶液を減圧濃縮して得られた 濃縮残渣をクロ口ホルムで抽出し、 有機層を 10% クェン酸、 飽和炭酸水 素ナトリ ゥム水溶液で 1回ずつ洗浄して、 乾燥剤と して無水硫酸マグネ シゥムを用いて乾燥させた後、 乾燥剤を濾去して減圧濃縮を行った。 減 圧濃縮によって得られた濃縮残渣をシリ力ゲルクロマ トグラフィー (50 g, トルエン : 酢酸ェチル = 5 : 1) で精製して、 化合物 2 4 (220 mg, 収率 : 30%) を黄色の油状物として得た。 この化合物 2 4の E S I — M S (positive) 測定を行ったところ、 m/z 641.25 [ (M+Na) +]であった。 これによつて化合物 2' 4の構造を確認することができた。 なお、 この化 合物 2 4の分子質量は 6 1 8. 2 5である。
( 2 ) 化合物 2 5の合成
化合物 2 4 (103 mg, 11.67 mmol) をジクロロメタン (2 ml) に溶解 し、 0°Cで TFA (247 μ 1) を加え、 同温で 1時間攪拌した。 反応溶液を 濃縮後、 トルエンで共沸した。 得.られた濃縮残渣を酢酸ェチルに溶解し 05003220
72
、 ト リェチルァミン水溶液を加えて、 水相の pHを 8 と した後、 有機相を 無水硫酸マグネシゥムを用いて乾燥させた後、 乾燥剤を濾去して減圧濃 縮を行った。 得られた濃縮残渣をシリカゲル力ラムクロマトグラフィー
(5 mg、 クロ口ホルム : アセ トン = 5: 1) で精製し、 ィヒ合物 2 5を黄 色の油状物と して得た。 収量は 46.8 mg (67%) であった。 この化合物 2 5につレヽて1 H- NMRスペク トル (600 MHz、 CDC13) 測定を行ったところ 、 δ 6.93-6.89 (m, 2H, aromaric), 6..71-6.68 (d, 1H, J = 8.4 Hz, ar omaric) , 6.37— 6.35 (d, 1H, J = 8.4 Hz, aromaric), 2.66 (t, 2H, J = 6.6 Hz, 0=C - C^), 2.36 (t, 2H, J = 7.2 Hz, (¾ - S), 1.98—1.9 4 (m, 2H, J
Figure imgf000074_0001
であった。 また、 化合物 2 5の E S I — MS (positive) 測定を行ったところ、 m/z 419.06 [ (M+H )+]であった。 以上から化合物 2 5の構造を確認することができた。 な お、 この化合物 2 5の分子質量は 4 1 8 · 1 5である。
( 3 ) リガ:ンド複合体 (化合物 2 6 ) の合成
. 以下、 式 ( 3 3 ) にしたがって説明する。
Figure imgf000074_0002
26
•••(33) 化合物 2 5 (5.04 mg, 12 μ mol) とグルコース (4.79 mg, 26 μ mol .) をメタノール/水 (1:1, 1 ml) に溶解し、 酢酸 (50 μ 1) を加え、 37 °Cで 4時間放置した。 反応液に酢酸 (950 μ 1) , メタノール/水 (1:1, 1 ml) , シァノ水素化ホウ素ナトリ ウム (5.14 mg, 72 μ mol) を加え 、 37°Cでさらに 72時間放置した。 反応液を濃縮した。 得られた残渣は、 2005/003220
73
L H— 2 0を用いたカラムクロマトグラフィー (50 g, メタノール 水 =50 / 50) によって精製した。 化合物 2 6は白色の.固体と して得られ た。 収量は 2.58 mg (29%) であった。
この化合物 2 6について1 H- NMRスぺク トル (600 MHz、 D20) 測定を行 つたと ころ、 56.94 (t, 1H, J = 7.8 Hz, aromaric) , 6.66 (s, 1H, a romaric), 6.55 (d, 1H, J = 8.4 Hz, aromaric), 6.37 (d, 1H, J = 9 .6 Hz, aromaric), 3.714 - 3.707 (m, 1H, J = 4.2 Hz) , 3.58—3.51 (m, 3H), 3.44- 3.37 (m, 2H,), 3.10-3.07 (m, 2H, J = 8.4 Hz, 13.8 Hz ), 2.56-2.50 (m, 2H, 0=C - , 2.24 (t, 2H, J = 3.6 Hz, - S) , Ϊ.83— 1.81 (m, 2H, であった。 MALDI - T0F-MS測定を行ったと ころ、 m/z 747.21[(M+H)+]であった。 これらによって化合物 2 6の構造 を確認することができた。 なお、 この化合物 2 6の分子質量は 7 4 6. 2 9である。
(4 ) リガンド複合体 (化合物 2 7 ) の合成
以下、 式 ( 3 4 ) に.したがって説明する。
Figure imgf000075_0001
(34) 化合物 2 5 (5.1 mg, 12 μ mol) とマル トース (9.2 mg, 26 μ mol) をメタノール/水 (1:1, 1 ml) に溶解し、 酢酸 (50 μ 1) を加え、 37°C. で 4時間放置した。 反応液に酢酸 (950 μ 1) , メタノール/水 (1:1, 1 ml) , シァノ水素化ホウ素ナトリ ウム (5.22 mg, 72 μ mol) を加え、 3 7°Cでさらに 120時間放置した。 反応液を濃縮した。 得られた残渣は、 L H - 2 0を用いたカラムクロマ トグラフィー (50 g, メタノール 水= 50/50) によって精製した。 化合物 2 7は白色の固体と して得られた。 収量は 2.74 mg (21%) であった。
この化合物 2 7について1 H-NMRスぺク トル (600 MHz, D20) 測定を行 つたところ、 δ 7.04 (t, 1H, J = 4.2 Hz, aromaric) , 6.77 (s, 1H, a romaric) , 6.64 (d, 1H, J = 7.8 Hz, aromaric) , 6.54 (d, 1H, J = 8 .4 Hz, aromaric) , 4.93 (d, 1H, J =3.6 Hz), 3.82-3.78 (m, 2H) , 3. 75 - 3.70 (m, 3H) , 3.63—3.56 (m, 3H), 3.48 (dd, 1H, J = 6.6 Hz, 11 .4 Hz), 3.41-3.39 (m, 1H) 3.27 (t, 1H, J = 9.0 Hz), 3.18 (s, 3H) , 3.08-3.06 (m, 1H) , 2.65 (t, 2H, 4.8 Hz , 0=C-CH2) , 2.34 (t, 2H, J = 7.2 Hz, CH^-S) , 1.91 (t, 2H, J = 7.2 Hz, CHsC^CH であった 。 MALDI- T0F-MS測定を行ったところ、 m/z 1093.27 [ (M+Na) +]であった 。 これらによって化合物 2 7の構造を確認することができた。 なお、 こ の化合物 2 7の分子質量は 1 0 7 0. 3 9である。
〔実施例 5〕
上記一般式 ( 9 ) にて表される構造において n 1および qが 0であり 、 上記群 ( 2 0 ) に示される糖鎖が導入されたリガンド複合体を合成し た。 なお、 測定方法、 試薬等は、 上記実施例 4 と同じである。
( 1 ) リガンド複合体 (化合物 3 0 ) の合成
リガンド複'合体 (化合物 3 0 ) の合成の手順を、 式 ( 3 5 ) にしたがつ て説明する。
Figure imgf000077_0001
Figure imgf000077_0002
NaBH3CN
DMAo/H20/AcOH (1/1/0.2)
Figure imgf000077_0003
30
•••(35) 化合物 2 8 (2.47 mg, 8.24 μ mol) とシアル酸含有三糠 (化合物 2 9、 5.11 mg, 7.57 μ mol) をジメチルァセトアミ ド /水 (1:1, 1.0 ml ) に溶解し、 酢酸 (100 μ 1) を加え、 37°Cで 10時間放置した。 反応液 にシァノ水素化ホウ素ナト リ ウム (1.55 mg, 24.7 - mol) を加え、 37 °Cでさらに 72時間放置した。 反応液にアセ トン 3 mlを加え、 未反応のシ ァノ化ホウ素ナトリ ウムをクェンチした後、 濃縮した。 得られた残渣は 、 C h r o m a t o r e x OD Sを用いたカラムクロマトグラフィー 、 H P L C (カラム : DAISO SP - 120 - 5 - ODS - BP) 、 Sephadex G-25を用レヽ たクロマトグラフィーを順に行って精製した。 化合物 3 0は白色の固体 と して得られた。 収量は 2.31 mg (32%) であった。
この化合物 3 0の1 H- NMRスぺク トル (600 MHz、 D20) 測定を行った。 図 7に示すチヤ一トが得られた。 また MALDI - T0F - MS測定を行ったところ 、 m/z 977.5 〔(M+Na)+]であつた。 これらによつて化合物 3 0の構造を 確認することができた。 なお、 この化合物 3 0の分子質量は 9 5 4. 3 4である。
( 2 ) リガンド複合体 (式 ( 3 6 ) ) の合成
式 ( 3 6 ) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で 合成した。
Figure imgf000078_0001
•(36) このリガンド複合体の1 H - NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート を図 8に示じた。 これによつて、 式 ( 3 6 ) にて表されるリガンド複合 体の構造を確認することができた。
. ( 3 ) リガンド複合体 (式 ( 3 7 ) ) の合成 . . 式 ( 3 7 ) にて表されるリガンド複合体を上記. ( 1 ) と同様の手順で 合成した。
Figure imgf000079_0001
•(37) このリガンド複合体の NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート ¾図 9に示し 。 これによ.つて、 式 ( 3 7 ) にて表されるリガンド複合 体の構造を確認することができた。
: (4 ) リガンド複合体 (式 ( 3 8 ) ) の合成
式'( 3 8 ) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で 合成した。
Figure imgf000079_0002
•••(38) このリガンド複合体の - NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート を図 1 0に示した。 これによつて、 式 ( 3 8 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認することができた。
( 5 ) リ ガンド複合体 (式 ( 3 9 ) ) の合成
式 ( 3 9 ) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で 合成した。
Figure imgf000080_0001
•••(39) このリガンド複合体の ¾- NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート を図 1 1に示した。 これによつて、 式 ( 3 9 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認することができた。
( 6 ) リガンド複合体 (式 (4 0 )' ) の合成
式 ( 4 0 )' にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で 合成した。
Figure imgf000081_0001
•(40) このリガンド複合体の1 H- NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート を.図 1 2に示した。 これによつて、 式 (.4 0 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認することができた。 .
( 7 ) リガンド複合体 (式 (4 1 ) ) の合成
式 (4 1 ) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で 合成した 0
Figure imgf000081_0002
•'•(41)
" このリガンド複合体の - NMRスベク トルを測定し、 得られたチャート を図 1 3に示した。 これによつて、 式 (4 1 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認することができた。
( 8 ) リガンド複合体 (式 (4 2 ) ) の合成
式 (4 2 ) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で '合成した。
Figure imgf000082_0001
このリガンド複合体の NMRスベク トルを測定し、 得られたチャート を図 1 4に示した。 これによつて、 式 (4 2 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認することができた。
( 9 ) リガンド複合体.(式 (4 3 ) ) の合成
• 式 (4 3 ) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で 合成した。
Figure imgf000082_0002
•(43)
• このリガンド複合体の - NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート を図 1 5に示した。 これによつて、 式 (4 3 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認することができた。
( 1 0 ) リガンド複合体 (式 (4 4 ) ) の合成 式 (4 4) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と'同様の手順で 合成した。
Figure imgf000083_0001
•(44)
' このリガンド複合体の1 H - NMRスペク トルを測定し、 得られたテヤート を図 1 6に示した。 これによつて、'式 (44) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認することができた。
I ( 1 1 ) リガンド複合体 (式 (4 5 ) ) の合成
式 (4 5) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で 合成した。
Figure imgf000083_0002
••'(45) このリガンド複合体の - NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート を図 1 7に示した。 これによつて、 式 (4 5 ) にて表される リガンド複 合体の構造を確認することができた。
( 1 2 ) リガンド複合体 (式 (4 6 ) ) の合成
式 (4 6 ) にて表されるリガンド複合体を上記
合成した。
Figure imgf000084_0001
•(46) このリガンド複合体の ^-NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート を図 1 8に示した。 これによって、 式 (4 6 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認するこ.とができた。
( 1 3 ) リガンド複合体 (式 (4 7 ) ) の合成
'. '式 (4 7 ) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で "合成した。
Figure imgf000084_0002
(47) このリガンド複合体の NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート を図 1 9に示した。 これによつて、 式 (4 7 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認することができた。
( 1 4) リガンド複合体 (式 (4 8 ) ) の合成
式 ( 4 8 ) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で 合成した。
Figure imgf000085_0001
•■•(48) このリガンド複合体の1 H-丽 Rスぺク トルを測定し、 得られたチヤ一ト を図 2 0に示した。 これによつて、 式 (4 8 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認するこ'とができた。
( 1 5 ) リガンド複合体 (式 (4 9 ) ) の合成
式 (4 9 ) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で 合成した。
Figure imgf000086_0001
•(49) このリガンド複合体の - NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート を図 2 1に示した。 これによつて、 式 (4 9 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認することができた。
( 1 6 ) リガンド複合.体 (式 ( 5 0 ) ) の合成
式 ( 5 0 ) にて表されるリガンド複合体を上記 ( 1 ) と同様の手順で 合成した。
Figure imgf000086_0002
•■•(50) このリガンド複合体の ^ - NMRスぺク トルを測定し、 得られたチャート を図 2 2に示した。 これによつて、 式 ( 5 0 ) にて表される リガンド複 合体の構造を確認することができた。
( 1 7 ) リガンド複合体 (式 ( 5 1 ) ) の合成
式 ( 5 1 ) にて表されるリガンド複合体を上記
合成した。
Figure imgf000087_0001
•(51) このリガンド複合体の1 H - NMRスぺク トルを測定し、 得られたチヤ一ト を図 2 3に示した。 これによつて、 式 ( 5 1 ) にて表されるリガンド複 合体の構造を確認することができた。
なお、 発明を実施する.ための最良の形態の項においてなした具体的な 実施態様または実施例は、 あくまでも、 本発明の技術内容を明らかにす るものであって、 そのような具体例にのみ限定して狭義に解釈されるべ 'きものではなく、 本発明の精神.と次に記载する請求の範囲内で、 いろい ろと変更して実施することができるものである。 産業上の利用の可能性
以上のように、 本発明にかかるリガンド複合体は、 一つのリガンド複 合体内に複数の糖分子を導入することができるので、 上記リガンド複合 体同士が支持体表面に集合化することを避けつつ、 糖分子については集 合化させることができる。 本発明のリ ンカー化合物を用いることによつ て、 上記糖分子とタンパク質との相互作用を再現性よく評価することが 可能になる。
また、 本発明にかかるリガンド担持体は、 未知タンパク質の同定に利 用することができるという効果を奏する。 さらに、 本発明にかかるタン パク質の分析方法によれば、 未知タンパク質の同定を行うことができる 本発明は、 タンパク質の機能解析に有効利用することのできる新規な リガンド複合体やリガンド担持体などを提供するものである。 オリ ゴ糖 鎖を固定化したリガンド担持体 (チップ) が糠鎖やタンパク質の機能解 祈のツールとして発展すれば、 ォリ ゴ糖鎖が関与する生命現象の解明に 貢献するだけでなく、 医薬品開発における重要な技術となることが期待 される。 それゆえ、 本発明の有用性は高いと考えられる。

Claims

87
請求の範囲
一般式 ( 1 )
Figure imgf000089_0001
(式中、 P , qはそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数) にて表される 構造を備え、
上記 Xと して、 末端に芳香族アミノ基を有するとともに、 主鎖に炭素 一窒素結合を有していてもよい炭化水素誘導鎖を、 1鎖又は 2鎖又は 3 鎖含んでなる構造を備え、 上記 Yと して、 硫黄原子又は硫黄原子を含む 炭化水素構造を備え、 上記 Zとして、 炭素一炭素結合又は炭素一酸素結 合を持つ直鎖構造を備えているリンカー化合物と、 還元末端を有する糖 とが、 上記芳香族アミノ基を介して結合している構造を有していること を特徴とするリガンド複合体。
2 . 上記 Yは、 S— S結合または S H基を含む炭化水素構造であること を特徴とする請求項 1に記載のリガンド複合体。
3 . 上記 Xは、 一般式 ( 2 )
Figure imgf000090_0001
(式中、 m1, m2, m3はそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数。 R ' は水素 (H) または R。 ) にて表される構造を備え、
上記 Rは糖鎖由来化合物であることを特癍とする請求項 1または 2 記載のリガンド複合体。
4. 上記 は、 一般式 ( 3 )
(3)
Figure imgf000090_0002
(式中、 m4, m5はそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数。 R' は水 素 (H) または RD ) にて表される構造を備え、
上記 Rは由来化合物であることを特徴とする請求項 1または 2に記載 のリガンド複合体。
5. 上記 Xは、 一般式 (4 )
Figure imgf000091_0001
(式中、 R' は水素 (Η) または R) にて表される構造を備え、 上記 Rは糖鎖由来化合物であることを特徴とする請求項 1または 2に 記載のリガンド複合体。
6. 上記 Ζは、 式 ( 5 ) または式 ( 6 )
Figure imgf000091_0002
Figure imgf000091_0003
(式中、 n 1, η 2はそれぞれ 1以上 6以下の整数) にて表される構造 を備えていることを特徴とする請求項 1または 2に記載のリガンド複合 体。
7. 一般式 〖 7 )
Figure imgf000092_0001
(式中、 m1, m2, m3はそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数、 n 1 は 1以上 6以下の整数) にて表される構造を備えているリンカー化合物 、 または、 一般式 ( 8 )
Figure imgf000092_0002
Γ (式中、 m4, m5はそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数、 η 1は 1以 上 6以下の整数) にて表される構造を備えているリ ンカ一化合物、 また は、 一般式 ( 9 )
Figure imgf000092_0003
' (式中、 n 1, qはそれぞれ独立して 0以上 6以下の整数) にて表され る構造を備えているリ ンカー化合物、 または、 一般式 ( 1 0 )
Figure imgf000093_0001
(式中、 n 2は 1以上 6以下の整数) にて表される構造を備えているリ 5 ンカー化合物、 または、 一般式 ( 1 1 )
Figure imgf000093_0002
10 . (式中、 n 1は 1以上 6以下の整数) にて表される構造を備えているリ , ' ンカー化合物と、
, . 還元末端を有する糖とを用いて還元アミノ化反応を行うことを特徴と - するリガンド複合体の製造方法。
,
8 . 請求項 1ないし 6の何れか 1項に記載のリガンド複合体を、 .表面に ^ 金属を有する支持体上に固定化させてなることを特徴とするリガンド担 持体。
9 . タンパク質の分析に使用されることを特徴とする請求項 8に記載の リガンド担持体。
1 0 . 請求項 1ないし 6の何れか 1項に記載のリガンド複合体を、 支持 20 体と接触させることによって、 当該リガンド複合体を支持体上に固定化 させたリガンド担持体を作成する工程と、
' 上記リガンド担持体を、 タンパク質溶液と接触させた後、 分子間相互 作用の測定を行う工程と、
上記分子間相互作用の測定の後に質量分析を行って、 上記リガンド担 2「 持体に結合しているタンパク質を同定する工程と、 からなることを特徴とするタンパク質の分析方法。
PCT/JP2005/003220 2004-02-18 2005-02-18 糖鎖リガンド複合体、およびそのリガンド複合体を用いたタンパク質の分析方法 WO2005077965A1 (ja)

Priority Applications (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP05710751A EP1726596A4 (en) 2004-02-18 2005-02-18 SUGAR CHAIN LIGAND COMPOSITE AND METHOD OF PROTEIN ANALYSIS WITH LIGAND COMPOSITE
CA2556406A CA2556406C (en) 2004-02-18 2005-02-18 Sugar chain ligand composite and method of analyzing protein with the ligand composite
CN2005800051869A CN1930179B (zh) 2004-02-18 2005-02-18 糖链配体络合物和利用该配体络合物的蛋白质的分析方法
US10/590,045 US8765384B2 (en) 2004-02-18 2005-02-18 Carbohydrate-ligand conjugates and their application for the analysis of carbohydrate-protein interaction
JP2005518081A JP4800771B2 (ja) 2004-02-18 2005-02-18 糖鎖リガンド複合体、およびそのリガンド複合体を用いたタンパク質の分析方法
IL177526A IL177526A0 (en) 2004-02-18 2006-08-16 Sugar chain ligand composite and method of analyzing protein with the ligand composite
US14/274,521 US20140295566A1 (en) 2004-02-18 2014-05-09 Carbohydrate-ligand conjugates and their application for the analysis of carbohydrate-protein interaction

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2004041994 2004-02-18
JP2004-041994 2004-02-18

Related Child Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
US10/590,045 A-371-Of-International US8765384B2 (en) 2004-02-18 2005-02-18 Carbohydrate-ligand conjugates and their application for the analysis of carbohydrate-protein interaction
US14/274,521 Division US20140295566A1 (en) 2004-02-18 2014-05-09 Carbohydrate-ligand conjugates and their application for the analysis of carbohydrate-protein interaction

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2005077965A1 true WO2005077965A1 (ja) 2005-08-25

Family

ID=34857959

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/JP2005/003220 WO2005077965A1 (ja) 2004-02-18 2005-02-18 糖鎖リガンド複合体、およびそのリガンド複合体を用いたタンパク質の分析方法

Country Status (9)

Country Link
US (2) US8765384B2 (ja)
EP (1) EP1726596A4 (ja)
JP (2) JP4800771B2 (ja)
KR (1) KR100811969B1 (ja)
CN (1) CN1930179B (ja)
CA (1) CA2556406C (ja)
IL (1) IL177526A0 (ja)
TW (1) TWI356816B (ja)
WO (1) WO2005077965A1 (ja)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2009057755A1 (ja) * 2007-11-02 2009-05-07 National Institute Of Advanced Industrial Science And Technology 糖鎖アレイ基板とそれを用いた糖鎖結合分子検出法
US9239329B2 (en) 2006-12-18 2016-01-19 Japan Science And Technology Agency Method of measuring interaction between biomaterial and sugar chain, method of evaluating biomaterial in sugar chain selectivity, method of screening biomaterial, method of patterning biomaterials, and kits for performing these methods
US9464281B2 (en) 2009-07-28 2016-10-11 SUDx-Biotec Corporation Method for concentrating viruses, method for concentrating cells or bacteria, and magnetic composite

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20110243851A1 (en) 2008-12-11 2011-10-06 Agency For Science, Technology And Research Glucose-peg conjugates for reducing glucose transport into a cell
US7928067B2 (en) * 2009-05-14 2011-04-19 Ischemix Llc Compositions and methods for treating ischemia and ischemia-reperfusion injury
ES2640474T3 (es) 2010-11-18 2017-11-03 Ischemix Llc Compuestos lipoílicos y su uso para el tratamiento de la lesión isquémica
TWI493042B (zh) * 2012-03-05 2015-07-21 Sudx Life Science Corp 自唾液檢體檢測hiv-1之早期檢測方法及其聚糖固定化金屬奈米粒子
ES2952834T3 (es) 2017-04-25 2023-11-06 Ischemix Llc Lipoil-Glu-Ala para el tratamiento de daño neurodegenerativo producido por traumatismo craneoencefálico

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2003083969A (ja) * 2001-09-14 2003-03-19 Japan Science & Technology Corp リンカー化合物およびリガンド並びにオリゴ糖鎖の固定化方法および蛋白質分析用の支持体
WO2004022583A1 (ja) * 2002-09-09 2004-03-18 Japan Science And Technology Agency リンカー化合物及びリガンド、並びにそれらの製造方法

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB9518429D0 (en) 1995-09-08 1995-11-08 Pharmacia Biosensor A rapid method for providing kinetic and structural data in molecular interaction analysis
JP3834607B2 (ja) 2000-06-28 2006-10-18 国立大学法人大阪大学 オリゴ糖鎖・フェニレンジアミン複合化合物の製造方法、オリゴ糖鎖集合化用リンカー化合物、リンカー化合物により集合化したオリゴ糖鎖・フェニレンジアミン複合化合物
JP2002022745A (ja) * 2000-07-12 2002-01-23 National Institute Of Advanced Industrial & Technology 大腸菌o−157の生産するベロ毒素の検出センサー及びその検出方法
US6821529B2 (en) 2001-09-05 2004-11-23 Deanna Jean Nelson Oligo(ethylene glycoll)-terminated 1,2-dithiolanes and their conjugates useful for preparing self-assembled monolayers
JP4430344B2 (ja) 2002-09-09 2010-03-10 独立行政法人科学技術振興機構 多岐用途型リンカー化合物及びリガンド、並びにそれらの製造方法
EP1731517B1 (en) * 2004-02-05 2010-11-17 Japan Science and Technology Agency Linker compound, ligand complex and process for producing them

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2003083969A (ja) * 2001-09-14 2003-03-19 Japan Science & Technology Corp リンカー化合物およびリガンド並びにオリゴ糖鎖の固定化方法および蛋白質分析用の支持体
WO2004022583A1 (ja) * 2002-09-09 2004-03-18 Japan Science And Technology Agency リンカー化合物及びリガンド、並びにそれらの製造方法

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
KONO A. ET AL: "Heparin Bubun Kozo o Yusuru Cluster-ka Oligosaccharide Ligand no Gosei to Chip Technology eno Oyo.", THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN KOEN YOKOSHU., vol. 82, 2002, pages 137, XP002991805 *
KONO A. ET AL: "Ryusana Oligosaccharide o Shugoka shite Koteika shita Sugar Chip no Chosei to SPR-ho eno Oyo.", THE JAPANESE SOCIETY OF CARBOHYDRATE RESEARCH NENKAI YOSHISHU., vol. 24, 2003, pages 127, XP002991804 *
SUDA Y. ET AL: "oligosaccharide Chain no Nano Level Kino Kaisei System no Kaihatsu.", THE JAPANESE SOCIETY OF CARBOHYDRATE RESEARCH., vol. 24, 2003, pages 36, XP002991262 *

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9239329B2 (en) 2006-12-18 2016-01-19 Japan Science And Technology Agency Method of measuring interaction between biomaterial and sugar chain, method of evaluating biomaterial in sugar chain selectivity, method of screening biomaterial, method of patterning biomaterials, and kits for performing these methods
WO2009057755A1 (ja) * 2007-11-02 2009-05-07 National Institute Of Advanced Industrial Science And Technology 糖鎖アレイ基板とそれを用いた糖鎖結合分子検出法
JP5454896B2 (ja) * 2007-11-02 2014-03-26 独立行政法人産業技術総合研究所 糖鎖アレイ基板とそれを用いた糖鎖結合分子検出法
US9464281B2 (en) 2009-07-28 2016-10-11 SUDx-Biotec Corporation Method for concentrating viruses, method for concentrating cells or bacteria, and magnetic composite

Also Published As

Publication number Publication date
TW200533632A (en) 2005-10-16
CN1930179B (zh) 2010-06-09
US20070287195A1 (en) 2007-12-13
JPWO2005077965A1 (ja) 2007-10-18
US20140295566A1 (en) 2014-10-02
CA2556406A1 (en) 2005-08-25
EP1726596A4 (en) 2009-08-26
CA2556406C (en) 2013-04-02
KR20060122961A (ko) 2006-11-30
JP5339310B2 (ja) 2013-11-13
TWI356816B (en) 2012-01-21
IL177526A0 (en) 2006-12-10
KR100811969B1 (ko) 2008-03-10
JP2011201921A (ja) 2011-10-13
CN1930179A (zh) 2007-03-14
EP1726596A1 (en) 2006-11-29
JP4800771B2 (ja) 2011-10-26
US8765384B2 (en) 2014-07-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP5339310B2 (ja) 糖鎖リガンド複合体、およびそのリガンド複合体を用いたタンパク質の分析方法
Arosio et al. Synthesis and cholera toxin binding properties of multivalent GM1 mimics
Virta et al. Solid-supported synthesis of oligomeric bioconjugates
CA2500190C (en) Linker compound, ligand, and producing method thereof
JP4628960B2 (ja) リンカー化合物及びリガンド複合体、並びにそれらの製造方法
JP4430344B2 (ja) 多岐用途型リンカー化合物及びリガンド、並びにそれらの製造方法
KR100877644B1 (ko) 링커 화합물 및 리간드 복합체, 및 그것들의 제조 방법
Nelson Carbohydrate-containing polymers and macrocycles
JPH08134089A (ja) 糖脂質誘導体およびその製造法

Legal Events

Date Code Title Description
AK Designated states

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): AE AG AL AM AT AU AZ BA BB BG BR BW BY BZ CA CH CN CO CR CU CZ DE DK DM DZ EC EE EG ES FI GB GD GE GH GM HR HU ID IL IN IS JP KE KG KP KR KZ LC LK LR LS LT LU LV MA MD MG MK MN MW MX MZ NA NI NO NZ OM PG PH PL PT RO RU SC SD SE SG SK SL SY TJ TM TN TR TT TZ UA UG US UZ VC VN YU ZA ZM ZW

AL Designated countries for regional patents

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): BW GH GM KE LS MW MZ NA SD SL SZ TZ UG ZM ZW AM AZ BY KG KZ MD RU TJ TM AT BE BG CH CY CZ DE DK EE ES FI FR GB GR HU IE IS IT LT LU MC NL PL PT RO SE SI SK TR BF BJ CF CG CI CM GA GN GQ GW ML MR NE SN TD TG

121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application
DPEN Request for preliminary examination filed prior to expiration of 19th month from priority date (pct application filed from 20040101)
WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2556406

Country of ref document: CA

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 177526

Country of ref document: IL

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2005518081

Country of ref document: JP

Ref document number: 200580005186.9

Country of ref document: CN

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

WWW Wipo information: withdrawn in national office

Country of ref document: DE

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2005710751

Country of ref document: EP

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 1020067019099

Country of ref document: KR

WWP Wipo information: published in national office

Ref document number: 2005710751

Country of ref document: EP

WWP Wipo information: published in national office

Ref document number: 1020067019099

Country of ref document: KR

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 10590045

Country of ref document: US

WWP Wipo information: published in national office

Ref document number: 10590045

Country of ref document: US