WO1999041362A1 - Appareil pour preparation de genotheque immobilisee, appareil pour amplification de gene, procede de regulation de temperature et procede de comparaison systematique des genes - Google Patents

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Description

明 細 書 固定化 D N Aライブラリー作製装置、 遺伝子増幅装置、 温度制御方法及び遺伝子 を系統的に比較する方法 技術分野
本発明は、 遺伝子工学、 蛋白質工学、 細胞工学、 発生工学、 免疫学等の、 分子 生物学関連分野や生化学関連分野等において、 微量の溶液で加熱を伴う各種反応 に使用する反応装置に関する。 より詳しくは、 固定化 D N Aライブラリー作製方
( 0 法、 遺伝子増幅方法、 遺伝子を系統的に比較する方法及びそれらに用いる装置、 さらにはそれに用いる固定化 D N Aライブラリーに関する。
背景技術
従来、 遺伝子増幅する手段として、 ポリメラーゼ ·チェイン ' リアクション
I 5 ( P C R ) 法が広く用いられている。 この P C R法は、 反応溶液をいれたチュー ブ状のプラスチック反応容器をアルミプロックなどの中に挿入し、 反応溶液の水 分蒸発を防止するため蓋をし、 アルミブロックの温度を、 熱変性温度、 ァニーリ ング温度、 D N A合成温度の順に熱サイクルを所定の回数コントロールするとい うものである。
20 しかしながら、 このような従来の P C R法に用いられた装置では、 熱容量が大 きく熱伝導性が悪いブラスチック反応容器が用レ、られており、 しかもアルミブ口 ック自体を温度コントロールするため、 昇温や冷却に時間がかかるという問題点 があった。
また、 反応溶液の温度制御が完全ではないため、 目的とする D N Aの複製収量
2- が低いという問題点もあった。
本発明は、 上記問題点に鑑み、 操作が簡単で、 昇温や冷却を迅速に行え、 反応 の熱サイクルを短時間で行える遺伝子増幅装置及び遺伝子増幅方法を提供するこ とを技術的課題とする。
また、 このような装置に用いることが好適な D N Aを固定化した基体及び固定 化 D N Aライブラリー作製方法を提供することも、 本発明の技術的課題である。 さらに、 上記装置を用いて遺伝子を系統的に比較をする方法を提供することも、 本発明の技術的課題である。
発明の概要
本発明の固定化 D N Aライブラリ一作製装置は、 容器を挿入する凹部が形成さ ( 0 れた反応器本体と、 この反応器本体の上部に取付けられ、 加熱 '冷却手段、 冷却 手段を設けた蓋部とが設けられた装置であって、 前記容器は、 化学修飾された基 体で形成されていることを特徴とする。
本発明の遺伝子増幅装置は、 容器を挿入する凹部が形成された反応器本体と、 この反応器本体の上部に取付けられ、 加熱 ·冷却手段、 冷却手段を設けた蓋部と ( 5 が設けられた装置であって、 前記容器は、 化学修飾された基体で形成されている ことを特徴とする。
本発明の遺伝子増幅装置は、 容器を揷入する凹部が形成された反応器本体と、 この反応器本体の上部に取付けられ、 加熱 '冷却手段、 冷却手段を設けた蓋部と が設けられた装置であって、 前記容器は、 遺伝子を固定化した基体で形成されて ζθ いることを特徴とする。
これらの装置は、 前記基体が、 固体状の基体であることが望ましく、 前記容器 が分解型であることが望ましく、 前記容器がカセット型であることが望ましい。 本発明の遺伝子増幅装置の温度制御方法は、 温度測定部 6 1からの信号をコン ピュータ制御部 6 4に入力し、 コンピュータ制御部 6 4は予め入力されたプ口グ ^ ラムチャートと比較し、 加熱 ·冷却手段 5 1の温度制御部 6 2と冷却手段 5 2の 温度制御部 6 3とを駆動させることを特徴とする。 本発明の D N Aを固定化した基体は、 これらの装置で用いる基体であることを 特徴とする。
本発明の基体を冷凍保存する方法は、 D N Aを固定化した基体を冷凍保存する ことを特徴とする。
？ 本発明の遺伝子を系統的に比較する方法は、 複数個の固定化 D N Aライブラリ 一を容器内に設置してするものであることを特徴とする。 図面の簡単な説明
図 1は、 本発明の遺伝子増幅装置を開蓋した状態を示す概略平面図である。 図 ! ϋ 2は、 図 1の A— Α断面概略図である。 図 3は、 図 1の B— B断面概略図である。
図 4は、 容器の組立概略図である。 図 5は、 本発明の遺伝子増幅装置の断面状態 を示す概略断面図である。 図 6は、 本発明の遺伝子増幅装置の温度制御を示す概 略図である。 図 7は、 固定化 c D N Aライブラリーの作成及び遺伝子増幅の説明 図である。 図 8は、 固定化 g D N Aライブラリーの作成及び遺伝子増幅の説明図 15 である。 発明を実施するための最良の形態
本発明の遺伝子増幅装置を図面を用いて説明する。
図 1は、 本発明の遺伝子増幅装置を開蓋した状態を示す概略平面図である。 図 2 D は、 図 1の A— A断面概略図である。 図 3は、 図 1の B— B断面概略図である。
図 4は、 容器の組立概略図である。 図 5は、 本発明の遺伝子増幅装置の断面状態 を示す概略断面図である。
図 1〜図 3において、 1 0は反応器本体、 1 1は反応器本体内に形成された凹 部である。 反応器本体 1 0は、 化学的に安定な、 たとえばアクリル樹脂、 ポリス ^ チレン樹脂等の高分子材料で形成されることが望ましい。 凹部 1 1は反応器本体 内に少なく とも 1個設けられており、 たとえば、 円筒状、 三角もしくは四角等の 多角柱状などのものが好ましい。
容器 1 2は、 熱伝導性のよい基体 4 1、 たとえばダイヤモンド基体、 窒化アル ミ、 炭化珪素などのセラッミタス基体や、 アルミニウム、 ステンレススチール等 の金属基体から構成されていることが好ましい。
あるいは、 一部にダイヤモンドが形成されたダイヤモンドライク 'カーボン、 炭 素、 炭素化合物なども好ましい。 また、 ポリカーボネートやフッ素樹脂等のブラ スチック基体等も好ましい。 さらに上記基体を組み合わせたもので形成されてい ることも好ましい。
容器 1 2は底付きのものであればよく、 凹部 1 1に埋設 ·取外しが容易に行える ことが好ましい。
また、 容器 1 2は、 基体 4 1を底や側壁を分解型にしておくことも好ましく、 たとえば四角柱状の容器であれば、 底 1枚、 側壁 4枚の基体に分解できる。 たと えば図 4の （a ) に示すように、 一辺が 5〜 1 O mm程度で厚みが 0 . 1 mm程 度の基体 4 1を、 たとえば （b ) に示すように、 合成樹脂製の基体ホルダー 4 2 内の底 4 3と側壁 4 4とに組み立てて容器 1 2とすることができる （ （c ) 参 照） 。
この場合、 容器 1 2は、 底、 側壁の少なくとも 1枚は上記基体上に遺伝子を固 定化したもので形成されているものを用いることが好ましい。
さらに、 これらの容器をいくつか連結して （カセット型） 、 複数の容器を複数 の凹部 1 1にワンタッチで埋設 ·取外しできるようにして、 操作の効率化を図る こともできる。 このカセッ ト型の具体的態様については後述の固定化 D N Aライ ブラリーの部分で詳述する。
図 5は、 本発明の遺伝子増幅装置の断面状態を示す概略断面図である。 図 5に おいて、 （a ) は、 反応器本体 1 0の上部に蓋部 5 0を設置する態様を示した概 略説明図である。 （b ) は、 図 5の （a ) に示す C一 C断面概略図である。 図 5 において、 5 0は蓋部、 5 1は加熱 ·冷却手段、 5 2は冷却手段を示す 蓋部 5 0は、 化学的に安定な、 たとえばアク リル樹脂、 ポリスチレン樹脂等の高分子材 料で形成されることが望ましい。
加熱 ·冷却手段 5 1は、 容器 1 2と接触して容器 1 2を加熱 ·冷却する手段で あり、 ペルチェ素子、 電熱ヒータ、 赤外線ランプ等を用いるのが好ましい。 この
5 加熱 ·冷却手段 5 1を、 容器 1 2と直接的に接触させて設置することによって容 器 1 2の温度を直接的に制御できるので、 従来の増幅装置よりも温度制御精度が よい。 冷却手段 5 2は、 冷却水や冷風を流通させるパイブや冷却ファンを設置し たュニットであり、 容器 1 2を急速に冷却するための手段である。
図 6は、 本発明の遺伝子増幅装置の温度制御を示す概略図である。 図 6におい
I C て、 容器 1 2の温度制御は、 温度測定部 6 1からの情報に基づき加熱 ·冷却手段 5 1の温度制御部 6 2と冷却手段 5 2の温度制御部 6 3とによつて行われる。 す なわち容器 1 2の底もしくは側壁に直接的に接して設けられた温度測定部 6 1か らの信号をコンピュータ制御部 6 4に入力し、 コンピュータ制御部 6 4は予め入 力されてあるプログラムチャート （昇温速度、 保持温度、 保持時間、 降温速度
I 等） と比較し、 加熱 ·冷却手段 5 1の温度制御部 6 2と冷却手段 5 2の温度制御 部 6 3を駆動させる。
実施例
本発明の実施例を図 7及び図 8を用いてさらに詳細に説明する。
容器 1 2として 5 mm四方 （厚さ 0 . 1 mm) のダイヤモンドチップ 4 1をダイ ZD ャモンド基体として用いた。 このダイヤモンドチップ 4 1を、 底に 1枚と側壁に 4枚使用して、 図 4に示すように、 合成樹脂製の基体ホルダー 4 2の側壁に組み 立てて容器 1 2とした。 この側壁に使用したダイヤモンドチップ 4 1にはすでに 有機カルボン酸で化学修飾済みのものを用いた。 その後蓋部 5 0を、 反応器本体 1 0上部に設置した。
2 (固定化 D N Aライブラリ一の作製）
次に、 固定化 D N Aライブラリーの作製例を図 7 , 図 8を用いて説明する、 ま ず、 有機カルボン酸で化学修飾した 4枚のダイヤモンドチップ 4 1を用いて構成 した容器 1 2内の溶液と接触するダイヤモンドチップ 4 1表面に、 mRNA (me ssenger RNA:メッセンジャー RNA) の場合はォリゴー d T , B 。 を、 一方 gD NA (genomic DNA:染色体 DNA) の場合は目的の制限酵素部位を持ったオリゴ ヌクレオチドを、 まず化学的なエステル結合反応によって固定化した （図 7、 図 8参照） 。 これらの固定化反応のためには、 ォリゴー dT,™ では 3' 末端側 及びオリゴヌクレオチドでは 5 ' 末端側がアミノ基を有するアデニン （A) かシ トシン （C) であることが要求される。 なお、 図 7、 図 8において、 " ADC— R— " で示す記号は、 有機カルボン酸を化学修飾したダイヤモンドチップを表す。 Ό 次に、 c DNA (complementary DNA) ライブラリーでの場合は、 組織 ·細胞か ら抽出した全 RN A溶液を加えて 0〜4°Cの低温で mRNAを固定化オリゴー d T, «-2。 にハイブリダィズさせた後に、 37〜60°Cの範囲内での適当な一定温 度で逆転写酵素 （Reverse Transcriptase： RT) によって c D N A合成を行った。 このときの c DNAは、 固定化オリゴ一 d Τ , κ— 2。 の 5' へ向けての延長反応さ
)5 せ固定化したものを用いた。
合成された固定化 c DN Αと mRNAとのハイブリダイズ状態にある溶液を 9 0°Cに昇温させて mRNAを脱ハイブリダィズした後、 反応溶液を T r i s— E DTA(TE)緩衝液に交換し、 再度 0〜4°Cの低温にしてエタノール洗浄し、 一 本鎖 DN Aの状態の精製された固定化 c DN Aライブラリーを作製した （図 7参 ζΌ 照） 。
gDNAライブラリーでの場合は、 まず、 目的の制限酵素部位を持った固定側 オリゴヌクレオチド （図 8参照） を上記のォリゴー d T - の場合と同様にダ ィャモンドチップ 4 1の表面に固定化した。 次に、 その化学的な固定化のための 反応溶液を 0〜 4 °Cの低温でハイブリ側ォリゴヌクレオチドと目的の制限酵素を 25" 含む反応溶液に交換した。 そして、 オリゴヌクレオチド間のハイブリダイゼーシ ョン後、 3 7 °Cにまで昇温して半固定化されたオリゴヌクレオチドの制限酵素切 断を行った。
制限酵素切断後に、 再度反応容器を 0〜4°Cの低温にして、 目的の制限酵素で 断片化した g DN Aとライゲーシヨン酵素 （Ligase) を含む反応溶液に交換し、 再び温度を 3 7°Cにまで上昇させてライゲーシヨン反応を行い、 一本鎖 DNAの 状態の g DN Aライブラリーを作製した （図 8参照） 。
なお、 ダイヤモンドチップ 4 1の表面上に上記作製された固定化 c DN Aライ ブラリー或いは上記作製された固定化 g D N Aライブラリ一を、
①多検体での同種の組織 ·細胞の遺伝子変異の比較、
②同一検体での各組織 ·細胞の遺伝子発現変動の比較、
10 ③同一検体での治療 ·手術等に伴う余後経過に対応する遺伝子発現変動の比較、 等を目的として、 それぞれを別の容器内に設置することができる。
たとえば①の場合は、 同種の組織 ·細胞の遺伝子変異の比較をするために、 多 検体 （固定化 DNAライブラリーを有した複数のダイヤモンドチップ） を、 別の 容器中に設置し、 これらの複数の容器を連結した 1カセットとする。 そしてこれ 15 らのカセットを反応器本体に埋設する。 さらにこれらのカセットを 2カセット以 上を系統的に作れば、 効率的に多検体の比較を行うことができる。
本発明では、 これらの複数の容器を連結した 1カセットあるいは複数のカセッ カセッ トを集合体にして、 これらのそれぞれの容器内に固定化 DN Aライブラリ 一を設置したものを、 カセット型固定化 DNAライブラリーとする。 本発明では αθ これらのカセッ ト型固定化 DNAライブラリーを用いて、 前記①〜②の比較を系 統的に行うことによって、 遺伝子の変動を効率的に調査できる。
そして、 このカセット型固定化 DNAライブラリ一は、 P CR過程に供しなか つた場合でも供した場合でも、 その容器を TE緩衝液及び 7 0〜 7 5%のェタノ ール水溶液で十分に洗浄後、 1 00%エタノールに浸潤して冷凍保存すれば、 比 ιζ 較データ等の要求に応じて半永久的に利用可能である。
(固定化 DNAライブラリーを用いての遺伝子増幅） 上記の固定化 c DNAライブラリー又は gDNAライブラリーで作製したカセ ット型固定化 DN Aライブラリーで容器 1 2の側壁を構成した。 この容器 1 2内 面を TE緩衝液で十分に洗浄後、 増幅目的の DN Aに対するプライマーをセット し、 4種のヌクレオチド及び DN Aポリメラーゼを含む P C R反応溶液を加えた c
5" その後、 容器 12を、 二本鎖の DNAを一本鎖 DNAに分離させる熱変性温度
(95°0で約1. 5分間） 、 一本鎖 DN Aと DNAプライマとを結合させるァニ 一リング温度 （ 45 °Cで約 1分間） 、 耐熱性 D N Aポリメラーゼにより D N A鎖 の伸長反応を行わせる DN A増幅温度 （74°Cで約 2分間） にそれぞれ順に温度 制御し、 これらの温度変化を 30サイクル繰り返し PC Rを行った （図 7, 図 8 ιθ 参照） 。
なお、 多検体の遺伝子診断を一度に短時間で可能にするためには、 このカセッ ト型固定化 DNAライブラリー作製 ·遺伝子増幅装置を必要な数だけ並列的に配 置できる形のシステムを提供することで解決できる。 この場合は、 例えば、 50 試料の処理では、 5組の本発明の遺伝子増幅装置を並列的に配置した形にするこ 15 とが好ましい。 産業上の利用可能性
本発明の装置を用いれば、 反応容器内の反応溶液を昇温や冷却を迅速に行うこ とができるので、 非常に短時間で DNAの増幅を行うことができる。 また、 自動 2J0 化遺伝子診断装置にも適用可能である。 すなわち、 自動化遺伝子診断装置の開発 において技術的に最も重要な 2点は、 半永久的に利用可能なカセッ ト型固定化ラ ィブラリ一の作製及び遺伝子増幅の効率 ·特異性の優れた遺伝子増幅装置の開発 である。
前記の両方の問題点は、 ライブラリー作製から PC Rまでの一連の操作を温度 制御が、 同一基体でもってできるという最高の利点から、 現状では最も簡便、 小 型で高性能な形の自動化カセット型固定化 DN Aライブラリー作製及び遺伝子増 幅装置を提供することができる。
すなわち、 本発明の装置を用いれば、 D N A固定化反応の直接的な温度制御に 加えて、 D N Aライブラリ一を固定化したダイヤモンドチップをそのまま利用し ての遺伝子増幅に関する直接的な温度制御も可能である。
5 さらに本発明の装置は、 高熱伝導性のダイヤモンドなどの基体を用いての P C R反応溶液の直接的な温度制御を行うことができるので、 P C Rの温度制御効率 を格段に進歩させて所要時間を大幅に短縮することができるのみならず、 目的 D N Aの特異的増幅といった P C R効率も上昇させることができる。
また、 本発明の基体に高熱伝導性の基体を用いれば、 高熱伝導性の他に、 化学
1C 試薬に对して安定である点、 耐熱性に優れている点、 放射線照射によるダメージ が少ない点等のダイヤモンドの特性を利用することにより、 作製された固定化 D N Aライブラリ一は非常に安定なものとなり、 一度カセット型固定化 D N Aライ ブラリ一を作製すれば、 何度の繰返し利用も可能な半永久的な D N Aライブラリ 一を提供することができる。
! 5 なお、 ダイヤモンド基体の高熱伝導性を利用して、 化学修飾していないダイヤ モンド基体等のチップを本発明の増幅装置内にセットして、 従来行われている P C R法を行うこともできる。

Claims

請 求 の 範 囲
1、 容器を挿入する凹部が形成された反応器本体と、
この反応器本体の上部に取付けられ、 加熱 ·冷却手段、 冷却手段を設けた蓋部と が設けられた装置であって、 前記容器は、 化学修飾された基体で形成されている 固定化 D N Aライブラリ一作製装置。
2、 容器を挿入する凹部が形成された反応器本体と、
この反応器本体の上部に取付けられ、 加熱 ·冷却手段、 冷却手段を設けた蓋部と が設けられた装置であって、 前記容器は、 化学修飾された基体で形成されているC 遺伝子増幅装置。
3、 容器を揷入する凹部が形成された反応器本体と、
この反応器本体の上部に取付けられ、 加熱 ·冷却手段、 冷却手段を設けた蓋部と が設けられた装置であって、 前記容器は、 遺伝子を固定化した基体で形成されて いる遺伝子増幅装置。
i5
4、 前記基体が、 固体状の基体である請求項 1〜3のいずれかに記載の装置。
5、 前記容器が分解型である請求項 1〜4のいずれかに記載の装置。
6、 前記容器がカセット型である請求項 1〜5のいずれかに記載の装置。
7、 請求項 1〜6のいずれかに記載の装置において、
温度測定部 6 1からの信号をコンピュータ制御部 6 4に入力し、 コンピュータ制 Ζΰ 御部 6 4は予め入力されたプログラムチャートと比較し、 加熱 ·冷却手段 5 1の 温度制御部 6 2と冷却手段 5 2の温度制御部 6 3とを駆動させる遺伝子増幅装置 の温度制御方法。
8、 請求項 1〜 6記載のいずれかの装置で用いる D N Αを固定化した基体。 9， D N Aを固定化した基体を冷凍保存する方法。
1 0、 複数個の固定化 D N Aライブラリーを容器内に設置し、 遺伝子を系統的 に比較する方法。
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Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2000068368A1 (fr) * 1999-05-10 2000-11-16 Toyo Kohan Co.,Ltd. Procedes de construction de banque d'adn et support sur lequel ladite banque d'adn est immobilisee
JP2001074750A (ja) * 1999-09-07 2001-03-23 Kyowa Medex Co Ltd 恒温装置及びこれを用いた恒温ユニット
WO2002052266A1 (fr) * 2000-12-25 2002-07-04 Japan Science And Technology Corporation Procede permettant de fixer un acide nucleique sur un diamant, conjugue diamant-mononucleoside et conjugue diamant-acide nucleique
WO2005054458A1 (ja) * 2003-12-03 2005-06-16 Hitachi High-Technologies Corporation 核酸分析方法、核酸分析用セル、および核酸分析装置
JP2008125459A (ja) * 2006-11-22 2008-06-05 National Agriculture & Food Research Organization 温度感作実験用金属製微量試験管及びそれを用いた微量液体試料中の微生物の加熱殺菌実験方法

Families Citing this family (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8293064B2 (en) * 1998-03-02 2012-10-23 Cepheid Method for fabricating a reaction vessel
US6657169B2 (en) * 1999-07-30 2003-12-02 Stratagene Apparatus for thermally cycling samples of biological material with substantial temperature uniformity
US6403037B1 (en) * 2000-02-04 2002-06-11 Cepheid Reaction vessel and temperature control system
KR20030029928A (ko) * 2000-09-06 2003-04-16 도요 고한 가부시키가이샤 표면처리층이 형성된 고체 지지체
EP1266958A1 (en) * 2001-06-11 2002-12-18 Tao-Kuang Chang Bio-chip substrate for the embedding of DNA or protein and its fabrication method
US20030170883A1 (en) * 2002-03-11 2003-09-11 Corning Incorporated Microplate manufactured from a thermally conductive material and methods for making and using such microplates
GB2402090B (en) * 2003-05-30 2006-12-06 Electrothermal Eng Ltd Multi-station reaction apparatus
US7659110B2 (en) * 2005-01-21 2010-02-09 Thermogen Inc. DNA amplification device
KR101269741B1 (ko) * 2006-07-04 2013-05-30 쓰리엠 이노베이티브 프로퍼티즈 캄파니 탄성 및 접착성을 갖는 전자기파 차단용 가스켓
EP2185929A4 (en) * 2007-08-09 2015-04-29 Univ Arizona DETECTION AND IDENTIFICATION OF BIOLOGICAL SAMPLES USING MICROFLUIDIC DEVICES
RU2487944C2 (ru) * 2007-11-30 2013-07-20 Корбетт Рисёч Пти Лтд Устройство и способ управления температурой реакционной смеси
EP2393596B1 (en) 2009-02-09 2016-09-28 Whitespace Enterprise Corporation Microfluidic devices and methods of providing a storable sample
WO2011130785A1 (en) * 2010-04-20 2011-10-27 Corbett Research Pty Ltd Temperature control method and apparatus
JP2015154722A (ja) * 2014-02-20 2015-08-27 セイコーエプソン株式会社 核酸増幅反応容器及び核酸増幅反応装置
CN107338288A (zh) * 2017-06-14 2017-11-10 杨华卫 一种生物分子检测方法

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH01208685A (ja) * 1988-02-15 1989-08-22 Hitachi Ltd 冷凍装置
JPH0793370A (ja) * 1993-09-27 1995-04-07 Hitachi Device Eng Co Ltd 遺伝子データベース検索システム
JPH07303468A (ja) * 1986-02-25 1995-11-21 Perkin Elmer Corp:The ポリメラーゼ連鎖反応プロトコルを実施するための熱サイクリングシステム
JPH0870898A (ja) * 1994-09-07 1996-03-19 Hitachi Ltd Ｄｎａの分離・分取法及びその解析法
JPH09313163A (ja) * 1996-05-27 1997-12-09 Rikagaku Kenkyusho 微量検体のためのインキュベーターの温度制御方法及びインキュベーター

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5656493A (en) * 1985-03-28 1997-08-12 The Perkin-Elmer Corporation System for automated performance of the polymerase chain reaction
US5082935A (en) * 1988-12-15 1992-01-21 Amoco Corporation Diagnostic reagents made by attaching cytidine containing nucleic acid probes to amino functionalized solid supports by bisulfite mediated transamination
ATE154981T1 (de) * 1990-04-06 1997-07-15 Perkin Elmer Corp Automatisiertes labor für molekularbiologie
KR100236506B1 (ko) * 1990-11-29 2000-01-15 퍼킨-엘머시터스인스트루먼츠 폴리머라제 연쇄 반응 수행 장치
US5401607A (en) * 1991-04-17 1995-03-28 Polaroid Corporation Processes and compositions for photogeneration of acid
EP0537524A1 (en) * 1991-10-17 1993-04-21 Shipley Company Inc. Radiation sensitive compositions and methods
US5605662A (en) * 1993-11-01 1997-02-25 Nanogen, Inc. Active programmable electronic devices for molecular biological analysis and diagnostics
US5767259A (en) * 1994-12-27 1998-06-16 Naxcor Oligonucleotides containing base-free linking groups with photoactivatable side chains
JP3566377B2 (ja) * 1995-03-01 2004-09-15 株式会社神戸製鋼所 ダイヤモンド薄膜バイオセンサ
US5856174A (en) * 1995-06-29 1999-01-05 Affymetrix, Inc. Integrated nucleic acid diagnostic device
US6210882B1 (en) * 1998-01-29 2001-04-03 Mayo Foundation For Medical Education And Reseach Rapid thermocycling for sample analysis

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH07303468A (ja) * 1986-02-25 1995-11-21 Perkin Elmer Corp:The ポリメラーゼ連鎖反応プロトコルを実施するための熱サイクリングシステム
JPH01208685A (ja) * 1988-02-15 1989-08-22 Hitachi Ltd 冷凍装置
JPH0793370A (ja) * 1993-09-27 1995-04-07 Hitachi Device Eng Co Ltd 遺伝子データベース検索システム
JPH0870898A (ja) * 1994-09-07 1996-03-19 Hitachi Ltd Ｄｎａの分離・分取法及びその解析法
JPH09313163A (ja) * 1996-05-27 1997-12-09 Rikagaku Kenkyusho 微量検体のためのインキュベーターの温度制御方法及びインキュベーター

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
LAMTURE J. B., ET AL.: "DIRECT DETECTION OF NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION ON THE SURFACE OF A CHARGE COUPLED DEVICE.", NUCLEIC ACIDS RESEARCH, INFORMATION RETRIEVAL LTD., GB, vol. 22., no. 11., 1 January 1994 (1994-01-01), GB, pages 2121 - 2125., XP002910811, ISSN: 0305-1048 *
See also references of EP1054056A4 *

Cited By (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2000068368A1 (fr) * 1999-05-10 2000-11-16 Toyo Kohan Co.,Ltd. Procedes de construction de banque d'adn et support sur lequel ladite banque d'adn est immobilisee
US7029881B1 (en) 1999-05-10 2006-04-18 Nihon Parkerizing Hiroshima Co., Ltd. Methods for constructing DNA library and support carrying DNA library immobilized thereon
JP2001074750A (ja) * 1999-09-07 2001-03-23 Kyowa Medex Co Ltd 恒温装置及びこれを用いた恒温ユニット
WO2002052266A1 (fr) * 2000-12-25 2002-07-04 Japan Science And Technology Corporation Procede permettant de fixer un acide nucleique sur un diamant, conjugue diamant-mononucleoside et conjugue diamant-acide nucleique
WO2005054458A1 (ja) * 2003-12-03 2005-06-16 Hitachi High-Technologies Corporation 核酸分析方法、核酸分析用セル、および核酸分析装置
JP2008125459A (ja) * 2006-11-22 2008-06-05 National Agriculture & Food Research Organization 温度感作実験用金属製微量試験管及びそれを用いた微量液体試料中の微生物の加熱殺菌実験方法

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